JP2009232849A - 異なる遺伝子に対するトランスジェニック動物、および遺伝子の特徴づけのためのその使用 - Google Patents
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Abstract
【課題】新規遺伝子破壊、およびそれに関連した組成物および方法を提供する。
【解決手段】本発明は、遺伝子機能の特徴づけに関するトランスジェニック動物ならびに組成物および方法に関する。このようなin vivoにおける研究および特徴づけは、遺伝子破壊に関連する疾患または機能障害(例えば、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨の代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常)の予防、寛解または矯正に有用な治療薬および/または処置法の価値ある同定および発見を提供し得る。
【選択図】なし
【解決手段】本発明は、遺伝子機能の特徴づけに関するトランスジェニック動物ならびに組成物および方法に関する。このようなin vivoにおける研究および特徴づけは、遺伝子破壊に関連する疾患または機能障害(例えば、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨の代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常)の予防、寛解または矯正に有用な治療薬および/または処置法の価値ある同定および発見を提供し得る。
【選択図】なし
Description
(発明の分野)
本発明は、トランスジェニック動物およびノックアウト動物を含む組成物ならびに疾患または障害の診断および処置のためにそのような組成物を使用する方法に関する。
本発明は、トランスジェニック動物およびノックアウト動物を含む組成物ならびに疾患または障害の診断および処置のためにそのような組成物を使用する方法に関する。
(発明の背景)
細胞外タンパク質は、とりわけ、多細胞生物の形成、分化および維持において重要な役割を果たしている。多くの個々の細胞の運命、例えば、増殖、移動、分化または他の細胞との相互作用は、代表的には他の細胞および/または直属の環境から受ける情報により支配されている。この情報は、分泌ポリペプチド(例えば、分裂促進因子、生存因子、細胞傷害性因子、分化因子、神経ペプチドおよびホルモン)により伝達されることが多く、そのポリペプチドは、その後多様な細胞レセプターまたは膜結合タンパク質から受け、そして解釈される。これらの分泌ポリペプチドまたはシグナル伝達分子は、通常、細胞分泌経路を通って細胞外環境におけるそれらの作用部位に到達する。
細胞外タンパク質は、とりわけ、多細胞生物の形成、分化および維持において重要な役割を果たしている。多くの個々の細胞の運命、例えば、増殖、移動、分化または他の細胞との相互作用は、代表的には他の細胞および/または直属の環境から受ける情報により支配されている。この情報は、分泌ポリペプチド(例えば、分裂促進因子、生存因子、細胞傷害性因子、分化因子、神経ペプチドおよびホルモン)により伝達されることが多く、そのポリペプチドは、その後多様な細胞レセプターまたは膜結合タンパク質から受け、そして解釈される。これらの分泌ポリペプチドまたはシグナル伝達分子は、通常、細胞分泌経路を通って細胞外環境におけるそれらの作用部位に到達する。
分泌タンパク質は、医薬品、診断薬、バイオセンサーおよびバイオリアクターを含む様々な産業上の用途を有している。現在利用可能なほとんどのタンパク質薬物(例えば、血栓溶解剤、インターフェロン、インターロイキン、エリトロポイエチン、コロニー刺激因子および様々な他のサイトカイン)は、分泌タンパク質である。膜タンパク質であるそれらのレセプターもまた、治療薬または診断薬としての潜在性を有する。産業界および学術界の両方によって、新規の天然の分泌タンパク質を同定するための努力がなされている。多くの努力は、新規の分泌タンパク質に対するコード配列を同定するための哺乳動物組換えDNAライブラリーのスクリーニングに着目している。スクリーニングの方法および手法の例は、文献に記載されている[例えば、非特許文献1;特許文献1を参照のこと]。
膜結合タンパク質およびレセプターは、とりわけ、多細胞生物の形成、分化および維持において重要な役割を果たし得る。多くの個々の細胞の運命、例えば、増殖、移動、分化または他の細胞との相互作用は、代表的には他の細胞および/または直属の環境から受ける情報により支配されている。この情報は、分泌ポリペプチド(例えば、分裂促進因子、生存因子、細胞傷害性因子、分化因子、神経ペプチドおよびホルモン)により伝達されることが多く、そのポリペプチドは、その後多様な細胞レセプターまたは膜結合タンパク質により受け、そして解釈される。このような膜結合タンパク質および細胞レセプターとしては、サイトカインレセプター、レセプターキナーゼ、レセプターホスファターゼ、細胞−細胞相互作用に関与するレセプターならびにセレクチンおよびインテグリンのような細胞接着分子が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、細胞の成長および分化を制御するシグナルの伝達は、部分的に、様々な細胞タンパク質のリン酸化により制御される。そのプロセスを触媒する酵素であるタンパク質チロシンキナーゼは、成長因子レセプターとしても機能できる。例としては、線維芽細胞成長因子レセプターおよび神経成長因子レセプターが挙げられる。
膜結合タンパク質およびレセプター分子は、医薬品および診断薬を含む様々な産業上の用途を有している。例えば、レセプター免疫接着は、レセプター−リガンド相互作用を阻止するための治療薬として使用され得る。膜結合タンパク質は、関連するレセプター/リガンド相互作用の潜在的なペプチドまたは小分子のインヒビターのスクリーニングのためにも使用され得る。
産業界および学術界の両方で新規の天然のレセプターまたは膜結合タンパク質を同定するための努力がなされている。多くの努力は、新規のレセプターまたは膜結合タンパク質に対するコード配列を同定するための哺乳動物組換えDNAライブラリーのスクリーニングに着目している。
生物学的過程および疾患の過程における分泌タンパク質および膜結合タンパク質の重要性を鑑みれば、in vivoでの研究および特徴づけは、疾患または機能障害の予防、寛解または矯正において有用な治療薬および/または処置法の価値ある同定および発見を提供とし得る。この点に関して、遺伝子操作されたマウスは、免疫学、癌、神経生物学、心臓血管生物学、肥満症および他の多くのものを含むヒトの疾患に関連する生物学的過程の機能的分析のための貴重な道具であることが示されている。遺伝子ノックアウトは高度に特異的なアンタゴニストの活性をin vivoで予測することにより薬物作用の生物学的機序をモデル化しているものとして捉えることができる。ノックアウトマウスは、薬物の活性をモデル化していることが示されており;特定の薬学的標的タンパク質が欠損したマウスの表現型は、対応するアンタゴニスト薬物によって引き起こされるヒトの臨床表現型を模倣し得る。遺伝子ノックアウトは、標的の作用機序、標的の主要な生理学的役割、および標的の阻害から生じ得る機序に基づいた副作用を哺乳動物において発見可能とする。このタイプの例としては、アンギオテンシン変換酵素(ACE)欠損マウス[非特許文献2]およびシクロオキシゲナーゼ−1(COX1)遺伝子欠損マウス[非特許文献3]が挙げられる。逆に、マウスにおいて遺伝子をノックアウトすることは、対応する標的へのアゴニスト剤の投与後にヒトにおいて観察されるものとは逆の表現型作用を有することができる。例としては、変異の結果が赤血球産生不全であるエリトロポイエチンノックアウト[非特許文献4]および変異マウスが活動亢進および応答性亢進を示すGABA(A)−R−β3ノックアウト[非特許文献5]が挙げられる。これらの表現型は共にヒトにおけるエリトロポイエチンおよびベンゾジアゼピンの投与の作用とは逆である。マウス遺伝学を用いて確証された標的の顕著な例は、ACC2遺伝子である。ヒトACC2遺伝子は数年前に同定されたが、薬物開発の標的としてのACC2への関心は、ノックアウトマウスを用いたACC2機能解析後の最近になってようやく活気づいた。ACC2変異マウスは、その野生型同腹仔よりも大食であるが、より多くの脂肪を燃焼し、その脂肪細胞中への脂肪の貯留は少ないことから、この酵素は、肥満症の処置における化学的拮抗作用に関する推定標的となる[非特許文献6]。
本出願において、変異した遺伝子の破壊は、CNS/神経の撹乱もしくは障害(例えば、不安);眼の異常および関連疾患;アテローム性動脈硬化症を含む心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;異常な代謝障害(糖尿病および血清中のトリグリセリドおよびコレステロールのレベルの上昇に伴う異脂肪血症を含む);免疫学的障害および炎症性障害;腫瘍学的障害;骨の代謝の異常もしくは障害(例えば、関節炎、骨粗鬆症および大理石骨病);または胚性致死などの発達疾患を含む様々な疾患状態または機能障害に関連する表現型の観察結果をもたらした。
Klein et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.93:7108−7113(1996)
Esther,C.R.et al.,Lab.Invest.,74:953−965(1996)
Langenbach,R.et al.,Cell,83:483−492(1995)
Wu,C.S.et al.,Cell.,83:59−67(1996)
DeLorey,T.M.,J.Neurosci.,18:8505−8514(1998)
(発明の要旨)
A.実施形態
本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。
A.実施形態
本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する。
1つの態様において、前記単離された核酸分子は、(a)本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを欠いたアミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを含むか、もしくは含まない、膜貫通タンパク質の細胞外ドメインまたは本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントを有する、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNA分子、または(b)(a)のDNA分子の相補物に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%の核酸配列同一性、あるいは少なく
とも約93%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%の核酸配列同一性、およびあるいは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
とも約93%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%の核酸配列同一性、およびあるいは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
他の態様において、前記単離された核酸分子は、(a)本明細書中に開示するような全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドcDNAのコード配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを欠く、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのコード配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを含むか、もしくは含まない、膜貫通型PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO
37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメインのコード配列、または本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントのコード配列を含むDNA分子、あるいは(b)(a)のDNA分子の相補物に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約93%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%の核酸配列同一性および、あるいは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメインのコード配列、または本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントのコード配列を含むDNA分子、あるいは(b)(a)のDNA分子の相補物に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約93%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%の核酸配列同一性および、あるいは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む。
さらなる態様において、本発明は、(a)本明細書中に開示するようなATCCに寄託されているヒトタンパク質cDNAのいずれかによってコードされる同じ成熟ポリペプチドをコードするDNA分子、または(b)(a)のDNA分子の相補物に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約93%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%の核酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%核酸配列同一性、およびあるいは少なくとも約99%の核酸配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子に関する。
本発明の別の態様は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供し、それらのポリペプチドは、膜貫通型ドメイン欠失型もしくは膜貫通型ドメイン不活性型のいずれかであるか、またはそのようなコーディングヌ
クレオチド配列に相補的であり、ここで、そのようなポリペプチドの膜貫通型ドメインを、本明細書中で記載する。したがって、本明細書中に記載される、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの可溶性細胞外ドメインが企図される。
クレオチド配列に相補的であり、ここで、そのようなポリペプチドの膜貫通型ドメインを、本明細書中で記載する。したがって、本明細書中に記載される、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの可溶性細胞外ドメインが企図される。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチドコード配列またはそれらの相補物のフラグメントも提供し、それらのフラグメントは、例えば、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203もしくは抗PRO35250抗体に対する結合部位を含むポ
リペプチドを必要に応じてコードし得る、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのコーディングフラグメントに対するハイブリダイゼーションプローブまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドプローブとしての用途が見出され得る。このような核酸フラグメントは、通常約10ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約10ヌクレオチド長、あるいは約15ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約15ヌクレオチド長、あるいは約20ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約20ヌクレオチド長、あるいは約30ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約30ヌクレオチド長、あるいは約40ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約40ヌクレオチド長、あるいは約50ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約50ヌクレオチド長、あるいは約60ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約60ヌクレオチド長、あるいは約70ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約70ヌクレオチド長、あるいは約80ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約80ヌクレオチド長、あるいは約90ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約90ヌクレオチド長、あるいは約100ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約100ヌクレオチド長、あるいは約110ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約110ヌクレオチド長、あるいは約120ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約120ヌクレオチド長、あるいは約130ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約130ヌクレオチド長、あるいは約140ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約140ヌクレオチド長、あるいは約150ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約150ヌクレオチド長、あるいは約160ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約160ヌクレオチド長、あるいは約170ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約170ヌクレオチド長、あるいは約180ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約180ヌクレオチド長、あるいは約190ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約190ヌクレオチド長、あるいは約200ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約200ヌクレオチド長、あるいは約250ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約250ヌクレオチド長、あるいは約300ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約300ヌクレオチド長、あるいは約350ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約350ヌクレオチド長、あるいは約400ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約400ヌクレオチド長、あるいは約450ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約450ヌクレオチド長、あるいは約500ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約500ヌクレオチド長、あるいは約600ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約600ヌクレオチド長、あるいは約700ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約700ヌクレオチド長、あるいは約800ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約800ヌクレオチド長、あるいは約900ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約900ヌクレオチド長、およびあるいは約1000ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約1000ヌクレオチド長であり、ここで、この文脈において、用語「約」とは、参照ヌクレオチド配列の長さ±その参照配列の長さの10%を意味する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234
、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の新規フラグメントは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と他の公知のヌクレオチド配列とを、多くの周知の配列アラインメントプログラムのいずれかを使用してアラインメントして、いずれのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列フラグメントが新規であるかを判定することによって、慣習的な様式で決定され得ることが
注目される。このようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のすべてが、本明細書中で企図される。これらのヌクレオチド分子フラグメントによってコードされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメント、好ましくは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体に対する結合部位を含む、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO23
4、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメントもまた、企図される。
リペプチドを必要に応じてコードし得る、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのコーディングフラグメントに対するハイブリダイゼーションプローブまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドプローブとしての用途が見出され得る。このような核酸フラグメントは、通常約10ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約10ヌクレオチド長、あるいは約15ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約15ヌクレオチド長、あるいは約20ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約20ヌクレオチド長、あるいは約30ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約30ヌクレオチド長、あるいは約40ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約40ヌクレオチド長、あるいは約50ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約50ヌクレオチド長、あるいは約60ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約60ヌクレオチド長、あるいは約70ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約70ヌクレオチド長、あるいは約80ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約80ヌクレオチド長、あるいは約90ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約90ヌクレオチド長、あるいは約100ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約100ヌクレオチド長、あるいは約110ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約110ヌクレオチド長、あるいは約120ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約120ヌクレオチド長、あるいは約130ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約130ヌクレオチド長、あるいは約140ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約140ヌクレオチド長、あるいは約150ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約150ヌクレオチド長、あるいは約160ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約160ヌクレオチド長、あるいは約170ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約170ヌクレオチド長、あるいは約180ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約180ヌクレオチド長、あるいは約190ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約190ヌクレオチド長、あるいは約200ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約200ヌクレオチド長、あるいは約250ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約250ヌクレオチド長、あるいは約300ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約300ヌクレオチド長、あるいは約350ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約350ヌクレオチド長、あるいは約400ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約400ヌクレオチド長、あるいは約450ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約450ヌクレオチド長、あるいは約500ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約500ヌクレオチド長、あるいは約600ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約600ヌクレオチド長、あるいは約700ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約700ヌクレオチド長、あるいは約800ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約800ヌクレオチド長、あるいは約900ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約900ヌクレオチド長、およびあるいは約1000ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約1000ヌクレオチド長であり、ここで、この文脈において、用語「約」とは、参照ヌクレオチド配列の長さ±その参照配列の長さの10%を意味する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234
、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の新規フラグメントは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と他の公知のヌクレオチド配列とを、多くの周知の配列アラインメントプログラムのいずれかを使用してアラインメントして、いずれのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列フラグメントが新規であるかを判定することによって、慣習的な様式で決定され得ることが
注目される。このようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列のすべてが、本明細書中で企図される。これらのヌクレオチド分子フラグメントによってコードされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメント、好ましくは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体に対する結合部位を含む、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO23
4、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメントもまた、企図される。
本発明は、本明細書の上で同定された、単離された核酸配列のいずれかによってコードされる、単離されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。
特定の態様において、本発明は、本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを欠くアミノ酸配列、本明細書中に開示するようなシグナルペプチドを含むか、もしくは含まない膜貫通タンパク質の細胞外ドメイン、または本明細書中に開示するような全長アミノ酸配列の他の任意の特別に定義されたフラグメントを有する、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PR
O23203またはPRO35250ポリペプチドに対して、少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約93%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%のアミノ酸配列同一性および、あるいは少なくとも約99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単離されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに関する。
O23203またはPRO35250ポリペプチドに対して、少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約93%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%のアミノ酸配列同一性および、あるいは少なくとも約99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単離されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに関する。
さらなる態様において、本発明は、本明細書中に開示するようなATCCに寄託されているヒトタンパク質cDNAのいずれかによってコードされるアミノ酸配列に対して、少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約81%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約82%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約83%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約84%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約85%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約86%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約87%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約88%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約89%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約90%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約91%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約92%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約93%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約94%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約95%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約96%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約97%のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約98%のアミノ酸配列同一性および、あるいは少なくとも約99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、単離されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1
605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに関する。
605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに関する。
1つの態様において、本発明は、約10アミノ酸長であるかまたは少なくとも約10アミノ酸長であるか、あるいは、約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長もしくはそれ以上であるか、または少なくとも約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、 200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長またはそれ以上であるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドに関する。必要に応じて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO1
9646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較した場合、1つまたはただ1つの保存的アミノ酸置換を有するか、あるいは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較した場合、2、3、4、5、6、7、8、9または10個またはわずか2、3、4、5、6、7、8、9または10個の保存的アミノ酸置換を有する。
9646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較した場合、1つまたはただ1つの保存的アミノ酸置換を有するか、あるいは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較した場合、2、3、4、5、6、7、8、9または10個またはわずか2、3、4、5、6、7、8、9または10個の保存的アミノ酸置換を有する。
特定の態様において、本発明は、N末端のシグナル配列および/または開始メチオニンを有さず、そして、本明細書中の上に記載したようなアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列によってコードされる、単離されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19
646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。同じものを生成するためのプロセスもまた、本明細書中に記載し、そのプロセスは、適切なコード核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物からPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを回収する工程を含む。
646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。同じものを生成するためのプロセスもまた、本明細書中に記載し、そのプロセスは、適切なコード核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物からPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを回収する工程を含む。
別の態様において、本発明は、膜貫通型ドメイン欠失型または膜貫通型ドメイン不活性型のいずれかである、単離されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20
110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。同じものを生成するためのプロセスもまた、本明細書中に記載し、そのプロセスは、適切なコード核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物からPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを回収する工程を含む。
110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。同じものを生成するためのプロセスもまた、本明細書中に記載し、そのプロセスは、適切なコード核酸分子を含むベクターを含む宿主細胞を、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物からPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを回収する工程を含む。
本発明は、本明細書中で定義されるようなネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストを提供する。特に、前記アゴニストまたはアンタゴニス
トは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203もしくは抗PRO35250抗体または小分子である。
トは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203もしくは抗PRO35250抗体または小分子である。
本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアゴニストまたはアンタゴニストを同定する方法を提供し、その方法は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを候補分子と接触させる工程および前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356
、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドによって媒介される生物学的活性をモニターする工程を含む。好ましくは、前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドである。
、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドによって媒介される生物学的活性をモニターする工程を含む。好ましくは、前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドである。
本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO156
8、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチド、あるいは本明細書中に記載されるようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニスト、あるいは抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を、担体と組み合わせて含む物質の組成物を提供する。必要に応じて、前記担体は、薬学的に許容可能な担体である。
8、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチド、あるいは本明細書中に記載されるようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニスト、あるいは抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を、担体と組み合わせて含む物質の組成物を提供する。必要に応じて、前記担体は、薬学的に許容可能な担体である。
本発明は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO157
3、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体に対して応答性である状態の処置に有用な薬物を調製するための、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチド、あるいは本明細書中の前に記載されたようなそれらのアゴニストまたはアンタゴニスト、あるいは抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体の使用を提供する。
3、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体に対して応答性である状態の処置に有用な薬物を調製するための、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203もしくはPRO35250ポリペプチド、あるいは本明細書中の前に記載されたようなそれらのアゴニストまたはアンタゴニスト、あるいは抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体の使用を提供する。
本発明は、本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかをコードするDNAを含むベクターを提供する。任意のこのようなベクターを含む宿主細胞もまた、提供される。例としては、前記宿主細胞は、CHO細胞、E.coliまたは酵母であり得る。本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかを生成するためのプロセスがさらに提供され、そのプロセスは、宿主細胞を所望のポリペプチドの発現に適した条件下で培養する工程およびその細胞培養物から所望のポリペプチドを回収する工程を含む。
本発明は、異種性のポリペプチドまたはアミノ酸配列に融合された、本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかを含むキメラ分子を提供する。そのようなキメラ分子の例は、エピトープタグ配列または免疫グロブリンのFc領域に融合された、本明細書中に記載するポリペプチドのいずれかを含む。
本発明は、好ましくは、上記または下記のポリペプチドのいずれかに特異的に結合する抗体を提供する。必要に応じて、その抗体は、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、抗体フラグメントまたは一本鎖抗体である。
本発明は、ゲノムおよびcDNAヌクレオチド配列を単離するため、関連遺伝子の発現を測定または検出するために有用であり得るオリゴヌクレオチドプローブまたはアンチセンスプローブとしてのオリゴヌクレオチドプローブを提供し、ここで、それらのプローブは、上記または下記のヌクレオチド配列のいずれかから得られることがある。好ましいプローブの長さは、本明細書中に記載する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;および
(c)測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、ここで、その野生型動物の生理学的特徴と異なる非ヒトトランスジェニック動物の
生理学的特徴を、非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する。1つの態様において、非ヒトトランスジェニック動物は、哺乳動物である。別の態様において、前記哺乳動物は、げっ歯類である。さらに別の態様において、前記哺乳動物は、ラットまたはマウスである。1つの態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である。別の態様において、性別一致野生型同腹仔と比較したときの非ヒトトランスジェニック動物によって示される表現型は、以下:神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常のうちの少なくとも1つである。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;および
(c)測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、ここで、その野生型動物の生理学的特徴と異なる非ヒトトランスジェニック動物の
生理学的特徴を、非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する。1つの態様において、非ヒトトランスジェニック動物は、哺乳動物である。別の態様において、前記哺乳動物は、げっ歯類である。さらに別の態様において、前記哺乳動物は、ラットまたはマウスである。1つの態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である。別の態様において、性別一致野生型同腹仔と比較したときの非ヒトトランスジェニック動物によって示される表現型は、以下:神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常のうちの少なくとも1つである。
なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害(learning disorder)/障害(disability)、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性(histronic)、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする
。
。
さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症(dysplaisa spondyloepiphysaria congentia)、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病(Albers−Schnoberg disease)、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群(Alagile syndrome)、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群(Pierre−Marie dunsdrome)、スティックラー症候群、カロチン血症(carotinemeia)、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群(Hallerman−Streiff syndrome)、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー(Trismoy)13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症(hypoparathroidism)またはコンラーディ症候群)である。
さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。
さらになおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。
さらに別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス(systemic lupus erythematosis);関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管
間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性(non−hepatotropic)のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性(non−hepatotropic)のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
さらに別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。
別の態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のネイティブCD4T細胞およびネイティブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血
清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(total tissue mass;TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度(connectivity
density)の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症(systemic histiocytic storage disease);肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(pancreatic dyserythropoietic
anemia)(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症(hydronephosis);びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変
化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(total tissue mass;TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度(connectivity
density)の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症(systemic histiocytic storage disease);肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(pancreatic dyserythropoietic
anemia)(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症(hydronephosis);びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変
化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物から得られた単離された細胞を提供する。1つの態様において、前記単離された細胞は、マウス細胞である。なおも別の態様において、前記マウス細胞は、胚性幹細胞である。さらに別の態様において、前記単離された細胞は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の表現型:神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常のうちの少なくとも1つを示す非ヒトトランスジェニック動物から得られる。本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、
PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
を含む。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、
PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
を含む。
1つの態様において、前記遺伝子の破壊に関連する表現型は、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を含む。
なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
なおも別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。
さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫
、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である。
さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。
さらに別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。
さらに別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片
拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
さらに別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。
別の態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のネイティブCD4T細胞およびネイティブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテー
ジの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
ジの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
本発明はまた、遺伝子の破壊と関連する表現型を調節する薬剤を提供する。1つの態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、P
RO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、前記アゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、前記アンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
RO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、前記アゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、前記アンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1
693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)遺伝子破壊と関連する前記生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
を含む。
693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)遺伝子破壊と関連する前記生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
を含む。
1つの態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮
化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のネイティブCD4T細胞およびネイティブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均
体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のネイティブCD4T細胞およびネイティブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均
体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を提供する。1つの態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO61
82、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、前記アゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、前記アンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
82、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、前記アゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、前記アンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO
6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程;
(c)(b)の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される観察された行動と異なる、前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記薬剤が、遺伝子破壊と関連する前記行動を調節するか否かを判定する工程
を含む。
6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程;
(c)(b)の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される観察された行動と異なる、前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記薬剤が、遺伝子破壊と関連する前記行動を調節するか否かを判定する工程
を含む。
1つの態様において、前記観察された行動は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記観察された行動は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記観察された行動は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記観察された行動は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記観察された行動は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記観察された行動としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられ
るがこれらに限定されない)に適用し得る。
るがこれらに限定されない)に適用し得る。
本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を提供する。1つの態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO
23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO1
9820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO1
9820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む。
なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。
さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊
張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である。
さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。
なおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。
さらになおも別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
なおも別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。
別の態様において、前記非ヒトトランスジェニック動物は、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケ
ージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のネイティブCD4T細胞およびネイティブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清
中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
ージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のネイティブCD4T細胞およびネイティブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のネイティブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清
中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す。
本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を提供する。1つの態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO691
22、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
22、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常の処置のための治療薬を提供する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程;および
(b)その試験薬剤が、その宿主細胞によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、
PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節しているか否かを判定する工程を含む。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程;および
(b)その試験薬剤が、その宿主細胞によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、
PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節しているか否かを判定する工程を含む。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節する薬剤を提供する。1つの態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、
抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を評価する方法を提供し、その方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する同定された状態に対する前記試験薬剤の作用を評価する工程
を含む。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する同定された状態に対する前記試験薬剤の作用を評価する工程
を含む。
1つの態様において、前記状態は、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常である。
本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を提供する。1つの態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、P
RO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
RO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を含む薬学的組成物を提供する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法を提供し、その方法は、前記障害をすでに有し得るか、または前記障害を有する傾向にあり得るか、もしくは前記障害を予防すべき状態であり得る、そのような処置を必要とする被験体に、治療有効量の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害または疾患を効果的に処置または予防または寛解する。
なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。
さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様
々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である。
さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。
なおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。
さらになおも別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);
肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
なおも別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。
別の態様において、前記治療薬は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗P
RO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
RO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法を提供し、その方法は:
(a)非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、前記培養物の各細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO442
3、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程;
(b)前記細胞培養に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記細胞培養物において、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む。
(a)非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、前記培養物の各細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO442
3、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程;
(b)前記細胞培養に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記細胞培養物において、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む。
なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である。なおも別の態様において、前記神経障害は、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である。なおも別の態様において、前記神経障害は、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である。なおも別の態様において、前記神経障害としては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられる。そのような神経障害は、「不安障害」と定義されるカテゴリーを含み、その「不安障害」としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられるがこれらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
別の態様において、前記眼の異常は、網膜の異常である。さらに別の態様において、前記眼の異常は、視覚問題または失明と一致する。なおも別の態様において、前記網膜の異常は、色素性網膜炎と一致するか、または網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする。
さらに別の態様において、前記網膜の異常は、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、
コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する。
さらに別の態様において、前記眼の異常は、白内障である。さらになおも別の態様において、前記白内障は、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である。
さらに別の態様において、前記発達異常は、胚性致死または生存能低下を含む。
なおも別の態様において、前記心臓血管、内皮または血管形成の障害は、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である。
さらになおも別の態様において、前記免疫障害は、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患と一致する。
なおも別の態様において、前記骨代謝の異常または障害は、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症または大理石骨病である。
本発明はまた、前記培養物中の遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を提供する。1つの態様にお
いて、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、
抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
いて、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型のアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、その薬剤は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである。なおも別の態様において、そのアゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。さらに別の態様において、そのアンタゴニスト剤は、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、
抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法を提供し、その方法は、前記表現型をすでに有し得るか、または前記表現型を有する傾向にあり得るか、もしくは前記表現型を予防すべき状態であり得る被験体に、前記表現型を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記表現型を効果的に調節する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO
23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法を提供し、その方法は、前記生理学的特徴をすでに示し得るか、または前記生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは前記生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、前記生理学的特徴を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記生理学的特徴を効果的に調節する。
23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法を提供し、その方法は、前記生理学的特徴をすでに示し得るか、または前記生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは前記生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、前記生理学的特徴を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記生理学的特徴を効果的に調節する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する方法を提供し、その方法は、前記行動をすでに示し得るか、または前記行動を示す傾向にあり得るか、もしくは前記示される行動を予防すべき状態であり得る被験体に、前記行動を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記行動を効果的に調節する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節する方法を提供し、その方法は、前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864
、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞に、前記発現を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、前記ポリペプチドの発現を効果的に調節する。
、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞に、前記発現を調節すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、前記ポリペプチドの発現を効果的に調節する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法を提供し、その方法は、前記状態を有し得るか、または前記状態を有する傾向にあり得るか、もしくは前記状態を予防すべき状態であり得る被験体に、前記状態を調節すると同定された治療有効量の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記状態を効果的に調節する。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害、または胚性致死を処置または予防または寛解する方法を提供し、その方法は、各細胞がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1
110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、前記障害を処置または予防または寛解すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する。
110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、前記障害を処置または予防または寛解すると同定された有効量の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する。
B.さらなる実施形態
なおもさらなる実施形態において、本発明は、本出願に係る潜在的な項目の以下のセットに関する:
1.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、本方法は、
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非
ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;および
(c)前記測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、
ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、方法。
なおもさらなる実施形態において、本発明は、本出願に係る潜在的な項目の以下のセットに関する:
1.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を同定する方法であって、本方法は、
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非
ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;および
(c)前記測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程を含み、
ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、方法。
2.前記非ヒトトランスジェニック動物が、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に対してヘテロ接合性である、請求項1に記載の方法。
3.性別一致野生型同腹仔と比較した場合の前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記表現型が、以下:神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常のうちの少なくとも1つである、請求項1に記載の方法。
4.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項3に記載の方法。
5.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項3に記載の方法。
6.前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項3に記載の方法。
7.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項3に記載の方法。
8.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項3に記載の方法。
9.前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項3に記載の方法。
10.前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項3に記載の方法。
11.前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項3に記載の方法。
12.前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項10に記載の方法。
13.前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項10に記載の方法。
14.前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項10に記載の方法。
15.前記眼の異常が、白内障である、請求項3に記載の方法。
16.前記白内障が、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)と一致する、請求項15に記載の方法。
17.前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項3に記載の方法。
18.前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項3に記載の方法。
19.前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫
斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項3に記載の方法。
斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項3に記載の方法。
20.前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項3に記載の方法。
21.前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のナイーブCD4T細胞およびナイーブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;
平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存
能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項1に記載の方法。
平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存
能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項1に記載の方法。
22.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物由来の単離細胞。
23.マウス細胞である、請求項22に記載の単離細胞。
24.前記マウス細胞が、胚性幹細胞である、請求項23に記載の単離細胞。
25.性別一致野生型同腹仔と比較して、前記非ヒトトランスジェニック動物が以下の表現型:神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常のうちの少なくとも1つを示す、請求項22に記載の単離細胞。
26.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、P
RO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する前記同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、P
RO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる表現型と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊と関連する前記同定された表現型を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
27.前記遺伝子破壊と関連する前記表現型が、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常または障害;脂質代謝障害;または発達異常を含む、請求項26に記載の方法。
28.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項27に記載の方法。
29.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項27に記載の方法。
30.前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項27に記載の方法。
31.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項27に記載の方法。
32.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項27に記載の方法。
33.前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項27に記載の方法。
34.前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項27に記載の方法。
35.前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項27に記載の方法。
36.前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項34に記載の方法。
37.前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項34に記載の方法。
38.前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項34に記載の方法。
39.前記眼の異常が、白内障である、請求項27に記載の方法。
40.前記白内障が、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)と一致する、請求項39に記載の方法。
41.前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項27に記載の方法。
42.前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項27に記載の方法。
43.前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の
非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項27に記載の方法。
非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項27に記載の方法。
44.前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項27に記載の方法。
45.前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のナイーブCD4T細胞およびナイーブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平
均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項26に記載の方法。
均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項26に記載の方法。
46.請求項26に記載の方法によって同定される薬剤。
47.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項46に記載の薬剤。
48.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項47に記載の薬剤。
49.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO198
20、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項47に記載の薬剤。
20、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項47に記載の薬剤。
50.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)遺伝子破壊と関連する前記生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
を含む、方法。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記生理学的特徴を、遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)遺伝子破壊と関連する前記生理学的特徴が調節されているか否かを判定する工程
を含む、方法。
51.前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホー
ムケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のナイーブCD4T細胞およびナイーブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に
対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項50に記載の方法。
ムケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のナイーブCD4T細胞およびナイーブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に
対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項50に記載の方法。
52.請求項50に記載の方法によって同定される薬剤。
53.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項52に記載の薬剤。
54.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項53に記載の薬剤。
55.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項53に記載の薬剤。
56.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO
19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程;
(c)(b)の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される前記観察された行動と異なる、前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記薬剤が、遺伝子破壊と関連する前記行動を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物によって示される行動を観察する工程;
(c)(b)の観察された行動を性別一致野生型動物の行動と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物によって示される前記観察された行動と異なる、前記非ヒトトランスジェニック動物によって示される前記観察された行動を、遺伝子の破壊に関連する行動と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記薬剤が、遺伝子破壊と関連する前記行動を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
57.前記行動が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項56に記載の方法。
58.前記行動が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項56に記載の方法。
59.前記行動が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項56に記載の方法。
60.前記行動が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項56に記載の方法。
61.前記行動が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項56に記載の方法。
62.前記行動が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項56に記載の方法。
63.請求項56に記載の方法によって同定される薬剤。
64.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234
、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項63に記載の薬剤。
、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項63に記載の薬剤。
65.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項64に記載の薬剤。
66.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO232
03または抗PRO35250抗体である、請求項64に記載の薬剤。
03または抗PRO35250抗体である、請求項64に記載の薬剤。
67.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物において、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)前記非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記非ヒトトランスジェニック動物において、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
68.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項67に記載の方法。
69.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項67に記載の方法。
70.前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項
67に記載の方法。
67に記載の方法。
71.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項67に記載の方法。
72.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項67に記載の方法。
73.前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項67に記載の方法。
74.前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項67に記載の方法。
75.前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項67に記載の方法。
76.前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項74に記載の方法。
77.前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項74に記載の方法。
78.前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項74に記載の方法。
79.前記眼の異常が、白内障である、請求項67に記載の方法。
80.前記白内障が、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である、請求項79に記載の方法。
81.前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項67に記載の方法。
82.前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗
塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項67に記載の方法。
塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項67に記載の方法。
83.前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項67に記載の方法。
84.前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項67に記載の方法。
85.前記非ヒトトランスジェニック動物が、性別一致野生型同腹仔と比較して、以下の生理学的特徴:オープンフィールド試験中の不安様応答の増大;オープンフィールド試験中の不安の低減;概日リズムを有しない機能低下;オープンフィールド試験中の総移動距離の増加(活動亢進);オープンフィールド試験中の自発運動活性の低下;ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム(明期中の活性の低下);歩行回数の減少を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;歩行回数の増加を含むホームケージ活動性試験中の異常な概日リズム;不安表現型に起因するひげの喪失;概日リズムの増大;ストレス応答の増大を伴うストレス誘導性高体温の増大(不安の増大);ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の増大;ストレス誘導性高体温に対する抵抗性の低下;反転スクリーン試験中の運動協調性の増大;反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性;尾懸垂における不動の増加(抑鬱様応答の増大);尾懸垂試験中の抑鬱様応答の増大;尾懸垂試験中の抑鬱様応答の減少;尾懸垂試験中に後肢を握ること;プレパルス抑制試験中の驚愕応答の低下;難聴を示唆する無驚愕応答;感覚運動ゲーティング/注意の増大を伴うプレパルス抑制の増大;熱誘導性疼痛に対する感度の低下を示唆するホットプレート上での潜伏時間の増大;眼科学的異常;瘢痕および視覚の遮断を伴う角膜支質の角膜の上皮化;角膜および強膜の化生;網膜動脈の減弱;網膜出血;視神経異常;視神経乳頭の拡大;眼内圧上昇;未発達の眼瞼を伴う角膜の上皮化;網膜変性症;ハーダー腺の発育不全;網膜血管の組織崩壊、微小動脈瘤および網膜毛細血管漏出;障害性の視力;心拍数の減少;平均収縮期血圧の低下;平均収縮期血圧の上昇;インスリン感度の増大;平均絶食時血清中グルコースレベルの上昇;平均血清中グルコースレベルの低下;平均血清中コレステロールレベルの上昇;平均血清中コレステロールレベルの低下;平均血清中トリグリセリドレベルの上昇
;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のナイーブCD4T細胞およびナイーブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす
全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項67に記載の方法。
;耐糖能の増大;耐糖能障害;平均血清中インスリンレベルの低下;ケトン血症;平均血清中カルシウムの減少;血中のウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質およびケトン類;ナトリウムおよび塩化物の減少;ビリルビンの増加;顕著な脂肪血症;尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの上昇;平均血清中アルカリホスファターゼレベルの低下;尿中の血液;糖尿;亜硝酸塩尿症の増大;ケトン尿症;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの上昇;ナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;異常な白血球数;リンパ球減少症および顆粒球減少症に起因する白血球減少症;CD4細胞の平均パーセンテージの上昇;CD4細胞の平均パーセンテージの低下;CD8細胞の平均パーセンテージの低下;リンパ節中のナイーブCD4T細胞およびナイーブCD8T細胞のパーセンテージの低下;末梢血中のB細胞の平均パーセンテージの上昇;総白血球細胞数およびリンパ球数の減少;リンパ球の絶対数の減少;単球の平均絶対数の増加;好中球の平均絶対数の増加;平均血清中IgAレベルの低下;平均血清中IgAレベルの上昇;IgG1レベルの上昇;平均血清中IgG1レベルの低下;平均血清中IgG1、IgG3、IgG2bおよびIgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの低下;平均血清中IgG2bレベルの低下;平均血清中IgG3およびIgMレベルの低下;平均血清中IgG2aレベルの上昇;平均血清中IgG1、IgG2aおよびIgG3レベルの上昇;平均血清中IgG3レベルの上昇;貧血;赤血球数の減少、平均赤血球数の増加を伴うヘモグロビンの減少およびヘマトクリットの減少;平均血球体積の増加;平均血球体積の減少;平均血球ヘモグロビンの減少;赤血球分布幅の増大;赤血球形成の不足;骨髄中のIgM+IgD+およびB220hi/CD43−細胞の増加;骨髄中のB220hi/CD43−IgM+IgD+細胞のパーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+細胞のパーセンテージの上昇;リンパ節中のナイーブT細胞の減少(特にCD4);脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)のパーセンテージの上昇;骨髄中のIgM+、CD117+細胞のパーセンテージの上昇、死んだB細胞の高パーセンテージ、B細胞の減少、リンパ中のCD4T細胞およびCD8T細胞の増加;骨髄中のB細胞の増加およびリンパ節中のB細胞のかなりの減少;脾臓中のCD21hiCD23medB細胞の顕著な減少;パイエル板中のB220+細胞の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD8およびナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のTCRB+CD38+活性化T細胞数の減少;B細胞の平均パーセンテージの上昇を伴うCD4細胞の平均パーセンテージの低下;パイエル板中のB220+CD38lowおよびIgMの減少;平均血小板数の増加;平均血小板数の減少;広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓中のT細胞の枯渇;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG2a応答の増大;卵白アルブミン負荷に対する血清中IgG1およびIgG2aの応答の減少から喪失;卵白アルブミン負荷に対する平均血清中IgG1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の低減;LPS負荷に対する平均血清中MCP−1応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ応答の増大;LPS負荷に対する平均血清中IL−6応答の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の増大;皮膚線維芽細胞の増殖の低減;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの増加;平均体重の増加;平均体長の増大;総組織質量(TTM)の増加;除脂肪体重(LBM)の増加;大腿骨の骨塩密度(BMD)の増加;椎骨の骨塩密度(BMD)の増加;骨塩密度(BMD)の増加;全身の体積測定による骨塩密度(vBMD)の増加;骨塩量(BMC)の増加;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の増加;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の増加;総体脂肪および総脂肪質量の平均パーセントの減少;平均体重の減少;平均体長の低減;総組織質量(TTM)の減少;除脂肪体重(LBM)の減少;大腿骨の骨塩密度(BMD)の減少;椎骨の骨塩密度(BMD)の減少;骨塩密度(BMD)の減少;骨塩量(BMC)の減少;骨塩密度指標の減少;体積測定による骨塩密度(vBMD)の減少;大腿骨中軸の平均皮質厚および平均断面積の減少;椎骨骨梁の平均体積、平均数および平均結合性密度の減少;骨石灰化の増加を伴う著明な大理石骨病;様々な組織における慢性炎症;胸腺萎縮;肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節中のマクロファージに影響を及ぼす
全身性組織球蓄積症;肝臓の大きさの縮小;限局的な肝細胞壊死を伴う慢性活動性肝炎;肝臓中の脂肪変化;肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内の空洞化の増大;膵臓の赤血球異形成貧血(1型);多巣性神経細胞壊死;小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力;脳の多巣性発生奇形;水腎症;びまん性脱毛症;表皮性角質増殖;異常な赤血球を特徴とする、血色素減少症および赤血球大小不同症(異常に少ないヘモグロビンおよび赤血球形成の減少);成長遅延;発生異常;骨髄の顆粒球の形成不全;骨髄性顆粒球細胞前駆体の数の減少;顆粒球形成の低減;無歯;すべての器官の大きさの全般的な縮小を伴う発育不全;心筋細胞の不完全な構造および配列を伴う心筋欠損;凝縮した好酸球性筋形質を伴う心筋症;鬱血性心不全;膵臓のランゲルハンス島の縮小ならびにアルファ(グリコーゲン)細胞およびベータ(インスリン)細胞の分布の変化;脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化(コレステロールおよびトリグリセリドの増加)と一致する副腎の束状帯におけるすべての細胞の細胞質の著明な組織病理学的変化;不妊症;精巣変性;精細管の空胞変性;精液過少症;萎縮睾丸;卵巣および子宮の発育不全;ほんの数本の管を示す乳腺;生存能低下を伴う成長遅延;ならびに胚性致死のうちの少なくとも1つを示す、請求項67に記載の方法。
86.請求項67に記載の方法によって同定される薬剤。
87.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項86に記載の薬剤。
88.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820
、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項87に記載の薬剤。
、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項87に記載の薬剤。
89.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項87に記載の薬剤。
90.請求項67に記載の方法によって同定される治療薬。
91.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、
PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程;および
(b)前記試験薬剤が、前記宿主細胞による前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
(a)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、
PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞と試験薬剤を接触させる工程;および
(b)前記試験薬剤が、前記宿主細胞による前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
92.請求項91に記載の方法によって同定される薬剤。
93.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項92に記載の薬剤。
94.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO
1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項93に記載の薬剤。
1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項93に記載の薬剤。
95.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項93に記載の薬剤。
96.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態に影響を及ぼすことができる治療薬を評価する方法であって、前記方法は:
(a)前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568
、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する前記同定された状態に対する前記試験薬剤の作用を評価する工程
を含む、方法。
(a)前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568
、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物を提供する工程;
(b)(a)の非ヒトトランスジェニック動物の生理学的特徴を測定する工程;
(c)(b)の測定された生理学的特徴を性別一致野生型動物の生理学的特徴と比較する工程であって、ここで、前記野生型動物の前記生理学的特徴と異なる前記非ヒトトランスジェニック動物の前記生理学的特徴を、前記非ヒトトランスジェニック動物における前記遺伝子の破壊から生じる状態と同定する、工程;
(d)(a)の非ヒトトランスジェニック動物に試験薬剤を投与する工程;および
(e)前記非ヒトトランスジェニック動物における遺伝子破壊に関連する前記同定された状態に対する前記試験薬剤の作用を評価する工程
を含む、方法。
97.前記状態が、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常または障害;脂質代謝障害;または発達異常である、請求項96に記載の方法。
98.請求項96に記載の方法によって同定される治療薬。
99.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項98に記載の治療薬。
100.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214,抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568
、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項99に記載の治療薬。
、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項99に記載の治療薬。
101.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗 PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項99に記載の治療薬。
102.請求項98に記載の治療薬を含む薬学的組成物。
103.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、前記方法は、前記障害をすでに有し得るか、または前記障害を有する傾向にあり得るか、もしくは前記障害を予防すべき状態であり得る、そのような処置を必要とする被験体に、治療有効量の
請求項94に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。
請求項94に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。
104.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項103に記載の方法。
105.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項103に記載の方法。
106.前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項103に記載の方法。
107.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項103に記載の方法。
108.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項103に記載の方法。
109.前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項103に記載の方法。
110.前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項103に記載の方法。
111.前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項103に記載の方法。
112.前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項110に記載の方法。
113.前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項110に記載の方法。
114.前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項110に記載の方法。
115.前記眼の異常が、白内障である、請求項103に記載の方法。
116.前記白内障が、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である、請求項115に記載の方法。
117.前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項103に記載の方法。
118.前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項103に記載の方法。
119.前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項103に記載の方法。
120.前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項103に記載の方法。
121.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423
、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮または血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常または障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、前記培養物の各細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程;
(b)前記細胞培養に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記細胞培養物において、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮または血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常または障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節する薬剤を同定する方法であって、前記方法は:
(a)非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物を提供する工程であって、前記培養物の各細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている、工程;
(b)前記細胞培養に試験薬剤を投与する工程;および
(c)前記試験薬剤が、前記細胞培養物において、前記神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;眼の異常;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害;脂質代謝障害;または発達異常を寛解または調節するか否かを判定する工程
を含む、方法。
122.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の増大である、請求項121に記載の方法。
123.前記神経障害が、オープンフィールド活動性試験中の不安様応答の低減である、請求項121に記載の方法。
124.前記神経障害が、ホームケージ活動性試験中の異常な概日リズムである、請求項121に記載の方法。
125.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の運動協調性の増大である、請求項121に記載の方法。
126.前記神経障害が、反転スクリーン試験中の障害性の運動協調性である、請求項121に記載の方法。
127.前記神経障害が、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏または感覚障害である、請求項121に記載の方法。
128.前記眼の異常が、網膜の異常である、請求項121に記載の方法。
129.前記眼の異常が、視覚問題または失明と一致する、請求項121に記載の方法。
130.前記網膜の異常が、網膜色素変性症と一致する、請求項128に記載の方法。
131.前記網膜の異常が、網膜変性症または網膜の形成異常を特徴とする、請求項128に記載の方法。
132.前記網膜の異常が、網膜の形成異常、未熟児網膜症を含む様々な網膜症、水晶体後線維増殖症、血管新生緑内障、加齢性黄斑変性、糖尿病性黄斑浮腫、角膜血管新生、角膜移植片血管新生、角膜移植片拒絶、網膜/脈絡膜血管新生、隅角血管新生(ルベオーシス)、眼球の血管新生性疾患、血管再狭窄、動静脈奇形(AVM)、髄膜腫、血管腫、血管線維腫、甲状腺肥大(グレーブス病を含む)、角膜および他の組織の移植、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスと一致する、請求項128に記載の方法。
133.前記眼の異常が、白内障である、請求項121に記載の方法。
134.前記白内障が、全身性疾患(例えば、ヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群)である、請求項133に記載の方法。
135.前記発達異常が、胚性致死または生存能低下を含む、請求項121に記載の方法。
136.前記心臓血管、内皮または血管形成の障害が、動脈疾患(例えば、真性糖尿病;乳頭浮腫;視神経萎縮;アテローム性動脈硬化症;アンギナ;急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大および鬱血性心不全などの心不全;高血圧症;炎症性血管炎;レイノー病およびレイノー現象;動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);末梢血管疾患;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫);腫瘍血管新生;外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕;虚血再灌流傷害;関節リウマチ;脳血管疾患;急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症である、請求項121に記載の方法。
137.前記免疫障害が、全身性エリテマトーデス;関節リウマチ;若年性慢性関節炎;脊椎関節症;全身硬化症(強皮症);特発性炎症性筋障害(皮膚筋炎、多発性筋炎);シェーグレン症候群;全身性血管炎;サルコイドーシス;自己免疫性溶血性貧血(免疫性汎血球減少症、発作性夜間血色素尿症);自己免疫性血小板減少症(特発性血小板減少性紫斑病、免疫媒介性血小板減少症);甲状腺炎(グレーブス病、橋本甲状腺炎、若年性リンパ球性甲状腺炎、萎縮性甲状腺炎);真性糖尿病;免疫媒介性腎疾患(糸球体腎炎、尿細管間質性腎炎);中枢および末梢神経系の脱髄疾患(例えば、多発性硬化症、特発性脱髄性多発ニューロパシーまたはギランバレー症候群および慢性炎症性脱髄性多発ニューロパシー);肝胆疾患(例えば、感染性肝炎(A型、B型、C型、D型、E型肝炎および他の非肝向性のウイルスによる肝炎)、自己免疫性慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、肉芽腫性肝炎および硬化性胆管炎);炎症性腸疾患(潰瘍性大腸炎:クローン病);グルテン過敏性腸症およびホイップル病;水疱性疾患、多形性紅斑および接触性皮膚炎を含む自己免疫性または免疫媒介性の皮膚疾患、乾癬;アレルギー性疾患(例えば、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、食物過敏症および蕁麻疹);肺の免疫学的疾患(例えば、好酸球性肺炎、特発性肺線維症および過敏性肺炎);または移植片拒絶および移植片対宿主病を含む移植関連疾患である、請求項121に記載の方法。
138.前記骨代謝の異常または障害が、関節炎、骨粗鬆症または大理石骨病である、請求項121に記載の方法。
139.請求項121に記載の方法によって同定される薬剤。
140.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストである、請求項139に記載の薬剤。
141.前記アゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4
979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項140に記載の薬剤。
979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項140に記載の薬剤。
142.前記アンタゴニストが、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体である、請求項140に記載の薬剤。
143.請求項121に記載の方法によって同定される治療薬。
144.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する表現型を調節する方法であって、前記方法は、前記表現型をすでに有し得るか、または前記表現型を有する傾向にあり得るか、もしくは前記表現型を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項46に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記表現型を効果的に調節する、方法。
145.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110
、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、前記方法は、前記生理学的特徴をすでに示し得るか、または前記生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは前記生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項52に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記生理学的特徴を効果的に調節する、方法。
、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する生理学的特徴を調節する方法であって、前記方法は、前記生理学的特徴をすでに示し得るか、または前記生理学的特徴を示す傾向にあり得るか、もしくは前記生理学的特徴を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項52に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記生理学的特徴を効果的に調節する、方法。
146.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する行動を調節する方法であって、前記方法は、前記行動をすでに示し得るか、または前記行動を示す傾向にあり得るか、もしくは前記示される行動を予防すべき状態であり得る被験体に、有効量の請求項63に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記行動を効果的に調節する、方法。
147.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO285、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912
、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節する方法であって、前記方法は、前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞に、有効量の請求項92に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、前記ポリペプチドの発現を効果的に調節する、方法。
、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現を調節する方法であって、前記方法は、前記PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現している宿主細胞に、有効量の請求項92に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それによって、前記ポリペプチドの発現を効果的に調節する、方法。
148.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する状態を調節する方法であって、前記方法は、前記状態を有し得るか、または前記状態を有する傾向にあり得るか、もしくは前記状態を予防すべき状態であり得る被験体に、治療有効量の請求項98に記載の治療薬またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記状態を効果的に調節する、方法。
149.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423
、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、前記方法は、各細胞がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、治療有効量の請求項139に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。
、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子の破壊に関連する、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;骨代謝の異常もしくは障害または胚性致死を処置または予防または寛解する方法であって、前記方法は、各細胞がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されている非ヒトトランスジェニック動物の細胞培養物に、治療有効量の請求項139に記載の薬剤またはそのアゴニストもしくはアンタゴニストを投与する工程を含み、それにより、前記障害を効果的に処置または予防または寛解する、方法。
(好ましい実施形態の詳細な説明)
I.定義
用語「PROポリペプチド」および「PRO」とは、本明細書中で使用されるとき、および番号の表記が直後に来る場合は、種々のポリペプチドのことをいい、ここで完全な表記(すなわちPRO/番号)は本明細書に記載する特定のポリペプチド配列のことをいう。用語「PRO/番号ポリペプチド」および「PRO/番号」(ここで、用語「番号」が本明細書中で使用される実際の番号の表記として提示される)は、ネイティブの配列のポリペプチドおよびポリペプチド改変体(これは本明細書においてさらに定義する)を包含する。本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110
、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは種々の起源(例えば、ヒト組織型または他の原料)から単離され得るか、または、組換え法または合成法により調製され得る。用語「PROポリペプチド」とは、本明細書に開示した各々の個々のPRO/番号ポリペプチドのことをいう。「PROポリペプチド」にあてはまる本明細書中のすべての開示は、ポリペプチドの各々を、個別にならびに総括していう。例えば、その調製、精製、誘導、それに対する抗体の形成、その投与、それを含有する組成物、それによる疾患の処置に関する記載などは本発明のポリペプチドの各々に個別に関するものである。用語「PROポリペプチド」はまた、本明細書に開示したPRO/番号ポリペプチドの改変体を含む。
I.定義
用語「PROポリペプチド」および「PRO」とは、本明細書中で使用されるとき、および番号の表記が直後に来る場合は、種々のポリペプチドのことをいい、ここで完全な表記(すなわちPRO/番号)は本明細書に記載する特定のポリペプチド配列のことをいう。用語「PRO/番号ポリペプチド」および「PRO/番号」(ここで、用語「番号」が本明細書中で使用される実際の番号の表記として提示される)は、ネイティブの配列のポリペプチドおよびポリペプチド改変体(これは本明細書においてさらに定義する)を包含する。本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110
、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは種々の起源(例えば、ヒト組織型または他の原料)から単離され得るか、または、組換え法または合成法により調製され得る。用語「PROポリペプチド」とは、本明細書に開示した各々の個々のPRO/番号ポリペプチドのことをいう。「PROポリペプチド」にあてはまる本明細書中のすべての開示は、ポリペプチドの各々を、個別にならびに総括していう。例えば、その調製、精製、誘導、それに対する抗体の形成、その投与、それを含有する組成物、それによる疾患の処置に関する記載などは本発明のポリペプチドの各々に個別に関するものである。用語「PROポリペプチド」はまた、本明細書に開示したPRO/番号ポリペプチドの改変体を含む。
「ネイティブ配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド」は、自然界から得られる対応するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと同じアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。そのようなネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、
PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、自然界から単離することができるか、または、組換えまたは合成手段により製造できる。用語「ネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド」は、特に特定のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然に存在する切断型または分泌型(例えば、細胞外ドメイン配列)、前記ポリペプチドの天然に存在する改変体型(例えば、選択的スプライシングされた形態)および天然に存在する対立遺伝子改変体を包含する。本発明は、添付図面に示す完全長のアミノ酸配列を含む成熟または完全長のネイティブ配列ポリペプチドである本明細書に開示されたネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、P
RO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。開始コドンおよび終止コドンは、図面中では太字で示し、下線を付した。しかしながら、添付図面において開示したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは図面中でアミノ酸1位として本明細書において表記したメチオニン残基で開始するように示されているが、図面中のアミノ酸1位よりも上流または下流に位置する他のメチオニン残基もPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのための開始アミノ酸残基として使用され得ると考えられ、その可能性がある。
PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、自然界から単離することができるか、または、組換えまたは合成手段により製造できる。用語「ネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド」は、特に特定のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然に存在する切断型または分泌型(例えば、細胞外ドメイン配列)、前記ポリペプチドの天然に存在する改変体型(例えば、選択的スプライシングされた形態)および天然に存在する対立遺伝子改変体を包含する。本発明は、添付図面に示す完全長のアミノ酸配列を含む成熟または完全長のネイティブ配列ポリペプチドである本明細書に開示されたネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、P
RO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを提供する。開始コドンおよび終止コドンは、図面中では太字で示し、下線を付した。しかしながら、添付図面において開示したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは図面中でアミノ酸1位として本明細書において表記したメチオニン残基で開始するように示されているが、図面中のアミノ酸1位よりも上流または下流に位置する他のメチオニン残基もPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのための開始アミノ酸残基として使用され得ると考えられ、その可能性がある。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PR
O37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの「細胞外ドメイン」または「ECD」とは、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインを本質的に含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形態のことをいう。通常は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのECDは、そのような膜貫通ドメインおよび/または細胞質ドメインの1%未満を有し、好ましくはそのようなドメインの0.5%未満を有する。本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドについて同定されるいずれの膜貫通ドメインも疎水性ドメインのこのような型を同定するために当該分野で日常的
に使用されている基準に従って同定される。膜貫通ドメインの厳密な境界は変動し得るが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたドメインのいずれかの末端において約5アミノ酸を超えないものである。したがって、必要に応じて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメインは実施例または明細書において同定される膜貫通ドメイン/細胞外ドメインの境界のいずれかの側において約5個以下のアミノ酸を含んでよく、付随するシグナルペプチドを含むか含まないそのようなポリペプチドおよびそれらをコードする核酸は、本発明により企図される。
O37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの「細胞外ドメイン」または「ECD」とは、膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインを本質的に含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形態のことをいう。通常は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのECDは、そのような膜貫通ドメインおよび/または細胞質ドメインの1%未満を有し、好ましくはそのようなドメインの0.5%未満を有する。本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドについて同定されるいずれの膜貫通ドメインも疎水性ドメインのこのような型を同定するために当該分野で日常的
に使用されている基準に従って同定される。膜貫通ドメインの厳密な境界は変動し得るが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたドメインのいずれかの末端において約5アミノ酸を超えないものである。したがって、必要に応じて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメインは実施例または明細書において同定される膜貫通ドメイン/細胞外ドメインの境界のいずれかの側において約5個以下のアミノ酸を含んでよく、付随するシグナルペプチドを含むか含まないそのようなポリペプチドおよびそれらをコードする核酸は、本発明により企図される。
本明細書に開示した様々なPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの「シグナルペプチド」のおよその位置は、本明細書および/または添付図面に示す。しかしながら、シグナルペプチドのC末端の境界は、変動し得るが、最もあり得るのは本明細書において最初に同定されたシグナルペプチドのC末端の境界のいずれかの側において約5アミノ酸を超えないものであり、ここでそのシグナルペプチドのC末端の境界は、アミノ酸配列エレメントのそのような型を同定するために当該分野で日常的に使用されている基準に従って同定され得る(例えば、Nielsen et al.,Prot.Eng.10:1−6(1997)およびvon Heinje et al.,Nucl.Acids.Res.14:4683−4690(1986))。さらに、いくつかの場合において、分泌ポリペプチドからのシグナル配列の切断は、完全に均一ではなく、2つ以上の分泌種をもたらす。これらの成熟ポリペプチド(シグナルペプチドは、本明細書において同定されたシグナルペプチドのC末端の境界のいずれかの側の約5アミノ酸以内において切断されている)およびそれらをコードするポリヌクレオチドは、本発明により企図される。
「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド改変体」とは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、好ましくは、少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性を有する、本明細書中で定義される活性なPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、本明細書中で開示する全長ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、
PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠くPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または本明細書中で開示する全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO
5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の任意のフラグメント(全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドについての完全なコード配列の一部のみを表す核酸によってコードされるものなど)のことを意味する。そのようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1
788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド改変体としては、例えば、全長ネイティブアミノ酸配列のN末端またはC末端において1以上のアミノ酸残基が付加または欠失しているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、P
RO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが挙げられる。通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド改変体は、本明細書中で開示する全長ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠くPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO2120
1、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または本明細書中で開示する全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の特別に定義される任意のフラグメントに対して、約80%のアミノ酸配列同一性を有するかまたは少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性を有するか、あるいは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%のアミノ酸配列同一性を有するかまたは少なくとも約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%のアミノ酸配列同一性を有する。通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO
9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、約10アミノ酸長であるかまたは少なくとも約10アミノ酸長であるか、あるいは、約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長もしくはそれ以上であるかまたは少なくとも約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、 200、210、220、230、2
40、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長もしくはそれ以上である。必要に応じて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO2
1201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較して、ただ1つの保存的アミノ酸置換を有するか、あるいはネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較して、2、3、4、5、6、7、8、9または10個またはわずか2、3、4、5、6、7、8、9または10個の保存的アミノ酸置換を有する。
PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠くPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または本明細書中で開示する全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO
5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の任意のフラグメント(全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドについての完全なコード配列の一部のみを表す核酸によってコードされるものなど)のことを意味する。そのようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1
788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド改変体としては、例えば、全長ネイティブアミノ酸配列のN末端またはC末端において1以上のアミノ酸残基が付加または欠失しているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、P
RO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが挙げられる。通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド改変体は、本明細書中で開示する全長ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠くPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO2120
1、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または本明細書中で開示する全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の特別に定義される任意のフラグメントに対して、約80%のアミノ酸配列同一性を有するかまたは少なくとも約80%のアミノ酸配列同一性を有するか、あるいは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%のアミノ酸配列同一性を有するかまたは少なくとも約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%のアミノ酸配列同一性を有する。通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO
9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、約10アミノ酸長であるかまたは少なくとも約10アミノ酸長であるか、あるいは、約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長もしくはそれ以上であるかまたは少なくとも約20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、 200、210、220、230、2
40、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600アミノ酸長もしくはそれ以上である。必要に応じて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、ネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO2
1201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較して、ただ1つの保存的アミノ酸置換を有するか、あるいはネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列と比較して、2、3、4、5、6、7、8、9または10個またはわずか2、3、4、5、6、7、8、9または10個の保存的アミノ酸置換を有する。
本明細書において同定されるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列に関して「パーセント(%)アミノ酸配列同一性」とは、最大パーセントの配列同一性を達成するように必要に応じて配列をアラインメントし、ギャップを導入した後に、いかなる保存的置換も配列同一性の部分とはみなさない場合に、特定のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO196
46、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の範囲内の様々な方法、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア(例えば、BLAST、BLAST−2、ALIGNまたはMegalign(DNASTAR)ソフトウェア)を用いて達成することができる。当業者は、比較すべき配列の完全長に亘って最大アラインメントを達成するために必要ないずれかのアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書の目的のためには、%アミノ酸同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN−2を用いて生成し、ここでALIGN−2プログラムに関する完全なソースコードを以下の表1に示す。ALIGN−2配列比較コンピュータプログラムは、Genentech,Inc.により作成され、そして以下の表1に示すソースコードは、米国著作権局Washington D.C.,20559においてユーザー文書と共に提出されており、米国著作権登録番号TXU510087として登録されている。ALIGN−2プログラムは、Genentech,Inc.,South San Francisco,Californiaから公的に入手することができ、または、以下の表1に示すソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN−2プログラムは、UNIX(登録商標)オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX(登録商標)V4.0D上で使用するためにコンパイルしなければならない。すべての配列比較パラメータはALIGN−2プログラムにより設定され、変更しない。
46、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。パーセントアミノ酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の範囲内の様々な方法、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア(例えば、BLAST、BLAST−2、ALIGNまたはMegalign(DNASTAR)ソフトウェア)を用いて達成することができる。当業者は、比較すべき配列の完全長に亘って最大アラインメントを達成するために必要ないずれかのアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書の目的のためには、%アミノ酸同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN−2を用いて生成し、ここでALIGN−2プログラムに関する完全なソースコードを以下の表1に示す。ALIGN−2配列比較コンピュータプログラムは、Genentech,Inc.により作成され、そして以下の表1に示すソースコードは、米国著作権局Washington D.C.,20559においてユーザー文書と共に提出されており、米国著作権登録番号TXU510087として登録されている。ALIGN−2プログラムは、Genentech,Inc.,South San Francisco,Californiaから公的に入手することができ、または、以下の表1に示すソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN−2プログラムは、UNIX(登録商標)オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX(登録商標)V4.0D上で使用するためにコンパイルしなければならない。すべての配列比較パラメータはALIGN−2プログラムにより設定され、変更しない。
アミノ酸配列比較のためにALIGN−2を使用する場合において、所与のアミノ酸配列Bに対する所与のアミノ酸配列Aの%アミノ酸配列同一性(これは代替として、所与のアミノ酸配列Bに対する特定の%アミノ酸配列同一性を有するか、または含む所与のアミノ酸配列Aと表現できる)は、以下のとおり:
100×分数X/Y
[式中、Xは、AおよびBのプログラムのアラインメントにおいて配列アラインメントプログラムALIGN−2により同一で一致とスコア付けされたアミノ酸残基の数であり、Yは、Bにおけるアミノ酸残基の総数である]計算される。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合は、Bに対するAの%アミノ酸配列同一性は、Aに対するBの%アミノ酸配列同一性と等しくならないことが理解されるだろう。この方法を用いた%アミノ酸配列同一性の計算の例として、表2および3は、「PRO」と表記したアミノ酸配列に対する「比較タンパク質」と表記したアミノ酸配列の%アミノ酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO」は、目的の仮説PROポリペプチドのアミノ酸配列を示し、「比較タンパク質」は、目的の「PRO」ポリペプチドを比較する相手であるポリペプチドのアミノ酸配列を示し、そして「X」、「Y」および「Z」は、各々異なる仮説アミノ酸残基を示す。他に特段の記載がない限り、本明細書で使用するすべての%アミノ酸配列同一性の値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
100×分数X/Y
[式中、Xは、AおよびBのプログラムのアラインメントにおいて配列アラインメントプログラムALIGN−2により同一で一致とスコア付けされたアミノ酸残基の数であり、Yは、Bにおけるアミノ酸残基の総数である]計算される。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと等しくない場合は、Bに対するAの%アミノ酸配列同一性は、Aに対するBの%アミノ酸配列同一性と等しくならないことが理解されるだろう。この方法を用いた%アミノ酸配列同一性の計算の例として、表2および3は、「PRO」と表記したアミノ酸配列に対する「比較タンパク質」と表記したアミノ酸配列の%アミノ酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO」は、目的の仮説PROポリペプチドのアミノ酸配列を示し、「比較タンパク質」は、目的の「PRO」ポリペプチドを比較する相手であるポリペプチドのアミノ酸配列を示し、そして「X」、「Y」および「Z」は、各々異なる仮説アミノ酸残基を示す。他に特段の記載がない限り、本明細書で使用するすべての%アミノ酸配列同一性の値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PR
O36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチド」または「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体核酸配列」とは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、好ましくは本明細書に定義する活性なPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードし、そして、本明細書中で開示する完全長のネイティブ
の配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠く完全長のネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または、本明細書中で開示する完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO131
6、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の任意のフラグメント(例えば、完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO
4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドについての完全なコード配列の一部分のみを示す核酸によりコードされるもの)をコードするヌクレオチド酸配列に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性を有する核酸分子を意味する。通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドは、本明細書中で開示する完全長のネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO
540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠く完全長のネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または、本明細書中で開示する完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO16
04、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の任意のフラグメントをコードする核酸配列に対して、約80%の核酸配列同一性を有するか、または少なくとも約80%の核酸配列同一性を有するか、あるいは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の核酸配列同一性を有するか、または少なくとも約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の核酸配列同一性を有する。改変体は、ネイティブヌクレオチド配列を包含しない。
O36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチド」または「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体核酸配列」とは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、好ましくは本明細書に定義する活性なPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードし、そして、本明細書中で開示する完全長のネイティブ
の配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠く完全長のネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または、本明細書中で開示する完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO131
6、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の任意のフラグメント(例えば、完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO
4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドについての完全なコード配列の一部分のみを示す核酸によりコードされるもの)をコードするヌクレオチド酸配列に対して、少なくとも約80%の核酸配列同一性を有する核酸分子を意味する。通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドは、本明細書中で開示する完全長のネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO
540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを欠く完全長のネイティブの配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列、本明細書中で開示するシグナルペプチドを含むかもしくは含まないPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの細胞外ドメイン、または、本明細書中で開示する完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO16
04、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド配列の他の任意のフラグメントをコードする核酸配列に対して、約80%の核酸配列同一性を有するか、または少なくとも約80%の核酸配列同一性を有するか、あるいは、約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の核酸配列同一性を有するか、または少なくとも約81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の核酸配列同一性を有する。改変体は、ネイティブヌクレオチド配列を包含しない。
通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドは、約5ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約5ヌクレオチド長であるか、あるいは、約6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990または1000ヌクレオチド長であるかまたは少なくとも約6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、
160、165、170、175、180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990または1000ヌクレオチド長であり、ここで、この文脈において、用語「約」は、参照ヌクレオチド配列長±その参照した長さの10%を意味する。
160、165、170、175、180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990または1000ヌクレオチド長であり、ここで、この文脈において、用語「約」は、参照ヌクレオチド配列長±その参照した長さの10%を意味する。
本明細書において同定される、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード核酸配列に関する「パーセント(%)核酸配列同一性」とは、最大パーセントの配列同一性を達成するように必要に応じて配列をアラインメントし、ギャップを導入した後に、目的のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸配列中のヌクレオチドと同一である候補配列中のヌクレオチドのパーセンテージとして定義される。パーセント核酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当業者の範囲内の様々な方法、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア(例えば、BLAST、BLAST−2、ALIGNまたはMegalign(DNASTAR)ソフトウェア)を用いて達成することができる。しかしながら、本明細書の目的のためには、%核酸同一性の値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN−2を用いて生成し、ここでALIGN−2プログラムに関する完全なソースコードを以下の表1に示す。ALI
GN−2配列比較コンピュータプログラムは、Genentech,Inc.により作成され、そして以下の表1に示すソースコードは、米国著作権局Washington D.C.,20559においてユーザー文書と共に提出されており、米国著作権登録番号TXU510087として登録されている。ALIGN−2プログラムは、Genentech,Inc.,South San Francisco,Californiaから公的に入手することができ、または、以下の表1に示すソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN−2プログラムは、UNIX(登録商標)オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX(登録商標)V4.0D上で使用するためにコンパイルしなければならない。すべての配列比較パラメータはALIGN−2プログラムにより設定され、変更しない。
GN−2配列比較コンピュータプログラムは、Genentech,Inc.により作成され、そして以下の表1に示すソースコードは、米国著作権局Washington D.C.,20559においてユーザー文書と共に提出されており、米国著作権登録番号TXU510087として登録されている。ALIGN−2プログラムは、Genentech,Inc.,South San Francisco,Californiaから公的に入手することができ、または、以下の表1に示すソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN−2プログラムは、UNIX(登録商標)オペレーティングシステム、好ましくはデジタルUNIX(登録商標)V4.0D上で使用するためにコンパイルしなければならない。すべての配列比較パラメータはALIGN−2プログラムにより設定され、変更しない。
核酸配列比較のためにALIGN−2を使用する場合において、所与の核酸配列Dに対する所与の核酸配列Cの%核酸配列同一性(これは代替として、所与の核酸配列Dに対する特定の%核酸配列同一性を有するか、または含む所与の核酸配列Cと表現できる)は、以下のとおり:
100×分数W/Z
[式中、Wは、CおよびDのプログラムのアラインメントにおいて配列アラインメントプログラムALIGN−2により同一で一致とスコア付けされたヌクレオチドの数であり、Zは、Dにおけるヌクレオチドの総数である]計算される。核酸配列Cの長さが核酸配列Dの長さと等しくない場合は、Dに対するCの%核酸配列同一性は、Cに対するDの%核酸配列同一性と等しくならないことが理解されるだろう。%核酸配列同一性の計算の例として、表4および5は、「PRO−DNA」と表記した核酸配列に対する「比較DNA」と表記した核酸配列の%核酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO−DNA」は、目的の仮説PROコード核酸配列を示し、「比較タンパク質」は、目的の「PRO−DNA」核酸分子を比較する相手である核酸分子の核酸配列を示し、そして「N」、「L」および「V」は、各々異なる仮説ヌクレオチドを示す。他に特段の記載がない限り、本明細書で使用するすべての%核酸配列同一性の値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
100×分数W/Z
[式中、Wは、CおよびDのプログラムのアラインメントにおいて配列アラインメントプログラムALIGN−2により同一で一致とスコア付けされたヌクレオチドの数であり、Zは、Dにおけるヌクレオチドの総数である]計算される。核酸配列Cの長さが核酸配列Dの長さと等しくない場合は、Dに対するCの%核酸配列同一性は、Cに対するDの%核酸配列同一性と等しくならないことが理解されるだろう。%核酸配列同一性の計算の例として、表4および5は、「PRO−DNA」と表記した核酸配列に対する「比較DNA」と表記した核酸配列の%核酸配列同一性をどのように計算するかを示しており、ここで「PRO−DNA」は、目的の仮説PROコード核酸配列を示し、「比較タンパク質」は、目的の「PRO−DNA」核酸分子を比較する相手である核酸分子の核酸配列を示し、そして「N」、「L」および「V」は、各々異なる仮説ヌクレオチドを示す。他に特段の記載がない限り、本明細書で使用するすべての%核酸配列同一性の値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを用いて直前のパラグラフにおいて記載した通りに得られる。
本発明はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする核酸分子であり、そして、本明細書中で開示する完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481
、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に、好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下および洗浄条件下でハイブリダイズすることができるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドを提供する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、
PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドによりコードされるものであり得る。
、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に、好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下および洗浄条件下でハイブリダイズすることができるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドを提供する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリペプチドは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、
PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体ポリヌクレオチドによりコードされるものであり得る。
用語「完全長コード領域」とは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする核酸を言及する際に使用する場合、本発明の完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチドの配列のことをいう(これは、添付図面において開始コドンと終止コドン(それらを含む)との間に示される場合が多い)。用語「完全長コード領域」とは、ATCC寄託核酸を言及する際に使用する場合、ATCCに寄託されているベクター内に挿入されているcDNAのうちPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、P
RO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする部分のことをいう(これは、添付図面において開始コドンと終止コドン(それらを含む)との間に示される場合が多い)。
RO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする部分のことをいう(これは、添付図面において開始コドンと終止コドン(それらを含む)との間に示される場合が多い)。
「単離された」とは、本明細書中で開示する様々なポリペプチドを説明するために用いる場合、その天然の環境の成分中から同定および分離および/または回収されたポリペプチドを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、代表的にはポリペプチドの診断または治療上の使用を妨害する物質であり、それらとしては、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質性または非タンパク質性の溶質が挙げられ得る。本発明は(1)スピニングカップ(spinning cup)配列決定装置を用いてN末端または内部のアミノ酸配列の少なくとも15残基を得るのに十分な程度まで、または(2)クマシーブルー染色もしくは好ましくは銀染色を用いた非還元または還元条件下のSDS−PAGEによる均質性となるように、ポリペプチドが精製されることを可能とする。単離されたポリペプチドは組換え細胞内のin situのポリペプチドを包むが、その理由はPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然の環境の成分の少なくとも1つの成分が存在しないためである。しかしながら通常は、単離されたポリペプチドは、少なくとも1つの精製工程により調製される。
「単離された」PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドコード核酸または他のポリペプチドコード核酸は、ポリペプチドコード核酸の天然の起源において通常関連する少なくとも1つの
夾雑核酸分子から同定され、分離される核酸分子である。単離されたポリペプチドコード核酸分子は、自然界にそれが存在する形態または状態以外のものである。したがって、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、天然の細胞内にそれが存在する場合、特定のポリペプチドコード核酸分子とは区別される。しかしながら、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、例えば、その核酸分子が天然の細胞のものとは異なる染色体位置にある場合、通常そのポリペプチドを発現する細胞に含まれるポリペプチドコード核酸分子を包む。
夾雑核酸分子から同定され、分離される核酸分子である。単離されたポリペプチドコード核酸分子は、自然界にそれが存在する形態または状態以外のものである。したがって、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、天然の細胞内にそれが存在する場合、特定のポリペプチドコード核酸分子とは区別される。しかしながら、単離されたポリペプチドコード核酸分子は、例えば、その核酸分子が天然の細胞のものとは異なる染色体位置にある場合、通常そのポリペプチドを発現する細胞に含まれるポリペプチドコード核酸分子を包む。
用語「調節配列」は、特定の宿主生物中の作動可能に連結されたコード配列の発現のために必要なDNA配列のことをいう。例えば、原核生物に適した調節配列は、プロモーター、必要に応じてオペレーター配列およびリボソーム結合部位を包む。真核生物の細胞は、プロモーター、ポリアデニル化シグナルおよびエンハンサーを利用することが知られている。
核酸は、それが別の核酸配列との機能的関連性の内部におかれる場合に「作動可能に連結」されている。例えば、プレ配列または分泌リーダーに対するDNAは、それがポリペプチドの分泌に関与するプレタンパク質として発現される場合にはそのポリペプチドに対するDNAに作動可能に連結されており;プロモーターもしくはエンハンサーは、それが配列の転写に影響する場合にはコード配列に作動可能に連結されており;または、リボソーム結合部位は、それが翻訳を促進するように位置付けられている場合にコード配列に作動可能に連結されている。一般的に「作動可能に連結された」とは、連結されるDNA配列が隣接しており、そして、分泌リーダーの場合は隣接し、かつリーディングフェーズにあることを意味する。しかしながら、エンハンサーは、隣接している必要はない。連結は、好都合な制限部位におけるライゲーションにより達成される。そのような部位が存在しない場合は、合成オリゴヌクレオチドアダプターまたはリンカーを従来の慣行に従って使用する。
ハイブリダイゼーション反応の「ストリンジェンシー」とは、当業者が容易に決定できるものであり、一般的にプローブ長、洗浄温度および塩濃度に依存した実験的計算値である。一般に、長いプローブほど適切なアニーリングのためにより高温を必要とし、短いプローブほどより低温を必要とする。ハイブリダイゼーションは、一般に、相補鎖がその融点より低温の環境中に存在する場合、変性したDNAが再アニーリングする能力に依存する。プローブとハイブリダイズ可能な配列との間の所望の相同性の程度が高いほど、使用できる相対温度は高くなる。その結果、より高い相対温度は、反応条件をよりストリンジェントとする傾向があり、より低い温度は、その傾向が小さい。ハイブリダイゼーション反応のストリンジェンシーに関するさらなる詳細および説明については、Ausubel
et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Wiley Interscience Publishers,(1995)を参照のこと。
et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Wiley Interscience Publishers,(1995)を参照のこと。
「ストリンジェントな条件」または「高ストリンジェンシー条件」とは、本明細書において定義する場合、(1)低いイオン強度および高い洗浄温度、例えば、0.015M塩化ナトリウム/0.0015Mクエン酸ナトリウム/0.1%ドデシル硫酸ナトリウムを50℃において使用するか;(2)ハイブリダイゼーションの間、ホルムアミドなどの変性剤、例えば、50%(v/v)ホルムアミド+0.1%ウシ血清アルブミン/0.1%Ficoll/0.1%ポリビニルピロリドン/50mMリン酸ナトリウム緩衝液pH6.5+750mM塩化ナトリウム、75mMクエン酸ナトリウムを42℃で使用するか;または(3)50%ホルミアミド、5×SSC(0.75M NaCl、0.075Mクエン酸ナトリウム)、50mMリン酸ナトリウム(pH6.8)、0.1%ピロリン酸ナトリウム、5×Denhardt溶液、超音波処理サケ精子DNA(50μg/mL)、
0.1%SDSおよび10%デキストラン硫酸を42℃で使用し、そして洗浄は42℃で0.2×SSC(塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム)および55℃の50%ホルムアミド、その後55℃のEDTA含有0.1×SSCからなる高ストリンジェンシー洗浄条件を使用するものとして特定され得る。
0.1%SDSおよび10%デキストラン硫酸を42℃で使用し、そして洗浄は42℃で0.2×SSC(塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム)および55℃の50%ホルムアミド、その後55℃のEDTA含有0.1×SSCからなる高ストリンジェンシー洗浄条件を使用するものとして特定され得る。
「中等度にストリンジェントな条件」とは、Sambrook et al.,Molecular Cloning;A Laboratory Manual,New York:Cold Spring Harbor Press,1989による説明と同一と考えてよく、そして、上記したものより低ストリンジェントな洗浄溶液およびハイブリダイゼーションの条件(例えば、温度、イオン強度および%SDS)の使用を包む。中等度にストリンジェントな条件の例は、20%ホルムアミド、5×SSC(150mM NaCl、15mMクエン酸三ナトリウム)、50mMリン酸ナトリウム(pH7.6)、5×Denhardt溶液、10%デキストラン硫酸および20mg/mL変性撹拌サケ精子DNAを含む溶液中37℃での一晩のインキュベーションおよびその後の約37〜50℃における1×SSC中フィルターの洗浄である。プローブ長などのような因子を適合させるために必要に応じて温度、イオン強度などを調節する方法は当業者の認識する通りである。
用語「エピトープタグ化された」とは、本明細書中で使用されるとき、「タグポリペプチド」に融合されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含むキメラポリペプチドのことをいう。タグポリペプチドは、対応する抗体が作製できるエピトープを提供するために十分な残基を有するが、融合相手のポリペプチドの活性を妨害しないくらい短い。タグポリペプチドは、好ましくは抗体が他のエピトープと実質的に交差反応しないほど高度に特有のものである。適当なタグポリペプチドは、一般に少なくとも6アミノ酸残基、そして通常は約8〜50アミノ酸残基(好ましくは約10〜20アミノ酸残基)を有する。
「活性な」または「活性」とは、本明細書の目的では、ネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO
36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの生物学的および/または免疫学的な活性を保持するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形態のことをいい、ここで、「生物学的」活性とは、ネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが有する抗原性エピトープに対する抗体の産生を誘導する能力以外のネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21
201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドによって引き起こされる生物学的機能(抑制性または促進性のいずれか)のことをいい、そして「免疫学的」活性とは、ネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが有する抗原性エピトープに対する抗体の産生を誘導する能力のことをいう。
36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの生物学的および/または免疫学的な活性を保持するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形態のことをいい、ここで、「生物学的」活性とは、ネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが有する抗原性エピトープに対する抗体の産生を誘導する能力以外のネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21
201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドによって引き起こされる生物学的機能(抑制性または促進性のいずれか)のことをいい、そして「免疫学的」活性とは、ネイティブまたは天然に存在するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが有する抗原性エピトープに対する抗体の産生を誘導する能力のことをいう。
用語「アンタゴニスト」は、[特段の制限がない限り]最も広範な意味において使用され、そして本明細書中で開示するネイティブのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの生物学的活性を部分的または完全に阻止、抑制または中和する任意の分子を含む。同様の様式において、用語「アゴニスト」は、[特段の制限がない限り]最も広範な意味において使用され、そして本明細書中で開示するネイティブのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO743
6、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの生物学的活性を模倣する任意の分子を包む。適当なアゴニスト分子またはアンタゴニスト分子は、特にネイティブのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、ペプチド、アンチセンスオリゴヌクレオチド、有機小分子などのアゴニストもしくはアンタゴニスト抗体または抗体フラグメント、フラグメントあるいはアミノ酸配列改変体を包む。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストを同定するための方法は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチ
ドを候補アゴニスト分子または候補アンタゴニスト分子に接触させる工程およびPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに通常関連している1以上の生物学的活性の検出可能な変化を測定する工程を含み得る。
6、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの生物学的活性を模倣する任意の分子を包む。適当なアゴニスト分子またはアンタゴニスト分子は、特にネイティブのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、ペプチド、アンチセンスオリゴヌクレオチド、有機小分子などのアゴニストもしくはアンタゴニスト抗体または抗体フラグメント、フラグメントあるいはアミノ酸配列改変体を包む。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストを同定するための方法は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチ
ドを候補アゴニスト分子または候補アンタゴニスト分子に接触させる工程およびPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに通常関連している1以上の生物学的活性の検出可能な変化を測定する工程を含み得る。
「処置する」または「処置」または「軽減」とは、治療的な施療および予防的または防止的な手段の両方のことをいい、ここで、その目的は、ターゲティングされた病的状態または障害を予防するか緩徐化(低減)することである。処置を必要とする被験体は、すでに疾患を有し得るか、または、疾患を有する傾向にあり得るか、もしくは疾患を予防すべき状態であり得る。
「長期」投与とは、長期間に亘り初期の処置効果(活性)を維持するために短期の様式とは逆の持続的な様式における薬剤の投与のことをいう。「間欠的」投与は中断なく連続的に行われるのではなく、周期的な性質を有する処置である。
「哺乳動物」とは、処置の目的のためには、哺乳動物に分類される任意の動物のことをいい、それらとしては、ヒト、ラットまたはマウスなどのげっ歯類、家畜および牧場動物および動物園、競技用または愛玩用の動物、例えば、イヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ウサギなどが挙げられる。好ましくは、哺乳動物は、ヒトである。
さらなる1以上の処置薬と「組み合わせた」投与は、同時(併用)および任意の順序での連続投与を包む。
「担体」とは、本明細書中で使用されるとき、使用する用量および濃度において曝露対象となる細胞または哺乳動物に対して非毒性である薬学的に許容可能な担体、賦形剤または安定化剤を包む。生理学的に許容可能な担体は、水性のpH緩衝溶液であることが多い。生理学的に許容可能な担体の例としては、緩衝剤(例えば、リン酸塩、クエン酸塩および他の有機酸);アスコルビン酸を含む抗酸化剤;低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン);ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンまたはリシン);グルコース、マンノースまたはデキストリンを含む、単糖類、二糖類および他の炭水化物;EDTAなどのキレート化剤;マンニトールおよびソルビトールなどの糖アルコール;ナトリウムなどの塩形成対イオン;ならびに/または非イオン性界面活性剤、例えばTWEENTM、ポリエチレングリコール(PEG)およびPLURONICSTMが挙げられる。
「固相」とは、本発明の抗体が接着できる非水性マトリックスを意味する。本明細書に
おいて包含される固相の例としては、ガラス(例えば、細孔性ガラス)、多糖類(例えば、アガロース)、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、ポリビニルアルコールおよびシリコーンから部分的または完全に形成されているものが挙げられる。文脈に応じて、固相は、アッセイプレートのウェルを含み得;他の場合は精製カラム(例えば、アフィニティークロマトグラフィーカラム)である。この用語はまた、米国特許第4,275,149号に記載されているものなどの個々の粒子の不連続な固相を含む。
おいて包含される固相の例としては、ガラス(例えば、細孔性ガラス)、多糖類(例えば、アガロース)、ポリアクリルアミド、ポリスチレン、ポリビニルアルコールおよびシリコーンから部分的または完全に形成されているものが挙げられる。文脈に応じて、固相は、アッセイプレートのウェルを含み得;他の場合は精製カラム(例えば、アフィニティークロマトグラフィーカラム)である。この用語はまた、米国特許第4,275,149号に記載されているものなどの個々の粒子の不連続な固相を含む。
「リポソーム」とは、哺乳動物への薬剤(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはそれに対する抗体)の送達のために有用な脂質、リン脂質および/または界面活性剤の様々な型から構成される小型ベシクルである。リポソームの成分は生物学的膜の脂質の配置と同様に、二層を形成して通常配置される。
「小分子」とは、約500ダルトン未満の分子量を有するものとして本明細書においては定義する。
本明細書中で開示するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1
481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子またはこれ等のアゴニストまたはアンタゴニストの「有効量」とは、特に記載した目的を実施するために十分な量である。「有効量」は記載した目的との関係において実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。
481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子またはこれ等のアゴニストまたはアンタゴニストの「有効量」とは、特に記載した目的を実施するために十分な量である。「有効量」は記載した目的との関係において実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。
用語「治療有効量」とは、被験体または哺乳動物における疾患または障害を「処置する」ために有効な抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO15
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RO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子または他の薬剤の量のことをいう。癌の場合、薬剤の治療有効量は、癌細胞の数を減少させるか;腫瘍サイズを低減するか;末梢器官への癌細胞の浸潤を抑制(すなわち、ある程度まで緩徐化、好ましくは停止)するか;腫瘍の転移を抑制(すなわち、ある程度まで緩徐化、好ましくは停止)するか;腫瘍の成長をある程度まで抑制するか;そして/または癌に関連する症状の1つ以上をある程度まで軽減し得る。「処置する」の本明細書における定義を参照のこと。薬剤が、既存の癌細胞の成長を予防し得、そして/または既存の癌細胞を殺滅し得る限り、その薬剤は、細胞分裂抑制性および/または細胞傷害性であり得る。
73、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、P
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語句「心臓血管、内皮および血管形成の障害」、「心臓血管、内皮および血管形成の機能不全」、「心臓血管、内皮または血管形成の障害」および「心臓血管、内皮または血管形成の機能不全」は、交換可能に使用され、部分的には、血管に影響する全身性の障害(例えば、真性糖尿病、ならびに、動脈、毛細管、静脈および/またはリンパのような脈管自体の疾患)のことをいう。これには、血管形成および/または心臓血管形成を刺激する適応症ならびに血管形成および/または心臓血管形成を抑制するものが含まれる。このような障害としては、動脈疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症、高血圧症、炎症性血管炎、レイノー病およびレイノー現象、動脈瘤ならびに動脈再狭窄);静脈およびリンパの障害(例えば、血栓静脈炎、リンパ管炎およびリンパ浮腫);ならびに末梢血管疾患などのほかの血管障害;癌(例えば、血管腫瘍、例えば、血管腫(毛細管および海綿状)、グロムス腫瘍、毛細管拡張症、細菌性血管腫症、血管内皮腫、血管肉腫、血管外皮腫、カポジ肉腫、リンパ管腫およびリンパ管肉腫)、腫瘍血管新生、外傷(例えば、創傷、熱傷および他の組織の傷害)、移植片固定、瘢痕、虚血再灌流傷害、関節リウマチ、脳血管疾患、急性腎不全などの腎疾患または骨粗鬆症が挙げられる。これらにはまた、アンギナ、急性心筋梗塞などの心筋梗塞、心臓肥大およびCHFなどの心不全が含まれる。
「肥大」とは、本明細書中で使用されるとき、腫瘍形成に関与しない天然の成長とは無関係の器官または構造の嵩の増大として定義される。器官または組織の肥大は、個々の細胞の嵩の増大(真の肥大)またはその組織を構成している細胞の数の増加(過形成)のいずれか、またはそれらの両方によるものである。心臓などの特定の器官は、出生後短期間で分裂する能力を失う。したがって、「心臓肥大」とは、成人において同時細胞分裂を伴わない心筋細胞のサイズおよび収縮タンパク質含有量の増大を特徴とする心臓の嵩の増大として定義される。肥大を刺激する原因となるストレスの特徴(例えば、心筋梗塞の場合のような、前負荷の増大、後負荷の増大、筋細胞の減少、または収縮力の一次的低下)が応答の性質を決定する場合に重要な役割を果たしていると考えられる。心臓肥大の早期の段階は、通常、筋原線維の大きさおよびミトコンドリアの増大により、ならびに、ミトコンドリアおよび核の膨大により形態学的に特徴付けられる。この段階において、筋細胞は、正常よりも大型となるが、細胞の組織は、大半は温存されている。心臓肥大のより進行した段階において、ミトコンドリアなどの特定の細胞内小器官のサイズまたは数の優先的な増大が生じ、そして、新しい収縮エレメントが不規則な様式で細胞の局所的領域に付加される。長時間持続する肥大に関与した細胞は、隣接する筋原線維に置き換わり、正常なZ線の表示の崩壊をもたらす高度に小葉化した膜を伴って顕著に膨大した核を含む、細胞組成のより顕著な破壊を示す。語句「心臓肥大」は、根本的な心臓障害とは無関係に様々な程度の心筋の構造的損傷を特徴とするこの状態の進行のすべての段階を包むために使用される。したがって、この用語はまた、心臓肥大(例えば、血圧の上昇、大動脈の狭窄または心筋梗塞)の発生に寄与する生理学的状態を含む。
「心不全」とは、代謝している組織の要求に対して必要とされる速度では心臓が血液を送液しない心臓機能の異常のことをいう。心不全は、虚血性、先天性、リウマチ性または
特発性の形態を含む多くの要因により誘発され得る。
特発性の形態を含む多くの要因により誘発され得る。
「鬱血性心不全」(CHF)は、心臓が末梢組織に対し酸素付加された血液を送達するために十分な心拍出量(経時的に心臓により送液される血液の容量)を供給することがますます不可能になっている進行性の病的状態である。CHFが進行するに従い、構造的および血行力学的な損傷が生じる。これらの損傷は、種々の徴候を有するが、1つの特徴的な症状は、心室の肥大である。CHFは、多くの様々な心臓障害の共通した最終結果である。
「心筋梗塞」は、一般に冠状動脈のアテローム性動脈硬化症から生じ、混合型の冠状動脈血栓を伴う場合が多い。これは2つの主要な型:心筋の壊死が心室壁の厚みすべてに関与している経壁梗塞、およびその壊死が心室壁から心外膜に至るまでの拡張を伴わない心内膜下、壁内心筋層、またはその両方が関与する心内膜下(非貫壁性)梗塞に分類され得る。心筋梗塞は、血行力学的作用の変化および心臓の損傷部および健常部における構造の変化の両方をもたらすことが知られている。すなわち、例えば、心筋梗塞は、心臓の最大心拍出量および一回拍出量を減少させる。また、間隙において生じるDNA合成の刺激ならびに罹患していない心臓の領域におけるコラーゲンの形成の増大が、心筋梗塞に関連する。
例えば、全末梢血管抵抗の増大に起因する長期間高血圧である心臓に対して与えられるストレスまたは緊張の増大の結果として、心臓肥大には「高血圧」が長く関わっている。慢性的な圧力の過剰負荷の結果として肥大した心室の特徴は減損した拡張期の機能である。Fouad et al.,J.Am.Coll.Cardiol.,4:1500−1506(1984);Smith et al.,J.Am.Coll.Cardiol.,5:869−874(1985)。長期の左心室の弛緩は、正常または過剰な収縮機能にも関わらず、早期の本態性高血圧において検出されている。Hartford et al.,Hypertension,6:329−338(1984)。しかしながら、血圧のレベルと心臓肥大の間には緊密な平行性はない。抗高血圧療法に応答した左心室機能の改善がヒトにおいて報告されているが、利尿剤(ヒドロクロロチアジド)、β−遮断薬(プロプラノロール)またはカルシウムチャネル遮断薬(ジルチアゼム)で多様に処置されている患者は、拡張機能の改善を伴わない左心室肥大の回復を示している。Inouye et al.,Am.J.Cardiol.,53:1583−7(1984)。
心臓肥大に伴う別の複合的心臓疾患は、「肥大性心筋症」である。この状態は、非常に多様な形態学的、機能的および臨床的な特徴により特徴付けられ(Maron et al.,N.Engl.J.Med.,316:780−789(1987);Spirito et al.,N.Engl.J.Med.,320:749−755(1989);Louie and Edwards,Prog.Cardiovasc.Dis.,36:275−308(1994);Wigle et al.,Circulation,92:1680−1692(1995))、その不均質性は、それが全世代の患者に及んでいるという事実により強調されている。Spirito et al.,N.Engl.J.Med.,336:775−785(1997)。肥大性心筋症の原因もまた多様であり、ほとんど解明されていない。一般に、筋節タンパク質をコードする遺伝子における変異が、肥大性心筋症に関連している。最近のデータによれば、β−ミオシン重鎖の変異が、家族性の肥大性心筋症の症例の約30〜40パーセントを占め得ることが示唆されている。Watkins et al.,N.Engl.J.Med.,326:1108−1114(1992);Schwartz et al.,Circulation,91:532−540(1995);Marian and Roberts,Circulation,92:1336−1347(1995);Thierfeld
er et al.,Cell,77:701−712(1994);Watkins et al.,Nat.Gen.,11:434−437(1995)。β−ミオシン重鎖以外に、他の位置の遺伝子変異としては、心臓トロポニンT、アルファトポミオシン、心臓ミオシン結合タンパク質C、必須ミオシン軽鎖および調節ミオシン軽鎖が挙げられる。Malik and Watkins,Curr.Opin.Cardiol.,12:295−302(1997)を参照のこと。
er et al.,Cell,77:701−712(1994);Watkins et al.,Nat.Gen.,11:434−437(1995)。β−ミオシン重鎖以外に、他の位置の遺伝子変異としては、心臓トロポニンT、アルファトポミオシン、心臓ミオシン結合タンパク質C、必須ミオシン軽鎖および調節ミオシン軽鎖が挙げられる。Malik and Watkins,Curr.Opin.Cardiol.,12:295−302(1997)を参照のこと。
弁上部「大動脈狭窄症」は、上行大動脈の狭窄を特徴とする遺伝性の血管障害であるが、肺動脈を含む他の動脈も罹患する場合がある。未処置の大動脈狭窄は、心筋の肥大ならびに最終的には心不全および死亡の原因となる心臓内圧の上昇をもたらす場合がある。この障害の病因は、完全には解明されていないが、内側平滑筋の肥大および恐らくは過形成が、この障害の顕著な特徴である。エラスチン遺伝子の分子改変体が、大動脈狭窄の発症および病因に関与していると報告されている。1997年7月22日発行の米国特許第5,650,282号。
「弁逆流」は、心臓の弁の障害をもたらす心臓疾患の結果として生じる。リウマチ熱のような様々な疾患は、弁開口部の収縮または引き離しをもたらす場合があるが、他の疾患は、心内膜炎、心内膜または房室開口部の内膜の炎症および心臓手術の原因となる場合がある。弁狭窄部の狭小化および弁の閉鎖欠陥などの欠陥は、心臓腔中の血液の蓄積または弁を通過する血液の逆流をもたらす。改善されない場合、長期の弁の狭窄または不全により、心臓肥大および関連する心筋の損傷がもたらされ、それにより最終的には弁の交換が必要となる場合がある。
用語「免疫関連疾患」は、哺乳動物の免疫系の構成要素が、哺乳動物における罹患に対し、誘発、媒介または他の方法で寄与する疾患を意味する。同様に含まれるものは、免疫応答の刺激または介入が疾患の進行に対して寛解作用を有する疾患である。この用語に含まれるものは、免疫媒介炎症性疾患、非免疫媒介炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新生物形成などである。
用語「T細胞媒介疾患」は、T細胞が哺乳動物における罹患を直接的または間接的に媒介するか、他の方法において寄与する疾患を意味する。T細胞媒介疾患は、細胞媒介作用、リンフォカイン媒介作用などに関連し得、そしてB細胞が、例えばT細胞の分泌したリンフォカインにより刺激される場合にはB細胞関連作用にも関連し得る。
「自己免疫疾患」は、器官特異的疾患であり得る(すなわち、免疫応答が、器官系(例えば、内分泌系、造血系、皮膚、心肺系、消化器および肝臓系、腎臓系、甲状腺、耳、神経筋系、中枢神経系など)に特異的に関する)か、または、複数の器官系に罹患し得る全身性疾患(例えば、全身性エリテマトーデス(SLE)、関節リウマチ、多発性筋炎など)であり得る。好ましいそのような疾患としては、自己免疫性のリウマチ学的障害(例えば、関節リウマチ、シェーグレン症候群、強皮症、SLEおよびループス腎炎などの狼瘡、多発性筋炎/皮膚筋炎、クリオグロブリン血症、抗リン脂質抗体症候群および乾癬性関節炎)、自己免疫性の消化器および肝臓の障害(例えば、炎症性腸疾患(例えば、潰瘍性大腸炎およびクローン病)、自己免疫性胃炎および悪性貧血、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎およびセリアック病)、血管炎(例えば、チャーグ−ストラウス血管炎、ヴェーゲナー肉芽腫症および多発性動脈炎(polyarteriitis)を含むANCA関連血管炎)、自己免疫性神経障害(例えば、多発性硬化症、眼球クローヌス筋クローヌス症候群、重症筋無力症、視神経脊髄炎、パーキンソン病、アルツハイマー病および自己免疫性多発ニューロパシー)、腎障害(例えば、糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群およびバージャー病)、自己免疫性皮膚障害(例えば、乾癬、蕁麻疹(urticaria)、蕁麻疹(hives)、尋常性天疱瘡、水疱性類天疱瘡および
皮膚エリテマトーデス)、血液学的障害(例えば、血小板減少性紫斑病、血栓性血小板減少性紫斑病、輸血後の紫斑病および自己免疫性溶血性貧血)、アテローム性動脈硬化症、ブドウ膜炎、自己免疫性聴覚疾患(例えば、内耳疾患および聴覚喪失)、ベーチェット病、レイノー症候群、臓器移植および自己免疫内分泌障害(例えば、インスリン依存性真性糖尿病(IDDM)などの糖尿病関連自己免疫性疾患、アジソン病および自己免疫性甲状腺疾患(例えば、グレーブス病および甲状腺炎))が挙げられる。より好ましいこのような疾患としては、例えば、関節リウマチ、潰瘍性大腸炎、ANCA関連血管炎、狼瘡、多発性硬化症、シェーグレン症候群、グレーブス病、IDDM、悪性貧血、甲状腺炎および糸球体腎炎が挙げられる。
皮膚エリテマトーデス)、血液学的障害(例えば、血小板減少性紫斑病、血栓性血小板減少性紫斑病、輸血後の紫斑病および自己免疫性溶血性貧血)、アテローム性動脈硬化症、ブドウ膜炎、自己免疫性聴覚疾患(例えば、内耳疾患および聴覚喪失)、ベーチェット病、レイノー症候群、臓器移植および自己免疫内分泌障害(例えば、インスリン依存性真性糖尿病(IDDM)などの糖尿病関連自己免疫性疾患、アジソン病および自己免疫性甲状腺疾患(例えば、グレーブス病および甲状腺炎))が挙げられる。より好ましいこのような疾患としては、例えば、関節リウマチ、潰瘍性大腸炎、ANCA関連血管炎、狼瘡、多発性硬化症、シェーグレン症候群、グレーブス病、IDDM、悪性貧血、甲状腺炎および糸球体腎炎が挙げられる。
場合により上で列挙したものを包含する本明細書において定義する他の自己免疫疾患の特定の例としては、関節炎(例えば、若年性発症型の関節リウマチおよびリウマチ様滑膜炎の段階、痛風または痛風性関節炎、急性免疫学的関節炎、慢性炎症性関節炎、変形性関節症、II型コラーゲン誘導関節炎、感染性関節炎、ライム関節炎、増殖性関節炎、乾癬性関節炎、スティル病、椎骨関節炎、骨関節炎、慢性進行性関節炎(arthritis
chronica progrediente)、慢性関節リウマチ、原発性慢性多発性関節炎(polyarthritis chronica primaria)、反応性関節炎、閉経期関節炎、エストロゲン枯渇関節炎および強直性脊椎炎/リウマチ様脊椎炎を含む急性および慢性の関節リウマチ)、自己免疫性リンパ増殖性疾患、炎症性増殖亢進性皮膚疾患、乾癬(例えば、プラーク乾癬、滴状乾癬(gutatte psoriasis)、膿疱性乾癬および爪の乾癬)、枯草熱およびヨブ症候群などのアトピー性疾患を含むアトピー、皮膚炎(接触性皮膚炎、慢性接触性皮膚炎、剥脱性皮膚炎、アレルギー性皮膚炎、アレルギー性接触性皮膚炎、蕁麻疹(hives)、疱疹状皮膚炎、貨幣状皮膚炎、脂漏性皮膚炎、非特異的皮膚炎、一次刺激性接触性皮膚炎およびアトピー性皮膚炎を含む)、X連鎖高IgM症候群、アレルギー性眼内炎症性疾患、蕁麻疹(urticaria)(例えば、慢性アレルギー性蕁麻疹および慢性特発性蕁麻疹(慢性自己免疫性蕁麻疹を含む)、筋炎、多発性筋炎/皮膚筋炎、若年性皮膚筋炎、中毒性表皮壊死症、強皮症(全身強皮症を含む)、硬化症(例えば、全身硬化症、多発性硬化症(MS)(例えば、視神経脊髄型MS(spino−optical MS)、一次性進行性MS(PPMS)および再発寛解型MS(RRMS))、進行性全身硬化症、アテローム性動脈硬化症、動脈硬化症、播種性硬化症、失調性硬化症)、視神経脊髄炎(NMO)、炎症性腸疾患(IBD)(例えば、クローン病、自己免疫媒介消化器系疾患、消化器系炎症、大腸炎(例えば、潰瘍性大腸炎(ulcerative colitis)、潰瘍性大腸炎(colitis ulcerosa)、微視的大腸炎、コラーゲン蓄積大腸炎、ポリープ性大腸炎(colitis polyposa)、壊死性腸炎および経壁性大腸炎ならびに自己免疫性炎症性腸疾患)、腸炎症、壊疽性膿皮症、結節性紅斑、原発性硬化性胆管炎、呼吸窮迫症候群(例えば、成人呼吸窮迫症候群または急性呼吸窮迫症候群(ARDS))、髄膜炎、ブドウ膜の全体または部分の炎症、虹彩炎、脈絡膜炎、自己免疫性血液学的障害、移植片対宿主病、血管性水腫(例えば、遺伝性の血管性水腫)、髄膜炎の場合等の脳神経損傷、妊娠性ヘルペス、妊娠性類天疱瘡、陰嚢掻痒(pruritis scroti)、自己免疫性早発性卵巣不全、自己免疫性状態による突発性難聴、IgE媒介疾患(例えば、アナフィラキシーならびにアレルギー性およびアトピー性の鼻炎)、脳炎(例えば、ラスムッセン脳炎ならびに辺縁および/または脳幹の脳炎)、ブドウ膜炎(例えば、前部ブドウ膜炎、急性前部ブドウ膜炎、肉芽腫性ブドウ膜炎、非肉芽腫性ブドウ膜炎、水晶体起因性ブドウ膜炎、後部ブドウ膜炎または自己免疫性ブドウ膜炎)、ネフローゼ症候群を伴うか伴わない糸球体腎炎(GN)(例えば、慢性または急性の糸球体腎炎(例えば、原発性GN、免疫媒介性GN、膜性GN(膜性腎症)、特発性膜性GNまたは特発性膜性腎症、膜性または膜増殖性のGN(MPGN)(I型およびII型を含む)および急速進行性GN(RPGN))、増殖性腎炎、自己免疫性多内分泌腺不全、亀頭炎(形質細胞亀頭炎を含む)、亀頭包皮炎、遠心性環状紅斑、色素異常性固定性紅斑、多形性紅斑(ey
thema multiform)、環状肉芽腫、光沢苔癬、硬化性萎縮性苔癬、ビダール苔癬、棘状苔癬、扁平苔癬、葉状魚鱗癬、表皮剥離性角質増殖症、前癌角化症、壊疽性膿皮症、アレルギー性の状態および応答、食物アレルギー、薬剤アレルギー、昆虫アレルギー、稀少なアレルギー性障害(例えば、肥満細胞症、アレルギー性反応、湿疹(アレルギー性またはアトピー性の湿疹、皮脂欠乏性湿疹、異汗性湿疹および小水疱性の掌蹠湿疹を含む)、喘息(例えば、気管支喘息(asthma bronchiale)、気管支喘息(bronchial asthma)および自己免疫性喘息)、T細胞の浸潤が関与する状態および慢性の炎症応答、外来抗原(例えば、妊娠中の胎児A−B−O血液型群)に対する免疫反応、慢性肺炎症性疾患、自己免疫性心筋炎、白血球接着不全、狼瘡(ループス腎炎、ループス脳炎、小児ループス、非腎性ループス、腎外ループス、円板状ループスおよび円板状エリテマトーデス、脱毛性ループス、SLE(例えば、皮膚SLEまたは亜急性皮膚SLE)、新生児ループス症候群(NLE)ならびに播種性エリテマトーデスを含む)、若年発症(I型)真性糖尿病(小児IDDMを含む)、成人発症真性糖尿病(II型)、自己免疫性糖尿病、特発性尿崩症、糖尿病性網膜炎、糖尿病性腎症、糖尿病性大腸炎、糖尿病性大動脈障害、サイトカインおよびTリンパ球により媒介される急性および遅延型の過敏症に関連する免疫応答、結核、サルコイドーシス、肉芽腫症(リンパ腫様肉芽腫症、ヴェーゲナー肉芽腫症を含む)、顆粒球減少症、脈管炎(血管炎、大型血管の血管炎(リウマチ性多発性筋痛症および巨細胞性(高安)動脈炎を含む)、中型血管の血管炎(川崎病および結節性多発性動脈炎/結節性動脈周囲炎)、微視的多発性血管炎、免疫血管炎、CNS血管炎、皮膚血管炎、過敏性血管炎、壊死性血管炎、例えば、全身性壊死性血管炎およびANCA関連血管炎、例えば、チャーグ‐ストラウス血管炎または症候群(CSS)およびANCA関連の小型血管の血管炎、側頭動脈炎、再生不良性貧血、自己免疫性再生不良性貧血、クームズ陽性貧血、ダイアモンド‐ブラックファン貧血、溶血性貧血または免疫溶血性貧血、例えば、自己免疫性溶血性貧血(AIHA)、悪性貧血(pernicious anemia)(悪性貧血(anemia perniciosa))、アジソン病、先天性低形成貧血または形成不全(PRCA)、第VIII因子欠乏症、血友病A、自己免疫性好中球減少症、血球減少症、例えば、汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出が関与する疾患、CNS炎症性障害、アルツハイマー病、パーキンソン病、多臓器傷害症候群、例えば、敗血症、外傷または出血に対して二次的なもの、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、抗リン脂質抗体症候群、運動神経炎(motoneuritis)、アレルギー性神経炎、ベーチェット病/症候群、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、レイノー症候群、シェーグレン症候群、スティーブンス−ジョンソン症候群、類天疱瘡、例えば、水疱性類天疱瘡および皮膚類天疱瘡、天疱瘡(例えば、尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡、粘液天疱瘡−膜類天疱瘡および紅斑性天疱瘡)、自己免疫性多発性内分泌腺症、ライター病または症候群、自己免疫性状態に起因する熱傷害、子癇前症、免疫複合体障害、例えば、免疫複合体腎炎、抗体媒介腎炎、神経炎症性障害、多発性ニューロパシー、慢性ニューロパシー、例えば、IgM多発性ニューロパシーまたはIgM媒介ニューロパシー、血小板減少症(例えば、心筋梗塞患者により発症)(血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、輸血後の紫斑病(PTP)、ヘパリン誘導血小板減少症および自己免疫性または免疫媒介性の血小板減少症(例えば、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)(慢性または急性のITPを含む)を含む))、強膜炎(例えば、特発性角膜強膜炎、上強膜炎)、精巣および卵巣の自己免疫性疾患(自己免疫性の精巣炎および卵巣炎を含む)、原発性甲状腺機能低下症、上皮小体機能低下症、自己免疫性内分泌疾患(甲状腺炎(例えば、自己免疫性甲状腺炎、橋本病、慢性甲状腺炎(橋本甲状腺炎)または亜急性甲状腺炎)、自己免疫性甲状腺疾患、特発性甲状腺機能低下症、グレーブス病、多腺症候群(例えば、自己免疫性多腺症候群(例えば、I型(または多腺性内分泌障害症候群))、新生物随伴症候群(神経学的新生物随伴症候群(例えば、ランバート−イートン筋無力症候群またはイートン−ランバート症候群、スティッフマン症候群またはスティッフパーソン症候群)を含む)、脳脊髄炎(例えば、アレルギー性脳脊髄炎(allergic encephalomyelitis)またはアレルギー性脳脊髄炎(
encephalomyelitis allergica)および実験的アレルギー性脳脊髄炎(EAE))、重症筋無力症(例えば、胸腺腫関連重症筋無力症)、小脳変性症、神経性筋強直症、眼球クローヌスまたは眼球クローヌス筋クローヌス症候群(OMS)および感覚神経障害、多病巣性運動神経障害、シーハン症候群、自己免疫性肝炎、慢性肝炎、ルポイド肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎または自己免疫性慢性活動性肝炎、肺炎(例えば、リンパ様間質性肺炎(LIP)、閉塞性細気管支炎(非移植)vs NSIP、ギラン‐バレー症候群、バージャー病(IgA腎症)、特発性IgA腎症、線状IgA皮膚症、急性熱性好中球性皮膚症、角層下膿疱症、一過性棘融解性皮膚症、硬変(例えば、原発性胆汁性肝硬変および肺硬変(pneumonocirrhosis))、自己免疫性腸症候群、セリアック病、セリアックスプルー(グルテン性腸症)、難治性スプルー、特発性スプルー、クリオグロブリン血症(例えば、混合型クリオグロブリン血症)、筋萎縮性(amylotrophic)側索硬化症(ALS;ルーゲーリック病)、冠状動脈疾患、自己免疫性耳疾患(例えば、自己免疫性内耳疾患(AIED)、自己免疫性聴覚損失)、多発性軟骨炎(例えば、難治性または再発性または回帰性の多発性軟骨炎、肺胞タンパク症、コーガン症候群/非梅毒性角膜実質炎、ベル麻痺、スウィート病/症候群、自己免疫性酒さ(rosacea autoimmune)、帯状疱疹関連疼痛、アミロイド症、非癌性リンパ球増加症、原発性リンパ球増加症(例えば、モノクローナルB細胞リンパ球増加症(例えば、良性のモノクローナル高ガンマグロブリン血症および重大性不明のモノクローナル高ガンマグロブリン血症、MGUS)を含む)、末梢ニューロパシー、新生物随伴症候群、チャネル病(例えば、癲癇、偏頭痛、不整脈、筋肉障害、難聴、失明、周期性麻痺およびCNSのチャネル病)、自閉症、炎症性筋障害、巣状または分節状または巣状分節状の糸球体硬化症(FSGS)、内分泌性眼障害、ブドウ膜網膜炎、脈絡網膜炎、自己免疫性血液学的障害、線維筋痛症、多発性内分泌不全、シュミット症候群、副腎炎、胃萎縮、初老期痴呆、脱髄性疾患(例えば、自己免疫性脱髄性疾患および慢性炎症性脱髄性多発性ニューロパシー)、ドレスラー症候群、円形脱毛症、完全脱毛症、CREST症候群(石灰沈着症、レイノー現象、食道運動障害、強指症および毛細血管拡張症)、例えば、抗精子抗体による男性および女性の自己免疫性不妊、混合結合組織病、シャーガス病、リウマチ熱、反復流産、農夫肺、多形性紅斑、心術後症候群、クッシング症候群、鳥飼肺、アレルギー性肉芽腫性血管炎、良性リンパ球性血管炎、アルポート症候群、肺胞炎(例えば、アレルギー性肺胞炎および線維化肺胞炎)、間質性肺疾患、輸血反応、ハンセン病、マラリア、寄生虫病(例えば、リーシュマニア症、トリパノソーマ症(kypanosomiasis)、住血吸虫症、回虫症、アスペルギルス症、サンプター症候群、カプラン症候群、デング熱、心内膜炎、心内膜心筋線維症、びまん性間質性肺線維症、間質性肺線維症、線維形成性縦隔炎、肺線維症、特発性肺線維症、嚢胞性線維症、眼内炎、持久性隆起性紅斑、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎(eosinophilic faciitis)、シャルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症(flariasis)、毛様体炎(例えば、慢性毛様体炎、異時性毛様体炎、虹彩毛様体炎(急性または慢性)またはフックス毛様体炎)、ヘノッホシェーンライン紫斑病、ヒト免疫不全ウイ
