JP2008541781A - 異なる遺伝子に対するトランスジェニック動物、および遺伝子の特徴づけのためのその使用 - Google Patents

Abstract

本発明は、遺伝子機能の特徴づけに関するトランスジェニック動物ならびに組成物および方法に関する。このようなｉｎ ｖｉｖｏにおける研究および特徴づけは、遺伝子破壊に関連する疾患または機能障害（例えば、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨の代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常）の予防、寛解または矯正に有用な治療薬および／または処置法の価値ある同定および発見を提供し得る。

Description

（発明の分野）
本発明は、トランスジェニック動物およびノックアウト動物を含む組成物ならびに疾患または障害の診断および処置のためにそのような組成物を使用する方法に関する。

（発明の背景）
細胞外タンパク質は、とりわけ、多細胞生物の形成、分化および維持において重要な役割を果たしている。多くの個々の細胞の運命、例えば、増殖、移動、分化または他の細胞との相互作用は、代表的には他の細胞および／または直属の環境から受ける情報により支配されている。この情報は、分泌ポリペプチド（例えば、分裂促進因子、生存因子、細胞傷害性因子、分化因子、神経ペプチドおよびホルモン）により伝達されることが多く、そのポリペプチドは、その後多様な細胞レセプターまたは膜結合タンパク質から受け、そして解釈される。これらの分泌ポリペプチドまたはシグナル伝達分子は、通常、細胞分泌経路を通って細胞外環境におけるそれらの作用部位に到達する。

分泌タンパク質は、医薬品、診断薬、バイオセンサーおよびバイオリアクターを含む様々な産業上の用途を有している。現在利用可能なほとんどのタンパク質薬物（例えば、血栓溶解剤、インターフェロン、インターロイキン、エリトロポイエチン、コロニー刺激因子および様々な他のサイトカイン）は、分泌タンパク質である。膜タンパク質であるそれらのレセプターもまた、治療薬または診断薬としての潜在性を有する。産業界および学術界の両方によって、新規の天然の分泌タンパク質を同定するための努力がなされている。多くの努力は、新規の分泌タンパク質に対するコード配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリーのスクリーニングに着目している。スクリーニングの方法および手法の例は、文献に記載されている［例えば、非特許文献１；特許文献１を参照のこと］。

膜結合タンパク質およびレセプターは、とりわけ、多細胞生物の形成、分化および維持において重要な役割を果たし得る。多くの個々の細胞の運命、例えば、増殖、移動、分化または他の細胞との相互作用は、代表的には他の細胞および／または直属の環境から受ける情報により支配されている。この情報は、分泌ポリペプチド（例えば、分裂促進因子、生存因子、細胞傷害性因子、分化因子、神経ペプチドおよびホルモン）により伝達されることが多く、そのポリペプチドは、その後多様な細胞レセプターまたは膜結合タンパク質により受け、そして解釈される。このような膜結合タンパク質および細胞レセプターとしては、サイトカインレセプター、レセプターキナーゼ、レセプターホスファターゼ、細胞−細胞相互作用に関与するレセプターならびにセレクチンおよびインテグリンのような細胞接着分子が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、細胞の成長および分化を制御するシグナルの伝達は、部分的に、様々な細胞タンパク質のリン酸化により制御される。そのプロセスを触媒する酵素であるタンパク質チロシンキナーゼは、成長因子レセプターとしても機能できる。例としては、線維芽細胞成長因子レセプターおよび神経成長因子レセプターが挙げられる。

膜結合タンパク質およびレセプター分子は、医薬品および診断薬を含む様々な産業上の用途を有している。例えば、レセプター免疫接着は、レセプター−リガンド相互作用を阻止するための治療薬として使用され得る。膜結合タンパク質は、関連するレセプター／リガンド相互作用の潜在的なペプチドまたは小分子のインヒビターのスクリーニングのためにも使用され得る。

産業界および学術界の両方で新規の天然のレセプターまたは膜結合タンパク質を同定するための努力がなされている。多くの努力は、新規のレセプターまたは膜結合タンパク質に対するコード配列を同定するための哺乳動物組換えＤＮＡライブラリーのスクリーニングに着目している。

生物学的過程および疾患の過程における分泌タンパク質および膜結合タンパク質の重要性を鑑みれば、ｉｎ ｖｉｖｏでの研究および特徴づけは、疾患または機能障害の予防、寛解または矯正において有用な治療薬および／または処置法の価値ある同定および発見を提供とし得る。この点に関して、遺伝子操作されたマウスは、免疫学、癌、神経生物学、心臓血管生物学、肥満症および他の多くのものを含むヒトの疾患に関連する生物学的過程の機能的分析のための貴重な道具であることが示されている。遺伝子ノックアウトは高度に特異的なアンタゴニストの活性をｉｎ ｖｉｖｏで予測することにより薬物作用の生物学的機序をモデル化しているものとして捉えることができる。ノックアウトマウスは、薬物の活性をモデル化していることが示されており；特定の薬学的標的タンパク質が欠損したマウスの表現型は、対応するアンタゴニスト薬物によって引き起こされるヒトの臨床表現型を模倣し得る。遺伝子ノックアウトは、標的の作用機序、標的の主要な生理学的役割、および標的の阻害から生じ得る機序に基づいた副作用を哺乳動物において発見可能とする。このタイプの例としては、アンギオテンシン変換酵素（ＡＣＥ）欠損マウス［非特許文献２］およびシクロオキシゲナーゼ−１（ＣＯＸ１）遺伝子欠損マウス［非特許文献３］が挙げられる。逆に、マウスにおいて遺伝子をノックアウトすることは、対応する標的へのアゴニスト剤の投与後にヒトにおいて観察されるものとは逆の表現型作用を有することができる。例としては、変異の結果が赤血球産生不全であるエリトロポイエチンノックアウト［非特許文献４］および変異マウスが活動亢進および応答性亢進を示すＧＡＢＡ（Ａ）−Ｒ−β３ノックアウト［非特許文献５］が挙げられる。これらの表現型は共にヒトにおけるエリトロポイエチンおよびベンゾジアゼピンの投与の作用とは逆である。マウス遺伝学を用いて確証された標的の顕著な例は、ＡＣＣ２遺伝子である。ヒトＡＣＣ２遺伝子は数年前に同定されたが、薬物開発の標的としてのＡＣＣ２への関心は、ノックアウトマウスを用いたＡＣＣ２機能解析後の最近になってようやく活気づいた。ＡＣＣ２変異マウスは、その野生型同腹仔よりも大食であるが、より多くの脂肪を燃焼し、その脂肪細胞中への脂肪の貯留は少ないことから、この酵素は、肥満症の処置における化学的拮抗作用に関する推定標的となる［非特許文献６］。

本出願において、変異した遺伝子の破壊は、ＣＮＳ／神経の撹乱もしくは障害（例えば、不安）；眼の異常および関連疾患；アテローム性動脈硬化症を含む心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；異常な代謝障害（糖尿病および血清中のトリグリセリドおよびコレステロールのレベルの上昇に伴う異脂肪血症を含む）；免疫学的障害および炎症性障害；腫瘍学的障害；骨の代謝の異常もしくは障害（例えば、関節炎、骨粗鬆症および大理石骨病）；または胚性致死などの発達疾患を含む様々な疾患状態または機能障害に関連する表現型の観察結果をもたらした。
米国特許第５，５３６，６３７号明細書 Ｋｌｅｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９３：７１０８−７１１３（１９９６） Ｅｓｔｈｅｒ，Ｃ．Ｒ．ｅｔ ａｌ．，Ｌａｂ．Ｉｎｖｅｓｔ．，７４：９５３−９６５（１９９６） Ｌａｎｇｅｎｂａｃｈ，Ｒ．ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ，８３：４８３−４９２（１９９５） Ｗｕ，Ｃ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ．，８３：５９−６７（１９９６） ＤｅＬｏｒｅｙ，Ｔ．Ｍ．，Ｊ．Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，１８：８５０５−８５１４（１９９８）

（発明の要旨）
Ａ．実施形態
本発明は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。

１つの態様において、前記単離された核酸分子は、（ａ）本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを欠いたアミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを含むか、もしくは含まない、膜貫通タンパク質の細胞外ドメインまたは本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントを有する、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、または（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の相補物に対して、少なくとも約８０％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８１％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８２％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８３％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８４％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８５％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８６％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８７％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８８％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８９％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９０％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９１％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９２％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９３％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９４％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９５％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９６％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９７％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９８％の核酸配列同一性、およびあるいは少なくとも約９９％の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。

他の態様において、前記単離された核酸分子は、（ａ）本明細書中に開示するような全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドｃＤＮＡのコード配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを欠く、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのコード配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを含むか、もしくは含まない、膜貫通型ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの細胞外ドメインのコード配列、または本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントのコード配列を含むＤＮＡ分子、あるいは（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の相補物に対して、少なくとも約８０％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８１％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８２％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８３％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８４％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８５％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８６％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８７％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８８％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８９％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９０％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９１％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９２％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９３％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９４％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９５％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９６％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９７％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９８％の核酸配列同一性および、あるいは少なくとも約９９％の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。

さらなる態様において、本発明は、（ａ）本明細書中に開示するようなＡＴＣＣに寄託されているヒトタンパク質ｃＤＮＡのいずれかによってコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子、または（ｂ）（ａ）のＤＮＡ分子の相補物に対して、少なくとも約８０％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８１％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８２％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８３％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８４％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８５％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８６％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８７％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８８％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約８９％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９０％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９１％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９２％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９３％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９４％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９５％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９６％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９７％の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約９８％核酸配列同一性、およびあるいは少なくとも約９９％の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子に関する。

本発明の別の態様は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供し、それらのポリペプチドは、膜貫通型ドメイン欠失型もしくは膜貫通型ドメイン不活性型のいずれかであるか、またはそのようなコーディングヌクレオチド配列に相補的であり、ここで、そのようなポリペプチドの膜貫通型ドメインを、本明細書中で記載する。したがって、本明細書中に記載される、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの可溶性細胞外ドメインが企図される。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３もしくはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドコード配列またはそれらの相補物のフラグメントも提供し、それらのフラグメントは、例えば、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３もしくは抗ＰＲＯ３５２５０抗体に対する結合部位を含むポリペプチドを必要に応じてコードし得る、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのコーディングフラグメントに対するハイブリダイゼーションプローブまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドプローブとしての用途が見出され得る。このような核酸フラグメントは、通常約１０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１０ヌクレオチド長、あるいは約１５ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１５ヌクレオチド長、あるいは約２０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約２０ヌクレオチド長、あるいは約３０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約３０ヌクレオチド長、あるいは約４０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約４０ヌクレオチド長、あるいは約５０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約５０ヌクレオチド長、あるいは約６０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約６０ヌクレオチド長、あるいは約７０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約７０ヌクレオチド長、あるいは約８０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約８０ヌクレオチド長、あるいは約９０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約９０ヌクレオチド長、あるいは約１００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１００ヌクレオチド長、あるいは約１１０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１１０ヌクレオチド長、あるいは約１２０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１２０ヌクレオチド長、あるいは約１３０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１３０ヌクレオチド長、あるいは約１４０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１４０ヌクレオチド長、あるいは約１５０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１５０ヌクレオチド長、あるいは約１６０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１６０ヌクレオチド長、あるいは約１７０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１７０ヌクレオチド長、あるいは約１８０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１８０ヌクレオチド長、あるいは約１９０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１９０ヌクレオチド長、あるいは約２００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約２００ヌクレオチド長、あるいは約２５０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約２５０ヌクレオチド長、あるいは約３００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約３００ヌクレオチド長、あるいは約３５０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約３５０ヌクレオチド長、あるいは約４００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約４００ヌクレオチド長、あるいは約４５０ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約４５０ヌクレオチド長、あるいは約５００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約５００ヌクレオチド長、あるいは約６００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約６００ヌクレオチド長、あるいは約７００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約７００ヌクレオチド長、あるいは約８００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約８００ヌクレオチド長、あるいは約９００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約９００ヌクレオチド長、およびあるいは約１０００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約１０００ヌクレオチド長であり、ここで、この文脈において、用語「約」とは、参照ヌクレオチド配列の長さ±その参照配列の長さの１０％を意味する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の新規フラグメントは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と他の公知のヌクレオチド配列とを、多くの周知の配列アラインメントプログラムのいずれかを使用してアラインメントして、いずれのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列フラグメントが新規であるかを判定することによって、慣習的な様式で決定され得ることが





注目される。このようなＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のすべてが、本明細書中で企図される。これらのヌクレオチド分子フラグメントによってコードされるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドフラグメント、好ましくは、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体に対する結合部位を含む、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドフラグメントもまた、企図される。

本発明は、本明細書の上で同定された、単離された核酸配列のいずれかによってコードされる、単離されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを提供する。

特定の態様において、本発明は、本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを欠くアミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを含むか、もしくは含まない膜貫通タンパク質の細胞外ドメイン、または本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントを有する、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対して、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８１％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８２％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８３％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８４％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８５％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８６％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８７％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８８％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８９％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９０％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９１％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９２％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９３％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９４％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９５％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９６％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９７％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９８％のアミノ酸配列同一性および、あるいは少なくとも約９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単離されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに関する。

さらなる態様において、本発明は、本明細書中に開示するようなＡＴＣＣに寄託されているヒトタンパク質ｃＤＮＡのいずれかによってコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８１％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８２％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８３％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８４％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８５％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８６％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８７％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８８％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８９％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９０％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９１％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９２％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９３％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９４％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９５％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９６％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９７％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約９８％のアミノ酸配列同一性および、あるいは少なくとも約９９％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、単離されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに関する。

１つの態様において、本発明は、約１０アミノ酸長であるかまたは少なくとも約１０アミノ酸長であるか、あるいは、約２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００アミノ酸長もしくはそれ以上であるか、または少なくとも約２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、 ２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００アミノ酸長またはそれ以上であるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリペプチドに関する。必要に応じて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリペプチドは、ネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列と比較した場合、１つまたはただ１つの保存的アミノ酸置換を有するか、あるいは、ネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列と比較した場合、２、３、４、５、６、７、８、９または１０個またはわずか２、３、４、５、６、７、８、９または１０個の保存的アミノ酸置換を有する。

特定の態様において、本発明は、Ｎ末端のシグナル配列および／または開始メチオニンを有さず、そして、本明細書中の上に記載したようなアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列によってコードされる、単離されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを提供する。同じものを生成するためのプロセスもまた、本明細書中に記載し、そのプロセスは、適切なコード核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物からＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを回収する工程を含む。

別の態様において、本発明は、膜貫通型ドメイン欠失型または膜貫通型ドメイン不活性型のいずれかである、単離されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを提供する。同じものを生成するためのプロセスもまた、本明細書中に記載し、そのプロセスは、適切なコード核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物からＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを回収する工程を含む。

本発明は、本明細書中で定義されるようなネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを提供する。特に、前記アゴニストまたはアンタゴニストは、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３もしくは抗ＰＲＯ３５２５０抗体または小分子である。

本発明は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアゴニストまたはアンタゴニストを同定する方法を提供し、その方法は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを候補分子と接触させる工程および前記ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドによって媒介される生物学的活性をモニターする工程を含む。好ましくは、前記ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、ネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドである。

本発明は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３もしくはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、あるいは本明細書中に記載されるようなＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３もしくはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニスト、あるいは抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を、担体と組み合わせて含む物質の組成物を提供する。必要に応じて、前記担体は、薬学的に許容可能な担体である。

本発明は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体に対して応答性である状態の処置に有用な薬物を調製するための、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３もしくはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、あるいは本明細書中の前に記載されたようなそれらのアゴニストまたはアンタゴニスト、あるいは抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体の使用を提供する。

本発明は、本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかをコードするＤＮＡを含むベクターを提供する。任意のこのようなベクターを含む宿主細胞もまた、提供される。例としては、前記宿主細胞は、ＣＨＯ細胞、Ｅ．ｃｏｌｉまたは酵母であり得る。本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかを生成するためのプロセスがさらに提供され、そのプロセスは、宿主細胞を所望のポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物から所望のポリペプチドを回収する工程を含む。

本発明は、異種性のポリペプチドまたはアミノ酸配列に融合された、本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかを含むキメラ分子を提供する。そのようなキメラ分子の例は、エピトープタグ配列または免疫グロブリンのＦｃ領域に融合された、本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかを含む。

本発明は、好ましくは、上記または下記のポリペプチドのいずれかに特異的に結合する抗体を提供する。必要に応じて、その抗体は、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、抗体フラグメントまたは一本鎖抗体である。

本発明は、ゲノムおよびｃＤＮＡヌクレオチド配列を単離するため、関連遺伝子の発現を測定または検出するために有用であり得るオリゴヌクレオチドプローブまたはアンチセンスプローブとしてのオリゴヌクレオチドプローブを提供し、ここで、それらのプローブは、上記または下記のヌクレオチド配列のいずれかから得られることがある。好ましいプローブの長さは、本明細書中に記載する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；および
（ｃ）測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、ここで、その野生型動物の生理学的特徴と異なる非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する。１つの態様において、非ヒトトランスジェニック動物は、哺乳動物である。別の態様において、前記哺乳動物は、げっ歯類である。さらに別の態様において、前記哺乳動物は、ラットまたはマウスである。１つの態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である。別の態様において、性別一致野生型同腹仔と比較したときの非ヒトトランスジェニック動物によって示される表現型は、以下：神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常のうちの少なくとも１つである。

なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害（ｌｅａｒｎｉｎｇ ｄｉｓｏｒｄｅｒ）／障害（ｄｉｓａｂｉｌｉｔｙ）、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性（ｈｉｓｔｒｏｎｉｃ）、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。

さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症（ｄｙｓｐｌａｉｓａ ｓｐｏｎｄｙｌｏｅｐｉｐｈｙｓａｒｉａ ｃｏｎｇｅｎｔｉａ）、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病（Ａｌｂｅｒｓ−Ｓｃｈｎｏｂｅｒｇ ｄｉｓｅａｓｅ）、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群（Ａｌａｇｉｌｅ ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群（Ｐｉｅｒｒｅ−Ｍａｒｉｅ ｄｕｎｓｄｒｏｍｅ）、スティックラー症候群、カロチン血症（ｃａｒｏｔｉｎｅｍｅｉａ）、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。

さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群（Ｈａｌｌｅｒｍａｎ−Ｓｔｒｅｉｆｆ ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー（Ｔｒｉｓｍｏｙ）１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症（ｈｙｐｏｐａｒａｔｈｒｏｉｄｉｓｍ）またはコンラーディ症候群）である。

さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。

さらになおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。

さらに別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス（ｓｙｓｔｅｍｉｃ ｌｕｐｕｓ ｅｒｙｔｈｅｍａｔｏｓｉｓ）；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性（ｎｏｎ−ｈｅｐａｔｏｔｒｏｐｉｃ）のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。

さらに別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。

別の態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のネイティブＣＤ４Ｔ細胞およびネイティブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のネイティブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ｔｏｔａｌ ｔｉｓｓｕｅ ｍａｓｓ；ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度（ｃｏｎｎｅｃｔｉｖｉｔｙ ｄｅｎｓｉｔｙ）の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症（ｓｙｓｔｅｍｉｃ ｈｉｓｔｉｏｃｙｔｉｃ ｓｔｏｒａｇｅ ｄｉｓｅａｓｅ）；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（ｐａｎｃｒｅａｔｉｃ ｄｙｓｅｒｙｔｈｒｏｐｏｉｅｔｉｃ ａｎｅｍｉａ）（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症（ｈｙｄｒｏｎｅｐｈｏｓｉｓ）；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物から得られた単離された細胞を提供する。１つの態様において、前記単離された細胞は、マウス細胞である。なおも別の態様において、前記マウス細胞は、胚性幹細胞である。さらに別の態様において、前記単離された細胞は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の表現型：神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常のうちの少なくとも１つを示す非ヒトトランスジェニック動物から得られる。本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；
（ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
を含む。

１つの態様において、前記遺伝子の破壊に関連する表現型は、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を含む。

なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害／障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

なおも別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。

さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。

さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である。

さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。

さらに別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。

さらに別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。

さらに別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。

別の態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のネイティブＣＤ４Ｔ細胞およびネイティブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のネイティブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す。

本発明はまた、遺伝子の破壊と関連する表現型を調節する薬剤を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、前記アゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、前記アンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程；
（ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）遺伝子破壊と関連する前記生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
を含む。

１つの態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のネイティブＣＤ４Ｔ細胞およびネイティブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のネイティブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す。

本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、前記アゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、前記アンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程；
（ｃ）（ｂ）の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される観察された行動と異なる、前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）前記薬剤が、遺伝子破壊と関連する前記行動を調節するか否かを判定する工程
を含む。

１つの態様において、前記観察された行動は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記観察された行動は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記観察された行動は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記観察された行動は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記観察された行動は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記観察された行動としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害／障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）前記非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｃ）前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する、前記神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む。

なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害／障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。

さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。

さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である。

さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。

なおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。

さらになおも別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。

なおも別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。

別の態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のネイティブＣＤ４Ｔ細胞およびネイティブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のネイティブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す。

本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常の処置のための治療薬を提供する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程；および
（ｂ）その試験薬剤が、その宿主細胞によるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節しているか否かを判定する工程を含む。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する薬剤を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を評価する方法を提供し、その方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；
（ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する同定された状態に対する前記試験薬剤の作用を評価する工程
を含む。

１つの態様において、前記状態は、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常である。

本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を含む薬学的組成物を提供する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法を提供し、その方法は、前記障害をすでに有し得るか、または前記障害を有する傾向にあり得るか、もしくは前記障害を予防すべき状態であり得る、そのような処置を必要とする被験体に、治療有効量の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害または疾患を効果的に処置または予防または寛解する。

なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害／障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。

さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。

さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である。

さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。

なおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。

さらになおも別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。

なおも別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。

別の態様において、前記治療薬は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は：
（ａ）非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、前記培養物の各細胞は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程；
（ｂ）前記細胞培養に試験薬剤を投与する工程；および
（ｃ）前記試験薬剤が、前記細胞培養物において、前記神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む。

なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害／障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。

さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。

さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である。

さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。

なおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。

さらになおも別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。

なおも別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。

本発明はまた、前記培養物中の遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を提供する。１つの態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法を提供し、その方法は、前記表現型をすでに有し得るか、または前記表現型を有する傾向にあり得るか、もしくは前記表現型を予防すべき状態であり得る被験体に、前記表現型を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記表現型を効果的に調節する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法を提供し、その方法は、前記生理学的特徴をすでに示し得るか、または前記生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは前記生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、前記生理学的特徴を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記生理学的特徴を効果的に調節する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する方法を提供し、その方法は、前記行動をすでに示し得るか、または前記行動を示す傾向にあり得るか、もしくは前記示される行動を予防すべき状態であり得る被験体に、前記行動を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記行動を効果的に調節する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する方法を提供し、その方法は、前記ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現している宿主細胞に、前記発現を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、前記ポリペプチドの発現を効果的に調節する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法を提供し、その方法は、前記状態を有し得るか、または前記状態を有する傾向にあり得るか、もしくは前記状態を予防すべき状態であり得る被験体に、前記状態を調節すると同定された治療有効量の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記状態を効果的に調節する。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害、または胚性致死を処置または予防または寛解する方法を提供し、その方法は、各細胞がＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、前記障害を処置または予防または寛解すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する。

Ｂ．さらなる実施形態
なおもさらなる実施形態において、本発明は、本出願に係る潜在的な項目の以下のセットに関する：
１．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、本方法は、
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；および
（ｃ）前記測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、
ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、方法。

２．前記非ヒトトランスジェニック動物が、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、請求項１に記載の方法。

３．性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記表現型が、以下：神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常のうちの少なくとも１つである、請求項１に記載の方法。

４．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項３に記載の方法。

５．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項３に記載の方法。

６．前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項３に記載の方法。

７．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項３に記載の方法。

８．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項３に記載の方法。

９．前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項３に記載の方法。

１０．前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項３に記載の方法。

１１．前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項３に記載の方法。

１２．前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項１０に記載の方法。

１３．前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項１０に記載の方法。

１４．前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項１０に記載の方法。

１５．前記眼の異常が、白内障である、請求項３に記載の方法。

１６．前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）と一致する、請求項１５に記載の方法。

１７．前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項３に記載の方法。

１８．前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項３に記載の方法。

１９．前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項３に記載の方法。

２０．前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項３に記載の方法。

２１．前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項１に記載の方法。

２２．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物由来の単離細胞。

２３．マウス細胞である、請求項２２に記載の単離細胞。

２４．前記マウス細胞が、胚性幹細胞である、請求項２３に記載の単離細胞。

２５．性別一致野生型同腹仔と比較して、前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型：神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常のうちの少なくとも１つを示す、請求項２２に記載の単離細胞。

２６．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；
（ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する前記同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。

２７．前記遺伝子破壊と関連する前記表現型が、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常または障害；脂質代謝障害；または発達異常を含む、請求項２６に記載の方法。

２８．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項２７に記載の方法。

２９．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項２７に記載の方法。

３０．前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項２７に記載の方法。

３１．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項２７に記載の方法。

３２．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項２７に記載の方法。

３３．前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項２７に記載の方法。

３４．前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項２７に記載の方法。

３５．前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項２７に記載の方法。

３６．前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項３４に記載の方法。

３７．前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項３４に記載の方法。

３８．前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項３４に記載の方法。

３９．前記眼の異常が、白内障である、請求項２７に記載の方法。

４０．前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）と一致する、請求項３９に記載の方法。

４１．前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項２７に記載の方法。

４２．前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項２７に記載の方法。

４３．前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項２７に記載の方法。

４４．前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項２７に記載の方法。

４５．前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項２６に記載の方法。

４６．請求項２６に記載の方法によって同定される薬剤。

４７．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項４６に記載の薬剤。

４８．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項４７に記載の薬剤。

４９．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項４７に記載の薬剤。

５０．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程；
（ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）遺伝子破壊と関連する前記生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
を含む、方法。

５１．前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項５０に記載の方法。

５２．請求項５０に記載の方法によって同定される薬剤。

５３．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項５２に記載の薬剤。

５４．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項５３に記載の薬剤。

５５．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項５３に記載の薬剤。

５６．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程；
（ｃ）（ｂ）の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される前記観察された行動と異なる、前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）前記薬剤が、遺伝子破壊と関連する前記行動を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。

５７．前記行動が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項５６に記載の方法。

５８．前記行動が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項５６に記載の方法。

５９．前記行動が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項５６に記載の方法。

６０．前記行動が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項５６に記載の方法。

６１．前記行動が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項５６に記載の方法。

６２．前記行動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項５６に記載の方法。

６３．請求項５６に記載の方法によって同定される薬剤。

６４．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項６３に記載の薬剤。

６５．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項６４に記載の薬剤。

６６．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項６４に記載の薬剤。

６７．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）前記非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｃ）前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物において、前記神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。

６８．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項６７に記載の方法。

６９．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項６７に記載の方法。

７０．前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項６７に記載の方法。

７１．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項６７に記載の方法。

７２．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項６７に記載の方法。

７３．前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項６７に記載の方法。

７４．前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項６７に記載の方法。

７５．前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項６７に記載の方法。

７６．前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項７４に記載の方法。

７７．前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項７４に記載の方法。

７８．前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項７４に記載の方法。

７９．前記眼の異常が、白内障である、請求項６７に記載の方法。

８０．前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である、請求項７９に記載の方法。

８１．前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項６７に記載の方法。

８２．前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項６７に記載の方法。

８３．前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項６７に記載の方法。

８４．前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項６７に記載の方法。

８５．前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項６７に記載の方法。

８６．請求項６７に記載の方法によって同定される薬剤。

８７．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項８６に記載の薬剤。

８８．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項８７に記載の薬剤。

８９．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項８７に記載の薬剤。

９０．請求項６７に記載の方法によって同定される治療薬。

９１．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は：
（ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程；および
（ｂ）前記試験薬剤が、前記宿主細胞による前記ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。

９２．請求項９１に記載の方法によって同定される薬剤。

９３．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項９２に記載の薬剤。

９４．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９３に記載の薬剤。

９５．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９３に記載の薬剤。

９６．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を評価する方法であって、前記方法は：
（ａ）前記ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
（ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；
（ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程；
（ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
（ｅ）前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する前記同定された状態に対する前記試験薬剤の作用を評価する工程
を含む、方法。

９７．前記状態が、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常または障害；脂質代謝障害；または発達異常である、請求項９６に記載の方法。

９８．請求項９６に記載の方法によって同定される治療薬。

９９．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項９８に記載の治療薬。

１００．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４，抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９９に記載の治療薬。

１０１．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗 ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９９に記載の治療薬。

１０２．請求項９８に記載の治療薬を含む薬学的組成物。

１０３．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、前記方法は、前記障害をすでに有し得るか、または前記障害を有する傾向にあり得るか、もしくは前記障害を予防すべき状態であり得る、そのような処置を必要とする被験体に、治療有効量の請求項９４に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。

１０４．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項１０３に記載の方法。

１０５．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項１０３に記載の方法。

１０６．前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項１０３に記載の方法。

１０７．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項１０３に記載の方法。

１０８．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項１０３に記載の方法。

１０９．前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項１０３に記載の方法。

１１０．前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項１０３に記載の方法。

１１１．前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項１０３に記載の方法。

１１２．前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項１１０に記載の方法。

１１３．前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項１１０に記載の方法。

１１４．前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項１１０に記載の方法。

１１５．前記眼の異常が、白内障である、請求項１０３に記載の方法。

１１６．前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である、請求項１１５に記載の方法。

１１７．前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項１０３に記載の方法。

１１８．前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項１０３に記載の方法。

１１９．前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項１０３に記載の方法。

１２０．前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項１０３に記載の方法。

１２１．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮または血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常または障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は：
（ａ）非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、前記培養物の各細胞は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程；
（ｂ）前記細胞培養に試験薬剤を投与する工程；および
（ｃ）前記試験薬剤が、前記細胞培養物において、前記神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。

１２２．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項１２１に記載の方法。

１２３．前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項１２１に記載の方法。

１２４．前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項１２１に記載の方法。

１２５．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項１２１に記載の方法。

１２６．前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項１２１に記載の方法。

１２７．前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項１２１に記載の方法。

１２８．前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項１２１に記載の方法。

１２９．前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項１２１に記載の方法。

１３０．前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項１２８に記載の方法。

１３１．前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項１２８に記載の方法。

１３２．前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項１２８に記載の方法。

１３３．前記眼の異常が、白内障である、請求項１２１に記載の方法。

１３４．前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である、請求項１３３に記載の方法。

１３５．前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項１２１に記載の方法。

１３６．前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項１２１に記載の方法。

１３７．前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項１２１に記載の方法。

１３８．前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項１２１に記載の方法。

１３９．請求項１２１に記載の方法によって同定される薬剤。

１４０．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項１３９に記載の薬剤。

１４１．前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項１４０に記載の薬剤。

１４２．前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項１４０に記載の薬剤。

１４３．請求項１２１に記載の方法によって同定される治療薬。

１４４．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、前記方法は、前記表現型をすでに有し得るか、または前記表現型を有する傾向にあり得るか、もしくは前記表現型を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項４６に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記表現型を効果的に調節する、方法。

１４５．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、前記方法は、前記生理学的特徴をすでに示し得るか、または前記生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは前記生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項５２に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記生理学的特徴を効果的に調節する、方法。

１４６．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する方法であって、前記方法は、前記行動をすでに示し得るか、または前記行動を示す傾向にあり得るか、もしくは前記示される行動を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項６３に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記行動を効果的に調節する、方法。

１４７．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ２８５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する方法であって、前記方法は、前記ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現している宿主細胞に、有効量の請求項９２に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、前記ポリペプチドの発現を効果的に調節する、方法。

１４８．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、前記方法は、前記状態を有し得るか、または前記状態を有する傾向にあり得るか、もしくは前記状態を予防すべき状態であり得る被験体に、治療有効量の請求項９８に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記状態を効果的に調節する、方法。

１４９．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、前記方法は、各細胞がＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、治療有効量の請求項１３９に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。

（好ましい実施形態の詳細な説明）
Ｉ．定義
用語「ＰＲＯポリペプチド」および「ＰＲＯ」とは、本明細書中で使用されるとき、および番号の表記が直後に来る場合は、種々のポリペプチドのことをいい、ここで完全な表記（すなわちＰＲＯ／番号）は本明細書に記載する特定のポリペプチド配列のことをいう。用語「ＰＲＯ／番号ポリペプチド」および「ＰＲＯ／番号」（ここで、用語「番号」が本明細書中で使用される実際の番号の表記として提示される）は、ネイティブの配列のポリペプチドおよびポリペプチド改変体（これは本明細書においてさらに定義する）を包含する。本明細書に記載するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは種々の起源（例えば、ヒト組織型または他の原料）から単離され得るか、または、組換え法または合成法により調製され得る。用語「ＰＲＯポリペプチド」とは、本明細書に開示した各々の個々のＰＲＯ／番号ポリペプチドのことをいう。「ＰＲＯポリペプチド」にあてはまる本明細書中のすべての開示は、ポリペプチドの各々を、個別にならびに総括していう。例えば、その調製、精製、誘導、それに対する抗体の形成、その投与、それを含有する組成物、それによる疾患の処置に関する記載などは本発明のポリペプチドの各々に個別に関するものである。用語「ＰＲＯポリペプチド」はまた、本明細書に開示したＰＲＯ／番号ポリペプチドの改変体を含む。

「ネイティブ配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド」は、自然界から得られる対応するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと同じアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。そのようなネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、自然界から単離することができるか、または、組換えまたは合成手段により製造できる。用語「ネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド」は、特に特定のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの天然に存在する切断型または分泌型（例えば、細胞外ドメイン配列）、前記ポリペプチドの天然に存在する改変体型（例えば、選択的スプライシングされた形態）および天然に存在する対立遺伝子改変体を包含する。本発明は、添付図面に示す完全長のアミノ酸配列を含む成熟または完全長のネイティブ配列ポリペプチドである本明細書に開示されたネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを提供する。開始コドンおよび終止コドンは、図面中では太字で示し、下線を付した。しかしながら、添付図面において開示したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは図面中でアミノ酸１位として本明細書において表記したメチオニン残基で開始するように示されているが、図面中のアミノ酸１位よりも上流または下流に位置する他のメチオニン残基もＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのための開始アミノ酸残基として使用され得ると考えられ、その可能性がある。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの「細胞外ドメイン」または「ＥＣＤ」とは、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインを本質的に含まないＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの形態のことをいう。通常は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのＥＣＤは、そのような膜貫通ドメインおよび／または細胞質ドメインの１％未満を有し、好ましくはそのようなドメインの０．５％未満を有する。本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドについて同定されるいずれの膜貫通ドメインも疎水性ドメインのこのような型を同定するために当該分野で日常的に使用されている基準に従って同定される。膜貫通ドメインの厳密な境界は変動し得るが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたドメインのいずれかの末端において約５アミノ酸を超えないものである。したがって、必要に応じて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの細胞外ドメインは実施例または明細書において同定される膜貫通ドメイン／細胞外ドメインの境界のいずれかの側において約５個以下のアミノ酸を含んでよく、付随するシグナルペプチドを含むか含まないそのようなポリペプチドおよびそれらをコードする核酸は、本発明により企図される。

本明細書に開示した様々なＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの「シグナルペプチド」のおよその位置は、本明細書および／または添付図面に示す。しかしながら、シグナルペプチドのＣ末端の境界は、変動し得るが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたシグナルペプチドのＣ末端の境界のいずれかの側において約５アミノ酸を超えないものであり、ここでそのシグナルペプチドのＣ末端の境界は、アミノ酸配列エレメントのそのような型を同定するために当該分野で日常的に使用されている基準に従って同定され得る（例えば、Ｎｉｅｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔ．Ｅｎｇ．１０：１−６（１９９７）およびｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．１４：４６８３−４６９０（１９８６））。さらに、いくつかの場合において、分泌ポリペプチドからのシグナル配列の切断は、完全に均一ではなく、２つ以上の分泌種をもたらす。これらの成熟ポリペプチド（シグナルペプチドは、本明細書において同定されたシグナルペプチドのＣ末端の境界のいずれかの側の約５アミノ酸以内において切断されている）およびそれらをコードするポリヌクレオチドは、本発明により企図される。

「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド改変体」とは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、好ましくは、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有する、本明細書中で定義される活性なＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、本明細書中で開示する全長ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列と、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠くＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの細胞外ドメイン、または本明細書中で開示する全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列の他の任意のフラグメント（全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドについての完全なコード配列の一部のみを表す核酸によってコードされるものなど）のことを意味する。そのようなＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１





７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド改変体としては、例えば、全長ネイティブアミノ酸配列のＮ末端またはＣ末端において１以上のアミノ酸残基が付加または欠失しているＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが挙げられる。通常、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド改変体は、本明細書中で開示する全長ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠くＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの細胞外ドメイン、または本明細書中で開示する全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列の他の特別に定義される任意のフラグメントに対して、約８０％のアミノ酸配列同一性を有するかまたは少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有するか、あるいは、約８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％もしくは９９％のアミノ酸配列同一性を有するかまたは少なくとも約８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％もしくは９９％のアミノ酸配列同一性を有する。通常、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリペプチドは、約１０アミノ酸長であるかまたは少なくとも約１０アミノ酸長であるか、あるいは、約２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００アミノ酸長もしくはそれ以上であるかまたは少なくとも約２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、 ２００、２１０、２２０、２３０、２





４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００アミノ酸長もしくはそれ以上である。必要に応じて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリペプチドは、ネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列と比較して、ただ１つの保存的アミノ酸置換を有するか、あるいはネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列と比較して、２、３、４、５、６、７、８、９または１０個またはわずか２、３、４、５、６、７、８、９または１０個の保存的アミノ酸置換を有する。

本明細書において同定されるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列に関して「パーセント（％）アミノ酸配列同一性」とは、最大パーセントの配列同一性を達成するように必要に応じて配列をアラインメントし、ギャップを導入した後に、いかなる保存的置換も配列同一性の部分とはみなさない場合に、特定のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の範囲内の様々な方法、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア（例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ−２、ＡＬＩＧＮまたはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア）を用いて達成することができる。当業者は、比較すべき配列の完全長に亘って最大アラインメントを達成するために必要ないずれかのアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書の目的のためには、％アミノ酸同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムＡＬＩＧＮ−２を用いて生成し、ここでＡＬＩＧＮ−２プログラムに関する完全なソースコードを以下の表１に示す。ＡＬＩＧＮ−２配列比較コンピュータプログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．により作成され、そして以下の表１に示すソースコードは、米国著作権局Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｄ．Ｃ．，２０５５９においてユーザー文書と共に提出されており、米国著作権登録番号ＴＸＵ５１００８７として登録されている。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．，Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａから公的に入手することができ、または、以下の表１に示すソースコードからコンパイルしてもよい。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、ＵＮＩＸ（登録商標）オペレーティングシステム、好ましくはデジタルＵＮＩＸ（登録商標）Ｖ４．０Ｄ上で使用するためにコンパイルしなければならない。すべての配列比較パラメータはＡＬＩＧＮ−２プログラムにより設定され、変更しない。

アミノ酸配列比較のためにＡＬＩＧＮ−２を使用する場合において、所与のアミノ酸配列Ｂに対する所与のアミノ酸配列Ａの％アミノ酸配列同一性（これは代替として、所与のアミノ酸配列Ｂに対する特定の％アミノ酸配列同一性を有するか、または含む所与のアミノ酸配列Ａと表現できる）は、以下のとおり：
１００×分数Ｘ／Ｙ
［式中、Ｘは、ＡおよびＢのプログラムのアラインメントにおいて配列アラインメントプログラムＡＬＩＧＮ−２により同一で一致とスコア付けされたアミノ酸残基の数であり、Ｙは、Ｂにおけるアミノ酸残基の総数である］計算される。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの長さと等しくない場合は、Ｂに対するＡの％アミノ酸配列同一性は、Ａに対するＢの％アミノ酸配列同一性と等しくならないことが理解されるだろう。この方法を用いた％アミノ酸配列同一性の計算の例として、表２および３は、「ＰＲＯ」と表記したアミノ酸配列に対する「比較タンパク質」と表記したアミノ酸配列の％アミノ酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「ＰＲＯ」は、目的の仮説ＰＲＯポリペプチドのアミノ酸配列を示し、「比較タンパク質」は、目的の「ＰＲＯ」ポリペプチドを比較する相手であるポリペプチドのアミノ酸配列を示し、そして「Ｘ」、「Ｙ」および「Ｚ」は、各々異なる仮説アミノ酸残基を示す。他に特段の記載がない限り、本明細書で使用するすべての％アミノ酸配列同一性の値は、ＡＬＩＧＮ−２コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。

「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリヌクレオチド」または「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体核酸配列」とは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、好ましくは本明細書に定義する活性なＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードし、そして、本明細書中で開示する完全長のネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠く完全長のネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの細胞外ドメイン、または、本明細書中で開示する完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列の他の任意のフラグメント（例えば、完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ





４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドについての完全なコード配列の一部分のみを示す核酸によりコードされるもの）をコードするヌクレオチド酸配列に対して、少なくとも約８０％の核酸配列同一性を有する核酸分子を意味する。通常、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリヌクレオチドは、本明細書中で開示する完全長のネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠く完全長のネイティブの配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの細胞外ドメイン、または、本明細書中で開示する完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド配列の他の任意のフラグメントをコードする核酸配列に対して、約８０％の核酸配列同一性を有するか、または少なくとも約８０％の核酸配列同一性を有するか、あるいは、約８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％もしくは９９％の核酸配列同一性を有するか、または少なくとも約８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％もしくは９９％の核酸配列同一性を有する。改変体は、ネイティブヌクレオチド配列を包含しない。

通常、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリヌクレオチドは、約５ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約５ヌクレオチド長であるか、あるいは、約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１１５、１２０、１２５、１３０、１３５、１４０、１４５、１５０、１５５、１６０、１６５、１７０、１７５、１８０、１８５、１９０、１９５、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００、６１０、６２０、６３０、６４０、６５０、６６０、６７０、６８０、６９０、７００、７１０、７２０、７３０、７４０、７５０、７６０、７７０、７８０、７９０、８００、８１０、８２０、８３０、８４０、８５０、８６０、８７０、８８０、８９０、９００、９１０、９２０、９３０、９４０、９５０、９６０、９７０、９８０、９９０または１０００ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１０５、１１０、１１５、１２０、１２５、１３０、１３５、１４０、１４５、１５０、１５５、１６０、１６５、１７０、１７５、１８０、１８５、１９０、１９５、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、５００、５１０、５２０、５３０、５４０、５５０、５６０、５７０、５８０、５９０、６００、６１０、６２０、６３０、６４０、６５０、６６０、６７０、６８０、６９０、７００、７１０、７２０、７３０、７４０、７５０、７６０、７７０、７８０、７９０、８００、８１０、８２０、８３０、８４０、８５０、８６０、８７０、８８０、８９０、９００、９１０、９２０、９３０、９４０、９５０、９６０、９７０、９８０、９９０または１０００ヌクレオチド長であり、ここで、この文脈において、用語「約」は、参照ヌクレオチド配列長±その参照した長さの１０％を意味する。

本明細書において同定される、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード核酸配列に関する「パーセント（％）核酸配列同一性」とは、最大パーセントの配列同一性を達成するように必要に応じて配列をアラインメントし、ギャップを導入した後に、目的のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０核酸配列中のヌクレオチドと同一である候補配列中のヌクレオチドのパーセンテージとして定義される。パーセント核酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の範囲内の様々な方法、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア（例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ−２、ＡＬＩＧＮまたはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア）を用いて達成することができる。しかしながら、本明細書の目的のためには、％核酸同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムＡＬＩＧＮ−２を用いて生成し、ここでＡＬＩＧＮ−２プログラムに関する完全なソースコードを以下の表１に示す。ＡＬＩＧＮ−２配列比較コンピュータプログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．により作成され、そして以下の表１に示すソースコードは、米国著作権局Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｄ．Ｃ．，２０５５９においてユーザー文書と共に提出されており、米国著作権登録番号ＴＸＵ５１００８７として登録されている。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．，Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａから公的に入手することができ、または、以下の表１に示すソースコードからコンパイルしてもよい。ＡＬＩＧＮ−２プログラムは、ＵＮＩＸ（登録商標）オペレーティングシステム、好ましくはデジタルＵＮＩＸ（登録商標）Ｖ４．０Ｄ上で使用するためにコンパイルしなければならない。すべての配列比較パラメータはＡＬＩＧＮ−２プログラムにより設定され、変更しない。

核酸配列比較のためにＡＬＩＧＮ−２を使用する場合において、所与の核酸配列Ｄに対する所与の核酸配列Ｃの％核酸配列同一性（これは代替として、所与の核酸配列Ｄに対する特定の％核酸配列同一性を有するか、または含む所与の核酸配列Ｃと表現できる）は、以下のとおり：
１００×分数Ｗ／Ｚ
［式中、Ｗは、ＣおよびＤのプログラムのアラインメントにおいて配列アラインメントプログラムＡＬＩＧＮ−２により同一で一致とスコア付けされたヌクレオチドの数であり、Ｚは、Ｄにおけるヌクレオチドの総数である］計算される。核酸配列Ｃの長さが核酸配列Ｄの長さと等しくない場合は、Ｄに対するＣの％核酸配列同一性は、Ｃに対するＤの％核酸配列同一性と等しくならないことが理解されるだろう。％核酸配列同一性の計算の例として、表４および５は、「ＰＲＯ−ＤＮＡ」と表記した核酸配列に対する「比較ＤＮＡ」と表記した核酸配列の％核酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「ＰＲＯ−ＤＮＡ」は、目的の仮説ＰＲＯコード核酸配列を示し、「比較タンパク質」は、目的の「ＰＲＯ−ＤＮＡ」核酸分子を比較する相手である核酸分子の核酸配列を示し、そして「Ｎ」、「Ｌ」および「Ｖ」は、各々異なる仮説ヌクレオチドを示す。他に特段の記載がない限り、本明細書で使用するすべての％核酸配列同一性の値は、ＡＬＩＧＮ−２コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。

本発明はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする核酸分子であり、そして、本明細書中で開示する完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に、好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下および洗浄条件下でハイブリダイズすることができるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリヌクレオチドを提供する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリペプチドは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ポリヌクレオチドによりコードされるものであり得る。

用語「完全長コード領域」とは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする核酸を言及する際に使用する場合、本発明の完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチドの配列のことをいう（これは、添付図面において開始コドンと終止コドン（それらを含む）との間に示される場合が多い）。用語「完全長コード領域」とは、ＡＴＣＣ寄託核酸を言及する際に使用する場合、ＡＴＣＣに寄託されているベクター内に挿入されているｃＤＮＡのうちＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする部分のことをいう（これは、添付図面において開始コドンと終止コドン（それらを含む）との間に示される場合が多い）。

「単離された」とは、本明細書中で開示する様々なポリペプチドを説明するために用いる場合、その天然の環境の成分中から同定および分離および／または回収されたポリペプチドを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、代表的にはポリペプチドの診断または治療上の使用を妨害する物質であり、それらとしては、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質性または非タンパク質性の溶質が挙げられ得る。本発明は（１）スピニングカップ（ｓｐｉｎｎｉｎｇ ｃｕｐ）配列決定装置を用いてＮ末端または内部のアミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度まで、または（２）クマシーブルー染色もしくは好ましくは銀染色を用いた非還元または還元条件下のＳＤＳ−ＰＡＧＥによる均質性となるように、ポリペプチドが精製されることを可能とする。単離されたポリペプチドは組換え細胞内のｉｎ ｓｉｔｕのポリペプチドを包むが、その理由はＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの天然の環境の成分の少なくとも１つの成分が存在しないためである。しかしながら通常は、単離されたポリペプチドは、少なくとも１つの精製工程により調製される。

「単離された」ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドコード核酸または他のポリペプチドコード核酸は、ポリペプチドコード核酸の天然の起源において通常関連する少なくとも１つの夾雑核酸分子から同定され、分離される核酸分子である。単離されたポリペプチドコード核酸分子は、自然界にそれが存在する形態または状態以外のものである。したがって、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、天然の細胞内にそれが存在する場合、特定のポリペプチドコード核酸分子とは区別される。しかしながら、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、例えば、その核酸分子が天然の細胞のものとは異なる染色体位置にある場合、通常そのポリペプチドを発現する細胞に含まれるポリペプチドコード核酸分子を包む。

用語「調節配列」は、特定の宿主生物中の作動可能に連結されたコード配列の発現のために必要なＤＮＡ配列のことをいう。例えば、原核生物に適した調節配列は、プロモーター、必要に応じてオペレーター配列およびリボソーム結合部位を包む。真核生物の細胞は、プロモーター、ポリアデニル化シグナルおよびエンハンサーを利用することが知られている。

核酸は、それが別の核酸配列との機能的関連性の内部におかれる場合に「作動可能に連結」されている。例えば、プレ配列または分泌リーダーに対するＤＮＡは、それがポリペプチドの分泌に関与するプレタンパク質として発現される場合にはそのポリペプチドに対するＤＮＡに作動可能に連結されており；プロモーターもしくはエンハンサーは、それが配列の転写に影響する場合にはコード配列に作動可能に連結されており；または、リボソーム結合部位は、それが翻訳を促進するように位置付けられている場合にコード配列に作動可能に連結されている。一般的に「作動可能に連結された」とは、連結されるＤＮＡ配列が隣接しており、そして、分泌リーダーの場合は隣接し、かつリーディングフェーズにあることを意味する。しかしながら、エンハンサーは、隣接している必要はない。連結は、好都合な制限部位におけるライゲーションにより達成される。そのような部位が存在しない場合は、合成オリゴヌクレオチドアダプターまたはリンカーを従来の慣行に従って使用する。

ハイブリダイゼーション反応の「ストリンジェンシー」とは、当業者が容易に決定できるものであり、一般的にプローブ長、洗浄温度および塩濃度に依存した実験的計算値である。一般に、長いプローブほど適切なアニーリングのためにより高温を必要とし、短いプローブほどより低温を必要とする。ハイブリダイゼーションは、一般に、相補鎖がその融点より低温の環境中に存在する場合、変性したＤＮＡが再アニーリングする能力に依存する。プローブとハイブリダイズ可能な配列との間の所望の相同性の程度が高いほど、使用できる相対温度は高くなる。その結果、より高い相対温度は、反応条件をよりストリンジェントとする傾向があり、より低い温度は、その傾向が小さい。ハイブリダイゼーション反応のストリンジェンシーに関するさらなる詳細および説明については、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，（１９９５）を参照のこと。

「ストリンジェントな条件」または「高ストリンジェンシー条件」とは、本明細書において定義する場合、（１）低いイオン強度および高い洗浄温度、例えば、０．０１５Ｍ塩化ナトリウム／０．００１５Ｍクエン酸ナトリウム／０．１％ドデシル硫酸ナトリウムを５０℃において使用するか；（２）ハイブリダイゼーションの間、ホルムアミドなどの変性剤、例えば、５０％（ｖ／ｖ）ホルムアミド＋０．１％ウシ血清アルブミン／０．１％Ｆｉｃｏｌｌ／０．１％ポリビニルピロリドン／５０ｍＭリン酸ナトリウム緩衝液ｐＨ６．５＋７５０ｍＭ塩化ナトリウム、７５ｍＭクエン酸ナトリウムを４２℃で使用するか；または（３）５０％ホルミアミド、５×ＳＳＣ（０．７５Ｍ ＮａＣｌ、０．０７５Ｍクエン酸ナトリウム）、５０ｍＭリン酸ナトリウム（ｐＨ６．８）、０．１％ピロリン酸ナトリウム、５×Ｄｅｎｈａｒｄｔ溶液、超音波処理サケ精子ＤＮＡ（５０μｇ／ｍＬ）、０．１％ＳＤＳおよび１０％デキストラン硫酸を４２℃で使用し、そして洗浄は４２℃で０．２×ＳＳＣ（塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム）および５５℃の５０％ホルムアミド、その後５５℃のＥＤＴＡ含有０．１×ＳＳＣからなる高ストリンジェンシー洗浄条件を使用するものとして特定され得る。

「中等度にストリンジェントな条件」とは、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ；Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，１９８９による説明と同一と考えてよく、そして、上記したものより低ストリンジェントな洗浄溶液およびハイブリダイゼーションの条件（例えば、温度、イオン強度および％ＳＤＳ）の使用を包む。中等度にストリンジェントな条件の例は、２０％ホルムアミド、５×ＳＳＣ（１５０ｍＭ ＮａＣｌ、１５ｍＭクエン酸三ナトリウム）、５０ｍＭリン酸ナトリウム（ｐＨ７．６）、５×Ｄｅｎｈａｒｄｔ溶液、１０％デキストラン硫酸および２０ｍｇ／ｍＬ変性撹拌サケ精子ＤＮＡを含む溶液中３７℃での一晩のインキュベーションおよびその後の約３７〜５０℃における１×ＳＳＣ中フィルターの洗浄である。プローブ長などのような因子を適合させるために必要に応じて温度、イオン強度などを調節する方法は当業者の認識する通りである。

用語「エピトープタグ化された」とは、本明細書中で使用されるとき、「タグポリペプチド」に融合されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを含むキメラポリペプチドのことをいう。タグポリペプチドは、対応する抗体が作製できるエピトープを提供するために十分な残基を有するが、融合相手のポリペプチドの活性を妨害しないくらい短い。タグポリペプチドは、好ましくは抗体が他のエピトープと実質的に交差反応しないほど高度に特有のものである。適当なタグポリペプチドは、一般に少なくとも６アミノ酸残基、そして通常は約８〜５０アミノ酸残基（好ましくは約１０〜２０アミノ酸残基）を有する。

「活性な」または「活性」とは、本明細書の目的では、ネイティブまたは天然に存在するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの生物学的および／または免疫学的な活性を保持するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの形態のことをいい、ここで、「生物学的」活性とは、ネイティブまたは天然に存在するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが有する抗原性エピトープに対する抗体の産生を誘導する能力以外のネイティブまたは天然に存在するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドによって引き起こされる生物学的機能（抑制性または促進性のいずれか）のことをいい、そして「免疫学的」活性とは、ネイティブまたは天然に存在するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが有する抗原性エピトープに対する抗体の産生を誘導する能力のことをいう。

用語「アンタゴニスト」は、［特段の制限がない限り］最も広範な意味において使用され、そして本明細書中で開示するネイティブのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの生物学的活性を部分的または完全に阻止、抑制または中和する任意の分子を含む。同様の様式において、用語「アゴニスト」は、［特段の制限がない限り］最も広範な意味において使用され、そして本明細書中で開示するネイティブのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの生物学的活性を模倣する任意の分子を包む。適当なアゴニスト分子またはアンタゴニスト分子は、特にネイティブのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ペプチド、アンチセンスオリゴヌクレオチド、有機小分子などのアゴニストもしくはアンタゴニスト抗体または抗体フラグメント、フラグメントあるいはアミノ酸配列改変体を包む。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストを同定するための方法は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを候補アゴニスト分子または候補アンタゴニスト分子に接触させる工程およびＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに通常関連している１以上の生物学的活性の検出可能な変化を測定する工程を含み得る。

「処置する」または「処置」または「軽減」とは、治療的な施療および予防的または防止的な手段の両方のことをいい、ここで、その目的は、ターゲティングされた病的状態または障害を予防するか緩徐化（低減）することである。処置を必要とする被験体は、すでに疾患を有し得るか、または、疾患を有する傾向にあり得るか、もしくは疾患を予防すべき状態であり得る。

「長期」投与とは、長期間に亘り初期の処置効果（活性）を維持するために短期の様式とは逆の持続的な様式における薬剤の投与のことをいう。「間欠的」投与は中断なく連続的に行われるのではなく、周期的な性質を有する処置である。

「哺乳動物」とは、処置の目的のためには、哺乳動物に分類される任意の動物のことをいい、それらとしては、ヒト、ラットまたはマウスなどのげっ歯類、家畜および牧場動物および動物園、競技用または愛玩用の動物、例えば、イヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ウサギなどが挙げられる。好ましくは、哺乳動物は、ヒトである。

さらなる１以上の処置薬と「組み合わせた」投与は、同時（併用）および任意の順序での連続投与を包む。

「担体」とは、本明細書中で使用されるとき、使用する用量および濃度において曝露対象となる細胞または哺乳動物に対して非毒性である薬学的に許容可能な担体、賦形剤または安定化剤を包む。生理学的に許容可能な担体は、水性のｐＨ緩衝溶液であることが多い。生理学的に許容可能な担体の例としては、緩衝剤（例えば、リン酸塩、クエン酸塩および他の有機酸）；アスコルビン酸を含む抗酸化剤；低分子量（約１０残基未満）のポリペプチド；タンパク質（例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン）；ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー；アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンまたはリシン）；グルコース、マンノースまたはデキストリンを含む、単糖類、二糖類および他の炭水化物；ＥＤＴＡなどのキレート化剤；マンニトールおよびソルビトールなどの糖アルコール；ナトリウムなどの塩形成対イオン；ならびに／または非イオン性界面活性剤、例えばＴＷＥＥＮ^ＴＭ、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）およびＰＬＵＲＯＮＩＣＳ^ＴＭが挙げられる。

「固相」とは、本発明の抗体が接着できる非水性マトリックスを意味する。本明細書において包含される固相の例としては、ガラス（例えば、細孔性ガラス）、多糖類（例えば、アガロース）、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、ポリビニルアルコールおよびシリコーンから部分的または完全に形成されているものが挙げられる。文脈に応じて、固相は、アッセイプレートのウェルを含み得；他の場合は精製カラム（例えば、アフィニティークロマトグラフィーカラム）である。この用語はまた、米国特許第４，２７５，１４９号に記載されているものなどの個々の粒子の不連続な固相を含む。

「リポソーム」とは、哺乳動物への薬剤（例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはそれに対する抗体）の送達のために有用な脂質、リン脂質および／または界面活性剤の様々な型から構成される小型ベシクルである。リポソームの成分は生物学的膜の脂質の配置と同様に、二層を形成して通常配置される。

「小分子」とは、約５００ダルトン未満の分子量を有するものとして本明細書においては定義する。

本明細書中で開示するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子またはこれ等のアゴニストまたはアンタゴニストの「有効量」とは、特に記載した目的を実施するために十分な量である。「有効量」は記載した目的との関係において実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。

用語「治療有効量」とは、被験体または哺乳動物における疾患または障害を「処置する」ために有効な抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子または他の薬剤の量のことをいう。癌の場合、薬剤の治療有効量は、癌細胞の数を減少させるか；腫瘍サイズを低減するか；末梢器官への癌細胞の浸潤を抑制（すなわち、ある程度まで緩徐化、好ましくは停止）するか；腫瘍の転移を抑制（すなわち、ある程度まで緩徐化、好ましくは停止）するか；腫瘍の成長をある程度まで抑制するか；そして／または癌に関連する症状の１つ以上をある程度まで軽減し得る。「処置する」の本明細書における定義を参照のこと。薬剤が、既存の癌細胞の成長を予防し得、そして／または既存の癌細胞を殺滅し得る限り、その薬剤は、細胞分裂抑制性および／または細胞傷害性であり得る。

語句「心臓血管、内皮および血管形成の障害」、「心臓血管、内皮および血管形成の機能不全」、「心臓血管、内皮または血管形成の障害」および「心臓血管、内皮または血管形成の機能不全」は、交換可能に使用され、部分的には、血管に影響する全身性の障害（例えば、真性糖尿病、ならびに、動脈、毛細管、静脈および／またはリンパのような脈管自体の疾患）のことをいう。これには、血管形成および／または心臓血管形成を刺激する適応症ならびに血管形成および／または心臓血管形成を抑制するものが含まれる。このような障害としては、動脈疾患（例えば、アテローム性動脈硬化症、高血圧症、炎症性血管炎、レイノー病およびレイノー現象、動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；ならびに末梢血管疾患などのほかの血管障害；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）、腫瘍血管新生、外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕、虚血再灌流傷害、関節リウマチ、脳血管疾患、急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症が挙げられる。これらにはまた、アンギナ、急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大およびＣＨＦなどの心不全が含まれる。

「肥大」とは、本明細書中で使用されるとき、腫瘍形成に関与しない天然の成長とは無関係の器官または構造の嵩の増大として定義される。器官または組織の肥大は、個々の細胞の嵩の増大（真の肥大）またはその組織を構成している細胞の数の増加（過形成）のいずれか、またはそれらの両方によるものである。心臓などの特定の器官は、出生後短期間で分裂する能力を失う。したがって、「心臓肥大」とは、成人において同時細胞分裂を伴わない心筋細胞のサイズおよび収縮タンパク質含有量の増大を特徴とする心臓の嵩の増大として定義される。肥大を刺激する原因となるストレスの特徴（例えば、心筋梗塞の場合のような、前負荷の増大、後負荷の増大、筋細胞の減少、または収縮力の一次的低下）が応答の性質を決定する場合に重要な役割を果たしていると考えられる。心臓肥大の早期の段階は、通常、筋原線維の大きさおよびミトコンドリアの増大により、ならびに、ミトコンドリアおよび核の膨大により形態学的に特徴付けられる。この段階において、筋細胞は、正常よりも大型となるが、細胞の組織は、大半は温存されている。心臓肥大のより進行した段階において、ミトコンドリアなどの特定の細胞内小器官のサイズまたは数の優先的な増大が生じ、そして、新しい収縮エレメントが不規則な様式で細胞の局所的領域に付加される。長時間持続する肥大に関与した細胞は、隣接する筋原線維に置き換わり、正常なＺ線の表示の崩壊をもたらす高度に小葉化した膜を伴って顕著に膨大した核を含む、細胞組成のより顕著な破壊を示す。語句「心臓肥大」は、根本的な心臓障害とは無関係に様々な程度の心筋の構造的損傷を特徴とするこの状態の進行のすべての段階を包むために使用される。したがって、この用語はまた、心臓肥大（例えば、血圧の上昇、大動脈の狭窄または心筋梗塞）の発生に寄与する生理学的状態を含む。

「心不全」とは、代謝している組織の要求に対して必要とされる速度では心臓が血液を送液しない心臓機能の異常のことをいう。心不全は、虚血性、先天性、リウマチ性または特発性の形態を含む多くの要因により誘発され得る。

「鬱血性心不全」（ＣＨＦ）は、心臓が末梢組織に対し酸素付加された血液を送達するために十分な心拍出量（経時的に心臓により送液される血液の容量）を供給することがますます不可能になっている進行性の病的状態である。ＣＨＦが進行するに従い、構造的および血行力学的な損傷が生じる。これらの損傷は、種々の徴候を有するが、１つの特徴的な症状は、心室の肥大である。ＣＨＦは、多くの様々な心臓障害の共通した最終結果である。

「心筋梗塞」は、一般に冠状動脈のアテローム性動脈硬化症から生じ、混合型の冠状動脈血栓を伴う場合が多い。これは２つの主要な型：心筋の壊死が心室壁の厚みすべてに関与している経壁梗塞、およびその壊死が心室壁から心外膜に至るまでの拡張を伴わない心内膜下、壁内心筋層、またはその両方が関与する心内膜下（非貫壁性）梗塞に分類され得る。心筋梗塞は、血行力学的作用の変化および心臓の損傷部および健常部における構造の変化の両方をもたらすことが知られている。すなわち、例えば、心筋梗塞は、心臓の最大心拍出量および一回拍出量を減少させる。また、間隙において生じるＤＮＡ合成の刺激ならびに罹患していない心臓の領域におけるコラーゲンの形成の増大が、心筋梗塞に関連する。

例えば、全末梢血管抵抗の増大に起因する長期間高血圧である心臓に対して与えられるストレスまたは緊張の増大の結果として、心臓肥大には「高血圧」が長く関わっている。慢性的な圧力の過剰負荷の結果として肥大した心室の特徴は減損した拡張期の機能である。Ｆｏｕａｄ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｏｌｌ．Ｃａｒｄｉｏｌ．，４：１５００−１５０６（１９８４）；Ｓｍｉｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｏｌｌ．Ｃａｒｄｉｏｌ．，５：８６９−８７４（１９８５）。長期の左心室の弛緩は、正常または過剰な収縮機能にも関わらず、早期の本態性高血圧において検出されている。Ｈａｒｔｆｏｒｄ ｅｔ ａｌ．，Ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎ，６：３２９−３３８（１９８４）。しかしながら、血圧のレベルと心臓肥大の間には緊密な平行性はない。抗高血圧療法に応答した左心室機能の改善がヒトにおいて報告されているが、利尿剤（ヒドロクロロチアジド）、β−遮断薬（プロプラノロール）またはカルシウムチャネル遮断薬（ジルチアゼム）で多様に処置されている患者は、拡張機能の改善を伴わない左心室肥大の回復を示している。Ｉｎｏｕｙｅ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ．Ｊ．Ｃａｒｄｉｏｌ．，５３：１５８３−７（１９８４）。

心臓肥大に伴う別の複合的心臓疾患は、「肥大性心筋症」である。この状態は、非常に多様な形態学的、機能的および臨床的な特徴により特徴付けられ（Ｍａｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，３１６：７８０−７８９（１９８７）；Ｓｐｉｒｉｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，３２０：７４９−７５５（１９８９）；Ｌｏｕｉｅ ａｎｄ Ｅｄｗａｒｄｓ，Ｐｒｏｇ．Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ．Ｄｉｓ．，３６：２７５−３０８（１９９４）；Ｗｉｇｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ，９２：１６８０−１６９２（１９９５））、その不均質性は、それが全世代の患者に及んでいるという事実により強調されている。Ｓｐｉｒｉｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，３３６：７７５−７８５（１９９７）。肥大性心筋症の原因もまた多様であり、ほとんど解明されていない。一般に、筋節タンパク質をコードする遺伝子における変異が、肥大性心筋症に関連している。最近のデータによれば、β−ミオシン重鎖の変異が、家族性の肥大性心筋症の症例の約３０〜４０パーセントを占め得ることが示唆されている。Ｗａｔｋｉｎｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．，３２６：１１０８−１１１４（１９９２）；Ｓｃｈｗａｒｔｚ ｅｔ ａｌ．，Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ，９１：５３２−５４０（１９９５）；Ｍａｒｉａｎ ａｎｄ Ｒｏｂｅｒｔｓ，Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ，９２：１３３６−１３４７（１９９５）；Ｔｈｉｅｒｆｅｌｄｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ，７７：７０１−７１２（１９９４）；Ｗａｔｋｉｎｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｇｅｎ．，１１：４３４−４３７（１９９５）。β−ミオシン重鎖以外に、他の位置の遺伝子変異としては、心臓トロポニンＴ、アルファトポミオシン、心臓ミオシン結合タンパク質Ｃ、必須ミオシン軽鎖および調節ミオシン軽鎖が挙げられる。Ｍａｌｉｋ ａｎｄ Ｗａｔｋｉｎｓ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｃａｒｄｉｏｌ．，１２：２９５−３０２（１９９７）を参照のこと。

弁上部「大動脈狭窄症」は、上行大動脈の狭窄を特徴とする遺伝性の血管障害であるが、肺動脈を含む他の動脈も罹患する場合がある。未処置の大動脈狭窄は、心筋の肥大ならびに最終的には心不全および死亡の原因となる心臓内圧の上昇をもたらす場合がある。この障害の病因は、完全には解明されていないが、内側平滑筋の肥大および恐らくは過形成が、この障害の顕著な特徴である。エラスチン遺伝子の分子改変体が、大動脈狭窄の発症および病因に関与していると報告されている。１９９７年７月２２日発行の米国特許第５，６５０，２８２号。

「弁逆流」は、心臓の弁の障害をもたらす心臓疾患の結果として生じる。リウマチ熱のような様々な疾患は、弁開口部の収縮または引き離しをもたらす場合があるが、他の疾患は、心内膜炎、心内膜または房室開口部の内膜の炎症および心臓手術の原因となる場合がある。弁狭窄部の狭小化および弁の閉鎖欠陥などの欠陥は、心臓腔中の血液の蓄積または弁を通過する血液の逆流をもたらす。改善されない場合、長期の弁の狭窄または不全により、心臓肥大および関連する心筋の損傷がもたらされ、それにより最終的には弁の交換が必要となる場合がある。

用語「免疫関連疾患」は、哺乳動物の免疫系の構成要素が、哺乳動物における罹患に対し、誘発、媒介または他の方法で寄与する疾患を意味する。同様に含まれるものは、免疫応答の刺激または介入が疾患の進行に対して寛解作用を有する疾患である。この用語に含まれるものは、免疫媒介炎症性疾患、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成などである。

用語「Ｔ細胞媒介疾患」は、Ｔ細胞が哺乳動物における罹患を直接的または間接的に媒介するか、他の方法において寄与する疾患を意味する。Ｔ細胞媒介疾患は、細胞媒介作用、リンフォカイン媒介作用などに関連し得、そしてＢ細胞が、例えばＴ細胞の分泌したリンフォカインにより刺激される場合にはＢ細胞関連作用にも関連し得る。

「自己免疫疾患」は、器官特異的疾患であり得る（すなわち、免疫応答が、器官系（例えば、内分泌系、造血系、皮膚、心肺系、消化器および肝臓系、腎臓系、甲状腺、耳、神経筋系、中枢神経系など）に特異的に関する）か、または、複数の器官系に罹患し得る全身性疾患（例えば、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、関節リウマチ、多発性筋炎など）であり得る。好ましいそのような疾患としては、自己免疫性のリウマチ学的障害（例えば、関節リウマチ、シェーグレン症候群、強皮症、ＳＬＥおよびループス腎炎などの狼瘡、多発性筋炎／皮膚筋炎、クリオグロブリン血症、抗リン脂質抗体症候群および乾癬性関節炎）、自己免疫性の消化器および肝臓の障害（例えば、炎症性腸疾患（例えば、潰瘍性大腸炎およびクローン病）、自己免疫性胃炎および悪性貧血、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎およびセリアック病）、血管炎（例えば、チャーグ−ストラウス血管炎、ヴェーゲナー肉芽腫症および多発性動脈炎（ｐｏｌｙａｒｔｅｒｉｉｔｉｓ）を含むＡＮＣＡ関連血管炎）、自己免疫性神経障害（例えば、多発性硬化症、眼球クローヌス筋クローヌス症候群、重症筋無力症、視神経脊髄炎、パーキンソン病、アルツハイマー病および自己免疫性多発ニューロパシー）、腎障害（例えば、糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群およびバージャー病）、自己免疫性皮膚障害（例えば、乾癬、蕁麻疹（ｕｒｔｉｃａｒｉａ）、蕁麻疹（ｈｉｖｅｓ）、尋常性天疱瘡、水疱性類天疱瘡および皮膚エリテマトーデス）、血液学的障害（例えば、血小板減少性紫斑病、血栓性血小板減少性紫斑病、輸血後の紫斑病および自己免疫性溶血性貧血）、アテローム性動脈硬化症、ブドウ膜炎、自己免疫性聴覚疾患（例えば、内耳疾患および聴覚喪失）、ベーチェット病、レイノー症候群、臓器移植および自己免疫内分泌障害（例えば、インスリン依存性真性糖尿病（ＩＤＤＭ）などの糖尿病関連自己免疫性疾患、アジソン病および自己免疫性甲状腺疾患（例えば、グレーブス病および甲状腺炎））が挙げられる。より好ましいこのような疾患としては、例えば、関節リウマチ、潰瘍性大腸炎、ＡＮＣＡ関連血管炎、狼瘡、多発性硬化症、シェーグレン症候群、グレーブス病、ＩＤＤＭ、悪性貧血、甲状腺炎および糸球体腎炎が挙げられる。

場合により上で列挙したものを包含する本明細書において定義する他の自己免疫疾患の特定の例としては、関節炎（例えば、若年性発症型の関節リウマチおよびリウマチ様滑膜炎の段階、痛風または痛風性関節炎、急性免疫学的関節炎、慢性炎症性関節炎、変形性関節症、ＩＩ型コラーゲン誘導関節炎、感染性関節炎、ライム関節炎、増殖性関節炎、乾癬性関節炎、スティル病、椎骨関節炎、骨関節炎、慢性進行性関節炎（ａｒｔｈｒｉｔｉｓ ｃｈｒｏｎｉｃａ ｐｒｏｇｒｅｄｉｅｎｔｅ）、慢性関節リウマチ、原発性慢性多発性関節炎（ｐｏｌｙａｒｔｈｒｉｔｉｓ ｃｈｒｏｎｉｃａ ｐｒｉｍａｒｉａ）、反応性関節炎、閉経期関節炎、エストロゲン枯渇関節炎および強直性脊椎炎／リウマチ様脊椎炎を含む急性および慢性の関節リウマチ）、自己免疫性リンパ増殖性疾患、炎症性増殖亢進性皮膚疾患、乾癬（例えば、プラーク乾癬、滴状乾癬（ｇｕｔａｔｔｅ ｐｓｏｒｉａｓｉｓ）、膿疱性乾癬および爪の乾癬）、枯草熱およびヨブ症候群などのアトピー性疾患を含むアトピー、皮膚炎（接触性皮膚炎、慢性接触性皮膚炎、剥脱性皮膚炎、アレルギー性皮膚炎、アレルギー性接触性皮膚炎、蕁麻疹（ｈｉｖｅｓ）、疱疹状皮膚炎、貨幣状皮膚炎、脂漏性皮膚炎、非特異的皮膚炎、一次刺激性接触性皮膚炎およびアトピー性皮膚炎を含む）、Ｘ連鎖高ＩｇＭ症候群、アレルギー性眼内炎症性疾患、蕁麻疹（ｕｒｔｉｃａｒｉａ）（例えば、慢性アレルギー性蕁麻疹および慢性特発性蕁麻疹（慢性自己免疫性蕁麻疹を含む）、筋炎、多発性筋炎／皮膚筋炎、若年性皮膚筋炎、中毒性表皮壊死症、強皮症（全身強皮症を含む）、硬化症（例えば、全身硬化症、多発性硬化症（ＭＳ）（例えば、視神経脊髄型ＭＳ（ｓｐｉｎｏ−ｏｐｔｉｃａｌ ＭＳ）、一次性進行性ＭＳ（ＰＰＭＳ）および再発寛解型ＭＳ（ＲＲＭＳ））、進行性全身硬化症、アテローム性動脈硬化症、動脈硬化症、播種性硬化症、失調性硬化症）、視神経脊髄炎（ＮＭＯ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）（例えば、クローン病、自己免疫媒介消化器系疾患、消化器系炎症、大腸炎（例えば、潰瘍性大腸炎（ｕｌｃｅｒａｔｉｖｅ ｃｏｌｉｔｉｓ）、潰瘍性大腸炎（ｃｏｌｉｔｉｓ ｕｌｃｅｒｏｓａ）、微視的大腸炎、コラーゲン蓄積大腸炎、ポリープ性大腸炎（ｃｏｌｉｔｉｓ ｐｏｌｙｐｏｓａ）、壊死性腸炎および経壁性大腸炎ならびに自己免疫性炎症性腸疾患）、腸炎症、壊疽性膿皮症、結節性紅斑、原発性硬化性胆管炎、呼吸窮迫症候群（例えば、成人呼吸窮迫症候群または急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ））、髄膜炎、ブドウ膜の全体または部分の炎症、虹彩炎、脈絡膜炎、自己免疫性血液学的障害、移植片対宿主病、血管性水腫（例えば、遺伝性の血管性水腫）、髄膜炎の場合等の脳神経損傷、妊娠性ヘルペス、妊娠性類天疱瘡、陰嚢掻痒（ｐｒｕｒｉｔｉｓ ｓｃｒｏｔｉ）、自己免疫性早発性卵巣不全、自己免疫性状態による突発性難聴、ＩｇＥ媒介疾患（例えば、アナフィラキシーならびにアレルギー性およびアトピー性の鼻炎）、脳炎（例えば、ラスムッセン脳炎ならびに辺縁および／または脳幹の脳炎）、ブドウ膜炎（例えば、前部ブドウ膜炎、急性前部ブドウ膜炎、肉芽腫性ブドウ膜炎、非肉芽腫性ブドウ膜炎、水晶体起因性ブドウ膜炎、後部ブドウ膜炎または自己免疫性ブドウ膜炎）、ネフローゼ症候群を伴うか伴わない糸球体腎炎（ＧＮ）（例えば、慢性または急性の糸球体腎炎（例えば、原発性ＧＮ、免疫媒介性ＧＮ、膜性ＧＮ（膜性腎症）、特発性膜性ＧＮまたは特発性膜性腎症、膜性または膜増殖性のＧＮ（ＭＰＧＮ）（Ｉ型およびＩＩ型を含む）および急速進行性ＧＮ（ＲＰＧＮ））、増殖性腎炎、自己免疫性多内分泌腺不全、亀頭炎（形質細胞亀頭炎を含む）、亀頭包皮炎、遠心性環状紅斑、色素異常性固定性紅斑、多形性紅斑（ｅｙｔｈｅｍａ ｍｕｌｔｉｆｏｒｍ）、環状肉芽腫、光沢苔癬、硬化性萎縮性苔癬、ビダール苔癬、棘状苔癬、扁平苔癬、葉状魚鱗癬、表皮剥離性角質増殖症、前癌角化症、壊疽性膿皮症、アレルギー性の状態および応答、食物アレルギー、薬剤アレルギー、昆虫アレルギー、稀少なアレルギー性障害（例えば、肥満細胞症、アレルギー性反応、湿疹（アレルギー性またはアトピー性の湿疹、皮脂欠乏性湿疹、異汗性湿疹および小水疱性の掌蹠湿疹を含む）、喘息（例えば、気管支喘息（ａｓｔｈｍａ ｂｒｏｎｃｈｉａｌｅ）、気管支喘息（ｂｒｏｎｃｈｉａｌ ａｓｔｈｍａ）および自己免疫性喘息）、Ｔ細胞の浸潤が関与する状態および慢性の炎症応答、外来抗原（例えば、妊娠中の胎児Ａ−Ｂ−Ｏ血液型群）に対する免疫反応、慢性肺炎症性疾患、自己免疫性心筋炎、白血球接着不全、狼瘡（ループス腎炎、ループス脳炎、小児ループス、非腎性ループス、腎外ループス、円板状ループスおよび円板状エリテマトーデス、脱毛性ループス、ＳＬＥ（例えば、皮膚ＳＬＥまたは亜急性皮膚ＳＬＥ）、新生児ループス症候群（ＮＬＥ）ならびに播種性エリテマトーデスを含む）、若年発症（Ｉ型）真性糖尿病（小児ＩＤＤＭを含む）、成人発症真性糖尿病（ＩＩ型）、自己免疫性糖尿病、特発性尿崩症、糖尿病性網膜炎、糖尿病性腎症、糖尿病性大腸炎、糖尿病性大動脈障害、サイトカインおよびＴリンパ球により媒介される急性および遅延型の過敏症に関連する免疫応答、結核、サルコイドーシス、肉芽腫症（リンパ腫様肉芽腫症、ヴェーゲナー肉芽腫症を含む）、顆粒球減少症、脈管炎（血管炎、大型血管の血管炎（リウマチ性多発性筋痛症および巨細胞性（高安）動脈炎を含む）、中型血管の血管炎（川崎病および結節性多発性動脈炎／結節性動脈周囲炎）、微視的多発性血管炎、免疫血管炎、ＣＮＳ血管炎、皮膚血管炎、過敏性血管炎、壊死性血管炎、例えば、全身性壊死性血管炎およびＡＮＣＡ関連血管炎、例えば、チャーグ‐ストラウス血管炎または症候群（ＣＳＳ）およびＡＮＣＡ関連の小型血管の血管炎、側頭動脈炎、再生不良性貧血、自己免疫性再生不良性貧血、クームズ陽性貧血、ダイアモンド‐ブラックファン貧血、溶血性貧血または免疫溶血性貧血、例えば、自己免疫性溶血性貧血（ＡＩＨＡ）、悪性貧血（ｐｅｒｎｉｃｉｏｕｓ ａｎｅｍｉａ）（悪性貧血（ａｎｅｍｉａ ｐｅｒｎｉｃｉｏｓａ））、アジソン病、先天性低形成貧血または形成不全（ＰＲＣＡ）、第ＶＩＩＩ因子欠乏症、血友病Ａ、自己免疫性好中球減少症、血球減少症、例えば、汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出が関与する疾患、ＣＮＳ炎症性障害、アルツハイマー病、パーキンソン病、多臓器傷害症候群、例えば、敗血症、外傷または出血に対して二次的なもの、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、抗リン脂質抗体症候群、運動神経炎（ｍｏｔｏｎｅｕｒｉｔｉｓ）、アレルギー性神経炎、ベーチェット病／症候群、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、レイノー症候群、シェーグレン症候群、スティーブンス−ジョンソン症候群、類天疱瘡、例えば、水疱性類天疱瘡および皮膚類天疱瘡、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡、粘液天疱瘡−膜類天疱瘡および紅斑性天疱瘡）、自己免疫性多発性内分泌腺症、ライター病または症候群、自己免疫性状態に起因する熱傷害、子癇前症、免疫複合体障害、例えば、免疫複合体腎炎、抗体媒介腎炎、神経炎症性障害、多発性ニューロパシー、慢性ニューロパシー、例えば、ＩｇＭ多発性ニューロパシーまたはＩｇＭ媒介ニューロパシー、血小板減少症（例えば、心筋梗塞患者により発症）（血栓性血小板減少性紫斑病（ＴＴＰ）、輸血後の紫斑病（ＰＴＰ）、ヘパリン誘導血小板減少症および自己免疫性または免疫媒介性の血小板減少症（例えば、特発性血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）（慢性または急性のＩＴＰを含む）を含む））、強膜炎（例えば、特発性角膜強膜炎、上強膜炎）、精巣および卵巣の自己免疫性疾患（自己免疫性の精巣炎および卵巣炎を含む）、原発性甲状腺機能低下症、上皮小体機能低下症、自己免疫性内分泌疾患（甲状腺炎（例えば、自己免疫性甲状腺炎、橋本病、慢性甲状腺炎（橋本甲状腺炎）または亜急性甲状腺炎）、自己免疫性甲状腺疾患、特発性甲状腺機能低下症、グレーブス病、多腺症候群（例えば、自己免疫性多腺症候群（例えば、Ｉ型（または多腺性内分泌障害症候群））、新生物随伴症候群（神経学的新生物随伴症候群（例えば、ランバート−イートン筋無力症候群またはイートン−ランバート症候群、スティッフマン症候群またはスティッフパーソン症候群）を含む）、脳脊髄炎（例えば、アレルギー性脳脊髄炎（ａｌｌｅｒｇｉｃ ｅｎｃｅｐｈａｌｏｍｙｅｌｉｔｉｓ）またはアレルギー性脳脊髄炎（ｅｎｃｅｐｈａｌｏｍｙｅｌｉｔｉｓ ａｌｌｅｒｇｉｃａ）および実験的アレルギー性脳脊髄炎（ＥＡＥ））、重症筋無力症（例えば、胸腺腫関連重症筋無力症）、小脳変性症、神経性筋強直症、眼球クローヌスまたは眼球クローヌス筋クローヌス症候群（ＯＭＳ）および感覚神経障害、多病巣性運動神経障害、シーハン症候群、自己免疫性肝炎、慢性肝炎、ルポイド肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎または自己免疫性慢性活動性肝炎、肺炎（例えば、リンパ様間質性肺炎（ＬＩＰ）、閉塞性細気管支炎（非移植）ｖｓ ＮＳＩＰ、ギラン‐バレー症候群、バージャー病（ＩｇＡ腎症）、特発性ＩｇＡ腎症、線状ＩｇＡ皮膚症、急性熱性好中球性皮膚症、角層下膿疱症、一過性棘融解性皮膚症、硬変（例えば、原発性胆汁性肝硬変および肺硬変（ｐｎｅｕｍｏｎｏｃｉｒｒｈｏｓｉｓ））、自己免疫性腸症候群、セリアック病、セリアックスプルー（グルテン性腸症）、難治性スプルー、特発性スプルー、クリオグロブリン血症（例えば、混合型クリオグロブリン血症）、筋萎縮性（ａｍｙｌｏｔｒｏｐｈｉｃ）側索硬化症（ＡＬＳ；ルーゲーリック病）、冠状動脈疾患、自己免疫性耳疾患（例えば、自己免疫性内耳疾患（ＡＩＥＤ）、自己免疫性聴覚損失）、多発性軟骨炎（例えば、難治性または再発性または回帰性の多発性軟骨炎、肺胞タンパク症、コーガン症候群／非梅毒性角膜実質炎、ベル麻痺、スウィート病／症候群、自己免疫性酒さ（ｒｏｓａｃｅａ ａｕｔｏｉｍｍｕｎｅ）、帯状疱疹関連疼痛、アミロイド症、非癌性リンパ球増加症、原発性リンパ球増加症（例えば、モノクローナルＢ細胞リンパ球増加症（例えば、良性のモノクローナル高ガンマグロブリン血症および重大性不明のモノクローナル高ガンマグロブリン血症、ＭＧＵＳ）を含む）、末梢ニューロパシー、新生物随伴症候群、チャネル病（例えば、癲癇、偏頭痛、不整脈、筋肉障害、難聴、失明、周期性麻痺およびＣＮＳのチャネル病）、自閉症、炎症性筋障害、巣状または分節状または巣状分節状の糸球体硬化症（ＦＳＧＳ）、内分泌性眼障害、ブドウ膜網膜炎、脈絡網膜炎、自己免疫性血液学的障害、線維筋痛症、多発性内分泌不全、シュミット症候群、副腎炎、胃萎縮、初老期痴呆、脱髄性疾患（例えば、自己免疫性脱髄性疾患および慢性炎症性脱髄性多発性ニューロパシー）、ドレスラー症候群、円形脱毛症、完全脱毛症、ＣＲＥＳＴ症候群（石灰沈着症、レイノー現象、食道運動障害、強指症および毛細血管拡張症）、例えば、抗精子抗体による男性および女性の自己免疫性不妊、混合結合組織病、シャーガス病、リウマチ熱、反復流産、農夫肺、多形性紅斑、心術後症候群、クッシング症候群、鳥飼肺、アレルギー性肉芽腫性血管炎、良性リンパ球性血管炎、アルポート症候群、肺胞炎（例えば、アレルギー性肺胞炎および線維化肺胞炎）、間質性肺疾患、輸血反応、ハンセン病、マラリア、寄生虫病（例えば、リーシュマニア症、トリパノソーマ症（ｋｙｐａｎｏｓｏｍｉａｓｉｓ）、住血吸虫症、回虫症、アスペルギルス症、サンプター症候群、カプラン症候群、デング熱、心内膜炎、心内膜心筋線維症、びまん性間質性肺線維症、間質性肺線維症、線維形成性縦隔炎、肺線維症、特発性肺線維症、嚢胞性線維症、眼内炎、持久性隆起性紅斑、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎（ｅｏｓｉｎｏｐｈｉｌｉｃ ｆａｃｉｉｔｉｓ）、シャルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症（ｆｌａｒｉａｓｉｓ）、毛様体炎（例えば、慢性毛様体炎、異時性毛様体炎、虹彩毛様体炎（急性または慢性）またはフックス毛様体炎）、ヘノッホシェーンライン紫斑病、ヒト免疫不全ウイ





ルス（ＨＩＶ）感染症、ＳＣＩＤ、後天性免疫不全症候群（ＡＩＤＳ）、エコーウイルス感染症、敗血症（全身炎症性反応症候群（ＳＩＲＳ））、内毒素血症、膵臓炎、サイロキシン中毒（ｔｈｙｒｏｘｉｃｏｓｉｓ）、パルボウイルス感染症、風疹ウイルス感染症、ワクチン接種後症候群、先天性風疹感染症、エプスタイン・バーウイルス感染症、おたふくかぜ、エバンス症候群、自己免疫性性腺機能不全、シドナム舞踏病、連鎖球菌感染後腎炎、閉塞性血栓性血管炎（ｔｈｒｏｍｂｏａｎｇｉｔｉｓ ｕｂｉｔｅｒａｎｓ）、甲状腺中毒症、脊髄ろう、脈絡膜炎、巨細胞性多発性筋痛、慢性過敏性肺炎、結膜炎（例えば、春季カタル、乾性角結膜炎および流行性角結膜炎）、特発性腎炎症候群、微小変化腎症（ｍｉｎｉｍａｌ ｃｈａｎｇｅ ｎｅｐｈｒｏｐａｔｈｙ）、良性の家族性および虚血再灌流性の損傷、移植器官再灌流、網膜自己免疫、関節の炎症、気管支炎、慢性閉塞性気道／肺疾患、珪肺症、アフタ、アフタ性口内炎、動脈硬化性障害（脳血管不全）（例えば、動脈硬化性脳症および動脈硬化性網膜症、精液形成欠如（ａｓｐｅｒｍｉｏｇｅｎｅｓｅ）、自己免疫性溶血、ベック病、クリオグロブリン症、デュプュイトラン拘縮、水晶体過敏性眼内炎（ｅｎｄｏｐｈｔｈａｌｍｉａ ｐｈａｃｏａｎａｐｈｙｌａｃｔｉｃａ）、アレルギー性腸炎、らい性結節性紅斑、特発性顔面麻痺、慢性疲労症候群、リウマチ熱、ハマン−リッチ病、感覚神経聴覚損失、発作性ヘモグロビン尿症、生殖機能低下症、限局性回腸炎、白血球減少症、感染性単核細胞症、横断脊髄炎、原発性特発性粘液水腫、ネフローゼ、癒着性眼炎（ｏｐｈｔｈａｌｍｉａ ｓｙｍｐｈａｔｉｃａ）、肉芽腫性精巣炎、膵臓炎、急性多発性神経根炎、壊疽性膿皮症、ド・ケルヴァン甲状腺炎（Ｑｕｅｒｖａｉｎ’ｓ ｔｈｙｒｅｏｉｄｉｔｉｓ）、後天性脾臓萎縮（ａｃｑｕｉｒｅｄ ｓｐｅｎｉｃ ａｔｒｏｐｈｙ）、非悪性胸腺腫、リンパ濾胞性胸腺炎、白斑、トキシックショック症候群、食中毒、Ｔ細胞浸潤の関与する状態、白血球接着不全、サイトカインおよびＴリンパ球により媒介される急性または遅発型の過敏症に関連する免疫応答、白血球漏出の関与する疾患、多臓器傷害症候群、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、自己免疫性多発性内分泌腺症、卵巣炎、原発性粘液水腫、自己免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、リウマチ病、混合結合組織病、ネフローゼ症候群、インスリン炎、多内分泌腺不全、自己免疫性多腺症候群（Ｉ型多腺症候群を含む）、成人発症型特発性上皮小体機能低下症（ＡＯＩＨ）、心筋症（例えば、拡張性心筋症）、後天性表皮水疱症（ｅｐｉｄｅｒｍｏｌｉｓｉｓ ｂｕｌｌｏｓａ ａｃｑｕｉｓｉｔａ）（ＥＢＡ）、ヘモクロマトーシス、心筋炎、ネフローゼ症候群、原発性硬化性胆管炎、化膿性または非化膿性の静脈洞炎、急性または慢性の静脈洞炎、篩骨、前頭部、上顎または蝶形骨の静脈洞炎、アレルギー性静脈洞炎、好酸球関連障害（例えば、好酸球増加症、肺浸潤性好酸球増加症、好酸球増多−筋痛症候群、レフラー症候群、慢性好酸球性肺炎、熱帯性肺好酸球増加症、気管支肺アスペルギルス症、アスペルギルス腫または好酸球含有の肉芽腫、アナフィラキシー、脊椎関節症、セロネガティブ脊椎関節炎、多内分泌腺自己免疫疾患、硬化性胆管炎、強膜、上強膜、慢性の粘膜皮膚カンジダ症、ブルトン症候群、乳児の一過性低ガンマグロブリン血症、ヴィスコット‐オールドリッチ症候群、毛細血管拡張性運動失調症候群、血管拡張、コラーゲン疾患に関連する自己免疫性障害、リウマチ（例えば、慢性関節リウマチ、リンパ節炎、血圧応答の低下、血管機能不全、組織損傷、心臓血管虚血、痛覚過敏、腎虚血、大脳虚血および血管形成に伴う疾患、アレルギー性過敏障害、糸球体腎炎、再灌流損傷、虚血性再灌流障害、心筋または他の組織の再灌流損傷、リンパ腫性気管気管支炎、炎症性皮膚病、急性の炎症性要素を有する皮膚病、多臓器不全、水疱性疾患、腎皮質壊死、急性化膿性髄膜炎または他の中枢神経系の炎症性障害、眼球および眼窩の炎症性障害、顆粒球輸血関連症候群、サイトカイン誘導毒性、睡眠発作、急性重篤炎症、慢性難治性炎症、腎盂炎、動脈内膜過形成、消化性潰瘍、心弁膜炎および子宮内膜症が挙げられるがこれらに限定されない。

語句「不安関連障害」とは、不安、気分および薬物乱用の障害のこといい、それらとしては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられるがこれらに限定されない。そのような障害としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、Ｉ型またはＩＩ型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下（アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない）、疾患または損傷から生じる発作（癲癇、学習障害／障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない）が挙げられる。さらに、不安障害は、人格障害（以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない）に適用し得る。

用語「脂質代謝障害」とは、コレステロールおよびトリグリセリドの異常な臨床化学レベルのことをいい、ここでこれらの脂質の高いレベルは、アテローム性動脈硬化症の指標となる。さらに、異常な血清中脂質レベルは、様々な心臓血管疾患（高血圧、脳卒中、冠状動脈疾患、糖尿病および／または肥満症を含む）の指標となり得る。

語句「眼の異常」とは、アテローム性動脈硬化症または様々な眼科学的異常に関連し得る眼の潜在的障害のことをいう。そのような障害としては、以下：網膜形成不全、様々な網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられるがこれらに限定されない。白内障もまた眼の異常と考えられ、そしてヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群などの全身性疾患と関連している。他の眼の発達異常としては、無虹彩症、前区および発育不全症候群が挙げられる。白内障はまた、眼内感染または炎症（ブドウ膜炎）の結果として生じる場合もある。

抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドまたはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子の「成長抑制量」とは、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば、癌細胞の成長を抑制することができる量である。新生物細胞成長を抑制する目的のための抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドまたはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子の「成長抑制量」は、実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。

抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドまたはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子の「細胞傷害性量」とは、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば、癌細胞の破壊をもたらすことができる量である。新生物細胞成長を抑制する目的のための抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドまたはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子の「細胞傷害性量」は実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。

用語「抗体」は、最も広範な意味において使用され、そして特に、例えば、単一の抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体モノクローナル抗体（アゴニスト、アンタゴニストおよび中和抗体を含む）、多エピトープ性の特異性を有する抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体組成物、ポリクローナル抗体、一本鎖抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体および所望の生物学的または免疫学的活性を示す限り抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体のフラグメント（下記を参照のこと）を包含する。用語「免疫グロブリン」（Ｉｇ）は、本明細書においては抗体と交換可能に使用される。

「単離された抗体」とは、その天然の環境の成分中から同定ならびに分離および／または回収されるものを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、抗体の診断または治療上の使用を妨害する物質であり、それらとしては、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質性または非タンパク質性の溶質が挙げられ得る。本発明は、（１）Ｌｏｗｒｙ法により測定した場合に抗体の９５重量％超まで、最も好ましくは９９重量％超まで、（２）スピニングカップ配列決定装置を用いてＮ末端または内部のアミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るために十分な程度まで、または（３）クマシーブルーもしくは好ましくは銀染色を用いた還元または非還元条件下のＳＤＳ−ＰＡＧＥによる均質性となるように、抗体が精製されることを可能とする。単離された抗体は、組換え細胞内のｉｎ ｓｉｔｕの抗体を含むが、その理由は抗体の天然の環境の少なくとも１つの成分が存在しないためである。しかしながら、通常、単離された抗体は、少なくとも１つの精製工程により調製される。

基本的な４鎖抗体単位は、２本の同一の軽（Ｌ）鎖および２本の同一の重（Ｈ）鎖〜構成されるヘテロ４量体の糖タンパク質である（ＩｇＭ抗体は、Ｊ鎖と呼ばれるさらなるポリペプチドと共に基本的なヘテロ４量体単位５つからなり、したがって、１０個の抗原結合部位を含有するのに対し、分泌ＩｇＡ抗体は、重合してＪ鎖と共に基本的４鎖単位２〜５つを含む多価の組立物を形成することができる）。ＩｇＧの場合は、４鎖単位は、一般に約１５０，０００ダルトンである。各Ｌ鎖は、ジスルフィド共有結合１つによりＨ鎖に連結されているのに対し、２本のＨ鎖は、Ｈ鎖のアイソタイプに応じて１つ以上のジスルフィド結合により相互に連結されている。各Ｈ鎖および各Ｌ鎖はまた、規則的な間隔で鎖内ジスルフィド架橋を有する。各Ｈ鎖はＮ末端において可変ドメイン（Ｖ_Ｈ）とその後の３つの定常ドメイン（Ｃ_Ｈ）を各α鎖および各γ鎖について、そして４つのＣ_Ｈドメインをμおよびεアイソタイプについて有している。各Ｌ鎖は、Ｎ末端において可変ドメイン（Ｖ_Ｌ）とその後の定常ドメイン（Ｃ_Ｌ）をそのもう一端において有している。Ｖ_Ｌは、Ｖ_Ｈと並列され、そしてＣ_Ｌは、重鎖の最初の定常ドメイン（Ｃ_Ｈ１）と並列される。特定のアミノ酸残基が、軽鎖および重鎖の可変ドメインの間の界面を形成すると考えられている。Ｖ_ＨとＶ_Ｌの対形成により、単一の抗原結合部位が形成される。様々なクラスの抗体の構造および特性については、例えば、Ｂａｓｉｃ ａｎｄ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，８ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｄａｎｉｅｌ Ｐ．Ｓｔｉｔｅｓ，Ａｂｂａ Ｉ．Ｔｅｒｒ ａｎｄ Ｔｒｉｓｔｒａｍ Ｇ．Ｐａｒｓｌｏｗ （ｅｄｓ．），Ａｐｐｌｅｔｏｎ＆Ｌａｎｇｅ，Ｎｏｒｗａｌｋ，ＣＴ，１９９４，ｐ．７１およびＣｈａｐｔｅｒ６を参照のこと。

任意の脊椎動物種に由来するＬ鎖を、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいてカッパおよびラムダと称される２つの明確に異なった型の１つに割りあて得る。その重鎖の定常ドメイン（Ｃ_Ｈ）のアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンは、様々なクラスまたはアイソタイプに割りあてられ得る。免疫グロブリンには、５クラス：ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧおよびＩｇＭがあり、それぞれα、δ、ε、γおよびμと表記される重鎖を有する。γおよびαのクラスはさらに、Ｃ_Ｈ配列および機能の比較的小さい差異に基づいてサブクラスに分類され、例えば、ヒトは、以下のサブクラス：ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２を発現する。

用語「可変」は、可変ドメインの特定のセグメントが、抗体の間で配列が大きく異なっているという事実のことをいう。Ｖドメインは、抗原の結合を媒介し、そして、特定の抗体のその特定の抗原に対する特異性を決定する。しかしながら、可変性は、可変ドメインの１１０アミノ酸に亘って均一に分布していない。その代わり、Ｖ領域は、各々が９〜１２アミノ酸長の「超可変領域」と称される究極的な可変性のより短い領域によって分断された１５〜３０アミノ酸のフレームワーク領域（ＦＲ）と称される比較的不変の部分からなる。ネイティブの重鎖および軽鎖の可変ドメインは各々、βシート構造を連結する、そして一部の場合においてはその部分を形成するループを形成する３つの超可変領域により連結されたβシート配置を大半が採用している４つのＦＲを含む。各鎖の超可変領域は、ＦＲにより近接して保持され、そして、他の鎖の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１）を参照のこと）。定常ドメインは、抗原への抗体の結合に直接関与していないが、様々なエフェクター機能（例えば、抗体依存性細胞内細胞傷害（ＡＤＣＣ）への抗体の関与）を示す。

用語「超可変領域」は、本明細書中で使用されるとき、抗原結合の原因となる抗体のアミノ酸残基のことをいう。超可変領域は、一般に「相補性決定領域」すなわち「ＣＤＲ」に由来するアミノ酸残基（例えば、Ｖ_Ｌ内のおよそ残基２４〜３４（Ｌ１）、５０〜５６（Ｌ２）および８９〜９７（Ｌ３）ならびにＶ_Ｈ内のおよそ１〜３５（Ｈ１）、５０〜６５（Ｈ２）および９５〜１０２（Ｈ３）；Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ（１９９１））および／または「超可変ループ」に由来の残基（例えば、Ｖ_Ｌ内の残基２６〜３２（Ｌ１）、５０〜５２（Ｌ２）および９１〜９６（Ｌ３）ならびにＶ_Ｈ内の２６〜３２（Ｈ１）、５３〜５５（Ｈ２）および９６〜１０１（Ｈ３）；Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１〜９１７（１９８７））を含む。

用語「モノクローナル抗体」は、本明細書中で使用されるとき、実質的に均質な抗体の集団から得られた抗体のことをいい、すなわち、その集団を構成する個々の抗体は、わずかな量で存在し得る、天然に存在する可能性のある突然変異を除き同一である。モノクローナル抗体は、高度に特異的であり、単一の抗原部位に指向されている。さらに、さまざまな決定基（エピトープ）に対して指向されたさまざまな抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対して指向されている。その特異性に加えて、モノクローナル抗体は、他の抗体の混入を伴うことなく合成され得る点において好都合である。修飾語の「モノクローナル」とは、任意の特定の方法による抗体の作製を必要とするものとみなしてはならない。例えば、本発明において有用なモノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２５６：４９５（１９７５）により最初に報告されたハイブリドーマ法により調製され得るか、または、細菌、真核生物または植物の細胞において組換えＤＮＡ法を用いて作製され得る（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号を参照のこと）。「モノクローナル抗体」は、例えば、Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３５２：６２４−６２８（１９９１）およびＭａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８１−５９７（１９９１）に記載の手法を用いてファージ抗体ライブラリーから単離され得る。

本明細書におけるモノクローナル抗体は、重鎖および／または軽鎖の一部分が、特定の種から得られる抗体または特定の抗体クラスまたはサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一かまたは相同であるが、鎖の残りの部分は、別の種から得られる抗体または別の抗体クラスまたはサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一かまたは相同である「キメラ」抗体、ならびに所望の生物学的活性を示す限りにおいてそのような抗体のフラグメントを含む（米国特許第４，８１６，５６７号；およびＭｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１−６８５５（１９８４）を参照のこと）。本明細書における目的のキメラ抗体は、非ヒト霊長類（例えば、旧世界ザル、類人猿など）から得られた可変ドメイン抗原結合配列およびヒト定常領域配列を含む「霊長類化」抗体を含む。

「インタクトな」抗体とは、抗原結合部位ならびにＣ_Ｌおよび少なくとも重鎖定常ドメインＣ_Ｈ１、Ｃ_Ｈ２およびＣ_Ｈ３を含むものである。定常ドメインは、ネイティブの配列の定常ドメイン（例えば、ヒトネイティブ配列定常ドメイン）またはそのアミノ酸配列改変体であり得る。好ましくはインタクトな抗体は、１つ以上のエフェクター機能を有する。

「抗体フラグメント」は、インタクトな抗体の一部分、好ましくはインタクトな抗体の抗原結合または可変の領域を含む。抗体フラグメントの例としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）_２およびＦｖフラグメント；ダイアボディ；線状抗体（米国特許第５，６４１，８７０号の実施例２；Ｚａｐａｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．８（１０）：１０５７−１０６２［１９９５］を参照のこと）；一本鎖抗体分子；ならびに抗体フラグメントから形成された多重特異性の抗体が挙げられる。

抗体のパパイン消化により、「Ｆａｂ」フラグメントと称される２本の同一の抗原結合フラグメント、および容易に結晶化する能力を反映した表記である残りの部分の「Ｆｃ」フラグメントが得られる。Ｆａｂフラグメントは、Ｈ鎖の可変領域ドメイン（Ｖ_Ｈ）とともにＬ鎖全体および１本の重鎖の第１の定常ドメイン（Ｃ_Ｈ１）からなる。各Ｆａｂフラグメントは、抗原結合に関しては１価であり、すなわち、単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理により、単一の大型のＦ（ａｂ’）_２フラグメントが得られ、これは２価の抗原結合活性を有する２つのジスルフィド結合したＦａｂフラグメントに概ね相当し、そしてなお抗原に交差結合することができる。Ｆａｂ’フラグメントは、抗体のヒンジ領域に由来する１つ以上のシステインを含むＣ_Ｈ１ドメインのカルボキシ末端にさらに数残基を有することによりＦａｂフラグメントとは、異なっている。Ｆａｂ’−ＳＨは、本明細書においては定常ドメインのシステイン残基が遊離のチオール基を担持しているＦａｂ’に対する表記である。Ｆ（ａｂ’）_２抗体フラグメントは、当初はそれらの間にヒンジシステインを有するＦａｂ’フラグメントの対として作製された。抗体フラグメントの他の化学的カップリングも知られている。

Ｆｃフラグメントは、ジスルフィドで共に保持された両方のＨ鎖のカルボキシ末端部分を含む。抗体のエフェクター機能は、Ｆｃ領域における配列により決定され、この領域は、特定の型の細胞に存在するＦｃレセプター（ＦｃＲ）により認識される部分でもある。

「Ｆｖ」は、完全な抗原認識部位および抗原結合部位を含む最小の抗体フラグメントである。このフラグメントは、堅固な非共有結合の会合型としての１つの重鎖と１つの軽鎖との可変領域ドメインの２量体からなる。これらの２ドメインの折り畳みにより、６つの超可変ループ（３ループは各々Ｈ鎖およびＬ鎖由来）が生じ、これらは抗原結合のためのアミノ酸残基を与え、そして抗体に抗原結合特異性をもたらす。しかしながら、単一の可変ドメイン（または抗原に対して特異的なわずか３つのＣＤＲのみを含むＦｖの半分）であっても、結合部位全体よりも低親和性ではあるが、抗原を認識して結合する能力を有している。

「ｓＦｖ」または「ｓｃＦｖ」とも略記される「一本鎖Ｆｖ」は、連結されて単一のポリペプチド鎖となっているＶ_ＨおよびＶ_Ｌ抗体ドメインを含む抗体フラグメントである。好ましくは、ｓＦｖポリペプチドはさらに、抗原結合のために所望の構造をｓＦｖが形成できるようにするＶ_ＨドメインとＶ_Ｌドメインとの間のポリペプチドリンカーを含む。ｓＦｖに関する概説は、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｎ，Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ｐｐ．２６９−３１５（１９９４）；Ｂｏｒｒｅｂａｅｃｋ １９９９，後出を参照のこと。

用語「ダイアボディ」は、Ｖドメインの鎖内ではなく鎖間の対形成が達成されることにより２価のフラグメント、すなわち２つの抗原結合部位を有するフラグメントが生じるようにＶ_ＨドメインとＶ_Ｌドメインの間により短いリンカー（約５〜１０残基）と共にｓＦｖフラグメント（前パラグラフを参照のこと）を構築することにより調製される小型抗体フラグメントのことをいう。２重特異性のダイアボディは、２つの「クロスオーバー」ｓＦｖフラグメントのヘテロ２量体であり、この場合、２つの抗体のＶ_ＨドメインおよびＶ_Ｌドメインは異なるポリペプチド鎖上に存在する。ダイアボディは、例えば、ＥＰ４０４，０９７；ＷＯ９３／１１１６１；およびＨｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：６４４４−６４４８（１９９３）により詳細に記載されている。

非ヒト（例えば、げっ歯類）抗体の「ヒト化」型は、非ヒト抗体から得られた最小の配列を含むキメラ抗体である。大部分に関しては、ヒト化抗体は、レシピエントの超可変領域に由来する残基が、所望の抗体の特異性、親和性および能力を有する非ヒト種（例えば、マウス、ラット、ウサギまたは非ヒト霊長類）（ドナー抗体）の超可変領域に由来する残基で置き換えられているヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）である。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域（ＦＲ）の残基が対応する非ヒト残基により置き換えられる。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体またはドナー抗体に存在しない残基を含んでよい。これらの改変は、抗体の性能をさらに精密化するために行われる。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、そして代表的には２つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、その場合、超可変ループのすべてまたは実質的にすべてが、非ヒト免疫グロブリンのそれに相当し、そしてＦＲのすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリン配列のそれとなる。ヒト化抗体は、必要に応じてまた、免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）、代表的にはヒト免疫グロブリンのメンエキグロブリン定常領域の少なくとも一部分を含む。さらに詳細な説明は、Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２−５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３−３２９（１９８８）；およびＰｒｅｓｔａ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．２：５９３−５９６（１９９２）を参照のこと。

「種依存性抗体」、例えば、哺乳動物非ヒトＩｇＥ抗体は、第１の哺乳動物種由来の抗原に対して、第２の哺乳動物種由来のその抗原のホモログに対するよりも、より強力な結合親和性を有する抗体である。通常、種依存性抗体は、ヒト抗原に対して「特異的に結合する」（すなわち、たった約１×１０^−７Ｍ、好ましくはたった約１×１０^−８Ｍ、そして最も好ましくはたった約１×１０^−９Ｍの結合親和性（Ｋｄ）値を有する）が、第２の非ヒト哺乳動物種由来の抗原のホモログに対しては、ヒト抗原に対するその結合親和性よりも、少なくとも約５０倍、または少なくとも約５００倍、または少なくとも約１０００倍弱い結合親和性を有する。種依存性抗体は、上記の抗体の様々な型のいずれかであり得るが、好ましくはヒト化抗体またはヒト抗体である。

「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチド」とは、本明細書に記載したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに好ましくは特異的に結合するオリゴペプチドである。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドは、公知のオリゴペプチド合成法を用いて化学的に合成され得るか、または組換え技術を用いて調製および精製され得る。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドは、通常、約５アミノ酸長または少なくとも約５アミノ酸長、あるいは約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９または１００アミノ酸長またはそれ以上、または少なくとも約６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９または１００アミノ酸長またはそれ以上であり、ここでこのようなオリゴペプチドは、本明細書に記載したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができる。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合オリゴペプチドは、周知の手法を用いて過度の実験を行うことなく同定され得る。この点に関し、ポリペプチド標的に特異的に結合することができるオリゴペプチドについてオリゴペプチドライブラリーをスクリーニングするための手法が当該分野で周知であることに注意されたい（例えば、米国特許第５，５５６，７６２号、同第５，７５０，３７３号、同第４，７０８，８７１号、同第４，８３３，０９２号、同第５，２２３，４０９号、同第５，４０３，４８４号、同第５，５７１，６８９号、同第５，６６３，１４３号；ＰＣＴ公開ＷＯ８４／０３５０６およびＷＯ８４／０３５６４；Ｇｅｙｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．，８１：３９９８−４００２（１９８４）；Ｇｅｙｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．，８２：１７８−１８２（１９８５）；Ｇｅｙｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ Ｐｅｐｔｉｄｅｓ ａｓ Ａｎｔｉｇｅｎｓ，１３０−１４９（１９８６）；Ｇｅｙｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．，１０２：２５９−２７４（１９８７）；Ｓｃｈｏｏｆｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４０：６１１−６１６（１９８８），Ｃｗｉｒｌａ，Ｓ．Ｅ．ｅｔ ａｌ．，（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８７：６３７８；Ｌｏｗｍａｎ，Ｈ．Ｂ． ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，３０：１０８３２；Ｃｌａｃｋｓｏｎ，Ｔ．ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ，３５２：６２４；Ｍａｒｋｓ，Ｊ．Ｄ．ｅｔ ａｌ．，（１９９１），Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８１；Ｋａｎｇ，Ａ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８８：８３６３およびＳｍｉｔｈ，Ｇ．Ｐ．（１９９１）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２：６６８を参照のこと）。

「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子」とは、本明細書に記載するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに好ましくは特異的に結合する本明細書に定義するオリゴペプチドまたは抗体以外の有機分子である。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子は、公知の方法を用いて同定および化学的に合成され得る（例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ００／００８２３およびＷＯ００／３９５８５を参照のこと）。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合有機分子は、通常、約２０００ダルトン未満の大きさであるか、あるいは、約１５００、７５０、５００、２５０または２００ダルトン未満の大きさであり、ここで本明細書に記載するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができるこのような有機分子は、周知の手法を用いて過度の実験を行うことなく同定され得る。この点に関し、ポリペプチド標的に結合できる分子について有機分子ライブラリーをスクリーニングする手法が当該分野で周知であることに注意されたい（例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ００／００８２３およびＷＯ００／３９５８５を参照のこと）。

