JP2008532516A - 遺伝子破壊、組成物、およびそれに関連する方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は組成物、例えばトランスジェニック及びノックアウト動物及び疾患又は障害の診断及び治療のためにそのような組成物を使用する方法に関する。
細胞外蛋白はとりわけ多細胞生物の形成、分化及び維持において重要な役割を果たしている。多くの個々の細胞の消長、例えば増殖、遊走、分化又は他の細胞との相互作用は典型的には他の細胞及び/又は直属の環境から受領される情報により統括されている。この情報はしばしば、分泌ポリペプチド(例えばマイトジェン因子、生存因子、細胞毒性因子、分化因子、神経ペプチド及びホルモン)により伝達され、これはその後多様な細胞受容体又は膜結合蛋白により受領され、解釈される。これ等の分泌ポリペプチド又はシグナリング分子は通常は細胞分泌経路を通過して細胞外環境におけるその作用部位に到達する。
A.実施形態
本発明はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。
PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドコードヌクレオチド配列の全てを本明細書においては意図する。同様に意図されるものはこのようなヌクレオチド分子フラグメントによりコードされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドフラグメント、好ましくは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404抗体に対する結合部位を含む抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404ポリペプチドフラグメントである。
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;及び、
(c)測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること、
を含み、ここで野生型動物の生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される上記方法を提供する。1つの局面において、非ヒトトランスジェニック動物は哺乳類である。別の局面において、哺乳類はげっ歯類である。更に別の局面において、哺乳類はラット又はマウスである。1つの局面において、非ヒトトランスジェニック動物はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である。別の局面において、性別一致野生型同腹仔と比較した場合の非ヒトトランスジェニック動物により示される表現型は以下のもの、即ち:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つである。
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物の生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された表現型を調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物により示される生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴は遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴が調節されているかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される挙動を観察すること;
(c)(b)の観察された挙動を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物により示された観察された挙動とは異なる非ヒトトランスジェニック動物により示された観察された挙動は遺伝子の破壊に関連する挙動として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)薬剤が遺伝子の破壊に関連する挙動を調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)試験薬剤を該非ヒトトランスジェニック動物に投与すること;及び、
(c)試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
(a)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に試験薬剤を接触させること;及び、
(b)試験薬剤が宿主細胞によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで野生型動物の生理学的特徴とは異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた状態として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された状態に対する試験薬剤の作用を評価すること;
を含む上記方法を提供する。
(a)非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物を準備すること(ここで該培養物の各々の細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる);
(b)試験薬剤を該細胞培養物に投与すること;及び、
(c)試験薬剤が該培養物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む上記方法を提供する。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である。更に別の局面において、神経障害はホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである。
更に別の実施形態において、本発明は本出願に係る潜在的請求項の以下のセットを指向している。
(1) PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;及び、
(c)該測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること、
を含み、ここで該野生型動物の該生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴が、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される、方法。
(2) 前記非ヒトトランスジェニック動物が、PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、1記載の方法。
(3) 性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物により示される表現型が、以下:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つである、1記載の方法。
(4) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、3記載の方法。
(5) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、3記載の方法。
(6) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、3記載の方法。
(7) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、3記載の方法。
(8) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、3記載の方法。
(9) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、3記載の方法。
(10) 前記眼の異常が網膜の異常である、3記載の方法。
(11) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、3記載の方法。
(12) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、10記載の方法。
(13) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、10記載の方法。
(14) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病(Albers−Schnoberg disease)、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、10記載の方法。
(15) 前記眼の異常が白内障である、3記載の方法。
(16) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、15記載の方法。
(17) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、3記載の方法。
(18) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、3記載の方法。
(19) 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、3記載の方法。
(20) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、3記載の方法。
(21) 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞(blow cells);脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、1記載の方法。
(22) 自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物から誘導した、単離細胞。
(23) マウス細胞である、22記載の単離細胞。
(24) 前記マウス細胞が胚性幹細胞である23記載の単離細胞。
(25) 性別一致野生型同腹仔と比較した場合に前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つを示す、22記載の単離細胞。
(26) PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該試験薬剤が該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された表現型を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(27) 前記遺伝子の破壊に関連する表現型が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、26記載の方法。
(28) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、27記載の方法。
(29) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、27記載の方法。
(30) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、27記載の方法。
(31) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、27記載の方法。
(32) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、27記載の方法。
(33) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、27記載の方法。
(34) 前記眼の異常が網膜の異常である、27記載の方法。
(35) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、27記載の方法。
(36) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、34記載の方法。
(37) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、34記載の方法。
(38) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、34記載の方法。
(39) 前記眼の異常が白内障である、27記載の方法。
(40) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、39記載の方法。
(41) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、27記載の方法。
(42) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、27記載の方法。
(43) 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、27記載の方法。
(44) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、27記載の方法。
(45) 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、26記載の方法。
(46) 26記載の方法により同定された、薬剤。
(47) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、46記載の薬剤。
(48) 前記アゴニストが、抗−PRO179,抗−PRO181,抗−PRO244,抗−PRO247,抗−PRO269,抗−PRO293,抗−PRO298,抗−PRO339,抗−PRO341,抗−PRO347,抗−PRO531,抗−PRO537,抗−PRO718,抗−PRO773,抗−PRO860,抗−PRO871,抗−PRO872,抗−PRO813,抗−PRO828,抗−PRO1100,抗−PRO1114,抗−PRO1115,抗−PRO1126,抗−PRO1133,抗−PRO1154,抗−PRO1185,抗−PRO1194,抗−PRO1287,抗−PRO1291,抗−PRO1293,抗−PRO1310,抗−PRO1312,抗−PRO1335,抗−PRO1339,抗−PRO2155,抗−PRO1356,抗−PRO1385,抗−PRO1412,抗−PRO1487,抗−PRO1758,抗−PRO1779,抗−PRO1785,抗−PRO1889,抗−PRO90318,抗−PRO3434,抗−PRO3579,抗−PRO4322,抗−PRO4343,抗−PRO4347,抗−PRO4403,抗−PRO4976,抗−PRO260,抗−PRO6014,抗−PRO6027,抗−PRO6181,抗−PRO6714,抗−PRO9922,抗−PRO7179,抗−PRO7476,抗−PRO9824,抗−PRO19814,抗−PRO19836,抗−PRO20088,抗−PRO70789,抗−PRO50298,抗−PRO51592,抗−PRO1757,抗−PRO4421,抗−PRO9903,抗−PRO1106,抗−PRO1411,抗−PRO1486,抗−PRO1565,抗−PRO4399または抗−PRO4404抗体である、47記載の薬剤。
(49) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、47記載の薬剤。
(50) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特性を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示される生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴が、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴が調節されているかどうか決定すること;
を含む、方法。
(51) 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、50記載の方法。
(52) 50記載の方法により同定された、薬剤。
(53)抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404
ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、52記載の薬剤。
(54) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、53記載の薬剤。
(55) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、53記載の薬剤。
(56) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される挙動を観察すること;
(c)(b)の観察された挙動を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示された観察された挙動とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示された観察された挙動は、遺伝子の破壊に関連する挙動として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該薬剤が遺伝子の破壊に関連する挙動を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(57) 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、56記載の方法。
(58) 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、56記載の方法。
(59) 前記挙動がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、56記載の方法。
(60) 前記挙動が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、56記載の方法。
(61) 前記挙動が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、56記載の方法。
(62) 前記挙動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、56記載の方法。
(63) 56記載の方法により同定された、薬剤。
(64) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストであ、る63記載の薬剤。
(65) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、64記載の薬剤。
(66) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、64記載の薬剤。
(67) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)試験薬剤を該非ヒトトランスジェニック動物に投与すること;及び、
(c)該試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(68) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、67記載の方法。
(69) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、67記載の方法。
(70) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、67記載の方法。
(71) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、67記載の方法。
(72) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、67記載の方法。
(73) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、67記載の方法。
(74) 前記眼の異常が網膜の異常である、67記載の方法。
(75) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、67記載の方法。
(76) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、74記載の方法。
(77) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、74記載の方法。
(78) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、74記載の方法。
(79) 前記眼の異常が白内障である、67記載の方法。
(80) 前記白内障がヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、79記載の方法。
(81) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、67記載の方法。
(82) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、67記載の方法。
(83) 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、67記載の方法。
(84) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、67記載の方法。
(85) 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、67記載の方法。
(86) 67記載の方法により同定された、薬剤。
(87) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、86記載の薬剤。
(88) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、87記載の薬剤。
(89) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、87記載の薬剤。
(90) 67記載の方法により同定された、治療薬。
(91) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に試験薬剤を接触させること;及び、
(b)該試験薬剤が、宿主細胞によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(92) 91記載の方法により同定された、薬剤。
(93) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、92記載の薬剤。
(94) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、93記載の薬剤。
(95) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、93記載の薬剤。
(96) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を評価する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた状態として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された状態に対する、該試験薬剤の作用を評価すること;
を含む、方法。
(97) 前記状態が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、96記載の方法。
(98) 96記載の方法により同定された、治療薬。
(99) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、98記載の治療薬。
(100) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、99記載の治療薬。
(101) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、99記載の治療薬。
(102) 98記載の治療薬を含む、医薬組成物。
(103) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、既に疾患を有し得る者、又は疾患を有する傾向にあり得る者、又は疾患を予防すべきであり得る者であるそのような治療を必要とする被験体に、94記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの治療有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含む、方法。
(104) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、103記載の方法。
(105) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、103記載の方法。
(106) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、103記載の方法。
(107) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、103記載の方法。
(108) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、103記載の方法。
(109) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、103記載の方法。
(110) 前記眼の異常が網膜の異常である、103記載の方法。
(111) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、103記載の方法。
(112) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、110記載の方法。
(113) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、110記載の方法。
(114) 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、110記載の方法。
(115) 前記眼の異常が白内障である、103記載の方法。
(116) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、115記載の方法。
(117) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、103記載の方法。
(118) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である103記載の方法。
(119) 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、103記載の方法。
(120) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、103記載の方法。
(121) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物を準備すること(ここで該培養物の各々の細胞は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる);
(b)試験薬剤を該細胞培養物に投与すること;及び、
(c)該試験薬剤が該細胞培養物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。
(122) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、121記載の方法。
(123) 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、121記載の方法。
(124) 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、121記載の方法。
(125) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、121記載の方法。
(126) 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、121記載の方法。
(127) 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、121記載の方法。
(128) 前記眼の異常が網膜の異常である、121記載の方法。
(129) 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、121記載の方法。
(130) 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、128記載の方法。
(131) 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、128記載の方法。
(132) 前記網膜の異常が網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、128記載の方法。
(133) 前記眼の異常が白内障である、121記載の方法。
(134) 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、133記載の方法。
(135) 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、121記載の方法。
(136) 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である121記載の方法。
(137) 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、121記載の方法。
(138) 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、121記載の方法。
(139) 121記載の方法により同定された、薬剤。
(140) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、139記載の薬剤。
(141) 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、140記載の薬剤。
(142) 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、140記載の薬剤。
(143) 121記載の方法により同定された、治療薬。
(144) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、該方法が、既に表現型を有し得る被験体、又は表現型を有する傾向にあり得る被験体、又は表現型を予防すべきであり得る被験体に、46記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該表現型を効果的に調節することを含む、方法。
(145) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、該方法は、既に生理学的特徴を示し得る被験体、又は生理学的特徴を示す傾向にあり得る被験体、又は生理学的特徴を予防すべきであり得る被験体に、52記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該生理学的特徴を効果的に調節することを含む、方法。
(146) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する方法であって、該方法は、既に挙動を示し得る被験体、又は挙動を示す傾向にあり得る被験体、又は示された挙動を予防すべきであり得る被験体に、63記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該挙動を効果的に調節することを含む、方法。
(147) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する方法であって、該方法は、該PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に、92記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該ポリペプチドの発現を効果的に調節することを含む、方法。
(148) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、該方法は、既に状態を有し得る被験体、又は状態を有する傾向にあり得る被験体、又は状態を予防すべきであり得る被験体に、98記載の治療薬、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該状態を効果的に調節することを含む、方法。
(149) PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物に対して、139記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含み、ここで該培養物の各々の細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる、方法。
1.定義
「PROポリペプチド」及び「PRO」という用語は本明細書においては、そして数の表記が直後に来る場合は、種々のポリペプチドを指すものとし、ここで完全な表記(即ちPRO/数)は本明細書に記載する特定のポリペプチド配列を指す。「数」という用語が本明細書において使用される実際の数の表記として提示される場合の「PRO/数ポリペプチド」及び「PRO/数」という用語は、ネイティブの配列のポリペプチド及びポリペプチドの変異体(これは本明細書において更に定義する)を包含する。本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドは種々の原料から、例えばヒト組織型から、又は他の原料から単離してよく、又は、組み換え又は合成の方法により製造してよい。「PROポリペプチド」という用語は本明細書に開示した各々の個々のPRO/数ポリペプチドを指す。「PROポリペプチド」に言及する本明細書中の全ての開示は、ポリペプチドを個別に、並びに、総括して指すものとする。例えば、その製造、精製、誘導、それに対する抗体の形成、その投与、それを含有する組成物、それを伴う疾患の治療に関する説明等は本発明のポリペプチドの各々個々に関するものである。「PROポリペプチド」という用語はまた本明細書に開示したPRO/数ポリペプチドの変異体を包含する。
4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのための開始アミノ酸残基として使用してよい。
00,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体は例えば完全長のネイティブのアミノ酸配列のN又はC末端においてアミノ酸残基1つ以上が付加又は欠失しているPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを包含する。通常は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体は、本明細書に開示する完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示する完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列の何れかの他の特に定義されたフラグメントに対して約80%又はそれ以上のアミノ酸配列同一性を有するか、或いは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%又はそれ以上のアミノ酸配列同一性を有する。通常はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドは約10アミノ酸長又はそれ以上、或いは約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、43
0、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長又はそれ以上である。場合により、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリペプチドはネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と比較して1つより多くない保存的アミノ酸置換を有するか、又は、ネイティブのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列と比較して2、3、4、5、6、7、8、9又は10より多くない保存的アミノ酸置換を有する。
100×分数X/Y
[式中、XはA及びBのアライメントをプログラムする配列アライメントプログラムALIGN−2により同一マッチと採点されたアミノ酸残基の数であり、YはBにおけるアミノ酸残基の総数である]により計算される。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合は、Bに対するAの%アミノ酸配列同一性はAに対するBの%アミノ酸配列同一性と等しくならない。この方法を用いた%アミノ酸配列同一性計算の例として、表2及び3は「PRO」と表記したアミノ酸配列に対する「比較蛋白」と表記したアミノ酸配列の%アミノ酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO」は目的の仮説的PROポリペプチドのアミノ酸配列を示し、「比較蛋白」は目的の「PRO」ポリペプチドを比較する相手であるポリペプチドのアミノ酸配列を示し、そして「X」、「Y」及び「Z」は各々異なる仮説的アミノ酸残基を示す。特段の記載が無い限り、本明細書で使用する全ての%アミノ酸配列同一性の値はALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
O1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに関する完全なコーディング配列の一部分のみを示す核酸によりコードされるもの)に対して少なくとも約80%の核酸配列同一性を有する核酸分子を意味する。通常は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体ポリヌクレオチドは本明細書に開示する完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを欠いた完全長のネイティブの配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列、本明細書に開示するシグナルペプチドを有するか有しないPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの細胞外ドメイン、又は、本明細書に開示する完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド配列の何れかの他のフラグメントをコードする核酸配列に対して、約80%又はそれ以上の核酸配列同一性を有するか、或いは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%又はそれ以上の核酸配列同一性を有する。変異体はネイティブヌクレオチド配列を包含しない。
100×分数W/Z
[式中、WはC及びDのアライメントをプログラムする配列アライメントプログラムALIGN−2により同一マッチと採点されたヌクレオチドの数であり、ZはDにおけるヌクレオチドの総数である]により計算される。核酸配列Cの長さが核酸配列Dの長さと等しくない場合は、Dに対するCの%核酸配列同一性はCに対するDの%核酸配列同一性と等しくならない。%核酸配列同一性計算の例として、表4及び5は「PRO−DNA」と表記した核酸配列に対する「比較DNA」と表記した核酸配列の%核酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO−DNA」は目的の仮説的PRO−コード核酸配列を示し、「比較DNA」は目的の「PRO−DNA」核酸分子を比較する相手である核酸分子のヌクレオチド配列を示し、そして「N」、「L」及び「V」は各々異なる仮説的ヌクレオチドを示す。特段の記載が無い限り、本明細書で使用する全ての%核酸配列同一性の値はALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
血反応、らい病、マラリア、寄生虫疾患、例えばリーシュマニア症、トリパノソーマ症(kypanosomiasis)、住血吸虫症、回虫症、アスペルギルス症、サンプター症候群、キャプラン症候群、デング熱、心内膜炎、心内膜心筋線維症、播種性間質性肺線維症、間質性肺線維症、線維形成性縦隔炎、肺線維症、特発性肺線維症、嚢胞性線維症、眼内炎、持久性隆起性紅斑、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎、シャルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症、毛様体炎、例えば慢性毛様体炎、異虹彩色性毛様体炎、虹彩毛様体炎(急性又は慢性)又はフックス毛様体炎、ヘノッホ‐シェーンライン紫斑病、ヒト免疫不全ウィルス(HIV)感染症、SCID、後天性免疫不全症候群(AIDS)、エコーウィルス感染症、敗血症(全身炎症性応答症候群(SIRS))、内毒素血症、膵臓炎、サイロニン中毒、パルボウィルス感染症、風疹ウィルス感染症、ワクチン接種後症候群、先天性風疹感染症、エプスタイン・バーウィルス感染症、おたふくかぜ、エバンス症候群、自己免疫性性腺機能不全、シドナム舞踏病、後連鎖球菌性腎炎、閉塞性血栓性血管炎、甲状腺中毒症、脊髄ろう、脈絡膜炎、巨細胞性多発性筋痛、慢性過敏性肺炎、結膜炎、例えば春季カタル、乾性角結膜炎及び流行性角結膜炎、特発性腎炎症候群、最小変化腎症、良性家族性及び虚血再灌流性の傷害、移植臓器再灌流、網膜自己免疫、関節の炎症、気管支炎、慢性閉塞性気道/肺疾患、珪肺症、アフタ、アフタ性口内炎、動脈硬化性障害(脳血管不全)、例えば動脈硬化性の脳症及び動脈硬化性の網膜症、精液形成欠如、自己免疫性溶血、ベック病、クリオグロブリン症、デュプュイトラン拘縮、水晶体過敏性眼内炎、アレルギー性腸炎、らい性結節性紅斑、特発性顔面神経麻痺、慢性疲労症候群、リューマチ熱、ハマン−リッチ病、脊髄末梢神経聴覚消失、発作性ヘモグロビン尿症、性機能低下症、限局性回腸炎、白血球減少症、感染性単核細胞症、横断脊髄炎、原発性特発性粘液水腫、ネフローゼ、癒着性眼炎、肉芽腫性精巣炎、膵臓炎、急性多発性神経根炎、壊疽性膿皮症、ド・ケルヴァン甲状腺炎、後天性脾臓萎縮、非悪性胸腺腫、リンパ小節胸腺炎、白斑、毒性ショック症候群、食物中毒、T細胞浸潤の関与する状態、白血球接着不全、サイトカイン及びTリンパ球により媒介される急性又は遅発型の過敏症に関連する免疫応答、白血球漏出の関与する疾患、多臓器傷害症候群、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、自己免疫性多発性内分泌腺症、卵巣炎、原発性粘液水腫、自己免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、リウマチ病、混合型結合組織病、ネフローゼ症候群、インスリン炎、多内分泌腺不全、自己免疫性多腺症候群、例えばI型多腺症候群、成人発症性特発性上皮小体機能低下症(AOIH)、心筋症、例えば拡張性心筋症、後天性表皮水疱症(EBA)、ヘモクロマトーシス、心筋炎、ネフローゼ症候群、原発性硬化性胆管炎、化膿性又は非化膿性の静脈洞炎、急性又は慢性の静脈洞炎、篩骨洞、前頭洞、上顎洞又は蝶形骨洞の洞炎、アレルギー性洞炎、好酸球関連障害、例えば好酸球増加症、肺浸潤性好酸球増加症、好酸球増加症−筋痛症候群、レフラー症候群、慢性好酸球性肺炎、局所的肺好酸球増加症、気管支肺アスペルギルス症、アスペルギルス腫又は好酸球含有肉芽腫、アナフィラキシー、脊椎関節症、セロネガティブ脊椎関節症、多内分泌腺自己免疫疾患、硬化性胆管炎、強膜、上強膜、慢性の粘膜皮膚カンジダ症、バートン症候群、幼児の一過性低ガンマグロブリン血症、ヴィスコット‐オールドリッチ症候群、毛細血管拡張性運動失調症候群、血管拡張、コラーゲン疾患に関連する自己免疫性障害、リューマチ、例えば慢性関節リューマチ、リンパ節炎、血圧応答の低下、血管機能不全、組織傷害、心臓血管虚血、痛覚過敏、腎虚血、大脳虚血及び血管形成に伴う疾患、アレルギー性過敏障害、糸球体腎炎、再灌流傷害、虚血性再灌流障害、心筋又は他の組織の再灌流傷害、リンパ腫性気管気管支炎、炎症性皮膚病、急性の炎症性要素を有する皮膚病、多臓器不全、水疱性疾患、腎皮質壊死、急性化膿性髄膜炎又は他の中枢神経系の炎症性障害、眼及び眼窩の炎症性障害、顆粒球輸血関連症候群、サイトカイン誘導毒性、睡眠発作、急性重篤炎症、慢性難治性炎症、腎盂炎、動脈内膜過形成、消化性潰瘍、心弁膜炎および子宮内膜症を包含する。
1.前立腺癌:アンドロゲン、ドセタキセル、パクリタキセル、エストラムスチン、ドキソルビシン、ミトキサントロン、ErbB2の細胞外ドメイン(例えばErbB2の概ね残基22〜概ね残基584の領域における残基の何れかの1つ以上)の領域に結合する2C4のようなErbB2ドメインに対する抗体(WO01/00245;ハイブリドーマATCCHB−12697)、AVASTINTM抗血管内皮細胞成長因子(VEGF)、TARCEVATMOSI−774(エルロチニブ)(Genenetech and OSI Pharmaceuticals)又は他の表皮成長因子受容体チロシンキナーゼ阻害剤(EGFRTKI)。
2.胃癌:5−フルオロウラシル(5FU)、XELODATMカペシタビン、メトトレキセート、エトポシド、シスプラチン/カルボプラチン、パクリタキセル、ドセタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシン及びCPT−11(カンプトテシン−11;イリノテカン、合衆国商標:CAMPTOSAR(登録商標))。
3.膵臓癌:ゲムシタビン、5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、ドセタキセル、パクリタキセル、シスプラチン、カルボプラチン、TARCEVATMエルロチニブ及び他のEGFRTKI。
4.結腸直腸癌:5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、オキサリプラチン、AVASTINTM抗VEGF、TARCEVATMエルロチニブ及び他のEGFRTKI及びEGFRに結合し受容体活性化及び腫瘍へのシグナリングを開始するEGFの能力をブロックするERBITUXTM(旧称IMC−C225)ヒト:マウス−キメラ化モノクローナル抗体。
5.腎臓癌:IL−2、インターフェロンアルファ、AVASTINTM抗VEGF、MEGACETM(メゲストロールアセテート)プロゲスチン、ビンブラスチン、TARCEVATMエルロチニブ及び他のEGFRTKI。
4÷12=33.3%
II.組成物及び本発明の方法
A.完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド
本発明は本出願においてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドと称するポリペプチドをコードする新規に同定され単離されたヌクレオチド配列を提供する。特に、種々のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするcDNAが後述する実施例において更に詳細に開示する通り同定され、単離された。別個の発現ラウンドにおいて生産される蛋白に異なるPRO番号を付与してよいが、UNQ番号は何れかの所定のDNA及びコードされる蛋白に対してユニークのものであり、変化することは無い。しかしながら、簡便のため、本明細書においては、本明細書に開示する完全長のネイティブの核酸分子によりコードされる蛋白並びにPROの前記した定義に包含される全ての他のネイティブの相同体及び変異体は、その起源又は製造様式に関わらず、「PRO/数」と称する。
B.PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド変異体
本明細書に記載した完全長のネイティブ配列のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに加えて、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体が製造可能であることが意図される。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404変異体はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404DNA内に適切なヌクレオチドの変化を導入することにより、及び/又は、所望のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの合成により、製造できる。アミノ酸の変化はグリコシル化部位の数又は位置を変化させたり、又は、膜アンカリング特性を改変させたりするなどの、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの翻訳後の過程を改変する場合があることは当業者の知る通りである。
(1)非極性;Ala(A)、Val(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M)
(2)未荷電極性:Gly(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q)
(3)酸性:Asp(D)、Glu(E)
(4)塩基性:Lys(K)、Arg(R)、His(H)
となるように群分けしてよい。
或いは、天然に存在する残基は共通の側鎖の特性に基づいて以下の通り、即ち:
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile:
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln:
(3)酸性:Asp、Glu
(4)塩基性:His、Lys、Arg
(5)鎖の方向に影響する残基:Gly、Pro
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe
となるように群分けしてよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの共有結合修飾は本発明の範囲に包含される。共有結合修飾の1つの型はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの選択された側鎖又はN又はC末端の残基と反応することができる有機誘導体形成剤とPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのターゲティングされたアミノ酸残基を反応させることを包含する。二官能性剤を用いた誘導体化は、例えば抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を精製するための方法において使用する水不溶性支持体マトリックス又は表面にPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを交差結合するため、又はその逆のために有用である。一般的に使用される交差結合剤は例えば1,1−ビス(ジアゾアセチル)−2−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば4−アジドサリチル酸とのエステル、ホモ2官能性イミドエステル、例えばジスクシンイミジルエステル、例えば3,3’−ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)、2官能性マレイミド、例えばビス−N−マレイミド−1,8−オクタン及びメチル−3−[(p−アジドフェニル)ジチオ]プロピオイミデートのような物質を包含する。
以下の説明は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸を含有するベクターで形質転換又はトランスフェクトした細胞を培養することによるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの製造に主に関するものである。当然ながら当該分野で良く知られている代替法を用いてPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを製造してもよいことを意図している。例えばPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の配列又はその部分は固相法を用いた直接ペプチド合成により製造してよい[例えばStewart et al.,Solid−Phase Peptide Synthesis,W.H.Freeman Co.,San Francisco,CA(1969);Merrifield,J.Am.Chem.Soc.,85:2149−2154(1963)を参照]。インビトロの蛋白合成を手動の手法又は自動により実施してよい。自動合成は例えばApplied Biosystems Peptide Synthesizer(Foster City,CA)を用いて製造元の説明書により行ってよい。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの種々の部分を別個に化学合成し、そして化学的又は酵素的な方法を用いて組み合わせることにより完全長PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを製造してよい。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするDNAはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404mRNAを保有し、そしてそれを検出可能なレベルで発現すると考えられる組織から調製したcDNAライブラリから得てよい。従ってヒトPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−DNAは実施例に記載するようなヒト組織から調製したcDNAライブラリから好都合に得ることができる。PRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−コード遺伝子もまた、ゲノムライブラリから、又は、知られた合成操作法(例えば自動核酸合成)により得てよい。
宿主細胞はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの生産に関して本明細書に記載した発現又はクローニングベクターを用いてトランスフェクト又は形質転換し、そしてプロモーターの誘導、形質転換体の選択又は所望の配列をコードする遺伝子の増幅の為に適切であるように変性された従来の栄養培地中で培養する。培地、温度、pH等のような培養条件は予定外の実験を要することなく当業者が選択できる。一般的に、細胞培養の生産性を最大にするための原理、プロトコル及び実際の手法はMammalian Cell Biotechnology:a Practical Approach,M.Butler,ed.(IRL Press,1991)及び上出Sambrook et al.に記載されている。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする核酸(例えばcDNA又はゲノムDNA)をクローニング(DNAの増幅)のため、又は、発現の為に、複製可能なベクター内に挿入してよい。種々のベクターが公的に入手可能である。ベクターは例えばプラスミド、コスミド、ウィルス粒子、又はファージの形態であってよい。適切な核酸配列を種々の操作法でベクター内に挿入してよい。一般的に、DNAは当該分野で知られた手法を用いて適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入する。ベクター成分は一般的に限定しないが1つ以上のシグナル配列、複製起点、1つ以上のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター及び転写終止配列を包含する。これ等の成分1つ以上を含有する適当なベクターの構築は当業者に知られた標準的なライゲーション手法を用いる。
4.遺伝子の増幅/発現の検出
遺伝子の増幅及び/又は発現は例えばmRNAの転写を定量するための従来のサザンブロッティング、ノーザンブロッティング[Thomas,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:5201−5205(1980)]、ドットブロッティング(DNA分析)、又はインサイチュハイブリダイゼーションにより、適切な標識プローブを用いて、本明細書において提供される配列に基づいて、直接試料中で測定してよい。或いは、DNAデュプレックス、RNAデュプレックス及びDNA−RNAハイブリッドデュプレックス又はDNA−蛋白デュプレックスを包含する特定のデュプレックスを認識できる抗体を使用してよい。そして抗体を標識し、表面上のデュプレックスの形成によりデュプレックスに結合した抗体の存在が検出できるようにデュプレックスが表面に結合した状態で試験を実施してよい。
5.ポリペプチドの精製
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの形態は培地から、又は宿主細胞溶解物から回収してよい。膜結合の場合は、適当な洗浄液(例えばTriton−X100)を用いるか、酵素的切断により、膜から遊離させることができる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現に使用される細胞は種々の物理的又は化学的手段、例えば凍結解凍の反復、超音波処理、機械的破壊又は細胞溶解剤等により破壊することができる。
PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列(又はその相補体)はハイブリダイゼーションプローブとしての使用を包含する分子生物学において、染色体及び遺伝子のマッピングにおいて、及びアンチセンスRNA及びDNAの生成において、種々の用途を有している。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404核酸はまた本明細書に記載する組み換え手法によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの製造の為に有用である。