ルス(HIV)感染症、SCID、後天性免疫不全症候群(AIDS)、エコーウイルス感染症、敗血症(全身炎症性反応症候群(SIRS))、内毒素血症、膵臓炎、サイロキシン中毒(thyroxicosis)、パルボウイルス感染症、風疹ウイルス感染症、ワクチン接種後症候群、先天性風疹感染症、エプスタイン・バーウイルス感染症、おたふくかぜ、エバンス症候群、自己免疫性性腺機能不全、シドナム舞踏病、連鎖球菌感染後腎炎、閉塞性血栓性血管炎(thromboangitis ubiterans)、甲状
腺中毒症、脊髄ろう、脈絡膜炎、巨細胞性多発性筋痛、慢性過敏性肺炎、結膜炎(例えば、春季カタル、乾性角結膜炎および流行性角結膜炎)、特発性腎炎症候群、微小変化腎症(minimal change nephropathy)、良性の家族性および虚血再灌流性の損傷、移植器官再灌流、網膜自己免疫、関節の炎症、気管支炎、慢性閉塞性気道/肺疾患、珪肺症、アフタ、アフタ性口内炎、動脈硬化性障害(脳血管不全)(例えば、動脈硬化性脳症および動脈硬化性網膜症、精液形成欠如(aspermiogenese)、自己免疫性溶血、ベック病、クリオグロブリン症、デュプュイトラン拘縮、水晶体過敏性眼内炎(endophthalmia phacoanaphylactica)、アレルギー性腸炎、らい性結節性紅斑、特発性顔面麻痺、慢性疲労症候群、リウマチ熱、ハマン−リッチ病、感覚神経聴覚損失、発作性ヘモグロビン尿症、生殖機能低下症、限局性回腸炎、白血球減少症、感染性単核細胞症、横断脊髄炎、原発性特発性粘液水腫、ネフローゼ、癒着性眼炎(ophthalmia symphatica)、肉芽腫性精巣炎、膵臓炎、急性多発性神経根炎、壊疽性膿皮症、ド・ケルヴァン甲状腺炎(Quervain’s thyreoiditis)、後天性脾臓萎縮(acquired spenic atrophy)、非悪性胸腺腫、リンパ濾胞性胸腺炎、白斑、トキシックショック症候群、食中毒、T細胞浸潤の関与する状態、白血球接着不全、サイトカインおよびTリンパ球により媒介される急性または遅発型の過敏症に関連する免疫応答、白血球漏出の関与する疾患、多臓器傷害症候群、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、自己免疫性多発性内分泌腺症、卵巣炎、原発性粘液水腫、自己免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、リウマチ病、混合結合組織病、ネフローゼ症候群、インスリン炎、多内分泌腺不全、自己免疫性多腺症候群(I型多腺症候群を含む)、成人発症型特発性上皮小体機能低下症(AOIH)、心筋症(例えば、拡張性心筋症)、後天性表皮水疱症(epidermolisis bullosa acquisita)(EBA)、ヘモクロマトーシス、心筋炎、ネフローゼ症候群、原発性硬化性胆管炎、化膿性または非化膿性の静脈洞炎、急性または慢性の静脈洞炎、篩骨、前頭部、上顎または蝶形骨の静脈洞炎、アレルギー性静脈洞炎、好酸球関連障害(例えば、好酸球増加症、肺浸潤性好酸球増加症、好酸球増多−筋痛症候群、レフラー症候群、慢性好酸球性肺炎、熱帯性肺好酸球増加症、気管支肺アスペルギルス症、アスペルギルス腫または好酸球含有の肉芽腫、アナフィラキシー、脊椎関節症、セロネガティブ脊椎関節炎、多内分泌腺自己免疫疾患、硬化性胆管炎、強膜、上強膜、慢性の粘膜皮膚カンジダ症、ブルトン症候群、乳児の一過性低ガンマグロブリン血症、ヴィスコット‐オールドリッチ症候群、毛細血管拡張性運動失調症候群、血管拡張、コラーゲン疾患に関連する自己免疫性障害、リウマチ(例えば、慢性関節リウマチ、リンパ節炎、血圧応答の低下、血管機能不全、組織損傷、心臓血管虚血、痛覚過敏、腎虚血、大脳虚血および血管形成に伴う疾患、アレルギー性過敏障害、糸球体腎炎、再灌流損傷、虚血性再灌流障害、心筋または他の組織の再灌流損傷、リンパ腫性気管気管支炎、炎症性皮膚病、急性の炎症性要素を有する皮膚病、多臓器不全、水疱性疾患、腎皮質壊死、急性化膿性髄膜炎または他の中枢神経系の炎症性障害、眼球および眼窩の炎症性障害、顆粒球輸血関連症候群、サイトカイン誘導毒性、睡眠発作、急性重篤炎症、慢性難治性炎症、腎盂炎、動脈内膜過形成、消化性潰瘍、心弁膜炎および子宮内膜症が挙げられるがこれらに限定されない。
chronica progrediente)、慢性関節リウマチ、原発性慢性多発性関節炎(polyarthritis chronica primaria)、反応性関節炎、閉経期関節炎、エストロゲン枯渇関節炎および強直性脊椎炎/リウマチ様脊椎炎を含む急性および慢性の関節リウマチ)、自己免疫性リンパ増殖性疾患、炎症性増殖亢進性皮膚疾患、乾癬(例えば、プラーク乾癬、滴状乾癬(gutatte psoriasis)、膿疱性乾癬および爪の乾癬)、枯草熱およびヨブ症候群などのアトピー性疾患を含むアトピー、皮膚炎(接触性皮膚炎、慢性接触性皮膚炎、剥脱性皮膚炎、アレルギー性皮膚炎、アレルギー性接触性皮膚炎、蕁麻疹(hives)、疱疹状皮膚炎、貨幣状皮膚炎、脂漏性皮膚炎、非特異的皮膚炎、一次刺激性接触性皮膚炎およびアトピー性皮膚炎を含む)、X連鎖高IgM症候群、アレルギー性眼内炎症性疾患、蕁麻疹(urticaria)(例えば、慢性アレルギー性蕁麻疹および慢性特発性蕁麻疹(慢性自己免疫性蕁麻疹を含む)、筋炎、多発性筋炎/皮膚筋炎、若年性皮膚筋炎、中毒性表皮壊死症、強皮症(全身強皮症を含む)、硬化症(例えば、全身硬化症、多発性硬化症(MS)(例えば、視神経脊髄型MS(spino−optical MS)、一次性進行性MS(PPMS)および再発寛解型MS(RRMS))、進行性全身硬化症、アテローム性動脈硬化症、動脈硬化症、播種性硬化症、失調性硬化症)、視神経脊髄炎(NMO)、炎症性腸疾患(IBD)(例えば、クローン病、自己免疫媒介消化器系疾患、消化器系炎症、大腸炎(例えば、潰瘍性大腸炎(ulcerative colitis)、潰瘍性大腸炎(colitis ulcerosa)、微視的大腸炎、コラーゲン蓄積大腸炎、ポリープ性大腸炎(colitis polyposa)、壊死性腸炎および経壁性大腸炎ならびに自己免疫性炎症性腸疾患)、腸炎症、壊疽性膿皮症、結節性紅斑、原発性硬化性胆管炎、呼吸窮迫症候群(例えば、成人呼吸窮迫症候群または急性呼吸窮迫症候群(ARDS))、髄膜炎、ブドウ膜の全体または部分の炎症、虹彩炎、脈絡膜炎、自己免疫性血液学的障害、移植片対宿主病、血管性水腫(例えば、遺伝性の血管性水腫)、髄膜炎の場合等の脳神経損傷、妊娠性ヘルペス、妊娠性類天疱瘡、陰嚢掻痒(pruritis scroti)、自己免疫性早発性卵巣不全、自己免疫性状態による突発性難聴、IgE媒介疾患(例えば、アナフィラキシーならびにアレルギー性およびアトピー性の鼻炎)、脳炎(例えば、ラスムッセン脳炎ならびに辺縁および/または脳幹の脳炎)、ブドウ膜炎(例えば、前部ブドウ膜炎、急性前部ブドウ膜炎、肉芽腫性ブドウ膜炎、非肉芽腫性ブドウ膜炎、水晶体起因性ブドウ膜炎、後部ブドウ膜炎または自己免疫性ブドウ膜炎)、ネフローゼ症候群を伴うか伴わない糸球体腎炎(GN)(例えば、慢性または急性の糸球体腎炎(例えば、原発性GN、免疫媒介性GN、膜性GN(膜性腎症)、特発性膜性GNまたは特発性膜性腎症、膜性または膜増殖性のGN(MPGN)(I型およびII型を含む)および急速進行性GN(RPGN))、増殖性腎炎、自己免疫性多内分泌腺不全、亀頭炎(形質細胞亀頭炎を含む)、亀頭包皮炎、遠心性環状紅斑、色素異常性固定性紅斑、多形性紅斑(ey
thema multiform)、環状肉芽腫、光沢苔癬、硬化性萎縮性苔癬、ビダール苔癬、棘状苔癬、扁平苔癬、葉状魚鱗癬、表皮剥離性角質増殖症、前癌角化症、壊疽性膿皮症、アレルギー性の状態および応答、食物アレルギー、薬剤アレルギー、昆虫アレルギー、稀少なアレルギー性障害(例えば、肥満細胞症、アレルギー性反応、湿疹(アレルギー性またはアトピー性の湿疹、皮脂欠乏性湿疹、異汗性湿疹および小水疱性の掌蹠湿疹を含む)、喘息(例えば、気管支喘息(asthma bronchiale)、気管支喘息(bronchial asthma)および自己免疫性喘息)、T細胞の浸潤が関与する状態および慢性の炎症応答、外来抗原(例えば、妊娠中の胎児A−B−O血液型群)に対する免疫反応、慢性肺炎症性疾患、自己免疫性心筋炎、白血球接着不全、狼瘡(ループス腎炎、ループス脳炎、小児ループス、非腎性ループス、腎外ループス、円板状ループスおよび円板状エリテマトーデス、脱毛性ループス、SLE(例えば、皮膚SLEまたは亜急性皮膚SLE)、新生児ループス症候群(NLE)ならびに播種性エリテマトーデスを含む)、若年発症(I型)真性糖尿病(小児IDDMを含む)、成人発症真性糖尿病(II型)、自己免疫性糖尿病、特発性尿崩症、糖尿病性網膜炎、糖尿病性腎症、糖尿病性大腸炎、糖尿病性大動脈障害、サイトカインおよびTリンパ球により媒介される急性および遅延型の過敏症に関連する免疫応答、結核、サルコイドーシス、肉芽腫症(リンパ腫様肉芽腫症、ヴェーゲナー肉芽腫症を含む)、顆粒球減少症、脈管炎(血管炎、大型血管の血管炎(リウマチ性多発性筋痛症および巨細胞性(高安)動脈炎を含む)、中型血管の血管炎(川崎病および結節性多発性動脈炎/結節性動脈周囲炎)、微視的多発性血管炎、免疫血管炎、CNS血管炎、皮膚血管炎、過敏性血管炎、壊死性血管炎、例えば、全身性壊死性血管炎およびANCA関連血管炎、例えば、チャーグ‐ストラウス血管炎または症候群(CSS)およびANCA関連の小型血管の血管炎、側頭動脈炎、再生不良性貧血、自己免疫性再生不良性貧血、クームズ陽性貧血、ダイアモンド‐ブラックファン貧血、溶血性貧血または免疫溶血性貧血、例えば、自己免疫性溶血性貧血(AIHA)、悪性貧血(pernicious anemia)(悪性貧血(anemia perniciosa))、アジソン病、先天性低形成貧血または形成不全(PRCA)、第VIII因子欠乏症、血友病A、自己免疫性好中球減少症、血球減少症、例えば、汎血球減少症、白血球減少症、白血球漏出が関与する疾患、CNS炎症性障害、アルツハイマー病、パーキンソン病、多臓器傷害症候群、例えば、敗血症、外傷または出血に対して二次的なもの、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、抗リン脂質抗体症候群、運動神経炎(motoneuritis)、アレルギー性神経炎、ベーチェット病/症候群、キャッスルマン症候群、グッドパスチャー症候群、レイノー症候群、シェーグレン症候群、スティーブンス−ジョンソン症候群、類天疱瘡、例えば、水疱性類天疱瘡および皮膚類天疱瘡、天疱瘡(例えば、尋常性天疱瘡、落葉状天疱瘡、粘液天疱瘡−膜類天疱瘡および紅斑性天疱瘡)、自己免疫性多発性内分泌腺症、ライター病または症候群、自己免疫性状態に起因する熱傷害、子癇前症、免疫複合体障害、例えば、免疫複合体腎炎、抗体媒介腎炎、神経炎症性障害、多発性ニューロパシー、慢性ニューロパシー、例えば、IgM多発性ニューロパシーまたはIgM媒介ニューロパシー、血小板減少症(例えば、心筋梗塞患者により発症)(血栓性血小板減少性紫斑病(TTP)、輸血後の紫斑病(PTP)、ヘパリン誘導血小板減少症および自己免疫性または免疫媒介性の血小板減少症(例えば、特発性血小板減少性紫斑病(ITP)(慢性または急性のITPを含む)を含む))、強膜炎(例えば、特発性角膜強膜炎、上強膜炎)、精巣および卵巣の自己免疫性疾患(自己免疫性の精巣炎および卵巣炎を含む)、原発性甲状腺機能低下症、上皮小体機能低下症、自己免疫性内分泌疾患(甲状腺炎(例えば、自己免疫性甲状腺炎、橋本病、慢性甲状腺炎(橋本甲状腺炎)または亜急性甲状腺炎)、自己免疫性甲状腺疾患、特発性甲状腺機能低下症、グレーブス病、多腺症候群(例えば、自己免疫性多腺症候群(例えば、I型(または多腺性内分泌障害症候群))、新生物随伴症候群(神経学的新生物随伴症候群(例えば、ランバート−イートン筋無力症候群またはイートン−ランバート症候群、スティッフマン症候群またはスティッフパーソン症候群)を含む)、脳脊髄炎(例えば、アレルギー性脳脊髄炎(allergic encephalomyelitis)またはアレルギー性脳脊髄炎(
encephalomyelitis allergica)および実験的アレルギー性脳脊髄炎(EAE))、重症筋無力症(例えば、胸腺腫関連重症筋無力症)、小脳変性症、神経性筋強直症、眼球クローヌスまたは眼球クローヌス筋クローヌス症候群(OMS)および感覚神経障害、多病巣性運動神経障害、シーハン症候群、自己免疫性肝炎、慢性肝炎、ルポイド肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎または自己免疫性慢性活動性肝炎、肺炎(例えば、リンパ様間質性肺炎(LIP)、閉塞性細気管支炎(非移植)vs NSIP、ギラン‐バレー症候群、バージャー病(IgA腎症)、特発性IgA腎症、線状IgA皮膚症、急性熱性好中球性皮膚症、角層下膿疱症、一過性棘融解性皮膚症、硬変(例えば、原発性胆汁性肝硬変および肺硬変(pneumonocirrhosis))、自己免疫性腸症候群、セリアック病、セリアックスプルー(グルテン性腸症)、難治性スプルー、特発性スプルー、クリオグロブリン血症(例えば、混合型クリオグロブリン血症)、筋萎縮性(amylotrophic)側索硬化症(ALS;ルーゲーリック病)、冠状動脈疾患、自己免疫性耳疾患(例えば、自己免疫性内耳疾患(AIED)、自己免疫性聴覚損失)、多発性軟骨炎(例えば、難治性または再発性または回帰性の多発性軟骨炎、肺胞タンパク症、コーガン症候群/非梅毒性角膜実質炎、ベル麻痺、スウィート病/症候群、自己免疫性酒さ(rosacea autoimmune)、帯状疱疹関連疼痛、アミロイド症、非癌性リンパ球増加症、原発性リンパ球増加症(例えば、モノクローナルB細胞リンパ球増加症(例えば、良性のモノクローナル高ガンマグロブリン血症および重大性不明のモノクローナル高ガンマグロブリン血症、MGUS)を含む)、末梢ニューロパシー、新生物随伴症候群、チャネル病(例えば、癲癇、偏頭痛、不整脈、筋肉障害、難聴、失明、周期性麻痺およびCNSのチャネル病)、自閉症、炎症性筋障害、巣状または分節状または巣状分節状の糸球体硬化症(FSGS)、内分泌性眼障害、ブドウ膜網膜炎、脈絡網膜炎、自己免疫性血液学的障害、線維筋痛症、多発性内分泌不全、シュミット症候群、副腎炎、胃萎縮、初老期痴呆、脱髄性疾患(例えば、自己免疫性脱髄性疾患および慢性炎症性脱髄性多発性ニューロパシー)、ドレスラー症候群、円形脱毛症、完全脱毛症、CREST症候群(石灰沈着症、レイノー現象、食道運動障害、強指症および毛細血管拡張症)、例えば、抗精子抗体による男性および女性の自己免疫性不妊、混合結合組織病、シャーガス病、リウマチ熱、反復流産、農夫肺、多形性紅斑、心術後症候群、クッシング症候群、鳥飼肺、アレルギー性肉芽腫性血管炎、良性リンパ球性血管炎、アルポート症候群、肺胞炎(例えば、アレルギー性肺胞炎および線維化肺胞炎)、間質性肺疾患、輸血反応、ハンセン病、マラリア、寄生虫病(例えば、リーシュマニア症、トリパノソーマ症(kypanosomiasis)、住血吸虫症、回虫症、アスペルギルス症、サンプター症候群、カプラン症候群、デング熱、心内膜炎、心内膜心筋線維症、びまん性間質性肺線維症、間質性肺線維症、線維形成性縦隔炎、肺線維症、特発性肺線維症、嚢胞性線維症、眼内炎、持久性隆起性紅斑、胎児赤芽球症、好酸球性筋膜炎(eosinophilic faciitis)、シャルマン症候群、フェルティ症候群、フィラリア症(flariasis)、毛様体炎(例えば、慢性毛様体炎、異時性毛様体炎、虹彩毛様体炎(急性または慢性)またはフックス毛様体炎)、ヘノッホシェーンライン紫斑病、ヒト免疫不全ウイ
ルス(HIV)感染症、SCID、後天性免疫不全症候群(AIDS)、エコーウイルス感染症、敗血症(全身炎症性反応症候群(SIRS))、内毒素血症、膵臓炎、サイロキシン中毒(thyroxicosis)、パルボウイルス感染症、風疹ウイルス感染症、ワクチン接種後症候群、先天性風疹感染症、エプスタイン・バーウイルス感染症、おたふくかぜ、エバンス症候群、自己免疫性性腺機能不全、シドナム舞踏病、連鎖球菌感染後腎炎、閉塞性血栓性血管炎(thromboangitis ubiterans)、甲状
腺中毒症、脊髄ろう、脈絡膜炎、巨細胞性多発性筋痛、慢性過敏性肺炎、結膜炎(例えば、春季カタル、乾性角結膜炎および流行性角結膜炎)、特発性腎炎症候群、微小変化腎症(minimal change nephropathy)、良性の家族性および虚血再灌流性の損傷、移植器官再灌流、網膜自己免疫、関節の炎症、気管支炎、慢性閉塞性気道/肺疾患、珪肺症、アフタ、アフタ性口内炎、動脈硬化性障害(脳血管不全)(例えば、動脈硬化性脳症および動脈硬化性網膜症、精液形成欠如(aspermiogenese)、自己免疫性溶血、ベック病、クリオグロブリン症、デュプュイトラン拘縮、水晶体過敏性眼内炎(endophthalmia phacoanaphylactica)、アレルギー性腸炎、らい性結節性紅斑、特発性顔面麻痺、慢性疲労症候群、リウマチ熱、ハマン−リッチ病、感覚神経聴覚損失、発作性ヘモグロビン尿症、生殖機能低下症、限局性回腸炎、白血球減少症、感染性単核細胞症、横断脊髄炎、原発性特発性粘液水腫、ネフローゼ、癒着性眼炎(ophthalmia symphatica)、肉芽腫性精巣炎、膵臓炎、急性多発性神経根炎、壊疽性膿皮症、ド・ケルヴァン甲状腺炎(Quervain’s thyreoiditis)、後天性脾臓萎縮(acquired spenic atrophy)、非悪性胸腺腫、リンパ濾胞性胸腺炎、白斑、トキシックショック症候群、食中毒、T細胞浸潤の関与する状態、白血球接着不全、サイトカインおよびTリンパ球により媒介される急性または遅発型の過敏症に関連する免疫応答、白血球漏出の関与する疾患、多臓器傷害症候群、抗原−抗体複合体媒介疾患、抗糸球体基底膜疾患、自己免疫性多発性内分泌腺症、卵巣炎、原発性粘液水腫、自己免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、リウマチ病、混合結合組織病、ネフローゼ症候群、インスリン炎、多内分泌腺不全、自己免疫性多腺症候群(I型多腺症候群を含む)、成人発症型特発性上皮小体機能低下症(AOIH)、心筋症(例えば、拡張性心筋症)、後天性表皮水疱症(epidermolisis bullosa acquisita)(EBA)、ヘモクロマトーシス、心筋炎、ネフローゼ症候群、原発性硬化性胆管炎、化膿性または非化膿性の静脈洞炎、急性または慢性の静脈洞炎、篩骨、前頭部、上顎または蝶形骨の静脈洞炎、アレルギー性静脈洞炎、好酸球関連障害(例えば、好酸球増加症、肺浸潤性好酸球増加症、好酸球増多−筋痛症候群、レフラー症候群、慢性好酸球性肺炎、熱帯性肺好酸球増加症、気管支肺アスペルギルス症、アスペルギルス腫または好酸球含有の肉芽腫、アナフィラキシー、脊椎関節症、セロネガティブ脊椎関節炎、多内分泌腺自己免疫疾患、硬化性胆管炎、強膜、上強膜、慢性の粘膜皮膚カンジダ症、ブルトン症候群、乳児の一過性低ガンマグロブリン血症、ヴィスコット‐オールドリッチ症候群、毛細血管拡張性運動失調症候群、血管拡張、コラーゲン疾患に関連する自己免疫性障害、リウマチ(例えば、慢性関節リウマチ、リンパ節炎、血圧応答の低下、血管機能不全、組織損傷、心臓血管虚血、痛覚過敏、腎虚血、大脳虚血および血管形成に伴う疾患、アレルギー性過敏障害、糸球体腎炎、再灌流損傷、虚血性再灌流障害、心筋または他の組織の再灌流損傷、リンパ腫性気管気管支炎、炎症性皮膚病、急性の炎症性要素を有する皮膚病、多臓器不全、水疱性疾患、腎皮質壊死、急性化膿性髄膜炎または他の中枢神経系の炎症性障害、眼球および眼窩の炎症性障害、顆粒球輸血関連症候群、サイトカイン誘導毒性、睡眠発作、急性重篤炎症、慢性難治性炎症、腎盂炎、動脈内膜過形成、消化性潰瘍、心弁膜炎および子宮内膜症が挙げられるがこれらに限定されない。
語句「不安関連障害」とは、不安、気分および薬物乱用の障害のこといい、それらとしては、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥障害、睡眠障害、多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害が挙げられるがこれらに限定されない。そのような障害としては、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、特段に特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴ったパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、社会不安、自閉症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、一極性障害、I型またはII型双極性障害、特段に特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害、認知機能の増強、認知機
能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられる。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
能の低下(アルツハイマー病、脳卒中または脳の外傷に関連するものが挙げられるがこれらに限定されない)、疾患または損傷から生じる発作(癲癇、学習障害/障害、脳性麻痺が挙げられるがこれらに限定されない)が挙げられる。さらに、不安障害は、人格障害(以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない)に適用し得る。
用語「脂質代謝障害」とは、コレステロールおよびトリグリセリドの異常な臨床化学レベルのことをいい、ここでこれらの脂質の高いレベルは、アテローム性動脈硬化症の指標となる。さらに、異常な血清中脂質レベルは、様々な心臓血管疾患(高血圧、脳卒中、冠状動脈疾患、糖尿病および/または肥満症を含む)の指標となり得る。
語句「眼の異常」とは、アテローム性動脈硬化症または様々な眼科学的異常に関連し得る眼の潜在的障害のことをいう。そのような障害としては、以下:網膜形成不全、様々な網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞もしくは閉鎖;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊椎・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられるがこれらに限定されない。白内障もまた眼の異常と考えられ、そしてヒトダウン症候群、ハレルマン−ストレフ症候群、ロウ症候群、ガラクトース血症、マルファン症候群、トリソミー13−15、アルポート症候群、筋緊張性ジストロフィー、ファブリー病、上皮小体機能低下症またはコンラーディ症候群などの全身性疾患と関連している。他の眼の発達異常としては、無虹彩症、前区および発育不全症候群が挙げられる。白内障はまた、眼内感染または炎症(ブドウ膜炎)の結果として生じる場合もある。
抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、
PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「成長抑制量」とは、in vitroまたはin vivoのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば、癌細胞の成長を抑制することができる量である。新生物細胞成長を抑制する目的のための抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384
、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO
6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「成長抑制量」は、実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。
PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「成長抑制量」とは、in vitroまたはin vivoのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば、癌細胞の成長を抑制することができる量である。新生物細胞成長を抑制する目的のための抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384
、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO
6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「成長抑制量」は、実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。
抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PR
O20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「細胞傷害性量」とは、in vitroまたはin vivoのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば、癌細胞の破壊をもたらすことができる量である。新生物細胞成長を抑制する目的のための抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO6
18、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「細胞傷害性量」は実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。
O20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「細胞傷害性量」とは、in vitroまたはin vivoのいずれかで細胞、特に腫瘍、例えば、癌細胞の破壊をもたらすことができる量である。新生物細胞成長を抑制する目的のための抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO6
18、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子の「細胞傷害性量」は実験的に、そして日常的な様式で決定され得る。
用語「抗体」は、最も広範な意味において使用され、そして特に、例えば、単一の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体モノクローナル抗体(アゴニスト、アンタゴニストおよび中和抗体を含む)、多エピトープ性の特異性を有する抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO9
94、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体組成物、ポリクローナル抗体、一本鎖抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体および所望の生物学的または免疫学的活性を示す限り抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体のフラグメント(下記を参照のこと)を包含する。用語「免疫グロブリン」(Ig)は、本明細書においては抗体と交換可能に使用される。
94、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体組成物、ポリクローナル抗体、一本鎖抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体および所望の生物学的または免疫学的活性を示す限り抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体のフラグメント(下記を参照のこと)を包含する。用語「免疫グロブリン」(Ig)は、本明細書においては抗体と交換可能に使用される。
「単離された抗体」とは、その天然の環境の成分中から同定ならびに分離および/また
は回収されるものを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、抗体の診断または治療上の使用を妨害する物質であり、それらとしては、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質性または非タンパク質性の溶質が挙げられ得る。本発明は、(1)Lowry法により測定した場合に抗体の95重量%超まで、最も好ましくは99重量%超まで、(2)スピニングカップ配列決定装置を用いてN末端または内部のアミノ酸配列の少なくとも15残基を得るために十分な程度まで、または(3)クマシーブルーもしくは好ましくは銀染色を用いた還元または非還元条件下のSDS−PAGEによる均質性となるように、抗体が精製されることを可能とする。単離された抗体は、組換え細胞内のin situの抗体を含むが、その理由は抗体の天然の環境の少なくとも1つの成分が存在しないためである。しかしながら、通常、単離された抗体は、少なくとも1つの精製工程により調製される。
は回収されるものを意味する。その天然の環境の夾雑成分は、抗体の診断または治療上の使用を妨害する物質であり、それらとしては、酵素、ホルモンおよび他のタンパク質性または非タンパク質性の溶質が挙げられ得る。本発明は、(1)Lowry法により測定した場合に抗体の95重量%超まで、最も好ましくは99重量%超まで、(2)スピニングカップ配列決定装置を用いてN末端または内部のアミノ酸配列の少なくとも15残基を得るために十分な程度まで、または(3)クマシーブルーもしくは好ましくは銀染色を用いた還元または非還元条件下のSDS−PAGEによる均質性となるように、抗体が精製されることを可能とする。単離された抗体は、組換え細胞内のin situの抗体を含むが、その理由は抗体の天然の環境の少なくとも1つの成分が存在しないためである。しかしながら、通常、単離された抗体は、少なくとも1つの精製工程により調製される。
基本的な4鎖抗体単位は、2本の同一の軽(L)鎖および2本の同一の重(H)鎖〜構成されるヘテロ4量体の糖タンパク質である(IgM抗体は、J鎖と呼ばれるさらなるポリペプチドと共に基本的なヘテロ4量体単位5つからなり、したがって、10個の抗原結合部位を含有するのに対し、分泌IgA抗体は、重合してJ鎖と共に基本的4鎖単位2〜5つを含む多価の組立物を形成することができる)。IgGの場合は、4鎖単位は、一般に約150,000ダルトンである。各L鎖は、ジスルフィド共有結合1つによりH鎖に連結されているのに対し、2本のH鎖は、H鎖のアイソタイプに応じて1つ以上のジスルフィド結合により相互に連結されている。各H鎖および各L鎖はまた、規則的な間隔で鎖内ジスルフィド架橋を有する。各H鎖はN末端において可変ドメイン(VH)とその後の3つの定常ドメイン(CH)を各α鎖および各γ鎖について、そして4つのCHドメインをμおよびεアイソタイプについて有している。各L鎖は、N末端において可変ドメイン(VL)とその後の定常ドメイン(CL)をそのもう一端において有している。VLは、VHと並列され、そしてCLは、重鎖の最初の定常ドメイン(CH1)と並列される。特定のアミノ酸残基が、軽鎖および重鎖の可変ドメインの間の界面を形成すると考えられている。VHとVLの対形成により、単一の抗原結合部位が形成される。様々なクラスの抗体の構造および特性については、例えば、Basic and Clinical Immunology,8th edition,Daniel P.Stites,Abba I.Terr and Tristram G.Parslow (eds.),Appleton&Lange,Norwalk,CT,1994,p.71およびChapter6を参照のこと。
任意の脊椎動物種に由来するL鎖を、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいてカッパおよびラムダと称される2つの明確に異なった型の1つに割りあて得る。その重鎖の定常ドメイン(CH)のアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンは、様々なクラスまたはアイソタイプに割りあてられ得る。免疫グロブリンには、5クラス:IgA、IgD、IgE、IgGおよびIgMがあり、それぞれα、δ、ε、γおよびμと表記される重鎖を有する。γおよびαのクラスはさらに、CH配列および機能の比較的小さい差異に基づいてサブクラスに分類され、例えば、ヒトは、以下のサブクラス:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1およびIgA2を発現する。
用語「可変」は、可変ドメインの特定のセグメントが、抗体の間で配列が大きく異なっているという事実のことをいう。Vドメインは、抗原の結合を媒介し、そして、特定の抗体のその特定の抗原に対する特異性を決定する。しかしながら、可変性は、可変ドメインの110アミノ酸に亘って均一に分布していない。その代わり、V領域は、各々が9〜12アミノ酸長の「超可変領域」と称される究極的な可変性のより短い領域によって分断された15〜30アミノ酸のフレームワーク領域(FR)と称される比較的不変の部分からなる。ネイティブの重鎖および軽鎖の可変ドメインは各々、βシート構造を連結する、そして一部の場合においてはその部分を形成するループを形成する3つの超可変領域により連結されたβシート配置を大半が採用している4つのFRを含む。各鎖の超可変領域は、
FRにより近接して保持され、そして、他の鎖の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)を参照のこと)。定常ドメインは、抗原への抗体の結合に直接関与していないが、様々なエフェクター機能(例えば、抗体依存性細胞内細胞傷害(ADCC)への抗体の関与)を示す。
FRにより近接して保持され、そして、他の鎖の超可変領域と共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与している(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)を参照のこと)。定常ドメインは、抗原への抗体の結合に直接関与していないが、様々なエフェクター機能(例えば、抗体依存性細胞内細胞傷害(ADCC)への抗体の関与)を示す。
用語「超可変領域」は、本明細書中で使用されるとき、抗原結合の原因となる抗体のアミノ酸残基のことをいう。超可変領域は、一般に「相補性決定領域」すなわち「CDR」に由来するアミノ酸残基(例えば、VL内のおよそ残基24〜34(L1)、50〜56(L2)および89〜97(L3)ならびにVH内のおよそ1〜35(H1)、50〜65(H2)および95〜102(H3);Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991))および/または「超可変ループ」に由来の残基(例えば、VL内の残基26〜32(L1)、50〜52(L2)および91〜96(L3)ならびにVH内の26〜32(H1)、53〜55(H2)および96〜101(H3);Chothia and Lesk J.Mol.Biol.196:901〜917(1987))を含む。
用語「モノクローナル抗体」は、本明細書中で使用されるとき、実質的に均質な抗体の集団から得られた抗体のことをいい、すなわち、その集団を構成する個々の抗体は、わずかな量で存在し得る、天然に存在する可能性のある突然変異を除き同一である。モノクローナル抗体は、高度に特異的であり、単一の抗原部位に指向されている。さらに、さまざまな決定基(エピトープ)に対して指向されたさまざまな抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対して指向されている。その特異性に加えて、モノクローナル抗体は、他の抗体の混入を伴うことなく合成され得る点において好都合である。修飾語の「モノクローナル」とは、任意の特定の方法による抗体の作製を必要とするものとみなしてはならない。例えば、本発明において有用なモノクローナル抗体は、Kohler et al.,Nature,256:495(1975)により最初に報告されたハイブリドーマ法により調製され得るか、または、細菌、真核生物または植物の細胞において組換えDNA法を用いて作製され得る(例えば、米国特許第4,816,567号を参照のこと)。「モノクローナル抗体」は、例えば、Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)およびMarks et al.,J.Mol.Biol.,222:581−597(1991)に記載の手法を用いてファージ抗体ライブラリーから単離され得る。
本明細書におけるモノクローナル抗体は、重鎖および/または軽鎖の一部分が、特定の種から得られる抗体または特定の抗体クラスまたはサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一かまたは相同であるが、鎖の残りの部分は、別の種から得られる抗体または別の抗体クラスまたはサブクラスに属する抗体の対応する配列と同一かまたは相同である「キメラ」抗体、ならびに所望の生物学的活性を示す限りにおいてそのような抗体のフラグメントを含む(米国特許第4,816,567号;およびMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855(1984)を参照のこと)。本明細書における目的のキメラ抗体は、非ヒト霊長類(例えば、旧世界ザル、類人猿など)から得られた可変ドメイン抗原結合配列およびヒト定常領域配列を含む「霊長類化」抗体を含む。
「インタクトな」抗体とは、抗原結合部位ならびにCLおよび少なくとも重鎖定常ドメ
インCH1、CH2およびCH3を含むものである。定常ドメインは、ネイティブの配列の定常ドメイン(例えば、ヒトネイティブ配列定常ドメイン)またはそのアミノ酸配列改変体であり得る。好ましくはインタクトな抗体は、1つ以上のエフェクター機能を有する。
インCH1、CH2およびCH3を含むものである。定常ドメインは、ネイティブの配列の定常ドメイン(例えば、ヒトネイティブ配列定常ドメイン)またはそのアミノ酸配列改変体であり得る。好ましくはインタクトな抗体は、1つ以上のエフェクター機能を有する。
「抗体フラグメント」は、インタクトな抗体の一部分、好ましくはインタクトな抗体の抗原結合または可変の領域を含む。抗体フラグメントの例としては、Fab、Fab’、F(ab’)2およびFvフラグメント;ダイアボディ;線状抗体(米国特許第5,641,870号の実施例2;Zapata et al.,Protein Eng.8(10):1057−1062[1995]を参照のこと);一本鎖抗体分子;ならびに抗体フラグメントから形成された多重特異性の抗体が挙げられる。
抗体のパパイン消化により、「Fab」フラグメントと称される2本の同一の抗原結合フラグメント、および容易に結晶化する能力を反映した表記である残りの部分の「Fc」フラグメントが得られる。Fabフラグメントは、H鎖の可変領域ドメイン(VH)とともにL鎖全体および1本の重鎖の第1の定常ドメイン(CH1)からなる。各Fabフラグメントは、抗原結合に関しては1価であり、すなわち、単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理により、単一の大型のF(ab’)2フラグメントが得られ、これは2価の抗原結合活性を有する2つのジスルフィド結合したFabフラグメントに概ね相当し、そしてなお抗原に交差結合することができる。Fab’フラグメントは、抗体のヒンジ領域に由来する1つ以上のシステインを含むCH1ドメインのカルボキシ末端にさらに数残基を有することによりFabフラグメントとは、異なっている。Fab’−SHは、本明細書においては定常ドメインのシステイン残基が遊離のチオール基を担持しているFab’に対する表記である。F(ab’)2抗体フラグメントは、当初はそれらの間にヒンジシステインを有するFab’フラグメントの対として作製された。抗体フラグメントの他の化学的カップリングも知られている。
Fcフラグメントは、ジスルフィドで共に保持された両方のH鎖のカルボキシ末端部分を含む。抗体のエフェクター機能は、Fc領域における配列により決定され、この領域は、特定の型の細胞に存在するFcレセプター(FcR)により認識される部分でもある。
「Fv」は、完全な抗原認識部位および抗原結合部位を含む最小の抗体フラグメントである。このフラグメントは、堅固な非共有結合の会合型としての1つの重鎖と1つの軽鎖との可変領域ドメインの2量体からなる。これらの2ドメインの折り畳みにより、6つの超可変ループ(3ループは各々H鎖およびL鎖由来)が生じ、これらは抗原結合のためのアミノ酸残基を与え、そして抗体に抗原結合特異性をもたらす。しかしながら、単一の可変ドメイン(または抗原に対して特異的なわずか3つのCDRのみを含むFvの半分)であっても、結合部位全体よりも低親和性ではあるが、抗原を認識して結合する能力を有している。
「sFv」または「scFv」とも略記される「一本鎖Fv」は、連結されて単一のポリペプチド鎖となっているVHおよびVL抗体ドメインを含む抗体フラグメントである。好ましくは、sFvポリペプチドはさらに、抗原結合のために所望の構造をsFvが形成できるようにするVHドメインとVLドメインとの間のポリペプチドリンカーを含む。sFvに関する概説は、Pluckthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,Springer−Verlag,New York,pp.269−315(1994);Borrebaeck 1995,後出を参照のこと。
用語「ダイアボディ」は、Vドメインの鎖内ではなく鎖間の対形成が達成されることにより2価のフラグメント、すなわち2つの抗原結合部位を有するフラグメントが生じるようにVHドメインとVLドメインの間により短いリンカー(約5〜10残基)と共にsFvフラグメント(前パラグラフを参照のこと)を構築することにより調製される小型抗体フラグメントのことをいう。2重特異性のダイアボディは、2つの「クロスオーバー」sFvフラグメントのヘテロ2量体であり、この場合、2つの抗体のVHドメインおよびVLドメインは異なるポリペプチド鎖上に存在する。ダイアボディは、例えば、EP404,097;WO93/11161;およびHollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444−6448(1993)により詳細に記載されている。
非ヒト(例えば、げっ歯類)抗体の「ヒト化」型は、非ヒト抗体から得られた最小の配列を含むキメラ抗体である。大部分に関しては、ヒト化抗体は、レシピエントの超可変領域に由来する残基が、所望の抗体の特異性、親和性および能力を有する非ヒト種(例えば、マウス、ラット、ウサギまたは非ヒト霊長類)(ドナー抗体)の超可変領域に由来する残基で置き換えられているヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域(FR)の残基が対応する非ヒト残基により置き換えられる。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体またはドナー抗体に存在しない残基を含んでよい。これらの改変は、抗体の性能をさらに精密化するために行われる。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、そして代表的には2つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、その場合、超可変ループのすべてまたは実質的にすべてが、非ヒト免疫グロブリンのそれに相当し、そしてFRのすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリン配列のそれとなる。ヒト化抗体は、必要に応じてまた、免疫グロブリン定常領域(Fc)、代表的にはヒト免疫グロブリンのメンエキグロブリン定常領域の少なくとも一部分を含む。さらに詳細な説明は、Jones et al.,Nature 321:522−525(1986);Riechmann et al.,Nature
332:323−329(1988);およびPresta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593−596(1992)を参照のこと。
332:323−329(1988);およびPresta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593−596(1992)を参照のこと。
「種依存性抗体」、例えば、哺乳動物非ヒトIgE抗体は、第1の哺乳動物種由来の抗原に対して、第2の哺乳動物種由来のその抗原のホモログに対するよりも、より強力な結合親和性を有する抗体である。通常、種依存性抗体は、ヒト抗原に対して「特異的に結合する」(すなわち、たった約1×10−7M、好ましくはたった約1×10−8M、そして最も好ましくはたった約1×10−9Mの結合親和性(Kd)値を有する)が、第2の非ヒト哺乳動物種由来の抗原のホモログに対しては、ヒト抗原に対するその結合親和性よりも、少なくとも約50倍、または少なくとも約500倍、または少なくとも約1000倍弱い結合親和性を有する。種依存性抗体は、上記の抗体の様々な型のいずれかであり得るが、好ましくはヒト化抗体またはヒト抗体である。
「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、P
RO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチド」とは、本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合するオリゴペプチドである。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドは、公知のオリゴペプチド合成法を用いて化学的に合成され得るか、または組換え技術を用いて調製および精製され得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドは、通常、約5アミノ酸長または少なくとも約5アミノ酸長、あるいは約6、7、8、9
、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100アミノ酸長またはそれ以上、または少なくとも約6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100アミノ酸長またはそれ以上であり、ここでこのようなオリゴペプチドは、本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドは、周知の手法を用いて過度の実験を行うことなく同定され得る。この点に関し、ポリペプチド標的に特異的に結合することができるオリゴペプチドについてオリゴペプチドライブラリーをスクリーニングするための手法が当該分野で周知であることに注意されたい(例えば、米国特許第5,556,762号、同第5,750,373号、同第4,708,871号、同第4,833,092号、同第5,223,409号、同第5,403,484号、
同第5,571,689号、同第5,663,143号;PCT公開WO84/03506およびWO84/03564;Geysen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,81:3998−4002(1984);Geysen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,82:178−182(1985);Geysen et al.,Synthetic Peptides as Antigens,130−149(1986);Geysen et al.,J.Immunol.Meth.,102:259−274(1987);Schoofs et al.,J.Immunol.,140:611−616(1988),Cwirla,S.E.et al.,(1990)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6378;Lowman,H.B. et al.,(1991)Biochemistry,30:10832;Clackson,T.et al.,(1991)Nature,352:624;Marks,J.D.et al.,(1991),J.Mol.Biol.,222:581;Kang,A.S.et al.,(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:8363およびSmith,G.P.(1991)Current Opin.Biotechnol.,2:668を参照のこと)。
RO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチド」とは、本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合するオリゴペプチドである。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドは、公知のオリゴペプチド合成法を用いて化学的に合成され得るか、または組換え技術を用いて調製および精製され得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドは、通常、約5アミノ酸長または少なくとも約5アミノ酸長、あるいは約6、7、8、9
、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100アミノ酸長またはそれ以上、または少なくとも約6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99または100アミノ酸長またはそれ以上であり、ここでこのようなオリゴペプチドは、本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合オリゴペプチドは、周知の手法を用いて過度の実験を行うことなく同定され得る。この点に関し、ポリペプチド標的に特異的に結合することができるオリゴペプチドについてオリゴペプチドライブラリーをスクリーニングするための手法が当該分野で周知であることに注意されたい(例えば、米国特許第5,556,762号、同第5,750,373号、同第4,708,871号、同第4,833,092号、同第5,223,409号、同第5,403,484号、
同第5,571,689号、同第5,663,143号;PCT公開WO84/03506およびWO84/03564;Geysen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,81:3998−4002(1984);Geysen et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,82:178−182(1985);Geysen et al.,Synthetic Peptides as Antigens,130−149(1986);Geysen et al.,J.Immunol.Meth.,102:259−274(1987);Schoofs et al.,J.Immunol.,140:611−616(1988),Cwirla,S.E.et al.,(1990)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6378;Lowman,H.B. et al.,(1991)Biochemistry,30:10832;Clackson,T.et al.,(1991)Nature,352:624;Marks,J.D.et al.,(1991),J.Mol.Biol.,222:581;Kang,A.S.et al.,(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:8363およびSmith,G.P.(1991)Current Opin.Biotechnol.,2:668を参照のこと)。
「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子」とは、本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合する本明細書に定義するオリゴペプチドまたは抗体以外の有機分子である。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO
1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子は、公知の方法を用いて同定および化学的に合成され得る(例えば、PCT公開WO00/00823およびWO00/39585を参照のこと)。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子は、通常、約2000ダルトン未満の大きさであるか、あるいは、約1500、750、500、250または200ダルトン未満の大きさであり、ここで本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができるこのような有機分子は、周知の手法を用いて過度の実験を行うことなく同定され得る。この点に関し、ポリペプチド標的に結合できる分子について有機分子ライブラリーをスクリーニングする手法が当該分野で周知であることに注意されたい(例えば、PCT公開WO00/00823およびWO00/39585を参照のこと)。
1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子は、公知の方法を用いて同定および化学的に合成され得る(例えば、PCT公開WO00/00823およびWO00/39585を参照のこと)。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合有機分子は、通常、約2000ダルトン未満の大きさであるか、あるいは、約1500、750、500、250または200ダルトン未満の大きさであり、ここで本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに好ましくは特異的に結合することができるこのような有機分子は、周知の手法を用いて過度の実験を行うことなく同定され得る。この点に関し、ポリペプチド標的に結合できる分子について有機分子ライブラリーをスクリーニングする手法が当該分野で周知であることに注意されたい(例えば、PCT公開WO00/00823およびWO00/39585を参照のこと)。
目的の抗原、例えば、腫瘍関連ポリペプチド抗原標的に「結合する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、好ましくは、抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子が抗原を発現している細胞または組織をターゲティングする場合の診断薬および/または処置薬として有用であり、そして他のタンパク質とは、有意な交差反応を起こさないような十分な親和性で抗原に結合するものである。「非標的」タンパク質への抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子の結合の程度は、蛍光励起細胞分取(FACS)解析または放射免疫沈降(RIA)により測定した場合に、抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子のその特定の標的タンパク質への結合の約10%未満である。標的分子への抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子の結合に関しては、特定のポリペプチドまたは特定のポリペプチド標的上のエピトープに対して、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」または「特異的である」は、非特異的な相互作用とは測定可能な差違がある結合を意味する。特異的結合は、例えば、一般には結合活性を有しない同様の構造の分子であるコントロール分子の結合と比較して分子の結合を決定することにより測定することができる。例えば、特異的結合は、標的と同様のコントロール分子、例えば、過剰量の非標識標的との競合により決定できる。この場合、プローブへの標識標的の結合が、過剰な非標識標的により競合的に抑制された場合に、特異的結合が示唆される。本明細書において使用されるとき、特定のポリペプチドまたは特定のポリペプチド標的上のエピトープに対して、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」または「特異的である」は、例えば、少なくとも約10−4M、あるいは少なくとも約10−5M、あるいは少なくとも約10−6M、あるいは少なくとも約10−7M、あるいは少なくとも約10−8M、あるいは少なくとも約10−9M、あるいは少なくとも約10−10M、あるいは少なくとも約10−11M、あるいは少なくとも約10−12Mまたはそれ以上の、標的に対するKdを有する分子により示され得る。用語「特異的結合」は、分子が他の任意のポリペプチドまたはポリペプチドエピトープに実質的に結合することなく特定のポリペプチドまたは特定のポリペプチド上のエピトープに結合する場合の結合のことをいう。
「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250」を発現する腫瘍細胞の成長を「抑制する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子あるいは「成長抑制性の」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、適切なPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864
、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現または過剰発現する癌細胞の測定可能な成長抑制をもたらすものである。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、癌細胞の表面上に発現された膜貫通ポリペプチドであってもよいし、または、癌細胞により産生および分泌されるポリペプチドであってもよい。好ましい成長抑制性の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、オリゴペプチドまたは有機分子は、適切なコントロールと比較して、20%または20%超、好ましくは約20%〜約50%、さらに好ましくは50%または50%超(例えば、約50%〜約100%)で、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO
1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現腫瘍細胞の成長を抑制し、ここでコントロールは代表的には、試験される抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子で処置されていない腫瘍細胞である。成長抑制は、細胞培養物中、約0.1〜30μg/mLまたは約0.5nM〜200nMの抗体濃度において測定することができ、ここで成長抑制は、抗体への腫瘍細胞の曝露から1〜10日後に測定される。in vivoの腫瘍細胞の成長抑制は、様々な方法で決定できる。抗体は、約1μg/kg〜約100mg/kg体重において抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を投与した場合に抗体の初回投与から約5日〜3ヶ月以内、好ましくは約5〜30日以内に腫瘍の大きさまたは腫瘍細胞の増殖の低減がもたらされる場合にin vivoで成長抑制性となる。
、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現または過剰発現する癌細胞の測定可能な成長抑制をもたらすものである。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、癌細胞の表面上に発現された膜貫通ポリペプチドであってもよいし、または、癌細胞により産生および分泌されるポリペプチドであってもよい。好ましい成長抑制性の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体、オリゴペプチドまたは有機分子は、適切なコントロールと比較して、20%または20%超、好ましくは約20%〜約50%、さらに好ましくは50%または50%超(例えば、約50%〜約100%)で、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO
1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現腫瘍細胞の成長を抑制し、ここでコントロールは代表的には、試験される抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子で処置されていない腫瘍細胞である。成長抑制は、細胞培養物中、約0.1〜30μg/mLまたは約0.5nM〜200nMの抗体濃度において測定することができ、ここで成長抑制は、抗体への腫瘍細胞の曝露から1〜10日後に測定される。in vivoの腫瘍細胞の成長抑制は、様々な方法で決定できる。抗体は、約1μg/kg〜約100mg/kg体重において抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を投与した場合に抗体の初回投与から約5日〜3ヶ月以内、好ましくは約5〜30日以内に腫瘍の大きさまたは腫瘍細胞の増殖の低減がもたらされる場合にin vivoで成長抑制性となる。
「アポトーシスを誘導する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、アネキシンVの結合、DNAのフラグメント化、細胞収縮、小胞体の拡張、細胞の断片化および/または膜ベシクル(アポトーシス体と称する)の形成により判断されるプログラムされた細胞死を誘導するものである。細胞は、通常、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを過剰発現するものである。好ましくは、細胞は、腫瘍細胞、例えば、前立腺、乳房、卵巣、胃、子宮
内膜、肺、腎臓、結腸、膀胱の細胞である。アポトーシスに関連する細胞事象を評価するために様々な方法が利用できる。例えば、ホスファチジルセリン(PS)転座は、アネキシン結合により測定でき;DNAフラグメント化は、DNAラダー化を介して評価でき;そして、DNAフラグメント化に伴う核/クロマチン縮合は、低二倍体細胞の任意の増大により評価できる。好ましくは、アポトーシスを誘導する抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、アネキシン結合アッセイにおいて非投与の細胞と比較してアネキシン結合の約2〜50倍、好ましくは約5〜50倍、そして最も好ましくは約10〜50倍の誘導をもたらすものである。
内膜、肺、腎臓、結腸、膀胱の細胞である。アポトーシスに関連する細胞事象を評価するために様々な方法が利用できる。例えば、ホスファチジルセリン(PS)転座は、アネキシン結合により測定でき;DNAフラグメント化は、DNAラダー化を介して評価でき;そして、DNAフラグメント化に伴う核/クロマチン縮合は、低二倍体細胞の任意の増大により評価できる。好ましくは、アポトーシスを誘導する抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、アネキシン結合アッセイにおいて非投与の細胞と比較してアネキシン結合の約2〜50倍、好ましくは約5〜50倍、そして最も好ましくは約10〜50倍の誘導をもたらすものである。
抗体の「エフェクター機能」は、抗体のFc領域(ネイティブ配列のFc領域またはアミノ酸配列改変体のFc領域)に起因し得る生物学的活性のことをいい、そして、抗体アイソタイプと共に変動する。抗体エフェクター機能の例としては、C1q結合および補体依存性細胞傷害;Fcレセプター結合;抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC);貪食作用;細胞表面レセプター(例えば、B細胞レセプター)のダウンレギュレーション;およびB細胞活性化が挙げられる。
「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害」すなわち「ADCC」とは、特定の細胞傷害性細胞(例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞、好中球およびマクロファージ)上に存在するFcレセプター(FcR)に結合している分泌Igにより、これらの細胞傷害性エフェクター細胞が抗原担持標的細胞に特異的に結合し、そしてその後、細胞毒素により標的細胞を殺滅することができるようにするという細胞傷害の形態のことをいう。抗体は、細胞傷害性細胞を「武装」させ、そしてそのような殺滅のために絶対に必要なものである。ADCCを媒介する主要な細胞であるNK細胞は、FcγRIIIのみを発現するのに対し、単球は、FcγRI、FcγRIIおよびFcγRIIIを発現する。造血細胞上のFcRの発現は、Ravetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457−92(1991)の464ページの表3に総括されている。目的の分子のADCC活性を評価するためには、米国特許第5,500,362号または同第5,821,337号に記載されているようなin vitroのADCCアッセイを実施してよい。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞(PBMC)およびナチュラルキラー(NK)細胞が挙げられる。あるいは、または追加的に、目的の分子のADCC活性は、例えば、Clynes et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,95:652−656(1998)に開示されているような動物モデルにおいてin vivoで評価してよい。
「Fcレセプター」すなわち「FcR」は、抗体のFc領域に結合するレセプターを説明する。好ましいFcRは、ネイティブ配列のヒトFcRである。さらに、好ましいFcRは、IgG抗体に結合するもの(γレセプター)であり、FcγRI、FcγRIIおよびFcγRIIIのサブクラスのレセプターが挙げられ、これらのレセプターの対立遺伝子改変体および選択的スプライシング型も含まれる。FcγRIIレセプターは、FcγRIIA(「活性化レセプター」)およびFcγRIIB(「抑制レセプター」)を包含し、これらはその細胞質ドメインにおいて主に異なっている類似のアミノ酸配列を有する。活性化レセプターFcγRIIAは、その細胞質ドメイン中に免疫受容活性化チロシンモチーフ(ITAM)を含む。抑制レセプターFcγRIIBは、その細胞質ドメインに免疫受容抑制性チロシンモチーフ(ITIM)を含む(Daeron,Annu.Rev.Immunol.15:203−234(1997)の概説Mを参照のこと)。FcRは、Ravetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457−492(1991);Capel et al.,Immunomethods
4:25−34(1994);およびde Haas et al.,J.Lab.Clin.Med.126:330−41(1995)において概説されている。将来同定されるものを含む他のFcRは、本明細書においては用語「FcR」に包含される。この
用語はまた、胎児への母体IgGの移行の原因となる新生児レセプターFcRnも含む(Guyer et al.,J.Immunol.117:587(1976)およびKim et al.,J.Immunol.24:249(1994))。
4:25−34(1994);およびde Haas et al.,J.Lab.Clin.Med.126:330−41(1995)において概説されている。将来同定されるものを含む他のFcRは、本明細書においては用語「FcR」に包含される。この
用語はまた、胎児への母体IgGの移行の原因となる新生児レセプターFcRnも含む(Guyer et al.,J.Immunol.117:587(1976)およびKim et al.,J.Immunol.24:249(1994))。
「ヒトエフェクター細胞」は、1つ以上のFcRを発現し、エフェクター機能を示す白血球である。好ましくは、この細胞は、少なくともFcγRIIIを発現し、そしてADCCエフェクター機能を示す。ADCCを媒介するヒト白血球の例としては、末梢血単核細胞(PBMC)、ナチュラルキラー(NK)細胞、単球、細胞傷害性T細胞および好中球が挙げられ;PBMCおよびNK細胞が好ましい。エフェクター細胞は、天然の起源から、例えば、血液から単離され得る。
「補体依存性細胞傷害」すなわち「CDC」は、補体の存在下における標的細胞の溶解のことをいう。古典的補体経路の活性化は、その同種抗原に結合している(適切なサブクラスの)抗体に補体系の第1成分(C1q)が結合することにより開始される。補体活性化を評価するためには、例えば、Gazzano−Santoro et al.,J.Immunol.Methods 202:163(1996)に記載されているようなCDCアッセイを実施してよい。
用語「癌」および「癌性の」は、代表的には調節されていない細胞の成長を特徴とする哺乳動物における生理学的状態のことをいうか、それを説明するものである。癌の例としては、癌腫、リンパ種、芽腫、肉腫および白血病が挙げられるがこれらに限定されない。このような癌のより特定の例としては、扁平上皮癌、肺癌(小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌および肺の扁平上皮癌)、腹膜の癌、肝細胞癌、胃癌(消化器癌を含む)、膵癌、神経膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、結腸癌、直腸結腸癌、子宮体癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝癌、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝臓癌種および様々な型の頭頚部癌ならびにB細胞リンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL);小リンパ球性(SL)NHL;中悪性度/濾胞性NHL;中悪性度のびまん性NHL;高悪性度の免疫芽球性NHL;高悪性度のリンパ芽球性NHL;高悪性度の小型非分割細胞NHL;嵩高い疾患(bulky disease)NHL;マントル細胞リンパ腫;AIDS関連リンパ腫;およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症を含む);慢性リンパ性白血病(CLL);急性リンパ芽球性白血病(ALL);ヘアリー細胞白血病;慢性骨髄芽球性白血病;および移植後のリンパ増殖性障害(PTLD)が挙げられる。好ましくは、癌は、IGFレセプターを発現する腫瘍、より好ましくは乳癌、肺癌、直腸結腸癌または前立腺癌、そして最も好ましくは乳癌または前立腺癌を含む。
「化学療法剤」とは、癌の処置において有用な化合物である。化学療法剤の例としては、アルキル化剤(例えば、チオテパおよびCYTOXAN(登録商標)シクロホスファミド);スルホン酸アルキル(例えば、ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン);アジリジン(例えば、ベンゾドパ(benzodopa)、カルボコン、メツレドパ(meturedopa)およびウレドパ(uredopa));エチレンイミンおよびメチラメラミン(アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミド(triethiylenethiophosphoramide)およびトリメチロールメラミン(trimethylolomelamine)を含む);アセトゲニン(特にブラタシンおよびブラタシノン);カンプトテシン(合成アナログトポテカンを含む);ブリオスタチン;カリスタチン(callystatin);CC−1065(アドゼレシン、カルゼレシン(carzelesin)およびビゼレシン合成アナログを含む);クリプトフィシン(cryptophycin)(特にクリプトフィシン1およびクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成アナログ、KW−2189およびCB1−TM1を含む);エレウテロビ
ン(eleutherobin);パンクラチスタチン(pancratistatin);サルコジクチン(sarcodictyin);スポンジスタチン(spongistatin);ナイトロジェンマスタード(例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド(cholophosphamide)、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミン、メルファラン、ノベンブシン(novembichin)、フェネステリン(phenesterine)、プレドニムスチン(prednimustine)、トロフォスファミド(trofosfamide)、ウラシルマスタード);ニトロソ尿素(nitrosurea)(例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、ホテムスチン(fotemustine)、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムヌスチン(ranimnustine));抗生物質(例えば、エネジン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケミシンガンマ1IおよびカリケミシンオメガI1(例えば、Agnew,Chem Intl.Ed.Engl.,33:183−186(1994)を参照のこと);ジネマイシン(dynemicin)(ジネマイシンAを含む);ビスホスホネート、例えば、クロドロネート;エスペラミシン(esperamicin);ならびにネオカルチノスタチン発色団および関連の色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団)、アクラシノマイシン(aclacinomysin)、アクチノマイシン、オースラマイシン(authramycin)、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン(carabicin)、カルミノマイシン(carminomycin)、カルジノフィリン(carzinophilin)、クロモマイシニス(chromomycinis)、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン(detorubicin)、6−ジアゾ−5−オキソ−L−ノルロイシン、ADRIAMYCIN(登録商標)ドキソルビシン(モルホリノ−ドキソルビシン、シアノモルホリノ−ドキソルビシン、2−ピロリノ−ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン(esorubicin)、イダルビシン、マルセロマイシン(marcellomycin)、マイトマイシン(例えば、マイトマイシンC、ミコフェノール酸、ノガラマイシン(nogalamycin)、オリボマイシン(olivomycin)、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン(tubercidin)、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン;代謝拮抗物質(例えば、メトトレキサートおよび5−フルオロウラシル(5−FU);葉酸アナログ(例えば、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート;プリンアナログ(例えば、フルダラビン、6−メルカプトプリン、チアミプリン(thiamiprine)、チオグアニン);ピリミジンアナログ(例えば、アンシタビン、アザシチジン、6−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン);アンドロゲン類(例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン;抗副腎剤(例えば、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン);葉酸補給剤(例えば、フロリン酸(frolinic acid));アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルウラシル(eniluracil);アムサクリン;ベストラブシル(bestrabucil);ビサントレン(bisantrene);エダトラキセート(edatraxate);デホファミン(defofamine);デメコルチン;ジアジコン;エルフォルニチン(elfornithine);酢酸エリプチニウム(elliptinium acetate);エポチロン;エトグルシド(etoglucid);硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダイニン(lonidainine);メイタンシノイド(例えば、メイタンシンおよびアンサミトシン(ansamitocin));ミトグアゾン(mitoguazone);ミトキサントロン;モピダンモール(mopidanmol);ニトラエリン(nitraerine);ペントスタチン;フェナメット(phenamet);ピラルビシン;ロソキサントロン(losoxantrone);ポドフィリン酸(podophyl
linic acid);2−エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK(登録商標)多糖類複合体(JHS Natural Products,Eugene,OR);ラゾキサン(razoxane);リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム(spirogermanium);テヌアゾン酸;トリアジクオン((triaziquone));2,2’,2’’−トリクロロトリエチルアミン;トリコテシン(特にT−2トキシン、ベラクリン(verracurin)A、ロリジン(roridin)Aおよびアングイジン(anguidine));ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール(mitolactol);ピポブロマン;ガシトシン(gacytosine);アラビノシド(「Ara−C」);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド(例えば、TAXOL(登録商標)パクリタキセル(Bristol−Myers Squibb Oncology,Princeton,NJ)、ABRAXANETMクレモホル(Cremophor)非含有、パクリタキセルのアルブミン操作ナノ粒子処方物(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,Illinois)およびTAXOTERE(登録商標)ドキセタキセル(doxetaxel)(Rhone−Poulenc Rorer、Antony,France);クロランブシル(chloranbucil);GEMZAR(登録商標)ゲムシタビン;6−チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;白金アナログ(例えば、シスプラチンおよびカルボプラチン);ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP−16);イホスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;NAVELBINE(登録商標)ビノレルビン;ノバントロン;テニポシド;エダトレキセート(edatrexate);ダウノマイシン;アミノプテリン;キセロダ(xeloda);イバンドロネート;CPT−11;トポイソメラーゼインヒビターRFS2000;ジフルオロメチルオルニチン(difluorometlhylornithine)(DMFO);レチノイド(例えば、レチノイン酸);カペシタビン;および上記のいずれかの薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体が挙げられる。
ン(eleutherobin);パンクラチスタチン(pancratistatin);サルコジクチン(sarcodictyin);スポンジスタチン(spongistatin);ナイトロジェンマスタード(例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド(cholophosphamide)、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミン、メルファラン、ノベンブシン(novembichin)、フェネステリン(phenesterine)、プレドニムスチン(prednimustine)、トロフォスファミド(trofosfamide)、ウラシルマスタード);ニトロソ尿素(nitrosurea)(例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、ホテムスチン(fotemustine)、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムヌスチン(ranimnustine));抗生物質(例えば、エネジン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケミシンガンマ1IおよびカリケミシンオメガI1(例えば、Agnew,Chem Intl.Ed.Engl.,33:183−186(1994)を参照のこと);ジネマイシン(dynemicin)(ジネマイシンAを含む);ビスホスホネート、例えば、クロドロネート;エスペラミシン(esperamicin);ならびにネオカルチノスタチン発色団および関連の色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団)、アクラシノマイシン(aclacinomysin)、アクチノマイシン、オースラマイシン(authramycin)、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン(carabicin)、カルミノマイシン(carminomycin)、カルジノフィリン(carzinophilin)、クロモマイシニス(chromomycinis)、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン(detorubicin)、6−ジアゾ−5−オキソ−L−ノルロイシン、ADRIAMYCIN(登録商標)ドキソルビシン(モルホリノ−ドキソルビシン、シアノモルホリノ−ドキソルビシン、2−ピロリノ−ドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン(esorubicin)、イダルビシン、マルセロマイシン(marcellomycin)、マイトマイシン(例えば、マイトマイシンC、ミコフェノール酸、ノガラマイシン(nogalamycin)、オリボマイシン(olivomycin)、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン(tubercidin)、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン;代謝拮抗物質(例えば、メトトレキサートおよび5−フルオロウラシル(5−FU);葉酸アナログ(例えば、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート;プリンアナログ(例えば、フルダラビン、6−メルカプトプリン、チアミプリン(thiamiprine)、チオグアニン);ピリミジンアナログ(例えば、アンシタビン、アザシチジン、6−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン);アンドロゲン類(例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン;抗副腎剤(例えば、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン);葉酸補給剤(例えば、フロリン酸(frolinic acid));アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルウラシル(eniluracil);アムサクリン;ベストラブシル(bestrabucil);ビサントレン(bisantrene);エダトラキセート(edatraxate);デホファミン(defofamine);デメコルチン;ジアジコン;エルフォルニチン(elfornithine);酢酸エリプチニウム(elliptinium acetate);エポチロン;エトグルシド(etoglucid);硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダイニン(lonidainine);メイタンシノイド(例えば、メイタンシンおよびアンサミトシン(ansamitocin));ミトグアゾン(mitoguazone);ミトキサントロン;モピダンモール(mopidanmol);ニトラエリン(nitraerine);ペントスタチン;フェナメット(phenamet);ピラルビシン;ロソキサントロン(losoxantrone);ポドフィリン酸(podophyl
linic acid);2−エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK(登録商標)多糖類複合体(JHS Natural Products,Eugene,OR);ラゾキサン(razoxane);リゾキシン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム(spirogermanium);テヌアゾン酸;トリアジクオン((triaziquone));2,2’,2’’−トリクロロトリエチルアミン;トリコテシン(特にT−2トキシン、ベラクリン(verracurin)A、ロリジン(roridin)Aおよびアングイジン(anguidine));ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール(mitolactol);ピポブロマン;ガシトシン(gacytosine);アラビノシド(「Ara−C」);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド(例えば、TAXOL(登録商標)パクリタキセル(Bristol−Myers Squibb Oncology,Princeton,NJ)、ABRAXANETMクレモホル(Cremophor)非含有、パクリタキセルのアルブミン操作ナノ粒子処方物(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,Illinois)およびTAXOTERE(登録商標)ドキセタキセル(doxetaxel)(Rhone−Poulenc Rorer、Antony,France);クロランブシル(chloranbucil);GEMZAR(登録商標)ゲムシタビン;6−チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;白金アナログ(例えば、シスプラチンおよびカルボプラチン);ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP−16);イホスファミド;ミトキサントロン;ビンクリスチン;NAVELBINE(登録商標)ビノレルビン;ノバントロン;テニポシド;エダトレキセート(edatrexate);ダウノマイシン;アミノプテリン;キセロダ(xeloda);イバンドロネート;CPT−11;トポイソメラーゼインヒビターRFS2000;ジフルオロメチルオルニチン(difluorometlhylornithine)(DMFO);レチノイド(例えば、レチノイン酸);カペシタビン;および上記のいずれかの薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体が挙げられる。
この定義に同様に含まれるものは、腫瘍に対するホルモンの作用を制御または阻害する作用を有する抗ホルモン剤(例えば、抗エストロゲンおよび選択的エストロゲンレセプターモジュレーター(modulator)(SERM)(タモキシフェン(例えば、NOLVADEX(登録商標)タモキシフェンを含む)、ラロキシフェン、ドロロキシフェン、4−ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン(trioxifene)、ケオキシフェン(keoxifene)、LY117018、オナプリストン(onapristone)およびFARESTONトレミフェン;副腎におけるエストロゲン産生を制御する酵素アロマターゼを阻害するアロマターゼインヒビター(例えば、4(5)−イミダゾール、アミノグルテチミド、MEGASE(登録商標)酢酸メゲストロール、AROMASIN(登録商標)エキセメスタン、フォルメスタニー(formestanie)、ファドロゾール、RIVISOR(登録商標)ボロゾール(vorozole)、FEMARA(登録商標)レトロゾールおよびARIMIDEX(登録商標)アナストロゾール);および抗アンドロゲン(例えば、フルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリドおよびゴセレリン);ならびにトロキサシタビン(troxacitabine)(1,3−ジオキソランヌクレオシドシトシンアナログ);アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に例えば、PKC−アルファ、RalfおよびH−Rasなどの異常な細胞増殖に関与するとされるシグナリ伝達経路における遺伝子の発現を抑制するもの;リボザイム(例えば、VEGF発現インヒビター(例えば、ANGIOZYME(登録商標)リボザイム)およびHER2発現インヒビター);ワクチン(例えば、遺伝子療法ワクチン、例えば、ALLOVECTIN(登録商標)ワクチン、LEUVECTIN(登録商標)ワクチンおよびVAXID(登録商標)ワクチン;PROLEUKIN(登録商標)rIL−2;LURTOTECAN(登録商標)トポイソメラーゼ1インヒビター;ABARELIX(登録商標)rmRH;および上記のいずれかの製薬上許容しうる塩、酸または誘導体である。
用語「細胞増殖性障害」および「増殖性障害」は、ある程度の異常な細胞増殖に関連する障害のことをいう。本発明の1つの態様において、細胞増殖性障害は、癌である。
「腫瘍」とは、本明細書中で使用されるとき、悪性良性に関わらずすべての新生物細胞の成長および増殖ならびにすべての前癌および癌性の細胞および組織のことをいう。
「細胞死を誘導する」抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、生存細胞を非生存性とするものである。その細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現するもの、好ましくは同じ組織型の正常細胞と比較してPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを過剰発現する細胞である。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO991
7、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、癌細胞表面に発現される膜貫通ポリペプチドであってもよいし、または、癌細胞により産生され分泌されるポリペプチドであってもよい。好ましくは、その細胞は、癌細胞、例えば、乳房、卵巣、胃、子宮内膜、唾液腺、肺、腎臓、結腸、甲状腺、膵臓または膀胱の細胞である。in vitroでの細胞死は、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)または補体依存性細胞傷害(CDC)により誘導された細胞死を識別するために補体および免疫エフェクター細胞の非存在下において決定され得る。すなわち、細胞死に関するアッセイは、熱不活性化血清を用い(すなわち補体非存在下において)、そして免疫エフェクター細胞の非存在下において実施され得る。抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子が細胞死を誘導することができるか否かを判定するためには、ヨウ化プロピジウム(PI)、トリパンブルー(Moore et al.,Cytotechnology 17:1−11(1995)を参照のこと)または7AADの取り込みにより評価される膜完全性の喪失を、未処理細胞と比較して評価することができる。好ましい細胞死誘導性の抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、BT474細胞におけるPI取り込みアッセイにおいてPI取り込みを誘導するものである。
7、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、癌細胞表面に発現される膜貫通ポリペプチドであってもよいし、または、癌細胞により産生され分泌されるポリペプチドであってもよい。好ましくは、その細胞は、癌細胞、例えば、乳房、卵巣、胃、子宮内膜、唾液腺、肺、腎臓、結腸、甲状腺、膵臓または膀胱の細胞である。in vitroでの細胞死は、抗体依存性細胞媒介細胞傷害(ADCC)または補体依存性細胞傷害(CDC)により誘導された細胞死を識別するために補体および免疫エフェクター細胞の非存在下において決定され得る。すなわち、細胞死に関するアッセイは、熱不活性化血清を用い(すなわち補体非存在下において)、そして免疫エフェクター細胞の非存在下において実施され得る。抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子が細胞死を誘導することができるか否かを判定するためには、ヨウ化プロピジウム(PI)、トリパンブルー(Moore et al.,Cytotechnology 17:1−11(1995)を参照のこと)または7AADの取り込みにより評価される膜完全性の喪失を、未処理細胞と比較して評価することができる。好ましい細胞死誘導性の抗体、オリゴペプチドまたは他の有機分子は、BT474細胞におけるPI取り込みアッセイにおいてPI取り込みを誘導するものである。
本明細書中で使用されるとき、用語「免疫接着物(immunoadhesion)」は、免疫グロブリンの定常ドメインのエフェクター機能に異種タンパク質の結合特異性(「接着」)を組み合わせた抗体様分子を表す。構造的には、免疫接着物は、抗体の抗原認識結合部位および抗原結合部位以外の所望の結合特異性を有する(すなわち「異種」)アミノ酸配列と免疫グロブリン定常ドメイン配列との融合を含む。免疫接着分子の接着部分は、代表的には、少なくともレセプターまたはリガンドの結合部位を含む隣接するアミノ酸配列である。免疫接着物における免疫グロブリン定常ドメイン配列は、任意の免疫グロブリン(例えば、IgG−1、IgG−2、IgG−3またはIgG−4サブタイプ、IgA(IgA−1およびIgA−2を含む)、IgE、IgDまたはIgM)から得てよい。
用語「標識」は、本明細書中で使用されるとき、「標識された」抗体を作製するために抗体に直接的または間接的に結合体化された検出可能な化合物または組成物のことをいう。標識は、それ自体が検出可能であり得る(例えば、放射性同位体標識または蛍光標識)か、または、酵素標識の場合は、検出可能な基質化合物または基質組成物の化学的改変を触媒し得る。
「複製防止剤」とは、アポトーシス、血管形成抑制、細胞増加、腫瘍殺傷、有糸分裂抑制、細胞周期進行遮断、細胞成長の停止、腫瘍への結合、細胞メディエーターとしての作用などの機序に関わらず、細胞の複製、機能および/または成長を抑制または防止するか、または細胞を破壊する薬剤である。そのような薬剤としては、化学療法剤、細胞傷害性薬剤、サイトカイン、成長抑制剤もしくは抗ホルモン剤、例えば、抗エストロゲン化合物(例えば、タモキシフェン、オナプリストン(EP616812参照)などの抗プロゲステロン;またはフルタミドなどの抗アンドロゲン、ならびにアロミダーゼインヒビターまたはアンドロゲンなどのホルモン剤が挙げられる。
用語「細胞傷害性薬剤」は、本明細書中で使用されるとき、細胞の機能を抑制または防止および/または細胞の破壊を引き起こす物質のことをいう。この用語は、放射性同位体(例えば、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32およびLuの放射性同位体)、化学療法剤、例えば、メトトレキサート、アドリアマイシン(adriamicin)、ビンカアルカロイド(ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド)、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシ
ンC、クロラムブシル、ダウノルビシンまたは他のインターカレート剤、酵素およびそのフラグメント(例えば、核溶解酵素、抗生物質およびトキシン(例えば、細菌、真菌、植物または動物起源の小分子トキシンまたは酵素活性トキシン(これらのフラグメントおよび/または改変体を含む)、および後述する様々な抗腫瘍剤または抗癌剤を含むと意図される。他の細胞傷害性薬剤は、下に記載する。殺腫瘍傷性薬剤は、腫瘍細胞の破壊をもたらす。
ンC、クロラムブシル、ダウノルビシンまたは他のインターカレート剤、酵素およびそのフラグメント(例えば、核溶解酵素、抗生物質およびトキシン(例えば、細菌、真菌、植物または動物起源の小分子トキシンまたは酵素活性トキシン(これらのフラグメントおよび/または改変体を含む)、および後述する様々な抗腫瘍剤または抗癌剤を含むと意図される。他の細胞傷害性薬剤は、下に記載する。殺腫瘍傷性薬剤は、腫瘍細胞の破壊をもたらす。
本明細書においてアンタゴニストと組み合わせて使用するための特定の腫瘍型に対する本明細書中の好ましい細胞傷害性薬剤は、以下の通りである:
1.前立腺癌:アンドロゲン、ドセタキセル、パクリタキセル、エストラムスチン、ドキソルビシン、ミトキサントロン、ErbB2の細胞外ドメイン(例えば、ErbB2のおよそ残基22〜およそ残基584の領域における残基の任意の1つ以上)の領域に結合する2C4(WO01/00245;ハイブリドーマATCC HB−12697)などのErbB2ドメインに対する抗体、AVASTINTM抗血管内皮細胞成長因子(VEGF)、TARCEVATMOSI−774(エルロチニブ)(Genenetech and OSI Pharmaceuticals)または他の表皮成長因子レセプターチロシンキナーゼインヒビター(EGFR TKI)。
2.胃癌:5−フルオロウラシル(5FU)、XELODATMカペシタビン、メトトレキサート、エトポシド、シスプラチン/カルボプラチン、パクリタキセル(pacliitaxel)、ドセタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシンおよびCPT−11(カンプトテシン(camptothcin)−11;イリノテカン、米国商標名:CAMPTOSAR(登録商標))。
3.膵臓癌:ゲムシタビン、5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、ドセタキセル、パクリタキセル、シスプラチン、カルボプラチン、TARCEVATMエルロチニブおよび他のEGFR TKI。
4.直腸結腸癌:5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、オキサリプラチン、AVASTINTM抗VEGF、TARCEVATMエルロチニブおよび他のEGFR TKIならびにEGFRに結合しレセプター活性化および腫瘍へのシグナル伝達を開始するEGFの能力を阻止するERBITUXTM(旧称IMC−C225)ヒト:マウス−キメラ化モノクローナル抗体。
5.腎臓癌:IL−2、インターフェロンアルファ、AVASTINTM抗VEGF、MEGACETM(酢酸メゲストロール)プロゲスチン、ビンブラスチン、TARCEVATMエルロチニブおよび他のEGFR TKI。
1.前立腺癌:アンドロゲン、ドセタキセル、パクリタキセル、エストラムスチン、ドキソルビシン、ミトキサントロン、ErbB2の細胞外ドメイン(例えば、ErbB2のおよそ残基22〜およそ残基584の領域における残基の任意の1つ以上)の領域に結合する2C4(WO01/00245;ハイブリドーマATCC HB−12697)などのErbB2ドメインに対する抗体、AVASTINTM抗血管内皮細胞成長因子(VEGF)、TARCEVATMOSI−774(エルロチニブ)(Genenetech and OSI Pharmaceuticals)または他の表皮成長因子レセプターチロシンキナーゼインヒビター(EGFR TKI)。
2.胃癌:5−フルオロウラシル(5FU)、XELODATMカペシタビン、メトトレキサート、エトポシド、シスプラチン/カルボプラチン、パクリタキセル(pacliitaxel)、ドセタキセル、ゲムシタビン、ドキソルビシンおよびCPT−11(カンプトテシン(camptothcin)−11;イリノテカン、米国商標名:CAMPTOSAR(登録商標))。
3.膵臓癌:ゲムシタビン、5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、ドセタキセル、パクリタキセル、シスプラチン、カルボプラチン、TARCEVATMエルロチニブおよび他のEGFR TKI。
4.直腸結腸癌:5FU、XELODATMカペシタビン、CPT−11、オキサリプラチン、AVASTINTM抗VEGF、TARCEVATMエルロチニブおよび他のEGFR TKIならびにEGFRに結合しレセプター活性化および腫瘍へのシグナル伝達を開始するEGFの能力を阻止するERBITUXTM(旧称IMC−C225)ヒト:マウス−キメラ化モノクローナル抗体。
5.腎臓癌:IL−2、インターフェロンアルファ、AVASTINTM抗VEGF、MEGACETM(酢酸メゲストロール)プロゲスチン、ビンブラスチン、TARCEVATMエルロチニブおよび他のEGFR TKI。
「成長抑制剤」とは、本明細書中で使用されるとき、細胞、特に、in vitroまたはin vivoのいずれかにおけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現癌細胞の成長を抑制する化
合物または組成物のことをいう。すなわち、成長抑制剤は、S期におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現細胞の比率を有意に低減させるものであり得る。成長抑制剤の例としては、細胞周期の進行を阻止する(S期以外の位置において)薬剤(例えば、G1停止およびM期停止を誘導する薬剤)が挙げられる。従来のM期遮断薬としては、ビンカ(ビンクリスチンおよびビンブラスチン)、タキサンおよびトポイソメラーゼIIインヒビター(例えば、ドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシドおよびブレオマイシン)が挙げられる。G1を停止させる薬剤、例えば、DNAアルキル化剤(例えば、タモキシフェン、プレドニソン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキサート、5−フルオロウラシルおよびara−C)はまた、S期停止にまで及ぶ。さらなる情報は、The Molecular Basis of Cancer,Mendelsohn and Israel,eds.,Chapter 1,“Cell cycle regulation,oncogenes,and antineoplastic drugs”,Murakami et al.,(WB Saunders:Philadelphia,1995)の特に13ページに見ることができる。タキサン類(パクリタキセルおよびドセタキセル)は、共にイチイ属の木から得られた抗癌剤である。ヨーロッパイチイから得られたドセタキセル(TAXOTERE(登録商標)、Rhone−Poulenc Rorer)は、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、Bristol−Myers Squibb)の半合成アナログである。パクリタキセルおよびドセタキセルは、チューブリン2量体からの微小管の組立を促進し、そして脱重合の防止によって微小管を安定化させることにより、細胞の有糸分裂の抑制をもたらす。
合物または組成物のことをいう。すなわち、成長抑制剤は、S期におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現細胞の比率を有意に低減させるものであり得る。成長抑制剤の例としては、細胞周期の進行を阻止する(S期以外の位置において)薬剤(例えば、G1停止およびM期停止を誘導する薬剤)が挙げられる。従来のM期遮断薬としては、ビンカ(ビンクリスチンおよびビンブラスチン)、タキサンおよびトポイソメラーゼIIインヒビター(例えば、ドキソルビシン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシドおよびブレオマイシン)が挙げられる。G1を停止させる薬剤、例えば、DNAアルキル化剤(例えば、タモキシフェン、プレドニソン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキサート、5−フルオロウラシルおよびara−C)はまた、S期停止にまで及ぶ。さらなる情報は、The Molecular Basis of Cancer,Mendelsohn and Israel,eds.,Chapter 1,“Cell cycle regulation,oncogenes,and antineoplastic drugs”,Murakami et al.,(WB Saunders:Philadelphia,1995)の特に13ページに見ることができる。タキサン類(パクリタキセルおよびドセタキセル)は、共にイチイ属の木から得られた抗癌剤である。ヨーロッパイチイから得られたドセタキセル(TAXOTERE(登録商標)、Rhone−Poulenc Rorer)は、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、Bristol−Myers Squibb)の半合成アナログである。パクリタキセルおよびドセタキセルは、チューブリン2量体からの微小管の組立を促進し、そして脱重合の防止によって微小管を安定化させることにより、細胞の有糸分裂の抑制をもたらす。
「ドキソルビシン」は、アントラサイクリン抗生物質である。ドキソルビシンの完全な化学名は、(8S−シス)−10−[(3−アミノ−2,3,6−トリデオキシ−α−L−リキソ−ヘキサピラノシル)オキシ]−7,8,9,10−テトラヒドロ−6,8,11−トリヒドロキシ−8−(ヒドロキシアセチル)−1−メトキシ−5,12−ナフタセンジオンである。
用語「サイトカイン」は、ある細胞集団により放出され、細胞間メディエーターとして別の細胞に作用するタンパク質に関する総称である。このようなサイトカインの例は、リンフォカイン、モノカインおよび従来のポリペプチドホルモンである。サイトカインに含まれるものは、成長ホルモン(例えば、ヒト成長ホルモン、N−メチオニルヒト成長ホルモンおよびウシ成長ホルモン);副甲状腺ホルモン;チロキシン;インスリン;プロインスリン;レラキシン;プロレラキシン;糖タンパク質ホルモン(例えば、卵胞刺激ホルモン(FSH)、甲状腺刺激ホルモン(TSH)および黄体形成ホルモン(LH));肝成長因子;線維芽細胞成長因子;プロラクチン;胎盤性ラクトーゲン;腫瘍壊死因子−αおよび−β;ミューラー阻害物質;マウスゴナドトロピン関連ペプチド;インヒビン;アク
チビン;血管内皮成長因子;インテグリン;トロンボポエチン(TPO);神経成長因子(例えば、NGF−β);血小板成長因子;トランスフォーミング成長因子(TGF)(例えば、TGF−αおよびTGF−β);インスリン様成長因子−Iおよび−II;エリスロポエチン(EPO);骨誘導因子(osteoinductive factor);インターフェロン(例えば、インターフェロン−α、−βおよび−γ);コロニー刺激因子(CSF)(例えば、マクロファージ−CSF(M−CSF));顆粒球−マクロファージ−CSF(GM−CSF);および顆粒球−CSF(G−CSF);インターロイキン(IL)(例えば、IL−1、IL−1a、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−11、IL−12);腫瘍壊死因子(例えば、TNF−αまたはTNF−β);および他のポリペプチド因子(LIFおよびキットリガンド(KL)を含む)である。本明細書中で使用されるとき、用語サイトカインは、天然起源由来または組換え細胞培養物由来のタンパク質およびネイティブ配列のサイトカインの生物学的活性同等物を含む。
チビン;血管内皮成長因子;インテグリン;トロンボポエチン(TPO);神経成長因子(例えば、NGF−β);血小板成長因子;トランスフォーミング成長因子(TGF)(例えば、TGF−αおよびTGF−β);インスリン様成長因子−Iおよび−II;エリスロポエチン(EPO);骨誘導因子(osteoinductive factor);インターフェロン(例えば、インターフェロン−α、−βおよび−γ);コロニー刺激因子(CSF)(例えば、マクロファージ−CSF(M−CSF));顆粒球−マクロファージ−CSF(GM−CSF);および顆粒球−CSF(G−CSF);インターロイキン(IL)(例えば、IL−1、IL−1a、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−8、IL−9、IL−11、IL−12);腫瘍壊死因子(例えば、TNF−αまたはTNF−β);および他のポリペプチド因子(LIFおよびキットリガンド(KL)を含む)である。本明細書中で使用されるとき、用語サイトカインは、天然起源由来または組換え細胞培養物由来のタンパク質およびネイティブ配列のサイトカインの生物学的活性同等物を含む。
用語「添付文書」とは、治療用製品の市販用パッケージ内に慣習的に含まれる指示書のことをいうために用いられ、そのような治療用製品の使用に関する適応症、使用法、用量、投与、禁忌および/または警告に関する情報を含んでいる。
用語「遺伝子」とは、(a)本明細書に開示したDNA配列の少なくとも1つを含む遺伝子;(b)本明細書中で開示するDNA配列によりコードされるアミノ酸配列をコードする任意のDNA配列および/または(c)本明細書中で開示するコード配列の相補物にハイブリダイズする任意のDNA配列のことをいう。好ましくは、この用語は、コード領域ならびに非コード領域を含み、好ましくは、正常な遺伝子発現に必要なすべての配列を包む。
用語「遺伝子ターゲティング」とは、ゲノムDNAフラグメントが哺乳動物細胞内に導入され、そしてそのフラグメントが内在性の相同配列を特定して組換えを起こす場合に生じる相同組換えの型のことをいう。相同組換えによる遺伝子ターゲティングは、特定のゲノム配列を特定の設計の外因性DNAと置き換える組換えDNA技術を使用する。
用語「相同組換え」とは、相同なヌクレオチド配列の部位における2つのDNA分子または染色分体の間のDNAフラグメントの交換のことをいう。
用語「標的遺伝子」(あるいは「標的遺伝子配列」または「標的DNA配列」とも呼ばれる)は、相同組換えにより改変されるべき任意の核酸分子、ポリヌクレオチドまたは遺伝子のことをいう。標的配列は、インタクトな遺伝子、エクソンもしくはイントロン、調節配列または遺伝子間の任意の領域を含む。標的遺伝子は、個々のゲノムDNAにおける特定の遺伝子または遺伝子座の一部分を含み得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PR
O7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の「破壊」は、ゲノムDNAフラグメントが内在性の相同配列を特定して組換えを起こす場合に生じ、ここで、破壊とは、ネイティブの遺伝子もしくはその一部分の欠失であるか、またはネイティブの遺伝子の変異であるか、あるいは、破壊は、ネイティブの遺伝子の機能的不活性化である。あるいは、配列の破壊は、遺伝子トラップベクターを用いた非特異的な挿入性の不活性化により生じてもよい(すなわち、ランダムに挿入されたトランスジーンを含み、発現する非ヒトトランスジェニック動物;例えば、2002年8月20日に発行された米国特許第6,436,707号を参照のこと)。これらの配列の破壊または改変としては、DNA配列の挿入、ミスセンス、フレームシフト、欠失または置換もしくは置き換えあるいはそれらの任意の組合せが挙げられ得る。挿入は、動物、植物、真菌、昆虫、原生動物またはウイルス起源であり得る遺伝子全体の挿入を含む。破壊は、例えば、正常な遺伝子産物の産生を部分的または完全に抑制するか、または正常な遺伝子産物の活性を増強することにより、その正常な遺伝子産物を変更することができる。好ましくは、破壊は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の有意な発現がないヌル破壊(null disruption)である。
O7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の「破壊」は、ゲノムDNAフラグメントが内在性の相同配列を特定して組換えを起こす場合に生じ、ここで、破壊とは、ネイティブの遺伝子もしくはその一部分の欠失であるか、またはネイティブの遺伝子の変異であるか、あるいは、破壊は、ネイティブの遺伝子の機能的不活性化である。あるいは、配列の破壊は、遺伝子トラップベクターを用いた非特異的な挿入性の不活性化により生じてもよい(すなわち、ランダムに挿入されたトランスジーンを含み、発現する非ヒトトランスジェニック動物;例えば、2002年8月20日に発行された米国特許第6,436,707号を参照のこと)。これらの配列の破壊または改変としては、DNA配列の挿入、ミスセンス、フレームシフト、欠失または置換もしくは置き換えあるいはそれらの任意の組合せが挙げられ得る。挿入は、動物、植物、真菌、昆虫、原生動物またはウイルス起源であり得る遺伝子全体の挿入を含む。破壊は、例えば、正常な遺伝子産物の産生を部分的または完全に抑制するか、または正常な遺伝子産物の活性を増強することにより、その正常な遺伝子産物を変更することができる。好ましくは、破壊は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の有意な発現がないヌル破壊(null disruption)である。
用語「ネイティブの発現」とは、野生型マウスにおいて存在する発現レベルにおけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子によりコードされる完全長ポリペプチドの発現のことをいう。すなわち、内在性PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PR
O540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の「ネイティブの発現が無い」破壊とは、哺乳動物の単一の細胞、選択された細胞またはすべての細胞の内在性PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子によりコードされるポリペプチドの少なくとも一部分の発現の部分的または完全な低下のことをいう。
O540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の「ネイティブの発現が無い」破壊とは、哺乳動物の単一の細胞、選択された細胞またはすべての細胞の内在性PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子によりコードされるポリペプチドの少なくとも一部分の発現の部分的または完全な低下のことをいう。
用語「ノックアウト」とは、破壊によりネイティブの遺伝子の機能的不活性化;ネイティブ遺伝子またはその一部分の欠失;またはネイティブの遺伝子の変異がもたらされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の破壊のことをいう。
用語「ノックイン」とは、特定のヒトPRO69122、PRO204、PRO214
、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード遺伝子またはその改変体のいずれかをコードするヒトcDNAによるマウスオルソログ(または他のマウス遺伝子)の置き換えのことをいう(すなわちこの破壊は、ネイティブのマウス遺伝子とネイティブのヒト遺伝子との置き換えをもたらす)。
、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード遺伝子またはその改変体のいずれかをコードするヒトcDNAによるマウスオルソログ(または他のマウス遺伝子)の置き換えのことをいう(すなわちこの破壊は、ネイティブのマウス遺伝子とネイティブのヒト遺伝子との置き換えをもたらす)。
用語「構築物」または「ターゲティング構築物」とは、標的の組織、細胞株または動物内に移行されるべき人工的に組み立てられたDNAセグメントのことをいう。代表的には、ターゲティング構築物は、特定の目的の遺伝子または核酸配列、マーカー遺伝子および適切なコントロール配列を含む。本明細書中で提供されるように、ターゲティング構築物は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ターゲティング構築物を含む。「PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO2
0026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ターゲティング構築物」は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の少なくとも一部分に相同なDNA配列を包み、そして、宿主細胞内でPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の破壊を生じさせることができる。
0026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ターゲティング構築物」は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の少なくとも一部分に相同なDNA配列を包み、そして、宿主細胞内でPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の破壊を生じさせることができる。
用語「トランスジェニック細胞」とは、そのゲノム内に、遺伝子ターゲティングの方法により完全にまたは部分的に破壊、改変、変更されているか、または置き換えられているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子を含む細胞のことをいう。
用語「トランスジェニック動物」とは、本明細書に記載した方法または当該分野で周知の他の方法により破壊または他の方法で改変または変異されている特定の遺伝子をそのゲノム内に含む動物のことをいう。好ましくは、その非ヒトトランスジェニック動物は、哺乳動物である。より好ましくは、その哺乳動物は、げっ歯類(例えば、ラットまたはマウス)である。さらに、「トランスジェニック動物」は、ヘテロ接合の動物(すなわち、1つの欠損対立遺伝子および1つの野生型対立遺伝子)またはホモ接合の動物(すなわち、2つの欠損対立遺伝子)であり得る。胚は、動物の定義内に属するとみなす。動物を提供することは、胚が在胎期を満了するかどうかにかかわらず、交配もしくは他の方法によって、子宮内に胚または胎児を提供することを含む。
本明細書中で使用されるとき、用語「選択マーカー」および「位置選択マーカー」とは、遺伝子を有している細胞のみを特定の条件下で生存および/または成長させることができる、ある産物をコードする遺伝子のことをいう。例えば、導入されたネオマイシン耐性(Neor)遺伝子を発現する植物細胞および動物細胞は、化合物G418に耐性である。Neor遺伝子マーカーを有しない細胞は、G418により殺滅される。他の陽性選択マーカーは、当業者に公知であるか、または推測できるものである。
用語「調節する」または「調節」は、本明細書中で使用されるとき、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の機能、発現、活性あるいはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子に関連する表現型の減少、抑制、低減、寛解、増大または増強のことをいう。
用語「寛解する」または「寛解」は、本明細書中で使用されるとき、状態、疾患、障害
または表現型(異常または症状を含む)の減少、低減または排除のことをいう。
または表現型(異常または症状を含む)の減少、低減または排除のことをいう。
用語「異常」とは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の関与が示唆される任意の疾患、障害、状態または表現型(病的状態および行動観察結果を含む)のことをいう。
PRO XXXXXXXXXXXXXXX(長さ=15アミノ酸)
比較タンパク質 XXXXXYYYYYYY (長さ=12アミノ酸)
%アミノ酸配列同一性=
ALIGN−2により決定した場合の2つのポリペプチド配列の間の同一で一致するアミノ酸残基の数)÷(PROポリペプチドのアミノ酸残基の総数)=
5÷15=33.3%
表3
PRO XXXXXXXXXX (長さ=10アミノ酸)
比較タンパク質 XXXXXYYYYYYZZYZ(長さ=15アミノ酸)
%アミノ酸配列同一性=
ALIGN−2により決定した場合の2つのポリペプチド配列の間の同一で一致するアミノ酸残基の数)÷(PROポリペプチドのアミノ酸残基の総数)=
5÷10=50%
表4
PRO−DNA NNNNNNNNNNNNNN (長さ=14ヌクレオチド)
比較DNA NNNNNNLLLLLLLLLL(長さ=16ヌクレオチド)
%核酸配列同一性=
ALIGN−2により決定した場合の2つの核酸配列の間の同一で一致するヌクレオチドの数)÷(PRO−DNA核酸配列のヌクレオチドの総数)=
6÷14=42.9%
表5
PRO−DNA NNNNNNNNNNNN(長さ=12ヌクレオチド)
比較DNA NNNNLLLVV (長さ=9ヌクレオチド)
%核酸配列同一性=
ALIGN−2により決定した場合の2つの核酸配列の間の同一で一致するヌクレオチドの数)÷(PRO−DNA核酸配列のヌクレオチドの総数)=
4÷12=33.3%
II.本発明の組成物および方法
A.完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286
、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド
本発明は、本出願においてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと呼ばれるポリペプチドをコードする新規に同定され単離されたヌクレオチド配列を提供する。特に、様々なPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするcDNAが、後述する実施例においてさらに詳細に開示するように同定され、単離された。別の回の発現において産生されるタンパク質に異なるPRO番号を付与し得るが、UNQ番号は、任意の所与のDNAおよびコードされるタンパク質に対して独自のものであり、変更することは無い。しかしながら、簡便のため、本明細書においては、本明細書中で開示する完全長のネイティブの核酸分子によりコードされるタンパク質ならびにPROの前記した定義に含まれるすべてのさらなるネイティブの相同体および改変体は、その起源または調製様式に関わらず、「PRO/番号」と呼ぶ。
後述する実施例に開示するように、様々なcDNAクローンがATCCに寄託されている。当業者は、これらのクローンの実際のヌクレオチド配列を、当該分野の日常的方法を用いて寄託クローンの配列決定により容易に決定することができる。予測されるアミノ酸配列は、日常的技術を用いてヌクレオチド配列から決定できる。本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドおよびそれらをコードする核酸に関して、出願人は、その時点で利用可能な配列の情報を用いて最も同定可能であるリーディングフレームであると考えられるものを同定している。
B.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド改変体
本明細書に記載した完全長のネイティブ配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO
19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに加えて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体が調製可能であることが企図される。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNA内に適切なヌクレオチドの変化を導入することおよび/または所望のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、
PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの合成により、調製できる。アミノ酸の変化は、グリコシル化部位の数または位置を変化させたり、または、膜アンカー特性を改変させたりして、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの翻訳後のプロセスを改変し得ることは、当業者の知る通りである。
本明細書に記載した完全長のネイティブ配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO
19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに加えて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体が調製可能であることが企図される。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNA内に適切なヌクレオチドの変化を導入することおよび/または所望のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、
PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの合成により、調製できる。アミノ酸の変化は、グリコシル化部位の数または位置を変化させたり、または、膜アンカー特性を改変させたりして、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの翻訳後のプロセスを改変し得ることは、当業者の知る通りである。
ネイティブ完全長配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO157
3、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの様々なドメインの変異は、例えば、米国特許第5,364,934号に記載されている保存的および非保存的な変異に関する手法および指針のいずれかを用いて形成することができる。変異は、ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと比較した場合に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアミノ酸配列の変化をもたらすPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5
801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする1つ以上のコドンの置換、欠失または挿入であり得る。必要に応じて、変異は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのドメインの1つ以上における他の任意のアミノ酸による少なくとも1つのアミノ酸の置換によるものであってもよい。所望の活性に悪影響を与えることなく、いずれのアミノ酸残基を挿入、置換または欠失させてよいかを決定する場合の指針は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの配列を相同な既知タンパク質分子の配列と比較することおよび相同性の高い領域で起こるアミノ酸配列の変化の数を最小限にすることにより見出され得る。アミノ酸置換は、1つのアミノ酸を同様の構造的および/または化学的特性を有する別のアミノ酸と置き換えること、例えば、ロイシンをセリンで置き換えること、すなわち保存的なアミノ酸の置き換えの結果であり得る。挿入および欠失は、必要に応じて約1〜5個のアミノ酸の範囲であってよい。許容される変異は、配列におけるアミノ酸の挿入、欠失または置換を系統的に行うことおよび得られた改変体を完全長または成熟ネイティブ配列により示される活性について試験することにより決定され得る。
3、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの様々なドメインの変異は、例えば、米国特許第5,364,934号に記載されている保存的および非保存的な変異に関する手法および指針のいずれかを用いて形成することができる。変異は、ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと比較した場合に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアミノ酸配列の変化をもたらすPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5
801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする1つ以上のコドンの置換、欠失または挿入であり得る。必要に応じて、変異は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのドメインの1つ以上における他の任意のアミノ酸による少なくとも1つのアミノ酸の置換によるものであってもよい。所望の活性に悪影響を与えることなく、いずれのアミノ酸残基を挿入、置換または欠失させてよいかを決定する場合の指針は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの配列を相同な既知タンパク質分子の配列と比較することおよび相同性の高い領域で起こるアミノ酸配列の変化の数を最小限にすることにより見出され得る。アミノ酸置換は、1つのアミノ酸を同様の構造的および/または化学的特性を有する別のアミノ酸と置き換えること、例えば、ロイシンをセリンで置き換えること、すなわち保存的なアミノ酸の置き換えの結果であり得る。挿入および欠失は、必要に応じて約1〜5個のアミノ酸の範囲であってよい。許容される変異は、配列におけるアミノ酸の挿入、欠失または置換を系統的に行うことおよび得られた改変体を完全長または成熟ネイティブ配列により示される活性について試験することにより決定され得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO
1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメントが、本明細書において提供される。そのようなフラグメントは、例えば、完全長のネイティブのタンパク質と比較した場合にN末端またはC末端で切断されているか、または、内部残基を欠いている場合がある。特定のフラグメントは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの所望の生物学的活性に必須ではないアミノ酸残基を欠いている。
1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメントが、本明細書において提供される。そのようなフラグメントは、例えば、完全長のネイティブのタンパク質と比較した場合にN末端またはC末端で切断されているか、または、内部残基を欠いている場合がある。特定のフラグメントは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの所望の生物学的活性に必須ではないアミノ酸残基を欠いている。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250フラグメントは、多くの従来の手法のいずれかにより調製され得る。所望のペプチドフラグメントは、化学的に合成され得る。代替法においては、酵素消化、例えば、特定のアミノ酸残基により定義される部位においてタンパク質を切断することがわかっている酵素でタンパク質を処理すること、または適当な制限酵素でDNAを消化し、そして所望のフラグメントを単離することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO33
2、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250フラグメントが得られる。さらに別の適当な手法では、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により所望のポリペプチドフラグメントをコードするDNAフラグメントを単離して増幅する。そのDNAフラグメントの所望の末端を定義するオリゴヌクレオチドをPCRにおける5’および3’のプライマーとして使用する。好ましくは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメントは、本明細書中で開示するネイティブのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと、少なくとも1つの生物学的および/または免疫学的活性を共有する。
2、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250フラグメントが得られる。さらに別の適当な手法では、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)により所望のポリペプチドフラグメントをコードするDNAフラグメントを単離して増幅する。そのDNAフラグメントの所望の末端を定義するオリゴヌクレオチドをPCRにおける5’および3’のプライマーとして使用する。好ましくは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドフラグメントは、本明細書中で開示するネイティブのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと、少なくとも1つの生物学的および/または免疫学的活性を共有する。
目的の保存的置換は、好ましい置換という見出しの下に表6に示す通りである。このような置換が、生物学的活性の変化をもたらす場合、より実質的な変化、表6において例示
される置換と称される置換、またはアミノ酸クラスを参照して後でさらに説明するものが好ましく導入され、その生成物がスクリーニングされる。
される置換と称される置換、またはアミノ酸クラスを参照して後でさらに説明するものが好ましく導入され、その生成物がスクリーニングされる。
)側鎖の嵩を維持することに対するその改変の作用において有意に異なる置換を選択することにより達成される。天然に存在する残基は、共通の側鎖の特性に基づいて群分けされ:アミノ酸は、その側鎖の特性における類似性(A.L.Lehninger,Biochemistry,Second ed.,pp.73−75,Worth Publishers,New York(1975))に従って:
(1)非極性;Ala(A)、Val(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M)
(2)無電荷極性:Gly(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q)
(3)酸性:Asp(D)、Glu(E)
(4)塩基性:Lys(K)、Arg(R)、His(H)
に群分けされ得る。
あるいは、天然に存在する残基は、共通の側鎖の特性に基づいて:
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖の方向に影響する残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe
に群分けされ得る。
非保存的置換は、これらのクラスの1つのメンバーを別のクラスと交換することを含む。そのような置換された残基はまた、保存的置換部位内に、またはより好ましくは残りの(非保存的な)部位に導入され得る。
変異は、オリゴヌクレオチド媒介性(部位指向性)突然変異誘発、アラニンスキャニングおよびPCR突然変異誘発などの当該分野で公知の方法を用いて生成することができる。部位指向性突然変異誘発[Carter et al.,Nucl.Acids Res.,13:4331(1986);Zoller et al.,Nucl.Acids Res.,10:6487(1987)]、カセット突然変異誘発[Wells et al.,Gene,34:315(1985)]、制限選択突然変異誘発[Wells et al.,Philos.Trans.R.Soc.London SerA,317:415(1986)]または他の公知の手法をクローニングされたDNAに対して実施することによりPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250改変体DNAを生成することができる。
スキャニングアミノ酸分析もまた、隣接する配列に沿って1つ以上のアミノ酸を同定す
るために使用できる。好ましいスキャニングアミノ酸には比較的小型の中性のアミノ酸が包含される。このようなアミノ酸としては、アラニン、グリシン、セリンおよびシステインが挙げられる。アラニンは、代表的には、それがベータ炭素を超えた側鎖を排除し、改変体の主鎖のコンホメーションを変更する可能性が低いため、この群の中では好ましいスキャニングアミノ酸である[Cunningham and Wells,Science,244:1081−1085(1989)]。アラニンはまた、代表的には、それが最も一般的なアミノ酸であるため好ましい。さらに、アラニンは、頻繁に埋没した位置および曝露される位置の両方において存在する[Creighton,The Proteins,(W.H.Freeman&Co.,N.Y.);Chothia,J.Mol.Biol.,150:1(1976)]。アラニン置換が十分な量の改変体をもたらさない場合は、同配体(isoteric)アミノ酸を使用できる。
るために使用できる。好ましいスキャニングアミノ酸には比較的小型の中性のアミノ酸が包含される。このようなアミノ酸としては、アラニン、グリシン、セリンおよびシステインが挙げられる。アラニンは、代表的には、それがベータ炭素を超えた側鎖を排除し、改変体の主鎖のコンホメーションを変更する可能性が低いため、この群の中では好ましいスキャニングアミノ酸である[Cunningham and Wells,Science,244:1081−1085(1989)]。アラニンはまた、代表的には、それが最も一般的なアミノ酸であるため好ましい。さらに、アラニンは、頻繁に埋没した位置および曝露される位置の両方において存在する[Creighton,The Proteins,(W.H.Freeman&Co.,N.Y.);Chothia,J.Mol.Biol.,150:1(1976)]。アラニン置換が十分な量の改変体をもたらさない場合は、同配体(isoteric)アミノ酸を使用できる。
C.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの改変
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの共有結合改変は、本発明の範囲に含まれる。共有結合修飾の1つの型は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO
1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの選択された側鎖またはN末端もしくはC末端の残基と反応することができる有機誘導体化剤と、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの標的アミノ酸残基を反応させることを含む。二官能性薬剤を用いた誘導体化は、例えば、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を精製するための方法において使用する水不溶性の支持体マトリックスまたは表面にPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PR
O5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを架橋結合するため、またはその逆のために有用である。一般に使用される架橋結合剤としては、例えば、1,1−ビス(ジアゾアセチル)−2−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば、4−アジドサリチル酸とのエステル、ホモ2官能性イミドエステル(3,3’−ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)などのジスクシンイミジルエステルを含む)、2官能性マレイミド(例えば、ビス−N−マレイミド−1,8−オクタンおよびメチル−3−[(p−アジドフェニル)ジチオ]プロピオイミデート)などの薬剤が挙げられる。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの共有結合改変は、本発明の範囲に含まれる。共有結合修飾の1つの型は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO
1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの選択された側鎖またはN末端もしくはC末端の残基と反応することができる有機誘導体化剤と、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの標的アミノ酸残基を反応させることを含む。二官能性薬剤を用いた誘導体化は、例えば、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を精製するための方法において使用する水不溶性の支持体マトリックスまたは表面にPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PR
O5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを架橋結合するため、またはその逆のために有用である。一般に使用される架橋結合剤としては、例えば、1,1−ビス(ジアゾアセチル)−2−フェニルエタン、グルタルアルデヒド、N−ヒドロキシスクシンイミドエステル、例えば、4−アジドサリチル酸とのエステル、ホモ2官能性イミドエステル(3,3’−ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)などのジスクシンイミジルエステルを含む)、2官能性マレイミド(例えば、ビス−N−マレイミド−1,8−オクタンおよびメチル−3−[(p−アジドフェニル)ジチオ]プロピオイミデート)などの薬剤が挙げられる。
他の改変としては、グルタミニル残基およびアスパルギニル残基からそれぞれ対応するグルタミル残基およびアスパルチル残基への脱アミド化、プロリンおよびリシンのヒドロキシル化、セリル残基またはスレオニル残基のヒドロキシル基のリン酸化、リシン、アルギニンおよびヒスチジン側鎖のα−アミノ基のメチル化[T.E.Creighton,Proteins:Structure and Molecular Properties,W.H.Freeman&Co.,San Francisco,pp.79−86(1983)]、N末端アミンのアセチル化ならびに任意のC末端カルボキシル基のアミド化が挙げられる。
本発明の範囲に含まれるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの共有結合改変の別の型は、そのポリペプチドのネイティブのグリコシル化パターンを変更することを含む。「ネイティブのグリコシル化パターンを変更すること」とは、本明細書の目的のためには、ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、
PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド内に存在する1つ以上の炭水化物部分を欠失させること(存在するグリコシル化部位を除去すること、または化学的および/もしくは酵素的な手段によりグリコシル化を欠失させることのいずれかによる)および/またはネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド内に存在しない1つ以上のグリコシル化部位を付加させることを意味する。さらに、この語句は、存在する様々な炭化水素部分の性質および比率の変化を含む、ネイティブタンパク質のグリコシル化の定性的変化を含む。
PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド内に存在する1つ以上の炭水化物部分を欠失させること(存在するグリコシル化部位を除去すること、または化学的および/もしくは酵素的な手段によりグリコシル化を欠失させることのいずれかによる)および/またはネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド内に存在しない1つ以上のグリコシル化部位を付加させることを意味する。さらに、この語句は、存在する様々な炭化水素部分の性質および比率の変化を含む、ネイティブタンパク質のグリコシル化の定性的変化を含む。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドへのグリコシル化部位の付加は、アミノ酸配列を変更することにより達成され得る。その変更は、例えば、ネイティブ配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5
995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250への1つ以上のセリン残基またはスレオニン残基の付加またはそれらによる置換によりなされ得る(O連結グリコシル化部位の場合)。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250アミノ酸配列は、必要に応じて、特に、所望のアミノ酸に翻訳されることになるコドンが生成されるように予め選択された塩基においてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAを変異させることによって、DNAレベルでの変化を介して変更され得る。
995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250への1つ以上のセリン残基またはスレオニン残基の付加またはそれらによる置換によりなされ得る(O連結グリコシル化部位の場合)。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250アミノ酸配列は、必要に応じて、特に、所望のアミノ酸に翻訳されることになるコドンが生成されるように予め選択された塩基においてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAを変異させることによって、DNAレベルでの変化を介して変更され得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PR
O37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド上の炭水化物部分の数を増大させる別の手段は、そのポリペプチドへのグリコシドの化学的または酵素的なカップリングによるものである。そのような方法は、当該分野において、例えば、1987年9月11日公開のWO87/05330およびAplin and Wriston,CRC Crit.Rev.Biochem.,pp.259−306(1981)に記載されている。
O37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド上の炭水化物部分の数を増大させる別の手段は、そのポリペプチドへのグリコシドの化学的または酵素的なカップリングによるものである。そのような方法は、当該分野において、例えば、1987年9月11日公開のWO87/05330およびAplin and Wriston,CRC Crit.Rev.Biochem.,pp.259−306(1981)に記載されている。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド上に存在する炭水化物部分の除去は、化学的もしくは酵素的に、またはグリコシル化のための標的として機能するアミノ酸残基をコードしているコドンの変異的置換により達成され得る。化学的脱グリコシル化手法は、当該分野で公知であり、そして例えば、Hakimuddin,et al.,Arch.Biochem.Biophys.,259:52(1987)およびEdge et al.,Anal.Biochem.,118:131(1981)に記載されている。ポリペプチド上の炭水化物部分の酵素的切断は、Thotakura et al.,Meth.Enzymol.138:350(1987)に記載されている種々のエンドグリコシダーゼおよびエキソグリコシダーゼの使用によって達成され得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの共有結合改変の別の型は、米国特許第4,640,835号;同第4,496,689号;同第4,301,144号;同第4,670,417号;同第4,791,192号または同第4,179,337号に記載されている様式における種々の非タンパク質性のポリマー、例えば、ポリエチレングリコール(PEG)
、ポリプロピレングリコールまたはポリオキシアルキレンの1つへのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの連結を含む。
、ポリプロピレングリコールまたはポリオキシアルキレンの1つへのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの連結を含む。
本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドはまた、別の異種性のポリペプチドまたはアミノ酸配列に融合したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含むキメラ分子を形成するための方法において改変され得る。
このようなキメラ分子は、抗タグ抗体が選択的に結合できるエピトープを提供するタグ
ポリペプチドとPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとの融合を含む。エピトープタグは、一般に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアミノ末端またはカルボキシル末端に位置する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのこのようなエピトープタグ化形態の存在は、タグポリペプチドに対する抗体を用いて検出できる。また、エピトープタグを提供することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO12
95、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、抗タグ抗体またはエピトープタグに結合する別の型のアフィニティーマトリックスを用いたアフィニティー精製により容易に精製できるようになる。様々なタグポリペプチドおよびその対応する抗体が当該分野で周知である。例としては、ポリヒスチジン(ポリ−his)またはポリヒスチジン−グリシン(ポリ−his−gly)タグ;インフルエンザHAタグポリペプチドおよびその抗体12CA5[Field et al.,Mol.Cell Biol.,8:2159−2165(1988)];c−mycタグおよびそれに対する8F9、3C7、6E10、G4、B7および9E10抗体[Evan et al.,Molecular and Cellular Biology,5:3610−3616(1985)];ならびに単純ヘルペスウイルス糖タンパク質D(gD)タグおよびその抗体[Paborsky et al.,Protein Engineering,3(6):547−553(1990)]が挙げられる。他のタグポリペプチドとしては、Flag−ペプチド[Hopp et al.,BioTechnology,6:1204−1210(1988)];KT3エピトープペプチド[Martin et al.,Science,255:192−194(1992)];α−チューブリンエピトープペプチド[Skinner et al.,J.Biol.Chem.,266:15163−15166(1991)];およびT7遺伝子10タンパク質ペプチドタグ[Lutz−Freyermuth et
al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6393−6397(1990)]が挙げられる。
ポリペプチドとPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとの融合を含む。エピトープタグは、一般に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアミノ末端またはカルボキシル末端に位置する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのこのようなエピトープタグ化形態の存在は、タグポリペプチドに対する抗体を用いて検出できる。また、エピトープタグを提供することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO12
95、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、抗タグ抗体またはエピトープタグに結合する別の型のアフィニティーマトリックスを用いたアフィニティー精製により容易に精製できるようになる。様々なタグポリペプチドおよびその対応する抗体が当該分野で周知である。例としては、ポリヒスチジン(ポリ−his)またはポリヒスチジン−グリシン(ポリ−his−gly)タグ;インフルエンザHAタグポリペプチドおよびその抗体12CA5[Field et al.,Mol.Cell Biol.,8:2159−2165(1988)];c−mycタグおよびそれに対する8F9、3C7、6E10、G4、B7および9E10抗体[Evan et al.,Molecular and Cellular Biology,5:3610−3616(1985)];ならびに単純ヘルペスウイルス糖タンパク質D(gD)タグおよびその抗体[Paborsky et al.,Protein Engineering,3(6):547−553(1990)]が挙げられる。他のタグポリペプチドとしては、Flag−ペプチド[Hopp et al.,BioTechnology,6:1204−1210(1988)];KT3エピトープペプチド[Martin et al.,Science,255:192−194(1992)];α−チューブリンエピトープペプチド[Skinner et al.,J.Biol.Chem.,266:15163−15166(1991)];およびT7遺伝子10タンパク質ペプチドタグ[Lutz−Freyermuth et
al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6393−6397(1990)]が挙げられる。
キメラ分子は、免疫グロブリンまたは免疫グロブリンの特定の領域とPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとの融合を含み得る。キメラ分子の2価の形態(「イムノアドヘシン」とも称する)については、このような融合はIgG分子のFc領域に対するものであり得る。Ig融合は、好ましくはIg分子内の少なくとも1つの可変領域の代替としてのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO61
8、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの可溶性(膜貫通ドメインの欠失型または不活性型)形態の置換を含む。本発明の特に好ましい態様において、免疫グロブリン融合は、IgG1分子のヒンジ、CH2およびCH3;またはIgG1分子のヒンジ、CH1、CH2およびCH3領域を含む。免疫グロブリン融合の生成については、1995年6月27日発行の米国特許第5,428,130号も参照のこと。
8、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの可溶性(膜貫通ドメインの欠失型または不活性型)形態の置換を含む。本発明の特に好ましい態様において、免疫グロブリン融合は、IgG1分子のヒンジ、CH2およびCH3;またはIgG1分子のヒンジ、CH1、CH2およびCH3領域を含む。免疫グロブリン融合の生成については、1995年6月27日発行の米国特許第5,428,130号も参照のこと。
D.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの調製
以下の説明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸を含むベクターで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を培養することによるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342
、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの調製に主に関するものである。当然ながら、当該分野で周知の代替法を用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを調製してもよいことが企図される。例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の配列またはその部分は、固相法を用いた直接ペプチド合成により生成され得る[例えば、Stewart et
al.,Solid−Phase Peptide Synthesis,W.H.Freeman Co.,San Francisco,CA(1969);Merrifield,J.Am.Chem.Soc.,85:2149−2154(1963)を参照のこと]。in vitroのタンパク質合成を、手動の手法または自動により実施してよい。自動合成は、例えば、Applied Biosystems Peptide
Synthesizer(Foster City,CA)を用いて製造元の指示書に
より達成され得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの様々な部分を、別々に化学合成し、そして化学的または酵素的な方法を用いて結合することにより完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを生成してよい。
以下の説明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸を含むベクターで形質転換またはトランスフェクトされた細胞を培養することによるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342
、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの調製に主に関するものである。当然ながら、当該分野で周知の代替法を用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを調製してもよいことが企図される。例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の配列またはその部分は、固相法を用いた直接ペプチド合成により生成され得る[例えば、Stewart et
al.,Solid−Phase Peptide Synthesis,W.H.Freeman Co.,San Francisco,CA(1969);Merrifield,J.Am.Chem.Soc.,85:2149−2154(1963)を参照のこと]。in vitroのタンパク質合成を、手動の手法または自動により実施してよい。自動合成は、例えば、Applied Biosystems Peptide
Synthesizer(Foster City,CA)を用いて製造元の指示書に
より達成され得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの様々な部分を、別々に化学合成し、そして化学的または酵素的な方法を用いて結合することにより完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを生成してよい。
1.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAの単離
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO
1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250mRNAを保有し、そしてそれを検出可能なレベルで発現すると考えられる組織から調製したcDNAライブラリーから得てよい。したがって、ヒトPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNAは、実施例に記載するようなヒト組織から調製したcDNAライブラリーから好都合に得ることができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1
753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード遺伝子はまた、ゲノムライブラリーまたは公知の合成手順(例えば、自動核酸合成)により得てもよい。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO
1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250mRNAを保有し、そしてそれを検出可能なレベルで発現すると考えられる組織から調製したcDNAライブラリーから得てよい。したがって、ヒトPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNAは、実施例に記載するようなヒト組織から調製したcDNAライブラリーから好都合に得ることができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1
753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード遺伝子はまた、ゲノムライブラリーまたは公知の合成手順(例えば、自動核酸合成)により得てもよい。
ライブラリーは、目的の遺伝子またはそれによりコードされるタンパク質を同定するように設計されたプローブ(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対する抗体または少なくとも約20〜80塩基のオリゴヌクレオチド)を用いてスクリーニングできる。選択されたプローブを用いたcDNAライブラリーまたはゲノムライブラリーのスクリーニングは、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989)に記載されているような標準的な手順を用いて実施され得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードする遺伝子を単離するための代替手段は、PCR法を使用することである[Sambrook et al.,前出;Dieffenbach et al.,PCR Primer:A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1995)]。
後述する実施例は、cDNAライブラリーをスクリーニングするための手法を説明するものである。プローブとして選択されたオリゴヌクレオチド配列は、偽陽性を最小限とするために十分な長さのものであり、そして十分明白なものでなければならない。このオリゴヌクレオチドは、好ましくは、スクリーニングされるライブラリーのDNAへのハイブリダイゼーション時にそれが検出できるように標識される。標識方法は、当該分野で周知であり、それらとしては、32P標識ATPのような放射性標識、ビオチニル化または酵素標識の使用が挙げられる。中ストリンジェンシーおよび高ストリンジェンシーを含むハイブリダイゼーション条件は、Sambrook et al.,に記載されている。
このようなライブラリースクリーニング法において同定された配列は、GenBankなどの公的データベースまたは他の私的配列データベースに寄託され入手可能である他の既知配列と比較し、アラインメントすることができる。分子の所定領域内または完全長配列に渡る配列同一性(アミノ酸またはヌクレオチドレベルのいずれかで)は、当該分野で公知の方法を用いて、そして、本明細書に記載するように決定することができる。
タンパク質コード配列を有する核酸は、本明細書において初めて開示された推定アミノ酸配列を用いて、そして、必要に応じて、前出のSambrook et al.に記載されている従来のプライマー伸長手順を用いて、選択されたcDNAまたはゲノムライブラリーをスクリーニングすることにより前駆体を検出すること、および、cDNAに逆転写されていないmRNAの中間体をプロセシングすることにより得られうる。
2.宿主細胞の選択および形質転換
宿主細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの産生に関して本明細書に記載した発現ベクターまたはクローニングベクターを用いてトランスフェクトまたは形質転換され、そしてプロモーターの誘導、形質転換体の選択または所望の配列をコードする遺伝子の増幅に適切であるように改変された従来の栄養培地中で培養される。培地、温度、pHなどのような培養条件は、過度の実験を要することなく当業者が選択できる。一般に、細胞培養の産生性を最大にするための原理、プロトコルおよび実際の手法は、Mammalian Cell Biotechnology:a Practical Approach,M.Butler,ed.(IRL Press,1991)およびSambrook et al.,前出に見ることができる。
宿主細胞は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの産生に関して本明細書に記載した発現ベクターまたはクローニングベクターを用いてトランスフェクトまたは形質転換され、そしてプロモーターの誘導、形質転換体の選択または所望の配列をコードする遺伝子の増幅に適切であるように改変された従来の栄養培地中で培養される。培地、温度、pHなどのような培養条件は、過度の実験を要することなく当業者が選択できる。一般に、細胞培養の産生性を最大にするための原理、プロトコルおよび実際の手法は、Mammalian Cell Biotechnology:a Practical Approach,M.Butler,ed.(IRL Press,1991)およびSambrook et al.,前出に見ることができる。
真核生物細胞トランスフェクションおよび原核生物細胞トランスフェクションの方法は、当業者に公知であり、例えば、CaCl2、CaPO4、リポソーム媒介およびエレクトロポレーションである。使用する宿主細胞に応じて、形質転換は、その細胞に適切な標
準的手法を用いて実施する。前出のSambrook et al.,に記載されているように塩化カルシウムを使用するカルシウム処理またはエレクトロポレーションが原核生物に対して一般に使用される。Shaw et al.,Gene,23:315(1983)および1989年6月29日公開のWO89/05859に記載されているように、特定の植物細胞の形質転換には、Agrobacterium tumefaciensによる感染が使用される。細胞壁を有しない哺乳動物細胞に対しては、Graham and van der Eb,Virology,52:456−457(1978)のリン酸カルシウム沈降法を使用できる。哺乳動物細胞宿主系トランスフェクションの一般的態様は、米国特許第4,399,216号に記載されている。酵母への形質転換は、代表的には、Van Solingen et al.,J.Bact.130:946(1977)およびHsiao et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA),76:3829(1979)の方法に従って実施される。しかしながら、細胞にDNAを導入するための別の方法(例えば、核マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、インタクトな細胞との細菌プロトプラスト融合またはポリカチオン、例えば、ポリブレン、ポリオルニチン)も使用され得る。哺乳動物細胞を形質転換するための様々な手法については、Keown et al.,Methods in Enzymology,185:527−537(1990)およびMansour et al.,Nature,336:348−352(1988)を参照のこと。
準的手法を用いて実施する。前出のSambrook et al.,に記載されているように塩化カルシウムを使用するカルシウム処理またはエレクトロポレーションが原核生物に対して一般に使用される。Shaw et al.,Gene,23:315(1983)および1989年6月29日公開のWO89/05859に記載されているように、特定の植物細胞の形質転換には、Agrobacterium tumefaciensによる感染が使用される。細胞壁を有しない哺乳動物細胞に対しては、Graham and van der Eb,Virology,52:456−457(1978)のリン酸カルシウム沈降法を使用できる。哺乳動物細胞宿主系トランスフェクションの一般的態様は、米国特許第4,399,216号に記載されている。酵母への形質転換は、代表的には、Van Solingen et al.,J.Bact.130:946(1977)およびHsiao et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.(USA),76:3829(1979)の方法に従って実施される。しかしながら、細胞にDNAを導入するための別の方法(例えば、核マイクロインジェクション、エレクトロポレーション、インタクトな細胞との細菌プロトプラスト融合またはポリカチオン、例えば、ポリブレン、ポリオルニチン)も使用され得る。哺乳動物細胞を形質転換するための様々な手法については、Keown et al.,Methods in Enzymology,185:527−537(1990)およびMansour et al.,Nature,336:348−352(1988)を参照のこと。
本明細書におけるベクター内のDNAをクローニングまたは発現するために適当な宿主細胞としては、原核生物、酵母または高等真核生物の細胞が挙げられる。適当な原核生物としては、真正細菌(例えば、グラム陰性またはグラム陽性の生物体、例えば、E.coliなどのEnterobacteriaceae科)が挙げられるがこれらに限定されない。様々なE.coli株(例えば、E.coliK12株MM294(ATCC31,446);E.coliX1776(ATCC31,537);E.coli株W3110(ATCC27,325)およびK5 772(ATCC53,635))が公的に入手できる。他の適当な原核生物宿主細胞としては、Enterobacteriaceae科(例えば、E.coliなどのEscherichia属、Enterobacter属、Erwinia属、Klebsiella属、Proteus属、Salmonella属(例えば、Salmonella typhimurium)、Serratia属(例えば、Serratia marcescans)およびShigella属ならびにBacilli属(例えば、B.subtilisおよびB.licheniformis(例えば、1989年4月12日公開のDD266,710に開示されているB.licheniformis 41P))、P.aeruginosaなどのPseudomonas属およびStreptomyces属が挙げられる。これらの例は、説明であって限定するものではない。株W3110は、組換えDNA産物の発酵のための一般的な宿主菌株であるため、1つの特に好ましい宿主または親宿主である。好ましくは、宿主細胞は、最小量のタンパク質分解酵素を分泌する。例えば、菌株W3110は、宿主に内在性であるタンパク質をコードする遺伝子における遺伝的変異に影響を及ぼすように改変してよく、そのような宿主の例としては、完全な遺伝子型tonAを有するE.coliW3110株1A2;完全な遺伝子型tonA ptr3を有するE.coliW3110株9E4;完全な遺伝子型tonA ptr3 phoA E15(argF−lac)169degP ompT kanrを有するE.coliW3110株27C7(ATCC55,244);完全な遺伝子型tonA ptr3 phoA E15(argF−lac)169degP ompT rbs7 ilvG kanrを有するE.coliW3110株37D6;非カナマイシン耐性degP欠失変異を有する株37D6であるE.coliW3110菌株40B4;および、1990年8月7日に発行された米国特許第4,946,783号に開示されている変異体の細胞周辺腔プロテアーゼを有するE.coli株が挙げられる。あるいは、in vitroにおけるクローニング方法、例えば、PCRまたは他の核酸ポリメラーゼ反応が適当である。
原核生物に加えて、糸状菌または酵母などの真核生物の微生物が、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コードベクターに適したクローニング宿主または発現宿主である。Saccharomyces cerevisiaeは、一般に使用されている下等真核生物の宿主微生物である。他のものとしては、Schizosaccharomyces pombe(Beach and Nurse,Nature,290:140[1981];1985年5月2日公開のEP139,383);Kluyveromyces属宿主(米国特許第4,943,529号;Fleer et al.,Bio/Technology,9:968−975(1991))(例えば、K.lactis(MW98−8C,CBS683、CBS4574;Louvencourt et al.,J.Bacteriol.,154(2):737−742[1983])、K.fragilis(ATCC12,424)、K.bulgaricus(ATCC16,045)、K.wickeramii(ATCC24,178)、K.waltii(ATCC56,500)、K.drosophilarum(ATCC36,906;Van den Berg et
al.,Bio/Technology,8:135(1990))、K.thermotoleransおよびK.marxianus);yarrowia属(EP402,226);Pichia pastoris(EP183,070;Sreekrishna et al.,J.Basic Microbiol.,28:265−278[1988]);Candida属;Trichoderma reesia(EP244,234);Neurospora crassa(Case et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,76:5259−5263[1979]);Schwanniomyces属(例えば、Schwanniomyces occidentalis(1990年10月31日公開のEP394,538));および糸状菌(例えば、Neurospora属、Penicillium属、Tolypocladium属(1991年1月10日公開のWO91/00357)およびAspergillus属宿主(例えば、A.nidulans(Ballance et al.,Biochem.Biophys.Res.Commun.,112:284−289[1983];Tilburn et al.,Gene,26:205−221[1983];Yelton et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:1470−1474[1984])およびA.niger(Kelly and Hynes,EMBO J.,4:475−479[1985]))が挙げられる。メチロトロピック(Methylotropic)酵母が、本発明において適しており、そしてそれらとしては、Hansenula属、Candida属、Kloeckera属、Pichia属、Saccharomyces属、Torulopsis属およびRhodotorula属からなる属から選択される、メタノールで生育できる酵母が挙げられるがこれらに限定されない。このクラスの酵母の例となる特定の種のリストは、C.Anth
ony,The Biochemistry of Methylotrophs,269(1982)に見ることができる。
al.,Bio/Technology,8:135(1990))、K.thermotoleransおよびK.marxianus);yarrowia属(EP402,226);Pichia pastoris(EP183,070;Sreekrishna et al.,J.Basic Microbiol.,28:265−278[1988]);Candida属;Trichoderma reesia(EP244,234);Neurospora crassa(Case et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,76:5259−5263[1979]);Schwanniomyces属(例えば、Schwanniomyces occidentalis(1990年10月31日公開のEP394,538));および糸状菌(例えば、Neurospora属、Penicillium属、Tolypocladium属(1991年1月10日公開のWO91/00357)およびAspergillus属宿主(例えば、A.nidulans(Ballance et al.,Biochem.Biophys.Res.Commun.,112:284−289[1983];Tilburn et al.,Gene,26:205−221[1983];Yelton et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:1470−1474[1984])およびA.niger(Kelly and Hynes,EMBO J.,4:475−479[1985]))が挙げられる。メチロトロピック(Methylotropic)酵母が、本発明において適しており、そしてそれらとしては、Hansenula属、Candida属、Kloeckera属、Pichia属、Saccharomyces属、Torulopsis属およびRhodotorula属からなる属から選択される、メタノールで生育できる酵母が挙げられるがこれらに限定されない。このクラスの酵母の例となる特定の種のリストは、C.Anth
ony,The Biochemistry of Methylotrophs,269(1982)に見ることができる。
グリコシル化されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に適した宿主細胞は、多細胞生物から得られる。無脊椎動物の細胞の例としては、昆虫細胞(例えば、Drosophila S2およびSpodoptera Sf9)ならびに植物細胞が挙げられる。有用な哺乳動物宿主細胞株の例としては、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞およびCOS細胞が挙げられる。より特定の例としては、SV40で形質転換したサル腎臓CV1株(COS−7、ATCC CRL 1651);ヒト胚性腎株(293細胞または懸濁培地中の生育のためにサブクローニングされた293細胞、Graham et al.,J.Gen.Virol.,36:59(1977));チャイニーズハムスター卵巣細胞/−DHFR(CHO、Urlaub and Chasin,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4216(1980));マウスセルトーリ細胞(TM4、Mather,Biol.Reprod.,23:243−251(1980));ヒト肺細胞(W138、ATCC CCL 75);ヒト肝細胞(Hep G2,HB8065);およびマウス乳癌(MMT060562、ATCC CCL51)が挙げられる。適切な宿主細胞の選択は、当業者の知る通りである。
3.複製可能なベクターの選択および使用
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする核酸(例えば、cDNAまたはゲノムDNA)は、クローニング(DNAの増幅)または発現のために、複製可能なベクター内に挿入され得る。様々なベクターが公的に入手可能である。そのベクターは、例えば、プラス
ミド、コスミド、ウイルス粒子またはファージの形態であり得る。適切な核酸配列が、種々の手順によりベクター内に挿入され得る。一般に、DNAは、当該分野で公知の手法を用いて適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。ベクター構成要素としては、一般に、シグナル配列の1つ以上、複製起点、マーカー遺伝子の1つ以上、エンハンサーエレメント、プロモーターおよび転写終止配列が挙げられるがこれらに限定されない。これらの構成要素の1つ以上を含む適当なベクターの構築は、当業者に公知の標準的なライゲーション手法を用いる。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする核酸(例えば、cDNAまたはゲノムDNA)は、クローニング(DNAの増幅)または発現のために、複製可能なベクター内に挿入され得る。様々なベクターが公的に入手可能である。そのベクターは、例えば、プラス
ミド、コスミド、ウイルス粒子またはファージの形態であり得る。適切な核酸配列が、種々の手順によりベクター内に挿入され得る。一般に、DNAは、当該分野で公知の手法を用いて適切な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入される。ベクター構成要素としては、一般に、シグナル配列の1つ以上、複製起点、マーカー遺伝子の1つ以上、エンハンサーエレメント、プロモーターおよび転写終止配列が挙げられるがこれらに限定されない。これらの構成要素の1つ以上を含む適当なベクターの構築は、当業者に公知の標準的なライゲーション手法を用いる。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、組換えにより、直接のみならず、成熟タンパク質または成熟ポリペプチドのN末端にシグナル配列または特定の切断部位を有する他のポリペプチドであり得る異種ポリペプチドとの融合ポリペプチドとして生成され得る。一般に、シグナル配列は、ベクターの成分であり得るか、またはベクターに挿入されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コードDNAの部分であり得る。シグナル配列は、例えば、アルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、lppまたは熱安定性エンテロトキシンIIリーダーの群から選択される原核生物のシグナル配列であり得る。酵母の分泌のためには、シグナル配列は、例えば、酵母インベルターゼリーダー、アルファ因子リーダー(SaccharomycesおよびKluyveromycesのα−因子リーダーを包み、後者は、米国特許第5,010,182号に記載)または酸ホスファターゼリーダー、C.albicansグルコアミラーゼリーダー(1990年4月4日公開のEP362,179)または1990年11月15日公開のWO90/13646に記載のシグナルであり得る。哺乳動物細胞発現においては、同じか関連する種の分泌ポリペプチド由来のシグナル配列などの哺乳動物シグナル配列を用いてタンパク質の分泌を誘導し得、ウイルスの分泌リーダーも使用
され得る。
され得る。
発現およびクローニングベクターは、両方とも1つ以上の選択された宿主細胞においてベクターを複製可能とする核酸配列を含む。そのような配列は、種々の細菌、酵母およびウイルスに関して周知である。プラスミドpBR322由来の複製起点が、大部分のグラム陰性細菌に適しており、2μプラスミド起点は、酵母に適しており、そして様々なウイルス起点(SV40、ポリオーマ、アデノウイルス、VSVまたはBPV)は、哺乳動物細胞におけるクローニングベクターのために有用である。
発現ベクターおよびクローニングベクターは、代表的には、選択可能なマーカーとも呼ばれる選択遺伝子を含む。代表的な選択遺伝子は、(a)抗生物質または他のトキシン、例えば、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキサートまたはテトラサイクリンに対する耐性を付与するタンパク質、(b)栄養要求性の欠損を補うタンパク質、または(c)複合培地から利用できない重要な栄養を供給するタンパク質をコードしており、例えば、BacilliのためのD−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子である。
哺乳動物細胞に適した選択可能なマーカーの例は、DHFRまたはチミジンキナーゼなどの、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード核酸の取り込み能力を有する細胞の同定を可能にするものである。野生型DHFRを使用する場合の適切な宿主細胞は、Urlaub et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:4216(1980)に記載されているように調製および増殖させたDHFR活性欠損のCHO細胞である。酵母において使用に適した選択遺伝子は、酵母プラスミドYRp7中に存在するtrp1遺伝子である[Stinchcomb et al.,Nature,282:39(1979);Kingsman et al.,Gene,7:141(1979);Tschemper et al.,Gene,10:157(1980)]。trp1遺伝子は、トリプトファン中で生育する能力を欠いた酵母の変異株、例えば、ATCC番号44076またはPEP4−1のための選択マーカーを提供する[Jones,Genetics,85:12(1977)]。
発現ベクターおよびクローニングベクターは、通常、mRNA合成を誘導するためにPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO15
73、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード核酸配列に作動可能に連結されたプロモーターを含む。種々の潜在的宿主細胞により認識されるプロモーターは、周知である。原核生物の宿主と共に使用するのに適したプロモーターとしては、β−ラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系[Chang et al.,Nature,275:615(1978);Goeddel et al.,Nature,281:544(1979)]、アルカリホスファターゼ、トリプトファン(trp)プロモーター系[Goeddel,Nucleic Acids Res.,8:4057(1980);EP36,776]およびハイブリッドプロモーター(例えば、tacプロモーター[deBoer et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,80:21−25(1983)])が挙げられる。細菌系における使用のためのプロモーターもまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAに作動可能に連結されたシャイン・ダルガノ(S.D.)配列を含む。
73、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード核酸配列に作動可能に連結されたプロモーターを含む。種々の潜在的宿主細胞により認識されるプロモーターは、周知である。原核生物の宿主と共に使用するのに適したプロモーターとしては、β−ラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系[Chang et al.,Nature,275:615(1978);Goeddel et al.,Nature,281:544(1979)]、アルカリホスファターゼ、トリプトファン(trp)プロモーター系[Goeddel,Nucleic Acids Res.,8:4057(1980);EP36,776]およびハイブリッドプロモーター(例えば、tacプロモーター[deBoer et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,80:21−25(1983)])が挙げられる。細菌系における使用のためのプロモーターもまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAに作動可能に連結されたシャイン・ダルガノ(S.D.)配列を含む。
酵母宿主と共に使用するのに適したプロモーター配列の例としては、3−ホスホグリセレートキナーゼ[Hitzeman et al.,J.Biol.Chem.,255:2073(1980)]または他の糖分解酵素[Hess et al.,J.Adv.Enzyme Reg.,7:149(1968);Holland,Biochemistry,17:4900(1978)](例えば、エノラーゼ、グリセルアルデヒド3リン酸脱水素酵素、ヘキソキナーゼ、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、ホスホフラクトキナーゼ、グルコース−6−リン酸イソメラーゼ、3−ホスホグリセリン酸ムターゼ、ピルビン酸キナーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、グルコースリン酸イソメラーゼおよびグルコキナーゼ)のためのプロモーターが挙げられる。
生育条件により制御される転写のさらなる利点を有する誘導プロモーターである他の酵母プロモーターは、アルコールデヒドロゲナーゼ2、イソチトクロームC、酸ホスファターゼ、窒素代謝に関連する分解性酵素、メタロチオネイン、グリセルアルデヒド3リン酸脱水素酵素およびマルトースおよびガラクトースの利用を担う酵素のためのプロモーター領域である。酵母発現において使用するために適したベクターおよびプロモーターは、E
P73,657においてさらに記載されている。
P73,657においてさらに記載されている。
哺乳動物宿主細胞中におけるベクターからのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の転写は、ウイルス(例えば、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス(1989年7月5日公開のUK2,211,504)、アデノウイルス(例えば、アデノウイルス2)、ウシ乳頭腫ウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルスおよびシミアンウイルス40(SV40))のゲノムから、異種の哺乳動物プロモーター(例えば、アクチンプロモーターまたは免疫グロブリンプロモーター)および熱ショックプロモーターから得られたプロモーターにより制御されるが、このようなプロモーターは、宿主細胞系と適合しなければならない。
高等真核生物によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAの転写は、ベクター中にエンハンサー配列を挿入することにより増大させ得る。エンハンサーは、通常、転写を増大させるプロモーターに対して作用する約10〜300bpのDNAのシス作用性エレメントである。哺乳動物遺伝子由来の多くのエンハンサー配列が現在知られている(グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテインおよびインスリン)。しかしながら代表的には、真核生物細胞ウイルス由来のエンハンサーを使用する。例としては、複製起点の後側上のSV40エンハンサー(bp100−270)、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後側上のポリオーマエンハンサーおよびアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。これらのエンハンサーは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、P
RO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード配列に対して5’または3’の位置においてベクターにスプライスされ得るが、好ましくは、プロモーターから5’側の部位に位置する。
RO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード配列に対して5’または3’の位置においてベクターにスプライスされ得るが、好ましくは、プロモーターから5’側の部位に位置する。
真核生物宿主細胞(酵母、真菌、昆虫、植物、動物、ヒトまたは他の多細胞生物体由来の有核細胞)中で使用される発現ベクターはまた、転写の終止のため、およびmRNAの安定化のために必要な配列を含む。そのような配列は、真核生物またはウイルスのDNAまたはcDNAの5’側、場合によっては3’側の非翻訳領域から一般に得られる。これらの領域は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするmRNAの非翻訳部分におけるポリアデニル化フラグメントとして転写されるヌクレオチドセグメントを含む。
組換え脊椎動物細胞培養物中のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20
110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの合成に適合させるために適したさらに他の方法、ベクターおよび宿主細胞は、Gething et al.,Nature,293:620−625(1981);Mantei et al.,Nature,281:40−46(1979);EP117,060;およびEP117,058に記載されている。
110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの合成に適合させるために適したさらに他の方法、ベクターおよび宿主細胞は、Gething et al.,Nature,293:620−625(1981);Mantei et al.,Nature,281:40−46(1979);EP117,060;およびEP117,058に記載されている。
4.遺伝子の増幅/発現の検出
遺伝子の増幅および/または発現は、例えば、mRNAの転写を定量するための従来のサザンブロッティング、ノーザンブロッティング[Thomas,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:5201−5205(1980)]、ドットブロッティング(DNA分析)またはin situハイブリダイゼーションにより、適切に標識されたプローブを用い、本明細書において提供される配列に基づいて、直接試料中で測定してよい。あるいは、DNA二重鎖、RNA二重鎖およびDNA−RNAハイブリッド二重鎖またはDNA−タンパク質二重鎖を含む特定の二重鎖を認識できる抗体を使用してよい。そしてその抗体が標識され得、表面上の二重鎖の形成により二重鎖に結合した抗体の存在が検出できるように二重鎖が表面に結合した状態でアッセイが実施され得る。
遺伝子の増幅および/または発現は、例えば、mRNAの転写を定量するための従来のサザンブロッティング、ノーザンブロッティング[Thomas,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,77:5201−5205(1980)]、ドットブロッティング(DNA分析)またはin situハイブリダイゼーションにより、適切に標識されたプローブを用い、本明細書において提供される配列に基づいて、直接試料中で測定してよい。あるいは、DNA二重鎖、RNA二重鎖およびDNA−RNAハイブリッド二重鎖またはDNA−タンパク質二重鎖を含む特定の二重鎖を認識できる抗体を使用してよい。そしてその抗体が標識され得、表面上の二重鎖の形成により二重鎖に結合した抗体の存在が検出できるように二重鎖が表面に結合した状態でアッセイが実施され得る。
あるいは、遺伝子発現が、細胞または組織の切片の免疫組織化学的染色などの免疫学的方法および細胞培養物または体液のアッセイにより測定されることにより、遺伝子産物の発現が直接定量され得る。免疫組織化学的染色および/またはサンプル液体のアッセイに有用な抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体のいずれかであり得、そして任意の哺乳動物において調製され得る。好都合には、これらの抗体は、ネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対して、または本明細書中で提供されるDNA配列に基づいた合成ペプチドに対して、またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646
、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250−DNAに融合され、そして特定の抗体エピトープをコードする外因性配列に対して調製され得る。
、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250−DNAに融合され、そして特定の抗体エピトープをコードする外因性配列に対して調製され得る。
5.ポリペプチドの精製
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形態は、培地または宿主細胞溶解物から回収され得る。膜結合の場合は、適当な界面活性溶液(例えば、Triton−X100)を用いるか、酵素的切断により、膜から遊離させることができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に使用される細胞を、様々な物理的または化学的な手段(例えば、凍結解凍の反復、超音波処理、機械的破壊または細胞溶解剤)により破壊することができる。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形態は、培地または宿主細胞溶解物から回収され得る。膜結合の場合は、適当な界面活性溶液(例えば、Triton−X100)を用いるか、酵素的切断により、膜から遊離させることができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの発現に使用される細胞を、様々な物理的または化学的な手段(例えば、凍結解凍の反復、超音波処理、機械的破壊または細胞溶解剤)により破壊することができる。
組換え細胞のタンパク質またはポリペプチドからPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6
001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを精製することが望ましい場合がある。以下の手順、すなわち、イオン交換カラムによる分画;エタノール沈降;逆相HPLC;シリカまたは陽イオン交換樹脂(例えば、DEAE)によるクロマトグラフィー;クロマトフォーカシング;SDS−PAGE;硫酸アンモニウム沈降法;例えば、SephadexG−75を用いたゲル濾過;IgGなどの夾雑物を除去するためのプロテインAセファロースカラム;およびPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのエピトープタグ化型を結合させるための金属キレートカラムが適当な精製の手順の例である。タンパク質精製の様々な方法を使用してよく、そのような方法は、当該分野で公知であり、例えば、Deutscher,Methods in Enzymology,182(1990);Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,Springer−Verlag,New York(1982)に記載されている。選択される精製工程は、例えば、使用される生成プロセスの性質および生成される特定のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに依存する。
E.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PR
O1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの使用
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列(またはその相補体)は、ハイブリダイゼーションプローブとしての使用を含む分子生物学の分野において、染色体および遺伝子マッピングにおいて、およびアンチセンスRNAおよびDNAの生成において、種々の用途を有している。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸はまた、本明細書に記載する組換え手法によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO186
4、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの調製に有用である。
001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを精製することが望ましい場合がある。以下の手順、すなわち、イオン交換カラムによる分画;エタノール沈降;逆相HPLC;シリカまたは陽イオン交換樹脂(例えば、DEAE)によるクロマトグラフィー;クロマトフォーカシング;SDS−PAGE;硫酸アンモニウム沈降法;例えば、SephadexG−75を用いたゲル濾過;IgGなどの夾雑物を除去するためのプロテインAセファロースカラム;およびPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのエピトープタグ化型を結合させるための金属キレートカラムが適当な精製の手順の例である。タンパク質精製の様々な方法を使用してよく、そのような方法は、当該分野で公知であり、例えば、Deutscher,Methods in Enzymology,182(1990);Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,Springer−Verlag,New York(1982)に記載されている。選択される精製工程は、例えば、使用される生成プロセスの性質および生成される特定のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに依存する。
E.PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PR
O1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの使用
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列(またはその相補体)は、ハイブリダイゼーションプローブとしての使用を含む分子生物学の分野において、染色体および遺伝子マッピングにおいて、およびアンチセンスRNAおよびDNAの生成において、種々の用途を有している。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸はまた、本明細書に記載する組換え手法によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO186
4、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの調製に有用である。
完全長ネイティブ配列のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子またはその部分は、完全長PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250cDNAを単離するためか、または本明細書に開示したネイティブPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、P
RO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250配列に対して所望の配列同一性を有するさらに他のcDNA(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然に存在する改変体または他の種に由来するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするもの)を単離するためのcDNAライブラリーのためのハイブリダイゼーションプローブとして使用され得る。必要に応じて、プローブの長さは、約20〜約50塩基である。ハイブリダイゼーションプローブは、完全長ネイティブヌクレオチド配列の少なくとも部分的に新規な領域から得られ、ここでそのような領域は、過度の実験をすることなく、またはネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO
20110、PRO23203またはPRO35250のプロモーター、エンハンサーエレメントおよびイントロンを含むゲノム配列から決定され得る。例示すれば、スクリーニング方法は、約40塩基の選択されたプローブを合成するために既知のDNA配列を用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子のコード領域を単離する工程を含む。ハイブリダイゼーションプローブは、32Pもしくは35Sなどの放射性核種を含む種々の標識、またはアビジン/ビオチンカップリング系を介してプローブに結合されたアルカリホスファターゼなどの酵素標識により標識され得る。本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の配列と相補的な配列を有する標識されたプローブを用いて、ヒトのcDNA、ゲノムDN
AまたはmRNAのライブラリーをスクリーニングすることにより、そのようなライブラリーのどのメンバーにプローブがハイブリダイズするか否かを判定することができる。ハイブリダイゼーションの手法は、後述する実施例においてさらに詳細に説明する。
RO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250配列に対して所望の配列同一性を有するさらに他のcDNA(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然に存在する改変体または他の種に由来するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするもの)を単離するためのcDNAライブラリーのためのハイブリダイゼーションプローブとして使用され得る。必要に応じて、プローブの長さは、約20〜約50塩基である。ハイブリダイゼーションプローブは、完全長ネイティブヌクレオチド配列の少なくとも部分的に新規な領域から得られ、ここでそのような領域は、過度の実験をすることなく、またはネイティブ配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO
20110、PRO23203またはPRO35250のプロモーター、エンハンサーエレメントおよびイントロンを含むゲノム配列から決定され得る。例示すれば、スクリーニング方法は、約40塩基の選択されたプローブを合成するために既知のDNA配列を用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子のコード領域を単離する工程を含む。ハイブリダイゼーションプローブは、32Pもしくは35Sなどの放射性核種を含む種々の標識、またはアビジン/ビオチンカップリング系を介してプローブに結合されたアルカリホスファターゼなどの酵素標識により標識され得る。本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の配列と相補的な配列を有する標識されたプローブを用いて、ヒトのcDNA、ゲノムDN
AまたはmRNAのライブラリーをスクリーニングすることにより、そのようなライブラリーのどのメンバーにプローブがハイブリダイズするか否かを判定することができる。ハイブリダイゼーションの手法は、後述する実施例においてさらに詳細に説明する。
本出願に開示する任意のEST配列を、本明細書中で開示する方法を用いてプローブとして同様に使用してよい。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、
PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸の他の有用なフラグメントとしては、標的のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250mRNA(センス)またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNA(アンチセンス)配列への結合が可能な一本鎖核酸配列(RNAまたはDNAのいずれか)を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドが挙げられる。本発明によればアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO147
5、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNAのコード領域のフラグメントを含む。そのようなフラグメントは、一般に、少なくとも約14ヌクレオチド、好ましくは、約14〜30ヌクレオチドを含む。所与のタンパク質をコードするcDNA配列に基づいてアンチセンスまたはセンスのオリゴヌクレオチドを誘導する能力は、例えば、Stein and Cohen(Cancer Res.48:2659,1988)およびvan der Krol et al.(BioTechniques
6:958,1988)に記載されている。
PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸の他の有用なフラグメントとしては、標的のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250mRNA(センス)またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNA(アンチセンス)配列への結合が可能な一本鎖核酸配列(RNAまたはDNAのいずれか)を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドが挙げられる。本発明によればアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO147
5、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250DNAのコード領域のフラグメントを含む。そのようなフラグメントは、一般に、少なくとも約14ヌクレオチド、好ましくは、約14〜30ヌクレオチドを含む。所与のタンパク質をコードするcDNA配列に基づいてアンチセンスまたはセンスのオリゴヌクレオチドを誘導する能力は、例えば、Stein and Cohen(Cancer Res.48:2659,1988)およびvan der Krol et al.(BioTechniques
6:958,1988)に記載されている。
標的核酸配列へのアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドの結合により、増強された二重鎖分解、転写または翻訳の早期の終了を含むいくつかの手段の1つによるか、または他の手段による、標的配列の転写または翻訳を阻止する二重鎖の形成がもたらされる。したがって、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現を阻止するために使用され得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドはさらに、改変された糖ホスホジエステル骨格(または他の糖連結部、例えば、WO91/06629に記載のもの)を有するオリゴヌクレオチドを含み、ここで、そのような糖連結部は、内因性ヌクレアーゼに対して抵抗性である。抵抗性の糖連結部を有するそのようなオリゴヌクレオチドは、in vivoで安定である(すなわち酵素による分解に抵抗することができる)が、標的ヌクレオチド配列に結合することができる配列特異性は、保持している。
センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドの他の例としては、WO90/10048に記載されているような有機部分、およびポリ−(L−リシン)などの標的核酸配列に対するオリゴヌクレオチドの親和性を増大させる他の部分に共有結合したオリゴヌクレオチドが挙げられる。エリプチシンなどのさらに別のインターカレート剤およびアルキル化剤または金属錯体をセンスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合させることにより標的核酸配列に対するアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドの結合特異性を改変し得る。
アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、任意の遺伝子導入法(例えば、CaPO4媒介DNAトランスフェクション、エレクトロポレーションを含む)によってか、またはエプスタイン・バーウイルスなどの遺伝子導入ベクターを使用することにより、標的核酸配列を含む細胞内に導入され得る。好ましい操作法においては、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはセンスオリゴヌクレオチドは、適当なレトロウイルスベクターに挿入される。標的核酸配列を含む細胞を組換えレトロウイルスベクターにin vivoまたはex vivoのいずれかで接触させる。適当なレトロウイルスベクターとしては、マウスレトロウイルスM−MuLV、N2(M−MuLV由来のレトロウイルス)から得られたもの、またはDCT5A、DCT5BおよびDCT5Cと表記されるダブルコピーベクター(WO90/13641を参照のこと)が挙げられるがこれらに限定されない。
センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、WO91/04753に記載されるようにリガンド結合分子との結合体の形成により標的ヌクレオチド配列を含む細胞内に導入され得る。適当なリガンド結合分子としては、細胞表面レセプター、成長因子、他のサイトカインまたは細胞表面レセプターに結合する他のリガンドが挙げられるがこれらに限定されない。好ましくは、リガンド結合分子の結合体化は、リガンド結合分子がその対応する分子またはレセプターに結合する能力を実質的に妨害したり、センスオリゴヌクレオチドもしくはアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはそのコンジュゲート型の細胞内への進入を阻止したりすることはない。
あるいは、センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドは、WO90/10448に記載されるようにオリゴヌクレオチド−脂質複合体の形成により標的核酸配列を含む細胞内に導入され得る。センスオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスオリゴヌクレオチド−脂質複合体は、好ましくは、内在性リパーゼにより細胞内で解離される。
アンチセンスまたはセンスのRNAまたはDNA分子は、一般に、少なくとも約5塩基長、約10塩基長、約15塩基長、約20塩基長、約25塩基長、約30塩基長、約35塩基長、約40塩基長、約45塩基長、約50塩基長、約55塩基長、約60塩基長、約65塩基長、約70塩基長、約75塩基長、約80塩基長、約85塩基長、約90塩基長、約95塩基長、約100塩基長またはそれより長い。
プローブはまた、緊密に関連するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード配列の同定のための配列のプールを作製するためのPCR法において使用され得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子をマッピングするため、および遺伝的障害を有する個体の遺伝的分析のためのハイブリダイゼーションプローブを構築するために使用できる。本明細書において提供されるヌクレオチド配列は、既知の手法(例えば、in situハイブリダイゼーション、既知染色体マーカーに対する連鎖分析およびライブラリーを用いたハイブリダイゼーションスクリーニング)を用いて染色体および染色体の特定の領域にマッピングされ得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203また
はPRO35250に関するコード配列が、別のタンパク質に結合するタンパク質をコードする場合(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250がレセプターである場合)は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、結合の相互作用に関与する他のタンパク質または分子を同定するためのアッセイにおいて使用できる。そのような方法により、レセプター/リガンド結合相互作用のインヒビターを同定できる。そのような結合相互作用に関与するタンパク質はまた、結合相互作用のペプチドまたは小分子のインヒビターまたはアゴニストについてのスクリーニングにおいて使用できる。また、レセプターPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250は、相関するリガンドを単離するために使用できる。スクリーニングアッセイは、ネイティブのPRO6912
2、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するレセプターの生物学的活性を模倣する鉛化合物を発見するように設計され得る。そのようなスクリーニングアッセイは、化学物質ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適したアッセイを含み、小分子薬剤候補の同定に特に適するものとなっている。企図される小分子は、合成の有機または無機の化合物を含む。アッセイは、タンパク質−タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、イムノアッセイおよび細胞ベースアッセイを含む種々の形式で実施でき、これらは、当該分野で十分に特徴付けられている。