目的の抗原、例えば、腫瘍関連ポリペプチド抗原標的に「結合する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、好ましくは、抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子が抗原を発現している細胞または組織をターゲティングする場合の診断薬および／または処置薬として有用であり、そして他のタンパク質とは、有意な交差反応を起こさないような十分な親和性で抗原に結合するものである。「非標的」タンパク質への抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子の結合の程度は、蛍光励起細胞分取（ＦＡＣＳ）解析または放射免疫沈降（ＲＩＡ）により測定した場合に、抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子のその特定の標的タンパク質への結合の約１０％未満である。標的分子への抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子の結合に関しては、特定のポリペプチドまたは特定のポリペプチド標的上のエピトープに対して、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」または「特異的である」は、非特異的な相互作用とは測定可能な差違がある結合を意味する。特異的結合は、例えば、一般には結合活性を有しない同様の構造の分子であるコントロール分子の結合と比較して分子の結合を決定することにより測定することができる。例えば、特異的結合は、標的と同様のコントロール分子、例えば、過剰量の非標識標的との競合により決定できる。この場合、プローブへの標識標的の結合が、過剰な非標識標的により競合的に抑制された場合に、特異的結合が示唆される。本明細書において使用されるとき、特定のポリペプチドまたは特定のポリペプチド標的上のエピトープに対して、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」または「特異的である」は、例えば、少なくとも約１０^−４Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−５Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−６Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−７Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−８Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−９Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−１０Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−１１Ｍ、あるいは少なくとも約１０^−１２Ｍまたはそれ以上の、標的に対するＫｄを有する分子により示され得る。用語「特異的結合」は、分子が他の任意のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープに実質的に結合することなく特定のポリペプチドまたは特定のポリペプチド上のエピトープに結合する場合の結合のことをいう。

「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０」を発現する腫瘍細胞の成長を「抑制する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子あるいは「成長抑制性の」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、適切なＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現または過剰発現する癌細胞の測定可能な成長抑制をもたらすものである。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、癌細胞の表面上に発現された膜貫通ポリペプチドであってもよいし、または、癌細胞により産生および分泌されるポリペプチドであってもよい。好ましい成長抑制性の抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体、オリゴペプチドまたは有機分子は、適切なコントロールと比較して、２０％または２０％超、好ましくは約２０％〜約５０％、さらに好ましくは５０％または５０％超（例えば、約５０％〜約１００％）で、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０発現腫瘍細胞の成長を抑制し、ここでコントロールは代表的には、試験される抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子で処置されていない腫瘍細胞である。成長抑制は、細胞培養物中、約０．１〜３０μｇ／ｍＬまたは約０．５ｎＭ〜２００ｎＭの抗体濃度において測定することができ、ここで成長抑制は、抗体への腫瘍細胞の曝露から１〜１０日後に測定される。ｉｎ ｖｉｖｏの腫瘍細胞の成長抑制は、様々な方法で決定できる。抗体は、約１μｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重において抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を投与した場合に抗体の初回投与から約５日〜３ヶ月以内、好ましくは約５〜３０日以内に腫瘍の大きさまたは腫瘍細胞の増殖の低減がもたらされる場合にｉｎ ｖｉｖｏで成長抑制性となる。

「アポトーシスを誘導する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、アネキシンＶの結合、ＤＮＡのフラグメント化、細胞収縮、小胞体の拡張、細胞の断片化および／または膜ベシクル（アポトーシス体と称する）の形成により判断されるプログラムされた細胞死を誘導するものである。細胞は、通常、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを過剰発現するものである。好ましくは、細胞は、腫瘍細胞、例えば、前立腺、乳房、卵巣、胃、子宮内膜、肺、腎臓、結腸、膀胱の細胞である。アポトーシスに関連する細胞事象を評価するために様々な方法が利用できる。例えば、ホスファチジルセリン（ＰＳ）転座は、アネキシン結合により測定でき；ＤＮＡフラグメント化は、ＤＮＡラダー化を介して評価でき；そして、ＤＮＡフラグメント化に伴う核／クロマチン縮合は、低二倍体細胞の任意の増大により評価できる。好ましくは、アポトーシスを誘導する抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、アネキシン結合アッセイにおいて非投与の細胞と比較してアネキシン結合の約２〜５０倍、好ましくは約５〜５０倍、そして最も好ましくは約１０〜５０倍の誘導をもたらすものである。

抗体の「エフェクター機能」は、抗体のＦｃ領域（ネイティブ配列のＦｃ領域またはアミノ酸配列改変体のＦｃ領域）に起因し得る生物学的活性のことをいい、そして、抗体アイソタイプと共に変動する。抗体エフェクター機能の例としては、Ｃ１ｑ結合および補体依存性細胞傷害；Ｆｃレセプター結合；抗体依存性細胞媒介性細胞傷害（ＡＤＣＣ）；貪食作用；細胞表面レセプター（例えば、Ｂ細胞レセプター）のダウンレギュレーション；およびＢ細胞活性化が挙げられる。

「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害」すなわち「ＡＤＣＣ」とは、特定の細胞傷害性細胞（例えば、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、好中球およびマクロファージ）上に存在するＦｃレセプター（ＦｃＲ）に結合している分泌Ｉｇにより、これらの細胞傷害性エフェクター細胞が抗原担持標的細胞に特異的に結合し、そしてその後、細胞毒素により標的細胞を殺滅することができるようにするという細胞傷害の形態のことをいう。抗体は、細胞傷害性細胞を「武装」させ、そしてそのような殺滅のために絶対に必要なものである。ＡＤＣＣを媒介する主要な細胞であるＮＫ細胞は、ＦｃγＲＩＩＩのみを発現するのに対し、単球は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩおよびＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞上のＦｃＲの発現は、Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４５７−９２（１９９１）の４６４ページの表３に総括されている。目的の分子のＡＤＣＣ活性を評価するためには、米国特許第５，５００，３６２号または同第５，８２１，３３７号に記載されているようなｉｎ ｖｉｔｒｏのＡＤＣＣアッセイを実施してよい。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）およびナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が挙げられる。あるいは、または追加的に、目的の分子のＡＤＣＣ活性は、例えば、Ｃｌｙｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，９５：６５２−６５６（１９９８）に開示されているような動物モデルにおいてｉｎ ｖｉｖｏで評価してよい。

「Ｆｃレセプター」すなわち「ＦｃＲ」は、抗体のＦｃ領域に結合するレセプターを説明する。好ましいＦｃＲは、ネイティブ配列のヒトＦｃＲである。さらに、好ましいＦｃＲは、ＩｇＧ抗体に結合するもの（γレセプター）であり、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩおよびＦｃγＲＩＩＩのサブクラスのレセプターが挙げられ、これらのレセプターの対立遺伝子改変体および選択的スプライシング型も含まれる。ＦｃγＲＩＩレセプターは、ＦｃγＲＩＩＡ（「活性化レセプター」）およびＦｃγＲＩＩＢ（「抑制レセプター」）を包含し、これらはその細胞質ドメインにおいて主に異なっている類似のアミノ酸配列を有する。活性化レセプターＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメイン中に免疫受容活性化チロシンモチーフ（ＩＴＡＭ）を含む。抑制レセプターＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインに免疫受容抑制性チロシンモチーフ（ＩＴＩＭ）を含む（Ｄａｅｒｏｎ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５：２０３−２３４（１９９７）の概説Ｍを参照のこと）。ＦｃＲは、Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４５７−４９２（１９９１）；Ｃａｐｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｏｍｅｔｈｏｄｓ ４：２５−３４（１９９４）；およびｄｅ Ｈａａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｌａｂ．Ｃｌｉｎ．Ｍｅｄ．１２６：３３０−４１（１９９５）において概説されている。将来同定されるものを含む他のＦｃＲは、本明細書においては用語「ＦｃＲ」に包含される。この用語はまた、胎児への母体ＩｇＧの移行の原因となる新生児レセプターＦｃＲｎも含む（Ｇｕｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１７：５８７（１９７６）およびＫｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２４：２４９（１９９４））。

「ヒトエフェクター細胞」は、１つ以上のＦｃＲを発現し、エフェクター機能を示す白血球である。好ましくは、この細胞は、少なくともＦｃγＲＩＩＩを発現し、そしてＡＤＣＣエフェクター機能を示す。ＡＤＣＣを媒介するヒト白血球の例としては、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、単球、細胞傷害性Ｔ細胞および好中球が挙げられ；ＰＢＭＣおよびＮＫ細胞が好ましい。エフェクター細胞は、天然の起源から、例えば、血液から単離され得る。

「補体依存性細胞傷害」すなわち「ＣＤＣ」は、補体の存在下における標的細胞の溶解のことをいう。古典的補体経路の活性化は、その同種抗原に結合している（適切なサブクラスの）抗体に補体系の第１成分（Ｃ１ｑ）が結合することにより開始される。補体活性化を評価するためには、例えば、Ｇａｚｚａｎｏ−Ｓａｎｔｏｒｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０２：１６３（１９９６）に記載されているようなＣＤＣアッセイを実施してよい。

用語「癌」および「癌性の」は、代表的には調節されていない細胞の成長を特徴とする哺乳動物における生理学的状態のことをいうか、それを説明するものである。癌の例としては、癌腫、リンパ種、芽腫、肉腫および白血病が挙げられるがこれらに限定されない。このような癌のより特定の例としては、扁平上皮癌、肺癌（小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌および肺の扁平上皮癌）、腹膜の癌、肝細胞癌、胃癌（消化器癌を含む）、膵癌、神経膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、結腸癌、直腸結腸癌、子宮体癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝癌、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝臓癌種および様々な型の頭頚部癌ならびにＢ細胞リンパ腫（低悪性度／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）；小リンパ球性（ＳＬ）ＮＨＬ；中悪性度／濾胞性ＮＨＬ；中悪性度のびまん性ＮＨＬ；高悪性度の免疫芽球性ＮＨＬ；高悪性度のリンパ芽球性ＮＨＬ；高悪性度の小型非分割細胞ＮＨＬ；嵩高い疾患（ｂｕｌｋｙ ｄｉｓｅａｓｅ）ＮＨＬ；マントル細胞リンパ腫；ＡＩＤＳ関連リンパ腫；およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症を含む）；慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）；急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）；ヘアリー細胞白血病；慢性骨髄芽球性白血病；および移植後のリンパ増殖性障害（ＰＴＬＤ）が挙げられる。好ましくは、癌は、ＩＧＦレセプターを発現する腫瘍、より好ましくは乳癌、肺癌、直腸結腸癌または前立腺癌、そして最も好ましくは乳癌または前立腺癌を含む。

「化学療法剤」とは、癌の処置において有用な化合物である。化学療法剤の例としては、アルキル化剤（例えば、チオテパおよびＣＹＴＯＸＡＮ（登録商標）シクロホスファミド）；スルホン酸アルキル（例えば、ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン）；アジリジン（例えば、ベンゾドパ（ｂｅｎｚｏｄｏｐａ）、カルボコン、メツレドパ（ｍｅｔｕｒｅｄｏｐａ）およびウレドパ（ｕｒｅｄｏｐａ））；エチレンイミンおよびメチラメラミン（アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミド（ｔｒｉｅｔｈｉｙｌｅｎｅｔｈｉｏｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｅ）およびトリメチロールメラミン（ｔｒｉｍｅｔｈｙｌｏｌｏｍｅｌａｍｉｎｅ）を含む）；アセトゲニン（特にブラタシンおよびブラタシノン）；カンプトテシン（合成アナログトポテカンを含む）；ブリオスタチン；カリスタチン（ｃａｌｌｙｓｔａｔｉｎ）；ＣＣ−１０６５（アドゼレシン、カルゼレシン（ｃａｒｚｅｌｅｓｉｎ）およびビゼレシン合成アナログを含む）；クリプトフィシン（ｃｒｙｐｔｏｐｈｙｃｉｎ）（特にクリプトフィシン１およびクリプトフィシン８）；ドラスタチン；デュオカルマイシン（合成アナログ、ＫＷ−２１８９およびＣＢ１−ＴＭ１を含む）；エレウテロビン（ｅｌｅｕｔｈｅｒｏｂｉｎ）；パンクラチスタチン（ｐａｎｃｒａｔｉｓｔａｔｉｎ）；サルコジクチン（ｓａｒｃｏｄｉｃｔｙｉｎ）；スポンジスタチン（ｓｐｏｎｇｉｓｔａｔｉｎ）；ナイトロジェンマスタード（例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド（ｃｈｏｌｏｐｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミン、メルファラン、ノベンブシン（ｎｏｖｅｍｂｉｃｈｉｎ）、フェネステリン（ｐｈｅｎｅｓｔｅｒｉｎｅ）、プレドニムスチン（ｐｒｅｄｎｉｍｕｓｔｉｎｅ）、トロフォスファミド（ｔｒｏｆｏｓｆａｍｉｄｅ）、ウラシルマスタード）；ニトロソ尿素（ｎｉｔｒｏｓｕｒｅａ）（例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、ホテムスチン（ｆｏｔｅｍｕｓｔｉｎｅ）、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムヌスチン（ｒａｎｉｍｎｕｓｔｉｎｅ））；抗生物質（例えば、エネジン抗生物質（例えば、カリケアマイシン、特にカリケミシンガンマ１ＩおよびカリケミシンオメガＩ１（例えば、Ａｇｎｅｗ，Ｃｈｅｍ Ｉｎｔｌ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．，３３：１８３−１８６（１９９４）を参照のこと）；ジネマイシン（ｄｙｎｅｍｉｃｉｎ）（ジネマイシンＡを含む）；ビスホスホネート、例えば、クロドロネート；エスペラミシン（ｅｓｐｅｒａｍｉｃｉｎ）；ならびにネオカルチノスタチン発色団および関連の色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団）、アクラシノマイシン（ａｃｌａｃｉｎｏｍｙｓｉｎ）、アクチノマイシン、オースラマイシン（ａｕｔｈｒａｍｙｃｉｎ）、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン（ｃａｒａｂｉｃｉｎ）、カルミノマイシン（ｃａｒｍｉｎｏｍｙｃｉｎ）、カルジノフィリン（ｃａｒｚｉｎｏｐｈｉｌｉｎ）、クロモマイシニス（ｃｈｒｏｍｏｍｙｃｉｎｉｓ）、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン（ｄｅｔｏｒｕｂｉｃｉｎ）、６−ジアゾ−５−オキソ−Ｌ−ノルロイシン、ＡＤＲＩＡＭＹＣＩＮ（登録商標）ドキソルビシン（モルホリノ−ドキソルビシン、シアノモルホリノ−ドキソルビシン、２−ピロリノ−ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む）、エピルビシン、エソルビシン（ｅｓｏｒｕｂｉｃｉｎ）、イダルビシン、マルセロマイシン（ｍａｒｃｅｌｌｏｍｙｃｉｎ）、マイトマイシン（例えば、マイトマイシンＣ、ミコフェノール酸、ノガラマイシン（ｎｏｇａｌａｍｙｃｉｎ）、オリボマイシン（ｏｌｉｖｏｍｙｃｉｎ）、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン（ｐｏｔｆｉｒｏｍｙｃｉｎ）、ピューロマイシン、クエラマイシン（ｑｕｅｌａｍｙｃｉｎ）、ロドルビシン（ｒｏｄｏｒｕｂｉｃｉｎ）、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン（ｔｕｂｅｒｃｉｄｉｎ）、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン；代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサートおよび５−フルオロウラシル（５−ＦＵ）；葉酸アナログ（例えば、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート；プリンアナログ（例えば、フルダラビン、６−メルカプトプリン、チアミプリン（ｔｈｉａｍｉｐｒｉｎｅ）、チオグアニン）；ピリミジンアナログ（例えば、アンシタビン、アザシチジン、６−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン）；アンドロゲン類（例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン；抗副腎剤（例えば、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン）；葉酸補給剤（例えば、フロリン酸（ｆｒｏｌｉｎｉｃ ａｃｉｄ））；アセグラトン；アルドホスファミドグリコシド；アミノレブリン酸；エニルウラシル（ｅｎｉｌｕｒａｃｉｌ）；アムサクリン；ベストラブシル（ｂｅｓｔｒａｂｕｃｉｌ）；ビサントレン（ｂｉｓａｎｔｒｅｎｅ）；エダトラキセート（ｅｄａｔｒａｘａｔｅ）；デホファミン（ｄｅｆｏｆａｍｉｎｅ）；デメコルチン；ジアジコン；エルフォルニチン（ｅｌｆｏｒｎｉｔｈｉｎｅ）；酢酸エリプチニウム（ｅｌｌｉｐｔｉｎｉｕｍ ａｃｅｔａｔｅ）；エポチロン；エトグルシド（ｅｔｏｇｌｕｃｉｄ）；硝酸ガリウム；ヒドロキシ尿素；レンチナン；ロニダイニン（ｌｏｎｉｄａｉｎｉｎｅ）；メイタンシノイド（例えば、メイタンシンおよびアンサミトシン（ａｎｓａｍｉｔｏｃｉｎ））；ミトグアゾン（ｍｉｔｏｇｕａｚｏｎｅ）；ミトキサントロン；モピダンモール（ｍｏｐｉｄａｎｍｏｌ）；ニトラエリン（ｎｉｔｒａｅｒｉｎｅ）；ペントスタチン；フェナメット（ｐｈｅｎａｍｅｔ）；ピラルビシン；ロソキサントロン（ｌｏｓｏｘａｎｔｒｏｎｅ）；ポドフィリン酸（ｐｏｄｏｐｈｙｌｌｉｎｉｃ ａｃｉｄ）；２−エチルヒドラジド；プロカルバジン；ＰＳＫ（登録商標）多糖類複合体（ＪＨＳ Ｎａｔｕｒａｌ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ，Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ）；ラゾキサン（ｒａｚｏｘａｎｅ）；リゾキシン；シゾフィラン；スピロゲルマニウム（ｓｐｉｒｏｇｅｒｍａｎｉｕｍ）；テヌアゾン酸；トリアジクオン（（ｔｒｉａｚｉｑｕｏｎｅ））；２，２’，２’’−トリクロロトリエチルアミン；トリコテシン（特にＴ−２トキシン、ベラクリン（ｖｅｒｒａｃｕｒｉｎ）Ａ、ロリジン（ｒｏｒｉｄｉｎ）Ａおよびアングイジン（ａｎｇｕｉｄｉｎｅ））；ウレタン；ビンデシン；ダカルバジン；マンノムスチン；ミトブロニトール；ミトラクトール（ｍｉｔｏｌａｃｔｏｌ）；ピポブロマン；ガシトシン（ｇａｃｙｔｏｓｉｎｅ）；アラビノシド（「Ａｒａ−Ｃ」）；シクロホスファミド；チオテパ；タキソイド（例えば、ＴＡＸＯＬ（登録商標）パクリタキセル（Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ，Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ，ＮＪ）、ＡＢＲＡＸＡＮＥ^ＴＭクレモホル（Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ）非含有、パクリタキセルのアルブミン操作ナノ粒子処方物（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐａｒｔｎｅｒｓ，Ｓｃｈａｕｍｂｅｒｇ，Ｉｌｌｉｎｏｉｓ）およびＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標）ドキセタキセル（ｄｏｘｅｔａｘｅｌ）（Ｒｈｏｎｅ−Ｐｏｕｌｅｎｃ Ｒｏｒｅｒ、Ａｎｔｏｎｙ，Ｆｒａｎｃｅ）；クロランブシル（ｃｈｌｏｒａｎｂｕｃｉｌ）；ＧＥＭＺＡＲ（登録商標）ゲムシタビン；６−チオグアニン；メルカプトプリン；メトトレキサート；白金アナログ（例えば、シスプラチンおよびカルボプラチン）；ビンブラスチン；白金；エトポシド（ＶＰ−１６）；イホスファミド；ミトキサントロン；ビンクリスチン；ＮＡＶＥＬＢＩＮＥ（登録商標）ビノレルビン；ノバントロン；テニポシド；エダトレキセート（ｅｄａｔｒｅｘａｔｅ）；ダウノマイシン；アミノプテリン；キセロダ（ｘｅｌｏｄａ）；イバンドロネート；ＣＰＴ−１１；トポイソメラーゼインヒビターＲＦＳ２０００；ジフルオロメチルオルニチン（ｄｉｆｌｕｏｒｏｍｅｔｌｈｙｌｏｒｎｉｔｈｉｎｅ）（ＤＭＦＯ）；レチノイド（例えば、レチノイン酸）；カペシタビン；および上記のいずれかの薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体が挙げられる。

この定義に同様に含まれるものは、腫瘍に対するホルモンの作用を制御または阻害する作用を有する抗ホルモン剤（例えば、抗エストロゲンおよび選択的エストロゲンレセプターモジュレーター（ｍｏｄｕｌａｔｏｒ）（ＳＥＲＭ）（タモキシフェン（例えば、ＮＯＬＶＡＤＥＸ（登録商標）タモキシフェンを含む）、ラロキシフェン、ドロロキシフェン、４−ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン（ｔｒｉｏｘｉｆｅｎｅ）、ケオキシフェン（ｋｅｏｘｉｆｅｎｅ）、ＬＹ１１７０１８、オナプリストン（ｏｎａｐｒｉｓｔｏｎｅ）およびＦＡＲＥＳＴＯＮトレミフェン；副腎におけるエストロゲン産生を制御する酵素アロマターゼを阻害するアロマターゼインヒビター（例えば、４（５）−イミダゾール、アミノグルテチミド、ＭＥＧＡＳＥ（登録商標）酢酸メゲストロール、ＡＲＯＭＡＳＩＮ（登録商標）エキセメスタン、フォルメスタニー（ｆｏｒｍｅｓｔａｎｉｅ）、ファドロゾール、ＲＩＶＩＳＯＲ（登録商標）ボロゾール（ｖｏｒｏｚｏｌｅ）、ＦＥＭＡＲＡ（登録商標）レトロゾールおよびＡＲＩＭＩＤＥＸ（登録商標）アナストロゾール）；および抗アンドロゲン（例えば、フルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリドおよびゴセレリン）；ならびにトロキサシタビン（ｔｒｏｘａｃｉｔａｂｉｎｅ）（１，３−ジオキソランヌクレオシドシトシンアナログ）；アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に例えば、ＰＫＣ−アルファ、ＲａｌｆおよびＨ−Ｒａｓなどの異常な細胞増殖に関与するとされるシグナリ伝達経路における遺伝子の発現を抑制するもの；リボザイム（例えば、ＶＥＧＦ発現インヒビター（例えば、ＡＮＧＩＯＺＹＭＥ（登録商標）リボザイム）およびＨＥＲ２発現インヒビター）；ワクチン（例えば、遺伝子療法ワクチン、例えば、ＡＬＬＯＶＥＣＴＩＮ（登録商標）ワクチン、ＬＥＵＶＥＣＴＩＮ（登録商標）ワクチンおよびＶＡＸＩＤ（登録商標）ワクチン；ＰＲＯＬＥＵＫＩＮ（登録商標）ｒＩＬ−２；ＬＵＲＴＯＴＥＣＡＮ（登録商標）トポイソメラーゼ１インヒビター；ＡＢＡＲＥＬＩＸ（登録商標）ｒｍＲＨ；および上記のいずれかの製薬上許容しうる塩、酸または誘導体である。

用語「細胞増殖性障害」および「増殖性障害」は、ある程度の異常な細胞増殖に関連する障害のことをいう。本発明の１つの態様において、細胞増殖性障害は、癌である。

「腫瘍」とは、本明細書中で使用されるとき、悪性良性に関わらずすべての新生物細胞の成長および増殖ならびにすべての前癌および癌性の細胞および組織のことをいう。

「細胞死を誘導する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、生存細胞を非生存性とするものである。その細胞は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現するもの、好ましくは同じ組織型の正常細胞と比較してＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを過剰発現する細胞である。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、癌細胞表面に発現される膜貫通ポリペプチドであってもよいし、または、癌細胞により産生され分泌されるポリペプチドであってもよい。好ましくは、その細胞は、癌細胞、例えば、乳房、卵巣、胃、子宮内膜、唾液腺、肺、腎臓、結腸、甲状腺、膵臓または膀胱の細胞である。ｉｎ ｖｉｔｒｏでの細胞死は、抗体依存性細胞媒介細胞傷害（ＡＤＣＣ）または補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）により誘導された細胞死を識別するために補体および免疫エフェクター細胞の非存在下において決定され得る。すなわち、細胞死に関するアッセイは、熱不活性化血清を用い（すなわち補体非存在下において）、そして免疫エフェクター細胞の非存在下において実施され得る。抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子が細胞死を誘導することができるか否かを判定するためには、ヨウ化プロピジウム（ＰＩ）、トリパンブルー（Ｍｏｏｒｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃｙｔｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １７：１−１１（１９９５）を参照のこと）または７ＡＡＤの取り込みにより評価される膜完全性の喪失を、未処理細胞と比較して評価することができる。好ましい細胞死誘導性の抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、ＢＴ４７４細胞におけるＰＩ取り込みアッセイにおいてＰＩ取り込みを誘導するものである。

本明細書中で使用されるとき、用語「免疫接着物（ｉｍｍｕｎｏａｄｈｅｓｉｏｎ）」は、免疫グロブリンの定常ドメインのエフェクター機能に異種タンパク質の結合特異性（「接着」）を組み合わせた抗体様分子を表す。構造的には、免疫接着物は、抗体の抗原認識結合部位および抗原結合部位以外の所望の結合特異性を有する（すなわち「異種」）アミノ酸配列と免疫グロブリン定常ドメイン配列との融合を含む。免疫接着分子の接着部分は、代表的には、少なくともレセプターまたはリガンドの結合部位を含む隣接するアミノ酸配列である。免疫接着物における免疫グロブリン定常ドメイン配列は、任意の免疫グロブリン（例えば、ＩｇＧ−１、ＩｇＧ−２、ＩｇＧ−３またはＩｇＧ−４サブタイプ、ＩｇＡ（ＩｇＡ−１およびＩｇＡ−２を含む）、ＩｇＥ、ＩｇＤまたはＩｇＭ）から得てよい。

用語「標識」は、本明細書中で使用されるとき、「標識された」抗体を作製するために抗体に直接的または間接的に結合体化された検出可能な化合物または組成物のことをいう。標識は、それ自体が検出可能であり得る（例えば、放射性同位体標識または蛍光標識）か、または、酵素標識の場合は、検出可能な基質化合物または基質組成物の化学的改変を触媒し得る。

「複製防止剤」とは、アポトーシス、血管形成抑制、細胞増加、腫瘍殺傷、有糸分裂抑制、細胞周期進行遮断、細胞成長の停止、腫瘍への結合、細胞メディエーターとしての作用などの機序に関わらず、細胞の複製、機能および／または成長を抑制または防止するか、または細胞を破壊する薬剤である。そのような薬剤としては、化学療法剤、細胞傷害性薬剤、サイトカイン、成長抑制剤もしくは抗ホルモン剤、例えば、抗エストロゲン化合物（例えば、タモキシフェン、オナプリストン（ＥＰ６１６８１２参照）などの抗プロゲステロン；またはフルタミドなどの抗アンドロゲン、ならびにアロミダーゼインヒビターまたはアンドロゲンなどのホルモン剤が挙げられる。

用語「細胞傷害性薬剤」は、本明細書中で使用されるとき、細胞の機能を抑制または防止および／または細胞の破壊を引き起こす物質のことをいう。この用語は、放射性同位体（例えば、Ａｔ^２１１、Ｉ^１３１、Ｉ^１２５、Ｙ^９０、Ｒｅ^１８６、Ｒｅ^１８８、Ｓｍ^１５３、Ｂｉ^２１２、Ｐ^３２およびＬｕの放射性同位体）、化学療法剤、例えば、メトトレキサート、アドリアマイシン（ａｄｒｉａｍｉｃｉｎ）、ビンカアルカロイド（ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド）、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシル、ダウノルビシンまたは他のインターカレート剤、酵素およびそのフラグメント（例えば、核溶解酵素、抗生物質およびトキシン（例えば、細菌、真菌、植物または動物起源の小分子トキシンまたは酵素活性トキシン（これらのフラグメントおよび／または改変体を含む）、および後述する様々な抗腫瘍剤または抗癌剤を含むと意図される。他の細胞傷害性薬剤は、下に記載する。殺腫瘍傷性薬剤は、腫瘍細胞の破壊をもたらす。

本明細書においてアンタゴニストと組み合わせて使用するための特定の腫瘍型に対する本明細書中の好ましい細胞傷害性薬剤は、以下の通りである：
１．前立腺癌：アンドロゲン、ドセタキセル、パクリタキセル、エストラムスチン、ドキソルビシン、ミトキサントロン、ＥｒｂＢ２の細胞外ドメイン（例えば、ＥｒｂＢ２のおよそ残基２２〜およそ残基５８４の領域における残基の任意の１つ以上）の領域に結合する２Ｃ４（ＷＯ０１／００２４５；ハイブリドーマＡＴＣＣ ＨＢ−１２６９７）などのＥｒｂＢ２ドメインに対する抗体、ＡＶＡＳＴＩＮ^ＴＭ抗血管内皮細胞成長因子（ＶＥＧＦ）、ＴＡＲＣＥＶＡ^ＴＭＯＳＩ−７７４（エルロチニブ）（Ｇｅｎｅｎｅｔｅｃｈ ａｎｄ ＯＳＩ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ）または他の表皮成長因子レセプターチロシンキナーゼインヒビター（ＥＧＦＲ ＴＫＩ）。
２．胃癌：５−フルオロウラシル（５ＦＵ）、ＸＥＬＯＤＡ^ＴＭカペシタビン、メトトレキサート、エトポシド、シスプラチン／カルボプラチン、パクリタキセル（ｐａｃｌｉｉｔａｘｅｌ）、ドセタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシンおよびＣＰＴ−１１（カンプトテシン（ｃａｍｐｔｏｔｈｃｉｎ）−１１；イリノテカン、米国商標名：ＣＡＭＰＴＯＳＡＲ（登録商標））。
３．膵臓癌：ゲムシタビン、５ＦＵ、ＸＥＬＯＤＡ^ＴＭカペシタビン、ＣＰＴ−１１、ドセタキセル、パクリタキセル、シスプラチン、カルボプラチン、ＴＡＲＣＥＶＡ^ＴＭエルロチニブおよび他のＥＧＦＲ ＴＫＩ。
４．直腸結腸癌：５ＦＵ、ＸＥＬＯＤＡ^ＴＭカペシタビン、ＣＰＴ−１１、オキサリプラチン、ＡＶＡＳＴＩＮ^ＴＭ抗ＶＥＧＦ、ＴＡＲＣＥＶＡ^ＴＭエルロチニブおよび他のＥＧＦＲ ＴＫＩならびにＥＧＦＲに結合しレセプター活性化および腫瘍へのシグナル伝達を開始するＥＧＦの能力を阻止するＥＲＢＩＴＵＸ^ＴＭ（旧称ＩＭＣ−Ｃ２２５）ヒト：マウス−キメラ化モノクローナル抗体。
５．腎臓癌：ＩＬ−２、インターフェロンアルファ、ＡＶＡＳＴＩＮ^ＴＭ抗ＶＥＧＦ、ＭＥＧＡＣＥ^ＴＭ（酢酸メゲストロール）プロゲスチン、ビンブラスチン、ＴＡＲＣＥＶＡ^ＴＭエルロチニブおよび他のＥＧＦＲ ＴＫＩ。

「成長抑制剤」とは、本明細書中で使用されるとき、細胞、特に、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏのいずれかにおけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０発現癌細胞の成長を抑制する化合物または組成物のことをいう。すなわち、成長抑制剤は、Ｓ期におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０発現細胞の比率を有意に低減させるものであり得る。成長抑制剤の例としては、細胞周期の進行を阻止する（Ｓ期以外の位置において）薬剤（例えば、Ｇ１停止およびＭ期停止を誘導する薬剤）が挙げられる。従来のＭ期遮断薬としては、ビンカ（ビンクリスチンおよびビンブラスチン）、タキサンおよびトポイソメラーゼＩＩインヒビター（例えば、ドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシドおよびブレオマイシン）が挙げられる。Ｇ１を停止させる薬剤、例えば、ＤＮＡアルキル化剤（例えば、タモキシフェン、プレドニソン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキサート、５−フルオロウラシルおよびａｒａ−Ｃ）はまた、Ｓ期停止にまで及ぶ。さらなる情報は、Ｔｈｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂａｓｉｓ ｏｆ Ｃａｎｃｅｒ，Ｍｅｎｄｅｌｓｏｈｎ ａｎｄ Ｉｓｒａｅｌ，ｅｄｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ １，“Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ，ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ，ａｎｄ ａｎｔｉｎｅｏｐｌａｓｔｉｃ ｄｒｕｇｓ”，Ｍｕｒａｋａｍｉ ｅｔ ａｌ．，（ＷＢ Ｓａｕｎｄｅｒｓ：Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，１９９５）の特に１３ページに見ることができる。タキサン類（パクリタキセルおよびドセタキセル）は、共にイチイ属の木から得られた抗癌剤である。ヨーロッパイチイから得られたドセタキセル（ＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標）、Ｒｈｏｎｅ−Ｐｏｕｌｅｎｃ Ｒｏｒｅｒ）は、パクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標）、Ｂｒｉｓｔｏｌ−Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）の半合成アナログである。パクリタキセルおよびドセタキセルは、チューブリン２量体からの微小管の組立を促進し、そして脱重合の防止によって微小管を安定化させることにより、細胞の有糸分裂の抑制をもたらす。

「ドキソルビシン」は、アントラサイクリン抗生物質である。ドキソルビシンの完全な化学名は、（８Ｓ−シス）−１０−［（３−アミノ−２，３，６−トリデオキシ−α−Ｌ−リキソ−ヘキサピラノシル）オキシ］−７，８，９，１０−テトラヒドロ−６，８，１１−トリヒドロキシ−８−（ヒドロキシアセチル）−１−メトキシ−５，１２−ナフタセンジオンである。

用語「サイトカイン」は、ある細胞集団により放出され、細胞間メディエーターとして別の細胞に作用するタンパク質に関する総称である。このようなサイトカインの例は、リンフォカイン、モノカインおよび従来のポリペプチドホルモンである。サイトカインに含まれるものは、成長ホルモン（例えば、ヒト成長ホルモン、Ｎ−メチオニルヒト成長ホルモンおよびウシ成長ホルモン）；副甲状腺ホルモン；チロキシン；インスリン；プロインスリン；レラキシン；プロレラキシン；糖タンパク質ホルモン（例えば、卵胞刺激ホルモン（ＦＳＨ）、甲状腺刺激ホルモン（ＴＳＨ）および黄体形成ホルモン（ＬＨ））；肝成長因子；線維芽細胞成長因子；プロラクチン；胎盤性ラクトーゲン；腫瘍壊死因子−αおよび−β；ミューラー阻害物質；マウスゴナドトロピン関連ペプチド；インヒビン；アクチビン；血管内皮成長因子；インテグリン；トロンボポエチン（ＴＰＯ）；神経成長因子（例えば、ＮＧＦ−β）；血小板成長因子；トランスフォーミング成長因子（ＴＧＦ）（例えば、ＴＧＦ−αおよびＴＧＦ−β）；インスリン様成長因子−Ｉおよび−ＩＩ；エリスロポエチン（ＥＰＯ）；骨誘導因子（ｏｓｔｅｏｉｎｄｕｃｔｉｖｅ ｆａｃｔｏｒ）；インターフェロン（例えば、インターフェロン−α、−βおよび−γ）；コロニー刺激因子（ＣＳＦ）（例えば、マクロファージ−ＣＳＦ（Ｍ−ＣＳＦ））；顆粒球−マクロファージ−ＣＳＦ（ＧＭ−ＣＳＦ）；および顆粒球−ＣＳＦ（Ｇ−ＣＳＦ）；インターロイキン（ＩＬ）（例えば、ＩＬ−１、ＩＬ−１ａ、ＩＬ−２、ＩＬ−３、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−６、ＩＬ−７、ＩＬ−８、ＩＬ−９、ＩＬ−１１、ＩＬ−１２）；腫瘍壊死因子（例えば、ＴＮＦ−αまたはＴＮＦ−β）；および他のポリペプチド因子（ＬＩＦおよびキットリガンド（ＫＬ）を含む）である。本明細書中で使用されるとき、用語サイトカインは、天然起源由来または組換え細胞培養物由来のタンパク質およびネイティブ配列のサイトカインの生物学的活性同等物を含む。

用語「添付文書」とは、治療用製品の市販用パッケージ内に慣習的に含まれる指示書のことをいうために用いられ、そのような治療用製品の使用に関する適応症、使用法、用量、投与、禁忌および／または警告に関する情報を含んでいる。

用語「遺伝子」とは、（ａ）本明細書に開示したＤＮＡ配列の少なくとも１つを含む遺伝子；（ｂ）本明細書中で開示するＤＮＡ配列によりコードされるアミノ酸配列をコードする任意のＤＮＡ配列および／または（ｃ）本明細書中で開示するコード配列の相補物にハイブリダイズする任意のＤＮＡ配列のことをいう。好ましくは、この用語は、コード領域ならびに非コード領域を含み、好ましくは、正常な遺伝子発現に必要なすべての配列を包む。

用語「遺伝子ターゲティング」とは、ゲノムＤＮＡフラグメントが哺乳動物細胞内に導入され、そしてそのフラグメントが内在性の相同配列を特定して組換えを起こす場合に生じる相同組換えの型のことをいう。相同組換えによる遺伝子ターゲティングは、特定のゲノム配列を特定の設計の外因性ＤＮＡと置き換える組換えＤＮＡ技術を使用する。

用語「相同組換え」とは、相同なヌクレオチド配列の部位における２つのＤＮＡ分子または染色分体の間のＤＮＡフラグメントの交換のことをいう。

用語「標的遺伝子」（あるいは「標的遺伝子配列」または「標的ＤＮＡ配列」とも呼ばれる）は、相同組換えにより改変されるべき任意の核酸分子、ポリヌクレオチドまたは遺伝子のことをいう。標的配列は、インタクトな遺伝子、エクソンもしくはイントロン、調節配列または遺伝子間の任意の領域を含む。標的遺伝子は、個々のゲノムＤＮＡにおける特定の遺伝子または遺伝子座の一部分を含み得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の「破壊」は、ゲノムＤＮＡフラグメントが内在性の相同配列を特定して組換えを起こす場合に生じ、ここで、破壊とは、ネイティブの遺伝子もしくはその一部分の欠失であるか、またはネイティブの遺伝子の変異であるか、あるいは、破壊は、ネイティブの遺伝子の機能的不活性化である。あるいは、配列の破壊は、遺伝子トラップベクターを用いた非特異的な挿入性の不活性化により生じてもよい（すなわち、ランダムに挿入されたトランスジーンを含み、発現する非ヒトトランスジェニック動物；例えば、２００２年８月２０日に発行された米国特許第６，４３６，７０７号を参照のこと）。これらの配列の破壊または改変としては、ＤＮＡ配列の挿入、ミスセンス、フレームシフト、欠失または置換もしくは置き換えあるいはそれらの任意の組合せが挙げられ得る。挿入は、動物、植物、真菌、昆虫、原生動物またはウイルス起源であり得る遺伝子全体の挿入を含む。破壊は、例えば、正常な遺伝子産物の産生を部分的または完全に抑制するか、または正常な遺伝子産物の活性を増強することにより、その正常な遺伝子産物を変更することができる。好ましくは、破壊は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の有意な発現がないヌル破壊（ｎｕｌｌ ｄｉｓｒｕｐｔｉｏｎ）である。

用語「ネイティブの発現」とは、野生型マウスにおいて存在する発現レベルにおけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子によりコードされる完全長ポリペプチドの発現のことをいう。すなわち、内在性ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の「ネイティブの発現が無い」破壊とは、哺乳動物の単一の細胞、選択された細胞またはすべての細胞の内在性ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子によりコードされるポリペプチドの少なくとも一部分の発現の部分的または完全な低下のことをいう。

用語「ノックアウト」とは、破壊によりネイティブの遺伝子の機能的不活性化；ネイティブ遺伝子またはその一部分の欠失；またはネイティブの遺伝子の変異がもたらされるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の破壊のことをいう。

用語「ノックイン」とは、特定のヒトＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード遺伝子またはその改変体のいずれかをコードするヒトｃＤＮＡによるマウスオルソログ（または他のマウス遺伝子）の置き換えのことをいう（すなわちこの破壊は、ネイティブのマウス遺伝子とネイティブのヒト遺伝子との置き換えをもたらす）。

用語「構築物」または「ターゲティング構築物」とは、標的の組織、細胞株または動物内に移行されるべき人工的に組み立てられたＤＮＡセグメントのことをいう。代表的には、ターゲティング構築物は、特定の目的の遺伝子または核酸配列、マーカー遺伝子および適切なコントロール配列を含む。本明細書中で提供されるように、ターゲティング構築物は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ターゲティング構築物を含む。「ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ターゲティング構築物」は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の少なくとも一部分に相同なＤＮＡ配列を包み、そして、宿主細胞内でＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の破壊を生じさせることができる。

用語「トランスジェニック細胞」とは、そのゲノム内に、遺伝子ターゲティングの方法により完全にまたは部分的に破壊、改変、変更されているか、または置き換えられているＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子を含む細胞のことをいう。

用語「トランスジェニック動物」とは、本明細書に記載した方法または当該分野で周知の他の方法により破壊または他の方法で改変または変異されている特定の遺伝子をそのゲノム内に含む動物のことをいう。好ましくは、その非ヒトトランスジェニック動物は、哺乳動物である。より好ましくは、その哺乳動物は、げっ歯類（例えば、ラットまたはマウス）である。さらに、「トランスジェニック動物」は、ヘテロ接合の動物（すなわち、１つの欠損対立遺伝子および１つの野生型対立遺伝子）またはホモ接合の動物（すなわち、２つの欠損対立遺伝子）であり得る。胚は、動物の定義内に属するとみなす。動物を提供することは、胚が在胎期を満了するかどうかにかかわらず、交配もしくは他の方法によって、子宮内に胚または胎児を提供することを含む。

本明細書中で使用されるとき、用語「選択マーカー」および「位置選択マーカー」とは、遺伝子を有している細胞のみを特定の条件下で生存および／または成長させることができる、ある産物をコードする遺伝子のことをいう。例えば、導入されたネオマイシン耐性（Ｎｅｏ^ｒ）遺伝子を発現する植物細胞および動物細胞は、化合物Ｇ４１８に耐性である。Ｎｅｏ^ｒ遺伝子マーカーを有しない細胞は、Ｇ４１８により殺滅される。他の陽性選択マーカーは、当業者に公知であるか、または推測できるものである。

用語「調節する」または「調節」は、本明細書中で使用されるとき、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の機能、発現、活性あるいはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子に関連する表現型の減少、抑制、低減、寛解、増大または増強のことをいう。

用語「寛解する」または「寛解」は、本明細書中で使用されるとき、状態、疾患、障害または表現型（異常または症状を含む）の減少、低減または排除のことをいう。

用語「異常」とは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の関与が示唆される任意の疾患、障害、状態または表現型（病的状態および行動観察結果を含む）のことをいう。

表２
ＰＲＯ ＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸ（長さ＝１５アミノ酸）
比較タンパク質 ＸＸＸＸＸＹＹＹＹＹＹＹ （長さ＝１２アミノ酸）
％アミノ酸配列同一性＝
ＡＬＩＧＮ−２により決定した場合の２つのポリペプチド配列の間の同一で一致するアミノ酸残基の数）÷（ＰＲＯポリペプチドのアミノ酸残基の総数）＝
５÷１５＝３３．３％
表３
ＰＲＯ ＸＸＸＸＸＸＸＸＸＸ （長さ＝１０アミノ酸）
比較タンパク質 ＸＸＸＸＸＹＹＹＹＹＹＺＺＹＺ（長さ＝１５アミノ酸）
％アミノ酸配列同一性＝
ＡＬＩＧＮ−２により決定した場合の２つのポリペプチド配列の間の同一で一致するアミノ酸残基の数）÷（ＰＲＯポリペプチドのアミノ酸残基の総数）＝
５÷１０＝５０％
表４
ＰＲＯ−ＤＮＡ ＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮ （長さ＝１４ヌクレオチド）
比較ＤＮＡ ＮＮＮＮＮＮＬＬＬＬＬＬＬＬＬＬ（長さ＝１６ヌクレオチド）
％核酸配列同一性＝
ＡＬＩＧＮ−２により決定した場合の２つの核酸配列の間の同一で一致するヌクレオチドの数）÷（ＰＲＯ−ＤＮＡ核酸配列のヌクレオチドの総数）＝
６÷１４＝４２．９％
表５
ＰＲＯ−ＤＮＡ ＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮＮ（長さ＝１２ヌクレオチド）
比較ＤＮＡ ＮＮＮＮＬＬＬＶＶ （長さ＝９ヌクレオチド）
％核酸配列同一性＝
ＡＬＩＧＮ−２により決定した場合の２つの核酸配列の間の同一で一致するヌクレオチドの数）÷（ＰＲＯ−ＤＮＡ核酸配列のヌクレオチドの総数）＝
４÷１２＝３３．３％
ＩＩ．本発明の組成物および方法
Ａ．完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド
本発明は、本出願においてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと呼ばれるポリペプチドをコードする新規に同定され単離されたヌクレオチド配列を提供する。特に、様々なＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするｃＤＮＡが、後述する実施例においてさらに詳細に開示するように同定され、単離された。別の回の発現において産生されるタンパク質に異なるＰＲＯ番号を付与し得るが、ＵＮＱ番号は、任意の所与のＤＮＡおよびコードされるタンパク質に対して独自のものであり、変更することは無い。しかしながら、簡便のため、本明細書においては、本明細書中で開示する完全長のネイティブの核酸分子によりコードされるタンパク質ならびにＰＲＯの前記した定義に含まれるすべてのさらなるネイティブの相同体および改変体は、その起源または調製様式に関わらず、「ＰＲＯ／番号」と呼ぶ。

後述する実施例に開示するように、様々なｃＤＮＡクローンがＡＴＣＣに寄託されている。当業者は、これらのクローンの実際のヌクレオチド配列を、当該分野の日常的方法を用いて寄託クローンの配列決定により容易に決定することができる。予測されるアミノ酸配列は、日常的技術を用いてヌクレオチド配列から決定できる。本明細書に記載するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドおよびそれらをコードする核酸に関して、出願人は、その時点で利用可能な配列の情報を用いて最も同定可能であるリーディングフレームであると考えられるものを同定している。

Ｂ．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド改変体
本明細書に記載した完全長のネイティブ配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに加えて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体が調製可能であることが企図される。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ＤＮＡ内に適切なヌクレオチドの変化を導入することおよび／または所望のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの合成により、調製できる。アミノ酸の変化は、グリコシル化部位の数または位置を変化させたり、または、膜アンカー特性を改変させたりして、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの翻訳後のプロセスを改変し得ることは、当業者の知る通りである。

ネイティブ完全長配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは本明細書に記載したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの様々なドメインの変異は、例えば、米国特許第５，３６４，９３４号に記載されている保存的および非保存的な変異に関する手法および指針のいずれかを用いて形成することができる。変異は、ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと比較した場合に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアミノ酸配列の変化をもたらすＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする１つ以上のコドンの置換、欠失または挿入であり得る。必要に応じて、変異は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのドメインの１つ以上における他の任意のアミノ酸による少なくとも１つのアミノ酸の置換によるものであってもよい。所望の活性に悪影響を与えることなく、いずれのアミノ酸残基を挿入、置換または欠失させてよいかを決定する場合の指針は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの配列を相同な既知タンパク質分子の配列と比較することおよび相同性の高い領域で起こるアミノ酸配列の変化の数を最小限にすることにより見出され得る。アミノ酸置換は、１つのアミノ酸を同様の構造的および／または化学的特性を有する別のアミノ酸と置き換えること、例えば、ロイシンをセリンで置き換えること、すなわち保存的なアミノ酸の置き換えの結果であり得る。挿入および欠失は、必要に応じて約１〜５個のアミノ酸の範囲であってよい。許容される変異は、配列におけるアミノ酸の挿入、欠失または置換を系統的に行うことおよび得られた改変体を完全長または成熟ネイティブ配列により示される活性について試験することにより決定され得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドフラグメントが、本明細書において提供される。そのようなフラグメントは、例えば、完全長のネイティブのタンパク質と比較した場合にＮ末端またはＣ末端で切断されているか、または、内部残基を欠いている場合がある。特定のフラグメントは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの所望の生物学的活性に必須ではないアミノ酸残基を欠いている。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０フラグメントは、多くの従来の手法のいずれかにより調製され得る。所望のペプチドフラグメントは、化学的に合成され得る。代替法においては、酵素消化、例えば、特定のアミノ酸残基により定義される部位においてタンパク質を切断することがわかっている酵素でタンパク質を処理すること、または適当な制限酵素でＤＮＡを消化し、そして所望のフラグメントを単離することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０フラグメントが得られる。さらに別の適当な手法では、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により所望のポリペプチドフラグメントをコードするＤＮＡフラグメントを単離して増幅する。そのＤＮＡフラグメントの所望の末端を定義するオリゴヌクレオチドをＰＣＲにおける５’および３’のプライマーとして使用する。好ましくは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドフラグメントは、本明細書中で開示するネイティブのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと、少なくとも１つの生物学的および／または免疫学的活性を共有する。

目的の保存的置換は、好ましい置換という見出しの下に表６に示す通りである。このような置換が、生物学的活性の変化をもたらす場合、より実質的な変化、表６において例示される置換と称される置換、またはアミノ酸クラスを参照して後でさらに説明するものが好ましく導入され、その生成物がスクリーニングされる。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの機能または免疫学的同一性における実質的な改変は、（ａ）例えば、シート状またはらせん状のコンホメーションとして置換の領域におけるポリペプチド骨格の構造、（ｂ）標的部位における分子の電荷もしくは疎水性、または（ｃ）側鎖の嵩を維持することに対するその改変の作用において有意に異なる置換を選択することにより達成される。天然に存在する残基は、共通の側鎖の特性に基づいて群分けされ：アミノ酸は、その側鎖の特性における類似性（Ａ．Ｌ．Ｌｅｈｎｉｎｇｅｒ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｓｅｃｏｎｄ ｅｄ．，ｐｐ．７３−７５，Ｗｏｒｔｈ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９７５））に従って：
（１）非極性；Ａｌａ（Ａ）、Ｖａｌ（Ｖ）、Ｌｅｕ（Ｌ）、Ｉｌｅ（Ｉ）、Ｐｒｏ（Ｐ）、Ｐｈｅ（Ｆ）、Ｔｒｐ（Ｗ）、Ｍｅｔ（Ｍ）
（２）無電荷極性：Ｇｌｙ（Ｇ）、Ｓｅｒ（Ｓ）、Ｔｈｒ（Ｔ）、Ｃｙｓ（Ｃ）、Ｔｙｒ（Ｙ）、Ａｓｎ（Ｎ）、Ｇｌｎ（Ｑ）
（３）酸性：Ａｓｐ（Ｄ）、Ｇｌｕ（Ｅ）
（４）塩基性：Ｌｙｓ（Ｋ）、Ａｒｇ（Ｒ）、Ｈｉｓ（Ｈ）
に群分けされ得る。
あるいは、天然に存在する残基は、共通の側鎖の特性に基づいて：
（１）疎水性：ノルロイシン、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ；
（２）中性親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ；
（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；
（４）塩基性：Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ；
（５）鎖の方向に影響する残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ；
（６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ
に群分けされ得る。

非保存的置換は、これらのクラスの１つのメンバーを別のクラスと交換することを含む。そのような置換された残基はまた、保存的置換部位内に、またはより好ましくは残りの（非保存的な）部位に導入され得る。

変異は、オリゴヌクレオチド媒介性（部位指向性）突然変異誘発、アラニンスキャニングおよびＰＣＲ突然変異誘発などの当該分野で公知の方法を用いて生成することができる。部位指向性突然変異誘発［Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１３：４３３１（１９８６）；Ｚｏｌｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１０：６４８７（１９８７）］、カセット突然変異誘発［Ｗｅｌｌｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ，３４：３１５（１９８５）］、制限選択突然変異誘発［Ｗｅｌｌｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｈｉｌｏｓ．Ｔｒａｎｓ．Ｒ．Ｓｏｃ．Ｌｏｎｄｏｎ ＳｅｒＡ，３１７：４１５（１９８６）］または他の公知の手法をクローニングされたＤＮＡに対して実施することによりＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０改変体ＤＮＡを生成することができる。

スキャニングアミノ酸分析もまた、隣接する配列に沿って１つ以上のアミノ酸を同定するために使用できる。好ましいスキャニングアミノ酸には比較的小型の中性のアミノ酸が包含される。このようなアミノ酸としては、アラニン、グリシン、セリンおよびシステインが挙げられる。アラニンは、代表的には、それがベータ炭素を超えた側鎖を排除し、改変体の主鎖のコンホメーションを変更する可能性が低いため、この群の中では好ましいスキャニングアミノ酸である［Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍ ａｎｄ Ｗｅｌｌｓ，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４４：１０８１−１０８５（１９８９）］。アラニンはまた、代表的には、それが最も一般的なアミノ酸であるため好ましい。さらに、アラニンは、頻繁に埋没した位置および曝露される位置の両方において存在する［Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｔｈｅ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，（Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ＆Ｃｏ．，Ｎ．Ｙ．）；Ｃｈｏｔｈｉａ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１５０：１（１９７６）］。アラニン置換が十分な量の改変体をもたらさない場合は、同配体（ｉｓｏｔｅｒｉｃ）アミノ酸を使用できる。

Ｃ．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの改変
ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの共有結合改変は、本発明の範囲に含まれる。共有結合修飾の１つの型は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの選択された側鎖またはＮ末端もしくはＣ末端の残基と反応することができる有機誘導体化剤と、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの標的アミノ酸残基を反応させることを含む。二官能性薬剤を用いた誘導体化は、例えば、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を精製するための方法において使用する水不溶性の支持体マトリックスまたは表面にＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを架橋結合するため、またはその逆のために有用である。一般に使用される架橋結合剤としては、例えば、１，１−ビス（ジアゾアセチル）−２−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば、４−アジドサリチル酸とのエステル、ホモ２官能性イミドエステル（３，３’−ジチオビス（スクシンイミジルプロピオネート）などのジスクシンイミジルエステルを含む）、２官能性マレイミド（例えば、ビス−Ｎ−マレイミド−１，８−オクタンおよびメチル−３−［（ｐ−アジドフェニル）ジチオ］プロピオイミデート）などの薬剤が挙げられる。

他の改変としては、グルタミニル残基およびアスパルギニル残基からそれぞれ対応するグルタミル残基およびアスパルチル残基への脱アミド化、プロリンおよびリシンのヒドロキシル化、セリル残基またはスレオニル残基のヒドロキシル基のホスホリル化、リシン、アルギニンおよびヒスチジン側鎖のα−アミノ基のメチル化［Ｔ．Ｅ．Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ：Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ＆Ｃｏ．，Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ｐｐ．７９−８６（１９８３）］、Ｎ末端アミンのアセチル化ならびに任意のＣ末端カルボキシル基のアミド化が挙げられる。

本発明の範囲に含まれるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの共有結合改変の別の型は、そのポリペプチドのネイティブのグリコシル化パターンを変更することを含む。「ネイティブのグリコシル化パターンを変更すること」とは、本明細書の目的のためには、ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド内に存在する１つ以上の炭水化物部分を欠失させること（存在するグリコシル化部位を除去すること、または化学的および／もしくは酵素的な手段によりグリコシル化を欠失させることのいずれかによる）および／またはネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド内に存在しない１つ以上のグリコシル化部位を付加させることを意味する。さらに、この語句は、存在する様々な炭化水素部分の性質および比率の変化を含む、ネイティブタンパク質のグリコシル化の定性的変化を含む。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドへのグリコシル化部位の付加は、アミノ酸配列を変更することにより達成され得る。その変更は、例えば、ネイティブ配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０への１つ以上のセリン残基またはスレオニン残基の付加またはそれらによる置換によりなされ得る（Ｏ連結グリコシル化部位の場合）。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０アミノ酸配列は、必要に応じて、特に、所望のアミノ酸に翻訳されることになるコドンが生成されるように予め選択された塩基においてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを変異させることによって、ＤＮＡレベルでの変化を介して変更され得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド上の炭水化物部分の数を増大させる別の手段は、そのポリペプチドへのグリコシドの化学的または酵素的なカップリングによるものである。そのような方法は、当該分野において、例えば、１９８７年９月１１日公開のＷＯ８７／０５３３０およびＡｐｌｉｎ ａｎｄ Ｗｒｉｓｔｏｎ，ＣＲＣ Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，ｐｐ．２５９−３０６（１９８１）に記載されている。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド上に存在する炭水化物部分の除去は、化学的もしくは酵素的に、またはグリコシル化のための標的として機能するアミノ酸残基をコードしているコドンの変異的置換により達成され得る。化学的脱グリコシル化手法は、当該分野で公知であり、そして例えば、Ｈａｋｉｍｕｄｄｉｎ，ｅｔ ａｌ．，Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．，２５９：５２（１９８７）およびＥｄｇｅ ｅｔ ａｌ．，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１１８：１３１（１９８１）に記載されている。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、Ｔｈｏｔａｋｕｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１３８：３５０（１９８７）に記載されている種々のエンドグリコシダーゼおよびエキソグリコシダーゼの使用によって達成され得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの共有結合改変の別の型は、米国特許第４，６４０，８３５号；同第４，４９６，６８９号；同第４，３０１，１４４号；同第４，６７０，４１７号；同第４，７９１，１９２号または同第４，１７９，３３７号に記載されている様式における種々の非タンパク質性のポリマー、例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリプロピレングリコールまたはポリオキシアルキレンの１つへのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの連結を含む。

本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドはまた、別の異種性のポリペプチドまたはアミノ酸配列に融合したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを含むキメラ分子を形成するための方法において改変され得る。

このようなキメラ分子は、抗タグ抗体が選択的に結合できるエピトープを提供するタグポリペプチドとＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドとの融合を含む。エピトープタグは、一般に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアミノ末端またはカルボキシル末端に位置する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのこのようなエピトープタグ化形態の存在は、タグポリペプチドに対する抗体を用いて検出できる。また、エピトープタグを提供することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、抗タグ抗体またはエピトープタグに結合する別の型のアフィニティーマトリックスを用いたアフィニティー精製により容易に精製できるようになる。様々なタグポリペプチドおよびその対応する抗体が当該分野で周知である。例としては、ポリヒスチジン（ポリ−ｈｉｓ）またはポリヒスチジン−グリシン（ポリ−ｈｉｓ−ｇｌｙ）タグ；インフルエンザＨＡタグポリペプチドおよびその抗体１２ＣＡ５［Ｆｉｅｌｄ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．，８：２１５９−２１６５（１９８８）］；ｃ−ｍｙｃタグおよびそれに対する８Ｆ９、３Ｃ７、６Ｅ１０、Ｇ４、Ｂ７および９Ｅ１０抗体［Ｅｖａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，５：３６１０−３６１６（１９８５）］；ならびに単純ヘルペスウイルス糖タンパク質Ｄ（ｇＤ）タグおよびその抗体［Ｐａｂｏｒｓｋｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，３（６）：５４７−５５３（１９９０）］が挙げられる。他のタグポリペプチドとしては、Ｆｌａｇ−ペプチド［Ｈｏｐｐ ｅｔ ａｌ．，ＢｉｏＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，６：１２０４−１２１０（１９８８）］；ＫＴ３エピトープペプチド［Ｍａｒｔｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５５：１９２−１９４（１９９２）］；α−チューブリンエピトープペプチド［Ｓｋｉｎｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２６６：１５１６３−１５１６６（１９９１）］；およびＴ７遺伝子１０タンパク質ペプチドタグ［Ｌｕｔｚ−Ｆｒｅｙｅｒｍｕｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８７：６３９３−６３９７（１９９０）］が挙げられる。

キメラ分子は、免疫グロブリンまたは免疫グロブリンの特定の領域とＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドとの融合を含み得る。キメラ分子の２価の形態（「イムノアドヘシン」とも称する）については、このような融合はＩｇＧ分子のＦｃ領域に対するものであり得る。Ｉｇ融合は、好ましくはＩｇ分子内の少なくとも１つの可変領域の代替としてのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの可溶性（膜貫通ドメインの欠失型または不活性型）形態の置換を含む。本発明の特に好ましい態様において、免疫グロブリン融合は、ＩｇＧ１分子のヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ３；またはＩｇＧ１分子のヒンジ、ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３領域を含む。免疫グロブリン融合の生成については、１９９５年６月２７日発行の米国特許第５，４２８，１３０号も参照のこと。

Ｄ．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの調製
以下の説明は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０核酸を含むベクターで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を培養することによるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの調製に主に関するものである。当然ながら、当該分野で周知の代替法を用いてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを調製してもよいことが企図される。例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の配列またはその部分は、固相法を用いた直接ペプチド合成により生成され得る［例えば、Ｓｔｅｗａｒｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｏｌｉｄ−Ｐｈａｓｅ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ Ｃｏ．，Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ（１９６９）；Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，８５：２１４９−２１５４（１９６３）を参照のこと］。ｉｎ ｖｉｔｒｏのタンパク質合成を、手動の手法または自動により実施してよい。自動合成は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｒ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡ）を用いて製造元の指示書により達成され得る。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの様々な部分を、別々に化学合成し、そして化学的または酵素的な方法を用いて結合することにより完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを生成してよい。

１．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡの単離
ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ｍＲＮＡを保有し、そしてそれを検出可能なレベルで発現すると考えられる組織から調製したｃＤＮＡライブラリーから得てよい。したがって、ヒトＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ＤＮＡは、実施例に記載するようなヒト組織から調製したｃＤＮＡライブラリーから好都合に得ることができる。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード遺伝子はまた、ゲノムライブラリーまたは公知の合成手順（例えば、自動核酸合成）により得てもよい。

ライブラリーは、目的の遺伝子またはそれによりコードされるタンパク質を同定するように設計されたプローブ（例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対する抗体または少なくとも約２０〜８０塩基のオリゴヌクレオチド）を用いてスクリーニングできる。選択されたプローブを用いたｃＤＮＡライブラリーまたはゲノムライブラリーのスクリーニングは、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，１９８９）に記載されているような標準的な手順を用いて実施され得る。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０をコードする遺伝子を単離するための代替手段は、ＰＣＲ法を使用することである［Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，前出；Ｄｉｅｆｆｅｎｂａｃｈ ｅｔ ａｌ．，ＰＣＲ Ｐｒｉｍｅｒ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，１９９５）］。

後述する実施例は、ｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングするための手法を説明するものである。プローブとして選択されたオリゴヌクレオチド配列は、偽陽性を最小限とするために十分な長さのものであり、そして十分明白なものでなければならない。このオリゴヌクレオチドは、好ましくは、スクリーニングされるライブラリーのＤＮＡへのハイブリダイゼーション時にそれが検出できるように標識される。標識方法は、当該分野で周知であり、それらとしては、^３２Ｐ標識ＡＴＰのような放射性標識、ビオチニル化または酵素標識の使用が挙げられる。中ストリンジェンシーおよび高ストリンジェンシーを含むハイブリダイゼーション条件は、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，に記載されている。

このようなライブラリースクリーニング法において同定された配列は、ＧｅｎＢａｎｋなどの公的データベースまたは他の私的配列データベースに寄託され入手可能である他の既知配列と比較し、アラインメントすることができる。分子の所定領域内または完全長配列に渡る配列同一性（アミノ酸またはヌクレオチドレベルのいずれかで）は、当該分野で公知の方法を用いて、そして、本明細書に記載するように決定することができる。

タンパク質コード配列を有する核酸は、本明細書において初めて開示された推定アミノ酸配列を用いて、そして、必要に応じて、前出のＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．に記載されている従来のプライマー伸長手順を用いて、選択されたｃＤＮＡまたはゲノムライブラリーをスクリーニングすることにより前駆体を検出すること、および、ｃＤＮＡに逆転写されていないｍＲＮＡの中間体をプロセシングすることにより得られうる。

２．宿主細胞の選択および形質転換
宿主細胞は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの産生に関して本明細書に記載した発現ベクターまたはクローニングベクターを用いてトランスフェクトまたは形質転換され、そしてプロモーターの誘導、形質転換体の選択または所望の配列をコードする遺伝子の増幅に適切であるように改変された従来の栄養培地中で培養される。培地、温度、ｐＨなどのような培養条件は、過度の実験を要することなく当業者が選択できる。一般に、細胞培養の産生性を最大にするための原理、プロトコルおよび実際の手法は、Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｍ．Ｂｕｔｌｅｒ，ｅｄ．（ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ，１９９１）およびＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，前出に見ることができる。

真核生物細胞トランスフェクションおよび原核生物細胞トランスフェクションの方法は、当業者に公知であり、例えば、ＣａＣｌ_２、ＣａＰＯ_４、リポソーム媒介およびエレクトロポレーションである。使用する宿主細胞に応じて、形質転換は、その細胞に適切な標準的手法を用いて実施する。前出のＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，に記載されているように塩化カルシウムを使用するカルシウム処理またはエレクトロポレーションが原核生物に対して一般に使用される。Ｓｈａｗ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ，２３：３１５（１９８３）および１９８９年６月２９日公開のＷＯ８９／０５８５９に記載されているように、特定の植物細胞の形質転換には、Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｍｅｆａｃｉｅｎｓによる感染が使用される。細胞壁を有しない哺乳動物細胞に対しては、Ｇｒａｈａｍ ａｎｄ ｖａｎ ｄｅｒ Ｅｂ，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，５２：４５６−４５７（１９７８）のリン酸カルシウム沈降法を使用できる。哺乳動物細胞宿主系トランスフェクションの一般的態様は、米国特許第４，３９９，２１６号に記載されている。酵母への形質転換は、代表的には、Ｖａｎ Ｓｏｌｉｎｇｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂａｃｔ．１３０：９４６（１９７７）およびＨｓｉａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．（ＵＳＡ），７６：３８２９（１９７９）の方法に従って実施される。しかしながら、細胞にＤＮＡを導入するための別の方法（例えば、核マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、インタクトな細胞との細菌プロトプラスト融合またはポリカチオン、例えば、ポリブレン、ポリオルニチン）も使用され得る。哺乳動物細胞を形質転換するための様々な手法については、Ｋｅｏｗｎ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１８５：５２７−５３７（１９９０）およびＭａｎｓｏｕｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３３６：３４８−３５２（１９８８）を参照のこと。

本明細書におけるベクター内のＤＮＡをクローニングまたは発現するために適当な宿主細胞としては、原核生物、酵母または高等真核生物の細胞が挙げられる。適当な原核生物としては、真正細菌（例えば、グラム陰性またはグラム陽性の生物体、例えば、Ｅ．ｃｏｌｉなどのＥｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ科）が挙げられるがこれらに限定されない。様々なＥ．ｃｏｌｉ株（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉＫ１２株ＭＭ２９４（ＡＴＣＣ３１，４４６）；Ｅ．ｃｏｌｉＸ１７７６（ＡＴＣＣ３１，５３７）；Ｅ．ｃｏｌｉ株Ｗ３１１０（ＡＴＣＣ２７，３２５）およびＫ５ ７７２（ＡＴＣＣ５３，６３５））が公的に入手できる。他の適当な原核生物宿主細胞としては、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ科（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉなどのＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ属、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ属、Ｅｒｗｉｎｉａ属、Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ属、Ｐｒｏｔｅｕｓ属、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ属（例えば、Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍ）、Ｓｅｒｒａｔｉａ属（例えば、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃａｎｓ）およびＳｈｉｇｅｌｌａ属ならびにＢａｃｉｌｌｉ属（例えば、Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓおよびＢ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ（例えば、１９８９年４月１２日公開のＤＤ２６６，７１０に開示されているＢ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ ４１Ｐ））、Ｐ．ａｅｒｕｇｉｎｏｓａなどのＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ属およびＳｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ属が挙げられる。これらの例は、説明であって限定するものではない。株Ｗ３１１０は、組換えＤＮＡ産物の発酵のための一般的な宿主菌株であるため、１つの特に好ましい宿主または親宿主である。好ましくは、宿主細胞は、最小量のタンパク質分解酵素を分泌する。例えば、菌株Ｗ３１１０は、宿主に内在性であるタンパク質をコードする遺伝子における遺伝的変異に影響を及ぼすように改変してよく、そのような宿主の例としては、完全な遺伝子型ｔｏｎＡを有するＥ．ｃｏｌｉＷ３１１０株１Ａ２；完全な遺伝子型ｔｏｎＡ ｐｔｒ３を有するＥ．ｃｏｌｉＷ３１１０株９Ｅ４；完全な遺伝子型ｔｏｎＡ ｐｔｒ３ ｐｈｏＡ Ｅ１５（ａｒｇＦ−ｌａｃ）１６９ｄｅｇＰ ｏｍｐＴ ｋａｎ^ｒを有するＥ．ｃｏｌｉＷ３１１０株２７Ｃ７（ＡＴＣＣ５５，２４４）；完全な遺伝子型ｔｏｎＡ ｐｔｒ３ ｐｈｏＡ Ｅ１５（ａｒｇＦ−ｌａｃ）１６９ｄｅｇＰ ｏｍｐＴ ｒｂｓ７ ｉｌｖＧ ｋａｎ^ｒを有するＥ．ｃｏｌｉＷ３１１０株３７Ｄ６；非カナマイシン耐性ｄｅｇＰ欠失変異を有する株３７Ｄ６であるＥ．ｃｏｌｉＷ３１１０菌株４０Ｂ４；および、１９９０年８月７日に発行された米国特許第４，９４６，７８３号に開示されている変異体の細胞周辺腔プロテアーゼを有するＥ．ｃｏｌｉ株が挙げられる。あるいは、ｉｎ ｖｉｔｒｏにおけるクローニング方法、例えば、ＰＣＲまたは他の核酸ポリメラーゼ反応が適当である。

原核生物に加えて、糸状菌または酵母などの真核生物の微生物が、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コードベクターに適したクローニング宿主または発現宿主である。Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅは、一般に使用されている下等真核生物の宿主微生物である。他のものとしては、Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ（Ｂｅａｃｈ ａｎｄ Ｎｕｒｓｅ，Ｎａｔｕｒｅ，２９０：１４０［１９８１］；１９８５年５月２日公開のＥＰ１３９，３８３）；Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ属宿主（米国特許第４，９４３，５２９号；Ｆｌｅｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，９：９６８−９７５（１９９１））（例えば、Ｋ．ｌａｃｔｉｓ（ＭＷ９８−８Ｃ，ＣＢＳ６８３、ＣＢＳ４５７４；Ｌｏｕｖｅｎｃｏｕｒｔ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．，１５４（２）：７３７−７４２［１９８３］）、Ｋ．ｆｒａｇｉｌｉｓ（ＡＴＣＣ１２，４２４）、Ｋ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ（ＡＴＣＣ１６，０４５）、Ｋ．ｗｉｃｋｅｒａｍｉｉ（ＡＴＣＣ２４，１７８）、Ｋ．ｗａｌｔｉｉ（ＡＴＣＣ５６，５００）、Ｋ．ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａｒｕｍ（ＡＴＣＣ３６，９０６；Ｖａｎ ｄｅｎ Ｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，８：１３５（１９９０））、Ｋ．ｔｈｅｒｍｏｔｏｌｅｒａｎｓおよびＫ．ｍａｒｘｉａｎｕｓ）；ｙａｒｒｏｗｉａ属（ＥＰ４０２，２２６）；Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ（ＥＰ１８３，０７０；Ｓｒｅｅｋｒｉｓｈｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂａｓｉｃ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．，２８：２６５−２７８［１９８８］）；Ｃａｎｄｉｄａ属；Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｒｅｅｓｉａ（ＥＰ２４４，２３４）；Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ ｃｒａｓｓａ（Ｃａｓｅ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７６：５２５９−５２６３［１９７９］）；Ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ属（例えば、Ｓｃｈｗａｎｎｉｏｍｙｃｅｓ ｏｃｃｉｄｅｎｔａｌｉｓ（１９９０年１０月３１日公開のＥＰ３９４，５３８））；および糸状菌（例えば、Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ属、Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｕｍ属、Ｔｏｌｙｐｏｃｌａｄｉｕｍ属（１９９１年１月１０日公開のＷＯ９１／００３５７）およびＡｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ属宿主（例えば、Ａ．ｎｉｄｕｌａｎｓ（Ｂａｌｌａｎｃｅ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．，１１２：２８４−２８９［１９８３］；Ｔｉｌｂｕｒｎ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ，２６：２０５−２２１［１９８３］；Ｙｅｌｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：１４７０−１４７４［１９８４］）およびＡ．ｎｉｇｅｒ（Ｋｅｌｌｙ ａｎｄ Ｈｙｎｅｓ，ＥＭＢＯ Ｊ．，４：４７５−４７９［１９８５］））が挙げられる。メチロトロピック（Ｍｅｔｈｙｌｏｔｒｏｐｉｃ）酵母が、本発明において適しており、そしてそれらとしては、Ｈａｎｓｅｎｕｌａ属、Ｃａｎｄｉｄａ属、Ｋｌｏｅｃｋｅｒａ属、Ｐｉｃｈｉａ属、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ属、Ｔｏｒｕｌｏｐｓｉｓ属およびＲｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ属からなる属から選択される、メタノールで生育できる酵母が挙げられるがこれらに限定されない。このクラスの酵母の例となる特定の種のリストは、Ｃ．Ａｎｔｈｏｎｙ，Ｔｈｅ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ｏｆ Ｍｅｔｈｙｌｏｔｒｏｐｈｓ，２６９（１９８２）に見ることができる。

グリコシル化されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現に適した宿主細胞は、多細胞生物から得られる。無脊椎動物の細胞の例としては、昆虫細胞（例えば、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓ２およびＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ Ｓｆ９）ならびに植物細胞が挙げられる。有用な哺乳動物宿主細胞株の例としては、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞およびＣＯＳ細胞が挙げられる。より特定の例としては、ＳＶ４０で形質転換したサル腎臓ＣＶ１株（ＣＯＳ−７、ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１）；ヒト胚性腎株（２９３細胞または懸濁培地中の生育のためにサブクローニングされた２９３細胞、Ｇｒａｈａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．，３６：５９（１９７７））；チャイニーズハムスター卵巣細胞／−ＤＨＦＲ（ＣＨＯ、Ｕｒｌａｕｂ ａｎｄ Ｃｈａｓｉｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７７：４２１６（１９８０））；マウスセルトーリ細胞（ＴＭ４、Ｍａｔｈｅｒ，Ｂｉｏｌ．Ｒｅｐｒｏｄ．，２３：２４３−２５１（１９８０））；ヒト肺細胞（Ｗ１３８、ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７５）；ヒト肝細胞（Ｈｅｐ Ｇ２，ＨＢ８０６５）；およびマウス乳癌（ＭＭＴ０６０５６２、ＡＴＣＣ ＣＣＬ５１）が挙げられる。適切な宿主細胞の選択は、当業者の知る通りである。

３．複製可能なベクターの選択および使用
ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする核酸（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）は、クローニング（ＤＮＡの増幅）または発現のために、複製可能なベクター内に挿入され得る。様々なベクターが公的に入手可能である。そのベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、ウイルス粒子またはファージの形態であり得る。適切な核酸配列が、種々の手順によりベクター内に挿入され得る。一般に、ＤＮＡは、当該分野で公知の手法を用いて適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。ベクター構成要素としては、一般に、シグナル配列の１つ以上、複製起点、マーカー遺伝子の１つ以上、エンハンサーエレメント、プロモーターおよび転写終止配列が挙げられるがこれらに限定されない。これらの構成要素の１つ以上を含む適当なベクターの構築は、当業者に公知の標準的なライゲーション手法を用いる。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、組換えにより、直接のみならず、成熟タンパク質または成熟ポリペプチドのＮ末端にシグナル配列または特定の切断部位を有する他のポリペプチドであり得る異種ポリペプチドとの融合ポリペプチドとして生成され得る。一般に、シグナル配列は、ベクターの成分であり得るか、またはベクターに挿入されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コードＤＮＡの部分であり得る。シグナル配列は、例えば、アルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、ｌｐｐまたは熱安定性エンテロトキシンＩＩリーダーの群から選択される原核生物のシグナル配列であり得る。酵母の分泌のためには、シグナル配列は、例えば、酵母インベルターゼリーダー、アルファ因子リーダー（ＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓおよびＫｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓのα−因子リーダーを包み、後者は、米国特許第５，０１０，１８２号に記載）または酸ホスファターゼリーダー、Ｃ．ａｌｂｉｃａｎｓグルコアミラーゼリーダー（１９９０年４月４日公開のＥＰ３６２，１７９）または１９９０年１１月１５日公開のＷＯ９０／１３６４６に記載のシグナルであり得る。哺乳動物細胞発現においては、同じか関連する種の分泌ポリペプチド由来のシグナル配列などの哺乳動物シグナル配列を用いてタンパク質の分泌を誘導し得、ウイルスの分泌リーダーも使用され得る。

発現およびクローニングベクターは、両方とも１つ以上の選択された宿主細胞においてベクターを複製可能とする核酸配列を含む。そのような配列は、種々の細菌、酵母およびウイルスに関して周知である。プラスミドｐＢＲ３２２由来の複製起点が、大部分のグラム陰性細菌に適しており、２μプラスミド起点は、酵母に適しており、そして様々なウイルス起点（ＳＶ４０、ポリオーマ、アデノウイルス、ＶＳＶまたはＢＰＶ）は、哺乳動物細胞におけるクローニングベクターのために有用である。

発現ベクターおよびクローニングベクターは、代表的には、選択可能なマーカーとも呼ばれる選択遺伝子を含む。代表的な選択遺伝子は、（ａ）抗生物質または他のトキシン、例えば、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキサートまたはテトラサイクリンに対する耐性を付与するタンパク質、（ｂ）栄養要求性の欠損を補うタンパク質、または（ｃ）複合培地から利用できない重要な栄養を供給するタンパク質をコードしており、例えば、ＢａｃｉｌｌｉのためのＤ−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子である。

哺乳動物細胞に適した選択可能なマーカーの例は、ＤＨＦＲまたはチミジンキナーゼなどの、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード核酸の取り込み能力を有する細胞の同定を可能にするものである。野生型ＤＨＦＲを使用する場合の適切な宿主細胞は、Ｕｒｌａｕｂ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７７：４２１６（１９８０）に記載されているように調製および増殖させたＤＨＦＲ活性欠損のＣＨＯ細胞である。酵母において使用に適した選択遺伝子は、酵母プラスミドＹＲｐ７中に存在するｔｒｐ１遺伝子である［Ｓｔｉｎｃｈｃｏｍｂ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２８２：３９（１９７９）；Ｋｉｎｇｓｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ，７：１４１（１９７９）；Ｔｓｃｈｅｍｐｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ，１０：１５７（１９８０）］。ｔｒｐ１遺伝子は、トリプトファン中で生育する能力を欠いた酵母の変異株、例えば、ＡＴＣＣ番号４４０７６またはＰＥＰ４−１のための選択マーカーを提供する［Ｊｏｎｅｓ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，８５：１２（１９７７）］。

発現ベクターおよびクローニングベクターは、通常、ｍＲＮＡ合成を誘導するためにＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード核酸配列に作動可能に連結されたプロモーターを含む。種々の潜在的宿主細胞により認識されるプロモーターは、周知である。原核生物の宿主と共に使用するのに適したプロモーターとしては、β−ラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系［Ｃｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２７５：６１５（１９７８）；Ｇｏｅｄｄｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２８１：５４４（１９７９）］、アルカリホスファターゼ、トリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系［Ｇｏｅｄｄｅｌ，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，８：４０５７（１９８０）；ＥＰ３６，７７６］およびハイブリッドプロモーター（例えば、ｔａｃプロモーター［ｄｅＢｏｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８０：２１−２５（１９８３）］）が挙げられる。細菌系における使用のためのプロモーターもまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡに作動可能に連結されたシャイン・ダルガノ（Ｓ．Ｄ．）配列を含む。

酵母宿主と共に使用するのに適したプロモーター配列の例としては、３−ホスホグリセレートキナーゼ［Ｈｉｔｚｅｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２５５：２０７３（１９８０）］または他の糖分解酵素［Ｈｅｓｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｄｖ．Ｅｎｚｙｍｅ Ｒｅｇ．，７：１４９（１９６８）；Ｈｏｌｌａｎｄ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，１７：４９００（１９７８）］（例えば、エノラーゼ、グリセルアルデヒド３リン酸脱水素酵素、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホフラクトキナーゼ、グルコース−６−リン酸イソメラーゼ、３−ホスホグリセリン酸ムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、グルコースリン酸イソメラーゼおよびグルコキナーゼ）のためのプロモーターが挙げられる。

生育条件により制御される転写のさらなる利点を有する誘導プロモーターである他の酵母プロモーターは、アルコールデヒドロゲナーゼ２、イソチトクロームＣ、酸ホスファターゼ、窒素代謝に関連する分解性酵素、メタロチオネイン、グリセルアルデヒド３リン酸脱水素酵素およびマルトースおよびガラクトースの利用を担う酵素のためのプロモーター領域である。酵母発現において使用するために適したベクターおよびプロモーターは、ＥＰ７３，６５７においてさらに記載されている。

哺乳動物宿主細胞中におけるベクターからのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の転写は、ウイルス（例えば、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス（１９８９年７月５日公開のＵＫ２，２１１，５０４）、アデノウイルス（例えば、アデノウイルス２）、ウシ乳頭腫ウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、Ｂ型肝炎ウイルスおよびシミアンウイルス４０（ＳＶ４０））のゲノムから、異種の哺乳動物プロモーター（例えば、アクチンプロモーターまたは免疫グロブリンプロモーター）および熱ショックプロモーターから得られたプロモーターにより制御されるが、このようなプロモーターは、宿主細胞系と適合しなければならない。

高等真核生物によるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡの転写は、ベクター中にエンハンサー配列を挿入することにより増大させ得る。エンハンサーは、通常、転写を増大させるプロモーターに対して作用する約１０〜３００ｂｐのＤＮＡのシス作用性エレメントである。哺乳動物遺伝子由来の多くのエンハンサー配列が現在知られている（グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテインおよびインスリン）。しかしながら代表的には、真核生物細胞ウイルス由来のエンハンサーを使用する。例としては、複製起点の後側上のＳＶ４０エンハンサー（ｂｐ１００−２７０）、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後側上のポリオーマエンハンサーおよびアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。これらのエンハンサーは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード配列に対して５’または３’の位置においてベクターにスプライスされ得るが、好ましくは、プロモーターから５’側の部位に位置する。

真核生物宿主細胞（酵母、真菌、昆虫、植物、動物、ヒトまたは他の多細胞生物体由来の有核細胞）中で使用される発現ベクターはまた、転写の終止のため、およびｍＲＮＡの安定化のために必要な配列を含む。そのような配列は、真核生物またはウイルスのＤＮＡまたはｃＤＮＡの５’側、場合によっては３’側の非翻訳領域から一般に得られる。これらの領域は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするｍＲＮＡの非翻訳部分におけるポリアデニル化フラグメントとして転写されるヌクレオチドセグメントを含む。

組換え脊椎動物細胞培養物中のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの合成に適合させるために適したさらに他の方法、ベクターおよび宿主細胞は、Ｇｅｔｈｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２９３：６２０−６２５（１９８１）；Ｍａｎｔｅｉ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２８１：４０−４６（１９７９）；ＥＰ１１７，０６０；およびＥＰ１１７，０５８に記載されている。

４．遺伝子の増幅／発現の検出
遺伝子の増幅および／または発現は、例えば、ｍＲＮＡの転写を定量するための従来のサザンブロッティング、ノーザンブロッティング［Ｔｈｏｍａｓ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，７７：５２０１−５２０５（１９８０）］、ドットブロッティング（ＤＮＡ分析）またはｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションにより、適切に標識されたプローブを用い、本明細書において提供される配列に基づいて、直接試料中で測定してよい。あるいは、ＤＮＡ二重鎖、ＲＮＡ二重鎖およびＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッド二重鎖またはＤＮＡ−タンパク質二重鎖を含む特定の二重鎖を認識できる抗体を使用してよい。そしてその抗体が標識され得、表面上の二重鎖の形成により二重鎖に結合した抗体の存在が検出できるように二重鎖が表面に結合した状態でアッセイが実施され得る。

あるいは、遺伝子発現が、細胞または組織の切片の免疫組織化学的染色などの免疫学的方法および細胞培養物または体液のアッセイにより測定されることにより、遺伝子産物の発現が直接定量され得る。免疫組織化学的染色および／またはサンプル液体のアッセイに有用な抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体のいずれかであり得、そして任意の哺乳動物において調製され得る。好都合には、これらの抗体は、ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対して、または本明細書中で提供されるＤＮＡ配列に基づいた合成ペプチドに対して、またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０−ＤＮＡに融合され、そして特定の抗体エピトープをコードする外因性配列に対して調製され得る。

５．ポリペプチドの精製
ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの形態は、培地または宿主細胞溶解物から回収され得る。膜結合の場合は、適当な界面活性溶液（例えば、Ｔｒｉｔｏｎ−Ｘ１００）を用いるか、酵素的切断により、膜から遊離させることができる。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現に使用される細胞を、様々な物理的または化学的な手段（例えば、凍結解凍の反復、超音波処理、機械的破壊または細胞溶解剤）により破壊することができる。

組換え細胞のタンパク質またはポリペプチドからＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを精製することが望ましい場合がある。以下の手順、すなわち、イオン交換カラムによる分画；エタノール沈降；逆相ＨＰＬＣ；シリカまたは陽イオン交換樹脂（例えば、ＤＥＡＥ）によるクロマトグラフィー；クロマトフォーカシング；ＳＤＳ−ＰＡＧＥ；硫酸アンモニウム沈降法；例えば、ＳｅｐｈａｄｅｘＧ−７５を用いたゲル濾過；ＩｇＧなどの夾雑物を除去するためのプロテインＡセファロースカラム；およびＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのエピトープタグ化型を結合させるための金属キレートカラムが適当な精製の手順の例である。タンパク質精製の様々な方法を使用してよく、そのような方法は、当該分野で公知であり、例えば、Ｄｅｕｔｓｃｈｅｒ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１８２（１９９０）；Ｓｃｏｐｅｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８２）に記載されている。選択される精製工程は、例えば、使用される生成プロセスの性質および生成される特定のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに依存する。
Ｅ．ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの使用
ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列（またはその相補体）は、ハイブリダイゼーションプローブとしての使用を含む分子生物学の分野において、染色体および遺伝子マッピングにおいて、およびアンチセンスＲＮＡおよびＤＮＡの生成において、種々の用途を有している。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０核酸はまた、本明細書に記載する組換え手法によるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの調製に有用である。

完全長ネイティブ配列のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子またはその部分は、完全長ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ｃＤＮＡを単離するためか、または本明細書に開示したネイティブＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０配列に対して所望の配列同一性を有するさらに他のｃＤＮＡ（例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの天然に存在する改変体または他の種に由来するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするもの）を単離するためのｃＤＮＡライブラリーのためのハイブリダイゼーションプローブとして使用され得る。必要に応じて、プローブの長さは、約２０〜約５０塩基である。ハイブリダイゼーションプローブは、完全長ネイティブヌクレオチド配列の少なくとも部分的に新規な領域から得られ、ここでそのような領域は、過度の実験をすることなく、またはネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０のプロモーター、エンハンサーエレメントおよびイントロンを含むゲノム配列から決定され得る。例示すれば、スクリーニング方法は、約４０塩基の選択されたプローブを合成するために既知のＤＮＡ配列を用いてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子のコード領域を単離する工程を含む。ハイブリダイゼーションプローブは、^３２Ｐもしくは^３５Ｓなどの放射性核種を含む種々の標識、またはアビジン／ビオチンカップリング系を介してプローブに結合されたアルカリホスファターゼなどの酵素標識により標識され得る。本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の配列と相補的な配列を有する標識されたプローブを用いて、ヒトのｃＤＮＡ、ゲノムＤＮ





ＡまたはｍＲＮＡのライブラリーをスクリーニングすることにより、そのようなライブラリーのどのメンバーにプローブがハイブリダイズするか否かを判定することができる。ハイブリダイゼーションの手法は、後述する実施例においてさらに詳細に説明する。

本出願に開示する任意のＥＳＴ配列を、本明細書中で開示する方法を用いてプローブとして同様に使用してよい。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０核酸の他の有用なフラグメントとしては、標的のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ｍＲＮＡ（センス）またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ＤＮＡ（アンチセンス）配列への結合が可能な一本鎖核酸配列（ＲＮＡまたはＤＮＡのいずれか）を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドが挙げられる。本発明によればアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ＤＮＡのコード領域のフラグメントを含む。そのようなフラグメントは、一般に、少なくとも約１４ヌクレオチド、好ましくは、約１４〜３０ヌクレオチドを含む。所与のタンパク質をコードするｃＤＮＡ配列に基づいてアンチセンスまたはセンスのオリゴヌクレオチドを誘導する能力は、例えば、Ｓｔｅｉｎ ａｎｄ Ｃｏｈｅｎ（Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．４８：２６５９，１９８８）およびｖａｎ ｄｅｒ Ｋｒｏｌ ｅｔ ａｌ．（ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ６：９５８，１９８８）に記載されている。

標的核酸配列へのアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドの結合により、増強された二重鎖分解、転写または翻訳の早期の終了を含むいくつかの手段の１つによるか、または他の手段による、標的配列の転写または翻訳を阻止する二重鎖の形成がもたらされる。したがって、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の発現を阻止するために使用され得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドはさらに、改変された糖ホスホジエステル骨格（または他の糖連結部、例えば、ＷＯ９１／０６６２９に記載のもの）を有するオリゴヌクレオチドを含み、ここで、そのような糖連結部は、内因性ヌクレアーゼに対して抵抗性である。抵抗性の糖連結部を有するそのようなオリゴヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｖｏで安定である（すなわち酵素による分解に抵抗することができる）が、標的ヌクレオチド配列に結合することができる配列特異性は、保持している。

センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドの他の例としては、ＷＯ９０／１００４８に記載されているような有機部分、およびポリ−（Ｌ−リシン）などの標的核酸配列に対するオリゴヌクレオチドの親和性を増大させる他の部分に共有結合したオリゴヌクレオチドが挙げられる。エリプチシンなどのさらに別のインターカレート剤およびアルキル化剤または金属錯体をセンスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合させることにより標的核酸配列に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドの結合特異性を改変し得る。

アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、任意の遺伝子導入法（例えば、ＣａＰＯ_４媒介ＤＮＡトランスフェクション、エレクトロポレーションを含む）によってか、またはエプスタイン・バーウイルスなどの遺伝子導入ベクターを使用することにより、標的核酸配列を含む細胞内に導入され得る。好ましい操作法においては、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、適当なレトロウイルスベクターに挿入される。標的核酸配列を含む細胞を組換えレトロウイルスベクターにｉｎ ｖｉｖｏまたはｅｘ ｖｉｖｏのいずれかで接触させる。適当なレトロウイルスベクターとしては、マウスレトロウイルスＭ−ＭｕＬＶ、Ｎ２（Ｍ−ＭｕＬＶ由来のレトロウイルス）から得られたもの、またはＤＣＴ５Ａ、ＤＣＴ５ＢおよびＤＣＴ５Ｃと表記されるダブルコピーベクター（ＷＯ９０／１３６４１を参照のこと）が挙げられるがこれらに限定されない。

センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、ＷＯ９１／０４７５３に記載されるようにリガンド結合分子との結合体の形成により標的ヌクレオチド配列を含む細胞内に導入され得る。適当なリガンド結合分子としては、細胞表面レセプター、成長因子、他のサイトカインまたは細胞表面レセプターに結合する他のリガンドが挙げられるがこれらに限定されない。好ましくは、リガンド結合分子の結合体化は、リガンド結合分子がその対応する分子またはレセプターに結合する能力を実質的に妨害したり、センスオリゴヌクレオチドもしくはアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはそのコンジュゲート型の細胞内への進入を阻止したりすることはない。

あるいは、センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＷＯ９０／１０４４８に記載されるようにオリゴヌクレオチド−脂質複合体の形成により標的核酸配列を含む細胞内に導入され得る。センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチド−脂質複合体は、好ましくは、内在性リパーゼにより細胞内で解離される。

アンチセンスまたはセンスのＲＮＡまたはＤＮＡ分子は、一般に、少なくとも約５塩基長、約１０塩基長、約１５塩基長、約２０塩基長、約２５塩基長、約３０塩基長、約３５塩基長、約４０塩基長、約４５塩基長、約５０塩基長、約５５塩基長、約６０塩基長、約６５塩基長、約７０塩基長、約７５塩基長、約８０塩基長、約８５塩基長、約９０塩基長、約９５塩基長、約１００塩基長またはそれより長い。

プローブはまた、緊密に関連するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード配列の同定のための配列のプールを作製するためのＰＣＲ法において使用され得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子をマッピングするため、および遺伝的障害を有する個体の遺伝的分析のためのハイブリダイゼーションプローブを構築するために使用できる。本明細書において提供されるヌクレオチド配列は、既知の手法（例えば、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、既知染色体マーカーに対する連鎖分析およびライブラリーを用いたハイブリダイゼーションスクリーニング）を用いて染色体および染色体の特定の領域にマッピングされ得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０に関するコード配列が、別のタンパク質に結合するタンパク質をコードする場合（例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０がレセプターである場合）は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、結合の相互作用に関与する他のタンパク質または分子を同定するためのアッセイにおいて使用できる。そのような方法により、レセプター／リガンド結合相互作用のインヒビターを同定できる。そのような結合相互作用に関与するタンパク質はまた、結合相互作用のペプチドまたは小分子のインヒビターまたはアゴニストについてのスクリーニングにおいて使用できる。また、レセプターＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０は、相関するリガンドを単離するために使用できる。スクリーニングアッセイは、ネイティブのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するレセプターの生物学的活性を模倣する鉛化合物を発見するように設計され得る。そのようなスクリーニングアッセイは、化学物質ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適したアッセイを含み、小分子薬剤候補の同定に特に適するものとなっている。企図される小分子は、合成の有機または無機の化合物を含む。アッセイは、タンパク質−タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、イムノアッセイおよび細胞ベースアッセイを含む種々の形式で実施でき、これらは、当該分野で十分に特徴付けられている。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする核酸またはその改変された形態はまた、治療上有用な試薬の開発およびスクリーニングにおいて有用となるトランスジェニック動物または「ノックアウト」動物のいずれかを作製するためにも使用できる。トランスジェニック動物（例えば、マウスまたはラット）は、トランスジーンを含む細胞を有する動物であり、そのトランスジーンは、出生前、例えば、胚の段階において動物または動物の先祖に導入されている。トランスジーンは、トランスジェニック動物を発生する細胞のゲノム内に組み込まれるＤＮＡである。本発明は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡを発現する細胞を含むトランスジェニック動物を作製するために使用される確立された手法およびゲノム配列にしたがって、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするゲノムＤＮＡをクローニングするために使用できるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするｃＤＮＡを提供する。当該分野で公知の任意の手法を用いて、標的遺伝子トランスジーンを動物に導入することにより、トランスジェニック動物の創始者が作製され得る。そのような手法としては、前核マイクロインジェクション（米国特許第４，８７３，１９１号、同第４，７３６，８６６号および同第４，８７０，００９号）；生殖細胞系へのレトロウイルス媒介遺伝子導入（Ｖａｎ ｄｅｒ Ｐｕｔｔｅｎ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８２：６１４８−６１５２（１９８５））；胚性幹細胞における遺伝子ターゲティング（Ｔｈｏｍｐｓｏｎ，ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ，５６：３１３−３２１（１９８９））；遺伝子トラップベクターを用いた非特異的挿入不活性化（米国特許第６，４３６，７０７号）；胚のエレクトロポレーション（Ｌｏ，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．，３：１８０３−１８１４（１９８３））；および精子媒介遺伝子導入（Ｌａｖｉｔｒａｎｏ，ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ，５７：７１７−７２３（１９８９）；などが挙げられるがこれらに限定されない。代表的には、特定の細胞は、組織特異的エンハンサーを用いてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０トランスジーン組み込みのためにターゲティングされる。胚の段階において動物の生殖細胞系に導入されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするトランスジーンのコピーを含むトランスジェニック動物は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡの増大した発現の作用を調べるために使用できる。そのような動物は、例えば、過剰発現に関連する病的状態からの保護を付与すると考えられる試薬に対する供試動物として使用できる。本発明のこの側面によれば、その試薬で動物を処置し、そして病的状態の発生率がトランスジーンを有する非処置の動物と比較して低減していれば、病的状態に対する潜在的治療的介入があったことを示す。あるいは、ＰＲ





Ｏ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの非ヒトホモログを用いて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０「ノックアウト」動物を構築することができ、そのノックアウト動物は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする内在性遺伝子と、動物の胚性幹細胞内に導入されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする改変ゲノムＤＮＡとの間の相同組換えの結果として、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０タンパク質をコードする欠損遺伝子または変更遺伝子を有する。好ましくは、前記ノックアウト動物は、哺乳動物である。より好ましくは、前記哺乳動物は、げっ歯類（例えば、ラットまたはマウス）である。例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするｃＤＮＡは、確立された手法にしたがって、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするゲノムＤＮＡをクローニングするために使用できる。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするゲノムＤＮＡの一部分は、欠失させ得るか、または別の遺伝子（例えば、組み込みをモニタリングするために使用できる選択可能なマーカーをコードする遺伝子）と置き換えられ得る。代表的には、非改変フランキングＤＮＡ（５’および３’末端の両方）の数キロ塩基をベクター内に含める［相同組換えベクターの説明については、例えば、Ｔｈｏｍａｓ ａｎｄ Ｃａｐｅｃｃｈｉ，Ｃｅｌｌ，５１：５０３（１９８７）を参照のこと］。そのベクターは、胚性幹細胞系統内に導入し（例えば、エレクトロポレーションによって）、そして導入されたＤＮＡが内在性ＤＮＡと相同組換えを起こしている細胞を選択す





る［例えば、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ，６９：９１５（１９９２）を参照のこと］。次に選択された細胞を動物（例えば、マウスまたはラット）の胚盤胞内に注入し、凝集キメラを形成する［例えば、Ｂｒａｄｌｅｙ，Ｔｅｒａｔｏｃａｒｃｉｎｏｍａｓ ａｎｄ Ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ Ｓｔｅｍ Ｃｅｌｌｓ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅ．Ｊ．Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ，ｅｄ．（ＩＲＬ，Ｏｘｆｏｒｄ，１９８７）ｐｐ．１１３−１５２参照］。次にキメラ胚を適当な擬似妊娠の雌里親動物内に移植し、胚を妊娠期間満了させることにより、「ノックアウト」動物を作製することができる。相同組換えされたＤＮＡをその生殖細胞に保有する子孫を標準的な手法で同定し、その動物の全細胞が相同組換えＤＮＡを含む動物を育てるために使用することができる。ノックアウト動物は、例えば、特定の病的状態に対するそのノックアウト動物の防御能力に関して、そして、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が存在しないことに起因する病的状態の発症に関して特徴付けることができる。

さらに、ノックアウトマウスは、遺伝子の機能および薬剤標的に関する薬学的有用性の発見において、ならびに所与の標的に関連する潜在的な標的上の副作用の測定において、高度な情報源であり得る。遺伝子の機能および生理学的特徴は、マウスとヒトとの間で十分保存されているが、その理由は、それらが共に哺乳動物であり、同様の数の遺伝子を含んでおり、それらの遺伝子が種間で高度に保存されているためである。例えば、マウス１６番染色体上の遺伝子の９８％がヒトオルソログを有することが最近十分に裏付けられた（Ｍｕｒａｌ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２９６：１６６１−７１（２００２））。

胚性幹（ＥＳ）細胞における遺伝子ターゲティングは、ヒト疾患に関連する多くの遺伝子における無発現変異を有するマウスの構築を可能にしているが、必ずしも遺伝子疾患のすべてが無発現変異に起因するわけではない。マウスの遺伝子座を破壊し、変異を有するヒト対応物を導入する遺伝子の置き換え（ノックイン）のための方法を確立することによってヒト疾患の価値あるマウスモデルを設計できる。その後、ヒトタンパク質をターゲティングするｉｎ ｖｉｖｏの薬剤アッセイを実施できる（Ｋｉｔａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ ａｎｄ Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａｌ Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．，２２２：７４２−４７（１９９６））。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする核酸はまた、遺伝子療法において使用され得る。遺伝子療法の用途においては、例えば、欠損遺伝子の置き換えのための治療上有効な遺伝子産物のｉｎ ｖｉｖｏ合成を達成するために細胞内に遺伝子を導入する。「遺伝子療法」とは、単回処置により持続した作用が達成される従来の遺伝子療法および治療上有効なＤＮＡまたはｍＲＮＡの単回投与または反復投与を行う遺伝子治療薬の投与の両方を含む。アンチセンスのＲＮＡおよびＤＮＡは、ｉｎ ｖｉｖｏで特定の遺伝子の発現を阻止するための治療薬として使用され得る。短いアンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞内に移入され、そこで細胞膜による限定された取り込みにより生じるその低い細胞内濃度にも関わらずインヒビターとして作用することができることが既に明らかになっている（Ｚａｍｅｃｎｉｋ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８３：４１４３−４１４６［１９８６］）。そのオリゴヌクレオチドは、例えば、その負に帯電したホスホジエステル基を非電荷の基で置換することにより、その取り込みが増強されるように改変できる。

生存細胞に核酸を導入するために使用できる種々の手法が存在する。その手法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで核酸を培養細胞中に、または意図する宿主の細胞内にｉｎ ｖｉｖｏで移入させるか応じて変動する。ｉｎ ｖｉｔｒｏの哺乳動物細胞への核酸の移入に適する手法としては、リポソームの使用、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、細胞融合、ＤＥＡＥデキストラン、リン酸カルシウム沈降法などが挙げられる。現時点で好ましいｉｎ ｖｉｖｏの遺伝子導入の手法としては、ウイルス（代表的には、レトロウイルス）ベクターによるトランスフェクションおよびウイルスコートタンパク質−リポソーム媒介トランスフェクションが挙げられる（Ｄｚａｕ ｅｔ ａｌ．，Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １１，２０５−２１０［１９９３］）。一部の状況においては、核酸起源に対し、標的細胞をターゲティングする薬剤（例えば、細胞表面膜タンパク質または標的細胞に対して特異的な抗体、標的細胞上のレセプターに対するリガンドなど）を提供することが望ましい。リポソームを使用する場合は、エンドサイトーシスに関連する細胞表面膜タンパク質に結合するタンパク質をターゲティングのためおよび／または取り込みを促進するために使用され得、そのようなものとしては、例えば、特定の細胞型に対して向性のキャプシドタンパク質またはそのフラグメント、サイクリングにおいて内在化を起こすタンパク質に対する抗体、細胞内局在化をターゲティングして細胞内半減期を増大させるタンパク質が挙げられる。レセプター媒介エンドサイトーシスの手法は、例えば、Ｗｕ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２，４４２９−４４３２（１９８７）；およびＷａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７，３４１０−３４１４（１９９０）に記載されている。遺伝子の作製および遺伝子療法のプロトコルについての概説は、Ａｎｄｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５６，８０８−８１３（１９９２）を参照のこと。

本明細書に記載したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドはまた、タンパク質電気泳動要の分子量マーカーとして使用され得、そして、単離された核酸配列は、これらのマーカーを組換え発現するために使用され得る。

本明細書に記載したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードする核酸分子は、染色体の同定のために有用である。この点に関し、実際の配列データに基づいた染色体マーカー試薬で現在使用できるものは、比較的少ないため、新しい染色体マーカーを同定する必要性がなお存在している。本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０核酸分子の各々は、染色体マーカーとして使用できる。

本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドおよび核酸分子は、また、本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが別のものと比較したときのある組織、好ましくは、同じ組織型の正常組織と比較したときの疾患組織において、差次的に発現され得る場合に、組織タイピングのために診断的に使用され得る。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０核酸分子は、ＰＣＲ、ノーザン分析、サザン分析およびウエスタン分析のためのプローブの生成のために使用される。

本明細書に記載したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドはまた、治療薬として使用され得る。本発明のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、薬学的に有用な組成物を調製するための公知の方法に従って処方され得、これによりそのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０生成物は、薬学的に許容可能な担体ビヒクルとの混合物中に組み合わせられる。治療用処方物は、凍結乾燥処方物または水溶液の形態で、任意の生理学的に許容可能な担体、賦形剤または安定化剤（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０））と、所望の純度を有する活性成分とを混合することにより保存用に調製される。許容可能な担体、賦形剤または安定化剤は、使用される用量および濃度においてレシピエントにとって非毒性であり、そしてそれらとしては、緩衝物質（例えば、リン酸塩、クエン酸塩および他の有機酸）；抗酸化剤（アスコルビン酸を含む）；低分子量（約１０残基未満）のポリペプチド；タンパク質（例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン）；親水性ポリマー（例えば、ポリビニルピロリドン、アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンまたはリシン））；単糖類、二糖類および他の炭水化物（グルコース、マンノースまたはデキストロースを含む）；キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）；糖アルコール（例えば、マンニトールまたはソルビトール）；塩形成対イオン（例えば、ナトリウム）；および／または非イオン性界面活性剤（例えば、ＴＷＥＥＮ^ＴＭ、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳ^ＴＭまたはＰＥＧ）が挙げられる。

ｉｎ ｖｉｖｏ投与のために使用される処方物は、滅菌されていなければならない。これは、凍結乾燥および再構成の前後に滅菌濾過膜に通して濾過することにより容易に達成される。

本明細書中の治療用組成物は、一般に、滅菌された取出し口を有する容器、例えば、皮下注射用の針で穿刺可能である蓋を有する静脈用溶液バッグまたはバイアル内に入っている。

投与経路は、公知の方法によるものであり、例えば、静脈内、腹腔内、脳内、筋肉内、眼内、動脈内または病巣内の経路により注射または注入を行うか、局所投与を行うか、または徐放系による。

本発明の薬学的組成物の用量および所望の薬剤濃度は、意図される特定の用途に応じて変動し得る。適切な用量または投与経路の決定は、十分に当業者の範囲内である。動物実験は、ヒトの治療有効量の決定のための信頼できる指針を与える。有効用量の種間のスケーリングは、Ｍｏｒｄｅｎｔｉ，Ｊ．ａｎｄ Ｃｈａｐｐｅｌｌ，Ｗ．“Ｔｈｅ ｕｓｅ ｏｆ ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｅｓ ｓｃａｌｉｎｇ ｉｎ ｔｏｘｉｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ”，Ｔｏｘｉｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ Ｎｅｗ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，Ｙａｃｏｂｉ ｅｔ ａｌ．，Ｅｄｓ．，Ｐｅｒｇａｍｏｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ １９８９，ｐｐ．４２−９６に記載されている原則に従って実施できる。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドあるいはそのアゴニストまたはアンタゴニストのｉｎ ｖｉｖｏ投与を用いる場合は、通常の用量は、投与経路に応じて１日当たり約１０ｎｇ／ｋｇ〜１００ｍｇ／ｋｇ哺乳動物体重またはそれ以上、好ましくは、約１μｇ／ｋｇ／日〜１０ｍｇ／ｋｇ／日の範囲であり得る。特定の用量および送達方法に関する指針は、文献に記載されており；例えば、米国特許第４，６５７，７６０号；同第５，２０６，３４４号；または同第５，２２５，２１２号を参照のこと。異なる処置用化合物および異なる障害に対しては、異なる製剤が有効であることが予想され、ある器官または組織をターゲティングする投与は、例えば、別の器官または組織の場合とは異なる様式の送達を必要とする場合がある。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの投与を必要とする任意の疾患または障害の処置に適した放出特性を有する処方物においてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの徐放投与が望まれる場合は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのマイクロカプセル化が企図される。徐放性放出のための組換えタンパク質のマイクロカプセル化は、ヒト成長ホルモン（ｒｈＧＨ）、インターフェロン（ｒｈＩＦＮ）、インターロイキン−２およびＭＮ ｒｇｐ１２０を用いて良好に行われている。Ｊｏｈｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．，２：７９５−７９９（１９９６）；Ｙａｓｕｄａ，Ｂｉｏｍｅｄ．Ｔｈｅｒ．，２７：１２２１−１２２３（１９９３）；Ｈｏｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，８：７５５−７５８（１９９０）；Ｃｌｅｌａｎｄ，“Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｓｉｎｇｌｅ Ｉｍｍｕｎｉｚａｔｉｏｎ Ｖａｃｃｉｎｅｓ Ｕｓｉｎｇ Ｐｏｌｙｌａｃｔｉｄｅ Ｐｏｌｙｇｌｙｃｏｌｉｄｅ Ｍｉｃｒｏｓｐｈｅｒｅ Ｓｙｓｔｅｍｓ”，Ｖａｃｃｉｎｅ Ｄｅｓｉｇｎ：Ｔｈｅ Ｓｕｂｕｎｉｔ ａｎｄ Ａｄｊｕｖａｎｔ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｐｏｗｅｌｌ ａｎｄ Ｎｅｗｍａｎ，ｅｄｓ，（Ｐｌｅｎｕｍ Ｐｒｅｓｓ：Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９５），ｐｐ．４３９−４６２；ＷＯ９７／０３６９２，ＷＯ９６／４００７２，ＷＯ９６／０７３９９；および米国特許第５，６５４，０１０号。

これらのタンパク質の徐放性処方物は、生体適合性および広範な生体分解性を有することからポリ乳酸グリコール酸（ＰＬＧＡ）共重合体を用いて開発された。ＰＬＧＡの分解生成物である乳酸およびグリコール酸は、ヒト身体内で迅速に除去される。さらに、このポリマーの分解性は、その分子量および組成に応じて数ヶ月〜数年に調節できる。Ｌｅｗｉｓ，“Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｒｅｌｅａｓｅ ｏｆ ｂｉｏａｃｔｉｖｅ ａｇｅｎｔｓ ｆｒｏｍ ｌａｃｔｉｄｅ／ｇｌｙｃｏｌｉｄｅ ｐｏｌｙｍｅｒ”，Ｍ．Ｃｈａｓｉｎ ａｎｄ Ｒ．Ｌａｎｇｅｒ（Ｅｄｓ．），Ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｂｌｅ Ｐｏｌｙｍｅｒｓ ａｓ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ（Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ：Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９０），ｐｐ．１−４１。

本発明は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを模倣する化合物（アゴニスト）またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの作用を妨害する化合物（アンタゴニスト）を同定するための化合物のスクリーニング方法を包含する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを模倣するアゴニストは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物による知見に基づいて、負の表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの作用を妨害するアンタゴニストは、非ヒトトランスジェニックノックアウト動物による観察結果に基づいて正の表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。アンタゴニスト薬剤候補についてのスクリーニングアッセイは、本明細書において同定される遺伝子によりコードされるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと結合もしくは複合体形成する化合物あるいはコードされたポリペプチドと他の細胞タンパク質との相互作用を他の方法で妨害する化合物を同定するために設計される。そのようなスクリーニングアッセイは、化学物質ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適したアッセイを含み、それは、小分子薬剤候補の同定に特に適したものとなっている。

そのアッセイは、例えば、タンパク質−タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、イムノアッセイおよび細胞ベースのアッセイを含む種々の形式において実施でき、これらは、当該分野で十分に特徴付けられている。

アンタゴニストに関するすべてのアッセイは、それらのアッセイが、薬剤候補と、本明細書中で同定した核酸によりコードされるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドとを、これら２成分が相互作用できるのに十分な条件下および十分な時間に亘り、接触させることを要する点において、共通である。

結合アッセイにおいては、相互作用は、結合であり、そして形成される複合体は、単離され得るか、または反応混合物中で検出され得る。本明細書中で同定される遺伝子によりコードされるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは薬剤候補を固相上、例えば、マイクロタイタープレート上に、共有結合または非共有結合により固定化する。非共有結合は、一般に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの溶液で固体表面をコーティングし、そして乾燥することにより達成される。あるいは、固定化されるべきＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに特異的な固定化抗体、例えば、モノクローナル抗体を用いて固体表面にそのポリペプチドを固定することができる。このアッセイは、検出可能な標識で標識されていてよい固定化されていない成分を固定化された成分、例えば、固定された成分を有するコーティングされた表面に添加することにより行う。反応終了後、非反応成分を、例えば洗浄により除去し、そして固体表面に固定された複合体を検出する。元々、固定されていない成分が検出可能な標識を有する場合は、表面に固定化された標識の検出は、複合体形成が起こったことを示す。元々、固定されていない成分が標識を有していない場合は、複合体形成は、例えば、固定化された複合体に特異的に結合する標識された抗体を使用することにより検出できる。

候補化合物が、本明細書中で同定される遺伝子によりコードされる特定のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと相互作用するが結合しない場合、そのポリペプチドとの相互作用は、タンパク質−タンパク質相互作用を検出するための周知の方法によりアッセイすることができる。そのようなアッセイとしては、従来の方法（例えば、架橋結合、同時免疫沈降および勾配またはクロマトグラフィーカラムを介した同時精製）が挙げられる。さらに、タンパク質−タンパク質相互作用は、Ｃｈｅｖｒａｙ ａｎｄ Ｎａｔｈａｎｓ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：５７８９−５７９３（１９９１）により開示されているように、Ｆｉｅｌｄｓおよび共同研究者らにより報告された酵母ベースの遺伝子系（Ｆｉｅｌｄｓ ａｎｄ Ｓｏｎｇ，Ｎａｔｕｒｅ（Ｌｏｎｄｏｎ），３４０：２４５−２４６（１９８９）；Ｃｈｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８８：９５７８−９５８２（１９９１））を用いてモニタリングできる。多くの転写活性化物質（例えば、酵母ＧＡＬ４）は、２つの物理的に個別のモジュラードメイン、一方は、ＤＮＡ結合ドメインとして作用するもの、他方は、転写活性化ドメインとして機能するものからなる。上記文献に記載された酵母発現系（一般に「ツーハイブリッド系」と呼ばれる）は、この性質を利用しており、そして、２つのハイブリッドタンパク質を使用し、一方においては、標的タンパク質がＧＡＬ４のＤＮＡ結合ドメインに融合しており、他方においては、候補の活性化タンパク質が活性化ドメインに融合している。ＧＡＬ４活性化プロモーターの制御下のＧＡＬ１−ｌａｃＺレポーター遺伝子の発現は、タンパク質−タンパク質相互作用を介したＧＡＬ４活性の再構成に依存している。相互作用ポリペプチドを含むコロニーは、β−ガラクトシダーゼに対する発色基質を用いて検出される。ツーハイブリッド手法を用いて２つの特定のタンパク質の間のタンパク質−タンパク質相互作用を同定するための完全なキット（ＭＡＴＣＨＭＡＫＥＲ^ＴＭ）は、Ｃｌｏｎｔｅｃｈから市販されている。この系はまた、特定のタンパク質相互作用に関与するタンパク質ドメインをマッピングするため、ならびにこれらの相互作用に必須であるアミノ酸残基を限定するためにも応用できる。