O19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404遺伝子のものと相補的な配列を有する標識されたプローブを用いてヒトcDNA、ゲノムDNA又はmRNAのライブラリをスクリーニングすることによりそのようなライブラリのどのメンバーにプローブがハイブリダイズするかを決定することができる。ハイブリダイゼーションの手法は後述する実施例において更に詳細に説明する。
を得るための供試動物として使用できる。本発明のこの側面によれば、試薬を動物に投与し、そして病的状態の発生率がトランスジーンを担持する未投与の動物と比較して低減していれば、病的状態に対する潜在的治療介入があったことを示す。或いは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする内因性遺伝子と動物の胚性幹細胞内に導入されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする改変されたゲノムDNAとの間の相同組み換えの結果としてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404蛋白をコードする欠損又は改変された遺伝子を有するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404「ノックアウト」動物を構築するためにPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの非ヒト相同体を用いルことができる。好ましくは、ノックアウト動物は哺乳類である。より好ましくは、哺乳類はげっ歯類、例えばラット又はマウスである。例えば、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするcDNAは確立された手法に従ってPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できる。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするゲノムDNAの一部分は、欠失させるか、又は、他の遺伝子、例
えば組み込みをモニタリングするために使用できる選択可能なマーカーをコードする遺伝子と置き換えることができる。典型的には、未改変フランキングDNA(5’及び3’末端の両方)の数キロ塩基をベクター内に含める[相同組み換えベクターの説明については例えばThomas and Capecchi,Cell,51:503(1987)参照]。ベクターは胚性幹細胞系統内に導入(例えばエレクトロポレーションによる)し、そして導入されたDNAが内因性DNAと相同組み換えを起こしている細胞を選択する[例えばLi et al.,Cell,69:915(1992)参照]。次に選択された細胞を動物(例えばマウス又はラット)の胚盤胞内に注入し、凝集キメラを形成する[例えばBradley,Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells:A Practical Approach,E.J.Robertson,ed.(IRL,Oxford,1987)pp.113−152参照]。次にキメラ胚を適当な擬似妊娠雌性里親動物内に移植し、胚を妊娠期間満了させ、「ノックアウト」動物を作成することができる。相同組み換えされたDNAをその生殖細胞に保有する子孫を標準的な手法で同定し、動物の全細胞が相同組み換えDNAを含有する動物を育種するために使用することができる。ノックアウト動物は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の非存在に起因する、特定の病的状態に対するそれらの防御能力に関して、そして、病的状態のそれらの発症に関して、特徴付けることができる。
たはPRO4404ポリペプチドに応答する細胞からポリアデニル化RNAを調製し、そしてこのRNAから作成したcDNAライブラリを幾つかのプールに分割し、COS細胞又はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに応答しない他の細胞をトランスフェクトするために使用する発現クローニングが使用される。スライドガラス上に生育したトランスフェクトした細胞を標識されたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに曝露する。PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドはヨウ素化又は部位特異的蛋白キナーゼに対する認識部位を含ませることを包含する種々の手段により標識できる。固定化及びインキュベーションの後、スライドをオートラジオグラフ分析に付す。陽性のプールを同定し、サブプールを作成し、相互作用的なサブプール化及び再スクリーニングの過程を用いながら再トランスフェクトし、最終的に推定受容体をコードする単一のクローンを得る。
F.抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体
本発明は本発明において治療薬及び/又は診断薬として使用してよい抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を提供する。例示される抗体はポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性及びヘテロコンジュゲート抗体を包含する。
1.ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は好ましくは関連する抗原及びアジュバントの多数回の皮下(sc)又は腹腔内(ip)注射により動物中で形成させる。関連する抗原は(特に合成ペプチドを使用する場合)免疫化すべき種において免疫原となる蛋白にコンジュゲートすることが有用である。例えば抗原は二官能性又は誘導体形成性の物質、例えばマレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を介したコンジュゲーション)、N−ヒドロキシスクシンイミド(リジン残基を介する)、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、SOCl2、又は、R1N=C=NR(ただしR及びR1は異なるアルキル基である)を用いて、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、血清アルブミン、ウシサイログロブリン又はダイズトリプシン阻害剤にコンジュゲートできる。
2.モノクローナル抗体
モノクローナル抗体はKohler et al.,Nature,256:495(1975)によりはじめて記載されたハイブリドーマ法を用いて作成してよく、又は、組み換えDNA法(米国特許第4,816,567号)により作成してもよい。
本発明の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は更にヒト化抗体又はヒト抗体を含み得る。非ヒト(例えばマウス)抗体のヒト化型は非ヒト免疫グロブリンから誘導された最小配列を含有するキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖又はそのフラグメント(例えばFv、Fab、Fab’、F(ab’)2又は抗体の他の抗原結合サブ配列)である。ヒト化抗体はヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)を包含し、これにおいては、レシピエントの相補性決定領域(CDR)に由来する残基が所望の特異性、親和性及び能力を有するマウス、ラット又はウサギのような非ヒト種(ドナー抗体)のCDRに由来する残基で置き換えられている。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基が相当する非ヒト残基により置き換えられている。ヒト化抗体は又レシピエント抗体及び移入されたCDR又はフレームワーク配列の何れにも存在しない残基を含んでよい。一般的に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、そして典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み、これにおいてはCDR領域の全て又は実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに相当し、そしてFR領域の全て又は実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである。ヒト化抗体は場合により更に免疫グロブリン定常領域の少なくとも一部分(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンのものを含む[Jones et al.,Nature,321:522−525(1986);Riechmann et al.,Nature,332:323−329(1988);及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.,2:593−596(1992)]。
特定の状況において、全抗体よりも抗体フラグメントを使用するほうが有利である。より小さいサイズのフラグメントは急速なクリアランスを可能にし、そして固形腫瘍への向上した接触をもたらすと考えられる。
二重特異性抗体は少なくとも2つの異なるエピトープに対して結合特異性を有する抗体である。例示される二重特異性抗体は本明細書に記載するPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404蛋白の2つの異なるエピトープに結合してよい。他のそのような抗体はPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の結合部位を他の蛋白に対する結合部位と組み合わせてよい。或いは、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404アームを白血球上のトリガリング分子、例えばT細胞受容体分子(例えばCD3)又はIgGに対するFc受容体(FcγR)、例えばFcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)及びFcγRIII(CD16)に結合するアームと組み合わせることにより、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404発現細胞に対して細胞防御機序を集中及び局在化させてよい。二重特異性抗体はまたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する細胞に細胞毒性剤を局在化させるために使用してよい。これ等の抗体はPRO179−,PRO181−,PRO244−,PRO247−,PRO269−,PRO293−,PRO298−,PRO339−,PRO341−,PRO347−,PRO531−,PRO537−,PRO718−,PRO773−,PRO860−,PRO871−,PRO872−,PRO813−,PRO828−,PRO1100−,PRO1114−,PRO1115−,PRO1126−,PRO1133−,PRO1154−,PRO1185−,PRO1194−,PRO1287−,PRO1291−,PRO1293−,PRO1310−,PRO1312−,PRO1335−,PRO1339−,PRO2155−,PRO1356−,PRO1385−,PRO1412−,PRO1487−,PRO1758−,PRO1779−,PRO1785−,PRO1889−,PRO90318−,PRO3434−,PRO3579−,PRO4322−,PRO4343−,PRO4347−,PRO4403−,PRO4976−,PRO260−,PRO6014−,PRO6027−,PRO6181−,PRO6714−,PRO9922−,PRO7179−,PRO7476−,PRO9824−,PRO19814−,PRO19836−,PRO20088−,PRO70789−,PRO50298−,PRO51592−,PRO1757−,PRO4421−,PRO9903−,PRO1106−,PRO1411−,PRO1486−,PRO1565−,PRO4399−またはPRO4404−結合アーム及び細胞毒性剤(例えばサポリン、抗インターフェロン−α、ビンカアルカロイド、リシンA鎖、メトトレキセート又は放射性同位体ハプテン)に結合するアームを保有している。二重特異性抗体は完全長抗体又は抗体フラグメント(例えばF(ab’)2二重特異性抗体)として製造できる。
ヘテロコンジュゲート抗体もまた本発明の範囲内に包含される。ヘテロコンジュゲート抗体は2つの共有結合した抗体よりなる。このような抗体は例えば望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングすること[米国特許第4,676,980号]及びHIV感染の治療のため[WO91/00360、WO92/200373及びEP03089]に提案されている。抗体は交差結合剤を用いる方法を包含する合成蛋白化学における既知の方法を用いてインビトロで製造してよいことを意図している。例えば、イムノトキシンは、ジスルフィド交換反応を用いて、又は、チオエーテル結合の形成により構築してよい。この目的のための適当な試薬の例はイミノチオレート及びメチル−4−メルカプトブチルイミデート及び例えば米国特許第4,676,980号に開示されているものを包含する。
多価抗体は抗体が結合する相手の抗原を発現する細胞により、2価抗体より急速に内在化(及び/又は異化)される場合がある。本発明の抗体は3つ以上の抗原結合部位を有する多価抗体(IgMクラス以外である)(例えば4価抗体)であることができ、これは抗体のポリペプチド鎖をコードする核酸の組み換え発現により容易に製造できる。多価抗体は2量化ドメイン及び3つ以上の抗原結合部位を含むことができる。好ましい2量化ドメインはFc領域又はヒンジ領域を含む(又はそれよりなる)。この設定においては、抗体はFc領域及びFc領域に対してアミノ末端側に3つ以上の抗原結合部位を含むことになる。好ましい多価抗体は本発明においては、3〜約8個、好ましくは4個の抗原結合部位を含む(又はそれよりなる)。多価抗体は少なくとも1つのポリペプチド鎖(及び好ましくは2つのポリペプチド鎖)を含み、ここでポリペプチド鎖は2つ以上の可変ドメインを含む。例えば、ポリペプチド鎖はVD1−(X1)n−VD2−(X2)n−Fcを含んでよく、式中VD1は第1の可変ドメイン、VD2は第2の可変ドメイン、FcはFc領域の1つのポリペプチド鎖であり、X1およびX2はアミノ酸又はポリペプチドを示し、nは0又は1である。例えば、ポリペプチド鎖はVH−CH1−フレキシブルリンカー−VH−CH1−Fc領域鎖;又はVH−CH1−VH−CH1−Fc領域鎖を含んでよい。本発明の多価抗体は好ましくは更に少なくとも2つ(好ましくは4つ)の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含む。本発明の多価抗体は例えば約2〜約8つの軽鎖可変ドメインポリペプチドを含んでよい。本明細書において意図される軽鎖可変ドメインポリペプチドは軽鎖可変ドメインを含み、そして場合により更にCLドメインを含む。
抗体の抗原依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC)及び/又は補体依存性細胞毒性(CDC)を増強するために、エフェクター機能に関して本発明の抗体を修飾することが望ましい場合がある。これは1つ以上アミノ酸置換を抗体のFc領域に導入することにより達成してよい。代替又は追加として、システイン残基をFc領域に導入することにより、この領域における鎖間のジスルフィド結合の形成を可能としてよい。このように形成されたホモ2量体抗体は向上した内在化能力及び/又は増大した補体媒介細胞殺傷及び抗体依存性細胞性細胞毒性(ADCC)を有する場合がある。Caron et al.,J.Exp.Med.,176:1191−1195(1992)及びShopes,B.J.Immunol.148:2918−2922(1992)を参照のこと。増強した抗腫瘍活性を有するホモ2量体抗体はまたWolff et al.,Cancer Research53:2560−2565(1993)に記載のヘテロ2官能性交差リンカーを用いて製造してもよい。或いは、二重にFc領域を有するため増強した補体溶解及びADCC能力を有する抗体を製作することもできる。Stevenson et al.,Anti−Cancer Drug Design3:219−230(1989)を参照のこと。抗体の血清中半減期を延長するためには、例えば米国特許第5,739,277号に記載の通り抗体(特に抗体フラグメント)中にサルベージ受容体結合エピトープを取り込んでよい。本明細書においては、「サルベージ受容体結合エピトープ」という用語はIgG分子のインビボの血清中半減期を延長する原因となるIgG分子(例えばIgG1、IgG2、IgG3及びIgG4)のFc領域のエピトープを指す。
本発明はまた細胞毒性剤、例えば化学療法剤、成長抑制剤、毒素(例えば細菌、カビ、植物又は動物起源の酵素的に活性な毒素又はそのフラグメント)又は放射性同位体(例えば放射性コンジュゲート)にコンジュゲートした抗体を含む免疫コンジュゲートに関する。
マイタンシン及びマイタンシノイド
本発明はマイタンシノイド分子1つ以上にコンジュゲートした抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体(完全長又はフラグメント)を提供する。
その治療指数を向上させる試みにおいて、マイタンシン及びマイタンシノイドは腫瘍細胞抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている。マイタンシノイドを含有する免疫コンジュゲート及びその治療用途は例えば参照により本明細書に組み込まれる米国特許第5,208,020号、第5,416,064号及び欧州特許EP0425235B1に開示されている。Liu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA93:8618−8623(1996)はヒト結腸直腸癌に対して指向されたモノクローナル抗体C242に連結したDM1と指名されたマイタンシノイドを含む免疫コンジュゲートを記載している。コンジュゲートは培養された結腸癌細胞に対しては高度に細胞毒性であることがわかり、そしてインビボの腫瘍生育試験において抗腫瘍活性を示している。Chari et al.,Cancer Research52:127−131(1992)はヒト結腸癌細胞系統上の抗原に結合するマウス抗体A7に、又は、HER−2/neu癌遺伝子に結合する別のマウスモノクローナル抗体TA.1にジスルフィドリンカーを介してマイタンシノイドをコンジュゲートしている免疫コンジュゲートを記載している。TA.1−マイタンシノイドコンジュゲートの細胞毒性は細胞当たり3x105HER−2表面抗原を発現するヒト乳癌細胞系統SK−BR−3に対してインビトロで試験されている。薬剤コンジュゲートは遊離のマイタンシノイド薬剤と同様の細胞毒性の程度を達成しており、これは抗体分子当たりのマイタンシノイド分子の数を増大させることにより増大させることができた。A7−マイタンシノイドコンジュゲートはマウスにおいて低い全身細胞毒性を示した。
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体マイタンシノイドコンジュゲートは抗体又はマイタンシノイド分子の何れかの生物学的活性を有意に低下させること無くマイタンシノイド分子に抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を化学的に連結することにより製造する。抗体分子当たり平均3〜4個のマイタンシノイド分子をコンジュゲートすると抗体の機能又は溶解性に悪影響を及ぼすことなく標的細胞の細胞毒性を増強する場合に有効であることがわかっているが、1分子毒素/抗体であっても抗体単独の使用よりも細胞毒性を増強できることが期待される。マイタンシノイドは当該分野でよく知られており、そして既知の手法により合成するか、又は、天然原料から単離することができる。適当なマイタンシノイドは例えば米国特許第5,208,020号に、そして、上記した他の特許又は非特許の公開物に開示されている。好ましいマイタンシノイドはマイタンシノール及び芳香環において、又は、マインタンシノール分子の他の位置において修飾されているマインタンシノール類似体、例えば種々のマインタンシノールエステルである。
カリケアマイシン
目的の免疫コンジュゲートの別のものはカリケアマイシン分子1つ以上にコンジュゲートした抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体を含む。抗生物質のカリケアマイシンファミリーはピコモル未満の濃度にいおいて2本鎖DNA切断をもたらすことができる。カリケアマイシンファミリーのコンジュゲートの製造に関しては米国特許第5,712,374号、第5,714,586号、第5,739,116号、第5,767,285号、第5,770,701号、第5,770,710号、第5,773,001号、第5,877,296号を参照のこと(全てAmerican Cyanamid Company)。使用してよいカリケアマイシンの構造的類似体は例えばγ1 I、α2 I、α3 I、N−アセチル−γ1 I、PSAG及びθI l(Himman et al.,Cancer Research53:3336−3342(1993)、Lode et al.,Cancer Research 58:2925−2928(1998)及び上記したAmerican Cyanamidへの米国特許)であるが、これらに限定されない。抗体をコンジュゲートできる別の抗腫瘍剤は抗葉酸エステルであるQFAである。カリケアマイシン及びQFAは両方とも細胞内作用部位を有し、原形質膜を容易に通過しない。従って、抗体媒介内在を介したこれらの薬剤の細胞内取り込みはその細胞毒性作用を大きく増大させる。
本発明の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体にコンジュゲートできる他の抗腫瘍剤はBCNU、ストレプトゾシン、ビンクリスチン及び5−フルオロウラシル、米国特許第5,053,394号、第5,770,710に号記載の総称LL−E33288複合体として知られる薬剤ファミリー、並びに、エスペラマイシン(米国特許第5,877,296号)を包含する。
本明細書に開示した抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体はまた免疫リポソームとして製剤してよい。「リポソーム」は哺乳類における薬剤の送達のために有用な脂質、リン脂質及び/又は界面活性剤の種々の型よりなる小型の小胞である。リポソームの成分は一般的には生物学的な膜の脂質の配置と同様に二層形態に配置している。抗体を含有するリポソームは例えばEpstein et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA82:3688(1985);Hwang et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4030(1980);米国特許第4,485,045号及び第4,544,545号;及び1997年10月23日に公開されたWO97/38731に記載されているような当該分野で知られた方法により製造される。長期の循環時間を有するリポソームは米国特許第5,013,556号に開示されている。
本発明により同定されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド並びに前述したスクリーニング試験により同定される他の分子に特異的に結合する抗体を医薬組成物の形態において種々の障害の治療のために投与できる。
本発明の抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;胚発生の障害又は致死性又は代謝異常に関する種々の治療上及び/又は診断上の有用性を有する。例えば、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体は抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404に関する診断試験、例えば特定の細胞、組織又は血清におけるその発現(及び一部の場合は示差的発現)を検出することにおいて使用してよい。当該分野で知られた種々の診断試験の手法、例えば競合的結合試験、直接又は間接のサンドイッチ試験及び不均質又は均質な相の何れかにおいて行う免疫沈降試験を使用してよい[Zola,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques,CRC Press,Inc.(1987)pp.147−158]。診断試験において使用される抗体は検出可能な部分で標識できる。検出可能な部分は直接又は間接的に検出可能なシグナルを生成することができるものでなければならない。例えば検出可能な部分は放射性同位体、例えば3H、14C、32P、35S又は125I、蛍光又はケミルミネセント化合物、例えばフルオレセインイソチオシアネート、ローダミン又はルシフェリン、又は酵素、例えばアルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼ又はセイヨウワサビパーオキシダーゼであってよい。検出可能な部分に抗体をコンジュゲートするための当該分野で知られた何れかの知られた方法、例えばHunter et al.,Nature,144:945(1962);David et al.,Biochemistry,13:1014(1974);Pain et al.,J.Immunol.Meth.,40:219(1981);及びNygren,J.Histochem. and Cytochem.,30:407(1982)に記載のものを使用してよい。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的データベース(例えば、Dayhoff、GenBank)および企業のデータベース(例えば、LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST−2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,WA)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
(1.オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
mRNAを、Invitrogen,San Diego,CA(Fast Track2)の試薬およびプロトコルを使用して目的のヒト組織から単離した。このRNAを使用し、Life Technologies,Gaithersburg,MD(Super Script Plasmid System)の試薬およびプロトコルを使用して、ベクターpRK5Dに、オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリを生成した。この手順において、二本鎖cDNAのうち、1000bpより大きいものを分離し、SalI/NotIリンカー付加されたcDNAを、XhoI/NotI切断されたベクターにクローニングした。pRK5Dは、XhoI/NotI cDNAクローニング部位の前に、sp6転写開始部位、SfiI制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。
1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すために、2次cDNAライブラリを構築した。Sp6RNAを1次ライブラリ(上記)から生成し、このRNAを使用し、Life Technologies(Super Script Plasmid System,上を参照のこと)の試薬およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリをベクターpSST−AMY.0に構築した。この手順において、二本鎖cDNAを、500〜1000bpに分離し、NotIアダプターに平滑末端でリンカー付加し、SfiIで切断し、そしてSfiI/NotIで切断されたベクターにクローニングした。pSST−AMY.0は、cDNAクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター(分泌シグナルなしの成熟配列)、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたcDNAは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。
上の段落2に記載したライブラリ由来のDNAを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントDH10B細菌(Life Technologies,20ml)に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、SOC培地(Life Technologies,1ml)を加えて、混合物を37℃で30分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な150mmLBプレート20枚に播き、16時間インキュベートした(37℃)。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのDNAを標準的なプロトコル、例えば、CsCl勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたDNAを以下の酵母プロトコルに用いた。
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、96ウェルプレート内の滅菌水(30μl)に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート(5μl)を、25μl容量中、以下:0.5μlのKlentaq(Clontech,Palo Alto,CA);4.0μlの10mM dNTP’s(Perkin Elmer−Cetus);2.5μlのKentaq緩衝液(Clontech);0.25μlの順方向オリゴ1;0.25μlの逆方向オリゴ2;12.5μlの蒸留水を含むPCR反応用の鋳型として使用した。
順方向オリゴヌクレオチド1の配列は:
5’−TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT−3’ (配列番号151)であった。
逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:
5’−CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT−3’ (配列番号152)であった。
次いで、PCRを以下のとおりに行った:
様々なポリペプチドをコードする核酸配列を、を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。アルゴリズムの使用により、数多くのポリペプチドをコードする核酸配列が同定された。
天然のヒトPRO179ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA16451−1078)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児肝臓ライブラリにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
OLI114:
5’−CCACGTTGGCTTGAAATTGA−3’ (配列番号153)
OLI115:
5’−CCTTTAGAATTGATCAAGACAATTCATGATTTGATTCTCTATCTCCAGAG−3’ (配列番号154)
OLI116:
5’−TCGTCTAACATAGCAAATC−3’ (配列番号155)。
上の実施例2に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列が、BLASTおよびFastA配列アラインメントによって見出され、コルニション(cornichon)タンパク質をコードするヌクレオチド配列に対する配列相同性を有した。このcDNA配列は、本明細書中でDNA13242と命名される。配列相同性に基づいて、オリゴヌクレオチドプローブを、DNA13242分子の配列から生成し、上の実施例2の段落1に記載されているように調製されたヒト胎盤(LIB89)ライブラリをスクリーニングするために使用した。クローニングベクターは、pRK5Bであり(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)、cDNAを、2800bp未満の大きさに切断した。
順方向PCRプライマー5’−GTGCAGCAGAGTGGCTTACA−3’ (配列番号156)
逆方向PCRプライマー5’−ACTGGACCAATTCTTCTGTG−3’ (配列番号157)
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GATATTCTAGCATATTGTCAGAAGGAAGGATGGTGCAAATTAGCT−3’ (配列番号158)
を含んでいた。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよびPRO244についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成し、使用した。
PCRプライマーの対(順方向および逆方向)を合成した:
5’−TTCAGCTTCTGGGATGTAGGG−3’ (30923.f1) (配列番号159)
5’−TATTCCTACCATTTCACAAATCCG−3’ (30923.r1) (配列番号160)
プローブも合成した:
5’−GGAGGACTGTGCCACCATGAGAGACTCTTCAAACCCAAGGCAAAATTGG−3’ (30923.p1) (配列番号161)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO244遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA33480と命名される。DNA33480コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO247についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー5’−CAACAATGAGGGCACCAAGC−3’ (配列番号162)
逆方向PCRプライマー5’−GATGGCTAGGTTCTGGAGGTTCTG−3’ (配列番号163)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA33480発現配列タグから構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CAACCTGCAGGAGATTGACCTCAAGGACAACAACCTCAAGACCATCG−3’ (配列番号164)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO247遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA35705と命名される。DNA35705コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO269についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー(.f1)5’−TGGAAGGAGATGCGATGCCACCTG −3’ (配列番号165)
順方向PCRプライマー(.f2)5’−TGACCAGTGGGGAAGGACAG−3’ (配列番号166)
順方向PCRプライマー(.f3)5’−ACAGAGCAGAGGGTGCCTTG−3’ (配列番号167)
逆方向PCRプライマー(.r1)5’−TCAGGGACAAGTGGTGTCTCTCCC−3’ (配列番号168)
逆方向PCRプライマー(.r2)5’−TCAGGGAAGGAGTGTGCAGTTCTG−3’ (配列番号169)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35705配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−ACAGCTCCCGATCTCAGTTACTTGCATCGCGGACGAAATCGGCGCTCGCT−3’ (配列番号170)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO269遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
Swiss−Prot公的タンパク質データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、発現配列タグ(EST)データベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー5’−AACAAGGTAAGATGCCATCCTG−3’ (配列番号171)
逆方向PCRプライマー5’−AAACTTGTCGATGGAGACCAGCTC−3’ (配列番号172)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有する発現配列タグから構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−AGGGGCTGCAAAGCCTGGAGAGCCTCTCCTTCTATGACAACCAGC−3’ (配列番号173)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO293遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
上記の実施例2に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNAを、本明細書中でDNA26832と命名する。次いで、DNA26832の配列を、発現配列タグ(EST)データベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology266:460−480(1996))を使用して実施された。タンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー1 CAACGTGATTTCAAAGCTGGGCTC (配列番号174)
順方向PCRプライマー2 GCCTCGTATCAAGAATTTCC (配列番号175)
順方向PCRプライマー3 AGTGGAAGTCGACCTCCC (配列番号176)
逆方向PCRプライマー1 CTCACCTGAAATCTCTCATAGCCC (配列番号177)
ハイブリダイゼーションプローブ1 CGCAAAACCCATTTTGGGAGCAGGAATTCCAATCATGTCTGTGATGGTGG (配列番号178)。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTを同定した。Incyteクローンのアセンブリおよびコンセンサス配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して、形成した。
順方向PCRプライマー1 5’−GGGATGCAGGTGGTGTCTCATGGGG−3’ (配列番号179)
順方向PCRプライマー2 5’−CCCTCATGTACCGGCTCC−3’ (配列番号180)
順方向PCRプライマー3 5’−GTGTGACACAGCGTGGGC−3’ (配列番号181)
順方向PCRプライマー4 5’−GACCGGCAGGCTTCTGCG−3’ (配列番号182)
逆方向PCRプライマー1 5’−CAGCAGCTTCAGCCACCAGGAGTGG−3’ (配列番号183)
逆方向PCRプライマー2 5’−CTGAGCCGTGGGCTGCAGTCTCGC−3’ (配列番号184)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサス配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CCGACTACGACTGGTTCTTCATCATGCAGGATGACACATATGTGC−3’ (配列番号185)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO339遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
本明細書中でDNA12920と命名されたクローンを、上の実施例2に記載したようにヒト胎盤組織ライブラリから単離した。次いで、DNA12920配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む様々なESTデータベースと比較することにより、相同なEST配列を同定した。比較は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA25314と命名する。次いで、DNA25314配列に基づいてオリゴヌクレオチドプライマーを合成し、ヒト胎盤cDNAライブラリをスクリーニングするために使用し、図17に示されるDNA26288−1239クローンが同定された。クローニングベクターは、pRK5B(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)であり、cDNAを2800bp未満に切断した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA39499と命名される。DNA39499コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO347についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を以下のとおりに合成した:
順方向PCRプライマー 5’−AGGAACTTCTGGATCGGGCTCACC−3’ (配列番号186)
逆方向PCRプライマー 5’−GGGTCTGGGCCAGGTGGAAGAGAG−3’ (配列番号187)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA39499配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GCCAAGGACTCCTTCCGCTGGGCCACAGGGGAGCACCAGGCCTTC−3’ (配列番号188)。
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO347遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した(LIB228)。
ECDデータベースを検索し、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからのプロトカドヘリン3に対する相同性を示した発現配列タグ(EST)を同定した。この配列に基づいて、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー 5’−CTGAGAACGCGCCTGAAACTGTG−3’ (配列番号189);
逆方向PCRプライマー 5’−AGCGTTGTCATTGACATCGGCG−3’ (配列番号190)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTAGTTGCTCCATTCAGGAGGATCTACCCTTCCTCCTGAAATCCGCGGAA−3’ (配列番号191)。
ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO531遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児脳組織から単離した(LIB153)。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyte ESTクラスター番号29605と命名される、IncyteデータベースからのESTクラスター配列が同定された。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA48350と命名する。
上の実施例2(ヒト胎児肺ライブラリ)に記載したアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列を、本明細書中でDNA43512と命名する。次いで、DNA43512配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA45625と命名する。企業のGenentech EST配列を、アセンブリに使用した。
順方向PCRプライマー 5’−GGGTGGATGGTACTGCTGCATCC−3’ (配列番号192)
逆方向PCRプライマー5’−TGTTGTGCTGTGGGAAATCAGATGTG−3’ (配列番号193)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA45625配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GTGTCTGGAGGCTGTGGCCGTTTTGTTTTCTTGGGCTAAAATCGGG−3’ (配列番号194)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO718遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、(1)企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)および(2)Genentechの企業ESTデータベースを含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー 5’−CCTGGGCTCTGGCTCTTCTTTCAG−3’ (配列番号195)
逆方向PCRプライマー 5’−CCACTCAGAGGCCTCAGCTTTTCC−3’ (配列番号196)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40751配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTTCGGCCACCCAGGCACGGAAAGGCTTCTGGGACTACTTCAGCC−3’ (配列番号197)
cDNAライブラリを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上の実施例1に記載したように種々のEST配列に対するコンセンサス配列を得た。ここで、得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA40324と命名した。DNA40324コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO871の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー1 5’−TGCGGAGATCCTACTGGCACAGGG−3’ (配列番号198)
順方向PCRプライマー2 5’−CGAGTTAGTCAGAGCATG−3’ (配列番号NO:199)
順方向PCRプライマー3 5’−CAGATGGTGCTGTTGCCG−3’ (配列番号200)
逆方向PCRプライマー1 5’−CAACTGGAACAGGAACTGAGATGTGGATC−3’ (配列番号201)
逆方向PCRプライマー2 5’−CTGGTTCAGCAGTGCAAGGGTCTG−3’ (配列番号202)
逆方向PCRプライマー3 5’−CCTCTCCGATTAAAACGC−3’ (配列番号203)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40324配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ5’−GAGAGGACTGGTTGCCATGGCAAATGCTGGTTCTCATGATAATGG−3’ (配列番号204)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対の一方を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO871遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した(LIB227)。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、本明細書中でclul20709.init.と命名される単一のIncyte EST配列が同定できた。次いで、clul20709.init配列を、企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)と比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA48254と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のIncyte ESTクラスター配列(Incyte ESTクラスター配列番号45501が同定できた。次いで、Incyte ESTクラスター配列番号45501の配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56400と命名する。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載した方法を使用して同定した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA35717と命名される。DNA35717コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO828についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー 5’−GCAGGACTTCTACGACTTCAAGGC−3’ (配列番号205);および
逆方向PCRプライマー 5’−AGTCTGGGCCAGGTACTTGAAGGC−3’ (配列番号206)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35717配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CAACATCCGGGGCAAACTGGTGTCGCTGGAGAAGTACCGCGGATCGGTGT−3’ (配列番号207)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO828遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児肺組織から単離した(LIB25)。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
実施例2に記載されたアミラーゼスクリーニングにおいて単離されたcDNA配列が、WU−BLAST2配列アラインメントコンピュータプログラムによって他の既知インターフェロンレセプターとの一定の配列同一性を有することが見出された。このcDNA配列を、本明細書中でDNA48466と命名する。その配列同一性に基づいて、プローブを、DNA48466分子の配列から生成し、上の実施例2の段落1に記載したように調製したヒト乳癌ライブラリ(LIB135)をスクリーニングするために使用した。クローニングベクターは、pRK5B(pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science.253:1278−1280(1991)を参照のこと)であり、cDNAを2800bp未満に切断した。
順方向PCRプライマー 5’−AGGCTTCGCTGCGACTAGACCTC−3’ (配列番号208)
逆方向PCRプライマー 5’−CCAGGTCGGGTAAGGATGGTTGAG−3’ (配列番号209)
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTTCTACGCATTGATTCCATGTTTGCTCACAGATGAAGTGGCCATTCTGC−3’ (配列番号210)
ヌクレオチド250−252位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1183−1185位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローンを、同定した(図41;配列番号41)。予測されるポリペプチド前駆体は、311アミノ酸長であり、約35,076ダルトンという算出された分子量および約5.04という推定pIを有する。図42(配列番号42)に示される完全長PRO1114インターフェロンレセプター配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約29のシグナルペプチド、アミノ酸約230〜アミノ酸約255の膜貫通型ドメイン、アミノ酸約40〜アミノ酸約43およびアミノ酸約134〜アミノ酸約137の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約92〜アミノ酸約119の組織因子タンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックならびにアミノ酸約232〜アミノ酸約262のインテグリンアルファ鎖タンパク質との相同性を有するアミノ酸配列ブロックの存在が明らかになる。クローンUNQ557(DNA57033−1403)は、1998年5月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209905が割り当てられている。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースから、Incyte ESTクラスター配列番号165008と命名される、ESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA55726と命名する。
(実施例25:ヒトPRO1126ポリペプチド[UNQ564]をコードするcDNAクローンの単離)
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56250と命名する。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。この配列を、phrapの繰り返しサイクルを使用して伸長した。伸長されたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA38102と命名する。DNA38102コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1133の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー1 5’−TCGATTATGGACGAACATGGCAGC−3’ (配列番号211);
順方向PCRプライマー25’−TTCTGAGATCCCTCATCCTC−3’ (配列番号212);および
逆方向プライマー 5’−AGGTTCAGGGACAGCAAGTTTGGG−3’ (配列番号213)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA38102配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’TTTGCTGGACCTCGGCTACGGAATTGGCTTCCCTCTACGGACAGCTGGAT3’ (配列番号214)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO1133遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56025と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56426と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。そのESTの1個以上は、ヒト松果体ライブラリ由来であった。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56511と命名する。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、フリンジ(fringe)タンパク質との相同性を示すESTを同定した。次いで、このEST配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々のESTデータベースと比較することにより、相同なEST配列を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、比較を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA40568と命名する。
順方向PCRプライマー 5’−CTCGGGGAAAGGGACTTGATGTTGG−3’ (配列番号215)
逆方向PCRプライマー1 5’−GCGAAGGTGAGCCTCTATCTCGTGCC−3’ (配列番号216)
逆方向PCRプライマー2 5’−CAGCCTACACGTATTGAGG−3’ (配列番号217)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40568配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CAGTCAGTACAATCCTGGCATAATATACGGCCACCATGATGCAGTCCC−3’ (配列番号218)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1287遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、120480と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56425と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、Incyte ESTクラスター配列番号115204と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56522と命名する。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA37164と命名される。DNA37164コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO1310についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー: 5’GTTCTCAATGAGCTACCCGTCCCC3’ (配列番号219)および