はPRO35250に関するコード配列が、別のタンパク質に結合するタンパク質をコードする場合(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250がレセプターである場合)は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、結合の相互作用に関与する他のタンパク質または分子を同定するためのアッセイにおいて使用できる。そのような方法により、レセプター/リガンド結合相互作用のインヒビターを同定できる。そのような結合相互作用に関与するタンパク質はまた、結合相互作用のペプチドまたは小分子のインヒビターまたはアゴニストについてのスクリーニングにおいて使用できる。また、レセプターPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250は、相関するリガンドを単離するために使用できる。スクリーニングアッセイは、ネイティブのPRO6912
2、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するレセプターの生物学的活性を模倣する鉛化合物を発見するように設計され得る。そのようなスクリーニングアッセイは、化学物質ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適したアッセイを含み、小分子薬剤候補の同定に特に適するものとなっている。企図される小分子は、合成の有機または無機の化合物を含む。アッセイは、タンパク質−タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、イムノアッセイおよび細胞ベースアッセイを含む種々の形式で実施でき、これらは、当該分野で十分に特徴付けられている。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203また
はPRO35250ポリペプチドをコードする核酸またはその改変された形態はまた、治療上有用な試薬の開発およびスクリーニングにおいて有用となるトランスジェニック動物または「ノックアウト」動物のいずれかを作製するためにも使用できる。トランスジェニック動物(例えば、マウスまたはラット)は、トランスジーンを含む細胞を有する動物であり、そのトランスジーンは、出生前、例えば、胚の段階において動物または動物の先祖に導入されている。トランスジーンは、トランスジェニック動物を発生する細胞のゲノム内に組み込まれるDNAである。本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAを発現する細胞を含むトランスジェニック動物を作製するために使用される確立された手法およびゲノム配列にしたがって、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO
19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするcDNAを提供する。当該分野で公知の任意の手法を用いて、標的遺伝子トランスジーンを動物に導入することにより、トランスジェニック動物の創始者が作製され得る。そのような手法としては、前核マイクロインジェクション(米国特許第4,873,191号、同第4,736,866号および同第4,870,009号);生殖細胞系へのレトロウイルス媒介遺伝子導入(Van der Putten,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,82:6148−6152(1985));胚性幹細胞における遺伝子ターゲティング(Thompson,et al.,Cell,56:313−321(1989));遺伝子トラップベクターを用いた非特異的挿入不活性化(米国特許第6,436,707号);胚のエレクトロポレーション(Lo,Mol.Cell.Biol.,3:1803−1814(1983));および精子媒介遺伝子導入(Lavitrano,et al.,Cell,57:717−723(1989);などが挙げられるがこれらに限定されない。代表的には、特定の細胞は、組織特異的エンハンサーを用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250トランスジーン組み込みのためにターゲティングされる。胚の段階において動物の生殖細胞系に導入されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするトランスジーンのコピーを含むトランスジェニック動物は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PR
O1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAの増大した発現の作用を調べるために使用できる。そのような動物は、例えば、過剰発現に関連する病的状態からの保護を付与すると考えられる試薬に対する供試動物として使用できる。本発明のこの側面によれば、その試薬で動物を処置し、そして病的状態の発生率がトランスジーンを有する非処置の動物と比較して低減していれば、病的状態に対する潜在的治療的介入があったことを示す。あるいは、PR
O69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの非ヒトホモログを用いて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250「ノックアウト」動物を構築することができ、そのノックアウト動物は、PRO69122、PRO20
4、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする内在性遺伝子と、動物の胚性幹細胞内に導入されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする改変ゲノムDNAとの間の相同組換えの結果として、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250タンパク質をコードする欠損遺伝子または変更遺伝子を有する。好ましくは、前記ノックアウト動物は、哺乳動物である。より好ましくは、前記哺乳動物は、げっ歯類(例えば、ラットまたはマウス)である。例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、P
RO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするcDNAは、確立された手法にしたがって、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするゲノムDNAの一部分は、欠失させ得るか、または別の遺伝子(例えば、組み込みをモニタリングするために使用できる選択可能なマーカーをコードする遺伝子)と置き換えられ得る。代表的には、非改変フランキングDNA(5’および3’末端の両方)の数キロ塩基をベクター内に含める[相同組換えベクターの説明については、例えば、Thomas and Capecchi,Cell,51:503(1987)を参照のこと]。そのベクターは、胚性幹細胞系統内に導入し(例えば、エレクトロポレーションによって)、そして導入されたDNAが内在性DNAと相同組換えを起こしている細胞を選択す
る[例えば、Li et al.,Cell,69:915(1992)を参照のこと]。次に選択された細胞を動物(例えば、マウスまたはラット)の胚盤胞内に注入し、凝集キメラを形成する[例えば、Bradley,Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells:A Practical Approach,E.J.Robertson,ed.(IRL,Oxford,1987)pp.113−152参照]。次にキメラ胚を適当な擬似妊娠の雌里親動物内に移植し、胚を妊娠期間満了させることにより、「ノックアウト」動物を作製することができる。相同組換えされたDNAをその生殖細胞に保有する子孫を標準的な手法で同定し、その動物の全細胞が相同組換えDNAを含む動物を育てるために使用することができる。ノックアウト動物は、例えば、特定の病的状態に対するそのノックアウト動物の防御能力に関して、そして、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が存在しないことに起因する病的状態の発症に関して特徴付けることができる。
はPRO35250ポリペプチドをコードする核酸またはその改変された形態はまた、治療上有用な試薬の開発およびスクリーニングにおいて有用となるトランスジェニック動物または「ノックアウト」動物のいずれかを作製するためにも使用できる。トランスジェニック動物(例えば、マウスまたはラット)は、トランスジーンを含む細胞を有する動物であり、そのトランスジーンは、出生前、例えば、胚の段階において動物または動物の先祖に導入されている。トランスジーンは、トランスジェニック動物を発生する細胞のゲノム内に組み込まれるDNAである。本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAを発現する細胞を含むトランスジェニック動物を作製するために使用される確立された手法およびゲノム配列にしたがって、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO
19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするcDNAを提供する。当該分野で公知の任意の手法を用いて、標的遺伝子トランスジーンを動物に導入することにより、トランスジェニック動物の創始者が作製され得る。そのような手法としては、前核マイクロインジェクション(米国特許第4,873,191号、同第4,736,866号および同第4,870,009号);生殖細胞系へのレトロウイルス媒介遺伝子導入(Van der Putten,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,82:6148−6152(1985));胚性幹細胞における遺伝子ターゲティング(Thompson,et al.,Cell,56:313−321(1989));遺伝子トラップベクターを用いた非特異的挿入不活性化(米国特許第6,436,707号);胚のエレクトロポレーション(Lo,Mol.Cell.Biol.,3:1803−1814(1983));および精子媒介遺伝子導入(Lavitrano,et al.,Cell,57:717−723(1989);などが挙げられるがこれらに限定されない。代表的には、特定の細胞は、組織特異的エンハンサーを用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250トランスジーン組み込みのためにターゲティングされる。胚の段階において動物の生殖細胞系に導入されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするトランスジーンのコピーを含むトランスジェニック動物は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PR
O1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAの増大した発現の作用を調べるために使用できる。そのような動物は、例えば、過剰発現に関連する病的状態からの保護を付与すると考えられる試薬に対する供試動物として使用できる。本発明のこの側面によれば、その試薬で動物を処置し、そして病的状態の発生率がトランスジーンを有する非処置の動物と比較して低減していれば、病的状態に対する潜在的治療的介入があったことを示す。あるいは、PR
O69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの非ヒトホモログを用いて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250「ノックアウト」動物を構築することができ、そのノックアウト動物は、PRO69122、PRO20
4、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする内在性遺伝子と、動物の胚性幹細胞内に導入されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする改変ゲノムDNAとの間の相同組換えの結果として、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250タンパク質をコードする欠損遺伝子または変更遺伝子を有する。好ましくは、前記ノックアウト動物は、哺乳動物である。より好ましくは、前記哺乳動物は、げっ歯類(例えば、ラットまたはマウス)である。例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、P
RO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするcDNAは、確立された手法にしたがって、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするゲノムDNAをクローニングするために使用できる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするゲノムDNAの一部分は、欠失させ得るか、または別の遺伝子(例えば、組み込みをモニタリングするために使用できる選択可能なマーカーをコードする遺伝子)と置き換えられ得る。代表的には、非改変フランキングDNA(5’および3’末端の両方)の数キロ塩基をベクター内に含める[相同組換えベクターの説明については、例えば、Thomas and Capecchi,Cell,51:503(1987)を参照のこと]。そのベクターは、胚性幹細胞系統内に導入し(例えば、エレクトロポレーションによって)、そして導入されたDNAが内在性DNAと相同組換えを起こしている細胞を選択す
る[例えば、Li et al.,Cell,69:915(1992)を参照のこと]。次に選択された細胞を動物(例えば、マウスまたはラット)の胚盤胞内に注入し、凝集キメラを形成する[例えば、Bradley,Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells:A Practical Approach,E.J.Robertson,ed.(IRL,Oxford,1987)pp.113−152参照]。次にキメラ胚を適当な擬似妊娠の雌里親動物内に移植し、胚を妊娠期間満了させることにより、「ノックアウト」動物を作製することができる。相同組換えされたDNAをその生殖細胞に保有する子孫を標準的な手法で同定し、その動物の全細胞が相同組換えDNAを含む動物を育てるために使用することができる。ノックアウト動物は、例えば、特定の病的状態に対するそのノックアウト動物の防御能力に関して、そして、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が存在しないことに起因する病的状態の発症に関して特徴付けることができる。
さらに、ノックアウトマウスは、遺伝子の機能および薬剤標的に関する薬学的有用性の発見において、ならびに所与の標的に関連する潜在的な標的上の副作用の測定において、高度な情報源であり得る。遺伝子の機能および生理学的特徴は、マウスとヒトとの間で十分保存されているが、その理由は、それらが共に哺乳動物であり、同様の数の遺伝子を含んでおり、それらの遺伝子が種間で高度に保存されているためである。例えば、マウス16番染色体上の遺伝子の98%がヒトオルソログを有することが最近十分に裏付けられた(Mural et al.,Science 296:1661−71(2002))。
胚性幹(ES)細胞における遺伝子ターゲティングは、ヒト疾患に関連する多くの遺伝子における無発現変異を有するマウスの構築を可能にしているが、必ずしも遺伝子疾患のすべてが無発現変異に起因するわけではない。マウスの遺伝子座を破壊し、変異を有するヒト対応物を導入する遺伝子の置き換え(ノックイン)のための方法を確立することによってヒト疾患の価値あるマウスモデルを設計できる。その後、ヒトタンパク質をターゲティングするin vivoの薬剤アッセイを実施できる(Kitamoto et al.,Biochemical and Biophysical Res.Commun.,222:742−47(1996))。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PR
O265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする核酸はまた、遺伝子療法において使用され得る。遺伝子療法の用途においては、例えば、欠損遺伝子の置き換えのための治療上有効な遺伝子産物のin vivo合成を達成するために細胞内に遺伝子を導入する。「遺伝子療法」とは、単回処置により持続した作用が達成される従来の遺伝子療法および治療上有効なDNAまたはmRNAの単回投与または反復投与を行う遺伝子治療薬の投与の両方を含む。アンチセンスのRNAおよびDNAは、in vivoで特定の遺伝子の発現を阻止するための治療薬として使用され得る。短いアンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞内に移入され、そこで細胞膜による限定された取り込みにより生じるその低い細胞内濃度にも関わらずインヒビターとして作用することができることが既に明らかになっている(Zamecnik et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:4143−4146[1986])。そのオリゴヌクレオチドは、例えば、その負に帯電したホスホジエステル基を非電荷の基で置換することにより、その取り込みが増強されるように改変できる。
O265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする核酸はまた、遺伝子療法において使用され得る。遺伝子療法の用途においては、例えば、欠損遺伝子の置き換えのための治療上有効な遺伝子産物のin vivo合成を達成するために細胞内に遺伝子を導入する。「遺伝子療法」とは、単回処置により持続した作用が達成される従来の遺伝子療法および治療上有効なDNAまたはmRNAの単回投与または反復投与を行う遺伝子治療薬の投与の両方を含む。アンチセンスのRNAおよびDNAは、in vivoで特定の遺伝子の発現を阻止するための治療薬として使用され得る。短いアンチセンスオリゴヌクレオチドは、細胞内に移入され、そこで細胞膜による限定された取り込みにより生じるその低い細胞内濃度にも関わらずインヒビターとして作用することができることが既に明らかになっている(Zamecnik et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:4143−4146[1986])。そのオリゴヌクレオチドは、例えば、その負に帯電したホスホジエステル基を非電荷の基で置換することにより、その取り込みが増強されるように改変できる。
生存細胞に核酸を導入するために使用できる種々の手法が存在する。その手法は、in
vitroで核酸を培養細胞中に、または意図する宿主の細胞内にin vivoで移入させるか応じて変動する。in vitroの哺乳動物細胞への核酸の移入に適する手法としては、リポソームの使用、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、細胞融合、DEAEデキストラン、リン酸カルシウム沈降法などが挙げられる。現時点で好ましいin vivoの遺伝子導入の手法としては、ウイルス(代表的には、レトロウイルス)ベクターによるトランスフェクションおよびウイルスコートタンパク質−リポソーム媒介トランスフェクションが挙げられる(Dzau et al.,Trends in Biotechnology 11,205−210[1993])。一部の状況においては、核酸起源に対し、標的細胞をターゲティングする薬剤(例えば、細胞表面膜タンパク質または標的細胞に対して特異的な抗体、標的細胞上のレセプターに対するリガンドなど)を提供することが望ましい。リポソームを使用する場合は、エンドサイトーシスに関連する細胞表面膜タンパク質に結合するタンパク質をターゲティングのためおよび/または取り込みを促進するために使用され得、そのようなものとしては、例えば、特定の細胞型に対して向性のキャプシドタンパク質またはそのフラグメント、サイクリングにおいて内在化を起こすタンパク質に対する抗体、細胞内局在化をターゲティングして細胞内半減期を増大させるタンパク質が挙げられる。レセプター媒介エンドサイトーシスの手法は、例えば、Wu et al.,J.Biol.Chem.262,4429−4432(1987);およびWagner et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87,3410−3414(1990)に記載されている。遺伝子の作製および遺伝子療法のプロトコルについての概説は、Anderson et al.,Science 256,808−813(1992)を参照のこと。
vitroで核酸を培養細胞中に、または意図する宿主の細胞内にin vivoで移入させるか応じて変動する。in vitroの哺乳動物細胞への核酸の移入に適する手法としては、リポソームの使用、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、細胞融合、DEAEデキストラン、リン酸カルシウム沈降法などが挙げられる。現時点で好ましいin vivoの遺伝子導入の手法としては、ウイルス(代表的には、レトロウイルス)ベクターによるトランスフェクションおよびウイルスコートタンパク質−リポソーム媒介トランスフェクションが挙げられる(Dzau et al.,Trends in Biotechnology 11,205−210[1993])。一部の状況においては、核酸起源に対し、標的細胞をターゲティングする薬剤(例えば、細胞表面膜タンパク質または標的細胞に対して特異的な抗体、標的細胞上のレセプターに対するリガンドなど)を提供することが望ましい。リポソームを使用する場合は、エンドサイトーシスに関連する細胞表面膜タンパク質に結合するタンパク質をターゲティングのためおよび/または取り込みを促進するために使用され得、そのようなものとしては、例えば、特定の細胞型に対して向性のキャプシドタンパク質またはそのフラグメント、サイクリングにおいて内在化を起こすタンパク質に対する抗体、細胞内局在化をターゲティングして細胞内半減期を増大させるタンパク質が挙げられる。レセプター媒介エンドサイトーシスの手法は、例えば、Wu et al.,J.Biol.Chem.262,4429−4432(1987);およびWagner et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87,3410−3414(1990)に記載されている。遺伝子の作製および遺伝子療法のプロトコルについての概説は、Anderson et al.,Science 256,808−813(1992)を参照のこと。
本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドはまた、タンパク質電気泳動要の分子量マーカーとして使用され得、そして、単離された核酸配列は、これらのマーカーを組換え発現するために使用され得る。
本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはそのフラグメントをコードする核酸分子は、染色体の同定のために有用である。この点に関し、実際の配列データに基づいた染色体マーカー試薬で現在使用できるものは、比較的少ないため、新しい染色体マーカーを同定する必要性がなお存在している。本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸分子の各々
は、染色体マーカーとして使用できる。
は、染色体マーカーとして使用できる。
本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドおよび核酸分子は、また、本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが別のものと比較したときのある組織、好ましくは、同じ組織型の正常組織と比較したときの疾患組織において、差次的に発現され得る場合に、組織タイピングのために診断的に使用され得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250核酸分子は、PCR、ノーザン分析、サザン分析およびウエスタン分析のためのプローブの生成のために使用される。
本明細書に記載したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドはまた、治療薬として使用され得る。本発明のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、薬学的に有用な組成物を調製するための公知の方法に従って処方され得、これによりそのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250生成物は、薬学的に許容可能な担体ビヒクルとの混合物中に組み合わせられる。治療用処方物は、凍結乾燥処方物または水溶液の形態で、任意の生理学的に許容可能な担体、賦形剤または安定化剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))と、所望の純度を有する活性成分とを混合することにより保存用に調製される。許容可能な担体、賦形剤または安定化剤は、
使用される用量および濃度においてレシピエントにとって非毒性であり、そしてそれらとしては、緩衝物質(例えば、リン酸塩、クエン酸塩および他の有機酸);抗酸化剤(アスコルビン酸を含む);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン);親水性ポリマー(例えば、ポリビニルピロリドン、アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンまたはリシン));単糖類、二糖類および他の炭水化物(グルコース、マンノースまたはデキストロースを含む);キレート剤(例えば、EDTA);糖アルコール(例えば、マンニトールまたはソルビトール);塩形成対イオン(例えば、ナトリウム);および/または非イオン性界面活性剤(例えば、TWEENTM、PLURONICSTMまたはPEG)が挙げられる。
使用される用量および濃度においてレシピエントにとって非毒性であり、そしてそれらとしては、緩衝物質(例えば、リン酸塩、クエン酸塩および他の有機酸);抗酸化剤(アスコルビン酸を含む);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン);親水性ポリマー(例えば、ポリビニルピロリドン、アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニンまたはリシン));単糖類、二糖類および他の炭水化物(グルコース、マンノースまたはデキストロースを含む);キレート剤(例えば、EDTA);糖アルコール(例えば、マンニトールまたはソルビトール);塩形成対イオン(例えば、ナトリウム);および/または非イオン性界面活性剤(例えば、TWEENTM、PLURONICSTMまたはPEG)が挙げられる。
in vivo投与のために使用される処方物は、滅菌されていなければならない。これは、凍結乾燥および再構成の前後に滅菌濾過膜に通して濾過することにより容易に達成される。
本明細書中の治療用組成物は、一般に、滅菌された取出し口を有する容器、例えば、皮下注射用の針で穿刺可能である蓋を有する静脈用溶液バッグまたはバイアル内に入っている。
投与経路は、公知の方法によるものであり、例えば、静脈内、腹腔内、脳内、筋肉内、眼内、動脈内または病巣内の経路により注射または注入を行うか、局所投与を行うか、または徐放系による。
本発明の薬学的組成物の用量および所望の薬剤濃度は、意図される特定の用途に応じて変動し得る。適切な用量または投与経路の決定は、十分に当業者の範囲内である。動物実験は、ヒトの治療有効量の決定のための信頼できる指針を与える。有効用量の種間のスケーリングは、Mordenti,J.and Chappell,W.“The use
of interspecies scaling in toxicokinetics”,Toxicokinetics and New Drug Development,Yacobi et al.,Eds.,Pergamon Press,New York 1989,pp.42−96に記載されている原則に従って実施できる。
of interspecies scaling in toxicokinetics”,Toxicokinetics and New Drug Development,Yacobi et al.,Eds.,Pergamon Press,New York 1989,pp.42−96に記載されている原則に従って実施できる。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドあるいはそのアゴニストまたはアンタゴニストのin vivo投与を用いる場合は、通常の用量は、投与経路に応じて1日当たり約10ng/kg〜100mg/kg哺乳動物体重またはそれ以上、好ましくは、約1μg/kg/日〜10mg/kg/日の範囲であり得る。特定の用量および送達方法に関する指針は、文
献に記載されており;例えば、米国特許第4,657,760号;同第5,206,344号;または同第5,225,212号を参照のこと。異なる処置用化合物および異なる障害に対しては、異なる製剤が有効であることが予想され、ある器官または組織をターゲティングする投与は、例えば、別の器官または組織の場合とは異なる様式の送達を必要とする場合がある。
献に記載されており;例えば、米国特許第4,657,760号;同第5,206,344号;または同第5,225,212号を参照のこと。異なる処置用化合物および異なる障害に対しては、異なる製剤が有効であることが予想され、ある器官または組織をターゲティングする投与は、例えば、別の器官または組織の場合とは異なる様式の送達を必要とする場合がある。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの投与を必要とする任意の疾患または障害の処置に適した放出特性を有する処方物においてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの徐放投与が望まれる場合は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO2320
3またはPRO35250ポリペプチドのマイクロカプセル化が企図される。徐放性放出のための組換えタンパク質のマイクロカプセル化は、ヒト成長ホルモン(rhGH)、インターフェロン(rhIFN)、インターロイキン−2およびMN rgp120を用いて良好に行われている。Johnson et al.,Nat.Med.,2:795−799(1996);Yasuda,Biomed.Ther.,27:1221−1223(1993);Hora et al.,Bio/Technology,8:755−758(1990);Cleland,“Design and Production of Single Immunization Vaccines Using Polylactide Polyglycolide Microsphere Systems”,Vaccine Design:The Subunit and Adjuvant Approach,Powell and Newman,eds,(Plenum Press:New York,1995),pp.439−462;WO97/03692,WO96/40072,WO96/07399;および米国特許第5,654,010号。
3またはPRO35250ポリペプチドのマイクロカプセル化が企図される。徐放性放出のための組換えタンパク質のマイクロカプセル化は、ヒト成長ホルモン(rhGH)、インターフェロン(rhIFN)、インターロイキン−2およびMN rgp120を用いて良好に行われている。Johnson et al.,Nat.Med.,2:795−799(1996);Yasuda,Biomed.Ther.,27:1221−1223(1993);Hora et al.,Bio/Technology,8:755−758(1990);Cleland,“Design and Production of Single Immunization Vaccines Using Polylactide Polyglycolide Microsphere Systems”,Vaccine Design:The Subunit and Adjuvant Approach,Powell and Newman,eds,(Plenum Press:New York,1995),pp.439−462;WO97/03692,WO96/40072,WO96/07399;および米国特許第5,654,010号。
これらのタンパク質の徐放性処方物は、生体適合性および広範な生体分解性を有することからポリ乳酸グリコール酸(PLGA)共重合体を用いて開発された。PLGAの分解生成物である乳酸およびグリコール酸は、ヒト身体内で迅速に除去される。さらに、このポリマーの分解性は、その分子量および組成に応じて数ヶ月〜数年に調節できる。Lewis,“Controlled release of bioactive agents from lactide/glycolide polymer”,M.Chasin and R.Langer(Eds.),Biodegradable Polymers as Drug Delivery Systems(Marcel Dekker:New York,1990),pp.1−41。
本発明は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを模倣する化合物(アゴニスト)またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO58
01、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの作用を妨害する化合物(アンタゴニスト)を同定するための化合物のスクリーニング方法を包含する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを模倣するアゴニストは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物による知見に基づいて、負の表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20
110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの作用を妨害するアンタゴニストは、非ヒトトランスジェニックノックアウト動物による観察結果に基づいて正の表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。アンタゴニスト薬剤候補についてのスクリーニングアッセイは、本明細書において同定される遺伝子によりコードされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと結合もしくは複合体形成する化合物あるいはコードされたポリペプチドと他の細胞タンパク質との相互作用を他の方法で妨害する化合物を同定するために設計される。そのようなスクリーニングアッセイは、化学物質ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適したアッセイを含み、それは、小分子薬剤候補の同定に特に適したものとなっている。
01、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの作用を妨害する化合物(アンタゴニスト)を同定するための化合物のスクリーニング方法を包含する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを模倣するアゴニストは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が破壊されたゲノムを有する非ヒトトランスジェニック動物による知見に基づいて、負の表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20
110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの作用を妨害するアンタゴニストは、非ヒトトランスジェニックノックアウト動物による観察結果に基づいて正の表現型が観察される場合に特に治療上価値あるものとなる。アンタゴニスト薬剤候補についてのスクリーニングアッセイは、本明細書において同定される遺伝子によりコードされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと結合もしくは複合体形成する化合物あるいはコードされたポリペプチドと他の細胞タンパク質との相互作用を他の方法で妨害する化合物を同定するために設計される。そのようなスクリーニングアッセイは、化学物質ライブラリーのハイスループットスクリーニングに適したアッセイを含み、それは、小分子薬剤候補の同定に特に適したものとなっている。
そのアッセイは、例えば、タンパク質−タンパク質結合アッセイ、生化学的スクリーニングアッセイ、イムノアッセイおよび細胞ベースのアッセイを含む種々の形式において実施でき、これらは、当該分野で十分に特徴付けられている。
アンタゴニストに関するすべてのアッセイは、それらのアッセイが、薬剤候補と、本明細書中で同定した核酸によりコードされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとを、これら2成分が相互作用できるのに十分な条件下および十分な時間に亘り、接触させることを要する点において、共通である。
結合アッセイにおいては、相互作用は、結合であり、そして形成される複合体は、単離され得るか、または反応混合物中で検出され得る。本明細書中で同定される遺伝子によりコードされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO2
34、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは薬剤候補を固相上、例えば、マイクロタイタープレート上に、共有結合または非共有結合により固定化する。非共有結合は、一般に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの溶液で固体表面をコーティングし、そして乾燥することにより達成される。あるいは、固定化されるべきPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに特異的な固定化抗体、例えば、モノクローナル抗体を用いて固体表面にそのポリペプチドを固定することができる。このアッセイは、検出可能な標識で標識されていてよい固定化されていない成分を固定化された成分、例えば、固定された成分を有するコーティングされた表面に添加することにより行う。反応終了後、非反応成分を、例えば洗浄により除去し、そして固体表面に固定された複合体を検出する。元々、固定されていない成分が検出
可能な標識を有する場合は、表面に固定化された標識の検出は、複合体形成が起こったことを示す。元々、固定されていない成分が標識を有していない場合は、複合体形成は、例えば、固定化された複合体に特異的に結合する標識された抗体を使用することにより検出できる。
34、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは薬剤候補を固相上、例えば、マイクロタイタープレート上に、共有結合または非共有結合により固定化する。非共有結合は、一般に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの溶液で固体表面をコーティングし、そして乾燥することにより達成される。あるいは、固定化されるべきPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに特異的な固定化抗体、例えば、モノクローナル抗体を用いて固体表面にそのポリペプチドを固定することができる。このアッセイは、検出可能な標識で標識されていてよい固定化されていない成分を固定化された成分、例えば、固定された成分を有するコーティングされた表面に添加することにより行う。反応終了後、非反応成分を、例えば洗浄により除去し、そして固体表面に固定された複合体を検出する。元々、固定されていない成分が検出
可能な標識を有する場合は、表面に固定化された標識の検出は、複合体形成が起こったことを示す。元々、固定されていない成分が標識を有していない場合は、複合体形成は、例えば、固定化された複合体に特異的に結合する標識された抗体を使用することにより検出できる。
候補化合物が、本明細書中で同定される遺伝子によりコードされる特定のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと相互作用するが結合しない場合、そのポリペプチドとの相互作用は、タンパク質−タンパク質相互作用を検出するための周知の方法によりアッセイすることができる。そのようなアッセイとしては、従来の方法(例えば、架橋結合、同時免疫沈降および勾配またはクロマトグラフィーカラムを介した同時精製)が挙げられる。さらに、タンパク質−タンパク質相互作用は、Chevray and Nathans,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:5789−5793(1991)により開示されているように、Fieldsおよび共同研究者らにより報告された酵母ベースの遺伝子系(Fields and Song,Nature(London),340:245−246(1989);Chien et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:9578−9582(1991))を用いてモニタリングできる。多くの転写活性化物質(例えば、酵母GAL4)は、2つの物理的に個別のモジュラードメイン、一方は、DNA結合ドメインとして作用するもの、他方は、転写活性化ドメインとして機能するものからなる。上記文献に記載された酵母発現系(一般に「ツーハイブリッド系」と呼ばれる)は、この性質を利用しており、そして、2つのハイブリッドタンパク質を使用し、一方においては、標的タンパク質がGAL4のDNA結合ドメインに融合しており、他方においては、候補の活性化タンパク質が活性化ドメインに融合している。GAL4活性化プロモーターの制御下のGAL1−lacZレポーター遺伝子の発現は、タンパク質−タンパク質相互作用を介したGAL4活性の再構成に依存している。相互作用ポリペプチドを含むコロニーは、β−ガラクトシダーゼに対する発色基質を用いて検出される。ツーハイブリッド手法を用いて2つの特定のタンパク質の間のタンパク質−タンパク質相互作用を同定するための完全なキット(MATCHMAKERTM)は、Clontechから市販されている。この系はまた、特定のタンパク質相互作用に関与するタンパク質ドメインをマッピングするため、ならびにこれらの相互作用に必須であるアミノ酸残基を限定するためにも応用できる。
本明細書中で同定されるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、
PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子と他の細胞内または細胞外の成分との相互作用を妨害する化合物のアッセイは、以下の通り行うことができる:通常、遺伝子産物および細胞内または細部外の成分を含む反応混合物を、2つの生成物の相互作用および結合を可能にする条件下および時間に渡り調製する。候補化合物が結合を抑制する能力を試験するために、反応を試験化合物の非存在下および存在下において実施する。さらに、プラセボを第3の反応混合物に添加し、ポジティブコントロールとして使用し得る。試験化合物と混合物中に存在する細胞内または細胞外の成分との間の結合(複合体形成)は、上記した通りモニタリングされる。コントロール反応においては、複合体が形成されるが試験化合物を含む反応混合物では、形成しないことは、被験化合物が被験化合物とその反応相手との相互作用を妨害することを示す。
PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子と他の細胞内または細胞外の成分との相互作用を妨害する化合物のアッセイは、以下の通り行うことができる:通常、遺伝子産物および細胞内または細部外の成分を含む反応混合物を、2つの生成物の相互作用および結合を可能にする条件下および時間に渡り調製する。候補化合物が結合を抑制する能力を試験するために、反応を試験化合物の非存在下および存在下において実施する。さらに、プラセボを第3の反応混合物に添加し、ポジティブコントロールとして使用し得る。試験化合物と混合物中に存在する細胞内または細胞外の成分との間の結合(複合体形成)は、上記した通りモニタリングされる。コントロール反応においては、複合体が形成されるが試験化合物を含む反応混合物では、形成しないことは、被験化合物が被験化合物とその反応相手との相互作用を妨害することを示す。
アンタゴニストをアッセイするために、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを、特定の活性に関してスクリーニングされる化合物と共に細胞に添加して、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプ
チドの存在下における目的の活性を抑制する化合物の能力は、その化合物がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストであることを示している。あるいは、アンタゴニストは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと、膜結合PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドレセプターまたは組換えレセプターに対する潜在的アンタゴニストとを競合的阻害アッセイのための適切な条件下で組み合わせることにより検出され得る。レセプターに結合しているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1
122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド分子の数を用いて潜在的アンタゴニストの有効性を測定することができるように、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを例えば、放射能により標識することができる。そのレセプターをコードする遺伝子は、当業者に公知の多くの方法、例えば、リガンドパニングおよびFACSソーティングにより同定できる。Coligan et al.,Current Protocols in Immun.,1(2):Chapter 5(1991)。好ましくは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに応答する細胞からポリアデニル化RNAを調製し、そしてこのRNAから作製したcDNAライブラリーをプールに分割し、COS細胞またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PR
O342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに応答しない他の細胞をトランスフェクトするために使用する発現クローニングが使用される。スライドガラス上の生育したトランスフェクト細胞を、標識されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに曝露する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、ヨウ素化または部位特異的タンパク質キナーゼに対する認識部位を含ませることを含む種々の手段により標識できる。固定化およびインキュベーションの後、スライドをオートラジオグラフ分析に供する。陽性のプー
ルを同定し、サブプールを調製し、相互作用的なサブプール化および再スクリーニングの過程を用いて再トランスフェクトし、最終的に推定レセプターをコードする単一のクローンを得る。
チドの存在下における目的の活性を抑制する化合物の能力は、その化合物がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストであることを示している。あるいは、アンタゴニストは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと、膜結合PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドレセプターまたは組換えレセプターに対する潜在的アンタゴニストとを競合的阻害アッセイのための適切な条件下で組み合わせることにより検出され得る。レセプターに結合しているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1
122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド分子の数を用いて潜在的アンタゴニストの有効性を測定することができるように、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを例えば、放射能により標識することができる。そのレセプターをコードする遺伝子は、当業者に公知の多くの方法、例えば、リガンドパニングおよびFACSソーティングにより同定できる。Coligan et al.,Current Protocols in Immun.,1(2):Chapter 5(1991)。好ましくは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに応答する細胞からポリアデニル化RNAを調製し、そしてこのRNAから作製したcDNAライブラリーをプールに分割し、COS細胞またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PR
O342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに応答しない他の細胞をトランスフェクトするために使用する発現クローニングが使用される。スライドガラス上の生育したトランスフェクト細胞を、標識されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに曝露する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、ヨウ素化または部位特異的タンパク質キナーゼに対する認識部位を含ませることを含む種々の手段により標識できる。固定化およびインキュベーションの後、スライドをオートラジオグラフ分析に供する。陽性のプー
ルを同定し、サブプールを調製し、相互作用的なサブプール化および再スクリーニングの過程を用いて再トランスフェクトし、最終的に推定レセプターをコードする単一のクローンを得る。
レセプターの同定のための代替アプローチとして、標識されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを、レセプター分子を発現する細胞膜または抽出調製物に光親和性連結させることができる。架橋結合された物質をPAGEで分離し、X線フィルムに曝露する。レセプターを含む標識された複合体を切り出し、ペプチドフラグメントに分離し、そしてタンパク質マイクロ配列決定に供することができる。マイクロ配列決定から得られたアミノ酸配列を用いて、cDNAライブラリーをスクリーニングするための変性オリゴヌクレオチドプローブのセットを設計することにより、推定レセプターをコードする遺伝子を同定する。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストの作用を評価する際の別の方法は、既知のノックアウト表現型を模倣するために、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO35
66、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250アンタゴニストを野生型マウスに投与することであり得る。すなわち、まず目的のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子をノックアウトし、そしてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子のノックアウトまたは破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、野生型マウスにPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO200
26、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストを投与することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストの有効性を評価することができる。有効なアンタゴニストは、ノックアウト動物において最初に観察された表現型の作用を模倣すると予測される。
66、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250アンタゴニストを野生型マウスに投与することであり得る。すなわち、まず目的のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子をノックアウトし、そしてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子のノックアウトまたは破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、野生型マウスにPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO200
26、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストを投与することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアンタゴニストの有効性を評価することができる。有効なアンタゴニストは、ノックアウト動物において最初に観察された表現型の作用を模倣すると予測される。
同様に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアゴニストの作用は、既知の負のノックアウト表現型を寛解するために非ヒトトランスジェニックマウスにPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250アゴニストを投与することにより評価することができる。すなわち、まず目的のPRO69122
、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子をノックアウトし、そしてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子のノックアウトまたは破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、非ヒトトランスジェニックマウスにPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアゴニストを投与することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO143
4、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアゴニストの有効性を評価することができる。有効なアゴニストは、ノックアウト動物において最初に観察された負の表現型の作用を寛解すると予測される。
、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子をノックアウトし、そしてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子のノックアウトまたは破壊の結果として生じた表現型を観察する。その後、非ヒトトランスジェニックマウスにPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアゴニストを投与することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO143
4、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対するアゴニストの有効性を評価することができる。有効なアゴニストは、ノックアウト動物において最初に観察された負の表現型の作用を寛解すると予測される。
アンタゴニストに関する別のアッセイでは、レセプターを発現する哺乳動物細胞または膜調製物を、候補化合物の存在下において標識されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと共にインキュベートする。次に、この相互作用を増強または阻止する化合物の能力を測定する。
潜在的アンタゴニストのより特定の例としては、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとの免疫グロブリンの融合物に結合するオリゴヌクレオチド、そして特に抗体(ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体ならびに抗体フラグメント、一本鎖抗体、抗イデオタイプ抗体ならびにそのような抗体またはフラグメントのキメラ型またはヒト化型、ならびにヒト抗体およびヒト抗体フラグメントが挙げられるがこれらに限定されない。あるいは、潜
在的アンタゴニストは、緊密に関連するタンパク質、例えば、レセプターを認識するが作用をもたらさないことから、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの作用を競合的に阻害するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの変異型であり得る。
在的アンタゴニストは、緊密に関連するタンパク質、例えば、レセプターを認識するが作用をもたらさないことから、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの作用を競合的に阻害するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの変異型であり得る。
別の潜在的PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドアンタゴニストは、例えば、アンチセンスRNAまたはアンチセンスDNA分子が標的mRNAにハイブリダイズし、タンパク質翻訳を妨害することによってmRNAの翻訳を直接阻止して作用する場合、アンチセンス技術を用いて調製されたアンチセンスRNA構築物またはアンチセンスDNA構築物である。
アンチセンス技術を用いて、三重らせん形成またはアンチセンスDNAもしくはアンチセンスRNAを介して遺伝子発現を制御することができ、これらの方法は、両方ともDNAまたはRNAへのポリヌクレオチドの結合に基づいている。例えば、本明細書中の成熟PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の5’コーディング部分を用いて、約10〜40塩基対長のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計する。DNAオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相補であるように設計(三重らせん−Lee et al.,Nucl.Acids Res.,6:3073(1979);Cooney et al.,Science,241:456(1988);Dervan et al.,Science,251:1360(1991))することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの転写および産生を妨害する。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドは、in vivoでmRNAにハイブリダイズし、そしてそのmRNA分子がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO
6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに翻訳されるのを阻止する(アンチセンス−Okano,Neurochem.,56:560(1991);Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of
Gene Expression(CRC Press:Boca Raton,FL,1988))。上記したオリゴヌクレオチドは、アンチセンスRNAまたはアンチセンスDNAがin vivoで発現され、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの産生を抑制するように、細胞に送達することもできる。アンチセンスDNAを使用する場合は、例えば、標的遺伝子ヌクレオチド配列の約−10〜+10位の間の翻訳開始部位から得られるオリゴデオキシリボヌクレオチドが好ましい。
アンチセンス技術を用いて、三重らせん形成またはアンチセンスDNAもしくはアンチセンスRNAを介して遺伝子発現を制御することができ、これらの方法は、両方ともDNAまたはRNAへのポリヌクレオチドの結合に基づいている。例えば、本明細書中の成熟PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の5’コーディング部分を用いて、約10〜40塩基対長のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計する。DNAオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相補であるように設計(三重らせん−Lee et al.,Nucl.Acids Res.,6:3073(1979);Cooney et al.,Science,241:456(1988);Dervan et al.,Science,251:1360(1991))することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの転写および産生を妨害する。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドは、in vivoでmRNAにハイブリダイズし、そしてそのmRNA分子がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO
6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに翻訳されるのを阻止する(アンチセンス−Okano,Neurochem.,56:560(1991);Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of
Gene Expression(CRC Press:Boca Raton,FL,1988))。上記したオリゴヌクレオチドは、アンチセンスRNAまたはアンチセンスDNAがin vivoで発現され、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの産生を抑制するように、細胞に送達することもできる。アンチセンスDNAを使用する場合は、例えば、標的遺伝子ヌクレオチド配列の約−10〜+10位の間の翻訳開始部位から得られるオリゴデオキシリボヌクレオチドが好ましい。
潜在的アンタゴニストは、活性部位、レセプター結合部位もしくは成長因子またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの他の関連する結合部位に結合することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PR
O1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの正常な生物学的活性を阻止する小分子を含む。小分子の例としては、小型のペプチドまたはペプチド様分子、好ましくは、可溶性ペプチドおよび合成の非ペプチジル有機化合物または非ペプチジル無機化合物が挙げられるがこれらに限定されない。
O1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの正常な生物学的活性を阻止する小分子を含む。小分子の例としては、小型のペプチドまたはペプチド様分子、好ましくは、可溶性ペプチドおよび合成の非ペプチジル有機化合物または非ペプチジル無機化合物が挙げられるがこれらに限定されない。
リボザイムは、RNAの特異的切断を触媒することができる酵素的RNA分子である。リボザイムは、相補的な標的RNAへの配列特異的ハイブリダイゼーション、およびその後のエンドヌクレアーゼ的切断により作用する。潜在的RNA標的内の特異的リボザイム切断部位は、公知の手法により同定できる。さらに詳細な説明については、例えば、Rossi,Current Biology,4:469−471(1994)およびPCT公開WO97/33551(1997年9月18日公開)を参照のこと。
転写を抑制するために使用される三重らせん形成における核酸分子は、一本鎖でありデオキシヌクレオチドから構成されるものでなければならない。これらのオリゴヌクレオチドの塩基の組成は、Hoogsteenの塩基対形成の規則によって三重螺旋形成を促進するように設計され、その規則には、一般に二重鎖の一方の鎖の上にかなりの長さのプリンまたはピリミジンが必要となる。さらに詳細な説明は、前出のPCT公開WO97/33551を参照のこと。
これらの小分子は、上記したスクリーニングアッセイの任意の1つ以上により、そして/または当業者に周知の他のスクリーニング手法により、同定することができる。
本明細書に開示した分子の診断上および治療上の使用はまた、後に開示および説明する正の機能のアッセイのヒットに基づき得る。
F.抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体
本発明は、治療薬および/または診断薬として本明細書中で使用され得る抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO
265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を提供する。例示される抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、二重特異性抗体およびヘテロ結合体化抗体を含む。
本発明は、治療薬および/または診断薬として本明細書中で使用され得る抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO
265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を提供する。例示される抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、二重特異性抗体およびヘテロ結合体化抗体を含む。
1.ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は、好ましくは、関連する抗原およびアジュバントの複数回の皮下(sc)注射または腹腔内(ip)注射により動物中で産生させる。その関連する抗原は、(特に合成ペプチドを使用する場合)免疫される種において免疫原となるタンパク質に結合体することが有用であり得る。例えば、抗原は、二官能性薬剤または誘導体形成性の物質、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を介した結合体化)、N−ヒドロキシスクシンイミド(リシン残基を介する)、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、SOCl2またはR1N=C=NR(式中、RおよびR1は、異なるアルキル基である)を用いて、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、血清アルブミン、ウシチログロブリンまたはダイズトリプシンインヒビターに結合体化され得る。
ポリクローナル抗体は、好ましくは、関連する抗原およびアジュバントの複数回の皮下(sc)注射または腹腔内(ip)注射により動物中で産生させる。その関連する抗原は、(特に合成ペプチドを使用する場合)免疫される種において免疫原となるタンパク質に結合体することが有用であり得る。例えば、抗原は、二官能性薬剤または誘導体形成性の物質、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を介した結合体化)、N−ヒドロキシスクシンイミド(リシン残基を介する)、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、SOCl2またはR1N=C=NR(式中、RおよびR1は、異なるアルキル基である)を用いて、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、血清アルブミン、ウシチログロブリンまたはダイズトリプシンインヒビターに結合体化され得る。
例えば、100μgまたは5μgのタンパク質または結合体(それぞれウサギまたはマウスの場合)を3容量のフロイント完全アジュバントと混合し、その溶液を複数部位に皮内注射することにより、抗原、免疫原性結合体または誘導体に対して動物を免疫する。1ヵ月後、複数部位への皮下注射によりフロイント完全アジュバント中のペプチドまたは結合体の元の量の1/5〜1/10を用いて動物を追加免疫する。7〜14日後、動物から採血し、血清の抗体力価をアッセイする。力価が平衡に達するまで動物を追加免疫する。結合体はまた、タンパク質融合物として組換え細胞培養物中において作製することもできる。また、ミョウバンなどの凝集剤を適宜使用して、免疫応答を増強する。
2.モノクローナル抗体
モノクローナル抗体は、Kohler et al.,Nature,256:495(1975)により、初めて報告されたハイブリドーマ法を用いて作製され得るか、または組換えDNA法(米国特許第4,816,567号)によりされ得る。
モノクローナル抗体は、Kohler et al.,Nature,256:495(1975)により、初めて報告されたハイブリドーマ法を用いて作製され得るか、または組換えDNA法(米国特許第4,816,567号)によりされ得る。
ハイブリドーマ法においては、マウスまたは他の適切な宿主動物(例えば、ハムスター)を上記したように免疫することにより、免疫に使用するタンパク質に特異的に結合する抗体を産生するか、または産生可能であるリンパ球を誘発させる。あるいは、リンパ球は、in vitroで免疫され得る。免疫の後、リンパ球を単離し、次に適当な融合剤(例えば、ポリエチレングリコール)を用いてミエローマ細胞株と融合することにより、ハイブリドーマ細胞が形成される(Goding,Monoclonal Antibod
ies,Principles and Practice,pp.59−103(Academic Press,1986))。
ies,Principles and Practice,pp.59−103(Academic Press,1986))。
このように調製されたハイブリドーマ細胞を適当な培養培地中に播種して生育させるが、その培地は、好ましくは、融合していない親ミエローマ細胞(融合相手とも呼ばれる)の生育または生存を抑制する1つ以上の物質を含むものである。例えば、親ミエローマ細胞が、酵素ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRTまたはHPRT)を欠失している場合は、ハイブリドーマに対する選択培養培地は、代表的には、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含み(HAT培地)、これらの物質は、HGPRT欠損細胞の生育を妨害する。
好ましい融合相手であるミエローマ細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による抗体の安定した高レベルの産生を支援し、そして融合していない親細胞に対して選択する選択培地に対して感受性であるものである。好ましいミエローマ細胞株は、マウスミエローマ株(例えば、Salk Institute Cell Distribution Center,San Diego,California USAより入手可能なMOPC−21およびMPC−11マウス腫瘍から得られるものおよびAmerican Type Culture Collection,Manassas,Virginia,USAより入手可能なSP−2および誘導体、例えば、X63−Ag8−653細胞)である。ヒトミエローマおよびマウス−ヒトヘテロミエローマ細胞株もまた、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている(Kozbor,J.Immunol.,133:3001(1984);およびBrodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,pp.51−63(Marcel Dekker,Inc.New York,1987))。
ハイブリドーマ細胞を生育させる培養培地は、抗原に対して指向されたモノクローナル抗体の産生に関してアッセイされる。好ましくは、ハイブリドーマ細胞により産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降またはin vitroの結合アッセイ(例えば、ラジオイムノアッセイ(RIA)または酵素結合免疫吸着測定法(ELISA))により測定する。
モノクローナル抗体の結合親和性は、例えば、Munson et al.,Anal.Biochem.,107:220(1980)に記載のスキャッチャード分析により測定できる。
所望の特異性、親和性および/または活性の抗体を産生するハイブリドーマ細胞が一旦同定されると、限界希釈法によりクローンをサブクローニングし、標準的な方法により生育させ得る(Goding,Monoclonal Antibodies,Principles and Practice,pp.59−103(Academic Press,1986))。この目的のための適当な培地としては、例えば、D−MEMまたはRPMI−1640培地が挙げられる。さらに、ハイブリドーマ細胞は、例えば、マウスへの細胞のi.p.注射により、動物における腹水腫瘍としてin vivoで生育させてよい。
サブクローンにより分泌されたモノクローナル抗体は、従来の抗体精製手順(例えば、アフィニティクロマトグラフィ(例えば、プロテインAまたはプロテインG−セファロースを使用)またはイオン交換クロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析など)により、培養培地、腹水または血清から適宜分離する。
モノクローナル抗体をコードするDNAは、従来の手順を用いて(例えば、マウス抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより)容易に単離および配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、そのようなDNAの好ましい起源となる。一旦、単離されると、そのDNAは、発現ベクター内に入れられ、次いで宿主細胞(例えば、E.coli細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞または他の方法で抗体タンパク質を産生しないミエローマ細胞)にトランスフェクトされることにより、組換え宿主細胞内でモノクローナル抗体の合成を行う。抗体をコードするDNAの細菌における組換え発現に関する概説としては、Skerra et al.,Curr.Opinion in Immunol.,5:256−262(1993)およびPlueckthun,Immunol.Revs.130:151−188(1992)が挙げられる。
モノクローナル抗体または抗体フラグメントは、McCafferty et al.,Nature,348:552−554(1990)に記載の手法を用いて作製した抗体ファージライブラリーから単離できる。Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)およびMarks et al.,J.Mol.Biol.,222:581−597(1991)は、ファージライブラリーを用いたそれぞれマウスおよびヒトの抗体の単離を報告している。その後の出版物は、チェインシャフリングによる高親和性(nM範囲)のヒト抗体の産生(Marks et al.,Bio/Technology,10:779−783(1992))ならびに極めて大型のファージライブラリーを構築するためのストラテジとしてのコンビナトリアル感染およびin vivo組換え(Waterhouse et al.,Nuc.Acids.Res.,21:2265−2266(1993))を報告している。すなわち、これらの手法は、モノクローナル抗体の単離のための従来のモノクローナル抗体ハイブリドーマ手法の実行可能な代替法である。
抗体をコードするDNAは、例えば、相同なマウス配列に対してヒトの重鎖および軽鎖の定常ドメイン(CHおよびCL)配列を置換することにより(米国特許第4,816,567号;およびMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851(1984))、または非免疫グロブリンポリペプチド(異種ポリペプチド)に対するコード配列の全部または一部に免疫グロブリンコード配列を融合することにより、キメラ抗体または融合抗体のポリペプチドが産生されるように改変され得る。非免疫グロブリンポリペプチド配列は、抗体の定常ドメインに対して置換することができるか、または抗体の1つの抗原複合化部位の可変ドメインに対して置換されることにより、抗原に対する特異性を有する1つの抗原複合化部位および異なる抗原に対する特異性を有する別の抗原複合化部位を含むキメラ2価抗体が生成される。
3.ヒト抗体およびヒト化抗体
本発明の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、
抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体はさらに、ヒト化抗体またはヒト抗体を含み得る。非ヒト(例えば、マウス)抗体のヒト化型は、非ヒト免疫グロブリンから得られる最小配列を含むキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはそのフラグメント(例えば、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2または抗体の他の抗原結合サブ配列)である。ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)を包含し、これにおいては、レシピエントの相補性決定領域(CDR)に由来する残基が所望の特異性、親和性および能力を有する非ヒト種(例えば、マウス、ラットまたはウサギ)(ドナー抗体)のCDRに由来する残基で置き換えられている。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられている。ヒト化抗体はまた、レシピエント抗体および移入されたCDR配列またはフレームワーク配列のいずれにも存在しない残基を含んでよい。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、代表的には2つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、これにおいては、CDR領域のすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのそれに相当し、そしてFR領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のそれである。ヒト化抗体はまた、必要に応じてさらに免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも一部分、代表的には、ヒト免疫グロブリンの少なくとも一部分を含む[Jones et al.,Nature,321:522−525(1986);Riechmann et al.,Nature,332:323−329(1988);およびPresta,Curr.Op.Struct.Biol.,2:593−596(1992)]。
本発明の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、
抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体はさらに、ヒト化抗体またはヒト抗体を含み得る。非ヒト(例えば、マウス)抗体のヒト化型は、非ヒト免疫グロブリンから得られる最小配列を含むキメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはそのフラグメント(例えば、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2または抗体の他の抗原結合サブ配列)である。ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)を包含し、これにおいては、レシピエントの相補性決定領域(CDR)に由来する残基が所望の特異性、親和性および能力を有する非ヒト種(例えば、マウス、ラットまたはウサギ)(ドナー抗体)のCDRに由来する残基で置き換えられている。一部の場合においては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基により置き換えられている。ヒト化抗体はまた、レシピエント抗体および移入されたCDR配列またはフレームワーク配列のいずれにも存在しない残基を含んでよい。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、代表的には2つの可変ドメインの実質的にすべてを含み、これにおいては、CDR領域のすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのそれに相当し、そしてFR領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のそれである。ヒト化抗体はまた、必要に応じてさらに免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも一部分、代表的には、ヒト免疫グロブリンの少なくとも一部分を含む[Jones et al.,Nature,321:522−525(1986);Riechmann et al.,Nature,332:323−329(1988);およびPresta,Curr.Op.Struct.Biol.,2:593−596(1992)]。
非ヒト抗体をヒト化するための方法は、当該分野で周知である。一般に、ヒト化抗体は、非ヒトである起源からそれに導入された1つ以上のアミノ酸残基を有する。これらの非ヒトアミノ酸残基は、しばしば「移入」残基と呼ばれ、これらは、代表的には、「移入」可変ドメインに由来する。ヒト化は、本質的には、げっ歯類のCDRまたはCDR配列とヒト抗体の対応する配列を置換することにより、Winterおよび共同研究者らの方法に従って実施することができる(Jones et al.Nature,321:522−525(1986);Riechmann et al.Nature,332:323−327(1988);Verhoeyen et al.Science,239:1534−1536(1988))に従って実施することができる。したがって、そのような「ヒト化」抗体は、インタクトなヒト可変ドメインより実質的に少ない部分が非ヒト種由来の対応する配列により置換されているキメラ抗体(米国特許第4,816,567号)である。実際、ヒト化抗体は、代表的には、一部のCDR残基および恐らくは、一部のFR残基が、げっ歯類抗体における類似の部位に由来する残基により置換されているヒト抗体である。
ヒト化抗体の作製において使用される軽鎖および重鎖の両方のヒト可変ドメインの選択は、抗体がヒトの治療上の使用を意図している場合は、抗原性およびHAMA(ヒト抗マウス抗体)応答を低減するために極めて重要である。いわゆる「ベストフィット」法にしたがって、げっ歯類抗体の可変ドメインの配列を、既知のヒト可変ドメイン配列の全ライブラリーに対してスクリーニングする。げっ歯類のものに最も近似しているヒトVドメイン配列を同定し、そして、その内部にあるヒトフレームワーク領域(FR)をヒト化抗体として許容する(Sims et al.J.Immunol.151:2296(1993);Chothia et al.J.Mol.Biol.,196:901(1987))。別の方法は、軽鎖または重鎖の特定のサブグループのすべてのヒト抗体のコンセンサス配列から得られる特定のフレームワーク領域を使用する。同じフレームワークがいくつかの異なるヒト化抗体に対して使用され得る(Carter et al.Pro
c.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);Presta
et al.J.Immunol.,151:2623(1993))。
c.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);Presta
et al.J.Immunol.,151:2623(1993))。
抗原に対する高い結合親和性および他の望ましい生物学的特性を保持しながら抗体をヒト化させることがさらに重要である。この目標を達成するために、好ましい方法にしたがって、親配列およびヒト化配列の三次元モデルを用いて、親配列および様々な概念的ヒト化産物の分析のプロセスにより、ヒト化抗体が調製される。三次元の免疫グロブリンモデルは、一般に入手可能であり、当業者によく知られているものである。選択された候補免疫グロブリン配列の推定三次元コンホメーション構造を図画し、表示するコンピュータプログラムが利用できる。これらの表示を精査することにより、候補免疫グロブリン配列が機能する際の残基の推定される役割の分析、すなわち候補免疫グロブリンがその抗原に結合する能力に影響する残基の分析が可能になる。このようにして、FR残基を、レシピエントおよび移入配列から、選択して組み合わせることができ、その結果、所望の抗体特性(例えば、標的抗原に対して増大した親和性)が達成される。一般に、超可変領域残基が、抗原結合への影響において、直接、そして最も実質的に関与する。
様々な形態のヒト化抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体が企図される。例えば、ヒト化抗体は、抗体フラグメント(例えば、Fab)であり得、これは、必要に応じて、免疫複合体を形成するために1個以上の細胞傷害性薬剤と結合体化される。あるいは、ヒト化抗体は、インタクトな抗体(例えば、インタクトなIgG1抗体)であり得る。
ヒト化の代替として、ヒト抗体が作製され得る。例えば、内因性免疫グロブリン産生のない状況下においてヒト抗体の完全なレパートリーを免疫により産生することができるトランスジェニック動物(例えば、マウス)を作製することが現在可能である。例えば、キメラマウスおよび生殖細胞系変異マウスにおける抗体重鎖連結領域(JH)遺伝子のホモ接合性の欠失が、内因性の抗体産生の完全な抑制をもたらすことが報告されている。ヒト生殖細胞系免疫グロブリン遺伝子アレイをそのような生殖細胞系変異マウスへの移入することは、抗原チャレンジ時のヒト抗体の産生をもたらすことになる。例えば、Jakobovits et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:2551(1993);Jakobovits et al.,Nature,362:255−258(1993);Bruggemann et al.,Year in Immuno.7:33(1993);米国特許第5,545,806号、同第5,569,825号、同第5,591,669号(すべてGenPharm);同第5,545,807号;およびWO97/17852を参照のこと。
あるいは、ファージディスプレイ技術(McCafferty et al.,Nature 348:552−553[1990])を用いることにより、免疫されていないドナー由来の免疫グロブリン可変(V)ドメイン遺伝子レパートリーからヒト抗体およびヒト抗体フラグメントをin vitroで作製することができる。この手法によれば、抗体Vドメイン遺伝子を糸状バクテリオファージ(例えば、M13またはfd)の主要なまたは副次的なコートタンパク質遺伝子のいずれかにインフレームでクローニングし、ファージ粒子の表面上の機能的抗体フラグメントとしてディスプレイさせる。糸状粒子は、ファージゲノムの一本鎖DNAコピーを含むため、抗体の機能的特性に基づいた選択もまた、これらの特性を示す抗体をコードする遺伝子の選択をもたらす。すなわち、ファージは、B細胞の特性の一部を模倣する。ファージディスプレイは、例えば、Johnson,Kevin S.and Chiswell,David J.,Current Opinion in Structural Biology,3:564−571(1993)において概説されている種々の形式で実施できる。V遺伝子セグメントのいくつかの起源をファージディスプレイのために使用できる。Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)では、免疫したマウスの脾臓から得られたV遺伝子の小型のランダムなコンビナトリアルライブラリーから抗オキサゾロン抗体の多様なアレイを単離した。免疫されていないヒトドナー由来のV遺伝子のレパートリーを構築することができ、そして抗原の多様なアレイ(自己抗原を含む)に対する抗体を、Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581−597(1991)またはGriffith et al.,EMBO J.12:725−734(1993)により記載された手法に本質的に従って単離することができる。米国特許第5,565,332号および同第5,573,905号も参照のこと。
上記したように、ヒト抗体はまた、in vitroでの活性化されたB細胞により作製され得る(米国特許第5,567,610号および同第5,229,275号を参照のこと)。
4.抗体フラグメント
特定の状況において、抗体全体ではなく、抗体フラグメントを使用するほうが有利である。より小さいサイズのフラグメントは、迅速なクリアランスを可能にし、そして固形腫瘍への向上した到達をもたらし得る。
特定の状況において、抗体全体ではなく、抗体フラグメントを使用するほうが有利である。より小さいサイズのフラグメントは、迅速なクリアランスを可能にし、そして固形腫瘍への向上した到達をもたらし得る。
抗体フラグメントの作製のための様々な手法が開発されている。伝統的には、これらのフラグメントは、インタクトな抗体のタンパク質分解的消化を介して得ていた(例えば、Morimoto et al.,Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107−117(1992);およびBrennan et al.,Science,229:81(1985)を参照のこと)。しかしながら、これらのフラグメントは、現在、組換え宿主細胞により直接作製することができる。Fab、FvおよびScFv抗体フラグメントはすべて、E.coliにおいて発現させ、これより分泌させることができ、これにより、大量のこれらのフラグメントを効率的に産生できる。抗体フラグメントは、上記した抗体ファージライブラリーから単離できる。あるいは、Fab’−SHフラグメントを直接、E.coliから回収し、化学的に結合してF(ab’)2フラグメントを形成することができる(Carter et al.,Bio/Technology 10:163−167(1992)。別の方法によれば、F(ab’)2フラグメントは、組換え宿主細胞培養物から直接単離できる。サルベージレセプター結合エピトープ残基を含むin vivo半減期が延長したFabおよびF(ab’)2フラグメントは、米国特許第5,869,046号に記載されている。抗体フラグメントの産生のための他の手法は、当業者に明らかである。選択された抗体は、一本鎖Fvフラグメント(scFv)である。WO93/161
85;米国特許第5,571,894号;および米国特許第5,587,458号を参照のこと。FvおよびsFvは、定常領域を欠いたインタクトな複合化部位を有する唯一の種であり;すなわち、それらは、in vivoにおいて使用する間の低い非特異的結合に適している。sFv融合タンパク質を構築することにより、sFvのアミノ末端またはカルボキシ末端のいずれかにエフェクタータンパク質を融合させてよい。Antibody Engineering,ed.Borrebaeck,前出を参照のこと。抗体フラグメントはまた、例えば、米国特許第5,641,870号に記載の「線状抗体」であってもよい。そのような線状抗体フラグメントは、単一特異性または二重特異性であり得る。
85;米国特許第5,571,894号;および米国特許第5,587,458号を参照のこと。FvおよびsFvは、定常領域を欠いたインタクトな複合化部位を有する唯一の種であり;すなわち、それらは、in vivoにおいて使用する間の低い非特異的結合に適している。sFv融合タンパク質を構築することにより、sFvのアミノ末端またはカルボキシ末端のいずれかにエフェクタータンパク質を融合させてよい。Antibody Engineering,ed.Borrebaeck,前出を参照のこと。抗体フラグメントはまた、例えば、米国特許第5,641,870号に記載の「線状抗体」であってもよい。そのような線状抗体フラグメントは、単一特異性または二重特異性であり得る。
5.二重特異性抗体
二重特異性抗体は、少なくとも2つの異なるエピトープに対する結合特異性を有する抗体である。例示される二重特異性抗体は、本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250タンパク質の2つの異なるエピトープに結合し得る。他のそのような抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の結合部位を別のタンパク質に対する結合部位と組み合わし得る。あるいは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗
PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250アームを白血球上のトリガー分子(例えば、T細胞レセプター分子(例えば、CD3)またはIgGに対するFcレセプター(FcγR)、例えば、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)およびFcγRIII(CD16))に結合するアームと組み合わせることにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現細胞に対して細胞防御機序を集中および局在化させ得る。二重特異性抗体はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現する細胞に細胞傷害性薬剤を局在化させるために使用され得る。これらの抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO17
77、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合アームおよび細胞傷害性薬剤(例えば、サポリン、抗インターフェロン−α、ビンカアルカロイド、リシンA鎖、メトトレキサートまたは放射性同位体ハプテン)に結合するアームを保有している。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体フラグメント(例えば、F(ab’)2二重特異性抗体)として調製できる。
二重特異性抗体は、少なくとも2つの異なるエピトープに対する結合特異性を有する抗体である。例示される二重特異性抗体は、本明細書に記載するPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250タンパク質の2つの異なるエピトープに結合し得る。他のそのような抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の結合部位を別のタンパク質に対する結合部位と組み合わし得る。あるいは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗
PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250アームを白血球上のトリガー分子(例えば、T細胞レセプター分子(例えば、CD3)またはIgGに対するFcレセプター(FcγR)、例えば、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)およびFcγRIII(CD16))に結合するアームと組み合わせることにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250発現細胞に対して細胞防御機序を集中および局在化させ得る。二重特異性抗体はまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを発現する細胞に細胞傷害性薬剤を局在化させるために使用され得る。これらの抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO17
77、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250結合アームおよび細胞傷害性薬剤(例えば、サポリン、抗インターフェロン−α、ビンカアルカロイド、リシンA鎖、メトトレキサートまたは放射性同位体ハプテン)に結合するアームを保有している。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体フラグメント(例えば、F(ab’)2二重特異性抗体)として調製できる。
WO96/16673は、二重特異性抗ErbB2/抗FcγRIII抗体を記載しており、そして米国特許第5,837,234号は、二重特異性抗ErbB2/抗FcγRI抗体を開示している。二重特異性抗ErbB2/Fcα抗体は、WO98/02463に示されている。米国特許第5,821,337号は、二重特異性抗ErbB2/抗CD3抗体を教示している。
二重特異性抗体を作製するための方法は、当該分野で公知である。完全長二重特異性抗体の従来の調製は、2つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の同時発現に基づいており、その場合、2つの鎖は、異なる特異性を有する(Millstein et al.,Nature 305:537−539(1983))。免疫グロブリンの重鎖および軽鎖のランダムな取合せに起因して、これらのハイブリドーマ(クアドローマ)は、10種の異なる抗体分子の潜在的混合物を生成し、そのうちわずか1種のみが正しい二重特異性構造を有する。通常、アフィニティクロマトグラフィ工程により行われる正しい分子の精製は、かなり面倒であり、そして生成物収率は、低い。同様の手順がWO93/08829およびTraunecker et al.,EMBO J,10:3655−3659(1991)に開示されている。
異なる方法によれば、所望の結合特異性を有する抗体可変ドメイン(抗体−抗原複合化部位)を、免疫グロブリンの定常ドメイン配列に融合させる。好ましくは、融合は、少なくとも一部のヒンジ、CH2およびCH3領域を含むIg重鎖定常ドメインと行う。融合物の少なくとも1つにおいて存在する、軽鎖結合に必要な部位を含む第1の重鎖定常領域(CH1)を有することが望ましい。免疫グロブリン重鎖融合物、および所望であれば、免疫グロブリン軽鎖をコードするDNAを別々の発現ベクターに挿入し安定な宿主細胞に同時トランスフェクトする。これにより、構築において使用した3種のポリペプチド鎖の等しくない比率が、所望の二重特異性抗体の最適な収率をもたらす場合、その3種のポリペプチドフラグメントの相互の割合を調節する際に多大な柔軟性がもたらされる。しかしながら、等しい比率における少なくとも2つのポリペプチド鎖の発現が高収率をもたらす場合、または比率が所望の鎖の組合せの収率に有意に影響しない場合は、単一の発現ベクター内に2つまたは3つすべてのポリペプチド鎖に関するコード配列を挿入することが可能である。
本発明は、一方のアームにおける第1の結合特異性を有するハイブリッド免疫グロブリン重鎖および他方のアームにおけるハイブリッド免疫グロブリン重鎖−軽鎖対(第2の結合特異性をもたらす)から構成される二重特異性抗体を提供する。この非対称の構造は、二重特異性分子の片方にのみ免疫グロブリン軽鎖が存在することにより、分離の効率的方法が提供されるため、望ましくない免疫グロブリン鎖の組合せから所望の二重特異性化合物を分離することを容易にすることがわかっている。この方法は、WO94/04690に開示されている。二重特異性抗体の作製のさらに詳細な説明は、例えば、Suresh
et al.,Methods in Enzymology 121:210(1986)を参照のこと。
et al.,Methods in Enzymology 121:210(1986)を参照のこと。
米国特許第5,731,168号に記載の別の方法によれば、抗体分子対の間の界面を操作することにより、組換え細胞培養から回収されるヘテロ2量体の割合を最大限にすることができる。好ましい界面は、CH3ドメインの少なくとも一部を含む。この方法において、第1の抗体分子の界面に由来する1つ以上の小型アミノ酸側鎖をより大きい鎖(例えば、チロシンまたはトリプトファン)で置き換える。大型の側鎖と同一または同様のサイズの代償的な「空洞」が、大型のアミノ酸側鎖をより小さいもの(例えば、アラニンまたはスレオニン)と置き換えることによって第2の抗体分子の界面上に形成される。これは、ホモ2量体などの他の望ましくない最終生成物よりもヘテロ2量体の収率を増大させるための機序を提供する。
二重特異性抗体は、架橋結合された抗体または「ヘテロ結合体」抗体を含む。例えば、ヘテロ結合体における抗体の一方をアビジンに、そして他方をビオチンに結合することができる。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングするため(米国特許第4,676,980号)およびHIV感染の処置のため(WO91/00360、WO92/200373およびEP03089)に提案されている。ヘテロ結合体抗体は、任意の好都合な架橋結合法を用いて作製され得る。適当な架橋結合剤は、当該分野で周知であり、そして多くの架橋結合の手法と共に米国特許第4,676,980号に開示されている。
抗体フラグメントから二重特異性抗体を作製するための手法もまた、文献に記載されている。例えば、二重特異性抗体は、キメラ連結を用いて調製できる。Brennan et al.,Science 229:81(1985)は、F(ab’)2フラグメントを作製するためにインタクトな抗体をタンパク質分解的に切断する手順を記載している。これらのフラグメントをジチオール複合体形成剤、亜ヒ酸ナトリウムの存在下で還元することにより、隣接ジチオールを安定化させ、分子間ジスルフィドの形成を妨害する。次に、形成されたFab’フラグメントをチオニトロベンゾエート(TNB)誘導体に変換する。次に、Fab’−TNB誘導体の1つを、メルカプトエチルアミンで還元することによりFab’−チオールに再変換し、等モル量の他のFab’−TNB誘導体と混合することにより、二重特異性抗体が形成される。生成した二重特異性抗体は、酵素の選択的固定化のための試薬として使用できる。
最近の進歩により、化学的に結合することにより二重特異性抗体を形成することができる、E.coliからのFab’−SHフラグメントの直接の回収が容易になった。Shalaby et al.,J.Exp.Med.175:217−225(1992)は、完全にヒト化された二重特異性抗体F(ab’)2分子の作製を記載している。各Fab’フラグメントを別個にE.coliから分泌させ、in vitroの指向性化学カップリングに供することにより、二重特異性抗体が作製される。このようにして形成された二重特異性抗体は、ErbB2レセプターを過剰発現する細胞および正常ヒトT細胞に結合することができ、同時にヒト乳房腫瘍標的に対するヒト細胞傷害性リンパ球の溶解活性をトリガーすることができた。組換え細胞培養物から直接、二重特異性抗体フラグメントを作製して単離する様々な手法も報告されている。例えば、二重特異性抗体を、ロイシンジッパーを用いて調製する。Kostelny et al.,J.Immunol.148(5):1547−1553(1992)。FosおよびJunタンパク質由来のロイシンジッパーペプチドを、遺伝子融合により2種の異なる抗体のFab’部分に連結した。その抗体のホモ2量体を、ヒンジ領域で還元することによりモノマーを形成し、次に、再び酸化して抗体ヘテロ2量体を形成させた。この方法はまた、抗体ホモ2量体の調製にも利用できる。Hollinger et al.,Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA 90:6444−6448(1993)に記載の「ダイアボディ」手法は、二重特異性抗体フラグメントを作製するための代替機序を提供している。そのフラグメントは、同じ鎖の2ドメイン間の対形成を可能とするには、短すぎるリンカーによってVLに連結されたVHを含む。したがって、1つのフラグメントのVHおよびVLドメインが別のフラグメントの相補的なVLドメインおよびVHドメインに強制的に対形成させられ、これにより2つの抗原結合部位が形成される。一本鎖Fv(sFv)2量体の使用による二重特異性抗体フラグメントを作製するための別のストラテジも報告されている。Gruber et al.,J.Immunol.,152:5368(1994)を参照のこと。
d.Sci.USA 90:6444−6448(1993)に記載の「ダイアボディ」手法は、二重特異性抗体フラグメントを作製するための代替機序を提供している。そのフラグメントは、同じ鎖の2ドメイン間の対形成を可能とするには、短すぎるリンカーによってVLに連結されたVHを含む。したがって、1つのフラグメントのVHおよびVLドメインが別のフラグメントの相補的なVLドメインおよびVHドメインに強制的に対形成させられ、これにより2つの抗原結合部位が形成される。一本鎖Fv(sFv)2量体の使用による二重特異性抗体フラグメントを作製するための別のストラテジも報告されている。Gruber et al.,J.Immunol.,152:5368(1994)を参照のこと。
2価より多価の抗体も企図される。例えば、3重特異性抗体が作製され得る。Tutt
et al.,J.Immunol.147:60(1991)。
et al.,J.Immunol.147:60(1991)。
6.ヘテロ結合体抗体
ヘテロ結合体抗体もまた、本発明の範囲内に含まれる。ヘテロ結合体抗体は、2つの共有結合した抗体から構成される。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングするため[米国特許第4,676,980号]およびHIV感染の処置のため[WO91/00360、WO92/200373およびEP03089]に提案されている。この抗体は、架橋結合剤を用いる方法を含む合成タンパク質化学における公知の方法を用いてin vitroで調製され得ると企図される。例えば、免疫トキシンは、ジスルフィド交換反応を用いて、またはチオエーテル結合の形成によって構築され得る。この目的に適した試薬の例としては、イミノチオレートおよびメチル−4−メルカプトブチルイミデートならびに例えば、米国特許第4,676,980号に開示されているものが挙げられる。
ヘテロ結合体抗体もまた、本発明の範囲内に含まれる。ヘテロ結合体抗体は、2つの共有結合した抗体から構成される。このような抗体は、例えば、望ましくない細胞に免疫系細胞をターゲティングするため[米国特許第4,676,980号]およびHIV感染の処置のため[WO91/00360、WO92/200373およびEP03089]に提案されている。この抗体は、架橋結合剤を用いる方法を含む合成タンパク質化学における公知の方法を用いてin vitroで調製され得ると企図される。例えば、免疫トキシンは、ジスルフィド交換反応を用いて、またはチオエーテル結合の形成によって構築され得る。この目的に適した試薬の例としては、イミノチオレートおよびメチル−4−メルカプトブチルイミデートならびに例えば、米国特許第4,676,980号に開示されているものが挙げられる。
7.多価抗体
多価抗体は、抗体が結合する抗原を発現する細胞によって、2価抗体より急速に内部移行(および/または異化)され得る。本発明の抗体は、3つ以上の抗原結合部位を有する多価抗体(IgMクラス以外である)(例えば、4価抗体)であり得、その抗体は、抗体のポリペプチド鎖をコードする核酸の組換え発現により容易に作製できる。多価抗体は、二量体化ドメインおよび3つ以上の抗原結合部位を含み得る。好ましい二量体化ドメインは、Fc領域またはヒンジ領域を含む(またはそれからなる)。この設定において、その抗体は、Fc領域およびFc領域に対してアミノ末端側に3つ以上の抗原結合部位を含む。好ましい多価抗体は、本明細書中で3個〜約8個、好ましくは、4個の抗原結合部位を含む(またはそれからなる)。多価抗体は、少なくとも1つのポリペプチド鎖(および好ましくは、2つのポリペプチド鎖)を含み、ここでそのポリペプチド鎖は、2つ以上の可変ドメインを含む。例えば、そのポリペプチド鎖は、VD1−(X1)n−VD2−(X2)n−Fcを含み得、式中、VD1は、第1の可変ドメイン、VD2は、第2の可変ドメイン、Fcは、Fc領域の1つのポリペプチド鎖であり、X1およびX2は、アミノ酸またはポリペプチドを示し、nは、0または1である。例えば、そのポリペプチド鎖は、VH−CH1−柔軟なリンカー−VH−CH1−Fc領域鎖;またはVH−CH1−VH−CH1−Fc領域鎖を含み得る。本明細書中の多価抗体は、好ましくは、さらに少なくとも2つ(好ましくは、4つ)の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含む。本明細書中の多価抗体は、例えば、約2個〜約8個の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含み得る。本明細書において企図される軽鎖可変ドメインポリペプチドは、軽鎖可変ドメインを含み、そして必要に応じて、さらにCLドメインを含む。
多価抗体は、抗体が結合する抗原を発現する細胞によって、2価抗体より急速に内部移行(および/または異化)され得る。本発明の抗体は、3つ以上の抗原結合部位を有する多価抗体(IgMクラス以外である)(例えば、4価抗体)であり得、その抗体は、抗体のポリペプチド鎖をコードする核酸の組換え発現により容易に作製できる。多価抗体は、二量体化ドメインおよび3つ以上の抗原結合部位を含み得る。好ましい二量体化ドメインは、Fc領域またはヒンジ領域を含む(またはそれからなる)。この設定において、その抗体は、Fc領域およびFc領域に対してアミノ末端側に3つ以上の抗原結合部位を含む。好ましい多価抗体は、本明細書中で3個〜約8個、好ましくは、4個の抗原結合部位を含む(またはそれからなる)。多価抗体は、少なくとも1つのポリペプチド鎖(および好ましくは、2つのポリペプチド鎖)を含み、ここでそのポリペプチド鎖は、2つ以上の可変ドメインを含む。例えば、そのポリペプチド鎖は、VD1−(X1)n−VD2−(X2)n−Fcを含み得、式中、VD1は、第1の可変ドメイン、VD2は、第2の可変ドメイン、Fcは、Fc領域の1つのポリペプチド鎖であり、X1およびX2は、アミノ酸またはポリペプチドを示し、nは、0または1である。例えば、そのポリペプチド鎖は、VH−CH1−柔軟なリンカー−VH−CH1−Fc領域鎖;またはVH−CH1−VH−CH1−Fc領域鎖を含み得る。本明細書中の多価抗体は、好ましくは、さらに少なくとも2つ(好ましくは、4つ)の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含む。本明細書中の多価抗体は、例えば、約2個〜約8個の軽鎖可変ドメインポリペプチドを含み得る。本明細書において企図される軽鎖可変ドメインポリペプチドは、軽鎖可変ドメインを含み、そして必要に応じて、さらにCLドメインを含む。
8.エフェクター機能の操作
例えば、抗体の抗原依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)および/または補体依存性細胞傷害(CDC)を増強するために、エフェクター機能に関して本発明の抗体を改変す
ることが望ましい場合がある。これは、1つ以上アミノ酸置換を抗体のFc領域に導入することにより達成され得る。代替または追加として、システイン残基をFc領域に導入することにより、この領域における鎖間のジスルフィド結合の形成が可能とされ得る。このように作製されたホモ2量体抗体は、向上した内部移行能力ならびに/または増大した補体媒介性細胞殺滅および抗体依存性細胞傷害(ADCC)を有し得る。Caron et
al.,J.Exp.Med.,176:1191−1195(1992)およびShopes,B.J.Immunol.148:2918−2922(1992)を参照のこと。増強された抗腫瘍活性を有するホモ2量体抗体はまた、Wolff et al.,Cancer Research 53:2560−2565(1993)に記載されているように、ヘテロ2官能性架橋リンカーを用いて調製され得る。あるいは、二重のFc領域を有することから、増強された補体溶解およびADCC能力を有し得る抗体を作製することもできる。Stevenson et al.,Anti−Cancer Drug Design 3:219−230(1989)を参照のこと。その抗体の血清中半減期を延長するために、例えば、米国特許第5,739,277号に記載されるように抗体(特に抗体フラグメント)中にサルベージレセプター結合エピトープを取り込んでよい。本明細書中で使用されるとき、用語「サルベージレセプター結合エピトープ」とは、IgG分子(例えば、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4)のin vivoの血清中半減期を延長する原因となるIgG分子のFc領域のエピトープのことをいう。
例えば、抗体の抗原依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)および/または補体依存性細胞傷害(CDC)を増強するために、エフェクター機能に関して本発明の抗体を改変す
ることが望ましい場合がある。これは、1つ以上アミノ酸置換を抗体のFc領域に導入することにより達成され得る。代替または追加として、システイン残基をFc領域に導入することにより、この領域における鎖間のジスルフィド結合の形成が可能とされ得る。このように作製されたホモ2量体抗体は、向上した内部移行能力ならびに/または増大した補体媒介性細胞殺滅および抗体依存性細胞傷害(ADCC)を有し得る。Caron et
al.,J.Exp.Med.,176:1191−1195(1992)およびShopes,B.J.Immunol.148:2918−2922(1992)を参照のこと。増強された抗腫瘍活性を有するホモ2量体抗体はまた、Wolff et al.,Cancer Research 53:2560−2565(1993)に記載されているように、ヘテロ2官能性架橋リンカーを用いて調製され得る。あるいは、二重のFc領域を有することから、増強された補体溶解およびADCC能力を有し得る抗体を作製することもできる。Stevenson et al.,Anti−Cancer Drug Design 3:219−230(1989)を参照のこと。その抗体の血清中半減期を延長するために、例えば、米国特許第5,739,277号に記載されるように抗体(特に抗体フラグメント)中にサルベージレセプター結合エピトープを取り込んでよい。本明細書中で使用されるとき、用語「サルベージレセプター結合エピトープ」とは、IgG分子(例えば、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4)のin vivoの血清中半減期を延長する原因となるIgG分子のFc領域のエピトープのことをいう。
9.免疫複合体
本発明はまた、細胞傷害性薬剤(例えば、化学療法剤、成長抑制剤、トキシン(例えば、細菌、真菌、植物または動物起源の酵素的に活性なトキシンまたはそのフラグメント)または放射性同位体(すなわち、放射性結合体)に結合体化された抗体を含む免疫複合体に関する。
本発明はまた、細胞傷害性薬剤(例えば、化学療法剤、成長抑制剤、トキシン(例えば、細菌、真菌、植物または動物起源の酵素的に活性なトキシンまたはそのフラグメント)または放射性同位体(すなわち、放射性結合体)に結合体化された抗体を含む免疫複合体に関する。
このような免疫複合体の作製に有用な化学療法剤は、上記の通りである。使用され得る酵素的に活性なトキシンおよびそのフラグメントとしては、ジフテリアA鎖、ジフテリアトキシンの非結合活性フラグメント、外毒素A鎖(Pseudomonas aeruginosa由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデクシンA鎖、アルファ−サルシン(sarcin)、Aleurites fordiiタンパク質、ジアンチン(dianthin)タンパク質、Phytolaca americanaタンパク質(PAPI、PAPIIおよびPAP−S)、momordica charantiaインヒビター、クルシン(curcin)、クロチン(crotin)、sapaonaria officinalisインヒビター、ゲロニン(gelonin)、マイトゲリン(mitogellin)、レストリクトシン(restrictocin)、フェノマイシン(phenomycin)、エノマイシン(enomycin)およびトリコテシン(tricothecene)が挙げられる。種々の放射性核種が、放射性結合体化抗体の作製のために使用できる。例としては、212Bi、131I、131In、90Yおよび186Reが挙げられる。抗体と細胞傷害性薬剤との結合体は、種々の2官能性タンパク質カップリング剤(例えば、N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの2官能性誘導体(例えば、ジメチルアジピミデートHCL)、活性エステル(例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル)、アルデヒド(例えば、グルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えば、ビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビスジアゾニウム誘導体(例えば、ビス(p−ジアゾニウムベンゾイル)−エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トリエン2,6−ジイソシアネート)およびビス活性フッ素化合物(例えば、1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン))を用いて作製される。例えば、リシン免疫トキシンは、Vitetta et al.,Science,238:1098(1987)に記載されているように調製され得る。炭素−14−標識1−イソチオシアナトベンジル−3−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸(MX−DTPA)は、抗体への放射
性核種の結合体化のための例示的なキレート剤である。WO94/11026を参照のこと。
性核種の結合体化のための例示的なキレート剤である。WO94/11026を参照のこと。
抗体および1つ以上の小分子トキシン(例えば、カリケアマイシン、メイタンシノイド、トリコテシンおよびCC1065)およびトキシン活性を有するこれらの毒素の誘導体の結合体もまた本明細書中で企図される。
メイタンシンおよびメイタンシノイド
本発明は、1つ以上のメイタンシノイド分子に結合体化された抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体(完全長またはフラグメント)を提供する。
メイタンシンおよびメイタンシノイド
本発明は、1つ以上のメイタンシノイド分子に結合体化された抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体(完全長またはフラグメント)を提供する。
メイタンシノイドは、チューブリン重合を抑制することにより機能する有糸分裂インヒビターである。メイタンシンは、東アフリカの低木であるMaytenus serrataから最初に単離された(米国特許第3,896,111号)。その後、特定の微生物もまた、メイタンシノイド(例えば、メイタンシノールおよびC−3メイタンシノールエステル)を産生することが発見された(米国特許第4,151,042号)。合成のメイタンシノールならびにその誘導体およびアナログは、例えば、米国特許第4,137,230号;同第4,248,870号;同第4,256,746号;同第4,260,608号;同第4,265,814号;同第4,294,757号;同第4,307,016号;同第4,308,268号;同第4,308,269号;同第4,309,428号;同第4,313,946号;同第4,315,929号;同第4,317,821号;同第4,322,348号;同第4,331,598号;同第4,361,650号;同第4,364,866号;同第4,424,219号;同第4,450,254号;同第4,362,663号;および同第4,371,533号に開示されており、これらの開示は、本明細書により、参考として明示的に援用される。
メイタンシノイド−抗体結合体
その処置指標を向上させる試みにおいて、メイタンシンおよびメイタンシノイドは、腫瘍細胞抗原に特異的に結合する抗体に結合体化された。メイタンシノイドを含む免疫複合体およびその治療的用途は、例えば、米国特許第5,208,020号、同第5,416,064号および欧州特許EP0425235B1(これらの開示は、本明細書により参考として明示的に援用される)に開示されている。Liu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:8618−8623(1996)は、ヒト直腸結腸癌に対して指向されたモノクローナル抗体C242に連結されたDM1と命名されたメイタンシノイドを含む免疫複合体を記載している。この結合体は、培養された結腸癌細胞に対しては、高度に細胞傷害性であることが見出され、そしてin vivoの腫瘍
生育アッセイにおいて抗腫瘍活性を示した。Chari et al.,Cancer Research 52:127−131(1992)は、ヒト結腸癌細胞株上の抗原に結合するマウス抗体A7に、またはHER−2/neu癌遺伝子に結合する別のマウスモノクローナル抗体TA.1にジスルフィドリンカーを介してメイタンシノイドを結合体化した免疫複合体を記載している。TA.1−メイタンシノイド結合体の細胞傷害性は、細胞当たり3×105のHER−2表面抗原を発現するヒト乳癌細胞株SK−BR−3に対してin vitroで試験された。薬剤結合体は、遊離メイタンシノイド薬剤と同様の細胞傷害性の程度を達成しており、これは、抗体分子当たりのメイタンシノイド分子の数を増大させることにより増大させることができた。A7−メイタンシノイド結合体は、マウスにおいて低い全身性の細胞傷害性を示した。
メイタンシノイド−抗体結合体
その処置指標を向上させる試みにおいて、メイタンシンおよびメイタンシノイドは、腫瘍細胞抗原に特異的に結合する抗体に結合体化された。メイタンシノイドを含む免疫複合体およびその治療的用途は、例えば、米国特許第5,208,020号、同第5,416,064号および欧州特許EP0425235B1(これらの開示は、本明細書により参考として明示的に援用される)に開示されている。Liu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:8618−8623(1996)は、ヒト直腸結腸癌に対して指向されたモノクローナル抗体C242に連結されたDM1と命名されたメイタンシノイドを含む免疫複合体を記載している。この結合体は、培養された結腸癌細胞に対しては、高度に細胞傷害性であることが見出され、そしてin vivoの腫瘍
生育アッセイにおいて抗腫瘍活性を示した。Chari et al.,Cancer Research 52:127−131(1992)は、ヒト結腸癌細胞株上の抗原に結合するマウス抗体A7に、またはHER−2/neu癌遺伝子に結合する別のマウスモノクローナル抗体TA.1にジスルフィドリンカーを介してメイタンシノイドを結合体化した免疫複合体を記載している。TA.1−メイタンシノイド結合体の細胞傷害性は、細胞当たり3×105のHER−2表面抗原を発現するヒト乳癌細胞株SK−BR−3に対してin vitroで試験された。薬剤結合体は、遊離メイタンシノイド薬剤と同様の細胞傷害性の程度を達成しており、これは、抗体分子当たりのメイタンシノイド分子の数を増大させることにより増大させることができた。A7−メイタンシノイド結合体は、マウスにおいて低い全身性の細胞傷害性を示した。
抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体−メイタンシノイド結合体(免疫複合体)
抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体−メイタンシノイド結合体は、抗体またはメイタンシノイド分子のいずれかの生物学的活性を有意に低下させることなくメイタンシノイド分子に抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1
286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を化学的に連結することによって調製される。抗体分子当たり平均3〜4個のメイタンシノイド分子を結合体化すると、抗体の機能または溶解性に悪影響を及ぼすことなく標的細胞の細胞傷害性を増強する場合に有効であることがわかっているが、1分子の毒素/抗体であっても、裸の抗体を使用したときよりも細胞傷害性を増強すると期待される。メイタンシノイドは、当該分野で周知であり、そして公知の手法により合成され得るか、または天然起源から単離され得る。適当なメイタンシノイドは、例えば、米国特許第5,208,020号ならびに上記した他の特許および特許でない出版物に開示されている。好ましいメイタンシノイドは、メイタンシノールおよび芳香環において、またはマインタンシノール分子(例えば、様々なメインタンシノールエステル)の他の位置において改変されているマインタンシノールアナログである。
抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体−メイタンシノイド結合体は、抗体またはメイタンシノイド分子のいずれかの生物学的活性を有意に低下させることなくメイタンシノイド分子に抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1
286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を化学的に連結することによって調製される。抗体分子当たり平均3〜4個のメイタンシノイド分子を結合体化すると、抗体の機能または溶解性に悪影響を及ぼすことなく標的細胞の細胞傷害性を増強する場合に有効であることがわかっているが、1分子の毒素/抗体であっても、裸の抗体を使用したときよりも細胞傷害性を増強すると期待される。メイタンシノイドは、当該分野で周知であり、そして公知の手法により合成され得るか、または天然起源から単離され得る。適当なメイタンシノイドは、例えば、米国特許第5,208,020号ならびに上記した他の特許および特許でない出版物に開示されている。好ましいメイタンシノイドは、メイタンシノールおよび芳香環において、またはマインタンシノール分子(例えば、様々なメインタンシノールエステル)の他の位置において改変されているマインタンシノールアナログである。
抗体−メイタンシノイド結合体を作製するための当該分野で公知の連結基が、多数存在し、それらとしては、例えば、米国特許第5,208,020号または欧州特許0425235B1ならびにChari et al.,Cancer Research 52:127−131(1992)に開示されているものが挙げられる。連結基としては、上で特定した特許に開示されているような、ジスルフィド基、チオエーテル基、酸不安定性基、光不安定性基、ペプチダーゼ不安定性基、またはエステラーゼ不安定性基が挙げられるが、ジスルフィド基およびチオエーテル基が好ましい。
抗体とメイタンシノイドとの結合体は、種々の2官能性タンパク質カップリング剤(例えば、N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)、スクシンイミジル−4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの2官能性誘導体(例えば、ジメチルアジピミデートHCL)、活性エステル(例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル)、アルデヒド(例えば、グルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えば、ビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビスジアゾニウム誘導体(例えば、ビス(p−ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トルエン2,6−ジイソシアネート)およびビス活性フッ素化合物(例えば、1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン))を用いて作製され得る。特に好ましいカップリング剤としては、ジスルフィド結合を提供するためのN−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)(Carlsson et al.,Biochem.J.,173:723−737[1978])およびN−スクシンイミジル−4−(2−ピリジルジチオ)ペンタノエート(SPP)が挙げられる。
リンカーは、連結の型に応じて様々な位置においてメイタンシノイド分子に結合され得る。例えば、エステル結合は、従来のカップリング手法を用いてヒドロキシル基との反応により形成され得る。この反応は、ヒドロキシル基を有するC3位、ヒロドキシメチルで改変されたC14位、ヒドロキシル基で改変されたC15位およびヒドロキシル基を有す
るC20位において起こり得る。連結は、メイタンシノールまたはメイタンシノールアナログのC3位において形成される。
るC20位において起こり得る。連結は、メイタンシノールまたはメイタンシノールアナログのC3位において形成される。
カリケアマイシン
目的の別の免疫複合体は、1つ以上のカリケアマイシン分子に結合体化された抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を含む。抗生物質のカリケアマイシンファミリーは、ピコモル以下の濃度において2本鎖DNA切断をもたらすことができる。カリケアマイシンファミリーの結合体の調製に関しては、米国特許第5,712,374号、同第5,714,586号、同第5,739,116号、同第5,767,285号、同第5,770,701号、同第5,770,710号、同第5,773,001号、同第5,877,296号を参照のこと(すべてAmerican Cyanamid Company)。使用され得るカリケアマイシンの構造アナログとしては、γ1 I、α2 I、α3 I、N−アセチル−γ1 I、PSAGおよびθI l(Himman et al.,Cancer Research 53:3336−3342(1993)、Lode et al.,Cancer Research 58:2925−2928(1998)および上記したAmerican Cyanamidに対する米国特許)が挙げられるが、これらに限定されない。抗体を結合体化できる別の抗腫瘍剤は、葉酸代謝拮抗薬であるQFAである。カリケアマイシンおよびQFAは、両方とも細胞内の作用部位を有し、原形質膜を容易に通過しない。したがって、抗体媒介性の内部移行を介したこれらの薬剤の細胞内取り込みは、その細胞傷害性作用を大きく増大させる。
目的の別の免疫複合体は、1つ以上のカリケアマイシン分子に結合体化された抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を含む。抗生物質のカリケアマイシンファミリーは、ピコモル以下の濃度において2本鎖DNA切断をもたらすことができる。カリケアマイシンファミリーの結合体の調製に関しては、米国特許第5,712,374号、同第5,714,586号、同第5,739,116号、同第5,767,285号、同第5,770,701号、同第5,770,710号、同第5,773,001号、同第5,877,296号を参照のこと(すべてAmerican Cyanamid Company)。使用され得るカリケアマイシンの構造アナログとしては、γ1 I、α2 I、α3 I、N−アセチル−γ1 I、PSAGおよびθI l(Himman et al.,Cancer Research 53:3336−3342(1993)、Lode et al.,Cancer Research 58:2925−2928(1998)および上記したAmerican Cyanamidに対する米国特許)が挙げられるが、これらに限定されない。抗体を結合体化できる別の抗腫瘍剤は、葉酸代謝拮抗薬であるQFAである。カリケアマイシンおよびQFAは、両方とも細胞内の作用部位を有し、原形質膜を容易に通過しない。したがって、抗体媒介性の内部移行を介したこれらの薬剤の細胞内取り込みは、その細胞傷害性作用を大きく増大させる。
他の細胞傷害性薬剤
本発明の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、
抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体に結合体化され得る他の抗腫瘍剤としては、BCNU、ストレプトゾシン(streptozoicin)、ビンクリスチンおよび5−フルオロウラシル、米国特許第5,053,394号、同第5,770,710号に記載の総称LL−E33288複合体として知られる薬剤ファミリー、ならびに、エスペラミシン(米国特許第5,877,296号)が挙げられる。
本発明の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、
抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体に結合体化され得る他の抗腫瘍剤としては、BCNU、ストレプトゾシン(streptozoicin)、ビンクリスチンおよび5−フルオロウラシル、米国特許第5,053,394号、同第5,770,710号に記載の総称LL−E33288複合体として知られる薬剤ファミリー、ならびに、エスペラミシン(米国特許第5,877,296号)が挙げられる。
使用され得る酵素的に活性なトキシンおよびそのフラグメントとしては、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性フラグメント、外毒素A鎖(Pseudomonas aeruginosa由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデクシンA鎖、アルファ−サルシン、Aleurites fordiiタンパク質、ジアンチンタンパク質、Phytolaca americanaタンパク質(PAPI、PAPIIおよびPAP−S)、momordica charantiaインヒビター、クルシン、クロチン、sapaonaria officinalisインヒビター、ゲロニン、マイトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシンおよびトリコテシンが挙げられる。例えば、1993年10月28日に公開されたWO93/21232を参照のこと。
本発明はさらに、抗体と核溶解活性を有する化合物(例えば、リボヌクレアーゼまたはDNAエンドヌクレアーゼ(例えば、デオキシリボヌクレアーゼ;DNase))との間に形成される免疫複合体を企図している。
腫瘍の選択的破壊のためには、抗体は、高度に放射性の原子を含んでよい。種々の放射性同位体が、放射性結合体化抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体の作製のために利用可能である。例としては、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212およびLuの放射性同位体が挙げられる。診断のために結合体を使用する場合、その結合体は、シンチグラフィー試験用の放射性原子、例えば、tc99mもしくはI123、または核磁気共鳴(NMR)イメージング(磁気共鳴イメージングMRIとしても公知の)要のスピン標識(例えば、ヨウ素−123、さらにヨウ素−131、インジウム−111、フッ素−19、炭素−13、窒素−15、酸素−17、ガドリニウム、マンガンまたは鉄)を含み得る。
放射標識または他の標識を、公知の方法で結合体に取り込ませてよい。例えば、水素の代わりにフッ素−19を含む適当なアミノ酸前駆体を用いて、ペプチドを生合成し得るか、またはアミノ酸化学合成法により合成し得る。標識(例えば、tc99mまたはI123、Re186、Re188およびIn111)をペプチド内のシステイン残基を介して結合することができる。イットリウム−90は、リシン残基を介して結合できる。IODOGEN法(Fraker et al(1978)Biochem.Biophys.Res.Commun.80:49−57)を用いてヨウ素−123を取り込むことができる。“Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy”(Chatal,CRC Press 1989)は、他の方法を詳細に説明している。
抗体と細胞傷害性薬剤との結合体は、種々の2官能性のタンパク質カップリング剤(例えば、N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルチオ)プロピオネート(SPDP)、スクシンイミジル−4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの2官能性誘導体(例えば、ジメチルアジピミデートHCL)、活性エステル(例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル)、アルデヒド(例えば、グルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えば、ビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビスジアゾニウム誘導体(例えば、ビス(p−ジアゾニウムベンゾイル)エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トリエン2,6−ジイソシアネート)およびビス活性フッ素化合物(例えば、1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン)を用いて作製され得る。例えば、リシン免疫トキシンは、Vitetta et al.,Science,238:1098(1987)に記載されているように調製され得る。炭素−14−標識1−イソチオシアナトベンジル−3−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸(MX−DTPA)は、抗体への放射性核種の結合体化のための例示的なキレート剤である。WO94/11026を参照のこと。リンカーは、細胞内での細胞傷害性薬剤の放出を容易にする「切断可能なリンカー」であり得る。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、光不安定性リンカー、ジメチルリンカーまたはジスルフィド含有リンカー(Chari et al.,Cancer Research 52:127−131(1992);米国特許第5,208,020号)が使用され得る。
あるいは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体および細胞傷害性薬剤を含む融合タンパク質は、例えば、組換え手法またはペプチド合成により作製され得る。DNAの長さは、相互に隣接するか、または結合体の所望の特性を損なわないリンカーペプチドをコードする領域によって分離されている結
合体の2つの部分をコードするそれぞれの領域を含み得る。
合体の2つの部分をコードするそれぞれの領域を含み得る。
本発明によれば、抗体−レセプター結合体を患者に投与し、その後浄化剤を用いて循環系から未結合の結合体を除去し、次に細胞傷害性薬剤(例えば、放射性ヌクレオチド)に結合体化された「リガンド」(例えば、アビジン)を投与する、腫瘍の予備ターゲティングにおいて利用するための「レセプター」(例えば、ストレプトアビジン)に抗体は結合体化され得る。
10.免疫リポソーム(Immunoliposome)
本明細書に開示した抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体はまた、免疫リポソームとして処方され得る。「リポソーム」は、哺乳動物における薬剤の送達のために有用な様々な型の脂質、リン脂質および/または界面活性剤から構成される小型のビヒクルである。リポソームの成分は、一般に、生物学的膜の脂質の配置と類似の二層形態で配置している。抗体を含むリポソームは、例えば、Epstein et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3688(1985);Hwang et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4030(1980);米国特許第4,485,045号および同第4,544,545号;および1997年10月23日に公開されたWO97/38731に記載されているような当該分野で公知の方法により調製される。長期の循環時間を有するリポソームは、米国特許第5,013,556号に開示されている。
本明細書に開示した抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体はまた、免疫リポソームとして処方され得る。「リポソーム」は、哺乳動物における薬剤の送達のために有用な様々な型の脂質、リン脂質および/または界面活性剤から構成される小型のビヒクルである。リポソームの成分は、一般に、生物学的膜の脂質の配置と類似の二層形態で配置している。抗体を含むリポソームは、例えば、Epstein et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3688(1985);Hwang et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4030(1980);米国特許第4,485,045号および同第4,544,545号;および1997年10月23日に公開されたWO97/38731に記載されているような当該分野で公知の方法により調製される。長期の循環時間を有するリポソームは、米国特許第5,013,556号に開示されている。
特に有用なリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロールおよびPEG誘導体化ホスファチジルエタノールアミン(PEG−PE)を含む脂質組成物を用いて逆相蒸発法により作製することができる。リポソームを、所定の孔径のフィルターに通して押し出すことにより、所望の直径を有するリポソームが得られる。本発明の抗体のFab’フラグメントは、ジスルフィド相互交換反応によりMartin et al.,J.Biol.Chem.257:286−288(1982)に記載されているようにリポソームに結合体化され得る。化学療法剤は、必要に応じてリポソーム内に含まれる。Gabizon et al.,J.National Cancer Inst.81(19):1484(1989)を参照のこと。
11.抗体の薬学的組成物
本明細書中で同定されるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、
PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドならびに前述したスクリーニングアッセイにより同定される他の分子に特異的に結合する抗体は、薬学的組成物の形態で様々な障害の処置のために投与され得る。
本明細書中で同定されるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、
PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドならびに前述したスクリーニングアッセイにより同定される他の分子に特異的に結合する抗体は、薬学的組成物の形態で様々な障害の処置のために投与され得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが細胞内にあり、抗体全体をインヒビターとして使用する場合、内部移行する抗体が好ましい。しかしながら、リポフェクションまたはリポソームはまた、抗体または抗体フラグメントを細胞に送達するためにも使用できる。抗体フラグメントを用いる場合、標的タンパク質の結合ドメインに特異的に結合する最も小さい阻害性フラグメントが好ましい。例えば、抗体の可変領域の配列に基づいて、標的タンパク質配列に結合する能力を保持しているペプチド分子を設計できる。そのようなペプチドは、化学合成および/または組換えDNA技術による調製が可能である。例えば、Marasco et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:7889−7893(1993)を参照のこと。本明細書中の処方物はまた、処置すべき特定の適応症に必要な2つ以上の活性化合物、好ましくは、相互に悪影響を及ぼさない補足的な活性を有するものを含み得る。あるいは、またはさらに、その組成物は、その機能を増強する薬剤(例えば、細胞傷害性薬剤、サイトカイン、化学療法剤または成長抑制剤)を含み得る。このような分子は、意図する目的のために有効である量における組み合わせにおいて適宜存在する。
活性成分はまた、例えば、コアセルベーション法または界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えば、それぞれヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチンマイクロカプセルおよびポリ−(メチルメタクリレート)マイクロカプセル中、コロイド状薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミン微小球、マイクロエマルジョン、ナノ粒子およびナノカプセル)中、またはマクロエマルジョン中に封入してもよい。このような手法は、前出のRemington’s Pharmaceuical Sciencesに開示さ
れている。
れている。
in vivo投与のために使用される処方物は、滅菌されていなければならない。これは、滅菌された濾過膜に通す濾過により容易に達成される。
徐放性処方物が調製され得る。徐放性処方物の適当な例としては、抗体を含む固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、そのようなマトリックスは、成形された物、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(2−ヒドロキシエチル−メタクリレート)またはポリ(ビニルアルコール))、ポリ乳酸(米国特許第3,773,919号)、L−グルタミン酸とγエチル−L−グルタメートとのコポリマー、非分解性エチレン−酢酸ビニル、分解性乳酸−グリコール酸コポリマー(例えば、LUPRON DEPOTTM(乳酸−グリコール酸コポリマーおよび酢酸ロイプロリドから構成される注射可能な微小球))およびポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。エチレン−酢酸ビニルおよび乳酸−グリコール酸などのポリマーは、100日間にわたる分子の放出を可能にするが、特定のヒドロゲルは、より短い時間にタンパク質を放出する。カプセル化抗体が身体内に長時間残存する場合、それらは、37℃の水分への曝露の結果として、変性するか凝集し、生物学的活性を消失するか、または免疫原性が変化する可能性がある。合理的なストラテジは、関与する機序に応じて安定化のために工夫することができる。例えば、凝集の機序がチオ−ジスルフィド交換を介した分子間S−S結合の形成であることが発見されれば、スルフィドリル残基の改変、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含有量の制御、適切な添加物の使用および特定のポリマーマトリックス組成物の開発によって安定化が達成され得る。
G.抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体の使用
本発明の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO186
4、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体は、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;胚発生の障害もしくは致死性または代謝異常に関する様々な治療上および/または診断上の有用性を有する。例えば、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に関する診断アッセイ、例えば、特定の細胞、組織または血清におけるその発現(および一部の場合は、差次的発現)を検出することにおいて使用され得る。当該分野で公知の様々な診断アッセイの手法、例えば、競合的結合アッセイ、直接または間接のサンドイッチアッセイおよび不均質または均質な相のいずれかにおいて行う免疫沈降アッセイが使用され得る[Zola,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques,CRC Press,Inc.(1987)pp.147−158]。診断アッセイにおいて使用される抗体は、検出可能な部分で標識できる。その検出可能な部分は、直接的または間接的に検出可能なシグナルを生成することができるものでなければならない。例えば、その検出可能な部分は、放射性同位体(例えば、3H、14C、32P、35Sまたは125I)、蛍光または化学発光化合物(例えば、フルオレセインイソチオシアネ
ート、ローダミンまたはルシフェリン)または酵素(例えば、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼ)であり得る。その検出可能な部分に抗体を結合体化するための当該分野で公知の任意の方法(Hunter et al.,Nature,144:945(1962);David et al.,Biochemistry,13:1014(1974);Pain et al.,J.Immunol.Meth.,40:219(1981);およびNygren,J.Histochem. and Cytochem.,30:407(1982)に記載されているものを含む)を使用し得る。
本発明の抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO186
4、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体は、神経障害;心臓血管、内皮もしくは血管形成の障害;免疫障害;腫瘍学的障害;胚発生の障害もしくは致死性または代謝異常に関する様々な治療上および/または診断上の有用性を有する。例えば、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に関する診断アッセイ、例えば、特定の細胞、組織または血清におけるその発現(および一部の場合は、差次的発現)を検出することにおいて使用され得る。当該分野で公知の様々な診断アッセイの手法、例えば、競合的結合アッセイ、直接または間接のサンドイッチアッセイおよび不均質または均質な相のいずれかにおいて行う免疫沈降アッセイが使用され得る[Zola,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques,CRC Press,Inc.(1987)pp.147−158]。診断アッセイにおいて使用される抗体は、検出可能な部分で標識できる。その検出可能な部分は、直接的または間接的に検出可能なシグナルを生成することができるものでなければならない。例えば、その検出可能な部分は、放射性同位体(例えば、3H、14C、32P、35Sまたは125I)、蛍光または化学発光化合物(例えば、フルオレセインイソチオシアネ
ート、ローダミンまたはルシフェリン)または酵素(例えば、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼ)であり得る。その検出可能な部分に抗体を結合体化するための当該分野で公知の任意の方法(Hunter et al.,Nature,144:945(1962);David et al.,Biochemistry,13:1014(1974);Pain et al.,J.Immunol.Meth.,40:219(1981);およびNygren,J.Histochem. and Cytochem.,30:407(1982)に記載されているものを含む)を使用し得る。
抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体はまた、組換え細胞培養物または天然起源からのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのアフィニティー精製にも有用である。このプロセスにおいて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、
PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対する抗体を当該分野で周知の方法を用いてSephadex樹脂または濾紙などの適当な支持体上に固定化する。次に、固定化された抗体を、精製すべきPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含むサンプルと接触させ、その後、固定化された抗体に結合しているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド以外のサンプル中の実質的にすべての物質を除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に抗体からPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO1964
6、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを遊離させる別の適当な溶媒で支持体を洗浄する。
PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに対する抗体を当該分野で周知の方法を用いてSephadex樹脂または濾紙などの適当な支持体上に固定化する。次に、固定化された抗体を、精製すべきPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含むサンプルと接触させ、その後、固定化された抗体に結合しているPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド以外のサンプル中の実質的にすべての物質を除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に抗体からPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO1964
6、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを遊離させる別の適当な溶媒で支持体を洗浄する。
以下の実施例は、説明のみを目的としており、本発明の範囲をいかなる面でも限定する意図はない。
本明細書中で引用したすべての特許および文献の参考資料は、その全体が本明細書により参考として援用される。
実施例において言及される市販の試薬は、他に指示がない限り、製造者の指示書に従って使用した。以下の実施例において、また本明細書を通して、ATCCアクセッション番号によって同定される細胞の起源は、American Type Culture Collection,Manassas,VAである。
実施例1:新規のポリペプチドおよびそれらをコードするcDNAを同定するための細胞外ドメインホモロジースクリーニング
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を使用して、ESTデータベースを検索した。そのESTデータベースは、公的データベース(例えば、Dayhoff、GenBank)および企業のデータベース(例えば、LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST−2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,WA)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を使用して、ESTデータベースを検索した。そのESTデータベースは、公的データベース(例えば、Dayhoff、GenBank)および企業のデータベース(例えば、LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST−2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して、ECDタンパク質配列の、EST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,WA)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
この細胞外ドメインホモロジースクリーニングを使用して、コンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他の同定されているEST配列に対して構築した。さらに、得られたコンセンサスDNA配列を、しばしば(必ずしもそうではないが)BLASTまたはBLAST−2およびphrapの繰り返しサイクルを使用して、伸長することにより、上に記載したEST配列の起源を使用してできる限りコンセンサス配列を伸長した。
上に記載したように得られたコンセンサス配列に基づいて、次いでオリゴヌクレオチドを、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するためおよびPROポリペプチドについての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために合成し、使用した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biologyのように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方
を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化(hemikinased)アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
実施例2:アミラーゼスクリーニングによるcDNAクローンの単離
1.オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリーの調製
mRNAを、Invitrogen,San Diego,CA(Fast Track2)の試薬およびプロトコルを使用して目的のヒト組織から単離した。このRNAを使用し、Life Technologies,Gaithersburg,MDの試薬(Super Script Plasmid System)およびプロトコルを使用して、ベクターpRK5Dに、オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリーを生成した。この手順において、二本鎖cDNAのうち、1000bpより大きいものを分離し、SalI/NotIリンカー付加されたcDNAを、XhoI/NotI切断されたベクターにクローニングした。pRK5Dは、XhoI/NotI cDNAクローニング部位の前に、sp6転写開始部位、SfiI制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。
1.オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリーの調製
mRNAを、Invitrogen,San Diego,CA(Fast Track2)の試薬およびプロトコルを使用して目的のヒト組織から単離した。このRNAを使用し、Life Technologies,Gaithersburg,MDの試薬(Super Script Plasmid System)およびプロトコルを使用して、ベクターpRK5Dに、オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリーを生成した。この手順において、二本鎖cDNAのうち、1000bpより大きいものを分離し、SalI/NotIリンカー付加されたcDNAを、XhoI/NotI切断されたベクターにクローニングした。pRK5Dは、XhoI/NotI cDNAクローニング部位の前に、sp6転写開始部位、SfiI制限酵素部位の順でそれらを有するクローニングベクターである。
2.ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリーの調製
1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すために、2次cDNAライブラリーを構築した。Sp6RNAを1次ライブラリー(上記)から生成し、このRNAを使用し、Life Technologiesの試薬(Super Script Plasmid System,上を参照のこと)およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリーをベクターpSST−AMY.0に構築した。この手順において、二本鎖cDNAを、500〜1000bpに分離し、NotIアダプターに平滑末端でリンカー付加し、SfiIで切断し、そしてSfiI/NotIで切断されたベクターにクローニングした。pSST−AMY.0は、cDNAクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター(分泌シグナルなしの成熟配列)、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたcDNAは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。
1次cDNAクローンの5’末端を優先的に表すために、2次cDNAライブラリーを構築した。Sp6RNAを1次ライブラリー(上記)から生成し、このRNAを使用し、Life Technologiesの試薬(Super Script Plasmid System,上を参照のこと)およびプロトコルを使用して、ランダムプライマーをプライマーとするcDNAライブラリーをベクターpSST−AMY.0に構築した。この手順において、二本鎖cDNAを、500〜1000bpに分離し、NotIアダプターに平滑末端でリンカー付加し、SfiIで切断し、そしてSfiI/NotIで切断されたベクターにクローニングした。pSST−AMY.0は、cDNAクローニング部位およびマウスアミラーゼ配列の前に酵母アルコールデヒドロゲナーゼプロモーター(分泌シグナルなしの成熟配列)、続いて、クローニング部位の後に酵母アルコールデヒドロゲナーゼターミネーターを有するクローニングベクターである。このようにして、アミラーゼ配列とインフレームで融合されたこのベクターにクローニングされたcDNAは、適切にトランスフェクトされた酵母コロニーからアミラーゼを分泌するようになる。
3.形質転換および検出
上の段落2に記載したライブラリー由来のDNAを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントDH10B細菌(Life Technologies,20mL)に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、SOC培地(Life Technologies,1mL)を加えて、混合物を37℃で30分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な150mmLBプレート20枚に播き、16時間インキュベートした(37℃)。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのDNAを標準的なプロトコル、例えば、CsCl勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたDNAを以下の酵母プロトコルに用いた。
上の段落2に記載したライブラリー由来のDNAを氷上で冷やし、エレクトロコンピテントDH10B細菌(Life Technologies,20mL)に加えた。次いで細菌およびベクター混合物を、製造者によって推奨されているように電気穿孔処理した。続いて、SOC培地(Life Technologies,1mL)を加えて、混合物を37℃で30分間インキュベートした。次いで、形質転換体をアンピシリンを含む標準的な150mmLBプレート20枚に播き、16時間インキュベートした(37℃)。陽性のコロニーをプレートから拾い、そのDNAを標準的なプロトコル、例えば、CsCl勾配を使用して細菌のペレットから単離した。次いで、精製されたDNAを以下の酵母プロトコルに用いた。
酵母法は、3つのカテゴリーに分けられる:(1)プラスミド/cDNA結合ベクターによる酵母の形質転換;(2)アミラーゼを分泌する酵母クローンの検出および単離;ならびに(3)酵母コロニーからの直接の挿入断片のPCR増幅ならびに配列決定およびさらなる解析のためのそのDNAの精製。
使用した酵母株は、HD56−5A(ATCC−90785)であった。この株は、以下の遺伝子型:MATアルファ、ura3−52、leu2−3、leu2−112、his3−11、his3−15、MAL+、SUC+、GAL+を有する。好ましくは、翻訳後経路を欠く酵母変異体が、使用され得る。このような変異体は、sec71、sec72、sec62において転座不全(translocation deficient)対立遺伝子を有し得、切断されたsec71が最も好ましい。あるいは、これらの遺伝子の正常な作用を干渉するアンタゴニスト(アンチセンスヌクレオチドおよび/またはリガンドを含む)、この翻訳後経路に関連する他のタンパク質(例えば、SEC61p、SEC72p、SEC62p、SEC63p、TDJ1pまたはSSA1p−4p)またはこれらのタンパク質の複合体形成物もまた、好ましくは、アミラーゼを発現する酵母と組み合わせて使用され得る。
形質転換は、Gietz et al.,Nucl.Acid.Res.,20:1425(1992)によって概説されているプロトコルに基づいて行われた。次いで、形質転換された細胞を寒天からYEPD複合培地ブロス(100mL)に接種し、30℃で一晩生育した。YEPDブロスを、Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,NY,p.207(1994)に記載されているように調製した。次いで、一晩培養したものを、新鮮YEPDブロス(500mL)に約2×106細胞/mL(およそOD600=0.1)に希釈し、1×107細胞/mL(およそOD600=0.4〜0.5)まで再び生育した。
次いで、細胞を回収し、形質転換に向けて調製し、GS3ローター瓶に移し、Sorval GS3ローターにて5,000rpmで5分間、遠心分離し、上清を廃棄し、次いで、滅菌水に再懸濁し、Beckman GS−6KR遠心機において、50mLファルコンチューブにて3,500rpmで再度遠心分離した。その上清を廃棄し、続いて細胞をLiAc/TE(10mL,10mM Tris−HCl,1mM EDTA pH7.5,100mM Li2OOCCH3)で洗浄し、LiAc/TE(2.5mL)に再懸濁した。
微量遠心チューブ内で、調製した細胞(100μL)と、新たに変性された一本鎖サケ精巣DNA(Lofstrand Labs,Gaithersburg,MD)と形質転換DNA(1μg、10μL未満の体積)とを混合することによって形質転換を起こした。混合物をボルテックスにより手短に混合し、次いで、40%PEG/TE(600μL,40%ポリエチレングリコール−4000,10mM Tris−HCl,1mM EDTA,100mM Li2OOCCH3,pH7.5)を加えた。この混合物を穏やかに混合し、30分間、撹拌しながら30℃でインキュベートした。次いで、細胞を15分間、42℃の熱ショックにかけ、反応容器を12,000rpmで5〜10秒間微量遠心し、デカントし、そしてTE(500μL,10mM Tris−HCl,1mM EDTA pH7.5)に再懸濁した後、再度遠心分離した。次いで、細胞をTE(1mL)に希釈し、アリコート(200μL)を、150mm増殖プレート(VWR)に予め調製された選択培地に播いた。
あるいは、多数の少量反応の代わりに、形質転換を、単一の大規模反応を使用して実施
し、ここで試薬の量は、それに合うようにスケールアップした。
し、ここで試薬の量は、それに合うようにスケールアップした。
使用した選択培地は、Kaiser et al.,Methods in Yeast Genetics,Cold Spring Harbor Press,Cold
Spring Harbor,NY,p.208−210(1994)に記載されているように調製されたウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天(SCD−Ura)であった。形質転換体を、30℃にて2〜3日間生育した。
Spring Harbor,NY,p.208−210(1994)に記載されているように調製されたウラシルを欠く合成完全デキストロース寒天(SCD−Ura)であった。形質転換体を、30℃にて2〜3日間生育した。
アミラーゼを分泌するコロニーの検出を、選択増殖培地中に赤デンプン(red starch)を含ませることによって行った。Biely et al.,Anal.Biochem.,172:176−179(1988)によって報告されている手順により、デンプンを赤色色素(Reactive Red−120,Sigma)に結合させた。結合したデンプンを、最終濃度0.15%(w/v)でSCD−Ura寒天プレートに取り込ませ、リン酸カリウムを用いてpH7.0(50〜100mMの最終濃度)まで緩衝した。
十分に分離し、同定可能な単一のコロニーを得るために、陽性のコロニーを拾い、新鮮選択培地(150mmプレート上)に画線した。アミラーゼ分泌が陽性の十分に分離した単一のコロニーを、緩衝SCD−Ura寒天に赤デンプンを直接取り込むことによって検出した。陽性のコロニーを、デンプンを分解して、陽性のコロニーの周辺に直接可視化されるクリアなハローを生じる能力によって判定した。
4.PCR増幅によるDNAの単離
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、96ウェルプレート内の滅菌水(30μL)に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート(5μL)を、25μL容量中、以下:0.5μLのKlentaq(Clontech,Palo Alto,CA);4.0μLの10mM dNTP’s(Perkin Elmer−Cetus);2.5μLのKentaq緩衝液(Clontech);0.25μLの順方向オリゴ1;0.25μLの逆方向オリゴ2;12.5μLの蒸留水を含むPCR反応用の鋳型として使用した。順方向オリゴヌクレオチド1の配列は:
5’−TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT−3’(配列番号143)
逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:
5’−CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT−3’(配列番号144)
であった。次いで、PCRを以下のとおりに行った:
a.変性 92℃、5分
b.変性 92℃、30秒
アニーリング 59℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
c.変性 92℃、30秒
アニーリング 57℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
d.変性 92℃,30秒
アニーリング 55℃,30秒
伸長 72℃,60秒を25サイクル
e.4℃保持
オリゴヌクレオチドの下線を引いた領域を、それぞれ、ADHプロモーター領域およびアミラーゼ領域にアニーリングさせ、挿入断片が存在しないとき、ベクターpSST−AMY.0から307bpの領域を増幅した。代表的には、これらのオリゴヌクレオチドの
5’末端の最初の18ヌクレオチドは、配列決定プライマー用のアニーリング部位を含んでいた。したがって、空のベクターからのPCR反応の総産物は、343bpであった。しかしながら、シグナル配列融合cDNAは、かなり長いヌクレオチド配列を生じた。
4.PCR増幅によるDNAの単離
陽性のコロニーを単離したら、その一部をつま楊枝で拾い、96ウェルプレート内の滅菌水(30μL)に希釈した。このとき、陽性のコロニーを、凍結して次の解析のために保存するか、またはすぐに増幅した。細胞のアリコート(5μL)を、25μL容量中、以下:0.5μLのKlentaq(Clontech,Palo Alto,CA);4.0μLの10mM dNTP’s(Perkin Elmer−Cetus);2.5μLのKentaq緩衝液(Clontech);0.25μLの順方向オリゴ1;0.25μLの逆方向オリゴ2;12.5μLの蒸留水を含むPCR反応用の鋳型として使用した。順方向オリゴヌクレオチド1の配列は:
5’−TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT−3’(配列番号143)
逆方向オリゴヌクレオチド2の配列は:
5’−CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCATT−3’(配列番号144)
であった。次いで、PCRを以下のとおりに行った:
a.変性 92℃、5分
b.変性 92℃、30秒
アニーリング 59℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
c.変性 92℃、30秒
アニーリング 57℃、30秒
伸長 72℃、60秒を3サイクル
d.変性 92℃,30秒
アニーリング 55℃,30秒
伸長 72℃,60秒を25サイクル
e.4℃保持
オリゴヌクレオチドの下線を引いた領域を、それぞれ、ADHプロモーター領域およびアミラーゼ領域にアニーリングさせ、挿入断片が存在しないとき、ベクターpSST−AMY.0から307bpの領域を増幅した。代表的には、これらのオリゴヌクレオチドの
5’末端の最初の18ヌクレオチドは、配列決定プライマー用のアニーリング部位を含んでいた。したがって、空のベクターからのPCR反応の総産物は、343bpであった。しかしながら、シグナル配列融合cDNAは、かなり長いヌクレオチド配列を生じた。
PCRの後、反応物(5μL)のアリコートを、Sambrook et al.,前出に記載されているようなTris−ホウ酸塩−EDTA(TBE)緩衝液系を使用した1%アガロースゲルのアガロースゲル電気泳動にかけた。400bpより長い単一の強力なPCR産物を生じたクローンを、96Qiaquick PCR精製カラム(Qiagen Inc.,Chatsworth,CA)で精製後、DNA配列決定によってさらに解析した。
実施例3:シグナルアルゴリズム解析を使用したcDNAクローンの単離
様々なポリペプチドをコードする核酸配列を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’−末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。アルゴリズムの使用により、数多くのポリペプチドをコードする核酸配列が同定された。
様々なポリペプチドをコードする核酸配列を、Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、ESTに基づく企業のシグナル配列探索アルゴリズムを適用することによって同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。シグナル配列アルゴリズムは、問題の配列または配列フラグメントの5’−末端の第1および必要に応じて第2のメチオニンコドン(ATG)の周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後に続くヌクレオチドは、いかなる終止コドンも含まない、少なくとも35個の明白なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが、必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNAおよび対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。アルゴリズムの使用により、数多くのポリペプチドをコードする核酸配列が同定された。
上記の実施例1〜3で説明されている技術を使用して、本明細書中に開示されるようなPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードする数多くの完全長cDNAクローンを同定した。次いで、これらのcDNAを、以下の表7に示すように、ブダペスト条約に従ってAmerican Type Culture Collection,10801 University Blvd.,Manassas,VA20110−2209,USA(ATCC)に寄託した。さらに、PRO69122ポリペプチドをコードするDNA284870の配列をGenBankアクセッション番号AF052059から同定し;PR
O342ポリペプチドをコードするDNA38649の配列をGenBankアクセッション番号AY358342から同定し;PRO36935ポリペプチドをコードするDNA336539の配列をGenBankアクセッション番号Z29083から同定し、PRO4979ポリペプチド(PRO38844ポリペプチドとしても公知である)をコードするDNA222844の配列をGenBankアクセッション番号AB098597から同定し;PRO6001ポリペプチドをコードするDNA98380の配列をGenBankアクセッション番号AY358785から同定し;PRO37337ポリペプチドをコードするDNA226874の配列をGenBankアクセッション番号Y07909から同定し;PRO37496ポリペプチドをコードするDNA227033の配列をGenBankアクセッション番号BC003006から同定し;そしてPRO21718ポリペプチドをコードするDNA188342の配列をGenBankアクセッション番号AF146761から同定した。
O342ポリペプチドをコードするDNA38649の配列をGenBankアクセッション番号AY358342から同定し;PRO36935ポリペプチドをコードするDNA336539の配列をGenBankアクセッション番号Z29083から同定し、PRO4979ポリペプチド(PRO38844ポリペプチドとしても公知である)をコードするDNA222844の配列をGenBankアクセッション番号AB098597から同定し;PRO6001ポリペプチドをコードするDNA98380の配列をGenBankアクセッション番号AY358785から同定し;PRO37337ポリペプチドをコードするDNA226874の配列をGenBankアクセッション番号Y07909から同定し;PRO37496ポリペプチドをコードするDNA227033の配列をGenBankアクセッション番号BC003006から同定し;そしてPRO21718ポリペプチドをコードするDNA188342の配列をGenBankアクセッション番号AF146761から同定した。
表7
材料 ATCC寄託番号 寄託日
DNA30871−1157 209380 1997年10月16日DNA32286−1191 209385 1997年10月16日DNA33107−1135 209251 1997年9月16日
DNA35557−1137 209255 1998年9月16日
DNA36350−1158 209378 1997年10月16日DNA61601−1223 209713 1998年3月31日
DNA40982−1235 209433 1997年11月7日
DNA47470−1130P1 209422 1997年10月28日DNA44189−1322 209699 1998年3月26日
DNA49152−1324 209813 1998年4月28日
DNA52185−1370 209861 1998年5月14日
DNA58855−1422 203018 1998年6月23日
DNA56050−1455 203011 1998年6月23日
DNA58727−1474 203171 1998年9月1日
DNA62377−1381−1 203552 1998年12月22日DNA58850−1495 209956 1998年6月9日
DNA59586−1520 203288 1998年9月29日
DNA64896−1539 203238 1998年9月9日
DNA64903−1553 203223 1998年9月15日
DNA59218−1559 203287 1998年9月29日
DNA59588−1571 203106 1998年8月11日
DNA60608−1577 203126 1998年8月18日
DNA58743−1609 203154 1998年8月25日
DNA71159−1617 203135 1998年8月18日
DNA73401−1633 203273 1998年9月22日
DNA68818−2536 203657 1999年2月9日
DNA61185−1646 203464 1998年11月17日DNA58732−1650 203290 1998年9月29日
DNA68880−1676 203319 1998年10月6日
DNA73735−1681 203356 1998年10月20日DNA62845−1684 203361 1998年10月20日DNA71286−1687 203357 1998年10月20日DNA77648−1688 203408 1998年10月27日DNA77301−1708 203407 1998年10月27日DNA68883−1691 203535 1998年12月15日
DNA76396−1698 203471 1998年11月17日DNA77652−2505 203480 1998年11月17日DNA71235−1706 203584 1999年1月12日
DNA45409−2511 203579 1999年1月12日
DNA82302−2529 203534 1998年12月15日DNA82340−2530 203547 1998年12月22日DNA59844−2542 203650 1999年2月9日
DNA90842−2574 203845 1999年3月16日
DNA96893−2621 PTA−12 1999年5月4日
DNA62849−2647 PTA−205 1999年6月8日
DNA97003−2649 PTA−43 1999年5月11日
DNA94849−2960 PTA−2306 2000年7月25日
DNA115291−2681 PTA−202 1999年6月8日
DNA96988−2685 PTA−384 1999年7月20日
DNA105680−2710 PTA−483 1999年8月3日
DNA110700−2716 PTA−512 1999年8月10日
DNA108722−2743 PTA−552 1999年8月17日
DNA108670−2744 PTA−546 1999年8月17日
DNA119535−2756 PTA−613 1999年8月31日
DNA108700−2802 PTA−1093 1999年12月22日DNA119474−2803 PTA−1097 1999年12月22日DNA145841−2868 PTA−1678 2000年4月11日
DNA149911−2885 PTA−1776 2000年4月25日
DNA168028−2956 PTA−2304 2000年7月25日
DNA154095−2998 PTA−2591 2000年10月10日DNA185171−2994 PTA−2513 2000年9月26日
DNA171732−3100 PTA−3329 2001年4月24日
特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約(ブダペスト条約)の規定に基づいてこれらの寄託を行った。これは、寄託日から30年間、寄託物の生存可能な培養物の維持を保証するものである。寄託物は、ブダペスト条約の規定に基づいてGenentech,Inc.とATCCとの合意に従い、ATCCから入手可能であり、これは、どれが最初であろうとも、関連の米国特許の発行時または任意の米国または外国の特許出願の公開時に、寄託培養物の子孫が永久かつ無制限に入手可能であることを保証し、米国特許法第122条およびそれに従う特許庁長官規則(特に参照番号886OG638の37CFR第1.14条を含む)に従って権利を有すると米国商標特許庁長官が決定した者に子孫を入手可能とすることを保証するものである。
材料 ATCC寄託番号 寄託日
DNA30871−1157 209380 1997年10月16日DNA32286−1191 209385 1997年10月16日DNA33107−1135 209251 1997年9月16日
DNA35557−1137 209255 1998年9月16日
DNA36350−1158 209378 1997年10月16日DNA61601−1223 209713 1998年3月31日
DNA40982−1235 209433 1997年11月7日
DNA47470−1130P1 209422 1997年10月28日DNA44189−1322 209699 1998年3月26日
DNA49152−1324 209813 1998年4月28日
DNA52185−1370 209861 1998年5月14日
DNA58855−1422 203018 1998年6月23日
DNA56050−1455 203011 1998年6月23日
DNA58727−1474 203171 1998年9月1日
DNA62377−1381−1 203552 1998年12月22日DNA58850−1495 209956 1998年6月9日
DNA59586−1520 203288 1998年9月29日
DNA64896−1539 203238 1998年9月9日
DNA64903−1553 203223 1998年9月15日
DNA59218−1559 203287 1998年9月29日
DNA59588−1571 203106 1998年8月11日
DNA60608−1577 203126 1998年8月18日
DNA58743−1609 203154 1998年8月25日
DNA71159−1617 203135 1998年8月18日
DNA73401−1633 203273 1998年9月22日
DNA68818−2536 203657 1999年2月9日
DNA61185−1646 203464 1998年11月17日DNA58732−1650 203290 1998年9月29日
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DNA73735−1681 203356 1998年10月20日DNA62845−1684 203361 1998年10月20日DNA71286−1687 203357 1998年10月20日DNA77648−1688 203408 1998年10月27日DNA77301−1708 203407 1998年10月27日DNA68883−1691 203535 1998年12月15日
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DNA45409−2511 203579 1999年1月12日
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DNA90842−2574 203845 1999年3月16日
DNA96893−2621 PTA−12 1999年5月4日
DNA62849−2647 PTA−205 1999年6月8日
DNA97003−2649 PTA−43 1999年5月11日
DNA94849−2960 PTA−2306 2000年7月25日
DNA115291−2681 PTA−202 1999年6月8日
DNA96988−2685 PTA−384 1999年7月20日
DNA105680−2710 PTA−483 1999年8月3日
DNA110700−2716 PTA−512 1999年8月10日
DNA108722−2743 PTA−552 1999年8月17日
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DNA119535−2756 PTA−613 1999年8月31日
DNA108700−2802 PTA−1093 1999年12月22日DNA119474−2803 PTA−1097 1999年12月22日DNA145841−2868 PTA−1678 2000年4月11日
DNA149911−2885 PTA−1776 2000年4月25日
DNA168028−2956 PTA−2304 2000年7月25日
DNA154095−2998 PTA−2591 2000年10月10日DNA185171−2994 PTA−2513 2000年9月26日
DNA171732−3100 PTA−3329 2001年4月24日
特許手続上の微生物の寄託の国際承認に関するブダペスト条約(ブダペスト条約)の規定に基づいてこれらの寄託を行った。これは、寄託日から30年間、寄託物の生存可能な培養物の維持を保証するものである。寄託物は、ブダペスト条約の規定に基づいてGenentech,Inc.とATCCとの合意に従い、ATCCから入手可能であり、これは、どれが最初であろうとも、関連の米国特許の発行時または任意の米国または外国の特許出願の公開時に、寄託培養物の子孫が永久かつ無制限に入手可能であることを保証し、米国特許法第122条およびそれに従う特許庁長官規則(特に参照番号886OG638の37CFR第1.14条を含む)に従って権利を有すると米国商標特許庁長官が決定した者に子孫を入手可能とすることを保証するものである。
本出願の譲受人は、適当な条件下で培養されていたときに、寄託された材料の培養物が、死滅または損失または破壊された場合、通知時に、その材料が迅速に同一の別のものに置き換えられることに同意する。寄託された材料の入手可能性は、特許法に従いあらゆる政府の権限下で認められた権利に違反して、本発明を実施するライセンスであるとみなされるものではない。
実施例4:ヒトPRO204ポリペプチド[UNQ178]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTを同定した。ヒト胎児網膜cDNAライブラリーをPCRオリゴヌクレオチドプライマーでスクリーニングし、EST配列に基づいた合成オリゴヌクレオチドプローブを用いた
ハイブリダイゼーションにより確認した。
ハイブリダイゼーションプローブ:
5’−GGCATGCAGCAGCTGGACATTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTG−3’(配列番号145)
順方向PCRプライマー:
5’−CTGCTGCAGAGTTGCACGAAC−3’(配列番号146)
逆方向PCRプライマー1:
5’−CAGTTGTTGTTGTCACAGAGAAG−3’(配列番号147)
逆方向PCRプライマー2:
5’−AGTTCGTGCAACTCTGCAGCAG−3’(配列番号148)
cDNAクローンを同定し、その全体を配列決定した。同定されたクローンDNA3087−1157のヌクレオチド配列の全体を図3に示した(配列番号3)。クローンDNA30871−1157(配列番号3)は、太字、下線で示されているように、ヌクレオチド376−378位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1498−1500位に見られる終止コドン(TAA)で終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図3;配列番号3)。予測されるPRO204ポリペプチド前駆体(すなわち、UNQ178、配列番号4)は、374アミノ酸長であり、その算出分子量は39,285ダルトン、pIは6.06であり、図4に示す。UNQ178(配列番号3)をコードするDNAを含むcDNAは、1997年10月16日にATCCに寄託され、寄託番号209380が割り当てられている。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTを同定した。ヒト胎児網膜cDNAライブラリーをPCRオリゴヌクレオチドプライマーでスクリーニングし、EST配列に基づいた合成オリゴヌクレオチドプローブを用いた
ハイブリダイゼーションにより確認した。
ハイブリダイゼーションプローブ:
5’−GGCATGCAGCAGCTGGACATTTGCGAGGGCTTTTGCTGGCTG−3’(配列番号145)
順方向PCRプライマー:
5’−CTGCTGCAGAGTTGCACGAAC−3’(配列番号146)
逆方向PCRプライマー1:
5’−CAGTTGTTGTTGTCACAGAGAAG−3’(配列番号147)
逆方向PCRプライマー2:
5’−AGTTCGTGCAACTCTGCAGCAG−3’(配列番号148)
cDNAクローンを同定し、その全体を配列決定した。同定されたクローンDNA3087−1157のヌクレオチド配列の全体を図3に示した(配列番号3)。クローンDNA30871−1157(配列番号3)は、太字、下線で示されているように、ヌクレオチド376−378位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1498−1500位に見られる終止コドン(TAA)で終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図3;配列番号3)。予測されるPRO204ポリペプチド前駆体(すなわち、UNQ178、配列番号4)は、374アミノ酸長であり、その算出分子量は39,285ダルトン、pIは6.06であり、図4に示す。UNQ178(配列番号3)をコードするDNAを含むcDNAは、1997年10月16日にATCCに寄託され、寄託番号209380が割り当てられている。
実施例5:ヒトPRO214ポリペプチド[UNQ188]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して構築した。このコンセンサスDNA配列は、本明細書中でDNA28744と命名する。このコンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して構築した。このコンセンサスDNA配列は、本明細書中でDNA28744と命名する。このコンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、下で同定されるPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO214遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肺組織から単離した。
cDNAクローンを全体に亘って配列決定した。DNA32286−1191の完全長ヌクレオチド配列を図5(配列番号5)に示す。DNA32286−1191は、ヌクレオチド103位の明らかな翻訳開始部位を有する単一のオープンリーディングフレームを含む(図5;配列番号5)。予測されるポリペプチド前駆体は、420アミノ酸長である(図6;配列番号6)。
完全長配列のBLASTおよびFastA配列アラインメント解析に基づいて、PRO214ポリペプチドは、HTタンパク質および/またはFibulinに対してアミノ酸配列同一性(それぞれ49%および38%)を示す。
上の手順において使用したオリゴヌクレオチド配列は、以下であった:
28744.p(OLI555)
5’−CCTGGCTATCAGCAGGTGGGCTCCAAGTGTCTCGATGTGGATGAGTGTGA−3’(配列番号149)
28744.f(OLI556)
5’−ATTCTGCGTGAACACTGAGGGC−3’(配列番号150)
28744.r(OLI557)
5’−ATCTGCTTGTAGCCCTCGGCAC−3’(配列番号151)
実施例6:ヒトPRO222ポリペプチド[UNQ196]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他の同定されたEST配列に関して構築し、ここで、このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA28771と命名する。DNA28771コンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRにより同定するため、およびPRO222についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
28744.p(OLI555)
5’−CCTGGCTATCAGCAGGTGGGCTCCAAGTGTCTCGATGTGGATGAGTGTGA−3’(配列番号149)
28744.f(OLI556)
5’−ATTCTGCGTGAACACTGAGGGC−3’(配列番号150)
28744.r(OLI557)
5’−ATCTGCTTGTAGCCCTCGGCAC−3’(配列番号151)
実施例6:ヒトPRO222ポリペプチド[UNQ196]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他の同定されたEST配列に関して構築し、ここで、このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA28771と命名する。DNA28771コンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRにより同定するため、およびPRO222についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマーの対(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−ATCTCCTATCGCTGCTTTCCCGG−3’(配列番号152)
逆方向PCRプライマー 5’−AGCCAGGATCGCAGTAAAACTCC−3’(配列番号153)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA28771配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−ATTTAAACTTGATGGGTCTGCGTATCTTGAGTGCTTACAAAACCTTATCT−3’(配列番号154)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO222遺伝子をコードするクローンを単離した。
順方向PCRプライマー 5’−ATCTCCTATCGCTGCTTTCCCGG−3’(配列番号152)
逆方向PCRプライマー 5’−AGCCAGGATCGCAGTAAAACTCC−3’(配列番号153)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA28771配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−ATTTAAACTTGATGGGTCTGCGTATCTTGAGTGCTTACAAAACCTTATCT−3’(配列番号154)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO222遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO222[本明細書中でDNA33107−1135と命名する]に対する完全長DNA配列およびPRO222に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA33107−1135のヌクレオチド配列全体を図7(配列番号7)に示す。DNA33107−1135は、ヌクレオチド159−161位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1629−1631位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図7;配列番号7)。予測されるポリペプチド前駆体は、490アミノ酸長である(図8;配列番号8)。クローンDNA33107−1135は、1997年9月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC 209251が割り当てられている。
完全長配列のBLASTおよびFastA配列アラインメント解析に基づいて、PRO222は、マウス補体因子h前駆体(25−26%)、補体レセプター(27−29%)、マウス補体C3bレセプター2型長形前駆体(25−47%)およびヒト仮説タンパク質kiaa0247(40%)に対してアミノ酸配列同一性を示す。
実施例7:ヒトPRO234ポリペプチド[UNQ208]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して構築した(DNA30926)。このコンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して構築した(DNA30926)。このコンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAを、標準的な単離プロトコル、例えば、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biologyを使用して組織または細胞株から単離したか、または商業的供給源(例えば、Clontech)から購入した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーを、市販の試薬(例えば、Invitrogen製)を使用して標準的な方法(例えば、Ausubel et al.)によって構築した。このライブラリーは、22週齢の胎児の脳組織から得た。
cDNAクローンを全体に亘って配列決定し、本明細書中でDNA35557−1137(配列番号9)と命名する。そのDNA355557−1137のヌクレオチド配列全体を図9(配列番号9)に示す。予測されるポリペプチド前駆体は、382アミノ酸長(PRO234と命名;配列番号10;図10)であり、その算出分子量は、約43.1kDaである。
上の手順において使用したオリゴヌクレオチド配列は、以下であった:
30926.p(OLI826)(配列番号155):
5’−GTTCATTGAAAACCTCTTGCCATCTGATGGTGACTTCTGGATTGGGCTCA−3’
30926.f(OLI827)(配列番号156):
5’−AAGCCAAAGAAGCCTGCAGGAGGG−3’
30926.r(OLI828)(配列番号157):
5’−CAGTCCAAGCATAAAGGTCCTGGC−3’
実施例8:ヒトPRO265ポリペプチド[UNQ232]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA33679と命名する。そのDNA33679コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO265についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
30926.p(OLI826)(配列番号155):
5’−GTTCATTGAAAACCTCTTGCCATCTGATGGTGACTTCTGGATTGGGCTCA−3’
30926.f(OLI827)(配列番号156):
5’−AAGCCAAAGAAGCCTGCAGGAGGG−3’
30926.r(OLI828)(配列番号157):
5’−CAGTCCAAGCATAAAGGTCCTGGC−3’
実施例8:ヒトPRO265ポリペプチド[UNQ232]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA33679と命名する。そのDNA33679コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO265についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(2つの順方向および1つの逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマーA:5’−CGGTCTACCTGTATGGCAACC−3’(配列番号158);
順方向PCRプライマーB:5’−GCAGGACAACCAGATAAACCAC−3’(配列番号159);
逆方向PCRプライマー 5’−ACGCAGATTTGAGAAGGCTGTC−3’(配列番号160)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA33679配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTCACGGGCTGCTCTTGCCCAGCTCTTGAAGCTTGAAGAGCTGCAC−3’(配列番号161)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅
によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO265遺伝子をコードするクローンを単離した。
順方向PCRプライマーA:5’−CGGTCTACCTGTATGGCAACC−3’(配列番号158);
順方向PCRプライマーB:5’−GCAGGACAACCAGATAAACCAC−3’(配列番号159);
逆方向PCRプライマー 5’−ACGCAGATTTGAGAAGGCTGTC−3’(配列番号160)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA33679配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TTCACGGGCTGCTCTTGCCCAGCTCTTGAAGCTTGAAGAGCTGCAC−3’(配列番号161)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅
によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO265遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児脳ライブラリーから単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO265[本明細書中でDNA36350−1158と命名する](配列番号11)に対する完全長DNA配列およびPRO265に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA36350−1158のヌクレオチド配列全体を図11に示す(配列番号11)。クローンDNA36350−1158は、ヌクレオチド352−354位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2332−2334位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図11)。予測されるポリペプチド前駆体は、660アミノ酸長である(図12;配列番号12)。クローンDNA36350−1158は、1997年10月16日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC 209378が割り当てられている。
完全長PRO265ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その配列の一部が、フィブロモジュリンおよびフィブロモジュリン前駆体に対して有意な相同性を有することが示唆されることから、PRO265は、ロイシンリッチリピートファミリーの新規メンバー、特に、フィブロモジュリンに関連するメンバーであり得ることが示唆される。
実施例9:ヒトPRO309ポリペプチド[UNQ272]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、胎児膵臓ライブラリー中のどのESTが、アダプタータンパク質Shcと有意な同一性を共有するか同定した。その単離されたESTに対応する完全長cDNAを、in vivoクローニング技術を使用して、pRK5に組み込まれているヒト胎児腎臓ライブラリーからクローニングした(Nsp1)。576アミノ酸タンパク質をコードする単一の長いオープンリーディングフレームが存在する。Nsp1のC末端は、いずれの既知の哺乳動物タンパク質とも有意な同一性を有しない。次いでこのC末端の配列を使用して、ESTデータベースを再度スクリーニングし、ここで、さらなるフラグメントを見出した。この配列から、クローニングプライマーおよび濃縮プライマーを構築し、対応する完全長配列を、in vivoクローニング技術を使用して、pRK5に組み込まれているヒト胎盤ライブラリーからNsp3について単離した。完全長配列のクローニングに使用したプローブは、以下であった:
Nsp1:
クローニングプライマー:ACTGAGGCCTGTTGAAAGTGCAGAGCTCAG(配列番号162)
濃縮プライマー:GCTGAAGAAGAGCTTCAG(配列番号163)
Nsp3:
クローニングプライマー:GGCCAGCATGATGGACATGGTGTGGAACCTTTCCAGCAGGTCTAGGCGTA(配列番号164)
濃縮プライマー:GGTGCAGCCCAGGATGTC(配列番号165)
Nsp3は、SH2ドメインおよび潜在的SH3相互作用ドメイン(PS領域)を有する。このタンパク質は、明らかなキナーゼドメインまたはホスファターゼドメインを欠く。cDNAクローンNsp1 Nsp3を、全体に亘って配列決定した。PRO309ポ
リペプチド[図14;配列番号14]をコードするDNA61601−1223のヌクレオチド配列全体[図13;配列番号13]は、1998年3月31日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209713が割り当てられている。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQTM,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、胎児膵臓ライブラリー中のどのESTが、アダプタータンパク質Shcと有意な同一性を共有するか同定した。その単離されたESTに対応する完全長cDNAを、in vivoクローニング技術を使用して、pRK5に組み込まれているヒト胎児腎臓ライブラリーからクローニングした(Nsp1)。576アミノ酸タンパク質をコードする単一の長いオープンリーディングフレームが存在する。Nsp1のC末端は、いずれの既知の哺乳動物タンパク質とも有意な同一性を有しない。次いでこのC末端の配列を使用して、ESTデータベースを再度スクリーニングし、ここで、さらなるフラグメントを見出した。この配列から、クローニングプライマーおよび濃縮プライマーを構築し、対応する完全長配列を、in vivoクローニング技術を使用して、pRK5に組み込まれているヒト胎盤ライブラリーからNsp3について単離した。完全長配列のクローニングに使用したプローブは、以下であった:
Nsp1:
クローニングプライマー:ACTGAGGCCTGTTGAAAGTGCAGAGCTCAG(配列番号162)
濃縮プライマー:GCTGAAGAAGAGCTTCAG(配列番号163)
Nsp3:
クローニングプライマー:GGCCAGCATGATGGACATGGTGTGGAACCTTTCCAGCAGGTCTAGGCGTA(配列番号164)
濃縮プライマー:GGTGCAGCCCAGGATGTC(配列番号165)
Nsp3は、SH2ドメインおよび潜在的SH3相互作用ドメイン(PS領域)を有する。このタンパク質は、明らかなキナーゼドメインまたはホスファターゼドメインを欠く。cDNAクローンNsp1 Nsp3を、全体に亘って配列決定した。PRO309ポ
リペプチド[図14;配列番号14]をコードするDNA61601−1223のヌクレオチド配列全体[図13;配列番号13]は、1998年3月31日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209713が割り当てられている。
実施例10:ヒトPRO332ポリペプチド[UNQ293]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例1に記載したように行ったECD相同性検索に基づいて、本明細書中でDNA36688と命名されるコンセンサスDNA配列を構築した。DNA36688コンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRにより同定するため、およびPRO332についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
上の実施例1に記載したように行ったECD相同性検索に基づいて、本明細書中でDNA36688と命名されるコンセンサスDNA配列を構築した。DNA36688コンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRにより同定するため、およびPRO332についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー対(順方向および逆方向)を合成した:
5’−GCATTGGCCGCGAGACTTTGCC−3’(配列番号166)
5’−GCGGCCACGGTCCTTGGAAATG−3’(配列番号167)
プローブも合成した:
5’−TGGAGGAGCTCAACCTCAGCTACAACCGCATCACCAGCCCACAGG−3’
(配列番号168)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO332遺伝子をコードするクローンを単離した。
5’−GCATTGGCCGCGAGACTTTGCC−3’(配列番号166)
5’−GCGGCCACGGTCCTTGGAAATG−3’(配列番号167)
プローブも合成した:
5’−TGGAGGAGCTCAACCTCAGCTACAACCGCATCACCAGCCCACAGG−3’
(配列番号168)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO332遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓ライブラリー(LIB229)から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、DNA40982−1235に対する完全長DNA配列およびPRO332について誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA40982−1235のヌクレオチド配列全体を図15(配列番号15)に示す。クローンDNA40982−1235は、(図15に示されるようにヌクレオチド342−344位に明らかな翻訳開始部位を有する)単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、642アミノ酸長であり(図16;配列番号16)、その算出分子量は、72,067(pI:6.60)である。クローンDNA40982−1235は、1997年11月7日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC 209433が割り当てられている。
完全長配列のBLASTおよびFastA配列アラインメント解析に基づいて、PRO332は、一連の既知プロテオグリカン配列(例えば、様々な種のフィブロモジュリンおよびフィブロモジュリン前駆体の配列(FMOD BOVIN、FMOD CHICK、FMOD RAT、FMOD MOUSE、FMOD HUMAN、PR36773)、オステオモジュリン(osteomodulin)配列(AB0001141、AB0078481)、デコリン配列(CFU831411、OCU033941、PR42266、PR42267、PR42260、PR89439)、ケラタン硫酸プロテオグリカン(BTU483601、AF0228901)、角膜プロテオグリカン(AF0222561)ならびに骨/軟骨プロテオグリカンおよびプロテオグリカン前駆体(PGS1 BOVIN、PGS2 MOUSE、PGS2 HUMAN)を含む)と約30−40%
のアミノ酸配列同一性を示す。
のアミノ酸配列同一性を示す。
実施例11:ヒトPRO356(NL4)ポリペプチド[UNQ313]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標)、Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ヒトTIE−2 L1およびTIE−2 L2に対する相同性を示したEST(#2939340)を同定した。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標)、Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ヒトTIE−2 L1およびTIE−2 L2に対する相同性を示したEST(#2939340)を同定した。
そのESTに基づいて、PCRプライマー対(順方向および逆方向)およびプローブを合成した:
NL4,5−1:5’−TTCAGCACCAAGGACAAGGACAATGACAACT−3’(配列番号169)
NL4,3−1:5’−TGTGCACACTTGTCCAAGCAGTTGTCATTGTC−3’(配列番号170)
NL4,3−3:5’−GTAGTACACTCCATTGAGGTTGG−3’(配列番号171).
オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリーを、ベクターpRK5Dに組み込まれている子宮mRNA(Clontech,Inc.(Palo Alto,CA,USA,カタログ#6537−1)から購入)から、Life Technologies,Gaithersburg,MD製の試薬およびプロトコル(Super Script Plasmid System)を使用して調製した。pRK5Dは、sp6転写開始部位、その後にSfiI制限酵素部位、さらにその後にXhoI/NotI cDNAクローニング部位を有するクローニングベクターである。cDNAを、オリゴdT含有NotI部位をプライマーとして増幅し、平滑末端でSalI半リン酸化アダプターに連結し、NotIで切断し、1000bpより大きいものをゲル電気泳動により適切に分離し、そしてXhoI/NotIで切断されたpRK5Dに規定の向きでクローニングした。
NL4,5−1:5’−TTCAGCACCAAGGACAAGGACAATGACAACT−3’(配列番号169)
NL4,3−1:5’−TGTGCACACTTGTCCAAGCAGTTGTCATTGTC−3’(配列番号170)
NL4,3−3:5’−GTAGTACACTCCATTGAGGTTGG−3’(配列番号171).
オリゴdTをプライマーとするcDNAライブラリーを、ベクターpRK5Dに組み込まれている子宮mRNA(Clontech,Inc.(Palo Alto,CA,USA,カタログ#6537−1)から購入)から、Life Technologies,Gaithersburg,MD製の試薬およびプロトコル(Super Script Plasmid System)を使用して調製した。pRK5Dは、sp6転写開始部位、その後にSfiI制限酵素部位、さらにその後にXhoI/NotI cDNAクローニング部位を有するクローニングベクターである。cDNAを、オリゴdT含有NotI部位をプライマーとして増幅し、平滑末端でSalI半リン酸化アダプターに連結し、NotIで切断し、1000bpより大きいものをゲル電気泳動により適切に分離し、そしてXhoI/NotIで切断されたpRK5Dに規定の向きでクローニングした。
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO356遺伝子をコードするクローンを単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、それぞれ図19および20に示される、完全長DNA配列DNA47470−1130P1(配列番号19;図19)およびその誘導されるPRO356タンパク質(配列番号20;図20)が得られた。
DNA47470−1130P1のヌクレオチド配列全体を図19(配列番号19)に示す。クローンDNA47470−1130P1(配列番号19)は、太字、下線で示すように、ヌクレオチド215−217位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1038−1040位のTAA終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。図20に示される、予測されるPRO356ポリペプチドは、346アミノ酸長であり(配列番号20)、その算出分子量は、40,018ダルトン、pIは、8.19である。DNA47470−1130P1(配列番号19)を含むcDNAクローンは、1997年10月28日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209422が割り当てられている。
図20(配列番号20)のPRO356ポリペプチドのさらなる解析から、アミノ酸残
基1〜約26のシグナルペプチド、残基約58−62、253−257および267−271のN−グリコシル化部位、残基167−171のグリコシルアミノグリカン(glycosyaminoglycan)結合部位、残基約176−180のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、残基約168−174、196−202、241−247、252−258、256−262、327−333のN−ミリストイル化部位、残基約199−202の細胞結合配列、および残基約160−198、201−210、219−256、266−279、283−313のフィブリノゲンベータ鎖およびガンマ鎖のC末端ドメインタンパク質が明らかになった。
基1〜約26のシグナルペプチド、残基約58−62、253−257および267−271のN−グリコシル化部位、残基167−171のグリコシルアミノグリカン(glycosyaminoglycan)結合部位、残基約176−180のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、残基約168−174、196−202、241−247、252−258、256−262、327−333のN−ミリストイル化部位、残基約199−202の細胞結合配列、および残基約160−198、201−210、219−256、266−279、283−313のフィブリノゲンベータ鎖およびガンマ鎖のC末端ドメインタンパク質が明らかになった。
実施例12:ヒトPRO540ポリペプチド[UNQ341]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサス配列を、上の実施例1に記載したように種々のEST配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA39631と命名する。そのDNA39631コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO540に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーを合成した:
順方向PCRプライマー5’−CTGGGGCTACACACGGGGTGAGG−3’(配列番号172)
逆方向PCRプライマー5’−GGTGCCGCTGCAGAAAGTAGAGCG−3’(配列番号173)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40654配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GCCCCAAATGAAAACGGGCCCTACTTCCTGGCCCTCCGCGAGATG−3’
(配列番号174)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーの一方を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO540遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織(LIB227)から単離した。
コンセンサス配列を、上の実施例1に記載したように種々のEST配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA39631と命名する。そのDNA39631コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO540に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーを合成した:
順方向PCRプライマー5’−CTGGGGCTACACACGGGGTGAGG−3’(配列番号172)
逆方向PCRプライマー5’−GGTGCCGCTGCAGAAAGTAGAGCG−3’(配列番号173)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40654配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GCCCCAAATGAAAACGGGCCCTACTTCCTGGCCCTCCGCGAGATG−3’
(配列番号174)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーの一方を用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO540遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織(LIB227)から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO540[本明細書中でUNQ341(DNA44189−1322)と命名する](配列番号21)に対する完全長DNA配列およびPRO540に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
UNQ341(DNA44189−1322)のヌクレオチド配列全体を図21(配列番号21)に示す。クローンUNQ341(DNA44189−1322)は、ヌクレオチド21−23位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1257−1259位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図21)。予測されるポリペプチド前駆体は、412アミノ酸長である(図22;配列番号22)。図22に示される完全長PRO540タンパク質は、推定分子量が約46,658ダルトン、pIが約6.65である。PRO540のアミノ酸配列の重要な領域は、シグナルペプチド、潜在的なN−グリコシル化部位、潜在的な脂質基質結合部位、リパーゼおよびセリンタンパク質に特有な配列ならびにベータトランスデューシンファミリーTrp−Aspリピートを含む。クローンUNQ341(DNA44189−1322)は、1998年3月26日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC209699が割り当てら
れている。
れている。
実施例13:ヒトPRO618ポリペプチド[UNQ354]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように種々のEST配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA30900と命名する。そのDNA30900コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO618に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように種々のEST配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA30900と命名する。そのDNA30900コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO618に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
順方向および逆方向PCRプライマーを合成した:
順方向PCRプライマー5’−TAACAGCTGCCCACTGCTTCCAGG−3’(配列番号175)
逆方向PCRプライマー5’−TAATCCAGCAGTGCAGGCCGGG−3’(配列番号176)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA30900配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−ATGGCCTCCACGGTGCTGTGGACCGTGTTCCTGGGCAAGGTGTGGCAGAA−3’
(配列番号177)
上で記載したライブラリーのスクリーニングにより、本明細書中でDNA3559と命名されるcDNAクローンの一部が得られた。BLASTおよびphrapを繰り返し行うことによって、この配列を伸長することにより、本明細書中でDNA43335と命名されるヌクレオチド配列が得られた。次いで、そのDNA43335コンセンサス配列に基づいたプライマーを次のように調製した。
順方向PCRプライマー5’−TGCCTATGCACTGAGGAGGCAGAAG−3’(配列番号178)
逆方向PCRプライマー5’−AGGCAGGGACACAGAGTCCATTCAC−3’(配列番号179)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA43335配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−AGTATGATTTGCCGTGCACCCAGGGCCAGTGGACGATCCAGAACAGGAGG−3’
(配列番号180)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、第2のプローブオリゴヌクレオチドおよび第2のセットのPCRプライマーの一方を使用して、PRO618遺伝子をコードする完全長クローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織(LIB229)から単離した。
順方向PCRプライマー5’−TAACAGCTGCCCACTGCTTCCAGG−3’(配列番号175)
逆方向PCRプライマー5’−TAATCCAGCAGTGCAGGCCGGG−3’(配列番号176)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA30900配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−ATGGCCTCCACGGTGCTGTGGACCGTGTTCCTGGGCAAGGTGTGGCAGAA−3’
(配列番号177)
上で記載したライブラリーのスクリーニングにより、本明細書中でDNA3559と命名されるcDNAクローンの一部が得られた。BLASTおよびphrapを繰り返し行うことによって、この配列を伸長することにより、本明細書中でDNA43335と命名されるヌクレオチド配列が得られた。次いで、そのDNA43335コンセンサス配列に基づいたプライマーを次のように調製した。
順方向PCRプライマー5’−TGCCTATGCACTGAGGAGGCAGAAG−3’(配列番号178)
逆方向PCRプライマー5’−AGGCAGGGACACAGAGTCCATTCAC−3’(配列番号179)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA43335配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−AGTATGATTTGCCGTGCACCCAGGGCCAGTGGACGATCCAGAACAGGAGG−3’
(配列番号180)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、第2のプローブオリゴヌクレオチドおよび第2のセットのPCRプライマーの一方を使用して、PRO618遺伝子をコードする完全長クローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織(LIB229)から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO618[本明細書中でUNQ354(DNA49152−1324)と命名する](配列番号23)に対する完全長DNA配列およびPRO618に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
UNQ354(DNA49152−1324)のヌクレオチド配列全体を図23(配列
番号23)に示す。クローンUNQ354(DNA49152−1324)は、ヌクレオチド73−75位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2479−2481位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図23)。予測されるポリペプチド前駆体は、802アミノ酸長である(図24;配列番号24)。図24に示される完全長PRO618タンパク質は、推定分子量が約88,846ダルトン、pIが約6.41である。PRO618のアミノ酸配列の重要な領域は、II型膜貫通ドメイン、プロテアーゼに特有の配列、トリプシンファミリー、ヒスチジン活性部位、複数のN−グリコシル化部位、Kringleドメインに特有の2つの配列、カリクレイン軽鎖に類似の配列を有する2つの領域、および低密度リポタンパク質レセプターに類似の配列を有する領域を含む。クローンUNQ354(DNA49152−1324)は、1998年4月28日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209813が割り当てられている。
番号23)に示す。クローンUNQ354(DNA49152−1324)は、ヌクレオチド73−75位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2479−2481位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図23)。予測されるポリペプチド前駆体は、802アミノ酸長である(図24;配列番号24)。図24に示される完全長PRO618タンパク質は、推定分子量が約88,846ダルトン、pIが約6.41である。PRO618のアミノ酸配列の重要な領域は、II型膜貫通ドメイン、プロテアーゼに特有の配列、トリプシンファミリー、ヒスチジン活性部位、複数のN−グリコシル化部位、Kringleドメインに特有の2つの配列、カリクレイン軽鎖に類似の配列を有する2つの領域、および低密度リポタンパク質レセプターに類似の配列を有する領域を含む。クローンUNQ354(DNA49152−1324)は、1998年4月28日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209813が割り当てられている。
実施例14:ヒトPRO944ポリペプチド[UNQ481]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように種々のEST配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA47374と命名する。種々の企業Genentech EST配列を構築に使用した。そのDNA47374コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO944に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように種々のEST配列に関して得て、ここで、そのコンセンサス配列を、本明細書中でDNA47374と命名する。種々の企業Genentech EST配列を構築に使用した。そのDNA47374コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO944に対する完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー対(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’−CGAGCGAGTCATGGCCAACGC−3’(配列番号181)
逆方向PCRプライマー5’−GTGTCACACGTAGTCTTTCCCGCTGG−3’(配列番号182)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47374配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CTGCAGCTGTTGGGCTTCATTCTCGCCTTCCTGGGATGGATCG−3’(配列番号183)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO944遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織(LIB227)から単離した。
順方向PCRプライマー5’−CGAGCGAGTCATGGCCAACGC−3’(配列番号181)
逆方向PCRプライマー5’−GTGTCACACGTAGTCTTTCCCGCTGG−3’(配列番号182)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47374配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CTGCAGCTGTTGGGCTTCATTCTCGCCTTCCTGGGATGGATCG−3’(配列番号183)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO944遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織(LIB227)から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO944[本明細書中でUNQ481(DNA52185−1370)と命名する](配列番号25)に対する完全長DNA配列およびPRO944に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
UNQ481(DNA52185−1370)のヌクレオチド配列全体を図25(配列番号25)に示す。クローンUNQ481(DNA52185−1370)は、ヌクレオチド219−221位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド852−854位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図25)。予測されるポリペプチド前駆体は、211アミノ酸長である(図26;配列番号26)。図26に示される完全長PRO944タンパク質は、その推定分子量が約22,744ダル
トン、pIが約8.51である。図26(配列番号26)に示される完全長PRO944配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約21のシグナルペプチド、アミノ酸約82〜アミノ酸約102、アミノ酸約118〜アミノ酸約142およびアミノ酸約161〜アミノ酸約187の膜貫通ドメイン、アミノ酸約72〜アミノ酸約75の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約70〜アミノ酸約111のPMP−22/EMP/MP20ファミリーのタンパク質に対する相同性を有する配列ブロックならびにアミノ酸約119〜アミノ酸約133のABC−2型輸送系内在性膜タンパク質に対する相同性を有する配列ブロックの存在が証明された。クローンUNQ481(DNA52185−1370)は、1998年5月14日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC209861が割り当てられている。
トン、pIが約8.51である。図26(配列番号26)に示される完全長PRO944配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約21のシグナルペプチド、アミノ酸約82〜アミノ酸約102、アミノ酸約118〜アミノ酸約142およびアミノ酸約161〜アミノ酸約187の膜貫通ドメイン、アミノ酸約72〜アミノ酸約75の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約70〜アミノ酸約111のPMP−22/EMP/MP20ファミリーのタンパク質に対する相同性を有する配列ブロックならびにアミノ酸約119〜アミノ酸約133のABC−2型輸送系内在性膜タンパク質に対する相同性を有する配列ブロックの存在が証明された。クローンUNQ481(DNA52185−1370)は、1998年5月14日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号ATCC209861が割り当てられている。
完全長PRO944ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、その配列が、CPE−Rタンパク質との有意な配列類似性を有することが示唆され、これにより、PRO944が、新規CPE−Rホモログであり得ると示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO944アミノ酸配列と以下のDayhoff配列、AB000713_1、AB000714_1、AF035814_1、AF000959_1、HSU89916_1、EMP2_HUMAN、JC5732、CELF53B3_6、PM22_MOUSEおよびCGU49797_1との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例15:ヒトPRO994ポリペプチド[UNQ518]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列(157555と命名)が同定できた。次いで、そのESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et
al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA55728と命名する。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列(157555と命名)が同定できた。次いで、そのESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et
al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA55728と命名する。
DNA55728コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号2860366内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのIncyte
ESTクローン2860366を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図27に示し、本明細書中でDNA58855−1422と命名する。
ESTクローン2860366を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図27に示し、本明細書中でDNA58855−1422と命名する。
クローンDNA58855−1422は、ヌクレオチド31−33位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド718−720位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図27;配列番号27)。予測されるポリペプチド前駆体は、229アミノ酸である(図28;配列番号28)。図28に示す完全長PRO994タンパク質は、推定分子量が約25,109ダルトン、pIは約6.83である。図28(配列番号28)に示す完全長PRO994配列の解析により、以下:アミノ酸約10〜アミノ酸約31、アミノ酸約50〜アミノ酸約72、アミノ酸約87〜アミノ酸約1
10およびアミノ酸約191〜アミノ酸約213の膜貫通ドメイン、アミノ酸約80〜アミノ酸約83、アミノ酸約132〜アミノ酸約135、アミノ酸約148〜アミノ酸約151およびアミノ酸約163〜アミノ酸約166の潜在的N−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約4〜アミノ酸約11のTNFR/NGFRシステインリッチ領域タンパク質との相同性を有するアミノ酸ブロックの存在が証明された。クローンDNA58855−1422は、1998年6月23日にATCCに寄託され、寄託番号203018が割り当てられている。
10およびアミノ酸約191〜アミノ酸約213の膜貫通ドメイン、アミノ酸約80〜アミノ酸約83、アミノ酸約132〜アミノ酸約135、アミノ酸約148〜アミノ酸約151およびアミノ酸約163〜アミノ酸約166の潜在的N−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約4〜アミノ酸約11のTNFR/NGFRシステインリッチ領域タンパク質との相同性を有するアミノ酸ブロックの存在が証明された。クローンDNA58855−1422は、1998年6月23日にATCCに寄託され、寄託番号203018が割り当てられている。
図28(配列番号28)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO994アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF027204_1、TAL6_HUMAN、ILT4_HUMAN、JC6205、MMU57570_1、S40363、ETU56093_1、S42858、P_R66849およびP_R74751との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例16:ヒトPRO1079ポリペプチド[UNQ536]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築し、ここで、このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA52714と命名する。この構築によって提供される情報に基づいて、Merck EST番号HO6898に対するクローンを得て、配列決定することにより、本明細書中でDNA56050−1455と称されるヌクレオチド配列を得た。DNA56050−1455のヌクレオチド配列全体を図29(配列番号29)に示す。クローンDNA56050−1455は、ヌクレオチド183−185位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド861−863位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図29)。予測されるポリペプチド前駆体は、226アミノ酸長である(図30;配列番号30)。図30に示す完全長PRO1079タンパク質は、推定分子量が約24,611ダルトン、pIが約4.85である。図30(配列番号30)に示す完全長PRO1079配列の解析により、以下の特徴:アミノ酸約1−29のシグナルペプチド;アミノ酸約10−15および51−56の潜在的N−ミリストイル化部位;アミノ酸約2〜20の光化学系I psaGおよびpsaKタンパク質に対する相同性;ならびにアミノ酸約150〜163のプロリルエンドペプチダーゼファミリーセリンタンパク質の存在が証明された。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築し、ここで、このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA52714と命名する。この構築によって提供される情報に基づいて、Merck EST番号HO6898に対するクローンを得て、配列決定することにより、本明細書中でDNA56050−1455と称されるヌクレオチド配列を得た。DNA56050−1455のヌクレオチド配列全体を図29(配列番号29)に示す。クローンDNA56050−1455は、ヌクレオチド183−185位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド861−863位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図29)。予測されるポリペプチド前駆体は、226アミノ酸長である(図30;配列番号30)。図30に示す完全長PRO1079タンパク質は、推定分子量が約24,611ダルトン、pIが約4.85である。図30(配列番号30)に示す完全長PRO1079配列の解析により、以下の特徴:アミノ酸約1−29のシグナルペプチド;アミノ酸約10−15および51−56の潜在的N−ミリストイル化部位;アミノ酸約2〜20の光化学系I psaGおよびpsaKタンパク質に対する相同性;ならびにアミノ酸約150〜163のプロリルエンドペプチダーゼファミリーセリンタンパク質の存在が証明された。
Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)を使用した完全長PRO1079ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、PRO1079アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CEK10C3_4、MMU50734_1、D69503、AF051149_1およびVSMP_CVMSとの間のいくらかの配列同一性が明らかになった。
クローンUNQ536(DNA56050−1455)は、1998年6月23日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203011が割り当てられている。
実施例17:ヒトPRO1110ポリペプチド[UNQ553]をコードするcDNAクローンの単離
ネイティブヒトPRO1110ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA58727−1474)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児腎臓cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。使用した酵母スクリーニングは、単一のESTクローンと同定され、本明細書中でDNA45566と命名する。次いで、そのDNA45566配列を、公的ESTデータベース(例えば、Ge
nBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む様々なESTデータベースと比較することにより、相同なEST配列を同定した。その比較は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996)]を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA46965と命名する。次いで、このDNA46965配列に基づいたオリゴヌクレオチドプライマーを合成し、それを使用して、ヒトSK−Lu−1腺癌cDNAライブラリー(LIB247)をスクリーニングしたところ、図31に示すDNA58727−1474クローンが同定された。
ネイティブヒトPRO1110ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA58727−1474)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児腎臓cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。使用した酵母スクリーニングは、単一のESTクローンと同定され、本明細書中でDNA45566と命名する。次いで、そのDNA45566配列を、公的ESTデータベース(例えば、Ge
nBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む様々なESTデータベースと比較することにより、相同なEST配列を同定した。その比較は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996)]を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を、本明細書中でDNA46965と命名する。次いで、このDNA46965配列に基づいたオリゴヌクレオチドプライマーを合成し、それを使用して、ヒトSK−Lu−1腺癌cDNAライブラリー(LIB247)をスクリーニングしたところ、図31に示すDNA58727−1474クローンが同定された。
図31に示す完全長DNA58727−1474クローンは、ヌクレオチド131−133位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1097−1099位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図31;配列番号31)。予測されるポリペプチド前駆体は、322アミノ酸長である(図32;配列番号32)。図32に示す完全長PRO1110タンパク質は、推定分子量が約35,274ダルトン、pIが約8.57である。図32(配列番号32)に示される完全長PRO1110配列の解析により、以下:アミノ酸約41〜アミノ酸約60、アミノ酸約66〜アミノ酸約85、アミノ酸約101〜アミノ酸約120、アミノ酸約137〜アミノ酸約153、アミノ酸約171〜アミノ酸約192、アミノ酸約205〜アミノ酸約226、アミノ酸約235〜アミノ酸約255およびアミノ酸約294〜アミノ酸約312の膜貫通ドメイン、アミノ酸約6〜アミノ酸約69の潜在的N−グリコシル化部位ならびにアミノ酸約18〜アミノ酸約21のグリコサミノグリカン結合部位の存在が証明された。クローンDNA58727−1474は、1998年9月1日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203171が割り当てられている。
図32(配列番号32)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1110アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:MMMYELUPR_1、P_R99799、MAL_HUMAN、P_P80929、RNMALGENE_1、S68406、PLLP_RAT、MMMALPROT_1、I38891およびS55622との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例18:ヒトPRO1122ポリペプチド[UNQ561]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTを同定した。そのESTは、DNA49665とも呼ばれるIncyte1347523であった。DNA49665に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1122についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。[例えば、Sambrook et al.,Molocular Cloning:A Laboratory Manual(New York:Cold Spring
Harbor Laboratory Press,1989);Dieffenbach et al.,PCR Primer:A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Laboratory Press,199
5)]。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTを同定した。そのESTは、DNA49665とも呼ばれるIncyte1347523であった。DNA49665に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1122についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。[例えば、Sambrook et al.,Molocular Cloning:A Laboratory Manual(New York:Cold Spring
Harbor Laboratory Press,1989);Dieffenbach et al.,PCR Primer:A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Laboratory Press,199
5)]。
順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約1〜1.5kpbより長いとき、追加のオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについて、いくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausuble et al.,Current Protocols in Molecular Biologyのように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によりスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向、逆方向およびハイブリダイゼーション)を合成した:
順方向PCRプライマー:5’−ATCCACAGAAGCTGGCCTTCGCCG−3’(配列番号184)
逆方向PCRプライマー:5’−GGGACGTGGATGAACTCGGTGTGG−3’(配列番号185)
ハイブリダイゼーションプローブ:
5’−TATCCACAGAAGCTGGCCTTCGCCGAGTGCCTGTGCAGAG−3’(配列番号186).
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1122遺伝子をコードするクローンを単離した。
順方向PCRプライマー:5’−ATCCACAGAAGCTGGCCTTCGCCG−3’(配列番号184)
逆方向PCRプライマー:5’−GGGACGTGGATGAACTCGGTGTGG−3’(配列番号185)
ハイブリダイゼーションプローブ:
5’−TATCCACAGAAGCTGGCCTTCGCCGAGTGCCTGTGCAGAG−3’(配列番号186).
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1122遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーを、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,235:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
al.,Science,235:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1122に対する完全長DNA配列[本明細書中でDNA62377−1381−1と命名](配列番号33)およびPRO1122に対して誘導されるタンパク質配列(UNQ561)(配列番号34)が得られた。
DNA62377−1381−1のヌクレオチド配列全体(配列番号33)を図33(配列番号33)に示す。クローンDNA62377−1381−1(配列番号33)は、配列番号33(図33)のヌクレオチド50−52位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド641−643位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、197アミノ酸長である(図34;配列番号34)。図34(UNQ561)に示す完全長PRO1122タンパク質(配列番号34)は、推定分子量が約21765ダルトン、pIが約8.53である。クローンDNA62377−1381−1は、1998年12月22日にATCCに寄託され、寄
託番号203552が割り当てられている。本明細書中に提供される配列中に配列決定の不規則性または誤りが存在する場合には、正確な配列は、寄託されている配列であることが理解される。さらに、本明細書中に提供されるすべての配列は、公知の配列決定技術の結果である。
託番号203552が割り当てられている。本明細書中に提供される配列中に配列決定の不規則性または誤りが存在する場合には、正確な配列は、寄託されている配列であることが理解される。さらに、本明細書中に提供されるすべての配列は、公知の配列決定技術の結果である。
単離された完全長PRO1122(UNQ561)のアミノ酸配列の解析により、その配列が、IL−17との類似性を有することが示唆され、このことにより、PRO1122(UNQ561)が新規サイトカインであり得ることが示唆され、本明細書中でIL−17Cと命名される。図34(配列番号34)はまた、シグナルペプチド、ロイシンジッパーパターンおよびIL−17との配列同一性を有する領域のおよその位置を示す。
実施例19:ヒトPRO1138ポリペプチド[UNQ576]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のIncyte EST配列(Incyteクラスター配列番号165212)が同定できた。次いで、このクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et
al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA54224と命名する。企業Genentech ESTを含むこのアセンブリを本明細書中でDNA49140と命名する。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、単一のIncyte EST配列(Incyteクラスター配列番号165212)が同定できた。次いで、このクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et
al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA54224と命名する。企業Genentech ESTを含むこのアセンブリを本明細書中でDNA49140と命名する。
DNA54224コンセンサス配列とIncyte ESTクローン番号3836613内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのIncyte
ESTクローン3836613を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図35に示し、これは、PRO1138に対する完全長DNA配列である。クローンDNA58850−1495は、1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209956が割り当てられた。
ESTクローン3836613を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。この挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図35に示し、これは、PRO1138に対する完全長DNA配列である。クローンDNA58850−1495は、1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209956が割り当てられた。
DNA58850−1495のヌクレオチド配列全体を図35(配列番号35)に示す。クローンDNA58850−1495は、ヌクレオチド38−40位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1043−1045位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図35)。予測されるポリペプチド前駆体は、335アミノ酸長である(図36;配列番号36)。図36に示す完全長PRO1138タンパク質は、推定分子量が約37,421ダルトン、pIが約6.36である。図36(配列番号36)に示される完全長PRO1138配列の解析により、以下の特徴:アミノ酸約1〜アミノ酸約22のシグナルペプチド;アミノ酸約224〜約250の膜貫通ドメイン;アミノ酸約229〜約250のロイシンジッパーパターン;ならびにアミノ酸約98〜101、142〜145、148〜151、172〜175、176〜179、204〜207および291〜295の潜在的N−グリコシル化部位の存在が証明される。
完全長PRO1138のアミノ酸配列の解析により、その配列が、CD84との有意な
配列類似性を有することが示唆され、このことにより、PRO1138がIgスーパーファミリーのポリペプチドの新規メンバーであり得ることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)を使用した完全長PRO1138ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、PRO1138アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU82988_1、HUMLY9_1、P_R97631、P_R97628、P_R97629、P_R97630、CD48_RAT、CD2_HUMAN、P_P93996およびHUMBGP_1との間の相同性が明らかになった。
配列類似性を有することが示唆され、このことにより、PRO1138がIgスーパーファミリーのポリペプチドの新規メンバーであり得ることが示唆される。より詳細には、Dayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)を使用した完全長PRO1138ポリペプチドのアミノ酸配列の解析により、PRO1138アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU82988_1、HUMLY9_1、P_R97631、P_R97628、P_R97629、P_R97630、CD48_RAT、CD2_HUMAN、P_P93996およびHUMBGP_1との間の相同性が明らかになった。
クローンDNA58850−1495は、1998年6月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号209956が割り当てられている。
実施例20:ヒトPRO1190ポリペプチド[UNQ604]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例1に記載した方法により、単一のMerck/Washington University EST配列、EST番号AA339802が同定でき、それを本明細書中で「DNA53943」と命名する。そのDNA53943配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1190についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
上の実施例1に記載した方法により、単一のMerck/Washington University EST配列、EST番号AA339802が同定でき、それを本明細書中で「DNA53943」と命名する。そのDNA53943配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1190についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:(53943.f1)GGGAAACACAGCAGTCATTGCCTGC(配列番号187)
逆方向PCRプライマー:(53943.r1)GCACACGTAGCCTGTCGCTGGAGC(配列番号188)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA53943配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ:(53943.p1)CACCCCAAAGCCCAGGTCCGGTACAGCGTCAAACAAGAGTGG(配列番号189)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1190遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト骨髄から単離した。
順方向PCRプライマー:(53943.f1)GGGAAACACAGCAGTCATTGCCTGC(配列番号187)
逆方向PCRプライマー:(53943.r1)GCACACGTAGCCTGTCGCTGGAGC(配列番号188)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA53943配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ:(53943.p1)CACCCCAAAGCCCAGGTCCGGTACAGCGTCAAACAAGAGTGG(配列番号189)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1190遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト骨髄から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1190に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA59586−1520と命名[図37,配列番号37])およびPRO1190に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
PRO1190のコード配列全体を図37に示す(配列番号37)。クローンDNA59586−1520は、ヌクレオチド340−342位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド3685−3687位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、1115アミノ酸長である。図38(配列番号38)に示す完全長PRO1190タンパク質は、推定分子量が約121,188ダルトン、pIが約7.07である。PRO1190タンパク質の他の特徴としては:アミノ酸16−30および854−879の2つの膜貫通ドメイン;アミノ酸1051−1060のシトクロムP450システインヘム鉄リガンドサイン;アミノ酸1045−1051のN−6アデニン特異的DNAメチラーゼサイン;ならびにアミノ酸65
−68、76−79、98−101、189−192、275−278、518−521、726−729および760−763の潜在的N−グリコシル化部位が挙げられる。クローンDNA59586−1520は、1998年9月29日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203288が割り当てられている。
−68、76−79、98−101、189−192、275−278、518−521、726−729および760−763の潜在的N−グリコシル化部位が挙げられる。クローンDNA59586−1520は、1998年9月29日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203288が割り当てられている。
図38(配列番号38)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1190アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF004840_1、AF004841_1、AF026465_1、HSU72391_1、P_R13144、AXO1_HUMAN、GEN13349、I58164、D87212_1、A53449およびD86983_1およびKIAA0230との間の相同性が明らかになった。
実施例21:ヒトPRO1272ポリペプチド[UNQ642]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、そのESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA58753と命名する。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、そのESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA58753と命名する。
DNA58753配列とESTクローン3049165内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、EST3049165を含むそのIncyte ESTクローン(肺ライブラリー由来)を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図39に示し、本明細書中でDNA64896−1539と命名する。
図39に示す完全長クローンは、ヌクレオチド58−60位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド556−558位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図39;配列番号39)。予測されるポリペプチド前駆体(図40,配列番号40)は、166アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号40のアミノ酸約1〜23である。PRO1272は、算出分子量が約19,171ダルトン、推定pIが約8.26である。クローンDNA64896−1539は、1998年9月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203238が割り当てられている。
図40(配列番号40)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1272アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(データベースからの情報は本明細書中で援用される):AF025474_1、D69100、AE000757_10、H69466、CELC50E3_12、XLRANBP1_
1、YD67_SCHPO、B69459、H36856およびFRU40755_1との間の配列同一性が明らかになった。
1、YD67_SCHPO、B69459、H36856およびFRU40755_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例22:ヒトPRO1286ポリペプチド[UNQ655]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定でき、ESTクラスター番号86809と命名した。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このアセンブリ中のESTは、腫瘍、細胞株または罹患組織から同定されるものを含んでいた。これらのESTの1つ以上は、罹患結腸組織から単離されたRNAから構築されたcDNAライブラリーから得られた。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA58822と命名する。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定でき、ESTクラスター番号86809と命名した。次いで、このESTクラスター配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このアセンブリ中のESTは、腫瘍、細胞株または罹患組織から同定されるものを含んでいた。これらのESTの1つ以上は、罹患結腸組織から単離されたRNAから構築されたcDNAライブラリーから得られた。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA58822と命名する。
DNA58822配列とEST番号1695434内に包含されるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、ESTクローン番号1695434を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図41に示し、本明細書中でDNA64903−1553(配列番号41)と命名する。
図41に示す完全長クローンは、ヌクレオチド93−95位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド372−374位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図41;配列番号41)。予測されるポリペプチド前駆体(図42,配列番号42)は、アミノ酸約1〜18のシグナル配列を有する93アミノ酸長である。PRO1286は、算出分子量が約10,111ダルトン、推定pIが約9.70である。
図42(配列番号42)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1286アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:SR5C_ARATH、CELC17H12_11、MCPD_ENTAE、JQ2283、INVO_LEMCA、P_R07309、ADEVBCAGN_4、AF020947_1、CELT23H2_1およびMDH_STRARとの間のいくらかの相同性が明らかになった。
クローンDNA64903−1553は、1998年9月15日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203223が割り当てられている。
実施例23:ヒトPRO1295ポリペプチド[UNQ664]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、そのESTクラスター
配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。これらのESTの1つ以上は、胸腺組織ライブラリーから得られた。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56262と命名する。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、そのESTクラスター
配列を、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースと比較することにより、存在する相同性を同定した。これらのESTの1つ以上は、胸腺組織ライブラリーから得られた。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中でDNA56262と命名する。
DNA56262配列とIncyte EST 3743334内に包含されるEST配列との間の配列相同性に鑑みて、このESTを含むクローンを購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図43に示し、本明細書中でDNA59218−1559と命名する。
図43に示す完全長クローンは、ヌクレオチド207−209位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1047−1049位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図43;配列番号43)。予測されるポリペプチド前駆体(図44,配列番号44)は、280アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号44のアミノ酸約1〜18である。標的シグナルおよびN−グリコシル化部位もまた、図44に示す。PRO1295は、算出分子量が約30,163ダルトン、推定pIが約6.87である。クローンDNA59218−1559は、1998年9月29日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203287が割り当てられている。
図44(配列番号44)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1295アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(データは本明細書中で援用される):AB011099_1、ILVE_MYCTU、ATTECR_2、AF010496_27、P_R15346、S37191、PER_DROMS、L2MU_ADECCおよびP_W34238との間の配列同一性が明らかになった。
実施例24:ヒトPRO1309ポリペプチド[UNQ675]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、SLITとの相同性を示したESTを同定した。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、SLITとの相同性を示したESTを同定した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児脳組織から単離した。ヒトPRO1309をコードするcDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位にお
いてクローニングした。
いてクローニングした。
cDNAライブラリー(上で記載したように調製)を、上記のIncyte EST配列から得られた合成オリゴヌクレオチドプローブ
:5’−TCCGTGCAGGGGGACGCCTTTCAGAAACTGCGCCGAGTTAAGGAAC−3’(配列番号190).
cDNAクローンを単離し、その全体に亘って配列決定した。DNA59588−1571のヌクレオチド配列全体を図45(配列番号45)に示す。クローンDNA59588−1571は、ヌクレオチド720−722位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2286−2288位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図45;配列番号45)。予測されるポリペプチド前駆体は、522アミノ酸長である(図46;配列番号46)。そのシグナルペプチドは、配列番号278の約1〜34であり、膜貫通ドメインは、約428〜450である。クローンDNA59588−1571は、1998年8月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203106が割り当てられている。図46に示す完全長PRO1309タンパク質は、推定分子量が約58,614ダルトン、pIが約7.42である。
:5’−TCCGTGCAGGGGGACGCCTTTCAGAAACTGCGCCGAGTTAAGGAAC−3’(配列番号190).
cDNAクローンを単離し、その全体に亘って配列決定した。DNA59588−1571のヌクレオチド配列全体を図45(配列番号45)に示す。クローンDNA59588−1571は、ヌクレオチド720−722位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2286−2288位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図45;配列番号45)。予測されるポリペプチド前駆体は、522アミノ酸長である(図46;配列番号46)。そのシグナルペプチドは、配列番号278の約1〜34であり、膜貫通ドメインは、約428〜450である。クローンDNA59588−1571は、1998年8月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203106が割り当てられている。図46に示す完全長PRO1309タンパク質は、推定分子量が約58,614ダルトン、pIが約7.42である。
図46(配列番号46)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1309アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AB007876_1、GPV_MOUSE、ALS_RAT、P_R85889、LUM_CHICK、AB014462_1、PGS1_CANFA、CEM88_7、A58532およびGEN11209との間の配列同一性が明らかになった。
実施例25:ヒトPRO1316ポリペプチド[UNQ682]をコードするcDNAクローンの単離
分泌配列を含むことが知られている公的に利用可能なデータベースの細胞外ドメイン(ECD)(もしあればシグナル配列を含む)を使用して、様々な公的に利用可能なEST(発現配列タグ)データベース(GenBank,Merck/Wash.U)を検索した。その検索は、そのECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996)]を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University
of Washington,Seattle,WA)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
分泌配列を含むことが知られている公的に利用可能なデータベースの細胞外ドメイン(ECD)(もしあればシグナル配列を含む)を使用して、様々な公的に利用可能なEST(発現配列タグ)データベース(GenBank,Merck/Wash.U)を検索した。その検索は、そのECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996)]を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University
of Washington,Seattle,WA)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
上の検索の結果、分泌タンパク質Dkk−1との相同性を示したW55979と命名されるESTが同定された。EST W55979(クローンNbHH19W)に対応するクローンをMerck/Washington Universityから購入し、そのcDNA挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。
購入したクローンによってコードされる完全長PRO1316(DNA60608−1577と命名)に対応する核酸配列を、図47(配列番号47)に示す。DNA60608−1577は、ヌクレオチド211−213位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド988−990位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図47;配列番号47)。予測されるポリペプチド前駆体は、259アミノ酸長である(図48;配列番号48)。特に興味深いさらなる領域としては、シグナルペプチドをコードしているヌクレオチド残基(211−283)、N−グリコシル化部位(36
4−366)およびZn(2)−Cys(6)二核性クラスタードメイン(505−655)が挙げられる。クローンDNA60608−1577は、1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203126が割り当てられている。図48に示す完全長PRO1316タンパク質は、推定分子量が約28,447ダルトン、pIが約9.48である。
4−366)およびZn(2)−Cys(6)二核性クラスタードメイン(505−655)が挙げられる。クローンDNA60608−1577は、1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203126が割り当てられている。図48に示す完全長PRO1316タンパク質は、推定分子量が約28,447ダルトン、pIが約9.48である。
完全長配列のBLASTおよびFastA配列アラインメント解析(ALIGNコンピュータプログラムを使用)に基づいて、PRO1316は、dickkopfファミリーのタンパク質に対して有意なアミノ酸配列同一性を示す。さらに、DNA60608は、AF030433_1、LFE4_CHICK、COL_RABIT、YQI6_CAEEL、ITB6_HUMAN、CONO_LYMST、S41033、D63483_1、D86864_1およびAB001978_1に対する相同性を示した。
実施例26:ヒトPRO1383ポリペプチド[UNQ719]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA53961と命名する。そのDNA53961コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1383についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA53961と命名する。そのDNA53961コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1383についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’−CATTTCCTTACCCTGGACCCAGCTCC−3’(配列番号191)
逆方向PCRプライマー5’−GAAAGGCCCACAGCACATCTGGCAG−3’(配列番号192)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA53961配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CCACGACCCGAGCAACTTCCTCAAGACCGACTTGTTTCTCTACAGC−3’(配列番号193)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1383遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児脳組織から単離した。
順方向PCRプライマー5’−CATTTCCTTACCCTGGACCCAGCTCC−3’(配列番号191)
逆方向PCRプライマー5’−GAAAGGCCCACAGCACATCTGGCAG−3’(配列番号192)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA53961配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CCACGACCCGAGCAACTTCCTCAAGACCGACTTGTTTCTCTACAGC−3’(配列番号193)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1383遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児脳組織から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1383(本明細書中でDNA58743−1609と命名[図49,配列番号49])に対する完全長DNA配列およびPRO1383に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA58743−1609のヌクレオチド配列全体を図49(配列番号49)に示す。クローンDNA58743−1609は、ヌクレオチド122−124位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1391−1393位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図49)。予測されるポリペプチド前駆体は、423アミノ酸長である(図50;配列番号50)。図50に示す完全長PRO1383タンパク質は、推定分子量が約46,989ダルトン、pIが約6.77である。図50(配列番号50)に示される完全長PRO1383配列の解析により、以下:アミノ酸
約1〜アミノ酸約24のシグナルペプチド、アミノ酸約339〜アミノ酸約362の膜貫通ドメインならびにアミノ酸約34〜アミノ酸約37、アミノ酸約58〜アミノ酸約61、アミノ酸約142〜アミノ酸約145、アミノ酸約197〜アミノ酸約200、アミノ酸約300〜アミノ酸約303およびアミノ酸約364〜アミノ酸約367の潜在的N−グリコシル化部位の存在が証明された。クローンDNA58743−1609は、1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203154が割り当てられている。
約1〜アミノ酸約24のシグナルペプチド、アミノ酸約339〜アミノ酸約362の膜貫通ドメインならびにアミノ酸約34〜アミノ酸約37、アミノ酸約58〜アミノ酸約61、アミノ酸約142〜アミノ酸約145、アミノ酸約197〜アミノ酸約200、アミノ酸約300〜アミノ酸約303およびアミノ酸約364〜アミノ酸約367の潜在的N−グリコシル化部位の存在が証明された。クローンDNA58743−1609は、1998年8月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203154が割り当てられている。
図50(配列番号50)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1383アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:NMB_HUMAN、QNR_COTJA、P_W38335、P115_CHICK、P_W38164、A45993_1、MMU70209_1、D83704_1およびP_W39176との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例27:ヒトPRO1384ポリペプチド[UNQ721]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA54192と命名する。そのDNA54192配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1384についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA54192と命名する。そのDNA54192配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1384についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’−TGCAGCCCCTGTGACACAAACTGG−3’(配列番号194)
逆方向PCRプライマー5’−CTGAGATAACCGAGCCATCCTCCCAC−3’(配列番号195)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA54192配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GGAGATAGCTGCTATGGGTTCTTCAGGCACAACTTAACATGGGAAG−3’(配列番号196)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1384遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓から単離した。
順方向PCRプライマー5’−TGCAGCCCCTGTGACACAAACTGG−3’(配列番号194)
逆方向PCRプライマー5’−CTGAGATAACCGAGCCATCCTCCCAC−3’(配列番号195)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するDNA54192配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GGAGATAGCTGCTATGGGTTCTTCAGGCACAACTTAACATGGGAAG−3’(配列番号196)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1384遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1384に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA71159−1617と命名[図51,配列番号51])およびPRO1384に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
PRO1384のコード配列全体を図51に示す(配列番号51)。クローンDNA71159−1617は、ヌクレオチド182−184位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド869−871位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、229アミノ酸長である(図52;配列番号52)。図52に示す完全長PRO1384タンパク質は、推定分子量が
約26,650ダルトン、pIが約8.76である。さらなる特徴としては、アミノ酸約32−57のII型膜貫通ドメインならびにアミノ酸約68−71、120−123および134−137の潜在的N−グリコシル化部位が挙げられる。
約26,650ダルトン、pIが約8.76である。さらなる特徴としては、アミノ酸約32−57のII型膜貫通ドメインならびにアミノ酸約68−71、120−123および134−137の潜在的N−グリコシル化部位が挙げられる。
図52(配列番号52)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1384アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF054819_1、HSAJ1687_1、AF009511_1、AB010710_1、GEN13595、HSAJ673_1、GEN13961、AB005900_1、LECH_CHICK、AF021349_1およびNK13_RATとの間の相同性が明らかになった。
クローンDNA71159−1617は、1998年8月18日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203135が割り当てられている。
実施例28:ヒトPRO1431ポリペプチド[UNQ737]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、SH3との相同性を示したEST(成人脳幹組織から単離)を同定した(1370141,DNA66505)。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト骨髄から単離した。単離したESTに対応する完全長cDNAを、pRK5においてin vitroクローニング技術を使用して単離した(DNA73401−1633)。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、SH3との相同性を示したEST(成人脳幹組織から単離)を同定した(1370141,DNA66505)。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト骨髄から単離した。単離したESTに対応する完全長cDNAを、pRK5においてin vitroクローニング技術を使用して単離した(DNA73401−1633)。
ヒトPRO1431をコードするcDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoIおよびNotIにおいてクローニングした。
cDNAクローンを全体に亘って配列決定した。DNA73401−1633のヌクレオチド配列全体(配列番号53)を図53に示す。クローンDNA73401−1633は、ヌクレオチド630−632位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1740−1742位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。DNA73401−1633によってコードされる、予測されるポリペプチド前駆体は、370アミノ酸長である(図54;配列番号54)。クローンDNA73401(DNA73402−1633と命名)は、1998年9月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203273が割り当てられている。
完全長配列の配列アラインメント解析(ALIGNコンピュータプログラムを使用)に基づいて、PRO1431は、SH17_HUMAN、SH3P17として知られるSH3含有タンパク質との有意なアミノ酸配列同一性を示す。さらなる有意な同一性スコアは、D89164_1、AF032118_1、EXLP_TOBAC、YHR4_YEAST、S46992、RATP130CAS_2、AF043259_1、RATP130CAS_1およびMYSC_ACACAに対して見られた。
実施例29:ヒトPRO1434ポリペプチド[UNQ739]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA54187と命名する。そのDNA54187コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1434についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA54187と命名する。そのDNA54187コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1434についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー5’−GAGGTGTCGCTGTGAAGCCAACGG−3’(配列番号197)
逆方向PCRプライマー5’−CGCTCGATTCTCCATGTGCCTTCC−3’(配列番号198)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA54187配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GACGGAGTGTGTGGACCCTGTGTACGAGCCTGATCAGTGCTGTCC−3’(配列番号199)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト網膜組織(LIB94)から単離した。
順方向PCRプライマー5’−GAGGTGTCGCTGTGAAGCCAACGG−3’(配列番号197)
逆方向PCRプライマー5’−CGCTCGATTCTCCATGTGCCTTCC−3’(配列番号198)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA54187配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−GACGGAGTGTGTGGACCCTGTGTACGAGCCTGATCAGTGCTGTCC−3’(配列番号199)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト網膜組織(LIB94)から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1434に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA68818−2536と命名[図55,配列番号55])およびPRO1434に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA68818−2536のヌクレオチド配列全体を図55(配列番号55)に示す。クローンDNA68818−2536は、ヌクレオチド581−583位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1556−1558位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図55)。予測されるポリペプチド前駆体は、325アミノ酸長である(図56;配列番号56)。図56に示す完全長PRO1434タンパク質は、推定分子量が約35,296ダルトン、pIが約5.37である。図56(配列番号56)に示す完全長PRO1434配列の解析により、図56に示すような種々の重要なタンパク質ドメインの存在が証明された。クローンDNA68818−2536は、1999年2月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203657が割り当てられている。
図56(配列番号56)に示される完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1434アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:NEL_MOUSE、APMU_PIG、P_W37501、NEL_RAT、TSP1_CHICK、P_W37500、NEL2_HUMAN、MMU010792_1、D86983_1および10MUCS_BOVINとの間の有意な相同性が明らかになった。
実施例30:ヒトPRO1475ポリペプチド[UNQ746]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA45639と命名する。そのDNA45639コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1475について
の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA45639と命名する。そのDNA45639コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1475について
の完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー(45639.f1)5’−GATGGCAAAACGTGTGTTTGACACG−3’(配列番号200)
順方向PCRプライマー(45639.f2)5’−CCTCAACCAGGCCACGGGCCAC−3’(配列番号201)
逆方向PCRプライマー(45639.r1)5’−CCCAGGCAGAGATGCAGTACAGGC−3’(配列番号202)
逆方向PCRプライマー(45639.r2)5’−CCTCCAGTAGGTGGATGGATTGGCTC−3’(配列番号203)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA45639配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(45639.p1)
5’−CTCACCTCATGAGGATGAGGCCATGGTGCTATTCCTCAACATGGTAG−3’(配列番号204)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1475遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児脳組織から単離した。
順方向PCRプライマー(45639.f1)5’−GATGGCAAAACGTGTGTTTGACACG−3’(配列番号200)
順方向PCRプライマー(45639.f2)5’−CCTCAACCAGGCCACGGGCCAC−3’(配列番号201)
逆方向PCRプライマー(45639.r1)5’−CCCAGGCAGAGATGCAGTACAGGC−3’(配列番号202)
逆方向PCRプライマー(45639.r2)5’−CCTCCAGTAGGTGGATGGATTGGCTC−3’(配列番号203)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA45639配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(45639.p1)
5’−CTCACCTCATGAGGATGAGGCCATGGTGCTATTCCTCAACATGGTAG−3’(配列番号204)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1475遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児脳組織から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1475に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA61185−1646と命名[図57,配列番号57])およびPRO1475に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA61185−1646のヌクレオチド配列全体を図57(配列番号57)に示す。クローンDNA61185−1646は、ヌクレオチド130−132位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2110−2112位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図57)。予測されるポリペプチド前駆体は、660アミノ酸長である(図58;配列番号58)。図58に示す完全長PRO1475タンパク質は、推定分子量が約75,220ダルトン、pIが約6.76である。図58(配列番号58)に示す完全長PRO1475配列の解析により、以下:アミノ酸約38〜アミノ酸約55の膜貫通ドメインおよびアミノ酸約229〜アミノ酸約660のマウスGNT1に対する相同領域の存在が証明された。クローンDNA61185−1646は、1998年11月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203464が割り当てられている。
図58(配列番号58)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1475アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:GNT1_MOUSE、CGU65792_1、CGU65791_1、P_R24781、CELF48E3_1、G786_HUMAN、P_W06547、GNT1_CAEEL、219_HUMANおよびEF07_MOUSEとの間の有意な相同性が明らかになった。
実施例31:ヒトPRO1481ポリペプチド[UNQ750]をコードするcDNAクローンの単離
本明細書中でDNA53254と称される最初のDNA配列を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児腎臓cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。そのDNA53254配列に基づいて、PRO1481についての完全長コード配列のクローンをヒト胎児腎臓cDNAライブラリーから単離するためのプローブ(またはプライマー)として使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
本明細書中でDNA53254と称される最初のDNA配列を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児腎臓cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。そのDNA53254配列に基づいて、PRO1481についての完全長コード配列のクローンをヒト胎児腎臓cDNAライブラリーから単離するためのプローブ(またはプライマー)として使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
図59に示す完全長DNA58732−1650クローンは、ヌクレオチド320−322位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1322−1324位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図59;配列番号59)。予測されるポリペプチド前駆体(図60,配列番号60)は、334アミノ酸長である。そのシグナルペプチドは、配列番号60のアミノ酸約1−23であり、膜貫通ドメインは、アミノ酸約235−262である。そのN−グリコシル化部位を、図60に示す。PRO1481は、算出分子量が約36,294ダルトン、推定pIが約4.98である。クローンDNA58732−1650は、1998年9月29日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203290が割り当てられている。
図60(配列番号60)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1481アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(データは本明細書中で援用される):YN23_YEAST、S67770、H36857、YLU2_PICAN、GEN12881、CVY15035_28、YM96_YEAST、ESC1_SCHPO、CELZK783_1およびS59310との間の配列同一性が明らかになった。
実施例32:ヒトPRO1568ポリペプチド[UNQ774]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、他のEST配列に関してphrapを使用して構築することにより、上の実施例1に記載したようにアセンブリを形成した。そのコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA54208」と命名する。DNA54208コンセンサス配列、そのアセンブリおよび他の情報ならびに本明細書中で提供される発見に基づいて、そのアセンブリ内のESTを含むクローンを、整列し、配列決定した。そのESTは、Incyte3089490である。全長の配列決定により、図61に示す配列が得られた。
コンセンサスDNA配列を、他のEST配列に関してphrapを使用して構築することにより、上の実施例1に記載したようにアセンブリを形成した。そのコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA54208」と命名する。DNA54208コンセンサス配列、そのアセンブリおよび他の情報ならびに本明細書中で提供される発見に基づいて、そのアセンブリ内のESTを含むクローンを、整列し、配列決定した。そのESTは、Incyte3089490である。全長の配列決定により、図61に示す配列が得られた。
PRO1568のコード配列全体が図61(配列番号61)に含まれている。クローンDNA68880−1676は、配列番号61のヌクレオチド208−210位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1123−1125位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、305アミノ酸長である(図62;配列番号62)。そのシグナルペプチド、膜貫通領域、N−ミリストイル化およびアミド化部位もまた、図62に示す。クローンDNA68880−1676は、1998年10月6日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203319が割り当てられている。図62に示す完全長PRO1568タンパク質は、推定分子量が約35,383ダルトン、pIが約5.99である。
図62(配列番号62)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1568アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用される):AF089749_1、AF054841_1、NAG2_HUMAN、CD63_HUMAN、CD82_HUMAN、P_W05732、P_R86834、A15_HUMAN、P_W27333およびCD37_HUMANとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例33:ヒトPRO1573ポリペプチド[UNQ779]をコードするcDNAクローンの単離
Incyteデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)内のEST 3628990を同定し、データベース内の他の配列との比較によって伸長することにより、アセンブリを形成した。アラインメント検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そのコンセンサス配列を本明細書中で「DNA69561」と命名する。
Incyteデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)内のEST 3628990を同定し、データベース内の他の配列との比較によって伸長することにより、アセンブリを形成した。アラインメント検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上の比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そのコンセンサス配列を本明細書中で「DNA69561」と命名する。
DNA69561コンセンサス配列および本明細書中で提供される他の情報に基づいて、そのアセンブリ由来の別のEST(Incyte DNA3752657)を含むクローンを購入し、配列決定した。このクローンは、乳房腫瘍組織ライブラリー由来であった。
PRO1573のコード配列全体は、図63(配列番号63)に含まれている。クローンDNA73735−1681は、ヌクレオチド97−99位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド772−774位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、225アミノ酸長である(図64;配列番号64)。そのシグナルペプチドは、配列番号64のアミノ酸約1〜17であり、膜貫通ドメインは、アミノ酸約82〜101、118〜145および164〜188である。膜貫通ドメインの1つ以上が欠失され得るか、または不活性化され得る。リン酸化部位、アミド化部位およびN−ミリストイル化部位を図64に示す。クローンDNA73735−1681は、1998年10月20日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203356が割り当てられている。図64に示す完全長PRO1573タンパク質は、推定分子量が約24,845ダルトン、pIが約9.07である。
図64(配列番号64)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1573アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中で援用される):AF007189_1、AB000714_1、AB000713_1、AB000712_1、A39484、AF000959_1、AF072127_、AF072128_1、AF068863_1およびAF077739_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例34:ヒトPRO1599ポリペプチド[UNQ782]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例1に記載の技術を使用して、既知タンパク質をコードしない、70以上のBLASTスコアを有する目的の配列としてIncyte EST番号1491360を同定した。EST番号1491360のヌクレオチド配列およびその相補配列を、本明細書中で「DNA37192」と命名する。DNA37192配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1599についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
上の実施例1に記載の技術を使用して、既知タンパク質をコードしない、70以上のBLASTスコアを有する目的の配列としてIncyte EST番号1491360を同定した。EST番号1491360のヌクレオチド配列およびその相補配列を、本明細書中で「DNA37192」と命名する。DNA37192配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1599についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:GACGTCTGCAACAGCTCCTGGAAG(37192.f1;配列番号205)
逆方向PCRプライマー:CGAGAAGGAAACGAGGCCGTGAG(37192.r1;配列番号206)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA37192配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ:TGACACTTACCATGCTCTGCACCCGCAGTGGGGACAGCCACAGA(配列番号207).
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1599遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。
順方向PCRプライマー:GACGTCTGCAACAGCTCCTGGAAG(37192.f1;配列番号205)
逆方向PCRプライマー:CGAGAAGGAAACGAGGCCGTGAG(37192.r1;配列番号206)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA37192配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ:TGACACTTACCATGCTCTGCACCCGCAGTGGGGACAGCCACAGA(配列番号207).