本明細書中で同定されるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子と他の細胞内または細胞外の成分との相互作用を妨害する化合物のアッセイは、以下の通り行うことができる：通常、遺伝子産物および細胞内または細部外の成分を含む反応混合物を、２つの生成物の相互作用および結合を可能にする条件下および時間に渡り調製する。候補化合物が結合を抑制する能力を試験するために、反応を試験化合物の非存在下および存在下において実施する。さらに、プラセボを第３の反応混合物に添加し、ポジティブコントロールとして使用し得る。試験化合物と混合物中に存在する細胞内または細胞外の成分との間の結合（複合体形成）は、上記した通りモニタリングされる。コントロール反応においては、複合体が形成されるが試験化合物を含む反応混合物では、形成しないことは、被験化合物が被験化合物とその反応相手との相互作用を妨害することを示す。

アンタゴニストをアッセイするために、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを、特定の活性に関してスクリーニングされる化合物と共に細胞に添加して、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの存在下における目的の活性を抑制する化合物の能力は、その化合物がＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアンタゴニストであることを示している。あるいは、アンタゴニストは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと、膜結合ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドレセプターまたは組換えレセプターに対する潜在的アンタゴニストとを競合的阻害アッセイのための適切な条件下で組み合わせることにより検出され得る。レセプターに結合しているＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド分子の数を用いて潜在的アンタゴニストの有効性を測定することができるように、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを例えば、放射能により標識することができる。そのレセプターをコードする遺伝子は、当業者に公知の多くの方法、例えば、リガンドパニングおよびＦＡＣＳソーティングにより同定できる。Ｃｏｌｉｇａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎ．，１（２）：Ｃｈａｐｔｅｒ ５（１９９１）。好ましくは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに応答する細胞からポリアデニル化ＲＮＡを調製し、そしてこのＲＮＡから作製したｃＤＮＡライブラリーをプールに分割し、ＣＯＳ細胞またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲ





Ｏ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに応答しない他の細胞をトランスフェクトするために使用する発現クローニングが使用される。スライドガラス上の生育したトランスフェクト細胞を、標識されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに曝露する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、ヨウ素化または部位特異的タンパク質キナーゼに対する認識部位を含ませることを含む種々の手段により標識できる。固定化およびインキュベーションの後、スライドをオートラジオグラフ分析に供する。陽性のプールを同定し、サブプールを調製し、相互作用的なサブプール化および再スクリーニングの過程を用いて再トランスフェクトし、最終的に推定レセプターをコードする単一のクローンを得る。

レセプターの同定のための代替アプローチとして、標識されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを、レセプター分子を発現する細胞膜または抽出調製物に光親和性連結させることができる。架橋結合された物質をＰＡＧＥで分離し、Ｘ線フィルムに曝露する。レセプターを含む標識された複合体を切り出し、ペプチドフラグメントに分離し、そしてタンパク質マイクロ配列決定に供することができる。マイクロ配列決定から得られたアミノ酸配列を用いて、ｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングするための変性オリゴヌクレオチドプローブのセットを設計することにより、推定レセプターをコードする遺伝子を同定する。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアンタゴニストの作用を評価する際の別の方法は、既知のノックアウト表現型を模倣するために、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０アンタゴニストを野生型マウスに投与することであり得る。すなわち、まず目的のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子をノックアウトし、そしてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子のノックアウトまたは破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、野生型マウスにＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアンタゴニストを投与することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアンタゴニストの有効性を評価することができる。有効なアンタゴニストは、ノックアウト動物において最初に観察された表現型の作用を模倣すると予測される。

同様に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストの作用は、既知の負のノックアウト表現型を寛解するために非ヒトトランスジェニックマウスにＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０アゴニストを投与することにより評価することができる。すなわち、まず目的のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子をノックアウトし、そしてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子のノックアウトまたは破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、非ヒトトランスジェニックマウスにＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアゴニストを投与することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対するアゴニストの有効性を評価することができる。有効なアゴニストは、ノックアウト動物において最初に観察された負の表現型の作用を寛解すると予測される。

アンタゴニストに関する別のアッセイでは、レセプターを発現する哺乳動物細胞または膜調製物を、候補化合物の存在下において標識されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと共にインキュベートする。次に、この相互作用を増強または阻止する化合物の能力を測定する。

潜在的アンタゴニストのより特定の例としては、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドとの免疫グロブリンの融合物に結合するオリゴヌクレオチド、そして特に抗体（ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体ならびに抗体フラグメント、一本鎖抗体、抗イデオタイプ抗体ならびにそのような抗体またはフラグメントのキメラ型またはヒト化型、ならびにヒト抗体およびヒト抗体フラグメントが挙げられるがこれらに限定されない。あるいは、潜在的アンタゴニストは、緊密に関連するタンパク質、例えば、レセプターを認識するが作用をもたらさないことから、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの作用を競合的に阻害するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの変異型であり得る。

別の潜在的ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドアンタゴニストは、例えば、アンチセンスＲＮＡまたはアンチセンスＤＮＡ分子が標的ｍＲＮＡにハイブリダイズし、タンパク質翻訳を妨害することによってｍＲＮＡの翻訳を直接阻止して作用する場合、アンチセンス技術を用いて調製されたアンチセンスＲＮＡ構築物またはアンチセンスＤＮＡ構築物である。アンチセンス技術を用いて、三重らせん形成またはアンチセンスＤＮＡもしくはアンチセンスＲＮＡを介して遺伝子発現を制御することができ、これらの方法は、両方ともＤＮＡまたはＲＮＡへのポリヌクレオチドの結合に基づいている。例えば、本明細書中の成熟ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の５’コーディング部分を用いて、約１０〜４０塩基対長のアンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドを設計する。ＤＮＡオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相補であるように設計（三重らせん−Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，６：３０７３（１９７９）；Ｃｏｏｎｅｙ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４１：４５６（１９８８）；Ｄｅｒｖａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５１：１３６０（１９９１））することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの転写および産生を妨害する。アンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｖｏでｍＲＮＡにハイブリダイズし、そしてそのｍＲＮＡ分子がＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに翻訳されるのを阻止する（アンチセンス−Ｏｋａｎｏ，Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．，５６：５６０（１９９１）；Ｏｌｉｇｏｄｅｏｘｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｓ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｓ ｏｆ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ（ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ：Ｂｏｃａ Ｒａｔｏｎ，ＦＬ，１９８８））。上記したオリゴヌクレオチドは、アンチセンスＲＮＡまたはアンチセンスＤＮＡがｉｎ ｖｉｖｏで発現され、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの産生を抑制するように、細胞に送達することもできる。アンチセンスＤＮＡを使用する場合は、例えば、標的遺伝子ヌクレオチド配列の約−１０〜＋１０位の間の翻訳開始部位から得られるオリゴデオキシリボヌクレオチドが好ましい。

潜在的アンタゴニストは、活性部位、レセプター結合部位もしくは成長因子またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの他の関連する結合部位に結合することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの正常な生物学的活性を阻止する小分子を含む。小分子の例としては、小型のペプチドまたはペプチド様分子、好ましくは、可溶性ペプチドおよび合成の非ペプチジル有機化合物または非ペプチジル無機化合物が挙げられるがこれらに限定されない。

リボザイムは、ＲＮＡの特異的切断を触媒することができる酵素的ＲＮＡ分子である。リボザイムは、相補的な標的ＲＮＡへの配列特異的ハイブリダイゼーション、およびその後のエンドヌクレアーゼ的切断により作用する。潜在的ＲＮＡ標的内の特異的リボザイム切断部位は、公知の手法により同定できる。さらに詳細な説明については、例えば、Ｒｏｓｓｉ，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｂｉｏｌｏｇｙ，４：４６９−４７１（１９９４）およびＰＣＴ公開ＷＯ９７／３３５５１（１９９７年９月１８日公開）を参照のこと。

転写を抑制するために使用される三重らせん形成における核酸分子は、一本鎖でありデオキシヌクレオチドから構成されるものでなければならない。これらのオリゴヌクレオチドの塩基の組成は、Ｈｏｏｇｓｔｅｅｎの塩基対形成の規則によって三重螺旋形成を促進するように設計され、その規則には、一般に二重鎖の一方の鎖の上にかなりの長さのプリンまたはピリミジンが必要となる。さらに詳細な説明は、前出のＰＣＴ公開ＷＯ９７／３３５５１を参照のこと。

これらの小分子は、上記したスクリーニングアッセイの任意の１つ以上により、そして／または当業者に周知の他のスクリーニング手法により、同定することができる。

本明細書に開示した分子の診断上および治療上の使用はまた、後に開示および説明する正の機能のアッセイのヒットに基づき得る。

Ｆ．抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体
本発明は、治療薬および／または診断薬として本明細書中で使用され得る抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を提供する。例示される抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、二重特異性抗体およびヘテロ結合体化抗体を含む。

１．ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は、好ましくは、関連する抗原およびアジュバントの複数回の皮下（ｓｃ）注射または腹腔内（ｉｐ）注射により動物中で産生させる。その関連する抗原は、（特に合成ペプチドを使用する場合）免疫される種において免疫原となるタンパク質に結合体することが有用であり得る。例えば、抗原は、二官能性薬剤または誘導体形成性の物質、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル（システイン残基を介した結合体化）、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド（リシン残基を介する）、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、ＳＯＣｌ_２またはＲ^１Ｎ＝Ｃ＝ＮＲ（式中、ＲおよびＲ^１は、異なるアルキル基である）を用いて、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）、血清アルブミン、ウシチログロブリンまたはダイズトリプシンインヒビターに結合体化され得る。

例えば、１００μｇまたは５μｇのタンパク質または結合体（それぞれウサギまたはマウスの場合）を３容量のフロイント完全アジュバントと混合し、その溶液を複数部位に皮内注射することにより、抗原、免疫原性結合体または誘導体に対して動物を免疫する。１ヵ月後、複数部位への皮下注射によりフロイント完全アジュバント中のペプチドまたは結合体の元の量の１／５〜１／１０を用いて動物を追加免疫する。７〜１４日後、動物から採血し、血清の抗体力価をアッセイする。力価が平衡に達するまで動物を追加免疫する。結合体はまた、タンパク質融合物として組換え細胞培養物中において作製することもできる。また、ミョウバンなどの凝集剤を適宜使用して、免疫応答を増強する。

２．モノクローナル抗体
モノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２５６：４９５（１９７５）により、初めて報告されたハイブリドーマ法を用いて作製され得るか、または組換えＤＮＡ法（米国特許第４，８１６，５６７号）によりされ得る。

ハイブリドーマ法においては、マウスまたは他の適切な宿主動物（例えば、ハムスター）を上記したように免疫することにより、免疫に使用するタンパク質に特異的に結合する抗体を産生するか、または産生可能であるリンパ球を誘発させる。あるいは、リンパ球は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで免疫され得る。免疫の後、リンパ球を単離し、次に適当な融合剤（例えば、ポリエチレングリコール）を用いてミエローマ細胞株と融合することにより、ハイブリドーマ細胞が形成される（Ｇｏｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，ｐｐ．５９−１０３（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９８６））。

このように調製されたハイブリドーマ細胞を適当な培養培地中に播種して生育させるが、その培地は、好ましくは、融合していない親ミエローマ細胞（融合相手とも呼ばれる）の生育または生存を抑制する１つ以上の物質を含むものである。例えば、親ミエローマ細胞が、酵素ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ（ＨＧＰＲＴまたはＨＰＲＴ）を欠失している場合は、ハイブリドーマに対する選択培養培地は、代表的には、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含み（ＨＡＴ培地）、これらの物質は、ＨＧＰＲＴ欠損細胞の生育を妨害する。

好ましい融合相手であるミエローマ細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベルの産生を支援し、そして融合していない親細胞に対して選択する選択培地に対して感受性であるものである。好ましいミエローマ細胞株は、マウスミエローマ株（例えば、Ｓａｌｋ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ Ｃｅｌｌ Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ Ｃｅｎｔｅｒ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ ＵＳＡより入手可能なＭＯＰＣ−２１およびＭＰＣ−１１マウス腫瘍から得られるものおよびＡｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ，Ｍａｎａｓｓａｓ，Ｖｉｒｇｉｎｉａ，ＵＳＡより入手可能なＳＰ−２および誘導体、例えば、Ｘ６３−Ａｇ８−６５３細胞）である。ヒトミエローマおよびマウス−ヒトヘテロミエローマ細胞株もまた、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている（Ｋｏｚｂｏｒ，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１３３：３００１（１９８４）；およびＢｒｏｄｅｕｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ｐｐ．５１−６３（Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８７））。

ハイブリドーマ細胞を生育させる培養培地は、抗原に対して指向されたモノクローナル抗体の産生に関してアッセイされる。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降またはｉｎ ｖｉｔｒｏの結合アッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）または酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ））により測定する。

モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Ｍｕｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１０７：２２０（１９８０）に記載のスキャッチャード分析により測定できる。

所望の特異性、親和性および／または活性の抗体を産生するハイブリドーマ細胞が一旦同定されると、限界希釈法によりクローンをサブクローニングし、標準的な方法により生育させ得る（Ｇｏｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，ｐｐ．５９−１０３（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９８６））。この目的のための適当な培地としては、例えば、Ｄ−ＭＥＭまたはＲＰＭＩ−１６４０培地が挙げられる。さらに、ハイブリドーマ細胞は、例えば、マウスへの細胞のｉ．ｐ．注射により、動物における腹水腫瘍としてｉｎ ｖｉｖｏで生育させてよい。

サブクローンにより分泌されたモノクローナル抗体は、従来の抗体精製手順（例えば、アフィニティクロマトグラフィ（例えば、プロテインＡまたはプロテインＧ−セファロースを使用）またはイオン交換クロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析など）により、培養培地、腹水または血清から適宜分離する。

モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、従来の手順を用いて（例えば、マウス抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより）容易に単離および配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、そのようなＤＮＡの好ましい起源となる。一旦、単離されると、そのＤＮＡは、発現ベクター内に入れられ、次いで宿主細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞、サルＣＯＳ細胞、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞または他の方法で抗体タンパク質を産生しないミエローマ細胞）にトランスフェクトされることにより、組換え宿主細胞内でモノクローナル抗体の合成を行う。抗体をコードするＤＮＡの細菌における組換え発現に関する概説としては、Ｓｋｅｒｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ．，５：２５６−２６２（１９９３）およびＰｌｕｅｃｋｔｈｕｎ，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖｓ．１３０：１５１−１８８（１９９２）が挙げられる。

モノクローナル抗体または抗体フラグメントは、ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３４８：５５２−５５４（１９９０）に記載の手法を用いて作製した抗体ファージライブラリーから単離できる。Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３５２：６２４−６２８（１９９１）およびＭａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８１−５９７（１９９１）は、ファージライブラリーを用いたそれぞれマウスおよびヒトの抗体の単離を報告している。その後の出版物は、チェインシャフリングによる高親和性（ｎＭ範囲）のヒト抗体の産生（Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１０：７７９−７８３（１９９２））ならびに極めて大型のファージライブラリーを構築するためのストラテジとしてのコンビナトリアル感染およびｉｎ ｖｉｖｏ組換え（Ｗａｔｅｒｈｏｕｓｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．，２１：２２６５−２２６６（１９９３））を報告している。すなわち、これらの手法は、モノクローナル抗体の単離のための従来のモノクローナル抗体ハイブリドーマ手法の実行可能な代替法である。

抗体をコードするＤＮＡは、例えば、相同なマウス配列に対してヒトの重鎖および軽鎖の定常ドメイン（Ｃ_ＨおよびＣ_Ｌ）配列を置換することにより（米国特許第４，８１６，５６７号；およびＭｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１（１９８４））、または非免疫グロブリンポリペプチド（異種ポリペプチド）に対するコード配列の全部または一部に免疫グロブリンコード配列を融合することにより、キメラ抗体または融合抗体のポリペプチドが産生されるように改変され得る。非免疫グロブリンポリペプチド配列は、抗体の定常ドメインに対して置換することができるか、または抗体の１つの抗原複合化部位の可変ドメインに対して置換されることにより、抗原に対する特異性を有する１つの抗原複合化部位および異なる抗原に対する特異性を有する別の抗原複合化部位を含むキメラ２価抗体が生成される。

３．ヒト抗体およびヒト化抗体
本発明の抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体はさらに、ヒト化抗体またはヒト抗体を含み得る。非ヒト（例えば、マウス）抗体のヒト化型は、非ヒト免疫グロブリンから得られる最小配列を含むキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはそのフラグメント（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）_２または抗体の他の抗原結合サブ配列）である。ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン（レシピエント抗体）を包含し、これにおいては、レシピエントの相補性決定領域（ＣＤＲ）に由来する残基が所望の特異性、親和性および能力を有する非ヒト種（例えば、マウス、ラットまたはウサギ）（ドナー抗体）のＣＤＲに由来する残基で置き換えられている。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのＦｖフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられている。ヒト化抗体はまた、レシピエント抗体および移入されたＣＤＲ配列またはフレームワーク配列のいずれにも存在しない残基を含んでよい。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、代表的には２つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、これにおいては、ＣＤＲ領域のすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのそれに相当し、そしてＦＲ領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のそれである。ヒト化抗体はまた、必要に応じてさらに免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）の少なくとも一部分、代表的には、ヒト免疫グロブリンの少なくとも一部分を含む［Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３２１：５２２−５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３３２：３２３−３２９（１９８８）；およびＰｒｅｓｔａ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．，２：５９３−５９６（１９９２）］。

非ヒト抗体をヒト化するための方法は、当該分野で周知である。一般に、ヒト化抗体は、非ヒトである起源からそれに導入された１つ以上のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、しばしば「移入」残基と呼ばれ、これらは、代表的には、「移入」可変ドメインに由来する。ヒト化は、本質的には、げっ歯類のＣＤＲまたはＣＤＲ配列とヒト抗体の対応する配列を置換することにより、Ｗｉｎｔｅｒおよび共同研究者らの方法に従って実施することができる（Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ，３２１：５２２−５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ，３３２：３２３−３２７（１９８８）；Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３９：１５３４−１５３６（１９８８））に従って実施することができる。したがって、そのような「ヒト化」抗体は、インタクトなヒト可変ドメインより実質的に少ない部分が非ヒト種由来の対応する配列により置換されているキメラ抗体（米国特許第４，８１６，５６７号）である。実際、ヒト化抗体は、代表的には、一部のＣＤＲ残基および恐らくは、一部のＦＲ残基が、げっ歯類抗体における類似の部位に由来する残基により置換されているヒト抗体である。

ヒト化抗体の作製において使用される軽鎖および重鎖の両方のヒト可変ドメインの選択は、抗体がヒトの治療上の使用を意図している場合は、抗原性およびＨＡＭＡ（ヒト抗マウス抗体）応答を低減するために極めて重要である。いわゆる「ベストフィット」法にしたがって、げっ歯類抗体の可変ドメインの配列を、既知のヒト可変ドメイン配列の全ライブラリーに対してスクリーニングする。げっ歯類のものに最も近似しているヒトＶドメイン配列を同定し、そして、その内部にあるヒトフレームワーク領域（ＦＲ）をヒト化抗体として許容する（Ｓｉｍｓ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５１：２２９６（１９９３）；Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９６：９０１（１９８７））。別の方法は、軽鎖または重鎖の特定のサブグループのすべてのヒト抗体のコンセンサス配列から得られる特定のフレームワーク領域を使用する。同じフレームワークがいくつかの異なるヒト化抗体に対して使用され得る（Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：４２８５（１９９２）；Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｕｎｏｌ．，１５１：２６２３（１９９３））。

抗原に対する高い結合親和性および他の望ましい生物学的特性を保持しながら抗体をヒト化させることがさらに重要である。この目標を達成するために、好ましい方法にしたがって、親配列およびヒト化配列の三次元モデルを用いて、親配列および様々な概念的ヒト化産物の分析のプロセスにより、ヒト化抗体が調製される。三次元の免疫グロブリンモデルは、一般に入手可能であり、当業者によく知られているものである。選択された候補免疫グロブリン配列の推定三次元コンホメーション構造を図画し、表示するコンピュータプログラムが利用できる。これらの表示を精査することにより、候補免疫グロブリン配列が機能する際の残基の推定される役割の分析、すなわち候補免疫グロブリンがその抗原に結合する能力に影響する残基の分析が可能になる。このようにして、ＦＲ残基を、レシピエントおよび移入配列から、選択して組み合わせることができ、その結果、所望の抗体特性（例えば、標的抗原に対して増大した親和性）が達成される。一般に、超可変領域残基が、抗原結合への影響において、直接、そして最も実質的に関与する。

様々な形態のヒト化抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体が企図される。例えば、ヒト化抗体は、抗体フラグメント（例えば、Ｆａｂ）であり得、これは、必要に応じて、免疫複合体を形成するために１個以上の細胞傷害性薬剤と結合体化される。あるいは、ヒト化抗体は、インタクトな抗体（例えば、インタクトなＩｇＧ１抗体）であり得る。

ヒト化の代替として、ヒト抗体が作製され得る。例えば、内因性免疫グロブリン産生のない状況下においてヒト抗体の完全なレパートリーを免疫により産生することができるトランスジェニック動物（例えば、マウス）を作製することが現在可能である。例えば、キメラマウスおよび生殖細胞系変異マウスにおける抗体重鎖連結領域（Ｊ_Ｈ）遺伝子のホモ接合性の欠失が、内因性の抗体産生の完全な抑制をもたらすことが報告されている。ヒト生殖細胞系免疫グロブリン遺伝子アレイをそのような生殖細胞系変異マウスへの移入することは、抗原チャレンジ時のヒト抗体の産生をもたらすことになる。例えば、Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：２５５１（１９９３）；Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３６２：２５５−２５８（１９９３）；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｙｅａｒ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏ．７：３３（１９９３）；米国特許第５，５４５，８０６号、同第５，５６９，８２５号、同第５，５９１，６６９号（すべてＧｅｎＰｈａｒｍ）；同第５，５４５，８０７号；およびＷＯ９７／１７８５２を参照のこと。

あるいは、ファージディスプレイ技術（ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３４８：５５２−５５３［１９９０］）を用いることにより、免疫されていないドナー由来の免疫グロブリン可変（Ｖ）ドメイン遺伝子レパートリーからヒト抗体およびヒト抗体フラグメントをｉｎ ｖｉｔｒｏで作製することができる。この手法によれば、抗体Ｖドメイン遺伝子を糸状バクテリオファージ（例えば、Ｍ１３またはｆｄ）の主要なまたは副次的なコートタンパク質遺伝子のいずれかにインフレームでクローニングし、ファージ粒子の表面上の機能的抗体フラグメントとしてディスプレイさせる。糸状粒子は、ファージゲノムの一本鎖ＤＮＡコピーを含むため、抗体の機能的特性に基づいた選択もまた、これらの特性を示す抗体をコードする遺伝子の選択をもたらす。すなわち、ファージは、Ｂ細胞の特性の一部を模倣する。ファージディスプレイは、例えば、Ｊｏｈｎｓｏｎ，Ｋｅｖｉｎ Ｓ．ａｎｄ Ｃｈｉｓｗｅｌｌ，Ｄａｖｉｄ Ｊ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ，３：５６４−５７１（１９９３）において概説されている種々の形式で実施できる。Ｖ遺伝子セグメントのいくつかの起源をファージディスプレイのために使用できる。Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３５２：６２４−６２８（１９９１）では、免疫したマウスの脾臓から得られたＶ遺伝子の小型のランダムなコンビナトリアルライブラリーから抗オキサゾロン抗体の多様なアレイを単離した。免疫されていないヒトドナー由来のＶ遺伝子のレパートリーを構築することができ、そして抗原の多様なアレイ（自己抗原を含む）に対する抗体を、Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１−５９７（１９９１）またはＧｒｉｆｆｉｔｈ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．１２：７２５−７３４（１９９３）により記載された手法に本質的に従って単離することができる。米国特許第５，５６５，３３２号および同第５，５７３，９０５号も参照のこと。

上記したように、ヒト抗体はまた、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの活性化されたＢ細胞により作製され得る（米国特許第５，５６７，６１０号および同第５，２２９，２７５号を参照のこと）。

４．抗体フラグメント
特定の状況において、抗体全体ではなく、抗体フラグメントを使用するほうが有利である。より小さいサイズのフラグメントは、迅速なクリアランスを可能にし、そして固形腫瘍への向上した到達をもたらし得る。

抗体フラグメントの作製のための様々な手法が開発されている。伝統的には、これらのフラグメントは、インタクトな抗体のタンパク質分解的消化を介して得ていた（例えば、Ｍｏｒｉｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ ａｎｄ Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２４：１０７−１１７（１９９２）；およびＢｒｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２２９：８１（１９８５）を参照のこと）。しかしながら、これらのフラグメントは、現在、組換え宿主細胞により直接作製することができる。Ｆａｂ、ＦｖおよびＳｃＦｖ抗体フラグメントはすべて、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて発現させ、これより分泌させることができ、これにより、大量のこれらのフラグメントを効率的に産生できる。抗体フラグメントは、上記した抗体ファージライブラリーから単離できる。あるいは、Ｆａｂ’−ＳＨフラグメントを直接、Ｅ．ｃｏｌｉから回収し、化学的に結合してＦ（ａｂ’）_２フラグメントを形成することができる（Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：１６３−１６７（１９９２）。別の方法によれば、Ｆ（ａｂ’）_２フラグメントは、組換え宿主細胞培養物から直接単離できる。サルベージレセプター結合エピトープ残基を含むｉｎ ｖｉｖｏ半減期が延長したＦａｂおよびＦ（ａｂ’）_２フラグメントは、米国特許第５，８６９，０４６号に記載されている。抗体フラグメントの産生のための他の手法は、当業者に明らかである。選択された抗体は、一本鎖Ｆｖフラグメント（ｓｃＦｖ）である。ＷＯ９３／１６１８５；米国特許第５，５７１，８９４号；および米国特許第５，５８７，４５８号を参照のこと。ＦｖおよびｓＦｖは、定常領域を欠いたインタクトな複合化部位を有する唯一の種であり；すなわち、それらは、ｉｎ ｖｉｖｏにおいて使用する間の低い非特異的結合に適している。ｓＦｖ融合タンパク質を構築することにより、ｓＦｖのアミノ末端またはカルボキシ末端のいずれかにエフェクタータンパク質を融合させてよい。Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ｅｄ．Ｂｏｒｒｅｂａｅｃｋ，前出を参照のこと。抗体フラグメントはまた、例えば、米国特許第５，６４１，８７０号に記載の「線状抗体」であってもよい。そのような線状抗体フラグメントは、単一特異性または二重特異性であり得る。

５．二重特異性抗体
二重特異性抗体は、少なくとも２つの異なるエピトープに対する結合特異性を有する抗体である。例示される二重特異性抗体は、本明細書に記載するＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０タンパク質の２つの異なるエピトープに結合し得る。他のそのような抗体は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の結合部位を別のタンパク質に対する結合部位と組み合わし得る。あるいは、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０アームを白血球上のトリガー分子（例えば、Ｔ細胞レセプター分子（例えば、ＣＤ３）またはＩｇＧに対するＦｃレセプター（ＦｃγＲ）、例えば、ＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）、ＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）およびＦｃγＲＩＩＩ（ＣＤ１６））に結合するアームと組み合わせることにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０発現細胞に対して細胞防御機序を集中および局在化させ得る。二重特異性抗体はまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現する細胞に細胞傷害性薬剤を局在化させるために使用され得る。これらの抗体は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０結合アームおよび細胞傷害性薬剤（例えば、サポリン、抗インターフェロン−α、ビンカアルカロイド、リシンＡ鎖、メトトレキサートまたは放射性同位体ハプテン）に結合するアームを保有している。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体フラグメント（例えば、Ｆ（ａｂ’）_２二重特異性抗体）として調製できる。

ＷＯ９６／１６６７３は、二重特異性抗ＥｒｂＢ２／抗ＦｃγＲＩＩＩ抗体を記載しており、そして米国特許第５，８３７，２３４号は、二重特異性抗ＥｒｂＢ２／抗ＦｃγＲＩ抗体を開示している。二重特異性抗ＥｒｂＢ２／Ｆｃα抗体は、ＷＯ９８／０２４６３に示されている。米国特許第５，８２１，３７７号は、二重特異性抗ＥｒｂＢ２／抗ＣＤ３抗体を教示している。

二重特異性抗体を作製するための方法は、当該分野で公知である。完全長二重特異性抗体の従来の調製は、２つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の同時発現に基づいており、その場合、２つの鎖は、異なる特異性を有する（Ｍｉｌｌｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３０５：５３７−５３９（１９８３））。免疫グロブリンの重鎖および軽鎖のランダムな取合せに起因して、これらのハイブリドーマ（クアドローマ）は、１０種の異なる抗体分子の潜在的混合物を生成し、そのうちわずか１種のみが正しい二重特異性構造を有する。通常、アフィニティクロマトグラフィ工程により行われる正しい分子の精製は、かなり面倒であり、そして生成物収率は、低い。同様の手順がＷＯ９３／０８８２９およびＴｒａｕｎｅｃｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ，１０：３６５５−３６５９（１９９１）に開示されている。

異なる方法によれば、所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン（抗体−抗原複合化部位）を、免疫グロブリンの定常ドメイン配列に融合させる。好ましくは、融合は、少なくとも一部のヒンジ、Ｃ_Ｈ２およびＣ_Ｈ３領域を含むＩｇ重鎖定常ドメインと行う。融合物の少なくとも１つにおいて存在する、軽鎖結合に必要な部位を含む第１の重鎖定常領域（Ｃ_Ｈ１）を有することが望ましい。免疫グロブリン重鎖融合物、および所望であれば、免疫グロブリン軽鎖をコードするＤＮＡを別々の発現ベクターに挿入し安定な宿主細胞に同時トランスフェクトする。これにより、構築において使用した３種のポリペプチド鎖の等しくない比率が、所望の二重特異性抗体の最適な収率をもたらす場合、その３種のポリペプチドフラグメントの相互の割合を調節する際に多大な柔軟性がもたらされる。しかしながら、等しい比率における少なくとも２つのポリペプチド鎖の発現が高収率をもたらす場合、または比率が所望の鎖の組合せの収率に有意に影響しない場合は、単一の発現ベクター内に２つまたは３つすべてのポリペプチド鎖に関するコード配列を挿入することが可能である。

本発明は、一方のアームにおける第１の結合特異性を有するハイブリッド免疫グロブリン重鎖および他方のアームにおけるハイブリッド免疫グロブリン重鎖−軽鎖対（第２の結合特異性をもたらす）から構成される二重特異性抗体を提供する。この非対称の構造は、二重特異性分子の片方にのみ免疫グロブリン軽鎖が存在することにより、分離の効率的方法が提供されるため、望ましくない免疫グロブリン鎖の組合せから所望の二重特異性化合物を分離することを容易にすることがわかっている。この方法は、ＷＯ９４／０４６９０に開示されている。二重特異性抗体の作製のさらに詳細な説明は、例えば、Ｓｕｒｅｓｈ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ １２１：２１０（１９８６）を参照のこと。

米国特許第５，７３１，１６８号に記載の別の方法によれば、抗体分子対の間の界面を操作することにより、組換え細胞培養から回収されるヘテロ２量体の割合を最大限にすることができる。好ましい界面は、Ｃ_Ｈ３ドメインの少なくとも一部を含む。この方法において、第１の抗体分子の界面に由来する１つ以上の小型アミノ酸側鎖をより大きい鎖（例えば、チロシンまたはトリプトファン）で置き換える。大型の側鎖と同一または同様のサイズの代償的な「空洞」が、大型のアミノ酸側鎖をより小さいもの（例えば、アラニンまたはスレオニン）と置き換えることによって第２の抗体分子の界面上に形成される。これは、ホモ２量体などの他の望ましくない最終生成物よりもヘテロ２量体の収率を増大させるための機序を提供する。

二重特異性抗体は、架橋結合された抗体または「ヘテロ結合体」抗体を含む。例えば、ヘテロ結合体における抗体の一方をアビジンに、そして他方をビオチンに結合することができる。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングするため（米国特許第４，６７６，９８０号）およびＨＩＶ感染の処置のため（ＷＯ９１／００３６０、ＷＯ９２／２００３７３およびＥＰ０３０８９）に提案されている。ヘテロ結合体抗体は、任意の好都合な架橋結合法を用いて作製され得る。適当な架橋結合剤は、当該分野で周知であり、そして多くの架橋結合の手法と共に米国特許第４，６７６，９８０号に開示されている。

抗体フラグメントから二重特異性抗体を作製するための手法もまた、文献に記載されている。例えば、二重特異性抗体は、キメラ連結を用いて調製できる。Ｂｒｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：８１（１９８５）は、Ｆ（ａｂ’）_２フラグメントを作製するためにインタクトな抗体をタンパク質分解的に切断する手順を記載している。これらのフラグメントをジチオール複合体形成剤、亜ヒ酸ナトリウムの存在下で還元することにより、隣接ジチオールを安定化させ、分子間ジスルフィドの形成を妨害する。次に、形成されたＦａｂ’フラグメントをチオニトロベンゾエート（ＴＮＢ）誘導体に変換する。次に、Ｆａｂ’−ＴＮＢ誘導体の１つを、メルカプトエチルアミンで還元することによりＦａｂ’−チオールに再変換し、等モル量の他のＦａｂ’−ＴＮＢ誘導体と混合することにより、二重特異性抗体が形成される。生成した二重特異性抗体は、酵素の選択的固定化のための試薬として使用できる。

最近の進歩により、化学的に結合することにより二重特異性抗体を形成することができる、Ｅ．ｃｏｌｉからのＦａｂ’−ＳＨフラグメントの直接の回収が容易になった。Ｓｈａｌａｂｙ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７５：２１７−２２５（１９９２）は、完全にヒト化された二重特異性抗体Ｆ（ａｂ’）_２分子の作製を記載している。各Ｆａｂ’フラグメントを別個にＥ．ｃｏｌｉから分泌させ、ｉｎ ｖｉｔｒｏの指向性化学カップリングに供することにより、二重特異性抗体が作製される。このようにして形成された二重特異性抗体は、ＥｒｂＢ２レセプターを過剰発現する細胞および正常ヒトＴ細胞に結合することができ、同時にヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞傷害性リンパ球の溶解活性をトリガーすることができた。組換え細胞培養物から直接、二重特異性抗体フラグメントを作製して単離する様々な手法も報告されている。例えば、二重特異性抗体を、ロイシンジッパーを用いて調製する。Ｋｏｓｔｅｌｎｙ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８（５）：１５４７−１５５３（１９９２）。ＦｏｓおよびＪｕｎタンパク質由来のロイシンジッパーペプチドを、遺伝子融合により２種の異なる抗体のＦａｂ’部分に連結した。その抗体のホモ２量体を、ヒンジ領域で還元することによりモノマーを形成し、次に、再び酸化して抗体ヘテロ２量体を形成させた。この方法はまた、抗体ホモ２量体の調製にも利用できる。Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４−６４４８（１９９３）に記載の「ダイアボディ」手法は、二重特異性抗体フラグメントを作製するための代替機序を提供している。そのフラグメントは、同じ鎖の２ドメイン間の対形成を可能とするには、短すぎるリンカーによってＶ_Ｌに連結されたＶ_Ｈを含む。したがって、１つのフラグメントのＶ_ＨおよびＶ_Ｌドメインが別のフラグメントの相補的なＶ_ＬドメインおよびＶ_Ｈドメインに強制的に対形成させられ、これにより２つの抗原結合部位が形成される。一本鎖Ｆｖ（ｓＦｖ）２量体の使用による二重特異性抗体フラグメントを作製するための別のストラテジも報告されている。Ｇｒｕｂｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５２：５３６８（１９９４）を参照のこと。

２価より多価の抗体も企図される。例えば、３重特異性抗体が作製され得る。Ｔｕｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：６０（１９９１）。

６．ヘテロ結合体抗体
ヘテロ結合体抗体もまた、本発明の範囲内に含まれる。ヘテロ結合体抗体は、２つの共有結合した抗体から構成される。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングするため［米国特許第４，６７６，９８０号］およびＨＩＶ感染の処置のため［ＷＯ９１／００３６０、ＷＯ９２／２００３７３およびＥＰ０３０８９］に提案されている。この抗体は、架橋結合剤を用いる方法を含む合成タンパク質化学における公知の方法を用いてｉｎ ｖｉｔｒｏで調製され得ると企図される。例えば、免疫トキシンは、ジスルフィド交換反応を用いて、またはチオエーテル結合の形成によって構築され得る。この目的に適した試薬の例としては、イミノチオレートおよびメチル−４−メルカプトブチルイミデートならびに例えば、米国特許第４，６７６，９８０号に開示されているものが挙げられる。

７．多価抗体
多価抗体は、抗体が結合する抗原を発現する細胞によって、２価抗体より急速に内部移行（および／または異化）され得る。本発明の抗体は、３つ以上の抗原結合部位を有する多価抗体（ＩｇＭクラス以外である）（例えば、４価抗体）であり得、その抗体は、抗体のポリペプチド鎖をコードする核酸の組換え発現により容易に作製できる。多価抗体は、二量体化ドメインおよび３つ以上の抗原結合部位を含み得る。好ましい二量体化ドメインは、Ｆｃ領域またはヒンジ領域を含む（またはそれからなる）。この設定において、その抗体は、Ｆｃ領域およびＦｃ領域に対してアミノ末端側に３つ以上の抗原結合部位を含む。好ましい多価抗体は、本明細書中で３個〜約８個、好ましくは、４個の抗原結合部位を含む（またはそれからなる）。多価抗体は、少なくとも１つのポリペプチド鎖（および好ましくは、２つのポリペプチド鎖）を含み、ここでそのポリペプチド鎖は、２つ以上の可変ドメインを含む。例えば、そのポリペプチド鎖は、ＶＤ１−（Ｘ１）_ｎ−ＶＤ２−（Ｘ２）_ｎ−Ｆｃを含み得、式中、ＶＤ１は、第１の可変ドメイン、ＶＤ２は、第２の可変ドメイン、Ｆｃは、Ｆｃ領域の１つのポリペプチド鎖であり、Ｘ１およびＸ２は、アミノ酸またはポリペプチドを示し、ｎは、０または１である。例えば、そのポリペプチド鎖は、ＶＨ−ＣＨ１−柔軟なリンカー−ＶＨ−ＣＨ１−Ｆｃ領域鎖；またはＶＨ−ＣＨ１−ＶＨ−ＣＨ１−Ｆｃ領域鎖を含み得る。本明細書中の多価抗体は、好ましくは、さらに少なくとも２つ（好ましくは、４つ）の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含む。本明細書中の多価抗体は、例えば、約２個〜約８個の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含み得る。本明細書において企図される軽鎖可変ドメインポリペプチドは、軽鎖可変ドメインを含み、そして必要に応じて、さらにＣＬドメインを含む。

８．エフェクター機能の操作
例えば、抗体の抗原依存性細胞媒介性細胞傷害（ＡＤＣＣ）および／または補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）を増強するために、エフェクター機能に関して本発明の抗体を改変することが望ましい場合がある。これは、１つ以上アミノ酸置換を抗体のＦｃ領域に導入することにより達成され得る。代替または追加として、システイン残基をＦｃ領域に導入することにより、この領域における鎖間のジスルフィド結合の形成が可能とされ得る。このように作製されたホモ２量体抗体は、向上した内部移行能力ならびに／または増大した補体媒介性細胞殺滅および抗体依存性細胞傷害（ＡＤＣＣ）を有し得る。Ｃａｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１７６：１１９１−１１９５（１９９２）およびＳｈｏｐｅｓ，Ｂ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８：２９１８−２９２２（１９９２）を参照のこと。増強された抗腫瘍活性を有するホモ２量体抗体はまた、Ｗｏｌｆｆ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５３：２５６０−２５６５（１９９３）に記載されているように、ヘテロ２官能性架橋リンカーを用いて調製され得る。あるいは、二重のＦｃ領域を有することから、増強された補体溶解およびＡＤＣＣ能力を有し得る抗体を作製することもできる。Ｓｔｅｖｅｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉ−Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓｉｇｎ ３：２１９−２３０（１９８９）を参照のこと。その抗体の血清中半減期を延長するために、例えば、米国特許第５，７３９，２７７号に記載されるように抗体（特に抗体フラグメント）中にサルベージレセプター結合エピトープを取り込んでよい。本明細書中で使用されるとき、用語「サルベージレセプター結合エピトープ」とは、ＩｇＧ分子（例えば、ＩｇＧ_１、ＩｇＧ_２、ＩｇＧ_３およびＩｇＧ_４）のｉｎ ｖｉｖｏの血清中半減期を延長する原因となるＩｇＧ分子のＦｃ領域のエピトープのことをいう。

９．免疫複合体
本発明はまた、細胞傷害性薬剤（例えば、化学療法剤、成長抑制剤、トキシン（例えば、細菌、真菌、植物または動物起源の酵素的に活性なトキシンまたはそのフラグメント）または放射性同位体（すなわち、放射性結合体）に結合体化された抗体を含む免疫複合体に関する。

このような免疫複合体の作製に有用な化学療法剤は、上記の通りである。使用され得る酵素的に活性なトキシンおよびそのフラグメントとしては、ジフテリアＡ鎖、ジフテリアトキシンの非結合活性フラグメント、外毒素Ａ鎖（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ由来）、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデクシンＡ鎖、アルファ−サルシン（ｓａｒｃｉｎ）、Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉタンパク質、ジアンチン（ｄｉａｎｔｈｉｎ）タンパク質、Ｐｈｙｔｏｌａｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａタンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩおよびＰＡＰ−Ｓ）、ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａインヒビター、クルシン（ｃｕｒｃｉｎ）、クロチン（ｃｒｏｔｉｎ）、ｓａｐａｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓインヒビター、ゲロニン（ｇｅｌｏｎｉｎ）、マイトゲリン（ｍｉｔｏｇｅｌｌｉｎ）、レストリクトシン（ｒｅｓｔｒｉｃｔｏｃｉｎ）、フェノマイシン（ｐｈｅｎｏｍｙｃｉｎ）、エノマイシン（ｅｎｏｍｙｃｉｎ）およびトリコテシン（ｔｒｉｃｏｔｈｅｃｅｎｅ）が挙げられる。種々の放射性核種が、放射性結合体化抗体の作製のために使用できる。例としては、^２１２Ｂｉ、^１３１Ｉ、^１３１Ｉｎ、^９０Ｙおよび^１８６Ｒｅが挙げられる。抗体と細胞傷害性薬剤との結合体は、種々の２官能性タンパク質カップリング剤（例えば、Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの２官能性誘導体（例えば、ジメチルアジピミデートＨＣＬ）、活性エステル（例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル）、アルデヒド（例えば、グルタルアルデヒド）、ビス−アジド化合物（例えば、ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン）、ビスジアゾニウム誘導体（例えば、ビス（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）−エチレンジアミン）、ジイソシアネート（例えば、トリエン２，６−ジイソシアネート）およびビス活性フッ素化合物（例えば、１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベンゼン））を用いて作製される。例えば、リシン免疫トキシンは、Ｖｉｔｅｔｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３８：１０９８（１９８７）に記載されているように調製され得る。炭素−１４−標識１−イソチオシアナトベンジル−３−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸（ＭＸ−ＤＴＰＡ）は、抗体への放射性核種の結合体化のための例示的なキレート剤である。ＷＯ９４／１１０２６を参照のこと。

抗体および１つ以上の小分子トキシン（例えば、カリケアマイシン、メイタンシノイド、トリコテシンおよびＣＣ１０６５）およびトキシン活性を有するこれらの毒素の誘導体の結合体もまた本明細書中で企図される。
メイタンシンおよびメイタンシノイド
本発明は、１つ以上のメイタンシノイド分子に結合体化された抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体（完全長またはフラグメント）を提供する。

メイタンシノイドは、チューブリン重合を抑制することにより機能する有糸分裂インヒビターである。メイタンシンは、東アフリカの低木であるＭａｙｔｅｎｕｓ ｓｅｒｒａｔａから最初に単離された（米国特許第３，８９６，１１１号）。その後、特定の微生物もまた、メイタンシノイド（例えば、メイタンシノールおよびＣ−３メイタンシノールエステル）を産生することが発見された（米国特許第４，１５１，０４２号）。合成のメイタンシノールならびにその誘導体およびアナログは、例えば、米国特許第４，１３７，２３０号；同第４，２４８，８７０号；同第４，２５６，７４６号；同第４，２６０，６０８号；同第４，２６５，８１４号；同第４，２９４，７５７号；同第４，３０７，０１６号；同第４，３０８，２６８号；同第４，３０８，２６９号；同第４，３０９，４２８号；同第４，３１３，９４６号；同第４，３１５，９２９号；同第４，３１７，８２１号；同第４，３２２，３４８号；同第４，３３１，５９８号；同第４，３６１，６５０号；同第４，３６４，８６６号；同第４，４２４，２１９号；同第４，４５０，２５４号；同第４，３６２，６６３号；および同第４，３７１，５３３号に開示されており、これらの開示は、本明細書により、参考として明示的に援用される。
メイタンシノイド−抗体結合体
その処置指標を向上させる試みにおいて、メイタンシンおよびメイタンシノイドは、腫瘍細胞抗原に特異的に結合する抗体に結合体化された。メイタンシノイドを含む免疫複合体およびその治療的用途は、例えば、米国特許第５，２０８，０２０号、同第５，４１６，０６４号および欧州特許ＥＰ０４２５２３５Ｂ１（これらの開示は、本明細書により参考として明示的に援用される）に開示されている。Ｌｉｕ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９３：８６１８−８６２３（１９９６）は、ヒト直腸結腸癌に対して指向されたモノクローナル抗体Ｃ２４２に連結されたＤＭ１と命名されたメイタンシノイドを含む免疫複合体を記載している。この結合体は、培養された結腸癌細胞に対しては、高度に細胞傷害性であることが見出され、そしてｉｎ ｖｉｖｏの腫瘍生育アッセイにおいて抗腫瘍活性を示した。Ｃｈａｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５２：１２７−１３１（１９９２）は、ヒト結腸癌細胞株上の抗原に結合するマウス抗体Ａ７に、またはＨＥＲ−２／ｎｅｕ癌遺伝子に結合する別のマウスモノクローナル抗体ＴＡ．１にジスルフィドリンカーを介してメイタンシノイドを結合体化した免疫複合体を記載している。ＴＡ．１−メイタンシノイド結合体の細胞傷害性は、細胞当たり３×１０^５のＨＥＲ−２表面抗原を発現するヒト乳癌細胞株ＳＫ−ＢＲ−３に対してｉｎ ｖｉｔｒｏで試験された。薬剤結合体は、遊離メイタンシノイド薬剤と同様の細胞傷害性の程度を達成しており、これは、抗体分子当たりのメイタンシノイド分子の数を増大させることにより増大させることができた。Ａ７−メイタンシノイド結合体は、マウスにおいて低い全身性の細胞傷害性を示した。

抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体−メイタンシノイド結合体（免疫複合体）
抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体−メイタンシノイド結合体は、抗体またはメイタンシノイド分子のいずれかの生物学的活性を有意に低下させることなくメイタンシノイド分子に抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を化学的に連結することによって調製される。抗体分子当たり平均３〜４個のメイタンシノイド分子を結合体化すると、抗体の機能または溶解性に悪影響を及ぼすことなく標的細胞の細胞傷害性を増強する場合に有効であることがわかっているが、１分子の毒素／抗体であっても、裸の抗体を使用したときよりも細胞傷害性を増強すると期待される。メイタンシノイドは、当該分野で周知であり、そして公知の手法により合成され得るか、または天然起源から単離され得る。適当なメイタンシノイドは、例えば、米国特許第５，２０８，０２０号ならびに上記した他の特許および特許でない出版物に開示されている。好ましいメイタンシノイドは、メイタンシノールおよび芳香環において、またはマインタンシノール分子（例えば、様々なメインタンシノールエステル）の他の位置において改変されているマインタンシノールアナログである。

抗体−メイタンシノイド結合体を作製するための当該分野で公知の連結基が、多数存在し、それらとしては、例えば、米国特許第５，２０８，０２０号または欧州特許０４２５２３５Ｂ１ならびにＣｈａｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５２：１２７−１３１（１９９２）に開示されているものが挙げられる。連結基としては、上で特定した特許に開示されているような、ジスルフィド基、チオエーテル基、酸不安定性基、光不安定性基、ペプチダーゼ不安定性基、またはエステラーゼ不安定性基が挙げられるが、ジスルフィド基およびチオエーテル基が好ましい。

抗体とメイタンシノイドとの結合体は、種々の２官能性タンパク質カップリング剤（例えば、Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）、スクシンイミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボキシレート、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの２官能性誘導体（例えば、ジメチルアジピミデートＨＣＬ）、活性エステル（例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル）、アルデヒド（例えば、グルタルアルデヒド）、ビス−アジド化合物（例えば、ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン）、ビスジアゾニウム誘導体（例えば、ビス（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）エチレンジアミン）、ジイソシアネート（例えば、トルエン２，６−ジイソシアネート）およびビス活性フッ素化合物（例えば、１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベンゼン））を用いて作製され得る。特に好ましいカップリング剤としては、ジスルフィド結合を提供するためのＮ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）（Ｃａｒｌｓｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．，１７３：７２３−７３７［１９７８］）およびＮ−スクシンイミジル−４−（２−ピリジルジチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）が挙げられる。

リンカーは、連結の型に応じて様々な位置においてメイタンシノイド分子に結合され得る。例えば、エステル結合は、従来のカップリング手法を用いてヒドロキシル基との反応により形成され得る。この反応は、ヒドロキシル基を有するＣ３位、ヒロドキシメチルで改変されたＣ１４位、ヒドロキシル基で改変されたＣ１５位およびヒドロキシル基を有するＣ２０位において起こり得る。連結は、メイタンシノールまたはメイタンシノールアナログのＣ３位において形成される。

カリケアマイシン
目的の別の免疫複合体は、１つ以上のカリケアマイシン分子に結合体化された抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を含む。抗生物質のカリケアマイシンファミリーは、ピコモル以下の濃度において２本鎖ＤＮＡ切断をもたらすことができる。カリケアマイシンファミリーの結合体の調製に関しては、米国特許第５，７１２，３７４号、同第５，７１４，５８６号、同第５，７３９，１１６号、同第５，７６７，２８５号、同第５，７７０，７０１号、同第５，７７０，７１０号、同第５，７７３，００１号、同第５，８７７，２９６号を参照のこと（すべてＡｍｅｒｉｃａｎ Ｃｙａｎａｍｉｄ Ｃｏｍｐａｎｙ）。使用され得るカリケアマイシンの構造アナログとしては、γ_１ ^Ｉ、α_２ ^Ｉ、α_３ ^Ｉ、Ｎ−アセチル−γ_１ ^Ｉ、ＰＳＡＧおよびθ^Ｉ _ｌ（Ｈｉｍｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５３：３３３６−３３４２（１９９３）、Ｌｏｄｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５８：２９２５−２９２８（１９９８）および上記したＡｍｅｒｉｃａｎ Ｃｙａｎａｍｉｄに対する米国特許）が挙げられるが、これらに限定されない。抗体を結合体化できる別の抗腫瘍剤は、葉酸代謝拮抗薬であるＱＦＡである。カリケアマイシンおよびＱＦＡは、両方とも細胞内の作用部位を有し、原形質膜を容易に通過しない。したがって、抗体媒介性の内部移行を介したこれらの薬剤の細胞内取り込みは、その細胞傷害性作用を大きく増大させる。

他の細胞傷害性薬剤
本発明の抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体に結合体化され得る他の抗腫瘍剤としては、ＢＣＮＵ、ストレプトゾシン（ｓｔｒｅｐｔｏｚｏｉｃｉｎ）、ビンクリスチンおよび５−フルオロウラシル、米国特許第５，０５３，３９４号、同第５，７７０，７１０号に記載の総称ＬＬ−Ｅ３３２８８複合体として知られる薬剤ファミリー、ならびに、エスペラミシン（米国特許第５，８７７，２９６号）が挙げられる。

使用され得る酵素的に活性なトキシンおよびそのフラグメントとしては、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合活性フラグメント、外毒素Ａ鎖（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ由来）、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデクシンＡ鎖、アルファ−サルシン、Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉタンパク質、ジアンチンタンパク質、Ｐｈｙｔｏｌａｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａタンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩおよびＰＡＰ−Ｓ）、ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａインヒビター、クルシン、クロチン、ｓａｐａｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓインヒビター、ゲロニン、マイトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシンおよびトリコテシンが挙げられる。例えば、１９９３年１０月２８日に公開されたＷＯ９３／２１２３２を参照のこと。

本発明はさらに、抗体と核溶解活性を有する化合物（例えば、リボヌクレアーゼまたはＤＮＡエンドヌクレアーゼ（例えば、デオキシリボヌクレアーゼ；ＤＮａｓｅ））との間に形成される免疫複合体を企図している。

腫瘍の選択的破壊のためには、抗体は、高度に放射性の原子を含んでよい。種々の放射性同位体が、放射性結合体化抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体の作製のために利用可能である。例としては、Ａｔ^２１１、Ｉ^１３１、Ｉ^１２５、Ｙ^９０、Ｒｅ^１８６、Ｒｅ^１８８、Ｓｍ^１５３、Ｂｉ^２１２、Ｐ^３２、Ｐｂ^２１２およびＬｕの放射性同位体が挙げられる。診断のために結合体を使用する場合、その結合体は、シンチグラフィー試験用の放射性原子、例えば、ｔｃ^９９ｍもしくはＩ^１２３、または核磁気共鳴（ＮＭＲ）イメージング（磁気共鳴イメージングＭＲＩとしても公知の）要のスピン標識（例えば、ヨウ素−１２３、さらにヨウ素−１３１、インジウム−１１１、フッ素−１９、炭素−１３、窒素−１５、酸素−１７、ガドリニウム、マンガンまたは鉄）を含み得る。

放射標識または他の標識を、公知の方法で結合体に取り込ませてよい。例えば、水素の代わりにフッ素−１９を含む適当なアミノ酸前駆体を用いて、ペプチドを生合成し得るか、またはアミノ酸化学合成法により合成し得る。標識（例えば、ｔｃ^９９ｍまたはＩ^１２３、Ｒｅ^１８６、Ｒｅ^１８８およびＩｎ^１１１）をペプチド内のシステイン残基を介して結合することができる。イットリウム−９０は、リシン残基を介して結合できる。ＩＯＤＯＧＥＮ法（Ｆｒａｋｅｒ ｅｔ ａｌ（１９７８）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．８０：４９−５７）を用いてヨウ素−１２３を取り込むことができる。“Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｓｃｉｎｔｉｇｒａｐｈｙ”（Ｃｈａｔａｌ，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ １９８９）は、他の方法を詳細に説明している。

抗体と細胞傷害性薬剤との結合体は、種々の２官能性のタンパク質カップリング剤（例えば、Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）、スクシンイミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボキシレート、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの２官能性誘導体（例えば、ジメチルアジピミデートＨＣＬ）、活性エステル（例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル）、アルデヒド（例えば、グルタルアルデヒド）、ビス−アジド化合物（例えば、ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン）、ビスジアゾニウム誘導体（例えば、ビス（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）エチレンジアミン）、ジイソシアネート（例えば、トリエン２，６−ジイソシアネート）およびビス活性フッ素化合物（例えば、１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベンゼン）を用いて作製され得る。例えば、リシン免疫トキシンは、Ｖｉｔｅｔｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３８：１０９８（１９８７）に記載されているように調製され得る。炭素−１４−標識１−イソチオシアナトベンジル−３−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸（ＭＸ−ＤＴＰＡ）は、抗体への放射性核種の結合体化のための例示的なキレート剤である。ＷＯ９４／１１０２６を参照のこと。リンカーは、細胞内での細胞傷害性薬剤の放出を容易にする「切断可能なリンカー」であり得る。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、光不安定性リンカー、ジメチルリンカーまたはジスルフィド含有リンカー（Ｃｈａｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ５２：１２７−１３１（１９９２）；米国特許第５，２０８，０２０号）が使用され得る。

あるいは、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体および細胞傷害性薬剤を含む融合タンパク質は、例えば、組換え手法またはペプチド合成により作製され得る。ＤＮＡの長さは、相互に隣接するか、または結合体の所望の特性を損なわないリンカーペプチドをコードする領域によって分離されている結合体の２つの部分をコードするそれぞれの領域を含み得る。

本発明によれば、抗体−レセプター結合体を患者に投与し、その後浄化剤を用いて循環系から未結合の結合体を除去し、次に細胞傷害性薬剤（例えば、放射性ヌクレオチド）に結合体化された「リガンド」（例えば、アビジン）を投与する、腫瘍の予備ターゲティングにおいて利用するための「レセプター」（例えば、ストレプトアビジン）に抗体は結合体化され得る。

１０．免疫リポソーム（Ｉｍｍｕｎｏｌｉｐｏｓｏｍｅ）
本明細書に開示した抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体はまた、免疫リポソームとして処方され得る。「リポソーム」は、哺乳動物における薬剤の送達のために有用な様々な型の脂質、リン脂質および／または界面活性剤から構成される小型のビヒクルである。リポソームの成分は、一般に、生物学的膜の脂質の配置と類似の二層形態で配置している。抗体を含むリポソームは、例えば、Ｅｐｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８２：３６８８（１９８５）；Ｈｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ７７：４０３０（１９８０）；米国特許第４，４８５，０４５号および同第４，５４４，５４５号；および１９９７年１０月２３日に公開されたＷＯ９７／３８７３１に記載されているような当該分野で公知の方法により調製される。長期の循環時間を有するリポソームは、米国特許第５，０１３，５５６号に開示されている。

特に有用なリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロールおよびＰＥＧ誘導体化ホスファチジルエタノールアミン（ＰＥＧ−ＰＥ）を含む脂質組成物を用いて逆相蒸発法により作製することができる。リポソームを、所定の孔径のフィルターに通して押し出すことにより、所望の直径を有するリポソームが得られる。本発明の抗体のＦａｂ’フラグメントは、ジスルフィド相互交換反応によりＭａｒｔｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５７：２８６−２８８（１９８２）に記載されているようにリポソームに結合体化され得る。化学療法剤は、必要に応じてリポソーム内に含まれる。Ｇａｂｉｚｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．８１（１９）：１４８４（１９８９）を参照のこと。

１１．抗体の薬学的組成物
本明細書中で同定されるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドならびに前述したスクリーニングアッセイにより同定される他の分子に特異的に結合する抗体は、薬学的組成物の形態で様々な障害の処置のために投与され得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが細胞内にあり、抗体全体をインヒビターとして使用する場合、内部移行する抗体が好ましい。しかしながら、リポフェクションまたはリポソームはまた、抗体または抗体フラグメントを細胞に送達するためにも使用できる。抗体フラグメントを用いる場合、標的タンパク質の結合ドメインに特異的に結合する最も小さい阻害性フラグメントが好ましい。例えば、抗体の可変領域の配列に基づいて、標的タンパク質配列に結合する能力を保持しているペプチド分子を設計できる。そのようなペプチドは、化学合成および／または組換えＤＮＡ技術による調製が可能である。例えば、Ｍａｒａｓｃｏ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９０：７８８９−７８９３（１９９３）を参照のこと。本明細書中の処方物はまた、処置すべき特定の適応症に必要な２つ以上の活性化合物、好ましくは、相互に悪影響を及ぼさない補足的な活性を有するものを含み得る。あるいは、またはさらに、その組成物は、その機能を増強する薬剤（例えば、細胞傷害性薬剤、サイトカイン、化学療法剤または成長抑制剤）を含み得る。このような分子は、意図する目的のために有効である量における組み合わせにおいて適宜存在する。

活性成分はまた、例えば、コアセルベーション法または界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えば、それぞれヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチンマイクロカプセルおよびポリ−（メチルメタクリレート）マイクロカプセル中、コロイド状薬物送達系（例えば、リポソーム、アルブミン微小球、マイクロエマルジョン、ナノ粒子およびナノカプセル）中、またはマクロエマルジョン中に封入してもよい。このような手法は、前出のＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓに開示されている。

ｉｎ ｖｉｖｏ投与のために使用される処方物は、滅菌されていなければならない。これは、滅菌された濾過膜に通す濾過により容易に達成される。

徐放性処方物が調製され得る。徐放性処方物の適当な例としては、抗体を含む固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、そのようなマトリックスは、成形された物、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ（２−ヒドロキシエチル−メタクリレート）またはポリ（ビニルアルコール））、ポリ乳酸（米国特許第３，７７３，９１９号）、Ｌ−グルタミン酸とγエチル−Ｌ−グルタメートとのコポリマー、非分解性エチレン−酢酸ビニル、分解性乳酸−グリコール酸コポリマー（例えば、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴ^ＴＭ（乳酸−グリコール酸コポリマーおよび酢酸ロイプロリドから構成される注射可能な微小球））およびポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。エチレン−酢酸ビニルおよび乳酸−グリコール酸などのポリマーは、１００日間にわたる分子の放出を可能にするが、特定のヒドロゲルは、より短い時間にタンパク質を放出する。カプセル化抗体が身体内に長時間残存する場合、それらは、３７℃の水分への曝露の結果として、変性するか凝集し、生物学的活性を消失するか、または免疫原性が変化する可能性がある。合理的なストラテジは、関与する機序に応じて安定化のために工夫することができる。例えば、凝集の機序がチオ−ジスルフィド交換を介した分子間Ｓ−Ｓ結合の形成であることが発見されれば、スルフィドリル残基の改変、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含有量の制御、適切な添加物の使用および特定のポリマーマトリックス組成物の開発によって安定化が達成され得る。

Ｇ．抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体の使用
本発明の抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体は、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；胚発生の障害もしくは致死性または代謝異常に関する様々な治療上および／または診断上の有用性を有する。例えば、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０に関する診断アッセイ、例えば、特定の細胞、組織または血清におけるその発現（および一部の場合は、差次的発現）を検出することにおいて使用され得る。当該分野で公知の様々な診断アッセイの手法、例えば、競合的結合アッセイ、直接または間接のサンドイッチアッセイおよび不均質または均質な相のいずれかにおいて行う免疫沈降アッセイが使用され得る［Ｚｏｌａ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．（１９８７）ｐｐ．１４７−１５８］。診断アッセイにおいて使用される抗体は、検出可能な部分で標識できる。その検出可能な部分は、直接的または間接的に検出可能なシグナルを生成することができるものでなければならない。例えば、その検出可能な部分は、放射性同位体（例えば、^３Ｈ、^１４Ｃ、^３２Ｐ、^３５Ｓまたは^１２５Ｉ）、蛍光または化学発光化合物（例えば、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミンまたはルシフェリン）または酵素（例えば、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼ）であり得る。その検出可能な部分に抗体を結合体化するための当該分野で公知の任意の方法（Ｈｕｎｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，１４４：９４５（１９６２）；Ｄａｖｉｄ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，１３：１０１４（１９７４）；Ｐａｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈ．，４０：２１９（１９８１）；およびＮｙｇｒｅｎ，Ｊ．Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ． ａｎｄ Ｃｙｔｏｃｈｅｍ．，３０：４０７（１９８２）に記載されているものを含む）を使用し得る。

抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体はまた、組換え細胞培養物または天然起源からのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアフィニティー精製にも有用である。このプロセスにおいて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに対する抗体を当該分野で周知の方法を用いてＳｅｐｈａｄｅｘ樹脂または濾紙などの適当な支持体上に固定化する。次に、固定化された抗体を、精製すべきＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを含むサンプルと接触させ、その後、固定化された抗体に結合しているＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド以外のサンプル中の実質的にすべての物質を除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に抗体からＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを遊離させる別の適当な溶媒で支持体を洗浄する。

以下の実施例は、説明のみを目的としており、本発明の範囲をいかなる面でも限定する意図はない。

本明細書中で引用したすべての特許および文献の参考資料は、その全体が本明細書により参考として援用される。

実施例において言及される市販の試薬は、他に指示がない限り、製造者の指示書に従って使用した。以下の実施例において、また本明細書を通して、ＡＴＣＣアクセッション番号によって同定される細胞の起源は、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ，Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡである。

実施例１：新規のポリペプチドおよびそれらをコードするｃＤＮＡを同定するための細胞外ドメインホモロジースクリーニング
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を使用して、ＥＳＴデータベースを検索した。そのＥＳＴデータベースは、公的データベース（例えば、Ｄａｙｈｏｆｆ、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のデータベース（例えば、ＬＩＦＥＳＥＱ^ＴＭ，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ−２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して、ＥＣＤタンパク質配列の、ＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，ＷＡ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

この細胞外ドメインホモロジースクリーニングを使用して、コンセンサスＤＮＡ配列を、ｐｈｒａｐを使用して他の同定されているＥＳＴ配列に対して構築した。さらに、得られたコンセンサスＤＮＡ配列を、しばしば（必ずしもそうではないが）ＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ−２およびｐｈｒａｐの繰り返しサイクルを使用して、伸長することにより、上に記載したＥＳＴ配列の起源を使用してできる限りコンセンサス配列を伸長した。

上に記載したように得られたコンセンサス配列に基づいて、次いでオリゴヌクレオチドを、目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するためおよびＰＲＯポリペプチドについての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成し、使用した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙのように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーを、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化（ｈｅｍｉｋｉｎａｓｅｄ）アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

実施例２：アミラーゼスクリーニングによるｃＤＮＡクローンの単離
１．オリゴｄＴをプライマーとするｃＤＮＡライブラリーの調製
ｍＲＮＡを、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ（Ｆａｓｔ Ｔｒａｃｋ２）の試薬およびプロトコルを使用して目的のヒト組織から単離した。このＲＮＡを使用し、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤの試薬（Ｓｕｐｅｒ Ｓｃｒｉｐｔ Ｐｌａｓｍｉｄ Ｓｙｓｔｅｍ）およびプロトコルを使用して、ベクターｐＲＫ５Ｄに、オリゴｄＴをプライマーとするｃＤＮＡライブラリーを生成した。この手順において、二本鎖ｃＤＮＡのうち、１０００ｂｐより大きいものを分離し、ＳａｌＩ／ＮｏｔＩリンカー付加されたｃＤＮＡを、ＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ切断されたベクターにクローニングした。ｐＲＫ５Ｄは、ＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ ｃＤＮＡクローニング部位の前に、ｓｐ６転写開始部位、ＳｆｉＩ制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。

２．ランダムプライマーをプライマーとするｃＤＮＡライブラリーの調製
１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に表すために、２次ｃＤＮＡライブラリーを構築した。Ｓｐ６ＲＮＡを１次ライブラリー（上記）から生成し、このＲＮＡを使用し、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓの試薬（Ｓｕｐｅｒ Ｓｃｒｉｐｔ Ｐｌａｓｍｉｄ Ｓｙｓｔｅｍ，上を参照のこと）およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするｃＤＮＡライブラリーをベクターｐＳＳＴ−ＡＭＹ．０に構築した。この手順において、二本鎖ｃＤＮＡを、５００〜１０００ｂｐに分離し、ＮｏｔＩアダプターに平滑末端でリンカー付加し、ＳｆｉＩで切断し、そしてＳｆｉＩ／ＮｏｔＩで切断されたベクターにクローニングした。ｐＳＳＴ−ＡＭＹ．０は、ｃＤＮＡクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター（分泌シグナルなしの成熟配列）、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたｃＤＮＡは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。

３．形質転換および検出
上の段落２に記載したライブラリー由来のＤＮＡを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントＤＨ１０Ｂ細菌（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，２０ｍＬ）に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、ＳＯＣ培地（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，１ｍＬ）を加えて、混合物を３７℃で３０分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な１５０ｍｍＬＢプレート２０枚に播き、１６時間インキュベートした（３７℃）。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのＤＮＡを標準的なプロトコル、例えば、ＣｓＣｌ勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたＤＮＡを以下の酵母プロトコルに用いた。

酵母法は、３つのカテゴリーに分けられる：（１）プラスミド／ｃＤＮＡ結合ベクターによる酵母の形質転換；（２）アミラーゼを分泌する酵母クローンの検出および単離；ならびに（３）酵母コロニーからの直接の挿入断片のＰＣＲ増幅ならびに配列決定およびさらなる解析のためのそのＤＮＡの精製。

使用した酵母株は、ＨＤ５６−５Ａ（ＡＴＣＣ−９０７８５）であった。この株は、以下の遺伝子型：ＭＡＴアルファ、ｕｒａ３−５２、ｌｅｕ２−３、ｌｅｕ２−１１２、ｈｉｓ３−１１、ｈｉｓ３−１５、ＭＡＬ^＋、ＳＵＣ^＋、ＧＡＬ^＋を有する。好ましくは、翻訳後経路を欠く酵母変異体が、使用され得る。このような変異体は、ｓｅｃ７１、ｓｅｃ７２、ｓｅｃ６２において転座不全（ｔｒａｎｓｌｏｃａｔｉｏｎ ｄｅｆｉｃｉｅｎｔ）対立遺伝子を有し得、切断されたｓｅｃ７１が最も好ましい。あるいは、これらの遺伝子の正常な作用を干渉するアンタゴニスト（アンチセンスヌクレオチドおよび／またはリガンドを含む）、この翻訳後経路に関連する他のタンパク質（例えば、ＳＥＣ６１ｐ、ＳＥＣ７２ｐ、ＳＥＣ６２ｐ、ＳＥＣ６３ｐ、ＴＤＪ１ｐまたはＳＳＡ１ｐ−４ｐ）またはこれらのタンパク質の複合体形成物もまた、好ましくは、アミラーゼを発現する酵母と組み合わせて使用され得る。

形質転換は、Ｇｉｅｔｚ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ．Ｒｅｓ．，２０：１４２５（１９９２）によって概説されているプロトコルに基づいて行われた。次いで、形質転換された細胞を寒天からＹＥＰＤ複合培地ブロス（１００ｍＬ）に接種し、３０℃で一晩生育した。ＹＥＰＤブロスを、Ｋａｉｓｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｙｅａｓｔ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，ｐ．２０７（１９９４）に記載されているように調製した。次いで、一晩培養したものを、新鮮ＹＥＰＤブロス（５００ｍＬ）に約２×１０^６細胞／ｍＬ（およそＯＤ_６００＝０．１）に希釈し、１×１０^７細胞／ｍＬ（およそＯＤ_６００＝０．４〜０．５）まで再び生育した。

次いで、細胞を回収し、形質転換に向けて調製し、ＧＳ３ローター瓶に移し、Ｓｏｒｖａｌ ＧＳ３ローターにて５，０００ｒｐｍで５分間、遠心分離し、上清を廃棄し、次いで、滅菌水に再懸濁し、Ｂｅｃｋｍａｎ ＧＳ−６ＫＲ遠心機において、５０ｍＬファルコンチューブにて３，５００ｒｐｍで再度遠心分離した。その上清を廃棄し、続いて細胞をＬｉＡｃ／ＴＥ（１０ｍＬ，１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ ｐＨ７．５，１００ｍＭ Ｌｉ_２ＯＯＣＣＨ_３）で洗浄し、ＬｉＡｃ／ＴＥ（２．５ｍＬ）に再懸濁した。

微量遠心チューブ内で、調製した細胞（１００μＬ）と、新たに変性された一本鎖サケ精巣ＤＮＡ（Ｌｏｆｓｔｒａｎｄ Ｌａｂｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）と形質転換ＤＮＡ（１μｇ、１０μＬ未満の体積）とを混合することによって形質転換を起こした。混合物をボルテックスにより手短に混合し、次いで、４０％ＰＥＧ／ＴＥ（６００μＬ，４０％ポリエチレングリコール−４０００，１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ，１００ｍＭ Ｌｉ_２ＯＯＣＣＨ_３，ｐＨ７．５）を加えた。この混合物を穏やかに混合し、３０分間、撹拌しながら３０℃でインキュベートした。次いで、細胞を１５分間、４２℃の熱ショックにかけ、反応容器を１２，０００ｒｐｍで５〜１０秒間微量遠心し、デカントし、そしてＴＥ（５００μＬ，１０ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ，１ｍＭ ＥＤＴＡ ｐＨ７．５）に再懸濁した後、再度遠心分離した。次いで、細胞をＴＥ（１ｍＬ）に希釈し、アリコート（２００μＬ）を、１５０ｍｍ増殖プレート（ＶＷＲ）に予め調製された選択培地に播いた。

あるいは、多数の少量反応の代わりに、形質転換を、単一の大規模反応を使用して実施し、ここで試薬の量は、それに合うようにスケールアップした。

使用した選択培地は、Ｋａｉｓｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｙｅａｓｔ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，ｐ．２０８−２１０（１９９４）に記載されているように調製されたウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天（ＳＣＤ−Ｕｒａ）であった。形質転換体を、３０℃にて２〜３日間生育した。

アミラーゼを分泌するコロニーの検出を、選択増殖培地中に赤デンプン（ｒｅｄ ｓｔａｒｃｈ）を含ませることによって行った。Ｂｉｅｌｙ ｅｔ ａｌ．，Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１７２：１７６−１７９（１９８８）によって報告されている手順により、デンプンを赤色色素（Ｒｅａｃｔｉｖｅ Ｒｅｄ−１２０，Ｓｉｇｍａ）に結合させた。結合したデンプンを、最終濃度０．１５％（ｗ／ｖ）でＳＣＤ−Ｕｒａ寒天プレートに取り込ませ、リン酸カリウムを用いてｐＨ７．０（５０〜１００ｍＭの最終濃度）まで緩衝した。

十分に分離し、同定可能な単一のコロニーを得るために、陽性のコロニーを拾い、新鮮選択培地（１５０ｍｍプレート上）に画線した。アミラーゼ分泌が陽性の十分に分離した単一のコロニーを、緩衝ＳＣＤ−Ｕｒａ寒天に赤デンプンを直接取り込むことによって検出した。陽性のコロニーを、デンプンを分解して、陽性のコロニーの周辺に直接可視化されるクリアなハローを生じる能力によって判定した。
４．ＰＣＲ増幅によるＤＮＡの単離
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、９６ウェルプレート内の滅菌水（３０μＬ）に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート（５μＬ）を、２５μＬ容量中、以下：０．５μＬのＫｌｅｎｔａｑ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）；４．０μＬの１０ｍＭ ｄＮＴＰ’ｓ（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ−Ｃｅｔｕｓ）；２．５μＬのＫｅｎｔａｑ緩衝液（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）；０．２５μＬの順方向オリゴ１；０．２５μＬの逆方向オリゴ２；１２．５μＬの蒸留水を含むＰＣＲ反応用の鋳型として使用した。順方向オリゴヌクレオチド１の配列は：
５’−ＴＧＴＡＡＡＡＣＧＡＣＧＧＣＣＡＧＴＴＡＡＡＴＡＧＡＣＣＴＧＣＡＡＴＴＡＴＴＡＡＴＣＴ−３’（配列番号１４３）
逆方向オリゴヌクレオチド２の配列は：
５’−ＣＡＧＧＡＡＡＣＡＧＣＴＡＴＧＡＣＣＡＣＣＴＧＣＡＣＡＣＣＴＧＣＡＡＡＴＣＣＡＴＴ−３’（配列番号１４４）
であった。次いで、ＰＣＲを以下のとおりに行った：
ａ．変性 ９２℃、５分
ｂ．変性 ９２℃、３０秒
アニーリング ５９℃、３０秒
伸長 ７２℃、６０秒を３サイクル
ｃ．変性 ９２℃、３０秒
アニーリング ５７℃、３０秒
伸長 ７２℃、６０秒を３サイクル
ｄ．変性 ９２℃，３０秒
アニーリング ５５℃，３０秒
伸長 ７２℃，６０秒を２５サイクル
ｅ．４℃保持
オリゴヌクレオチドの下線を引いた領域を、それぞれ、ＡＤＨプロモーター領域およびアミラーゼ領域にアニーリングさせ、挿入断片が存在しないとき、ベクターｐＳＳＴ−ＡＭＹ．０から３０７ｂｐの領域を増幅した。代表的には、これらのオリゴヌクレオチドの５’末端の最初の１８ヌクレオチドは、配列決定プライマー用のアニーリング部位を含んでいた。したがって、空のベクターからのＰＣＲ反応の総産物は、３４３ｂｐであった。しかしながら、シグナル配列融合ｃＤＮＡは、かなり長いヌクレオチド配列を生じた。

ＰＣＲの後、反応物（５μＬ）のアリコートを、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，前出に記載されているようなＴｒｉｓ−ホウ酸塩−ＥＤＴＡ（ＴＢＥ）緩衝液系を使用した１％アガロースゲルのアガロースゲル電気泳動にかけた。４００ｂｐより長い単一の強力なＰＣＲ産物を生じたクローンを、９６Ｑｉａｑｕｉｃｋ ＰＣＲ精製カラム（Ｑｉａｇｅｎ Ｉｎｃ．，Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ，ＣＡ）で精製後、ＤＮＡ配列決定によってさらに解析した。

実施例３：シグナルアルゴリズム解析を使用したｃＤＮＡクローンの単離
様々なポリペプチドをコードする核酸配列を、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、ＥＳＴに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの５’−末端の第１および必要に応じて第２のメチオニンコドン（ＡＴＧ）の周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも３５個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが、必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。アルゴリズムの使用により、数多くのポリペプチドをコードする核酸配列が同定された。

上記の実施例１〜３で説明されている技術を使用して、本明細書中に開示されるようなＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする数多くの完全長ｃＤＮＡクローンを同定した。次いで、これらのｃＤＮＡを、以下の表７に示すように、ブダペスト条約に従ってＡｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ，１０８０１ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｂｌｖｄ．，Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ２０１１０−２２０９，ＵＳＡ（ＡＴＣＣ）に寄託した。さらに、ＰＲＯ６９１２２ポリペプチドをコードするＤＮＡ２８４８７０の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＦ０５２０５９から同定し；ＰＲＯ３４２ポリペプチドをコードするＤＮＡ３８６４９の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＹ３５８３４２から同定し；ＰＲＯ３６９３５ポリペプチドをコードするＤＮＡ３３６５３９の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号Ｚ２９０８３から同定し、ＰＲＯ４９７９ポリペプチド（ＰＲＯ３８８４４ポリペプチドとしても公知である）をコードするＤＮＡ２２２８４４の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＢ０９８５９７から同定し；ＰＲＯ６００１ポリペプチドをコードするＤＮＡ９８３８０の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＹ３５８７８５から同定し；ＰＲＯ３７３３７ポリペプチドをコードするＤＮＡ２２６８７４の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号Ｙ０７９０９から同定し；ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドをコードするＤＮＡ２２７０３３の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＢＣ００３００６から同定し；そしてＰＲＯ２１７１８ポリペプチドをコードするＤＮＡ１８８３４２の配列をＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＡＦ１４６７６１から同定した。

表７
材料 ＡＴＣＣ寄託番号 寄託日
ＤＮＡ３０８７１−１１５７ ２０９３８０ １９９７年１０月１６日
ＤＮＡ３２２８６−１１９１ ２０９３８５ １９９７年１０月１６日
ＤＮＡ３３１０７−１１３５ ２０９２５１ １９９７年９月１６日
ＤＮＡ３５５５７−１１３７ ２０９２５５ １９９８年９月１６日
ＤＮＡ３６３５０−１１５８ ２０９３７８ １９９７年１０月１６日
ＤＮＡ６１６０１−１２２３ ２０９７１３ １９９８年３月３１日
ＤＮＡ４０９８２−１２３５ ２０９４３３ １９９７年１１月７日
ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１ ２０９４２２ １９９７年１０月２８日
ＤＮＡ４４１８９−１３２２ ２０９６９９ １９９８年３月２６日
ＤＮＡ４９１５２−１３２４ ２０９８１３ １９９８年４月２８日
ＤＮＡ５２１８５−１３７０ ２０９８６１ １９９８年５月１４日
ＤＮＡ５８８５５−１４２２ ２０３０１８ １９９８年６月２３日
ＤＮＡ５６０５０−１４５５ ２０３０１１ １９９８年６月２３日
ＤＮＡ５８７２７−１４７４ ２０３１７１ １９９８年９月１日
ＤＮＡ６２３７７−１３８１−１ ２０３５５２ １９９８年１２月２２日
ＤＮＡ５８８５０−１４９５ ２０９９５６ １９９８年６月９日
ＤＮＡ５９５８６−１５２０ ２０３２８８ １９９８年９月２９日
ＤＮＡ６４８９６−１５３９ ２０３２３８ １９９８年９月９日
ＤＮＡ６４９０３−１５５３ ２０３２２３ １９９８年９月１５日
ＤＮＡ５９２１８−１５５９ ２０３２８７ １９９８年９月２９日
ＤＮＡ５９５８８−１５７１ ２０３１０６ １９９８年８月１１日
ＤＮＡ６０６０８−１５７７ ２０３１２６ １９９８年８月１８日
ＤＮＡ５８７４３−１６０９ ２０３１５４ １９９８年８月２５日
ＤＮＡ７１１５９−１６１７ ２０３１３５ １９９８年８月１８日
ＤＮＡ７３４０１−１６３３ ２０３２７３ １９９８年９月２２日
ＤＮＡ６８８１８−２５３６ ２０３６５７ １９９９年２月９日
ＤＮＡ６１１８５−１６４６ ２０３４６４ １９９８年１１月１７日
ＤＮＡ５８７３２−１６５０ ２０３２９０ １９９８年９月２９日
ＤＮＡ６８８８０−１６７６ ２０３３１９ １９９８年１０月６日
ＤＮＡ７３７３５−１６８１ ２０３３５６ １９９８年１０月２０日
ＤＮＡ６２８４５−１６８４ ２０３３６１ １９９８年１０月２０日
ＤＮＡ７１２８６−１６８７ ２０３３５７ １９９８年１０月２０日
ＤＮＡ７７６４８−１６８８ ２０３４０８ １９９８年１０月２７日
ＤＮＡ７７３０１−１７０８ ２０３４０７ １９９８年１０月２７日
ＤＮＡ６８８８３−１６９１ ２０３５３５ １９９８年１２月１５日
ＤＮＡ７６３９６−１６９８ ２０３４７１ １９９８年１１月１７日
ＤＮＡ７７６５２−２５０５ ２０３４８０ １９９８年１１月１７日
ＤＮＡ７１２３５−１７０６ ２０３５８４ １９９９年１月１２日
ＤＮＡ４５４０９−２５１１ ２０３５７９ １９９９年１月１２日
ＤＮＡ８２３０２−２５２９ ２０３５３４ １９９８年１２月１５日
ＤＮＡ８２３４０−２５３０ ２０３５４７ １９９８年１２月２２日
ＤＮＡ５９８４４−２５４２ ２０３６５０ １９９９年２月９日
ＤＮＡ９０８４２−２５７４ ２０３８４５ １９９９年３月１６日
ＤＮＡ９６８９３−２６２１ ＰＴＡ−１２ １９９９年５月４日
ＤＮＡ６２８４９−２６４７ ＰＴＡ−２０５ １９９９年６月８日
ＤＮＡ９７００３−２６４９ ＰＴＡ−４３ １９９９年５月１１日
ＤＮＡ９４８４９−２９６０ ＰＴＡ−２３０６ ２０００年７月２５日
ＤＮＡ１１５２９１−２６８１ ＰＴＡ−２０２ １９９９年６月８日
ＤＮＡ９６９８８−２６８５ ＰＴＡ−３８４ １９９９年７月２０日
ＤＮＡ１０５６８０−２７１０ ＰＴＡ−４８３ １９９９年８月３日
ＤＮＡ１１０７００−２７１６ ＰＴＡ−５１２ １９９９年８月１０日
ＤＮＡ１０８７２２−２７４３ ＰＴＡ−５５２ １９９９年８月１７日
ＤＮＡ１０８６７０−２７４４ ＰＴＡ−５４６ １９９９年８月１７日
ＤＮＡ１１９５３５−２７５６ ＰＴＡ−６１３ １９９９年８月３１日
ＤＮＡ１０８７００−２８０２ ＰＴＡ−１０９３ １９９９年１２月２２日
ＤＮＡ１１９４７４−２８０３ ＰＴＡ−１０９７ １９９９年１２月２２日
ＤＮＡ１４５８４１−２８６８ ＰＴＡ−１６７８ ２０００年４月１１日
ＤＮＡ１４９９１１−２８８５ ＰＴＡ−１７７６ ２０００年４月２５日
ＤＮＡ１６８０２８−２９５６ ＰＴＡ−２３０４ ２０００年７月２５日
ＤＮＡ１５４０９５−２９９８ ＰＴＡ−２５９１ ２０００年１０月１０日
ＤＮＡ１８５１７１−２９９４ ＰＴＡ−２５１３ ２０００年９月２６日
ＤＮＡ１７１７３２−３１００ ＰＴＡ−３３２９ ２００１年４月２４日
特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約（ブダペスト条約）の規定に基づいてこれらの寄託を行った。これは、寄託日から３０年間、寄託物の生存可能な培養物の維持を保証するものである。寄託物は、ブダペスト条約の規定に基づいてＧｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．とＡＴＣＣとの合意に従い、ＡＴＣＣから入手可能であり、これは、どれが最初であろうとも、関連の米国特許の発行時または任意の米国または外国の特許出願の公開時に、寄託培養物の子孫が永久かつ無制限に入手可能であることを保証し、米国特許法第１２２条およびそれに従う特許庁長官規則（特に参照番号８８６ＯＧ６３８の３７ＣＦＲ第１．１４条を含む）に従って権利を有すると米国商標特許庁長官が決定した者に子孫を入手可能とすることを保証するものである。

本出願の譲受人は、適当な条件下で培養されていたときに、寄託された材料の培養物が、死滅または損失または破壊された場合、通知時に、その材料が迅速に同一の別のものに置き換えられることに同意する。寄託された材料の入手可能性は、特許法に従いあらゆる政府の権限下で認められた権利に違反して、本発明を実施するライセンスであるとみなされるものではない。

実施例４：ヒトＰＲＯ２０４ポリペプチド［ＵＮＱ１７８］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ＥＳＴを同定した。ヒト胎児網膜ｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲオリゴヌクレオチドプライマーでスクリーニングし、ＥＳＴ配列に基づいた合成オリゴヌクレオチドプローブを用いた
ハイブリダイゼーションにより確認した。
ハイブリダイゼーションプローブ：
５’−ＧＧＣＡＴＧＣＡＧＣＡＧＣＴＧＧＡＣＡＴＴＴＧＣＧＡＧＧＧＣＴＴＴＴＧＣＴＧＧＣＴＧ−３’（配列番号１４５）
順方向ＰＣＲプライマー：
５’−ＣＴＧＣＴＧＣＡＧＡＧＴＴＧＣＡＣＧＡＡＣ−３’（配列番号１４６）
逆方向ＰＣＲプライマー１：
５’−ＣＡＧＴＴＧＴＴＧＴＴＧＴＣＡＣＡＧＡＧＡＡＧ−３’（配列番号１４７）
逆方向ＰＣＲプライマー２：
５’−ＡＧＴＴＣＧＴＧＣＡＡＣＴＣＴＧＣＡＧＣＡＧ−３’（配列番号１４８）
ｃＤＮＡクローンを同定し、その全体を配列決定した。同定されたクローンＤＮＡ３０８７−１１５７のヌクレオチド配列の全体を図３に示した（配列番号３）。クローンＤＮＡ３０８７１−１１５７（配列番号３）は、太字、下線で示されているように、ヌクレオチド３７６−３７８位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１４９８−１５００位に見られる終止コドン（ＴＡＡ）で終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図３；配列番号３）。予測されるＰＲＯ２０４ポリペプチド前駆体（すなわち、ＵＮＱ１７８、配列番号４）は、３７４アミノ酸長であり、その算出分子量は３９，２８５ダルトン、ｐＩは６．０６であり、図４に示す。ＵＮＱ１７８（配列番号３）をコードするＤＮＡを含むｃＤＮＡは、１９９７年１０月１６日にＡＴＴＣに寄託され、寄託番号２０９３８０が割り当てられている。

実施例５：ヒトＰＲＯ２１４ポリペプチド［ＵＮＱ１８８］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したようにｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサスＤＮＡ配列は、本明細書中でＤＮＡ２８７４４と命名する。このコンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、下で同定されるＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ２１４遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肺組織から単離した。

ｃＤＮＡクローンを全体に亘って配列決定した。ＤＮＡ３２２８６−１１９１の完全長ヌクレオチド配列を図５（配列番号５）に示す。ＤＮＡ３２２８６−１１９１は、ヌクレオチド１０３位の明らかな翻訳開始部位を有する単一のオープンリーディングフレームを含む（図５；配列番号５）。予測されるポリペプチド前駆体は、４２０アミノ酸長である（図６；配列番号６）。

完全長配列のＢＬＡＳＴおよびＦａｓｔＡ配列アラインメント解析に基づいて、ＰＲＯ２１４ポリペプチドは、ＨＴタンパク質および／またはＦｉｂｕｌｉｎに対してアミノ酸配列同一性（それぞれ４９％および３８％）を示す。

上の手順において使用したオリゴヌクレオチド配列は、以下であった：
２８７４４．ｐ（ＯＬＩ５５５）
５’−ＣＣＴＧＧＣＴＡＴＣＡＧＣＡＧＧＴＧＧＧＣＴＣＣＡＡＧＴＧＴＣＴＣＧＡＴＧＴＧＧＡＴＧＡＧＴＧＴＧＡ−３’（配列番号１４９）
２８７４４．ｆ（ＯＬＩ５５６）
５’−ＡＴＴＣＴＧＣＧＴＧＡＡＣＡＣＴＧＡＧＧＧＣ−３’（配列番号１５０）
２８７４４．ｒ（ＯＬＩ５５７）
５’−ＡＴＣＴＧＣＴＴＧＴＡＧＣＣＣＴＣＧＧＣＡＣ−３’（配列番号１５１）
実施例６：ヒトＰＲＯ２２２ポリペプチド［ＵＮＱ１９６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他の同定されたＥＳＴ配列に関して構築し、ここで、このコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ２８７７１と命名する。ＤＮＡ２８７７１コンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲにより同定するため、およびＰＲＯ２２２についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマーの対（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−ＡＴＣＴＣＣＴＡＴＣＧＣＴＧＣＴＴＴＣＣＣＧＧ−３’（配列番号１５２）
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＡＧＣＣＡＧＧＡＴＣＧＣＡＧＴＡＡＡＡＣＴＣＣ−３’（配列番号１５３）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ２８７７１配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＡＴＴＴＡＡＡＣＴＴＧＡＴＧＧＧＴＣＴＧＣＧＴＡＴＣＴＴＧＡＧＴＧＣＴＴＡＣＡＡＡＡＣＣＴＴＡＴＣＴ−３’（配列番号１５４）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ２２２遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ２２２［本明細書中でＤＮＡ３３１０７−１１３５と命名する］に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ２２２に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ３３１０７−１１３５のヌクレオチド配列全体を図７（配列番号７）に示す。ＤＮＡ３３１０７−１１３５は、ヌクレオチド１５９−１６１位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１６２９−１６３１位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図７；配列番号７）。予測されるポリペプチド前駆体は、４９０アミノ酸長である（図８；配列番号８）。クローンＤＮＡ３３１０７−１１３５は、１９９７年９月１６日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＡＴＣＣ ２０９２５１が割り当てられている。

完全長配列のＢＬＡＳＴおよびＦａｓｔＡ配列アラインメント解析に基づいて、ＰＲＯ２２２は、マウス補体因子ｈ前駆体（２５−２６％）、補体レセプター（２７−２９％）、マウス補体Ｃ３ｂレセプター２型長形前駆体（２５−４７％）およびヒト仮説タンパク質ｋｉａａ０２４７（４０％）に対してアミノ酸配列同一性を示す。

実施例７：ヒトＰＲＯ２３４ポリペプチド［ＵＮＱ２０８］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したようにｐｈｒａｐを使用して構築した（ＤＮＡ３０９２６）。このコンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡを、標準的な単離プロトコル、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙを使用して組織または細胞株から単離したか、または商業的供給源（例えば、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）から購入した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーを、市販の試薬（例えば、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ製）を使用して標準的な方法（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．）によって構築した。このライブラリーは、２２週齢の胎児の脳組織から得た。

ｃＤＮＡクローンを全体に亘って配列決定し、本明細書中でＤＮＡ３５５５７−１１３７（配列番号９）と命名する。そのＤＮＡ３５５５５７−１１３７のヌクレオチド配列全体を図９（配列番号９）に示す。予測されるポリペプチド前駆体は、３８２アミノ酸長（ＰＲＯ２３４と命名；配列番号１０；図１０）であり、その算出分子量は、約４３．１ｋＤａである。

上の手順において使用したオリゴヌクレオチド配列は、以下であった：
３０９２６．ｐ（ＯＬＩ８２６）（配列番号１５５）：
５’−ＧＴＴＣＡＴＴＧＡＡＡＡＣＣＴＣＴＴＧＣＣＡＴＣＴＧＡＴＧＧＴＧＡＣＴＴＣＴＧＧＡＴＴＧＧＧＣＴＣＡ−３’
３０９２６．ｆ（ＯＬＩ８２７）（配列番号１５６）：
５’−ＡＡＧＣＣＡＡＡＧＡＡＧＣＣＴＧＣＡＧＧＡＧＧＧ−３’
３０９２６．ｒ（ＯＬＩ８２８）（配列番号１５７）：
５’−ＣＡＧＴＣＣＡＡＧＣＡＴＡＡＡＧＧＴＣＣＴＧＧＣ−３’
実施例８：ヒトＰＲＯ２６５ポリペプチド［ＵＮＱ２３２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ３３６７９と命名する。そのＤＮＡ３３６７９コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ２６５についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（２つの順方向および１つの逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマーＡ：５’−ＣＧＧＴＣＴＡＣＣＴＧＴＡＴＧＧＣＡＡＣＣ−３’（配列番号１５８）；
順方向ＰＣＲプライマーＢ：５’−ＧＣＡＧＧＡＣＡＡＣＣＡＧＡＴＡＡＡＣＣＡＣ−３’（配列番号１５９）；
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＡＣＧＣＡＧＡＴＴＴＧＡＧＡＡＧＧＣＴＧＴＣ−３’（配列番号１６０）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ３３６７９配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＴＴＣＡＣＧＧＧＣＴＧＣＴＣＴＴＧＣＣＣＡＧＣＴＣＴＴＧＡＡＧＣＴＴＧＡＡＧＡＧＣＴＧＣＡＣ−３’（配列番号１６１）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ２６５遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児脳ライブラリーから単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ２６５［本明細書中でＤＮＡ３６３５０−１１５８と命名する］（配列番号１１）に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ２６５に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ３６３５０−１１５８のヌクレオチド配列全体を図１１に示す（配列番号１１）。クローンＤＮＡ３６３５０−１１５８は、ヌクレオチド３５２−３５４位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド２３３２−２３３４位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１１）。予測されるポリペプチド前駆体は、６６０アミノ酸長である（図１２；配列番号１２）。クローンＤＮＡ３６３５０−１１５８は、１９９７年１０月１６日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＡＴＣＣ ２０９３７８が割り当てられている。

完全長ＰＲＯ２６５ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その配列の一部が、フィブロモジュリンおよびフィブロモジュリン前駆体に対して有意な相同性を有することが示唆されることから、ＰＲＯ２６５は、ロイシンリッチリピートファミリーの新規メンバー、特に、フィブロモジュリンに関連するメンバーであり得ることが示唆される。

実施例９：ヒトＰＲＯ３０９ポリペプチド［ＵＮＱ２７２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱＴＭ，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、胎児膵臓ライブラリー中のどのＥＳＴが、アダプタータンパク質Ｓｈｃと有意な同一性を共有するか同定した。その単離されたＥＳＴに対応する完全長ｃＤＮＡを、ｉｎ ｖｉｖｏクローニング技術を使用して、ｐＲＫ５に組み込まれているヒト胎児腎臓ライブラリーからクローニングした（Ｎｓｐ１）。５７６アミノ酸タンパク質をコードする単一の長いオープンリーディングフレームが存在する。Ｎｓｐ１のＣ末端は、いずれの既知の哺乳動物タンパク質とも有意な同一性を有しない。次いでこのＣ末端の配列を使用して、ＥＳＴデータベースを再度スクリーニングし、ここで、さらなるフラグメントを見出した。この配列から、クローニングプライマーおよび濃縮プライマーを構築し、対応する完全長配列を、ｉｎ ｖｉｖｏクローニング技術を使用して、ｐＲＫ５に組み込まれているヒト胎盤ライブラリーからＮｓｐ３について単離した。完全長配列のクローニングに使用したプローブは、以下であった：
Ｎｓｐ１：
クローニングプライマー：ＡＣＴＧＡＧＧＣＣＴＧＴＴＧＡＡＡＧＴＧＣＡＧＡＧＣＴＣＡＧ（配列番号１６２）
濃縮プライマー：ＧＣＴＧＡＡＧＡＡＧＡＧＣＴＴＣＡＧ（配列番号１６３）
Ｎｓｐ３：
クローニングプライマー：ＧＧＣＣＡＧＣＡＴＧＡＴＧＧＡＣＡＴＧＧＴＧＴＧＧＡＡＣＣＴＴＴＣＣＡＧＣＡＧＧＴＣＴＡＧＧＣＧＴＡ（配列番号１６４）
濃縮プライマー：ＧＧＴＧＣＡＧＣＣＣＡＧＧＡＴＧＴＣ（配列番号１６５）
Ｎｓｐ３は、ＳＨ２ドメインおよび潜在的ＳＨ３相互作用ドメイン（ＰＳ領域）を有する。このタンパク質は、明らかなキナーゼドメインまたはホスファターゼドメインを欠く。ｃＤＮＡクローンＮｓｐ１ Ｎｓｐ３を、全体に亘って配列決定した。ＰＲＯ３０９ポリペプチド［図１４；配列番号１４］をコードするＤＮＡ６１６０１−１２２３のヌクレオチド配列全体［図１３；配列番号１３］は、１９９８年３月３１日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０９７１３が割り当てられている。

実施例１０：ヒトＰＲＯ３３２ポリペプチド［ＵＮＱ２９３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例１に記載したように行ったＥＣＤ相同性検索に基づいて、本明細書中でＤＮＡ３６６８８と命名されるコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。ＤＮＡ３６６８８コンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲにより同定するため、およびＰＲＯ３３２についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー対（順方向および逆方向）を合成した：
５’−ＧＣＡＴＴＧＧＣＣＧＣＧＡＧＡＣＴＴＴＧＣＣ−３’（配列番号１６６）
５’−ＧＣＧＧＣＣＡＣＧＧＴＣＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧ−３’（配列番号１６７）
プローブも合成した：
５’−ＴＧＧＡＧＧＡＧＣＴＣＡＡＣＣＴＣＡＧＣＴＡＣＡＡＣＣＧＣＡＴＣＡＣＣＡＧＣＣＣＡＣＡＧＧ−３’
（配列番号１６８）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ３３２遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肝臓ライブラリー（ＬＩＢ２２９）から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＤＮＡ４０９８２−１２３５に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ３３２について誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ４０９８２−１２３５のヌクレオチド配列全体を図１５（配列番号１５）に示す。クローンＤＮＡ４０９８２−１２３５は、（図１５に示されるようにヌクレオチド３４２−３４４位に明らかな翻訳開始部位を有する）単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、６４２アミノ酸長であり（図１６；配列番号１６）、その算出分子量は、７２，０６７（ｐＩ：６．６０）である。クローンＤＮＡ４０９８２−１２３５は、１９９７年１１月７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＡＴＣＣ ２０９４３３が割り当てられている。

完全長配列のＢＬＡＳＴおよびＦａｓｔＡ配列アラインメント解析に基づいて、ＰＲＯ３３２は、一連の既知プロテオグリカン配列（例えば、様々な種のフィブロモジュリンおよびフィブロモジュリン前駆体の配列（ＦＭＯＤ ＢＯＶＩＮ、ＦＭＯＤ ＣＨＩＣＫ、ＦＭＯＤ ＲＡＴ、ＦＭＯＤ ＭＯＵＳＥ、ＦＭＯＤ ＨＵＭＡＮ、ＰＲ３６７７３）、オステオモジュリン（ｏｓｔｅｏｍｏｄｕｌｉｎ）配列（ＡＢ０００１１４１、ＡＢ００７８４８１）、デコリン配列（ＣＦＵ８３１４１１、ＯＣＵ０３３９４１、ＰＲ４２２６６、ＰＲ４２２６７、ＰＲ４２２６０、ＰＲ８９４３９）、ケラタン硫酸プロテオグリカン（ＢＴＵ４８３６０１、ＡＦ０２２８９０１）、角膜プロテオグリカン（ＡＦ０２２２５６１）ならびに骨／軟骨プロテオグリカンおよびプロテオグリカン前駆体（ＰＧＳ１ ＢＯＶＩＮ、ＰＧＳ２ ＭＯＵＳＥ、ＰＧＳ２ ＨＵＭＡＮ）を含む）と約３０−４０％のアミノ酸配列同一性を示す。

実施例１１：ヒトＰＲＯ３５６（ＮＬ４）ポリペプチド［ＵＮＱ３１３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）、Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ヒトＴＩＥ−２ Ｌ１およびＴＩＥ−２ Ｌ２に対する相同性を示したＥＳＴ（＃２９３９３４０）を同定した。

そのＥＳＴに基づいて、ＰＣＲプライマー対（順方向および逆方向）およびプローブを合成した：
ＮＬ４，５−１：５’−ＴＴＣＡＧＣＡＣＣＡＡＧＧＡＣＡＡＧＧＡＣＡＡＴＧＡＣＡＡＣＴ−３’（配列番号１６９）
ＮＬ４，３−１：５’−ＴＧＴＧＣＡＣＡＣＴＴＧＴＣＣＡＡＧＣＡＧＴＴＧＴＣＡＴＴＧＴＣ−３’（配列番号１７０）
ＮＬ４，３−３：５’−ＧＴＡＧＴＡＣＡＣＴＣＣＡＴＴＧＡＧＧＴＴＧＧ−３’（配列番号１７１）．
オリゴｄＴをプライマーとするｃＤＮＡライブラリーを、ベクターｐＲＫ５Ｄに組み込まれている子宮ｍＲＮＡ（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ，ＵＳＡ，カタログ＃６５３７−１）から購入）から、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ製の試薬およびプロトコル（Ｓｕｐｅｒ Ｓｃｒｉｐｔ Ｐｌａｓｍｉｄ Ｓｙｓｔｅｍ）を使用して調製した。ｐＲＫ５Ｄは、ｓｐ６転写開始部位、その後にＳｆｉＩ制限酵素部位、さらにその後にＸｈｏＩ／ＮｏｔＩ ｃＤＮＡクローニング部位を有するクローニングベクターである。ｃＤＮＡを、オリゴｄＴ含有ＮｏｔＩ部位をプライマーとして増幅し、平滑末端でＳａｌＩ半リン酸化アダプターに連結し、ＮｏｔＩで切断し、１０００ｂｐより大きいものをゲル電気泳動により適切に分離し、そしてＸｈｏＩ／ＮｏｔＩで切断されたｐＲＫ５Ｄに規定の向きでクローニングした。

完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ３５６遺伝子をコードするクローンを単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、それぞれ図１９および２０に示される、完全長ＤＮＡ配列ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１（配列番号１９；図１９）およびその誘導されるＰＲＯ３５６タンパク質（配列番号２０；図２０）が得られた。

ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１のヌクレオチド配列全体を図１９（配列番号１９）に示す。クローンＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１（配列番号１９）は、太字、下線で示すように、ヌクレオチド２１５−２１７位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１０３８−１０４０位のＴＡＡ終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。図２０に示される、予測されるＰＲＯ３５６ポリペプチドは、３４６アミノ酸長であり（配列番号２０）、その算出分子量は、４０，０１８ダルトン、ｐＩは、８．１９である。ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１（配列番号１９）を含むｃＤＮＡクローンは、１９９７年１０月２８日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０９４２２が割り当てられている。

図２０（配列番号２０）のＰＲＯ３５６ポリペプチドのさらなる解析から、アミノ酸残基１〜約２６のシグナルペプチド、残基約５８−６２、２５３−２５７および２６７−２７１のＮ−グリコシル化部位、残基１６７−１７１のグリコシルアミノグリカン（ｇｌｙｃｏｓｙａｍｉｎｏｇｌｙｃａｎ）結合部位、残基約１７６−１８０のｃＡＭＰ−およびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、残基約１６８−１７４、１９６−２０２、２４１−２４７、２５２−２５８、２５６−２６２、３２７−３３３のＮ−ミリストイル化部位、残基約１９９−２０２の細胞結合配列、および残基約１６０−１９８、２０１−２１０、２１９−２５６、２６６−２７９、２８３−３１３のフィブリノゲンベータ鎖およびガンマ鎖のＣ末端ドメインタンパク質が明らかになった。

実施例１２：ヒトＰＲＯ５４０ポリペプチド［ＵＮＱ３４１］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサス配列を、上の実施例１に記載したように種々のＥＳＴ配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ３９６３１と命名する。そのＤＮＡ３９６３１コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ５４０に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーを合成した：
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＣＴＧＧＧＧＣＴＡＣＡＣＡＣＧＧＧＧＴＧＡＧＧ−３’（配列番号１７２）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＧＧＴＧＣＣＧＣＴＧＣＡＧＡＡＡＧＴＡＧＡＧＣＧ−３’（配列番号１７３）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４０６５４配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＧＣＣＣＣＡＡＡＴＧＡＡＡＡＣＧＧＧＣＣＣＴＡＣＴＴＣＣＴＧＧＣＣＣＴＣＣＧＣＧＡＧＡＴＧ−３’
（配列番号１７４）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーの一方を用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ５４０遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織（ＬＩＢ２２７）から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ５４０［本明細書中でＵＮＱ３４１（ＤＮＡ４４１８９−１３２２）と命名する］（配列番号２１）に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ５４０に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＵＮＱ３４１（ＤＮＡ４４１８９−１３２２）のヌクレオチド配列全体を図２１（配列番号２１）に示す。クローンＵＮＱ３４１（ＤＮＡ４４１８９−１３２２）は、ヌクレオチド２１−２３位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１２５７−１２５９位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図２１）。予測されるポリペプチド前駆体は、４１２アミノ酸長である（図２２；配列番号２２）。図２２に示される完全長ＰＲＯ５４０タンパク質は、推定分子量が約４６，６５８ダルトン、ｐＩが約６．６５である。ＰＲＯ５４０のアミノ酸配列の重要な領域は、シグナルペプチド、潜在的なＮ−グリコシル化部位、潜在的な脂質基質結合部位、リパーゼおよびセリンタンパク質に特有な配列ならびにベータトランスデューシンファミリーＴｒｐ−Ａｓｐリピートを含む。クローンＵＮＱ３４１（ＤＮＡ４４１８９−１３２２）は、１９９８年３月２６日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＡＴＣＣ２０９６９９が割り当てられている。

実施例１３：ヒトＰＲＯ６１８ポリペプチド［ＵＮＱ３５４］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように種々のＥＳＴ配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ３０９００と命名する。そのＤＮＡ３０９００コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ６１８に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

順方向および逆方向ＰＣＲプライマーを合成した：
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＴＡＡＣＡＧＣＴＧＣＣＣＡＣＴＧＣＴＴＣＣＡＧＧ−３’（配列番号１７５）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＴＡＡＴＣＣＡＧＣＡＧＴＧＣＡＧＧＣＣＧＧＧ−３’（配列番号１７６）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ３０９００配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＡＴＧＧＣＣＴＣＣＡＣＧＧＴＧＣＴＧＴＧＧＡＣＣＧＴＧＴＴＣＣＴＧＧＧＣＡＡＧＧＴＧＴＧＧＣＡＧＡＡ−３’
（配列番号１７７）
上で記載したライブラリーのスクリーニングにより、本明細書中でＤＮＡ３５５９と命名されるｃＤＮＡクローンの一部が得られた。ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐを繰り返し行うことによって、この配列を伸長することにより、本明細書中でＤＮＡ４３３３５と命名されるヌクレオチド配列が得られた。次いで、そのＤＮＡ４３３３５コンセンサス配列に基づいたプライマーを次のように調製した。
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＴＧＣＣＴＡＴＧＣＡＣＴＧＡＧＧＡＧＧＣＡＧＡＡＧ−３’（配列番号１７８）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＡＧＧＣＡＧＧＧＡＣＡＣＡＧＡＧＴＣＣＡＴＴＣＡＣ−３’（配列番号１７９）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４３３３５配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＡＧＴＡＴＧＡＴＴＴＧＣＣＧＴＧＣＡＣＣＣＡＧＧＧＣＣＡＧＴＧＧＡＣＧＡＴＣＣＡＧＡＡＣＡＧＧＡＧＧ−３’
（配列番号１８０）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、第２のプローブオリゴヌクレオチドおよび第２のセットのＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ６１８遺伝子をコードする完全長クローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肝臓組織（ＬＩＢ２２９）から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ６１８［本明細書中でＵＮＱ３５４（ＤＮＡ４９１５２−１３２４）と命名する］（配列番号２３）に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ６１８に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＵＮＱ３５４（ＤＮＡ４９１５２−１３２４）のヌクレオチド配列全体を図２３（配列番号２３）に示す。クローンＵＮＱ３５４（ＤＮＡ４９１５２−１３２４）は、ヌクレオチド７３−７５位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド２４７９−２４８１位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図２３）。予測されるポリペプチド前駆体は、８０２アミノ酸長である（図２４；配列番号２４）。図２４に示される完全長ＰＲＯ６１８タンパク質は、推定分子量が約８８，８４６ダルトン、ｐＩが約６．４１である。ＰＲＯ６１８のアミノ酸配列の重要な領域は、ＩＩ型膜貫通ドメイン、プロテアーゼに特有の配列、トリプシンファミリー、ヒスチジン活性部位、複数のＮ−グリコシル化部位、Ｋｒｉｎｇｌｅドメインに特有の２つの配列、カリクレイン軽鎖に類似の配列を有する２つの領域、および低密度リポタンパク質レセプターに類似の配列を有する領域を含む。クローンＵＮＱ３５４（ＤＮＡ４９１５２−１３２４）は、１９９８年４月２８日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０９８１３が割り当てられている。

実施例１４：ヒトＰＲＯ９４４ポリペプチド［ＵＮＱ４８１］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように種々のＥＳＴ配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ４７３７４と命名する。種々の企業Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ ＥＳＴ配列を構築に使用した。そのＤＮＡ４７３７４コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ９４４に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー対（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＣＧＡＧＣＧＡＧＴＣＡＴＧＧＣＣＡＡＣＧ−３’（配列番号１８１）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＧＴＧＴＣＡＣＡＣＧＴＡＧＴＣＴＴＴＣＣＣＧＣＴＧＧ−３’（配列番号１８２）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４７３７４配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＣＴＧＣＡＧＣＴＧＴＴＧＧＧＣＴＴＣＡＴＴＣＴＣＧＣＣＴＴＣＣＴＧＧＧＡＴＧＧＡＴＣＧ−３’（配列番号１８３）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ９４４遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織（ＬＩＢ２２７）から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ９４４［本明細書中でＵＮＱ４８１（ＤＮＡ５２１８５−１３７０）と命名する］（配列番号２５）に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ９４４に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＵＮＱ４８１（ＤＮＡ５２１８５−１３７０）のヌクレオチド配列全体を図２５（配列番号２５）に示す。クローンＵＮＱ４８１（ＤＮＡ５２１８５−１３７０）は、ヌクレオチド２１９−２２１位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド８５２−８５４位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図２５）。予測されるポリペプチド前駆体は、２１１アミノ酸長である（図２６；配列番号２６）。図２６に示される完全長ＰＲＯ９４４タンパク質は、その推定分子量が約２２，７４４ダルトン、ｐＩが約８．５１である。図２６（配列番号２６）に示される完全長ＰＲＯ９４４配列の解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約２１のシグナルペプチド、アミノ酸約８２〜アミノ酸約１０２、アミノ酸約１１８〜アミノ酸約１４２およびアミノ酸約１６１〜アミノ酸約１８７の膜貫通ドメイン、アミノ酸約７２〜アミノ酸約７５の潜在的Ｎ−グリコシル化部位、アミノ酸約７０〜アミノ酸約１１１のＰＭＰ−２２／ＥＭＰ／ＭＰ２０ファミリーのタンパク質に対する相同性を有する配列ブロックならびにアミノ酸約１１９〜アミノ酸約１３３のＡＢＣ−２型輸送系内在性膜タンパク質に対する相同性を有する配列ブロックの存在が証明された。クローンＵＮＱ４８１（ＤＮＡ５２１８５−１３７０）は、１９９８年５月１４日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＡＴＣＣ２０９８６１が割り当てられている。