逆方向PCRプライマー:5’CGCGATGTAGTGGAACTCGGGCTC3’ (配列番号220)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47394配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’ATCCGCATAAACCCTCAGTCCTGGTTTGATAATGGGAGCATCTGCATGAG3’ (配列番号221)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1310遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児肝臓組織から単離した。
DNA55773を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示す酵母スクリーニングを使用してヒト胎児腎臓cDNAライブラリにおいて同定した。そのDNA55773配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、PRO1312の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA35727と命名される。DNA35727コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1335についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー(35727.f1)5’−GTAAAGTCGCTGGCCAGC−3’ (配列番号222)
順方向PCRプライマー(35727.f2)5’−CCCGATCTGCCTGCTGTA−3’ (配列番号223)
逆方向PCRプライマー(35727.r1)5’−CTGCACTGTATGGCCATTATTGTG−3’ (配列番号224)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35727配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ(35727.p1)
5’−CAGAAACCCATGATACCCTACTGAACACCGAATCCCCTGGAAGCC−3’ (配列番号225)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1335遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト網膜組織から単離した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA40652」と命名する。コンセンサス配列内のアセンブリはIncyte EST2479394であった。そのコンセンサス配列および他の発見ならびに本明細書中で提供される情報に基づいて、Incyte EST2479394を含むクローンを購入し、すべて配列決定した。配列決定により、図67に示す、PRO1339をコードする配列を含む核酸配列が提供された。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから、Incyte ESTクラスター配列番号44725と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56023と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから単一のESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA57952と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースから、Incyteクラスター番号101368と命名され、本明細書中で「DNA10643」とも呼ばれるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そのESTの1個以上は、雄性胎児から取り出された前立腺間質の線維芽細胞から単離されたRNA由来であった。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA58754」と命名する。
本明細書中で「DNA8208」と呼ばれる単一のMerck ESTのHSC2ID011を、上の実施例1において記載されたように既知タンパク質をコードしなかった70またはそれ以上のBLASTスコアを有する目的のESTとして同定した。そのDNA8208配列を、BLASTおよびプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)の繰り返しサイクルを使用して伸長することにより、上で記載したEST配列の起源を使用してその配列をできる限り伸長した。得られたコンセンサス配列を本明細書中で「DNA68836」と命名する。DNA68836コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1487の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー: GTGCCACTACGGGGTGTGGACGAC (54209.f1;配列番号226) および
逆方向PCRプライマー TCCCATTTCTTCCGTGGTGCCCAG (54209.r1;配列番号227)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA68836配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ CCAGAAGAAGTCCTTCATGATGCTCAAGTACATGCACGACCACTAC (54209.p1;配列番号228)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1487遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト胎児腎臓組織から単離した。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースから、ESTクラスター番号20926と命名されるESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、上述のデータベースからの種々の発現配列タグ(EST)と比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56260と命名する。
(1.オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
mRNAを、Invitrogen,San Diego,CA(Fast Track2)の試薬およびプロトコルを使用してヒト乳癌組織から単離した。このRNAを使用し、Life Technologies,Gaithersburg,MD(Super Script Plasmid System)の試薬およびプロトコルを使用して、ベクターpRK5Dに、オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリを生成した。この手順において、二本鎖cDNAのうち、1000bpより大きいものを分離し、SalI/NotIリンカー付加されたcDNAを、XhoI/NotI切断されたベクターにクローニングした。pRK5Dは、XhoI/NotI cDNAクローニング部位の前に、sp6転写開始部位、SfiI制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。
(2.ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリの調製)
1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すために、2次cDNAライブラリを構築した。Sp6RNAを1次ライブラリ(上記)から生成し、このRNAを使用し、Life Technologies(Super Script Plasmid System,上を参照のこと)の試薬およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリをベクターpSST−AMY.0に構築した。この手順において、二本鎖cDNAを、500〜1000bpに分離し、NotIアダプターに平滑末端でリンカー付加し、SfiIで切断し、そしてSfiI/NotIで切断されたベクターにクローニングした。pSST−AMY.0は、cDNAクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列(分泌シグナルなしの成熟配列)の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたcDNAは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。
(3.形質転換および検出)
上の段落2に記載したライブラリ由来のDNAを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントDH10B細菌(Life Technologies,20ml)に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、SOC培地(Life Technologies,1ml)を加えて、混合物を37℃で30分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な150mmLBプレート20枚に播き、16時間インキュベートした(37℃)。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのDNAを標準的なプロトコル、例えば、CsCl勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたDNAを以下の酵母プロトコルに用いた。
(4.PCR増幅によるDNAの単離)
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、96ウェルプレート内の滅菌水(30μl)に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート(5μl)を、25μl容量中、以下:0.5μlのKlentaq(Clontech,Palo Alto,CA);4.0μlの10mM dNTP’s(Perkin Elmer−Cetus);2.5μlのKentaq緩衝液(Clontech);0.25μlの順方向オリゴ1;0.25μlの逆方向オリゴ2;12.5μlの蒸留水を含むPCR反応用の鋳型として使用した。順方向オリゴヌクレオチド1の配列は:
5’−TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT−3’ (配列番号151)であった。
逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:
5’−CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT−3’ (配列番号152)であった。
b.変性 92℃、30秒
アニーリング 59℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
c.変性 92℃、30秒
アニーリング 57℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
d.変性 92℃,30秒
アニーリング 55℃,30秒
伸長 72℃,60秒を25サイクル
e.4℃保持
オリゴヌクレオチドの下線を引いた領域を、それぞれ、ADHプロモーター領域およびアミラーゼ領域にアニーリングさせ、挿入断片が存在しないとき、ベクターpSST−AMY.0から307bpの領域を増幅した。代表的には、これらのオリゴヌクレオチドの5’末端の最初の18ヌクレオチドは、配列決定プライマー用のアニーリング部位を含んでいた。従って、空のベクターからのPCR反応の総産物は、343bpであった。しかしながら、シグナル配列融合cDNAは、かなり長いヌクレオチド配列を生じた。
(5.完全長クローンの同定)
上記スクリーニングにおいて単離されたcDNA配列を本明細書中でDNA66065と命名する。次いで、そのDNA66065配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)、企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)および企業Genentech ESTデータベースを含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。コンセンサス配列を、本明細書中でDNA67977と命名する。企業Genentech EST配列をアセンブリに使用し、本明細書中でDNA66217と命名する。
順方向PCRプライマー(67977.f1)5’−TCCTTCGGCTGCTGTGATCAGCAC−3’ (配列番号229)
逆方向PCRプライマー(67977.r1)5’−CCCAGGTGGCGGTTGAGATAGTCG−3’ (配列番号230)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA67977配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ(67977.p1)
5’−CGCTGCCCGGTACTGGGACATCATGGAATATTTTGATCTGAAGAG−3’ (配列番号231)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO1779遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「DNA35718」と命名する。DNA35718コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO1785の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー:5’−ATCCTCCAACATGGAGCCTCTTGC−3’ (配列番号232);
順方向PCRプライマー:5’−GTATCTTGTCAACCCTGAGG−3’ (配列番号233);および
逆方向PCRプライマー:5’−TAACCAGAGCTGCTATGTCAGGCC−3’ (配列番号234);
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA35718配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ:5’−AGGCAAAGTTTCACTAGTTGTAAACGTGGCCAGTGACTGCCAACTCACAG−3’ (配列番号235)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1785遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト大動脈内皮細胞から単離した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA49310と命名する。DNA49310コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2779436内に含まれるESTとの間に見られる相同性に基づいて、Incyte EST クローン番号2779436を購入し、その挿入断片を得て、配列決定した。挿入断片の配列を図85に示し、本明細書中でDNA77623−2524と命名する。
上の実施例2に記載された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって、DNA77631−2537を同定した。上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56099と命名する。
DNA68862−2546を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)を適用することによって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
本明細書中で(DNA92223−2567)と命名された、天然ヒトPRO4322ポリペプチドをコードするcDNAクローンを、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すヒト組織cDNAライブラリにおいて酵母スクリーニングによって同定した。
DNA92255−2584を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー 5’GCTTTCATTGCCACGTGGAGTATG3’ (配列番号236)および
逆方向PCRプライマー 5’ACCTAGTGAGGCTGGGATTTGGC3’ (配列番号237)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するそのコンセンサス配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’CCGCCTGGCTCTGTGCCAAGCCCTTCAAAGTCATCTGTAT3’ (配列番号238)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO4403遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
最初のDNA配列(DNA90650)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表す酵母スクリーニングを使用して同定した。この配列を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、公的データベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)からのESTと比較した。そのESTをクラスター化し、コンピュータプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を使用してコンセンサスDNA配列に構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA94848」と命名する。DNA94848コンセンサス配列に基づいて、以下のオリゴヌクレオチドを、ヒトヒト胎児腎臓cDNAライブラリからPRO1377の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した:
5’CCGCCAGAAGAATGCAGTTCTG3’ (順方向,配列番号239)、
5’CCTCCACCCTCAGAACTGCCTC3’(逆方向,配列番号240),および
5’GCAATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATG3’ (プラスミド,配列番号241)。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中でDNA30834と命名される。DNA30834コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO260についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー:5’−TGGTTTGACCAGGCCAAGTTCGG−3’ (配列番号242);
逆方向PCRプライマーA:5’−GGATTCATCCTCAAGGAAGAGCGG−3’ (配列番号243);および
逆方向PCRプライマーB:5’−AACTTGCAGCATCAGCCACTCTGC−3’ (配列番号244)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA30834配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTCCGTGCCCAGCTTCGGTAGCGAGTGGTTCTGGTGGTATTGGCA−3’ (配列番号245)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO260遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
DNA92217−2697を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
DNA105838−2702を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、Merck/Washington University)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー 5’−CCAGCATTTGAGACTTGTGCAGC−3’ (配列番号246)
逆方向PCRプライマー 5’−GACTGTAGGAGGCAATGGACACTCC−3’ (配列番号247)および
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA80179配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’−CCATCTCCACTCTGCCCGGGCTGGAGCTCTTTTGTGCTATG−3’ (配列番号248)
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト精巣組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
DNA82358−2738を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
DNA108701−2749を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、サイトカイン/成長因子ホモログに対して検索を行った。成長因子ホモログをコードするエキソンを含む94.5KBの断片が見出されたが、しかしながら、この断片は、大きなイントロンによって分断されていた。このイントロンを、コンピュータアルゴリズムによって取り除いた。DNA102863コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO7476の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
順方向PCRプライマー:5’−ATGCAGCTCCCACTGGCCCTG−3’ (配列番号249)
逆方向PCRプライマー:5’−CTAGTAGGCGTTCTCCAGCTCGGCCTG−3’ (配列番号250)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA102863配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CTTCCGCTGCATCCCCGACCGCTACCGCGCGCAGCGCGTG−3’ (配列番号251)
上に記載したように単離されたクローンのDNA配列決定により、完全長PRO7476ポリペプチド(本明細書中でDNA115253−2757と命名[図117,配列番号117])の完全長DNA配列およびPRO7476の誘導タンパク質配列が得られた。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。これらのESTデータベースは、LIFESEQ7,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー 5’−CATCGTGTGTCGTGCCACCAAC−3’ (配列番号252)
逆方向PCRプライマー 5’−CTCTGGCCATTCTCCACGTCACC−3’ (配列番号253)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47457配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GGAAAGGAGACGTCGGTCACCATTGACATCCAGCACCCTCCAC−3’ (配列番号254)
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、混合組織からヒトオリゴdTから単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、企業ESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST−2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー 5’−GCTGCTCGTGCTCCGGCTG−3’ (配列番号255)
逆方向PCRプライマー 5’−CACAAAACGACAATCCGGGCCTG−3’ (配列番号256)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA90859配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GCACAAACTCTGCGCGGACGACGAATGCAGCATGTTAATGTAC−3’ (配列番号257)
cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとし、SalIヘミキナーゼ処理されたアダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD);pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベースから3つのEST配列が同定できた。それらを、Incyte ESTクローン番号2007947、2014962および1912034と命名する。次いで、これらのEST配列をクラスター化し、プログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列に構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA56054と命名する。
DNA96879−2619を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
DNA119596−2797を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。第1のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。第1のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、第2のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のIncyte EST配列が同定できた。次いで、この配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,Uni.of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築する。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56423と命名する。
上の実施例3に記載されたシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業EST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。これらのESTの1つ以上は、甲状腺組織ライブラリ由来であった。コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altshul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して、相同性検索を実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築する。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56013と命名する。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列は、本明細書中で「DNA48897」と命名される。DNA48897コンセンサス配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するためおよび2)PRO1486についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。
順方向PCRプライマー 5’AGGCAGCCACCAGCTCTGTGCTAC3’ (配列番号258);および
逆方向PCRプライマー 5’CAGAGAGGGAAGATGAGGAAGCCAGAG3’ (配列番号259)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA48897配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’CTGTGCTACTGCCCTTGGACCCTGGGGACCGAGTGTCTCTGC3’ (配列番号260)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1486遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。cDNAライブラリを構築するためのRNAを、ヒト腺癌細胞株から単離した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA67183と命名する。DNA67183コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2510320内に含まれるEST配列との間に観察される相同性に基づいて、Incyte EST クローン番号2510320を購入し、その挿入断片を得て、配列決定した。その挿入断片配列を図145に示し、本明細書中でDNA73727−1673(配列番号145)と命名する。
Incyte企業データベースを検索し、DNA79345を同定した。そのDNA79345配列に基づいて、オリゴヌクレオチドを、1)目的の配列を含むcDNAライブラリをPCRによって同定するため、および2)PRO4399の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、Ausubel et al,Current Protocols in Molecular Biology、前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
順方向PCRプライマー5’CGGCAGATTGAAGATGATCGAAAGACAC3’(配列番号261)、および逆方向PCRプライマー5’GTCTTGTTTCCAAGCTCAGCACTCTTTGG3’(配列番号262).
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA79345配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ
5’TCAGGAGTTGAAAGAGAAAATGGACGAGCTCCTGCCTTTGATCCC3’ (配列番号263).
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマー対を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO4399遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。ESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業ESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んだ。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology.266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施された。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
順方向PCRプライマー5’TCAGCAAGGAGACCAACTGCCAGAC3’(配列番号264)、および逆方向PCRプライマー5’CTGCAGGCAATGTGCATCCATCTG3’(配列番号265)
さらに、合成のオリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA77609配列から構築した。
ハイブリダイゼーションプローブ 5’CCTCAGGGCTACCGCTTCCAGAAGTTAAGCCGAGTGTTGAATCAG3’(配列番号266)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリをスクリーニングするために、ライブラリ由来のDNAを上で同定したPCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリを、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用してPRO4404遺伝子をコードするクローンを単離するために使用した。
抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404のポリペプチドの役割を研究するために、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404の遺伝子の破壊を相同組換えまたはレトロウイルスによる挿入技術によって行った。詳細には、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404の遺伝子の破壊を含むトランスジェニックマウス(すなわち、ノックアウトマウス)を、遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラッピングのいずれかによって作製した。サザンブロット解析によって変異を確認することにより、5’末端と3’末端の両方への正確なターゲティングを確認した。挿入部位に隣接するエキソンにアニーリングするプライマーを使用したRT−PCRによって裏付けられるように、遺伝子特異的なジェノタイピングをゲノムPCRによって行うことにより、内在性の天然の転写物が失われていることが確認された。ターゲティングベクターを129系統のES細胞に電気穿孔し、標的クローンを同定した。標的クローンを宿主胚盤胞に微量注入することにより、キメラを作製した。キメラをC57動物と交雑し、F1ヘテロ接合体を作製した。ヘテロ接合体を交雑受精することにより、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体コホートを作製し、表現型解析に使用した。まれに、F1ヘテロ接合体が十分に作製されない場合に、そのF1へテロ接合体を野生型C57マウスと交雑することにより、十分なヘテロ接合体を得て、表現型の解析用のコホートと交雑させた。すべての表現型解析を生後12〜16週から実施した。
70.1.DNA16451−1078(UNQ153)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO179ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA16451−1078と命名)(UNQ153)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC019491 ACCESSION:BC019491 NID:18044500 Mus musculus Mus musculus,アンジオポエチン様3、クローンMGC:28584 IMAGE:4211688;参照タンパク質:Q9R182 ACCESSION:Q9R182 NID:Mus musculus(マウス).アンジオポエチン関連タンパク質3(アンジオポエチン様3).MOUSESPTRNRDB;参照ヒト遺伝子配列:NM_014495 ACCESSION:NM_014495 NID:7656887 Homo sapiens Homo sapiensアンジオポエチン様3(ANGPTL3);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y5C1 ACCESSION:Q9Y5C1 NID:Homo sapiens(ヒト)アンジオポエチン関連タンパク質3.HUMANSPTRNRDB。
平均産仔数=7
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションBC019491.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、腎臓;肝臓;胃、小腸および結腸;ならびに心臓の13の成体組織サンプルから標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(70.1.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA16451−1078(UNQ153)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトアンジオポエチン様3(ANGPTL3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける血清コレステロールレベルおよび血清トリグリセリドレベルが減少した。雄および雌のホモ接合性変異マウスでは、性別一致野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清コレステロールレベルおよび平均トリグリセリドレベルが著しく減少した。ホモ接合性変異マウスの一部は、血尿(尿中に血液が存在)および水腎症を示した。さらに、ホモ接合性変異体では、LPS攻撃に対して、平均血清IL−6応答が増大した。(−/−)マウスではまた、骨関連測定値が低下した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/ml、0.25ml/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20ml/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
解析された3匹の(−/−)マウスのうち、2匹の雄(−/−)マウスは、右腎に中程度の水腎症を示した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重であった。注射の3時間後100μlの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
(−/−)マウスにおいて、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、LPS攻撃に対して平均血清IL−6応答が増大した。
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、異脂肪血症(例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および高血清トリグリセリド(高トリグリセリド血症))、糖尿病および/または肥満症を処置するために標的を本明細書中で同定した。表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。高コレステロールレベルおよび高トリグリセリド血液レベルは、循環器疾患および/または糖尿病の発症の危険因子と認識されている。血中脂質を測定することにより、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、循環器疾患のリスクの低減に有用であり得る。これらの血液化学試験において、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
雄および雌(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、著しく低い平均血清コレステロールレベル(背景的平均よりも1〜2標準偏差低い)および低い平均血清トリグリセリドレベル(背景的平均よりも>2標準偏差低い)を示した。
説明:
日常的な尿検査は、腎臓/泌尿器系の一般的な評価を提供するために実施されるスクリーニング検査である。尿が日常的に検査される特徴としては、タンパク質、グルコース、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノーゲン、硝酸塩および白血球エステラーゼならびにpHおよび比重についての検査が挙げられる。
解析された8匹の(−/−)マウスのうち、4匹が、血尿(尿中に血液が存在)を示した。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
マイクロCT:(−/−)ホモ接合性変異体は、(+/+)コントロール同腹仔と比較して骨関連測定値が低下しており、骨梁の骨容量、数および結合密度が低下していた。
これらのノックアウト実験において、PRO181ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA23330−1390と命名)(UNQ155)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_009919 ACCESSION:NM_009919 NID:gi27545444 refNM_009919.1 Mus musculusコルニションホモログ(Drosophila)(Cnih);参照タンパク質:O35372 ACCESSION:O35372 NID:Mus musculus(マウス).コルニションホモログ.MOUSESPTRNRDB;参照ヒト遺伝子配列:NM_005776 ACCESSION:NM_005776 NID:gi5031638 refNM_005776.1 Homo sapiensコルニションホモログ(Drosophila)(CNIH);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O95406ACCESSION:O95406 NID:Homo sapiens(ヒト).コルニションホモログ(TGAM77).HUMANSPTRNRDB。
平均産仔数=7
変異型:レトロウイルスによる挿入(OST)
説明:コーディングエキソン1と2との間のイントロンにレトロウイルスによって挿入した(NCBIアクセッションNM_009919.1)
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現が、RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて検出された。
2.QC発現:転写物が、解析された(−/−)マウス(F−104)に存在しないことがRT−PCR解析によって明らかになった。標的遺伝子の破壊をインバースPCRによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトコルニションホモログ(Drosophila)(CNIH)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雌(−/−)マウスと雄(−/−)マウスの両方において生存性低下が生じた。雌(−/−)マウスおよび雄(−/−)マウスは、著しい体重減少、総組織マスおよび除脂肪体重の減少ならびに骨中無機質密度および骨塩量の減少を示した。雄ホモ接合性変異マウスにおいては、平均脊椎骨梁の骨容量、厚さおよび結合密度が減少し、大腿骨中軸の皮質の厚さの平均および断面積が減少していた。雄(−/−)変異体は、平均血清インスリンレベルも減少していた。雌(−/−)マウスでは、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が上昇した。さらに、雄(−/−)マウスにおける不安関連応答の低下に注目した。RT−PCR解析により、その転写物がホモ接合性変異マウスに存在しないことが明らかになった。
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んでいた。
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン(seratonin)トランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイを、カスタマイズして感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして感情状態及び学習に関する探索パターンに関する変化を扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、探索に特に関連する活動である鼻を突っ込むことを可能にする4つの穴を床に設けた。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設計した。オープンフィールド試験はマウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子の全てが新しく開放性空間に関連した天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンと程度および特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。移動した全距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、オープンフィールド試験の間に中心にいた合計時間が高い中央値を示した。このことから変異体の不安様応答が低いことが示唆される。
手順:皮膚細胞を16週齢の成体動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合性マウス)から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、p53およびKu80で証明されている。Brdu取り込みを使用して増殖を測定した。
雌(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が上昇した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織マス(TTM)の変化を同定した。
身体測定:身長および体重の測定を、約16週齢で行った。
雄(−/−)マウスおよび雌(−/−)マウスにおいて、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均体重が著しく減少していた。身長データは、ノックアウト(−/−)マウスと、ヘテロ接合性(+/−)マウスと野生型(+/+)同腹仔コントロールとの間で差を示さなかった。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
1.DEXA:雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均総組織マスおよび除脂肪体重が減少していた。これらの変異体は、平均骨塩量および骨中無機質密度関連測定値が低かった。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均脊椎骨梁の骨容量、厚さおよび結合密度が低下しており、平均大腿骨中軸の皮質の厚さおよび断面積が減少していた。
マウスにおける血液化学試験を実施するための臨床的な設定のCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して血液化学解析を行った。
試験の説明:Lexicon Geneticsは、マウスにおける定量的インスリンアッセイを実施するための臨床的な設定のCobraIIシリーズ自動ガンマ計測システムを使用する。
雄(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清インスリンレベルが低下した。
PRO181ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、低い総組織マスおよび除脂肪体重を特徴とする組織消耗疾患に一致した表現型を示す。インスリンレベルは、異常に低く、糖尿病が示唆される。従って、PRO181ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの代謝関連作用を模倣し得る。他方では、PRO181ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような代謝性障害(例えば、糖尿病または他の組織消耗疾患)の予防および/または処置に有用であり得る。
F1ヘテロ接合性動物を交雑受精させて、F2野生型マウス(29匹の雌+/+;39匹の雄(+/+))、ヘテロ接合性マウス(65匹の雌+/−;64匹の雄(+/−))およびホモ接合性マウス(11匹の雌(−/−);12匹の雄(−/−))子孫を作製した。雌(−/−)マウスと雄(−/−)マウスの両方において観察された生存率は、2分の1であった。さらに、雌と雄のUNQ155ノックアウトマウスの両方が、野生型(+/+)とヘテロ接合性(+/−)子孫の両方と比較して著しい体重減少を示した(クリップ(clip)時、離乳時、6週間および8週間で行った測定)。従って、UNQ155ノックアウトマウスは、生存性低下を示すだけでなく、著しい体重減少もまた示す。このネガティブな代謝性の表現型により、PRO181ポリペプチドまたはそのアゴニストが、正常な成長および発達に不可欠であることが示唆される。
これらのノックアウト実験において、PRO244ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA35668−1171と命名)(UNQ218)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_019948 ACCESSION:NM_019948 NID:9910161 Mus musculus Mus musculus C型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9(Clecsf9);参照タンパク質:Q9R0Q8 ACCESSION:Q9R0Q8 NID:Mus musculus(マウス).マクロファージC型レクチンMINCLE(C型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9);参照ヒト遺伝子配列:NM_014358 ACCESSION:NM_014358 NID:7657332 Homo sapiens Homo sapiens C型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9(CLECSF9);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9ULY5 ACCESSION:Q9ULY5 NID:Homo sapiens(ヒト).マクロファージC型レクチンMINCLE。
平均産仔数=4
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1〜3を標的化した(NCBIアクセッションNM_019948.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、肝臓および脂肪において、標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトC型(カルシウム依存性、炭水化物認識ドメイン)レクチン、スーパーファミリーメンバー9(CLECSF9)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスは、機能観察バッテリー試験の間、挙尾を示した。雄(−/−)マウスにおいては、平均全身脂肪パーセントおよび総脂肪マスが増加した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫 性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んでいた。
FOBは、全体感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経学的機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検出および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
基本的な感覚および運動の観察結果:解析された8匹の(−/−)マウスのうち、4匹が、機能観察バッテリー試験の間に挙尾を示した。これらの観察結果は、変異(−/−)マウスにおける不安の増大を示唆し、その不安は、軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安および/または双極性障害;活動亢進;感覚障害;強迫性障害、分裂病または妄想性人格に関連する。従って、PRO244ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の処置に有用であり得る。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
DEXA:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび全身脂肪マスが増加した。
これらのノックアウト実験において、PRO247ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA35673−1201と命名)(UNQ221)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC048152 Mus musculusロイシンリッチ反復配列含有8、mRNA(cDNAクローンMGC:61242IMAGE:5708850);参照タンパク質:Q80WG5 ACCESSION:Q80WG5 NID:Mus musculus(マウス).ロイシンリッチ反復配列含有8前駆体;参照ヒト遺伝子配列:BC051322Homo sapiens ロイシンリッチ反復配列含有8、mRNA(cDNAクローンMGC:59975IMAGE:6250713);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8IWT6 ACCESSION:Q8IWT6 NID:Homo sapiens(ヒト)ロイシンリッチ反復配列含有8前駆体。
平均産仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションBC048152.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨を除く13の成体組織サンプルすべてにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチ反復配列含有8(LRRC8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が上昇した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
耐糖能試験:試験された雄変異(−/−)マウスでは、性別一致(+/+)同腹仔と比較するとき、耐糖能が上昇した。
これらのノックアウト実験において、PRO269ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA38260−1180と命名)(UNQ236)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_025809 ACCESSION:NM_025809 NID:gi 13385277 refNM_025809.1 Mus musculus RIKEN cDNA 1200003C23遺伝子(1200003C23Rik);参照タンパク質:Q9CXA8 ACCESSION:Q9CXA8 NID:Mus musculus(マウス).1200003C23RIKタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_175060 ACCESSION:NM_175060 NID:gi 28269706 ref NM_175060.1 Homo sapiens 14番染色体オープンリーディングフレーム27(C14orf27);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q86T13 ACCESSION:Q86T13 NID:Homo sapiens(ヒト).タンパク質C14orf27前駆体。
C14orf27は、仮想I型原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、C型レクチン(CTL)ドメイン(SMARTアクセッションSM00034)、上皮成長因子様ドメイン(SMARTアクセッションSM00181)、膜貫通型セグメントおよび細胞質のC末端からなる。このタンパク質は、糖タンパク質上の炭水化物残基と結合する可能性があり、リガンド、レセプターまたは細胞接着分子として機能し得る。
