JP2008532516A - 遺伝子破壊、組成物、およびそれに関連する方法 - Google Patents

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Abstract

本発明はトランスジェニック動物並びに遺伝子機能の特性化に関する組成物及び方法に関する。特に本発明は本明細書中に記載されるような遺伝子における破壊を含むトランスジェニックマウスを提供する。そのようなインビボ試験及び特性化により、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常のような遺伝子の破壊に関連する疾患又は機能不全の予防、緩解又は補正において有用な治療薬及び/又は治療法の価値ある識別及び発見が可能となる。

Description

(発明の分野)
本発明は組成物、例えばトランスジェニック及びノックアウト動物及び疾患又は障害の診断及び治療のためにそのような組成物を使用する方法に関する。
(発明の背景)
細胞外蛋白はとりわけ多細胞生物の形成、分化及び維持において重要な役割を果たしている。多くの個々の細胞の消長、例えば増殖、遊走、分化又は他の細胞との相互作用は典型的には他の細胞及び/又は直属の環境から受領される情報により統括されている。この情報はしばしば、分泌ポリペプチド(例えばマイトジェン因子、生存因子、細胞毒性因子、分化因子、神経ペプチド及びホルモン)により伝達され、これはその後多様な細胞受容体又は膜結合蛋白により受領され、解釈される。これ等の分泌ポリペプチド又はシグナリング分子は通常は細胞分泌経路を通過して細胞外環境におけるその作用部位に到達する。
分泌蛋白は医薬品、診断薬、バイオセンサー及びバイオリアクターを含む種々の産業上の用途を有している。血栓溶解剤、インターフェロン、インターロイキン、エリスロポエチン、コロニー刺激因子及び種々の他のサイトカインのような現在入手可能な蛋白薬剤の大部分は分泌蛋白である。膜蛋白であるそれらの受容体もまた治療薬又は診断薬としての潜在性を有する。産業界及び学術界の両方で新規な天然の分泌蛋白を同定するための努力がなされている。多くの努力は新規な分泌蛋白に関するコーディング配列を同定するための哺乳類組み換えDNAライブラリのスクリーニングに着目している。スクリーニングの方法及び手法の例は文献に記載されている[例えば、非特許文献1;特許文献1参照]。
膜結合蛋白及び受容体はとりわけ多細胞生物の形成、分化及び維持において重要な役割を果たし得る。多くの個々の細胞の消長、例えば増殖、遊走、分化又は他の細胞との相互作用は典型的には他の細胞及び/又は直属の環境から受領される情報により統括されている。この情報はしばしば、分泌ポリペプチド(例えばマイトジェン因子、生存因子、細胞毒性因子、分化因子、神経ペプチド及びホルモン)により伝達され、これはその後多様な細胞受容体又は膜結合蛋白により受領され、解釈される。このような膜結合蛋白及び細胞受容体は、限定されないが、サイトカイン受容体、受容体キナーゼ、受容体ホスファターゼ、細胞−細胞相互作用に関与する受容体、及び、細胞接着分子、例えばセレクチン及びインテグリンを包含する。例えば、細胞の成育及び分化を調節するシグナルの伝達は一つには種々の細胞蛋白のホスホリル化により調節される。その過程を触媒する酵素である蛋白チロシンキナーゼは成長因子受容体としても機能できる。例としては線維芽細胞成長因子受容体及び神経成長因子受容体が挙げられる。
膜結合蛋白及び受容体分子は医薬品及び診断薬を含む種々の産業上の用途を有している。例えば受容体免疫接着は受容体−リガンド相互作用をブロックするための治療薬として使用できる。膜結合蛋白は、関連する受容体/リガンド相互作用の潜在的なペプチド又は小分子の阻害剤のスクリーニングの為にも使用できる。
産業界及び学術界の両方で新規な天然の受容体又は膜結合蛋白を同定するための努力がなされている。多くの努力は新規な受容体又は膜結合蛋白に関するコーディング配列を同定するための哺乳類組み換えDNAライブラリのスクリーニングに着目している。
生物学及び疾患の過程における分泌及び膜結合の蛋白の重要性を鑑みれば、インビボの研究及び特性化は疾患又は機能不全の予防、緩解又は補正において有用な治療薬及び/又は治療法の価値ある識別及び道程を可能とし得る。この点に関し、遺伝子操作されたマウスは、免疫学、癌、神経生物学、心臓血管生物学、肥満及び他の多くを包含するヒトの疾患に関連する生物学的過程の機能的分析のための価値ある道具であることがわかっている。遺伝子ノックアウトは高度に特異的なアンタゴニストの活性をインビボで予測することにより薬剤作用の生物学的機序をモデル化しているものとして捉えることができる。ノックアウトマウスは薬剤の活性をモデル化していることがわかっており;特定の薬剤標的蛋白に関して欠損性であるマウスの表現型は相当する拮抗薬剤によって生じるヒト臨床表現型を模倣することができる。遺伝子ノックアウトは標的の作用機序、標的の主要な生理学的役割、及び、標的の抑制から生じると考えられる機序に基づいた副作用を哺乳類において発見可能とする。この型の例はアンジオテンシン変換酵素(ACE)[非特許文献2]及びシクロオキシゲナーゼ−1(COX1)遺伝子[非特許文献3]が欠損しているマウスを包含する。逆に、マウスにおいて遺伝子をノックアウトすることは相当する標的へのアゴニスト薬剤の投与後にヒトにおいて観察されるものとは逆の表現型作用を有する場合がある。その例としては突然変異の結果が赤血球生産不全であるエリスロポエチンノックアウト[非特許文献4]及び突然変異体マウスが活動亢進及び応答性亢進を示すGABA(A)−R−β3ノックアウト[非特許文献5]が挙げられる。これ等の表現型は共にヒトにおけるエリスロポエチン及びベンゾジアゼピン投与の作用とは逆である。マウス遺伝子学を用いて有効化された標的の意外な例はACC2遺伝子である。ヒトACC2遺伝子は数年前に同定されているが、薬剤開発の標的としてのACC2への関心はノックアウトマウスを用いたACC2機能分析後の最近になってようやく喚起された。ACC2突然変異マウスはその野生型同腹仔よりも大食であるが、より多くの脂肪を燃焼し、その脂肪細胞中への脂肪の貯留は低値であり、このことは、この酵素を肥満治療における化学的アンタゴニストに関する推定標的としている[非特許文献6]。
本出願においては、突然変異した遺伝子の破壊が、CNS/神経学的撹乱又は障害、例えば不安;眼の異常;及び関連の疾患;心臓血管、内皮又は血管形成の障害、例えばアテローム性動脈硬化症;異常な代謝の障害、例えば糖尿病及び上昇した血清中のトリグリセリド及びコレステロールのレベルに伴う脂質代謝障害;免疫学的及び炎症性の障害;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害、例えば関節炎、骨粗鬆症及び大理石骨病;又は発達疾患、例えば胚性致死を包含する種々の疾患状態又は機能不全に関連する表現型の観察事項をもたらしている。
米国特許第5,536,637号明細書 Klein et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.93:7108−7113(1996) Esther,C.R.et al.,Lab.Invest.,74:953−965(1996) Langenbach,R.et al.,Cell,83:483−492(1995) Wu,C.S.et al.,Cell.,83:59−67(1996) DeLorey,T.M.,J.Neurosci.,18:8505−8514(1998) Abu−Elheiga,L.et al.,Science,291:2613−2616(2001)
(発明の要旨)
A.実施形態
本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。
1つの局面において、単離された核酸分子は、(a)本明細書に開示する完全長のアミノ酸配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いたアミノ酸配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しない膜貫通蛋白の細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示した完全長アミノ酸配列の何れかの他の特に定義されるフラグメントを有するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNA分子、又は、(b)(a)のDNA分子の相補体に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約81%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約82%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約83%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約84%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約85%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約86%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約87%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約88%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約89%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約90%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約91%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約92%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約93%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約94%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約95%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約96%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約97%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約98%の核酸配列同一性、及び、或いは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
別の局面において、単離された核酸分子は、(a)本明細書に開示する完全長のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドcDNAのコーディング配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのコーディング配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しない膜貫通PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメインのコーディング配列、又は、本明細書に開示する完全長アミノ酸配列の何れかの他の特に定義されるフラグメントのコーディング配列を含むDNA分子、又は、(b)(a)のDNA分子の相補体に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約81%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約82%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約83%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約84%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約85%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約86%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約87%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約88%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約89%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約90%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約91%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約92%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約93%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約94%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約95%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約96%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約97%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約98%の核酸配列同一性、及び、或いは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
更に別の局面において、本発明は、(a)本明細書に開示するATCCにより寄託されたヒト蛋白cDNAの何れかによりコードされる同様の成熟ポリペプチドをコードするDNA分子、又は、(b)(a)のDNA分子の相補体に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約81%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約82%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約83%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約84%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約85%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約86%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約87%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約88%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約89%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約90%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約91%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約92%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約93%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約94%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約95%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約96%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約97%の核酸配列同一性、或いは少なくとも約98%の核酸配列同一性、及び、或いは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子に関する。
本発明の別の局面は、膜貫通ドメイン欠失又は膜貫通ドメイン不活性化されているか、又は、そのようなコードしているヌクレオチド配列に相補的なPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供し、ここでそのようなポリペプチドの膜貫通ドメインが本明細書において開示される。従って、本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの可溶性細胞外ドメインも意図される。
本発明は更に、例えば、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404抗体に対する結合部位を含むポリペプチドを場合によりコードしてよいPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのフラグメントをコードするためのハイブリダイゼーションプローブとして、又はアンチセンスオリゴヌクレオチドプローブとして使用してよい、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404ポリペプチドコーディング配列又はその相補体のフラグメントを提供する。このような核酸フラグメントは通常は、約10ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約15ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約20ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約30ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約40ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約50ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約60ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約70ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約80ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約90ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約100ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約110ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約120ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約130ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約140ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約150ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約160ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約170ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約180ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約190ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約200ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約250ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約300ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約350ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約400ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約450ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約500ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約600ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約700ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約800ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約900ヌクレオチド長又はそれ以上、及び、或いは約1000ヌクレオチド長又はそれ以上であり、ここで、この文脈において、「約」という用語は言及したヌクレオチド配列長±その言及した長さの10%を意味する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコードヌクレオチド配列の新規なフラグメントは、多くのよく知られた配列アライメントプログラムの何れかを用いてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコードヌクレオチド配列を他の既知ヌクレオチド配列とアラインすること、及び、どのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコードヌクレオチド配列フラグメントが新規であるかを決定することにより日常的に決定してよい。このようなPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,





PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコードヌクレオチド配列の全てを本明細書においては意図する。同様に意図されるものはこのようなヌクレオチド分子フラグメントによりコードされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドフラグメント、好ましくは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404抗体に対する結合部位を含む抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404ポリペプチドフラグメントである。
本発明は上記の通り同定された単離された核酸配列の何れかによりコードされる単離されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを提供する。
特定の局面において、本発明は本明細書に開示する完全長のアミノ酸配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いたアミノ酸配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しない膜貫通蛋白の細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示した完全長アミノ酸配列の何れかの他の特に定義されるフラグメントを有するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対して、少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約81%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約82%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約83%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約84%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約85%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約86%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約87%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約88%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約89%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約90%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約91%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約92%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約93%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約94%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約95%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約96%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約97%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約98%のアミノ酸配列同一性、及び、或いは少なくとも約99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単離されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに関する。
更に別の局面において、本発明は本明細書に開示するATCCにより寄託されたヒト蛋白cDNAの何れかによりコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約81%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約82%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約83%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約84%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約85%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約86%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約87%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約88%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約89%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約90%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約91%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約92%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約93%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約94%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約95%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約96%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約97%のアミノ酸配列同一性、或いは少なくとも約98%のアミノ酸配列同一性、及び、或いは少なくとも約99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単離されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに関する。
1つの局面において、本発明は約10アミノ酸長又はそれ以上、或いは約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長又はそれ以上のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドに関する。場合により、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドはネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と比較して1つ又はそれより多くない保存的アミノ酸置換を有し、或いは、ネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と比較して2、3、4、5、6、7、8、9又は10より多くない保存的アミノ酸置換を有する。
特定の局面において、本発明はN末端シグナル配列及び/又は開始メチオニンを有しない単離されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを提供し、前記したとおりそのようなアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列によりコードされる。これ等を製造するためのプロセスも本明細書に記載し、その場合、そのようなプロセスはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現に適する条件下に適切なコードしている核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を培養すること、及び、細胞培養物からPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを回収することを含む。
本発明の別の局面は膜貫通ドメイン欠失又は膜貫通ドメイン不活性化されている単離されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを提供する。これ等を製造するプロセスも本明細書に記載し、その場合、そのようなプロセスはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現に適する条件下に適切なコードしている核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を培養すること、及び、細胞培養物からPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを回収することを含む。
本発明は本明細書において定義されるネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト及びアンタゴニストを提供する。特に、アゴニスト又はアンタゴニストは抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体又は小分子である。
本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを候補分子と接触させること、及び、該PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドにより媒介される生物学的活性をモニタリングすることを含む、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対するアゴニスト又はアンタゴニストを同定する方法を提供する。好ましくは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドはネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドである。
本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、又は、本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404のアゴニスト又はアンタゴニスト、又は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を担体と組み合わせて含む組成物を提供する。場合により、担体は製薬上許容しうる担体である。
本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404抗体に対して応答する状態の治療において有用な医薬の製造のための抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404ポリペプチド又は上記したそのアゴニスト又はアンタゴニスト、又は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体の使用を提供する。
本発明は本明細書に記載したポリペプチドの何れかをコードするDNAを含むベクターを提供する。何れかのそのようなベクターを含む宿主細胞も提供される。例えば、宿主細胞はCHO細胞、E・コリ又は酵母であってよい。本明細書に記載したポリペプチドの何れかを製造するためのプロセスも更に提供され、それは所望のポリペプチドの発現の為に適する条件下において宿主細胞を培養すること及び細胞培養物から所望のポリペプチドを回収することを含む。
本発明は異種ポリペプチド又はアミノ酸配列に融合させた本明細書に記載したポリペプチドの何れかを含むキメラ分子を提供する。そのようなキメラ分子の例はエピトープタグ配列又は免疫グロブリンのFc領域に融合させた本明細書に記載したポリペプチドの何れかを含む。
本発明は前述又は後述のポリペプチドのいずれかに、好ましくは特異的に結合する抗体を提供する。場合により、抗体はモノクローナル抗体、ヒト化抗体、抗体フラグメント又は一本鎖抗体である。
本発明はゲノム及びcDNAのヌクレオチド配列を単離するために、関連する遺伝子の発現を測定又は検出するために、又は、アンチセンスプローブとして有用な、オリゴヌクレオチドプローブを提供し、ここでこれ等のプローブは前述又は後述のヌクレオチド配列の何れかから誘導してよい。好ましいプローブ長は前述の通りである。
本発明はまた、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;及び、
(c)測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること、
を含み、ここで野生型動物の生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される上記方法を提供する。1つの局面において、非ヒトトランスジェニック動物は哺乳類である。別の局面において、哺乳類はげっ歯類である。更に別の局面において、哺乳類はラット又はマウスである。1つの局面において、非ヒトトランスジェニック動物はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である。別の局面において、性別一致野生型同腹仔と比較した場合の非ヒトトランスジェニック動物により示される表現型は以下のもの、即ち:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つである。
更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の増強された運動共調である。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の減損した運動共調である。更に別の局面において、神経障害は抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である。このような神経障害は「不安障害」と定義されるカテゴリーを包含し、これは例えば限定しないが軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
別の局面において、眼の異常は網膜の異常である。更に別の局面において、眼の異常は網膜の視覚問題又は失明と関係している。別の局面において、網膜の異常は色素性網膜炎と関係しているか、又は網膜の異常は網膜変性又は網膜の形成異常を特徴としている。
更に別の局面において、網膜の異常は網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している。
更に別の局面において、眼の異常は白内障である。又更に別の局面において、白内障は全身疾患、例えばヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群である。
更に別の局面において、発達異常は胚性致死又は生存性低下を含む。
更に又別の局面において、心臓血管、内皮又は血管形成障害は動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である。
更に別の局面において、免疫不全は全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である。
更に別の局面において、骨代謝異常又は障害は関節炎、骨粗鬆症、骨減少症又は大理石骨病である。
別の局面において、非ヒトトランスジェニック動物は性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性、即ち:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す。
本発明は又、自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物から誘導した単離細胞を提供する。1つの局面において、単離細胞はマウス細胞である。別の局面において、マウス細胞は胚性幹細胞である。更に別の局面において、単離細胞は性別一致野生型同腹仔と比較した場合に以下の表現型、即ち:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つを示す非ヒトトランスジェニック動物から誘導される。本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物の生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された表現型を調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
1つの局面において、遺伝子の破壊に関連する表現型は神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む。
更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の増強された運動共調である。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の減損した運動共調である。更に別の局面において、神経障害は抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である。このような神経障害は「不安障害」と定義されるカテゴリーを包含し、これは例えば限定しないが軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
更に別の局面において、眼の異常は網膜の異常である。更に別の局面において、眼の異常は網膜の視覚問題又は失明と関係している。別の局面において、網膜の異常は色素性網膜炎と関係しているか、又は網膜の異常は網膜変性又は網膜の形成異常を特徴としている。
更に別の局面において、網膜の異常は網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している。
更に別の局面において、眼の異常は白内障である。又更に別の局面において、白内障は全身疾患、例えばヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群である。
更に別の局面において、発達異常は胚性致死又は生存性低下を含む。
更に又別の局面において、心臓血管、内皮又は血管形成障害は動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である。
更に別の局面において、免疫不全は全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である。
更に別の局面において、骨代謝異常又は障害は関節炎、骨粗鬆症、骨減少症又は大理石骨病である。
別の局面において、非ヒトトランスジェニック動物は性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性、即ち:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す。
本発明は又遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特性を調節する薬剤を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物により示される生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴は遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴が調節されているかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
1つの局面において、非ヒトトランスジェニック動物は性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性の少なくとも1つを示す。
別の局面において、非ヒトトランスジェニック動物は性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性、即ち:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び肺性致死の少なくとも1つを示す。
本発明はまた遺伝子の破壊に関連する生理学的特性を調節する薬剤を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する薬剤を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される挙動を観察すること;
(c)(b)の観察された挙動を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物により示された観察された挙動とは異なる非ヒトトランスジェニック動物により示された観察された挙動は遺伝子の破壊に関連する挙動として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)薬剤が遺伝子の破壊に関連する挙動を調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
1つの局面において、観察される挙動はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、観察される挙動はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、観察される挙動はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。更に別の局面において、観察される挙動は反転スクリーン試験中の増強された運動共調である。更に別の局面において、観察される挙動は反転スクリーン試験中の減損した運動共調である。更に別の局面において、観察される挙動は抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害を包含する。このような障害は「不安障害」と定義されるカテゴリーを包含し、これは例えば限定しないが軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
本発明は又、遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する薬剤を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)試験薬剤を該非ヒトトランスジェニック動物に投与すること;及び、
(c)試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の増強された運動共調である。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の減損した運動共調である。更に別の局面において、神経障害は抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である。このような神経障害は「不安障害」と定義されるカテゴリーを包含し、これは例えば限定しないが軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
別の局面において、眼の異常は網膜の異常である。更に別の局面において、眼の異常は網膜の視覚問題又は失明と関係している。別の局面において、網膜の異常は色素性網膜炎と関係しているか、又は網膜の異常は網膜変性又は網膜の形成異常を特徴としている。
更に別の局面において、網膜の異常は網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している。
更に別の局面において、眼の異常は白内障である。又更に別の局面において、白内障は全身疾患、例えばヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群である。
更に別の局面において、発達異常は胚性致死又は生存性低下を含む。
更に又別の局面において、心臓血管、内皮又は血管形成障害は動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である。
更に別の局面において、免疫不全は全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である。
更に別の局面において、骨代謝異常又は障害は関節炎、骨粗鬆症、骨減少症又は大理石骨病である。
別の局面において、非ヒトトランスジェニック動物は性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性、即ち:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す。
本発明は又、遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の治療のための治療薬を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に試験薬剤を接触させること;及び、
(b)試験薬剤が宿主細胞によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
本発明は又PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する薬剤を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明はまた、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を評価する方法であって、方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物の生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた状態として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された状態に対する試験薬剤の作用を評価すること;
を含む上記方法を提供する。
1つの局面において、状態は神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常である。
本発明は又、遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を含む医薬組成物を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、方法が既に疾患を有し得る者、又は疾患を有する傾向にあり得る者、又は疾患を予防すべきであり得る者であるそのような治療を必要とする被験体に治療薬、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの治療有効量を投与することにより、該障害又は疾患を効果的に治療又は予防又は緩解することを含む上記方法を提供する。
更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の増強された運動共調である。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の減損した運動共調である。更に別の局面において、神経障害は抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である。このような神経障害は「不安障害」と定義されるカテゴリーを包含し、これは例えば限定しないが軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
別の局面において、眼の異常は網膜の異常である。更に別の局面において、眼の異常は網膜の視覚問題又は失明と関係している。別の局面において、網膜の異常は色素性網膜炎と関係しているか、又は網膜の異常は網膜変性又は網膜の形成異常を特徴としている。
更に別の局面において、網膜の異常は網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している。
更に別の局面において、眼の異常は白内障である。又更に別の局面において、白内障は全身疾患、例えばヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群である。
更に別の局面において、発達異常は胚性致死又は生存性低下を含む。
更に又別の局面において、心臓血管、内皮又は血管形成障害は動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である。
更に別の局面において、免疫不全は全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である。
更に別の局面において、骨代謝異常又は障害は関節炎、骨粗鬆症、骨減少症又は大理石骨病である。
別の局面において、治療薬はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、方法が下記工程:
(a)非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物を準備すること(ここで該培養物の各々の細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる);
(b)試験薬剤を該細胞培養物に投与すること;及び、
(c)試験薬剤が該培養物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。
更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の増強された運動共調である。更に別の局面において、神経障害は反転スクリーン試験中の減損した運動共調である。更に別の局面において、神経障害は抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である。このような神経障害は「不安障害」と定義されるカテゴリーを包含し、これは例えば限定しないが軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
別の局面において、眼の異常は網膜の異常である。更に別の局面において、眼の異常は視覚問題又は失明と関係している。別の局面において、網膜の異常は色素性網膜炎と関係しているか、又は網膜の異常は網膜変性又は網膜の形成異常を特徴としている。
更に別の局面において、網膜の異常は網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している。
更に別の局面において、眼の異常は白内障である。又更に別の局面において、白内障は全身疾患、例えばヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群である。
更に別の局面において、発達異常は胚性致死又は生存性低下を含む。
更に又別の局面において、心臓血管、内皮又は血管形成障害は動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である。
更に別の局面において、免疫不全は全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である。
更に別の局面において、骨代謝異常又は障害は関節炎、骨粗鬆症、骨減少症又は大理石骨病である。
本発明は又、上記培養物において遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を提供する。1つの局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、薬剤はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである。更に別の局面において、アゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。更に別の局面において、アンタゴニストの薬剤は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、方法が既に表現型を有し得る被験体、又は表現型を有する傾向にあり得る被験体、又は表現型を予防すべきであり得る被験体に、該表現型を調節するものとして同定された薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、表現型を効果的に調節することを含む上記方法を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、方法が既に生理学的特徴を示し得る被験体、又は生理学的特徴を示す傾向にあり得る被験体、又は生理学的特徴を予防すべきであり得る被験体に、該生理学的特徴を調節するものとして同定された薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、生理学的特徴を効果的に調節することを含む上記方法を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する方法であって、方法が既に挙動を示し得る被験体、又は挙動を示す傾向にあり得る被験体、又は示された挙動を予防すべきであり得る被験体に、該挙動を調節するものとして同定された薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、挙動を効果的に調節することを含む上記方法を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する方法であって、方法が該PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に、該発現を調節するものとして同定された薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該ポリペプチドの発現を効果的に調節することを含む上記方法を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、方法が既に状態を有し得る被験体、又は状態を有する傾向にあり得る被験体、又は状態を予防すべきであり得る被験体に、該状態を調節するものとして同定された薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの治療有効量を投与することにより、状態を効果的に調節することを含む上記方法を提供する。
本発明は又、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、方法が非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物、ただし該培養物の各々の細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいるものに対して、該障害を治療又は予防又は緩解するものとして同定された薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含む上記方法を提供する。
B.別の実施形態
更に別の実施形態において、本発明は本出願に係る潜在的請求項の以下のセットを指向している。
(1) PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;及び、
(c)該測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること、
を含み、ここで該野生型動物の該生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴が、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される、方法。
(2) 前記非ヒトトランスジェニック動物が、PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、1記載の方法。
(3) 性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物により示される表現型が、以下:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つである、1記載の方法。
(4) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、3記載の方法。
(5) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、3記載の方法。
(6) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、3記載の方法。
(7) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、3記載の方法。
(8) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、3記載の方法。
(9) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、3記載の方法。
(10) 前記眼の異常が網膜の異常である、3記載の方法。
(11) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、3記載の方法。
(12) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、10記載の方法。
(13) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、10記載の方法。
(14) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病(Albers−Schnoberg disease)、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、10記載の方法。
(15) 前記眼の異常が白内障である、3記載の方法。
(16) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、15記載の方法。
(17) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、3記載の方法。
(18) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、3記載の方法。
(19) 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、3記載の方法。
(20) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、3記載の方法。
(21) 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞(blow cells);脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、1記載の方法。
(22) 自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物から誘導した、単離細胞。
(23) マウス細胞である、22記載の単離細胞。
(24) 前記マウス細胞が胚性幹細胞である23記載の単離細胞。
(25) 性別一致野生型同腹仔と比較した場合に前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つを示す、22記載の単離細胞。
(26) PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該試験薬剤が該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された表現型を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(27) 前記遺伝子の破壊に関連する表現型が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、26記載の方法。
(28) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、27記載の方法。
(29) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、27記載の方法。
(30) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、27記載の方法。
(31) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、27記載の方法。
(32) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、27記載の方法。
(33) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、27記載の方法。
(34) 前記眼の異常が網膜の異常である、27記載の方法。
(35) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、27記載の方法。
(36) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、34記載の方法。
(37) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、34記載の方法。
(38) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、34記載の方法。
(39) 前記眼の異常が白内障である、27記載の方法。
(40) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、39記載の方法。
(41) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、27記載の方法。
(42) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、27記載の方法。
(43) 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、27記載の方法。
(44) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、27記載の方法。
(45) 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、26記載の方法。
(46) 26記載の方法により同定された、薬剤。
(47) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、46記載の薬剤。
(48) 前記アゴニストが、抗−PRO179,抗−PRO181,抗−PRO244,抗−PRO247,抗−PRO269,抗−PRO293,抗−PRO298,抗−PRO339,抗−PRO341,抗−PRO347,抗−PRO531,抗−PRO537,抗−PRO718,抗−PRO773,抗−PRO860,抗−PRO871,抗−PRO872,抗−PRO813,抗−PRO828,抗−PRO1100,抗−PRO1114,抗−PRO1115,抗−PRO1126,抗−PRO1133,抗−PRO1154,抗−PRO1185,抗−PRO1194,抗−PRO1287,抗−PRO1291,抗−PRO1293,抗−PRO1310,抗−PRO1312,抗−PRO1335,抗−PRO1339,抗−PRO2155,抗−PRO1356,抗−PRO1385,抗−PRO1412,抗−PRO1487,抗−PRO1758,抗−PRO1779,抗−PRO1785,抗−PRO1889,抗−PRO90318,抗−PRO3434,抗−PRO3579,抗−PRO4322,抗−PRO4343,抗−PRO4347,抗−PRO4403,抗−PRO4976,抗−PRO260,抗−PRO6014,抗−PRO6027,抗−PRO6181,抗−PRO6714,抗−PRO9922,抗−PRO7179,抗−PRO7476,抗−PRO9824,抗−PRO19814,抗−PRO19836,抗−PRO20088,抗−PRO70789,抗−PRO50298,抗−PRO51592,抗−PRO1757,抗−PRO4421,抗−PRO9903,抗−PRO1106,抗−PRO1411,抗−PRO1486,抗−PRO1565,抗−PRO4399または抗−PRO4404抗体である、47記載の薬剤。
(49) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、47記載の薬剤。
(50) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特性を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示される生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴が、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴が調節されているかどうか決定すること;
を含む、方法。
(51) 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、50記載の方法。
(52) 50記載の方法により同定された、薬剤。
(53)抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404
ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、52記載の薬剤。
(54) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、53記載の薬剤。
(55) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、53記載の薬剤。
(56) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される挙動を観察すること;
(c)(b)の観察された挙動を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示された観察された挙動とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示された観察された挙動は、遺伝子の破壊に関連する挙動として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該薬剤が遺伝子の破壊に関連する挙動を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(57) 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、56記載の方法。
(58) 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、56記載の方法。
(59) 前記挙動がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、56記載の方法。
(60) 前記挙動が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、56記載の方法。
(61) 前記挙動が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、56記載の方法。
(62) 前記挙動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、56記載の方法。
(63) 56記載の方法により同定された、薬剤。
(64) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストであ、る63記載の薬剤。
(65) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、64記載の薬剤。
(66) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、64記載の薬剤。
(67) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)試験薬剤を該非ヒトトランスジェニック動物に投与すること;及び、
(c)該試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(68) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、67記載の方法。
(69) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、67記載の方法。
(70) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、67記載の方法。
(71) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、67記載の方法。
(72) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、67記載の方法。
(73) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、67記載の方法。
(74) 前記眼の異常が網膜の異常である、67記載の方法。
(75) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、67記載の方法。
(76) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、74記載の方法。
(77) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、74記載の方法。
(78) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、74記載の方法。
(79) 前記眼の異常が白内障である、67記載の方法。
(80) 前記白内障がヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、79記載の方法。
(81) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、67記載の方法。
(82) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、67記載の方法。
(83) 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、67記載の方法。
(84) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、67記載の方法。
(85) 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、67記載の方法。
(86) 67記載の方法により同定された、薬剤。
(87) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、86記載の薬剤。
(88) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、87記載の薬剤。
(89) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、87記載の薬剤。
(90) 67記載の方法により同定された、治療薬。
(91) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に試験薬剤を接触させること;及び、
(b)該試験薬剤が、宿主細胞によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(92) 91記載の方法により同定された、薬剤。
(93) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、92記載の薬剤。
(94) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、93記載の薬剤。
(95) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、93記載の薬剤。
(96) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を評価する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた状態として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された状態に対する、該試験薬剤の作用を評価すること;
を含む、方法。
(97) 前記状態が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、96記載の方法。
(98) 96記載の方法により同定された、治療薬。
(99) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、98記載の治療薬。
(100) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、99記載の治療薬。
(101) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、99記載の治療薬。
(102) 98記載の治療薬を含む、医薬組成物。
(103) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、既に疾患を有し得る者、又は疾患を有する傾向にあり得る者、又は疾患を予防すべきであり得る者であるそのような治療を必要とする被験体に、94記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの治療有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含む、方法。
(104) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、103記載の方法。
(105) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、103記載の方法。
(106) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、103記載の方法。
(107) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、103記載の方法。
(108) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、103記載の方法。
(109) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、103記載の方法。
(110) 前記眼の異常が網膜の異常である、103記載の方法。
(111) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、103記載の方法。
(112) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、110記載の方法。
(113) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、110記載の方法。
(114) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、110記載の方法。
(115) 前記眼の異常が白内障である、103記載の方法。
(116) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、115記載の方法。
(117) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、103記載の方法。
(118) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である103記載の方法。
(119) 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、103記載の方法。
(120) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、103記載の方法。
(121) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物を準備すること(ここで該培養物の各々の細胞は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる);
(b)試験薬剤を該細胞培養物に投与すること;及び、
(c)該試験薬剤が該細胞培養物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(122) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、121記載の方法。
(123) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、121記載の方法。
(124) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、121記載の方法。
(125) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、121記載の方法。
(126) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、121記載の方法。
(127) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、121記載の方法。
(128) 前記眼の異常が網膜の異常である、121記載の方法。
(129) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、121記載の方法。
(130) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、128記載の方法。
(131) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、128記載の方法。
(132) 前記網膜の異常が網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、128記載の方法。
(133) 前記眼の異常が白内障である、121記載の方法。
(134) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、133記載の方法。
(135) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、121記載の方法。
(136) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である121記載の方法。
(137) 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、121記載の方法。
(138) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、121記載の方法。
(139) 121記載の方法により同定された、薬剤。
(140) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、139記載の薬剤。
(141) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、140記載の薬剤。
(142) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、140記載の薬剤。
(143) 121記載の方法により同定された、治療薬。
(144) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、該方法が、既に表現型を有し得る被験体、又は表現型を有する傾向にあり得る被験体、又は表現型を予防すべきであり得る被験体に、46記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該表現型を効果的に調節することを含む、方法。
(145) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、該方法は、既に生理学的特徴を示し得る被験体、又は生理学的特徴を示す傾向にあり得る被験体、又は生理学的特徴を予防すべきであり得る被験体に、52記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該生理学的特徴を効果的に調節することを含む、方法。
(146) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する方法であって、該方法は、既に挙動を示し得る被験体、又は挙動を示す傾向にあり得る被験体、又は示された挙動を予防すべきであり得る被験体に、63記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該挙動を効果的に調節することを含む、方法。
(147) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する方法であって、該方法は、該PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に、92記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該ポリペプチドの発現を効果的に調節することを含む、方法。
(148) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、該方法は、既に状態を有し得る被験体、又は状態を有する傾向にあり得る被験体、又は状態を予防すべきであり得る被験体に、98記載の治療薬、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該状態を効果的に調節することを含む、方法。
(149) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物に対して、139記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含み、ここで該培養物の各々の細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる、方法。
(好ましい実施形態の詳細な説明)
1.定義
「PROポリペプチド」及び「PRO」という用語は本明細書においては、そして数の表記が直後に来る場合は、種々のポリペプチドを指すものとし、ここで完全な表記(即ちPRO/数)は本明細書に記載する特定のポリペプチド配列を指す。「数」という用語が本明細書において使用される実際の数の表記として提示される場合の「PRO/数ポリペプチド」及び「PRO/数」という用語は、ネイティブの配列のポリペプチド及びポリペプチドの変異体(これは本明細書において更に定義する)を包含する。本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは種々の原料から、例えばヒト組織型から、又は他の原料から単離してよく、又は、組み換え又は合成の方法により製造してよい。「PROポリペプチド」という用語は本明細書に開示した各々の個々のPRO/数ポリペプチドを指す。「PROポリペプチド」に言及する本明細書中の全ての開示は、ポリペプチドを個別に、並びに、総括して指すものとする。例えば、その製造、精製、誘導、それに対する抗体の形成、その投与、それを含有する組成物、それを伴う疾患の治療に関する説明等は本発明のポリペプチドの各々個々に関するものである。「PROポリペプチド」という用語はまた本明細書に開示したPRO/数ポリペプチドの変異体を包含する。
「ネイティブ配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド」とは自然界より誘導される相当するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと同じアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。そのようなネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは自然界から単離することができ、又は、組み換え又は合成手段により製造できる。「ネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド」という用語は特に特定のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド(例えば細胞外ドメイン配列)の天然に存在するトランケーションされた、又は分泌された形態、ポリペプチドの天然に存在する変異体型(例えばオルタナティブスプライシングされた形態)及び天然に存在する対立遺伝子変異体を包含する。本発明は添付図面に示す完全長のアミノ酸配列を含む成熟又は完全長のネイティブ配列ポリペプチドである本明細書に開示されたネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを提供する。開始及び終止コドンは図面中では太字で示し、下線を付した。しかしながら、添付図面において開示したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは図面中アミノ酸位置1として本明細書において表記したメチオニン残基で開始するように示されているが、図面中のアミノ酸位置1よりも上流又は下流に位置する他のメチオニン残基もPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO





4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのための開始アミノ酸残基として使用してよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの「細胞外ドメイン」又は「ECD」とは膜貫通及び細胞質ドメインを本質的に伴わないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの形態を指す。通常は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのECDはそのような膜貫通及び/又は細胞質ドメイン1%未満を有し、好ましくはそのようなドメイン0.5%未満を有する。本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに関して同定される何れの膜貫通ドメインも疎水性ドメインのこのような型を同定するために当該分野で日常的に使用されている基準に従って同定される。膜貫通ドメインの厳密な境界は変動してよいが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたドメインの何れかの末端において約5アミノ酸を超えないものである。従って場合により、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメインは実施例又は明細書において同定される膜貫通ドメイン/細胞外ドメインの境界の何れかの側において約5以下のアミノ酸を含んでよく、付随シグナルペプチドを有するか有しないそのようなポリペプチド及びそれらをコードする核酸は本発明により意図される。
本明細書に開示した種々のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの「シグナルペプチド」の大まかな位置は本明細書及び/又は添付図面に示す通りである。しかしながら、シグナルペプチドのC末端境界は変動してよいが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたシグナルペプチドC末端境界の何れかの側において約5アミノ酸を超えないものであり、ここでシグナルペプチドのC末端境界を、アミノ酸配列エレメントのそのような型を同定するために当該分野で日常的に使用されている基準に従って同定してよい(例えばNielsen et al.,Prot.Eng.10:1−6(1997)及びvon Heinje et al.,Nucl.Acids.Res.14:4683−4690(1986)参照)。更に又、場合により分泌ポリペプチドからのシグナル配列の切断は完全に均一ではなく、1つより多い分泌種をもたらす。シグナルペプチドが本明細書において同定されたシグナルペプチドC末端境界の何れかの側の5以下のアミノ酸内において切断されているこれ等の成熟ポリペプチド及びそれらをコードするポリヌクレオチドは本発明により意図される。
「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体」とはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、好ましくは、完全長のネイティブの配列の、本明細書に開示するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に定義するシグナルペプチドを欠いたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性を有するものとして本明細書において定義される活性なPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示する完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列の何れかの他のフラグメント(例えば完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに関する完全なコーディング配列の一部分のみを示す核酸によりコードされるもの)を意味する。そのようなPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO11





00,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体は例えば完全長のネイティブのアミノ酸配列のN又はC末端においてアミノ酸残基1つ以上が付加又は欠失しているPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを包含する。通常は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体は、本明細書に開示する完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示する完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列の何れかの他の特に定義されたフラグメントに対して約80%又はそれ以上のアミノ酸配列同一性を有するか、或いは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%又はそれ以上のアミノ酸配列同一性を有する。通常はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドは約10アミノ酸長又はそれ以上、或いは約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、43





0、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長又はそれ以上である。場合により、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドはネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と比較して1つより多くない保存的アミノ酸置換を有するか、又は、ネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と比較して2、3、4、5、6、7、8、9又は10より多くない保存的アミノ酸置換を有する。
本明細書において同定されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列に関して「パーセント(%)アミノ酸配列同一性」とは、最大パーセント配列同一性を達成するために必要に応じて配列をアラインし、ギャップを導入した後に、如何なる保存的置換も配列同一性の部分とはみなさない場合に、特定のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列におけるアミノ酸残基と同一である候補配列におけるアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一性を決定する目的のためのアライメントは当業者の知る種々の方法、例えばBLAST、BLAST−2、ALIGN又はMegalign(DNASTAR)ソフトウエアのような市販のコンピュータソフトウエアを用いて達成することができる。当業者は比較すべき配列の完全長に渡り最大アライメントを達成するために必要な何れかのアルゴリズムを含むアライメントを測定するための適切なパラメーターを決定することができる。しかしながら本明細書の目的のためには、%アミノ酸同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN−2を用いて発生させ、ここでALIGN−2プログラムに関する完全なソースコードは以下の表1に示す。ALIGN−2配列比較コンピュータプログラムはGenentech,Inc.により作成され、そして以下の表1に示すソースコードは合衆国著作権局Washington D.C.,20559において合衆国著作権登録番号TXU510087の下にユーザードキュメンテーションと共に保存されている。ALIGN−2プログラムはGenentech,Inc.,South San Francisco,Californiaから公的に入手するか、又は、以下の表1に示すソースコードからコンパイルしてよい。ALIGN−2プログラムはUNIX(登録商標)オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX(登録商標)V4.0D上で使用するためにコンパイルしなければならない。全ての配列比較パラメーターはALIGN−2プログラムにより設定され、変更されない。
アミノ酸配列比較のためにALIGN−2を使用する状況において、あるアミノ酸配列Aのあるアミノ酸配列Bに対する%アミノ酸配列同一性(これは代替としてあるアミノ酸配列Bに対する特定の%アミノ酸配列同一性を有する又は含むあるアミノ酸配列Aと表現できる)は下記式:
100×分数X/Y
[式中、XはA及びBのアライメントをプログラムする配列アライメントプログラムALIGN−2により同一マッチと採点されたアミノ酸残基の数であり、YはBにおけるアミノ酸残基の総数である]により計算される。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合は、Bに対するAの%アミノ酸配列同一性はAに対するBの%アミノ酸配列同一性と等しくならない。この方法を用いた%アミノ酸配列同一性計算の例として、表2及び3は「PRO」と表記したアミノ酸配列に対する「比較蛋白」と表記したアミノ酸配列の%アミノ酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO」は目的の仮説的PROポリペプチドのアミノ酸配列を示し、「比較蛋白」は目的の「PRO」ポリペプチドを比較する相手であるポリペプチドのアミノ酸配列を示し、そして「X」、「Y」及び「Z」は各々異なる仮説的アミノ酸残基を示す。特段の記載が無い限り、本明細書で使用する全ての%アミノ酸配列同一性の値はALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリヌクレオチド」又は「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体核酸配列」とは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、好ましくは本明細書に定義する活性なPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードし、そして、本明細書に開示する完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いた完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示する完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列の何れかの他のフラグメント(例えば完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PR





O1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに関する完全なコーディング配列の一部分のみを示す核酸によりコードされるもの)に対して少なくとも約80%の核酸配列同一性を有する核酸分子を意味する。通常は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリヌクレオチドは本明細書に開示する完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いた完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示する完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列の何れかの他のフラグメントをコードする核酸配列に対して、約80%又はそれ以上の核酸配列同一性を有するか、或いは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%又はそれ以上の核酸配列同一性を有する。変異体はネイティブヌクレオチド配列を包含しない。
通常はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリヌクレオチドは約5ヌクレオチド長又はそれ以上、或いは約6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990又は1000ヌクレオチド長又はそれ以上であり、ここで、この文脈において、「約」という用語は言及したヌクレオチド配列長±その言及した長さの10%を意味する。
本明細書において同定されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404コード核酸配列に関して「パーセント(%)核酸配列同一性」とは、最大パーセント配列同一性を達成するために必要に応じて配列をアラインし、ギャップを導入した後に、目的のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸配列におけるヌクレオチドと同一である候補配列におけるヌクレオチドのパーセンテージとして定義される。パーセント核酸配列同一性を決定する目的のためのアライメントは当業者の知る種々の方法、例えばBLAST、BLAST−2、ALIGN又はMegalign(DNASTAR)ソフトウエアのような市販のコンピュータソフトウエアを用いて達成することができる。しかしながら本明細書の目的のためには、%核酸配列同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN−2を用いて発生させ、ここでALIGN−2プログラムに関する完全なソースコードは以下の表1に示す。ALIGN−2配列比較コンピュータプログラムはGenentech,Inc.により作成され、そして以下の表1に示すソースコードは合衆国著作権局Washington D.C.,20559において合衆国著作権登録番号TXU510087の下にユーザードキュメンテーションと共に保存されている。ALIGN−2プログラムはGenentech,Inc.,South San Francisco,Californiaから公的に入手するか、又は、以下の表1に示すソースコードからコンパイルしてよい。ALIGN−2プログラムはUNIX(登録商標)オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX(登録商標)V4.0D上で使用するためにコンパイルしなければならない。全ての配列比較パラメーターはALIGN−2プログラムにより設定され、変更されない。
核酸配列比較のためにALIGN−2を使用する状況において、ある核酸配列Cのある核酸配列Dに対する%核酸配列同一性(これは代替としてある核酸配列Dに対する特定の%核酸配列同一性を有する又は含むある核酸配列Cと表現できる)は下記式:
100×分数W/Z
[式中、WはC及びDのアライメントをプログラムする配列アライメントプログラムALIGN−2により同一マッチと採点されたヌクレオチドの数であり、ZはDにおけるヌクレオチドの総数である]により計算される。核酸配列Cの長さが核酸配列Dの長さと等しくない場合は、Dに対するCの%核酸配列同一性はCに対するDの%核酸配列同一性と等しくならない。%核酸配列同一性計算の例として、表4及び5は「PRO−DNA」と表記した核酸配列に対する「比較DNA」と表記した核酸配列の%核酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO−DNA」は目的の仮説的PRO−コード核酸配列を示し、「比較DNA」は目的の「PRO−DNA」核酸分子を比較する相手である核酸分子のヌクレオチド配列を示し、そして「N」、「L」及び「V」は各々異なる仮説的ヌクレオチドを示す。特段の記載が無い限り、本明細書で使用する全ての%核酸配列同一性の値はALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
本発明は又PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする核酸分子であり、そして、本明細書において定義した完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション及び洗浄の条件の下にハイブリダイズすることができるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリヌクレオチドを提供する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリヌクレオチドによりコードされるものであってよい。
「完全長コーディング領域」という用語は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする核酸に言及して使用する場合は、本発明の完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチドの配列を指す(これは添付図面において開始〜終止コドンに示される場合が多い)。「完全長コーディング領域」という用語は、ATCC寄託核酸に言及して使用する場合は、ATCCに寄託されたベクター内に挿入されるcDNAのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコード部分を指す(これは添付図面において開始〜終止コドンに示される場合が多い)。
「単離された」とは、本明細書において開示する種々のポリペプチドを説明するために用いる場合は、その天然の環境の成分中から同定及び分離及び/又は回収されたポリペプチドを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、ポリペプチドの診断又は治療上の使用を典型的に妨害する物質であり、酵素、ホルモン及び他の蛋白性又は非蛋白性の溶質を包含してよい。本発明は(1)スピニングカップシーケネーターを用いてN末端又は内部のアミノ酸配列の少なくとも15残基を得るために十分な程度まで、又は、(2)クーマシーブルー又は好ましくは銀染色を用いた非還元又は還元条件下のSDS−PAGEによる均質性となるように、ポリペプチドが精製されることを可能とする。単離されたポリペプチドは組み換え細胞内のインサイチュのポリペプチドを包含するが、その理由はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの天然の環境の成分の少なくとも1つが存在しないためである。しかしながら通常は単離されたポリペプチドは少なくとも1つの精製工程により製造される。
「単離された」PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコード核酸又は他のポリペプチドコード核酸はポリペプチドコード核酸の天然の原料において通常それが付随している夾雑核酸分子少なくとも1つから識別され、分離される核酸分子である。単離されたポリペプチドコード核酸分子は自然界にそれが存在する形態又は状態以外のものである。従って単離されたポリペプチドコード核酸分子は天然の細胞内にそれが存在する場合の特定のポリペプチドコード核酸分子とは区別される。しかしながら、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、例えば核酸分子が天然の細胞の場合とは異なる染色体位置にある場合に通常ポリペプチドを発現する細胞に含有されるポリペプチドコード核酸分子を包含する。
「制御配列」という用語は特定の宿主生物中の作動可能に連結したコーディング配列の発現の為に必要なDNA配列を指す。例えば原核生物に適する制御配列はプロモーター、場合によりオペレーター配列及びリボソーム結合部位を包含する。真核生物の細胞はプロモーター、ポリアデニル化シグナル及びエンハンサーを利用することがわかっている。
核酸はそれが別の核酸配列との機能的関連性の内部におかれる場合に「作動可能に連結」されている。例えばプレ配列又は分泌リーダーに関わるDNAは、それがポリペプチドの分泌に関与するプレ蛋白として発現される場合にはポリペプチドに関するDNAに作動可能に連結しており;プロモーター又はエンハンサーはそれが配列の転写に影響する場合にはコーディング配列に作動可能に連結しており;又は、リボソーム結合部位はそれが翻訳を促進するように位置付けられている場合にコーディング配列に作動可能に連結している。一般的に「作動可能に連結した」とは、連結されるDNA配列が隣接しており、そして、分泌リーダーの場合は隣接し、そして読み込み期にある。しかしながら、エンハンサーは隣接している必要はない。連結は好都合な制限部位におけるライゲーションにより達成される。そのような部位が存在しない場合は、合成オリゴヌクレオチドアダプター又はリンカーを従来の慣行に従って使用する。
ハイブリダイゼーション反応の「ストリンジェンシー」とは当業者が容易に決定できるものであり、一般的にプローブ長、洗浄温度及び塩濃度に依存した実験的計算である。一般的により長いプローブほど適切なアニーリングのためにはより高温を必要とし、より短いプローブほどより低温を必要とする。ハイブリダイゼーションは一般的には、相補鎖が環境中にその融点より低温で存在する場合は変性したDNAが再アニーリングする能力に依存している。プローブとハイブリダイズ可能な配列との間の所望の相同性の程度が高いほど、使用できる相対温度は高くなる。その結果、より高い相対温度は反応条件をよりストリンジェントとする傾向があり、より低い温度はその傾向が小さい。ハイブリダイゼーション反応のストリンジェンシーに関する追加的な詳細及び説明については、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Wiley Interscience Publishers,(1995)を参照のこと。
「ストリンジェントな条件」又は「高ストリンジェンシー条件」とは、本明細書において定義する場合は、(1)低いイオン強度及び高い洗浄温度、例えば0.015M塩化ナトリウム/0.0015Mクエン酸ナトリウム/0.1%ドデシル硫酸ナトリウムを50℃において使用するか;(2)ハイブリダイゼーションの間は変性剤、例えばホルムアミド、例えば50%(v/v)ホルムアミド+0.1%ウシ血清アルブミン/0.1%Ficoll/0.1%ポリビニルピロリドン/50mMリン酸ナトリウム緩衝液pH6.5+750mM塩化ナトリウム、75mMクエン酸ナトリウムを42℃で用いるか;又は(3)50%ホルミアミド、5xSSC(0.75MNaCl、0.075Mクエン酸ナトリウム)、50mMリン酸ナトリウム(pH6.8)、0.1%ピロリン酸ナトリウム、5xDenhardt溶液、超音波処理サケ精子DNA(50μg/ml)、0.1%SDS及び10%デキストランスルフェートを42℃で使用し、そして洗浄は42℃において0.2xSSC(塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム)及び50%ホルムアミド中55℃、その後55℃におけるEDTA含有0.1xSSCよりなる高ストリンジェンシー洗浄条件を用いるものとして特定してよい。
「中等度にストリンジェントな条件」とは、Sambrook et al.,Molecular Cloning;A Laboratory Manual,New York:Cold Spring Harbor Press,1989による説明として特定してよく、そして、上記したものより低ストリンジェントな洗浄溶液及びハイブリダイゼーションの条件(例えば温度、イオン強度及び%SDS)の使用を包含する。中等度にストリンジェントな条件の例は、20%ホルムアミド、5xSSC(150mMNaCl、15mMクエン酸3ナトリウム)、50mMリン酸ナトリウム(pH7.6)、5xDenhardt溶液、10%デキストランスルフェート及び20mg/ml変性攪拌サケ精子DNAを含む溶液中37℃での一夜のインキュベーション及びその後の約37〜50℃における1xSSC中フィルターの洗浄である。プローブ長等のようなファクターを適合させるために必要に応じて温度、イオン強度等を調節する方法は当業者の知る通りである。
「エピトープタグ付けされた」という用語は本明細書においては、「タグポリペプチド」に融合されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを含むキメラポリペプチドを指す。タグポリペプチドは対応する抗体が作成できるエピトープを提供するために十分な残基を有し、かつ、融合相手のポリペプチドの活性を妨害しないように十分短い。タグポリペプチドは好ましくは抗体が他のエピトープと実質的に交差反応しないほど高度にユニークなものである。適当なタグポリペプチドは一般的に少なくとも6アミノ酸残基、そして通常は約8〜50アミノ酸残基(好ましくは約10〜20アミノ酸残基)を有する。
「活性な」又は「活性」とは本明細書の目的のためにはネイティブ又は天然に存在するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの生物学的及び/又は免疫学的活性を保持しているPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの形態を指し、ここで、「生物学的」活性とは、ネイティブ又は天然に存在するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドにより保有される抗原性エピトープに対する抗体の生産を誘導する能力以外のネイティブ又は天然に存在するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドにより誘発される生物学的機能(抑制性又は促進性の何れか)を指し、そして、「免疫学的」活性とは、ネイティブ又は天然に存在するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドにより保有される抗原性エピトープに対する抗体の生産を誘導する能力を指す。
「アンタゴニスト」という用語は[特段の記載が無い限り]最も広範な意味において使用され、そして本明細書に開示するネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの生物学的活性を部分的又は完全にブロック、抑制又は中和する何れかの分子を包含する。同様に、「アゴニスト」という用語は[特段の記載が無い限り]最も広範な意味において使用され、そして本明細書に開示するネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの生物学的活性を模倣する何れかの分子を包含する。適当なアゴニスト又はアンタゴニスト分子は特にネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、ペプチド、アンチセンスオリゴヌクレオチド、小型有機分子等のアゴニスト又はアンタゴニスト抗体又は抗体フラグメント、フラグメント又はアミノ酸配列変異体を包含する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストを同定するための方法はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを候補アゴニスト又はアンタゴニスト分子に接触させること、及び、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに通常付随している1つ以上の生物学的活性における検出可能な変化を測定することを含んでよい。
「治療する」又は「治療」又は「緩解」とは治療的な施療及び予防的又は予防的な手段の両方を指し、ここで目的は標的の病的状態又は障害を予防するか緩徐化(低減)することである。治療を必要とする被験体は既に疾患を有するか、又は、疾患に罹患し易いか、又は疾患を予防すべきものであってよい。
「長期」投与とは長期間に渡り初期の治療効果(活性)を維持するために短期の様式とは逆の持続的な様式における薬剤の投与を指す。「間歇的」投与は中断無く連続的に行われるのではなく、むしろ周期的な性質を有する治療である。
「哺乳類」とは治療の目的のためには、哺乳類に分類される何れかの動物、例えばヒト、げっ歯類、例えばラット又はマウス、家畜及び牧場動物及び動物園、競技用又は愛玩用の動物、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ウサギ等を指す。好ましくは、哺乳類はヒトである。
別の治療薬1つ以上と「組み合わせた」投与は同時(併用)及び何れかの順序の連続投与を包含する。
「担体」とは本明細書においては、使用する用量及び濃度において曝露対象となる細胞又は哺乳類に対して非毒性である製薬上許容しうる担体、賦形剤又は安定化剤を包含する。生理学的に許容される担体は水性のpH緩衝溶液である場合が多い。生理学的に許容される担体の例は緩衝剤、例えばリン酸塩、クエン酸塩及び他の有機酸;抗酸化剤、例えばアスコルビン酸;低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;蛋白、例えば血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン;親水性重合体、例えばポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン又はリジン;単糖類、2糖類及び他の炭水化物、例えばグルコース、マンノース又はデキストリン;キレート形成剤、例えばEDTA;糖アルコール、例えばマンニトール及びソルビトール;塩形成対イオン、例えばナトリウム;及び/又はノニオン系界面活性剤、例えばTWEENTM、ポリエチレングリコール(PEG)及びPLURONICSTMを包含する。
「固相」とは本発明の抗体が接着できる非水性のマトリックスを意味する。本明細書において包含される固相の例はガラス(例えば制御細孔ガラス)、多糖類(例えばアガロース)、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、ポリビニルアルコール及びシリコーンから部分的又は完全に形成されているものを包含する。文脈に応じて、固相は試験プレートのウエルを包含でき;他の場合は精製カラムである(例えばアフィニティークロマトグラフィーカラム)。この用語は又、米国特許第4,275,149号に記載されているもののような個々の粒子の不連続の固相を包含する。
「リポソーム」とは哺乳類への薬剤(例えばPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド又はそれに対する抗体)の送達の為に有用な脂質、リン脂質及び/又は界面活性剤の種々の型よりなる小型小胞である。リポソームの成分は生物学的膜の脂質の配置と同様に、二層の形成において共通して配置される。
「小分子」とは約500ダルトン未満の分子量を有するものとして本明細書においては定義する。
本明細書に開示するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子又はこれ等のアゴニスト又はアンタゴニストの「有効量」とは、特に記載した目的を実施するために十分な量である。「有効量」は記載した目的との関係において実験的、そして日常的に決定してよい。
「治療有効量」という用語は、被験体又は哺乳類における疾患又は障害を「治療する」為に有効な抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子又は他の薬剤の量を指す。癌の場合は、薬剤の治療有効量は癌細胞の数を低減するか;腫瘍サイズを低減するか;末梢臓器への癌細胞の浸潤を抑制(即ちある程度まで緩徐化、好ましくは停止)するか;腫瘍の転移を抑制(即ちある程度まで緩徐化、好ましくは停止)するか;腫瘍の生育をある程度まで抑制するか;及び/又は癌に関わる症状1つ以上をある程度まで軽減し得る。「治療する」の本明細書における定義を参照のこと。薬剤が既存の癌細胞の成育を予防及び/又は殺傷する限り、それは細胞増殖抑制性及び/又は細胞毒性であってよい。
「心臓血管、内皮及び血管形成の障害」、「心臓血管、内皮及び血管形成の機能不全」、「心臓血管、内皮又は血管形成の障害」及び「心臓血管、内皮又は血管形成の機能不全」という表現は互換的に使用され、一つには血管に影響する全身性の障害、例えば真性糖尿病、並びに、動脈、毛細管、静脈及び/又はリンパのような脈管自体の疾患を指す。これには血管形成及び/又は心臓血管形成を刺激する適応症、及び、血管形成及び/又は心臓血管形成を抑制するものが包含される。このような障害は、例えば動脈疾患、例えばアテローム性動脈硬化症、高血圧、炎症性血管炎、レイノー病及びレイノー現象、動脈瘤及び動脈再狭窄、静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫、及び他の血管障害、例えば末梢血管疾患、癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫、腫瘍血管形成、外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕、虚血再灌流傷害、関節リューマチ、脳血管疾患、腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症を包含する。これ等にはまたアンギナ、心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えばCHFが包含される。
「肥大」とは本明細書においては、腫瘍形成の関与しない天然の成長とは無関係の臓器又は構造の嵩の増大として定義される。臓器又は組織の肥大は個々の細胞の嵩の増大(真の肥大)又は組織を構成している細胞の数の増大(過形成)の何れか、又は両方によるものである。心臓のような特定の臓器は出生後短期間で分裂する能力を失う。従って、「心臓肥大」とは成人において同時細胞分裂を伴わない心筋細胞のサイズ及び収縮性蛋白含有量の増大を特徴とする心臓の嵩の増大として定義される。肥大を刺激する原因となるストレスの特徴(例えば心筋梗塞の場合のような増大した前負荷、増大した後負荷、筋細胞の消失、又は収縮性の一次的減圧)が応答の性質を決定する場合に重要な役割を果たしていると考えられる。心臓肥大の早期の段階は通常は筋原線維の大きさ及びミトコンドリアの増大により、並びに、ミトコンドリア及び核の膨大により形態学的には特徴付けられる。この段階において、筋細胞は正常よりも大型となるが、細胞の組織は大半は温存されている。心臓肥大のより進行した段階においては特定の細胞内小器官、例えばミトコンドリアのサイズ又は数の優先的な増大が生じ、そして、新しい収縮エレメントが不規則に細胞の局所的領域に付加される。長時間持続する肥大に関与した細胞は細胞組織のより顕著な破壊を呈し、例えば高度に小葉化した膜を伴った顕著に膨大した核が隣接する筋原線維を排除し、正常なZ線の表示の崩壊をもたらす。「心臓肥大」という用語は伏在する心臓障害とは無関係に心筋の構造的損傷の種々の程度を特徴とするこの状態の進行の全ての段階を包含するために使用される。従って、用語は又、上昇した血圧、大動脈の狭窄又は心筋梗塞のような心臓肥大の発生に寄与する生理学的状態を包含する。
「心不全」とは代謝している組織の条件に対して必要とされる速度では心臓が血液を送液しない心臓機能の異常を指す。心不全は虚血性、先天性、リューマチ性又は特発性の形態を含む多くの要因により誘発され得る。
「鬱血性心不全」(CHF)は進行した病的状態であり、ここでは心臓が末梢組織に対し酸素付加された血液を送達するために十分な心拍出量(経時的に心臓により送液される血液の容量)を供給することがますます不可能になる。CHFが進行するに従い、構造的及び血行力学的な損傷が生じる。これ等の損傷は多様に顕在化するが、1つの特徴的症状は心室の肥大である。CHFは多くの種々の心臓障害の共通した最終結果である。
「心筋梗塞」は一般的に冠動脈のアテローム性動脈硬化症から生じ、混合型の冠動脈血栓を伴う場合が多い。これは2つの主要な型、即ち、心筋の壊死に心室壁の全厚みが関与している経壁梗塞、及び、壊死に心内膜下、壁内心筋、又は両方が関与しており、心室壁から心外膜に至る全行程への伸長を伴わない心内膜下(非経壁)梗塞に分類される。心筋梗塞は血行力学的作用の変化及び心臓の損傷部及び健常部における構造の改変の両方をもたらすことがわかっている。即ち、例えば、心筋梗塞は心臓の最大心拍出量及び一回拍出量を低下させる。更に又、心筋梗塞に付随しているものは間質において生じるDNA合成の刺激並びに罹患していない心臓の領域におけるコラーゲンの形成の増大である。
例えば増大した総末梢抵抗に起因する長期間の高血圧に付された心臓に対して与えられる増大したストレス又は緊張の結果として、心臓肥大には「高血圧」が長く関わっている。慢性的な圧力の過剰負荷の結果として肥大した心室の特徴は減損した拡張期の機能である。Fouad et al.,J.Am.Coll.Cardiol.,4:1500−1506(1984);Smith et al.,J.Am.Coll.Cardiol.,5:869−874(1985)。長期の左心室の弛緩は、正常又は過剰な収縮期機能にも関わらず、早期の本態性高血圧において検出されている。Hartford et al.,Hypertension,6:329−338(1984)。しかしながら、血圧のレベルと心臓肥大の間には緊密な平行性は無い。抗高血圧療法に応答した左心室機能の改善がヒトにおいて報告されているが、利尿剤(ヒドロクロロチアジド)、β−ブロッカー(プロプラノロール)又はカルシウムチャンネルブロッカー(ジルチアゼム)で多様に治療されている患者は拡張期機能の改善を伴わない左心室肥大の病態逆転を示している。Inouye et al.,Am.J.Cardiol.,53:1583−7(1984)。
心臓肥大に伴う別の複合的心臓疾患は「肥大性心筋症」である。この状態は非常に多様な形態学的、機能的及び臨床的な側面により特徴付けられ(Maron et al.,N.Engl.J.Med.,316:780−789(1987);Spirito et al.,N.Engl.J.Med.,320:749−755(1989);Louie and Edwards,Prog.Cardiovasc.Dis.,36:275−308(1994);Wigle et al.,Circulation,92:1680−1692(1995))、その不均質性はそれが全世代の患者に及んでいるという事実により強調されている。Spirito et al.,N.Engl.J.Med.,336:775−785(1997)。肥大性心筋症の原因もまた多様であり、殆ど解明されていない。一般的に筋節性の蛋白をコードする遺伝子における突然変異が肥大性心筋症に関連している。最近のデータによれば、β−ミオシンの重鎖の突然変異が家族性の肥大性心筋症の症例の約30〜40パーセントを占めることが示唆されている。Watkins et al.,N.Engl.J.Med.,326:1108−1114(1992);Schwartz et al.,Circulation,91:532−540(1995);Marian and Roberts,Circulation,92:1336−1347(1995);Thierfelder et al.,Cell,77:701−712(1994);Watkins et al.,Nat.Gen.,11:434−437(1995)。β−ミオシン重鎖以外に、遺伝子突然変異の他の位置には心臓トロポニンT、アルファトポミオシン、心臓ミオシン結合蛋白C、必須ミオシン軽鎖及び調節ミオシン軽鎖が包含される。Malik and Watkins,Curr.Opin.Cardiol.,12:295−302(1997)を参照のこと。
弁上部「大動脈狭窄症」は上行大動脈の狭窄を特徴とするが、他の動脈、例えば肺動脈も罹患する場合がある遺伝性の血管障害である。未治療の大動脈狭窄は心筋の肥大及び最終的には心不全及び死亡の原因となる上昇した心内圧力をもたらす場合がある。この障害の病因は完全には解明されていないが、内側平滑筋の肥大及び恐らくは過形成がこの障害の顕著な側面である。エラスチン遺伝子の分子変異体が大動脈狭窄の発症及び病因に関与していると報告されている。1997年7月22日発行の米国特許第5,650,282号。
「弁膜逆流」は心臓の弁の障害をもたらす心臓疾患の結果として生じる。種々の疾患、例えばリューマチ熱は弁のオリフィスの収縮又は引き離しをもたらす場合があるが、他の疾患は心内膜炎、心内膜又は房室オリフィスの内膜の炎症及び心臓手術の原因となる場合がある。弁狭窄部の狭小化および弁の閉鎖欠陥のような欠陥は心臓腔中の血液の蓄積又は弁を通過する血液の逆流をもたらす。是正しない場合、長期の弁の狭窄又は不全により心臓肥大及び関連する心筋の損傷がもたらされ、それにより最終的には弁の交換が必要となる場合がある。
「免疫関連疾患」という用語は哺乳類の免疫系の要素が哺乳類における罹患に対し、誘発、媒介又は他の態様で寄与する疾患を意味する。同様に包含されるものは免疫応答の刺激又は介入が疾患の進行に対して緩解作用を有する疾患である。この用語に包含されるものは免疫媒介炎症性疾患、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成等である。
「T細胞媒介疾患」という用語はT細胞が哺乳類における罹患を直接又は間接的に媒介するか、他の態様において寄与する疾患を意味する。T細胞媒介疾患は細胞媒介作用、リンホカイン媒介作用等に関連し得、そしてB細胞が例えばT細胞の分泌したリンホカインにより刺激される場合にはB細胞関連作用にも関連している。
免疫関連及び一部は免疫又はT細胞媒介性である炎症性の疾患は、全身エリテマトーデス、関節リューマチ、若年性慢性関節炎、脊椎関節症、全身硬化症(硬皮症)、特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎)、シェーグレン症候群、全身性血管炎、サルコイドーシス、自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症)、自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症)、甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎)、真性糖尿病、免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎)、中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー、肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎、炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎、クローン病)、グルテン感受性腸症及びホイップル病、自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬、アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹、肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎、又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病を包含する。感染性疾患はウィルス疾患、例えばAIDS(HIV感染)、A、B、C、D及びE型肝炎、ヘルペス等、細菌感染症、カビ感染症、原虫感染症及び寄生虫感染症を包含する。
「自己免疫疾患」とは本明細書においては個体の自身の組織又は臓器又は同時分離物から生じるかそれを指向する疾患又は障害又はその顕在化又はそれより生じる状態である。これ等の自己免疫及び炎症性の障害の多くにおいて、多くの臨床上及び研究用のマーカーが存在し得、例えば限定しないが、高ガンマグロブリン血症、自己抗体高値、抗原−抗体複合体組織付着、コルチコステロイド又は免疫抑制剤治療の奏功、及び罹患組織におけるリンパ様細胞の凝集が挙げられる。B細胞媒介自己免疫疾患の何れの一理論にも制約されないが、B細胞は自己抗体生産、免疫複合体形成、樹状及びT細胞の活性化、サイトカイン合成、直接のケモカイン放出及び異所性のリンパ球新生のための病巣の提供を含む多くの機構的経路を介してヒトの自己免疫疾患において病原性作用を呈すると考えられる。これ等の経路の各々が自己免疫疾患の病理において多用な程度で関与していると考えられる。
「自己免疫疾患」は臓器特異的疾患であり得る(即ち、免疫応答が内分泌系、造血系、皮膚、心肺系、胃腸肝臓系、腎臓系、甲状腺、耳、神経筋系、中枢神経系のような臓器系に特異的に指向される)か、又は、複数の臓器系を罹患させることができる全身性の疾患(例えば全身エリテマトーデス(SLE)、関節リューマチ、多発性筋炎等)であり得る。好ましいそのような疾患は自己免疫リウマチ学的障害(例えば慢性関節リューマチ、シェーグレン症候群、硬皮症、SLR及びループス腎炎のような狼瘡、多発性筋炎/皮膚筋炎、クリオグロブリン血症、抗リン脂質抗体症候群及び乾癬性関節炎)、自己免疫性の胃腸及び肝臓の障害(例えば炎症性腸疾患(例えば潰瘍性結腸炎及びクローン病)、自己免疫性胃炎及び悪性貧血、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎及びセリアック病)、血管炎(例えばANCA関連血管炎、例えばチャーグ−ストラウス血管炎、ヴェーゲナー肉芽腫症及び多発性動脈炎)、自己免疫性神経障害(例えば多発性硬化症、眼球クローヌス筋クローヌス症候群、重症筋無力症、視神経脊髄炎、パーキンソン病、アルツハイマー病及び自己免疫性多発ニューロパシー)、腎障害(例えば糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群及びバージャー病)、自己免疫性皮膚障害(例えば乾癬、蕁麻疹、膨疹、尋常性天疱瘡、水疱性類天疱瘡及び皮膚エリテマトーデス)、血液学的障害(例えば血小板減少性紫斑病、血栓性血小板減少性紫斑病、輸血後の紫斑病及び自己免疫性溶血性貧血)、アテローム性動脈硬化症、ブドウ膜炎、自己免疫性聴覚疾患(例えば内耳疾患及び聴覚消失)、ベーチェット病、レイノー症候群、臓器移植及び自己免疫内分泌障害(例えば糖尿病関連自己免疫性疾患、例えばインスリン依存性真性糖尿病(IDDM)、アジソン病及び自己免疫性甲状腺疾患(例えばグレーブス病及び甲状腺炎))を包含する。より好ましいこのような疾患は例えば関節リューマチ、潰瘍性結腸炎、ANCA関連血管炎、狼瘡、多発性硬化症、シェーグレン症候群、グレーブス病、IDDM、悪性貧血、甲状腺炎及び糸球体腎炎を包含する。場合により上記したものを包含する本明細書において定義する他の自己免疫疾患の特定の例は限定しないが、関節炎(急性及び慢性、関節リューマチ、例えば若年性発症型の関節リューマチ及びリューマチ様滑膜炎の段階、痛風又は痛風性関節炎、急性免疫学的関節炎、慢性炎症性関節炎、変性関節炎、II型コラーゲン誘導関節炎、感染性関節炎、ライム関節炎、増殖性関節炎、乾癬性関節炎、スティル病、椎骨関節炎、骨関節炎、慢性進行性関節炎、変形性関節炎、原発性慢性多発性関節炎、反応性関節炎、閉経期関節炎、エストロゲン枯渇関節炎及び強直性脊椎炎/リウマチ様脊椎炎)、自己免疫性リンパ増殖性疾患、炎症性増殖亢進性皮膚疾患、乾癬、例えばプラーク乾癬、液状乾癬、膿疱性乾癬及び爪の乾癬、アトピー、例えばアトピー性疾患、例えば花粉症及びジョブ症候群、皮膚炎、例えば接触性皮膚炎、慢性接触性皮膚炎、剥脱性皮膚炎、アレルギー性皮膚炎、アレルギー性接触性皮膚炎、膨疹、疱疹状皮膚炎、貨幣状皮膚炎、脂漏性皮膚炎、非特異的皮膚炎、一次刺激性接触性皮膚炎及びアトピー性皮膚炎、X連鎖高IgM症候群、アレルギー性眼内炎症性疾患、蕁麻疹、例えば慢性アレルギー性蕁麻疹及び慢性特発性蕁麻疹、例えば慢性自己免疫性蕁麻疹、筋炎、多発性筋炎/皮膚筋炎、若年性皮膚筋炎、毒性皮膚表皮壊死症、硬皮症(全身硬皮症を含む)、硬化症、例えば全身硬化症、多発性硬化症(MS)例えば脊髄視覚MS、一次性進行性MS(PPMS)及び回帰性弛張性MS(RRMS)、進行性全身硬化症、アテローム性動脈硬化症、動脈硬化症、播種性硬化症、失調性硬化症、視神経脊髄炎(NMO)、炎症性腸疾患(IBD)(例えばクローン病、自己免疫媒介胃腸疾患、胃腸炎症、結腸炎、例えば潰瘍性結腸炎、結腸潰瘍、微視的結腸炎、コラーゲン蓄積大腸炎、結腸ポリポーシス、壊死性腸炎及び経壁結腸炎、及び自己免疫性炎症性腸疾患)、腸炎症、壊疽性膿皮症、結節性紅斑、原発性硬化性胆管炎、呼吸窮迫症候群、例えば成人又は急性の呼吸窮迫症候群(ARDS)、髄膜炎、ブドウ膜の全体又は部分の炎症、虹彩炎、脈絡膜炎、自己免疫性血液学的障害、移植片対宿主病、血管性水腫、例えば遺伝性の血管性水腫、髄膜炎の場合等の脳神経損傷、妊娠性ヘルペス、妊娠性類天疱瘡、陰嚢掻痒、自己免疫性早発性卵巣不全、自己免疫状態による突然難聴、IgE媒介疾患、例えばアナフィラキシー及びアレルギー性及びアトピー性の鼻炎、脳炎、例えばラスムッセン脳炎及び辺縁及び/又は脳幹の脳炎、ブドウ膜炎、例えば前部ブドウ膜炎、急性前部ブドウ膜炎、肉芽腫性ブドウ膜炎、非肉芽腫性ブドウ膜炎、水晶体起因性ブドウ膜炎、後部ブドウ膜炎又は自己免疫性ブドウ膜炎、腎症の症候群を伴うか伴わない糸球体腎炎(GN)、例えば慢性又は急性の糸球体腎炎、例えば一次性GN、免疫媒介GN、膜性GN(膜性腎症)、特発性膜性GN又は特発性膜性腎症、膜性又は膜増殖性のGN(MPGN)、例えばI型及びII型、及び急速進行性GN(RPGN)、増殖性腎炎、自己免疫性多内分泌腺不全、亀頭炎、例えば形質細胞亀頭炎、亀頭包皮炎、遠心性環状紅斑、色素異常性固定性紅斑、多形性紅斑、環状肉芽腫、光沢苔癬、硬化性萎縮性苔癬、慢性単純性苔癬、棘状性苔癬、扁平苔癬、葉状魚鱗癬、表皮剥離性角質増殖症、前悪性角化症、壊疽性膿皮症、アレルギー性の状態及び応答、食物アレルギー、薬剤アレルギー、昆虫アレルギー、稀少なアレルギー性障害、例えば肥満細胞症、アレルギー性反応、湿疹、例えばアレルギー性又はアトピー性湿疹、皮脂欠乏性湿疹、発汗障害性湿疹及び水疱性掌蹠湿疹、喘息、例えば細気管支喘息、気管支喘息、及び自己免疫性喘息、T細胞の浸潤の関与する状態及び慢性の炎症応答、外来性抗原、例えば妊娠中の胎児A−B−O血液群に対する免疫反応、慢性肺炎症性疾患、自己免疫性心筋炎、白血球接着不全、狼瘡、例えばループス腎炎、ループス脳炎、小児ループス、非腎性ループス、腎外ループス、円板状ループス及び円板状エリテマトーデス、脱毛性ループス、SLE、例えば皮膚SLE又は亜急性皮膚SLE、新生児ループス症候群(NLE)及び播種性エリテマトーデス、若年発症(I型)真性糖尿病、例えば小児IDDM、成人発症真性糖尿病(II型)、自己免疫性糖尿病、特発性尿崩症、糖尿病性網膜炎、糖尿病性腎症、糖尿病性結腸炎、糖尿病性大動脈障害、サイトカイン及びTリンパ球により媒介される急性又は遅発型の過敏症に関連する免疫応答、結核、サルコイドーシス、肉芽腫症、例えばリンパ腫様肉芽腫症、ヴェーゲナー肉芽腫症、顆粒球減少症、血管炎類、例えば血管炎、大型血管の血管炎(例えばリウマチ性多発性筋炎及び巨細胞性(高安)動脈炎)、中型血管の血管炎(川崎病及び結節性多発性動脈炎/結節性動脈周囲炎)、微視的多発性血管炎、免疫血管炎、CNS血管炎、皮膚血管炎、過敏症血管炎、壊死性血管炎、例えば全身性壊死性血管炎及びANCA関連血管炎、例えばチャーグ‐ストラウス血管炎又は症候群(CSS)及びANCA関連の小型血管の血管炎、側頭動脈炎、再生不良性貧血、自己免疫性再生不良性貧血、クームズ陽性貧血、ダイアモンド‐ブラックファン貧血、溶血性貧血又は免疫溶血性貧血、例えば自己免疫性溶血性貧血(AIHA)、悪性貧血(悪性の貧血)、アジソン病、先天性低形成貧血又は形成不良(PRCA)、第VIII因子欠損、A型血友病、自己免疫性好中球減少症、血球減少症、例えば汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出が関与する疾患、CNS炎症性障害、アルツハイマー病、パーキンソン病、多臓器傷害症候群、例えば敗血症、外傷又は出血に二次的なもの、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、抗リン脂質抗体症候群、神経中膜炎、アレルギー性神経炎、ベーチェット病/症候群、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、レイノー症候群、シェーグレン症候群、スティーブンス−ジョンソン症候群、類天疱瘡、例えば水疱性類天疱瘡及び皮膚類天疱瘡、天疱瘡(例えば尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡、粘膜天疱瘡−膜類天疱瘡及び紅斑性天疱瘡)、自己免疫性多発性内分泌腺症、ライター病又は症候群、自己免疫性状態に起因する熱傷害、子癇前症、免疫複合体障害、例えば免疫複合体腎炎、抗体媒介腎炎、神経炎症性障害、多発性ニューロパシー、慢性ニューロパシー、例えばIgM多発性ニューロパシー又はIgM媒介ニューロパシー、血小板減少症(例えば心筋梗塞患者により発症)、例えば血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、輸血後の紫斑病(PTP)ヘパリン誘導血小板減少症及び自己免疫性又は免疫媒介性の血小板減少症、例えば特発性血小板減少性紫斑病(ITP)、例えば慢性又は急性のITP、強膜炎、例えば特発性角膜強膜炎、上強膜炎、精巣及び卵巣の自己免疫性疾患、例えば自己免疫性精巣炎及び卵巣炎、一次性甲状腺機能低下症、上皮小体機能低下症、自己免疫性内分泌疾患、例えば甲状腺炎、例えば自己免疫性甲状腺炎、橋本病、慢性甲状腺炎(橋本甲状腺炎)又は亜急性甲状腺炎、自己免疫性甲状腺疾患、特発性甲状腺機能低下症、グレーブス病、多腺症候群、例えば自己免疫性多腺症候群、例えばI型(又は多腺性内分泌障害症候群)、新生物随伴症候群、例えば神経学的新生物随伴症候群、例えばランバート−イートン筋無力症候群又はイートン−ランバート症候群、スティッフマン症候群、スティッフパーソン症候群、脳脊髄炎、例えばアレルギー性脳脊髄炎又はアレルギー性の脳脊髄炎および実験的アレルギー性脳脊髄炎(EAE)、重症筋無力症、例えば胸腺腫関連重症筋無力症、小脳変性、神経筋緊張症、眼球クローヌス又は眼球クローヌス筋クローヌス症候群(OMS)及び感覚神経障害、多病巣性運動神経障害、シーハン症候群、自己免疫性肝炎、慢性肝炎、ルポイド肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎又は自己免疫性慢性活動性肝炎、肺炎、例えばリンパ様間質性肺炎(LIP)、閉塞性細気管支炎(非移植)vsNSIP、ギラン‐バレー症候群、バージャー病(IgA腎症)、特発性IgA腎症、線状IgA皮膚症、急性熱性好中球性皮膚症、角層下膿疱症、一過性棘細胞離開性皮膚症、硬変、例えば原発性胆汁性肝硬変及び肺硬変、自己免疫性腸症候群、セリアック病、セリアックスプルー(グルテン性腸症)、難治性スプルー、特発性スプルー、クリオグロブリン血症、例えば混合型クリオグロブリン血症、筋萎縮性側索硬化症(ALS;ルーゲーリック病)、冠動脈疾患、自己免疫性耳疾患、例えば自己免疫性内耳疾患(AIED)、自己免疫性聴覚消失、多発性軟骨炎、例えば難治性又は回帰後又は回帰性の多発性軟骨炎、肺胞蛋白症、コーガン症候群/非梅毒性間質性角膜炎、ベル麻痺、スウィート病/症候群、しゅさ自己免疫症、帯状疱疹関連疼痛、アミロイド症、非癌性リンパ球増加症、原発性リンパ球増加症、例えばモノクローナルB細胞リンパ球増加症(例えば良性のモノクローナル高ガンマグロブリン血症及び重大性不明のモノクローナル高ガンマグロブリン血症、MGUS)、末梢ニューロパシー、新生物随伴症候群、チャンネル症、例えば癲癇、偏頭痛、不整脈、筋肉障害、聴覚消失、視力消失、周期的片麻痺及びCNSのチャンネル症、自閉症、炎症性筋障害、巣状又は分節性又は巣状分節性の糸球体硬化症(FSGS)、内分泌性眼症、ブドウ膜網膜炎、脈絡網膜炎、自己免疫性血液学的障害、線維筋肉痛、多発性内分泌不全、シュミット症候群、副腎炎、胃萎縮、初老期痴呆、脱髄性疾患、例えば自己免疫性脱髄性疾患及び慢性炎症性脱髄性多発性ニューロパシー、ドレスラー症候群、円形脱毛症、完全脱毛症、CREST症候群(石灰沈着症、レイノー現象、食道運動不全、強指症及び毛細血管拡張症)、例えば抗精子抗体による男性及び女性の自己免疫性不妊、混合型結合組織疾患、シャーガス病、リューマチ熱、再発性流産、農夫肺、多形性紅斑、心術後症候群、クッシング症候群、鳥飼育者肺、アレルギー性肉芽腫性血管炎、良性リンパ球性血管炎、アルポート症候群、肺胞炎、例えばアレルギー性肺胞炎及び線維形成性肺胞炎、間質性肺疾患、輸