完全長ＰＲＯ９４４ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その配列が、ＣＰＥ−Ｒタンパク質との有意な配列類似性を有することが示唆され、これにより、ＰＲＯ９４４が、新規ＣＰＥ−Ｒホモログであり得ると示唆される。より詳細には、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ９４４アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列、ＡＢ０００７１３＿１、ＡＢ０００７１４＿１、ＡＦ０３５８１４＿１、ＡＦ０００９５９＿１、ＨＳＵ８９９１６＿１、ＥＭＰ２＿ＨＵＭＡＮ、ＪＣ５７３２、ＣＥＬＦ５３Ｂ３＿６、ＰＭ２２＿ＭＯＵＳＥおよびＣＧＵ４９７９７＿１との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例１５：ヒトＰＲＯ９９４ポリペプチド［ＵＮＱ５１８］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＩｎｃｙｔｅデータベースからＥＳＴクラスター配列（１５７５５５と命名）が同定できた。次いで、そのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ５５７２８と命名する。

ＤＮＡ５５７２８コンセンサス配列とＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン番号２８６０３６６内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン２８６０３６６を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図２７に示し、本明細書中でＤＮＡ５８８５５−１４２２と命名する。

クローンＤＮＡ５８８５５−１４２２は、ヌクレオチド３１−３３位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド７１８−７２０位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図２７；配列番号２７）。予測されるポリペプチド前駆体は、２２９アミノ酸である（図２８；配列番号２８）。図２８に示す完全長ＰＲＯ９９４タンパク質は、推定分子量が約２５，１０９ダルトン、ｐＩは約６．８３である。図２８（配列番号２８）に示す完全長ＰＲＯ９９４配列の解析により、以下：アミノ酸約１０〜アミノ酸約３１、アミノ酸約５０〜アミノ酸約７２、アミノ酸約８７〜アミノ酸約１１０およびアミノ酸約１９１〜アミノ酸約２１３の膜貫通ドメイン、アミノ酸約８０〜アミノ酸約８３、アミノ酸約１３２〜アミノ酸約１３５、アミノ酸約１４８〜アミノ酸約１５１およびアミノ酸約１６３〜アミノ酸約１６６の潜在的Ｎ−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約４〜アミノ酸約１１のＴＮＦＲ／ＮＧＦＲシステインリッチ領域タンパク質との相同性を有するアミノ酸ブロックの存在が証明された。クローンＤＮＡ５８８５５−１４２２は、１９９８年６月２３日にＡＴＴＣに寄託され、寄託番号２０３０１８が割り当てられている。

図２８（配列番号２８）に示される完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ９９４アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＦ０２７２０４＿１、ＴＡＬ６＿ＨＵＭＡＮ、ＩＬＴ４＿ＨＵＭＡＮ、ＪＣ６２０５、ＭＭＵ５７５７０＿１、Ｓ４０３６３、ＥＴＵ５６０９３＿１、Ｓ４２８５８、Ｐ＿Ｒ６６８４９およびＰ＿Ｒ７４７５１との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例１６：ヒトＰＲＯ１０７９ポリペプチド［ＵＮＱ５３６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したようにｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築し、ここで、このコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ５２７１４と命名する。この構築によって提供される情報に基づいて、Ｍｅｒｃｋ ＥＳＴ番号ＨＯ６８９８に対するクローンを得て、配列決定することにより、本明細書中でＤＮＡ５６０５０−１４５５と称されるヌクレオチド配列を得た。ＤＮＡ５６０５０−１４５５のヌクレオチド配列全体を図２９（配列番号２９）に示す。クローンＤＮＡ５６０５０−１４５５は、ヌクレオチド１８３−１８５位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド８６１−８６３位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図２９）。予測されるポリペプチド前駆体は、２２６アミノ酸長である（図３０；配列番号３０）。図３０に示す完全長ＰＲＯ１０７９タンパク質は、推定分子量が約２４，６１１ダルトン、ｐＩが約４．８５である。図３０（配列番号３０）に示す完全長ＰＲＯ１０７９配列の解析により、以下の特徴：アミノ酸約１−２９のシグナルペプチド；アミノ酸約１０−１５および５１−５６の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位；アミノ酸約２〜２０の光化学系Ｉ ｐｓａＧおよびｐｓａＫタンパク質に対する相同性；ならびにアミノ酸約１５０〜１６３のプロリルエンドペプチダーゼファミリーセリンタンパク質の存在が証明された。

Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）を使用した完全長ＰＲＯ１０７９ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、ＰＲＯ１０７９アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＣＥＫ１０Ｃ３＿４、ＭＭＵ５０７３４＿１、Ｄ６９５０３、ＡＦ０５１１４９＿１およびＶＳＭＰ＿ＣＶＭＳとの間のいくらかの配列同一性が明らかになった。

クローンＵＮＱ５３６（ＤＮＡ５６０５０−１４５５）は、１９９８年６月２３日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３０１１が割り当てられている。

実施例１７：ヒトＰＲＯ１１１０ポリペプチド［ＵＮＱ５５３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
ネイティブヒトＰＲＯ１１１０ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ５８７２７−１４７４）を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒト胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。使用した酵母スクリーニングは、単一のＥＳＴクローンと同定され、本明細書中でＤＮＡ４５５６６と命名する。次いで、そのＤＮＡ４５５６６配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む様々なＥＳＴデータベースと比較することにより、相同なＥＳＴ配列を同定した。その比較は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ４６９６５と命名する。次いで、このＤＮＡ４６９６５配列に基づいたオリゴヌクレオチドプライマーを合成し、それを使用して、ヒトＳＫ−Ｌｕ−１腺癌ｃＤＮＡライブラリー（ＬＩＢ２４７）をスクリーニングしたところ、図３１に示すＤＮＡ５８７２７−１４７４クローンが同定された。

図３１に示す完全長ＤＮＡ５８７２７−１４７４クローンは、ヌクレオチド１３１−１３３位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１０９７−１０９９位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図３１；配列番号３１）。予測されるポリペプチド前駆体は、３２２アミノ酸長である（図３２；配列番号３２）。図３２に示す完全長ＰＲＯ１１１０タンパク質は、推定分子量が約３５，２７４ダルトン、ｐＩが約８．５７である。図３２（配列番号３２）に示される完全長ＰＲＯ１１１０配列の解析により、以下：アミノ酸約４１〜アミノ酸約６０、アミノ酸約６６〜アミノ酸約８５、アミノ酸約１０１〜アミノ酸約１２０、アミノ酸約１３７〜アミノ酸約１５３、アミノ酸約１７１〜アミノ酸約１９２、アミノ酸約２０５〜アミノ酸約２２６、アミノ酸約２３５〜アミノ酸約２５５およびアミノ酸約２９４〜アミノ酸約３１２の膜貫通ドメイン、アミノ酸約６〜アミノ酸約６９の潜在的Ｎ−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約１８〜アミノ酸約２１のグリコサミノグリカン結合部位の存在が証明された。クローンＤＮＡ５８７２７−１４７４は、１９９８年９月１日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１７１が割り当てられている。

図３２（配列番号３２）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１１１０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＭＭＭＹＥＬＵＰＲ＿１、Ｐ＿Ｒ９９７９９、ＭＡＬ＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｐ８０９２９、ＲＮＭＡＬＧＥＮＥ＿１、Ｓ６８４０６、ＰＬＬＰ＿ＲＡＴ、ＭＭＭＡＬＰＲＯＴ＿１、Ｉ３８８９１およびＳ５５６２２との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例１８：ヒトＰＲＯ１１２２ポリペプチド［ＵＮＱ５６１］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ＥＳＴを同定した。そのＥＳＴは、ＤＮＡ４９６６５とも呼ばれるＩｎｃｙｔｅ１３４７５２３であった。ＤＮＡ４９６６５に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１１２２についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。［例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｏｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ：Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，１９８９）；Ｄｉｅｆｆｅｎｂａｃｈ ｅｔ ａｌ．，ＰＣＲ Ｐｒｉｍｅｒ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，１９９５）］。

順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約１〜１．５ｋｐｂより長いとき、追加のオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについて、いくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙのように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によりスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向、逆方向およびハイブリダイゼーション）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー：５’−ＡＴＣＣＡＣＡＧＡＡＧＣＴＧＧＣＣＴＴＣＧＣＣＧ−３’（配列番号１８４）
逆方向ＰＣＲプライマー：５’−ＧＧＧＡＣＧＴＧＧＡＴＧＡＡＣＴＣＧＧＴＧＴＧＧ−３’（配列番号１８５）
ハイブリダイゼーションプローブ：
５’−ＴＡＴＣＣＡＣＡＧＡＡＧＣＴＧＧＣＣＴＴＣＧＣＣＧＡＧＴＧＣＣＴＧＴＧＣＡＧＡＧ−３’（配列番号１８６）．
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１１２２遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーを、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１１２２に対する完全長ＤＮＡ配列［本明細書中でＤＮＡ６２３７７−１３８１−１と命名］（配列番号３３）およびＰＲＯ１１２２に対して誘導されるタンパク質配列（ＵＮＱ５６１）（配列番号３４）が得られた。

ＤＮＡ６２３７７−１３８１−１のヌクレオチド配列全体（配列番号３３）を図３３（配列番号３３）に示す。クローンＤＮＡ６２３７７−１３８１−１（配列番号３３）は、配列番号３３（図３３）のヌクレオチド５０−５２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド６４１−６４３位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、１９７アミノ酸長である（図３４；配列番号３４）。図３４（ＵＮＱ５６１）に示す完全長ＰＲＯ１１２２タンパク質（配列番号３４）は、推定分子量が約２１７６５ダルトン、ｐＩが約８．５３である。クローンＤＮＡ６２３７７−１３８１−１は、１９９８年１２月２２日にＡＴＴＣに寄託され、寄託番号２０３５５２が割り当てられている。本明細書中に提供される配列中に配列決定の不規則性または誤りが存在する場合には、正確な配列は、寄託されている配列であることが理解される。さらに、本明細書中に提供されるすべての配列は、公知の配列決定技術の結果である。

単離された完全長ＰＲＯ１１２２（ＵＮＱ５６１）のアミノ酸配列の解析により、その配列が、ＩＬ−１７との類似性を有することが示唆され、このことにより、ＰＲＯ１１２２（ＵＮＱ５６１）が新規サイトカインであり得ることが示唆され、本明細書中でＩＬ−１７Ｃと命名される。図３４（配列番号３４）はまた、シグナルペプチド、ロイシンジッパーパターンおよびＩＬ−１７との配列同一性を有する領域のおよその位置を示す。

実施例１９：ヒトＰＲＯ１１３８ポリペプチド［ＵＮＱ５７６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴ配列（Ｉｎｃｙｔｅクラスター配列番号１６５２１２）が同定できた。次いで、このクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ５４２２４と命名する。企業Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ ＥＳＴを含むこのアセンブリを本明細書中でＤＮＡ４９１４０と命名する。

ＤＮＡ５４２２４コンセンサス配列とＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン番号３８３６６１３内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン３８３６６１３を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図３５に示し、これは、ＰＲＯ１１３８に対する完全長ＤＮＡ配列である。クローンＤＮＡ５８８５０−１４９５は、１９９８年６月９日にＡＴＣＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０９９５６が割り当てられた。

ＤＮＡ５８８５０−１４９５のヌクレオチド配列全体を図３５（配列番号３５）に示す。クローンＤＮＡ５８８５０−１４９５は、ヌクレオチド３８−４０位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１０４３−１０４５位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図３５）。予測されるポリペプチド前駆体は、３３５アミノ酸長である（図３６；配列番号３６）。図３６に示す完全長ＰＲＯ１１３８タンパク質は、推定分子量が約３７，４２１ダルトン、ｐＩが約６．３６である。図３６（配列番号３６）に示される完全長ＰＲＯ１１３８配列の解析により、以下の特徴：アミノ酸約１〜アミノ酸約２２のシグナルペプチド；アミノ酸約２２４〜約２５０の膜貫通ドメイン；アミノ酸約２２９〜約２５０のロイシンジッパーパターン；ならびにアミノ酸約９８〜１０１、１４２〜１４５、１４８〜１５１、１７２〜１７５、１７６〜１７９、２０４〜２０７および２９１〜２９５の潜在的Ｎ−グリコシル化部位の存在が証明される。

完全長ＰＲＯ１１３８のアミノ酸配列の解析により、その配列が、ＣＤ８４との有意な配列類似性を有することが示唆され、このことにより、ＰＲＯ１１３８がＩｇスーパーファミリーのポリペプチドの新規メンバーであり得ることが示唆される。より詳細には、Ｄａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）を使用した完全長ＰＲＯ１１３８ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、ＰＲＯ１１３８アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＨＳＵ８２９８８＿１、ＨＵＭＬＹ９＿１、Ｐ＿Ｒ９７６３１、Ｐ＿Ｒ９７６２８、Ｐ＿Ｒ９７６２９、Ｐ＿Ｒ９７６３０、ＣＤ４８＿ＲＡＴ、ＣＤ２＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｐ９３９９６およびＨＵＭＢＧＰ＿１との間の相同性が明らかになった。

クローンＤＮＡ５８８５０−１４９５は、１９９８年６月９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０９９５６が割り当てられている。

実施例２０：ヒトＰＲＯ１１９０ポリペプチド［ＵＮＱ６０４］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例１に記載した方法により、単一のＭｅｒｃｋ／Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ＥＳＴ配列、ＥＳＴ番号ＡＡ３３９８０２が同定でき、それを本明細書中で「ＤＮＡ５３９４３」と命名する。そのＤＮＡ５３９４３配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１１９０についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー：（５３９４３．ｆ１）ＧＧＧＡＡＡＣＡＣＡＧＣＡＧＴＣＡＴＴＧＣＣＴＧＣ（配列番号１８７）
逆方向ＰＣＲプライマー：（５３９４３．ｒ１）ＧＣＡＣＡＣＧＴＡＧＣＣＴＧＴＣＧＣＴＧＧＡＧＣ（配列番号１８８）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するＤＮＡ５３９４３配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ：（５３９４３．ｐ１）ＣＡＣＣＣＣＡＡＡＧＣＣＣＡＧＧＴＣＣＧＧＴＡＣＡＧＣＧＴＣＡＡＡＣＡＡＧＡＧＴＧＧ（配列番号１８９）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１１９０遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト骨髄から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１１９０に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ５９５８６−１５２０と命名［図３７，配列番号３７］）およびＰＲＯ１１９０に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＰＲＯ１１９０のコード配列全体を図３７に示す（配列番号３７）。クローンＤＮＡ５９５８６−１５２０は、ヌクレオチド３４０−３４２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド３６８５−３６８７位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、１１１５アミノ酸長である。図３８（配列番号３８）に示す完全長ＰＲＯ１１９０タンパク質は、推定分子量が約１２１，１８８ダルトン、ｐＩが約７．０７である。ＰＲＯ１１９０タンパク質の他の特徴としては：アミノ酸１６−３０および８５４−８７９の２つの膜貫通ドメイン；アミノ酸１０５１−１０６０のシトクロムＰ４５０システインヘム鉄リガンドサイン；アミノ酸１０４５−１０５１のＮ−６アデニン特異的ＤＮＡメチラーゼサイン；ならびにアミノ酸６５−６８、７６−７９、９８−１０１、１８９−１９２、２７５−２７８、５１８−５２１、７２６−７２９および７６０−７６３の潜在的Ｎ−グリコシル化部位が挙げられる。クローンＤＮＡ５９５８６−１５２０は、１９９８年９月２９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８８が割り当てられている。

図３８（配列番号３８）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１１９０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＦ００４８４０＿１、ＡＦ００４８４１＿１、ＡＦ０２６４６５＿１、ＨＳＵ７２３９１＿１、Ｐ＿Ｒ１３１４４、ＡＸＯ１＿ＨＵＭＡＮ、ＧＥＮ１３３４９、Ｉ５８１６４、Ｄ８７２１２＿１、Ａ５３４４９およびＤ８６９８３＿１およびＫＩＡＡ０２３０との間の相同性が明らかになった。

実施例２１：ヒトＰＲＯ１２７２ポリペプチド［ＵＮＱ６４２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＩｎｃｙｔｅデータベースからＥＳＴクラスター配列が同定できた。次いで、そのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ５８７５３と命名する。

ＤＮＡ５８７５３配列とＥＳＴクローン３０４９１６５内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、ＥＳＴ３０４９１６５を含むそのＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン（肺ライブラリー由来）を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図３９に示し、本明細書中でＤＮＡ６４８９６−１５３９と命名する。

図３９に示す完全長クローンは、ヌクレオチド５８−６０位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド５５６−５５８位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図３９；配列番号３９）。予測されるポリペプチド前駆体（図４０，配列番号４０）は、１６６アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号４０のアミノ酸約１〜２３である。ＰＲＯ１２７２は、算出分子量が約１９，１７１ダルトン、推定ｐＩが約８．２６である。クローンＤＮＡ６４８９６−１５３９は、１９９８年９月９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２３８が割り当てられている。

図４０（配列番号４０）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１２７２アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列（データベースからの情報は本明細書中で援用される）：ＡＦ０２５４７４＿１、Ｄ６９１００、ＡＥ０００７５７＿１０、Ｈ６９４６６、ＣＥＬＣ５０Ｅ３＿１２、ＸＬＲＡＮＢＰ１＿１、ＹＤ６７＿ＳＣＨＰＯ、Ｂ６９４５９、Ｈ３６８５６およびＦＲＵ４０７５５＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例２２：ヒトＰＲＯ１２８６ポリペプチド［ＵＮＱ６５５］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベースからＥＳＴクラスター配列が同定でき、ＥＳＴクラスター番号８６８０９と命名した。次いで、このＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。このアセンブリ中のＥＳＴは、腫瘍、細胞株または罹患組織から同定されるものを含んでいた。これらのＥＳＴの１つ以上は、罹患結腸組織から単離されたＲＮＡから構築されたｃＤＮＡライブラリーから得られた。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ５８８２２と命名する。

ＤＮＡ５８８２２配列とＥＳＴ番号１６９５４３４内に包含されるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号１６９５４３４を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図４１に示し、本明細書中でＤＮＡ６４９０３−１５５３（配列番号４１）と命名する。

図４１に示す完全長クローンは、ヌクレオチド９３−９５位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド３７２−３７４位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図４１；配列番号４１）。予測されるポリペプチド前駆体（図４２，配列番号４２）は、アミノ酸約１〜１８のシグナル配列を有する９３アミノ酸長である。ＰＲＯ１２８６は、算出分子量が約１０，１１１ダルトン、推定ｐＩが約９．７０である。

図４２（配列番号４２）に示される完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１２８６アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＳＲ５Ｃ＿ＡＲＡＴＨ、ＣＥＬＣ１７Ｈ１２＿１１、ＭＣＰＤ＿ＥＮＴＡＥ、ＪＱ２２８３、ＩＮＶＯ＿ＬＥＭＣＡ、Ｐ＿Ｒ０７３０９、ＡＤＥＶＢＣＡＧＮ＿４、ＡＦ０２０９４７＿１、ＣＥＬＴ２３Ｈ２＿１およびＭＤＨ＿ＳＴＲＡＲとの間のいくらかの相同性が明らかになった。

クローンＤＮＡ６４９０３−１５５３は、１９９８年９月１５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２２３が割り当てられている。

実施例２３：ヒトＰＲＯ１２９５ポリペプチド［ＵＮＱ６６４］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＩｎｃｙｔｅデータベースからＥＳＴクラスター配列が同定できた。次いで、そのＥＳＴクラスター配列を、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。これらのＥＳＴの１つ以上は、胸腺組織ライブラリーから得られた。相同性検索を、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でＤＮＡ５６２６２と命名する。

ＤＮＡ５６２６２配列とＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴ ３７４３３３４内に包含されるＥＳＴ配列との間の配列相同性に鑑みて、このＥＳＴを含むクローンを購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図４３に示し、本明細書中でＤＮＡ５９２１８−１５５９と命名する。

図４３に示す完全長クローンは、ヌクレオチド２０７−２０９位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１０４７−１０４９位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図４３；配列番号４３）。予測されるポリペプチド前駆体（図４４，配列番号４４）は、２８０アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号４４のアミノ酸約１〜１８である。標的シグナルおよびＮ−グリコシル化部位もまた、図４４に示す。ＰＲＯ１２９５は、算出分子量が約３０，１６３ダルトン、推定ｐＩが約６．８７である。クローンＤＮＡ５９２１８−１５５９は、１９９８年９月２９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２８７が割り当てられている。

図４４（配列番号４４）に示される完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１２９５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列（データは本明細書中で援用される）：ＡＢ０１１０９９＿１、ＩＬＶＥ＿ＭＹＣＴＵ、ＡＴＴＥＣＲ＿２、ＡＦ０１０４９６＿２７、Ｐ＿Ｒ１５３４６、Ｓ３７１９１、ＰＥＲ＿ＤＲＯＭＳ、Ｌ２ＭＵ＿ＡＤＥＣＣおよびＰ＿Ｗ３４２３８との間の配列同一性が明らかになった。

実施例２４：ヒトＰＲＯ１３０９ポリペプチド［ＵＮＱ６７５］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ＳＬＩＴとの相同性を示したＥＳＴを同定した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児脳組織から単離した。ヒトＰＲＯ１３０９をコードするｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

ｃＤＮＡライブラリー（上で記載したように調製）を、上記のＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴ配列から得られた合成オリゴヌクレオチドプローブ
：５’−ＴＣＣＧＴＧＣＡＧＧＧＧＧＡＣＧＣＣＴＴＴＣＡＧＡＡＡＣＴＧＣＧＣＣＧＡＧＴＴＡＡＧＧＡＡＣ−３’（配列番号１９０）．
ｃＤＮＡクローンを単離し、その全体に亘って配列決定した。ＤＮＡ５９５８８−１５７１のヌクレオチド配列全体を図４５（配列番号４５）に示す。クローンＤＮＡ５９５８８−１５７１は、ヌクレオチド７２０−７２２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド２２８６−２２８８位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図４５；配列番号４５）。予測されるポリペプチド前駆体は、５２２アミノ酸長である（図４６；配列番号４６）。そのシグナルペプチドは、配列番号２７８の約１〜３４であり、膜貫通ドメインは、約４２８〜４５０である。クローンＤＮＡ５９５８８−１５７１は、１９９８年８月１１日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１０６が割り当てられている。図４６に示す完全長ＰＲＯ１３０９タンパク質は、推定分子量が約５８，６１４ダルトン、ｐＩが約７．４２である。

図４６（配列番号４６）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１３０９アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＢ００７８７６＿１、ＧＰＶ＿ＭＯＵＳＥ、ＡＬＳ＿ＲＡＴ、Ｐ＿Ｒ８５８８９、ＬＵＭ＿ＣＨＩＣＫ、ＡＢ０１４４６２＿１、ＰＧＳ１＿ＣＡＮＦＡ、ＣＥＭ８８＿７、Ａ５８５３２およびＧＥＮ１１２０９との間の配列同一性が明らかになった。

実施例２５：ヒトＰＲＯ１３１６ポリペプチド［ＵＮＱ６８２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
分泌配列を含むことが知られている公的に利用可能なデータベースの細胞外ドメイン（ＥＣＤ）（もしあればシグナル配列を含む）を使用して、様々な公的に利用可能なＥＳＴ（発現配列タグ）データベース（ＧｅｎＢａｎｋ，Ｍｅｒｃｋ／Ｗａｓｈ．Ｕ）を検索した。その検索は、そのＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，ＷＡ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

上の検索の結果、分泌タンパク質Ｄｋｋ−１との相同性を示したＷ５５９７９と命名されるＥＳＴが同定された。ＥＳＴ Ｗ５５９７９（クローンＮｂＨＨ１９Ｗ）に対応するクローンをＭｅｒｃｋ／Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙから購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。

購入したクローンによってコードされる完全長ＰＲＯ１３１６（ＤＮＡ６０６０８−１５７７と命名）に対応する核酸配列を、図４７（配列番号４７）に示す。ＤＮＡ６０６０８−１５７７は、ヌクレオチド２１１−２１３位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド９８８−９９０位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図４７；配列番号４７）。予測されるポリペプチド前駆体は、２５９アミノ酸長である（図４８；配列番号４８）。特に興味深いさらなる領域としては、シグナルペプチドをコードしているヌクレオチド残基（２１１−２８３）、Ｎ−グリコシル化部位（３６４−３６６）およびＺｎ（２）−Ｃｙｓ（６）二核性クラスタードメイン（５０５−６５５）が挙げられる。クローンＤＮＡ６０６０８−１５７７は、１９９８年８月１８日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１２６が割り当てられている。図４８に示す完全長ＰＲＯ１３１６タンパク質は、推定分子量が約２８，４４７ダルトン、ｐＩが約９．４８である。

完全長配列のＢＬＡＳＴおよびＦａｓｔＡ配列アラインメント解析（ＡＬＩＧＮコンピュータプログラムを使用）に基づいて、ＰＲＯ１３１６は、ｄｉｃｋｋｏｐｆファミリーのタンパク質に対して有意なアミノ酸配列同一性を示す。さらに、ＤＮＡ６０６０８は、ＡＦ０３０４３３＿１、ＬＦＥ４＿ＣＨＩＣＫ、ＣＯＬ＿ＲＡＢＩＴ、ＹＱＩ６＿ＣＡＥＥＬ、ＩＴＢ６＿ＨＵＭＡＮ、ＣＯＮＯ＿ＬＹＭＳＴ、Ｓ４１０３３、Ｄ６３４８３＿１、Ｄ８６８６４＿１およびＡＢ００１９７８＿１に対する相同性を示した。

実施例２６：ヒトＰＲＯ１３８３ポリペプチド［ＵＮＱ７１９］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ５３９６１と命名する。そのＤＮＡ５３９６１コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１３８３についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＣＡＴＴＴＣＣＴＴＡＣＣＣＴＧＧＡＣＣＣＡＧＣＴＣＣ−３’（配列番号１９１）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＧＡＡＡＧＧＣＣＣＡＣＡＧＣＡＣＡＴＣＴＧＧＣＡＧ−３’（配列番号１９２）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ５３９６１配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＣＣＡＣＧＡＣＣＣＧＡＧＣＡＡＣＴＴＣＣＴＣＡＡＧＡＣＣＧＡＣＴＴＧＴＴＴＣＴＣＴＡＣＡＧＣ−３’（配列番号１９３）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１３８３遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児脳組織から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３８３（本明細書中でＤＮＡ５８７４３−１６０９と命名［図４９，配列番号４９］）に対する完全長ＤＮＡ配列およびＰＲＯ１３８３に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ５８７４３−１６０９のヌクレオチド配列全体を図４９（配列番号４９）に示す。クローンＤＮＡ５８７４３−１６０９は、ヌクレオチド１２２−１２４位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１３９１−１３９３位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図４９）。予測されるポリペプチド前駆体は、４２３アミノ酸長である（図５０；配列番号５０）。図５０に示す完全長ＰＲＯ１３８３タンパク質は、推定分子量が約４６，９８９ダルトン、ｐＩが約６．７７である。図５０（配列番号５０）に示される完全長ＰＲＯ１３８３配列の解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約２４のシグナルペプチド、アミノ酸約３３９〜アミノ酸約３６２の膜貫通ドメインならびにアミノ酸約３４〜アミノ酸約３７、アミノ酸約５８〜アミノ酸約６１、アミノ酸約１４２〜アミノ酸約１４５、アミノ酸約１９７〜アミノ酸約２００、アミノ酸約３００〜アミノ酸約３０３およびアミノ酸約３６４〜アミノ酸約３６７の潜在的Ｎ−グリコシル化部位の存在が証明された。クローンＤＮＡ５８７４３−１６０９は、１９９８年８月２５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１５４が割り当てられている。

図５０（配列番号５０）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１３８３アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＮＭＢ＿ＨＵＭＡＮ、ＱＮＲ＿ＣＯＴＪＡ、Ｐ＿Ｗ３８３３５、Ｐ１１５＿ＣＨＩＣＫ、Ｐ＿Ｗ３８１６４、Ａ４５９９３＿１、ＭＭＵ７０２０９＿１、Ｄ８３７０４＿１およびＰ＿Ｗ３９１７６との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例２７：ヒトＰＲＯ１３８４ポリペプチド［ＵＮＱ７２１］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ５４１９２と命名する。そのＤＮＡ５４１９２配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１３８４についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＴＧＣＡＧＣＣＣＣＴＧＴＧＡＣＡＣＡＡＡＣＴＧＧ−３’（配列番号１９４）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＣＴＧＡＧＡＴＡＡＣＣＧＡＧＣＣＡＴＣＣＴＣＣＣＡＣ−３’（配列番号１９５）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するＤＮＡ５４１９２配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＧＧＡＧＡＴＡＧＣＴＧＣＴＡＴＧＧＧＴＴＣＴＴＣＡＧＧＣＡＣＡＡＣＴＴＡＡＣＡＴＧＧＧＡＡＧ−３’（配列番号１９６）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１３８４遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肝臓から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１３８４に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ７１１５９−１６１７と命名［図５１，配列番号５１］）およびＰＲＯ１３８４に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＰＲＯ１３８４のコード配列全体を図５１に示す（配列番号５１）。クローンＤＮＡ７１１５９−１６１７は、ヌクレオチド１８２−１８４位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド８６９−８７１位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、２２９アミノ酸長である（図５２；配列番号５２）。図５２に示す完全長ＰＲＯ１３８４タンパク質は、推定分子量が約２６，６５０ダルトン、ｐＩが約８．７６である。さらなる特徴としては、アミノ酸約３２−５７のＩＩ型膜貫通ドメインならびにアミノ酸約６８−７１、１２０−１２３および１３４−１３７の潜在的Ｎ−グリコシル化部位が挙げられる。

図５２（配列番号５２）に示される完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１３８４アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＦ０５４８１９＿１、ＨＳＡＪ１６８７＿１、ＡＦ００９５１１＿１、ＡＢ０１０７１０＿１、ＧＥＮ１３５９５、ＨＳＡＪ６７３＿１、ＧＥＮ１３９６１、ＡＢ００５９００＿１、ＬＥＣＨ＿ＣＨＩＣＫ、ＡＦ０２１３４９＿１およびＮＫ１３＿ＲＡＴとの間の相同性が明らかになった。

クローンＤＮＡ７１１５９−１６１７は、１９９８年８月１８日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３１３５が割り当てられている。

実施例２８：ヒトＰＲＯ１４３１ポリペプチド［ＵＮＱ７３７］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ＳＨ３との相同性を示したＥＳＴ（成人脳幹組織から単離）を同定した（１３７０１４１，ＤＮＡ６６５０５）。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト骨髄から単離した。単離したＥＳＴに対応する完全長ｃＤＮＡを、ｐＲＫ５においてｉｎ ｖｉｔｒｏクローニング技術を使用して単離した（ＤＮＡ７３４０１−１６３３）。

ヒトＰＲＯ１４３１をコードするｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩおよびＮｏｔＩにおいてクローニングした。

ｃＤＮＡクローンを全体に亘って配列決定した。ＤＮＡ７３４０１−１６３３のヌクレオチド配列全体（配列番号５３）を図５３に示す。クローンＤＮＡ７３４０１−１６３３は、ヌクレオチド６３０−６３２位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１７４０−１７４２位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。ＤＮＡ７３４０１−１６３３によってコードされる、予測されるポリペプチド前駆体は、３７０アミノ酸長である（図５４；配列番号５４）。クローンＤＮＡ７３４０１（ＤＮＡ７３４０２−１６３３と命名）は、１９９８年９月２２日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２７３が割り当てられている。

完全長配列の配列アラインメント解析（ＡＬＩＧＮコンピュータプログラムを使用）に基づいて、ＰＲＯ１４３１は、ＳＨ１７＿ＨＵＭＡＮ、ＳＨ３Ｐ１７として知られるＳＨ３含有タンパク質との有意なアミノ酸配列同一性を示す。さらなる有意な同一性スコアは、Ｄ８９１６４＿１、ＡＦ０３２１１８＿１、ＥＸＬＰ＿ＴＯＢＡＣ、ＹＨＲ４＿ＹＥＡＳＴ、Ｓ４６９９２、ＲＡＴＰ１３０ＣＡＳ＿２、ＡＦ０４３２５９＿１、ＲＡＴＰ１３０ＣＡＳ＿１およびＭＹＳＣ＿ＡＣＡＣＡに対して見られた。

実施例２９：ヒトＰＲＯ１４３４ポリペプチド［ＵＮＱ７３９］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ５４１８７と命名する。そのＤＮＡ５４１８７コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１４３４についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー５’−ＧＡＧＧＴＧＴＣＧＣＴＧＴＧＡＡＧＣＣＡＡＣＧＧ−３’（配列番号１９７）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＣＧＣＴＣＧＡＴＴＣＴＣＣＡＴＧＴＧＣＣＴＴＣＣ−３’（配列番号１９８）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ５４１８７配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＧＡＣＧＧＡＧＴＧＴＧＴＧＧＡＣＣＣＴＧＴＧＴＡＣＧＡＧＣＣＴＧＡＴＣＡＧＴＧＣＴＧＴＣＣ−３’（配列番号１９９）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト網膜組織（ＬＩＢ９４）から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４３４に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ６８８１８−２５３６と命名［図５５，配列番号５５］）およびＰＲＯ１４３４に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ６８８１８−２５３６のヌクレオチド配列全体を図５５（配列番号５５）に示す。クローンＤＮＡ６８８１８−２５３６は、ヌクレオチド５８１−５８３位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１５５６−１５５８位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図５５）。予測されるポリペプチド前駆体は、３２５アミノ酸長である（図５６；配列番号５６）。図５６に示す完全長ＰＲＯ１４３４タンパク質は、推定分子量が約３５，２９６ダルトン、ｐＩが約５．３７である。図５６（配列番号５６）に示す完全長ＰＲＯ１４３４配列の解析により、図５６に示すような種々の重要なタンパク質ドメインの存在が証明された。クローンＤＮＡ６８８１８−２５３６は、１９９９年２月９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３６５７が割り当てられている。

図５６（配列番号５６）に示される完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１４３４アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＮＥＬ＿ＭＯＵＳＥ、ＡＰＭＵ＿ＰＩＧ、Ｐ＿Ｗ３７５０１、ＮＥＬ＿ＲＡＴ、ＴＳＰ１＿ＣＨＩＣＫ、Ｐ＿Ｗ３７５００、ＮＥＬ２＿ＨＵＭＡＮ、ＭＭＵ０１０７９２＿１、Ｄ８６９８３＿１および１０ＭＵＣＳ＿ＢＯＶＩＮとの間の有意な相同性が明らかになった。

実施例３０：ヒトＰＲＯ１４７５ポリペプチド［ＵＮＱ７４６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ４５６３９と命名する。そのＤＮＡ４５６３９コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１４７５についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー（４５６３９．ｆ１）５’−ＧＡＴＧＧＣＡＡＡＡＣＧＴＧＴＧＴＴＴＧＡＣＡＣＧ−３’（配列番号２００）
順方向ＰＣＲプライマー（４５６３９．ｆ２）５’−ＣＣＴＣＡＡＣＣＡＧＧＣＣＡＣＧＧＧＣＣＡＣ−３’（配列番号２０１）
逆方向ＰＣＲプライマー（４５６３９．ｒ１）５’−ＣＣＣＡＧＧＣＡＧＡＧＡＴＧＣＡＧＴＡＣＡＧＧＣ−３’（配列番号２０２）
逆方向ＰＣＲプライマー（４５６３９．ｒ２）５’−ＣＣＴＣＣＡＧＴＡＧＧＴＧＧＡＴＧＧＡＴＴＧＧＣＴＣ−３’（配列番号２０３）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４５６３９配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ（４５６３９．ｐ１）
５’−ＣＴＣＡＣＣＴＣＡＴＧＡＧＧＡＴＧＡＧＧＣＣＡＴＧＧＴＧＣＴＡＴＴＣＣＴＣＡＡＣＡＴＧＧＴＡＧ−３’（配列番号２０４）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１４７５遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児脳組織から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１４７５に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ６１１８５−１６４６と命名［図５７，配列番号５７］）およびＰＲＯ１４７５に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ６１１８５−１６４６のヌクレオチド配列全体を図５７（配列番号５７）に示す。クローンＤＮＡ６１１８５−１６４６は、ヌクレオチド１３０−１３２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド２１１０−２１１２位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図５７）。予測されるポリペプチド前駆体は、６６０アミノ酸長である（図５８；配列番号５８）。図５８に示す完全長ＰＲＯ１４７５タンパク質は、推定分子量が約７５，２２０ダルトン、ｐＩが約６．７６である。図５８（配列番号５８）に示す完全長ＰＲＯ１４７５配列の解析により、以下：アミノ酸約３８〜アミノ酸約５５の膜貫通ドメインおよびアミノ酸約２２９〜アミノ酸約６６０のマウスＧＮＴ１に対する相同領域の存在が証明された。クローンＤＮＡ６１１８５−１６４６は、１９９８年１１月１７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４６４が割り当てられている。

図５８（配列番号５８）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１４７５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＧＮＴ１＿ＭＯＵＳＥ、ＣＧＵ６５７９２＿１、ＣＧＵ６５７９１＿１、Ｐ＿Ｒ２４７８１、ＣＥＬＦ４８Ｅ３＿１、Ｇ７８６＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｗ０６５４７、ＧＮＴ１＿ＣＡＥＥＬ、２１９＿ＨＵＭＡＮおよびＥＦ０７＿ＭＯＵＳＥとの間の有意な相同性が明らかになった。

実施例３１：ヒトＰＲＯ１４８１ポリペプチド［ＵＮＱ７５０］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
本明細書中でＤＮＡ５３２５４と称される最初のＤＮＡ配列を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒト胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。そのＤＮＡ５３２５４配列に基づいて、ＰＲＯ１４８１についての完全長コード配列のクローンをヒト胎児腎臓ｃＤＮＡライブラリーから単離するためのプローブ（またはプライマー）として使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

図５９に示す完全長ＤＮＡ５８７３２−１６５０クローンは、ヌクレオチド３２０−３２２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１３２２−１３２４位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図５９；配列番号５９）。予測されるポリペプチド前駆体（図６０，配列番号６０）は、３３４アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号６０のアミノ酸約１−２３であり、膜貫通ドメインは、アミノ酸約２３５−２６２である。そのＮ−グリコシル化部位を、図６０に示す。ＰＲＯ１４８１は、算出分子量が約３６，２９４ダルトン、推定ｐＩが約４．９８である。クローンＤＮＡ５８７３２−１６５０は、１９９８年９月２９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３２９０が割り当てられている。

図６０（配列番号６０）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１４８１アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列（データは本明細書中で援用される）：ＹＮ２３＿ＹＥＡＳＴ、Ｓ６７７７０、Ｈ３６８５７、ＹＬＵ２＿ＰＩＣＡＮ、ＧＥＮ１２８８１、ＣＶＹ１５０３５＿２８、ＹＭ９６＿ＹＥＡＳＴ、ＥＳＣ１＿ＳＣＨＰＯ、ＣＥＬＺＫ７８３＿１およびＳ５９３１０との間の配列同一性が明らかになった。

実施例３２：ヒトＰＲＯ１５６８ポリペプチド［ＵＮＱ７７４］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築することにより、上の実施例１に記載したようにアセンブリを形成した。そのコンセンサス配列を、本明細書中で「ＤＮＡ５４２０８」と命名する。ＤＮＡ５４２０８コンセンサス配列、そのアセンブリおよび他の情報ならびに本明細書中で提供される発見に基づいて、そのアセンブリ内のＥＳＴを含むクローンを、整列し、配列決定した。そのＥＳＴは、Ｉｎｃｙｔｅ３０８９４９０である。全長の配列決定により、図６１に示す配列が得られた。

ＰＲＯ１５６８のコード配列全体が図６１（配列番号６１）に含まれている。クローンＤＮＡ６８８８０−１６７６は、配列番号６１のヌクレオチド２０８−２１０位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１１２３−１１２５位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、３０５アミノ酸長である（図６２；配列番号６２）。そのシグナルペプチド、膜貫通領域、Ｎ−ミリストイル化およびアミド化部位もまた、図６２に示す。クローンＤＮＡ６８８８０−１６７６は、１９９８年１０月６日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３１９が割り当てられている。図６２に示す完全長ＰＲＯ１５６８タンパク質は、推定分子量が約３５，３８３ダルトン、ｐＩが約５．９９である。

図６２（配列番号６２）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１５６８アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列（本明細書中で援用される）：ＡＦ０８９７４９＿１、ＡＦ０５４８４１＿１、ＮＡＧ２＿ＨＵＭＡＮ、ＣＤ６３＿ＨＵＭＡＮ、ＣＤ８２＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｗ０５７３２、Ｐ＿Ｒ８６８３４、Ａ１５＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｗ２７３３３およびＣＤ３７＿ＨＵＭＡＮとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例３３：ヒトＰＲＯ１５７３ポリペプチド［ＵＮＱ７７９］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｉｎｃｙｔｅデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）内のＥＳＴ ３６２８９９０を同定し、データベース内の他の配列との比較によって伸長することにより、アセンブリを形成した。アラインメント検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そのコンセンサス配列を本明細書中で「ＤＮＡ６９５６１」と命名する。

ＤＮＡ６９５６１コンセンサス配列および本明細書中で提供される他の情報に基づいて、そのアセンブリ由来の別のＥＳＴ（Ｉｎｃｙｔｅ ＤＮＡ３７５２６５７）を含むクローンを購入し、配列決定した。このクローンは、乳房腫瘍組織ライブラリー由来であった。

ＰＲＯ１５７３のコード配列全体は、図６３（配列番号６３）に含まれている。クローンＤＮＡ７３７３５−１６８１は、ヌクレオチド９７−９９位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド７７２−７７４位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、２２５アミノ酸長である（図６４；配列番号６４）。そのシグナルペプチドは、配列番号６４のアミノ酸約１〜１７であり、膜貫通ドメインは、アミノ酸約８２〜１０１、１１８〜１４５および１６４〜１８８である。膜貫通ドメインの１つ以上が欠失され得るか、または不活性化され得る。リン酸化部位、アミド化部位およびＮ−ミリストイル化部位を図６４に示す。クローンＤＮＡ７３７３５−１６８１は、１９９８年１０月２０日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５６が割り当てられている。図６４に示す完全長ＰＲＯ１５７３タンパク質は、推定分子量が約２４，８４５ダルトン、ｐＩが約９．０７である。

図６４（配列番号６４）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１５７３アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列（本明細書中で援用される）：ＡＦ００７１８９＿１、ＡＢ０００７１４＿１、ＡＢ０００７１３＿１、ＡＢ０００７１２＿１、Ａ３９４８４、ＡＦ０００９５９＿１、ＡＦ０７２１２７＿、ＡＦ０７２１２８＿１、ＡＦ０６８８６３＿１およびＡＦ０７７７３９＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例３４：ヒトＰＲＯ１５９９ポリペプチド［ＵＮＱ７８２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例１に記載の技術を使用して、既知タンパク質をコードしない、７０以上のＢＬＡＳＴスコアを有する目的の配列としてＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴ番号１４９１３６０を同定した。ＥＳＴ番号１４９１３６０のヌクレオチド配列およびその相補配列を、本明細書中で「ＤＮＡ３７１９２」と命名する。ＤＮＡ３７１９２配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１５９９についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー：ＧＡＣＧＴＣＴＧＣＡＡＣＡＧＣＴＣＣＴＧＧＡＡＧ（３７１９２．ｆ１；配列番号２０５）
逆方向ＰＣＲプライマー：ＣＧＡＧＡＡＧＧＡＡＡＣＧＡＧＧＣＣＧＴＧＡＧ（３７１９２．ｒ１；配列番号２０６）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ３７１９２配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ：ＴＧＡＣＡＣＴＴＡＣＣＡＴＧＣＴＣＴＧＣＡＣＣＣＧＣＡＧＴＧＧＧＧＡＣＡＧＣＣＡＣＡＧＡ（配列番号２０７）．
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１５９９遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肝臓組織から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１５９９に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ６２８４５−１６８４と命名［図６５，配列番号６５］）およびＰＲＯ１５９９に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＰＲＯ１５９９のコード配列全体を図６５（配列番号６５）に示す。クローンＤＮＡ６２８４５−１６８４は、ヌクレオチド６９−７１位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド９１８−９２０位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、２８３アミノ酸長である（図６６；配列番号６６）。図６６に示す完全長ＰＲＯ１５９９タンパク質は、推定分子量が約３０，３５０ダルトン、ｐＩが約９．６６である。ＰＲＯ１５９９のさらなる特徴としては：アミノ酸約１〜３０のシグナルペプチド；アミノ酸約１２９〜１３２および１８９〜１９２の潜在的Ｎ−グリコシル化部位；アミノ酸約２６３〜２６６の潜在的ｃＡＭＰ−およびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位；アミノ酸約２８〜３３、５５〜６０、１７４〜１７９および２３６〜２４１の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位；アミノ酸約１４４〜１４７の潜在的アミド化部位；ならびにアミノ酸約７０−７５のセリンプロテアーゼ、トリプシンファミリー、ヒスチジン活性部位が挙げられる。

図６６（配列番号６６）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１５９９アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＣＦＡＤ＿ＰＩＧとの間の有意な相同性が明らかになった。ＰＲＯ１５９９アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列との間にも相同性が見られた。ＣＦＡＤ＿ＨＵＭＡＮ；Ｐ＿Ｒ０５４２１；Ｐ＿Ｒ５５７５７；Ｐ＿Ｒ０５７７２；ＧＲＡＭ＿ＨＵＭＡＮ；ＭＵＳＬＭＥＴ＿１；Ｐ＿Ｐ８０３３５；Ｐ＿Ｒ５５７５８；Ａ４２０４８＿１；およびＰ＿Ｗ０５３８３。

クローンＤＮＡ６２８４５−１６８４は、１９９８年１０月２０日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３６１が割り当てられている。

実施例３５：ヒトＰＲＯ１６０４ポリペプチド［ＵＮＱ７８５］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索した。Ｉｎｃｙｔｅ ＥＳＴ番号３５５０４４０を、ＨＤＧＦとの相同性を有すると同定した。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）およびＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベースを含む様々なＥＳＴデータベースとＥＳＴ番号３５５０４４０を比較することにより、相同なＥＳＴ配列を同定した。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「ＤＮＡ６７２３７」と命名する。

ＤＮＡ６７２３７配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース由来のＥＳＴ番号３３６７０６０との間の配列相同性に鑑みて、Ｉｎｃｙｔｅ ＥＳＴ番号３３６７０６０を含むクローンを購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定することにより、図６７（配列番号６７）に示すＰＲＯ１６０４のコード配列全体を得た。

クローンＤＮＡ７１２８６−１６８７は、ヌクレオチド６５−６７位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド２０７８−２０８０位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、６７１アミノ酸長である（図６８；配列番号６８）。図６８に示す完全長ＰＲＯ１６０４タンパク質は、推定分子量が約７４，３１７ダルトン、ｐＩが約７．６２である。さらなる特徴としては、アミノ酸約１−１３のシグナルペプチド；アミノ酸約１５６−１５９、１７１−１７４および４５１−４５４の潜在的ｃＡＭＰ−およびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位；アミノ酸約４６−５１、３６５−３７０および３６７−３７２の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位；ならびにアミノ酸約６６１−６６３の細胞結合配列が挙げられる。

図６８（配列番号６８）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１６０４アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列番号Ｐ＿Ｗ３７４８３との間の有意な相同性が明らかになった。ＰＲＯ１６０４アミノ酸配列と以下のさらなるＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＦ０６３０２０＿１、Ｐ＿Ｒ６６７２７、Ｐ＿Ｗ３７４８２、ＪＣ５６６１、ＣＥＣ２５Ａ１＿１１、ＣＥＵ３３０５８＿１、Ｉ３８０７３、ＭＳＴ２＿ＤＲＯＨＹおよびＨＳＡＴＲＸ３６＿１との間にも相同性が見られた。

クローンＤＮＡ７１２８６−１６８７は、１９９８年１０月２０日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３３５７が割り当てられている。

実施例３６：ヒトＰＲＯ１６０５ポリペプチド［ＵＮＱ７８６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
ネイティブヒトＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ７７６４８−１６８８）を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒト胎児ｃＤＮＡ腎臓ライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。

図６９に示す完全長ＤＮＡ７７６４８−１６８８クローン（配列番号６９）は、ヌクレオチド４２５−４２７位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド８４５−８４７位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図６９）。予測されるポリペプチド前駆体は、１４０アミノ酸長である（図７０；配列番号７０）。図７０に示す完全長ＰＲＯ１６０５タンパク質は、推定分子量が約１５，６６８ダルトン、ｐＩが約１０．１４である。図７０（配列番号７０）に示される完全長ＰＲＯ１６０５配列の解析から、アミノ酸約１〜アミノ酸約２６のシグナルペプチドの存在が証明された。クローンＤＮＡ７７６４８−１６８８は、１９９８年１０月２７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０８が割り当てられている。

図７０（配列番号７０）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１６０５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＧＮＴ５＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｒ４８９７５、Ｐ＿Ｗ２２５１９、ＭＭ２６ＳＰＲＯＴ＿１、ＨＳＵ８６７８２＿１、ＣＨ６０＿ＬＥＰＩＮ、ＨＭＣＴ＿ＨＥＬＰＹ、Ｆ６５１２６、ＨＩＵ０８８７５＿１およびＰ＿Ｒ４１７２４との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例３７：ヒトＰＲＯ１６９３ポリペプチド［ＵＮＱ８０３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したように他のＥＳＴ配列に関してｐｈｒａｐを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ３８２５１と命名する。そのＤＮＡ３８２５１コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１６９３についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー（３８２５１．ｆ１）５’−ＣＴＧＧＧＡＴＣＴＧＡＡＣＡＧＴＴＴＣＧＧＧＧＣ−３’（配列番号２０８）
逆方向ＰＣＲプライマー（３８２５１．ｒ１）５’−ＧＧＴＣＣＣＣＡＧＧＡＣＡＴＧＧＴＣＴＧＴＣＣＣ−３’（配列番号２０９）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ３８２５１配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ（３８２５１．ｐ１）
５’−ＧＣＴＧＡＧＴＴＴＡＣＡＴＴＴＡＣＧＧＴＣＴＡＡＣＴＣＣＣＴＧＡＧＡＡＣＣＡＴＣＣＣＴＧＴＧＣＧ−３’（配列番号２１０）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１６９３遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１６９３に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ７７３０１−１７０８と命名［図７１，配列番号７１］）およびＰＲＯ１６９３に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ７７３０１−１７０８のヌクレオチド配列全体を図７１（配列番号７１）に示す。クローンＤＮＡ７７３０１−１７０８は、ヌクレオチド５０８−５１０位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド２０４７−２０４９位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図７１）。予測されるポリペプチド前駆体は、５１３アミノ酸長である（図７２；配列番号７２）。図７２に示す完全長ＰＲＯ１６９３タンパク質は、推定分子量が約５８，２６６ダルトン、ｐＩが約９．８４である。図７２（配列番号７２）に示される完全長ＰＲＯ１６９３配列の解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約３３のシグナルペプチド、アミノ酸約４２０〜アミノ酸約４４２の膜貫通ドメイン、アミノ酸約１２６〜アミノ酸約１２９、アミノ酸約３５７〜アミノ酸約３６０、アミノ酸約４９６〜アミノ酸約４９９およびアミノ酸約５０４〜アミノ酸約５０７の潜在的Ｎ−グリコシル化部位、アミノ酸約４６５〜アミノ酸約４６８のｃＡＭＰ−およびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、アミノ酸約１３６〜アミノ酸約１４２のチロシンキナーゼリン酸化部位ならびにアミノ酸約１１〜アミノ酸約１６、アミノ酸約３３〜アミノ酸約３８、アミノ酸約２４５〜アミノ酸約２５０、アミノ酸約３３２〜アミノ酸約３３７、アミノ酸約４９７〜アミノ酸約５０２およびアミノ酸約５０７〜アミノ酸約５１２の潜在的Ｎ−ミリストイル化（ｍｙｒｉｓｔｏｌａｔｉｏｎ）部位の存在が証明された。クローンＤＮＡ７７３０１−１７０８は、１９９８年１０月２７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４０７が割り当てられている。

図７２（配列番号７２）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１６９３アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＢ００７８７６＿１、ＡＬＳ＿ＭＯＵＳＥ、ＨＳＣＨＯＮ０３＿１、Ｐ＿Ｒ８５８８９、ＡＦ０６２００６＿１、ＡＢ０１４４６２＿１、Ａ５８５３２、ＭＵＳＬＲＲＰＡ＿１、ＡＢ００７８６５＿１およびＡＦ０３０４３５＿１との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例３８：ヒトＰＲＯ１７５３ポリペプチド［ＵＮＱ８２６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された企業のシグナル配列検索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ６８８８３を同定するだけでなく、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業のデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントをクラスター化し、構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベースからＥＳＴクラスター配列が同定でき、Ｉｎｃｙｔｅクラスター番号５４４６３と命名する。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースとこのＥＳＴクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「ＤＮＡ５４２３３」と命名する。ＤＮＡ５４２３３配列とＥＳＴ番号２５９７４４４との間の配列相同性に鑑みて、そのＥＳＴクローン２５９７４４４を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。ＥＳＴクローン２５９７４４４は、卵巣腫瘍組織から単離されたＲＮＡ由来であった。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図７３に示し、本明細書中で「ＤＮＡ６８８８３−１６９１」と命名する。

図７３に示す完全長クローンは、ヌクレオチド１９７〜１９９位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１８３２〜１８３４位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図７３；配列番号７３）。予測されるポリペプチド前駆体（図７４，配列番号７４）は、５４５アミノ酸長である。ＰＲＯ１７５３は、算出分子量が約６００２２ダルトン、推定ｐＩが約５．５０である。ＰＲＯ１７５３のさらなる特徴としては：アミノ酸約１−１６のシグナルペプチド；アミノ酸約８９−９２、１１６−１１９、２５９−２６２、２９１−２９４および２９９−３０２の潜在的Ｎ−グリコシル化部位；アミノ酸約４１１−４１７および４４３−４５０の潜在的チロシンキナーゼリン酸化部位；アミノ酸約２２６−２３１、２３３−２３８、２４０−２４５、２５２−２５７、２９６−３０１、３００−３０５、５２２−５２７および５３１−５３６の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位；ならびにアミノ酸約１９７−２０８のアスパラギン酸およびアスパラギンヒドロキシル化部位が挙げられる。

図７４（配列番号７４）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１７５３アミノ酸配列とＤａｙｈｏｆｆ配列ＭＭＵ７２６７８＿１との間の有意な相同性が明らかになった。ＰＲＯ１７５３アミノ酸配列と以下のさらなるＤａｙｈｏｆｆ配列：ＧＰ２＿ＨＵＭＡＮ；ＵＲＯＭ＿ＨＵＭＡＮ；ＭＭＵ６９２６２＿１；Ｐ＿Ｗ５２８４０；ＥＧＦ＿ＨＵＭＡＮ；Ｐ＿Ｐ５０２９６；Ｐ＿Ｗ３１７０５；ＣＥＴ０５Ａ１＿８；およびＨＳＡＪ４７４＿１との間にも相同性が見られた。

ＤＮＡ６８８８３−１６９１と命名されるクローンＤＮＡ６８８８３（ＵＮＱ８２６）は、１９９８年１２月１５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３５３５が割り当てられている。

実施例３９：ヒトＰＲＯ１７５５ポリペプチド［ＵＮＱ８２８］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
上の実施例３に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベースからＥＳＴクラスター配列が同定でき、ＥＳＴクラスター番号１４１８７２と命名した。次いで、このＥＳＴクラスター配列を、上で列挙したデータベース由来の種々のＥＳＴと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中で「ＤＮＡ５５７３１」と命名する。

ＤＮＡ５５７３１配列とＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴ番号２５７３２３内に包含される配列との間の配列相同性に鑑みて、そのＥＳＴクローンを購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。Ｉｎｃｙｔｅクローン２５７３２３は、発生の初期段階で拘束されたニューロンの前駆体と特徴付けられた特性を示すヒト奇形癌由来であるｈＮＴ２細胞株（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅライブラリー番号ＳＴＲ９３７２３１０）から単離されたＲＮＡを使用して構築されたライブラリー由来であった。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図７５に示し、本明細書中で「ＤＮＡ７６３９６−１６９８」と命名する。あるいは、このＤＮＡ７６３９６−１６９８配列は、オリゴヌクレオチドプローブおよびプライマーを調製して、適切なライブラリー（例えば、ＳＴＲ９３７２３１０）から配列を単離することによって得ることができる。

図７５に示す完全長クローンは、ヌクレオチド５８〜６０位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド８８６〜８８８位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図７５；配列番号７５）。予測されるポリペプチド前駆体（図７６，配列番号７６）は、２７６アミノ酸長である。ＰＲＯ１７５５は、算出分子量が約２９，４２６ダルトン、推定ｐＩが約９．４０である。さらなる特徴としては：アミノ酸約１−３１のシグナルペプチド配列；アミノ酸約１７８−１９８の膜貫通ドメイン；アミノ酸約２１０−２１３のｃＡＭＰおよびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位；アミノ酸約１１７−１２２、１５４−１４９および２１４−２１９の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位；ならびにアミノ酸約１４９−１５１の細胞結合配列が挙げられる。

図７６（配列番号７６）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１７５５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＰＧ−ＢＲＡＮＡ、Ｐ＿Ｒ３７７４３、ＮＡＵ８８５８７＿１、ＹＨＬ１＿ＥＢＶ、Ｐ＿Ｗ３１８５５、ＣＥＴ１０Ｂ１０＿４、ＡＦ０３９４０４＿１、ＰＲＰ１＿ＨＵＭＡＮ、ＡＦ０３８５７５＿１およびＡＦ０５３０９１＿１との間のいくらかの相同性が明らかになった。

クローンＤＮＡ７６３９６−１６９８は、１９９８年１１月１７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４７１が割り当てられている。

実施例４０：ヒトＰＲＯ１７７７ポリペプチド［ＵＮＱ８３９］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

コンセンサスＤＮＡ配列を、ｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ４７４３５と命名する。

ＤＮＡ４７４３５コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１７７７についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー（４７４３４．ｆ１）５’−ＣＴＧＴＴＡＣＡＣＴＧＡＣＧＴＧＧＣＣＣＴＣＣＣ−３’（配列番号２１１）
逆方向ＰＣＲプライマー（４７４３４．ｒ１）５’−ＣＡＴＴＣＴＧＡＣＣＣＡＣＧＧＧＣＣＡＴＴＧＴＣ−３’（配列番号２１２）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４７４３５配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ（４７４３４．ｐ１）
５’−ＧＴＧＧＡＧＣＡＧＣＣＧＧＴＧＡＡＣＴＴＧＡＧＣＡＧＣＣＴＴＧＣＣＣＡＧＡＡＧＴＡＴＧＣ−３’（配列番号２１３）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト海馬組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１７７７に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ７１２３５−１７０６と命名［図７７，配列番号７７］）；（ＵＮＱ８３９）およびＰＲＯ１７７７に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＵＮＱ８３９（ＤＮＡ７１２３５−１７０６）のヌクレオチド配列全体を図７７（配列番号７７）に示す。クローンＵＮＱ８３９（ＤＮＡ７１２３５−１７０６）は、ヌクレオチド７９７−７９９位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド２３７２−２３７４位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図７７）。予測されるポリペプチド前駆体は、５２５アミノ酸長である（図７８；配列番号７８）。図７８に示す完全長ＰＲＯ１７７７タンパク質は、推定分子量が約５７，１３３ダルトン、ｐＩが約６．５５である。図７８（配列番号７８）に示される完全長ＰＲＯ１７７７配列の解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約１６のシグナルペプチド、アミノ酸約３５３〜アミノ酸約３７３の膜貫通ドメイン、アミノ酸約１１７〜アミノ酸約１２０、アミノ酸約２１５〜アミノ酸約２１８、アミノ酸約３５６〜アミノ酸約３５９およびアミノ酸約４９７〜アミノ酸約５００の潜在的Ｎ−グリコシル化部位、アミノ酸約１２〜アミノ酸約１７、アミノ酸約３３〜アミノ酸約３８、アミノ酸約５２〜アミノ酸約５７、アミノ酸約９７〜アミノ酸約１０２、アミノ酸約１０１〜アミノ酸約１０６、アミノ酸約１１３〜アミノ酸約１１８、アミノ酸約１５８〜アミノ酸約１６３、アミノ酸約３２８〜アミノ酸約３３３、アミノ酸約３８８〜アミノ酸約３９３、アミノ酸約４１８〜アミノ酸約４２３、アミノ酸約４３５〜アミノ酸約４４０およびアミノ酸約４３６〜アミノ酸約４４１の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位、アミノ酸約３８２〜アミノ酸約３８５のアミド化部位ならびにアミノ酸約１２９〜アミノ酸約１３８のスルファターゼサイン２配列の存在が証明された。クローンＵＮＱ８３９（ＤＮＡ７１２３５−１７０６）は、１９９９年１月１２日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３５８４が割り当てられている。図７８（配列番号７８）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１７７７アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｇ０２８５７、ＧＡ６Ｓ＿ＨＵＭＡＮ、ＨＧＳ＿Ａ１３９、ＧＥＮ１２６４７、ＳＴＳ＿ＨＵＭＡＮ、ＧＥＮ１２６４８、ＳＰＨＭ＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｗ４７２９８、ＧＥＮ１３８９２およびＡＦ０５０１４５＿１との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例４１：ヒトＰＲＯ１７８８ポリペプチド［ＵＮＱ８５０］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知タンパク質をコードしない、７０以上のＢＬＡＳＴスコアを有する目的の配列として、Ｉｎｃｙｔｅ ＥＳＴ番号２９６８３０４を同定した。Ｉｎｃｙｔｅクローン番号２９６８３０４のヌクレオチド配列を本明細書中で「ＤＮＡ６６１２」と命名する。

さらに、ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐ（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）の繰り返しサイクルを使用して、ＤＮＡ６６１２配列を伸長することにより、上記のＥＳＴ配列の起源を使用してその配列をできる限り伸長した。その伸長したコンセンサス配列を本明細書中で「ＤＮＡ４９６４８」と命名する。ＤＮＡ４９６４８コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１７８８についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー：ＣＣＣＴＧＣＣＡＧＣＣＧＡＧＡＧＣＴＴＣＡＣＣ（４９６４８．ｆ１；配列番号２１４）
逆方向ＰＣＲプライマー：ＧＧＴＴＧＧＴＧＣＣＣＧＡＡＡＧＧＴＣＣＡＧＣ（４９６４８．ｒ１；配列番号２１５）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４９６４８配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ：ＣＡＡＣＣＣＣＡＡＧＣＴＴＡＡＣＴＧＧＧＣＡＧＧＡＧＣＴＧＡＧＧＴＧＴＴＴＴＣＡＧＧＣＣ（４９６４８．ｐ１；配列番号２１６）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ１７８８遺伝子をコードするクローンを単離した。ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織から単離した。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１７８８に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ７７６５２−２５０５と命名［図７９，配列番号７９］）およびＰＲＯ１７８８に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ７７６５２−２５０５のコード配列全体を図７９（配列番号７９）に示す。クローンＤＮＡ７７６５２−２５０５は、ヌクレオチド６４−６６位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１１２３−１１２５位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、３５３アミノ酸長である（図８０；配列番号８０）。図８０に示す完全長ＰＲＯ１７８８タンパク質は、推定分子量が約３７，８４７ダルトン、ｐＩが約６．８０である。ＰＲＯ１７８８のさらなる特徴としては：アミノ酸約１−１６のシグナルペプチド；アミノ酸約２１５−２３２および２８７−３０４の膜貫通ドメイン；アミノ酸約７４−７７および１３７−１４０の潜在的Ｎ−グリコシル化部位；アミノ酸約４５−４８のグリコサミノグリカン結合部位；アミノ酸約３１８−３２５のチロシンキナーゼリン酸化部位；アミノ酸約１３−１８、３２−３７、８８−９３、２１４−２１９および２２３−２２８のＮ−ミリストイル化部位；ならびにアミノ酸約２８４−３０５のロイシンジッパーパターンが挙げられる。

図８０（配列番号８０）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１７８８アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＦ０３０４３５＿１；ＡＦ０６２００６＿１；ＤＭＴＡＲＴＡＮ＿１；ＧＡＲＰ＿ＨＵＭＡＮ；Ｓ４２７９９；Ｐ＿Ｒ７１２９４；ＨＳＵ８８８７９＿１；ＤＲＯＷＨＥＥＬＥＲ＿１；Ａ５８５３２；およびＡＦ０６８９２０＿１との間の有意な相同性が明らかになった。

クローンＤＮＡ７７６５２−２５０５は、１９９８年１１月１７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３４８０が割り当てられている。

実施例４２：ヒトＰＲＯ１８６４ポリペプチド［ＵＮＱ８５５］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）、企業のＥＳＴデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）およびＧｅｎｅｎｔｅｃｈの企業ＥＳＴを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

コンセンサスＤＮＡ配列を、ｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＣｏｎｃｅｎ１４２４と命名する。さらに、ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐの繰り返しサイクルを使用して、Ｃｏｎｓｅｎ１４２４コンセンサスＤＮＡ配列を伸長することにより、上記のＥＳＴ配列の起源を使用してそのコンセンサス配列をできる限り伸長した。その伸長したコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ４０６４９と命名する。

ＤＮＡ４０６４９コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１８６４についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー（４０６４９．ｆ１）５’−ＣＴＣＣＴＣＣＡＧＧＡＴＧＡＡＣＣＡＣＣＴＧＣＣ−３’（配列番号２１７）
順方向ＰＣＲプライマー（４０６４９．ｆ２）５’−ＣＡＧＧＡＴＧＣＴＴＣＡＧＡＧＡＧＧ−３’（配列番号２１８）
逆方向ＰＣＲプライマー（４０６４９．ｒ１）５’−ＣＣＴＧＣＣＴＴＣＧＧＡＴＴＣＣＡＧＧＡＧＧＧＧ−３’（配列番号２１９）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ４０６４９配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ（４０６４９．ｐ１）
５’−ＣＣＡＴＣＡＡＣＣＣＣＡＣＡＣＡＡＣＴＣＡＴＧＧＣＣＡＧＧＡＴＴＧＡＧＴＣＣＴＡＴＧ−３’（配列番号２２０）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肝臓組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１８６４に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ４５４０９−２５１１と命名［図８１，配列番号８１］）；（ＵＮＱ８５５）およびＰＲＯ１８６４に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＵＮＱ８５５（ＤＮＡ４５４０９−２５１１）のヌクレオチド配列全体を図８１（配列番号８１）に示す。クローンＵＮＱ８５５（ＤＮＡ４５４０９−２５１１）は、ヌクレオチド１００−１０２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド８０２−８０４位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図８１）。予測されるポリペプチド前駆体は、２３４アミノ酸長である（図８２；配列番号８２）。図８２に示す完全長ＰＲＯ１８６４タンパク質は、推定分子量が約２６，６５５ダルトン、ｐＩが約４．７９である。図８２（配列番号８２）に示される完全長ＰＲＯ１８６４配列の解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約２０のシグナルペプチドならびにアミノ酸約５４〜アミノ酸約７２、アミノ酸約１００〜アミノ酸約１１８、アミノ酸約１３０〜アミノ酸約１４４およびアミノ酸約１４６〜アミノ酸約１６６の膜貫通ドメインの存在が証明された。クローンＵＮＱ８５５（ＤＮＡ４５４０９−２５１１）は、１９９９年１月１２日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３５７９が割り当てられている。図８２（配列番号８２）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１８６４アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｐ＿Ｗ２５７６８、Ｉ３８０２７、Ｄ３８２５５＿１、ＭＭＥＳ６４＿１、ＯＣＵ９２８１２＿１、ＤＲＰＡＴＣＨ＿１、ＤＰＯＤ＿ＰＬＡＦＫ、ＲＴＭ１＿ＹＥＡＳＴ、Ｐ＿Ｒ７７８４４およびＰ＿Ｒ９０７６５との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例４３：ヒトＰＲＯ１９２５ポリペプチド［ＵＮＱ９０４］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムを発現配列タグ（ＥＳＴ）に適用することによってＤＮＡ８２３０２を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベースからＥＳＴクラスター配列が同定でき、クラスター番号３１１１３＿２と命名する。次いで、上で列挙したＥＳＴデータベースとこのＥＳＴクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中で「ＤＮＡ７３８８４」と命名する。ＤＮＡ７３８８４配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース由来のＥＳＴ番号３２７１６０８ＨＩとの間の配列相同性に鑑みて、ＥＳＴクローン番号３２７１６０８ＨＩを購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このクローンは、罹患ヒト脳組織を使用して構築したライブラリー由来であった。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図８３に示し、本明細書中でＤＮＡ８２３０２と命名する。

図８３に示す完全長クローンは、ヌクレオチド８９〜９１位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１４０９〜１４１１位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図８３；配列番号８３）。予測されるポリペプチド前駆体（図８４，配列番号８４）は、４４０アミノ酸長である。ＰＲＯ１９２５は、算出分子量が約４９，４０３ダルトン、推定ｐＩが約７．１６である。さらなる特徴としては、アミノ酸約３９−５６のＩＩ型膜貫通ドメイン；アミノ酸約１４９−１５５および２７４−２８１のチロシンキナーゼリン酸化部位；アミノ酸約１０−１５、２０−２５、６３−６８および２０８−２１３のＮ−ミリストイル化部位；アミノ酸約１０−１３のアミド化部位；ならびにアミノ酸約２３０−２３６の糖タンパク質ホルモンβ鎖サイン１が挙げられる。

図８４（配列番号８４）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１９２５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｐ＿Ｒ９５９１３、ＡＦ０１０１４４＿１、ＨＳＡＦ０００９９６＿１、ＨＵＭＴＲＲＰ＿１、Ｐ＿Ｗ００８３８、Ｉ５４３７４、ＰＶＰＶＡ１＿１、ＲＥＬ＿ＨＵＭＡＮ、ＨＳＵ９４３６２＿１およびＰ＿Ｗ１９９４３との間のいくらかの相同性が明らかになった。

ＤＮＡ８２３０２−２５２９と命名されるクローンＤＮＡ８２３０２（ＵＮＱ９０４）は、１９９８年１２月１５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３５３４が割り当てられている。

実施例４４：ヒトＰＲＯ１９２６ポリペプチド［ＵＮＱ９０５］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ８２３４０を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

次いで、上で述べたデータベース由来の種々のＥＳＴと同定されたＥＳＴ配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ７３８８７と命名する。ＤＮＡ７３８８７配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）由来のＥＳＴ番号３５７７１０５との間の配列相同性に鑑みて、ヒト気管支組織から構築されたｃＤＮＡライブラリー由来であったそのＥＳＴクローンを購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図８５に示し、本明細書中でＤＮＡ８２３４０−２５３０と命名する。

図８５に示す完全長クローンは、ヌクレオチド７４〜７６位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド８００〜８０２位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図８５；配列番号８５）。予測されるポリペプチド前駆体（図８６，配列番号８６）は、２４２アミノ酸長である。ＰＲＯ１９２６は、算出分子量が約２６，４７１ダルトン、推定ｐＩが約９．５０である。さらなる特徴としては：アミノ酸約１−２３のシグナルペプチド；アミノ酸約１３６−１８０の膜貫通ドメイン；アミノ酸約１８４−１８７の潜在的Ｎ−グリコシル化部位；アミノ酸約３７−４０および２３６−２３９のグリコサミノグリカン結合部位；アミノ酸約１５１−１５４のｃＡＭＰ−およびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位；アミノ酸約３３−３８、３６−４１、３８−４３および２２９−２３４の潜在的Ｎ−ミリストイル化部位；アミノ酸約２３８−２４１のアミド化部位；ならびにアミノ酸約２２９−２３６のＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位モチーフＡ（Ｐ−ループ）が挙げられる。

図８６（配列番号８６）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１９２６配列のうちのカルボキシ末端の最後の８１アミノ酸とＤａｙｈｏｆｆ配列Ｐ＿Ｗ５７８９３との間の１００パーセントの配列同一性が明らかになった。ＰＲＯ１９２６アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｓ７２５７８、ＡＲ２０＿ＣＡＥＥＬ、ＨＧＳ＿Ａ１９８、ＨＧＳ＿Ａ２７３、ＡＦ００７５７０＿１、ＧＥＮ１２４０１、ＤＭＳＴＫＩＮ＿１、ＦＡＴ＿ＤＲＯＭＥ、ＭＮＢ＿ＤＲＯＭＥとの間にもいくらかの相同性が見られた。

ＤＮＡ８２３４０−２５３０と命名されるクローンＤＮＡ８２３４０（ＵＮＱ９０５）は、１９９８年１２月２２日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３５４７が割り当てられている。

実施例４５：ヒトＰＲＯ３５６６ポリペプチド［ＵＮＱ１８４０］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ５９８４４−２５４２を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＩｎｃｙｔｅデータベースからＥＳＴクラスター配列が同定できた。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（Ｌｉｆｅｓｅｑ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースとこのＥＳＴクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ５６０１６と命名する。ＤＮＡ５６０１６配列とＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン番号２６０３３９２との間の配列相同性に鑑みて、Ｉｎｃｙｔｅ ＥＳＴクローン番号２６０３３９２を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図８７に示し、本明細書中でＤＮＡ５９８４４−２５４２と命名する。

クローンＵＮＱ１８４０（ＤＮＡ５９８４４−２５４２）は、ヌクレオチド５−７位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド９８０−９８２位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図８７；配列番号８７）。予測されるポリペプチド前駆体は、３２５アミノ酸長である（図８８；配列番号８８）。図８８に示す完全長ＰＲＯ３５６６タンパク質は、推定分子量が約３４，２５６ダルトン、ｐＩが約７．１４である。図８８（配列番号８８）に示される完全長ＰＲＯ３５６６配列の解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約２６のシグナルペプチドならびに図８８に示す様々な他の領域の存在が証明された。クローンＵＮＱ１８４０（ＤＮＡ５９８４４−２５４２）は、１９９９年２月９日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号２０３６５０が割り当てられている。

図８８（配列番号８８）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ３５６６アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＨＥＬＷＡＭＩＤＥ＿１、ＣＡ２１＿ＭＯＵＳＥ、ＳＰ６２＿ＨＵＭＡＮ、ＡＦ０９５４６４＿１、ＨＭＵ９２８１３＿１、ＰＲＩＯ＿ＢＯＶＩＮ、ＳＮ２４＿ＨＵＭＡＮ、ＴＰＭ４＿ＤＲＯＭＥ、ＳＹＮ１＿ＲＡＴおよびＣＥＬＴ２８Ｆ２＿７との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例４６：ヒトＰＲＯ４３３０ポリペプチド［ＵＮＱ１８８６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、トロンボスポンジンとの相同性を示したＥＳＴである４２８７５２９Ｈ１（配列番号３、本明細書中でＤＮＡ８５５３８とも呼ばれるかまたはＤＮＡ由来）を同定した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト大動脈内皮細胞から単離した。ヒトＰＲＯ４３３０をコードするｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩおよびＮｏｔＩにおいてクローニングした。

ヒトｃＤＮＡライブラリー（上記のように調製）を合成オリゴヌクレオチドプローブ：
５’ＧＧＡＧＡＣＡＴＧＴＴＴＣＧＡＡＴＧＧＡＣＡＡＣＴＧＴＣ３’（順方向，配列番号２２１）；５’ＣＴＧＧＡＴＣＴＴＣＡＣＡＣＡＣＴＧＧＧＣＡＧＣ３’（逆方向，配列番号２２２）；および５’ＣＣＣＡＧＴＧＴＧＧＴＧＡＧＡＴＡＡＡＣＴＧＣＧＡＧＡＧＧＴＡＣＴＡＣＧＴＧＣＣＣＧＡＡＧＧ３’（プラスミド，配列番号２２３）
を用いてハイブリダイゼーションによりスクリーニングした。

ｃＤＮＡクローンを全体に亘って配列決定した。コードＰＲＯ４３３０を含むヌクレオチド配列を図８９（配列番号８９）に示す。クローンＤＮＡ９０８４２−２５７４は、ヌクレオチド３６８−３７０位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド３４７６−３４７８位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図８９；配列番号８９）。予測されるポリペプチド前駆体は、１０３６アミノ酸長である（図９０；配列番号９０）。

図９０に示す完全長ＰＲＯ４３３０タンパク質は、推定分子量が約１１３７３８ダルトン、ｐＩが約５．１４である。

図９０（配列番号９０）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ４３３０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列（本明細書中に援用される）：Ｄ８３０１７＿１、Ｐ＿Ｗ３７５００、ＮＥＬ＿ＲＡＴ、Ｐ＿Ｗ３７５０１、ＮＥＬ２＿ＨＵＭＡＮ、ＡＦ０３４６０６＿１、Ｐ＿Ｗ４０２８８、ＣＨＲＤ＿ＸＥＮＬＡ、ＴＳＰ１＿ＣＨＩＣＫおよびＳＯＧ＿ＤＲＯＭＥとの間の相同性が明らかになった。

実施例４７：ヒトＰＲＯ４４２３ポリペプチド［ＵＮＱ１９４０］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ９６８９３−２６２１を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Ｉｎｃｙｔｅデータベース、企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴ配列が同定できた。ＤＮＡ８０５９４に基づいて、ＤＮＡ９６８９３−２６２１を同定し、配列決定した。

図９１に示す完全長クローンは、ヌクレオチド１１０−１１２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド６３９−６４１位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図９１；配列番号９１）。予測されるポリペプチド前駆体（図９２，配列番号９２）は、１７３アミノ酸長である。ＰＲＯ４４２３は、算出分子量が約１９７３３ダルトン、推定ｐＩが約８．７８である。

図９２（配列番号９２）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ４４２３アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｓ０９６４６およびＹＨＹ４＿ＹＥＡＳＴとの間の相同性が明らかになった。ＤＮＡ９６８９３−２６２１と命名されるクローンＤＮＡ９６８９３−２６２１（ＵＮＱ１９４０）は、１９９９年５月４日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１２が割り当てられている。

実施例４８：ヒトＰＲＯ４９７７ポリペプチド［ＵＮＱ２４２０］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
コンセンサスＤＮＡ配列を、上の実施例１に記載したようにｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、およびＰＲＯ４９７７についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。

ＰＣＲプライマー対（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−ＡＴＧＣＣＡＡＴＡＡＣＴＴＴＧＣＣＴＣＧＧＡＧＣ−３’（配列番号２２４）
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＣＣＡＧＡＡＧＧＣＣＡＧＧＧＣＴＴＴＣＴＣＴＧ−３’（配列番号２２５）
ハイブリダイゼーションプローブもまた合成した：
５’−ＧＡＧＴＧＣＡＴＧＡＧＣＡＧＣＴＧＣＣＡＧＧＧＡＴＣＴＣＴＣＣＡＴＧＧＧＣＣＣＣ−３’（配列番号２２６）
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、上で同定されたＰＣＲプライマーを用いたＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびＰＣＲプライマーの一方を使用して、ＰＲＯ４９７７遺伝子をコードするクローンを単離した。

ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓ライブラリーから単離した。上記のように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲ４９７７についての完全長ＤＮＡ配列およびそれに誘導されるタンパク質配列が得られた。

ＤＮＡ６２８４９−２６４７のヌクレオチド配列全体を図９５（配列番号９５）に示す。クローンＤＮＡ６２８４９−２６４７は、ヌクレオチド３３０−３３２位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１７６１−１７６３位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、４７７アミノ酸長である（図９６；配列番号９６）。クローンＤＮＡ６２８４９−２６４７は、１９９９年６月８日にＡＴＴＣに寄託され（ＤＮＡ６２８４９−２６４７と命名）、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２０５が割り当てられている。完全長ＰＲＯ４９７７タンパク質は、推定分子量が約５１１１２ダルトン、ｐＩが約６．６６である。図９６（配列番号９６）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＴＯ４９７７アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＤＪ５３４Ｋ４＿３、ＡＦ４１０５３＿１、ＣＥＬＺＫ３７７７＿２．ＡＦ０６０５７０＿１、ＡＦ０２６４６５＿１；Ｉ５０６００、ＨＳＵ６１２６２＿１、ＤＭＵ８８５７８＿１、Ｐ＿Ｗ０８７４７およびＤＭＮＲＧ２＿２との間の相同性が明らかになった。

実施例４９：ヒトＰＲＯ４９８０ポリペプチド［ＵＮＱ２４２２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
本明細書中でＤＮＡ８１５７３と呼ぶ最初のＤＮＡ配列を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒトｃＤＮＡライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。次いで、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）由来のＥＳＴとこのｃＤＮＡを比較した。このＥＳＴをクラスター化し、プログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ９０６１３と命名する。

ヒト大動脈内皮細胞ｃＤＮＡライブラリーからＰＲＯ４９８０についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために、ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）をＤＮＡ９０６１３配列に基づいて合成した：
順方向ＰＣＲプライマー：
５’−ＣＡＡＣＣＧＴＡＴＧＧＧＡＣＣＧＡＴＡＣＴＣＧ−３’（配列番号２２７）
逆方向ＰＣＲプライマー：
５’−ＣＡＣＧＣＴＣＡＡＣＧＡＧＴＣＴＴＣＡＴＧ−３’（配列番号２２８）
ハイブリダイゼーションプローブ：
５’−ＧＴＧＧＣＣＣＴＣＧＣＡＧＴＧＣＡＧＧＣＣＴＴＣＴＡＣＧＴＣＣＡＡＴＡＣＡＡＧＴＧ−３’（配列番号２２９）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト大動脈内皮細胞組織から単離した。そのｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、Ｎｏｔ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、Ｓａｌ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、Ｎｏｔで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、Ｓｆｉ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏ部位およびＮｏｔ部位においてクローニングした。

このスクリーニングから得られた完全長ＤＮＡ９７００３−２６４９クローンを図９９［配列番号９９］に示し、このクローンは、ヌクレオチド２８６−２８８位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１９００−１９０２位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、５３８アミノ酸長である（図１００；配列番号１００）。図１００に示す完全長ＰＲＯ４９８０タンパク質は、推定分子量が約５９，２６８ダルトン、ｐＩが約８．９４である。図１００（配列番号１００）に示す完全長ＰＲＯ４９８０配列の解析により、種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。図１００に示す完全長ＰＲＯ４９８０ポリペプチドの解析により、以下：アミノ酸約１〜アミノ酸約３６のシグナルペプチド；アミノ酸約７７〜アミノ酸約９５、アミノ酸約１１１〜アミノ酸約１３３、アミノ酸約１６１〜アミノ酸約１８４、アミノ酸約２２５〜アミノ酸約２４８、アミノ酸約２５５〜アミノ酸約２７３、アミノ酸約２９９〜アミノ酸約３１４、アミノ酸約３４８〜アミノ酸約３７３、アミノ酸約４０６〜アミノ酸約４２１、アミノ酸約４３５〜アミノ酸約４５６およびアミノ酸約４８０〜アミノ酸約４９７の膜貫通ドメイン；アミノ酸約５００〜アミノ酸約５０４のＮ−グリコシル化部位；アミノ酸約３２１〜アミノ酸約３２５のｃＡＭＰ−およびｃＧＭＰ−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位；アミノ酸約１３〜アミノ酸約１９、アミノ酸約１８〜アミノ酸約２４、アミノ酸約８０〜アミノ酸約８６、アミノ酸約１１１〜アミノ酸約１１７、アミノ酸約１１８〜アミノ酸約１２４、アミノ酸約１４５〜アミノ酸約１５１、アミノ酸約２３８〜アミノ酸約２４４、アミノ酸約２５１〜アミノ酸約２５７、アミノ酸約４３０〜アミノ酸約４３６、アミノ酸約４３３〜アミノ酸約４３９、アミノ酸約４４８〜アミノ酸約４５４、アミノ酸約４５８〜アミノ酸約４６４、アミノ酸約４６８〜アミノ酸約４７４、アミノ酸約４７５〜アミノ酸約４８１、アミノ酸約４９６〜アミノ酸約５０２およびアミノ酸約５０８〜アミノ酸約５１４のＮ−ミリストイル化部位；ならびにアミノ酸約３０２〜アミノ酸約３１３の原核生物の膜リポタンパク質脂質結合部位の存在が証明された。クローンＤＮＡ９７００３−２６４９は、１９９９年５月１１日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−４３が割り当てられている。

図１００（配列番号１００）に示す完全長配列のＷＵ−ＢＬＡＳＴ２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ４９８０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＳＣ５９＿ＹＥＡＳＴ、Ｓ７６８５７、ＣＥＬＦ３１Ｆ４＿１２、ＡＣ００２４６４＿１、ＮＵ５Ｍ＿ＣＨＯＣＲ、Ｓ５９１０９、ＳＡＹ１０１０８＿２、ＡＦ０５５４８２＿２、Ｆ６９０４９およびＧ７０４３３との間の有意な相同性が明らかになった。

実施例５０：ヒトＰＲＯ４９８１ポリペプチド［ＵＮＱ２４２３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
ネイティブヒトＰＲＯ４９８１ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ９４８４９−２９６０）を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒト精巣ｃＤＮＡライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。

クローンＤＮＡ９４８４９−２９６０は、ヌクレオチド１４５−１４７位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１６９０−１６９２位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１０１；配列番号１０１）。予測されるポリペプチド前駆体は、５１５アミノ酸長である（図１０２；配列番号１０２）。図１０２に示す完全長ＰＲＯ４９８１タンパク質は、推定分子量が約５９３５７ダルトン、ｐＩが約９．４０である。図１０２に示す完全長ＰＲＯ４９８１配列（配列番号１０２）の解析により、図１０２に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ９４８４９−２９６０は、２０００年７月２５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２３０６が割り当てられている。

図１０２（配列番号１０２）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ４９８１アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＴＭＡ２７２０７３＿１、ＡＫ００１３２４＿１、ＡＥ００３８０６＿１２、ＡＥ００３７４５＿１８、ＭＳ２＿ＡＲＡＴＨ、ＡＦ１４９９１７＿１、ＡＴＭＳ２ＬＩＰＲ＿１、ＨＥＴＭ＿ＡＮＡＳＰ、Ｔ１８５５２、ＬＹＳ２＿ＹＥＡＳＴとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例５１：ヒトＰＲＯ５８０１ポリペプチド［ＵＮＱ２５０１］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、（１）公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および（２）企業のＥＳＴデータベース（例えば、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

コンセンサスＤＮＡ配列を、上記のようにｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ１０５８５０と命名する。いくつかの場合において、このコンセンサス配列は、ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスＤＮＡ配列から得られ、これにより、上記のＥＳＴ配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。

ＤＮＡ１０５８５０コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ５８０１についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー１ ５’−ＡＣＴＣＣＡＴＡＴＴＴＴＣＣＴＡＣＴＴＧＴＧＧＣＡ−３’（配列番号２３０）
順方向ＰＣＲプライマー２ ５’−ＣＣＣＡＡＡＧＴＧＡＣＣＴＡＡＧＡＡＣ−３’（配列番号２３１）
逆方向ＰＣＲプライマー５’−ＴＣＡＣＴＧＡＡＴＴＴＣＴＴＣＡＡＡＡＣＣＡＴＴＧＣＡ−３’（配列番号２３２）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ１０５８５０配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＴＧＴＧＧＣＡＧＣＧＡＣＴＧＣＡＴＣＣＧＡＣＡＴＡＡＡＧＧＡＡＣＡＧＴＴＧＴＧＣＴＣＴＧＣＣＣＡＣＡ−３’（配列番号２３３）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児肝臓組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、完全長ＰＲＯ５８０１ポリペプチドに対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ１１５２９１−２６８１と命名［図１０３，配列番号１０３］）およびそのＰＲＯ５８０１に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

上で同定した完全長クローンは、ヌクレオチド７−９位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１５１３−１５１５位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図１０３，配列番号１０３）。予測されるポリペプチド前駆体は、５０２アミノ酸長であり、その算出分子量は、約５５，８８４ダルトン、推定ｐＩは、約８．５２である。図１０４（配列番号１０４）に示す完全長ＰＲＯ５８０１配列の解析により、図１０４に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１１５２９１−２６８１は、１９９９年６月８日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２０２が割り当てられている。

Ｄａｙｈｏｆｆデータベースの解析により、ＰＲＯ５８０１が、ＩＬ−１７レセプタータンパク質に対する配列類似性を有することが示され、ＰＲＯ５８０１はまた、本明細書中でＩＬ−１７ＲＨ１と称される。特に、図１０４（配列番号１０４）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ５８０１アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＨＳＵ５８９１７＿１、Ｐ＿Ｗ９２４０９、Ｐ＿Ｗ６１２７２、Ｐ＿Ｗ０４１８５、Ｐ＿Ｗ６１２７１、Ｐ＿Ｗ０４１８４、Ｐ＿Ｗ９２４０８、ＧＥＮ１３９７９、ＭＭＵ３１９９３＿１およびＹＳＯ２＿ＣＡＥＥＬとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例５２：ヒトＰＲＯ５９９５ポリペプチド［ＵＮＱ２５０７］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、（１）公的ＥＳＴデータベース（例えば、Ｍｅｒｃｋ／Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ）および（２）企業のＥＳＴデータベース（例えば、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

コンセンサスＤＮＡ配列を、上記のようにｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ９２９３４と命名する。いくつかの場合において、このＤＮＡ９２９３４コンセンサス配列は、ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスＤＮＡ配列から得られ、これにより、上記のＥＳＴ配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。

ＤＮＡ９２９３４コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ５９９５についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−ＧＧＡＴＣＴＣＴＴＧＴＴＣＡＡＧＣＡＴＣＣＴＡＣＣＡＡＣ−３’（配列番号２３４）
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＴＧＴＣＡＴＣＡＣＴＧＣＡＡＧＴＴＡＡＧＧＣＴＴＣＣＣ−３’（配列番号２３５）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ９２９３４配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’ＣＧＴＡＧＡＧＡＡＧＴＴＡＴＡＡＴＧＣＴＧＧＣＣＴＧＣＡＧＴＴＴＴＧＧＣＡＡＣＡＡＧＣＡＣＴＧ３’（配列番号２３６）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト胎児腎臓組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、完全長ＰＲＯ５９９５ポリペプチドに対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ９６９８８−２６８５と命名［図１０５，配列番号１０５］）およびＰＲＯ５９９５ポリペプチドに対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

上で同定した完全長クローンは、ヌクレオチド２４−２６位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド３０９６−３０９８位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図１０５，配列番号１０５）。予測されるポリペプチド前駆体は、１０２４アミノ酸長であり、その算出分子量は、約１１７０４９ダルトン、推定ｐＩは、約６．９０である。図１０６（配列番号１０６）に示す完全長ＰＲＯ５９９５配列の解析により、図１０６に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ９６９８８−２６８５は、１９９９年７月２０日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−３８４が割り当てられている。

図１０６（配列番号１０６）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ５９９５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｉ５９３３１；ＡＭＰＮ＿ＲＡＴ；ＡＭＰＮ＿ＨＵＭＡＮ；ＡＭＰＥ＿ＨＵＭＡＮ；Ｐ＿Ｒ９４５１２；ＨＵＭＰＬＡＡ＿１；Ａ６５８８８＿１；ＡＡＰ１＿ＹＥＡＳＴ；Ｐ＿Ｗ３３６６１；ＡＦ０４９２３４＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例５３：ヒトＰＲＯ６０９５ポリペプチド［ＵＮＱ２５４３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
ネイティブヒトＰＲＯ６０９５ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ１０５６８０−２７１０）を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒト骨髄ｃＤＮＡライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。

クローンＤＮＡ１０５６８０−２７１０は、ヌクレオチド３７２−３７４位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド４５８−４６０位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１０９；配列番号１０９）。予測されるポリペプチド前駆体は、４５７アミノ酸長である（図１１０；配列番号１１０）。図１１０に示す完全長ＰＲＯ６０９５タンパク質は、推定分子量が約５２，０１５ダルトン、ｐＩが約９．２２である。図１１０（配列番号１１０）に示す完全長ＰＲＯ６０９５配列の解析により、図１１０に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１０５６８０−２７１０は、１９９９年８月３日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−４８３が割り当てられている。

図１１０（配列番号１１０）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ６０９５アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＣＥＬＺＣ３２８＿５、Ｆ１５Ｋ９＿２、Ｓ５９７９２、Ｓ７８５７０、Ｓ５３０２１、Ｆ１００３＿１０、Ａ５７５１４、ＧＡＲ２＿ＳＣＨＰＯ、Ａ７０３８７およびＣＥＬＷ０９Ｃ３＿４との間の配列同一性が明らかになった。

実施例５４：ヒトＰＲＯ６１８２ポリペプチド［ＵＮＱ２５５３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
ネイティブヒトＰＲＯ６１８２ポリペプチドをコードするｃＤＮＡクローン（ＤＮＡ１１０７００−２７１６）を、１次ｃＤＮＡクローンの５’末端を優先的に示すヒト乳癌ｃＤＮＡライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。

クローンＤＮＡ１１０７００−２７１６は、ヌクレオチド１８−２０位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１２３６−１２３８位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１１１；配列番号１１１）。予測されるポリペプチド前駆体は、４０６アミノ酸長である（図１１２）。図１１２に示す完全長ＰＲＯ６１８２タンパク質は、推定分子量が約４３，８７８ダルトン、ｐＩが約６．５０である。図１１２（配列番号１１２）に示す完全長ＰＲＯ６１８２配列の解析により、図１１２に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１１０７００−２７１６は、１９９９年８月１０日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−５１２が割り当てられている。

図１１２（配列番号１１２）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ６１８２アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＢ０１１１６１＿１；ＡＣ００５５４２＿２；ＥＭＵ４１６０２＿１；ＨＵＭＩＧＣＨ０６＿１；ＰＴＮ８＿ＭＯＵＳＥ；ＨＵＭＩＧＣＨ０８＿１；ＡＦ０１２８４８＿１；Ｓ１７５９７；Ｐ＿Ｐ４０２５４；ＤＴＣ＿ＨＵＭＡＮとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例５５：ヒトＰＲＯ７１７０ポリペプチド［ＵＮＱ２７８２］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ１０８７２２−２７４３を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ ＡｌｔｏからＥＳＴクラスター配列が同定でき、本明細書中でＣＬＵ５７８３６と命名する。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースとこのＥＳＴクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ５８７５６と命名する。

ＤＮＡ５８７５６配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ由来のクローン番号２２５１４６２内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号２２５１４６２を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図１１３に示し、本明細書中でＤＮＡ１０８７２２−２７４３と命名する。

クローンＤＮＡ１０８７２２−２７４３は、ヌクレオチド６０−６２位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１５０６−１５０８位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１１３；配列番号１１３）。予測されるポリペプチド前駆体は、４８２アミノ酸長である（図１１４；配列番号１１４）。図１１４に示す完全長ＰＲＯ７１７０タンパク質は、推定分子量が約４９，０６０ダルトン、ｐＩが約４．７４である。図１１４（配列番号１１４）に示す完全長ＰＲＯ７１７０配列の解析により、図１１４に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１０８７２２−２７４３は、１９９９年８月１７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−５５２が割り当てられている。

図１１４（配列番号１１４）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ７１７０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｐ＿Ｙ１２２９１、Ｉ４７１４１、Ｄ８８７３３＿１、ＤＭＣ５６Ｇ７＿１、Ｐ＿Ｙ１１６０６、ＨＷＰ１＿ＣＡＮＡＬ、ＨＳＭＵＣ５ＢＥＸ＿１、ＨＳＵ７８５５０＿１、ＨＳＵ７０１３６＿１およびＳＧＳ３＿ＤＲＯＭＥとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例５６：ヒトＰＲＯ７１７１ポリペプチド［ＵＮＱ２７８３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ１０８６７０−２７４４を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡからＥＳＴ配列が同定でき、本明細書中で２１２３６９と命名する。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースとこのＥＳＴ配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ７９０８９と命名する。

ＤＮＡ７９０８９配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ由来のクローン番号２１２３６９内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号２１２３６９を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図１１５に示し、本明細書中でＤＮＡ１０８６７０−２７４４と命名する。

クローンＤＮＡ１０８６７０−２７４４は、ヌクレオチド９３−９５位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド４９５−４９７位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１１５；配列番号１１５）。予測されるポリペプチド前駆体は、１３４アミノ酸長である（図１１６；配列番号１１６）。図１１６に示す完全長ＰＲＯ７１７１タンパク質は、推定分子量が約１４，１２０ダルトン、ｐＩが約４．７７である。図１１６（配列番号１１６）に示す完全長ＰＲＯ７１７１配列の解析により、図１１６に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１０８６７０−２７４４は、１９９９年８月１７日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−５４６が割り当てられている。

図１１６（配列番号１１６）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ７１７１アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＣ００７５０４＿２８、ＡＦ１０３９００＿１、ＯＰＵＤ＿ＢＡＣＳＵ、Ｇ６９６７０、Ｔ０２３６１およびＴＳ１１＿ＧＩＡＬＡとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例５７：ヒトＰＲＯ７４３６ポリペプチド［ＵＮＱ２９７３］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ１１９５３５−２７５６を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡからＥＳＴ配列が同定でき、本明細書中で５３２５６３６と命名する。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースとこのＥＳＴ配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ１０５４２８と命名する。

ＤＮＡ１０５４２８配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）データベース，Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ由来のクローン番号５３２５６３６内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号５３２５６３６を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図１１７に示し、本明細書中でＤＮＡ１１９５３５−２７５６と命名する。

クローンＤＮＡ１１９５３５−２７５６は、ヌクレオチド２１１−２１３位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１１１１−１１１３位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１１７；配列番号１１７）。予測されるポリペプチド前駆体は、３００アミノ酸長である（図１１８；配列番号１１８）。図１１８に示す完全長ＰＲＯ７４３６タンパク質は、推定分子量が約３２，６３８ダルトン、ｐＩが約６．０２である。図１１８（配列番号１１８）に示す完全長ＰＲＯ７４３６配列の解析により、図１１８に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１１９５３５−２７５６は、１９９９年８月３１日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−６１３が割り当てられている。

図１１８（配列番号１１８）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ７４３６アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＣ００５９５５＿１、ＣＧＭ１＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｒ２２０４１、ＣＣＥＭ＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｒ０６４３４、Ｐ＿Ｐ９３９９６、ＣＥ１０＿ＭＯＵＳＥ、ＨＯＭ６ＰＳＧ２＿１、ＰＳＧ６＿ＨＵＭＡＮおよびＥＣＴＯ＿ＲＡＴとの間の配列同一性が明らかになった。

実施例５８：ヒトＰＲＯ９９１２ポリペプチド［ＵＮＱ３０７７］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベースＬＩＦＥＳＥＱ（Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、オートタキシンとの相同性を示したＥＳＴを同定した。

次いで、ＥＳＴクローン番号２９２１８４５をＬＩＦＥＳＥＱ（Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）から購入し、そのクローンのｃＤＮＡ挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。本明細書中でＤＮＡ１０８７００−２８０２と命名されるクローンのヌクレオチド配列全体を図１１９（配列番号１１９）に示す。ＤＮＡ１０８７００−２８０２クローンは、ヌクレオチド４−６位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１３７８−１３８０位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１１９，配列番号１１９）。予測されるポリペプチド前駆体は、４５８アミノ酸長であり、算出分子量が、約５１５０６ダルトン、推定ｐＩが約６．７９である。図１２０（配列番号１２０）に示す完全長ＰＲＯ９９１２配列の解析により、図１２０に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１０８７００−２８０２は、１９９９年１２月２２日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１０９３が割り当てられている。

図１２０（配列番号１２０）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ９９１２アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＨＳ８Ｂ１＿１、Ｐ＿Ｗ７５８５９、ＡＢ０２０６８６＿１、Ｐ＿Ｙ１７５２９、Ｐ＿Ｙ３４３２４、Ｔ０９９３３、ＰＤＮＰ３＿１、ＰＣ１＿ＨＵＭＡＮ、ＨＵＭＡＴＸＴ＿１およびＰ＿Ｒ８６５９５との間の配列同一性が明らかになった。

実施例５９：ヒトＰＲＯ９９１７ポリペプチド［ＵＮＱ３０７９］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベースＬＩＦＥＳＥＱ（Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ヒト前立腺幹細胞抗原との相同性を示したＥＳＴを同定した。

次いで、ＥＳＴクローン番号２４９８３４９をＩｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡから購入し、そのクローンのｃＤＮＡ挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。

本明細書中でＤＮＡ１１９４７４−２８０３と称されるクローンのヌクレオチド配列全体を図１２１（配列番号１２１）に示す。ＤＮＡ１１９４７４−２８０３クローンは、ヌクレオチド１２１−１２３位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド５４４−５４６位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１２１，配列番号１２１）。予測されるポリペプチド前駆体は、１４１アミノ酸長であり、その算出分子量は、約１５２４０ダルトン、推定ｐＩは約８．４７である。図１２２（配列番号１２２）に示す完全長ＰＲＯ９９１７配列の解析により、図１２２に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。染色体マッピングにより、ＰＲＯ９９１７をコードする核酸は、ヒトの２ｑ２１−ｑ２２にマッピングされることが証明される。クローンＤＮＡ１１９４７４−２８０３は、１９９９年１２月２２日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１０９７が割り当てられている。

図１２２（配列番号１２２）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ９９１７アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＰＳＣＡ＿１、Ｐ＿Ｗ８０９５６、ＡＦ０４３４９８＿１、Ｐ＿Ｗ７０５２２、Ｐ＿Ｗ８６０２４、Ｐ＿Ｗ６２０６６、Ｐ＿Ｙ１３９３８、Ｐ＿Ｙ１３３４７、Ｄ４５８３５およびＨＳＵ０８８３９＿１との間の配列同一性が明らかになった。興味深いことに、そのＰＲＯ９９１７ポリペプチドは、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）ファミリーのほぼすべてのメンバーが有するＧＰＩテイルを欠いている。

実施例６０：ヒトＰＲＯ１９６４６ポリペプチド［ＵＮＱ５８２７］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、（１）公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）、（２）企業のＥＳＴデータベース（例えば、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）および（３）Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈの企業のＥＳＴデータベースを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

コンセンサスＤＮＡ配列を、上記のようにｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ１４４２６７と命名する。いくつかの場合において、このコンセンサス配列は、ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスＤＮＡ配列から得られ、これにより、上記のＥＳＴ配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。

ＤＮＡ１４４２６７コンセンサス配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１９６４６についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−−３’（配列番号２３７）ＧＴＣＧＣＣＣＣＡＴＴＴＣＣＴＧＣＡＡＣＡＧ
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−−３’（配列番号２３８）ＧＧＧＣＣＴＧＣＴＣＴＣＣＣＴＣＴＧＡＡＧＣ
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ１４４２６７配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−−３’（配列番号２３９）ＧＴＧＣＴＧＧＧＣＴＣＴＧＧＡＧＣＣＡＣＡＣＴＧＣＧＴＣＴＴＣＣＧＴＣ
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト［組織タイプを特定する］組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫ５ＢまたはｐＲＫ５Ｄ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、ＰＲＯ１９６４６に対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ１４５８４１−２８６８と命名［図１２７，配列番号１２７］）およびＰＲＯ１９６４６に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

上で同定した完全長クローンは、ヌクレオチド１９９−２０１位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド２３２２−２３２４位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図１２７，配列番号１２７）。予測されるポリペプチド前駆体は、７０８アミノ酸長であり、その算出分子量は、約７５０９３ダルトン、推定ｐＩは、約６．６５である。図１２８（配列番号１２８）に示す完全長ＰＲＯ１９６４６配列の解析により、図１２８に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１４５８４１−２８６８は、２０００年４月１１日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１６７８が割り当てられている。

図１２８（配列番号１２８）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１９６４６アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＤＭＣ１６３Ａ１０＿１、ＩＣＣＲ＿ＤＲＯＭＥ、ＮＭ＿００４６４６＿１、ＡＦ２１０３１６＿１、ＰＧＢＭ＿ＨＵＭＡＮ、ＮＭ＿００２８２１＿１、Ｐ＿Ｗ８３９２７、ＨＳＵ３３Ｇ３５＿１、ＭＡＧ＿ＨＵＭＡＮ、ＮＭ＿００１７７１＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例６１：ヒトＰＲＯ１９８２０ポリペプチド［ＵＮＱ５９２６］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース由来のゲノムＤＮＡに適用することによって、ＤＮＡ１４９９１１−２８８５を同定した。この場合、Ｓｔａｎｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙから使用許可を受けている遺伝子予測プログラムＧＥＮＳＣＡＮを使用して、ＧｅｎＢａｎｋ（アクセッション番号）由来のゲノム配列を解析した。ＧＥＮＳＣＡＮ解析は、潜在的なエクソンを同定し、イントロンを取り除き、次いで、そのシグナルアルゴリズムに供されるＤＮＡ配列を作製することによって、遺伝子コード領域を予測する。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＧｅｎＢａｎｋデータベースからある配列が同定でき、本明細書中でＤＮＡ１４４３３６と命名する。

ＤＮＡ１４４３３６配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ１９８２０についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−ＡＧＣＣＣＣＡＧＧＧＡＧＣＡＣＡＧＧＣＴ−３’（配列番号２４０）
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＧＣＴＣＧＴＣＡＣＧＧＣＣＡＴＣＴＴＣＡＣＣ−３’（配列番号２４１）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ１４４３８９配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＴＧＣＧＡＣＡＧＣＧＧＣＡＴＣＡＧＧＣＧＧＴＴＣＴＴＣ−３’（配列番号２４２）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト混合組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫ５ＢまたはｐＲＫ５Ｄ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、完全長ＰＲＯ１９８２０ポリペプチドに対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ１４９９１１−２８８５と命名［図１３１，配列番号１３１］）およびＰＲＯ１９８２０に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

クローンＤＮＡ１４９９１１−２８８５は、ヌクレオチド９−１１位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド３４２−３４４位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１３１）。予測されるポリペプチド前駆体は、１１１アミノ酸長である（図１３２；配列番号１３２）。図１３２に示す完全長ＰＲＯ１９８２０タンパク質は、推定分子量が約１２４４７ダルトン、ｐＩが約８．３１である。図１３２（配列番号１３２）に示す完全長ＰＲＯ１９８２０配列の解析により、図１３２に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１４９９１１−２８８５は、２０００年４月２５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−１７７６が割り当てられている。

図１３２（配列番号１３２）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ１９８２０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｐ＿Ｙ４１７０５、ＮＭ＿０００７２７＿１、Ｇ７０８６４、ＣＣＧ１＿ＨＵＭＡＮ、ＭＮＴ＿ＨＵＭＡＮ、Ｐ＿Ｙ０６５２７、Ｔ１３０４９、Ｐ＿Ｗ４７５２４、ＡＦ０３０１００＿１およびＲＮＡＪ６９６＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例６２：ヒトＰＲＯ２１２０１ポリペプチド［ＵＮＱ６０９８］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース由来のゲノムＤＮＡに適用することによって、ＤＮＡ１６８０２８−２９５６を同定した。この場合、Ｓｔａｎｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙから使用許可を受けている遺伝子予測プログラムＧＥＮＳＣＡＮを使用して、ＧｅｎＢａｎｋ（アクセッション番号Ｚ９８２００）由来のゲノム配列を解析した。ＧＥＮＳＣＡＮ解析は、潜在的なエクソンを同定し、イントロンを取り除き、次いで、そのシグナルアルゴリズムに供されるＤＮＡ配列を作製することによって、遺伝子コード領域を予測する。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。その配列が、確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＧｅｎＢａｎｋデータベースから配列が同定でき、ＤＮＡ１４４３３０と命名する。

ＤＮＡ１４４３３０配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ２１２０１についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−ＴＣＣＡＣＧＡＣＣＴＣＣＴＧＴＣＧＧＡＧＣ−３’（配列番号２４３）
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＡＧＡＣＣＣＴＧＴＧＣＧＧＡＣＴＧＣＴＧＣ−３’（配列番号２４４）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ１４４３３０配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ５’−ＡＧＣＣＣＣＧＡＣＣＡＣＡＧＣＡＧＣＡＧＣＣＣＣ−３’（配列番号２４５）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト組織の混合物から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫ５ＢまたはｐＲＫ５Ｄ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、完全長ＰＲＯ２１２０１ポリペプチドに対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ１６８０２８−２９５６と命名［図１３３，配列番号１３３］）およびＰＲＯ２１２０１に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

クローンＤＮＡ１６８０２８−２９５６は、ヌクレオチド７８−８０位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド１０８０−１０８２位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１３３）。予測されるポリペプチド前駆体は、３３４アミノ酸長である（図１３４；配列番号１３４）。図１３４に示す完全長ＰＲＯ２１２０１タンパク質は、推定分子量が約３７２５７ダルトン、ｐＩが約５．９５である。図１３４（配列番号１３４）に示す完全長ＰＲＯ２１２０１配列の解析により、図１３４に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１６８０２８−２９５６は、２０００年７月２５日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２３０４が割り当てられている。

図１３４（配列番号１３４）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ２１２０１アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＮＭ＿０１４０２８＿１、ＡＦ０７７２０５＿１、ＹＲ５３＿ＣＡＥＥＬおよびＴ２２０８４との間の配列同一性が明らかになった。

実施例６３：ヒトＰＲＯ２００２６ポリペプチド［ＵＮＱ６１１５］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ公的データベースからの約９５０個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）配列（もしあれば、分泌シグナル配列を含む）を、ＥＳＴデータベースを検索するために使用した。そのＥＳＴデータベースは、企業のＥＳＴデータベース（例えば、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２［Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，２６６：４６０−４８０（１９９６）］を使用して、ＥＣＤタンパク質配列とＥＳＴ配列の６フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。

コンセンサスＤＮＡ配列を、上記のようにｐｈｒａｐを使用して他のＥＳＴ配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ１４９８７０と命名する。いくつかの場合において、このＤＮＡ１４９８７０コンセンサス配列は、ＢＬＡＳＴおよびｐｈｒａｐの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスＤＮＡ配列から得られ、これにより、上記のＥＳＴ配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。

ＤＮＡ１４９８７０コンセンサス配列に基づいて、フリップクローニング（ｆｌｉｐ ｃｌｏｎｉｎｇ）を行った。１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ２００２６についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約ｌ〜１．５ｋｂｐより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ｓｃｈａｎｋｅ ｅｔ ａｌ．，ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，１６：４１４−４１６（１９９４）のように、ＰＣＲプライマー対を用いてフリップＰＣＲ（Ｆｌｉｐ ＰＣＲ）増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

ＰＣＲプライマー（順方向および逆方向）を合成した：
順方向ＰＣＲプライマー：
５’−ＣＧＴＴＧＴＴＴＧＴＣＡＧＴＧＧＡＧＡＧＣＡＧＧＧ−３’（配列番号２４６）
逆方向ＰＣＲプライマー
５’−ＣＡＧＧＡＡＣＡＣＣＴＧＡＧＧＣＡＧＡＡＧＣＧ−３’（配列番号２４７）
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスＤＮＡ１４９８７０配列から構築した：
ハイブリダイゼーションプローブ
５’−ＣＴＡＴＣＴＣＣＣＴＧＣＣＡＧＧＡＧＧＣＣＧＧＡＧＴＧＧＧＧＧＡＧＧＴＣＡＧＡＣ−３’（配列番号２４８）
ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト組織から単離した。ｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩ部位およびＮｏｔＩ部位においてクローニングした。

上で記載したように単離したクローンのＤＮＡ配列決定により、完全長ＰＲＯ２００２６ポリペプチドに対する完全長ＤＮＡ配列（本明細書中でＤＮＡ１５４０９５−２９９８と命名［図１３５，配列番号１３５］）およびＰＲＯ２００２６ポリペプチドに対して誘導されるタンパク質配列が得られた。

上で同定された完全長クローンは、ヌクレオチド７０−７２位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド２２５４−２２５６位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた（図１３５，配列番号１３５）。予測されるポリペプチド前駆体は、７２８アミノ酸長であり、その算出分子量は、約８１，３１０ダルトン、推定ｐＩは、約６．８４である。図１３６（配列番号１３６）に示す完全長ＰＲＯ２００２６配列の解析により、図１３６に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１５４０９５−２９９８は、２０００年１０月１０日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２５９１が割り当てられている。