平均産仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッション(NM_025809.3)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、脊髄、胸腺、骨格筋、骨および脂肪を除く13の成体組織サンプルすべてにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト14番染色体オープンリーディングフレーム27(C14orf27)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける骨中無機質密度測定値が減少した。遺伝子破壊をサザンブロットにより確認した。
UNQ236(単一の膜貫通タンパク質)は、マウスの胚における血管のサブセットにおいて発現される:特に、E9.75頭部;E9.75体幹(前腸内胚葉;心臓;中腸内胚葉);E10.5頭部;およびE9.75腹側体幹(肝臓および膵臓の芽を含む前腸内胚葉)。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
1.DEXA:雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、全身、大腿骨および脊椎において平均骨塩量、骨塩量指標(BMC/LBM)および骨中無機質密度が減少した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均脊椎骨梁骨容量および結合密度が減少した。
これらのノックアウト実験において、PRO293ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA37151−1193と命名)(UNQ256)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_010732 Mus musculus ロイシンリッチ反復配列タンパク質2、ニューロン(Lrrn2);参照タンパク質:Q6PHP6 ACCESSION:Q6PHP6 NID:Mus musculus(マウス).ロイシンリッチ反復配列タンパク質2、ニューロン;参照ヒト遺伝子配列:NM_006338 ACCESSION:NM_006338 NID:5453655 Homo sapiens Homo sapiens1番染色体で増幅されるグリオーマタンパク質(ロイシンリッチ)(GAC1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O75325 ACCESSION:O75325 NID:Homo sapiens(ヒト).1番染色体で増幅されるグリオーマタンパク質前駆体。
平均産仔数=7
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションNM_010732.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13の成体組織サンプルのすべて(肺、骨格筋および骨を除く)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチ反復配列ニューロン5(LRRN5)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける神経性の異常が生じた。野生型同腹仔と比較するとき、ホモ接合性変異マウスは、不安様応答の低下および疼痛に対する感度の低下を含む神経性の異常を示した。ホモ接合性変異マウスはまた、全身脂肪(パーセント%および質量(g)の両方)が増加した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んでいた。
FOBは、全体感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経学的機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらを正常に検出および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
不安:雄(−/−)マウスにおいて、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、ストレス誘導性高体温に対する応答が低下したことから、変異体における不安様応答の低下が示唆される。従って、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏ならびに感覚障害および/または双極性障害に一致する表現型を示した。従って、PRO293ポリペプチドおよびそのアゴニストは、うつ病性障害に関連する症状の処置または回復に有用であり得る。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
DEXA:雄(−/−)マウスにおいて、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび全身脂肪マスが増加した。
これらのノックアウト実験において、PRO298ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA39975−1210と命名)(UNQ261)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172465 ACCESSION:NM_172465 NID:gi 27369635 refNM_172465.1 Mus musculus RIKEN cDNA 9530098M12遺伝子(9530098M12Rik);参照タンパク質:P59268 ACCESSION:P59268 NID:Mus musculus(マウス).ジンクフィンガーDHHCドメイン含有タンパク質9;参照ヒト遺伝子配列:NM_016032 Homo sapiens ジンクフィンガー,DHHCドメイン含有9(ZDHHC9);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y397 ACCESSION:Q9Y397 NID:Homo sapiens(ヒト).ジンクフィンガーDHHCドメイン含有タンパク質9(ジンクフィンガータンパク質379)(CGI−89)(UNQ261/PRO298)。
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションNM_172465.1)。
このプロジェクトは、X連鎖である。
性別および遺伝子型によるX連鎖遺伝子分配の概要
(雄キメラ由来のアグーチ子孫のみが含まれる)
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトジンクフィンガーであるDHHCドメイン含有9(ZDHHC9)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(0/−)マウスにおける血小板数が増加した。この変異は、X連鎖遺伝子である。雄と雌の野生型マウスの両方を解析した一方で、雄ヘミ接合性変異マウスおよび雌ヘテロ接合性マウスのみを解析した。雄ヘミ接合性(野生型)マウスおよびヘミ接合性変異マウスを、それぞれ(+/+)および(−/−)と命名する。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験を、自動血液分析器である、Abbott’s Cell−Dyn 3500Rによって実施する。この特徴のいくつかは、5つに分かれたWBCディファレンシャルを含む。「患者」レポートは、全部で22のパラメータを網羅し得る。
血液学:(0/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血小板数が増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、血球計算ビーズアレイ(CBA)キットを使用して実施する。このアッセイは、単一サンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定するために使用される。表される値は、「相対的蛍光単位」であり、カッパー軽鎖の検出に基づく。6未満のいずれの値も有意ではない。
(0/−)マウスにおいては、性別一致同腹仔コントロールと比較して、血清IgG3が減少した。
神経学の分野において、解析は、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのインビボにおける有効な標的の同定に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、一般的な病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害IまたはII、別段特定されない双極性障害、循環気質、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会的、回避性行動、境界線人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートにおいて実施した。生存性低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
試験の説明:侵害受容についてのホットプレート試験を、各マウスを小型の閉鎖系である55℃のホットプレートに置くことによって実施する。ホットプレート上での最大時間を30秒として、後肢応答(なめる、振るまたは跳ねる)までの時間を記録する。各動物は1回試験される。
変異(−/−)マウスにおいては、この試験では、性別一致(+/+)同腹仔コントロールと比較するとき応答性が低下した。これらの結果から、侵害受容応答の低下が示唆される。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
マイクロCT:(−/−)変異体においては、(+/+)コントロール同腹仔と比較して、骨梁骨容量、数および結合密度の低下とともに骨関連測定値が低下した。さらに、大腿骨中軸の厚さもまた、(−/−)ノックアウトマウスにおいて減少した。
これらのノックアウト実験において、PRO339ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA43466−1225と命名)(UNQ299)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_133913 Mus musculus RIKEN cDNA 2010209O12遺伝子(2010209O12Rik);参照タンパク質:Q80TE1 ACCESSION:Q80TE1 NID:Mus musculus(マウス).MKIAA1402タンパク質(フラグメント);参照ヒト遺伝子配列:NM_019015 Homo sapiensコンドロイチン硫酸グルクロン酸転移酵素(CSGlcA−T);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UXD2 ACCESSION:Q6UXD2 NID:Homo sapiens(ヒト).RLSS299。
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1および2を標的化した(NCBIアクセッションNM_133913.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および骨以外の13のすべての成体組織サンプルから標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトコンドロイチン硫酸グルクロン酸転移酵素(CSGlcA−T)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、IL6およびTNFアルファのレベルの上昇;血清免疫グロブリンIgG2aレベルの減少、脾臓、リンパ節およびパイアー斑におけるB細胞の増加ならびに活性化/記憶T細胞の増加を伴うLPS応答性の上昇を含むいくつかの免疫学的異常が生じた。ヘテロ接合体とホモ接合体の両方において、尿酸のレベルが上昇した。雄(−/−)マウスと雌(−/−)マウスの両方において、身長が小さくなった。骨関連測定値の低下もまた(−/−)マウスにおいて観察された。雌ノックアウトは、総組織マス、脂肪(%)および脂肪マス(g)の増加も示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
(1)蛍光(Flourescence)標識細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
FACS:ホモ接合(−/−)マウスにおいては、性別一致野生型(+/+)同腹仔および背景的平均と比較して、脾臓、リンパ節およびパイアー斑内のB細胞のパーセンテージが上昇した。パイアー斑は、小腸、特に回腸に沿ったリンパ球の集合体である。さらに、(−/−)マウスは、CD25+染色およびCD62L/CD44染色によって活性化/記憶T細胞のレベルの上昇を示した。さらに、(−/−)マウスは、野生型(+/+)同腹仔と比較して、脾臓内のNK細胞のレベルの減少を示した。
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重であった。注射の3時間後100μlの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、LPS攻撃に対する平均血清IL6およびTNF−アルファ応答が増大した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、血球計算ビーズアレイ(CBA)キットを使用して実施する。このアッセイは、単一サンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定するために使用される。表される値は、「相対的蛍光単位」であり、カッパー軽鎖の検出に基づく。6未満のいずれの値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、性別一致同腹仔(+/+)コントロールと比較して、ホモ接合体(−/−)マウスにおけるIgG2aのレベルの低下または減少が示された。
(1)組織質量および除脂肪体重測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織マス(TTM)の変化を同定した。
身体測定:身長および体重の測定を約16週齢で行った。
身長:雄(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均身長の低下(1〜2標準偏差未満)が見られたことから、成長遅延が示唆される。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
1.DEXA:雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、全身および脊椎における平均骨塩量、骨塩量指標および骨中無機質密度が減少した。さらに、雌(−/−)マウスは、総組織マス(TTM)、脂肪(%)および脂肪(g)の減少を示した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均脊椎骨梁の骨容量、数および結合密度が減少し、平均大腿骨中軸の厚さが減少した。
DEXAおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較するとき、骨測定値が減少したことから、異常な骨障害が示唆される。しかしながら、雌変異(−/−)マウスはまた、体脂肪の平均パーセンテージの上昇を示したことから、肥満症表現型が示唆される。これらの観察結果から、PRO339ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、脂肪の蓄積に関連する代謝障害だけでなく、肥満症に関連し得る一般的な代謝障害を反映する異常な骨測定値をもたらすことが示唆される。従って、PRO339ポリペプチドまたはそのアゴニストが、このような障害(例えば、肥満症または他の代謝性疾患)の処置または予防に有用であり得る。しかしながら、ネガティブな骨表現型はまた、PRO339ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることが示唆される。さらに、PRO339ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用である一方で、PRO339ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連した炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的骨障害をもたらし得る。
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。血中グルコースレベルの測定に加えて、以下の血液化学試験もまた慣習的に行った:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノ−トランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;亜リン酸;クレアチニン;BUN=血液尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;およびクロライド。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
血液化学解析は、性別一致(+/+)同腹仔コントロールおよび背景的平均と比較するとき、ヘテロ接合性(+/−)マウスとホモ接合性(−/−)マウスの両方において尿酸レベルの上昇(2標準偏差より大きい)を示した。従って、変異(−/−)マウスおよび(+/−)マウスは、痛風(異常なプリン代謝)のタイプに共通である腎結石(および関連腎臓疾患)が示唆される血液中の尿酸の著しい上昇に関連したネガティブな表現型を示す。PRO339ポリペプチドおよびそのアゴニストは、腎結石の形成および/または異常なプリン代謝に関連するこのような疾患の処置に有用であり得る。
これらのノックアウト実験において、PRO341ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA26288−1239と命名)(UNQ300)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:AK006096 Mus musculus雄成体精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリ、クローン:1700018O18産物:仮想MyC型、ヘリックス−ループ−ヘリックス二量体化ドメイン含有タンパク質、全長挿入断片配列;参照タンパク質:Q9DA75 ACCESSION:Q9DA75 NID:Mus musculus(マウス).1700018O18Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_032793 Homo sapiens 仮想タンパク質FLJ14490(FLJ14490);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q96F59 ACCESSION:Q96F59 NID:Homo sapiens(ヒト).仮想タンパク質FLJ90702。
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1および2を標的化した(NCBIアクセッションAK006096.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋、骨、心臓および脂肪を除く)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質(FLJ14490)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおいて総体脂肪が減少し、雄においてより顕著であった。(−/−)マウスにおいては、体重および身長が減少し、体脂肪が減少した。さらに、雌(−/−)マウスは、骨髄様過形成を示した。NK細胞数のレベルの低下もまた(−/−)マウスにおいて観察された。雄変異体においてはまた、平均血清インスリンが減少した。顕微鏡解析により、解析された2匹の雌変異体の大腿および胸骨の骨髄における骨髄様過形成が明らかになった。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
顕微鏡観察:試験された4匹すべての雌マウスの骨髄において骨髄様過形成を観察したが、2匹の雄マウスには存在しなかった。骨髄様過形成は、胸骨と大腿の骨髄の両方に存在した。脾臓における赤血球過形成は、骨髄中に骨髄様過形成を有するマウスに通常見られる。雌マウスの皮膚、乳腺および肝臓における組織炎症のわずかな増加が見られた。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析によって組織のパネルに検出されなかった。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
蛍光標示式細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
FACS:
(−/−)マウスにおいては、野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下を特徴とする、様々な白血球サブセットの分布の変化を示した。
(1)組織質量および除脂肪体重測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織マス(TTM)の変化を同定した。
身体測定:身長および体重の測定を約16週齢で行った。
一般的な観察結果:(−/−)マウスは、(+/+)と比較するとき、震え行動を示した。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
1.DEXA:(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび総脂肪マスが低下した。その差は、雄においてより顕著であった。
マウスにおける血液化学試験を実施するための臨床的な設定のCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して血液化学解析を行った。
試験の説明:Lexicon Geneticsは、マウスにおける定量的インスリンアッセイを実施するための臨床的な設定のCobra IIシリーズ自動ガンマ計測システムを使用する。
雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清インスリンレベルが低下した。
これらのノックアウト実験において、PRO347ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA44176−1244と命名)(UNQ306)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_181549 Mus musculusマンノースレセプター様前駆体(Mrcl);参照タンパク質:Q7TSQ7 ACCESSION:Q7TSQ7 NID:Mus musculus(マウス).マンノースレセプター様;参照ヒト遺伝子配列:NM_182619 Homo sapiens分泌タンパク質LOC348174(LOC348174);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8NCF0 ACCESSION:Q8NCF0 NID:Homo sapiens(ヒト).仮想タンパク質FLJ90292。
平均産仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1〜3を標的化した(NCBIアクセッションNM_181549.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13の成体組織サンプルのうち、脳、脊髄、眼、胸腺、腎臓、骨格筋および心臓において、標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト分泌タンパク質(LOC348174)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける血清グルコースレベルおよび総体脂肪が増加した。雄と雌のホモ接合性変異体マウスの両方では、性別一致野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清グルコースレベルおよび総体脂肪が増加した。(−/−)マウスではまた、DEXAおよびマイクロCT測定によって示される骨関連測定値が低下した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
血液化学:雄および雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清グルコースレベルが上昇した。しかしながら、耐糖能試験は正常であった。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
1.DEXA:雄(−/−)マウスと雌(−/−)マウスの両方においては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均全身脂肪パーセントおよび総脂肪マスが増加した。さらに、雄(−/−)マウスはまた、平均骨塩量および骨塩量指標(BMC/LBM指標)が減少した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、大腿骨中軸の平均断面積が減少した。
これらのノックアウト実験において、PRO531ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA48314−1320と命名)(UNQ332)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_053141 Mus musculusプロトカドヘリンベータ16(Pcdhb16);参照タンパク質:Q91Y03 ACCESSION:Q91 Y03 NID:Mus musculus(マウス).プロトカドヘリンベータ16;参照ヒト遺伝子配列:NM_019120 ACCESSION:NM_019120 NID:14195614 Homo sapiens Homo sapiens プロトカドヘリンベータ8(PCDHB8);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UN66 ACCESSION:Q9UN66 NID:Homo sapiens(ヒト).プロトカドヘリンベータ8前駆体(PCDH−BETA8)(プロトカドヘリン31)。
平均産仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションNM_053141.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肺;骨格筋;骨;ならびに胃、小腸および結腸を除く)において標的遺伝子の発現を検出した
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトプロトカドヘリンベータ8(PCDHB8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、ホモ接合性(−/−)マウスの脾臓における活性化/記憶T細胞が増加した。(−/−)マウスはまた、LBM、BMCおよびBMC/LBM指標の増加を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
1.DEXA:雌(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均除脂肪体重が増加した。これらの変異体はまた、BMC/LBM指標の増加を含む、骨塩量および骨中無機質密度関連測定値の増加を示した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
蛍光標示式細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
FACS:変異(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較して、脾臓における活性化/記憶T細胞の増加を示した。
これらのノックアウト実験において、PRO537ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49141−1431と命名)(UNQ338)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:AK014425 Mus musculus 妊娠18日の成体雌胎盤および胚体外組織cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリ、クローン:3830408D24産物:仮想ヒスチジンリッチ領域含有タンパク質、全挿入断片配列;参照タンパク質:Q9D6B9 ACCESSION:Q9D6B9NID:Mus musculus(マウス).3830408D24Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:AY358408 Homo sapiens クローンDNA49141 LGLL338(UNQ338);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:AAQ88774LGLL338[Homo sapiens]。
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1を標的化した(NCBIアクセッションAK014425)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトHomo sapiensクローンDNA49141 LGLL338(UNQ338)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおいて免疫学的異常および胃腸運動性の減損が生じた。変異(−/−)マウスは、単球数の減少、B細胞の平均パーセンテージの上昇ならびにCD4およびCD8細胞のパーセンテージの低下を伴う数多くの免疫学的異常を示した。変異(−/−)マウスにおいてはまた、骨関連測定値が上昇した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
血液学解析:
試験の説明:血液試験を、自動血液分析器である、Abbott’s Cell−Dyn 3500Rによって実施する。この特徴のいくつかは、5つに分かれたWBCディファレンシャルを含む。「患者」レポートは、全部で22のパラメータを網羅し得る。
血液学:(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均絶対単球数が減少した。
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するときの、B細胞の平均パーセンテージの上昇ならびに細胞集団内のCD4細胞およびCD8細胞の平均パーセンテージの低下を特徴とする、末梢血中の白血球サブセットの分布が変化した。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
手順:マイクロCTを使用して、BMDの非常に感度の高い測定を行った。1つの脊椎および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの脊椎骨梁骨容量、骨梁厚、結合密度および大腿骨中軸の全骨領域および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析のための目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部脊椎(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/ml、0.25ml/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20ml/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
1.DEXA:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、全身および大腿骨における平均容量分析的骨中無機質密度および骨中無機質密度が増加した。
2.マイクロCT:雄(−/−)マウスにおいては、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、大腿骨中軸の平均断面積が増大した。
3.CATスキャン:解析に利用可能な3匹すべての(−/−)マウス(M−101、M−110およびF−186)が、胃腸含有量の著しい増加を示したことから、変異体における胃腸運動性の減損が示唆される。しかしながら、閉塞の徴候は観察されなかった。
これらのノックアウト実験において、PRO718ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49647−1398と命名)(UNQ386)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_027935 Mus musculus RIKEN cDNA 3200001F09 遺伝子(3200001F09Rik);参照タンパク質:Q9CXL1 ACCESSION:Q9CXL1 NID:Mus musculus(マウス).3200001F09RIKPROTEIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_014313 ACCESSION:NM_014313 NTD:gi 20357549 ref NM_014313.2 Homo sapiens小型膜タンパク質1(SMP1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O95807 ACCESSION:O95807 NID:Homo sapiens(ヒト).小型膜タンパク質1。
平均産仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1および隣接している5プライム非コーディングエキソンを標的化した(NCBIアクセッションNM_027935.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13のすべての成体組織サンプルから標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト小型膜タンパク質1(SMP1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおいて貧血が生じた。(−/−)マウスではまた、LPS攻撃に対するTNF−アルファ応答が増大し、平均血清IgG2aレベルが低下した。ホモ接合性変異マウスは、野生型同腹仔および背景的平均と比較するとき、貧血の徴候を示した。血液化学により、(−/−)マウスにおいて血清グルコースレベルおよび尿中のケトン体が増加したことが明らかになった。雌(−/−)マウスにおいてもまた、平均骨中無機質密度関連測定値が上昇した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
(1)急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重であった。注射の3時間後100μlの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
(−/−)マウスにおいては、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、LPS攻撃に対する平均血清TNF−アルファ応答が増大した。
試験の説明:血液試験を、自動血液分析器である、Abbott’s Cell−Dyn 3500Rによって実施する。この特徴のいくつかは、5つに分かれたWBCディファレンシャルを含む。「患者」レポートは、全部で22のパラメータを網羅し得る。
(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均総赤血球数、ヘモグロビンレベルおよびヘマトクリットの減少ならびに血球体積の増大を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、血球計算ビーズアレイ(CBA)キットを使用して実施する。このアッセイは、単一サンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定するために使用される。表される値は、「相対的蛍光単位」であり、カッパー軽鎖の検出に基づく。6未満のいずれの値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、性別一致同腹仔(+/+)コントロールと比較して、ホモ接合性(−/−)マウスにおけるIgG2aのレベルの減少または低下を示した。
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血中グルコース測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
雄(−/−)マウスと雌(−/−)マウスの両方が、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均血清グルコースレベルの上昇を示した。しかしながら、耐糖能試験は、正常であった。
説明:
日常的な尿検査は、腎臓/泌尿器系の一般的な評価を提供するために実施されるスクリーニング検査である。尿が日常的に検査される特徴としては、タンパク質、グルコース、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノーゲン、硝酸塩および白血球エステラーゼならびにpHおよび比重についての検査が挙げられる。
変異ホモ接合体(−/−)マウスおよびヘテロ接合性(+/−)マウスにおいてケトン尿症が観察された。従って、変異(−/−)マウスおよび(+/−)マウスは、異常なグルコース代謝および糖尿病に通常関連するケトン体の異常な存在を示した。
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のためならびに骨の治癒を促進する標的を同定するために標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および脊椎における骨中無機質密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨中無機質密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、総身体BMD、大腿骨BMDおよび脊椎BMDを測定した。
1.DEXA:雌(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および背景的平均と比較するとき、平均骨中無機質密度関連測定値(総身体vBMD、総身体BMDおよび大腿骨BMD)の増加を示した。
これらのノックアウト実験において、PRO773ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA48303−2829と命名)(UNQ411)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_080434 Mus musculusアポリポタンパク質A−V(Apoa5);参照タンパク質:Q8C7G5 ACCESSION:Q8C7G5 NID:Mus musculus(マウス).Mus musculus成体雄肝臓腫瘍cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリ、クローン:C730033H22産物:アポリポタンパク質A−V、全挿入断片配列;参照ヒト遺伝子配列:NM_052968 ACCESSION:NM_052968 NID:gi 22091457 ref NM_052968.2Homo sapiensアポリポタンパク質A−V(APOA5);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UBJ3 ACCESSION:Q9UBJ3 NID:Homo sapiens(ヒト).再生関連タンパク質3。
平均産仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コーディングエキソン1から3を標的化した(NCBIアクセッションNM_080434.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13の成体組織サンプルのうち、眼、胸腺、腎臓および肝臓において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
70.14.1.表現型分析(破壊遺伝子;DNA48303−2829 UNQ411)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトアポリポタンパク質A−V(APOA5)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの血液化学が異常になった。雄および雌のホモ接合性変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均(historical means)と比較した場合、コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。雌(−/−)マウスはまた、総組織マス(TTM)および脊椎骨中無機質密度(BMD)の測定値ならびに小柱数が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
1.血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベル(平均より3標準偏差超)および平均血清トリグリセリドレベル(標準より6倍(雄)および4倍(雌))が顕著に増加した。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度(connectivity density)、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
1.DEXA:雌ノックアウト(−/−)マウスは、野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび脊椎骨中無機質密度が減少した。
2.マイクロCT:(−/−)マウスは、野生型(+/+)同腹仔と比較して、小柱数が減少した。
70.15.DNA60614(UNQ421)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO860ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60614と示す)(UNQ421)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_028783 ムス・ムスクルスラウンドアバウト(roundabout)ホモログ4(ショウジョウバエ)(Robo4);タンパク質リファレンス:NP_083059ラウンドアバウトホモログ4;マジックラウンドアバウト(Magic roundabout);ラウンドアバウトホモログ4(ショウジョウバエ)(ムス・ムスクルス)gi|26334430|dbj|BAB23506.2|無名のタンパク質産物(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_019055アクセッション:NM_019055NID:gi 17511434 refNM_019055.4ホモ・サピエンスラウンドアバウトホモログ4、マジックラウンドアバウト(ショウジョウバエ)(ROBO4);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8WZ75アクセッション:Q8WZ75 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。マジックラウンドアバウト。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028783.2)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.15.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA60614(UNQ421)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトラウンドアバウトホモログ4、マジックラウンドアバウト(ショウジョウバエ)(ROBO4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、オープンフィールド試験において、雄(−/−)マウスで不安関連応答が増加した。血液化学の結果は、コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルの増加ならびにリンレベルの上昇を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)発現
UNQ421は、マウス胚の血管内皮で特異的に発現する(E10.5神経管(trunk))。
(c)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン(seratonin)輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比(center−to−total distance traveled ratio)は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
結果:
不安:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において、中心滞在時間の合計の中央値が減少し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。
(d)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。 高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルの増加(1標準偏差>歴史的平均)および平均血清コレステロールレベルの増加(2標準偏差>歴史的平均)を示した。
(e)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
結果:
変異(−/−)マウスは、リンレベルが上昇した(歴史的平均を超える約2標準偏差)。リン測定値が異常であるにもかかわらず、変異(−/−)マウスは、所見に関連し得る典型的な骨測定値を示さなかった。
70.16.DNA50919−1361(UNQ438)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO871ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA50919−1361と示す)(UNQ438)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_127535 ムス・ムスクルス(血清学的に定義された結腸癌抗原10(Sdccag10));タンパク質リファレンス:XP_127535(血清学的に定義された結腸癌抗原10(ムス・ムスクルス));ヒト遺伝子配列リファレンス:AY358569ホモ・サピエンスクローンDNA50919 SDCCAG10(UNQ438);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UX04アクセッション:Q6UX04 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)SDCCAG10。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションBC025437).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.16.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA50919−1361(UNQ438)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトの血清学的に定義された結腸癌抗原10(SDCCAG10)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの顕著な生存性低下が示された。1匹の生存(−/−)マウスは、成長遅延および網膜色素脱失を示した。多数の神経学的異常、免疫学的異常、および血液化学的異常も(−/−)マウスで認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡観察:12.5日目に、46個の胚を観察した:8個の(−/−)胚、21個の(+/−)、7個の(+/+)胚、5個の再吸収モル(resorption moles)、および5個の不確定な胚。(−/−)胚は、一般に、その(+/+)同腹仔よりも似ているが、肉眼的試験または組織学的試験によって他の発生異常は認められなかった。
遺伝子発現:免疫組織化学分析によって、組織パネル中にLacZ活性は検出されなかった。
(c)遺伝学:
(−/−)マウスの顕著な生存性低下が認められた。1つを除いた全ての同定した(−/−)マウスは、胚サンプルであった。
(d)免疫学表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:
分析(M−130)に利用可能な1匹の(−/−)マウスは、絶対好中球数および絶対単球数の増加、絶対リンパ球数の減少、赤血球数、ヘモグロビンレベル、ヘマトクリットレベル、平均赤血球容積、および平均赤血球ヘモグロビンの減少、ならびに赤血球分布幅および平均血小板容積の増加を示した。(+/−)マウスでは顕著な相違は認められなかった。
(e)心血管表現型分析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群(Alstom’s syndrome)、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常(dysplaisa spondyloepiphysaria congentia)、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:野生型マウスおよびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
結果:
眼底:分析に利用可能な1匹の(−/−)マウス(M−130)は、網膜中心領域に両眼の網膜血管に沿って色素脱失および斑点を示した。このような異常は、網膜変性に関連する。
(f)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
1.血液化学:分析に利用可能な1匹の(−/−)マウス(M−130)は、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血清グルコース値および血清アルブミン値が減少した。(+/−)マウスでは顕著な相違は認められなかった。
2.耐糖能試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、空腹時血清グルコースレベルが顕著に減少し、耐糖能が増大した。
尿検査
説明:
日常的な尿検査は、腎臓/泌尿器系の一般的評価を得るために行われるスクリーニング試験である。日常的に試験される尿の特徴には、タンパク質、グルコース、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノゲン、硝酸塩、および白血球エステラーゼ、pH、および比重が含まれる。
結果:
(−/−)マウスは、白血球尿および血尿を示した。尿中白血球の所見は、異常な白血球組成の免疫学的所見と一致する。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
一般的所見:誕生した1匹の(−/−)マウス(M−130)は、その性別一致(+/+)同腹仔よりも小さかった。(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、体重が減少し、体長が短かった。
(2)骨代謝:放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、野生型マウスおよびホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
1.DEXA:分析(M−130)に利用可能な1匹の(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび除脂肪体重が減少した。また、(−/−)マウスは、脊椎骨中無機質密度が減少した。(+/−)マウスでは顕著な相違は認められなかった。
2.マイクロCT:試験した1匹の雄ノックアウト(−/−)マウスは、小柱体積、数、厚さ、連結密度、および大腿骨骨幹部総骨領域が減少した。
(3)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、収縮期血圧が減少した。
70.17.DNA49819−1439(UNQ439)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO872ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49819−1439と示す)(UNQ439)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:AF466400 ムス・ムスクルス仮説タンパク質MMT−7遺伝子、完全なcds;タンパク質リファレンス:Q8VHE7アクセッション:Q8VHE7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)仮説67.5 kDaタンパク質;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_017750アクセッション:NM_017750 NID:gi 8923274 ref NM_017750.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ20296(FLJ20296);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8N2H5アクセッション:Q8N2H5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)仮説タンパク質FLJ90780。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(Accession:AF466400)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに肺、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.17.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA49819−1439(UNQ439)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
(−/−)マウスにおいて、ヒト仮説オキシドレダクターゼ酵素のオーソログをコードする遺伝子の変異により、総体脂肪率および総脂肪マスが増加し、総組織マスが増加した。雄(−/−)マウスはまた、血清コレステロールレベルが増加し、血中にケトン体が存在した。(−/−)変異体マウスは、免疫学的異常を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病発症の認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。したがって、PRO872遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO872ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO872ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
結果:
DEXA:分析した8匹の(−/−)マウスのうち、3匹の雄および3匹の雌は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪率および総脂肪マスが顕著に増加した。雄(−/−)マウスはまた、平均総組織マスが増加した。
(d)免疫学表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析/組織特異的FACS
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、腹腔洗浄後のB220/med/CD23細胞およびB220+/CDllb−low/CD23細胞の比が偏った。したがって、PRO872ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、B細胞前駆体の異常な分布によって特徴づけられるこの負の表現型を模倣すると予想されるであろう。他方では、PRO872ポリペプチドまたはそのアゴニストは、適切なレベルのB細胞前駆体の維持または産生で有用であり、適応的免疫応答に重要なB細胞の変異を支持するであろう。
70.18.DNA57834−1339(UNQ465)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO813ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57834−1339と示す)(UNQ465)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_025467 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1810036H07遺伝子(1810036H07Rik);タンパク質リファレンス:Q9CQS6アクセッション:Q9CQS6 NID:ムス・ムスクルス(マウス).1810036H07Rikタンパク質;ヒト遺伝子配列リファレンス:胃癌GDDR(GDDR)で下方制御されたNM_182536 ホモ・サピエンス;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q86XP6アクセッション:Q86XP6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).GDDR.