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1599遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1599に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA62845−1684と命名[図65,配列番号65])およびPRO1599に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
PRO1599のコード配列全体を図65(配列番号65)に示す。クローンDNA62845−1684は、ヌクレオチド69−71位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド918−920位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、283アミノ酸長である(図66;配列番号66)。図66に示す完全長PRO1599タンパク質は、推定分子量が約30,350ダルトン、pIが約9.66である。PRO1599のさらなる特徴としては:アミノ酸約1〜30のシグナルペプチド;アミノ酸約129〜132および189〜192の潜在的N−グリコシル化部位;アミノ酸約263〜266の潜在的cAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約28〜33、55〜60、174〜179および236〜241の潜在的N−ミリストイル化部位;アミノ酸約144〜147の潜在的アミド化部位;ならびにアミノ酸約70−75のセリンプロテアーゼ、トリプシンファミリー、ヒスチジン活性部位が挙げられる。
図66(配列番号66)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1599アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CFAD_PIGとの間の有意な相同性が明らかになった。PRO1599アミノ酸配列と以下のDayhoff配列との間にも相同性が見られた。CFAD_HUMAN;P_R05421;P_R55757;P_R05772;GRAM_HUMAN;MUSLMET_1;P_P80335;P_R55758;A42048_1;およびP_W05383。
クローンDNA62845−1684は、1998年10月20日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203361が割り当てられている。
実施例35:ヒトPRO1604ポリペプチド[UNQ785]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索した。In
cyte EST番号3550440を、HDGFとの相同性を有すると同定した。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)およびLIFESEQ(登録商標)データベースを含む様々なESTデータベースとEST番号3550440を比較することにより、相同なEST配列を同定した。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「DNA67237」と命名する。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索した。In
cyte EST番号3550440を、HDGFとの相同性を有すると同定した。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)およびLIFESEQ(登録商標)データベースを含む様々なESTデータベースとEST番号3550440を比較することにより、相同なEST配列を同定した。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「DNA67237」と命名する。
DNA67237配列とLIFESEQ(登録商標)データベース由来のEST番号3367060との間の配列相同性に鑑みて、Incyte EST番号3367060を含むクローンを購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定することにより、図67(配列番号67)に示すPRO1604のコード配列全体を得た。
クローンDNA71286−1687は、ヌクレオチド65−67位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2078−2080位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、671アミノ酸長である(図68;配列番号68)。図68に示す完全長PRO1604タンパク質は、推定分子量が約74,317ダルトン、pIが約7.62である。さらなる特徴としては、アミノ酸約1−13のシグナルペプチド;アミノ酸約156−159、171−174および451−454の潜在的cAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約46−51、365−370および367−372の潜在的N−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約661−663の細胞結合配列が挙げられる。
図68(配列番号68)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1604アミノ酸配列と以下のDayhoff配列番号P_W37483との間の有意な相同性が明らかになった。PRO1604アミノ酸配列と以下のさらなるDayhoff配列:AF063020_1、P_R66727、P_W37482、JC5661、CEC25A1_11、CEU33058_1、I38073、MST2_DROHYおよびHSATRX36_1との間にも相同性が見られた。
クローンDNA71286−1687は、1998年10月20日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203357が割り当てられている。
実施例36:ヒトPRO1605ポリペプチド[UNQ786]をコードするcDNAクローンの単離
ネイティブヒトPRO1605ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA77648−1688)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児cDNA腎臓ライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
ネイティブヒトPRO1605ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA77648−1688)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト胎児cDNA腎臓ライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
図69に示す完全長DNA77648−1688クローン(配列番号69)は、ヌクレオチド425−427位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド845−847位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図69)。予測されるポリペプチド前駆体は、140アミノ酸長である(図70;配列番号70)。図70に示す完全長PRO1605タンパク質は、推定分子量が約15,668ダルトン
、pIが約10.14である。図70(配列番号70)に示される完全長PRO1605配列の解析から、アミノ酸約1〜アミノ酸約26のシグナルペプチドの存在が証明された。クローンDNA77648−1688は、1998年10月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203408が割り当てられている。
、pIが約10.14である。図70(配列番号70)に示される完全長PRO1605配列の解析から、アミノ酸約1〜アミノ酸約26のシグナルペプチドの存在が証明された。クローンDNA77648−1688は、1998年10月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203408が割り当てられている。
図70(配列番号70)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1605アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:GNT5_HUMAN、P_R48975、P_W22519、MM26SPROT_1、HSU86782_1、CH60_LEPIN、HMCT_HELPY、F65126、HIU08875_1およびP_R41724との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例37:ヒトPRO1693ポリペプチド[UNQ803]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA38251と命名する。そのDNA38251コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1693についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したように他のEST配列に関してphrapを使用して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA38251と命名する。そのDNA38251コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1693についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー(38251.f1)5’−CTGGGATCTGAACAGTTTCGGGGC−3’(配列番号208)
逆方向PCRプライマー(38251.r1)5’−GGTCCCCAGGACATGGTCTGTCCC−3’(配列番号209)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA38251配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(38251.p1)
5’−GCTGAGTTTACATTTACGGTCTAACTCCCTGAGAACCATCCCTGTGCG−3’(配列番号210)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1693遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。
順方向PCRプライマー(38251.f1)5’−CTGGGATCTGAACAGTTTCGGGGC−3’(配列番号208)
逆方向PCRプライマー(38251.r1)5’−GGTCCCCAGGACATGGTCTGTCCC−3’(配列番号209)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA38251配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(38251.p1)
5’−GCTGAGTTTACATTTACGGTCTAACTCCCTGAGAACCATCCCTGTGCG−3’(配列番号210)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1693遺伝子をコードするクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1693に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA77301−1708と命名[図71,配列番号71])およびPRO1693に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA77301−1708のヌクレオチド配列全体を図71(配列番号71)に示す。クローンDNA77301−1708は、ヌクレオチド508−510位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2047−2049位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図71)。予測されるポリペプチド前駆体は、513アミノ酸長である(図72;配列番号72)。図72に示す完全長PRO1693タンパク質は、推定分子量が約58,266ダルトン、pIが約9.84である。図72(配列番号72)に示される完全長PRO1693配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約33のシグナルペプチド、アミノ酸約420〜アミノ酸約442の膜貫
通ドメイン、アミノ酸約126〜アミノ酸約129、アミノ酸約357〜アミノ酸約360、アミノ酸約496〜アミノ酸約499およびアミノ酸約504〜アミノ酸約507の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約465〜アミノ酸約468のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、アミノ酸約136〜アミノ酸約142のチロシンキナーゼリン酸化部位ならびにアミノ酸約11〜アミノ酸約16、アミノ酸約33〜アミノ酸約38、アミノ酸約245〜アミノ酸約250、アミノ酸約332〜アミノ酸約337、アミノ酸約497〜アミノ酸約502およびアミノ酸約507〜アミノ酸約512の潜在的N−ミリストイル化(myristolation)部位の存在が証明された。クローンDNA77301−1708は、1998年10月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203407が割り当てられている。
通ドメイン、アミノ酸約126〜アミノ酸約129、アミノ酸約357〜アミノ酸約360、アミノ酸約496〜アミノ酸約499およびアミノ酸約504〜アミノ酸約507の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約465〜アミノ酸約468のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位、アミノ酸約136〜アミノ酸約142のチロシンキナーゼリン酸化部位ならびにアミノ酸約11〜アミノ酸約16、アミノ酸約33〜アミノ酸約38、アミノ酸約245〜アミノ酸約250、アミノ酸約332〜アミノ酸約337、アミノ酸約497〜アミノ酸約502およびアミノ酸約507〜アミノ酸約512の潜在的N−ミリストイル化(myristolation)部位の存在が証明された。クローンDNA77301−1708は、1998年10月27日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203407が割り当てられている。
図72(配列番号72)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1693アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AB007876_1、ALS_MOUSE、HSCHON03_1、P_R85889、AF062006_1、AB014462_1、A58532、MUSLRRPA_1、AB007865_1およびAF030435_1との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例38:ヒトPRO1753ポリペプチド[UNQ826]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された企業のシグナル配列検索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA68883を同定するだけでなく、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業のデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントをクラスター化し、構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された企業のシグナル配列検索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA68883を同定するだけでなく、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業のデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントをクラスター化し、構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定でき、Incyteクラスター番号54463と命名する。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのESTクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中で「DNA54233」と命名する。DNA54233配列とEST番号25974
44との間の配列相同性に鑑みて、そのESTクローン2597444を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。ESTクローン2597444は、卵巣腫瘍組織から単離されたRNA由来であった。このcDNA挿入断片の配列を図73に示し、本明細書中で「DNA68883−1691」と命名する。
44との間の配列相同性に鑑みて、そのESTクローン2597444を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。ESTクローン2597444は、卵巣腫瘍組織から単離されたRNA由来であった。このcDNA挿入断片の配列を図73に示し、本明細書中で「DNA68883−1691」と命名する。
図73に示す完全長クローンは、ヌクレオチド197〜199位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1832〜1834位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図73;配列番号73)。予測されるポリペプチド前駆体(図74,配列番号74)は、545アミノ酸長である。PRO1753は、算出分子量が約60022ダルトン、推定pIが約5.50である。PRO1753のさらなる特徴としては:アミノ酸約1−16のシグナルペプチド;アミノ酸約89−92、116−119、259−262、291−294および299−302の潜在的N−グリコシル化部位;アミノ酸約411−417および443−450の潜在的チロシンキナーゼリン酸化部位;アミノ酸約226−231、233−238、240−245、252−257、296−301、300−305、522−527および531−536の潜在的N−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約197−208のアスパラギン酸およびアスパラギンヒドロキシル化部位が挙げられる。
図74(配列番号74)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1753アミノ酸配列とDayhoff配列MMU72678_1との間の有意な相同性が明らかになった。PRO1753アミノ酸配列と以下のさらなるDayhoff配列:GP2_HUMAN;UROM_HUMAN;MMU69262_1;P_W52840;EGF_HUMAN;P_P50296;P_W31705;CET05A1_8;およびHSAJ474_1との間にも相同性が見られた。
DNA68883−1691と命名されるクローンDNA68883(UNQ826)は、1998年12月15日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203535が割り当てられている。
実施例39:ヒトPRO1755ポリペプチド[UNQ828]をコードするcDNAクローンの単離
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定でき、ESTクラスター番号141872と命名した。次いで、このESTクラスター配列を、上で列挙したデータベース由来の種々のESTと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA55731」と命名する。
上の実施例3に記載したシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定でき、ESTクラスター番号141872と命名した。次いで、このESTクラスター配列を、上で列挙したデータベース由来の種々のESTと比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索を、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を、本明細書中で「DNA55731」と命名する。
DNA55731配列とIncyte EST番号257323内に包含される配列との間の配列相同性に鑑みて、そのESTクローンを購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。Incyteクローン257323は、発生の初期段階で拘束されたニューロンの前駆体と特徴付けられた特性を示すヒト奇形癌由来であるhNT2細胞株(Stratageneライブラリー番号STR9372310)から単離されたRNAを使
用して構築されたライブラリー由来であった。このcDNA挿入断片の配列を図75に示し、本明細書中で「DNA76396−1698」と命名する。あるいは、このDNA76396−1698配列は、オリゴヌクレオチドプローブおよびプライマーを調製して、適切なライブラリー(例えば、STR9372310)から配列を単離することによって得ることができる。
用して構築されたライブラリー由来であった。このcDNA挿入断片の配列を図75に示し、本明細書中で「DNA76396−1698」と命名する。あるいは、このDNA76396−1698配列は、オリゴヌクレオチドプローブおよびプライマーを調製して、適切なライブラリー(例えば、STR9372310)から配列を単離することによって得ることができる。
図75に示す完全長クローンは、ヌクレオチド58〜60位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド886〜888位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図75;配列番号75)。予測されるポリペプチド前駆体(図76,配列番号76)は、276アミノ酸長である。PRO1755は、算出分子量が約29,426ダルトン、推定pIが約9.40である。さらなる特徴としては:アミノ酸約1−31のシグナルペプチド配列;アミノ酸約178−198の膜貫通ドメイン;アミノ酸約210−213のcAMPおよびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約117−122、154−149および214−219の潜在的N−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約149−151の細胞結合配列が挙げられる。
図76(配列番号76)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1755アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:APG−BRANA、P_R37743、NAU88587_1、YHL1_EBV、P_W31855、CET10B10_4、AF039404_1、PRP1_HUMAN、AF038575_1およびAF053091_1との間のいくらかの相同性が明らかになった。
クローンDNA76396−1698は、1998年11月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203471が割り当てられている。
実施例40:ヒトPRO1777ポリペプチド[UNQ839]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA47435と命名する。
DNA47435コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1777についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを
合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー(47434.f1)5’−CTGTTACACTGACGTGGCCCTCCC−3’(配列番号211)
逆方向PCRプライマー(47434.r1)5’−CATTCTGACCCACGGGCCATTGTC−3’(配列番号212)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47435配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(47434.p1)
5’−GTGGAGCAGCCGGTGAACTTGAGCAGCCTTGCCCAGAAGTATGC−3’(配列番号213)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト海馬組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー(47434.f1)5’−CTGTTACACTGACGTGGCCCTCCC−3’(配列番号211)
逆方向PCRプライマー(47434.r1)5’−CATTCTGACCCACGGGCCATTGTC−3’(配列番号212)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA47435配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(47434.p1)
5’−GTGGAGCAGCCGGTGAACTTGAGCAGCCTTGCCCAGAAGTATGC−3’(配列番号213)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト海馬組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1777に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA71235−1706と命名[図77,配列番号77]);(UNQ839)およびPRO1777に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
UNQ839(DNA71235−1706)のヌクレオチド配列全体を図77(配列番号77)に示す。クローンUNQ839(DNA71235−1706)は、ヌクレオチド797−799位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド2372−2374位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図77)。予測されるポリペプチド前駆体は、525アミノ酸長である(図78;配列番号78)。図78に示す完全長PRO1777タンパク質は、推定分子量が約57,133ダルトン、pIが約6.55である。図78(配列番号78)に示される完全長PRO1777配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約16のシグナルペプチド、アミノ酸約353〜アミノ酸約373の膜貫通ドメイン、アミノ酸約117〜アミノ酸約120、アミノ酸約215〜アミノ酸約218、アミノ酸約356〜アミノ酸約359およびアミノ酸約497〜アミノ酸約500の潜在的N−グリコシル化部位、アミノ酸約12〜アミノ酸約17、アミノ酸約33〜アミノ酸約38、アミノ酸約52〜アミノ酸約57、アミノ酸約97〜アミノ酸約102、アミノ酸約101〜アミノ酸約106、アミノ酸約113〜アミノ酸約118、アミノ酸約158〜アミノ酸約163、アミノ酸約328〜アミ
ノ酸約333、アミノ酸約388〜アミノ酸約393、アミノ酸約418〜アミノ酸約423、アミノ酸約435〜アミノ酸約440およびアミノ酸約436〜アミノ酸約441の潜在的N−ミリストイル化部位、アミノ酸約382〜アミノ酸約385のアミド化部位ならびにアミノ酸約129〜アミノ酸約138のスルファターゼサイン2配列の存在が証明された。クローンUNQ839(DNA71235−1706)は、1999年1月12日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203584が割り当てられている。図78(配列番号78)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1777アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:G02857、GA6S_HUMAN、HGS_A139、GEN12647、STS_HUMAN、GEN12648、SPHM_HUMAN、P_W47298、GEN13892およびAF050145_1との間の有意な相同性が明らかになった。
ノ酸約333、アミノ酸約388〜アミノ酸約393、アミノ酸約418〜アミノ酸約423、アミノ酸約435〜アミノ酸約440およびアミノ酸約436〜アミノ酸約441の潜在的N−ミリストイル化部位、アミノ酸約382〜アミノ酸約385のアミド化部位ならびにアミノ酸約129〜アミノ酸約138のスルファターゼサイン2配列の存在が証明された。クローンUNQ839(DNA71235−1706)は、1999年1月12日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203584が割り当てられている。図78(配列番号78)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1777アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:G02857、GA6S_HUMAN、HGS_A139、GEN12647、STS_HUMAN、GEN12648、SPHM_HUMAN、P_W47298、GEN13892およびAF050145_1との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例41:ヒトPRO1788ポリペプチド[UNQ850]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知タンパク質をコードしない、70以上のBLASTスコアを有する目的の配列として、Incyte EST番号2968304を同定した。Incyteクローン番号2968304のヌクレオチド配列を本明細書中で「DNA6612」と命名する。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知タンパク質をコードしない、70以上のBLASTスコアを有する目的の配列として、Incyte EST番号2968304を同定した。Incyteクローン番号2968304のヌクレオチド配列を本明細書中で「DNA6612」と命名する。
さらに、BLASTおよびphrap(Phil Green,University
of Washington,Seattle,Washington)の繰り返しサイクルを使用して、DNA6612配列を伸長することにより、上記のEST配列の起源を使用してその配列をできる限り伸長した。その伸長したコンセンサス配列を本明細書中で「DNA49648」と命名する。DNA49648コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1788についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
of Washington,Seattle,Washington)の繰り返しサイクルを使用して、DNA6612配列を伸長することにより、上記のEST配列の起源を使用してその配列をできる限り伸長した。その伸長したコンセンサス配列を本明細書中で「DNA49648」と命名する。DNA49648コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1788についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:CCCTGCCAGCCGAGAGCTTCACC(49648.f1;配列番号214)
逆方向PCRプライマー:GGTTGGTGCCCGAAAGGTCCAGC(49648.r1;配列番号215)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA49648配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ:CAACCCCAAGCTTAACTGGGCAGGAGCTGAGGTGTTTTCAGGCC(49648.p1;配列番号216)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1788遺伝子をコードす
るクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。
順方向PCRプライマー:CCCTGCCAGCCGAGAGCTTCACC(49648.f1;配列番号214)
逆方向PCRプライマー:GGTTGGTGCCCGAAAGGTCCAGC(49648.r1;配列番号215)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA49648配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ:CAACCCCAAGCTTAACTGGGCAGGAGCTGAGGTGTTTTCAGGCC(49648.p1;配列番号216)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO1788遺伝子をコードす
るクローンを単離した。cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1788に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA77652−2505と命名[図79,配列番号79])およびPRO1788に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA77652−2505のコード配列全体を図79(配列番号79)に示す。クローンDNA77652−2505は、ヌクレオチド64−66位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1123−1125位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、353アミノ酸長である(図80;配列番号80)。図80に示す完全長PRO1788タンパク質は、推定分子量が約37,847ダルトン、pIが約6.80である。PRO1788のさらなる特徴としては:アミノ酸約1−16のシグナルペプチド;アミノ酸約215−232および287−304の膜貫通ドメイン;アミノ酸約74−77および137−140の潜在的N−グリコシル化部位;アミノ酸約45−48のグリコサミノグリカン結合部位;アミノ酸約318−325のチロシンキナーゼリン酸化部位;アミノ酸約13−18、32−37、88−93、214−219および223−228のN−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約284−305のロイシンジッパーパターンが挙げられる。
図80(配列番号80)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1788アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AF030435_1;AF062006_1;DMTARTAN_1;GARP_HUMAN;S42799;P_R71294;HSU88879_1;DROWHEELER_1;A58532;およびAF068920_1との間の有意な相同性が明らかになった。
クローンDNA77652−2505は、1998年11月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203480が割り当てられている。
実施例42:ヒトPRO1864ポリペプチド[UNQ855]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)、企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)およびGenentechの企業ESTを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil
Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)、企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)およびGenentechの企業ESTを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil
Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、phrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でConcen1424と命名する。さらに、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して、Consen1424コンセンサスDNA配列を伸長することにより、上記のEST配列の起源を使用してそのコンセンサ
ス配列をできる限り伸長した。その伸長したコンセンサス配列を本明細書中でDNA40649と命名する。
ス配列をできる限り伸長した。その伸長したコンセンサス配列を本明細書中でDNA40649と命名する。
DNA40649コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO1864についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー(40649.f1)5’−CTCCTCCAGGATGAACCACCTGCC−3’(配列番号217)
順方向PCRプライマー(40649.f2)5’−CAGGATGCTTCAGAGAGG−3’(配列番号218)
逆方向PCRプライマー(40649.r1)5’−CCTGCCTTCGGATTCCAGGAGGGG−3’(配列番号219)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40649配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(40649.p1)
5’−CCATCAACCCCACACAACTCATGGCCAGGATTGAGTCCTATG−3’(配列番号220)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー(40649.f1)5’−CTCCTCCAGGATGAACCACCTGCC−3’(配列番号217)
順方向PCRプライマー(40649.f2)5’−CAGGATGCTTCAGAGAGG−3’(配列番号218)
逆方向PCRプライマー(40649.r1)5’−CCTGCCTTCGGATTCCAGGAGGGG−3’(配列番号219)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA40649配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ(40649.p1)
5’−CCATCAACCCCACACAACTCATGGCCAGGATTGAGTCCTATG−3’(配列番号220)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO1864に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA45409−2511と命名[図81,配列番号81]);(UNQ855)およびPRO1864に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
UNQ855(DNA45409−2511)のヌクレオチド配列全体を図81(配列番号81)に示す。クローンUNQ855(DNA45409−2511)は、ヌクレオチド100−102位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド802−804位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図81)。予測されるポリペプチド前駆体は、234アミノ酸長である(図82;配列番号82)。図82に示す完全長PRO1864タンパク質は、推定分子量が約26,655ダルトン、
pIが約4.79である。図82(配列番号82)に示される完全長PRO1864配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約20のシグナルペプチドならびにアミノ酸約54〜アミノ酸約72、アミノ酸約100〜アミノ酸約118、アミノ酸約130〜アミノ酸約144およびアミノ酸約146〜アミノ酸約166の膜貫通ドメインの存在が証明された。クローンUNQ855(DNA45409−2511)は、1999年1月12日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203579が割り当てられている。図82(配列番号82)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1864アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_W25768、I38027、D38255_1、MMES64_1、OCU92812_1、DRPATCH_1、DPOD_PLAFK、RTM1_YEAST、P_R77844およびP_R90765との間の有意な相同性が明らかになった。
pIが約4.79である。図82(配列番号82)に示される完全長PRO1864配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約20のシグナルペプチドならびにアミノ酸約54〜アミノ酸約72、アミノ酸約100〜アミノ酸約118、アミノ酸約130〜アミノ酸約144およびアミノ酸約146〜アミノ酸約166の膜貫通ドメインの存在が証明された。クローンUNQ855(DNA45409−2511)は、1999年1月12日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203579が割り当てられている。図82(配列番号82)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1864アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_W25768、I38027、D38255_1、MMES64_1、OCU92812_1、DRPATCH_1、DPOD_PLAFK、RTM1_YEAST、P_R77844およびP_R90765との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例43:ヒトPRO1925ポリペプチド[UNQ904]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムを発現配列タグ(EST)に適用することによってDNA82302を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムを発現配列タグ(EST)に適用することによってDNA82302を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベースからESTクラスター配列が同定でき、クラスター番号31113_2と命名する。次いで、上で列挙したESTデータベースとこのESTクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中で「DNA73884」と命名する。DNA73884配列とLIFESEQ(登録商標)データベース由来のEST番号3271608HIとの間の配列相同性に鑑みて、ESTクローン番号3271608HIを購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このクローンは、罹患ヒト脳組織を使用して構築したライブラリー由来であった。このcDNA挿入断片の配列を図83に示し、本明細書中でDNA82302と命名する。
図83に示す完全長クローンは、ヌクレオチド89〜91位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1409〜1411位に見られる終止コドンで終結する単一のオープ
ンリーディングフレームを含んでいた(図83;配列番号83)。予測されるポリペプチド前駆体(図84,配列番号84)は、440アミノ酸長である。PRO1925は、算出分子量が約49,403ダルトン、推定pIが約7.16である。さらなる特徴としては、アミノ酸約39−56のII型膜貫通ドメイン;アミノ酸約149−155および274−281のチロシンキナーゼリン酸化部位;アミノ酸約10−15、20−25、63−68および208−213のN−ミリストイル化部位;アミノ酸約10−13のアミド化部位;ならびにアミノ酸約230−236の糖タンパク質ホルモンβ鎖サイン1が挙げられる。
ンリーディングフレームを含んでいた(図83;配列番号83)。予測されるポリペプチド前駆体(図84,配列番号84)は、440アミノ酸長である。PRO1925は、算出分子量が約49,403ダルトン、推定pIが約7.16である。さらなる特徴としては、アミノ酸約39−56のII型膜貫通ドメイン;アミノ酸約149−155および274−281のチロシンキナーゼリン酸化部位;アミノ酸約10−15、20−25、63−68および208−213のN−ミリストイル化部位;アミノ酸約10−13のアミド化部位;ならびにアミノ酸約230−236の糖タンパク質ホルモンβ鎖サイン1が挙げられる。
図84(配列番号84)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1925アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_R95913、AF010144_1、HSAF000996_1、HUMTRRP_1、P_W00838、I54374、PVPVA1_1、REL_HUMAN、HSU94362_1およびP_W19943との間のいくらかの相同性が明らかになった。
DNA82302−2529と命名されるクローンDNA82302(UNQ904)は、1998年12月15日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203534が割り当てられている。
実施例44:ヒトPRO1926ポリペプチド[UNQ905]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA82340を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA82340を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
次いで、上で述べたデータベース由来の種々のESTと同定されたEST配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA73887と命名する。DNA73887配列とLIFESEQ(登録商標)由来のEST番号3577105との間の配列相同性に鑑みて、ヒト気管支組織から構築されたcDNAライブラリー由来であったそのESTクローンを購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。この
cDNA挿入断片の配列を図85に示し、本明細書中でDNA82340−2530と命名する。
cDNA挿入断片の配列を図85に示し、本明細書中でDNA82340−2530と命名する。
図85に示す完全長クローンは、ヌクレオチド74〜76位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド800〜802位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図85;配列番号85)。予測されるポリペプチド前駆体(図86,配列番号86)は、242アミノ酸長である。PRO1926は、算出分子量が約26,471ダルトン、推定pIが約9.50である。さらなる特徴としては:アミノ酸約1−23のシグナルペプチド;アミノ酸約136−180の膜貫通ドメイン;アミノ酸約184−187の潜在的N−グリコシル化部位;アミノ酸約37−40および236−239のグリコサミノグリカン結合部位;アミノ酸約151−154のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約33−38、36−41、38−43および229−234の潜在的N−ミリストイル化部位;アミノ酸約238−241のアミド化部位;ならびにアミノ酸約229−236のATP/GTP結合部位モチーフA(P−ループ)が挙げられる。
図86(配列番号86)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO1926配列のうちのカルボキシ末端の最後の81アミノ酸とDayhoff配列P_W57893との間の100パーセントの配列同一性が明らかになった。PRO1926アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S72578、AR20_CAEEL、HGS_A198、HGS_A273、AF007570_1、GEN12401、DMSTKIN_1、FAT_DROME、MNB_DROMEとの間にもいくらかの相同性が見られた。
DNA82340−2530と命名されるクローンDNA82340(UNQ905)は、1998年12月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203547が割り当てられている。
実施例45:ヒトPRO3566ポリペプチド[UNQ1840]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA59844−2542を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA59844−2542を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、IncyteデータベースからESTクラスター配列が同定できた。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(Lifeseq(登録商標),
Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのESTクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA56016と命名する。DNA56016配列とIncyte ESTクローン番号2603392との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号2603392を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図87に示し、本明細書中でDNA59844−2542と命名する。
Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのESTクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA56016と命名する。DNA56016配列とIncyte ESTクローン番号2603392との間の配列相同性に鑑みて、Incyte ESTクローン番号2603392を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片の配列を図87に示し、本明細書中でDNA59844−2542と命名する。
クローンUNQ1840(DNA59844−2542)は、ヌクレオチド5−7位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド980−982位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図87;配列番号87)。予測されるポリペプチド前駆体は、325アミノ酸長である(図88;配列番号88)。図88に示す完全長PRO3566タンパク質は、推定分子量が約34,256ダルトン、pIが約7.14である。図88(配列番号88)に示される完全長PRO3566配列の解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約26のシグナルペプチドならびに図88に示す様々な他の領域の存在が証明された。クローンUNQ1840(DNA59844−2542)は、1999年2月9日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号203650が割り当てられている。
図88(配列番号88)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO3566アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HELWAMIDE_1、CA21_MOUSE、SP62_HUMAN、AF095464_1、HMU92813_1、PRIO_BOVIN、SN24_HUMAN、TPM4_DROME、SYN1_RATおよびCELT28F2_7との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例46:ヒトPRO4330ポリペプチド[UNQ1886]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、トロンボスポンジンとの相同性を示したESTである4287529H1(配列番号3、本明細書中でDNA85538とも呼ばれるかまたはDNA由来)を同定した。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、トロンボスポンジンとの相同性を示したESTである4287529H1(配列番号3、本明細書中でDNA85538とも呼ばれるかまたはDNA由来)を同定した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト大動脈内皮細胞から単離した。ヒトPRO4330をコードするcDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoIおよびNotIにおいて
クローニングした。
クローニングした。
ヒトcDNAライブラリー(上記のように調製)を合成オリゴヌクレオチドプローブ:5’GGAGACATGTTTCGAATGGACAACTGTC3’(順方向,配列番号221);5’CTGGATCTTCACACACTGGGCAGC3’(逆方向,配列番号222);および5’CCCAGTGTGGTGAGATAAACTGCGAGAGGTACTACGTGCCCGAAGG3’(プラスミド,配列番号223)
を用いてハイブリダイゼーションによりスクリーニングした。
を用いてハイブリダイゼーションによりスクリーニングした。
cDNAクローンを全体に亘って配列決定した。コードPRO4330を含むヌクレオチド配列を図89(配列番号89)に示す。クローンDNA90842−2574は、ヌクレオチド368−370位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド3476−3478位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図89;配列番号89)。予測されるポリペプチド前駆体は、1036アミノ酸長である(図90;配列番号90)。
図90に示す完全長PRO4330タンパク質は、推定分子量が約113738ダルトン、pIが約5.14である。
図90(配列番号90)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4330アミノ酸配列と以下のDayhoff配列(本明細書中に援用される):D83017_1、P_W37500、NEL_RAT、P_W37501、NEL2_HUMAN、AF034606_1、P_W40288、CHRD_XENLA、TSP1_CHICKおよびSOG_DROMEとの間の相同性が明らかになった。
実施例47:ヒトPRO4423ポリペプチド[UNQ1940]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA96893−2621を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA96893−2621を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、Incyteデータベース、企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)からEST配列が同定できた。DNA80594に基づいて、DNA96893−2621を同定し、配列決定した。
図91に示す完全長クローンは、ヌクレオチド110−112位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド639−641位に見られる終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図91;配列番号91)。予測されるポリペプチド前駆体(図92,配列番号92)は、173アミノ酸長である。PRO4423は、算出分子量が約19733ダルトン、推定pIが約8.78である。
図92(配列番号92)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4423アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:S09646およびYHY4_YEASTとの間の相同性が明らかになった。DNA96893−2621と命名されるクローンDNA96893−2621(UNQ1940)は、1999年5月4日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−12が割り当てられている。
実施例48:ヒトPRO4977ポリペプチド[UNQ2420]をコードするcDNAクローンの単離
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、およびPRO4977についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
コンセンサスDNA配列を、上の実施例1に記載したようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列に基づいて、目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、およびPRO4977についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。
PCRプライマー対(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−ATGCCAATAACTTTGCCTCGGAGC−3’(配列番号224)
逆方向PCRプライマー 5’−CCAGAAGGCCAGGGCTTTCTCTG−3’(配列番号225)
ハイブリダイゼーションプローブもまた合成した:
5’−GAGTGCATGAGCAGCTGCCAGGGATCTCTCCATGGGCCCC−3’(配列番号226)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO4977遺伝子をコードするクローンを単離した。
順方向PCRプライマー 5’−ATGCCAATAACTTTGCCTCGGAGC−3’(配列番号224)
逆方向PCRプライマー 5’−CCAGAAGGCCAGGGCTTTCTCTG−3’(配列番号225)
ハイブリダイゼーションプローブもまた合成した:
5’−GAGTGCATGAGCAGCTGCCAGGGATCTCTCCATGGGCCCC−3’(配列番号226)
完全長クローンの起源についていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、上で同定されたPCRプライマーを用いたPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用し、プローブオリゴヌクレオチドおよびPCRプライマーの一方を使用して、PRO4977遺伝子をコードするクローンを単離した。
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓ライブラリーから単離した。上記のように単離したクローンのDNA配列決定により、PR4977についての完全長DNA配列およびそれに誘導されるタンパク質配列が得られた。
DNA62849−2647のヌクレオチド配列全体を図95(配列番号95)に示す。クローンDNA62849−2647は、ヌクレオチド330−332位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1761−1763位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、477アミノ酸長である(図96;配列番号96)。クローンDNA62849−2647は、1999年6月8日にATCCに寄託され(DNA62849−2647と命名)、ATCC寄託番号PTA−205が割り当てられている。完全長PRO4977タンパク質は、推定分子量が約51112ダルトン、pIが約6.66である。図96(配列番号96)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、
PTO4977アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:DJ534K4_3、AF41053_1、CELZK3777_2.AF060570_1、AF026465_1;I50600、HSU61262_1、DMU88578_1、P_W08747およびDMNRG2_2との間の相同性が明らかになった。
PTO4977アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:DJ534K4_3、AF41053_1、CELZK3777_2.AF060570_1、AF026465_1;I50600、HSU61262_1、DMU88578_1、P_W08747およびDMNRG2_2との間の相同性が明らかになった。
実施例49:ヒトPRO4980ポリペプチド[UNQ2422]をコードするcDNAクローンの単離
本明細書中でDNA81573と呼ぶ最初のDNA配列を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒトcDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。次いで、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、公的データベース(例えば、GenBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)由来のESTとこのcDNAを比較した。このESTをクラスター化し、プログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA90613と命名する。
本明細書中でDNA81573と呼ぶ最初のDNA配列を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒトcDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。次いで、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、公的データベース(例えば、GenBank)および企業のESTデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)由来のESTとこのcDNAを比較した。このESTをクラスター化し、プログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA90613と命名する。
ヒト大動脈内皮細胞cDNAライブラリーからPRO4980についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するために、PCRプライマー(順方向および逆方向)をDNA90613配列に基づいて合成した:
順方向PCRプライマー:
5’−CAACCGTATGGGACCGATACTCG−3’(配列番号227)
逆方向PCRプライマー:
5’−CACGCTCAACGAGTCTTCATG−3’(配列番号228)
ハイブリダイゼーションプローブ:
5’−GTGGCCCTCGCAGTGCAGGCCTTCTACGTCCAATACAAGTG−3’(配列番号229)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト大動脈内皮細胞組織から単離した。そのcDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、Not部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、Sal半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、Notで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、Sfi部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXho部位およびNot部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー:
5’−CAACCGTATGGGACCGATACTCG−3’(配列番号227)
逆方向PCRプライマー:
5’−CACGCTCAACGAGTCTTCATG−3’(配列番号228)
ハイブリダイゼーションプローブ:
5’−GTGGCCCTCGCAGTGCAGGCCTTCTACGTCCAATACAAGTG−3’(配列番号229)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト大動脈内皮細胞組織から単離した。そのcDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、Not部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、Sal半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、Notで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、Sfi部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXho部位およびNot部位においてクローニングした。
このスクリーニングから得られた完全長DNA97003−2649クローンを図99[配列番号99]に示し、このクローンは、ヌクレオチド286−288位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1900−1902位の明らかな終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる。予測されるポリペプチド前駆体は、538アミノ酸長である(図100;配列番号100)。図100に示す完全長PRO4980タンパク質は、推定分子量が約59,268ダルトン、pIが約8.94である。図100(配列番号100)に示す完全長PRO4980配列の解析により、種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。図100に示す完全長PRO4980ポリペプチドの解析により、以下:アミノ酸約1〜アミノ酸約36のシグナルペプチド;アミノ酸約77〜アミノ酸約95、アミノ酸約111〜アミノ酸約133、アミノ
酸約161〜アミノ酸約184、アミノ酸約225〜アミノ酸約248、アミノ酸約255〜アミノ酸約273、アミノ酸約299〜アミノ酸約314、アミノ酸約348〜アミノ酸約373、アミノ酸約406〜アミノ酸約421、アミノ酸約435〜アミノ酸約456およびアミノ酸約480〜アミノ酸約497の膜貫通ドメイン;アミノ酸約500〜アミノ酸約504のN−グリコシル化部位;アミノ酸約321〜アミノ酸約325のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約13〜アミノ酸約19、アミノ酸約18〜アミノ酸約24、アミノ酸約80〜アミノ酸約86、アミノ酸約111〜アミノ酸約117、アミノ酸約118〜アミノ酸約124、アミノ酸約145〜アミノ酸約151、アミノ酸約238〜アミノ酸約244、アミノ酸約251〜アミノ酸約257、アミノ酸約430〜アミノ酸約436、アミノ酸約433〜アミノ酸約439、アミノ酸約448〜アミノ酸約454、アミノ酸約458〜アミノ酸約464、アミノ酸約468〜アミノ酸約474、アミノ酸約475〜アミノ酸約481、アミノ酸約496〜アミノ酸約502およびアミノ酸約508〜アミノ酸約514のN−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約302〜アミノ酸約313の原核生物の膜リポタンパク質脂質結合部位の存在が証明された。クローンDNA97003−2649は、1999年5月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−43が割り当てられている。
酸約161〜アミノ酸約184、アミノ酸約225〜アミノ酸約248、アミノ酸約255〜アミノ酸約273、アミノ酸約299〜アミノ酸約314、アミノ酸約348〜アミノ酸約373、アミノ酸約406〜アミノ酸約421、アミノ酸約435〜アミノ酸約456およびアミノ酸約480〜アミノ酸約497の膜貫通ドメイン;アミノ酸約500〜アミノ酸約504のN−グリコシル化部位;アミノ酸約321〜アミノ酸約325のcAMP−およびcGMP−依存性タンパク質キナーゼリン酸化部位;アミノ酸約13〜アミノ酸約19、アミノ酸約18〜アミノ酸約24、アミノ酸約80〜アミノ酸約86、アミノ酸約111〜アミノ酸約117、アミノ酸約118〜アミノ酸約124、アミノ酸約145〜アミノ酸約151、アミノ酸約238〜アミノ酸約244、アミノ酸約251〜アミノ酸約257、アミノ酸約430〜アミノ酸約436、アミノ酸約433〜アミノ酸約439、アミノ酸約448〜アミノ酸約454、アミノ酸約458〜アミノ酸約464、アミノ酸約468〜アミノ酸約474、アミノ酸約475〜アミノ酸約481、アミノ酸約496〜アミノ酸約502およびアミノ酸約508〜アミノ酸約514のN−ミリストイル化部位;ならびにアミノ酸約302〜アミノ酸約313の原核生物の膜リポタンパク質脂質結合部位の存在が証明された。クローンDNA97003−2649は、1999年5月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−43が割り当てられている。
図100(配列番号100)に示す完全長配列のWU−BLAST2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4980アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:SC59_YEAST、S76857、CELF31F4_12、AC002464_1、NU5M_CHOCR、S59109、SAY10108_2、AF055482_2、F69049およびG70433との間の有意な相同性が明らかになった。
実施例50:ヒトPRO4981ポリペプチド[UNQ2423]をコードするcDNAクローンの単離
ネイティブヒトPRO4981ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA94849−2960)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト精巣cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
ネイティブヒトPRO4981ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA94849−2960)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト精巣cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
クローンDNA94849−2960は、ヌクレオチド145−147位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1690−1692位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図101;配列番号101)。予測されるポリペプチド前駆体は、515アミノ酸長である(図102;配列番号102)。図102に示す完全長PRO4981タンパク質は、推定分子量が約59357ダルトン、pIが約9.40である。図102に示す完全長PRO4981配列(配列番号102)の解析により、図102に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA94849−2960は、2000年7月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−2306が割り当てられている。
図102(配列番号102)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO4981アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:TMA272073_1、AK001324_1、AE003806_12、AE003745_18、MS2_ARATH、AF149917_1、ATMS2LIPR_1、HETM_ANASP、T18552、LYS2_YEASTとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例51:ヒトPRO5801ポリペプチド[UNQ2501]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、(1)公的データベース(例えば、GenBank)および(2)企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、(1)公的データベース(例えば、GenBank)および(2)企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上記のようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA105850と命名する。いくつかの場合において、このコンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得られ、これにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA105850コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO5801についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー1 5’−ACTCCATATTTTCCTACTTGTGGCA−3’(配列番号230)
順方向PCRプライマー2 5’−CCCAAAGTGACCTAAGAAC−3’(配列番号231)
逆方向PCRプライマー5’−TCACTGAATTTCTTCAAAACCATTGCA−3’(配列番号232)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA105850配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TGTGGCAGCGACTGCATCCGACATAAAGGAACAGTTGTGCTCTGCCCACA−3’(配列番号233)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen
,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー1 5’−ACTCCATATTTTCCTACTTGTGGCA−3’(配列番号230)
順方向PCRプライマー2 5’−CCCAAAGTGACCTAAGAAC−3’(配列番号231)
逆方向PCRプライマー5’−TCACTGAATTTCTTCAAAACCATTGCA−3’(配列番号232)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA105850配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TGTGGCAGCGACTGCATCCGACATAAAGGAACAGTTGTGCTCTGCCCACA−3’(配列番号233)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児肝臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen
,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、完全長PRO5801ポリペプチドに対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA115291−2681と命名[図103,配列番号103])およびそのPRO5801に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
上で同定した完全長クローンは、ヌクレオチド7−9位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1513−1515位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図103,配列番号103)。予測されるポリペプチド前駆体は、502アミノ酸長であり、その算出分子量は、約55,884ダルトン、推定pIは、約8.52である。図104(配列番号104)に示す完全長PRO5801配列の解析により、図104に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA115291−2681は、1999年6月8日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−202が割り当てられている。
Dayhoffデータベースの解析により、PRO5801が、IL−17レセプタータンパク質に対する配列類似性を有することが示され、PRO5801はまた、本明細書中でIL−17RH1と称される。特に、図104(配列番号104)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO5801アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HSU58917_1、P_W92409、P_W61272、P_W04185、P_W61271、P_W04184、P_W92408、GEN13979、MMU31993_1およびYSO2_CAEELとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例52:ヒトPRO5995ポリペプチド[UNQ2507]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、(1)公的ESTデータベース(例えば、Merck/Washington University)および(2)企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、(1)公的ESTデータベース(例えば、Merck/Washington University)および(2)企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上記のようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA92934と命名する。いくつかの場合において、このDNA92934コンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得られ、これにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA92934コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO5995についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−GGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAAC−3’(配列番号234)
逆方向PCRプライマー 5’−TGTCATCACTGCAAGTTAAGGCTTCCC−3’(配列番号235)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA92934配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’CGTAGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTG3’(配列番号236)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー 5’−GGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAAC−3’(配列番号234)
逆方向PCRプライマー 5’−TGTCATCACTGCAAGTTAAGGCTTCCC−3’(配列番号235)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA92934配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’CGTAGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTG3’(配列番号236)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト胎児腎臓組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、完全長PRO5995ポリペプチドに対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA96988−2685と命名[図105,配列番号105])およびPRO5995ポリペプチドに対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
上で同定した完全長クローンは、ヌクレオチド24−26位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド3096−3098位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図105,配列番号105)。予測されるポリペプチド前駆体は、1024アミノ酸長であり、その算出分子量は、約117049ダルトン、推定p
Iは、約6.90である。図106(配列番号106)に示す完全長PRO5995配列の解析により、図106に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA96988−2685は、1999年7月20日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−384が割り当てられている。
Iは、約6.90である。図106(配列番号106)に示す完全長PRO5995配列の解析により、図106に示す種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA96988−2685は、1999年7月20日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−384が割り当てられている。
図106(配列番号106)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO5995アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:I59331;AMPN_RAT;AMPN_HUMAN;AMPE_HUMAN;P_R94512;HUMPLAA_1;A65888_1;AAP1_YEAST;P_W33661;AF049234_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例53:ヒトPRO6095ポリペプチド[UNQ2543]をコードするcDNAクローンの単離
ネイティブヒトPRO6095ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA105680−2710)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト骨髄cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
ネイティブヒトPRO6095ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA105680−2710)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト骨髄cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
クローンDNA105680−2710は、ヌクレオチド372−374位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド458−460位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図109;配列番号109)。予測されるポリペプチド前駆体は、457アミノ酸長である(図110;配列番号110)。図110に示す完全長PRO6095タンパク質は、推定分子量が約52,015ダルトン、pIが約9.22である。図110(配列番号110)に示す完全長PRO6095配列の解析により、図110に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA105680−2710は、1999年8月3日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−483が割り当てられている。
図110(配列番号110)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO6095アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:CELZC328_5、F15K9_2、S59792、S78570、S53021、F1003_10、A57514、GAR2_SCHPO、A70387およびCELW09C3_4との間の配列同一性が明らかになった。
実施例54:ヒトPRO6182ポリペプチド[UNQ2553]をコードするcDNAクローンの単離
ネイティブヒトPRO6182ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA110700−2716)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト乳癌cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
ネイティブヒトPRO6182ポリペプチドをコードするcDNAクローン(DNA110700−2716)を、1次cDNAクローンの5’末端を優先的に示すヒト乳癌cDNAライブラリーにおいて酵母スクリーニングを使用して同定した。
クローンDNA110700−2716は、ヌクレオチド18−20位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1236−1238位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図111;配列番号111)。予測されるポリペプチド前駆体は、406アミノ酸長である(図112)。図112に示す完全長PRO6182タンパク質は、推定分子量が約43,878ダルトン、pIが約6.50である。図112(配列番号112)に示す完全長PRO6182配列の解析により、図112に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要な
ポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA110700−2716は、1999年8月10日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−512が割り当てられている。
ポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA110700−2716は、1999年8月10日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−512が割り当てられている。
図112(配列番号112)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO6182アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AB011161_1;AC005542_2;EMU41602_1;HUMIGCH06_1;PTN8_MOUSE;HUMIGCH08_1;AF012848_1;S17597;P_P40254;DTC_HUMANとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例55:ヒトPRO7170ポリペプチド[UNQ2782]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA108722−2743を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA108722−2743を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo AltoからESTクラスター配列が同定でき、本明細書中でCLU57836と命名する。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのESTクラスター配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA58756と命名する。
DNA58756配列とLIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA由来のクローン番号2251462内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号2251462を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入
断片の配列を図113に示し、本明細書中でDNA108722−2743と命名する。
断片の配列を図113に示し、本明細書中でDNA108722−2743と命名する。
クローンDNA108722−2743は、ヌクレオチド60−62位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1506−1508位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図113;配列番号113)。予測されるポリペプチド前駆体は、482アミノ酸長である(図114;配列番号114)。図114に示す完全長PRO7170タンパク質は、推定分子量が約49,060ダルトン、pIが約4.74である。図114(配列番号114)に示す完全長PRO7170配列の解析により、図114に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA108722−2743は、1999年8月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−552が割り当てられている。
図114(配列番号114)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO7170アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_Y12291、I47141、D88733_1、DMC56G7_1、P_Y11606、HWP1_CANAL、HSMUC5BEX_1、HSU78550_1、HSU70136_1およびSGS3_DROMEとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例56:ヒトPRO7171ポリペプチド[UNQ2783]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA108670−2744を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA108670−2744を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからEST配列が同定でき、本明細書中で212369と命名する。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのEST配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Wa
shington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA79089と命名する。
shington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA79089と命名する。
DNA79089配列とLIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA由来のクローン番号212369内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号212369を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図115に示し、本明細書中でDNA108670−2744と命名する。
クローンDNA108670−2744は、ヌクレオチド93−95位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド495−497位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図115;配列番号115)。予測されるポリペプチド前駆体は、134アミノ酸長である(図116;配列番号116)。図116に示す完全長PRO7171タンパク質は、推定分子量が約14,120ダルトン、pIが約4.77である。図116(配列番号116)に示す完全長PRO7171配列の解析により、図116に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA108670−2744は、1999年8月17日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−546が割り当てられている。
図116(配列番号116)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO7171アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AC007504_28、AF103900_1、OPUD_BACSU、G69670、T02361およびTS11_GIALAとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例57:ヒトPRO7436ポリペプチド[UNQ2973]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA119535−2756を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA119535−2756を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAからEST配列が同定でき、本明細書中で5325636と命名する。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベー
ス(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのEST配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods
in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA105428と命名する。
ス(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのEST配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods
in Enzymology,266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA105428と命名する。
DNA105428配列とLIFESEQ(登録商標)データベース,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA由来のクローン番号5325636内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号5325636を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図117に示し、本明細書中でDNA119535−2756と命名する。
クローンDNA119535−2756は、ヌクレオチド211−213位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1111−1113位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図117;配列番号117)。予測されるポリペプチド前駆体は、300アミノ酸長である(図118;配列番号118)。図118に示す完全長PRO7436タンパク質は、推定分子量が約32,638ダルトン、pIが約6.02である。図118(配列番号118)に示す完全長PRO7436配列の解析により、図118に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA119535−2756は、1999年8月31日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−613が割り当てられている。
図118(配列番号118)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO7436アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AC005955_1、CGM1_HUMAN、P_R22041、CCEM_HUMAN、P_R06434、P_P93996、CE10_MOUSE、HOM6PSG2_1、PSG6_HUMANおよびECTO_RATとの間の配列同一性が明らかになった。
実施例58:ヒトPRO9912ポリペプチド[UNQ3077]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベースLIFESEQ(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、オートタキシンとの相同性を示したESTを同定した。
発現配列タグ(EST)DNAデータベースLIFESEQ(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、オートタキシンとの相同性を示したESTを同定した。
次いで、ESTクローン番号2921845をLIFESEQ(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)から購入し、そのクローンのcDNA挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。本明細書中でDNA108700−2802と命名されるクローンのヌクレオチド配列全体を図119(配列番号119)に示す。DNA108700−2802クローンは、ヌクレオチド4−6位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1378−1380位の終止シグナルを有する単一のオ
ープンリーディングフレームを含んでいる(図119,配列番号119)。予測されるポリペプチド前駆体は、458アミノ酸長であり、算出分子量が、約51506ダルトン、推定pIが約6.79である。図120(配列番号120)に示す完全長PRO9912配列の解析により、図120に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA108700−2802は、1999年12月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1093が割り当てられている。
ープンリーディングフレームを含んでいる(図119,配列番号119)。予測されるポリペプチド前駆体は、458アミノ酸長であり、算出分子量が、約51506ダルトン、推定pIが約6.79である。図120(配列番号120)に示す完全長PRO9912配列の解析により、図120に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA108700−2802は、1999年12月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1093が割り当てられている。
図120(配列番号120)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO9912アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:HS8B1_1、P_W75859、AB020686_1、P_Y17529、P_Y34324、T09933、PDNP3_1、PC1_HUMAN、HUMATXT_1およびP_R86595との間の配列同一性が明らかになった。
実施例59:ヒトPRO9917ポリペプチド[UNQ3079]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベースLIFESEQ(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ヒト前立腺幹細胞抗原との相同性を示したESTを同定した。
発現配列タグ(EST)DNAデータベースLIFESEQ(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ヒト前立腺幹細胞抗原との相同性を示したESTを同定した。
次いで、ESTクローン番号2498349をIncyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CAから購入し、そのクローンのcDNA挿入断片を得て、その全体に亘って配列決定した。
本明細書中でDNA119474−2803と称されるクローンのヌクレオチド配列全体を図121(配列番号121)に示す。DNA119474−2803クローンは、ヌクレオチド121−123位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド544−546位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図121,配列番号121)。予測されるポリペプチド前駆体は、141アミノ酸長であり、その算出分子量は、約15240ダルトン、推定pIは約8.47である。図122(配列番号122)に示す完全長PRO9917配列の解析により、図122に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。染色体マッピングにより、PRO9917をコードする核酸は、ヒトの2q21−q22にマッピングされることが証明される。クローンDNA119474−2803は、1999年12月22日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1097が割り当てられている。
図122(配列番号122)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO9917アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:PSCA_1、P_W80956、AF043498_1、P_W70522、P_W86024、P_W62066、P_Y13938、P_Y13347、D45835およびHSU08839_1との間の配列同一性が明らかになった。興味深いことに、そのPRO9917ポリペプチドは、前立腺幹細胞抗原(PSCA)ファミリーのほぼすべてのメンバーが有するGPIテイルを欠いている。
実施例60:ヒトPRO19646ポリペプチド[UNQ5827]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、(1)公的ESTデータベース(例えば、GenBank)、(2)企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)および(3)Genentechの企業のESTデータベースを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul
et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University
of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、(1)公的ESTデータベース(例えば、GenBank)、(2)企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)および(3)Genentechの企業のESTデータベースを含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul
et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University
of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上記のようにphrapを使用して他のEST配列に関して構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA144267と命名する。いくつかの場合において、このコンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得られ、これにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA144267コンセンサス配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO19646についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current
Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−−3’(配列番号237)GTCGCCCCATTTCCTGCAACAG
逆方向PCRプライマー 5’−−3’(配列番号238)GGGCCTGCTCTCCCTCTGAAGC
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA144267配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−−3’(配列番号239)GTGCTGGGCTCTGGAGCCACACTGCGTCTTCCGTC
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト[組織タイプを特定する]組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル
電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー 5’−−3’(配列番号237)GTCGCCCCATTTCCTGCAACAG
逆方向PCRプライマー 5’−−3’(配列番号238)GGGCCTGCTCTCCCTCTGAAGC
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA144267配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−−3’(配列番号239)GTGCTGGGCTCTGGAGCCACACTGCGTCTTCCGTC
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト[組織タイプを特定する]組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル
電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、PRO19646に対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA145841−2868と命名[図127,配列番号127])およびPRO19646に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
上で同定した完全長クローンは、ヌクレオチド199−201位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2322−2324位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図127,配列番号127)。予測されるポリペプチド前駆体は、708アミノ酸長であり、その算出分子量は、約75093ダルトン、推定pIは、約6.65である。図128(配列番号128)に示す完全長PRO19646配列の解析により、図128に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA145841−2868は、2000年4月11日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1678が割り当てられている。
図128(配列番号128)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO19646アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:DMC163A10_1、ICCR_DROME、NM_004646_1、AF210316_1、PGBM_HUMAN、NM_002821_1、P_W83927、HSU33G35_1、MAG_HUMAN、NM_001771_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例61:ヒトPRO19820ポリペプチド[UNQ5926]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース由来のゲノムDNAに適用することによって、DNA149911−2885を同定した。この場合、Stanford Universityから使用許可を受けている遺伝子予測プログラムGENSCANを使用して、GenBank(アクセッション番号)由来のゲノム配列を解析した。GENSCAN解析は、潜在的なエクソンを同定し、イントロンを取り除き、次いで、そのシグナルアルゴリズムに供されるDNA配列を作製することによって、遺伝子コード領域を予測する。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース由来のゲノムDNAに適用することによって、DNA149911−2885を同定した。この場合、Stanford Universityから使用許可を受けている遺伝子予測プログラムGENSCANを使用して、GenBank(アクセッション番号)由来のゲノム配列を解析した。GENSCAN解析は、潜在的なエクソンを同定し、イントロンを取り除き、次いで、そのシグナルアルゴリズムに供されるDNA配列を作製することによって、遺伝子コード領域を予測する。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、GenBankデータベースからある配列が同定でき、本明細書中でDNA144336と命名する。
DNA144336配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO19820についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−AGCCCCAGGGAGCACAGGCT−3’(配列番号240)
逆方向PCRプライマー 5’−GCTCGTCACGGCCATCTTCACC−3’(配列番号241)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA144389配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TGCGACAGCGGCATCAGGCGGTTCTTC−3’(配列番号242)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト混合組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー 5’−AGCCCCAGGGAGCACAGGCT−3’(配列番号240)
逆方向PCRプライマー 5’−GCTCGTCACGGCCATCTTCACC−3’(配列番号241)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA144389配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−TGCGACAGCGGCATCAGGCGGTTCTTC−3’(配列番号242)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト混合組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et
al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、完全長PRO19820ポリペプチドに対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA149911−2885と命名[図131,配列番号131])およびPRO19820に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
クローンDNA149911−2885は、ヌクレオチド9−11位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド342−344位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図131)。予測されるポリペプチド前駆体は、111アミノ酸長である(図132;配列番号132)。図132に示す完全長PRO19820タンパク質は、推定分子量が約12447ダルトン、pIが約8.31である。図132(配列番号132)に示す完全長PRO19820配列の解析により、図132に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA149911−2885は、2000年4月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−1776が割り当てられている。
図132(配列番号132)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO19820アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:P_Y41705、NM_000727_1、G70864、CCG1_HUMAN、MNT_HUMAN、P_Y06527、T13049、P_W47524、AF030100_1およびRNAJ696_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例62:ヒトPRO21201ポリペプチド[UNQ6098]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース由来のゲノムDNAに適用することによって、DNA168028−2956を同定した。この場合、Stanford Universityから使用許可を受けている遺伝子予測プログラムGENSCANを使用して、GenBank(アクセッション番号Z98200)由来のゲノム配列を解析した。GENSCAN解析は、潜在的なエクソンを同定し、イントロンを取り除き、次いで、そのシグナルアルゴリズムに供されるDNA配列を作製することによって、遺伝子コード領域を予測する。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。その配列が、確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された企業のシグナル配列探索アルゴリズムを、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース由来のゲノムDNAに適用することによって、DNA168028−2956を同定した。この場合、Stanford Universityから使用許可を受けている遺伝子予測プログラムGENSCANを使用して、GenBank(アクセッション番号Z98200)由来のゲノム配列を解析した。GENSCAN解析は、潜在的なエクソンを同定し、イントロンを取り除き、次いで、そのシグナルアルゴリズムに供されるDNA配列を作製することによって、遺伝子コード領域を予測する。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少なくとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。その配列が、確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、GenBankデータベースから配列が同定でき、DNA144330と命名する。
DNA144330配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO21201についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー 5’−TCCACGACCTCCTGTCGGAGC−3’(配列番号243)
逆方向PCRプライマー 5’−AGACCCTGTGCGGACTGCTGC−3’(配列番号244)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA144330配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ5’−AGCCCCGACCACAGCAGCAGCCCC−3’(配列番号245)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト組織の混合物から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー 5’−TCCACGACCTCCTGTCGGAGC−3’(配列番号243)
逆方向PCRプライマー 5’−AGACCCTGTGCGGACTGCTGC−3’(配列番号244)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA144330配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ5’−AGCCCCGACCACAGCAGCAGCCCC−3’(配列番号245)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト組織の混合物から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRK5BまたはpRK5D;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、完全長PRO21201ポリペプチドに対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA168028−2956と命名[図133,配列番号133])およびPRO21201に対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
クローンDNA168028−2956は、ヌクレオチド78−80位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド1080−1082位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図133)。予測されるポリペプチド前駆体は、334アミノ酸長である(図134;配列番号134)。図134に示す完全長PRO21201タンパク質は、推定分子量が約37257ダルトン、pIが約5.95である。図134(配列番号134)に示す完全長PRO21201配列の解析により、図134に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA168028−2956は、2000年7月25日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−2304が割り当てられている。
図134(配列番号134)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO21201アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:NM_014028_1、AF077205_1、YR53_CAEELおよびT22084との間の配列同一性が明らかになった。
実施例63:ヒトPRO20026ポリペプチド[UNQ6115]をコードするcDNAクローンの単離
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
Swiss−Prot公的データベースからの約950個の既知の分泌タンパク質の細胞外ドメイン(ECD)配列(もしあれば、分泌シグナル配列を含む)を、ESTデータベースを検索するために使用した。そのESTデータベースは、企業のESTデータベース(例えば、LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含んでいた。検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2[Altschul et al.,Methods in Enzymology,266:460−480(1996)]を使用して、ECDタンパク質配列とEST配列の6フレーム翻訳との比較として実施した。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。
コンセンサスDNA配列を、上記のようにphrapを使用して他のEST配列に関し
て構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA149870と命名する。いくつかの場合において、このDNA149870コンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得られ、これにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
て構築した。このコンセンサス配列を本明細書中でDNA149870と命名する。いくつかの場合において、このDNA149870コンセンサス配列は、BLASTおよびphrapの繰り返しサイクルを使用して伸長された中間コンセンサスDNA配列から得られ、これにより、上記のEST配列の起源を使用してその中間コンセンサス配列をできる限り伸長した。
DNA149870コンセンサス配列に基づいて、フリップクローニング(flip cloning)を行った。1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO20026についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。いくつかの場合において、コンセンサス配列が約l〜1.5kbpより大きいとき、さらなるオリゴヌクレオチドを合成する。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Schanke et al.,BioTechniques,16:414−416(1994)のように、PCRプライマー対を用いてフリップPCR(Flip PCR)増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
PCRプライマー(順方向および逆方向)を合成した:
順方向PCRプライマー:
5’−CGTTGTTTGTCAGTGGAGAGCAGGG−3’(配列番号246)逆方向PCRプライマー
5’−CAGGAACACCTGAGGCAGAAGCG−3’(配列番号247)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA149870配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CTATCTCCCTGCCAGGAGGCCGGAGTGGGGGAGGTCAGAC−3’(配列番号248)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San
Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
順方向PCRプライマー:
5’−CGTTGTTTGTCAGTGGAGAGCAGGG−3’(配列番号246)逆方向PCRプライマー
5’−CAGGAACACCTGAGGCAGAAGCG−3’(配列番号247)
さらに、合成オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションプローブを、以下のヌクレオチド配列を有するコンセンサスDNA149870配列から構築した:
ハイブリダイゼーションプローブ
5’−CTATCTCCCTGCCAGGAGGCCGGAGTGGGGGAGGTCAGAC−3’(配列番号248)
cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト組織から単離した。cDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San
Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoI部位およびNotI部位においてクローニングした。
上で記載したように単離したクローンのDNA配列決定により、完全長PRO20026ポリペプチドに対する完全長DNA配列(本明細書中でDNA154095−2998と命名[図135,配列番号135])およびPRO20026ポリペプチドに対して誘導されるタンパク質配列が得られた。
上で同定された完全長クローンは、ヌクレオチド70−72位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド2254−2256位の終止コドンを有する単一のオープンリーディングフレームを含んでいた(図135,配列番号135)。予測されるポリペプチド前駆体は、728アミノ酸長であり、その算出分子量は、約81,310ダルトン、推定pI
は、約6.84である。図136(配列番号136)に示す完全長PRO20026配列の解析により、図136に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA154095−2998は、2000年10月10日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−2591が割り当てられている。
は、約6.84である。図136(配列番号136)に示す完全長PRO20026配列の解析により、図136に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA154095−2998は、2000年10月10日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−2591が割り当てられている。
Dayhoffデータベースの解析により、PRO20026が、IL−17レセプタータンパク質との配列類似性を有することが示され、PRO2006はまた、本明細書中でIL−17RH4と称される。特に、図136(配列番号136)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO20026アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:T42695、P_W04185、P_W92409、P_W61272、NM_014339_1、HSU58917_1、MMU31993_1、GEN13979、P_W04184、P_W61271との間の配列同一性が明らかになった。
実施例64:ヒトPRO23202ポリペプチド[UNQ6507]をコードするcDNAクローンの単離
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTをGEPISによって同定した。インシリコでの遺伝子発現プロファイリング(Gene
expression profiling in silico;GEPIS)は、新規の治療標的について目的の遺伝子を特徴付けるバイオインフォマティクスツールである。GEPISは、莫大な量のEST配列およびライブラリー情報を利用することにより、遺伝子発現プロファイルを決定する。GEPISは、遺伝子の発現レベルがESTデータベース中のその出現数と比例して相関しているという仮定に基づいており、GEPISは、厳密な方法および統計的に有意な方法でIncyte ESTリレーショナルデータベースとGenentech企業の情報を統合することによって機能する。GEPISは、非常に特別な解析または広範なスクリーニングタスクのいずれかを行うために設定され得るが、この実施例においては、新規の腫瘍抗原を同定し、相互確認するために使用される。最初のスクリーニングでは、GEPISを使用して、ライブラリーから配列を決定する。Incyteデータベース全体を使用して、そのライブラリー情報に基づいて配列をクラスター化した。乳房、結腸、肺および前立腺を、特定された標的器官とした。次いで、この最初のクラスター化において見出された配列を、分泌ドメインおよび膜貫通含有ドメインについてのスクリーニングに供した。次いで、残った配列を、新規のものおよび同定された個別の配列についてスクリーニングした。最後の工程において、次いで、各々個別の配列をGEPISスクリーニングに供し、今度は配列からライブラリーを決定した。これにより、もとの標的組織におけるその発現プロファイルを確認した。このタイプのスクリーニングバイオインフォマティクスを使用して、DNA182753を同定し、この配列を使用して設計されたPCRプライマーを使用して、その完全長クローンについてライブラリーをスクリーニングした。
発現配列タグ(EST)DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を検索し、ESTをGEPISによって同定した。インシリコでの遺伝子発現プロファイリング(Gene
expression profiling in silico;GEPIS)は、新規の治療標的について目的の遺伝子を特徴付けるバイオインフォマティクスツールである。GEPISは、莫大な量のEST配列およびライブラリー情報を利用することにより、遺伝子発現プロファイルを決定する。GEPISは、遺伝子の発現レベルがESTデータベース中のその出現数と比例して相関しているという仮定に基づいており、GEPISは、厳密な方法および統計的に有意な方法でIncyte ESTリレーショナルデータベースとGenentech企業の情報を統合することによって機能する。GEPISは、非常に特別な解析または広範なスクリーニングタスクのいずれかを行うために設定され得るが、この実施例においては、新規の腫瘍抗原を同定し、相互確認するために使用される。最初のスクリーニングでは、GEPISを使用して、ライブラリーから配列を決定する。Incyteデータベース全体を使用して、そのライブラリー情報に基づいて配列をクラスター化した。乳房、結腸、肺および前立腺を、特定された標的器官とした。次いで、この最初のクラスター化において見出された配列を、分泌ドメインおよび膜貫通含有ドメインについてのスクリーニングに供した。次いで、残った配列を、新規のものおよび同定された個別の配列についてスクリーニングした。最後の工程において、次いで、各々個別の配列をGEPISスクリーニングに供し、今度は配列からライブラリーを決定した。これにより、もとの標的組織におけるその発現プロファイルを確認した。このタイプのスクリーニングバイオインフォマティクスを使用して、DNA182753を同定し、この配列を使用して設計されたPCRプライマーを使用して、その完全長クローンについてライブラリーをスクリーニングした。
次いで、cDNAライブラリーを構築するためのRNAをヒト前立腺組織から単離した。ヒトPRO23203をコードするcDNAクローンを単離するために使用したcDNAライブラリーは、Invitrogen,San Diego,CAの試薬などの市販の試薬を使用して標準的な方法によって構築した。cDNAを、NotI部位を含むオリゴdTをプライマーとして増幅し、SalI半リン酸化アダプターに平滑末端で連結し、NotIで切断し、ゲル電気泳動によって適切にサイズ分離し、適当なクローニングベクター(例えば、pRKBまたはpRKD;pRK5Bは、SfiI部位を含まないpRK5Dの前駆体である;Holmes et al.,Science,253:1278
−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoIおよびNotIにおいてクローニングした。
−1280(1991)を参照のこと)に所定の方向で独特のXhoIおよびNotIにおいてクローニングした。
次いで、上記EST配列に基づいて、1)目的の配列を含むcDNAライブラリーをPCRによって同定するため、および2)PRO23203についての完全長コード配列のクローンを単離するためのプローブとして使用するためにオリゴヌクレオチドプローブを合成した。順方向および逆方向PCRプライマーは、一般に20〜30ヌクレオチドの範囲であり、約100〜1000bp長のPCR産物が得られるように設計されることが多い。プローブ配列は、代表的には40〜55bp長である。完全長クローンについていくつかのライブラリーをスクリーニングするために、そのライブラリー由来のDNAを、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,前出のように、PCRプライマー対を用いてPCR増幅によってスクリーニングした。次いで、陽性のライブラリーを使用して、プローブオリゴヌクレオチドおよびプライマー対の一方を用いて目的の遺伝子をコードするクローンを単離した。
使用したオリゴヌクレオチドプローブは、次のとおりであった:
順方向PCRプライマー 5’−GATATTTGTTTCTCAACATGGCTTATCAGCAGG−3’(配列番号249)
逆方向PCRプライマー 5’−TCTCTGACCTTCTCATCGGTAAGCAGAGG−3’(配列番号250)
ハイブリダイゼーションプローブ 5’−TCTTTTGCAGCTTTGCAGATACCCAGACTGAGCTGGAACTGGA−3’(配列番号251)
ヌクレオチド188−190位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1550−1552位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローン[本明細書中でDNA185171−2994と命名]を同定した(図139,配列番号139)。予測されるポリペプチド前駆体は、454アミノ酸長であり、その算出分子量は、約52008ダルトン、推定pIは、約8.83である。図140(配列番号140)に示す完全長PRO23203配列の解析により、図140に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA185171−2994は、2000年9月26日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−2513が割り当てられている。
順方向PCRプライマー 5’−GATATTTGTTTCTCAACATGGCTTATCAGCAGG−3’(配列番号249)
逆方向PCRプライマー 5’−TCTCTGACCTTCTCATCGGTAAGCAGAGG−3’(配列番号250)
ハイブリダイゼーションプローブ 5’−TCTTTTGCAGCTTTGCAGATACCCAGACTGAGCTGGAACTGGA−3’(配列番号251)
ヌクレオチド188−190位の明らかな翻訳開始部位およびヌクレオチド1550−1552位の終止シグナルを有する単一のオープンリーディングフレームを含む完全長クローン[本明細書中でDNA185171−2994と命名]を同定した(図139,配列番号139)。予測されるポリペプチド前駆体は、454アミノ酸長であり、その算出分子量は、約52008ダルトン、推定pIは、約8.83である。図140(配列番号140)に示す完全長PRO23203配列の解析により、図140に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA185171−2994は、2000年9月26日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−2513が割り当てられている。
図140(配列番号140)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したタンパク質データベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO23203アミノ酸配列と以下の配列:AK001691_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例65:ヒトPRO35250ポリペプチド[UNQ9574]をコードするcDNAクローンの単離
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA171732−3100を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少な
くとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
Genentech,Inc.(South San Francisco,CA)によって開発された、企業のシグナル配列探索アルゴリズムをESTに適用することによってDNA171732−3100を同定するだけでなく、クラスター化し、公的データベース(例えば、GenBank)および/または企業データベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Inc.,Palo Alto,CA)からESTフラグメントを構築した。そのシグナル配列アルゴリズムは、目的の配列または配列フラグメントの5’−末端の1番目および必要に応じて2番目のメチオニンコドン(ATG)周辺のDNAヌクレオチドの特徴に基づいて分泌シグナルスコアを計算する。1番目のATGの後のヌクレオチドは、いかなる終止コドンも有しない少な
くとも35個の明確なアミノ酸をコードしなければならない。1番目のATGが必要なアミノ酸を有する場合、2番目のATGは、試験されない。どちらもが必要条件を満たさない場合、候補配列は、スコア付けされない。EST配列が確実なシグナル配列を含むか否かを判定するために、ATGコドンの周辺のDNA配列および対応するアミノ酸配列を、分泌シグナルに関連することが知られている7つのセンサー(評価パラメータ)のセットを使用してスコア付けする。
上記のシグナル配列アルゴリズムを使用することにより、LIFESEQ(登録商標)(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)データベースからEST配列が同定でき、本明細書中で248197.2と命名する。そのEST配列の起源は、脳葉切除の間に45歳黒人男性から取り出された右側頭葉組織から調製されたライブラリーであった。NotIアンカー付加されたオリゴ(dT)プライマーを使用してCDNA合成を開始した。二本鎖cDNAを平滑末端化し、EcoRIアダプターを連結し、NotIで消化し、サイズ選択し、そしてpINCYベクター(Incyte)のNotIおよびEcoRI部位にクローニングした。次いで、公的ESTデータベース(例えば、GenBank)および企業のEST DNAデータベース(LIFESEQ(登録商標),Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)を含む種々の発現配列タグ(EST)データベースとこのEST配列を比較することにより、存在する相同性を同定した。相同性検索は、コンピュータプログラムBLASTまたはBLAST2(Altschul et al.,Methods in Enzymology 266:460−480(1996))を使用して行った。既知のタンパク質をコードしなかった、BLASTスコアが70(またはいくつかの場合においては90)またはそれ以上であった比較結果を、クラスター化し、そしてプログラム「phrap」(Phil Green,University of Washington,Seattle,Washington)を用いてコンセンサスDNA配列を構築した。そこから得られたコンセンサス配列を本明細書中でDNA130657と命名する。
DNA130657配列とLIFESEQ(登録商標)(Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,CA)データベース由来のクローン番号4028188内に包含されるEST配列との間で観察された配列相同性に鑑みて、そのクローン番号4028188を購入し、そのcDNA挿入断片を得て、配列決定した。このcDNA挿入断片が、完全長タンパク質をコードしていることが見出された。このcDNA挿入断片の配列を図141に示し、本明細書中でDNA171732−3100と命名する。
クローンDNA171732−3100は、ヌクレオチド52−54位の明らかな翻訳開始部位を有し、ヌクレオチド604−606位の終止コドンで終結する単一のオープンリーディングフレームを含んでいる(図141;配列番号141)。予測されるポリペプチド前駆体は、184アミノ酸長である(図142;配列番号142)。図142に示す完全長PRO35250タンパク質は、推定分子量が約19,806ダルトン、pIが約4.74である。図142(配列番号142)に示す完全長PRO35250配列の解析により、図142に示すように種々の重要なポリペプチドドメインの存在が証明され、ここで、その重要なポリペプチドドメインについて与えられる位置は、上記のようにおよその位置である。クローンDNA171732−3100は、2001年4月24日にATCCに寄託され、ATCC寄託番号PTA−3329が割り当てられている。
図142(配列番号142)に示す完全長配列のALIGN−2配列アラインメント解析を使用したDayhoffデータベース(バージョン35.45 SwissProt35)の解析により、PRO35250アミノ酸配列と以下のDayhoff配列:AK
003305_1との間の配列同一性が明らかになった。
003305_1との間の配列同一性が明らかになった。
実施例66:PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの役割を調べるために、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の破壊を相同組換え技術またはレトロウイルス挿入技術により行った。詳細には、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PR
O1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子が破壊されたトランスジェニックマウス(すなわち、ノックアウトマウス)を遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップのいずれかにより作製した。サザンブロット解析により変異を確認することにより、5’末端と3’末端の両方における正確なターゲティングを確認した。挿入部位に隣接するエクソンにアニーリングするプライマーを使用したRT−PCRによって裏付けられるように、遺伝子特異的なジェノタイピングをゲノムPCRによって行うことにより、内在性の天然の転写物が失われていることが確認された。ターゲティングベクターを129系統のES細胞に電気穿孔し、標的クローンを同定した。標的クローンを宿主胚盤胞に微量注入することにより、キメラを作製した。キメラをC57動物と交雑し、F1ヘテロ接合体を作製した。ヘテロ接合体を交雑受精することにより、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体コホートを作製し、表現型解析に使用した。まれに、F1ヘテロ接合体が十分に作製されない場合に、そのF1へテロ接合体を野生型C57マウスと交雑することにより、十分なヘテロ接合体を得て、表現型の解析用のコホートと交雑させた。すべての表現型解析を生後12〜16週から実施した。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの役割を調べるために、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子の破壊を相同組換え技術またはレトロウイルス挿入技術により行った。詳細には、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PR
O1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250遺伝子が破壊されたトランスジェニックマウス(すなわち、ノックアウトマウス)を遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップのいずれかにより作製した。サザンブロット解析により変異を確認することにより、5’末端と3’末端の両方における正確なターゲティングを確認した。挿入部位に隣接するエクソンにアニーリングするプライマーを使用したRT−PCRによって裏付けられるように、遺伝子特異的なジェノタイピングをゲノムPCRによって行うことにより、内在性の天然の転写物が失われていることが確認された。ターゲティングベクターを129系統のES細胞に電気穿孔し、標的クローンを同定した。標的クローンを宿主胚盤胞に微量注入することにより、キメラを作製した。キメラをC57動物と交雑し、F1ヘテロ接合体を作製した。ヘテロ接合体を交雑受精することにより、F2野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体コホートを作製し、表現型解析に使用した。まれに、F1ヘテロ接合体が十分に作製されない場合に、そのF1へテロ接合体を野生型C57マウスと交雑することにより、十分なヘテロ接合体を得て、表現型の解析用のコホートと交雑させた。すべての表現型解析を生後12〜16週から実施した。
表現型結果の全体的な概要:
66.1.DNA284870(UNQ128)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO69122ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA284870と命名)(UNQ128)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:AK005023ムス・ムスクルス成雄肝臓cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:1300016D21産物:Sel1(lin−12のサプレッサー)1ホモログ(C.elegans);参照タンパク質:Q9Z2G6 アクセッション:Q9Z2G6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。Sel−1ホモログ前駆体(lin−12様タンパク質のサプレッサー)(Sel−1L);参照ヒト遺伝子配列:NM_005065 アクセッション:NM_005065 NID:lin−12様の19923668 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス sel−1サプレッサー(C.elegans)(SEL1L);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UBV2 アクセッション:Q9UBV2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。SEL−1ホモログ前駆体(LIN−12様タンパク質のサプレッサー)(SEL−1L)。
66.1.DNA284870(UNQ128)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO69122ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA284870と命名)(UNQ128)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:AK005023ムス・ムスクルス成雄肝臓cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:1300016D21産物:Sel1(lin−12のサプレッサー)1ホモログ(C.elegans);参照タンパク質:Q9Z2G6 アクセッション:Q9Z2G6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。Sel−1ホモログ前駆体(lin−12様タンパク質のサプレッサー)(Sel−1L);参照ヒト遺伝子配列:NM_005065 アクセッション:NM_005065 NID:lin−12様の19923668 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス sel−1サプレッサー(C.elegans)(SEL1L);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UBV2 アクセッション:Q9UBV2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。SEL−1ホモログ前駆体(LIN−12様タンパク質のサプレッサー)(SEL−1L)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトSEL1L(lin−12様[C.elegans]のsel−1サプレッサー)オルソログであるSel1h(Sel1[lin−12のサプレッサー]1ホモログ[C.elegans])である。別名としては、IBD2;SEL1様;sel−1(lin−12のサプレッサー,C.elegans)様;およびlin12のサプレッサー(sel−1),C.elegansのホモログが挙げられる。
SEL1Lは、シグナルペプチド、フィブロネクチンII型ドメイン、膜貫通セグメン
トおよびプロリンリッチC末端からなる細胞内のベシクル関連タンパク質である。このタンパク質の機能は未知であるが、SEL1Lは、プロセス(例えば、Notchシグナル伝達、細胞内のタンパク質の輸送、分泌、細胞成長阻害および腫瘍攻撃)において重要な役割を果たすと考えられている;この遺伝子は、膵臓の発生中に発現し、また、神経管および後根神経節において発現している(Donoviel et al,Mech Dev 78(1−2):203−7(1998);Cattaneo et al,Gene 326:149−56(2004);Chiaramonte et al,Anticancer Res 22(6C):4211−4(2002);Orlandi et al,Cancer Res 62(2):567−74(2002);Biunno et al,Genomics 46(2):284−6(1997);Grant and Greenwald,Development 124(3):637−44(1997))。
トおよびプロリンリッチC末端からなる細胞内のベシクル関連タンパク質である。このタンパク質の機能は未知であるが、SEL1Lは、プロセス(例えば、Notchシグナル伝達、細胞内のタンパク質の輸送、分泌、細胞成長阻害および腫瘍攻撃)において重要な役割を果たすと考えられている;この遺伝子は、膵臓の発生中に発現し、また、神経管および後根神経節において発現している(Donoviel et al,Mech Dev 78(1−2):203−7(1998);Cattaneo et al,Gene 326:149−56(2004);Chiaramonte et al,Anticancer Res 22(6C):4211−4(2002);Orlandi et al,Cancer Res 62(2):567−74(2002);Biunno et al,Genomics 46(2):284−6(1997);Grant and Greenwald,Development 124(3):637−44(1997))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 36 0 52
予測値 13.0 26.0 13.0 52
カイ二乗値=33.49 有意性=5.3424262E−8(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_011344.1)。
野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 36 0 52
予測値 13.0 26.0 13.0 52
カイ二乗値=33.49 有意性=5.3424262E−8(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_011344.1)。
野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.1.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA284870(UNQ128)
(a)全体的な表現型の概要:
lin−12様(C.elegans)(SEL1L)のヒトsel−1サプレッサーのオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
組織マイクロアレイ解析により、UNQ128が、膵臓において強く発現していることおよび膵癌でダウンレギュレートされていることが示されている。さらに、UNQ128はまた、正常な乳房組織と比較して乳房腫瘍において過剰発現している。
(c)病理学
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、40個の胚:21個の(+/−)胚、2個の(+/+)胚、4個の再吸収モル(resorption moles)、10個の未定胚および3個の不確定な胚が観察された。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって組織パネルにおいて検出されなかった。12.5dpcにおけるヘテロ接合性胚のLacZ全載標本(wholemount
s)の横断面は、網膜の内層;前肢の筋肉;頭側脈管構造の内皮、および神経管の底板(神経のパターン形成における役割を示唆する)における発現を示す。
(a)全体的な表現型の概要:
lin−12様(C.elegans)(SEL1L)のヒトsel−1サプレッサーのオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
組織マイクロアレイ解析により、UNQ128が、膵臓において強く発現していることおよび膵癌でダウンレギュレートされていることが示されている。さらに、UNQ128はまた、正常な乳房組織と比較して乳房腫瘍において過剰発現している。
(c)病理学
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、40個の胚:21個の(+/−)胚、2個の(+/+)胚、4個の再吸収モル(resorption moles)、10個の未定胚および3個の不確定な胚が観察された。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって組織パネルにおいて検出されなかった。12.5dpcにおけるヘテロ接合性胚のLacZ全載標本(wholemount
s)の横断面は、網膜の内層;前肢の筋肉;頭側脈管構造の内皮、および神経管の底板(神経のパターン形成における役割を示唆する)における発現を示す。
致死性の胚の発達異常に関連する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
66.2.DNA30871−1157(UNQ178)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO204ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA30871−1157と命名)(UNQ178)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2(Tmeff2)を含むNM_019790 ムス・ムスクルス膜貫通タンパク質;参照タンパク質:Q9QYM9 アクセッション:Q9QYM9 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。TMEFF2タンパク質前駆体;ヒト遺伝子配列は、次の参照に対応する:NM_016192 アクセッション:NM_016192 NID:EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2(Tmeff2)を含む12383050 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス膜貫通タンパク質;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UIK5 アクセッション:Q9UIK5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TMEFF2タンパク質前駆体(膜貫通タンパク質TENB2)(TPEF)(EGF様および2つのフォリスタチン様ドメイン2を含む膜貫通タンパク質)。
これらのノックアウト実験において、PRO204ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA30871−1157と命名)(UNQ178)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2(Tmeff2)を含むNM_019790 ムス・ムスクルス膜貫通タンパク質;参照タンパク質:Q9QYM9 アクセッション:Q9QYM9 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。TMEFF2タンパク質前駆体;ヒト遺伝子配列は、次の参照に対応する:NM_016192 アクセッション:NM_016192 NID:EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2(Tmeff2)を含む12383050 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス膜貫通タンパク質;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UIK5 アクセッション:Q9UIK5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TMEFF2タンパク質前駆体(膜貫通タンパク質TENB2)(TPEF)(EGF様および2つのフォリスタチン様ドメイン2を含む膜貫通タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトTMEFF2のオルソログであるTmeff2(EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2を含む膜貫通タンパク質)である。
別名としては、4832418D20Rik、TR、HPP1、TPEF、TENB2、トモレグリン(tomoregulin)、膜貫通タンパク質TENB2ならびにEGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2を含む推定膜貫通タンパク質が挙げられる。
別名としては、4832418D20Rik、TR、HPP1、TPEF、TENB2、トモレグリン(tomoregulin)、膜貫通タンパク質TENB2ならびにEGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2を含む推定膜貫通タンパク質が挙げられる。
TMEFF2は、プロテアーゼインヒビターまたはシグナル伝達レセプターとして機能し得るI型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、2つのKazal型セリンプロテアーゼインヒビタードメイン(PfamアクセッションPF00050)、EGF様ドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞質C末端Gタンパク質活性化モチーフを含む。TMEFF2は、細胞外ドメインが分断されると、プロテアーゼドメインおよびEGF様ドメインからなる分泌型を生成する。TMEFF2の細胞外セグメントは、レセプターチロシンキナーゼERBB4のチロシンリン酸化を刺激することができ、このことから、TMEFF2は、シグナル伝達リガンドとして機能することが示唆される。さらに、TMEFF2細胞外セグメントは、培養されたニューロンの生存を増大し得ることから、TMEFF2は、生存因子として機能していることが示唆される。TMEFF2遺伝子は、いくつかのタイプの癌において過剰メチル化されており、前立腺癌細胞株における異所性のTMEFF2遺伝子発現は、成長を阻害することから、TMEFF2が腫瘍サプレッサーとして機能することが示唆される。TMEFF2は、脳のニューロンの特徴的なサブセットにおいて主に発現しているが、結腸、膀胱、前立腺および他のいくつか
の組織においても発現している。TMEFF2と反応性であり、細胞傷害性薬剤のアウリスタチン(auristatin)Eと結合体化されたモノクローナル抗体が、前立腺癌に対する処置法としてマウスにおいて確かめられている(Uchida et al,Biochem Biophys Res Commun 266(2):593−602(1999);Horie et al,Genomics 67(2):146−52(2000);Liang et al,Cancer Res 60(17):4907−12(2000);Lin et al,Life Sci 73(13):1617−27(2003);Gery et al,Oncogene 21(31):4739−46(2002);Gery and Koeffler,J Mol Biol
328(5):977−83(2003);Afar et al,Mol Cancer Ther 3(8):921−32(2004))。
の組織においても発現している。TMEFF2と反応性であり、細胞傷害性薬剤のアウリスタチン(auristatin)Eと結合体化されたモノクローナル抗体が、前立腺癌に対する処置法としてマウスにおいて確かめられている(Uchida et al,Biochem Biophys Res Commun 266(2):593−602(1999);Horie et al,Genomics 67(2):146−52(2000);Liang et al,Cancer Res 60(17):4907−12(2000);Lin et al,Life Sci 73(13):1617−27(2003);Gery et al,Oncogene 21(31):4739−46(2002);Gery and Koeffler,J Mol Biol
328(5):977−83(2003);Afar et al,Mol Cancer Ther 3(8):921−32(2004))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 39 20 82
予測値 20.5 41.0 20.5 82
カイ二乗値=1.02 有意性=0.6004956(hom/n)=0.29
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_019790.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 23 39 20 82
予測値 20.5 41.0 20.5 82
カイ二乗値=1.02 有意性=0.6004956(hom/n)=0.29
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_019790.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.2.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA30871−1157(UNQ178)
(a)全体的な表現型の概要:
EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2を含むヒト膜貫通タンパク質(TMEFF2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、成育できなかった小さい(−/−)マウスをもたらした。ホモ接合性変異マウスは、小さく、病弱であり、3週齢までに何匹かが死亡した。残りのホモ接合性変異体は、ネクロプシーに移され、顕微鏡解析により、白血球減少症および骨髄発育不全が明らかになった。さらに、広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓内のT細胞の枯渇が見られた。白血球減少症および骨髄発育不全が、(−/−)マウスにおいて示された。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学アッセイ−特有の概要
肉眼的:ホモ接合性変異マウスは、正常の年齢一致野生型マウスの体重の半分未満を示し、小さく、成育できなかった。ほとんどの器官が、(−/−)マウスにおいて軽い全体の体重に比例して小さかった。脾臓および胸腺が、野生型同腹仔コントロールと比較して特
に小さかった。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、リンパ球減少症と顆粒球減少症の両方および骨髄の顆粒球の形成不全に起因する白血球減少症を示した。骨髄は、(−/−)マウスにおいてびまん性再生不良であり、赤血球形成の量は正常であるが、骨髄性顆粒球細胞前駆体の数は著しく減少していた。このことから、白血球減少症を引き起こす顆粒球形成の減少が示唆される。広範なアポトーシスならびに胸腺皮質におけるTリンパ球の減少および脾臓内のT細胞の枯渇が見られた。胸腺退縮は、ストレスを受けたマウスまたは重篤な疾患のマウスにおいてよく見られ、リンパ球減少症の結果であることが多い。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
(a)全体的な表現型の概要:
EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメイン2を含むヒト膜貫通タンパク質(TMEFF2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、成育できなかった小さい(−/−)マウスをもたらした。ホモ接合性変異マウスは、小さく、病弱であり、3週齢までに何匹かが死亡した。残りのホモ接合性変異体は、ネクロプシーに移され、顕微鏡解析により、白血球減少症および骨髄発育不全が明らかになった。さらに、広範なアポトーシスおよび胸腺皮質中のTリンパ球の減少および脾臓内のT細胞の枯渇が見られた。白血球減少症および骨髄発育不全が、(−/−)マウスにおいて示された。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学アッセイ−特有の概要
肉眼的:ホモ接合性変異マウスは、正常の年齢一致野生型マウスの体重の半分未満を示し、小さく、成育できなかった。ほとんどの器官が、(−/−)マウスにおいて軽い全体の体重に比例して小さかった。脾臓および胸腺が、野生型同腹仔コントロールと比較して特
に小さかった。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、リンパ球減少症と顆粒球減少症の両方および骨髄の顆粒球の形成不全に起因する白血球減少症を示した。骨髄は、(−/−)マウスにおいてびまん性再生不良であり、赤血球形成の量は正常であるが、骨髄性顆粒球細胞前駆体の数は著しく減少していた。このことから、白血球減少症を引き起こす顆粒球形成の減少が示唆される。広範なアポトーシスならびに胸腺皮質におけるTリンパ球の減少および脾臓内のT細胞の枯渇が見られた。胸腺退縮は、ストレスを受けたマウスまたは重篤な疾患のマウスにおいてよく見られ、リンパ球減少症の結果であることが多い。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:明らか:(−/−)マウスは、小さく、病弱であり、3週齢までに何匹かが死亡した。生存(−/−)変異体のうち、6匹は、3週齢でネクロプシーに移され、残りのマウスは、3.5週齢で病理学的検査のために安楽死させた。
66.3.DNA32286−1191(UNQ188)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO214ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA32286−1191と命名)(UNQ188)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_133930 アクセッション:NM_133930
NID:EGF様ドメイン1(Creld1)を含むgi19527147ref NM_133930.1 ムス・ムスクルスシステインリッチ;参照タンパク質:Q91XD7 アクセッション:Q91XD7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。未知;参照ヒト遺伝子配列:NM_015513 アクセッション:NM_015513 NID:EGF様ドメイン1(CRELD1)を含むgi22095396 ref NM_015513.2 ホモ・サピエンスシステインリッチ;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y409 アクセッション:Q9Y409 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説44.9KDAタンパク質。
これらのノックアウト実験において、PRO214ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA32286−1191と命名)(UNQ188)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_133930 アクセッション:NM_133930
NID:EGF様ドメイン1(Creld1)を含むgi19527147ref NM_133930.1 ムス・ムスクルスシステインリッチ;参照タンパク質:Q91XD7 アクセッション:Q91XD7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。未知;参照ヒト遺伝子配列:NM_015513 アクセッション:NM_015513 NID:EGF様ドメイン1(CRELD1)を含むgi22095396 ref NM_015513.2 ホモ・サピエンスシステインリッチ;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y409 アクセッション:Q9Y409 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説44.9KDAタンパク質。
目的のマウス遺伝子は、ヒトCRELD1のオルソログであるCreld1(EGF様ドメイン1を含むシステインリッチ)である。別名としては、AVSD2、CIRRIN、DKFZP566D213および房室中隔欠損2が挙げられる。CRELD1は、細胞接着分子として機能し得るIII型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、トリプトファンリッチドメインおよびグルタミン酸リッチ(WE)ドメイン、タンデムに並んだEGF様リピートおよび短い細胞質ドメインで分断された2つのC末端膜貫通セグメントを含む。CRELD1遺伝子における変異は、房室中隔欠損を発生
する危険性を増大させ得る(Robinson et al,Am J Hum Genet 72(4):1047−52(2003);Rupp et al,Gene 293(1−2):47−57(2002))。
する危険性を増大させ得る(Robinson et al,Am J Hum Genet 72(4):1047−52(2003);Rupp et al,Gene 293(1−2):47−57(2002))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 30 0 46
予測値 11.5 23.0 11.5 46
カイ二乗値=34.36 有意性=3.4579656E−8(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133930.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13のすべての成体組織サンプル(脂肪ならびに胃、小腸および結腸以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 30 0 46
予測値 11.5 23.0 11.5 46
カイ二乗値=34.36 有意性=3.4579656E−8(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133930.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13のすべての成体組織サンプル(脂肪ならびに胃、小腸および結腸以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.3.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA32286−1191(UNQ188)
(a)全体的な表現型の概要:
EGF様ドメイン1を含むヒトシステインリッチ(CRELD1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、50個の胚:19個の(+/−)胚、13個の(+/+)胚、16個の再吸収モルおよび2個の不確定な胚が観察された。
(a)全体的な表現型の概要:
EGF様ドメイン1を含むヒトシステインリッチ(CRELD1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、50個の胚:19個の(+/−)胚、13個の(+/+)胚、16個の再吸収モルおよび2個の不確定な胚が観察された。
致死性の胚の発達異常に関連する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
UNQ188欠損マウスは、心臓欠損であり、妊娠中期あたりで心不全により死亡する。ex vivo解析により、UNQ188が、心臓発生中の内皮細胞の移動に必要であ
ることが示され、胚の心臓におけるUNQ188の機能についての発生経路が定義される。
ることが示され、胚の心臓におけるUNQ188の機能についての発生経路が定義される。
66.4.DNA33107−1135(UNQ196)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO222ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA33107−1135と命名)(UNQ196)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_144796 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA E430021N18遺伝子(E430021N18Rik);参照タンパク質:Q8BH32 アクセッション:Q8BH32 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス生後16日の新生仔小脳cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:9630004A14産物:仮説Sushiドメイン/SCRリピート/CCPモジュール含有タンパク質、完全長挿入配列(ムス・ムスクルス生後2日の新生仔胸腺細胞cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:E430021N18産物:仮説Sushiドメイン/SCRリピート/CCPモジュール含有タンパク質、完全長挿入配列);参照ヒト遺伝子配列:AY358495ホモ・サピエンスクローンDNA33107 YHGM196(UNQ196);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UX62 アクセッション:Q6UX62 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。YHGM196。
これらのノックアウト実験において、PRO222ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA33107−1135と命名)(UNQ196)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_144796 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA E430021N18遺伝子(E430021N18Rik);参照タンパク質:Q8BH32 アクセッション:Q8BH32 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス生後16日の新生仔小脳cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:9630004A14産物:仮説Sushiドメイン/SCRリピート/CCPモジュール含有タンパク質、完全長挿入配列(ムス・ムスクルス生後2日の新生仔胸腺細胞cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:E430021N18産物:仮説Sushiドメイン/SCRリピート/CCPモジュール含有タンパク質、完全長挿入配列);参照ヒト遺伝子配列:AY358495ホモ・サピエンスクローンDNA33107 YHGM196(UNQ196);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UX62 アクセッション:Q6UX62 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。YHGM196。
目的のマウス遺伝子は、ヒト「クローンDNA33107YHGM196」(YHGM196)のオルソログであるRIKEN cDNA E430021N18遺伝子である。別名としては、MGC30368およびUNQ196が挙げられる。
YHGM196は、シグナルペプチド、4つのsushiドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞質C末端からなる推定I型原形質膜タンパク質である。このタンパク質の機能は、未知である;しかしながら、sushiドメインは、細胞接着分子および補体に見られることが多い(PfamアクセッションPF00084)。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 14 43 19 76
予測値 19.0 38.0 19.0 76
カイ二乗値=0.04 有意性=0.9801987(hom/n)=0.25
平均同腹仔数=9
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1(NCBIアクセッションNM_144796.2)およびその前の非コードエクソン(NCBIアクセッションBM944003)をターゲティングした。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋;骨;ならびに胃、小腸および結腸以外)に
おいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 14 43 19 76
予測値 19.0 38.0 19.0 76
カイ二乗値=0.04 有意性=0.9801987(hom/n)=0.25
平均同腹仔数=9
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1(NCBIアクセッションNM_144796.2)およびその前の非コードエクソン(NCBIアクセッションBM944003)をターゲティングした。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋;骨;ならびに胃、小腸および結腸以外)に
おいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.4.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA33107−1135(UNQ196)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト「クローンDNA33107YHGM196」(YHGM196)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける収縮期血圧の低下をもたらした。さらに、変異体(−/−)マウスは、コントロール(+/+)同腹仔と比較して平均血清IgG3レベルの上昇を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析により、UNQ196が正常な乳房組織と比較して乳癌において過剰発現しているか、またはアップレギュレートしていることが明らかになっている。さらに、UNQ196は、胚の乳腺において発現している。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト「クローンDNA33107YHGM196」(YHGM196)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける収縮期血圧の低下をもたらした。さらに、変異体(−/−)マウスは、コントロール(+/+)同腹仔と比較して平均血清IgG3レベルの上昇を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析により、UNQ196が正常な乳房組織と比較して乳癌において過剰発現しているか、またはアップレギュレートしていることが明らかになっている。さらに、UNQ196は、胚の乳腺において発現している。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロール、計画実行用の(+/+)マウスおよび歴史的中央値と比較して平均血清中IgG3レベルの上昇を示した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロール、計画実行用の(+/+)マウスおよび歴史的中央値と比較して平均血清中IgG3レベルの上昇を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、成体ホモ接合体が、血清IgG3レベルの上昇を示したことが明らかになった。したがって、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して血清中免疫グロブリンの増加を示した。IgG3免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないが、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、PRO222ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、負の制御因子として作用するPRO222ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(d)心臓学−血圧
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
(d)心臓学−血圧
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下(歴史的平均より1SD低い)を示した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下(歴史的平均より1SD低い)を示した。
66.5.DNA35557−1137(UNQ208)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO234ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA3557−1137と命名)(UNQ208)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:XM_146887 PREDICTED:ムス・ムスクルス
RIKEN cDNA E030012M19遺伝子(E030012M19Rik);参照タンパク質:ライリン(layilin)[ムス・ムスクルス]に類似のXP_146887;参照ヒト遺伝子配列:NM_178834 ホモ・サピエンスライリン(LOC143903);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q96NF3 アクセッション:Q96NF3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDNA FLJ30977 FIS,CRICETULUS GRISEUSライリンに非常に似ているクロ
ーンHHDPC2000095。
これらのノックアウト実験において、PRO234ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA3557−1137と命名)(UNQ208)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:XM_146887 PREDICTED:ムス・ムスクルス
RIKEN cDNA E030012M19遺伝子(E030012M19Rik);参照タンパク質:ライリン(layilin)[ムス・ムスクルス]に類似のXP_146887;参照ヒト遺伝子配列:NM_178834 ホモ・サピエンスライリン(LOC143903);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q96NF3 アクセッション:Q96NF3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDNA FLJ30977 FIS,CRICETULUS GRISEUSライリンに非常に似ているクロ
ーンHHDPC2000095。
目的のマウス遺伝子は、ヒトライリンのオルソログであるRIKEN cDNA E030012M19遺伝子である。別名としては、Gm511が挙げられる。
ライリンは、おそらく細胞接着分子またはレセプターとして機能するI型内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、細胞外マトリックスタンパク質ヒアルロナンと結合し、細胞骨格のアダプタータンパク質タリンと関連する。ライリンは、おそらくプロセス(例えば、細胞接着、運動性および創傷治癒)において役割を果たす(Borowsky and Hynes,J Cell Biol 143(2):429−42(1998);Bono et al,Mol Biol Cell 12(4):891−900(2001))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 39 10 72
予測値 18 36 18 72
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_146887.3)。
カイ二乗値=3.56 有意性=0.16863815(hom/n)=0.23
平均同腹仔数=9
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 23 39 10 72
予測値 18 36 18 72
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_146887.3)。
カイ二乗値=3.56 有意性=0.16863815(hom/n)=0.23
平均同腹仔数=9
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.5.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA35557−1137(UNQ208)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトライリンのオルソログをコードする遺伝子の変異は、期待数の約半分のホモ接合遺伝子型をもたらした。雄(−/−)マウスは、平均除脂肪体重の減少も示した。さらに、雄ノックアウトマウスは、全身、大腿骨および椎骨における、骨塩量(BMC)の減少および骨塩密度(BMD)の減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学/放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測
定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトライリンのオルソログをコードする遺伝子の変異は、期待数の約半分のホモ接合遺伝子型をもたらした。雄(−/−)マウスは、平均除脂肪体重の減少も示した。さらに、雄ノックアウトマウスは、全身、大腿骨および椎骨における、骨塩量(BMC)の減少および骨塩密度(BMD)の減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学/放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測
定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
PRO234ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、除脂肪体重の減少を特徴とする組織るいそう疾患と一致する表現型を示す。さらに、雄ノックアウトマウスは、全身、大腿骨および椎骨において骨塩量(BMC)の減少および骨塩密度(BMD)の減少を示した。したがって、(−/−)マウスは、通常、骨粗鬆症に関連する組織るいそう疾患および骨代謝異常の徴候を示した。PRO234ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨の治癒または骨粗鬆症などの骨関連障害の処置に有用であり得る一方で、PRO234ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、負の骨表現型を模倣し得る。
PRO234ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、除脂肪体重の減少を特徴とする組織るいそう疾患と一致する表現型を示す。さらに、雄ノックアウトマウスは、全身、大腿骨および椎骨において骨塩量(BMC)の減少および骨塩密度(BMD)の減少を示した。したがって、(−/−)マウスは、通常、骨粗鬆症に関連する組織るいそう疾患および骨代謝異常の徴候を示した。PRO234ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨の治癒または骨粗鬆症などの骨関連障害の処置に有用であり得る一方で、PRO234ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、負の骨表現型を模倣し得る。
66.6.DNA36350−1158(UNQ232)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO265ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA36350−1158と命名)(UNQ232)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_201518 ムス・ムスクルスフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2(Flrt2);参照タンパク質:Q8BLU0 アクセッション:Q8BLU0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス成雄大動脈および静脈cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:A530098L04産物:KIAA0405(ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質FLRT2)ホモログ(フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2);参照ヒト遺伝子配列:NM_013231ホモ・サピエンスフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2(FLRT2);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O43155 アクセッション:O43155 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質FLRT2前駆体(フィブロネクチン様ドメイン含有ロイシンリッチ膜貫通タンパク質2)(UNQ232/PRO265)。
これらのノックアウト実験において、PRO265ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA36350−1158と命名)(UNQ232)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_201518 ムス・ムスクルスフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2(Flrt2);参照タンパク質:Q8BLU0 アクセッション:Q8BLU0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス成雄大動脈および静脈cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:A530098L04産物:KIAA0405(ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質FLRT2)ホモログ(フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2);参照ヒト遺伝子配列:NM_013231ホモ・サピエンスフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2(FLRT2);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O43155 アクセッション:O43155 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ロイシンリッチリピート膜貫通タンパク質FLRT2前駆体(フィブロネクチン様ドメイン含有ロイシンリッチ膜貫通タンパク質2)(UNQ232/PRO265)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトFLRT2のオルソログであるFlrt2(フィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2)である。別名としては、KIAA0405が挙げられる。
FLRT2は、膵臓、骨格筋、脳および心臓において発現している推定I型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチリピート、フィブロネクチンドメイン、膜貫通セグメントおよび短い細胞質C末端を含む。F
LRT2は、レセプターシグナル伝達において機能する可能性がある(Lacy et al,Genomics 62(3):417−26(1999);FLRT3は、神経突起の成長を促進し、神経損傷でアップレギュレートされる[Bottcher et al,Nat Cell Biol 6(1):38−44(2004)]。
LRT2は、レセプターシグナル伝達において機能する可能性がある(Lacy et al,Genomics 62(3):417−26(1999);FLRT3は、神経突起の成長を促進し、神経損傷でアップレギュレートされる[Bottcher et al,Nat Cell Biol 6(1):38−44(2004)]。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 25 46 2 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗値=39.54 有意性=2.5941669E−9(hom/n)=0.03平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_201518.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、骨格筋および骨以外の13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 25 46 2 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗値=39.54 有意性=2.5941669E−9(hom/n)=0.03平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_201518.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、骨格筋および骨以外の13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.6.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA36350−1158(UNQ232)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2(FLRT2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の大きな生存能低下をもたらした。遺伝的データは、この変異が、ホモ接合性変異体の大きな生存能低下をもたらしたことを示唆する。同定された(−/−)マウスのうちの3匹は、胚の提出であった。2匹の生存変異体マウスは、野生型同腹仔よりも小さく、そして難聴を含む多くの異常を示した。顕微鏡解析により、ホモ接合性変異体において心不全をもたらす心筋症が明らかになった。さらに、雌ホモ接合性およびヘテロ接合性のマウスは、皮膚線維芽細胞増殖速度が高まった。さらに、生存ノックアウトマウスは、平均血清IgG2aレベルおよび平均血清IgG1レベルの上昇を特徴とするいくつかの免疫学的異常を示した。しかしながら、1匹の(−/−)マウスは、LPS負荷に対する血清TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6の応答が低下した。生存(−/−)マウスはまた、総組織質量の減少、体脂肪のパーセンテージの減少および脂肪質量の減少を示した。雌ノックアウトマウスは、体積測定による骨塩密度(vBMD)および全身の骨塩密度(BMD)の減少を示した。雄(−/−)マウスは、マイクロCTの骨測定値の増加を示した。1匹の雌(−/−)マウスはまた、普及型視神経乳頭を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、51個の胚:3個の(−/−)胚、22個の(+/−)胚、11個の(+/+)胚、8個の再吸収モルおよび7個の不確定な胚が観察された。解析に利用可能なその3個の(−/−)胚は、高度に凝縮した好酸球性筋形質を有する緊密に詰
まった筋細胞を特徴とする心筋症を示した。これらの小さく高密度な筋細胞は、薄壁および心室および心房の小柱を形成する薄いバンドを形成した。その筋細胞は、心室の内腔を部分的に満たす多数の大きな原始的な内心膜性細胞によって取り囲まれていた。胚において血管の拡張を伴う腹部器官の広範な血管の鬱血が見られたことから、不完全な心筋発生から生じる鬱血性心不全が示唆される。生存している(−/−)胚は、概してその(+/+)同腹仔よりも小さかったが、胚死およびネクロプシーにおける再吸収の証拠でもあった。その不完全な構造および心筋細胞の配列が、明らかに出生前心機能の漸進的な低下、心不全の発生および胚死をもたらした。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって解析された組織パネル中の副甲状腺において検出された。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトフィブロネクチンロイシンリッチ膜貫通タンパク質2(FLRT2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の大きな生存能低下をもたらした。遺伝的データは、この変異が、ホモ接合性変異体の大きな生存能低下をもたらしたことを示唆する。同定された(−/−)マウスのうちの3匹は、胚の提出であった。2匹の生存変異体マウスは、野生型同腹仔よりも小さく、そして難聴を含む多くの異常を示した。顕微鏡解析により、ホモ接合性変異体において心不全をもたらす心筋症が明らかになった。さらに、雌ホモ接合性およびヘテロ接合性のマウスは、皮膚線維芽細胞増殖速度が高まった。さらに、生存ノックアウトマウスは、平均血清IgG2aレベルおよび平均血清IgG1レベルの上昇を特徴とするいくつかの免疫学的異常を示した。しかしながら、1匹の(−/−)マウスは、LPS負荷に対する血清TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6の応答が低下した。生存(−/−)マウスはまた、総組織質量の減少、体脂肪のパーセンテージの減少および脂肪質量の減少を示した。雌ノックアウトマウスは、体積測定による骨塩密度(vBMD)および全身の骨塩密度(BMD)の減少を示した。雄(−/−)マウスは、マイクロCTの骨測定値の増加を示した。1匹の雌(−/−)マウスはまた、普及型視神経乳頭を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、51個の胚:3個の(−/−)胚、22個の(+/−)胚、11個の(+/+)胚、8個の再吸収モルおよび7個の不確定な胚が観察された。解析に利用可能なその3個の(−/−)胚は、高度に凝縮した好酸球性筋形質を有する緊密に詰
まった筋細胞を特徴とする心筋症を示した。これらの小さく高密度な筋細胞は、薄壁および心室および心房の小柱を形成する薄いバンドを形成した。その筋細胞は、心室の内腔を部分的に満たす多数の大きな原始的な内心膜性細胞によって取り囲まれていた。胚において血管の拡張を伴う腹部器官の広範な血管の鬱血が見られたことから、不完全な心筋発生から生じる鬱血性心不全が示唆される。生存している(−/−)胚は、概してその(+/+)同腹仔よりも小さかったが、胚死およびネクロプシーにおける再吸収の証拠でもあった。その不完全な構造および心筋細胞の配列が、明らかに出生前心機能の漸進的な低下、心不全の発生および胚死をもたらした。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって解析された組織パネル中の副甲状腺において検出された。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび2匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび2匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より小さい(プレパルス)音に先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似ランダム順に6回、合計36回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より小さい(プレパルス)音に先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似ランダム順に6回、合計36回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
感覚運動ゲーティング/注意:変異(−/−)マウスの両方が、驚愕応答を示さなかったことから、変異体における難聴が示唆される。
(d)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷
を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
感覚運動ゲーティング/注意:変異(−/−)マウスの両方が、驚愕応答を示さなかったことから、変異体における難聴が示唆される。
(d)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷
を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、(−/−)マウスが、(+/+)同腹仔、計画実行内の(+/+)マウスおよび歴史的平均と比較して、平均血清IgG2aレベルおよび平均血清IgG1レベルの上昇を示したという観察結果がもたらされた。
血清免疫グロブリンアイソタイピングにより、(−/−)マウスが、(+/+)同腹仔、計画実行内の(+/+)マウスおよび歴史的平均と比較して、平均血清IgG2aレベルおよび平均血清IgG1レベルの上昇を示したという観察結果がもたらされた。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、IgG2aおよびIgG1血清免疫グロブリンの増加を示した。これらの免疫グロブリンは、中和作用を
有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。観察された表現型から、PRO265ポリペプチドが、炎症性応答の負の制御因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常から、PRO265ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が、免疫系を刺激し得る重要な物質であり得、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO265ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。観察された表現型から、PRO265ポリペプチドが、炎症性応答の負の制御因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常から、PRO265ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が、免疫系を刺激し得る重要な物質であり得、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO265ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6の応答の低下を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6の応答の低下を示した。
まとめると、LPSエンドトキシン負荷により、PRO265ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、LPSエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答(TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6産生)を誘発する能力の低下を示したことから、炎症性応答の低下が示唆される。TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6は、後期のB細胞活性化に寄与する。さらに、IL−6は、急性期反応および全身性炎症の誘導に重要な役割を果たす。
(e)表現型解析:代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験もまた日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノ−トランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;亜リン酸;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
(e)表現型解析:代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験もまた日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノ−トランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;亜リン酸;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
結果:
解析に利用可能な1匹の雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロールおよび歴史的平均と比較して、尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇を示した。したがって、変異(−/−)マウスは、ある種の痛風(異常なプリン代謝)に共通する腎結石(および関連の腎臓疾患)を示唆する血液中の尿酸の著しい増加に関連する負の表現型を示す。ヘテロ接合性(+/−)マウスもまた、野生型(+/+)同腹仔コントロールよりも高い傾向にあった。PRO265ポリペプチドおよびそのアゴニストは、腎結石の形成および/または異常なプリン代謝に関連するそのような疾患の処置に有用であり得る。さらに、変異マウスは、これらのマウスの生存能低下に関連し得る平均血清中グルコースレベルの低下を示した。
(f)成体皮膚細胞増殖:
手順:皮膚細胞を16週齢の動物(野生型マウス、ヘテロ接合性マウスおよび1匹のホ
モ接合性マウス)から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、p53およびKu80で証明されている。Brdu取り込みを使用して増殖を測定した。
解析に利用可能な1匹の雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロールおよび歴史的平均と比較して、尿酸レベルおよびカリウムレベルの上昇を示した。したがって、変異(−/−)マウスは、ある種の痛風(異常なプリン代謝)に共通する腎結石(および関連の腎臓疾患)を示唆する血液中の尿酸の著しい増加に関連する負の表現型を示す。ヘテロ接合性(+/−)マウスもまた、野生型(+/+)同腹仔コントロールよりも高い傾向にあった。PRO265ポリペプチドおよびそのアゴニストは、腎結石の形成および/または異常なプリン代謝に関連するそのような疾患の処置に有用であり得る。さらに、変異マウスは、これらのマウスの生存能低下に関連し得る平均血清中グルコースレベルの低下を示した。
(f)成体皮膚細胞増殖:
手順:皮膚細胞を16週齢の動物(野生型マウス、ヘテロ接合性マウスおよび1匹のホ
モ接合性マウス)から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、p53およびKu80で証明されている。Brdu取り込みを使用して増殖を測定した。
詳細には、これらの研究において、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化された培養物中の細胞数の増加を、相対的な増殖性能力の基準として使用した。野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚バイオプシーから初代線維芽細胞を確立した。5万個の細胞の2つ組または3つ組の培養物を播種し、6日間生育させた。培養期間の終わりに、培養物中に存在する細胞の数を、電子粒子カウンターを使用して測定した。
結果:
ヘテロ接合性(+/−)マウスの3分の1(1/3)が、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の増加を示した。さらに、1匹の(−/−)マウスは、増殖の増加も示した。
ヘテロ接合性(+/−)マウスの3分の1(1/3)が、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の増加を示した。さらに、1匹の(−/−)マウスは、増殖の増加も示した。
したがって、ホモ接合性とヘテロ接合性の変異マウスの両方が、過剰増殖性の表現型を示した。これらの観察結果により示唆されるように、PRO265ポリペプチドまたはそのアゴニストは、腫瘍サプレッサーとして機能し得、異常な細胞増殖を低下させるのに有用であり得る。
(g)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび1匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
(g)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび1匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
1匹の雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した(平均より2〜3SD低い)。
1匹の雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した(平均より2〜3SD低い)。
受精能:
解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウスは、雌(+/+)マウスとの2回の交尾のあとに子孫を残すことはなかったことから、受精能の障害が証明された。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測
定するためのマイクロCT
を含んだ。
解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウスは、雌(+/+)マウスとの2回の交尾のあとに子孫を残すことはなかったことから、受精能の障害が証明された。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測
定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび2匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび2匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび2匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび2匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
Dexa:解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウスおよび1匹の雌(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、総組織質量、総脂肪質量および総体脂肪パーセントの減少を示した。さらに、雌ノックアウトはまた、体積測定による骨塩密度(vBMD)および全身骨塩密度(BMD)の減少を示した。
マイクロCT:解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウス(M−225)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、椎骨骨梁の体積、数および結合性密度の増加を示した。そのマウスが小さいので、このことは、興味深いことである。
Dexa:解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウスおよび1匹の雌(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、総組織質量、総脂肪質量および総体脂肪パーセントの減少を示した。さらに、雌ノックアウトはまた、体積測定による骨塩密度(vBMD)および全身骨塩密度(BMD)の減少を示した。
マイクロCT:解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウス(M−225)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、椎骨骨梁の体積、数および結合性密度の増加を示した。そのマウスが小さいので、このことは、興味深いことである。
Dexaおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、異常な骨障害を示唆する、骨の測定値の減少および身体の質量の測定値の減少を示した。さらに、このノックアウトマウスは、成長関連障害および/または悪液質などの組織るいそう疾患を示唆する、総組織質量および体脂肪の減少を示した。これらの結果は、(−/−)マウスの生存能低下と一致する。(−/−)マウスはまた、負の骨表現型を示し、骨の代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した。骨および代謝の負の表現型は、PRO265ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得るか、または他の代謝障害の処置に有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO265ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO265ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、異常な骨代謝に関連する炎症性疾患(関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む)を含む、異常または病理学的な骨障害に導き得る。(h)心拍数:
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲
性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲
性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果:
解析に利用可能な1匹の生存雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、心拍数が顕著に減少した(平均より約3SD低い)。これらの結果は、心機能の漸進的な低下を示唆する病理学の報告と一致する。
解析に利用可能な1匹の生存雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、心拍数が顕著に減少した(平均より約3SD低い)。これらの結果は、心機能の漸進的な低下を示唆する病理学の報告と一致する。
66.7.DNA61601−1223(UNQ272)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO309ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61601−1223と命名)(UNQ272)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_013781 ムス・ムスクルス SH2ドメイン含有3C(Sh2d3c);参照タンパク質:Q9QZS8 アクセッション:Q9QZS8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。SH2ドメイン含有EPHレセプター結合タンパク質SHEP1(CHAT−H);参照ヒト遺伝子配列:BC032365 アクセッション:BC032365 NID:21619056 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス,SH2ドメイン含有3C,クローンMGC:40418 IMAGE:4521962;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8N5H7 アクセッション:Q8N5H7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。SH2ドメイン含有3C。
これらのノックアウト実験において、PRO309ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61601−1223と命名)(UNQ272)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_013781 ムス・ムスクルス SH2ドメイン含有3C(Sh2d3c);参照タンパク質:Q9QZS8 アクセッション:Q9QZS8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。SH2ドメイン含有EPHレセプター結合タンパク質SHEP1(CHAT−H);参照ヒト遺伝子配列:BC032365 アクセッション:BC032365 NID:21619056 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス,SH2ドメイン含有3C,クローンMGC:40418 IMAGE:4521962;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8N5H7 アクセッション:Q8N5H7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。SH2ドメイン含有3C。
目的のマウス遺伝子は、ヒトSH2D3CのオルソログであるSh2d3c(SH2ドメイン含有3C)である。別名としては、Chat、Nsp3、Shep1、新規SH2含有タンパク質3、Cas/HEF1関連シグナル伝達物質、SH2ドメイン含有3CおよびSH2含有Ephレセプター結合タンパク質1が挙げられる。
SH2D3Cは、小分子RasスーパーファミリーGTPasesを、活性化されたレセプターチロシンキナーゼに連結するシグナル伝達アダプター分子として機能する細胞質タンパク質である。このタンパク質は、SH2ドメインおよびRasグアニンヌクレオチド交換因子ドメインからなり、このことから、SH2D3Cは、グアニンヌクレオチド交換因子としても機能し得る。SH2D3Cは、GTPase R−RasおよびRap1A、足場タンパク質Crk関連基質(Cas)ならびにレセプターチロシンキナーゼEphB2と結合する。さらに、SH2D3Cは、上皮成長因子レセプター、神経成長因子レセプター、T細胞レセプターおよびインテグリンに対するアダプターとしても機能し得る。SH2D3Cは、プロセス(例えば、膜ラフリング、細胞遊走、T細胞活性化およびサイトカイン産生)をおそらく制御する(Dail et al,J Biol Chem
279(40):41892−902(2004);Sakakibara et al,J Biol Chem 278(8):6012−7(2003);Sakakibara et al,J Cell Sci 115(Pt 24):4915−24(2002);Sakakibara and Hattori,J Biol Chem 275(9):6404−10(2000);Dodelet et al,J Biol Chem 274(45):31941−6(1999))。
279(40):41892−902(2004);Sakakibara et al,J Biol Chem 278(8):6012−7(2003);Sakakibara et al,J Cell Sci 115(Pt 24):4915−24(2002);Sakakibara and Hattori,J Biol Chem 275(9):6404−10(2000);Dodelet et al,J Biol Chem 274(45):31941−6(1999))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受
精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 44 13 78
予測値 19.5 39.0 19.5 78
カイ二乗値=1.66 有意性=0.43604928(hom/n)=0.22
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン4〜6をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_013781.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 21 44 13 78
予測値 19.5 39.0 19.5 78
カイ二乗値=1.66 有意性=0.43604928(hom/n)=0.22
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン4〜6をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_013781.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.7.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA61601−1223(UNQ272)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSH2ドメイン含有3C(SH2D3C)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける脾臓内のCD21hiCD23medB細胞のパーセンテージの低下を示した。さらに、(−/−)マウスは、平均体重の減少、平均総組織質量および除脂肪体重の減少を示した。雄ノックアウト(−/−)マウスは、椎骨骨塩密度(BMD)の著しい減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSH2ドメイン含有3C(SH2D3C)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける脾臓内のCD21hiCD23medB細胞のパーセンテージの低下を示した。さらに、(−/−)マウスは、平均体重の減少、平均総組織質量および除脂肪体重の減少を示した。雄ノックアウト(−/−)マウスは、椎骨骨塩密度(BMD)の著しい減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して平均体重の減少を示した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して平均体重の減少を示した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総組織質量および平均除脂肪体重の減少を示した。さらに、雄ノックアウト(−/−)マウスは、椎骨骨塩密度(BMD)の顕著な減少を示した。
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総組織質量および平均除脂肪体重の減少を示した。さらに、雄ノックアウト(−/−)マウスは、椎骨骨塩密度(BMD)の顕著な減少を示した。
Dexaにより解析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較して、総組織質量および除脂肪体重の顕著な減少ならびに骨測定値の減少を示した。このことから、これらの変異体における成長遅延が示唆される。このことと体重が減少した観察結果と結びつけることにより、悪液質などの組織るいそう状態または他の成長関連障害が示唆される。したがって、PRO309ポリペプチドまたはそのアゴニストは、悪液質または他の組織るいそう疾患を含む成長障害の処置または予防に有用であり得る。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち
、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
蛍光(Flourescence)標識細胞分取(FACS)解析−組織特異的FACS
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
蛍光(Flourescence)標識細胞分取(FACS)解析−組織特異的FACS
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。
試験の説明:6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得る。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用してサンプルを解析する。
試験の説明:6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得る。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用してサンプルを解析する。
結果:
組織特異的FACS−マウス:血液、脾臓、骨髄および腹水中のリンパ球および抗原提示細胞のサブセットの解析により、以下の主な知見:総脾臓細胞数が野生型またはヘテロ接合性の同腹仔よりも少ないことが見られた。また、以下のサブセット:脾臓−辺縁帯B細
胞、濾胞性B細胞、T1/B細胞、T2/辺縁帯B細胞、活性化CD4T細胞、ナイーブCD8T細胞、ミエロイド樹状細胞および形質細胞様樹状細胞;骨髄−総細胞数、未成熟B細胞、プレB細胞、プロB細胞、IgM+およびIgM−血漿細胞のうちのノックアウト細胞の数の統計的に有意に減少が観察された。(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較して、脾臓中のCD21hiCD23medB細胞のパーセンテージの著しい低下を示した。これらの結果から、そのノックアウトマウスが、記憶細胞のプールを含み、迅速な免疫応答に関与するB細胞のサブセット(辺縁帯B細胞)の減少を示したことが示唆される。したがって、変異ホモ接合性マウスは、脾臓中のB細胞前駆細胞のレベルの低下に関与する免疫学的異常を示した。
組織特異的FACS−マウス:血液、脾臓、骨髄および腹水中のリンパ球および抗原提示細胞のサブセットの解析により、以下の主な知見:総脾臓細胞数が野生型またはヘテロ接合性の同腹仔よりも少ないことが見られた。また、以下のサブセット:脾臓−辺縁帯B細
胞、濾胞性B細胞、T1/B細胞、T2/辺縁帯B細胞、活性化CD4T細胞、ナイーブCD8T細胞、ミエロイド樹状細胞および形質細胞様樹状細胞;骨髄−総細胞数、未成熟B細胞、プレB細胞、プロB細胞、IgM+およびIgM−血漿細胞のうちのノックアウト細胞の数の統計的に有意に減少が観察された。(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較して、脾臓中のCD21hiCD23medB細胞のパーセンテージの著しい低下を示した。これらの結果から、そのノックアウトマウスが、記憶細胞のプールを含み、迅速な免疫応答に関与するB細胞のサブセット(辺縁帯B細胞)の減少を示したことが示唆される。したがって、変異ホモ接合性マウスは、脾臓中のB細胞前駆細胞のレベルの低下に関与する免疫学的異常を示した。
これらの結果は、ノックアウト(−/−)マウスが、その野生型(+/+)同腹仔と比較して、免疫学的異常を示すことを示す。PRO309ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、この表現型を模倣すると予想される。PRO309ポリペプチドまたはそのアゴニストは、迅速な免疫応答に関与し得るB細胞の発達または成熟に有用であり得る。
66.8.DNA40982−1235(UNQ293)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO332ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA40982−1235と命名)(UNQ293)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172874 ムス・ムスクルスポドカン(podocan)(Podn);参照タンパク質:Q7TQ62 アクセッション:Q7TQ62
NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ポドカンタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_153703 ホモ・サピエンスポドカン(PODN);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q5VVZ3 アクセッション:Q5VVZ3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ポドカン。
これらのノックアウト実験において、PRO332ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA40982−1235と命名)(UNQ293)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172874 ムス・ムスクルスポドカン(podocan)(Podn);参照タンパク質:Q7TQ62 アクセッション:Q7TQ62
NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ポドカンタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_153703 ホモ・サピエンスポドカン(PODN);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q5VVZ3 アクセッション:Q5VVZ3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ポドカン。
目的のマウス遺伝子は、ヒトPODNのオルソログであるPodn(ポドカン)である。別名としては、Pcan、SLRR5A、9430070G18およびMGC24995が挙げられる。
PODNは、1型コラーゲンと結合し得る推定分泌タンパク質であり、おそらく細胞外マトリックスタンパク質として機能する。この611アミノ酸タンパク質は、非コラーゲン性細胞外マトリックスタンパク質の小さいロイシンリッチリピート(SLR)ファミリーのメンバーであり、システインリッチN末端、20個のロイシンリッチリピートおよび酸性C末端ドメインからなる。腎糸球体内で、PODNは、足細胞および血管内皮細胞において発現しており、基底膜に見られる。PODNは、心臓および血管平滑筋細胞を含む他の組織においても発現している。PODNは、糸球体基底膜における原線維発生をおそらく調節しており、また、糸球体濾過、HIV感染に関連した硬化性糸球体病変形成および循環器系組織の成長制御において役割を果たし得る(Ross et al,J Biol Chem 278(35):33248−55(2003);Shimizu−Hirota et al,FEBS Lett 563(1−3):69−74(2004))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マ
ウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
ウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 24 46 19 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗値=2.61 有意性=0.27117255(hom/n)=0.24
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172874.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 24 46 19 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗値=2.61 有意性=0.27117255(hom/n)=0.24
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172874.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.8.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA40982−1235(UNQ293)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトポドカン(PODN)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、血清IgG3レベルの上昇をもたらした。さらに、変異(−/−)マウスは、骨塩密度の測定値の増加および平均大腿骨中軸の断面積の増加を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトポドカン(PODN)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、血清IgG3レベルの上昇をもたらした。さらに、変異(−/−)マウスは、骨塩密度の測定値の増加および平均大腿骨中軸の断面積の増加を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロールと比較して、平均血清IgG3レベルの上昇を示した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロールと比較して、平均血清IgG3レベルの上昇を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合性成体が、血清IgG3レベルの上昇を示したことが明らかになった。したがって、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して、血清免疫グロブリンの増加を示した。IgG3免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、PRO332ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO332ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
(c)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均に対する値と比較して、体積測定による平均骨塩密度および全身骨塩密度の増加を示した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のものと比較して、大腿骨中軸の平均断面積の増加を示した。
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均に対する値と比較して、体積測定による平均骨塩密度および全身骨塩密度の増加を示した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のものと比較して、大腿骨中軸の平均断面積の増加を示した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、骨塩量ならびに全身および大腿骨の骨塩密度の増加を示した。これらの結果から、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病のような骨の異常に関連し得ることが示唆される。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO332ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。骨塩量ならびに全身および大腿骨の骨塩密度の増加に関する表現型から、これらの作用を模倣する物質(例えば、PRO332ポリペプチドのアンタゴニスト)が、骨の治癒に有用であり得ることが示唆される。
66.9.DNA38649(UNQ301)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO342ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA38649と命名)(UNQ301)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_023059 アクセッション:NM_023059 NID:12746439 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス 単一Ig IL−1レセプター関連タンパク質(未決定Sigirr);参照タンパク質:Q9JLZ8 アクセッション:Q9JLZ8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。TOLL/インターロイキン−1レセプター8;参照ヒト遺伝子配列:NM_021805 アクセッション:NM_021805 NID:11141876 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス 単一Ig IL−1R関連分子(SIGIRR);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応
する:Q9H733 アクセッション:Q9H733 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDNA:FLJ21446 FIS,クローンCOL04458。
これらのノックアウト実験において、PRO342ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA38649と命名)(UNQ301)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_023059 アクセッション:NM_023059 NID:12746439 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス 単一Ig IL−1レセプター関連タンパク質(未決定Sigirr);参照タンパク質:Q9JLZ8 アクセッション:Q9JLZ8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。TOLL/インターロイキン−1レセプター8;参照ヒト遺伝子配列:NM_021805 アクセッション:NM_021805 NID:11141876 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス 単一Ig IL−1R関連分子(SIGIRR);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応
する:Q9H733 アクセッション:Q9H733 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDNA:FLJ21446 FIS,クローンCOL04458。
目的のマウス遺伝子は、ヒトSIGIRR(単一のIg IL−1R関連分子)のオルソログであるAI256711(発現配列AI256711)である。別名としては、TIR8、単一Ig IL−1R関連タンパク質および単一Ig IL−1レセプター関連タンパク質が挙げられる。
SIGIRRは、「シグナル伝達しない」レセプターまたは「デコイ」レセプターとして機能するI型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、細胞外免疫グロブリンドメイン、膜貫通セグメントおよび細胞内トール/インターロイキン−1レセプター(TIR)ドメインからなる。刺激されると、炎症誘発性インターロイキン−1レセプター(IL−1R)およびトール様レセプター(TLR)は、SIGIRRをリクルートし、次いで、下流のシグナル伝達分子であるインターロイキン−1レセプター関連キナーゼ(IRAK)およびTNFレセプター関連因子6(TRAF6)を捕捉することにより、シグナル伝達を阻害する。SIGIRRは、自然免疫応答の負の調節に関連する。このタンパク質は、多くの組織ならびに腎臓、結腸および他の粘膜組織における樹状細胞および上皮細胞を含む細胞において発現し、また、リポ多糖(LPS)に応答してダウンレギュレートされる。したがって、SIGIRRは、刺激されていない細胞における自然免疫応答を阻止することから、慢性炎症および敗血症などの有害な作用をおそらく阻害する(Thomassen et al,Cytokine 11(6):389−99(1999);Polentarutti et al,Eur Cytokine Netw 14(4):211−8(2003);Wald et al,Nat Immunol 4(9):920−7(2003);Mantovani et al,J Leukoc Biol 75(5):738−42(2004);O’Neill,Nat Immunol 4(9):823−4(2003);Garlanda et al,Proc
Natl Acad Sci USA 101(10):3522−6(2004))。
Natl Acad Sci USA 101(10):3522−6(2004))。
Waldおよび共同研究者ら[Nat Immunol 4(9):920−7(2003)]ならびにGarlandaおよび共同研究者ら[Proc Natl Acad
Sci USA 101(10):3522−6(2004)]は、ノックアウトマウスを用いてSIGIRRの生理学的役割について研究した。彼らは、IL−1またはLPSに対して応答した炎症および腸管の炎症の感受性が、SIGIRR欠損マウスのほうが野生型マウスよりも高いことを示した。これらの著者らは、SIGIRRが、自然免疫応答を調節するのに必須であり、消化管における炎症を制御するために重要であり得ると結論付けた。
Sci USA 101(10):3522−6(2004)]は、ノックアウトマウスを用いてSIGIRRの生理学的役割について研究した。彼らは、IL−1またはLPSに対して応答した炎症および腸管の炎症の感受性が、SIGIRR欠損マウスのほうが野生型マウスよりも高いことを示した。これらの著者らは、SIGIRRが、自然免疫応答を調節するのに必須であり、消化管における炎症を制御するために重要であり得ると結論付けた。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 18 20 54
予測値 13.5 27 13.5 54
カイ二乗値=0.73 有意性=0.69419664(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜9をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_023059.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 18 20 54
予測値 13.5 27 13.5 54
カイ二乗値=0.73 有意性=0.69419664(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜9をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_023059.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.9.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA38649(UNQ301)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト単一IgIL−1R関連分子(SIGIRR)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、末梢血中のCD4細胞の平均パーセンテージの低下ならびに平均血清IgAレベルの低下をもたらした。ホモ接合性マウスはまた、疼痛応答の低下(熱誘導性疼痛に対する感度の低下)を示した。さらに、変異雄(−/−)および(+/−)マウスは、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルの上昇を示した。放射線学の結果は、雌(−/−)マウスが骨塩量および骨塩密度指標の測定値の低下を示したことを示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:心臓学
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠動脈疾患、異常脂肪血症(例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの増加(高トリグリセリド血症))、糖尿病および/または肥満症の処置のための標的を本明細書中で同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト単一IgIL−1R関連分子(SIGIRR)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、末梢血中のCD4細胞の平均パーセンテージの低下ならびに平均血清IgAレベルの低下をもたらした。ホモ接合性マウスはまた、疼痛応答の低下(熱誘導性疼痛に対する感度の低下)を示した。さらに、変異雄(−/−)および(+/−)マウスは、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルの上昇を示した。放射線学の結果は、雌(−/−)マウスが骨塩量および骨塩密度指標の測定値の低下を示したことを示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:心臓学
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠動脈疾患、異常脂肪血症(例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの増加(高トリグリセリド血症))、糖尿病および/または肥満症の処置のための標的を本明細書中で同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的が同定され得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra400(mfr:Roche)を、マウスの血液化学試験のために使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的が同定され得る。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートを、このアッセイで試験した。高いコレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの上昇は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートを、このアッセイで試験した。高いコレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの上昇は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄(−/−)および(+/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルおよび平均血清中トリグリセリドレベルの上昇を示した[(−/−)雄において2SD超のコレステロール;(+/−)マウスにおいて2SD超のコレステロール;(−/−)雄において1〜2SD超のトリグリセリド]。
血液化学:雄(−/−)および(+/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルおよび平均血清中トリグリセリドレベルの上昇を示した[(−/−)雄において2SD超のコレステロール;(+/−)マウスにおいて2SD超のコレステロール;(−/−)雄において1〜2SD超のトリグリセリド]。
上でまとめられたように、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および
歴史的平均と比較して、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルの著しい上昇を示した。したがって、PRO342遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患のモデルとして役立ち得る。PRO342ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の制御に有用であり得る。したがって、PRO342ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満症のような心血管疾患の処置に有用であり得る。(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
歴史的平均と比較して、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルの著しい上昇を示した。したがって、PRO342遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患のモデルとして役立ち得る。PRO342ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の制御に有用であり得る。したがって、PRO342ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠状動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病および/または肥満症のような心血管疾患の処置に有用であり得る。(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)蛍光標識細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
(1)蛍光標識細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および6匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用してサンプルを解析した。
結果:
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、計画実行用の(+/+)マウスおよび歴史的平均と比較して、CD4細胞の平均パーセンテージの減少を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、計画実行用の(+/+)マウスおよび歴史的平均と比較して、CD4細胞の平均パーセンテージの減少を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、細胞集団中のCD4細胞の平均パーセンテージの減少を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
したがって、PRO342ポリペプチドをコードする遺伝子をノックアウトすることにより、T細胞集団の減少が引き起こされる。これらの観察結果から、PRO342ポリペプチドまたはPRO342をコードする遺伝子が、T細胞増殖の制御因子として作用するようである。したがって、PRO342ポリペプチドは、T細胞増殖の増強に有益であり得る。
(2)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
(2)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、計画実行用の(+/+)マウスおよび歴史的中央値と比較して、平均血清中IgAレベルの低下を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、計画実行用の(+/+)マウスおよび歴史的中央値と比較して、平均血清中IgAレベルの低下を示した。
これらの結果から、これらのノックアウトマウスに関連する表現型が、IgAにおける免疫グロブリン欠損を示唆する。最もよくある免疫グロブリン欠損の遺伝型は、800人中約1人に見られる選択的IgA欠損である。IgAは、細菌のトキシンおよびウイルス
を中和し得る上皮細胞保護体として主に機能する。明らかでない疾患の感受性が選択的IgA欠損と関連するが、その感受性は、通常の集団よりも慢性肺疾患を有する人々においてよくあることである。このことは、IgAの欠損が、様々な病原体による肺感染症に対する素因をもたらし得、そして体表での防御におけるIgAの役割と一致することを示唆する。したがって、PRO342ポリペプチドまたはそのアゴニストは、皮膚感染症に対する天然の免疫保護として保護の際に重要な役割を果たし、より重要には、肺感染症に対する感受性を予防し得る。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
を中和し得る上皮細胞保護体として主に機能する。明らかでない疾患の感受性が選択的IgA欠損と関連するが、その感受性は、通常の集団よりも慢性肺疾患を有する人々においてよくあることである。このことは、IgAの欠損が、様々な病原体による肺感染症に対する素因をもたらし得、そして体表での防御におけるIgAの役割と一致することを示唆する。したがって、PRO342ポリペプチドまたはそのアゴニストは、皮膚感染症に対する天然の免疫保護として保護の際に重要な役割を果たし、より重要には、肺感染症に対する感受性を予防し得る。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
ホットプレート試験
試験の説明:侵害受容についてのホットプレート試験を、各マウスを小型の閉鎖系である55℃のホットプレートに置くことによって実施する。ホットプレート上での最大時間を30秒として、後肢応答(なめる、振るまたは跳ねる)までの時間を記録する。各動物を1回試験する。
試験の説明:侵害受容についてのホットプレート試験を、各マウスを小型の閉鎖系である55℃のホットプレートに置くことによって実施する。ホットプレート上での最大時間を30秒として、後肢応答(なめる、振るまたは跳ねる)までの時間を記録する。各動物を1回試験する。
結果:
ホットプレート:ホットプレート試験での応答までの時間が、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、(−/−)マウスでは長かったことから、変異体では急性疼痛に対する感度が低下していることが示唆される。
(e)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
ホットプレート:ホットプレート試験での応答までの時間が、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、(−/−)マウスでは長かったことから、変異体では急性疼痛に対する感度が低下していることが示唆される。
(e)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/L
BM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/L
BM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
Dexa:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、全身、大腿骨および椎骨における平均骨塩量、骨塩密度指標および骨塩密度の減少を示した。
Dexa:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、全身、大腿骨および椎骨における平均骨塩量、骨塩密度指標および骨塩密度の減少を示した。
Dexaおよび骨マイクロCT解析により解析された(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較して骨測定値の低下を示した。このことから、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する異常な骨測定値の減少を含む負の骨表現型を示した。その負の骨表現型は、PRO342ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO342ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO342ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む異常な骨障害または病理学的な骨障害に導き得る。
66.10.DNA47470−1130P1(UNQ313)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO356ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA47470−1130P1と命名)(UNQ313)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC023373 アクセッション:BC023373
NID:19483941 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス、アンジオポエチン様因子に類似、クローンMGC:32448 IMAGE:5043159;参照タンパク質:Q8R1Q3 アクセッション:Q8R1Q3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。アンジオポエチン様因子(ムス・ムスクルス 13日の胚の雄精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:6030482D04産物:CDT6(アンジオポエチン様因子)(CDT6 タンパク質)ホモログ);参照ヒト遺伝子配列:NM_021146 アクセッション:NM_021146 NID:20127595 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス アンジオポエチン様因子(CDT6);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O43827 アクセッション:O4382
7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDT6(アンジオポエチン様因子)(CDT6タンパク質)。
これらのノックアウト実験において、PRO356ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA47470−1130P1と命名)(UNQ313)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC023373 アクセッション:BC023373
NID:19483941 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス、アンジオポエチン様因子に類似、クローンMGC:32448 IMAGE:5043159;参照タンパク質:Q8R1Q3 アクセッション:Q8R1Q3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。アンジオポエチン様因子(ムス・ムスクルス 13日の胚の雄精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:6030482D04産物:CDT6(アンジオポエチン様因子)(CDT6 タンパク質)ホモログ);参照ヒト遺伝子配列:NM_021146 アクセッション:NM_021146 NID:20127595 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス アンジオポエチン様因子(CDT6);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O43827 アクセッション:O4382
7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDT6(アンジオポエチン様因子)(CDT6タンパク質)。
ヒトCDT6(角膜由来転写物6)のオルソログである目的のマウス遺伝子は、「アンジオポエチン様因子に類似」として定義されている。別名としては、アンジオポエチン様因子、AngXおよびdJ647M16.1が挙げられる。
CDT6は、角膜支質において発現している分泌タンパク質であり、おそらくリガンドとして機能する。CDT6は、概して血管新生を制御するレセプターに結合するアンジオポエチンファミリーのタンパク質と構造的に類似である。マウス異種移植片モデルにおいて、CDT6は、腫瘍成長および異常な血管形成を阻害し、細胞外マトリックスの蓄積を刺激した。したがって、CDT6は、おそらく角膜における血管新生を阻害し、角膜の表現型を誘導するモルフォゲンとして機能する。しかしながら、抗腫瘍薬剤としてのCDT6の可能性は、疑わしい(Peek et al,Invest Ophthalmol
Vis Sci 39(10):1782−8(1998);Peek et al,J Biol Chem 277(1):686−93(2002);Bouis et
al,In Vivo 17(2):157−61(2003))。
Vis Sci 39(10):1782−8(1998);Peek et al,J Biol Chem 277(1):686−93(2002);Bouis et
al,In Vivo 17(2):157−61(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 19 45 14 78
予測値 19.5 39 19.5 78
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションBC023373)。
カイ二乗値=0.21 有意性=0.9003245(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=9
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(心臓以外)において標的遺伝子の発現を検出した。2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 19 45 14 78
予測値 19.5 39 19.5 78
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションBC023373)。
カイ二乗値=0.21 有意性=0.9003245(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=9
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(心臓以外)において標的遺伝子の発現を検出した。2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.10.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA47470−1130P1(UNQ313)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト角膜由来転写物6(CDT6)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける骨塩密度測定値の増加をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は
:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト角膜由来転写物6(CDT6)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける骨塩密度測定値の増加をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は
:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、全身および大腿骨における体積測定による平均骨塩密度の増加を示した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、大腿骨中軸の平均断面積の増加を示した。
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、全身および大腿骨における体積測定による平均骨塩密度の増加を示した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、大腿骨中軸の平均断面積の増加を示した。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、骨塩量の増加ならびに全身および大腿骨中軸の断面積の増加を示した。これらの結果から、ノックアウト変異表現型が、大理石骨病のような骨の異常に関連し得ることが示唆される。大理石骨病は、骨の異常な肥厚および硬化ならびに骨の異常な脆弱性を特徴とする状態である。そのため、PRO356ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病の処置に有益であり得る。骨塩量ならびに全身および大腿骨の骨塩密度の増加に関する表現型から、これらの作用を模倣する物質(例えば、PRO356ポリペプチドのアンタゴニスト)が、骨の治癒に有用であり得ることが示唆される。
66.11.DNA44189−1322(UNQ341)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO540ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA44189−1322と命名)(UNQ341)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対
応する:参照ヌクレオチド:NM_133792 ムス・ムスクルスリゾホスホリパーゼ3(Lypla3);参照タンパク質:Q8VEB4 アクセッション:Q8VEB4 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。LCAT様リゾホスホリパーゼ(リソソームのホスホリパーゼA2)に類似;参照ヒト遺伝子配列:NM_012320 アクセッション:NM_012320 NID:gi20302150 ref NM_012320.2 ホモ・サピエンスリゾホスホリパーゼ3(リソソームのホスホリパーゼA2)(LYPLA3);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8NCC3 アクセッション:Q8NCC3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質FLJ90347。
これらのノックアウト実験において、PRO540ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA44189−1322と命名)(UNQ341)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対
応する:参照ヌクレオチド:NM_133792 ムス・ムスクルスリゾホスホリパーゼ3(Lypla3);参照タンパク質:Q8VEB4 アクセッション:Q8VEB4 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。LCAT様リゾホスホリパーゼ(リソソームのホスホリパーゼA2)に類似;参照ヒト遺伝子配列:NM_012320 アクセッション:NM_012320 NID:gi20302150 ref NM_012320.2 ホモ・サピエンスリゾホスホリパーゼ3(リソソームのホスホリパーゼA2)(LYPLA3);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8NCC3 アクセッション:Q8NCC3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質FLJ90347。
目的のマウス遺伝子は、ヒトLYPLA3(リゾホスホリパーゼ3[リソソームホスホリパーゼA2])のオルソログであるLypla3(リゾホスホリパーゼ3)である。別名としては、ACS、LLPL、LPLA2、リソソームホスホリパーゼA2、DKFZp564A0122、1−O−アシルセラミドシンターゼおよびLCAT様リゾホスホリパーゼが挙げられる。
LYPLA3は、リン脂質におけるsn−2位のアシル基をセラミドのC−1ヒドロキシル基に移行させるのを触媒して、1−O−アシルセラミドを形成する、アシルトランスフェラーゼとして機能するリソソームの酵素であり得る。セラミドが存在しない場合、この酵素は、ホスホリパーゼとしても機能し得、リン脂質からリゾホスホリピドおよび遊離脂肪酸を形成する。この酵素は、弱いリゾホスホリパーゼ活性も有し得、そして血漿中で検出される。LYPLA3は、カルシウム非依存性であり、必要に応じて酸性pHで活性であり、多岐に亘る組織において発現している(Taniyama et al,Biochem Biophys Res Commun 257(1):50−6(1999);Hiraoka et al,J Biol Chem 277(12):10090−9(2002))。LYPLA3は、肺胞マクロファージによる肺サーファクタント異化において役割を果たし得る(Abe et al,J Biol Chem 279(41):42605−11(2004))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 33 19 75
予測値 18.75 37.5 18.75 75
カイ二乗値=1.53 有意性=0.46533394(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133792.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した
。
実測値 23 33 19 75
予測値 18.75 37.5 18.75 75
カイ二乗値=1.53 有意性=0.46533394(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133792.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した
。
66.11.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA44189−1322(UNQ341)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトリゾホスホリパーゼ3(リソソームのホスホリパーゼA2)(LYPLA3)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、雄(−/−)マウスにおける骨塩密度測定値の減少をもたらした。ノックアウトマウスはまた、耐糖能障害を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトリゾホスホリパーゼ3(リソソームのホスホリパーゼA2)(LYPLA3)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、雄(−/−)マウスにおける骨塩密度測定値の減少をもたらした。ノックアウトマウスはまた、耐糖能障害を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および全身診断学:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造についての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均に対する値と比較して、平均骨塩量ならびに全身大腿骨および椎骨における骨塩密度の減少を示した。しかしながら、椎骨骨塩密度における差は、中央値より約1SD小さかった。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のものと比較して、大腿骨中軸の平均断面積の減少を示した。
Dexa:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均に対する値と比較して、平均骨塩量ならびに全身大腿骨および椎骨における骨塩密度の減少を示した。しかしながら、椎骨骨塩密度における差は、中央値より約1SD小さかった。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のものと比較して、大腿骨中軸の平均断面積の減少を示した。
Dexaおよび骨マイクロCT解析によって解析された(−/−)マウスは、その(+
/+)同腹仔と比較して、異常な骨障害を示唆する、骨の測定値の減少を示した。その(−/−)マウスは、負の骨表現型を示し、骨の代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した。骨の負の表現型は、PRO540ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO540ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO540ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的な骨障害に導き得る。
(c)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
/+)同腹仔と比較して、異常な骨障害を示唆する、骨の測定値の減少を示した。その(−/−)マウスは、負の骨表現型を示し、骨の代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した。骨の負の表現型は、PRO540ポリペプチドまたはそのアゴニストが、骨ホメオスタシスの維持に有用であり得ることを示唆する。さらに、PRO540ポリペプチドは、骨の治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の処置に有用であり得る一方で、PRO540ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、関節炎、骨粗鬆症および骨減少症を含む異常な骨代謝に関連する炎症性疾患を含む、異常な骨障害または病理学的な骨障害に導き得る。
(c)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Lifescan血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。20%溶液として送達される2g/kgのD−グルコースを動物にIP注射し、血糖値を注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
雄(−/−)マウスは、高脂肪食を与えられたとき、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して耐糖能障害を示した。
血糖値/耐糖能試験:
雄(−/−)マウスは、高脂肪食を与えられたとき、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して耐糖能障害を示した。
これらの研究では、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が減少を示したかまたは耐糖能障害を示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示し、それゆえ、PRO540ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそれをコードする遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または糖尿病を含む様々な循環器疾患に関連した状態の処置に有用であり得る。
66.12.DNA49152−1324(UNQ354)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO618ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49152−1324と命名)(UNQ354)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC029645 アクセッション:BC029645 NID:20987285 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス膜貫通セリンプロテアーゼ6,mRNA(cDNAクローンMGC:25857IMAGE:4195486);参照タンパク質:Q9DBI0 アクセッション:Q9DBI0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。1300008A22RIKタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_153609 ホモ・サピエンス膜貫通プロテアーゼ,セリン6(TMPRSS6);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8IU80 アクセッション:Q8IU80 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。II型膜貫通セリンプロテアーゼ6。
これらのノックアウト実験において、PRO618ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA49152−1324と命名)(UNQ354)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC029645 アクセッション:BC029645 NID:20987285 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス膜貫通セリンプロテアーゼ6,mRNA(cDNAクローンMGC:25857IMAGE:4195486);参照タンパク質:Q9DBI0 アクセッション:Q9DBI0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。1300008A22RIKタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_153609 ホモ・サピエンス膜貫通プロテアーゼ,セリン6(TMPRSS6);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8IU80 アクセッション:Q8IU80 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。II型膜貫通セリンプロテアーゼ6。
目的のマウス遺伝子は、ヒトTMPRSS6のオルソログであるTmprss6(膜貫通セリンプロテアーゼ6)である。別名としては、1300008A22Rik、マトリプターゼ(matriptase)2、II型膜貫通セリンプロテアーゼ6、FLJ30744および膜結合モザイクセリンプロテイナーゼが挙げられる。
TMPRSS6は、主に肝臓において発現し、細胞外マトリックスタンパク質の加水分解を触媒するトリプシン様セリンプロテアーゼとして機能するII型原形質膜タンパク質である。TMPRSS6は、肝臓における細胞外マトリックスリモデリングにおいて役割をおそらく果たす。TMPRSS6は、侵襲性の腺細胞癌腫を増大させることから、TMPRSS6は、転移においても役割を果たし得ると示唆されている(Hooper et
al,Biochem J 373(Pt3):689−702(2003);Overall et al,Biol Chem 385(6):493−504(2004);Velasco et al,J Biol Chem 277(40):37637−46(2002))。
al,Biochem J 373(Pt3):689−702(2003);Overall et al,Biol Chem 385(6):493−504(2004);Velasco et al,J Biol Chem 277(40):37637−46(2002))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 26 41 14 81
予測値 20.25 40.5 20.25 81
カイ二乗値=2.05 有意性=0.35879648(hom/n)=0.21
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027902.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13のすべての成体組織サンプル(胸腺、脾臓、肺、骨格筋、骨および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 26 41 14 81
予測値 20.25 40.5 20.25 81
カイ二乗値=2.05 有意性=0.35879648(hom/n)=0.21
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027902.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13のすべての成体組織サンプル(胸腺、脾臓、肺、骨格筋、骨および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.12.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA49152−1324(UNQ354)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト膜貫通セリンプロテアーゼ6(TMPRSS6)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、体重および体長、総組織質量ならびに除脂肪体重の減少ならびに骨塩量の減少および骨塩密度の測定値の減少を含む成長遅延の徴候を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。変異(−/−)マウスはまた、貧血の徴候および平均血小板数の増加も示した。概日性試験により、概日リズムがないこと(またはその機能低下)が明らかになった。さらに、変異体は、RBCまたはヘモグロビンの欠損を示唆する異常な赤血球を特徴とする脱毛症、血色素減少症および赤血球大小不同症を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
肉眼的:(−/−)マウスは、脱毛症および表皮性角質増殖を示した。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、赤血球またはヘモグロビンの産生の欠陥を示唆する、ヘモグロビンが正常な数よりも少なく、骨髄および脾臓における赤血球形成の期待レベルよりも少ない異常な赤血球を特徴とする血色素減少症および赤血球大小不同症を示した。さらに、(−/−)変異体は、びまん性脱毛症および表皮性角質増殖を示した。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト膜貫通セリンプロテアーゼ6(TMPRSS6)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、体重および体長、総組織質量ならびに除脂肪体重の減少ならびに骨塩量の減少および骨塩密度の測定値の減少を含む成長遅延の徴候を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。変異(−/−)マウスはまた、貧血の徴候および平均血小板数の増加も示した。概日性試験により、概日リズムがないこと(またはその機能低下)が明らかになった。さらに、変異体は、RBCまたはヘモグロビンの欠損を示唆する異常な赤血球を特徴とする脱毛症、血色素減少症および赤血球大小不同症を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
肉眼的:(−/−)マウスは、脱毛症および表皮性角質増殖を示した。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、赤血球またはヘモグロビンの産生の欠陥を示唆する、ヘモグロビンが正常な数よりも少なく、骨髄および脾臓における赤血球形成の期待レベルよりも少ない異常な赤血球を特徴とする血色素減少症および赤血球大小不同症を示した。さらに、(−/−)変異体は、びまん性脱毛症および表皮性角質増殖を示した。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均におけるレベルと比較して、平均ヘモグロビンレベルおよび平均ヘマトクリットレベルの低下ならびに平均赤血球数の増加を示した。さらに、平均血球体積および平均血球ヘモグロビンは、(−/−)マウスにおいて減少したが、赤血球細胞の分布幅が増大したことから、赤血球の大きさは、変異体において不定であることが示唆される。(−/−)マウスはまた、平均血小板数の増加を示した。
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均におけるレベルと比較して、平均ヘモグロビンレベルおよび平均ヘマトクリットレベルの低下ならびに平均赤血球数の増加を示した。さらに、平均血球体積および平均血球ヘモグロビンは、(−/−)マウスにおいて減少したが、赤血球細胞の分布幅が増大したことから、赤血球の大きさは、変異体において不定であることが示唆される。(−/−)マウスはまた、平均血小板数の増加を示した。
これらの結果は、貧血に関連する表現型に関係する。したがって、PRO618ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO618ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に必須であるに違いなく、ゆえに貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。
さらに、(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血小板数の増加を示した。したがって、DNA49152−1324遺伝子が欠損した変異マウスは、凝血障害に関連する表現型を生じた。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
(1)概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
(1)概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:雌(−/−)マウスは、1時間および12時間の慣れ期間ならびにすべての明期および暗期の間の概日リズムのない機能低下および機能低下を示したことから、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均で測定されたレベルと比較して、試験の最後の24時間の異常な睡眠/覚醒サイクルが示唆される。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の減少を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO618ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
(2)機能観察総合評価(FOB)試験
FOBは、全身感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検知および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
概日性:雌(−/−)マウスは、1時間および12時間の慣れ期間ならびにすべての明期および暗期の間の概日リズムのない機能低下および機能低下を示したことから、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均で測定されたレベルと比較して、試験の最後の24時間の異常な睡眠/覚醒サイクルが示唆される。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の減少を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO618ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
(2)機能観察総合評価(FOB)試験
FOBは、全身感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検知および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
結果:
8匹すべての(−/−)マウスが、毛の薄い柔皮および/またははげた斑を示した。
8匹すべての(−/−)マウスが、毛の薄い柔皮および/またははげた斑を示した。
(e)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した。
明らかな全体的外見:(−/−)マウスは、胸部および腹部の背側および腹側の領域における脱毛症を示した。(−/−)マウスのすべておよび(+/−)マウスの数匹の尾は、側方弯曲またはわずかな屈曲を伴って短くなっていたように見られた。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
を含んだ。
雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した。
明らかな全体的外見:(−/−)マウスは、胸部および腹部の背側および腹側の領域における脱毛症を示した。(−/−)マウスのすべておよび(+/−)マウスの数匹の尾は、側方弯曲またはわずかな屈曲を伴って短くなっていたように見られた。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
Dexa:雄と雌の両方の(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、除脂肪体重ならびに骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。雄ノックアウトはまた、平均総組織質量(TTM)の減少も示した。
Dexa:雄と雌の両方の(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、除脂肪体重ならびに骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。雄ノックアウトはまた、平均総組織質量(TTM)の減少も示した。
PRO618ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、平均総質量、除脂肪体重の減少を特徴とする、成長遅延および組織るいそう疾患と一致する表現型を示した。これらの結果は、上で報告した平均体重および平均体長の減少の観察結果と一致する。さらに、変異(−/−)マウスは、骨粗鬆症を示唆する、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。したがって、PRO618ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連作用を模倣し得る。他方で、PRO618ポリペプチドまたはそのアゴニストは、悪液質または他の組織るいそう疾患などの成長または疾患に関連するそのような代謝障害の予防および/または処置に有用であり得、ならびに骨減少に関連する骨障害の処置に有用であり得る。
66.13.DNA52185−1370(UNQ481)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO944ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA52185−1370と命名)(UNQ481)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_016674 ムス・ムスクルスクローディン1(Cldn1);参照タンパク質:O88551 アクセッション:O88551 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。クローディン−1;参照ヒト遺伝子配列:NM_021101 アクセッション:NM_021101 NID:gi21536297 ref NM_021101.3 ホモ・サピエンスクローディン1(CLDN1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O95832 アクセッション:O95832 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。クローディン−1(老化関連上皮膜タンパク質)。
これらのノックアウト実験において、PRO944ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA52185−1370と命名)(UNQ481)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_016674 ムス・ムスクルスクローディン1(Cldn1);参照タンパク質:O88551 アクセッション:O88551 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。クローディン−1;参照ヒト遺伝子配列:NM_021101 アクセッション:NM_021101 NID:gi21536297 ref NM_021101.3 ホモ・サピエンスクローディン1(CLDN1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:O95832 アクセッション:O95832 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。クローディン−1(老化関連上皮膜タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトCLDN1のオルソログであるCldn1(クローディン1)である。別名としては、CLD1、SEMP1および老化関連上皮膜タンパク質1が挙げられる。
CLDN1は、溶質および水の傍細胞輸送を制限する細胞間の障壁を形成する細胞接着分子であるタイトジャンクションの構成要素として機能する内在性原形質膜タンパク質である。CLDN1の細胞外セグメントは、隣接細胞上のクローディンと接着して相互作用し、側方に共重合することにより、タイトジャンクションストランドを形成する。CLD
N1は、肝臓、気道上皮、膵臓、胎盤、副腎、前立腺および卵巣において発現する。CLDN1は、おそらく細胞の極性および透過性の維持および制御に重要な役割を果たす(Furuse et al,J Cell Biol 141(7):1539−50(1998);Swisshelm et al,Gene 226(2):285−95(1999);Heiskala et al,Traffic 2(2):93−8(2001);Furuse et al,J Cell Biol 156(6):1099−111(2002);Coyne et al,Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol 285(5):L1166−78(2003);Sasaki et al,Proc Natl Acad Sci USA 100(7):3971−6(2003))。
N1は、肝臓、気道上皮、膵臓、胎盤、副腎、前立腺および卵巣において発現する。CLDN1は、おそらく細胞の極性および透過性の維持および制御に重要な役割を果たす(Furuse et al,J Cell Biol 141(7):1539−50(1998);Swisshelm et al,Gene 226(2):285−95(1999);Heiskala et al,Traffic 2(2):93−8(2001);Furuse et al,J Cell Biol 156(6):1099−111(2002);Coyne et al,Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol 285(5):L1166−78(2003);Sasaki et al,Proc Natl Acad Sci USA 100(7):3971−6(2003))。
Furuseおよび共同研究者ら(2002)は、ノックアウトマウスを用いてCLDN1の生理学的役割を研究した。CLDN1ホモ接合ヌルマウスは、生後1日以内に死亡した。タイトジャンクションが、CLDN1ホモ接合ヌルマウスの表皮において明らかであるが、600ダルトンの追跡用色素は、CLDN1ホモ接合ヌルマウスの表皮性タイトジャンクションを介して拡散したが、野生型マウスの表皮性タイトジャンクションを介して拡散しなかった。Furuseおよび共同研究者らは、CLDN1は、哺乳動物の皮膚において障壁機能に必要であると結論付けた。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 40 2 60
予測値 15.0 30 15.0 60
カイ二乗値=12.72 有意性=0.0017293665(hom/n)=0.12平均同腹仔数=9
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_016674.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨、心臓および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 40 2 60
予測値 15.0 30 15.0 60
カイ二乗値=12.72 有意性=0.0017293665(hom/n)=0.12平均同腹仔数=9
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_016674.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨、心臓および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.13.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA52185−1370(UNQ481)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトクローディン1(CLDN1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。(−/−)仔は、遺伝子型同定の時点で死亡していた。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、41個の胚:9個の(−/−)胚、20個の(+/−)胚、
8個の(+/+)胚、2個の再吸収モル、1個の未定胚および1個の不確定な胚が観察された。12.5日目の変異体胚において、発達異常は、組織学的検査によっては検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトクローディン1(CLDN1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。(−/−)仔は、遺伝子型同定の時点で死亡していた。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、41個の胚:9個の(−/−)胚、20個の(+/−)胚、
8個の(+/+)胚、2個の再吸収モル、1個の未定胚および1個の不確定な胚が観察された。12.5日目の変異体胚において、発達異常は、組織学的検査によっては検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
致死性の胚の発達異常に関連する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死マウスは、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死マウスは、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
66.14.DNA58855−1422(UNQ518)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO994ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58855−1422と命名)(UNQ518)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_025453 アクセッション:NM_025453
NID:gi 13384857 ref NM_025453.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1810018L02遺伝子(1810018L02Rik);参照タンパク質:Q9CQY8 アクセッション:Q9CQY8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。1810018L02Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_024795 アクセッション:NM_024795 NID:gi13376165 ref NM_024795.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ22800(FLJ22800);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9H5X9 アクセッション:Q9H5X9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質FLJ22800。
これらのノックアウト実験において、PRO994ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58855−1422と命名)(UNQ518)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_025453 アクセッション:NM_025453
NID:gi 13384857 ref NM_025453.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1810018L02遺伝子(1810018L02Rik);参照タンパク質:Q9CQY8 アクセッション:Q9CQY8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。1810018L02Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_024795 アクセッション:NM_024795 NID:gi13376165 ref NM_024795.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質FLJ22800(FLJ22800);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9H5X9 アクセッション:Q9H5X9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質FLJ22800。
目的のマウス遺伝子は、ヒト仮説タンパク質FLJ22800のオルソログであるRIKEN cDNA1810018L02遺伝子である。
仮説タンパク質FLJ22800は、シグナルペプチドおよびL6膜タンパク質ドメイン内に含まれる4回膜貫通ドメインからなる推定内在性原形質膜タンパク質である(PfamアクセッションPF05805)。この仮説タンパク質の機能は未知である;しかしながら、他のL6膜ファミリーメンバーは、癌と関係している(Wright et al,Protein Sci 9(8):1594−600(2000))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 41 23 80
予測値 20 40 20 80
カイ二乗値=1.62 有意性=0.44485807(hom/n)=0.25
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_025453.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、骨格筋および骨以外の13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 41 23 80
予測値 20 40 20 80
カイ二乗値=1.62 有意性=0.44485807(hom/n)=0.25
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_025453.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、骨格筋および骨以外の13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.14.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58855−1422(UNQ518)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(FLJ22800)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける不安関連応答の低下をもたらした。UNQ518は、他の組織と比較して膵臓および小腸において高レベルで発現している。(−/−)マウスはまた、運動協調性の増大を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(FLJ22800)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおける不安関連応答の低下をもたらした。UNQ518は、他の組織と比較して膵臓および小腸において高レベルで発現している。(−/−)マウスはまた、運動協調性の増大を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を計測するためのオープンフィールドを含んだ。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を計測するためのオープンフィールドを含んだ。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン(seratonin)トランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッ
セイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、4つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。全移動距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン(seratonin)トランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッ
セイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、4つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。全移動距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
マウスが新しい環境に対して正常な慣れ応答を示す傾向を、5回の間隔にわたるその水平自発運動の変化すべてを測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは5回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な慣れは、負の傾きの値によって表される。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、オープンフィールド試験中の中心にいる時間の合計の中央値の増加を示したことから、変異体における不安様応答の低下が示唆される。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、オープンフィールド試験中の中心にいる時間の合計の中央値の増加を示したことから、変異体における不安様応答の低下が示唆される。
注目すべき差が、オープンフィールド活動性試験中に観察された。雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、中心領域にいる時間の合計の中央値の増加を示した。これは、変異体における不安様応答の低下を示唆する。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏ならびに感覚障害および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO994ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:雌(−/−)マウスは、12時間の慣れ期間ならびにすべての明期および暗期の間の歩行活動性の低下を示したことから、その性別一致(+/+)同腹仔で測定されたレベルおよび歴史的平均と比較して、試験の最後の24時間の異常な睡眠/覚醒サイクルが示唆される。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の減少を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏お
よび感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO994ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:雌(−/−)マウスは、12時間の慣れ期間ならびにすべての明期および暗期の間の歩行活動性の低下を示したことから、その性別一致(+/+)同腹仔で測定されたレベルおよび歴史的平均と比較して、試験の最後の24時間の異常な睡眠/覚醒サイクルが示唆される。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の減少を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏お
よび感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO994ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
反転スクリーン試験:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートに対して行動スクリーニングを行った。生存能低下によってより早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験を12〜16週齢で行った。これらの試験には、不安、活動レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートに対して行動スクリーニングを行った。生存能低下によってより早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験を12〜16週齢で行った。これらの試験には、不安、活動レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
反転スクリーン試験データ:
反転するスクリーンを使用して、運動力/共調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を180°回転させた。以下の行動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上。
反転するスクリーンを使用して、運動力/共調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を180°回転させた。以下の行動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上。
結果:
遺伝子型 落下率 % 登上率 %
+/+(n=8) 0/8 0 4/8 50
−/−(n=8) 0/8 0 8/8 100
野生型集団 落下3.62% 登上60.04%
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しなかった0/8もしくは1/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性障害を示す。登上した7/8もしくは8/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性の増強を示す。
遺伝子型 落下率 % 登上率 %
+/+(n=8) 0/8 0 4/8 50
−/−(n=8) 0/8 0 8/8 100
野生型集団 落下3.62% 登上60.04%
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しなかった0/8もしくは1/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性障害を示す。登上した7/8もしくは8/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性の増強を示す。
反転スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するように設定する:
8匹の(−/−)マウスのうち、8匹すべての(−/−)マウスがスクリーンに登上したのに対して、4/8(+/+)マウスが登上した。この結果から、変異体の運動協調性の増大が示唆される。
8匹の(−/−)マウスのうち、8匹すべての(−/−)マウスがスクリーンに登上したのに対して、4/8(+/+)マウスが登上した。この結果から、変異体の運動協調性の増大が示唆される。
66.15.DNA56050−1455(UNQ536)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1079ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA56050−1455と命名)(UNQ536)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_029537 アクセッション:NM_029537 NID:gi22095006 ref NM_029537.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 6530411B15遺伝子(6530411B15Rik);参照タンパク質:Q91X86 アクセッション:Q91X86 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。未知(MGCについてのタンパク質:19304);参照ヒト遺伝子配列:NM_015544 アクセッション:NM_015544 NID:gi7661615 ref NM_015544.1 ホモ・サピエンス DKFZP564K1964タンパク質(DKFZP564K1964);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y2Y6 アクセッション:Q9Y2Y6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TADA1タンパク質(DKFZP564K1964タンパク質)。
これらのノックアウト実験において、PRO1079ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA56050−1455と命名)(UNQ536)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_029537 アクセッション:NM_029537 NID:gi22095006 ref NM_029537.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 6530411B15遺伝子(6530411B15Rik);参照タンパク質:Q91X86 アクセッション:Q91X86 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。未知(MGCについてのタンパク質:19304);参照ヒト遺伝子配列:NM_015544 アクセッション:NM_015544 NID:gi7661615 ref NM_015544.1 ホモ・サピエンス DKFZP564K1964タンパク質(DKFZP564K1964);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9Y2Y6 アクセッション:Q9Y2Y6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TADA1タンパク質(DKFZP564K1964タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトDKFZP564K1964タンパク質のオルソログであ
るRIKEN cDNA6530411B15遺伝子である。別名としては、TADA1タンパク質、ETVV536およびUNQ536が挙げられる。
るRIKEN cDNA6530411B15遺伝子である。別名としては、TADA1タンパク質、ETVV536およびUNQ536が挙げられる。
DKFZP564K1964タンパク質は、推定分泌タンパク質であり、弱く予測されるシグナルペプチドからなり、他の保存されたドメインを含まない。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 11 31 2 44
予測値 11 22 11 44
カイ二乗値=13.06 有意性=0.0014590055(hom/n)=0.09平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_029537.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。(−/−)マウスの生存能低下が観察された。同定された(−/−)マウスのうちの7匹が胎仔サンプルとして提出された。
66.15.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA56050−1455(UNQ536)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体において大きな生存能低下をもたらした。同定された(−/−)マウスのうち7匹が、胚サンプルとして提出された。2匹の生存変異体のうち、雄は、血圧解析の後すぐに死亡したが、雌は、大部分のレベル1試験を経験した。ホモ接合性変異体は、貧血を含む多くの免疫学的異常を示した。オープンフィールド試験の結果により、変異(−/−)マウスにおける活動亢進が示唆される。1匹の雄(−/−)マウスは、総組織質量および除脂肪体重の減少を示したが、雌(−/−)ノックアウトは、総組織質量、脂肪質量(g)および%総体脂肪の増加を示した。1匹のマウスは、網膜出血を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 11 31 2 44
予測値 11 22 11 44
カイ二乗値=13.06 有意性=0.0014590055(hom/n)=0.09平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_029537.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。(−/−)マウスの生存能低下が観察された。同定された(−/−)マウスのうちの7匹が胎仔サンプルとして提出された。
66.15.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA56050−1455(UNQ536)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体において大きな生存能低下をもたらした。同定された(−/−)マウスのうち7匹が、胚サンプルとして提出された。2匹の生存変異体のうち、雄は、血圧解析の後すぐに死亡したが、雌は、大部分のレベル1試験を経験した。ホモ接合性変異体は、貧血を含む多くの免疫学的異常を示した。オープンフィールド試験の結果により、変異(−/−)マウスにおける活動亢進が示唆される。1匹の雄(−/−)マウスは、総組織質量および除脂肪体重の減少を示したが、雌(−/−)ノックアウトは、総組織質量、脂肪質量(g)および%総体脂肪の増加を示した。1匹のマウスは、網膜出血を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、39個の胚:7個の(−/−)胚、9個の(+/−)胚、9個の(+/+)胚、4個の再吸収モルおよび10個の不確定な胚が観察された。(−/−)胚は、概してその(+/+)同腹仔よりも小さかったが、他の発達異常は、12.5日目の胚においては検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
顕微鏡的:12.5日目に、39個の胚:7個の(−/−)胚、9個の(+/−)胚、9個の(+/+)胚、4個の再吸収モルおよび10個の不確定な胚が観察された。(−/−)胚は、概してその(+/+)同腹仔よりも小さかったが、他の発達異常は、12.5日目の胚においては検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび2匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を計測するためのオープンフィールドを含んだ。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび2匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。これらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を計測するためのオープンフィールドを含んだ。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニントランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros
et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、4つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。全移動距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニントランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros
et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、4つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。全移動距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
マウスが新しい環境に対して正常な慣れ応答を示す傾向を、5回の間隔にわたるその水平自発運動の変化すべてを測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは5回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な慣れは、負の傾きの値によって表される。
結果:
不安:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、オープンフィールド試験中の総移動距離の合計の増加を示したことから、変異体における活動亢進または不安様応答の増大が示唆される。
不安:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、オープンフィールド試験中の総移動距離の合計の増加を示したことから、変異体における活動亢進または不安様応答の増大が示唆される。
まとめると、オープンフィールド試験により、軽度から中程度の不安、全般的病状による不安および/もしくは双極性障害;活動亢進;感覚障害;強迫性障害、精神分裂病または妄想性人格に関連し得る不安の増大に関連する表現型が明らかになった。したがって、PRO1079ポリペプチドまたはそのアゴニストは、そのような神経障害の処置に有用であり得る。
(d)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
(d)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するた
めに(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
めに(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:解析に利用可能な雌(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血球体積および赤血球分布幅の増大を伴う、赤血球数、ヘモグロビン濃度およびヘマトクリットの減少を示す貧血性であった。
血液学:解析に利用可能な雌(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血球体積および赤血球分布幅の増大を伴う、赤血球数、ヘモグロビン濃度およびヘマトクリットの減少を示す貧血性であった。
これらの結果は、貧血に関連する表現型に関係する。したがって、PRO1079ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO1079ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に必須であるに違いなく、ゆえに、貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。
(2)蛍光標識細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および1匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および1匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用してサンプルを解析した。
結果:
FACS3:解析した1匹の雌(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、ナチュラルキラー細胞のパーセンテージの増加を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
FACS3:解析した1匹の雌(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、ナチュラルキラー細胞のパーセンテージの増加を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
FACS結果から、ホモ接合性変異マウスにおいてナチュラルキラー細胞の平均パーセンテージが増加したことが示される。したがって、PRO1079ポリペプチドまたはそのアゴニストは、NK細胞集団の負の制御因子として機能する。ナチュラルキラー細胞は、ウイルスの免疫および腫瘍に対する防御に関係するので、これらの細胞は、ウイルス感
染に対する防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞すなわちNK細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害におけるエフェクターとして作用し、それらは、事前の免疫または活性化の必要なしに、特定のリンパ系腫瘍細胞株をin vitroにおいて殺滅する能力によって同定されてきた。したがって、PRO1079ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害に重要であるNK細胞の産生に有用であり得る。
染に対する防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞すなわちNK細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害におけるエフェクターとして作用し、それらは、事前の免疫または活性化の必要なしに、特定のリンパ系腫瘍細胞株をin vitroにおいて殺滅する能力によって同定されてきた。したがって、PRO1079ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害に重要であるNK細胞の産生に有用であり得る。
(3)卵白アルブミン負荷
手順:このアッセイは、7匹の野生型および2匹のホモ接合体において行った。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが、同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合免疫吸着測定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠損性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
手順:このアッセイは、7匹の野生型および2匹のホモ接合体において行った。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが、同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合免疫吸着測定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠損性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
上記のように、このプロトコルでは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力が評価される。動物に50mgのニワトリ卵白アルブミン(完全フロイントアジュバント中に乳化)をIP注射し、14日後に、抗卵白アルブミン抗体(IgM、IgG1およびIgG2サブクラス)の血清力価を測定した。血清サンプル中のOVA特異的抗体の量は、96ウェルサンプルプレートをスキャンする装置によって得られる光学密度(OD)値に比例する。データは、各血清サンプルの一組の連続希釈物に対して収集した。
この負荷の結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清IgG1応答および平均血清IgG2a応答の低下(低い/全くない)を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較すると、平均血清IgG1応答および平均血清IgG2a応答の低下(低い/全くない)を示した。
要約すると、卵白アルブミン負荷試験は、PRO1079ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較すると免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異マウスは、T細胞依存性OVA抗原で攻撃すると、免疫学的応答を生じる能力の低下を示した。したがって、PRO1079ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫系の刺激(例えば、T細胞増殖など)に有用であり得、この効果が個体に有益であり得る場合(例えば、白血病および他のタイプの癌の場合などにおいて、ならびに免疫無防備状態の患者(例えば、AIDS罹患者))において有用性が見出され得る。したがって、PRO1079ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答の阻害に有用であり得、このため、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合において有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(e)心臓血管表現型解析:
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。1つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェ
ーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。
(e)心臓血管表現型解析:
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。1つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェ
ーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および1匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、Hawesおよび共同研究者ら(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)に従って改変したKowa Genesis小動物用眼底カメラを用いて覚醒時の動物において行った。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得が可能となった。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈(A/V)比を測定した。
眼科学的解析は、作製したF2の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体の変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行った。具体的には、A/V比は、Kowa COMIT+ソフトウェアを用いて眼底像に従って測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔でカラー写真を撮影する:像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比(A/V)は、静脈直径に対する動脈直径(血管の分岐部の前で測定)の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性(色素性網膜炎として知られる)または網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異型子孫において、野生型(+/+)同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、そのような病理状態を示唆し得る。
結果:
眼底:1匹の(−/−)(M−99)マウスは、動静脈比の解析を妨げる網膜出血を示した。
血管造影:1匹の(−/−)マウス(M−99)は、網膜血管漏出を示した。
眼底:1匹の(−/−)(M−99)マウスは、動静脈比の解析を妨げる網膜出血を示した。
血管造影:1匹の(−/−)マウス(M−99)は、網膜血管漏出を示した。
そのような検出された網膜の変化は、高血圧症(および、高血圧症、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または網膜変性症などの眼科学的障害に対応する他の眼球の疾患の血管系の疾患に関連し得る循環器の疾患または障害に最もよく関連するものである。したがって、PRO1079コード遺伝子のアンタゴニストは、類似の病理学的な網膜の変化に導き得る一方で、アゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症または網膜変性症およびこの状態(上で同定されたような)に関連する疾患を含む他の眼科学的(opthamological)障害の処置における治療薬として有用であり得る。
(f)骨代謝および全身診断学/放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測
定するためのマイクロCT
を含んだ。
(f)骨代謝および全身診断学/放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測
定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび1匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび1匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
Dexa:解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、総組織質量および除脂肪体重の減少を示した一方で、解析した雌(−/−)マウスは、総組織質量(TTM)、総脂肪質量および総体脂肪パーセント(1匹の(−/−)雌マウスは、34%の体脂肪を有した)の増加を示した。
Dexa:解析に利用可能な1匹の雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、総組織質量および除脂肪体重の減少を示した一方で、解析した雌(−/−)マウスは、総組織質量(TTM)、総脂肪質量および総体脂肪パーセント(1匹の(−/−)雌マウスは、34%の体脂肪を有した)の増加を示した。
Dexaにより解析した雄(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較して、総組織質量および除脂肪体重の顕著な減少ならびに骨測定値の減少を示し、このことから、これらの変異体における成長遅延が示唆される。これらの観察結果は、ノックアウトマウスにおいて示された生存能低下と一致する。このことと体重および体長の減少の観察結果とを結びつけることにより、成長遅延、悪液質または他の成長関連障害などの組織るいそう状態が示唆される。したがって、PRO1079ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長障害および/または生存能の低下の処置または予防に有用であり得る。雌(−/−)マウスが、体脂肪が著しく増加した肥満症の徴候を示したことは、興味深い。
66.16.DNA58727−1474(UNQ553)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1110ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58727−1474と命名)(UNQ553)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_016969 アクセッション:NM_016969 NID:gi8393799 ref NM_016969.1 ムス・ムスクルスミエロイド関連分化マーカー(Myadm);参照タンパク質:O35682 アクセッション:O35682 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ミエロイド関連分化マーカー(ミエロイドをアップレギュレートするタンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_138373 ホモ・サピエンスミエロイド関連分化マーカー(MYADM);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q96S97 アクセッション:Q96S97 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ミエロイド関連分化マーカー(SB135)。
これらのノックアウト実験において、PRO1110ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58727−1474と命名)(UNQ553)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_016969 アクセッション:NM_016969 NID:gi8393799 ref NM_016969.1 ムス・ムスクルスミエロイド関連分化マーカー(Myadm);参照タンパク質:O35682 アクセッション:O35682 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ミエロイド関連分化マーカー(ミエロイドをアップレギュレートするタンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_138373 ホモ・サピエンスミエロイド関連分化マーカー(MYADM);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q96S97 アクセッション:Q96S97 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ミエロイド関連分化マーカー(SB135)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトMYADMのオルソログであるMyadm(ミエロイド関連分化マーカー)である。別名としては、D7Wsu62eが挙げられる。
MYADMは、2つのMARVELドメイン内に含まれる8回膜貫通セグメントからな
るおそらく内在性原形質膜タンパク質である。MARVELドメインは、輸送ベシクル生合成に関与する脂質関連タンパク質に見られることが多い(PfamアクセッションPF01284)。MYADMは、骨髄性細胞において発現しており、おそらくミエロイド分化に関係する(Pettersson et al,J Leukoc Biol 67(3):423−31(2000);Cui et al,Mol Biol Rep 28(3):123−38(2001))。
るおそらく内在性原形質膜タンパク質である。MARVELドメインは、輸送ベシクル生合成に関与する脂質関連タンパク質に見られることが多い(PfamアクセッションPF01284)。MYADMは、骨髄性細胞において発現しており、おそらくミエロイド分化に関係する(Pettersson et al,J Leukoc Biol 67(3):423−31(2000);Cui et al,Mol Biol Rep 28(3):123−38(2001))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 11 33 16 60
予測値 15 30 15 60
カイ二乗値=4.24 有意性=0.12003164(hom/n)=0.24
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_016969.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、骨および脂肪以外の13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.16.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58727−1474(UNQ553)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトミエロイド関連分化マーカー(MYADM)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいてLPS負荷に対するTNFアルファ、MCP−1およびIL−6応答の増大をもたらした。さらに、高脂肪食を与えられた変異(−/−)マウスは、わずかに耐糖能が増大した。変異(−/−)マウスは、驚愕応答がなかったかまたは驚愕応答の低下を示し、難聴が示唆される。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
実測値 11 33 16 60
予測値 15 30 15 60
カイ二乗値=4.24 有意性=0.12003164(hom/n)=0.24
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_016969.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、骨および脂肪以外の13のすべての成体組織サンプルにおいて標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.16.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58727−1474(UNQ553)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトミエロイド関連分化マーカー(MYADM)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいてLPS負荷に対するTNFアルファ、MCP−1およびIL−6応答の増大をもたらした。さらに、高脂肪食を与えられた変異(−/−)マウスは、わずかに耐糖能が増大した。変異(−/−)マウスは、驚愕応答がなかったかまたは驚愕応答の低下を示し、難聴が示唆される。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的
な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の増大を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清中TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6応答の増大を示した。
まとめると、LPSエンドトキシン負荷により、PRO1110ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、LPSエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答(TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6産生)を誘発する能力の増大を示したことから、炎症誘発性応答が示唆される。TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6は、後期のB細胞活性化に寄与する。TNF−アルファは、重要な炎症
性メディエーターである。さらに、TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6は、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。TNF−アルファは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルに代わり得る(したがって、エフェクター分子として働く)。このことは、PRO1110ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO1110ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
性メディエーターである。さらに、TNF−アルファ、MCP−1およびIL−6は、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。TNF−アルファは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルに代わり得る(したがって、エフェクター分子として働く)。このことは、PRO1110ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO1110ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
(c)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Lifescan血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。20%溶液として送達される2g/kgのD−グルコースを動物にIP注射し、血糖値を注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
耐糖能試験:高脂肪食を与えられた雄変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、わずかな耐糖能の増強を示した。
耐糖能試験:高脂肪食を与えられた雄変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、わずかな耐糖能の増強を示した。
これらの研究において、変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、正常な空腹時グルコースの存在下で、3回すべて試験間隔において耐糖能の増大または増強を示した。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感度のわずかな増大または障害性グルコースホメオスタシスの逆の表現型パターンを示した。したがって、PRO1110ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト(インヒビター)は、障害性のグルコースホメオスタシスの処置に有用であり得る。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より小さい(プレパルス)音に先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似ランダム順に6回、合計36回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より小さい(プレパルス)音に先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似ランダム順に6回、合計36回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
ノックアウト変異(−/−)マウスは、驚愕応答が低かったか、または驚愕応答がなかったことから難聴が示唆される。
ノックアウト変異(−/−)マウスは、驚愕応答が低かったか、または驚愕応答がなかったことから難聴が示唆される。
66.17.DNA62377−1381−1(UNQ561)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1122ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62377−1381−1と命名)(UNQ561)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_145834 アクセッション:NM_145834 NID:gi22003879ref NM_145834.1 ムス・ムスクルス インターロイキン17C(Il17c);参照タンパク質:Q8K4C5 アクセッション:Q8K4C5 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。IL−17C;参照ヒト遺伝子配列:NM_013278 アクセッション:NM_013278 NID:gi 27477078 ref NM_013278.3 ホモ・サピエンス インターロイキン 17C(IL17C);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9P0M4 アクセッション:Q9P0M4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン−17C前駆体(IL−17C)(サイトカインCX2)。
これらのノックアウト実験において、PRO1122ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62377−1381−1と命名)(UNQ561)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_145834 アクセッション:NM_145834 NID:gi22003879ref NM_145834.1 ムス・ムスクルス インターロイキン17C(Il17c);参照タンパク質:Q8K4C5 アクセッション:Q8K4C5 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。IL−17C;参照ヒト遺伝子配列:NM_013278 アクセッション:NM_013278 NID:gi 27477078 ref NM_013278.3 ホモ・サピエンス インターロイキン 17C(IL17C);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9P0M4 アクセッション:Q9P0M4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン−17C前駆体(IL−17C)(サイトカインCX2)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトIL17CのオルソログであるIl17c(インターロイキン17C)である。別名としては、IL−17C、CX2、IL−21およびサイトカインCX2が挙げられる。
IL17Cは、おそらくインターロイキン−17ファミリーレセプターに対するリガンドとして機能する分泌タンパク質である。このサイトカインを発現する細胞は、同定されていない;しかしながら、IL17Cは、単球性細胞株THP−1からの腫瘍壊死因子アルファおよびIL−1βの放出を刺激する。
さらに、IL17Cは、好中球増加ならびに肺気道におけるインターフェロンガンマおよびインターロイキン−6の発現を誘導することから、免疫機能におけるIL17Cの役割が支持される(Li et al,Proc Natl Acad Sci USA 97(2):773−8(2000);Hurst et al,J Immunol 169(1):443−53(2002);Moseley et al,Cytokine Growth Factor Rev 14(2):155−74(2003)).