血反応、らい病、マラリア、寄生虫疾患、例えばリーシュマニア症、トリパノソーマ症(kypanosomiasis)、住血吸虫症、回虫症、アスペルギルス症、サンプター症候群、キャプラン症候群、デング熱、心内膜炎、心内膜心筋線維症、播種性間質性肺線維症、間質性肺線維症、線維形成性縦隔炎、肺線維症、特発性肺線維症、嚢胞性線維症、眼内炎、持久性隆起性紅斑、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎、シャルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症、毛様体炎、例えば慢性毛様体炎、異虹彩色性毛様体炎、虹彩毛様体炎(急性又は慢性)又はフックス毛様体炎、ヘノッホ‐シェーンライン紫斑病、ヒト免疫不全ウィルス(HIV)感染症、SCID、後天性免疫不全症候群(AIDS)、エコーウィルス感染症、敗血症(全身炎症性応答症候群(SIRS))、内毒素血症、膵臓炎、サイロニン中毒、パルボウィルス感染症、風疹ウィルス感染症、ワクチン接種後症候群、先天性風疹感染症、エプスタイン・バーウィルス感染症、おたふくかぜ、エバンス症候群、自己免疫性性腺機能不全、シドナム舞踏病、後連鎖球菌性腎炎、閉塞性血栓性血管炎、甲状腺中毒症、脊髄ろう、脈絡膜炎、巨細胞性多発性筋痛、慢性過敏性肺炎、結膜炎、例えば春季カタル、乾性角結膜炎及び流行性角結膜炎、特発性腎炎症候群、最小変化腎症、良性家族性及び虚血再灌流性の傷害、移植臓器再灌流、網膜自己免疫、関節の炎症、気管支炎、慢性閉塞性気道/肺疾患、珪肺症、アフタ、アフタ性口内炎、動脈硬化性障害(脳血管不全)、例えば動脈硬化性の脳症及び動脈硬化性の網膜症、精液形成欠如、自己免疫性溶血、ベック病、クリオグロブリン症、デュプュイトラン拘縮、水晶体過敏性眼内炎、アレルギー性腸炎、らい性結節性紅斑、特発性顔面神経麻痺、慢性疲労症候群、リューマチ熱、ハマン−リッチ病、脊髄末梢神経聴覚消失、発作性ヘモグロビン尿症、性機能低下症、限局性回腸炎、白血球減少症、感染性単核細胞症、横断脊髄炎、原発性特発性粘液水腫、ネフローゼ、癒着性眼炎、肉芽腫性精巣炎、膵臓炎、急性多発性神経根炎、壊疽性膿皮症、ド・ケルヴァン甲状腺炎、後天性脾臓萎縮、非悪性胸腺腫、リンパ小節胸腺炎、白斑、毒性ショック症候群、食物中毒、T細胞浸潤の関与する状態、白血球接着不全、サイトカイン及びTリンパ球により媒介される急性又は遅発型の過敏症に関連する免疫応答、白血球漏出の関与する疾患、多臓器傷害症候群、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、自己免疫性多発性内分泌腺症、卵巣炎、原発性粘液水腫、自己免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、リウマチ病、混合型結合組織病、ネフローゼ症候群、インスリン炎、多内分泌腺不全、自己免疫性多腺症候群、例えばI型多腺症候群、成人発症性特発性上皮小体機能低下症(AOIH)、心筋症、例えば拡張性心筋症、後天性表皮水疱症(EBA)、ヘモクロマトーシス、心筋炎、ネフローゼ症候群、原発性硬化性胆管炎、化膿性又は非化膿性の静脈洞炎、急性又は慢性の静脈洞炎、篩骨洞、前頭洞、上顎洞又は蝶形骨洞の洞炎、アレルギー性洞炎、好酸球関連障害、例えば好酸球増加症、肺浸潤性好酸球増加症、好酸球増加症−筋痛症候群、レフラー症候群、慢性好酸球性肺炎、局所的肺好酸球増加症、気管支肺アスペルギルス症、アスペルギルス腫又は好酸球含有肉芽腫、アナフィラキシー、脊椎関節症、セロネガティブ脊椎関節症、多内分泌腺自己免疫疾患、硬化性胆管炎、強膜、上強膜、慢性の粘膜皮膚カンジダ症、バートン症候群、幼児の一過性低ガンマグロブリン血症、ヴィスコット‐オールドリッチ症候群、毛細血管拡張性運動失調症候群、血管拡張、コラーゲン疾患に関連する自己免疫性障害、リューマチ、例えば慢性関節リューマチ、リンパ節炎、血圧応答の低下、血管機能不全、組織傷害、心臓血管虚血、痛覚過敏、腎虚血、大脳虚血及び血管形成に伴う疾患、アレルギー性過敏障害、糸球体腎炎、再灌流傷害、虚血性再灌流障害、心筋又は他の組織の再灌流傷害、リンパ腫性気管気管支炎、炎症性皮膚病、急性の炎症性要素を有する皮膚病、多臓器不全、水疱性疾患、腎皮質壊死、急性化膿性髄膜炎又は他の中枢神経系の炎症性障害、眼及び眼窩の炎症性障害、顆粒球輸血関連症候群、サイトカイン誘導毒性、睡眠発作、急性重篤炎症、慢性難治性炎症、腎盂炎、動脈内膜過形成、消化性潰瘍、心弁膜炎および子宮内膜症を包含する。
「不安関連障害」という表現は不安、気分及び薬物乱用の障害を指し、例えば限定しないが抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である。このような障害は軽度から中等度の不安、全般的医学的状態による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、外傷後のストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、双極性障害I又はII、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱病、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の消失とそれに伴った例えばアルツハイマー病、卒中、又は、脳の外傷、疾患又は傷害に起因する発作、例えば癲癇、学習障害/学習不能症、脳性まひを包含する。更に又、不安障害は人格障害、例えば限定されないが以下の型、即ち、偏執性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己陶酔性、強迫性、分裂様及び分裂型に当てはまる。
「脂質代謝障害」という用語はコレステロール及びトリグリセリドの異常な臨床化学水準を差し、その場合、これ等の脂質の上昇した水準がアテローム性動脈硬化症の指標となる。更に又、異常な血清中脂質水準は種々の心臓血管病、例えば高血圧、卒中、冠動脈疾患、糖尿病及び/又は肥満の指標となる。
「眼の異常」という用語はアテローム性動脈硬化症又は種々の眼科学的異常に関連する眼の潜在的障害を指す。そのような障害は限定しないが以下のもの、即ち、網膜形成不全、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスを包含する。白内障もまた眼の異常と考えられ、そしてヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関連している。他の眼の発達異常は無虹彩、前部及び発育不全症候群を包含する。白内障は眼内感染又は炎症(ブドウ膜炎)の結果として生じる場合もある。
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子の「生育抑制量」とはインビトロ又はインビボのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば癌細胞の生育を抑制することができる量である。新生物細胞生育を抑制する目的のための抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子の「生育抑制量」は実験的に、そして日常的に決定してよい。
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子の「細胞毒性量」とはインビトロ又はインビボのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば癌細胞の破壊をもたらすことができる量である。新生物細胞生育を抑制する目的のための抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子の「細胞毒性量」は実験的に、そして日常的に決定してよい。
「抗体」という用語は最も広範な意味において使用され、そして特に、例えば単一の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体モノクローナル抗体(アゴニスト、アンタゴニストおよび中和抗体を包含する)、多エピトープ性の特異性を有する抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体組成物、ポリクローナル抗体、一本鎖抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、及び、所望の生物学的又は免疫学的活性を示す限り抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体のフラグメント(後述)を包含する。「免疫グロブリン」(Ig)という用語は本明細書においては抗体と互換的に使用する。
「単離された抗体」とは、その天然の環境の成分中から同定及び分離及び/又は回収されているものを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、抗体の診断又は治療上の使用を妨害する物質であり、酵素、ホルモン及び他の蛋白性又は非蛋白性の溶質を包含してよい。本発明は(1)Lowry法により測定した場合に抗体の95重量%超まで、最も好ましくは99重量%超まで、(2)スピニングカップシーケネーターを用いてN末端又は内部のアミノ酸配列の少なくとも15残基を得るために十分な程度まで、又は、(3)クーマシーブルー又は好ましくは銀染色を用いた還元又は非還元条件下のSDS−PAGEによる均質性となるように、抗体が精製されることを可能とする。単離された抗体は組み換え細胞内のインサイチュの抗体を包含するが、その理由は抗体の天然の環境の成分少なくとも1つが存在しないためである。しかしながら通常は単離された抗体は少なくとも1つの精製工程により製造される。
基本的な4鎖抗体単位は2つの同一の軽(L)鎖及び2つの同一の重(H)鎖よりなるヘテロ4量体の糖蛋白である(IgM抗体はJ鎖と呼ばれる追加的ポリペプチドと共に基本的なヘテロ4量体単位5つよりなり、従って、10抗原結合部位を含有するのに対し、分泌IgA抗体は重合してJ鎖と共に基本的4鎖単位2〜5つを含む多価の組立物を形成することができる)。IgGの場合は、4鎖単位は一般的に約150,000ダルトンである。各L鎖はジスルフィド共有結合1つによりH鎖に連結されているのに対し、2つのH鎖はH鎖のアイソタイプに応じてジスルフィド結合1つ以上により相互に連結されている。各H及びL鎖はまた規則的な間隔で鎖内ジスルフィド架橋を有する。各H鎖はN末端において可変ドメイン(V)とその後の3つの定常ドメイン(C)を各α及びγ鎖について、そして4つのCドメインをμ及びεアイソタイプについて有している。各L鎖はN末端において可変ドメイン(V)とその後の定常ドメイン(C)をそのもう一端において有している。VはVとアラインされ、そしてCは重鎖の最初の定常ドメイン(C1)とアラインされる。特定のアミノ酸残基が軽鎖及び重鎖の可変ドメインの間の界面を形成すると考えられている。VとVの対形成により単一の抗原結合部位が形成される。種々のクラスの抗体の構造及び特性については、例えばBasic and Clinical Immunology, 8th edition, Daniel P.Stites, Abba I.Terr and Tristram G.Parslow (eds.),Appleton&Lange,Norwalk,CT,1994,p.71, Chapter 6を参照のこと。
何れかの脊椎動物種に由来するL鎖をその定常ドメインのアミノ酸配列に基づいてカッパ及びラムダと称される2つの明確に異なった型の1つに割り付けることができる。その重鎖の定常ドメイン(C)のアミノ酸配列に基づいて、免疫グロブリンは異なるクラス又はアイソタイプに割り付けることができる。免疫グロブリンには5クラス、即ちIgA、IgD、IgE、IgG及びIgMがあり、それぞれα、δ、ε、γ及びμと表記される重鎖を有する。γ及びαのクラスは更に、C配列および機能の比較的小さい相違に基づいてサブクラスに分類され、例えばヒトは以下のサブクラス、即ち、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及びIgA2を発現する。
「可変」という用語は、可変ドメインの特定のセグメントは抗体の間で配列が広範に異なっているという事実を指す。Vドメインは抗原の結合を媒介し、そして、特定の抗体のその特定の抗原に対する特異性を決定する。しかしながら、可変性は可変ドメインの110アミノ酸スパンに渡って均一に分布していない。むしろ、V領域は各々が9〜12アミノ酸長の「超可変領域」と称される究極的な可変性のより短い領域によって分離された15〜30アミノ酸のフレームワーク領域(FR)と称される比較的不変のストレッチよりなる。ネイティブの重鎖及び軽鎖の可変ドメインは各々、βシート構造を連結する、そして一部の場合においてはその部分を形成するループを形成する3つの超可変領域により連結されたβシート配置を大半が採用している4つのFRを含む。各鎖の超可変領域はFRにより近接して保持され、そして、他の鎖の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)参照)。定常ドメインは抗原に対する抗体の結合に直接関与していないが、種々のエフェクター機能、例えば抗体依存性細胞内細胞毒性(ADCC)への抗体の参加を示す。
「超可変領域」という用語は本明細書においては、抗原結合の原因となる抗体のアミノ酸残基を指す。超可変領域は一般的に「相補性決定領域」即ち「CDR」に由来するアミノ酸残基(例えばV内の概ね残基24〜34(L1)、50〜56(L2)及び89〜97(L3)及びV内の概ね1〜35(H1)、50〜65(H2)及び95〜102(H3);Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991))及び/又は「超可変ループ」に由来する残基(例えばV内の残基26〜32(L1)、50〜52(L2)及び91〜96(L3)及びV内の26〜32(H1)、53〜55(H2)及び96〜101(H3);Chothia and Lesk J.Mol.Biol.196:901〜917(1987))からなる。
「モノクローナル抗体」という用語は本明細書においては、実質的に均質な抗体の集団から得られた抗体を指し、即ち、集団を構成する個々の抗体は僅かな量において存在しえる可能な天然に存在する突然変異を除き同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一の抗原部位に指向されている。更に又、さまざまな決定基(エピトープ)に対して指向されたさまざまな抗体を包含するポリクローナル抗体調製品とは対照的に、各モノクローナル抗体は抗原上の単一の決定基に対して指向されている。その特異性に加えて、モノクローナル抗体は他の抗体の混在を伴うことなく合成される点において好都合である。修飾語の「モノクローナル」とは何れかの特定の方法による抗体の製造を必要とするものとみなしてはならない。例えば、本発明において有用なモノクローナル抗体はKohler et al.,Nature,256:495(1975)により最初に記載されたハイブリドーマ方法により製造するか、又は、細菌、真核生物又は植物の細胞において組み換えDNA法を用いて作成してもよい(例えば米国特許第4,816,567号参照)。「モノクローナル抗体」は例えばClackson et al.,Nature,352:624−628(1991)及びMarks et al.,J.Mol.Biol.,222:581−597(1991)に記載の手法を用いてファージ抗体ライブラリから単離してもよい。
本明細書におけるモノクローナル抗体は、重鎖及び/又は軽鎖の一部分は特定の種から誘導されるか又は特定の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の相当する配列と同一又は相同であるが、鎖の残余部分は別の種から誘導されるか又は別の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の相当する配列と同一又は相同である「キメラ」抗体、並びに、所望の生物学的活性を示す限りにおいてそのような抗体のフラグメントを含む(米国特許第4,816,567号;及びMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855(1984)参照)。本明細書における目的のキメラ抗体は非ヒト霊長類(例えば旧世界ザル、類人猿)から誘導された可変ドメイン抗原結合配列及びヒト定常領域配列を含む「霊長類化」抗体を包含する。
「未損傷の」抗体とは、抗原結合部位並びにC及び少なくとも重鎖定常ドメインC1、C2及びC3を含むものである。定常ドメインはネイティブの配列の定常ドメイン(例えばヒトネイティブ配列定常ドメイン)又はそのアミノ酸配列変異体であってよい。好ましくは未損傷の抗体は1つ以上のエフェクター機能を有する。
「抗体フラグメント」は未損傷の抗体の一部分、好ましくは未損傷の抗体の抗原結合又は可変の領域を含む。抗体フラグメントの例はFab、Fab’、F(ab’)及びFvフラグメント;ダイアボディ;線状抗体(米国特許第5,641,870号、実施例2;Zapata et al.,Protein Eng.8(10):1057−1062[1995]参照);一本鎖抗体分子;及び抗体フラグメントから形成された多重特異性の抗体を包含する。
抗体のパパイン消化により「Fab」フラグメントと称される2つの同一の抗原結合フラグメント、及び、容易に結晶化する能力を反映した表記である残余の「Fc」フラグメントが形成される。FabフラグメントはH鎖の可変領域(V)に沿った全L鎖及び1つの重鎖の第1の定常ドメイン(C1)よりなる。各Fabフラグメントは抗原結合に関しては1価であり、即ち、単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理により単一の大型のF(ab’)フラグメントが生じ、これは2価の抗原結合活性を有する2つのジスルフィド結合したFabフラグメントに概ね相当し、そしてなお抗原に交差結合することができる。Fab’フラグメントは抗体のヒンジ領域に由来するシステインを1つ以上包含するC1ドメインのカルボキシ末端の追加的な数残基を有することによりFabフラグメントとは異なっている。Fab’−SHは本明細書においては定常ドメインのシステイン残基が遊離のチオール基を担持しているFab’に対する表記である。F(ab’)抗体フラグメントは当初は間にヒンジシステインを有するFab’フラグメントの対として製造された。抗体フラグメントの他の化学的カップリングも知られている。
Fcフラグメントはジスルフィドで共に保持された両方のH鎖のカルボキシ末端部分を含む。抗体のエフェクター機能はFc領域における配列により決定され、この領域は細胞の特定の型に存在するFc受容体(FcR)により認識される部分でもある。
「Fv」は完全な抗原認識及び結合部位を含有する最小の抗体フラグメントである。このフラグメントは堅固な非共有結合の会合型としての1つの重鎖及び1つの軽鎖の可変領域ドメインの2量体よりなる。これ等の2ドメインの折り畳みにより、6つの超可変ループ(3ループは各々H及びL鎖由来)が生じ、これ等は抗原結合のためのアミノ酸残基を与え、そして抗体に抗原結合特異性をもたらす。しかしながら、単一の可変ドメイン(又は抗原に対して特異的な僅か3つのCDRのみを含むFvの半分)であっても、全結合部位よりも低親和性ではあるが、抗原を認識して結合する能力を有している。
「sFv」又は「scFv」とも略記される「一本鎖Fv」は、連結されて単一のポリペプチド鎖となっているV及びV抗体ドメインを含む抗体フラグメントである。好ましくは、sFvポリペプチドは更に、抗原結合の為の望ましい構造をsFvが形成できるようにするV及びVドメインの間のポリペプチドリンカーを含む。sFvに関する考察はPluckthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,Springer−Verlag,New York,pp.269−315(1994);Borrebaeck 1999,後出を参照のこと。
「ダイアボディ」という用語は、Vドメインの鎖内ではなく鎖間の対形成が達成されることにより2価のフラグメント、即ち2つの抗原結合部位を有するフラグメントが生じるようにVとVの間により短いリンカー(約5〜10残基)と共にsFvフラグメント(前パラグラフ参照)を形成することにより製造される小型抗体フラグメントを指す。2重特異性のダイアボディは2つの「クロスオーバー」sFvフラグメントのヘテロ2量体であり、この場合、2つの抗体のV及びVドメインは異なるポリペプチド鎖上に存在する。ダイアボディは例えばEP404,097;WO93/11161;及びHollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444−6448(1993)により詳細に記載されている。
非ヒト(例えばげっ歯類)抗体の「ヒト化」型は非ヒト抗体から誘導された最小の配列を含有するキメラ抗体である。大部分に関しては、ヒト化抗体はレシピエントの超可変領域に由来する残基が、所望の抗体の特異性、親和性及び能力を有するマウス、ラット、ウサギ又は非ヒト霊長類のような非ヒト種(ドナー抗体)の超可変領域に由来する残基で置き換えられているヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域(FR)の残基が相当する非ヒト残基により置き換えられる。更に又、ヒト化抗体はレシピエント抗体又はドナー抗体に存在しない残基を含んでよい。これらの修飾は抗体の性能を更に精密化するために行われる。一般的に、ヒト化抗体は少なくとも1つ、そして典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含むことになり、その場合、超可変ループの全て又は実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに相当し、そしてFRの全て又は実質的に全てがヒト免疫グロブリン配列のものとなる。ヒト化抗体は場合によりまた、免疫グロブリン定常領域(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンのものの少なくとも一部分を含むことになる。更に詳細な説明は、Jones et al.,Nature 321:522−525(1986);Riechmann et al.,Nature 332:323−329(1988);及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593−596(1992)を参照のこと。
「種依存性抗体」、例えば哺乳類非ヒトIgE抗体は、第1の哺乳類動物種由来の抗原に対して、第2の哺乳類動物種由来のその抗原の相同体に対するよりも、より強力な結合親和性を有する抗体である。通常は、種依存性の抗体はヒト抗原に対して「特異的に結合する」(即ち、約1x10−7M以下、好ましくは約1x10−8M以下、そして最も好ましくは約1x10−9M以下の結合親和性(Kd)値を有する)が、第2の非ヒト哺乳類種由来の抗原の相同体に対しては、ヒト抗原に対するその結合親和性よりも、少なくとも約50倍、又は少なくとも約500倍、又は少なくとも約1000倍弱い結合親和性を有する。種依存性抗体は上記した抗体の種々の型の何れかであることができるが、好ましくはヒト化又はヒト抗体である。
「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチド」とは本明細書に記載したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに好ましくは特異的に結合するオリゴペプチドである。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチドは知られたオリゴペプチド合成方法を用いて化学合成するか、又は、組み換え技術を用いて製造及び精製してよい。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチドは通常は約5アミノ酸長又はそれ以上、或いは約6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99又は100アミノ酸長又はそれ以上、又はそれより長く、ここでこのようなオリゴペプチドは本明細書に記載したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合オリゴペプチドはよく知られた手法を用いて予定外の実験を行うことなく同定してよい。この点に関し、ポリペプチド標的に特異的に結合することができるオリゴペプチドを得るためにオリゴペプチドライブラリをスクリーニングするための手法は当該分野で良く知られている(例えば米国特許第5,556,762号、第5,750,373号、第4,708,871号、第4,833,092号、第5,223,409号、第5,403,484号、第5,571,689号、第5,663,143号;PCT公開WO84/03506及びWO84/03564;Geysen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,81:3998−4002(1984);Geysen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,82:178−182(1985);Geysen et al.,in Synthetic Peptides as Antigens,130−149(1986);Geysen et al.,J.Immunol.Meth.,102:259−274(1987);Schoofs et al.,J.Immunol.,140:611−616(1988),Cwirla,S.E.et al.,(1990)Proc.Natl.Acad.Sci.USA.87:6378;Lowman,H.B. et al.,(1991)Biochemistry,30:10832;Clackson,T.et al.,(1991)Nature,352:624;Marks,J.D.et al.,(1991),J.Mol.Biol.,222:581;Kang,A.S.et al.,(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:8363及びSmith,G.P.(1991)Current Opin.Biotechnol.,2:668参照)。
「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子」とは本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに好ましくは特異的に結合する本明細書に定義するオリゴペプチド又は抗体以外の有機分子である。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子は知られた方法を用いて同定及び化学合成してよい(例えばPCT公開WO00/00823及びWO00/39585参照)。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404結合有機分子は通常は約2000ダルトン未満の大きさであるか、或いは、約1500、750、500、250又は200ダルトン未満の大きさであり、ここで本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができるこのような有機分子はよく知られた手法を用いて予定外の実験を行うことなく同定してよい。この点に関し、ポリペプチド標的に結合できる分子を得るために有機分子ライブラリをスクリーニングする手法は当該分野で良く知られている(例えばPCT公開WO00/00823及びWO00/39585参照)。
目的の抗原、例えば腫瘍関連ポリペプチド抗原標的に「結合する」抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子は、好ましくは、抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子が抗原を発現している細胞又は組織をターゲティングする場合の診断薬及び/又は治療薬として有用であり、そして他の蛋白とは有意な交差反応を起こさないような十分な親和性で抗原に結合するものである。「非標的」蛋白への抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子の結合の程度は、蛍光活性化細胞ソーティング(FACS)分析又は放射免疫沈降(RIA)により測定した場合に、抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子のその特定の標的蛋白への結合の約10%未満である。標的分子への抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子の結合に関しては、特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド標的上のエピトープに対して「特異的結合」又は「特異的に結合する」又は「特異的である」という用語は、非特異的な相互作用とは測定可能な相違がある結合を意味する。特異的結合は例えば、一般的には結合活性を有しない同様の構造の分子である対照分子の結合と比較して分子の結合を決定することにより測定することができる。例えば特異的結合は、標的と同様の対照分子、例えば過剰量の非標識標的との競合により決定できる。この場合、プローブへの標識標的の結合が過剰な未標識標的により競合的に抑制された場合に、特異的結合が示されている。本明細書において使用される特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド標的上のエピトープに対して「特異的結合」又は「特異的に結合する」又は「特異的である」という用語は、例えば、少なくとも約10−4M、又は、少なくとも約10−5M、又は、少なくとも約10−6M、又は、少なくとも約10−7M、又は、少なくとも約10−8M、又は、少なくとも約10−9M、又は、少なくとも約10−10M、又は、少なくとも約10−11M、又は、少なくとも約10−12M以上の標的に対するKdを有する分子により示される。「特異的結合」という用語は、分子が何れかの他のポリペプチド又はポリペプチドエピトープに実質的に結合することなく特定のポリペプチド又は特定のポリペプチド上のエピトープに結合する場合の結合を指す。
「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404」を発現する腫瘍細胞の成育を「抑制する」抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子又は「成長抑制性の」抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子は適切なPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現又は過剰発現する癌細胞の測定可能な成育抑制をもたらすものである。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは癌細胞の表面上に発現された膜貫通ポリペプチドであってよく、又は、癌細胞により生産及び分泌されるポリペプチドであってよい。好ましい成長抑制性の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体、オリゴペプチド又は有機分子は、適切な対照と比較して20%又はそれより高値、好ましくは約20%〜約50%、更に好ましくは50%又はそれより高値(例えば約50%〜約100%)でPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−発現腫瘍細胞の成育を抑制し、ここで対照は典型的には試験すべき抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子で治療されない腫瘍細胞である。成長抑制は、細胞培養物中、約0.1〜30μg/ml又は約0.5nM〜200nMの抗体濃度において測定することができ、ここで成長抑制は抗体への腫瘍細胞の曝露から1〜10日後に決定される。インビボの腫瘍細胞の成長抑制は種々の方法で決定できる。抗体は約1μg/kg〜約100mg/kg体重において抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を投与した場合に抗体の初回投与から約5日〜3ヶ月以内、好ましくは約5〜30日以内に腫瘍の大きさ又は腫瘍細胞の増殖の低減がもたらされる場合にインビボで成長抑制性となる。
「アポトーシスを誘導する」抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子は、アネキシンVの結合、DNAのフラグメント化、細胞収縮、小胞体の拡張、細胞の断片化、及び/又は、膜小胞(アポトーシス体と称する)の形成により判断されるプログラムされた細胞死を誘導するものである。細胞は通常はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを過剰発現するものである。好ましくは、細胞は腫瘍細胞、例えば前立腺、乳房、卵巣、胃、子宮内膜、肺、腎臓、結腸、膀胱の細胞である。アポトーシスに関連する細胞事象を評価するために種々の方法が使用できる。例えば、ホスファチジルセリン(PS)転座は、アネキシン結合により測定でき;DNAフラグメント化はDNAラダー化を介して評価でき;そして、DNAフラグメント化に伴う核/クロマチン縮合は低二倍体細胞の何れかの増大により評価できる。好ましくは、アポトーシスを誘導する抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子はアネキシン結合試験において未投与の細胞と相対比較してアネキシン結合の約2〜50倍、好ましくは約5〜50倍、そして最も好ましくは約10〜50倍の誘導をもたらすものである。
抗体の「エフェクター機能」は抗体のFc領域(ネイティブ配列のFc領域又はアミノ酸配列変異体のFc領域)に起因する生物学的活性を指し、そして、抗体アイソタイプと共に変動する。抗体エフェクター機能の例はC1q結合及び補体依存性細胞毒性;Fc受容体結合;抗体依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC);貪食作用;細胞表面受容体(例えばB細胞受容体)のダウンレギュレーション;及びB細胞活性化を包含する。
「抗体依存性細胞媒介細胞毒性」即ち「ADCC」とは、特定の細胞毒性細胞(例えばナチュラルキラー(NK)細胞、好中球及びマクロファージ)上に存在するFc受容体(FcR)に結合している分泌Igにより、これ等の細胞毒性エフェクター細胞が抗原担持標的細胞に特異的に結合し、そしてその後、細胞毒素により標的細胞を殺傷することができるようになるという細胞毒性の形態を指す。抗体は細胞毒性細胞を「武装」させ、そしてそのような殺傷のために絶対に必要なものである。ADCCを媒介する主要な細胞であるNK細胞はFcγRIIIのみを発現するのに対し、単球はFcγRI、FcγRII及びFcγRIIIを発現する。造血細胞上のFcRの発現はRavetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457−92(1991)の464ページの表3に総括されている。目的の分子のADCC活性を試験するためには、米国特許第5,500,362号又は第5,821,337号に記載されているようなインビトロのADCC試験を実施してよい。このような試験のための有用なエフェクター細胞は末梢血単核細胞(PBMC)及びナチュラルキラー(NK)細胞を包含する。代替又は追加的に、目的の分子のADCC活性は例えばClynes et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95:652−656(1998)に開示されているような動物モデルにおいてインビボで試験してよい。
「Fc受容体」即ち「FcR」は、抗体のFc領域に結合する受容体を説明する。好ましいFcRはネイティブ配列のヒトFcRである。更に又、好ましいFcRはIgG抗体に結合するもの(γ受容体)であり、FcγRI、FcγRII及びFcγRIIIのサブクラスの受容体を包含し、これ等の受容体のアレル変異体及びオルタナティブスプライス型も包含される。FcγRII受容体はFcγRIIA(「活性化受容体」)及びFcγRIIB(「抑制受容体」)を包含し、これ等はその細胞質ドメインにおいて主に異なっている同様のアミノ酸配列を有する。活性化受容体FcγRIIAはその細胞質ドメインに免疫受容体チロシン系活性化モチーフ(ITAM)を含有している。抑制受容体FcγRIIBはその細胞質ドメインに免疫受容体チロシン系抑制モチーフ(ITIM)を含有している(Daeron,Annu.Rev.Immunol.15:203−234(1997)の考察M参照)。FcRはRavetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457−492(1991);Capel et al.,Immunomethods 4:25−34(1994);及びde Haas et al.,J.Lab.Clin.Med.126:330−41(1995)において考察されている。将来同定されるものを含む他のFcRは本明細書においては用語「FcR」に包含される。用語は又胎児への母体IgGの移行の原因となる新生児受容体、FcRnも包含する(Guyer et al.,J.Immunol.117:587(1976)及びKim et al.,J.Immunol.24:249(1994))。
「ヒトエフェクター細胞」は1つ以上のFcRを発現し、エフェクター機能を示す白血球である。好ましくは、細胞は少なくともFcγRIIIを発現し、そしてADCCエフェクター機能を示す。ADCCを媒介するヒト白血球の例は末梢血単核細胞(PBMC)、ナチュラルキラー(NK)細胞、単球、細胞毒性T細胞及び好中球を包含し;PBMC及びNK細胞が好ましい。エフェクター細胞は天然の原料から、例えば血液から単離される。
「補体依存性細胞毒性」即ち「CDC」は補体の存在下における標的細胞の溶解を指す。古典的な補体経路の活性化は同種抗原に結合している(適切なサブクラスの)抗体への補体系の第1成分(C1q)の結合により開始される。補体活性化を試験するためには、例えばGazzano−Santoro et al.,J.Immunol.Methods 202:163(1996)に記載されているもののようなCDC試験を実施してよい。
「癌」及び「癌性の」という用語は典型的には未調節の細胞の成長を特徴とする哺乳類における生理学的状態を指すか、それを説明するものである。癌の例は限定しないが癌腫、リンパ種、芽腫、肉腫及び白血病を包含する。このような癌のより特定的な例は、扁平上皮癌、肺癌(小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌及び肺の扁平上皮癌)、腹膜の癌、肝細胞癌、胃癌(胃腸癌を包含する)、膵臓癌、神経膠芽細胞癌、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜又は子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝癌、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝臓癌種及び種々の型の頭部及び頚部の癌並びにB細胞リンパ腫(例えば低等級/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL);小リンパ球性(SL)NHL;中等級/濾胞性NHL;中等級の播種性NHL;高等級免疫芽球性NHL;高等級リンパ芽球性NHL;高等級小型非分割細胞NHL;バルキー疾患NHL;マントル細胞リンパ腫;AIDS関連リンパ腫;及びヴァルデンストレームマクログロブリン血症);慢性リンパ球性白血病(CLL);急性リンパ芽球性白血病(ALL);ヘアリー細胞白血病;慢性骨髄芽球性白血病;及び移植後のリンパ増殖性障害(PTLD)を包含する。好ましくは、癌はIGF受容体を発現する腫瘍、より好ましくは乳癌、肺癌、結腸直腸癌又は前立腺癌、そして最も好ましくは乳癌又は前立腺癌を含む。
「化学療法剤」とは癌の治療において有用な化合物である。化学療法剤の例はアルキル化剤、例えばチオテパ及びCYTOXAN(登録商標)シクロホスファミド;アルキルスルホネート、例えばブスルファン、イムプロスルファン及びピポスルファン;アジリジン、例えばベンゾドパ、カルボコン、メツレドパ及びウレドパ;エチレンイミン及びメチラメラミン、例えばアルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド及びトリメチロールメラミン;アセトゲニン(特にブラタシン及びブラタシノン);カンプトテシン(例えば合成類似体トポテカン);ブリオスタチン;カリスタチン;CC−1065(例えばアドゼレシン、カルゼレシン及びビゼレシン合成類似体);クリプトフィシン(特にクリプトフィシン1及びクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(例えば合成類似体、KW−2189及びCB1−TM1);エレウテロビン;パンクラチスタチン;サルコジクチン;スポンジスタチン;窒素マスタード、例えばクロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イフォスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミンオキシド、メルファラン、ノベムブシン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロフォスファミド、ウラシルマスタード;ニトロソ尿素、例えばカルムスチン、クロロゾトシン、ホテムスチン、ロムスチン、ニムスチン及びラニムヌスチン;抗生物質、例えばエネジン抗生物質(例えばカリケミシン、特にカリケミシンガンマ1I及びカリケミシンオメガI1(例えばAgnew,Chem Intl.Ed.Engl.,33:183−186(1994)参照);ジネマイシン、例えばジネマイシンA;ビスホスホネート、例えばクロドロネート;エスペラミシン;並びにネオカルチノスタチン発色団及び関連の色素蛋白エネジン抗生物質発色団)、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オースラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシニス、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6−ジアゾ−5−オキソ−L−ノルロイシン、ADRIAMYCIN(登録商標)ドキソルビシン(例えばモルホリノ−ドキソルビシン、シアノモルホリノ−ドキソルビシン、2−ピロリノ−ドキソルビシン及びデオキシドキソルビシン)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、例えばマイトマイシンC、マイコフェノール酸、ノガラマイシ、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、ケラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシン;代謝拮抗物質、例えばメトトレキセート及び5−フルオロウラシル(5−FU);葉酸類似体、例えばデノプテリン、メトトレキセート、プテロプテリン、トリメトレキセート;プリン類似体、例えばフルダラビン、6−メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン;ピリミジン類似体、例えばアンシタビン、アザシチジン、6−アザウリジン、カルモファー、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフリジン、エノシタビン、フロクスイジン;アンドロゲン類、例えばカルステロン、ドロモスタノロンプロピオネート、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン;抗副腎剤、例えばアミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン;葉酸補給物、例えばフロリニック酸;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトラキセート;デホファミン;デメコルシン;ジアジクオン;エルホルニチン;エリプチニウムアセテート;エポチロン;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダイニン;マイタンシノイド、例えばマイタンシン及びアンサミトシン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダンモール;ニトラエリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ロソキサントロン;ポドフィリン酸;2−エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK(登録商標)多糖類複合体(JHS Natural Products,Eugene,OR);ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクオン;2,2’,2”−トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン(特にT−2毒素、ベラクリンA、ロリジンA及びアングイジン);ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン;アラビノシド(「Ara−C」);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド、例えばTAXOL(登録商標)パクリタキセル(Bristol−Myers Squibb Oncology,Princeton,NJ)、ABRAXANETMクレモフォー非含有、パクリタキセルのアルブミン操作ナノ粒子製剤(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,Illinois)及びTAXOTERE(登録商標)ドキセタキセル(Rhone−Poulenc Rorer、Antony,France);クロランブシル;GEMZAR(登録商標)ゲムシタビン;6−チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキセート;白金類似体、例えばシスプラチン及びカルボプラチン;ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP−16);イフォスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;NAVELBINE(登録商標)ビノレルビン;ノバントロン;テニポシド;エダトレキセート;ダウノマイシン;アミノプテリン;キセロダ;イバンドロネート;CPT−11;トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイド、例えばレチン酸;カペシタビン;及び上記の何れかの製薬上許容しうる塩、酸又は誘導体を包含する。
この定義に同様に包含されるものは、腫瘍に対するホルモンの作用を調節又は抑制する作用を有する抗ホルモン剤、例えば抗エストロゲン及び選択的エストロゲン受容体モジュレーター(SERM)、例えばタモキシフェン(例えばNOLVADEX(登録商標)タモキシフェン)、ラロキシフェン、ドロロキシフェン、4−ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、LY117018、オナプリストン及びFARESTONトレミフェン;副腎におけるエストロゲン生産を調節する酵素アロマターゼを阻害するアロマターゼ阻害剤、例えば4(5)−イミダゾール、アミノグルテチミド、MEGASE(登録商標)メゲストロールアセテート、AROMASIN(登録商標)エキセメスタン、フォルメスタニー、ファドロゾール、RIVISOR(登録商標)ボロゾール、FEMARA(登録商標)レトロゾール及びARIMIDEX(登録商標)アナストロゾール;及び抗アンドロゲン、例えばフルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリド及びゴセレリン;並びにトロキサシタビン(1,3−ジオキソランヌクレオシドシトシン類似体);アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に例えばPKC−アルファ、Ralf及びH−Rasのような異常な細胞増殖に関与するとされるシグナリング経路における遺伝子の発現を抑制するもの;リボザイム、例えばVEGF発現阻害剤(例えばANGIOZYME(登録商標)リボザイム)及びHER2発現阻害剤;ワクチン、例えば遺伝子療法ワクチン、例えば、ALLOVECTIN(登録商標)ワクチン、LEUVECTIN(登録商標)ワクチン及びVAXID(登録商標)ワクチン;PROLEUKIN(登録商標)rIL−2;LURTOTECAN(登録商標)トポイソメラーゼ1阻害剤、ABARELIX(登録商標)rmRH;及び上記の何れかの製薬上許容しうる塩、酸又は誘導体である。
「細胞増殖性障害」及び「増殖性障害」という用語はある程度の異常な細胞増殖に関連する障害を指す。本発明の1つの局面において、細胞増殖性障害は癌である。
「腫瘍」とは本明細書においては、悪性良性に関わらず全ての新生物細胞の成長及び増殖、及び全ての前癌及び癌性の細胞及び組織を指す。
「細胞死を誘導する」抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子は生存細胞を非生存性とするものである。細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現するもの、好ましくは同様の組織型の正常細胞と比較してPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを過剰発現する細胞である。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは癌細胞表面に発現される膜貫通ポリペプチドであってよく、又は、癌細胞により生産され分泌されるポリペプチドであってよい。好ましくは、細胞は癌細胞、例えば乳房、卵巣、胃、子宮内膜、唾液腺、肺、腎臓、結腸、甲状腺、膵臓又は膀胱の細胞である。インビトロの細胞死は抗体依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC)又は補体依存性細胞毒性(CDC)により誘導された細胞死を識別するために補体及び免疫エフェクター細胞の非存在下において決定してよい。即ち、細胞死に関する試験は熱不活性化血清を用いながら(即ち補体非存在下において)、そして免疫エフェクター細胞の非存在下において実施してよい。抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子が細胞死を誘導することができるかどうかを決定するためには、ヨウ化プロピジウム(PI)、トリパンブルー(Moore et al.,Cytotechnology17:1−11(1995)参照)又は7AADの取り込みにより評価される膜一体性の消失を未投与細胞と相対比較しながら試験することができる。好ましい細胞死誘導性の抗体、オリゴペプチド又は他の有機分子はBT474細胞におけるPI取り込み試験においてPI取り込みを誘導するものである。
本明細書においては、「免疫接着(immunoadhesion)」という用語は免疫グロブリンの定常ドメインのエフェクター機能に非相同蛋白の結合特異性(「接着」)を組み合わせる抗体様分子を表す。構造的には、免疫接着は抗体の抗原認識結合部位以外(即ち「非相同」)の所望の結合特異性を有するアミノ酸配列及び免疫グロブリン定常ドメイン配列の融合を含む。免疫接着分子の接着部分は典型的には、受容体又はリガンドの結合部位を少なくとも含む隣接するアミノ酸配列である。免疫接着における免疫グロブリン定常ドメイン配列は何れかの免疫グロブリン、例えばIgG−1、IgG−2、IgG−3又はIgG−4サブタイプ、IgA(IgA−1及びIgA−2を包含する)、IgE、IgD又はIgMから得てよい。
「標識」という用語は本明細書においては、「標識された」抗体を作成するために抗体に直接又は間接的にコンジュゲートされた検出可能な化合物又は組成物を指す。標識はそれ自体が検出可能である(例えば放射性同位体標識又は蛍光標識)か、又は、酵素標識の場合は、検出され得る基質化合物又は組成物の化学的改変を触媒してよい。
「複製予防剤」とは、アポトーシス、血管形成抑制、細胞増加、腫瘍殺傷、有糸分裂抑制、細胞周期進行遮断、細胞成長の停止、腫瘍への結合、細胞メディエーターとしての作用等の機序に関わらず、細胞の複製、機能及び/又は成長が抑制又は予防されるか、又は細胞が破壊される薬剤である。そのような薬剤は化学療法剤、細胞毒性剤、サイトカイン、成長抑制剤、又は抗ホルモン剤、例えば抗エストロゲン化合物、例えばタモキシフェン、抗プロゲステロン、例えばオナプリストン(EP616812参照);又は抗アンドロゲン、例えばフルタミド、並びにアロミダーゼ阻害剤、又はホルモン剤、例えばアンドロゲンを包含する。
「細胞毒性剤」という用語は本明細書においては細胞の機能を抑制又は予防及び/又は細胞の破壊を誘発する物質を指す。用語は放射性同位体(例えばAt211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32及びLuの放射性同位体)、化学療法剤、例えばメトトレキセート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイド(ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド)、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンC、クロラムブシル、ダウノルビシン又は他のインターカレーション剤、酵素及びそのフラグメント、例えば核溶解酵素、抗生物質及び毒素、例えば細菌、カビ、植物又は動物起源の小分子毒素又は酵素活性毒素、及びこれ等のフラグメント及び/又は変異体、及び、後述する種々の抗腫瘍又は抗癌剤を包含することを意図している。他の細胞毒性剤は後に記載する。腫瘍殺傷剤は腫瘍細胞の破壊をもたらす。
本明細書においてアンタゴニストと組み合わせて使用するための特定の腫瘍型に対する好ましい細胞毒性剤は以下の通りである。
1.前立腺癌:アンドロゲン、ドセタキセル、パクリタキセル、エストラムスチン、ドキソルビシン、ミトキサントロン、ErbB2の細胞外ドメイン(例えばErbB2の概ね残基22〜概ね残基584の領域における残基の何れかの1つ以上)の領域に結合する2C4のようなErbB2ドメインに対する抗体(WO01/00245;ハイブリドーマATCCHB−12697)、AVASTINTM抗血管内皮細胞成長因子(VEGF)、TARCEVATMOSI−774(エルロチニブ)(Genenetech and OSI Pharmaceuticals)又は他の表皮成長因子受容体チロシンキナーゼ阻害剤(EGFRTKI)。
2.胃癌:5−フルオロウラシル(5FU)、XELODATMカペシタビン、メトトレキセート、エトポシド、シスプラチン/カルボプラチン、パクリタキセル、ドセタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシン及びCPT−11(カンプトテシン−11;イリノテカン、合衆国商標:CAMPTOSAR(登録商標))。
3.膵臓癌:ゲムシタビン、5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、ドセタキセル、パクリタキセル、シスプラチン、カルボプラチン、TARCEVATMエルロチニブ及び他のEGFRTKI。
4.結腸直腸癌:5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、オキサリプラチン、AVASTINTM抗VEGF、TARCEVATMエルロチニブ及び他のEGFRTKI及びEGFRに結合し受容体活性化及び腫瘍へのシグナリングを開始するEGFの能力をブロックするERBITUXTM(旧称IMC−C225)ヒト:マウス−キメラ化モノクローナル抗体。
5.腎臓癌:IL−2、インターフェロンアルファ、AVASTINTM抗VEGF、MEGACETM(メゲストロールアセテート)プロゲスチン、ビンブラスチン、TARCEVATMエルロチニブ及び他のEGFRTKI。
「成長抑制剤」とは本明細書においては細胞、特に、インビトロ又はインビボのPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−発現癌細胞の成長を抑制する化合物又は組成物を指す。即ち、成長抑制剤はS期におけるPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−発現細胞の比率を有意に低減するものであってよい。成長抑制剤の例は細胞周期の進行をブロックする(S期以外の位置において)薬剤、例えばG1停止及びM期停止を誘導する薬剤を包含する。伝統的なM期ブロッカーはビンカ(ビンクリスチン及びビンブラスチン)、タキサン、及びトポイソメラーゼII阻害剤、例えばドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシド及びブレオマイシンを包含する。G1を停止させる薬剤、例えばDNAアルキル化剤、例えばタモキシフェン、プレドニソン、デカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキセート、5−フルオロウラシル及びara−CはS期停止にまでスピルオーバーする。更に詳細な情報はThe Molecular Basis of Cancer,Mendelsohn and Israel,eds.,Chapter 1,“Cell cycle regulation,oncogenes, and antineoplastic drugs”, Murakami et al.,(WB Saunders:Philadelphia,1995)の特に13ページに記載されている。タキサン類(パクリタキセル及びドセタキセル)は共にイチイの木から誘導された抗癌剤である。ヨーロッパイチイから誘導されたドセタキセル(TAXOTERE(登録商標)、Rhone−Poulenc Rorer)はパクリタキセル(TAXOL(登録商標)、Bristol−Myers Squibb)の半合成類似体である。パクリタキセル及びドセタキセルはチューブリン2量体からの微小管の組立を促進し、そして、細胞の有糸分裂の抑制をもたらす脱重合の予防により微小管を安定化させる。
「ドキソルビシン」はアントラサイクリン抗生物質である。ドキソルビシンの完全な化学名は(8S−シス)−10−[(3−アミノ−2,3,6−トリデオキシ−α−L−リキソ−ヘキサピラノシル)オキシ]−7,8,9,10−テトラヒドロ−6,8,11−トリヒドロキシ−8−(ヒドロキシアセチル)−1−メトキシ−5,12−ナフタセンジオンである。
「サイトカイン」という用語はある細胞集団により放出され、細胞間メディエーターとして他の細胞に作用する蛋白に関する総称である。このようなサイトカインの例はリンホカイン、モノカイン及び伝統的なポリペプチドホルモンである。サイトカインに属するものとしては、成長ホルモン、例えばヒト成長ホルモン、N−メチオニルヒト成長ホルモン、及びウシ成長ホルモン;副甲状腺ホルモン;チロキシン;インスリン;プロインスリン;リラキシン;プロリラキシン;糖蛋白ホルモン、例えば卵胞刺激ホルモン(FSH)、甲状腺刺激ホルモン(TSH)及び黄体形成ホルモン(LH);肝成長因子;線維芽細胞成長因子;プロラクチン;胎盤ラクトーゲン;腫瘍壊死因子−α及び−β;ミューラー阻害物質;マウスゴナドトロピン関連ペプチド;インヒビン;アクチビン;血管内皮成長因子;インテグリン;トロンボポエチン(TPO);神経成長因子、例えばNGF−β;血小板成長因子;形質転換成長因子(TGF)、例えばTGF−α及びTGF−β;インスリン様成長因子−I及び−II;エリスロポエチン(EPO);骨誘導因子;インターフェロン、例えばインターフェロン−α、−β及び−γ;コロニー刺激因子(CSF)、例えばマクロファージ−CSF(M−CSF);顆粒球−マクロファージ−CSF(GM−CSF);及び顆粒球−CSF(G−CSF);インターロイキン(IL)、例えばIL−1、IL−1a、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−11、IL−12;腫瘍壊死因子、例えばTNF−α又はTNF−β;及び他のポリペプチド因子、例えばLIF及びキットリガンド(KL)が挙げられる。本明細書においては、サイトカインという用語は天然原料由来又は組み換え細胞培養物由来の蛋白、及び、ネイティブ配列のサイトカインの生物学的活性同等物を包含する。
「パッケージインサート」という用語は治療用製品の市販用パッケージ内に慣用的に包含される説明書を指すのに用いられ、そのような治療用製品の使用に関する適応症、使用法、用量、投与、禁忌及び/又は警告に関する情報を含んでいる。
「遺伝子」という用語は(a)本明細書に開示したDNA配列の少なくとも1つを含有する遺伝子;(b)本明細書に開示するDNA配列によりコードされるアミノ酸配列をコードする何れかのDNA配列、及び/又は、(c)本明細書に開示するコーディング配列の補体にハイブリダイズする何れかのDNA配列を指す。好ましくは、用語はコーディング並びに非コーディング領域を包含し、好ましくは正常な遺伝子発現に必要な全ての配列を包含する。
「遺伝子ターゲティング」という用語はゲノムDNAフラグメントが哺乳類細胞内に導入され、そしてそのフラグメントが内因性の相同配列を特定して組み換えを起こす場合に生じる相同組み換えの型を指す。相同組み換えによる遺伝子ターゲティングは特定のデザインの外因性DNAで特定のゲノム配列を置き換えるために組み換えDNA技術を使用する。
「相同組み換え」という用語は相同ヌクレオチド配列の部位における2つのDNA分子又は染色分体の間のDNAフラグメントの交換を指す。
「標的遺伝子」(或いは「標的遺伝子配列」又は「標的DNA配列」とも称する)という用語は、相同組み換えにより修飾すべき何れかの核酸分子、ポリヌクレオチド又は遺伝子を指す。標的配列は未損傷の遺伝子、エクソン又はイントロン、調節配列又は遺伝子間の何れかの領域を包含する。標的遺伝子は個々のゲノムDNAにおける特定の遺伝子又は遺伝子座の一部分を含んでよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子の「破壊」はゲノムDNAフラグメントが内因性の相同配列を特定して組み換えを起こす場合に生じ、その場合、破壊とはネイティブの遺伝子又はその一部分の欠失であるか、又は、ネイティブの遺伝子の突然変異であるか、又は、破壊はネイティブの遺伝子の機能的不活性化である。或いは、配列の破壊は遺伝子トラップベクターを用いた非特異的な挿入性の不活性化により生じてもよい(即ちランダムに挿入されたトランスジーンを含有し、発現する非ヒトトランスジェニック動物;例えば2002年8月20日に発行された米国特許第6,436,707号参照)。これ等の配列の破壊又は修飾はDNA配列の挿入、ミスセンス、フレームシフト、欠失又は置換又は置き換え、又はそれらの何れかの組合せを包含してよい。挿入は動物、植物、カビ、昆虫、原生動物又はウィルス起源のものであってよい全遺伝子の挿入を包含する。破壊は、例えば正常な遺伝子産物を、その生産を部分的又は完全に抑制することにより、又は、正常な遺伝子産物の活性を増強することにより、改変することができる。好ましくは、破壊はヌル破壊であり、その場合、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子の有意な発現はない。
「ネイティブの発現」という用語は野生型マウスにおいて存在する発現水準におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子によりコードされる完全長ポリペプチドの発現を指す。即ち、内因性PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子の「ネイティブの発現が無い」破壊とは哺乳類の単一の細胞、選択された細胞又は全ての細胞の内因性PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子によりコードされるポリペプチドの少なくとも一部分の発現の部分的又は完全な低減を指す。
「ノックアウト」という用語は、破壊によりネイティブの遺伝子の機能的不活性化;ネイティブ遺伝子又はその一部分の欠失;又はネイティブの遺伝子の突然変異がもたらされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子の破壊を指す。
「ノックイン」という用語は特定のヒトPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404コード遺伝子又はその変異体の何れかをコードするヒトcDNAによるマウスオーソログ(又は他のマウス遺伝子)の置き換えを指す(即ち破壊はネイティブのマウス遺伝子のネイティブのヒト遺伝子による置き換えをもたらす)。
「コンストラクト」又は「ターゲティングコンストラクト」という用語は標的組織、細胞系統又は動物内に転移されるべき人工的に組み立てられたDNAセグメントを指す。典型的には、ターゲティングコンストラクトは特定の目的の遺伝子又は核酸配列、マーカー遺伝子及び適切な対照配列を包含することになる。本明細書においては、ターゲティングコンストラクトはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ターゲティングコンストラクトを含む。「PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ターゲティングコンストラクト」は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子の少なくとも一部分に相同なDNA配列を包含し、そして、宿主細胞内でPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子における破壊を生じさせることができる。
「トランスジェニック細胞」という用語は、そのゲノム内に、遺伝子ターゲティングの方法により完全に又は部分的に破壊、修飾、改変又は置き換えられているPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子を含有する細胞を指す。
「トランスジェニック動物」という用語は本明細書に記載した方法又は当該分野で良く知られている他の方法により破壊又は他の態様で修飾又は突然変異されている特定の遺伝子をそのゲノム内に含有する動物を指す。好ましくは非ヒトトランスジェニック動物は哺乳類である。より好ましくは哺乳類はげっ歯類、例えばラット又はマウスである。更に又、「トランスジェニック動物」はヘテロ接合の動物(即ち1つの欠損対立遺伝子及び1つの野生型対立遺伝子)又はホモ接合の動物(即ち2つの欠損対立遺伝子)であってよい。胚は動物の定義内に属するとみなす。動物を準備することは子宮内に胚又は胎児を準備することを包含し、交配によるか、他の態様によるか、そして胚が在胎期満了するかどうかは問わない。
本明細書においては、「選択マーカー」及び「位置選択マーカー」という用語は、ある遺伝子を担持している細胞のみを特定の条件下に生存及び/又は成長させることができるような、ある産物をコードする遺伝子を指す。例えば、導入されたネオマイシン耐性(Neo)遺伝子を発現する植物及び動物細胞は化合物G418に耐性である。Neo遺伝子マーカーを担持しない細胞はG418により殺傷される。他の陽性選択マーカーは当業者の知る、又は推測できるものである。
「調節する」又は「調節」という用語は本明細書においては、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子の機能、発現、活性又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子に関連する表現型の減少、抑制、低減、軽減、増大又は増強を指す。
「軽減する」又は「軽減」という用語は本明細書においては、状態、疾患、障害又は表現型、例えば異常又は症状の減少、低減又は排除を指す。
「異常」という用語はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の関与が示唆される何れかの疾患、障害、状態又は表現型を指し、病的状態及び挙動観察事例を包含する。
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%アミノ酸配列同一性=ALIGN−2により測定した場合の2ポリペプチド配列の間の同一的にマッチするアミノ酸残基の数)÷(PROポリペプチドのアミノ酸残基の総数)=
5÷15=33.3%
Figure 2008532516
%アミノ酸配列同一性=ALIGN−2により測定した場合の2ポリペプチド配列の間の同一的にマッチするアミノ酸残基の数)÷(PROポリペプチドのアミノ酸残基の総数)=
5÷10=50%
Figure 2008532516
%核酸配列同一性=ALIGN−2により測定した場合の2核酸配列の間の同一的にマッチするヌクレオチドの数)÷(PRO−DNA核酸配列のヌクレオチドの総数)=
6÷14=42.9%
Figure 2008532516
%核酸配列同一性=ALIGN−2により測定した場合の2核酸配列の間の同一的にマッチするヌクレオチドの数)÷(PRO−DNA核酸配列のヌクレオチドの総数)=
4÷12=33.3%
II.組成物及び本発明の方法
A.完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド
本発明は本出願においてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと称するポリペプチドをコードする新規に同定され単離されたヌクレオチド配列を提供する。特に、種々のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするcDNAが後述する実施例において更に詳細に開示する通り同定され、単離された。別個の発現ラウンドにおいて生産される蛋白に異なるPRO番号を付与してよいが、UNQ番号は何れかの所定のDNA及びコードされる蛋白に対してユニークのものであり、変化することは無い。しかしながら、簡便のため、本明細書においては、本明細書に開示する完全長のネイティブの核酸分子によりコードされる蛋白並びにPROの前記した定義に包含される全ての他のネイティブの相同体及び変異体は、その起源又は製造様式に関わらず、「PRO/数」と称する。
後述する実施例に開示する通り、種々のcDNAクローンがATCCに寄託されている。当業者はこれ等のクローンの実際のヌクレオチド配列を当該分野の日常的方法を用いた寄託クローンの配列決定により容易に決定することができる。予測されるアミノ酸配列は日常的技術を用いてヌクレオチド配列から決定できる。本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド及びコードする核酸に関しては、出願人はその時点で使用可能な配列の情報を用いて最も同定可能であるリーディングフレームであると考えられるものを同定している。
B.PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体
本明細書に記載した完全長のネイティブ配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに加えて、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体が製造可能であることが意図される。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNA内に適切なヌクレオチドの変化を導入することにより、及び/又は、所望のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの合成により、製造できる。アミノ酸の変化はグリコシル化部位の数又は位置を変化させたり、又は、膜アンカリング特性を改変させたりするなどの、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの翻訳後の過程を改変する場合があることは当業者の知る通りである。
ネイティブ完全長配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド又は本明細書に記載したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの種々のドメインの変異は、例えば米国特許第5,364,934号に記載されている保存的及び非保存的突然変異に関する手法及び指針の何れかを用いて形成することができる。変異はネイティブ配列PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと比較した場合にPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアミノ酸配列の変化をもたらすPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするコドン1つ以上の置換、欠失又は挿入であってよい。場合により、変異はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのドメイン1つ以上における何れかの他のアミノ酸による少なくとも1つのアミノ酸の置換によるものである。所望の活性に悪影響を与えることなくどのアミノ酸残基を挿入、置換又は欠失させてよいかを決定する場合の指針はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの配列を相同既知蛋白分子のものと比較すること、及び、高相同性の領域で起こるアミノ酸配列変化の数を最小限にすることにより、発見してよい。アミノ酸置換はあるアミノ酸を同様の構造的及び/又は化学的特性を有するアミノ酸と置き換えること、例えばロイシンをセリンで置き換えること、即ち保存的なアミノ酸の置き換えの結果であることができる。挿入及び欠失は場合により約1〜5アミノ酸の範囲であってよい。許容される変異は配列におけるアミノ酸の挿入、欠失又は置換を系統的に行うこと、及び、得られた変異体に完全長又は成熟ネイティブ配列により示される活性があるかどうか試験することにより決定してよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドフラグメントが本明細書において提供される。そのようなフラグメントは例えば完全長のネイティブの蛋白と比較した場合にN末端又はC末端でトランケーションされているか、又は、内部残基を欠いていてよい。特定のフラグメントはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの所望の生物学的活性の為に必須ではないアミノ酸残基を欠いている。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404フラグメントは多くの従来の手法の何れかにより製造してよい。所望のペプチドフラグメントは化学合成してよい。代替法においては、酵素消化により、例えば特定のアミノ酸残基により定義される部位において蛋白を切断することがわかっている酵素で蛋白を処理することにより、又は、適当な制限酵素でDNAを消化し、そして所望のフラグメントを単離することにより、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404フラグメントを形成する。更に別の適当な手法では、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により所望のポリペプチドフラグメントをコードするDNAフラグメントを単離して増幅する。DNAフラグメントの所望の末端を定義するオリゴヌクレオチドをPCRにおける5’及び3’プライマーとして使用する。好ましくは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドフラグメントは本明細書に開示するネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと、少なくとも1つの生物学的及び/又は免疫学的活性を共有する。
目的の保存的置換は好ましい置換という見出しの下に表6に示す通りである。このような置換が生物学的活性における変化をもたらす場合、より実質的な変化、表6において例示される置換と称される置換、又はアミノ酸クラスに言及しながら後述において更に説明するものが好ましく導入され、生成物がスクリーニングされる。
Figure 2008532516
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの機能又は免疫学的同一性における実質的な修飾は(a)例えばシート又は螺旋状のコンホーメーションとしての置換域におけるポリペプチド骨格の構造、(b)標的部位における分子の電荷又は疎水性、又は(c)側鎖の嵩を維持することに対するその作用において有意に異なる置換を選択することにより達成される。天然に存在する残基は共通の側鎖の特性に基づいて群分けされ:アミノ酸はその側鎖の特性における同様性(A.L.Lehninger,Biochemistry,2nd ed.,pp.73−75,Worth Publishers,New York(1975))に従って以下の通り、即ち:
(1)非極性;Ala(A)、Val(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M)
(2)未荷電極性:Gly(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q)
(3)酸性:Asp(D)、Glu(E)
(4)塩基性:Lys(K)、Arg(R)、His(H)
となるように群分けしてよい。
或いは、天然に存在する残基は共通の側鎖の特性に基づいて以下の通り、即ち:
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile:
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln:
(3)酸性:Asp、Glu
(4)塩基性:His、Lys、Arg
(5)鎖の方向に影響する残基:Gly、Pro
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe
となるように群分けしてよい。
非保存的置換はこれ等のクラスの1つのメンバーを他のクラスと交換することを包含する。そのような置換された残基はまた保存的置換部位内に、又はより好ましくは残余(非保存)の部位に導入されてよい。
変異はオリゴヌクレオチド媒介(部位指向性)突然変異誘発、アラニンスキャニング及びPCR突然変異誘発のような当該分野で知られた方法を用いて行うことができる。部位指向性突然変異誘発[Carter et al.,Nucl.Acids Res.,13:4331(1986);Zoller et al.,Nucl.Acids Res.,10:6487(1987)]、カセット突然変異誘発[Wells et al.,Gene,34:315(1985)]、制限選択突然変異誘発[Wells et al.,Philos.Trans.R.Soc.London SerA,317:415(1986)]又は他の知られた手法をクローニングされたDNAに対して実施することによりPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体DNAを製造することができる。
スキャニングアミノ酸分析もまた隣接する配列に沿ってアミノ酸1つ以上を同定するために使用できる。好ましいスキャニングアミノ酸には比較的小型の中性のアミノ酸が包含される。このようなアミノ酸はアラニン、グリシン、セリン及びシステインを包含する。アラニンは典型的には、それがベータ炭素を超えた側鎖を排除し、変異体の主鎖のコンホーメーションを改変する可能性が低いため、この群の中では好ましいスキャニングアミノ酸である[Cunningham and Wells,Science,244:1081−1085(1989)]。アラニンはまた典型的には、それが最も一般的なアミノ酸であることから好ましい。更に又それは頻繁に埋没及び曝露の位置の両方において存在する[Creighton,The Proteins,(W.H.Freeman&Co.,N.Y.);Chothia,J.Mol.Biol.,150:1(1976)]。アラニン置換が十分な量の変異体をもたらさない場合は、同配体アミノ酸を使用できる。
C.PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの修飾
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの共有結合修飾は本発明の範囲に包含される。共有結合修飾の1つの型はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの選択された側鎖又はN又はC末端の残基と反応することができる有機誘導体形成剤とPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのターゲティングされたアミノ酸残基を反応させることを包含する。二官能性剤を用いた誘導体化は、例えば抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を精製するための方法において使用する水不溶性支持体マトリックス又は表面にPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを交差結合するため、又はその逆のために有用である。一般的に使用される交差結合剤は例えば1,1−ビス(ジアゾアセチル)−2−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば4−アジドサリチル酸とのエステル、ホモ2官能性イミドエステル、例えばジスクシンイミジルエステル、例えば3,3’−ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)、2官能性マレイミド、例えばビス−N−マレイミド−1,8−オクタン及びメチル−3−[(p−アジドフェニル)ジチオ]プロピオイミデートのような物質を包含する。
他の修飾にはグルタミニル及びアスパルギニル残基からそれぞれ相当するグルタミル及びアスパルチル残基への脱アミド化、プロリン及びリジンのヒドロキシル化、セリル又はスレオニル残基のヒドロキシル基のホスホリル化、リジン、アルギニン及びヒスチジン側鎖のα−アミノ基のメチル化[T.E.Creighton,Proteins:Structure and Molecular Properties,W.H.Freeman&Co.,San Francisco,pp.79−86(1983)]、N末端アミンのアセチル化及び何れかのC末端カルボキシル基のアミド化が包含される。
本発明の範囲に包含されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの共有結合修飾の別の型はポリペプチドのネイティブのグリコシル化パターンを改変することを含む。「ネイティブのグリコシル化パターンを改変すること」とは、本明細書の目的のためには、ネイティブ配列PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド内に存在する炭水化物部分1つ以上を欠失させること(伏在するグリコシル化部位を除去することによるか、又は、化学的及び/又は酵素的手段によりグリコシル化を欠失させることによる)及び/又はネイティブ配列PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド内に存在しないグリコシル化部位1つ以上を付加させることを意味する。更に又、この文言には存在する種々の炭化水素部分の性質及び比率の変化を含む、ネイティブ蛋白のグリコシル化の定性的変化を包含する。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドへのグリコシル化部位の付加はアミノ酸配列を改変することにより達成してよい。改変は、例えばネイティブ配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404へのセリン又はスレオニン残基1つ以上の付加又は置換により行ってよい(O連結グリコシル化部位の場合)。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404アミノ酸配列は場合により、特に、所望のアミノ酸に翻訳されることになるコドンが形成されるように予め選択された塩基においてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAを突然変異することにより、DNAレベルの変化を介して改変してよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド上の炭水化物部分の数を増大させる別の手段はポリペプチドへのグリコシドの化学的又は酵素的なカップリングによるものである。そのような方法は当該分野において、例えば、1987年9月11日公開のWO87/05330及びAplin and Wriston,CRC Crit.Rev.Biochem.,pp.259−306(1981)に記載されている。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド上に存在する炭水化物部分の除去は、化学的又は酵素的に、又は、グリコシル化のための標的として機能するアミノ酸残基についてコードしているコドンの突然変異的置換により達成してよい。化学的脱グリコシル化手法は当該分野で知られており、そして例えばHakimuddin,et al.,Arch.Biochem.Biophys.,259:52(1987)及びEdge et al.,Anal.Biochem.,118:131(1981)に記載されている。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断はThotakura et al.,Meth.Enzymol.138:350(1987)に記載されている種々のエンドグリコシダーゼ及びエキソグリコシダーゼの使用によって達成できる。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの共有結合修飾の別の型は米国特許第4,640,835号;第4,496,689号;第4,301,144号;第4,670,417号;第4,791,192号又は第4,179,337号に記載されている態様における種々の非蛋白性の重合体、例えばポリエチレングリコール(PEG)、ポリプロピレングリコール又はポリオキシアルキレンの1つへのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの連結を含む。
本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドはまた別の非相同ポリペプチド又はアミノ酸配列に融合したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを含むキメラ分子を形成するための態様において修飾してもよい。
このようなキメラ分子は抗タグ抗体が選択的に結合できる相手であるエピトープを与えるタグポリペプチドとのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの融合を含む。エピトープタグは一般的に、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアミノ又はカルボキシル末端に位置させる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのこのようなエピトープタグ付形態の存在は、タグポリペプチドに対する抗体を用いて検出できる。又、エピトープタグを準備することで、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは、抗タグ抗体又はエピトープタグに結合するアフィニティーマトリックスの別の型を用いたアフィニティー精製により容易に精製できるようになる。種々のタグポリペプチド及びその対応する抗体が当該分野で良く知られている。例としては、ポリヒスチジン(poly−his)又はポリヒスチジン−グリシン(poly−his−gly)タグ;インフルエンザHAタグポリペプチド及びその抗体12CA5[Field et al.,Mol.Cell Biol.,8:2159−2165(1988)];c−mycタグ及びそれに対する8F9、3C7、6E10、G4、B7及び9E10抗体[Evan et al.,Molecular and Cellular Biology,5:3610−3616(1985)];及び単純疱疹ウィルス糖蛋白D(gD)タグ及びその抗体[Paborsky et al.,Protein Engineering,3(6):547−553(1990)]が包含される。他のタグポリペプチドはFlag−ペプチド[Hopp et al.,BioTechnology,6:1204−1210(1988)];KT3エピトープペプチド[Martin et al.,Science,255:192−194(1992)];α−チューブリンエピトープペプチド[Skinner et al.,J.Biol.Chem.,266:15163−15166(1991)];及びT7遺伝子10蛋白ペプチドタグ[Lutz−Freyermuth et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6393−6397(1990)]を包含する。
キメラ分子は免疫グロブリン又は免疫グロブリンの特定の領域とのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの融合を含んでよい。キメラ分子の2価の形態(「イムノアドヘシン」とも称する)については、このような融合はIgG分子のFc領域に対するものであり得る。Ig融合は好ましくはIg分子内の可変領域少なくとも1つの代替としてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの可溶性(膜貫通ドメイン欠失又は不活性化)形態の置換を包含する。本発明の特に好ましい局面においては、免疫グロブリン融合はIgG1分子のヒンジ、CH2及びCH3;又はヒンジ、CH1、CH2及びCH3領域を包含する。免疫グロブリン融合の作成については、1995年6月27日発行の米国特許第5,428,130号も参照のこと。
D.PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの製造
以下の説明は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸を含有するベクターで形質転換又はトランスフェクトした細胞を培養することによるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの製造に主に関するものである。当然ながら当該分野で良く知られている代替法を用いてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを製造してもよいことを意図している。例えばPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の配列又はその部分は固相法を用いた直接ペプチド合成により製造してよい[例えばStewart et al.,Solid−Phase Peptide Synthesis,W.H.Freeman Co.,San Francisco,CA(1969);Merrifield,J.Am.Chem.Soc.,85:2149−2154(1963)を参照]。インビトロの蛋白合成を手動の手法又は自動により実施してよい。自動合成は例えばApplied Biosystems Peptide Synthesizer(Foster City,CA)を用いて製造元の説明書により行ってよい。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの種々の部分を別個に化学合成し、そして化学的又は酵素的な方法を用いて組み合わせることにより完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを製造してよい。
1.PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAの単離
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404mRNAを保有し、そしてそれを検出可能なレベルで発現すると考えられる組織から調製したcDNAライブラリから得てよい。従ってヒトPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−DNAは実施例に記載するようなヒト組織から調製したcDNAライブラリから好都合に得ることができる。PRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−コード遺伝子もまた、ゲノムライブラリから、又は、知られた合成操作法(例えば自動核酸合成)により得てよい。
ライブラリは目的の遺伝子又はそれによりコードされる蛋白を同定するように設計されたプローブ(例えばPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対する抗体又は少なくとも約20〜80塩基のオリゴヌクレオチド)を用いてスクリーニングできる。選択されたプローブを用いたcDNA又はゲノムライブラリのスクリーニングはSambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)に記載されているもののような標準的な操作法を用いて実施してよい。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404をコードする遺伝子を単離するための代替手段はPCR法を使用することである[Sambrook et al.,上出;Dieffenbach et al.,PCR Primer:A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1995)]。
後述する実施例はcDNAライブラリをスクリーニングするための手法を説明するものである。プローブとして選択されたオリゴヌクレオチド配列は擬陽性を最小限とするために十分な長さのものであり、そして十分明白なもので無ければならない。オリゴヌクレオチドは好ましくは、スクリーニングされるライブラリのDNAへのハイブリダイゼーション時にそれが検出できるように標識される。標識方法は当該分野で良く知られており、32P標識ATPのような放射性標識、ビオチニル化又は酵素標識の使用を包含する。ハイブリダイゼーション条件、例えば中ストリンジェンシー及び高ストリンジェンシーは上出のSambrook et al.に記載されている。
このようなライブラリスクリーニング法において同定された配列は、GenBankのような公的データベース又は他の私的配列データベースに寄託され入手可能である他の既知配列と比較し、アラインすることができる。分子の所定領域内又は完全長配列に渡る配列同一性(アミノ酸又はヌクレオチドレベルの何れか)は当該分野で知られた方法を用いて、そして、本明細書に記載する通り、決定することができる。
蛋白コーディング配列を有する核酸は、本明細書において初めて開示された推定アミノ酸配列を用いて、そして、必要に応じて、上出のSambrook et al.に記載されている従来のプライマー伸長操作法を用いて、選択されたcDNA又はゲノムライブラリをスクリーニングすることにより前駆体を検出すること、及び、cDNAに逆転写されていないmRNAの中間体をプロセシングすることにより得てよい。
2.宿主細胞の選択及び形質転換
宿主細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの生産に関して本明細書に記載した発現又はクローニングベクターを用いてトランスフェクト又は形質転換し、そしてプロモーターの誘導、形質転換体の選択又は所望の配列をコードする遺伝子の増幅の為に適切であるように変性された従来の栄養培地中で培養する。培地、温度、pH等のような培養条件は予定外の実験を要することなく当業者が選択できる。一般的に、細胞培養の生産性を最大にするための原理、プロトコル及び実際の手法はMammalian Cell Biotechnology:a Practical Approach,M.Butler,ed.(IRL Press,1991)及び上出Sambrook et al.に記載されている。
真核生物細胞トランスフェクション及び原核生物細胞トランスフェクションの方法は、当業者に知られており、例えばCaCl、CaPO、リポソーム媒介及びエレクトロポレーションである。使用する宿主細胞に応じて、形質転換はその細胞に適切な標準的手法を用いて実施する。上出のSambrook et al.,に記載されているもののような塩化カルシウムを使用するカルシウム処理、又は、エレクトロポレーションが原核生物に対して一般的に使用される。Shaw et al.,Gene,23:315(1983)及び1989年6月29日公開のWO89/05859記載のような、特定の植物細胞の形質転換の為にアグロバクテリウム・ツメファシエンス感染が使用される。細胞壁を有しない哺乳類細胞に対してはGraham and van der Eb,Virology,52:456−457(1978)のリン酸カルシウム沈降法を使用できる。哺乳類細胞宿主系トランスフェクションの一般的側面は米国特許第4,399,216号に記載されている。酵母への形質転換は典型的には、Van Solingen et al.,J.Bact.130:946(1977)及びHsiao et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA),76:3829(1979)の方法に従って実施する。しかしながら、細胞にDNAを導入する別の方法、例えば核マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、未損傷細胞との細菌プロトプラスト融合又はポリカチオン、例えばポリブレン、ポリオルニチンも使用してよい。哺乳類細胞を形質転換するための種々の手法についてはKeown et al.,Methods in Enzymology,185:527−537(1990)及びMansour et al.,Nature,336:348−352(1988)を参照のこと。
本明細書におけるベクター内のDNAをクローニング又は発現するための適当な宿主細胞は原核生物、酵母又はより高等の真核生物の細胞を包含する。適当な原核生物は限定しないが、真正細菌目、例えばグラム陰性又はグラム陽性の生物、例えば腸内細菌科、例えばE・コリを包含する。種々のE・コリ菌株が公的に入手でき、例えばE・コリK12菌株MM294(ATCC31,446);E・コリX1776(ATCC31,537);E・コリ菌株W3110(ATCC27,325)及びK5772(ATCC53,635)が挙げられる。他の適当な原核生物宿主細胞は腸内細菌科、例えばエシェリシア属、例えばE・コリ、エンテロバクター、エルウイニア、クレブシエラ、プロテウス、サルモネラ、例えばサルモネラ・チフィムリウム、セラチア、例えばセラチア・マルセサンス、及び、シゲラ並びにバチルス類、例えばB・サブチルス及びB・リシェニフォルミス(例えば1989年4月12日公開のDD266,710に開示されているB・リシェニフォルミス41P)、シュードモナス、例えばP・アエルギノーサ及びストレプトマイセスを包含する。これ等の例は説明であって限定するものではない。菌株W3110は組み換えDNA産物の醗酵のための一般的な宿主菌株であることから1つの特に好ましい宿主又は親宿主である。好ましくは、宿主細胞は最小量の蛋白分解酵素を分泌する。例えば菌株W3110は宿主に内因性である蛋白をコードする遺伝子における遺伝子突然変異を起こすように修飾してよく、そのような宿主の例には、完全な遺伝子型tonAを有するE・コリW3110菌株1A2;完全な遺伝子型tonAptr3を有するE・コリW3110菌株9E4;完全な遺伝子型tonAptr3phoAE15(argF−lac)169degPompTkanr.を有するE・コリW3110菌株27C7(ATCC55,244);完全な遺伝子型tonAptr3phoAE15(argF−lac)169degPompTrbs7ilvGkanr.を有するE・コリW3110菌株37D6;非カナマイシン耐性degP欠失突然変異を有する菌株37D6であるE・コリW3110菌株40B4;及び、1990年8月7日に発行された米国特許第4,946,783号に開示されている突然変異体のペリプラズムプロテアーゼを有するE・コリ菌株が包含される。或いは、クローニングのインビトロの方法、例えばPCR又は他の核酸ポリメラーゼ反応が適当である。
原核生物のほかに、真核生物の微生物、例えば線維状カビ又は酵母がPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−コードベクターのための適当なクローニング又は発現宿主である。サッカロマイセス・セレビシアエは一般的に使用されている下等な真核生物の宿主微生物である。他のものにはスキゾサッカロマイセス・ポンベ(Beach and Nurse,Nature,290:140[1981];1985年5月2日公開のEP139,383);クルイベロマイセス宿主(米国特許第4,943,529号;Fleer et al.,Bio/Technology,9:968−975(1991))、例えばK・ラクチス(MW98−8C,CBS683、CBS4574;Louvencourt et al.,J.Bacteriol.,154(2):737−742[1983])、K・フラジリス(ATCC12,424)、K・ブルガリクス(ATCC16,045)、K・ウイケラミ(ATCC24,178)、K・ワルチ(ATCC56,500)、K・ドロソフィラルム(ATCC36,906;Van den Berg et al.,Bio/Technology,8:135(1990))、K・サーモトレランス及びK・マルキシアヌス;ヤロウイア(EP402,226);ピシア・パストリス(EP183,070;Sreekrishna et al.,J.Basic Microbiol.28:265−278[1988]);カンジダ;トリコデルマ・リエシア(EP244,234);ニューロスポラ・クラッサ(Case et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,76:5259−5263[1979]);シュワニオマイセス、例えばシュワニオマイセス・オシデンタリス(1990年10月31日公開のEP394,538);及び線維状カビ、例えばニューロスポラ、ペニシリウム、トリポクラジウム(1991年1月10日公開のWO91/00357)及びアスペルギルス宿主、例えばA・ニズランス(Ballance et al.,Biochem.Biophys.Res.Commun.,112:284−289[1983];Tilburn et al.,Gene,26:205−221[1983];Yelton et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:1470−1474[1984])及びA・ナイジャー(Kelly and Hynes,EMBOJ.,4:475−479[1985])が包含される。メチル向性の酵母が本発明において適しており、そして限定しないが、ハンセヌラ、カンジダ、クロエケラ、ピシア、サッカロマイセス、トルロプシス及びロドトルラよりなる属から選択されるメタノール上で生育できる酵母を包含する。このクラスの酵母の例となる特定の種のリストはC.Anthony,The Biochemistry of Methylotrophs,269(1982)に記載されている。
グリコシル化されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現のための適当な宿主細胞は多細胞生物から誘導される。無脊椎動物の細胞の例は、昆虫細胞、例えばショウジョウバエS2及びヨトウSf9並びに植物細胞を包含する。有用な哺乳類宿主細胞系統の例はチャイニーズハムスター卵巣(CHO)及びCOS細胞を包含する。より特定した例は、SV40で形質転換したサル腎臓CV1系統(COS−7、ATCCCRL1651);ヒト胚性腎系統(293又は懸濁培地中の生育の為にサブクローニングされた293細胞、Graham et al.,J.Gen.Virol.,36:59(1977));チャイニーズハムスター卵巣細胞/−DHFR(CHO、Urlaub and Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4216(1980));マウスセルトーリ細胞(TM4、Mather,Biol.Reprod.,23:243−251(1980));ヒト肺細胞(W138、ATCCCCL75);ヒト肝細胞(HepG2,HB8065);及びマウス乳癌(MMT060562、ATCCCCL51)を包含する。適切な宿主細胞の選択は当業者の知る通りである。
3.複製可能なベクターの選択及び使用
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする核酸(例えばcDNA又はゲノムDNA)をクローニング(DNAの増幅)のため、又は、発現の為に、複製可能なベクター内に挿入してよい。種々のベクターが公的に入手可能である。ベクターは例えばプラスミド、コスミド、ウィルス粒子、又はファージの形態であってよい。適切な核酸配列を種々の操作法でベクター内に挿入してよい。一般的に、DNAは当該分野で知られた手法を用いて適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入する。ベクター成分は一般的に限定しないが1つ以上のシグナル配列、複製起点、1つ以上のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター及び転写終止配列を包含する。これ等の成分1つ以上を含有する適当なベクターの構築は当業者に知られた標準的なライゲーション手法を用いる。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは組み換えにより、直接のみならず、シグナル配列又は成熟蛋白又はポリペプチドのN末端に特定の切断部位を有する他のポリペプチドであってよい非相同ポリペプチドとの融合ポリペプチドとして製造してよい。一般的に、シグナル配列はベクターの成分であってよく、又は、それはベクターに挿入されたPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−コードDNAの部分であってよい。シグナル配列は例えばアルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、lpp又は熱安定性エンテロトキシンIIリーダーの群から選択される原核生物のシグナル配列であってよい。酵母の分泌のためには、シグナル配列は例えば酵母インベルターゼリーダー、アルファ因子リーダー(サッカロマイセス及びクルイベロマイセスのα−因子リーダーを包含、後者は米国特許第5,010,182号に記載)又は酸ホスファターゼリーダー、C・アルビカンスグルコアミラーゼリーダー(1990年4月4日公開のEP362,179)又は1990年11月15日公開のWO90/13646に記載のシグナルであってよい。哺乳類細胞発現においては、同じか関連する種の分泌ポリペプチド由来のシグナル配列のような哺乳類シグナル配列を用いて蛋白の分泌を誘導してよく、ウィルスの分泌リーダーも使用される。
発現及びクローニングベクターは両方とも1つ以上の選択された宿主細胞においてベクターを複製可能とする核酸配列を含有する。そのような配列は種々の細菌、酵母及びウィルスに関してよく知られている。プラスミドpBR322由来の複製起点が大部分のグラム陰性細菌に適しており、2μプラスミド起点は酵母に適しており、そして種々のウィルス起点(SV40、ポリオーマ、アデノウィルス、VSV又はBPV)は哺乳類細胞オにおけるクローニングベクターの為に有用である。
発現及びクローニングベクターは典型的には選択可能なマーカーとも称される選択遺伝子を含有する。典型的な選択遺伝子は(a)抗生物質又は他の毒素、例えばアンピシリン、ネオマイシン、メトトレキセート又はテトラサイクリンに対する耐性を付与し、(b)栄養要求性の欠損を補償し、又は(c)複合培地から得られない重要な栄養を供給する蛋白をコードしており、例えばバチルスのためのD−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子である。
哺乳類細胞のための適当な選択可能なマーカーの例は、DHFR又はチミジンキナーゼのような、PRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−コード核酸の取り込み能力を有する細胞の同定を可能にするものである。野生型DHFRを使用する場合の適切な宿主細胞はUrlaub et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4216(1980)に記載の通り製造及び増殖させたDHFR活性欠損のCHO細胞である。酵母で使用するための適当な選択遺伝子は酵母プラスミドYRp7中に存在するtrp1遺伝子である[Stinchcomb et al.,Nature,282:39(1979);Kingsman et al.,Gene,7:141(1979);Tschemper et al.,Gene,10:157(1980)]。trp1遺伝子はトリプトファン中で生育する能力を欠いた酵母の突然変異株、例えばATCC44076又はPEP4−1のための選択マーカーを与える[Jones,Genetics,85:12(1977)]。
発現及びクローニングベクターは通常はmRNA合成を誘導するためにPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−コード核酸配列に作動可能に連結したプロモーターを含有する。種々の潜在的宿主細胞により認識されるプロモーターはよく知られている。原核生物の宿主で使用するのに適するプロモーターはβ−ラクタマーゼ及びラクトースプロモーター系[Chang et al.,Nature,275:615(1978);Goeddel et al.,Nature,281:544(1979)]、アルカリホスファターゼ、トリプトファン(trp)プロモーター系[Goeddel,Nucleic Acids Res.,8:4057(1980);EP36,776]及びハイブリッドプロモーター、例えばtacプロモーター[deBoer et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,80:21−25(1983)]を包含する。細菌系における使用のためのプロモーターもまたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAに作動可能に連結したShine−Dalgarno(S.D.)配列を含有する。
酵母宿主と共に使用するための適当なプロモーター配列の例は3−ホスホグリセレートキナーゼ[Hitzeman et al.,J.Biol.Chem.,255:2073(1980)]又は他の糖分解酵素[Hess et al.,J.Adv.Enzyme Reg.,7:149(1968);Holland,Biochemistry,17:4900(1978)]、例えばエノラーゼ、グリセルアルデヒド−3−ホスフェートデヒドロゲナーゼ、ヘキソキナーゼ、ピルベートデカルボキシラーゼ、ホスホフラクトキナーゼ、グルコース−6−ホスフェートイソメラーゼ、3−ホスホグリセレートムターゼ、ピルベートキナーゼ、トリオースホスフェートイソメラーゼ、ホスホグルコースイソメラーゼ及びグルコキナーゼのためのプロモーターを包含する。
生育条件により制御される転写の追加的利点を有する誘導プロモーターである他の酵母プロモーターはアルコールデヒドロゲナーゼ2、イソチトクロームC、酸ホスファターゼ、窒素代謝に関連する分解性酵素、メタロチオネイン、グリセルアルデヒド−3−ホスフェートデヒドロゲナーゼ及びマルトース及びガラクトースの利用を担う酵素のプロモーター領域である。酵母発現において使用するための適当なベクター及びプロモーターはEP73,657においても記載されている。
哺乳類宿主細胞中におけるベクターからのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の転写は例えばポリオーマウィルス、鶏痘ウィルス(1989年7月5日公開のUK2,211,504)、アデノウィルス(例えばアデノウィルス2)、ウシ乳頭腫ウィルス、トリ肉腫ウィルス、サイトメガロウィルス、レトロウィルス、B型肝炎ウィルス及びシミアンウィルス40(SV40)のようなウィルスのゲノムから、非相同哺乳類プロモーター、例えばアクチンプロモーター又は免疫グロブリンプロモーターから、そして、熱ショックプロモーターから得られたプロモーターにより制御されるが、このようなプロモーターは宿主細胞系と適合しなければならない。
より高等な真核生物によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAの転写はベクター中にエンハンサー配列を挿入することにより増大させてよい。エンハンサーは通常は約10〜300bpのDNAのシス作用性エレメントであり、これはプロモーターに対してその転写を増大させるように作用する。哺乳類遺伝子由来の多くのエンハンサー配列が現在知られている(グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテイン及びインスリン)。しかしながら典型的には、真核生物細胞ウィルス由来のエンハンサーを使用することになる。例としては複製起点の後期側上のSV40エンハンサー(bp100−270)、サイトメガロウィルス早期プロモーターエンハンサー、複製起点の後期側上のポリオーマエンハンサー及びアデノウィルスエンハンサーが包含される。エンハンサーはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404コーディング配列に対して5’又は3’の位置においてベクター内にスプライスしてよいが、好ましくはプロモーターから5’側の部位に位置する。
真核生物宿主細胞(酵母、カビ、昆虫、植物、動物、ヒト又は他の多細胞生物由来の有核細胞)中で使用する発現ベクターはまた転写の終止のため、及びmRNAの安定化のために必要な配列を含有する。そのような配列は真核生物又はウィルスのDNA又はcDNAの5’側、場合によっては3’側の未翻訳の領域から一般的に得られる。これ等の領域はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするmRNAの未翻訳部分内のポリアデニル化フラグメントとして転写されるヌクレオチドセグメントを含有する。
組み換え脊椎動物細胞培養物中のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの合成に適合させるために適するさらに別の方法、ベクター及び宿主細胞はGething et al.,Nature,293:620−625(1981);Mantei et al.,Nature,281:40−46(1979);EP117,060;及びEP117,058に記載されている。
4.遺伝子の増幅/発現の検出
遺伝子の増幅及び/又は発現は例えばmRNAの転写を定量するための従来のサザンブロッティング、ノーザンブロッティング[Thomas,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:5201−5205(1980)]、ドットブロッティング(DNA分析)、又はインサイチュハイブリダイゼーションにより、適切な標識プローブを用いて、本明細書において提供される配列に基づいて、直接試料中で測定してよい。或いは、DNAデュプレックス、RNAデュプレックス及びDNA−RNAハイブリッドデュプレックス又はDNA−蛋白デュプレックスを包含する特定のデュプレックスを認識できる抗体を使用してよい。そして抗体を標識し、表面上のデュプレックスの形成によりデュプレックスに結合した抗体の存在が検出できるようにデュプレックスが表面に結合した状態で試験を実施してよい。
或いは遺伝子発現を細胞又は組織の切片の免疫組織化学的染色のような免疫学的方法及び細胞培養物又は体液の試験により測定することにより、遺伝子産物の発現を直接定量してよい。免疫学的染色及び/又は試料液体の試験の為に有用な抗体はモノクローナル抗体又はポリクローナル抗体の何れかであってよく、そして何れかの哺乳類において製造してよい。好都合には、抗体はネイティブ配列PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対して、又は、本発明において提供されるDNA配列に基づいた合成ペプチドに対して、又は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNAに融合され、そして特定の抗体エピトープをコードする外因性配列に対して作成してよい。
5.ポリペプチドの精製
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの形態は培地から、又は宿主細胞溶解物から回収してよい。膜結合の場合は、適当な洗浄液(例えばTriton−X100)を用いるか、酵素的切断により、膜から遊離させることができる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現に使用される細胞は種々の物理的又は化学的手段、例えば凍結解凍の反復、超音波処理、機械的破壊又は細胞溶解剤等により破壊することができる。
組み換え細胞の蛋白又はポリペプチドからPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを精製することが望ましい場合がある。以下の操作法、即ち、イオン交換カラム上の分画;エタノール沈降;逆相HPLC;シリカ上又はカチオン交換樹脂、例えばDEAE上のクロマトグラフィー;クロマトフォーカシング;SDS−PAGE;硫酸アンモニウム沈降法;例えばSephadexG−75を用いたゲル濾過;IgGのような夾雑物を除去するためのプロテインAセファロースカラム;及びPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのエピトープタグ付型を結合させるための金属キレートカラムが適当な精製の操作法の例である。蛋白精製の種々の方法を使用してよく、そしてそのような方法は当該分野で知られており、そして例えばDeutscher,Methods in Enzymology,182(1990);Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,Springer−Verlag,New York(1982)に記載されている。選択される精製工程は、例えば使用される製造プロセスの性質及び製造される特定のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに依存する。
E.PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの使用
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列(又はその相補体)はハイブリダイゼーションプローブとしての使用を包含する分子生物学において、染色体及び遺伝子のマッピングにおいて、及びアンチセンスRNA及びDNAの生成において、種々の用途を有している。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸はまた本明細書に記載する組み換え手法によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの製造の為に有用である。
完全長ネイティブ配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子又はその部分は完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404cDNAを単離するため、又は本明細書に開示したネイティブPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404配列に対して所望の配列同一性を有する更に別のcDNA(例えばPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの天然に存在する変異体又は他の種に由来するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするもの)を単離するためのcDNAライブラリのためのハイブリダイゼーションプローブとして使用してよい。場合により、プローブの長さは約20〜約50塩基となる。ハイブリダイゼーションプローブは完全長ネイティブヌクレオチド配列の少なくとも部分的に新規な領域から誘導してよく、ここでそのような領域は予定外の実験をすることなく、又は、ネイティブ配列PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404のプロモーター、エンハンサーエレメント及びイントロンを包含するゲノム配列から決定してよい。例示すれば、スクリーニング方法は約40塩基の選択されたプローブを合成するために既知のDNA配列を用いてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子のコーディング領域を単離することを包含する。ハイブリダイゼーションプローブは種々の標識、例えば放射性核種、例えば32P又は35S、又は酵素標識、例えばアビジン/ビオチンカップリング系を介してプローブにカップリングされたアルカリホスファターゼにより標識してよい。本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PR





O19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子のものと相補的な配列を有する標識されたプローブを用いてヒトcDNA、ゲノムDNA又はmRNAのライブラリをスクリーニングすることによりそのようなライブラリのどのメンバーにプローブがハイブリダイズするかを決定することができる。ハイブリダイゼーションの手法は後述する実施例において更に詳細に説明する。
本出願に開示する何れかのEST配列を本明細書に開示する方法を用いてプローブとして同様に使用してよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸の他の有用なフラグメントは標的のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404mRNA(センス)又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNA(アンチセンス)配列への結合が可能な一本鎖核酸配列(RNA又はDNAの何れか)を含むアンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドを包含する。本発明によればアンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNAのコーディング領域のフラグメントを含む。そのようなフラグメントは一般的に、少なくとも約14ヌクレオチド、好ましくは約14〜30ヌクレオチドを含む。所定の蛋白をコードするcDNA配列に基づいてアンチセンス又はセンスのオリゴヌクレオチドを誘導する能力は例えばStein and Cohen(Cancer Res.48:2659,1988)及びvan der Krol et al.(BioTechniques 6:958,1988)に記載されている。
標的核酸配列へのアンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドの結合により、増強されたデュプレックス分解、転写又は翻訳の早期の終了を含む幾つかの手段の1つによる、又は他の手段による、標的配列の転写又は翻訳をブロックするデュプレックスの形成がもたらされる。即ちアンチセンスオリゴヌクレオチドはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現をブロックするために使用してよい。アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは更に修飾された糖ホスホジエステル骨格(又は他の糖連結部、例えばWO91/06629に記載のもの)を有するオリゴヌクレオチドを含み、その場合、そのような糖連結部は内因性ヌクレアーゼに対して抵抗性である。抵抗性の糖連結物を有するそのようなオリゴヌクレオチドはインビボで安定である(即ち酵素による分解に抵抗することができる)が、標的ヌクレオチド配列に結合することができる配列特異性は保持している。
センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドの他の例はWO90/10048記載のような有機部分又はポリ−(L−リジン)のような標的核酸配列に対するオリゴヌクレオチドの親和性を増大させる他の部分に共有結合したオリゴヌクレオチドを包含する。エリプチシンのような更に別のインターカレーション剤及びアルキル化剤又は金属錯体をセンス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合させることにより標的核酸配列に対するアンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドの結合特異性を修飾することができる。
アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドは何れかの遺伝子導入法、例えばCaPO媒介DNAトランスフェクション、エレクトロポレーションにより、又は、エプスタイン・バーウィルスのような遺伝子導入ベクターを使用することにより標的核酸配列を含有する細胞内に導入してよい。好ましい操作法においては、アンチセンス又はセンスオリゴヌクレオチドを適当なレトロウィルスベクターに挿入する。標的核酸配列を含有する細胞を組み換えレトロウィルスベクターにインビボ又はエクスビボのいずれかで接触させる。適当なレトロウィルスベクターは限定しないが、マウスレトロウィルスM−MuLV、N2(M−MuLVから誘導されたレトロウィルス)から誘導されたもの、又は、DCT5A、DCT5B及びDCT5Cと表記されるダブルコピーを包含する(WO90/13641参照)。
センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドはまたWO91/04753に記載の通りリガンド結合分子とのコンジュゲートの形成により標的ヌクレオチド配列を含有する細胞内に導入してよい。適当なリガンド結合分子は限定しないが細胞表面受容体、成長因子、他のサイトカイン又は細胞表面受容体に結合する他のリガンドを包含する。好ましくは、リガンド結合分子のコンジュゲーションはリガンド結合分子がその相当する分子又は受容体に結合する能力を大きく妨害したり、細胞内へのセンス又はアンチセンスオリゴヌクレオチド又はそのコンジュゲート型の進入をブロックしたりすることはない。
或いは、センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチドはWO90/10448に記載の通りオリゴヌクレオチド−脂質複合体の形成により標的核酸配列を含有する細胞内に導入してよい。センス又はアンチセンスオリゴヌクレオチド−脂質複合体は好ましくは内因性リパーゼにより細胞内で解離される。
アンチセンス又はセンスRNA又はDNA分子は一般的に少なくとも約5塩基長、約10塩基長、約15塩基長、約20塩基長、約25塩基長、約30塩基長、約35塩基長、約40塩基長、約45塩基長、約50塩基長、約55塩基長、約60塩基長、約65塩基長、約70塩基長、約75塩基長、約80塩基長、約85塩基長、約90塩基長、約95塩基長、約100塩基長又はそれより長い。
プローブは又緊密に関連するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404コーディング配列の同定のための配列のプールを作成するためのPCR法において使用してよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列はまたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子をマッピングするため、及び遺伝的疾患を有する個体の遺伝子的分析のためのハイブリダイゼーションプローブを構築するために使用できる。本明細書において提供されるヌクレオチド配列は既知の手法、例えばインサイチュハイブリダイゼーション、既知染色体マーカーに対するリンケージ分析及びライブラリを用いたハイブリダイゼーションスクリーニングを用いて染色体及び染色体の特定の領域にマッピングしてよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に関するコーディング配列が別の蛋白に結合する蛋白をコードする場合(例えばPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404が受容体である場合)は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは結合の相互作用に関与する他の蛋白又は分子を同定するための試験において使用できる。そのような方法により、受容体/リガンド結合相互作用の抑制を同定できる。そのような結合相互作用に関与する蛋白はまた、結合相互作用のペプチド又は小分子の阻害剤又はアゴニストを得るためのスクリーニングにおいて使用できる。又、受容体PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404は相関するリガンドを単離するために使用できる。スクリーニング試験はネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対する受容体の生物学的活性を模倣する鉛化合物を発見するために設計できる。そのようなスクリーニング試験は化学物質ライブラリの高スループットのスクリーニングに適した試験を包含し、小分子薬剤候補の同定の為に特に適するものとなっている。意図される小分子は合成の有機又は無機の化合物を包含する。試験は種々のフォーマット、例えば蛋白−蛋白結合試験、生化学的スクリーニング試験、免疫試験及び細胞系試験において実施でき、これ等は当該分野で良く特徴付けられている。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする核酸又はその修飾された形態はまた、治療上有用な試薬の開発及びスクリーニングにおいて有用となるトランスジェニック動物又は「ノックアウト」動物のいずれかを作成するためにも使用できる。トランスジェニック動物(例えばマウス又はラット)はトランスジーンを含有する細胞を有する動物であり、そのトランスジーンは出生前、例えば胚の段階において動物又は動物の先祖に導入されている。トランスジーンはトランスジェニック動物の発生の元となる細胞のゲノム内に組み込まれるDNAである。本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAを発現する細胞を含有するトランスジェニック動物を形成するために使用される確立された手法及びゲノム配列に従ってPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするcDNAを提供する。当該分野で知られた何れかの手法を用いて標的遺伝子トランスジーンを動物に導入することによりトランスジェニック動物の始祖体を作成してよい。そのような手法は限定しないが前核マイクロインジェクション(米国特許第4,873,191号、第4,736,866号及び第4,870,009号);生殖細胞系統へのレトロウィルス媒介遺伝子導入(Van der Putten,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,82:6148−6152(1985));胚性幹細胞における遺伝子ターゲティング(Thompson,et al.,Cell,56:313−321(1989));遺伝子トラップベクターを用いた非特異的挿入不活性化(米国特許第6,436,707号);胚のエレクトロポレーション(Lo,Mol.Cell.Biol.3:1803−1814(1983));及び精子媒介遺伝子導入(Lavitrano,et al.,Cell,57:717−723(1989);等を包含する。典型的には、特定の細胞は組織特異的エンハンサーを用いてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404トランスジーン取り込みの為にターゲティングされる。胚の段階において動物の生殖細胞系統に導入されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするトランスジーンのコピーを包含するトランスジェニック動物は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAの増大した発現の作用を調べるために使用できる。そのような動物は、例えば過剰発現に関連する病的状態からの保護を付与すると考えられる試薬





を得るための供試動物として使用できる。本発明のこの側面によれば、試薬を動物に投与し、そして病的状態の発生率がトランスジーンを担持する未投与の動物と比較して低減していれば、病的状態に対する潜在的治療介入があったことを示す。或いは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする内因性遺伝子と動物の胚性幹細胞内に導入されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする改変されたゲノムDNAとの間の相同組み換えの結果としてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404蛋白をコードする欠損又は改変された遺伝子を有するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404「ノックアウト」動物を構築するためにPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの非ヒト相同体を用いルことができる。好ましくは、ノックアウト動物は哺乳類である。より好ましくは、哺乳類はげっ歯類、例えばラット又はマウスである。例えば、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするcDNAは確立された手法に従ってPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするゲノムDNAの一部分は、欠失させるか、又は、他の遺伝子、例