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 1810036H07遺伝子(ヒトGDDRのオーソログ(胃癌GDDRで下方制御される))である。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_025467.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の胃、小腸、および結腸中のみでの標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.18.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA57834−1339(UNQ465)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
胃癌GDDR(GDDR)で下方制御されたヒトのオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが、その(+/+)同腹仔と比較した場合、血清グルコースレベルが上昇するという所見が得られた。(−/−)変異体はまた、平均体重が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清グルコースレベルが顕著に増加した。
(c)骨代謝および身体診断
組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後約16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
70.19.DNA57037−1444(UNQ469)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO828ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57037−1444と示す)(UNQ469)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_024198アクセッション:NM_024198 NID:13195625 ムス・ムスクルス、ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 3110050F08遺伝子(3110050F08Rik);タンパク質リファレンス:Q99LJ6アクセッション:Q99LJ6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(RIKEN CDNA 3110050F08遺伝子の類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_015696アクセッション:NM_015696 NID:15618996 ホモ・サピエンス(グルタチオンペルオキシダーゼ2(CL683)に少し類似するホモ・サピエンス);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q96SL4アクセッション:Q96SL4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).CDNA FLJ14777 FIS、CLONE NT2RP4000259(グルタチオンペルオキシダーゼ2(EC 1.11.1.9)に少しの類似物)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_024198.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.19.1 表現型分析(破壊遺伝子:DNA57037−1444(UNQ469)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトグルタチオンペルオキシダーゼ7(GPX7)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの体脂肪(%)および脂肪(マス)が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
70.20.DNA59619−1464(UNQ546)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1100ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59619−1464と示す)(UNQ546)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_354640 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA D430035D22遺伝子(D430035D22Rik);タンパク質リファレンス:XP_354640 RIKEN cDNAD430035D22遺伝子(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_033419 ホモ・サピエンスper1様ドメイン含有1(PERLD1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q96FM1アクセッション:Q96FM1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)、CAB2タンパク質(AGLA546)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションAK052486.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.20.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA59619−1464(UNQ546)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトper1様ドメイン含有1(PERLD1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの総体脂肪が増加し、血圧が低下した。(−/−)マウスはまた、血液化学および挙動の異常を示した。ホモ接合体変異マウスは、その性別一致同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪、血清アルカリホスファターゼ、およびリンレベルが増加し、収縮期血圧が減少した。さらに、雄および雌ホモ接合変異体の両方で尾部懸垂した場合にその後肢および前肢が硬直し、雄変異体は顔が小さく、且つ髭が短かった。変異(−/−)マウスはまた、総組織マス、骨塩量、BMC/LBM、および骨中無機質密度の測定値が減少し、骨マイクロCT測定値が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立活動および穴掘りが減少し、変異体における探索応答の減少が示唆される。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
結果:(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において、探索応答が減少した。
(c)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼ(雌p=0.00076;雄p=0.017)およびリンレベル(雄p=0.0118;雌p=0.256)が顕著に増加した。これらの結果は、以下で考察した骨関連測定値と一致する。
(d)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。
(e)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
CATスキャンプロトコル:
マウスにCT造影剤Omnipaque300(Nycomed Amershan、ヨウ素300mg/ml、0.25ml/動物、またはヨウ素2.50−3.75g/kg体重)を腹腔内注射した。ケージ内で約10分間休憩させた後、マウスをアベルチン(1.25% 2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって落ち着かせた。テストベッド上に腹臥位にした麻酔動物を用いて、MicroCATスキャナ(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。ImTek 3D RECONソフトウェアを使用した一連のワークステーションにおけるFeldkampアルゴリズムによって三次元画像を再構成した。
結果:
一般的所見:雄(−/−)マウスは、体長が短く、顔が小さく、髭が短かった。さらに、雄および雌の(−/−)マウスは、尾部懸垂した場合にその後肢および前肢が硬直した。雄および雌ホモ接合体の両方は、歴史的平均より1〜2標準偏差低い心拍数を示した。
DEXA:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。3匹の変異(−/−)マウスで異常な脂肪代謝を示すケトンも認められた。さらに、雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均総組織マスが減少し、平均骨塩量、骨塩量指数(BMC/LBM)、および平均骨中無機質密度が減少した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
CATスキャン:分析した全ての(−/−)マウス(M−112、M−155、およびF−157)は、腹部脂肪蓄積が増加した。
まとめ:
(−/−)マウスについての上記の神経学的所見とは別に、DEXA、骨マイクロCT分析、およびCATスキャンによって分析した変異(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。しかし、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率および腹部の脂肪蓄積が増加し、脂肪表現型が示唆される。これらの所見により、PRO1100ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO1100ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。しかし、負の骨表現型により、PRO1100ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であることも示唆されるであろう。さらに、PRO1100ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1100ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
70.21.DNA57033−1403(UNQ557)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1114ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57033−1403と示す)(UNQ557)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:IL20R−βに類似のXM_135077 ムス・ムスクルス(LOC213208);タンパク質リファレンス:IL20R−βに類似のXP_135077(ムス・ムスクルス]);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_144717 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC34923(MGC34923);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UXL0アクセッション:Q6UXL0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).IL20R−β。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_135077.2),
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および脾臓、腎臓、肝臓、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.21.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA57033−1403 (UNQ557)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質(MGC34923)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨塩量/除脂肪体重比(BMC/LBM)の減少および総組織マスの減少を示す(−/−)マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔と比較した場合、BMC/LBM指数および総組織マスが減少した。
70.22.DNA56868−1478(UNQ558)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1115ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA56868−1478と示す)(UNQ558)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_145394アクセッション:NM_145394NID:21703787ムス・ムスクルス(コリン輸送体様タンパク質(LOC213603)に類似のムス・ムスクルス);タンパク質リファレンス:Q921V7アクセッション:Q921V7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(輸送体様タンパク質類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_152369 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC45474(MGC45474);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q7Z6C5アクセッション:Q7Z6C5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)(仮説タンパク質)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145394.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.22.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA56868−1478(UNQ558)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質(MGC45474)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、野生型同腹仔と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが増加した。
70.23.DNA60615−1483(UNQ564)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1126ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60615−1483と示す)(UNQ564)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_172907 ムス・ムスクルスcDNA配列BC047207(BC047207);タンパク質リファレンス:Q8BSH2アクセッション:Q8BSH2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。(ムス・ムスクルスの12日目の胚の雄ウォルフ管には、周辺領域のcDNA、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:6720478C22産物:仮説タンパク質、全長インサート配列(仮説タンパク質BC047207)が含まれる);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_198474 ホモ・サピエンスオルファクトメジン様1(OLFML1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UWY5アクセッション:Q6UWY5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).MVAL564。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172907.2)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および肺、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.23.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA60615−1483(UNQ564)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトオルファクトメジン様1(OLFML1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの平均血清IgMレベルが増加した。さらに、ホモ接合体マウスは、平均血清コレステロールレベルが増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病発症の認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用してコレステロール測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgMレベルが増加した。
70.24.DNA53913−1490(UNQ571)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1133ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA53913−1133と示す)(UNQ571)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_030699ムス・ムスクルスネトリンG1(Ntng1);タンパク質リファレンス:Q9ESR3アクセッション:Q9ESR3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)NETRIN−GlA;ヒト遺伝子配列リファレンス:BC030220ホモ・サピエンスネトリンG1のmRNA(cDNAクローンMGC:34337 IMAGE:5206594)(完全なcds);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9Y2I2ネトリンG1前駆体(ラミネット−1(Laminet−1))(UNQ571/PRO1133)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1およびをターゲティングした(NCBIアクセッションNM_030699.1)。
1.野生型発現パネル:脳、脊髄、眼、脾臓、腎臓、心臓、および脂肪中、ならびにRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.24.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA53913−1490(UNQ571)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトネトリンG1(NTNG1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの神経学的異常が生じた。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、直立の増加によって示される探索応答が増加した。さらに、雌変異体は、ホームケージ活動性試験(日周期リズムの増強)中に異常な睡眠/覚醒周期を示し、尾部懸垂アッセイでほとんど完全に動かなかった。(−/−)マウスはまた、平均血清IgG3レベルが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立活動が増加し、変異体で探索応答が増加することが示唆された。
(−/−)マウスは、双極性障害、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る探索応答の増加を示した。したがって、PRO571ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で役割を果たし得る。
機能観察バッテリー(FOB)試験 − 尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:ほとんどの(−/−)マウスは、鬱応答の増加を示す尾部懸垂試験でほぼ完全に動かなかった。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1133ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の12時間の馴化期間に歩行回数が増加した。雌(−/−)マウスはまた、明期−暗期活動比および明期−総活動比の中央値が減少し、試験の最後の24時間の異常な睡眠/覚醒周期が示唆される。これらの結果は日周期リズムの増強を示した。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔と比較した場合、平均血清IgG3が減少した。
70.25.DNA59846−1503(UNQ584)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1154ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59846−1503と示す)(UNQ584)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_030711 ムス・ムスクルス1型腫瘍壊死因子受容体切断(shedding)アミノペプチド調節因子(Arts1);タンパク質リファレンス:Q9EQH2アクセッション:Q9EQH2 NID:ムス・ムスクルス(マウス).脂肪細胞由来ロイシンアミノペプチダーゼ前駆体(EC 3.4.11.−)(A−LAP)(ARTS−1)(アミノペプチダーゼPILS)(ピューロマイシン非感受性ロイシル特異的アミノペプチダーゼ)(PILS−AP)(VEGF誘導性アミノペプチダーゼ);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_016442アクセッション:NM_016442NID:20149636ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス1型腫瘍壊死因子受容体切断アミノペプチダーゼ調節因子(ARTS−1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UWY6アクセッション:Q6UWY6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).ARTS−1。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAB047552.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびにRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の肝臓、心臓、および脂肪中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.25.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA59846−1503(UNQ584)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト1型腫瘍壊死因子受容体切断アミノペプチダーゼ調節因子(ARTS−1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加するという所見が得られた。特に雌(−/−)マウスで血圧の上昇も認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均収縮期血圧が増加した(特に、雌で顕著)。この所見は、高血圧を示す。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
70.26.DNA62881−1515(UNQ599)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1185ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62881−1515と示す)(UNQ599)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:肝細胞癌関連遺伝子TD26に類似するBC051501ムス・ムスクルスmRNA(cDNAクローンIMAGE:1313868);タンパク質リファレンス:Q80WX2アクセッション:Q80WX2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(肝細胞癌関連遺伝子TD26の類似物(フラグメント));ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_018687 ホモ・サピエンス肝細胞癌関連遺伝子TD26(LOC55908);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9NQZ1アクセッション:Q9NQZ1NID:ホモ・サピエンス(ヒト).肝細胞癌関連遺伝子TD26。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションBC024408.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.26.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA62881−1515(UNQ599)について
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト「肝細胞癌関連遺伝子TD26」のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスのトリグリセリドが減少した。雄および雌ホモ接合体変異マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用してコレステロールの測定値を記録した。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に減少した。4匹の(+/−)マウスのうちの2匹および8匹の(−/−)マウスのうちの2匹でケトンが認められた。
70.27.DNA57841−1522(UNQ607)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1194ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA57841−1522と示す)(UNQ607)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_181417 ムス・ムスクルスシステインおよびグリセリンリッチタンパク質2結合タンパク質(Csrp2bp);タンパク質リファレンス:Q8CID0アクセッション:Q8CID0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(CSRP2結合タンパク質の類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_020536 ホモ・サピエンス CSRP2結合タンパク質(CSRP2BP)、転写変異型1;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9H8E8アクセッション:Q9H8E8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).システインリッチタンパク質2結合タンパク質(CSRP2結合タンパク質)(CRP2BP)(CRP2結合タンパク質)。
変異情報
変異型:レトロウイルス挿入(OST)
説明:コードエクソン2と3との間のイントロンでレトロウイルス挿入が起こる(NCBIアクセッションNM_181417.2).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:死亡により、転写発現分析を行わなかった。標的遺伝子の破壊を、逆PCRによって確認した。
70.27.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA57841−1522(UNQ607)について
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトCSRP2結合タンパク質(CSRP2BPのオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが死亡した。遺伝子データは、このレトロウイルス挿入によってホモ接合変異体が死亡したことを示す。死亡により、転写発現分析を行わなかった。ヘテロ接合体(+/−)マウスは、末梢血中の平均B細胞率が増加した。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(b)病理学
顕微鏡観察:胚性致死のために試験を行わなかった。12.5日目に、以下の48個の胚を観察した:21個の(+/−)胚、20個の(+/+)胚、6個の再吸収モル、および1個の不確定な胚。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。野生型マウスおよびホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
FACS:
ヘテロ接合体(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均B細胞率が増加した。
70.28.DNA61755−1554(UNQ656)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1287ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61755−1554と示す)(UNQ656)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_172753 ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 4732435N03遺伝子(4732435N03Rik);タンパク質リファレンス:Q8BJQ9アクセッション:Q8BJQ9 NID:ムス・ムスクルス(マウス).ムス・ムスクルス出生10日目の皮質cDNA、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:A830097M06産物−仮説ヌクレオチド−ジホスホ−糖トランスフェラーゼ構造含有タンパク質、全長挿入配列;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_018371 ホモ・サピエンスコンドロイチンβ1,4−N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ(ChGn);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8TDX6アクセッション:Q8TDX6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).コンドロイチンβ4 N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ(MMVR656)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172753.2).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋、骨、胃、小腸、および結腸以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.28.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA61755−1554(UNQ656)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトコンドロイチンβ1,4−N−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼ(ChGn)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雄(−/−)マウスの不安関連応答が減少した。臓器重量データは、雌(−/−)マウスの胸腺萎縮を示した。雄ホモ接合体変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド活動性試験において不安様応答が減少した。(−/−)マウスはまた、骨関連測定値が減少し、総組織マスおよび体脂肪が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が増加し、変異体の不安様応答の減少が示唆される。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨塩量および骨塩量指数が減少した。さらに、雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、脂肪(%)、および脂肪マス(g)が増加した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。
70.29.DNA59610−1556(UNQ659)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1291ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59610−1556と示す)(UNQ659)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_178594ムス・ムスクルスcDNA配列BC032925(BC032925);タンパク質リファレンス:Q8K091アクセッション:Q8K091 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(仮説タンパク質FLJ22418の類似物);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024626アクセッション:NM_024626 NID:gi 13375849 refNM_024626.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ22418(FLJ22418);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9H6B2アクセッション:Q9H6B2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質FLJ22418。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_178594.2).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.29.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA59610−1556(UNQ659)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト免疫同時刺激タンパク質B7−H4(B7−H4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスのストレス誘導過温症が増加した。さらに、ヘテロ接合体(+/−)マウスおよびホモ接合体(−/−)マウスの両方は、平均総脂肪率および総脂肪マスが増加し、骨小柱の容積および厚さが減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験 −ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
不安:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO1291ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
結果:
DEXA:雄(+/−)マウスおよび(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
マイクロCT:(−/−)ノックアウトマウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨小柱の容積および厚さが減少した。
70.30.DNA60618−1557(UNQ662)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1293ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60618−1557と示す)(UNQ662)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_024263アクセッション:NM_024263 NID:15277326 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1200013A08遺伝子(1200013A08Rik));タンパク質リファレンス:Q920S7アクセッション:Q920S7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)脂肪細胞特異的タンパク質3;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_032348アクセッション:NM_032348 NID:14150144 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC3047(MGC3047));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9BRK3アクセッション:Q9BRK3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).RIKEN CDNA 1200013A08遺伝子の類似物(仮説49.1KDAタンパク質)。
変異情報
変異型:レトロウイルス挿入(OST)
説明:コードエクソン4中でレトロウイルス挿入が起こる(NCBIアクセッションNM_024263.3)。
1.野生型発現パネル:骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:RT−PCR分析により、分析した(−/−)マウス(M−81)中に転写物が存在しないことが明らかとなった。
標的遺伝子の破壊を、逆PCRによって確認した。
70.30.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA60618−1557(UNQ662)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質(MGC3047)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの骨関連測定値が増加した。また、(−/−)マウスは、リンパ節中のCD25 T細胞が増加し、ペイエル板中のCD38非リンパ細胞が増加した。RT−PCRでは転写物は存在しなかった。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
FACS:
(−/−)マウスは、野生型同腹仔と比較した場合、リンパ節中のCD25 T細胞が増加し、パイエル板中のCD38非リンパ細胞が増加した。
(c)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨塩量、容積測定骨中無機質密度、ならびに全身および大腿骨中の骨中無機質密度が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱骨の容積および数が増加した。
70.31.DNA47394−1572(UNQ676)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1310ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA47394−1572と示す)(UNQ676)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_018867アクセッション:NM_018867NID:18466803ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルスカルボキシペプチダーゼX2(M14ファミリー)(Cpxm2));タンパク質リファレンス:Q9D2L5アクセッション:Q9D2L5NID:ムス・ムスクルス(マウス)(潜在的なカルボキシペプチダーゼ様タンパク質X2前駆体);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_198148アクセッション:NM_198148 NID:gi 39930572 ref NM_198148.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質LOCI 19587(LOCI 19587);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8N436アクセッション:Q8N436 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).潜在的なカルボキシペプチダーゼ様タンパク質X2前駆体。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAFO 17639.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.31.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA47394−1572(UNQ676)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトカルボキシペプチダーゼX(M14ファミリー)のメンバー2(CPXM2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雄(−/−)マウスの耐糖能が低下した。(−/−)マウスはまた、脾臓CD25 T細胞および腹膜CD23 B細胞が増加した。ホモ接合体変異マウスはまた、LPS攻撃誘発に対する平均血清TNF−αおよびIL−6応答が増加した。ホモ接合体マウスでIgG2aレベルも上昇した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清TNF−αおよびIL−6応答が増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、(−/−)マウスが、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血清IgG2aが2倍に増加するという所見が得られた。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
FACS:
ホモ接合体(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、リンパ節および脾臓中のCD25T細胞ならびに腹膜CD23B細胞が増加した。
(c)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
結果:
耐糖能試験:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、T−60およびT−90での耐糖能が低下した。
70.32.DNA61873−1574(UNQ678)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1312ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61873−1574と示す)(UNQ678)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_020626アクセッション:NM_020626 NID:10181181 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルス腎臓特異的膜タンパク質(Nxl7−pending));タンパク質リファレンス:Q9ESG4アクセッション:Q9ESG4 NID:ムス・ムスクルス(マウス).腎臓特異的膜タンパク質NX−17(0610008J07RIKタンパク質);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_020665アクセッション:NM_020665 NID:21361864 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス腎臓特異的膜タンパク質(NX−17));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9HBJ8アクセッション:Q9HBJ8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).腎臓特異的膜タンパク質NX−17(仮説25.2KDAタンパク質)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_020626.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに肺、骨、胃、小腸、結腸、および心臓以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.32.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA61873−1574(UNQ678)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト膜貫通タンパク質27(TMEM27)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雌ホモ接合変異体マウスおよび雄ヘミ接合変異体マウスが、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験時に抑鬱症様応答が減少するという所見が得られた。いくつかの雌のヘテロ接合変異体およびホモ接合変異体ならびに1匹の雄ヘミ接合変異体の網膜に散発性の色素脱失した斑点も認められた。さらに、ホモ接合体マウスにおいて脾臓CD25T細胞および腹膜CD23B細胞の増加も認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。この変異は、X連鎖遺伝子中に存在する。雄ヘミ接合マウス(野生型)およびヘミ接合変異マウスを、それぞれ、(+/+)および(−/−)と示す。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験 − 尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
無力に対する応答:雌(−/−)マウスおよび雄(0/−)マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験中に不動時間の中央値が減少し、抑鬱症様応答の減少が示唆された。まとめると、尾部懸垂試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO1312ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(c)心血管表現型分析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
結果:
眼底:2/4(−/−)マウス(F−50およびF−84)、1/4(0/−)マウス(M−59)、および2/4(+/−)マウス(F−60およびF−79)の網膜に散発性の色素脱失した斑点が認められた。網膜の色素脱失は、網膜変性に関連し得る。
(d)免疫学表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
FACS:
ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、脾臓中のCD25 T細胞が増加し、腹膜CD23B細胞が増加した。これらの結果は、変異(−/−)マウスがCD25 T細胞の増加および成熟B細胞の増加によって特徴づけられる表現型を示すことを示す。したがって、得られた変異マウスは、正の免疫学的表現型を示し、PRO1312ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの結果を模倣すると予想されるであろう。明らかに、PRO1312ポリペプチドは、T細胞活性化およびB細胞増殖の負の調節因子として作用する。
70.33.DNA62812−1594(UNQ690)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1335ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62812−1594と示す)(UNQ690)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_011797アクセッション:NM_011797 NID:6753263 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルス炭酸脱水酵素14(Car14));タンパク質リファレンス:Q9WVT6アクセッション:Q9WVT6 NID:ムス・ムスクルス(マウス).炭酸脱水酵素XIV前駆体(EC 4.2.1.1)(炭酸デヒドラターゼXIV)(CA−XIV);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_012113アクセッション:NM_012113 NID.−6912283 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス炭酸脱水酵素XIV(CA14));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9ULX7アクセッション:Q9ULX7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).炭酸脱水酵素XIV前駆体(EC 4.2.1.1)(炭酸デヒドラターゼXIV)(CA−XIV)。
変異情報
変異型:レトロウイルス挿入(OST)
説明:コードエクソン1と2との間のイントロンでレトロウイルス挿入が起こる(NCBIアクセッションNM_011797.1)。
1.野生型発現パネル:脾臓、肝臓、骨、胃、小腸、結腸、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:RT−PCR分析により、分析した(−/−)マウス(M− 184)に転写物が存在しないことが明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、逆PCRによって確認した。
70.33.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA62812−1594(UNQ690)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト炭酸脱水酵素XIV(CA14)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスのLPS攻撃誘発に対する血清TNF−α、MCP−1、およびIL−6応答が増加した。雌ノックアウトは、尿酸レベルが有意に増加した(p=0.01198)。RT−PCR分析により、ホモ接合体変異マウス中に転写物が存在しないことが明らかとなった。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清TNF−α、MCP−1、およびIL−6応答が増加した。
(c)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
結果:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尿酸レベルが顕著に増加した(p=0.01198)。
70.34.DNA66669−1597(UNQ694)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1339ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA66669−1597と示す)(UNQ694)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_027926ムス・ムスクルスカルボキシペプチダーゼA4(Cpa4);タンパク質リファレンス:Q6P8K8アクセッション:Q6P8K8 NID:ムス・ムスクルス(マウス).カルボキシペプチダーゼA4;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_016352アクセッション:NM_016352 NID:10047105 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンスカルボキシペプチダーゼA3(LOC51200));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9UI42アクセッション:Q9UI42 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).カルボキシペプチダーゼA4前駆体(EC 3.4.17.−)(カルボキシペプチダーゼA3)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン5〜7をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027926.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびにRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルの間の脳、脊髄、眼、胸腺、肺、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.34.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA66669−1597(UNQ694)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトカルボキシペプチダーゼA4(CPA4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、LPSに対するIL−6の応答が増加した。さらに、(−/−)マウスでIgMレベルおよびIgG3レベルの減少が認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清IL−6応答が増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6を超えないいかなる値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、(−/−)マウスが、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血清IgMが1/5に減少し、IgG3が1/2に減少するという所見が得られた。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、赤血球細胞分布が増加した。これらの結果は、RBC容積の増加に起因する赤血球組成の異常を示す。
70.35.DNA88062(UNQ696)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO2155ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA88062と示す)(UNQ696)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_009654 ムス・ムスクルスアルブミン1(Alb1);タンパク質リファレンス:P07724アクセッション:P07724 NID:ムス・ムスクルス(マウス).血清アルブミン前駆体;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_000477アクセッション:NM_000477 NID:8392890 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンスアルブミン(ALB));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:P02768アクセッション:P02768 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).血清アルブミン前駆体。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_009654.1)。
1.野生型発現パネル:脳および脊髄以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.35.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA88062(UNQ696)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトアルブミン(ALB)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの血清アルブミンが顕著に減少した。雌(−/−)マウスは平均血清グルコースレベルが減少し、雄(−/−)マウスは平均血清コレステロールレベルが増加した。(−/−)マウスでインスリンレベルの減少も認められた。雌(−/−)マウスは、より小さく、体長が減少した。(−/−)マウスは、LPS攻撃誘発に対するIL−6、MCP1、およびTNFαの応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均血清IL−6、MCP−1、およびTNF−α応答が増加した。
(c)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。 高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病発症の認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
(d)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、肝臓機能上の問題を示す平均血清アルブミンレベルが顕著に減少した。(−/−)マウスはまた、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均血清グルコースレベルが減少した。しかし、(−/−)マウスでインスリンレベルの減少は認められなかった。
(e)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後約16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体長が減少した。この所見により、いくらかの程度の成長遅延が示唆されるであろう。しかし、成長異常の他の指標は認められなかった。
70.36.DNA64886−1601(UNQ705)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1356ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64886−1601と示す)(UNQ705)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_016675アクセッション:NM_016675 NID:gi 7710003 ref NM_016675.1 ムス・ムスクルスクラウジン(claudin)2(Cldn2);タンパク質リファレンス:O88552アクセッション:O88552 NID:ムス・ムスクルス(マウス).クラウジン−2;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_020384アクセッション:NM_020384 NID:gi 9966780 ref NM_020384.1 ホモ・サピエンスクラウジン2(CLDN2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:P57739アクセッション:P57739 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).クラウジン−2。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_016675.3).
1.野生型発現パネル:脾臓、肺、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.36.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA64886−1601(UNQ705)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトクラウジン2(CLDN2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(0/−)マウスの耐糖能が低下し、空腹時血清グルコースレベルが増加した。この変異は、X連鎖遺伝子中に存在する。雄および雌の野生型マウスの両方を分析したのに対して、雄ヘミ接合変異体および雌ヘテロ接合体マウスのみを分析した。雄ヘミ接合マウス(野生型)およびヘミ接合変異マウスを、それぞれ、(+/+)および(−/−)と示す。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
FACS:ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致野生型(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ペイエル板中のB細胞の比率が減少した。ペイエル板は、リンパ球の集合体であり、小腸、特に回腸に沿って存在する。
(c)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または糖尿病。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(0/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能が低下した。(0/−)マウスはまた、平均空腹時血清グルコースレベルが増加した。
(d)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
結果:
一般的活動および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、直立活動および穴掘りが減少し、変異体における探索応答の減少が示唆される。
オープンフィールド試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、探索応答が減少し、変異体における不安様応答の減少が示唆される。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1356ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
70.37.DNA68869−1610(UNQ720)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1385ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68869−1610と示す)(UNQ720)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_178780 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA E130307J04遺伝子(E130307J04Rik);タンパク質リファレンス:NP_848895 RIKEN cDNA E130307J04遺伝子(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024557 ホモ・サピエンス RIC3タンパク質(RIC3);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:NP_078833 RIC3タンパク質(ホモ・サピエンス)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(アクセッション:NM_178780)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに肺、肝臓、骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.37.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA68869−1610(UNQ720)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトRIC3のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの耐糖能が増強された。雄ホモ接合体マウスは、心拍数が減少した。雄(−/−)マウスは、大腿骨測定値が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN =血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
結果:
耐糖能試験:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、耐糖能が増強された。しかし、雄(−/−)マウスの血糖値は、測定した3つの間隔で依然として歴史的な正常範囲内であった。
(c)診断−血圧
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した(2標準偏差低い)。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
70.38.DNA64897−1628(UNQ730)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1412ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64897−1628と示す)(UNQ730)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_028732 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4632428N05遺伝子(4632428N05Rik);タンパク質リファレンス:Q9D659アクセッション:Q9D659 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(ムス・ムスクルス出生0日目の皮膚cDNA、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:4632428N05産物:仮説免疫グロブリンおよび主要組織適合遺伝子複合体ドメイン/免疫グロブリンサブタイプ含有タンパク質(全長挿入配列)(RIKEN cDNA 4632428N05);ヒト遺伝子配列リファレンス:AY358379 ホモ・サピエンスクローンDNA64897 GVPT730(UNQ730);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UXF3アクセッション:Q6UXF3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).GVPT730。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028732.2)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および心臓以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.38.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA64897−1628(UNQ730)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説I型原形質膜タンパク質(PP2135)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。雄(−/−)マウスは、耐糖能が増強された。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均白血球数および絶対好中球数が増加し、CD4細胞の平均比率が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
結果:
耐糖能試験:試験した雄変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能が増強された。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総白血球数および絶対好中球数が増加した。
蛍光活性化細胞分取(FACS)分析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS分析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS分析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
結果:
FACS:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、CD4細胞およびCD8細胞の平均比率が増加し、B細胞の比率が低下した。しかし、(−/−)マウスは、CD11が腹膜中の細胞より少なかった(blow)。したがって、PRO1412ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、T細胞集団が増加する。これらの所見から、PRO1412ポリペプチドまたはPRO1412をコードする遺伝子は、T細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、PRO1412ポリペプチドまたはそのアゴニストは、顕著なT細胞増殖が存在する(例えば、関節リューマチ患者で起こるなど)場合のT細胞増幅の負の調節因子として有利であろう。さらに、PRO1412ポリペプチドは、移植片拒絶の予防で特に有用であろう。
70.39.DNA68836−1656(UNQ756)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1487ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68836−1656と示す)(UNQ756)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_194358 ムス・ムスクルス(mKIAA0990タンパク質(LOC269941)に類似);タンパク質リファレンス:Q6ZQ11アクセッション:Q6ZQ11 NID:ムス・ムスクルス(マウス).MKIAA0990タンパク質(フラグメント);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_014918 ホモ・サピエンス炭水化物(コンドロイチン)シンターゼ1(CHSYl);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9Y2J5アクセッション:Q9Y2J5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質KIAA0990(コンドロイチンシンターゼ)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAK129255.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.39.1.表現型分析(破壊遺伝子;DNA68836−1656(UNQ756)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト炭水化物(コンドロイチン)シンターゼ1(CHSYl)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが、関節炎、網膜変異、運動力の低下、および骨中無機質密度の減少が起こった。(−/−)マウスはまた、赤血球の異常が示された。ホモ接合体マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、慢性活動性関節炎を発症し、骨中無機質密度が顕著に減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)病理学:
顕微鏡観察:
(−/−)マウスは、増殖性軟骨疾患、大腿骨−脛骨接合部に関与する関節症、およびびまん性軽度網膜変性を伴う慢性活動性関節炎を示した。大腿骨−脛骨接合部中の病変は、軟骨の増殖ならびに十字靱帯および軟骨膜結合組織の軟骨化生を含んでいた。慢性活動性炎症は、関節周囲の結合組織中に存在し、隣接する骨格筋に伸長した。
(−/−)マウス中で認められた網膜変性は、外核層のびまん性の軽度の菲薄化によって特徴づけられる。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメーターを対象とすることができる。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均赤血球容積が増加し、平均赤血球ヘモグロビンレベルが増加した。(−/−)マウスはまた、平均赤血球分布幅が減少した。これらの結果は、PRO1487ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストがこの異常な表現型を模倣することを示す。
(d)心血管表現型分析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
結果:
眼底:8匹全ての(−/−)マウスは、網膜動脈が脆弱化した(attentuated)複数の網膜変性斑が認められた。(−/−)マウスの視神経円板を拡張し、視神経の先端は、その(+/+)同腹仔よりも薄かった。
(e)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウス)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
結果:
1匹の雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が増加した。
(f)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
逆スクリーン(Inverted Screen)試験:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
逆スクリーン試験データ:
逆スクリーンを使用して、運動力/共調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上部に個別に置いた。棒を180°回転させてマウスをスクリーンの底に配置させた。以下の挙動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上(climing up)。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定 − Dexa
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:生後16週間で体長および体重の測定を行った。
結果:
1.一般的所見:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔よりも小さかった。
2.体重:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
3.体長:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体長が減少した。
(2)骨代謝:放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均総組織マスが減少した。雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨中無機質の測定値が顕著に減少した。
2.マイクロ−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎骨小柱の容積、数、厚さ、および連結密度(connectivity density)が顕著に減少し、平均大腿骨骨幹部断面積および皮質の厚さが顕著に減少した。
(−/−)マウスは、組織消耗性疾患に起因し得る成長遅延の徴候を示した。さらに、DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析された変異(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO1487ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用なようであることを示す。さらに、PRO1487ポリペプチドは、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療で有用なようであるのに対して、PRO1487ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)によって異常なまたは病理学的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
(h)さらなる研究
F1ヘテロ接合体マウスを交雑受精して、F2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。雌の受胎能は低く、28%(4/14)のノックアウトマウスが雌であった。93%(93%)(13/14)のノックアウト動物の指が太く短いのに対して、ヘテロ接合体マウスまたは野生型マウスでは認めらないことが、この表現型を示していた。太く短い指の表現型は、早ければ1〜2週齢で認められた。
70.40.DNA76399−1700(UNQ831)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1758ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA76399−1700と示す)(UNQ831)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:BC057953 ムス・ムスクルスcDNAクローンMGC:68074 IMAGE:5340780;ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_052878 ホモ・サピエンス第19染色体読み取り枠36(C19orf36);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UXA2アクセッション:Q6UXA2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).ALLL831。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションBC057953.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.40.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA76399−1700(UNQ831)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト第19染色体読み取り枠3636(C19orf36)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した雌(−/−)マウスが得られた。雌(−/−)マウスは、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。変異ノックアウト(−/−)マウスはまた、小柱数および連結密度が増加したが、大腿骨骨幹部総骨領域は減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドが増加した。
(c)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウス)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
結果:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
マイクロCT:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、小柱数および連結密度が増加した。(−/−)マウスで、大腿骨骨幹部総骨領域の減少も認められた。
70.41.DNA73775−1707(UNQ841)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1779ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA73775−1707と示す)(UNQ841)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_030175アクセッション:NM_030175 NID:gi 21313471 ref NM_030175.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4930507C10遺伝子(4930507C10Rik);タンパク質リファレンス:Q9D2G9アクセッション:Q9D2G9 NID:ムス・ムスクルス(マウス).4930507C10Rikタンパク質(RIKEN cDNA 4930507C10遺伝子);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024746アクセッション:NM_024746 NID:gi 21362001 refNM_024746.2ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ 13840(FLJ 13840);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q9H8A0アクセッション:Q9H8A0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質FLJ13840。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_030175.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.41.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA73775−1707(UNQ841)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、変異(−/−)マウスの加熱板試験における疼痛知覚が増加した。ホモ接合体(−/−)マウスはまた、総組織マス、除脂肪体重、総脂肪マス(g)、および脂肪率(%)が増加し、骨中無機質密度の測定値が増加した。変異(−/−)マウスのマイクロCT測定値も増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪率、脂肪マスが増加し、骨中無機質密度の測定値が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均総体脂肪が増加し、骨中無機質密度の測定値および大腿骨骨幹部皮質の厚さが増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO1779ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の治療に有利であろう。骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加に関連する表現型により、この効果を模倣する薬剤(例えば、PRO1779ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒で有用であることが示唆される。さらに、雌変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO1779ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO1779ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。
(c)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
加熱板試験
試験の説明:各マウスを小さな囲いのある(enclosed)55℃の加熱板上に配置することによって痛覚についての加熱板試験を行う。後肢応答(なめる、震える、跳ぶ)までの反応時間を記録し、加熱板上の最大滞在時間を30秒とする。各動物について試験を1回行う。
結果:
(−/−)ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、加熱板試験における反応時間が減少し、疼痛知覚の増加を示す。
70.42.DNA80136−2503(UNQ847)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1785ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA80136−2503と示す)(UNQ847)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_027127アクセッション:NM_027127 NID:21312335 ムス・ムスクルス(ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 2310016C16遺伝子(2310016C16Rik));タンパク質リファレンス:Q9D7B7アクセッション:Q9D7B7 NID:ムス・ムスクルス(マウス).2310016C16RIKタンパク質;ヒト遺伝子配列リファレンス:AK074216アクセッション:AK074216 NID:18676756 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス cDNA FLJ23636 fis、クローンCAS07176);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8TED1アクセッション:Q8TED1NID:ホモ・サピエンス(ヒト).仮説タンパク質FLJ23636(EPLA847)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027127.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞ならびに骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.42.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA80136−2503(UNQ847)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトグルタチオンペルオキシダーゼ(FLJ23636)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雄(−/−)マウスが皮膚炎を起こした。顕微分析により、雄ホモ接合体変異マウスにおいて、角質増殖を伴う上皮過形成によって特徴づけられる慢性活動性皮膚炎が明らかとなった。ホモ接合体はまた、容積測定骨中無機質密度および平均全身骨中無機質密度が増加し、平均の大腿骨骨幹部の厚さが増加した。雌(−/−)マウスで平均皮膚線維芽細胞増殖の減少も認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)病理学:
顕微鏡観察:分析した4匹の雄(−/−)マウスのうち、3匹が、角質増殖を伴う上皮過形成によって特徴づけられる慢性多病巣性活動性皮膚炎(chronic multifocal active dermatitis)を示した。罹患雄変異体では、真皮の深部に最小から軽度の慢性活動性炎症からなる病巣が存在し、この病巣は、時折、皮筋の変性および再生に関連する。さらに、真皮深部の異物肉芽腫は、異所性毛幹に関連した。1/4(−/−)マウスで上皮潰瘍形成および痂皮形成も認められた。軽度から中等度の脊髄過形成は、より強く罹患された変異体の骨髄中に存在した。高レベルの抗酸化剤は、皮膚炎の容態に関連する。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウス)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度および平均全身骨中無機質密度が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均の大腿骨骨幹部の厚さおよび断面積が増加した。
70.43.DNA77623−2524(UNQ871)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO1889ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77623−2524と示す)(UNQ871)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_128173 PREDICTED:ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 2300005B03遺伝子(2300005B03Rik);タンパク質リファレンス:XP_128173アクセッション:XP_128173 NID:gi 20902557 ref XP_128173.1 RIKEN cDNA 2300005B03(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_177458ホモ・サピエンス分泌Ly6/uPAR関連タンパク質2(SLURP2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q86SR0アクセッション:Q86SR0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).分泌Ly6/uPAR関連タンパク質2(QLGT871)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションBY339783)。
1.野生型発現パネル:腎臓、骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.43.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA77623−2524(UNQ871)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト分泌Ly6/uPAR放出タンパク質2(SLURP2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの骨中無機質密度が減少した。ホモ接合体変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨中無機質密度が減少した。(−/−)変異マウスで活動性低下が認められたが、日周期リズムは依然として認められた。変異(−/−)マウスはまた、心拍数が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の1時間の馴化期間および両明期に歩行回数が減少した(活動性低下)。日周期リズムは変異マウスに依然として認められた。これらの結果は、嗜眠または抑鬱障害と一致する。PRO1889ポリペプチドまたはPRO1889コード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、この挙動を模倣すると予想されるであろう。同様に、PRO1889ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害(抑鬱障害が含まれる)の治療または他の不安様症状(嗜眠、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害など)の治療で有用であろう。
(c)診断−心拍数
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均心拍数が減少した(歴史的平均より2標準偏差低い)。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度が減少した。
70.44.DNA336109(UNQ907)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO90318ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA336109と示す)(UNQ907)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_138655 ムス・ムスクルス膜貫通チャネル様遺伝子ファミリー2(Tmc2);タンパク質リファレンス:Q8R4P4アクセッション:Q8R4P4 NID:ムス・ムスクルス(マウス).膜貫通蝸牛発現タンパク質2);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_080751 ホモ・サピエンス膜貫通チャネル様(TMC2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q8TDI7膜貫通蝸牛発現タンパク質2gi|28642835|gb|AAL86401.2|膜貫通チャネル様タンパク質2(ホモ・サピエンス)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:第1のコードエクソンをターゲティングした(アクセッション:NM_138655)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうち、脳のみで検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.44.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA336109(UNQ907)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト膜貫通チャネル様2(TMC2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、オープンフィールド試験においてホモ接合体変異マウスの穴掘りおよび直立が減少し、これは探索行動の減少を示す。(−/−)マウスはまた、LPSに対するIL6応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)免疫表現型分析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リューマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μlの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃誘発に対する平均IL−6応答が増加した。
(c)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、穴掘りおよび直立が減少し、探索行動が減少した。
70.45.DNA77631−2537(UNQ 1821)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO3434ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77631−2537と示す)(UNQ 1821)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_026748 ムス・ムスクルスRIKEN cDNA 1110015K06遺伝子(1110015K06Rik);タンパク質リファレンス:Q6P4S8アクセッション:Q6P4S8 NID:ムス・ムスクルス(マウス).RIKEN cDNA 1110015K06;ヒト遺伝子配列リファレンス:XM_291222(推定):ホモ・サピエンス DKFZP586J0619タンパク質(DKFZP586J0619);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:XP_291222(推定):DKFZP586J0619タンパク質(ホモ・サピエンス)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン18〜21をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_026748.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.45.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA77631−2537(UNQ 1821)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト仮説タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが死亡した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(b)病理学
顕微鏡観察:胚性致死のために試験を行わなかった。12.5日目に、以下の43個の胚を観察した:24個の(+/−)胚、13個の(+/+)胚、2個の未定(to−be−determined)、および4個の不確定な胚。
70.46.DNA68862−2546(UNQ1849)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO3579ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68862−2546と示す)(UNQ1849)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:XM_128781(推定):HSRG1849(LOC225010)に類似するムス・ムスクルス;タンパク質リファレンス:HSRG1849に類似するXP_128781(ムス・ムスクルス);ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_001002257 ホモ・サピエンスアシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1(lysocardiolipinacyl transferase 1)(ALCATl)(転写変異型2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:NP_001002257アシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1イソ型2;HSRG1849(ホモ・サピエンス)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_128781.5).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.46.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA68862−2546(UNQ1849)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒトアシル−CoA:リソカルジオリピンアシルトランスフェラーゼ1(ALCAT1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの不安関連応答が増加した。雄ホモ接合体変異マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導過温症試験の間に不安様応答が増加した。雄(−/−)マウスは、容積測定骨中無機質密度が増加し、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。さらに、(−/−)マウスは、総体脂肪が増加し、血中トリグリセリドレベルが上昇した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(b)表現型分析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験 − ストレス誘導過温症
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
不安:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(c)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質 手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドレベルが上昇した。
(d)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度および平均全身骨中無機質密度が増加した。(−/−)マウスはまた、その性別一致野生型同腹仔と比較した場合、総体脂肪が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、骨中無機質密度の測定値および大腿骨骨幹部断面積が増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の治療に有利であろう。骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加に関連する表現型により、この効果を模倣する薬剤(例えば、PRO3579ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒で有用であることが示唆される。さらに、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO3579ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO3579ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。
70.47.DNA92223−2567(UNQ 1879)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO4322ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA92223−2567と示す)(UNQ 1879)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:NM_145562アクセッション:NM_145562 NID:gi 21704107 refNM_145562.1 ムス・ムスクルス(DKFZP564O0823タンパク質(LOC231440)に類似する);タンパク質リファレンス:Q923D3アクセッション:Q923D3 NID:ムス・ムスクルス(マウス).DKFZP564O0823タンパク質の類似物(CASTRATION誘導性前立腺アポトーシス関連タンパク質−1);ヒト遺伝子配列リファレンス:AY358777 ホモ・サピエンスクローンDNA92223 VYKT1879(UNQ1879);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q6UWI2アクセッション:Q6UWI2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).VYKT1879。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145562.1).