Ｄａｙｈｏｆｆデータベースの解析により、ＰＲＯ２００２６が、ＩＬ−１７レセプタータンパク質との配列類似性を有することが示され、ＰＲＯ２００６はまた、本明細書中でＩＬ−１７ＲＨ４と称される。特に、図１３６（配列番号１３６）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ２００２６アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：Ｔ４２６９５、Ｐ＿Ｗ０４１８５、Ｐ＿Ｗ９２４０９、Ｐ＿Ｗ６１２７２、ＮＭ＿０１４３３９＿１、ＨＳＵ５８９１７＿１、ＭＭＵ３１９９３＿１、ＧＥＮ１３９７９、Ｐ＿Ｗ０４１８４、Ｐ＿Ｗ６１２７１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例６４：ヒトＰＲＯ２３２０２ポリペプチド［ＵＮＱ６５０７］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
発現配列タグ（ＥＳＴ）ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を検索し、ＥＳＴをＧＥＰＩＳによって同定した。インシリコでの遺伝子発現プロファイリング（Ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐｒｏｆｉｌｉｎｇ ｉｎ ｓｉｌｉｃｏ；ＧＥＰＩＳ）は、新規の治療標的について目的の遺伝子を特徴付けるバイオインフォマティクスツールである。ＧＥＰＩＳは、莫大な量のＥＳＴ配列およびライブラリー情報を利用することにより、遺伝子発現プロファイルを決定する。ＧＥＰＩＳは、遺伝子の発現レベルがＥＳＴデータベース中のその出現数と比例して相関しているという仮定に基づいており、ＧＥＰＩＳは、厳密な方法および統計的に有意な方法でＩｎｃｙｔｅ ＥＳＴリレーショナルデータベースとＧｅｎｅｎｔｅｃｈ企業の情報を統合することによって機能する。ＧＥＰＩＳは、非常に特別な解析または広範なスクリーニングタスクのいずれかを行うために設定され得るが、この実施例においては、新規の腫瘍抗原を同定し、相互確認するために使用される。最初のスクリーニングでは、ＧＥＰＩＳを使用して、ライブラリーから配列を決定する。Ｉｎｃｙｔｅデータベース全体を使用して、そのライブラリー情報に基づいて配列をクラスター化した。乳房、結腸、肺および前立腺を、特定された標的器官とした。次いで、この最初のクラスター化において見出された配列を、分泌ドメインおよび膜貫通含有ドメインについてのスクリーニングに供した。次いで、残った配列を、新規のものおよび同定された個別の配列についてスクリーニングした。最後の工程において、次いで、各々個別の配列をＧＥＰＩＳスクリーニングに供し、今度は配列からライブラリーを決定した。これにより、もとの標的組織におけるその発現プロファイルを確認した。このタイプのスクリーニングバイオインフォマティクスを使用して、ＤＮＡ１８２７５３を同定し、この配列を使用して設計されたＰＣＲプライマーを使用して、その完全長クローンについてライブラリーをスクリーニングした。

次いで、ｃＤＮＡライブラリーを構築するためのＲＮＡをヒト前立腺組織から単離した。ヒトＰＲＯ２３２０３をコードするｃＤＮＡクローンを単離するために使用したｃＤＮＡライブラリーは、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。ｃＤＮＡを、ＮｏｔＩ部位を含むオリゴｄＴをプライマーとして増幅し、ＳａｌＩ半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、ＮｏｔＩで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター（例えば、ｐＲＫＢまたはｐＲＫＤ；ｐＲＫ５Ｂは、ＳｆｉＩ部位を含まないｐＲＫ５Ｄの前駆体である；Ｈｏｌｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１２７８−１２８０（１９９１）を参照のこと）に所定の方向で独特のＸｈｏＩおよびＮｏｔＩにおいてクローニングした。

次いで、上記ＥＳＴ配列に基づいて、１）目的の配列を含むｃＤＮＡライブラリーをＰＣＲによって同定するため、および２）ＰＲＯ２３２０３についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドプローブを合成した。順方向および逆方向ＰＣＲプライマーは、一般に２０〜３０ヌクレオチドの範囲であり、約１００〜１０００ｂｐ長のＰＣＲ産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には４０〜５５ｂｐ長である。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のＤＮＡを、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，前出のように、ＰＣＲプライマー対を用いてＰＣＲ増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。

使用したオリゴヌクレオチドプローブは、次のとおりであった：
順方向ＰＣＲプライマー ５’−ＧＡＴＡＴＴＴＧＴＴＴＣＴＣＡＡＣＡＴＧＧＣＴＴＡＴＣＡＧＣＡＧＧ−３’（配列番号２４９）
逆方向ＰＣＲプライマー ５’−ＴＣＴＣＴＧＡＣＣＴＴＣＴＣＡＴＣＧＧＴＡＡＧＣＡＧＡＧＧ−３’（配列番号２５０）
ハイブリダイゼーションプローブ ５’−ＴＣＴＴＴＴＧＣＡＧＣＴＴＴＧＣＡＧＡＴＡＣＣＣＡＧＡＣＴＧＡＧＣＴＧＧＡＡＣＴＧＧＡ−３’（配列番号２５１）
ヌクレオチド１８８−１９０位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド１５５０−１５５２位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローン［本明細書中でＤＮＡ１８５１７１−２９９４と命名］を同定した（図１３９，配列番号１３９）。予測されるポリペプチド前駆体は、４５４アミノ酸長であり、その算出分子量は、約５２００８ダルトン、推定ｐＩは、約８．８３である。図１４０（配列番号１４０）に示す完全長ＰＲＯ２３２０３配列の解析により、図１４０に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１８５１７１−２９９４は、２０００年９月２６日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−２５１３が割り当てられている。

図１４０（配列番号１４０）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したタンパク質データベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ２３２０３アミノ酸配列と以下の配列：ＡＫ００１６９１＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例６５：ヒトＰＲＯ３５２５０ポリペプチド［ＵＮＱ９５７４］をコードするｃＤＮＡクローンの単離
Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをＥＳＴに適用することによってＤＮＡ１７１７３２−３１００を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および／または企業データベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）からＥＳＴフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの５’−末端の１番目および必要に応じて２番目のメチオニンコドン（ＡＴＧ）周辺のＤＮＡヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。１番目のＡＴＧの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも３５個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。１番目のＡＴＧが必要なアミノ酸を有する場合、２番目のＡＴＧは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。ＥＳＴ配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ＡＴＧコドンの周辺のＤＮＡ配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている７つのセンサー（評価パラメータ）のセットを使用してスコア付けする。

上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）（Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）データベースからＥＳＴ配列が同定でき、本明細書中で２４８１９７．２と命名する。そのＥＳＴ配列の起源は、脳葉切除の間に４５歳黒人男性から取り出された右側頭葉組織から調製されたライブラリーであった。ＮｏｔＩアンカー付加されたオリゴ（ｄＴ）プライマーを使用してＣＤＮＡ合成を開始した。二本鎖ｃＤＮＡを平滑末端化し、ＥｃｏＲＩアダプターを連結し、ＮｏｔＩで消化し、サイズ選択し、そしてｐＩＮＣＹベクター（Ｉｎｃｙｔｅ）のＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローニングした。次いで、公的ＥＳＴデータベース（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ）および企業のＥＳＴ ＤＮＡデータベース（ＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標），Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）を含む種々の発現配列タグ（ＥＳＴ）データベースとこのＥＳＴ配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムＢＬＡＳＴまたはＢＬＡＳＴ２（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２６６：４６０−４８０（１９９６））を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、ＢＬＡＳＴスコアが７０（またはいくつかの場合においては９０）またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「ｐｈｒａｐ」（Ｐｈｉｌ Ｇｒｅｅｎ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ，Ｓｅａｔｔｌｅ，Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ）を用いてコンセンサスＤＮＡ配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でＤＮＡ１３０６５７と命名する。

ＤＮＡ１３０６５７配列とＬＩＦＥＳＥＱ（登録商標）（Ｉｎｃｙｔｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｐａｌｏ Ａｌｔｏ，ＣＡ）データベース由来のクローン番号４０２８１８８内に包含されるＥＳＴ配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号４０２８１８８を購入し、そのｃＤＮＡ挿入断片を得て、配列決定した。このｃＤＮＡ挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このｃＤＮＡ挿入断片の配列を図１４１に示し、本明細書中でＤＮＡ１７１７３２−３１００と命名する。

クローンＤＮＡ１７１７３２−３１００は、ヌクレオチド５２−５４位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド６０４−６０６位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる（図１４１；配列番号１４１）。予測されるポリペプチド前駆体は、１８４アミノ酸長である（図１４２；配列番号１４２）。図１４２に示す完全長ＰＲＯ３５２５０タンパク質は、推定分子量が約１９，８０６ダルトン、ｐＩが約４．７４である。図１４２（配列番号１４２）に示す完全長ＰＲＯ３５２５０配列の解析により、図１４２に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンＤＮＡ１７１７３２−３１００は、２００１年４月２４日にＡＴＴＣに寄託され、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ−３３２９が割り当てられている。

図１４２（配列番号１４２）に示す完全長配列のＡＬＩＧＮ−２配列アラインメント解析を使用したＤａｙｈｏｆｆデータベース（バージョン３５．４５ ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ３５）の解析により、ＰＲＯ３５２５０アミノ酸配列と以下のＤａｙｈｏｆｆ配列：ＡＫ００３３０５＿１との間の配列同一性が明らかになった。

実施例６６：ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの役割を調べるために、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子の破壊を相同組換え技術またはレトロウイルス挿入技術により行った。詳細には、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０遺伝子が破壊されたトランスジェニックマウス（すなわち、ノックアウトマウス）を遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップのいずれかにより作製した。サザンブロット解析により変異を確認することにより、５’末端と３’末端の両方における正確なターゲティングを確認した。挿入部位に隣接するエクソンにアニーリングするプライマーを使用したＲＴ−ＰＣＲによって裏付けられるように、遺伝子特異的なジェノタイピングをゲノムＰＣＲによって行うことにより、内在性の天然の転写物が失われていることが確認された。ターゲティングベクターを１２９系統のＥＳ細胞に電気穿孔し、標的クローンを同定した。標的クローンを宿主胚盤胞に微量注入することにより、キメラを作製した。キメラをＣ５７動物と交雑し、Ｆ１ヘテロ接合体を作製した。ヘテロ接合体を交雑受精することにより、Ｆ２野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体コホートを作製し、表現型解析に使用した。まれに、Ｆ１ヘテロ接合体が十分に作製されない場合に、そのＦ１へテロ接合体を野生型Ｃ５７マウスと交雑することにより、十分なヘテロ接合体を得て、表現型の解析用のコホートと交雑させた。すべての表現型解析を生後１２〜１６週から実施した。

表現型結果の全体的な概要：
６６．１．ＤＮＡ２８４８７０（ＵＮＱ１２８）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ６９１２２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ２８４８７０と命名）（ＵＮＱ１２８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＡＫ００５０２３ムス・ムスクルス成雄肝臓ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：１３０００１６Ｄ２１産物：Ｓｅｌ１（ｌｉｎ−１２のサプレッサー）１ホモログ（Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓ）；参照タンパク質：Ｑ９Ｚ２Ｇ６ アクセッション：Ｑ９Ｚ２Ｇ６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。Ｓｅｌ−１ホモログ前駆体（ｌｉｎ−１２様タンパク質のサプレッサー）（Ｓｅｌ−１Ｌ）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿００５０６５ アクセッション：ＮＭ＿００５０６５ ＮＩＤ：ｌｉｎ−１２様の１９９２３６６８ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス ｓｅｌ−１サプレッサー（Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓ）（ＳＥＬ１Ｌ）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９ＵＢＶ２ アクセッション：Ｑ９ＵＢＶ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＳＥＬ−１ホモログ前駆体（ＬＩＮ−１２様タンパク質のサプレッサー）（ＳＥＬ−１Ｌ）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＳＥＬ１Ｌ（ｌｉｎ−１２様［Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓ］のｓｅｌ−１サプレッサー）オルソログであるＳｅｌ１ｈ（Ｓｅｌ１［ｌｉｎ−１２のサプレッサー］１ホモログ［Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓ］）である。別名としては、ＩＢＤ２；ＳＥＬ１様；ｓｅｌ−１（ｌｉｎ−１２のサプレッサー，Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓ）様；およびｌｉｎ１２のサプレッサー（ｓｅｌ−１），Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓのホモログが挙げられる。

ＳＥＬ１Ｌは、シグナルペプチド、フィブロネクチンＩＩ型ドメイン、膜貫通セグメントおよびプロリンリッチＣ末端からなる細胞内のベシクル関連タンパク質である。このタンパク質の機能は未知であるが、ＳＥＬ１Ｌは、プロセス（例えば、Ｎｏｔｃｈシグナル伝達、細胞内のタンパク質の輸送、分泌、細胞成長阻害および腫瘍攻撃）において重要な役割を果たすと考えられている；この遺伝子は、膵臓の発生中に発現し、また、神経管および後根神経節において発現している（Ｄｏｎｏｖｉｅｌ ｅｔ ａｌ，Ｍｅｃｈ Ｄｅｖ ７８（１−２）：２０３−７（１９９８）；Ｃａｔｔａｎｅｏ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｅ ３２６：１４９−５６（２００４）；Ｃｈｉａｒａｍｏｎｔｅ ｅｔ ａｌ，Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ２２（６Ｃ）：４２１１−４（２００２）；Ｏｒｌａｎｄｉ ｅｔ ａｌ，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ６２（２）：５６７−７４（２００２）；Ｂｉｕｎｎｏ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ４６（２）：２８４−６（１９９７）；Ｇｒａｎｔ ａｎｄ Ｇｒｅｅｎｗａｌｄ，Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ １２４（３）：６３７−４４（１９９７））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ３６ ０ ５２
予測値 １３．０ ２６．０ １３．０ ５２
カイ二乗値＝３３．４９ 有意性＝５．３４２４２６２Ｅ−８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１１３４４．１）。
野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ２８４８７０（ＵＮＱ１２８）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ｌｉｎ−１２様（Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓ）（ＳＥＬ１Ｌ）のヒトｓｅｌ−１サプレッサーのオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の致死性をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）マイクロアレイ解析
組織マイクロアレイ解析により、ＵＮＱ１２８が、膵臓において強く発現していることおよび膵癌でダウンレギュレートされていることが示されている。さらに、ＵＮＱ１２８はまた、正常な乳房組織と比較して乳房腫瘍において過剰発現している。
（ｃ）病理学
顕微鏡的：胚性致死により試験されなかった。１２．５日目に、４０個の胚：２１個の（＋／−）胚、２個の（＋／＋）胚、４個の再吸収モル（ｒｅｓｏｒｐｔｉｏｎ ｍｏｌｅｓ）、１０個の未定胚および３個の不確定な胚が観察された。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学によって組織パネルにおいて検出されなかった。１２．５ｄｐｃにおけるヘテロ接合性胚のＬａｃＺ全載標本（ｗｈｏｌｅｍｏｕｎｔｓ）の横断面は、網膜の内層；前肢の筋肉；頭側脈管構造の内皮、および神経管の底板（神経のパターン形成における役割を示唆する）における発現を示す。

致死性の胚の発達異常に関連する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない）によって生じるか、または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性（＋／−）変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。

６６．２．ＤＮＡ３０８７１−１１５７（ＵＮＱ１７８）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ２０４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３０８７１−１１５７と命名）（ＵＮＱ１７８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＥＧＦ様ドメインおよび２つのフォリスタチン様ドメイン２（Ｔｍｅｆｆ２）を含むＮＭ＿０１９７９０ ムス・ムスクルス膜貫通タンパク質；参照タンパク質：Ｑ９ＱＹＭ９ アクセッション：Ｑ９ＱＹＭ９ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＴＭＥＦＦ２タンパク質前駆体；ヒト遺伝子配列は、次の参照に対応する：ＮＭ＿０１６１９２ アクセッション：ＮＭ＿０１６１９２ ＮＩＤ：ＥＧＦ様ドメインおよび２つのフォリスタチン様ドメイン２（Ｔｍｅｆｆ２）を含む１２３８３０５０ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス膜貫通タンパク質；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９ＵＩＫ５ アクセッション：Ｑ９ＵＩＫ５ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＴＭＥＦＦ２タンパク質前駆体（膜貫通タンパク質ＴＥＮＢ２）（ＴＰＥＦ）（ＥＧＦ様および２つのフォリスタチン様ドメイン２を含む膜貫通タンパク質）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＴＭＥＦＦ２のオルソログであるＴｍｅｆｆ２（ＥＧＦ様ドメインおよび２つのフォリスタチン様ドメイン２を含む膜貫通タンパク質）である。
別名としては、４８３２４１８Ｄ２０Ｒｉｋ、ＴＲ、ＨＰＰ１、ＴＰＥＦ、ＴＥＮＢ２、トモレグリン（ｔｏｍｏｒｅｇｕｌｉｎ）、膜貫通タンパク質ＴＥＮＢ２ならびにＥＧＦ様ドメインおよび２つのフォリスタチン様ドメイン２を含む推定膜貫通タンパク質が挙げられる。

ＴＭＥＦＦ２は、プロテアーゼインヒビターまたはシグナル伝達レセプターとして機能し得るＩ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、２つのＫａｚａｌ型セリンプロテアーゼインヒビタードメイン（ＰｆａｍアクセッションＰＦ０００５０）、ＥＧＦ様ドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞質Ｃ末端Ｇタンパク質活性化モチーフを含む。ＴＭＥＦＦ２は、細胞外ドメインが分断されると、プロテアーゼドメインおよびＥＧＦ様ドメインからなる分泌型を生成する。ＴＭＥＦＦ２の細胞外セグメントは、レセプターチロシンキナーゼＥＲＢＢ４のチロシンリン酸化を刺激することができ、このことから、ＴＭＥＦＦ２は、シグナル伝達リガンドとして機能することが示唆される。さらに、ＴＭＥＦＦ２細胞外セグメントは、培養されたニューロンの生存を増大し得ることから、ＴＭＥＦＦ２は、生存因子として機能していることが示唆される。ＴＭＥＦＦ２遺伝子は、いくつかのタイプの癌において過剰メチル化されており、前立腺癌細胞株における異所性のＴＭＥＦＦ２遺伝子発現は、成長を阻害することから、ＴＭＥＦＦ２が腫瘍サプレッサーとして機能することが示唆される。ＴＭＥＦＦ２は、脳のニューロンの特徴的なサブセットにおいて主に発現しているが、結腸、膀胱、前立腺および他のいくつかの組織においても発現している。ＴＭＥＦＦ２と反応性であり、細胞傷害性薬剤のアウリスタチン（ａｕｒｉｓｔａｔｉｎ）Ｅと結合体化されたモノクローナル抗体が、前立腺癌に対する処置法としてマウスにおいて確かめられている（Ｕｃｈｉｄａ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ２６６（２）：５９３−６０２（１９９９）；Ｈｏｒｉｅ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ６７（２）：１４６−５２（２０００）；Ｌｉａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ６０（１７）：４９０７−１２（２０００）；Ｌｉｎ ｅｔ ａｌ，Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ７３（１３）：１６１７−２７（２００３）；Ｇｅｒｙ ｅｔ ａｌ，Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ２１（３１）：４７３９−４６（２００２）；Ｇｅｒｙ ａｎｄ Ｋｏｅｆｆｌｅｒ，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３２８（５）：９７７−８３（２００３）；Ａｆａｒ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ ３（８）：９２１−３２（２００４））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ３９ ２０ ８２
予測値 ２０．５ ４１．０ ２０．５ ８２
カイ二乗値＝１．０２ 有意性＝０．６００４９５６（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２９
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１９７９０．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３０８７１−１１５７（ＵＮＱ１７８）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ＥＧＦ様ドメインおよび２つのフォリスタチン様ドメイン２を含むヒト膜貫通タンパク質（ＴＭＥＦＦ２）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、成育できなかった小さい（−／−）マウスをもたらした。ホモ接合性変異マウスは、小さく、病弱であり、３週齢までに何匹かが死亡した。残りのホモ接合性変異体は、ネクロプシーに移され、顕微鏡解析により、白血球減少症および骨髄発育不全が明らかになった。さらに、広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓内のＴ細胞の枯渇が見られた。白血球減少症および骨髄発育不全が、（−／−）マウスにおいて示された。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学アッセイ−特有の概要
肉眼的：ホモ接合性変異マウスは、正常の年齢一致野生型マウスの体重の半分未満を示し、小さく、成育できなかった。ほとんどの器官が、（−／−）マウスにおいて軽い全体の体重に比例して小さかった。脾臓および胸腺が、野生型同腹仔コントロールと比較して特に小さかった。
顕微鏡的：（−／−）マウスは、リンパ球減少症と顆粒球減少症の両方および骨髄の顆粒球の形成不全に起因する白血球減少症を示した。骨髄は、（−／−）マウスにおいてびまん性再生不良であり、赤血球形成の量は正常であるが、骨髄性顆粒球細胞前駆体の数は著しく減少していた。このことから、白血球減少症を引き起こす顆粒球形成の減少が示唆される。広範なアポトーシスならびに胸腺皮質におけるＴリンパ球の減少および脾臓内のＴ細胞の枯渇が見られた。胸腺退縮は、ストレスを受けたマウスまたは重篤な疾患のマウスにおいてよく見られ、リンパ球減少症の結果であることが多い。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
（ｃ）骨代謝および全身診断学
（１）組織質量および除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して総組織質量（ＴＴＭ）の変化を同定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨）の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：明らか：（−／−）マウスは、小さく、病弱であり、３週齢までに何匹かが死亡した。生存（−／−）変異体のうち、６匹は、３週齢でネクロプシーに移され、残りのマウスは、３．５週齢で病理学的検査のために安楽死させた。

６６．３．ＤＮＡ３２２８６−１１９１（ＵＮＱ１８８）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ２１４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３２２８６−１１９１と命名）（ＵＮＱ１８８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１３３９３０ アクセッション：ＮＭ＿１３３９３０ ＮＩＤ：ＥＧＦ様ドメイン１（Ｃｒｅｌｄ１）を含むｇｉ１９５２７１４７ｒｅｆ ＮＭ＿１３３９３０．１ ムス・ムスクルスシステインリッチ；参照タンパク質：Ｑ９１ＸＤ７ アクセッション：Ｑ９１ＸＤ７ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。未知；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１５５１３ アクセッション：ＮＭ＿０１５５１３ ＮＩＤ：ＥＧＦ様ドメイン１（ＣＲＥＬＤ１）を含むｇｉ２２０９５３９６ ｒｅｆ ＮＭ＿０１５５１３．２ ホモ・サピエンスシステインリッチ；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９Ｙ４０９ アクセッション：Ｑ９Ｙ４０９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説４４．９ＫＤＡタンパク質。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＣＲＥＬＤ１のオルソログであるＣｒｅｌｄ１（ＥＧＦ様ドメイン１を含むシステインリッチ）である。別名としては、ＡＶＳＤ２、ＣＩＲＲＩＮ、ＤＫＦＺＰ５６６Ｄ２１３および房室中隔欠損２が挙げられる。ＣＲＥＬＤ１は、細胞接着分子として機能し得るＩＩＩ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、トリプトファンリッチドメインおよびグルタミン酸リッチ（ＷＥ）ドメイン、タンデムに並んだＥＧＦ様リピートおよび短い細胞質ドメインで分断された２つのＣ末端膜貫通セグメントを含む。ＣＲＥＬＤ１遺伝子における変異は、房室中隔欠損を発生する危険性を増大させ得る（Ｒｏｂｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ，Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ７２（４）：１０４７−５２（２００３）；Ｒｕｐｐ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｅ ２９３（１−２）：４７−５７（２００２））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ３０ ０ ４６
予測値 １１．５ ２３．０ １１．５ ４６
カイ二乗値＝３４．３６ 有意性＝３．４５７９６５６Ｅ−８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１３３９３０．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された１３のすべての成体組織サンプル（脂肪ならびに胃、小腸および結腸以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３２２８６−１１９１（ＵＮＱ１８８）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ＥＧＦ様ドメイン１を含むヒトシステインリッチ（ＣＲＥＬＤ１）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の致死性をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：胚性致死により試験されなかった。１２．５日目に、５０個の胚：１９個の（＋／−）胚、１３個の（＋／＋）胚、１６個の再吸収モルおよび２個の不確定な胚が観察された。

致死性の胚の発達異常に関連する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない）によって生じるか、または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性（＋／−）変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。

ＵＮＱ１８８欠損マウスは、心臓欠損であり、妊娠中期あたりで心不全により死亡する。ｅｘ ｖｉｖｏ解析により、ＵＮＱ１８８が、心臓発生中の内皮細胞の移動に必要であることが示され、胚の心臓におけるＵＮＱ１８８の機能についての発生経路が定義される。

６６．４．ＤＮＡ３３１０７−１１３５（ＵＮＱ１９６）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ２２２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３３１０７−１１３５と命名）（ＵＮＱ１９６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１４４７９６ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ４３００２１Ｎ１８遺伝子（Ｅ４３００２１Ｎ１８Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＨ３２ アクセッション：Ｑ８ＢＨ３２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス生後１６日の新生仔小脳ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：９６３０００４Ａ１４産物：仮説Ｓｕｓｈｉドメイン／ＳＣＲリピート／ＣＣＰモジュール含有タンパク質、完全長挿入配列（ムス・ムスクルス生後２日の新生仔胸腺細胞ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：Ｅ４３００２１Ｎ１８産物：仮説Ｓｕｓｈｉドメイン／ＳＣＲリピート／ＣＣＰモジュール含有タンパク質、完全長挿入配列）；参照ヒト遺伝子配列：ＡＹ３５８４９５ホモ・サピエンスクローンＤＮＡ３３１０７ ＹＨＧＭ１９６（ＵＮＱ１９６）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ６ＵＸ６２ アクセッション：Ｑ６ＵＸ６２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＹＨＧＭ１９６。

目的のマウス遺伝子は、ヒト「クローンＤＮＡ３３１０７ＹＨＧＭ１９６」（ＹＨＧＭ１９６）のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ４３００２１Ｎ１８遺伝子である。別名としては、ＭＧＣ３０３６８およびＵＮＱ１９６が挙げられる。

ＹＨＧＭ１９６は、シグナルペプチド、４つのｓｕｓｈｉドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞質Ｃ末端からなる推定Ｉ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質の機能は、未知である；しかしながら、ｓｕｓｈｉドメインは、細胞接着分子および補体に見られることが多い（ＰｆａｍアクセッションＰＦ０００８４）。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １４ ４３ １９ ７６
予測値 １９．０ ３８．０ １９．０ ７６
カイ二乗値＝０．０４ 有意性＝０．９８０１９８７（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５
平均同腹仔数＝９
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４４７９６．２）およびその前の非コードエクソン（ＮＣＢＩアクセッションＢＭ９４４００３）をターゲティングした。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨格筋；骨；ならびに胃、小腸および結腸以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３３１０７−１１３５（ＵＮＱ１９６）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト「クローンＤＮＡ３３１０７ＹＨＧＭ１９６」（ＹＨＧＭ１９６）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおける収縮期血圧の低下をもたらした。
さらに、変異体（−／−）マウスは、コントロール（＋／＋）同腹仔と比較して平均血清ＩｇＧ３レベルの上昇を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析により、ＵＮＱ１９６が正常な乳房組織と比較して乳癌において過剰発現しているか、またはアップレギュレートしていることが明らかになっている。さらに、ＵＮＱ１９６は、胚の乳腺において発現している。
（ｃ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔コントロール、計画実行用の（＋／＋）マウスおよび歴史的中央値と比較して平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇を示した。

血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、成体ホモ接合体が、血清ＩｇＧ３レベルの上昇を示したことが明らかになった。したがって、ホモ接合体は、（＋／＋）同腹仔と比較して血清中免疫グロブリンの増加を示した。ＩｇＧ３免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないが、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、ＰＲＯ２２２ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、負の制御因子として作用するＰＲＯ２２２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
（ｄ）心臓学−血圧
試験の説明：Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧解析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。

結果
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下（歴史的平均より１ＳＤ低い）を示した。

６６．５．ＤＮＡ３５５５７−１１３７（ＵＮＱ２０８）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ２３４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３５５７−１１３７と命名）（ＵＮＱ２０８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿１４６８８７ ＰＲＥＤＩＣＴＥＤ：ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ０３００１２Ｍ１９遺伝子（Ｅ０３００１２Ｍ１９Ｒｉｋ）；参照タンパク質：ライリン（ｌａｙｉｌｉｎ）［ムス・ムスクルス］に類似のＸＰ＿１４６８８７；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１７８８３４ ホモ・サピエンスライリン（ＬＯＣ１４３９０３）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９６ＮＦ３ アクセッション：Ｑ９６ＮＦ３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＣＤＮＡ ＦＬＪ３０９７７ ＦＩＳ，ＣＲＩＣＥＴＵＬＵＳ ＧＲＩＳＥＵＳライリンに非常に似ているクローンＨＨＤＰＣ２００００９５。

目的のマウス遺伝子は、ヒトライリンのオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ０３００１２Ｍ１９遺伝子である。別名としては、Ｇｍ５１１が挙げられる。

ライリンは、おそらく細胞接着分子またはレセプターとして機能するＩ型内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、細胞外マトリックスタンパク質ヒアルロナンと結合し、細胞骨格のアダプタータンパク質タリンと関連する。ライリンは、おそらくプロセス（例えば、細胞接着、運動性および創傷治癒）において役割を果たす（Ｂｏｒｏｗｓｋｙ ａｎｄ Ｈｙｎｅｓ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １４３（２）：４２９−４２（１９９８）；Ｂｏｎｏ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｃｅｌｌ １２（４）：８９１−９００（２００１））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ３９ １０ ７２
予測値 １８ ３６ １８ ７２
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜３をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＸＭ＿１４６８８７．３）。
カイ二乗値＝３．５６ 有意性＝０．１６８６３８１５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２３
平均同腹仔数＝９
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨格筋および骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３５５５７−１１３７（ＵＮＱ２０８）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトライリンのオルソログをコードする遺伝子の変異は、期待数の約半分のホモ接合遺伝子型をもたらした。雄（−／−）マウスは、平均除脂肪体重の減少も示した。さらに、雄ノックアウトマウスは、全身、大腿骨および椎骨における、骨塩量（ＢＭＣ）の減少および骨塩密度（ＢＭＤ）の減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）骨代謝および全身診断学／放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
ＰＲＯ２３４ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異（−／−）マウスは、除脂肪体重の減少を特徴とする組織るいそう疾患と一致する表現型を示す。さらに、雄ノックアウトマウスは、全身、大腿骨および椎骨において骨塩量（ＢＭＣ）の減少および骨塩密度（ＢＭＤ）の減少を示した。したがって、（−／−）マウスは、通常、骨粗鬆症に関連する組織るいそう疾患および骨代謝異常の徴候を示した。ＰＲＯ２３４ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨の治癒または骨粗鬆症などの骨関連障害の処置に有用であり得る一方で、ＰＲＯ２３４ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、負の骨表現型を模倣し得る。

６６．６．ＤＮＡ３６３５０−１１５８（ＵＮＱ２３２）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ２６５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３６３５０−１１５８と命名）（ＵＮＱ２３２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿２０１５１８ ムス・ムスクルスフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質２（Ｆｌｒｔ２）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＬＵ０ アクセッション：Ｑ８ＢＬＵ０ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス成雄大動脈および静脈ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：Ａ５３００９８Ｌ０４産物：ＫＩＡＡ０４０５（ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質ＦＬＲＴ２）ホモログ（フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質２）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１３２３１ホモ・サピエンスフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質２（ＦＬＲＴ２）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｏ４３１５５ アクセッション：Ｏ４３１５５ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質ＦＬＲＴ２前駆体（フィブロネクチン様ドメイン含有ロイシンリッチ膜貫通タンパク質２）（ＵＮＱ２３２／ＰＲＯ２６５）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＦＬＲＴ２のオルソログであるＦｌｒｔ２（フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質２）である。別名としては、ＫＩＡＡ０４０５が挙げられる。

ＦＬＲＴ２は、膵臓、骨格筋、脳および心臓において発現している推定Ｉ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチリピート、フィブロネクチンドメイン、膜貫通セグメントおよび短い細胞質Ｃ末端を含む。ＦＬＲＴ２は、レセプターシグナル伝達において機能する可能性がある（Ｌａｃｙ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ６２（３）：４１７−２６（１９９９）；ＦＬＲＴ３は、神経突起の成長を促進し、神経損傷でアップレギュレートされる［Ｂｏｔｔｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ６（１）：３８−４４（２００４）］。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２５ ４６ ２ ７３
予測値 １８．２５ ３６．５ １８．２５ ７３
カイ二乗値＝３９．５４ 有意性＝２．５９４１６６９Ｅ−９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０３
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿２０１５１８．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、骨格筋および骨以外の１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３６３５０−１１５８（ＵＮＱ２３２）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質２（ＦＬＲＴ２）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の大きな生存能低下をもたらした。遺伝的データは、この変異が、ホモ接合性変異体の大きな生存能低下をもたらしたことを示唆する。同定された（−／−）マウスのうちの３匹は、胚の提出であった。２匹の生存変異体マウスは、野生型同腹仔よりも小さく、そして難聴を含む多くの異常を示した。顕微鏡解析により、ホモ接合性変異体において心不全をもたらす心筋症が明らかになった。さらに、雌ホモ接合性およびヘテロ接合性のマウスは、皮膚線維芽細胞増殖速度が高まった。さらに、生存ノックアウトマウスは、平均血清ＩｇＧ２ａレベルおよび平均血清ＩｇＧ１レベルの上昇を特徴とするいくつかの免疫学的異常を示した。しかしながら、１匹の（−／−）マウスは、ＬＰＳ負荷に対する血清ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６の応答が低下した。生存（−／−）マウスはまた、総組織質量の減少、体脂肪のパーセンテージの減少および脂肪質量の減少を示した。雌ノックアウトマウスは、体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）および全身の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少を示した。雄（−／−）マウスは、マイクロＣＴの骨測定値の増加を示した。１匹の雌（−／−）マウスはまた、普及型視神経乳頭を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：１２．５日目に、５１個の胚：３個の（−／−）胚、２２個の（＋／−）胚、１１個の（＋／＋）胚、８個の再吸収モルおよび７個の不確定な胚が観察された。解析に利用可能なその３個の（−／−）胚は、高度に凝縮した好酸球性筋形質を有する緊密に詰まった筋細胞を特徴とする心筋症を示した。これらの小さく高密度な筋細胞は、薄壁および心室および心房の小柱を形成する薄いバンドを形成した。その筋細胞は、心室の内腔を部分的に満たす多数の大きな原始的な内心膜性細胞によって取り囲まれていた。胚において血管の拡張を伴う腹部器官の広範な血管の鬱血が見られたことから、不完全な心筋発生から生じる鬱血性心不全が示唆される。生存している（−／−）胚は、概してその（＋／＋）同腹仔よりも小さかったが、胚死およびネクロプシーにおける再吸収の証拠でもあった。その不完全な構造および心筋細胞の配列が、明らかに出生前心機能の漸進的な低下、心不全の発生および胚死をもたらした。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学によって解析された組織パネル中の副甲状腺において検出された。
（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび２匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。

聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より小さい（プレパルス）音に先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似ランダム順に６回、合計３６回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。

結果：
感覚運動ゲーティング／注意：変異（−／−）マウスの両方が、驚愕応答を示さなかったことから、変異体における難聴が示唆される。
（ｄ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、（−／−）マウスが、（＋／＋）同腹仔、計画実行内の（＋／＋）マウスおよび歴史的平均と比較して、平均血清ＩｇＧ２ａレベルおよび平均血清ＩｇＧ１レベルの上昇を示したという観察結果がもたらされた。

変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ１血清免疫グロブリンの増加を示した。これらの免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。観察された表現型から、ＰＲＯ２６５ポリペプチドが、炎症性応答の負の制御因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常から、ＰＲＯ２６５ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）が、免疫系を刺激し得る重要な物質であり得、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ２６５ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。

急性期反応：
試験の説明：細菌のリポ多糖（ＬＰＳ）は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルＩのＬＰＳマウスの腹腔内に（ｉ．ｐ．）、２００μＬ滅菌食塩水中の致死量未満の用量のＬＰＳを２６ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、１μｇ／ｇ体重とした。注射の３時間後に１００μＬの血液サンプルを採取し、ＴＮＦａ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６の存在をＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置で解析した。

結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６の応答の低下を示した。

まとめると、ＬＰＳエンドトキシン負荷により、ＰＲＯ２６５ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、ＬＰＳエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答（ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６産生）を誘発する能力の低下を示したことから、炎症性応答の低下が示唆される。ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６は、後期のＢ細胞活性化に寄与する。さらに、ＩＬ−６は、急性期反応および全身性炎症の誘導に重要な役割を果たす。
（ｅ）表現型解析：代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験もまた日常的に行う：アルカリホスファターゼ；アラニンアミノ−トランスフェラーゼ；アルブミン；ビリルビン；亜リン酸；クレアチニン；ＢＵＮ＝血中尿素窒素；カルシウム；尿酸；ナトリウム；カリウム；および塩化物。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。

結果：
解析に利用可能な１匹の雄および雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔コントロールおよび歴史的平均と比較して、尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇を示した。したがって、変異（−／−）マウスは、ある種の痛風（異常なプリン代謝）に共通する腎結石（および関連の腎臓疾患）を示唆する血液中の尿酸の著しい増加に関連する負の表現型を示す。ヘテロ接合性（＋／−）マウスもまた、野生型（＋／＋）同腹仔コントロールよりも高い傾向にあった。ＰＲＯ２６５ポリペプチドおよびそのアゴニストは、腎結石の形成および／または異常なプリン代謝に関連するそのような疾患の処置に有用であり得る。さらに、変異マウスは、これらのマウスの生存能低下に関連し得る平均血清中グルコースレベルの低下を示した。
（ｆ）成体皮膚細胞増殖：
手順：皮膚細胞を１６週齢の動物（野生型マウス、ヘテロ接合性マウスおよび１匹のホモ接合性マウス）から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、ｐ５３およびＫｕ８０で証明されている。Ｂｒｄｕ取り込みを使用して増殖を測定した。

詳細には、これらの研究において、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化された培養物中の細胞数の増加を、相対的な増殖性能力の基準として使用した。野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚バイオプシーから初代線維芽細胞を確立した。５万個の細胞の２つ組または３つ組の培養物を播種し、６日間生育させた。培養期間の終わりに、培養物中に存在する細胞の数を、電子粒子カウンターを使用して測定した。

結果：
ヘテロ接合性（＋／−）マウスの３分の１（１／３）が、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の増加を示した。さらに、１匹の（−／−）マウスは、増殖の増加も示した。

したがって、ホモ接合性とヘテロ接合性の変異マウスの両方が、過剰増殖性の表現型を示した。これらの観察結果により示唆されるように、ＰＲＯ２６５ポリペプチドまたはそのアゴニストは、腫瘍サプレッサーとして機能し得、異常な細胞増殖を低下させるのに有用であり得る。
（ｇ）骨代謝および全身診断学
（１）組織質量および除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび１匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して総組織質量（ＴＴＭ）の変化を同定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨）の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。

結果：
１匹の雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した（平均より２〜３ＳＤ低い）。

受精能：
解析に利用可能な１匹の雄（−／−）マウスは、雌（＋／＋）マウスとの２回の交尾のあとに子孫を残すことはなかったことから、受精能の障害が証明された。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび２匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

骨マイクロＣＴ解析：
手順：マイクロＣＴを使用して、非常に感度の高いＢＭＤの測定を行った。１つの椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび２匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の５つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、１６マイクロメートルの解像度で第５腰部椎骨（ＬＶ５）において解析し、皮質骨パラメータを、２０マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。

結果：
Ｄｅｘａ：解析に利用可能な１匹の雄（−／−）マウスおよび１匹の雌（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、総組織質量、総脂肪質量および総体脂肪パーセントの減少を示した。さらに、雌ノックアウトはまた、体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）および全身骨塩密度（ＢＭＤ）の減少を示した。
マイクロＣＴ：解析に利用可能な１匹の雄（−／−）マウス（Ｍ−２２５）は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、椎骨骨梁の体積、数および結合性密度の増加を示した。そのマウスが小さいので、このことは、興味深いことである。

Ｄｅｘａおよび骨マイクロＣＴ解析によって解析された（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、異常な骨障害を示唆する、骨の測定値の減少および身体の質量の測定値の減少を示した。さらに、このノックアウトマウスは、成長関連障害および／または悪液質などの組織るいそう疾患を示唆する、総組織質量および体脂肪の減少を示した。これらの結果は、（−／−）マウスの生存能低下と一致する。（−／−）マウスはまた、負の骨表現型を示し、骨の代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した。骨および代謝の負の表現型は、ＰＲＯ２６５ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得るか、または他の代謝障害の処置に有用であり得ることを示唆する。さらに、ＰＲＯ２６５ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、ＰＲＯ２６５ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト（またはインヒビター）は、異常な骨代謝に関連する炎症性疾患（関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む）を含む、異常または病理学的な骨障害に導き得る。
（ｈ）心拍数：
試験の説明：Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧解析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。

結果：
解析に利用可能な１匹の生存雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、心拍数が顕著に減少した（平均より約３ＳＤ低い）。これらの結果は、心機能の漸進的な低下を示唆する病理学の報告と一致する。

６６．７．ＤＮＡ６１６０１−１２２３（ＵＮＱ２７２）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ３０９ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６１６０１−１２２３と命名）（ＵＮＱ２７２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１３７８１ ムス・ムスクルス ＳＨ２ドメイン含有３Ｃ（Ｓｈ２ｄ３ｃ）；参照タンパク質：Ｑ９ＱＺＳ８ アクセッション：Ｑ９ＱＺＳ８ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＳＨ２ドメイン含有ＥＰＨレセプター結合タンパク質ＳＨＥＰ１（ＣＨＡＴ−Ｈ）；参照ヒト遺伝子配列：ＢＣ０３２３６５ アクセッション：ＢＣ０３２３６５ ＮＩＤ：２１６１９０５６ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス，ＳＨ２ドメイン含有３Ｃ，クローンＭＧＣ：４０４１８ ＩＭＡＧＥ：４５２１９６２；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８Ｎ５Ｈ７ アクセッション：Ｑ８Ｎ５Ｈ７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＳＨ２ドメイン含有３Ｃ。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＳＨ２Ｄ３ＣのオルソログであるＳｈ２ｄ３ｃ（ＳＨ２ドメイン含有３Ｃ）である。別名としては、Ｃｈａｔ、Ｎｓｐ３、Ｓｈｅｐ１、新規ＳＨ２含有タンパク質３、Ｃａｓ／ＨＥＦ１関連シグナル伝達物質、ＳＨ２ドメイン含有３ＣおよびＳＨ２含有Ｅｐｈレセプター結合タンパク質１が挙げられる。

ＳＨ２Ｄ３Ｃは、小分子ＲａｓスーパーファミリーＧＴＰａｓｅｓを、活性化されたレセプターチロシンキナーゼに連結するシグナル伝達アダプター分子として機能する細胞質タンパク質である。このタンパク質は、ＳＨ２ドメインおよびＲａｓグアニンヌクレオチド交換因子ドメインからなり、このことから、ＳＨ２Ｄ３Ｃは、グアニンヌクレオチド交換因子としても機能し得る。ＳＨ２Ｄ３Ｃは、ＧＴＰａｓｅ Ｒ−ＲａｓおよびＲａｐ１Ａ、足場タンパク質Ｃｒｋ関連基質（Ｃａｓ）ならびにレセプターチロシンキナーゼＥｐｈＢ２と結合する。さらに、ＳＨ２Ｄ３Ｃは、上皮成長因子レセプター、神経成長因子レセプター、Ｔ細胞レセプターおよびインテグリンに対するアダプターとしても機能し得る。ＳＨ２Ｄ３Ｃは、プロセス（例えば、膜ラフリング、細胞遊走、Ｔ細胞活性化およびサイトカイン産生）をおそらく制御する（Ｄａｉｌ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７９（４０）：４１８９２−９０２（２００４）；Ｓａｋａｋｉｂａｒａ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（８）：６０１２−７（２００３）；Ｓａｋａｋｉｂａｒａ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｓｃｉ １１５（Ｐｔ ２４）：４９１５−２４（２００２）；Ｓａｋａｋｉｂａｒａ ａｎｄ Ｈａｔｔｏｒｉ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７５（９）：６４０４−１０（２０００）；Ｄｏｄｅｌｅｔ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７４（４５）：３１９４１−６（１９９９））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ４４ １３ ７８
予測値 １９．５ ３９．０ １９．５ ７８
カイ二乗値＝１．６６ 有意性＝０．４３６０４９２８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２２
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン４〜６をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１３７８１．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６１６０１−１２２３（ＵＮＱ２７２）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＳＨ２ドメイン含有３Ｃ（ＳＨ２Ｄ３Ｃ）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおける脾臓内のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞のパーセンテージの低下を示した。さらに、（−／−）マウスは、平均体重の減少、平均総組織質量および除脂肪体重の減少を示した。雄ノックアウト（−／−）マウスは、椎骨骨塩密度（ＢＭＤ）の著しい減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）骨代謝および全身診断学
（１）組織質量および除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して総組織質量（ＴＴＭ）の変化を同定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨）の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。

結果：
雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して平均体重の減少を示した。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総組織質量および平均除脂肪体重の減少を示した。さらに、雄ノックアウト（−／−）マウスは、椎骨骨塩密度（ＢＭＤ）の顕著な減少を示した。

Ｄｅｘａにより解析した（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較して、総組織質量および除脂肪体重の顕著な減少ならびに骨測定値の減少を示した。このことから、これらの変異体における成長遅延が示唆される。このことと体重が減少した観察結果と結びつけることにより、悪液質などの組織るいそう状態または他の成長関連障害が示唆される。したがって、ＰＲＯ３０９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、悪液質または他の組織るいそう疾患を含む成長障害の処置または予防に有用であり得る。
（ｃ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
蛍光（Ｆｌｏｕｒｅｓｃｅｎｃｅ）標識細胞分取（ＦＡＣＳ）解析−組織特異的ＦＡＣＳ
手順：
ＣＤ４、ＣＤ８およびＴ細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のＦＡＣＳ解析を実施して、Ｔリンパ球、Ｂリンパ球に対するＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５およびナチュラルキラー細胞に対するｐａｎ ＮＫを評価した。ＦＡＣＳ解析は、２匹の野生型および６匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。

これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のＣＤ４およびＣＤ８陽性のＴ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−レーザーＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞および単球の数を記録する。
試験の説明：６つの系統特異的抗体のパネル：ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥおよびＣＤ１９ ＦＩＴＣを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得る。２種類のＦＩＴＣ標識抗体およびＰＥ標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用してサンプルを解析する。

結果：
組織特異的ＦＡＣＳ−マウス：血液、脾臓、骨髄および腹水中のリンパ球および抗原提示細胞のサブセットの解析により、以下の主な知見：総脾臓細胞数が野生型またはヘテロ接合性の同腹仔よりも少ないことが見られた。また、以下のサブセット：脾臓−辺縁帯Ｂ細胞、濾胞性Ｂ細胞、Ｔ１／Ｂ細胞、Ｔ２／辺縁帯Ｂ細胞、活性化ＣＤ４Ｔ細胞、ナイーブＣＤ８Ｔ細胞、ミエロイド樹状細胞および形質細胞様樹状細胞；骨髄−総細胞数、未成熟Ｂ細胞、プレＢ細胞、プロＢ細胞、ＩｇＭ＋およびＩｇＭ−血漿細胞のうちのノックアウト細胞の数の統計的に有意に減少が観察された。（−／−）マウスは、（＋／＋）マウスと比較して、脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞のパーセンテージの著しい低下を示した。これらの結果から、そのノックアウトマウスが、記憶細胞のプールを含み、迅速な免疫応答に関与するＢ細胞のサブセット（辺縁帯Ｂ細胞）の減少を示したことが示唆される。したがって、変異ホモ接合性マウスは、脾臓中のＢ細胞前駆細胞のレベルの低下に関与する免疫学的異常を示した。

これらの結果は、ノックアウト（−／−）マウスが、その野生型（＋／＋）同腹仔と比較して、免疫学的異常を示すことを示す。ＰＲＯ３０９ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、この表現型を模倣すると予想される。ＰＲＯ３０９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、迅速な免疫応答に関与し得るＢ細胞の発達または成熟に有用であり得る。

６６．８．ＤＮＡ４０９８２−１２３５（ＵＮＱ２９３）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ３３２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ４０９８２−１２３５と命名）（ＵＮＱ２９３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７２８７４ ムス・ムスクルスポドカン（ｐｏｄｏｃａｎ）（Ｐｏｄｎ）；参照タンパク質：Ｑ７ＴＱ６２ アクセッション：Ｑ７ＴＱ６２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ポドカンタンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５３７０３ ホモ・サピエンスポドカン（ＰＯＤＮ）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ５ＶＶＺ３ アクセッション：Ｑ５ＶＶＺ３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ポドカン。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＰＯＤＮのオルソログであるＰｏｄｎ（ポドカン）である。別名としては、Ｐｃａｎ、ＳＬＲＲ５Ａ、９４３００７０Ｇ１８およびＭＧＣ２４９９５が挙げられる。

ＰＯＤＮは、１型コラーゲンと結合し得る推定分泌タンパク質であり、おそらく細胞外マトリックスタンパク質として機能する。この６１１アミノ酸タンパク質は、非コラーゲン性細胞外マトリックスタンパク質の小さいロイシンリッチリピート（ＳＬＲ）ファミリーのメンバーであり、システインリッチＮ末端、２０個のロイシンリッチリピートおよび酸性Ｃ末端ドメインからなる。腎糸球体内で、ＰＯＤＮは、足細胞および血管内皮細胞において発現しており、基底膜に見られる。ＰＯＤＮは、心臓および血管平滑筋細胞を含む他の組織においても発現している。ＰＯＤＮは、糸球体基底膜における原線維発生をおそらく調節しており、また、糸球体濾過、ＨＩＶ感染に関連した硬化性糸球体病変形成および循環器系組織の成長制御において役割を果たし得る（Ｒｏｓｓ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（３５）：３３２４８−５５（２００３）；Ｓｈｉｍｉｚｕ−Ｈｉｒｏｔａ ｅｔ ａｌ，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ ５６３（１−３）：６９−７４（２００４））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２４ ４６ １９ ８９
予測値 ２２．２５ ４４．５ ２２．２５ ８９
カイ二乗値＝２．６１ 有意性＝０．２７１１７２５５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２４
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜５をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７２８７４．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨格筋以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ４０９８２−１２３５（ＵＮＱ２９３）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトポドカン（ＰＯＤＮ）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、血清ＩｇＧ３レベルの上昇をもたらした。さらに、変異（−／−）マウスは、骨塩密度の測定値の増加および平均大腿骨中軸の断面積の増加を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔コントロールと比較して、平均血清ＩｇＧ３レベルの上昇を示した。

血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合性成体が、血清ＩｇＧ３レベルの上昇を示したことが明らかになった。したがって、ホモ接合体は、（＋／＋）同腹仔と比較して、血清免疫グロブリンの増加を示した。ＩｇＧ３免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、ＰＲＯ３３２ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ３３２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
（ｃ）骨代謝および全身診断学：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

骨マイクロＣＴ解析：
手順：マイクロＣＴを使用して、非常に感度の高いＢＭＤの測定を行った。１つの椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の５つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、１６マイクロメートルの解像度で第５腰部椎骨（ＬＶ５）において解析し、皮質骨パラメータを、２０マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均に対する値と比較して、体積測定による平均骨塩密度および全身骨塩密度の増加を示した。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のものと比較して、大腿骨中軸の平均断面積の増加を示した。

雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、骨塩量ならびに全身および大腿骨の骨塩密度の増加を示した。これらの結果から、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病のような骨の異常に関連し得ることが示唆される。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、ＰＲＯ３３２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。骨塩量ならびに全身および大腿骨の骨塩密度の増加に関する表現型から、これらの作用を模倣する物質（例えば、ＰＲＯ３３２ポリペプチドのアンタゴニスト）が、骨の治癒に有用であり得ることが示唆される。

６６．９．ＤＮＡ３８６４９（ＵＮＱ３０１）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ３４２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３８６４９と命名）（ＵＮＱ３０１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２３０５９ アクセッション：ＮＭ＿０２３０５９ ＮＩＤ：１２７４６４３９ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス 単一Ｉｇ ＩＬ−１レセプター関連タンパク質（未決定Ｓｉｇｉｒｒ）；参照タンパク質：Ｑ９ＪＬＺ８ アクセッション：Ｑ９ＪＬＺ８ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＴＯＬＬ／インターロイキン−１レセプター８；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２１８０５ アクセッション：ＮＭ＿０２１８０５ ＮＩＤ：１１１４１８７６ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス 単一Ｉｇ ＩＬ−１Ｒ関連分子（ＳＩＧＩＲＲ）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９Ｈ７３３ アクセッション：Ｑ９Ｈ７３３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＣＤＮＡ：ＦＬＪ２１４４６ ＦＩＳ，クローンＣＯＬ０４４５８。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＳＩＧＩＲＲ（単一のＩｇ ＩＬ−１Ｒ関連分子）のオルソログであるＡＩ２５６７１１（発現配列ＡＩ２５６７１１）である。別名としては、ＴＩＲ８、単一Ｉｇ ＩＬ−１Ｒ関連タンパク質および単一Ｉｇ ＩＬ−１レセプター関連タンパク質が挙げられる。

ＳＩＧＩＲＲは、「シグナル伝達しない」レセプターまたは「デコイ」レセプターとして機能するＩ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、細胞外免疫グロブリンドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞内トール／インターロイキン−１レセプター（ＴＩＲ）ドメインからなる。刺激されると、炎症誘発性インターロイキン−１レセプター（ＩＬ−１Ｒ）およびトール様レセプター（ＴＬＲ）は、ＳＩＧＩＲＲをリクルートし、次いで、下流のシグナル伝達分子であるインターロイキン−１レセプター関連キナーゼ（ＩＲＡＫ）およびＴＮＦレセプター関連因子６（ＴＲＡＦ６）を捕捉することにより、シグナル伝達を阻害する。ＳＩＧＩＲＲは、自然免疫応答の負の調節に関連する。このタンパク質は、多くの組織ならびに腎臓、結腸および他の粘膜組織における樹状細胞および上皮細胞を含む細胞において発現し、また、リポ多糖（ＬＰＳ）に応答してダウンレギュレートされる。したがって、ＳＩＧＩＲＲは、刺激されていない細胞における自然免疫応答を阻止することから、慢性炎症および敗血症などの有害な作用をおそらく阻害する（Ｔｈｏｍａｓｓｅｎ ｅｔ ａｌ，Ｃｙｔｏｋｉｎｅ １１（６）：３８９−９９（１９９９）；Ｐｏｌｅｎｔａｒｕｔｔｉ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ｎｅｔｗ １４（４）：２１１−８（２００３）；Ｗａｌｄ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ ４（９）：９２０−７（２００３）；Ｍａｎｔｏｖａｎｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｌｅｕｋｏｃ Ｂｉｏｌ ７５（５）：７３８−４２（２００４）；Ｏ’Ｎｅｉｌｌ，Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ ４（９）：８２３−４（２００３）；Ｇａｒｌａｎｄａ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １０１（１０）：３５２２−６（２００４））。

Ｗａｌｄおよび共同研究者ら［Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ ４（９）：９２０−７（２００３）］ならびにＧａｒｌａｎｄａおよび共同研究者ら［Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １０１（１０）：３５２２−６（２００４）］は、ノックアウトマウスを用いてＳＩＧＩＲＲの生理学的役割について研究した。彼らは、ＩＬ−１またはＬＰＳに対して応答した炎症および腸管の炎症の感受性が、ＳＩＧＩＲＲ欠損マウスのほうが野生型マウスよりも高いことを示した。これらの著者らは、ＳＩＧＩＲＲが、自然免疫応答を調節するのに必須であり、消化管における炎症を制御するために重要であり得ると結論付けた。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ １８ ２０ ５４
予測値 １３．５ ２７ １３．５ ５４
カイ二乗値＝０．７３ 有意性＝０．６９４１９６６４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜９をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２３０５９．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨および脂肪以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３８６４９（ＵＮＱ３０１）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト単一ＩｇＩＬ−１Ｒ関連分子（ＳＩＧＩＲＲ）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、末梢血中のＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下ならびに平均血清ＩｇＡレベルの低下をもたらした。ホモ接合性マウスはまた、疼痛応答の低下（熱誘導性疼痛に対する感度の低下）を示した。さらに、変異雄（−／−）および（＋／−）マウスは、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルの上昇を示した。放射線学の結果は、雌（−／−）マウスが骨塩量および骨塩密度指標の測定値の低下を示したことを示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）表現型解析：心臓学
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠動脈疾患、異常脂肪血症（例えば、高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの増加（高トリグリセリド血症））、糖尿病および／または肥満症の処置のための標的を本明細書中で同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。

代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的が同定され得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血液化学試験のために使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的が同定され得る。

血中脂質
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートを、このアッセイで試験した。高いコレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの上昇は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：雄（−／−）および（＋／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルおよび平均血清中トリグリセリドレベルの上昇を示した［（−／−）雄において２ＳＤ超のコレステロール；（＋／−）マウスにおいて２ＳＤ超のコレステロール；（−／−）雄において１〜２ＳＤ超のトリグリセリド］。

上でまとめられたように、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルの著しい上昇を示した。したがって、ＰＲＯ３４２遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患のモデルとして役立ち得る。ＰＲＯ３４２ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の制御に有用であり得る。したがって、ＰＲＯ３４２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および／または肥満症のような心血管疾患の処置に有用であり得る。
（ｃ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
（１）蛍光標識細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
ＣＤ４、ＣＤ８およびＴ細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のＦＡＣＳ解析を実施して、Ｔリンパ球、Ｂリンパ球に対するＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５およびナチュラルキラー細胞に対するｐａｎ ＮＫを評価した。ＦＡＣＳ解析は、２匹の野生型および６匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。

これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のＣＤ４およびＣＤ８陽性のＴ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−レーザーＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞および単球の数を記録する。６つの系統特異的抗体のパネル：ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥおよびＣＤ１９ ＦＩＴＣを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。２種類のＦＩＴＣ標識抗体およびＰＥ標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用してサンプルを解析した。

結果：
ＦＡＣＳ３：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、計画実行用の（＋／＋）マウスおよび歴史的平均と比較して、ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの減少を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。

（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、細胞集団中のＣＤ４細胞の平均パーセンテージの減少を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。

したがって、ＰＲＯ３４２ポリペプチドをコードする遺伝子をノックアウトすることにより、Ｔ細胞集団の減少が引き起こされる。これらの観察結果から、ＰＲＯ３４２ポリペプチドまたはＰＲＯ３４２をコードする遺伝子が、Ｔ細胞増殖の制御因子として作用するようである。したがって、ＰＲＯ３４２ポリペプチドは、Ｔ細胞増殖の増強に有益であり得る。
（２）血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、計画実行用の（＋／＋）マウスおよび歴史的中央値と比較して、平均血清中ＩｇＡレベルの低下を示した。

これらの結果から、これらのノックアウトマウスに関連する表現型が、ＩｇＡにおける免疫グロブリン欠損を示唆する。最もよくある免疫グロブリン欠損の遺伝型は、８００人中約１人に見られる選択的ＩｇＡ欠損である。ＩｇＡは、細菌のトキシンおよびウイルスを中和し得る上皮細胞保護体として主に機能する。明らかでない疾患の感受性が選択的ＩｇＡ欠損と関連するが、その感受性は、通常の集団よりも慢性肺疾患を有する人々においてよくあることである。このことは、ＩｇＡの欠損が、様々な病原体による肺感染症に対する素因をもたらし得、そして体表での防御におけるＩｇＡの役割と一致することを示唆する。したがって、ＰＲＯ３４２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、皮膚感染症に対する天然の免疫保護として保護の際に重要な役割を果たし、より重要には、肺感染症に対する感受性を予防し得る。
（ｄ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。

ホットプレート試験
試験の説明：侵害受容についてのホットプレート試験を、各マウスを小型の閉鎖系である５５℃のホットプレートに置くことによって実施する。ホットプレート上での最大時間を３０秒として、後肢応答（なめる、振るまたは跳ねる）までの時間を記録する。各動物を１回試験する。

結果：
ホットプレート：ホットプレート試験での応答までの時間が、（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、（−／−）マウスでは長かったことから、変異体では急性疼痛に対する感度が低下していることが示唆される。
（ｅ）骨代謝および全身診断学：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

骨マイクロＣＴ解析：
手順：マイクロＣＴを使用して、非常に感度の高いＢＭＤの測定を行った。１つの椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の５つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、１６マイクロメートルの解像度で第５腰部椎骨（ＬＶ５）において解析し、皮質骨パラメータを、２０マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。

結果：
Ｄｅｘａ：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、全身、大腿骨および椎骨における平均骨塩量、骨塩密度指標および骨塩密度の減少を示した。

Ｄｅｘａおよび骨マイクロＣＴ解析により解析された（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較して骨測定値の低下を示した。このことから、異常な骨障害が示唆される。（−／−）マウスは、骨代謝障害を反映する異常な骨測定値の減少を含む負の骨表現型を示した。その負の骨表現型は、ＰＲＯ３４２ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、ＰＲＯ３４２ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、ＰＲＯ３４２ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト（またはインヒビター）は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む異常な骨障害または病理学的な骨障害に導き得る。

６６．１０．ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１（ＵＮＱ３１３）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ３５６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１と命名）（ＵＮＱ３１３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＢＣ０２３３７３ アクセッション：ＢＣ０２３３７３ ＮＩＤ：１９４８３９４１ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス、アンジオポエチン様因子に類似、クローンＭＧＣ：３２４４８ ＩＭＡＧＥ：５０４３１５９；参照タンパク質：Ｑ８Ｒ１Ｑ３ アクセッション：Ｑ８Ｒ１Ｑ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。アンジオポエチン様因子（ムス・ムスクルス １３日の胚の雄精巣ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：６０３０４８２Ｄ０４産物：ＣＤＴ６（アンジオポエチン様因子）（ＣＤＴ６ タンパク質）ホモログ）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２１１４６ アクセッション：ＮＭ＿０２１１４６ ＮＩＤ：２０１２７５９５ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス アンジオポエチン様因子（ＣＤＴ６）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｏ４３８２７ アクセッション：Ｏ４３８２７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＣＤＴ６（アンジオポエチン様因子）（ＣＤＴ６タンパク質）。

ヒトＣＤＴ６（角膜由来転写物６）のオルソログである目的のマウス遺伝子は、「アンジオポエチン様因子に類似」として定義されている。別名としては、アンジオポエチン様因子、ＡｎｇＸおよびｄＪ６４７Ｍ１６．１が挙げられる。

ＣＤＴ６は、角膜支質において発現している分泌タンパク質であり、おそらくリガンドとして機能する。ＣＤＴ６は、概して血管新生を制御するレセプターに結合するアンジオポエチンファミリーのタンパク質と構造的に類似である。マウス異種移植片モデルにおいて、ＣＤＴ６は、腫瘍成長および異常な血管形成を阻害し、細胞外マトリックスの蓄積を刺激した。したがって、ＣＤＴ６は、おそらく角膜における血管新生を阻害し、角膜の表現型を誘導するモルフォゲンとして機能する。しかしながら、抗腫瘍薬剤としてのＣＤＴ６の可能性は、疑わしい（Ｐｅｅｋ ｅｔ ａｌ，Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ３９（１０）：１７８２−８（１９９８）；Ｐｅｅｋ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（１）：６８６−９３（２００２）；Ｂｏｕｉｓ ｅｔ ａｌ，Ｉｎ Ｖｉｖｏ １７（２）：１５７−６１（２００３））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １９ ４５ １４ ７８
予測値 １９．５ ３９ １９．５ ７８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＢＣ０２３３７３）。
カイ二乗値＝０．２１ 有意性＝０．９００３２４５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６
平均同腹仔数＝９
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（心臓以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．１０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１（ＵＮＱ３１３）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト角膜由来転写物６（ＣＤＴ６）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおける骨塩密度測定値の増加をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）骨代謝および全身診断学：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

骨マイクロＣＴ解析：
手順：マイクロＣＴを使用して、非常に感度の高いＢＭＤの測定を行った。１つの椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の５つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、１６マイクロメートルの解像度で第５腰部椎骨（ＬＶ５）において解析し、皮質骨パラメータを、２０マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、全身および大腿骨における体積測定による平均骨塩密度の増加を示した。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、大腿骨中軸の平均断面積の増加を示した。

雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、骨塩量の増加ならびに全身および大腿骨中軸の断面積の増加を示した。これらの結果から、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病のような骨の異常に関連し得ることが示唆される。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、ＰＲＯ３５６ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。骨塩量ならびに全身および大腿骨の骨塩密度の増加に関する表現型から、これらの作用を模倣する物質（例えば、ＰＲＯ３５６ポリペプチドのアンタゴニスト）が、骨の治癒に有用であり得ることが示唆される。

６６．１１．ＤＮＡ４４１８９−１３２２（ＵＮＱ３４１）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ５４０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ４４１８９−１３２２と命名）（ＵＮＱ３４１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１３３７９２ ムス・ムスクルスリゾホスホリパーゼ３（Ｌｙｐｌａ３）；参照タンパク質：Ｑ８ＶＥＢ４ アクセッション：Ｑ８ＶＥＢ４ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＬＣＡＴ様リゾホスホリパーゼ（リソソームのホスホリパーゼＡ２）に類似；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１２３２０ アクセッション：ＮＭ＿０１２３２０ ＮＩＤ：ｇｉ２０３０２１５０ ｒｅｆ ＮＭ＿０１２３２０．２ ホモ・サピエンスリゾホスホリパーゼ３（リソソームのホスホリパーゼＡ２）（ＬＹＰＬＡ３）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８ＮＣＣ３ アクセッション：Ｑ８ＮＣＣ３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＦＬＪ９０３４７。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＬＹＰＬＡ３（リゾホスホリパーゼ３［リソソームホスホリパーゼＡ２］）のオルソログであるＬｙｐｌａ３（リゾホスホリパーゼ３）である。別名としては、ＡＣＳ、ＬＬＰＬ、ＬＰＬＡ２、リソソームホスホリパーゼＡ２、ＤＫＦＺｐ５６４Ａ０１２２、１−Ｏ−アシルセラミドシンターゼおよびＬＣＡＴ様リゾホスホリパーゼが挙げられる。

ＬＹＰＬＡ３は、リン脂質におけるｓｎ−２位のアシル基をセラミドのＣ−１ヒドロキシル基に移行させるのを触媒して、１−Ｏ−アシルセラミドを形成する、アシルトランスフェラーゼとして機能するリソソームの酵素であり得る。セラミドが存在しない場合、この酵素は、ホスホリパーゼとしても機能し得、リン脂質からリゾホスホリピドおよび遊離脂肪酸を形成する。この酵素は、弱いリゾホスホリパーゼ活性も有し得、そして血漿中で検出される。ＬＹＰＬＡ３は、カルシウム非依存性であり、必要に応じて酸性ｐＨで活性であり、多岐に亘る組織において発現している（Ｔａｎｉｙａｍａ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ２５７（１）：５０−６（１９９９）；Ｈｉｒａｏｋａ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（１２）：１００９０−９（２００２））。ＬＹＰＬＡ３は、肺胞マクロファージによる肺サーファクタント異化において役割を果たし得る（Ａｂｅ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７９（４１）：４２６０５−１１（２００４））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ３３ １９ ７５
予測値 １８．７５ ３７．５ １８．７５ ７５
カイ二乗値＝１．５３ 有意性＝０．４６５３３３９４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１３３７９２．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．１１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ４４１８９−１３２２（ＵＮＱ３４１）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトリゾホスホリパーゼ３（リソソームのホスホリパーゼＡ２）（ＬＹＰＬＡ３）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、雄（−／−）マウスにおける骨塩密度測定値の減少をもたらした。ノックアウトマウスはまた、耐糖能障害を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）骨代謝および全身診断学：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

骨マイクロＣＴ解析：
手順：マイクロＣＴを使用して、非常に感度の高いＢＭＤの測定を行った。１つの椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の５つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、１６マイクロメートルの解像度で第５腰部椎骨（ＬＶ５）において解析し、皮質骨パラメータを、２０マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均に対する値と比較して、平均骨塩量ならびに全身大腿骨および椎骨における骨塩密度の減少を示した。しかしながら、椎骨骨塩密度における差は、中央値より約１ＳＤ小さかった。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のものと比較して、大腿骨中軸の平均断面積の減少を示した。

Ｄｅｘａおよび骨マイクロＣＴ解析によって解析された（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較して、異常な骨障害を示唆する、骨の測定値の減少を示した。その（−／−）マウスは、負の骨表現型を示し、骨の代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した。骨の負の表現型は、ＰＲＯ５４０ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、ＰＲＯ５４０ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、ＰＲＯ５４０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト（またはインヒビター）は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的な骨障害に導き得る。
（ｃ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態：１型糖尿病および２型糖尿病、シンドロームＸ、様々な循環器疾患および／または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。

手順：２匹の野生型および４匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。２０％溶液として送達される２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースを動物にＩＰ注射し、血糖値を注射の０、３０、６０および９０分後に測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
雄（−／−）マウスは、高脂肪食を与えられたとき、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して耐糖能障害を示した。

これらの研究では、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が減少を示したかまたは耐糖能障害を示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示し、それゆえ、ＰＲＯ５４０ポリペプチド（またはそのアゴニスト）またはそれをコードする遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または糖尿病を含む様々な循環器疾患に関連した状態の処置に有用であり得る。

６６．１２．ＤＮＡ４９１５２−１３２４（ＵＮＱ３５４）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ６１８ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ４９１５２−１３２４と命名）（ＵＮＱ３５４）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＢＣ０２９６４５ アクセッション：ＢＣ０２９６４５ ＮＩＤ：２０９８７２８５ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス膜貫通セリンプロテアーゼ６，ｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：２５８５７ＩＭＡＧＥ：４１９５４８６）；参照タンパク質：Ｑ９ＤＢＩ０ アクセッション：Ｑ９ＤＢＩ０ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。１３００００８Ａ２２ＲＩＫタンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５３６０９ ホモ・サピエンス膜貫通プロテアーゼ，セリン６（ＴＭＰＲＳＳ６）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８ＩＵ８０ アクセッション：Ｑ８ＩＵ８０ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼ６。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＴＭＰＲＳＳ６のオルソログであるＴｍｐｒｓｓ６（膜貫通セリンプロテアーゼ６）である。別名としては、１３００００８Ａ２２Ｒｉｋ、マトリプターゼ（ｍａｔｒｉｐｔａｓｅ）２、ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼ６、ＦＬＪ３０７４４および膜結合モザイクセリンプロテイナーゼが挙げられる。

ＴＭＰＲＳＳ６は、主に肝臓において発現し、細胞外マトリックスタンパク質の加水分解を触媒するトリプシン様セリンプロテアーゼとして機能するＩＩ型原形質膜タンパク質である。ＴＭＰＲＳＳ６は、肝臓における細胞外マトリックスリモデリングにおいて役割をおそらく果たす。ＴＭＰＲＳＳ６は、侵襲性の腺細胞癌腫を増大させることから、ＴＭＰＲＳＳ６は、転移においても役割を果たし得ると示唆されている（Ｈｏｏｐｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ ３７３（Ｐｔ３）：６８９−７０２（２００３）；Ｏｖｅｒａｌｌ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ３８５（６）：４９３−５０４（２００４）；Ｖｅｌａｓｃｏ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（４０）：３７６３７−４６（２００２））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２６ ４１ １４ ８１
予測値 ２０．２５ ４０．５ ２０．２５ ８１
カイ二乗値＝２．０５ 有意性＝０．３５８７９６４８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２１
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜３をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２７９０２．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された１３のすべての成体組織サンプル（胸腺、脾臓、肺、骨格筋、骨および脂肪以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．１２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ４９１５２−１３２４（ＵＮＱ３５４）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト膜貫通セリンプロテアーゼ６（ＴＭＰＲＳＳ６）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、体重および体長、総組織質量ならびに除脂肪体重の減少ならびに骨塩量の減少および骨塩密度の測定値の減少を含む成長遅延の徴候を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。変異（−／−）マウスはまた、貧血の徴候および平均血小板数の増加も示した。概日性試験により、概日リズムがないこと（またはその機能低下）が明らかになった。さらに、変異体は、ＲＢＣまたはヘモグロビンの欠損を示唆する異常な赤血球を特徴とする脱毛症、血色素減少症および赤血球大小不同症を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学
肉眼的：（−／−）マウスは、脱毛症および表皮性角質増殖を示した。
顕微鏡的：（−／−）マウスは、赤血球またはヘモグロビンの産生の欠陥を示唆する、ヘモグロビンが正常な数よりも少なく、骨髄および脾臓における赤血球形成の期待レベルよりも少ない異常な赤血球を特徴とする血色素減少症および赤血球大小不同症を示した。さらに、（−／−）変異体は、びまん性脱毛症および表皮性角質増殖を示した。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学によって組織パネルにおいて検出されなかった。
（ｃ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
血液学解析：
試験の説明：血液試験は、Ａｂｂｏｔｔ社のＣｅｌｌ−Ｄｙｎ３５００Ｒ自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、５種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で２２を超えるパラメータが含まれ得る。

結果：
血液学：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均におけるレベルと比較して、平均ヘモグロビンレベルおよび平均ヘマトクリットレベルの低下ならびに平均赤血球数の増加を示した。さらに、平均血球体積および平均血球ヘモグロビンは、（−／−）マウスにおいて減少したが、赤血球細胞の分布幅が増大したことから、赤血球の大きさは、変異体において不定であることが示唆される。（−／−）マウスはまた、平均血小板数の増加を示した。

これらの結果は、貧血に関連する表現型に関係する。したがって、ＰＲＯ６１８ポリペプチド、そのアゴニストまたはＰＲＯ６１８ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に必須であるに違いなく、ゆえに貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。

さらに、（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血小板数の増加を示した。したがって、ＤＮＡ４９１５２−１３２４遺伝子が欠損した変異マウスは、凝血障害に関連する表現型を生じた。
（ｄ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。
（１）概日性試験の説明：
雌マウスを、試験の１日目の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、１２時間明／暗サイクル（午前７時に点灯し、午後７時に消灯する）に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、３日間の試験中、１時間間隔で６０回記録する。得られたデータは、３日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル（概日リズム）の中央値および各明／暗サイクル中の総活動性（自発活動性）の中央値によって示される。

結果：
概日性：雌（−／−）マウスは、１時間および１２時間の慣れ期間ならびにすべての明期および暗期の間の概日リズムのない機能低下および機能低下を示したことから、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均で測定されたレベルと比較して、試験の最後の２４時間の異常な睡眠／覚醒サイクルが示唆される。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の減少を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ６１８ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
（２）機能観察総合評価（ＦＯＢ）試験
ＦＯＢは、全身感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経機能を評価するＩｒｗｉｎ神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検知および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約１０分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。

結果：
８匹すべての（−／−）マウスが、毛の薄い柔皮および／またははげた斑を示した。

（ｅ）骨代謝および全身診断学
（１）組織質量および除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して総組織質量（ＴＴＭ）の変化を同定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨）の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。

結果：
雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した。
明らかな全体的外見：（−／−）マウスは、胸部および腹部の背側および腹側の領域における脱毛症を示した。（−／−）マウスのすべておよび（＋／−）マウスの数匹の尾は、側方弯曲またはわずかな屈曲を伴って短くなっていたように見られた。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄と雌の両方の（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、除脂肪体重ならびに骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。雄ノックアウトはまた、平均総組織質量（ＴＴＭ）の減少も示した。

ＰＲＯ６１８ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異（−／−）マウスは、平均総質量、除脂肪体重の減少を特徴とする、成長遅延および組織るいそう疾患と一致する表現型を示した。これらの結果は、上で報告した平均体重および平均体長の減少の観察結果と一致する。さらに、変異（−／−）マウスは、骨粗鬆症を示唆する、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。したがって、ＰＲＯ６１８ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連作用を模倣し得る。他方で、ＰＲＯ６１８ポリペプチドまたはそのアゴニストは、悪液質または他の組織るいそう疾患などの成長または疾患に関連するそのような代謝障害の予防および／または処置に有用であり得、ならびに骨減少に関連する骨障害の処置に有用であり得る。

６６．１３．ＤＮＡ５２１８５−１３７０（ＵＮＱ４８１）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ９４４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５２１８５−１３７０と命名）（ＵＮＱ４８１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１６６７４ ムス・ムスクルスクローディン１（Ｃｌｄｎ１）；参照タンパク質：Ｏ８８５５１ アクセッション：Ｏ８８５５１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。クローディン−１；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２１１０１ アクセッション：ＮＭ＿０２１１０１ ＮＩＤ：ｇｉ２１５３６２９７ ｒｅｆ ＮＭ＿０２１１０１．３ ホモ・サピエンスクローディン１（ＣＬＤＮ１）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｏ９５８３２ アクセッション：Ｏ９５８３２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。クローディン−１（老化関連上皮膜タンパク質）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＣＬＤＮ１のオルソログであるＣｌｄｎ１（クローディン１）である。別名としては、ＣＬＤ１、ＳＥＭＰ１および老化関連上皮膜タンパク質１が挙げられる。

ＣＬＤＮ１は、溶質および水の傍細胞輸送を制限する細胞間の障壁を形成する細胞接着分子であるタイトジャンクションの構成要素として機能する内在性原形質膜タンパク質である。ＣＬＤＮ１の細胞外セグメントは、隣接細胞上のクローディンと接着して相互作用し、側方に共重合することにより、タイトジャンクションストランドを形成する。ＣＬＤＮ１は、肝臓、気道上皮、膵臓、胎盤、副腎、前立腺および卵巣において発現する。ＣＬＤＮ１は、おそらく細胞の極性および透過性の維持および制御に重要な役割を果たす（Ｆｕｒｕｓｅ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １４１（７）：１５３９−５０（１９９８）；Ｓｗｉｓｓｈｅｌｍ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｅ ２２６（２）：２８５−９５（１９９９）；Ｈｅｉｓｋａｌａ ｅｔ ａｌ，Ｔｒａｆｆｉｃ ２（２）：９３−８（２００１）；Ｆｕｒｕｓｅ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １５６（６）：１０９９−１１１（２００２）；Ｃｏｙｎｅ ｅｔ ａｌ，Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｌｕｎｇ Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２８５（５）：Ｌ１１６６−７８（２００３）；Ｓａｓａｋｉ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １００（７）：３９７１−６（２００３））。

Ｆｕｒｕｓｅおよび共同研究者ら（２００２）は、ノックアウトマウスを用いてＣＬＤＮ１の生理学的役割を研究した。ＣＬＤＮ１ホモ接合ヌルマウスは、生後１日以内に死亡した。タイトジャンクションが、ＣＬＤＮ１ホモ接合ヌルマウスの表皮において明らかであるが、６００ダルトンの追跡用色素は、ＣＬＤＮ１ホモ接合ヌルマウスの表皮性タイトジャンクションを介して拡散したが、野生型マウスの表皮性タイトジャンクションを介して拡散しなかった。Ｆｕｒｕｓｅおよび共同研究者らは、ＣＬＤＮ１は、哺乳動物の皮膚において障壁機能に必要であると結論付けた。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ４０ ２ ６０
予測値 １５．０ ３０ １５．０ ６０
カイ二乗値＝１２．７２ 有意性＝０．００１７２９３６６５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１２
平均同腹仔数＝９
変異型：相同組換え（標準）
コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１６６７４．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨、心臓および脂肪以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．１３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５２１８５−１３７０（ＵＮＱ４８１）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトクローディン１（ＣＬＤＮ１）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の致死性をもたらした。（−／−）仔は、遺伝子型同定の時点で死亡していた。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：１２．５日目に、４１個の胚：９個の（−／−）胚、２０個の（＋／−）胚、８個の（＋／＋）胚、２個の再吸収モル、１個の未定胚および１個の不確定な胚が観察された。１２．５日目の変異体胚において、発達異常は、組織学的検査によっては検出されなかった。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

致死性の胚の発達異常に関連する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない）によって生じるか、または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死マウスは、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性（＋／−）変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。

６６．１４．ＤＮＡ５８８５５−１４２２（ＵＮＱ５１８）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ９９４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５８８５５−１４２２と命名）（ＵＮＱ５１８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２５４５３ アクセッション：ＮＭ＿０２５４５３ ＮＩＤ：ｇｉ １３３８４８５７ ｒｅｆ ＮＭ＿０２５４５３．１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ １８１００１８Ｌ０２遺伝子（１８１００１８Ｌ０２Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９ＣＱＹ８ アクセッション：Ｑ９ＣＱＹ８ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。１８１００１８Ｌ０２Ｒｉｋタンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２４７９５ アクセッション：ＮＭ＿０２４７９５ ＮＩＤ：ｇｉ１３３７６１６５ ｒｅｆ ＮＭ＿０２４７９５．１ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＦＬＪ２２８００（ＦＬＪ２２８００）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９Ｈ５Ｘ９ アクセッション：Ｑ９Ｈ５Ｘ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＦＬＪ２２８００。

目的のマウス遺伝子は、ヒト仮説タンパク質ＦＬＪ２２８００のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ１８１００１８Ｌ０２遺伝子である。

仮説タンパク質ＦＬＪ２２８００は、シグナルペプチドおよびＬ６膜タンパク質ドメイン内に含まれる４回膜貫通ドメインからなる推定内在性原形質膜タンパク質である（ＰｆａｍアクセッションＰＦ０５８０５）。この仮説タンパク質の機能は未知である；しかしながら、他のＬ６膜ファミリーメンバーは、癌と関係している（Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉ ９（８）：１５９４−６００（２０００））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ４１ ２３ ８０
予測値 ２０ ４０ ２０ ８０
カイ二乗値＝１．６２ 有意性＝０．４４４８５８０７（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２５４５３．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、骨格筋および骨以外の１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．１４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５８８５５−１４２２（ＵＮＱ５１８）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説タンパク質（ＦＬＪ２２８００）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおける不安関連応答の低下をもたらした。ＵＮＱ５１８は、他の組織と比較して膵臓および小腸において高レベルで発現している。（−／−）マウスはまた、運動協調性の増大を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を計測するためのオープンフィールドを含んだ。

オープンフィールド試験：
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン（ｓｅｒａｔｏｎｉｎ）トランスポーター、ドーパミントランスポーター（Ｇｉｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．１９９６ Ｆｅｂ １５；３７９（６５６６）：６０６−１２）およびＧＡＢＡレセプター（Ｈｏｍａｎｉｃｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．１９９７ Ａｐｒ １５；９４（８）：４１４３−８）のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド（４０×４０ｃｍ）をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、４つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。３つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域（４０ｃｍ×４０ｃｍ、ＡｃｃｕＳｃａｎ ＩｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓのＶｅｒｓａＭａｘ動物活動性モニターシステム）を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を２０分間測定した。この試験のデータを４分間隔で５回分析した。全移動距離（ｃｍ）、垂直移動回数（直立）、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。

マウスが新しい環境に対して正常な慣れ応答を示す傾向を、５回の間隔にわたるその水平自発運動の変化すべてを測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは５回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な慣れは、負の傾きの値によって表される。

結果：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、オープンフィールド試験中の中心にいる時間の合計の中央値の増加を示したことから、変異体における不安様応答の低下が示唆される。

注目すべき差が、オープンフィールド活動性試験中に観察された。雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、中心領域にいる時間の合計の中央値の増加を示した。これは、変異体における不安様応答の低下を示唆する。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏ならびに感覚障害および／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ９９４ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。

概日性試験の説明：
雌マウスを、試験の１日目の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、１２時間明／暗サイクル（午前７時に点灯し、午後７時に消灯する）に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、３日間の試験中、１時間間隔で６０回記録する。得られたデータは、３日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル（概日リズム）の中央値および各明／暗サイクル中の総活動性（自発活動性）の中央値によって示される。
結果：
概日性：雌（−／−）マウスは、１２時間の慣れ期間ならびにすべての明期および暗期の間の歩行活動性の低下を示したことから、その性別一致（＋／＋）同腹仔で測定されたレベルおよび歴史的平均と比較して、試験の最後の２４時間の異常な睡眠／覚醒サイクルが示唆される。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の減少を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ９９４ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。

反転スクリーン試験：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートに対して行動スクリーニングを行った。生存能低下によってより早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験を１２〜１６週齢で行った。これらの試験には、不安、活動レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。

反転スクリーン試験データ：
反転するスクリーンを使用して、運動力／共調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形（７．５ｃｍ×７．５ｃｍ）のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を１８０°回転させた。以下の行動応答を、１分間の試験にわたって記録した：落下、登上せず、および登上。

結果：
遺伝子型 落下率 ％ 登上率 ％
＋／＋（ｎ＝８） ０／８ ０ ４／８ ５０
−／−（ｎ＝８） ０／８ ０ ８／８ １００
野生型集団 落下３．６２％ 登上６０．０４％
運動力の欠損は、（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスと（＋／＋）マウスとの間で落下応答が５０％異なる場合に明らかである。登上しなかった０／８もしくは１／８匹の（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスは、運動協調性障害を示す。登上した７／８もしくは８／８匹の（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスは、運動協調性の増強を示す。

反転スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するように設定する：
８匹の（−／−）マウスのうち、８匹すべての（−／−）マウスがスクリーンに登上したのに対して、４／８（＋／＋）マウスが登上した。この結果から、変異体の運動協調性の増大が示唆される。

６６．１５．ＤＮＡ５６０５０−１４５５（ＵＮＱ５３６）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５６０５０−１４５５と命名）（ＵＮＱ５３６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２９５３７ アクセッション：ＮＭ＿０２９５３７ ＮＩＤ：ｇｉ２２０９５００６ ｒｅｆ ＮＭ＿０２９５３７．１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ６５３０４１１Ｂ１５遺伝子（６５３０４１１Ｂ１５Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９１Ｘ８６ アクセッション：Ｑ９１Ｘ８６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。未知（ＭＧＣについてのタンパク質：１９３０４）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１５５４４ アクセッション：ＮＭ＿０１５５４４ ＮＩＤ：ｇｉ７６６１６１５ ｒｅｆ ＮＭ＿０１５５４４．１ ホモ・サピエンス ＤＫＦＺＰ５６４Ｋ１９６４タンパク質（ＤＫＦＺＰ５６４Ｋ１９６４）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９Ｙ２Ｙ６ アクセッション：Ｑ９Ｙ２Ｙ６ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＴＡＤＡ１タンパク質（ＤＫＦＺＰ５６４Ｋ１９６４タンパク質）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＤＫＦＺＰ５６４Ｋ１９６４タンパク質のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ６５３０４１１Ｂ１５遺伝子である。別名としては、ＴＡＤＡ１タンパク質、ＥＴＶＶ５３６およびＵＮＱ５３６が挙げられる。

ＤＫＦＺＰ５６４Ｋ１９６４タンパク質は、推定分泌タンパク質であり、弱く予測されるシグナルペプチドからなり、他の保存されたドメインを含まない。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １１ ３１ ２ ４４
予測値 １１ ２２ １１ ４４
カイ二乗値＝１３．０６ 有意性＝０．００１４５９００５５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０９
平均同腹仔数＝７
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２９５３７．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。（−／−）マウスの生存能低下が観察された。同定された（−／−）マウスのうちの７匹が胎仔サンプルとして提出された。
６６．１５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５６０５０−１４５５（ＵＮＱ５３６）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト推定分泌タンパク質のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体において大きな生存能低下をもたらした。同定された（−／−）マウスのうち７匹が、胚サンプルとして提出された。２匹の生存変異体のうち、雄は、血圧解析の後すぐに死亡したが、雌は、大部分のレベル１試験を経験した。ホモ接合性変異体は、貧血を含む多くの免疫学的異常を示した。オープンフィールド試験の結果により、変異（−／−）マウスにおける活動亢進が示唆される。１匹の雄（−／−）マウスは、総組織質量および除脂肪体重の減少を示したが、雌（−／−）ノックアウトは、総組織質量、脂肪質量（ｇ）および％総体脂肪の増加を示した。１匹のマウスは、網膜出血を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：１２．５日目に、３９個の胚：７個の（−／−）胚、９個の（＋／−）胚、９個の（＋／＋）胚、４個の再吸収モルおよび１０個の不確定な胚が観察された。（−／−）胚は、概してその（＋／＋）同腹仔よりも小さかったが、他の発達異常は、１２．５日目の胚においては検出されなかった。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび２匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を計測するためのオープンフィールドを含んだ。

オープンフィールド試験：
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニントランスポーター、ドーパミントランスポーター（Ｇｉｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．１９９６ Ｆｅｂ １５；３７９（６５６６）：６０６−１２）およびＧＡＢＡレセプター（Ｈｏｍａｎｉｃｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．１９９７ Ａｐｒ １５；９４（８）：４１４３−８）のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド（４０×４０ｃｍ）をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、４つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。３つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域（４０ｃｍ×４０ｃｍ、ＡｃｃｕＳｃａｎ ＩｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓのＶｅｒｓａＭａｘ動物活動性モニターシステム）を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を２０分間測定した。この試験のデータを４分間隔で５回分析した。全移動距離（ｃｍ）、垂直移動回数（直立）、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。

マウスが新しい環境に対して正常な慣れ応答を示す傾向を、５回の間隔にわたるその水平自発運動の変化すべてを測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは５回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な慣れは、負の傾きの値によって表される。

結果：
不安：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、オープンフィールド試験中の総移動距離の合計の増加を示したことから、変異体における活動亢進または不安様応答の増大が示唆される。

まとめると、オープンフィールド試験により、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安および／もしくは双極性障害；活動亢進；感覚障害；強迫性障害、精神分裂病または妄想性人格に関連し得る不安の増大に関連する表現型が明らかになった。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、そのような神経障害の処置に有用であり得る。
（ｄ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
（１）血液学解析：
試験の説明：血液試験は、Ａｂｂｏｔｔ社のＣｅｌｌ−Ｄｙｎ３５００Ｒ自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、５種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で２２を超えるパラメータが含まれ得る。

結果：
血液学：解析に利用可能な雌（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血球体積および赤血球分布幅の増大を伴う、赤血球数、ヘモグロビン濃度およびヘマトクリットの減少を示す貧血性であった。

これらの結果は、貧血に関連する表現型に関係する。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチド、そのアゴニストまたはＰＲＯ１０７９ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に必須であるに違いなく、ゆえに、貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。

（２）蛍光標識細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
ＣＤ４、ＣＤ８およびＴ細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のＦＡＣＳ解析を実施して、Ｔリンパ球、Ｂリンパ球に対するＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５およびナチュラルキラー細胞に対するｐａｎ ＮＫを評価した。ＦＡＣＳ解析は、２匹の野生型および１匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。

これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のＣＤ４およびＣＤ８陽性のＴ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−レーザーＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞および単球の数を記録する。６つの系統特異的抗体のパネル：ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥおよびＣＤ１９ ＦＩＴＣを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。２種類のＦＩＴＣ標識抗体およびＰＥ標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用してサンプルを解析した。

結果：
ＦＡＣＳ３：解析した１匹の雌（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ナチュラルキラー細胞のパーセンテージの増加を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。

ＦＡＣＳ結果から、ホモ接合性変異マウスにおいてナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージが増加したことが示される。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、ＮＫ細胞集団の負の制御因子として機能する。ナチュラルキラー細胞は、ウイルスの免疫および腫瘍に対する防御に関係するので、これらの細胞は、ウイルス感染に対する防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞すなわちＮＫ細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害におけるエフェクターとして作用し、それらは、事前の免疫または活性化の必要なしに、特定のリンパ系腫瘍細胞株をｉｎ ｖｉｔｒｏにおいて殺滅する能力によって同定されてきた。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害に重要であるＮＫ細胞の産生に有用であり得る。

（３）卵白アルブミン負荷
手順：このアッセイは、７匹の野生型および２匹のホモ接合体において行った。ニワトリ卵白アルブミン（ＯＶＡ）は、Ｔ細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。ＯＶＡは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。ＯＶＡに対するマウスの免疫応答は、Ｔ細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが、同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗ＯＶＡ抗体を、免疫処置の８〜１０日後に酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＺＡ）を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠損性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。

上記のように、このプロトコルでは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力が評価される。動物に５０ｍｇのニワトリ卵白アルブミン（完全フロイントアジュバント中に乳化）をＩＰ注射し、１４日後に、抗卵白アルブミン抗体（ＩｇＭ、ＩｇＧ１およびＩｇＧ２サブクラス）の血清力価を測定した。血清サンプル中のＯＶＡ特異的抗体の量は、９６ウェルサンプルプレートをスキャンする装置によって得られる光学密度（ＯＤ）値に比例する。データは、各血清サンプルの一組の連続希釈物に対して収集した。

この負荷の結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清ＩｇＧ１応答および平均血清ＩｇＧ２ａ応答の低下（低い／全くない）を示した。

要約すると、卵白アルブミン負荷試験は、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較すると免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異マウスは、Ｔ細胞依存性ＯＶＡ抗原で攻撃すると、免疫学的応答を生じる能力の低下を示した。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫系の刺激（例えば、Ｔ細胞増殖など）に有用であり得、この効果が個体に有益であり得る場合（例えば、白血病および他のタイプの癌の場合などにおいて、ならびに免疫無防備状態の患者（例えば、ＡＩＤＳ罹患者））において有用性が見出され得る。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）は、免疫応答の阻害に有用であり得、このため、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
（ｅ）心臓血管表現型解析：
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。１つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比（Ａ／Ｖ比）を測定した。異常なＡ／Ｖ比は、高血圧（および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患）、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下：網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。

手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体および１匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、Ｈａｗｅｓおよび共同研究者ら（Ｈａｗｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９９９ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｖｉｓｉｏｎ １９９９；５：２２）に従って改変したＫｏｗａ Ｇｅｎｅｓｉｓ小動物用眼底カメラを用いて覚醒時の動物において行った。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得が可能となった。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈（Ａ／Ｖ）比を測定した。

眼科学的解析は、作製したＦ２の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体の変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行った。具体的には、Ａ／Ｖ比は、Ｋｏｗａ ＣＯＭＩＴ＋ソフトウェアを用いて眼底像に従って測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔でカラー写真を撮影する：像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比（Ａ／Ｖ）は、静脈直径に対する動脈直径（血管の分岐部の前で測定）の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性（色素性網膜炎として知られる）または網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体（−／−）およびヘテロ接合体（＋／−）変異型子孫において、野生型（＋／＋）同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、そのような病理状態を示唆し得る。

結果：
眼底：１匹の（−／−）（Ｍ−９９）マウスは、動静脈比の解析を妨げる網膜出血を示した。
血管造影：１匹の（−／−）マウス（Ｍ−９９）は、網膜血管漏出を示した。

そのような検出された網膜の変化は、高血圧症（および、高血圧症、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患）、糖尿病または網膜変性症などの眼科学的障害に対応する他の眼球の疾患の血管系の疾患に関連し得る循環器の疾患または障害に最もよく関連するものである。したがって、ＰＲＯ１０７９コード遺伝子のアンタゴニストは、類似の病理学的な網膜の変化に導き得る一方で、アゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症または網膜変性症およびこの状態（上で同定されたような）に関連する疾患を含む他の眼科学的（ｏｐｔｈａｍｏｌｏｇｉｃａｌ）障害の処置における治療薬として有用であり得る。
（ｆ）骨代謝および全身診断学／放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび１匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
Ｄｅｘａ：解析に利用可能な１匹の雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、総組織質量および除脂肪体重の減少を示した一方で、解析した雌（−／−）マウスは、総組織質量（ＴＴＭ）、総脂肪質量および総体脂肪パーセント（１匹の（−／−）雌マウスは、３４％の体脂肪を有した）の増加を示した。

Ｄｅｘａにより解析した雄（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較して、総組織質量および除脂肪体重の顕著な減少ならびに骨測定値の減少を示し、このことから、これらの変異体における成長遅延が示唆される。これらの観察結果は、ノックアウトマウスにおいて示された生存能低下と一致する。このことと体重および体長の減少の観察結果とを結びつけることにより、成長遅延、悪液質または他の成長関連障害などの組織るいそう状態が示唆される。したがって、ＰＲＯ１０７９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長障害および／または生存能の低下の処置または予防に有用であり得る。雌（−／−）マウスが、体脂肪が著しく増加した肥満症の徴候を示したことは、興味深い。

６６．１６．ＤＮＡ５８７２７−１４７４（ＵＮＱ５５３）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１１１０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５８７２７−１４７４と命名）（ＵＮＱ５５３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１６９６９ アクセッション：ＮＭ＿０１６９６９ ＮＩＤ：ｇｉ８３９３７９９ ｒｅｆ ＮＭ＿０１６９６９．１ ムス・ムスクルスミエロイド関連分化マーカー（Ｍｙａｄｍ）；参照タンパク質：Ｏ３５６８２ アクセッション：Ｏ３５６８２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ミエロイド関連分化マーカー（ミエロイドをアップレギュレートするタンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１３８３７３ ホモ・サピエンスミエロイド関連分化マーカー（ＭＹＡＤＭ）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９６Ｓ９７ アクセッション：Ｑ９６Ｓ９７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ミエロイド関連分化マーカー（ＳＢ１３５）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＭＹＡＤＭのオルソログであるＭｙａｄｍ（ミエロイド関連分化マーカー）である。別名としては、Ｄ７Ｗｓｕ６２ｅが挙げられる。

ＭＹＡＤＭは、２つのＭＡＲＶＥＬドメイン内に含まれる８回膜貫通セグメントからなるおそらく内在性原形質膜タンパク質である。ＭＡＲＶＥＬドメインは、輸送ベシクル生合成に関与する脂質関連タンパク質に見られることが多い（ＰｆａｍアクセッションＰＦ０１２８４）。ＭＹＡＤＭは、骨髄性細胞において発現しており、おそらくミエロイド分化に関係する（Ｐｅｔｔｅｒｓｓｏｎ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｌｅｕｋｏｃ Ｂｉｏｌ ６７（３）：４２３−３１（２０００）；Ｃｕｉ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｒｅｐ ２８（３）：１２３−３８（２００１））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １１ ３３ １６ ６０
予測値 １５ ３０ １５ ６０
カイ二乗値＝４．２４ 有意性＝０．１２００３１６４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２４
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１６９６９．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、骨および脂肪以外の１３のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．１６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５８７２７−１４７４（ＵＮＱ５５３）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトミエロイド関連分化マーカー（ＭＹＡＤＭ）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおいてＬＰＳ負荷に対するＴＮＦアルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の増大をもたらした。さらに、高脂肪食を与えられた変異（−／−）マウスは、わずかに耐糖能が増大した。変異（−／−）マウスは、驚愕応答がなかったかまたは驚愕応答の低下を示し、難聴が示唆される。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。

（ｂ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
急性期反応：
試験の説明：細菌のリポ多糖（ＬＰＳ）は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルＩのＬＰＳマウスの腹腔内に（ｉ．ｐ．）、２００μＬ滅菌食塩水中の致死量未満の用量のＬＰＳを２６ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、１μｇ／ｇ体重とした。注射の３時間後に１００μＬの血液サンプルを採取し、ＴＮＦａ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６の存在をＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置で解析した。

結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の増大を示した。

まとめると、ＬＰＳエンドトキシン負荷により、ＰＲＯ１１１０ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、ＬＰＳエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答（ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６産生）を誘発する能力の増大を示したことから、炎症誘発性応答が示唆される。ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６は、後期のＢ細胞活性化に寄与する。ＴＮＦ−アルファは、重要な炎症性メディエーターである。さらに、ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６は、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。ＴＮＦ−アルファは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルに代わり得る（したがって、エフェクター分子として働く）。このことは、ＰＲＯ１１１０ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ１１１０ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
（ｃ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態：１型糖尿病および２型糖尿病、シンドロームＸ、様々な循環器疾患および／または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。

手順：２匹の野生型および４匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。２０％溶液として送達される２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースを動物にＩＰ注射し、血糖値を注射の０、３０、６０および９０分後に測定した。

結果：
耐糖能試験：高脂肪食を与えられた雄変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、わずかな耐糖能の増強を示した。

これらの研究において、変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、正常な空腹時グルコースの存在下で、３回すべて試験間隔において耐糖能の増大または増強を示した。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感度のわずかな増大または障害性グルコースホメオスタシスの逆の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ１１１０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト（インヒビター）は、障害性のグルコースホメオスタシスの処置に有用であり得る。
（ｄ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。

聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より小さい（プレパルス）音に先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似ランダム順に６回、合計３６回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。

結果：
ノックアウト変異（−／−）マウスは、驚愕応答が低かったか、または驚愕応答がなかったことから難聴が示唆される。

６６．１７．ＤＮＡ６２３７７−１３８１−１（ＵＮＱ５６１）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６２３７７−１３８１−１と命名）（ＵＮＱ５６１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１４５８３４ アクセッション：ＮＭ＿１４５８３４ ＮＩＤ：ｇｉ２２００３８７９ｒｅｆ ＮＭ＿１４５８３４．１ ムス・ムスクルス インターロイキン１７Ｃ（Ｉｌ１７ｃ）；参照タンパク質：Ｑ８Ｋ４Ｃ５ アクセッション：Ｑ８Ｋ４Ｃ５ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＩＬ−１７Ｃ；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１３２７８ アクセッション：ＮＭ＿０１３２７８ ＮＩＤ：ｇｉ ２７４７７０７８ ｒｅｆ ＮＭ＿０１３２７８．３ ホモ・サピエンス インターロイキン １７Ｃ（ＩＬ１７Ｃ）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９Ｐ０Ｍ４ アクセッション：Ｑ９Ｐ０Ｍ４ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。インターロイキン−１７Ｃ前駆体（ＩＬ−１７Ｃ）（サイトカインＣＸ２）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＩＬ１７ＣのオルソログであるＩｌ１７ｃ（インターロイキン１７Ｃ）である。別名としては、ＩＬ−１７Ｃ、ＣＸ２、ＩＬ−２１およびサイトカインＣＸ２が挙げられる。

ＩＬ１７Ｃは、おそらくインターロイキン−１７ファミリーレセプターに対するリガンドとして機能する分泌タンパク質である。このサイトカインを発現する細胞は、同定されていない；しかしながら、ＩＬ１７Ｃは、単球性細胞株ＴＨＰ−１からの腫瘍壊死因子アルファおよびＩＬ−１βの放出を刺激する。
さらに、ＩＬ１７Ｃは、好中球増加ならびに肺気道におけるインターフェロンガンマおよびインターロイキン−６の発現を誘導することから、免疫機能におけるＩＬ１７Ｃの役割が支持される（Ｌｉ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９７（２）：７７３−８（２０００）；Ｈｕｒｓｔ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６９（１）：４４３−５３（２００２）；Ｍｏｓｅｌｅｙ ｅｔ ａｌ，Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ｇｒｏｗｔｈ Ｆａｃｔｏｒ Ｒｅｖ １４（２）：１５５−７４（２００３））．
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ３４ １３ ６５
予測値 １６．２５ ３２．５ １６．２５ ６５
カイ二乗値＝２．５９ 有意性＝０．２７３８９７９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２１
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４５８３４．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（肝臓；骨格筋；骨；胃、小腸および結腸；ならびに脂肪以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．１７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６２３７７−１３８１−１（ＵＮＱ５６１）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトインターロイキン１７Ｃ（ＩＬ１７Ｃ）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおいてＩｇＭ血清免疫グロブリンの平均血清レベルの上昇をもたらした。変異（−／−）マウスはまた、ＬＰＳに対するＩＬ−６応答の増大を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的中央値と比較して平均血清ＩｇＭレベルの上昇を示した。

変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、ＩｇＭ血清免疫グロブリンの増加を示した。ＩｇＭ免疫グロブリンは、細菌のトキシンの中和に対する体液性免疫応答において最初に産生され、補体系を活性化する際に特に重要である。観察された表現型から、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドが、炎症性応答の負の制御因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常から、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）が、免疫系（例えば、Ｔ細胞増殖）を刺激し得る重要な物質であり得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。

急性期反応：
試験の説明：細菌のリポ多糖（ＬＰＳ）は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルＩのＬＰＳマウスの腹腔内に（ｉ．ｐ．）、２００μＬ滅菌食塩水中の致死量未満の用量のＬＰＳを２６ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、１μｇ／ｇ体重とした。注射の３時間後に１００μＬの血液サンプルを採取し、ＴＮＦａ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６の存在をＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置で解析した。

結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ＬＰＳ負荷に対する平均血清ＩＬ−６の応答の増大を示した。

まとめると、ＬＰＳエンドトキシン負荷により、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、ＬＰＳエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答（ＩＬ−６産生）を誘発する能力の増大を示したことから、炎症誘発性応答が示唆される。ＩＬ−６は、後期のＢ細胞活性化に寄与し、急性期反応および全身性炎症の誘導に重要な役割を果たす。このことは、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ１１２２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。

６６．１８．ＤＮＡ５８８５０−１４９５（ＵＮＱ５７６）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１１３８ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５８８５０−１４９５と命名）（ＵＮＱ５７６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１４４５３９ ムス・ムスクルス ＳＬＡＭファミリーメンバー７（Ｓｌａｍｆ７）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＨＫ６ アクセッション：Ｑ８ＢＨＫ６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス成雄精巣ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：４９３２７０２Ｈ２２産物：１９Ａ２４タンパク質ホモログに類似（ムス・ムスクルス成雄精巣ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：４９３２７０４Ｋ１１産物：１９Ａ２４タンパク質ホモログに類似）（ムス・ムスクルス成雄大動脈および静脈ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：Ａ５３００１４Ｃ０２産物：１９Ａ２４タンパク質ホモログに類似）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２１１８１ ホモ・サピエンス ＳＬＡＭファミリーメンバー７（ＳＬＡＭＦ７）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９ＮＹ０８ アクセッション：Ｑ９ＮＹ０８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。１９Ａタンパク質。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＳＬＡＭＦ７のオルソログであるＳｌａｍｆ７（ＳＬＡＭファミリーメンバー７）である。別名としては、１９Ａ、ＣＳ１、１９Ａ２４、ＣＲＡＣＣ、４９３０５６０Ｄ０３Ｒｉｋ、細胞傷害性細胞を活性化するＣＤ２様レセプター、新規Ｌｙ９および新規ＬＹ９（リンパ球抗原９）様タンパク質が挙げられる。

ＳＬＡＭＦ７は、同種親和性レセプターまたは細胞接着分子として機能し、ナチュラルキラー細胞、Ｔ細胞および活性化されたＢ細胞で主に発現するＩ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、２つの細胞外免疫グロブリン様ドメイン、膜貫通セグメントおよび８８アミノ酸細胞質ドメインからなる。ＳＬＡＭＦ７は、おそらく、ＮＫ細胞の細胞溶解活性およびリンパ球接着を制御する際に役割を果たす（Ｋｕｍａｒｅｓａｎ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ ３９（１−２）：１−８（２００２）；Ｍｕｒｐｈｙ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ ３６１（Ｐｔ３）：４３１−６（２００２）；Ｂｏｕｃｈｏｎ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６７（１０）：５５１７−２１（２００１）；Ｔｏｖａｒ ｅｔ ａｌ，Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ５４（６）：３９４−４０２（２００２））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２２ ３７ １６ ７５
予測値 １８．７５ ３７．５ １８．７５ ７５
カイ二乗値＝１．６３ 有意性＝０．４４２６３９３２（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２２
平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン２〜６をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４４５３９．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、１３のすべての成体組織サンプル（骨格筋および骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．１８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５８８５０−１４９５（ＵＮＱ５７６）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＳＬＡＭファミリーメンバー７（ＳＬＡＭＦ７）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、ＬＰＳに対するＩＬ−６応答の増大をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
急性期反応：
試験の説明：細菌のリポ多糖（ＬＰＳ）は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルＩのＬＰＳマウスの腹腔内に（ｉ．ｐ．）、２００μＬ滅菌食塩水中の致死量未満の用量のＬＰＳを２６ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、１μｇ／ｇ体重とした。注射の３時間後に１００μＬの血液サンプルを採取し、ＴＮＦａ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６の存在をＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置で解析した。

結果：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ＬＰＳ負荷に対する平均血清ＩＬ−６応答の増大を示した。

まとめると、ＬＰＳエンドトキシン負荷により、ＰＲＯ１１３８ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、ＬＰＳエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答（ＩＬ−６産生）を誘発する能力の増強を示したことから、炎症誘発性応答が示唆される。ＩＬ−６は、後期のＢ細胞活性化に寄与し、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。このことは、ＰＲＯ１１３８ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ１１３８ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。

６６．１９．ＤＮＡ５９５８６−１５２０（ＵＮＱ６０４）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１１９０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５９５８６−１５２０と命名）（ＵＮＱ６０４）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７２５０６ ムス・ムスクルス二領域性（ｂｉｒｅｇｉｏｎａｌ）細胞接着分子に関連する／癌遺伝子によってダウンレギュレートされる（Ｃｄｏｎ）結合タンパク質（Ｂｏｃ）；参照タンパク質：Ｑ８ＣＥ９１ アクセッション：Ｑ８ＣＥ９１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス生後１０日新生仔皮膚ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：４７３２４５５Ｃ１１産物：二領域性細胞接着分子に関連する／癌遺伝子によってダウンレギュレートされる（Ｃｄｏｎ）結合タンパク質、完全長挿入配列；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０３３２５４ アクセッション：ＮＭ＿０３３２５４ ＮＩＤ：ｇｉ１５１４７２３９ｒｅｆ ＮＭ＿０３３２５４．１ ホモ・サピエンス ＣＤＯ（ＢＯＣ）の同種；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９ＢＷＶ１ アクセッション：Ｑ９ＢＷＶ１ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＣＤＯの同種。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＢＯＣ（ＣＤＯと同類）のオルソログであるＢｏｃ（二領域性細胞接着分子に関連する／癌遺伝子によってダウンレギュレートされる（Ｃｄｏｎ）結合タンパク質）である。別名としては、４７３２４５５Ｃ１１および二領域性Ｃｄｏｎ結合タンパク質が挙げられる。

ＢＯＣは、おそらく、細胞−細胞コミュニケーションのためのレセプターサブユニットとして機能するＩ型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、ｃｉｓ様式で、ホモログＣＤＯＮ（細胞接着分子に関連する／癌遺伝子によってダウンレギュレートされる）、Ｎ−カドヘリンおよびＭ−カドヘリンと相互作用することにより、筋芽細胞における細胞−細胞接触の部位でレセプター複合体を形成する。胚発生の間、ＢＯＣは、筋骨格および中枢神経系ならびに増殖および分化の領域において発現する。ＢＯＣは、おそらく筋細胞の分化および形質転換において役割を果たす（Ｗｅｇｏｒｚｅｗｓｋａ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｃａｒｃｉｎｏｇ ３７（１）：１−４（２００３）；Ｍｕｌｉｅｒｉ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖ Ｄｙｎ ２２３（３）：３７９−８８（２００２）；Ｋａｎｇ ｅｔ ａｌ，ＥＭＢＯ Ｊ ２１（１−２）：１１４−２４（２００２）；Ｋａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １００（７）：３９８９−９４（２００３））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ３０ ２０ ６８
予測値 １７ ３４ １７ ６８
カイ二乗値＝１．３ 有意性＝０．５２２０４５８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７２５０６．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨格筋および骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．１９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５９５８６−１５２０（ＵＮＱ６０４）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＣＤＯ（ＢＯＣ）と同種のオルソログをコードする遺伝子の変異は、いくかの器官においてマクロファージにのみ影響を与える全身性組織球蓄積症を示す２匹のノックアウトマウスをもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学
肉眼的：検査した（−／−）マウスのうちの２匹（Ｍ−１３８およびＦ−１３９）が、肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節の肥大を示した。
顕微鏡的：解析した（−／−）マウスのうち、２匹（Ｆ−１３９およびＭ−１３８）が、いくつかの器官においてマクロファージにのみ影響を及ぼす全身性組織球蓄積症を示した。肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節は、組織学的に最も影響を受けていた。マクロファージの細胞質は、著しく拡大しており、主に透明な空胞を含み、原線維材料が非常に少なかった。その透明な空胞は、組織学的スライドを作製するために必要なプロセスの間に溶解される物質を含む人工のレムナントであった。取り出された物質は、主に脂質をおそらく含んでいた。これらの病変は、脂質蓄積疾患として知られる遺伝的疾患の群に特徴的である。

６６．２０．ＤＮＡ６４８９６−１５３９（ＵＮＱ６４２）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１２７２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６４８９６−１５３９と命名）（ＵＮＱ６４２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿２０７５３１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ０３００２５Ｌ２１遺伝子（Ｅ０３００２５Ｌ２１Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８Ｒ３Ｗ７ アクセッション：Ｑ８Ｒ３Ｗ７ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ０３００２５Ｌ２１遺伝子；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１７６８１３ ホモ・サピエンス乳癌膜タンパク質１１（ＢＣＭＰ１１）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８ＴＤ０６ アクセッション：Ｑ８ＴＤ０６ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。上側の勾配タンパク質３（ＭＬＨＳ６４２）（乳癌膜タンパク質１１）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＢＣＭＰ１１（乳癌膜タンパク質１１）のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｅ０３００２５Ｌ２１遺伝子である。別名としては、Ｇｍ８８８、ＨＡＧ３、ｈＡＧ−３および上側の勾配タンパク質３が挙げられる。