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビ
ノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
さらに、IL17Cは、好中球増加ならびに肺気道におけるインターフェロンガンマおよびインターロイキン−6の発現を誘導することから、免疫機能におけるIL17Cの役割が支持される(Li et al,Proc Natl Acad Sci USA 97(2):773−8(2000);Hurst et al,J Immunol 169(1):443−53(2002);Moseley et al,Cytokine Growth Factor Rev 14(2):155−74(2003)).
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビ
ノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 34 13 65
予測値 16.25 32.5 16.25 65
カイ二乗値=2.59 有意性=0.2738979(hom/n)=0.21
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145834.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肝臓;骨格筋;骨;胃、小腸および結腸;ならびに脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.17.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA62377−1381−1(UNQ561)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17C(IL17C)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいてIgM血清免疫グロブリンの平均血清レベルの上昇をもたらした。変異(−/−)マウスはまた、LPSに対するIL−6応答の増大を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
実測値 18 34 13 65
予測値 16.25 32.5 16.25 65
カイ二乗値=2.59 有意性=0.2738979(hom/n)=0.21
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145834.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肝臓;骨格筋;骨;胃、小腸および結腸;ならびに脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.17.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA62377−1381−1(UNQ561)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17C(IL17C)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいてIgM血清免疫グロブリンの平均血清レベルの上昇をもたらした。変異(−/−)マウスはまた、LPSに対するIL−6応答の増大を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫
応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的中央値と比較して平均血清IgMレベルの上昇を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的中央値と比較して平均血清IgMレベルの上昇を示した。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、IgM血清免疫グロブリンの増加を示した。IgM免疫グロブリンは、細菌のトキシンの中和に対する体液性免疫応答において最初に産生され、補体系を活性化する際に特に重要である。観察された表現型から、PRO1122ポリペプチドが、炎症性応答の負の制御因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常から、PRO1122ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が、免疫系(例えば、T細胞増殖)を刺激し得る重要な物質であり得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO1122ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をF
ACSCalibur装置で解析した。
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をF
ACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清IL−6の応答の増大を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清IL−6の応答の増大を示した。
まとめると、LPSエンドトキシン負荷により、PRO1122ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、LPSエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答(IL−6産生)を誘発する能力の増大を示したことから、炎症誘発性応答が示唆される。IL−6は、後期のB細胞活性化に寄与し、急性期反応および全身性炎症の誘導に重要な役割を果たす。このことは、PRO1122ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO1122ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
66.18.DNA58850−1495(UNQ576)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1138ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58850−1495と命名)(UNQ576)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_144539 ムス・ムスクルス SLAMファミリーメンバー7(Slamf7);参照タンパク質:Q8BHK6 アクセッション:Q8BHK6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス成雄精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:4932702H22産物:19A24タンパク質ホモログに類似(ムス・ムスクルス成雄精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:4932704K11産物:19A24タンパク質ホモログに類似)(ムス・ムスクルス成雄大動脈および静脈cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:A530014C02産物:19A24タンパク質ホモログに類似);参照ヒト遺伝子配列:NM_021181 ホモ・サピエンス SLAMファミリーメンバー7(SLAMF7);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9NY08 アクセッション:Q9NY08 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。19Aタンパク質。
これらのノックアウト実験において、PRO1138ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58850−1495と命名)(UNQ576)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_144539 ムス・ムスクルス SLAMファミリーメンバー7(Slamf7);参照タンパク質:Q8BHK6 アクセッション:Q8BHK6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス成雄精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:4932702H22産物:19A24タンパク質ホモログに類似(ムス・ムスクルス成雄精巣cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:4932704K11産物:19A24タンパク質ホモログに類似)(ムス・ムスクルス成雄大動脈および静脈cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:A530014C02産物:19A24タンパク質ホモログに類似);参照ヒト遺伝子配列:NM_021181 ホモ・サピエンス SLAMファミリーメンバー7(SLAMF7);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9NY08 アクセッション:Q9NY08 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。19Aタンパク質。
目的のマウス遺伝子は、ヒトSLAMF7のオルソログであるSlamf7(SLAMファミリーメンバー7)である。別名としては、19A、CS1、19A24、CRACC、4930560D03Rik、細胞傷害性細胞を活性化するCD2様レセプター、新規Ly9および新規LY9(リンパ球抗原9)様タンパク質が挙げられる。
SLAMF7は、同種親和性レセプターまたは細胞接着分子として機能し、ナチュラルキラー細胞、T細胞および活性化されたB細胞で主に発現するI型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、2つの細胞外免疫グロブリン様ドメイン、膜貫通セグメントおよび88アミノ酸細胞質ドメインからなる。SLAMF7は、おそらく、NK細胞の細胞溶解活性およびリンパ球接着を制御する際に役割を果たす(Kumaresan et al,Mol Immunol 39(1−2):1−8(2002);Murphy et al,Biochem J 361(Pt3):431−6(2002);Bouchon et al,J Immunol 167(10):5517−21(200
1);Tovar et al,Immunogenetics 54(6):394−402(2002))。
1);Tovar et al,Immunogenetics 54(6):394−402(2002))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 22 37 16 75
予測値 18.75 37.5 18.75 75
カイ二乗値=1.63 有意性=0.44263932(hom/n)=0.22
平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2〜6をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_144539.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13のすべての成体組織サンプル(骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.18.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58850−1495(UNQ576)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSLAMファミリーメンバー7(SLAMF7)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、LPSに対するIL−6応答の増大をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
実測値 22 37 16 75
予測値 18.75 37.5 18.75 75
カイ二乗値=1.63 有意性=0.44263932(hom/n)=0.22
平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2〜6をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_144539.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13のすべての成体組織サンプル(骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.18.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58850−1495(UNQ576)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSLAMファミリーメンバー7(SLAMF7)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、LPSに対するIL−6応答の増大をもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞
傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
急性期反応:
試験の説明:細菌のリポ多糖(LPS)は、エンドトキシンであり、急性期反応および全身性炎症の強力な誘導物質である。レベルIのLPSマウスの腹腔内に(i.p.)、200μL滅菌食塩水中の致死量未満の用量のLPSを26ゲージ針を使用して注射した。この用量は、試験マウスの平均体重に基づき、1μg/g体重とした。注射の3時間後に100μLの血液サンプルを採取し、TNFa、MCP−1およびIL−6の存在をFACSCalibur装置で解析した。
結果:
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清IL−6応答の増大を示した。
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、LPS負荷に対する平均血清IL−6応答の増大を示した。
まとめると、LPSエンドトキシン負荷により、PRO1138ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を示したことが証明された。特に、変異マウスは、LPSエンドトキシンで攻撃されたときの免疫学的応答(IL−6産生)を誘発する能力の増強を示したことから、炎症誘発性応答が示唆される。IL−6は、後期のB細胞活性化に寄与し、急性期反応および全身性炎症を誘導する際に重要な役割を果たす。このことは、PRO1138ポリペプチドに対するインヒビターまたはアンタゴニストが、免疫系を刺激し得、この作用が白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO1138ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害に有用であり得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
66.19.DNA59586−1520(UNQ604)遺伝子が破壊されたマウス
の作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1190ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59586−1520と命名)(UNQ604)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172506 ムス・ムスクルス二領域性(biregional)細胞接着分子に関連する/癌遺伝子によってダウンレギュレートされる(Cdon)結合タンパク質(Boc);参照タンパク質:Q8CE91 アクセッション:Q8CE91 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス生後10日新生仔皮膚cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:4732455C11産物:二領域性細胞接着分子に関連する/癌遺伝子によってダウンレギュレートされる(Cdon)結合タンパク質、完全長挿入配列;参照ヒト遺伝子配列:NM_033254 アクセッション:NM_033254 NID:gi15147239ref NM_033254.1 ホモ・サピエンス CDO(BOC)の同種;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9BWV1 アクセッション:Q9BWV1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDOの同種。
の作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1190ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59586−1520と命名)(UNQ604)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172506 ムス・ムスクルス二領域性(biregional)細胞接着分子に関連する/癌遺伝子によってダウンレギュレートされる(Cdon)結合タンパク質(Boc);参照タンパク質:Q8CE91 アクセッション:Q8CE91 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス生後10日新生仔皮膚cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:4732455C11産物:二領域性細胞接着分子に関連する/癌遺伝子によってダウンレギュレートされる(Cdon)結合タンパク質、完全長挿入配列;参照ヒト遺伝子配列:NM_033254 アクセッション:NM_033254 NID:gi15147239ref NM_033254.1 ホモ・サピエンス CDO(BOC)の同種;ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9BWV1 アクセッション:Q9BWV1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDOの同種。
目的のマウス遺伝子は、ヒトBOC(CDOと同類)のオルソログであるBoc(二領域性細胞接着分子に関連する/癌遺伝子によってダウンレギュレートされる(Cdon)結合タンパク質)である。別名としては、4732455C11および二領域性Cdon結合タンパク質が挙げられる。
BOCは、おそらく、細胞−細胞コミュニケーションのためのレセプターサブユニットとして機能するI型原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、cis様式で、ホモログCDON(細胞接着分子に関連する/癌遺伝子によってダウンレギュレートされる)、N−カドヘリンおよびM−カドヘリンと相互作用することにより、筋芽細胞における細胞−細胞接触の部位でレセプター複合体を形成する。胚発生の間、BOCは、筋骨格および中枢神経系ならびに増殖および分化の領域において発現する。BOCは、おそらく筋細胞の分化および形質転換において役割を果たす(Wegorzewska et al,Mol Carcinog 37(1):1−4(2003);Mulieri et al,Dev Dyn 223(3):379−88(2002);Kang et al,EMBO J 21(1−2):114−24(2002);Kang et al,Proc Natl Acad Sci USA 100(7):3989−94(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 30 20 68
予測値 17 34 17 68
カイ二乗値=1.3 有意性=0.5220458(hom/n)=0.25
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172506.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.19.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59586−1520(UNQ604)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトCDO(BOC)と同種のオルソログをコードする遺伝子の変異は、いくかの器官においてマクロファージにのみ影響を与える全身性組織球蓄積症を示す2匹のノックアウトマウスをもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
肉眼的:検査した(−/−)マウスのうちの2匹(M−138およびF−139)が、肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節の肥大を示した。
顕微鏡的:解析した(−/−)マウスのうち、2匹(F−139およびM−138)が、いくつかの器官においてマクロファージにのみ影響を及ぼす全身性組織球蓄積症を示した。肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節は、組織学的に最も影響を受けていた。マクロファージの細胞質は、著しく拡大しており、主に透明な空胞を含み、原線維材料が非常に少なかった。その透明な空胞は、組織学的スライドを作製するために必要なプロセスの間に溶解される物質を含む人工のレムナントであった。取り出された物質は、主に脂質をおそらく含んでいた。これらの病変は、脂質蓄積疾患として知られる遺伝的疾患の群に特徴的である。
実測値 18 30 20 68
予測値 17 34 17 68
カイ二乗値=1.3 有意性=0.5220458(hom/n)=0.25
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172506.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.19.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59586−1520(UNQ604)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトCDO(BOC)と同種のオルソログをコードする遺伝子の変異は、いくかの器官においてマクロファージにのみ影響を与える全身性組織球蓄積症を示す2匹のノックアウトマウスをもたらした。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
肉眼的:検査した(−/−)マウスのうちの2匹(M−138およびF−139)が、肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節の肥大を示した。
顕微鏡的:解析した(−/−)マウスのうち、2匹(F−139およびM−138)が、いくつかの器官においてマクロファージにのみ影響を及ぼす全身性組織球蓄積症を示した。肝臓、脾臓および腸間膜リンパ節は、組織学的に最も影響を受けていた。マクロファージの細胞質は、著しく拡大しており、主に透明な空胞を含み、原線維材料が非常に少なかった。その透明な空胞は、組織学的スライドを作製するために必要なプロセスの間に溶解される物質を含む人工のレムナントであった。取り出された物質は、主に脂質をおそらく含んでいた。これらの病変は、脂質蓄積疾患として知られる遺伝的疾患の群に特徴的である。
66.20.DNA64896−1539(UNQ642)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1272ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64896−1539と命名)(UNQ642)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_207531 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA E030025L21遺伝子(E030025L21Rik);参照タンパク質:Q8R3W7 アクセッション:Q8R3W7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。RIKEN cDNA E030025L21遺伝子;参照ヒト遺伝子配列:NM_176813 ホモ・サピエンス乳癌膜タンパク質11(BCMP11);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8TD06 アクセッション:Q8TD06 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。上側の勾配タンパク質3(MLHS642)(乳癌膜タンパク質11)。
これらのノックアウト実験において、PRO1272ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64896−1539と命名)(UNQ642)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_207531 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA E030025L21遺伝子(E030025L21Rik);参照タンパク質:Q8R3W7 アクセッション:Q8R3W7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。RIKEN cDNA E030025L21遺伝子;参照ヒト遺伝子配列:NM_176813 ホモ・サピエンス乳癌膜タンパク質11(BCMP11);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8TD06 アクセッション:Q8TD06 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。上側の勾配タンパク質3(MLHS642)(乳癌膜タンパク質11)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトBCMP11(乳癌膜タンパク質11)のオルソログであるRIKEN cDNA E030025L21遺伝子である。別名としては、Gm888、HAG3、hAG−3および上側の勾配タンパク質3が挙げられる。
BCMP11は、主にエストロゲンレセプター陽性乳腺癌腫上皮細胞において発現する推定分泌タンパク質である。その166アミノ酸タンパク質は、シグナルペプチドを含むが、他の識別される保存されたドメインを含まない。BCMP11は、細胞質ベシクル中に集中しているが、グリコシルホスファチジルイノシトールアンカー転移関連タンパク質C4.4Aおよび細胞外アルファジストログリカン(DAG−1)と相互作用することができる。さらに、BCMP11は、Xenopus laevis分泌タンパク質であるXAG−1およびXAG−2と相同であることから、さらに、細胞外分泌タンパク質とし
てのBCMP11の機能が支持される。BCMP11は、乳房腫瘍細胞の成長または転移に役割を果たし得る(Adam et al,J Biol Chem 278(8):6482−9(2003);Fletcher et al,Br J Cancer 88(4):579−85(2003))。
てのBCMP11の機能が支持される。BCMP11は、乳房腫瘍細胞の成長または転移に役割を果たし得る(Adam et al,J Biol Chem 278(8):6482−9(2003);Fletcher et al,Br J Cancer 88(4):579−85(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 22 23 17 62
予測値 15.5 31 15.5 62
カイ二乗値=0.79 有意性=0.67368(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン3〜7をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_207531.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち脳;脊髄;眼;肺;ならびに胃、小腸および結腸において標的遺伝子の発現を検出した。2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 22 23 17 62
予測値 15.5 31 15.5 62
カイ二乗値=0.79 有意性=0.67368(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン3〜7をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_207531.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち脳;脊髄;眼;肺;ならびに胃、小腸および結腸において標的遺伝子の発現を検出した。2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.20.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA64896−1539(UNQ642)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト乳癌膜タンパク質11(BCMP11)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較して、耐糖能障害を伴う平均血清中グルコースレベルの上昇を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。さらに、雄変異体において耐糖能障害が観察された。糖尿およびケトン尿症もまた、(−/−)マウスにおいて明らかになった。ホモ接合性変異マウスはまた、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少ならびに心拍数の減少を示した。神経解析により、障害性の運動協調性および震える行動を含む多くの異常が明らかになった。(−/−)マウスは、小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力を示した。雄(−/−)マウスはまた、精巣変性を示し、雌(−/−)マウスは、卵巣および子宮の発育不全を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:(−/−)マウスは、小脳の顆粒細胞層と分子細胞層の両方が薄くなる、顆粒細胞の広範な減少および神経膠症を特徴とする小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力を示した。特に、プルキンエ細胞およびゴルジ細胞ならびに小脳傍片葉の顆粒細胞層が、神経膠症およびニューロンの減少によって重篤な影響を受けることはほとんどなかった。雄(−/−)マウスは、小さい精巣、精巣変性および精液過少症を示した。精細管の退縮の証拠は、最小であり、精子細胞および精子の後期に限られたものであった。しかしながら、正常な精子は、精巣上体または精管にほとんど存在せず、精子の変質および凝集が頻繁に見られた。雌(−/−)マウスは、卵巣および子宮の発育不全を示し、卵巣および子宮は、若
年性を示した。乳腺は、ほんの数本の管が存在しただけであった。心臓の重量は、(−/−)マウスで増大したが、組織病理学的病変は示さなかった。変異体における膵臓のランゲルハンス島は、(+/+)コントロールよりも小さい傾向にあり、α(グルカゴン)細胞およびβ(インスリン)細胞の分布が変化していた。正常には、グルカゴン産生島細胞は、島の末梢周辺に整列しているが、変異体におけるグルカゴン細胞は、島全体に亘って均等に分布していた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)心臓学−心拍数
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト乳癌膜タンパク質11(BCMP11)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較して、耐糖能障害を伴う平均血清中グルコースレベルの上昇を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。さらに、雄変異体において耐糖能障害が観察された。糖尿およびケトン尿症もまた、(−/−)マウスにおいて明らかになった。ホモ接合性変異マウスはまた、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少ならびに心拍数の減少を示した。神経解析により、障害性の運動協調性および震える行動を含む多くの異常が明らかになった。(−/−)マウスは、小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力を示した。雄(−/−)マウスはまた、精巣変性を示し、雌(−/−)マウスは、卵巣および子宮の発育不全を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:(−/−)マウスは、小脳の顆粒細胞層と分子細胞層の両方が薄くなる、顆粒細胞の広範な減少および神経膠症を特徴とする小脳顆粒細胞層の広汎性無生活力を示した。特に、プルキンエ細胞およびゴルジ細胞ならびに小脳傍片葉の顆粒細胞層が、神経膠症およびニューロンの減少によって重篤な影響を受けることはほとんどなかった。雄(−/−)マウスは、小さい精巣、精巣変性および精液過少症を示した。精細管の退縮の証拠は、最小であり、精子細胞および精子の後期に限られたものであった。しかしながら、正常な精子は、精巣上体または精管にほとんど存在せず、精子の変質および凝集が頻繁に見られた。雌(−/−)マウスは、卵巣および子宮の発育不全を示し、卵巣および子宮は、若
年性を示した。乳腺は、ほんの数本の管が存在しただけであった。心臓の重量は、(−/−)マウスで増大したが、組織病理学的病変は示さなかった。変異体における膵臓のランゲルハンス島は、(+/+)コントロールよりも小さい傾向にあり、α(グルカゴン)細胞およびβ(インスリン)細胞の分布が変化していた。正常には、グルカゴン産生島細胞は、島の末梢周辺に整列しているが、変異体におけるグルカゴン細胞は、島全体に亘って均等に分布していた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)心臓学−心拍数
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
心拍数:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平と比較して、平均心拍数の減少を示し(雄(−/−)は、平均より2SD超低く;雌(−/−)は、平均より3SD超低い)、その差は、雌のほうが顕著であった。
(d)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
心拍数:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平と比較して、平均心拍数の減少を示し(雄(−/−)は、平均より2SD超低く;雌(−/−)は、平均より3SD超低い)、その差は、雌のほうが顕著であった。
(d)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Lifescan血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。20%溶液として送達される2g/kgのD−グルコースを動物にIP注射し、血糖値を注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
雄と雌の両方の変異(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中グルコースレベルの著しい上昇を示した。さらに、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、試験した間隔の各々において耐糖能障害を示した。(−/−)変異マウスにおいて糖尿およびケトン尿症が見られた。
血糖値/耐糖能試験:
雄と雌の両方の変異(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中グルコースレベルの著しい上昇を示した。さらに、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、試験した間隔の各々において耐糖能障害を示した。(−/−)変異マウスにおいて糖尿およびケトン尿症が見られた。
これらの研究では、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が減少を示したかまたは耐糖能障害を示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示し、それゆえ、PRO1272ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそれをコードする遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または糖尿病を含む様々な循環器疾患に関連した状態の処置に有用であり得る。
(e)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害
の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
(e)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害
の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
(1)概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
(1)概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:(−/−)マウスは、両方の明期の間の歩行活動性の低下およびホームケージ活動性試験中の明期と全体との活動性の比の減少を示した。これらの結果から、異常な概日リズムを証明し、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示唆する。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1272ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
(2)機能観察総合評価(FOB)試験
FOBは、全身感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検知および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
概日性:(−/−)マウスは、両方の明期の間の歩行活動性の低下およびホームケージ活動性試験中の明期と全体との活動性の比の減少を示した。これらの結果から、異常な概日リズムを証明し、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示唆する。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1272ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
(2)機能観察総合評価(FOB)試験
FOBは、全身感覚および運動欠陥を測定するために動物に適用される一連の状態である。全身の神経機能を評価するIrwin神経性のスクリーニングからの試験のサブセットを使用する。一般に、短期間、触覚、嗅覚および視覚の刺激を動物に適用することにより、それらが正常に検知および応答する能力を測定する。これらの簡単な試験は、約10分を要し、マウスは、試験後、ホームケージに戻される。
結果:
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、4匹が、1分間の観察時間の間に震える行動を示した。さらに、(−/−)マウスにおいて、立ち上がりは観察されなかった。
(3)反転スクリーン試験データ:
反転するスクリーンを使用して、運動力/運動協調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を180°回転させた。以下の行動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上。
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、4匹が、1分間の観察時間の間に震える行動を示した。さらに、(−/−)マウスにおいて、立ち上がりは観察されなかった。
(3)反転スクリーン試験データ:
反転するスクリーンを使用して、運動力/運動協調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を180°回転させた。以下の行動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上。
結果:
遺伝子型 落下率 % 登上率 %
+/+(n=8)0/8 0 6/8 75
−/−(n=8)1/8 13 1/8 13
WT集団は、落下が3.62、登上が60.04。
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しなかった0/8もしくは1/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性障害を示す。登上した7/8もしくは8/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性の増強を示す。
遺伝子型 落下率 % 登上率 %
+/+(n=8)0/8 0 6/8 75
−/−(n=8)1/8 13 1/8 13
WT集団は、落下が3.62、登上が60.04。
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しなかった0/8もしくは1/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性障害を示す。登上した7/8もしくは8/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性の増強を示す。
反転スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するように設定する:
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、1匹の(−/−)マウスだけがスクリーンを登上したのに対して、6/8匹の(+/+)マウスが登上した。これらの結果から、変異体の運動協調性の障害が示唆される。これらの結果は、下に示すような骨関連測定値における観察結果と一致する。
(f)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、1匹の(−/−)マウスだけがスクリーンを登上したのに対して、6/8匹の(+/+)マウスが登上した。これらの結果から、変異体の運動協調性の障害が示唆される。これらの結果は、下に示すような骨関連測定値における観察結果と一致する。
(f)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重の減少を示した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重の減少を示した。
受精能:雄(−/−)マウスは、交配および4回の交尾の60日後に子孫をもうけなかった。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウス
のコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウス
のコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
Dexa:雄(−/−)マウスは、平均総組織質量および除脂肪体重の減少を示した。雄と雌の両方の(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、全身、大腿骨および椎骨において、平均骨塩量、骨塩量指標および骨塩密度の減少を示した。
Dexa:雄(−/−)マウスは、平均総組織質量および除脂肪体重の減少を示した。雄と雌の両方の(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、全身、大腿骨および椎骨において、平均骨塩量、骨塩量指標および骨塩密度の減少を示した。
PRO1272ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、成長遅延および/または平均総質量、除脂肪体重の減少を特徴とする組織るいそう疾患と一致する表現型を示す。これらの結果は、上で報告した平均体重の減少の観察結果と一致する。さらに、変異(−/−)マウスは、骨粗鬆症を示唆する、骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。したがって、PRO1272ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連作用を模倣し得る。他方で、PRO1272ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長遅延、悪液質または他の組織るいそう疾患のようなそのような代謝障害の予防および/または処置に有用であり得、ならびに骨減少に関連する骨障害の処置に有用であり得る。
(g)成体皮膚細胞増殖:
手順:皮膚細胞を16週齢の動物(2匹の野生型マウス4匹のホモ接合性マウス)から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、p53およびKu80で証明されている。Brdu取り込みを使用して増殖を測定した。
(g)成体皮膚細胞増殖:
手順:皮膚細胞を16週齢の動物(2匹の野生型マウス4匹のホモ接合性マウス)から単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物に発達させて、その線維芽細胞増殖速度を厳密に制御されたプロトコルにおいて測定した。このアッセイが過剰増殖性表現型および低増殖性表現型を検出する能力は、p53およびKu80で証明されている。Brdu取り込みを使用して増殖を測定した。
詳細には、これらの研究において、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化された培養物中の細胞数の増加を、相対的な増殖性能力の基準として使用した。野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚バイオプシーから初代線維芽細胞を確立した。5万個の細胞の2つ組または3つ組の培養物を播種し、6日間生育させた。培養期間の終わりに、培養物中に存在する細胞の数を、電子粒子カウンターを使用して測定した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の増加を示した。
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較して、平均皮膚線維芽細胞増殖速度の増加を示した。
したがって、ホモ接合性変異マウスは、過剰増極性の表現型を示した。これらの観察結果によって示唆されるように、PRO1272ポリペプチドまたはそのアゴニストは、異常な細胞増殖を低下させるのに有用であり得る。
66.21.DNA64903−1553(UNQ655)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1286ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64903−1553と命名)(UNQ655)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC029863 アクセッション:BC029863 NID:20987635 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス,クローンMGC:36861 IMAGE:4460168;参照タンパク質:Q8K2T4 アクセッション:Q8K2T4 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質;参照ヒト遺伝子配列:AY358935 ホモ・サピエンスクローンDNA64903 DSLR655(UNQ655);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UW78タンパク質UNQ655/PRO1286前駆体。
これらのノックアウト実験において、PRO1286ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA64903−1553と命名)(UNQ655)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:BC029863 アクセッション:BC029863 NID:20987635 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス,クローンMGC:36861 IMAGE:4460168;参照タンパク質:Q8K2T4 アクセッション:Q8K2T4 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質;参照ヒト遺伝子配列:AY358935 ホモ・サピエンスクローンDNA64903 DSLR655(UNQ655);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UW78タンパク質UNQ655/PRO1286前駆体。
目的のマウス遺伝子は、ヒトUNQ655のオルソログである「タンパク質UNQ655/PRO1286前駆体」(UNQ655)をコードする。
UNQ655は、93アミノ酸からなる推定分泌タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチドを含むが、他の識別可能な保存ドメインを含まない。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 34 0 55
予測値 13.75 27.5 13.75 55
カイ二乗値=38.76 有意性=3.8315395E−9(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションBC029863.1)。
1.野生型発現パネル:パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.21.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA64903−1553(UNQ655)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトUNQ655のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性を示した。ヘテロ接合性マウスは、平均血清中IgG2aレベルの低下を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
実測値 21 34 0 55
予測値 13.75 27.5 13.75 55
カイ二乗値=38.76 有意性=3.8315395E−9(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションBC029863.1)。
1.野生型発現パネル:パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.21.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA64903−1553(UNQ655)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトUNQ655のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性を示した。ヘテロ接合性マウスは、平均血清中IgG2aレベルの低下を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、49個の胚:18個の(+/−)胚、8個の(+/+)胚、22個の再吸収モルおよび1個の不確定な胚が観察さ
れた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、49個の胚:18個の(+/−)胚、8個の(+/+)胚、22個の再吸収モルおよび1個の不確定な胚が観察さ
れた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
致死性の胚の発達異常に関連する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセスで重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定
した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示される値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
血清免疫2:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、計画実行内の(+/+)マウスのレベルおよび歴史的中央値と比較して、平均血清IgG2aレベルの低下を示した。
血清免疫2:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、計画実行内の(+/+)マウスのレベルおよび歴史的中央値と比較して、平均血清IgG2aレベルの低下を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイは、その性別一致同腹仔(+/+)コントロールと比較して、ヘテロ接合性(+/−)マウスにおけるIgG2aのレベルの低下または減少を示した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ヘテロ接合性成体が、血清IgG2aレベルの低下を示したことが明らかになった。したがって、ヘテロ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して異常に低い血清免疫グロブリンを示した。したがって、PRO1286ポリペプチドをコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはガンマグロブリン)を生成するのに必須である。別で、IgG2a免疫グロブリンは、中和作用を有し、それほどではないにせよ、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常から、PRO1286ポリペプチドまたはそのアゴニストが、免疫系の刺激に有用であり得、白血病および他のタイプの癌の場合の個体ならびにAIDS罹患者などの免疫無防備状態の患者にとって有益であり得る場合に有用性が見出され得ることが示唆される。したがって、PRO1286ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答を阻害し得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主病の場合における有害な免疫応答を抑制するための有用な候補であり得る。
66.22.DNA59218−1559(UNQ664)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1295ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59218−1559と命名)(UNQ664)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:XM_485054 PREDICTED:ムス・ムスクルス先天性赤血球異形成貧血、I型(ヒト)(Cdan1);参照タンパク質:XP_485054先天性赤血球異形成貧血,I型[ムス・ムスクルス];参照ヒト遺伝子配列:NM_138477 ホモ・サピエンス先天性赤血球異形成貧血,I型(CDAN1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8IWY9 アクセッション:Q8IWY9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。Codanin1(UNQ664/PRO1295)。
66.22.DNA59218−1559(UNQ664)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1295ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59218−1559と命名)(UNQ664)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:XM_485054 PREDICTED:ムス・ムスクルス先天性赤血球異形成貧血、I型(ヒト)(Cdan1);参照タンパク質:XP_485054先天性赤血球異形成貧血,I型[ムス・ムスクルス];参照ヒト遺伝子配列:NM_138477 ホモ・サピエンス先天性赤血球異形成貧血,I型(CDAN1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8IWY9 アクセッション:Q8IWY9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。Codanin1(UNQ664/PRO1295)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトCDAN1のオルソログであるCdan1(先天性赤血球異形成貧血、I型[ヒト])である。別名としては、CDA1、CDAI、CDA−I、1500015A01Rik、codaninおよびcodanin1が挙げられる。
CDAN1は、核膜と微小管とを連結する構造タンパク質としておそらく機能する、細胞質に位置し、遍在性に発現するタンパク質である。CDAN1は、核膜の完全性の保存に関与し得る。CDAN1の変異により、後期赤血球前駆体の形成異常の変化に関連する遺伝性赤血球障害のまれな群である先天性赤血球異形成貧血を引き起こし得る(Dgany et al,Am J Hum Genet 71(6):1467−74(2002);Pielage et al,Dev Cell 5(6):841−51(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 32 0 53
予測値 13.25 26.5 13.25 53
カイ二乗値=47.76 有意性=4.256456E−11(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン3〜8をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_485054.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.22.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59218−1559(UNQ664)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト先天性赤血球異形成貧血、I型(ヒト)(CDAN1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。致死性は、おそらく赤血球形成の欠陥に起因する。UNQ675は、他の組織と比較してCNSにおいて高度に発現する。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
実測値 21 32 0 53
予測値 13.25 26.5 13.25 53
カイ二乗値=47.76 有意性=4.256456E−11(hom/n)=0.0
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン3〜8をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_485054.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨および脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.22.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59218−1559(UNQ664)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト先天性赤血球異形成貧血、I型(ヒト)(CDAN1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の致死性をもたらした。致死性は、おそらく赤血球形成の欠陥に起因する。UNQ675は、他の組織と比較してCNSにおいて高度に発現する。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、51個の胚:23個の(+/−)胚、15個の(+/+)胚、9個の再吸収および4個の未定胚が観察された。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
顕微鏡的:胚性致死により試験されなかった。12.5日目に、51個の胚:23個の(+/−)胚、15個の(+/+)胚、9個の再吸収および4個の未定胚が観察された。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
致死性の胚の発達異常に関連する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセス
で重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
66.23.DNA59588−1571(UNQ675)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1309ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59588−1571と命名)(UNQ675)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_028880 ムス・ムスクルスロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1(Lrrtm1);参照タンパク質:Q8K377 アクセッション:Q8K377 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。Lrrtm1タンパク質(ムス・ムスクルス生後0日の新生仔眼球cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:E130010O21産物:仮説RNI様構造含有タンパク質、完全長挿入配列)(ムス・ムスクルス生後0日の新生仔眼球cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:E130012A05産物:仮説RNI様構造含有タンパク質、完全長挿入配列)(ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_178839 ホモ・サピエンスロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1(LRRTM1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q86UE6 アクセッション:Q86UE6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。LRRTM1 タンパク質(DFLL675)。
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発生上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が挙げられるが、これらに限定されない)によって生じるか、または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達プロセス
で重要な役割を果たす場合に生じる。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合性(+/−)変異動物は、これらがノックアウトされた遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりを明らかにする表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示したが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
66.23.DNA59588−1571(UNQ675)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1309ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59588−1571と命名)(UNQ675)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_028880 ムス・ムスクルスロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1(Lrrtm1);参照タンパク質:Q8K377 アクセッション:Q8K377 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。Lrrtm1タンパク質(ムス・ムスクルス生後0日の新生仔眼球cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:E130010O21産物:仮説RNI様構造含有タンパク質、完全長挿入配列)(ムス・ムスクルス生後0日の新生仔眼球cDNA,RIKENの完全長を多く含むライブラリー,クローン:E130012A05産物:仮説RNI様構造含有タンパク質、完全長挿入配列)(ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_178839 ホモ・サピエンスロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1(LRRTM1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q86UE6 アクセッション:Q86UE6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。LRRTM1 タンパク質(DFLL675)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトLRRTM1のオルソログであるLrrtm1(ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1)である。別名としては、4632401D06Rik、ロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1、DFLL675およびFLJ32082が挙げられる。
LRRTM1は、おそらく細胞接着分子またはレセプターとして機能する主に神経系に発現している推定内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチリピートおよび膜貫通セグメントからなる。LRRTM1は、神経系の発生および維持において役割を果たし得る(Lauren et al,Genomics 81(4):411−21(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 46 15 82
予測値 20.5 41 20.5 82
カイ二乗値=0.71 有意性=0.7011734(hom/n)=0.23
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028880.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち脳、脊髄、眼および脂肪においてのみ標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.23.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59588−1571(UNQ675)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1(LRRTM1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)および(+/−)マウスにおいて体脂肪の増加をもたらした。さらに、変異(−/−)マウスは、概日リズム試験中の歩行回数の中央値の減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
実測値 21 46 15 82
予測値 20.5 41 20.5 82
カイ二乗値=0.71 有意性=0.7011734(hom/n)=0.23
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028880.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち脳、脊髄、眼および脂肪においてのみ標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.23.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59588−1571(UNQ675)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチリピート膜貫通ニューロン1(LRRTM1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)および(+/−)マウスにおいて体脂肪の増加をもたらした。さらに、変異(−/−)マウスは、概日リズム試験中の歩行回数の中央値の減少を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、ホームケージ活動性試験中の両方の暗期の間の歩行回数の中央値の減少を示した。
概日性:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、ホームケージ活動性試験中の両方の暗期の間の歩行回数の中央値の減少を示した。
これらの結果は、異常な概日リズムを証明し、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を証明した。したがって、PRO1309ポリペプチドおよびそのアゴニストは
、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
(c)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
Dexa:雄と雌の両方の(+/−)および(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総体脂肪パーセントおよび総脂肪質量の増加を示し、その差は、大腿骨においてより顕著であった。雌(−/−)マウスは、平均総組織質量の顕著な増加も示した。
Dexa:雄と雌の両方の(+/−)および(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総体脂肪パーセントおよび総脂肪質量の増加を示し、その差は、大腿骨においてより顕著であった。雌(−/−)マウスは、平均総組織質量の顕著な増加も示した。
これらの研究から、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、肥満症に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO1309ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝プロセスに必須であり、特に肥満症の予防および/または処置に重要であり得る。
66.24.DNA60608−1577(UNQ682)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1316ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60608−1577と命名)(UNQ682)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_020265 ムス・ムスクルス dickkopfホモログ2(Xenopus laevis)(Dkk2);参照タンパク質:Q9QYZ8 Dickkopf関連タンパク質−2前駆体(Dkk−2)(Dickkopf−2)(mDkk−2)gi|6272205|emb|CAB60110.1|dickkopf−2[ムス・ムスクルス];参照ヒト遺伝子配列:NM_014421 ホモ・サピエンス dickkopfホモログ2(Xenopus laevis)(DKK2);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UBU2 アクセッション:Q9UBU2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。Dickkopf関連タンパク質−2前駆体(Dkk−2)(Dickkopf−2)(hDkk−2)。
これらのノックアウト実験において、PRO1316ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA60608−1577と命名)(UNQ682)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_020265 ムス・ムスクルス dickkopfホモログ2(Xenopus laevis)(Dkk2);参照タンパク質:Q9QYZ8 Dickkopf関連タンパク質−2前駆体(Dkk−2)(Dickkopf−2)(mDkk−2)gi|6272205|emb|CAB60110.1|dickkopf−2[ムス・ムスクルス];参照ヒト遺伝子配列:NM_014421 ホモ・サピエンス dickkopfホモログ2(Xenopus laevis)(DKK2);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9UBU2 アクセッション:Q9UBU2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。Dickkopf関連タンパク質−2前駆体(Dkk−2)(Dickkopf−2)(hDkk−2)。
目的のマウス遺伝子は、ヒトDKK2のオルソログであるDkk2(dickkopfホモログ2[Xenopus laevis])である。別名としては、DKK−2、dickkopf2、dickkopf−2についてのmRNA(dkk−2遺伝子)、dickkopfホモログ1(Xenopus laevis)、Dickkopf遺伝子2およびdickkopf(Xenopus laevis)ホモログ2が挙げられる。
DKK2は、規範的なWnt/β−カテニンシグナル伝達経路のコレセプターに対するリガンドとして機能する分泌タンパク質である。コレセプターKREMEN2(クリングル含有膜貫通タンパク質2)が存在しない場合、DKK2は、コレセプターLRP6(低密度リポタンパク質レセプター関連タンパク質6)と結合することによってWntシグナル伝達を活性化する。しかしながら、KREMEN2が存在する場合は、DKK2は、KREMEN2と結合することによってWntシグナル伝達を阻害する(Mao and Niehrs,Gene 302(1−2):179−83(2003);Brott and Sokol,Mol Cell Biol 22(17):6100−10(2002);Li et al,J Biol Chem 277(8):5977−81(2002);Krupnik et al,Gene 238(2):301−13(1999))。DKK2は、発生に関与する(Monaghan et al,Mech
Dev 87(1−2):45−56(1999);Ang et al,Gene Expr Patterns 4(3):289−95(2004))。
Dev 87(1−2):45−56(1999);Ang et al,Gene Expr Patterns 4(3):289−95(2004))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 43 19 80
予測値 20 40 20 80
カイ二乗値=3.62 有意性=0.16365415(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_020265.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(脊髄、胸腺および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 43 19 80
予測値 20 40 20 80
カイ二乗値=3.62 有意性=0.16365415(hom/n)=0.26
平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_020265.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(脊髄、胸腺および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.24.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA60608−1577(UNQ682)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトdickkopfホモログ2(Xenopus laevis)(DKK2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、未発達の眼瞼およびハーダー腺の発育不全を伴う角膜の上皮化を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。これにより、変異体における視
力の障害がもたらされる。(−/−)マウスのうちの8匹すべてが、眼瞼閉塞を示す6匹の(−/−)マウスを含む眼の異常を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトdickkopfホモログ2(Xenopus laevis)(DKK2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、未発達の眼瞼およびハーダー腺の発育不全を伴う角膜の上皮化を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。これにより、変異体における視
力の障害がもたらされる。(−/−)マウスのうちの8匹すべてが、眼瞼閉塞を示す6匹の(−/−)マウスを含む眼の異常を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)病理学
肉眼的:8匹すべての(−/−)マウスが、変異体の視覚を妨げる角膜支質および瘢痕の肥厚を特徴とする重篤な角膜の上皮化を示した。(−/−)マウスの眼瞼はまた、未発達で、眼瞼を不完全にしか閉じることができなかった。数匹は、正常な眼よりも小さいようであった。両眼瞼が、著しい形成不全であり、ハーダー腺は、(−/−)マウスの肉眼的検査では目視できなかった。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、変異体において視覚の障害を生じる、未発達の眼瞼およびハーダー腺の発育不全を伴う角膜の上皮化を示した。(−/−)マウスは、コラーゲン性(collageneous)の支質のびまん性線維症ならびに多巣性慢性で活性な角膜炎および潰瘍形成を伴う表面上皮を角質化する角質増殖を特徴とする角膜および強膜の広範な形成異常を示した。多巣的に、角膜および強膜において皮脂腺および毛包が見られた。これらの変化は、雌よりも雄変異体のほうが重篤であった。(−/−)マウスはまた、ハーダー腺の発育不全を示した。眼窩内の涙腺は、いくつかの切片において存在したが、ハーダー腺は、一様に存在せず、眼瞼は、すべての変異マウスにおいて形成不全であった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
肉眼的:8匹すべての(−/−)マウスが、変異体の視覚を妨げる角膜支質および瘢痕の肥厚を特徴とする重篤な角膜の上皮化を示した。(−/−)マウスの眼瞼はまた、未発達で、眼瞼を不完全にしか閉じることができなかった。数匹は、正常な眼よりも小さいようであった。両眼瞼が、著しい形成不全であり、ハーダー腺は、(−/−)マウスの肉眼的検査では目視できなかった。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、変異体において視覚の障害を生じる、未発達の眼瞼およびハーダー腺の発育不全を伴う角膜の上皮化を示した。(−/−)マウスは、コラーゲン性(collageneous)の支質のびまん性線維症ならびに多巣性慢性で活性な角膜炎および潰瘍形成を伴う表面上皮を角質化する角質増殖を特徴とする角膜および強膜の広範な形成異常を示した。多巣的に、角膜および強膜において皮脂腺および毛包が見られた。これらの変化は、雌よりも雄変異体のほうが重篤であった。(−/−)マウスはまた、ハーダー腺の発育不全を示した。眼窩内の涙腺は、いくつかの切片において存在したが、ハーダー腺は、一様に存在せず、眼瞼は、すべての変異マウスにおいて形成不全であった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)心臓血管表現型解析:
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。1つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。1つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、Hawesおよび共同研究者ら(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)に従って改変したKowa Genesis小動物用眼底カメラを用いて覚醒時の動物において行った。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得が可能となった。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の
変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈(A/V)比を測定した。
変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈(A/V)比を測定した。
眼科学的解析は、作製したF2の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体の変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行った。具体的には、A/V比は、Kowa COMIT+ソフトウェアを用いて眼底像に従って測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔でカラー写真を撮影する:像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比(A/V)は、静脈直径に対する動脈直径(血管の分岐部の前で測定)の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性(色素性網膜炎として知られる)または網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異型子孫において、野生型(+/+)同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、そのような病理状態を示唆し得る。
結果:
眼底:8匹すべての(−/−)マウスが、変異体の視覚を妨げる角膜支質および瘢痕の肥厚を特徴とする重篤な角膜の上皮化を示した。(−/−)マウスの眼瞼は、未発達であったことから、眼瞼が不完全にしか閉じることができない。したがって、変異体において動静脈比を測定することができなかった。
血管造影:(−/−)マウスのうちの1匹のみが解析に成功した。注目すべき前眼房は観察されなかった。
眼底:8匹すべての(−/−)マウスが、変異体の視覚を妨げる角膜支質および瘢痕の肥厚を特徴とする重篤な角膜の上皮化を示した。(−/−)マウスの眼瞼は、未発達であったことから、眼瞼が不完全にしか閉じることができない。したがって、変異体において動静脈比を測定することができなかった。
血管造影:(−/−)マウスのうちの1匹のみが解析に成功した。注目すべき前眼房は観察されなかった。
66.25.DNA58743−1609(UNQ719)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1383ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58743−1609と命名)(UNQ719)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_177735 ムス・ムスクルス仮説タンパク質C130036G08(C130036G08);参照タンパク質:Q6NXM3 アクセッション:Q6NXM3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質C130036G08;参照ヒト遺伝子配列:NM_152913 アクセッション:NM_152913 NID:gi23097273 ref NM_152913.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp761L1417(DKFZp761L1417);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8N0W9 アクセッション:Q8N0W9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。QNR−71タンパク質に類似(仮説タンパク質)。
これらのノックアウト実験において、PRO1383ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58743−1609と命名)(UNQ719)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_177735 ムス・ムスクルス仮説タンパク質C130036G08(C130036G08);参照タンパク質:Q6NXM3 アクセッション:Q6NXM3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質C130036G08;参照ヒト遺伝子配列:NM_152913 アクセッション:NM_152913 NID:gi23097273 ref NM_152913.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp761L1417(DKFZp761L1417);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8N0W9 アクセッション:Q8N0W9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。QNR−71タンパク質に類似(仮説タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、ヒト「仮説タンパク質DKFZp761L1417」のオルソログである「仮説タンパク質C130036G08」である。別名としては、C130036G08およびDKFZp761L1417が挙げられる。
仮説タンパク質DKFZp761L1417は、シグナルペプチド、PKD(多発性嚢胞腎1[PKD1]および他のタンパク質におけるリピート)ドメイン(SMARTアクセッションSM00089)および膜貫通セグメントを含む推定I型内在性原形質膜タンパク質である。PKDドメインは、おそらく、タンパク質−タンパク質またはタンパク質−炭水化物相互作用に関与することから、仮説タンパク質DKFZp761L1417が細胞接着分子またはシグナル伝達レセプターとして機能することが示唆される。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビ
ノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
ノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 15 44 19 78
予測値 19.5 39 19.5 78
カイ二乗値=1.42 有意性=0.4916442(hom/n)=0.27
平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン3〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_177735.3)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肝臓、骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 15 44 19 78
予測値 19.5 39 19.5 78
カイ二乗値=1.42 有意性=0.4916442(hom/n)=0.27
平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン3〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_177735.3)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肝臓、骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.25.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58743−1609(UNQ719)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト「仮説タンパク質DKFZp761L1417」のオルソログをコードする遺伝子の変異は、野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、オープンフィールド試験中に自発運動活性の低下または穏やかな機能低下を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。UNQ719は、他の組織と比較して、CNSにおいて高発現を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト「仮説タンパク質DKFZp761L1417」のオルソログをコードする遺伝子の変異は、野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、オープンフィールド試験中に自発運動活性の低下または穏やかな機能低下を示すホモ接合性変異マウスをもたらした。UNQ719は、他の組織と比較して、CNSにおいて高発現を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。こ
れらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んだ。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。こ
れらの試験は、不安、活動性レベルおよび探索を測定するオープンフィールドを含んだ。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン(seratonin)トランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、4つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。全移動距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験において表現型を示した。これらとしては、セロトニン(seratonin)トランスポーター、ドーパミントランスポーター(Giros et al.,Nature.1996 Feb 15;379(6566):606−12)およびGABAレセプター(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトを含む。自動化されたオープンフィールドアッセイをカスタマイズして、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンを扱った。まず、フィールド(40×40cm)をマウスに対して比較的大きくなるように選択することによって探索に関連する自発運動の変化を取り上げるように設計した。さらに、4つの穴を床に設け、探索に特に関連する活動である鼻の突っ込みを可能にした。この試験に関連した感情状態を高めるためにいくつかの因子を設けた。オープンフィールド試験は、マウスが試験される最初の実験的手順であり、なされる測定は被験体のチャンバーとの最初の経験であった。さらに、オープンフィールドは明るく照らした。これらの因子のすべてによって、新しい開放性空間に関連する天然の不安が高められる。次いで、探索活動のパターンおよび程度ならびに特に中心からの全移動距離比は、不安または抑鬱症に対する罹りやすさに関する変化を識別することができる。3つの異なったレベルでの赤外線ビームを用いた大きな活動領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動性モニターシステム)を用いて、直立、穴への突っ込みおよび自発運動を記録した。動物を中心に置き、その活動を20分間測定した。この試験のデータを4分間隔で5回分析した。全移動距離(cm)、垂直移動回数(直立)、穴突っ込み回数および中心からの全移動距離比を記録した。
マウスが新しい環境に対して正常な慣れ応答を示す傾向を、5回の間隔にわたるその水平自発運動の変化すべてを測定することにより評価する。経時的な活動性の変化のこの算定傾きは、絶対値ではなく正規化された全移動距離を使用して決定する。傾きは5回の間隔のそれぞれにおける正規化された活動を通しての回帰直線から決定する。正常な慣れは、負の傾きの値によって表される。
結果:
注目すべき差が、オープンフィールド活動性試験中に観察された。(−/−)マウスは、総移動距離の合計の中央値の減少を示した。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1383ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
注目すべき差が、オープンフィールド活動性試験中に観察された。(−/−)マウスは、総移動距離の合計の中央値の減少を示した。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1383ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
66.26.DNA71159−1617(UNQ721)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1384ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA71159−1617と命名)(UNQ721)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_019985 ムス・ムスクルス C型レクチン様レセプター2(Clec2);参照タンパク質:Q9JL99 アクセッション:Q9JL99 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。C型レクチン様レセプター2;参照ヒト遺伝子配列:NM_016509 アクセッション:NM_016509 NID:7706060 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス C型レクチン様レセプター−2(LOC51266);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9P126 アクセッション:Q9P126 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。C型レクチン様レセプタ
ー−2。目的のマウス遺伝子は、ヒトCLEC2のオルソログであるClec2(C型レクチン様レセプター2)である。別名としては、Clec−2、mCLEC−2、1810061I13Rik、PRO1384およびQDED721が挙げられる。
これらのノックアウト実験において、PRO1384ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA71159−1617と命名)(UNQ721)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_019985 ムス・ムスクルス C型レクチン様レセプター2(Clec2);参照タンパク質:Q9JL99 アクセッション:Q9JL99 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。C型レクチン様レセプター2;参照ヒト遺伝子配列:NM_016509 アクセッション:NM_016509 NID:7706060 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス C型レクチン様レセプター−2(LOC51266);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9P126 アクセッション:Q9P126 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。C型レクチン様レセプタ
ー−2。目的のマウス遺伝子は、ヒトCLEC2のオルソログであるClec2(C型レクチン様レセプター2)である。別名としては、Clec−2、mCLEC−2、1810061I13Rik、PRO1384およびQDED721が挙げられる。
CLEC2は、レセプターとしておそらく機能するII型内在性原形質膜タンパク質である。CLEC2は、シグナルアンカーおよび炭水化物残基と結合するC型レクチンドメインからなる。CLEC2は、肝臓およびミエロイドならびにナチュラルキラー細胞において発現する。CLEC2は、シグナル伝達および免疫において役割を果たし得る(Colonna et al,Eur J Immunol 30(2):697−704(2000);Sobanov et al,Eur J Immunol 31(12):3493−503(2001))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 43 3 62
予測値 15.5 31 15.5 62
カイ二乗値=10.34 有意性=0.0056845685(hom/n)=0.12平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_019985.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13のすべての成体組織サンプル(骨格筋;骨;胃、小腸および結腸;心臓;ならびに脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 43 3 62
予測値 15.5 31 15.5 62
カイ二乗値=10.34 有意性=0.0056845685(hom/n)=0.12平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_019985.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、13のすべての成体組織サンプル(骨格筋;骨;胃、小腸および結腸;心臓;ならびに脂肪以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.26.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA71159−1617(UNQ721)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトC型レクチン様レセプター2(CLEC2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の大きな生存能低下をもたらした。遺伝的データは、この変異が、ホモ接合性変異体の大きな生存能低下をもたらしたことを示唆する。顕微鏡解析により、ホモ接合性胚の間脳および内耳神経節における軽度から中程度の鬱血および出血を含む多くの脳の欠陥が明らかになった。2匹の生存雌ホモ接合性変異マウスは、貧血の徴候ならびに血清コレステロール、心拍数および血圧の低下を示した。その変異体はまた、末梢血中のCD4細胞の平均パーセンテージの増加を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトC型レクチン様レセプター2(CLEC2)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)変異体の大きな生存能低下をもたらした。遺伝的データは、この変異が、ホモ接合性変異体の大きな生存能低下をもたらしたことを示唆する。顕微鏡解析により、ホモ接合性胚の間脳および内耳神経節における軽度から中程度の鬱血および出血を含む多くの脳の欠陥が明らかになった。2匹の生存雌ホモ接合性変異マウスは、貧血の徴候ならびに血清コレステロール、心拍数および血圧の低下を示した。その変異体はまた、末梢血中のCD4細胞の平均パーセンテージの増加を示した。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
全般的な観察結果:(−/−)マウスの生存能低下が観察された。(−/−)マウスの2
匹以外のすべてのマウスは、遺伝子型同定の時点で死亡していた。したがって、高い胚性致死および出生前致死が観察された。
顕微鏡的:12.5日目に、45個の胚:11個の(−/−)胚、18個の(+/−)胚、11個の(+/+)胚、3個の再吸収モルおよび2個の不確定な胚が観察された。
解析に利用可能な(−/−)胚は、脳(間脳)および内耳神経節の軽度から中程度の鬱血および出血を示した。多巣的な鬱血および出血が、検査した4匹すべての(−/−)胚の間脳において検出され、12.5日目の(−/−)胚の2/4匹の内耳神経節の片側において検出された。さらに、多数の拡張した毛細血管が、発生中の脳の患部において観察された。さらに、循環血液細胞が、胚全体に亘って、特に胎児肝臓において見られた。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
全般的な観察結果:(−/−)マウスの生存能低下が観察された。(−/−)マウスの2
匹以外のすべてのマウスは、遺伝子型同定の時点で死亡していた。したがって、高い胚性致死および出生前致死が観察された。
顕微鏡的:12.5日目に、45個の胚:11個の(−/−)胚、18個の(+/−)胚、11個の(+/+)胚、3個の再吸収モルおよび2個の不確定な胚が観察された。
解析に利用可能な(−/−)胚は、脳(間脳)および内耳神経節の軽度から中程度の鬱血および出血を示した。多巣的な鬱血および出血が、検査した4匹すべての(−/−)胚の間脳において検出され、12.5日目の(−/−)胚の2/4匹の内耳神経節の片側において検出された。さらに、多数の拡張した毛細血管が、発生中の脳の患部において観察された。さらに、循環血液細胞が、胚全体に亘って、特に胎児肝臓において見られた。遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)心臓学−血圧/心拍数
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
血圧:2匹の生存(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下を示した。
心拍数:2匹の生存(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均心拍数の減少(歴史的平均より約1〜2SD低い)を示した。
血圧:2匹の生存(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下を示した。
心拍数:2匹の生存(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均心拍数の減少(歴史的平均より約1〜2SD低い)を示した。
(d)表現型解析:心臓学
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠動脈疾患、異常脂肪血症(例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの増加(高トリグリセリド血症))、糖尿病および/または肥満症の処置のための標的を本明細書中で同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
心臓血管生物学の分野において、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、様々な冠動脈疾患、異常脂肪血症(例えば、高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの増加(高トリグリセリド血症))、糖尿病および/または肥満症の処置のための標的を本明細書中で同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび2匹のホモ接合性マウスのコホートを、このアッセイで試験した。高いコレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの上昇は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび2匹のホモ接合性マウスのコホートを、このアッセイで試験した。高いコレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの上昇は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを制御する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:2匹の生存雌(−/−)マウス(F−104およびF−133)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルの低下を示した。
血液化学:2匹の生存雌(−/−)マウス(F−104およびF−133)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルの低下を示した。
上でまとめられたように、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中コレステロールレベルの著しい低下を示した。したがって、PRO1384遺伝子が欠損した変異マウスは、不完全な膜の形成および/または融合に導き得る低コレステロール血症(hypocholestremia)を起こした。
(e)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:2匹の生存(−/−)マウス(F−104およびF−133)が、その(+/+
)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、平均赤血球数、ヘモグロビン濃度およびヘマトクリットレベルの低下を示した。
血液学:2匹の生存(−/−)マウス(F−104およびF−133)が、その(+/+
)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、平均赤血球数、ヘモグロビン濃度およびヘマトクリットレベルの低下を示した。
これらの結果は、貧血に関連する表現型に関係する。したがって、PRO1384ポリペプチド、そのアゴニストまたはPRO1384ポリペプチドをコードする遺伝子は、正常な赤血球産生に必須であるに違いなく、ゆえに、貧血または低ヘマトクリットに関連する血液障害の処置に有用であり得る。
(2)蛍光標識細胞分取(FACS)解析
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および2匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
手順:
CD4、CD8およびT細胞レセプターを含む、末梢血由来の免疫細胞組成物のFACS解析を実施して、Tリンパ球、Bリンパ球に対するCD19、白血球マーカーとしてのCD45およびナチュラルキラー細胞に対するpan NKを評価した。FACS解析は、2匹の野生型および2匹のホモ接合性マウスにおいて実施し、胸腺、脾臓、骨髄およびリンパ節由来の細胞を含んだ。
これらの研究において、解析される細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄およびリンパ節から単離した。単核細胞集団内のCD4およびCD8陽性のT細胞、B細胞、NK細胞および単球の相対的比率を決定するようにフローサイトメトリーを設定した。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−レーザーFACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この装置は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞および単球の数を記録する。6つの系統特異的抗体のパネル:CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PEおよびCD19 FITCを用いて、各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルを染色することによって単核細胞プロファイルを得た。2種類のFITC標識抗体およびPE標識抗体は、相互に排他的な細胞タイプを染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用してサンプルを解析した。
結果:
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、CD4細胞の平均パーセンテージの増加を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、CD4細胞の平均パーセンテージの増加を特徴とする末梢血中の白血球サブセットの分布の変化を示した。
したがって、PRO1384ポリペプチドをコードする遺伝子をノックアウトすることにより、T細胞集団の増加が引き起こされる。これらの観察結果から、PRO1384ポリペプチドまたはPRO1384をコードする遺伝子は、T細胞増殖の負の制御因子として作用するようだ。したがって、PRO1384ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、この表現型を模倣し得、T細胞増殖を増強する際に有益であり得る。
66.27.DNA73401−1633(UNQ737)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1431ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA73401−1633と命名)(UNQ737)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_175684 ムス・ムスクルス FCHおよび二重SH3ドメイン1(Fchsd1);参照タンパク質:Q6PFY1 アクセッション:Q6PFY1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。FCHおよび二重SH3ドメイン1;参照ヒト遺伝子配列:NM_033449 ホモ・サピエンス FCHおよび二重
SH3ドメイン1(FCHSD1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q86WN1 アクセッション:Q86WN1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。FLJ00007様タンパク質。
これらのノックアウト実験において、PRO1431ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA73401−1633と命名)(UNQ737)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_175684 ムス・ムスクルス FCHおよび二重SH3ドメイン1(Fchsd1);参照タンパク質:Q6PFY1 アクセッション:Q6PFY1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。FCHおよび二重SH3ドメイン1;参照ヒト遺伝子配列:NM_033449 ホモ・サピエンス FCHおよび二重
SH3ドメイン1(FCHSD1);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q86WN1 アクセッション:Q86WN1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。FLJ00007様タンパク質。
目的のマウス遺伝子は、ヒトFCHSD1のオルソログであるFchsd1(FCHおよび二重のSH3ドメイン1)である。別名としては、A030002D08RikおよびFLJ00007が挙げられる。
FCHSD1は、Fes/CIP4(Fesチロシンキナーゼ/Cdc42相互作用タンパク質)相同性ドメイン、2つのSH3(src相同性3)ドメインおよびプロリンリッチC末端からなる推定細胞質タンパク質である(Katoh and Katoh,Int J Mol Med 13(5):749−54(2004))。FES−CIP4相同性ドメインは、チューブリンと結合する(Takahashi et al,J Biol Chem 278(49):49129−33(2003);Laurent
et al,Mol Cell Biol 24(21):9351−8(2004))。SH3ドメインは、おそらく、プロセス(例えば、局所的なタンパク質濃度を増大させること、タンパク質の細胞内局在を決定することおよび大型の多タンパク質複合体の構築を媒介すること)を媒介する(InterProアクセッションIPR001452)。したがって、FCHSD1は、細胞骨格再構成に関与するプロセスに対するドッキングタンパク質として機能し得る。
et al,Mol Cell Biol 24(21):9351−8(2004))。SH3ドメインは、おそらく、プロセス(例えば、局所的なタンパク質濃度を増大させること、タンパク質の細胞内局在を決定することおよび大型の多タンパク質複合体の構築を媒介すること)を媒介する(InterProアクセッションIPR001452)。したがって、FCHSD1は、細胞骨格再構成に関与するプロセスに対するドッキングタンパク質として機能し得る。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 38 19 78
予測値 19.5 39 19.5 78
カイ二乗値=0.9 有意性=0.63762814(hom/n)=0.22
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜7をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_175684.3)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 21 38 19 78
予測値 19.5 39 19.5 78
カイ二乗値=0.9 有意性=0.63762814(hom/n)=0.22
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜7をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_175684.3)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.27.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA73401−1633(UNQ737)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトFCHおよび二重のSH3ドメイン1(FCHSD1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、平均血清中グルコースレベルの上昇を示す変異(−/−)マウスをもたらした。雄ノックアウト(−/−)マウスはまた、脂肪パーセンテージの上昇および脂肪
質量(g)の増加を示し、ならびに雌(−/−)マウスは、大腿骨の骨塩密度および全身の骨塩密度の減少を示した。さらに、雄(−/−)マウスは、平均収縮期血圧の低下を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトFCHおよび二重のSH3ドメイン1(FCHSD1)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、平均血清中グルコースレベルの上昇を示す変異(−/−)マウスをもたらした。雄ノックアウト(−/−)マウスはまた、脂肪パーセンテージの上昇および脂肪
質量(g)の増加を示し、ならびに雌(−/−)マウスは、大腿骨の骨塩密度および全身の骨塩密度の減少を示した。さらに、雄(−/−)マウスは、平均収縮期血圧の低下を示した。遺伝子破壊をサザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。
結果:
血液化学:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中グルコースレベルの著しい上昇を示した。しかしながら、耐糖能試験は正常であった。
血液化学:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均血清中グルコースレベルの著しい上昇を示した。しかしながら、耐糖能試験は正常であった。
上でまとめられたように、(−/−)マウスは、平均血清中グルコースレベルの上昇を示したことから、異常なグルコース代謝または前糖尿病性状態が示唆される。
(c)心臓学−血圧/心拍数
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
試験の説明:Visitech BP−2000血圧解析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
血圧:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下を示した。
(d)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
血圧:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均収縮期血圧の低下を示した。
(d)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
結果:
Dexa:雄(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総体脂肪パーセントおよび総脂肪質量の増加を示した。雌(−/−)マウスは、大腿骨の骨塩密度および総骨塩密度の減少を示した。
Dexa:雄(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総体脂肪パーセントおよび総脂肪質量の増加を示した。雌(−/−)マウスは、大腿骨の骨塩密度および総骨塩密度の減少を示した。
これらの研究から、変異雄(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が、肥満症に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO1431ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝プロセスに必須であり、特に肥満症の予防および/または処置に重要であり得る。雌ノックアウトマウスは、骨粗鬆症に起因し得る骨塩密度測定値の減少に関連する負の骨表現型を示した。したがって、PRO1431ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨塩密度の減少を特徴とするそのような骨障害の処置に有用であり得る。
66.28.DNA68818−2536(UNQ739)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1434ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68818−2536と命名)(UNQ739)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_177033 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA A930041G11遺伝子(A930041G11Rik);参照タンパク質:Q8C8N3 アクセッション:Q8C8N3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説フォン・ビルブラント因子;参照ヒト遺伝子配列:NM_198570 ホモ・サピエンス PSST739(UNQ739);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UXE2 アクセッション:Q6UXE2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。PSST739。
これらのノックアウト実験において、PRO1434ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68818−2536と命名)(UNQ739)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_177033 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA A930041G11遺伝子(A930041G11Rik);参照タンパク質:Q8C8N3 アクセッション:Q8C8N3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説フォン・ビルブラント因子;参照ヒト遺伝子配列:NM_198570 ホモ・サピエンス PSST739(UNQ739);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q6UXE2 アクセッション:Q6UXE2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。PSST739。
目的のマウス遺伝子は、ヒトUNQ739のオルソログであるRIKEN cDNA A930041G11遺伝子である。別名としては、PSST739が挙げられる。
UNQ739は、シグナルペプチドおよび2つのタンデムなフォン・ビルブラント因子タイプC(VWC)ドメインを含む推定分泌タンパク質である。VWCドメインは、多くの血漿タンパク質ならびに細胞内タンパク質に見られる。VWCドメインは、おそらくオリゴマー形成または複合体形成に関与する(Pfamアクセッション00093)。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 34 27 86
予測値 21.5 43 21.5 86
カイ二乗値=1.21 有意性=0.5460744(hom/n)=0.27
平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1の前のエクソンおよびコードエクソン1をターゲティングした(
NCBIアクセッションAK033944.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち、脳、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺および心臓において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 34 27 86
予測値 21.5 43 21.5 86
カイ二乗値=1.21 有意性=0.5460744(hom/n)=0.27
平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1の前のエクソンおよびコードエクソン1をターゲティングした(
NCBIアクセッションAK033944.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち、脳、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺および心臓において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.28.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA68818−2536(UNQ739)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質(UNQ739)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいて感覚運動ゲーティング/注意の増大をもたらした。ホモ接合性変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、4段階中3段階のプレパルス強度で感覚運動ゲーティング/注意の増大を示した。さらに、(−/−)マウスは、アルカリホスファターゼレベルの低下傾向を示した。血液学から、(−/−)マウスにおける平均総白血球細胞数およびリンパ球の絶対数の減少が明らかになった。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質(UNQ739)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいて感覚運動ゲーティング/注意の増大をもたらした。ホモ接合性変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、4段階中3段階のプレパルス強度で感覚運動ゲーティング/注意の増大を示した。さらに、(−/−)マウスは、アルカリホスファターゼレベルの低下傾向を示した。血液学から、(−/−)マウスにおける平均総白血球細胞数およびリンパ球の絶対数の減少が明らかになった。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より小さい(プレパルス)音に先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似ランダム順に6回、合計36回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より小さい(プレパルス)音に先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似ランダム順に6回、合計36回の試行が繰り返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、pp4、pp8およびpp12の間のプレパルス抑制の中央値の著しい増加を示した
ことから、変異体における感覚運動ゲーティング/注意の増強が示唆される。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
PPI:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較して、pp4、pp8およびpp12の間のプレパルス抑制の中央値の著しい増加を示した
ことから、変異体における感覚運動ゲーティング/注意の増強が示唆される。
(c)免疫学表現型解析
免疫関連疾患および炎症性疾患は、正常な生理機能において、傷害または損傷に応答し、傷害または損傷からの修復を開始し、そして外来生物体に対する先天的および後天的な防御を開始することにとって重大な意味を有する、かなり複雑で、複雑に相互連結していることが多い生物学的経路の症状または結果である。これらの正常な生理学的経路が、応答の強度に直接関連してか、異常な制御もしくは過度の刺激の結果としてか、自己に対する応答としてか、またはこれらの組み合わせのいずれかとして、さらなる傷害または損傷を引き起こすときに、疾患または病態が生じる。
これらの疾患の起源が、多段階の経路および複数の異なる生物学的系/経路に関連することが多いが、これらの経路の1個以上の重大な点における介入は、寛解性または治療的な効果を有し得る。治療的な介入は、有害なプロセス/経路の拮抗作用または有益なプロセス/経路の刺激のいずれかによって生じ得る。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物の免疫応答の重要な成分である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己の分子に関連する抗原を認識する。この抗原は、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上にMHC分子とともに提示され得る。T細胞系は、宿主哺乳動物に対して健康への脅威をもたらすこれらの改変細胞を排除する。T細胞としては、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が挙げられる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体を認識した後、広範囲に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、種々のサイトカイン、すなわち、リンフォカインを分泌する。リンフォカインは、B細胞、細胞傷害性T細胞および免疫応答に関与する他の種々の細胞の活性化において中心的な役割を果たす。
多くの免疫応答において、炎症細胞は、損傷または感染の部位を浸潤する。遊走細胞は、罹患組織の組織学的検査によって決定され得るような、好中球、好酸球、単球またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が知られており、広く研究されている。このような疾患としては、免疫媒介性炎症性疾患(例えば、関節リウマチ、免疫媒介性腎疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬および喘息)、非免疫媒介性炎症性疾患、感染性疾患、免疫不全疾患、新形成および移植片拒絶などが挙げられる。免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を同定した。
免疫学の分野において、炎症および炎症性障害の処置のための標的を本明細書中で同定した。免疫関連疾患は、1つの場合において、免疫応答を抑制することによって処置され得る。免疫刺激性活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫媒介性疾患および炎症性疾患の処置に有益であり得る。免疫応答を阻害する分子は、免疫応答を阻害するために(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)利用され得、その結果、免疫関連疾患を寛解させ得る。
以下の試験を実施した:
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
(1)血液学解析:
試験の説明:血液試験は、Abbott社のCell−Dyn3500R自動血液学分析装置によって行う。その特徴の一部としては、5種類の白血球分画が挙げられる。「患者」レポートには、全部で22を超えるパラメータが含まれ得る。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総白血球細胞数およびリンパ球の絶対数の減少を示した。
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均総白血球細胞数およびリンパ球の絶対数の減少を示した。
これらの結果から、変異(−/−)マウスが、その野生型同腹仔と比較して、免疫学的異常を有することが示唆される。(−/−)マウスは、異常な適応免疫を示唆するリンパ球の絶対数の減少を示した。したがって、PRO1434ポリペプチドは、正常な免疫学的プロファイルを維持するために、特に適応免疫にとって必須であるにちがいない。
66.29.DNA61185−1646(UNQ746)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1475ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61185−1646と命名)(UNQ746)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_026651 アクセッション:NM_026651 NID:22267451 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4930467B06遺伝子(4930467B06Rik);参照タンパク質:Q91X88 アクセッション:Q91X88 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。O−マンノシルN−アセチルグルコサミン転移酵素;参照ヒト遺伝子配列:NM_017739 アクセッション:NM_017739 NID:8923252 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス O連結型マンノースβ1,2−N−アセチルグルコサミン転移酵素(FLJ20277);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9NXF9 アクセッション:Q9NXF9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDNA FLJ20277 FIS,クローンHEP02567。
これらのノックアウト実験において、PRO1475ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA61185−1646と命名)(UNQ746)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_026651 アクセッション:NM_026651 NID:22267451 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4930467B06遺伝子(4930467B06Rik);参照タンパク質:Q91X88 アクセッション:Q91X88 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。O−マンノシルN−アセチルグルコサミン転移酵素;参照ヒト遺伝子配列:NM_017739 アクセッション:NM_017739 NID:8923252 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス O連結型マンノースβ1,2−N−アセチルグルコサミン転移酵素(FLJ20277);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q9NXF9 アクセッション:Q9NXF9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。CDNA FLJ20277 FIS,クローンHEP02567。
目的のマウス遺伝子は、ヒトFLJ20277(O結合型マンノースβ1,2−N−アセチルグルコサミン転移酵素)のオルソログであるRIKEN cDNA 4930467B06遺伝子である。別名としては、0610016I07Rik、O−マンノシルN−アセチルグルコサミン転移酵素、MEB、GnTI.2、MGAT1.2、POMGNT1およびUDP−GlcNAcが挙げられる。
FLJ20277は、O−マンノシル化タンパク質のアルファ連結型末端マンノース(Man)へのN−アセチルグルコサミン(GlcNAc)の付加を触媒するゴルジ膜グリコシルトランスフェラーゼである(Zhang e al,Biochem J 361(Pt1):153−62(2002);Schacter,Biochim Biophys Acta 1573(3):292−300(2002))。この酵素は、主に脳、神経および骨格筋で生じるO−マンノシルグリカン合成に関与する(Yoshida
et al,Dev Cell1(5):717−24(2001))。FLJ20277の変異は、先天性筋ジストロフィー、脳形成異常および眼球の異常を特徴とする常染色体劣性遺伝障害である筋肉−眼−脳疾患を引き起こす(Vervoort et al,Ann Neurol 56(1):143−8(2004);Manya et al,Biochem Biophys Res Commun 306(1):93−7(2003);Taniguchi et al,Hum Mol Genet 12(5):527−34(2003))。
et al,Dev Cell1(5):717−24(2001))。FLJ20277の変異は、先天性筋ジストロフィー、脳形成異常および眼球の異常を特徴とする常染色体劣性遺伝障害である筋肉−眼−脳疾患を引き起こす(Vervoort et al,Ann Neurol 56(1):143−8(2004);Manya et al,Biochem Biophys Res Commun 306(1):93−7(2003);Taniguchi et al,Hum Mol Genet 12(5):527−34(2003))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受
精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 39 13 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗値=10.29 有意性=0.0058284746(hom/n)=0.18平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1の前のエクソンおよびコードエクソン1〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_026651.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち脳および脊髄において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 21 39 13 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗値=10.29 有意性=0.0058284746(hom/n)=0.18平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1の前のエクソンおよびコードエクソン1〜5をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_026651.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された13の成体組織サンプルのうち脳および脊髄において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.29.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA61185−1646(UNQ746)
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトO連結型マンノースβ1,2−N−アセチルグルコサミン転移酵素(FLJ20277)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいて脳の発生奇形をもたらした。網膜血管組織崩壊、末梢性網膜変性症および微細動脈瘤が、ホモ接合性変異マウスにおいて眼底検査で観察された。顕微鏡解析により、網膜の異常が確認され、変異体における脳の発生奇形が明らかになった。さらに、雄と雌の(−/−)マウスの両方が、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較して耐糖能障害を示した。(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔よりも小さく、平均体重および平均体長の減少を示した。放射線学的観察結果から、骨粗鬆症に関連する異常な骨関連測定値が示された。いくつかの神経異常がまた、ノックアウト(−/−)マウスにおいて観察された。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトO連結型マンノースβ1,2−N−アセチルグルコサミン転移酵素(FLJ20277)のオルソログをコードする遺伝子の変異は、(−/−)マウスにおいて脳の発生奇形をもたらした。網膜血管組織崩壊、末梢性網膜変性症および微細動脈瘤が、ホモ接合性変異マウスにおいて眼底検査で観察された。顕微鏡解析により、網膜の異常が確認され、変異体における脳の発生奇形が明らかになった。さらに、雄と雌の(−/−)マウスの両方が、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較して耐糖能障害を示した。(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔よりも小さく、平均体重および平均体長の減少を示した。放射線学的観察結果から、骨粗鬆症に関連する異常な骨関連測定値が示された。いくつかの神経異常がまた、ノックアウト(−/−)マウスにおいて観察された。標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:(−/−)マウスは、軽度から中程度の脳の多巣性発生奇形を示した。小脳における外顆粒細胞ニューロンの巣の保持および小脳回の関連する融合、海馬の歯状回の波型の腹側の腕、ニューロンの広範な組織崩壊および大脳皮質における神経細胞層の減少、ならびに背側正中溝の領域における両半球の融合によって示されるような、脳における不完全な神経細胞の移動に関する広範な証拠が見られた。頻繁に、側脳室の軽度の拡張もまた観察された。(−/−)マウスはまた、内側および外側の網膜顆粒層の薄層化に関連する、神経節の細胞数の全体的な減少(末梢でより重篤)を特徴とする広範な網膜萎縮を示した。網膜血管が、正常に神経節細胞層内に包埋される代わりにガラス体と直接接触して網膜の表面に存在することが多かった。いくつかの眼において、末梢の内側の顆粒層において網膜分離症が見られた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、軽度から中程度の脳の多巣性発生奇形を示した。小脳における外顆粒細胞ニューロンの巣の保持および小脳回の関連する融合、海馬の歯状回の波型の腹側の腕、ニューロンの広範な組織崩壊および大脳皮質における神経細胞層の減少、ならびに背側正中溝の領域における両半球の融合によって示されるような、脳における不完全な神経細胞の移動に関する広範な証拠が見られた。頻繁に、側脳室の軽度の拡張もまた観察された。(−/−)マウスはまた、内側および外側の網膜顆粒層の薄層化に関連する、神経節の細胞数の全体的な減少(末梢でより重篤)を特徴とする広範な網膜萎縮を示した。網膜血管が、正常に神経節細胞層内に包埋される代わりにガラス体と直接接触して網膜の表面に存在することが多かった。いくつかの眼において、末梢の内側の顆粒層において網膜分離症が見られた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学解析によって組織パネルにおいて検出されなかった。
(c)心臓血管表現型解析:
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。1つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症
を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。
心臓血管の生物学の領域において、表現型試験を行い、心臓血管、内皮または血管形成の障害の処置のための潜在的標的を同定した。1つのそのような表現型試験は、眼底写真撮影および血管造影を含み、様々な目の異常を見出すために網膜動静脈比(A/V比)を測定した。異常なA/V比は、高血圧(および高血圧、例えば、アテローム性動脈硬化症
を引き起こす任意の疾患)、糖尿病または眼科学的障害に対応する他の眼疾患という血管疾患と関係し得る全身性の疾患または障害の徴候を示す。そのような目の異常としては、以下:網膜の異常は、網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉塞または閉鎖である;網膜血管系の二次的萎縮を引き起こす網膜変性症、色素性網膜炎、黄斑ジストロフィー、シュタルガルト病、先天性停在性夜盲症、コロイデレミア、脳回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性椎骨・骨端異形成症、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルグ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮症、ピエール・マリー症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無βリポタンパク質血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症またはマンノシドーシスが挙げられ得るがこれらに限定されない。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイにおいて試験した。眼底写真撮影を、Hawesおよび共同研究者ら(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)に従って改変したKowa Genesis小動物用眼底カメラを用いて覚醒時の動物において行った。フルオレセインの腹腔内注射により、各検査での直接光眼底像および蛍光血管造影図の取得が可能となった。直接的な眼科学的変化に加え、この試験では、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜の異常と関連する網膜の変化が検出され得る。通常の光の下で眼底の像を得た。血管造影により、目の動脈および静脈の検査が可能となった。また、目について動静脈(A/V)比を測定した。
眼科学的解析は、作製したF2の野生型、ヘテロ接合体およびホモ接合体の変異型子孫において、上記のプロトコルを用いて行った。具体的には、A/V比は、Kowa COMIT+ソフトウェアを用いて眼底像に従って測定および計算した。この試験では、散大させた瞳孔でカラー写真を撮影する:像は、多くの疾患の検出および分類を補助する。動静脈比(A/V)は、静脈直径に対する動脈直径(血管の分岐部の前で測定)の比である。多くの疾患、すなわち、糖尿病、心臓血管の障害、乳頭浮腫、視神経萎縮または他の目の異常、例えば、網膜変性(色素性網膜炎として知られる)または網膜の形成異常、視覚問題もしくは失明などは、この比に影響を及ぼす。したがって、ホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異型子孫において、野生型(+/+)同腹仔と比較して動静脈比の増加がもたらされた表現型観察結果は、そのような病理状態を示唆し得る。
結果:
眼底:(−/−)マウスは、視神経線維層の線(striation)および凝集、網膜血管組織崩壊および辺縁の網膜変性症を示した。1匹の(−/−)マウス(F−174)はまた、腫脹眼を示したことから、眼内圧上昇が示唆される。
血管造影:(−/−)マウスは、重篤な網膜血管組織崩壊、微細動脈瘤および網膜の毛細管漏出を示した。
眼底:(−/−)マウスは、視神経線維層の線(striation)および凝集、網膜血管組織崩壊および辺縁の網膜変性症を示した。1匹の(−/−)マウス(F−174)はまた、腫脹眼を示したことから、眼内圧上昇が示唆される。
血管造影:(−/−)マウスは、重篤な網膜血管組織崩壊、微細動脈瘤および網膜の毛細管漏出を示した。
まとめると、この研究において、(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較して、異常な網膜血管および網膜変性症に導き得る眼科学的(opthamological)異常を示した。まとめると、PRO1475ポリペプチドをコードするDNA61185−1646と同定された遺伝子をノックアウトすることによって、ホモ接合性変異体の子孫は、視神経および網膜動脈の異常に関連する表現型を示す。そのような検出された網膜の変化は、高血圧症(および高血圧症、例えば、アテローム性動脈硬化症を引き起こ
す任意の疾患)、糖尿病または網膜変性症および失明などの眼科学的障害に対応する他の眼球の疾患の血管系の疾患に関連し得る循環器の疾患または障害に最もよく関連する。したがって、PRO1475コード遺伝子のアンタゴニストは、類似の病理学的な網膜の変化に導き得る一方で、アゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症または網膜変性症およびこの状態(上で同定されたように)に関連する疾患を含む他の眼科学的障害の処置における治療薬として有用であり得る。
す任意の疾患)、糖尿病または網膜変性症および失明などの眼科学的障害に対応する他の眼球の疾患の血管系の疾患に関連し得る循環器の疾患または障害に最もよく関連する。したがって、PRO1475コード遺伝子のアンタゴニストは、類似の病理学的な網膜の変化に導き得る一方で、アゴニストは、高血圧症、アテローム性動脈硬化症または網膜変性症およびこの状態(上で同定されたように)に関連する疾患を含む他の眼科学的障害の処置における治療薬として有用であり得る。
(d)表現型解析:CNS/神経学
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
神経学の分野において、抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、精神分裂病、認知障害、痛覚過敏および感覚障害を含む神経性障害および精神医学的障害の処置のためのin vivoにおいて有効な標的の同定についての解析に本明細書中では注目した。神経障害は、「不安障害」として定義されるカテゴリーを含む。その「不安障害」としては、以下:軽度から中程度の不安、全般的病状による不安障害、別段特定されない不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖症を伴うパニック障害、広場恐怖症を伴わないパニック障害、心的外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定の恐怖症、物質誘導性不安障害、急性アルコール禁断、強迫性障害、広場恐怖症、I型またはII型の双極性障害、別段特定されない双極性障害、循環病、抑鬱性障害、大鬱性障害、気分障害、物質誘導性気分障害が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、不安障害は、人格障害にあてはまることがあり、その人格障害としては、以下のタイプ:妄想性、反社会性、回避行動、境界性人格障害、依存性、演技性、自己愛性、強迫性、分裂性および統合失調型が挙げられるがこれらに限定されない。
手順:
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
行動スクリーニングを、4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートにおいて実施した。生存能低下のために、より早期の試験が必要とならない限り、すべての行動試験は、12〜16週齢の間に実施した。
概日性試験の説明:
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均に対する数と比較して、特に明期の間の歩行回数の中央値の減少を示した。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1475ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
雌マウスを、試験の1日目の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージ内に個々に収容し、飼料および水を随意に与える。動物を、12時間明/暗サイクル(午前7時に点灯し、午後7時に消灯する)に曝露する。システムソフトウェアが、動物の動きによって引き起こされる光線遮断回数を記録し、光線中断回数は自動的に移動回数で割り算される。活動性は、3日間の試験中、1時間間隔で60回記録する。得られたデータは、3日間の試験期間における各時間で記録した活動性レベル(概日リズム)の中央値および各明/暗サイクル中の総活動性(自発活動性)の中央値によって示される。
結果:
概日性:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均に対する数と比較して、特に明期の間の歩行回数の中央値の減少を示した。これらの結果から、異常な概日リズムが証明される。ホームケージ活動性試験はまた、変異体における不安様応答の低下を示唆する活動性の低下または低機能を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、認知障害、痛覚過敏および感覚障害ならびに/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO1475ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の処置または寛解に有用であり得る。
反転スクリーン試験:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートに対して行動スクリーニングを行った。すべての行動試験を、生存能低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12〜16週齢で行った。これらの試験には、不安、活動レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性変異マウスおよび8匹のホモ接合性変異マウスのコホートに対して行動スクリーニングを行った。すべての行動試験を、生存能低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12〜16週齢で行った。これらの試験には、不安、活動レベルおよび探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
反転スクリーン試験データ:
反転するスクリーンを使用して、運動力/運動協調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を180°回転させた。以下の行動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上。
反転するスクリーンを使用して、運動力/運動協調を測定する。訓練されていないマウスを、金属棒上に水平に配置した正方形(7.5cm×7.5cm)のワイヤースクリーンの上に個別に置いた。次いで、マウスがスクリーン下になるように、その棒を180°回転させた。以下の行動応答を、1分間の試験にわたって記録した:落下、登上せず、および登上。
結果:
遺伝子型 落下率 % 登上率 %
+/+(n=8) 1/8 12.5% 0/8 0
−/−(n=8) 4/8 50% 0/8 0
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しなかった0/8もしくは1/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性障害を示す。登上した7/8もしくは8/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性の増強を示す。
遺伝子型 落下率 % 登上率 %
+/+(n=8) 1/8 12.5% 0/8 0
−/−(n=8) 4/8 50% 0/8 0
運動力の欠損は、(−/−)マウスまたは(+/−)マウスと(+/+)マウスとの間で落下応答が50%異なる場合に明らかである。登上しなかった0/8もしくは1/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性障害を示す。登上した7/8もしくは8/8匹の(−/−)マウスまたは(+/−)マウスは、運動協調性の増強を示す。
反転スクリーン試験を、基本的な感覚および運動観察を測定するように設定する:
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、4匹すべての(−/−)マウスがスクリーンから落下したのに対して、1/8匹の(+/+)マウスが落下した。この結果から、変異体の運動協調性の障害が示唆される。
(e)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
解析した8匹の(−/−)マウスのうち、4匹すべての(−/−)マウスがスクリーンから落下したのに対して、1/8匹の(+/+)マウスが落下した。この結果から、変異体の運動協調性の障害が示唆される。
(e)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。マウスにおける血液化学試験を実施するためにCOBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用した。代謝の分野において、糖尿病の処置のための標的を同定し得る。血液化学表現型解析は、インスリン感度およびグルコース代謝の変化を測定する耐糖能試験を含む。異常な耐糖能試験結果は、以下の障害または状態:1型糖尿病および2型糖尿病、シンドロームX、様々な循環器疾患および/または肥満症を示唆し得るが、これらに限定されない。
手順:2匹の野生型および4匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイに使用した。耐糖能試験は、哺乳動物における損傷したグルコースホメオスタシスを定義するための標準的な試験である。Lifescan血糖測定器を使用して耐糖能試験を行った。20%溶液として送達される2g/kgのD−グルコースを動物にIP注射し、血糖値を注射の0、30、60および90分後に測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
経口耐糖能:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、耐糖能障害を示した。
血糖値/耐糖能試験:
経口耐糖能:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、耐糖能障害を示した。
これらの研究では、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔において正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が減少を示したかまたは耐糖能障害を示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示し、それゆえ、PRO1475ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそれをコードする遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または糖尿病を含む様々な循環器疾患に関連した状態の処置に有用であり得る。
(f)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
(f)骨代謝および全身診断学
(1)組織質量および除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して総組織質量(TTM)の変化を同定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI、すなわち、全身、椎骨および両大腿骨)の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
明らかな観察結果:明らか:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔よりも小さく、尾から吊るされたときに後肢をしっかりと握った。
明らかな観察結果:明らか:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔よりも小さく、尾から吊るされたときに後肢をしっかりと握った。
体重/体長:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均体重および平均体長の減少を示した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝の分野において、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症および大理石骨病の処置のため、ならびに骨の治癒を促進する標的を同定するための標的を本明細書中で同定した。試験は:
・大腿骨および椎骨における骨塩密度を測定するためのDEXA
・骨梁と皮質骨の両方についての骨塩密度を非常に高い解像度および非常に高い感度で測定するためのマイクロCT
を含んだ。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合性マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートをこのアッセイで試験した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を、うまく使用して骨の変化を同定した。麻酔動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容量測定による骨塩密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMDおよび椎骨BMDを測定した。
Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロモエタノール,20mL/kg体重)をマウスに腹腔内注射することにより麻酔し、体長および体重を測定し、次いで、そのマウスをDEXAスキャンのためにPIXImusTMデンシトメーター(Lunar
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位にした。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、目的の領域(ROI)[すなわち、全身、椎骨および両大腿骨]の骨塩密度(BMD)および脂肪組成物(%脂肪)および総組織質量(TTM)を測定した。
骨マイクロCT解析:
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造に
ついての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
手順:マイクロCTを使用して、非常に感度の高いBMDの測定を行った。1つの椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合性マウスのコホートから取り出した。腰部の5つの椎骨骨梁骨体積、骨梁厚、結合性密度ならびに大腿骨中軸の骨の総面積および皮質厚の測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および構造に
ついての詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに置き、自動的にスキャンした。装置ソフトウェアを使用して、解析用の目的の領域を選択した。骨梁骨パラメータを、16マイクロメートルの解像度で第5腰部椎骨(LV5)において解析し、皮質骨パラメータを、20マイクロメートルの解像度で大腿骨中軸において解析した。
結果:
マイクロCT:マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均椎骨骨梁の体積、数、厚さおよび結合性密度の減少を示した。
マイクロCT:マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して、平均椎骨骨梁の体積、数、厚さおよび結合性密度の減少を示した。
PRO1475ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、成長遅延および/または組織るいそう疾患ならびに異常な骨代謝と一致する表現型を示す。これらの結果は、その(+/+)同腹仔よりも小さい外見という観察結果ならびに上で報告した平均体重および平均体長の減少と一致する。さらに、変異(−/−)マウスは、骨粗鬆症を示唆する椎骨骨梁の骨塩量および骨塩密度の測定値の減少を示した。したがって、PRO1475ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連作用を模倣し得る。他方で、PRO1475ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長遅延、悪液質または他の組織るいそう疾患のようなそのような代謝障害の予防および/または処置に有用であり得、ならびに骨減少に関連する骨障害の処置に有用であり得る。
66.30.DNA58732−1650(UNQ750)遺伝子が破壊されたマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験において、PRO1481ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58732−1650と命名)(UNQ750)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172979 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA D730046L02遺伝子(D730046L02Rik);参照タンパク質:Q8C6Z1 アクセッション:Q8C6Z1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムチン15前駆体;参照ヒト遺伝子配列:NM_145650 ホモ・サピエンスムチン15(MUC15);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8N387 アクセッション:Q8N387 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。MUC15タンパク質前駆体。
これらのノックアウト実験において、PRO1481ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA58732−1650と命名)(UNQ750)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報は、以下のとおりである:変異されたマウス遺伝子は、次のものに対応する:参照ヌクレオチド:NM_172979 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA D730046L02遺伝子(D730046L02Rik);参照タンパク質:Q8C6Z1 アクセッション:Q8C6Z1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムチン15前駆体;参照ヒト遺伝子配列:NM_145650 ホモ・サピエンスムチン15(MUC15);ヒトタンパク質配列は、次の参照に対応する:Q8N387 アクセッション:Q8N387 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。MUC15タンパク質前駆体。
目的のマウス遺伝子は、ヒトMUC15(ムチン15)のオルソログであるRIKEN
cDNA D730046L02遺伝子である。別名としては、4732460E09、PASIII、PAS3、糖タンパク質C、糖タンパク質4および成分IIが挙げられる。MUC15は、シグナルペプチド、細胞外の大いにグリコシル化されたセグメント、膜貫通セグメントおよび短い細胞質C末端からなるI型原形質膜タンパク質である。膜貫通セグメントを欠く第2のアイソフォームは、分泌され得る。このタンパク質は、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、結腸、末梢血白血球、骨髄、リンパ節および肺を含む多岐に亘る組織において発現する。MUC15は、おそらく、細胞外マトリックスへの細胞接着において役割を果たす(Pallesen et al,Eur J Biochem 269(11):2755−63(2002))。
cDNA D730046L02遺伝子である。別名としては、4732460E09、PASIII、PAS3、糖タンパク質C、糖タンパク質4および成分IIが挙げられる。MUC15は、シグナルペプチド、細胞外の大いにグリコシル化されたセグメント、膜貫通セグメントおよび短い細胞質C末端からなるI型原形質膜タンパク質である。膜貫通セグメントを欠く第2のアイソフォームは、分泌され得る。このタンパク質は、脾臓、胸腺、前立腺、精巣、卵巣、小腸、結腸、末梢血白血球、骨髄、リンパ節および肺を含む多岐に亘る組織において発現する。MUC15は、おそらく、細胞外マトリックスへの細胞接着において役割を果たす(Pallesen et al,Eur J Biochem 269(11):2755−63(2002))。
遺伝子ターゲティングまたは遺伝子トラップによる変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞において生じさせる。キメラマウスをC57BL/6Jアルビノマウスと交雑させ、F1ヘテロ接合性動物を作製する。これらの子孫を、交雑受精することにより、F2の野生型、ヘテロ接合性およびホモ接合性の変異体子孫を作製する。まれに、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合に、F1ヘテロ接合性マ
ウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
ウスを129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑することにより、交雑受精用のさらなるヘテロ接合性動物を得て、F2マウスを作製する。この世代のマウスについてレベルI表現型解析を実施する。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 19 39 23 81
予測値 20.25 40.5 20.25 81
カイ二乗値=2.06 有意性=0.35700697(hom/n)=0.29
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172979.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肝臓、骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 19 39 23 81
予測値 20.25 40.5 20.25 81
カイ二乗値=2.06 有意性=0.35700697(hom/n)=0.29
平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172979.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験された、胚性幹細胞(ES)細胞および13のすべての成体組織サンプル(肝臓、骨格筋および骨以外)において標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊をサザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.30.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA58732−1650(UNQ750))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトムチン15(MUC15)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均(historical means)と比較した場合、プレパルス抑制試験中に、感覚運動ゲーティング/注意が増強されたホモ接合性変異マウスが得られた。さらに、変異(−/−)マウスは、免疫学的異常を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析により、正常な乳房組織と比較した乳房腫瘍におけるUNQ750の過剰発現が明らかとなる。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異
なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、pp4、pp8、およびpp12中にプレパルス抑制の中間値の増加を示し、これは、変異体における感覚運動ゲーティング/注意の増加を示す。
(d)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトムチン15(MUC15)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均(historical means)と比較した場合、プレパルス抑制試験中に、感覚運動ゲーティング/注意が増強されたホモ接合性変異マウスが得られた。さらに、変異(−/−)マウスは、免疫学的異常を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析により、正常な乳房組織と比較した乳房腫瘍におけるUNQ750の過剰発現が明らかとなる。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異
なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、pp4、pp8、およびpp12中にプレパルス抑制の中間値の増加を示し、これは、変異体における感覚運動ゲーティング/注意の増加を示す。
(d)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
(1)蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
(1)蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
組織特異的FACS−プロジェクト:(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較した場合、パイエル板中のTCRB+細胞の比率の増加およびB220+細胞の比率の減少を示した。これらの結果は、活性化T細胞(TCRB+CD38+)の増加を示す。
結果:
組織特異的FACS−プロジェクト:(−/−)マウスは、(+/+)マウスと比較した場合、パイエル板中のTCRB+細胞の比率の増加およびB220+細胞の比率の減少を示した。これらの結果は、活性化T細胞(TCRB+CD38+)の増加を示す。
これらの結果は、ノックアウトマウスがB細胞の小集団(プレB細胞、未熟B細胞、および成熟B細胞)の増加を示すことを示す。したがって、変異ホモ接合性マウスは、B細胞前駆細胞の減少に関連する免疫学的異常を示した。さらに、ノックアウトマウスは、T細胞の増加を示す。
これらの結果は、ノックアウト(−/−)マウスがその野生型(+/+)同腹仔と比較して免疫学的異常を示すことを示す。PRO1481ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、この表現型を模倣するであろう。PRO1481ポリペプチドまたはそのアゴニストは、T細胞産生の負の調節因子およびB細胞発生の正の調節因子として作用するようであり、B細胞の発生または成熟で有用であり、その後の迅速な免疫応答に関与し得る。PRO1481ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、T細胞の産生の刺激で有用であろう。
66.31.DNA68880−1676(UNQ774)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1568ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68880−1676と示す)(UNQ774)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_173007 ムス・ムスクルス膜貫通4スーパーファミリーメンバー12(Tm4sf12);参照タンパク質:Q8BKT6 アクセッション:Q8BKT6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス9日胚全身cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:D030012P12産物:TETRASPAN NET−2ホモログ(Tm4sf12タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_0123
38 アクセッション:NM_012338 NID:21264567 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス膜貫通4スーパーファミリーメンバーテトラスパンNET−2(NET−2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:O95859 アクセッション:O95859 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TETRASPAN NET−2。
これらのノックアウト実験では、PRO1568ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68880−1676と示す)(UNQ774)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_173007 ムス・ムスクルス膜貫通4スーパーファミリーメンバー12(Tm4sf12);参照タンパク質:Q8BKT6 アクセッション:Q8BKT6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス9日胚全身cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:D030012P12産物:TETRASPAN NET−2ホモログ(Tm4sf12タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_0123
38 アクセッション:NM_012338 NID:21264567 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス膜貫通4スーパーファミリーメンバーテトラスパンNET−2(NET−2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:O95859 アクセッション:O95859 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TETRASPAN NET−2。
目的のマウス遺伝子は、Tm4sf12(膜貫通4スーパーファミリーメンバー12)(ヒトTM4SF12のオーソログ)である。別名には、9030619E17、EST
AI426782、NET−2、およびテトラスパンNET−2が含まれる。
AI426782、NET−2、およびテトラスパンNET−2が含まれる。
TM4SF12は、推定内在性原形質膜タンパク質であり、且つ細胞接着およびシグナル伝達で機能する可能性が高いより大きな細胞表面複合体のサブユニットである。TM4SF12は、テトラスパニンスーパーファミリーのメンバーであり、テトラスパニンファミリードメイン内に4つの膜貫通セグメントを含む。TM4SF12の生理学的役割は知られていないが、テトラスパニンは、一般に、細胞の接着、移動、受精、免疫、発生、および転移などの過程で役割を果たすインテグリンによって媒介される接着依存性シグナル伝達に関与する(Serru et al,Biochim Biophys Acta
1478(1):159−63(2000);Berditchevski,J Cell Sci 114(Pt 23):4143−51(2001);Tarrant et al,Trends Immunol 24(11):610−7(2003);Le Naour et al,Cancer Immunol Immunother
53(3):148−52(2004))。
1478(1):159−63(2000);Berditchevski,J Cell Sci 114(Pt 23):4143−51(2001);Tarrant et al,Trends Immunol 24(11):610−7(2003);Le Naour et al,Cancer Immunol Immunother
53(3):148−52(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 20 36 25 81
予測値 20.25 40.5 20.25 81
カイ二乗=0.99 有意性=0.6095709(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_173007.1)。
1.野生型発現パネル:骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 20 36 25 81
予測値 20.25 40.5 20.25 81
カイ二乗=0.99 有意性=0.6095709(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_173007.1)。
1.野生型発現パネル:骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.31.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA68880−1676(UNQ774))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト膜貫通4スーパーファミリーメンバー12(TM4SF12)のオーソログをコー
ドする遺伝子の変異により、多数の眼科的異常(網膜毛細血管瘤および不均一な(non−homogeneous)網膜バックグラウンドが含まれる)を示すホモ接合体マウスが得られた。さらに、CATスキャン分析により、分析した3つのホモ接合性変異体のうちの2つおよび2つのヘテロ接合性マウスのうちの1つで中等度の水腎症が明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト膜貫通4スーパーファミリーメンバー12(TM4SF12)のオーソログをコー
ドする遺伝子の変異により、多数の眼科的異常(網膜毛細血管瘤および不均一な(non−homogeneous)網膜バックグラウンドが含まれる)を示すホモ接合体マウスが得られた。さらに、CATスキャン分析により、分析した3つのホモ接合性変異体のうちの2つおよび2つのヘテロ接合性マウスのうちの1つで中等度の水腎症が明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)心血管表現型解析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群(Alstom’s syndrome)、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常(dysplaisa spondyloepiphysaria congentia)、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群(Alstom’s syndrome)、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常(dysplaisa spondyloepiphysaria congentia)、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで試験した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
上記プロトコルを使用して、作製したF2野生型、ヘテロ接合体、およびホモ接合体変異子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Kowa COMIT+ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってA/V比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比(A/V)は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である(血管の分岐前に測定する)。多くの疾患(すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常(網膜変性(色素性網膜炎として公知)など)、網膜の形成異常、視覚問題、または失明)がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型(+/+)同腹仔と比較してホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果:
眼底:(−/−)マウスは、不均一なバックグラウンドを有する不健康な網膜床を示した。2匹の(−/−)マウス(M−79およびM−98)はまた、網膜血管上に白色沈着物を示し、これは、視神経円板の約2〜3倍であった。
結果:
眼底:(−/−)マウスは、不均一なバックグラウンドを有する不健康な網膜床を示した。2匹の(−/−)マウス(M−79およびM−98)はまた、網膜血管上に白色沈着物を示し、これは、視神経円板の約2〜3倍であった。
血管造影図:8匹全ての(−/−)マウスは、複数の微細動脈瘤および左右対称に網膜毛細血管の漏れを示した。
このような検出された網膜の変化は、最も一般的に、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患(網膜変性など)に関連し得る心血管全身疾患または障害に関連する。したがって、PRO1568コード遺伝子のアンタゴニストにより、類似の網膜変化が起こるのに対して、アゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、または他の眼科障害(網膜変性およびこの容態に関連する疾患(上記)が含まれる)の治療薬として有用であり得る。
その後の研究は、UNQ774ノックアウト網膜(特に、神経線維層(NFL);内網状層(IPL)、および外網状層(OPL)新芽形成性(sprouting)血管形成の欠損を示した(したがって、網膜血管の3つの層状組織は、野生型(+/+)およびヘテロ接合体(+/−)切片(網膜の全組織標本イソレクチン染色、10倍の共焦点像)と比較した場合、血管形成の芽が欠損していた)。
(c)病態/CATスキャン
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
(c)病態/CATスキャン
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
分析された6匹のマウスのうち、1匹の(+/−)マウスおよび2匹の(−/−)マウスは、中程度の水腎症を示した。
分析された6匹のマウスのうち、1匹の(+/−)マウスおよび2匹の(−/−)マウスは、中程度の水腎症を示した。
66.32.DNA73735−1681(UNQ779)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1573ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA73735−1681と示す)(UNQ779)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_018778 ムス・ムスクルスクラウジン8(Cldn8);参照タンパク質:Q9Z260 アクセッション:Q9Z260 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。クラウジン8;参照ヒト遺伝子配列:NM_199328 ホモ・サピエンスクラウジン8(CLDN8);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:P56748 アクセッション:P56748 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。クラウジン8。
これらのノックアウト実験では、PRO1573ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA73735−1681と示す)(UNQ779)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_018778 ムス・ムスクルスクラウジン8(Cldn8);参照タンパク質:Q9Z260 アクセッション:Q9Z260 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。クラウジン8;参照ヒト遺伝子配列:NM_199328 ホモ・サピエンスクラウジン8(CLDN8);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:P56748 アクセッション:P56748 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。クラウジン8。
目的のマウス遺伝子は、Cldn8(クラウジン(claudin)8)(ヒトCLDN8のオーソログ)である。
CLDN8は、接着分子および密着結合の構成要素として機能する内在性原形質膜タン
パク質である。このタンパク質は、4つの膜貫通セグメントを含む1つのクラウジンファミリードメインからなる(PfamアクセッションPF00822)。CLDN8は主に肺および腎臓に発現し、特に、アルドステロン感受性腎単位に沿った密着結合に集中している。CLDN8は、傍細胞カチオン輸送および浸透性で役割を果たす可能性が高い(Yu et al,J Biol Chem 278(19):17350−9(2003);Morita et al,Proc Natl Acad Sci U S A 96(2):511−6(1999);Heiskala et al,Traffic
2(2):93−8(2001);Li et al,Am J Physiol Renal Physiol 286(6):F1063−71(2004))。
パク質である。このタンパク質は、4つの膜貫通セグメントを含む1つのクラウジンファミリードメインからなる(PfamアクセッションPF00822)。CLDN8は主に肺および腎臓に発現し、特に、アルドステロン感受性腎単位に沿った密着結合に集中している。CLDN8は、傍細胞カチオン輸送および浸透性で役割を果たす可能性が高い(Yu et al,J Biol Chem 278(19):17350−9(2003);Morita et al,Proc Natl Acad Sci U S A 96(2):511−6(1999);Heiskala et al,Traffic
2(2):93−8(2001);Li et al,Am J Physiol Renal Physiol 286(6):F1063−71(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 17 47 19 83
予測値 20.75 41.5 20.75 83
カイ二乗=2.58 有意性=0.2752708(hom/n)=0.21 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_018778.2)。
1.野生型発現パネル:脾臓、骨、心臓、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 17 47 19 83
予測値 20.75 41.5 20.75 83
カイ二乗=2.58 有意性=0.2752708(hom/n)=0.21 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_018778.2)。
1.野生型発現パネル:脾臓、骨、心臓、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.32.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA73735−1681(UNQ779))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトクラウジン8(CLDN8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、変異(−/−)マウスの驚愕反射が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトクラウジン8(CLDN8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、変異(−/−)マウスの驚愕反射が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性
気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:(−/−)マウスは驚愕反応が減少し、変異体の聴覚障害が示唆される。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性
気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:(−/−)マウスは驚愕反応が減少し、変異体の聴覚障害が示唆される。
66.33.DNA62845−1684(UNQ782)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
破壊
これらのノックアウト実験では、PRO1599ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62845−1684と示す)(UNQ782)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_196763 PREDICTED:ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2900092M14遺伝子(2900092M14Rik);参照タンパク質:XP_196763 RIKEN cDNA 2900092M14[ムス・ムスクルス];参照ヒト遺伝子配列:NM_214710 ホモ・サピエンスプロテアーゼ、セリン様1(PRSSL1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWY2 アクセッション:Q6UWY2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。GLGL782。
破壊
これらのノックアウト実験では、PRO1599ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62845−1684と示す)(UNQ782)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_196763 PREDICTED:ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2900092M14遺伝子(2900092M14Rik);参照タンパク質:XP_196763 RIKEN cDNA 2900092M14[ムス・ムスクルス];参照ヒト遺伝子配列:NM_214710 ホモ・サピエンスプロテアーゼ、セリン様1(PRSSL1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWY2 アクセッション:Q6UWY2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。GLGL782。
目的のマウス遺伝子は、Prssl1(プロテアーゼ、セリン様1)(ヒトPRSSL1のオーソログ)である。別名には、UNQ782、GLGL782、および2900092M14Rikが含まれる。
PRSSL1は、シグナルペプチドおよびトリプシン様セリンプロテアーゼドメインからなる推定分泌プロテアーゼである(SMARTアクセッションSM00020)。
不運なことに、科学論文および配列データベースでは、別の哺乳動物遺伝子座(KLK10、カリクレイン10、遺伝子ID:5655)もPRSSL1と呼ばれている。本明細書中に記載の破壊遺伝子座KLK10ではなく、全く別の遺伝子を示す。PRSSL1(本プロジェクトのための目的の遺伝子)に関する公開されていない情報を、本明細書の記載時に見出すことができる。したがって、全てKLK10をいう。したがって、データベース配列として科学論文を解釈する場合に注意が必要である。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウ
スがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
スがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 33 24 80
予測値 20 40 20 80
カイ二乗=1.1 有意性=0.5769498(hom/n)=0.28 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_196763.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプル中の脊髄、胸腺、および脾臓のみにおいて標的遺伝子の発現が検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 23 33 24 80
予測値 20 40 20 80
カイ二乗=1.1 有意性=0.5769498(hom/n)=0.28 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_196763.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプル中の脊髄、胸腺、および脾臓のみにおいて標的遺伝子の発現が検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.33.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA62845−1684(UNQ782))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトプロテアーゼ、セリン様1(PRSSL1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合性変異体マウスは、末梢血中のCD8およびNK細胞の比率の減少およびB細胞の平均比率の増加を示した。さらに、変異体は、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清TNF−αおよびMCP−1応答の増加ならびにオボアルブミンに対する平均血清IgG2a応答の増加を示した。ノックアウトマウスはまた、いくつかの組織の炎症を示した。さらに、変異(−/−)マウスは、平均全質量、総体脂肪率、および総脂肪質量の増加を伴う肥満の徴候を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトプロテアーゼ、セリン様1(PRSSL1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合性変異体マウスは、末梢血中のCD8およびNK細胞の比率の減少およびB細胞の平均比率の増加を示した。さらに、変異体は、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清TNF−αおよびMCP−1応答の増加ならびにオボアルブミンに対する平均血清IgG2a応答の増加を示した。ノックアウトマウスはまた、いくつかの組織の炎症を示した。さらに、変異(−/−)マウスは、平均全質量、総体脂肪率、および総脂肪質量の増加を伴う肥満の徴候を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細
胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
(1)蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、CD8細胞およびNK細胞の平均比率の減少およびB細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、CD8細胞およびNK細胞の平均比率の減少およびB細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
まとめると、免疫細胞組成物のFACS解析は、ノックアウトマウス(−/−)が、B細胞および細胞傷害性T細胞の両方(CD8−MHCクラスI分子の補助受容体として機能する胸腺細胞小集団)に関する免疫学的相違を示すことを示す。PRO1599ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストはB細胞産生で有用あるのに対して、PRO1599ポリペプチドは逆効果を導くと予想されるであろう。他方では、PRO1599ポリペプチドは、CD8細胞およびNK細胞の正の調節因子として機能するようである(FACSの結果は、ホモ接合性変異マウスのCD8細胞およびナチュラルキラー細胞の平均比率が減少したことを示す)。ナチュラルキラー細胞は、ウイルス感染の最初の防衛線である。なぜなら、これらの細胞はウイルス免疫および腫瘍に対する防御に関与しているからである。ナチュラルキラー細胞(すなわり、NK細胞)は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性におけるエフェクターとして機能し、事前に免疫化または活性化することなくin vitroで一定のリンパ系腫瘍細胞株を死滅させる能力によって同定される。したがって、PRO1599ポリペプチドまたはそのアゴニストは、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性に重要な細胞傷害性T細胞およびNK細胞の産生で有用であろう。
(2)急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルI LPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
急性期応答:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清TNF−αおよびMCP−1応答が増加した。
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルI LPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
急性期応答:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清TNF−αおよびMCP−1応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃は、PRO1599ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃した場合、免疫応答(TNF−αおよびMCP−1産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。TNF−αおよびMCP−1は、より後期のB細胞活性化に寄与する。これにより、PRO1599ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストが免疫応答を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO1599ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(3)卵白アルブミン攻撃
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行った。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行った。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
上記のように、このプロトコルは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力を評価する。動物に50mgのニワトリ卵白アルブミン(完全フロイントアジュバント中に乳化)をIP注射し、14日後に、抗卵白アルブミン抗体(IgM、IgG1およびIgG2サブクラス)の血清力価を測定した。血清試料中のOVA特異的抗体の量は、96ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度(OD)値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。
この攻撃の結果:
卵白アルブミン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、卵白アルブミン攻撃に対する平均血清IgG2a応答の増加を示した。
卵白アルブミン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、卵白アルブミン攻撃に対する平均血清IgG2a応答の増加を示した。
まとめると、卵白アルブミン攻撃研究は、PRO1599ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異マウスは、T細胞依存性OVA抗原で攻撃した場合、免疫学的応答を誘発する能力の低下を示した。したがって、PRO1599ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、免疫系の刺激に有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO1599ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶、移植片対宿主疾患、または自己免疫疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(c)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雌(−/−)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
結果:
DEXA:雌(−/−)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO1599ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および/または肥満の予防および/または治療で特に重要であろう。
66.34.DNA71286−1687(UNQ785)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1604ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA71286−1687と示す)(UNQ785)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_008233 アクセッション:NM_008233 NID:6680200 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス 肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2(Hdgfrp2);参照タンパク質:O35540 O35540 O35540 肝細胞癌由来成長因子;参照ヒト遺伝子配列:NM_032631 ホモ・サピエンス肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2(HDGF2)、転写変異型(variant)2;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9BW08 アクセッション:Q9BW08 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2に類似。
これらのノックアウト実験では、PRO1604ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA71286−1687と示す)(UNQ785)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_008233 アクセッション:NM_008233 NID:6680200 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス 肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2(Hdgfrp2);参照タンパク質:O35540 O35540 O35540 肝細胞癌由来成長因子;参照ヒト遺伝子配列:NM_032631 ホモ・サピエンス肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2(HDGF2)、転写変異型(variant)2;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9BW08 アクセッション:Q9BW08 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2に類似。
目的のマウス遺伝子は、Hdgfrp2(肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2)(ヒトHDGF2のオーソログ)である。別名には、MGC2641、肝細胞癌由来成長因子2、およびHRP−2が含まれる。
HDGF2は、精巣および骨格筋で発現する推定核タンパク質である。このタンパク質は、PWWPドメインおよび二分核定位シグナルを含む。PWWPドメインは、典型的には、核タンパク質中で見出され、タンパク質−タンパク質相互作用に関与する可能性が高い。HDGF2は、肝細胞癌由来成長因子(HDGF)(細胞株中で過剰発現した場合または外因的に細胞に適用した場合にDNA合成および細胞増殖を刺激する核タンパク質)と構造的に類似している。HDGFの外見上の分裂促進活性は、その核に侵入する能力に依存する(Izumoto et al,Biochem Biophys Res Commun 238(1):26−32(1997);Kishima et al,J
Biol Chem 277(12):10315−22(2002))。
Biol Chem 277(12):10315−22(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 20 36 17 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=7.54 有意性=0.023052063(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_008233.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 20 36 17 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=7.54 有意性=0.023052063(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_008233.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.34.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA71286−1687(UNQ785))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2(HDGF2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加したホモ接合性変異マウスが得られた。サーカディアン試験中、変異(−/−)マウスは、全明暗期中に多動を示した。さらに、雌変異体は、平均皮膚線維芽細胞増殖率が減少した。雄(−/−)マウスは、骨塩量および骨中無機質密度の測定値が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト肝細胞癌由来成長因子関連タンパク質2(HDGF2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加したホモ接合性変異マウスが得られた。サーカディアン試験中、変異(−/−)マウスは、全明暗期中に多動を示した。さらに、雌変異体は、平均皮膚線維芽細胞増殖率が減少した。雄(−/−)マウスは、骨塩量および骨中無機質密度の測定値が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は血糖値測定も含む。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
代謝領域では、代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は血糖値測定も含む。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
結果:
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、兵器血清アルカリホスファターゼレベルが増加した。この結果は、肝臓の変化に起因する可能性が高い。
雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、兵器血清アルカリホスファターゼレベルが増加した。この結果は、肝臓の変化に起因する可能性が高い。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の12時間の馴化期間および全明暗期に歩行回数が増加した(多動)。これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および感覚障害と一致する。
(d)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の12時間の馴化期間および全明暗期に歩行回数が増加した(多動)。これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および感覚障害と一致する。
(d)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
結果:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO1604ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
(e)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
(e)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度(connectivity density)、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40ス
キャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の値と比較した場合、骨塩量および脊椎骨中無機質密度ならびに全身および大腿骨中無機質密度が減少する傾向があるようであった。
マイクロCT:雄ノックアウトは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、小柱の厚さおよび連結密度ならびに大腿骨骨幹部総領域が減少する傾向があるようであった。DEXAおよびマイクロCTの結果は、わずかに中央値の1SD低い。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度(connectivity density)、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40ス
キャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の値と比較した場合、骨塩量および脊椎骨中無機質密度ならびに全身および大腿骨中無機質密度が減少する傾向があるようであった。
マイクロCT:雄ノックアウトは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、小柱の厚さおよび連結密度ならびに大腿骨骨幹部総領域が減少する傾向があるようであった。DEXAおよびマイクロCTの結果は、わずかに中央値の1SD低い。
66.35.DNA77648−1688(UNQ786)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1605ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77648−1688と示す)(UNQ786)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_175098 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 6330407D12遺伝子(6330407D12Rik);参照タンパク質:Q8BIS8 アクセッション:Q8BIS8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス成体雄延髄cDNA,RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:6330407D12産物:N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの少しの類似物(weakly similar);参照ヒト遺伝子配列:NM_138771 アクセッション:NM_138771 NID:gi 20270308 ref NM_138771.1 ホモ・サピエンスα−1,3(6)−マンノシル糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様(LOC90693);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q96EE4 アクセッション:Q96EE4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質。
これらのノックアウト実験では、PRO1605ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77648−1688と示す)(UNQ786)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_175098 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 6330407D12遺伝子(6330407D12Rik);参照タンパク質:Q8BIS8 アクセッション:Q8BIS8 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス成体雄延髄cDNA,RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:6330407D12産物:N−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼの少しの類似物(weakly similar);参照ヒト遺伝子配列:NM_138771 アクセッション:NM_138771 NID:gi 20270308 ref NM_138771.1 ホモ・サピエンスα−1,3(6)−マンノシル糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様(LOC90693);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q96EE4 アクセッション:Q96EE4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 6330407D12遺伝子(ヒトα−1,3(6)−マンノシル糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様のオーソログ)である。別名には、EST AA675040が含まれる。
140アミノ酸の仮説タンパク質は、1つのペプチドからなり、且つ他の保存ドメインをを含まず、ゴルジ装置または細胞外間隙(分泌性)中に存在すると予想される。このタンパク質は、MGAT5(マンノシル[α−1,6−]−糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ)およびMGAT5B(マンノシル[α−1,6−]−糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼイソ酵素B)(糖タンパク質オリゴサッカリド生合成を触媒する約750アミノ酸のグリコシルトランスフェラーゼ)のN末端セグメントと構造的に関連する。MGAT5は、ゴルジ装置の膜内に存在し、分泌もされる。分泌性MGAT5は、グリコシル化と無関係の機構によってヘパラン硫酸プロテオグリカンから線維芽細胞成長因子を放出し、FGF−2が標的細胞上のその受容体を活性化することができる可能性が高い(Saito et al,J Biol Chem 277(19):17002−8(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウ
スがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
スがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 14 50 26 90
予測値 22.5 45 22.5 90
カイ二乗=1.3 有意性=0.5220458(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:第1のコードエクソンをターゲティングした(NM_175098.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 14 50 26 90
予測値 22.5 45 22.5 90
カイ二乗=1.3 有意性=0.5220458(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:第1のコードエクソンをターゲティングした(NM_175098.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.35.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA77648−1688(UNQ786))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトα−1,3(6)−マンノシル糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様のオーソログをコードする遺伝子の変異により、トリグリセリドレベルが増加した変異(−/−)マウスが得られた。4匹の(−/−)マウスは、肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内空胞化の増加を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:分析した6匹の(−/−)マウスのうち、4匹が肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内空胞化の中程度の増加を示した。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトα−1,3(6)−マンノシル糖タンパク質β−1,6−N−アセチル−グルコサミニルトランスフェラーゼ様のオーソログをコードする遺伝子の変異により、トリグリセリドレベルが増加した変異(−/−)マウスが得られた。4匹の(−/−)マウスは、肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内空胞化の増加を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:分析した6匹の(−/−)マウスのうち、4匹が肝細胞中のグリコーゲンの細胞質内空胞化の中程度の増加を示した。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的
平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。したがって、PRO1605遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO1605ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO1605ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。したがって、PRO1605遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO1605ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO1605ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
66.36.DNA77301−1708(UNQ803)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1693ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77301−1708と示す)(UNQ803)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_178678 ムス・ムスクルスロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3(Lrrtm3);参照タンパク質:Q8BGJ7 アクセッション:Q8BGJ7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス 16日新生児小脳cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:9630003D05産物:仮説ロイシンリッチ反復、典型的なサブタイプ含有タンパク質、全インサート配列;参照ヒト遺伝子配列:NM_178011 ホモ・サピエンスロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3(LRRTM3);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q86VH5 アクセッション:Q86VH5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3タンパク質(GFNV803)。
これらのノックアウト実験では、PRO1693ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77301−1708と示す)(UNQ803)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_178678 ムス・ムスクルスロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3(Lrrtm3);参照タンパク質:Q8BGJ7 アクセッション:Q8BGJ7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス 16日新生児小脳cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:9630003D05産物:仮説ロイシンリッチ反復、典型的なサブタイプ含有タンパク質、全インサート配列;参照ヒト遺伝子配列:NM_178011 ホモ・サピエンスロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3(LRRTM3);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q86VH5 アクセッション:Q86VH5 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3タンパク質(GFNV803)。
目的のマウス遺伝子は、Lrrtm3(ロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3)(ヒトLRRTM3のオーソログ)である。別名には、9630044H04Rikおよびロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3タンパク質が含まれる。
LRRTM3は、推定内在性原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチ反復、膜貫通セグメント、および潜在的な細胞質C末端ドメインからなる。このタンパク質は、主に、脊椎動物の神経系に発現する。LRRTM3は、細胞接着分子またはシグナル伝達受容体として機能することができ、おそらく、神経系の発達および維持で役割を果たす(Lauren et al,Genomics 81(4):411−21(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 24 25 15 64
予測値 16 32 16 64
カイ二乗=0.15 有意性=0.9277435(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_178678.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプル中の脳、脊髄、および眼のみにおいて標的遺伝子の発現が検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 24 25 15 64
予測値 16 32 16 64
カイ二乗=0.15 有意性=0.9277435(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_178678.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプル中の脳、脊髄、および眼のみにおいて標的遺伝子の発現が検出された。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.36.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA77301−1708(UNQ803))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3(LRRTM3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均絶対白血球数が増加したホモ接合体マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトロイシンリッチ反復膜貫通ニューロナル3(LRRTM3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均絶対白血球数が増加したホモ接合体マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメータを対象とすることができる。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その野生型同腹仔(+/+)マウスおよび歴史的平均と比較した場合、平均絶対好中球数の増加を示した。
血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメータを対象とすることができる。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その野生型同腹仔(+/+)マウスおよび歴史的平均と比較した場合、平均絶対好中球数の増加を示した。
これらの結果は、変異(−/−)マウスがその野生型同腹仔と比較して免疫学的異常を示すことを示す。まとめると、血液学の結果は、ホモ接合体変異マウスが好中球数の増加を示し、これは、細胞外病原体を飲み込むか死滅させる食細胞活性または能力が増加したマクロファージ前駆体レベルの上昇を示す。
66.37.DNA68883−1691(UNQ826)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1753ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68883−1691と示す)(UNQ826)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_010959 ムス・ムスクルスオンコプロテイン誘導性転写物3(Oit3);参照タンパク質:Q8C9U1 アクセッション:Q8C9U1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス 0日新生児胸腺cDNA,RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:A430107A04産物:ALC homolog;参照ヒト遺伝子配列:NM_152635 ホモ・サピエンスオンコプロテイン誘導性転写物3(OIT3);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8WWZ8 アクセッション:Q8WWZ8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。LZP(仮説タンパク質FLJ39116)(PPFL826)。
これらのノックアウト実験では、PRO1753ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA68883−1691と示す)(UNQ826)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_010959 ムス・ムスクルスオンコプロテイン誘導性転写物3(Oit3);参照タンパク質:Q8C9U1 アクセッション:Q8C9U1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス 0日新生児胸腺cDNA,RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:A430107A04産物:ALC homolog;参照ヒト遺伝子配列:NM_152635 ホモ・サピエンスオンコプロテイン誘導性転写物3(OIT3);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8WWZ8 アクセッション:Q8WWZ8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。LZP(仮説タンパク質FLJ39116)(PPFL826)。
目的のマウス遺伝子は、Oit3(オンコプロテイン誘導性転写物3)(ヒトOIT3のオーソログ)である。別名には、LZP、EF−9、FLJ39116、および肝臓特異的ZPドメイン含有タンパク質が含まれる。
OIT3は、主に肝臓で発現する推定分泌タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、3つのタンデム上皮成長因子様ドメイン、および新規の透明帯ドメインを含む。タンパク質の短縮形態を血中で検出できるにもかかわらず、OIT3は、主に、肝細胞の角膜上に存在する。OIT3遺伝子は、NIH3T3線維芽細胞中でオンコプロテインE2a−Pbx1によって活性化されるが、肝細胞癌中で稀にしか発現されず、OIT3は肝細胞癌にの湯様な負のマーカーであり得ることが示唆される。OIT3の生物学的役割は知られていない(Fu and Kamp,Mol Cell Biol 17(3):1503−12(1997);Xu et al,Hepatology 38(3):735−44(2003);Xu et al,DNA Seq 15(2):81−7(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交
配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 19 41 15 75
予測値 18.75 37.5 18.75 75
カイ二乗=5.82 有意性=0.054475725(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_010959.1)。
1.野生型発現パネル:脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 19 41 15 75
予測値 18.75 37.5 18.75 75
カイ二乗=5.82 有意性=0.054475725(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_010959.1)。
1.野生型発現パネル:脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.37.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA68883−1691(UNQ826))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトオンコプロテイン誘導性転写物3(OIT3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において不安様応答が増加した雄ホモ接合体マウスが得られた。さらに、組織特異的FACSにより、B220hiCD43−、IgM+、およびIgD+の比率の減少によって特徴づけられた変異(−/−)マウスで免疫学的変化が明らかとなった。雌(−/−)マウスは、骨塩量および骨中無機質密度の測定値が減少した。UNQ826は、正常および罹患した肝臓組織の両方で高発現を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトオンコプロテイン誘導性転写物3(OIT3)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オープンフィールド試験において不安様応答が増加した雄ホモ接合体マウスが得られた。さらに、組織特異的FACSにより、B220hiCD43−、IgM+、およびIgD+の比率の減少によって特徴づけられた変異(−/−)マウスで免疫学的変化が明らかとなった。雌(−/−)マウスは、骨塩量および骨中無機質密度の測定値が減少した。UNQ826は、正常および罹患した肝臓組織の両方で高発現を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼ
すこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
すこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析/組織特異的FACS