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
70.47.1.表現型分析(破壊遺伝子:DNA92223−2567(UNQ 1879)について)
(a)全体的な表現型のまとめ:
ヒト原形質膜タンパク質(DKFZP564O0823)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨関連測定値が増加し、総体脂肪が増加した。雄および雌(−/−)ホモ接合体では、トリグリセリドレベルの上昇も認められた。雄ノックアウトはまた、血糖値が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)発現
UNQ1879は、細胞内ドメイン中に潜在的なチロシンリン酸化部位を有する単一の膜貫通タンパク質である。発現は、マウスおよびヒト組織中の血管平滑筋細胞および他の筋肉前駆細胞中に認められる(特に、E11.5マウス胚、E11.5中脳およびE11.5脳梁幹(trunk))。
(c)表現型分析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型分析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清グルコースレベルが減少した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血糖値が減少した。まとめると、これらのノックアウト変異マウスは、インスリン感受性の増加に関連する表現型を示した。
(d)表現型分析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、トリグリセリドレベルが上昇した(雄でさらに顕著)。
(e)骨代謝および放射線表現型分析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa分析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体マウス、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメーターを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメーターを分析した。
結果:DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均容積測定骨中無機質密度および全身骨中無機質密度が増加した。(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総体脂肪が増加した。
マイクロ−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔と比較した場合、平均総体脂肪が増加し、骨中無機質密度の測定値が増加した。これらの結果は、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病などの骨の異常に関連することを示す。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性によって特徴づけられる容態である。したがって、PRO4322ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の治療に有利であろう。骨塩量、ならびに全身および大腿骨中の無機質密度の増加に関連する表現型により、この効果を模倣する薬剤(例えば、PRO4322ポリペプチドのアンタゴニスト)が骨治癒で有用であることが示唆される。さらに、変異(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率が増加し、ホモ接合体マウスのトリグリセリドレベルの上昇を示す血液化学分析を考慮して、肥満表現型が示唆された。これらの所見により、PRO4322ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスが脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こし、肥満に関連し得る全身代謝障害を反映する骨測定値の異常も起こすことが示唆される。したがって、PRO4322ポリペプチドまたはそのアゴニストは、肥満または他の代謝疾患などの障害の治療または予防で有用であろう。
70.48.DNA92255−2584(UNQ1897)遺伝子破壊を含むマウスの作製および分析
これらのノックアウト実験では、PRO4343ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA92255−2584と示す)(UNQ1897)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:ヌクレオチドリファレンス:BC029841 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2010008E23遺伝子のmRNA(cDNAクローンMGC:36813 IMAGE:4209499);タンパク質リファレンス:Q9D8C5アクセッション:Q9D8C5 NID:ムス・ムスクルス(マウス)(ムス・ムスクルス成体雄小腸cDNA)、RIKEN全長富化ライブラリ、クローン:2010008E23産物:仮説ユビキチンドメイン含有タンパク質(全長挿入配列));ヒト遺伝子配列リファレンス:NM_024107アクセッション:NM_024107 NID:13129117 ホモ・サピエンス(ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC3123(MGC3123));ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:リファレンス:Q71RG4アクセッション:Q71RG4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト).FP2653(ELSDI897)(MGC3123タンパク質)。
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションAK008158.1)。
1.野生型発現パネル:胚幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリッド形成分析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質(MGC3123)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減されたプレパルス抑制が(−/−)マウスにおいてもたらされた。また、ホモ接合体マウスは、増大した小柱の数および結合密度を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大鬱病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用し得る。
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減されたプレパルス抑制または増強された聴覚驚愕応答を示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のための標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(Dual Energy X−ray Absorptiometry)(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
MicroCT:(−/−)マウスは、その野生型同腹仔と比較して、増大した小柱の数および結合密度を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO4347ポリペプチド(DNA92288−2588で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1901)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AK003894ハツカマウス18日胚全身cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリに対応する、クローン:1110021D20産物:仮想ヌクレオチド−ジホスホ−糖トランスフェラーゼ構造含有タンパク質、完全挿入配列;タンパク質参照:Q9D163 Q9D163 Q9D163 1110021D20RIK PROTEIN;ヒト遺伝子配列参照:NM_031302ホモサピエンスグリコシルトランスフェラーゼ(LOC83468);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H1C3 ACCESSION:Q9H1C3 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。グリコシルトランスフェラーゼ(仮想タンパク質FLJ31494)(グリコシルトランスフェラーゼ)(ALLR1901)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン3および4を標的化した(NCBI受託AK003894.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、胸腺、腎臓、肺および脂肪において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:ヒト仮想グリコシルトランスフェラーゼのオーソログをコードする遺伝子の変異により、卵白アルブミン攻撃に対する低減された血清IgG1およびIgG2a応答が(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスは低減された平均体重および平均体長、加えて、低減された総組織マス、総脂肪マスおよび総平均総体脂肪パーセンテージ(低減された血中トリグリセリドも雄(−/−)マウスで観察された)を示した。雄(−/−)マウスは、低減された大腿骨測定値を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満などの処置のために、標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された血中トリグリセリドレベルを示した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定-Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均体重および低減された平均体長を示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために、標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
DEXA:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、低減された平均総組織マス、総脂肪マスおよび平均総体脂肪パーセンテージを示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均大腿中軸断面積を示した。
これらの結果は、PRO4347ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウト変異型雄マウスが、低減された体重および体長ならびに低減された組織マスおよび脂肪によって示される成長異常を示すことを示す。骨組成/測定値の欠如はまた、低減された骨大腿中軸断面積およびおそらく骨折に至る脆弱性を特徴とする(−/−)マウスにおいても認められた。高カルシウム血症、高血糖症または増大したアルカリ性リン酸塩は、血中化学成分試験において検出されず、腎臓、副甲状腺または副腎の機能不全が低減された骨測定値と関係しているかもしれないことを示した。したがって、PRO4347ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長関連障害の抑制ならびに骨恒常性の促進に有用であり得ると思われる。また、PRO4347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得、一方、PRO4347ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニストは、異常な、または病理的骨障害、例えば、異常な骨代謝と関連している炎症性疾患(関節炎など)、骨粗鬆症および骨減少症をもたらし得る。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示すかなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、このような通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行なった。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清IgG1およびIgG2a応答を示した。
このノックアウト実験では、PRO4403ポリペプチド(DNA83509−2612で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1928)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_183297ハツカマウスニューレキソフィリン4(Nxph4);タンパク質参照:Q8BTD1 ACCESSION:Q8BTD1 NID:ハツカマウス(マウス)に対応する。ニューレキソフィリン4。MOUSESPTRNRDB;ヒト遺伝子配列参照:NM_007224ホモサピエンスニューレキソフィリン4(NXPH4);ヒトタンパク質配列は、参照:Q7Z6L3 ACCESSION:Q7Z6L3 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。ニューレキソフィリン4(NXPH4)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン2を標的化した(NCBI受託NM_183297.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、腎臓および肝臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトニューレキソフィリン4(NXPH4)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された血清トリグリセリドレベルが雌(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、亜硝酸塩尿症も示した。また、(−/−)マウスはグルコース耐性の低下を示した。雄および雌両方の(−/−)マウスが低減された平均体長を示した。雄(−/−)マウスは、脊椎骨の平均骨無機質密度の著しい減少を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、コレステロール測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
雌ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清トリグリセリドレベルを示した。
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するグルコース耐性試験が挙げられる。異常なグルコース耐性試験の結果、以下の障害または状態:1型および2型糖尿病、X症候群、種々の心血管疾患および/または肥満を示すものであり得るが、これらに限定され得ない。
グルコース耐性試験:試験した変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、グルコース耐性の減少または減損を示した。
記:
常套的な尿検査は、腎臓の/泌尿器系の一般的な評価を得るために行なわれるスクリーニング試験である。尿を常套的に検査するための特性値としては、タンパク質、糖、ケトン、血液、ビリルビン、ウロビリノーゲン、硝酸塩および白血球エステラーゼ、ならびにpHおよび比重の検査値が挙げられる。
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、7匹が亜硝酸塩尿症を示した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、脊椎骨において平均骨無機質密度の著しい減少を示した。
このノックアウト実験では、PRO4976ポリペプチド(DNA100902−2646で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2419)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_172282ハツカマウスRIKEN cDNA B230339H12遺伝子(B230339H12Rik)に対応する;タンパク質参照:Q8BH01 ACCESSION:Q8BH01 NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス成体雄結腸cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:9030405H12産物:仮想Na/H交換体含有タンパク質、完全挿入配列(RIKEN cDNA B230339H12)(ハツカマウス2日目新生児胸腺細胞cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:E430029F23産物:仮想Na/H交換体含有タンパク質、完全挿入配列);ヒト遺伝子配列参照:NM_017905ホモサピエンス第13染色体オープンリーディングフレーム11(C13orf11);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UWJ1 ACCESSION:Q6UWJ1 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。C13orf11。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_172282.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト第13染色体オープンリーディングフレーム11(C13orf11)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低運動および増大した運動抑制性が神経学的試験の際に(−/−)マウスにおいてもたらされた。雄(−/−)マウスは、除脂肪体重の著しい減少および低減された平均大腿中軸断面積を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均除脂肪体重の著しい減少を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均大腿中軸断面積を示した。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用し得る。
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
既知薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型が示されている。これらとしては、セロトニン輸送体、ドーパミン輸送体のノックアウト(Girosら,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)、およびGABA受容体のノックアウト(Homanicsら,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)が挙げられる。自動オープンフィールドアッセイを、感情状態と関係する変化および学習と関係する探索パターンに対処されるようにカスタマイズした。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択し、したがって、探索に伴う自発活動における変化が収集されるように設計した。また、床には、探索に具体的に関係する活動である鼻を突っ込むことができる4つの穴を設けた。また、この試験と関連する感情状態を強調するためのいくつかの要素も設計した。オープンフィールド試験は、マウスを試験する最初の実験的手順であり、得られた測定値は、チャンバを用いた被験体の最初の経験であった。また、オープンフィールドは明るく照明した。これらのすべての要素により、新しくて開放された空間と関連する自然な不安が強調される。次いで、探索活動のパターンおよび程度、特に、中心対全移動距離比により、不安または抑鬱症に対する感受性と関連する変化を認識し得る。大領域(arena)(40cm×40cm,VersaMax動物の活動性モニタリングシステム、AccuScan Instruments製)を3種類の異なるレベルの赤外線ビームとともに用い、直立、穴掘りおよび自発活動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを、4分間隔で5回解析した。全移動距離(cm)、上下移動回数(直立)、穴掘りの回数、および中心対全移動距離比を記録した。
(−/−)マウスは、オープンフィールド試験の際、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された穴掘りおよび直立ならびに全体的な低運動(移動距離が少ない)を示した。
全体的および探索活動:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較すると、変異型における低減された探索応答を示す低減された直立活動および穴掘りを示した。
オープンフィールド試験:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、低運動および低減された探索応答を示した。これらの観察結果は、変異型における低減された不安様応答を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO4976ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱障害と関連する症状の処置または改善に有用であり得る。
尾部懸垂試験は、齧歯類における鬱病様行動のモデルとして開発された手順である。この特定の設定において、マウスをその尾部によって6分間懸垂し、それに応答して、マウスは、この体勢から逃れようとしてもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これを、学習性無力感パラダイムの一類型と解釈する。無効データを有する動物(すなわち、試験期間中、その尾部によじ登った)は、解析から除外する。
(−/−)マウスは、尾部懸垂試験中、増大した応答時間を示した。これらの結果は、低減された学習性無力感または増大した運動抑制性を示す。したがって、変異型マウスは、増大した鬱病様行動を示す。
これらのノックアウト実験では、PRO260ポリペプチド(DNA33470−1175で指定される)をコードする遺伝子(UNQ227)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_025799ハツカマウスRIKEN cDNA0610025O11遺伝子(0610025O11Rik)に対応する;タンパク質参照:Q99KR8 ACCESSION:Q99KR8 NID:ハツカマウス(マウス)。RIKEN CDNA 0610025O11GENE;ヒト遺伝子配列参照:NM_032020ホモサピエンスフコシダーゼ、α−L−2、血漿(FUCA2);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9BTY2 ACCESSION:Q9BTY2 NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。フコシダーゼ、α−L−1、組織(MGC1314タンパク質)と同様。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託NM_025799.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち、骨および脂肪以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトフコシダーゼ、α−L−2、血漿(FUCA2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した総組織マス、脂肪(%)および脂肪(g)が変異型ホモ接合体マウスにおいてもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
DEXA:(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した総組織マス、総体脂肪マス(g)および総平均体脂肪割合(%)を示した。
このノックアウト実験では、PRO6014ポリペプチド(DNA92217−2697で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2521)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_138750 ACCESSION:NM_138750NID:20270282ハツカマウスハツカマウスプロミニン関連タンパク質(Prom−rp);タンパク質参照:Q8R4Y7 ACCESSION:Q8R4Y7NID:ハツカマウス(マウス)に対応する。プロミニン−2;ヒト遺伝子配列参照:NM_144707ホモサピエンスプロミニン2(PROM2);ヒトタンパク質配列は、参照:Q8TAE2 ACCESSION:Q8TAE2NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。プロミニン−2バリアントA(PROM2)(プロミニン−2バリアントB)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜6を標的化した(NCBI受託NM_138750.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨格筋、骨および心臓以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトプロミニン2(PROM2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、貧血が(−/−)マウスにおいてもたらされた。ホモ接合体変異型マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、貧血の徴候、例えば、低減された平均赤血球計数ならびに低減された平均ヘモグロビンおよびヘマトクリットレベルを示した。(−/)マウスはまた、低減された血清グルコースレベルを示したが、グルコース耐性試験は正常であった。変異型(−/−)マウスは、低減された平均体重および平均体長を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均総赤血球計数、ヘモグロビンレベルおよびヘマトクリットレベルを示した。
組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均体重および平均体長を示した。したがって、身体測定値は、成長関連問題を示した。
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。血糖レベルの測定に加え、下記の血中化学成分:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血液尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物の試験もまた常套的に行なわれる。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清グルコースレベルを示した。しかしながら、(−/−)マウス正常なグルコース耐性を有した。
このノックアウト実験では、PRO6027ポリペプチド(DNA105838−2702で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2528)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_027476ハツカマウス白血球受容体クラスター(LRC)メンバー4(Leng4)に対応する;タンパク質参照:Q6IR37 ACCESSION:Q6IR37NID:ハツカマウス(マウス)。Leng4タンパク質;ヒト遺伝子配列参照:NM_207340ホモサピエンス仮想タンパク質LOC254359(LOC254359);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UX98 ACCESSION:Q6UX98NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。LENG4。
変異情報
変異の型:レトロウイルス挿入(OST)
記:レトロウイルス挿入は、コードエキソン1および2の間のイントロンにおいて行なった(NCBI受託NM_027476.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち目、肝臓、骨格筋、骨、心臓および脂肪以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:RT−PCR解析により、転写物は、解析した(−/−)マウス(M−104)に存在しないことが示された。標的遺伝子の破壊は、インバースPCRによって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質(LOC254359)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、貧血がホモ接合体変異型マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、増大した平均大腿中軸皮質厚さも示した。転写物は、RT−PCRにより、存在していなかった。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均総赤血球計数、ヘモグロビンレベルおよびヘマトクリットレベルを示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均大腿中軸皮質厚さを示した。
このノックアウト実験では、PRO6181ポリペプチド(DNA107698−2715で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2552)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_182785ハツカマウスRIKEN cDNA4933400F01遺伝子(4933400F01Rik)に対応する;タンパク質参照:Q8BVP6 ACCESSION:Q8BVP6NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス成体雄精巣cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:4933400F01産物:仮想セリンプロテアーゼ、トリプシンファミリー含有タンパク質、完全挿入配列(仮想タンパク質4933400F01Rik);ヒト遺伝子配列参照:NM_173506ホモサピエンス仮想タンパク質MGC42718(MGC42718);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UWN0 ACCESSION:Q6UWN0NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。GPQH2552。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_182785.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、目、胸腺、脾臓、肺および脂肪において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想タンパク質MGC42718のオーソログをコードする遺伝子の変異により、卵白アルブミン攻撃に対する増大したIgG2a応答が(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、低減された総組織マスおよび総体脂肪割合(%)および脂肪マス(g)も示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行なった。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分キャラクタライズされている。抗OVA抗体は、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出され得、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
(−/−)マウスは、それらの(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清IgG2a応答を示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
雌(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された総組織マス、平均総体脂肪割合(%)および総平均体脂肪マス(g)を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO6714ポリペプチド(DNA82358−2738で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2759)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_023158 ACCESSION:NM_023158NID:gi14249120refNM_023158.2ハツカマウスCxcケモカインリガンド16(Cxcllβ)に対応する;タンパク質参照:Q9EPB3 ACCESSION:Q9EPB3NID:ハツカマウス(マウス)。SR−PSOX(膜貫通型ケモカインCXCL16)(0910001K24RIKタンパク質)(CXCケモカインリガンド16);ヒト遺伝子配列参照:NM_022059ホモサピエンスケモカイン(C−X−Cモチーフ)リガンド16(CXCL16);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H2A7 ACCESSION:Q9H2A7NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。誘導性小サイトカインB16(膜貫通型ケモカインCXCL16)(SR−PSOX)(ホスファチジルセリンおよび酸化された低密度リポタンパク質のスカベンジャー受容体)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_023158.3)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトケモカイン(C−X−Cモチーフ)リガンド16(CXCL16)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、神経学的試験の際、(−/−)マウスにおいて活動亢進がもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
雌マウスを、試験の第1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウエアにより、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断は自動的に移動回数に分けられる。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータを、3日間の試験期間における各時間で記録したメジアン活動性レベル(日周期リズム)および各明/暗サイクル中のメジアン総活動性(自発活動)によって示す。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、ホームケージ活動性試験の両方の暗期間中、多動性行動パターンをもたらす増大した歩行回数を示し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害全般性不安障害などの神経障害と一致する増大した不安を示す。したがって、PRO6714ポリペプチドは、かかる障害の処置に有用であり得る。
これらのノックアウト実験では、PRO9922ポリペプチド(DNA142524で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2768)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_126166ハツカマウスtoll様受容体3(Tlr3)に対応する;タンパク質参照:Q99MB1 Q99MB1 Q99MB1 TOLL−LIKE RECEPTOR3;ヒト遺伝子配列参照:NM_003265 ACCESSION:NM_003265NID:19718735ホモサピエンスホモサピエンスtoll様受容体3(TLR3);ヒトタンパク質配列は、参照:O15455 O15455 O15455 TOLL−LIKE RECEPTOR3に対応する。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託NM_126166.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトtoll様受容体3(TLR3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された脊椎骨関連測定値がもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均脊椎骨中無機質密度を示した。雌(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔と比較すると、低減されたBMC/LBM指数を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均脊椎骨海綿質の体積、数、厚さおよび結合密度、ならびに低減された平均大腿中軸断面積を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO7179ポリペプチド(DNA108701−2749で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2789)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_010584 ACCESSION:NM_010584NID:6754387ハツカマウスハツカマウスインテレクチン(Mn)に対応する;タンパク質参照:O88310 ACCESSION:O88310NID:ハツカマウス(マウス)。INTELECTIN(10日齢雄膵臓CDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、CLONE:1810012B21、全挿入配列);ヒト遺伝子配列参照:NM_017625 ACCESSION:NM_017625NID:8923027ホモサピエンスホモサピエンスインテレクチン(ITLN);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9NP67 ACCESSION:Q9NP67NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。INTELECTIN(CDNA FLJ20022FIS、CLONE ADSE01331)(内皮レクチンHL−1)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_010584.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち胃、小腸および結腸においてのみ検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトインテレクチン1(ガラクトフラノース結合)(ITLN1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された骨塩量および密度の測定値が(−/−)マウスにおいてもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された骨塩量、低減されたBMC/LBM指数、低減された大腿骨骨無機質密度および低減された脊椎骨骨無機質密度を示した。
MicroCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された脊椎骨海綿質体積、数および厚さならびに低減された平均大腿中軸断面積を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO7476ポリペプチド(DNA115253−2757で指定される)をコードする遺伝子(UNQ2976)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_024449 ACCESSION:NM_024449NID:14209687ハツカマウスハツカマウススクレロスチン(Sost)に対応する;タンパク質参照:Q99P68 ACCESSION:Q99P68NID:ハツカマウス(マウス)。SCLEROSTIN PRECURSOR;ヒト遺伝子配列参照:NM_025237 ACCESSION:NM_025237NID:13376845ホモサピエンスホモサピエンス骨硬化症(sclerosteosis)(SOST);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9BQB4 ACCESSION:Q9BQB4NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。SCLEROSTIN PRECURSOR。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託AK017295.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、目、胸腺、脾臓、肺、腎臓および心臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト骨硬化症(SOST)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、大理石骨病が(−/−)マウスにおいてもたらされた。(−/−)マウスはまた、血中化学成分および血液学的異常も示した。ホモ接合体変異型マウスは、海綿質のびまん性肥厚ならびに増大した骨塩量および密度の測定値を特徴とするびまん性で中等度の大理石骨病を示した。また、(−/−)マウスは、増大した平均血清IgG2bレベルならびに低減された赤血球計数および低減された平均赤血球容積を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
巨視的観察結果:解析した6匹の(−/−)マウスのうち、3匹が肥厚した骨を示した。
微視的観察結果:6匹の(−/−)マウスはすべて、大腿骨、胸骨、脊椎骨ならびに鼻甲介および頭部の顎骨における海綿質のびまん性肥厚を特徴とするびまん性で中等度の大理石骨病を示した。骨表面は、骨芽細胞によって完全に覆われており、わずかに少数の破骨細胞が存在した。これらの変異型における病変は、骨硬化症を有するヒト患者に見られるものと類似していた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクト内の(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、増大した平均血清IgG2bレベルを示した。
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均赤血球計数および増大した平均赤血球容積を示した。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均血清トリグリセリドレベルを示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
マウスにCT造影剤Omnipaque 300(Nycomed Amershan,300mgのヨウ素/ml、0.25ml/動物1匹または2.50〜3.75gヨウ素/体重kg)を腹腔内注射した。ケージ内で約10分間安静にした後、次いで、マウスを、アベルティン(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール、20ml/kg体重)の腹腔内注射によって鎮静させた。麻酔した動物を試験床面上にうつ伏せにして置き、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を用いてCAT−スキャンを行なった。3次元画像を、ImTek 3D RECONソフトウエアを使用し、ワークステーションのクラスター内のFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
DEXA:雄および雌の(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、全身、大腿骨および脊椎骨において平均骨塩量、骨塩量指数(BMC/LBM)、容量分析的骨中無機質密度および骨無機質密度の著しい増加を示した。また、雄および雌(−/−)マウスは、増大した平均総体脂肪パーセンテージを示した。雌(−/−)ノックアウトはまた、増大した総組織マスおよび脂肪マス(g)を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、著しく増大した平均脊椎骨海綿質体積、数、厚さおよび結合密度ならびに増大した平均大腿中軸皮質厚さおよび断面積を示した。
CAT−スキャン:(−/−)マウスは、頭蓋および顔面の構造の明瞭な変形または寸法の差は示さなかった。しかしながら、2D投影図により、一般的に増大した骨密度が明らかになり、3D表面図により、3匹すべての(−/−)マウスにおいて肩甲骨の肥厚が明らかになった。
CAT−スキャンの結果により、ノックアウトマウスについて異常な骨表現型を反映する頭蓋および顔面の構造の変形が示された。
これらのノックアウト実験では、PRO9824ポリペプチド(DNA111030で指定される)をコードする遺伝子(UNQ3026)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_172833ハツカマウス粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1(Malt1)に対応する;タンパク質参照:Q8BFT0 ACCESSION:Q8BFT0NID:ハツカマウス(マウス)。粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1と類似;ヒト遺伝子配列参照:NM_006785ホモサピエンス粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1(MALT1)、転写物バリアント1;ヒトタンパク質配列は、参照:Q9UDY8 ACCESSION:Q9UDY8NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転移タンパク質1(EC3.4.22.−)(MALT−リンパ腫関連転座)(パラカスパーゼ)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託NM_172833.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト粘膜結合リンパ系組織リンパ腫転座遺伝子1(MALT1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、全般性炎症および免疫学的異常が(−/−)マウスにおいてもたらされた。ホモ接合体変異型マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、免疫学的異常ならびに急性および慢性の全般性炎症を示した。また、雄(−/−)マウスは、増大した平均容量分析的骨中無機質密度および平均総骨無機質密度ならびに増大した平均大腿中軸断面積および低減された皮質厚さを示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
微視的観察結果:(−/−)マウスは、骨格筋、腎臓、膀胱、消化器系および上気道において急性および慢性の全般性炎症を示した。最も重症な病変は、雌変異型(F−147)において発生したびまん性化膿性髄膜炎であった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
手順:CD4、CD8およびT細胞受容体を含む末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を行ない、Tリンパ球、Bリンパ球のCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞のpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合体マウスにおいて行ない、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含めた。
(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較すると、胸腺において低減されたCD4/CD8DP細胞パーセンテージおよび増大したTCRB+細胞パーセンテージを示した。(−/−)マウスはまた、(+/+)マウスと比較して、脾臓において低減されたCD21hi/CD23med B細胞を示した。したがって、(−/−)マウスは、胸腺における低減されたT細胞レベルおよび脾臓における低減されたB細胞の子孫細胞を示す。
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのため、急性期応答および全身性炎症の強力な誘導因子である。レベルI LPSマウスに、亜致死量用量のLPS(200μLの滅菌生理食塩水)を、26ゲージ針を用いて腹腔内(i.p.)注射した。用量は、試験したマウスの平均重量を基準にし、注射の3時間後に1μg/g体重とした。次いで、100ulの血液試料を採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在についてFACSCalibur装置にて解析した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、LPS攻撃に対する増大した平均血清TNF−αおよびIL−6応答を示した。
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行なった。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分キャラクタライズされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出し得、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、卵白アルブミン攻撃に対する低減された平均血清IgG1およびIgG2a応答を示した。
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した好中球、リンパ球、単球および好塩基球の絶対計数を特徴とする増大した平均総白血球計数を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクト内の(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、低減された平均血清IgM、IgA、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルを示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均容量分析的骨中無機質密度および全身骨無機質密度を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均大腿中軸断面積を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO19814ポリペプチド(DNA148004−2882で指定される)をコードする遺伝子(UNQ5923)を破壊した。この試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:IRRE様3(Drosophila)のNM_026324ハツカマウスkin(Kirrel3)に対応する;タンパク質参照:Q810H3 ACCESSION:Q810H3NID:ハツカマウス(マウス)。膜タンパク質mKirre;ヒト遺伝子配列参照:IRRE様3(Drosophila)のNM_032531ホモサピエンスkin(KIRREL3);ヒトタンパク質配列は、参照:Q8IZU9 ACCESSION:Q8IZU9NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。NPEH2。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン5を標的化した(NCBI受託NM_026324.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち肝臓以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
IRRE様3(Drosophila)のヒトkinのオーソログをコードする遺伝子(KIRREL3)の変異により、低減された血清インスリンが雄(−/−)マウスにおいてもたらされた。雄および雌両方のノックアウトマウスが増大した総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪含量ならびに増大した血中トリグリセリドレベルを示した。雄(−/−)マウスは、低減された平均脊椎骨中無機質密度ならびに低減された平均脊椎骨海綿質の体積、数、厚さおよび結合密度を示した。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清トリグリセリドおよびコレステロールレベルの著しい増加を示した。
血中化学成分解析は、COBAS Integra 400(Roche製)を使用し、マウスにおいて血中化学成分試験を行なうためのその臨床状況において行なった。
試験の説明:Lexicon Geneticsにて、マウスにおいて定量的インスリンアッセイを行なうためのその臨床状況において、Cobra II Series Auto−Gamma Counting Systemを使用する。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清インスリンレベルを示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