ＢＣＭＰ１１は、主にエストロゲンレセプター陽性乳腺癌腫上皮細胞において発現する推定分泌タンパク質である。その１６６アミノ酸タンパク質は、シグナルペプチドを含むが、他の識別される保存されたドメインを含まない。ＢＣＭＰ１１は、細胞質ベシクル中に集中しているが、グリコシルホスファチジルイノシトールアンカー転移関連タンパク質Ｃ４．４Ａおよび細胞外アルファジストログリカン（ＤＡＧ−１）と相互作用することができる。さらに、ＢＣＭＰ１１は、Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ分泌タンパク質であるＸＡＧ−１およびＸＡＧ−２と相同であることから、さらに、細胞外分泌タンパク質としてのＢＣＭＰ１１の機能が支持される。ＢＣＭＰ１１は、乳房腫瘍細胞の成長または転移に役割を果たし得る（Ａｄａｍ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（８）：６４８２−９（２００３）；Ｆｌｅｔｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｂｒ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ ８８（４）：５７９−８５（２００３））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２２ ２３ １７ ６２
予測値 １５．５ ３１ １５．５ ６２
カイ二乗値＝０．７９ 有意性＝０．６７３６８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン３〜７をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿２０７５３１．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された１３の成体組織サンプルのうち脳；脊髄；眼；肺；ならびに胃、小腸および結腸において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６４８９６−１５３９（ＵＮＱ６４２）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト乳癌膜タンパク質１１（ＢＣＭＰ１１）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較して、耐糖能障害を伴う平均血清中グルコースレベルの上昇を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。さらに、雄変異体において耐糖能障害が観察された。糖尿およびケトン尿症もまた、（−／−）マウスにおいて明らかになった。ホモ接合性変異マウスはまた、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少ならびに心拍数の減少を示した。神経解析により、障害性の運動協調性および震える行動を含む多くの異常が明らかになった。（−／−）マウスは、小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力を示した。雄（−／−）マウスはまた、精巣変性を示し、雌（−／−）マウスは、卵巣および子宮の発育不全を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：（−／−）マウスは、小脳の顆粒細胞層と分子細胞層の両方が薄くなる、顆粒細胞の広範な減少および神経膠症を特徴とする小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力を示した。特に、プルキンエ細胞およびゴルジ細胞ならびに小脳傍片葉の顆粒細胞層が、神経膠症およびニューロンの減少によって重篤な影響を受けることはほとんどなかった。雄（−／−）マウスは、小さい精巣、精巣変性および精液過少症を示した。精細管の退縮の証拠は、最小であり、精子細胞および精子の後期に限られたものであった。しかしながら、正常な精子は、精巣上体または精管にほとんど存在せず、精子の変質および凝集が頻繁に見られた。雌（−／−）マウスは、卵巣および子宮の発育不全を示し、卵巣および子宮は、若年性を示した。乳腺は、ほんの数本の管が存在しただけであった。心臓の重量は、（−／−）マウスで増大したが、組織病理学的病変は示さなかった。変異体における膵臓のランゲルハンス島は、（＋／＋）コントロールよりも小さい傾向にあり、α（グルカゴン）細胞およびβ（インスリン）細胞の分布が変化していた。正常には、グルカゴン産生島細胞は、島の末梢周辺に整列しているが、変異体におけるグルカゴン細胞は、島全体に亘って均等に分布していた。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
（ｃ）心臓学−心拍数
試験の説明：Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧解析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。

結果
心拍数：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平と比較して、平均心拍数の減少を示し（雄（−／−）は、平均より２ＳＤ超低く；雌（−／−）は、平均より３ＳＤ超低い）、その差は、雌のほうが顕著であった。
（ｄ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態：１型糖尿病および２型糖尿病、シンドロームＸ、様々な循環器疾患および／または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。

手順：２匹の野生型および４匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。２０％溶液として送達される２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースを動物にＩＰ注射し、血糖値を注射の０、３０、６０および９０分後に測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
雄と雌の両方の変異（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中グルコースレベルの著しい上昇を示した。さらに、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、試験した間隔の各々において耐糖能障害を示した。（−／−）変異マウスにおいて糖尿およびケトン尿症が見られた。

これらの研究では、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が減少を示したかまたは耐糖能障害を示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示し、それゆえ、ＰＲＯ１２７２ポリペプチド（またはそのアゴニスト）またはそれをコードする遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または糖尿病を含む様々な循環器疾患に関連した状態の処置に有用であり得る。
（ｅ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。
（１）概日性試験の説明：
雌マウスを、試験の１日目の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、１２時間明／暗サイクル（午前７時に点灯し、午後７時に消灯する）に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、３日間の試験中、１時間間隔で６０回記録する。得られたデータは、３日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル（概日リズム）の中央値および各明／暗サイクル中の総活動性（自発活動性）の中央値によって示される。

結果：
概日性：（−／−）マウスは、両方の明期の間の歩行活動性の低下およびホームケージ活動性試験中の明期と全体との活動性の比の減少を示した。これらの結果から、異常な概日リズムを証明し、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示唆する。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ１２７２ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
（２）機能観察総合評価（ＦＯＢ）試験
ＦＯＢは、全身感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経機能を評価するＩｒｗｉｎ神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検知および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約１０分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。

結果：
解析した８匹の（−／−）マウスのうち、４匹が、１分間の観察時間の間に震える行動を示した。さらに、（−／−）マウスにおいて、立ち上がりは観察されなかった。
（３）反転スクリーン試験データ：
反転するスクリーンを使用して、運動力／運動協調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形（７．５ｃｍ×７．５ｃｍ）のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を１８０°回転させた。以下の行動応答を、１分間の試験にわたって記録した：落下、登上せず、および登上。

結果：
遺伝子型 落下率 ％ 登上率 ％
＋／＋（ｎ＝８）０／８ ０ ６／８ ７５
−／−（ｎ＝８）１／８ １３ １／８ １３
ＷＴ集団は、落下が３．６２、登上が６０．０４。
運動力の欠損は、（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスと（＋／＋）マウスとの間で落下応答が５０％異なる場合に明らかである。登上しなかった０／８もしくは１／８匹の（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスは、運動協調性障害を示す。登上した７／８もしくは８／８匹の（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスは、運動協調性の増強を示す。

反転スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するように設定する：
解析した８匹の（−／−）マウスのうち、１匹の（−／−）マウスだけがスクリーンを登上したのに対して、６／８匹の（＋／＋）マウスが登上した。これらの結果から、変異体の運動協調性の障害が示唆される。これらの結果は、下に示すような骨関連測定値における観察結果と一致する。
（ｆ）骨代謝および全身診断学
（１）組織質量および除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して総組織質量（ＴＴＭ）の変化を同定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨）の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。

結果：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重の減少を示した。

受精能：雄（−／−）マウスは、交配および４回の交尾の６０日後に子孫をもうけなかった。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄（−／−）マウスは、平均総組織質量および除脂肪体重の減少を示した。雄と雌の両方の（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、全身、大腿骨および椎骨において、平均骨塩量、骨塩量指標および骨塩密度の減少を示した。

ＰＲＯ１２７２ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異（−／−）マウスは、成長遅延および／または平均総質量、除脂肪体重の減少を特徴とする組織るいそう疾患と一致する表現型を示す。これらの結果は、上で報告した平均体重の減少の観察結果と一致する。さらに、変異（−／−）マウスは、骨粗鬆症を示唆する、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。したがって、ＰＲＯ１２７２ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連作用を模倣し得る。他方で、ＰＲＯ１２７２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長遅延、悪液質または他の組織るいそう疾患のようなそのような代謝障害の予防および／または処置に有用であり得、ならびに骨減少に関連する骨障害の処置に有用であり得る。
（ｇ）成体皮膚細胞増殖：
手順：皮膚細胞を１６週齢の動物（２匹の野生型マウス４匹のホモ接合性マウス）から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、ｐ５３およびＫｕ８０で証明されている。Ｂｒｄｕ取り込みを使用して増殖を測定した。

詳細には、これらの研究において、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化された培養物中の細胞数の増加を、相対的な増殖性能力の基準として使用した。野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚バイオプシーから初代線維芽細胞を確立した。５万個の細胞の２つ組または３つ組の培養物を播種し、６日間生育させた。培養期間の終わりに、培養物中に存在する細胞の数を、電子粒子カウンターを使用して測定した。

結果：
雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較して、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の増加を示した。

したがって、ホモ接合性変異マウスは、過剰増極性の表現型を示した。これらの観察結果によって示唆されるように、ＰＲＯ１２７２ポリペプチドまたはそのアゴニストは、異常な細胞増殖を低下させるのに有用であり得る。

６６．２１．ＤＮＡ６４９０３−１５５３（ＵＮＱ６５５）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１２８６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６４９０３−１５５３と命名）（ＵＮＱ６５５）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＢＣ０２９８６３ アクセッション：ＢＣ０２９８６３ ＮＩＤ：２０９８７６３５ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス，クローンＭＧＣ：３６８６１ ＩＭＡＧＥ：４４６０１６８；参照タンパク質：Ｑ８Ｋ２Ｔ４ アクセッション：Ｑ８Ｋ２Ｔ４ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。仮説タンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＡＹ３５８９３５ ホモ・サピエンスクローンＤＮＡ６４９０３ ＤＳＬＲ６５５（ＵＮＱ６５５）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ６ＵＷ７８タンパク質ＵＮＱ６５５／ＰＲＯ１２８６前駆体。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＵＮＱ６５５のオルソログである「タンパク質ＵＮＱ６５５／ＰＲＯ１２８６前駆体」（ＵＮＱ６５５）をコードする。

ＵＮＱ６５５は、９３アミノ酸からなる推定分泌タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチドを含むが、他の識別可能な保存ドメインを含まない。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ３４ ０ ５５
予測値 １３．７５ ２７．５ １３．７５ ５５
カイ二乗値＝３８．７６ 有意性＝３．８３１５３９５Ｅ−９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０
平均同腹仔数＝７
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＢＣ０２９８６３．１）。
１．野生型発現パネル：パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．２１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６４９０３−１５５３（ＵＮＱ６５５）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＵＮＱ６５５のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の致死性を示した。ヘテロ接合性マウスは、平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：胚性致死により試験されなかった。１２．５日目に、４９個の胚：１８個の（＋／−）胚、８個の（＋／＋）胚、２２個の再吸収モルおよび１個の不確定な胚が観察された。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

致死性の胚の発達異常に関連する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない）によって生じるか、または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性（＋／−）変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。

（ｃ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
血清免疫２：（＋／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、計画実行内の（＋／＋）マウスのレベルおよび歴史的中央値と比較して、平均血清ＩｇＧ２ａレベルの低下を示した。

血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、その性別一致同腹仔（＋／＋）コントロールと比較して、ヘテロ接合性（＋／−）マウスにおけるＩｇＧ２ａのレベルの低下または減少を示した。

血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ヘテロ接合性成体が、血清ＩｇＧ２ａレベルの低下を示したことが明らかになった。したがって、ヘテロ接合体は、（＋／＋）同腹仔と比較して異常に低い血清免疫グロブリンを示した。したがって、ＰＲＯ１２８６ポリペプチドをコードする遺伝子は、免疫グロブリン（またはガンマグロブリン）を生成するのに必須である。別で、ＩｇＧ２ａ免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、ＰＲＯ１２８６ポリペプチドまたはそのアゴニストが、免疫系の刺激に有用であり得、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにＡＩＤＳ罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、ＰＲＯ１２８６ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）は、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
６６．２２．ＤＮＡ５９２１８−１５５９（ＵＮＱ６６４）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１２９５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５９２１８−１５５９と命名）（ＵＮＱ６６４）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿４８５０５４ ＰＲＥＤＩＣＴＥＤ：ムス・ムスクルス先天性赤血球異形成貧血、Ｉ型（ヒト）（Ｃｄａｎ１）；参照タンパク質：ＸＰ＿４８５０５４先天性赤血球異形成貧血，Ｉ型［ムス・ムスクルス］；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１３８４７７ ホモ・サピエンス先天性赤血球異形成貧血，Ｉ型（ＣＤＡＮ１）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８ＩＷＹ９ アクセッション：Ｑ８ＩＷＹ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。Ｃｏｄａｎｉｎ１（ＵＮＱ６６４／ＰＲＯ１２９５）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＣＤＡＮ１のオルソログであるＣｄａｎ１（先天性赤血球異形成貧血、Ｉ型［ヒト］）である。別名としては、ＣＤＡ１、ＣＤＡＩ、ＣＤＡ−Ｉ、１５０００１５Ａ０１Ｒｉｋ、ｃｏｄａｎｉｎおよびｃｏｄａｎｉｎ１が挙げられる。

ＣＤＡＮ１は、核膜と微小管とを連結する構造タンパク質としておそらく機能する、細胞質に位置し、遍在性に発現するタンパク質である。ＣＤＡＮ１は、核膜の完全性の保存に関与し得る。ＣＤＡＮ１の変異により、後期赤血球前駆体の形成異常の変化に関連する遺伝性赤血球障害のまれな群である先天性赤血球異形成貧血を引き起こし得る（Ｄｇａｎｙ ｅｔ ａｌ，Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ７１（６）：１４６７−７４（２００２）；Ｐｉｅｌａｇｅ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖ Ｃｅｌｌ ５（６）：８４１−５１（２００３））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ３２ ０ ５３
予測値 １３．２５ ２６．５ １３．２５ ５３
カイ二乗値＝４７．７６ 有意性＝４．２５６４５６Ｅ−１１（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン３〜８をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＸＭ＿４８５０５４．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨および脂肪以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．２２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５９２１８−１５５９（ＵＮＱ６６４）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト先天性赤血球異形成貧血、Ｉ型（ヒト）（ＣＤＡＮ１）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の致死性をもたらした。致死性は、おそらく赤血球形成の欠陥に起因する。ＵＮＱ６７５は、他の組織と比較してＣＮＳにおいて高度に発現する。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：胚性致死により試験されなかった。１２．５日目に、５１個の胚：２３個の（＋／−）胚、１５個の（＋／＋）胚、９個の再吸収および４個の未定胚が観察された。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

致死性の胚の発達異常に関連する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない）によって生じるか、または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性（＋／−）変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。
６６．２３．ＤＮＡ５９５８８−１５７１（ＵＮＱ６７５）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１３０９ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５９５８８−１５７１と命名）（ＵＮＱ６７５）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２８８８０ ムス・ムスクルスロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン１（Ｌｒｒｔｍ１）；参照タンパク質：Ｑ８Ｋ３７７ アクセッション：Ｑ８Ｋ３７７ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。Ｌｒｒｔｍ１タンパク質（ムス・ムスクルス生後０日の新生仔眼球ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：Ｅ１３００１０Ｏ２１産物：仮説ＲＮＩ様構造含有タンパク質、完全長挿入配列）（ムス・ムスクルス生後０日の新生仔眼球ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮの完全長を多く含むライブラリー，クローン：Ｅ１３００１２Ａ０５産物：仮説ＲＮＩ様構造含有タンパク質、完全長挿入配列）（ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン１タンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１７８８３９ ホモ・サピエンスロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン１（ＬＲＲＴＭ１）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８６ＵＥ６ アクセッション：Ｑ８６ＵＥ６ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＬＲＲＴＭ１ タンパク質（ＤＦＬＬ６７５）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＬＲＲＴＭ１のオルソログであるＬｒｒｔｍ１（ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン１）である。別名としては、４６３２４０１Ｄ０６Ｒｉｋ、ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン１、ＤＦＬＬ６７５およびＦＬＪ３２０８２が挙げられる。

ＬＲＲＴＭ１は、おそらく細胞接着分子またはレセプターとして機能する主に神経系に発現している推定内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチリピートおよび膜貫通セグメントからなる。ＬＲＲＴＭ１は、神経系の発生および維持において役割を果たし得る（Ｌａｕｒｅｎ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ８１（４）：４１１−２１（２００３））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ４６ １５ ８２
予測値 ２０．５ ４１ ２０．５ ８２
カイ二乗値＝０．７１ 有意性＝０．７０１１７３４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２３
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２８８８０．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された１３の成体組織サンプルのうち脳、脊髄、眼および脂肪においてのみ標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
６６．２３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５９５８８−１５７１（ＵＮＱ６７５）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン１（ＬＲＲＴＭ１）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）および（＋／−）マウスにおいて体脂肪の増加をもたらした。さらに、変異（−／−）マウスは、概日リズム試験中の歩行回数の中央値の減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。

概日性試験の説明：
雌マウスを、試験の１日目の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、１２時間明／暗サイクル（午前７時に点灯し、午後７時に消灯する）に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、３日間の試験中、１時間間隔で６０回記録する。得られたデータは、３日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル（概日リズム）の中央値および各明／暗サイクル中の総活動性（自発活動性）の中央値によって示される。

結果：
概日性：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ホームケージ活動性試験中の両方の暗期の間の歩行回数の中央値の減少を示した。

これらの結果は、異常な概日リズムを証明し、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに／または双極性障害と一致する表現型を証明した。したがって、ＰＲＯ１３０９ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
（ｃ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄と雌の両方の（＋／−）および（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総体脂肪パーセントおよび総脂肪質量の増加を示し、その差は、大腿骨においてより顕著であった。雌（−／−）マウスは、平均総組織質量の顕著な増加も示した。

これらの研究から、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が、肥満症に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ１３０９ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝プロセスに必須であり、特に肥満症の予防および／または処置に重要であり得る。

６６．２４．ＤＮＡ６０６０８−１５７７（ＵＮＱ６８２）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１３１６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６０６０８−１５７７と命名）（ＵＮＱ６８２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２０２６５ ムス・ムスクルス ｄｉｃｋｋｏｐｆホモログ２（Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ）（Ｄｋｋ２）；参照タンパク質：Ｑ９ＱＹＺ８ Ｄｉｃｋｋｏｐｆ関連タンパク質−２前駆体（Ｄｋｋ−２）（Ｄｉｃｋｋｏｐｆ−２）（ｍＤｋｋ−２）ｇｉ｜６２７２２０５｜ｅｍｂ｜ＣＡＢ６０１１０．１｜ｄｉｃｋｋｏｐｆ−２［ムス・ムスクルス］；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１４４２１ ホモ・サピエンス ｄｉｃｋｋｏｐｆホモログ２（Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ）（ＤＫＫ２）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９ＵＢＵ２ アクセッション：Ｑ９ＵＢＵ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。Ｄｉｃｋｋｏｐｆ関連タンパク質−２前駆体（Ｄｋｋ−２）（Ｄｉｃｋｋｏｐｆ−２）（ｈＤｋｋ−２）。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＤＫＫ２のオルソログであるＤｋｋ２（ｄｉｃｋｋｏｐｆホモログ２［Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ］）である。別名としては、ＤＫＫ−２、ｄｉｃｋｋｏｐｆ２、ｄｉｃｋｋｏｐｆ−２についてのｍＲＮＡ（ｄｋｋ−２遺伝子）、ｄｉｃｋｋｏｐｆホモログ１（Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ）、Ｄｉｃｋｋｏｐｆ遺伝子２およびｄｉｃｋｋｏｐｆ（Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ）ホモログ２が挙げられる。

ＤＫＫ２は、規範的なＷｎｔ／β−カテニンシグナル伝達経路のコレセプターに対するリガンドとして機能する分泌タンパク質である。コレセプターＫＲＥＭＥＮ２（クリングル含有膜貫通タンパク質２）が存在しない場合、ＤＫＫ２は、コレセプターＬＲＰ６（低密度リポタンパク質レセプター関連タンパク質６）と結合することによってＷｎｔシグナル伝達を活性化する。しかしながら、ＫＲＥＭＥＮ２が存在する場合は、ＤＫＫ２は、ＫＲＥＭＥＮ２と結合することによってＷｎｔシグナル伝達を阻害する（Ｍａｏ ａｎｄ Ｎｉｅｈｒｓ，Ｇｅｎｅ ３０２（１−２）：１７９−８３（２００３）；Ｂｒｏｔｔ ａｎｄ Ｓｏｋｏｌ，Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ２２（１７）：６１００−１０（２００２）；Ｌｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（８）：５９７７−８１（２００２）；Ｋｒｕｐｎｉｋ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｅ ２３８（２）：３０１−１３（１９９９））。ＤＫＫ２は、発生に関与する（Ｍｏｎａｇｈａｎ ｅｔ ａｌ，Ｍｅｃｈ Ｄｅｖ ８７（１−２）：４５−５６（１９９９）；Ａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒ Ｐａｔｔｅｒｎｓ ４（３）：２８９−９５（２００４））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ４３ １９ ８０
予測値 ２０ ４０ ２０ ８０
カイ二乗値＝３．６２ 有意性＝０．１６３６５４１５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２０２６５．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（脊髄、胸腺および骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６０６０８−１５７７（ＵＮＱ６８２）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトｄｉｃｋｋｏｐｆホモログ２（Ｘｅｎｏｐｕｓ ｌａｅｖｉｓ）（ＤＫＫ２）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、未発達の眼瞼およびハーダー腺の発育不全を伴う角膜の上皮化を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。これにより、変異体における視力の障害がもたらされる。（−／−）マウスのうちの８匹すべてが、眼瞼閉塞を示す６匹の（−／−）マウスを含む眼の異常を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。

（ｂ）病理学
肉眼的：８匹すべての（−／−）マウスが、変異体の視覚を妨げる角膜支質および瘢痕の肥厚を特徴とする重篤な角膜の上皮化を示した。（−／−）マウスの眼瞼はまた、未発達で、眼瞼を不完全にしか閉じることができなかった。数匹は、正常な眼よりも小さいようであった。両眼瞼が、著しい形成不全であり、ハーダー腺は、（−／−）マウスの肉眼的検査では目視できなかった。
顕微鏡的：（−／−）マウスは、変異体において視覚の障害を生じる、未発達の眼瞼およびハーダー腺の発育不全を伴う角膜の上皮化を示した。（−／−）マウスは、コラーゲン性（ｃｏｌｌａｇｅｎｅｏｕｓ）の支質のびまん性線維症ならびに多巣性慢性で活性な角膜炎および潰瘍形成を伴う表面上皮を角質化する角質増殖を特徴とする角膜および強膜の広範な形成異常を示した。多巣的に、角膜および強膜において皮脂腺および毛包が見られた。これらの変化は、雌よりも雄変異体のほうが重篤であった。（−／−）マウスはまた、ハーダー腺の発育不全を示した。眼窩内の涙腺は、いくつかの切片において存在したが、ハーダー腺は、一様に存在せず、眼瞼は、すべての変異マウスにおいて形成不全であった。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

（ｃ）心臓血管表現型解析：
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。１つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比（Ａ／Ｖ比）を測定した。異常なＡ／Ｖ比は、高血圧（および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患）、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下：網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。

手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、Ｈａｗｅｓおよび共同研究者ら（Ｈａｗｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９９９ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｖｉｓｉｏｎ １９９９；５：２２）に従って改変したＫｏｗａ Ｇｅｎｅｓｉｓ小動物用眼底カメラを用いて覚醒時の動物において行った。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得が可能となった。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈（Ａ／Ｖ）比を測定した。

眼科学的解析は、作製したＦ２の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体の変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行った。具体的には、Ａ／Ｖ比は、Ｋｏｗａ ＣＯＭＩＴ＋ソフトウェアを用いて眼底像に従って測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔でカラー写真を撮影する：像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比（Ａ／Ｖ）は、静脈直径に対する動脈直径（血管の分岐部の前で測定）の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性（色素性網膜炎として知られる）または網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体（−／−）およびヘテロ接合体（＋／−）変異型子孫において、野生型（＋／＋）同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、そのような病理状態を示唆し得る。

結果：
眼底：８匹すべての（−／−）マウスが、変異体の視覚を妨げる角膜支質および瘢痕の肥厚を特徴とする重篤な角膜の上皮化を示した。（−／−）マウスの眼瞼は、未発達であったことから、眼瞼が不完全にしか閉じることができない。したがって、変異体において動静脈比を測定することができなかった。
血管造影：（−／−）マウスのうちの１匹のみが解析に成功した。注目すべき前眼房は観察されなかった。

６６．２５．ＤＮＡ５８７４３−１６０９（ＵＮＱ７１９）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１３８３ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５８７４３−１６０９と命名）（ＵＮＱ７１９）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７７７３５ ムス・ムスクルス仮説タンパク質Ｃ１３００３６Ｇ０８（Ｃ１３００３６Ｇ０８）；参照タンパク質：Ｑ６ＮＸＭ３ アクセッション：Ｑ６ＮＸＭ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。仮説タンパク質Ｃ１３００３６Ｇ０８；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５２９１３ アクセッション：ＮＭ＿１５２９１３ ＮＩＤ：ｇｉ２３０９７２７３ ｒｅｆ ＮＭ＿１５２９１３．１ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７（ＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８Ｎ０Ｗ９ アクセッション：Ｑ８Ｎ０Ｗ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＱＮＲ−７１タンパク質に類似（仮説タンパク質）。

目的のマウス遺伝子は、ヒト「仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７」のオルソログである「仮説タンパク質Ｃ１３００３６Ｇ０８」である。別名としては、Ｃ１３００３６Ｇ０８およびＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７が挙げられる。

仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７は、シグナルペプチド、ＰＫＤ（多発性嚢胞腎１［ＰＫＤ１］および他のタンパク質におけるリピート）ドメイン（ＳＭＡＲＴアクセッションＳＭ０００８９）および膜貫通セグメントを含む推定Ｉ型内在性原形質膜タンパク質である。ＰＫＤドメインは、おそらく、タンパク質−タンパク質またはタンパク質−炭水化物相互作用に関与することから、仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７が細胞接着分子またはシグナル伝達レセプターとして機能することが示唆される。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １５ ４４ １９ ７８
予測値 １９．５ ３９ １９．５ ７８
カイ二乗値＝１．４２ 有意性＝０．４９１６４４２（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２７
平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン３〜５をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７７７３５．３）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（肝臓、骨格筋および骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５８７４３−１６０９（ＵＮＱ７１９）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト「仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ７６１Ｌ１４１７」のオルソログをコードする遺伝子の変異は、野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、オープンフィールド試験中に自発運動活性の低下または穏やかな機能低下を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。ＵＮＱ７１９は、他の組織と比較して、ＣＮＳにおいて高発現を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。

（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んだ。

オープンフィールド試験：
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン（ｓｅｒａｔｏｎｉｎ）トランスポーター、ドーパミントランスポーター（Ｇｉｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．１９９６ Ｆｅｂ １５；３７９（６５６６）：６０６−１２）およびＧＡＢＡレセプター（Ｈｏｍａｎｉｃｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．１９９７ Ａｐｒ １５；９４（８）：４１４３−８）のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド（４０×４０ｃｍ）をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、４つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。３つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域（４０ｃｍ×４０ｃｍ、ＡｃｃｕＳｃａｎ ＩｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓのＶｅｒｓａＭａｘ動物活動性モニターシステム）を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を２０分間測定した。この試験のデータを４分間隔で５回分析した。全移動距離（ｃｍ）、垂直移動回数（直立）、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。

マウスが新しい環境に対して正常な慣れ応答を示す傾向を、５回の間隔にわたるその水平自発運動の変化すべてを測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは５回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な慣れは、負の傾きの値によって表される。

結果：
注目すべき差が、オープンフィールド活動性試験中に観察された。（−／−）マウスは、総移動距離の合計の中央値の減少を示した。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ１３８３ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。

６６．２６．ＤＮＡ７１１５９−１６１７（ＵＮＱ７２１）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１３８４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７１１５９−１６１７と命名）（ＵＮＱ７２１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１９９８５ ムス・ムスクルス Ｃ型レクチン様レセプター２（Ｃｌｅｃ２）；参照タンパク質：Ｑ９ＪＬ９９ アクセッション：Ｑ９ＪＬ９９ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。Ｃ型レクチン様レセプター２；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１６５０９ アクセッション：ＮＭ＿０１６５０９ ＮＩＤ：７７０６０６０ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス Ｃ型レクチン様レセプター−２（ＬＯＣ５１２６６）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９Ｐ１２６ アクセッション：Ｑ９Ｐ１２６ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。Ｃ型レクチン様レセプター−２。目的のマウス遺伝子は、ヒトＣＬＥＣ２のオルソログであるＣｌｅｃ２（Ｃ型レクチン様レセプター２）である。別名としては、Ｃｌｅｃ−２、ｍＣＬＥＣ−２、１８１００６１Ｉ１３Ｒｉｋ、ＰＲＯ１３８４およびＱＤＥＤ７２１が挙げられる。

ＣＬＥＣ２は、レセプターとしておそらく機能するＩＩ型内在性原形質膜タンパク質である。ＣＬＥＣ２は、シグナルアンカーおよび炭水化物残基と結合するＣ型レクチンドメインからなる。ＣＬＥＣ２は、肝臓およびミエロイドならびにナチュラルキラー細胞において発現する。ＣＬＥＣ２は、シグナル伝達および免疫において役割を果たし得る（Ｃｏｌｏｎｎａ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ ３０（２）：６９７−７０４（２０００）；Ｓｏｂａｎｏｖ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ ３１（１２）：３４９３−５０３（２００１））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ４３ ３ ６２
予測値 １５．５ ３１ １５．５ ６２
カイ二乗値＝１０．３４ 有意性＝０．００５６８４５６８５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１２
平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１９９８５．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、１３のすべての成体組織サンプル（骨格筋；骨；胃、小腸および結腸；心臓；ならびに脂肪以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７１１５９−１６１７（ＵＮＱ７２１）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＣ型レクチン様レセプター２（ＣＬＥＣ２）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）変異体の大きな生存能低下をもたらした。遺伝的データは、この変異が、ホモ接合性変異体の大きな生存能低下をもたらしたことを示唆する。顕微鏡解析により、ホモ接合性胚の間脳および内耳神経節における軽度から中程度の鬱血および出血を含む多くの脳の欠陥が明らかになった。２匹の生存雌ホモ接合性変異マウスは、貧血の徴候ならびに血清コレステロール、心拍数および血圧の低下を示した。その変異体はまた、末梢血中のＣＤ４細胞の平均パーセンテージの増加を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
全般的な観察結果：（−／−）マウスの生存能低下が観察された。（−／−）マウスの２匹以外のすべてのマウスは、遺伝子型同定の時点で死亡していた。したがって、高い胚性致死および出生前致死が観察された。
顕微鏡的：１２．５日目に、４５個の胚：１１個の（−／−）胚、１８個の（＋／−）胚、１１個の（＋／＋）胚、３個の再吸収モルおよび２個の不確定な胚が観察された。
解析に利用可能な（−／−）胚は、脳（間脳）および内耳神経節の軽度から中程度の鬱血および出血を示した。多巣的な鬱血および出血が、検査した４匹すべての（−／−）胚の間脳において検出され、１２．５日目の（−／−）胚の２／４匹の内耳神経節の片側において検出された。さらに、多数の拡張した毛細血管が、発生中の脳の患部において観察された。さらに、循環血液細胞が、胚全体に亘って、特に胎児肝臓において見られた。遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

（ｃ）心臓学−血圧／心拍数
試験の説明：Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧解析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。

結果
血圧：２匹の生存（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下を示した。
心拍数：２匹の生存（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均心拍数の減少（歴史的平均より約１〜２ＳＤ低い）を示した。

（ｄ）表現型解析：心臓学
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠動脈疾患、異常脂肪血症（例えば、高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの増加（高トリグリセリド血症））、糖尿病および／または肥満症の処置のための標的を本明細書中で同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。

血中脂質
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび２匹のホモ接合性マウスのコホートを、このアッセイで試験した。高いコレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの上昇は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：２匹の生存雌（−／−）マウス（Ｆ−１０４およびＦ−１３３）は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルの低下を示した。

上でまとめられたように、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルの著しい低下を示した。したがって、ＰＲＯ１３８４遺伝子が欠損した変異マウスは、不完全な膜の形成および／または融合に導き得る低コレステロール血症（ｈｙｐｏｃｈｏｌｅｓｔｒｅｍｉａ）を起こした。

（ｅ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
（１）血液学解析：
試験の説明：血液試験は、Ａｂｂｏｔｔ社のＣｅｌｌ−Ｄｙｎ３５００Ｒ自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、５種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で２２を超えるパラメータが含まれ得る。

結果：
血液学：２匹の生存（−／−）マウス（Ｆ−１０４およびＦ−１３３）が、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、平均赤血球数、ヘモグロビン濃度およびヘマトクリットレベルの低下を示した。

これらの結果は、貧血に関連する表現型に関係する。したがって、ＰＲＯ１３８４ポリペプチド、そのアゴニストまたはＰＲＯ１３８４ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に必須であるに違いなく、ゆえに、貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。

（２）蛍光標識細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
ＣＤ４、ＣＤ８およびＴ細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のＦＡＣＳ解析を実施して、Ｔリンパ球、Ｂリンパ球に対するＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５およびナチュラルキラー細胞に対するｐａｎ ＮＫを評価した。ＦＡＣＳ解析は、２匹の野生型および２匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。

これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のＣＤ４およびＣＤ８陽性のＴ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−レーザーＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞および単球の数を記録する。６つの系統特異的抗体のパネル：ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥおよびＣＤ１９ ＦＩＴＣを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。２種類のＦＩＴＣ標識抗体およびＰＥ標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用してサンプルを解析した。

結果：
ＦＡＣＳ３：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの増加を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。

したがって、ＰＲＯ１３８４ポリペプチドをコードする遺伝子をノックアウトすることにより、Ｔ細胞集団の増加が引き起こされる。これらの観察結果から、ＰＲＯ１３８４ポリペプチドまたはＰＲＯ１３８４をコードする遺伝子は、Ｔ細胞増殖の負の制御因子として作用するようだ。したがって、ＰＲＯ１３８４ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、この表現型を模倣し得、Ｔ細胞増殖を増強する際に有益であり得る。

６６．２７．ＤＮＡ７３４０１−１６３３（ＵＮＱ７３７）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１４３１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７３４０１−１６３３と命名）（ＵＮＱ７３７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７５６８４ ムス・ムスクルス ＦＣＨおよび二重ＳＨ３ドメイン１（Ｆｃｈｓｄ１）；参照タンパク質：Ｑ６ＰＦＹ１ アクセッション：Ｑ６ＰＦＹ１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＦＣＨおよび二重ＳＨ３ドメイン１；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０３３４４９ ホモ・サピエンス ＦＣＨおよび二重ＳＨ３ドメイン１（ＦＣＨＳＤ１）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８６ＷＮ１ アクセッション：Ｑ８６ＷＮ１ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＦＬＪ００００７様タンパク質。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＦＣＨＳＤ１のオルソログであるＦｃｈｓｄ１（ＦＣＨおよび二重のＳＨ３ドメイン１）である。別名としては、Ａ０３０００２Ｄ０８ＲｉｋおよびＦＬＪ００００７が挙げられる。

ＦＣＨＳＤ１は、Ｆｅｓ／ＣＩＰ４（Ｆｅｓチロシンキナーゼ／Ｃｄｃ４２相互作用タンパク質）相同性ドメイン、２つのＳＨ３（ｓｒｃ相同性３）ドメインおよびプロリンリッチＣ末端からなる推定細胞質タンパク質である（Ｋａｔｏｈ ａｎｄ Ｋａｔｏｈ，Ｉｎｔ Ｊ Ｍｏｌ Ｍｅｄ １３（５）：７４９−５４（２００４））。ＦＥＳ−ＣＩＰ４相同性ドメインは、チューブリンと結合する（Ｔａｋａｈａｓｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（４９）：４９１２９−３３（２００３）；Ｌａｕｒｅｎｔ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ２４（２１）：９３５１−８（２００４））。ＳＨ３ドメインは、おそらく、プロセス（例えば、局所的なタンパク質濃度を増大させること、タンパク質の細胞内局在を決定することおよび大型の多タンパク質複合体の構築を媒介すること）を媒介する（ＩｎｔｅｒＰｒｏアクセッションＩＰＲ００１４５２）。したがって、ＦＣＨＳＤ１は、細胞骨格再構成に関与するプロセスに対するドッキングタンパク質として機能し得る。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ３８ １９ ７８
予測値 １９．５ ３９ １９．５ ７８
カイ二乗値＝０．９ 有意性＝０．６３７６２８１４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２２
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜７をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７５６８４．３）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７３４０１−１６３３（ＵＮＱ７３７）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＦＣＨおよび二重のＳＨ３ドメイン１（ＦＣＨＳＤ１）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、平均血清中グルコースレベルの上昇を示す変異（−／−）マウスをもたらした。雄ノックアウト（−／−）マウスはまた、脂肪パーセンテージの上昇および脂肪質量（ｇ）の増加を示し、ならびに雌（−／−）マウスは、大腿骨の骨塩密度および全身の骨塩密度の減少を示した。さらに、雄（−／−）マウスは、平均収縮期血圧の低下を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。

（ｂ）表現型解析：代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。

結果：
血液化学：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中グルコースレベルの著しい上昇を示した。しかしながら、耐糖能試験は正常であった。

上でまとめられたように、（−／−）マウスは、平均血清中グルコースレベルの上昇を示したことから、異常なグルコース代謝または前糖尿病性状態が示唆される。

（ｃ）心臓学−血圧／心拍数
試験の説明：Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧解析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。

結果
血圧：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下を示した。
（ｄ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

結果：
Ｄｅｘａ：雄（−／−）マウスは、性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総体脂肪パーセントおよび総脂肪質量の増加を示した。雌（−／−）マウスは、大腿骨の骨塩密度および総骨塩密度の減少を示した。

これらの研究から、変異雄（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が、肥満症に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ１４３１ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝プロセスに必須であり、特に肥満症の予防および／または処置に重要であり得る。雌ノックアウトマウスは、骨粗鬆症に起因し得る骨塩密度測定値の減少に関連する負の骨表現型を示した。したがって、ＰＲＯ１４３１ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨塩密度の減少を特徴とするそのような骨障害の処置に有用であり得る。

６６．２８．ＤＮＡ６８８１８−２５３６（ＵＮＱ７３９）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１４３４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６８８１８−２５３６と命名）（ＵＮＱ７３９）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７７０３３ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ａ９３００４１Ｇ１１遺伝子（Ａ９３００４１Ｇ１１Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８Ｃ８Ｎ３ アクセッション：Ｑ８Ｃ８Ｎ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。仮説フォン・ビルブラント因子；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１９８５７０ ホモ・サピエンス ＰＳＳＴ７３９（ＵＮＱ７３９）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ６ＵＸＥ２ アクセッション：Ｑ６ＵＸＥ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＰＳＳＴ７３９。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＵＮＱ７３９のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ａ９３００４１Ｇ１１遺伝子である。別名としては、ＰＳＳＴ７３９が挙げられる。

ＵＮＱ７３９は、シグナルペプチドおよび２つのタンデムなフォン・ビルブラント因子タイプＣ（ＶＷＣ）ドメインを含む推定分泌タンパク質である。ＶＷＣドメインは、多くの血漿タンパク質ならびに細胞内タンパク質に見られる。ＶＷＣドメインは、おそらくオリゴマー形成または複合体形成に関与する（Ｐｆａｍアクセッション０００９３）。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ３４ ２７ ８６
予測値 ２１．５ ４３ ２１．５ ８６
カイ二乗値＝１．２１ 有意性＝０．５４６０７４４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２７
平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１の前のエクソンおよびコードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＡＫ０３３９４４．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された１３の成体組織サンプルのうち、脳、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺および心臓において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６８８１８−２５３６（ＵＮＱ７３９）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト推定分泌タンパク質（ＵＮＱ７３９）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおいて感覚運動ゲーティング／注意の増大をもたらした。ホモ接合性変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、４段階中３段階のプレパルス強度で感覚運動ゲーティング／注意の増大を示した。さらに、（−／−）マウスは、アルカリホスファターゼレベルの低下傾向を示した。血液学から、（−／−）マウスにおける平均総白血球細胞数およびリンパ球の絶対数の減少が明らかになった。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。

聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より小さい（プレパルス）音に先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似ランダム順に６回、合計３６回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。

結果：
ＰＰＩ：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、ｐｐ４、ｐｐ８およびｐｐ１２の間のプレパルス抑制の中央値の著しい増加を示したことから、変異体における感覚運動ゲーティング／注意の増強が示唆される。
（ｃ）免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。

これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系／経路に関連することが多いが、これらの経路の１個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス／経路の拮抗作用または有益なプロセス／経路の刺激のいずれかによって生じ得る。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にＭＨＣ分子とともに提示され得る。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。Ｔ細胞としては、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が挙げられる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。

多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患（例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬および喘息）、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。

免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、１つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために（タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して）利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。

以下の試験を実施した：
（１）血液学解析：
試験の説明：血液試験は、Ａｂｂｏｔｔ社のＣｅｌｌ−Ｄｙｎ３５００Ｒ自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、５種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で２２を超えるパラメータが含まれ得る。

結果：
血液学：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総白血球細胞数およびリンパ球の絶対数の減少を示した。

これらの結果から、変異（−／−）マウスが、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を有することが示唆される。（−／−）マウスは、異常な適応免疫を示唆するリンパ球の絶対数の減少を示した。したがって、ＰＲＯ１４３４ポリペプチドは、正常な免疫学的プロファイルを維持するために、特に適応免疫にとって必須であるにちがいない。

６６．２９．ＤＮＡ６１１８５−１６４６（ＵＮＱ７４６）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１４７５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６１１８５−１６４６と命名）（ＵＮＱ７４６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２６６５１ アクセッション：ＮＭ＿０２６６５１ ＮＩＤ：２２２６７４５１ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ４９３０４６７Ｂ０６遺伝子（４９３０４６７Ｂ０６Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９１Ｘ８８ アクセッション：Ｑ９１Ｘ８８ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。Ｏ−マンノシルＮ−アセチルグルコサミン転移酵素；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１７７３９ アクセッション：ＮＭ＿０１７７３９ ＮＩＤ：８９２３２５２ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス Ｏ連結型マンノースβ１，２−Ｎ−アセチルグルコサミン転移酵素（ＦＬＪ２０２７７）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ９ＮＸＦ９ アクセッション：Ｑ９ＮＸＦ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＣＤＮＡ ＦＬＪ２０２７７ ＦＩＳ，クローンＨＥＰ０２５６７。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＦＬＪ２０２７７（Ｏ結合型マンノースβ１，２−Ｎ−アセチルグルコサミン転移酵素）のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ４９３０４６７Ｂ０６遺伝子である。別名としては、０６１００１６Ｉ０７Ｒｉｋ、Ｏ−マンノシルＮ−アセチルグルコサミン転移酵素、ＭＥＢ、ＧｎＴＩ．２、ＭＧＡＴ１．２、ＰＯＭＧＮＴ１およびＵＤＰ−ＧｌｃＮＡｃが挙げられる。

ＦＬＪ２０２７７は、Ｏ−マンノシル化タンパク質のアルファ連結型末端マンノース（Ｍａｎ）へのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）の付加を触媒するゴルジ膜グリコシルトランスフェラーゼである（Ｚｈａｎｇ ｅ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ ３６１（Ｐｔ１）：１５３−６２（２００２）；Ｓｃｈａｃｔｅｒ，Ｂｉｏｃｈｉｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ １５７３（３）：２９２−３００（２００２））。この酵素は、主に脳、神経および骨格筋で生じるＯ−マンノシルグリカン合成に関与する（Ｙｏｓｈｉｄａ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖ Ｃｅｌｌ１（５）：７１７−２４（２００１））。ＦＬＪ２０２７７の変異は、先天性筋ジストロフィー、脳形成異常および眼球の異常を特徴とする常染色体劣性遺伝障害である筋肉−眼−脳疾患を引き起こす（Ｖｅｒｖｏｏｒｔ ｅｔ ａｌ，Ａｎｎ Ｎｅｕｒｏｌ ５６（１）：１４３−８（２００４）；Ｍａｎｙａ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ３０６（１）：９３−７（２００３）；Ｔａｎｉｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｈｕｍ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔ １２（５）：５２７−３４（２００３））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ３９ １３ ７３
予測値 １８．２５ ３６．５ １８．２５ ７３
カイ二乗値＝１０．２９ 有意性＝０．００５８２８４７４６（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１８
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１の前のエクソンおよびコードエクソン１〜５をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２６６５１．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された１３の成体組織サンプルのうち脳および脊髄において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．２９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６１１８５−１６４６（ＵＮＱ７４６）
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＯ連結型マンノースβ１，２−Ｎ−アセチルグルコサミン転移酵素（ＦＬＪ２０２７７）のオルソログをコードする遺伝子の変異は、（−／−）マウスにおいて脳の発生奇形をもたらした。網膜血管組織崩壊、末梢性網膜変性症および微細動脈瘤が、ホモ接合性変異マウスにおいて眼底検査で観察された。顕微鏡解析により、網膜の異常が確認され、変異体における脳の発生奇形が明らかになった。さらに、雄と雌の（−／−）マウスの両方が、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較して耐糖能障害を示した。（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔よりも小さく、平均体重および平均体長の減少を示した。放射線学的観察結果から、骨粗鬆症に関連する異常な骨関連測定値が示された。いくつかの神経異常がまた、ノックアウト（−／−）マウスにおいて観察された。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：（−／−）マウスは、軽度から中程度の脳の多巣性発生奇形を示した。小脳における外顆粒細胞ニューロンの巣の保持および小脳回の関連する融合、海馬の歯状回の波型の腹側の腕、ニューロンの広範な組織崩壊および大脳皮質における神経細胞層の減少、ならびに背側正中溝の領域における両半球の融合によって示されるような、脳における不完全な神経細胞の移動に関する広範な証拠が見られた。頻繁に、側脳室の軽度の拡張もまた観察された。（−／−）マウスはまた、内側および外側の網膜顆粒層の薄層化に関連する、神経節の細胞数の全体的な減少（末梢でより重篤）を特徴とする広範な網膜萎縮を示した。網膜血管が、正常に神経節細胞層内に包埋される代わりにガラス体と直接接触して網膜の表面に存在することが多かった。いくつかの眼において、末梢の内側の顆粒層において網膜分離症が見られた。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。

（ｃ）心臓血管表現型解析：
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。１つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比（Ａ／Ｖ比）を測定した。異常なＡ／Ｖ比は、高血圧（および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患）、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下：網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。

手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、Ｈａｗｅｓおよび共同研究者ら（Ｈａｗｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９９９ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｖｉｓｉｏｎ １９９９；５：２２）に従って改変したＫｏｗａ Ｇｅｎｅｓｉｓ小動物用眼底カメラを用いて覚醒時の動物において行った。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得が可能となった。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈（Ａ／Ｖ）比を測定した。

眼科学的解析は、作製したＦ２の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体の変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行った。具体的には、Ａ／Ｖ比は、Ｋｏｗａ ＣＯＭＩＴ＋ソフトウェアを用いて眼底像に従って測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔でカラー写真を撮影する：像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比（Ａ／Ｖ）は、静脈直径に対する動脈直径（血管の分岐部の前で測定）の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性（色素性網膜炎として知られる）または網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体（−／−）およびヘテロ接合体（＋／−）変異型子孫において、野生型（＋／＋）同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、そのような病理状態を示唆し得る。

結果：
眼底：（−／−）マウスは、視神経線維層の線（ｓｔｒｉａｔｉｏｎ）および凝集、網膜血管組織崩壊および辺縁の網膜変性症を示した。１匹の（−／−）マウス（Ｆ−１７４）はまた、腫脹眼を示したことから、眼内圧上昇が示唆される。
血管造影：（−／−）マウスは、重篤な網膜血管組織崩壊、微細動脈瘤および網膜の毛細管漏出を示した。

まとめると、この研究において、（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較して、異常な網膜血管および網膜変性症に導き得る眼科学的（ｏｐｔｈａｍｏｌｏｇｉｃａｌ）異常を示した。まとめると、ＰＲＯ１４７５ポリペプチドをコードするＤＮＡ６１１８５−１６４６と同定された遺伝子をノックアウトすることによって、ホモ接合性変異体の子孫は、視神経および網膜動脈の異常に関連する表現型を示す。そのような検出された網膜の変化は、高血圧症（および高血圧症、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患）、糖尿病または網膜変性症および失明などの眼科学的障害に対応する他の眼球の疾患の血管系の疾患に関連し得る循環器の疾患または障害に最もよく関連する。したがって、ＰＲＯ１４７５コード遺伝子のアンタゴニストは、類似の病理学的な網膜の変化に導き得る一方で、アゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症または網膜変性症およびこの状態（上で同定されたように）に関連する疾患を含む他の眼科学的障害の処置における治療薬として有用であり得る。

（ｄ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのｉｎ ｖｉｖｏにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下：軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、Ｉ型またはＩＩ型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ：妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。

手順：
行動スクリーニングを、４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、１２〜１６週齢の間に実施した。

概日性試験の説明：
雌マウスを、試験の１日目の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、１２時間明／暗サイクル（午前７時に点灯し、午後７時に消灯する）に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、３日間の試験中、１時間間隔で６０回記録する。得られたデータは、３日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル（概日リズム）の中央値および各明／暗サイクル中の総活動性（自発活動性）の中央値によって示される。
結果：
概日性：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均に対する数と比較して、特に明期の間の歩行回数の中央値の減少を示した。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ１４７５ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。

反転スクリーン試験：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性変異マウスおよび８匹のホモ接合性変異マウスのコホートに対して行動スクリーニングを行った。すべての行動試験を、生存能低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２〜１６週齢で行った。これらの試験には、不安、活動レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。

反転スクリーン試験データ：
反転するスクリーンを使用して、運動力／運動協調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形（７．５ｃｍ×７．５ｃｍ）のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を１８０°回転させた。以下の行動応答を、１分間の試験にわたって記録した：落下、登上せず、および登上。

結果：
遺伝子型 落下率 ％ 登上率 ％
＋／＋（ｎ＝８） １／８ １２．５％ ０／８ ０
−／−（ｎ＝８） ４／８ ５０％ ０／８ ０
運動力の欠損は、（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスと（＋／＋）マウスとの間で落下応答が５０％異なる場合に明らかである。登上しなかった０／８もしくは１／８匹の（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスは、運動協調性障害を示す。登上した７／８もしくは８／８匹の（−／−）マウスまたは（＋／−）マウスは、運動協調性の増強を示す。

反転スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するように設定する：
解析した８匹の（−／−）マウスのうち、４匹すべての（−／−）マウスがスクリーンから落下したのに対して、１／８匹の（＋／＋）マウスが落下した。この結果から、変異体の運動協調性の障害が示唆される。
（ｅ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態：１型糖尿病および２型糖尿病、シンドロームＸ、様々な循環器疾患および／または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。

手順：２匹の野生型および４匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。２０％溶液として送達される２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースを動物にＩＰ注射し、血糖値を注射の０、３０、６０および９０分後に測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
経口耐糖能：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、耐糖能障害を示した。

これらの研究では、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔において正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が減少を示したかまたは耐糖能障害を示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示し、それゆえ、ＰＲＯ１４７５ポリペプチド（またはそのアゴニスト）またはそれをコードする遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または糖尿病を含む様々な循環器疾患に関連した状態の処置に有用であり得る。
（ｆ）骨代謝および全身診断学
（１）組織質量および除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して総組織質量（ＴＴＭ）の変化を同定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨）の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。

結果：
明らかな観察結果：明らか：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔よりも小さく、尾から吊るされたときに後肢をしっかりと握った。

体重／体長：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は：
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのＤＥＸＡ
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロＣＴ
を含んだ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合性マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容量測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤおよび椎骨ＢＭＤを測定した。

Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロモエタノール，２０ｍＬ／ｋｇ体重）をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをＤＥＸＡスキャンのためにＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメーター（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位にした。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、目的の領域（ＲＯＩ）［すなわち、全身、椎骨および両大腿骨］の骨塩密度（ＢＭＤ）および脂肪組成物（％脂肪）および総組織質量（ＴＴＭ）を測定した。

骨マイクロＣＴ解析：
手順：マイクロＣＴを使用して、非常に感度の高いＢＭＤの測定を行った。１つの椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の５つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、１６マイクロメートルの解像度で第５腰部椎骨（ＬＶ５）において解析し、皮質骨パラメータを、２０マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。

結果：
マイクロＣＴ：マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して、平均椎骨骨梁の体積、数、厚さおよび結合性密度の減少を示した。

ＰＲＯ１４７５ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異（−／−）マウスは、成長遅延および／または組織るいそう疾患ならびに異常な骨代謝と一致する表現型を示す。これらの結果は、その（＋／＋）同腹仔よりも小さい外見という観察結果ならびに上で報告した平均体重および平均体長の減少と一致する。さらに、変異（−／−）マウスは、骨粗鬆症を示唆する椎骨骨梁の骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。したがって、ＰＲＯ１４７５ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連作用を模倣し得る。他方で、ＰＲＯ１４７５ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長遅延、悪液質または他の組織るいそう疾患のようなそのような代謝障害の予防および／または処置に有用であり得、ならびに骨減少に関連する骨障害の処置に有用であり得る。

６６．３０．ＤＮＡ５８７３２−１６５０（ＵＮＱ７５０）遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、ＰＲＯ１４８１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５８７３２−１６５０と命名）（ＵＮＱ７５０）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである：変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７２９７９ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｄ７３００４６Ｌ０２遺伝子（Ｄ７３００４６Ｌ０２Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８Ｃ６Ｚ１ アクセッション：Ｑ８Ｃ６Ｚ１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムチン１５前駆体；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１４５６５０ ホモ・サピエンスムチン１５（ＭＵＣ１５）；ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する：Ｑ８Ｎ３８７ アクセッション：Ｑ８Ｎ３８７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＭＵＣ１５タンパク質前駆体。

目的のマウス遺伝子は、ヒトＭＵＣ１５（ムチン１５）のオルソログであるＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｄ７３００４６Ｌ０２遺伝子である。別名としては、４７３２４６０Ｅ０９、ＰＡＳＩＩＩ、ＰＡＳ３、糖タンパク質Ｃ、糖タンパク質４および成分ＩＩが挙げられる。ＭＵＣ１５は、シグナルペプチド、細胞外の大いにグリコシル化されたセグメント、膜貫通セグメントおよび短い細胞質Ｃ末端からなるＩ型原形質膜タンパク質である。膜貫通セグメントを欠く第２のアイソフォームは、分泌され得る。このタンパク質は、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、結腸、末梢血白血球、骨髄、リンパ節および肺を含む多岐に亘る組織において発現する。ＭＵＣ１５は、おそらく、細胞外マトリックスへの細胞接着において役割を果たす（Ｐａｌｌｅｓｅｎ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ ２６９（１１）：２７５５−６３（２００２））。

遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞において生じさせる。キメラマウスをＣ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交雑させ、Ｆ１ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、Ｆ２の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合に、Ｆ１ヘテロ接合性マウスを１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、Ｆ２マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルＩ表現型解析を実施する。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １９ ３９ ２３ ８１
予測値 ２０．２５ ４０．５ ２０．２５ ８１
カイ二乗値＝２．０６ 有意性＝０．３５７００６９７（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２９
平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７２９７９．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験された、胚性幹細胞（ＥＳ）細胞および１３のすべての成体組織サンプル（肝臓、骨格筋および骨以外）において標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５８７３２−１６５０（ＵＮＱ７５０））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトムチン１５（ＭＵＣ１５）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均（ｈｉｓｔｏｒｉｃａｌ ｍｅａｎｓ）と比較した場合、プレパルス抑制試験中に、感覚運動ゲーティング／注意が増強されたホモ接合性変異マウスが得られた。さらに、変異（−／−）マウスは、免疫学的異常を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析により、正常な乳房組織と比較した乳房腫瘍におけるＵＮＱ７５０の過剰発現が明らかとなる。
（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より柔らかい（プレパルス）音より先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似乱数順に６回、合計３６試行繰返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果：
ＰＰＩ：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ｐｐ４、ｐｐ８、およびｐｐ１２中にプレパルス抑制の中間値の増加を示し、これは、変異体における感覚運動ゲーティング／注意の増加を示す。
（ｄ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
（１）蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果：
組織特異的ＦＡＣＳ−プロジェクト：（−／−）マウスは、（＋／＋）マウスと比較した場合、パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞の比率の増加およびＢ２２０＋細胞の比率の減少を示した。これらの結果は、活性化Ｔ細胞（ＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋）の増加を示す。

これらの結果は、ノックアウトマウスがＢ細胞の小集団（プレＢ細胞、未熟Ｂ細胞、および成熟Ｂ細胞）の増加を示すことを示す。したがって、変異ホモ接合性マウスは、Ｂ細胞前駆細胞の減少に関連する免疫学的異常を示した。さらに、ノックアウトマウスは、Ｔ細胞の増加を示す。

これらの結果は、ノックアウト（−／−）マウスがその野生型（＋／＋）同腹仔と比較して免疫学的異常を示すことを示す。ＰＲＯ１４８１ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、この表現型を模倣するであろう。ＰＲＯ１４８１ポリペプチドまたはその作用剤は、Ｔ細胞産生の負の調節因子およびＢ細胞発生の正の調節因子として作用するようであり、Ｂ細胞の発生または成熟で有用であり、その後の迅速な免疫応答に関与し得る。ＰＲＯ１４８１ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、Ｔ細胞の産生の刺激で有用であろう。

６６．３１．ＤＮＡ６８８８０−１６７６（ＵＮＱ７７４）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１５６８ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６８８８０−１６７６と示す）（ＵＮＱ７７４）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７３００７ ムス・ムスクルス膜貫通４スーパーファミリーメンバー１２（Ｔｍ４ｓｆ１２）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＫＴ６ アクセッション：Ｑ８ＢＫＴ６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス９日胚全身ｃＤＮＡ、ＲＩＫＥＮ全長富化ライブラリー、クローン：Ｄ０３００１２Ｐ１２産物：ＴＥＴＲＡＳＰＡＮ ＮＥＴ−２ホモログ（Ｔｍ４ｓｆ１２タンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１２３３８ アクセッション：ＮＭ＿０１２３３８ ＮＩＤ：２１２６４５６７ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス膜貫通４スーパーファミリーメンバーテトラスパンＮＥＴ−２（ＮＥＴ−２）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｏ９５８５９ アクセッション：Ｏ９５８５９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＴＥＴＲＡＳＰＡＮ ＮＥＴ−２。

目的のマウス遺伝子は、Ｔｍ４ｓｆ１２（膜貫通４スーパーファミリーメンバー１２）（ヒトＴＭ４ＳＦ１２のオーソログ）である。別名には、９０３０６１９Ｅ１７、ＥＳＴ ＡＩ４２６７８２、ＮＥＴ−２、およびテトラスパンＮＥＴ−２が含まれる。

ＴＭ４ＳＦ１２は、推定内在性原形質膜タンパク質であり、且つ細胞接着およびシグナル伝達で機能する可能性が高いより大きな細胞表面複合体のサブユニットである。ＴＭ４ＳＦ１２は、テトラスパニンスーパーファミリーのメンバーであり、テトラスパニンファミリードメイン内に４つの膜貫通セグメントを含む。ＴＭ４ＳＦ１２の生理学的役割は知られていないが、テトラスパニンは、一般に、細胞の接着、移動、受精、免疫、発生、および転移などの過程で役割を果たすインテグリンによって媒介される接着依存性シグナル伝達に関与する（Ｓｅｒｒｕ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｉｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ １４７８（１）：１５９−６３（２０００）；Ｂｅｒｄｉｔｃｈｅｖｓｋｉ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｓｃｉ １１４（Ｐｔ ２３）：４１４３−５１（２００１）；Ｔａｒｒａｎｔ ｅｔ ａｌ，Ｔｒｅｎｄｓ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２４（１１）：６１０−７（２００３）；Ｌｅ Ｎａｏｕｒ ｅｔ ａｌ，Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ ５３（３）：１４８−５２（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２０ ３６ ２５ ８１
予測値 ２０．２５ ４０．５ ２０．２５ ８１
カイ二乗＝０．９９ 有意性＝０．６０９５７０９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７３００７．１）。
１．野生型発現パネル：骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６８８８０−１６７６（ＵＮＱ７７４））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト膜貫通４スーパーファミリーメンバー１２（ＴＭ４ＳＦ１２）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、多数の眼科的異常（網膜毛細血管瘤および不均一な（ｎｏｎ−ｈｏｍｏｇｅｎｅｏｕｓ）網膜バックグラウンドが含まれる）を示すホモ接合体マウスが得られた。さらに、ＣＡＴスキャン分析により、分析した３つのホモ接合性変異体のうちの２つおよび２つのヘテロ接合性マウスのうちの１つで中等度の水腎症が明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）心血管表現型解析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。１つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比（Ａ／Ｖ比）を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なＡ／Ｖ比は、高血圧の血管疾患（および高血圧を引き起こす任意の疾患（例えば、アテローム性動脈硬化症））、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない：網膜の異常は、以下である：網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞；網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群（Ａｌｓｔｏｍ’ｓ ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常（ｄｙｓｐｌａｉｓａ ｓｐｏｎｄｙｌｏｅｐｉｐｈｙｓａｒｉａ ｃｏｎｇｅｎｔｉａ）、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。

手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで試験した。Ｈａｗｅｓ ａｎｄ ｃｏａｕｔｈｏｒｓ（Ｈａｗｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９９９ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｖｉｓｉｏｎ １９９９；５：２２）にしたがって修正したＫｏｗａ Ｇｅｎｅｓｉｓ小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈（Ａ／Ｖ）比を決定した。

上記プロトコルを使用して、作製したＦ２野生型、ヘテロ接合体、およびホモ接合体変異子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Ｋｏｗａ ＣＯＭＩＴ＋ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってＡ／Ｖ比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比（Ａ／Ｖ）は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である（血管の分岐前に測定する）。多くの疾患（すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常（網膜変性（色素性網膜炎として公知）など）、網膜の形成異常、視覚問題、または失明）がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型（＋／＋）同腹仔と比較してホモ接合体（−／−）およびヘテロ接合体（＋／−）変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果：
眼底：（−／−）マウスは、不均一なバックグラウンドを有する不健康な網膜床を示した。２匹の（−／−）マウス（Ｍ−７９およびＭ−９８）はまた、網膜血管上に白色沈着物を示し、これは、視神経円板の約２〜３倍であった。

血管造影図：８匹全ての（−／−）マウスは、複数の微細動脈瘤および左右対称に網膜毛細血管の漏れを示した。

このような検出された網膜の変化は、最も一般的に、高血圧の血管疾患（および高血圧を引き起こす任意の疾患（例えば、アテローム性動脈硬化症））、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患（網膜変性など）に関連し得る心血管全身疾患または障害に関連する。したがって、ＰＲＯ１５６８コード遺伝子のアンタゴニストにより、類似の網膜変化が起こるのに対して、作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、または他の眼科障害（網膜変性およびこの容態に関連する疾患（上記）が含まれる）の治療薬として有用であり得る。

その後の研究は、ＵＮＱ７７４ノックアウト網膜（特に、神経線維層（ＮＦＬ）；内網状層（ＩＰＬ）、および外網状層（ＯＰＬ）新芽形成性（ｓｐｒｏｕｔｉｎｇ）血管形成の欠損を示した（したがって、網膜血管の３つの層状組織は、野生型（＋／＋）およびヘテロ接合体（＋／−）切片（網膜の全組織標本イソレクチン染色、１０倍の共焦点像）と比較した場合、血管形成の芽が欠損していた）。
（ｃ）病態／ＣＡＴスキャン
ＣＡＴスキャンプロトコル：
ＣＴ造影剤であるＯｍｎｉｐａｑｕｅ３００（Ｎｙｃｏｍｅｄ Ａｍｅｒｓｈａｎ，３００ｍｇヨウ素／ｍＬ、０．２５ｍＬ／動物または２．５０〜３．７５ｇヨウ素／ｋｇ体重）をマウスの腹腔内に注射した。約１０分間、ケージ内で安静にさせた後、Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロムエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、ＭｉｃｒｏＣＡＴスキャナー（ＩｍＴｅｋ，Ｉｎｃ．）を使用してＣＡＴスキャンを行った。三次元像を、ＩｍＴｅｋ ３Ｄ ＲＥＣＯＮソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでＦｅｌｄｋａｍｐアルゴリズムによって再構成した。

結果：
分析された６匹のマウスのうち、１匹の（＋／−）マウスおよび２匹の（−／−）マウスは、中程度の水腎症を示した。

６６．３２．ＤＮＡ７３７３５−１６８１（ＵＮＱ７７９）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１５７３ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７３７３５−１６８１と示す）（ＵＮＱ７７９）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１８７７８ ムス・ムスクルスクラウジン８（Ｃｌｄｎ８）；参照タンパク質：Ｑ９Ｚ２６０ アクセッション：Ｑ９Ｚ２６０ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。クラウジン８；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１９９３２８ ホモ・サピエンスクラウジン８（ＣＬＤＮ８）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｐ５６７４８ アクセッション：Ｐ５６７４８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。クラウジン８。

目的のマウス遺伝子は、Ｃｌｄｎ８（クラウジン（ｃｌａｕｄｉｎ）８）（ヒトＣＬＤＮ８のオーソログ）である。

ＣＬＤＮ８は、接着分子および密着結合の構成要素として機能する内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、４つの膜貫通セグメントを含む１つのクラウジンファミリードメインからなる（ＰｆａｍアクセッションＰＦ００８２２）。ＣＬＤＮ８は主に肺および腎臓に発現し、特に、アルドステロン感受性腎単位に沿った密着結合に集中している。ＣＬＤＮ８は、傍細胞カチオン輸送および浸透性で役割を果たす可能性が高い（Ｙｕ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（１９）：１７３５０−９（２００３）；Ｍｏｒｉｔａ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ Ｓ Ａ ９６（２）：５１１−６（１９９９）；Ｈｅｉｓｋａｌａ ｅｔ ａｌ，Ｔｒａｆｆｉｃ ２（２）：９３−８（２００１）；Ｌｉ ｅｔ ａｌ，Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｒｅｎａｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２８６（６）：Ｆ１０６３−７１（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １７ ４７ １９ ８３
予測値 ２０．７５ ４１．５ ２０．７５ ８３
カイ二乗＝２．５８ 有意性＝０．２７５２７０８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２１ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１８７７８．２）。
１．野生型発現パネル：脾臓、骨、心臓、および脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７３７３５−１６８１（ＵＮＱ７７９））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトクラウジン８（ＣＬＤＮ８）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、変異（−／−）マウスの驚愕反射が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より柔らかい（プレパルス）音より先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似乱数順に６回、合計３６試行繰返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果：
ＰＰＩ：（−／−）マウスは驚愕反応が減少し、変異体の聴覚障害が示唆される。

６６．３３．ＤＮＡ６２８４５−１６８４（ＵＮＱ７８２）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
破壊
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６２８４５−１６８４と示す）（ＵＮＱ７８２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿１９６７６３ ＰＲＥＤＩＣＴＥＤ：ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２９０００９２Ｍ１４遺伝子（２９０００９２Ｍ１４Ｒｉｋ）；参照タンパク質：ＸＰ＿１９６７６３ ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２９０００９２Ｍ１４［ムス・ムスクルス］；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿２１４７１０ ホモ・サピエンスプロテアーゼ、セリン様１（ＰＲＳＳＬ１）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＵＷＹ２ アクセッション：Ｑ６ＵＷＹ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＧＬＧＬ７８２。

目的のマウス遺伝子は、Ｐｒｓｓｌ１（プロテアーゼ、セリン様１）（ヒトＰＲＳＳＬ１のオーソログ）である。別名には、ＵＮＱ７８２、ＧＬＧＬ７８２、および２９０００９２Ｍ１４Ｒｉｋが含まれる。

ＰＲＳＳＬ１は、シグナルペプチドおよびトリプシン様セリンプロテアーゼドメインからなる推定分泌プロテアーゼである（ＳＭＡＲＴアクセッションＳＭ０００２０）。

不運なことに、科学論文および配列データベースでは、別の哺乳動物遺伝子座（ＫＬＫ１０、カリクレイン１０、遺伝子ＩＤ：５６５５）もＰＲＳＳＬ１と呼ばれている。本明細書中に記載の破壊遺伝子座ＫＬＫ１０ではなく、全く別の遺伝子を示す。ＰＲＳＳＬ１（本プロジェクトのための目的の遺伝子）に関する公開されていない情報を、本明細書の記載時に見出すことができる。したがって、全てＫＬＫ１０をいう。したがって、データベース配列として科学論文を解釈する場合に注意が必要である。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ３３ ２４ ８０
予測値 ２０ ４０ ２０ ８０
カイ二乗＝１．１ 有意性＝０．５７６９４９８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２８ 平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン２および３をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＸＭ＿１９６７６３．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプル中の脊髄、胸腺、および脾臓のみにおいて標的遺伝子の発現が検出された。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６２８４５−１６８４（ＵＮＱ７８２））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトプロテアーゼ、セリン様１（ＰＲＳＳＬ１）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合性変異体マウスは、末梢血中のＣＤ８およびＮＫ細胞の比率の減少およびＢ細胞の平均比率の増加を示した。さらに、変異体は、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＬＰＳ攻撃に対する平均血清ＴＮＦ−αおよびＭＣＰ−１応答の増加ならびにオボアルブミンに対する平均血清ＩｇＧ２ａ応答の増加を示した。ノックアウトマウスはまた、いくつかの組織の炎症を示した。さらに、変異（−／−）マウスは、平均全質量、総体脂肪率、および総脂肪質量の増加を伴う肥満の徴候を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

（１）蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
ＦＡＣＳ３：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＣＤ８細胞およびＮＫ細胞の平均比率の減少およびＢ細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。

まとめると、免疫細胞組成物のＦＡＣＳ解析は、ノックアウトマウス（−／−）が、Ｂ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞の両方（ＣＤ８−ＭＨＣクラスＩ分子の補助受容体として機能する胸腺細胞小集団）に関する免疫学的相違を示すことを示す。ＰＲＯ１５９９ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストはＢ細胞産生で有用あるのに対して、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドは逆効果を導くと予想されるであろう。他方では、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドは、ＣＤ８細胞およびＮＫ細胞の正の調節因子として機能するようである（ＦＡＣＳの結果は、ホモ接合性変異マウスのＣＤ８細胞およびナチュラルキラー細胞の平均比率が減少したことを示す）。ナチュラルキラー細胞は、ウイルス感染の最初の防衛線である。なぜなら、これらの細胞はウイルス免疫および腫瘍に対する防御に関与しているからである。ナチュラルキラー細胞（すなわり、ＮＫ細胞）は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性におけるエフェクターとして機能し、事前に免疫化または活性化することなくｉｎ ｖｉｔｒｏで一定のリンパ系腫瘍細胞株を死滅させる能力によって同定される。したがって、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドまたはその作用剤は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性に重要な細胞傷害性Ｔ細胞およびＮＫ細胞の産生で有用であろう。

（２）急性期応答：
試験の説明：細菌リポ多糖（ＬＰＳ）は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルＩ ＬＰＳマウスに、２６ゲージの針を使用して、亜致死量のＬＰＳを含む２００μＬ滅菌生理食塩水を腹腔内（ｉ．ｐ．）注射した。この用量は、注射から３時間後に１μｇ／ｇ体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、１００μＬの血液サンプルを採取し、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置でＴＮＦａ、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６の存在について分析した。
結果：
急性期応答：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＬＰＳ攻撃に対する平均血清ＴＮＦ−αおよびＭＣＰ−１応答が増加した。

まとめると、ＬＰＳ内毒素攻撃は、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、ＬＰＳ内毒素で攻撃した場合、免疫応答（ＴＮＦ−αおよびＭＣＰ−１産生）を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。ＴＮＦ−αおよびＭＣＰ−１は、より後期のＢ細胞活性化に寄与する。これにより、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫応答を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドまたはその作用剤は、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（３）卵白アルブミン攻撃
手順：このアッセイは、７匹の野生型および８匹のホモ接合体マウスにおいて行った。ニワトリ卵白アルブミン（ＯＶＡ）は、Ｔ細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。ＯＶＡは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。ＯＶＡに対するマウスの免疫応答は、Ｔ細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗ＯＶＡ抗体を、免疫処置の８〜１０日後に酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＺＡ）を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。

上記のように、このプロトコルは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力を評価する。動物に５０ｍｇのニワトリ卵白アルブミン（完全フロイントアジュバント中に乳化）をＩＰ注射し、１４日後に、抗卵白アルブミン抗体（ＩｇＭ、ＩｇＧ１およびＩｇＧ２サブクラス）の血清力価を測定した。血清試料中のＯＶＡ特異的抗体の量は、９６ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度（ＯＤ）値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。

この攻撃の結果：
卵白アルブミン：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、卵白アルブミン攻撃に対する平均血清ＩｇＧ２ａ応答の増加を示した。

まとめると、卵白アルブミン攻撃研究は、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異マウスは、Ｔ細胞依存性ＯＶＡ抗原で攻撃した場合、免疫学的応答を誘発する能力の低下を示した。したがって、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、免疫系の刺激に有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドまたはその作用剤は、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶、移植片対宿主疾患、または自己免疫疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（ｃ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：雌（−／−）は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。

これらの研究により、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ１５９９ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および／または肥満の予防および／または治療で特に重要であろう。

６６．３４．ＤＮＡ７１２８６−１６８７（ＵＮＱ７８５）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１６０４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７１２８６−１６８７と示す）（ＵＮＱ７８５）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿００８２３３ アクセッション：ＮＭ＿００８２３３ ＮＩＤ：６６８０２００ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス 肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質２（Ｈｄｇｆｒｐ２）；参照タンパク質：Ｏ３５５４０ Ｏ３５５４０ Ｏ３５５４０ 肝細胞癌由来成長因子；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０３２６３１ ホモ・サピエンス肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質２（ＨＤＧＦ２）、転写変異型（ｖａｒｉａｎｔ）２；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＢＷ０８ アクセッション：Ｑ９ＢＷ０８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質２に類似。

目的のマウス遺伝子は、Ｈｄｇｆｒｐ２（肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質２）（ヒトＨＤＧＦ２のオーソログ）である。別名には、ＭＧＣ２６４１、肝細胞癌由来成長因子２、およびＨＲＰ−２が含まれる。

ＨＤＧＦ２は、精巣および骨格筋で発現する推定核タンパク質である。このタンパク質は、ＰＷＷＰドメインおよび二分核定位シグナルを含む。ＰＷＷＰドメインは、典型的には、核タンパク質中で見出され、タンパク質−タンパク質相互作用に関与する可能性が高い。ＨＤＧＦ２は、肝細胞癌由来成長因子（ＨＤＧＦ）（細胞株中で過剰発現した場合または外因的に細胞に適用した場合にＤＮＡ合成および細胞増殖を刺激する核タンパク質）と構造的に類似している。ＨＤＧＦの外見上の分裂促進活性は、その核に侵入する能力に依存する（Ｉｚｕｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ２３８（１）：２６−３２（１９９７）；Ｋｉｓｈｉｍａ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（１２）：１０３１５−２２（２００２））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２０ ３６ １７ ７３
予測値 １８．２５ ３６．５ １８．２５ ７３
カイ二乗＝７．５４ 有意性＝０．０２３０５２０６３（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１８ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜３をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿００８２３３．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７１２８６−１６８７（ＵＮＱ７８５））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質２（ＨＤＧＦ２）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加したホモ接合性変異マウスが得られた。サーカディアン試験中、変異（−／−）マウスは、全明暗期中に多動を示した。さらに、雌変異体は、平均皮膚線維芽細胞増殖率が減少した。雄（−／−）マウスは、骨塩量および骨中無機質密度の測定値が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）表現型解析：代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は血糖値測定も含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ．Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う：アルカリホスファターゼ；アラニンアミノトランスフェラーゼ；アルブミン；ビリルビン；リン；クレアチニン；ＢＵＮ＝血中尿素窒素；カルシウム；尿酸；ナトリウム；カリウム；および塩化物。

結果：
雄および雌（−／−）マウスの両方は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、兵器血清アルカリホスファターゼレベルが増加した。この結果は、肝臓の変化に起因する可能性が高い。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明：
雌マウスを、試験初日の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前７時に照明をつけ、午後７時に照明を消す１２時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数（ビームが自動的に歩行に妨害される）を記録する。活動を、３日間の試験中に１時間間隔で６０秒間記録する。得られたデータを、３日間の試験期間にわたって各時間（日周期リズム）について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値（自発運動）によって表示した。
結果：
雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の１２時間の馴化期間および全明暗期に歩行回数が増加した（多動）。これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および感覚障害と一致する。
（ｄ）成体皮膚細胞の増殖：
手順：１６週齢の動物（２匹の野生型および４匹のホモ接合体）から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、ｐ５３およびＫｕ８０を使用して証明した。Ｂｒｄｕ組み込みを使用して、増殖を測定した。

詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。５万個の細胞の２連または３連の培養物をプレートし、６日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果：
雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。

したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、ＰＲＯ１６０４ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
（ｅ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度（ｃｏｎｎｅｃｔｉｖｉｔｙ ｄｅｎｓｉｔｙ）、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均の値と比較した場合、骨塩量および脊椎骨中無機質密度ならびに全身および大腿骨中無機質密度が減少する傾向があるようであった。
マイクロＣＴ：雄ノックアウトは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、小柱の厚さおよび連結密度ならびに大腿骨骨幹部総領域が減少する傾向があるようであった。ＤＥＸＡおよびマイクロＣＴの結果は、わずかに中央値の１ＳＤ低い。

６６．３５．ＤＮＡ７７６４８−１６８８（ＵＮＱ７８６）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１６０５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７７６４８−１６８８と示す）（ＵＮＱ７８６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７５０９８ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ６３３０４０７Ｄ１２遺伝子（６３３０４０７Ｄ１２Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＩＳ８ アクセッション：Ｑ８ＢＩＳ８ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス成体雄延髄ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮ全長富化ライブラリー、クローン：６３３０４０７Ｄ１２産物：Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの少しの類似物（ｗｅａｋｌｙ ｓｉｍｉｌａｒ）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１３８７７１ アクセッション：ＮＭ＿１３８７７１ ＮＩＤ：ｇｉ ２０２７０３０８ ｒｅｆ ＮＭ＿１３８７７１．１ ホモ・サピエンスα−１，３（６）−マンノシル糖タンパク質β−１，６−Ｎ−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様（ＬＯＣ９０６９３）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９６ＥＥ４ アクセッション：Ｑ９６ＥＥ４ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ６３３０４０７Ｄ１２遺伝子（ヒトα−１，３（６）−マンノシル糖タンパク質β−１，６−Ｎ−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様のオーソログ）である。別名には、ＥＳＴ ＡＡ６７５０４０が含まれる。

１４０アミノ酸の仮説タンパク質は、１つのペプチドからなり、且つ他の保存ドメインをを含まず、ゴルジ装置または細胞外間隙（分泌性）中に存在すると予想される。このタンパク質は、ＭＧＡＴ５（マンノシル［α−１，６−］−糖タンパク質β−１，６−Ｎ−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ）およびＭＧＡＴ５Ｂ（マンノシル［α−１，６−］−糖タンパク質β−１，６−Ｎ−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼイソ酵素Ｂ）（糖タンパク質オリゴサッカリド生合成を触媒する約７５０アミノ酸のグリコシルトランスフェラーゼ）のＮ末端セグメントと構造的に関連する。ＭＧＡＴ５は、ゴルジ装置の膜内に存在し、分泌もされる。分泌性ＭＧＡＴ５は、グリコシル化と無関係の機構によってヘパラン硫酸プロテオグリカンから線維芽細胞成長因子を放出し、ＦＧＦ−２が標的細胞上のその受容体を活性化することができる可能性が高い（Ｓａｉｔｏ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（１９）：１７００２−８（２００２））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １４ ５０ ２６ ９０
予測値 ２２．５ ４５ ２２．５ ９０
カイ二乗＝１．３ 有意性＝０．５２２０４５８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２７ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：第１のコードエクソンをターゲティングした（ＮＭ＿１７５０９８．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨格筋および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７７６４８−１６８８（ＵＮＱ７８６））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトα−１，３（６）−マンノシル糖タンパク質β−１，６−Ｎ−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様のオーソログをコードする遺伝子の変異により、トリグリセリドレベルが増加した変異（−／−）マウスが得られた。４匹の（−／−）マウスは、肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内空胞化の増加を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：分析した６匹の（−／−）マウスのうち、４匹が肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内空胞化の中程度の増加を示した。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
（ｃ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。
結果：
血液化学：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。したがって、ＰＲＯ１６０５遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ１６０５ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ１６０５ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。

６６．３６．ＤＮＡ７７３０１−１７０８（ＵＮＱ８０３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１６９３ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７７３０１−１７０８と示す）（ＵＮＱ８０３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７８６７８ ムス・ムスクルスロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル３（Ｌｒｒｔｍ３）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＧＪ７ アクセッション：Ｑ８ＢＧＪ７ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス １６日新生児小脳ｃＤＮＡ、ＲＩＫＥＮ全長富化ライブラリー、クローン：９６３０００３Ｄ０５産物：仮説ロイシンリッチ反復、典型的なサブタイプ含有タンパク質、全インサート配列；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１７８０１１ ホモ・サピエンスロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル３（ＬＲＲＴＭ３）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８６ＶＨ５ アクセッション：Ｑ８６ＶＨ５ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル３タンパク質（ＧＦＮＶ８０３）。

目的のマウス遺伝子は、Ｌｒｒｔｍ３（ロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル３）（ヒトＬＲＲＴＭ３のオーソログ）である。別名には、９６３００４４Ｈ０４Ｒｉｋおよびロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル３タンパク質が含まれる。

ＬＲＲＴＭ３は、推定内在性原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチ反復、膜貫通セグメント、および潜在的な細胞質Ｃ末端ドメインからなる。このタンパク質は、主に、脊椎動物の神経系に発現する。ＬＲＲＴＭ３は、細胞接着分子またはシグナル伝達受容体として機能することができ、おそらく、神経系の発達および維持で役割を果たす（Ｌａｕｒｅｎ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ８１（４）：４１１−２１（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２４ ２５ １５ ６４
予測値 １６ ３２ １６ ６４
カイ二乗＝０．１５ 有意性＝０．９２７７４３５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７８６７８．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプル中の脳、脊髄、および眼のみにおいて標的遺伝子の発現が検出された。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７７３０１−１７０８（ＵＮＱ８０３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル３（ＬＲＲＴＭ３）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均絶対白血球数が増加したホモ接合体マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
血液学分析：
試験の説明：Ａｂｂｏｔｔ’ｓ Ｃｅｌｌ−Ｄｙｎ ３５００Ｒ（自動血液学分析器）によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、５つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で２２個のパラメータを対象とすることができる。
結果：
血液学：（−／−）マウスは、その野生型同腹仔（＋／＋）マウスおよび歴史的平均と比較した場合、平均絶対好中球数の増加を示した。

これらの結果は、変異（−／−）マウスがその野生型同腹仔と比較して免疫学的異常を示すことを示す。まとめると、血液学の結果は、ホモ接合体変異マウスが好中球数の増加を示し、これは、細胞外病原体を飲み込むか死滅させる食細胞活性または能力が増加したマクロファージ前駆体レベルの上昇を示す。

６６．３７．ＤＮＡ６８８８３−１６９１（ＵＮＱ８２６）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１７５３ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６８８８３−１６９１と示す）（ＵＮＱ８２６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１０９５９ ムス・ムスクルスオンコプロテイン誘導性転写物３（Ｏｉｔ３）；参照タンパク質：Ｑ８Ｃ９Ｕ１ アクセッション：Ｑ８Ｃ９Ｕ１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス ０日新生児胸腺ｃＤＮＡ，ＲＩＫＥＮ全長富化ライブラリー、クローン：Ａ４３０１０７Ａ０４産物：ＡＬＣ ｈｏｍｏｌｏｇ；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５２６３５ ホモ・サピエンスオンコプロテイン誘導性転写物３（ＯＩＴ３）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＷＷＺ８ アクセッション：Ｑ８ＷＷＺ８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＬＺＰ（仮説タンパク質ＦＬＪ３９１１６）（ＰＰＦＬ８２６）。

目的のマウス遺伝子は、Ｏｉｔ３（オンコプロテイン誘導性転写物３）（ヒトＯＩＴ３のオーソログ）である。別名には、ＬＺＰ、ＥＦ−９、ＦＬＪ３９１１６、および肝臓特異的ＺＰドメイン含有タンパク質が含まれる。

ＯＩＴ３は、主に肝臓で発現する推定分泌タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、３つのタンデム上皮成長因子様ドメイン、および新規の透明帯ドメインを含む。タンパク質の短縮形態を血中で検出できるにもかかわらず、ＯＩＴ３は、主に、肝細胞の角膜上に存在する。ＯＩＴ３遺伝子は、ＮＩＨ３Ｔ３線維芽細胞中でオンコプロテインＥ２ａ−Ｐｂｘ１によって活性化されるが、肝細胞癌中で稀にしか発現されず、ＯＩＴ３は肝細胞癌にの湯様な負のマーカーであり得ることが示唆される。ＯＩＴ３の生物学的役割は知られていない（Ｆｕ ａｎｄ Ｋａｍｐ，Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １７（３）：１５０３−１２（１９９７）；Ｘｕ ｅｔ ａｌ，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ ３８（３）：７３５−４４（２００３）；Ｘｕ ｅｔ ａｌ，ＤＮＡ Ｓｅｑ １５（２）：８１−７（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １９ ４１ １５ ７５
予測値 １８．７５ ３７．５ １８．７５ ７５
カイ二乗＝５．８２ 有意性＝０．０５４４７５７２５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２ 平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１０９５９．１）。
１．野生型発現パネル：脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６８８８３−１６９１（ＵＮＱ８２６））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトオンコプロテイン誘導性転写物３（ＯＩＴ３）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において不安様応答が増加した雄ホモ接合体マウスが得られた。さらに、組織特異的ＦＡＣＳにより、Ｂ２２０ｈｉＣＤ４３−、ＩｇＭ＋、およびＩｇＤ＋の比率の減少によって特徴づけられた変異（−／−）マウスで免疫学的変化が明らかとなった。雌（−／−）マウスは、骨塩量および骨中無機質密度の測定値が減少した。ＵＮＱ８２６は、正常および罹患した肝臓組織の両方で高発現を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析／組織特異的ＦＡＣＳ
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
組織特異的ＦＡＣＳプロジェクト：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨髄中のＢ２２０ｈｉＣＤ４３細胞、ＩｇＭ＋細胞、およびＩｇＤ＋細胞の比率が減少した。これらの結果は、骨髄中のプレＢ細胞、未成熟および成熟Ｂ細胞のサブセットの減少を示す。したがって、ＰＲＯ１７５３ポリペプチドは、骨髄中でのＢ細胞集団の発達に重要であり、Ｂ細胞産生の刺激に有用であろう。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。

手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。

オープンフィールド試験：
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン（ｓｅｒａｔｏｎｉｎ）輸送体、ドーパミン輸送体（Ｇｉｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．１９９６ Ｆｅｂ ｌ５；３７９（６５６６）：６０６−１２）、およびＧＡＢＡ受容体（Ｈｏｍａｎｉｃｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．１９９７ Ａｐｒ １５；９４（８）：４１４３−８）のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第１に、マウスにとって比較的巨大であるように領域（４０×４０ｃｍ）を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く（特に探索に関する活動）ことが可能な４個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第１の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第１の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比（ｃｅｎｔｅｒ−ｔｏ−ｔｏｔａｌ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｔｒａｖｅｌｅｄ ｒａｔｉｏ）は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。３つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域（４０ｃｍ×４０ｃｍ、ＡｃｃｕＳｃａｎ ＩｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓのＶｅｒｓａＭａｘ動物活動モニタリングシステム）を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を２０分間測定した。この試験からのデータを、４分間隔で５回分析した。総移動距離（ｃｍ）、上下運動数（直立）、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。

新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、５回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各５回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。

結果：
オープンフィールド２：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が減少し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。さらに、８匹の（＋／＋）野生型マウスのうちの２匹および８匹の（−／−）ノックアウトマウスのうちの６匹で髭が無かった。髭のない頻度が高いノックアウトマウスは、おそらく、不安表現型に関連する。

まとめると、オープンフィールド試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および／または双極性障害、活動亢進；感覚障害；強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、ＰＲＯ１７５３ポリペプチドまたはその作用剤は、このような神経障害の治療で有用であろう。

（ｄ）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。

結果：
ＤＥＸＡ：
雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均骨塩量および骨中無機質密度が減少した。

したがって、ＰＲＯ１７５３ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異（−／−）マウスは、骨塩量およびの測定値の減少によって記される骨粗鬆症と一致する表現型を示す。したがって、ＰＲＯ１７５３ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連効果を模倣するであろう。他方では、ＰＲＯ１７５３ポリペプチドまたはその作用剤は、骨量減少に関連する骨障害の予防および／または治療で有用であろう。

６６．３８．ＤＮＡ７６３９６−１６９８（ＵＮＱ８２８）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１７５５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７６３９６−１６９８と示す）（ＵＮＱ８２８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７５６９６ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｃ５３００２８Ｏ２１ ｇｅｎｅ（Ｃ５３００２８Ｏ２１Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ６Ｐ１Ｂ３ アクセッション：Ｑ６Ｐ１Ｂ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。Ｃ５３００２８Ｏ２１Ｒｉｋタンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５３６８５ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ５４７Ｄ２２１０（ＤＫＦＺｐ５４７Ｄ２２１０）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＩＹＪ０ アクセッション：Ｑ８ＩＹＪ０ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ５４７Ｄ２２１０。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｃ５３００２８Ｏ２１遺伝子（ヒト仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ５４７Ｄ２２１０のオーソログ）である。別名には、ＥＳＴ ＡＩ２５５１８３およびＤＫＦＺｐ５４７Ｄ２２１０が含まれる。

仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ５４７Ｄ２２１０は、Ｉ型内在性膜タンパク質であり、シグナルペプチドおよび膜貫通ドメインからなる。このタンパク質の機能は知られておらず、その推定される細胞中の位置はあいまいである。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ３３ １６ ６５
予測値 １６．２５ ３２．５ １６．２５ ６５
カイ二乗＝０．０９ 有意性＝０．９５５９９７４７（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜４をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７５６９６．２）
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７６３９６−１６９８（ＵＮＱ８２８））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖率が増加した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。さらに、雌（−／−）マウスは、耐糖能障害を示した。（−／−）マウスはまた、平均血清ＩｇＧ１レベルが減少した。ＵＮＱ８２８は、他の正常組織と比較してＣＮＳ中に高度に発現する。内皮はまた、中程度に高い発現を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
経口耐糖能：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中程度の耐糖能障害を示した。

これらの研究は、（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ１７５５ポリペプチド（またはその作用剤）またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または種々の心血管障害（糖尿病が含まれる）に関連する病態の治療で有用であろう。
（ｃ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行のための（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＧ１レベルが減少した。

したがって、変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較してＩｇＧ１血清免疫グロブリンが減少した。これらの免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。認められた表現型により、ＰＲＯ１７５５ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。したがって、ＰＲＯ１７５５ポリペプチドをコードする遺伝子は、ＩｇＧ１免疫グロブリン（またはγグロブリン）の作製に不可欠である。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ１７５５ポリペプチドが免疫系を刺激することができ、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ１７５５ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、免疫応答の阻害で役割を果たし得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
（ｄ）成体皮膚細胞の増殖：
手順：１６週齢の動物（２匹の野生型および４匹のホモ接合体）から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、ｐ５３およびＫｕ８０を使用して証明した。Ｂｒｄｕ組み込みを使用して、増殖を測定した。

詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。５万個の細胞の２連または３連の培養物をプレートし、６日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果：
皮膚増殖：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が増加した。４匹の（−／−）マウスのうちの２匹は、増殖が有意に増加した。

したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、ＰＲＯ１７５５ポリペプチドまたはその作用剤は、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。

６６．３９．ＤＮＡ７１２３５−１７０６（ＵＮＱ８３９）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７１２３５−１７０６と示す）（ＵＮＱ８３９）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２８７１０ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ６３３０４０６Ｐ０８遺伝子（６３３０４０６Ｐ０８Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９Ｄ３Ｂ４ アクセッション：Ｑ９Ｄ３Ｂ４ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。６３３０４０６Ｐ０８ＲＩＫ ＰＲＯＴＥＩＮ；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１４９６０ ホモ・サピエンスアリールスルファターゼＧ（ＫＩＡＡ１００１）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９６ＥＧ１ アクセッション：Ｑ９６ＥＧ１ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。アリールスルファターゼＧ。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ６３３０４０６Ｐ０８遺伝子（ヒトＡＲＳＧ（アリールスルファターゼＧ）のオーソログ）である。別名には、ＫＩＡＡ１００１が含まれる。

ＡＲＳＧは、アリールスルホエステル結合の加水分解を触媒する可能性が高い酵素である。この酵素の位置は、明確に知られていない。ＡＲＳＧのバイオインフォマティクス分析により、この酵素がリソソーム中に存在し得るか分泌することができることが示唆される。ＣＯＳ７細胞中に発現したＡＲＳＧは、小胞体中に存在する（Ｆｅｒｒａｎｔｅ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ １０（１２）：８１３−８（２００２））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １２ ３３ １２ ５７
予測値 １４．２５ ２８．５ １４．２５ ５７
カイ二乗＝０．０１ 有意性＝０．９９５０１２４６（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２８７１０．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨格筋、骨、および脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．３９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７１２３５−１７０６（ＵＮＱ８３９））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトアリールスルファターゼＧ（ＡＲＳＧ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合性変異体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均比率の減少および平均血清ＩｇＧ３レベルの増加を示した。雌変異体はまた、平均皮膚線維芽細胞の増殖率が減少した。雄（−／−）マウスはまた、平均総体脂肪マス率が増加し、平均骨中無機質密度関連測定値が減少した。マイクロＣＴの結果は、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。雌（−／−）マウスは、ホームケージ試験時に歩行回数の中央値が増加し、これは、日周期リズムの増強を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析は、正常な乳房組織と比較して乳房腫瘍でＵＮＱ８３９が過剰発現することを示す。
（ｃ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
（１）蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果：
ＦＡＣＳ：
（−／−）マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均比率の低下によって特徴づけられる異なる白血球サブセットの分布の変化を示した。

まとめると、ＦＡＣＳ結果は、特に、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドをコードするＤＮＡ７１２３５−１７０６遺伝子のノックアウトに関連した負の表現型の指標であるナチュラルキラー細胞の平均比率の低下を考慮すると、ホモ接合性変異マウスの免疫系が損なわれたことが示唆される。ナチュラルキラー細胞は、ウイルス免疫および腫瘍に対する防御に関与しているため、ウイルス感染の防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞またはＮＫ細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性においてエフェクターとして作用し、事前の免疫化または活性化の必要なしに一定のリンパ系腫瘍細胞株をｉｎ ｖｉｔｒｏで死滅する能力によって同定されてきた。しかしながら、宿主防御におけるこれらの公知の機能は、いくつかの細胞内の病原体、特にヘルペスウイルスの感染の初期においてである。したがって、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドおよびその作用剤は、健康な免疫系に重要であり、且つ特にウイルス感染時の免疫系刺激で有用であろう。
（２）血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行のための（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＧ３レベルが増加した。

免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合体成体が血清ＩｇＧ３レベルの増加を示すことが明らかとなった。したがって、ホモ接合体は、（＋／＋）同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが上昇した。ＩｇＧ３免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターがが免疫系を刺激し、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドまたはその作用剤は、免疫応答を阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
（ｄ）成体皮膚細胞の増殖：
手順：１６週齢の動物（２匹の野生型および４匹のホモ接合体）から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、ｐ５３およびＫｕ８０を使用して証明した。Ｂｒｄｕ組み込みを使用して、増殖を測定した。

詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。５万個の細胞の２連または３連の培養物をプレートし、６日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果：
皮膚増殖：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。

したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、この高増殖表現型を模倣し、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。これらの結果は、乳房腫瘍におけるこの遺伝子の過剰発現を示すマイクロアレイデータと一致する。
（ｅ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明：
雌マウスを、試験初日の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前７時に照明をつけ、午後７時に照明を消す１２時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数（ビームが自動的に歩行に妨害される）を記録する。活動を、３日間の試験中に１時間間隔で６０秒間記録する。得られたデータを、３日間の試験期間にわたって各時間（日周期リズム）について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値（自発運動）によって表示した。
結果：
サーカディアン：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均の数と比較した場合、両暗期中に歩行回数の中央値が顕著に増加した（多動）。
これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および感覚障害と一致する。
（ｆ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄（−／−）マウスは、性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨塩量および平均骨中無機質密度の減少を伴う平均骨中無機質密度関連測定値が減少した。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスはまた、性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。

これらの結果は、ノックアウト変異マウスが、密度の減少および骨折し得る脆弱性を伴う骨量の減少によって特徴づけられる骨粗鬆症に類似する骨測定値が減少した異常な骨代謝を示すことを証明する。したがって、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドまたはその作用剤が骨ホメオスタシスの維持で有用なようである。さらに、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療に有用であろう。それに対して、ＰＲＯ１７７７またはそのコード遺伝子のアンタゴニストは、病的骨障害（関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる）を引き起こすであろう。

雄（−／−）マウスはまた、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。

これらの研究により、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことが示唆される。病理学的所見は、放射線学的所見と一致する。したがって、ＰＲＯ１７７７ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および／または肥満症の防止および／または治療で特に重要であろう。

６６．４０．ＤＮＡ７７６５２−２５０５（ＵＮＱ８５０）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１７８８ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ７７６５２−２５０５と示す）（ＵＮＱ８５０）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿４８５９６５ ＰＲＥＤＩＣＴＥＤ：ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ９５３００５１Ｋ０１遺伝子（９５３００５１Ｋ０１Ｒｉｋ）；参照タンパク質：ＸＰ＿４８５９６５（仮説タンパク質の類似物）、エストラジオール誘導性（ムス・ムスクルス）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１５５１６ ホモ・サピエンス仮説タンパク質、エストラジオール誘導性（Ｅ２ＩＧ４）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＵＪＸ９ アクセッション：Ｑ９ＵＪＸ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。Ｅ２ＩＧ４。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ９５３００５１Ｋ０１遺伝子（ヒトＴＳＫのオーソログ（ニワトリツクシ（ｃｈｉｃｋｅｎ ｔｓｕｋｕｓｈｉ）のオーソログである可能性が高い））である。別名には、Ｅ２ＩＧ４が含まれる。

ＴＳＫは、分泌タンパク質であり、シグナルペプチド、ロイシンリッチ反復Ｎ末端ドメイン、およびいくつかのロイシンリッチ反復からなる。ＴＳＫは、骨形態形成タンパク質またはコーディンに結合して三元複合体を形成し、原腸陥入時のＢＭＰ誘導性ヘンゼン結節形成を阻害する。ＴＳＫは、胚発生時の背側化で役割を果たす可能性が高い（Ｏｈｔａ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖ Ｃｅｌｌ ７（３）：３４７−５８（２００４））。ＴＳＫはまた、エストロゲン応答性癌細胞中に発現し、乳房組織再造形または上皮−間質相互作用で役割を果たすと提案されている（Ｃｈａｒｐａｅｎｔｉｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ６０（２１）：５９７７−８３（２０００））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ４２ ２６ ８９
予測値 ２２．２５ ４４．５ ２２．２５ ８９
カイ二乗＝０．７８ 有意性＝０．６７７０５６９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２７ 平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
コードエクソン２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＡＫ０３５４６１．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脾臓、肝臓、骨格筋、胃、小腸、結腸、心臓、および脂肪中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ７７６５２−２５０５（ＵＮＱ８５０））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ニワトリツクシ（ＴＳＫ）のヒト様オーソログをコードする遺伝子の変異により、平均血清ＩｇＭレベルが増加した変異（−／−）マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行のための（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＭレベルが増加した。

変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較してＩｇＭ血清免疫グロブリンが上昇した。ＩｇＭ免疫グロブリンは、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において最初に産生され、補体系の活性化に特に重要である。認められた表現型により、ＰＲＯ１７８８ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ１７８８ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）が免疫系（Ｔ細胞増殖など）を刺激することができ、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ１７８８ポリペプチドまたは作用剤は、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

６６．４１．ＤＮＡ４５４０９−２５１１（ＵＮＱ８５５）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１８６４ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ４５４０９−２５１１と示す）（ＵＮＱ８５５）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２４２７０ ムス・ムスクルス ＳＴＡＲＤ３ Ｎ末端様（Ｓｔａｒｄ３ｎｌ）；参照タンパク質：Ｑ９ＤＣＩ３ アクセッション：Ｑ９ＤＣＩ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＭＬＮ６４ Ｎ末端ドメインホモログ（ＳＴＡＲＤ３Ｎ末端様タンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０３２０１６ ホモ・サピエンス ＳＴＡＲＤ３ Ｎ末端様（ＳＴＡＲＤ３ＮＬ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｏ９５７７２ アクセッション：Ｏ９５７７２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。Ｈ＿ＮＨ１０２１Ａ０８．１タンパク質（未知）（ＭＧＣのタンパク質：１４６０７）（ステロイド産生急性調節タンパク質関連物の類似物）。

目的のマウス遺伝子は、Ｓｔａｒｄ３ｎｌ（ＳＴＡＲＤ３ Ｎ末端様）（ヒトＳＴＡＲＤ３ＮＬのオーソログ）である。別名には、ＭＥＮＴＨＯ、０６１００３５Ｎ０１Ｒｉｋ、６５３０４０９Ｌ２２Ｒｉｋ、ＭＧＣ３２５１、およびＭＬＮ６４ Ｎ末端ドメインホモログが含まれる。ＳＴＡＲＤ３ＮＬは、主に後期エンドソーム上に存在する遍在的に発現する内在性膜タンパク質である。バイオインフォマティクス分析により、ＳＴＡＲＤ３ＮＬが細胞外タンパク質でもあり得ることが示唆される。ＳＴＡＲＤ３ＮＬは、後期エンドソームへのタンパク質のターゲティングおよび繋留に関与するＭＥＮＴＡＬ（ＭＬＮ６４ Ｎ末端）ドメイン内の４つの膜貫通セグメントからなる。ＳＴＡＲＤ３ＮＬは、エンドソーム輸送で役割を果たす可能性が高い（Ａｌｐｙ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（５２）：５０７８０−７（２００２）；Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ １３（１０）：２２６５−７０（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １５ ３５ ２４ ７４
予測値 １８．５ ３７ １８．５ ７４
カイ二乗＝２．８２ 有意性＝０．２４４１４３２９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．３ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２４２７０．１）
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨格筋および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ４５４０９−２５１１（ＵＮＱ８５５））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＳＴＡＲＤ３ Ｎ末端様（ＳＴＡＲＤ３ＮＬ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、水腎症を示す変異（−／−）マウスが得られた。８匹の（＋／＋）マウスのうちの４匹および８匹の（−／−）マウスのうちの５匹に髭が存在せず、８匹の（＋／＋）マウスのうちの４匹および８匹の（−／−）マウスのうちの５匹に排便が無かった。血液化学の結果は、（＋／＋）、（＋／−）、および（−／−）マウスにおいて異常なレベルのウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質、およびケトン体を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）ＣＡＴスキャンプロトコル：
ＣＴ造影剤であるＯｍｎｉｐａｑｕｅ３００（Ｎｙｃｏｍｅｄ Ａｍｅｒｓｈａｎ，３００ｍｇヨウ素／ｍＬ、０．２５ｍＬ／動物または２．５０〜３．７５ｇヨウ素／ｋｇ体重）をマウスの腹腔内に注射した。約１０分間、ケージ内で安静にさせた後、Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロムエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、ＭｉｃｒｏＣＡＴスキャナー（ＩｍＴｅｋ，Ｉｎｃ．）を使用してＣＡＴスキャンを行った。三次元像を、ＩｍＴｅｋ ３Ｄ ＲＥＣＯＮソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでＦｅｌｄｋａｍｐアルゴリズムによって再構成した。
結果：
試験した３匹の（−／−）マウスのうち、２匹の（−／−）（Ｍ−２２６およびＦ−１８０）は、水腎症を示した。水腎症は、流出の閉塞の結果としての腎盂中の尿の蓄積によって腎臓の嚢胞が拡張する容態である。したがって、ＰＲＯ１８６４ポリペプチドをコードする遺伝子の欠失により、腎臓および嚢胞の萎縮が起こる。
（ｃ）表現型解析：代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病および他の代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ．Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う：アルカリホスファターゼ；アラニンアミノトランスフェラーゼ；アルブミン；ビリルビン；リン；クレアチニン；ＢＵＮ＝血中尿素窒素；カルシウム；尿酸；ナトリウム；カリウム；および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果：
血液化学分析は、野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスの異常を示した。ウロビリノーゲンは、８匹の変異（−／−）マウスのうちの４匹で見出され、亜硝酸塩は４匹の（＋／＋）野生型マウスのうちの２匹、４匹のヘテロ接合体マウス（＋／−）のうちの１匹、および８匹の（−／−）マウス農地の４匹で見出され、タンパク質は４匹の（＋／＋）野生型マウスのうちの２匹、４匹の（＋／−）マウスのうちの１匹、および８匹の（−／−）マウスのうちの３匹で見出され、ケトン体は４匹の（＋／＋）野生型マウスのうちの２匹、４匹の（＋／−）ヘテロ接合体マウスのうちの２匹、および８匹の変異（−／−）マウスのうちの５匹で見出された。ヘテロ接合体（＋／−）マス卯およびホモ接合体（−／−）マウス中のタンパク質、亜硝酸塩、およびケトン体の発生率の増加は、ＣＡＴスキャンで発見された異常な腎臓の結果に関連する。これらの結果は、水腎症を示すＣＡＴ−スキャンの結果と一致する。

６６．４２．ＤＮＡ８２３０２−２５２９（ＵＮＱ９０４）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１９２５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ８２３０２−２５２９と示す）（ＵＮＱ９０４）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿１５５９７３ ＰＲＥＤＩＣＴＥＤ：ムス・ムスクルス（ＳＡＲＧ９０４の類似物）（ＬＯＣ２３９６９１）；参照タンパク質：ＸＰ＿１５５９７３（ＳＡＲＧ９０４の類似物）（ムス・ムスクルス）ｇｉ｜５１７６９４４２｜ｒｅｆ｜ＸＰ＿３５８７５５．２｜（ＳＡＲＧ９０４の類似物）（ムス・ムスクルス）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５２４５９ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＭＧＣ４５４３８（ＭＧＣ４５４３８）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８Ｎ２Ｉ３ アクセッション：Ｑ８Ｎ２Ｉ３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＦＬＪ９０７６１。

目的のマウス遺伝子は、「ＳＡＲＧ９０４の類似物」（ヒト仮説タンパク質ＭＧＣ４５４３８のオーソログ）である。

仮説タンパク質ＭＧＣ４５４３８は、推定分泌タンパク質であり、シグナルペプチドおよびいくつかの不十分に予想された部分的に保存されたドメイン（セルピン（セリンプロテアーゼインヒビター）ドメイン（ＳＭＡＲＴアクセッションＳＭ０００９３）、Ｂ細胞リンパ腫（ＢＣＬ；抗アポトーシス性）ドメイン（ＳＭＡＲＴアクセッションＳＭ００３３７）、およびトポイソメラーゼＩＩドメイン（ＳＭＡＲＴアクセッションＳＭ００４３３）など）からなる。このタンパク質の機能は知られていない。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ３０ １５ ６６
予測値 １６．５ ３３ １６．５ ６６
カイ二乗＝４．３８ 有意性＝０．１１１９１６７４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１９ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＢＭ４５３８２３．１）。
１．野生型発現パネル：骨、胃、小腸、および結腸以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ８２３０２−２５２９（ＵＮＱ９０４））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説タンパク質（ＭＧＣ４５４３８）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、総脂肪マスおよび総体脂肪率の増加および総組織マスの増加を示す（−／−）マウスが得られた。４匹の（＋／＋）野生型マウスのうちの１匹および８匹の変異（−／−）マウスのうちの４匹で白血球が認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄および雌（−／−）の両方は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。

これらの研究により、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ１９２５ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な脂肪および脂質代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および／または肥満の予防および／または治療で特に重要であろう。

６６．４３．ＤＮＡ８２３４０−２５３０（ＵＮＱ９０５）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１９２６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ８２３４０−２５３０と示す）（ＵＮＱ９０５）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１３３７４９ アクセッション：ＮＭ＿１３３７４９ ＮＩＤ：ｇｉ １９５２６９５５ ｒｅｆ ＮＭ＿１３３７４９．１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２９０００６４Ａ１３遺伝子（２９０００６４Ａ１３Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９ＥＰ７２ アクセッション：Ｑ９ＥＰ７２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。仮説タンパク質（推定ＡＴＧ／ＧＴＰ結合タンパク質前駆体）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２０１５４ アクセッション：ＮＭ＿０２０１５４ ＮＩＤ：ｇｉ ９９１０３４５ ｒｅｆ ＮＭ＿０２０１５４．１ ホモ・サピエンス第１１染色体仮説タンパク質ＯＲＦ３（ＬＯＣ５６８５１）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＮＰＡ０ アクセッション：Ｑ９ＮＰＡ０ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。推定ＡＴＧ／ＧＴＰ結合タンパク質前駆体（ＨＴ０２２）。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２９０００６４Ａ１３遺伝子（ヒトＣ１５ｏｒｆ２４（第１５染色体読み取り枠２４）のオーソログ）である。別名には、ｃ１１ｏｒｆ３、ＨＴ０２２、ＯＲＦ１−ＦＬ１、および第１５染色体推定ＡＴＰ／ＧＴＰ結合タンパク質が含まれる。

Ｃ１５ｏｒｆ２４は、推定内在性膜タンパク質であり、シグナルペプチド、膜貫通セグメント、および潜在的なＡＴＰ／ＧＴＰ結合部位を含む（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ２７３（１）：９０−４（２０００））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ５０ ０ ７３
予測値 １８．２５ ３６．５ １８．２５ ７３
カイ二乗＝４７．１７ 有意性＝５．７１６９５８５Ｅ−１１（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１３３７４９．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ８２３４０−２５３０（ＵＮＱ９０５））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト第１５染色体読み取り枠２４（Ｃ１５ｏｒｆ２４）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。雄ヘテロ接合体マウスは、ストレス誘導性高熱試験中に不安様応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：分析した（＋／−）マウスにおいて顕著な相違は認められなかった。しかし、（−／−）マウスは分析に利用できなかった。１２．５日目に、以下の５１個の胚を観察した：２７個の（＋／−）胚、１０個の（＋／＋）胚、１２個の吸収奇胎（ｒｅｓｏｒｐｔｉｏｎ ｍｏｌｅｓ）、および２個の不確定の胚。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない）または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体（＋／−）変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。
（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウスおよび４匹のヘテロ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−ストレス誘導過温症：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果：
ストレス誘導過温症：雄（＋／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。

まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および／または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、ＰＲＯ１９２６ポリペプチドまたはその作用剤は、このような神経障害の治療で有用であろう。

６６．４４．ＤＮＡ５９８４４−２５４２（ＵＮＱ１８４０）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ３５６６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ５９８４４−２５４２と示す）（ＵＮＱ１８４０）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７５１４８ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２３００００２Ｍ２３遺伝子（２３００００２Ｍ２３Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＭ１５ アクセッション：Ｑ８ＢＭ１５ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＴＡＳＴＥ芽（ｂｕｄ）特異的タンパク質前駆体の少しの類似物；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１４０７０ ホモ・サピエンス第６染色体読み取り枠１５（Ｃ６ｏｒｆ１５）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＵＩＧ３ アクセッション：Ｑ９ＵＩＧ３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＳＴＧタンパク質。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２３００００２Ｍ２３遺伝子（ヒトＣ６ｏｒｆ１５（第６染色体読み取り枠１５）のオーソログ）である。別名には、ＳＴＧおよびＳＴＧタンパク質が含まれる。

Ｃ６ｏｒｆ１５は、推定分泌タンパク質であり、主要プリオンタンパク質（ＰＲＰ）内にシグナルペプチドおよびいくつかの内部反復を含む。Ｃ６ｏｒｆ１５の機能は知られていないが、味覚細胞の小集団中に発現することから、Ｃ６ｏｒｆ１５が味覚細胞生理学で役割を果たし得ることが示唆される（Ｎｅｉｒａ ｅｔ ａｌ，Ｍａｍｍ Ｇｅｎｏｍｅ １２（１）：６０−６（２００１）；Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ １３（１０）：２２６５−７０（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １３ ３９ ２１ ７３
予測値 １８．２５ ３６．５ １８．２５ ７３
カイ二乗＝３．６８ 有意性＝０．１５８８１７４３（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２９ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７５１４８．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、胸腺、脾臓、肺、腎臓、肝臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ５９８４４−２５４２（ＵＮＱ１８４０））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト第６染色体読み取り枠１５（Ｃ６ｏｒｆ１５）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび総体脂肪が減少した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）骨代謝および身体診断／放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：雌（−／−）は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが減少した。

これらの研究により、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が成長遅延および／または組織消耗性障害に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ３５６６ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な脂肪および脂質の代謝過程に不可欠であり、悪液質などの組織消耗性障害の予防および／または治療で特に重要であろう。

６６．４５．ＤＮＡ９０８４２−２５７４（ＵＮＱ１８８６）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ４３３０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ９０８４２−２５７４と示す）（ＵＮＱ１８８６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＡＦ１６８６８０ アクセッション：ＡＦ１６８６８０ ＮＩＤ：６９７９３１２ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルスシステインリッチ反復含有タンパク質ＣＲＩＭ１（Ｃｒｉｍ１）；参照タンパク質：Ｑ９ＪＬＬ０ アクセッション：Ｑ９ＪＬＬ０ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。システインリッチ反復含有タンパク質ＣＲＩＭ１前駆体（フラグメント）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１６４４１ アクセッション：ＮＭ＿０１６４４１ ＮＩＤ：１００９２６３８ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンスシステインリッチ運動ニューロン１（ＣＲＩＭ１）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＮＺＶ１ アクセッション：Ｑ９ＮＺＶ１ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。システインリッチ反復含有タンパク質Ｓ５２前駆体（ＣＲＩＭ１ ＰＲＯＴＥＩＮ）。

目的のマウス遺伝子は、Ｃｒｉｍ１（システインリッチ運動ニューロン１）（ヒトＣＲＩＭ１のオーソログ）である。別名には、Ｓ５２およびシステインリッチ反復含有タンパク質Ｓ５２前駆体が含まれる。