えば組み込みをモニタリングするために使用できる選択可能なマーカーをコードする遺伝子と置き換えることができる。典型的には、未改変フランキングDNA(5’及び3’末端の両方)の数キロ塩基をベクター内に含める[相同組み換えベクターの説明については例えばThomas and Capecchi,Cell,51:503(1987)参照]。ベクターは胚性幹細胞系統内に導入(例えばエレクトロポレーションによる)し、そして導入されたDNAが内因性DNAと相同組み換えを起こしている細胞を選択する[例えばLi et al.,Cell,69:915(1992)参照]。次に選択された細胞を動物(例えばマウス又はラット)の胚盤胞内に注入し、凝集キメラを形成する[例えばBradley,Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells:A Practical Approach,E.J.Robertson,ed.(IRL,Oxford,1987)pp.113−152参照]。次にキメラ胚を適当な擬似妊娠雌性里親動物内に移植し、胚を妊娠期間満了させ、「ノックアウト」動物を作成することができる。相同組み換えされたDNAをその生殖細胞に保有する子孫を標準的な手法で同定し、動物の全細胞が相同組み換えDNAを含有する動物を育種するために使用することができる。ノックアウト動物は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の非存在に起因する、特定の病的状態に対するそれらの防御能力に関して、そして、病的状態のそれらの発症に関して、特徴付けることができる。
更に又、ノックアウトマウスは遺伝子の機能及び薬剤標的に関する薬学的利用性の発見において、並びに、所定の標的に関連する潜在的な標的上の副作用の測定において、高度な情報源となる。遺伝子の機能及び生理学的特徴はマウスとヒトとの間で十分保存されているが、その理由はそれらが共に哺乳類であり、同様の数の遺伝子を含有しており、それらが種間で高度に保存されているためである。例えばマウス染色体16上の遺伝子の98%がヒトオーソログを有することが最近十分に裏付けられた(Mural et al.,Science 296:1661−71(2002))。
肺性幹(ES)細胞における遺伝子ターゲティングはヒト疾患に関連する多くの遺伝子におけるヌル突然変異を有するマウスの構築を可能にしているが、遺伝子疾患の全てがヌル突然変異に起因するわけではない。マウスの遺伝子座を破壊し、突然変異を有するヒト対応物を導入する遺伝子の置き換え(ノックイン)のための方法を確立することによりヒト疾患の価値あるマウスモデルを設計できる。その後、ヒト蛋白をターゲティングするインビボの薬剤試験を実施できる(Kitamoto et al.,Biochemical and Biophysical Res.Commun.,222:742−47(1996))。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする核酸は又遺伝子療法において使用してよい。遺伝子療法用途においては、例えば欠損遺伝子の置き換えの為に治療上有効な遺伝子産物のインビボ合成を達成するために細胞内に遺伝子を導入する。「遺伝子療法」とは単回の投与により持続する作用が達成される従来の遺伝子療法及び治療上有効なDNA又はmRNAの一回又は反復投与を行う遺伝子治療薬の投与の両方を包含する。アンチセンスRNA及びDNAはインビボで特定の遺伝子の発現をブロックするための治療薬として使用できる。短いアンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞内に移入されてそこで細胞膜によるその限定された取り込みにより生じるその低値の細胞内濃度にも関わらず阻害剤として作用することができることが既に明らかになっている(Zamecnik et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA83:4143−4146[1986])。オリゴヌクレオチドは例えばその負荷電ホスホジエステル基を未荷電の基で置換することにより、その取り込みが増強されるように修飾できる。
生存細胞に核酸を導入するために使用できる種々の手法が存在する。手法は核酸を培養細胞中にインビトロで、又は意図する宿主の細胞内にインビボで転移させるかにより、変動する。インビトロの哺乳類細胞への核酸の転移に適する手法はリポソームの使用、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、細胞融合、DEAEデキストラン、リン酸カルシウム沈降法等を包含する。現時点で好ましいインビボの遺伝子導入の手法はウィルス(典型的にはレトロウィルス)ベクターによるトランスフェクション及びウィルス外皮蛋白−リポソーム媒介トランスフェクションを包含する(Dzau et al.,Trends in Biotechnoilogy 11,205−210[1993])。一部の状況においては、核酸原料に対し、標的細胞をターゲティングする薬剤、例えば細胞表面膜蛋白又は標的細胞に対して特異的な抗体、標的細胞上の受容体に対するリガンド等を提供することが望ましい。リポソームを使用する場合は、エンドサイトーシスに関連する細胞表面膜蛋白に結合する蛋白をターゲティングのため及び/又は取り込みを促進するために使用してよく、そのようなものとしては例えば特定の細胞型に対して向性のキャプシド蛋白又はそのフラグメント、サイクリングにおいて内在化を起こす蛋白に対する抗体、細胞内局在化をターゲティングして細胞内半減期を増大させる蛋白が挙げられる。受容体媒介エンドサイトーシスの手法は例えばWu et al.,J.Biol.Chem.262,4429−4432(1987);及びWagner et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA87,3410−3414(1990)に記載されている。遺伝子の作成及び遺伝子療法のプロトコルについての考察は、Anderson et al.,Science256,808−813(1992)を参照のこと。
本明細書に記載したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドはまた蛋白電気泳動目的のための分子量マーカーとして使用してよく、そして、単離された核酸配列はこれ等のマーカーを組み換え発現するために使用してよい。
本明細書に記載したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド又はそのフラグメントをコードする核酸分子は染色体の同定の為に有用である。この点に関し、実際の配列データに基づいた染色体マーカー試薬で現在使用できるものは比較的少ないため、新しい染色体マーカーを同定する必要性がなお存在している。本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸分子各々は染色体マーカーとして使用できる。
本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド及び核酸分子はまた、本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドが他のものと比較してある組織において、好ましくは同じ組織型の正常組織と比較して疾患組織において、示差的に発現される場合に、組織タイピングの為に診断的に使用してよい。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸分子はPCR、ノーザン分析、サザン分析及びウエスタン分析のためのプローブの形成の為に使用される。
本明細書に記載したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは又治療薬として使用してよい。本発明のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは薬学的に有用な組成物を製造するための既知の方法に従って製剤することができ、これによりそのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404製品は製薬上許容しうる担体ベヒクルとの混合物中に組み合わせられる。治療用製剤は、凍結乾燥製剤又は水溶液の形態において、任意の生理学的に許容される担体、賦形剤又は安定化剤(Remington’s Pharmaceutical Science 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))と共に所望の純度を有する活性成分を混合することにより保存用に製造される。許容される担体、賦形剤又は安定化剤は使用される用量及び濃度においてレシピエントにとって非毒性であり、そして、緩衝物質、例えばリン酸塩、クエン酸塩及び他の有機酸;抗酸化剤、例えばアスコルビン酸;低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;蛋白、例えば血清アルブミン、ゼラチン又は免疫グロブリン;親水性重合体、例えばポリビニルピロリドン、アミノ酸、例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン又はリジン;単糖類、2糖類及び他の炭水化物、例えばグルコース、マンノース又はデキストロース;キレート形成剤、例えばEDTA;糖アルコール、例えばマンニトール又はソルビトール;塩形成対イオン、例えばナトリウム;及び/又はノニオン性界面活性剤、例えばTWEENTM、PLURONICSTM又はPEGを包含する。
インビボ投与の為に使用される製剤は滅菌されていなければならない。これは凍結乾燥及び再構成の前後に滅菌濾過膜を通して濾過することにより容易に達成される。
本明細書においては治療用組成物は一般的に滅菌取出し口を有する容器、例えば皮下注射用の針で穿刺可能である蓋を有する静脈用溶液バッグ又はバイアル内に投入する。
投与経路は既知の方法によるものであり、例えば静脈内、腹腔内、脳内、筋肉内、眼内、動脈内又は患部内の経路により注射又は注入を行うか、局所投与を行うか、又は、除放性の系による。
本発明の医薬組成物の用量及び所望の薬剤濃度は意図される特定の使用に応じて変動する。適切な用量又は投与経路の決定は通常の医師の技量の範囲内で十分に行える。動物実験はヒトの治療のための有効な用量の決定のための信頼できる指針を与える。有効用量の種間のスケーリングはMordenti,J.and Chappell,W.“The use of interspecies scaling in toxicokinetics”,Toxicokinetics and New Drug Development,Yacobi et al.,Eds.,Pergamon Press,New York 1989,pp.42−96に記載されている原則に従って実施できる。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド又はそのアゴニスト又はアンタゴニストのインビボ投与を用いる場合は、通常の用量は投与経路に応じて一日当たり約10ng/kg〜100mg/kg哺乳類体重以上、好ましくは約1μg/kg/日〜10mg/kg/日であってよい。特定の用量及び送達方法に関する指針は文献に記載されており;例えば米国特許第4,657,760号;第5,206,344号;又は第5,225,212号に記載されている。異なる治療用化合物及び異なる障害に対しては異なる製剤が有効であることが予想され、ある臓器又は組織をターゲティングする投与は、例えば別の臓器又は組織の場合とは異なる態様の送達を必要とする場合がある。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの投与を必要とする何れかの疾患又は障害の治療の為に適する放出特性を有する製剤においてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの除放性投与が望まれる場合は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのマイクロカプセル化が意図される。除放性放出のための組み換え蛋白のマイクロカプセル化はヒト成長ホルモン(rhGH)、インターフェロン(rhIFN)、インターロイキン−2及びMNrgp120を用いて良好に行われている。Johnson et al.,Nat.Med.,2:795−799(1996);Yasuda,Biomed.Ther.,27:1221−1223(1993);Hora et al.,Bio/Technology,8:755−758(1990);Cleland,“Design and Production of Single Immunization Vaccines Using Polylactide Polyglycolide Microsphere Systems”, Vaccine Design:The Subunit and Adjuvant Approach, Powell and Newman, eds,(Plenum Press:New York,1995),pp.439−462;WO97/03692,WO96/40072,WO96/07399;及び米国特許第5,654,010号。
これ等の蛋白の除放性製剤は生体適合性及び広範な生体分解性を有することからポリ乳酸グリコール酸(PLGA)重合体を用いて開発されている。PLGAの分解生成物である乳酸及びグリコール酸はヒト身体内で迅速に浄化される。更に又、この重合体の分解性はその分子量及び組成に応じて数ヶ月〜数年に調節できる。Lewis,“Controlled release of bioactive agents from lactide/glycolide polymer”,M.Chasin and R.Langer(Eds.),Biodegradable Polymers as Drug Delivery Systems(Marcel Dekker:New York,1990),pp.1−41。
本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを模倣(アゴニスト)又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの作用を予防(アンタゴニスト)するものを同定するための化合物のスクリーニング方法を包含する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを模倣するアゴニストはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を自身のゲノムが含んでいる非ヒトトランスジェニック動物による所見に基づいて陰性表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの作用を予防するアンタゴニストは非ヒトトランスジェニックノックアウト動物による観察に基づいて陽性表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。アンタゴニスト薬剤候補を得るためのスクリーニング試験は、本明細書において同定される遺伝子によりコードされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと結合又は複合体形成するか、又は、他の態様においてコードされたポリペプチドの他の細胞蛋白との相互作用を妨害する化合物を同定するために設計される。そのようなスクリーニング試験は化学物質ライブラリの高スループットのスクリーニングに適した試験を包含し、小分子薬剤候補の同定の為に特に適するものとなっている。
試験は種々のフォーマット、例えば蛋白−蛋白結合試験、生化学的スクリーニング試験、免疫試験及び細胞系試験において実施でき、これ等は当該分野で良く特徴付けられている。
アンタゴニストに関する全試験は、それらが、薬剤候補を本発明において同定される核酸によりコードされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと、これら2成分が相互作用できるような条件下において十分な時間に渡り、接触させることを要する点において、共通である。
結合試験においては、相互作用は結合であり、そして形成される複合体を単離するか、又は反応混合物中で検出することができる。本発明において同定される遺伝子によりコードされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド又は薬剤候補を固相上、例えばマイクロタイタープレート上に、共有結合又は非共有結合により固定化する。非共有結合は一般的にPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの溶液で固対表面をコーティングし、そして乾燥することにより達成される。或いは、固定化すべきPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに特異的な固定化抗体、例えばモノクローナル抗体を用いて固体表面にそれをアンカリングすることができる。試験は検出可能な標識で標識されていてよい非固定化成分を固定化成分、例えばアンカリングされた成分を含有するコーティングされた表面に添加することにより行う。反応終了後、非反応成分を例えば洗浄により除去し、そして固体表面にアンカリングした複合体を検出する。元来非固定化の成分が検出可能な標識を担持する場合は、表面に固定化された標識の検出は複合体形成が起こったことを示す。元来非固定化の成分が標識を担持していない場合は、複合体形成は、例えば固定化された複合体に特異的に結合する標識された抗体を使用することにより検出できる。
候補化合物が本発明において同定される遺伝子によりコードされる特定のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと相互作用するが結合しない場合、そのポリペプチドとの相互作用は蛋白−蛋白相互作用を検出するためのよく知られた方法により試験することができる。そのような試験は伝統的な方法、例えば交差結合、同時免疫沈降及び勾配又はクロマトグラフィーカラムを介した同時精製を包含する。更に又、蛋白−蛋白相互作用はChevray and Nathans,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:5789−5793(1991)により開示されている通り、Fields等により記載された酵母系の遺伝子系(Fields and Song、Nature(London),340:245−246(1989);Chien et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:9578−9582(1991))を用いてモニタリングできる。多くの転写活性化物質、例えば酵母GAL4は、2つの物理的に個別のモジュラードメイン、即ち1つはDNA結合ドメインに対して作用するもの、もう1つは転写活性化ドメインとして機能するものよりなる。上記文献に記載された酵母発現系(一般的に「ツーハイブリッド系」と称される)はこの性質を利用しており、そして、2つのハイブリッド蛋白を使用し、その1つにおいては標的蛋白がGAL4のDNA結合ドメインに融合しており、もう1つにおいては候補の活性化蛋白が活性化ドメインに融合している。GAL4活性化プロモーターの制御下のGAL1−lacZレポーター遺伝子の発現は蛋白−蛋白相互作用を介したGAL4活性の再構成に依存している。相互作用ポリペプチドを含有するコロニーはβ−ガラクトシダーゼに対する発色基質を用いて検出する。ツーハイブリッド手法を用いて2つの特定の蛋白の間の蛋白−蛋白相互作用を同定するための完全なキット(MATCHMAKERTM)はClontechから市販されている。この系はまた特定の蛋白相互作用に関与する蛋白ドメインをマッピングするため、並びに、これ等の相互作用に必須であるアミノ酸残基を限定するためにも応用できる。
本発明において同定されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子と他の細胞内又は細胞外の成分との相互作用を妨害する化合物の試験は以下の通り行い、即ち、通常は遺伝子産物と細胞内又は細部外成分を含有する反応混合物を、2生成物の相互作用と結合を可能にする条件下及び時間に渡り調製する。候補化合物が結合を抑制する能力を試験するためには反応を被験化合物の非存在下及び存在下において実施する。更に、プラセボを第3の反応混合物に添加し、陽性対照として使用する。被験化合物と混合物中に存在する細胞内又は細胞外成分の間の結合(複合体形成)は上記した通りモニタリングする。対照反応においては複合体が形成されるが被験化合物を含有する反応混合物では形成しないことは、被験化合物が被験化合物とその反応相手の相互作用を妨害することを示す。
アンタゴニストを試験するためには、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを特定の活性に関してスクリーニングすべき化合物と共に細胞に添加し、そして、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの存在下における目的の活性を抑制する化合物の能力は、その化合物がPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対するアンタゴニストであることを示している。或いは、アンタゴニストはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと膜結合PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド受容体又は組み換え受容体に対する潜在的アンタゴニストを競合的阻害試験のための適切な条件下に組み合わせることにより検出してよい。受容体に結合しているPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド分子の数を用いて潜在的アンタゴニストの有効性を測定することができるように、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを例えば放射能により標識することができる。受容体をコードする遺伝子は、当業者の知る多くの方法、例えばリガンドパニング及びFACSソーティングにより同定できる。Coligan et al.,Current Protocols in Immun.,1(2):Chapter5(1991)。好ましくは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399ま