DEXA:雄および雌両方の(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪含量ならびに低減された平均脊椎骨中無機質密度を示した。
Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均脊椎骨海綿質の体積、数、厚さおよび結合密度を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO19836ポリペプチド(DNA144839で指定される)をコードする遺伝子(UNQ5930)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_018776 ACCESSION:NM_018776NID:gi9055199 refNM_018776.1ハツカマウスサイトカイン受容体様因子3(Crlf3)に対応する;タンパク質参照:Q9Z2L7 ACCESSION:Q9Z2L7NID:ハツカマウス(マウス)。CYTOKINE RECEPTOR RELATED PROTEIN4;ヒト遺伝子配列参照:NM_015986ホモサピエンスサイトカイン受容体様因子3(CRLF3);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9Y6M8 ACCESSION:Q9Y6M8NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。サイトカイン受容体関連タンパク質4。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン3〜6を標的化した(NCBI受託NM_018776.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち腎臓および脂肪以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトサイトカイン受容体様因子3(CRLF3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスにおける低減された血小板ならびに増大した平均血清IgMおよびIgG2aレベルがもたらされた。標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的が同定された。
試験の説明:血液試験は、アボット社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行なう。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」報告書には、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血小板計数(17.9%減少)を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクト内の(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、増大した平均血清IgMおよびIgG2aレベルを示した。
これらのノックアウト実験では、PRO20088ポリペプチド(DNA150157−2898で指定される)をコードする遺伝子(UNQ6077)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_177389ハツカマウス黒色腫阻害活性3(Mia3)に対応する;タンパク質参照:Q8BI84 ACCESSION:Q8BI84NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス成体網膜cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:A930039G15産物:NPIP−LIKE PROTEINと弱く類似する;ヒト遺伝子配列参照:XM_496436 PREDICTED:ホモサピエンスRIKEN cDNA A930039G15遺伝子(LOC440718)と類似する;ヒトタンパク質配列は、参照:XP_496436 PREDICTEDに対応する:RIKEN cDNA A930039G15遺伝子[ホモサピエンス]と類似する。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン2および3を標的化した(NCBI受託NM_177389.2)。UNQ6077欠失はエキソン2の3’の11ヌクレオチドから始まり、エキソン3と4との間のイントロン内の10ヌクレオチドで終結する。エキソン4はなおUNQ6077(−/−)において転写される。ヒトTANGO遺伝子の解析およびRT−PCRは、おそらく、選択的3’転写物が存在していることを示す。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトUNQ6077のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)変異型の致死がもたらされた。UNQ6077ホモ接合体ノックアウト(−/−)マウスは、野生型(+/+)マウスと比較して、胚発生中(E18.5)に欠陥性骨形成を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
ノックアウトマウスにおける胚致死は、通常、種々の重症な発生上の問題、例えば、限定されないが、神経変性疾患、血管形成障害、炎症性疾患、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスに重要な役割を有する場合に起因する。また、胚致死は潜在的癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異型動物は、表現型および/またはノックアウト遺伝子の機能に関して高度に情報提供的な手がかりを示す病理学報告を示す場合、特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性であったが、胚に関する病態報告では、RBCの顕著な減損は示されなかった。
微視的観察結果:45個の胚を第12.5日に観察した:5個の(−/−)胚、14個の(+/−)胚、10個の(+/+)胚、および16個の吸収奇胎(resorption mole)。16個の吸収奇胎のうち、7個は単一の雌由来であった。
UNQ6077ヘテロ接合体マウス間の異種交配を時限的交配(timed mating)として設定し、ホモ接合体変異型の子を作製した。子は、18.5日胚のときに帝王切開によって取り出した。骨格調製物を、Sollowayら,Dev Genet 22:321−339(1998)に従って作製した。簡単には、E18.5胚をドライアイス床上で安楽死させ、内器官全摘出を行ない、皮膚を剥いだ。100%エタノール、その後アセトン中で一晩脱水させた後、胚を2日間、0.06%アルシアンブルー、0.02%アリザリンレッド、5%氷酢酸および60%エタノールを含む溶液中で染色した。染色された胚を、続いて、1%水酸化カリウムを2回交換して数日間かけて清澄化し、水酸化カリウム/グリセロール系に通して移し、最後に、保存および写真撮影用の80%グリセロール中に入れた。
結果:
UNQ6077ホモ接合体ノックアウト(−/−)マウスは、野生型(+/+)マウスと比較して、胚発生中(E18.5)に欠陥性骨形成を示した。骨格調製物(前述)は、E18.5(−/−)の子において骨特異的染色物質によって示されるように、(−/−)胚の子において広範な欠陥性骨形成を示した。3種類の異なる型の骨形成が、その発生において欠陥性であることが示された。具体的には、野生型(+/+)の子(E18.5)の同じ3つの型の骨と比較すると、皮骨は完全に存在しないことがわかり、軟骨膜骨は、完全に存在しないか、または重篤に障害されているかのいずれかであり、軟骨内性骨は強く障害されていた。
これらのノックアウト実験では、PRO70789ポリペプチド(DNA295801で指定される)をコードする遺伝子(UNQ9659)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AK033906 ACCESSION:AK033906NID:gi26083649 dbj AK033906.1ハツカマウス成体雄間脳cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリに対応する、クローン:9330112P04産物仮想タンパク質、完全挿入配列;タンパク質参照:Q9CTN8 ACCESSION:Q9CTN8NID:ハツカマウス(マウス)。A930031L14Rikタンパク質(断片);ヒト遺伝子配列参照:NM_199000ホモサピエンス脂肪腫HMGIC融合パートナー様3(LHFPL3);ヒトタンパク質配列は、参照:Q86UP9 ACCESSION:Q86UP9NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。脂肪腫HMGIC融合パートナー様タンパク質。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託AK020916.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目および腎臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト脂肪腫HMGIC融合パートナー様3(LHFPL3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された平均皮膚線維芽細胞増殖速度が(−/−)マウスにおいてもたらされた。変異型(−/−)マウスはまた、日周期リズムの顕著化を示した。雌(−/−)マウスは増大した平均全身骨無機質密度を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
手順:皮膚細胞を16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体マウス)から分離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発展させ、線維芽細胞増殖速度を、厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイで過剰増殖性および低増殖性の表現型を検出できる能力を、p53およびKu80を用いて示した。増殖は、Brdu取り込みを用いて測定した。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の低下を示した。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。
雌マウスを、試験の第1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウエアにより、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断は自動的に移動回数に分けられる。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータを、3日間の試験期間における各時間で記録したメジアン活動性レベル(日周期リズム)および各明/暗サイクル中のメジアン総活動性(自発活動)によって示す。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、ホームケージ活動性試験の12時間馴化期間中、日周期リズムの顕著化(増大した歩行回数)を示した。このような所見は、変異型(−/−)マウスにおける増大した多動性または不安表現型を示す。PRO70789ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、この神経学的表現型を模倣することが期待され得る。一方、PRO70789ポリペプチドまたはそのアゴニストは、軽度〜中等度の不安、全般性不安障害、心的外傷後ストレス障害、強迫性障害または双極性障害などの神経障害の処置に有用であり得る。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均全身骨無機質密度を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO50298ポリペプチド(DNA255219で指定される)をコードする遺伝子(UNQ11632)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_145580 ACCESSION:NM_145580NID:gi21704165 refNM_145580.1ハツカマウス発現配列AW553050(AW553050)に対応する;タンパク質参照:Q8VE58 ACCESSION:Q8VE58NID:ハツカマウス(マウス)。仮想タンパク質FLJ22573と類似;ヒト遺伝子配列参照:NM_024660 ACCESSION:NM_024660NID:gi13375912 refNM_024660.1ホモサピエンス仮想タンパク質FLJ22573(FLJ22573);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H665 ACCESSION:Q9H665NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。仮想タンパク質FLJ22573。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_145580.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、胸腺、脾臓および腎臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減されたmicroCT骨関連測定値がもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
MicroCT:雄(−/−)ノックアウト体は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された小柱の数および結合密度を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO51592ポリペプチド(DNA256561で指定される)をコードする遺伝子(UNQ12179)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_019465 ACCESSION:NM_019465NID:9506516ハツカマウスハツカマウス細胞傷害性および調節性T細胞分子(Crtam)に対応する;タンパク質参照:Q9Z151 ACCESSION:Q9Z151NID:ハツカマウス(マウス)。クラスI MHC拘束T細胞結合分子;ヒト遺伝子配列参照:NM_019604ホモサピエンスクラスI MHC拘束T細胞結合分子(CRTAM);ヒトタンパク質配列は、参照:O95727 ACCESSION:O95727NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。クラスI MHC拘束T細胞結合分子。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託NM_019465.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち胸腺、脾臓ならびに胃、小腸および結腸において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトクラスI MHC拘束T細胞結合分子(CRTAM)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、胸腺T細胞リンパ腫が1匹の(−/−)マウスにおいてもたらされた。また、数匹のヘテロ接合体(+/−)およびホモ接合体(−/−)マウスは、種々の重篤度の白内障を示した。また、改善されたグルコース耐性が(−/−)マウスにおいて認められた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
微視的観察結果:検査した6匹の(−/−)マウスのうち、1匹は胸腺内にリンパ球性悪性リンパ腫を示し、これは、胸腺皮質を削り、縦隔および肺内に局所浸潤していた。リンパ節および脾臓は、罹患マウスにおいて新生物細胞について陰性であった。このT細胞リンパ腫は(−/−)マウスの1/6にのみ存在したが、これはこの歳のマウスには稀な腫瘍であり、遺伝子関連性である可能性が非常に高い。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行ない、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のために潜在的標的を同定した。かかる表現型試験では、眼底写真撮影および血管造影を含め、種々の目の異常の徴候を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に相当する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。かかる目の異常としては、限定されないが、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシスが挙げられ得る。
眼底:解析した(−/−)および(+/−)マウスのうち、数匹のマウスは、種々の重篤度の白内障を示した。
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。血中化学成分の表現型解析としては、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するグルコース耐性試験が挙げられる。異常なグルコース耐性試験の結果、以下の障害または状態:1型および2型糖尿病、X症候群、種々の心血管疾患および/または肥満を示すものであり得るが、これらに限定され得ない。
グルコース耐性試験:試験した雄変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大したグルコース耐性を示した。
UNQ12179は、リンパ節において免疫細胞の組織選択的輸送に関与しているようである。エフェクター/記憶CD4T細胞の過剰増殖が、TcR刺激(抗CD3+抗CD28)後のノックアウト動物において起こる。
これらのノックアウト実験では、PRO1757ポリペプチド(DNA76398−1699で指定される)をコードする遺伝子(UNQ830)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AK014261ハツカマウス13日胚頭部cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリに対応する、クローン:3110079O15産物仮想タンパク質、完全挿入配列;タンパク質参照:Q9CXL7 ACCESSION:Q9CXL7NID:ハツカマウス(マウス)。3110079O15Rikタンパク質;ヒト遺伝子配列参照:NM_206895ホモサピエンスASCL830(UNQ830);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UX34 ACCESSION:Q6UX34NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。ASCL830。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン2および3を標的化した(NCBI受託AK014261.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳および脊髄においてのみ検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)変異型の生存性低下がもたらされた。生き残った雄(−/−)マウスは、低減された血清トリグリセリドおよびコレステロールレベルならびに低減された血清グルコースレベルを示した。生き残った雌(−/−)マウスは、ホームケージ活動性試験中、低減された活動性を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
微視的観察結果:妊娠18日目の4個の(−/−)胚、11個の(+/−)胚および3個の(+/+)胚の合計18個の胚の検査。4個の(−/−)胚および2個の(+/+)胚の組織学的検査により、顕著な差は示されなかった。ホモ接合体のメンデル数は18.5日胚に存在し、組織学的に正常に見える。しかしながら、第6週目では、ホモ接合体の予想値の3分の1しか生存していない。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
行動のスクリーニングを、野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。
雌マウスを、試験の第1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウエアにより、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断は自動的に移動回数に分けられる。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータを、3日間の試験期間における各時間で記録したメジアン活動性レベル(日周期リズム)および各明/暗サイクル中のメジアン総活動性(自発活動)によって示す。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、ホームケージ活動性試験の12時間馴化期間中、低減されたメジアン歩行回数を示した。また、オープンフィールド試験における低減された直立がホモ接合体で観察された。両方の観察結果は(−/−)マウスにおける低運動を示す。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清トリグリセリドおよびコレステロールレベルの著しい減少を示した。
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的が同定され得る。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均血清グルコースレベルを示した。
これらのノックアウト実験では、PRO4421ポリペプチド(DNA96879−2619で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1938)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_029612 ACCESSION:NM_029612NID:20514783ハツカマウスハツカマウスCD2抗原ファミリー,メンバー10(Cd2f10懸垂(−pending))に対応する;タンパク質参照:Q9D780 ACCESSION:Q9D780NID:ハツカマウス(マウス)。2310026I04RIK PROTEIN;ヒト遺伝子配列参照:NM_033438 ACCESSION:NM_033438NID:15559204ホモサピエンスホモサピエンスCD84−H1前駆体(CD84−H1);ヒトタンパク質配列は、参照:Q96A28 ACCESSION:Q96A28NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。CD84−H1(CD2 FAMILY10)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託NM_029612.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトSLAMファミリーメンバー9(SLAMF9)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪パーセンテージおよび脂肪マス(g)がホモ接合体(−/−)においてもたらされた。また、(−/−)マウスは、増大した骨関連測定値を示した。雄および雌両方の(−/−)マウスが、増大したトリグリセリドレベルを示し、一方で、雄(−/−)マウスはまた、平均血清コレステロールのレベルの上昇も示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールの測定を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。高コレステロールレベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
血中化学成分:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均血清コレステロールレベルを示した。また、雄および雌両方のノックアウトマウス(−/−)がその(t heir)(+/+)同腹仔と比較して、増大した平均血清トリグリセリドレベルを示した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均総組織マス、除脂肪体重、総体脂肪パーセンテージ、容量分析的骨中無機質密度、および全身骨無機質密度ならびに脂肪(g)を示した。また、雄(−/−)マウスも増大した総組織マス、除脂肪体重および総体脂肪を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO9903ポリペプチド(DNA119516−2797で指定される)をコードする遺伝子(UNQ3071)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:XM_355322 PREDICTED:ハツカマウスRIKEN cDNA 5930434B04遺伝子(5930434B04Rik)に対応する;タンパク質参照:Q8BG21 ACCESSION:Q8BG21NID:ハツカマウス(マウス)。ハツカマウス0日目新生児胸腺cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:A430023D18産物:未知EST、完全挿入配列(ハツカマウス13日胚胃cDNA、RIKEN完全長富化ライブラリ、クローン:D530007N05産物:未知EST、完全挿入配列);ヒト遺伝子配列参照:NM_017586 ACCESSION:NM_017586NID:gi8922115refNM_017586.1ホモサピエンス第9染色体オープンリーディングフレーム7(C9orf7);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9UGQ2 ACCESSION:Q9UGQ2NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。仮想タンパク質FLJ90371(第9染色体オープンリーディングフレーム7)(仮想タンパク質NT2RP3001619)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託AK020041)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨ならびに胃、小腸および結腸以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト第9染色体オープンリーディングフレーム7(C9orf7)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、聴覚障害が(−/−)マウスにおいてもたらされた。雄および雌両方の(−/−)マウスが増大した平均血清トリグリセリドレベルを示し、雌においてより顕著であった。雄(−/−)マウスはまた、増大した平均血清コレステロールも示した。また、血清IgMおよびIgG2aレベルが(−/−)ノックアウトマウスにおいても減少していた。2匹の雌(−/−)マウスは、骨髄において骨髄様過形成を示した。雄(−/−)マウスは、増大した平均総組織マスおよび除脂肪体重ならびに増大した平均大腿中軸皮質厚さを示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
微視的観察結果:雌(−/−)マウスはともに、骨髄において骨髄様過形成を示した。雄(−/−)マウスでは、顕著な差は観察されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的解析による組織パネルにおいて検出されなかった。
心臓血管の生物学の領域において、本明細書では、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、脂質代謝異常、例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)、糖尿病および/または肥満の処置のために標的を同定した。この表現型試験には、血清コレステロールおよびトリグリセリドの測定を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートをこのアッセイにおいて試験した。増大した高コレステロールレベルおよびトリグリセリドの血中レベルは、心血管疾患および/または糖尿病の発症のリスクファクターと認識されている。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの所見が助長される。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患のリスクを低減させるのに有用であり得る。これらの血中化学成分試験では、測定値は、COBAS Integra 400(Roche製)を用いて記録した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均血清コレステロールレベルを示した。雄および雌両方の(−/−)マウスが、増大した平均血清トリグリセリドレベルを示し、その差は、雌においてより顕著であった。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、これらの通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
血清免疫グロブリン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のもの、実行プロジェクトの(+/+)マウスおよび歴史的メジアンと比較すると、低減された平均血清IgMレベルを示した。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用され得る。
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。これらの試験には、不安、活動性レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドを含めた。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(Vmax)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
感覚運動ゲーティング/注意:試験した8匹の(−/−)マウスのうち、1匹のみが驚愕応答を示し、これは、変異型における聴覚障害を示す。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
1.DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均総組織マスおよび除脂肪体重を示した。
2.Micro−CT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した平均大腿中軸皮質厚さを示した。
これらのノックアウト実験では、PRO1106ポリペプチド(DNA59609−1470で指定される)をコードする遺伝子(UNQ549)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_146118ハツカマウス可溶性担体ファミリー25(ミトコンドリア担体、リン酸塩担体)、メンバー25(Slc25a25)に対応する;タンパク質参照:Q8JZT8 ACCESSION:Q8JZT8NID:ハツカマウス(マウス)。ミトコンドリアCa2依存性可溶性担体;ヒト遺伝子配列参照:NM_052901ホモサピエンス可溶性担体ファミリー25(ミトコンドリア担体;リン酸塩担体)、メンバー25(SLC25A25);ヒトタンパク質配列は、参照:Q705K2 ACCESSION:Q705K2NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。ミトコンドリアATP−Mg/Pi担体(小さいカルシウム結合ミトコンドリア担体2)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜3を標的化した(NCBI受託BC019978.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト可溶性担体ファミリー25(ミトコンドリア担体、リン酸塩担体)、メンバー25(SLC25A25)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、低減された体長という観察結果が雌(−/−)マウスにおいてもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した
(b)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、低減された平均体長を示した。これらの結果は、PRO1106遺伝子をノックアウトすることと関連する負の表現型が成長異常をもたらすことを示す。したがって、PRO1106ポリペプチドおよびそのアゴニストは、正常な成長代謝の維持に有用であり得、一方、PRO1106ポリペプチドのアンタゴニスト(もしくはインヒビター)は、負の成長関連表現型を模倣し得る。
これらのノックアウト実験では、PRO1411ポリペプチド(DNA59212−1627で指定される)をコードする遺伝子(UNQ729)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:AY444557ハツカマウス表皮特異的分泌タンパク質SK89前駆体、mRNA、完全cd、選択的スプライシング体に対応する;タンパク質参照:Q6SZJ9 ACCESSION:Q6SZJ9NID:ハツカマウス(マウス)。表皮特異的分泌タンパク質SK89前駆体;ヒト遺伝子配列参照:NM_033317ホモサピエンスデルモカイン(dermokine)(ZD52F10);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6E0U4 ACCESSION:Q6E0U4NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。デルモカイン−β。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_172899.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち肝臓、骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトデルモカイン(ZD52F10)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した平均血清IgG2aレベルが(−/−)マウスにおいてもたらされた。雌ホモ接合体(−/−)マウスはまた、平均収縮期血圧の上昇も示した。雄(−/−)マウスは、減損したグルコース耐性を示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、通常の生理機能において、傷害または損傷に対して応答するのに重要であり、傷害または損傷からの修復を開始し、かつ外来生物に対する先天的および後天的防御を示す、かなり複雑で、多くの場合、多数の相互に連結された生物学的経路の明示または結果である。疾患または病変は、このような通常の生理学的経路により、応答の強度との直接関連として、異常調節もしくは過剰刺激の結果として、自身に対する反応として、またはこれらの組合せとしてのいずれかで、さらなる傷害または損傷が引き起こされる場合に起こる。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。かかる疾患としては、免疫媒介炎症性疾患(例えば、関節リューマチ、免疫媒介腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息など)、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成ならびに移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の領域において、炎症および炎症性障害の処置のために標的を同定した。
血清免疫グロブリンアイソタイプ分類アッセイは、Cytometric Bead Array(CBA)キットを用いて行なう。このアッセイを用いて、単一の試料中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖アイソタイプが速やかに同定される。表示した値は「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。<6の値はいずれも有意でない。
(−/−)マウスは、その性別一致同腹仔対照と比較すると、増大した平均血清IgG2aレベルを示した。
記:
収縮期血圧は、非侵襲的テイルカフ法により4日間、Visitech BP−2000血圧解析システムにおいて測定する。血圧は各日10回で4日間測定する。次いで、この4日分を平均し、マウスの覚醒時の収縮期血圧を得る。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔(p=0.05)および歴史的平均と比較すると、平均収縮期血圧の上昇を示し、これは、ホモ接合体マウスの高血圧を示す。
代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。代謝の領域において、糖尿病の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するグルコース耐性試験が挙げられる。異常なグルコース耐性試験の結果以下の障害または状態:1型および2型糖尿病、X症候群、種々の心血管疾患および/または肥満を示すものであり得るが、これらに限定され得ない。
グルコース耐性試験:試験した変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、T−60において減損したグルコース耐性を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO1486ポリペプチド(DNA71180−1655で指定される)をコードする遺伝子(UNQ755)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_019820ハツカマウスセレベリン3前駆体タンパク質(Cbln3)に対応する;タンパク質参照:Q9JHG0 ACCESSION:Q9JHG0NID:ハツカマウス(マウス)。CBLN3;ヒト遺伝子配列参照:AY359070ホモサピエンスクローンDNA71180セレベリン(UNQ755);ヒトタンパク質配列は、参照:Q6UW01 ACCESSION:Q6UW01NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。セレベリン。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1〜4を標的化した(NCBI受託NM_019820.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち肺、骨格筋および骨以外のすべてにおいて検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒト仮想分泌タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、増大した小柱の結合密度および総中軸大腿骨領域を示すノックアウト(−/−)マウスがもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
手順:また、MicroCTを、非常に感度のよいBMDの測定値を得るために使用した。1本の脊椎骨および1本の大腿骨を、4匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎の海綿質体積、小柱の厚さ、結合密度および中軸大腿骨総骨面積ならびに皮質厚さの測定値を得た。μCT40スキャンにより、骨量および骨構造に関する詳細な情報が得られた。多数の骨を試料ホルダー内に入れ、自動的にスキャンした。機器のソフトウエアを用いて解析の対象領域を選択した。海綿質パラメータは、第5腰椎(LV5)において16マイクロメートル解像度で解析し、皮質骨パラメータは、大腿骨中軸において20マイクロメートルの解像度で解析した。
MicroCT:(−/−)ホモ接合体変異型は、(+/+)対照同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した小柱の結合密度および総中軸大腿骨領域を伴う増大した骨関連測定値を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO1565ポリペプチド(DNA73727−1673で指定される)をコードする遺伝子(UNQ771)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_022322ハツカマウステノモジュリン(Tnmd)に対応する;タンパク質参照:Q9EP64 ACCESSION:Q9EP64NID:ハツカマウス(マウス)。テノモジュリン(TeM)(mTeM)(コンドロモジュリン−I様タンパク質)(ChM IL)(mChM IL)(ミオジュリン)(テンジン(tendin));ヒト遺伝子配列参照:NM_022144ホモサピエンステノモジュリン(TNMD);ヒトタンパク質配列は、参照:Q9H2S6 テノモジュリン(TeM)(hTeM)(コンドロモジュリン−I様タンパク質)(ChM1L)(hChM1L)(ミオジュリン(myodulin))(テンジン)(UNQ771/PRO1565)gi|15077276|gb|AAK83109.1|コンドロモジュリン−IB[ホモサピエンス]gi|12231527|gb|AAG49144.1|テノモジュリン[ホモサピエンス]gi|25392187|pir||JC7597コンドロモジュリン−I様タンパク質、ChM1L−ヒトgi|12698293|dbj|BAB21756.1|ChM1L[ホモサピエンス]に対応する。
このプロジェクト(project)はX連鎖であり、ヘミ接合体は注目に値する表現型は有しない。
性別および遺伝子型によるX連鎖遺伝子分布のまとめ
(雄キメラ由来のアグーチの子のみを含める。)
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1および2を標的化した(NCBI受託NM_022322.2)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、胸腺、骨格筋、骨および脂肪において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトテノモジュリン(TNMD)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(+/+)同胞種と比較して、ホモ接合体(−/−)マウスにおいて増大した平均体長がもたらされた。雌(−/−)マウスはまた、増大した血清カリウムレベルも示した。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、総組織マス(TTM)における変化が成功裡に確認された。
身体測定:体長および体重の測定は、およそ16週齢のときに行なった。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較すると、増大した平均体長を示した。
代謝の領域において、代謝障害の処置のために標的を同定し得る。血中化学成分の表現型解析としては、血糖の測定が挙げられる。COBAS Integra 400(Roche製)を用い、血中化学成分試験をマウスにおいて行なった。血糖レベルの測定に加え、下記の血中化学成分:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血液尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物の試験もまた常套的に行なわれる。
雌(−/−)マウスは、その(−/+)同腹仔と比較すると、増大した平均血清カリウムレベルを示した。この観察結果は、ホモ接合体マウスが、腎臓機能不全の結果であり得る改変された電解質平衡を有することを示す。
これらのノックアウト実験では、PRO4399ポリペプチド(DNA89220−2608で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1924)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_153157ハツカマウスオルファクトメジン3(Olfm3)、転写物バリアントBに対応する;タンパク質参照:Q8QZW0ネオリン(Noelin)3前駆体(オルファクトメジン3)(オプチメジン(Optimedin));ヒト遺伝子配列参照:AY358722ホモサピエンスクローンDNA89220olfM3(UNQ1924);ヒトタンパク質配列は、参照:Q96PB7 ACCESSION:Q96PB7NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。NOELIN 3 PRECURSOR。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン4を標的化した(NCBI受託NM_153157.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、RT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、腎臓および肝臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトオルファクトメジン3(0LFM3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、雌ホモ接合体(−/−)マウスは、増大した総組織マスおよび総体脂肪含量を示す観察結果というがもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
骨代謝の領域において、本明細書では、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のために標的を同定し、加えて、骨治癒を促進する標的も同定した。試験には、
・ 大腿骨および脊椎骨における骨無機質密度の測定のためのDEXA
・ 海綿質および皮質骨の両方の骨無機質密度の非常に高い解像度および非常に高い感度での測定のためのMicroCT
を含めた。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイにおいて試験した。二重X線吸収骨塩定量(DEXA)を用いて、骨における変化が成功裡に確認された。麻酔した動物を検査し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量分析的骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび脊椎骨BMDを測定した。
雌ホモ接合体(−/−)マウスは、その性別一致野生型(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、増大した総組織マスおよび総脂肪含量を示した。
これらのノックアウト実験では、PRO4404ポリペプチド(DNA84142−2613で指定される)をコードする遺伝子(UNQ1929)を破壊した。これらの試験での遺伝子の特定情報は、以下のとおりである:変異型マウス遺伝子は、ヌクレオチド参照:NM_001003947ハツカマウスシトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーX、ポリペプチド1(Cyp4X1)に対応する;タンパク質参照:Q6A152 ACCESSION:Q6A152NID:ハツカマウス(マウス)。シトクロムP450;ヒト遺伝子配列参照:NM_178033ホモサピエンスシトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーX、ポリペプチド1(CYP4X1);ヒトタンパク質配列は、参照:Q8N118 ACCESSION:Q8N118NID:ホモサピエンス(ヒト)に対応する。シトクロムP450 4X1(EC1.14.14.1)(CYPIVXl)(UNQ1929/PRO4404)。
変異情報
変異の型:相同組換え(標準)
記:コードエキソン1を標的化した(NCBI受託NM_001003947.1)。
1.野生型発現パネル:標的遺伝子の発現は、胚性幹(ES)細胞、ならびにRT−PCRによって試験した13の成体組織試料のうち脳、脊髄、目、脾臓および腎臓において検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊は、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全般的な表現型の概要:
ヒトシトクロムP450、ファミリー4、サブファミリーx、ポリペプチド1(CYP4X1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、ホットプレート試験の際に、長い潜時期間を示す変異型(−/−)マウスがもたらされた。遺伝子の破壊をサザンブロットによって確認した。
神経学の領域において、解析は、本明細書では、神経学的および精神医学的障害、例えば、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害の処置のためのインビボで確認される標的を同定することに焦点をあてた。神経障害としては、「不安障害」と規定されるカテゴリーのもの、例えば、限定されないが、軽度〜中等度の不安、一般的な病状による不安障害、特に規定のない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖、特定の恐怖、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖症、双極I型またはII型障害、特に規定のない双極性障害、循環病、抑鬱障害、大抑鬱病、気分障害、物質誘発性気分障害が挙げられる。また、不安障害は、人格障害、例えば、限定されないが、以下の型:妄想性、反社会的、回避性行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂病質および分裂病型に適用し得る。
行動のスクリーニングを、4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体マウスのコホートにおいて行なった。すべての行動試験は、生存性低下によって、より早期の試験が必要とされない限り、12〜16週齢で行なった。
試験の説明:侵害受容のホットプレート試験は、各マウスを小型の密閉55℃ホットプレート上に配置することにより行なう。後肢応答潜時(舐める、震えるまたは飛び跳ねる)を記録し、ホットプレート上での最大時間は30秒間である。各動物は一度に試験する。
雌変異型(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔対照と比較すると、長い応答潜時(例えば、低減された感応性の差)を示した。これらの結果は、疼痛知覚の改変を示す。
実施例71:ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の使用
下記の方法は、ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の使用を記載したものである。
実施例72:大腸菌におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
この実施例は、大腸菌内での組換え発現によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの非グリコシル化形態の調製を示す。
実施例73:哺乳動物細胞におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
この実施例は、哺乳動物細胞内での組換え発現によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの潜在的にグリコシル化された形態の調製を示す。
実施例74:酵母におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
下記の方法は、酵母におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の組換え発現を記載したものである。
実施例75:バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の発現
下記の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404の組換え発現を記載したものである。
実施例76:GeneExpress(登録商標)を用いた組織発現プロファイリング
遺伝子発現情報(GeneExpress(登録商標),Gene Logic Inc.,Gaithersburg,MD)を含むプロプライエタリ(proprietary)データベースを、その発現が他の腫瘍(1種類または複数種)および/または正常組織と比べ、対象の特定の腫瘍組織(1種類または複数種)において有意に上方調節されるポリペプチド(およびそのコード核酸)を同定する試みにおいて解析した。具体的には、GeneExpress(登録商標)データベースの解析は、Gene Logic Inc.,Gaithersburg,MDから入手可能な、GeneExpress(登録商標)データベースの使用のためのソフトウエア、またはGenentech,Inc.で書き込みおよび開発されたGeneExpress(登録商標)データベースの使用のためのプロプライエタリソフトウエアのいずれかを用いて行なった。解析における陽性ヒットの評価は、いくつかの基準、例えば、正常な必須組織および/または正常な増殖組織における組織特異性、腫瘍特異性および発現レベルなどに基づく。以下のものは、GeneExpress(登録商標)データベースの解析から測定されるその組織発現プロフィールによって、他の腫瘍(1種類または複数種)および/または正常組織と比べて特定の腫瘍または腫瘍における高い組織発現および発現の有意な上方調節が証明され、任意選択で、正常な必須組織および/または正常な増殖組織における比較的低い発現が証明される分子の列挙である。
実施例77:癌性腫瘍におけるUNQ遺伝子の上方調節を検出するためのマイクロアレイ解析
核酸マイクロアレイ(多くの場合、数千個の遺伝子配列を含む)は、その対応する正常組織と比べて疾患組織において示差的に発現される遺伝子を同定するのに有用である。核酸マイクロアレイを用いて、試験組織試料および対照組織試料由来の試験mRNA試料および対照mRNA試料を逆転写し、標識してcDNAプローブを作製する。次いで、cDNAプローブを、固相支持体上に固定化させた核酸のアレイにハイブリダイズさせる。アレイは、アレイの各メンバーの配列および位置が既知であるように構成する。例えば、ある特定の疾患状態で発現されることがわかっている一群の選択された遺伝子が固相支持体上でアレイ状になり得る。標識プローブとある特定のアレイメンバーとのハイブリダイゼーションは、プローブを誘導した試料が遺伝子を発現することを示す。試験(疾患組織)試料由来のプローブのハイブリダイゼーションシグナルが、対照(正常組織)試料由来のプローブのハイブリダイゼーションシグナルより大きい場合、疾患組織において過剰発現される遺伝子(1つまたは複数)が同定される。この結果が示唆することは、疾患組織において過剰発現されるタンパク質は、疾患状態の存在の診断用マーカーとしてだけでなく、疾患状態の処置のための治療用標的として有用であるということである。