ＣＲＩＭ１は、細胞接着分子または受容体として機能する可能性が高いＩ型原形質膜タンパク質である。ＣＲＩＭ１は分泌タンパク質でもあり、これは、細胞外ドメインが原形質膜からタンパク質分解的に切断されるためである。ＣＲＩＭ１は、骨形成タンパク質（ＢＭＰ）−４およびＢＭＰ−７に結合し、ＢＭＰシグナル伝達を阻害する（Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（３６）：３４１８１−８（２００３））。Ｃｒｉｍ１は、成長中の脊髄、眼、レンズ、および精巣に発現し、潜在的にＣＮＳの成長および器官形成で役割を果たす（Ｋｏｌｌｅ ｅｔ ａｌ，Ｍｅｃｈ Ｄｅｖ ９０（２）：１８１−９３（２０００）；Ｌｏｖｉｃｕ ｅｔ ａｌ，Ｍｅｃｈ Ｄｅｖ ９４（１−２）：２６１−５（２０００）；Ｇｅｏｒｇａｓ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖ Ｄｙｎ ２１９（４）：５８２−７（２０００））。ＣＲＩＭ１は内皮細胞でも発現し、血管形成時の毛細管形成で役割を果たす可能性が高い（Ｇｌｉｅｎｋｅ ｅｔ ａｌ，Ｍｅｃｈ Ｄｅｖ １１９（２）：１６５−７５（２００２））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １４ ２２ ０ ３６
予測値 ９ １８ ９ ３６
カイ二乗＝１４．８５ 有意性＝５．９６１６０７７Ｅ ４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０９ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン５をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＸＭ＿１２８７５１．５）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ９０８４２−２５７４（ＵＮＱ１８８６））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトシステインリッチ運動ニューロン１（ＣＲＩＭ１）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ＵＮＱ１８８６は血管中に高度に発現し、骨形成タンパク質の調節にも関与する。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均Ｂ細胞率が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）病理学
顕微鏡的：１２．５日目に、以下の５３個の胚を観察した：１０個の（−／−）胚、２１個の（＋／−）胚、１３個の（＋／＋）胚、および９個の再吸収奇胎。組織学的試験によって１２．５日目の胚に成長異常は検出されなかった。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学によって分析された組織パネルのうちで脳内しか検出されなかった。
ＵＮＱ１８８６ノックアウト胚研究：
ＵＮＱ１８８６ノックアウト胚の組織胚研究は、皮膚の水疱および出血表現型を示し、ＵＮＱ１８８６が２つの組織層の間の強い相互作用の維持に関与することが示唆された。Ｅ１２．５ノックアウト胚は、胚前頭部の６μｍのＦＦＰＥ切片によって示されるように、頭部（眼の高さ）の両側に皮膚の水疱を示す。皮膚の水疱は、Ｅ１３．５ノックアウト胚の頭蓋背部、脊椎中央、および眼の高さにも認められた。出血は、頭蓋前頭部にも見出された。Ｅ１４ノックアウト胚（ｌａｃＺ染色前頭部の１４μｍの凍結切片−眼の高さ）は、成長中の皮膚中のＵＮＱ１８６の発現を示す。全組織標本子宮の子宮切片の遺伝子３β−ｇａｌ活性染色は、ＵＮＱ１８８６の発現を示した。ノックアウト胚（Ｅ１３．５およびＥ１５．５）における多病巣性出血は、前頭部切片（眼および鼻腔）に生じ、前肢および腹部に出血が生じた。
死亡率についての胚発達異常に関する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない）または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体（＋／−）変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。
（ｃ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のヘテロ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果：
ＦＡＣＳ３：（＋／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、（−／−）マウス中のＢ細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。

まとめると、免疫細胞組成物のＦＡＣＳ解析は、ヘテロ接合体（＋／−）マウスがＢ細胞に関して免疫学的相違を示すことを示す。

６６．４６．ＤＮＡ９６８９３−２６２１（ＵＮＱ１９４０）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ４４２３ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ９６８９３−２６２１と示す）（ＵＮＱ１９４０）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７３３７５アクセッション：ＮＭ＿１７３３７５ ＮＩＤ：ｇｉ ２７７３４０６５ ｒｅｆ ＮＭ＿１７３３７５．１ ムス・ムスクルス仮説タンパク質Ｂ２３０３１４Ｏ１９（Ｂ２３０３１４Ｏ１９）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＲ２１ アクセッション：Ｑ８ＢＲ２１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。仮説タンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿２０５８５５ ホモ・サピエンス ＨＷＫＭ１９４０（ＵＮＱ１９４０）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＵＷＦ９ アクセッション：Ｑ６ＵＷＦ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＨＷＫＭ１９４０。

目的のマウス遺伝子は、ｃＤＮＡ配列ＢＣ０６４０３３（ヒトＵＮＱ１９４０のオーソログ）である。別名には、Ｂ２３０３１４Ｏ１９およびＨＷＫＭ１９４０が含まれる。

ＵＮＱ１９４０は、推定１７３アミノ酸分泌タンパク質であり、シグナルペプチドおよび他で定義されていない保存ドメインを含む。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １３ ３０ １９ ６２
予測値 １５．５ ３１ １５．５ ６２
カイ二乗＝０．６８ 有意性＝０．７１１７７０３（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２４ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン２および３をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７３３７５．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨格筋および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ９６８９３−２６２１（ＵＮＱ１９４０））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト推定分泌タンパク質（ＵＮＱ１９４０）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスの末梢血中のＣＤ４細胞の比率が減少し、Ｂ細胞の比率が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果：
ホモ接合体（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のＣＤ４細胞の平均比率が減少した。さらに、（−／−）マウスは、Ｂ細胞の比率が増加した。

まとめると、ＦＡＣＳの結果は、ホモ接合性変異体がＴ細胞集団の減少およびＢ細胞集団の増加によって特徴づけられた免疫学的異常を証明することを示す。これらの所見から、ＰＲＯ４４２３ポリペプチドまたはＰＲＯ４４２３をコードする遺伝子は、Ｔ細胞増殖の正の調節因子として作用するようであるが、Ｂ細胞集団の負の調節因子である。ＰＲＯ４４２３ポリペプチドおよびその作用剤は、健康な免疫系に重要であり、且つ特にＴ細胞増殖の増加のための免疫系の刺激で有用であろう。

６６．４７．ＤＮＡ３３６５３９（ＵＮＱ２２５７）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ３６９３５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ３３６５３９と示す）（ＵＮＱ２２５７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１１６２７ ムス・ムスクルス栄養膜糖タンパク質（Ｔｐｂｇ）；参照タンパク質：Ｑ９Ｚ０Ｌ０ アクセッション：Ｑ９Ｚ０Ｌ０ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。５Ｔ４腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質前駆体；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿００６６７０ ホモ・サピエンス栄養膜糖タンパク質（ＴＰＢＧ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ１３６４１ アクセッション：Ｑ１３６４１ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。５Ｔ４腫瘍胎児抗原前駆体（５Ｔ４腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質前駆体）。

目的のマウス遺伝子は、Ｔｐｂｇ（栄養膜糖タンパク質）（ヒトＴＰＢＧのオーソログ）である。別名には、５Ｔ４、Ｍ６Ｐ１、５Ｔ４−ＡＧ、５Ｔ４抗原、および５Ｔ４腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質が含まれる。

ＴＰＢＧは、内在性原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチ反復、膜貫通セグメント、およいび短い細胞質Ｃ末端からなる。ＴＰＢＧは、栄養膜細胞、羊膜上皮、脳、卵巣、および種々の癌腫中に発現する。ＴＰＢＧは、接着細胞の調整、形状、および運動性による胎盤形成および転移などの過程で役割を果たし得る（Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｓｃｉ １１６（Ｐｔ ２２）：４５３３−４２（２００３）；Ｓｈａｗ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｊ ３６３（Ｐｔ １）：１３７−４５（２００２）；Ｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｉｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ １４４５（３）２５７−７０（１９９９）；Ｍｙｅｒｓ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２６９（１２）：９３１９−２４（１９９４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ２９ １６ ６８
予測値 １７ ３４ １７ ６８
カイ二乗＝４．２５ 有意性＝０．１１９４３２９７（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２３ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１１６２７．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、および脾臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ３３６５３９（ＵＮＱ２２５７））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト栄養膜糖タンパク質（ＴＰＢＧ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスの尾部懸垂試験における抑鬱様応答が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−尾部懸垂試験：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。

尾部懸垂試験：
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を６分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ（すなわち、試験中にその尾部を登る）を有する動物を、この分析から排除する。

結果：
（−／−）マウスは、（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較して尾部懸垂試験中に不動時間が増加した。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ３６９３５ポリペプチドおよびその作用剤は、抑鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。

６６．４８．ＤＮＡ６２８４９−２６４７（ＵＮＱ２４２０）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ４９７７ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ６２８４９−２６４７と示す）（ＵＮＱ２４２０）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１３０８８７ アクセッション：ＮＭ＿１３０８８７ ＮＩＤ：１８７０００２９ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス ｐａｐｉｌｉｎ（ＬＯＣ１７０７２１）；参照タンパク質：Ｑ９ＥＰＸ２ アクセッション：Ｑ９ＥＰＸ２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＰＡＰＩＬＩＮ；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１７３４６２ ホモ・サピエンスパピリン（ｐａｐｉｌｉｎ）、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質（ＰＡＰＬＮ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：ＮＰ＿７７５７３３ アクセッション：ＮＰ＿７７５７３３ ＮＩＤ：ｇｉ ５００８３２９５ ｒｅｆ ＮＰ＿７７５７３３．２パピリン（ホモ・サピエンス）。

目的のマウス遺伝子は、Ｐａｐｌｎ（パピリン、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質）（ヒトＰＡＰＬＮのオーソログ）である。別名には、Ｅ０３００３３Ｃ１６ＲｉｋおよびＭＧＣ５０４５２が含まれる。

ＰＡＰＬＮは、細胞外基質に関連し、プロテアーゼインヒビターとして機能する可能性が高い分泌タンパク質である（Ｋｒａｍｅｒｏｖａ ｅｔ ａｌ，２０００）。ＰＡＰＬＮは、シグナルペプチド、いくつかのトロンボスポンジン反復（細胞外基質結合および細胞接着；ＰｆａｍアクセッションＰＦ０００９０）、Ｋｕｎｉｔｚ／ウシ膵臓トリプシンインヒビタードメイン（セリンプロテアーゼインヒビターを示す；ＰｆａｍアクセッションＰＦ０００１４）、および３つのＣ末端免疫グロブリンドメイン（タンパク質−タンパク質またはタンパク質−リガンド相互作用；ＰｆａｍアクセッションＰＦ０００４７）からなる。ＰＡＰＬＮは、成長および器官形成で役割を果たし得る（Ｋｒａｍｅｒｏｖａ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ １２７（２４）：５４７５−８５（２０００）；Ｆｅｓｓｌｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｉｎｔ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ３６（６）：１０７９−８４（２００４）；Ｔｕｃｋｅｒ，Ｉｎｔ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ３６（６）：９６９−７４（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２７ ３４ １６ ７７
予測値 １９．２５ ３８．５ １９．２５ ７７
カイ二乗＝５．１１ 有意性＝０．０７７６９２２２６（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および先行する非コードエクソンをターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１３０８８７．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ６２８４９−２６４７（ＵＮＱ２４２０））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトパピリン、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質（ＰＡＰＬＮ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスの末梢血中のＣＤ４細胞の比率が増加した。変異（−／−）マウスはまた、プレパルス阻害が増加する傾向が示された。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
ＦＡＣＳ：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＣＤ４細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。したがって、ＰＲＯ４９７７ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、Ｔ細胞集団が増加する。これらの所見から、ＰＲＯ４９７７ポリペプチドまたはＰＲＯ４９７７をコードする遺伝子は、Ｔ細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、ＰＲＯ４９７７ポリペプチドまたはその作用剤は、自己免疫疾患（例えば、関節リウマチ患者）などで起こるＴ細胞増殖が顕著であるような場合には、Ｔ細胞増殖の負の調節因子として有用であろう。さらに、ＰＲＯ４９７７ポリペプチドは、皮膚移植片拒絶の防止で特に有用であろう。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より柔らかい（プレパルス）音より先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似乱数順に６回、合計３６試行繰返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果：
変異（−／−）マウスは、聴覚驚愕反射のプレパルス阻害が増加する傾向を示し、これは、感覚運動ゲーティング／注意の増強を示す。

６６．４９．ＤＮＡ２２２８４４（ＵＮＱ２４２１）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ４９７９ポリペプチド（ＰＲＯ３８８４４ポリペプチドとしても公知）をコードする遺伝子（ＤＮＡ２２２８４４と示す）（ＵＮＱ２４２１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７３１８２ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ １６０００１９Ｏ０４遺伝子（１６０００１９Ｏ０４Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ６ＮＷＷ９ アクセッション：Ｑ６ＮＷＷ９ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＦＡＤ１０４；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２２７６３ ホモ・サピエンス ＦＡＤ１０４（ＦＡＤ１０４）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＩＸＢ２ アクセッション：Ｑ８ＩＸＢ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＦＡＤ１０４。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ １６０００１９Ｏ０４遺伝子（ヒトＦＡＤ１０４（脂肪細胞分化因子１０４）のオーソログ）である。別名には、ＦＬＪ２３３９９およびＤＫＦＺｐ７６２Ｋ１３７が含まれる。

ＦＡＤ１０４は、受容体または細胞接着分子として機能する可能性が高い推定内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、９個のフィブロネクチンＩＩＩ型ドメインおよびＣ末端膜貫通セグメントを含む。ＦＡＤ１０４は、脂肪形成で役割を果たし得る（Ｔｏｍｉｎａｇａ ｅｔ ａｌ，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ ５７７（１−２）：４９−５４（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １７ ３６ １ ５４
予測値 １３．５ ２７ １３．５ ５４
カイ二乗＝２０．４７ 有意性＝３．５８９１８７３Ｅ−５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０８ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７３１８２．１）
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．４９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ２２２８４４（ＵＮＱ２４２１））
（ａ）全体的な表現型の概要：
脂肪細胞分化因子１０４（ＦＡＤ１０４）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、平均血清ＩｇＧ２ａレベルが増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
遺伝学：ホモ接合体の死亡。（−／−）仔マウスは、遺伝子型特定時に死亡した。
顕微鏡的：組織学的試験によって１２．５日目の胚に成長異常は検出されなかった。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない）または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体（＋／−）変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。

（ｃ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（＋／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行のための（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＧ２ａレベルが増加した。

ヘテロ接合体（＋／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較してＩｇＧ２ａ血清免疫グロブリンが上昇した。ＩｇＧ２ａは、食細胞による貪食のために病原体を有効にオプソニン化し、補体系を活性化する。認められた表現型により、ＰＲＯ４９７９ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。

６６．５０．ＤＮＡ９７００３−２６４９（ＵＮＱ２４２２）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ４９８０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ９７００３−２６４９と示す）（ＵＮＱ２４２２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７７６４８ ムス・ムスクルス膜貫通タンパク質１５（Ｔｍｅｍ１５）；参照タンパク質：Ｑ８Ｒ２Ｙ３ アクセッション：Ｑ８Ｒ２Ｙ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＫＩＡＡ１０９４タンパク質の類似物；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１４９０８ ホモ・サピエンス膜貫通タンパク質１５（ＴＭＥＭ１５）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＵＰＱ８ アクセッション：Ｑ９ＵＰＱ８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＫＩＡＡ１０９４。

目的のマウス遺伝子は、Ｔｍｅｍ１５（膜貫通タンパク質１５）（ヒトＴＭＥＭ１５のオーソログ）である。別名には、ＭＧＣ３６６８３、ｍＫＩＡＡ１０９４、ｃＤＮＡ配列ＢＣ０２６９７３、およびＫＩＡＡ１０９４が含まれる。

ＴＭＥＭ１５は、有望な内在性原形質膜タンパク質であり、不十分に予想されたアクチン様ＡＴＰアーゼドメイン（ＳＣＯＰ）内のシグナルペプチドおよび１１〜１４個の膜貫通セグメントからなる。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ３３ ０ ５１
予測値 １２．７５ ２５．５ １２．７５ ５１
カイ二乗＝４１．７４ 有意性＝８．６３５２２７５Ｅ−１０（ｈｏｍ／ｎ）＝０．０ 平均同腹仔数＝７
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７７６４８．２）。
１．野生型発現パネル：骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ９７００３−２６４９（ＵＮＱ２４２２））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト膜貫通タンパク質１５（ＴＭＥＭ１５）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ヘテロ接合体マウスは、抑鬱症様応答が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：胚が死亡したため試験を行わなかった。１２．５日目に、以下の３９個の胚を観察した：２３個の（＋／−）胚、１１個の（＋／＋）胚、３個の未決定、および２個の不確定の胚。７．５ｄｐｃおよび１２．５ｄｐｃの全組織標本データは、野生型胚の広範且つ遍在する染色を示す。ヘテロ接合体マウス（＋／−）胚において６．５ｄｐｃおよび７．５ｄｐｃで胚外外胚葉が強くＬａｃＺ染色される。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察：
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題（神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない）または遺伝子／タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体（＋／−）変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および／または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、ＥＰＯノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、ＲＢＣの著しい欠如を示した。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウスおよび４匹のヘテロ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−尾部懸垂試験：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験：
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を６分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ（すなわち、試験中にその尾部を登る）を有する動物を、この分析から排除する。
結果：
尾部懸垂２：（＋／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験中に不動時間が減少し、変異体における抑鬱症様応答の減少が示唆される。

したがって、ヘテロ接合体マウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ４９８０ポリペプチドまたはその作用剤は、抑鬱性障害に関連した症状の治療または改善に有用であろう。

６６．５１．ＤＮＡ９４８４９−２９６０（ＵＮＱ２４２３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ４９８１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ９４８４９−２９６０と示す）（ＵＮＱ２４２３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２７３７９ ムス・ムスクルス 雄性不稔症ドメイン含有２（Ｍｌｓｔｄ２）；参照タンパク質：Ｑ９２２Ｊ９ アクセッション：Ｑ９２２Ｊ９ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ３７３２４０９Ｃ０５遺伝子；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０３２２２８ ホモ・サピエンス 雄性不稔症ドメイン含有２（ＭＬＳＴＤ２）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＷＶＸ９ アクセッション：Ｑ８ＷＶＸ９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ３７３２４０９Ｃ０５遺伝子の類似物。

目的のマウス遺伝子は、Ｍｌｓｔｄ２（雄性不稔症ドメイン含有２）（ヒトＭＬＳＴＤ２のオーソログ）である。別名には、ＦＡＲ１、２６０００１１Ｍ１９Ｒｉｋ、３７３２４０９Ｃ０５Ｒｉｋ、ＦＡＲ１、ＦＬＪ２２７２８、および脂肪アシルＣｏＡレダクターゼ１が含まれる。

ＭＬＳＴＤ２は、補助基質ＮＡＤＰＨでの脂肪アシル−ＣｏＡの還元（１６または１８個の炭素の不飽和脂肪酸が好ましい）による脂肪アルコールの形成を触媒するペルオキシソーム酵素である。この酵素は、主に、包皮腺（脂腺型の１つ）、脳、脂質エーテルリッチ組織中に発現する。ＭＬＳＴＤ２は、ワックスモノエステルおよび脂質エーテルの生合成で役割を果たす可能性が高い（Ｃｈｅｎｇ ａｎｄ Ｒｕｓｓｅｌｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７９（３６）：３７７８９−９７（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ３０ １６ ６４
予測値 １６ ３２ １６ ６４
カイ二乗＝３．５１ 有意性＝０．１７２９０７２５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．３１ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２７３７９．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、および腎臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ９４８４９−２９６０（ＵＮＱ２４２３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト雄性不稔症ドメイン含有２（ＭＬＳＴＤ２）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、聴覚障害を示すホモ接合体変異マウスが得られる。ノックアウト（−／−）マウスはまた、ストレス誘導性高熱が増加し、日周期リズムが増強される傾向がある。顕微分析により、雄変異体の精巣変性が明らかとなり、これは、診断で認められた不稔症と一致した。さらに、ホモ接合体変異マウスで、雌変異体の体脂肪の顕著な増加と共に骨塩量および骨中無機質密度の減少が認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
巨視的：分析に利用可能な２匹の雄（−／−）マウスは、雄ノックアウトにおいて精巣重量が有意に減少した。
顕微鏡的：分析した２匹の雄（−／−）マウス（Ｍ−２１４およびＭ−２２６）は、細精管中の巨大な多核巨細胞によって特徴づけられる顕著な精巣変性を示し、復睾丸中に精子が存在しなかった。肝細胞は、雌では顕著および中程度の強度であるが雄ではわずかなグリコーゲン蓄積を特徴とする細胞質内空胞を有していた。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学によって分析された組織パネルのうちで精巣中にのみ検出された。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より柔らかい（プレパルス）音より先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似乱数順に６回、合計３６試行繰返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果：
ＰＰＩ：８匹の（−／−）マウス中のたった３匹が驚愕反応を欠き、変異体の聴覚障害が示唆される。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−ストレス誘導過温症：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果：
ストレス誘導過温症：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。これらの結果は、日周期リズムの神経学的試験と一致する。したがって、ＰＲＯ４９８１ポリペプチドまたはその作用剤は、不安関連障害の治療で有用であろう。
サーカディアン試験の説明：
雌マウスを、試験初日の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前７時に照明をつけ、午後７時に照明を消す１２時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数（ビームが自動的に歩行に妨害される）を記録する。活動を、３日間の試験中に１時間間隔で６０秒間記録する。得られたデータを、３日間の試験期間にわたって各時間（日周期リズム）について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値（自発運動）によって表示した。
結果：
日周期：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の１２時間の馴化期間に歩行回数が増加した。これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、不安様応答に関連し得る。
（ｄ）心臓学／血圧および心拍数
説明：
Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧分析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。
血圧の結果：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、収縮期血圧が減少した。
（ｅ）表現型解析：代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ．Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う：アルカリホスファターゼ；アラニンアミノトランスフェラーゼ；アルブミン；ビリルビン；リン；クレアチニン；ＢＵＮ＝血中尿素窒素；カルシウム；尿酸；ナトリウム；カリウム；および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果：
血液化学：雄および雌（−／−）マウスの両方は、平均血清カルシウムレベルが減少した。カルシウムレベルの減少は、骨塩量および骨中無機質密度が減少する所見と一致する。
（ｆ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。
結果：
血糖値／耐糖能試験：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に任意に耐糖能障害を示した。

これらの研究は、（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ４９８１ポリペプチド（またはその作用剤）またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または種々の心血管障害（糖尿病が含まれる）に関連する病態の治療で有用であろう。
（ｇ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重および体長：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。
受精能：分析に利用可能な雄（−／−）マウスは、繁殖から４０日後で且つ雌（＋／＋）マウスとの４交配後に仔は生まれなかった。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄および雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均除脂肪体重、骨塩量、および骨中無機質密度が減少した。雌（−／−）マウスはまた、平均総組織マス増加し、総脂肪マスおよび総体脂肪率がわずかに増加した。

マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。

ＤＥＸＡおよび骨マイクロＣＴ分析によって分析した（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少した。しかし、変異（−／−）マウスはまた、雄（−／−）マウスにおいて体重、体長、および除脂肪体重、ならびに受精能が減少した。他方では、雌（−／−）マウスは、平均体脂肪率がわずかに増加した。これらの所見により、ＰＲＯ４９８１ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した大部分の雄変異マウスが（−／−）マウスにおいて成長遅延に関連する代謝障害を引き起こし、骨粗鬆症を反映する異常な骨測定値も得られることが示唆される。したがって、ＰＲＯ４９８１ポリペプチドまたはその作用剤は、骨粗鬆症などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。ＰＲＯ４９８１ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト（またはインヒビター）は、異常または病的な骨障害（異常な骨代謝に関連する炎症性障害（関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる）が含まれる）を引き起こすであろう。

６６．５２．ＤＮＡ１１５２９１−２６８１（ＵＮＱ２５０１）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ５８０１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１１５２９１−２６８１と示す）（ＵＮＱ２５０１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＢＣ０２６５４６ ムス・ムスクルスインターロイキン１７受容体Ｂ、ｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：３５９２４ ＩＭＡＧＥ：５０４２４６６）；参照タンパク質：Ｑ９ＪＩＰ３ アクセッション：Ｑ９ＪＩＰ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。インターロイキン−１７Ｂ受容体前駆体（ＩＬ−１７Ｂ受容体）（ＩＬ−１７受容体ホモログ１）（ＩＬ−１７ＲＨ１）（ＩＬ１７ＲＨ１）（ＩＬ−１７ＥＲ）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１８７２５ ホモ・サピエンスインターロイキン１７受容体Ｂ（ＩＬ１７ＲＢ）、転写変異型１；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９ＮＲＭ６ アクセッション：Ｑ９ＮＲＭ６ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。インターロイキン−１７Ｂ受容体前駆体（ＩＬ−１７Ｂ受容体）（ＩＬ−１７受容体ホモログ１）（ＩＬ−１７ＲＨ１）（ＩＬ１７ＲＨ１）（サイトカイン受容体ＣＲＬ４）。

目的のマウス遺伝子は、Ｉｌ１７ｒｂ（インターロイキン１７受容体Ｂ）（ヒトＩＬ１７ＲＢのオーソログ）である。別名には、Ｅｖｉ２７、Ｉｌ１７ｂｒ、ＩＬ―１７ＥＲ、ＩＬ１７ＲＨ１、ＩＬ―１７Ｒｈ１、ＣＲＬ４、ＭＧＣ５２４５、ＩＬ−１７Ｂ受容体、サイトカイン受容体ＣＲＬ４、インターロイキン１７Ｂ受容体、インターロイキン１７受容体ホモログ、インターロイキン１７受容体ホモログ１、およびエコトロピックウイルス組み込み部位２７が含まれる。

ＩＬ１７ＲＢは、サイトカインＩＬ１７ＥおよびＩＬ１７Ｂの受容体として機能するＩ型原形質膜タンパク質である。受容体は、核因子κＢを活性化し、炎症誘発性ケモカインＩＬ−８の産生を刺激することができる。ＩＬ１７ＲＢは、肝臓、腎臓、膵臓、精巣、結腸、脳、および小腸で発現する。ＩＬ１７ＲＢは、炎症で役割を果たす可能性が高く、種々の疾患過程（関節リウマチ、乾癬、多発性硬化症、腫瘍成長の促進、および移植片拒絶など）に関与し得る（Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７６（２）：１６６０−４（２００１）；Ｔｉａｎ ｅｔ ａｌ，Ｏｎｃｏｇｅｎｅ １９（１７）：２０９８−１０９（２０００）；Ｓｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７５（２５）：１９１６７−７６（２０００）；Ｍｏｓｅｌｅｙ ｅｔ ａｌ，Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ｇｒｏｗｔｈ Ｆａｃｔｏｒ Ｒｅｖ １４（２）：１５５−７４（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １９ ３４ ２４ ７７
予測値 １９．２５ ３８．５ １９．２５ ７７
カイ二乗＝２．１８ 有意性＝０．３３６２１６４８（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２９ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜４をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１９５８３．１）。
１．野生型発現パネル：骨格筋、骨、および心臓以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１１５２９１−２６８１（ＵＮＱ２５０１））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトインターロイキン１７受容体Ｂ（ＩＬ１７ＲＢ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が増強された（−／−）が得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。
結果：
耐糖能試験：高脂肪食を与えた雄変異（−／−）は、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較した場合、耐糖能が増強された。

これらの研究では、変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔における正常な空腹時グルコースの存在下で耐糖能が増加または増強した。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感受性の増加またはグルコースホメオスタシス障害の反対の表現型パターンを示し、そのようなものとして、ＰＲＯ５８０１ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト（インヒビター）は、グルコースホメオスタシス障害の治療で有用であろう。

６６．５３．ＤＮＡ９６９８８−２６８５（ＵＮＱ２５０７）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ５９９５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ９６９８８−２６８５と示す）（ＵＮＱ２５０７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１４６２４１ アクセッション：ＮＭ＿１４６２４１ ＮＩＤ：ｇｉ ２２１２２８１６ ｒｅｆ ＮＭ＿１４６２４１．１ ムス・ムスクルス甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素（Ｔｒｈｄｅ未決定（ｐｅｎｄｉｎｇ））；参照タンパク質：Ｑ８Ｋ０９３ アクセッション：Ｑ８Ｋ０９３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。仮説タンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１３３８１ アクセッション：ＮＭ＿０１３３８１ ＮＩＤ：ｇｉ ７０１９５６０ ｒｅｆ ＮＭ＿０１３３８１．１ ホモ・サピエンス甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素（ＴＲＨＤＥ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＵＷＪ４ アクセッション：Ｑ６ＵＷＪ４ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＴＲＨＤＥ。

目的のマウス遺伝子は、Ｔｒｈｄｅ（甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素）（ヒトＴＲＨＤＥのオーソログ）である。別名には、ＭＧＣ４０８３１、９３３０１５５Ｐ２１Ｒｉｋ、ＰＡＰ−ＩＩ、ピログルタミルペプチダーゼＩＩ、ＴＲＨ分解外酵素、ＴＲＨ−ＤＥ、ＴＲＨ−特異的アミノペプチダーゼ、およびサイロリベリナーゼ（ｔｈｙｒｏｌｉｂｅｒｉｎａｓｅ）が含まれる。

ＴＲＨＤＥは、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン（ＴＲＨ）からのＮ末端ピログルタミル基の除去を触媒する細胞外ＩＩ型原形質膜タンパク質および亜鉛メタロプロテアーゼである。ＴＲＨＤＥは、その放出後の神経ペプチドの不活化によるＴＲＨシグナル伝達で役割を果たす可能性が高い。ＴＲＨＤＥは、主に脳内に発現するが、心臓、肺、肝臓、骨格筋、および血清中にも発現する（Ｂａｅｚａ ｅｔ ａｌ，Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ ６８（１７）：２０５１−６０（２００１）；Ｓｃｈｏｍｂｕｒｇ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ ２６５（１）：４１５−２２（１９９９）；Ｋｅｌｌｙ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７５（２２）：１６７４６−５１（２０００）；Ｓｃｈｍｉｔｍｅｉｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｅｕｒ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ ２６９（４）：１２７８−８６（２００２））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２７ ３５ ２７ ８９
予測値 ２２．２５ ４４．５ ２２．２５ ８９
カイ二乗＝０．９８ 有意性＝０．６１２６２６４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２７ 平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４６２４１．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨格筋、骨、および脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ９６９８８−２６８５（ＵＮＱ２５０７））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素（ＴＲＨＤＥ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均体重および体長が減少し、総組織マスおよび除脂肪体重が減少した変異（−／−）マウスが得られた。尾部懸垂試験は、（−／−）マウスの不動が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
（ｂ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重および体長：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。
受精能：分析に利用可能な雄（−／−）マウスは、繁殖から４０日後で且つ雌（＋／＋）マウスとの交配後に仔は生まれなかった。
（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マスおよび除脂肪体重が減少した。

したがって、変異（−／−）マウスは、体重、体長、総組織マス、および除脂肪体重の減少によって特徴づけられる負の表現型を示し、これは成長の遅延または悪液質などの組織消耗性容態に起因し得る。したがって、ＰＲＯ５９９５ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連効果を模倣するであろう。他方では、ＰＲＯ５９９５ポリペプチドまたはその作用剤は、悪液質などの代謝障害または他の組織消耗性疾患の予防および／または治療で有用であり、正常な成長に重要であろう。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−尾部懸垂試験：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。

尾部懸垂試験：
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を６分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ（すなわち、試験中にその尾部を登る）を有する動物を、この分析から排除する。

結果：
尾部懸垂２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、不動時間が増加し、これは、変異体での抑鬱応答を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および／または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、ＰＲＯ５９９５ポリペプチドおよびその作用剤は、抑鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。

６６．５４．ＤＮＡ９８３８０（ＵＮＱ２５１２）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ６００１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ９８３８０と示す）（ＵＮＱ２５１２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１３３１８７ アクセッション：ＮＭ＿１３３１８７ ＮＩＤ：ｇｉ １８８７５３２７ ｒｅｆ ＮＭ＿１３３１８７．１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ １１１００３２Ｅ２３遺伝子（１１１００３２Ｅ２３Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９ＥＴ２５ アクセッション：Ｑ９ＥＴ２５ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。 仮説タンパク質塩基性タンパク質Ｉ−１９；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１６６１３ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｌ１４２（ＤＫＦＺｐ４３４Ｌ１４２）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＵＷＨ４ アクセッション：Ｑ６ＵＷＨ４ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＴＣＰＤ２５１２。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ １１１００３２Ｅ２３遺伝子（ヒト仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｌ１４２のオーソログ）である。別名には、ＡＤ０２１およびＡＤ０３６が含まれる。

仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｌ１４２は、Ｎ末端付近の膜貫通セグメント以外の保存ドメインを含まない推定５１７アミノ酸タンパク質である。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ４３ ２１ ８２
予測値 ２０．５ ４１ ２０．５ ８２
カイ二乗＝８．５７ 有意性＝０．０１３７７３６２４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２４ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１３３１８７．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ９８３８０（ＵＮＱ２５１２））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説タンパク質（ＤＫＦＺｐ４３４Ｌ１４２）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスの耐糖能が損なわれた。雄（−／−）マウスはまた、基礎体温が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。

これらの研究は、（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ６００１ポリペプチド（またはその作用剤）またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または種々の心血管障害（糖尿病が含まれる）に関連する病態の治療で有用であろう。

６６．５５．ＤＮＡ１０５６８０−２７１０（ＵＮＱ２５４３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１０５６８０−２７１０と示す）（ＵＮＱ２５４３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１５３５２８ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ４９２１５２１Ｎ１４遺伝子（４９２１５２１Ｎ１４Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ８ＣＩ５２ アクセッション：Ｑ８ＣＩ５２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ４９２１５２１Ｎ１４；参照ヒト遺伝子配列：ＢＣ０３５０４０ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＩＹＳ０ アクセッション：Ｑ８ＩＹＳ０ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８タンパク質。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ４９２１５２１Ｎ１４遺伝子（ヒト仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８のオーソログ）である。別名には、ＭＧＣ４７３１５が含まれる。

仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８は、推定膜タンパク質であり、ＧＲＡＭドメイン、膜貫通セグメント、および潜在的なグリコシルリン脂質（ＧＰＩ）繋留部位からなる。ＧＲＡＭドメインは、グルコシルトランスフェラーゼ、ミオチューブラリン、および他の膜結合タンパク質などのタンパク質中で見出され、膜ターゲティングで機能する可能性が高い（Ｄｏｅｒｋｓ ｅｔ ａｌ，Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｓｃｉ ２５（１０）：４８３−５（２０００））。仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８の細胞中の位置は不明である。膜貫通セグメントにより、仮説タンパク質が内在性膜タンパク質であり得ることが示唆されるのに対して、ＧＰＩ繋留部位により、このタンパク質が原形質膜の細胞外表面に会合し得ることが示唆される。ＧＲＡＭドメインが標的膜とのタンパク質の結合に関与し得るので（Ｏｋｕ ｅｔ ａｌ，ＥＭＢＯ Ｊ ２２（１３）３２３１−４１（２００３））、仮説タンパク質ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８は、細胞内膜上に存在し得る。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２０ ３０ １８ ６８
予測値 １７ ３４ １７ ６８
カイ二乗＝１．８６ 有意性＝０．３９４５５３７２（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２９ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１５３５２８．１）
。
１．野生型発現パネル：パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
ＱＣ画像：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１０５６８０−２７１０（ＵＮＱ２５４３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説タンパク質（ＤＫＦＺｐ４３４Ｃ０３２８）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔のレベル比較した場合、骨髄中のＩｇＭ＋、ＩｇＤ＋のＢ細胞、およびＢ２２０ｈｉ ＣＤ４３細胞が増加した。さらに、変異（−／−）マウスは、体重の増加および骨中無機質密度の測定値の増加につれて総組織マスおよび脂肪分（コレステロールレベルの上昇を伴う）が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。
結果：
血液化学：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。したがって、ＰＲＯ６０９５遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ６０９５ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。

（ｃ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
組織特異的ＦＡＣＳプロジェクト：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨髄中のＩｇＭ＋細胞、ＩｇＤ＋細胞、およびＢ２２０ｈｉ ＣＤ４３細胞が増加した。成熟ナイーブＢ細胞は、ＩｇＭおよびＩｇＤを同時発現し、骨髄をリンパ器官中に循環させたままにする。ＰＲＯ６０９５ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異（−／−）マウスのＢ細胞前駆体およびこれらの細胞によって発現される免疫グロブリンの比率が増加した。したがって、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドは、Ｂ細胞の分化および／または増殖のための負の調節因子として作用するようである。ＰＲＯ６０９５ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、Ｂ細胞産生の刺激で有用であろう。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。

結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔コントロール、プロジェクト実行のための（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＧ３レベルが増加した。

血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合体成体あが血清ＩｇＧ３レベルの増加を示すことが明らかとなった。したがって、ホモ接合体は、（＋／＋）同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが上昇した。ＩｇＧ３免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターが免疫系を刺激し、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドまたはその作動剤は、免疫応答を阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（ｄ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重および体長：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が増加した。

（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。

結果：
ＤＥＸＡ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総脂肪マス、および総体脂肪率が増加した。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均脊椎骨小柱連結性（ｍｅａｎ ｖｅｒｔｅｂｒａｌ ｔｒａｂｅｃｕｌａｒ ｂｏｎｅ ｃｏｎｎｅｃｔｉｖｉｔｙ ｄｅｎｓｉｔｙ）が増加した。

これらの結果は、ノックアウト変異マウスが骨密度の増加によって特徴づけられる大理石骨病に類似の平均脊椎骨小柱測定値の増加を伴う異常な骨代謝を示すことが証明される。したがって、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドまたはその作用剤は、骨ホメオスタシスの維持および破骨細胞と骨芽細胞の活性の釣り合わせによる骨再造形に有用であろう。さらに、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、骨治癒または骨石灰化に関連する他の骨関連異常の治療で有用であろう。

（−／−）マウスはまた、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マスが増加し、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。これらの所見は、（−／−）変異マウスによって示される平均体重および体長の増加と一致する。

これらの研究は、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドまたはその作用剤は、正常ａＮ成長および代謝過程に不可欠であり、特に、脂質蓄積症および／または肥満の防止および／または治療で有用であろう。

６６．５６．ＤＮＡ１１０７００−２７１６（ＵＮＱ２５５３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１１０７００−２７１６と示す）（ＵＮＱ２５５３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２０００３ アクセッション：ＮＭ＿０２０００３ ＮＩＤ：ｇｉ ９９１０４５７ ｒｅｆ ＮＭ＿０２０００３．１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ０６１００３１Ｊ０６遺伝子（０６１００３１Ｊ０６Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９ＪＨＪ３ アクセッション：Ｑ９ＪＨＪ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。腎臓優性タンパク質（ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ０６１００３１Ｊ０６遺伝子）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１４４５８０ アクセッション：ＮＭ＿１４４５８０ ＮＩＤ：ｇｉ ２４３０７８７０ ｒｅｆ ＮＭ＿１４４５８０．１ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＭＧＣ３１９６３（ＭＧＣ３１９６３）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＷＷＢ７ アクセッション：Ｑ８ＷＷＢ７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＮＴ２ＲＰ１０００５６７。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ０６１００３１Ｊ０６遺伝子（ヒトＭＧＣ３１９６３（腎臓優性タンパク質 ＮＣＵ−Ｇ１）のオーソログ）である。別名には、ＮＣＵ−Ｇ１が含まれる。

ＭＧＣ３１９６３は、推定Ｉ型内在性原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチドおよびＣ末端付近に膜貫通セグメントを含む。このタンパク質は、腎臓皮質に高レベルで発現し、いくつかの他の組織中により低いレベルで発現する（Ｋａｗａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｇｅｎｅｔ ３９（１−２）：３３−４２（２００１）；Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ １３（１０）：２２６５−７０（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２４ ４０ １３ ７７
予測値 １９．２５ ３８．５ １９．２５ ７７
カイ二乗＝０．５３ 有意性＝０．７６７２０５９５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜６をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２０００３．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１１０７００−２７１６（ＵＮＱ２５５３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト腎臓優性タンパク質ＮＣＵ−Ｇ１（ＭＧＣ３１９６３）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスが肝炎を発症した。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、貧血性および免疫学的異常の徴候を示した。さらに、雄および雌のホモ接合体変異マウスの両方は、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均グルコースレベルが減少した。（−／−）マウスはまた、全身のｖＢＭＤおよびＢＭＤが減少し、平均脊椎骨小柱数および連結性が減少した。（−／−）マウスは、プレパルス阻害が増加する傾向を示した。肉眼的検査によって変異体の肝臓は正常な肝臓よりも小さく、顕微分析により、軽度から中等度の壊死性肝炎が明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
巨視的：（−／−）マウスの肝臓は正常な肝臓よりも小さく、柔組織の基礎的（ｕｎｄｅｒｌｙｉｎｇ）喪失／虚脱にのために肝臓被膜表面（ｈｅｐａｔｉｃ ｃａｐｓｕｌａｒ ｓｕｒｆａｃｅ）は不規則で窪みがあった。
顕微鏡的：分析した（−／−）マウスは、最小の進行中の肝細胞の壊死および変性によって特徴づけられる軽度から中等度の多病巣性壊死性肝炎を示した。最小から中等度の亜急性および活動性炎症炎症性浸潤も実質喪失領域中に存在する。多病巣性に、肝臓中に造血細胞（顆粒球）のクラスターおよび顆粒球前駆体のびまん性過形成が存在し、赤血球系細胞前駆体、脾臓、および骨髄が同時に減少した。これらの変異体に存在する最小の肝線維症は、肝損傷に対するＣ５７Ｂｌ／６マウスの肝線維形成誘発性応答の既知の減少を反映する。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。

（ｃ）病態／ＣＡＴスキャン
ＣＡＴスキャンプロトコル：
ＣＴ造影剤であるＯｍｎｉｐａｑｕｅ３００（Ｎｙｃｏｍｅｄ Ａｍｅｒｓｈａｎ，３００ｍｇヨウ素／ｍＬ、０．２５ｍＬ／動物または２．５０〜３．７５ｇヨウ素／ｋｇ体重）をマウスの腹腔内に注射した。約１０分間、ケージ内で安静にさせた後、Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロムエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、ＭｉｃｒｏＣＡＴスキャナー（ＩｍＴｅｋ，Ｉｎｃ．）を使用してＣＡＴスキャンを行った。三次元像を、ＩｍＴｅｋ ３Ｄ ＲＥＣＯＮソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでＦｅｌｄｋａｍｐアルゴリズムによって再構成した。

結果：
ＣＡＴスキャン：分析した３匹全ての（−／−）マウス（Ｍ−２１８、Ｍ−２４９、およびＦ−２５４）は、肝臓サイズが減少した。

（ｄ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

（１）血液学分析：
試験の説明：Ａｂｂｏｔｔ’ｓ Ｃｅｌｌ−Ｄｙｎ ３５００Ｒ（自動血液学分析器）によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、５つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で２２個のパラメータを対象とすることができる。

結果：
（１）血液学（血小板数）：
（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血小板数が顕著に減少し、平均血小板体積が増加した。

したがって、ＤＮＡ１１０７００−２７１６遺伝子が欠損した変異マウスは、凝固障害に関連する表現型が得られた。これに関して、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドまたはその作用剤は、血友病などの異常な血液凝固に関連する障害の治療で有用であろう。

（２）血液学（赤血球およびヘモグロビン）：
（−／−）マウスはまた、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総白血球数および全体白血球数が減少し、平均絶対単球数が増加した。（−／−）マウスはまた、貧血の徴候（その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合の平均赤血球数、ヘモグロビン濃度、およびヘマトクリット値の減少ならびに赤血球分布幅の増加が含まれる）を示した。

これらの結果は、貧血性に関連する表現型および免疫系の低下に関連する。したがって、ＰＲＯ６１８２ポリペプチド、その作用剤、またはＰＲＯ６１８２ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球産生に不可欠であり、そのようなものとして、貧血性または低ヘマトクリット治に関連する血液障害の治療で有用であろう。さらに、（−／−）マウスは、適応的免疫応答に重要なリンパ球数の欠陥を示す。

（２）血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行のための（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、ＩｇＧ２ｂ、およびＩｇＧ３レベルが減少した。

血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ヘミ接合体変異成体が血清ＩｇＧ免疫グロブリンレベルの減少を示すことが明らかとなった。したがって、ホモ接合体（−／−）マウスは、（＋／＋）同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが異常に低かった。したがって、ＰＲＯ６１８２をコードする遺伝子は、免疫グロブリン（またはγグロブリン）の作製に不可欠である。γグロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドまたはその作用剤が免疫系の刺激に有用であり、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）は、免疫応答の阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（３）蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
ＦＡＣＳ３：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔のレベルと比較した場合、ＣＤ８細胞の平均比率の減少および単球の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。

組織特異的組織特異的ＦＡＣＳマウス：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞が増加した。

まとめると、（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨髄中のＩｇＭ＋、ＩｇＤ＋、およびＢ２２０ｈｉ ＣＤ４３−細胞が増加した。成熟ナイーブＢ細胞は、ＩｇＭおよびＩｇＤを同時発現し、骨髄をリンパ器官中に循環させたままにする。ＰＲＯ６０９５ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異（−／−）マウスのＢ細胞前駆体およびこれらの細胞によって発現される免疫グロブリンの比率が増加した。したがって、ＰＲＯ６０９５ポリペプチドは、Ｂ細胞の分化および／または増殖のための負の調節因子として作用するようである。さらに、（−／−）マウスは、ＣＤ８細胞の平均比率が減少した。ＣＤ８タンパク質は、抗原認識においてＴ細胞受容体と協力するためにＭＨＣクラスＩ分子を結合／認識する補助受容体分子である。

（４）急性期応答：
試験の説明：細菌リポ多糖（ＬＰＳ）は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルＩＬＰＳマウスに、２６ゲージの針を使用して、亜致死量のＬＰＳを含む２００μＬ滅菌生理食塩水を腹腔内（ｉ．ｐ．）注射した。この用量は、注射から３時間後に１μｇ／ｇ体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、１００μＬの血液サンプルを採取し、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置でＴＮＦａ、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６の存在について分析した。
結果：
（＋／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＬＰＳ攻撃に対する平均血清ＴＮＦ−α、ＭＣＰ−１、特にＩＬ−６応答が増加した。

まとめると、ＬＰＳ内毒素攻撃は、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、ＬＰＳ内毒素で攻撃した場合、免疫応答（ＴＮＦ−α、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６産生）を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。ＴＮＦ−α、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６は、より後期のＢ細胞活性化に寄与する。ＴＮＦ−αは、重要な炎症メディエーターである。ＴＮＦ−αは、重要な炎症性メディエーターである。さらに、ＴＮＦ−α、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。ＴＮＦ−αは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルの代わりに機能し得る（したがって、エフェクター分子としての機能を果たす）。

（ｅ）表現型解析：代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病および他の代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ．Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う：アルカリホスファターゼ；アラニンアミノトランスフェラーゼ；アルブミン；ビリルビン；リン；クレアチニン；ＢＵＮ＝血中尿素窒素；カルシウム；尿酸；ナトリウム；カリウム；および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果：
血液化学：雄および雌（−／−）マウスの両方は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均血清グルコースレベルが減少した。平均血清アルカリホスファターゼレベルの増加は、平均骨中無機質密度測定値の減少の所見および認められた肝臓異常および慢性肝炎の所見と一致する。

（ｆ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな１２０デシベル（ｄＢ）驚愕誘発音が、より柔らかい（プレパルス）音より先行する場合に起こる。ＰＰＩパラダイムは、６種類の異なる試行型（７０ｄＢバックグラウンドノイズ、１２０ｄＢ単独、７４ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ４、７８ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ８、８２ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ１２、および９０ｄＢ＋１２０ｄＢ−ｐｐ２０）からなり、各々、擬似乱数順に６回、合計３６試行繰返される。刺激に対する最大応答（Ｖ ｍａｘ）を、各試行型について平均する。１００以下の１２０ｄＢ平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。

結果：
感覚運動ゲーティング／注意：変異（−／−）マウスは、聴覚驚愕反射のプレパルス阻害が増加する傾向があり、これは、感覚運動ゲーティング／注意を示す。
（ｇ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。

（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。

結果：
ＤＥＸＡ：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身、大腿骨、および脊椎の平均骨塩量、容積測定骨中無機質密度、および骨中無機質密度が減少した。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨小柱の体積、数、および連結性が減少した。

ＤＥＸＡおよび骨マイクロＣＴ分析によって分析した（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨測定値および体重（ｂｏｄｙ ｍａｓｓ）が減少し、異常な骨障害が示唆される。（−／−）マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドまたはその作用剤が骨ホメオスタシスの維持に有用であることを示す。さらに、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドは、関節炎または骨粗鬆症の治癒または治療で有用であるのに対して、ＰＲＯ６１８２ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストによって異常または病的な骨障害（異常な骨代謝に関連する炎症性疾患（関節炎、骨粗鬆症、および骨減症が含まれる）が含まれる）を引き起こすであろう。（−／−）マウスはまた、成長遅延の徴候を示した。

６６．５７．ＤＮＡ１０８７２２−２７４３（ＵＮＱ２７８２）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１０８７２２−２７４３と示す）（ＵＮＱ２７８２）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：膜貫通ムチンＭＵＣ２０のＡＢ０９８７３２ ムス・ムスクルスｍＲＮＡ；参照タンパク質：Ｑ７６Ｉ８４ アクセッション：Ｑ７６Ｉ８４ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。膜貫通ムチンＭＵＣ２０；参照ヒト遺伝子配列：ＢＣ０２９２６７ ホモ・サピエンスムチン２０のｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：３４７１７ ＩＭＡＧＥ：３８５１９５２）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８Ｎ３０７ アクセッション：Ｑ８Ｎ３０７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＭＵＣ２０タンパク質。

目的のマウス遺伝子は、Ｍｕｃ２０（ムチン２０）（ヒトＭＵＣ２０のオーソログ）である。別名には、ＭＧＣ３１０８１、ＦＬＪ１４４０８、ＫＩＡＡ１３５９、およびｃＤＮＡ配列ＢＣ０２６３６７が含まれる。

ＭＵＣ２０は、主に腎近位尿細管上皮細胞中に発現する内在性原形質膜タンパク質である。ＭＵＣ２０はまた、胎盤、結腸、肺、前立腺、および肝臓中に中程度に発現する。ＭＵＣ２０は、肝細胞成長因子受容体ＭＥＴ上のＧｒｂ２ドッキング部位と相互作用し、Ｇｒｂ２ Ｒａｓ経路を介したＭＥＴシグナル伝達を阻害することができる。さらに、ＭＵＣ２０は、肝細胞成長因子誘導性マトリックスメタロプロテイナーゼ発現および細胞増殖を阻害する。これらの所見により、ＭＵＣ２０はＨＧＦシグナル伝達を調節する役割を果たすことが示唆される。ＭＵＣ２０は、中等度の免疫グロブリンＡ腎症の患者および糸球体腎炎の実験マウスモデルで上方制御され、ＭＵＣ２０が糸球体腎炎および他の腎臓損傷の進行で役割を果たし得ることが示唆される（Ｈｉｇｕｃｈｉ，Ｏｒｉｔａ，Ｋａｔｓｕｙａ ｅｔ ａｌ，Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ２４（１７）：７４５６−６８（２００４）；Ｈｉｇｕｃｈｉ，Ｏｒｉｔａ，Ｎａｋａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７９（３）：１９６８−７９（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ３５ ２１ ７４
予測値 １８．５ ３７ １８．５ ７４
カイ二乗＝１．６９ 有意性＝０．４２９５５７３５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４６０７１．１）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの眼、肺、腎臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１０８７２２−２７４３（ＵＮＱ２７８２））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトムチン２０（ＭＵＣ２０）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスに免疫学的異常が生じた。血液および脾臓中のＴ細胞の比率が正常であるにもかかわらず、リンパ節中のナイーブＴ細胞が減少する。ＩｇＭ Ｂ細胞は骨髄中で増加するが、リンパ節中で有意に減少する。さらに、雄変異体は、平均血清インスリンレベルが減少した。雄ノックアウト（−／−）マウスは、総組織マスおよび除脂肪体重が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
組織特異的ＦＡＣＳプロジェクト：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨髄中のＩｇＭ＋およびＣＤ１１７＋Ｂ細胞が増加した。血液および脾臓中のＴ細胞の比率が正常であるにもかかわらず、リンパ節中のナイーブＴ細胞が減少する（特にＣＤ４＋）。さらに、（−／−）マウスは、リンパ節中の死細胞の比率がより高く、Ｂ細胞が減少し、（ＣＤ８細胞がわずかに減少するにもかかわらず）ＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞が増加する。（−／−）マウスはまた、脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）が増加し、これは、血液学結果において単球が増加する所見と一致する。

したがって、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、複雑なパターンの多数の免疫学的異常が生じる。本質的に、リンパ節中のＢ細胞集団（プレＢ細胞またはプロＢ細胞、未成熟および成熟Ｂ細胞が含まれる）が顕著に減少し、Ｔ細胞集団（特に、ナイーブＴ細胞）が減少する。これらの所見から、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドまたはＰＲＯ７１７０ポリペプチドをコードする遺伝子は、リンパ節中のＢ細胞およびＴ細胞の両集団の発生に重要なようである。したがって、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドは、Ｂ細胞およびＴ細胞の増殖の増強または進行に有利であろう。

（ｃ）血液化学
マウスにおける血液化学試験の実施のための臨床的状況で、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して血液化学分析を行った。
インスリンデータ：
試験の説明：Ｌｅｘｉｃｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓは、マウスにおける定量的インスリンアッセイの実施のための臨床的状況で、Ｃｏｂｒａ ＩＩシリーズ自動γカウンティングシステムを使用する。

結果：
インスリン：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清インスリンレベルが減少した。

ＰＲＯ７１７０ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異（−／−）マウスは、糖尿病を示し得る低インスリンレベルによって特徴づけられる表現型を示す。したがって、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの代謝関連効果を模倣するであろう。他方では、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドまたはその作用剤は、糖尿病などの代謝障害の防止および／または治療で有用であろう。

（ｄ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄（−／−）は、平均総組織マスおよび徐脂肪体重が増加した。

これらの研究により、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ７１７０ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満または他の成長関連障害の予防および／または治療で特に重要であろう。

６６．５８．ＤＮＡ１０８６７０−２７４４（ＵＮＱ２７８３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ７１７１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１０８６７０−２７４４と示す）（ＵＮＱ２７８３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＡＡ０３０２９６ アクセッション：ＡＡ０３０２９６ ＮＩＤ：１４９７４３６ ムス・ムスクルス ｍｉ０２ｄ１０．ｒ１ Ｓｏａｒｅｓマウス胎盤４ＮｂＭＰ１３．５ １４．５ ムス・ムスクルス ｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ：４５９２８３ ５￥’； 参照ヒト遺伝子配列：ＡＹ３５８６２１ ホモ・サピエンスクローンＤＮＡ１０８６７０ ＷＷＬＳ２７８３（ＵＮＱ２７８３）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＵＷＶ７ アクセッション：Ｑ６ＵＷＶ７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＷＷＬＳ２７８３。

目的のマウス遺伝子は、部分的ｃＤＮＡ（ＮＣＢＩアクセッションＡＡＯ３０２９６）によって示され、これは、ホモ・サピエンスクローンＤＮＡ１０８６７０ ＷＷＬＳ２７８３（ＵＮＱ２７８３）を有するオーソログである。別名には、仮説タンパク質ＭＧＣ５２４９８およびＰＲＯ７１７１が含まれる。

ＵＮＱ２７８３は、推定分泌タンパク質であり、１３４個のアミノ酸からなり、シグナルペプチドを含む（Ｃｌａｒｋ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ １３（１０）：２２６５−７０（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２３ ３２ １２ ６７
予測値 １６．７５ ３３．５ １６．７５ ６７
カイ二乗＝３．５ 有意性＝０．１７３７７３９４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および脾臓、腎臓、肝臓、骨、および脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１０８６７０−２７４４（ＵＮＱ２７８３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト推定分泌タンパク質（ＵＮＱ２７８３）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび体脂肪が増加した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。変異（−／−）マウスはまた、トリグリセリドレベルが増加した。マイクロアレイ分析は、リンパ腫瘍中のＵＮＱ２７８３の過剰発現を示す。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。

これらの結果は、ノックアウト変異マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重の増加、ならびに平均総体脂肪率および総脂肪マスの増加によって特徴づけられる異常な体重および脂肪測定値を示すことを証明する。

これらの結果は、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、ＰＲＯ７１７１ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および／または肥満症の予防および／または治療で特に重要であろう。

（ｃ）診断−心拍数／血圧
説明
Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧分析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。１匹の（−／−）雄マウスはまた、心拍数が減少した（歴史的平均よりも２標準偏差を超えて低い）。

Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧分析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、１日あたり１０回４日間にわたって測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果：
血圧：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。

心拍数：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均心拍数が増加した。

（ｄ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、ＰＲＯ７１７１遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ７１７１ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ７１７１ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。

６６．５９．ＤＮＡ１１９５３５−２７５６（ＵＮＱ２９７３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ７４３６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１１９５３５−２７５６と示す）（ＵＮＱ２９７３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７７０３６ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｃ１３００２２Ｐ０９遺伝子（Ｃ１３００２２Ｐ０９Ｒｉｋ）；参照タンパク質：ＮＰ＿７９６０１０ ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｃ１３００２２Ｐ０９遺伝子（ムス・ムスクルス）ｇｉ｜２６３４７８９５｜ｄｂｊ｜ＢＡＣ３７５９６．１｜不特定のタンパク質産物（ムス・ムスクルス）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２０２１９ ホモ・サピエンス癌胎児性抗原様１（ＣＥＡＬ１）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ７Ｚ６９２ アクセッション：Ｑ７Ｚ６９２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。癌胎児性抗原様１前駆体（ＵＮＱ２９７３／ＰＲＯ７４３６）。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ Ｃ１３００２２Ｐ０９遺伝子（ヒトＣＥＡＬ１（癌胎児性抗原様１）のオーソログ）である。別名には、ＤＫＦＺｐ５４７Ｎ１５７が含まれる。

ＣＥＡＬ１は、推定Ｉ型内在性膜タンパク質であり、シグナルペプチド、免疫グロブリン様ドメイン、および膜貫通セグメントを含む。第２のＣＥＡＬ１変異型は、免疫グロブリン様ドメインを欠く。他の癌胎児性抗原（ＣＥＡ）ファミリーメンバーに類似することにより、ＣＥＡＬ１は、原形質膜中に存在する可能性が高い。ＣＥＡＬ１は広範に発現し、臨床的に侵襲性の卵巣癌の小集団中に過剰発現し得る（Ｓｃｏｒｉｌａｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ ３１０：７９−８９（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ４６ ２１ ８５
予測値 ２１．２５ ４２．５ ２１．２５ ８５
カイ二乗＝２．３８ 有意性＝０．３０４２２１２４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２３ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７７０３６．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、腎臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．５９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１１９５３５−２７５６（ＵＮＱ２９７３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト癌胎児性抗原様１（ＣＥＡＬ１）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が有意に増加するホモ接合体変異マウスが得られた。雌（−／−）マウスはまた、総体脂肪およびコレステロールの減少と共に体重および総組織マスが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）成体皮膚細胞の増殖：
手順：１６週齢の動物（２匹の野生型および４匹のホモ接合体）から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、ｐ５３およびＫｕ８０を使用して証明した。Ｂｒｄｕ組み込みを使用して、増殖を測定した。

詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。５万個の細胞の２連または３連の培養物をプレートし、６日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果：
皮膚増殖：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が顕著に増加した。

したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、ＰＲＯ７４３６ポリペプチドまたはその作用剤は、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。

（ｃ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。

（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：分析に利用可能な１匹の雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、総脂肪マス、および総体脂肪率が減少した。

ＤＥＸＡによって分析した（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、総組織マスおよび除脂肪体重ならびに脂肪測定値が減少し、これらの変異体の成長遅延が示唆される。これは、体重および体長が減少する所見と併せて、悪液質または他の成長遅延障害などの組織消耗性容態が示唆される。したがって、ＰＲＯ７４３６ポリペプチドまたはその作用剤は、成長障害（悪液質または他の組織消耗性疾患が含まれる）の治療または防止で有用であろう。

（ｄ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが減少した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが顕著に増加した。したがって、ＰＲＯ７４３６遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ７４３６ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。

６６．６０．ＤＮＡ１０８７００−２８０２（ＵＮＱ３０７７）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ９９１２ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１０８７００−２８０２と示す）（ＵＮＱ３０７７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿１３７９１４（推定）：ムス・ムスクルス（エクトヌクレオチド（ｅｃｔｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）ピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ７の類似物）；アルカリスフィンゴミエリナーゼ（ＬＯＣ２３８０１１）；参照タンパク質：ＸＰ＿１３７９１４ アクセッション：ＸＰ＿１３７９１４ ＮＩＤ：ｇｉ ５１７６６５６７ ｒｅｆ ＸＰ＿１３７９１４．４（エクトヌクレオチドピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ７の類似物）；アルカリスフィンゴミエリナーゼ（ムス・ムスクルス）；参照ヒト遺伝子配列：ＢＣ０４１４５３ アクセッション：ＢＣ０４１４５３ ＮＩＤ：２７３７１２３５ ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス（エクトヌクレオチドピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ５、クローンＩＭＡＧＥ：５１８６７４３の類似物）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＩＵＳ８ アクセッション：Ｑ８ＩＵＳ８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。エクトヌクレオチドピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ５の類似物（フラグメント）。

目的のマウス遺伝子は、「エクトヌクレオチドピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ７の類似物；アルカリスフィンゴミエリナーゼ」、ヒトＥＮＰＰ７（エクトヌクレオチドピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ７）のオーソログ」である。別名には、ＭＧＣ５０１７９、ＡＬＫ ＳＭａｓｅ、およびアルカリスフィンゴミエリナーゼが含まれる。

ＥＮＰＰ７は、主に小腸および肝臓で発現し、スフィンゴミエリンの加水分解を触媒するエクト酵素である。このタンパク質は、シグナルペプチド、Ｉ型ホスホジエステラーゼ／ヌクレオチドピロホスファターゼドメイン（ＰｆａｍアクセッションＰＦ０１６６３）、および原形質膜の細胞外表面にタンパク質を弱く繋留することができるＣ末端付近の疎水性領域からなる（Ｄｕａｎ ｅｔ ａｌ，２００３）。他のスフィンゴミエリナーゼと異なり、ＥＮＰＰ７はアルカリｐＨでの至適触媒活性、トリプシン耐性、および特異的胆汁塩を示す。この酵素は、特に、小腸上皮細胞の絨毛膜の細胞外表面上および胆汁中に集中している。ＥＮＰＰ７は、食事性スフィンゴミエリン消化、コレステロール吸収、および小腸腫瘍発生で役割を果たす可能性が高い（Ｄｕａｎ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（４０）：３８５２８（２００３）；Ｗｕ ｅｔ ａｌ，Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ ２５（８）：１３２７−３３（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２２ ３７ １１ ７０
予測値 １７．５ ３５ １７．５ ７０
カイ二乗＝５．１８ 有意性＝０．０７５０２００４５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１９ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜３をターゲティングした（ＸＭ＿１３７９１４．４）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、胸腺、脾臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１０８７００−２８０２（ＵＮＱ３０７７））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトエクトヌクレオチドピロホスファターゼ／ホスホジエステラーゼ７（ＥＮＰＰ７）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均の測定値と比較した場合、総組織マスおよび総体脂肪が増加した雄および雌のヘテロ接合性およびホモ接合体変異マウスを得た。さらに、ノックアウト（−／−）マウスは、不安様応答が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験：
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン（ｓｅｒａｔｏｎｉｎ）輸送体、ドーパミン輸送体（Ｇｉｒｏｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．１９９６ Ｆｅｂ ｌ５；３７９（６５６６）：６０６−１２）、およびＧＡＢＡ受容体（Ｈｏｍａｎｉｃｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ．１９９７ Ａｐｒ １５；９４（８）：４１４３−８）のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第１に、マウスにとって比較的巨大であるように領域（４０×４０ｃｍ）を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く（特に探索に関する活動）ことが可能な４個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第１の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第１の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。３つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域（４０ｃｍ×４０ｃｍ、ＡｃｃｕＳｃａｎ ＩｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓのＶｅｒｓａＭａｘ動物活動モニタリングシステム）を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を２０分間測定した。この試験からのデータを、４分間隔で５回分析した。総移動距離（ｃｍ）、上下運動数（直立）、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。

新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、５回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各５回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果：
オープンフィールド２：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均の値と比較した場合、中心滞在時間の合計が増加し、雄変異体における不安様応答の減少が示唆される。

オープンフィールド活動試験中に顕著な相違が認められた。雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が増加し、変異体における不安様応答の減少を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および／または双極性障害と一致する表現型を証明した。したがって、ＰＲＯ９９１２ポリペプチドおよびその作用剤は、不安障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。

（ｃ）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄および雌の（＋／−）マウスおよび（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、平均総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。

これらの研究は、ホモ接合体変異（−／−）マウスおよびヘテロ接合体（＋／−）マウスの両方が肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、ＰＲＯ９９１２ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝の過程に不可欠であり、脂質蓄積症、異常脂質血症、および／または肥満症の防止および／または治療で有用であろう。

６６．６１．ＤＮＡ１１９４７４−２８０３ （ＵＮＱ３０７９）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ９９１７ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１１９４７４−２８０３と示す）（ＵＮＱ３０７９）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１４５１００ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２７０００５０Ｃ１２遺伝子（２７０００５０Ｃ１２Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９ＪＪ９６ アクセッション：Ｑ９ＪＪ９６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス脳ｃＤＮＡ、クローンＭＮＣｂ ０６７１；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１４４５８６ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＭＧＣ２９６４３（ＭＧＣ２９６４３）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８Ｎ２Ｇ４ アクセッション：Ｑ８Ｎ２Ｇ４ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＰＳＥＣ０１８１。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２７０００５０Ｃ１２遺伝子（ヒト仮説タンパク質ＭＧＣ２９６４３のオーソログ）である。別名には、Ｃ５３０００８Ｏ１６Ｒｉｋが含まれる。

ＭＧＣ２９６４３は、推定分泌性タンパク質であり、シグナルペプチドおよびＬｙ−６抗原／ｕＰＡ受容体様ドメインからなる。このドメインは、ウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベーター受容体およびいくつかのグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）結合細胞表面糖タンパク質（白血球抗原など）中で生じる。このドメインを有するタンパク質は、細胞接着またはシグナル伝達分子（ＳＭＡＲＴアクセッションＳＭ００１３４）おつぃて機能することができる。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １８ ２９ １６ ６３
予測値 １５．７５ ３１．５ １５．７５ ６３
カイ二乗＝５．４２ 有意性＝０．０６６５３６８１（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２３ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４５１００．２）。
１．野生型発現パネル：ＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胸腺、肺、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１１９４７４−２８０３（ＵＮＱ３０７９））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説タンパク質ＭＧＣ２９６４３のオーソログをコードする遺伝子の変異により、尾部懸垂試験において抑鬱様応答が減少し、ストレス誘導性高温試験において不安様応答が減少した。さらに、雄および雌の変異マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、心拍数が増加した。変異（−／−）マウスはまた、平均血清コレステロールレベルが増加し、耐糖能が低下した。雄および雌（−／−）マウスは、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。
結果：
血液化学：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが顕著に増加した。したがって、ＰＲＯ９９１７遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ９９１７ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ９９１７ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。

（ｃ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。

これらの研究は、（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ９９１７ポリペプチド（またはその作用剤）またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または種々の心血管障害（糖尿病が含まれる）に関連する病態の治療で有用であろう。

（ｄ）診断−心拍数
説明
Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧分析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、１日あたり１０回４日間にわたって測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果：
心拍数：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均心拍数が増加した（平均よりも約２標準偏差高い）。

（ｅ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−尾部懸垂試験：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。

尾部懸垂試験：
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を６分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ（すなわち、試験中にその尾部を登る）を有する動物を、この分析から排除する。

結果：
尾部懸垂２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合に不動時間が減少し、これは、変異体で抑鬱様応答が減少することをを示す。したがって、ＰＲＯ９９１７のアンタゴニスト（インヒビター）は、この表現型を模倣すると予想されるであろう。
機能観察バッテリー（ＦＯＢ）試験−ストレス誘導過温症：
ＦＯＢは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約１０分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。

結果：
ストレス誘導過温症：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する耐性が阻害され、変異体における不安様応答の減少が示唆される。したがって、ＰＲＯ９９１７ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、不安関連障害の治療で有用であろう。

（ｆ）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。

Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。

結果：
ＤＥＸＡ：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、平均総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。

これらの研究は、変異（−／−）マウスが肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、ＰＲＯ９９１７ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝の過程に不可欠であり、脂質蓄積症、異常脂質血症、および／または肥満症の防止および／または治療で有用であろう。

６６．６２．ＤＮＡ２２６８７４（ＵＮＱ５２９１）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ３７３３７ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ２２６８７４と示す）（ＵＮＱ５２９１）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１０１２８ ムス・ムスクルス上皮膜タンパク質１（Ｅｍｐ１）；参照タンパク質：Ｐ４７８０１ アクセッション：Ｐ４７８０１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。上皮膜タンパク質１（ＥＭＰ１）（腫瘍関連膜タンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿００１４２３ ホモ・サピエンス上皮膜タンパク質１（ＥＭＰ１）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｐ５４８４９ アクセッション：Ｐ５４８４９ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。上皮膜タンパク質１（ＥＭＰ１）（腫瘍関連膜タンパク質）（ＣＬ ２０）（Ｂ４Ｂタンパク質）。

目的のマウス遺伝子は、Ｅｍｐ１（上皮膜タンパク質 １）（ヒトＥＭＰ１のオーソログ）である。別名には、腫瘍関連膜タンパク質、ＴＭＰ、Ｂ４Ｂタンパク質、およびＣＬ−２０が含まれる。

ＥＭＰ１は、推定内在性原形質膜糖タンパク質であり、１つのＰＭＰ２２ファミリードメイン内の４つの膜貫通セグメントからなる（Ｌｏｂｓｉｇｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ３６（３）：３７９−８７（１９９６）；Ｍａｒｖｉｎ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７０（４８）：２８９１０−６（１９９５）；Ｒｕｅｇｇ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５７（１）：７２−８０（１９９６））。ＥＭＰ１は、密着結合成分として機能するクローディンおよび調節サブユニットとして機能する電位依存性カルシウムチャネルγサブユニットと構造が類似する（ＩｎｔｅｒＰｒｏアクセッションＩＰＲ００４０３１）。ＥＭＰ１は、主に発生中のニューロン中に発現するが（Ｗｕｌｆ ａｎｄ Ｓｕｔｅｒ，Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓ Ｄｅｖ Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓ １１６（２）：１６９−８０（１９９９））、いくつかの他の組織（腫瘍（Ｂｅｎ Ｐｏｒａｔｈ ａｎｄ Ｂｅｎｖｅｎｉｓｔｙ，Ｇｅｎｅ １８３（１−２）：６９−７５（１９９６））、扁平上皮分化気管支上皮細胞（Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ４１（１）：４０−８（１９９７））、および未熟Ｂ細胞亜集団（Ｒｕｅｇｇ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５７（１）：７２−８０（１９９６）が含まれる）中でも発現する。ＥＭＰ１は、細胞の増殖、発達、分化、および細胞死などの過程で役割を果たし得る（Ｒｕｅｇｇ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １５７（１）：７２−８０（１９９６）；Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｗｏｒｌｄ Ｊ Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ ９（３）：３９２−８（２００３）；Ｗｕｌｆ ａｎｄ Ｓｕｔｅｒ，Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓ Ｄｅｖ Ｂｒａｉｎ Ｒｅｓ １１６（２）：１６９−８０（１９９９））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １０ ４１ １３ ６４
予測値 １６ ３２ １６ ６４
カイ二乗＝１．３５ 有意性＝０．５０９１５６４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２３ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１０１２８．３）．
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６２．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ２２６８７４（ＵＮＱ５２９１））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト上皮膜タンパク質 １（ＥＭＰ１）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨中無機質密度の測定値が増加した変異（−／−）マウスが得られた。雄および雌の（−／−）マウスの両方は、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。雌（−／−）マウスはまた、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。胚発現は、脈管構造中に強いシグナルを示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。

結果：
ＤＥＸＡ：（−／−）マウスは、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。さらに、雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および大腿骨中の平均容積測定骨中無機質密度および骨中無機質密度が増加した。

マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。

これらの結果は、骨量の増加によって特徴づけられる大理石骨病に類似の骨測定値の増加伴う異常な骨代謝を示すことが証明される。ノックアウト（−／−）マウスはまた、肥満症表現型の徴候を示した。したがって、ＰＲＯ３７３３７ポリペプチドまたはその作用剤は、骨ホメオスタシスの維持および破骨細胞と骨芽細胞の活性の釣り合わせによる骨再造形に有用であろう。さらに、ＰＲＯ３７３３７ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、骨治癒または骨石灰化に関連する他の骨関連異常の治療で有用であろう。

６６．６３．ＤＮＡ２２７０３３（ＵＮＱ５４０７）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ２２７０３３と示す）（ＵＮＱ５４０７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０１０７６２ ムス・ムスクルスミエリンおよびリンパ球タンパク質、Ｔ細胞分化タンパク質（Ｍａｌ）；参照タンパク質：Ｏ０９１９８アクセッション：Ｏ０９１９８ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ミエリンおよびリンパ球タンパク質（Ｔリンパ球成熟化関連タンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿００２３７１アクセッション：ＮＭ＿００２３７１ ＮＩＤ：ｇｉ １２４０８６６６ ｒｅｆ ＮＭ＿００２３７１．２ ホモ・サピエンスｍａｌ、Ｔ細胞分化タンパク質（ＭＡＬ）、転写物変異型ａ；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｐ２１１４５ アクセッション：Ｐ２１１４５ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ミエリンおよびリンパ球タンパク質（Ｔリンパ球成熟化関連タンパク質）。

目的のマウス遺伝子は、Ｍａｌ（ミエリンおよびリンパ球タンパク質、Ｔ細胞分化タンパク質）（ヒトＭＡＬ（ｍａｌ，Ｔ細胞分化タンパク質）のオーソログ）である。別名には、ＭＰＶ１７、ＶＩＰ１７、ミエリンおよびリンパ球タンパク質、ならびにＴ細胞分化タンパク質ＭＡＬが含まれる。

ＭＡＬは親油性内在性膜タンパク質であり、ＭＡＲＶＥＬ（膜結合）ドメイン（ＰｆａｍアクセッションＰＦ０１２８４）内に含まれる４つの膜貫通セグメントからなる。ＭＡＬは、上皮細胞、成熟Ｔ細胞、およびミエリン形成細胞の糖脂質富化マイクロドメイン中に見出される。さらに、ＭＡＬは、いくつかの細胞内位置（小胞体、ゴルジ装置、小胞（ｌａｒｇｅ ｖｅｓｉｃｌｅ）、および原形質膜が含まれる）中で検出されている。ＭＡＬの機能は、明確に知られていないが、偏向した糖脂質およびタンパク質の輸送、小胞形成、および髄鞘形成で役割を果たし得る（Ｍａｒａｚｕｅｌａ ａｎｄ Ａｌｏｎｓｏ，Ｈｉｓｔｏｌ Ｈｉｓｔｏｐａｔｈｏｌ １９（３）：９２５−３３（２００４）；Ｐｕｅｒｔｏｌｌａｎｏ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７２（２９）：１８３１１−５（１９９７）；Ｍａｇｙａｒ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｅ １８９（２）：２６９−７５（１９９７）；Ｅｒｎｅ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ ８２（３）：５５０−６２（２００２）；Ｓｃｈａｅｒｅｎ Ｗｉｅｍｅｒｓ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ １６６（５）：７３１−４２（２００４）；Ｓａｒａｖａｎａｎ ｅｔ ａｌ，Ｎｅｕｒｏｂｉｏｌ Ｄｉｓ １６（２）：３９６−４０６（２００４）；Ｆｒａｎｋ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ ７３（２）：５８７−９７（１９９９）；Ｆｒａｎｋ，Ｐｒｏｇ Ｎｅｕｒｏｂｉｏｌ ６０（６）：５３１−４４（２０００））。

Ｓｃｈａｅｒｅｎ Ｗｉｅｍｅｒｓ ａｎｄ ｃｏｌｌｅａｇｕｅｓ（２００４）は、ノックアウトマウスを使用してＭＡＬの生理学的役割を調査した。彼らは、ミエリン形成およびノード近傍（ｐａｒａｎｏｄｅ）−軸索接触面構造がＭＡＬ欠損マウスで異常であったが、野生型マウスでは異常でなかったことを示した。著者は、ＭＡＬが中枢神経系におけるノード近傍形成に極めて重要であると結論づけた。彼らは、ＭＡＬが乏突起膠細胞中の種々の膜成分の輸送または分類を調節する可能性が高いと提案した。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２１ ３７ １８ ７６
予測値 １９ ３８ １９ ７６
カイ二乗＝２．０９ 有意性＝０．３５１６９１８４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２４ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０１０７６２．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および胸腺、肺、肝臓、、骨格筋、および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６３．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ２２７０３３（ＵＮＱ５４０７））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトｍａｌ（Ｔ細胞分化タンパク質（ＭＡＬ））のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のＣＤ８細胞の平均比率が減少し、リンパ節中のナイーブＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞が減少したホモ接合体変異マウスが得られた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）解析／組織特異的ＦＡＣＳ
手順：
末梢血由来の免疫細胞組成物（Ｔリンパ球を評価するためのＣＤ４、ＣＤ８、およびＴ細胞受容体、Ｂリンパ球のためのＣＤ１９、白血球マーカーとしてのＣＤ４５、およびナチュラルキラー細胞のためのｐａｎＮＫが含まれる）のＦＡＣＳ解析を行った。２匹の野生型マウスおよび６匹のホモ接合体マウスに対してＦＡＣＳ解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。

これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のＣＤ４およびＣＤ８陽性Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ ３−ｌａｓｅｒ ＦＡＣＳ装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、ＣＤ４＋／ＣＤ８＋比に加えて、ＣＤ４＋／ＣＤ８−、ＣＤ８＋／ＣＤ４−、ＮＫ、Ｂ細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、６系統特異的抗体のパネル（ＣＤ４５ ＰｅｒＣＰ、抗ＴＣＲｂ ＡＰＣ、ＣＤ４ ＰＥ、ＣＤ８ ＦＩＴＣ、ｐａｎ−ＮＫ ＰＥ、およびＣＤ１９ ＦＩＴＣ）を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。２つのＦＩＴＣおよびＰＥ標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。ＣｅｌｌＱｕｅｓｔソフトウェアを備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。

結果：
ＦＡＣＳ３：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、リンパ節中のＣＤ８細胞の平均比率の減少ならびにナイーブＣＤ４およびＣＤ８Ｔ細胞のの比率の減少によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。

ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異（−／−）マウスは、ＣＤ８細胞およびＣＤ４ナイーブＴ細胞の平均比率が減少した。ＣＤ８タンパク質は、抗原認識においてＴ細胞受容体と協力するためにＭＨＣクラスＩ分子を結合／認識する補助受容体分子である。したがって、ＰＲＯ３７９４９６ポリペプチドまたはその作用剤は、免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろう。したがって、ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、免疫応答の阻害に有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

さらに、（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、細胞中のナイーブＣＤ４細胞の平均比率が減少した。したがって、ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、Ｔ細胞集団が増加する。これらの所見から、ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドまたはＰＲＯ３７４９６をコードする遺伝子は、Ｔ細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、ＰＲＯ３７４９６ポリペプチドは、Ｔ細胞増殖の増強で有利であろう。

６６．６４．ＤＮＡ１４５８４１−２８６８（ＵＮＱ５８２７）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１９６４６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１４５８４１−２８６８と示す）（ＵＮＱ５８２７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＩＲＲＥ様２のＮＭ＿１７２８９８ ムス・ムスクルス類（ｋｉｎ）（ショウジョウバエ）（Ｋｉｒｒｅｌ２）；参照タンパク質：Ｑ７ＴＳＵ７ アクセッション：Ｑ７ＴＳＵ７ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＩＲＲＥ様２類；参照ヒト遺伝子配列：ＩＲＲＥ様２のＮＭ＿１９９１８０ ホモ・サピエンス類（ショウジョウバエ）（ＫＩＲＲＥＬ２）、転写物変異型３；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＵＷＬ６ アクセッション：Ｑ６ＵＷＬ６ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＩＲＲＥ様タンパク質２前駆体類（不規則なキアズマ様タンパク質２類）（ネフリン様タンパク質３）（ＵＮＱ５８２７／ＰＲＯ１９６４６）。

目的のマウス遺伝子は、Ｋｉｒｒｅｌ２（ＩＲＲＥ様２類（ショウジョウバエ））（ヒトＫＩＲＲＥＬ２のオーソログ）である。別名には、ＮＬＧ１、ＮＥＰＨ３、ＦＩＬＴＲＩＮ、ＭＧＣ１５７１８、ＤＫＦＺＰ５６４Ａ１１６４、Ｃ３３００１９Ｆ２２Ｒｉｋ、不規則なキアズマ様タンパク質２類、ＩＲＲＥ様２のＸ類（ショウジョウバエ）、ネフリン様３、およびネフリン様遺伝子１が含まれる。

ＫＩＲＲＥＬ２は、細胞接着分子として機能する可能性が高いＩ型内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、５つのＩｇ様ドメイン、膜貫通ドメイン、およびファミリーメンバーＫＩＲＲＥＬおよびＫＩＲＲＥＬ３中に保存された９個のアミノ酸を含む細胞質Ｃ末端を含む。ＫＩＲＲＥＬ２のＣ末端ドメインは、ＫＩＲＲＥＬおよびＫＩＲＲＥＬ３と同様に、ポドシン（糸球体濾過バリアとして機能する構造（スリット膜）の成分）と相互作用することができる。ＫＩＲＲＥＬ２は、多数の異なる組織中で発現するが、主に膵島β細胞およびリンパ節中で発現するようである。さらに、ＫＩＲＲＥＬ２の発現は、非肥満性糖尿病（ＮＯＤ）マウスにおける膵島のＴ細胞侵襲および糖尿病発症と負に相関する。ＫＩＲＲＥＬ２は、糸球体濾過、膵臓β細胞機能、および免疫などの生理学的過程に関与し得る（Ｉｈａｌｍｏ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ３００（２）：３６４−７０（２００３）；Ｓｅｌｌｉｎ ｅｔ ａｌ，ＦＡＳＥＢ Ｊ １７（１）：１１５−７（２００３）；Ｓｕｎ ｅｔ ａｌ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ８２（２）：１３０−４２（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １４ ３１ １３ ５８
予測値 １４．５ ２９ １４．５ ５８
カイ二乗＝０．７４ 有意性＝０．６９０７３４３（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２２ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜３をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７２８９８．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６４．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１４５８４１−２８６８（ＵＮＱ５８２７））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ＩＲＲＥ様２のヒト類（ショウジョウバエ）（ＫＩＲＲＥＬ２）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均体重および体長が減少した。さらに、雄（−／−）マウスは、細精管の変性が示された。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：分析した雄（−／−）マウスは、細精管の空胞変性を示した。１匹の（−／−）マウス（Ｍ−１７３）はまた、肝臓の小葉中心部分の微小空胞の脂肪が変化した。
遺伝子発現：標的遺伝子の発現は、免疫組織化学分析によって組織パネル中に検出されなかった。

（ｃ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重および体長：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。したがって、変異（−／−）マウスは、成長遅延に関連し得る表現型を示した。ＰＲＯ１９６４６ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長の促進で有用であろうことに対して、ＰＲＯ１９６４６ポリペプチドインヒビターまたはアンタゴニストはこの負の表現型を模倣するであろう。

６６．６５．ＤＮＡ１８８３４２（ＵＮＱ５８９３）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ２１７１８ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１８８３４２と示す）（ＵＮＱ５８９３）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＢＣ０２４５８７ アクセッション：ＢＣ０２４５８７ ＮＩＤ：１９３５４０４２ ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ５８３０４０８Ｆ０６遺伝子の類似物、クローンＭＧＣ：３７７１６ ＩＭＡＧＥ：５０６６２８３；参照タンパク質：Ｑ９Ｄ３Ｇ２ アクセッション：Ｑ９Ｄ３Ｇ２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。５８３０４０８Ｆ０６Ｒｉｋタンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０２０１２５ アクセッション：ＮＭ＿０２０１２５ ＮＩＤ：ｇｉ ９９１０３４１ ｒｅｆ ＮＭ＿０２０１２５．１ ホモ・サピエンス Ｂリンパ球活性化因子マクロファージ（発現型）（ｌｙｍｐｈｏｃｙｔｅ ａｃｔｉｖａｔｏｒ ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ）（ＢＬＡＭＥ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ９Ｐ０Ｖ８ アクセッション：Ｑ９Ｐ０Ｖ８ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。ＢＣＭ様膜タンパク質（仮説タンパク質ＦＬＪ９０１８８）。

目的のマウス遺伝子は、Ｓｌａｍｆ８（ＳＬＡＭファミリーメンバー８）（ヒトＳＬＡＭＦ８のオーソログ）である。別名には、Ｂｌａｍｅ、ＳＢＢＩ４２、５８３０４０８Ｆ０６Ｒｉｋ、Ｂリンパ球活性化因子マクロファージ（発現型）、およびＢＣＭ様膜タンパク質前駆体が含まれる。

ＳＬＡＭＦ８は、受容体またはＢ細胞補助受容体として機能する可能性が高いＩ型原形質膜タンパク質である。ＳＬＡＭＦ８は、いくつかのリンパ組織（リンパ節、脾臓、胸腺、および骨髄が含まれる）ならびにγインターフェロン活性化末梢血単核細胞、接着活性化単球、および樹状細胞サブセット中に発現する。ＳＬＡＭＦ８は、Ｂ細胞系統の関連付け（ｃｏｍｍｉｔｍｅｎｔ）またはＢ細胞受容体シグナル伝達で役割を果たす可能性が高い（Ｋｉｎｇｓｂｕｒｙ ｅｔ ａｌ， Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６６（９）：５６７５−８０（２００１））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２８ ４１ ２０ ８９
予測値 ２２．２５ ４４．５ ２２．２５ ８９
カイ二乗＝２．３５ 有意性＝０．３０８８１９（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２６ 平均同腹仔数＝１０
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＢＣ０２４５８７．１）。
１．野生型発現パネル：骨格筋、骨、および脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６５．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１８８３４２（ＵＮＱ５８９３））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトＳＬＡＭファミリーメンバー８（ＳＬＡＭＦ８）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が低下した変異（−／−）マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。

結果：
血糖値／耐糖能試験：
（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。

これらの研究は、（−／−）マウスが、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ２１７１８ポリペプチド（またはその作用剤）またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および／または種々の心血管障害（糖尿病が含まれる）に関連する病態の治療で有用であろう。

６６．６６．ＤＮＡ１４９９１１−２８８５（ＵＮＱ５９２６）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ１９８２０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１４９９１１−２８８５と示す）（ＵＮＱ５９２６）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿０２６５１６ アクセッション：ＮＭ＿０２６５１６ ＮＩＤ：ｇｉ ２１３１２６５５ ｒｅｆ ＮＭ＿０２６５１６．１ ムス・ムスクルス ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２８１０４１７Ｍ０５遺伝子（２８１０４１７Ｍ０５Ｒｉｋ）；参照タンパク質：Ｑ９ＣＺ１６アクセッション：Ｑ９ＣＺ１６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。２８１０４１７Ｍ０５Ｒｉｋタンパク質；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５２３９０アクセッション：ＮＭ＿１５２３９０ ＮＩＤ：ｇｉ ２２７４８８３４ ｒｅｆ ＮＭ＿１５２３９０．１ ホモ・サピエンス仮説タンパク質ＭＧＣ３３９２６（ＭＧＣ３３９２６）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＮＢＬ３ アクセッション：Ｑ８ＮＢＬ３ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。仮説タンパク質ＰＬＡＣＥ１００４３２２。

目的のマウス遺伝子は、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２８１０４１７Ｍ０５遺伝子（ヒト仮説タンパク質ＭＧＣ３３９２６のオーソログ）である。

仮説タンパク質ＭＧＣ３３９２６は、２９７アミノ酸ポリペプチドであり、シグナルペプチド、３つの潜在的膜貫通セグメント、およびＣ末端付近の潜在的なグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）繋留部位を含む。この仮説タンパク質の予想される機能および細胞中の位置は不明である。バイオインフォマティクス分析により、膜貫通ドメインがクローディン（典型的には密着結合成分として機能する内在性原形質膜タンパク質）（ＴｒＥＭＢＬアクセッションＱ８ＮＢＬ３；ＩｎｔｅｒＰｒｏアクセッションＩＰＲ００６１８７）の膜貫通ドメインと類似すると示唆される。他のバイオインフォマティクス分析により、ヒトタンパク質がＧＰＩアンカーによって原形質膜の細胞外表面に繋留することが示唆される。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １４ ４０ １９ ７３
予測値 １８．２５ ３６．５ １８．２５ ７３
カイ二乗＝２．４２ 有意性＝０．２９８１９７２７（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２９ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿０２６５１６．１）。
１．野生型発現パネル：骨格筋、骨、胃、小腸、および結腸以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６６．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１４９９１１−２８８５（ＵＮＱ５９２６））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト仮説タンパク質（ＭＧＣ３３９２６）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性高熱試験中に不安様応答が増加した。８匹の（−／−）変異マウスのうちの３匹で排便が無かった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。

手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。

結果：
ストレス誘導性高熱：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性高熱に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆された。

まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安、および／または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、ＰＲＯ１９８２０ポリペプチドまたはその作用剤は、このような神経障害の治療で有用であろう。

６６．６７．ＤＮＡ１６８０２８−２９５６（ＵＮＱ６０９８）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ２１２０１ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１６８０２８−２９５６と示す）（ＵＮＱ６０９８）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１７２４１６アクセッション：ＮＭ＿１７２４１６ ＮＩＤ：ｇｉ ２９２９３８３０ ｒｅｆ ＮＭ＿１７２４１６．２ ムス・ムスクルスグレイ致死性大理石骨病（ｇｒｅｙ ｌｅｔｈａｌ 大理石骨病）（Ｇｌ未決定）；参照タンパク質：Ｑ８ＢＧＴ０アクセッション：Ｑ８ＢＧＴ０ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。大理石骨病関連膜貫通タンパク質１前駆体（グレイ致死性タンパク質）；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０１４０２８ アクセッション：ＮＭ＿０１４０２８ ＮＩＤ：ｇｉ ３００２５０２５ ｒｅｆ ＮＭ＿０１４０２８．２ ホモ・サピエンスグレイ致死性大理石骨病（ＧＬ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８６ＷＣ４ アクセッション：Ｑ８６ＷＣ４ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。大理石骨病関連膜貫通タンパク質１前駆体（ＨＳＰＣ０１９）（ＵＮＱ６０９８／ＰＲＯ２１２０１）。

目的のマウス遺伝子は、Ｏｓｔｍ１（大理石骨病関連膜貫通タンパク質１）（ヒトＯＳＴＭ１のオーソログ）である。別名には、ＧＬ、ＧＩＰＮ、ＨＳＰＣ０１９、１２００００２Ｈ１３Ｒｉｋ、グレイ致死性、グレイ致死性大理石骨病、グレイ致死性大理石骨病、およびＧＡＩＰ相互作用タンパク質Ｎ末端が含まれる。

ＯＳＴＭ１は、骨芽細胞、メラノサイト、腎臓、脳、胸腺、脾臓、およびいくつかの他の組織中に発現する推定Ｅ３ユビキチンリガーゼである。このタンパク質は、サイトゾルおよび原形質膜区画（特に、遠位尿細管の側底膜）中に存在する。ＯＳＴＭ１は、Ｇタンパク質αサブユニットｉ３（ＧＮＡＩ３）のユビキチン化を触媒し、したがって、このタンパク質は、プロテアソーム経路を介した分解によってＧタンパク質媒介性シグナル伝達を調節する可能性が高い。ＯＳＴＭ１はまた、破骨細胞およびメラノサイトの成熟化および機能に必要である。ＯＳＴＭ１遺伝子の機能喪失成熟により、ヒトおよびマウスで大理石骨病を発症し、マウスの毛色が欠損する（Ｃｈａｌｈｏｕｂ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｍｅｄ ９（４）：３９５−４０６（２００３）；Ｆｉｓｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ Ｓ Ａ １００（１４）：８２７０−５（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２６ ３９ ２６ ９１
予測値 ２２．７５ ４５．５ ２２．７５ ９１
カイ二乗＝３．１８ 有意性＝０．２０３９２５６１（ｈｏｍ／ｎ）＝０．３１ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１７２４１６．２）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６７．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１６８０２８−２９５６（ＵＮＱ６０９８））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト大理石骨病関連膜貫通タンパク質１（ＯＳＴＭ１）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔よりも顕著に小さいホモ接合体変異マウスが得られた。ノックアウト（−／−）マウスは、発育できず、平均体重が非常に減少し、毛色が灰色であり、歯が無かった。顕微分析により、ホモ接合性変異体で網膜変性、ニューロンの壊死、および大理石骨病が明らかとなった。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＬＰＳ攻撃に対する平均血清ＩＬ−６応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：（−／−）マウスは、著しいびまん性大理石骨病、中等度のびまん性網膜変性、および軽度の多病巣性ニューロン壊死を示した。全ての長骨、脊椎、および胸骨分節の髄腔は、線維性骨小柱で満たされていた。破骨細胞数は増加し、頻繁に、巨大な小胞状核を有していた（活性化していた）。いくつかの領域では、破骨細胞が変性して壊死していた。破骨細胞は、細長く且つ線維芽細胞のようになる傾向があるが、これらも多数存在した。頭蓋中の骨、鼻小柱、および長骨の骨端部は、弱い線維性の骨および小柱を豊富に含んでいた。臼歯は骨基質から萌出することができず、埋伏した切歯の基底部に分散した異形成の歯原組織が存在した。網膜変性は、受容体および外核層に影響を及ぼした。光受容体層に多数のマクロファージが存在した。大脳皮質では、層状構造の（ｌａｍｉｎａｒ）変性およびＩＶ／Ｖニューロン層の壊死／アポトーシスが存在した。同様に、影響を及ぼされたニューロンは、海馬および歯状回にも存在した。全ての変異（−／−）マウスの器官は小さかったが、そのほとんどがマウスの体重に比例していた（（＋／＋）同腹仔の重量の１／２〜１／３）。しかし、胸腺は、より小さい傾向にあった（（＋／＋）同腹仔の重量の約１／１０）。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。

（ｃ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
明白な一般的所見：（−／−）マウスは、小さく、毛色が灰色で歯が無かった。変異体は、その発育の失敗により、死亡したか屠殺した。
体重：（−／−）マウスは、２週間目および４週間目の測定値においてその性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が顕著に減少した。（−／−）マウスの体長のデータは収集していなかったが、肉眼的写真では、（−／−）マウスは、（＋／＋）同胞よりも短いようであった。

したがって、変異（−／−）マウスは、生存能の低下および成長遅延に関連し得る表現型を示した。歯の不在は、臼歯が歯基質から萌出できなかったという病理学的所見と一致する。したがって、ＰＲＯ２１２０１ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および発達に不可欠なようであるのに対して、ＰＲＯ２１２０１ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストはこの負の表現型を模倣するであろう。

（ｄ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
急性期応答：
試験の説明：細菌リポ多糖（ＬＰＳ）は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルＩＬＰＳマウスに、２６ゲージの針を使用して、亜致死量のＬＰＳを含む２００μＬ滅菌生理食塩水を腹腔内（ｉ．ｐ．）注射した。この用量は、注射から３時間後に１μｇ／ｇ体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、１００μＬの血液サンプルを採取し、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置でＴＮＦａ、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６の存在について分析した。
結果：
（＋／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＬＰＳ攻撃に対する平均血清ＩＬ−６応答が増加した。

まとめると、ＬＰＳ内毒素攻撃は、ＰＲＯ２１２０１ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、ＬＰＳ内毒素で攻撃した場合、免疫応答（ＩＬ−６産生）を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。ＩＬ−６は、より後期のＢ細胞活性化に寄与する。ＴＮＦ−αは、重要な炎症メディエーターである。さらに、ＩＬ−６は、急性期応答および全身炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。

６６．６８．ＤＮＡ１５４０９５−２９９８（ＵＮＱ６１１５）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ２００２６ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１５４０９５−２９９８と示す）（ＵＮＱ６１１５）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１３４４３７ アクセッション：ＮＭ＿１３４４３７ ＮＩＤ：ｇｉ ２４０２５６６１ ｒｅｆ ＮＭ＿１３４４３７．１ ムス・ムスクルス（Ｆｇｆ遺伝子の類似発現物）（Ｓｅｆ未決定）；参照タンパク質：Ｑ８ＪＺＬ１ アクセッション：Ｑ８ＪＺＬ１ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。膜貫通タンパク質（インターロイキン１７受容体様タンパク質の長形態（ｌｏｎｇ ｆｏｒｍ））；参照ヒト遺伝子配列：ＡＦ４９４２０８ホモ・サピエンスインターロイキン１７受容体様タンパク質の長形態（ＩＬ１７ＲＬＭ）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＮＦＭ７ アクセッション：Ｑ８ＮＦＭ７ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。インターロイキン１７受容体様タンパク質の長形態。

目的のマウス遺伝子は、Ｉｌ１７ｒｄ（インターロイキン１７受容体Ｄ）（ヒトＩＬ１７ＲＤのオーソログ）である。別名には、Ｓｅｆ、Ｓｅｆ−Ｓ、Ｆｇｆ遺伝子の類似発現物、ＩＬ１７ＲＬＭ、ＦＬＪ３５７５５、ＤＫＦＺｐ４３４Ｎ１９２８、ＦＧＦタンパク質の類似発現物が含まれる。

ＩＬ１７ＲＤは、線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ）シグナル伝達のフィードバック阻害およびアポトーシス調節経路の活性化に関与する受容体またはシグナル伝達分子として機能する可能性が高いＩ型原形質膜タンパク質である。選択的スプライシングによって生成したＩＬ１７ＲＤのより短い細胞質基質イソ型もＦＧＦシグナル伝達を阻害する。ＩＬ１７ＲＤは、ＦＧＦ受容体チロシンリン酸化およびＲＡＳ／ＥＲＫ ＭＡＰキナーゼ経路の遮断によってＦＧＦシグナル伝達を阻害する。ＩＬ１７ＲＤは、ＴＡＫ１／ｃ−Ｊｕｎ Ｎ末端キナーゼ経路の活性化によってアポトーシスを刺激する。ＩＬ１７ＲＤは、血管内皮細胞中、高脈管化組織中（腎臓、結腸、骨格筋、心臓、小腸など）、ならびに腎臓、唾液腺、および精嚢の導管上皮細胞中に発現する。ＩＬ１７ＲＤの細胞質基質形態の発現は、見かけ上より制限される。ＩＬ１７ＲＤは、細胞増殖、細胞の移動、分化、アポトーシス、および血管形成などの過程で役割を果たす可能性が高い（Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７９（３７）：３８０９９−１０２（２００４）；Ｔｏｒｉｉ ｅｔ ａｌ，Ｄｅｖ Ｃｅｌｌ ７（１）：３３−４４（２００４）；Ｐｒｅｇｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ Ｓ Ａ １０１（５）：１２２９−３４（２００４）；Ｘｉｏｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（５０）：５０２７３−８２（２００３）；Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（３５）：３３２３２−８（２００３）；Ｋｏｖａｌｅｎｋｏ ｅｔ ａｌ， Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（１６）：１４０８７−９１（２００３）；Ｆｕｒｔｈａｕｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ４（２）：１７０−４（２００２）；Ｔｓａｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｎａｔ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ４（２）：１６５−９（２００２））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １６ ２５ １４ ５５
予測値 １３．７５ ２７．５ １３．７５ ５５
カイ二乗＝０．２ 有意性＝０．９０４８３７４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２５ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
コードエクソン４をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１３４４３７．１）。
１．野生型発現パネル：胸腺、肝臓、胃、小腸、結腸、および脂肪以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６８．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１５４０９５−２９９８（ＵＮＱ６１１５））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトインターロイキン１７受容体Ｄ（ＩＬ１７ＲＤ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔よりも体重および体長が増加し、総組織マスが増加し、徐脂肪体重が増加した、巨大な雄ホモ接合体変異マウスが得られた。雄（−／−）マウスは、総脂肪マスが増加し、血清トリグリセリドレベルがより低い傾向があった。雄（−／−）マウスはまた、血圧の低下および睾丸萎縮を示した。雄変異体は、耐糖能が増強された。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）心臓学−血圧
試験の説明：Ｖｉｓｉｔｅｃｈ ＢＰ−２０００血圧分析システムによる４日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、４日間にわたって１日１０回測定する。次いで、４日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
血圧：雄（−／−）マウスは、（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血圧が減少した。

（ｃ）表現型解析：代謝−血液化学／耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない：１型および２型糖尿病、症候群Ｘ、種々の心血管疾患、および／または肥満症。

手順：２匹の野生型マウスおよび４匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Ｌｉｆｅｓｃａｎ血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、２０％溶液として２ｇ／ｋｇのＤ−グルコースをＩＰ注射し、注射から０、３０分、６０分、および９０分後に血糖値を測定した。

結果：
経口耐糖能：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能の増加を示した。

これらの研究では、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した３つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強を示した。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感受性の増加またはグルコースホメオスタシス障害の逆の表現型パターンを示した。したがって、ＰＲＯ２００２６ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト（インヒビター）は、グルコースホメオスタシス障害の治療で有用であろう。

（ｄ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、ＰＲＯ２００２６遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ２００２６ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ２００２６ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
（ｅ）骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
ＣＡＴ−スキャンプロトコル：
ＣＴ造影剤であるＯｍｎｉｐａｑｕｅ３００（Ｎｙｃｏｍｅｄ Ａｍｅｒｓｈａｎ，３００ｍｇヨウ素／ｍＬ、０．２５ｍＬ／動物または２．５０〜３．７５ｇヨウ素／ｋｇ体重）をマウスの腹腔内に注射した。約１０分間、ケージ内で安静にさせた後、Ａｖｅｒｔｉｎ（１．２５％２，２，２，−トリブロムエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、ＭｉｃｒｏＣＡＴスキャナー（ＩｍＴｅｋ，Ｉｎｃ．）を使用してＣＡＴスキャンを行った。三次元像を、ＩｍＴｅｋ ３Ｄ ＲＥＣＯＮソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでＦｅｌｄｋａｍｐアルゴリズムによって再構成した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重、および総脂肪マスが増加した。

これらの研究により、変異（−／−）非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことが示唆される。したがって、ＰＲＯ２００２６ポリペプチドまたはその作用剤は、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満症の防止および／または治療で特に重要であろう。
ＣＡＴスキャン：分析した２匹の雄（−／−）マウス（Ｍ−７５およびＭ−１００）は、左精巣が萎縮した。

６６．６９．ＤＮＡ１６６８１９−Ｐ１３８１Ｒ１Ｃ１Ｐ１（ＵＮＱ６１２９）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１６６８１９−１３８１Ｒ１Ｃ１Ｐ１と示す）（ＵＮＱ６１２９）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＮＭ＿１４５８５６ アクセッション：ＮＭ＿１４５８５６ ＮＩＤ：ｇｉ ２２００３９１５ ｒｅｆ ＮＭ＿１４５８５６．１ ムス・ムスクルスインターロイキン１７Ｆ（ＩＬ １７Ｆ）；参照タンパク質：Ｑ８Ｋ４Ｃ３ アクセッション：Ｑ８Ｋ４Ｃ３ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ＩＬ１７Ｆ；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿０５２８７２ ホモ・サピエンスインターロイキン１７Ｆ（ＩＬ１７Ｆ），転写物変異型１；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６ＮＳＩ０ アクセッション：Ｑ６ＮＳＩ０ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。インターロイキン１７Ｆのイソ型１。

目的のマウス遺伝子は、Ｉｌ１７ｆ（インターロイキン１７Ｆ）（ヒトＩＬ１７Ｆのオーソログ）である。別名には、ＭＬ１、ＩＬ−２４、ＭＬ−１、ＩＬ−２４、ＩＬ−２６、ＩＬ−１７Ｆ、サイトカインＭＬ−１、およびインターロイキン２４が含まれる。

ＩＬ１７Ｆは、シグナル伝達リガンドとして機能し、Ｔ細胞ヘルパー１型（Ｔｈ１）応答に典型的な炎症性サイトカインおよびケモカインの産生を刺激するサイトカインである。ＩＬ１７Ｆは、気管支上皮細胞または欠陥内皮細胞中のＩＬ−６、ＩＬ−８、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）、ＩＬ−２、トランスフォーミング増殖因子β、および単球走化性タンパク質１の産生を刺激する（Ｋａｗａｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（１８）：１５２２９−３２（２００２）；Ｓｔａｒｎｅｓ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６７（８）：４１３７−４０（２００１）；Ｎｕｍａｓａｋｅ ｅｔ ａｌ，Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｌｅｔｔ ９５（２）：１７５−８４（２００４）；Ｋａｗａｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ａｌｌｅｒｇｙ Ｃｌｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ １１４（２）：４４４−５０（２００４））。ＩＬ１７Ｆ誘導性サイトカインまたはケモカイン産生のためのシグナル伝達経路は、細胞外シグナル調節キナーゼ（ＥＲＫ）１／２の活性化に関与する可能性が高い（Ｋａｗａｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（１８）：１５２２９−３２（２００２）；Ｋａｗａｇｕｃｈｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ａｌｌｅｒｇｙ Ｃｌｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ １１４（２）：４４４−５０（２００４））。ＩＬ１７Ｆは、血管形成の阻害（Ｓｔａｒｎｅｓ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６７（８）：４１３７−４０（２００１）、好中球増加症の誘導、および抗原誘導性アレルギー反応の増幅（Ｏｄａ ｅｔ ａｌ，Ａｍ Ｊ Ｒｅｓｐｉｒ Ｃｒｉｔ Ｃａｒｅ Ｍｅｄ １７１（１）：１２−１８（２００４））で役割を果たす。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２０ ４０ １８ ７８
予測値 １９．５ ３９ １９．５ ７８
カイ二乗＝９．６５ 有意性＝０．００８０２６５５５（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１８ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１および２をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＮＭ＿１４５８５６．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、胸腺、脾臓、および腎臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．６９．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１６６８１９−Ｐ１３８１Ｒ１Ｃ１Ｐ１（ＵＮＱ６１２９））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒトインターロイキン１７Ｆ（ＩＬ１７Ｆ）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスの不安関連応答が増加した。さらに、変異（−／−）マウスは、平均血清ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、およびＩｇＧ３レベルが増加し、平均体重および体長が増加し、骨中無機質密度の測定値の増加を伴って総組織マス、除脂肪体重、および総体脂肪率が増加した。（−／−）マウスは、平均小柱の体積、数、および連結性が増加した。（−／−）マウスはまた、コレステロールおよびトリグリセリドレベルが上昇する傾向が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行の範囲内の（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、およびＩｇＧ３レベルが増加した。

変異（−／−）マウスは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａ、およびＩｇＧ３血清免疫グロブリンが上昇した。これらの免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。認められた表現型により、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドが炎症反応の負の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドが免疫系を刺激に有用であり、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドまたはその作用剤は、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
結果：
ストレス誘導性高熱：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性高熱に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆された。

まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安、および／または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドまたはその作用剤は、このような神経障害の治療で有用であろう。

（ｄ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：雄および雌（−／−）マウスの両方は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルが増加した。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、ＰＲＯ２０１１０遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。

（ｅ）骨代謝および身体診断
（１）組織マスおよび除脂肪体重の測定−Ｄｅｘａ
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、総組織マス（ＴＴＭ）の変化を首尾よく同定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
身体測定（体長および体重）：
身体測定：約１６週齢で体長および体重の測定を行った。
結果：
体重および体長：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が増加した。

（２）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果：
ＤＥＸＡ：雄および雌の（−／−）マウスの両方は、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較した場合、平均総組織マスが増加した。雄変異体はまた、平均除脂肪体重、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加し、雌変異体は、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
マイクロＣＴ：雄（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱の体積、数、および連結性が増加した。

ＤＥＸＡおよび骨マイクロＣＴ分析によって分析した（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、大理石骨病などの異常な骨障害が示唆された。しかし、変異（−／−）マウスはまた、体重および体長、総組織マス、および除脂肪体重が増加した。雌（−／−）マウスはまた、平均体脂肪率および脂肪量が増加し、肥満症が示唆された。これらの所見により、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こすが、大理石骨病を反映する異常な骨測定値も得られる。したがって、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドまたはその作用剤は、大理石骨病などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。さらに、ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドは、正常な脂質代謝の維持で有用であろう。肥満症、高コレステロール血症、および高トリグリセリド血症の治療でも有用である。ＰＲＯ２０１１０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト（またはインヒビター）は、異常または病的な骨障害（異常な骨代謝に関連する炎症性障害が含まれる）を引き起こすであろう。

６６．７０．ＤＮＡ１８５１７１−２９９４（ＵＮＱ６５０７）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ２３２０３ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１８５１７１−２９９４と示す）（ＵＮＱ６５０７）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＡＫ０５２９８１ムス・ムスクルス１５日胚頭部ｃＤＮＡ、ＲＩＫＥＮ全長富化ライブラリー、クローン：Ｄ９３０００７Ｌ０６産物：腫瘍抑制因子ＰＨＹＤＥの少しの類似物（ラッタス・ノルヴェギクス（Ｒａｔｔｕｓ ｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ））、全インサート配列；参照タンパク質：Ｑ８ＢＷＢ６アクセッション：Ｑ８ＢＷＢ６ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。ムス・ムスクルス１５日胚頭部ｃＤＮＡ、ＲＩＫＥＮ全長富化ライブラリー、クローン：Ｄ９３０００７Ｌ０６産物：腫瘍抑制因子ＰＨＹＤＥの少しの類似物；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１５２９９９アクセッション：ＮＭ＿１５２９９９ ＮＩＤ：ｇｉ ２５０９２６００ ｒｅｆ ＮＭ＿１５２９９９．２ホモ・サピエンス前立腺の６回膜貫通上皮抗原２（ＳＴＥＡＰ２）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ８ＮＦＴ２ アクセッション：Ｑ８ＮＦＴ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。前立腺の６回膜貫通上皮抗原２。

目的のマウス遺伝子は、Ｓｔｅａｐ２（前立腺の６回膜貫通上皮抗原２）（ヒトＳＴＥＡＰ２のオーソログ）である。別名には、ＳＴＭＰ、ＩＰＣＡ１、ＩＰＣＡ １、ＳＴＡＭＰ１、ＰＣＡＮＡＰ１、４９２１５３８Ｂ１７Ｒｉｋ、前立腺癌関連遺伝子１、６回膜貫通前立腺タンパク質、前立腺癌関連タンパク質１、および前立腺の６回膜貫通タンパク質１が含まれる。

ＳＴＥＡＰ２は、主に原形質膜およびトランスゴルジ網に存在するが、細胞質ゾル小胞細管構造およびエンドソーム中にも存在する内在性膜タンパク質である。このタンパク質は、ＮＡＤＰＨオキシダーゼファミリーメンバーおよびＴｅｄＺ細菌オキシドレダクターゼファミリーメンバーの６ＴＭヘム結合ドメインと構造が類似した６回膜貫通（６ＴＭ）ドメインを含む。ＳＴＥＡＰ２発現は、前立腺上皮中で高いが、他の組織（心臓、脳、腎臓、膵臓、および卵巣など）中で検出可能である。ＳＴＥＡＰ２は、ゴルジ装置から原形質膜への小胞輸送または分泌調節で役割を果たし得る。ＳＴＥＡＰ２発現が一般に正常な前立腺上皮細胞中よりも前立腺癌中で高いので、ＳＴＥＡＰ２はまた、前立腺癌の発症または進行で役割を果たし得る（Ｋｏｒｋｍａｚ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７（３９）：３６６８９−９６（２００２）；Ｐｏｒｋｋａ ｅｔ ａｌ，Ｌａｂ Ｉｎｖｅｓｔ ８２（１１）：１５７３−８２（２００２）；Ｓａｎｃｈｅｚ Ｐｕｌｉｄｏ ｅｔ ａｌ，ＢＭＣ Ｃａｎｃｅｒ ４（１）：９８（２００４））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 ２０ ４２ ２０ ８２
予測値 ２０．５ ４１ ２０．５ ８２
カイ二乗＝０．４３ 有意性＝０．８０６５４１４４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．２７ 平均同腹仔数＝８
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１の前のエクソンおよびコードエクソン１をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＡＫ０５２９８１．１）。
１．野生型発現パネル：胚性幹（ＥＳ）細胞およびＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．７０．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１８５１７１−２９９４（ＵＮＱ６５０７））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト前立腺の６回膜貫通上皮抗原２（ＳＴＥＡＰ２）のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オボアルブミン攻撃に対する平均血清ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａ応答が増加したホモ接合体変異マウスが得られた。さらに、雌（−／−）マウスは、日周期リズム試験中に不安が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。
卵白アルブミン攻撃
手順：このアッセイは、７匹の野生型および８匹のホモ接合体マウスにおいて行った。ニワトリ卵白アルブミン（ＯＶＡ）は、Ｔ細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。ＯＶＡは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。ＯＶＡに対するマウスの免疫応答は、Ｔ細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗ＯＶＡ抗体を、免疫処置の８〜１０日後に酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＺＡ）を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。

上記のように、このプロトコルは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力を評価する。動物に５０ｍｇのニワトリ卵白アルブミン（完全フロイントアジュバント中に乳化）をＩＰ注射し、１４日後に、抗卵白アルブミン抗体（ＩｇＭ、ＩｇＧ１およびＩｇＧ２サブクラス）の血清力価を測定した。血清試料中のＯＶＡ特異的抗体の量は、９６ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度（ＯＤ）値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。

この攻撃の結果：
卵白アルブミン：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、卵白アルブミン攻撃に対する平均血清ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａ応答の増加を示した。