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析/組織特異的FACS
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
組織特異的FACSプロジェクト:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のB220hiCD43細胞、IgM+細胞、およびIgD+細胞の比率が減少した。これらの結果は、骨髄中のプレB細胞、未成熟および成熟B細胞のサブセッ
トの減少を示す。したがって、PRO1753ポリペプチドは、骨髄中でのB細胞集団の発達に重要であり、B細胞産生の刺激に有用であろう。
組織特異的FACSプロジェクト:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のB220hiCD43細胞、IgM+細胞、およびIgD+細胞の比率が減少した。これらの結果は、骨髄中のプレB細胞、未成熟および成熟B細胞のサブセッ
トの減少を示す。したがって、PRO1753ポリペプチドは、骨髄中でのB細胞集団の発達に重要であり、B細胞産生の刺激に有用であろう。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン(seratonin)輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比(center−to−total distance traveled ratio)は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらには、セラトニン(seratonin)輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比(center−to−total distance traveled ratio)は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各
5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:
オープンフィールド2:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が減少し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。さらに、8匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹および8匹の(−/−)ノックアウトマウスのうちの6匹で髭が無かった。髭のない頻度が高いノックアウトマウスは、おそらく、不安表現型に関連する。
オープンフィールド2:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が減少し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。さらに、8匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹および8匹の(−/−)ノックアウトマウスのうちの6匹で髭が無かった。髭のない頻度が高いノックアウトマウスは、おそらく、不安表現型に関連する。
まとめると、オープンフィールド試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進;感覚障害;強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO1753ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(d)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均骨塩量および骨中無機質密度が減少した。
DEXA:
雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均骨塩量および骨中無機質密度が減少した。
したがって、PRO1753ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、骨塩量およびの測定値の減少によって記される骨粗鬆症と一致する表現型を示す。したがって、PRO1753ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連効果を模倣するであろう。他方では、PRO1753ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨量減少に関連する骨障害の予防および/または治療で有用であろう。
66.38.DNA76396−1698(UNQ828)遺伝子破壊を含むマウスの
作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1755ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA76396−1698と示す)(UNQ828)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_175696 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA C530028O21 gene(C530028O21Rik);参照タンパク質:Q6P1B3 アクセッション:Q6P1B3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。C530028O21Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_153685 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp547D2210(DKFZp547D2210);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IYJ0 アクセッション:Q8IYJ0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質DKFZp547D2210。
作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1755ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA76396−1698と示す)(UNQ828)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_175696 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA C530028O21 gene(C530028O21Rik);参照タンパク質:Q6P1B3 アクセッション:Q6P1B3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。C530028O21Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_153685 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp547D2210(DKFZp547D2210);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IYJ0 アクセッション:Q8IYJ0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質DKFZp547D2210。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA C530028O21遺伝子(ヒト仮説タンパク質DKFZp547D2210のオーソログ)である。別名には、EST AI255183およびDKFZp547D2210が含まれる。
仮説タンパク質DKFZp547D2210は、I型内在性膜タンパク質であり、シグナルペプチドおよび膜貫通ドメインからなる。このタンパク質の機能は知られておらず、その推定される細胞中の位置はあいまいである。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 33 16 65
予測値 16.25 32.5 16.25 65
カイ二乗=0.09 有意性=0.95599747(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_175696.2)
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 33 16 65
予測値 16.25 32.5 16.25 65
カイ二乗=0.09 有意性=0.95599747(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_175696.2)
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.38.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA76396−1698(UNQ828))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖率が増加した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。さらに、雌(−/−)マウスは、耐糖能障害を示した。(−/−)マウスはまた、平均血清IgG1レベルが減少した。UNQ828は、他の正
常組織と比較してCNS中に高度に発現する。内皮はまた、中程度に高い発現を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説膜タンパク質のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖率が増加した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。さらに、雌(−/−)マウスは、耐糖能障害を示した。(−/−)マウスはまた、平均血清IgG1レベルが減少した。UNQ828は、他の正
常組織と比較してCNS中に高度に発現する。内皮はまた、中程度に高い発現を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
経口耐糖能:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中程度の耐糖能障害を示した。
血糖値/耐糖能試験:
経口耐糖能:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、中程度の耐糖能障害を示した。
これらの研究は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、PRO1755ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または種々の心血管障害(糖尿病が含まれる)に関連する病態の治療で有用であろう。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG1レベルが減少した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG1レベルが減少した。
したがって、変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較してIgG1血清免疫グロブリンが減少した。これらの免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。認められた表現型により、PRO1755ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。したがって、PRO1755ポリペプチドをコードする遺伝子は、IgG1免疫グロブリン(またはγグロブリン)の作製に不可欠である。これらの免疫学的異常により、PRO1755ポリペプチドが免疫系を刺激することができ、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO1755ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、免疫応答の阻害で役割を果たし得、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(d)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
(d)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マ
ウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
皮膚増殖:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が増加した。4匹の(−/−)マウスのうちの2匹は、増殖が有意に増加した。
ウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
皮膚増殖:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が増加した。4匹の(−/−)マウスのうちの2匹は、増殖が有意に増加した。
したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO1755ポリペプチドまたはそのアゴニストは、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
66.39.DNA71235−1706(UNQ839)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1777ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA71235−1706と示す)(UNQ839)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_028710 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 6330406P08遺伝子(6330406P08Rik);参照タンパク質:Q9D3B4 アクセッション:Q9D3B4 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。6330406P08RIK PROTEIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_014960 ホモ・サピエンスアリールスルファターゼG(KIAA1001);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q96EG1 アクセッション:Q96EG1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。アリールスルファターゼG。
これらのノックアウト実験では、PRO1777ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA71235−1706と示す)(UNQ839)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_028710 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 6330406P08遺伝子(6330406P08Rik);参照タンパク質:Q9D3B4 アクセッション:Q9D3B4 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。6330406P08RIK PROTEIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_014960 ホモ・サピエンスアリールスルファターゼG(KIAA1001);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q96EG1 アクセッション:Q96EG1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。アリールスルファターゼG。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 6330406P08遺伝子(ヒトARSG(アリールスルファターゼG)のオーソログ)である。別名には、KIAA1001が含まれる。
ARSGは、アリールスルホエステル結合の加水分解を触媒する可能性が高い酵素である。この酵素の位置は、明確に知られていない。ARSGのバイオインフォマティクス分析により、この酵素がリソソーム中に存在し得るか分泌することができることが示唆される。COS7細胞中に発現したARSGは、小胞体中に存在する(Ferrante et al,Eur J Hum Genet 10(12):813−8(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 12 33 12 57
予測値 14.25 28.5 14.25 57
カイ二乗=0.01 有意性=0.99501246(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028710.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 12 33 12 57
予測値 14.25 28.5 14.25 57
カイ二乗=0.01 有意性=0.99501246(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_028710.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.39.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA71235−1706(UNQ839))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトアリールスルファターゼG(ARSG)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合性変異体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均比率の減少および平均血清IgG3レベルの増加を示した。雌変異体はまた、平均皮膚線維芽細胞の増殖率が減少した。雄(−/−)マウスはまた、平均総体脂肪マス率が増加し、平均骨中無機質密度関連測定値が減少した。マイクロCTの結果は、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。雌(−/−)マウスは、ホームケージ試験時に歩行回数の中央値が増加し、これは、日周期リズムの増強を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析は、正常な乳房組織と比較して乳房腫瘍でUNQ839が過剰発現することを示す。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトアリールスルファターゼG(ARSG)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合性変異体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均比率の減少および平均血清IgG3レベルの増加を示した。雌変異体はまた、平均皮膚線維芽細胞の増殖率が減少した。雄(−/−)マウスはまた、平均総体脂肪マス率が増加し、平均骨中無機質密度関連測定値が減少した。マイクロCTの結果は、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。雌(−/−)マウスは、ホームケージ試験時に歩行回数の中央値が増加し、これは、日周期リズムの増強を示す。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)マイクロアレイ解析
マイクロアレイ解析は、正常な乳房組織と比較して乳房腫瘍でUNQ839が過剰発現することを示す。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリン
パ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
パ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
(1)蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
(1)蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:
(−/−)マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均比率の低下によって特徴づけられる異なる白血球サブセットの分布の変化を示した。
結果:
FACS:
(−/−)マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のナチュラルキラー細胞の平均比率の低下によって特徴づけられる異なる白血球サブセットの分布の変化を示した。
まとめると、FACS結果は、特に、PRO1777ポリペプチドをコードするDNA71235−1706遺伝子のノックアウトに関連した負の表現型の指標であるナチュラルキラー細胞の平均比率の低下を考慮すると、ホモ接合性変異マウスの免疫系が損なわれたことが示唆される。ナチュラルキラー細胞は、ウイルス免疫および腫瘍に対する防御に関与しているため、ウイルス感染の防御の第一線である。ナチュラルキラー細胞またはNK細胞は、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性においてエフェクターとして作用し、事前の免疫化または活性化の必要なしに一定のリンパ系腫瘍細胞株をin vitroで死滅す
る能力によって同定されてきた。しかしながら、宿主防御におけるこれらの公知の機能は、いくつかの細胞内の病原体、特にヘルペスウイルスの感染の初期においてである。したがって、PRO1777ポリペプチドおよびそのアゴニストは、健康な免疫系に重要であり、且つ特にウイルス感染時の免疫系刺激で有用であろう。
(2)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG3レベルが増加した。
る能力によって同定されてきた。しかしながら、宿主防御におけるこれらの公知の機能は、いくつかの細胞内の病原体、特にヘルペスウイルスの感染の初期においてである。したがって、PRO1777ポリペプチドおよびそのアゴニストは、健康な免疫系に重要であり、且つ特にウイルス感染時の免疫系刺激で有用であろう。
(2)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG3レベルが増加した。
免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合体成体が血清IgG3レベルの増加を示すことが明らかとなった。したがって、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが上昇した。IgG3免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、PRO1777ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターがが免疫系を刺激し、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO1777ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答を阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(d)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
(d)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
皮膚増殖:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
結果:
皮膚増殖:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が減少した。
したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO1777ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、この高増殖表現型を模倣し、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。これらの結果は、乳房腫瘍におけるこの遺伝子の過剰発現を示すマイクロアレイデータと一致する。
(e)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限
定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
サーカディアン:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の数と比較した場合、両暗期中に歩行回数の中央値が顕著に増加した(多動)。
これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および感覚障害と一致する。
(f)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
(e)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限
定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
サーカディアン:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の数と比較した場合、両暗期中に歩行回数の中央値が顕著に増加した(多動)。
これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および感覚障害と一致する。
(f)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮
質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨塩量および平均骨中無機質密度の減少を伴う平均骨中無機質密度関連測定値が減少した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスはまた、性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮
質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、骨塩量および平均骨中無機質密度の減少を伴う平均骨中無機質密度関連測定値が減少した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスはまた、性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が減少した。
これらの結果は、ノックアウト変異マウスが、密度の減少および骨折し得る脆弱性を伴う骨量の減少によって特徴づけられる骨粗鬆症に類似する骨測定値が減少した異常な骨代謝を示すことを証明する。したがって、PRO1777ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持で有用なようである。さらに、PRO1777ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、骨治癒または関節炎もしくは骨粗鬆症の治療に有用であろう。それに対して、PRO1777またはそのコード遺伝子のアンタゴニストは、病的骨障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)を引き起こすであろう。
雄(−/−)マウスはまた、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことが示唆される。病理学的所見は、放射線学的所見と一致する。したがって、PRO1777ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および/または肥満症の防止および/または治療で特に重要であろう。
66.40.DNA77652−2505(UNQ850)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1788ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA77652−2505と示す)(UNQ850)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_485965 PREDICTED:ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 9530051K01遺伝子(9530051K01Rik);参照タンパク質:XP_485965(仮説タンパク質の類似物)、エストラジオール誘導性(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:NM_015516 ホモ・サピエンス仮説タンパク質、エストラジオール誘導性(E2IG4);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9UJX9 アクセッション:Q9UJX9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。E2IG4。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 9530051K01遺伝子(ヒトTSKのオーソログ(ニワトリツクシ(chicken tsukushi)のオーソログである可能性が高い))である。別名には、E2IG4が含まれる。
TSKは、分泌タンパク質であり、シグナルペプチド、ロイシンリッチ反復N末端ドメイン、およびいくつかのロイシンリッチ反復からなる。TSKは、骨形態形成タンパク質またはコーディンに結合して三元複合体を形成し、原腸陥入時のBMP誘導性ヘンゼン結
節形成を阻害する。TSKは、胚発生時の背側化で役割を果たす可能性が高い(Ohta
et al,Dev Cell 7(3):347−58(2004))。TSKはまた、エストロゲン応答性癌細胞中に発現し、乳房組織再造形または上皮−間質相互作用で役割を果たすと提案されている(Charpaentier et al,Cancer
Res 60(21):5977−83(2000))。
節形成を阻害する。TSKは、胚発生時の背側化で役割を果たす可能性が高い(Ohta
et al,Dev Cell 7(3):347−58(2004))。TSKはまた、エストロゲン応答性癌細胞中に発現し、乳房組織再造形または上皮−間質相互作用で役割を果たすと提案されている(Charpaentier et al,Cancer
Res 60(21):5977−83(2000))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 42 26 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗=0.78 有意性=0.6770569(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションAK035461.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脾臓、肝臓、骨格筋、胃、小腸、結腸、心臓、および脂肪中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 21 42 26 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗=0.78 有意性=0.6770569(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン2をターゲティングした(NCBIアクセッションAK035461.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脾臓、肝臓、骨格筋、胃、小腸、結腸、心臓、および脂肪中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.40.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA77652−2505(UNQ850))
(a)全体的な表現型の概要:
ニワトリツクシ(TSK)のヒト様オーソログをコードする遺伝子の変異により、平均血清IgMレベルが増加した変異(−/−)マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
(a)全体的な表現型の概要:
ニワトリツクシ(TSK)のヒト様オーソログをコードする遺伝子の変異により、平均血清IgMレベルが増加した変異(−/−)マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要
組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgMレベルが増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgMレベルが増加した。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較してIgM血清免疫グロブリンが上昇した。IgM免疫グロブリンは、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において最初に産生され、補体系の活性化に特に重要である。認められた表現型により、PRO1788ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、PRO1788ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が免疫系(T細胞増殖など)を刺激することができ、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO1788ポリペプチドまたはアゴニストは、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
66.41.DNA45409−2511(UNQ855)遺伝子破壊を含むマウスの
作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1864ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA45409−2511と示す)(UNQ855)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_024270 ムス・ムスクルス STARD3 N末端様(Stard3nl);参照タンパク質:Q9DCI3 アクセッション:Q9DCI3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。MLN64 N末端ドメインホモログ(STARD3N末端様タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_032016 ホモ・サピエンス STARD3 N末端様(STARD3NL);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:O95772 アクセッション:O95772 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。H_NH1021A08.1タンパク質(未知)(MGCのタンパク質:14607)(ステロイド産生急性調節タンパク質関連物の類似物)。
作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1864ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA45409−2511と示す)(UNQ855)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_024270 ムス・ムスクルス STARD3 N末端様(Stard3nl);参照タンパク質:Q9DCI3 アクセッション:Q9DCI3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。MLN64 N末端ドメインホモログ(STARD3N末端様タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_032016 ホモ・サピエンス STARD3 N末端様(STARD3NL);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:O95772 アクセッション:O95772 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。H_NH1021A08.1タンパク質(未知)(MGCのタンパク質:14607)(ステロイド産生急性調節タンパク質関連物の類似物)。
目的のマウス遺伝子は、Stard3nl(STARD3 N末端様)(ヒトSTARD3NLのオーソログ)である。別名には、MENTHO、0610035N01Rik、6530409L22Rik、MGC3251、およびMLN64 N末端ドメインホモログが含まれる。STARD3NLは、主に後期エンドソーム上に存在する遍在的に発現する内在性膜タンパク質である。バイオインフォマティクス分析により、STARD3NLが細胞外タンパク質でもあり得ることが示唆される。STARD3NLは、後期エンドソームへのタンパク質のターゲティングおよび繋留に関与するMENTAL(MLN64 N末端)ドメイン内の4つの膜貫通セグメントからなる。STARD3NLは、エンドソーム輸送で役割を果たす可能性が高い(Alpy et al,J Biol Chem 277(52):50780−7(2002);Clark et al,Genome Res 13(10):2265−70(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 15 35 24 74
予測値 18.5 37 18.5 74
カイ二乗=2.82 有意性=0.24414329(hom/n)=0.3 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_024270.1)
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 15 35 24 74
予測値 18.5 37 18.5 74
カイ二乗=2.82 有意性=0.24414329(hom/n)=0.3 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_024270.1)
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.41.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA45409−2511(UNQ855))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSTARD3 N末端様(STARD3NL)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、水腎症を示す変異(−/−)マウスが得られた。8匹の(+/+)マウスのうちの4匹および8匹の(−/−)マウスのうちの5匹に髭が存在せず、8匹の(+/+)マウスのうちの4匹および8匹の(−/−)マウスのうちの5匹に排便が無かった。血液化学の結果は、(+/+)、(+/−)、および(−/−)マウスにおいて異常なレベルのウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質、およびケトン体を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
試験した3匹の(−/−)マウスのうち、2匹の(−/−)(M−226およびF−180)は、水腎症を示した。水腎症は、流出の閉塞の結果としての腎盂中の尿の蓄積によって腎臓の嚢胞が拡張する容態である。したがって、PRO1864ポリペプチドをコードする遺伝子の欠失により、腎臓および嚢胞の萎縮が起こる。
(c)表現型解析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病および他の代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学分析は、野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスの異常を示した。ウロビリノーゲンは、8匹の変異(−/−)マウスのうちの4匹で見出され、亜硝酸塩は4匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹、4匹のヘテロ接合体マウス(+/−)のうちの1匹、および8匹の(−/−)マウス農地の4匹で見出され、タンパク質は4匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹、4匹の(+/−)マウスのうちの1匹、および8匹の(−/−)マウスのうちの3匹で見出され、ケトン体は4匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹、4匹の(+/−)ヘテロ接合体マウスのうちの2匹、および8匹の変異(−/−)マウスのうちの5匹で見出された。ヘテロ接合体(+/−)マス卯およびホモ接合体(−/−)マウス中のタンパク質、亜硝酸塩、およびケトン体の発生率の増加は、CATスキャンで発見された異常な腎臓の結果に関連する。これらの結果は、水腎症を示すCAT−スキャンの結果と一致する。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSTARD3 N末端様(STARD3NL)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、水腎症を示す変異(−/−)マウスが得られた。8匹の(+/+)マウスのうちの4匹および8匹の(−/−)マウスのうちの5匹に髭が存在せず、8匹の(+/+)マウスのうちの4匹および8匹の(−/−)マウスのうちの5匹に排便が無かった。血液化学の結果は、(+/+)、(+/−)、および(−/−)マウスにおいて異常なレベルのウロビリノーゲン、亜硝酸塩、タンパク質、およびケトン体を示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
試験した3匹の(−/−)マウスのうち、2匹の(−/−)(M−226およびF−180)は、水腎症を示した。水腎症は、流出の閉塞の結果としての腎盂中の尿の蓄積によって腎臓の嚢胞が拡張する容態である。したがって、PRO1864ポリペプチドをコードする遺伝子の欠失により、腎臓および嚢胞の萎縮が起こる。
(c)表現型解析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病および他の代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学分析は、野生型マウス、ヘテロ接合体マウス、およびホモ接合体マウスの異常を示した。ウロビリノーゲンは、8匹の変異(−/−)マウスのうちの4匹で見出され、亜硝酸塩は4匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹、4匹のヘテロ接合体マウス(+/−)のうちの1匹、および8匹の(−/−)マウス農地の4匹で見出され、タンパク質は4匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹、4匹の(+/−)マウスのうちの1匹、および8匹の(−/−)マウスのうちの3匹で見出され、ケトン体は4匹の(+/+)野生型マウスのうちの2匹、4匹の(+/−)ヘテロ接合体マウスのうちの2匹、および8匹の変異(−/−)マウスのうちの5匹で見出された。ヘテロ接合体(+/−)マス卯およびホモ接合体(−/−)マウス中のタンパク質、亜硝酸塩、およびケトン体の発生率の増加は、CATスキャンで発見された異常な腎臓の結果に関連する。これらの結果は、水腎症を示すCAT−スキャンの結果と一致する。
66.42.DNA82302−2529(UNQ904)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1925ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA82302−2529と示す)(UNQ904)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_155973 PREDICTED:ムス・ムスクルス(SARG904の類似物)(LOC239691);参照タンパク質:XP_155973(SARG904
の類似物)(ムス・ムスクルス)gi|51769442|ref|XP_358755.2|(SARG904の類似物)(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:NM_152459 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC45438(MGC45438);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8N2I3 アクセッション:Q8N2I3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質FLJ90761。
これらのノックアウト実験では、PRO1925ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA82302−2529と示す)(UNQ904)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_155973 PREDICTED:ムス・ムスクルス(SARG904の類似物)(LOC239691);参照タンパク質:XP_155973(SARG904
の類似物)(ムス・ムスクルス)gi|51769442|ref|XP_358755.2|(SARG904の類似物)(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:NM_152459 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC45438(MGC45438);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8N2I3 アクセッション:Q8N2I3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質FLJ90761。
目的のマウス遺伝子は、「SARG904の類似物」(ヒト仮説タンパク質MGC45438のオーソログ)である。
仮説タンパク質MGC45438は、推定分泌タンパク質であり、シグナルペプチドおよびいくつかの不十分に予想された部分的に保存されたドメイン(セルピン(セリンプロテアーゼインヒビター)ドメイン(SMARTアクセッションSM00093)、B細胞リンパ腫(BCL;抗アポトーシス性)ドメイン(SMARTアクセッションSM00337)、およびトポイソメラーゼIIドメイン(SMARTアクセッションSM00433)など)からなる。このタンパク質の機能は知られていない。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 30 15 66
予測値 16.5 33 16.5 66
カイ二乗=4.38 有意性=0.11191674(hom/n)=0.19 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションBM453823.1)。
1.野生型発現パネル:骨、胃、小腸、および結腸以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 21 30 15 66
予測値 16.5 33 16.5 66
カイ二乗=4.38 有意性=0.11191674(hom/n)=0.19 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションBM453823.1)。
1.野生型発現パネル:骨、胃、小腸、および結腸以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.42.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA82302−2529(UNQ904))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(MGC45438)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、総脂肪マスおよび総体脂肪率の増加および総組織マスの増加を示す(−/−)マウスが得られた。4匹の(+/+)野生型マウスのうちの1匹および8匹の変異(−/−)マウスのうちの4匹で白血球が認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含
んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(MGC45438)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、総脂肪マスおよび総体脂肪率の増加および総組織マスの増加を示す(−/−)マウスが得られた。4匹の(+/+)野生型マウスのうちの1匹および8匹の変異(−/−)マウスのうちの4匹で白血球が認められた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含
んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)の両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)の両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO1925ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な脂肪および脂質代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および/または肥満の予防および/または治療で特に重要であろう。
66.43.DNA82340−2530(UNQ905)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO1926ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA82340−2530と示す)(UNQ905)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_133749 アクセッション:NM_133749 NID:gi 19526955 ref NM_133749.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2900064A13遺伝子(2900064A13Rik);参照タンパク質:Q9EP72 アクセッション:Q9EP72 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質(推定ATG/GTP結合タンパク質前駆体);参照ヒト遺伝子配列:NM_020154 アクセッション:NM_020154 NID:gi 9910345
ref NM_020154.1 ホモ・サピエンス第11染色体仮説タンパク質ORF3(LOC56851);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9NPA0 アクセッション:Q9NPA0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。推定ATG/GTP結合タンパク質前駆体(HT022)。
これらのノックアウト実験では、PRO1926ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA82340−2530と示す)(UNQ905)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_133749 アクセッション:NM_133749 NID:gi 19526955 ref NM_133749.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2900064A13遺伝子(2900064A13Rik);参照タンパク質:Q9EP72 アクセッション:Q9EP72 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質(推定ATG/GTP結合タンパク質前駆体);参照ヒト遺伝子配列:NM_020154 アクセッション:NM_020154 NID:gi 9910345
ref NM_020154.1 ホモ・サピエンス第11染色体仮説タンパク質ORF3(LOC56851);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9NPA0 アクセッション:Q9NPA0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。推定ATG/GTP結合タンパク質前駆体(HT022)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2900064A13遺伝子(ヒトC15orf24(第15染色体読み取り枠24)のオーソログ)である。別名には、c11orf3、HT022、ORF1−FL1、および第15染色体推定ATP/GTP結合タンパク質が含まれる。
C15orf24は、推定内在性膜タンパク質であり、シグナルペプチド、膜貫通セグメント、および潜在的なATP/GTP結合部位を含む(O’Brien et al,Biochem Biophys Res Commun 273(1):90−4(2
000))。
000))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 50 0 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=47.17 有意性=5.7169585E−11(hom/n)=0.0 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133749.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 23 50 0 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=47.17 有意性=5.7169585E−11(hom/n)=0.0 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133749.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.43.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA82340−2530(UNQ905))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト第15染色体読み取り枠24(C15orf24)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。雄ヘテロ接合体マウスは、ストレス誘導性高熱試験中に不安様応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:分析した(+/−)マウスにおいて顕著な相違は認められなかった。しかし、(−/−)マウスは分析に利用できなかった。12.5日目に、以下の51個の胚を観察した:27個の(+/−)胚、10個の(+/+)胚、12個の吸収奇胎(resorption moles)、および2個の不確定の胚。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障
害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウスおよび4匹のヘテロ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
ストレス誘導過温症:雄(+/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト第15染色体読み取り枠24(C15orf24)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。雄ヘテロ接合体マウスは、ストレス誘導性高熱試験中に不安様応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:分析した(+/−)マウスにおいて顕著な相違は認められなかった。しかし、(−/−)マウスは分析に利用できなかった。12.5日目に、以下の51個の胚を観察した:27個の(+/−)胚、10個の(+/+)胚、12個の吸収奇胎(resorption moles)、および2個の不確定の胚。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障
害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウスおよび4匹のヘテロ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
ストレス誘導過温症:雄(+/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。
まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO1926ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
66.44.DNA59844−2542(UNQ1840)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO3566ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59844−2542と示す)(UNQ1840)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_175148 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2300002M23遺伝子(2300002M23Rik);参照タンパク質:Q8BM15 アクセッション:Q8BM15 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。TASTE芽(bud)特異的タンパク質前駆体の少しの類似物;参照ヒト遺伝子配列:NM_014070 ホモ・サピエンス第6染色体読み取り枠15(C6orf15);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9UIG3 アクセッション:Q9UIG3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。STGタンパク質。
これらのノックアウト実験では、PRO3566ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA59844−2542と示す)(UNQ1840)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_175148 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2300002M23遺伝子(2300002M23Rik);参照タンパク質:Q8BM15 アクセッション:Q8BM15 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。TASTE芽(bud)特異的タンパク質前駆体の少しの類似物;参照ヒト遺伝子配列:NM_014070 ホモ・サピエンス第6染色体読み取り枠15(C6orf15);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9UIG3 アクセッション:Q9UIG3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。STGタンパク質。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2300002M23遺伝子(ヒトC6orf15(第6染色体読み取り枠15)のオーソログ)である。別名には、STGおよびSTGタンパク質が含まれる。
C6orf15は、推定分泌タンパク質であり、主要プリオンタンパク質(PRP)内にシグナルペプチドおよびいくつかの内部反復を含む。C6orf15の機能は知られていないが、味覚細胞の小集団中に発現することから、C6orf15が味覚細胞生理学で役割を果たし得ることが示唆される(Neira et al,Mamm Genome
12(1):60−6(2001);Clark et al,Genome Res
13(10):2265−70(2003))。
12(1):60−6(2001);Clark et al,Genome Res
13(10):2265−70(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 13 39 21 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=3.68 有意性=0.15881743(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_175148.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、胸腺、脾臓、肺、腎臓、肝臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 13 39 21 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=3.68 有意性=0.15881743(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_175148.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、胸腺、脾臓、肺、腎臓、肝臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.44.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA59844−2542(UNQ1840))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト第6染色体読み取り枠15(C6orf15)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび総体脂肪が減少した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)骨代謝および身体診断/放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMD
を測定した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト第6染色体読み取り枠15(C6orf15)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび総体脂肪が減少した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)骨代謝および身体診断/放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMD
を測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雌(−/−)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが減少した。
結果:
DEXA:雌(−/−)は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが減少した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が成長遅延および/または組織消耗性障害に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO3566ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な脂肪および脂質の代謝過程に不可欠であり、悪液質などの組織消耗性障害の予防および/または治療で特に重要であろう。
66.45.DNA90842−2574(UNQ1886)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4330ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA90842−2574と示す)(UNQ1886)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:AF168680 アクセッション:AF168680 NID:6979312
ムス・ムスクルス ムス・ムスクルスシステインリッチ反復含有タンパク質CRIM1(Crim1);参照タンパク質:Q9JLL0 アクセッション:Q9JLL0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。システインリッチ反復含有タンパク質CRIM1前駆体(フラグメント);参照ヒト遺伝子配列:NM_016441 アクセッション:NM_016441 NID:10092638 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンスシステインリッチ運動ニューロン1(CRIM1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9NZV1 アクセッション:Q9NZV1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。システインリッチ反復含有タンパク質S52前駆体(CRIM1 PROTEIN)。
これらのノックアウト実験では、PRO4330ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA90842−2574と示す)(UNQ1886)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:AF168680 アクセッション:AF168680 NID:6979312
ムス・ムスクルス ムス・ムスクルスシステインリッチ反復含有タンパク質CRIM1(Crim1);参照タンパク質:Q9JLL0 アクセッション:Q9JLL0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。システインリッチ反復含有タンパク質CRIM1前駆体(フラグメント);参照ヒト遺伝子配列:NM_016441 アクセッション:NM_016441 NID:10092638 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンスシステインリッチ運動ニューロン1(CRIM1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9NZV1 アクセッション:Q9NZV1 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。システインリッチ反復含有タンパク質S52前駆体(CRIM1 PROTEIN)。
目的のマウス遺伝子は、Crim1(システインリッチ運動ニューロン1)(ヒトCRIM1のオーソログ)である。別名には、S52およびシステインリッチ反復含有タンパク質S52前駆体が含まれる。
CRIM1は、細胞接着分子または受容体として機能する可能性が高いI型原形質膜タンパク質である。CRIM1は分泌タンパク質でもあり、これは、細胞外ドメインが原形質膜からタンパク質分解的に切断されるためである。CRIM1は、骨形成タンパク質(BMP)−4およびBMP−7に結合し、BMPシグナル伝達を阻害する(Wilkinson et al,J Biol Chem 278(36):34181−8(2003))。Crim1は、成長中の脊髄、眼、レンズ、および精巣に発現し、潜在的にCNSの成長および器官形成で役割を果たす(Kolle et al,Mech Dev
90(2):181−93(2000);Lovicu et al,Mech Dev 94(1−2):261−5(2000);Georgas et al,Dev Dyn 219(4):582−7(2000))。CRIM1は内皮細胞でも発現し、血管形成時の毛細管形成で役割を果たす可能性が高い(Glienke et al,Mech Dev 119(2):165−75(2002))。
90(2):181−93(2000);Lovicu et al,Mech Dev 94(1−2):261−5(2000);Georgas et al,Dev Dyn 219(4):582−7(2000))。CRIM1は内皮細胞でも発現し、血管形成時の毛細管形成で役割を果たす可能性が高い(Glienke et al,Mech Dev 119(2):165−75(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 14 22 0 36
予測値 9 18 9 36
カイ二乗=14.85 有意性=5.9616077E 4(hom/n)=0.09 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン5をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_128751.5)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 14 22 0 36
予測値 9 18 9 36
カイ二乗=14.85 有意性=5.9616077E 4(hom/n)=0.09 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン5をターゲティングした(NCBIアクセッションXM_128751.5)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.45.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA90842−2574(UNQ1886))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトシステインリッチ運動ニューロン1(CRIM1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。UNQ1886は血管中に高度に発現し、骨形成タンパク質の調節にも関与する。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均B細胞率が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、以下の53個の胚を観察した:10個の(−/−)胚、21個の(+/−)胚、13個の(+/+)胚、および9個の再吸収奇胎。組織学的試験によって12.5日目の胚に成長異常は検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって分析された組織パネルのうちで脳内しか検出されなかった。
UNQ1886ノックアウト胚研究:
UNQ1886ノックアウト胚の組織胚研究は、皮膚の水疱および出血表現型を示し、UNQ1886が2つの組織層の間の強い相互作用の維持に関与することが示唆された。E12.5ノックアウト胚は、胚前頭部の6μmのFFPE切片によって示されるように、頭部(眼の高さ)の両側に皮膚の水疱を示す。皮膚の水疱は、E13.5ノックアウト胚の頭蓋背部、脊椎中央、および眼の高さにも認められた。出血は、頭蓋前頭部にも見出された。E14ノックアウト胚(lacZ染色前頭部の14μmの凍結切片−眼の高さ)は、成長中の皮膚中のUNQ186の発現を示す。全組織標本子宮の子宮切片の遺伝子3β−gal活性染色は、UNQ1886の発現を示した。ノックアウト胚(E13.5およびE15.5)における多病巣性出血は、前頭部切片(眼および鼻腔)に生じ、前肢および腹部に出血が生じた。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトシステインリッチ運動ニューロン1(CRIM1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。UNQ1886は血管中に高度に発現し、骨形成タンパク質の調節にも関与する。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中の平均B細胞率が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:12.5日目に、以下の53個の胚を観察した:10個の(−/−)胚、21個の(+/−)胚、13個の(+/+)胚、および9個の再吸収奇胎。組織学的試験によって12.5日目の胚に成長異常は検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって分析された組織パネルのうちで脳内しか検出されなかった。
UNQ1886ノックアウト胚研究:
UNQ1886ノックアウト胚の組織胚研究は、皮膚の水疱および出血表現型を示し、UNQ1886が2つの組織層の間の強い相互作用の維持に関与することが示唆された。E12.5ノックアウト胚は、胚前頭部の6μmのFFPE切片によって示されるように、頭部(眼の高さ)の両側に皮膚の水疱を示す。皮膚の水疱は、E13.5ノックアウト胚の頭蓋背部、脊椎中央、および眼の高さにも認められた。出血は、頭蓋前頭部にも見出された。E14ノックアウト胚(lacZ染色前頭部の14μmの凍結切片−眼の高さ)は、成長中の皮膚中のUNQ186の発現を示す。全組織標本子宮の子宮切片の遺伝子3β−gal活性染色は、UNQ1886の発現を示した。ノックアウト胚(E13.5およびE15.5)における多病巣性出血は、前頭部切片(眼および鼻腔)に生じ、前肢および腹部に出血が生じた。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のヘテロ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のヘテロ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS3:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、(−/−)マウス中のB細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
結果:
FACS3:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、(−/−)マウス中のB細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
まとめると、免疫細胞組成物のFACS解析は、ヘテロ接合体(+/−)マウスがB細胞に関して免疫学的相違を示すことを示す。
66.46.DNA96893−2621(UNQ1940)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4423ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA96893−2621と示す)(UNQ1940)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_173375アクセッション:NM_173375 NID:gi 27734065 ref NM_173375.1 ムス・ムスクルス仮説タンパク質B230314O19(B230314O19);参照タンパク質:Q8BR21 アクセッション:Q8BR21 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_205855 ホモ・サピエンス HWKM1940(UNQ1940);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWF9 アクセッション:Q6UWF9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。HWKM1940。
これらのノックアウト実験では、PRO4423ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA96893−2621と示す)(UNQ1940)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_173375アクセッション:NM_173375 NID:gi 27734065 ref NM_173375.1 ムス・ムスクルス仮説タンパク質B230314O19(B230314O19);参照タンパク質:Q8BR21 アクセッション:Q8BR21 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_205855 ホモ・サピエンス HWKM1940(UNQ1940);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWF9 アクセッション:Q6UWF9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。HWKM1940。
目的のマウス遺伝子は、cDNA配列BC064033(ヒトUNQ1940のオーソログ)である。別名には、B230314O19およびHWKM1940が含まれる。
UNQ1940は、推定173アミノ酸分泌タンパク質であり、シグナルペプチドおよび他で定義されていない保存ドメインを含む。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来
の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 13 30 19 62
予測値 15.5 31 15.5 62
カイ二乗=0.68 有意性=0.7117703(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_173375.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 13 30 19 62
予測値 15.5 31 15.5 62
カイ二乗=0.68 有意性=0.7117703(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン2および3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_173375.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.46.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA96893−2621(UNQ1940))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質(UNQ1940)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの末梢血中のCD4細胞の比率が減少し、B細胞の比率が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質(UNQ1940)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの末梢血中のCD4細胞の比率が減少し、B細胞の比率が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
ホモ接合体(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のCD4細胞の平均比率が減少した。さらに、(−/−)マウスは、B細胞の比率が増加した。
結果:
ホモ接合体(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のCD4細胞の平均比率が減少した。さらに、(−/−)マウスは、B細胞の比率が増加した。
まとめると、FACSの結果は、ホモ接合性変異体がT細胞集団の減少およびB細胞集団の増加によって特徴づけられた免疫学的異常を証明することを示す。これらの所見から、PRO4423ポリペプチドまたはPRO4423をコードする遺伝子は、T細胞増殖の正の調節因子として作用するようであるが、B細胞集団の負の調節因子である。PRO4423ポリペプチドおよびそのアゴニストは、健康な免疫系に重要であり、且つ特にT細胞
増殖の増加のための免疫系の刺激で有用であろう。
増殖の増加のための免疫系の刺激で有用であろう。
66.47.DNA336539(UNQ2257)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO36935ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA336539と示す)(UNQ2257)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_011627 ムス・ムスクルス栄養膜糖タンパク質(Tpbg);参照タンパク質:Q9Z0L0 アクセッション:Q9Z0L0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。5T4腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質前駆体;参照ヒト遺伝子配列:NM_006670 ホモ・サピエンス栄養膜糖タンパク質(TPBG);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q13641 アクセッション:Q13641 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。5T4腫瘍胎児抗原前駆体(5T4腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質前駆体)。
これらのノックアウト実験では、PRO36935ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA336539と示す)(UNQ2257)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_011627 ムス・ムスクルス栄養膜糖タンパク質(Tpbg);参照タンパク質:Q9Z0L0 アクセッション:Q9Z0L0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。5T4腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質前駆体;参照ヒト遺伝子配列:NM_006670 ホモ・サピエンス栄養膜糖タンパク質(TPBG);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q13641 アクセッション:Q13641 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。5T4腫瘍胎児抗原前駆体(5T4腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質前駆体)。
目的のマウス遺伝子は、Tpbg(栄養膜糖タンパク質)(ヒトTPBGのオーソログ)である。別名には、5T4、M6P1、5T4−AG、5T4抗原、および5T4腫瘍胎児栄養膜糖タンパク質が含まれる。
TPBGは、内在性原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチド、いくつかのロイシンリッチ反復、膜貫通セグメント、およいび短い細胞質C末端からなる。TPBGは、栄養膜細胞、羊膜上皮、脳、卵巣、および種々の癌腫中に発現する。TPBGは、接着細胞の調整、形状、および運動性による胎盤形成および転移などの過程で役割を果たし得る(Ward et al,J Cell Sci 116(Pt 22):4533−42(2003);Shaw et al,Biochem J 363(Pt 1):137−45(2002);King et al,Biochim Biophys Acta 1445(3)257−70(1999);Myers et al,J Biol Chem 269(12):9319−24(1994))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 29 16 68
予測値 17 34 17 68
カイ二乗=4.25 有意性=0.11943297(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_011627.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、および脾臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 23 29 16 68
予測値 17 34 17 68
カイ二乗=4.25 有意性=0.11943297(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_011627.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、および脾臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.47.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA336539(UNQ2257))(a)全体的な表現型の概要:
ヒト栄養膜糖タンパク質(TPBG)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの尾部懸垂試験における抑鬱様応答が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
ヒト栄養膜糖タンパク質(TPBG)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの尾部懸垂試験における抑鬱様応答が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して尾部懸垂試験中に不動時間が増加した。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO36935ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較して尾部懸垂試験中に不動時間が増加した。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO36935ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
66.48.DNA62849−2647(UNQ2420)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4977ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62849−2647と示す)(UNQ2420)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_130887 アクセッション:NM_130887 NID:18700029 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス papilin(LOC170721);参照タンパク質:Q9EPX2 アクセッション:Q9EPX2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。PAPILIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_173462 ホモ・サピエンスパピリン(papilin)、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質(PAPLN);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:NP_775733 アクセッション:NP_775733 NID:gi 50083295 ref NP_775733.2パピリン(ホモ・サピエンス)。
これらのノックアウト実験では、PRO4977ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA62849−2647と示す)(UNQ2420)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_130887 アクセッション:NM_130887 NID:18700029 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス papilin(LOC170721);参照タンパク質:Q9EPX2 アクセッション:Q9EPX2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。PAPILIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_173462 ホモ・サピエンスパピリン(papilin)、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質(PAPLN);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:NP_775733 アクセッション:NP_775733 NID:gi 50083295 ref NP_775733.2パピリン(ホモ・サピエンス)。
目的のマウス遺伝子は、Papln(パピリン、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質)(ヒトPAPLNのオーソログ)である。別名には、E030033C16RikおよびMGC50452が含まれる。
PAPLNは、細胞外基質に関連し、プロテアーゼインヒビターとして機能する可能性が高い分泌タンパク質である(Kramerova et al,2000)。PAPLNは、シグナルペプチド、いくつかのトロンボスポンジン反復(細胞外基質結合および細胞接着;PfamアクセッションPF00090)、Kunitz/ウシ膵臓トリプシンインヒビタードメイン(セリンプロテアーゼインヒビターを示す;PfamアクセッションPF00014)、および3つのC末端免疫グロブリンドメイン(タンパク質−タンパク質またはタンパク質−リガンド相互作用;PfamアクセッションPF00047)からなる。PAPLNは、成長および器官形成で役割を果たし得る(Kramerova et al,Development 127(24):5475−85(2000);Fessler et al,Int J Biochem Cell Biol 36(6):1079−84(2004);Tucker,Int J Biochem Cell Biol 36(6):969−74(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 27 34 16 77
予測値 19.25 38.5 19.25 77
カイ二乗=5.11 有意性=0.077692226(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および先行する非コードエクソンをターゲティングした(NCBIアクセッションNM_130887.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認し
た。
実測値 27 34 16 77
予測値 19.25 38.5 19.25 77
カイ二乗=5.11 有意性=0.077692226(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および先行する非コードエクソンをターゲティングした(NCBIアクセッションNM_130887.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認し
た。
66.48.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA62849−2647(UNQ2420))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトパピリン、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質(PAPLN)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの末梢血中のCD4細胞の比率が増加した。変異(−/−)マウスはまた、プレパルス阻害が増加する傾向が示された。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトパピリン、プロテオグリカン様硫酸化糖タンパク質(PAPLN)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの末梢血中のCD4細胞の比率が増加した。変異(−/−)マウスはまた、プレパルス阻害が増加する傾向が示された。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、CD4細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。したがって、PRO4977ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、T細胞集団が増加する。これらの所見から、PRO4977ポリペプチドまたはPRO4977をコードする遺伝子は、T細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、PRO4977ポリペプチドまたはそのアゴニストは、自己免疫疾患(例えば、関節リウマチ患者)などで起こるT細胞増殖が顕著であるような場合には、T細胞増殖の負の調節因子として有用であろう。さらに、PRO4977ポリペプチドは、皮膚移植片拒絶の防止で特に有用であろう。
FACS:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、CD4細胞の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。したがって、PRO4977ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、T細胞集団が増加する。これらの所見から、PRO4977ポリペプチドまたはPRO4977をコードする遺伝子は、T細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、PRO4977ポリペプチドまたはそのアゴニストは、自己免疫疾患(例えば、関節リウマチ患者)などで起こるT細胞増殖が顕著であるような場合には、T細胞増殖の負の調節因子として有用であろう。さらに、PRO4977ポリペプチドは、皮膚移植片拒絶の防止で特に有用であろう。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウ
スのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
変異(−/−)マウスは、聴覚驚愕反射のプレパルス阻害が増加する傾向を示し、これは、感覚運動ゲーティング/注意の増強を示す。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウ
スのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
変異(−/−)マウスは、聴覚驚愕反射のプレパルス阻害が増加する傾向を示し、これは、感覚運動ゲーティング/注意の増強を示す。
66.49.DNA222844(UNQ2421)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4979ポリペプチド(PRO38844ポリペプチドとしても公知)をコードする遺伝子(DNA222844と示す)(UNQ2421)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_173182 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1600019O04遺伝子(1600019O04Rik);参照タンパク質:Q6NWW9 アクセッション:Q6NWW9 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。FAD104;参照ヒト遺伝子配列:NM_022763 ホモ・サピエンス FAD104(FAD104);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IXB2 アクセッション:Q8IXB2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。FAD104。
これらのノックアウト実験では、PRO4979ポリペプチド(PRO38844ポリペプチドとしても公知)をコードする遺伝子(DNA222844と示す)(UNQ2421)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_173182 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1600019O04遺伝子(1600019O04Rik);参照タンパク質:Q6NWW9 アクセッション:Q6NWW9 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。FAD104;参照ヒト遺伝子配列:NM_022763 ホモ・サピエンス FAD104(FAD104);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IXB2 アクセッション:Q8IXB2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。FAD104。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 1600019O04遺伝子(ヒトFAD104(脂肪細胞分化因子104)のオーソログ)である。別名には、FLJ23399およびDKFZp762K137が含まれる。
FAD104は、受容体または細胞接着分子として機能する可能性が高い推定内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、9個のフィブロネクチンIII型ドメインおよびC末端膜貫通セグメントを含む。FAD104は、脂肪形成で役割を果たし得る(Tominaga et al,FEBS Lett 577(1−2):49−54(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 17 36 1 54
予測値 13.5 27 13.5 54
カイ二乗=20.47 有意性=3.5891873E−5(hom/n)=0.08 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_173182.1)
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 17 36 1 54
予測値 13.5 27 13.5 54
カイ二乗=20.47 有意性=3.5891873E−5(hom/n)=0.08 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_173182.1)
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.49.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA222844(UNQ2421))
(a)全体的な表現型の概要:
脂肪細胞分化因子104(FAD104)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、平均血清IgG2aレベルが増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
脂肪細胞分化因子104(FAD104)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、平均血清IgG2aレベルが増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
遺伝学:ホモ接合体の死亡。(−/−)仔マウスは、遺伝子型特定時に死亡した。
顕微鏡的:組織学的試験によって12.5日目の胚に成長異常は検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
遺伝学:ホモ接合体の死亡。(−/−)仔マウスは、遺伝子型特定時に死亡した。
顕微鏡的:組織学的試験によって12.5日目の胚に成長異常は検出されなかった。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼ
すこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
すこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG2aレベルが増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG2aレベルが増加した。
ヘテロ接合体(+/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較してIgG2a血清免疫グロブリンが上昇した。IgG2aは、食細胞による貪食のために病原体を有効にオプソニン化し、補体系を活性化する。認められた表現型により、PRO4979ポリペプチドが炎症反応の調節因子であることが示唆される。
66.50.DNA97003−2649(UNQ2422)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4980ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA97003−2649と示す)(UNQ2422)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_177648 ムス・ムスクルス膜貫通タンパク質15(Tmem15);参照タンパク質:Q8R2Y3 アクセッション:Q8R2Y3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。KIAA1094タンパク質の類似物;参照ヒト遺伝子配列:NM_014908 ホモ・サピエンス膜貫通タンパク質15(TMEM15);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9UPQ8 アクセッション:Q9UPQ8 NID
:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質KIAA1094。
これらのノックアウト実験では、PRO4980ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA97003−2649と示す)(UNQ2422)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_177648 ムス・ムスクルス膜貫通タンパク質15(Tmem15);参照タンパク質:Q8R2Y3 アクセッション:Q8R2Y3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。KIAA1094タンパク質の類似物;参照ヒト遺伝子配列:NM_014908 ホモ・サピエンス膜貫通タンパク質15(TMEM15);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9UPQ8 アクセッション:Q9UPQ8 NID
:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質KIAA1094。
目的のマウス遺伝子は、Tmem15(膜貫通タンパク質15)(ヒトTMEM15のオーソログ)である。別名には、MGC36683、mKIAA1094、cDNA配列BC026973、およびKIAA1094が含まれる。
TMEM15は、有望な内在性原形質膜タンパク質であり、不十分に予想されたアクチン様ATPアーゼドメイン(SCOP)内のシグナルペプチドおよび11〜14個の膜貫通セグメントからなる。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 33 0 51
予測値 12.75 25.5 12.75 51
カイ二乗=41.74 有意性=8.6352275E−10(hom/n)=0.0 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_177648.2)。
1.野生型発現パネル:骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 33 0 51
予測値 12.75 25.5 12.75 51
カイ二乗=41.74 有意性=8.6352275E−10(hom/n)=0.0 平均同腹仔数=7
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_177648.2)。
1.野生型発現パネル:骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.50.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA97003−2649(UNQ2422))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト膜貫通タンパク質15(TMEM15)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ヘテロ接合体マウスは、抑鬱症様応答が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト膜貫通タンパク質15(TMEM15)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、この変異によってホモ接合性変異体が死亡することを示す遺伝子データが得られた。ヘテロ接合体マウスは、抑鬱症様応答が減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:胚が死亡したため試験を行わなかった。12.5日目に、以下の39個の胚を観察した:23個の(+/−)胚、11個の(+/+)胚、3個の未決定、および2個の不確定の胚。7.5dpcおよび12.5dpcの全組織標本データは、野生型胚の広範且つ遍在する染色を示す。ヘテロ接合体マウス(+/−)胚において6.5dpcおよび7.5dpcで胚外外胚葉が強くLacZ染色される。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
顕微鏡的:胚が死亡したため試験を行わなかった。12.5日目に、以下の39個の胚を観察した:23個の(+/−)胚、11個の(+/+)胚、3個の未決定、および2個の不確定の胚。7.5dpcおよび12.5dpcの全組織標本データは、野生型胚の広範且つ遍在する染色を示す。ヘテロ接合体マウス(+/−)胚において6.5dpcおよび7.5dpcで胚外外胚葉が強くLacZ染色される。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
死亡率についての胚発達異常に関する考察:
ノックアウトマウスにおける胚性致死は、通常、種々の重篤な発達上の問題(神経変性疾患、血管障害、炎症性疾患が含まれるが、これらに限定されない)または遺伝子/タンパク質が多くの細胞型において基礎的な細胞シグナル伝達過程で重要な役割を果たすことに起因する。さらに、胚性致死は、潜在的な癌モデルとして有用である。同様に、対応するヘテロ接合体(+/−)変異動物は、これらがノックアウト遺伝子の機能に関する非常に有益なてがかりが明らかとなる表現型および/または病理学報告を示す場合に特に有用である。例えば、EPOノックアウト動物は胚致死性を示すが、胚に関する病理学報告は、RBCの著しい欠如を示した。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウスおよび4匹のヘテロ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
尾部懸垂2:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験中に不動時間が減少し、変異体における抑鬱症様応答の減少が示唆される。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウスおよび4匹のヘテロ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
尾部懸垂2:(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、尾部懸垂試験中に不動時間が減少し、変異体における抑鬱症様応答の減少が示唆される。
したがって、ヘテロ接合体マウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO4980ポリペプチドまたはそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連した症状の治療または改善に有用であろう。
66.51.DNA94849−2960(UNQ2423)遺伝子破壊を含むマウス
の作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4981ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA94849−2960と示す)(UNQ2423)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_027379 ムス・ムスクルス 雄性不稔症ドメイン含有2(Mlstd2);参照タンパク質:Q922J9 アクセッション:Q922J9 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。RIKEN cDNA 3732409C05遺伝子;参照ヒト遺伝子配列:NM_032228 ホモ・サピエンス 雄性不稔症ドメイン含有2(MLSTD2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8WVX9 アクセッション:Q8WVX9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。RIKEN cDNA 3732409C05遺伝子の類似物。
の作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO4981ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA94849−2960と示す)(UNQ2423)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_027379 ムス・ムスクルス 雄性不稔症ドメイン含有2(Mlstd2);参照タンパク質:Q922J9 アクセッション:Q922J9 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。RIKEN cDNA 3732409C05遺伝子;参照ヒト遺伝子配列:NM_032228 ホモ・サピエンス 雄性不稔症ドメイン含有2(MLSTD2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8WVX9 アクセッション:Q8WVX9 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。RIKEN cDNA 3732409C05遺伝子の類似物。
目的のマウス遺伝子は、Mlstd2(雄性不稔症ドメイン含有2)(ヒトMLSTD2のオーソログ)である。別名には、FAR1、2600011M19Rik、3732409C05Rik、FAR1、FLJ22728、および脂肪アシルCoAレダクターゼ1が含まれる。
MLSTD2は、補助基質NADPHでの脂肪アシル−CoAの還元(16または18個の炭素の不飽和脂肪酸が好ましい)による脂肪アルコールの形成を触媒するペルオキシソーム酵素である。この酵素は、主に、包皮腺(脂腺型の1つ)、脳、脂質エーテルリッチ組織中に発現する。MLSTD2は、ワックスモノエステルおよび脂質エーテルの生合成で役割を果たす可能性が高い(Cheng and Russell,J Biol Chem 279(36):37789−97(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 30 16 64
予測値 16 32 16 64
カイ二乗=3.51 有意性=0.17290725(hom/n)=0.31 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027379.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、および腎臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 30 16 64
予測値 16 32 16 64
カイ二乗=3.51 有意性=0.17290725(hom/n)=0.31 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_027379.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、および腎臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.51.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA94849−2960(UNQ2423))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト雄性不稔症ドメイン含有2(MLSTD2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、聴覚障害を示すホモ接合体変異マウスが得られる。ノックアウト(−/−)マウスはまた、ストレス誘導性高熱が増加し、日周期リズムが増強される傾向がある。顕微分析により、雄変異体の精巣変性が明らかとなり、これは、診断で認められた不稔症と一致した。さらに、ホモ接合体変異マウスで、雌変異体の体脂肪の顕著な増加と共に骨塩量および骨中無機質密度の減少が認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト雄性不稔症ドメイン含有2(MLSTD2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、聴覚障害を示すホモ接合体変異マウスが得られる。ノックアウト(−/−)マウスはまた、ストレス誘導性高熱が増加し、日周期リズムが増強される傾向がある。顕微分析により、雄変異体の精巣変性が明らかとなり、これは、診断で認められた不稔症と一致した。さらに、ホモ接合体変異マウスで、雌変異体の体脂肪の顕著な増加と共に骨塩量および骨中無機質密度の減少が認められた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
巨視的:分析に利用可能な2匹の雄(−/−)マウスは、雄ノックアウトにおいて精巣重量が有意に減少した。
顕微鏡的:分析した2匹の雄(−/−)マウス(M−214およびM−226)は、細精管中の巨大な多核巨細胞によって特徴づけられる顕著な精巣変性を示し、復睾丸中に精子が存在しなかった。肝細胞は、雌では顕著および中程度の強度であるが雄ではわずかなグリコーゲン蓄積を特徴とする細胞質内空胞を有していた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって分析された組織パネルのうちで精巣中にのみ検出された。
巨視的:分析に利用可能な2匹の雄(−/−)マウスは、雄ノックアウトにおいて精巣重量が有意に減少した。
顕微鏡的:分析した2匹の雄(−/−)マウス(M−214およびM−226)は、細精管中の巨大な多核巨細胞によって特徴づけられる顕著な精巣変性を示し、復睾丸中に精子が存在しなかった。肝細胞は、雌では顕著および中程度の強度であるが雄ではわずかなグリコーゲン蓄積を特徴とする細胞質内空胞を有していた。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学によって分析された組織パネルのうちで精巣中にのみ検出された。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:8匹の(−/−)マウス中のたった3匹が驚愕反応を欠き、変異体の聴覚障害が示唆される。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状
況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
ストレス誘導過温症:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。これらの結果は、日周期リズムの神経学的試験と一致する。したがって、PRO4981ポリペプチドまたはそのアゴニストは、不安関連障害の治療で有用であろう。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
日周期:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の12時間の馴化期間に歩行回数が増加した。これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、不安様応答に関連し得る。
(d)心臓学/血圧および心拍数
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。
血圧の結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、収縮期血圧が減少した。
(e)表現型解析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、平均血清カルシウムレベルが減少した。カルシウムレベルの減少は、骨塩量および骨中無機質密度が減少する所見と一致する。
(f)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
PPI:8匹の(−/−)マウス中のたった3匹が驚愕反応を欠き、変異体の聴覚障害が示唆される。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状
況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
ストレス誘導過温症:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆される。これらの結果は、日周期リズムの神経学的試験と一致する。したがって、PRO4981ポリペプチドまたはそのアゴニストは、不安関連障害の治療で有用であろう。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
日周期:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ホームケージ活動性試験の12時間の馴化期間に歩行回数が増加した。これらの結果は日周期リズムの増強を示す。ホームケージ活動性試験はまた、活動の増加または多動を示唆し、これは、不安様応答に関連し得る。
(d)心臓学/血圧および心拍数
説明:
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。
血圧の結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、収縮期血圧が減少した。
(e)表現型解析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、平均血清カルシウムレベルが減少した。カルシウムレベルの減少は、骨塩量および骨中無機質密度が減少する所見と一致する。
(f)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に任意に耐糖能障害を示した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に任意に耐糖能障害を示した。
これらの研究は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、PRO4981ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または種々の心血管障害(糖尿病が含まれる)に関連する病態の治療で有用であろう。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。
受精能:分析に利用可能な雄(−/−)マウスは、繁殖から40日後で且つ雌(+/+)マウスとの4交配後に仔は生まれなかった。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。
受精能:分析に利用可能な雄(−/−)マウスは、繁殖から40日後で且つ雌(+/+)マウスとの4交配後に仔は生まれなかった。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均除脂肪体重、骨塩量、および骨中無機質密度が減少した。雌(−/−)マウスはまた、平均総組織マス増加し、総脂肪マスおよび総体脂肪率がわずかに増加した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および脊椎中の平均除脂肪体重、骨塩量、および骨中無機質密度が減少した。雌(−/−)マウスはまた、平均総組織マス増加し、総脂肪マスおよび総体脂肪率がわずかに増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。
DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少した。しかし、変異(−/−)マウスはまた、雄(−/−)マウスにおいて体重、体長、および除脂肪体重、ならびに受精能が減少した。他方では、雌(−/−)マウスは、平均体脂肪率がわずかに増加した。これらの所見により、PRO4981ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した大部分の雄変異マウスが(−/−)マウスにおいて成長遅延に関連する代謝障害を引き起こし、骨粗鬆症を反映する異常な骨測定値も得られることが示唆される。したがって、PRO4981ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨粗鬆症などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。PRO4981ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、異常または病的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害(関節炎、骨粗鬆症、および骨減少症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。
66.52.DNA115291−2681(UNQ2501)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO5801ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA115291−2681と示す)(UNQ2501)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:BC026546 ムス・ムスクルスインターロイキン17受容体B、mRNA(cDNAクローンMGC:35924 IMAGE:5042466);参照タンパク質:Q9JIP3 アクセッション:Q9JIP3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。インターロイキン−17B受容体前駆体(IL−17B受容体)(IL−17受容体ホモログ1)(IL−17RH1)(IL17RH1)(IL−17ER);参照ヒト遺伝子配列:NM_018725 ホモ・サピエンスインターロイキン17受容体B(IL17RB)、転写変異型1;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9NRM
6 アクセッション:Q9NRM6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン−17B受容体前駆体(IL−17B受容体)(IL−17受容体ホモログ1)(IL−17RH1)(IL17RH1)(サイトカイン受容体CRL4)。
これらのノックアウト実験では、PRO5801ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA115291−2681と示す)(UNQ2501)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:BC026546 ムス・ムスクルスインターロイキン17受容体B、mRNA(cDNAクローンMGC:35924 IMAGE:5042466);参照タンパク質:Q9JIP3 アクセッション:Q9JIP3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。インターロイキン−17B受容体前駆体(IL−17B受容体)(IL−17受容体ホモログ1)(IL−17RH1)(IL17RH1)(IL−17ER);参照ヒト遺伝子配列:NM_018725 ホモ・サピエンスインターロイキン17受容体B(IL17RB)、転写変異型1;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9NRM
6 アクセッション:Q9NRM6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン−17B受容体前駆体(IL−17B受容体)(IL−17受容体ホモログ1)(IL−17RH1)(IL17RH1)(サイトカイン受容体CRL4)。
目的のマウス遺伝子は、Il17rb(インターロイキン17受容体B)(ヒトIL17RBのオーソログ)である。別名には、Evi27、Il17br、IL―17ER、IL17RH1、IL―17Rh1、CRL4、MGC5245、IL−17B受容体、サイトカイン受容体CRL4、インターロイキン17B受容体、インターロイキン17受容体ホモログ、インターロイキン17受容体ホモログ1、およびエコトロピックウイルス組み込み部位27が含まれる。
IL17RBは、サイトカインIL17EおよびIL17Bの受容体として機能するI型原形質膜タンパク質である。受容体は、核因子κBを活性化し、炎症誘発性ケモカインIL−8の産生を刺激することができる。IL17RBは、肝臓、腎臓、膵臓、精巣、結腸、脳、および小腸で発現する。IL17RBは、炎症で役割を果たす可能性が高く、種々の疾患過程(関節リウマチ、乾癬、多発性硬化症、腫瘍成長の促進、および移植片拒絶など)に関与し得る(Lee et al,J Biol Chem 276(2):1660−4(2001);Tian et al,Oncogene 19(17):2098−109(2000);Shi et al,J Biol Chem 275(25):19167−76(2000);Moseley et al,Cytokine Growth Factor Rev 14(2):155−74(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 19 34 24 77
予測値 19.25 38.5 19.25 77
カイ二乗=2.18 有意性=0.33621648(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_019583.1)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、および心臓以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 19 34 24 77
予測値 19.25 38.5 19.25 77
カイ二乗=2.18 有意性=0.33621648(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_019583.1)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、および心臓以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.52.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA115291−2681(UNQ2501))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17受容体B(IL17RB)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が増強された(−/−)が得られた。遺伝子破壊を、サザンブロッ
トによって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17受容体B(IL17RB)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が増強された(−/−)が得られた。遺伝子破壊を、サザンブロッ
トによって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
耐糖能試験:高脂肪食を与えた雄変異(−/−)は、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、耐糖能が増強された。
結果:
耐糖能試験:高脂肪食を与えた雄変異(−/−)は、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、耐糖能が増強された。
これらの研究では、変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔における正常な空腹時グルコースの存在下で耐糖能が増加または増強した。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感受性の増加またはグルコースホメオスタシス障害の反対の表現型パターンを示し、そのようなものとして、PRO5801ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト(インヒビター)は、グルコースホメオスタシス障害の治療で有用であろう。
66.53.DNA96988−2685(UNQ2507)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO5995ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA96988−2685と示す)(UNQ2507)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_146241 アクセッション:NM_146241 NID:gi 22122816 ref NM_146241.1 ムス・ムスクルス甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素(Trhde未決定(pending));参照タンパク質:Q8K093 アクセッション:Q8K093 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_013381 アクセッション:NM_013381 NID:gi 7019560 ref NM_013381.1 ホモ・サピエンス甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素(TRHDE);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWJ4 アクセッション:Q6UWJ4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TRHDE。
これらのノックアウト実験では、PRO5995ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA96988−2685と示す)(UNQ2507)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_146241 アクセッション:NM_146241 NID:gi 22122816 ref NM_146241.1 ムス・ムスクルス甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素(Trhde未決定(pending));参照タンパク質:Q8K093 アクセッション:Q8K093 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。仮説タンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_013381 アクセッション:NM_013381 NID:gi 7019560 ref NM_013381.1 ホモ・サピエンス甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素(TRHDE);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWJ4 アクセッション:Q6UWJ4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TRHDE。
目的のマウス遺伝子は、Trhde(甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素)(ヒトTRHDEのオーソログ)である。別名には、MGC40831、9330155P21Rik、PAP−II、ピログルタミルペプチダーゼII、TRH分解外酵素、TRH−DE、TRH−特異的アミノペプチダーゼ、およびサイロリベリナーゼ(thyroliberinase)が含まれる。
TRHDEは、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン(TRH)からのN末端ピログルタミル基の除去を触媒する細胞外II型原形質膜タンパク質および亜鉛メタロプロテアーゼである。TRHDEは、その放出後の神経ペプチドの不活化によるTRHシグナル伝達で役
割を果たす可能性が高い。TRHDEは、主に脳内に発現するが、心臓、肺、肝臓、骨格筋、および血清中にも発現する(Baeza et al,Life Sci 68(17):2051−60(2001);Schomburg et al,Eur J Biochem 265(1):415−22(1999);Kelly et al,J
Biol Chem 275(22):16746−51(2000);Schmitmeier et al,Eur J Biochem 269(4):1278−86(2002))。
割を果たす可能性が高い。TRHDEは、主に脳内に発現するが、心臓、肺、肝臓、骨格筋、および血清中にも発現する(Baeza et al,Life Sci 68(17):2051−60(2001);Schomburg et al,Eur J Biochem 265(1):415−22(1999);Kelly et al,J
Biol Chem 275(22):16746−51(2000);Schmitmeier et al,Eur J Biochem 269(4):1278−86(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 27 35 27 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗=0.98 有意性=0.6126264(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_146241.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 27 35 27 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗=0.98 有意性=0.6126264(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_146241.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.53.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA96988−2685(UNQ2507))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素(TRHDE)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均体重および体長が減少し、総組織マスおよび除脂肪体重が減少した変異(−/−)マウスが得られた。尾部懸垂試験は、(−/−)マウスの不動が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン分解外酵素(TRHDE)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均体重および体長が減少し、総組織マスおよび除脂肪体重が減少した変異(−/−)マウスが得られた。尾部懸垂試験は、(−/−)マウスの不動が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、
関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マスおよび除脂肪体重が減少した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マスおよび除脂肪体重が減少した。
したがって、変異(−/−)マウスは、体重、体長、総組織マス、および除脂肪体重の減少によって特徴づけられる負の表現型を示し、これは成長の遅延または悪液質などの組織消耗性容態に起因し得る。したがって、PRO5995ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの異常な代謝関連効果を模倣するであろう。他方では、PRO5995ポリペプチドまたはそのアゴニストは、悪液質などの代謝障害または他の組織消耗性疾患の予防および/または治療で有用であり、正常な成長に重要であろう。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
尾部懸垂2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、不動時間が増加し、これは、変異体での抑鬱応答を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO5995ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
尾部懸垂2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、不動時間が増加し、これは、変異体での抑鬱応答を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を示した。したがって、PRO5995ポリペプチドおよびそのアゴニストは、抑鬱性障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
66.54.DNA98380(UNQ2512)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO6001ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA98380と示す)(UNQ2512)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_133187 アクセッション:NM_133187 NID:gi 18875327 ref NM_133187.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1110032E23遺伝子(1110032E23Rik);参照タンパク質:Q9ET25 アクセッション:Q9ET25 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。 仮説タンパク質塩基性タンパク質I−19;参照ヒト遺伝子配列:NM_016613 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp434L142(DKFZp434L142);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWH4 アクセッション:Q6UWH
4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TCPD2512。
これらのノックアウト実験では、PRO6001ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA98380と示す)(UNQ2512)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_133187 アクセッション:NM_133187 NID:gi 18875327 ref NM_133187.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 1110032E23遺伝子(1110032E23Rik);参照タンパク質:Q9ET25 アクセッション:Q9ET25 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。 仮説タンパク質塩基性タンパク質I−19;参照ヒト遺伝子配列:NM_016613 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp434L142(DKFZp434L142);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWH4 アクセッション:Q6UWH
4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。TCPD2512。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 1110032E23遺伝子(ヒト仮説タンパク質DKFZp434L142のオーソログ)である。別名には、AD021およびAD036が含まれる。
仮説タンパク質DKFZp434L142は、N末端付近の膜貫通セグメント以外の保存ドメインを含まない推定517アミノ酸タンパク質である。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 43 21 82
予測値 20.5 41 20.5 82
カイ二乗=8.57 有意性=0.013773624(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133187.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 43 21 82
予測値 20.5 41 20.5 82
カイ二乗=8.57 有意性=0.013773624(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_133187.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.54.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA98380(UNQ2512))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(DKFZp434L142)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの耐糖能が損なわれた。雄(−/−)マウスはまた、基礎体温が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(DKFZp434L142)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの耐糖能が損なわれた。雄(−/−)マウスはまた、基礎体温が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%
溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。
これらの研究は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、PRO6001ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または種々の心血管障害(糖尿病が含まれる)に関連する病態の治療で有用であろう。
66.55.DNA105680−2710(UNQ2543)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO6095ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA105680−2710と示す)(UNQ2543)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_153528 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4921521N14遺伝子(4921521N14Rik);参照タンパク質:Q8CI52 アクセッション:Q8CI52 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。RIKEN cDNA 4921521N14;参照ヒト遺伝子配列:BC035040 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp434C0328;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IYS0 アクセッション:Q8IYS0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。DKFZp434C0328タンパク質。
これらのノックアウト実験では、PRO6095ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA105680−2710と示す)(UNQ2543)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_153528 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 4921521N14遺伝子(4921521N14Rik);参照タンパク質:Q8CI52 アクセッション:Q8CI52 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。RIKEN cDNA 4921521N14;参照ヒト遺伝子配列:BC035040 ホモ・サピエンス仮説タンパク質DKFZp434C0328;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IYS0 アクセッション:Q8IYS0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。DKFZp434C0328タンパク質。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 4921521N14遺伝子(ヒト仮説タンパク質DKFZp434C0328のオーソログ)である。別名には、MGC47315が含まれる。
仮説タンパク質DKFZp434C0328は、推定膜タンパク質であり、GRAMドメイン、膜貫通セグメント、および潜在的なグリコシルリン脂質(GPI)繋留部位からなる。GRAMドメインは、グルコシルトランスフェラーゼ、ミオチューブラリン、および他の膜結合タンパク質などのタンパク質中で見出され、膜ターゲティングで機能する可能性が高い(Doerks et al,Trends Biochem Sci 25(10):483−5(2000))。仮説タンパク質DKFZp434C0328の細胞中の位置は不明である。膜貫通セグメントにより、仮説タンパク質が内在性膜タンパク質であり得ることが示唆されるのに対して、GPI繋留部位により、このタンパク質が原形質膜の細胞外表面に会合し得ることが示唆される。GRAMドメインが標的膜とのタンパク質の結合に関与し得るので(Oku et al,EMBO J 22(13)3231−41(2003))、仮説タンパク質DKFZp434C0328は、細胞内膜上に存在し得る。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvB
rd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
rd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 20 30 18 68
予測値 17 34 17 68
カイ二乗=1.86 有意性=0.39455372(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_153528.1)
。
1.野生型発現パネル:パネル:胚性幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
QC画像:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 20 30 18 68
予測値 17 34 17 68
カイ二乗=1.86 有意性=0.39455372(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_153528.1)
。
1.野生型発現パネル:パネル:胚性幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
QC画像:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.55.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA105680−2710(UNQ2543))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(DKFZp434C0328)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔のレベル比較した場合、骨髄中のIgM+、IgD+のB細胞、およびB220hi CD43細胞が増加した。さらに、変異(−/−)マウスは、体重の増加および骨中無機質密度の測定値の増加につれて総組織マスおよび脂肪分(コレステロールレベルの上昇を伴う)が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的
平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。したがって、PRO6095遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO6095ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO6095ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。したがって、PRO6095遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO6095ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO6095ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
組織特異的FACSプロジェクト:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のIgM+細胞、IgD+細胞、およびB220hi CD43細胞が増加した。成熟ナイーブB細胞は、IgMおよびIgDを同時発現し、骨髄をリンパ器官中に循環させたままにする。PRO6095ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異(−/−)マウスのB細胞前駆体およびこれらの細胞によって発現される免疫グロブリンの比率が増加した。したがって、PRO6095ポリペプチドは、B細胞の分化および/または増殖のための負の調節因子として作用するようである。PRO6095ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、B細胞産生の刺激で有用であろう。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
組織特異的FACSプロジェクト:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のIgM+細胞、IgD+細胞、およびB220hi CD43細胞が増加した。成熟ナイーブB細胞は、IgMおよびIgDを同時発現し、骨髄をリンパ器官中に循環させたままにする。PRO6095ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異(−/−)マウスのB細胞前駆体およびこれらの細胞によって発現される免疫グロブリンの比率が増加した。したがって、PRO6095ポリペプチドは、B細胞の分化および/または増殖のための負の調節因子として作用するようである。PRO6095ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、B細胞産生の刺激で有用であろう。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロール、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG3レベルが増加した。
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔コントロール、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG3レベルが増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ホモ接合体成体あが血清IgG3レベルの増加を示すことが明らかとなった。したがって、ホモ接合体は、(+/+)同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが上昇した。IgG3免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、PRO6095ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターが免疫系を刺激し、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO
6095ポリペプチドまたはその作動剤は、免疫応答を阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
6095ポリペプチドまたはその作動剤は、免疫応答を阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(d)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が増加した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が増加した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部におけ
る皮質骨パラメータを分析した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部におけ
る皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総脂肪マス、および総体脂肪率が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均脊椎骨小柱連結性(mean vertebral trabecular bone connectivity density)が増加した。
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、総脂肪マス、および総体脂肪率が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均脊椎骨小柱連結性(mean vertebral trabecular bone connectivity density)が増加した。
これらの結果は、ノックアウト変異マウスが骨密度の増加によって特徴づけられる大理石骨病に類似の平均脊椎骨小柱測定値の増加を伴う異常な骨代謝を示すことが証明される。したがって、PRO6095ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨ホメオスタシスの維持および破骨細胞と骨芽細胞の活性の釣り合わせによる骨再造形に有用であろう。さらに、PRO6095ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、骨治癒または骨石灰化に関連する他の骨関連異常の治療で有用であろう。
(−/−)マウスはまた、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マスが増加し、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。これらの所見は、(−/−)変異マウスによって示される平均体重および体長の増加と一致する。
これらの研究は、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO6095ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常成長および代謝過程に不可欠であり、特に、脂質蓄積症および/または肥満の防止および/または治療で有用であろう。
66.56.DNA110700−2716(UNQ2553)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO6182ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA110700−2716と示す)(UNQ2553)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_020003 アクセッション:NM_020003 NID:gi 9910457 ref NM_020003.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 0610031J06遺伝子(0610031J06Rik);参照タンパク質:Q9JHJ3 アクセッション:Q9JHJ3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。腎臓優性タンパク質(RIKEN cDNA 0610031J06遺伝子);参照ヒト遺伝子配列:NM_144580 アクセッション:NM_144580 NID:gi
24307870 ref NM_144580.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC31963(MGC31963);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8WWB7 アクセッション:Q8WWB7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質NT2RP1000567。
これらのノックアウト実験では、PRO6182ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA110700−2716と示す)(UNQ2553)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_020003 アクセッション:NM_020003 NID:gi 9910457 ref NM_020003.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 0610031J06遺伝子(0610031J06Rik);参照タンパク質:Q9JHJ3 アクセッション:Q9JHJ3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。腎臓優性タンパク質(RIKEN cDNA 0610031J06遺伝子);参照ヒト遺伝子配列:NM_144580 アクセッション:NM_144580 NID:gi
24307870 ref NM_144580.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC31963(MGC31963);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8WWB7 アクセッション:Q8WWB7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質NT2RP1000567。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 0610031J06遺伝子(ヒトMGC31963(腎臓優性タンパク質 NCU−G1)のオーソログ)である。別名には、NCU−G1が含まれる。
MGC31963は、推定I型内在性原形質膜タンパク質であり、シグナルペプチドおよびC末端付近に膜貫通セグメントを含む。このタンパク質は、腎臓皮質に高レベルで発現し、いくつかの他の組織中により低いレベルで発現する(Kawamura et al,Biochem Genet 39(1−2):33−42(2001);Clar
k et al,Genome Res 13(10):2265−70(2003))。
k et al,Genome Res 13(10):2265−70(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 24 40 13 77
予測値 19.25 38.5 19.25 77
カイ二乗=0.53 有意性=0.76720595(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜6をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_020003.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 24 40 13 77
予測値 19.25 38.5 19.25 77
カイ二乗=0.53 有意性=0.76720595(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜6をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_020003.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.56.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA110700−2716(UNQ2553))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト腎臓優性タンパク質NCU−G1(MGC31963)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが肝炎を発症した。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、貧血性および免疫学的異常の徴候を示した。さらに、雄および雌のホモ接合体変異マウスの両方は、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均グルコースレベルが減少した。(−/−)マウスはまた、全身のvBMDおよびBMDが減少し、平均脊椎骨小柱数および連結性が減少した。(−/−)マウスは、プレパルス阻害が増加する傾向を示した。肉眼的検査によって変異体の肝臓は正常な肝臓よりも小さく、顕微分析により、軽度から中等度の壊死性肝炎が明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト腎臓優性タンパク質NCU−G1(MGC31963)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスが肝炎を発症した。ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、貧血性および免疫学的異常の徴候を示した。さらに、雄および雌のホモ接合体変異マウスの両方は、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均グルコースレベルが減少した。(−/−)マウスはまた、全身のvBMDおよびBMDが減少し、平均脊椎骨小柱数および連結性が減少した。(−/−)マウスは、プレパルス阻害が増加する傾向を示した。肉眼的検査によって変異体の肝臓は正常な肝臓よりも小さく、顕微分析により、軽度から中等度の壊死性肝炎が明らかとなった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
巨視的:(−/−)マウスの肝臓は正常な肝臓よりも小さく、柔組織の基礎的(underlying)喪失/虚脱にのために肝臓被膜表面(hepatic capsular
surface)は不規則で窪みがあった。
顕微鏡的:分析した(−/−)マウスは、最小の進行中の肝細胞の壊死および変性によって特徴づけられる軽度から中等度の多病巣性壊死性肝炎を示した。最小から中等度の亜急性および活動性炎症炎症性浸潤も実質喪失領域中に存在する。多病巣性に、肝臓中に造血細胞(顆粒球)のクラスターおよび顆粒球前駆体のびまん性過形成が存在し、赤血球系細胞前駆体、脾臓、および骨髄が同時に減少した。これらの変異体に存在する最小の肝線維症は、肝損傷に対するC57Bl/6マウスの肝線維形成誘発性応答の既知の減少を反映する。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
巨視的:(−/−)マウスの肝臓は正常な肝臓よりも小さく、柔組織の基礎的(underlying)喪失/虚脱にのために肝臓被膜表面(hepatic capsular
surface)は不規則で窪みがあった。
顕微鏡的:分析した(−/−)マウスは、最小の進行中の肝細胞の壊死および変性によって特徴づけられる軽度から中等度の多病巣性壊死性肝炎を示した。最小から中等度の亜急性および活動性炎症炎症性浸潤も実質喪失領域中に存在する。多病巣性に、肝臓中に造血細胞(顆粒球)のクラスターおよび顆粒球前駆体のびまん性過形成が存在し、赤血球系細胞前駆体、脾臓、および骨髄が同時に減少した。これらの変異体に存在する最小の肝線維症は、肝損傷に対するC57Bl/6マウスの肝線維形成誘発性応答の既知の減少を反映する。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)病態/CATスキャン
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
CATスキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
CATスキャン:分析した3匹全ての(−/−)マウス(M−218、M−249、およびF−254)は、肝臓サイズが減少した。
CATスキャン:分析した3匹全ての(−/−)マウス(M−218、M−249、およびF−254)は、肝臓サイズが減少した。
(d)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定し
た。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定し
た。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
(1)血液学分析:
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメータを対象とすることができる。
試験の説明:Abbott’s Cell−Dyn 3500R(自動血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、5つの白血球分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22個のパラメータを対象とすることができる。
結果:
(1)血液学(血小板数):
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血小板数が顕著に減少し、平均血小板体積が増加した。
(1)血液学(血小板数):
(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血小板数が顕著に減少し、平均血小板体積が増加した。
したがって、DNA110700−2716遺伝子が欠損した変異マウスは、凝固障害に関連する表現型が得られた。これに関して、PRO6182ポリペプチドまたはそのアゴニストは、血友病などの異常な血液凝固に関連する障害の治療で有用であろう。
(2)血液学(赤血球およびヘモグロビン):
(−/−)マウスはまた、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総白血球数および全体白血球数が減少し、平均絶対単球数が増加した。(−/−)マウスはまた、貧血の徴候(その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合の平均赤血球数、ヘモグロビン濃度、およびヘマトクリット値の減少ならびに赤血球分布幅の増加が含まれる)を示した。
(−/−)マウスはまた、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総白血球数および全体白血球数が減少し、平均絶対単球数が増加した。(−/−)マウスはまた、貧血の徴候(その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合の平均赤血球数、ヘモグロビン濃度、およびヘマトクリット値の減少ならびに赤血球分布幅の増加が含まれる)を示した。
これらの結果は、貧血性に関連する表現型および免疫系の低下に関連する。したがって、PRO6182ポリペプチド、そのアゴニスト、またはPRO6182ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球産生に不可欠であり、そのようなものとして、貧血性または低ヘマトクリット治に関連する血液障害の治療で有用であろう。さらに、(−/−)マウスは、適応的免疫応答に重要なリンパ球数の欠陥を示す。
(2)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG1、IgG2a、IgG2b、およびIgG3レベルが減少した。
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行のための(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG1、IgG2a、IgG2b、およびIgG3レベルが減少した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイにより、ヘミ接合体変異成体が血清IgG免疫グロブリンレベルの減少を示すことが明らかとなった。したがって、ホモ接合体(
−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが異常に低かった。したがって、PRO6182をコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはγグロブリン)の作製に不可欠である。γグロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、PRO6182ポリペプチドまたはそのアゴニストが免疫系の刺激に有用であり、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO6182ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答の阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
−/−)マウスは、(+/+)同腹仔と比較して血清免疫グロブリンが異常に低かった。したがって、PRO6182をコードする遺伝子は、免疫グロブリン(またはγグロブリン)の作製に不可欠である。γグロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。これらの免疫学的異常により、PRO6182ポリペプチドまたはそのアゴニストが免疫系の刺激に有用であり、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO6182ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)は、免疫応答の阻害し、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(3)蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のレベルと比較した場合、CD8細胞の平均比率の減少および単球の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔のレベルと比較した場合、CD8細胞の平均比率の減少および単球の平均比率の増加によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
組織特異的組織特異的FACSマウス:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、脾臓中のCD11b+CD11c−細胞が増加した。
まとめると、(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のIgM+、IgD+、およびB220hi CD43−細胞が増加した。成熟ナイーブB細胞は、IgMおよびIgDを同時発現し、骨髄をリンパ器官中に循環させたままにする。PRO6095ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異(−/−)マウスのB細胞前駆体およびこれらの細胞によって発現される免疫グロブリンの比率が増加した。したがって、PRO6095ポリペプチドは、B細胞の分化および/または増殖のための負の調節因子として作用するようである。さらに、(−/−)マウスは、CD8細胞の平均比率が減少した。CD8タンパク質は、抗原認識においてT細胞受容体と協力するためにMHCクラスI分子を結合/認識する補助受容体分子である。
(4)急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清TNF−α、MCP−1、特にIL−6応答が増加した。
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清TNF−α、MCP−1、特にIL−6応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃は、PRO6182ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃した場合、免疫応答(TNF−α、MCP−1、およびIL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。TNF−α、MCP−1、およびIL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。TNF−αは、重要な炎症メディエーターである。TNF−αは、重要な炎症性メディエーターである。さらに、TNF−α、MCP−1、およびIL−6は、急性期応答および全身性炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。TNF−αは、マクロファージ活性化における膜結合シグナルの代わりに機能し得る(したがって、エフェクター分子としての機能を果たす)。
(e)表現型解析:代謝−血液化学
代謝領域では、糖尿病および他の代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均血清グルコースレベルが減少した。平均血清アルカリホスファターゼレベルの増加は、平均骨中無機質密度測定値の減少の所見および認められた肝臓異常および慢性肝炎の所見と一致する。
代謝領域では、糖尿病および他の代謝障害の治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析には、血糖値測定が含まれる。COBAS Integra 400(mfr.Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。血糖値の測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清アルカリホスファターゼレベルが増加し、平均血清グルコースレベルが減少した。平均血清アルカリホスファターゼレベルの増加は、平均骨中無機質密度測定値の減少の所見および認められた肝臓異常および慢性肝炎の所見と一致する。
(f)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制
聴覚驚愕反射のプレパルス抑制は、大きな120デシベル(dB)驚愕誘発音が、より柔らかい(プレパルス)音より先行する場合に起こる。PPIパラダイムは、6種類の異なる試行型(70dBバックグラウンドノイズ、120dB単独、74dB+120dB−pp4、78dB+120dB−pp8、82dB+120dB−pp12、および90dB+120dB−pp20)からなり、各々、擬似乱数順に6回、合計36試行繰返される。刺激に対する最大応答(V max)を、各試行型について平均する。100以下の120dB平均値を有する動物は、解析から除外する。プレパルスが動物の驚愕刺激に対する応答を抑制するパーセンテージを計算し、グラフで示す。
結果:
感覚運動ゲーティング/注意:変異(−/−)マウスは、聴覚驚愕反射のプレパルス阻害が増加する傾向があり、これは、感覚運動ゲーティング/注意を示す。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
感覚運動ゲーティング/注意:変異(−/−)マウスは、聴覚驚愕反射のプレパルス阻害が増加する傾向があり、これは、感覚運動ゲーティング/注意を示す。
(g)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身、大腿骨、および脊椎の平均骨塩量、容積測定骨中無機質密度、および骨中無機質密度が減少した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨小柱の体積、数、および連結性が減少した。
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身、大腿骨、および脊椎の平均骨塩量、容積測定骨中無機質密度、および骨中無機質密度が減少した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均骨小柱の体積、数、および連結性が減少した。
DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値および体重(body mass)が減少し、異常な骨障害が示唆される。(−/−)マウスは、骨代謝障害を反映する骨測定値が異常に減少した負の骨表現型を示した。負の骨表現型は、PRO6182ポリペプチドまたはそのアゴニストが骨ホメオスタシスの維持に有用であることを示す。さらに、PRO6182ポリペプチドは、関節炎または骨粗鬆症の治癒または治療で有用であるのに対して、PRO6182ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストによって異常または病的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性疾患(関節炎、骨粗鬆症、および骨減症が含まれる)が含まれる)を引き起こすであろう。(−/−)マウスはまた、成長遅延の徴候を示した。
66.57.DNA108722−2743(UNQ2782)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO7170ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA108722−2743と示す)(UNQ2782)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:膜貫通ムチンMUC20のAB098732 ムス・ムスクルスmRNA;参照タンパク質:Q76I84 アクセッション:Q76I84 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。膜貫通ムチンMUC20;参照ヒト遺伝子配列:BC029267 ホモ・サピエンスムチン20のmRNA(cDNAクローンMGC:34717 IMAGE:3851952);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8N307 アクセッション:Q8N307 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。MUC20タンパク質。
これらのノックアウト実験では、PRO7170ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA108722−2743と示す)(UNQ2782)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:膜貫通ムチンMUC20のAB098732 ムス・ムスクルスmRNA;参照タンパク質:Q76I84 アクセッション:Q76I84 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。膜貫通ムチンMUC20;参照ヒト遺伝子配列:BC029267 ホモ・サピエンスムチン20のmRNA(cDNAクローンMGC:34717 IMAGE:3851952);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8N307 アクセッション:Q8N307 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。MUC20タンパク質。
目的のマウス遺伝子は、Muc20(ムチン20)(ヒトMUC20のオーソログ)である。別名には、MGC31081、FLJ14408、KIAA1359、およびcDNA配列BC026367が含まれる。
MUC20は、主に腎近位尿細管上皮細胞中に発現する内在性原形質膜タンパク質である。MUC20はまた、胎盤、結腸、肺、前立腺、および肝臓中に中程度に発現する。MUC20は、肝細胞成長因子受容体MET上のGrb2ドッキング部位と相互作用し、Grb2 Ras経路を介したMETシグナル伝達を阻害することができる。さらに、MUC20は、肝細胞成長因子誘導性マトリックスメタロプロテイナーゼ発現および細胞増殖を阻害する。これらの所見により、MUC20はHGFシグナル伝達を調節する役割を果たすことが示唆される。MUC20は、中等度の免疫グロブリンA腎症の患者および糸球体腎炎の実験マウスモデルで上方制御され、MUC20が糸球体腎炎および他の腎臓損傷の進行で役割を果たし得ることが示唆される(Higuchi,Orita,Katsuya et al,Mol Cell Biol 24(17):7456−68(2004);Higuchi,Orita,Nakanishi et al,J Biol
Chem 279(3):1968−79(2004))。
Chem 279(3):1968−79(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 35 21 74
予測値 18.5 37 18.5 74
カイ二乗=1.69 有意性=0.42955735(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_146071.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの眼、肺、腎臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 35 21 74
予測値 18.5 37 18.5 74
カイ二乗=1.69 有意性=0.42955735(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_146071.1)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの眼、肺、腎臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.57.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA108722−2743(UNQ2782))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトムチン20(MUC20)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。血液および脾臓中のT細胞の比率が正常であるにもかかわらず、リンパ節中のナイーブT細胞が減少する。IgM B細胞は骨髄中で増加するが、リンパ節中で有意に減少する。さらに、雄変異体は、平均血清インスリンレベルが減少した。雄ノックアウト(−/−)マウスは、総組織マスおよび除脂肪体重が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトムチン20(MUC20)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに免疫学的異常が生じた。血液および脾臓中のT細胞の比率が正常であるにもかかわらず、リンパ節中のナイーブT細胞が減少する。IgM B細胞は骨髄中で増加するが、リンパ節中で有意に減少する。さらに、雄変異体は、平均血清インスリンレベルが減少した。雄ノックアウト(−/−)マウスは、総組織マスおよび除脂肪体重が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるため
に極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるため
に極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−
Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
組織特異的FACSプロジェクト:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のIgM+およびCD117+B細胞が増加した。血液および脾臓中のT細胞の比率が正常であるにもかかわらず、リンパ節中のナイーブT細胞が減少する(特にCD4+)。さらに、(−/−)マウスは、リンパ節中の死細胞の比率がより高く、B細胞が減少し、(CD8細胞がわずかに減少するにもかかわらず)CD4およびCD8T細胞が増加する。(−/−)マウスはまた、脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)が増加し、これは、血液学結果において単球が増加する所見と一致する。
組織特異的FACSプロジェクト:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨髄中のIgM+およびCD117+B細胞が増加した。血液および脾臓中のT細胞の比率が正常であるにもかかわらず、リンパ節中のナイーブT細胞が減少する(特にCD4+)。さらに、(−/−)マウスは、リンパ節中の死細胞の比率がより高く、B細胞が減少し、(CD8細胞がわずかに減少するにもかかわらず)CD4およびCD8T細胞が増加する。(−/−)マウスはまた、脾臓中のCD11b+CD11c−細胞(単球)が増加し、これは、血液学結果において単球が増加する所見と一致する。
したがって、PRO7170ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、複雑なパターンの多数の免疫学的異常が生じる。本質的に、リンパ節中のB細胞集団(プレB細胞またはプロB細胞、未成熟および成熟B細胞が含まれる)が顕著に減少し、T細胞集団(特に、ナイーブT細胞)が減少する。これらの所見から、PRO7170ポリペプチドまたはPRO7170ポリペプチドをコードする遺伝子は、リンパ節中のB細胞およびT細胞の両集団の発生に重要なようである。したがって、PRO7170ポリペプチドは、B細胞およびT細胞の増殖の増強または進行に有利であろう。
(c)血液化学
マウスにおける血液化学試験の実施のための臨床的状況で、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して血液化学分析を行った。
インスリンデータ:
試験の説明:Lexicon Geneticsは、マウスにおける定量的インスリンアッセイの実施のための臨床的状況で、Cobra IIシリーズ自動γカウンティングシステムを使用する。
マウスにおける血液化学試験の実施のための臨床的状況で、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して血液化学分析を行った。
インスリンデータ:
試験の説明:Lexicon Geneticsは、マウスにおける定量的インスリンアッセイの実施のための臨床的状況で、Cobra IIシリーズ自動γカウンティングシステムを使用する。
結果:
インスリン:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清インスリンレベルが減少した。
インスリン:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清インスリンレベルが減少した。
PRO7170ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異(−/−)マウスは、糖尿病を示し得る低インスリンレベルによって特徴づけられる表現型を示す。したがって、PRO7170ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、これらの代謝関連効果を模倣するであろう。他方では、PRO7170ポリペプチドまたはそのアゴニストは、糖尿病などの代謝障害の防止および/または治療で有用であろう。
(d)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含
んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含
んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄(−/−)は、平均総組織マスおよび徐脂肪体重が増加した。
結果:
DEXA:雄(−/−)は、平均総組織マスおよび徐脂肪体重が増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満に関連し得る負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO7170ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満または他の成長関連障害の予防および/または治療で特に重要であろう。
66.58.DNA108670−2744(UNQ2783)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO7171ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA108670−2744と示す)(UNQ2783)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:AA030296 アクセッション:AA030296 NID:1497436 ムス・ムスクルス mi02d10.r1 Soaresマウス胎盤4NbMP13.5 14.5 ムス・ムスクルス cDNAクローンIMAGE:459283 5¥’; 参照ヒト遺伝子配列:AY358621 ホモ・サピエンスクローンDNA108670 WWLS2783(UNQ2783);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWV7 アクセッション:Q6UWV7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。WWLS2783。
これらのノックアウト実験では、PRO7171ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA108670−2744と示す)(UNQ2783)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:AA030296 アクセッション:AA030296 NID:1497436 ムス・ムスクルス mi02d10.r1 Soaresマウス胎盤4NbMP13.5 14.5 ムス・ムスクルス cDNAクローンIMAGE:459283 5¥’; 参照ヒト遺伝子配列:AY358621 ホモ・サピエンスクローンDNA108670 WWLS2783(UNQ2783);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWV7 アクセッション:Q6UWV7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。WWLS2783。
目的のマウス遺伝子は、部分的cDNA(NCBIアクセッションAAO30296)によって示され、これは、ホモ・サピエンスクローンDNA108670 WWLS2783(UNQ2783)を有するオーソログである。別名には、仮説タンパク質MGC52498およびPRO7171が含まれる。
UNQ2783は、推定分泌タンパク質であり、134個のアミノ酸からなり、シグナルペプチドを含む(Clark et al,Genome Res 13(10):2265−70(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、
ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 23 32 12 67
予測値 16.75 33.5 16.75 67
カイ二乗=3.5 有意性=0.17377394(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および脾臓、腎臓、肝臓、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 23 32 12 67
予測値 16.75 33.5 16.75 67
カイ二乗=3.5 有意性=0.17377394(hom/n)=0.2 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および脾臓、腎臓、肝臓、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.58.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA108670−2744(UNQ2783))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質(UNQ2783)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび体脂肪が増加した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。変異(−/−)マウスはまた、トリグリセリドレベルが増加した。マイクロアレイ分析は、リンパ腫瘍中のUNQ2783の過剰発現を示す。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト推定分泌タンパク質(UNQ2783)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マスおよび体脂肪が増加した雌ホモ接合体変異マウスが得られた。変異(−/−)マウスはまた、トリグリセリドレベルが増加した。マイクロアレイ分析は、リンパ腫瘍中のUNQ2783の過剰発現を示す。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
結果:
DEXA:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、平均総組織マス、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
これらの結果は、ノックアウト変異マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重の増加、ならびに平均総体脂肪率および総脂肪マスの増加によって特徴づけられる異常な体重および脂肪測定値を示すことを証明する。
これらの結果は、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO7171ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、脂質蓄積症および/または肥満症の予防および/または治療で特に重要であろう。
(c)診断−心拍数/血圧
説明
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。1匹の(−/−)雄マウスはまた、心拍数が減少した(歴史的平均よりも2標準偏差を超えて低い)。
説明
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。1匹の(−/−)雄マウスはまた、心拍数が減少した(歴史的平均よりも2標準偏差を超えて低い)。
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、1日あたり10回4日間にわたって測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果:
血圧:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。
結果:
血圧:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。
心拍数:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均心拍数が増加した。
(d)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
血液化学:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的
平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO7171遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO7171ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO7171ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO7171遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO7171ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO7171ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
66.59.DNA119535−2756(UNQ2973)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO7436ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA119535−2756と示す)(UNQ2973)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_177036 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA C130022P09遺伝子(C130022P09Rik);参照タンパク質:NP_796010
RIKEN cDNA C130022P09遺伝子(ムス・ムスクルス)gi|26347895|dbj|BAC37596.1|不特定のタンパク質産物(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:NM_020219 ホモ・サピエンス癌胎児性抗原様1(CEAL1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q7Z692 アクセッション:Q7Z692 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。癌胎児性抗原様1前駆体(UNQ2973/PRO7436)。
これらのノックアウト実験では、PRO7436ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA119535−2756と示す)(UNQ2973)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_177036 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA C130022P09遺伝子(C130022P09Rik);参照タンパク質:NP_796010
RIKEN cDNA C130022P09遺伝子(ムス・ムスクルス)gi|26347895|dbj|BAC37596.1|不特定のタンパク質産物(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:NM_020219 ホモ・サピエンス癌胎児性抗原様1(CEAL1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q7Z692 アクセッション:Q7Z692 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。癌胎児性抗原様1前駆体(UNQ2973/PRO7436)。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA C130022P09遺伝子(ヒトCEAL1(癌胎児性抗原様1)のオーソログ)である。別名には、DKFZp547N157が含まれる。
CEAL1は、推定I型内在性膜タンパク質であり、シグナルペプチド、免疫グロブリン様ドメイン、および膜貫通セグメントを含む。第2のCEAL1変異型は、免疫グロブリン様ドメインを欠く。他の癌胎児性抗原(CEA)ファミリーメンバーに類似することにより、CEAL1は、原形質膜中に存在する可能性が高い。CEAL1は広範に発現し、臨床的に侵襲性の卵巣癌の小集団中に過剰発現し得る(Scorilas et al.,Gene 310:79−89(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 46 21 85
予測値 21.25 42.5 21.25 85
カイ二乗=2.38 有意性=0.30422124(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_
177036.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、腎臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 46 21 85
予測値 21.25 42.5 21.25 85
カイ二乗=2.38 有意性=0.30422124(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_
177036.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脊髄、眼、胸腺、脾臓、肺、腎臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.59.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA119535−2756(UNQ2973))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト癌胎児性抗原様1(CEAL1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が有意に増加するホモ接合体変異マウスが得られた。雌(−/−)マウスはまた、総体脂肪およびコレステロールの減少と共に体重および総組織マスが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト癌胎児性抗原様1(CEAL1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が有意に増加するホモ接合体変異マウスが得られた。雌(−/−)マウスはまた、総体脂肪およびコレステロールの減少と共に体重および総組織マスが減少した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)成体皮膚細胞の増殖:
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
手順:16週齢の動物(2匹の野生型および4匹のホモ接合体)から皮膚細胞を単離した。これらを、初代線維芽細胞培養物中で成長させ、線維芽細胞の増殖速度を厳格に規制したプロトコルで測定した。このアッセイが高増殖表現型および低増殖表現型を検出する能力を、p53およびKu80を使用して証明した。Brdu組み込みを使用して、増殖を測定した。
詳細には、これらの研究では、皮膚線維芽細胞増殖アッセイを使用した。標準化培養物中での細胞数の増加を、相対増殖能の基準として使用した。初代線維芽細胞を、野生型マウスおよび変異マウスから採取した皮膚生検から確立した。5万個の細胞の2連または3連の培養物をプレートし、6日間成長させた。培養終了後、培養物中に存在する細胞数を、電子粒子計数器を使用して決定した。
結果:
皮膚増殖:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が顕著に増加した。
結果:
皮膚増殖:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均皮膚線維芽細胞増殖速度が顕著に増加した。
したがって、ホモ接合体変異マウスは、高増殖表現型を示した。これらの所見によって示唆されるように、PRO7436ポリペプチドまたはそのアゴニストは、腫瘍抑制因子として機能することができ、異常な細胞増殖の減少に有用であろう。
(c)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が減少した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:分析に利用可能な1匹の雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、総脂肪マス、および総体脂肪率が減少した。
結果:
DEXA:分析に利用可能な1匹の雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、総脂肪マス、および総体脂肪率が減少した。
DEXAによって分析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、総組織マスおよび除脂肪体重ならびに脂肪測定値が減少し、これらの変異体の成長遅延が示唆される。これは、体重および体長が減少する所見と併せて、悪液質または他の成長遅延障害などの組織消耗性容態が示唆される。したがって、PRO7436ポリペプチドまたはそのアゴニストは、成長障害(悪液質または他の組織消耗性疾患が含まれる)の治療または防止で有用であろう。
(d)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を
使用して測定値を記録した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を
使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが減少した。
血液化学:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが減少した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが顕著に増加した。したがって、PRO7436遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO7436ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。
66.60.DNA108700−2802(UNQ3077)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO9912ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA108700−2802と示す)(UNQ3077)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_137914(推定):ムス・ムスクルス(エクトヌクレオチド(ectonucleotide)ピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7の類似物);アルカリスフィンゴミエリナーゼ(LOC238011);参照タンパク質:XP_137914 アクセッション:XP_137914 NID:gi 51766567 ref XP_137914.4(エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7の類似物);アルカリスフィンゴミエリナーゼ(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:BC041453 アクセッション:BC041453 NID:27371235 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス(エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ5、クローンIMAGE:5186743の類似物);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IUS8 アクセッション:Q8IUS8
NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ5の類似物(フラグメント)。
これらのノックアウト実験では、PRO9912ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA108700−2802と示す)(UNQ3077)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_137914(推定):ムス・ムスクルス(エクトヌクレオチド(ectonucleotide)ピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7の類似物);アルカリスフィンゴミエリナーゼ(LOC238011);参照タンパク質:XP_137914 アクセッション:XP_137914 NID:gi 51766567 ref XP_137914.4(エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7の類似物);アルカリスフィンゴミエリナーゼ(ムス・ムスクルス);参照ヒト遺伝子配列:BC041453 アクセッション:BC041453 NID:27371235 ホモ・サピエンス ホモ・サピエンス(エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ5、クローンIMAGE:5186743の類似物);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8IUS8 アクセッション:Q8IUS8
NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ5の類似物(フラグメント)。
目的のマウス遺伝子は、「エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7の類似物;アルカリスフィンゴミエリナーゼ」、ヒトENPP7(エクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7)のオーソログ」である。別名には、MGC50179、ALK SMase、およびアルカリスフィンゴミエリナーゼが含まれる。
ENPP7は、主に小腸および肝臓で発現し、スフィンゴミエリンの加水分解を触媒するエクト酵素である。このタンパク質は、シグナルペプチド、I型ホスホジエステラーゼ/ヌクレオチドピロホスファターゼドメイン(PfamアクセッションPF01663)、および原形質膜の細胞外表面にタンパク質を弱く繋留することができるC末端付近の疎水性領域からなる(Duan et al,2003)。他のスフィンゴミエリナーゼと異なり、ENPP7はアルカリpHでの至適触媒活性、トリプシン耐性、および特異的胆汁塩を示す。この酵素は、特に、小腸上皮細胞の絨毛膜の細胞外表面上および胆汁中に集中している。ENPP7は、食事性スフィンゴミエリン消化、コレステロール吸収、および小腸腫瘍発生で役割を果たす可能性が高い(Duan et al,J Biol Chem 278(40):38528(2003);Wu et al,Carcinogenesis 25(8):1327−33(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交
配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 22 37 11 70
予測値 17.5 35 17.5 70
カイ二乗=5.18 有意性=0.075020045(hom/n)=0.19 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(XM_137914.4)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、胸腺、脾臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 22 37 11 70
予測値 17.5 35 17.5 70
カイ二乗=5.18 有意性=0.075020045(hom/n)=0.19 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(XM_137914.4)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、胸腺、脾臓、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.60.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA108700−2802(UNQ3077))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトエクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7(ENPP7)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均の測定値と比較した場合、総組織マスおよび総体脂肪が増加した雄および雌のヘテロ接合性およびホモ接合体変異マウスを得た。さらに、ノックアウト(−/−)マウスは、不安様応答が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトエクトヌクレオチドピロホスファターゼ/ホスホジエステラーゼ7(ENPP7)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均の測定値と比較した場合、総組織マスおよび総体脂肪が増加した雄および雌のヘテロ接合性およびホモ接合体変異マウスを得た。さらに、ノックアウト(−/−)マウスは、不安様応答が減少した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらに
は、セラトニン(seratonin)輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。これらの試験には、不安、活動レベル、および探索を測定するためのオープンフィールドが含まれていた。
オープンフィールド試験:
公知の薬物のいくつかの標的は、オープンフィールド試験で表現型を示した。これらに
は、セラトニン(seratonin)輸送体、ドーパミン輸送体(Giros et al.,Nature.1996 Feb l5;379(6566):606−12)、およびGABA受容体(Homanics et al.,Proc Natl Acad Sci USA.1997 Apr 15;94(8):4143−8)のノックアウトが含まれる。自動化オープンフィールドアッセイを、感情状態に関連する変化および学習に関する探索パターンに対応するようにカスタマイズした。第1に、マウスにとって比較的巨大であるように領域(40×40cm)を選択し、それにより、探索に関連する自発運動の変化を選別するようにデザインした。さらに、鼻で突く(特に探索に関する活動)ことが可能な4個の穴が床に存在した。この試験に関連する感情状態を高めるためのいくつかの因子もデザインした。オープンフィールド試験は、マウスを試験する第1の実験手順であり、得られた測定値は、室を使用した被験体の第1の経験であった。さらに、オープンフィールドを明るく照らした。全てのこれらの因子は、新規の空間に関連する天然の不安を高める。次いで、探索活動のパターンおよび範囲、特に、中心−総移動距離比は、不安または抑鬱症に対する感受性に関する変化を識別することができる。3つの異なるレベルの赤外線ビームを使用した巨大な領域(40cm×40cm、AccuScan InstrumentsのVersaMax動物活動モニタリングシステム)を使用して、直立、穴掘り、および自発運動を記録した。動物を、中心に配置し、その活動を20分間測定した。この試験からのデータを、4分間隔で5回分析した。総移動距離(cm)、上下運動数(直立)、穴掘り数、および中心−総距離比を記録した。
新規の環境に対して通常の馴化応答を示すマウスの傾向を、5回の間隔にわたるその水平方向の自発運動の全変化の決定によって評価する。この計算された長期間の活動の変化の勾配を、正規化された、絶対移動距離よりもむしろ総移動距離を使用して決定する。各5回の間隔での正規化活動による回帰直線から勾配を決定する。正常な馴化を、負の勾配値によって示す。
結果:
オープンフィールド2:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の値と比較した場合、中心滞在時間の合計が増加し、雄変異体における不安様応答の減少が示唆される。
結果:
オープンフィールド2:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の値と比較した場合、中心滞在時間の合計が増加し、雄変異体における不安様応答の減少が示唆される。
オープンフィールド活動試験中に顕著な相違が認められた。雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、中心滞在時間の合計の中央値が増加し、変異体における不安様応答の減少を示す。したがって、ノックアウトマウスは、抑鬱症、全般性不安障害、認知障害、痛覚過敏、感覚障害、および/または双極性障害と一致する表現型を証明した。したがって、PRO9912ポリペプチドおよびそのアゴニストは、不安障害に関連する症状の治療または改善に有用であろう。
(c)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:雄および雌の(+/−)マウスおよび(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、平均総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
結果:
DEXA:雄および雌の(+/−)マウスおよび(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、平均総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
これらの研究は、ホモ接合体変異(−/−)マウスおよびヘテロ接合体(+/−)マウスの両方が肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO9912ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝の過程に不可欠であり、脂質蓄積症、異常脂質血症、および/または肥満症の防止および/または治療で有用であろう。
66.61.DNA119474−2803 (UNQ3079)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO9917ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA119474−2803と示す)(UNQ3079)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_145100 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2700050C12遺伝子(2700050C12Rik);参照タンパク質:Q9JJ96 アクセッション:Q9JJ96 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス脳cDNA、クローンMNCb 0671;参照ヒト遺伝子配列:NM_144586 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC29643(MGC29643);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8N2G4 アクセッション:Q8N2G4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質PSEC0181。
これらのノックアウト実験では、PRO9917ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA119474−2803と示す)(UNQ3079)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_145100 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2700050C12遺伝子(2700050C12Rik);参照タンパク質:Q9JJ96 アクセッション:Q9JJ96 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス脳cDNA、クローンMNCb 0671;参照ヒト遺伝子配列:NM_144586 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC29643(MGC29643);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8N2G4 アクセッション:Q8N2G4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質PSEC0181。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2700050C12遺伝子(ヒト仮説タンパク質MGC29643のオーソログ)である。別名には、C530008O16Rikが含まれる。
MGC29643は、推定分泌性タンパク質であり、シグナルペプチドおよびLy−6抗原/uPA受容体様ドメインからなる。このドメインは、ウロキナーゼ型プラスミノゲンアクチベーター受容体およびいくつかのグリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)結合細胞表面糖タンパク質(白血球抗原など)中で生じる。このドメインを有するタンパク質は、細胞接着またはシグナル伝達分子(SMARTアクセッションSM00134)おつぃて機能することができる。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 18 29 16 63
予測値 15.75 31.5 15.75 63
カイ二乗=5.42 有意性=0.06653681(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145100.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胸腺、肺、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 18 29 16 63
予測値 15.75 31.5 15.75 63
カイ二乗=5.42 有意性=0.06653681(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145100.2)。
1.野生型発現パネル:RT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胸腺、肺、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.61.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA119474−2803(UNQ3079))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質MGC29643のオーソログをコードする遺伝子の変異により、尾部懸垂試験において抑鬱様応答が減少し、ストレス誘導性高温試験において不安様応答が減少した。さらに、雄および雌の変異マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、心拍数が増加した。変異(−/−)マウスはまた、平均血清コレステロールレベルが増加し、耐糖能が低下した。雄および雌(−/−)マウスは、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質MGC29643のオーソログをコードする遺伝子の変異により、尾部懸垂試験において抑鬱様応答が減少し、ストレス誘導性高温試験において不安様応答が減少した。さらに、雄および雌の変異マウスの両方は、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、心拍数が増加した。変異(−/−)マウスはまた、平均血清コレステロールレベルが増加し、耐糖能が低下した。雄および雌(−/−)マウスは、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルが顕著に増加した。したがって、PRO9917遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO9917ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO9917ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(c)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。
これらの研究は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、PRO9917ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または種々の心血管障害(糖尿病が含まれる)に関連する病態の治療で有用であろう。
(d)診断−心拍数
説明
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、1日あたり10回4日間にわたって測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果:
心拍数:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均心拍数が増加した(平均よりも約2標準偏差高い)。
説明
Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって心拍数を測定する。心拍数を、1日あたり10回4日間にわたって測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下心拍数を得る。
結果:
心拍数:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均心拍数が増加した(平均よりも約2標準偏差高い)。
(e)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
機能観察バッテリー(FOB)試験−尾部懸垂試験:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂試験:
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
尾部懸垂試験は、げっ歯類の抑鬱症様挙動モデルとして開発された手順である。この特定の準備では、マウスの尾部を6分間懸垂し、それに応じてマウスがこの位置から逃れるためにもがく。一定時間後、マウスのもがきは減少し、これは、どうすることもできないパラダイムの学習型と解釈される。無効なデータ(すなわち、試験中にその尾部を登る)を有する動物を、この分析から排除する。
結果:
尾部懸垂2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合に不動時間が減少し、これは、変異体で抑鬱様応答が減少することをを示す。したがって、PRO9917のアンタゴニスト(インヒビター)は、この表現型を模倣すると予想されるであろう。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
尾部懸垂2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合に不動時間が減少し、これは、変異体で抑鬱様応答が減少することをを示す。したがって、PRO9917のアンタゴニスト(インヒビター)は、この表現型を模倣すると予想されるであろう。
機能観察バッテリー(FOB)試験−ストレス誘導過温症:
FOBは、肉眼的に感覚および運動の欠損を決定するために動物に適用される一連の状況である。肉眼的神経機能を評価するアーウィンの神経学的スクリーニング由来の試験の一部を使用する。一般に、短期間の触覚、嗅覚、および視覚に対する刺激を動物に適用して、その正常に検出および応答する能力を決定する。これらの簡潔な試験は約10分かかり、試験終了後にマウスをそのホームケージに戻す。
結果:
ストレス誘導過温症:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する耐性が阻害され、変異体における不安様応答の減少が示唆される。したがって、PRO9917ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、不安関連障害の治療で有用であろう。
ストレス誘導過温症:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性過温症に対する耐性が阻害され、変異体における不安様応答の減少が示唆される。したがって、PRO9917ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、不安関連障害の治療で有用であろう。
(f)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
結果:
DEXA:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、平均総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
DEXA:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総組織マス、平均総体脂肪率、および総脂肪マスが増加した。
これらの研究は、変異(−/−)マウスが肥満症に関連する負の表現型を示すことを示す。したがって、PRO9917ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝の過程に不可欠であり、脂質蓄積症、異常脂質血症、および/または肥満症の防止および/または治療で有用であろう。
66.62.DNA226874(UNQ5291)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO37337ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA226874と示す)(UNQ5291)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_010128 ムス・ムスクルス上皮膜タンパク質1(Emp1);参照タンパク質:P47801 アクセッション:P47801 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。上皮膜タンパク質1(EMP1)(腫瘍関連膜タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_001423 ホモ・サピエンス上皮膜タンパク質1(EMP1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:P54849 アクセッション:P54849 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。上皮膜タンパク質1(EMP1)(腫瘍関連膜タンパク質)(CL 20)(B4Bタンパク質)。
これらのノックアウト実験では、PRO37337ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA226874と示す)(UNQ5291)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_010128 ムス・ムスクルス上皮膜タンパク質1(Emp1);参照タンパク質:P47801 アクセッション:P47801 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。上皮膜タンパク質1(EMP1)(腫瘍関連膜タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_001423 ホモ・サピエンス上皮膜タンパク質1(EMP1);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:P54849 アクセッション:P54849 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。上皮膜タンパク質1(EMP1)(腫瘍関連膜タンパク質)(CL 20)(B4Bタンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、Emp1(上皮膜タンパク質 1)(ヒトEMP1のオーソログ)である。別名には、腫瘍関連膜タンパク質、TMP、B4Bタンパク質、およびCL−20が含まれる。
EMP1は、推定内在性原形質膜糖タンパク質であり、1つのPMP22ファミリードメイン内の4つの膜貫通セグメントからなる(Lobsiger et al,Genomics 36(3):379−87(1996);Marvin et al,J Biol Chem 270(48):28910−6(1995);Ruegg et al,J Immunol 157(1):72−80(1996))。EMP1は、密着結合成分として機能するクローディンおよび調節サブユニットとして機能する電位依存性カルシウムチャネルγサブユニットと構造が類似する(InterProアクセッションIPR004031)。EMP1は、主に発生中のニューロン中に発現するが(Wulf and Suter,Brain Res Dev Brain Res 116(2):169−80(1999))、いくつかの他の組織(腫瘍(Ben Porath
and Benvenisty,Gene 183(1−2):69−75(1996))、扁平上皮分化気管支上皮細胞(Chen et al,Genomics 41(1):40−8(1997))、および未熟B細胞亜集団(Ruegg et al,J
Immunol 157(1):72−80(1996)が含まれる)中でも発現する。EMP1は、細胞の増殖、発達、分化、および細胞死などの過程で役割を果たし得る(Ruegg et al,J Immunol 157(1):72−80(1996)
;Wang et al,World J Gastroenterol 9(3):392−8(2003);Wulf and Suter,Brain Res Dev Brain Res 116(2):169−80(1999))。
and Benvenisty,Gene 183(1−2):69−75(1996))、扁平上皮分化気管支上皮細胞(Chen et al,Genomics 41(1):40−8(1997))、および未熟B細胞亜集団(Ruegg et al,J
Immunol 157(1):72−80(1996)が含まれる)中でも発現する。EMP1は、細胞の増殖、発達、分化、および細胞死などの過程で役割を果たし得る(Ruegg et al,J Immunol 157(1):72−80(1996)
;Wang et al,World J Gastroenterol 9(3):392−8(2003);Wulf and Suter,Brain Res Dev Brain Res 116(2):169−80(1999))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 10 41 13 64
予測値 16 32 16 64
カイ二乗=1.35 有意性=0.5091564(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_010128.3).