実施例78:UNQ mRNA発現の定量的解析
このアッセイでは、5’ヌクレアーゼアッセイ(例えば、TaqMan(登録商標))およびリアルタイム定量的PCR(例えば、ABI Prizm 7700 Sequence Detection System(登録商標)(Perkin Elmer,Applied Biosystems Division,Foster City,CA))を用い、他の癌性腫瘍または正常な非癌性組織と比べて癌性腫瘍(1種類または複数種)で有意に過剰発現される遺伝子を見出した。5’ヌクレアーゼアッセイ反応は、遺伝子発現を、リアルタイムをモニターするのにTaq DNAポリメラーゼ酵素の5’エキソヌクレアーゼ活性を利用する蛍光PCRに基づく手法である。2種類のオリゴヌクレオチドプライマー(その配列は、目的の遺伝子またはEST配列に基づく)を用い、PCR反応に典型的なアンプリコンを作製する。この2つのPCRプライマー間に位置するヌクレオチド配列を検出するための第3のオリゴヌクレオチドあるいはプローブを設計する。プローブは、Taq DNAポリメラーゼ酵素によって非伸長可能であり、レポーター蛍光色素およびクエンチャー蛍光色素で標識される。レポーター色素からのレーザー誘導型発光はいずれも、2つの色素がプローブ上に存在している場合に互いの位置が近接したとき、クエンチャー色素によってクエンチされる。PCR増幅反応中、Taq DNAポリメラーゼ酵素は、プローブを鋳型依存的に切断する。得られたプローブ断片は溶液中で解離し、放出されたレポーター色素からのシグナルには、第2のフルオロフォアのクエンチ効果はない。レポーター色素の一方の分子は、合成された新たな分子の各々について遊離され、クエンチされていないレポーター色素の検出は、データの定量的解釈の根拠を提供する。
実施例79:インサイチューハイブリダイゼーション
インサイチューハイブリダイゼーションは、細胞または組織の調製物内の核酸配列の検出および位置特定のための強力で多用途の手法である。これは、例えば、遺伝子の発現部位を同定するため、転写の組織分布を解析するため、ウイルス感染を同定および位置特定するため、特定のmRNA合成における変化を追跡するため、ならびに染色体マッピングを補助するために有用であり得る。
33Pリボプローブ合成
6.0μl(125mCi)の33P−UTP(Amersham BF 1002、SA<2000Ci/mmol)を高速真空乾燥した。乾燥33P−UTPを入れた各チューブに、以下の成分を加えた:
2.0μlの5×転写バッファー
1.0μlのDTT(100mM)
2.0μlのNTPミックス(2.5mM:10μ;各々10mMのGTP、CTPおよびATP+10μlのH2O)
1.0μlのUTP(50μM)
1.0μlのRnasin
1.0μlのDNA鋳型(1μg)
1.0μlのH2O
1.0μlのRNAポリメラーゼ(PCR産物用、T3=AS、T7=S、通常)
チューブを37℃で1時間インキュベートした。1.0μlのRQ1 DNアーゼを添加した後、37℃で15分間インキュベーションを行なった。90μlのTE(10mM Tris pH7.6/1mM EDTA pH8.0)を添加し、混合物をDE81紙上にピペッティングした。残った溶液をMicrocon−50限外濾過ユニット内に負荷し、プログラム10を用いてスピンした(6分間)。濾過ユニットを第2のチューブ上に反転し、プログラム2を用いてスピンした(3分間)。最終の回収スピン後、100μlのTEを添加した。1μlの最終産物をDE81紙上にピペッティングし、6mlのBiofluor II中で計数した。
33P−ハイブリダイゼーション
A.凍結切片の前処理
スライドをフリーザーから取り出し、アルミニウムトレイ上に置き、室温で5分間解凍した。トレイを55℃のインキュベーター内に5分間配置し、結露を低減させた。スライドを、ヒュームフード内で氷上の4%パラホルムアルデヒド中に10分間固定し、0.5×SSC中で5分間、室温にて洗浄した(25ml 20×SSC+975ml SQ H2O)。0.5μg/mlのプロテイナーゼK中、10分間37℃でのタンパク質除去(250mlの予備加温RNアーゼ無含有RNアーゼバッファー中、12.5μlの10mg/mlストック)後、切片を0.5×SSC中で10分間、室温にて洗浄した。切片を、70%、95%、100%エタノール中で各々2分間脱水した。
スライドを脱パラフィン処理し、SQ H2O中に入れ、2×SSC中で2回、室温で各回5分間リンス処理した。切片を、20μg/mlのプロテイナーゼK(250mlのRNアーゼ無含有RNアーゼバッファー中10mg/mlで500μl;37℃、15分間)(ヒト胚)、または8×プロテイナーゼK(250mlのRnアーゼバッファー中100μl、37℃、30分間)(ホルマリン組織)中でタンパク質除去処理した。続いて、0.5×SSC中でのリンス処理および脱水を、上記のようにして行なった。
スライドを、Boxバッファー(4×SSC、50%ホルムアミド)を飽和させた濾紙を内側に貼り付けたプラスチックボックス内に並べた。
スライド1.0×106cpmのプローブおよび1.0μlのtRNA(50mg/mlストック)を95℃で3分間加熱した。スライドを氷上で冷却し、スライド1枚あたり48μlのハイブリダイゼーションバッファーを添加した。ボルテックスした後、50μlの33Pミックスを、スライド上の50μlのプレハイブリダイゼーション液に添加した。スライドを一晩55℃でインキュベートした。
洗浄は、室温で、2×SSC、EDTAを用いて10分間を2回行なった(400mlの20×SSC+16mlの0.25M EDTA、Vf=4L)後、RNアーゼA処理を37℃で30分間行なった(250mlのRnアーゼバッファー中10mg/ml=20μg/mで500μl)。スライドを室温で2×SSC、EDTAにて10分間、2回洗浄した。ストリンジェンシー洗浄条件は、以下の通り:55℃で2時間、0.1×SSC、EDTA(20mlの20×SSC+16ml EDTA、Vf=4L)とした。
インサイチュー解析を、本明細書に開示したさまざまなDNA配列において行なった。これらの解析に用いたオリゴヌクレオチドは、添付の図面に示した核酸(またはその相補配列)に相補的となるように得た。
実施例80:PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に結合する抗体の調製
この実施例は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404に特異的に結合し得るモノクローナル抗体の調製を示す。
実施例81:特異的抗体を用いたPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの精製
天然または組換えPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを、タンパク質精製の分野におけるさまざまな標準的な手法によって精製し得る。例えば、pro−PRO179,pro−PRO181,pro−PRO244,pro−PRO247,pro−PRO269,pro−PRO293,pro−PRO298,pro−PRO339,pro−PRO341,pro−PRO347,pro−PRO531,pro−PRO537,pro−PRO718,pro−PRO773,pro−PRO860,pro−PRO871,pro−PRO872,pro−PRO813,pro−PRO828,pro−PRO1100,pro−PRO1114,pro−PRO1115,pro−PRO1126,pro−PRO1133,pro−PRO1154,pro−PRO1185,pro−PRO1194,pro−PRO1287,pro−PRO1291,pro−PRO1293,pro−PRO1310,pro−PRO1312,pro−PRO1335,pro−PRO1339,pro−PRO2155,pro−PRO1356,pro−PRO1385,pro−PRO1412,pro−PRO1487,pro−PRO1758,pro−PRO1779,pro−PRO1785,pro−PRO1889,pro−PRO90318,pro−PRO3434,pro−PRO3579,pro−PRO4322,pro−PRO4343,pro−PRO4347,pro−PRO4403,pro−PRO4976,pro−PRO260,pro−PRO6014,pro−PRO6027,pro−PRO6181,pro−PRO6714,pro−PRO9922,pro−PRO7179,pro−PRO7476,pro−PRO9824,pro−PRO19814,pro−PRO19836,pro−PRO20088,pro−PRO70789,pro−PRO50298,pro−PRO51592,pro−PRO1757,pro−PRO4421,pro−PRO9903,pro−PRO1106,pro−PRO1411,pro−PRO1486,pro−PRO1565,pro−PRO4399またはpro−PRO4404ポリペプチド、成熟PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたはpre−PRO179,pre−PRO181,pre−PRO244,pre−PRO247,pre−PRO269,pre−PRO293,pre−PRO298,pre−PRO339,pre−PRO341,pre−PRO347,pre−PRO531,pre−PRO537,pre−PRO718,pre−PRO773,pre−PRO860,pre−PRO871,pre−PRO872,pre−PRO813,pre−PRO828,pre−PRO1100,pre−PRO1114,pre−PRO1115,pre−PRO1126,pre−PRO1133,pre−PRO1154,pre−PRO1185,pre−PRO1194,pre−PRO1287,pre−PRO1291,pre−PRO1293,pre−PRO1310,pre−PRO1312,pre−PRO1335,pre−PRO1339,pre−PRO2155,pre−PRO1356,pre−PRO1385,pre−PRO1412,pre−PRO1487,pre−PRO1758,pre−PRO1779,pre−PRO1785,pre−PRO1889,pre−PRO90318,pre−PRO3434,pre−PRO3579,pre−PRO4322,pre−PRO4343,pre−PRO4347,pre−PRO4403,pre−PRO4976,pre−PRO260,pre−PRO6014,pre−PRO6027,pre−PRO6181,pre−PRO6714,pre−PRO9922,pre−PRO7179,pre−PRO7476,pre−PRO9824,pre−PRO19814,pre−PRO19836,pre−PRO20088,pre−PRO70789,pre−PRO50298,pre−PRO51592,pre−PRO1757,pre−PRO4421,pre−PRO9903,pre−PRO1106,pre−PRO1411,pre−PRO1486,pre−PRO1565,pre−PRO4399またはpre−PRO4404ポリペプチドを、対象のPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドに特異的な抗体を用いたイムノアフィニティクロマトグラフィーによって精製する。一般に、イムノアフィニティカラムは、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404ポリペプチド抗体を活性化したクロマトグラフィー樹脂に共有結合によってカップリングさせることにより構成されている。
実施例82:薬物スクリーニング
本発明は、さまざまな薬物スクリーニング手法のいずれかにおいて、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたはその結合断片を用いることによる化合物のスクリーニングに特に有用である。かかる試験に使用されるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片は、溶液中で遊離、固相支持体に固定、細胞表面上に担持、または細胞内に局在のいずれかであり得る。薬物スクリーニング方法の一例では、組換え核酸で安定に形質転換された、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片を発現する真核生物または原核生物の宿主細胞を用いる。薬物は、競合的結合アッセイで、かかる形質転換細胞に対してスクリーニングする。かかる細胞は、バイアブルな状態または固定された形態のいずれかで、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドまたは断片と試験対象の薬剤との複合体の形成を測定できる。あるいはまた、試験される薬剤によって引き起こされるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドとその標的細胞または標的受容体との複合体形成の減少を検査できる。
実施例83:合理的な薬物設計
合理的な薬物設計の目的は、目的の生物学的に活性なポリペプチド(すなわち、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチド)または該ポリペプチドと相互作用する小分子、例えば、アゴニスト、アンタゴニストもしくはインヒビターの構造的類縁体を作製することである。これらの例のいずれかを用い、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのより活性または安定な形態である薬物またはPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの機能をインビボで増強もしくは干渉する薬物を創出し得る(Hodgson,Bio/Technology,9:19−21(1991)を参照)。
Claims (149)
- PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;及び、
(c)該測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること、
を含み、ここで該野生型動物の該生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴が、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される、方法。 - 前記非ヒトトランスジェニック動物が、PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、請求項1記載の方法。
- 性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物により示される表現型が、以下:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つである、請求項1記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項3記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項3記載の方法。
- 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項3記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項3記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項3記載の方法。
- 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項3記載の方法。
- 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項3記載の方法。
- 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項3記載の方法。
- 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項10記載の方法。
- 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項10記載の方法。
- 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病(Albers−Schnoberg disease)、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項10記載の方法。
- 前記眼の異常が白内障である、請求項3記載の方法。
- 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、請求項15記載の方法。
- 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項3記載の方法。
- 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、請求項3記載の方法。
- 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項3記載の方法。
- 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項3記載の方法。
- 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞(blow cells);脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項1記載の方法。
- 自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物から誘導した、単離細胞。
- マウス細胞である、請求項22記載の単離細胞。
- 前記マウス細胞が胚性幹細胞である請求項23記載の単離細胞。
- 性別一致野生型同腹仔と比較した場合に前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型:神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常の少なくとも1つを示す、請求項22記載の単離細胞。
- PRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179、PRO181、PRO244、PRO247、PRO269、PRO293、PRO298、PRO339、PRO341、PRO347、PRO531、PRO537、PRO718、PRO773、PRO860、PRO871、PRO872、PRO813、PRO828、PRO1100、PRO1114、PRO1115、PRO1126、PRO1133、PRO1154、PRO1185、PRO1194、PRO1287、PRO1291、PRO1293、PRO1310、PRO1312、PRO1335、PRO1339、PRO2155、PRO1356、PRO1385、PRO1412、PRO1487、PRO1758、PRO1779、PRO1785、PRO1889、PRO90318、PRO3434、PRO3579、PRO4322、PRO4343、PRO4347、PRO4403、PRO4976、PRO260、PRO6014、PRO6027、PRO6181、PRO6714、PRO9922、PRO7179、PRO7476、PRO9824、PRO19814、PRO19836、PRO20088、PRO70789、PRO50298、PRO51592、PRO1757、PRO4421、PRO9903、PRO1106、PRO1411、PRO1486、PRO1565、PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた表現型として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該試験薬剤が該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された表現型を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。 - 前記遺伝子の破壊に関連する表現型が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、請求項26記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項27記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項27記載の方法。
- 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項27記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項27記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項27記載の方法。
- 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項27記載の方法。
- 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項27記載の方法。
- 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項27記載の方法。
- 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項34記載の方法。
- 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項34記載の方法。
- 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項34記載の方法。
- 前記眼の異常が白内障である、請求項27記載の方法。
- 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患と関係している、請求項39記載の方法。
- 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項27記載の方法。
- 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、請求項27記載の方法。
- 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項27記載の方法。
- 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項27記載の方法。
- 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項26記載の方法。
- 請求項26記載の方法により同定された、薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項46記載の薬剤。
- 前記アゴニストが、抗−PRO179,抗−PRO181,抗−PRO244,抗−PRO247,抗−PRO269,抗−PRO293,抗−PRO298,抗−PRO339,抗−PRO341,抗−PRO347,抗−PRO531,抗−PRO537,抗−PRO718,抗−PRO773,抗−PRO860,抗−PRO871,抗−PRO872,抗−PRO813,抗−PRO828,抗−PRO1100,抗−PRO1114,抗−PRO1115,抗−PRO1126,抗−PRO1133,抗−PRO1154,抗−PRO1185,抗−PRO1194,抗−PRO1287,抗−PRO1291,抗−PRO1293,抗−PRO1310,抗−PRO1312,抗−PRO1335,抗−PRO1339,抗−PRO2155,抗−PRO1356,抗−PRO1385,抗−PRO1412,抗−PRO1487,抗−PRO1758,抗−PRO1779,抗−PRO1785,抗−PRO1889,抗−PRO90318,抗−PRO3434,抗−PRO3579,抗−PRO4322,抗−PRO4343,抗−PRO4347,抗−PRO4403,抗−PRO4976,抗−PRO260,抗−PRO6014,抗−PRO6027,抗−PRO6181,抗−PRO6714,抗−PRO9922,抗−PRO7179,抗−PRO7476,抗−PRO9824,抗−PRO19814,抗−PRO19836,抗−PRO20088,抗−PRO70789,抗−PRO50298,抗−PRO51592,抗−PRO1757,抗−PRO4421,抗−PRO9903,抗−PRO1106,抗−PRO1411,抗−PRO1486,抗−PRO1565,抗−PRO4399または抗−PRO4404抗体である、請求項47記載の薬剤。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項47記載の薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特性を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示される生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示される生理学的特徴が、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴が調節されているかどうか決定すること;
を含む、方法。 - 前記非ヒトトランスジェニック動物が性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項50記載の方法。
- 請求項50記載の方法により同定された、薬剤。
- 抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404
ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項52記載の薬剤。 - 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項53記載の薬剤。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項53記載の薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物により示される挙動を観察すること;
(c)(b)の観察された挙動を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物により示された観察された挙動とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物により示された観察された挙動は、遺伝子の破壊に関連する挙動として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該薬剤が遺伝子の破壊に関連する挙動を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。 - 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項56記載の方法。
- 前記挙動がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項56記載の方法。
- 前記挙動がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項56記載の方法。
- 前記挙動が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項56記載の方法。
- 前記挙動が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項56記載の方法。
- 前記挙動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項56記載の方法。
- 請求項56記載の方法により同定された、薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストであ、る請求項63記載の薬剤。
- 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項64記載の薬剤。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項64記載の薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は、下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)試験薬剤を該非ヒトトランスジェニック動物に投与すること;及び、
(c)該試験薬剤が非ヒトトランスジェニック動物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。 - 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項67記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項67記載の方法。
- 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項67記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項67記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項67記載の方法。
- 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項67記載の方法。
- 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項67記載の方法。
- 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項67記載の方法。
- 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項74記載の方法。
- 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項74記載の方法。
- 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項74記載の方法。
- 前記眼の異常が白内障である、請求項67記載の方法。
- 前記白内障がヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、請求項79記載の方法。
- 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項67記載の方法。
- 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である、請求項67記載の方法。
- 前記免疫不全が、全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項67記載の方法。
- 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項67記載の方法。
- 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して以下の生理学的特性:オープンフィールド試験中の増大した不安様応答;オープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答;オープンフィールド試験中の活動亢進とそれに伴った増大した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の低運動とそれに伴った低減した直立及び穴掘り活動;オープンフィールド試験中の増大した探索活動;オープンフィールド試験中の低減した探索活動;日周期リズムの顕著化;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば低減した歩行回数;ホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズム、例えば増大した歩行回数;増強された日周期リズム;増大したストレス応答を伴った増大したストレス誘導性の高体温;ストレス誘導高体温に対する増大した抵抗性;ストレス誘導高体温に対する低減した抵抗性;反転スクリーン試験中の減損した運動共調;尾部懸垂試験の間の増大した抑鬱様応答;尾部懸垂試験の間の低減した抑鬱様応答;プレパルス抑制試験の間の低減した驚愕応答;難聴を示す無驚愕応答;ホットプレート試験における低減した応答潜時;ホットプレート試験における増大した疼痛知覚;ホットプレート試験における延長した応答潜時;ホットプレート試験における低減した疼痛知覚;機能観察バッテリー試験の間の挙尾;眼科学的異常;減衰した網膜動脈;視神経異常;網膜変性;網膜色素脱失;白内障;低減した心拍数;低減した平均収縮期血圧;増大した平均収縮期血圧;増大したインスリン感受性;増大した平均絶食時血清中グルコースレベル;低減した平均血清中グルコースレベル;増大した平均血清中コレステロールレベル;低減した平均血清中コレステロールレベル;増大した平均血清中トリグリセリドレベル;低減した平均血清中トリグリセリドレベル;増強されたグルコース耐性;減損したグルコース耐性;低減した平均血清中インスリンレベル;増大した尿酸レベル;ケトン血症;増大した平均血清中リンレベル;増大した平均血清中カリウムレベル;増大した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;低減した平均血清中アルカリホスファターゼレベル;尿中の血液;増大した亜硝酸塩尿症;ケトン尿症;低減した平均血清中アルブミン;ナチュラルキラー細胞の低減した平均パーセンテージ;異常な白血球数;CD4細胞の増大した平均パーセンテージ;CD4細胞の低減した平均パーセンテージ;末梢血液中のB細胞の増大した平均パーセンテージ;B細胞の低減を伴ったCD4+及びCD8+細胞の増大;腹腔内の低減したB細胞及びCD11血球細胞;脾臓、リンパ節及びパイアー斑における増大した平均パーセンテージB細胞;CD25+染色及びCD62L/CD44染色による活性化/記憶T細胞の増大;脾臓における活性化/記憶T細胞の増大;CD8+細胞の低減した平均パーセンテージ;増大した総白血球(好中球、リンパ球、単球及び好塩基球の増大);低減したリンパ球;増大した平均絶対単球数;増大した平均絶対好中球数;低減した平均絶対単球数;低減した平均血清中IgM、IgA、IgG3、IgG2b及びIgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3レベル;低減した平均血清中IgMレベル;低減した平均血清中IgG2aレベル;低減した平均血清中IgG3及びIgMレベル;平均血清中IgMレベルの増大;平均血清中IgG2aレベルの増大;平均血清中IgG2bレベルの増大;貧血;低減した赤血球数、低減したヘモグロビン及び低減したヘマトクリット;増大した平均赤血球容積;増大した平均赤血球ヘモグロビン;低減した平均赤血球容積;低減した平均赤血球ヘモグロビン;増大した赤血球分布幅及び平均血小板容量;低減した赤血球分布幅;腹腔洗浄後のB220med/CD23−及びB220+/CD11−低/CD23−細胞の歪対照の比;リンパ節及び脾臓中の増大したCD25T細胞;パイヤー斑中の増大したCD38非リンパ様細胞;増大したCD23B細胞(腹腔);胸腺中のCD4/CD8DP細胞の低減したパーセンテージ及びTCRB+細胞の増大したパーセンテージ;パイヤー斑B細胞の低減;パイヤー斑中のTCRB+CD38+活性化T細胞の低減した数;増大した脾臓CD25+細胞及び腹腔内CD23B細胞;増大した平均血小板数;低減した平均血小板数;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG1応答;卵白アルブミン攻撃に対する低減した平均血清中IgG2a応答;卵白アルブミン攻撃に対する増大した平均血清中IgG2a応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中MCP−1応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中TNF−アルファ応答;LPS攻撃に対する増大した平均血清中IL−6応答;増大した皮膚線維芽細胞増殖;低減した皮膚線維芽細胞増殖;総体脂肪及び総脂肪マスの増大した平均パーセント;増大した平均体重;増大した平均身長;増大した総組織マス(TTM);増大した除脂肪体重(LBM);増大した大腿骨中無機質密度(BMD);増大した脊椎骨中無機質密度(BMD);増大したBMC/LBM比;増大した骨中無機質密度(BMD);増大した総身体容量分析的骨中無機質密度(vBMD);増大した骨塩量(BMC);増大した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;増大した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;総体脂肪及び総脂肪マスの低減した平均パーセント;低減した平均体重;低減した平均身長;低減した総組織マス(TTM);低減した除脂肪体重(LBM);低減した大腿骨中無機質密度(BMD);低減した脊椎骨中無機質密度(BMD);低減したBMC/LBM比;低減した骨中無機質密度(BMD);低減した骨塩量(BMC);低減した容量分析的骨中無機質密度(vBMD);低減した平均大腿骨中軸皮質厚み及び断面積;低減した平均脊椎骨梁骨容量、数量及び結合性密度;骨髄における骨髄様過形成;増大した骨石灰化を伴った大理石骨病;腹部脂肪貯留の増大;慢性活動性関節炎;増殖性軟骨疾患及び関節症;大腿脛骨関節における軟骨の増殖;十字靱帯及び軟骨膜結合組織の軟骨化生;慢性活動性皮膚炎;関節周囲組織の慢性活動性炎症;種々の組織における慢性炎症;関連する脾臓の赤血球過形成を伴う大腿及び胸骨の骨髄様過形成;増大した脾臓重量;減損した胃腸運動性;胸腺萎縮;胸腺T細胞リンパ腫;成長遅延;発達異常;全臓器サイズの全般的減少を伴った矮小成長;生存性低下を伴う成長遅延;及び胚性致死の少なくとも1つを示す、請求項67記載の方法。
- 請求項67記載の方法により同定された、薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項86記載の薬剤。
- 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項87記載の薬剤。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項87記載の薬剤。
- 請求項67記載の方法により同定された、治療薬。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に試験薬剤を接触させること;及び、
(b)該試験薬剤が、宿主細胞によるPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。 - 請求項91記載の方法により同定された、薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項92記載の薬剤。
- 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項93記載の薬剤。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項93記載の薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響することができる治療薬を評価する方法であって、該方法が下記工程:
(a)自身のゲノムがPRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含む非ヒトトランスジェニック動物を準備すること;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定すること;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物のものと比較すること(ただしここで該野生型動物の生理学的特徴とは異なる該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴は、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じた状態として同定される);
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与すること;及び、
(e)該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊に関連する同定された状態に対する、該試験薬剤の作用を評価すること;
を含む、方法。 - 前記状態が、神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を含む、請求項96記載の方法。
- 請求項96記載の方法により同定された、治療薬。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項98記載の治療薬。
- 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項99記載の治療薬。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項99記載の治療薬。
- 請求項98記載の治療薬を含む、医薬組成物。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;又は胚性致死を治療又は予防又は緩解する方法であって、該方法は、既に疾患を有し得る者、又は疾患を有する傾向にあり得る者、又は疾患を予防すべきであり得る者であるそのような治療を必要とする被験体に、請求項94記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの治療有効量を投与することにより、該障害を効果的に治療又は予防又は緩解することを含む、方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項103記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項103記載の方法。
- 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項103記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項103記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項103記載の方法。
- 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項103記載の方法。
- 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項103記載の方法。
- 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項103記載の方法。
- 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項110記載の方法。
- 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項110記載の方法。
- 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項110記載の方法。
- 前記眼の異常が白内障である、請求項103記載の方法。
- 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、請求項115記載の方法。
- 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項103記載の方法。
- 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である請求項103記載の方法。
- 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項103記載の方法。
- 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項103記載の方法。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節する薬剤を同定する方法であって、該方法が下記工程:
(a)非ヒトトランスジェニック動物細胞培養物を準備すること(ここで該培養物の各々の細胞は、PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊を含んでいる);
(b)試験薬剤を該細胞培養物に投与すること;及び、
(c)該試験薬剤が該細胞培養物における神経障害;心臓血管、内皮又は血管形成の障害;眼の異常;免疫不全;腫瘍学的障害;骨代謝異常又は障害;脂質代謝障害;又は発達異常を緩解又は調節するかどうか決定すること;
を含む、方法。 - 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の増大した不安様応答である、請求項121記載の方法。
- 前記神経障害がオープンフィールド活動性試験中の低減した不安様応答である、請求項121記載の方法。
- 前記神経障害がホームケージ活動性試験中の異常な日周期リズムである、請求項121記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の増強された運動共調である、請求項121記載の方法。
- 前記神経障害が反転スクリーン試験中の減損した運動共調である、請求項121記載の方法。
- 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠如障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏又は感覚障害である、請求項121記載の方法。
- 前記眼の異常が網膜の異常である、請求項121記載の方法。
- 前記眼の異常が視覚問題又は失明と関係している、請求項121記載の方法。
- 前記網膜の異常が色素性網膜炎と関係している、請求項128記載の方法。
- 前記網膜の異常が網膜変性又は網膜の形成異常を特徴とする、請求項128記載の方法。
- 前記網膜の異常が網膜の形成異常、種々の網膜症、例えば未熟児網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼の血管新生性疾患、血管再狭窄、動脈静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を包含する)、角膜及び他の組織の移植、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮をもたらす網膜変性、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症又はマンノシドーシスと関係している、請求項128記載の方法。
- 前記眼の異常が白内障である、請求項121記載の方法。
- 前記白内障が、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症又はコンラーディ症候群のような全身疾患である、請求項133記載の方法。
- 前記発達異常が胚性致死又は生存性低下を含む、請求項121記載の方法。
- 前記心臓血管、内皮又は血管形成障害が、動脈疾患、例えば真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;心筋梗塞、例えば急性心筋梗塞、心臓肥大及び心不全、例えば鬱血性心不全;高血圧;炎症性血管炎;レイノー病及びレイノー現象;動脈瘤及び動脈再狭窄;静脈及びリンパの障害、例えば血栓静脈炎、リンパ管炎及びリンパ浮腫;末梢血管疾患;癌、例えば血管腫瘍、例えば血管腫(毛細管及び海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管周囲細胞腫、カポジ肉腫、リンパ管腫及びリンパ管肉腫;腫瘍血管形成;外傷、例えば創傷、熱傷及び他の傷害組織、移植物固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リューマチ;脳血管疾患;腎疾患、例えば急性腎不全又は骨粗鬆症である請求項121記載の方法。
- 免疫不全が全身エリテマトーデス;関節リューマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(硬皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢及び末梢神経系の脱髄疾患、例えば多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシー又はギラン−バレー症候群及び慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー;肝胆疾患、例えば感染性肝炎(A、B、C、D、E型及び他の非肝向性のウィルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎及び硬化性胆管炎;炎症性腸疾患(潰瘍性結腸炎;クローン病);グルテン感受性腸症及びホイップル病;自己免疫性又は免疫媒介性の皮膚疾患、例えば水疱性疾患、多形性紅斑及び接触性皮膚炎、乾癬;アレルギー性疾患、例えば喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症及び蕁麻疹;肺の免疫学的疾患、例えば好酸球性肺炎、特発性肺線維症及び過敏性肺炎;又は移植関連疾患、例えば移植片拒絶及び移植片対宿主病である、請求項121記載の方法。
- 前記骨代謝異常又は障害が、関節炎、骨粗鬆症又は大理石骨病である、請求項121記載の方法。
- 請求項121記載の方法により同定された、薬剤。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストである、請求項139記載の薬剤。
- 前記アゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項140記載の薬剤。
- 前記アンタゴニストが、抗PRO179,抗PRO181,抗PRO244,抗PRO247,抗PRO269,抗PRO293,抗PRO298,抗PRO339,抗PRO341,抗PRO347,抗PRO531,抗PRO537,抗PRO718,抗PRO773,抗PRO860,抗PRO871,抗PRO872,抗PRO813,抗PRO828,抗PRO1100,抗PRO1114,抗PRO1115,抗PRO1126,抗PRO1133,抗PRO1154,抗PRO1185,抗PRO1194,抗PRO1287,抗PRO1291,抗PRO1293,抗PRO1310,抗PRO1312,抗PRO1335,抗PRO1339,抗PRO2155,抗PRO1356,抗PRO1385,抗PRO1412,抗PRO1487,抗PRO1758,抗PRO1779,抗PRO1785,抗PRO1889,抗PRO90318,抗PRO3434,抗PRO3579,抗PRO4322,抗PRO4343,抗PRO4347,抗PRO4403,抗PRO4976,抗PRO260,抗PRO6014,抗PRO6027,抗PRO6181,抗PRO6714,抗PRO9922,抗PRO7179,抗PRO7476,抗PRO9824,抗PRO19814,抗PRO19836,抗PRO20088,抗PRO70789,抗PRO50298,抗PRO51592,抗PRO1757,抗PRO4421,抗PRO9903,抗PRO1106,抗PRO1411,抗PRO1486,抗PRO1565,抗PRO4399または抗PRO4404抗体である、請求項140記載の薬剤。
- 請求項121記載の方法により同定された、治療薬。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、該方法が、既に表現型を有し得る被験体、又は表現型を有する傾向にあり得る被験体、又は表現型を予防すべきであり得る被験体に、請求項46記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該表現型を効果的に調節することを含む、方法。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、該方法は、既に生理学的特徴を示し得る被験体、又は生理学的特徴を示す傾向にあり得る被験体、又は生理学的特徴を予防すべきであり得る被験体に、請求項52記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該生理学的特徴を効果的に調節することを含む、方法。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する挙動を調節する方法であって、該方法は、既に挙動を示し得る被験体、又は挙動を示す傾向にあり得る被験体、又は示された挙動を予防すべきであり得る被験体に、請求項63記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該挙動を効果的に調節することを含む、方法。
- PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドの発現を調節する方法であって、該方法は、該PRO179,PRO181,PRO244,PRO247,PRO269,PRO293,PRO298,PRO339,PRO341,PRO347,PRO531,PRO537,PRO718,PRO773,PRO860,PRO871,PRO872,PRO813,PRO828,PRO1100,PRO1114,PRO1115,PRO1126,PRO1133,PRO1154,PRO1185,PRO1194,PRO1287,PRO1291,PRO1293,PRO1310,PRO1312,PRO1335,PRO1339,PRO2155,PRO1356,PRO1385,PRO1412,PRO1487,PRO1758,PRO1779,PRO1785,PRO1889,PRO90318,PRO3434,PRO3579,PRO4322,PRO4343,PRO4347,PRO4403,PRO4976,PRO260,PRO6014,PRO6027,PRO6181,PRO6714,PRO9922,PRO7179,PRO7476,PRO9824,PRO19814,PRO19836,PRO20088,PRO70789,PRO50298,PRO51592,PRO1757,PRO4421,PRO9903,PRO1106,PRO1411,PRO1486,PRO1565,PRO4399またはPRO4404ポリペプチドを発現する宿主細胞に、請求項92記載の薬剤、又はそのアゴニスト又はアンタゴニストの有効量を投与することにより、該ポリペプチドの発現を効果的に調節することを含む、方法。
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Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20110712 |
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A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20111202 |