たはPRO4404ポリペプチドに応答する細胞からポリアデニル化RNAを調製し、そしてこのRNAから作成したcDNAライブラリを幾つかのプールに分割し、COS細胞又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに応答しない他の細胞をトランスフェクトするために使用する発現クローニングが使用される。スライドガラス上に生育したトランスフェクトした細胞を標識されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに曝露する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドはヨウ素化又は部位特異的蛋白キナーゼに対する認識部位を含ませることを包含する種々の手段により標識できる。固定化及びインキュベーションの後、スライドをオートラジオグラフ分析に付す。陽性のプールを同定し、サブプールを作成し、相互作用的なサブプール化及び再スクリーニングの過程を用いながら再トランスフェクトし、最終的に推定受容体をコードする単一のクローンを得る。
受容体の同定のための代替法として、標識されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを受容体分子を発現する細胞膜又は抽出調製物に光親和性連結させることができる。交差結合した物質をPAGEで分割し、X線フィルムに曝露する。受容体を含有する標識された複合体を切り出し、ペプチドフラグメントに分割し、そして蛋白マイクロ配列決定に付すことができる。マイクロ配列決定から得られたアミノ酸配列を用いて、cDNAライブラリをスクリーニングするための変性オリゴヌクレオチドプローブのセットを設計することにより、推定受容体をコードする遺伝子を同定する。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対するアンタゴニストの作用を試験する際の別の方法はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404アンタゴニストを野生型マウスに投与することにより既知のノックアウト表現型を模倣することである。即ち、先ず目的のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子をノックアウトし、そしてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子のノックアウト又は破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、野生型マウスにPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対するアンタゴニストを投与することによりPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対するアンタゴニストの有効性を試験することができる。有効なアンタゴニストはノックアウト動物で最初に観察された表現型の作用を模倣すると予測される。
同様に、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニストの作用は、既知陰性ノックアウト表現型を軽減するために非ヒトトランスジェニックマウスにPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404アゴニストを投与することにより試験することができる。即ち、先ず目的のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子をノックアウトし、そしてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子のノックアウト又は破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、非ヒトトランスジェニックマウスにPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニストを投与することによりPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニストの有効性を試験することができる。有効なアゴニストはノックアウト動物で最初に観察された陰性の表現型の作用を軽減すると予測される。
アンタゴニストに関する別の試験では、受容体を発現する哺乳類細胞又は膜の調製品を候補化合物の存在下に標識PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと共にインキュベートする。次にこの相互作用を増強又はブロックする化合物の能力を測定する。
潜在的アンタゴニストのより特定の例は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドとの免疫グロブリンの融合物に結合するオリゴヌクレオチド、そして特に、抗体、例えば限定しないが、ポリ及びモノクローナル抗体及び抗体フラグメント、一本鎖抗体、抗イデオタイプ抗体、及び、そのような抗体又はフラグメントのキメラ又はヒト化型、並びにヒト抗体及び抗体フラグメントを包含する。或いは潜在的アンタゴニストは緊密に関連する蛋白、例えば受容体を認識するが作用をもたらさないため、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの作用を競合的に阻害するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの突然変異した形態であってよい。
別の潜在的PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドアンタゴニストは、例えばアンチセンスRNA又はDNA分子が標的mRNAにハイブリダイズし、蛋白翻訳を予防することによりmRNAの翻訳を直接ブロックする作用を示す、アンチセンス技術を用いて製造されたアンチセンスRNA又はDNA構築物である。アンチセンス技術は三重螺旋形成又はアンチセンスDNA又はRNAを介して遺伝子発現を制御するために使用でき、これ等の方法は両方ともDNA又はRNAへのポリヌクレオチドの結合に基づいている。例えば、本発明の成熟PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の5’コーディング部分を用いて約10〜40塩基対長のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計する。DNAオリゴヌクレオチドは転写に関与する遺伝子の領域に相補であるように設計(三重螺旋−Lee et al.,Nucl.Acids Res.,6:3073(1979);Cooney et al.,Science,241:456(1988);Dervan et al.,Science,251:1360(1991))することによりPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの転写及び生産を予防することができる。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドはインビボでmRNAにハイブリダイズし、そしてmRNA分子のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドへの翻訳をブロックする(アンチセンス−Okano,Neurochem.,56:560(1991);Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression(CRC Press:Boca Raton,FL,1988))。上記したオリゴヌクレオチドは、アンチセンスRNA又はDNAがインビボで発現され、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの生産を抑制するように、細胞に送達することもできる。アンチセンスDNAを使用する場合は、例えば標的遺伝子ヌクレオチド配列の約−10〜+10位の間の翻訳開始部位から誘導されたオリゴデオキシリボヌクレオチドが好ましい。
潜在的アンタゴニストはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの活性部位、受容体結合部位又は成長因子又は他の関連する結合部位に結合することによりPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの正常な生物学的活性をブロックする小分子を包含する。小分子の例は限定しないが小型のペプチド又はペプチド様分子、好ましくは可溶性ペプチド及び合成の非ペプチジル有機又は無機化合物を包含する。
リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素的RNA分子である。リボザイムは相補標的RNAへの配列特異的ハイブリダイズとその後のエンドヌクレアーゼ的切断により作用する。潜在的RNA標的内の特異的リボザイム切断部位は既知の手法により同定できる。更に詳細な説明については例えばRossi,Current Biology,4:469−471(1994)及びPCT公開WO97/33551(1997年9月18日公開)を参照のこと。
転写を抑制するために使用される三重螺旋形成における核酸分子は一本鎖でありデオキシヌクレオチドよりなるものでなければならない。これ等のオリゴヌクレオチドの塩基の組成は、Hoogsteenの塩基対形成の規則を介して三重螺旋形成を促進するように設計され、それには一般的に二重らせんの一方の鎖の上にプリン又はピリミジンのかなりの大きさのストレッチが必要である。更に詳細な説明は上出のPCT公開WO97/33551を参照のこと。
これ等の小分子は上記したスクリーニング試験の何れかの1つ以上により、及び/又は、当業者に良く知られている他のスクリーニング手法により、同定することができる。
本明細書に開示した分子の診断及び治療上の使用はまた後に開示及び説明する正の機能の試験のヒットに基づいてもよい。
F.抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体
本発明は本発明において治療薬及び/又は診断薬として使用してよい抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を提供する。例示される抗体はポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性及びヘテロコンジュゲート抗体を包含する。
1.ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は好ましくは関連する抗原及びアジュバントの多数回の皮下(sc)又は腹腔内(ip)注射により動物中で形成させる。関連する抗原は(特に合成ペプチドを使用する場合)免疫化すべき種において免疫原となる蛋白にコンジュゲートすることが有用である。例えば抗原は二官能性又は誘導体形成性の物質、例えばマレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を介したコンジュゲーション)、N−ヒドロキシスクシンイミド(リジン残基を介する)、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、SOCl、又は、RN=C=NR(ただしR及びRは異なるアルキル基である)を用いて、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、血清アルブミン、ウシサイログロブリン又はダイズトリプシン阻害剤にコンジュゲートできる。
例えば100μg又は5μgの蛋白又はコンジュゲート(それぞれウサギ又はマウスの場合)を3容量のフロイント完全アジュバントと混合し、溶液を複数部位に皮内注射することにより、抗原、免疫原性コンジュゲート又は誘導体に対して動物を免疫化する。一ヵ月後、複数部位への皮下注射によりフロイント完全アジュバント中ペプチド又はコンジュゲートの元の量の1/5〜1/10を用いて動物をブーストする。7〜14日後、動物から採血し、血清の抗体力価を試験する。力価が平衡に達するまで動物をブーストする。コンジュゲートは蛋白融合物として組み換え細胞培養物中に作成することもできる。更に又、ミョウバンのような凝集剤を適宜使用して免疫応答を増強する。
2.モノクローナル抗体
モノクローナル抗体はKohler et al.,Nature,256:495(1975)によりはじめて記載されたハイブリドーマ法を用いて作成してよく、又は、組み換えDNA法(米国特許第4,816,567号)により作成してもよい。
ハイブリドーマ法においては、マウス又は他の適切な宿主動物、例えばハムスターを上記した通り免疫化することにより、免疫化に使用する蛋白に特異的に結合する抗体を生産する又は生産可能であるリンパ球を発生させる。或いはリンパ球はインビトロで免疫化してよい。免疫化の後、リンパ球を単離し、次に適当な融合剤、例えばポリエチレングリコールを用いてミエローマ細胞系統に融合することによりハイブリドーマ細胞を形成する(Goding,Monoclonal Antibodies,Principles and Practice,pp.59−103(Academic Press,1986))。
このように製造されたハイブリドーマ細胞を適当な培地中に播種して成育させるが、その培地は好ましくは未融合の親ミエローマ細胞(融合相手とも称する)の生育又は生存を抑制する物質1つ以上を含有するものである。例えば親ミエローマ細胞が酵素ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRT又はHPRT)を欠失している場合は、ハイブリドーマに対する選択培地は典型的にはヒポキサンチン、アミノプテリン及びチミジンを含み(HAT培地)、これらの物質はHGPRT欠損細胞の成育を予防する。
好ましい融合相手のミエローマ細胞は効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高水準生産を支援し、そして未融合親細胞に対抗して選択する選択培地に対して感受性であるものである。好ましいミエローマ細胞系統は、マウスミエローマ系統、例えばSalk Institute Cell Distribution Center,San Diego,California USAより入手可能なMOPC−21及びMPC−11マウス腫瘍より誘導されるもの、及び、American Type Culture Collection,Manassas,Virginia,USAより入手可能なSP−2及び誘導体、例えばX63−Ag8−653細胞である。ヒトミエローマ及びマウス−ヒトヘテロミエローマ細胞系統もまたヒトモノクローナル抗体の生産に関して記載されている(Kozbor,J.Immunol.,133:3001(1984);及びBrodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,pp.51−63(Marcel Dekker,Inc.New York,1987))。
ハイブリドーマ細胞を成育させる培地は抗原に対して指向されたモノクローナル抗体の生産に関して試験する。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により生産されるモノクローナル抗体の結合特異性は免疫沈降により、又は、インビトロの結合試験、例えばラジオイムノアッセイ(RIA)又は酵素結合免疫吸着試験(ELISA)により、測定する。
モノクローナル抗体の結合親和性は例えばMunson et al.,Anal.Biochem.,107:220(1980)に記載のスカッチャード分析により測定できる。
所望の特異性、親和性及び/又は活性の抗体を生産するハイブリドーマ細胞が同定された後、限界希釈法によりクローンをサブクローニングし、標準的な方法により生育させる(Goding,Monoclonal Antibodies,Principles and Practice,pp.59−103(Academic Press,1986))。この目的のための適当な培地は例えばD−MEM又はRPMI−1640培地を包含する。更に又、ハイブリドーマ細胞は例えばマウスへの細胞の腹腔内注射により、動物における腹水腫瘍としてインビボで生育させてよい。
サブクローンにより分泌されたモノクローナル抗体は従来の抗体精製操作法、例えばアフィニティークロマトグラフィー(例えばプロテインA又はプロテインG−セファロースを使用)又はイオン交換クロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析等により、培地、腹水又は血清から適宜分離する。
モノクローナル抗体をコードするDNAは従来の操作法を用いて(例えばマウス抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより)容易に単離及び配列決定される。ハイブリドーマ細胞はそのようなDNAの好ましい原料となる。単離後、DNAを発現ベクター内に入れ、これを次に他の態様では抗体蛋白を生産しないE・コリ細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞又はミエローマ細胞のような宿主細胞にトランスフェクトすることにより組み換え宿主細胞内でモノクローナル抗体の合成を行う。抗体をコードするDNAの細菌における組み換え発現に関する考察はSkerra et al.,Curr.Opinion in Immunol.,5:256−262(1993)及びPluckthun,Immunol.Revs.130:151−188(1992)を包含する。
モノクローナル抗体又は抗体フラグメントはMcCafferty et al.,Nature 348:552−554(1990)に記載の手法を用いて作成した抗体ファージライブラリから単離できる。Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)及びMarks et al.,J.Mol.Biol.,222:581−597(1991)はファージライブラリを用いたそれぞれマウス及びヒトの抗体の単離を記載している。その後の出版物は鎖シャフリングによる高親和性(nM範囲)のヒト抗体の生産(Marks et al.,Bio/Technology,10:779−783(1992))並びに極めて大型のファージライブラリを構築するための方策としてのコンビナトリアル感染及びインビボ組み換え(Waterhouse et al.,Nuc.Acids.Res.,21:2265−2266(1993))を記載している。即ち、これ等の手法はモノクローナル抗体の単離のための伝統的なモノクローナル抗体ハイブリドーマ手法の実行可能な代替法である。
抗体をコードするDNAは例えば相同マウス配列に対してヒト重鎖及び軽鎖定常ドメイン(C及びC)配列を置換することにより(米国特許第4,816,567号;及びMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851(1984))、又は、非免疫グロブリンポリペプチド(非相同ポリペプチド)に対するコーディング配列の全て又は部分に免疫グロブリンコーディング配列を融合することにより、キメラ又は融合抗体のポリペプチドが生産されるように修飾してよい。非免疫グロブリンポリペプチド配列は抗体の定常ドメインに対して置換するか、又は、それらは抗体の1つの抗原複合化部位の可変ドメインに対して置換することにより、抗原に対する特異性を有する1つの抗原複合化部位及び異なる抗原に対する特異性を有する別の抗原複合化部位を含むキメラ2価抗体を生成する。
3.ヒト及びヒト化抗体
本発明の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は更にヒト化抗体又はヒト抗体を含み得る。非ヒト(例えばマウス)抗体のヒト化型は非ヒト免疫グロブリンから誘導された最小配列を含有するキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖又はそのフラグメント(例えばFv、Fab、Fab’、F(ab’)又は抗体の他の抗原結合サブ配列)である。ヒト化抗体はヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)を包含し、これにおいては、レシピエントの相補性決定領域(CDR)に由来する残基が所望の特異性、親和性及び能力を有するマウス、ラット又はウサギのような非ヒト種(ドナー抗体)のCDRに由来する残基で置き換えられている。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基が相当する非ヒト残基により置き換えられている。ヒト化抗体は又レシピエント抗体及び移入されたCDR又はフレームワーク配列の何れにも存在しない残基を含んでよい。一般的に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、そして典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み、これにおいてはCDR領域の全て又は実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに相当し、そしてFR領域の全て又は実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである。ヒト化抗体は場合により更に免疫グロブリン定常領域の少なくとも一部分(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンのものを含む[Jones et al.,Nature,321:522−525(1986);Riechmann et al.,Nature,332:323−329(1988);及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.,2:593−596(1992)]。
非ヒト抗体をヒト化するための方法は当該分野で良く知られている。一般的にヒト化抗体は非ヒトである原料からそれに導入されたアミノ酸残基1つ以上を有する。これ等の非ヒトアミノ酸残基はしばしば「移入」残基と称され、これ等は典型的には「移入」可変ドメインに由来する。ヒト化は本質的にはげっ歯類のCDR又はCDR配列とヒト抗体の相当する配列を置換することにより、Winter等の方法に従って実施することができる(Jones et al.Nature321:522−525(1986);Riechmann et al.Nature 332:323−327(1988);Verhoeyen et al.Science 239:1534−1536(1988))に従って実施することができる。従ってそのような「ヒト化」抗体は、未損傷のヒト可変ドメインより実質的に少ない部分が非ヒト種の相当する配列により置換されているキメラ抗体(米国特許第4,816,567号)である。実際、ヒト化抗体は典型的には、一部のCDR残基及び恐らくは一部のFR残基がげっ歯類抗体における類似の部位に由来する残基により置換されているヒト抗体である。
ヒト化抗体の作成において使用すべき軽鎖及び重鎖の両方のヒト可変ドメインの選択は抗原性及び抗体がヒトの治療上の使用を意図している場合はHAMA応答(ヒト抗マウス抗体)を低減するために極めて重要である。いわゆる「ベストフィット」法に従えば、げっ歯類抗体の可変ドメインの配列を既知のヒト可変ドメイン配列の全ライブラリに対してスクリーニングする。げっ歯類のものに最も近似しているヒトVドメイン配列を同定し、そして、その内部にあるヒトフレームワーク領域(FR)をヒト化抗体として許容する(Sims et al.J.Immunol.151:2296(1993);Chothia et al.J.Mol.Biol.196:901(1987))。別の方法は軽鎖又は重鎖の特定のサブグループの全ヒト抗体のコンセンサス配列から誘導した特定のフレームワーク領域を使用する。同じフレームワークを数種の異なるヒト化抗体に対して使用してよい(Carter et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);Presta et al.J.Imunol.,151:2623(1993))。
抗原に対する高い結合親和性及び他の望ましい生物学的特性を保持しながら抗体をヒト化させることが更に重要である。この目標を達成するためには、好ましい方法によれば、親配列及び種々の概念的ヒト化産物の分析の過程により、親及びヒト化配列の三次元モデルを用いながら、ヒト化抗体を製造する。三次元の免疫グロブリンモデルは一般に入手可能であり、当業者のよく知るものである。選択された候補免疫グロブリン配列の推定三次元コンホーメーション構造を説明してディスプレイするコンピュータプログラムが使用できる。これらのディスプレイを精査することにより、候補免疫グロブリン配列の機能における残基の推定される役割の分析、即ち候補免疫グロブリンがその抗原に結合する能力に影響する残基の分析が可能になる。このようにして、FR残基を選択肢、レシピエント及びインポート配列から、標的抗原に対する増大した親和性のような所望の抗体特性が達成されるように組み合わせることができる。一般的に超可変領域残基は、抗原結合への影響においては直接、そして最も大きく関与している。
種々の形態のヒト化抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体が意図される。例えばヒト化抗体は抗体フラグメント、例えばFabであってよく、これは場合によりイムノコンジュゲートを形成するために細胞毒性剤1つ以上にコンジュゲートされる。或いは、ヒト化抗体は未損傷の抗体、例えば未損傷のIgG1抗体であってよい。
ヒト化の代替として、ヒト抗体を形成することができる。例えば免疫化により内因性免疫グロブリン生産の非存在下においてヒト抗体の完全なレパートリーを作成することができるトランスジェニック動物(例えばマウス)を作成することが現在可能である。例えばキメラ及び生殖細胞系統の突然変異体マウスにおける抗体重鎖連関領域(J)遺伝子のホモ接合性の欠失が内因性抗体生産の完全な抑制をもたらすことが報告されている。ヒト生殖細胞系統免疫グロブリン遺伝子アレイのそのような生殖細胞系統突然変異体マウスへの転移は抗原攻撃時のヒト抗体の生産をもたらすことになる。例えばJakobovits et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:2551(1993);Jakobovits et al.,Nature,362:255−258(1993);Bruggemann et al.,Year in Immuno.7:33(1993);米国特許第5,545,806号、第5,569,825号、第5,591,669号(全てGenPharm);第5,545,807号;及びWO97/17852を参照のこと。
或いは、ファージディスプレイ技術(McCafferty et al.,Nature 348:552−553[1990])を用いることにより未免疫化ドナー由来の免疫グロブリン可変(V)ドメイン遺伝子レパートリーからヒト抗体及び抗体フラグメントをインビトロで製造することができる。この手法によれば、抗体Vドメイン遺伝子を糸状バクテリオファージ、例えばM13又はfdの主要な又は副次的な外皮蛋白遺伝子の何れかにインフレームにクローニングし、ファージ粒子の表面上の機能的抗体フラグメントとしてディスプレイさせる。糸状粒子はファージゲノムの一本鎖DNAコピーを含有しているため、抗体の機能的特性に基づいた選択もまたこれ等の特性を示す抗体をコードする遺伝子の選択をもたらす。即ち、ファージはB細胞の特性の一部を模倣する。ファージディスプレイは例えばJohnson,Kevin S. and Chiswell,David J.,Current Opinion in Structural Biology, 3:564−571(1993)において考察されている種々のフォーマットで実施できる。V遺伝子セグメントの幾つかの原料をファージディスプレイの為に使用できる。Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)は免疫化マウスの脾臓から誘導されたV遺伝子の小型の無作為のコンビナトリアルなライブラリから抗オキサゾロン抗体の多様なアレイを単離している。本質的にMarks et al.,J.Mol.Biol.222:581−597(1991)又はGriffith et al.,EMBOJ,12:725−734(1993)により記載された手法に従って、未免疫化ヒトドナーのV遺伝子のレパートリーを構築することができ、そして抗原の多様なアレイ(自己抗原を包含)に対する抗体を単離することができる。米国特許第5,565,332号及び第5,573,905号も参照のこと。
上記した通り、ヒト抗体は又、インビトロの活性化B細胞により形成してもよい(米国特許第5,567,610号及び第5,229,275号参照)。
4.抗体フラグメント
特定の状況において、全抗体よりも抗体フラグメントを使用するほうが有利である。より小さいサイズのフラグメントは急速なクリアランスを可能にし、そして固形腫瘍への向上した接触をもたらすと考えられる。
抗体フラグメントの製造のためには種々の手法が開発されている。伝統的には、これ等のフラグメントは未損傷の抗体の蛋白分解的消化を介して誘導されている(例えばMorimoto et al.,Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107−117(1192);及びBrennan et al.,Science,229:81(1985)参照)。しかしながら、これ等のフラグメントは現在組み換え宿主細胞により直接製造することができる。Fab、Fv及びScFv抗体フラグメントは全てE・コリにおいて発現させ、これより分泌させることができ、これにより、これ等のフラグメントの大量を効率的に生産できる。抗体フラグメントは上記した抗体ファージライブラリから単離できる。或いは、Fab’−SHフラグメントを直接E・コリから回収し、化学的にカップリングしてF(ab’)フラグメントを形成することができる(Carter et al.,Bio/Technology 10:163−167(1992)。別の方法によれば、F(ab’)フラグメントは組み換え宿主細胞培養物から直接単離できる。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含むインビボ半減期の延長されたFab及びF(ab’)フラグメントは米国特許第5,869,046号に記載されている。抗体フラグメントの生産のための他の手法は当業者の知る通りである。選択された抗体は一重鎖Fvフラグメント(scFv)である。WO93/16185;米国特許第5,571,894号;及び米国特許第5,587,458号を参照のこと。Fv及びsFvは定常領域を欠いた未損傷の複合化部位を有する限定的種であり;即ち、それらはインビボ使用時の低下した非特異的結合の為に適している。sFv融合蛋白を構築することによりsFvのアミノ又はカルボキシ末端の何れかにエフェクター蛋白を融合させてよい。Antibody Engineering,ed.Borrebaeck,上出を参照のこと。抗体フラグメントは又例えば米国特許第5,641,870号に記載の「線状抗体」であってもよい。そのような線状抗体フラグメントは単一特異性又は二重特異性であってよい。
5.二重特異性抗体
二重特異性抗体は少なくとも2つの異なるエピトープに対して結合特異性を有する抗体である。例示される二重特異性抗体は本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404蛋白の2つの異なるエピトープに結合してよい。他のそのような抗体はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の結合部位を他の蛋白に対する結合部位と組み合わせてよい。或いは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404アームを白血球上のトリガリング分子、例えばT細胞受容体分子(例えばCD3)又はIgGに対するFc受容体(FcγR)、例えばFcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)及びFcγRIII(CD16)に結合するアームと組み合わせることにより、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404発現細胞に対して細胞防御機序を集中及び局在化させてよい。二重特異性抗体はまたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する細胞に細胞毒性剤を局在化させるために使用してよい。これ等の抗体はPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−結合アーム及び細胞毒性剤(例えばサポリン、抗インターフェロン−α、ビンカアルカロイド、リシンA鎖、メトトレキセート又は放射性同位体ハプテン)に結合するアームを保有している。二重特異性抗体は完全長抗体又は抗体フラグメント(例えばF(ab’)二重特異性抗体)として製造できる。
WO96/16673は二重特異性抗ErbB2/抗−FcγRIII抗体を記載しており、そして米国特許第5,837,234号は二重特異性抗ErbB2/抗−FcγRI抗体を開示している。二重特異性抗ErbB2/Fcα抗体はWO98/02463に示されている。米国特許第5,821,377号は二重特異性抗ErbB2/抗−CD3抗体を教示している。
二重特異性抗体を作成するための方法は当該分野で知られている。完全長に重篤異性抗体の伝統的製造は2つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の同時発現に基づいており、その場合、2つの鎖は異なる特異性を有する(Millstein et al.,Nature 305:537−539(1983))。免疫グロブリン重鎖及び軽鎖の無作為の取合せのため、これ等のハイブリドーマ(クアドローマ)は10種の異なる抗体分子の潜在的混合物を生成し、そのうち僅か1種のみが正しい二重特異性構造を有する。通常はアフィニティークロマトグラフィー工程により行われる正しい分子の精製は面倒であり、そして生成物収率は低値である。同様の操作法がWO93/08829及びTraunecker et al.,EMBOJ,10:3655−3659(1991)に開示されている。
異なる方法によれば、所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン(抗体−抗原複合化部位)を免疫グロブリンの定常ドメイン配列に融合させる。好ましくは、融合は少なくとも一部のヒンジ、C2及びC3領域を含むIg重鎖定常ドメインと行う。融合の少なくとも1つにおいて存在する軽鎖結合に必要な部位を含有する第1の重鎖定常領域(C1)を有することが望ましい。免疫グロブリン重鎖融合物及び所望により免疫グロブリン軽鎖をコードするDNAを別個の発現ベクターに挿入し安定な宿主細胞に同時トランスフェクトする。これにより、構築において使用した3種のポリペプチド鎖の等しくない比率が所望の二重特異性抗体の最適な収率をもたらす場合の3種のポリペプチドフラグメントの相互の割合を調節する場合に大きい柔軟性をもたらす。しかしながら、等しい比率における少なくとも2つのポリペプチド鎖の発現が高収率をもたらす場合、又は、比率が所望の鎖の組合せの収率に有意に影響しない場合は、単一の発現ベクター内に2つ又は3つ全てのポリペプチド鎖に関するコーディング配列を挿入することが可能である。
本発明は一方のアームにおける第1の結合特異性を有するハイブリッド免疫グロブリン重鎖及び他方のアームにおけるハイブリッド免疫グロブリン重鎖−軽鎖対(第2の結合特異性をもたらす)よりなる二重特異性抗体を提供する。この非対称の構造は、二重特異性分子の半片方にのみ免疫グロブリン軽鎖が存在することは分離の効率的方法となるため、望ましくない免疫グロブリン鎖の組合せからの所望の二重特異性化合物の分離を容易にすることがわかっている。この方法はWO94/04690に開示されている。二重特異性抗体の形成の更に詳細な説明は例えばSuresh et al.,Methods in Enzymology121:210(1986)を参照のこと。
米国特許第5,731,168号に記載の別の方法によれば、抗体分子対の間の界面を操作することにより組み換え細胞培養から回収されるヘテロ2量体の割合を最大限にすることができる。好ましい界面はC3ドメインの少なくとも部分を含む。この方法においては、第1の抗体分子の界面に由来する小型アミノ酸側鎖1つ以上をより大きい鎖(例えばチロシン又はトリプトファン)で置き換える。大型のアミノ酸側鎖をより小さいもの(例えばアラニン又はスレオニン)と置き換えることにより第2の抗体分子の界面上には同一又は同様のサイズと大型の側鎖との差を補償する「空洞」が第2の抗体分子の界面上に形成される。これはホモ2量体のような他の望ましくない最終生成物を超えてヘテロ2量体の収率を増大させるための機序を与える。
二重特異性抗体は交差結合又は「ヘテロコンジュゲート」抗体を包含する。例えば、ヘテロコンジュゲートにおける抗体の一方をアビジンに、そして他方をビオチンにカップリングすることができる。このような抗体は例えば望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングすること(米国特許第4,676,980号)及びHIV感染の治療のため(WO91/00360、WO92/200373及びEP03089)に提案されている。ヘテロコンジュゲート抗体は何れかの好都合な交差結合法を用いて作成してよい。適当な交差結合剤は当該分野で良く知られており、そして多くの交差結合の手法と共に米国特許第4,676,980号に開示されている。
抗体フラグメントから二重特異性抗体を形成するための手法もまた文献に記載されている。例えば二重特異性抗体はキメラ連結を用いて製造できる。Brennan et al.,Science229:81(1985)はF(ab’)フラグメントを形成するために未損傷の抗体を蛋白分解的に切断する操作法を記載している。これ等のフラグメントをジチオール複合体形成剤、亜ヒ酸ナトリウムの存在下に還元することにより、隣接ジチオールを安定化させ、分子間ジスルフィドの形成を予防する。次に形成されたFab’フラグメントをチオニトロベンゾエート(TNB)誘導体に変換する。Fab’−TNB誘導体の1つは次にメルカプトエチルアミンで還元することによりFab’−チオールに再変換し、等モル量の他のFab’−TNB誘導体と混合することにより二重特異性抗体を形成する。生成した二重特異性抗体は酵素の選択的固定化のための試薬として使用できる。
最近の進歩により、化学的にカップリングすることにより二重特異性抗体を形成できるE・コリからのFab’−SHフラグメントの直接の回収が容易になった。Shalaby et al.,J.Exp.Med.175:217−225(1992)は完全にヒト化された二重特異性抗体F(ab’)分子の製造を記載している。各Fab’フラグメントを別個にE・コリから分泌させ、インビトロの指向性化学カップリングに付すことにより、二重特異性抗体を形成する。このようにして形成された二重特異性抗体はErbB2受容体を過剰発現する細胞及び正常ヒトT細胞に結合することができ、同時にヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞毒性リンパ球の溶解活性をトリガーすることができる。組み換え細胞培養物より直接二重特異性抗体フラグメントを作成して単離する種々の手法も報告されている。例えば、二重特異性抗体はロイシンジッパーを用いて製造されている。Kostelny et al.,J.Immunol.148(5):1547−1553(1992)。Fos及びJun蛋白由来のロイシンジッパーペプチドを遺伝子融合により2種の異なる抗体のFab’部分に連結している。抗体のホモ2量体をヒンジ領域で還元することによりモノマーを形成し、次に、再酸化して抗体ヘテロ2量体を形成している。この方法は又抗体ホモ2量体の製造の為にも利用できる。Hollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA90:6444−6448(1993)に記載の「ダイアボディー」手法は二重特異性抗体フラグメントを作成するための代替機序を与えている。フラグメントは同じ鎖の2ドメイン間の対形成を可能とするには短すぎるリンカーによりVに連結されたVを含む。従って、1つのフラグメントのV及びVドメインが別のフラグメントの相補V及びVドメインに強制的に対形成させられ、これにより2つの抗原結合部位が形成される。一本鎖Fv(sFv)2量体の使用により二重特異性抗体フラグメントを作成するための別の方策も報告されている。Gruber et al.,J.Immunol.,152:5368(1994)を参照のこと。
2価より多価の抗体も意図される。例えば3重特異性抗体を作成できる。Tutt et al.,J.Immunol.147:60(1991)。
6.ヘテロコンジュゲート抗体
ヘテロコンジュゲート抗体もまた本発明の範囲内に包含される。ヘテロコンジュゲート抗体は2つの共有結合した抗体よりなる。このような抗体は例えば望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングすること[米国特許第4,676,980号]及びHIV感染の治療のため[WO91/00360、WO92/200373及びEP03089]に提案されている。抗体は交差結合剤を用いる方法を包含する合成蛋白化学における既知の方法を用いてインビトロで製造してよいことを意図している。例えば、イムノトキシンは、ジスルフィド交換反応を用いて、又は、チオエーテル結合の形成により構築してよい。この目的のための適当な試薬の例はイミノチオレート及びメチル−4−メルカプトブチルイミデート及び例えば米国特許第4,676,980号に開示されているものを包含する。
7.多価抗体
多価抗体は抗体が結合する相手の抗原を発現する細胞により、2価抗体より急速に内在化(及び/又は異化)される場合がある。本発明の抗体は3つ以上の抗原結合部位を有する多価抗体(IgMクラス以外である)(例えば4価抗体)であることができ、これは抗体のポリペプチド鎖をコードする核酸の組み換え発現により容易に製造できる。多価抗体は2量化ドメイン及び3つ以上の抗原結合部位を含むことができる。好ましい2量化ドメインはFc領域又はヒンジ領域を含む(又はそれよりなる)。この設定においては、抗体はFc領域及びFc領域に対してアミノ末端側に3つ以上の抗原結合部位を含むことになる。好ましい多価抗体は本発明においては、3〜約8個、好ましくは4個の抗原結合部位を含む(又はそれよりなる)。多価抗体は少なくとも1つのポリペプチド鎖(及び好ましくは2つのポリペプチド鎖)を含み、ここでポリペプチド鎖は2つ以上の可変ドメインを含む。例えば、ポリペプチド鎖はVD1−(X1)−VD2−(X2)−Fcを含んでよく、式中VD1は第1の可変ドメイン、VD2は第2の可変ドメイン、FcはFc領域の1つのポリペプチド鎖であり、X1およびX2はアミノ酸又はポリペプチドを示し、nは0又は1である。例えば、ポリペプチド鎖はVH−CH1−フレキシブルリンカー−VH−CH1−Fc領域鎖;又はVH−CH1−VH−CH1−Fc領域鎖を含んでよい。本発明の多価抗体は好ましくは更に少なくとも2つ(好ましくは4つ)の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含む。本発明の多価抗体は例えば約2〜約8つの軽鎖可変ドメインポリペプチドを含んでよい。本明細書において意図される軽鎖可変ドメインポリペプチドは軽鎖可変ドメインを含み、そして場合により更にCLドメインを含む。
8.エフェクター機能操作
抗体の抗原依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC)及び/又は補体依存性細胞毒性(CDC)を増強するために、エフェクター機能に関して本発明の抗体を修飾することが望ましい場合がある。これは1つ以上アミノ酸置換を抗体のFc領域に導入することにより達成してよい。代替又は追加として、システイン残基をFc領域に導入することにより、この領域における鎖間のジスルフィド結合の形成を可能としてよい。このように形成されたホモ2量体抗体は向上した内在化能力及び/又は増大した補体媒介細胞殺傷及び抗体依存性細胞性細胞毒性(ADCC)を有する場合がある。Caron et al.,J.Exp.Med.,176:1191−1195(1992)及びShopes,B.J.Immunol.148:2918−2922(1992)を参照のこと。増強した抗腫瘍活性を有するホモ2量体抗体はまたWolff et al.,Cancer Research53:2560−2565(1993)に記載のヘテロ2官能性交差リンカーを用いて製造してもよい。或いは、二重にFc領域を有するため増強した補体溶解及びADCC能力を有する抗体を製作することもできる。Stevenson et al.,Anti−Cancer Drug Design3:219−230(1989)を参照のこと。抗体の血清中半減期を延長するためには、例えば米国特許第5,739,277号に記載の通り抗体(特に抗体フラグメント)中にサルベージ受容体結合エピトープを取り込んでよい。本明細書においては、「サルベージ受容体結合エピトープ」という用語はIgG分子のインビボの血清中半減期を延長する原因となるIgG分子(例えばIgG、IgG、IgG及びIgG)のFc領域のエピトープを指す。
9.イムノコンジュゲート
本発明はまた細胞毒性剤、例えば化学療法剤、成長抑制剤、毒素(例えば細菌、カビ、植物又は動物起源の酵素的に活性な毒素又はそのフラグメント)又は放射性同位体(例えば放射性コンジュゲート)にコンジュゲートした抗体を含む免疫コンジュゲートに関する。
このような免疫コンジュゲートの形成において有用な化学療法剤は上記の通りである。使用できる酵素的に活性な毒素及びそのフラグメントはジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性フラグメント、エキソトキシンA鎖(シュードモナス・アエルギノーサ由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ−サルシン、Aleurites Fordii蛋白、ジアンシン蛋白、Phytolaca americana蛋白(PAPI、PAPII及びPAP−S)、momordica charantia阻害剤、クルシン、クロチン、sapaonaria officinalis阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコテセンを包含する。種々の放射性核種が放射性コンジュゲート抗体の製造のために使用できる。例は212Bi、131I、131In、90Y及び186Reを包含する。抗体及び細胞毒性剤のコンジュゲートは種々の2官能性蛋白カップリング剤、例えばN−スクシンイミジル3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの2官能性誘導体(例えばジメチルアジピミデートHCl)、活性エステル(例えばジスクシンイミジルズベレート)、アルデヒド(例えばグルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えばビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビスジアゾニウム誘導体(例えばビス(p−ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えばトリエン2,6−ジイソシアネート)及びビス活性フッ素化合物(例えば1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン)を用いて作成される。例えば、リシンイムノトキシンはVitetta et al.,Science,238:1098(1987)に記載の通り製造できる。炭素−14−標識1−イソチオシアナトベンジル−3−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸(MX−DTPA)は抗体への放射性核種のコンジュゲーションのための例示されるキレート剤である。WO94/11026を参照のこと。
抗体及び1つ以上の小分子毒素、例えばカリケアマイシン、マイタンシノイド、トリコテセン及びCC1065及び毒素活性を有するこれらの毒素の誘導体のコンジュゲートもまた本発明において意図している。
マイタンシン及びマイタンシノイド
本発明はマイタンシノイド分子1つ以上にコンジュゲートした抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体(完全長又はフラグメント)を提供する。
マイタンシノイドはチュブリン重合を抑制することにより機能する有糸分裂抑制剤である。マイタンシンは東アフリカの潅木であるMaytenus serrataから最初に単離された(米国特許第3,896,111号)。その後、特定の微生物もまたマイタンシノイド、例えばマイタンシノール及びC−3マイタンシノールエステルを生産することが発見された(米国特許第4,151,042号)。合成のマイタンシノール及びその誘導体及び類似体は例えば参照により本明細書に組み込まれる米国特許第4,137,230号;第4,248,870号;第4,256,746号;第4,260,608号;第4,265,814号;第4,294,757号;第4,307,016号;第4,308,268号;第4,308,269号;第4,309,428号;第4,313,946号;第4,315,929号;第4,317,821号;第4,322,348号;第4,331,598号;第4,361,650号;第4,364,866号;第4,424,219号;第4,450,254号;第4,362,663号;および第4,371,533号に開示されている。
マイタンシノイド−抗体コンジュゲート
その治療指数を向上させる試みにおいて、マイタンシン及びマイタンシノイドは腫瘍細胞抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている。マイタンシノイドを含有する免疫コンジュゲート及びその治療用途は例えば参照により本明細書に組み込まれる米国特許第5,208,020号、第5,416,064号及び欧州特許EP0425235B1に開示されている。Liu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA93:8618−8623(1996)はヒト結腸直腸癌に対して指向されたモノクローナル抗体C242に連結したDM1と指名されたマイタンシノイドを含む免疫コンジュゲートを記載している。コンジュゲートは培養された結腸癌細胞に対しては高度に細胞毒性であることがわかり、そしてインビボの腫瘍生育試験において抗腫瘍活性を示している。Chari et al.,Cancer Research52:127−131(1992)はヒト結腸癌細胞系統上の抗原に結合するマウス抗体A7に、又は、HER−2/neu癌遺伝子に結合する別のマウスモノクローナル抗体TA.1にジスルフィドリンカーを介してマイタンシノイドをコンジュゲートしている免疫コンジュゲートを記載している。TA.1−マイタンシノイドコンジュゲートの細胞毒性は細胞当たり3x10HER−2表面抗原を発現するヒト乳癌細胞系統SK−BR−3に対してインビトロで試験されている。薬剤コンジュゲートは遊離のマイタンシノイド薬剤と同様の細胞毒性の程度を達成しており、これは抗体分子当たりのマイタンシノイド分子の数を増大させることにより増大させることができた。A7−マイタンシノイドコンジュゲートはマウスにおいて低い全身細胞毒性を示した。
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体−マイタンシノイドコンジュゲート(免疫コンジュゲート)
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体マイタンシノイドコンジュゲートは抗体又はマイタンシノイド分子の何れかの生物学的活性を有意に低下させること無くマイタンシノイド分子に抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を化学的に連結することにより製造する。抗体分子当たり平均3〜4個のマイタンシノイド分子をコンジュゲートすると抗体の機能又は溶解性に悪影響を及ぼすことなく標的細胞の細胞毒性を増強する場合に有効であることがわかっているが、1分子毒素/抗体であっても抗体単独の使用よりも細胞毒性を増強できることが期待される。マイタンシノイドは当該分野でよく知られており、そして既知の手法により合成するか、又は、天然原料から単離することができる。適当なマイタンシノイドは例えば米国特許第5,208,020号に、そして、上記した他の特許又は非特許の公開物に開示されている。好ましいマイタンシノイドはマイタンシノール及び芳香環において、又は、マインタンシノール分子の他の位置において修飾されているマインタンシノール類似体、例えば種々のマインタンシノールエステルである。
抗体−マイタンシノイドコンジュゲートを作成するための当該分野で知られた連結基は多数存在し、例えば米国特許第5,208,020号又は欧州特許EP0425235B1及びChari et al.,Cancer Research52:127−131(1992)に開示されているもの等が挙げられる。連結基は上記特許に開示されている通りジスルフィド基、チオエーテル基、酸不安定性基、光不安定性基、ペプチダーゼ不安定性基、又はエステラーゼ不安定性基を包含するが、ジスルフィド及びチオエーテル基が好ましい。
抗体とマイタンシノイドのコンジュゲートは種々の2官能性蛋白カップリング剤、例えばN−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)、スクシンイミジル−4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの2官能性誘導体(例えばジメチルアジピミデートHCl)、活性エステル(例えばジスクシンイミジルズベレート)、アルデヒド(例えばグルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えばビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビスジアゾニウム誘導体(例えばビス(p−ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えばトルエン2,6−ジイソシアネート)及びビス活性フッ素化合物(例えば1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン)を用いて作成してよい。特に好ましいカップリング剤は、ジスルフィド結合を与えるためのN−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)(Carlsson et al.,Biochem.J.,173,723−737(1978))及びN−スクシンイミジル−4−(2−ピリジルジチオ)ペンタノエート(SPP)を包含する。
リンカーは連結部の型に応じて種々の位置においてマイタンシノイド分子に結合してよい。例えば、エステル結合は従来のカップリング手法を用いてヒドロキシル基との反応により形成してよい。反応はヒドロキシル基を有するC3位、ヒロドキシメチルで修飾されたC14位、ヒドロキシル基で修飾されたC15位及びヒドロキシル基を有するC20位において起こってよい。連結はマイタンシノール又はマイタンシノール類似体のC3位において形成される。
カリケアマイシン
目的の免疫コンジュゲートの別のものはカリケアマイシン分子1つ以上にコンジュゲートした抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を含む。抗生物質のカリケアマイシンファミリーはピコモル未満の濃度にいおいて2本鎖DNA切断をもたらすことができる。カリケアマイシンファミリーのコンジュゲートの製造に関しては米国特許第5,712,374号、第5,714,586号、第5,739,116号、第5,767,285号、第5,770,701号、第5,770,710号、第5,773,001号、第5,877,296号を参照のこと(全てAmerican Cyanamid Company)。使用してよいカリケアマイシンの構造的類似体は例えばγ 、α 、α 、N−アセチル−γ 、PSAG及びθ (Himman et al.,Cancer Research53:3336−3342(1993)、Lode et al.,Cancer Research 58:2925−2928(1998)及び上記したAmerican Cyanamidへの米国特許)であるが、これらに限定されない。抗体をコンジュゲートできる別の抗腫瘍剤は抗葉酸エステルであるQFAである。カリケアマイシン及びQFAは両方とも細胞内作用部位を有し、原形質膜を容易に通過しない。従って、抗体媒介内在を介したこれらの薬剤の細胞内取り込みはその細胞毒性作用を大きく増大させる。
他の細胞毒性剤
本発明の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体にコンジュゲートできる他の抗腫瘍剤はBCNU、ストレプトゾシン、ビンクリスチン及び5−フルオロウラシル、米国特許第5,053,394号、第5,770,710に号記載の総称LL−E33288複合体として知られる薬剤ファミリー、並びに、エスペラマイシン(米国特許第5,877,296号)を包含する。
使用できる酵素的に活性な毒素及びそのフラグメントは、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性フラグメント、エキソトキシンA鎖(シュードモナス・アエルギノーサ由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ−サルシン、Aleurites Fordii蛋白、ジアンシン蛋白、Phytolaca americana蛋白(PAPI、PAPII及びPAP−S)、momordica charantia阻害剤、クルシン、クロチン、sapaonaria officinalis阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコテセンを包含する。例えば1993年10月28日に公開されたWO93/21232を参照のこと。
本発明は更に抗体と核溶解活性を有する化合物との間に形成される免疫コンジュゲートを意図している(例えばリボヌクレアーゼ又はDNAエンドヌクレアーゼ、例えばデオキシリボヌクレアーゼ;DNase)。
腫瘍の選択的破壊のためには、抗体は高度に放射性の原子を含んでよい。種々の放射性同位体が放射性コンジュゲート抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体の製造のために使用される。例示されるものはAt211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212及びLuの放射性同位体を包含する。検出のためにコンジュゲートを使用する場合は、それはシンチグラフィー試験のための放射性原子、例えばtc99m又はI123、又は核磁気共鳴(NMR)画像化(磁気共鳴画像化MRIとしても知られている)のためのスピン標識、例えばヨウ素−123、更にヨウ素−131、インジウム−111、フッ素−19、炭素−13、窒素−15、酸素−17、ガドリニウム、マンガン又は鉄を含んでよい。
放射標識又は他の標識を既知の方法でコンジュゲートに取り込ませてよい。例えば、水素の代わりにフッ素−19を含む適当なアミノ酸前駆体を用いて、ペプチドを生合成するか、又はアミノ酸化学合成法により合成してよい。tc99m又はI123、Re186、Re188及びIn111のような標識をペプチド内のシステイン残基を介して結合することができる。イットリウム−90はリジン残基を介して結合できる。IODOGEN法(Fraker et al(1987)Biochem.Biophys.Res.Commun.80:49−57)を用いてヨウ素−123を取り込むことができる。Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy(Chatal,CRC Press 1989)は他の方法を詳細に説明している。
抗体と細胞毒性剤のコンジュゲートは種々の2官能性の蛋白カップリング剤、例えば、N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)、スクシンイミジル−4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの2官能性誘導体(例えばジメチルアジピミデートHCl)、活性エステル(例えばジスクシンイミジルズベレート)、アルデヒド(例えばグルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えばビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビスジアゾニウム誘導体(例えばビス(p−ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えばトリエン2,6−ジイソシアネート)及びビス活性フッ素化合物(例えば1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン)を用いて作成してよい。例えば、リシンイムノトキシンはVitetta et al.,Science,238:1098(1987)に記載の通り製造できる。炭素−14−標識1−イソチオシアナトベンジル−3−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸(MX−DTPA)は抗体への放射性核種のコンジュゲーションのための例示されるキレート剤である。WO94/11026を参照のこと。リンカーは細胞内での細胞毒性剤の放出を容易にする「切断可能なリンカー」であってよい。例えば酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、光不安定性リンカー、ジメチルリンカー又はジスルフィド含有リンカー(Chari et al.,Cancer Research52:127−131(1992);米国特許第5,208,020号)を使用してよい。
或いは、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体及び細胞毒性剤を含む融合蛋白は例えば組み換え手法又はペプチド合成により作成してよい。DNAの長さは相互に隣接するかコンジュゲートの所望の特性を損なわないリンカーペプチドをコードする領域により分離されているコンジュゲートの2つの部分をコードするそれぞれの領域を含んでよい。
本発明によれば、抗体は、抗体−受容体コンジュゲートを患者に投与し、その後浄化剤を用いて循環系より未結合コンジュゲートを除去し、そして次に細胞毒性剤(例えば放射性ヌクレオチド)にコンジュゲートした「リガンド」(例えばアビジン)を投与する腫瘍の予備ターゲティングにおいて利用するための「受容体」(例えばストレプトアビジン)にコンジュゲートしてよい。
10.免疫リポソーム
本明細書に開示した抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体はまた免疫リポソームとして製剤してよい。「リポソーム」は哺乳類における薬剤の送達のために有用な脂質、リン脂質及び/又は界面活性剤の種々の型よりなる小型の小胞である。リポソームの成分は一般的には生物学的な膜の脂質の配置と同様に二層形態に配置している。抗体を含有するリポソームは例えばEpstein et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA82:3688(1985);Hwang et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4030(1980);米国特許第4,485,045号及び第4,544,545号;及び1997年10月23日に公開されたWO97/38731に記載されているような当該分野で知られた方法により製造される。長期の循環時間を有するリポソームは米国特許第5,013,556号に開示されている。
特に有用なリポソームはホスファチジルコリン、コレステロール及びPEG誘導体化ホスファチジルエタノールアミン(PEG−PE)を含む脂質組成物を用いて逆相蒸発法により形成することができる。リポソームを所定の孔径のフィルターを通して押し出すことにより、所望の直径を有するリポソームが得られる。本発明の抗体のFab’フラグメントはジスルフィド相互交換反応によりMartin et al.,J.Biol.Chem.257:286−288(1982)に記載の通りリポソームにコンジュゲートできる。化学療法剤を場合によりリポソーム内に含有させる。Gabizon et al.,J.National Cancer Inst.81(19):1484(1989)を参照のこと。
11.抗体の医薬組成物
本発明により同定されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド並びに前述したスクリーニング試験により同定される他の分子に特異的に結合する抗体を医薬組成物の形態において種々の障害の治療のために投与できる。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドが細胞内にあり、全抗体を阻害剤として使用する場合は、内在化抗体が好ましい。しかしながら、リポフェクション又はリポソームはまた抗体又は抗体フラグメントを細胞に送達するためにも使用できる。抗体フラグメントを用いる場合は、標的蛋白の結合ドメインに特異的に結合する最も小さい阻害性フラグメントが好ましい。例えば、抗体の可変領域の配列に基づいて、標的蛋白配列に結合する能力を保持しているペプチド分子を設計できる。そのようなペプチドは化学合成及び/又は組み換えDNA技術による製造が可能である。例えばMarasco et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:7889−7893(1993)を参照のこと。本発明の製剤は又、治療すべき特定の適応症のために必要に応じて1つより多い活性化合物、好ましくは相互に悪影響を及ぼさない補足的な活性を有するものを含有してよい。代替として、又は追加的に、組成物はその機能を増強する薬剤、例えば細胞毒性剤、サイトカイン、化学療法剤又は成長抑制剤を含んでよい。このような分子は意図する目的のために有効である量における組み合わせにおいて適宜存在する。
活性成分はまた例えばコアセルベーション法によるか、又は、界面重合により製造されたマイクロカプセル、例えばそれぞれヒドロキシメチルセルロース又はゼラチンマイクロカプセル及びポリ−(メチルメタクリレート)マイクロカプセル中、コロイド状薬物送達系(例えばリポソーム、アルブミン微小球、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル)中、又はマクロエマルジョン中に捕獲させてもよい。このような手法は上出のRemington’s Pharmaceuical Sciencesに開示されている。
インビボ投与のために使用されるべき製剤は滅菌されていなければならない。これは滅菌濾過メンブレンを通過する濾過により容易に達成される。
持続放出製剤を製造してよい。持続放出製剤の適当な例は抗体を含有する固体疎水性重合体の半透過性マトリックスを包含し、そのようなマトリックスは形状付与された物品、例えばフィルム又はマイクロカプセルの形態である。持続放出マトリックスの例は、ポリエステル、ヒドロゲル(例えばポリ(2−ヒドロキシエチル−メタクリレート)、又はポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(米国特許第3,773,919号)、L−グルタミン酸及びγエチル−L−グルタメートの共重合体、非分解性エチレン−酢酸ビニル、分解性乳酸−グリコール酸共重合体、例えばLUPRON DEPOTTM(乳酸−グリコール酸共重合体及び酢酸ロイプロリドよりなる注射可能な微小球)及びポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸を包含する。エチレン−酢酸ビニル及び乳酸−グリコール酸のような重合体は100日間にわたる分子の放出を可能にするが、特定のヒドロゲルはより短い時間に蛋白を放出する。カプセル化抗体が身体内に長時間残存する場合、それらは、37℃の水分への曝露の結果として、変性するか凝集し、生物学的活性を消失するか、又は、免疫原性が変化する可能性がある。合理的な方策は関与する機序に応じて安定化のために考案することができる。例えば、凝集の機序がチオ−ジスルフィド交換を介した分子間S−S結合の形成であることが発見されれば、スルフィドリル残基の修飾、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含有量の制御、適切な添加物の使用、及び、特定の重合体マトリックス組成物の開発により安定化を達成してよい。
G.抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体の使用
本発明の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;胚発生の障害又は致死性又は代謝異常に関する種々の治療上及び/又は診断上の有用性を有する。例えば、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404に関する診断試験、例えば特定の細胞、組織又は血清におけるその発現(及び一部の場合は示差的発現)を検出することにおいて使用してよい。当該分野で知られた種々の診断試験の手法、例えば競合的結合試験、直接又は間接のサンドイッチ試験及び不均質又は均質な相の何れかにおいて行う免疫沈降試験を使用してよい[Zola,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques,CRC Press,Inc.(1987)pp.147−158]。診断試験において使用される抗体は検出可能な部分で標識できる。検出可能な部分は直接又は間接的に検出可能なシグナルを生成することができるものでなければならない。例えば検出可能な部分は放射性同位体、例えばH、14C、32P、35S又は125I、蛍光又はケミルミネセント化合物、例えばフルオレセインイソチオシアネート、ローダミン又はルシフェリン、又は酵素、例えばアルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼ又はセイヨウワサビパーオキシダーゼであってよい。検出可能な部分に抗体をコンジュゲートするための当該分野で知られた何れかの知られた方法、例えばHunter et al.,Nature,144:945(1962);David et al.,Biochemistry,13:1014(1974);Pain et al.,J.Immunol.Meth.,40:219(1981);及びNygren,J.Histochem. and Cytochem.,30:407(1982)に記載のものを使用してよい。
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は又組み換え細胞培養物又は天然原料からのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアフィニティー精製の為にも有用である。この過程においてはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに対する抗体を当該分野で良く知られている方法を用いてセファデックス樹脂又は濾紙のような適当な支持体上に固定化する。次に固定化された抗体を精製すべきPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを含有する試料と接触させ、その後、固定化抗体に結合しているPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを除き試料中の実質的に全ての物質を除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に抗体からPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを遊離させる別の適当な溶媒で支持体を洗浄する。
以下の実施例は説明のみを目的としており、本発明の範囲を如何なる面でも限定する意図はない。
本明細書において引用した全ての特許及び文献の参考資料は参照により全体が本明細書に組み込まれる。
実施例において言及される市販の試薬は、他に指示がない限り、製造者の指示書に従って使用した。以下の実施例において、また本明細書を通して、ATCCアクセッション番号によって同定される細胞の起源は、American Type Culture Collection,Manassas,VAである。
(実施例1:新規のポリペプチドおよびそれらをコードするcDNAを同定するための細胞外ドメインホモロジースクリーニング)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的データベース(例えば、Dayhoff、GenBank)および企業のデータベース(例えば、LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST−2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,WA)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
この細胞外ドメインホモロジースクリーニングを使用して、コンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他の同定されているEST配列に対して構築した。さらに、得られたコンセンサスDNA配列を、しばしば(必ずしもそうではないが)BLASTまたはBLAST−2およびphrapの繰り返しサイクルを使用して、伸長することにより、上に記載したEST配列の起源を使用してできる限りコンセンサス配列を伸長した。
上に記載したように得られたコンセンサス配列に基づいて、次いでオリゴヌクレオチドを、目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよびPROポリペプチドについての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成し、使用した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biologyのように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理された(hemikinased)アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
(実施例2:アミラーゼスクリーニングによるcDNAクローンの単離)
(1.オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
mRNAを、Invitrogen,San Diego,CA(Fast Track2)の試薬およびプロトコルを使用して目的のヒト組織から単離した。このRNAを使用し、Life Technologies,Gaithersburg,MD(Super Script Plasmid System)の試薬およびプロトコルを使用して、ベクターpRK5Dに、オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリを生成した。この手順において、二本鎖cDNAのうち、1000bpより大きいものを分離し、SalI/NotIリンカー付加されたcDNAを、XhoI/NotI切断されたベクターにクローニングした。pRK5Dは、XhoI/NotI cDNAクローニング部位の前に、sp6転写開始部位、SfiI制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。
(2.ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すために、2次cDNAライブラリを構築した。Sp6RNAを1次ライブラリ(上記)から生成し、このRNAを使用し、Life Technologies(Super Script Plasmid System,上を参照のこと)の試薬およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリをベクターpSST−AMY.0に構築した。この手順において、二本鎖cDNAを、500〜1000bpに分離し、NotIアダプターに平滑末端でリンカー付加し、SfiIで切断し、そしてSfiI/NotIで切断されたベクターにクローニングした。pSST−AMY.0は、cDNAクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター(分泌シグナルなしの成熟配列)、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたcDNAは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。
(3.形質転換および検出)
上の段落2に記載したライブラリ由来のDNAを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントDH10B細菌(Life Technologies,20ml)に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、SOC培地(Life Technologies,1ml)を加えて、混合物を37℃で30分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な150mmLBプレート20枚に播き、16時間インキュベートした(37℃)。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのDNAを標準的なプロトコル、例えば、CsCl勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたDNAを以下の酵母プロトコルに用いた。
酵母法は、3つのカテゴリーに分けられる:(1)プラスミド/cDNA結合ベクターによる酵母の形質転換;(2)アミラーゼを分泌する酵母クローンの検出および単離;ならびに(3)酵母コロニーからの直接の挿入断片のPCR増幅ならびに配列決定およびさらなる解析のためのそのDNAの精製。
使用した酵母株は、HD56−5A(ATCC−90785)であった。この株は、以下の遺伝子型:MATアルファ、ura3−52、leu2−3、leu2−112、his3−11、his3−15、MAL、SUC、GALを有する。好ましくは、翻訳後経路を欠く酵母変異体が、使用され得る。このような変異体は、sec71、sec72、sec62において転座不全(translocation deficient)対立遺伝子を有し得、切断されたsec71が最も好ましい。あるいは、これらの遺伝子の正常な作用を干渉するアンタゴニスト(アンチセンスヌクレオチドおよび/またはリガンドを含む)、この翻訳後経路に関連する他のタンパク質(例えば、SEC61p、SEC72p、SEC62p、SEC63p、TDJ1pまたはSSA1p−4p)またはこれらのタンパク質の複合体形成物もまた、好ましくは、アミラーゼを発現する酵母と組み合わせて使用され得る。
形質転換は、Gietz et al.,Nucl.Acid.Res.,20:1425(1992)によって概説されているプロトコルに基づいて行われた。次いで、形質転換された細胞を寒天からYEPD複合培地ブロス(100ml)に接種し、30℃で一晩生育した。YEPDブロスを、Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY,p.207(1994)に記載されているように調製した。次いで、一晩培養したものを、新鮮YEPDブロス(500ml)に約2×10細胞/ml(およそOD600=0.1)に希釈し、1×10細胞/ml(およそOD600=0.4〜0.5)まで再び生育した。
次いで、細胞を回収し、形質転換に向けて調製し、GS3ローター瓶に移し、Sorval GS3ローターにて5,000rpmで5分間、遠心分離し、上清を廃棄し、次いで、滅菌水に再懸濁し、Beckman GS−6KR遠心機において、50mlファルコンチューブにて3,500rpmで再度遠心分離した。その上清を廃棄し、続いて細胞をLiAc/TE(10ml,10mM Tris−HCl,1mM EDTA pH7.5,100mM LiOOCCH)で洗浄し、LiAc/TE(2.5ml)に再懸濁した。
微量遠心チューブ内で、調製した細胞(100μl)と、新たに変性された一本鎖サケ精巣DNA(Lofstrand Labs,Gaithersburg,MD)と形質転換DNA(1μg、10μl未満の体積)とを混合することによって形質転換を起こした。混合物をボルテックスにより手短に混合し、次いで、40%PEG/TE(600μl,40%ポリエチレングリコール−4000,10mM Tris−HCl,1mM EDTA,100mM LiOOCCH,pH7.5)を加えた。この混合物を穏やかに混合し、30分間、撹拌しながら30℃でインキュベートした。次いで、細胞を15分間、42℃の熱ショックにかけ、反応容器を12,000rpmで5〜10秒間微量遠心し、デカントし、そしてTE(500μl,10mM Tris−HCl,1mM EDTA pH7.5)に再懸濁した後、再度遠心分離した。次いで、細胞をTE(1ml)に希釈し、アリコート(200μl)を、150mm増殖プレート(VWR)に予め調製された選択培地に播いた。
あるいは、多数の少量反応の代わりに、形質転換を、単一の大規模反応を使用して実施し、ここで試薬の量は、それに合うようにスケールアップした。
使用した選択培地は、Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY,p.208−210(1994)に記載されているように調製されたウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天(SCD−Ura)であった。形質転換体を、30℃にて2〜3日間生育した。
アミラーゼを分泌するコロニーの検出を、選択増殖培地中に赤デンプン(red starch)を含ませることによって行った。Biely et al.,Anal. Biochem.,172:176−179(1988)によって報告されている手順により、デンプンを赤色色素(Reactive Red−120,Sigma)に結合させた。結合したデンプンを、最終濃度0.15%(w/v)でSCD−Ura寒天プレートに取り込ませ、リン酸カリウムを用いてpH7.0(50〜100mMの最終濃度)まで緩衝した。
十分に分離し、同定可能な単一のコロニーを得るために、陽性のコロニーを拾い、新鮮選択培地(150mmプレート上)に画線した。アミラーゼ分泌が陽性の十分に分離した単一のコロニーを、緩衝SCD−Ura寒天に赤デンプンを直接取り込むことによって検出した。陽性のコロニーを、デンプンを分解して、陽性のコロニーの周辺に直接可視化されるクリアなハローを生じる能力によって判定した。
(4.PCR増幅によるDNAの単離)
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、96ウェルプレート内の滅菌水(30μl)に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート(5μl)を、25μl容量中、以下:0.5μlのKlentaq(Clontech,Palo Alto,CA);4.0μlの10mM dNTP’s(Perkin Elmer−Cetus);2.5μlのKentaq緩衝液(Clontech);0.25μlの順方向オリゴ1;0.25μlの逆方向オリゴ2;12.5μlの蒸留水を含むPCR反応用の鋳型として使用した。
順方向オリゴヌクレオチド1の配列は:
5’−TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT−3’ (配列番号151)であった。
逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:
5’−CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT−3’ (配列番号152)であった。
次いで、PCRを以下のとおりに行った:
Figure 2008532516
オリゴヌクレオチドの下線を引いた領域を、それぞれ、ADHプロモーター領域およびアミラーゼ領域にアニーリングさせ、挿入断片が存在しないとき、ベクターpSST−AMY.0から307bpの領域を増幅した。代表的には、これらのオリゴヌクレオチドの5’末端の最初の18ヌクレオチドは、配列決定プライマー用のアニーリング部位を含んでいた。従って、空のベクターからのPCR反応の総産物は、343bpであった。しかしながら、シグナル配列融合cDNAは、かなり長いヌクレオチド配列を生じた。
PCRの後、反応物(5μl)のアリコートを、Sambrook et al.,前出に記載されているようなTris−ホウ酸塩−EDTA(TBE)緩衝液系を使用した1%アガロースゲルのアガロースゲル電気泳動にかけた。400bpより長い単一の強力なPCR産物を生じたクローンを、96Qiaquick PCR精製カラム(Qiagen Inc.,Chatsworth,CA)で精製後、DNA配列決定によってさらに解析した。
(実施例3:シグナルアルゴリズム解析を使用したcDNAクローンの単離)
様々なポリペプチドをコードする核酸配列を、を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。アルゴリズムの使用により、数多くのポリペプチドをコードする核酸配列が同定された。
上記の実施例1〜3で説明されている技術を使用して、本明細書中に開示されるようなPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする数多くの完全長cDNAクローンを同定した。次いで、これらのcDNAを、以下の表7に示すように、ブダペスト条約に従ってAmerican Type Culture Collection,10801 University Blvd.,Manassas,VA20110−2209,USA(ATCC)に寄託した。さらに、PRO860ポリペプチドをコードするDNA60614の配列を、GenBankアクセッション番号AF361473から同定し;PRO2155ポリペプチドをコードするDNA88062の配列を、GenBankアクセッション番号A06977から同定し;PRO90318ポリペプチドをコードするDNA336109の配列を、GenBankアクセッション番号AF417580から同定し;PRO9922ポリペプチドをコードするDNA142524の配列を、GenBankアクセッション番号U88879から同定し;PRO9824ポリペプチドをコードするDNA111030の配列を、GenBankアクセッション番号AF316597から同定し;PRO19836ポリペプチドをコードするDNA144839の配列を、GenBankアクセッション番号BC023567から同定し;PRO70789ポリペプチドをコードするDNA295801の配列を、GenBankアクセッション番号AY260763から同定し;PRO50298ポリペプチドをコードするDNA255219の配列を、GenBankアクセッション番号AK026226から同定し;そしてPRO51592ポリペプチドをコードするDNA256561の配列を、GenBankアクセッション番号AF001622から同定した。
Figure 2008532516
Figure 2008532516
Figure 2008532516
特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約(ブダペスト条約)の規定に基づいてこれらの寄託を行った。これは、寄託日から30年間、寄託物の生存可能な培養物の維持を保証するものである。寄託物は、ブダペスト条約の規定に基づいてGenentech,Inc.とATCCとの合意に従い、ATCCから入手可能であり、これは、どれが最初であろうとも、関連の米国特許の発行時または任意の米国または外国の特許出願の公開時に、寄託培養物の子孫が永久かつ無制限に入手可能であることを保証し、米国特許法第122条およびそれに従う特許庁長官規則(特に参照番号886OG638の37CFR第1.14条を含む)に従って権利を有すると米国商標特許庁長官が決定した者に子孫を入手可能とすることを保証するものである。
本出願の譲受人は、適当な条件下で培養されていたときに、寄託された材料の培養物が、死滅または損失または破壊された場合、通知時に、その材料が迅速に同一の別のものに置き換えられることに同意する。寄託された材料の入手可能性は、特許法に従いあらゆる政府の権限下で認められた権利に違反して、本発明を実施するライセンスであるとみなされるものではない。
(実施例4:ヒトPRO179ポリペプチド[UNQ153]をコードするcDNAクローンの単離)
天然のヒトPRO179ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA16451−1078)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児肝臓ライブラリにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
DNA16451−1078の同定に使用したプライマーは、以下のとおりである:
OLI114:
5’−CCACGTTGGCTTGAAATTGA−3’ (配列番号153)
OLI115:
5’−CCTTTAGAATTGATCAAGACAATTCATGATTTGATTCTCTATCTCCAGAG−3’ (配列番号154)
OLI116:
5’−TCGTCTAACATAGCAAATC−3’ (配列番号155)。
クローンDNA16451−1078は、ヌクレオチド37−39位に明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1417−1419位に明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む(図1;配列番号1)。予測されるポリペプチド前駆体は、460アミノ酸長である。完全長PRO179タンパク質を、図2(配列番号2)に示す。
図2(配列番号2)に示した完全長PRO179配列の解析から、図2に示されるような重要なポリペプチドドメインの存在が明らかにされ、ここで、その重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおよそのものである。完全長PRO179配列(図2;配列番号2)の解析は、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約16のシグナルペプチド;アミノ酸約23〜アミノ酸約27、アミノ酸約115〜アミノ酸約119、アミノ酸約296〜アミノ酸約300およびアミノ酸約357〜アミノ酸約361のN−グリコシル化部位;アミノ酸約100〜アミノ酸約104およびアミノ酸約204〜アミノ酸約208のcAMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約342〜アミノ酸約351のチロシンキナーゼリン酸化部位;アミノ酸約279〜アミノ酸約285、アミノ酸約352〜アミノ酸約358およびアミノ酸約367〜アミノ酸約373のN−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約120〜アミノ酸約142およびアミノ酸約127〜約アミノ149のロイシンジッパーパターンの存在を明らかにする。
クローンDNA16451−1078は、1997年9月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209281が割り当てられている。図2に示される完全長PRO179タンパク質は、約53,637ダルトン推定分子量および約6.61のpIを有する。
図2(配列番号2)に示される完全長配列のDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、TIE−2レセプター(h−TIE−2L1およびh−TIE−2L2)という2種類の既知ヒトリガンドと高度な配列相同性を示すフィブリノゲン様ドメインの存在が明らかになった。省略形「TIE」は、「IgおよびEGF相同ドメインを含むチロシンキナーゼ」を表す頭文字であり、レセプターチロシンキナーゼの新規ファミリーを命名するために作られた。従って、PRO179は、TIEリガンドファミリーの新規メンバーとして同定される。
(実施例5:ヒトPRO181ポリペプチド[UNQ155]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例2に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列が、BLASTおよびFastA配列アラインメントによって見出され、コルニション(cornichon)タンパク質をコードするヌクレオチド配列に対する配列相同性を有した。このcDNA配列は、本明細書中でDNA13242と命名される。配列相同性に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを、DNA13242分子の配列から生成し、上の実施例2の段落1に記載されているように調製されたヒト胎盤(LIB89)ライブラリをスクリーニングするために使用した。クローニングベクターは、pRK5Bであり(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)、cDNAを、2800bp未満の大きさに切断した。
使用したオリゴヌクレオチドプローブは、以下:
順方向PCRプライマー5’−GTGCAGCAGAGTGGCTTACA−3’ (配列番号156)
逆方向PCRプライマー5’−ACTGGACCAATTCTTCTGTG−3’ (配列番号157)
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GATATTCTAGCATATTGTCAGAAGGAAGGATGGTGCAAATTAGCT−3’ (配列番号158)
を含んでいた。
ヌクレオチド14−16位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド446−448位に見られた終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローンを、同定した(図3;配列番号3)。予測されるポリペプチド前駆体は、144アミノ酸長であり、約16,699ダルトンという算出された分子量および約5.6という推定pIを有する。図4(配列番号4)に示される完全長PRO181配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約20のシグナルペプチド、アミノ酸約11〜アミノ酸約31の推定II型膜貫通型ドメインならびにアミノ酸約57〜アミノ酸約77およびアミノ酸約123〜アミノ酸約143の他の膜貫通型ドメインの存在が明らかになった。クローンUNQ155(DNA23330−1390)は、1998年4月14日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209775が割り当てられている。
完全長PRO181ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、コルニションタンパク質との著しい配列類似性を有することが示唆され、それによって、PRO181が新規コルニションホモログであり得ることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO181アミノ酸配列と以下のDayhoff配列である、AF022811_1、CET09E8_3、S64058、YGF4_YEAST、YB60_YEAST、EBU89455_1、SIU36383_3およびPH1371との間に著しい相同性が存在することが明らかになった。
(実施例6:ヒトPRO244ポリペプチド[UNQ218]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよびPRO244についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成し、使用した。
PCRプライマーの対(順方向および逆方向)を合成した:
5’−TTCAGCTTCTGGGATGTAGGG−3’ (30923.f1) (配列番号159)
5’−TATTCCTACCATTTCACAAATCCG−3’ (30923.r1) (配列番号160)
プローブも合成した:
5’−GGAGGACTGTGCCACCATGAGAGACTCTTCAAACCCAAGGCAAAATTGG−3’ (30923.p1) (配列番号161)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO244遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓ライブラリから単離した。上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO244の完全長DNA配列および誘導タンパク質配列が得られた。
PRO244のヌクレオチド配列全体を、図5(配列番号5)に示す。クローンDNA35668−1171は、ヌクレオチド106−108位で明らかな翻訳開始部位を有する単一のオープンリーディングフレームを含む(図5)。予測されるポリペプチド前駆体は、219アミノ酸長である(図6;配列番号6)。クローンDNA35668−1171は、1997年10月16日にATCCに寄託され(DNA35668−1171と命名)、ATCC寄託番号ATCC209371が割り当てられている。そのタンパク質は、細胞質ドメイン(aa1−20)、膜貫通型ドメイン(aa21−46)および細胞外ドメイン(aa47−219)を有し、aa55−206にC−レクチンドメインを含む。
完全長配列のBLASTおよびFastA配列アラインメント解析に基づいて、PRO244は、gallus gallusの肝臓のレクチン(43%)、HIC hp120結合C型レクチン(42%)、マクロファージレクチン2(HUMHML2−1,41%)および配列PR32188(44%)に対して注目すべきアミノ酸配列同一性を示す。
(実施例7:ヒトPRO247ポリペプチド[UNQ211]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA33480と命名される。DNA33480コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO247についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマーの対(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’−CAACAATGAGGGCACCAAGC−3’ (配列番号162)
逆方向PCRプライマー5’−GATGGCTAGGTTCTGGAGGTTCTG−3’ (配列番号163)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA33480発現配列タグから構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CAACCTGCAGGAGATTGACCTCAAGGACAACAACCTCAAGACCATCG−3’ (配列番号164)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO247遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児脳組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO247[本明細書中でDNA35673−1201と命名](配列番号7)の完全長DNA配列およびPRO247の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA35673−1201のヌクレオチド配列全体を、図7(配列番号7)に示す。クローンDNA35673−1201は、配列番号249のヌクレオチド80−82位に明らかな翻訳開始部位を有し、配列番号7(図7)のヌクレオチド1717位の後の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、546アミノ酸長である(図8;配列番号8)。クローンDNA35673−1201は、1997年10月28日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209418が割り当てられている。
完全長PRO247ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その一部が、デンシン(densin)分子およびKIAA0231に対して著しい相同性を有することが示唆され、それにより、PRO247が新規のロイシンリッチ反復タンパク質であり得ることが示唆される。
(実施例8:ヒトPRO269ポリペプチド[UNQ236]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA35705と命名される。DNA35705コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO269についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向および逆方向PCRプライマーを合成した:
順方向PCRプライマー(.f1)5’−TGGAAGGAGATGCGATGCCACCTG −3’ (配列番号165)
順方向PCRプライマー(.f2)5’−TGACCAGTGGGGAAGGACAG−3’ (配列番号166)
順方向PCRプライマー(.f3)5’−ACAGAGCAGAGGGTGCCTTG−3’ (配列番号167)
逆方向PCRプライマー(.r1)5’−TCAGGGACAAGTGGTGTCTCTCCC−3’ (配列番号168)
逆方向PCRプライマー(.r2)5’−TCAGGGAAGGAGTGTGCAGTTCTG−3’ (配列番号169)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35705配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−ACAGCTCCCGATCTCAGTTACTTGCATCGCGGACGAAATCGGCGCTCGCT−3’ (配列番号170)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO269遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO269[本明細書中でDNA38260−1180と命名](配列番号9)の完全長DNA配列およびPRO269の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA38260−1180のヌクレオチド配列全体を、図9(配列番号9)に示す。クローンDNA38260−1180は、ヌクレオチド314−316位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1784−1786位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(配列番号9;図9)。予測されるポリペプチド前駆体は、490アミノ酸長である(図10;配列番号10)。クローンDNA38260−1180は、1997年10月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC209397が割り当てられている。
完全長PRO269のアミノ酸配列の解析により、その一部が、ヒトトロンボモジュリンタンパク質に対して著しい相同性を有することが示唆され、それにより、PRO269が1個以上のトロンボモジュリン様ドメインを有し得ることが示唆される。
(実施例9:ヒトPRO293ポリペプチド[UNQ256]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的タンパク質データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、発現配列タグ(EST)データベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
上記の解析で同定されたT08294と本明細書中で命名される発現配列タグに基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO293についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマーの対(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’−AACAAGGTAAGATGCCATCCTG−3’ (配列番号171)
逆方向PCRプライマー5’−AAACTTGTCGATGGAGACCAGCTC−3’ (配列番号172)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有する発現配列タグから構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−AGGGGCTGCAAAGCCTGGAGAGCCTCTCCTTCTATGACAACCAGC−3’ (配列番号173)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO293遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児脳組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO293[本明細書中でDNA37151−1193と命名](配列番号11)の完全長DNA配列およびPRO293の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA37151−1193のヌクレオチド配列全体を、図11(配列番号11)に示す。クローンDNA37151−1193は、ヌクレオチド881−883位に明らかな翻訳開始部位を有し、配列番号11(図11)のヌクレオチド3019位の後の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、713アミノ酸長である(図12;配列番号12)。クローンDNA37151−1193は、1997年10月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC209393が割り当てられている。
完全長PRO293ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その一部が、NLRRタンパク質に対して著しい相同性を有することが示唆され、それにより、PRO293が新規のNLRRタンパク質であり得ることが示唆される。
(実施例10:ヒトPRO298ポリペプチド[UNQ261]をコードするcDNAクローンの単離)
上記の実施例2に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNAを、本明細書中でDNA26832と命名する。次いで、DNA26832の配列を、発現配列タグ(EST)データベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology266:460−480(1996))を使用して実施された。タンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他のEST配列に関して構築した。コンセンサス配列を決定し、次いで、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長することにより、上に記載したEST配列の起源を使用してできる限りコンセンサス配列を伸長した。伸長したアセンブリ配列をDNA35861と命名した。DNA35861コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO298の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向プライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biologyのように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)およびハイブリダイゼーションプローブを合成した:
順方向PCRプライマー1 CAACGTGATTTCAAAGCTGGGCTC (配列番号174)
順方向PCRプライマー2 GCCTCGTATCAAGAATTTCC (配列番号175)
順方向PCRプライマー3 AGTGGAAGTCGACCTCCC (配列番号176)
逆方向PCRプライマー1 CTCACCTGAAATCTCTCATAGCCC (配列番号177)
ハイブリダイゼーションプローブ1 CGCAAAACCCATTTTGGGAGCAGGAATTCCAATCATGTCTGTGATGGTGG (配列番号178)。
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO298遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児肺組織から単離した(LIB25)。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO298(本明細書中でUNQ261[DNA39975−1210]と命名)(配列番号13)の完全長DNA配列およびPRO298の誘導タンパク質配列(配列番号14)が得られた。
UNQ261(DNA39975−1210)のヌクレオチド配列全体を、図13(配列番号13)に示す。クローンDNA39975−1210は、ヌクレオチド375−377位に明らかな翻訳開始部位を有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、364アミノ酸長である(図14;配列番号14)。そのタンパク質は、それぞれアミノ酸36−55位(II型TM)、65−84位、188−208位および229−245位の4つの推定膜貫通型ドメインを含む。推定N結合型グリコシル化部位は、アミノ酸253位から開始する。さらに、以下の特徴が、このタンパク質配列において同定された:cAMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、8位から開始;それぞれ173および262位から開始するN−ミリストイル化部位;およびアミノ酸45−60位のZPドメイン。クローンDNA39975−1210は、ATCCに寄託され(1998年4月21日)、ATCC寄託番号209783が割り当てられている。
(実施例11:ヒトPRO339ポリペプチド[UNQ299]をコードするcDNAクローンの単離)
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTを同定した。Incyteクローンのアセンブリおよびコンセンサス配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して、形成した。
順方向および逆方向PCRプライマーを、アセンブリ形成コンセンサス配列に基づいて合成した:
順方向PCRプライマー1 5’−GGGATGCAGGTGGTGTCTCATGGGG−3’ (配列番号179)
順方向PCRプライマー2 5’−CCCTCATGTACCGGCTCC−3’ (配列番号180)
順方向PCRプライマー3 5’−GTGTGACACAGCGTGGGC−3’ (配列番号181)
順方向PCRプライマー4 5’−GACCGGCAGGCTTCTGCG−3’ (配列番号182)
逆方向PCRプライマー1 5’−CAGCAGCTTCAGCCACCAGGAGTGG−3’ (配列番号183)
逆方向PCRプライマー2 5’−CTGAGCCGTGGGCTGCAGTCTCGC−3’ (配列番号184)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサス配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CCGACTACGACTGGTTCTTCATCATGCAGGATGACACATATGTGC−3’ (配列番号185)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO339遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児肝臓組織から単離した。
cDNAクローンの全体を配列決定した。DNA43466−1225のヌクレオチド配列全体を、図15(配列番号15)に示す。クローンDNA43466−1225は、ヌクレオチド333−335位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2649−2651位に見られた終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(配列番号15;図15)。予測されるポリペプチド前駆体は、772アミノ酸長であり、分子量が約86,226ダルトンであると算出された(図16;配列番号16)。クローンDNA43466−1225は、ATCCに寄託され(1997年11月21日)、ATCC寄託番号ATCC209490が割り当てられている。
完全長配列のBLASTおよびFastA配列アラインメント解析(ALIGNコンピュータプログラムを使用した)に基づいて、PRO339は、C.elegansタンパク質およびコラーゲン様ポリマー配列ならびにフリンジ(fringe)に対する相同性を有し、それによって、PRO339は、発生または組織増殖に関連し得ることが示唆される。
(実施例12:ヒトPRO341ポリペプチド[UNQ300]をコードするcDNAクローンの単離)
本明細書中でDNA12920と命名されたクローンを、上の実施例2に記載したようにヒト胎盤組織ライブラリから単離した。次いで、DNA12920配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む様々なESTデータベースと比較することにより、相同なEST配列を同定した。比較は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA25314と命名する。次いで、DNA25314配列に基づいてオリゴヌクレオチドプライマーを合成し、ヒト胎盤cDNAライブラリをスクリーニングするために使用し、図17に示されるDNA26288−1239クローンが同定された。クローニングベクターは、pRK5B(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)であり、cDNAを2800bp未満に切断した。
ヌクレオチド380−382位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1754−1756位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローンを、同定した(図17;配列番号17)。予測されるポリペプチド前駆体は、458アミノ酸長であり、約50,264ダルトンという算出された分子量および約8.17という推定pIを有する。図18(配列番号18)に示される完全長PRO341配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約17のシグナルペプチド、アミノ酸約171〜アミノ酸約190、アミノ酸約220〜アミノ酸約239、アミノ酸約259〜アミノ酸約275、アミノ酸約286〜アミノ酸約305、アミノ酸約316〜アミノ酸約335、アミノ酸約353〜アミノ酸約378およびアミノ酸約396〜アミノ酸約417の膜貫通型ドメインならびにアミノ酸約145〜アミノ酸約147およびアミノ酸約155〜アミノ酸約158の潜在的N−グリコシル化部位の存在が明らかになる。クローンDNA26288−1239は、1998年4月21日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209792が割り当てられている。
図18(配列番号18)に示される完全長配列のWU−BLAST−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO341アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S75696、H69788、D69852、A69888、B64918、F64752、LPU89276_1、G64962、S52977およびS44253との間の相同性が明らかになった。
(実施例13:ヒトPRO347ポリペプチド[UNQ306]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA39499と命名される。DNA39499コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO347についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を以下のとおりに合成した:
順方向PCRプライマー 5’−AGGAACTTCTGGATCGGGCTCACC−3’ (配列番号186)
逆方向PCRプライマー 5’−GGGTCTGGGCCAGGTGGAAGAGAG−3’ (配列番号187)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA39499配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTC−3’ (配列番号188)。
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO347遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した(LIB228)。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO347[本明細書中でDNA44176−1244と命名](配列番号19)の完全長DNA配列およびPRO347の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA44176−1244のヌクレオチド配列全体を、図19(配列番号19)に示す。クローンDNA44176−1244は、ヌクレオチド123−125位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1488−1490位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図19)。予測されるポリペプチド前駆体は、455アミノ酸長である(図20;配列番号20)。図20に示される完全長PRO347タンパク質は、推定分子量が約50,478ダルトンであり、pIが約8.44である。クローンDNA44176−1244は、ATCCに寄託され(1997年12月10日)、ATCC寄託番号ATCC209532が割り当てられている。
完全長PRO347ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その一部が、様々なシステインリッチ分泌タンパク質に対して著しい相同性を有することが示唆され、それにより、PRO347が新規のシステインリッチ分泌タンパク質であり得ることが示唆される。
(実施例14:ヒトPRO531ポリペプチド[UNQ332]をコードするcDNAクローンの単離)
ECDデータベースを検索し、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからのプロトカドヘリン3に対する相同性を示した発現配列タグ(EST)を同定した。この配列に基づいて、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他のEST配列に関して構築した。得られたコンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO531についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマーの対(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−CTGAGAACGCGCCTGAAACTGTG−3’ (配列番号189);
逆方向PCRプライマー 5’−AGCGTTGTCATTGACATCGGCG−3’ (配列番号190)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTAGTTGCTCCATTCAGGAGGATCTACCCTTCCTCCTGAAATCCGCGGAA−3’ (配列番号191)。
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO531遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児脳組織から単離した(LIB153)。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO531[本明細書中でUNQ332(DNA48314−1320)と命名](配列番号21)の完全長DNA配列およびPRO531の誘導タンパク質配列が得られた。
UNQ332(DNA48314−1320)の代表的なヌクレオチド配列全体を、図21(配列番号21)に示す。実際の配列が、DNA48314−1320としてATCCに寄託されたクローン内の配列であることが理解される。クローンUNQ332(DNA48314−1320)は、ヌクレオチド171−173位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2565−2567位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図21)。予測されるポリペプチド前駆体は、789アミノ酸長である(図22;配列番号22)。図22に示される完全長PRO531タンパク質は、推定分子量が約87,552ダルトンであり、pIが約4.84である。クローンUNQ332(DNA48314−1320)は、1998年3月26日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209702が割り当てられている。
完全長PRO531ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その一部が、プロトカドヘリン3に対して著しい相同性を有することが示唆される。さらに、PRO531は、他のプロトカドヘリンと同様に、脳に見られることにより、PRO531がカドヘリンスーパーファミリーの新規のメンバーであることが示唆される。
配列番号22のアミノ酸配列をさらに解析すると、カドヘリン細胞外反復ドメインシグネチャーが、配列番号22のアミノ酸約122−132、231−241、336−346、439−449および549−559に見られる。ATP/GTP−結合部位モチーフA(P−ループ)が、配列番号22のアミノ酸約285−292に見られる。N−グリコシル化部位が、配列番号22の少なくともアミノ酸約567−570、786−790、418−421および336−339に見られる。シグナルペプチドは、アミノ酸約1−26であり、膜貫通型ドメインは、配列番号22のアミノ酸約685−712である。
(実施例15:ヒトPRO537ポリペプチド[UNQ338]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyte ESTクラスター番号29605と命名される、IncyteデータベースからのESTクラスター配列が同定された。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA48350と命名する。
DNA48350コンセンサス配列とMerck ESTクローン番号R63443内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、Merck ESTクローンR63443を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図23に示し、本明細書中でDNA49141−1431と命名する。
クローンDNA49141−1431は、ヌクレオチド97−99位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド442−444位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図23;配列番号23)。予測されるポリペプチド前駆体は、115アミノ酸長である(図24;配列番号24)。図24に示す完全長PRO537タンパク質は、推定分子量が約13,183ダルトンであり、pIが約12.13である。図24(配列番号24)に示される完全長PRO537配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約31のシグナルペプチド、アミノ酸約44〜アミノ酸約47の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約3〜アミノ酸約8およびアミノ酸約16〜アミノ酸約21の潜在的N−ミリストイル化部位ならびにアミノ酸約97〜アミノ酸約105のマルチ銅オキシダーゼタンパク質に対する相同性を有するアミノ酸ブロックの存在が明らかになる。クローンDNA49141−1431は、1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203003が割り当てられている。
図24(配列番号24)に示される完全長配列のWU−BLAST−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO537アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:A54523、CELF22H10_2、FKH4_MOUSE、OTX1_HUMAN、URB1_USTMA、KNOB_PLAFN、A32895_1、AF036332_1、HRG_HUMANおよびHRP3_PLAFSとの間の相同性が明らかになった。
(実施例16:ヒトPRO718ポリペプチド[UNQ386]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例2(ヒト胎児肺ライブラリ)に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列を、本明細書中でDNA43512と命名する。次いで、DNA43512配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA45625と命名する。企業のGenentech EST配列を、アセンブリに使用した。
DNA45625配列に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを生成し、上の実施例2の段落1に記載したように調製されたヒト胎児肺ライブラリ(LIB25)をスクリーニングするために使用した。クローニングベクターは、pRK5B(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)であり、cDNAを2800bp未満に切断した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−GGGTGGATGGTACTGCTGCATCC−3’ (配列番号192)
逆方向PCRプライマー5’−TGTTGTGCTGTGGGAAATCAGATGTG−3’ (配列番号193)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA45625配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GTGTCTGGAGGCTGTGGCCGTTTTGTTTTCTTGGGCTAAAATCGGG−3’ (配列番号194)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO718遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
ヌクレオチド36−38位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド607−609位に見られた終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローンを、同定した(図25;配列番号25)。予測されるポリペプチド前駆体は、157アミノ酸長であり、約17,400ダルトンという算出された分子量および約5.78という推定pIを有する。図26(配列番号26)に示される完全長PRO718配列の解析により、以下:アミノ酸約21〜アミノ酸約40のII型膜貫通型ドメインならびにアミノ酸約58〜アミノ酸約78,アミノ酸約95〜アミノ酸約114およびアミノ酸約127〜アミノ酸約147の他の膜貫通型ドメイン;アミノ酸約79〜アミノ酸約81の細胞接着配列;ならびにアミノ酸約53〜アミノ酸約56の潜在的N−グリコシル化部位の存在が明らかになった。クローンDNA49647−1398は、1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209919が割り当てられている。
完全長PRO718ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、完全長PRO718ポリペプチドが、任意の既知タンパク質との著しい配列類似性を有しないことが示唆される。しかしながら,Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO718アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF045606_1,AF039906_1,SPBC8D2_2,S63441,F64728,COX1_TRYBB,F64375,E64173,RPYGJT_3, MTCY261_23との間でいくらかの程度の相同性が明らかになった。
(実施例17:ヒトPRO773ポリペプチド[UNQ411]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、(1)企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)および(2)Genentechの企業ESTデータベースを含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に対して構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA40751と命名する。いくつかの場合において、このコンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長することにより、上に記載したEST配列の起源を使用してできる限り中間コンセンサス配列を伸長した中間コンセンサスDNA配列に由来する。
DNA40751コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO773の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−CCTGGGCTCTGGCTCTTCTTTCAG−3’ (配列番号195)
逆方向PCRプライマー 5’−CCACTCAGAGGCCTCAGCTTTTCC−3’ (配列番号196)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40751配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTTCGGCCACCCAGGCACGGAAAGGCTTCTGGGACTACTTCAGCC−3’ (配列番号197)
cDNAライブラリを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、完全長PRO773ポリペプチド(本明細書中でDNA48303−2829と命名[図27,配列番号27])の完全長DNA配列およびPRO773ポリペプチドの誘導タンパク質配列が得られた。
上で同定された完全長クローンは、ヌクレオチド12−14位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド834−836位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図27;配列番号27)。予測されるポリペプチド前駆体は、274アミノ酸長であり、約30754ダルトンという算出された分子量および約7.77という推定pIを有する。図28(配列番号28)に示される完全長PRO773配列の解析により、図28に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになり、ここで、それらの重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおおよそのものである。染色体マッピングにより、PRO773をコードする核酸が、ヒトの染色体11q23にマッピングされることが明らかになる。クローンDNA48303−2829は、2000年2月8日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1342が割り当てられている。
図28(配列番号28)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO773アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:APA4_PIG、APA4_MACFA、APA4_HUMAN、APA4_PAPAN、P_R45244、P_R39501、P_R39499、APA4_RAT、APA4_MOUSEおよびP_R34032との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例18:ヒトPRO871ポリペプチド[UNQ438]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例1に記載したように種々のEST配列に対するコンセンサス配列を得た。ここで、得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA40324と命名した。DNA40324コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO871の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー1 5’−TGCGGAGATCCTACTGGCACAGGG−3’ (配列番号198)
順方向PCRプライマー2 5’−CGAGTTAGTCAGAGCATG−3’ (配列番号NO:199)
順方向PCRプライマー3 5’−CAGATGGTGCTGTTGCCG−3’ (配列番号200)
逆方向PCRプライマー1 5’−CAACTGGAACAGGAACTGAGATGTGGATC−3’ (配列番号201)
逆方向PCRプライマー2 5’−CTGGTTCAGCAGTGCAAGGGTCTG−3’ (配列番号202)
逆方向PCRプライマー3 5’−CCTCTCCGATTAAAACGC−3’ (配列番号203)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40324配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ5’−GAGAGGACTGGTTGCCATGGCAAATGCTGGTTCTCATGATAATGG−3’ (配列番号204)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対の一方を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO871遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した(LIB227)。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO871[本明細書中でUNQ438(DNA50919−1361)と命名](配列番号31)の完全長DNA配列およびPRO871の誘導タンパク質配列が得られた。
UNQ438(DNA50919−1361)のヌクレオチド配列全体を、図31(配列番号31)に示す。クローンUNQ438(DNA50919−1361)は、ヌクレオチド191−193位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1607−1609位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図31)。予測されるポリペプチド前駆体は、472アミノ酸長である(図32;配列番号32)。図32に示される完全長PRO871タンパク質は、推定分子量が約53,847ダルトンであり、pIが約5.75である。図32(配列番号32)に示される完全長PRO871配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約21のシグナルペプチド、アミノ酸約109〜アミノ酸約112およびアミノ酸約201〜アミノ酸約204の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約49〜アミノ酸約66のシクロフィリン型ペプチジ−プロリルシス−トランスイソメラーゼシグネチャー配列ならびにアミノ酸約96〜アミノ酸約140、アミノ酸約49〜アミノ酸約89およびアミノ酸約22〜アミノ酸約51のシクロフィリン型ペプチジ−プロリルシス−トランスイソメラーゼに相同である領域の存在が明らかになる。クローンUNQ438(DNA50919−1361)は、1998年5月6日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209848が割り当てられている。
完全長PRO871ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その一部が、シクロフィリンファミリーのタンパク質に対して著しい配列同一性を有することが示唆され、それにより、PRO871が新規のシクロフィリンタンパク質ファミリーメンバーであり得ることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO871アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:SPBC16H5_5、S64705、YAL5_SCHPO、CYP4_CAEEL、CELC34D4_7、CYPA_CAEEL、HUMORF006_1、CYPI_MYCTU、AF043642_lおよびHSSRCYP_1との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例19:ヒトPRO872ポリペプチド[UNQ439]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、本明細書中でclul20709.init.と命名される単一のIncyte EST配列が同定できた。次いで、clul20709.init配列を、企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)と比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA48254と命名する。
DNA48254コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号3438068内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン3438068を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列は、図33に示され、PRO872の完全長DNA配列である。クローンDNA49819−1439は、1998年6月2日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209931が割り当てられている。
DNA49819−1439のヌクレオチド配列全体を、図33(配列番号33)に示す。クローンDNA49819−1439は、ヌクレオチド14−16位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1844−1846位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含む(図33)。予測されるポリペプチド前駆体は、610アミノ酸長である(図34;配列番号34)。図34に示される完全長PRO872タンパク質は、推定分子量が約66,820ダルトンであり、pIが約8.65である。図34(配列番号34)に示される完全長PRO872配列の解析により、以下:アミノ酸1〜約 18のシグナルペプチド、アミノ酸約70−87、200−222および568−588の推定膜貫通型ドメイン;アミノ酸約71−105の細菌型フィトエンデヒドロゲナーゼタンパク質との配列同一性;アミノ酸約201−211の染色体凝縮(RCC1)シグネチャー2の制御因子との配列同一性;アミノ酸約214−235、221−242、228−249および364−385のロイシンジッパーパターン;アミノ酸約271−274の潜在的N−グリコシル化部位;ならびにアミノ酸約75−78のグリコサミノグリカン接着部位の存在が明らかになる。Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)を使用した完全長PRO872ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、PRO872アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PRCRTI_1、S75951、S74689、CELF37C4_3、CRTI_RHOCA、S76617、YNI2_METTL、MTV014_14、AOFB_HUMANおよびMMU70429_1との間の相同性が明らかになった。
(実施例20:ヒトPRO813ポリペプチド[UNQ465]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のIncyte ESTクラスター配列(Incyte ESTクラスター配列番号45501が同定できた。次いで、Incyte ESTクラスター配列番号45501の配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56400と命名する。
DNA56400コンセンサス配列とMerck ESTクローン番号T90592内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、Merck ESTクローンT90592を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図35に示し、本明細書中でDNA57834−1339と命名する。
図35に示される完全長クローンは、ヌクレオチド109−111位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド637−639位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図35;配列番号35)。予測されるポリペプチド前駆体は、176アミノ酸長であり、約19,616ダルトンという算出された分子量および約7.11という推定pIを有する。図36(配列番号36)に示される完全長PRO813配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約26のシグナルペプチドおよびアミノ酸約48〜アミノ酸約53、アミノ酸約153〜アミノ酸約158、アミノ酸約156〜アミノ酸約161およびアミノ酸約167〜アミノ酸約172の潜在的N−ミリストイル化部位の存在が明らかになる。クローンDNA57834−1339は、1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209954が割り当てられている。
完全長PRO813ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、完全長PRO813ポリペプチドが肺サーファクタント関連タンパク質Cとの配列類似性を有することが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO813アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、PSPC−MUSVI、P_P92071、G02964、P_R65489、P_P82977、P_R84555、S55542、MUSIGHAJ_1およびPH1158との間のいくらかの程度の相同性が明らかになった。
(実施例21:ヒトPRO828ポリペプチド[UNQ469]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載した方法を使用して同定した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA35717と命名される。DNA35717コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO828についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−GCAGGACTTCTACGACTTCAAGGC−3’ (配列番号205);および
逆方向PCRプライマー 5’−AGTCTGGGCCAGGTACTTGAAGGC−3’ (配列番号206)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35717配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CAACATCCGGGGCAAACTGGTGTCGCTGGAGAAGTACCGCGGATCGGTGT−3’ (配列番号207)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO828遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児肺組織から単離した(LIB25)。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO828[本明細書中でDNA57037−1444と命名](配列番号37)の完全長DNA配列およびPRO828の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA57037−1444のヌクレオチド配列全体を、図37(配列番号37)に示す。クローンDNA57037−1444は、ヌクレオチド34−36位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド595−597位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図37)。予測されるポリペプチド前駆体は、187アミノ酸長である(図38;配列番号38)。図38に示される完全長PRO828タンパク質は、推定分子量が約20,996ダルトンであり、pIが約8.62である。図38(配列番号38)に示される完全長PRO828配列の解析により、以下:アミノ酸約1−21のシグナルペプチド;アミノ酸約82−89のグルタチオンペルオキシダーゼシグネチャー2との配列同一性;アミノ酸約35−60、63−100、107−134および 138−159のグルタチオンペルオキシダーゼセレノシステインタンパク質との配列同一性の存在が明らかになる。クローンDNA57037−1444は、1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209903が割り当てられている。
完全長PRO828ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、完全長PRO828ポリペプチドが、グルタチオンペルオキシダーゼとの著しい配列類似性を有することが示唆され、それにより、PRO828が新規のペルオキシダーゼ酵素であり得ることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO828アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF053311_1、CELT09A12_2、AC004151_3、BTUE_ECOLI、CER05H10_3、P_P80918、PWU88907_1およびP_W22308との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例22:ヒトPRO1100ポリペプチド[UNQ546]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
得られたコンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2305379内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン2305379を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図39に示し、本明細書中でDNA59619−1464と命名する。
DNA59619−1464のヌクレオチド配列全体を図39(配列番号39)に示す。クローンDNA59619−1464は、配列番号39(図39)のヌクレオチド33−35位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド993−995位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、320アミノ酸長である(図40;配列番号40)。図40に示された完全長PRO1100タンパク質は、推定分子量が約36,475ダルトンであり、pIが約7.29である。クローンDNA59619−1464は、1998年7月1日にATCCに寄託された(ATCC寄託番号203041)。寄託されたクローンが実際の核酸配列を有し、本明細書中で提供される配列は、公知の配列決定技術に基づくことが理解される。
配列番号40を解析するとき、シグナルペプチド、膜貫通型ドメイン、N−グリコシル化部位、N−ミリストイル化部位、CUBドメインおよびアミロライド感受性ナトリウムチャネルドメインのおよその位置が存在する。PRO1100は、チャネルとして機能し得ると考えられる。これらのアミノ酸に対応する核酸および他のものは、配列番号40が与えられるとき、慣習的に決定され得る。
(実施例23:ヒトPRO1114ポリペプチド[UNQ557]をコードするcDNAクローンの単離)
実施例2に記載されたアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列が、WU−BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムによって他の既知インターフェロンレセプターとの一定の配列同一性を有することが見出された。このcDNA配列を、本明細書中でDNA48466と命名する。その配列同一性に基づいて、プローブを、DNA48466分子の配列から生成し、上の実施例2の段落1に記載したように調製したヒト乳癌ライブラリ(LIB135)をスクリーニングするために使用した。クローニングベクターは、pRK5B(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science.253:1278−1280(1991)を参照のこと)であり、cDNAを2800bp未満に切断した。
使用したオリゴヌクレオチドプローブは、以下のとおりであった:
順方向PCRプライマー 5’−AGGCTTCGCTGCGACTAGACCTC−3’ (配列番号208)
逆方向PCRプライマー 5’−CCAGGTCGGGTAAGGATGGTTGAG−3’ (配列番号209)
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTTCTACGCATTGATTCCATGTTTGCTCACAGATGAAGTGGCCATTCTGC−3’ (配列番号210)
ヌクレオチド250−252位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1183−1185位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローンを、同定した(図41;配列番号41)。予測されるポリペプチド前駆体は、311アミノ酸長であり、約35,076ダルトンという算出された分子量および約5.04という推定pIを有する。図42(配列番号42)に示される完全長PRO1114インターフェロンレセプター配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約29のシグナルペプチド、アミノ酸約230〜アミノ酸約255の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約40〜アミノ酸約43およびアミノ酸約134〜アミノ酸約137の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約92〜アミノ酸約119の組織因子タンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックならびにアミノ酸約232〜アミノ酸約262のインテグリンアルファ鎖タンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックの存在が明らかになる。クローンUNQ557(DNA57033−1403)は、1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209905が割り当てられている。
図42(配列番号42)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1114インターフェロンレセプターアミノ酸配列と以下のDayhoff配列:G01418、INR1_MOUSE、P_R71035、INGS_HUMAN、A26595_1、A26593_1、I56215およびTF_HUMANとの間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例24:ヒトPRO1115ポリペプチド[UNQ558]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースから、Incyte ESTクラスター配列番号165008と命名される、ESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA55726と命名する。
DNA55726コンセンサス配列とMerck ESTクローン番号R75784内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、Merck ESTクローンR75784を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図43に示し、本明細書中でDNA56868−1478と命名する。
図43に示される完全長クローンは、ヌクレオチド189−191位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1524−1526位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図43;配列番号43)。予測されるポリペプチド前駆体(図44,配列番号44)は、445アミノ酸長である。PRO1115は、約50,533ダルトンという算出された分子量および約8.26という推定pIを有する。さらなる特徴としては、アミノ酸約1−20のシグナルペプチド;アミノ酸約204−207、295−298および313−316の潜在的N−グリコシル化部位;ならびにアミノ酸約35−54、75−97、126−146、185−204、333−350および353−371の推定膜貫通型ドメインが挙げられる。
図44(配列番号44)に示される完全長配列のWU−BLAST−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1115アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF053947_79、S73698、CEC47A10_4、CCOMTNDS5G_1、HS4LMP2AC_1、LMP2_EBV、PA24_MOUSE、HCU33331_7、P−W05508、および AF002273_1との間のいくらかのアミノ酸配列同一性が明らかになった。
クローンDNA56868−1478は、1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203024が割り当てられている。
(実施例25:ヒトPRO1126ポリペプチド[UNQ564]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56250と命名する。
DNA56250コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号1437250内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン1437250を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図45に示し、本明細書中でDNA60615−1483と命名する。
クローンDNA60615−1483は、ヌクレオチド110−112位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1316−1318位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図45;配列番号45)。予測されるポリペプチド前駆体は、402アミノ酸長である(図46;配列番号46)。図46に示された完全長PRO1126タンパク質は、推定分子量が約45,921ダルトンであり、pIが約8.60である。図46(配列番号46)に示される完全長PRO1126配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約25のシグナルペプチドおよびアミノ酸約66〜アミノ酸約69、アミノ酸約138〜アミノ酸約141およびアミノ酸約183〜アミノ酸約186の潜在的N−グリコシル化部位の存在が明らかになる。クローンDNA60615−1483は、1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209980が割り当てられている。
図46(配列番号46)に示される完全長配列のWU−BLAST−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1126アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:I73636、NOMR_HUMAN、MMUSMYOC3_1、HS454G6_1、P_R98225、RNU78105_1、RNU72487_1、AF035301_1、CEELC48E7_4およびCEF11C3_3との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例26:ヒトPRO1133ポリペプチド[UNQ571]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。この配列を、phrapの繰り返しサイクルを使用して伸長した。伸長されたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA38102と命名する。DNA38102コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1133の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(2つの順方向および1つの逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー1 5’−TCGATTATGGACGAACATGGCAGC−3’ (配列番号211);
順方向PCRプライマー25’−TTCTGAGATCCCTCATCCTC−3’ (配列番号212);および
逆方向プライマー 5’−AGGTTCAGGGACAGCAAGTTTGGG−3’ (配列番号213)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA38102配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’TTTGCTGGACCTCGGCTACGGAATTGGCTTCCCTCTACGGACAGCTGGAT3’ (配列番号214)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO1133遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1133の完全長DNA配列およびPRO1133の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO1133のコード配列全体を、図47(配列番号47)に示す。クローンDNA53913−1490は、配列番号47のヌクレオチド266−268位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1580−1582位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、438アミノ酸長である(図48;配列番号48)。そのシグナルペプチドは、配列番号48のアミノ酸1−18である。EGF様ドメインシステインパターンシグネチャーは、図48の配列番号48の315および385から開始する。クローンDNA53913−1490は、ATCCに寄託され(1998年8月25日)、ATCC寄託番号203162が割り当てられている。図48に示される完全長PRO1133タンパク質は、約49,260ダルトンという推定分子量を有し、そのpIは、約6.15である。
図48(配列番号48)に示される完全長配列のWU−BLAST−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1133アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用されるデータベースからのデータ):AF002717_1、LMG1_HUMAN、B54665、UNC6_CAEEL、LML1_CAEEL、LMA5_MOUSE、MMU88353_1、LMAI_HUMAN、HSLN2C64_1およびAF005258_1との間のいくらかの配列同一性が明らかになった。
(実施例27:ヒトPRO1154ポリペプチド[UNQ584]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56025と命名する。
DNA56025コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2169375内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン2169375を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図49に示し、本明細書中でDNA59846−1503と命名する。
図49に示される完全長クローンは、ヌクレオチド86−88位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2909−2911位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図49;配列番号49)。予測されるポリペプチド前駆体(図50,配列番号50)は、941アミノ酸長である。PRO1154は、約107,144ダルトンという算出された分子量および約6.26という推定pIを有する。クローンDNA59846−1503は、ATCCに寄託され(1998年6月16日)、ATCC寄託番号209978が割り当てられている。
完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析(ALIGNコンピュータプログラムを使用)に基づいて、PRO1154は、少なくとも以下のDayhoff名:AB011097_1、AMPN_HUMAN、RNU76997_1、159331、GEN14047、HSU62768_1、P_R51281、CET07F10_1、SSU66371_1およびAMPRE_HUMANと配列同一性を示す。
(実施例28:ヒトPRO1185ポリペプチド[UNQ599]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56426と命名する。
DNA56426コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号3284411内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン3284411を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図51に示し、本明細書中でDNA62881−1515と命名する。
図51に示される完全長DNA62881−1515クローンは、ヌクレオチド4−6位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド598−600位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図51;配列番号51)。予測されるポリペプチド前駆体(図52,配列番号52)は、198アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号52のアミノ酸約1−21である。PRO1185は、約22,105ダルトンという算出された分子量および約7.73という推定pIを有する。クローンDNA62881−1515は、ATCCに寄託され(1998年8月4日)、ATCC寄託番号203096が割り当てられている。
図52(配列番号52)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1185アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:TUP1_YEAST、AF041382_1、MAOM_SOLTU、SPPBPHU9_1、I41024、EPCPLCFAIL_1、HSPLEC_1、YKL4_CAEEL、A44643、TGU65922_1との間のいくらかの配列同一性が明らかになった。
(実施例29:ヒトPRO1194ポリペプチド[UNQ607]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。そのESTの1個以上は、ヒト松果体ライブラリ由来であった。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56511と命名する。
DNA56511配列とMerck EST AA069568内に包含されるESTとの間の配列相同性に鑑みて、クローン382736を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図53に示し、本明細書中でDNA57841−1522と命名する。
図53に示される完全長クローンは、ヌクレオチド9−11位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド252−254位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図53;配列番号53)。予測されるポリペプチド前駆体(図54,配列番号54)は、81アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号54のアミノ酸約1−21である。PRO1194は、約9,223ダルトンという算出された分子量および約10.47という推定pIを有する。クローンDNA57841−1522は、1998年11月3日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203458が割り当てられている。
図54(配列番号54)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1194アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PT17_YEAST、RR2_CHLVU、CEK12F2_1、S22452、S76705、AF031898_7、A4_DROME、AF038931_1、E49905およびGSPL_AERHYとの間の配列同一性が明らかになった。
(実施例30:ヒトPRO1287ポリペプチド[UNQ656]をコードするcDNAクローンの単離)
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、フリンジ(fringe)タンパク質との相同性を示すESTを同定した。次いで、このEST配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々のESTデータベースと比較することにより、相同なEST配列を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、比較を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA40568と命名する。
DNA40568コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1287の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−CTCGGGGAAAGGGACTTGATGTTGG−3’ (配列番号215)
逆方向PCRプライマー1 5’−GCGAAGGTGAGCCTCTATCTCGTGCC−3’ (配列番号216)
逆方向PCRプライマー2 5’−CAGCCTACACGTATTGAGG−3’ (配列番号217)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40568配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CAGTCAGTACAATCCTGGCATAATATACGGCCACCATGATGCAGTCCC−3’ (配列番号218)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1287遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト骨髄組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1287(本明細書中でDNA61755−1554と命名[図55、配列番号55])の完全長DNA配列およびPRO1287の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA61755−1554のヌクレオチド配列全体を、図55(配列番号55)に示す。その完全長クローンは、ヌクレオチド655−657位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2251−2253位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図55、配列番号55)。予測されるポリペプチド前駆体は、532アミノ酸長であり、約61,351ダルトンという算出された分子量および約8.77という推定pIを有する。図56(配列番号56)に示される完全長PRO1287配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約27のシグナルペプチドならびにアミノ酸約315〜アミノ酸約318およびアミノ酸約324〜アミノ酸約327の潜在的N−グリコシル化部位の存在が明らかになる。クローンDNA61755−1554は、1998年8月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203112が割り当てられている。
図56(配列番号56)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1287アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CET24D1_1、EZRI_BOVIN、GGU19889_1、CC3_YEAST、S74244、NALS_MOUSE、MOES_PIG、S28660、S44860およびYNA4_CAEELとの間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例31:ヒトPRO1291ポリペプチド[UNQ659]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、120480と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56425と命名する。
DNA56425配列とIncyte ESTクローン番号2798803内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン2798803を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図57に示し、本明細書中でDNA59610−1556と命名する。
クローンDNA59610−1556は、ヌクレオチド61−63位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド907−909位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図57;配列番号57)。予測されるポリペプチド前駆体は、282アミノ酸長である(図58;配列番号58)。図58に示される完全長PRO1291タンパク質は、約30,878ダルトンという推定分子量および約5.27というpIを有する。図58(配列番号58)に示される完全長PRO1291配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約28のシグナルペプチド、アミノ酸約258〜アミノ酸約281の膜貫通型ドメインならびにアミノ酸約112〜アミノ酸約115、アミノ酸約160〜アミノ酸約163、アミノ酸約190〜アミノ酸約193、アミノ酸約196〜アミノ酸約199、アミノ酸約205〜アミノ酸約208、アミノ酸約216〜アミノ酸約219およびアミノ酸約220〜アミノ酸約223の潜在的N−グリコシル化部位の存在が明らかになる。クローンDNA59610−1556は、1998年6月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209990が割り当てられている。
図58(配列番号58)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1291アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU90552_1、HSU90144_1、AF033107_1、HSB73_1、HSU90142_1、GGCD80_1、P_W34452、MOG_MOUSE、B39371およびP_R71360との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例32:ヒトPRO1293ポリペプチド[UNQ662]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、Incyte ESTクラスター配列番号115204と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56522と命名する。
DNA56522配列とIncyte ESTクローン番号2966119内に包含されるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号2966119を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図59に示し、本明細書中でDNA60618−1557と命名する。
クローンDNA60618−1557は、ヌクレオチド37−39位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1060−1062位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図59;配列番号59)。予測されるポリペプチド前駆体は、341アミノ酸長である(図60;配列番号60)。図60に示される完全長PRO1293タンパク質は、約38,070ダルトンという推定分子量および約6.88というpIを有する。図60(配列番号60)に示される完全長PRO1293配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約19のシグナルペプチド、アミノ酸約237〜アミノ酸約262の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約205〜アミノ酸約208の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約151〜アミノ酸約152の細胞接着配列およびアミノ酸約115〜アミノ酸約140のコプロポルフィリノーゲンIIIオキシダーゼタンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックの存在が明らかになる。クローンDNA60618−1557は、1998年9月29日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203292が割り当てられている。
図60(配列番号60)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1293アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSVCD54_1、A33_HUMAN、AF009220_1、HSU82279_1、AF004230_1、P_R13272、AF004231_1、AF043644_1、S44125およびHSIGGHC85_1との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例33:ヒトPRO1310ポリペプチド[UNQ676]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA37164と命名される。DNA37164コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO1310についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー: 5’GTTCTCAATGAGCTACCCGTCCCC3’ (配列番号219)および
逆方向PCRプライマー:5’CGCGATGTAGTGGAACTCGGGCTC3’ (配列番号220)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47394配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’ATCCGCATAAACCCTCAGTCCTGGTTTGATAATGGGAGCATCTGCATGAG3’ (配列番号221)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1310遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児肝臓組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1310の完全長DNA配列およびPRO1310の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO1310のコード配列全体を、図61(配列番号61)に示す。クローンDNA47394−1572は、ヌクレオチド326−328位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2594−2596位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む(配列番号61)。予測されるポリペプチド前駆体は、765アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号62のアミノ酸約1−25である。クローンDNA47394−1572は、ATCCに寄託され(1998年8月11日)、ATCC寄託番号203109が割り当てられている。図62に示される完全長PRO1310タンパク質は、約85,898ダルトンという推定分子量および約6.87というpIを有する。
図62(配列番号62)に示される完全長配列のWU−BLAST−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1310アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF017639_1、P_W36817、JC5256、CBPH_HUMAN、MMU23184_1、CBPN_HUMAN、HSU83411_1、CEF01D4_7、RNU62897_1およびP_W11851との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例34:ヒトPRO1312ポリペプチド[UNQ678]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA55773を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示す酵母スクリーニングを使用してヒト胎児腎臓cDNAライブラリにおいて同定した。そのDNA55773配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、PRO1312の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
図63(配列番号63)に示される完全長DNA61873−1574クローンは、ヌクレオチド7−9位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド643−645位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた。予測されるポリペプチド前駆体は、212アミノ酸長である(図64、配列番号64)。PRO1312は、約24,024ダルトンという算出された分子量および約6.26という推定pIを有する。他の特徴としては、アミノ酸約1−14のシグナルペプチド;アミノ酸約141−160の膜貫通型ドメインならびにアミノ酸約76−79および93−96の潜在的N−グリコシル化部位が挙げられる。
図64(配列番号64)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1312アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:GCINTALPH_1、GIBMUCIA_1、P_R96298、AF001406_1、PVU88874_1、P_R85151、AF041409_1、CELC50F2_7、C45875およびAB009510_21との間のいくらかの相同性が明らかになった。
クローンDNA61873−1574は、ATCCに寄託され(1998年8月18日)、ATCC寄託番号203132が割り当てられている。
(実施例35:ヒトPRO1335ポリペプチド[UNQ690]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA35727と命名される。DNA35727コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1335についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー(35727.f1)5’−GTAAAGTCGCTGGCCAGC−3’ (配列番号222)
順方向PCRプライマー(35727.f2)5’−CCCGATCTGCCTGCTGTA−3’ (配列番号223)
逆方向PCRプライマー(35727.r1)5’−CTGCACTGTATGGCCATTATTGTG−3’ (配列番号224)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35727配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ(35727.p1)
5’−CAGAAACCCATGATACCCTACTGAACACCGAATCCCCTGGAAGCC−3’ (配列番号225)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1335遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト網膜組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1335(本明細書中でDNA62812−1594と命名[図65,配列番号65])の完全長DNA配列およびPRO1335の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA62812−1594のヌクレオチド配列全体を、図65(配列番号65)に示す。クローンDNA62812−1594は、ヌクレオチド271−273位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1282−1284位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図65)。予測されるポリペプチド前駆体は、337アミノ酸長である(図66;配列番号66)。図66に示される完全長PRO1335タンパク質は、約37,668ダルトンという推定分子量および約6.27というpIを有する。図66(配列番号66)に示される完全長PRO1335配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約15のシグナルペプチド、アミノ酸約291〜アミノ酸約310の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約213〜アミノ酸約216の潜在的N−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約197〜アミノ酸約245、アミノ酸約104〜アミノ酸約140およびアミノ酸約22〜アミノ酸約69の真核生物型炭酸脱水酵素タンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックの存在が明らかになる。クローンDNA62812−1594は、1998年9月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203248が割り当てられている。
図66(配列番号66)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1335アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF037335_1、I38013、PTPG_MOUSE、CAH2_HUMAN、ICAC、CAH7_HUMAN、CAH3_HUMAN、CAH1_HUMAN、CAH5_HUMANおよびP_R41746との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例36:ヒトPRO1339ポリペプチド[UNQ694]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA40652」と命名する。コンセンサス配列内のアセンブリはIncyte EST2479394であった。そのコンセンサス配列および他の発見ならびに本明細書中で提供される情報に基づいて、Incyte EST2479394を含むクローンを購入し、すべて配列決定した。配列決定により、図67に示す、PRO1339をコードする配列を含む核酸配列が提供された。
クローンDNA66669−1597は、図67(配列番号67)のヌクレオチド9−11位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1272−1274位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、421アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、図68(配列番号68)のアミノ酸約1−16である。亜鉛カルボキシペプチダーゼおよびN−グリコシル化部位において保存されている領域を、図68に示す。クローンDNA66669−1597は、ATCCに寄託され(1998年9月22日)、ATCC寄託番号203272が割り当てられている。図68に示される完全長PRO1339タンパク質は、約47,351ダルトンという推定分子量および約6.61というpIを有する。
図68(配列番号68)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1339アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用されるデータ):P_W01505、CBP1_HUMAN、HSA224866_1、P_R90293、YHT2_YEAST、CEF02D8_4、CEW01A8_6、P_W36815、HSU83411_1およびCBPN_HUMANとの間の配列同一性が明らかになった。
(実施例37:ヒトPRO1356ポリペプチド[UNQ705]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、Incyte ESTクラスター配列番号44725と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56023と命名する。
DNA56023配列とIncyte ESTクローン番号4071746内に包含されるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号4071746を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図71に示し、本明細書中でDNA64886−1601と命名する。
クローンDNA64886−1601は、ヌクレオチド122−124位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド812−814位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図71;配列番号71)。予測されるポリペプチド前駆体は、230アミノ酸長である(図72;配列番号72)。図72に示される完全長PRO1356タンパク質は、約24,549ダルトンという推定分子量および約8.56というpIを有する。図72(配列番号72)に示される完全長PRO1356配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約24のシグナルペプチド、アミノ酸約82〜アミノ酸約102、アミノ酸約117〜アミノ酸約140およびアミノ酸約163〜アミノ酸約182の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約190〜アミノ酸約193の潜在的N−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約46〜アミノ酸約59のPMP−22/EMP/MP20ファミリーのタンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックの存在が明らかになる。クローンDNA64886−1601は、1998年9月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203241が割り当てられている。
図72(配列番号72)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1356アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AB00014_1、AB000712_1、A39484、AF000959_1、AF035814_1、HSU89916_1、MMU19582_1、P_R30059、HUAC004125_1およびPM22_RATとの間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例38:ヒトPRO1385ポリペプチド[UNQ720]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA57952と命名する。
DNA57952コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号3129630内に包含されるESTとの間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン3129630を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図73に示し、本明細書中でDNA68869−1610と命名する。
クローンDNA68869−1610は、ヌクレオチド26−28位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド410−412位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図73;配列番号73)。予測されるポリペプチド前駆体は、128アミノ酸長である(図74;配列番号74)。図74に示される完全長PRO1385タンパク質は、約13,663ダルトンという推定分子量および約10.97というpIを有する。図74(配列番号74)に示される完全長PRO1385配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約28のシグナルペプチドならびにアミノ酸約82〜アミノ酸約85およびアミノ酸約91〜アミノ酸約94のグリコシルアミノグリカン接着部位の存在が明らかになる。クローンDNA68869−1610は、1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203164が割り当てられている。
図74(配列番号74)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1185アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CELT14A8_1,LMNACHRA1_1、HXD9_HUMAN、CHKCMLF_1、HS5PP34_2、DMDRING_1、A37107_1、MMLUNGENE_1、PUM_DROMEおよびDMU25117_1との間の低い相同性が明らかになった。
(実施例39:ヒトPRO1412ポリペプチド[UNQ730]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースから、Incyteクラスター番号101368と命名され、本明細書中で「DNA10643」とも呼ばれるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そのESTの1個以上は、雄性胎児から取り出された前立腺間質の線維芽細胞から単離されたRNA由来であった。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA58754」と命名する。
DNA58754配列とEST番号3597385内に含まれるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、ESTクローン3597385を購入し、cDNA挿入断片を得て、その全体を配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図75に示し、本明細書中で「DNA64897−1628」と命名する。
図75に示される完全長クローンは、ヌクレオチド142〜144位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1075〜1077位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図75;配列番号75)。予測されるポリペプチド前駆体(図76,配列番号76)は、311アミノ酸長である。PRO1412タンパク質の他の特徴としては:アミノ酸約1−28のシグナル配列;アミノ酸約190−216の膜貫通ドメイン;アミノ酸約49−52、91−94、108−111、128−131、135−138および190−193の潜在的N−グリコシル化部位;アミノ酸約62−69のチロシンキナーゼリン酸化部位;ならびにアミノ酸約183−224のリソソーム関連膜糖タンパク質重複ドメインが挙げられる。PRO1412は、約33,908ダルトンという算出された分子量および約6.87という推定pIを有する。クローンDNA64897−1628は、1998年9月15日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203216が割り当てられている。
図76(配列番号76)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1412アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:I50116、AF035963_1、NCA2_RAT、I61783、P_W07682、MMHC135G15_3、S21461、MMIGL2_1、ONHIGMV9A_1およびMMU70448_1との間のいくらかの相同性が明らかになった。
(実施例40:ヒトPRO1487ポリペプチド[UNQ756]をコードするcDNAクローンの単離)
本明細書中で「DNA8208」と呼ばれる単一のMerck ESTのHSC2ID011を、上の実施例1において記載されたように既知タンパク質をコードしなかった70またはそれ以上のBLASTスコアを有する目的のESTとして同定した。そのDNA8208配列を、BLASTおよびプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)の繰り返しサイクルを使用して伸長することにより、上で記載したEST配列の起源を使用してその配列をできる限り伸長した。得られたコンセンサス配列を本明細書中で「DNA68836」と命名する。DNA68836コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1487の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー: GTGCCACTACGGGGTGTGGACGAC (54209.f1;配列番号226) および
逆方向PCRプライマー TCCCATTTCTTCCGTGGTGCCCAG (54209.r1;配列番号227)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA68836配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ CCAGAAGAAGTCCTTCATGATGCTCAAGTACATGCACGACCACTAC (54209.p1;配列番号228)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1487遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1487(本明細書中でDNA68836−1656と命名(図77A−77B;配列番号77))の完全長DNA配列およびPRO1487の誘導タンパク質配列(図78;配列番号78)が得られた。
PRO1487のコード配列全体を、図77A−77B(配列番号77)に示す。クローンDNA68836−1656は、ヌクレオチド489−491位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2895−2897位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、802アミノ酸長である。図78に示される完全長PRO1487タンパク質は、約91,812ダルトンという推定分子量および約9.52というpIを有する。さらなる特徴としては、アミノ酸約1−23のシグナルペプチド;アミノ酸約189−192、623−626および796−799の潜在的N−グリコシル化部位;ならびにアミノ酸約62−64の細胞接着配列が挙げられる。
図78(配列番号78)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1487アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CET24D1_1、S44860、CELC02H6_1、CEC38H2_3、CELC17A2_5、CET09E11_10、CEE03H4_3、CELT22B11_3、GGU82088_1およびCEF56H6_1との間の著しい相同性が明らかになった。
クローンDNA68836−1656は、1998年11月3日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203455が割り当てられている。
(実施例41:ヒトPRO1758ポリペプチド[UNQ831]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースから、ESTクラスター番号20926と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、上述のデータベースからの種々の発現配列タグ(EST)と比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56260と命名する。
DNA56260配列とLIFESEQ(登録商標)データベースからのEST番号2936330内に含まれる配列との間の配列相同性に鑑みて、無脳体で死亡した胎児の胸腺組織から構築されたライブラリから生じた、そのESTクローンを購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図79に示し、本明細書中でDNA76399−1700と命名する。
図79に示される完全長クローンは、ヌクレオチド78〜80位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド549−551位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図79;配列番号79)。予測されるポリペプチド前駆体(図80,配列番号80)は、157アミノ酸長である。PRO1758は、約17,681ダルトンという算出された分子量および約7.65という推定pIを有する。さらなる特徴としては:アミノ酸約1−15のシグナルペプチド;アミノ酸約24−27の潜在的N−グリコシル化部位;アミノ酸約27−30のcAMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約60−63のカゼインキナーゼIIリン酸化部位;アミノ酸約17−22、50−55、129−134および133−138の潜在的N−ミリストイル化部位;アミノ酸約153−155の細胞接着配列;ならびにアミノ酸約18−23のシトクロムcファミリーヘム結合部位シグネチャーが挙げられる。
図80(配列番号80)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1758アミノ酸配列と以下のDayhoff配列番号AC005328_2との間の著しい相同性が明らかになった。相同性は、PRO1758アミノ酸配列とDayhoff配列番号CELC46F2_1との間においても見られた。
クローンDNA76399−1700は、1998年11月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203472が割り当てられている。
(実施例42:ヒトPRO1779ポリペプチド[UNQ841]をコードするcDNAクローンの単離)
(1.オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
mRNAを、Invitrogen,San Diego,CA(Fast Track2)の試薬およびプロトコルを使用してヒト乳癌組織から単離した。このRNAを使用し、Life Technologies,Gaithersburg,MD(Super Script Plasmid System)の試薬およびプロトコルを使用して、ベクターpRK5Dに、オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリを生成した。この手順において、二本鎖cDNAのうち、1000bpより大きいものを分離し、SalI/NotIリンカー付加されたcDNAを、XhoI/NotI切断されたベクターにクローニングした。pRK5Dは、XhoI/NotI cDNAクローニング部位の前に、sp6転写開始部位、SfiI制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。
(2.ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すために、2次cDNAライブラリを構築した。Sp6RNAを1次ライブラリ(上記)から生成し、このRNAを使用し、Life Technologies(Super Script Plasmid System,上を参照のこと)の試薬およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリをベクターpSST−AMY.0に構築した。この手順において、二本鎖cDNAを、500〜1000bpに分離し、NotIアダプターに平滑末端でリンカー付加し、SfiIで切断し、そしてSfiI/NotIで切断されたベクターにクローニングした。pSST−AMY.0は、cDNAクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列(分泌シグナルなしの成熟配列)の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたcDNAは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。
(3.形質転換および検出)
上の段落2に記載したライブラリ由来のDNAを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントDH10B細菌(Life Technologies,20ml)に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、SOC培地(Life Technologies,1ml)を加えて、混合物を37℃で30分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な150mmLBプレート20枚に播き、16時間インキュベートした(37℃)。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのDNAを標準的なプロトコル、例えば、CsCl勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたDNAを以下の酵母プロトコルに用いた。
酵母法は、3つのカテゴリーに分けられる:(1)プラスミド/cDNA結合ベクターによる酵母の形質転換;(2)アミラーゼを分泌する酵母クローンの検出および単離;ならびに(3)酵母コロニーからの直接の挿入断片のPCR増幅ならびに配列決定およびさらなる解析のためのそのDNAの精製。
使用した酵母株は、HD56−5A(ATCC−90785)であった。この株は、以下の遺伝子型:MATアルファ、ura3−52、leu2−3、leu2−112、his3−11、his3−15、MAL、SUC、GALを有する。好ましくは、翻訳後経路を欠く酵母変異体が、使用され得る。このような変異体は、sec71、sec72、sec62において転座不全対立遺伝子を有し得、切断されたsec71が最も好ましい。あるいは、これらの遺伝子の正常な作用を干渉するアンタゴニスト(アンチセンスヌクレオチドおよび/またはリガンドを含む)、この翻訳後経路に関連する他のタンパク質(例えば、SEC61p、SEC72p、SEC62p、SEC63p、TDJ1pまたはSSA1p−4p)またはこれらのタンパク質の複合体形成物もまた、好ましくは、アミラーゼを発現する酵母と組み合わせて使用され得る。
形質転換は、Gietz et al.,Nucl.Acid.Res.,20:1425(1992)によって概説されているプロトコルに基づいて行われた。次いで、形質転換された細胞を寒天からYEPD複合培地ブロス(100ml)に接種し、30℃で一晩生育した。YEPDブロスを、Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY,p.207(1994)に記載されているように調製した。次いで、一晩培養したものを、新鮮YEPDブロス(500ml)に約2×10細胞/ml(およそOD600=0.1)に希釈し、1×10細胞/ml(およそOD600=0.4〜0.5)まで再び生育した。
次いで、細胞を回収し、形質転換に向けて調製し、GS3ローター瓶に移し、Sorval GS3ローターにて5,000rpmで5分間、遠心分離し、上清を廃棄し、次いで、滅菌水に再懸濁し、Beckman GS−6KR遠心機において、50mlファルコンチューブにて3,500rpmで再度遠心分離した。その上清を廃棄し、続いて細胞をLiAc/TE(10ml,10mM Tris−HCl,1mM EDTA pH7.5,100mM LiOOCCH)で洗浄し、LiAc/TE(2.5ml)に再懸濁した。
微量遠心チューブ内で、調製した細胞(100μl)と、新たに変性された一本鎖サケ精巣DNA(Lofstrand Labs,Gaithersburg,MD)と形質転換DNA(1μg、10μl未満の体積)とを混合することによって形質転換を起こした。混合物をボルテックスにより手短に混合し、次いで、40%PEG/TE(600μl,40%ポリエチレングリコール−4000,10mM Tris−HCl,1mM EDTA,100mM LiOOCCH,pH7.5)を加えた。この混合物を穏やかに混合し、30分間、撹拌しながら30℃でインキュベートした。次いで、細胞を15分間、42℃の熱ショックにかけ、反応容器を12,000rpmで5〜10秒間微量遠心し、デカントし、そしてTE(500μl,10mM Tris−HCl,1mM EDTA pH7.5)に再懸濁した後、再度遠心分離した。次いで、細胞をTE(1ml)に希釈し、アリコート(200μl)を、150mm増殖プレート(VWR)に予め調製された選択培地に播いた。
あるいは、多数の少量反応の代わりに、形質転換を、単一の大規模反応を使用して実施し、ここで試薬の量は、それに合うようにスケールアップした。
使用した選択培地は、Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY,p.208−210(1994)に記載されているように調製されたウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天(SCD−Ura)であった。形質転換体を、30℃にて2〜3日間生育した。
アミラーゼを分泌するコロニーの検出を、選択増殖培地中に赤デンプンを含ませることによって行った。Biely et al.,Anal. Biochem.,172:176−179(1988)によって報告されている手順により、デンプンを赤色色素(Reactive Red−120,Sigma)に結合させた。結合したデンプンを、最終濃度0.15%(w/v)でSCD−Ura寒天プレートに取り込ませ、リン酸カリウムを用いてpH7.0(50〜100mMの最終濃度)まで緩衝した。
十分に分離し、同定可能な単一のコロニーを得るために、陽性のコロニーを拾い、新鮮選択培地(150mmプレート上)に画線した。アミラーゼ分泌が陽性の十分に分離した単一のコロニーを、緩衝SCD−Ura寒天に赤デンプンを直接取り込むことによって検出した。陽性のコロニーを、デンプンを分解して、陽性のコロニーの周辺に直接可視化されるクリアなハローを生じる能力によって判定した。
(4.PCR増幅によるDNAの単離)
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、96ウェルプレート内の滅菌水(30μl)に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート(5μl)を、25μl容量中、以下:0.5μlのKlentaq(Clontech,Palo Alto,CA);4.0μlの10mM dNTP’s(Perkin Elmer−Cetus);2.5μlのKentaq緩衝液(Clontech);0.25μlの順方向オリゴ1;0.25μlの逆方向オリゴ2;12.5μlの蒸留水を含むPCR反応用の鋳型として使用した。順方向オリゴヌクレオチド1の配列は:
5’−TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT−3’ (配列番号151)であった。
逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:
5’−CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT−3’ (配列番号152)であった。
次いで、PCRを以下のとおりに行った:
Figure 2008532516
a.変性 92℃、5分
b.変性 92℃、30秒
アニーリング 59℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
c.変性 92℃、30秒
アニーリング 57℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
d.変性 92℃,30秒
アニーリング 55℃,30秒
伸長 72℃,60秒を25サイクル
e.4℃保持
オリゴヌクレオチドの下線を引いた領域を、それぞれ、ADHプロモーター領域およびアミラーゼ領域にアニーリングさせ、挿入断片が存在しないとき、ベクターpSST−AMY.0から307bpの領域を増幅した。代表的には、これらのオリゴヌクレオチドの5’末端の最初の18ヌクレオチドは、配列決定プライマー用のアニーリング部位を含んでいた。従って、空のベクターからのPCR反応の総産物は、343bpであった。しかしながら、シグナル配列融合cDNAは、かなり長いヌクレオチド配列を生じた。
PCRの後、反応物(5μl)のアリコートを、Sambrook et al.,前出に記載されているようなTris−ホウ酸塩−EDTA(TBE)緩衝液系を使用した1%アガロースゲルのアガロースゲル電気泳動にかけた。400bpより長い単一の強力なPCR産物を生じたクローンを、96Qiaquick PCR精製カラム(Qiagen Inc.,Chatsworth,CA)で精製後、DNA配列決定によってさらに解析した。
(5.完全長クローンの同定)
上記スクリーニングにおいて単離されたcDNA配列を本明細書中でDNA66065と命名する。次いで、そのDNA66065配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)、企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)および企業Genentech ESTデータベースを含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。コンセンサス配列を、本明細書中でDNA67977と命名する。企業Genentech EST配列をアセンブリに使用し、本明細書中でDNA66217と命名する。
DNA67977コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを、上の段落1に記載したように調製されたヒト乳癌(LIB135)ライブラリをスクリーニングするために生成し、使用した。クローニングベクターは、pRK5Bであり(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)、cDNAを、2800bp未満の大きさに切断した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー(67977.f1)5’−TCCTTCGGCTGCTGTGATCAGCAC−3’ (配列番号229)
逆方向PCRプライマー(67977.r1)5’−CCCAGGTGGCGGTTGAGATAGTCG−3’ (配列番号230)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA67977配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ(67977.p1)
5’−CGCTGCCCGGTACTGGGACATCATGGAATATTTTGATCTGAAGAG−3’ (配列番号231)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO1779遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
ヌクレオチド41−43位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2213−2215位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる完全長クローンを、同定した(図81;配列番号81)。予測されるポリペプチド前駆体は、724アミノ酸長であり、約80,779ダルトンという算出された分子量および約9.34という推定pIを有する。図82A−82B(配列番号82)に示される完全長PRO1779配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約41のシグナルペプチド、アミノ酸約17〜アミノ酸約36の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約372〜アミノ酸約375およびアミノ酸約480〜アミノ酸約483の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約645〜アミノ酸約648およびアミノ酸約699〜アミノ酸約702のcAMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、アミノ酸約81〜アミノ酸約88のチロシンキナーゼリン酸化部位、アミノ酸約11〜アミノ酸約16、アミノ酸約37〜アミノ酸約42、アミノ酸約156〜アミノ酸約161、アミノ酸約165〜アミノ酸約170、アミノ酸約357〜アミノ酸約362、アミノ酸約365〜アミノ酸約370、アミノ酸約368〜アミノ酸約373、アミノ酸約408〜アミノ酸約413、アミノ酸約459〜アミノ酸約464、アミノ酸約548〜アミノ酸約553およびアミノ酸約557〜アミノ酸約562の潜在的N−ミリストイル化(myristolation)部位、アミノ酸約391〜アミノ酸約394およびアミノ酸約696〜アミノ酸約699のアミド化部位、アミノ酸約428〜アミノ酸約430の細胞接着配列ならびにアミノ酸約25〜アミノ酸約46のロイシンジッパーパターン配列の存在が明らかになる。クローンUNQ841(DNA73775−1707)は、1999年5月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−128が割り当てられている。
図82A−82B(配列番号82)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1779アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:XLU37373_1、P_W56538、S74981、E64821、P_W56540、AF083072_2、VTA2_XENLA、Y112_HUMAN、STE2_YEASTおよびSON_HUMANとの間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例43:ヒトPRO1785ポリペプチド[UNQ847]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「DNA35718」と命名する。DNA35718コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1785の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:5’−ATCCTCCAACATGGAGCCTCTTGC−3’ (配列番号232);
順方向PCRプライマー:5’−GTATCTTGTCAACCCTGAGG−3’ (配列番号233);および
逆方向PCRプライマー:5’−TAACCAGAGCTGCTATGTCAGGCC−3’ (配列番号234);
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35718配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ:5’−AGGCAAAGTTTCACTAGTTGTAAACGTGGCCAGTGACTGCCAACTCACAG−3’ (配列番号235)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1785遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト大動脈内皮細胞から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1785(本明細書中でDNA80136−2503と命名[図83、配列番号83])の完全長DNA配列およびPRO1785の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO1785のコード配列全体を、図83(配列番号83)に示す。クローンDNA80136−2503は、配列番号83のヌクレオチド2−4位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド629−631位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、209アミノ酸長である。配列番号84のアミノ酸約1−31にシグナルペプチド、アミノ酸約18−37に膜貫通型ドメインおよびアミノ酸約104−111にグルタチオンペルオキシダーゼシグネチャーが存在する。クローンDNA80136−2503は、ATCCに寄託され(1998年12月15日)、ATCC寄託番号203541が割り当てられている。図84に示される完全長PRO1785タンパク質は、約23,909ダルトンという推定分子量および約9.68というpIを有する。
図84(配列番号84)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1785アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:GSHC_SCHMA、P_R44988、AB012395_1、GSHH_HUMAN、AC004151_3、BTUE_ECOLI、GSHC_HUMAN、P_R89910、PWU88907_1およびD37916_1との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例44:ヒトPRO1889ポリペプチド[UNQ871]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA49310と命名する。DNA49310コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2779436内に含まれるESTとの間に見られる相同性に基づいて、Incyte EST クローン番号2779436を購入し、その挿入断片を得て、配列決定した。挿入断片の配列を図85に示し、本明細書中でDNA77623−2524と命名する。
DNA77623−2524のヌクレオチド配列全体を図85(配列番号85)に示す。クローンDNA77623−2524は、ヌクレオチド39−41位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド330−332位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図85)。予測されるポリペプチド前駆体は、97アミノ酸長である(図86)。図86に示される完全長PRO1889タンパク質は、約10,160ダルトンという推定分子量および約6.56というpIを有する。図86(配列番号86)に示される完全長PRO1889配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約20のシグナルペプチド、アミノ酸約6〜アミノ酸約11およびアミノ酸約33〜アミノ酸約38の潜在的N−ミリストイル化部位ならびにアミノ酸約24〜アミノ酸約34およびアミノ酸約78〜アミノ酸約88の原核生物の膜リポタンパク質脂質接着部位の存在が明らかになる。クローンDNA77623−2524は、1998年12月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203546が割り当てられている。
図86(配列番号86)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1889アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSE48ATGN_1、P_W06292、AB012293_1、THYB_MOUSE、P_R70984、CHKSCA2A_1、P_W61628、I48639、BMBUNGKP4_1およびUPAR_HUMANとの間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例45:ヒトPRO3434ポリペプチド[UNQ1821]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例2に記載された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって、DNA77631−2537を同定した。上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56099と命名する。
DNA56099配列とIncyte ESTクローン番号3327089との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号3327089を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図89A−89B(配列番号89)に示し、本明細書中でDNA77631−2537と命名する。
クローンDNA77631−2537は、ヌクレオチド46−48位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド3133−3135位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図89A−89B)。予測されるポリペプチド前駆体は、1029アミノ酸長である(図90;配列番号90)。図90に示される完全長PRO3434タンパク質は、約114,213ダルトンという推定分子量および約6.42というpIを有する。図90(配列番号90)に示される完全長PRO3434配列の解析により、種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになり、ここで、それらの重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。図90に示される完全長PRO3434配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約16のシグナルペプチド;アミノ酸約154〜アミノ酸約158、アミノ酸約331〜アミノ酸約335、アミノ酸約616〜アミノ酸約620、アミノ酸約785〜アミノ酸約789およびアミノ酸約891〜アミノ酸約895のcAMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約91〜アミノ酸約97、アミノ酸約136〜アミノ酸約142、アミノ酸約224〜アミノ酸約230、アミノ酸約435〜アミノ酸約441、アミノ酸約439〜アミノ酸約445、アミノ酸約443〜アミノ酸約449、アミノ酸約665〜アミノ酸約671およびアミノ酸約698〜アミノ酸約704の潜在的N−ミリストイル化部位;アミノ酸約329〜アミノ酸約333およびアミノ酸約634〜アミノ酸約638のアミド化部位;ならびにアミノ酸約96〜アミノ酸約135のオリゴアデニル合成酵素部位の存在が明らかになる。クローンDNA77631−2537は、1999年2月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203651が割り当てられている。
図90(配列番号90)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO3434アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:VATX_YEAST,P_R51171,POLS_IBDVP,IBDVORF_2,JC5043,IBDVPIV_1,VE7_HPV11,GEN14220,MUTS_THETHおよびCOAC_CHICKとの間の著しい配列同一性が明らかになった。
(実施例46:ヒトPRO3579ポリペプチド[UNQ1849]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA68862−2546を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)を適用することによって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、Incyte EST クローン番号3040247と命名される、EST配列が同定できた。次いで、このEST配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA57723と命名する。DNA57723配列とIncyte ESTクローン番号2377329との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号2377329を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図91に示し、本明細書中でDNA68862−2546と命名する。
クローンUNQ1849(DNA68862−2546)は、ヌクレオチド210−212位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1452−1454位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図91;配列番号91)。予測されるポリペプチド前駆体は、414アミノ酸長である(図92;配列番号92)。図92に示される完全長PRO3579タンパク質は、約48,920ダルトンという推定分子量および約8.95というpIを有する。図92(配列番号92)に示される完全長PRO3579配列の解析により、図92に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。クローンUNQ1849(DNA68862−2546)は、1999年2月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203652が割り当てられている。
図92(配列番号92)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO3579アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CELT05H4_15、CELZK40_1、A38840_1、S52645、P_R99249、YBP2_YEAST、P_R59713、BNAGPATRF_1、D86960_1およびYIHG_ECOLIとの間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例47:ヒトPRO4322ポリペプチド[UNQ1879]をコードするcDNAクローンの単離)
本明細書中で(DNA92223−2567)と命名された、天然ヒトPRO4322ポリペプチドをコードするcDNAクローンを、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すヒト組織cDNAライブラリにおいて酵母スクリーニングによって同定した。
図93に示される完全長DNA92223−2567クローンは、ヌクレオチド199−201位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1129−1131位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図93;配列番号93)。予測されるポリペプチド前駆体は、310アミノ酸長である(図94;配列番号94)。図94に示される完全長PRO4322タンパク質は、約32,289ダルトンという推定分子量および約4.62というpIを有する。図94(配列番号94)に示される完全長PRO4322配列の解析により、図94に示されるように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。クローンUNQ1879(DNA92223−2567)は、1999年3月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203851が割り当てられている。