まとめると、卵白アルブミン攻撃研究は、ＰＲＯ２３２０３ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異マウスは、Ｔ細胞依存性ＯＶＡ抗原で攻撃した場合、免疫学的応答を誘発する能力の低下を示した。したがって、ＰＲＯ２３２０３ポリペプチドのアンタゴニスト（インヒビター）は、免疫系の刺激に有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ２３２０３ポリペプチドまたはその作用剤は、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（ｃ）表現型解析：ＣＮＳ／神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害（抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる）の治療のためのｉｎ ｖｉｖｏでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない：軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害（Ｉ型またはＩＩ型）、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない：偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順：
４匹の野生型マウス、４匹のヘテロ接合体変異マウス、および８匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、１２週齢と１６週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明：
雌マウスを、試験初日の午後４時に４８．２ｃｍ×２６．５ｃｍのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前７時に照明をつけ、午後７時に照明を消す１２時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数（ビームが自動的に歩行に妨害される）を記録する。活動を、３日間の試験中に１時間間隔で６０秒間記録する。得られたデータを、３日間の試験期間にわたって各時間（日周期リズム）について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値（自発運動）によって表示した。

結果：
日周期：雌（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均の数と比較した場合、１２時間の馴化期間および両暗期に歩行回数の中央値が増加した。

ホームケージ活動性試験中のこれらの所見は、活動亢進および不安の増加を示し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および全般性不安障害などの神経障害と一致する。

６６．７１．ＤＮＡ１７１７３２−３１００（ＵＮＱ９５７４）遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子（ＤＮＡ１７１７３２−３１００と示す）（ＵＮＱ９５７４）を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す：変異マウス遺伝子は、以下に対応する：参照ヌクレオチド：ＸＭ＿１２８００１（推定）：ムス・ムスクルス ＧＰＩ繋留ＨＤＬ結合タンパク質１（Ｇｐｉｈｂｐ１）；参照タンパク質：Ｑ９Ｄ１Ｎ２ アクセッション：Ｑ９Ｄ１Ｎ２ ＮＩＤ：ムス・ムスクルス（マウス）。１１１０００２Ｊ１９ＲＩＫ ＰＲＯＴＥＩＮ；参照ヒト遺伝子配列：ＮＭ＿１７８１７２ ホモ・サピエンス高密度リポタンパク質結合タンパク質（ＬＯＣ３３８３２８）；ヒトタンパク質配列は、以下に対応する：参照：Ｑ６Ｐ３Ｔ２ アクセッション：Ｑ６Ｐ３Ｔ２ ＮＩＤ：ホモ・サピエンス（ヒト）。高密度リポタンパク質結合タンパク質。

目的のマウス遺伝子は、Ｇｐｉｈｂｐ１（ＧＰＩ繋留ＨＤＬ結合タンパク質１）（ヒト「高密度リポタンパク質結合タンパク質」のオーソログ）である。別名には、ＧＰＩ−ＨＢＰ１および１１１０００２Ｊ１９Ｒｉｋが含まれる。

Ｇｐｉｈｂｐ１は高密度リポタンパク質結合タンパク質として機能するグリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）繋留細胞外膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、酸性領域、リンパ球抗原ファミリーの間で高度に保存されるＬｙ−６ドメイン、および疎水性Ｃ末端領域を含む。Ｇｐｉｈｂｐ１は、選択的脂質取り込みを媒介することができるが、コレステロール流出を媒介するこはできない。Ｇｐｉｈｂｐ１は、肝臓のクッパー細胞、肝臓の類洞上皮（ｓｉｎｕｓｏｉｄａｌ ｅｐｉｔｈｅｌｉｕｍ）、心筋細胞、気管支上皮細胞、および歯槽マクロファージ中で発現し、ＨＤＬコレステロールの初期取り込みで役割を果たす可能性が高い（Ｉｏｋａ ｅｔ ａｌ，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８（９）：７３４４−９（２００３））。

ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ由来の胚性幹（ＥＳ）細胞で行った。キメラマウスを、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊアルビノマウスと交配してＦ１ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してＦ２野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、Ｆ１マウスがキメラからほとんど得られない場合、Ｆ１ヘテロ接合体マウスを、１２９ＳｖＥｖ^Ｂｒｄ／Ｃ５７ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してＦ２マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルＩ表現型解析を行う。

野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 １４ ５８ １４ ８６
予測値 ２１．５ ４３ ２１．５ ８６
カイ二乗＝１３．９７ 有意性＝９．２５６６３１６Ｅ ４（ｈｏｍ／ｎ）＝０．１８ 平均同腹仔数＝９
変異情報
変異型：相同組換え（標準）
説明：コードエクソン１〜４をターゲティングした（ＮＣＢＩアクセッションＢＣ０６１２２５）。
１．野生型発現パネル：脳、眼、骨格筋、および骨以外のＲＴ−ＰＣＲによって試験した１３個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
２．ＱＣ発現：標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

６６．７１．１．表現型解析（破壊遺伝子：ＤＮＡ１７１７３２−３１００（ＵＮＱ９５７４））
（ａ）全体的な表現型の概要：
ヒト「高密度リポタンパク質結合タンパク質」のオーソログをコードする遺伝子の変異により、（−／−）マウスに脂肪血症が生じた。血液化学の測定値および顕微分析により、ホモ接合体変異マウスが顕著に脂肪血症を示すことが明らかとなった。変異体における非常に増加した血清脂質濃度は、いくつかの他のレベル１パラメータ（総ビリルビンの測定値ならびに眼底および血管造影図の分析が含まれる）に影響を与えた。さらに、ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均の測定値と比較した場合、貧血性および免疫学的異常の徴候を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。

（ｂ）病理学
顕微鏡的：試験した６匹の（−／−）マウスのうち、４匹が剖検において顕著な抗し失血症が示した。組織病理学により、散在性血管中の淡色染色無細胞物質量の増加が明らかとなった。４匹の脂質血症の（−／−）マウスでは、副腎の束状帯中の全細胞の細胞質のみが顕著な組織病理学的変化を示し、これは、これらの細胞中の脂質／コレステロール取り込みまたは代謝と一致する。正常組織中のこれらの細胞に典型的な正常な微小血管化細胞質の代わりに、これらの細胞の細胞質は、高脂質血症マウスにおいて微小空胞を欠いた。その代わり、変異体における束状帯の細胞質は、不規則に細かい顆粒状且つ好酸性を示し、これは、これらの細胞中の脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化と一致するであろう。
遺伝子発現：ＬａｃＺ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。

（ｃ）心血管表現型解析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。１つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比（Ａ／Ｖ比）を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なＡ／Ｖ比は、高血圧の血管疾患（および高血圧を引き起こす任意の疾患（例えば、アテローム性動脈硬化症））、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない：網膜の異常は、以下である：網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞；網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。

手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで試験した。Ｈａｗｅｓ ａｎｄ ｃｏａｕｔｈｏｒｓ（Ｈａｗｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９９９ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｖｉｓｉｏｎ １９９９；５：２２）にしたがって修正したＫｏｗａ Ｇｅｎｅｓｉｓ小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈（Ａ／Ｖ）比を決定した。

上記プロトコルを使用して、作製したＦ２野生型、ヘテロ接合体、およびホモ接合体変異子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Ｋｏｗａ ＣＯＭＩＴ＋ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってＡ／Ｖ比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比（Ａ／Ｖ）は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である（血管の分岐前に測定する）。多くの疾患（すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常（網膜変性（色素性網膜炎として公知）など）、網膜の形成異常、視覚問題、または失明）がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型（＋／＋）同腹仔と比較してホモ接合体（−／−）およびヘテロ接合体（＋／−）変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果：
眼底：（−／−）マウスは全て、桃色の半透明のの網膜血管を示した。眼底顕微鏡下で血流を観察することができ、変異体における網膜脈管構造の異常が示唆される。血管造影図：（−／−）マウスの主な網膜脈管構造を、フルオレセイン色素投与前の青色光の照明を用いて明確に視覚化することができ、変異マウスの血液中に既存の蛍光物質の増加が示唆される。フルオレセイン色素の投与後、（−／−）マウスとその（＋／＋）同腹仔との間に顕著な相違は認められなかった。

（ｄ）免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。

これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系／生物学的経路に関与するが、１つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程／経路の拮抗作用または有益な過程／経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。

Ｔリンパ球（Ｔ細胞）は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。Ｔ細胞は、主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のＭＨＣ分子と共に提示することができる。Ｔ細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。Ｔ細胞には、ヘルパーＴ細胞および細胞傷害性Ｔ細胞が含まれる。ヘルパーＴ細胞は、抗原提示細胞上の抗原−ＭＨＣ複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーＴ細胞はまた、Ｂ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン（すなわち、リンフォカイン）を分泌する。

多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ，１９９４，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患（関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、乾癬、および喘息など）、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。

免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子（直接または抗体作用剤の使用を介したタンパク質）を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。

以下の試験を行った。

（１）血液学
試験の説明：Ａｂｂｏｔｔ’ｓ Ｃｅｌｌ Ｄｙｎ ３５００Ｒ（自動化血液学分析器）によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、白血球５分類が含まれる。「患者」報告は、全部で２２のパラメータを対象とすることができる。
結果：
血液学：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均絶対好中球数が増加し、平均絶対リンパ球数が減少した。（−／−）マウスはまた、平均赤血球数が減少し、平均ヘマトクリットレベルが減少した。さらに、（−／−）マウスは、平均血球体積、平均血球ヘモグロビン、平均血球ヘモグロビン濃度、および赤血球の分布幅が増加し、このことにより、変異マウス中の赤血球がサイズ変動が増加した正常マウスよりも少し大きいことが示唆される。

これらの結果は、貧血性に関連する表現型に関連する。したがって、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、その作用剤、またはＰＲＯ３５３５０ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球産生に不可欠なはずであり、そのようなものとして、貧血性または低ヘマトクリットに関連する血液障害の治療で有用であろう。

（２）急性期応答：
試験の説明：細菌リポ多糖（ＬＰＳ）は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルＩＬＰＳマウスに、２６ゲージの針を使用して、亜致死量のＬＰＳを含む２００μＬ滅菌生理食塩水を腹腔内（ｉ．ｐ．）注射した。この用量は、注射から３時間後に１μｇ／ｇ体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、１００μＬの血液サンプルを採取し、ＦＡＣＳＣａｌｉｂｕｒ装置でＴＮＦａ、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−６の存在について分析した。
結果：
急性期応答：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ＬＰＳ攻撃に対する平均血清ＩＬ−６応答が顕著に増加した。

まとめると、ＬＰＳ内毒素攻撃は、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、ＬＰＳ内毒素で攻撃した場合、免疫応答（ＩＬ−６産生）を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。ＩＬ−６は、より後期のＢ細胞活性化に寄与する。ＴＮＦ−αは、重要な炎症メディエーターである。さらに、ＩＬ−６は、急性期応答および全身炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。したがって、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、免疫応答の負の調節因子として機能する。
（３）血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ：
Ｃｙｔｏｍｅｔｒｉｃ Ｂｅａｄ Ａｒｒａｙ（ＣＢＡ）キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、１つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。６未満のいかなる値も有意ではない。
結果：
Ｓｅｒｕｍ Ｉｍｍ．２：（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔、プロジェクト実行の範囲内の（＋／＋）マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清ＩｇＭレベルが増加した。

変異（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較してＩｇＭ血清免疫グロブリンが上昇した。ＩｇＭ免疫グロブリンは、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において最初に産生され、補体系の活性化に特に重要である。変異（−／−）マウスはまた、その性別一致（＋／＋）同腹仔と比較してＩｇＧ３血清免疫グロブリンが上昇した。これらの免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。認められた表現型により、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが炎症反応の負の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのインヒビター（アンタゴニスト）が免疫系（Ｔ細胞増殖など）を刺激することができ、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者（ＡＩＤＳ患者など）などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは作用剤は、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。

（ｅ）表現型解析：心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症（高コレステロール（高コレステロール血症）および血清トリグリセリドの上昇（高トリグリセリド血症）など）、糖尿病、および／または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。血中脂質レベルの測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う：アルカリホスファターゼ；アラニンアミノトランスフェラーゼ；アルブミン；ビリルビン；リン；クレアチニン；ＢＵＮ＝血中尿素窒素；カルシウム；尿酸；ナトリウム；カリウム；および塩化物。
血中脂質および血液化学の結果
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および／または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、ＣＯＢＡＳ Ｉｎｔｅｇｒａ ４００（ｍｆｒ：Ｒｏｃｈｅ）を使用して測定値を記録した。

結果：
血液化学：雄および雌（−／−）マウスの両方は、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベル（平均より１１標準偏差を超えて高い）および平均血清トリグリセリドレベル（平均より約２１４標準偏差高い）が非常に増加した。アルカリホスファターゼレベルはまた、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総ビリルビン（正常の約２９倍）と同様に上昇し、カルシウムレベルは減少した（平均より８標準偏差低い）。

上記をまとめると、（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、ＰＲＯ３５２５０遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはその作用剤は、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および／または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。

（−／−）マウスは、平均血清カルシウム、ナトリウム、および塩化物レベルが顕著に減少した。（−／−）マウスはまた、平均血清ビリルビンレベルが増加したが、わずかな脂質症の存在でさえもビリルビン測定値の信頼性に影響を与えることが公知であるので、変異サンプルにおける顕著な脂質血症によってこの読み取りが歪められ得る。ナトリウムおよび塩化物レベルの減少は、電解質の不均衡を示す。平均血清カルシウムレベルの減少は、上記のアルカリホスファターゼ活性の増加を示し得る。
（ｆ）骨代謝：放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのＤＥＸＡ
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロＣＴ。
Ｄｅｘａ解析−試験の説明：
手順：４匹の野生型、４匹のヘテロ接合体、および８匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーＸ線吸収測定法（ＤＥＸＡ）を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量（ＢＭＣ）、ＢＭＣ／ＬＢＭ比、容積測定骨中無機質密度（ｖＢＭＤ）、全身ＢＭＤ、大腿骨ＢＭＤ、および脊椎骨ＢＭＤを測定した。

マウスを、アベルチン（１．２５％２，２，２−トリブロモエタノール、２０ｍＬ／ｋｇ体重）の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、ＤＥＸＡスキャンのために、マウスをＰＩＸＩｍｕｓＴＭデンシトメータ（Ｌｕｎａｒ Ｉｎｃ．）のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Ｌｕｎａｒ ＰＩＸＩｍｕｓソフトウェアを使用して、関心領域（ＲＯＩ）（すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨）中の骨中無機質密度（ＢＭＤ）、脂肪組成（脂肪率）、および総組織マス（ＴＴＭ）を決定した。
骨マイクロＣＴ分析：
手順：マイクロＣＴも使用して、非常に高感度のＢＭＤ測定を行った。１つの脊椎骨および１つの大腿骨を、４匹の野生型マウスおよび８匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第５腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μＣＴ４０スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。１６μｍの分解能で第５腰椎（ＬＶ５）における骨小柱パラメータを分析し、２０μｍの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果：
マイクロＣＴ：（−／−）マウスは、その性別一致（＋／＋）同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱数および連結性が増加した。

骨マイクロＣＴ分析によって分析した（−／−）マウスは、その（＋／＋）同腹仔と比較した場合、骨測定値が増加し、大理石骨病などの異常な骨障害が示唆された。これらの所見により、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、代謝障害（大理石骨病を反映する異常な骨測定値）を引き起こす。したがって、ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはその作用剤は、大理石骨病などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト（またはインヒビター）は、異常または病的な骨障害（異常な骨代謝に関連する炎症性障害が含まれる）を引き起こすであろう。

実施例６７：ハイブリダイゼーションプローブとしてのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の使用
下記の方法は、ハイブリダイゼーションプローブとしてのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の使用を記載したものである。

本明細書に開示した完全長または成熟ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのコード配列を含むＤＮＡを、ヒト組織ｃＤＮＡライブラリーまたはヒト組織ゲノムライブラリーにおいて相同なＤＮＡ（例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの天然に存在するバリアントをコードするものなど）をスクリーニングするためのプローブとして使用する。

いずれかのライブラリーＤＮＡを含むフィルターのハイブリダイゼーションおよび洗浄は、下記の高ストリンジェンシー条件下で行う。放射能標識されたＰＲＯ６９１２２−、ＰＲＯ２０４−、ＰＲＯ２１４−、ＰＲＯ２２２−、ＰＲＯ２３４−、ＰＲＯ２６５−、ＰＲＯ３０９−、ＰＲＯ３３２−、ＰＲＯ３４２−、ＰＲＯ３５６−、ＰＲＯ５４０−、ＰＲＯ６１８−、ＰＲＯ９４４−、ＰＲＯ９９４−、ＰＲＯ１０７９−、ＰＲＯ１１１０−、ＰＲＯ１１２２−、ＰＲＯ１１３８−、ＰＲＯ１１９０−、ＰＲＯ１２７２−、ＰＲＯ１２８６−、ＰＲＯ１２９５−、ＰＲＯ１３０９−、ＰＲＯ１３１６−、ＰＲＯ１３８３−、ＰＲＯ１３８４−、ＰＲＯ１４３１−、ＰＲＯ１４３４−、ＰＲＯ１４７５−、ＰＲＯ１４８１−、ＰＲＯ１５６８−、ＰＲＯ１５７３−、ＰＲＯ１５９９−、ＰＲＯ１６０４−、ＰＲＯ１６０５−、ＰＲＯ１６９３−、ＰＲＯ１７５３−、ＰＲＯ１７５５−、ＰＲＯ１７７７−、ＰＲＯ１７８８−、ＰＲＯ１８６４−、ＰＲＯ１９２５−、ＰＲＯ１９２６−、ＰＲＯ３５６６−、ＰＲＯ４３３０−、ＰＲＯ４４２３−、ＰＲＯ３６９３５−、ＰＲＯ４９７７−、ＰＲＯ４９７９−、ＰＲＯ４９８０−、ＰＲＯ４９８１−、ＰＲＯ５８０１−、ＰＲＯ５９９５−、ＰＲＯ６００１−、ＰＲＯ６０９５−、ＰＲＯ６１８２−、ＰＲＯ７１７０−、ＰＲＯ７１７１−、ＰＲＯ７４３６−、ＰＲＯ９９１２−、ＰＲＯ９９１７−、ＰＲＯ３７３３７−、ＰＲＯ３７４９６−、ＰＲＯ１９６４６−、ＰＲＯ２１７１８−、ＰＲＯ１９８２０−、ＰＲＯ２１２０１−、ＰＲＯ２００２６−、ＰＲＯ２０１１０−、ＰＲＯ２３２０３−またはＰＲＯ３５２５０由来プローブのフィルターへのハイブリダイゼーションは、５０％ホルムアミド、５×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、０．１％ピロリン酸ナトリウム、５０ｍＭリン酸ナトリウム、ｐＨ６．８、２×デンハルト溶液および１０％硫酸デキストランの溶液中、４２℃で２０時間行われる。フィルターの洗浄は、０．１×ＳＳＣおよび０．１％ＳＤＳの水溶液中、４２℃で行う。

次いで、完全長の天然配列ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡと所望の配列同一性を有するＤＮＡを、当該技術分野で知られた標準的な技術を用いて同定し得る。

実施例６８：大腸菌におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の発現
この実施例は、大腸菌内での組換え発現によるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの非グリコシル化形態の調製を示す。

最初に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードするＤＮＡ配列を、選択したＰＣＲプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位を含む必要がある。さまざまな発現ベクターを使用し得る。好適なベクターの一例は、アンピリシンおよびテトラサイクリン耐性遺伝子を含むｐＢＲ３２２（大腸菌由来；Ｂｏｌｉｖａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅ，２：９５（１９７７）を参照）である。ベクターを制限酵素で消化し、脱ホスホリル化する。ＰＣＲ増幅された配列を、次いで、ベクター内にライゲートする。ベクターは、好ましくは、抗生物質耐性遺伝子、ｔｒｐプロモーター、ポリｈｉｓリーダー（最初の６つのＳＴＩＩコドン、ポリｈｉｓ配列およびエンテロキナーゼ切断部位を含む）、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０コード領域、λ転写ターミネータ、ならびにａｒｇＵ遺伝子をコードする配列を含む。

次いで、ライゲーション混合物を用い、選択した大腸菌系統をＳａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．（前出）に記載の方法を用いて形質転換する。形質転換体を、ＬＢプレート上でのその生育能力によって同定し、次いで抗生物質耐性コロニーを選択する。プラスミドＤＮＡを、制限解析によって単離し、ＤＮＡ配列決定によって確認し得る。

選択されたクローンは、液体培養培地（例えば、抗生物質を加えたＬＢブロスなど）中で一晩培養し得る。一晩培養物は、続いて大規模培養物にイノキュレートするために使用され得る。次いで、細胞を所望の光学密度まで培養し、この間に発現プロモーターが作動する。

細胞をさらに数時間培養した後、細胞を、遠心分離によって回収し得る。遠心分離によって得られた細胞ペレットを、当該技術分野で知られた種々の薬剤を用いて可溶化し得、可溶化されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０タンパク質を、次いで、金属キレートカラムを用い、タンパク質の強固な結合を可能にする条件下で精製し得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０は大腸菌においてポリ−Ｈｉｓタグ化された形態で、下記の手順を用いて発現させ得る。最初に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０をコードするＤＮＡを、選択したＰＣＲプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位、ならびに効率的で信頼性のある翻訳の開始、金属キレートカラム上での速やかな精製およびエンテロキナーゼによるタンパク質分解的除去をもたらすのに有用な他の配列を含む。次いで、ＰＣＲ増幅されたポリ−Ｈｉｓタグ化配列を発現ベクター内にライゲートし、これを用いて菌株５２（Ｗ３１１０ｆｕｈＡ（ｔｏｎＡ）ｌｏｎ ｇａｌＥ ｒｐｏＨｔｓ（ｈｔｐＲｔｓ）ｃｌｐＰ（ｌａＩｑ）系の大腸菌宿主を形質転換する。形質転換体を、まず、５０ｍｇ／ｍＬのカルベニシリンを含有するＬＢ中にて３０℃で、振とうさせながら３〜５のＯ．Ｄ．６００が達成されるまで培養する。次いで、培養物をＣＲＡＰ培地（３．５７ｇの（ＮＨ_４）_２ＳＯ_４、０．７１ｇのクエン酸ナトリウム・２Ｈ２Ｏ、１．０７ｇのＫＣｌ、５．３６ｇのＤｉｆｃｏ製酵母抽出物、５．３６ｇのＳｈｅｆｆｉｅｌｄ ｈｙｃａｓｅ ＳＦ（５００ｍＬの水中）、ならびに１１０ｍＭのＭＰＯＳ、ｐＨ７．３、０．５５％（ｗ／ｖ）のグルコースおよび７ｍＭのＭｇＳＯ_４を混合することにより調製）中で５０〜１００倍に希釈し、およそ２０〜３０時間３０℃で、振とうさせながら培養する。試料を取り出し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ解析によって発現を確認し、バルク培養物を遠心分離して細胞をペレット化する。細胞ペレットは、精製およびリフォールディングまで凍結しておく。

０．５〜１Ｌの発酵物からの大腸菌ペースト（６〜１０ｇのペレット）を１０容量（ｗ／ｖ）で７Ｍグアニジン、２０ｍＭ Ｔｒｉｓ（ｐＨ８）バッファー中に再懸濁する。固形亜硫酸ナトリウムおよび四チオン酸ナトリウムを、それぞれ、終濃度が０．１Ｍおよび０．０２Ｍとなるように添加し、溶液を一晩４℃で攪拌する。この工程により、すべてのシステイン残基がスルフィトリル化（ｓｕｌｆｉｔｏｌｉｚａｔｉｏｎ）によってブロックされた変性タンパク質がもたらされる。この溶液を４０，０００ｒｐｍで、Ｂｅｃｋｍａｎ超遠心分離機にて３０分間遠心分離する。上清みを３〜５容量の金属キレートカラムバッファー（６Ｍグアニジン、２０ｍＭ Ｔｒｉｓ、ｐＨ７．４）で希釈し、０．２２ミクロンフィルターに通して濾過して清澄化する。清澄化された抽出物を、金属キレートカラムバッファー中で平衡化した５ｍＬ容Ｑｉａｇｅｎ Ｎｉ−ＮＴＡ金属キレートカラム上に負荷する。カラムを５０ｍＭイミダゾール（Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ，Ｕｔｒｏｌグレード）を含有するさらなるバッファー（ｐＨ７．４）で洗浄する。タンパク質を、２５０ｍＭイミダゾールを含有するバッファーで溶出する。所望のタンパク質を含む画分をプールし、４℃で保存する。タンパク質濃度を、そのアミノ酸配列に基づいて計算された消衰係数を用い、２８０ｎｍにおけるその吸光度によって推定する。

タンパク質を、２０ｍＭ Ｔｒｉｓ（ｐＨ８．６）、０．３Ｍ ＮａＣｌ、２．５Ｍの尿素、５ｍＭのシステイン、２０ｍＭのグリシンおよび１ｍＭ ＥＤＴＡからなる新たに調製したリフォールディングバッファー中に試料をゆっくり希釈することによりリフォールディングさせる。リフォールディング容量は、最終タンパク質濃度が５０〜１００マイクログラム／ｍＬとなるように選択される。リフォールディング溶液は、１２〜３６時間４℃で穏やかに攪拌する。リフォールディング反応を、終濃度０．４％（およそ３のｐＨ）までＴＦＡを添加することによってクエンチする。タンパク質のさらなる精製の前に、溶液を０．２２ミクロンフィルターに通して濾過し、アセトニトリルを２〜１０％の終濃度まで添加する。リフォールディングさせたタンパク質をＰｏｒｏｓ Ｒ１／Ｈ逆相カラム上で、０．１％ＴＦＡの移動相バッファーを用い、１０〜８０％のアセトニトリルの勾配での溶出を伴ってクロマトグラフィー処理する。Ａ２８０吸光度を有する画分のアリコートをＳＤＳポリアクリルアミドゲル上で解析し、均質なリフォールディングタンパク質を含む画分をプールする。一般的に、大部分のタンパク質が適正にリフォールディングされた種は、その疎水性内部が最も緻密であり、逆相樹脂との相互作用から遮断されるため、最低濃度のアセトニトリルで溶出される。凝集した種は、通常、より高いアセトニトリル濃度で溶出される。ミスフォールド形態のタンパク質を所望の形態から分離することに加え、逆相工程ではまた、内毒素を試料から除去する。

フォールドされた所望のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを含む画分をプールし、アセトニトリルを、溶液に指向した穏やかな窒素流を用いて除去する。透析によって、または構築バッファー中で平衡化したＧ２５ Ｓｕｐｅｒｆｉｎｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）樹脂を用いたゲル濾過によって、０．１４Ｍの塩化ナトリウムおよび４％マンニトールを含む２０ｍＭ Ｈｅｐｅｓ（ｐＨ６．８）中にタンパク質を構築し、滅菌濾過する。

実施例６９： 哺乳動物細胞におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の発現
この実施例は、哺乳動物細胞内での組換え発現によるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの潜在的にグリコシル化された形態の調製を示す。

ベクターｐＲＫ５（ＥＰ３０７，２４７（１９８９年３月１５日公開）を参照のこと）を発現ベクターとして使用する。任意選択で、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ ＤＮＡをｐＲＫ５内に、選択した制限酵素を用いてライゲートし、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．（前出）に記載のものなどのライゲーション方法を用いてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ ＤＮＡの挿入を可能にする。得られたベクターをｐＲＫ５−ＰＲＯ６９１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２６５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３３２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３４２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５４０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９４４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１０７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１３８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１９０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２７２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２８６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３１６、ｐＲＫ５−ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４７５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５６８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５７３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５９９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６９３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７８８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１８６４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４３３０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４４２３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３６９３５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５８０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５９９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６００１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６０９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７４３６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７３３７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７４９６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９６４６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１７１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９８２０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１２０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２００２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３２０３またはｐＲＫ５−ＰＲＯ３５２５０とよぶ。

選択される宿主細胞は２９３細胞であり得る。ヒト２９３細胞（ＡＴＣＣ ＣＣＬ １５７３）を組織培養プレート内で、ウシ胎仔血清ならびに任意選択で栄養成分および／または抗生物質を補給したＤＭＥＭなどの培地中でコンフルエンスまで培養する。約１０μｇのｐＲＫ５−ＰＲＯ６９１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２６５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３３２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３４２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５４０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９４４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１０７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１３８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１９０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２７２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２８６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３１６、ｐＲＫ５−ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４７５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５６８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５７３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５９９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６９３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７８８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１８６４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４３３０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４４２３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３６９３５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５８０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５９９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６００１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６０９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７４３６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７３３７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７４９６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９６４６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１７１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９８２０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１２０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２００２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３２０３またはｐＲＫ５−ＰＲＯ３５２５０ ＤＮＡをＶＡ ＲＮＡ遺伝子［Ｔｈｉｍｍａｐｐａｙａ ｅｔ ａｌ．Ｃｅｌｌ，３１：５４３（１９８２）］をコードするＤＮＡ約１μｇと混合し、５００μＬの１ｍＭ Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、０．１ｍＭ ＥＤＴＡ、０．２２７Ｍ ＣａＣｌ_２中に溶解する。この混合物に、５００μＬの５０ｍＭ ＨＥＰＥＳ（ｐＨ７．３５）、２８０ｍＭ ＮａＣｌ、１．５ｍＭ ＮａＰＯ_４を滴下し、２５℃で１０分間、沈殿物を形成させる。沈殿物を懸濁して２９３細胞に添加し、３７℃で約４時間沈降させる。培養培地を吸引除去し、２ｍＬの２０％グリセロール含有ＰＢＳを３０秒間添加する。次いで、２９３細胞を血清無含有培地で洗浄し、新鮮培地を添加し、細胞を約５日間インキュベートする。

トランスフェクションのおよそ２４時間後、培養培地を除去し、培養培地（単独）または２００μＣｉ／ｍＬの^３５Ｓ−システインおよび２００μＣｉ／ｍＬの^３５Ｓ−メチオニンを含有する培養培地と交換する。１２時間のインキュベーション後、ならし培地を回収し、スピンフィルターにて濃縮し、１５％ＳＤＳゲル上に負荷する。加工処理したゲルは、乾燥させ、選択した時間フィルムに露光し、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの存在を顕現させ得る。トランスフェクト細胞を含む培養物は、さらなるインキュベーション（血清無含有培地中）に供してもよく、培地を、選択したバイオアッセイにおいて試験する。

択一的な手法において、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を、Ｓｏｍｐａｒｙｒａｃ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，１２：７５７５（１９８１）に記載された硫酸デキストラン法を用い、一過的に２９３細胞内に導入してもよい。２９３細胞をスピナーフラスコ内で最大密度まで培養し、７００μｇのｐＲＫ５−ＰＲＯ６９１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２６５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３３２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３４２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５４０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９４４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１０７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１３８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１９０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２７２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２８６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３１６、ｐＲＫ５−ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４７５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５６８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５７３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５９９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６９３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７８８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１８６４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４３３０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４４２３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３６９３５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５８０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５９９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６００１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６０９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７４３６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７３３７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７４９６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９６４６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１７１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９８２０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１２０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２００２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３２０３またはｐＲＫ５−ＰＲＯ３５２５０ＤＮＡを添加する。該細胞を、まず、スピナーフラスコから遠心分離によって濃縮し、ＰＢＳで洗浄する。ＤＮＡ−デキストラン沈殿物を、細胞ペレット上で４時間インキュベートする。細胞を２０％グリセロールで９０秒間処理し、組織培養培地で洗浄し、組織培養培地、５μｇ／ｍＬウシインスリンおよび０．１μｇ／ｍＬウシトランスフェリンを入れたスピナーフラスコ内に再導入する。約４日後、ならし培地を遠心分離し、濾過して細胞および残屑を除去する。発現されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を含む試料を、次いで、選択した任意の方法、例えば、透析および／またはカラムクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０は、ＣＨＯ細胞において発現させ得る。ｐＲＫ５−ＰＲＯ６９１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２６５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３３２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３４２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５４０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９４４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１０７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１２２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１３８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１１９０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２７２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２８６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１２９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３０９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３１６、ｐＲＫ５−ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１３８４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４３４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４７５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１４８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５６８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５７３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１５９９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６０５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１６９３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７５５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１７８８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１８６４、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３５６６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４３３０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４４２３、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３６９３５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９７９、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ４９８１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５８０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ５９９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６００１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６０９５、ｐＲＫ５−ＰＲＯ６１８２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７１７１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ７４３６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１２、ｐＲＫ５−ＰＲＯ９９１７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７３３７、ｐＲＫ５−ＰＲＯ３７４９６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９６４６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１７１８、ｐＲＫ５−ＰＲＯ１９８２０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２１２０１、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２００２６、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２０１１０、ｐＲＫ５−ＰＲＯ２３２０３またはｐＲＫ５−ＰＲＯ３５２５０をＣＨＯ細胞内に、ＣａＰＯ_４またはＤＥＡＥ−デキストランなどの既知の試薬を用いてトランスフェクトし得る。上記のように、細胞培養物をインキュベートすることができ、培地は培養培地（単独）または^３５Ｓ−メチオニンなどの放射能標識を含有する培地と交換することができる。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの存在を調べた後、培養培地を血清無含有培地と交換してもよい。好ましくは、培養物を約６日間インキュベートし、次いで、ならし培地を回収する。発現されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を含有する培地を、次いで、選択した任意の方法によって濃縮および精製し得る。

また、エピトープタグ化したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を宿主ＣＨＯ細胞において発現させてもよい。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を、ｐＲＫ５ベクターにサブクローニングし得る。サブクローン挿入物はＰＣＲに供し、インフレームで、選択したエピトープタグ（例えば、ポリ−Ｈｉｓタグなど）とともにバキュロウイルス発現ベクター内に融合させ得る。ポリ−Ｈｉｓタグ化ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０挿入物を、次いで、安定なクローンの選択のためのＤＨＦＲなどの選択マーカーを含有するＳＶ４０駆動ベクター内にサブクローニングし得る。最後に、ＣＨＯ細胞にＳＶ４０駆動ベクターをトランスフェクトさせ得る（上記のようにして）。標識化は、上記のように、発現を確認するために行い得る。発現されたポリ−Ｈｉｓタグ化ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を含有する培養培地を、次いで、選択した任意の方法、例えば、Ｎｉ^２＋キレートアフィニティクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０はまた、ＣＨＯおよび／またはＣＯＳ細胞において一過性発現手順によって、あるいはＣＨＯ細胞において別の安定な発現手順によって発現させ得る。

ＣＨＯ細胞における安定な発現は、下記の手順を用いて行われる。タンパク質はＩｇＧ構築物（イムノアドヘシン）として発現させ、それぞれのタンパク質の可溶性形態のコード配列（例えば、細胞外ドメイン）を、ヒンジ、ＣＨ２およびＣＨ２ドメインを含有するＩｇＧ１定常領域配列と融合させる、および／またはポリ−Ｈｉｓタグ化された形態である。

ＰＣＲ増幅後、それぞれのＤＮＡを、ＣＨＯ発現ベクター内に、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｕｎｉｔ ３．１６，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ（１９９７）に記載のような標準的は手法を用いてサブクローニングする。ＣＨＯ発現ベクターは、ｃＤＮＡの簡便なシャトリングが可能となるように目的のＤＮＡの５’および３’側に適合性の制限部位を有するように構築する。ＣＨＯ細胞における発現に使用されるベクターは、Ｌｕｃａｓ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２４：９（１７７４−１７７９（１９９６）に記載されているとおりであり、対象のｃＤＮＡおよびジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）の発現を駆動するためのＳＶ４０初期プロモーター／エンハンサーを使用する。ＤＨＦＲ発現により、トランスフェクション後のプラスミドの安定な維持のための選択が可能になる。

１２マイクログラムの所望のプラスミドＤＮＡを、およそ１０００００００個のＣＨＯ細胞内に、市販のトランスフェクション試薬Ｓｕｐｅｒｆｅｃｔ（登録商標）（Ｑｉａｇｅｎ）、Ｄｏｓｐｅｒ（登録商標）またはＦｕｇｅｎｅ（登録商標）（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｍａｎｎｈｅｉｍ）を用いて導入する。細胞を、Ｌｕｃａｓ ｅｔ ａｌ．（前出）に記載のようにして培養する。およそ３×１０^７細胞を、下記のようなさらなる培養および生成のために、アンプル内で凍結させる。

プラスミドＤＮＡの入ったアンプルを、水浴内への配置によって解凍し、ボルテックスによって混合する。内容物を、１０ｍＬの培地を入れた遠心分離チューブ内にピペッティングし、１０００ｒｐｍで５分間遠心分離する。上清みを吸引し、細胞を１０ｍＬの選択培地（５％の０．２μｍ透析濾過ウシ胎児血清含有０．２μｍ濾過ＰＳ２０）中に再懸濁する。次いで、細胞のアリコートを、９０ｍＬの選択培地を入れた１００ｍＬ容量のスピナー内に採取する。１〜２日後、細胞を、１５０ｍＬの選択培養培地で満たした２５０ｍＬ容量のスピナー内に移し、３７℃でインキュベートする。さらに２〜３日後、２５０ｍＬ、５００ｍＬおよび２０００ｍＬ容量のスピナーに３×１０^５細胞／ｍＬを播種する。細胞培地を新たな培地と、遠心分離および生産培地中への再懸濁によって交換する。任意の適当なＣＨＯ培地を使用し得るが、米国特許第５，１２２，４６９号（１９９２年６月１６日発行）に記載の生産培地を実際に使用することができる。３Ｌ容量の生産用スピナーに１．２×１０^６細胞／ｍＬで播種する。第０日目、細胞数 ｐＨを測定する（ｉｅ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ）。第１日目、スピナーから試料を採取し、濾過空気でのスパージングを開始する。第２日目、スピナーから試料を採取し、温度を３３℃にシフトし、３０ｍＬの５００ｇ／Ｌグルコースおよび０．６ｍＬの１０％消泡剤（例えば、３５％ポリジメチルシロキサンエマルジョン、Ｄｏｗ Ｃｏｒｎｉｎｇ ３６５医薬グレードＥｍｕｌｓｉｏｎ）を採用する。作製全体を通して、ｐＨは、７．２前後に維持されるように必要に応じて調整する。１０日後、またはバイアビリティが７０％未満に低下したときまで、細胞培養物を、遠心分離および０．２２μｍフィルターに通す濾過によって回収する。濾液は、４℃で保存するか、または直接、精製用カラム上に負荷するかのいずれかとした。

ポリ−Ｈｉｓタグ化構築物に関して、タンパク質は、Ｎｉ−ＮＴＡカラム（Ｑｉａｇｅｎ）を用いて精製する。精製前、イミダゾールをならし培地に５ｍＭの濃度まで添加する。ならし培地を、２０ｍＭ Ｈｅｐｅｓ（ｐＨ７．４）０．３Ｍ ＮａＣｌおよび５ｍＭイミダゾール含有バッファー中で平衡化した６ｍＬ容量のＮｉ−ＮＴＡカラム上に、４〜５ｍＬ／分の流速で４℃にてポンピングする。負荷後、カラムをさらなる平衡化バッファーで洗浄し、タンパク質を、０．２５Ｍイミダゾールを含有する平衡化バッファーで溶出させる。高度に精製されたタンパク質を、続いて、２５ｍＬ容量のＧ２５ Ｓｕｐｅｒｆｉｎｅ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）カラムを用い、１０ｍＭ Ｈｅｐｅｓ、０．１４Ｍ ＮａＣｌおよび４％マンニトール（ｐＨ６．８）を含有する保存バッファー中にて脱塩し、−８０℃で保存する。

イムノアドヘシン（Ｆｃ含有）構築物をならし培地から、以下のようにして精製する。ならし培地を、２０ｍＭリン酸ナトリウムバッファー（ｐＨ６．８）中で平衡化しておいた５ｍＬ容量のタンパク質Ａカラム（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）上にポンピングする。負荷後、１００ｍＭクエン酸（ｐＨ３．５）で溶出する前に、カラムを平衡化バッファーで徹底的に洗浄する。溶出させたタンパク質は、１ｍＬずつの画分を、２７５μＬの１Ｍ Ｔｒｉｓバッファー（ｐＨ９）を入れたチューブ内に収集することにより直ちに中和する。高度に精製されたタンパク質を、続いて、ポリ−Ｈｉｓタグ化タンパク質について上記の保存バッファー中にて脱塩する。均質性を、ＳＤＳポリアクリルアミドゲルおよびエドマン分解によるＮ末端アミノ酸配列決定によって評価する。

実施例７０：酵母におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の発現
下記の方法は、酵母におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の組換え発現を記載したものである。

まず、ＡＤＨ２／ＧＡＰＤＨプロモーターからのＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の細胞内での産生または分泌のための酵母発現ベクターを構築する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０およびプロモーターをコードするＤＮＡを、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の細胞内発現を指向させるために選択したプラスミド内の適当な制限酵素部位に挿入する。分泌のため、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０をコードするＤＮＡは、選択したプラスミドに、ＡＤＨ２／ＧＡＰＤＨプロモーター、天然ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０シグナルペプチドもしくは他の哺乳動物用シグナルペプチド、または例えば、酵母のα因子もしくはインベルターゼ分泌シグナル／リーダー配列、およびＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の発現のためのリンカー配列（必要であれば）をコードするＤＮＡとともにクローニングし得る。

次いで、酵母細胞（例えば、酵母系統ＡＢ１１０など）を上記の発現プラスミドで形質転換し、選択した発酵培地中で培養し得る。形質転換された酵母の上清みを、１０％トリクロロ酢酸を用いた沈殿によって解析し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分離した後、ゲルをクマシーブルー染色で染色し得る。

続いて、組換えＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を、酵母細胞を発酵培地から遠心分離によって除去し、次いで、選択したカートリッジフィルターを用いて培地を濃縮することにより単離および精製し得る。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を含む濃縮物を、選択したカラムクロマトグラフィー樹脂を用いてさらに精製し得る。

実施例７１：バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の発現
下記の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の組換え発現を記載したものである。

ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０をコードする配列を、バキュロウイルス発現ベクター内に含有されるエピトープタグの上流と融合させる。かかるエピトープタグとしては、ポリ−Ｈｉｓタグおよび免疫グロブリンタグ（ＩｇＧのＦｃ領域など）が挙げられる。さまざまなプラスミド、例えば、市販のプラスミド（例えば、ｐＶＬ１３９３（Ｎｏｖａｇｅｎ）など）から誘導されるプラスミドを使用し得る。簡単には、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０をコードする配列またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０のコード配列の所望の部分、例えば、膜貫通タンパク質の細胞外ドメインをコードする配列、またはタンパク質が細胞外のものである場合はその成熟タンパク質をコードする配列などを、５’および３’領域に相補的なプライマーを用いたＰＣＲによって増幅する。５’プライマーは、（選択した）フランキング制限酵素部位を組み込んでいてよい。次いで、産物を、選択した制限酵素で消化し、発現ベクター内にサブクローニングする。

組換えバキュロウイルスを、上記のプラスミドおよびＢａｃｕｌｏＧｏｌｄ（商標）ウイルスＤＮＡ（Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ）をＳｐｏｄｏｐｔｅｒａ ｆｍｇｉｐｅｒｄａ（「Ｓｆ９」）細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ １７１１）内に、リポフェクチン（ＧＩＢＣＯ−ＢＲＬから市販）を用いてコトランスフェクトすることにより作製する。２８℃で４〜５日間のインキュベーション後、放出されたウイルスを回収し、さらなる増幅に用いる。ウイルス感染およびタンパク質発現は、Ｏ’Ｒｅｉｌｌｅｙ ｅｔ ａｌ．Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｖｅｃｔｏｒｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｏｘｆｏｒｄ：Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９４）に記載のように行う。

発現されたポリ−Ｈｉｓタグ化ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０は、次いで、例えば、Ｎｉ^２＋キレートアフィニティクロマトグラフィーによって以下のようにして精製し得る。抽出物は、組換えウイルス感染Ｓｆ９細胞から、Ｒｕｐｅｒｔ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ，３６２：１７５−１７９（１９９３）に記載のように調製する。簡単には、Ｓｆ９細胞を洗浄し、音波破砕バッファー（２５ｍＬ Ｈｅｐｅｓ、ｐＨ７．９；１２．５ｍＭ ＭｇＣｌ_２；０．１ｍＭ ＥＤＴＡ；１０％グリセロール；０．１％ＮＰ−４０；０．４Ｍ ＫＣｌ）中に再懸濁し、氷上で２０秒間、２回音波破砕する。音波破砕物を遠心分離によって清澄化し、上清みを、負荷バッファー（５０ｍＭリン酸塩、３００ｍＭ ＮａＣｌ、１０％グリセロール、ｐＨ７．８）中で５０倍に希釈し、０．４５μｍフィルターに通して濾過する。Ｎｉ^２＋ＮＴＡアガロースカラム（Ｑｉａｇｅｎから市販）を５ｍＬ容量の床を用いて調製し、２５ｍＬの水で洗浄し、２５ｍＬの負荷バッファーで平衡化する。濾過した細胞抽出物をカラム上に０．５ｍＬ／分で負荷する。カラムをベースライン_Ａ２８０まで負荷バッファーで洗浄し、この時点で、画分収集を開始する。次に、カラムを二次洗浄バッファー（５０ｍＭリン酸塩；３００ｍＭ ＮａＣｌ、１０％グリセロール、ｐＨ６．０）で洗浄し、これにより、非特異的結合タンパク質を溶出する。再度_Ａ２８０ベースラインに達した後、カラムを二次洗浄バッファー中０〜５００ｍＭイミダゾールの勾配で展開させる。１ｍＬずつの画分を収集し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよび銀染色またはＮｉ^２＋−ＮＴＡコンジュゲートアルカリホスファターゼ（Ｑｉａｇｅｎ）を用いたウエスタンブロットによって解析する。溶出されたＨｉｓ_１０タグ化ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０を含有する画分をプールし、負荷バッファーに対して透析する。

あるいはまた、ＩｇＧタグ化（またはＦｃタグ化）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の精製が、既知のクロマトグラフィー手法、例えば、タンパク質Ａまたはタンパク質Ｇカラムクロマトグラフィーなどを用いて行われ得る。

実施例７２：ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０に結合する抗体の調製
この実施例は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０に特異的に結合し得るモノクローナル抗体の調製を示す。

モノクローナル抗体を作製するための手法は当該技術分野で知られており、例えば、Ｇｏｄｉｎｇ（前出）に記載されている。使用され得る免疫原としては、精製されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを含有する融合タンパク質、および組換えＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを細胞表面上に発現する細胞が挙げられる。免疫原の選択は、当業者が必要以上に実験を行うことなく行い得る。

Ｂａｌｂ／ｃなどのマウスを、完全フロイントアジュバント中で乳化させたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０免疫原で免疫処置し、１〜１００マイクログラムの量で皮下または腹腔内注射する。あるいはまた、免疫原を、ＭＰＬ−ＴＤＭアジュバント（Ｒｉｂｉ Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｈａｍｉｌｔｏｎ，ＭＴ）中に乳化させ、動物の後肢支脚皿に注射する。次いで、免疫処置されたマウスを１０〜１２日後、選択したアジュバント中に乳化させたさらなる免疫原で追加免疫刺激する。その後、数週間、マウスにさらなる免疫処置注射により追加免疫刺激してもよい。血清試料を、定期的にマウスから後眼窩採血によって採取し、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体を検出するＥＬＩＳＡアッセイにおいて試験し得る。

適当な抗体力価が検出された後、抗体について「陽性」の動物に、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０の最終の静脈内注射が注射され得る。３〜４日後、マウスを屠殺し、脾臓細胞を回収する。次いで、脾臓細胞を、選択したマウス骨髄腫細胞株（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ １５９７から入手可能なＰ３Ｘ６３ＡｇＵ．１など）と融合させる（３５％ポリエチレングリコールを使用）。融合によりハイブリドーマ細胞を作製し、次いで、これを、非融合細胞、骨髄腫ハイブリッドおよび脾臓細胞ハイブリッドの増殖を阻害するＨＡＴ（ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジン）培地を入れた９６ウェル組織培養プレート内にプレーティングし得る。

ハイブリドーマ細胞は、ＥＬＩＳＡにおいてＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０に対する反応性についてスクリーニングする。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０に対する所望のモノクローナル抗体を分泌する「陽性」ハイブリドーマ細胞の決定は、当該技術分野の技量の範囲内である。

陽性ハイブリドーマ細胞を同系Ｂａｌｂ／ｃマウスに腹腔内注射し、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３またはａｎｔｉ−ＰＲＯ３５２５０モノクローナル抗体を含有する腹水を生成し得る。あるいはまた、ハイブリドーマ細胞を組織培養フラスコまたはローラーボトル内で培養してもよい。腹水内に産生されたモノクローナル抗体の精製は、硫酸アンモニウム沈殿の後ゲル排除クロマトグラフィーを用いて行い得る。あるいはまた、タンパク質Ａまたはタンパク質Ｇに対する抗体の結合に基づくアフィニティクロマトグラフィを使用し得る。

実施例７３：特異的抗体を用いたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの精製
ネイティブまたは組換えＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを、タンパク質精製の分野におけるさまざまな標準的な手法によって精製し得る。例えば、プロＰＲＯ６９１２２、プロＰＲＯ２０４、プロＰＲＯ２１４、プロＰＲＯ２２２、プロＰＲＯ２３４、プロＰＲＯ２６５、プロＰＲＯ３０９、プロＰＲＯ３３２、プロＰＲＯ３４２、プロＰＲＯ３５６、プロＰＲＯ５４０、プロＰＲＯ６１８、プロＰＲＯ９４４、プロＰＲＯ９９４、プロＰＲＯ１０７９、プロＰＲＯ１１１０、プロＰＲＯ１１２２、プロＰＲＯ１１３８、プロＰＲＯ１１９０、プロＰＲＯ１２７２、プロＰＲＯ１２８６、プロＰＲＯ１２９５、プロＰＲＯ１３０９、プロＰＲＯ１３１６、プロＰＲＯ１３８３、プロＰＲＯ１３８４、プロＰＲＯ１４３１、プロＰＲＯ１４３４、プロＰＲＯ１４７５、プロＰＲＯ１４８１、プロＰＲＯ１５６８、プロＰＲＯ１５７３、プロＰＲＯ１５９９、プロＰＲＯ１６０４、プロＰＲＯ１６０５、プロＰＲＯ１６９３、プロＰＲＯ１７５３、プロＰＲＯ１７５５、プロＰＲＯ１７７７、プロＰＲＯ１７８８、プロＰＲＯ１８６４、プロＰＲＯ１９２５、プロＰＲＯ１９２６、プロＰＲＯ３５６６、プロＰＲＯ４３３０、プロＰＲＯ４４２３、プロＰＲＯ３６９３５、プロＰＲＯ４９７７、プロＰＲＯ４９７９、プロＰＲＯ４９８０、プロＰＲＯ４９８１、プロＰＲＯ５８０１、プロＰＲＯ５９９５、プロＰＲＯ６００１、プロＰＲＯ６０９５、プロＰＲＯ６１８２、プロＰＲＯ７１７０、プロＰＲＯ７１７１、プロＰＲＯ７４３６、プロＰＲＯ９９１２、プロＰＲＯ９９１７、プロＰＲＯ３７３３７、プロＰＲＯ３７４９６、プロＰＲＯ１９６４６、プロＰＲＯ２１７１８、プロＰＲＯ１９８２０、プロＰＲＯ２１２０１、プロＰＲＯ２００２６、プロＰＲＯ２０１１０、プロＰＲＯ２３２０３またはプロＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、成熟ＰＲＯ６９１２２、成熟ＰＲＯ２０４、成熟ＰＲＯ２１４、成熟ＰＲＯ２２２、成熟ＰＲＯ２３４、成熟ＰＲＯ２６５、成熟ＰＲＯ３０９、成熟ＰＲＯ３３２、成熟ＰＲＯ３４２、成熟ＰＲＯ３５６、成熟ＰＲＯ５４０、成熟ＰＲＯ６１８、成熟ＰＲＯ９４４、成熟ＰＲＯ９９４、成熟ＰＲＯ１０７９、成熟ＰＲＯ１１１０、成熟ＰＲＯ１１２２、成熟ＰＲＯ１１３８、成熟ＰＲＯ１１９０、成熟ＰＲＯ１２７２、成熟ＰＲＯ１２８６、成熟ＰＲＯ１２９５、成熟ＰＲＯ１３０９、成熟ＰＲＯ１３１６、成熟ＰＲＯ１３８３、成熟ＰＲＯ１３８４、成熟ＰＲＯ１４３１、成熟ＰＲＯ１４３４、成熟ＰＲＯ１４７５、成熟ＰＲＯ１４８１、成熟ＰＲＯ１５６８、成熟ＰＲＯ１５７３、成熟ＰＲＯ１５９９、成熟ＰＲＯ１６０４、成熟ＰＲＯ１６０５、成熟ＰＲＯ１６９３、成熟ＰＲＯ１７５３、成熟ＰＲＯ１７５５、成熟ＰＲＯ１７７７、成熟ＰＲＯ１７８８、成熟ＰＲＯ１８６４、成熟ＰＲＯ１９２５、成熟ＰＲＯ１９２６、成熟ＰＲＯ３５６６、成熟ＰＲＯ４３３０、成熟ＰＲＯ４４２３、成熟ＰＲＯ３６９３５、成熟ＰＲＯ４９７７、成熟ＰＲＯ４９７９、成熟ＰＲＯ４９８０、成熟ＰＲＯ４９８１、成熟ＰＲＯ５８０１、成熟ＰＲＯ５９９５、成熟ＰＲＯ６００１、成熟ＰＲＯ６０９５、成熟ＰＲＯ６１８２、成熟ＰＲＯ７１７０、成熟ＰＲＯ７１７１、成熟ＰＲＯ７４３６、成熟ＰＲＯ９９１２、成熟ＰＲＯ９９１７、成熟ＰＲＯ３７３３７、成熟ＰＲＯ３７４９６、成熟ＰＲＯ１９６４６、成熟ＰＲＯ２１７１８、成熟ＰＲＯ１９８２０、成熟ＰＲＯ２１２０１、成熟ＰＲＯ２００２６、成熟ＰＲＯ２０１１０、成熟ＰＲＯ２３２０３または成熟ＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはプレＰＲＯ６９１２２、プレＰＲＯ２０４、プレＰＲＯ２１４、プレＰＲＯ２２２、プレＰＲＯ２３４、プレＰＲＯ２６５、プレＰＲＯ３０９、プレＰＲＯ３３２、プレＰＲＯ３４２、プレＰＲＯ３５６、プレＰＲＯ５４０、プレＰＲＯ６１８、プレＰＲＯ９４４、プレＰＲＯ９９４、プレＰＲＯ１０７９、プレＰＲＯ１１１０、プレＰＲＯ１１２２、プレＰＲＯ１１３８、プレＰＲＯ１１９０、プレＰＲＯ１２７２、プレＰＲＯ１２８６、プレＰＲＯ１２９５、プレＰＲＯ１３０９、プレＰＲＯ１３１６、ｐｅｒ−ＰＲＯ１３８３、プレＰＲＯ１３８４、プレＰＲＯ１４３１、プレＰＲＯ１４３４、プレＰＲＯ１４７５、プレＰＲＯ１４８１、プレＰＲＯ１５６８、プレＰＲＯ１５７３、プレＰＲＯ１５９９、プレＰＲＯ１６０４、プレＰＲＯ１６０５、プレＰＲＯ１６９３、プレＰＲＯ１７５３、プレＰＲＯ１７５５、プレＰＲＯ１７７７、プレＰＲＯ１７８８、プレＰＲＯ１８６４、プレＰＲＯ１９２５、プレＰＲＯ１９２６、プレＰＲＯ３５６６、プレＰＲＯ４３３０、プレＰＲＯ４４２３、プレＰＲＯ３６９３５、プレＰＲＯ４９７７、プレＰＲＯ４９７９、プレＰＲＯ４９８０、プレＰＲＯ４９８１、プレＰＲＯ５８０１、プレＰＲＯ５９９５、プレＰＲＯ６００１、プレＰＲＯ６０９５、プレＰＲＯ６１８２、プレＰＲＯ７１７０、プレＰＲＯ７１７１、プレＰＲＯ７４３６、プレＰＲＯ９９１２、プレＰＲＯ９９１７、プレＰＲＯ３７３３７、プレＰＲＯ３７４９６、プレＰＲＯ１９６４６、プレＰＲＯ２１７１８、プレＰＲＯ１９８２０、プレＰＲＯ２１２０１、プレＰＲＯ２００２６、プレＰＲＯ２０１１０、プレＰＲＯ２３２０３またはプレＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを、対象のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに特異的な抗体を用いたイムノアフィニティクロマトグラフィーによって精製する。一般に、イムノアフィニティカラムは、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０ポリペプチド抗体を活性化したクロマトグラフィー樹脂に共有結合によってカップリングさせることにより構成されている。

ポリクローナル免疫グロブリンを、免疫血清から、硫酸アンモニウムでの沈殿、または固定化したタンパク質Ａ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＬＫＢ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，Ｎ．Ｊ．）上での精製のいずれかによって調製する。同様に、モノクローナル抗体を、マウス腹水から、硫酸アンモニウム沈殿または固定化したタンパク質Ａ上でのクロマトグラフィーによって調製する。部分精製された免疫グロブリンを、ＣｎＢｒ活性化ＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（商標）（Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＬＫＢ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）などのクロマトグラフィー樹脂に共有結合させる。抗体を樹脂にカップリングさせ、樹脂をブロックし、誘導体樹脂を、製造業者の使用説明書に従って洗浄する。

かかるイムノアフィニティカラムは、可溶性形態のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを含む細胞由来の画分を調製することにより、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの精製に利用する。この調製物を、デタージェントの添加による分画遠心分離により得られた完全体細胞または亜細胞画分の可溶化によって、または当該技術分野でよく知られた他の方法によって誘導する。あるいはまた、シグナル配列を含む可溶性ポリペプチドを、有用な量で、該細胞を培養している培地中に分泌し得る。

可溶性ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド含有調製物をイムノアフィニティカラムに通し、カラムを、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの優先的吸収を可能にする条件下（例えば、デタージェントの存在下の高イオン強度バッファー）で洗浄する。次いで、カラムを、抗体／ＰＲＯ６９１２２、抗体／ＰＲＯ２０４、抗体／ＰＲＯ２１４、抗体／ＰＲＯ２２２、抗体／ＰＲＯ２３４、抗体／ＰＲＯ２６５、抗体／ＰＲＯ３０９、抗体／ＰＲＯ３３２、抗体／ＰＲＯ３４２、抗体／ＰＲＯ３５６、抗体／ＰＲＯ５４０、抗体／ＰＲＯ６１８、抗体／ＰＲＯ９４４、抗体／ＰＲＯ９９４、抗体／ＰＲＯ１０７９、抗体／ＰＲＯ１１１０、抗体／ＰＲＯ１１２２、抗体／ＰＲＯ１１３８、抗体／ＰＲＯ１１９０、抗体／ＰＲＯ１２７２、抗体／ＰＲＯ１２８６、抗体／ＰＲＯ１２９５、抗体／ＰＲＯ１３０９、抗体／ＰＲＯ１３１６、抗体／ＰＲＯ１３８３、抗体／ＰＲＯ１３８４、抗体／ＰＲＯ１４３１、抗体／ＰＲＯ１４３４、抗体／ＰＲＯ１４７５、抗体／ＰＲＯ１４８１、抗体／ＰＲＯ１５６８、抗体／ＰＲＯ１５７３、抗体／ＰＲＯ１５９９、抗体／ＰＲＯ１６０４、抗体／ＰＲＯ１６０５、抗体／ＰＲＯ１６９３、抗体／ＰＲＯ１７５３、抗体／ＰＲＯ１７５５、抗体／ＰＲＯ１７７７、抗体／ＰＲＯ１７８８、抗体／ＰＲＯ１８６４、抗体／ＰＲＯ１９２５、抗体／ＰＲＯ１９２６、抗体／ＰＲＯ３５６６、抗体／ＰＲＯ４３３０、抗体／ＰＲＯ４４２３、抗体／ＰＲＯ３６９３５、抗体／ＰＲＯ４９７７、抗体／ＰＲＯ４９７９、抗体／ＰＲＯ４９８０、抗体／ＰＲＯ４９８１、抗体／ＰＲＯ５８０１、抗体／ＰＲＯ５９９５、抗体／ＰＲＯ６００１、抗体／ＰＲＯ６０９５、抗体／ＰＲＯ６１８２、抗体／ＰＲＯ７１７０、抗体／ＰＲＯ７１７１、抗体／ＰＲＯ７４３６、抗体／ＰＲＯ９９１２、抗体／ＰＲＯ９９１７、抗体／ＰＲＯ３７３３７、抗体／ＰＲＯ３７４９６、抗体／ＰＲＯ１９６４６、抗体／ＰＲＯ２１７１８、抗体／ＰＲＯ１９８２０、抗体／ＰＲＯ２１２０１、抗体／ＰＲＯ２００２６、抗体／ＰＲＯ２０１１０、抗体／ＰＲＯ２３２０３または抗体／ＰＲＯ３５２５０ポリペプチド結合を破壊する条件下（例えば、低ｐＨバッファー（例えば、およそｐＨ２〜３など）または高濃度のカオトロピック薬剤（例えば、尿素またはチオシアネートイオンなど））で溶出させ、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを収集する。

実施例７４：薬物スクリーニング
本発明は、さまざまな薬物スクリーニング手法のいずれかにおいて、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはその結合フラグメントを用いることによる化合物のスクリーニングに特に有用である。かかる試験に使用されるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは断片は、溶液中で遊離、固相支持体に固定、細胞表面上に担持、または細胞内に局在のいずれかであり得る。薬物スクリーニング方法の一例では、組換え核酸で安定に形質転換された、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは断片を発現する真核生物または原核生物の宿主細胞を用いる。薬物は、競合的結合アッセイで、かかる形質転換細胞に対してスクリーニングする。かかる細胞は、バイアブルな状態または固定された形態のいずれかで、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは断片と試験対象の薬剤との複合体の形成を測定できる。あるいはまた、試験される薬剤によって引き起こされるＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドとその標的細胞または標的受容体との複合体形成の減少を検査できる。

したがって、本発明は、薬物またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド関連の疾患または障害に影響を及ぼし得る任意の他の薬剤のスクリーニング方法を提供する。このような方法は、かかる薬剤をＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはその断片と接触させること、および（Ｉ）該薬剤とＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドもしくは断片との複合体の存在について、または（ｉｉ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドもしくは断片を細胞との複合体の存在について、当該技術分野でよく知られた方法によってアッセイすることを含む。かかる競合的結合アッセイでは、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは断片を、典型的には標識する。適当なインキュベーション後、遊離ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたは断片を、結合された形態で存在するものから分離し、遊離または非複合体形成標識の量を、その特定の薬剤がＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに結合する能力またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド／細胞複合体に干渉する能力の尺度とする。

薬物スクリーニングのための別の手法は、ポリペプチドに対して適当な結合親和性を有する化合物のハイスループットスクリーニングを提供し、ＷＯ８４／０３５６４（１９８４年９月１３日に公開）に詳細に記載されている。簡単に述べると、多数の異なる小ペプチド試験化合物を、プラスチックピンまたはいずれかの他の表面などの固相基材上で合成する。ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに適用し、ペプチド試験化合物をＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと反応させ、洗浄する。結合されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドは、当該技術分野でよく知られた方法によって検出する。また、精製したＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを、前述の薬物スクリーニング手法における使用のために、直接プレート上にコートしてもよい。また、非中和抗体を用いてペプチドを捕捉し、固相支持体上に固定化してもよい。

本発明ではまた、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドに結合できる中和抗体が、試験化合物と、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドまたはその断片に対する結合に関して特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイの使用が想定される。このようにして、該抗体は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドと１つ以上の抗原性決定基とを共有する任意のペプチドの存在を検出するために使用できる。

実施例７５：合理的な薬物設計
合理的な薬物設計の目的は、目的の生物学的に活性なポリペプチド（すなわち、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド）または該ポリペプチドと相互作用する小分子、例えば、作用剤、アンタゴニストもしくはインヒビターの構造的類縁体を作製することである。これらの例のいずれかを用い、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのより活性または安定な形態である薬物またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの機能をインビボで増強もしくは干渉する薬物を創出し得る（Ｈｏｄｇｓｏｎ，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，９：１９−２１（１９９１）を参照）。

アプローチの一例において、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド、またはＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド−インヒビター複合体の３次元構造を、ｘ線結晶学、コンピュータモデル設計または、最も典型的には、この２つのアプローチの組合せによって決定する。該分子の構造を解明するため、および活性部位（１つまたは複数）を決定するためには、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの形状および電荷の両方が確認されなければならない。頻度は低いが、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの構造に関する有用な情報を、相同タンパク質の構造に基づいたモデル設計によって得ることができる。両方の場合において、関連する構造的情報は、類縁ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチド様分子を設計するため、または効率的なインヒビターを同定するために使用する。合理的な薬物設計の有用な例としては、Ｂｒａｘｔｏｎ ａｎｄ Ｗｅｌｌｓ，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，３１：７７９６−７８０１（１９９２）に示されたような改善された活性もしくは安定性を有する分子、またはＡｔｈａｕｄａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．，１１３：７４２−７４６（１９９３）に示されたような天然ペプチドのインヒビター、作用剤もしくはアンタゴニストとして作用する分子が挙げられ得る。

また、上記のようにして機能アッセイによって選択された標的特異的抗体を単離し、次いで、その結晶構造を解明することも可能である。このアプローチは、原理的には、その後の薬物設計の基礎となり得るファーマコアをもたらす。タンパク質結晶学は、機能性の薬理学的に活性な抗体に対する抗イデオタイプ抗体（抗ｉｄ）を作製することにより、全く回避することが可能である。鏡像の鏡像として、抗ｉｄの結合部位は、元の受容体の類縁体であることが予測され得る。次いで、抗ｉｄを、化学的または生物学的に作製されたペプチドのバンクからペプチドを同定および単離するために使用できる。次いで、単離されたペプチドは、ファーマコアとしての役目を果たし得る。

本発明により、Ｘ線結晶学などの解析的研究を行うのに充分な量のＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドが利用可能となり得る。また、本明細書に提供されたＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドアミノ酸配列の知得により、ｘ線結晶学の代わり、またはこれに加えてにコンピュータモデル設計手法が使用されるものに対する手引きが提供される。

図１は、ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１）を示し、ここで、配列番号１は、本明細書中で「ＤＮＡ２８４８７０」（ＵＮＱ１２８）と称されるクローンである。 図１は、ネイティブ配列ＰＲＯ６９１２２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１）を示し、ここで、配列番号１は、本明細書中で「ＤＮＡ２８４８７０」（ＵＮＱ１２８）と称されるクローンである。 図２は、図１に示される配列番号１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号２）を示す。 図３は、ネイティブ配列ＰＲＯ２０４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３）を示し、ここで、配列番号３は、本明細書中で「ＤＮＡ３０８７１−１１５７」（ＵＮＱ１７８）と称されるクローンである。 図４は、図３に示される配列番号３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号４）を示す。 図５は、ネイティブ配列ＰＲＯ２１４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号５）を示し、ここで、配列番号５は、本明細書中で「ＤＮＡ３２２８６−１１９１」（ＵＮＱ１８８）と称されるクローンである。 図６は、図５に示される配列番号５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号６）を示す。 図７は、ネイティブ配列ＰＲＯ２２２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号７）を示し、ここで、配列番号７は、本明細書中で「ＤＮＡ３３１０７−１１３５」（ＵＮＱ１９６）と称されるクローンである。 図８は、図７に示される配列番号７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号８）を示す。 図９は、ネイティブ配列ＰＲＯ２３４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９）を示し、ここで、配列番号９は、本明細書中で「ＤＮＡ３５５５７−１１３７」（ＵＮＱ２０８）と称されるクローンである。 図１０は、図９に示される配列番号９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１０）を示す。 図１１は、ネイティブ配列ＰＲＯ２６５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１）を示し、ここで、配列番号１１は、本明細書中で「ＤＮＡ３６３５０−１１５８」（ＵＮＱ２３２）と称されるクローンである。 図１１は、ネイティブ配列ＰＲＯ２６５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１）を示し、ここで、配列番号１１は、本明細書中で「ＤＮＡ３６３５０−１１５８」（ＵＮＱ２３２）と称されるクローンである。 図１２は、図１１に示される配列番号１１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１２）を示す。 図１３は、ネイティブ配列ＰＲＯ３０９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１３）を示し、ここで、配列番号１３は、本明細書中で「ＤＮＡ６１６０１−１２２３」（ＵＮＱ２７２）と称されるクローンである。 図１４は、図１３に示される配列番号１３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１４）を示す。 図１５は、ネイティブ配列ＰＲＯ３３２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１５）を示し、ここで、配列番号１５は、本明細書中で「ＤＮＡ４０９８２−１２３５」（ＵＮＱ２９３）と称されるクローンである。 図１５は、ネイティブ配列ＰＲＯ３３２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１５）を示し、ここで、配列番号１５は、本明細書中で「ＤＮＡ４０９８２−１２３５」（ＵＮＱ２９３）と称されるクローンである。 図１６は、図１５に示される配列番号１５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１６）を示す。 図１７は、ネイティブ配列ＰＲＯ３４２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１７）を示し、ここで、配列番号１７は、本明細書中で「ＤＮＡ３８６４９」（ＵＮＱ３０１）と称されるクローンである。 図１８は、図１７に示される配列番号１７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１８）を示す。 図１９は、ネイティブ配列ＰＲＯ３５６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１９）を示し、ここで、配列番号１９は、本明細書中で「ＤＮＡ４７４７０−１１３０Ｐ１」（ＵＮＱ３１３）と称されるクローンである。 図２０は、図１９に示される配列番号１９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号２０）を示す。 図２１は、ネイティブ配列ＰＲＯ５４０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号２１）を示し、ここで、配列番号２１は、本明細書中で「ＤＮＡ４４１８９−１３２２」（ＵＮＱ３４１）と称されるクローンである。 図２２は、図２１に示される配列番号２１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号２２）を示す。 図２３は、ネイティブ配列ＰＲＯ６１８ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号２３）を示し、ここで、配列番号２３は、本明細書中で「ＤＮＡ４９１５２−１３２４」（ＵＮＱ３５４）と称されるクローンである。 図２３は、ネイティブ配列ＰＲＯ６１８ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号２３）を示し、ここで、配列番号２３は、本明細書中で「ＤＮＡ４９１５２−１３２４」（ＵＮＱ３５４）と称されるクローンである。 図２４は、図２３に示される配列番号２３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号２４）を示す。 図２５は、ネイティブ配列ＰＲＯ９４４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号２５）を示し、ここで、配列番号２５は、本明細書中で「ＤＮＡ５２１８５−１３７０」（ＵＮＱ４８１）と称されるクローンである。 図２６は、図２５に示される配列番号２５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号２６）を示す。 図２７は、ネイティブ配列ＰＲＯ９９４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号２７）を示し、ここで、配列番号２７は、本明細書中で「ＤＮＡ５８８５５−１４２２」（ＵＮＱ５１８）と称されるクローンである。 図２８は、図２７に示される配列番号２７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号２８）を示す。 図２９は、ネイティブ配列ＰＲＯ１０７９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号２９）を示し、ここで、配列番号２９は、本明細書中で「ＤＮＡ５６０５０−１４５５」（ＵＮＱ５３６）と称されるクローンである。 図３０は、図２９に示される配列番号２９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号３０）を示す。 図３１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１１１０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３１）を示し、ここで、配列番号３１は、本明細書中で「ＤＮＡ５８７２７−１４７４」（ＵＮＱ５５３）と称されるクローンである。 図３２は、図３１に示される配列番号３１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号３２）を示す。 図３３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１１２２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３３）を示し、ここで、配列番号３３は、本明細書中で「ＤＮＡ６２３７７−１３８１−１」（ＵＮＱ５６１）と称されるクローンである。 図３４は、図３３に示される配列番号３３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号３４）を示す。 図３５は、ネイティブ配列ＰＲＯ１１３８ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３５）を示し、ここで、配列番号３５は、本明細書中で「ＤＮＡ５８８５０−１４９５」（ＵＮＱ５７６）と称されるクローンである。 図３６は、図３５に示される配列番号３５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号３６）を示す。 図３７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１１９０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３７）を示し、ここで、配列番号３７は、本明細書中で「ＤＮＡ５９５８６−１５２０」（ＵＮＱ６０４）と称されるクローンである。 図３７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１１９０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３７）を示し、ここで、配列番号３７は、本明細書中で「ＤＮＡ５９５８６−１５２０」（ＵＮＱ６０４）と称されるクローンである。 図３８は、図３７に示される配列番号３７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号３８）を示す。 図３９は、ネイティブ配列ＰＲＯ１２７２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号３９）を示し、ここで、配列番号３９は、本明細書中で「ＤＮＡ６４８９６−１５３９」（ＵＮＱ６４２）と称されるクローンである。 図４０は、図３９に示される配列番号３９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号４０）を示す。 図４１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１２８６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号４１）を示し、ここで、配列番号４１は、本明細書中で「ＤＮＡ６４９０３−１５５３」（ＵＮＱ６５５）と称されるクローンである。 図４２は、図４１に示される配列番号４１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号４２）を示す。 図４３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１２９５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号４３）を示し、ここで、配列番号４３は、本明細書中で「ＤＮＡ５９２１８−１５５９」（ＵＮＱ６６４）と称されるクローンである。 図４３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１２９５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号４３）を示し、ここで、配列番号４３は、本明細書中で「ＤＮＡ５９２１８−１５５９」（ＵＮＱ６６４）と称されるクローンである。 図４４は、図４３に示される配列番号４３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号４４）を示す。 図４５は、ネイティブ配列ＰＲＯ１３０９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号４５）を示し、ここで、配列番号４５は、本明細書中で「ＤＮＡ５９５８８−１５７１」（ＵＮＱ６７５）と称されるクローンである。 図４６は、図４５に示される配列番号４５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号４６）を示す。 図４７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１３１６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号４７）を示し、ここで、配列番号４７は、本明細書中で「ＤＮＡ６０６０８−１５７７」（ＵＮＱ６８２）と称されるクローンである。 図４８は、図４７に示される配列番号４７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号４８）を示す。 図４９は、ネイティブ配列ＰＲＯ１３８３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号４９）を示し、ここで、配列番号４９は、本明細書中で「ＤＮＡ５８７４３−１６０９」（ＵＮＱ７１９）と称されるクローンである。 図５０は、図４９に示される配列番号４９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号５０）を示す。 図５１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１３８４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号５１）を示し、ここで、配列番号５１は、本明細書中で「ＤＮＡ７１１５９−１６１７」（ＵＮＱ７２１）と称されるクローンである。 図５２は、図５１に示される配列番号５１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号５２）を示す。 図５３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１４３１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号５３）を示し、ここで、配列番号５３は、本明細書中で「ＤＮＡ７３４０１−１６３３」（ＵＮＱ７３７）と称されるクローンである。 図５４は、図５３に示される配列番号５３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号５４）を示す。 図５５は、ネイティブ配列ＰＲＯ１４３４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号５５）を示し、ここで、配列番号５５は、本明細書中で「ＤＮＡ６８８１８−２５３６」（ＵＮＱ７３９）と称されるクローンである。 図５６は、図５５に示される配列番号５５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号５６）を示す。 図５７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１４７５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号５７）を示し、ここで、配列番号５７は、本明細書中で「ＤＮＡ６１１８５−１６４６」（ＵＮＱ７４６）と称されるクローンである。 図５８は、図５７に示される配列番号５７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号５８）を示す。 図５９は、ネイティブ配列ＰＲＯ１４８１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号５９）を示し、ここで、配列番号５９は、本明細書中で「ＤＮＡ５８７３２−１６５０」（ＵＮＱ７５０）と称されるクローンである。 図６０は、図５９に示される配列番号５９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号６０）を示す。 図６１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１５６８ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号６１）を示し、ここで、配列番号６１は、本明細書中で「ＤＮＡ６８８８０−１６７６」（ＵＮＱ７７４）と称されるクローンである。 図６２は、図６１に示される配列番号６１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号６２）を示す。 図６３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１５７３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号６３）を示し、ここで、配列番号６３は、本明細書中で「ＤＮＡ７３７３５−１６８１」（ＵＮＱ７７９）と称されるクローンである。 図６４は、図６３に示される配列番号６３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号６４）を示す。 図６５は、ネイティブ配列ＰＲＯ１５９９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号６５）を示し、ここで、配列番号６５は、本明細書中で「ＤＮＡ６２８４５−１６８４」（ＵＮＱ７８２）と称されるクローンである。 図６６は、図６５に示される配列番号６５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号６６）を示す。 図６７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１６０４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号６７）を示し、ここで、配列番号６７は、本明細書中で「ＤＮＡ７１２８６−１６８７」（ＵＮＱ７８５）と称されるクローンである。 図６８は、図６７に示される配列番号６７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号６８）を示す。 図６９は、ネイティブ配列ＰＲＯ１６０５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号６９）を示し、ここで、配列番号６９は、本明細書中で「ＤＮＡ７７６４８−１６８８」（ＵＮＱ７８６）と称されるクローンである。 図７０は、図６９に示される配列番号６９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号７０）を示す。 図７１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１６９３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号７１）を示し、ここで、配列番号７１は、本明細書中で「ＤＮＡ７７３０１−１７０８」（ＵＮＱ８０３）と称されるクローンである。 図７２は、図７１に示される配列番号７１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号７２）を示す。 図７３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１７５３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号７３）を示し、ここで、配列番号７３は、本明細書中で「ＤＮＡ６８８８３−１６９１」（ＵＮＱ８２６）と称されるクローンである。 図７４は、図７３に示される配列番号７３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号７４）を示す。 図７５は、ネイティブ配列ＰＲＯ１７５５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号７５）を示し、ここで、配列番号７５は、本明細書中で「ＤＮＡ７６３９６−１６９８」（ＵＮＱ８２８）と称されるクローンである。 図７６は、図７５に示される配列番号７５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号７６）を示す。 図７７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１７７７ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号７７）を示し、ここで、配列番号７７は、本明細書中で「ＤＮＡ７１２３５−１７０６」（ＵＮＱ８３９）と称されるクローンである。 図７８は、図７７に示される配列番号７７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号７８）を示す。 図７９は、ネイティブ配列ＰＲＯ１７８８ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号７９）を示し、ここで、配列番号７９は、本明細書中で「ＤＮＡ７７６５２−２５０５」（ＵＮＱ８５０）と称されるクローンである。 図８０は、図７９に示される配列番号７９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号８０）を示す。 図８１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１８６４ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号８１）を示し、ここで、配列番号８１は、本明細書中で「ＤＮＡ４５４０９−２５１１」（ＵＮＱ８５５）と称されるクローンである。 図８２は、図８１に示される配列番号８１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号８２）を示す。 図８３は、ネイティブ配列ＰＲＯ１９２５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号８３）を示し、ここで、配列番号８３は、本明細書中で「ＤＮＡ８２３０２−２５２９」（ＵＮＱ９０４）と称されるクローンである。 図８４は、図８３に示される配列番号８３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号８４）を示す。 図８５は、ネイティブ配列ＰＲＯ１９２６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号８５）を示し、ここで、配列番号８５は、本明細書中で「ＤＮＡ８２３４０−２５３０」（ＵＮＱ９０５）と称されるクローンである。 図８６は、図８５に示される配列番号８５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号８６）を示す。 図８７は、ネイティブ配列ＰＲＯ３５６６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号８７）を示し、ここで、配列番号８７は、本明細書中で「ＤＮＡ５９８４４−２５４２」（ＵＮＱ１８４０）と称されるクローンである。 図８８は、図８７に示される配列番号８７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号８８）を示す。 図８９は、ネイティブ配列ＰＲＯ４３３０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号８９）を示し、ここで、配列番号８９は、本明細書中で「ＤＮＡ９０８４２−２５７４」（ＵＮＱ１８８６）と称されるクローンである。 図８９は、ネイティブ配列ＰＲＯ４３３０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号８９）を示し、ここで、配列番号８９は、本明細書中で「ＤＮＡ９０８４２−２５７４」（ＵＮＱ１８８６）と称されるクローンである。 図９０は、図８９に示される配列番号８９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号９０）を示す。 図９１は、ネイティブ配列ＰＲＯ４４２３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９１）を示し、ここで、配列番号９１は、本明細書中で「ＤＮＡ９６８９３−２６２１」（ＵＮＱ１９４０）と称されるクローンである。 図９２は、図９１に示される配列番号９１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号９２）を示す。 図９３は、ネイティブ配列ＰＲＯ３６９３５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９３）を示し、ここで、配列番号９３は、本明細書中で「ＤＮＡ３３６５３９」（ＵＮＱ２２５７）と称されるクローンである。 図９４は、図９３に示される配列番号９３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号９４）を示す。 図９５は、ネイティブ配列ＰＲＯ４９７７ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９５）を示し、ここで、配列番号９５は、本明細書中で「ＤＮＡ６２８４９−２６４７」（ＵＮＱ２４２０）と称されるクローンである。 図９５は、ネイティブ配列ＰＲＯ４９７７ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９５）を示し、ここで、配列番号９５は、本明細書中で「ＤＮＡ６２８４９−２６４７」（ＵＮＱ２４２０）と称されるクローンである。 図９６は、図９５に示される配列番号９５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号９６）を示す。 図９７は、ネイティブ配列ＰＲＯ４９７９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９７）を示し、ここで、配列番号９７は、本明細書中で「ＤＮＡ２２２８４４」（ＵＮＱ２４２１）と称されるクローンである。 図９７は、ネイティブ配列ＰＲＯ４９７９ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９７）を示し、ここで、配列番号９７は、本明細書中で「ＤＮＡ２２２８４４」（ＵＮＱ２４２１）と称されるクローンである。 図９８は、図９７に示される配列番号９７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号９８）を示す。 図９９は、ネイティブ配列ＰＲＯ４９８０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号９９）を示し、ここで、配列番号９９は、本明細書中で「ＤＮＡ９７００３−２６４９」（ＵＮＱ２４２２）と称されるクローンである。 図１００は、図９９に示される配列番号９９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１００）を示す。 図１０１は、ネイティブ配列ＰＲＯ４９８１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０１）を示し、ここで、配列番号１０１は、本明細書中で「ＤＮＡ９４８４９−２９６０」（ＵＮＱ２４２３）と称されるクローンである。 図１０２は、図１０１に示される配列番号１０１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１０２）を示す。 図１０３は、ネイティブ配列ＰＲＯ５８０１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０３）を示し、ここで、配列番号１０３は、本明細書中で「ＤＮＡ１１５２９１−２６８１」（ＵＮＱ２５０１）と称されるクローンである。 図１０４は、図１０３に示される配列番号１０３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１０４）を示す。 図１０５は、ネイティブ配列ＰＲＯ５９９５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０５）を示し、ここで、配列番号１０５は、本明細書中で「ＤＮＡ９６９８８−２６８５」（ＵＮＱ２５０７）と称されるクローンである。 図１０５は、ネイティブ配列ＰＲＯ５９９５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０５）を示し、ここで、配列番号１０５は、本明細書中で「ＤＮＡ９６９８８−２６８５」（ＵＮＱ２５０７）と称されるクローンである。 図１０６は、図１０５に示される配列番号１０５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１０６）を示す。 図１０６は、図１０５に示される配列番号１０５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１０６）を示す。 図１０７は、ネイティブ配列ＰＲＯ６００１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０７）を示し、ここで、配列番号１０７は、本明細書中で「ＤＮＡ９８３８０」（ＵＮＱ２５１２）と称されるクローンである。 図１０７は、ネイティブ配列ＰＲＯ６００１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０７）を示し、ここで、配列番号１０７は、本明細書中で「ＤＮＡ９８３８０」（ＵＮＱ２５１２）と称されるクローンである。 図１０８は、図１０７に示される配列番号１０７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１０８）を示す。 図１０９は、ネイティブ配列ＰＲＯ６０９５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０９）を示し、ここで、配列番号１０９は、本明細書中で「ＤＮＡ１０５６８０−２７１０」（ＵＮＱ２５４３）と称されるクローンである。 図１０９は、ネイティブ配列ＰＲＯ６０９５ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１０９）を示し、ここで、配列番号１０９は、本明細書中で「ＤＮＡ１０５６８０−２７１０」（ＵＮＱ２５４３）と称されるクローンである。 図１１０は、図１０９に示される配列番号１０９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１１０）を示す。 図１１１は、ネイティブ配列ＰＲＯ６１８２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１１）を示し、ここで、配列番号１１１は、本明細書中で「ＤＮＡ１１０７００−２７１６」（ＵＮＱ２５５３）と称されるクローンである。 図１１２は、図１１１に示される配列番号１１１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１１２）を示す。 図１１３は、ネイティブ配列ＰＲＯ７１７０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１３）を示し、ここで、配列番号１１３は、本明細書中で「ＤＮＡ１０８７２２−２７４３」（ＵＮＱ２７８２）と称されるクローンである。 図１１４は、図１１３に示される配列番号１１３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１１４）を示す。 図１１５は、ネイティブ配列ＰＲＯ７１７１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１５）を示し、ここで、配列番号１１５は、本明細書中で「ＤＮＡ１０８６７０−２７４４」（ＵＮＱ２７８３）と称されるクローンである。 図１１６は、図１１５に示される配列番号１１５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１１６）を示す。 図１１７は、ネイティブ配列ＰＲＯ７４３６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１７）を示し、ここで、配列番号１１７は、本明細書中で「ＤＮＡ１１９５３５−２７５６」（ＵＮＱ２９７３）と称されるクローンである。 図１１８は、図１１７に示される配列番号１１７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１１８）を示す。 図１１９は、ネイティブ配列ＰＲＯ９９１２ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１１９）を示し、ここで、配列番号１１９は、本明細書中で「ＤＮＡ１０８７００−２８０２」（ＵＮＱ３０７７）と称されるクローンである。 図１２０は、図１１９に示される配列番号１１９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１２０）を示す。 図１２１は、ネイティブ配列ＰＲＯ９９１７ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１２１）を示し、ここで、配列番号１２１は、本明細書中で「ＤＮＡ１１９４７４−２８０３」（ＵＮＱ３０７９）と称されるクローンである。 図１２２は、図１２１に示される配列番号１２１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１２２）を示す。 図１２３は、ネイティブ配列ＰＲＯ３７３３７ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１２３）を示し、ここで、配列番号１２３は、本明細書中で「ＤＮＡ２２６８７４」（ＵＮＱ５２９１）と称されるクローンである。 図１２３は、ネイティブ配列ＰＲＯ３７３３７ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１２３）を示し、ここで、配列番号１２３は、本明細書中で「ＤＮＡ２２６８７４」（ＵＮＱ５２９１）と称されるクローンである。 図１２４は、図１２３に示される配列番号１２３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１２４）を示す。 図１２５は、ネイティブ配列ＰＲＯ３７４９６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１２５）を示し、ここで、配列番号１２５は、本明細書中で「ＤＮＡ２２７０３３」（ＵＮＱ５４０７）と称されるクローンである。 図１２６は、図１２５に示される配列番号１２５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１２６）を示す。 図１２７は、ネイティブ配列ＰＲＯ１９６４６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１２７）を示し、ここで、配列番号１２７は、本明細書中で「ＤＮＡ１４５８４１−２８６８」（ＵＮＱ５８２７）と称されるクローンである。 図１２８は、図１２７に示される配列番号１２７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１２８）を示す。 図１２９は、ネイティブ配列ＰＲＯ２１７１８ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１２９）を示し、ここで、配列番号１２９は、本明細書中で「ＤＮＡ１８８３４２」（ＵＮＱ５８９３）と称されるクローンである。 図１３０は、図１２９に示される配列番号１２９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１３０）を示す。 図１３１は、ネイティブ配列ＰＲＯ１９８２０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１３１）を示し、ここで、配列番号１３１は、本明細書中で「ＤＮＡ１４９９１１−２８８５」（ＵＮＱ５９２６）と称されるクローンである。 図１３２は、図１３１に示される配列番号１３１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１３２）を示す。 図１３３は、ネイティブ配列ＰＲＯ２１２０１ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１３３）を示し、ここで、配列番号１３３は、本明細書中で「ＤＮＡ１６８０２８−２９５６」（ＵＮＱ６０９８）と称されるクローンである。 図１３４は、図１３３に示される配列番号１３３のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１３４）を示す。 図１３５は、ネイティブ配列ＰＲＯ２００２６ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１３５）を示し、ここで、配列番号１３５は、本明細書中で「ＤＮＡ１５４０９５−２９９８」（ＵＮＱ６１１５）と称されるクローンである。 図１３６は、図１３５に示される配列番号１３５のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１３６）を示す。 図１３７は、ネイティブ配列ＰＲＯ２０１１０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１３７）を示し、ここで、配列番号１３７は、本明細書中で「ＤＮＡ１６６８１９−１３８１Ｒ１Ｐ１」（ＵＮＱ６１２９）と称されるクローンである。 図１３８は、図１３７に示される配列番号１３７のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１３８）を示す。 図１３９は、ネイティブ配列ＰＲＯ２３２０３ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１３９）を示し、ここで、配列番号１３９は、本明細書中で「ＤＮＡ１８５１７１−２９９４」（ＵＮＱ６５０７）と称されるクローンである。 図１４０は、図１３９に示される配列番号１３９のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１４０）を示す。 図１４１は、ネイティブ配列ＰＲＯ３５２５０ｃＤＮＡのヌクレオチド配列（配列番号１４１）を示し、ここで、配列番号１４１は、本明細書中で「ＤＮＡ１７１７３２−３１００」（ＵＮＱ９５７４）と称されるクローンである。 図１４２は、図１４１に示される配列番号１４１のコード配列から得られるアミノ酸配列（配列番号１４２）を示す。

Claims (149)

1. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、該方法は、
   （ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
   （ｂ）該非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；および
   （ｃ）該測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、
   ここで、該野生型動物の該生理学的特徴と異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴を、該非ヒトトランスジェニック動物における該遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、方法。
2. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、請求項１に記載の方法。
3. 性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記表現型が、以下：神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常のうちの少なくとも１つである、請求項１に記載の方法。
4. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項３に記載の方法。
5. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項３に記載の方法。
6. 前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項３に記載の方法。
7. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項３に記載の方法。
8. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項３に記載の方法。
9. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項３に記載の方法。
10. 前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項３に記載の方法。
11. 前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項３に記載の方法。
12. 前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項１０に記載の方法。
13. 前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項１０に記載の方法。
14. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症（ｄｙｓｐｌａｉｓａ ｓｐｏｎｄｙｌｏｅｐｉｐｈｙｓａｒｉａ ｃｏｎｇｅｎｔｉａ）、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病（Ａｌｂｅｒｓ−Ｓｃｈｎｏｂｅｒｇ ｄｉｓｅａｓｅ）、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群（Ａｌａｇｉｌｅ ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群（Ｐｉｅｒｒｅ−Ｍａｒｉｅ ｄｕｎｓｄｒｏｍｅ）、スティックラー症候群、カロチン血症（ｃａｒｏｔｉｎｅｍｅｉａ）、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項１０に記載の方法。
15. 前記眼の異常が、白内障である、請求項３に記載の方法。
16. 前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群（Ｈａｌｌｅｒｍａｎ−Ｓｔｒｅｉｆｆ ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー（Ｔｒｉｓｍｏｙ）１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症（ｈｙｐｏｐａｒａｔｈｒｏｉｄｉｓｍ）またはコンラーディ症候群）と一致する、請求項１５に記載の方法。
17. 前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項３に記載の方法。
18. 前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項３に記載の方法。
19. 前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス（ｓｙｓｔｅｍｉｃ ｌｕｐｕｓ ｅｒｙｔｈｅｍａｔｏｓｉｓ）；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性（ｎｏｎ−ｈｅｐａｔｏｔｒｏｐｉｃ）のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項３に記載の方法。
20. 前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項３に記載の方法。
21. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日（ｃｉｒｃａｄｉｉａｎ）リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管（ｒｅｔｉｎａｌ ｃａｐｉｌａｒｙ）漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ｔｏｔａｌ ｔｉｓｓｕｅ ｍａｓｓ；ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度（ｃｏｎｎｅｃｔｉｖｉｔｙ ｄｅｎｓｉｔｙ）の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症（ｓｙｓｔｅｍｉｃ ｈｉｓｔｉｏｃｙｔｉｃ ｓｔｏｒａｇｅ ｄｉｓｅａｓｅ）；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（ｐａｎｃｒｅａｔｉｃ ｄｙｓｅｒｙｔｈｒｏｐｏｉｅｔｉｃ ａｎｅｍｉａ）（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症（ｈｙｄｒｏｎｅｐｈｏｓｉｓ）；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項１に記載の方法。
22. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物由来の単離細胞。
23. マウス細胞である、請求項２２に記載の単離細胞。
24. 前記マウス細胞が、胚性幹細胞である、請求項２３に記載の単離細胞。
25. 性別一致野生型同腹仔と比較して、前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型：神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常のうちの少なくとも１つを示す、請求項２２に記載の単離細胞。
26. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は：
    （ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
    （ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；
    （ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、該野生型動物の該生理学的特徴と異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴を、該非ヒトトランスジェニック動物における該遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程；
    （ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
    （ｅ）該試験薬剤が、該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する該同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
    を含む、方法。
27. 前記遺伝子破壊と関連する前記表現型が、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常または障害；脂質代謝障害；または発達異常を含む、請求項２６に記載の方法。
28. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項２７に記載の方法。
29. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項２７に記載の方法。
30. 前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項２７に記載の方法。
31. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項２７に記載の方法。
32. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項２７に記載の方法。
33. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項２７に記載の方法。
34. 前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項２７に記載の方法。
35. 前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項２７に記載の方法。
36. 前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項３４に記載の方法。
37. 前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項３４に記載の方法。
38. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項３４に記載の方法。
39. 前記眼の異常が、白内障である、請求項２７に記載の方法。
40. 前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）と一致する、請求項３９に記載の方法。
41. 前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項２７に記載の方法。
42. 前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項２７に記載の方法。
43. 前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項２７に記載の方法。
44. 前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項２７に記載の方法。
45. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項２６に記載の方法。
46. 請求項２６に記載の方法によって同定される薬剤。
47. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項４６に記載の薬剤。
48. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項４７に記載の薬剤。
49. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項４７に記載の薬剤。
50. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は：
    （ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
    （ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程；
    （ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、該野生型動物によって示される該生理学的特徴と異なる該非ヒトトランスジェニック動物によって示される該生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程；
    （ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
    （ｅ）遺伝子破壊と関連する該生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
    を含む、方法。
51. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項５０に記載の方法。
52. 請求項５０に記載の方法によって同定される薬剤。
53. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項５２に記載の薬剤。
54. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項５３に記載の薬剤。
55. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項５３に記載の薬剤。
56. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は：
    （ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
    （ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程；
    （ｃ）（ｂ）の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、該野生型動物によって示される該観察された行動と異なる、該非ヒトトランスジェニック動物によって示される該観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程；
    （ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
    （ｅ）該薬剤が、遺伝子破壊と関連する該行動を調節するか否かを判定する工程
    を含む、方法。
57. 前記行動が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項５６に記載の方法。
58. 前記行動が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項５６に記載の方法。
59. 前記行動が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項５６に記載の方法。
60. 前記行動が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項５６に記載の方法。
61. 前記行動が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項５６に記載の方法。
62. 前記行動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項５６に記載の方法。
63. 請求項５６に記載の方法によって同定される薬剤。
64. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項６３に記載の薬剤。
65. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項６４に記載の薬剤。
66. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項６４に記載の薬剤。
67. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は：
    （ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
    （ｂ）該非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
    （ｃ）該試験薬剤が、該非ヒトトランスジェニック動物において、該神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
    を含む、方法。
68. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項６７に記載の方法。
69. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項６７に記載の方法。
70. 前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項６７に記載の方法。
71. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項６７に記載の方法。
72. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項６７に記載の方法。
73. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項６７に記載の方法。
74. 前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項６７に記載の方法。
75. 前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項６７に記載の方法。
76. 前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項７４に記載の方法。
77. 前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項７４に記載の方法。
78. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項７４に記載の方法。
79. 前記眼の異常が、白内障である、請求項６７に記載の方法。
80. 前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である、請求項７９に記載の方法。
81. 前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項６７に記載の方法。
82. 前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項６７に記載の方法。
83. 前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項６７に記載の方法。
84. 前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項６７に記載の方法。
85. 前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴：オープンフィールド試験中の不安様応答の増大；オープンフィールド試験中の不安の低減；概日リズムを有しない機能低下；オープンフィールド試験中の総移動距離の増加（活動亢進）；オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下；ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム（明期中の活性の低下）；歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム；不安表現型に起因するひげの喪失；概日リズムの増大；ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大（不安の増大）；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大；ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下；反転スクリーン試験中の運動協調性の増大；反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性；尾懸垂における不動の増加（抑鬱様応答の増大）；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大；尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少；尾懸垂試験中に後肢を握ること；プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下；難聴を示唆する無驚愕応答；感覚運動ゲーティング／注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大；熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大；眼科学的異常；瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化；角膜および強膜の化生；網膜動脈の減弱；網膜出血；視神経異常；視神経乳頭の拡大；眼内圧上昇；未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化；網膜変性症；ハーダー腺の発育不全；網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出；障害性の視力；心拍数の減少；平均収縮期血圧の低下；平均収縮期血圧の上昇；インスリン感度の増大；平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇；平均血清中グルコースレベルの低下；平均血清中コレステロールレベルの上昇；平均血清中コレステロールレベルの低下；平均血清中トリグリセリドレベルの上昇；耐糖能の増大；耐糖能障害；平均血清中インスリンレベルの低下；ケトン血症；平均血清中カルシウムの減少；血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類；ナトリウムおよび塩化物の減少；ビリルビンの増加；顕著な脂肪血症；尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇；平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下；尿中の血液；糖尿；亜硝酸塩尿症の増大；ケトン尿症；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇；ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；異常な白血球数；リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの上昇；ＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；ＣＤ８細胞の平均パーセンテージの低下；リンパ節中のナイーブＣＤ４Ｔ細胞およびナイーブＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージの低下；末梢血中のＢ細胞の平均パーセンテージの上昇；総白血球細胞数およびリンパ球数の減少；リンパ球の絶対数の減少；単球の平均絶対数の増加；好中球の平均絶対数の増加；平均血清中ＩｇＡレベルの低下；平均血清中ＩｇＡレベルの上昇；ＩｇＧ１レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１レベルの低下；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、ＩｇＧ２ｂおよびＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ｂレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ３およびＩｇＭレベルの低下；平均血清中ＩｇＧ２ａレベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ１、ＩｇＧ２ａおよびＩｇＧ３レベルの上昇；平均血清中ＩｇＧ３レベルの上昇；貧血；赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少；平均血球体積の増加；平均血球体積の減少；平均血球ヘモグロビンの減少；赤血球分布幅の増大；赤血球形成の不足；骨髄中のＩｇＭ＋ＩｇＤ＋およびＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−細胞の増加；骨髄中のＢ２２０ｈｉ／ＣＤ４３−ＩｇＭ＋ＩｇＤ＋細胞のパーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋細胞のパーセンテージの上昇；リンパ節中のナイーブＴ細胞の減少（特にＣＤ４）；脾臓中のＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１１ｃ−細胞（単球）のパーセンテージの上昇；骨髄中のＩｇＭ＋、ＣＤ１１７＋細胞のパーセンテージの上昇、死んだＢ細胞の高パーセンテージ、Ｂ細胞の減少、リンパ中のＣＤ４Ｔ細胞およびＣＤ８Ｔ細胞の増加；骨髄中のＢ細胞の増加およびリンパ節中のＢ細胞のかなりの減少；脾臓中のＣＤ２１ｈｉＣＤ２３ｍｅｄＢ細胞の顕著な減少；パイエル板中のＢ２２０＋細胞の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ８およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＴＣＲＢ＋ＣＤ３８＋活性化Ｔ細胞数の減少；Ｂ細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うＣＤ４細胞の平均パーセンテージの低下；パイエル板中のＢ２２０＋ＣＤ３８ｌｏｗおよびＩｇＭの減少；平均血小板数の増加；平均血小板数の減少；広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のＴリンパ球の減少および脾臓中のＴ細胞の枯渇；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ２ａ応答の増大；卵白アルブミン負荷に対する血清中ＩｇＧ１およびＩｇＧ２ａの応答の減少から喪失；卵白アルブミン負荷に対する平均血清中ＩｇＧ１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ、ＭＣＰ−１およびＩＬ−６応答の低減；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＭＣＰ−１応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＴＮＦ−アルファ応答の増大；ＬＰＳ負荷に対する平均血清中ＩＬ−６応答の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の増大；皮膚線維芽細胞の増殖の低減；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加；平均体重の増加；平均体長の増大；総組織質量（ＴＴＭ）の増加；除脂肪体重（ＬＢＭ）の増加；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；骨塩密度（ＢＭＤ）の増加；全身の体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の増加；骨塩量（ＢＭＣ）の増加；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加；総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少；平均体重の減少；平均体長の低減；総組織質量（ＴＴＭ）の減少；除脂肪体重（ＬＢＭ）の減少；大腿骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；椎骨の骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩密度（ＢＭＤ）の減少；骨塩量（ＢＭＣ）の減少；骨塩密度指標の減少；体積測定による骨塩密度（ｖＢＭＤ）の減少；大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少；椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少；骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病；様々な組織における慢性炎症；胸腺萎縮；肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症；肝臓の大きさの縮小；限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎；肝臓中の脂肪変化；肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大；膵臓の赤血球異形成貧血（１型）；多巣性神経細胞壊死；小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力；脳の多巣性発生奇形；水腎症；びまん性脱毛症；表皮性角質増殖；異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症（異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少）；成長遅延；発生異常；骨髄の顆粒球の形成不全；骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少；顆粒球形成の低減；無歯；すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全；心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損；凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症；鬱血性心不全；膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ（グリコーゲン）細胞およびベータ（インスリン）細胞の分布の変化；脂質／コレステロールの取り込みまたは代謝の変化（コレステロールおよびトリグリセリドの増加）と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化；不妊症；精巣変性；精細管の空胞変性；精液過少症；萎縮睾丸；卵巣および子宮の発育不全；ほんの数本の管を示す乳腺；生存能低下を伴う成長遅延；ならびに胚性致死のうちの少なくとも１つを示す、請求項６７に記載の方法。
86. 請求項６７に記載の方法によって同定される薬剤。
87. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項８６に記載の薬剤。
88. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項８７に記載の薬剤。
89. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項８７に記載の薬剤。
90. 請求項６７に記載の方法によって同定される治療薬。
91. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は：
    （ａ）ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程；および
    （ｂ）該試験薬剤が、該宿主細胞による該ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節するか否かを判定する工程
    を含む、方法。
92. 請求項９１に記載の方法によって同定される薬剤。
93. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項９２に記載の薬剤。
94. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９３に記載の薬剤。
95. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９３に記載の薬剤。
96. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を評価する方法であって、該方法は：
    （ａ）該ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程；
    （ｂ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程；
    （ｃ）（ｂ）の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、該野生型動物の該生理学的特徴と異なる該非ヒトトランスジェニック動物の該生理学的特徴を、該非ヒトトランスジェニック動物における該遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程；
    （ｄ）（ａ）の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程；および
    （ｅ）該非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する該同定された状態に対する該試験薬剤の作用を評価する工程
    を含む、方法。
97. 前記状態が、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常または障害；脂質代謝障害；または発達異常である、請求項９６に記載の方法。
98. 請求項９６に記載の方法によって同定される治療薬。
99. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項９８に記載の治療薬。
100. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４，抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９９に記載の治療薬。
101. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗 ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項９９に記載の治療薬。
102. 請求項９８に記載の治療薬を含む薬学的組成物。
103. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、該方法は、該障害をすでに有し得るか、または該障害を有する傾向にあり得るか、もしくは該障害を予防すべき状態であり得る、そのような処置を必要とする被験体に、治療有効量の請求項９４に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、該障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。
104. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項１０３に記載の方法。
105. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項１０３に記載の方法。
106. 前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項１０３に記載の方法。
107. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項１０３に記載の方法。
108. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項１０３に記載の方法。
109. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項１０３に記載の方法。
110. 前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項１０３に記載の方法。
111. 前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項１０３に記載の方法。
112. 前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項１１０に記載の方法。
113. 前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項１１０に記載の方法。
114. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項１１０に記載の方法。
115. 前記眼の異常が、白内障である、請求項１０３に記載の方法。
116. 前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である、請求項１１５に記載の方法。
117. 前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項１０３に記載の方法。
118. 前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項１０３に記載の方法。
119. 前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項１０３に記載の方法。
120. 前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項１０３に記載の方法。
121. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮または血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常または障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、該方法は：
     （ａ）非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、該培養物の各細胞は、ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程；
     （ｂ）該細胞培養物に試験薬剤を投与する工程；および
     （ｃ）該試験薬剤が、該細胞培養物において、該神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；眼の異常；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害；脂質代謝障害；または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
     を含む、方法。
122. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項１２１に記載の方法。
123. 前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項１２１に記載の方法。
124. 前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項１２１に記載の方法。
125. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項１２１に記載の方法。
126. 前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項１２１に記載の方法。
127. 前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項１２１に記載の方法。
128. 前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項１２１に記載の方法。
129. 前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項１２１に記載の方法。
130. 前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項１２８に記載の方法。
131. 前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項１２８に記載の方法。
132. 前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜／脈絡膜血管新生、隅角血管新生（ルベオーシス）、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形（ＡＶＭ）、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大（グレーブス病を含む）、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖；網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項１２８に記載の方法。
133. 前記眼の異常が、白内障である、請求項１２１に記載の方法。
134. 前記白内障が、全身性疾患（例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー１３−１５、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群）である、請求項１３３に記載の方法。
135. 前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項１２１に記載の方法。
136. 前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患（例えば、真性糖尿病；乳頭浮腫；視神経萎縮；アテローム性動脈硬化症；アンギナ；急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全；高血圧症；炎症性血管炎；レイノー病およびレイノー現象；動脈瘤ならびに動脈再狭窄）；静脈およびリンパの障害（例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫）；末梢血管疾患；癌（例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫（毛細管および海綿状）、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫）；腫瘍血管新生；外傷（例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害）、移植片固定、瘢痕；虚血再灌流傷害；関節リウマチ；脳血管疾患；急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項１２１に記載の方法。
137. 前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス；関節リウマチ；若年性慢性関節炎；脊椎関節症；全身硬化症（強皮症）；特発性炎症性筋障害（皮膚筋炎、多発性筋炎）；シェーグレン症候群；全身性血管炎；サルコイドーシス；自己免疫性溶血性貧血（免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症）；自己免疫性血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症）；甲状腺炎（グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎）；真性糖尿病；免疫媒介性腎疾患（糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎）；中枢および末梢神経系の脱髄疾患（例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー）；肝胆疾患（例えば、感染性肝炎（Ａ型、Ｂ型、Ｃ型、Ｄ型、Ｅ型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎）、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎）；炎症性腸疾患（潰瘍性大腸炎：クローン病）；グルテン過敏性腸症およびホイップル病；水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬；アレルギー性疾患（例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹）；肺の免疫学的疾患（例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎）；または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項１２１に記載の方法。
138. 前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項１２１に記載の方法。
139. 請求項１２１に記載の方法によって同定される薬剤。
140. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項１３９に記載の薬剤。
141. 前記アゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項１４０に記載の薬剤。
142. 前記アンタゴニストが、抗ＰＲＯ６９１２２、抗ＰＲＯ２０４、抗ＰＲＯ２１４、抗ＰＲＯ２２２、抗ＰＲＯ２３４、抗ＰＲＯ２６５、抗ＰＲＯ３０９、抗ＰＲＯ３３２、抗ＰＲＯ３４２、抗ＰＲＯ３５６、抗ＰＲＯ５４０、抗ＰＲＯ６１８、抗ＰＲＯ９４４、抗ＰＲＯ９９４、抗ＰＲＯ１０７９、抗ＰＲＯ１１１０、抗ＰＲＯ１１２２、抗ＰＲＯ１１３８、抗ＰＲＯ１１９０、抗ＰＲＯ１２７２、抗ＰＲＯ１２８６、抗ＰＲＯ１２９５、抗ＰＲＯ１３０９、抗ＰＲＯ１３１６、抗ＰＲＯ１３８３、抗ＰＲＯ１３８４、抗ＰＲＯ１４３１、抗ＰＲＯ１４３４、抗ＰＲＯ１４７５、抗ＰＲＯ１４８１、抗ＰＲＯ１５６８、抗ＰＲＯ１５７３、抗ＰＲＯ１５９９、抗ＰＲＯ１６０４、抗ＰＲＯ１６０５、抗ＰＲＯ１６９３、抗ＰＲＯ１７５３、抗ＰＲＯ１７５５、抗ＰＲＯ１７７７、抗ＰＲＯ１７８８、抗ＰＲＯ１８６４、抗ＰＲＯ１９２５、抗ＰＲＯ１９２６、抗ＰＲＯ３５６６、抗ＰＲＯ４３３０、抗ＰＲＯ４４２３、抗ＰＲＯ３６９３５、抗ＰＲＯ４９７７、抗ＰＲＯ４９７９、抗ＰＲＯ４９８０、抗ＰＲＯ４９８１、抗ＰＲＯ５８０１、抗ＰＲＯ５９９５、抗ＰＲＯ６００１、抗ＰＲＯ６０９５、抗ＰＲＯ６１８２、抗ＰＲＯ７１７０、抗ＰＲＯ７１７１、抗ＰＲＯ７４３６、抗ＰＲＯ９９１２、抗ＰＲＯ９９１７、抗ＰＲＯ３７３３７、抗ＰＲＯ３７４９６、抗ＰＲＯ１９６４６、抗ＰＲＯ２１７１８、抗ＰＲＯ１９８２０、抗ＰＲＯ２１２０１、抗ＰＲＯ２００２６、抗ＰＲＯ２０１１０、抗ＰＲＯ２３２０３または抗ＰＲＯ３５２５０抗体である、請求項１４０に記載の薬剤。
143. 請求項１２１に記載の方法によって同定される治療薬。
144. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、該方法は、該表現型をすでに有し得るか、または該表現型を有する傾向にあり得るか、もしくは該表現型を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項４６に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、該表現型を効果的に調節する、方法。
145. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、該方法は、該生理学的特徴をすでに示し得るか、または該生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは該生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項５２に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、該生理学的特徴を効果的に調節する、方法。
146. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する方法であって、該方法は、該行動をすでに示し得るか、または該行動を示す傾向にあり得るか、もしくは該示される行動を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項６３に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、該行動を効果的に調節する、方法。
147. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ２８５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドの発現を調節する方法であって、該方法は、該ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドを発現している宿主細胞に、有効量の請求項９２に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、該ポリペプチドの発現を効果的に調節する、方法。
148. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、該方法は、該状態を有し得るか、または該状態を有する傾向にあり得るか、もしくは該状態を予防すべき状態であり得る被験体に、治療有効量の請求項９８に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、該状態を効果的に調節する、方法。
149. ＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害；心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害；免疫障害；腫瘍学的障害；骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、該方法は、各細胞がＰＲＯ６９１２２、ＰＲＯ２０４、ＰＲＯ２１４、ＰＲＯ２２２、ＰＲＯ２３４、ＰＲＯ２６５、ＰＲＯ３０９、ＰＲＯ３３２、ＰＲＯ３４２、ＰＲＯ３５６、ＰＲＯ５４０、ＰＲＯ６１８、ＰＲＯ９４４、ＰＲＯ９９４、ＰＲＯ１０７９、ＰＲＯ１１１０、ＰＲＯ１１２２、ＰＲＯ１１３８、ＰＲＯ１１９０、ＰＲＯ１２７２、ＰＲＯ１２８６、ＰＲＯ１２９５、ＰＲＯ１３０９、ＰＲＯ１３１６、ＰＲＯ１３８３、ＰＲＯ１３８４、ＰＲＯ１４３１、ＰＲＯ１４３４、ＰＲＯ１４７５、ＰＲＯ１４８１、ＰＲＯ１５６８、ＰＲＯ１５７３、ＰＲＯ１５９９、ＰＲＯ１６０４、ＰＲＯ１６０５、ＰＲＯ１６９３、ＰＲＯ１７５３、ＰＲＯ１７５５、ＰＲＯ１７７７、ＰＲＯ１７８８、ＰＲＯ１８６４、ＰＲＯ１９２５、ＰＲＯ１９２６、ＰＲＯ３５６６、ＰＲＯ４３３０、ＰＲＯ４４２３、ＰＲＯ３６９３５、ＰＲＯ４９７７、ＰＲＯ４９７９、ＰＲＯ４９８０、ＰＲＯ４９８１、ＰＲＯ５８０１、ＰＲＯ５９９５、ＰＲＯ６００１、ＰＲＯ６０９５、ＰＲＯ６１８２、ＰＲＯ７１７０、ＰＲＯ７１７１、ＰＲＯ７４３６、ＰＲＯ９９１２、ＰＲＯ９９１７、ＰＲＯ３７３３７、ＰＲＯ３７４９６、ＰＲＯ１９６４６、ＰＲＯ２１７１８、ＰＲＯ１９８２０、ＰＲＯ２１２０１、ＰＲＯ２００２６、ＰＲＯ２０１１０、ＰＲＯ２３２０３またはＰＲＯ３５２５０ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、治療有効量の請求項１３９に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、該障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。
     

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