図94(配列番号94)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4322アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AMYH_YEAAST、MUC2_HUMAN、RNMUCASGP7_1、C114_MOUSE、AGA1_YEAST、D88734_1、VGP3_EBVA8、P_P91941、A37232およびFIG2_YEASTとの間のいくらかの程度の相同性が明らかになった。
(実施例48:ヒトPRO4343ポリペプチド[UNQ1897]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA92255−2584を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記シグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA59225と命名する。配列DNA59225に照らして、配列DNA92255−2584を同定した。
図95に示される完全長クローンは、ヌクレオチド124−226位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1027−1029位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図95;配列番号95)。予測されるポリペプチド前駆体(図96,配列番号96)は、301アミノ酸長である。PRO4343は、約31607ダルトンという算出された分子量および約4.89という推定pIを有する。
図96(配列番号96)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4343アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用される配列および関連文献):YKA4_CAEEL、GGARBP_1、TPM5_DROME、DROTRO11_1、P_R60126、CHU45963_1、MMHC188A7_5、AF085809_1、P_R37683およびAF098511_lとの間の相同性が明らかになった。
DNA92255−2584と命名されるクローンDNA92255−2584(UNQ1897)は、1999年3月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203866が割り当てられている。
(実施例49:ヒトPRO4347ポリペプチド[UNQ1901]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
PRO4347をコードするコンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他のEST配列に対して構築し、繰り返しサイクルを使用して伸長した。このコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA77498」と命名する。
DNA77498コンセンサス配列に基づいて、クローンを同定し、配列決定した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO4347(本明細書中でDNA92288−2588と命名[図97,配列番号97])の完全長DNA配列およびPRO4347の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO4347のコード配列全体を、図97(配列番号97)に示す。クローンDNA92288−2588は、ヌクレオチド191−193位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1238−1240位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、349アミノ酸長である。DNA92288−2588と命名されたクローンDNA92288−2588(UNQ1901)は、ATCCに寄託され(1999年3月30日)、ATCC寄託番号203892が割り当てられている。図98に示される完全長PRO4347タンパク質は、約40026ダルトンという推定分子量および約7.0というpIを有する。
図98(配列番号98)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4347アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:F20P5_18、ATAC00549915、Y258_HAEIN、C64146、NMU65788_3、AF019745_6、AB020211_2、GSPA_BACSU、P_R91313およびRFAJ_SALTYとの間の相同性が明らかになった。
(実施例50:ヒトPRO4403ポリペプチド[UNQ1928]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
PRO4403をコードするコンセンサスDNA配列を、phrapの繰り返しサイクルを使用して他のEST配列に対して構築した。
そのコンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO4403の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’GCTTTCATTGCCACGTGGAGTATG3’ (配列番号236)および
逆方向PCRプライマー 5’ACCTAGTGAGGCTGGGATTTGGC3’ (配列番号237)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するそのコンセンサス配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’CCGCCTGGCTCTGTGCCAAGCCCTTCAAAGTCATCTGTAT3’ (配列番号238)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO4403遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト腺癌細胞株から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO4403(本明細書中でDNA83509−2612と命名[図99,配列番号99])の完全長DNA配列およびPRO4403の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO4403のコード配列全体を、図99(配列番号99)に示す。クローンDNA83509−2612は、ヌクレオチド167−169位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1090−1093位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、308アミノ酸長である。DNA83509−2612と命名されるクローンDNA83509−2612(UNQ1928)は、ATCCに寄託され(1999年4月27日)、ATCC寄託番号203965が割り当てられている。図100に示される完全長PRO4403タンパク質は、約33065ダルトンという推定分子量および約10.13というpIを有する。
図100(配列番号100)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4403アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用される配列および関連文献):AF042714_1、AC004613_1、NPH1_RAT、NPH2_BOVIN、AF043467_1、AF043469_1、AF043468_1、ELS_MOUSE、AF029249_1およびK2C3_BOVINとの間の相同性が明らかになった。
(実施例51:ヒトPRO4976ポリペプチド[UNQ2419]をコードするcDNAクローンの単離)
最初のDNA配列(DNA90650)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表す酵母スクリーニングを使用して同定した。この配列を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、公的データベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)からのESTと比較した。そのESTをクラスター化し、コンピュータプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を使用してコンセンサスDNA配列に構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA94848」と命名する。DNA94848コンセンサス配列に基づいて、以下のオリゴヌクレオチドを、ヒトヒト胎児腎臓cDNAライブラリからPRO1377の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した:
5’CCGCCAGAAGAATGCAGTTCTG3’ (順方向,配列番号239)、
5’CCTCCACCCTCAGAACTGCCTC3’(逆方向,配列番号240),および
5’GCAATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATG3’ (プラスミド,配列番号241)。
図101に示される完全長DNA100902−2646クローンは、ヌクレオチド140−142位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2171−2173位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図101;配列番号101)。予測されるポリペプチド前駆体(図102,配列番号102)は、677アミノ酸長である。PRO4976は、約75598ダルトンという算出された分子量および約6.85という推定pIを有する。
図102(配列番号102)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4976アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:ATAC00591720、MGNMAGA_1、P_W27454、E64778、KEEB_ECOLI、D71642、G69819、T4B21_16、MXU37008_2およびF70591との間の相同性が明らかになった。
DNA100902−2646と命名されるクローンDNA100902−2646(UNQ2419)は、ATCCに寄託され(1999年5月11日)、ATCC寄託番号PTA−42が割り当てられている。
(実施例52:ヒトPRO260ポリペプチド[UNQ227]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA30834と命名される。DNA30834コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO260についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および2つの逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:5’−TGGTTTGACCAGGCCAAGTTCGG−3’ (配列番号242);
逆方向PCRプライマーA:5’−GGATTCATCCTCAAGGAAGAGCGG−3’ (配列番号243);および
逆方向PCRプライマーB:5’−AACTTGCAGCATCAGCCACTCTGC−3’ (配列番号244)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA30834配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTCCGTGCCCAGCTTCGGTAGCGAGTGGTTCTGGTGGTATTGGCA−3’ (配列番号245)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO260遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO260[本明細書中でDNA33470−1175と命名](配列番号103)の完全長DNA配列およびPRO260の誘導タンパク質配列が得られた。
DNA33470−1175のヌクレオチド配列全体を、図103(配列番号103)に示す。クローンDNA33470−1175は、ヌクレオチド67−69位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1468−1470位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図103を参照のこと)。予測されるポリペプチド前駆体は、467アミノ酸長である(図104;配列番号104)。クローンDNA33470−1175は、1997年10月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209398が割り当てられている。
完全長PRO260ポリペプチドのアミノ酸配列(図104;配列番号104)の解析により、その一部が、アルファ−1−フコシダーゼ前駆体に対して著しい相同性を有することが示唆され、それにより、PRO260が新規のフコシダーゼであり得ることが示唆される。
(実施例53:ヒトPRO6014ポリペプチド[UNQ2521]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA92217−2697を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからEST配列が同定でき、本明細書中で3402774H1と命名する。次いで、このEST配列を公的ESTデータベース(例えば、Genbank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA79331と命名する。
DNA79331配列とLIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからのクローン番号3402774H1内に包含されるEST配列との間で観察される配列相同性に鑑みて、クローン番号3402774H1を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図105A−105B(配列番号105)に示し、本明細書中でDNA92217−2697と命名する。
クローンDNA92217−2697は、ヌクレオチド90−92位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2592−2594位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図105A−105B)。予測されるポリペプチド前駆体は、834アミノ酸長である(図106A−106B)。図106A−106Bに示される完全長PRO6014タンパク質は、約91,911ダルトンという推定分子量および約6.17というpIを有する。図106A−106B(配列番号106)に示される完全長PRO6014配列の解析により、図106A−106Bに示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになり、ここで、それらの重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA92217−2697は、1999年8月10日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−513が割り当てられている。
図106A−106B(配列番号106)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO6014アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF128113_1;AF026269_1;AF039663_1;P_W26769;AF027208_1;AF127935_1;NFL_COTJA;GCMYO2_1;AF014204_1;P_W23996との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例54:ヒトPRO6027ポリペプチド[UNQ2528]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA105838−2702を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)(Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)データベースからESTクラスター配列が同定でき、本明細書中でクラスター173032と命名する。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA59467と命名する。
DNA59467配列とIncyte(Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)データベースからのクローン番号3274259内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、クローン番号3274259を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、本明細書中で完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図107に示し、本明細書中でDNA105838−2702と命名する。
クローンDNA105838−2702は、ヌクレオチド198−200位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1050−1052位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図107;配列番号107)。予測されるポリペプチド前駆体は、284アミノ酸長である(図108;配列番号108)。図108に示される完全長PRO6027タンパク質は、約30176ダルトンという推定分子量および約9.03というpIを有する。図108(配列番号108)に示される完全長PRO6027配列の解析により、図108に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインについて与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA105838−2702は、1999年8月3日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−476が割り当てられている。
図108(配列番号108)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO6027アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CEF09B12_2;YB3F_SCHPO;S59392;YO41_CAEEL;ATT12H12_14;YA2A_SCHPO;S61981;CAR012683_1;HSU90653_1;S52691との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例55:ヒトPRO6181ポリペプチド[UNQ2552]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、Merck/Washington University)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に対して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA80179と命名する。いくつかの場合において、このDNA80179コンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得ることにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA80179コンセンサス配列に基づいてオリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO6181の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−CCAGCATTTGAGACTTGTGCAGC−3’ (配列番号246)
逆方向PCRプライマー 5’−GACTGTAGGAGGCAATGGACACTCC−3’ (配列番号247)および
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA80179配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’−CCATCTCCACTCTGCCCGGGCTGGAGCTCTTTTGTGCTATG−3’ (配列番号248)
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト精巣組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、完全長PRO6181ポリペプチド(本明細書中でDNA107698−2715と命名[図109,配列番号109])の完全長DNA配列およびPRO6181の誘導タンパク質配列が得られた。
その完全長クローンは、ヌクレオチド986−988位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1724−1726位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む(図109,配列番号109)。予測されるポリペプチド前駆体は、246アミノ酸長であり、約26,773ダルトンという算出された分子量および約8.82という推定pIを有する。図110(配列番号110)に示される完全長PRO6181配列の解析により、図110に示されるように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA107698−2715は、1999年8月3日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−472が割り当てられている。
図110(配列番号110)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO6181アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_W67722;P_W79090;AC006276_1;P_W26579;P_W79142;TTU15793_1;YN9B_YEAST;S54056;AC005327_1;およびT01837との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例56:ヒトPRO6714ポリペプチド[UNQ2759]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA82358−2738を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CAデータベースからESTクラスター配列が同定でき、本明細書中でクラスターCLU15700と命名する。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA73878と命名する。
DNA73878配列とLIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからのクローン番号3743689H1内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、クローン番号3743689H1を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、本明細書中で完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図111に示し、本明細書中でDNA82358−2738と命名する。
クローンDNA82358−2738は、ヌクレオチド435−437位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1,197−1,199位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図111;配列番号111)。予測されるポリペプチド前駆体は、254アミノ酸長である(図112;配列番号112)。図112に示される完全長PRO6714タンパク質は、約27,579ダルトンという推定分子量および約9.14というpIを有する。図112(配列番号112)に示される完全長PRO6714配列の解析により、図112に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインについて与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA82358−2738は、1999年8月10日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−510が割り当てられている。
図112(配列番号112)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO6714アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:XLIMB1_1;CELM70_3;CELC01G8_8;CEY47H9B_2;P_R70126;VIE1_MCMVS;ATT23J7_20;EVU28134_2;T02729;およびI48201との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例57:ヒトPRO7179ポリペプチド[UNQ2789]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA108701−2749を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CAデータベースからESTクラスター配列が同定でき、本明細書中でCLU192050と命名する。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築する。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA91964と命名する。
DNA91964配列とLIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CAデータベースからのクローン番号4049488内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、クローン番号4049488を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、本明細書中で完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図115に示し、本明細書中でDNA108701−2749と命名する。
クローンDNA108701−2749は、ヌクレオチド59−61位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1034−1036位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図115;配列番号115)。予測されるポリペプチド前駆体は、325アミノ酸長である(図116;配列番号116)。図116に示される完全長PRO7179タンパク質は、約36212ダルトンという推定分子量および約8.68というpIを有する。図116(配列番号116)に示される完全長PRO7179配列の解析により、図116に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインについて与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA108701−2749は、1999年8月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−554が割り当てられている。
図116(配列番号116)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO7179アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_Y02655;HGS_RQ155;JE0328;XLU86699_1;S49589;HGS_RQ307;P_Y02807;FIBA_PARPA;P_R82243;FIBB_HUMANとの間の配列同一性が明らかになった。
(実施例58:ヒトPRO7476ポリペプチド[UNQ2976]をコードするcDNAクローンの単離)
コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、サイトカイン/成長因子ホモログに対して検索を行った。成長因子ホモログをコードするエキソンを含む94.5KBの断片が見出されたが、しかしながら、この断片は、大きなイントロンによって分断されていた。このイントロンを、コンピュータアルゴリズムによって取り除いた。DNA102863コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO7476の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:5’−ATGCAGCTCCCACTGGCCCTG−3’ (配列番号249)
逆方向PCRプライマー:5’−CTAGTAGGCGTTCTCCAGCTCGGCCTG−3’ (配列番号250)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA102863配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CTTCCGCTGCATCCCCGACCGCTACCGCGCGCAGCGCGTG−3’ (配列番号251)
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、完全長PRO7476ポリペプチド(本明細書中でDNA115253−2757と命名[図117,配列番号117])の完全長DNA配列およびPRO7476の誘導タンパク質配列が得られた。
上で同定された完全長クローンは、ヌクレオチド62−64位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド701−703位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図117,配列番号117)。予測されるポリペプチド前駆体は、213アミノ酸長であり、約24,031ダルトンという算出された分子量および約9.59という推定pIを有する。図118(配列番号118)に示される完全長PRO7476配列の解析により、図118に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインについて与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA115253−2757は、1999年8月31日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−612が割り当てられている。
図118(配列番号118)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO7476アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_W58704;P_W95711;P_W09408;P_Y12009;T08710;P_W44090;P_W27654;P_Y03225;LSHB_MELGA;AB011030_1との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例59:ヒトPRO19814ポリペプチド[UNQ5923]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。これらのESTデータベースは、LIFESEQ7,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に対して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA47457と命名する。いくつかの場合において、このDNA80179コンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得ることにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA47457コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO19814の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−CATCGTGTGTCGTGCCACCAAC−3’ (配列番号252)
逆方向PCRプライマー 5’−CTCTGGCCATTCTCCACGTCACC−3’ (配列番号253)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47457配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GGAAAGGAGACGTCGGTCACCATTGACATCCAGCACCCTCCAC−3’ (配列番号254)
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、混合組織からヒトオリゴdTから単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、完全長PRO19814ポリペプチド(本明細書中でDNA148004−2882と命名[図121,配列番号121])の完全長DNA配列およびPRO19814ポリペプチドの誘導タンパク質配列が得られた。
上で同定された完全長クローンは、ヌクレオチド302−304位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2101−2103位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図121,配列番号121)。予測されるポリペプチド前駆体は、600アミノ酸長であり、約65,308ダルトンという算出された分子量および約8.35という推定pIを有する。図122(配列番号122)に示される完全長PRO19814配列の解析により、図122に示されるように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA148004−2882は、2000年4月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1779が割り当てられている。
(実施例60:ヒトPRO20088ポリペプチド[UNQ6077]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST−2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に対して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA90859と命名する。いくつかの場合において、このDNA90859コンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得ることにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA90859コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO20088の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Schanke et al.,BioTechniques. 16:414−416(1994)のように、PCRプライマー対を用いてFlip PCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−GCTGCTCGTGCTCCGGCTG−3’ (配列番号255)
逆方向PCRプライマー 5’−CACAAAACGACAATCCGGGCCTG−3’ (配列番号256)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA90859配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GCACAAACTCTGCGCGGACGACGAATGCAGCATGTTAATGTAC−3’ (配列番号257)
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、完全長PRO20088ポリペプチド(本明細書中でDNA150157−2898と命名[図125,配列番号125])の完全長DNA配列およびPRO20088ポリペプチドの誘導タンパク質配列が得られた。
上で同定された完全長クローンは、ヌクレオチド4−6位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1501−1503位の終止シグナルを含む単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図125,配列番号125)。予測されるポリペプチド前駆体は、499アミノ酸長であり、約56,471ダルトンという算出された分子量および約4.31という推定pIを有する。図126(配列番号126)に示される完全長PRO20088配列の解析により、図126に示されるように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインに与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA150157−2898は、2000年4月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1777が割り当てられている。
図126(配列番号126)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO20088アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_Y24788;A71623;NM_006533_1;MIA_HUMAN;P_R69811;MMU85612_1;GEN14164;P_W03627;AF148805_6;およびAF206632_1との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例61:ヒトPRO1757ポリペプチド[UNQ830]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから3つのEST配列が同定できた。それらを、Incyte ESTクローン番号2007947、2014962および1912034と命名する。次いで、これらのEST配列をクラスター化し、プログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列に構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA56054と命名する。
DNA56054配列とIncyte ESTクローン番号2007947内に含まれるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号2007947を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を、本明細書中でDNA76398−1699と命名する。
クローンDNA76398−1699は、ヌクレオチド59−61位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド422−424位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図133;配列番号133)。予測されるポリペプチド前駆体は、121アミノ酸長である(図134;配列番号134)。図134に示される完全長PRO1757タンパク質は、約12,073ダルトンという推定分子量および約4.11というpIを有する。図134(配列番号134)に示される完全長PRO1757配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約19のシグナルペプチド、アミノ酸約91〜アミノ酸約110の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約44〜アミノ酸約47のグリコサミノグリカン接着部位、アミノ酸約116〜アミノ酸約119のcAMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位ならびにアミノ酸約91〜アミノ酸約96の潜在的N−ミリストイル化部位の存在が明らかになる。クローンDNA76398−1699は、1998年11月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203474が割り当てられている。
図134(配列番号134)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1757アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:JQ0964、COLL_HSVS7、HSU70136_1、AF003473_1、D89728_1、MTF1_MOUSE、AF029777_1、HSU88153_1およびP_W05321との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例62:ヒトPRO4421ポリペプチド[UNQ1938]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA96879−2619を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA80133と命名する。そのアセンブリにおいて、GenentechデータベースにおけるESTを同定した。この配列に照らして、DNA96879−2619を同定し、配列決定した。
図135に示される完全長クローンは、ヌクレオチド81−83位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド675−677位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図135;配列番号135)。予測されるポリペプチド前駆体(図136,配列番号136)は、198アミノ酸長である。PRO4421は、約22584ダルトンという算出された分子量および約9.4という推定pIを有する。
図136(配列番号136)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4421アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用される配列および関連文献):HSU82988_1、HGS_B476、HSAJ3324_1、HSU96627_1、HUMLY9_1、AF043445_1、LY9_MOUSE、AC005626_1、P_R71478およびCD86_HUMANとの間の相同性が明らかになった。
DNA96879−2619と命名されるクローンDNA96879−2619(UNQ1938)は、1999年4月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203967が割り当てられている。
(実施例63:ヒトPRO9903ポリペプチド[UNQ3071]をコードするcDNAクローンの単離)
DNA119596−2797を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQデータベースからESTクラスター配列が同定でき、本明細書中でCLU67175と命名する。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA105268と命名する。
DNA105268配列とLIFESEQデータベースからのクローン番号1648912H1内に包含されるEST配列との間に観察される配列相同性に鑑みて、クローン番号1648912H1を購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、本明細書中で完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図137に示し、本明細書中でDNA119596−2797と命名する。クローンDNA119596−2797は、ヌクレオチド51−53位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド566−568位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図137;配列番号137)。予測されるポリペプチド前駆体は、172アミノ酸長である(図138;配列番号138)。図138に示される完全長PRO9903タンパク質は、約18470ダルトンという推定分子量および約5.45というpIを有する。図138(配列番号138)に示される完全長PRO9903配列の解析により、図138に示されるような種々の重要なポリペプチドドメインの存在が明らかになる。ここで、それらの重要なポリペプチドドメインについて与えられた位置は、上に記載したようにおよその位置である。クローンDNA119596−2797は、1999年12月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1083が割り当てられている。
図138(配列番号138)に示される完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO9903アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CEF20D1_1、VEU34999_2、POLS_EEVVM、AF075252_2、VEU96408_1、AF004464_1、AF004458_2、AF004472_2、POLS_EEVV3、S63615との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例64:ヒトPRO1106ポリペプチド[UNQ549]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のIncyte EST配列が同定できた。次いで、この配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,Uni.of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築する。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56423と命名する。
DNA56423とIncyte ESTクローン番号1711247内に包含されるESTとの間に観察される配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号1711247を得て、その挿入断片を配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。図139に示され、PRO1106の完全長DNA配列であるその断片を本明細書中でDNA59609−1470と命名する。クローンDNA59609−1470は、1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209963が割り当てられている。
DNA59609−1470のヌクレオチド配列全体を、図139(配列番号139)に示す。クローンDNA59609−1470は、配列番号139(図139)のヌクレオチド61−63位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1468−1470位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、469アミノ酸長である(図140;配列番号140)。図140に示される完全長PRO1106タンパク質は、約52,689ダルトンという推定分子量および約8.68というpIを有する。当業者は、ポリペプチドまたはそれをコードする核酸を構築することにより、これらのドメインのすべての任意の1個以上を排除することができると理解される。例えば、膜貫通型ドメイン領域および/またはアミノ末端もしくはカルボキシル末端のいずれかが排除され得る。クローンDNA59609−1470は、1998年6月9日にATCCに寄託された(ATCC番号209963)。寄託されたクローンは、実際の核酸配列を有し、本明細書中で提供される配列は、公知の配列決定技術に基づくことが理解される。
完全長PRO1106ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、完全長PRO1106ポリペプチドが、ペルオキシソームのca−依存性溶質キャリアに対して著しい配列類似性を有することが示唆され、それにより、PRO1106が新規のトランスポーターであり得ることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1106アミノ酸配列と少なくとも以下のDayhoff配列、AF004161_1、IG002N01_25、GDC_BOVINおよびBT1_MAIZEとの間の配列同一性が明らかになった。
(実施例65:ヒトPRO1411ポリペプチド[UNQ729]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。これらのESTの1つ以上は、甲状腺組織ライブラリ由来であった。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築する。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56013と命名する。
DNA56013配列とIncyte EST1444225内に含まれるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、このESTを含んでいるクローンを購入し、cDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片を図141に示し、本明細書中でDNA59212−1627と命名する。
図141に示される完全長クローンは、ヌクレオチド184−186位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1504−1506位に見られる終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図141;配列番号141)。予測されるポリペプチド前駆体(図142、配列番号142)は、440アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、アミノ酸約1−21であり、細胞接着部位は、配列番号142のアミノ酸約301−303である。PRO1411は、約42,208ダルトンという算出された推定分子量および約6.36という推定pIを有する。クローンDNA59212−1627は、1998年9月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203245が割り当てられている。
図142(配列番号142)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1411アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(データベースからのデータは本明細書中で援用される):MTV023_19、P_R05307、P_W26348、P_P82962、AF000949_1、EBN1_EBV、P_R95107、GRP2_PHAVU、P_R81318およびS74439_1との間の配列同一性が明らかになった。
(実施例66:ヒトPRO1486ポリペプチド[UNQ755]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中で「DNA48897」と命名される。DNA48897コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO1486についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’AGGCAGCCACCAGCTCTGTGCTAC3’ (配列番号258);および
逆方向PCRプライマー 5’CAGAGAGGGAAGATGAGGAAGCCAGAG3’ (配列番号259)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA48897配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’CTGTGCTACTGCCCTTGGACCCTGGGGACCGAGTGTCTCTGC3’ (配列番号260)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1486遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト腺癌細胞株から単離した。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO1486の完全長DNA配列およびPRO1486の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO1486のコード配列全体を、図143(配列番号143)に示す。クローンDNA71180−1655は、配列番号143のヌクレオチド472−474位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1087−1089位の明らかな終止コドンを含む単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、205アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号144のアミノ酸約1−32である。C1qおよびN−グリコシル化部位の領域に類似した領域は、図144に示されるように位置する。クローンDNA71180−1655は、1998年10月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203403が割り当てられている。図144に示される完全長PRO1486タンパク質は、約21,521ダルトンという推定分子量および約7.07というpIを有する。
図144(配列番号144)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1486アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CERB_HUMAN、CERL_RAT、GEN11893、P_R22263、CA18_HUMAN、C1QC_HUMAN、AF054891_1、A57131、HUMC1Qb2_1、ACR3_MOUSEとの間の配列同一性が明らかになった。
(実施例67:ヒトPRO1565ポリペプチド[UNQ771]をコードするcDNAクローンの単離)
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA67183と命名する。DNA67183コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2510320内に含まれるEST配列との間に観察される相同性に基づいて、Incyte EST クローン番号2510320を購入し、その挿入断片を得て、配列決定した。その挿入断片配列を図145に示し、本明細書中でDNA73727−1673(配列番号145)と命名する。
DNA73727−1673のヌクレオチド配列全体を、図145(配列番号145)に示す。クローンDNA73727−1673は、ヌクレオチド59−61位に明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1010−1012位の終止コドンで終結している単一のオープンリーディングフレームを含む(図145)。予測されるポリペプチド前駆体は、317アミノ酸長である(図146;配列番号146)。図146に示される完全長PRO1565タンパク質は、約37,130ダルトンという推定分子量および約5.18というpIを有する。図146(配列番号146)に示される完全長PRO1565配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約40のシグナルペプチド、アミノ酸約25〜アミノ酸約47の潜在的II型膜貫通型ドメイン、アミノ酸約94〜アミノ酸約97およびアミノ酸約180〜アミノ酸約183の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約92〜アミノ酸約95、アミノ酸約70〜アミノ酸約73、アミノ酸約85〜アミノ酸約88、アミノ酸約133〜アミノ酸約136、アミノ酸約148〜アミノ酸約151、アミノ酸約192〜アミノ酸約195およびアミノ酸約239〜アミノ酸約242のグリコサミノグリカン接着部位、アミノ酸約33〜アミノ酸約38、アミノ酸約95〜アミノ酸約100、アミノ酸約116〜アミノ酸約121、アミノ酸約215〜アミノ酸約220およびアミノ酸約272〜アミノ酸約277の潜在的N−ミリストイル化部位、アミノ酸約315〜アミノ酸約317のミクロボディC末端標的シグナル配列ならびにアミノ酸約9〜アミノ酸約14のシトクロムCファミリーヘム結合部位シグネチャー配列の存在が明らかになる。クローンDNA73727−1673は、1998年11月3日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203459が割り当てられている。
図146(配列番号146)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1565アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF051425_1、P_R65490、P_R65488、GRPE_STAAU、RNU31330_1、ACCD_BRANA、D50558_1、HUMAMYAB3_1、P_W34452およびP_P50629との間の著しい相同性が明らかになった。
(実施例68:ヒトPRO4399ポリペプチド[UNQ1924]をコードするcDNAクローンの単離)
Incyte企業データベースを検索し、DNA79345を同定した。そのDNA79345配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO4399の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’CGGCAGATTGAAGATGATCGAAAGACAC3’(配列番号261)、および逆方向PCRプライマー5’GTCTTGTTTCCAAGCTCAGCACTCTTTGG3’(配列番号262).
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA79345配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’TCAGGAGTTGAAAGAGAAAATGGACGAGCTCCTGCCTTTGATCCC3’ (配列番号263).
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO4399遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO4399(本明細書中でDNA89220−2608と命名[図147,配列番号147]の完全長DNA配列;およびPRO4399の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO4399のコード配列全体を、図147(配列番号147)に示す。クローンDNA89220−2608は、ヌクレオチド72−74位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1506−1508位の明らかな終止コドンを含む単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、478アミノ酸長である。DNA89220−2608と命名されるクローンDNA89220−2608(UNQ1924)は、1999年5月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−130が割り当てられている。図148に示される完全長PRO4399タンパク質は、約54930ダルトンという推定分子量および約8.46というpIを有する。
図148(配列番号148)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4399アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:NOMR_RAT、173637、D78262_1、I73636、AF028740_1、NOMR_HUMAN、173635、D78263_1、JE0096およびP_W60670との間の相同性が明らかになった。
(実施例69:ヒトPRO4404ポリペプチド[UNQ1929]をコードするcDNAクローンの単離)
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
PRO4404をコードするコンセンサスDNA配列を、phrapの繰り返しサイクルを使用して他のEST配列に対して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「DNA77609」と命名する。
DNA77609コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO4404の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’TCAGCAAGGAGACCAACTGCCAGAC3’(配列番号264)、および逆方向PCRプライマー5’CTGCAGGCAATGTGCATCCATCTG3’(配列番号265)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA77609配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’CCTCAGGGCTACCGCTTCCAGAAGTTAAGCCGAGTGTTGAATCAG3’(配列番号266)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO4404遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト大動脈細胞から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、PRO4404(本明細書中でDNA84142−2613と命名[図149,配列番号149]の完全長DNA配列;およびPRO4404の誘導タンパク質配列が得られた。
PRO4404のコード配列全体を、図149(配列番号149)に示す。クローンDNA84142−2613は、ヌクレオチド234−236位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1761−1763位の明らかな終止コドンを含む単一のオープンリーディングフレームを含む。予測されるポリペプチド前駆体は、509アミノ酸長である。DNA84142−2613と命名されるクローンDNA84142−2613(UNQ1929)は、1999年5月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−22が割り当てられている。図150に示される完全長PRO4404タンパク質は、約58875ダルトンという推定分子量および約8.86という推定分子量を有する。
図150(配列番号150)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4404アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CP44_RABIT、CP45_RABIT、AB018421_1、CP41_RAT、CP47_RABIT、GEN11564、S47553、AC005336_1、AF054821、AF017002_1との間の相同性が明らかになった。
(実施例70:抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404の遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析)
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404のポリペプチドの役割を研究するために、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404の遺伝子の破壊を相同組換えまたはレトロウイルスによる挿入技術によって行った。詳細には、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404の遺伝子の破壊を含むトランスジェニックマウス(すなわち、ノックアウトマウス)を、遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングのいずれかによって作製した。サザンブロット解析によって変異を確認することにより、5’末端と3’末端の両方への正確なターゲティングを確認した。挿入部位に隣接するエキソンにアニーリングするプライマーを使用したRT−PCRによって裏付けられるように、遺伝子特異的なジェノタイピングをゲノムPCRによって行うことにより、内在性の天然の転写物が失われていることが確認された。ターゲティングベクターを129系統のES細胞に電気穿孔し、標的クローンを同定した。標的クローンを宿主胚盤胞に微量注入することにより、キメラを作製した。キメラをC57動物と交雑し、F1ヘテロ接合体を作製した。ヘテロ接合体を交雑受精することにより、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体コホートを作製し、表現型解析に使用した。まれに、F1ヘテロ接合体が十分に作製されない場合に、そのF1へテロ接合体を野生型C57マウスと交雑することにより、十分なヘテロ接合体を得て、表現型の解析用のコホートと交雑させた。すべての表現型解析を生後12〜16週から実施した。
表現型結果の全体的な概要:
70.1.DNA16451−1078(UNQ153)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO179ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA16451−1078と命名)(UNQ153)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC019491 ACCESSION:BC019491 NID:18044500 Mus musculus Mus musculus,アンジオポエチン様3、クローンMGC:28584 IMAGE:4211688;参照タンパク質:Q9R182 ACCESSION:Q9R182 NID:Mus musculus(マウス).アンジオポエチン関連タンパク質3(アンジオポエチン様3).MOUSESPTRNRDB;参照ヒト遺伝子配列:NM_014495 ACCESSION:NM_014495 NID:7656887 Homo sapiens Homo sapiensアンジオポエチン様3(ANGPTL3);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y5C1 ACCESSION:Q9Y5C1 NID:Homo sapiens(ヒト)アンジオポエチン関連タンパク質3.HUMANSPTRNRDB。
目的のマウス遺伝子は、ヒトANGPTL3のオーソログであるAngptl3(アンジオポエチン様3)である。別名としては、hypl、低脂血症、ANGPT5およびアンジオポエチン5が挙げられる。
ANGPTL3は、脂肪細胞上のレセプターまたは内皮細胞上のインテグリンアルファvベータ3におそらく結合する、肝臓に主に発現している分泌タンパク質である(Conklin et al,Genomics 62(3):477−82(1999);Shimamura et al,Shimamura et al,Biochem Biophys Res Commun 301(2):604−9(2003);Camenisch et al,J Biol Chem 277(19):17281−90(2002))。ANGPTL3は、脂質代謝の制御に関与する(Koishi et al,Nat Genet 30(2):151−7(2002))。ANGPTL3は、脂肪分解を刺激することによって血漿遊離脂肪酸を増加させ、脂肪細胞リポタンパク質リパーゼを阻害することにより血漿トリグリセリドを増加させ、そしてその結果として、VLDLクリアランスが起きる(Shimamura et al,Biochem Biophys Res Commun 301(2):604−9(2003);Shimizugawa et al,J Biol Chem 277(37):33742−8(2002))。このタンパク質は、N末端のコイルドコイルドメイン、リンカー領域およびC末端フィブリノゲン関連ドメインからなる。インビボにおいて、ANGPTL3のリンカー領域が切断されることにより、コイルドコイルドメインを含むフラグメントおよびフィブリノゲン関連ドメインを含むフラグメントが生じる。N末端のコイルドコイルドメインは、マウスにおいて血漿トリグリセリドレベルが上昇する際に最も活性であるようだ。このことから、ANGPTL3は、タンパク分解性切断によって活性化されると示唆される(Ono et al,J Biol Chem 278(43):41804−9(2003))。
ANGPTL3の発現は、コレステロールおよび合成アゴニストT0901317によって活性化される核ホルモンレセプターである、肝臓Xレセプターによって刺激され(Kaplan et al,J Lipid Res 44(1):136−43(2003);Inaba et al,J Biol Chem 278(24):21344−51(2003))、そしてインスリンによって抑制される(Inukai et al,Biochem Biophys Res Commun317(4):1075−9(2004))。さらに、マウスにおけるANGPTL3発現が、実験的なI型およびII型糖尿病を増加させることから、ANGPTL3は、糖尿病に関連する高脂血症に重要な役割を果たすことが示唆される(Inukai et al,Biochem Biophys Res Commun 317(4):1075−9(2004))。
Koishiおよび共同研究者のNat Genet 30(2):151−7((2002)では、マウス系統KK/SanのANGPTL3遺伝子が機能喪失変異すると、低脂血症が引き起こされことが示された。さらに、ANGPTL3タンパク質をこれらの変異マウスに投与することにより、血漿脂質レベルが上昇することが示され、このことから、ANGPTL3がおそらく脂質代謝を制御すると結論付けられる。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=1.45 有意性=0.48432454(ホモ/n)=0.23
平均産仔数=7
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションBC019491.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、腎臓;肝臓;胃、小腸および結腸;ならびに心臓の13の成体組織サンプルから標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(70.1.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA16451−1078(UNQ153)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトアンジオポエチン様3(ANGPTL3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける血清コレステロールレベルおよび血清トリグリセリドレベルが減少した。雄および雌のホモ接合性変異マウスでは、性別一致野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清コレステロールレベルおよび平均トリグリセリドレベルが著しく減少した。ホモ接合性変異マウスの一部は、血尿(尿中に血液が存在)および水腎症を示した。さらに、ホモ接合性変異体では、LPS攻撃に対して、平均血清IL−6応答が増大した。(−/−)マウスではまた、骨関連測定値が低下した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病態/CATスキャン
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/ml、0.25ml/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20ml/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
解析された3匹の(−/−)マウスのうち、2匹の雄(−/−)マウスは、右腎に中程度の水腎症を示した。
(c)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重であった。注射の3時間後100μlの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスにおいて、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、LPS攻撃に対して平均血清IL−6応答が増大した。
要約すれば、LPSエンドトキシン攻撃により、PRO179ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスが、野生型同腹仔と比較して免疫学的異常を示すことが証明された。特に、変異マウスは、LPSエンドトキシンによる攻撃を受けたとき、免疫学的応答(IL−6産生)を誘発する能力が増大した。このことから、炎症促進性応答が示唆される。IL−6は、B細胞活性化の後半の段階に寄与する。さらに、IL−6は、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。このことから、PRO179ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患患者などの免疫低下患者にとって有益であり得る場合において有用性が見出され得ることが示唆される。従って、PRO179ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害する際に役割を果たし得、有害な免疫応答、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合を抑制するための有用な候補であり得る。
(d)表現型解析:心臓病学
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、異脂肪血症(例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および高血清トリグリセリド(高トリグリセリド血症))、糖尿病および/または肥満症を処置するために標的を本明細書中で同定した。表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。高コレステロールレベルおよび高トリグリセリド血液レベルは、循環器疾患および/または糖尿病の発症の危険因子と認識されている。血中脂質を測定することにより、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、循環器疾患のリスクの低減に有用であり得る。これらの血液化学試験において、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄および雌(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、著しく低い平均血清コレステロールレベル(背景的平均よりも1〜2標準偏差低い)および低い平均血清トリグリセリドレベル(背景的平均よりも>2標準偏差低い)を示した。
上で概要を述べたように、(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが著しく低かった。従って、PRO179遺伝子が欠損した変異マウスは、循環器疾患のモデルとして機能し得る。PRO179ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のインヒビターまたはアンタゴニストは、トリグリセリドなどの血中脂質の制御に有用であり得る。従って、PRO179ポリペプチドのアンタゴニストは、このような循環器疾患(例えば、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満症)の処置に有用であり得る。
尿検査
説明:
日常的な尿検査は、腎臓/泌尿器系の一般的な評価を提供するために実施されるスクリーニング検査である。尿が日常的に検査される特徴としては、タンパク質、グルコース、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノーゲン、硝酸塩および白血球エステラーゼならびにpHおよび比重についての検査が挙げられる。
結果:
解析された8匹の(−/−)マウスのうち、4匹が、血尿(尿中に血液が存在)を示した。
(e)骨代謝および全身診断学:放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
マイクロCT:(−/−)ホモ接合性変異体は、(+/+)コントロール同腹仔と比較して骨関連測定値が低下しており、骨梁の骨容量、数および結合密度が低下していた。
骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が低下しており、異常な骨障害が示唆された。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する異常な骨測定値または低い骨測定値を有するネガティブな骨表現型を示した。ネガティブな骨表現型は、PRO179ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスを維持するために有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO179ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO179ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的骨障害を誘導し得る。
70.2.DNA23330−1390(UNQ155)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO181ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA23330−1390と命名)(UNQ155)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_009919 ACCESSION:NM_009919 NID:gi27545444 refNM_009919.1 Mus musculusコルニションホモログ(Drosophila)(Cnih);参照タンパク質:O35372 ACCESSION:O35372 NID:Mus musculus(マウス).コルニションホモログ.MOUSESPTRNRDB;参照ヒト遺伝子配列:NM_005776 ACCESSION:NM_005776 NID:gi5031638 refNM_005776.1 Homo sapiensコルニションホモログ(Drosophila)(CNIH);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O95406ACCESSION:O95406 NID:Homo sapiens(ヒト).コルニションホモログ(TGAM77).HUMANSPTRNRDB。
目的のマウス遺伝子は、ヒトCNIHのオーソログであるCnih(コルニションホモログ[Drosophila])である。別名としては、0610007J15、CNIL、TGAM77およびコルニション様が挙げられる。
CNIHは、発生の間の上皮成長因子シグナル伝達に関与する、おそらく内在性原形質膜タンパク質である(Hwang et al,Dev Genes Evol 209(2):120−5(1999))。CNIHの発現は、T細胞活性化の初期にアップレギュレートされる(Utku et al,Biochim Biophys Acta 1449(3):203−10(1999))。このタンパク質の生化学的機能は、未知である。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=13.96 有意性=9.303032E−4(ホモ/n)=0.16
平均産仔数=7
変異型:レトロウイルスによる挿入(OST)
説明:コーディングエキソン1と2との間のイントロンにレトロウイルスによって挿入した(NCBIアクセッションNM_009919.1)
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現が、RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて検出された。
2.QC発現:転写物が、解析された(−/−)マウス(F−104)に存在しないことがRT−PCR解析によって明らかになった。標的遺伝子の破壊をインバースPCRによって確認した。
70.2.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA23330−1390(UNQ155)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトコルニションホモログ(Drosophila)(CNIH)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雌(−/−)マウスと雄(−/−)マウスの両方において生存性低下が生じた。雌(−/−)マウスおよび雄(−/−)マウスは、著しい体重減少、総組織マスおよび除脂肪体重の減少ならびに骨中無機質密度および骨塩量の減少を示した。雄ホモ接合性変異マウスにおいては、平均脊椎骨梁の骨容量、厚さおよび結合密度が減少し、大腿骨中軸の皮質の厚さの平均および断面積が減少していた。雄(−/−)変異体は、平均血清インスリンレベルも減少していた。雌(−/−)マウスでは、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が上昇した。さらに、雄(−/−)マウスにおける不安関連応答の低下に注目した。RT−PCR解析により、その転写物がホモ接合性変異マウスに存在しないことが明らかになった。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んでいた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン(seratonin)トランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイを、カスタマイズして感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして感情状態及び学習に関する探索パターンに関する変化を扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、探索に特に関連する活動である鼻を突っ込むことを可能にする4つの穴を床に設けた。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設計した。オープンフィールド試験はマウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子の全てが新しく開放性空間に関連した天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンと程度および特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。移動した全距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
マウスが新しい環境に対して正常な馴化応答を示す傾向を、5回の間隔にわたるその水平自発運動の全変化を測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは5回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な習慣性は負の傾きの値によって表される。
結果:
雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、オープンフィールド試験の間に中心にいた合計時間が高い中央値を示した。このことから変異体の不安様応答が低いことが示唆される。
注目すべき差がオープンフィールド活動性試験の間に観察された。雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、中心領域にいた合計時間の中央値が高かったことから、変異体において不安様応答が低下することが示唆される。よって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。従って、PRO181ポリペプチドおよびそのアゴニストは、うつ病性障害に関連する症状の処置または回復に有用であり得る。
(c)成体皮膚細胞増殖:
手順:皮膚細胞を16週齢の成体動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合性マウス)から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、p53およびKu80で証明されている。Brdu取り込みを使用して増殖を測定した。
詳細には、これらの研究において、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化された培地中の細胞の数の増加を、相対的な増殖性能力の基準として使用した。初代線維芽細胞を野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚バイオプシーから確立した。5万個の細胞の2重または3重の培養物を播種し、6日間生育させた。培養期間の終わりに、培養物中に存在する細胞の数を、電子粒子カウンターを使用して測定した。
結果:
雌(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が上昇した。
したがって、ホモ接合性変異マウスは、過剰増殖性表現型を示した。これらの観察結果によって示唆されるように、PRO181ポリペプチドまたはそのアゴニストは、腫瘍サプレッサーとして機能し得、そして異常な細胞増殖の増大に有用であり得る。
(d)骨代謝および全身診断学
(1)組織マスおよび除脂肪体重測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織マス(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、脊椎および両大腿骨)の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
身体測定(身長および体重):
身体測定:身長および体重の測定を、約16週齢で行った。
結果:
雄(−/−)マウスおよび雌(−/−)マウスにおいて、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均体重が著しく減少していた。身長データは、ノックアウト(−/−)マウスと、ヘテロ接合性(+/−)マウスと野生型(+/+)同腹仔コントロールとの間で差を示さなかった。
(2)骨代謝:放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
1.DEXA:雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均総組織マスおよび除脂肪体重が減少していた。これらの変異体は、平均骨塩量および骨中無機質密度関連測定値が低かった。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均脊椎骨梁の骨容量、厚さおよび結合密度が低下しており、平均大腿骨中軸の皮質の厚さおよび断面積が減少していた。
DEXAおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が減少しており、体重測定値が低下していたことから、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値の異常な減少を伴うネガティブな骨表現型を示した。そのネガティブな骨表現型は、PRO181ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスを維持するために有用であることを示唆する。さらに、PRO181ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用である一方で、PRO181ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理的な骨障害に導き得る。
(e)血液化学
マウスにおける血液化学試験を実施するための臨床的な設定のCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して血液化学解析を行った。
インスリンデータ:
試験の説明:Lexicon Geneticsは、マウスにおける定量的インスリンアッセイを実施するための臨床的な設定のCobraIIシリーズ自動ガンマ計測システムを使用する。
結果:
雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清インスリンレベルが低下した。
要約:
PRO181ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、低い総組織マスおよび除脂肪体重を特徴とする組織消耗疾患に一致した表現型を示す。インスリンレベルは、異常に低く、糖尿病が示唆される。従って、PRO181ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの代謝関連作用を模倣し得る。他方では、PRO181ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような代謝性障害(例えば、糖尿病または他の組織消耗疾患)の予防および/または処置に有用であり得る。
(f)さらなる研究
F1ヘテロ接合性動物を交雑受精させて、F2野生型マウス(29匹の雌+/+;39匹の雄(+/+))、ヘテロ接合性マウス(65匹の雌+/−;64匹の雄(+/−))およびホモ接合性マウス(11匹の雌(−/−);12匹の雄(−/−))子孫を作製した。雌(−/−)マウスと雄(−/−)マウスの両方において観察された生存率は、2分の1であった。さらに、雌と雄のUNQ155ノックアウトマウスの両方が、野生型(+/+)とヘテロ接合性(+/−)子孫の両方と比較して著しい体重減少を示した(クリップ(clip)時、離乳時、6週間および8週間で行った測定)。従って、UNQ155ノックアウトマウスは、生存性低下を示すだけでなく、著しい体重減少もまた示す。このネガティブな代謝性の表現型により、PRO181ポリペプチドまたはそのアゴニストが、正常な成長および発達に不可欠であることが示唆される。
70.3.DNA35668−1171(UNQ218)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO244ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA35668−1171と命名)(UNQ218)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_019948 ACCESSION:NM_019948 NID:9910161 Mus musculus Mus musculus C型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9(Clecsf9);参照タンパク質:Q9R0Q8 ACCESSION:Q9R0Q8 NID:Mus musculus(マウス).マクロファージC型レクチンMINCLE(C型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9);参照ヒト遺伝子配列:NM_014358 ACCESSION:NM_014358 NID:7657332 Homo sapiens Homo sapiens C型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9(CLECSF9);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9ULY5 ACCESSION:Q9ULY5 NID:Homo sapiens(ヒト).マクロファージC型レクチンMINCLE。
目的のマウス遺伝子は、ヒトCLECSF9のオーソログである、Clecsf9(C型[カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン]レクチン、スーパーファミリーメンバー9)である。別名としては、MINCLEおよびマクロファージ誘導性C型レクチンが挙げられる。
CLECSF9は、C型レクチンスーパーファミリーに属するII型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルアンカーおよびC型レクチンドメインからなる。このドメインを有するタンパク質は、代表的には、細胞接着、細胞−細胞シグナル伝達、炎症および免疫機能に関与する。CLECSF9の発現は、LPS、TNF−アルファ、IL−6およびIFN−ガンマに応答して、マクロファージにおいて誘導される(Matsumoto et al,J Immunol 163(9):5039−48(1999);Ebner et al,Proteins 53(1):44−55(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=3.39 有意性=0.18359922(ホモ/n)=0.22
平均産仔数=4
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1〜3を標的化した(NCBIアクセッションNM_019948.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、肝臓および脂肪において、標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.3.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA35668−1171(UNQ218)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトC型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9(CLECSF9)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスは、機能観察バッテリー試験の間、挙尾を示した。雄(−/−)マウスにおいては、平均全身脂肪パーセントおよび総脂肪マスが増加した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫 性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んでいた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、全体感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経学的機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検出および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
結果:
基本的な感覚および運動の観察結果:解析された8匹の(−/−)マウスのうち、4匹が、機能観察バッテリー試験の間に挙尾を示した。これらの観察結果は、変異(−/−)マウスにおける不安の増大を示唆し、その不安は、軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安および/または双極性障害;活動亢進;感覚障害;強迫性障害、分裂病または妄想性人格に関連する。従って、PRO244ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の処置に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび全身脂肪マスが増加した。
これらの研究から、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、肥満症に関連し得るネガティブな表現型を示すことが示唆される。従って、PRO244ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝プロセスに不可欠であり、特に肥満症の予防および/または処置に重要であり得る。
70.4.DNA35673−1201(UNQ221)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO247ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA35673−1201と命名)(UNQ221)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC048152 Mus musculusロイシンリッチ反復配列含有8、mRNA(cDNAクローンMGC:61242IMAGE:5708850);参照タンパク質:Q80WG5 ACCESSION:Q80WG5 NID:Mus musculus(マウス).ロイシンリッチ反復配列含有8前駆体;参照ヒト遺伝子配列:BC051322Homo sapiens ロイシンリッチ反復配列含有8、mRNA(cDNAクローンMGC:59975IMAGE:6250713);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8IWT6 ACCESSION:Q8IWT6 NID:Homo sapiens(ヒト)ロイシンリッチ反復配列含有8前駆体。
目的のマウス遺伝子は、ヒトLRRC8のオーソログである、Lrrc8(ロイシンリッチ反復配列含有8)である。別名としては、MGC49146、MGC61242、mKIAA1437、FLJ10337および K1AA1437が挙げられる。
LRRC8は、レセプターまたは細胞接着分子としておそらく機能する内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、4回膜貫通型セグメントおよび8ロイシンリッチ反復配列の細胞外C末端ドメインからなる。LRRC8は、T細胞およびB系統細胞において発現し、B細胞の発達に重要である可能性がある。LRRC8遺伝子の変異は、無ガンマグロビン尿症(agammaglobinuria)を引き起こし得る(Sawada et al,J Clin Invest 112(11):1707−13(2003):Kubota et al,FEBS Lett 564(1−2):147−52(2004):Conley.J Clin Invest 112(11):1636−8(2003);Smits and Kajava,Mol Immunol 41(5):561−2(2004))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=0.19 有意性=0.9093729(ホモ/n)=0.24
平均産仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションBC048152.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨を除く13の成体組織サンプルすべてにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.4.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA35673−1201(UNQ221)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチ反復配列含有8(LRRC8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が上昇した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Lifescan血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。20%溶液として送達される2g/kgのD−グルコースを動物にIP注射し、血中グルコースレベルを注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
耐糖能試験:試験された雄変異(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、耐糖能が上昇した。
これらの研究において、変異(−/−)マウスは、試験された3つの間隔すべてにおいて、正常な空腹時のグルコースの存在下で、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、高いか、または促進された耐糖能を示した。従って、ノックアウトマウスは、高いインスリン感度または損傷したグルコースホメオスタシスの反対の表現型パターンを示し、PRO247ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト(インヒビター)は、損傷したグルコースホメオスタシスの処置に有用であり得る。
70.5.DNA38260−1180(UNQ236)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO269ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA38260−1180と命名)(UNQ236)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_025809 ACCESSION:NM_025809 NID:gi 13385277 refNM_025809.1 Mus musculus RIKEN cDNA 1200003C23遺伝子(1200003C23Rik);参照タンパク質:Q9CXA8 ACCESSION:Q9CXA8 NID:Mus musculus(マウス).1200003C23RIKタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_175060 ACCESSION:NM_175060 NID:gi 28269706 ref NM_175060.1 Homo sapiens 14番染色体オープンリーディングフレーム27(C14orf27);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q86T13 ACCESSION:Q86T13 NID:Homo sapiens(ヒト).タンパク質C14orf27前駆体。
目的のマウス遺伝子は、ヒトC14orf27(14番染色体オープンリーディングフレーム27)のオーソログである、RIKEN cDNA 1200003C23遺伝子である。
C14orf27は、仮想I型原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、C型レクチン(CTL)ドメイン(SMARTアクセッションSM00034)、上皮成長因子様ドメイン(SMARTアクセッションSM00181)、膜貫通型セグメントおよび細胞質のC末端からなる。このタンパク質は、糖タンパク質上の炭水化物残基と結合する可能性があり、リガンド、レセプターまたは細胞接着分子として機能し得る。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=6.64 有意性=0.036152836(ホモ/n)=0.18
平均産仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッション(NM_025809.3)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、脊髄、胸腺、骨格筋、骨および脂肪を除く13の成体組織サンプルすべてにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.5.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA38260−1180(UNQ236)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト14番染色体オープンリーディングフレーム27(C14orf27)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける骨中無機質密度測定値が減少した。遺伝子破壊をサザンブロットにより確認した。
(b)発現
UNQ236(単一の膜貫通タンパク質)は、マウスの胚における血管のサブセットにおいて発現される:特に、E9.75頭部;E9.75体幹(前腸内胚葉;心臓;中腸内胚葉);E10.5頭部;およびE9.75腹側体幹(肝臓および膵臓の芽を含む前腸内胚葉)。
UNQ236ヒト遺伝子のGeneLogic発現プロファイルは、その発現が血管内皮の細胞株に限定されることを示す(大動脈EC;HMVEC;肺性大動脈ECおよびHUVEC)。
(c)骨代謝および放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
1.DEXA:雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、全身、大腿骨および脊椎において平均骨塩量、骨塩量指標(BMC/LBM)および骨中無機質密度が減少した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均脊椎骨梁骨容量および結合密度が減少した。
DEXAおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が減少したことから、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝性障害を反映する異常な骨測定値および低い骨測定値を含むネガティブな骨表現型を示した。ネガティブな骨表現型は、PRO269ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO269ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方、PRO269ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理的な骨障害をもたらし得る。
70.6.DNA37151−1193(UNQ256)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO293ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA37151−1193と命名)(UNQ256)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_010732 Mus musculus ロイシンリッチ反復配列タンパク質2、ニューロン(Lrrn2);参照タンパク質:Q6PHP6 ACCESSION:Q6PHP6 NID:Mus musculus(マウス).ロイシンリッチ反復配列タンパク質2、ニューロン;参照ヒト遺伝子配列:NM_006338 ACCESSION:NM_006338 NID:5453655 Homo sapiens Homo sapiens1番染色体で増幅されるグリオーマタンパク質(ロイシンリッチ)(GAC1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O75325 ACCESSION:O75325 NID:Homo sapiens(ヒト).1番染色体で増幅されるグリオーマタンパク質前駆体。
目的のマウス遺伝子は、ヒトLRRN5(ロイシンリッチ反復配列ニューロン5)のオーソログである、Lrrn2(ロイシンリッチ反復タンパク質2、ニューロン)である。別名としては、NLRR−2、5730406J09Rik、GAC1、LRANK1、ロイシンリッチおよびアンキリン反復配列1、1番染色体で増幅されるグルオーマタンパク質が挙げられる。
LRRN5は、細胞接着分子またはレセプターとしておそらく機能する、主に中枢神経系に発現する推定I型原形質膜である。そのタンパク質は、シグナルペプチド、ロイシンリッチ反復配列、膜貫通型セグメントおよび短い細胞質のC末端を含む。LRRN5は、神経系の発達および分化において役割を果たし得る。LRRN5 mRNAの発現は、いくつかの悪性グリオーマにおいて過剰発現される(Taguchi et al,Brain Res Mol Brain Res 35(l−2):31−40(1996);Almeida et al,Oncogene 16(23):2997−3002(1998);Riemenschneider et al,Int J Cancer 104(6):752−7(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=4.18 有意性=0.12368715(ホモ/n)=0.27
平均産仔数=7
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションNM_010732.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13の成体組織サンプルのすべて(肺、骨格筋および骨を除く)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.6.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA37151−1193(UNQ256)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチ反復配列ニューロン5(LRRN5)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける神経性の異常が生じた。野生型同腹仔と比較するとき、ホモ接合性変異マウスは、不安様応答の低下および疼痛に対する感度の低下を含む神経性の異常を示した。ホモ接合性変異マウスはまた、全身脂肪(パーセント%および質量(g)の両方)が増加した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んでいた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導性高体温:
FOBは、全体感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経学的機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらを正常に検出および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
結果:
不安:雄(−/−)マウスにおいて、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、ストレス誘導性高体温に対する応答が低下したことから、変異体における不安様応答の低下が示唆される。従って、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏ならびに感覚障害および/または双極性障害に一致する表現型を示した。従って、PRO293ポリペプチドおよびそのアゴニストは、うつ病性障害に関連する症状の処置または回復に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスにおいて、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび全身脂肪マスが増加した。
これらの研究から、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、肥満症に関連し得るネガティブな表現型を示すことが示唆される。従って、PRO293ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝プロセスに不可欠であり、特に肥満症の予防および/または処置において重要であり得る。
70.7.DNA39975−1210(UNQ261)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO298ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA39975−1210と命名)(UNQ261)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172465 ACCESSION:NM_172465 NID:gi 27369635 refNM_172465.1 Mus musculus RIKEN cDNA 9530098M12遺伝子(9530098M12Rik);参照タンパク質:P59268 ACCESSION:P59268 NID:Mus musculus(マウス).ジンクフィンガーDHHCドメイン含有タンパク質9;参照ヒト遺伝子配列:NM_016032 Homo sapiens ジンクフィンガー,DHHCドメイン含有9(ZDHHC9);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y397 ACCESSION:Q9Y397 NID:Homo sapiens(ヒト).ジンクフィンガーDHHCドメイン含有タンパク質9(ジンクフィンガータンパク質379)(CGI−89)(UNQ261/PRO298)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトZDHHC9のオーソログである、Zdhhc9(ジンクフィンガー、DHHCドメイン含有9)である。別名としては、6430508G22、9530098M12Rik、CGI−89、ZNF379およびCGI−89タンパク質が挙げられる。
ZDHHC9は、推定膜タンパク質であり、2回膜貫通型セグメントによって各側に隣接しているDHHCジンクフィンガードメインからなる。このタンパク質の機能は未知である;しかしながら、DHHCジンクフィンガードメインは、タンパク質−タンパク質相互作用、タンパク質−DNA相互作用およびパルミトイルトランスフェラーゼ活性(PfamアクセッションPF01529)に関連し得る。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=69.82 有意性=6.8988975E−16(ホモ/n)=0.67
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションNM_172465.1)。
このプロジェクトは、X連鎖である。
性別および遺伝子型によるX連鎖遺伝子分配の概要
(雄キメラ由来のアグーチ子孫のみが含まれる)
Figure 2008532516
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および骨を除く13の成体組織サンプルすべてにおいて、標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.7.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA39975−1210(UNO261)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトジンクフィンガーであるDHHCドメイン含有9(ZDHHC9)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(0/−)マウスにおける血小板数が増加した。この変異は、X連鎖遺伝子である。雄と雌の野生型マウスの両方を解析した一方で、雄ヘミ接合性変異マウスおよび雌ヘテロ接合性マウスのみを解析した。雄ヘミ接合性(野生型)マウスおよびヘミ接合性変異マウスを、それぞれ(+/+)および(−/−)と命名する。
ヘミ接合性変異マウス(0/−)は、野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血小板数の増加ならびに血清IgG3レベルの減少を示した。ホットプレート試験において、雄(−/−)マウスにおける応答性が減少した。さらに、ノックアウトマウスは、マイクロCT骨測定値の低下を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験を、自動血液分析器である、Abbott’s Cell−Dyn 3500Rによって実施する。この特徴のいくつかは、5つに分かれたWBCディファレンシャルを含む。「患者」レポートは、全部で22のパラメータを網羅し得る。
結果:
血液学:(0/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血小板数が増加した。
従って、DNA39975−1210遺伝子が欠損した変異マウスは、凝固障害に関連する表現型を生じた。この点において、PRO298ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、血友病などの異常な血液凝固に関連する障害の処置に有用であり得る。
(2)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、血球計算ビーズアレイ(CBA)キットを使用して実施する。このアッセイは、単一サンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定するために使用される。表される値は、「相対的蛍光単位」であり、カッパー軽鎖の検出に基づく。6未満のいずれの値も有意ではない。
結果:
(0/−)マウスにおいては、性別一致同腹仔コントロールと比較して、血清IgG3が減少した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ヘミ接合性変異成体が、血清IgG3レベルの低下を示すことが明らかになった。従って、ヘミ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して、異常に低い血清免疫グロブリンを示した。ゆえに、PRO298をコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはガンマグロブリン)を生成するために不可欠である。IgG3免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、PRO298ポリペプチドまたはそのアゴニストが、免疫系(T細胞増殖など)の刺激に有用であり得、この作用が、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患患者などの免疫低下患者に有益であり得る場合において有用性が見出され得ることが示唆される。従って、PRO298ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合の有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
ホットプレート試験
試験の説明:侵害受容についてのホットプレート試験を、各マウスを小型の閉鎖系である55℃のホットプレートに置くことによって実施する。ホットプレート上での最大時間を30秒として、後肢応答(なめる、振るまたは跳ねる)までの時間を記録する。各動物は1回試験される。
結果:
変異(−/−)マウスにおいては、この試験では、性別一致(+/+)同腹仔コントロールと比較するとき応答性が低下した。これらの結果から、侵害受容応答の低下が示唆される。
(d)骨代謝および全身診断学:放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
マイクロCT:(−/−)変異体においては、(+/+)コントロール同腹仔と比較して、骨梁骨容量、数および結合密度の低下とともに骨関連測定値が低下した。さらに、大腿骨中軸の厚さもまた、(−/−)ノックアウトマウスにおいて減少した。
骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が低下したことから、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、異常な骨測定値および低い骨測定値を伴うネガティブな骨表現型を示したことから、骨代謝障害が示唆される。ネガティブな骨表現型は、PRO298ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO298ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO298ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連した炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的な骨障害に導き得る。
70.8.DNA43466−1225(UNQ299)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO339ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA43466−1225と命名)(UNQ299)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_133913 Mus musculus RIKEN cDNA 2010209O12遺伝子(2010209O12Rik);参照タンパク質:Q80TE1 ACCESSION:Q80TE1 NID:Mus musculus(マウス).MKIAA1402タンパク質(フラグメント);参照ヒト遺伝子配列:NM_019015 Homo sapiensコンドロイチン硫酸グルクロン酸転移酵素(CSGlcA−T);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UXD2 ACCESSION:Q6UXD2 NID:Homo sapiens(ヒト).RLSS299。
目的のマウス遺伝子は、ヒトCSGlcA−T(コンドロイチン硫酸グルクロン酸転移酵素)のオーソログである、mKIAA1402タンパク質である。別名としては、KIAA1402が挙げられる。
CSGlcA−Tは、コンドロイチン硫酸においてグルクロン酸がN−アセチルガラクトサミンへ転移するのを触媒する酵素として機能するII型内在性膜タンパク質である。他の膜関連グリコシルトランスフェラーゼのように、CSGlcA−Tは、ゴルジ装置に局在する可能性がある。CSGlcA−Tは、細胞接着、シグナル伝達および組織の物理的強度に寄与する細胞表面および細胞外マトリックスプロテオグリカンである、コンドロイチン硫酸上におけるオリゴ糖鎖の伸長に重要な役割を果たし得る(Gotoh et al,J Biol Chem 277(41):38179−88(2002))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=0.84 有意性=0.65704685(ホモ/n)=0.24
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1および2を標的化した(NCBIアクセッションNM_133913.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および骨以外の13のすべての成体組織サンプルから標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.8.1.表現型解析(破壊遺伝子;DNA43466−1225(UNQ299)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトコンドロイチン硫酸グルクロン酸転移酵素(CSGlcA−T)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、IL6およびTNFアルファのレベルの上昇;血清免疫グロブリンIgG2aレベルの減少、脾臓、リンパ節およびパイアー斑におけるB細胞の増加ならびに活性化/記憶T細胞の増加を伴うLPS応答性の上昇を含むいくつかの免疫学的異常が生じた。ヘテロ接合体とホモ接合体の両方において、尿酸のレベルが上昇した。雄(−/−)マウスと雌(−/−)マウスの両方において、身長が小さくなった。骨関連測定値の低下もまた(−/−)マウスにおいて観察された。雌ノックアウトは、総組織マス、脂肪(%)および脂肪マス(g)の増加も示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)蛍光(Flourescence)標識細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。フローサイトメトリーは、単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するために設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。サンプルを、CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して解析した。
結果:
FACS:ホモ接合(−/−)マウスにおいては、性別一致野生型(+/+)同腹仔および背景的平均と比較して、脾臓、リンパ節およびパイアー斑内のB細胞のパーセンテージが上昇した。パイアー斑は、小腸、特に回腸に沿ったリンパ球の集合体である。さらに、(−/−)マウスは、CD25+染色およびCD62L/CD44染色によって活性化/記憶T細胞のレベルの上昇を示した。さらに、(−/−)マウスは、野生型(+/+)同腹仔と比較して、脾臓内のNK細胞のレベルの減少を示した。
要約すれば、免疫細胞組成物のFACS解析から、ノックアウト(−/−)マウスが、B細胞と活性化T細胞の両方に関して、免疫学的差異を示すと示唆される。PRO339のインヒビターまたはアンタゴニストは、B細胞産生ならびに活性化/記憶T細胞の数の増加に有用であり得る一方で、PRO339ポリペプチドは、その反対の作用に導くと考えられ得る。さらに、FACS結果から、ホモ接合性変異マウスが、ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下を示すことが示唆される。ナチュラルキラー細胞は、ウイルス免疫および腫瘍に対する防御に結び付けられてきたので、これらの細胞は、ウイルス感染の防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞またはNK細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性におけるエフェクターとして作用し、事前の免疫または活性化の必要なしにインビトロにおいて特定のリンパ系腫瘍細胞株を殺滅する能力によって同定されてきた。
(2)急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重であった。注射の3時間後100μlの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、LPS攻撃に対する平均血清IL6およびTNF−アルファ応答が増大した。
要約すれば、LPSエンドトキシン攻撃から、PRO339ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスが、野生型同腹仔と比較するとき、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、LPSエンドトキシンによる攻撃を受けたとき、免疫学的応答(TNF−アルファおよびIL−6の産生)を誘発する能力が増大したことが示されたことから、炎症促進性応答が示唆される。IL−6およびTNF−アルファは、B細胞活性化の後期に寄与する。さらに、IL−6は、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。このことから、PRO339ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、そしてこの効果が白血病および他のタイプの癌の場合などの個体およびAIDS罹患患者などの免疫低下患者に有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。従って、PRO339ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、そして、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合などの有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(3)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、血球計算ビーズアレイ(CBA)キットを使用して実施する。このアッセイは、単一サンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定するために使用される。表される値は、「相対的蛍光単位」であり、カッパー軽鎖の検出に基づく。6未満のいずれの値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、性別一致同腹仔(+/+)コントロールと比較して、ホモ接合体(−/−)マウスにおけるIgG2aのレベルの低下または減少が示された。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイから、ホモ接合性成体における血清IgG2aレベルの減少が明らかになった。従って、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して異常に低い血清免疫グロブリンを示した。従って、PRO339をコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはガンマグロブリン)を生成するために不可欠である。同様に、IgG2a免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどでないにせよ、補体系の活性化に重要である。
(c)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織マス(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、脊椎および両大腿骨)の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
身体測定(身長および体重):
身体測定:身長および体重の測定を約16週齢で行った。
結果:
身長:雄(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均身長の低下(1〜2標準偏差未満)が見られたことから、成長遅延が示唆される。
(2)骨代謝:放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
1.DEXA:雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、全身および脊椎における平均骨塩量、骨塩量指標および骨中無機質密度が減少した。さらに、雌(−/−)マウスは、総組織マス(TTM)、脂肪(%)および脂肪(g)の減少を示した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均脊椎骨梁の骨容量、数および結合密度が減少し、平均大腿骨中軸の厚さが減少した。
要約:
DEXAおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が減少したことから、異常な骨障害が示唆される。しかしながら、雌変異(−/−)マウスはまた、体脂肪の平均パーセンテージの上昇を示したことから、肥満症表現型が示唆される。これらの観察結果から、PRO339ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、脂肪の蓄積に関連する代謝障害だけでなく、肥満症に関連し得る一般的な代謝障害を反映する異常な骨測定値をもたらすことが示唆される。従って、PRO339ポリペプチドまたはそのアゴニストが、このような障害(例えば、肥満症または他の代謝性疾患)の処置または予防に有用であり得る。しかしながら、ネガティブな骨表現型はまた、PRO339ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることが示唆される。さらに、PRO339ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用である一方で、PRO339ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連した炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的骨障害をもたらし得る。
(d)表現型解析:代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。血中グルコースレベルの測定に加えて、以下の血液化学試験もまた慣習的に行った:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノ−トランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;亜リン酸;クレアチニン;BUN=血液尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;およびクロライド。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
結果:
血液化学解析は、性別一致(+/+)同腹仔コントロールおよび背景的平均と比較するとき、ヘテロ接合性(+/−)マウスとホモ接合性(−/−)マウスの両方において尿酸レベルの上昇(2標準偏差より大きい)を示した。従って、変異(−/−)マウスおよび(+/−)マウスは、痛風(異常なプリン代謝)のタイプに共通である腎結石(および関連腎臓疾患)が示唆される血液中の尿酸の著しい上昇に関連したネガティブな表現型を示す。PRO339ポリペプチドおよびそのアゴニストは、腎結石の形成および/または異常なプリン代謝に関連するこのような疾患の処置に有用であり得る。
70.9.DNA26288−1239(UNQ300)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO341ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA26288−1239と命名)(UNQ300)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:AK006096 Mus musculus雄成体精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリ、クローン:1700018O18産物:仮想MyC型、ヘリックス−ループ−ヘリックス二量体化ドメイン含有タンパク質、全長挿入断片配列;参照タンパク質:Q9DA75 ACCESSION:Q9DA75 NID:Mus musculus(マウス).1700018O18Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_032793 Homo sapiens 仮想タンパク質FLJ14490(FLJ14490);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q96F59 ACCESSION:Q96F59 NID:Homo sapiens(ヒト).仮想タンパク質FLJ90702。
目的のマウス遺伝子は、ヒト仮想タンパク質FLJ14490のオーソログである、RIKEN cDNA1700018O18遺伝子である。
仮想タンパク質FLJ14490は、10回膜貫通型セグメントからなる内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、Escherichia coliにおけるメリビオースキャリアに類似している(Yazyu et al,J Biol Chem 259(7):4320−6(1984))ことから、この仮想ヒトタンパク質が、トランスポーターとして機能することが示唆される。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=3.09 有意性=0.21331188(ホモ/n)=0.22
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1および2を標的化した(NCBIアクセッションAK006096.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋、骨、心臓および脂肪を除く)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.9.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA26288−1239(UNQ300)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質(FLJ14490)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおいて総体脂肪が減少し、雄においてより顕著であった。(−/−)マウスにおいては、体重および身長が減少し、体脂肪が減少した。さらに、雌(−/−)マウスは、骨髄様過形成を示した。NK細胞数のレベルの低下もまた(−/−)マウスにおいて観察された。雄変異体においてはまた、平均血清インスリンが減少した。顕微鏡解析により、解析された2匹の雌変異体の大腿および胸骨の骨髄における骨髄様過形成が明らかになった。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡観察:試験された4匹すべての雌マウスの骨髄において骨髄様過形成を観察したが、2匹の雄マウスには存在しなかった。骨髄様過形成は、胸骨と大腿の骨髄の両方に存在した。脾臓における赤血球過形成は、骨髄中に骨髄様過形成を有するマウスに通常見られる。雌マウスの皮膚、乳腺および肝臓における組織炎症のわずかな増加が見られた。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析によって組織のパネルに検出されなかった。
(c)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
蛍光標示式細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。フローサイトメトリーは、単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するために設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。サンプルを、CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して解析した。
結果:
FACS:
(−/−)マウスにおいては、野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下を特徴とする、様々な白血球サブセットの分布の変化を示した。
要約すれば、FACS結果は、特に、PRO341ポリペプチドをコードするDNA26288−1239遺伝子のノックアウトに関連したネガティブな表現型の指標であるナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下を考慮すると、ホモ接合性変異マウスの免疫系が減損することが示唆される。ナチュラルキラー細胞は、ウイルス免疫および腫瘍に対する防御に関係付けられているので、これらの細胞は、ウイルス感染の防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞またはNK細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性においてエフェクターとして作用し、事前の免疫または活性化の必要なしに一定のリンパ系腫瘍細胞株をインビトロにおいて殺滅する能力によって同定されてきた。しかしながら、宿主防御におけるそれらの既知の機能は、いくつかの細胞内の病原体、特にヘルペスウイルスの感染の初期においてである。従って、PRO341ポリペプチドおよびそのアゴニストは、健康な免疫系に重要であり得、そして免疫系を刺激する際、特にウイルス感染の間において有用であり得る。
(d)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織マス(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、脊椎および両大腿骨)の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
身体測定(身長および体重):
身体測定:身長および体重の測定を約16週齢で行った。
結果:
一般的な観察結果:(−/−)マウスは、(+/+)と比較するとき、震え行動を示した。
(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均体重の減少(背景的平均より1〜2標準偏差低い)および平均身長の低下(背景的平均よりも>2標準偏差低い)を示した。
(2)骨代謝:放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
結果:
1.DEXA:(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび総脂肪マスが低下した。その差は、雄においてより顕著であった。
変異(−/−)マウスは、組織消耗疾患を示唆する総体脂肪および脂肪マスの枯渇を示した。(−/−)マウスの体重および身体測定値の低下は、成長遅延表現型を実証している。従って、PRO341ポリペプチドのアンタゴニスト(またはインヒビター)は、このネガティブな表現型を模倣すると考えられ得る。PRO341ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な脂肪代謝および関連の成長関連代謝の維持に有用であり得る。
(e)血液化学
マウスにおける血液化学試験を実施するための臨床的な設定のCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して血液化学解析を行った。
インスリンデータ:
試験の説明:Lexicon Geneticsは、マウスにおける定量的インスリンアッセイを実施するための臨床的な設定のCobra IIシリーズ自動ガンマ計測システムを使用する。
結果:
雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清インスリンレベルが低下した。
PRO341ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異体(−/−)マウスは、体重および身長の減少ならびに組織消耗疾患(総体脂肪(%)および脂肪マス(g)の減少)によって特徴付けられる成長遅延に一致した表現型を示す。インスリンレベルもまた、異常に低いことから、糖尿病が示唆され得る。従って、PRO341ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの代謝性作用および成長関連作用を模倣し得る。他方では、PRO341ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような代謝性障害(例えば、糖尿病または他の組織消耗疾患)の予防および/または処置に有用であり得る。
70.10.DNA44176−1244(UNQ306)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO347ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA44176−1244と命名)(UNQ306)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_181549 Mus musculusマンノースレセプター様前駆体(Mrcl);参照タンパク質:Q7TSQ7 ACCESSION:Q7TSQ7 NID:Mus musculus(マウス).マンノースレセプター様;参照ヒト遺伝子配列:NM_182619 Homo sapiens分泌タンパク質LOC348174(LOC348174);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8NCF0 ACCESSION:Q8NCF0 NID:Homo sapiens(ヒト).仮想タンパク質FLJ90292。
目的のマウス遺伝子は、ヒト分泌タンパク質LOC348174のオーソログである、Mrcl(マンノースレセプター様前駆体)である。
Mrclは、おそらく分泌タンパク質であり、シグナルペプチド、SCP様細胞外タンパク質ドメイン(PfamアクセッションPF00188)、2つの上皮成長因子様ドメインおよびC型レクチンドメイン(PfamアクセッションPF00059)からなる。このタンパク質の機能は未知である。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=0.8 有意性=0.67032003(ホモ/n)=0.27
平均産仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1〜3を標的化した(NCBIアクセッションNM_181549.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13の成体組織サンプルのうち、脳、脊髄、眼、胸腺、腎臓、骨格筋および心臓において、標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.10.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA44176−1244(UNQ306)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト分泌タンパク質(LOC348174)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける血清グルコースレベルおよび総体脂肪が増加した。雄と雌のホモ接合性変異体マウスの両方では、性別一致野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清グルコースレベルおよび総体脂肪が増加した。(−/−)マウスではまた、DEXAおよびマイクロCT測定によって示される骨関連測定値が低下した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清グルコースレベルが上昇した。しかしながら、耐糖能試験は正常であった。
上で概要を述べたように、(−/−)マウスにおいては、平均血清グルコースレベルが上昇したことから、異常なグルコース代謝または前糖尿病状態が示唆される。さらに、変異(−/−)マウスはまた、総体脂肪および脂肪マスの増加を示したことから、異脂肪血症が示唆される。従って、PRO347遺伝子が欠損した変異マウスは、脂肪および血中グルコースのレベルの上昇に関連した循環器疾患に対するモデルとしての機能を果たし得る。PRO347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、正常な血中脂質レベル(トリグリセリドなど)の制御に有用であり得る。従って、PRO347ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような循環器疾患(例えば、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満症)の処置に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
1.DEXA:雄(−/−)マウスと雌(−/−)マウスの両方においては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび総脂肪マスが増加した。さらに、雄(−/−)マウスはまた、平均骨塩量および骨塩量指標(BMC/LBM指標)が減少した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、大腿骨中軸の平均断面積が減少した。
DEXAおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が減少したことから、異常な骨障害が示唆される。しかしながら、変異(−/−)マウスはまた、体脂肪の平均パーセンテージの上昇を示したことから、肥満症表現型が示唆される。これらの観察結果から、PRO347ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、脂肪の蓄積に関連する代謝性障害だけでなく、肥満症に関連し得る一般的な代謝性障害を反映する異常な骨測定値をもたらすことが示唆される。従って、PRO347ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような障害(例えば、肥満症または他の代謝性疾患)の処置または予防に有用であり得る。しかしながら、ネガティブな骨表現型はまた、PRO347ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆し得る。さらに、PRO347ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的な骨障害をもたらし得る。
70.11.DNA48314−1320(UNQ332)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO531ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA48314−1320と命名)(UNQ332)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_053141 Mus musculusプロトカドヘリンベータ16(Pcdhb16);参照タンパク質:Q91Y03 ACCESSION:Q91 Y03 NID:Mus musculus(マウス).プロトカドヘリンベータ16;参照ヒト遺伝子配列:NM_019120 ACCESSION:NM_019120 NID:14195614 Homo sapiens Homo sapiens プロトカドヘリンベータ8(PCDHB8);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UN66 ACCESSION:Q9UN66 NID:Homo sapiens(ヒト).プロトカドヘリンベータ8前駆体(PCDH−BETA8)(プロトカドヘリン31)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトPCDHB8(プロトカドヘリンベータ8)のオーソログである、Pcdhb16(プロトカドヘリンベータ16)である。別名としては、Pcdhb8、PcdhbP、PCDH3I、PCDH−BETA8およびプロトカドヘリン−3iが挙げられる。
PCDHB8は、細胞接着分子として機能する、主に神経組織に発現するI型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、細胞−細胞相互作用において役割を果たす可能性がある(Vanhalst et al,FEBS Lett 495(1−2):120−5(2001);Yagi and Takeichi,Gene Dev 14(10):1169−80(2000))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=5.28 有意性=0.07136126(ホモ/n)=0.24
平均産仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションNM_053141.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肺;骨格筋;骨;ならびに胃、小腸および結腸を除く)において標的遺伝子の発現を検出した
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.11.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA48314−1320(UNQ332)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトプロトカドヘリンベータ8(PCDHB8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、ホモ接合性(−/−)マウスの脾臓における活性化/記憶T細胞が増加した。(−/−)マウスはまた、LBM、BMCおよびBMC/LBM指標の増加を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
結果:
1.DEXA:雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均除脂肪体重が増加した。これらの変異体はまた、BMC/LBM指標の増加を含む、骨塩量および骨中無機質密度関連測定値の増加を示した。
要約すれば、(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、平均除脂肪体重、骨塩量および骨中無機質密度が増加した。これらの結果から、ノックアウト変異体表現型が、大理石骨病などのこのような骨異常に関連していることが示唆される。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。同様に、PRO531ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方では、PRO531ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨の治癒に有用であり得る。
(c)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
蛍光標示式細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。フローサイトメトリーは、単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するために設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。サンプルを、CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して解析した。
結果:
FACS:変異(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較して、脾臓における活性化/記憶T細胞の増加を示した。
要約すれば、免疫細胞組成物のFACS解析により、ノックアウトマウス(−/−)が、活性化/記憶T細胞に関する免疫学的差異を示すことが示唆される。これらの観察結果から、PRO531ポリペプチドまたはPRO531をコードする遺伝子が、T細胞増殖の負の制御因子として作用するようだ。従って、PRO531ポリペプチドまたはそのアゴニストは、関節リューマチ患者において生じるように明白なT細胞増殖が見られる場合に、T細胞増殖の負の制御因子として有益であり得る。PRO531のインヒビターまたはアンタゴニストは、活性化/記憶T細胞の数を増加させるのに有用であり得る一方で、PRO531ポリペプチドまたはそのアゴニストは、その反対の作用をもたらすと考えられ得る。
70.12.DNA49141−1431(UNQ338)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO537ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49141−1431と命名)(UNQ338)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:AK014425 Mus musculus 妊娠18日の成体雌胎盤および胚体外組織cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリ、クローン:3830408D24産物:仮想ヒスチジンリッチ領域含有タンパク質、全挿入断片配列;参照タンパク質:Q9D6B9 ACCESSION:Q9D6B9NID:Mus musculus(マウス).3830408D24Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:AY358408 Homo sapiens クローンDNA49141 LGLL338(UNQ338);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:AAQ88774LGLL338[Homo sapiens]。
目的のマウス遺伝子は、ヒトUNQ338(Homo sapiensクローンDNA49141 LGLL338[UNQ338]mRNA)のオーソログである、RIKEN cDNA3830408D24遺伝子である。
UNQ338は、推定分泌タンパク質またはII型原形質膜タンパク質である。115アミノ酸タンパク質は、シグナルペプチドまたはシグナルアンカーおよびグリシンリッチタンパク質(GRP)ドメインと予測され得る部分を含む。このドメインは、ストレスに応答して誘導される植物タンパク質に見られる(PfamアクセッションPF07172)。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=2.61 有意性=0.27117255(ホモ/n)=0.21
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションAK014425)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.12.1.表現型解析(破壊遺伝子;DNA49141−1431(UNQ3381)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトHomo sapiensクローンDNA49141 LGLL338(UNQ338)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおいて免疫学的異常および胃腸運動性の減損が生じた。変異(−/−)マウスは、単球数の減少、B細胞の平均パーセンテージの上昇ならびにCD4およびCD8細胞のパーセンテージの低下を伴う数多くの免疫学的異常を示した。変異(−/−)マウスにおいてはまた、骨関連測定値が上昇した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
血液学解析:
試験の説明:血液試験を、自動血液分析器である、Abbott’s Cell−Dyn 3500Rによって実施する。この特徴のいくつかは、5つに分かれたWBCディファレンシャルを含む。「患者」レポートは、全部で22のパラメータを網羅し得る。
結果:
血液学:(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均絶対単球数が減少した。
要約すれば、血液学結果は、ホモ接合性変異マウスが、同腹仔コントロールと比較して単球数の減少を示したことを示し、このことからマクロファージの前駆体のレベルの抑制が示唆される。これらの結果は、ホモ接合性(−/−)ノックアウトマウスが異常な免疫学的表現型を示すことを示唆する。
蛍光標示式細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。フローサイトメトリーは、単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するために設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。サンプルを、CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して解析した。
結果:
(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するときの、B細胞の平均パーセンテージの上昇ならびに細胞集団内のCD4細胞およびCD8細胞の平均パーセンテージの低下を特徴とする、末梢血中の白血球サブセットの分布が変化した。
したがって、PRO537ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトによって、T細胞集団の減少が引き起こされるだけでなく、B細胞集団の増加が引き起こされる。これらの観察結果から、PRO537ポリペプチドまたはPRO537をコードする遺伝子は、B細胞増殖の負の制御因子として機能するようだ。従って、PRO537ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、B細胞増殖の促進およびT細胞増殖の抑制に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/ml、0.25ml/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20ml/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
1.DEXA:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、全身および大腿骨における平均容量分析的骨中無機質密度および骨中無機質密度が増加した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、大腿骨中軸の平均断面積が増大した。
3.CATスキャン:解析に利用可能な3匹すべての(−/−)マウス(M−101、M−110およびF−186)が、胃腸含有量の著しい増加を示したことから、変異体における胃腸運動性の減損が示唆される。しかしながら、閉塞の徴候は観察されなかった。
要約すれば、(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、全身および大腿骨における平均容量分析的骨中無機質密度および骨中無機質密度の増加ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加を示した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨異常に関連していることを示唆する。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。同様に、PRO537ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方では、PRO537ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨の治癒に有用であり得る。CATスキャン結果は、消化管におけるオピオイドレセプター軸に関連し得るGI運動性の減損を示した。
70.13.DNA49647−1398(UNQ386)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO718ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49647−1398と命名)(UNQ386)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_027935 Mus musculus RIKEN cDNA 3200001F09 遺伝子(3200001F09Rik);参照タンパク質:Q9CXL1 ACCESSION:Q9CXL1 NID:Mus musculus(マウス).3200001F09RIKPROTEIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_014313 ACCESSION:NM_014313 NTD:gi 20357549 ref NM_014313.2 Homo sapiens小型膜タンパク質1(SMP1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O95807 ACCESSION:O95807 NID:Homo sapiens(ヒト).小型膜タンパク質1。
目的のマウス遺伝子は、ヒトSMP1(小型膜タンパク質1)のオーソログである、RIKEN cDNA3200001F09遺伝子である。別名としては、CAM、Smp1および小型膜タンパク質1が挙げられる。
SMP1は、シグナルペプチドおよび4回膜貫通型セグメントを含む157アミノ酸の推定膜タンパク質である。このタンパク質は、普遍的に発現しており、細胞質に局在しているようである。このタンパク質の機能は、未知である(Kumada et al,Gene 299(1−2):165−72(2002);Wagner and Flegel,Blood 95(12):3662−8(2000);Reboul et al.Genome Res 9(3):242−50(1999))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=2.02 有意性=0.36421898(ホモ/n)=0.29
平均産仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1および隣接している5プライム非コーディングエキソンを標的化した(NCBIアクセッションNM_027935.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13のすべての成体組織サンプルから標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.13.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA49647−1398(UNQ386)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト小型膜タンパク質1(SMP1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおいて貧血が生じた。(−/−)マウスではまた、LPS攻撃に対するTNF−アルファ応答が増大し、平均血清IgG2aレベルが低下した。ホモ接合性変異マウスは、野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、貧血の徴候を示した。血液化学により、(−/−)マウスにおいて血清グルコースレベルおよび尿中のケトン体が増加したことが明らかになった。雌(−/−)マウスにおいてもまた、平均骨中無機質密度関連測定値が上昇した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫学的表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、緩解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得る、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のために本明細書中で標的を同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を緩解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重であった。注射の3時間後100μlの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、LPS攻撃に対する平均血清TNF−アルファ応答が増大した。
要約すれば、LPSエンドトキシン攻撃により、PRO718ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスが、野生型同腹仔と比較するとき、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスにおいては、LPSエンドトキシンによる攻撃を受けたとき、免疫学的応答(TNF−アルファ産生)を誘発する能力が増大したことから、炎症促進性応答が示唆される。TNF−アルファは、重要な炎症性メディエーターである。さらに、TNF−アルファは、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。TNF−アルファは、マクロファージ活性化において膜結合シグナルに代わり得る(ゆえに、エフェクター分子としての役割を果たす)。このことは、PRO718ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体およびAIDS罹患患者などの免疫低下患者にとって有益であり得る場合に有用性が見られ得ることを示唆する。従って、PRO718ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の抑制に有用であり得、そして有害な免疫応答、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合を抑制するための有用な候補であり得る。
(2)血液学解析:
試験の説明:血液試験を、自動血液分析器である、Abbott’s Cell−Dyn 3500Rによって実施する。この特徴のいくつかは、5つに分かれたWBCディファレンシャルを含む。「患者」レポートは、全部で22のパラメータを網羅し得る。
結果:
(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均総赤血球数、ヘモグロビンレベルおよびヘマトクリットの減少ならびに血球体積の増大を示した。
これらの結果は、貧血に関連した表現型に関する。従って、PRO718ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO718ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に不可欠であるに違いなく、また、貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。
(3)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、血球計算ビーズアレイ(CBA)キットを使用して実施する。このアッセイは、単一サンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定するために使用される。表される値は、「相対的蛍光単位」であり、カッパー軽鎖の検出に基づく。6未満のいずれの値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、性別一致同腹仔(+/+)コントロールと比較して、ホモ接合性(−/−)マウスにおけるIgG2aのレベルの減少または低下を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイから、ホモ接合性成体が、血清IgG2aレベルの上昇を示したことが明らかになった。従って、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して異常に低い血清免疫グロブリンを示した。ゆえに、PRO718ポリペプチドをコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはガンマグロブリン)の生成に不可欠である。同様に、IgG2a免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、PRO718ポリペプチドまたはそのアゴニストが、免疫系(T細胞増殖など)の刺激に有用であり得、そしてこの効果が白血病および他のタイプの癌の場合などの個体およびAIDS罹患患者などの免疫低下患者に有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。従って、PRO718ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答を阻害し得、そして、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合などの有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)表現型解析:代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
結果:
雄(−/−)マウスと雌(−/−)マウスの両方が、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清グルコースレベルの上昇を示した。しかしながら、耐糖能試験は、正常であった。
上で概要を述べたように、(−/−)マウスは、平均血清グルコースレベルの顕著な増加を示したことから、異常なグルコース代謝または前糖尿病状態が示唆される。従って、PRO718遺伝子が欠損した変異マウスは、異常なグルコース代謝に関連する循環器疾患のモデルとして役割を果たし得る。PRO718ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、正常な血中グルコースレベルの制御に有用であり得る。従って、PRO718ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような循環器疾患(例えば、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患または糖尿病)の処置に有用であり得る。
尿検査
説明:
日常的な尿検査は、腎臓/泌尿器系の一般的な評価を提供するために実施されるスクリーニング検査である。尿が日常的に検査される特徴としては、タンパク質、グルコース、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノーゲン、硝酸塩および白血球エステラーゼならびにpHおよび比重についての検査が挙げられる。
結果:
変異ホモ接合体(−/−)マウスおよびヘテロ接合性(+/−)マウスにおいてケトン尿症が観察された。従って、変異(−/−)マウスおよび(+/−)マウスは、異常なグルコース代謝および糖尿病に通常関連するケトン体の異常な存在を示した。
(d)骨代謝および放射線学的表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール,20ml/kg 体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、身長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PDflmusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎および両大腿骨]の骨中無機質密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織マス(TTM)を測定した。
結果:
1.DEXA:雌(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均骨中無機質密度関連測定値(総身体vBMD、総身体BMDおよび大腿骨BMD)の増加を示した。
要約すれば、(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、平均骨中無機質密度関連測定値の増加を示した。これらの結果から、ノックアウト変異体表現型が、大理石骨病などの骨異常に関連することが示唆される。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。同様に、PRO718ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方では、PRO718ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨の治癒に有用であり得る。
70.14.DNA48303−2829(UNQ411)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO773ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA48303−2829と命名)(UNQ411)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_080434 Mus musculusアポリポタンパク質A−V(Apoa5);参照タンパク質:Q8C7G5 ACCESSION:Q8C7G5 NID:Mus musculus(マウス).Mus musculus成体雄肝臓腫瘍cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリ、クローン:C730033H22産物:アポリポタンパク質A−V、全挿入断片配列;参照ヒト遺伝子配列:NM_052968 ACCESSION:NM_052968 NID:gi 22091457 ref NM_052968.2Homo sapiensアポリポタンパク質A−V(APOA5);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UBJ3 ACCESSION:Q9UBJ3 NID:Homo sapiens(ヒト).再生関連タンパク質3。
目的のマウス遺伝子は、ヒトAPOA5のオーソログである、Apoa5(アポリポタンパク質A−V)である。別名としては、RAP3、Apoav、1300007O05Rik、APOA−V、アポリポタンパク質A5、アポリポタンパク質AVおよび再生関連タンパク質3が挙げられる。
APOA5は、はっきりと理解されていないメカニズムによって血漿トリグリセリドレベルを低下させる、主に肝臓で発現するアポリポタンパク質である(Pennacchio et al,Science 294(5540):169−73(2001);van der Vliet et al,J Biol Chem 276(48):44512−20(2001);van der Vliet et al,Biochem Biophys Res Commun 295(5):1156−9(2002))。APOA5は、高密度リポタンパク質(HDL)、超低密度リポタンパク質(VLDL)およびリポタンパク質リパーゼと相互作用する。さらに、リポタンパク質リパーゼと相互作用することによって、APOA5は、リパーゼ活性を刺激する。リポタンパク質リパーゼ活性の増大は、VLDLサイズを減少させ、トリグリセリド代謝回転およびVLDLクリアランスを増大させることにより、血漿トリグリセリドを低下させる可能性がある(Fruchart−Najib et al,Biochem Biophys Res Commun 319(2):397−404(2004);Schaap et al,J Biol Chem 279(27):27941−7(2004))。APOA5は、小胞体の膜上で凝集しており、COS細胞において発現するとき、十分に分泌されない。さらに、血漿中のAPOA5の濃度は、他のアポリポタンパク質の濃度よりもかなり低く、このことから、APOA5の機能が、主に細胞外でないことが示唆される。細胞内のAPOA5は、肝臓内のトリグリセリドリッチ粒子集合を妨害することにより、血漿トリグリセリドを低下させ得る(Weinberg et al,J Biol Chem 278(36):34438−44(2003))。
APOA5の生理学的役割は、Pennacchioおよび共同研究者によってAPOA5無マウスを使用して研究され(Science 294(5540):169−73(2001)、そしてヒトAPOA5を発現するマウスを使用して、Pennacchioおよび共同研究者(2001)ならびに何人かの他の者によって研究されてきた(van der Vliet et al,Biochem Biophys Res Commun 295(5):1156−9(2002);Fruchart−Najib et al,Biochem Biophys Res Commun 319(2):397−404(2004);Schaap et al,J Biol Chem 279(27):27941−7(2004))。彼らは、血漿トリグリセリドが、野生型マウスにおいてよりもAPOA5無マウスのほうが4倍高かったことおよびヒトAPOA5を発現するマウスの血漿トリグリセリドレベルが、野生型マウスの3分の1であったことを示した。さらに、Pennacchioおよび共同研究者ならびに他の者(OMIM 606368)は、APOA5遺伝子における変異が、血漿トリグリセリドレベルに関連することを見出した。彼らは、APOA5が、血漿トリグリセリドレベルの重要な決定因子であると結論付けた。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
Figure 2008532516
カイ二乗値=1.54 有意性=0.46301308(ホモ/n)=0.26
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1から3を標的化した(NCBIアクセッションNM_080434.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13の成体組織サンプルのうち、眼、胸腺、腎臓および肝臓において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.14.1.表現型分析(破壊遺伝子;DNA48303−2829 UNQ411)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトアポリポタンパク質A−V(APOA5)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの血液化学が異常になった。雄および雌のホモ接合性変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均(historical means)と比較した場合、コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。雌(−/−)マウスはまた、総組織マス(TTM)および脊椎骨中無機質密度(BMD)の測定値ならびに小柱数が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
1.血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベル(平均より3標準偏差超)および平均血清トリグリセリドレベル(標準より6倍(雄)および4倍(雌))が顕著に増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO773遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO733ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO733ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度(connectivity density)、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
1.DEXA:雌ノックアウト(−/−)マウスは、野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび脊椎骨中無機質密度が減少した。
2.マイクロCT:(−/−)マウスは、野生型(+/+)同腹仔と比較して、小柱数が減少した。
DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析された(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO773ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用なようであることを示す。さらに、PRO773ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO773ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.15.DNA60614(UNQ421)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO860ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60614と示す)(UNQ421)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_028783 ムス・ムスクルスラウンドアバウト(roundabout)ホモログ4(ショウジョウバエ)(Robo4);タンパク質リファレンス:NP_083059ラウンドアバウトホモログ4;マジックラウンドアバウト(Magic roundabout);ラウンドアバウトホモログ4(ショウジョウバエ)(ムス・ムスクルス)gi|26334430|dbj|BAB23506.2|無名のタンパク質産物(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_019055アクセッション:NM_019055NID:gi 17511434 refNM_019055.4ホモ・サピエンスラウンドアバウトホモログ4、マジックラウンドアバウト(ショウジョウバエ)(ROBO4);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8WZ75アクセッション:Q8WZ75 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。マジックラウンドアバウト。
目的のマウス遺伝子は、Robo4(ラウンドアバウトホモログ4(ショウジョウバエ))、ヒトROBO4のオーソログ(ラウンドアバウトホモログ4、マジックラウンドアバウト(ショウジョウバエ))である。別名には、1200012D0IRik、マジックラウンドアバウト、およびFLJ20798が含まれる。
ROBO4は、受容体として機能する可能性が高い内皮細胞で主に発現するI型原形質膜タンパク質である。SLITタンパク質またはおそらく他のリガンドでのROBO4の活性化により、血管内皮細胞の移動、管の形成、および血管形成が阻害され、ROBO4が血管発芽で役割を果たすことが示唆される(Huminiecki et al.Genomics 79(4):547−52(2002);Park et al,Dev Biol 261(l):251−67(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=2.02 有意性=0.36421898(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028783.2)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.15.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA60614(UNQ421)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトラウンドアバウトホモログ4、マジックラウンドアバウト(ショウジョウバエ)(ROBO4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、オープンフィールド試験において、雄(−/−)マウスで不安関連応答が増加した。血液化学の結果は、コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルの増加ならびにリンレベルの上昇を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)発現
UNQ421は、マウス胚の血管内皮で特異的に発現する(E10.5神経管(trunk))。
(c)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン(seratonin)輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比(center−to−total distance traveled ratio)は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:
不安:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において、中心滞在時間の合計の中央値が減少し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。
(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較した場合、2、3、および5回の間隔で、中心滞在時間の合計の中央値が減少し、(−/−)マウスにおける不安様応答の増加が示唆される。まとめると、オープンフィールド試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進;感覚障害;強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO860ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(d)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。 高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルの増加(1標準偏差>歴史的平均)および平均血清コレステロールレベルの増加(2標準偏差>歴史的平均)を示した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO860遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO860ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドおよびコレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO860ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(e)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。
結果:
変異(−/−)マウスは、リンレベルが上昇した(歴史的平均を超える約2標準偏差)。リン測定値が異常であるにもかかわらず、変異(−/−)マウスは、所見に関連し得る典型的な骨測定値を示さなかった。
70.16.DNA50919−1361(UNQ438)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO871ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA50919−1361と示す)(UNQ438)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_127535 ムス・ムスクルス(血清学的に定義された結腸癌抗原10(Sdccag10));タンパク質リファレンス:XP_127535(血清学的に定義された結腸癌抗原10(ムス・ムスクルス));ヒト遺伝子配列リファレンス:AY358569ホモ・サピエンスクローンDNA50919 SDCCAG10(UNQ438);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UX04アクセッション:Q6UX04 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)SDCCAG10。
目的のマウス遺伝子は、Sdccag10(血清学的に定義された結腸癌抗原10)(ヒトSDCCAG10のオーソログ)。別名には、NY−CO−10および3110009E13Rikが含まれる。
SDCCAG10は、プロリンイミド酸ペプチド結合のシス−トランス異性化を触媒する推定核ペプチジル−プロリルシス−トランスイソメラーゼである。タンパク質は、シクロフィリン型ペプチジル−プロリルシス−トランスイソメラーゼドメイン(PfamアクセッションPF00160)および二分核定位シグナルを含む。SDCCAG10は、タンパク質折り畳みに関与する可能性が高い。SDCCAG10はまた、いくつかの結腸癌で認められる腫瘍抗原である(Scanlan et al,Int J Cancer 76(5):652−8(1998))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=20.9 有意性=2.894828E−5(hom/n)=0.07 平均同腹仔数=4
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションBC025437).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.16.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA50919−1361(UNQ438)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトの血清学的に定義された結腸癌抗原10(SDCCAG10)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの顕著な生存性低下が示された。1匹の生存(−/−)マウスは、成長遅延および網膜色素脱失を示した。多数の神経学的異常、免疫学的異常、および血液化学的異常も(−/−)マウスで認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡観察:12.5日目に、46個の胚を観察した:8個の(−/−)胚、21個の(+/−)、7個の(+/+)胚、5個の再吸収モル(resorption moles)、および5個の不確定な胚。(−/−)胚は、一般に、その(+/+)同腹仔よりも似ているが、肉眼的試験または組織学的試験によって他の発生異常は認められなかった。
遺伝子発現:免疫組織化学分析によって、組織パネル中にLacZ活性は検出されなかった。
(c)遺伝学:
(−/−)マウスの顕著な生存性低下が認められた。1つを除いた全ての同定した(−/−)マウスは、胚サンプルであった。
(d)免疫学表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与し、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:
分析(M−130)に利用可能な1匹の(−/−)マウスは、絶対好中球数および絶対単球数の増加、絶対リンパ球数の減少、赤血球数、ヘモグロビンレベル、ヘマトクリットレベル、平均赤血球容積、および平均赤血球ヘモグロビンの減少、ならびに赤血球分布幅および平均血小板容積の増加を示した。(+/−)マウスでは顕著な相違は認められなかった。
これらの結果は、変異(−/−)マウスがその野生型同腹仔と比較していくつかの免疫学的異常を有することを示す。まとめると、血液学の結果は、ホモ接合体変異マウスがその同腹仔コントロールと比較して好中球数および単球数の増加を示し、これは、食細胞が細胞外病原体を飲み込むか死滅させる活性または能力が増加したマクロファージの前駆体レベルの上昇を示す。さらに、(−/−)マウスは、異常な適応的免疫を示す絶対リンパ球数の減少を示した。好中球および単球の減少が認められたのに加え、変異(−/−)マウスは、貧血に関連する表現型を示した。したがって、PRO871ポリペプチド、そのアゴニスト、またはPRO871ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球産生に不可欠に違いなく、そのようなものとして、貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の治療で有用であろう。さらに、PRO871ポリペプチドは、特に適応的免疫のための正常な免疫学的プロフィールの維持に不可欠に違いない。
(e)心血管表現型分析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群(Alstom’s syndrome)、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常(dysplaisa spondyloepiphysaria congentia)、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:野生型マウスおよびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
上記プロトコルを使用して、作製したF2野生型マウスおよびホモ接合体変異子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Kowa COMIT+ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってA/V比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比(A/V)は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である(血管の分岐前に測定する)。多くの疾患(すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常(網膜変性(色素性網膜炎として公知)など)、網膜の形成異常、視覚問題、または失明)がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型(+/+)同腹仔と比較してホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果:
眼底:分析に利用可能な1匹の(−/−)マウス(M−130)は、網膜中心領域に両眼の網膜血管に沿って色素脱失および斑点を示した。このような異常は、網膜変性に関連する。
まとめると、本研究では、1匹の(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、異常な網膜血管および網膜変性を発症するであろう眼科学的異常を示した。まとめると、PRO871ポリペプチドをコードするDNA50919−1361として同定された遺伝子のノックアウトにより、ホモ接合体変異子孫が網膜動脈異常に関連する表現型を示す。このような検出された網膜の変化は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科障害に対応する他の眼疾患(網膜変性および失明など)に関連し得る心血管全身疾患または障害と最も一般的に関連する。したがって、PRO871コード遺伝子のアンタゴニストが類似の病理学的な網膜の変化を引き起こすのに対して、アゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、または他の眼科障害(網膜変性およびこの容態に関連する障害(上記など)が含まれる)の治療における治療薬として有用であろう。
(f)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:野生型マウスおよびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
1.血液化学:分析に利用可能な1匹の(−/−)マウス(M−130)は、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血清グルコース値および血清アルブミン値が減少した。(+/−)マウスでは顕著な相違は認められなかった。
2.耐糖能試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、空腹時血清グルコースレベルが顕著に減少し、耐糖能が増大した。
これらの研究では、変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強された。さらに、(−/−)マウスでは、高インスリン血症は明らかでなかった。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感受性またはグルコースホメオスタシス障害の逆の表現型パターンが増加した。
尿検査
説明:
日常的な尿検査は、腎臓/泌尿器系の一般的評価を得るために行われるスクリーニング試験である。日常的に試験される尿の特徴には、タンパク質、グルコース、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノゲン、硝酸塩、および白血球エステラーゼ、pH、および比重が含まれる。
結果:
(−/−)マウスは、白血球尿および血尿を示した。尿中白血球の所見は、異常な白血球組成の免疫学的所見と一致する。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
一般的所見:誕生した1匹の(−/−)マウス(M−130)は、その性別一致(+/+)同腹仔よりも小さかった。(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、体重が減少し、体長が短かった。
(2)骨代謝:放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、野生型マウスおよびホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
1.DEXA:分析(M−130)に利用可能な1匹の(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび除脂肪体重が減少した。また、(−/−)マウスは、脊椎骨中無機質密度が減少した。(+/−)マウスでは顕著な相違は認められなかった。
2.マイクロCT:試験した1匹の雄ノックアウト(−/−)マウスは、小柱体積、数、厚さ、連結密度、および大腿骨骨幹部総骨領域が減少した。
1匹の(−/−)マウスにおいて、身体測定ならびにDEXA分析およびマイクロCT分析(体重、体長、総組織マス、および除脂肪体重)は成長遅延を示し、これは、(−/−)マウスの生存性低下に付随して起こる。DEXAによって分析した(−/−)マウスはまた、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO871ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用なようであることを示す。さらに、PRO871ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO871ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
(3)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、収縮期血圧が減少した。
70.17.DNA49819−1439(UNQ439)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO872ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49819−1439と示す)(UNQ439)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:AF466400 ムス・ムスクルス仮説タンパク質MMT−7遺伝子、完全なcds;タンパク質リファレンス:Q8VHE7アクセッション:Q8VHE7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)仮説67.5 kDaタンパク質;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_017750アクセッション:NM_017750 NID:gi 8923274 ref NM_017750.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ20296(FLJ20296);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8N2H5アクセッション:Q8N2H5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)仮説タンパク質FLJ90780。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 0610039N19遺伝子(ヒト仮説タンパク質FLJ20296(FLJ20296)のオーソログである。
仮説タンパク質FLJ20296は、推定オキシドレダクターゼである。このタンパク質は、ペプチド、重複膜貫通セグメント、およびフィトエンデヒドロゲナーゼドメイン(InterProアクセッションIPR008151)を含む。このドメインを有するタンパク質には、アミンオキシダーゼ(モノアミンオキシダーゼおよびL−アミノ酸オキシダーゼなど)が含まれ、補基質としてFADまたはNADを使用する(InterProアクセッションIPR002937)。仮説タンパク質FLJ20296の推定細胞内位置は不明である。タンパク質は、小胞体膜、ミトコンドリア膜、または原形質膜に会合することができる。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=4.74 有意性=0.093480736(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(Accession:AF466400)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに肺、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.17.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA49819−1439(UNQ439)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
(−/−)マウスにおいて、ヒト仮説オキシドレダクターゼ酵素のオーソログをコードする遺伝子の変異により、総体脂肪率および総脂肪マスが増加し、総組織マスが増加した。雄(−/−)マウスはまた、血清コレステロールレベルが増加し、血中にケトン体が存在した。(−/−)変異体マウスは、免疫学的異常を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病発症の認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。したがって、PRO872遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO872ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO872ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
異常な脂質代謝および/または糖尿病を示すケトン体も血中に認められた。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:分析した8匹の(−/−)マウスのうち、3匹の雄および3匹の雌は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪率および総脂肪マスが顕著に増加した。雄(−/−)マウスはまた、平均総組織マスが増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO872ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満の予防および/または治療で特に重要であろう。
(d)免疫学表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与し、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析/組織特異的FACS
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、腹腔洗浄後のB220/med/CD23細胞およびB220+/CDllb−low/CD23細胞の比が偏った。したがって、PRO872ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、B細胞前駆体の異常な分布によって特徴づけられるこの負の表現型を模倣すると予想されるであろう。他方では、PRO872ポリペプチドまたはそのアゴニストは、適切なレベルのB細胞前駆体の維持または産生で有用であり、適応的免疫応答に重要なB細胞の変異を支持するであろう。
70.18.DNA57834−1339(UNQ465)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO813ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57834−1339と示す)(UNQ465)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_025467 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1810036H07遺伝子(1810036H07Rik);タンパク質リファレンス:Q9CQS6アクセッション:Q9CQS6 NID:ムス・ムスクルス(マウス).1810036H07Rikタンパク質;ヒト遺伝子配列リファレンス:胃癌GDDR(GDDR)で下方制御されたNM_182536 ホモ・サピエンス;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q86XP6アクセッション:Q86XP6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).GDDR.
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 1810036H07遺伝子(ヒトGDDRのオーソログ(胃癌GDDRで下方制御される))である。
GDDRは、シグナルペプチドおよびBRICHOSドメイン(PfamアクセッションPF04089)からなる推定分泌タンパク質である。このドメインを有するタンパク質は、認知症、呼吸困難、および癌に関与している。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.05 有意性=0.9753099(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_025467.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の胃、小腸、および結腸中のみでの標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.18.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA57834−1339(UNQ465)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
胃癌GDDR(GDDR)で下方制御されたヒトのオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが、その(+/+)同腹仔と比較した場合、血清グルコースレベルが上昇するという所見が得られた。(−/−)変異体はまた、平均体重が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清グルコースレベルが顕著に増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、平均血清グルコースレベルが顕著に増加し、前糖尿病状態が示唆される。したがって、PRO813遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患(糖尿病が含まれる)のモデルとして役立ち得る。PRO813ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、正常な血糖値の調節で有用であろう。したがって、PRO813ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)骨代謝および身体診断
組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後約16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
70.19.DNA57037−1444(UNQ469)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO828ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57037−1444と示す)(UNQ469)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_024198アクセッション:NM_024198 NID:13195625 ムス・ムスクルス、ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 3110050F08遺伝子(3110050F08Rik);タンパク質リファレンス:Q99LJ6アクセッション:Q99LJ6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(RIKEN CDNA 3110050F08遺伝子の類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_015696アクセッション:NM_015696 NID:15618996 ホモ・サピエンス(グルタチオンペルオキシダーゼ2(CL683)に少し類似するホモ・サピエンス);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q96SL4アクセッション:Q96SL4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).CDNA FLJ14777 FIS、CLONE NT2RP4000259(グルタチオンペルオキシダーゼ2(EC 1.11.1.9)に少しの類似物)。
目的のマウス遺伝子は、Gpx7(グルタチオンペルオキシダーゼ7)(ヒトGPX7のオーソログ)である。別名には、GPX6、3110050F08Rik、CL683、FLJ14777、およびグルタチオンペルオキシダーゼ6が含まれる。
GPX7は、グルタチオンペルオキシダーゼファミリーのメンバーである。セレン含有酵素は、シグナルペプチドおよびグルタチオンペルオキシダーゼドメイン(PfamアクセッションPF00255)からなる。グルタチオンペルオキシダーゼは、過酸化水素および脂質ヒドロペルオキシドのグルタチオン依存性還元を触媒し、細胞の酸化ダメージからの防御で重要な役割を果たす(Miyamoto et al,Biol Chem 384(4):567−74(2003))。GPX7は、分泌型と予想される。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=1.92 有意性=0.3828929(hom/n)=0.21 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_024198.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.19.1 表現型分析(破壊遺伝子:DNA57037−1444(UNQ469)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトグルタチオンペルオキシダーゼ7(GPX7)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの体脂肪(%)および脂肪(マス)が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連するであろう負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO828ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満の予防および/または治療で特に重要であろう。
70.20.DNA59619−1464(UNQ546)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1100ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59619−1464と示す)(UNQ546)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_354640 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA D430035D22遺伝子(D430035D22Rik);タンパク質リファレンス:XP_354640 RIKEN cDNAD430035D22遺伝子(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_033419 ホモ・サピエンスper1様ドメイン含有1(PERLD1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q96FM1アクセッション:Q96FM1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)、CAB2タンパク質(AGLA546)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA D430035D22遺伝子(ヒトPERLD1(per1様ドメイン含有1)のオーソログである。別名には、CAB2、PP1498、AGLA546、MGC9753、およびCAB2タンパク質が含まれる。
PERLD1は、原形質膜上に存在すると予想されている内在性膜タンパク質である可能性が高い。このタンパク質は、Per1様ドメイン内にシグナルペプチドおよび7回膜貫通セグメントを含む(Katoh and Katoh,Int J Oncol 22(6):1369−74(2003))。このドメイン内のタンパク質は、小胞体中でのタンパク質プロセシングに関与している(PfamアクセッションPF04080)。PERLD1は、酵母COS16のホモログであり、DNA二本鎖の破壊の修復が必要である(Nezu et al,Jpn J Cancer Res 93(ll):1183−6(2002))。PERLD1は、ERBB2増幅乳房腫瘍の重要な挙動に寄与し得る(Kauraniemi et al,AmJPathol 165(5):1979−84(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=1.22 有意性=0.5433509(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションAK052486.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.20.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA59619−1464(UNQ546)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトper1様ドメイン含有1(PERLD1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの総体脂肪が増加し、血圧が低下した。(−/−)マウスはまた、血液化学および挙動の異常を示した。ホモ接合体変異マウスは、その性別一致同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪、血清アルカリホスファターゼ、およびリンレベルが増加し、収縮期血圧が減少した。さらに、雄および雌ホモ接合変異体の両方で尾部懸垂した場合にその後肢および前肢が硬直し、雄変異体は顔が小さく、且つ髭が短かった。変異(−/−)マウスはまた、総組織マス、骨塩量、BMC/LBM、および骨中無機質密度の測定値が減少し、骨マイクロCT測定値が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立活動および穴掘りが減少し、変異体における探索応答の減少が示唆される。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において、探索応答が減少した。
オープンフィールド活動性試験で顕著な相違が認められた。(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、探索応答が減少し、これは、変異体の不安様応答の減少を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害に一致する表現型を示した。したがって、PRO1100ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抗鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
(c)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼ(雌p=0.00076;雄p=0.017)およびリンレベル(雄p=0.0118;雌p=0.256)が顕著に増加した。これらの結果は、以下で考察した骨関連測定値と一致する。
(d)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。
(e)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
CATスキャンプロトコル:
マウスにCT造影剤Omnipaque300(Nycomed Amershan、ヨウ素300mg/ml、0.25ml/動物、またはヨウ素2.50−3.75g/kg体重)を腹腔内注射した。ケージ内で約10分間休憩させた後、マウスをアベルチン(1.25% 2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって落ち着かせた。テストベッド上に腹臥位にした麻酔動物を用いて、MicroCATスキャナ(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。ImTek 3D RECONソフトウェアを使用した一連のワークステーションにおけるFeldkampアルゴリズムによって三次元画像を再構成した。
結果:
一般的所見:雄(−/−)マウスは、体長が短く、顔が小さく、髭が短かった。さらに、雄および雌の(−/−)マウスは、尾部懸垂した場合にその後肢および前肢が硬直した。雄および雌ホモ接合体の両方は、歴史的平均より1〜2標準偏差低い心拍数を示した。
DEXA:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。3匹の変異(−/−)マウスで異常な脂肪代謝を示すケトンも認められた。さらに、雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均総組織マスが減少し、平均骨塩量、骨塩量指数(BMC/LBM)、および平均骨中無機質密度が減少した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
CATスキャン:分析した全ての(−/−)マウス(M−112、M−155、およびF−157)は、腹部脂肪蓄積が増加した。
まとめ:
(−/−)マウスについての上記の神経学的所見とは別に、DEXA、骨マイクロCT分析、およびCATスキャンによって分析した変異(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。しかし、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率および腹部の脂肪蓄積が増加し、脂肪表現型が示唆される。これらの所見により、PRO1100ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO1100ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。しかし、負の骨表現型により、PRO1100ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であることも示唆されるであろう。さらに、PRO1100ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1100ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.21.DNA57033−1403(UNQ557)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1114ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57033−1403と示す)(UNQ557)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:IL20R−βに類似のXM_135077 ムス・ムスクルス(LOC213208);タンパク質リファレンス:IL20R−βに類似のXP_135077(ムス・ムスクルス]);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_144717 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC34923(MGC34923);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UXL0アクセッション:Q6UXL0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).IL20R−β。
目的のマウス遺伝子は、発現配列AV228068(ヒト仮説タンパク質MGC34923のオーソログ)である。別名には、Gml86および「IL20R−βの類似物」が含まれる。
GmI86は、受容体または細胞接着分子として機能する可能性が高い推定I型原形質膜タンパク質である。タンパク質は、シグナルペプチド、フィブロネクチンIII型ドメイン(PfamアクセッションPF00041)、膜貫通セグメント、および短い細胞質C末端を含む。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=2.78 有意性=0.24907531(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=5
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_135077.2),
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および脾臓、腎臓、肝臓、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.21.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA57033−1403 (UNQ557)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質(MGC34923)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨塩量/除脂肪体重比(BMC/LBM)の減少および総組織マスの減少を示す(−/−)マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔と比較した場合、BMC/LBM指数および総組織マスが減少した。
DEXAによって分析された(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、身体マス測定値および骨塩量が減少し、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO1114ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用なようであることを示す。さらに、PRO1114ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1114ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.22.DNA56868−1478(UNQ558)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1115ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA56868−1478と示す)(UNQ558)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_145394アクセッション:NM_145394NID:21703787ムス・ムスクルス(コリン輸送体様タンパク質(LOC213603)に類似のムス・ムスクルス);タンパク質リファレンス:Q921V7アクセッション:Q921V7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(輸送体様タンパク質類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_152369 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC45474(MGC45474);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q7Z6C5アクセッション:Q7Z6C5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)(仮説タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、「cDNA配列BC010552」(ヒト「仮説タンパク質」のオーソログ)である。別名には、MGC18084およびMGC38127が含まれる。
仮説タンパク質MGC45474は、原形質膜中に存在する有望な輸送体(KOG 1362、コリン輸送体様タンパク質(脂質輸送体および代謝))であり、少なくとも7回膜貫通セグメントおよびDUF580ドメインからなる。DUF580ドメイン含有タンパク質は、特徴づけられていないタンパク質の固有のファミリー(PfamアクセッションPF04515)から構成される。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=7.02 有意性 =0.029896915(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=5
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145394.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.22.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA56868−1478(UNQ558)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質(MGC45474)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、野生型同腹仔と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。

骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが増加した。
まとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO115ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病および他の骨関連疾患の治療に有利であろう。他方では、PRO115ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であろう。
70.23.DNA60615−1483(UNQ564)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1126ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60615−1483と示す)(UNQ564)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_172907 ムス・ムスクルスcDNA配列BC047207(BC047207);タンパク質リファレンス:Q8BSH2アクセッション:Q8BSH2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。(ムス・ムスクルスの12日目の胚の雄ウォルフ管には、周辺領域のcDNA、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:6720478C22産物:仮説タンパク質、全長インサート配列(仮説タンパク質BC047207)が含まれる);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_198474 ホモ・サピエンスオルファクトメジン様1(OLFML1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UWY5アクセッション:Q6UWY5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).MVAL564。
目的のマウス遺伝子は、Olfml1(オルファクトメジン様1)(ヒトOLFML1のオーソログ)である。別名には、MVAL564、MGC56882、6720478C22、UNQ564、およびcDNA配列BC047207が含まれる。
OLFML1は、細胞外基質タンパク質として機能し得る推定分泌タンパク質である。OLFM1は、シグナルペプチドおよびオルファクトメジン様ドメイン(PfamアクセッションPF02191)からなる。類似のドメイン組成を有するタンパク質には、オルファクトメジンおよびミオシリンが含まれる。オルファクトメジンは、嗅神経上皮に特異的な細胞外基質タンパク質である(Yokoe and Anholt,Proc Natl Acad Sci U S A 90(10):4655−9(1993))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=1.35 有意性=0.5091564(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172907.2)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および肺、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.23.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA60615−1483(UNQ564)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトオルファクトメジン様1(OLFML1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの平均血清IgMレベルが増加した。さらに、ホモ接合体マウスは、平均血清コレステロールレベルが増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病発症の認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用してコレステロール測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、コレステロールレベルが顕著に増加した。したがって、PRO1126遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO1126ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO1126ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgMレベルが増加した。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、IgM血清免疫グロブリンが上昇した。IgM免疫グロブリンは、細菌毒素の中和のための体液性免疫応答で最初に産生され、補体系の活性で特に重要である。認められた表現型により、PRO1126ポリペプチドが炎症反応の負の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、PRO1126ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が免疫系(T細胞増殖など)の刺激で有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1126ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
70.24.DNA53913−1490(UNQ571)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1133ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA53913−1133と示す)(UNQ571)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_030699ムス・ムスクルスネトリンG1(Ntng1);タンパク質リファレンス:Q9ESR3アクセッション:Q9ESR3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)NETRIN−GlA;ヒト遺伝子配列リファレンス:BC030220ホモ・サピエンスネトリンG1のmRNA(cDNAクローンMGC:34337 IMAGE:5206594)(完全なcds);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9Y2I2ネトリンG1前駆体(ラミネット−1(Laminet−1))(UNQ571/PRO1133)。
目的のマウス遺伝子は、Ntng1(ネトリンG1)(ヒトNTNGLのオーソログ)である。別名には、Lmnt1、ネトリン−G1、A930010C08Rik、KIAA0976、およびラミネット1が含まれる。
NTNG1は、ネトリンG1リガンド(NGL1)の受容体として機能するグリコシルホスファチジルイノシトールアンカー型細胞外膜タンパク質である。NTNG1は、主に、種々の脳領域内の軸索および樹状突起で発現するが、肺、腎臓、精巣、および卵巣でも発現する。脳では、NTNG1およびそのリガンドは、軸索および樹状突起のガイダンスおよび伸長に関与する(Lin et al,Nat Neurosci 6(12):1270−6(2003);Nakashiba et al,Mech Dev 11 l(l−2):47−60(2002);Yin et al,Mol Cell Neurosci 19(3):344−58(2002);Nakashiba et al,J Neurosci 20(17):6540−50(2000))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=2.12 有意性=0.34645584(hom/n)=0.21 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1およびをターゲティングした(NCBIアクセッションNM_030699.1)。
1.野生型発現パネル:脳、脊髄、眼、脾臓、腎臓、心臓、および脂肪中、ならびにRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.24.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA53913−1490(UNQ571)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトネトリンG1(NTNG1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの神経学的異常が生じた。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、直立の増加によって示される探索応答が増加した。さらに、雌変異体は、ホームケージ活動性試験(日周期リズムの増強)中に異常な睡眠/覚醒周期を示し、尾部懸垂アッセイでほとんど完全に動かなかった。(−/−)マウスはまた、平均血清IgG3レベルが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立活動が増加し、変異体で探索応答が増加することが示唆された。
(−/−)マウスは、双極性障害、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る探索応答の増加を示した。したがって、PRO571ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で役割を果たし得る。
機能観察バッテリー(FOB)試験 − 尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:ほとんどの(−/−)マウスは、鬱応答の増加を示す尾部懸垂試験でほぼ完全に動かなかった。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1133ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の12時間の馴化期間に歩行回数が増加した。雌(−/−)マウスはまた、明期−暗期活動比および明期−総活動比の中央値が減少し、試験の最後の24時間の異常な睡眠/覚醒周期が示唆される。これらの結果は日周期リズムの増強を示した。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔と比較した場合、平均血清IgG3が減少した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合体マスの血清IgG3レベルが減少することが明らかとなった。したがって、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較した場合、異常に低い血清アルブミンを示した。したがって、PRO1133をコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはγグロブリン)の作製に不可欠である。IgG3免疫グロブリンは、中和効果を有し、補体系の活性化により小さな程度で重要である。これらの免疫学的異常により、PRO1133ポリペプチドまたはそのアゴニストが免疫系(T細胞増殖など)の刺激で有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1133ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答を阻害し、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
70.25.DNA59846−1503(UNQ584)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1154ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59846−1503と示す)(UNQ584)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_030711 ムス・ムスクルス1型腫瘍壊死因子受容体切断(shedding)アミノペプチド調節因子(Arts1);タンパク質リファレンス:Q9EQH2アクセッション:Q9EQH2 NID:ムス・ムスクルス(マウス).脂肪細胞由来ロイシンアミノペプチダーゼ前駆体(EC 3.4.11.−)(A−LAP)(ARTS−1)(アミノペプチダーゼPILS)(ピューロマイシン非感受性ロイシル特異的アミノペプチダーゼ)(PILS−AP)(VEGF誘導性アミノペプチダーゼ);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_016442アクセッション:NM_016442NID:20149636ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス1型腫瘍壊死因子受容体切断アミノペプチダーゼ調節因子(ARTS−1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UWY6アクセッション:Q6UWY6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).ARTS−1。
目的のマウス遺伝子は、Arts1(1型腫瘍壊死因子受容体切断アミノペプチダーゼ調節因子)(ヒトARTS−1のオーソログ)である。別名には、ERAAP、PILSA、PILSAP、ALAP、A−LAP、ARTS1、ERAP1、APPILS、KIAA0525、脂肪細胞由来ロイシンアミノペプチダーゼ、およびアミノペプチダーゼPILSが含まれる。
ARTS−1は、N末端アミノ酸(ロイシンを優先)の放出を触媒する広範に発現する亜鉛メタロペプチダーゼである。このプロテアーゼは、広範な基質特異性を有し、触媒に亜鉛を必要とする。ARTS−1は、小胞体中または原形質膜の細胞外表面上に存在するII型膜タンパク質である(Serwold et al,Nature 419(6906):480−3(2002);Cui et al,J Clin Invest 110(4):515−26(2002))。さらに、このプロテアーゼは、分泌されることが報告されている(Hattori et al,J Biochem(Tokyo)128(5):755−62(2000))。
ARTS−1は、サイトカイン受容体の外部ドメイン切断、それによるサイトカイン生物活性の調節に関与する(Cui et al,J Biol Chem 278(31):28677−85(2003a);Cui et al,J Immunol 171(12):6814−9(2003b);Cui et al,J Clin Invest 110(4):515−26(2002))。このプロテアーゼはまた、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)クラスI分子が抗原ペプチドに結合して細胞表面上に提示することができる抗原プロセシングに関与する(York et al,Nat Immunol 3(12):1177−84(2002);Serwold et al.Nature 419(6906):480−3(2002))。ARTS−1は、アンギオテンシンIIの不活化または腎臓のブラジキニン生成による血圧の調節で役割を果たし得る(Yamamoto et al,Hum Mutat 19(3):251−7(2002);Hattori et al,J.Biochem(Tokyo)128(5):755−62(2000))。血管内皮細胞中に発現されたARTS−1は、血管内皮成長因子(VEGF)によって誘導され、出生後血管形成で役割を果たす可能性が高い(Miyashita et al,Blood 99(9):3241−9(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=1.46 有意性=0.48190898(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=5
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAB047552.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびにRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の肝臓、心臓、および脂肪中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.25.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA59846−1503(UNQ584)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト1型腫瘍壊死因子受容体切断アミノペプチダーゼ調節因子(ARTS−1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加するという所見が得られた。特に雌(−/−)マウスで血圧の上昇も認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均収縮期血圧が増加した(特に、雌で顕著)。この所見は、高血圧を示す。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
まとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。これらの結果は、ノックアウト変異体表現型は、大理石骨病などの骨異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO1154ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病および他の骨関連疾患の治療に有利であろう。他方では、PRO1154ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であろう。
70.26.DNA62881−1515(UNQ599)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1185ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62881−1515と示す)(UNQ599)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:肝細胞癌関連遺伝子TD26に類似するBC051501ムス・ムスクルスmRNA(cDNAクローンIMAGE:1313868);タンパク質リファレンス:Q80WX2アクセッション:Q80WX2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(肝細胞癌関連遺伝子TD26の類似物(フラグメント));ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_018687 ホモ・サピエンス肝細胞癌関連遺伝子TD26(LOC55908);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9NQZ1アクセッション:Q9NQZ1NID:ホモ・サピエンス(ヒト).肝細胞癌関連遺伝子TD26。
目的のマウス遺伝子は、「肝細胞癌関連遺伝子TD26の類似物」(NCBIアクセッションBC051501)(ヒト「肝細胞癌関連遺伝子TD26」のオーソログ)である。別名には、PRO1185およびPVPA599が含まれる。
約250アミノ酸の仮説タンパク質は、潜在的なシグナルアンカーを含むII型膜タンパク質であり得る。この仮説タンパク質の機能および細胞の位置は知られていない。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=1.2 有意性= 0.5488116(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションBC024408.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.26.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA62881−1515(UNQ599)について
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト「肝細胞癌関連遺伝子TD26」のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスのトリグリセリドが減少した。雄および雌ホモ接合体変異マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用してコレステロールの測定値を記録した。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に減少した。4匹の(+/−)マウスのうちの2匹および8匹の(−/−)マウスのうちの2匹でケトンが認められた。
したがって、PRO1185コード遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患(特に、異常脂肪血症に関連する疾患)の治療モデルとして役立ち得る。PRO1185ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のインヒビター(アンタゴニスト)は、血中脂質の調節、特に、正常なトリグリセリドレベルの維持で有用であろう。したがって、PRO1185ポリペプチドのアンタゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、高トリグリセリド血症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、および/または肥満症や糖尿病などの心血管疾患の治療で有用であろう。
70.27.DNA57841−1522(UNQ607)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1194ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57841−1522と示す)(UNQ607)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_181417 ムス・ムスクルスシステインおよびグリセリンリッチタンパク質2結合タンパク質(Csrp2bp);タンパク質リファレンス:Q8CID0アクセッション:Q8CID0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(CSRP2結合タンパク質の類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_020536 ホモ・サピエンス CSRP2結合タンパク質(CSRP2BP)、転写変異型1;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9H8E8アクセッション:Q9H8E8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).システインリッチタンパク質2結合タンパク質(CSRP2結合タンパク質)(CRP2BP)(CRP2結合タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、Csrp2bp(システインおよびグリセリンリッチタンパク質2結合タンパク質)(ヒトCSRP2BP(CSRP2結合タンパク質)のオーソログ)である。別名には、D2Ertd473e、E430020F17、2510008M08Rik、システインリッチタンパク質2結合タンパク質、CRP2BP、MGC15388、dJ717M23.1、CRP2結合パートナー、CRP2結合タンパク質が含まれる。
CSRP2BPは、システインおよびグリセリンリッチタンパク質2に結合する核および細胞質のタンパク質である(Weiskirchen and Gressner,Biochem Biophys Res Commun 274(3):655−63(2000))。タンパク質は、アセチルトランスフェラーゼドメインを含み、CSRP2BPが酵素として機能することができることが示唆される。このドメインを有するタンパク質には、ヒストン上でのアセチル−CoAからリジンE−アミノ基へのアセチル基の転移を触媒するヒストンアセチラーゼ(PfamアクセッションPF00538)が含まれる。CSRP2BPの主な核局在化により、遺伝子転写の調節で役割を果たし得ることが示唆される。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=46.85 有意性= 6.708912E−11(hom/n)=0.0 平均同腹仔数=5
変異情報
変異型:レトロウイルス挿入(OST)
説明:コードエクソン2と3との間のイントロンでレトロウイルス挿入が起こる(NCBIアクセッションNM_181417.2).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:死亡により、転写発現分析を行わなかった。標的遺伝子の破壊を、逆PCRによって確認した。
70.27.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA57841−1522(UNQ607)について
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトCSRP2結合タンパク質(CSRP2BPのオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが死亡した。遺伝子データは、このレトロウイルス挿入によってホモ接合変異体が死亡したことを示す。死亡により、転写発現分析を行わなかった。ヘテロ接合体(+/−)マウスは、末梢血中の平均B細胞率が増加した。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(b)病理学
顕微鏡観察:胚性致死のために試験を行わなかった。12.5日目に、以下の48個の胚を観察した:21個の(+/−)胚、20個の(+/+)胚、6個の再吸収モル、および1個の不確定な胚。
遺伝子発現:neo転写物の発現は、in situハイブリッド形成によって分析した組織パネルで検出されなかった。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。野生型マウスおよびホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:
ヘテロ接合体(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均B細胞率が増加した。
したがって、FACSは、ヘテロ接合体変異マウスが、野生型同腹仔と比較した場合、末梢血中の平均成熟B細胞率が増加することを示した。
70.28.DNA61755−1554(UNQ656)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1287ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61755−1554と示す)(UNQ656)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_172753 ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 4732435N03遺伝子(4732435N03Rik);タンパク質リファレンス:Q8BJQ9アクセッション:Q8BJQ9 NID:ムス・ムスクルス(マウス).ムス・ムスクルス出生10日目の皮質cDNA、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:A830097M06産物−仮説ヌクレオチド−ジホスホ−糖トランスフェラーゼ構造含有タンパク質、全長挿入配列;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_018371 ホモ・サピエンスコンドロイチンβ1,4−N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ(ChGn);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8TDX6アクセッション:Q8TDX6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).コンドロイチンβ4 N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ(MMVR656)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 4732435N03遺伝子(ヒトChGn(コンドロイチンβl,4 N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼのオーソログ)である。別名には、FLJl1264、CSGalNAcT−1、β4GalNAcT、およびβ1,4 N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼが含まれる。
ChGnは、コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(細胞外基質の成分)中のグルクロン酸へのN−アセチルガラクトサミンの転移を触媒するグリコシルトランスフェラーゼである。この酵素は、小胞体またはゴルジ装置中に存在すると予想されているII型膜タンパク質である。ChGnは、コンドロイチン硫酸生合成の阻害に重要である可能性が高い(Sato et al,J Biol Chem 278(5):3063−71(2003);Uyama et al,J Biol Chem 278(5):3072−8(2003);Gotoh et al,J Biol Chem 277(41):38189−96(2002);Uyama et al,J Biol Chem 277(11):8841−6(2002);Nadanaka et al,Biochem J 340(Pt2):353−7(1999))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=4.04 有意性=0.13265547(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172753.2).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋、骨、胃、小腸、および結腸以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.28.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA61755−1554(UNQ656)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトコンドロイチンβ1,4−N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ(ChGn)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雄(−/−)マウスの不安関連応答が減少した。臓器重量データは、雌(−/−)マウスの胸腺萎縮を示した。雄ホモ接合体変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド活動性試験において不安様応答が減少した。(−/−)マウスはまた、骨関連測定値が減少し、総組織マスおよび体脂肪が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が増加し、変異体の不安様応答の減少が示唆される。
オープンフィールド活動性試験で顕著な相違が認められた。雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が増加し、これは、変異体の不安様応答の減少を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害に一致する表現型を示した。したがって、PRO1287ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抗鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨塩量および骨塩量指数が減少した。さらに、雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、脂肪(%)、および脂肪マス(g)が増加した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。
DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析された(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。しかし、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO1287ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO1287ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。しかし、負の骨表現型により、PRO1287ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であることも示唆されるであろう。さらに、PRO1287ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1287ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.29.DNA59610−1556(UNQ659)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1291ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59610−1556と示す)(UNQ659)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_178594ムス・ムスクルスcDNA配列BC032925(BC032925);タンパク質リファレンス:Q8K091アクセッション:Q8K091 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(仮説タンパク質FLJ22418の類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024626アクセッション:NM_024626 NID:gi 13375849 refNM_024626.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ22418(FLJ22418);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9H6B2アクセッション:Q9H6B2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質FLJ22418。
目的のマウス遺伝子は、cDNA配列BC032925(ヒトB7−H4(免疫同時刺激タンパク質B7−H4)のオーソログ)である。別名には、B7S1、B7−H4、MGC41287、B7X、FLJ22418、および免疫同時刺激タンパク質B7−H4が含まれる。
B7−H4は、リガンドまたは刺激分子として機能するグリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)アンカー型細胞外膜タンパク質である。このタンパク質は、免疫細胞、非リンパ組織、およびいくつかの腫瘍細胞株上で発現する。B7−H4は、活性化T細胞表面上で発現する同族受容体に結合し、それにより、T細胞増殖およびサイトカイン産生を遮断し、末梢組織における細胞媒介免疫を負に制御する(Sica et al, Immunity 18(6):849−61(2003);Prasad et al.Immunity 18(6):863−73(2003);Zang et al,Proc Natl Acad Sci U S A 100(18):10388−92(2003);Choi et al,J Immunol 171(9):4650−4(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=3.51 有意性=0.17290725(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_178594.2).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.29.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA59610−1556(UNQ659)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト免疫同時刺激タンパク質B7−H4(B7−H4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスのストレス誘導過温症が増加した。さらに、ヘテロ接合体(+/−)マウスおよびホモ接合体(−/−)マウスの両方は、平均総脂肪率および総脂肪マスが増加し、骨小柱の容積および厚さが減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験 −ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
不安:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO1291ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄(+/−)マウスおよび(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
マイクロCT:(−/−)ノックアウトマウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨小柱の容積および厚さが減少した。
骨マイクロCT分析によって分析された(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。しかし、雄変異(−/−)マウスおよび(+/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、脂肪表現型が示唆される。これらの所見により、PRO1291ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO1291ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。しかし、負の骨表現型により、PRO1291ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であることも示唆されるであろう。さらに、PRO1291ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1291ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.30.DNA60618−1557(UNQ662)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1293ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60618−1557と示す)(UNQ662)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_024263アクセッション:NM_024263 NID:15277326 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1200013A08遺伝子(1200013A08Rik));タンパク質リファレンス:Q920S7アクセッション:Q920S7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)脂肪細胞特異的タンパク質3;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_032348アクセッション:NM_032348 NID:14150144 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC3047(MGC3047));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9BRK3アクセッション:Q9BRK3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).RIKEN CDNA 1200013A08遺伝子の類似物(仮説49.1KDAタンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 1200013A08遺伝子(ヒト仮説タンパク質MGC3047のオーソログ)である。別名には、リミトリン(limitrin)および脂肪細胞特異的タンパク質3(NCBIアクセッションAB040488)が含まれる。
リミトリンは、細胞接着分子または受容体として機能する可能性が高いI型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、2つの免疫グロブリン様ドメイン(SMARTアクセッションSM00409)、膜貫通セグメント、および短い細胞質C末端からなる。リミトリンは、血管周囲領域中の星状膠細胞の終末球および軟膜中に発現する。リミトリンは、血液脳関門の成分である可能性が高い(Yonezawa et al.Glia 44(3):190−204(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.68 有意性=0.7117703(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:レトロウイルス挿入(OST)
説明:コードエクソン4中でレトロウイルス挿入が起こる(NCBIアクセッションNM_024263.3)。
1.野生型発現パネル:骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:RT−PCR分析により、分析した(−/−)マウス(M−81)中に転写物が存在しないことが明らかとなった。
標的遺伝子の破壊を、逆PCRによって確認した。
70.30.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA60618−1557(UNQ662)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質(MGC3047)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの骨関連測定値が増加した。また、(−/−)マウスは、リンパ節中のCD25 T細胞が増加し、ペイエル板中のCD38非リンパ細胞が増加した。RT−PCRでは転写物は存在しなかった。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:
(−/−)マウスは、野生型同腹仔と比較した場合、リンパ節中のCD25 T細胞が増加し、パイエル板中のCD38非リンパ細胞が増加した。
これらの結果は、(−/−)マウスがCD25 T細胞の増加およびより早い段階のT細胞の増加によって特徴づけられる表現型を示すことを示す。したがって、得られた変異マウスは、正の免疫学的表現型を示し、PRO1293ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの結果を模倣すると予想されるであろう。明らかに、PRO1293ポリペプチドは、T細胞活性化の負の調節因子として作用する。したがって、PRO1293ポリペプチドまたはそのアゴニストは、顕著なT細胞増殖が存在する(例えば、関節リューマチ患者で起こるなど)場合のT細胞増幅の負の調節因子として有利であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨塩量、容積測定骨中無機質密度、ならびに全身および大腿骨中の骨中無機質密度が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱骨の容積および数が増加した。
まとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、骨中無機質関連測定値および小柱骨密度の測定値が増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO1293ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病および他の骨関連疾患の治療に有利であろう。他方では、PRO1293ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であろう。
70.31.DNA47394−1572(UNQ676)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1310ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA47394−1572と示す)(UNQ676)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_018867アクセッション:NM_018867NID:18466803ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルスカルボキシペプチダーゼX2(M14ファミリー)(Cpxm2));タンパク質リファレンス:Q9D2L5アクセッション:Q9D2L5NID:ムス・ムスクルス(マウス)(潜在的なカルボキシペプチダーゼ様タンパク質X2前駆体);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_198148アクセッション:NM_198148 NID:gi 39930572 ref NM_198148.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質LOCI 19587(LOCI 19587);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8N436アクセッション:Q8N436 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).潜在的なカルボキシペプチダーゼ様タンパク質X2前駆体。
目的のマウス遺伝子は、Cpxm2(カルボキシペプチダーゼX2(M14ファミリー)(ヒトCPXM2(カルボキシペプチダーゼ様タンパク質X2)のオーソログ)である。別名には、Cpx2、CPX−2、4632435C11Rik、カルボキシペプチダーゼX2、メタロカルボキシペプチダーゼ2、およびカルボキシペプチダーゼHloが含まれる。
CPXM2は、脳、肝臓、腎臓、および肺中で発現する分泌タンパク質である可能性が高い。CPXM2は、シグナルペプチド、ジスコイジンドメイン、および触媒的に活性である可能性が低い痕跡メタロカルボキシペプチダーゼドメインを含む(Xin et al,DNA Cell Biol 17(10):897−909(1998))。ジスコイジンドメインは、細胞表面結合炭水化物または陰イオンリン脂質への結合に関与すると考えられる。ジスコイジンドメインは、血液凝固因子VおよびVIIIおよび粘菌細胞接着タンパク質ジスコイジン中に見出される。CPXM2は、細胞接着に関与し得る(SMARTアクセッションSM00231;Lei et al.DNA Cell Biol 18(2):175−85(1999))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.3 有意性=0.860708(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAFO 17639.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.31.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA47394−1572(UNQ676)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトカルボキシペプチダーゼX(M14ファミリー)のメンバー2(CPXM2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雄(−/−)マウスの耐糖能が低下した。(−/−)マウスはまた、脾臓CD25 T細胞および腹膜CD23 B細胞が増加した。ホモ接合体変異マウスはまた、LPS攻撃誘発に対する平均血清TNF−αおよびIL−6応答が増加した。ホモ接合体マウスでIgG2aレベルも上昇した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清TNF−αおよびIL−6応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃誘発は、PRO1310ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃誘発した場合、免疫応答(TNF−αおよびIL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。IL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。TNF−αは、重要な炎症メディエーターである。さらに、TNF−αおよびIL−6は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。TNF−αは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルと置き換わることができる(したがって、エフェクター分子としての機能を果たす)。これにより、PRO1310ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1310ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、(−/−)マウスが、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血清IgG2aが2倍に増加するという所見が得られた。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、IgG2a血清免疫グロブリンが上昇した。IgG2a免疫グロブリンは、中和効果を有し、補体系の活性化により小さな程度で重要である。認められた表現型により、PRO1310ポリペプチドが炎症反応の負の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、PRO1310ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が免疫系(T細胞増殖など)の刺激で有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1310ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:
ホモ接合体(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、リンパ節および脾臓中のCD25T細胞ならびに腹膜CD23B細胞が増加した。
これらの結果は、(−/−)マウスがCD25T細胞およびCD23B細胞の増加によって特徴づけられた表現型を示す。したがって、得られた変異マウスは、正の免疫学的表現型を示し、PRO1312ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターはこれらの結果を模倣すると予想されるであろう。明らかに、PRO1312ポリペプチドは、T細胞活性化の負の調節因子として作用する。
(c)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
耐糖能試験:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、T−60およびT−90での耐糖能が低下した。
これらの研究は、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験したT−60およびT−90間隔における正常な空腹時グルコースの存在下で耐糖能が減少または低下することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシスが低下した表現型パターンを示し、したがって、PRO1310ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害に関連する容態および/または種々の心血管疾患(糖尿病が含まれる)の治療で有用であろう。
70.32.DNA61873−1574(UNQ678)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1312ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61873−1574と示す)(UNQ678)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_020626アクセッション:NM_020626 NID:10181181 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルス腎臓特異的膜タンパク質(Nxl7−pending));タンパク質リファレンス:Q9ESG4アクセッション:Q9ESG4 NID:ムス・ムスクルス(マウス).腎臓特異的膜タンパク質NX−17(0610008J07RIKタンパク質);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_020665アクセッション:NM_020665 NID:21361864 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス腎臓特異的膜タンパク質(NX−17));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9HBJ8アクセッション:Q9HBJ8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).腎臓特異的膜タンパク質NX−17(仮説25.2KDAタンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、Tmem27(膜貫通タンパク質27)(ヒトTMEM27のオーソログ)である。別名には、NX17、NX−17、NX=17、コレクトリン、0610008 J07Rik、および腎臓特異的膜タンパク質が含まれる。
TMEM27は、腎臓集合管の管腔原形質膜上に発現する膜貫通糖タンパク質である。このタンパク質は、アンギオテンシン変換酵素2と構造的に類似しているが、触媒的に不活性であり、ジペプチジルカルボキシペプチダーゼ触媒ドメインを欠く。TMEM27 mRNAは、発生中および腎臓剥離後の肥大性腎臓で上方制御され、TMEM27が腎臓器官形成および進行性腎不全で役割を果たし得ることが示唆される(Zhang et al,J Biol Chem 276(20):17132−9(2001))。
この計画は、X連鎖性である。
性別および遺伝子型によるX連鎖遺伝子分布のまとめ(雄キメラ由来のアグーチ属の子のみが含まれる)
Figure 2008532516
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=101.56 有意性=8.841516E−23(hom/n)=0.59 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_020626.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに肺、骨、胃、小腸、結腸、および心臓以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.32.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA61873−1574(UNQ678)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト膜貫通タンパク質27(TMEM27)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雌ホモ接合変異体マウスおよび雄ヘミ接合変異体マウスが、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験時に抑鬱症様応答が減少するという所見が得られた。いくつかの雌のヘテロ接合変異体およびホモ接合変異体ならびに1匹の雄ヘミ接合変異体の網膜に散発性の色素脱失した斑点も認められた。さらに、ホモ接合体マウスにおいて脾臓CD25T細胞および腹膜CD23B細胞の増加も認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。この変異は、X連鎖遺伝子中に存在する。雄ヘミ接合マウス(野生型)およびヘミ接合変異マウスを、それぞれ、(+/+)および(−/−)と示す。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験 − 尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
無力に対する応答:雌(−/−)マウスおよび雄(0/−)マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験中に不動時間の中央値が減少し、抑鬱症様応答の減少が示唆された。まとめると、尾部懸垂試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO1312ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(c)心血管表現型分析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
上記プロトコルを使用して、作製したF2野生型、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Kowa COMIT+ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってA/V比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比(A/V)は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である(血管の分岐前に測定する)。多くの疾患(すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常(網膜変性(色素性網膜炎として公知)など)、網膜の形成異常、視覚問題、または失明)がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型(+/+)同腹仔と比較してホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果:
眼底:2/4(−/−)マウス(F−50およびF−84)、1/4(0/−)マウス(M−59)、および2/4(+/−)マウス(F−60およびF−79)の網膜に散発性の色素脱失した斑点が認められた。網膜の色素脱失は、網膜変性に関連し得る。
まとめると、本研究では、1匹の(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、網膜血管の色素脱失および網膜変性を発症するであろう眼科学的異常を示した。まとめると、PRO 1312ポリペプチドをコードするDNA61873−1574として同定された遺伝子のノックアウトにより、ホモ接合体変異子孫が網膜動脈異常に関連する表現型を示す。このような検出された網膜の変化は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科障害に対応する他の眼疾患(網膜変性など)に関連し得る心血管全身疾患または障害と最も一般的に関連する。したがって、PRO 1312コード遺伝子のアンタゴニストが類似の病理学的な網膜の変化を引き起こすのに対して、アゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、または他の眼科障害(網膜変性およびこの容態に関連する障害(上記など)が含まれる)の治療における治療薬として有用であろう。
(d)免疫学表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:
ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、脾臓中のCD25 T細胞が増加し、腹膜CD23B細胞が増加した。これらの結果は、変異(−/−)マウスがCD25 T細胞の増加および成熟B細胞の増加によって特徴づけられる表現型を示すことを示す。したがって、得られた変異マウスは、正の免疫学的表現型を示し、PRO1312ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの結果を模倣すると予想されるであろう。明らかに、PRO1312ポリペプチドは、T細胞活性化およびB細胞増殖の負の調節因子として作用する。
70.33.DNA62812−1594(UNQ690)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1335ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62812−1594と示す)(UNQ690)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_011797アクセッション:NM_011797 NID:6753263 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルス炭酸脱水酵素14(Car14));タンパク質リファレンス:Q9WVT6アクセッション:Q9WVT6 NID:ムス・ムスクルス(マウス).炭酸脱水酵素XIV前駆体(EC 4.2.1.1)(炭酸デヒドラターゼXIV)(CA−XIV);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_012113アクセッション:NM_012113 NID.−6912283 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス炭酸脱水酵素XIV(CA14));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9ULX7アクセッション:Q9ULX7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).炭酸脱水酵素XIV前駆体(EC 4.2.1.1)(炭酸デヒドラターゼXIV)(CA−XIV)。
目的のマウス遺伝子は、Car14(炭酸脱水酵素14)(ヒトCA14(炭酸脱水酵素 XIV)のオーソログ)である。別名には、炭酸デヒドラターゼが含まれる。
CA14は、炭酸を形成させるための二酸化炭素の可逆的水和を触媒するI型原形質膜タンパク質および酵素である。このタンパク質は、シグナルペプチド、細胞外触媒ドメイン、膜貫通セグメント、および短い細胞質C末端からなる。CA14は、近位尿細管および他の組織(心臓、骨格筋、脳、肺、および肝臓など)中に高レベルで発現する。CA14は、二酸化炭素代謝および酸−塩基バランスに関与する可能性が高い(Fujikawa− Adachi et al,Genomics 61(1):74−81(1999);Mori et al,J Biol Chem 274(22):15701−5(1999);Parkkila et al.BMC Gastroenterol 2(1):13(2002);Whittington et al.J Biol Chem 279(8):7223−8(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.12 有意性=0.94176453(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:レトロウイルス挿入(OST)
説明:コードエクソン1と2との間のイントロンでレトロウイルス挿入が起こる(NCBIアクセッションNM_011797.1)。
1.野生型発現パネル:脾臓、肝臓、骨、胃、小腸、結腸、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:RT−PCR分析により、分析した(−/−)マウス(M− 184)に転写物が存在しないことが明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、逆PCRによって確認した。
70.33.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA62812−1594(UNQ690)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト炭酸脱水酵素XIV(CA14)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスのLPS攻撃誘発に対する血清TNF−α、MCP−1、およびIL−6応答が増加した。雌ノックアウトは、尿酸レベルが有意に増加した(p=0.01198)。RT−PCR分析により、ホモ接合体変異マウス中に転写物が存在しないことが明らかとなった。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清TNF−α、MCP−1、およびIL−6応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃誘発は、PRO1335ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃誘発した場合、免疫応答(TNF−α、MCP−1、およびIL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。TNF−α、MCP−1、およびIL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。TNF−αは、重要な炎症メディエーターである。さらに、TNF−α、MCP−1、およびIL−6は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。TNF−αは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルと置き換わることができる(したがって、エフェクター分子としての機能を果たす)。これにより、PRO1335ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1335ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
(c)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
結果:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尿酸レベルが顕著に増加した(p=0.01198)。
したがって、変異(−/−)マウスは、痛風型(異常なプリン代謝)で一般的な腎結石(および関連腎疾患)を示す血中尿酸レベルの顕著な上昇に関連する負の表現型を示す。PRO1335ポリペプチドおよびそのアゴニストは、腎結石の形成および/または異常なプリン代謝に関連する疾患の治療で有用であろう。
70.34.DNA66669−1597(UNQ694)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1339ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA66669−1597と示す)(UNQ694)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_027926ムス・ムスクルスカルボキシペプチダーゼA4(Cpa4);タンパク質リファレンス:Q6P8K8アクセッション:Q6P8K8 NID:ムス・ムスクルス(マウス).カルボキシペプチダーゼA4;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_016352アクセッション:NM_016352 NID:10047105 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンスカルボキシペプチダーゼA3(LOC51200));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9UI42アクセッション:Q9UI42 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).カルボキシペプチダーゼA4前駆体(EC 3.4.17.−)(カルボキシペプチダーゼA3)。
目的のマウス遺伝子は、Cpa4(カルボキシペプチダーゼA4)(ヒトCPA4のオーソログ)である。別名には、1110019K20Rik、CPA3、およびカルボキシペプチダーゼA3が含まれる。
CPA4は、タンパク質のC末端由来のアミノ酸の切断を触媒する推定分泌メタロプロテアーゼである。CPA4は、シグナルペプチド、アミノ末端活性化セグメント、および亜鉛カルボキシペプチダーゼ触媒ドメインを含む。したがって、タンパク質は、活性化セグメントの切断の際に活性化される酵素原として分泌される可能性が高い。CPA4は、分化に関与し得、前立腺癌侵襲の候補遺伝子である(Huang et al,Cancer Res 59(12):2981−8(1999);Kayashima et al,Hum Genet 112(3):220−6(2003);Bentley et al,J Med Genet 40(4):249−56(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=6.48 有意性=0.039163895(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン5〜7をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027926.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびにRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の脳、脊髄、眼、胸腺、肺、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.34.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA66669−1597(UNQ694)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトカルボキシペプチダーゼA4(CPA4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、LPSに対するIL−6の応答が増加した。さらに、(−/−)マウスでIgMレベルおよびIgG3レベルの減少が認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清IL−6応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃誘発は、PRO1339ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃誘発した場合、免疫応答(IL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。IL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。さらに、IL−6は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。これにより、PRO1339ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1339ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、(−/−)マウスが、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血清IgMが1/5に減少し、IgG3が1/2に減少するという所見が得られた。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、IgMおよびIgG3血清免疫グロブリンが減少した。IgM免疫グロブリンは、細菌毒素の中和のための体液性免疫応答で最初に産生され、補体系の活性で特に重要である。同様に、IgG3免疫グロブリンは、中和効果を有し、補体系の活性化により小さな程度で重要である。認められた表現型により、PRO1339ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、PRO1339ポリペプチドまたはそのアゴニストが免疫系(T細胞増殖など)の刺激で有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO1339ポリペプチドのアンタゴニスト(またはインヒビター)は、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、赤血球細胞分布が増加した。これらの結果は、RBC容積の増加に起因する赤血球組成の異常を示す。
70.35.DNA88062(UNQ696)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO2155ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA88062と示す)(UNQ696)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_009654 ムス・ムスクルスアルブミン1(Alb1);タンパク質リファレンス:P07724アクセッション:P07724 NID:ムス・ムスクルス(マウス).血清アルブミン前駆体;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_000477アクセッション:NM_000477 NID:8392890 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンスアルブミン(ALB));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:P02768アクセッション:P02768 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).血清アルブミン前駆体。
目的のマウス遺伝子は、Alb1(アルブミン1)(ヒトALB(アルブミン)のオーソログ)である。別名には、Alb−1、血清アルブミン変異型が含まれる。
ALBは、主に肝臓中に発現し、細胞外液量の安定剤および疎水性化合物(ステロイド、脂肪酸、甲状腺ホルモン、および生体異物(OMIM 103600)など)のキャリアとして機能する分泌血清タンパク質である。ALBはまた、強い抗酸化剤であり、虚血性脳損傷の治療または予防に使用される(Gum et al.Stroke 35(2):590−5(2004))。ALB遺伝子の変異により、家族性アルブミン異常過チロキシン血症を発症し得る。この障害下では、ALBは、チロキシン(T4)に対してより高い親和性を有し、それにより、血清中の総T4は高いが遊離T4は正常である。したがって、家族性アルブミン異常過チロキシン血症により、甲状腺機能亢進症の誤診断および不適切な治療を引き起こし得る(Petitpas et al,Proc Natl Acad Sci U S A 100(11):6440−5(2003))。無アルブミン血症(血清ALBが存在しない常染色体劣性障害)の個体は、健康なようであるが、この障害は、しばしば、アテローム性動脈硬化症を引き起こし得る。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=6.35 有意性=0.041794106(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_009654.1)。
1.野生型発現パネル:脳および脊髄以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.35.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA88062(UNQ696)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトアルブミン(ALB)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの血清アルブミンが顕著に減少した。雌(−/−)マウスは平均血清グルコースレベルが減少し、雄(−/−)マウスは平均血清コレステロールレベルが増加した。(−/−)マウスでインスリンレベルの減少も認められた。雌(−/−)マウスは、より小さく、体長が減少した。(−/−)マウスは、LPS攻撃誘発に対するIL−6、MCP1、およびTNFαの応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清IL−6、MCP−1、およびTNF−α応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃誘発は、PRO2155ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃誘発した場合、免疫応答(TNF−α、MCP−1、およびIL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。TNF−α、MCP−1、およびIL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。TNF−αは、重要な炎症メディエーターである。さらに、TNF−α、MCP−1、およびIL−6は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。TNF−αは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルと置き換わることができる(したがって、エフェクター分子としての機能を果たす)。これにより、PRO2155ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO2155ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
(c)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。 高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病発症の認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、コレステロールレベルが顕著に増加した。したがって、PRO2155遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO2155ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO2155ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(d)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、肝臓機能上の問題を示す平均血清アルブミンレベルが顕著に減少した。(−/−)マウスはまた、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均血清グルコースレベルが減少した。しかし、(−/−)マウスでインスリンレベルの減少は認められなかった。
(e)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後約16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体長が減少した。この所見により、いくらかの程度の成長遅延が示唆されるであろう。しかし、成長異常の他の指標は認められなかった。
70.36.DNA64886−1601(UNQ705)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1356ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64886−1601と示す)(UNQ705)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_016675アクセッション:NM_016675 NID:gi 7710003 ref NM_016675.1 ムス・ムスクルスクラウジン(claudin)2(Cldn2);タンパク質リファレンス:O88552アクセッション:O88552 NID:ムス・ムスクルス(マウス).クラウジン−2;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_020384アクセッション:NM_020384 NID:gi 9966780 ref NM_020384.1 ホモ・サピエンスクラウジン2(CLDN2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:P57739アクセッション:P57739 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).クラウジン−2。
目的のマウス遺伝子は、Cldn2(クラウジン2)(ヒトCLDN2のオーソログ)である。
CLDN2は、クラウジンファミリードメイン内の4つの膜貫通セグメントからなる内在性原形質膜タンパク質である(PfamアクセッションPF00822)。CLDN2は、内皮細胞および上皮細胞中に強固な接合部を形成する細胞接着分子として機能する。強固な接合部は、傍細胞輸送の調節に重要である(Colegio et al,Am J Physiol Cell Physiol 284(6):1346−54(2003);Gonzales−Mariscal et al,ProgBiophys Mol Biol 81(1):1−44(2003);Tsukita et al.Nat Rev Mol Cell Biol 2(4):285−93(2001);Morita et al.Proc Natl Acad Sci U S A 96(2):511−6(1999))。
この変異は、X連鎖遺伝子中に存在する。雄および雌の野生型マウスの両方を分析したのに対して、雄ヘミ接合変異体および雌ヘテロ接合体マウスのみを分析した。雄ヘミ接合マウス(野生型)およびヘミ接合変異マウスを、それぞれ、(+/+)および(−/−)と示す。
性別および遺伝子型によるX連鎖遺伝子分布のまとめ(雄キメラ由来のアグーチ属の子のみが含まれる)
Figure 2008532516
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=25.43 有意性=3.0056997E−6(hom/n)=0.48 平均同腹仔数=6
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_016675.3).
1.野生型発現パネル:脾臓、肺、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.36.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA64886−1601(UNQ705)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトクラウジン2(CLDN2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(0/−)マウスの耐糖能が低下し、空腹時血清グルコースレベルが増加した。この変異は、X連鎖遺伝子中に存在する。雄および雌の野生型マウスの両方を分析したのに対して、雄ヘミ接合変異体および雌ヘテロ接合体マウスのみを分析した。雄ヘミ接合マウス(野生型)およびヘミ接合変異マウスを、それぞれ、(+/+)および(−/−)と示す。
ヘミ接合変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能が低下し、平均空腹時血清グルコースレベルが増加した。雌ノックアウト(−/−)は、探索行動が減少した。変異ノックアウトは、ペイエル板B細胞の比率が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致野生型(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ペイエル板中のB細胞の比率が減少した。ペイエル板は、リンパ球の集合体であり、小腸、特に回腸に沿って存在する。
まとめると、免疫細胞組成物のFACS分析は、ノックアウトマウス(−/−)が、その野生型(+/+)同腹仔と比較した場合、B細胞に関する免疫学的相違を示すことを示す。したがって、PRO1356ポリペプチドまたはそのアゴニストはB細胞産生で有用あるのに対して、PRO1356ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは逆効果を導くと予想されるであろう。
(c)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または糖尿病。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(0/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能が低下した。(0/−)マウスはまた、平均空腹時血清グルコースレベルが増加した。
これらの研究は、(0/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔における正常な空腹時グルコースの存在下で耐糖能が減少または低下することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシスが低下した表現型パターンを示し、したがって、PRO1356ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害に関連する容態および/または種々の心血管疾患(糖尿病が含まれる)の治療で有用であろう。
(d)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立活動および穴掘りが減少し、変異体における探索応答の減少が示唆される。
オープンフィールド試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、探索応答が減少し、変異体における不安様応答の減少が示唆される。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1356ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
70.37.DNA68869−1610(UNQ720)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1385ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68869−1610と示す)(UNQ720)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_178780 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA E130307J04遺伝子(E130307J04Rik);タンパク質リファレンス:NP_848895 RIKEN cDNA E130307J04遺伝子(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024557 ホモ・サピエンス RIC3タンパク質(RIC3);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:NP_078833 RIC3タンパク質(ホモ・サピエンス)。
ターゲティングされたマウス遺伝子は、仮説タンパク質(RIKEN cDNA E130307J04)(ヒトRIC3(RIC3タンパク質)のオーソログである)をコードする。別名には、Ric−3、hric3、およびFLJ11608が含まれる。
RIC3は、進化によってnAChR媒介伝達を調節すると考えられる遺伝子の保存ファミリーに属する膜タンパク質である可能性が最も高い(PMID:12821669)。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=1.99 有意性=0.36972344(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(アクセッション:NM_178780)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに肺、肝臓、骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.37.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA68869−1610(UNQ720)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトRIC3のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの耐糖能が増強された。雄ホモ接合体マウスは、心拍数が減少した。雄(−/−)マウスは、大腿骨測定値が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
耐糖能試験:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、耐糖能が増強された。しかし、雄(−/−)マウスの血糖値は、測定した3つの間隔で依然として歴史的な正常範囲内であった。
(c)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した(2標準偏差低い)。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
まとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、大腿骨骨幹部断面積の厚さが増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO1385ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病および他の骨関連疾患の治療に有利であろう。他方では、PRO1385ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であろう。
70.38.DNA64897−1628(UNQ730)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1412ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64897−1628と示す)(UNQ730)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_028732 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4632428N05遺伝子(4632428N05Rik);タンパク質リファレンス:Q9D659アクセッション:Q9D659 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(ムス・ムスクルス出生0日目の皮膚cDNA、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:4632428N05産物:仮説免疫グロブリンおよび主要組織適合遺伝子複合体ドメイン/免疫グロブリンサブタイプ含有タンパク質(全長挿入配列)(RIKEN cDNA 4632428N05);ヒト遺伝子配列リファレンス:AY358379 ホモ・サピエンスクローンDNA64897 GVPT730(UNQ730);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UXF3アクセッション:Q6UXF3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).GVPT730。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 4632428N05遺伝子(ヒトPP2135タンパク質のオーソログ)である。別名には、GI24、FLJ00041、および血小板受容体GI24が含まれる。
PP2135タンパク質は、シグナル配列、免疫グロブリン様ドメイン(PfamアクセッションPF00047)、膜貫通セグメント、および短いC末端セグメントを含む仮説I型原形質膜タンパク質である。免疫グロブリン様ドメインは、通常、タンパク質−タンパク質相互作用に関与し、広範な種々のタンパク質中に見出される。したがって、PP2135タンパク質は、受容体または細胞接着分子として機能する可能性が高い。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.4 有意性=0.8187308(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028732.2)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および心臓以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.38.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA64897−1628(UNQ730)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説I型原形質膜タンパク質(PP2135)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。雄(−/−)マウスは、耐糖能が増強された。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均白血球数および絶対好中球数が増加し、CD4細胞の平均比率が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
耐糖能試験:試験した雄変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能が増強された。
これらの研究では、変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強された。さらに、(−/−)マウスでは、高インスリン血症は明らかでなかった。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感受性またはグルコースホメオスタシス障害の逆の表現型パターンが増加した。したがって、このようなPRO1412ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト(インヒビター)は、グルコースホメオスタシス障害の治療で有用であろう。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総白血球数および絶対好中球数が増加した。
まとめると、血液学の結果は、ホモ接合体変異マウスが、その(+/+)同腹仔コントロールと比較した場合、絶対好中球数が増加したことを示し、これは、マクロファージ前駆体レベルの上昇を示す。これらの結果は、ホモ接合体(−/−)ノックアウトマウスが異常な免疫学的表現型を示すことを示す。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、CD4細胞およびCD8細胞の平均比率が増加し、B細胞の比率が低下した。しかし、(−/−)マウスは、CD11が腹膜中の細胞より少なかった(blow)。したがって、PRO1412ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、T細胞集団が増加する。これらの所見から、PRO1412ポリペプチドまたはPRO1412をコードする遺伝子は、T細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、PRO1412ポリペプチドまたはそのアゴニストは、顕著なT細胞増殖が存在する(例えば、関節リューマチ患者で起こるなど)場合のT細胞増幅の負の調節因子として有利であろう。さらに、PRO1412ポリペプチドは、移植片拒絶の予防で特に有用であろう。
70.39.DNA68836−1656(UNQ756)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1487ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68836−1656と示す)(UNQ756)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_194358 ムス・ムスクルス(mKIAA0990タンパク質(LOC269941)に類似);タンパク質リファレンス:Q6ZQ11アクセッション:Q6ZQ11 NID:ムス・ムスクルス(マウス).MKIAA0990タンパク質(フラグメント);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_014918 ホモ・サピエンス炭水化物(コンドロイチン)シンターゼ1(CHSYl);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9Y2J5アクセッション:Q9Y2J5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質KIAA0990(コンドロイチンシンターゼ)。
目的のマウス遺伝子は、Chsy1(炭水化物(コンドロイチン)シンターゼ1)(ヒトCHSY1のオーソログ)である。別名には、KIAA0990、mKIAA0990、KIAA0990、およびコンドロイチンシンターゼが含まれる。
CHSY1は、コンドロイチン(コンドロイチン硫酸プロテオグリカンの多糖ポリマー)の生合成を触媒するゴルジ装置中のII型膜タンパク質である。CHSY1は、β−1,3−グルクロン酸トランスフェラーゼ活性およびβ−1,4−アセチルガラクトサミントランスフェラーゼ活性の両方を有する。コンドロイチンを重合させるために、CHSY1は、特定の活性化因子としての機能を果たすコンドロイチン重合因子の同時発現が必要である。CHSY1は、コンドロイチン硫酸プロテオグリカンの生合成において、中心的な役割を果たす。これらのプロテオグリカンは、細胞表面上および細胞外基質中に存在し、軸索の成長、分岐、および新規ネットワークの形成のメディエーターとして機能する(Kitagawa et al,J Biol Chem 276(42):38721−6(2001);Kitagawa et al,J Biol Chem 278(26):23666−71(2003);Sandvig et al,Glia 46(3):225−51(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.5 有意性=0.7788008(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAK129255.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.39.1.表現型分析(破壊遺伝子;DNA68836−1656(UNQ756)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト炭水化物(コンドロイチン)シンターゼ1(CHSYl)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが、関節炎、網膜変異、運動力の低下、および骨中無機質密度の減少が起こった。(−/−)マウスはまた、赤血球の異常が示された。ホモ接合体マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、慢性活動性関節炎を発症し、骨中無機質密度が顕著に減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)病理学:
顕微鏡観察:
(−/−)マウスは、増殖性軟骨疾患、大腿骨−脛骨接合部に関与する関節症、およびびまん性軽度網膜変性を伴う慢性活動性関節炎を示した。大腿骨−脛骨接合部中の病変は、軟骨の増殖ならびに十字靱帯および軟骨膜結合組織の軟骨化生を含んでいた。慢性活動性炎症は、関節周囲の結合組織中に存在し、隣接する骨格筋に伸長した。
(−/−)マウス中で認められた網膜変性は、外核層のびまん性の軽度の菲薄化によって特徴づけられる。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均赤血球容積が増加し、平均赤血球ヘモグロビンレベルが増加した。(−/−)マウスはまた、平均赤血球分布幅が減少した。これらの結果は、PRO1487ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストがこの異常な表現型を模倣することを示す。
(d)心血管表現型分析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
上記プロトコルを使用して、作製したF2野生型、ヘテロ接合体子孫、およびホモ接合体子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Kowa COMIT+ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってA/V比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比(A/V)は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である(血管の分岐前に測定する)。多くの疾患(すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常(網膜変性(色素性網膜炎として公知)など)、網膜の形成異常、視覚問題、または失明)がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型(+/+)同腹仔と比較してホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果:
眼底:8匹全ての(−/−)マウスは、網膜動脈が脆弱化した(attentuated)複数の網膜変性斑が認められた。(−/−)マウスの視神経円板を拡張し、視神経の先端は、その(+/+)同腹仔よりも薄かった。
まとめると、本研究では、1匹の(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、脆弱化した網膜血管および網膜変性を発症するであろう眼科学的異常を示した。まとめると、PRO1487ポリペプチドをコードするDNA68836−1656として同定された遺伝子のノックアウトにより、ホモ接合体変異子孫が網膜動脈異常に関連する表現型を示す。このような検出された網膜の変化は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科障害に対応する他の眼疾患(網膜変性など)に関連し得る心血管全身疾患または障害と最も一般的に関連する。したがって、PRO1487コード遺伝子のアンタゴニストが類似の病理学的な網膜の変化を引き起こすのに対して、アゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、または他の眼科障害(網膜変性およびこの容態に関連する障害(上記など)が含まれる)の治療における治療薬として有用であろう。
(e)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウス)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
1匹の雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が増加した。
したがって、1匹のホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO1487ポリペプチドまたはそのアゴニストは、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
(f)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
逆スクリーン(Inverted Screen)試験:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
逆スクリーン試験データ:
逆スクリーンを使用して、運動力/共調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上部に個別に置いた。棒を180°回転させてマウスをスクリーンの底に配置させた。以下の挙動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上(climing up)。
Figure 2008532516
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しない0/8もしくは1/8(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動共調障害を示す。登上した7/8もしくは8/8(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動共調の増強を示す。
逆スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するようにデザインする。
8匹の(−/−)マウスのうち、5匹が逆スクリーンから落下したのに対して、1/8(+/+)マウスのみが落下した。これらの結果は、変異体の運動力の低下を示す。これらの結果は、下記の骨関連測定値の所見と一致する。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
1.一般的所見:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔よりも小さかった。
2.体重:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
3.体長:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体長が減少した。
(2)骨代謝:放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均総組織マスが減少した。雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨中無機質の測定値が顕著に減少した。
2.マイクロ−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎骨小柱の容積、数、厚さ、および連結密度(connectivity density)が顕著に減少し、平均大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが顕著に減少した。
(−/−)マウスは、組織消耗性疾患に起因し得る成長遅延の徴候を示した。さらに、DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析された変異(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO1487ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用なようであることを示す。さらに、PRO1487ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1487ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
(h)さらなる研究
F1ヘテロ接合体マウスを交雑受精して、F2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。雌の受胎能は低く、28%(4/14)のノックアウトマウスが雌であった。93%(93%)(13/14)のノックアウト動物の指が太く短いのに対して、ヘテロ接合体マウスまたは野生型マウスでは認めらないことが、この表現型を示していた。太く短い指の表現型は、早ければ1〜2週齢で認められた。
足および脊椎のFaxitron X線を使用して、骨関連測定値を得た。マイクロCT分析は、全ノックアウト(−/−)マウスにおいて骨密度の喪失を示した(前足および後足の骨密度:野生型=15283;KO=14577)。全ての野生型マウスおよびヘテロ接合体マウスは、近位大腿骨の骨髄空間中の骨小柱が豊富であるのに対して、全てのノックアウトマウスでは骨小柱が減少する。ノックアウトマウスの指節骨は奇形であり、皮質が菲薄化し、軟骨コア(cartilage cores)が遺残している(薄い皮質、奇形(指節骨の融合の可能性がある)、遺残軟骨コア)。野生型マウスは、中指の指節骨の正常な画像を示した。したがって、UNQ756(−/−)マウスは、有意な軟骨異形成を示した。ノックアウトマウスはまた、局所関節組織マイクロアレイ分析および炎症誘発性サイトカイン分析によって滑膜炎を示した(後足は巣状壊死および炎症を示し、橈骨の主根骨間の関節(radial carpal joint)中に滑膜炎を示した)。
骨関連研究に加えて、UNQ756ノックアウトマウスは、桿体細胞および錐体細胞を含む外核層が菲薄化した網膜変性を示した。全ての野生型動物およびヘテロ接合体マウスの網膜は正常であるのに対して、全てのノックアウト動物では網膜が変化していた。
まとめると、UNQ756ノックアウトマウスは、関節炎様表現型(太く短い指)を明らかに示した。ノックアウトマウスで、発育欠陥(皮質骨が菲薄化した指の奇形(軟骨異形成)および網膜変性が含まれる)が認められた。いくつかの(−/−)動物は炎症病変を示した。このように、UNQ756ノックアウトマウスは関節炎のモデルとして役立つ。
70.40.DNA76399−1700(UNQ831)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1758ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA76399−1700と示す)(UNQ831)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:BC057953 ムス・ムスクルスcDNAクローンMGC:68074 IMAGE:5340780;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_052878 ホモ・サピエンス第19染色体読み取り枠36(C19orf36);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UXA2アクセッション:Q6UXA2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).ALLL831。
目的のマウス遺伝子を、「ムス・ムスクルスcDNAクローンMGC:68074 IMAGE:5340780、完全なcds」(ヒトC19orf36(第19染色体読み取り枠36)のオーソログである)として定義されるcDNAによって示す。
C19orf36は、約160アミノ酸の推定分泌タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチドを含むが、他の保存ドメインを含まない。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=4.59 有意性=0.100761384(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションBC057953.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.40.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA76399−1700(UNQ831)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト第19染色体読み取り枠3636(C19orf36)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した雌(−/−)マウスが得られた。雌(−/−)マウスは、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。変異ノックアウト(−/−)マウスはまた、小柱数および連結密度が増加したが、大腿骨骨幹部総骨領域は減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドが顕著に増加した。したがって、PRO1758遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO1758ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO1758ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウス)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
したがって、ホモ接合体変異マウスは、低増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO1758ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターはこの低増殖表現型を模倣し、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、小柱数および連結密度が増加した。(−/−)マウスで、大腿骨骨幹部総骨領域の減少も認められた。
70.41.DNA73775−1707(UNQ841)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1779ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA73775−1707と示す)(UNQ841)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_030175アクセッション:NM_030175 NID:gi 21313471 ref NM_030175.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4930507C10遺伝子(4930507C10Rik);タンパク質リファレンス:Q9D2G9アクセッション:Q9D2G9 NID:ムス・ムスクルス(マウス).4930507C10Rikタンパク質(RIKEN cDNA 4930507C10遺伝子);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024746アクセッション:NM_024746 NID:gi 21362001 refNM_024746.2ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ 13840(FLJ 13840);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9H8A0アクセッション:Q9H8A0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質FLJ13840。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 4930507C10遺伝子(ヒト仮説タンパク質FLJ13840のオーソログ)である。
仮説タンパク質は、酵素として機能する可能性が高い。このタンパク質は、アシネトバクター・カルコアセティカス(PDB ID:lcru)由来の可溶性キノタンパク質グルコースデヒドロゲナーゼで見出されるドメインに類似のドメインを含む。細菌酵素は、D−グルコースおよびユビキノンからのD−グルコノ−1,5−ラクトンおよびユビキノールの形成を触媒する(Oubrie et al.Proc Natl Acad Sci USA 96(21):11787−91(1999))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.39 有意性=0.8228347(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_030175.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.41.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA73775−1707(UNQ841)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、変異(−/−)マウスの加熱板試験における疼痛知覚が増加した。ホモ接合体(−/−)マウスはまた、総組織マス、除脂肪体重、総脂肪マス(g)、および脂肪率(%)が増加し、骨中無機質密度の測定値が増加した。変異(−/−)マウスのマイクロCT測定値も増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪率、脂肪マスが増加し、骨中無機質密度の測定値が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均総体脂肪が増加し、骨中無機質密度の測定値および大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO1779ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の治療に有利であろう。骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加に関連する表現型により、この効果を模倣する薬剤(例えば、PRO1779ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒で有用であることが示唆される。さらに、雌変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO1779ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO1779ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。
(c)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
加熱板試験
試験の説明:各マウスを小さな囲いのある(enclosed)55℃の加熱板上に配置することによって痛覚についての加熱板試験を行う。後肢応答(なめる、震える、跳ぶ)までの反応時間を記録し、加熱板上の最大滞在時間を30秒とする。各動物について試験を1回行う。
結果:
(−/−)ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、加熱板試験における反応時間が減少し、疼痛知覚の増加を示す。
70.42.DNA80136−2503(UNQ847)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1785ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA80136−2503と示す)(UNQ847)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_027127アクセッション:NM_027127 NID:21312335 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 2310016C16遺伝子(2310016C16Rik));タンパク質リファレンス:Q9D7B7アクセッション:Q9D7B7 NID:ムス・ムスクルス(マウス).2310016C16RIKタンパク質;ヒト遺伝子配列リファレンス:AK074216アクセッション:AK074216 NID:18676756 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス cDNA FLJ23636 fis、クローンCAS07176);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8TED1アクセッション:Q8TED1NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質FLJ23636(EPLA847)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2310016C16遺伝子(ヒトcDNA FLJ23636のオーソログ)である。別名には、「グルタチオンペルオキシダーゼ2の少しの類似物(weakly similar)」が含まれる。
FLJ23636は、グルタチオンペルオキシダーゼファミリーのメンバーである。これらのセレン含有酵素は、過酸化水素および脂質ヒドロペルオキシドのグルタチオン依存性還元を触媒する。FLJ23636は、小胞体膜中に存在すると予想されるII型膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルアンカーおよびグルタチオンペルオキシダーゼドメイン(PfamアクセッションPF00255)からなる。グルタチオンペルオキシダーゼは、細胞の酸化ダメージからの防御で重要な役割を果たす(Miyamoto et al,Biol Chem 384(4):567−74(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=2.73 有意性=0.25538066(hom/n)=0.28 平均同腹仔数=5
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027127.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.42.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA80136−2503(UNQ847)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトグルタチオンペルオキシダーゼ(FLJ23636)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雄(−/−)マウスが皮膚炎を起こした。顕微分析により、雄ホモ接合体変異マウスにおいて、角質増殖を伴う上皮過形成によって特徴づけられる慢性活動性皮膚炎が明らかとなった。ホモ接合体はまた、容積測定骨中無機質密度および平均全身骨中無機質密度が増加し、平均の大腿骨骨幹部の厚さが増加した。雌(−/−)マウスで平均皮膚線維芽細胞増殖の減少も認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)病理学:
顕微鏡観察:分析した4匹の雄(−/−)マウスのうち、3匹が、角質増殖を伴う上皮過形成によって特徴づけられる慢性多病巣性活動性皮膚炎(chronic multifocal active dermatitis)を示した。罹患雄変異体では、真皮の深部に最小から軽度の慢性活動性炎症からなる病巣が存在し、この病巣は、時折、皮筋の変性および再生に関連する。さらに、真皮深部の異物肉芽腫は、異所性毛幹に関連した。1/4(−/−)マウスで上皮潰瘍形成および痂皮形成も認められた。軽度から中等度の脊髄過形成は、より強く罹患された変異体の骨髄中に存在した。高レベルの抗酸化剤は、皮膚炎の容態に関連する。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウス)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
したがって、ホモ接合体変異マウスは、低増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO1785ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターはこの低増殖表現型を模倣し、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度および平均全身骨中無機質密度が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部の厚さおよび断面積が増加した。
まとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、骨中無機質密度の測定値ならびに大腿骨骨幹部断面積および厚さが増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO1785ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の治療に有利であろう。他方では、PRO178ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であろう。
70.43.DNA77623−2524(UNQ871)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1889ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77623−2524と示す)(UNQ871)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_128173 PREDICTED:ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 2300005B03遺伝子(2300005B03Rik);タンパク質リファレンス:XP_128173アクセッション:XP_128173 NID:gi 20902557 ref XP_128173.1 RIKEN cDNA 2300005B03(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_177458ホモ・サピエンス分泌Ly6/uPAR関連タンパク質2(SLURP2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q86SR0アクセッション:Q86SR0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).分泌Ly6/uPAR関連タンパク質2(QLGT871)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2300005B03遺伝子(ヒトSLURP2(分泌Ly6/uPAR関連タンパク質2のオーソログ)である。別名には、SLURP−2が含まれる。
SLURP2は、サイトカイン様リガンドとして機能する可能性が高い推定分泌タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチドおよびLy−6抗原/ウロキナーゼ型プラスミノゲン受容体様(Ly6/uPAR)ドメインを含む。Ly6/uPARドメインは、典型的には、細胞シグナル伝達および免疫機能に関与するタンパク質(SMARTアクセッションSM00134)中に見出される。SLURP2は、いくつかの異なる組織(皮膚およびケラチノサイトが含まれる)由来の上皮中に発現する。SLURP2の生理学的役割は不明であるが、乾癬の病理発生に関与しており、おそらく、ケラチノサイト過剰増殖、T細胞分化、またはT細胞活性化で役割を果たす(Tsuji et al,Genomics 81(l):26−33(2003);Adermann et al.Protein Sci 8(4):810−9(1999))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=3.13 有意性=0.209088(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションBY339783)。
1.野生型発現パネル:腎臓、骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.43.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA77623−2524(UNQ871)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト分泌Ly6/uPAR放出タンパク質2(SLURP2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの骨中無機質密度が減少した。ホモ接合体変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨中無機質密度が減少した。(−/−)変異マウスで活動性低下が認められたが、日周期リズムは依然として認められた。変異(−/−)マウスはまた、心拍数が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の1時間の馴化期間および両明期に歩行回数が減少した(活動性低下)。日周期リズムは変異マウスに依然として認められた。これらの結果は、嗜眠または抑鬱障害と一致する。PRO1889ポリペプチドまたはPRO1889コード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、この挙動を模倣すると予想されるであろう。同様に、PRO1889ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害(抑鬱障害が含まれる)の治療または他の不安様症状(嗜眠、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害など)の治療で有用であろう。
(c)診断−心拍数
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均心拍数が減少した(歴史的平均より2標準偏差低い)。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度が減少した。
DEXAによって分析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨中無機質密度の測定値が減少した。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO1889ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用なようであることを示す。さらに、PRO1889ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1889ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.44.DNA336109(UNQ907)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO90318ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA336109と示す)(UNQ907)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_138655 ムス・ムスクルス膜貫通チャネル様遺伝子ファミリー2(Tmc2);タンパク質リファレンス:Q8R4P4アクセッション:Q8R4P4 NID:ムス・ムスクルス(マウス).膜貫通蝸牛発現タンパク質2);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_080751 ホモ・サピエンス膜貫通チャネル様(TMC2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8TDI7膜貫通蝸牛発現タンパク質2gi|28642835|gb|AAL86401.2|膜貫通チャネル様タンパク質2(ホモ・サピエンス)。
目的のマウス遺伝子は、Tmc2(膜貫通チャネル様遺伝子ファミリー2)(ヒトTMC2(膜貫通チャネル様2)のオーソログ)である。別名には、膜貫通蝸牛発現2;C20orfl45;dJ686C3.3;第20染色体読み取り枠145;および膜貫通蝸牛発現2が含まれる。
TMC2は、チャネルまたは輸送体の修飾因子として機能する可能性が高い内在性膜タンパク質である。このタンパク質は、8回膜貫通セグメントおよび膜貫通セグメント6の細胞外ループ上流の中のTMCシグニチャー配列を含む。TMC2は蝸牛および精巣中に発現し、蝸牛有毛細胞機能に必要なTMC1(膜貫通蝸牛発現遺伝子1)のパラログである。TMC1のように、TMC2は、蝸牛有毛細胞による音の機械電子的伝達に関与し得る(Kurima et al,Genomics 82(3):300−8(2003);Kurima et al,Nat Genet 30(3):277−84(2002);Keresztes et al,BMC Genomics 4(1):24(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=4.7 有意性=0.09536917(hom/n)=0.31 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:第1のコードエクソンをターゲティングした(アクセッション:NM_138655)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうち、脳のみで検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.44.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA336109(UNQ907)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト膜貫通チャネル様2(TMC2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、オープンフィールド試験においてホモ接合体変異マウスの穴掘りおよび直立が減少し、これは探索行動の減少を示す。(−/−)マウスはまた、LPSに対するIL6応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンホカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(直接または抗体アゴニストの使用を介したタンパク質)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均IL−6応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃誘発は、PRO90318ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃誘発した場合、免疫応答(IL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。IL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。さらに、IL−6は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。これにより、PRO90318ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫無防状態の患者(AIDS患者など)などの患者に有利である場合に有用であることが示唆される。したがって、PRO90318ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり、有害な免疫応答(例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合)の抑制のための有用な候補であろう。
(c)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、穴掘りおよび直立が減少し、探索行動が減少した。
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立行動および穴掘りが減少し、変異体の探索応答の減少が示唆される。
オープンフィールド試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、探索応答が減少し、これは、変異体の不安様応答の減少を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害に一致する表現型を示した。したがって、PRO90318ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抗鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
70.45.DNA77631−2537(UNQ 1821)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO3434ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77631−2537と示す)(UNQ 1821)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_026748 ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 1110015K06遺伝子(1110015K06Rik);タンパク質リファレンス:Q6P4S8アクセッション:Q6P4S8 NID:ムス・ムスクルス(マウス).RIKEN cDNA 1110015K06;ヒト遺伝子配列リファレンス:XM_291222(推定):ホモ・サピエンス DKFZP586J0619タンパク質(DKFZP586J0619);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:XP_291222(推定):DKFZP586J0619タンパク質(ホモ・サピエンス)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 1110015K06遺伝子(ヒトDKFZP586J0619タンパク質のオーソログ)である。
DKFZP586J0619タンパク質は、2000を超えるアミノ酸の非常に巨大な仮説ポリペプチドである。C末端付近に、マウスタンパク質は、約70アミノ酸にわたるTAZ亜鉛フィンガードメインを含む(PfamアクセッションPF02135)。このドメインを有するタンパク質には、転写アダプターおよび抑制因子と相互作用する巨大核分子CBPおよびp300が含まれる。これらの転写アダプター分子は、シグナル伝達分子を遺伝子転写に関連づける可能性が高い。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=47.57 有意性=4.680646E−11(hom/n)=0.0 平均同腹仔数=4
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン18〜21をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_026748.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.45.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA77631−2537(UNQ 1821)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが死亡した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(b)病理学
顕微鏡観察:胚性致死のために試験を行わなかった。12.5日目に、以下の43個の胚を観察した:24個の(+/−)胚、13個の(+/+)胚、2個の未定(to−be−determined)、および4個の不確定な胚。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
70.46.DNA68862−2546(UNQ1849)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO3579ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68862−2546と示す)(UNQ1849)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_128781(推定):HSRG1849(LOC225010)に類似するムス・ムスクルス;タンパク質リファレンス:HSRG1849に類似するXP_128781(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_001002257 ホモ・サピエンスアシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1(lysocardiolipinacyl transferase 1)(ALCATl)(転写変異型2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:NP_001002257アシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1イソ型2;HSRG1849(ホモ・サピエンス)。
目的のマウス遺伝子は、遺伝子モデル91(ヒトALCAT1(アシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1)のオーソログ)である。別名には、UNQ1849、FLJ37965、HSRG1849、および「HSRG1849の類似物」が含まれる。
ALCAT1は、小胞体中に存在し、モノリソカルジオリピンおよびジリソカルジオリピンのアシル−CoA依存性アシル化を触媒する酵素である。この酵素は、カルジオリピンをリモデリングするいくつかの酵素のうちの1つであり、生物活性に必要なアシル組成にする。カルジオリピンは、エネルギー代謝に関与する多数のミトコンドリア酵素活性に必要な膜ポリグリセロリン脂質である(Cao et al,J Biol Chem 279(30):31727−34(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.56 有意性=0.75578374(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_128781.5).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.46.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA68862−2546(UNQ1849)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトアシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1(ALCAT1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの不安関連応答が増加した。雄ホモ接合体変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導過温症試験の間に不安様応答が増加した。雄(−/−)マウスは、容積測定骨中無機質密度が増加し、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。さらに、(−/−)マウスは、総体脂肪が増加し、血中トリグリセリドレベルが上昇した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験 − ストレス誘導過温症
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
不安:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(c)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質 手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドレベルが上昇した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO3579遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO3579ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度および平均全身骨中無機質密度が増加した。(−/−)マウスはまた、その性別一致野生型同腹仔と比較した場合、総体脂肪が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、骨中無機質密度の測定値および大腿骨骨幹部断面積が増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の治療に有利であろう。骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加に関連する表現型により、この効果を模倣する薬剤(例えば、PRO3579ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒で有用であることが示唆される。さらに、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO3579ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。
70.47.DNA92223−2567(UNQ 1879)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO4322ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA92223−2567と示す)(UNQ 1879)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_145562アクセッション:NM_145562 NID:gi 21704107 refNM_145562.1 ムス・ムスクルス(DKFZP564O0823タンパク質(LOC231440)に類似する);タンパク質リファレンス:Q923D3アクセッション:Q923D3 NID:ムス・ムスクルス(マウス).DKFZP564O0823タンパク質の類似物(CASTRATION誘導性前立腺アポトーシス関連タンパク質−1);ヒト遺伝子配列リファレンス:AY358777 ホモ・サピエンスクローンDNA92223 VYKT1879(UNQ1879);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UWI2アクセッション:Q6UWI2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).VYKT1879。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 9130213B05遺伝子(ヒトDKFZP564O0823タンパク質のオーソログ)である。別名には、2210012L08Rikが含まれる。
DKFZP564O0823タンパク質は、シグナルペプチド、膜貫通セグメント、および短いC末端を含む有望なI型原形質膜タンパク質である。この細胞の機能は知られていない。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.04 有意性=0.9801987(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145562.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.47.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA92223−2567(UNQ 1879)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト原形質膜タンパク質(DKFZP564O0823)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨関連測定値が増加し、総体脂肪が増加した。雄および雌(−/−)ホモ接合体では、トリグリセリドレベルの上昇も認められた。雄ノックアウトはまた、血糖値が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)発現
UNQ1879は、細胞内ドメイン中に潜在的なチロシンリン酸化部位を有する単一の膜貫通タンパク質である。発現は、マウスおよびヒト組織中の血管平滑筋細胞および他の筋肉前駆細胞中に認められる(特に、E11.5マウス胚、E11.5中脳およびE11.5脳梁幹(trunk))。
(c)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清グルコースレベルが減少した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血糖値が減少した。まとめると、これらのノックアウト変異マウスは、インスリン感受性の増加に関連する表現型を示した。
(d)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドレベルが上昇した(雄でさらに顕著)。
まとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO4322遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO4322ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO4322ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(e)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度および全身骨中無機質密度が増加した。(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪が増加した。
マイクロ−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔と比較した場合、平均総体脂肪が増加し、骨中無機質密度の測定値が増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO4322ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の治療に有利であろう。骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加に関連する表現型により、この効果を模倣する薬剤(例えば、PRO4322ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒で有用であることが示唆される。さらに、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、ホモ接合体マウスのトリグリセリドレベルの上昇を示す血液化学分析を考慮して、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO4322ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO4322ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。
70.48.DNA92255−2584(UNQ1897)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO4343ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA92255−2584と示す)(UNQ1897)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:BC029841 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2010008E23遺伝子のmRNA(cDNAクローンMGC:36813 IMAGE:4209499);タンパク質リファレンス:Q9D8C5アクセッション:Q9D8C5 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(ムス・ムスクルス成体雄小腸cDNA)、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:2010008E23産物:仮説ユビキチンドメイン含有タンパク質(全長挿入配列));ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024107アクセッション:NM_024107 NID:13129117 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC3123(MGC3123));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q71RG4アクセッション:Q71RG4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).FP2653(ELSDI897)(MGC3123タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2010008E23遺伝子(ヒト仮説タンパク質MGC3123のオーソログ)である。
仮説タンパク質MGC3123は、シグナルペプチド、ユビキチンホモログドメイン(SMARTアクセッションSM00213)、および2つのC末端膜貫通セグメントからなる有望な内在性原形質膜タンパク質である。ユビキチンホモログドメインが原形質膜の細胞外側または細胞内側のいずれに面しているかについては不明である。仮説タンパク質は、プロテアーゼインヒビターとして機能することができる(GOアクセッション0004867)。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、129SvEvBrd株由来の胚幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、少数のF1マウスがキメラから得られた場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型分析を行う。
Figure 2008532516
カイ二乗=0.39 有意性=0.8228347(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションAK008158.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.48.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA92255−2584(UNQ1897)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質(MGC3123)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減されたプレパルス抑制が(−/−)マウスにおいてもたらされた。また、ホモ接合体マウスは、増大した小柱の数および結合密度を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大鬱病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用し得る。
手順:
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減されたプレパルス抑制または増強された聴覚驚愕応答を示した。
(c)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のための標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(Dual Energy X−ray Absorptiometry)(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
MicroCT:(−/−)マウスは、その野生型同腹仔と比較して、増大した小柱の数および結合密度を示した。
(−/−)マウスは、増大した海綿質体積および結合密度を示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO4343ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。増加した骨塩量ならびに全身および大腿骨中無機質密度と関連する表現型は、このような効果を模倣する薬剤(例えば、PRO4343ポリペプチドのアンタゴニスト)は、骨治癒に有用であり得ることを示す。
70.49.DNA92288−2588(UNQ1901)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4347ポリペプチド(DNA92288−2588で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1901)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AK003894ハツカマウス18日胚全身cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリに対応する、クローン:1110021D20産物:仮想ヌクレオチド−ジホスホ−糖トランスフェラーゼ構造含有タンパク質、完全挿入配列;タンパク質参照:Q9D163 Q9D163 Q9D163 1110021D20RIK PROTEIN;ヒト遺伝子配列参照:NM_031302ホモサピエンスグリコシルトランスフェラーゼ(LOC83468);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H1C3 ACCESSION:Q9H1C3 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。グリコシルトランスフェラーゼ(仮想タンパク質FLJ31494)(グリコシルトランスフェラーゼ)(ALLR1901)。
対象のマウス遺伝子は、ヒト「グリコシルトランスフェラーゼ」のオーソログであるRIKENcDNA 1110021D20遺伝子である。
仮想タンパク質は、グリコシルトランスフェラーゼとしての機能を果たす適当なII型膜タンパク質である。タンパク質は、シグナルアンカーおよびグリコシルトランスフェラーゼファミリー第8ドメインからなる。このファミリーのメンバーは、典型的には、リポ多糖およびグリコーゲンの合成に関与している(Pfam受託PF01501)。このタンパク質は、ゴルジ装置または小胞体内に位置すると予想される。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=23.25有意性=8.939776E−6(hom/n)=0.15平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン3および4を標的化した(NCBI受託AK003894.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、胸腺、腎臓、肺および脂肪において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.49.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA92288−2588(UNQ1901)について
(a)全般的な表現型の概要:ヒト仮想グリコシルトランスフェラーゼのオーソログをコードする遺伝子の変異により、卵白アルブミン攻撃に対する低減された血清IgG1およびIgG2a応答が(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスは低減された平均体重および平均体長、加えて、低減された総組織マス、総脂肪マスおよび総平均総体脂肪パーセンテージ(低減された血中トリグリセリドも雄(−/−)マウスで観察された)を示した。雄(−/−)マウスは、低減された大腿骨測定値を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満などの処置のために、標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された血中トリグリセリドレベルを示した。
上記に要約したように、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、トリグリセリドレベルの著しい減少を示した。したがって、PRO4347遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患のモデルとしての役割を果たし得る。PRO4347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、トリグリセリドなどの血中脂質の調節に有用であり得る。したがって、PRO4347ポリペプチドのアンタゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠状動脈性心臓病などの心血管疾患、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満の処置に有用であり得る。
(c)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定-Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI、すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨)において測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均体重および低減された平均体長を示した。
(2)骨代謝:放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために、標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
DEXA:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、低減された平均総組織マス、総脂肪マスおよび平均総体脂肪パーセンテージを示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均大腿中軸断面積を示した。
まとめ
これらの結果は、PRO4347ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウト変異型雄マウスが、低減された体重および体長ならびに低減された組織マスおよび脂肪によって示される成長異常を示すことを示す。骨組成/測定値の欠如はまた、低減された骨大腿中軸断面積およびおそらく骨折に至る脆弱性を特徴とする(−/−)マウスにおいても認められた。高カルシウム血症、高血糖症または増大したアルカリ性リン酸塩は、血中化学成分試験において検出されず、腎臓、副甲状腺または副腎の機能不全が低減された骨測定値と関係しているかもしれないことを示した。したがって、PRO4347ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長関連障害の抑制ならびに骨恒常性の促進に有用であり得ると思われる。また、PRO4347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO4347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニストは、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
(d)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示すかなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、このような通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
このような疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって起こり得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子にコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこのような改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置し得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用できる。
下記の試験を行なった。
卵白アルブミン攻撃
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行なった。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
上記のように、このプロトコルでは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力が評価される。動物に50mgのニワトリ卵白アルブミン(完全フロイントアジュバント中に乳化)をIP注射し、14日後に、抗卵白アルブミン抗体(IgM、IgG1およびIgG2サブクラス)の血清力価を測定した。血清試料中のOVA特異的抗体の量は、96ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度(OD)値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。
この攻撃の結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清IgG1およびIgG2a応答を示した。
要約すると、卵白アルブミン攻撃試験は、PRO4347ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較すると免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異型マウスは、T細胞依存性OVA抗原で攻撃すると、免疫学的応答を生じる能力の低下を示した。したがって、PRO4347ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫系の刺激(例えば、T細胞増殖など)に有用であり得、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得る。したがって、PRO4347ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)免疫応答の阻害に有用であり得、このため、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
70.50.DNA83509−2612(UNQ1928)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
このノックアウト実験では、PRO4403ポリペプチド(DNA83509−2612で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1928)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_183297ハツカマウスニューレキソフィリン4(Nxph4);タンパク質参照:Q8BTD1 ACCESSION:Q8BTD1 NID:ハツカマウス(マウス)に対応する。ニューレキソフィリン4。MOUSESPTRNRDB;ヒト遺伝子配列参照:NM_007224ホモサピエンスニューレキソフィリン4(NXPH4);ヒトタンパク質配列は、参照:Q7Z6L3 ACCESSION:Q7Z6L3 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。ニューレキソフィリン4(NXPH4)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトNXPH4のオーソログであるNxph4(ニューレキソフィリン4)である。別名としては、1110036M10RikおよびNPH4がある。
NXPH4は、おそらく、受容体リガンドとしての機能を果たす分泌神経ペプチド様糖タンパク質である。NXPH4は、シグナルペプチド、可変N末端ドメイン、高度に保存されたN−グリコシル化中心ドメイン、短鎖リンカー領域および保存されたシステイン多含有C末端ドメインからなる。神経細胞株では、ニューレキソフィリンが、他の神経ペプチドホルモンと同様に、内部タンパク質分解的切断によってプロセッシングされるようである。ニューレキソフィリンファミリーメンバー1および3は、おそらく細胞−表面受容体としての機能を果たしている神経膜タンパク質であるα−ニューレキシンと結合する。対照的に、NXPH4は、α−ニューレキシンとは結合せず、NXPH4の内在性受容体は依然として未知のままである(MisslerおよびSudhof,J Neurosci 18(10):3630−8(1998);Misslerら,J Biol Chem 273(52):34716−23(1998))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=1.32有意性=0.5168513(hom/n)=0.27平均同腹仔サイズ=10
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン2を標的化した(NCBI受託NM_183297.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、腎臓および肝臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.50.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA83509−2612(UNQ1928)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトニューレキソフィリン4(NXPH4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された血清トリグリセリドレベルが雌(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、亜硝酸塩尿症も示した。また、(−/−)マウスはグルコース耐性の低下を示した。雄および雌両方の(−/−)マウスが低減された平均体長を示した。雄(−/−)マウスは、脊椎骨の平均骨無機質密度の著しい減少を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、コレステロール測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
雌ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清トリグリセリドレベルを示した。
したがって、PRO4403コード遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患、特に、脂質代謝異常と関連する疾患の処置のモデルとしての役割を果たし得る。PRO4403ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のインヒビター(アンタゴニスト)は、血中脂質の調節、特に、トリグリセリドの正常レベルの維持に有用であり得る。したがって、PRO4403ポリペプチドのアンタゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠状動脈性心臓病などの心血管疾患および/または肥満あるいは糖尿病の処置に有用であり得る。
(c)表現型解析:代謝−血中化学成分/グルコース耐性
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するグルコース耐性試験が挙げられる。異常なグルコース耐性試験の結果、以下の障害または状態:1型および2型糖尿病、X症候群、種々の心血管疾患および/または肥満を示すものであり得るが、これらに限定され得ない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて使用した。グルコース耐性試験は、哺乳動物における減損したグルコース恒常性を規定するための標準である。グルコース耐性試験は、Lifescan社のグルコメーターを用いて行なった。動物に、20%溶液として送達されるD−グルコースを2g/kgでIP注射し、血糖レベルを、注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
グルコース耐性試験:試験した変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、グルコース耐性の減少または減損を示した。
この試験は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、試験した3つのすべての時間枠で、通常の空腹時グルコースの存在下においてグルコース耐性の減少または減損を示すことを示した。このように、ノックアウト変異型マウスは、減損したグルコース恒常性の表現型パターンを示し、したがって、PRO4403ポリペプチド(もしくはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、減損したグルコース恒常性と関連している状態および/または種々の心血管疾患、例えば、糖尿病の処置に有用であり得る。
尿検査
記:
常套的な尿検査は、腎臓の/泌尿器系の一般的な評価を得るために行なわれるスクリーニング試験である。尿を常套的に検査するための特性値としては、タンパク質、糖、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノーゲン、硝酸塩および白血球エステラーゼ、ならびにpHおよび比重の検査値が挙げられる。
結果:
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、7匹が亜硝酸塩尿症を示した。
(d)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI、すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨)において測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
結果:雄および雌の(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、低減された平均体長を示した。
(2)骨代謝:放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、脊椎骨において平均骨無機質密度の著しい減少を示した。
DEXAによって解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、異常な骨障害を示唆する低減された骨測定値を示した。(−/−)マウスはまた、成長関連障害と関連し得る低減された体長測定値を示した。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値の異常および減少を伴う負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO4403ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨恒常性の維持に有用であり得ることを示す。また、PRO4403ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO4403ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
70.51.DNA100902−2646(UNQ2419)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
このノックアウト実験では、PRO4976ポリペプチド(DNA100902−2646で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2419)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_172282ハツカマウスRIKEN cDNA B230339H12遺伝子(B230339H12Rik)に対応する;タンパク質参照:Q8BH01 ACCESSION:Q8BH01 NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス成体雄結腸cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:9030405H12産物:仮想Na/H交換体含有タンパク質、完全挿入配列(RIKEN cDNA B230339H12)(ハツカマウス2日目新生児胸腺細胞cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:E430029F23産物:仮想Na/H交換体含有タンパク質、完全挿入配列);ヒト遺伝子配列参照:NM_017905ホモサピエンス第13染色体オープンリーディングフレーム11(C13orf11);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UWJ1 ACCESSION:Q6UWJ1 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。C13orf11。
対象のマウス遺伝子は、ヒトC13orf11(第13染色体オープンリーディングフレーム11)のオーソログであるRIKEN cDNA B230339H12遺伝子である。別名としては、FLJ20623およびB230339H12Rikがある。
C13orf11は、おそらくプロトン/ナトリウム対向輸送体としての機能を果たしている仮想内在性原形質膜タンパク質である。C13orf11は、シグナルペプチド、コイルドコイル領域、およびナトリウム/水素交換体ドメイン内に含まれる10回膜貫通セグメントからなる。このドメインを有するタンパク質は、おそらく、細胞内pHを調節して、代謝の際に生成するプロトンを排出するのにある役割を果たしている(Pfam受託PF00999)。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.19有意性=0.9093729(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_172282.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.51.1.表現型解析(破壊された遺伝子DNA 100902−2646(UNQ2419)について:
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト第13染色体オープンリーディングフレーム11(C13orf11)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低運動および増大した運動抑制性が神経学的試験の際に(−/−)マウスにおいてもたらされた。雄(−/−)マウスは、除脂肪体重の著しい減少および低減された平均大腿中軸断面積を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および身体診断
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均除脂肪体重の著しい減少を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均大腿中軸断面積を示した。
DEXAおよび骨microCT解析によって解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、異常な骨障害を示唆する低減されたボディー・マスおよび骨測定値を示した。負の骨表現型は、PRO4976ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨恒常性の維持に有用であり得ることを示す。また、PRO4976ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO4976ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用し得る。
手順:
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
オープンフィールド試験:
既知薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型が示されている。これらとしては、セロトニン輸送体、ドーパミン輸送体のノックアウト(Girosら,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)、およびGABA受容体のノックアウト(Homanicsら,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)が挙げられる。自動オープンフィールドアッセイを、感情状態と関係する変化および学習と関係する探索パターンに対処されるようにカスタマイズした。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択し、したがって、探索に伴う自発活動における変化が収集されるように設計した。また、床には、探索に具体的に関係する活動である鼻を突っ込むことができる4つの穴を設けた。また、この試験と関連する感情状態を強調するためのいくつかの要素も設計した。オープンフィールド試験は、マウスを試験する最初の実験的手順であり、得られた測定値は、チャンバを用いた被験体の最初の経験であった。また、オープンフィールドは明るく照明した。これらのすべての要素により、新しくて開放された空間と関連する自然な不安が強調される。次いで、探索活動のパターンおよび程度、特に、中心対全移動距離比により、不安または抑鬱症に対する感受性と関連する変化を認識し得る。大領域(arena)(40cm×40cm,VersaMax動物の活動性モニタリングシステム、AccuScan Instruments製)を3種類の異なるレベルの赤外線ビームとともに用い、直立、穴掘りおよび自発活動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを、4分間隔で5回解析した。全移動距離(cm)、上下移動回数(直立)、穴掘りの回数、および中心対全移動距離比を記録した。
マウスが新しい環境に対して正常な馴化応答を示す傾向を、その左右方向の自発活動における全体的な変化を5分間の時間枠で測定することにより評価する。この経時的な活動における変化の計算された傾きを、絶対全移動距離ではなく標準化した全移動距離を用いて決定する。この傾きは、5回の時間枠の各々の活動の標準化による回帰直線から決定する。正常な馴化は、負の傾き値で表される。
結果:
(−/−)マウスは、オープンフィールド試験の際、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された穴掘りおよび直立ならびに全体的な低運動(移動距離が少ない)を示した。
全体的および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、変異型における低減された探索応答を示す低減された直立活動および穴掘りを示した。
オープンフィールド試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、低運動および低減された探索応答を示した。これらの観察結果は、変異型における低減された不安様応答を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO4976ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱障害と関連する症状の処置または改善に有用であり得る。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、齧歯類における鬱病様行動のモデルとして開発された手順である。この特定の設定において、マウスをその尾部によって6分間懸垂し、それに応答して、マウスは、この体勢から逃れようとしてもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これを、学習性無力感パラダイムの一類型と解釈する。無効データを有する動物(すなわち、試験期間中、その尾部によじ登った)は、解析から除外する。
結果:
(−/−)マウスは、尾部懸垂試験中、増大した応答時間を示した。これらの結果は、低減された学習性無力感または増大した運動抑制性を示す。したがって、変異型マウスは、増大した鬱病様行動を示す。
70.52.DNA33470−1175(UNQ227)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO260ポリペプチド(DNA33470−1175で指定される)をコードする遺伝子(UNQ227)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_025799ハツカマウスRIKEN cDNA0610025O11遺伝子(0610025O11Rik)に対応する;タンパク質参照:Q99KR8 ACCESSION:Q99KR8 NID:ハツカマウス(マウス)。RIKEN CDNA 0610025O11GENE;ヒト遺伝子配列参照:NM_032020ホモサピエンスフコシダーゼ、α−L−2、血漿(FUCA2);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9BTY2 ACCESSION:Q9BTY2 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。フコシダーゼ、α−L−1、組織(MGC1314タンパク質)と同様。
対象のマウス遺伝子は、ヒトFUCA2(フコシダーゼ、α−L−2、血漿)のオーソログであるRIKEN cDNA0610025O11遺伝子である。別名としては、MGC1314、dJ20N2.5および5530401P20Rikがある。
FUCA2は、糖タンパク質およびスフィンゴ糖脂質内の末端α−L−フコース結合の加水分解を触媒する血漿酵素である。酵素は、おそらく、N−グリカン分解において役割を果たしている(JohnsonおよびAlhadeff,Comp Biochem Phvsiol B 99(3):479−88(1991);Eibergら,Clin Genet 26(1):23−9(1984))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、系統129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.89有意性=0.64082426(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=11
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託NM_025799.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち、骨および脂肪以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.52.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA33470−1175(UNQ227)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトフコシダーゼ、α−L−2、血漿(FUCA2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した総組織マス、脂肪(%)および脂肪(g)が変異型ホモ接合体マウスにおいてもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および身体診断
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
結果:
DEXA:(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した総組織マス、総体脂肪マス(g)および総平均体脂肪割合(%)を示した。
この試験は、変異型(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、肥満と関連し得る負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO260ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満の予防および/または処置に特に重要であり得る。
70.53.DNA92217−2697(UNQ2521)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
このノックアウト実験では、PRO6014ポリペプチド(DNA92217−2697で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2521)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_138750 ACCESSION:NM_138750NID:20270282ハツカマウスハツカマウスプロミニン関連タンパク質(Prom−rp);タンパク質参照:Q8R4Y7 ACCESSION:Q8R4Y7NID:ハツカマウス(マウス)に対応する。プロミニン−2;ヒト遺伝子配列参照:NM_144707ホモサピエンスプロミニン2(PROM2);ヒトタンパク質配列は、参照:Q8TAE2 ACCESSION:Q8TAE2NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。プロミニン−2バリアントA(PROM2)(プロミニン−2バリアントB)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトPROM2のオーソログであるProm2(プロミニン2)である。別名としては、PROM−2、Prom−rp、MGC31164およびプロミニン関連タンパク質がある。
PROM2は、上皮細胞および非上皮細胞内の原形質膜の突出部に見られる内在性膜タンパク質である。タンパク質は、細胞外N末端セグメント、5回膜貫通ドメイン、および細胞質C末端セグメントからなる。タンパク質は、ヒトの網膜変性と関連するファミリーメンバープロミニン−1と共存している。PROM2は、腎臓、消化管および他の上皮において発現される。プロミニン−1とは異なり、PROM2は、目では発現されない(Fargeasら,J Biol Chem 278(10):8586−96(2003))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.47有意性=0.79057086(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜6を標的化した(NCBI受託NM_138750.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨格筋、骨および心臓以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.53.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA92217−2697(TJNO2521)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトプロミニン2(PROM2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、貧血が(−/−)マウスにおいてもたらされた。ホモ接合体変異型マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、貧血の徴候、例えば、低減された平均赤血球計数ならびに低減された平均ヘモグロビンおよびヘマトクリットレベルを示した。(−/)マウスはまた、低減された血清グルコースレベルを示したが、グルコース耐性試験は正常であった。変異型(−/−)マウスは、低減された平均体重および平均体長を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なうことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞がある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置し得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用できる。
下記の試験を行なった。
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均総赤血球計数、ヘモグロビンレベルおよびヘマトクリットレベルを示した。
変異型(−/−)マウスは、貧血と関連する表現型を示した。したがって、PRO6014ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO6014ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球生成に不可欠なはずであり、そのため、貧血または低ヘマトクリットと関連する血液疾患の処置に有用であり得る。
(c)骨代謝および身体診断
組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI、すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨)において測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均体重および平均体長を示した。したがって、身体測定値は、成長関連問題を示した。
(d)表現型解析:代謝−血中化学成分
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。血糖レベルの測定に加え、下記の血中化学成分:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血液尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物の試験もまた常套的に行なわれる。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清グルコースレベルを示した。しかしながら、(−/−)マウス正常なグルコース耐性を有した。
70.54.DNA105838−2702(UNQ2528)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
このノックアウト実験では、PRO6027ポリペプチド(DNA105838−2702で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2528)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_027476ハツカマウス白血球受容体クラスター(LRC)メンバー4(Leng4)に対応する;タンパク質参照:Q6IR37 ACCESSION:Q6IR37NID:ハツカマウス(マウス)。Leng4タンパク質;ヒト遺伝子配列参照:NM_207340ホモサピエンス仮想タンパク質LOC254359(LOC254359);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UX98 ACCESSION:Q6UX98NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。LENG4。
対象のマウス遺伝子は、ヒト仮想タンパク質LOC254359のオーソログであるLeng4(白血球受容体クラスター[LRC]メンバー4)である。別名としては、5730496N17Rikがある。
Leng4は、おそらく内在性膜タンパク質であり、3回膜貫通セグメントおよびDHHCジンクフィンガードメイン(Pfam受託PF01529)からなる。Leng4の予測される細胞内局在は不明瞭である;これは、原形質膜上またはミトコンドリア内に局在し得る。DHHCジンクフィンガードメインを有するタンパク質としては、D.melanogaster由来の推定転写因子DNZ1(Mesilaty−Grossら,Gene 231(1−2):173−86(1999))およびS.cerevisiae由来の、小胞体の膜上に局在する非触媒性パルミトイルトランスフェラーゼサブユニットERF2(Loboら,J Biol Chem 277(43):41268−73(2002))が挙げられる。DHHCジンクフィンガードメインは、タンパク質−タンパク質またはタンパク質−DNA相互作用に関与していることが予測されている(Putilinaら,Mol Cell Biochem 195(1−2):219−26(1999))。Leng4の機能はわかっていない。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=4.83有意性=0.089367345(hom/n)=0.19平均同腹仔サイズ=9
変異情報
変異の型:レトロウイルス挿入(OST)
記:レトロウイルス挿入は、コードエキソン1および2の間のイントロンにおいて行なった(NCBI受託NM_027476.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち目、肝臓、骨格筋、骨、心臓および脂肪以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:RT−PCR解析により、転写物は、解析した(−/−)マウス(M−104)に存在しないことが示された。標的遺伝子の破壊は、インバースPCRによって確認した。
70.54.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA105838−2702(UNQ2528)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質(LOC254359)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、貧血がホモ接合体変異型マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、増大した平均大腿中軸皮質厚さも示した。転写物は、RT−PCRにより、存在していなかった。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なうことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置し得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用できる。
下記の試験を行なった。
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均総赤血球計数、ヘモグロビンレベルおよびヘマトクリットレベルを示した。
変異型(−/−)マウスは、貧血と関連する表現型を示した。したがって、PRO6027ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO6027ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球生成に不可欠なはずであり、そのため、貧血または低ヘマトクリットと関連する血液疾患の処置に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均大腿中軸皮質厚さを示した。
要約すると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した大腿中軸皮質厚さを示した。このような結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO6027ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方において、PRO6027ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であり得る。
70.55.DNA107698−2715(UNQ2552)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
このノックアウト実験では、PRO6181ポリペプチド(DNA107698−2715で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2552)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_182785ハツカマウスRIKEN cDNA4933400F01遺伝子(4933400F01Rik)に対応する;タンパク質参照:Q8BVP6 ACCESSION:Q8BVP6NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス成体雄精巣cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:4933400F01産物:仮想セリンプロテアーゼ、トリプシンファミリー含有タンパク質、完全挿入配列(仮想タンパク質4933400F01Rik);ヒト遺伝子配列参照:NM_173506ホモサピエンス仮想タンパク質MGC42718(MGC42718);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UWN0 ACCESSION:Q6UWN0NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。GPQH2552。
対象のマウス遺伝子は、ヒト仮想タンパク質MGC42718のオーソログであるRIKEN cDNA4933400F01遺伝子である。別名としては、MGC58778およびMGC42718がある。
仮想タンパク質MGC42718は、シグナルペプチドを含有する約250アミノ酸の推定分泌タンパク質である。他に保存されたドメインは検出されなかった。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.04有意性=0.9801987(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=9
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_182785.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、目、胸腺、脾臓、肺および脂肪において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.55.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA107698−2715(UNQ2552)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質MGC42718のオーソログをコードする遺伝子の変異により、卵白アルブミン攻撃に対する増大したIgG2a応答が(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、低減された総組織マスおよび総体脂肪割合(%)および脂肪マス(g)も示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なうことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置し得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用できる。
下記の試験を行なった。
卵白アルブミン攻撃
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行なった。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分キャラクタライズされている。抗OVA抗体は、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出され得、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
上記のように、このプロトコルでは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力が評価される。動物に50mgのニワトリ卵白アルブミン(完全フロイントアジュバント中に乳化)をIP注射し、14日後に、抗卵白アルブミン抗体(IgM、IgG1およびIgG2サブクラス)の血清力価を測定した。血清試料中のOVA特異的抗体の量は、96ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度(OD)値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。
この攻撃の結果:
(−/−)マウスは、それらの(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清IgG2a応答を示した。
要約すると、卵白アルブミン攻撃試験は、PRO6181ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、それらの野生型同腹仔と比較すると、免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異型マウスは、T細胞依存性OVA抗原で攻撃すると、増大した免疫学的応答を生じる能力を示した。したがって、PRO6181ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、免疫系の刺激(例えば、T細胞増殖など)に有用であり得、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得る。したがって、PRO6181ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、このため、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された総組織マス、平均総体脂肪割合(%)および総平均体脂肪マス(g)を示した。
これらの試験は、変異型(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、組織消耗性疾患と関連し得る負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO6181ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠である。
70.56.DNA82358−2738(UNQ2759)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO6714ポリペプチド(DNA82358−2738で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2759)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_023158 ACCESSION:NM_023158NID:gi14249120refNM_023158.2ハツカマウスCxcケモカインリガンド16(Cxcllβ)に対応する;タンパク質参照:Q9EPB3 ACCESSION:Q9EPB3NID:ハツカマウス(マウス)。SR−PSOX(膜貫通型ケモカインCXCL16)(0910001K24RIKタンパク質)(CXCケモカインリガンド16);ヒト遺伝子配列参照:NM_022059ホモサピエンスケモカイン(C−X−Cモチーフ)リガンド16(CXCL16);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H2A7 ACCESSION:Q9H2A7NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。誘導性小サイトカインB16(膜貫通型ケモカインCXCL16)(SR−PSOX)(ホスファチジルセリンおよび酸化された低密度リポタンパク質のスカベンジャー受容体)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトCXCL16のオーソログであるCxcl16(ケモカイン[C−X−Cモチーフ]リガンド16)である。別名としては、SR−PSOX、SRPSOX、CXCLG16、AV290116、0910001K24Rik、SR−PSOX/CXCL16およびCxcケモカインリガンド16がある。
CXCL16は、Gタンパク質共役型受容体CXCR6(ケモカイン[C−X−Cモチーフ]受容体6)のケモカインリガンドとしての機能を果たすI型内在性原形質膜タンパク質である(Matloubianら,Nat Immunol 1(4):298−304(2000))。マクロファージでは、CXCL16はまた、酸化された低密度リポタンパク質のスカベンジャー受容体としての機能を果たす(Shimaokaら,J Biol Chem 275(52):40663−6(2000))。マクロファージ上のCXCL16は、炎症メディエーター(例えば、腫瘍壊死因子−αまたはリポ多糖など)に応答してインビトロで急速に切断(shed)され、これは、タンパク質がまた、細胞外にも局在することを示す(Wilbanksら,2001)。
CXCL16は、主に、パイエル斑、肺、腎臓、小腸、赤脾髄、および白脾髄のT細胞領域、リンパ節、ならびに胸腺髄質において発現される。CXCL16発現は、さまざまな免疫細胞、例えば、樹状細胞、B−細胞、単球およびマクロファージ上で検出されている(Matloubianら,Nat Immunol 1(41:298−304(2000);Shimaokaら,J Biol Chem 275(52):40663−6(2000))。CXCL16発現は、一般的に、炎症性刺激に応答して増大し、CXCL16は、T細胞の強い化学走性を誘導する。したがって、CXCL16は、おそらく、T細胞遊走、免疫細胞相互作用、免疫細胞接着、食作用、およびマクロファージにおける酸化された低密度リポタンパク質のエンドサイトーシスに関与している(Wilbanksら,J Immunol 166(8):5145−54(2001);Chandrasekarら,J Biol Chem 279(5):3188−96(2004);Shimaokaら,J Leukoc Biol 75(2):267−74(2004);Shimaokaら、J Immunol 171(4):1647−51(2003))。さらに、CXCL16は、炎症性疾患、例えば、自己免疫性脳脊髄炎およびアテローム性動脈硬化症などに、ある役割を果たしている可能性がある(Fukumotoら,J Immunol 173(3):1620−7(2004);Chandrasekarら,J Biol Chem 279(5):3188−96(2004);Yamauchiら,Arterioscler Thromb Vasc Biol 24(2):282−7(2004);Wuttgeら,Arterioscler Thromb Vasc Biol 24(4):750−5(2004))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=1.43有意性=0.48919213(hom/n)=0.23平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_023158.3)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.56.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA82358−2738(UNQ2759)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトケモカイン(C−X−Cモチーフ)リガンド16(CXCL16)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、神経学的試験の際、(−/−)マウスにおいて活動亢進がもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
手順:
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
日周期試験の説明:
雌マウスを、試験の第1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウエアにより、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断は自動的に移動回数に分けられる。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータを、3日間の試験期間における各時間で記録したメジアン活動性レベル(日周期リズム)および各明/暗サイクル中のメジアン総活動性(自発活動)によって示す。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、ホームケージ活動性試験の両方の暗期間中、多動性行動パターンをもたらす増大した歩行回数を示し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害全般性不安障害などの神経障害と一致する増大した不安を示す。したがって、PRO6714ポリペプチドは、かかる障害の処置に有用であり得る。
70.57.DNA142524(UNQ2768)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO9922ポリペプチド(DNA142524で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2768)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_126166ハツカマウスtoll様受容体3(Tlr3)に対応する;タンパク質参照:Q99MB1 Q99MB1 Q99MB1 TOLL−LIKE RECEPTOR3;ヒト遺伝子配列参照:NM_003265 ACCESSION:NM_003265NID:19718735ホモサピエンスホモサピエンスtoll様受容体3(TLR3);ヒトタンパク質配列は、参照:O15455 O15455 O15455 TOLL−LIKE RECEPTOR3に対応する。
対象のマウス遺伝子は、ヒトTLR3のオーソログであるTlr3(toll様受容体3)である。
TLR3は、パターン認識受容体としての機能を果たすI型原形質膜タンパク質であり、二本鎖RNAおよび他の微生物因子を認識する(Alexopoulouら,Nature 413(6857):732−8(2001);Brightbillら,Science 285(5428):732−6(1999);Rockら,Proc Natl Acad Sci USA 95(2):588−93(1998))。TLR3は、胎盤、膵臓(Rockら,Proc Natl Acad Sci USA 95(2):588−93(1998))、樹状細胞(Muzioら,J Immunol 164(11):5998−6004(2000)、および破骨細胞前駆体(Takamiら,J Immunol 169(3):1516−23(2002)において発現される。TLR3の活性化により、強力な殺菌剤一酸化窒素(Brightbillら,Science 285(5428):732−6(1999))および炎症性サイトカイン(Karikoら,J Immunol 172(11):6545−9(2004);Alexopoulouら、Nature 413(6857):732−8(2001))の生成がもたらされる。TLR3は、先天性および適応免疫に関与している(Heinzら,JBiol Chem278(24):21502−9(2003);Olson and Miller,J Immunol 173(6):3916−24(2004);Applequistら,Int Immunol 14(9):1065−74(2002))。
Alexopoulouおよびcolleagues[Nature 413(6857):732−8(2001)]により、ノックアウトマウスを用いてTLR3の生理学的役割が調査された。彼らにより、二本鎖RNAに応答した炎症および炎症性サイトカイン生成は、TLR3欠損マウスにおいて、野生型マウスよりもかなり低いことが見出された。さらに、D−ガラクトサミンに感作させたTLR3欠損マウスにおける二本鎖RNAに対する応答は、D−ガラクトサミンに感作させた野生型マウスよりも致死性が低いことが示された。彼らは、TLR3が二本鎖RNAを認識する能力が、ウイルス感染に対する先天性免疫をもたらすと結論付けた。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=13.84有意性=9.878299E−4(hom/n)=0.19平均同腹仔サイズ=9
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託NM_126166.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.57.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA142524(UNQ2768)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトtoll様受容体3(TLR3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された脊椎骨関連測定値がもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均脊椎骨中無機質密度を示した。雌(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔と比較すると、低減されたBMC/LBM指数を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均脊椎骨海綿質の体積、数、厚さおよび結合密度、ならびに低減された平均大腿中軸断面積を示した。
DEXAおよび骨microCT解析によって解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、異常な骨障害を示唆する低減された脊椎骨測定値を示した。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値の異常および減少を伴う負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO9922ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨恒常性の維持に有用であり得ることを示す。また、PRO9922ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO9922ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
70.58.DNA108701−2749(UNQ2789)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO7179ポリペプチド(DNA108701−2749で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2789)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_010584 ACCESSION:NM_010584NID:6754387ハツカマウスハツカマウスインテレクチン(Mn)に対応する;タンパク質参照:O88310 ACCESSION:O88310NID:ハツカマウス(マウス)。INTELECTIN(10日齢雄膵臓CDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、CLONE:1810012B21、全挿入配列);ヒト遺伝子配列参照:NM_017625 ACCESSION:NM_017625NID:8923027ホモサピエンスホモサピエンスインテレクチン(ITLN);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9NP67 ACCESSION:Q9NP67NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。INTELECTIN(CDNA FLJ20022FIS、CLONE ADSE01331)(内皮レクチンHL−1)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトITLN1(インテレクチン1[ガラクトフラノース結合])のオーソログであるItln(インテレクチン)である。別名としては、IntL、LFR、HL−1、ITLN、hIntL、FLJ20022、内皮レクチンHL−I、および腸内ラクトフェリン受容体がある。
ITLN1は、グリコシル−ホスファチジルイノシトールアンカー型細胞外タンパク質である。これは、おそらく、ラクトフェリンの受容体および細菌細胞壁内のガラクトフラノシル残基と結合する分泌レクチン様タンパク質としての機能を果たす。タンパク質は、小腸、結腸、心臓および胸腺において発現される。新生児、ITLN1は、おそらく、小腸上皮の表面上で発現されており、乳汁内の鉄分の主要形態であるラクトフェリンの取り込みにある役割を果たしている。ITLN1はまた、微生物と結合することにより、先天性免疫において機能を果たすこともできる(Suzukiら,Biochemistry 40(51):15771−9(2001);Komivaら,Biochem Biophys Res Commun 251(3):759−62(1998);Tsujiら,J Biol Chem 276(26):23456−63(2001))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=9.16有意性=0.010254897(hom/n)=0.16平均同腹仔サイズ=7
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_010584.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち胃、小腸および結腸においてのみ検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.58.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA108701−2749(UNQ2789)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトインテレクチン1(ガラクトフラノース結合)(ITLN1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された骨塩量および密度の測定値が(−/−)マウスにおいてもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された骨塩量、低減されたBMC/LBM指数、低減された大腿骨骨無機質密度および低減された脊椎骨骨無機質密度を示した。
MicroCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された脊椎骨海綿質体積、数および厚さならびに低減された平均大腿中軸断面積を示した。
DEXAおよび骨microCT解析によって解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、異常な骨障害を示唆する低減された骨測定値を示した。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値の異常な減少を伴う負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO7179ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨恒常性の維持に有用であり得ることを示す。また、PRO7179ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO7179ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
70.59.DNA115253−2757(UNQ2976)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO7476ポリペプチド(DNA115253−2757で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2976)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_024449 ACCESSION:NM_024449NID:14209687ハツカマウスハツカマウススクレロスチン(Sost)に対応する;タンパク質参照:Q99P68 ACCESSION:Q99P68NID:ハツカマウス(マウス)。SCLEROSTIN PRECURSOR;ヒト遺伝子配列参照:NM_025237 ACCESSION:NM_025237NID:13376845ホモサピエンスホモサピエンス骨硬化症(sclerosteosis)(SOST);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9BQB4 ACCESSION:Q9BQB4NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。SCLEROSTIN PRECURSOR。
対象のマウス遺伝子は、ヒトSOSTのオーソログであるSost(スクレロスチン)である。別名としては、5430411E23Rikがある。
SOSTは、主に、骨細胞において発現される分泌糖タンパク質であり、骨形成タンパク質受容体と結合し、骨形成タンパク質による受容体活性化を拮抗する。SOSTは、骨恒常性に関与しており、骨芽細胞の石灰化を抑制する。SOST遺伝子における機能低下変異は、骨格過成長を特徴とする常染色体劣性障害である骨硬化症を引き起こす(Brunkowら,Am J Hum Genet 68(3):577−89(2001);Balemansら,Hum Mol Genet 10(5):537−43(2001);Winklerら,EMBO J 22(23):6267−76(2003);Kusuら,J Biol Chem 278(26):24113−7(2003);Van Bezooijenら,J Exp Med 199(6):805−14(2004))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.96有意性=0.6187834(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託AK017295.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、目、胸腺、脾臓、肺、腎臓および心臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.59.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA115253−2757(UNQ2976)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト骨硬化症(SOST)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、大理石骨病が(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、血中化学成分および血液学的異常も示した。ホモ接合体変異型マウスは、海綿質のびまん性肥厚ならびに増大した骨塩量および密度の測定値を特徴とするびまん性で中等度の大理石骨病を示した。また、(−/−)マウスは、増大した平均血清IgG2bレベルならびに低減された赤血球計数および低減された平均赤血球容積を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学:
巨視的観察結果:解析した6匹の(−/−)マウスのうち、3匹が肥厚した骨を示した。
微視的観察結果:6匹の(−/−)マウスはすべて、大腿骨、胸骨、脊椎骨ならびに鼻甲介および頭部の顎骨における海綿質のびまん性肥厚を特徴とするびまん性で中等度の大理石骨病を示した。骨表面は、骨芽細胞によって完全に覆われており、わずかに少数の破骨細胞が存在した。これらの変異型における病変は、骨硬化症を有するヒト患者に見られるものと類似していた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入を、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行ない得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置され得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用できる。
下記の試験を行なった。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
結果:
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクト内の(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、増大した平均血清IgG2bレベルを示した。
したがって、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較すると、平均血清免疫グロブリンの上昇を示した。IgG2b免疫グロブリンは中和効果を有し、程度は低いが、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常は、PRO7476ポリペプチドアンタゴニストまたはインヒビターにより免疫系が刺激(例えば、T細胞増殖など)され得ること、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得ることを示す。したがって、PRO7476ポリペプチドまたはそのアゴニストは免疫応答を阻害するものであり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均赤血球計数および増大した平均赤血球容積を示した。
増大した血清IgG2b免疫グロブリンという観察結果に加え、変異型(−/−)マウスは、貧血と関連する表現型を示した。したがって、PRO7476ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO7476ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球生成に不可欠なはずであり、そのため、貧血または低ヘマトクリットと関連する血液疾患の処置に有用であり得る。
(d)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均血清トリグリセリドレベルを示した。
したがって、PRO7476コード遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患、特に、脂質代謝異常と関連する疾患の処置のモデルとしての役割を果たし得る。PRO7476ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、血中脂質の調節、特に、トリグリセリドの正常レベルの維持に有用であり得る。したがって、PRO7476ポリペプチドは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患などの心血管疾患および/または肥満あるいは糖尿病の処置に有用であり得る。
(e)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
CAT−スキャンプロトコル:
マウスにCT造影剤Omnipaque 300(Nycomed Amershan,300mgのヨウ素/ml、0.25ml/動物1匹または2.50〜3.75gヨウ素/体重kg)を腹腔内注射した。ケージ内で約10分間安静にした後、次いで、マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって鎮静させた。麻酔した動物を試験床面上にうつ伏せにして置き、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を用いてCAT−スキャンを行なった。3次元画像を、ImTek 3D RECONソフトウエアを使用し、ワークステーションのクラスター内のFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
DEXA:雄および雌の(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、全身、大腿骨および脊椎骨において平均骨塩量、骨塩量指数(BMC/LBM)、容量分析的骨中無機質密度および骨無機質密度の著しい増加を示した。また、雄および雌(−/−)マウスは、増大した平均総体脂肪パーセンテージを示した。雌(−/−)ノックアウトはまた、増大した総組織マスおよび脂肪マス(g)を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、著しく増大した平均脊椎骨海綿質体積、数、厚さおよび結合密度ならびに増大した平均大腿中軸皮質厚さおよび断面積を示した。
CAT−スキャン:(−/−)マウスは、頭蓋および顔面の構造の明瞭な変形または寸法の差は示さなかった。しかしながら、2D投影図により、一般的に増大した骨密度が明らかになり、3D表面図により、3匹すべての(−/−)マウスにおいて肩甲骨の肥厚が明らかになった。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した平均総体脂肪ならびに増大した骨無機質密度測定値および海綿質関連測定値および大腿中軸皮質厚さおよび断面積を示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO7476ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。増加した骨塩量ならびに全身および大腿骨中無機質密度と関連する表現型は、このような効果を模倣する薬剤(例えば、PRO1779ポリペプチドのアンタゴニスト)は、骨治癒に有用であり得ることを示す。また、雌変異型該(−/−)マウスは、肥満の表現型を示す増大した平均体脂肪パーセンテージおよび増大したトリグリセリドレベルも示した。これらの観察結果は、PRO7476ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失した変異型マウスでは、脂肪の蓄積と関連する代謝障害だけでなく、肥満と関連し得る一般代謝障害を反映する異常な骨測定値が誘導されることを示唆する。したがって、PRO7476ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満などの障害または他の代謝病の処置または予防に有用であり得る。
CAT−スキャンの結果により、ノックアウトマウスについて異常な骨表現型を反映する頭蓋および顔面の構造の変形が示された。
70.60.DNA111030(UNQ3026)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO9824ポリペプチド(DNA111030で指定される)をコードする遺伝子(UNQ3026)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_172833ハツカマウス粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1(Malt1)に対応する;タンパク質参照:Q8BFT0 ACCESSION:Q8BFT0NID:ハツカマウス(マウス)。粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1と類似;ヒト遺伝子配列参照:NM_006785ホモサピエンス粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1(MALT1)、転写物バリアント1;ヒトタンパク質配列は、参照:Q9UDY8 ACCESSION:Q9UDY8NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転移タンパク質1(EC3.4.22.−)(MALT−リンパ腫関連転座)(パラカスパーゼ)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトMALT1のオーソログであるMalt1(粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1)である。別名としては、A630046N12、D430033E09Rik、パラカスパーゼ、MLT、MLT1、DKFZp434L132、カスパーゼ様タンパク質、MALT関連転座およびMALT−リンパ腫関連転座がある。
MALT1は、B−およびT−リンパ球上の細胞−表面抗原受容体による核性因子(NF)−κBの活性化に関与する。タンパク質は、デスドメイン(Pfam受託PF00531)、2つの免疫グロブリンドメイン(Pfam受託PF00047)およびカスパーゼドメイン(Pfam受託PF00656)からなる。MALT1のカスパーゼドメインは、プロテアーゼ活性とNF−κBの活性化とに重要な保存されたシステイン残基およびジスチジン残基を含む。しかしながら、MALT1プロテアーゼ活性は、検出されていない(Urenら,Mol Cell 6(4):961−7(2000);Lucasら,J Cell Sci 117(Pt1:31−9(2004))。MALT1は、おそらく、ユビキチンリガーゼ(Zhouら,Nature 427(6970):167−71(2004))またはユビキチンリガーゼTRAF6のオリゴマー化および活性化を促進するアダプタータンパク質(Sunら,Mol Cell 14(3):289−301(2004))としての機能を果たしている。NF−κB必須モジュレーター(NEMO)(これは、IκBキナーゼ複合体の調節性サブユニットである)のポリユビキチン化により、IκBキナーゼおよびNF−κBの連続した活性化がもたらされる。MALT1は、成熟B−およびT−リンパ球の活性化および増殖に重要な役割を果たす。MALT1遺伝子の転座は、粘膜結合リンパ系組織のB−細胞リンパ腫の形成と関連している(Lucasら,J Cell Sci 117(Pt1):31−9(2004);Thome,Nat Rev Immunol 4(5):348−59(2004))。
Ruefli−Brasseおよび共働者;Science 302(5650):1581−4(2003)により、MALT1欠損マウスを用いて、リンパ球の活性化および発生におけるMALT1の役割が調査された。彼らにより、MALT1ホモ接合体ヌルマウス由来のT−およびB−リンパ球は、抗原受容体誘導型NF−κB活性化、サイトカイン生成および増殖の欠陥を示すことが示された。彼らは、MALT1がIκBキナーゼ複合体を、これと直接会合することにより、またはIκBキナーゼ活性化に必要とされる他のタンパク質を漸増させることにより活性化すると結論付けた。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=4.59有意性=0.100761384(hom/n)=0.19平均同腹仔サイズ=7
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託NM_172833.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.60.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA111030(UNQ3026)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1(MALT1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、全般性炎症および免疫学的異常が(−/−)マウスにおいてもたらされた。ホモ接合体変異型マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、免疫学的異常ならびに急性および慢性の全般性炎症を示した。また、雄(−/−)マウスは、増大した平均容量分析的骨中無機質密度および平均総骨無機質密度ならびに増大した平均大腿中軸断面積および低減された皮質厚さを示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学:
微視的観察結果:(−/−)マウスは、骨格筋、腎臓、膀胱、消化器系および上気道において急性および慢性の全般性炎症を示した。最も重症な病変は、雌変異型(F−147)において発生したびまん性化膿性髄膜炎であった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
このような疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なうことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこのような改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置し得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用できる。
下記の試験を行なった。
蛍光標示式細胞分取(FACS)解析
手順:CD4、CD8およびT細胞受容体を含む末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を行ない、Tリンパ球、Bリンパ球のCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞のpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合体マウスにおいて行ない、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含めた。
これらの試験では、解析した細胞は、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。フローサイトメトリーは、単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞ならびに単球の相対割合が決定されるように設計した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS機を用いて、免疫状態を評価した。表現型分類アッセイおよびスクリーニングのため、この機械にて、CD4+/CD8+比に加え、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6つの連鎖特異的抗体:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCのパネルを用い、各マウス由来の溶解末梢血の単一の試料を染色することにより誘導した。2つのFITC標識抗体およびPE標識抗体は、互いに排他的な細胞型を染色する。試料を、CellQuestソフトウエアを使用し、Becton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを用いて解析した。
結果:
(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較すると、胸腺において低減されたCD4/CD8DP細胞パーセンテージおよび増大したTCRB+細胞パーセンテージを示した。(−/−)マウスはまた、(+/+)マウスと比較して、脾臓において低減されたCD21hi/CD23med B細胞を示した。したがって、(−/−)マウスは、胸腺における低減されたT細胞レベルおよび脾臓における低減されたB細胞の子孫細胞を示す。
急性期応答:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのため、急性期応答および全身性炎症の強力な誘導因子である。レベルI LPSマウスに、亜致死量用量のLPS(200μLの滅菌生理食塩水)を、26ゲージ針を用いて腹腔内(i.p.)注射した。用量は、試験したマウスの平均重量を基準にし、注射の3時間後に1μg/g体重とした。次いで、100ulの血液試料を採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在についてFACSCalibur装置にて解析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、LPS攻撃に対する増大した平均血清TNF−αおよびIL−6応答を示した。
要約すると、LPS内毒素攻撃は、PRO9824ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較すると、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異型マウスは、LPS内毒素で攻撃すると炎症誘発性応答を示す免疫学的応答を誘発する増大した能力(TNF−αおよびIL−6産生)を示した。TNF−αおよびIL−6は、B細胞活性化の後期段階に寄与する。TNF−αは重要な炎症メディエーターである。また、TNF−αおよびIL−6はともに、急性期応答および全身性炎症の誘発に重要な役割を果たす。TNF−αは、マクロファージ活性化における膜結合型シグナルに代用され得る(したがって、エフェクター分子としての機能を果たす)。
卵白アルブミン攻撃
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行なった。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分キャラクタライズされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出し得、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
上記のように、このプロトコルでは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力が評価される。動物に50mgのニワトリ卵白アルブミン(完全フロイントアジュバント中に乳化)をIP注射し、14日後に、抗卵白アルブミン抗体(IgM、IgG1およびIgG2サブクラス)の血清力価を測定した。血清試料中のOVA特異的抗体の量は、96ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度(OD)値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。
この攻撃の結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、卵白アルブミン攻撃に対する低減された平均血清IgG1およびIgG2a応答を示した。
要約すると、卵白アルブミン攻撃試験は、PRO9824ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較すると、免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異型マウスは、T細胞依存性OVA抗原で攻撃すると、免疫学的応答を生じる能力の低下を示した。したがって、PRO9824ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫系の刺激(例えば、T細胞増殖など)に有用であり得、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得る。したがって、PRO9824ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は免疫応答の阻害に有用であり得、このため、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した好中球、リンパ球、単球および好塩基球の絶対計数を特徴とする増大した平均総白血球計数を示した。
要約すると、血液学検査結果は、ホモ接合体変異型マウスが、その(+/+)同腹仔対照と比較して、マクロファージ前駆体レベルの上昇を示す増大した白血球計数を示したことを示す。これらの結果は、ホモ接合体(−/−)ノックアウトマウスが異常な免疫学的表現型を示すことを示す。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
結果:
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクト内の(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、低減された平均血清IgM、IgA、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルを示した。
変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、低減されたIgM、IgAおよびIgG3血清免疫グロブリンのレベルを示した。IgM免疫グロブリンは、まず、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において生成され、補体系の活性化に特に重要である。同様に、IgG免疫グロブリンは中和効果を有し、程度は低いが、補体系の活性化に重要である。IgAは、主に上皮細胞保護因子としての機能を果たし、細菌毒素およびウイルスを中和し得る。選択的IgA欠損は、関連する明瞭な疾患感受性はないが、一般集団よりも慢性肺疾患を有する人々によく見られる。これは、IgAの欠損が、種々の病原体による肺感染症に対する素因をもたらし得ることを示し、体表面での防御におけるIgAの役割と整合する。この場合、ノックアウトマウスで観察された表現型では増大したIgA血清レベルがもたらされ、PRO9824ポリペプチドまたはそのアゴニストが、皮膚感染症に対する自然免疫保護に有用であり得、より重要なことには、肺感染症に対する易感染性を予防し得ることを示す。IgG3、IgG2aおよびIgG2b免疫グロブリンは中和効果を有し、程度は低いが、補体系の活性化に重要である。観察された表現型は、PRO9824ポリペプチドが炎症性応答の調節因子であることを示す。これらの免疫学的異常は、PRO9824ポリペプチドまたはそのアゴニストが免疫系を刺激(例えば、T細胞増殖など)し得る有用な薬剤であり得ること、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得ることを示す。したがって、PRO9824ポリペプチドアンタゴニストまたはインヒビターは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(d)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均容量分析的骨中無機質密度および全身骨無機質密度を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均大腿中軸断面積を示した。
要約すると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した容量分析的骨中無機質密度および骨無機質密度ならびに大腿中軸断面積を示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO9824ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方において、PRO9824ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であり得る。
70.61.DNA148004−2882(UNQ5923)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO19814ポリペプチド(DNA148004−2882で指定される)をコードする遺伝子(UNQ5923)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:IRRE様3(Drosophila)のNM_026324ハツカマウスkin(Kirrel3)に対応する;タンパク質参照:Q810H3 ACCESSION:Q810H3NID:ハツカマウス(マウス)。膜タンパク質mKirre;ヒト遺伝子配列参照:IRRE様3(Drosophila)のNM_032531ホモサピエンスkin(KIRREL3);ヒトタンパク質配列は、参照:Q8IZU9 ACCESSION:Q8IZU9NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。NPEH2。
対象のマウス遺伝子は、ヒトKIRREL3のオーソログであるKirrel3 (IRRE様3[Drosophila]のkin)である。別名としては、SST4、NEPH2、mKirre、mKIAA1867、1500010O20Rik、膜タンパク質mKirre、IRRE様3(Drosophila)のX kin、KIRREおよびKIAA1867がある。
KIRREL3はI型原形質膜タンパク質であり、おそらく、細胞接着分子またはシグナル伝達分子としての機能を果たしている。タンパク質は、シグナルペプチド、5つの免疫グロブリン様ドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞質C末端ドメインからなる。3つのすべてのKIRRELファミリーメンバーの細胞質ドメインはGrb2 SH2結合部位およびPDZK1結合部位を含み、これは、KIRREL3が受容体としての機能を果たすことを示す(Sellinら,FASEB J 17(1):115−7(2003))。骨髄間質細胞上のKIRREL3の細胞外ドメインは、マトリックスメタロプロテイナーゼによって切断され、おそらく、造血性幹細胞分化を阻害するリガンドとして、または造血性幹細胞の遊走を制御するホーミング受容体としての機能を果たし得る(Uenoら,Nat Immunol 4(5):457−63(2003))。
KIRREL3は、いくつかの異なる組織および細胞型、例えば、脳、心臓、神経系、腎臓、腎臓の糸球体、腎臓の糸球体有足細胞細胞株、骨髄間質細胞、および肺癌細胞株において発現される。骨および造血に関与している他の組織では、KIRREL3は、おそらく、造血性幹細胞の支持にある役割を果たしている。腎臓では、KIRREL3は、糸球体濾過にある役割を果たしている可能性がある(Sellinら,FASEB J 17(1):115−7(2003);Uenoら,Nat Immunol 4(5):457−63(2003))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.57有意性=0.7520143(hom/n)=0.23平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン5を標的化した(NCBI受託NM_026324.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち肝臓以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.61.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA148004−2882(UNQ5923)について
(a)全般的な表現型の概要:
IRRE様3(Drosophila)のヒトkinのオーソログをコードする遺伝子(KIRREL3)の変異により、低減された血清インスリンが雄(−/−)マウスにおいてもたらされた。雄および雌両方のノックアウトマウスが増大した総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪含量ならびに増大した血中トリグリセリドレベルを示した。雄(−/−)マウスは、低減された平均脊椎骨中無機質密度ならびに低減された平均脊椎骨海綿質の体積、数、厚さおよび結合密度を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清トリグリセリドおよびコレステロールレベルの著しい増加を示した。
したがって、PRO19814コード遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患、特に、脂質代謝異常と関連する疾患の処置のモデルとしての役割を果たし得る。PRO19814ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、血中脂質の調節、特に、トリグリセリドおよびコレステロールの正常レベルの維持に有用であり得る。したがって、PRO19814ポリペプチドは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患などの心血管疾患、脂質代謝異常、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症および/または肥満もしくは糖尿病の処置に有用であり得る。
(c)血中化学成分
血中化学成分解析は、COBAS Integra 400(Roche製)を使用し、マウスにおいて血中化学成分試験を行なうためのその臨床状況において行なった。
インスリンデータ:
試験の説明:Lexicon Geneticsにて、マウスにおいて定量的インスリンアッセイを行なうためのその臨床状況において、Cobra II Series Auto−Gamma Counting Systemを使用する。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清インスリンレベルを示した。
PRO19814ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失した変異型(−/−)マウスは、脂質代謝異常と一致する表現型を示す。インスリンレベルは減少し、これは、糖尿病を示し得る。したがって、PRO19814ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの代謝効果を模倣し得る。他方において、PRO19814ポリペプチドまたはそのアゴニストは、糖尿病などの代謝障害の予防および/または処置に有用であり得る。
(d)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
DEXA:雄および雌両方の(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪含量ならびに低減された平均脊椎骨中無機質密度を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均脊椎骨海綿質の体積、数、厚さおよび結合密度を示した。
DEXAおよび骨microCT解析によって解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、異常な骨障害を示唆する低減された骨測定値を示した。しかしながら、変異型該(−/−)マウスはまた、特に、コレステロールおよびトリグリセリドの両方の血清レベルの上昇を示す血中化学成分解析を考慮すると肥満の表現型を示す増大したボディー・マス測定値および増大した平均体脂肪パーセンテージも示した。このような観察結果は、PRO19814ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失した変異型マウスでは、脂肪の蓄積と関連する代謝障害だけでなく、肥満と関連し得る一般代謝障害を反映する異常な骨測定値が誘導されることを示す。したがって、PRO19814ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満などの障害または他の代謝病の処置または予防に有用であり得る。しかしながら、この負の骨表現型はまた、PRO19814ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨恒常性の維持に有用であり得ることを示し得る。また、PRO19814ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO19814ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
70.62.DNA144839(UNQ5930)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO19836ポリペプチド(DNA144839で指定される)をコードする遺伝子(UNQ5930)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_018776 ACCESSION:NM_018776NID:gi9055199 refNM_018776.1ハツカマウスサイトカイン受容体様因子3(Crlf3)に対応する;タンパク質参照:Q9Z2L7 ACCESSION:Q9Z2L7NID:ハツカマウス(マウス)。CYTOKINE RECEPTOR RELATED PROTEIN4;ヒト遺伝子配列参照:NM_015986ホモサピエンスサイトカイン受容体様因子3(CRLF3);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9Y6M8 ACCESSION:Q9Y6M8NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。サイトカイン受容体関連タンパク質4。
対象のマウス遺伝子は、ヒトCRLF3のオーソログであるCrlf3(サイトカイン受容体様因子3)である。別名としては、Crlf2、Creme9、Cytor4、MGC20661、サイトカイン受容体様因子2、サイトカイン受容体様分子9、およびサイトカイン受容体関連タンパク質4がある。
CRLF3は仮想非分泌タンパク質であり、単一のフィブロネクチン3型ドメイン(SMART受託SM00060)を含む。CRLF3の機能は未知である。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.57有意性=0.7520143(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=6
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン3〜6を標的化した(NCBI受託NM_018776.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち腎臓および脂肪以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.62.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA144839(UNQ5930)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトサイトカイン受容体様因子3(CRLF3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける低減された血小板ならびに増大した平均血清IgMおよびIgG2aレベルがもたらされた。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なわれ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置され得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用され得る。
下記の試験を行なった。
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血小板計数(17.9%減少)を示した。
したがって、DNA144839遺伝子が欠失した変異型マウスにより、凝固障害と関連する表現型がもたらされた。これと関連して、PRO19836ポリペプチドまたはそのアゴニストは、異常な血液凝固と関連する障害(例えば、血友病など)の処置に有用であり得る。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
結果:
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクト内の(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、増大した平均血清IgMおよびIgG2aレベルを示した。
変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、IgMおよびIgG2a血清免疫グロブリンの上昇を示した。IgM免疫グロブリンは、まず、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において生成され、補体系の活性化に特に重要である。同様に、IgG2a免疫グロブリンも中和効果を有し、程度は低いが、補体系の活性化に重要である。観察された表現型は、PRO19836ポリペプチドが炎症性応答の負の調節因子であることを示す。これらの免疫学的異常は、PRO19836ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が免疫系を刺激(例えば、T細胞増殖など)し得る重要な薬剤であり得、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得ることを示す。したがって、PRO19836ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
70.63.DNA150157−2898(UNQ6077)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO20088ポリペプチド(DNA150157−2898で指定される)をコードする遺伝子(UNQ6077)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_177389ハツカマウス黒色腫阻害活性3(Mia3)に対応する;タンパク質参照:Q8BI84 ACCESSION:Q8BI84NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス成体網膜cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:A930039G15産物:NPIP−LIKE PROTEINと弱く類似する;ヒト遺伝子配列参照:XM_496436 PREDICTED:ホモサピエンスRIKEN cDNA A930039G15遺伝子(LOC440718)と類似する;ヒトタンパク質配列は、参照:XP_496436 PREDICTEDに対応する:RIKEN cDNA A930039G15遺伝子[ホモサピエンス]と類似する。
対象のマウス遺伝子は、ヒトUNQ6077のオーソログであるMia3(黒色腫阻害活性3)である。別名としては、Tango、A930039G15RikおよびAAAP6077がある。
ヒトUNQ6077およびマウスオーソログMiaは、おそらく、大きなタンパク質をコードしている遺伝子である。しかしながら、これらの遺伝子に対する現時点の推測では依然として不明瞭である。ヒトUNQ6077は、約2000アミノ酸のタンパク質をコードするようである。仮想タンパク質は、シグナルペプチド、src相同性3ドメイン、および約700アミノ酸の潜在的C末端保存ドメインを含有する。このC末端領域は、保存ドメイン有糸分裂チェックポイントタンパク質(Pfam受託PF05557;E値=0.04)、ビシリンN末端領域(Pfam受託PF04702;E値=0.06)、TolAタンパク質(Pfam受託PF06519;E値=0.07)およびミオシンテイル(Pfam受託PF01576;E値=0.01)と弱い類似性を示す。マウスMia3は、シグナルペプチド、src相同性3ドメイン、不明瞭な保存ドメインおよびC末端膜貫通セグメントからなる仮想1239アミノ酸タンパク質をコードする。不明瞭な保存ドメインは、トリプシン−αアミラーゼインヒビタードメイン(SMART受託SM00499)およびメニンドメイン(PFAM受託PF05053)のN末端部分と類似する。ヒトおよびマウス両方の仮想タンパク質の予測される細胞の局在は不明瞭である。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスが該キメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=21.46有意性=2.1878644E−5(hom/n)=0.06平均同腹仔サイズ=5
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン2および3を標的化した(NCBI受託NM_177389.2)。UNQ6077欠失はエキソン2の3’の11ヌクレオチドから始まり、エキソン3と4との間のイントロン内の10ヌクレオチドで終結する。エキソン4はなおUNQ6077(−/−)において転写される。ヒトTANGO遺伝子の解析およびRT−PCRは、おそらく、選択的3’転写物が存在していることを示す。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.63.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA150157−2898(UNQ6077)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトUNQ6077のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)変異型の致死がもたらされた。UNQ6077ホモ接合体ノックアウト(−/−)マウスは、野生型(+/+)マウスと比較して、胚発生中(E18.5)に欠陥性骨形成を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
致死の胚の発達異常に関する論考:
ノックアウトマウスにおける胚致死は、通常、種々の重症な発生上の問題、例えば、限定されないが、神経変性疾患、血管形成障害、炎症性疾患、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスに重要な役割を有する場合に起因する。また、胚致死は潜在的癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異型動物は、表現型および/またはノックアウト遺伝子の機能に関して高度に情報提供的な手がかりを示す病理学報告を示す場合、特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性であったが、胚に関する病態報告では、RBCの顕著な減損は示されなかった。
(b)病態
微視的観察結果:45個の胚を第12.5日に観察した:5個の(−/−)胚、14個の(+/−)胚、10個の(+/+)胚、および16個の吸収奇胎(resorption mole)。16個の吸収奇胎のうち、7個は単一の雌由来であった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)UNQ6077胚致死のさらなる解析
UNQ6077ヘテロ接合体マウス間の異種交配を時限的交配(timed mating)として設定し、ホモ接合体変異型の子を作製した。子は、18.5日胚のときに帝王切開によって取り出した。骨格調製物を、Sollowayら,Dev Genet 22:321−339(1998)に従って作製した。簡単には、E18.5胚をドライアイス床上で安楽死させ、内器官全摘出を行ない、皮膚を剥いだ。100%エタノール、その後アセトン中で一晩脱水させた後、胚を2日間、0.06%アルシアンブルー、0.02%アリザリンレッド、5%氷酢酸および60%エタノールを含む溶液中で染色した。染色された胚を、続いて、1%水酸化カリウムを2回交換して数日間かけて清澄化し、水酸化カリウム/グリセロール系に通して移し、最後に、保存および写真撮影用の80%グリセロール中に入れた。
結果:
UNQ6077ホモ接合体ノックアウト(−/−)マウスは、野生型(+/+)マウスと比較して、胚発生中(E18.5)に欠陥性骨形成を示した。骨格調製物(前述)は、E18.5(−/−)の子において骨特異的染色物質によって示されるように、(−/−)胚の子において広範な欠陥性骨形成を示した。3種類の異なる型の骨形成が、その発生において欠陥性であることが示された。具体的には、野生型(+/+)の子(E18.5)の同じ3つの型の骨と比較すると、皮骨は完全に存在しないことがわかり、軟骨膜骨は、完全に存在しないか、または重篤に障害されているかのいずれかであり、軟骨内性骨は強く障害されていた。
これらの試験は、PRO20088ポリペプチドをコードするUNQ6077が、正常な骨発生に不可欠であることを示す。PRO20088ポリペプチドまたはそのアゴニストは、胚発生中での正常な骨発生の促進に不可欠である。骨転形は動的プロセスであり、おそらく、PRO20088ポリペプチドは、正常な骨代謝の維持に重要であり得、骨粗鬆症などの骨障害の処置に有用であり得る。UNQ6077のアンタゴニスト(インヒビター)は、ノックアウト(−/−)の子で観察された負の骨表現型を模倣し得る。
70.64.DNA295801(UNQ9659)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO70789ポリペプチド(DNA295801で指定される)をコードする遺伝子(UNQ9659)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AK033906 ACCESSION:AK033906NID:gi26083649 dbj AK033906.1ハツカマウス成体雄間脳cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリに対応する、クローン:9330112P04産物仮想タンパク質、完全挿入配列;タンパク質参照:Q9CTN8 ACCESSION:Q9CTN8NID:ハツカマウス(マウス)。A930031L14Rikタンパク質(断片);ヒト遺伝子配列参照:NM_199000ホモサピエンス脂肪腫HMGIC融合パートナー様3(LHFPL3);ヒトタンパク質配列は、参照:Q86UP9 ACCESSION:Q86UP9NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。脂肪腫HMGIC融合パートナー様タンパク質。
対象のマウス遺伝子は、ヒトLHFPL3(脂肪腫HMGIC融合パートナー様3)のオーソログであるRIKEN cDNA A930031L14遺伝子である。
LHFPL3はおそらく原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチドおよび3回膜貫通セグメントを含む。LHFPL3は、ヒト脂肪腫におけるHMGIC遺伝子の融合パートナーである脂肪腫HMGIC融合パートナー(LHFP)を含む遺伝子のファミリーに属する(Petitら,Genomics 57(3):438−41(1999))。LHFPL3の機能は未知である。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.41有意性=0.8146473(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=0
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託AK020916.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目および腎臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.64.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA295801(UNQ9659)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト脂肪腫HMGIC融合パートナー様3(LHFPL3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された平均皮膚線維芽細胞増殖速度が(−/−)マウスにおいてもたらされた。変異型(−/−)マウスはまた、日周期リズムの顕著化を示した。雌(−/−)マウスは増大した平均全身骨無機質密度を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)成体皮膚細胞増殖:
手順:皮膚細胞を16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体マウス)から分離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発展させ、線維芽細胞増殖速度を、厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイで過剰増殖性および低増殖性の表現型を検出できる能力を、p53およびKu80を用いて示した。増殖は、Brdu取り込みを用いて測定した。
具体的には、これらの試験において皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化した培養物中の細胞数の増加を、相対増殖能の尺度として用いた。初代線維芽細胞を、野生型および変異型マウスから採取した皮膚生検材料から確立した。50000個の細胞の2連または3連の培養物をプレーティングし、6日間増殖させた。培養期間の終わりに、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数装置を用いて測定した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の低下を示した。
したがって、ホモ接合体変異型マウスは、低増殖性表現型を示した。このような観察結果から示されるように、PRO70789ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、この低増殖性表現型を模倣し得、腫瘍サプレッサーとしての機能を果たし得、異常な細胞増殖の低減に有用であり得る。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
手順:
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。
日周期試験の説明:
雌マウスを、試験の第1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウエアにより、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断は自動的に移動回数に分けられる。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータを、3日間の試験期間における各時間で記録したメジアン活動性レベル(日周期リズム)および各明/暗サイクル中のメジアン総活動性(自発活動)によって示す。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、ホームケージ活動性試験の12時間馴化期間中、日周期リズムの顕著化(増大した歩行回数)を示した。このような所見は、変異型(−/−)マウスにおける増大した多動性または不安表現型を示す。PRO70789ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、この神経学的表現型を模倣することが期待され得る。一方、PRO70789ポリペプチドまたはそのアゴニストは、軽度〜中等度の不安、全般性不安障害、心的外傷後ストレス障害、強迫性障害または双極性障害などの神経障害の処置に有用であり得る。
(d)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均全身骨無機質密度を示した。
要約すると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した全身骨無機質密度を示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO70789ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方において、PRO70789ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であり得る。
70.65.DNA255219(UNQ11632)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO50298ポリペプチド(DNA255219で指定される)をコードする遺伝子(UNQ11632)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_145580 ACCESSION:NM_145580NID:gi21704165 refNM_145580.1ハツカマウス発現配列AW553050(AW553050)に対応する;タンパク質参照:Q8VE58 ACCESSION:Q8VE58NID:ハツカマウス(マウス)。仮想タンパク質FLJ22573と類似;ヒト遺伝子配列参照:NM_024660 ACCESSION:NM_024660NID:gi13375912 refNM_024660.1ホモサピエンス仮想タンパク質FLJ22573(FLJ22573);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H665 ACCESSION:Q9H665NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。仮想タンパク質FLJ22573。
対象のマウス遺伝子は、ヒト仮想タンパク質FLJ22573(FLJ22573)のオーソログである仮想タンパク質MGC30332(MGC30332)である。
FLJ22573は仮想I型原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、細胞外ドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞質ドメインからなる。現時点では、その機能は未知である。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.75有意性=0.6872893(hom/n)=0.23平均同腹仔サイズ=0
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_145580.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、胸腺、脾臓および腎臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.65.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA255219(UNQ11632)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減されたmicroCT骨関連測定値がもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
MicroCT:雄(−/−)ノックアウト体は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された小柱の数および結合密度を示した。
骨microCT解析によって解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、異常な骨障害を示す低減された骨測定値を示した。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値の異常および減少を伴う負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO50298ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨恒常性の維持に有用であり得ることを示す。また、PRO50298ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO50298ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
70.66.DNA256561(UNQ12179)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO51592ポリペプチド(DNA256561で指定される)をコードする遺伝子(UNQ12179)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_019465 ACCESSION:NM_019465NID:9506516ハツカマウスハツカマウス細胞傷害性および調節性T細胞分子(Crtam)に対応する;タンパク質参照:Q9Z151 ACCESSION:Q9Z151NID:ハツカマウス(マウス)。クラスI MHC拘束T細胞結合分子;ヒト遺伝子配列参照:NM_019604ホモサピエンスクラスI MHC拘束T細胞結合分子(CRTAM);ヒトタンパク質配列は、参照:O95727 ACCESSION:O95727NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。クラスI MHC拘束T細胞結合分子。
対象のマウス遺伝子は、ヒトCRTAM(クラスI MHC拘束T細胞結合分子)のオーソログであるCrtam(細胞傷害性および調節性T細胞分子)である。別名としては、クラスI拘束T細胞結合分子がある。
CRTAMは、T細胞において発現されるI型原形質膜タンパク質であり、おそらく受容体または細胞接着分子としての機能を果たしている。タンパク質は、シグナルペプチド、免疫グロブリン様ドメイン(Pfam受託PF00047)、膜貫通セグメントおよび細胞質C末端からなる。CRTAMは、おそらく、免疫機能にある役割を果たしている(Kennedyら、 J Leukoc Biol 67(5):725−34(2000);Du Pasquierら,C R Biol 327(6):591−601(2004))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.52有意性=0.7710516(hom/n)=0.25平均同腹仔サイズ=8
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託NM_019465.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち胸腺、脾臓ならびに胃、小腸および結腸において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.66.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA256561(UNQ12179)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトクラスI MHC拘束T細胞結合分子(CRTAM)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、胸腺T細胞リンパ腫が1匹の(−/−)マウスにおいてもたらされた。また、数匹のヘテロ接合体(+/−)およびホモ接合体(−/−)マウスは、種々の重篤度の白内障を示した。また、改善されたグルコース耐性が(−/−)マウスにおいて認められた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学:
微視的観察結果:検査した6匹の(−/−)マウスのうち、1匹は胸腺内にリンパ球性悪性リンパ腫を示し、これは、胸腺皮質を削り、縦隔および肺内に局所浸潤していた。リンパ節および脾臓は、罹患マウスにおいて新生物細胞について陰性であった。このT細胞リンパ腫は(−/−)マウスの1/6にのみ存在したが、これはこの歳のマウスには稀な腫瘍であり、遺伝子関連性である可能性が非常に高い。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)心臓血管の表現型解析:
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行ない、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のために潜在的標的を同定した。かかる表現型試験では、眼底写真撮影および血管造影を含め、種々の目の異常の徴候を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に相当する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。かかる目の異常としては、限定されないが、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシスが挙げられ得る。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、覚醒時の動物において、Kowa Genesis小動物用眼底カメラをHawesおよびcoauthors(Hawesら,1999 Molecular Vision 1999;5:22)に従って改造して用いて行なった。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得を可能にした。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の画像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能であった。また、目について動静脈(A/V)比を測定した。
眼科学的解析は、作製したF2匹の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行なった。具体的には、A/V比は、眼底像に従ってKowa C0MIT+ソフトウエアを用いて測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔からカラー写真を撮影する:画像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比(A/V)は、静脈直径に対する動脈直径(血管の分岐部の前で測定)の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性(色素性網膜炎として知られる)もしくは網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異型子孫において、野生型(+/+)同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、かかる病理状態を示すものであり得る。
結果:
眼底:解析した(−/−)および(+/−)マウスのうち、数匹のマウスは、種々の重篤度の白内障を示した。
要約すると、DNA256561(UNQ12179)と同定された、PRO51592ポリペプチドをコードする遺伝子をノックアウトすることにより、ホモ接合体変異型子孫は、白内障形成および/または他の眼科学的障害と関連する表現型を示す。検出されたかかる眼科学的変化は、心臓血管の全身疾患と関連して最もよく見られる。特に、白内障形成は、血液凝固カスケードの撹乱と関係する心臓血管の合併症を示し得る。白内障はまた、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、13〜15トリソミー状態、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、甲状腺機能低下症、コンラーディ症候群などの全身疾患と関連している。したがって、PRO51592コード遺伝子のアンタゴニストは、同様の病理的変化をもたらし得、一方、アゴニストは、白内障形成および/または根本的な心血管疾患もしくは眼科学的障害の予防において治療剤として有用であり得る。
(d)表現型解析:代謝−血中化学成分/グルコース耐性
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。血中化学成分の表現型解析としては、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するグルコース耐性試験が挙げられる。異常なグルコース耐性試験の結果、以下の障害または状態:1型および2型糖尿病、X症候群、種々の心血管疾患および/または肥満を示すものであり得るが、これらに限定され得ない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて使用した。グルコース耐性試験は、哺乳動物における減損したグルコース恒常性を規定するための標準である。グルコース耐性試験は、Lifescan社のグルコメーターを用いて行なった。動物に、20%溶液として送達されるD−グルコースを2g/kgでIP注射し、血糖レベルを、注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
グルコース耐性試験:試験した雄変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大したグルコース耐性を示した。
これらの試験において、変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、試験した3つのすべての時間枠で、通常の空腹時グルコースの存在下においてグルコース耐性の増加または増大を示した。また、高インスリン血症は、(−/−)マウスにおいて顕性でなかった。したがって、ノックアウトマウスは、増大したインスリン感受性または減損したグルコース恒常性と反対の表現型パターンを示した。
(e)さらなる試験
UNQ12179は、リンパ節において免疫細胞の組織選択的輸送に関与しているようである。エフェクター/記憶CD4T細胞の過剰増殖が、TcR刺激(抗CD3+抗CD28)後のノックアウト動物において起こる。
70.67.DNA76398−1699(UNQ830)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1757ポリペプチド(DNA76398−1699で指定される)をコードする遺伝子(UNQ830)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AK014261ハツカマウス13日胚頭部cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリに対応する、クローン:3110079O15産物仮想タンパク質、完全挿入配列;タンパク質参照:Q9CXL7 ACCESSION:Q9CXL7NID:ハツカマウス(マウス)。3110079O15Rikタンパク質;ヒト遺伝子配列参照:NM_206895ホモサピエンスASCL830(UNQ830);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UX34 ACCESSION:Q6UX34NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。ASCL830。
対象のマウス遺伝子は、ヒトASCL830(UNQ830)のオーソログであるRIKEN cDNA 3110079O15遺伝子である。ASCL830は、おそらくI型原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、細胞外ドメイン、膜貫通セグメントおよび短鎖C末端ドメインからなる。このタンパク質の機能は未知である。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=15.11有意性=5.2348623E−4(hom/n)=0.1平均同腹仔サイズ=6
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン2および3を標的化した(NCBI受託AK014261.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳および脊髄においてのみ検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.67.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA76398−1699(UNQ830)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)変異型の生存性低下がもたらされた。生き残った雄(−/−)マウスは、低減された血清トリグリセリドおよびコレステロールレベルならびに低減された血清グルコースレベルを示した。生き残った雌(−/−)マウスは、ホームケージ活動性試験中、低減された活動性を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病態
微視的観察結果:妊娠18日目の4個の(−/−)胚、11個の(+/−)胚および3個の(+/+)胚の合計18個の胚の検査。4個の(−/−)胚および2個の(+/+)胚の組織学的検査により、顕著な差は示されなかった。ホモ接合体のメンデル数は18.5日胚に存在し、組織学的に正常に見える。しかしながら、第6週目では、ホモ接合体の予想値の3分の1しか生存していない。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
手順:
行動のスクリーニングを、野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。
日周期試験の説明:
雌マウスを、試験の第1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウエアにより、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断は自動的に移動回数に分けられる。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータを、3日間の試験期間における各時間で記録したメジアン活動性レベル(日周期リズム)および各明/暗サイクル中のメジアン総活動性(自発活動)によって示す。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、ホームケージ活動性試験の12時間馴化期間中、低減されたメジアン歩行回数を示した。また、オープンフィールド試験における低減された直立がホモ接合体で観察された。両方の観察結果は(−/−)マウスにおける低運動を示す。
これらの結果は、(−/−)マウスにおける顕著な低い自発活動を示し、無気力(lethargy)または抑鬱障害と一致する。PRO1757ポリペプチドまたはPRO1757コード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、この挙動を模倣することが期待され得る。同様に、PRO1757ポリペプチドまたはそのアゴニストは、かかる神経障害、例えば、抑鬱障害または他の減少された不安様症状(例えば、無気力、認知障害、痛覚過敏および感覚障害など)の処置に有用であり得る。
(d)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清トリグリセリドおよびコレステロールレベルの著しい減少を示した。
したがって、PRO1757コード遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患、特に、脂質代謝異常と関連する疾患の処置のモデルとしての役割を果たし得る。PRO1757ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、血中脂質の調節、特に、トリグリセリドの正常レベルの維持に有用であり得る。
(e)表現型解析:代謝−血中化学成分
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清グルコースレベルを示した。
70.68.DNA96879−2619(UNQ1938)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4421ポリペプチド(DNA96879−2619で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1938)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_029612 ACCESSION:NM_029612NID:20514783ハツカマウスハツカマウスCD2抗原ファミリー,メンバー10(Cd2f10懸垂(−pending))に対応する;タンパク質参照:Q9D780 ACCESSION:Q9D780NID:ハツカマウス(マウス)。2310026I04RIK PROTEIN;ヒト遺伝子配列参照:NM_033438 ACCESSION:NM_033438NID:15559204ホモサピエンスホモサピエンスCD84−H1前駆体(CD84−H1);ヒトタンパク質配列は、参照:Q96A28 ACCESSION:Q96A28NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。CD84−H1(CD2 FAMILY10)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトSLAMF9オーソログであるSlamf9(SLAMファミリーメンバー9)である。別名としては、Cd2f10、SF2001、CD2F−10、CD84−H1、2310026I04Rik、PRO4421およびCD2抗原ファミリーメンバー10がある。SLAMF9は内在性原形質膜タンパク質であり、おそらく、接着分子または受容体としての機能を果たしている。タンパク質は、シグナルペプチド、細胞外Ig様ドメイン、膜貫通セグメントおよび短鎖細胞質C末端からなる。SLAMF9は、CD2ファミリーメンバーの類縁体であり、リンパ球活性化または接着の補助受容体としての機能を果たす。SLAMF9は、脾臓、肺、精巣およびマクロファージ細胞株において発現されるが、末梢血白血球では発現されない(Fennellyら,Immuno genetics 53(7):599−602(2001))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=4.48有意性=0.1064585(hom/n)=0.2平均同腹仔サイズ=7
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_029612.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.68.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA96879−2619(UNQ1938)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトSLAMファミリーメンバー9(SLAMF9)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪パーセンテージおよび脂肪マス(g)がホモ接合体(−/−)においてもたらされた。また、(−/−)マウスは、増大した骨関連測定値を示した。雄および雌両方の(−/−)マウスが、増大したトリグリセリドレベルを示し、一方で、雄(−/−)マウスはまた、平均血清コレステロールのレベルの上昇も示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
血中化学成分:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均血清コレステロールレベルを示した。また、雄および雌両方のノックアウトマウス(−/−)がその(t heir)(+/+)同腹仔と比較して、増大した平均血清トリグリセリドレベルを示した。
上記に要約したように、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清コレステロールおよびトリグリセリドレベルの著しい増加を示した。したがって、PRO4421遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患モデルとして機能し得る。PRO4421ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節に有用であり得る。したがって、PRO14421ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠状動脈性心臓病などの心血管疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満の処置に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪パーセンテージ、容量分析的骨中無機質密度、および全身骨無機質密度ならびに脂肪(g)を示した。また、雄(−/−)マウスも増大した総組織マス、除脂肪体重および総体脂肪を示した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、総組織マスおよび増大した平均総体脂肪ならびに増大した骨無機質密度測定値を示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO4421ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。増加した骨塩量ならびに全身および大腿骨中無機質密度と関連する表現型は、これらの効果を模倣する薬剤(例えば、PRO4421ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒に有用であり得ることを示す。また、雌変異型該(−/−)マウスは、肥満の表現型を示す増大した平均体脂肪パーセンテージ(ならびに増大したトリグリセリドおよびコレステロールレベル)も示した。これらの観察結果は、PRO4421ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失した変異型マウスでは、脂肪の蓄積と関連する代謝障害(脂質代謝異常)だけでなく、肥満と関連し得る一般代謝障害を反映する異常な骨測定値が誘導されることを示す。したがって、PRO4421ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満などの障害または他の代謝病の処置または予防に有用であり得る。
70.69.DNA119516−2797(UNQ3071)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO9903ポリペプチド(DNA119516−2797で指定される)をコードする遺伝子(UNQ3071)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:XM_355322 PREDICTED:ハツカマウスRIKEN cDNA 5930434B04遺伝子(5930434B04Rik)に対応する;タンパク質参照:Q8BG21 ACCESSION:Q8BG21NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス0日目新生児胸腺cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:A430023D18産物:未知EST、完全挿入配列(ハツカマウス13日胚胃cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:D530007N05産物:未知EST、完全挿入配列);ヒト遺伝子配列参照:NM_017586 ACCESSION:NM_017586NID:gi8922115refNM_017586.1ホモサピエンス第9染色体オープンリーディングフレーム7(C9orf7);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9UGQ2 ACCESSION:Q9UGQ2NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。仮想タンパク質FLJ90371(第9染色体オープンリーディングフレーム7)(仮想タンパク質NT2RP3001619)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトC9orf7(第9染色体オープンリーディングフレーム7)のオーソログであるRIKEN cDNA 5930434B04遺伝子である。別名としては、D9S2135がある。
C9orf7は推定原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチドおよび2つの膜貫通セグメントからなる。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=1.62有意性0.44485807(hom/n)=0.28平均同腹仔サイズ=12
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託AK020041)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨ならびに胃、小腸および結腸以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.69.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA119516−2797(UNQ3071)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト第9染色体オープンリーディングフレーム7(C9orf7)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、聴覚障害が(−/−)マウスにおいてもたらされた。雄および雌両方の(−/−)マウスが増大した平均血清トリグリセリドレベルを示し、雌においてより顕著であった。雄(−/−)マウスはまた、増大した平均血清コレステロールも示した。また、血清IgMおよびIgG2aレベルが(−/−)ノックアウトマウスにおいても減少していた。2匹の雌(−/−)マウスは、骨髄において骨髄様過形成を示した。雄(−/−)マウスは、増大した平均総組織マスおよび除脂肪体重ならびに増大した平均大腿中軸皮質厚さを示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学:
微視的観察結果:雌(−/−)マウスはともに、骨髄において骨髄様過形成を示した。雄(−/−)マウスでは、顕著な差は観察されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)表現型解析:心臓病学
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均血清コレステロールレベルを示した。雄および雌両方の(−/−)マウスが、増大した平均血清トリグリセリドレベルを示し、その差は、雌においてより顕著であった。
上記に要約したように、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清コレステロールおよびトリグリセリドレベルの著しい増加を示した。したがって、PRO9903遺伝子が欠失した変異型マウスは、心血管疾患モデルとして機能し得る。PRO9903ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節に有用であり得る。したがって、PRO9903ポリペプチドまたはその(ther/eof)アゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠状動脈性心臓病などの心血管疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満の処置に有用であり得る。
(d)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なわれ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。該抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置され得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用され得る。
下記の試験を行なった。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
結果:
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクトの(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、低減された平均血清IgMレベルを示した。
変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、低減されたIgM血清免疫グロブリンを示した。IgM免疫グロブリンは、まず、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において生成され、補体系の活性化に特に重要である。観察された表現型は、PRO9903ポリペプチドが炎症性応答の調節因子であることを示す。これらの免疫学的異常は、PRO9903ポリペプチドまたはそのアゴニストが免疫系を刺激(例えば、T細胞増殖など)し得る重要な薬剤であり得ること、およびこの効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得ることを示す。したがって、PRO9903ポリペプチドのアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(e)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
手順:
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(Vmax)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
感覚運動ゲーティング/注意:試験した8匹の(−/−)マウスのうち、1匹のみが驚愕応答を示し、これは、変異型における聴覚障害を示す。
(f)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
1.DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均総組織マスおよび除脂肪体重を示した。
2.Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均大腿中軸皮質厚さを示した。
要約すると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した平均総組織マスおよび除脂肪体重ならびに増大した大腿中軸皮質厚さを示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO9903ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方において、PRO9903ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であり得る。変異型(−/−)マウスにおいて認められた増大した総組織マスおよび除脂肪体重は、肥満表現型と関連している。したがって、PRO9903ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満と関連する脂質代謝異常の処置に有用であり得る。
70.70.DNA59609−1470(UNQ549)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1106ポリペプチド(DNA59609−1470で指定される)をコードする遺伝子(UNQ549)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_146118ハツカマウス可溶性担体ファミリー25(ミトコンドリア担体、リン酸塩担体)、メンバー25(Slc25a25)に対応する;タンパク質参照:Q8JZT8 ACCESSION:Q8JZT8NID:ハツカマウス(マウス)。ミトコンドリアCa2依存性可溶性担体;ヒト遺伝子配列参照:NM_052901ホモサピエンス可溶性担体ファミリー25(ミトコンドリア担体;リン酸塩担体)、メンバー25(SLC25A25);ヒトタンパク質配列は、参照:Q705K2 ACCESSION:Q705K2NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。ミトコンドリアATP−Mg/Pi担体(小さいカルシウム結合ミトコンドリア担体2)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトSLC25A25のオーソログであるSlc25a25(可溶性担体ファミリー25[ミトコンドリア担体、リン酸塩担体]、メンバー25)である。別名としては、MCSC;MGC36388;mKIAA1896;1110030N17Rik;PCSCL;SCAMC−2;ミトコンドリアCa2依存性可溶性担体;可溶性担体ファミリー25[ミトコンドリア担体;リン酸塩担体]、メンバー25;および単鎖カルシウム結合ミトコンドリア担体2がある。
SLC25A25は、ミトコンドリアの内膜内に位置するカルシウム依存性輸送体であり、リン酸塩の交換においてミトコンドリアとサイトゾルとの間でマグネシウム−ATPをシャトル輸送する。SLC25A25は、主に、肝臓および骨格筋において発現される(Mashimaら,J Biol Chem 278(11):9520−7(2003);del ArcoおよびSatrustegui,J Biol Chem 279(231:24701−13(2004);Fiermonteら,J Biol Chem 279(29):30722−30(2004))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=3.25有意性=0.19691168(hom/n)=0.23平均同腹仔サイズ=7
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託BC019978.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.70.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA59609−1470(UNQ549)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト可溶性担体ファミリー25(ミトコンドリア担体、リン酸塩担体)、メンバー25(SLC25A25)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された体長という観察結果が雌(−/−)マウスにおいてもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した
(b)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI、すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨)において測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均体長を示した。これらの結果は、PRO1106遺伝子をノックアウトすることと関連する負の表現型が成長異常をもたらすことを示す。したがって、PRO1106ポリペプチドおよびそのアゴニストは、正常な成長代謝の維持に有用であり得、一方、PRO1106ポリペプチドのアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、負の成長関連表現型を模倣し得る。
70.71.DNA59212−1627(UNQ729)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1411ポリペプチド(DNA59212−1627で指定される)をコードする遺伝子(UNQ729)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AY444557ハツカマウス表皮特異的分泌タンパク質SK89前駆体、mRNA、完全cd、選択的スプライシング体に対応する;タンパク質参照:Q6SZJ9 ACCESSION:Q6SZJ9NID:ハツカマウス(マウス)。表皮特異的分泌タンパク質SK89前駆体;ヒト遺伝子配列参照:NM_033317ホモサピエンスデルモカイン(dermokine)(ZD52F10);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6E0U4 ACCESSION:Q6E0U4NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。デルモカイン−β。
対象のマウス遺伝子は、ヒトZD52F10(デルモカイン)のオーソログであるRIKEN cDNA 1110014F24遺伝子である。別名としては、Dmkn、SK30、SK89、C130074A08、UNQ729、および表皮特異的分泌タンパク質がある。
ZD52F10は、主に表皮ケラチノサイトにおいて発現される分泌タンパク質である。ZD52F10発現の誘導は、分化中の培養ヒトケラチノサイトにおいて行なわれる(Moffattら,Gene 344:123−31(2004);Matsuiら,Genomics 84(2):384−97(2004))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=4.48有意性=0.1064585(hom/n)=0.22平均同腹仔サイズ=0
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_172899.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち肝臓、骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.71.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA59212−1627(UNQ729)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトデルモカイン(ZD52F10)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した平均血清IgG2aレベルが(−/−)マウスにおいてもたらされた。雌ホモ接合体(−/−)マウスはまた、平均収縮期血圧の上昇も示した。雄(−/−)マウスは、減損したグルコース耐性を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、このような通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
これらの疾患の発生は、多くの場合、多段階経路(多くの場合、多数の異なる生物学的系/経路)を伴うが、これらの経路の1つ以上における危機的な時点での介入は、改善的または治療的効果を有し得る。治療的介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって行なわれ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされた自己分子と会合している抗原を認識する。抗原はMHC分子と一緒に、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上に提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康に害をもたらすこれらの改変された細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞と細胞傷害性T細胞とがある。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後、大量に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与するさまざまな他の細胞の活性化に中心的な役割を果たすさまざまなサイトカイン、すなわちリンホカインを分泌する。
多くの免疫応答では、炎症性細胞は損傷または感染の部位に浸潤する。遊走性細胞は、好中球、好酸球、単球またはリンパ球性であり得、これらは罹患組織の組織学的検査によって測定され得る。Current Protocols in Immunology,John E.Coligan編,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
免疫学の領域において、本明細書では、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。免疫関連疾患は、一例において、免疫応答を抑制することにより処置され得る。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体を使用することは、免疫媒介疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は(タンパク質を直接、または抗体アゴニストの使用により)、免疫応答を阻害し、したがって免疫関連疾患を改善するために利用され得る。
下記の試験を行なった。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイ:
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔対照と比較すると、増大した平均血清IgG2aレベルを示した。
変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、IgG2a血清免疫グロブリンの上昇を示した。IgG2a免疫グロブリンは中和効果を有し、程度は低いが、補体系の活性化に重要である。観察された表現型は、PRO1411ポリペプチドが炎症性応答の負の調節因子であることを示す。これらの免疫学的異常は、PRO1411ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が免疫系を刺激(例えば、T細胞増殖など)し得る重要な薬剤であり得、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他の型の癌の場合など)において、ならびに免疫抑制患者(例えば、AIDSに苦しむ人)において有用性が見出され得ることを示す。したがって、PRO1411ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)診断−血圧
記:
収縮期血圧は、非侵襲的テイルカフ法により4日間、Visitech BP−2000血圧解析システムにおいて測定する。血圧は各日10回で4日間測定する。次いで、この4日分を平均し、マウスの覚醒時の収縮期血圧を得る。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔(p=0.05)および歴史的平均と比較すると、平均収縮期血圧の上昇を示し、これは、ホモ接合体マウスの高血圧を示す。
(d)表現型解析:代謝−血中化学成分/グルコース耐性
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するグルコース耐性試験が挙げられる。異常なグルコース耐性試験の結果以下の障害または状態:1型および2型糖尿病、X症候群、種々の心血管疾患および/または肥満を示すものであり得るが、これらに限定され得ない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて使用した。グルコース耐性試験は、哺乳動物における減損したグルコース恒常性を規定するための標準である。グルコース耐性試験は、Lifescan社のグルコメーターを用いて行なった。動物に、20%溶液として送達されるD−グルコースを2g/kgでIP注射し、血糖レベルを、注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
グルコース耐性試験:試験した変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、T−60において減損したグルコース耐性を示した。
これらの試験は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、通常の空腹時グルコースの存在下において低減されたグルコース耐性または減損を示すことを示した。このように、ノックアウト変異型マウスは、減損したグルコース恒常性の表現型パターンを示し、したがって、PRO1411ポリペプチド(もしくはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、減損したグルコース恒常性と関連している状態および/または種々の心血管疾患、例えば、糖尿病の処置に有用であり得る。
70.72.DNA71180−1655(UNQ755)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1486ポリペプチド(DNA71180−1655で指定される)をコードする遺伝子(UNQ755)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_019820ハツカマウスセレベリン3前駆体タンパク質(Cbln3)に対応する;タンパク質参照:Q9JHG0 ACCESSION:Q9JHG0NID:ハツカマウス(マウス)。CBLN3;ヒト遺伝子配列参照:AY359070ホモサピエンスクローンDNA71180セレベリン(UNQ755);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UW01 ACCESSION:Q6UW01NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。セレベリン。
対象のマウス遺伝子は、ヒト「CBLN3」(Swiss−Prot受託Q6UW01)のオーソログであるCbln3(セレベリン3前駆体タンパク質)である。別名としては、プレセレベリン3、UNQ755、およびPRO1486がある。
Cbln3は、主に、小脳および背側蝸牛核(dorsal cochlear nucleus)において発現されるプレセレベリンファミリーの推定分泌タンパク質である。該タンパク質は、リガンドとして、または細胞外マトリックスの成分としての機能を果たし得る。Cbln3は、シグナルペプチドおよび補体成分Clqドメインを含有し、プレセレベリンファミリーメンバーであるセレベリン1とヘテロマー(heteromer)を形成する。このタンパク質の生物学的役割は未知である。しかしながら、プルキンエ細胞萎縮、成長遅滞、全身性振せんおよび運動失調を特徴とするマウス変異アジタン(agitan)の候補遺伝子であることが提案されている(Pangら,J Neurosci 20(17):6333−9(2000))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.23有意性=0.8913661(hom/n)=0.26平均同腹仔サイズ=6
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_019820.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち肺、骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.72.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA71180−1655(UNQ755)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想分泌タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した小柱の結合密度および総中軸大腿骨領域を示すノックアウト(−/−)マウスがもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および身体診断:放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
骨microCT解析:
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
結果:
MicroCT:(−/−)ホモ接合体変異型は、(+/+)対照同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した小柱の結合密度および総中軸大腿骨領域を伴う増大した骨関連測定値を示した。
要約すると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した小柱の結合密度および大腿中軸断面積を示した。これらの結果は、ノックアウト変異型表現型が大理石骨病などの骨異常と関連していることを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO1486ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病または他の骨関連疾患の処置に有益であり得る。他方において、PRO1486ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストは、骨治癒に有用であり得る。
70.73.DNA73727−1673(UNQ771)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1565ポリペプチド(DNA73727−1673で指定される)をコードする遺伝子(UNQ771)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_022322ハツカマウステノモジュリン(Tnmd)に対応する;タンパク質参照:Q9EP64 ACCESSION:Q9EP64NID:ハツカマウス(マウス)。テノモジュリン(TeM)(mTeM)(コンドロモジュリン−I様タンパク質)(ChM IL)(mChM IL)(ミオジュリン)(テンジン(tendin));ヒト遺伝子配列参照:NM_022144ホモサピエンステノモジュリン(TNMD);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H2S6 テノモジュリン(TeM)(hTeM)(コンドロモジュリン−I様タンパク質)(ChM1L)(hChM1L)(ミオジュリン(myodulin))(テンジン)(UNQ771/PRO1565)gi|15077276|gb|AAK83109.1|コンドロモジュリン−IB[ホモサピエンス]gi|12231527|gb|AAG49144.1|テノモジュリン[ホモサピエンス]gi|25392187|pir||JC7597コンドロモジュリン−I様タンパク質、ChM1L−ヒトgi|12698293|dbj|BAB21756.1|ChM1L[ホモサピエンス]に対応する。
対象のマウス遺伝子は、ヒトTNMDのオーソログであるTnmd(テノモジュリン)である。別名としては、ChM1L、テンジン、1110017I01Rik、ミオジュリン、TEM、BRICD4、CHM1−LIKE、ミオジュリンタンパク質、テノモジュリンタンパク質、およびBRICHOSドメイン含有4がある。
TNMDは、コンドロモジュリン−IファミリーのII型原形質膜タンパク質であり、おそらく、血管形成の阻害に関与するリガンドとしての機能を果たしている。該タンパク質は、シグナルアンカーおよび抗血管形成ドメインからなる。TNMDは、骨格筋の筋外膜および腱、外眼筋の腱、ならびに目の強膜角膜および線維細胞において発現される。網膜では、TNMDは、神経節層ならびに内顆粒層細胞および網膜の色素上皮細胞において発現される。TNMDは、おそらく、ある種の組織型において血管新生の阻害にある役割を果たしている(Yamanaら,Biochem Biophys Res Commun 280(4):1101−6(2001);Shukunamiら,Biochem Biophys Res Commun 280(5):1323−7(2001);Brandauら,Dev Dvn 221(1):72−80(2001);Oshimaら,Ophthalmol Vis Sci 44(5):1814−23(2003);Oshimaら,J Cell Sci 117(Pt13):2731−44(2004))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=44.12有意性=2.6270236E−10(hom/n)=0.56平均同腹仔サイズ=0
このプロジェクト(project)はX連鎖であり、ヘミ接合体は注目に値する表現型は有しない。
性別および遺伝子型によるX連鎖遺伝子分布のまとめ
(雄キメラ由来のアグーチの子のみを含める。)
Figure 2008532516
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託NM_022322.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、胸腺、骨格筋、骨および脂肪において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.73.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA73727−1673(UNQ771)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトテノモジュリン(TNMD)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(+/+)同胞種と比較して、ホモ接合体(−/−)マウスにおいて増大した平均体長がもたらされた。雌(−/−)マウスはまた、増大した血清カリウムレベルも示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI,すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨)において測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した平均体長を示した。
(c)表現型解析:代謝−血中化学成分
代謝の領域において、代謝障害の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。血糖レベルの測定に加え、下記の血中化学成分:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血液尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物の試験もまた常套的に行なわれる。
結果:
雌(−/−)マウスは、その(−/+)同腹仔と比較すると、増大した平均血清カリウムレベルを示した。この観察結果は、ホモ接合体マウスが、腎臓機能不全の結果であり得る改変された電解質平衡を有することを示す。
70.74.DNA89220−2608(UNQ1924)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4399ポリペプチド(DNA89220−2608で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1924)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_153157ハツカマウスオルファクトメジン3(Olfm3)、転写物バリアントBに対応する;タンパク質参照:Q8QZW0ネオリン(Noelin)3前駆体(オルファクトメジン3)(オプチメジン(Optimedin));ヒト遺伝子配列参照:AY358722ホモサピエンスクローンDNA89220olfM3(UNQ1924);ヒトタンパク質配列は、参照:Q96PB7 ACCESSION:Q96PB7NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。NOELIN 3 PRECURSOR。
対象のマウス遺伝子は、ヒトOLFM3のオーソログであるOlfm3(オルファクトメジン3)である。別名としては、B230206G02Rik、オプチメジン、NOE3、OPTIMEDIN、ネオリン3、およびオルファクトメジン関連ER局在タンパク質3がある。
OLFM3は、主に、脳および網膜において発現される分泌タンパク質であり、緑内障候補遺伝子であるミオシリン(MYOC)と関連している。MYOCとの相互作用は、OLFM3もまた緑内障の候補遺伝子であり得ることを示す(Torradoら,Hum Mol Genet 11(11):1291−301(2002))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=6.49有意性=0.03896857(hom/n)=0.26平均同腹仔サイズ=0
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン4を標的化した(NCBI受託NM_153157.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、腎臓および肝臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.74.1.表現型解析(破壊された遺伝子;DNA89220−2608(UNQ1924)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトオルファクトメジン3(0LFM3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雌ホモ接合体(−/−)マウスは、増大した総組織マスおよび総体脂肪含量を示す観察結果というがもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線学表現型解析
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、マウスを、DEXAスキャン用のPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)の台の上にうつ伏せにして置いた。Lunar PIXImusソフトウエアを使用し、骨無機質密度(BMD)および脂肪組成(脂肪%)および総組織マス(TTM)を、対象領域(ROI)[すなわち、全身、脊椎骨および両大腿骨]において測定した。
結果:
雌ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致野生型(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した総組織マスおよび総脂肪含量を示した。
これらの試験は、変異型(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、肥満と関連している負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO4399ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満の予防および/または処置に特に重要であり得る。
70.75.DNA84142−2613(UNQ1929)遺伝子の破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4404ポリペプチド(DNA84142−2613で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1929)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_001003947ハツカマウスシトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーX、ポリペプチド1(Cyp4X1)に対応する;タンパク質参照:Q6A152 ACCESSION:Q6A152NID:ハツカマウス(マウス)。シトクロムP450;ヒト遺伝子配列参照:NM_178033ホモサピエンスシトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーX、ポリペプチド1(CYP4X1);ヒトタンパク質配列は、参照:Q8N118 ACCESSION:Q8N118NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。シトクロムP450 4X1(EC1.14.14.1)(CYPIVXl)(UNQ1929/PRO4404)。
対象のマウス遺伝子は、ヒトCYP4X1のオーソログであるCyp4X1(シトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーx、ポリペプチド1)である。別名としては、CYP_a;A230025G20;シトクロムP450、4x1;およびMGC40051がある。
CYP4X1は、推定ヘム含有モノオキシゲナーゼであり、おそらく、補基質としての還元型フラビンタンパク質および分子酸素により、種々の分子、例えば、ステロイド、脂肪酸、胆汁酸、毒素、薬物および他の生体異物などの酸化を触媒している。該酵素は、主に、脳(ニューロンおよび血管内皮細胞を含む)において発現され、小胞体内に位置すると予想される。この酵素の生物学的役割は未知である。しかしながら、これは、神経血管の機能に関与している可能性がある(Bylundら,Biochem Biophys Res Commun 296(3):677−84(2002))。
標的化変異または遺伝子トラップ変異を、129SvEvBrd由来胚性幹(ES)細胞において生成させる。キメラマウスをC57BL/6J白マウスと交配し、F1ヘテロ接合動物を作製する。これらの子孫を異種交配し、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体変異型子孫を作製する。稀な場合において、例えば、ごくわずかにF1マウスがキメラから得られる場合、F1ヘテロ接合体マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交配し、さらなるヘテロ接合動物を得、異種交配してF2マウスを得る。レベルIの表現型解析を、この世代のマウスにおいて行なう。
Figure 2008532516
Chi−Sq.=0.64有意性=0.726149(hom/n)=0.23平均同腹仔サイズ=9
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託NM_001003947.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、脾臓および腎臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.75.1.表現型解析(破壊された遺伝子:DNA84142−2613(UNQ1929)について
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトシトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーx、ポリペプチド1(CYP4X1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、ホットプレート試験の際に、長い潜時期間を示す変異型(−/−)マウスがもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用し得る。
手順:
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。
ホットプレート試験
試験の説明:侵害受容のホットプレート試験は、各マウスを小型の密閉55℃ホットプレート上に配置することにより行なう。後肢応答潜時(舐める、震えるまたは飛び跳ねる)を記録し、ホットプレート上での最大時間は30秒間である。各動物は一度に試験する。
結果:
雌変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔対照と比較すると、長い応答潜時(例えば、低減された感応性の差)を示した。これらの結果は、疼痛知覚の改変を示す。
実施例71:ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の使用
下記の方法は、ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の使用を記載したものである。
本明細書に開示した完全長または成熟PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのコード配列を含むDNAを、ヒト組織cDNAライブラリまたはヒト組織ゲノムライブラリにおいて相同なDNA(例えば、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの天然に存在するバリアントをコードするものなど)をスクリーニングするためのプローブとして使用する。
いずれかのライブラリDNAを含むフィルターのハイブリダイゼーションおよび洗浄は、下記の高ストリンジェンシー条件下で行なう。放射能標識されたPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−由来プローブのフィルターへのハイブリダイゼーションは、50%ホルムアミド、5×SSC、0.1%SDS、0.1%ピロリン酸ナトリウム、50mMリン酸ナトリウム、pH6.8、2×デンハルト溶液および10%硫酸デキストランの溶液中、42℃で20時間行なわれる。フィルターの洗浄は、0.1×SSCおよび0.1%SDSの水溶液中、42℃で行なう。
次いで、完全長の天然配列PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAと所望の配列同一性を有するDNAを、当該技術分野で知られた標準的は手法を用いて同定し得る。
実施例72:大腸菌におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
この実施例は、大腸菌内での組換え発現によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの非グリコシル化形態の調製を示す。
最初に、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNA配列を、選択したPCRプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位を含む必要がある。さまざまな発現ベクターを使用し得る。好適なベクターの一例は、アンピリシンおよびテトラサイクリン耐性遺伝子を含むpBR322(大腸菌由来;Bolivarら,Gene.2:95(1977)を参照)である。ベクターを制限酵素で消化し、脱ホスホリル化する。PCR増幅された配列を、次いで、ベクター内にライゲートする。ベクターは、好ましくは、抗生物質耐性遺伝子、trpプロモーター、ポリhisリーダー(最初の6つのSTIIコドン、ポリhis配列およびエンテロキナーゼ切断部位を含む)、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404コード領域、λ転写ターミネータ、ならびにargU遺伝子をコードする配列を含む。
次いで、ライゲーション混合物を用い、選択した大腸菌系統をSambrookら(前掲)に記載の方法を用いて形質転換する。形質転換体を、LBプレート上でのその生育能力によって同定し、次いで抗生物質耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを、制限解析によって単離し、DNA配列決定によって確認し得る。
選択されたクローンは、液体培養培地(例えば、抗生物質を加えたLBブイヨンなど)中で一晩培養し得る。一晩培養物は、続いて大規模培養物にイノキュレートするために使用され得る。次いで、細胞を所望の光学密度まで培養し、この間に発現プロモーターが作動する。
細胞をさらに数時間培養した後、細胞を、遠心分離によって回収し得る。遠心分離によって得られた細胞ペレットを、当該技術分野で知られた種々の薬剤を用いて可溶化し得、可溶化されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404タンパク質を、次いで、金属キレートカラムを用い、タンパク質の強固な結合を可能にする条件下で精製し得る。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404は大腸菌においてポリ−Hisタグ化された形態で、下記の手順を用いて発現させ得る。最初に、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404をコードするDNAを、選択したPCRプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位、ならびに効率的で信頼性のある翻訳の開始、金属キレートカラム上での速やかな精製およびエンテロキナーゼによるタンパク質分解的除去をもたらすのに有用な他の配列を含む。次いで、PCR増幅されたポリ−Hisタグ化配列を発現ベクター内にライゲートし、これを用いて菌株52(W3110fuhA(tonA)lon galE rpoHts(htpRts)clpP(laIq)系の大腸菌宿主を形質転換する。形質転換体を、まず、50mg/mlのカルベニシリンを含有するLB中にて30℃で、振とうさせながら3〜5のO.D.600が達成されるまで培養する。次いで、培養物をCRAP培地(3.57gの(NHSO、0.71gのクエン酸ナトリウム・2H2O、1.07gのKCl、5.36gのDifco製酵母抽出物、5.36gのSheffield hycase SF(500mLの水中)、ならびに110mMのMPOS、pH7.3、0.55%(w/v)のグルコースおよび7mMのMgSOを混合することにより調製)中で50〜100倍に希釈し、およそ20〜30時間30℃で、振とうさせながら培養する。試料を取り出し、SDS−PAGE解析によって発現を確認し、バルク培養物を遠心分離して細胞をペレット化する。細胞ペレットは、精製およびリフォールディングまで凍結しておく。
0.5〜1Lの発酵物からの大腸菌ペースト(6〜10gのペレット)を10容量(w/v)で7Mグアニジン、20mM Tris(pH8)バッファー中に再懸濁する。固形亜硫酸ナトリウムおよび四チオン酸ナトリウムを、それぞれ、終濃度が0.1Mおよび0.02Mとなるように添加し、溶液を一晩4℃で攪拌する。この工程により、すべてのシステイン残基がスルフィトリル化(sulfitolization)によってブロックされた変性タンパク質がもたらされる。この溶液を40,000rpmで、Beckman超遠心分離機にて30分間遠心分離する。上清みを3〜5容量の金属キレートカラムバッファー(6Mグアニジン、20mM Tris、pH7.4)で希釈し、0.22ミクロンフィルターに通して濾過して清澄化する。清澄化された抽出物を、金属キレートカラムバッファー中で平衡化した5ml容Qiagen Ni−NTA金属キレートカラム上に負荷する。カラムを50mMイミダゾール(Calbiochem,Utrolグレード)を含有するさらなるバッファー(pH7.4)で洗浄する。タンパク質を、250mMイミダゾールを含有するバッファーで溶出する。所望のタンパク質を含む画分をプールし、4℃で保存する。タンパク質濃度を、そのアミノ酸配列に基づいて計算された消衰係数を用い、280nmにおけるその吸光度によって推定する。
タンパク質を、20mM Tris(pH8.6)、0.3M NaCl、2.5Mの尿素、5mMのシステイン、20mMのグリシンおよび1mM EDTAからなる新たに調製したリフォールディングバッファー中に試料をゆっくり希釈することによりリフォールディングさせる。リフォールディング容量は、最終タンパク質濃度が50〜100マイクログラム/mlとなるように選択される。リフォールディング溶液は、12〜36時間4℃で穏やかに攪拌する。リフォールディング反応を、終濃度0.4%(およそ3のpH)までTFAを添加することによってクエンチする。タンパク質のさらなる精製の前に、溶液を0.22ミクロンフィルターに通して濾過し、アセトニトリルを2〜10%の終濃度まで添加する。リフォールディングさせたタンパク質をPoros R1/H逆相カラム上で、0.1%TFAの移動相バッファーを用い、10〜80%のアセトニトリルの勾配での溶出を伴ってクロマトグラフィー処理する。A280吸光度を有する画分のアリコートをSDSポリアクリルアミドゲル上で解析し、均質なリフォールディングタンパク質を含む画分をプールする。一般的に、大部分のタンパク質が適正にリフォールディングされた種は、その疎水性内部が最も緻密であり、逆相樹脂との相互作用から遮断されるため、最低濃度のアセトニトリルで溶出される。凝集した種は、通常、より高いアセトニトリル濃度で溶出される。ミスフォールド形態のタンパク質を所望の形態から分離することに加え、逆相工程ではまた、内毒素を試料から除去する。
フォールドされた所望のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを含む画分をプールし、アセトニトリルを、溶液に指向した穏やかな窒素流を用いて除去する。透析によって、または構築バッファー中で平衡化したG25 Superfine(Pharmacia)樹脂を用いたゲル濾過によって、0.14Mの塩化ナトリウムおよび4%マンニトールを含む20mM Hepes(pH6.8)中にタンパク質を構築し、滅菌濾過する。
実施例73:哺乳動物細胞におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
この実施例は、哺乳動物細胞内での組換え発現によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの潜在的にグリコシル化された形態の調製を示す。
ベクターpRK5(EP307,247(1989年3月15日公開)を参照のこと)を発現ベクターとして使用する。任意選択で、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNAをpRK5内に、選択した制限酵素を用いてライゲートし、Sambrookら(前掲)に記載のものなどのライゲーション方法を用いてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNAの挿入を可能にする。得られたベクターをpRK5−PRO179,pRK5−PRO181,pRK5−PRO244,pRK5−PRO247,pRK5−PRO269,pRK5−PRO293,pRK5−PRO298,pRK5−PRO339,pRK5−PRO341,pRK5−PRO347,pRK5−PRO531,pRK5−PRO537,pRK5−PRO718,pRK5−PRO773,pRK5−PRO860,pRK5−PRO871,pRK5−PRO872,pRK5−PRO813,pRK5−PRO828,pRK5−PRO1100,pRK5−PRO1114,pRK5−PRO1115,pRK5−PRO1126,pRK5−PRO1133,pRK5−PRO1154,pRK5−PRO1185,pRK5−PRO1194,pRK5−PRO1287,pRK5−PRO1291,pRK5−PRO1293,pRK5−PRO1310,pRK5−PRO1312,pRK5−PRO1335,pRK5−PRO1339,pRK5−PRO2155,pRK5−PRO1356,pRK5−PRO1385,pRK5−PRO1412,pRK5−PRO1487,pRK5−PRO1758,pRK5−PRO1779,pRK5−PRO1785,pRK5−PRO1889,pRK5−PRO90318,pRK5−PRO3434,pRK5−PRO3579,pRK5−PRO4322,pRK5−PRO4343,pRK5−PRO4347,pRK5−PRO4403,pRK5−PRO4976,pRK5−PRO260,pRK5−PRO6014,pRK5−PRO6027,pRK5−PRO6181,pRK5−PRO6714,pRK5−PRO9922,pRK5−PRO7179,pRK5−PRO7476,pRK5−PRO9824,pRK5−PRO19814,pRK5−PRO19836,pRK5−PRO20088,pRK5−PRO70789,pRK5−PRO50298,pRK5−PRO51592,pRK5−PRO1757,pRK5−PRO4421,pRK5−PRO9903,pRK5−PRO1106,pRK5−PRO1411,pRK5−PRO1486,pRK5−PRO1565,pRK5−PRO4399またはpRK5−PRO4404とよぶ。
選択される宿主細胞は293細胞であり得る。ヒト293細胞(ATCC CCL 1573)を組織培養プレート内で、ウシ胎仔血清ならびに任意選択で栄養成分および/または抗生物質を補給したDMEMなどの培地中でコンフルエンスまで培養する。約10μgのpRK5−PRO179,pRK5−PRO181,pRK5−PRO244,pRK5−PRO247,pRK5−PRO269,pRK5−PRO293,pRK5−PRO298,pRK5−PRO339,pRK5−PRO341,pRK5−PRO347,pRK5−PRO531,pRK5−PRO537,pRK5−PRO718,pRK5−PRO773,pRK5−PRO860,pRK5−PRO871,pRK5−PRO872,pRK5−PRO813,pRK5−PRO828,pRK5−PRO1100,pRK5−PRO1114,pRK5−PRO1115,pRK5−PRO1126,pRK5−PRO1133,pRK5−PRO1154,pRK5−PRO1185,pRK5−PRO1194,pRK5−PRO1287,pRK5−PRO1291,pRK5−PRO1293,pRK5−PRO1310,pRK5−PRO1312,pRK5−PRO1335,pRK5−PRO1339,pRK5−PRO2155,pRK5−PRO1356,pRK5−PRO1385,pRK5−PRO1412,pRK5−PRO1487,pRK5−PRO1758,pRK5−PRO1779,pRK5−PRO1785,pRK5−PRO1889,pRK5−PRO90318,pRK5−PRO3434,pRK5−PRO3579,pRK5−PRO4322,pRK5−PRO4343,pRK5−PRO4347,pRK5−PRO4403,pRK5−PRO4976,pRK5−PRO260,pRK5−PRO6014,pRK5−PRO6027,pRK5−PRO6181,pRK5−PRO6714,pRK5−PRO9922,pRK5−PRO7179,pRK5−PRO7476,pRK5−PRO9824,pRK5−PRO19814,pRK5−PRO19836,pRK5−PRO20088,pRK5−PRO70789,pRK5−PRO50298,pRK5−PRO51592,pRK5−PRO1757,pRK5−PRO4421,pRK5−PRO9903,pRK5−PRO1106,pRK5−PRO1411,pRK5−PRO1486,pRK5−PRO1565,pRK5−PRO4399またはpRK5−PRO4404をVA RNA遺伝子[Thimmappayaら,Cell,31:543(1982)]をコードするDNA約1μgと混合し、500μlの1mM Tris−HCl、0.1mM EDTA、0.227M CaCl中に溶解する。この混合物に、500μlの50mM HEPES(pH7.35)、280mM NaCl、1.5mM NaPOを滴下し、25℃で10分間、沈殿物を形成させる。沈殿物を懸濁して293細胞に添加し、37℃で約4時間沈降させる。培養培地を吸引除去し、2mlの20%グリセロール含有PBSを30秒間添加する。次いで、293細胞を血清無含有培地で洗浄し、新鮮培地を添加し、細胞を約5日間インキュベートする。
トランスフェクションのおよそ24時間後、培養培地を除去し、培養培地(単独)または200μCi/mlの35S−システインおよび200μCi/mlの35S−メチオニンを含有する培養培地と交換する。12時間のインキュベーション後、ならし培地を回収し、スピンフィルターにて濃縮し、15%SDSゲル上に負荷する。加工処理したゲルは、乾燥させ、選択した時間フィルムに露光し、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの存在を顕現させ得る。トランスフェクト細胞を含む培養物は、さらなるインキュベーション(血清無含有培地中)に供してもよく、培地を、選択したバイオアッセイにおいて試験する。
択一的な手法において、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を、Somparyracら,Proc.Natl.Acad.Sci.,12:7575(1981)に記載された硫酸デキストラン法を用い、一過的に293細胞内に導入してもよい。293細胞をスピナーフラスコ内で最大密度まで培養し、700μgのpRK5−PRO179,pRK5−PRO181,pRK5−PRO244,pRK5−PRO247,pRK5−PRO269,pRK5−PRO293,pRK5−PRO298,pRK5−PRO339,pRK5−PRO341,pRK5−PRO347,pRK5−PRO531,pRK5−PRO537,pRK5−PRO718,pRK5−PRO773,pRK5−PRO860,pRK5−PRO871,pRK5−PRO872,pRK5−PRO813,pRK5−PRO828,pRK5−PRO1100,pRK5−PRO1114,pRK5−PRO1115,pRK5−PRO1126,pRK5−PRO1133,pRK5−PRO1154,pRK5−PRO1185,pRK5−PRO1194,pRK5−PRO1287,pRK5−PRO1291,pRK5−PRO1293,pRK5−PRO1310,pRK5−PRO1312,pRK5−PRO1335,pRK5−PRO1339,pRK5−PRO2155,pRK5−PRO1356,pRK5−PRO1385,pRK5−PRO1412,pRK5−PRO1487,pRK5−PRO1758,pRK5−PRO1779,pRK5−PRO1785,pRK5−PRO1889,pRK5−PRO90318,pRK5−PRO3434,pRK5−PRO3579,pRK5−PRO4322,pRK5−PRO4343,pRK5−PRO4347,pRK5−PRO4403,pRK5−PRO4976,pRK5−PRO260,pRK5−PRO6014,pRK5−PRO6027,pRK5−PRO6181,pRK5−PRO6714,pRK5−PRO9922,pRK5−PRO7179,pRK5−PRO7476,pRK5−PRO9824,pRK5−PRO19814,pRK5−PRO19836,pRK5−PRO20088,pRK5−PRO70789,pRK5−PRO50298,pRK5−PRO51592,pRK5−PRO1757,pRK5−PRO4421,pRK5−PRO9903,pRK5−PRO1106,pRK5−PRO1411,pRK5−PRO1486,pRK5−PRO1565,pRK5−PRO4399またはpRK5−PRO4404を添加する。該細胞を、まず、スピナーフラスコから遠心分離によって濃縮し、PBSで洗浄する。DNA−デキストラン沈殿物を、細胞ペレット上で4時間インキュベートする。細胞を20%グリセロールで90秒間処理し、組織培養培地で洗浄し、組織培養培地、5μg/mlウシインスリンおよび0.1μg/mlウシトランスフェリンを入れたスピナーフラスコ内に再導入する。約4日後、ならし培地を遠心分離し、濾過して細胞および残屑を除去する。発現されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を含む試料を、次いで、選択した任意の方法、例えば、透析および/またはカラムクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404は、CHO細胞において発現させ得る。pRK5−PRO179,pRK5−PRO181,pRK5−PRO244,pRK5−PRO247,pRK5−PRO269,pRK5−PRO293,pRK5−PRO298,pRK5−PRO339,pRK5−PRO341,pRK5−PRO347,pRK5−PRO531,pRK5−PRO537,pRK5−PRO718,pRK5−PRO773,pRK5−PRO860,pRK5−PRO871,pRK5−PRO872,pRK5−PRO813,pRK5−PRO828,pRK5−PRO1100,pRK5−PRO1114,pRK5−PRO1115,pRK5−PRO1126,pRK5−PRO1133,pRK5−PRO1154,pRK5−PRO1185,pRK5−PRO1194,pRK5−PRO1287,pRK5−PRO1291,pRK5−PRO1293,pRK5−PRO1310,pRK5−PRO1312,pRK5−PRO1335,pRK5−PRO1339,pRK5−PRO2155,pRK5−PRO1356,pRK5−PRO1385,pRK5−PRO1412,pRK5−PRO1487,pRK5−PRO1758,pRK5−PRO1779,pRK5−PRO1785,pRK5−PRO1889,pRK5−PRO90318,pRK5−PRO3434,pRK5−PRO3579,pRK5−PRO4322,pRK5−PRO4343,pRK5−PRO4347,pRK5−PRO4403,pRK5−PRO4976,pRK5−PRO260,pRK5−PRO6014,pRK5−PRO6027,pRK5−PRO6181,pRK5−PRO6714,pRK5−PRO9922,pRK5−PRO7179,pRK5−PRO7476,pRK5−PRO9824,pRK5−PRO19814,pRK5−PRO19836,pRK5−PRO20088,pRK5−PRO70789,pRK5−PRO50298,pRK5−PRO51592,pRK5−PRO1757,pRK5−PRO4421,pRK5−PRO9903,pRK5−PRO1106,pRK5−PRO1411,pRK5−PRO1486,pRK5−PRO1565,pRK5−PRO4399またはpRK5−PRO4404をCHO細胞内に、CaPOまたはDEAE−デキストランなどの既知の試薬を用いてトランスフェクトし得る。上記のように、細胞培養物をインキュベートすることができ、培地は培養培地(単独)または35S−メチオニンなどの放射能標識を含有する培地と交換することができる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの存在を調べた後、培養培地を血清無含有培地と交換してもよい。好ましくは、培養物を約6日間インキュベートし、次いで、ならし培地を回収する。発現されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を含有する培地を、次いで、選択した任意の方法によって濃縮および精製し得る。
また、エピトープタグ化したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を宿主CHO細胞において発現させてもよい。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を、pRK5ベクターにサブクローニングし得る。サブクローン挿入物はPCRに供し、インフレームで、選択したエピトープタグ(例えば、ポリ−Hisタグなど)とともにバキュロウイルス発現ベクター内に融合させ得る。ポリ−Hisタグ化PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404挿入物を、次いで、安定なクローンの選択のためのDHFR選択マーカーを含有するSV40駆動ベクター内にサブクローニングし得る。最後に、CHO細胞にSV40駆動ベクターをトランスフェクトさせ得る(上記のようにして)。標識化は、上記のように、発現を確認するために行ない得る。発現されたポリ−Hisタグ化PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を含有する培養培地を、次いで、選択した任意の方法、例えば、Ni2+キレートアフィニティクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404はまた、CHOおよび/またはCOS細胞において一過性発現手順によって、あるいはCHO細胞において別の安定な発現手順によって発現させ得る。
CHO細胞における安定な発現は、下記の手順を用いて行なわれる。タンパク質はIgG構築物(イムノアドヘシン)として発現させ、それぞれのタンパク質の可溶性形態のコード配列(例えば、細胞外ドメイン)を、ヒンジ、CH2およびCH2ドメインを含有するIgG1定常領域配列と融合させる、および/またはポリ−Hisタグ化された形態である。
PCR増幅後、それぞれのDNAを、CHO発現ベクター内に、Ausubelら,Current Protocols of Molecular Biology,Unit 3.16,John Wiley and Sons(1997)に記載のような標準的は手法を用いてサブクローニングする。CHO発現ベクターは、cDNAの簡便なシャトリングが可能となるように目的のDNAの5’および3’側に適合性の制限部位を有するように構築する。CHO細胞における発現に使用されるベクターは、Lucasら,Nucl.Acids Res.24:9(1774−1779(1996)に記載されているとおりであり、対象のcDNAおよびジヒドロ葉酸還元酵素(DHFR)の発現を駆動するためのSV40初期プロモーター/エンハンサーを使用する。DHFR発現により、トランスフェクション後のプラスミドの安定な維持のための選択が可能になる。
12マイクログラムの所望のプラスミドDNAを、およそ10000000個のCHO細胞内に、市販のトランスフェクション試薬Superfect(登録商標)(Qiagen)、Dosper(登録商標)またはFugene(登録商標)(Boehringer Mannheim)を用いて導入する。細胞を、Lucasら(前掲)に記載のようにして培養する。およそ3×10細胞を、下記のようなさらなる培養および生成のために、アンプル内で凍結させる。
プラスミドDNAの入ったアンプルを、水浴内への配置によって解凍し、ボルテックスによって混合する。内容物を、10mLの培地を入れた遠心分離チューブ内にピペッティングし、1000rpmで5分間遠心分離する。上清みを吸引し、細胞を10mLの選択培地(5%の0.2μm透析濾過ウシ胎児血清含有0.2μm濾過PS20)中に再懸濁する。次いで、細胞のアリコートを、90mLの選択培地を入れた100mL容量のスピナー内に採取する。1〜2日後、細胞を、150mLの選択培養培地で満たした250mL容量のスピナー内に移し、37℃でインキュベートする。さらに2〜3日後、250mL、500mLおよび2000mL容量のスピナーに3×10細胞/mLを播種する。細胞培地を新たな培地と、遠心分離および生産培地中への再懸濁によって交換する。任意の適当なCHO培地を使用し得るが、米国特許第5,122,469号(1992年6月16日発行)に記載の生産培地を実際に使用することができる。3L容量の生産用スピナーに1.2×10細胞/mLで播種する。第0日目、細胞数 pHを測定する(ie determined)。第1日目、スピナーから試料を採取し、濾過空気でのスパージングを開始する。第2日目、スピナーから試料を採取し、温度を33℃にシフトし、30mLの500g/Lグルコースおよび0.6mLの10%消泡剤(例えば、35%ポリジメチルシロキサンエマルジョン、Dow Corning 365医薬グレードEmulsion)を採用する。作製全体を通して、pHは、7.2前後に維持されるように必要に応じて調整する。10日後、またはバイアビリティが70%未満に低下したときまで、細胞培養物を、遠心分離および0.22μmフィルターに通す濾過によって回収する。濾液は、4℃で保存するか、または直接、精製用カラム上に負荷するかのいずれかとした。
ポリ−Hisタグ化構築物に関して、タンパク質は、Ni−NTAカラム(Qiagen)を用いて精製する。精製前、イミダゾールをならし培地に5mMの濃度まで添加する。ならし培地を、20mM Hepes(pH7.4)0.3M NaClおよび5mMイミダゾール含有バッファー中で平衡化した6ml容量のNi−NTAカラム上に、4〜5ml/分の流速で4℃にてポンピングする。負荷後、カラムをさらなる平衡化バッファーで洗浄し、タンパク質を、0.25Mイミダゾールを含有する平衡化バッファーで溶出させる。高度に精製されたタンパク質を、続いて、25ml容量のG25 Superfine(Pharmacia)カラムを用い、10mM Hepes、0.14M NaClおよび4%マンニトール(pH6.8)を含有する保存バッファー中にて脱塩し、−80℃で保存する。
イムノアドヘシン(Fc含有)構築物をならし培地から、以下のようにして精製する。ならし培地を、20mMリン酸ナトリウムバッファー(pH6.8)中で平衡化しておいた5ml容量のタンパク質Aカラム(Pharmacia)上にポンピングする。負荷後、100mMクエン酸(pH3.5)で溶出する前に、カラムを平衡化バッファーで徹底的に洗浄する。溶出させたタンパク質は、1mlずつの画分を、275μLの1M Trisバッファー(pH9)を入れたチューブ内に収集することにより直ちに中和する。高度に精製されたタンパク質を、続いて、ポリ−Hisタグ化タンパク質について上記の保存バッファー中にて脱塩する。均質性を、SDSポリアクリルアミドゲルおよびエドマン分解によるN末端アミノ酸配列決定によって評価する。
実施例74:酵母におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
下記の方法は、酵母におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の組換え発現を記載したものである。
まず、ADH2/GAPDHプロモーターからのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の細胞内での産生または分泌のための酵母発現ベクターを構築する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404およびプロモーターをコードするDNAを、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の細胞内発現を指向させるために選択したプラスミド内の適当な制限酵素部位に挿入する。分泌のため、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404をコードするDNAは、選択したプラスミドに、ADH2/GAPDHプロモーター、天然PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404シグナルペプチドもしくは他の哺乳動物用シグナルペプチド、または例えば、酵母のα因子もしくはインベルターゼ分泌シグナル/リーダー配列、およびPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現のためのリンカー配列(必要であれば)をコードするDNAとともにクローニングし得る。
次いで、酵母細胞(例えば、酵母系統AB110など)を上記の発現プラスミドで形質転換し、選択した発酵培地中で培養し得る。形質転換された酵母の上清みを、10%トリクロロ酢酸を用いた沈殿によって解析し、SDS−PAGEによって分離した後、ゲルをクマシーブルー染色で染色し得る。
続いて、組換えPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を、酵母細胞を発酵培地から遠心分離によって除去し、次いで、選択したカートリッジフィルターを用いて培地を濃縮することにより単離および精製し得る。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を含む濃縮物を、選択したカラムクロマトグラフィー樹脂を用いてさらに精製し得る。
実施例75:バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
下記の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の組換え発現を記載したものである。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404をコードする配列を、バキュロウイルス発現ベクター内に含有されるエピトープタグの上流と融合させる。かかるエピトープタグとしては、ポリ−Hisタグおよび免疫グロブリンタグ(IgGのFc領域など)が挙げられる。さまざまなプラスミド、例えば、市販のプラスミド(例えば、pVL1393(Novagen)など)から誘導されるプラスミドを使用し得る。簡単には、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404をコードする配列またはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404のコード配列の所望の部分、例えば、膜貫通タンパク質の細胞外ドメインをコードする配列、またはタンパク質が細胞外のものである場合はその成熟タンパク質をコードする配列などを、5’および3’領域に相補的なプライマーを用いたPCRによって増幅する。5’プライマーは、(選択した)フランキング制限酵素部位を組み込んでいてよい。次いで、産物を、選択した制限酵素で消化し、発現ベクター内にサブクローニングする。
組換えバキュロウイルスを、上記のプラスミドおよびBaculoGold(商標)ウイルスDNA(Pharmingen)をSpodoptera fmgiperda(「Sf9」)細胞(ATCC CRL 1711)内に、リポフェクチン(GIBCO−BRLから市販)を用いてコトランスフェクトすることにより作製する。28℃で4〜5日間のインキュベーション後、放出されたウイルスを回収し、さらなる増幅に用いる。ウイルス感染およびタンパク質発現は、O’Reilleyら,Baculovirus expression vectors:A Laboratory Manual,Oxford:Oxford University Press(1994)に記載のように行なう。
発現されたポリ−Hisタグ化PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404は、次いで、例えば、Ni2+キレートアフィニティクロマトグラフィーによって以下のようにして精製し得る。抽出物は、組換えウイルス感染Sf9細胞から、Rupertら,Nature,362:175−179(1993)に記載のように調製する。簡単には、Sf9細胞を洗浄し、音波破砕バッファー(25mL Hepes、pH7.9;12.5mM MgCl;0.1mM EDTA;10%グリセロール;0.1%NP−40;0.4M KCl)中に再懸濁し、氷上で20秒間、2回音波破砕する。音波破砕物を遠心分離によって清澄化し、上清みを、負荷バッファー(50mMリン酸塩、300mM NaCl、10%グリセロール、pH7.8)中で50倍に希釈し、0.45μmフィルターに通して濾過する。Ni2+NTAアガロースカラム(Qiagenから市販)を5mL容量の床を用いて調製し、25mLの水で洗浄し、25mLの負荷バッファーで平衡化する。濾過した細胞抽出物をカラム上に0.5mL/分で負荷する。カラムをベースラインA280まで負荷バッファーで洗浄し、この時点で、画分収集を開始する。次に、カラムを二次洗浄バッファー(50mMリン酸塩;300mM NaCl、10%グリセロール、pH6.0)で洗浄し、これにより、非特異的結合タンパク質を溶出する。再度A280ベースラインに達した後、カラムを二次洗浄バッファー中0〜500mMイミダゾールの勾配で展開させる。1mLずつの画分を収集し、SDS−PAGEおよび銀染色またはNi2+−NTAコンジュゲートアルカリホスファターゼ(Qiagen)を用いたウエスタンブロットによって解析する。溶出されたHis10タグ化PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404を含有する画分をプールし、負荷バッファーに対して透析する。
あるいはまた、IgGタグ化(またはFcタグ化)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の精製が、既知のクロマトグラフィー手法、例えば、タンパク質Aまたはタンパク質Gカラムクロマトグラフィーなどを用いて行なわれ得る。
実施例76:GeneExpress(登録商標)を用いた組織発現プロファイリング
遺伝子発現情報(GeneExpress(登録商標),Gene Logic Inc.,Gaithersburg,MD)を含むプロプライエタリ(proprietary)データベースを、その発現が他の腫瘍(1種類または複数種)および/または正常組織と比べ、対象の特定の腫瘍組織(1種類または複数種)において有意に上方調節されるポリペプチド(およびそのコード核酸)を同定する試みにおいて解析した。具体的には、GeneExpress(登録商標)データベースの解析は、Gene Logic Inc.,Gaithersburg,MDから入手可能な、GeneExpress(登録商標)データベースの使用のためのソフトウエア、またはGenentech,Inc.で書き込みおよび開発されたGeneExpress(登録商標)データベースの使用のためのプロプライエタリソフトウエアのいずれかを用いて行なった。解析における陽性ヒットの評価は、いくつかの基準、例えば、正常な必須組織および/または正常な増殖組織における組織特異性、腫瘍特異性および発現レベルなどに基づく。以下のものは、GeneExpress(登録商標)データベースの解析から測定されるその組織発現プロフィールによって、他の腫瘍(1種類または複数種)および/または正常組織と比べて特定の腫瘍または腫瘍における高い組織発現および発現の有意な上方調節が証明され、任意選択で、正常な必須組織および/または正常な増殖組織における比較的低い発現が証明される分子の列挙である。
実施例77:癌性腫瘍におけるUNQ遺伝子の上方調節を検出するためのマイクロアレイ解析
核酸マイクロアレイ(多くの場合、数千個の遺伝子配列を含む)は、その対応する正常組織と比べて疾患組織において示差的に発現される遺伝子を同定するのに有用である。核酸マイクロアレイを用いて、試験組織試料および対照組織試料由来の試験mRNA試料および対照mRNA試料を逆転写し、標識してcDNAプローブを作製する。次いで、cDNAプローブを、固相支持体上に固定化させた核酸のアレイにハイブリダイズさせる。アレイは、アレイの各メンバーの配列および位置が既知であるように構成する。例えば、ある特定の疾患状態で発現されることがわかっている一群の選択された遺伝子が固相支持体上でアレイ状になり得る。標識プローブとある特定のアレイメンバーとのハイブリダイゼーションは、プローブを誘導した試料が遺伝子を発現することを示す。試験(疾患組織)試料由来のプローブのハイブリダイゼーションシグナルが、対照(正常組織)試料由来のプローブのハイブリダイゼーションシグナルより大きい場合、疾患組織において過剰発現される遺伝子(1つまたは複数)が同定される。この結果が示唆することは、疾患組織において過剰発現されるタンパク質は、疾患状態の存在の診断用マーカーとしてだけでなく、疾患状態の処置のための治療用標的として有用であるということである。
核酸のハイブリダイゼーションおよびマイクロアレイ技術の方法論は、当該技術分野でよく知られている。一例において、ハイブリダイゼーション用核酸およびプローブ、スライドの具体的な調製ならびにハイブリダイゼーション条件はすべて、2001年3月30日に出願されたPCT特許出願番号PCT/US01/10482(引用により本明細書に組み込まれる)に詳述されている。
本発明の実施例では、種々のヒト組織由来の癌性腫瘍を、異なる組織型および/または非癌性ヒト組織における癌性腫瘍と比べた遺伝子発現の上方調節について、ある特定の癌性腫瘍(1種類または複数種)において過剰発現されるポリペプチドを同定する試みにおいて試験した。ある特定の実験では、同じ組織型(多くの場合、同じ患者由来)の癌性ヒト腫瘍組織および非癌性ヒト腫瘍組織を得、UNQポリペプチド発現について解析した。さらに、任意のさまざまな異なるヒト腫瘍由来の癌性ヒト腫瘍組織を得、上皮起源の非癌性ヒト組織、例えば、肝臓、腎臓および肺をプールすることにより調製した「普遍」上皮対照試料と比較した。プールした組織から単離したmRNAは、これらの異なる組織に由来する発現された遺伝子産物の混合物を提示する。プールした対照試料を用いたマイクロアレイハイブリダイゼーション実験により、2色解析において線形プロットを作成した。次いで、2色解析において作成した直線の傾きを用い、各実験内での(試験:対照検出)の比を標準化した。次いで、種々の実験の標準化した比を比較し、遺伝子発現のクラスタリングを確認するために使用した。したがって、プールされた「普遍対照」試料によって、試料の2試料比較において有効な相対的遺伝子発現の測定が可能となっただけでなく、いくつかの実験間での多重試料比較もまた可能となった。
本発明の実験では、本明細書に記載のUNQポリペプチドコード核酸配列に由来する核酸プローブをマイクロアレイの創製に使用し、種々の腫瘍組織由来のRNAをそのハイブリダイゼーションに使用した。以下に、これらの実験の結果を示すが、これは、本発明の種々のUNQポリペプチドが、種々のヒト腫瘍組織において、その対応する正常組織(1種類または複数種)と比べて有意に過剰発現されることを示す。さらに、以下に示す分子はすべて、その特異的腫瘍組織(1種類または複数種)において、「普遍」上皮対照と比べて有意に過剰発現される。上記のように、これらのデータは、本発明のUNQポリペプチドが、1種類以上の癌性腫瘍の存在の診断用マーカーとして有用であるだけでなく、該腫瘍の処置のための治療用標的として機能することを示す。
実施例78:UNQ mRNA発現の定量的解析
このアッセイでは、5’ヌクレアーゼアッセイ(例えば、TaqMan(登録商標))およびリアルタイム定量的PCR(例えば、ABI Prizm 7700 Sequence Detection System(登録商標)(Perkin Elmer,Applied Biosystems Division,Foster City,CA))を用い、他の癌性腫瘍または正常な非癌性組織と比べて癌性腫瘍(1種類または複数種)で有意に過剰発現される遺伝子を見出した。5’ヌクレアーゼアッセイ反応は、遺伝子発現を、リアルタイムをモニターするのにTaq DNAポリメラーゼ酵素の5’エキソヌクレアーゼ活性を利用する蛍光PCRに基づく手法である。2種類のオリゴヌクレオチドプライマー(その配列は、目的の遺伝子またはEST配列に基づく)を用い、PCR反応に典型的なアンプリコンを作製する。この2つのPCRプライマー間に位置するヌクレオチド配列を検出するための第3のオリゴヌクレオチドあるいはプローブを設計する。プローブは、Taq DNAポリメラーゼ酵素によって非伸長可能であり、レポーター蛍光色素およびクエンチャー蛍光色素で標識される。レポーター色素からのレーザー誘導型発光はいずれも、2つの色素がプローブ上に存在している場合に互いの位置が近接したとき、クエンチャー色素によってクエンチされる。PCR増幅反応中、Taq DNAポリメラーゼ酵素は、プローブを鋳型依存的に切断する。得られたプローブ断片は溶液中で解離し、放出されたレポーター色素からのシグナルには、第2のフルオロフォアのクエンチ効果はない。レポーター色素の一方の分子は、合成された新たな分子の各々について遊離され、クエンチされていないレポーター色素の検出は、データの定量的解釈の根拠を提供する。
5’ヌクレアーゼ手順は、ABI Prism 7700TM Sequence Detectionなどのリアルタイム定量的PCR装置において行なわれる。システムは、サーモサイクラー、レーザー、電荷結合素子(CCD)カメラおよびコンピュータからなる。システムにより、試料を、サーモサイクラーにて96ウェル形態において増幅する。増幅中、レーザー誘導型蛍光シグナルを、光ファイバーケーブルを介して96個のウェルすべてについてリアルタイムで収集し、CCDで検出する。システムは、装置の作動およびデータの解析のためのをソフトウエアを含む。
スクリーニングのための出発材料は、さまざまな異なる癌性組織単離されたmRNAであった。mRNAは、例えば、蛍光測定法により正確に定量される。陰性対照として、RNAを、試験される癌性組織と同じ組織型の種々の正常組織から単離した。
5’ヌクレアーゼアッセイデータを、まず、Ctすなわち閾値サイクル数として示す。これは、レポーターシグナルが、バックグラウンドより高い蛍光レベルに蓄積されるサイクルと規定する。ΔCt値を、癌mRNAの結果を正常なヒトmRNAの結果と比較した場合の、核酸試料中のある特定の標的配列の相対的出発コピー数の定量的測定値として用いる。1単位のCtは、1回のPCRサイクルまたは正常と比べておよそ2倍の相対的増加に相当するため、2単位は4倍の相対的増加に相当し、3単位は8倍の相対的増加に相当するなどであり、2種類以上の異なる組織間でのmRNA発現における相対増加倍数を定量的に測定し得る。この手法を用い、該分子は、その正常な非癌性対応する組織(1種類または複数種)(同じ組織ドナー由来および異なる組織ドナー由来の両方)と比べて、ある特定の腫瘍(1種類または複数種)において有意に過剰発現され、したがって、哺乳動物における癌の診断および治療のための優れたポリペプチド標的を提示すると確認された。
実施例79:インサイチューハイブリダイゼーション
インサイチューハイブリダイゼーションは、細胞または組織の調製物内の核酸配列の検出および位置特定のための強力で多用途の手法である。これは、例えば、遺伝子の発現部位を同定するため、転写の組織分布を解析するため、ウイルス感染を同定および位置特定するため、特定のmRNA合成における変化を追跡するため、ならびに染色体マッピングを補助するために有用であり得る。
インサイチューハイブリダイゼーションを、LuおよびGillett,Cell Vision 1:169−176(1994)の最適化された型のプロトコルに従い、PCR生成33P標識リボプローブを用いて行なった。簡単には、ホルマリン固定し、パラフィン包埋したヒト組織を切片化し、脱パラフィン化し、プロテイナーゼK(20g/ml)中で15分間37℃にてタンパク質除去し、LuおよびGillett(前掲)に記載のようにインサイチューハイブリダイゼーション用にさらに加工処理した。[33P]UTP標識アンチセンスリボプローブをPCR産物から作製し、55℃で一晩ハイブリダイズさせた。スライドをKodak NTB2核トラック乳剤中に浸漬し、4週間露光した。
33Pリボプローブ合成
6.0μl(125mCi)の33P−UTP(Amersham BF 1002、SA<2000Ci/mmol)を高速真空乾燥した。乾燥33P−UTPを入れた各チューブに、以下の成分を加えた:
2.0μlの5×転写バッファー
1.0μlのDTT(100mM)
2.0μlのNTPミックス(2.5mM:10μ;各々10mMのGTP、CTPおよびATP+10μlのHO)
1.0μlのUTP(50μM)
1.0μlのRnasin
1.0μlのDNA鋳型(1μg)
1.0μlのH
1.0μlのRNAポリメラーゼ(PCR産物用、T3=AS、T7=S、通常)
チューブを37℃で1時間インキュベートした。1.0μlのRQ1 DNアーゼを添加した後、37℃で15分間インキュベーションを行なった。90μlのTE(10mM Tris pH7.6/1mM EDTA pH8.0)を添加し、混合物をDE81紙上にピペッティングした。残った溶液をMicrocon−50限外濾過ユニット内に負荷し、プログラム10を用いてスピンした(6分間)。濾過ユニットを第2のチューブ上に反転し、プログラム2を用いてスピンした(3分間)。最終の回収スピン後、100μlのTEを添加した。1μlの最終産物をDE81紙上にピペッティングし、6mlのBiofluor II中で計数した。
プローブをTBE/尿素ゲル上で泳動させた。1〜3μlのプローブまたは5μlのRNA Mrk IIIを3μlの負荷バッファーに添加した。95℃のヒートブロック上で3分間加熱後、プローブを直接、氷上に置いた。ゲルのウェルをフラッシュ洗浄し、試料を負荷し、180〜250ボルトで45分間泳動させた。ゲルをサランラップでラップし、増感紙を有するXARフィルムに、−70℃のフリーザー内で1時間から一晩露光した。
33P−ハイブリダイゼーション
A.凍結切片の前処理
スライドをフリーザーから取り出し、アルミニウムトレイ上に置き、室温で5分間解凍した。トレイを55℃のインキュベーター内に5分間配置し、結露を低減させた。スライドを、ヒュームフード内で氷上の4%パラホルムアルデヒド中に10分間固定し、0.5×SSC中で5分間、室温にて洗浄した(25ml 20×SSC+975ml SQ HO)。0.5μg/mlのプロテイナーゼK中、10分間37℃でのタンパク質除去(250mlの予備加温RNアーゼ無含有RNアーゼバッファー中、12.5μlの10mg/mlストック)後、切片を0.5×SSC中で10分間、室温にて洗浄した。切片を、70%、95%、100%エタノール中で各々2分間脱水した。
B.パラフィン包埋切片の前処理
スライドを脱パラフィン処理し、SQ HO中に入れ、2×SSC中で2回、室温で各回5分間リンス処理した。切片を、20μg/mlのプロテイナーゼK(250mlのRNアーゼ無含有RNアーゼバッファー中10mg/mlで500μl;37℃、15分間)(ヒト胚)、または8×プロテイナーゼK(250mlのRnアーゼバッファー中100μl、37℃、30分間)(ホルマリン組織)中でタンパク質除去処理した。続いて、0.5×SSC中でのリンス処理および脱水を、上記のようにして行なった。
C.プレハイブリダイゼーション
スライドを、Boxバッファー(4×SSC、50%ホルムアミド)を飽和させた濾紙を内側に貼り付けたプラスチックボックス内に並べた。
D.ハイブリダイゼーション
スライド1.0×10cpmのプローブおよび1.0μlのtRNA(50mg/mlストック)を95℃で3分間加熱した。スライドを氷上で冷却し、スライド1枚あたり48μlのハイブリダイゼーションバッファーを添加した。ボルテックスした後、50μlの33Pミックスを、スライド上の50μlのプレハイブリダイゼーション液に添加した。スライドを一晩55℃でインキュベートした。
E.洗浄
洗浄は、室温で、2×SSC、EDTAを用いて10分間を2回行なった(400mlの20×SSC+16mlの0.25M EDTA、V=4L)後、RNアーゼA処理を37℃で30分間行なった(250mlのRnアーゼバッファー中10mg/ml=20μg/mで500μl)。スライドを室温で2×SSC、EDTAにて10分間、2回洗浄した。ストリンジェンシー洗浄条件は、以下の通り:55℃で2時間、0.1×SSC、EDTA(20mlの20×SSC+16ml EDTA、V=4L)とした。
F.オリゴヌクレオチド
インサイチュー解析を、本明細書に開示したさまざまなDNA配列において行なった。これらの解析に用いたオリゴヌクレオチドは、添付の図面に示した核酸(またはその相補配列)に相補的となるように得た。
実施例80:PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に結合する抗体の調製
この実施例は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に特異的に結合し得るモノクローナル抗体の調製を示す。
モノクローナル抗体を作製するための手法は当該技術分野で知られており、例えば、Goding(前掲)に記載されている。使用され得る免疫原としては、精製されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを含有する融合タンパク質、および組換えPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを細胞表面上に発現する細胞が挙げられる。免疫原の選択は、当業者が必要以上に実験を行なうことなく行ない得る。
Balb/cなどのマウスを、完全フロイントアジュバント中で乳化させたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404免疫原で免疫処置し、1〜100マイクログラムの量で皮下または腹腔内注射する。あるいはまた、免疫原を、MPL−TDMアジュバント(Ribi Immunochemical Research,Hamilton,MT)中に乳化させ、動物の後肢支脚皿に注射する。次いで、免疫処置されたマウスを10〜12日後、選択したアジュバント中に乳化させたさらなる免疫原で追加免疫刺激する。その後、数週間、マウスにさらなる免疫処置注射により追加免疫刺激してもよい。血清試料を、定期的にマウスから後眼窩採血によって採取し、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を検出するELISAアッセイにおいて試験し得る。
適当な抗体力価が検出された後、抗体について「陽性」の動物に、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の最終の静脈内注射が注射され得る。3〜4日後、マウスを犠牲死させ、脾臓細胞を回収する。次いで、脾臓細胞を、選択したマウス骨髄腫細胞株(例えば、ATCC番号CRL 1597から入手可能なP3X63AgU.1など)と融合させる(35%ポリエチレングリコールを使用)。融合によりハイブリドーマ細胞を作製し、次いで、これを、非融合細胞、骨髄腫ハイブリッドおよび脾臓細胞ハイブリッドの増殖を阻害するHAT(ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジン)培地を入れた96ウェル組織培養プレート内にプレーティングし得る。
ハイブリドーマ細胞は、ELISAにおいてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に対する反応性についてスクリーニングする。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に対する所望のモノクローナル抗体を分泌する「陽性」ハイブリドーマ細胞の決定は、当該技術分野の技量の範囲内である。
陽性ハイブリドーマ細胞を同系Balb/cマウスに腹腔内注射し、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404モノクローナル抗体を含有する腹水を生成し得る。あるいはまた、ハイブリドーマ細胞を組織培養フラスコまたはローラーボトル内で培養してもよい。腹水内に産生されたモノクローナル抗体の精製は、硫酸アンモニウム沈殿の後ゲル排除クロマトグラフィーを用いて行ない得る。あるいはまた、タンパク質Aまたはタンパク質Gに対する抗体の結合に基づくアフィニティクロマトグラフィーを使用し得る。
実施例81:特異的抗体を用いたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの精製
天然または組換えPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを、タンパク質精製の分野におけるさまざまな標準的な手法によって精製し得る。例えば、pro−PRO179,pro−PRO181,pro−PRO244,pro−PRO247,pro−PRO269,pro−PRO293,pro−PRO298,pro−PRO339,pro−PRO341,pro−PRO347,pro−PRO531,pro−PRO537,pro−PRO718,pro−PRO773,pro−PRO860,pro−PRO871,pro−PRO872,pro−PRO813,pro−PRO828,pro−PRO1100,pro−PRO1114,pro−PRO1115,pro−PRO1126,pro−PRO1133,pro−PRO1154,pro−PRO1185,pro−PRO1194,pro−PRO1287,pro−PRO1291,pro−PRO1293,pro−PRO1310,pro−PRO1312,pro−PRO1335,pro−PRO1339,pro−PRO2155,pro−PRO1356,pro−PRO1385,pro−PRO1412,pro−PRO1487,pro−PRO1758,pro−PRO1779,pro−PRO1785,pro−PRO1889,pro−PRO90318,pro−PRO3434,pro−PRO3579,pro−PRO4322,pro−PRO4343,pro−PRO4347,pro−PRO4403,pro−PRO4976,pro−PRO260,pro−PRO6014,pro−PRO6027,pro−PRO6181,pro−PRO6714,pro−PRO9922,pro−PRO7179,pro−PRO7476,pro−PRO9824,pro−PRO19814,pro−PRO19836,pro−PRO20088,pro−PRO70789,pro−PRO50298,pro−PRO51592,pro−PRO1757,pro−PRO4421,pro−PRO9903,pro−PRO1106,pro−PRO1411,pro−PRO1486,pro−PRO1565,pro−PRO4399またはpro−PRO4404ポリペプチド、成熟PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたはpre−PRO179,pre−PRO181,pre−PRO244,pre−PRO247,pre−PRO269,pre−PRO293,pre−PRO298,pre−PRO339,pre−PRO341,pre−PRO347,pre−PRO531,pre−PRO537,pre−PRO718,pre−PRO773,pre−PRO860,pre−PRO871,pre−PRO872,pre−PRO813,pre−PRO828,pre−PRO1100,pre−PRO1114,pre−PRO1115,pre−PRO1126,pre−PRO1133,pre−PRO1154,pre−PRO1185,pre−PRO1194,pre−PRO1287,pre−PRO1291,pre−PRO1293,pre−PRO1310,pre−PRO1312,pre−PRO1335,pre−PRO1339,pre−PRO2155,pre−PRO1356,pre−PRO1385,pre−PRO1412,pre−PRO1487,pre−PRO1758,pre−PRO1779,pre−PRO1785,pre−PRO1889,pre−PRO90318,pre−PRO3434,pre−PRO3579,pre−PRO4322,pre−PRO4343,pre−PRO4347,pre−PRO4403,pre−PRO4976,pre−PRO260,pre−PRO6014,pre−PRO6027,pre−PRO6181,pre−PRO6714,pre−PRO9922,pre−PRO7179,pre−PRO7476,pre−PRO9824,pre−PRO19814,pre−PRO19836,pre−PRO20088,pre−PRO70789,pre−PRO50298,pre−PRO51592,pre−PRO1757,pre−PRO4421,pre−PRO9903,pre−PRO1106,pre−PRO1411,pre−PRO1486,pre−PRO1565,pre−PRO4399またはpre−PRO4404ポリペプチドを、対象のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに特異的な抗体を用いたイムノアフィニティクロマトグラフィーによって精製する。一般に、イムノアフィニティカラムは、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404ポリペプチド抗体を活性化したクロマトグラフィー樹脂に共有結合によってカップリングさせることにより構成されている。
ポリクローナル免疫グロブリンを、免疫血清から、硫酸アンモニウムでの沈殿、または固定化したタンパク質A(Pharmacia LKB Biotechnology,Piscataway,N.J.)上での精製のいずれかによって調製する。同様に、モノクローナル抗体を、マウス腹水から、硫酸アンモニウム沈殿または固定化したタンパク質A上でのクロマトグラフィーによって調製する。部分精製された免疫グロブリンを、CnBr活性化SEPHAROSE(商標)(Pharmacia LKB Biotechnology)などのクロマトグラフィー樹脂に共有結合させる。抗体を樹脂にカップリングさせ、樹脂をブロックし、誘導体樹脂を、製造業者の使用説明書に従って洗浄する。
かかるイムノアフィニティカラムは、可溶性形態のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを含む細胞由来の画分を調製することにより、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの精製に利用する。この調製物を、デタージェントの添加による分画遠心分離により得られた完全体細胞または亜細胞画分の可溶化によって、または当該技術分野でよく知られた他の方法によって誘導する。あるいはまた、シグナル配列を含む可溶性ポリペプチドを、有用な量で、該細胞を培養している培地中に分泌し得る。
可溶性PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド含有調製物をイムノアフィニティカラムに通し、カラムを、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの優先的吸収を可能にする条件下(例えば、デタージェントの存在下の高イオン強度バッファー)で洗浄する。次いで、カラムを、抗体/PRO179,抗体/PRO181,抗体/PRO244,抗体/PRO247,抗体/PRO269,抗体/PRO293,抗体/PRO298,抗体/PRO339,抗体/PRO341,抗体/PRO347,抗体/PRO531,抗体/PRO537,抗体/PRO718,抗体/PRO773,抗体/PRO860,抗体/PRO871,抗体/PRO872,抗体/PRO813,抗体/PRO828,抗体/PRO1100,抗体/PRO1114,抗体/PRO1115,抗体/PRO1126,抗体/PRO1133,抗体/PRO1154,抗体/PRO1185,抗体/PRO1194,抗体/PRO1287,抗体/PRO1291,抗体/PRO1293,抗体/PRO1310,抗体/PRO1312,抗体/PRO1335,抗体/PRO1339,抗体/PRO2155,抗体/PRO1356,抗体/PRO1385,抗体/PRO1412,抗体/PRO1487,抗体/PRO1758,抗体/PRO1779,抗体/PRO1785,抗体/PRO1889,抗体/PRO90318,抗体/PRO3434,抗体/PRO3579,抗体/PRO4322,抗体/PRO4343,抗体/PRO4347,抗体/PRO4403,抗体/PRO4976,抗体/PRO260,抗体/PRO6014,抗体/PRO6027,抗体/PRO6181,抗体/PRO6714,抗体/PRO9922,抗体/PRO7179,抗体/PRO7476,抗体/PRO9824,抗体/PRO19814,抗体/PRO19836,抗体/PRO20088,抗体/PRO70789,抗体/PRO50298,抗体/PRO51592,抗体/PRO1757,抗体/PRO4421,抗体/PRO9903,抗体/PRO1106,抗体/PRO1411,抗体/PRO1486,抗体/PRO1565,抗体/PRO4399または抗体/PRO4404ポリペプチド結合を破壊する条件下(例えば、低pHバッファー(例えば、およそpH2〜3など)または高濃度のカオトロピック薬剤(例えば、尿素またはチオシアネートイオンなど))で溶出させ、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを収集する。
実施例82:薬物スクリーニング
本発明は、さまざまな薬物スクリーニング手法のいずれかにおいて、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたはその結合断片を用いることによる化合物のスクリーニングに特に有用である。かかる試験に使用されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片は、溶液中で遊離、固相支持体に固定、細胞表面上に担持、または細胞内に局在のいずれかであり得る。薬物スクリーニング方法の一例では、組換え核酸で安定に形質転換された、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片を発現する真核生物または原核生物の宿主細胞を用いる。薬物は、競合的結合アッセイで、かかる形質転換細胞に対してスクリーニングする。かかる細胞は、バイアブルな状態または固定された形態のいずれかで、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片と試験対象の薬剤との複合体の形成を測定できる。あるいはまた、試験される薬剤によって引き起こされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドとその標的細胞または標的受容体との複合体形成の減少を検査できる。
したがって、本発明は、薬物またはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド関連の疾患または障害に影響を及ぼし得る任意の他の薬剤のスクリーニング方法を提供する。このような方法は、かかる薬剤をPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたはその断片と接触させること、および(I)該薬剤とPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドもしくは断片との複合体の存在について、または(ii)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドもしくは断片を細胞との複合体の存在について、当該技術分野でよく知られた方法によってアッセイすることを含む。かかる競合的結合アッセイでは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片を、典型的には標識する。適当なインキュベーション後、遊離PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片を、結合された形態で存在するものから分離し、遊離または非複合体形成標識の量を、その特定の薬剤がPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに結合する能力またはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド/細胞複合体に干渉する能力の尺度とする。
薬物スクリーニングのための別の手法は、ポリペプチドに対して適当な結合親和性を有する化合物のハイスループットスクリーニングを提供し、WO84/03564(1984年9月13日に公開)に詳細に記載されている。簡単に述べると、多数の異なる小ペプチド試験化合物を、プラスチックピンまたはいずれかの他の表面などの固相基材上で合成する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに適用し、ペプチド試験化合物をPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと反応させ、洗浄する。結合されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは、当該技術分野でよく知られた方法によって検出する。また、精製したPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを、前述の薬物スクリーニング手法における使用のために、直接プレート上にコートしてもよい。また、非中和抗体を用いてペプチドを捕捉し、固相支持体上に固定化してもよい。
本発明ではまた、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに結合できる中和抗体が、試験化合物と、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたはその断片に対する結合に関して特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイの使用が想定される。このようにして、該抗体は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと1つ以上の抗原性決定基とを共有する任意のペプチドの存在を検出するために使用できる。
実施例83:合理的な薬物設計
合理的な薬物設計の目的は、目的の生物学的に活性なポリペプチド(すなわち、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド)または該ポリペプチドと相互作用する小分子、例えば、アゴニスト、アンタゴニストもしくはインヒビターの構造的類縁体を作製することである。これらの例のいずれかを用い、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのより活性または安定な形態である薬物またはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの機能をインビボで増強もしくは干渉する薬物を創出し得る(Hodgson,Bio/Technology,9:19−21(1991)を参照)。
アプローチの一例において、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド−インヒビター複合体の3次元構造を、x線結晶学、コンピュータモデル設計または、最も典型的には、この2つのアプローチの組合せによって決定する。該分子の構造を解明するため、および活性部位(1つまたは複数)を決定するためには、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの形状および電荷の両方が確認されなければならない。頻度は低いが、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの構造に関する有用な情報を、相同タンパク質の構造に基づいたモデル設計によって得ることができる。両方の場合において、関連する構造的情報は、類縁PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド様分子を設計するため、または効率的なインヒビターを同定するために使用する。合理的な薬物設計の有用な例としては、BraxtonおよびWells,Biochemistry,31:7796−7801(1992)に示されたような改善された活性もしくは安定性を有する分子、またはAthaudaら,J.Biochem.,113:742−746(1993)に示されたような天然ペプチドのインヒビター、アゴニストもしくはアンタゴニストとして作用する分子が挙げられ得る。
また、上記のようにして機能アッセイによって選択された標的特異的抗体を単離し、次いで、その結晶構造を解明することも可能である。このアプローチは、原理的には、その後の薬物設計の基礎となり得るファーマコアをもたらす。タンパク質結晶学は、機能性の薬理学的に活性な抗体に対する抗イデオタイプ抗体(抗id)を作製することにより、全く回避することが可能である。鏡像の鏡像として、抗idの結合部位は、元の受容体の類縁体であることが予測され得る。次いで、抗idを、化学的または生物学的に作製されたペプチドのバンクからペプチドを同定および単離するために使用できる。次いで、単離されたペプチドは、ファーマコアとしての役目を果たし得る。
本発明のおかげで、X線結晶学などの解析的研究を行なうのに充分な量のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドが利用可能となり得る。また、本明細書に提供されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドアミノ酸配列の知得により、x線結晶学の代わり、またはこれに加えてにコンピュータモデル設計手法が使用されるものに対する手引きが提供される。
図1はネイティブ配列PRO179cDNAのヌクレオチド配列(配列番号1)を示し、ここで配列番号1は「DNA16451−1078」(UNQ153)と本明細書において表記されるクローンである。 図2は図1に示す配列番号1のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号2)を示す。 図3はネイティブ配列PRO181cDNAのヌクレオチド配列(配列番号3)を示し、ここで配列番号3は「DNA23330−1390」(UNQ155)と本明細書において表記されるクローンである。 図4は図3に示す配列番号3のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号4)を示す。 図5はネイティブ配列PRO244cDNAのヌクレオチド配列(配列番号5)を示し、ここで配列番号5は「DNA35668−1171」(UNQ218)と本明細書において表記されるクローンである。 図6は図5に示す配列番号5のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号6)を示す。 図7はネイティブ配列PRO247cDNAのヌクレオチド配列(配列番号7)を示し、ここで配列番号7は「DNA35673−1201」(UNQ221)と本明細書において表記されるクローンである。 図8は図7に示す配列番号7のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号8)を示す。 図9はネイティブ配列PRO269cDNAのヌクレオチド配列(配列番号9)を示し、ここで配列番号9は「DNA38260−1180」(UNQ236)と本明細書において表記されるクローンである。 図10は図9に示す配列番号9のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号10)を示す。 図11はネイティブ配列PRO293cDNAのヌクレオチド配列(配列番号11)を示し、ここで配列番号11は「DNA37151−1193」(UNQ256)と本明細書において表記されるクローンである。 図12は図11に示す配列番号11のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号12)を示す。 図13はネイティブ配列PRO298cDNAのヌクレオチド配列(配列番号13)を示し、ここで配列番号13は「DNA39975−1210」(UNQ261)と本明細書において表記されるクローンである。 図14は図13に示す配列番号13のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号14)を示す。 図15はネイティブ配列PRO339cDNAのヌクレオチド配列(配列番号15)を示し、ここで配列番号15は「DNA43466−1225」(UNQ299)と本明細書において表記されるクローンである。 図16は図15に示す配列番号15のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号16)を示す。 図17はネイティブ配列PRO341cDNAのヌクレオチド配列(配列番号17)を示し、ここで配列番号17は「DNA26288−1239」(UNQ300)と本明細書において表記されるクローンである。 図18は図17に示す配列番号17のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号18)を示す。 図19はネイティブ配列PRO347cDNAのヌクレオチド配列(配列番号19)を示し、ここで配列番号19は「DNA44176−1244」(UNQ306)と本明細書において表記されるクローンである。 図20は図19に示す配列番号19のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号20)を示す。 図21はネイティブ配列PRO531cDNAのヌクレオチド配列(配列番号21)を示し、ここで配列番号21は「DNA48314−1320」(UNQ332)と本明細書において表記されるクローンである。 図22は図21に示す配列番号21のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号22)を示す。 図23はネイティブ配列PRO537cDNAのヌクレオチド配列(配列番号23)を示し、ここで配列番号23は「DNA49141−1431」(UNQ338)と本明細書において表記されるクローンである。 図24は図23に示す配列番号23のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号24)を示す。 図25はネイティブ配列PRO718cDNAのヌクレオチド配列(配列番号25)を示し、ここで配列番号25は「DNA49647−1398」(UNQ386)と本明細書において表記されるクローンである。 図26は図25に示す配列番号25のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号26)を示す。 図27はネイティブ配列PRO773cDNAのヌクレオチド配列(配列番号27)を示し、ここで配列番号27は「DNA48303−2829」(UNQ411)と本明細書において表記されるクローンである。 図28は図27に示す配列番号27のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号28)を示す。 図29はネイティブ配列PRO860cDNAのヌクレオチド配列(配列番号29)を示し、ここで配列番号29は「DNA60614」(UNQ421)と本明細書において表記されるクローンである。 図30は図29に示す配列番号29のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号30)を示す。 図31はネイティブ配列PRO871cDNAのヌクレオチド配列(配列番号31)を示し、ここで配列番号31は「DNA50919−1361」(UNQ438)と本明細書において表記されるクローンである。 図32は図31に示す配列番号31のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号32)を示す。 図33はネイティブ配列PRO872cDNAのヌクレオチド配列(配列番号33)を示し、ここで配列番号33は「DNA49819−1439」(UNQ439)と本明細書において表記されるクローンである。 図34は図33に示す配列番号33のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号34)を示す。 図35はネイティブ配列PRO813cDNAのヌクレオチド配列(配列番号35)を示し、ここで配列番号35は「DNA57834−1339」(UNQ465)と本明細書において表記されるクローンである。 図36は図35に示す配列番号35のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号36)を示す。 図37はネイティブ配列PRO828cDNAのヌクレオチド配列(配列番号37)を示し、ここで配列番号37は「DNA57037−1444」(UNQ469)と本明細書において表記されるクローンである。 図38は図37に示す配列番号37のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号38)を示す。 図39はネイティブ配列PRO1100cDNAのヌクレオチド配列(配列番号39)を示し、ここで配列番号39は「DNA59619−1464」(UNQ546)と本明細書において表記されるクローンである。 図40は図39に示す配列番号39のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号40)を示す。 図41はネイティブ配列PRO1114cDNAのヌクレオチド配列(配列番号41)を示し、ここで配列番号41は「DNA57033−1403」(UNQ557)と本明細書において表記されるクローンである。 図42は図41に示す配列番号41のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号42)を示す。 図43はネイティブ配列PRO1115cDNAのヌクレオチド配列(配列番号43)を示し、ここで配列番号43は「DNA56868−1478」(UNQ558)と本明細書において表記されるクローンである。 図44は図41に示す配列番号41のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号44)を示す。 図45はネイティブ配列PRO1126cDNAのヌクレオチド配列(配列番号45)を示し、ここで配列番号45は「DNA60615−1483」(UNQ564)と本明細書において表記されるクローンである。 図46は図45に示す配列番号45のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号46)を示す。 図47はネイティブ配列PRO1133cDNAのヌクレオチド配列(配列番号47)を示し、ここで配列番号47は「DNA53913−1490」(UNQ571)と本明細書において表記されるクローンである。 図48は図41に示す配列番号41のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号48)を示す。 図49はネイティブ配列PRO1154cDNAのヌクレオチド配列(配列番号49)を示し、ここで配列番号49は「DNA59846−1503」(UNQ584)と本明細書において表記されるクローンである。 図50は図49に示す配列番号49のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号50)を示す。 図51はネイティブ配列PRO1185cDNAのヌクレオチド配列(配列番号51)を示し、ここで配列番号51は「DNA62881−1515」(UNQ599)と本明細書において表記されるクローンである。 図52は図51に示す配列番号51のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号52)を示す。 図53はネイティブ配列PRO1194cDNAのヌクレオチド配列(配列番号53)を示し、ここで配列番号53は「DNA57841−1522」(UNQ607)と本明細書において表記されるクローンである。 図54は図53に示す配列番号53のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号54)を示す。 図55はネイティブ配列PRO1287cDNAのヌクレオチド配列(配列番号55)を示し、ここで配列番号55は「DNA61755−1554」(UNQ656)と本明細書において表記されるクローンである。 図56は図55に示す配列番号55のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号56)を示す。 図57はネイティブ配列PRO1291cDNAのヌクレオチド配列(配列番号57)を示し、ここで配列番号57は「DNA59610−1556」(UNQ659)と本明細書において表記されるクローンである。 図58は図57に示す配列番号57のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号58)を示す。 図59はネイティブ配列PRO1293cDNAのヌクレオチド配列(配列番号59)を示し、ここで配列番号59は「DNA60618−1557」(UNQ662)と本明細書において表記されるクローンである。 図60は図59に示す配列番号59のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号60)を示す。 図61はネイティブ配列PRO1310cDNAのヌクレオチド配列(配列番号61)を示し、ここで配列番号61は「DNA47394−1572」(UNQ676)と本明細書において表記されるクローンである。 図62は図61に示す配列番号61のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号62)を示す。 図63はネイティブ配列PRO1312cDNAのヌクレオチド配列(配列番号63)を示し、ここで配列番号63は「DNA61873−1574」(UNQ678)と本明細書において表記されるクローンである。 図64は図63に示す配列番号63のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号64)を示す。 図65はネイティブ配列PRO1335cDNAのヌクレオチド配列(配列番号65)を示し、ここで配列番号65は「DNA62812−1594」(UNQ690)と本明細書において表記されるクローンである。 図66は図65に示す配列番号65のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号66)を示す。 図67はネイティブ配列PRO1339cDNAのヌクレオチド配列(配列番号67)を示し、ここで配列番号67は「DNA66669−1597」(UNQ694)と本明細書において表記されるクローンである。 図68は図67に示す配列番号67のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号68)を示す。 図69はネイティブ配列PRO2155cDNAのヌクレオチド配列(配列番号69)を示し、ここで配列番号69は「DNA88062」(UNQ696)と本明細書において表記されるクローンである。 図70は図69に示す配列番号69のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号70)を示す。 図71はネイティブ配列PRO1356cDNAのヌクレオチド配列(配列番号71)を示し、ここで配列番号71は「DNA64886−1601」(UNQ705)と本明細書において表記されるクローンである。 図72は図71に示す配列番号71のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号72)を示す。 図73はネイティブ配列PRO1385cDNAのヌクレオチド配列(配列番号73)を示し、ここで配列番号73は「DNA68869−1610」(UNQ720)と本明細書において表記されるクローンである。 図74は図73に示す配列番号73のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号74)を示す。 図75はネイティブ配列PRO1412cDNAのヌクレオチド配列(配列番号75)を示し、ここで配列番号75は「DNA64897−1628」(UNQ730)と本明細書において表記されるクローンである。 図76は図75に示す配列番号75のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号76)を示す。 図77Aはネイティブ配列PRO1487Cdnaのヌクレオチド配列(配列番号77)を示し、ここで配列番号77は「DNA68836−1656」(UNQ756)と本明細書において表記されるクローンである。 図77Bはネイティブ配列PRO1487Cdnaのヌクレオチド配列(配列番号77)を示し、ここで配列番号77は「DNA68836−1656」(UNQ756)と本明細書において表記されるクローンである。 図78は図77A〜77Bに示す配列番号77のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号78)を示す。 図79はネイティブ配列PRO1758cDNAのヌクレオチド配列(配列番号79)を示し、ここで配列番号79は「DNA76399−1700」(UNQ831)と本明細書において表記されるクローンである。 図80は図79に示す配列番号79のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号80)を示す。 図81はネイティブ配列PRO1779cDNAのヌクレオチド配列(配列番号81)を示し、ここで配列番号81は「DNA73775−1707」(UNQ841)と本明細書において表記されるクローンである。 図82Aは図81に示す配列番号81のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号82)を示す。 図82Bは図81に示す配列番号81のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号82)を示す。 図83はネイティブ配列PRO1785cDNAのヌクレオチド配列(配列番号83)を示し、ここで配列番号83は「DNA80136−2503」(UNQ847)と本明細書において表記されるクローンである。 図84は図83に示す配列番号83のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号84)を示す。 図85はネイティブ配列PRO1889cDNAのヌクレオチド配列(配列番号85)を示し、ここで配列番号85は「DNA77623−2524」(UNQ871)と本明細書において表記されるクローンである。 図86は図85に示す配列番号85のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号86)を示す。 図87Aはネイティブ配列PRO90318Cdnaのヌクレオチド配列(配列番号87)を示し、ここで配列番号87は「DNA336109」(UNQ907)と本明細書において表記されるクローンである。 図87Bはネイティブ配列PRO90318Cdnaのヌクレオチド配列(配列番号87)を示し、ここで配列番号87は「DNA336109」(UNQ907)と本明細書において表記されるクローンである。 図88は図87A〜87Bに示す配列番号87のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号88)を示す。 図89Aはネイティブ配列PRO3434cDNAのヌクレオチド配列(配列番号89)を示し、ここで配列番号89は「DNA77631−2537」(UNQ1821)と本明細書において表記されるクローンである。 図89Bはネイティブ配列PRO3434cDNAのヌクレオチド配列(配列番号89)を示し、ここで配列番号89は「DNA77631−2537」(UNQ1821)と本明細書において表記されるクローンである。 図90は図89A〜89Bに示す配列番号89のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号90)を示す。 図91はネイティブ配列PRO3579cDNAのヌクレオチド配列(配列番号91)を示し、ここで配列番号91は「DNA68862−2546」(UNQ1849)と本明細書において表記されるクローンである。 図92は図91に示す配列番号91のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号92)を示す。 図93はネイティブ配列PRO4322cDNAのヌクレオチド配列(配列番号93)を示し、ここで配列番号93は「DNA92223−2567」(UNQ1879)と本明細書において表記されるクローンである。 図94は図93に示す配列番号93のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号94)を示す。 図95はネイティブ配列PRO4343cDNAのヌクレオチド配列(配列番号95)を示し、ここで配列番号95は「DNA92255−2584」(UNQ1897)と本明細書において表記されるクローンである。 図96は図95に示す配列番号95のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号96)を示す。 図97はネイティブ配列PRO4347cDNAのヌクレオチド配列(配列番号97)を示し、ここで配列番号97は「DNA92288−2588」(UNQ1901)と本明細書において表記されるクローンである。 図98は図97に示す配列番号97のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号98)を示す。 図99はネイティブ配列PRO4403cDNAのヌクレオチド配列(配列番号99)を示し、ここで配列番号99は「DNA83509−2612」(UNQ1928)と本明細書において表記されるクローンである。 図100は図99に示す配列番号99のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号100)を示す。 図101はネイティブ配列PRO4976Cdnaのヌクレオチド配列(配列番号101)を示し、ここで配列番号101は「DNA100902−2646」(UNQ2419)と本明細書において表記されるクローンである。 図102は図101に示す配列番号101のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号102)を示す。 図103はネイティブ配列PRO260cDNAのヌクレオチド配列(配列番号103)を示し、ここで配列番号103は「DNA33470−1175」(UNQ227)と本明細書において表記されるクローンである。 図104は図103に示す配列番号103のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号104)を示す。 図105はネイティブ配列PRO6014cDNAのヌクレオチド配列(配列番号105)を示し、ここで配列番号105は「DNA92217−2697」(UNQ2521)と本明細書において表記されるクローンである。 図106Aは図105に示す配列番号105のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号106)を示す。 図106Bは図105に示す配列番号105のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号106)を示す。 図107はネイティブ配列PRO6027cDNAのヌクレオチド配列(配列番号107)を示し、ここで配列番号107は「DNA105838−2702」(UNQ2528)と本明細書において表記されるクローンである。 図108は図107に示す配列番号107のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号108)を示す。 図109はネイティブ配列PRO6181cDNAのヌクレオチド配列(配列番号109)を示し、ここで配列番号109は「DNA107698−2715」(UNQ2552)と本明細書において表記されるクローンである。 図110は図109に示す配列番号109のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号110)を示す。 図111はネイティブ配列PRO6714cDNAのヌクレオチド配列(配列番号111)を示し、ここで配列番号111は「DNA82358−2738」(UNQ2759)と本明細書において表記されるクローンである。 図112は図111に示す配列番号111のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号112)を示す。 図113Aはネイティブ配列PRO9922cDNAのヌクレオチド配列(配列番号113)を示し、ここで配列番号113は「DNA142524」(UNQ2768)と本明細書において表記されるクローンである。 図113Bはネイティブ配列PRO9922cDNAのヌクレオチド配列(配列番号113)を示し、ここで配列番号113は「DNA142524」(UNQ2768)と本明細書において表記されるクローンである。 図114は図113A〜113Bに示す配列番号113のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号114)を示す。 図115はネイティブ配列PRO7179cDNAのヌクレオチド配列(配列番号115)を示し、ここで配列番号115は「DNA108701−2749」(UNQ2789)と本明細書において表記されるクローンである。 図116は図115に示す配列番号115のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号116)を示す。 図117はネイティブ配列PRO7476cDNAのヌクレオチド配列(配列番号117)を示し、ここで配列番号117は「DNA115253−2757」(UNQ2976)と本明細書において表記されるクローンである。 図118は図117に示す配列番号117のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号118)を示す。 図119Aはネイティブ配列PRO9824cDNAのヌクレオチド配列(配列番号119)を示し、ここで配列番号119は「DNA111030」(UNQ3026)と本明細書において表記されるクローンである。 図119Bはネイティブ配列PRO9824cDNAのヌクレオチド配列(配列番号119)を示し、ここで配列番号119は「DNA111030」(UNQ3026)と本明細書において表記されるクローンである。 図120は図119A〜119Bに示す配列番号119のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号120)を示す。 図121はネイティブ配列PRO19814cDNAのヌクレオチド配列(配列番号121)を示し、ここで配列番号121は「DNA148004−2882」(UNQ5923)と本明細書において表記されるクローンである。 図122は図121に示す配列番号121のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号122)を示す。 図123Aはネイティブ配列PRO19836cDNAのヌクレオチド配列(配列番号123)を示し、ここで配列番号123は「DNA144839」(UNQ5930)と本明細書において表記されるクローンである。 図123Bはネイティブ配列PRO19836cDNAのヌクレオチド配列(配列番号123)を示し、ここで配列番号123は「DNA144839」(UNQ5930)と本明細書において表記されるクローンである。 図124は図123A〜123Bに示す配列番号123のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号124)を示す。 図125はネイティブ配列PRO20088cDNAのヌクレオチド配列(配列番号125)を示し、ここで配列番号125は「DNA150157−2898」(UNQ6077)と本明細書において表記されるクローンである。 図126は図125に示す配列番号125のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号126)を示す。 図127はネイティブ配列PRO70789cDNAのヌクレオチド配列(配列番号127)を示し、ここで配列番号127は「DNA295801」(UNQ9659)と本明細書において表記されるクローンである。 図128は図127に示す配列番号127のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号128)を示す。 図129はネイティブ配列PRO50298cDNAのヌクレオチド配列(配列番号129)を示し、ここで配列番号129は「DNA255219」(UNQ11632)と本明細書において表記されるクローンである。 図130は図129に示す配列番号129のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号130)を示す。 図131はネイティブ配列PRO51592cDNAのヌクレオチド配列(配列番号131)を示し、ここで配列番号131は「DNA256561」(UNQ12179)と本明細書において表記されるクローンである。 図132は図131に示す配列番号131のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号132)を示す。 図133はネイティブ配列PRO1757cDNAのヌクレオチド配列(配列番号133)を示し、ここで配列番号133は「DNA76398−1699」(UNQ830)と本明細書において表記されるクローンである。 図134は図133に示す配列番号133のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号134)を示す。 図135はネイティブ配列PRO4421cDNAのヌクレオチド配列(配列番号135)を示し、ここで配列番号135は「DNA96879−2619」(UNQ1938)と本明細書において表記されるクローンである。 図136は図135に示す配列番号135のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号136)を示す。 図137はネイティブ配列PRO9903cDNAのヌクレオチド配列(配列番号137)を示し、ここで配列番号137は「DNA119516−2797」(UNQ3071)と本明細書において表記されるクローンである。 図138は図137に示す配列番号137のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号138)を示す。 図139はネイティブ配列PRO1106cDNAのヌクレオチド配列(配列番号139)を示し、ここで配列番号139は「DNA59609−1470」(UNQ549)と本明細書において表記されるクローンである。 図140は図139に示す配列番号139のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号140)を示す。 図141はネイティブ配列PRO1411cDNAのヌクレオチド配列(配列番号141)を示し、ここで配列番号141は「DNA59212−1627」(UNQ729)と本明細書において表記されるクローンである。 図142は図141に示す配列番号141のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号142)を示す。 図143はネイティブ配列PRO1486cDNAのヌクレオチド配列(配列番号143)を示し、ここで配列番号143は「DNA71180−1655」(UNQ755)と本明細書において表記されるクローンである。 図144は図143に示す配列番号143のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号144)を示す。 図145はネイティブ配列PRO1565cDNAのヌクレオチド配列(配列番号145)を示し、ここで配列番号145は「DNA73727−1643」(UNQ771)と本明細書において表記されるクローンである。 図146は図145に示す配列番号145のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号146)を示す。 図147はネイティブ配列PRO4399cDNAのヌクレオチド配列(配列番号147)を示し、ここで配列番号147は「DNA89220−2609」(UNQ1924)と本明細書において表記されるクローンである。 図148は図147に示す配列番号147のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号148)を示す。 図149はネイティブ配列PRO4404cDNAのヌクレオチド配列(配列番号149)を示し、ここで配列番号149は「DNA84142−2613」(UNQ1929)と本明細書において表記されるクローンである。 図150は図149に示す配列番号149のコーディング配列から誘導されるアミノ酸配列(配列番号150)を示す。

Claims (149)

  1. PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、該方法が下記工程:
    (a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
    (b)非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;及び、
    (c)該測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること、
    を含み、ここで該野生型動物の該生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴が、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される、方法。
  2. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、請求項1記載の方法。
  3. 性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物により示される表現型が、以下:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つである、請求項1記載の方法。
  4. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項3記載の方法。
  5. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項3記載の方法。
  6. 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項3記載の方法。
  7. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項3記載の方法。
  8. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項3記載の方法。
  9. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項3記載の方法。
  10. 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項3記載の方法。
  11. 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項3記載の方法。
  12. 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項10記載の方法。
  13. 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項10記載の方法。
  14. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病(Albers−Schnoberg disease)、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項10記載の方法。
  15. 前記眼の異常が白内障である、請求項3記載の方法。
  16. 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、請求項15記載の方法。
  17. 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項3記載の方法。
  18. 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、請求項3記載の方法。
  19. 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項3記載の方法。
  20. 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項3記載の方法。
  21. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞(blow cells);脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項1記載の方法。
  22. 自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物から誘導した、単離細胞。
  23. マウス細胞である、請求項22記載の単離細胞。
  24. 前記マウス細胞が胚性幹細胞である請求項23記載の単離細胞。
  25. 性別一致野生型同腹仔と比較した場合に前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つを示す、請求項22記載の単離細胞。
  26. PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
    (a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
    (b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
    (c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される);
    (d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
    (e)該試験薬剤が該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された表現型を調節するかどうか決定すること;
    を含む、方法。
  27. 前記遺伝子の破壊に関連する表現型が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、請求項26記載の方法。
  28. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項27記載の方法。
  29. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項27記載の方法。
  30. 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項27記載の方法。
  31. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項27記載の方法。
  32. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項27記載の方法。
  33. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項27記載の方法。
  34. 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項27記載の方法。
  35. 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項27記載の方法。
  36. 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項34記載の方法。
  37. 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項34記載の方法。
  38. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項34記載の方法。
  39. 前記眼の異常が白内障である、請求項27記載の方法。
  40. 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、請求項39記載の方法。
  41. 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項27記載の方法。
  42. 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、請求項27記載の方法。
  43. 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項27記載の方法。
  44. 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項27記載の方法。
  45. 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項26記載の方法。
  46. 請求項26記載の方法により同定された、薬剤。
  47. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項46記載の薬剤。
  48. 前記アゴニストが、抗−PRO179,抗−PRO181,抗−PRO244,抗−PRO247,抗−PRO269,抗−PRO293,抗−PRO298,抗−PRO339,抗−PRO341,抗−PRO347,抗−PRO531,抗−PRO537,抗−PRO718,抗−PRO773,抗−PRO860,抗−PRO871,抗−PRO872,抗−PRO813,抗−PRO828,抗−PRO1100,抗−PRO1114,抗−PRO1115,抗−PRO1126,抗−PRO1133,抗−PRO1154,抗−PRO1185,抗−PRO1194,抗−PRO1287,抗−PRO1291,抗−PRO1293,抗−PRO1310,抗−PRO1312,抗−PRO1335,抗−PRO1339,抗−PRO2155,抗−PRO1356,抗−PRO1385,抗−PRO1412,抗−PRO1487,抗−PRO1758,抗−PRO1779,抗−PRO1785,抗−PRO1889,抗−PRO90318,抗−PRO3434,抗−PRO3579,抗−PRO4322,抗−PRO4343,抗−PRO4347,抗−PRO4403,抗−PRO4976,抗−PRO260,抗−PRO6014,抗−PRO6027,抗−PRO6181,抗−PRO6714,抗−PRO9922,抗−PRO7179,抗−PRO7476,抗−PRO9824,抗−PRO19814,抗−PRO19836,抗−PRO20088,抗−PRO70789,抗−PRO50298,抗−PRO51592,抗−PRO1757,抗−PRO4421,抗−PRO9903,抗−PRO1106,抗−PRO1411,抗−PRO1486,抗−PRO1565,抗−PRO4399または抗−PRO4404抗体である、請求項47記載の薬剤。
  49. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項47記載の薬剤。
  50. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特性を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
    (a)自身のゲノムがPRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
    (b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴を測定すること;
    (c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示される生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴が、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴として同定される);
    (d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
    (e)遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴が調節されているかどうか決定すること;
    を含む、方法。
  51. 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項50記載の方法。
  52. 請求項50記載の方法により同定された、薬剤。
  53. 抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404
    ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項52記載の薬剤。
  54. 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項53記載の薬剤。
  55. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項53記載の薬剤。
  56. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
    (a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
    (b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される挙動を観察すること;
    (c)(b)の観察された挙動を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示された観察された挙動とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示された観察された挙動は、遺伝子の破壊に関連する挙動として同定される);
    (d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
    (e)該薬剤が遺伝子の破壊に関連する挙動を調節するかどうか決定すること;
    を含む、方法。
  57. 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項56記載の方法。
  58. 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項56記載の方法。
  59. 前記挙動がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項56記載の方法。
  60. 前記挙動が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項56記載の方法。
  61. 前記挙動が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項56記載の方法。
  62. 前記挙動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項56記載の方法。
  63. 請求項56記載の方法により同定された、薬剤。
  64. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストであ、る請求項63記載の薬剤。
  65. 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項64記載の薬剤。
  66. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項64記載の薬剤。
  67. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
    (a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
    (b)試験薬剤を該非ヒトトランスジェニック動物に投与すること;及び、
    (c)該試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
    を含む、方法。
  68. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項67記載の方法。
  69. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項67記載の方法。
  70. 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項67記載の方法。
  71. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項67記載の方法。
  72. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項67記載の方法。
  73. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項67記載の方法。
  74. 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項67記載の方法。
  75. 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項67記載の方法。
  76. 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項74記載の方法。
  77. 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項74記載の方法。
  78. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項74記載の方法。
  79. 前記眼の異常が白内障である、請求項67記載の方法。
  80. 前記白内障がヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、請求項79記載の方法。
  81. 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項67記載の方法。
  82. 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、請求項67記載の方法。
  83. 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項67記載の方法。
  84. 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項67記載の方法。
  85. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項67記載の方法。
  86. 請求項67記載の方法により同定された、薬剤。
  87. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項86記載の薬剤。
  88. 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項87記載の薬剤。
  89. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項87記載の薬剤。
  90. 請求項67記載の方法により同定された、治療薬。
  91. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
    (a)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に試験薬剤を接触させること;及び、
    (b)該試験薬剤が、宿主細胞によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節するかどうか決定すること;
    を含む、方法。
  92. 請求項91記載の方法により同定された、薬剤。
  93. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項92記載の薬剤。
  94. 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項93記載の薬剤。
  95. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項93記載の薬剤。
  96. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を評価する方法であって、該方法が下記工程:
    (a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
    (b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
    (c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた状態として同定される);
    (d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
    (e)該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された状態に対する、該試験薬剤の作用を評価すること;
    を含む、方法。
  97. 前記状態が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、請求項96記載の方法。
  98. 請求項96記載の方法により同定された、治療薬。
  99. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項98記載の治療薬。
  100. 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項99記載の治療薬。
  101. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項99記載の治療薬。
  102. 請求項98記載の治療薬を含む、医薬組成物。
  103. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、既に疾患を有し得る者、又は疾患を有する傾向にあり得る者、又は疾患を予防すべきであり得る者であるそのような治療を必要とする被験体に、請求項94記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの治療有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含む、方法。
  104. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項103記載の方法。
  105. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項103記載の方法。
  106. 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項103記載の方法。
  107. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項103記載の方法。
  108. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項103記載の方法。
  109. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項103記載の方法。
  110. 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項103記載の方法。
  111. 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項103記載の方法。
  112. 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項110記載の方法。
  113. 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項110記載の方法。
  114. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項110記載の方法。
  115. 前記眼の異常が白内障である、請求項103記載の方法。
  116. 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、請求項115記載の方法。
  117. 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項103記載の方法。
  118. 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である請求項103記載の方法。
  119. 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項103記載の方法。
  120. 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項103記載の方法。
  121. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
    (a)非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物を準備すること(ここで該培養物の各々の細胞は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる);
    (b)試験薬剤を該細胞培養物に投与すること;及び、
    (c)該試験薬剤が該細胞培養物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
    を含む、方法。
  122. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項121記載の方法。
  123. 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項121記載の方法。
  124. 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項121記載の方法。
  125. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項121記載の方法。
  126. 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項121記載の方法。
  127. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項121記載の方法。
  128. 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項121記載の方法。
  129. 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項121記載の方法。
  130. 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項128記載の方法。
  131. 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項128記載の方法。
  132. 前記網膜の異常が網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項128記載の方法。
  133. 前記眼の異常が白内障である、請求項121記載の方法。
  134. 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、請求項133記載の方法。
  135. 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項121記載の方法。
  136. 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である請求項121記載の方法。
  137. 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項121記載の方法。
  138. 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項121記載の方法。
  139. 請求項121記載の方法により同定された、薬剤。
  140. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項139記載の薬剤。
  141. 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項140記載の薬剤。
  142. 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項140記載の薬剤。
  143. 請求項121記載の方法により同定された、治療薬。
  144. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、該方法が、既に表現型を有し得る被験体、又は表現型を有する傾向にあり得る被験体、又は表現型を予防すべきであり得る被験体に、請求項46記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該表現型を効果的に調節することを含む、方法。
  145. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、該方法は、既に生理学的特徴を示し得る被験体、又は生理学的特徴を示す傾向にあり得る被験体、又は生理学的特徴を予防すべきであり得る被験体に、請求項52記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該生理学的特徴を効果的に調節することを含む、方法。
  146. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する方法であって、該方法は、既に挙動を示し得る被験体、又は挙動を示す傾向にあり得る被験体、又は示された挙動を予防すべきであり得る被験体に、請求項63記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該挙動を効果的に調節することを含む、方法。
  147. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する方法であって、該方法は、該PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に、請求項92記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該ポリペプチドの発現を効果的に調節することを含む、方法。
  148. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、該方法は、既に状態を有し得る被験体、又は状態を有する傾向にあり得る被験体、又は状態を予防すべきであり得る被験体に、請求項98記載の治療薬、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該状態を効果的に調節することを含む、方法。
  149. PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物に対して、請求項139記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含み、ここで該培養物の各々の細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる、方法。
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