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 10 41 13 64
予測値 16 32 16 64
カイ二乗=1.35 有意性=0.5091564(hom/n)=0.23 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_010128.3).
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.62.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA226874(UNQ5291))(a)全体的な表現型の概要:
ヒト上皮膜タンパク質 1(EMP1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨中無機質密度の測定値が増加した変異(−/−)マウスが得られた。雄および雌の(−/−)マウスの両方は、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。雌(−/−)マウスはまた、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。胚発現は、脈管構造中に強いシグナルを示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
ヒト上皮膜タンパク質 1(EMP1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、骨中無機質密度の測定値が増加した変異(−/−)マウスが得られた。雄および雌の(−/−)マウスの両方は、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。雌(−/−)マウスはまた、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均収縮期血圧が減少した。胚発現は、脈管構造中に強いシグナルを示した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:(−/−)マウスは、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。さらに、雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および大腿骨中の平均容積測定骨中無機質密度および骨中無機質密度が増加した。
DEXA:(−/−)マウスは、総組織マスおよび総体脂肪が増加した。さらに、雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、全身および大腿骨中の平均容積測定骨中無機質密度および骨中無機質密度が増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均大腿骨骨幹部断面積が増加した。
これらの結果は、骨量の増加によって特徴づけられる大理石骨病に類似の骨測定値の増加伴う異常な骨代謝を示すことが証明される。ノックアウト(−/−)マウスはまた、肥満症表現型の徴候を示した。したがって、PRO37337ポリペプチドまたはそのアゴニストは、骨ホメオスタシスの維持および破骨細胞と骨芽細胞の活性の釣り合わせによる骨再造形に有用であろう。さらに、PRO37337ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニストまたはインヒビターは、骨治癒または骨石灰化に関連する他の骨関連異常の治療で有用であろう。PRO37337ポリペプチドまたはそのアゴニストはまた、正常な脂質代謝を維持するために有用である。
66.63.DNA227033(UNQ5407)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO37496ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA227033と示す)(UNQ5407)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_010762 ムス・ムスクルスミエリンおよびリンパ球タンパク質、T細胞分化タンパク質(Mal);参照タンパク質:O09198アクセッション:O09198 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ミエリンおよびリンパ球タンパク質(Tリンパ球成熟化関連タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_002371アクセッション:NM_002371 NID:gi 12408666 ref NM_002371.2
ホモ・サピエンスmal、T細胞分化タンパク質(MAL)、転写物変異型a;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:P21145 アクセッション:P21145
NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ミエリンおよびリンパ球タンパク質(Tリンパ球成熟化関連タンパク質)。
これらのノックアウト実験では、PRO37496ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA227033と示す)(UNQ5407)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_010762 ムス・ムスクルスミエリンおよびリンパ球タンパク質、T細胞分化タンパク質(Mal);参照タンパク質:O09198アクセッション:O09198 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ミエリンおよびリンパ球タンパク質(Tリンパ球成熟化関連タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_002371アクセッション:NM_002371 NID:gi 12408666 ref NM_002371.2
ホモ・サピエンスmal、T細胞分化タンパク質(MAL)、転写物変異型a;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:P21145 アクセッション:P21145
NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。ミエリンおよびリンパ球タンパク質(Tリンパ球成熟化関連タンパク質)。
目的のマウス遺伝子は、Mal(ミエリンおよびリンパ球タンパク質、T細胞分化タンパク質)(ヒトMAL(mal,T細胞分化タンパク質)のオーソログ)である。別名には、MPV17、VIP17、ミエリンおよびリンパ球タンパク質、ならびにT細胞分化
タンパク質MALが含まれる。
タンパク質MALが含まれる。
MALは親油性内在性膜タンパク質であり、MARVEL(膜結合)ドメイン(PfamアクセッションPF01284)内に含まれる4つの膜貫通セグメントからなる。MALは、上皮細胞、成熟T細胞、およびミエリン形成細胞の糖脂質富化マイクロドメイン中に見出される。さらに、MALは、いくつかの細胞内位置(小胞体、ゴルジ装置、小胞(large vesicle)、および原形質膜が含まれる)中で検出されている。MALの機能は、明確に知られていないが、偏向した糖脂質およびタンパク質の輸送、小胞形成、および髄鞘形成で役割を果たし得る(Marazuela and Alonso,Histol Histopathol 19(3):925−33(2004);Puertollano et al,J Biol Chem 272(29):18311−5(1997);Magyar et al,Gene 189(2):269−75(1997);Erne et al,J Neurochem 82(3):550−62(2002);Schaeren Wiemers et al,J Cell Biol 166(5):731−42(2004);Saravanan et al,Neurobiol Dis 16(2):396−406(2004);Frank
et al,J Neurochem 73(2):587−97(1999);Frank,Prog Neurobiol 60(6):531−44(2000))。
et al,J Neurochem 73(2):587−97(1999);Frank,Prog Neurobiol 60(6):531−44(2000))。
Schaeren Wiemers and colleagues(2004)は、ノックアウトマウスを使用してMALの生理学的役割を調査した。彼らは、ミエリン形成およびノード近傍(paranode)−軸索接触面構造がMAL欠損マウスで異常であったが、野生型マウスでは異常でなかったことを示した。著者は、MALが中枢神経系におけるノード近傍形成に極めて重要であると結論づけた。彼らは、MALが乏突起膠細胞中の種々の膜成分の輸送または分類を調節する可能性が高いと提案した。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 21 37 18 76
予測値 19 38 19 76
カイ二乗=2.09 有意性=0.35169184(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_010762.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および胸腺、肺、肝臓、、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 21 37 18 76
予測値 19 38 19 76
カイ二乗=2.09 有意性=0.35169184(hom/n)=0.24 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_010762.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および胸腺、肺、肝臓、、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.63.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA227033(UNQ5407))(a)全体的な表現型の概要:
ヒトmal(T細胞分化タンパク質(MAL))のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のCD8細胞の平均比率が減少し、リンパ節中のナイーブCD4およびCD8T細胞が減少したホモ接合体変異マウスが得られた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
ヒトmal(T細胞分化タンパク質(MAL))のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、末梢血中のCD8細胞の平均比率が減少し、リンパ節中のナイーブCD4およびCD8T細胞が減少したホモ接合体変異マウスが得られた。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析/組織特異的FACS
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
蛍光活性化細胞分取(FACS)解析/組織特異的FACS
手順:
末梢血由来の免疫細胞組成物(Tリンパ球を評価するためのCD4、CD8、およびT細胞受容体、Bリンパ球のためのCD19、白血球マーカーとしてのCD45、およびナチュラルキラー細胞のためのpanNKが含まれる)のFACS解析を行った。2匹の野生型マウスおよび6匹のホモ接合体マウスに対してFACS解析を行い、マウスは、胸腺、脾臓、骨髄、およびリンパ節由来の細胞を含んでいた。
これらの研究では、分析細胞を、胸腺、末梢血、脾臓、骨髄、およびリンパ節から単離した。単核細胞集団中のCD4およびCD8陽性T細胞、B細胞、NK細胞、および単球の相対的比率が決定されるようにフローサイトメトリーをデザインした。Becton−Dickinson FACSCalibur 3−laser FACS装置を使用して、免疫状態を評価した。表現型アッセイおよびスクリーニングのために、この機械は、CD4+/CD8+比に加えて、CD4+/CD8−、CD8+/CD4−、NK、B細胞、および単球の数を記録する。単核細胞プロフィールを、6系統特異的抗体のパネル(CD45 PerCP、抗TCRb APC、CD4 PE、CD8 FITC、pan−NK PE、およびCD19 FITC)を使用した各マウス由来の溶解末梢血の単一サンプルの染色によって導いた。2つのFITCおよびPE標識抗体は、相互排除する細胞型を染色する。CellQuestソフトウェアを備えたBecton Dickinson FACSCaliburフローサイトメーターを使用して、サンプルを分析した。
結果:
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、リンパ節中のCD8細胞の平均比率の減少ならびにナイーブCD4およびCD8T細胞のの比率の減少によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
FACS3:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、リンパ節中のCD8細胞の平均比率の減少ならびにナイーブCD4およびCD8T細胞のの比率の減少によって特徴づけられる末梢血中の白血球小集団分布の変化を示した。
PRO37496ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、変異(−/−)マウスは、CD8細胞およびCD4ナイーブT細胞の平均比率が減少した。CD8タンパク質は、抗原認識においてT細胞受容体と協力するためにMHCクラスI分子を結合/認識する補助受容体分子である。したがって、PRO379496ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫系を刺激し、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろう。したがって、PRO37496ポリペプチドのアンタゴニストまたはインヒビターは、免疫応答の阻害に有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
さらに、(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、細胞中のナイーブCD4細胞の平均比率が減少した。したがって、PRO37496ポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトにより、T細胞集団が増加する。これらの所見から、PRO37496ポリペプチドまたはPRO37496をコードする遺伝子は、T細胞増殖の負の調節因子として作用するようである。したがって、PRO37496ポリペプチドは、T細胞増殖の増強で有利であろう。
66.64.DNA145841−2868(UNQ5827)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO19646ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA145841−2868と示す)(UNQ5827)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:IRRE様2のNM_172898 ムス・ムスクルス類(kin)(ショウジョウバエ)(Kirrel2);参照タンパク質:Q7TSU7 アクセッション:Q7TSU7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。IRRE様2類;参照ヒト遺伝子配
列:IRRE様2のNM_199180 ホモ・サピエンス類(ショウジョウバエ)(KIRREL2)、転写物変異型3;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWL6 アクセッション:Q6UWL6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。IRRE様タンパク質2前駆体類(不規則なキアズマ様タンパク質2類)(ネフリン様タンパク質3)(UNQ5827/PRO19646)。
これらのノックアウト実験では、PRO19646ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA145841−2868と示す)(UNQ5827)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:IRRE様2のNM_172898 ムス・ムスクルス類(kin)(ショウジョウバエ)(Kirrel2);参照タンパク質:Q7TSU7 アクセッション:Q7TSU7 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。IRRE様2類;参照ヒト遺伝子配
列:IRRE様2のNM_199180 ホモ・サピエンス類(ショウジョウバエ)(KIRREL2)、転写物変異型3;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6UWL6 アクセッション:Q6UWL6 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。IRRE様タンパク質2前駆体類(不規則なキアズマ様タンパク質2類)(ネフリン様タンパク質3)(UNQ5827/PRO19646)。
目的のマウス遺伝子は、Kirrel2(IRRE様2類(ショウジョウバエ))(ヒトKIRREL2のオーソログ)である。別名には、NLG1、NEPH3、FILTRIN、MGC15718、DKFZP564A1164、C330019F22Rik、不規則なキアズマ様タンパク質2類、IRRE様2のX類(ショウジョウバエ)、ネフリン様3、およびネフリン様遺伝子1が含まれる。
KIRREL2は、細胞接着分子として機能する可能性が高いI型内在性原形質膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、5つのIg様ドメイン、膜貫通ドメイン、およびファミリーメンバーKIRRELおよびKIRREL3中に保存された9個のアミノ酸を含む細胞質C末端を含む。KIRREL2のC末端ドメインは、KIRRELおよびKIRREL3と同様に、ポドシン(糸球体濾過バリアとして機能する構造(スリット膜)の成分)と相互作用することができる。KIRREL2は、多数の異なる組織中で発現するが、主に膵島β細胞およびリンパ節中で発現するようである。さらに、KIRREL2の発現は、非肥満性糖尿病(NOD)マウスにおける膵島のT細胞侵襲および糖尿病発症と負に相関する。KIRREL2は、糸球体濾過、膵臓β細胞機能、および免疫などの生理学的過程に関与し得る(Ihalmo et al,Biochem Biophys Res Commun 300(2):364−70(2003);Sellin et al,FASEB J 17(1):115−7(2003);Sun
et al,Genomics 82(2):130−42(2003))。
et al,Genomics 82(2):130−42(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 14 31 13 58
予測値 14.5 29 14.5 58
カイ二乗=0.74 有意性=0.6907343(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172898.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 14 31 13 58
予測値 14.5 29 14.5 58
カイ二乗=0.74 有意性=0.6907343(hom/n)=0.22 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜3をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172898.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、眼、胃、小腸、および結腸中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.64.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA145841−2868(UNQ5827))
(a)全体的な表現型の概要:
IRRE様2のヒト類(ショウジョウバエ)(KIRREL2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均体重および体長が減少した。さらに、雄(−/−)マウスは、細精管の変性が示された。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
IRRE様2のヒト類(ショウジョウバエ)(KIRREL2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、平均体重および体長が減少した。さらに、雄(−/−)マウスは、細精管の変性が示された。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:分析した雄(−/−)マウスは、細精管の空胞変性を示した。1匹の(−/−)マウス(M−173)はまた、肝臓の小葉中心部分の微小空胞の脂肪が変化した。
遺伝子発現:標的遺伝子の発現は、免疫組織化学分析によって組織パネル中に検出されなかった。
顕微鏡的:分析した雄(−/−)マウスは、細精管の空胞変性を示した。1匹の(−/−)マウス(M−173)はまた、肝臓の小葉中心部分の微小空胞の脂肪が変化した。
遺伝子発現:標的遺伝子の発現は、免疫組織化学分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。したがって、変異(−/−)マウスは、成長遅延に関連し得る表現型を示した。PRO19646ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長の促進で有用であろうことに対して、PRO19646ポリペプチドインヒビターまたはアンタゴニストはこの負の表現型を模倣するであろう。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が減少した。したがって、変異(−/−)マウスは、成長遅延に関連し得る表現型を示した。PRO19646ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長の促進で有用であろうことに対して、PRO19646ポリペプチドインヒビターまたはアンタゴニストはこの負の表現型を模倣するであろう。
66.65.DNA188342(UNQ5893)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO21718ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA188342と示す)(UNQ5893)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:BC024587 アクセッション:BC024587 NID:19354042 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス、RIKEN cDNA 5830408F06遺伝子の類似物、クローンMGC:37716 IMAGE:5066283;参照タンパク質:Q9D3G2 アクセッション:Q9D3G2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。5830408F06Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_020125
アクセッション:NM_020125 NID:gi 9910341 ref NM_020125.1 ホモ・サピエンス Bリンパ球活性化因子マクロファージ(発現型)(lymphocyte activator macrophage expressed)(BLAME);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9P0V8
アクセッション:Q9P0V8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。BCM様膜タン
パク質(仮説タンパク質FLJ90188)。
これらのノックアウト実験では、PRO21718ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA188342と示す)(UNQ5893)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:BC024587 アクセッション:BC024587 NID:19354042 ムス・ムスクルス ムス・ムスクルス、RIKEN cDNA 5830408F06遺伝子の類似物、クローンMGC:37716 IMAGE:5066283;参照タンパク質:Q9D3G2 アクセッション:Q9D3G2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。5830408F06Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_020125
アクセッション:NM_020125 NID:gi 9910341 ref NM_020125.1 ホモ・サピエンス Bリンパ球活性化因子マクロファージ(発現型)(lymphocyte activator macrophage expressed)(BLAME);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q9P0V8
アクセッション:Q9P0V8 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。BCM様膜タン
パク質(仮説タンパク質FLJ90188)。
目的のマウス遺伝子は、Slamf8(SLAMファミリーメンバー8)(ヒトSLAMF8のオーソログ)である。別名には、Blame、SBBI42、5830408F06Rik、Bリンパ球活性化因子マクロファージ(発現型)、およびBCM様膜タンパク質前駆体が含まれる。
SLAMF8は、受容体またはB細胞補助受容体として機能する可能性が高いI型原形質膜タンパク質である。SLAMF8は、いくつかのリンパ組織(リンパ節、脾臓、胸腺、および骨髄が含まれる)ならびにγインターフェロン活性化末梢血単核細胞、接着活性化単球、および樹状細胞サブセット中に発現する。SLAMF8は、B細胞系統の関連付け(commitment)またはB細胞受容体シグナル伝達で役割を果たす可能性が高い(Kingsbury et al, J Immunol 166(9):5675−80(2001))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 28 41 20 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗=2.35 有意性=0.308819(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションBC024587.1)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 28 41 20 89
予測値 22.25 44.5 22.25 89
カイ二乗=2.35 有意性=0.308819(hom/n)=0.26 平均同腹仔数=10
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションBC024587.1)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.65.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA188342(UNQ5893))(a)全体的な表現型の概要:
ヒトSLAMファミリーメンバー8(SLAMF8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が低下した変異(−/−)マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
ヒトSLAMファミリーメンバー8(SLAMF8)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、耐糖能が低下した変異(−/−)マウスが得られた。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容
態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容
態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。
血糖値/耐糖能試験:
(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、高脂肪食を与えた場合に耐糖能障害を示した。
これらの研究は、(−/−)マウスが、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強することを示した。したがって、ノックアウト変異マウスは、グルコースホメオスタシス障害の表現型パターンを示した。したがって、PRO21718ポリペプチド(またはそのアゴニスト)またはそのコード遺伝子は、グルコースホメオスタシス障害および/または種々の心血管障害(糖尿病が含まれる)に関連する病態の治療で有用であろう。
66.66.DNA149911−2885(UNQ5926)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO19820ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA149911−2885と示す)(UNQ5926)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_026516 アクセッション:NM_026516 NID:gi 21312655 ref NM_026516.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2810417M05遺伝子(2810417M05Rik);参照タンパク質:Q9CZ16アクセッション:Q9CZ16 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。2810417M05Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_152390アクセッション:NM_152390 NID:gi 22748834 ref NM_152390.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC33926(MGC33926);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8NBL3 アクセッション:Q8NBL3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質PLACE1004322。
これらのノックアウト実験では、PRO19820ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA149911−2885と示す)(UNQ5926)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_026516 アクセッション:NM_026516 NID:gi 21312655 ref NM_026516.1 ムス・ムスクルス RIKEN cDNA 2810417M05遺伝子(2810417M05Rik);参照タンパク質:Q9CZ16アクセッション:Q9CZ16 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。2810417M05Rikタンパク質;参照ヒト遺伝子配列:NM_152390アクセッション:NM_152390 NID:gi 22748834 ref NM_152390.1 ホモ・サピエンス仮説タンパク質MGC33926(MGC33926);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8NBL3 アクセッション:Q8NBL3 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。仮説タンパク質PLACE1004322。
目的のマウス遺伝子は、RIKEN cDNA 2810417M05遺伝子(ヒト仮説タンパク質MGC33926のオーソログ)である。
仮説タンパク質MGC33926は、297アミノ酸ポリペプチドであり、シグナルペプチド、3つの潜在的膜貫通セグメント、およびC末端付近の潜在的なグリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)繋留部位を含む。この仮説タンパク質の予想される機能および細胞中の位置は不明である。バイオインフォマティクス分析により、膜貫通ドメインがクローディン(典型的には密着結合成分として機能する内在性原形質膜タンパク質)(TrEMBLアクセッションQ8NBL3;InterProアクセッションIPR006187)の膜貫通ドメインと類似すると示唆される。他のバイオインフォマティクス分析により、ヒトタンパク質がGPIアンカーによって原形質膜の細胞外表面に繋留することが示唆される。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 14 40 19 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=2.42 有意性=0.29819727(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_026516.1)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、胃、小腸、および結腸以外のRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 14 40 19 73
予測値 18.25 36.5 18.25 73
カイ二乗=2.42 有意性=0.29819727(hom/n)=0.29 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_026516.1)。
1.野生型発現パネル:骨格筋、骨、胃、小腸、および結腸以外のRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.66.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA149911−2885(UNQ5926))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(MGC33926)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性高熱試験中に不安様応答が増加した。8匹の(−/−)変異マウスのうちの3匹で排便が無かった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト仮説タンパク質(MGC33926)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、ストレス誘導性高熱試験中に不安様応答が増加した。8匹の(−/−)変異マウスのうちの3匹で排便が無かった。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
結果:
ストレス誘導性高熱:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性高熱に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆された。
ストレス誘導性高熱:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性高熱に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆された。
まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO19820ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
66.67.DNA168028−2956(UNQ6098)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO21201ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA168028−2956と示す)(UNQ6098)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_172416アクセッション:NM_172416 NID:gi 29293830 ref NM_172416.2 ムス・ムスクルスグレイ致死性大理石骨病(grey lethal 大理石骨病)(Gl未決定);参照タンパク質:Q8BGT0アクセッション:Q8BGT0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。大理石骨病関連膜貫通タンパク質1前駆体(グレイ致死性タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_014028 アクセッション:NM_014028 NID:gi 30025025 ref NM_014028.2 ホモ・サピエンスグレイ致死性大理石骨病(GL);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q86WC4 アクセッション:Q86WC4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。大理石骨病関連膜貫通タンパク質1前駆体(HSPC019)(UNQ6098/PRO21201)。
これらのノックアウト実験では、PRO21201ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA168028−2956と示す)(UNQ6098)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_172416アクセッション:NM_172416 NID:gi 29293830 ref NM_172416.2 ムス・ムスクルスグレイ致死性大理石骨病(grey lethal 大理石骨病)(Gl未決定);参照タンパク質:Q8BGT0アクセッション:Q8BGT0 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。大理石骨病関連膜貫通タンパク質1前駆体(グレイ致死性タンパク質);参照ヒト遺伝子配列:NM_014028 アクセッション:NM_014028 NID:gi 30025025 ref NM_014028.2 ホモ・サピエンスグレイ致死性大理石骨病(GL);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q86WC4 アクセッション:Q86WC4 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。大理石骨病関連膜貫通タンパク質1前駆体(HSPC019)(UNQ6098/PRO21201)。
目的のマウス遺伝子は、Ostm1(大理石骨病関連膜貫通タンパク質1)(ヒトOSTM1のオーソログ)である。別名には、GL、GIPN、HSPC019、1200002H13Rik、グレイ致死性、グレイ致死性大理石骨病、グレイ致死性大理石骨病、およびGAIP相互作用タンパク質N末端が含まれる。
OSTM1は、骨芽細胞、メラノサイト、腎臓、脳、胸腺、脾臓、およびいくつかの他の組織中に発現する推定E3ユビキチンリガーゼである。このタンパク質は、サイトゾルおよび原形質膜区画(特に、遠位尿細管の側底膜)中に存在する。OSTM1は、Gタンパク質αサブユニットi3(GNAI3)のユビキチン化を触媒し、したがって、このタンパク質は、プロテアソーム経路を介した分解によってGタンパク質媒介性シグナル伝達を調節する可能性が高い。OSTM1はまた、破骨細胞およびメラノサイトの成熟化および機能に必要である。OSTM1遺伝子の機能喪失成熟により、ヒトおよびマウスで大理石骨病を発症し、マウスの毛色が欠損する(Chalhoub et al,Nat Med 9(4):395−406(2003);Fischer et al,Proc
Natl Acad Sci U S A 100(14):8270−5(2003))。
Natl Acad Sci U S A 100(14):8270−5(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析
を行う。
を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 26 39 26 91
予測値 22.75 45.5 22.75 91
カイ二乗=3.18 有意性=0.20392561(hom/n)=0.31 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172416.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 26 39 26 91
予測値 22.75 45.5 22.75 91
カイ二乗=3.18 有意性=0.20392561(hom/n)=0.31 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_172416.2)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.67.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA168028−2956(UNQ6098))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト大理石骨病関連膜貫通タンパク質1(OSTM1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔よりも顕著に小さいホモ接合体変異マウスが得られた。ノックアウト(−/−)マウスは、発育できず、平均体重が非常に減少し、毛色が灰色であり、歯が無かった。顕微分析により、ホモ接合性変異体で網膜変性、ニューロンの壊死、および大理石骨病が明らかとなった。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清IL−6応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト大理石骨病関連膜貫通タンパク質1(OSTM1)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔よりも顕著に小さいホモ接合体変異マウスが得られた。ノックアウト(−/−)マウスは、発育できず、平均体重が非常に減少し、毛色が灰色であり、歯が無かった。顕微分析により、ホモ接合性変異体で網膜変性、ニューロンの壊死、および大理石骨病が明らかとなった。ヘテロ接合体マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清IL−6応答が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:(−/−)マウスは、著しいびまん性大理石骨病、中等度のびまん性網膜変性、および軽度の多病巣性ニューロン壊死を示した。全ての長骨、脊椎、および胸骨分節の髄腔は、線維性骨小柱で満たされていた。破骨細胞数は増加し、頻繁に、巨大な小胞状核を有していた(活性化していた)。いくつかの領域では、破骨細胞が変性して壊死していた。破骨細胞は、細長く且つ線維芽細胞のようになる傾向があるが、これらも多数存在した。頭蓋中の骨、鼻小柱、および長骨の骨端部は、弱い線維性の骨および小柱を豊富に含んでいた。臼歯は骨基質から萌出することができず、埋伏した切歯の基底部に分散した異形成の歯原組織が存在した。網膜変性は、受容体および外核層に影響を及ぼした。光受容体層に多数のマクロファージが存在した。大脳皮質では、層状構造の(laminar)変性およびIV/Vニューロン層の壊死/アポトーシスが存在した。同様に、影響を及ぼされたニューロンは、海馬および歯状回にも存在した。全ての変異(−/−)マウスの器官は小さかったが、そのほとんどがマウスの体重に比例していた((+/+)同腹仔の重量の1/2〜1/3)。しかし、胸腺は、より小さい傾向にあった((+/+)同腹仔の重量の約1/10)。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
顕微鏡的:(−/−)マウスは、著しいびまん性大理石骨病、中等度のびまん性網膜変性、および軽度の多病巣性ニューロン壊死を示した。全ての長骨、脊椎、および胸骨分節の髄腔は、線維性骨小柱で満たされていた。破骨細胞数は増加し、頻繁に、巨大な小胞状核を有していた(活性化していた)。いくつかの領域では、破骨細胞が変性して壊死していた。破骨細胞は、細長く且つ線維芽細胞のようになる傾向があるが、これらも多数存在した。頭蓋中の骨、鼻小柱、および長骨の骨端部は、弱い線維性の骨および小柱を豊富に含んでいた。臼歯は骨基質から萌出することができず、埋伏した切歯の基底部に分散した異形成の歯原組織が存在した。網膜変性は、受容体および外核層に影響を及ぼした。光受容体層に多数のマクロファージが存在した。大脳皮質では、層状構造の(laminar)変性およびIV/Vニューロン層の壊死/アポトーシスが存在した。同様に、影響を及ぼされたニューロンは、海馬および歯状回にも存在した。全ての変異(−/−)マウスの器官は小さかったが、そのほとんどがマウスの体重に比例していた((+/+)同腹仔の重量の1/2〜1/3)。しかし、胸腺は、より小さい傾向にあった((+/+)同腹仔の重量の約1/10)。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:野生型、ヘテロ接合体、およびホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織
マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:野生型、ヘテロ接合体、およびホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織
マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
明白な一般的所見:(−/−)マウスは、小さく、毛色が灰色で歯が無かった。変異体は、その発育の失敗により、死亡したか屠殺した。
体重:(−/−)マウスは、2週間目および4週間目の測定値においてその性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が顕著に減少した。(−/−)マウスの体長のデータは収集していなかったが、肉眼的写真では、(−/−)マウスは、(+/+)同胞よりも短いようであった。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
明白な一般的所見:(−/−)マウスは、小さく、毛色が灰色で歯が無かった。変異体は、その発育の失敗により、死亡したか屠殺した。
体重:(−/−)マウスは、2週間目および4週間目の測定値においてその性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重が顕著に減少した。(−/−)マウスの体長のデータは収集していなかったが、肉眼的写真では、(−/−)マウスは、(+/+)同胞よりも短いようであった。
したがって、変異(−/−)マウスは、生存能の低下および成長遅延に関連し得る表現型を示した。歯の不在は、臼歯が歯基質から萌出できなかったという病理学的所見と一致する。したがって、PRO21201ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および発達に不可欠なようであるのに対して、PRO21201ポリペプチドのインヒビターまたはアンタゴニストはこの負の表現型を模倣するであろう。
(d)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,
ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清IL−6応答が増加した。
急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
(+/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清IL−6応答が増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃は、PRO21201ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃した場合、免疫応答(IL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。IL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。さらに、IL−6は、急性期応答および全身炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。
66.68.DNA154095−2998(UNQ6115)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO20026ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA154095−2998と示す)(UNQ6115)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_134437 アクセッション:NM_134437 NID:gi 24025661 ref NM_134437.1 ムス・ムスクルス(Fgf遺伝子の類似発現物)(Sef未決定);参照タンパク質:Q8JZL1 アクセッション:Q8JZL1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。膜貫通タンパク質(インターロイキン17受容体様タンパク質の長形態(long form));参照ヒト遺伝子配列:AF494208ホモ・サピエンスインターロイキン17受容体様タンパク質の長形態(IL17RLM);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8NFM7 アクセッション:Q8NFM7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン17受容体様タンパク質の長形態。
これらのノックアウト実験では、PRO20026ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA154095−2998と示す)(UNQ6115)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_134437 アクセッション:NM_134437 NID:gi 24025661 ref NM_134437.1 ムス・ムスクルス(Fgf遺伝子の類似発現物)(Sef未決定);参照タンパク質:Q8JZL1 アクセッション:Q8JZL1 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。膜貫通タンパク質(インターロイキン17受容体様タンパク質の長形態(long form));参照ヒト遺伝子配列:AF494208ホモ・サピエンスインターロイキン17受容体様タンパク質の長形態(IL17RLM);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8NFM7 アクセッション:Q8NFM7 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン17受容体様タンパク質の長形態。
目的のマウス遺伝子は、Il17rd(インターロイキン17受容体D)(ヒトIL17RDのオーソログ)である。別名には、Sef、Sef−S、Fgf遺伝子の類似発現
物、IL17RLM、FLJ35755、DKFZp434N1928、FGFタンパク質の類似発現物が含まれる。
物、IL17RLM、FLJ35755、DKFZp434N1928、FGFタンパク質の類似発現物が含まれる。
IL17RDは、線維芽細胞成長因子(FGF)シグナル伝達のフィードバック阻害およびアポトーシス調節経路の活性化に関与する受容体またはシグナル伝達分子として機能する可能性が高いI型原形質膜タンパク質である。選択的スプライシングによって生成したIL17RDのより短い細胞質基質イソ型もFGFシグナル伝達を阻害する。IL17RDは、FGF受容体チロシンリン酸化およびRAS/ERK MAPキナーゼ経路の遮断によってFGFシグナル伝達を阻害する。IL17RDは、TAK1/c−Jun N末端キナーゼ経路の活性化によってアポトーシスを刺激する。IL17RDは、血管内皮細胞中、高脈管化組織中(腎臓、結腸、骨格筋、心臓、小腸など)、ならびに腎臓、唾液腺、および精嚢の導管上皮細胞中に発現する。IL17RDの細胞質基質形態の発現は、見かけ上より制限される。IL17RDは、細胞増殖、細胞の移動、分化、アポトーシス、および血管形成などの過程で役割を果たす可能性が高い(Yang et al,J Biol Chem 279(37):38099−102(2004);Torii et al,Dev Cell 7(1):33−44(2004);Preger et al,Proc Natl Acad Sci U S A 101(5):1229−34(2004);Xiong et al,J Biol Chem 278(50):50273−82(2003);Yang et al,J Biol Chem
278(35):33232−8(2003);Kovalenko et al, J Biol Chem 278(16):14087−91(2003);Furthauer et al,Nat Cell Biol 4(2):170−4(2002);Tsang et al,Nat Cell Biol 4(2):165−9(2002))。
278(35):33232−8(2003);Kovalenko et al, J Biol Chem 278(16):14087−91(2003);Furthauer et al,Nat Cell Biol 4(2):170−4(2002);Tsang et al,Nat Cell Biol 4(2):165−9(2002))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 16 25 14 55
予測値 13.75 27.5 13.75 55
カイ二乗=0.2 有意性=0.9048374(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_134437.1)。
1.野生型発現パネル:胸腺、肝臓、胃、小腸、結腸、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 16 25 14 55
予測値 13.75 27.5 13.75 55
カイ二乗=0.2 有意性=0.9048374(hom/n)=0.25 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
コードエクソン4をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_134437.1)。
1.野生型発現パネル:胸腺、肝臓、胃、小腸、結腸、および脂肪以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.68.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA154095−2998(UNQ6115))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17受容体D(IL17RD)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔よりも体重および体長が増加し、総組織マスが増加し、徐脂肪体重が増加した、巨大な雄ホモ接合体変異マウスが得られた。雄(−/−)マウスは、総脂肪マスが増加し、血清トリグリセリドレベルがより低い傾向があった。雄(−/−)マウスはまた、血圧の低下および睾丸萎縮を示した。雄変異体は、耐糖能が増強された。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17受容体D(IL17RD)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その性別一致野生型同腹仔よりも体重および体長が増加し、総組織マスが増加し、徐脂肪体重が増加した、巨大な雄ホモ接合体変異マウスが得られた。雄(−/−)マウスは、総脂肪マスが増加し、血清トリグリセリドレベルがより低い傾向があった。雄(−/−)マウスはまた、血圧の低下および睾丸萎縮を示した。雄変異体は、耐糖能が増強された。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)心臓学−血圧
試験の説明:Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
血圧:雄(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血圧が減少した。
試験の説明:Visitech BP−2000血圧分析システムによる4日間の非侵襲性テールカフ法によって収縮期血圧を測定する。血圧を、4日間にわたって1日10回測定する。次いで、4日間の値を平均して、マウスの意識下収縮期血圧を得る。
結果
血圧:雄(−/−)マウスは、(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、血圧が減少した。
(c)表現型解析:代謝−血液化学/耐糖能
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、血糖測定を含む。COBAS Integra 400(mfr:Roche)を、マウスの血流化学試験のために使用した。代謝領域では、糖尿病治療のための標的を同定することができる。血液化学表現型解析は、インスリン感受性およびグルコース代謝の変化を測定するための耐糖能試験を含む。耐糖能試験の異常な結果は、以下の障害または容態を示し得るが、これらに限定されない:1型および2型糖尿病、症候群X、種々の心血管疾患、および/または肥満症。
手順:2匹の野生型マウスおよび4匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。耐糖能試験は、哺乳動物のグルコースホメオスタシス障害を定義するための基準である。Lifescan血糖計を使用して、耐糖能試験を行った。動物に、20%溶液として2g/kgのD−グルコースをIP注射し、注射から0、30分、60分、および90分後に血糖値を測定した。
結果:
経口耐糖能:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能の増加を示した。
経口耐糖能:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、耐糖能の増加を示した。
これらの研究では、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、試験した3つ全ての間隔で正常な空腹時血糖の存在下で耐糖能が増加または増強を示した。したがって、ノックアウトマウスは、インスリン感受性の増加またはグルコースホメオスタシス障害の逆の表現型パターンを示した。したがって、PRO20026ポリペプチドまたはそのコード遺伝子に対するアンタゴニスト(インヒビター)は、グルコースホメオスタシス障害の治療で有用であろう。
(d)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
血液化学:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清トリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO20026遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO20026ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、トリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO20026ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(e)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
(e)骨代謝および放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
CAT−スキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重、および総脂肪マスが増加した。
CAT−スキャンプロトコル:
CT造影剤であるOmnipaque300(Nycomed Amershan,300mgヨウ素/mL、0.25mL/動物または2.50〜3.75gヨウ素/kg体重)をマウスの腹腔内に注射した。約10分間、ケージ内で安静にさせた後、Avertin(1.25%2,2,2,−トリブロムエタノール、20mL/kg体重)を腹腔内注射することによりそのマウスを鎮静させた。麻酔動物を試験台に腹臥位にして、MicroCATスキャナー(ImTek,Inc.)を使用してCATスキャンを行った。三次元像を、ImTek 3D RECONソフトウェアを使用してワークステーションクラスターでFeldkampアルゴリズムによって再構成した。
結果:
DEXA:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均総組織マス、除脂肪体重、および総脂肪マスが増加した。
これらの研究により、変異(−/−)非ヒトトランスジェニック動物が肥満症に関連する負の表現型を示すことが示唆される。したがって、PRO20026ポリペプチドまたはそのアゴニストは、正常な成長および代謝過程に不可欠であり、肥満症の防止および/または治療で特に重要であろう。
CATスキャン:分析した2匹の雄(−/−)マウス(M−75およびM−100)は、左精巣が萎縮した。
CATスキャン:分析した2匹の雄(−/−)マウス(M−75およびM−100)は、左精巣が萎縮した。
66.69.DNA166819−P1381R1C1P1(UNQ6129)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO20110ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA166819−1381R1C1P1と示す)(UNQ6129)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_145856 アクセッション:NM_145856 NID:gi 22003915 ref NM_145856.1 ムス・ムスクルスインターロイキン17F(IL 17F);参照タンパク質:Q8K4C3 アクセッション:Q8K4C3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。IL17F;参照ヒト遺伝子配列:NM_052872 ホモ・サピエンスインターロイキン17F(IL17F),転写物変異型1;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6NSI0 アクセッション:Q6NSI0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン17Fのイソ型1。
これらのノックアウト実験では、PRO20110ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA166819−1381R1C1P1と示す)(UNQ6129)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:NM_145856 アクセッション:NM_145856 NID:gi 22003915 ref NM_145856.1 ムス・ムスクルスインターロイキン17F(IL 17F);参照タンパク質:Q8K4C3 アクセッション:Q8K4C3 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。IL17F;参照ヒト遺伝子配列:NM_052872 ホモ・サピエンスインターロイキン17F(IL17F),転写物変異型1;ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6NSI0 アクセッション:Q6NSI0 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。インターロイキン17Fのイソ型1。
目的のマウス遺伝子は、Il17f(インターロイキン17F)(ヒトIL17Fのオーソログ)である。別名には、ML1、IL−24、ML−1、IL−24、IL−26、IL−17F、サイトカインML−1、およびインターロイキン24が含まれる。
IL17Fは、シグナル伝達リガンドとして機能し、T細胞ヘルパー1型(Th1)応答に典型的な炎症性サイトカインおよびケモカインの産生を刺激するサイトカインである。IL17Fは、気管支上皮細胞または欠陥内皮細胞中のIL−6、IL−8、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、IL−2、トランスフォーミング増殖因子β、および単球走化性タンパク質1の産生を刺激する(Kawaguchi et
al,J Biol Chem 277(18):15229−32(2002);Starnes et al,J Immunol 167(8):4137−40(2001);Numasake et al,Immunol Lett 95(2):175−84(2004);Kawaguchi et al,J Allergy Clin Immunol 114(2):444−50(2004))。IL17F誘導性サイトカインまたはケモカイン産生のためのシグナル伝達経路は、細胞外シグナル調節キナーゼ(ERK)1/2の活性化に関与する可能性が高い(Kawaguchi et al,J Biol Chem 277(18):15229−32(2002);Kawaguchi et al,J Allergy Clin Immunol 114(2):444−50(2004))。IL17Fは、血管形成の阻害(Starnes et al,J Immunol 167(8):4137−40(2001)、好中球増加症の誘導、および抗原誘導性アレルギー反応の増幅(Oda et al,Am J
Respir Crit Care Med 171(1):12−18(2004))で役割を果たす。
al,J Biol Chem 277(18):15229−32(2002);Starnes et al,J Immunol 167(8):4137−40(2001);Numasake et al,Immunol Lett 95(2):175−84(2004);Kawaguchi et al,J Allergy Clin Immunol 114(2):444−50(2004))。IL17F誘導性サイトカインまたはケモカイン産生のためのシグナル伝達経路は、細胞外シグナル調節キナーゼ(ERK)1/2の活性化に関与する可能性が高い(Kawaguchi et al,J Biol Chem 277(18):15229−32(2002);Kawaguchi et al,J Allergy Clin Immunol 114(2):444−50(2004))。IL17Fは、血管形成の阻害(Starnes et al,J Immunol 167(8):4137−40(2001)、好中球増加症の誘導、および抗原誘導性アレルギー反応の増幅(Oda et al,Am J
Respir Crit Care Med 171(1):12−18(2004))で役割を果たす。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交
配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 20 40 18 78
予測値 19.5 39 19.5 78
カイ二乗=9.65 有意性=0.008026555(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145856.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、胸腺、脾臓、および腎臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 20 40 18 78
予測値 19.5 39 19.5 78
カイ二乗=9.65 有意性=0.008026555(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1および2をターゲティングした(NCBIアクセッションNM_145856.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個の成体組織サンプルのうちの脳、脊髄、胸腺、脾臓、および腎臓中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.69.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA166819−P1381R1C1P1(UNQ6129))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17F(IL17F)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの不安関連応答が増加した。さらに、変異(−/−)マウスは、平均血清IgG1、IgG2a、およびIgG3レベルが増加し、平均体重および体長が増加し、骨中無機質密度の測定値の増加を伴って総組織マス、除脂肪体重、および総体脂肪率が増加した。(−/−)マウスは、平均小柱の体積、数、および連結性が増加した。(−/−)マウスはまた、コレステロールおよびトリグリセリドレベルが上昇する傾向が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒトインターロイキン17F(IL17F)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスの不安関連応答が増加した。さらに、変異(−/−)マウスは、平均血清IgG1、IgG2a、およびIgG3レベルが増加し、平均体重および体長が増加し、骨中無機質密度の測定値の増加を伴って総組織マス、除脂肪体重、および総体脂肪率が増加した。(−/−)マウスは、平均小柱の体積、数、および連結性が増加した。(−/−)マウスはまた、コレステロールおよびトリグリセリドレベルが上昇する傾向が増加した。遺伝子破壊を、サザンブロットによって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼ
すこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
すこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行の範囲内の(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG1、IgG2a、およびIgG3レベルが増加した。
血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行の範囲内の(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgG1、IgG2a、およびIgG3レベルが増加した。
変異(−/−)マウスは、IgG1、IgG2a、およびIgG3血清免疫グロブリンが上昇した。これらの免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。認められた表現型により、PRO20110ポリペプチドが炎症反応の負の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、PRO20110ポリペプチドが免疫系を刺激に有用であり、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO20110ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限
定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
結果:
ストレス誘導性高熱:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性高熱に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆された。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限
定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
結果:
ストレス誘導性高熱:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均のレベルと比較した場合、ストレス誘導性高熱に対する感受性が増加し、変異体における不安様応答の増加が示唆された。
まとめると、機能観察試験により、軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安、および/または双極性障害、活動亢進、感覚障害、強迫性障害、分裂病、または偏執性人格に関連し得る不安の増加に関連する表現型が明らかとなった。したがって、PRO20110ポリペプチドまたはそのアゴニストは、このような神経障害の治療で有用であろう。
(d)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。
血中脂質
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよび平均血清トリグリセリドレベルが増加した。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO20110遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO20110ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO20110ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(e)骨代謝および身体診断
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
(1)組織マスおよび除脂肪体重の測定−Dexa
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、総組織マス(TTM)の変化を首尾よく同定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が増加した。
身体測定(体長および体重):
身体測定:約16週齢で体長および体重の測定を行った。
結果:
体重および体長:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均体重および平均体長が増加した。
(2)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌の(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均総組織マスが増加した。雄変異体はまた、平均除脂肪体重、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加し、雌変異体は、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱の体積、数、および連結性が増加した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
DEXA:雄および雌の(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔と比較した場合、平均総組織マスが増加した。雄変異体はまた、平均除脂肪体重、総体脂肪率、および総脂肪マスが増加し、雌変異体は、平均総体脂肪率および総脂肪マスが増加した。
マイクロCT:雄(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱の体積、数、および連結性が増加した。
DEXAおよび骨マイクロCT分析によって分析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が減少し、大理石骨病などの異常な骨障害が示唆された。しかし、変異(−/−)マウスはまた、体重および体長、総組織マス、および除脂肪体重が増加した。雌(−/−)マウスはまた、平均体脂肪率および脂肪量が増加し、肥満症が示唆された。これらの所見により、PRO20110ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、脂肪蓄積に関連する代謝障害を引き起こすが、大理石骨病を反映する異常な骨測定値も得られる。したがって、PRO20110ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。さらに、PRO20110ポリペプチドは、正常な脂質代謝の維持で有用であろう。肥満症、高コレステロール血症、および高トリグリセリド血症の治療でも有用である。PRO20110ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、異常または病的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害が含まれる)を引き起こすであろう。
66.70.DNA185171−2994(UNQ6507)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO23203ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA185171−2994と示す)(UNQ6507)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:AK052981ムス・ムスクルス15日胚頭部cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:D930007L06産物:腫瘍抑制因子PHYDEの少しの類似物(ラッタス・ノルヴェギクス(Rattus norvegicus))、全インサート配列;参照タンパク質:Q8BWB6アクセッション:Q8BWB6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス15日胚頭部cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:D930007L06産物:腫瘍抑制因子PHYDEの少しの類似物;参照ヒト遺伝子配列:NM_152999アクセッション:NM_152999 NID:gi 25092600 ref NM_152999.2ホモ・サピエンス前立腺の6回膜貫通上皮抗原2(STEAP2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8NFT2 アクセッション:Q8NFT2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。前立腺の6回膜貫通上皮抗原2。
これらのノックアウト実験では、PRO23203ポリペプチドをコードする遺伝子(DNA185171−2994と示す)(UNQ6507)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:AK052981ムス・ムスクルス15日胚頭部cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:D930007L06産物:腫瘍抑制因子PHYDEの少しの類似物(ラッタス・ノルヴェギクス(Rattus norvegicus))、全インサート配列;参照タンパク質:Q8BWB6アクセッション:Q8BWB6 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。ムス・ムスクルス15日胚頭部cDNA、RIKEN全長富化ライブラリー、クローン:D930007L06産物:腫瘍抑制因子PHYDEの少しの類似物;参照ヒト遺伝子配列:NM_152999アクセッション:NM_152999 NID:gi 25092600 ref NM_152999.2ホモ・サピエンス前立腺の6回膜貫通上皮抗原2(STEAP2);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q8NFT2 アクセッション:Q8NFT2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。前立腺の6回膜貫通上皮抗原2。
目的のマウス遺伝子は、Steap2(前立腺の6回膜貫通上皮抗原2)(ヒトSTEAP2のオーソログ)である。別名には、STMP、IPCA1、IPCA 1、STAMP1、PCANAP1、4921538B17Rik、前立腺癌関連遺伝子1、6回膜貫通前立腺タンパク質、前立腺癌関連タンパク質1、および前立腺の6回膜貫通タンパク質1が含まれる。
STEAP2は、主に原形質膜およびトランスゴルジ網に存在するが、細胞質ゾル小胞細管構造およびエンドソーム中にも存在する内在性膜タンパク質である。このタンパク質は、NADPHオキシダーゼファミリーメンバーおよびTedZ細菌オキシドレダクターゼファミリーメンバーの6TMヘム結合ドメインと構造が類似した6回膜貫通(6TM)ドメインを含む。STEAP2発現は、前立腺上皮中で高いが、他の組織(心臓、脳、腎臓、膵臓、および卵巣など)中で検出可能である。STEAP2は、ゴルジ装置から原形
質膜への小胞輸送または分泌調節で役割を果たし得る。STEAP2発現が一般に正常な前立腺上皮細胞中よりも前立腺癌中で高いので、STEAP2はまた、前立腺癌の発症または進行で役割を果たし得る(Korkmaz et al,J Biol Chem 277(39):36689−96(2002);Porkka et al,Lab Invest 82(11):1573−82(2002);Sanchez Pulido et al,BMC Cancer 4(1):98(2004))。
質膜への小胞輸送または分泌調節で役割を果たし得る。STEAP2発現が一般に正常な前立腺上皮細胞中よりも前立腺癌中で高いので、STEAP2はまた、前立腺癌の発症または進行で役割を果たし得る(Korkmaz et al,J Biol Chem 277(39):36689−96(2002);Porkka et al,Lab Invest 82(11):1573−82(2002);Sanchez Pulido et al,BMC Cancer 4(1):98(2004))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 20 42 20 82
予測値 20.5 41 20.5 82
カイ二乗=0.43 有意性=0.80654144(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1の前のエクソンおよびコードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAK052981.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 20 42 20 82
予測値 20.5 41 20.5 82
カイ二乗=0.43 有意性=0.80654144(hom/n)=0.27 平均同腹仔数=8
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1の前のエクソンおよびコードエクソン1をターゲティングした(NCBIアクセッションAK052981.1)。
1.野生型発現パネル:胚性幹(ES)細胞およびRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.70.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA185171−2994(UNQ6507))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト前立腺の6回膜貫通上皮抗原2(STEAP2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オボアルブミン攻撃に対する平均血清IgG1およびIgG2a応答が増加したホモ接合体変異マウスが得られた。さらに、雌(−/−)マウスは、日周期リズム試験中に不安が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト前立腺の6回膜貫通上皮抗原2(STEAP2)のオーソログをコードする遺伝子の変異により、その野生型同腹仔および歴史的平均と比較した場合、オボアルブミン攻撃に対する平均血清IgG1およびIgG2a応答が増加したホモ接合体変異マウスが得られた。さらに、雌(−/−)マウスは、日周期リズム試験中に不安が増加した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺
激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
卵白アルブミン攻撃
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行った。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
卵白アルブミン攻撃
手順:このアッセイは、7匹の野生型および8匹のホモ接合体マウスにおいて行った。ニワトリ卵白アルブミン(OVA)は、T細胞依存性抗原であり、マウスにおける抗原特異的免疫応答の研究用のモデルタンパク質として一般に使用されている。OVAは無毒で不活性であり、したがって、免疫応答が誘発されない場合であっても動物に害をもたらさない。OVAに対するマウスの免疫応答は、T細胞応答を惹起させる免疫優性ペプチドが同定されている程度まで充分に特徴付けされている。抗OVA抗体を、免疫処置の8〜10日後に酵素結合イムノソルベント検定法(ELIZA)を用いて検出することができ、抗体の異なるアイソタイプの測定によって、遺伝子操作されたマウスにおいて欠陥性応答をもたらし得る複雑なプロセスに関するさらなる情報が得られる。
上記のように、このプロトコルは、マウスが抗原特異的免疫応答を生じる能力を評価する。動物に50mgのニワトリ卵白アルブミン(完全フロイントアジュバント中に乳化)をIP注射し、14日後に、抗卵白アルブミン抗体(IgM、IgG1およびIgG2サブクラス)の血清力価を測定した。血清試料中のOVA特異的抗体の量は、96ウェル試料プレートをスキャンする装置によって得られる光学密度(OD)値に比例する。データは、各血清試料の一組の連続希釈物に対して収集した。
この攻撃の結果:
卵白アルブミン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較
した場合、卵白アルブミン攻撃に対する平均血清IgG1およびIgG2a応答の増加を示した。
卵白アルブミン:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較
した場合、卵白アルブミン攻撃に対する平均血清IgG1およびIgG2a応答の増加を示した。
まとめると、卵白アルブミン攻撃研究は、PRO23203ポリペプチドをコードする遺伝子が欠失したノックアウトマウスが、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示す。特に、変異マウスは、T細胞依存性OVA抗原で攻撃した場合、免疫学的応答を誘発する能力の低下を示した。したがって、PRO23203ポリペプチドのアンタゴニスト(インヒビター)は、免疫系の刺激に有用であり、この効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO23203ポリペプチドまたはそのアゴニストは、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(c)表現型解析:CNS/神経学
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
神経学領域では、本分析は、神経学的障害および精神医学的障害(抑鬱症、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、痛覚過敏、および感覚障害が含まれる)の治療のためのin vivoでの有効な標的の同定に焦点を当てた。神経障害には、「不安障害」と定義されるカテゴリーが含まれ、以下が含まれるが、これらに限定されない:軽度から中等度の不安、一般的病状に起因する不安障害、詳細不明の不安障害、全般性不安障害、パニック発作、広場恐怖を伴うパニック障害、広場恐怖を伴わないパニック障害、外傷後ストレス障害、社会恐怖症、特定恐怖症、物質誘発性不安障害、急性アルコール離脱、強迫性障害、広場恐怖、双極性障害(I型またはII型)、詳細不明の双極性障害、気分循環性障害、うつ病性障害、大うつ病性障害、気分障害、物質誘発性気分障害。さらに、不安障害は、人格障害に適用することができ、人格障害には、以下の型が含まれるが、これらに限定されない:偏執傾向型、反社会型、回避性行動型、境界性人格障害型、依存型、演技型、自己陶酔型、強迫型、分裂型、および統合失調型。
手順:
4匹の野生型マウス、4匹のヘテロ接合体変異マウス、および8匹のホモ接合体変異マウスのコホートに対して挙動スクリーニングを行った。全ての挙動試験を、生存率の低下によってより早期の試験が必要とならない限り、12週齢と16週齢との間で行った。
サーカディアン試験の説明:
雌マウスを、試験初日の午後4時に48.2cm×26.5cmのホームケージに個別に収容し、飼料および水を自由に与えた。動物を、午前7時に照明をつけ、午後7時に照明を消す12時間の明暗周期に曝露する。システムソフトウェアで動物の運動によって生じるビーム妨害数(ビームが自動的に歩行に妨害される)を記録する。活動を、3日間の試験中に1時間間隔で60秒間記録する。得られたデータを、3日間の試験期間にわたって各時間(日周期リズム)について記録した活動レベルの中央値および各明暗周期における総活動の中央値(自発運動)によって表示した。
結果:
日周期:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の数と比較した場合、12時間の馴化期間および両暗期に歩行回数の中央値が増加した。
日周期:雌(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均の数と比較した場合、12時間の馴化期間および両暗期に歩行回数の中央値が増加した。
ホームケージ活動性試験中のこれらの所見は、活動亢進および不安の増加を示し、これは、全般性不安障害、注意欠陥多動性障害、強迫性障害、分裂病、認知障害、および全般性不安障害などの神経障害と一致する。
66.71.DNA171732−3100(UNQ9574)遺伝子破壊を含むマウスの作製および解析
これらのノックアウト実験では、PRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子(
DNA171732−3100と示す)(UNQ9574)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_128001(推定):ムス・ムスクルス GPI繋留HDL結合タンパク質1(Gpihbp1);参照タンパク質:Q9D1N2 アクセッション:Q9D1N2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。1110002J19RIK PROTEIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_178172 ホモ・サピエンス高密度リポタンパク質結合タンパク質(LOC338328);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6P3T2 アクセッション:Q6P3T2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。高密度リポタンパク質結合タンパク質。
これらのノックアウト実験では、PRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子(
DNA171732−3100と示す)(UNQ9574)を破壊した。これらの研究のための遺伝子特異的情報を以下に示す:変異マウス遺伝子は、以下に対応する:参照ヌクレオチド:XM_128001(推定):ムス・ムスクルス GPI繋留HDL結合タンパク質1(Gpihbp1);参照タンパク質:Q9D1N2 アクセッション:Q9D1N2 NID:ムス・ムスクルス(マウス)。1110002J19RIK PROTEIN;参照ヒト遺伝子配列:NM_178172 ホモ・サピエンス高密度リポタンパク質結合タンパク質(LOC338328);ヒトタンパク質配列は、以下に対応する:参照:Q6P3T2 アクセッション:Q6P3T2 NID:ホモ・サピエンス(ヒト)。高密度リポタンパク質結合タンパク質。
目的のマウス遺伝子は、Gpihbp1(GPI繋留HDL結合タンパク質1)(ヒト「高密度リポタンパク質結合タンパク質」のオーソログ)である。別名には、GPI−HBP1および1110002J19Rikが含まれる。
Gpihbp1は高密度リポタンパク質結合タンパク質として機能するグリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)繋留細胞外膜タンパク質である。このタンパク質は、シグナルペプチド、酸性領域、リンパ球抗原ファミリーの間で高度に保存されるLy−6ドメイン、および疎水性C末端領域を含む。Gpihbp1は、選択的脂質取り込みを媒介することができるが、コレステロール流出を媒介するこはできない。Gpihbp1は、肝臓のクッパー細胞、肝臓の類洞上皮(sinusoidal epithelium)、心筋細胞、気管支上皮細胞、および歯槽マクロファージ中で発現し、HDLコレステロールの初期取り込みで役割を果たす可能性が高い(Ioka et al,J Biol Chem 278(9):7344−9(2003))。
ターゲティングされたか遺伝子トラップされた変異を、系統129SvEvBrd由来の胚性幹(ES)細胞で行った。キメラマウスを、C57BL/6Jアルビノマウスと交配してF1ヘテロ接合体動物を作製する。これらの子孫を交雑受精してF2野生型子孫、ヘテロ接合体変異子孫、およびホモ接合体変異子孫を作製する。稀に、例えば、F1マウスがキメラからほとんど得られない場合、F1ヘテロ接合体マウスを、129SvEvBrd/C57ハイブリッドマウスと交雑してさらなるヘテロ接合体動物を作製し、これを交雑受精してF2マウスを作製する。この世代由来のマウスに対してレベルI表現型解析を行う。
野生型 ヘテロ ホモ 合計
実測値 14 58 14 86
予測値 21.5 43 21.5 86
カイ二乗=13.97 有意性=9.2566316E 4(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションBC061225)。
1.野生型発現パネル:脳、眼、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
実測値 14 58 14 86
予測値 21.5 43 21.5 86
カイ二乗=13.97 有意性=9.2566316E 4(hom/n)=0.18 平均同腹仔数=9
変異情報
変異型:相同組換え(標準)
説明:コードエクソン1〜4をターゲティングした(NCBIアクセッションBC061225)。
1.野生型発現パネル:脳、眼、骨格筋、および骨以外のRT−PCRによって試験した13個全ての成体組織サンプル中の標的遺伝子の発現を検出した。
2.QC発現:標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
66.71.1.表現型解析(破壊遺伝子:DNA171732−3100(UNQ9574))
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト「高密度リポタンパク質結合タンパク質」のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに脂肪血症が生じた。血液化学の測定値および顕微分析により、ホモ接合体変異マウスが顕著に脂肪血症を示すことが明らかとなった。変異体における非常に増加した血清脂質濃度は、いくつかの他のレベル1パラメータ(総ビリルビンの測定値ならびに眼底および血管造影図の分析が含まれる)に影響を与えた。さらに、ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均の測定値と比較した場合、貧血性および免疫学的異常の徴候を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(a)全体的な表現型の概要:
ヒト「高密度リポタンパク質結合タンパク質」のオーソログをコードする遺伝子の変異により、(−/−)マウスに脂肪血症が生じた。血液化学の測定値および顕微分析により、ホモ接合体変異マウスが顕著に脂肪血症を示すことが明らかとなった。変異体における非常に増加した血清脂質濃度は、いくつかの他のレベル1パラメータ(総ビリルビンの測定値ならびに眼底および血管造影図の分析が含まれる)に影響を与えた。さらに、ホモ接合体変異マウスは、その野生型同腹仔および歴史的平均の測定値と比較した場合、貧血性および免疫学的異常の徴候を示した。標的遺伝子の破壊を、サザンハイブリダイゼーション解析によって確認した。
(b)病理学
顕微鏡的:試験した6匹の(−/−)マウスのうち、4匹が剖検において顕著な抗し失血症が示した。組織病理学により、散在性血管中の淡色染色無細胞物質量の増加が明らかとなった。4匹の脂質血症の(−/−)マウスでは、副腎の束状帯中の全細胞の細胞質のみが顕著な組織病理学的変化を示し、これは、これらの細胞中の脂質/コレステロール取り込みまたは代謝と一致する。正常組織中のこれらの細胞に典型的な正常な微小血管化細胞質の代わりに、これらの細胞の細胞質は、高脂質血症マウスにおいて微小空胞を欠いた。その代わり、変異体における束状帯の細胞質は、不規則に細かい顆粒状且つ好酸性を示し、これは、これらの細胞中の脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化と一致するであろう。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
顕微鏡的:試験した6匹の(−/−)マウスのうち、4匹が剖検において顕著な抗し失血症が示した。組織病理学により、散在性血管中の淡色染色無細胞物質量の増加が明らかとなった。4匹の脂質血症の(−/−)マウスでは、副腎の束状帯中の全細胞の細胞質のみが顕著な組織病理学的変化を示し、これは、これらの細胞中の脂質/コレステロール取り込みまたは代謝と一致する。正常組織中のこれらの細胞に典型的な正常な微小血管化細胞質の代わりに、これらの細胞の細胞質は、高脂質血症マウスにおいて微小空胞を欠いた。その代わり、変異体における束状帯の細胞質は、不規則に細かい顆粒状且つ好酸性を示し、これは、これらの細胞中の脂質/コレステロールの取り込みまたは代謝の変化と一致するであろう。
遺伝子発現:LacZ活性は、免疫組織化学的分析によって組織パネル中に検出されなかった。
(c)心血管表現型解析
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
心血管生物学領域では、心血管障害、内皮障害、または血管障害の治療のための潜在的標的を同定するために表現型試験を行った。1つのこのような表現型試験には、種々の眼の異常を合図するための網膜動静脈比(A/V比)を決定するための眼底撮影法および血管造影法が含まれた。異常なA/V比は、高血圧の血管疾患(および高血圧を引き起こす任意の疾患(例えば、アテローム性動脈硬化症))、糖尿病、または眼科疾患に対応する他の眼疾患に関連し得るこのような全身疾患または障害を示す。このような眼の異常には、以下が含まれ得るがこれらに限定されない:網膜の異常は、以下である:網膜の形成異常、種々の網膜症、再狭窄、網膜動脈閉鎖又は閉塞;網膜血管系の二次的萎縮を生じる網膜変性、色素性網膜炎、黄斑変性、シュタルガルト病、先天性停在夜盲症、コロイデレミア、回転状萎縮、レーバー先天性黒内障、網膜分離障害、ヴァーグナー症候群、アッシャー症候群、ツェルヴェーガー症候群、サルディーノ−マインザー症候群、シニアローケン症候群、バルデー−ビードル症候群、アルポート症候群、アルストレーム症候群、コケーン症候群、先天性脊骨端形成異常、フリン−エアード症候群、フリートライヒ運動失調、ハルグレン症候群、マーシャル症候群、アルベルス−シェーンベルク病、レフサム病、キーンズ・セイアー症候群、ワールデンブルヒ症候群、アラジール症候群、筋緊張性ジストロフィー、オリーブ橋小脳萎縮、ピエール・マリエ症候群、スティックラー症候群、カロチン血症、シスチン蓄積症、ウォルフラム症候群、バッセン−コルンツヴァイク症候群、無β‐リポ蛋白血症、色素失調症、バッテン病、ムコ多糖体沈着症、ホモシスチン尿症、またはマンノシドーシス。
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで試験した。Hawes and coauthors(Hawes et al.,1999 Molecular Vision 1999;5:22)にしたがって修正したKowa Genesis小動物用眼底カメラを使用して、意識のある動物に対して眼底撮影法を行った。フルオレセインの腹腔内注射によって、各試験についての直接照明眼底画像および蛍光血管造影図を取得した。直接的な眼科的変化に加えて、この試験は、糖尿病およびアテローム性動脈硬化症などの全身疾患または他の網膜異常に関連
した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
した網膜の変化を検出することができる。通常の光線下の眼底写真を得た。血管造影により、眼の動脈および静脈を試験することが可能であった。さらに、眼の動脈−静脈(A/V)比を決定した。
上記プロトコルを使用して、作製したF2野生型、ヘテロ接合体、およびホモ接合体変異子孫に対して眼科学分析を行った。詳細には、Kowa COMIT+ソフトウェアを使用した眼底画像に従ってA/V比を測定し、計算した。この試験は、瞳孔散大によってカラー写真を撮影する。この画像は、多くの疾患の検出および分類に役立つ。動脈−静脈比(A/V)は、静脈の直径に対する動脈の直径の比である(血管の分岐前に測定する)。多くの疾患(すなわち、糖尿病、心血管障害、乳頭浮腫、視神経萎縮、他の眼の異常(網膜変性(色素性網膜炎として公知)など)、網膜の形成異常、視覚問題、または失明)がこの比に影響を及ぼす。したがって、野生型(+/+)同腹仔と比較してホモ接合体(−/−)およびヘテロ接合体(+/−)変異子孫の動脈−静脈比が増加する表現型所見は、このような病的状態を示すであろう。
結果:
眼底:(−/−)マウスは全て、桃色の半透明のの網膜血管を示した。眼底顕微鏡下で血流を観察することができ、変異体における網膜脈管構造の異常が示唆される。血管造影図:(−/−)マウスの主な網膜脈管構造を、フルオレセイン色素投与前の青色光の照明を用いて明確に視覚化することができ、変異マウスの血液中に既存の蛍光物質の増加が示唆される。フルオレセイン色素の投与後、(−/−)マウスとその(+/+)同腹仔との間に顕著な相違は認められなかった。
結果:
眼底:(−/−)マウスは全て、桃色の半透明のの網膜血管を示した。眼底顕微鏡下で血流を観察することができ、変異体における網膜脈管構造の異常が示唆される。血管造影図:(−/−)マウスの主な網膜脈管構造を、フルオレセイン色素投与前の青色光の照明を用いて明確に視覚化することができ、変異マウスの血液中に既存の蛍光物質の増加が示唆される。フルオレセイン色素の投与後、(−/−)マウスとその(+/+)同腹仔との間に顕著な相違は認められなかった。
(d)免疫表現型解析
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
免疫関連疾患および炎症疾患は、通常の生理学では発作または損傷に応答し、発作または損傷からの修復を開始し、外来生物に対する先天性および後天性防御を増加させるために極めて重要な非常に複雑でしばしば複数の相互関連した生物学的経路の徴候および結果である。これらの正常な生理学的経路が応答強度の直接的関連、異常な制御または過剰な刺激の結果、自己反応、またはこれらの組み合わせとしてさらなる発作または損傷を引き起こす場合、疾患または病変が起こる。
これらの疾患の発症は、しばしば多段階経路およびしばしば複数の異なる生体系/生物学的経路に関与するが、1つまたは複数のこれらの経路における臨界点での介入が改善効果または治療効果を示し得る。有害な過程/経路の拮抗作用または有益な過程/経路の刺激のいずれかによって治療介入を行うことができる。
Tリンパ球(T細胞)は、哺乳動物免疫応答の重要な構成要素である。T細胞は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)内の遺伝子によってコードされる自己分子に関連する抗原を認識する。抗原を、抗原提示細胞、ウイルス感染細胞、癌細胞、移植片などの表面上のMHC分子と共に提示することができる。T細胞系は、宿主哺乳動物の健康に害を及ぼすこれらの変化した細胞を排除する。T細胞には、ヘルパーT細胞および細胞傷害性T細胞が含まれる。ヘルパーT細胞は、抗原提示細胞上の抗原−MHC複合体の認識後に大規模に増殖する。ヘルパーT細胞はまた、B細胞、細胞傷害性T細胞、および免疫応答に関与する種々の他の細胞の活性化で中心的な役割を果たす種々のサイトカイン(すなわち、リンフォカイン)を分泌する。
多くの免疫応答では、炎症細胞が損傷部位または感染部位に浸潤する。移動細胞は、罹患組織の組織学的試験によって決定することができる好中球、好酸球、単球、またはリンパ球であり得る。Current Protocols in Immunology,ed.John E.Coligan,1994,John Wiley & Sons,Inc.
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
多くの免疫関連疾患が公知であり、広く研究されている。このような疾患には、免疫介在炎症疾患(関節リウマチ、免疫介在腎臓疾患、肝胆疾患、炎症性腸疾患(IBD)、乾癬、および喘息など)、非免疫介在炎症疾患、感染症、免疫不全、新形成、および移植片拒絶などが含まれる。免疫学領域では、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。
免疫学領域では、本明細書中で、炎症および炎症障害の治療のための標的を同定した。免疫関連障害を、ある場合において、免疫応答の抑制によって治療することができる。免疫刺激活性を有する分子を阻害する中和抗体の使用は、免疫介在疾患および炎症疾患の治療で有利であろう。免疫応答を阻害する分子(タンパク質を直接または抗体アゴニストの使用を介して)を使用して、免疫応答を阻害し、免疫関連疾患を改善することができる。
以下の試験を行った。
(1)血液学
試験の説明:Abbott’s Cell Dyn 3500R(自動化血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、白血球5分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22のパラメータを対象とすることができる。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均絶対好中球数が増加し、平均絶対リンパ球数が減少した。(−/−)マウスはまた、平均赤血球数が減少し、平均ヘマトクリットレベルが減少した。さらに、(−/−)マウスは、平均血球体積、平均血球ヘモグロビン、平均血球ヘモグロビン濃度、および赤血球の分布幅が増加し、このことにより、変異マウス中の赤血球がサイズ変動が増加した正常マウスよりも少し大きいことが示唆される。
試験の説明:Abbott’s Cell Dyn 3500R(自動化血液学分析器)によって血液試験を行う。いくつかのその特徴には、白血球5分類が含まれる。「患者」報告は、全部で22のパラメータを対象とすることができる。
結果:
血液学:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均絶対好中球数が増加し、平均絶対リンパ球数が減少した。(−/−)マウスはまた、平均赤血球数が減少し、平均ヘマトクリットレベルが減少した。さらに、(−/−)マウスは、平均血球体積、平均血球ヘモグロビン、平均血球ヘモグロビン濃度、および赤血球の分布幅が増加し、このことにより、変異マウス中の赤血球がサイズ変動が増加した正常マウスよりも少し大きいことが示唆される。
これらの結果は、貧血性に関連する表現型に関連する。したがって、PRO35250ポリペプチド、そのアゴニスト、またはPRO35350ポリペプチドのコード遺伝子は、正常な赤血球産生に不可欠なはずであり、そのようなものとして、貧血性または低ヘマトクリットに関連する血液障害の治療で有用であろう。
(2)急性期応答:
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
急性期応答:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清IL−6応答が顕著に増加した。
試験の説明:細菌リポ多糖(LPS)は内毒素であり、そのようなものとして、急性期応答および全身性炎症の強い誘導因子である。レベルILPSマウスに、26ゲージの針を使用して、亜致死量のLPSを含む200μL滅菌生理食塩水を腹腔内(i.p.)注射した。この用量は、注射から3時間後に1μg/g体重で試験したマウスの平均体重に基づいた。次いで、100μLの血液サンプルを採取し、FACSCalibur装置でTNFa、MCP−1、およびIL−6の存在について分析した。
結果:
急性期応答:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、LPS攻撃に対する平均血清IL−6応答が顕著に増加した。
まとめると、LPS内毒素攻撃は、PRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損したノックアウトマウスは、その野生型同腹仔と比較した場合、免疫学的異常を示すことを示した。特に、変異マウスは、LPS内毒素で攻撃した場合、免疫応答(IL−6産生)を誘発する能力が増加し、炎症誘発応答を示す。IL−6は、より後期のB細胞活性化に寄与する。さらに、IL−6は、急性期応答および全身炎症の誘導で極めて重要な役割を果たす。したがって、PRO35250ポリペプチドは、免疫応答の負の調節因子として機能する。
(3)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行の範囲内の(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgMレベルが増加した。
(3)血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイ:
Cytometric Bead Array(CBA)キットを使用して、血清免疫グロブリンアイソタイピングアッセイを行う。このアッセイを使用して、1つのサンプル中のマウスモノクローナル抗体の重鎖および軽鎖のアイソタイプを迅速に同定する。示した値は、「相対蛍光単位」であり、κ軽鎖の検出に基づく。6未満のいかなる値も有意ではない。
結果:
Serum Imm.2:(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔、プロジェクト実行の範囲内の(+/+)マウス、および歴史的平均と比較した場合、平均血清IgMレベルが増加した。
変異(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔と比較してIgM血清免疫グロブリンが上昇した。IgM免疫グロブリンは、細菌毒素の中和のために体液性免疫応答において最初に産生され、補体系の活性化に特に重要である。変異(−/−)マウスはまた、その性別一致(+/+)同腹仔と比較してIgG3血清免疫グロブリンが上昇した。これらの免疫グロブリンは中和効果を有し、より小さな範囲で、補体系の活性化に重要である。認められた表現型により、PRO35250ポリペプチドが炎症反応の負の調節因子であることが示唆される。これらの免疫学的異常により、PRO35250ポリペプチドのインヒビター(アンタゴニスト)が免疫系(T細胞増殖など)を刺激することができ、且つこの効果が白血病、他の癌型、および免疫不全患者(AIDS患者など)などの場合の個体に有利である場合に使用されるであろうということが示唆される。したがって、PRO35250ポリペプチドまたはアゴニストは、免疫応答の阻害で有用であり、例えば、移植片拒絶または移植片対宿主疾患の場合の有害な免疫応答の抑制のための有用な候補であろう。
(e)表現型解析:心臓学
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。血中脂質レベルの測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
血中脂質および血液化学の結果
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
心血管生物学領域では、本明細書中で、標的を、高血圧症、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、異常脂肪血症(高コレステロール(高コレステロール血症)および血清トリグリセリドの上昇(高トリグリセリド血症)など)、糖尿病、および/または肥満症の治療のために同定した。表現型試験は、血清コレステロールおよび血清トリグリセリドの測定を含んでいた。血中脂質レベルの測定に加えて、以下の血液化学試験も日常的に行う:アルカリホスファターゼ;アラニンアミノトランスフェラーゼ;アルブミン;ビリルビン;リン;クレアチニン;BUN=血中尿素窒素;カルシウム;尿酸;ナトリウム;カリウム;および塩化物。
血中脂質および血液化学の結果
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体のコホートを、このアッセイで使用した。高コレステロールレベルおよび血中トリグリセリドレベルの増加は、心血管疾患および/または糖尿病の発症における認識された危険因子である。血中脂質の測定により、血中脂質レベルを調節する生物学的スイッチの発見が容易になる。血中脂質レベルを上昇させる因子の阻害は、心血管疾患リスクの軽減に有用であり得る。これらの血液化学試験では、COBAS Integra 400(mfr:Roche)を使用して測定値を記録した。
結果:
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベル(平均より11標準偏差を超えて高い)および平均血清トリグリセリドレベル(平均より約214標準偏差高い)が非常に増加した。アルカリホスファターゼレベルはまた、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総ビリルビン(正常の約29倍)と同様に上昇し、カルシウムレベルは減少した(平均より8標準偏差低い)。
血液化学:雄および雌(−/−)マウスの両方は、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベル(平均より11標準偏差を超えて高い)および平均血清トリグリセリドレベル(平均より約214標準偏差高い)が非常に増加した。アルカリホスファターゼレベルはまた、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、総ビリルビン(正常の約29倍)と同様に上昇し、カルシウムレベルは減少した(平均より8標準偏差低い)。
上記をまとめると、(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均血清コレステロールレベルおよびトリグリセリドレベルが顕著に増加した。したがって、PRO35250遺伝子が欠損した変異マウスは、心血管疾患モデルとして役立ち得る。PRO35250ポリペプチドまたはそのコード遺伝子は、コレステロールおよびトリグリセリドなどの血中脂質の調節で有用であろう。したがって、PRO35250ポリペプチドまたはそのアゴニストは、高血圧、アテローム性動脈硬化症、心不全、脳卒中、種々の冠動脈疾患、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、糖尿病、および/または肥満症などの心血管疾患の治療で有用であろう。
(−/−)マウスは、平均血清カルシウム、ナトリウム、および塩化物レベルが顕著に減少した。(−/−)マウスはまた、平均血清ビリルビンレベルが増加したが、わずかな脂質症の存在でさえもビリルビン測定値の信頼性に影響を与えることが公知であるので、変異サンプルにおける顕著な脂質血症によってこの読み取りが歪められ得る。ナトリウムおよび塩化物レベルの減少は、電解質の不均衡を示す。平均血清カルシウムレベルの減少は、上記のアルカリホスファターゼ活性の増加を示し得る。
(f)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
(f)骨代謝:放射線表現型解析
骨代謝領域では、本明細書中で、標的を、関節炎、骨粗鬆症、骨減少症、および大理石骨病の治療、ならびに骨治癒を促進する標的の同定のために同定した。試験は、以下を含んでいた。
・大腿骨および脊椎骨における骨中無機質密度の測定のためのDEXA
・骨小柱および皮質骨の骨中無機質密度の非常に高分解能且つ非常に高感度の測定のためのマイクロCT。
Dexa解析−試験の説明:
手順:4匹の野生型、4匹のヘテロ接合体、および8匹のホモ接合体マウスのコホートを、このアッセイで使用した。二重エネルギーX線吸収測定法(DEXA)を使用して、骨の変化を首尾よく同定した。麻酔した動物を試験し、骨塩量(BMC)、BMC/LBM比、容積測定骨中無機質密度(vBMD)、全身BMD、大腿骨BMD、および脊椎骨BMDを測定した。
マウスを、アベルチン(1.25%2,2,2−トリブロモエタノール、20mL/kg体重)の腹腔内注射によって麻酔し、体長および体重を測定し、DEXAスキャンのために、マウスをPIXImusTMデンシトメータ(Lunar Inc.)のプラットフォーム上に腹臥位で配置した。Lunar PIXImusソフトウェアを使用して、関心領域(ROI)(すなわち、全身、脊椎、および両大腿骨)中の骨中無機質密度(BMD)、脂肪組成(脂肪率)、および総組織マス(TTM)を決定した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
マイクロCT:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱数および連結性が増加した。
骨マイクロCT分析:
手順:マイクロCTも使用して、非常に高感度のBMD測定を行った。1つの脊椎骨および1つの大腿骨を、4匹の野生型マウスおよび8匹のホモ接合体マウスのコホートから採取した。第5腰椎小柱体積、小柱の厚さ、連結密度、大腿骨骨幹部総骨領域、および皮質の厚さの測定を行った。μCT40スキャンにより、骨量および骨構築に関する詳細な情報が得られた。複数の骨を、サンプルホルダーに入れ、自動でスキャンした。装置のソフトウェアを使用して、分析のための関心領域を選択した。16μmの分解能で第5腰椎(LV5)における骨小柱パラメータを分析し、20μmの分解能で大腿骨骨幹部における皮質骨パラメータを分析した。
結果:
マイクロCT:(−/−)マウスは、その性別一致(+/+)同腹仔および歴史的平均と比較した場合、平均脊椎小柱数および連結性が増加した。
骨マイクロCT分析によって分析した(−/−)マウスは、その(+/+)同腹仔と比較した場合、骨測定値が増加し、大理石骨病などの異常な骨障害が示唆された。これらの
所見により、PRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、代謝障害(大理石骨病を反映する異常な骨測定値)を引き起こす。したがって、PRO35250ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。PRO35250ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、異常または病的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害が含まれる)を引き起こすであろう。
所見により、PRO35250ポリペプチドをコードする遺伝子が欠損した変異マウスは、代謝障害(大理石骨病を反映する異常な骨測定値)を引き起こす。したがって、PRO35250ポリペプチドまたはそのアゴニストは、大理石骨病などの骨関連障害の治療で有用であるか、骨ホメオスタシスの維持に有用であろう。PRO35250ポリペプチドまたはそのコード遺伝子のアンタゴニスト(またはインヒビター)は、異常または病的な骨障害(異常な骨代謝に関連する炎症性障害が含まれる)を引き起こすであろう。
実施例67:ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の使用
下記の方法は、ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の使用を記載したものである。
下記の方法は、ハイブリダイゼーションプローブとしてのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の使用を記載したものである。
本明細書に開示した完全長または成熟PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、P
RO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのコード配列を含むDNAを、ヒト組織cDNAライブラリーまたはヒト組織ゲノムライブラリーにおいて相同なDNA(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然に存在するバリアントをコードするものなど)をスクリーニングするためのプローブとして使用する。
RO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのコード配列を含むDNAを、ヒト組織cDNAライブラリーまたはヒト組織ゲノムライブラリーにおいて相同なDNA(例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの天然に存在するバリアントをコードするものなど)をスクリーニングするためのプローブとして使用する。
いずれかのライブラリーDNAを含むフィルターのハイブリダイゼーションおよび洗浄は、下記の高ストリンジェンシー条件下で行う。放射能標識されたPRO69122−、PRO204−、PRO214−、PRO222−、PRO234−、PRO265−、PRO309−、PRO332−、PRO342−、PRO356−、PRO540−、PRO618−、PRO944−、PRO994−、PRO1079−、PRO1110−、PRO1122−、PRO1138−、PRO1190−、PRO1272−、PRO1286−、PRO1295−、PRO1309−、PRO1316−、PRO1383−、PRO1384−、PRO1431−、PRO1434−、PRO1475−、PRO1481−、PRO1568−、PRO1573−、PRO1599−、PRO1604−、PRO1605−、PRO1693−、PRO1753−、PRO1755−、PRO1777−、PRO1788−、PRO1864−、PRO1925−、PRO1926−、PRO3566−、PRO4330−、PRO4423−、PRO36935−、PRO4977−、PRO4979−、PRO4980−、PRO4981−、PRO5801−、PRO5995−、PRO6001−、PRO6095−、PRO6182−、PRO7170−、PRO7171−、PRO7436−、PRO9912−、PRO9917−、PRO37337−、PRO37496−、PRO19646−、PRO21718−、PRO19820−、PRO21201−、PRO20026−、PRO20110−、PRO23203−またはPRO35250由来プローブのフィルターへのハイブリダイゼーションは、50%ホルムアミド、5×SSC、0.1%SDS、0.1%ピロリン酸ナトリウム、50mMリン酸ナトリウム、pH6.8、2×デンハルト溶液および10%硫酸デキストランの溶液中、42℃で20時間行われる。フィルターの洗浄は、0.1×SSCおよび0.1%SDSの水溶液中、42℃で行う。
次いで、完全長の天然配列PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383
、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAと所望の配列同一性を有するDNAを、当該技術分野で知られた標準的な技術を用いて同定し得る。
、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNAと所望の配列同一性を有するDNAを、当該技術分野で知られた標準的な技術を用いて同定し得る。
実施例68:大腸菌におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現
この実施例は、大腸菌内での組換え発現によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの非グリコシル化形態の調製を示す。
この実施例は、大腸菌内での組換え発現によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの非グリコシル化形態の調製を示す。
最初に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384
、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNA配列を、選択したPCRプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位を含む必要がある。さまざまな発現ベクターを使用し得る。好適なベクターの一例は、アンピリシンおよびテトラサイクリン耐性遺伝子を含むpBR322(大腸菌由来;Bolivar et al.,Gene,2:95(1977)を参照)である。ベクターを制限酵素で消化し、脱リン酸化する。PCR増幅された配列を、次いで、ベクター内にライゲートする。ベクターは、好ましくは、抗生物質耐性遺伝子、trpプロモーター、ポリhisリーダー(最初の6つのSTIIコドン、ポリhis配列およびエンテロキナーゼ切断部位を含む)、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード領域、λ転写ターミネータ、ならびにargU遺伝子をコードする配列を含む。
、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドをコードするDNA配列を、選択したPCRプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位を含む必要がある。さまざまな発現ベクターを使用し得る。好適なベクターの一例は、アンピリシンおよびテトラサイクリン耐性遺伝子を含むpBR322(大腸菌由来;Bolivar et al.,Gene,2:95(1977)を参照)である。ベクターを制限酵素で消化し、脱リン酸化する。PCR増幅された配列を、次いで、ベクター内にライゲートする。ベクターは、好ましくは、抗生物質耐性遺伝子、trpプロモーター、ポリhisリーダー(最初の6つのSTIIコドン、ポリhis配列およびエンテロキナーゼ切断部位を含む)、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250コード領域、λ転写ターミネータ、ならびにargU遺伝子をコードする配列を含む。
次いで、ライゲーション混合物を用い、選択した大腸菌系統をSambrook et
al.(前出)に記載の方法を用いて形質転換する。形質転換体を、LBプレート上でのその生育能力によって同定し、次いで抗生物質耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを、制限解析によって単離し、DNA配列決定によって確認し得る。
al.(前出)に記載の方法を用いて形質転換する。形質転換体を、LBプレート上でのその生育能力によって同定し、次いで抗生物質耐性コロニーを選択する。プラスミドDNAを、制限解析によって単離し、DNA配列決定によって確認し得る。
選択されたクローンは、液体培養培地(例えば、抗生物質を加えたLBブロスなど)中で一晩培養し得る。一晩培養物は、続いて大規模培養物にイノキュレートするために使用され得る。次いで、細胞を所望の光学密度まで培養し、この間に発現プロモーターが作動する。
細胞をさらに数時間培養した後、細胞を、遠心分離によって回収し得る。遠心分離によって得られた細胞ペレットを、当該技術分野で知られた種々の薬剤を用いて可溶化し得、可溶化されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO128
6、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250タンパク質を、次いで、金属キレートカラムを用い、タンパク質の強固な結合を可能にする条件下で精製し得る。
6、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250タンパク質を、次いで、金属キレートカラムを用い、タンパク質の強固な結合を可能にする条件下で精製し得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250は大腸菌においてポリ−Hisタグ化された形態で、下記の手順を用いて発現させ得る。最初に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードするDNAを、選択したPCRプライマーを用いて増幅する。プライマーは、選択した発現ベクター上の制限酵素部位に対応する制限酵素部位、ならびに効率的で信頼性のある翻訳の開始、金属キレートカラム上での速やかな精製およびエンテロキナーゼによるタンパク質分解的除去をもたらすのに有用な他の配列を含む。次いで、PCR増幅されたポリ−Hisタグ化配列を発現ベクター内にライゲートし、これを用いて菌株52(W3110fuhA(tonA)lon galE rpoHts(htpRts)clpP(laIq)系の大腸菌宿主を形質転換する。形質転換体を、まず、50mg/mLのカルベニシリンを含有するLB中にて30
℃で、振とうさせながら3〜5のO.D.600が達成されるまで培養する。次いで、培養物をCRAP培地(3.57gの(NH4)2SO4、0.71gのクエン酸ナトリウム・2H2O、1.07gのKCl、5.36gのDifco製酵母抽出物、5.36gのSheffield hycase SF(500mLの水中)、ならびに110mMのMPOS、pH7.3、0.55%(w/v)のグルコースおよび7mMのMgSO4を混合することにより調製)中で50〜100倍に希釈し、およそ20〜30時間30℃で、振とうさせながら培養する。試料を取り出し、SDS−PAGE解析によって発現を確認し、バルク培養物を遠心分離して細胞をペレット化する。細胞ペレットは、精製およびリフォールディングまで凍結しておく。
℃で、振とうさせながら3〜5のO.D.600が達成されるまで培養する。次いで、培養物をCRAP培地(3.57gの(NH4)2SO4、0.71gのクエン酸ナトリウム・2H2O、1.07gのKCl、5.36gのDifco製酵母抽出物、5.36gのSheffield hycase SF(500mLの水中)、ならびに110mMのMPOS、pH7.3、0.55%(w/v)のグルコースおよび7mMのMgSO4を混合することにより調製)中で50〜100倍に希釈し、およそ20〜30時間30℃で、振とうさせながら培養する。試料を取り出し、SDS−PAGE解析によって発現を確認し、バルク培養物を遠心分離して細胞をペレット化する。細胞ペレットは、精製およびリフォールディングまで凍結しておく。
0.5〜1Lの発酵物からの大腸菌ペースト(6〜10gのペレット)を10容量(w/v)で7Mグアニジン、20mM Tris(pH8)バッファー中に再懸濁する。固形亜硫酸ナトリウムおよび四チオン酸ナトリウムを、それぞれ、終濃度が0.1Mおよび0.02Mとなるように添加し、溶液を一晩4℃で攪拌する。この工程により、すべてのシステイン残基がスルフィトリル化(sulfitolization)によってブロックされた変性タンパク質がもたらされる。この溶液を40,000rpmで、Beckman超遠心分離機にて30分間遠心分離する。上清みを3〜5容量の金属キレートカラムバッファー(6Mグアニジン、20mM Tris、pH7.4)で希釈し、0.22ミクロンフィルターに通して濾過して清澄化する。清澄化された抽出物を、金属キレートカラムバッファー中で平衡化した5mL容Qiagen Ni−NTA金属キレートカラム上に負荷する。カラムを50mMイミダゾール(Calbiochem,Utrolグレード)を含有するさらなるバッファー(pH7.4)で洗浄する。タンパク質を、250mMイミダゾールを含有するバッファーで溶出する。所望のタンパク質を含む画分をプールし、4℃で保存する。タンパク質濃度を、そのアミノ酸配列に基づいて計算された消衰係数を用い、280nmにおけるその吸光度によって推定する。
タンパク質を、20mM Tris(pH8.6)、0.3M NaCl、2.5Mの尿素、5mMのシステイン、20mMのグリシンおよび1mM EDTAからなる新たに調製したリフォールディングバッファー中に試料をゆっくり希釈することによりリフォールディングさせる。リフォールディング容量は、最終タンパク質濃度が50〜100マイクログラム/mLとなるように選択される。リフォールディング溶液は、12〜36時間4℃で穏やかに攪拌する。リフォールディング反応を、終濃度0.4%(およそ3のpH)までTFAを添加することによってクエンチする。タンパク質のさらなる精製の前に、溶液を0.22ミクロンフィルターに通して濾過し、アセトニトリルを2〜10%の終濃度まで添加する。リフォールディングさせたタンパク質をPoros R1/H逆相カラム上で、0.1%TFAの移動相バッファーを用い、10〜80%のアセトニトリルの勾配での溶出を伴ってクロマトグラフィー処理する。A280吸光度を有する画分のアリコートをSDSポリアクリルアミドゲル上で解析し、均質なリフォールディングタンパク質を含む画分をプールする。一般的に、大部分のタンパク質が適正にリフォールディングされた種は、その疎水性内部が最も緻密であり、逆相樹脂との相互作用から遮断されるため、最低濃度のアセトニトリルで溶出される。凝集した種は、通常、より高いアセトニトリル濃度で溶出される。ミスフォールド形態のタンパク質を所望の形態から分離することに加え、逆相工程ではまた、内毒素を試料から除去する。
フォールドされた所望のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、
PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含む画分をプールし、アセトニトリルを、溶液に指向した穏やかな窒素流を用いて除去する。透析によって、または構築バッファー中で平衡化したG25 Superfine(Pharmacia)樹脂を用いたゲル濾過によって、0.14Mの塩化ナトリウムおよび4%マンニトールを含む20mM Hepes(pH6.8)中にタンパク質を構築し、滅菌濾過する。
PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含む画分をプールし、アセトニトリルを、溶液に指向した穏やかな窒素流を用いて除去する。透析によって、または構築バッファー中で平衡化したG25 Superfine(Pharmacia)樹脂を用いたゲル濾過によって、0.14Mの塩化ナトリウムおよび4%マンニトールを含む20mM Hepes(pH6.8)中にタンパク質を構築し、滅菌濾過する。
実施例69: 哺乳動物細胞におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現
この実施例は、哺乳動物細胞内での組換え発現によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの潜在的にグリコシル化された形態の調製を示す。
この実施例は、哺乳動物細胞内での組換え発現によるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの潜在的にグリコシル化された形態の調製を示す。
ベクターpRK5(EP307,247(1989年3月15日公開)を参照のこと)を発現ベクターとして使用する。任意選択で、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994
、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250 DNAをpRK5内に、選択した制限酵素を用いてライゲートし、Sambrook et al.(前出)に記載のものなどのライゲーション方法を用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250 DNAの挿入を可能にする。得られたベクターをpRK5−PRO69122、pRK5−PRO204、pRK5−PRO214、pRK5−PRO222、pRK5−PRO234、pRK5−PRO265、pRK5−PRO309、pRK5−PRO332、pRK5−PRO342、pRK5−PRO356、pRK5−PRO540、pRK5−PRO618、pRK5−PRO944、pRK5−PRO994、pRK5−PRO1079、pRK5−PRO1110、pRK5−PRO1122、pRK5−PRO1138、pRK5−PRO1190、pRK5−PRO1272、pRK5−PRO1286、pRK5−PRO1295、pRK5−PRO1309、pRK5−PRO1316、pRK5−pRK5−PRO1383、pRK5−PRO1384、pRK5−PRO1431、pRK5−PRO1434、pRK5−PRO1475、pRK5−PRO1481、pRK5−PRO1568、pRK5−PRO1573、pRK5−PRO1599、pRK5−PRO1604、pRK5−PRO1605、pRK5−PRO1693、pRK5−PRO1753、pRK5−PRO1755、pRK5−PRO1777、pRK5−PRO1788、pRK5−PRO1864、pRK5−PRO1925、pRK5−PRO1926、pRK5−PRO3566、pRK5−PRO4330、pRK5−PRO4423、pRK5−PRO36935、pRK5−PRO4977、pRK5−PRO4979、pRK5−PRO4980、pRK5−PRO4981、pRK5−PRO5801、pRK5−PRO5995、pRK5−PRO6001、pRK5−PRO6095、pRK5−PRO6182、pRK5−PRO7170、pRK5−PRO7171、pRK5−PRO7436、pRK5−PRO9912、pRK5−PRO9917、pRK5−PRO37337、pRK5−PRO37496、pRK5−PRO19646、pRK5−PRO21718、pRK5−PRO19820、pRK5−PRO212
01、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250とよぶ。
、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250 DNAをpRK5内に、選択した制限酵素を用いてライゲートし、Sambrook et al.(前出)に記載のものなどのライゲーション方法を用いてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250 DNAの挿入を可能にする。得られたベクターをpRK5−PRO69122、pRK5−PRO204、pRK5−PRO214、pRK5−PRO222、pRK5−PRO234、pRK5−PRO265、pRK5−PRO309、pRK5−PRO332、pRK5−PRO342、pRK5−PRO356、pRK5−PRO540、pRK5−PRO618、pRK5−PRO944、pRK5−PRO994、pRK5−PRO1079、pRK5−PRO1110、pRK5−PRO1122、pRK5−PRO1138、pRK5−PRO1190、pRK5−PRO1272、pRK5−PRO1286、pRK5−PRO1295、pRK5−PRO1309、pRK5−PRO1316、pRK5−pRK5−PRO1383、pRK5−PRO1384、pRK5−PRO1431、pRK5−PRO1434、pRK5−PRO1475、pRK5−PRO1481、pRK5−PRO1568、pRK5−PRO1573、pRK5−PRO1599、pRK5−PRO1604、pRK5−PRO1605、pRK5−PRO1693、pRK5−PRO1753、pRK5−PRO1755、pRK5−PRO1777、pRK5−PRO1788、pRK5−PRO1864、pRK5−PRO1925、pRK5−PRO1926、pRK5−PRO3566、pRK5−PRO4330、pRK5−PRO4423、pRK5−PRO36935、pRK5−PRO4977、pRK5−PRO4979、pRK5−PRO4980、pRK5−PRO4981、pRK5−PRO5801、pRK5−PRO5995、pRK5−PRO6001、pRK5−PRO6095、pRK5−PRO6182、pRK5−PRO7170、pRK5−PRO7171、pRK5−PRO7436、pRK5−PRO9912、pRK5−PRO9917、pRK5−PRO37337、pRK5−PRO37496、pRK5−PRO19646、pRK5−PRO21718、pRK5−PRO19820、pRK5−PRO212
01、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250とよぶ。
選択される宿主細胞は293細胞であり得る。ヒト293細胞(ATCC CCL 1573)を組織培養プレート内で、ウシ胎仔血清ならびに任意選択で栄養成分および/または抗生物質を補給したDMEMなどの培地中でコンフルエンスまで培養する。約10μgのpRK5−PRO69122、pRK5−PRO204、pRK5−PRO214、pRK5−PRO222、pRK5−PRO234、pRK5−PRO265、pRK5−PRO309、pRK5−PRO332、pRK5−PRO342、pRK5−PRO356、pRK5−PRO540、pRK5−PRO618、pRK5−PRO944、pRK5−PRO994、pRK5−PRO1079、pRK5−PRO1110、pRK5−PRO1122、pRK5−PRO1138、pRK5−PRO1190、pRK5−PRO1272、pRK5−PRO1286、pRK5−PRO1295、pRK5−PRO1309、pRK5−PRO1316、pRK5−pRK5−PRO1383、pRK5−PRO1384、pRK5−PRO1431、pRK5−PRO1434、pRK5−PRO1475、pRK5−PRO1481、pRK5−PRO1568、pRK5−PRO1573、pRK5−PRO1599、pRK5−PRO1604、pRK5−PRO1605、pRK5−PRO1693、pRK5−PRO1753、pRK5−PRO1755、pRK5−PRO1777、pRK5−PRO1788、pRK5−PRO1864、pRK5−PRO1925、pRK5−PRO1926、pRK5−PRO3566、pRK5−PRO4330、pRK5−PRO4423、pRK5−PRO36935、pRK5−PRO4977、pRK5−PRO4979、pRK5−PRO4980、pRK5−PRO4981、pRK5−PRO5801、pRK5−PRO5995、pRK5−PRO6001、pRK5−PRO6095、pRK5−PRO6182、pRK5−PRO7170、pRK5−PRO7171、pRK5−PRO7436、pRK5−PRO9912、pRK5−PRO9917、pRK5−PRO37337、pRK5−PRO37496、pRK5−PRO19646、pRK5−PRO21718、pRK5−PRO19820、pRK5−PRO21201、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250 DNAをVA RNA遺伝子[Thimmappaya et al.Cell,31:543(1982)]をコードするDNA約1μgと混合し、500μLの1mM Tris−HCl、0.1mM EDTA、0.227M CaCl2中に溶解する。この混合物に、500μLの50mM HEPES(pH7.35)、280mM NaCl、1.5mM NaPO4を滴下し、25℃で10分間、沈殿物を形成させる。沈殿物を懸濁して293細胞に添加し、37℃で約4時間沈降させる。培養培地を吸引除去し、2mLの20%グリセロール含有PBSを30秒間添加する。次いで、293細胞を血清無含有培地で洗浄し、新鮮培地を添加し、細胞を約5日間インキュベートする。
トランスフェクションのおよそ24時間後、培養培地を除去し、培養培地(単独)または200μCi/mLの35S−システインおよび200μCi/mLの35S−メチオニンを含有する培養培地と交換する。12時間のインキュベーション後、ならし培地を回収し、スピンフィルターにて濃縮し、15%SDSゲル上に負荷する。加工処理したゲルは、乾燥させ、選択した時間フィルムに露光し、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO160
4、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの存在を顕現させ得る。トランスフェクト細胞を含む培養物は、さらなるインキュベーション(血清無含有培地中)に供してもよく、培地を、選択したバイオアッセイにおいて試験する。
4、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの存在を顕現させ得る。トランスフェクト細胞を含む培養物は、さらなるインキュベーション(血清無含有培地中)に供してもよく、培地を、選択したバイオアッセイにおいて試験する。
択一的な手法において、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を、Somparyrac et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,12:7575(1981)に記載された硫酸デキストラン法を用い、一過的に293細胞内に導入してもよい。293細胞をスピナーフラスコ内で最大密度まで培養し、700μgのpRK5−PRO69122、pRK5−PRO204、pRK5−PRO214、pRK5−PRO222、pRK5−PRO234、pRK5−PRO265、pRK5−PRO309、pRK5−PRO332、pRK5−PRO342、pRK5−PRO356、pRK5−PRO540、pRK5−PRO618、pRK5−PRO944、pRK5−PRO994、pRK5−PRO1079、pRK5−PRO1110、pRK5−PRO1122、pRK5−PRO1138、pRK5−PRO1190、pRK5−PRO1272、pRK5−PRO1286、pRK5−PRO1295、pRK5−PRO1309、pRK5−PRO1316、pRK5−pRK5−PRO1383、pRK5−PRO1384、pRK5−PRO1431、pRK5−PRO1434、pRK5−PRO1475、pRK5−PRO1481、pRK5−PRO1568、pRK5−PRO1573、pRK5−PRO1599、pRK5−PRO1604、pRK5−PRO1605、pRK5−PRO1693、pRK5−PRO1753、pRK5−PRO1755、pRK5−PRO1777、pRK5−PRO1788、pRK5−PRO1864、pRK5−PRO1925、pRK5−PRO1926、pRK5−PRO3566、pRK5−PRO4330、pRK5−PRO4423、pRK5−PRO36935、pRK5−PRO4977、pRK5−PRO4979、pRK5−PRO4980、pRK5−PRO4981、pRK5−PRO5801、pRK5−PRO5995、pRK5−PRO6001、pRK5−PRO6095、pRK5−PRO6182、pRK5−PRO7170、pRK5−PRO7171、pRK5−PRO7436、pRK5−PRO9912、pRK5−PRO9917、pRK5−PRO37337、pRK5−PRO37496、pRK5−PRO19646、pRK5−PRO21718、pRK5−PRO19820、
pRK5−PRO21201、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250DNAを添加する。該細胞を、まず、スピナーフラスコから遠心分離によって濃縮し、PBSで洗浄する。DNA−デキストラン沈殿物を、細胞ペレット上で4時間インキュベートする。細胞を20%グリセロールで90秒間処理し、組織培養培地で洗浄し、組織培養培地、5μg/mLウシインスリンおよび0.1μg/mLウシトランスフェリンを入れたスピナーフラスコ内に再導入する。約4日後、ならし培地を遠心分離し、濾過して細胞および残屑を除去する。発現されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含む試料を、次いで、選択した任意の方法、例えば、透析および/またはカラムクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。
pRK5−PRO21201、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250DNAを添加する。該細胞を、まず、スピナーフラスコから遠心分離によって濃縮し、PBSで洗浄する。DNA−デキストラン沈殿物を、細胞ペレット上で4時間インキュベートする。細胞を20%グリセロールで90秒間処理し、組織培養培地で洗浄し、組織培養培地、5μg/mLウシインスリンおよび0.1μg/mLウシトランスフェリンを入れたスピナーフラスコ内に再導入する。約4日後、ならし培地を遠心分離し、濾過して細胞および残屑を除去する。発現されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含む試料を、次いで、選択した任意の方法、例えば、透析および/またはカラムクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250は、CHO細胞において発現させ得る。pRK5−PRO69122、pRK5−PRO204、pRK5−PRO214、pRK5−PRO222、pRK5−PRO234、pRK5−PRO265、pRK5−PRO309、pRK5−PRO332、pRK5−PRO342、pRK5−PRO356、pRK5−PRO540、pRK5−PRO618、pRK5−PRO944、pRK5−PRO994、pRK5−PRO1079、pRK5−PRO1110、pRK5−PRO1122、pRK5−PRO1138、pRK5−PRO1190、pRK5−PRO1272、pRK5−PRO1286、pRK5−PRO1295、pRK5−PRO1309、pRK5−PRO1316、pRK5−pRK5−PRO1383、pRK5−PRO1384、pRK5−PRO1431、pRK5−PRO1434、pRK5−PRO1475、pRK5−PRO1481、pRK5−PRO1568、pRK5−PRO1573、pRK5−PRO1599、pRK5−PRO1604、pRK5−PRO1605、pRK5−
PRO1693、pRK5−PRO1753、pRK5−PRO1755、pRK5−PRO1777、pRK5−PRO1788、pRK5−PRO1864、pRK5−PRO1925、pRK5−PRO1926、pRK5−PRO3566、pRK5−PRO4330、pRK5−PRO4423、pRK5−PRO36935、pRK5−PRO4977、pRK5−PRO4979、pRK5−PRO4980、pRK5−PRO4981、pRK5−PRO5801、pRK5−PRO5995、pRK5−PRO6001、pRK5−PRO6095、pRK5−PRO6182、pRK5−PRO7170、pRK5−PRO7171、pRK5−PRO7436、pRK5−PRO9912、pRK5−PRO9917、pRK5−PRO37337、pRK5−PRO37496、pRK5−PRO19646、pRK5−PRO21718、pRK5−PRO19820、pRK5−PRO21201、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250をCHO細胞内に、CaPO4またはDEAE−デキストランなどの既知の試薬を用いてトランスフェクトし得る。上記のように、細胞培養物をインキュベートすることができ、培地は培養培地(単独)または35S−メチオニンなどの放射能標識を含有する培地と交換することができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの存在を調べた後、培養培地を血清無含有培地と交換してもよい。好ましくは、培養物を約6日間インキュベートし、次いで、ならし培地を回収する。発現されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含有する培地を、次いで、選択した任意の方法によって濃縮および精製し得る。
PRO1693、pRK5−PRO1753、pRK5−PRO1755、pRK5−PRO1777、pRK5−PRO1788、pRK5−PRO1864、pRK5−PRO1925、pRK5−PRO1926、pRK5−PRO3566、pRK5−PRO4330、pRK5−PRO4423、pRK5−PRO36935、pRK5−PRO4977、pRK5−PRO4979、pRK5−PRO4980、pRK5−PRO4981、pRK5−PRO5801、pRK5−PRO5995、pRK5−PRO6001、pRK5−PRO6095、pRK5−PRO6182、pRK5−PRO7170、pRK5−PRO7171、pRK5−PRO7436、pRK5−PRO9912、pRK5−PRO9917、pRK5−PRO37337、pRK5−PRO37496、pRK5−PRO19646、pRK5−PRO21718、pRK5−PRO19820、pRK5−PRO21201、pRK5−PRO20026、pRK5−PRO20110、pRK5−PRO23203またはpRK5−PRO35250をCHO細胞内に、CaPO4またはDEAE−デキストランなどの既知の試薬を用いてトランスフェクトし得る。上記のように、細胞培養物をインキュベートすることができ、培地は培養培地(単独)または35S−メチオニンなどの放射能標識を含有する培地と交換することができる。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの存在を調べた後、培養培地を血清無含有培地と交換してもよい。好ましくは、培養物を約6日間インキュベートし、次いで、ならし培地を回収する。発現されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含有する培地を、次いで、選択した任意の方法によって濃縮および精製し得る。
また、エピトープタグ化したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、P
RO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を宿主CHO細胞において発現させてもよい。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を、pRK5ベクターにサブクローニングし得る。サブクローン挿入物はPCRに供し、インフレームで、選択したエピトープタグ(例えば、ポリ−Hisタグなど)とともにバキュロウイルス発現ベクター内に融合させ得る。ポリ−Hisタグ化PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250挿入物を、次いで、安定なクローンの選択のためのDHFRなどの選択マーカーを含有するSV40駆動ベクター内にサブクローニングし得る。最後に、CHO細胞にSV40駆動ベクターをトランスフェクトさせ得る(上記のようにして)。標識化は、上記のように、発現を確認するために行い得る。発現されたポリ−Hisタグ化PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、P
RO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含有する培養培地を、次いで、選択した任意の方法、例えば、Ni2+キレートアフィニティクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。
RO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を宿主CHO細胞において発現させてもよい。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を、pRK5ベクターにサブクローニングし得る。サブクローン挿入物はPCRに供し、インフレームで、選択したエピトープタグ(例えば、ポリ−Hisタグなど)とともにバキュロウイルス発現ベクター内に融合させ得る。ポリ−Hisタグ化PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250挿入物を、次いで、安定なクローンの選択のためのDHFRなどの選択マーカーを含有するSV40駆動ベクター内にサブクローニングし得る。最後に、CHO細胞にSV40駆動ベクターをトランスフェクトさせ得る(上記のようにして)。標識化は、上記のように、発現を確認するために行い得る。発現されたポリ−Hisタグ化PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、P
RO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含有する培養培地を、次いで、選択した任意の方法、例えば、Ni2+キレートアフィニティクロマトグラフィーなどによって濃縮および精製し得る。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250はまた、CHOおよび/またはCOS細胞において一過性発現手順によって、あるいはCHO細胞において別の安定な発現手順によって発現させ得る。
CHO細胞における安定な発現は、下記の手順を用いて行われる。タンパク質はIgG構築物(イムノアドヘシン)として発現させ、それぞれのタンパク質の可溶性形態のコード配列(例えば、細胞外ドメイン)を、ヒンジ、CH2およびCH2ドメインを含有するIgG1定常領域配列と融合させる、および/またはポリ−Hisタグ化された形態である。
PCR増幅後、それぞれのDNAを、CHO発現ベクター内に、Ausubel et
al.,Current Protocols of Molecular Biology,Unit 3.16,John Wiley and Sons(1997)に記載のような標準的は手法を用いてサブクローニングする。CHO発現ベクターは、cDNAの簡便なシャトリングが可能となるように目的のDNAの5’および3’側に適合性の制限部位を有するように構築する。CHO細胞における発現に使用されるベクターは、Lucas et al.Nucl.Acids Res.24:9(1774−1779(1996)に記載されているとおりであり、対象のcDNAおよびジヒドロ葉酸還元酵素(DHFR)の発現を駆動するためのSV40初期プロモーター/エンハンサーを使用する。DHFR発現により、トランスフェクション後のプラスミドの安定な維持のための選択が可能になる。
al.,Current Protocols of Molecular Biology,Unit 3.16,John Wiley and Sons(1997)に記載のような標準的は手法を用いてサブクローニングする。CHO発現ベクターは、cDNAの簡便なシャトリングが可能となるように目的のDNAの5’および3’側に適合性の制限部位を有するように構築する。CHO細胞における発現に使用されるベクターは、Lucas et al.Nucl.Acids Res.24:9(1774−1779(1996)に記載されているとおりであり、対象のcDNAおよびジヒドロ葉酸還元酵素(DHFR)の発現を駆動するためのSV40初期プロモーター/エンハンサーを使用する。DHFR発現により、トランスフェクション後のプラスミドの安定な維持のための選択が可能になる。
12マイクログラムの所望のプラスミドDNAを、およそ10000000個のCHO細胞内に、市販のトランスフェクション試薬Superfect(登録商標)(Qiagen)、Dosper(登録商標)またはFugene(登録商標)(Boehringer Mannheim)を用いて導入する。細胞を、Lucas et al.(前出)に記載のようにして培養する。およそ3×107細胞を、下記のようなさらなる培養および生成のために、アンプル内で凍結させる。
プラスミドDNAの入ったアンプルを、水浴内への配置によって解凍し、ボルテックスによって混合する。内容物を、10mLの培地を入れた遠心分離チューブ内にピペッティングし、1000rpmで5分間遠心分離する。上清みを吸引し、細胞を10mLの選択培地(5%の0.2μm透析濾過ウシ胎児血清含有0.2μm濾過PS20)中に再懸濁する。次いで、細胞のアリコートを、90mLの選択培地を入れた100mL容量のスピナー内に採取する。1〜2日後、細胞を、150mLの選択培養培地で満たした250mL容量のスピナー内に移し、37℃でインキュベートする。さらに2〜3日後、250mL、500mLおよび2000mL容量のスピナーに3×105細胞/mLを播種する。細胞培地を新たな培地と、遠心分離および生産培地中への再懸濁によって交換する。任意の適当なCHO培地を使用し得るが、米国特許第5,122,469号(1992年6月16日発行)に記載の生産培地を実際に使用することができる。3L容量の生産用スピナーに1.2×106細胞/mLで播種する。第0日目、細胞数 pHを測定する(ie determined)。第1日目、スピナーから試料を採取し、濾過空気でのスパージングを開始する。第2日目、スピナーから試料を採取し、温度を33℃にシフトし、30mLの500g/Lグルコースおよび0.6mLの10%消泡剤(例えば、35%ポリジメチルシロキサンエマルジョン、Dow Corning 365医薬グレードEmulsion)を採用する。作製全体を通して、pHは、7.2前後に維持されるように必要に応じて調整する。10日後、またはバイアビリティが70%未満に低下したときまで、細胞培養物を、遠心分離および0.22μmフィルターに通す濾過によって回収する。濾液は、4℃で保存するか、または直接、精製用カラム上に負荷するかのいずれかとした。
ポリ−Hisタグ化構築物に関して、タンパク質は、Ni−NTAカラム(Qiagen)を用いて精製する。精製前、イミダゾールをならし培地に5mMの濃度まで添加する。ならし培地を、20mM Hepes(pH7.4)0.3M NaClおよび5mMイミダゾール含有バッファー中で平衡化した6mL容量のNi−NTAカラム上に、4〜5mL/分の流速で4℃にてポンピングする。負荷後、カラムをさらなる平衡化バッファーで洗浄し、タンパク質を、0.25Mイミダゾールを含有する平衡化バッファーで溶出させる。高度に精製されたタンパク質を、続いて、25mL容量のG25 Superfine(Pharmacia)カラムを用い、10mM Hepes、0.14M NaClおよび4%マンニトール(pH6.8)を含有する保存バッファー中にて脱塩し、−80℃で保存する。
イムノアドヘシン(Fc含有)構築物をならし培地から、以下のようにして精製する。ならし培地を、20mMリン酸ナトリウムバッファー(pH6.8)中で平衡化しておいた5mL容量のタンパク質Aカラム(Pharmacia)上にポンピングする。負荷後、100mMクエン酸(pH3.5)で溶出する前に、カラムを平衡化バッファーで徹底的に洗浄する。溶出させたタンパク質は、1mLずつの画分を、275μLの1M Trisバッファー(pH9)を入れたチューブ内に収集することにより直ちに中和する。高度に精製されたタンパク質を、続いて、ポリ−Hisタグ化タンパク質について上記の保存バッファー中にて脱塩する。均質性を、SDSポリアクリルアミドゲルおよびエドマン分解によるN末端アミノ酸配列決定によって評価する。
実施例70:酵母におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO2
22、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現
下記の方法は、酵母におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の組換え発現を記載したものである。
22、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現
下記の方法は、酵母におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の組換え発現を記載したものである。
まず、ADH2/GAPDHプロモーターからのPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の細胞内での産生または分泌のための酵母発現ベクターを構築する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO131
6、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250およびプロモーターをコードするDNAを、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の細胞内発現を指向させるために選択したプラスミド内の適当な制限酵素部位に挿入する。分泌のため、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードするDNAは、選択したプラスミドに、ADH2/GAPDHプロモーター、天然PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、P
RO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250シグナルペプチドもしくは他の哺乳動物用シグナルペプチド、または例えば、酵母のα因子もしくはインベルターゼ分泌シグナル/リーダー配列、およびPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現のためのリンカー配列(必要であれば)をコードするDNAとともにクローニングし得る。
6、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250およびプロモーターをコードするDNAを、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の細胞内発現を指向させるために選択したプラスミド内の適当な制限酵素部位に挿入する。分泌のため、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードするDNAは、選択したプラスミドに、ADH2/GAPDHプロモーター、天然PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、P
RO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250シグナルペプチドもしくは他の哺乳動物用シグナルペプチド、または例えば、酵母のα因子もしくはインベルターゼ分泌シグナル/リーダー配列、およびPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現のためのリンカー配列(必要であれば)をコードするDNAとともにクローニングし得る。
次いで、酵母細胞(例えば、酵母系統AB110など)を上記の発現プラスミドで形質転換し、選択した発酵培地中で培養し得る。形質転換された酵母の上清みを、10%トリクロロ酢酸を用いた沈殿によって解析し、SDS−PAGEによって分離した後、ゲルをクマシーブルー染色で染色し得る。
続いて、組換えPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を、酵母細胞を発酵培地から遠心分離によって除去し、次いで、選択したカートリッジフィルターを用いて培地を濃縮することにより単離および精製し得る。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO13
84、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含む濃縮物を、選択したカラムクロマトグラフィー樹脂を用いてさらに精製し得る。
84、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含む濃縮物を、選択したカラムクロマトグラフィー樹脂を用いてさらに精製し得る。
実施例71:バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の発現
下記の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の組換え発現を記載したものである。
下記の方法は、バキュロウイルス感染昆虫細胞におけるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の組換え発現を記載したものである。
PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO
1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードする配列を、バキュロウイルス発現ベクター内に含有されるエピトープタグの上流と融合させる。かかるエピトープタグとしては、ポリ−Hisタグおよび免疫グロブリンタグ(IgGのFc領域など)が挙げられる。さまざまなプラスミド、例えば、市販のプラスミド(例えば、pVL1393(Novagen)など)から誘導されるプラスミドを使用し得る。簡単には、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードする配列またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250のコード配列の所望の部分、例えば、膜貫通タンパク質の細胞外ドメインをコードする配列、またはタンパク質が細胞外のものである場合はその成熟タンパク質をコードする配列などを、5’および3’領域に相補的なプライマーを用いたPCRによって増幅する。5’プライマーは、(選択した)フランキング制限酵素部位を組み込んでいてよい。次いで、産物を、選択した制限酵素で消化し、発現ベクター内にサブクローニングする。
1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードする配列を、バキュロウイルス発現ベクター内に含有されるエピトープタグの上流と融合させる。かかるエピトープタグとしては、ポリ−Hisタグおよび免疫グロブリンタグ(IgGのFc領域など)が挙げられる。さまざまなプラスミド、例えば、市販のプラスミド(例えば、pVL1393(Novagen)など)から誘導されるプラスミドを使用し得る。簡単には、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250をコードする配列またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250のコード配列の所望の部分、例えば、膜貫通タンパク質の細胞外ドメインをコードする配列、またはタンパク質が細胞外のものである場合はその成熟タンパク質をコードする配列などを、5’および3’領域に相補的なプライマーを用いたPCRによって増幅する。5’プライマーは、(選択した)フランキング制限酵素部位を組み込んでいてよい。次いで、産物を、選択した制限酵素で消化し、発現ベクター内にサブクローニングする。
組換えバキュロウイルスを、上記のプラスミドおよびBaculoGold(商標)ウイルスDNA(Pharmingen)をSpodoptera fmgiperda(
「Sf9」)細胞(ATCC CRL 1711)内に、リポフェクチン(GIBCO−BRLから市販)を用いてコトランスフェクトすることにより作製する。28℃で4〜5日間のインキュベーション後、放出されたウイルスを回収し、さらなる増幅に用いる。ウイルス感染およびタンパク質発現は、O’Reilley et al.Baculovirus expression vectors:A Laboratory Manual,Oxford:Oxford University Press(1994)に記載のように行う。
「Sf9」)細胞(ATCC CRL 1711)内に、リポフェクチン(GIBCO−BRLから市販)を用いてコトランスフェクトすることにより作製する。28℃で4〜5日間のインキュベーション後、放出されたウイルスを回収し、さらなる増幅に用いる。ウイルス感染およびタンパク質発現は、O’Reilley et al.Baculovirus expression vectors:A Laboratory Manual,Oxford:Oxford University Press(1994)に記載のように行う。
発現されたポリ−Hisタグ化PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250は、次いで、例えば、Ni2+キレートアフィニティクロマトグラフィーによって以下のようにして精製し得る。抽出物は、組換えウイルス感染Sf9細胞から、Rupert et al.Nature,362:175−179(1993)に記載のように調製する。簡単には、Sf9細胞を洗浄し、音波破砕バッファー(25mL Hepes、pH7.9;12.5mM MgCl2;0.1mM EDTA;10%グリセロール;0.1%NP−40;0.4M KCl)中に再懸濁し、氷上で20秒間、2回音波破砕する。音波破砕物を遠心分離によって清澄化し、上清みを、負荷バッファー(50mMリン酸塩、300mM NaCl、10%グリセロール、pH7.8)中で50倍に希釈し、0.45μmフィルターに通して濾過する。Ni2+NTAアガロースカラム(Qiagenから市販)を5mL容量の床を用いて調製し、25mLの水で洗浄し、25mLの負荷バッファーで平衡化する。濾過した細胞抽出物をカラム上に0.5mL/分で負荷する。カラムをベースラインA280まで負荷バッファーで洗浄し、この時点で、画分収集を開始する。次に、カラムを二次洗浄バッファー(50mMリン酸塩;300mM NaCl、10%グリセロール、pH6.0)で洗浄し、これにより、非特異的結合タンパク質を溶出する。再度A280ベースラインに達した後、カラムを二次洗浄バッファー中0〜500mMイミダゾールの勾配で展開させる。1mLずつの画分を収集し、SDS−PAGEおよび銀染色またはNi2+−NTAコンジュゲートアルカリホスファターゼ(Qiagen)を用いたウエスタンブロットによって解析する。溶出されたHis10タグ化PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO49
79、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含有する画分をプールし、負荷バッファーに対して透析する。
79、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250を含有する画分をプールし、負荷バッファーに対して透析する。
あるいはまた、IgGタグ化(またはFcタグ化)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の精製が、既知のクロマトグラフィー手法、例えば、タンパク質Aまたはタンパク質Gカラムクロマトグラフィーなどを用いて行われ得る。
実施例72:PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に結合する抗体の調製
この実施例は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO
4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に特異的に結合し得るモノクローナル抗体の調製を示す。
この実施例は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO
4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に特異的に結合し得るモノクローナル抗体の調製を示す。
モノクローナル抗体を作製するための手法は当該技術分野で知られており、例えば、Goding(前出)に記載されている。使用され得る免疫原としては、精製されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含有する融合タンパク質、および組換えPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO991
7、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを細胞表面上に発現する細胞が挙げられる。免疫原の選択は、当業者が必要以上に実験を行うことなく行い得る。
7、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを細胞表面上に発現する細胞が挙げられる。免疫原の選択は、当業者が必要以上に実験を行うことなく行い得る。
Balb/cなどのマウスを、完全フロイントアジュバント中で乳化させたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250免疫原で免疫処置し、1〜100マイクログラムの量で皮下または腹腔内注射する。あるいはまた、免疫原を、MPL−TDMアジュバント(Ribi Immunochemical Research,Hamilton,MT)中に乳化させ、動物の後肢支脚皿に注射する。次いで、免疫処置されたマウスを10〜12日後、選択したアジュバント中に乳化させたさらなる免疫原で追加免疫刺激する。その後、数週間、マウスにさらなる免疫処置注射により追加免疫刺激してもよい。血清試料を、定期的にマウスから後眼窩採血によって採取し、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250抗体を検出するELISAアッセイにおいて試験し得る。
適当な抗体力価が検出された後、抗体について「陽性」の動物に、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO14
34、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の最終の静脈内注射が注射され得る。3〜4日後、マウスを屠殺し、脾臓細胞を回収する。次いで、脾臓細胞を、選択したマウス骨髄腫細胞株(例えば、ATCC番号CRL 1597から入手可能なP3X63AgU.1など)と融合させる(35%ポリエチレングリコールを使用)。融合によりハイブリドーマ細胞を作製し、次いで、これを、非融合細胞、骨髄腫ハイブリッドおよび脾臓細胞ハイブリッドの増殖を阻害するHAT(ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジン)培地を入れた96ウェル組織培養プレート内にプレーティングし得る。
34、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250の最終の静脈内注射が注射され得る。3〜4日後、マウスを屠殺し、脾臓細胞を回収する。次いで、脾臓細胞を、選択したマウス骨髄腫細胞株(例えば、ATCC番号CRL 1597から入手可能なP3X63AgU.1など)と融合させる(35%ポリエチレングリコールを使用)。融合によりハイブリドーマ細胞を作製し、次いで、これを、非融合細胞、骨髄腫ハイブリッドおよび脾臓細胞ハイブリッドの増殖を阻害するHAT(ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジン)培地を入れた96ウェル組織培養プレート内にプレーティングし得る。
ハイブリドーマ細胞は、ELISAにおいてPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に対する反応性についてスクリーニングする。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250に対する所望のモノクローナル抗体を分泌する「陽性」ハイブリドーマ細胞の決定は、当該技術分野の技量の範囲内である。
陽性ハイブリドーマ細胞を同系Balb/cマウスに腹腔内注射し、抗PRO6912
2、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203またはanti−PRO35250モノクローナル抗体を含有する腹水を生成し得る。あるいはまた、ハイブリドーマ細胞を組織培養フラスコまたはローラーボトル内で培養してもよい。腹水内に産生されたモノクローナル抗体の精製は、硫酸アンモニウム沈殿の後ゲル排除クロマトグラフィーを用いて行い得る。あるいはまた、タンパク質Aまたはタンパク質Gに対する抗体の結合に基づくアフィニティクロマトグラフィを使用し得る。
2、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203またはanti−PRO35250モノクローナル抗体を含有する腹水を生成し得る。あるいはまた、ハイブリドーマ細胞を組織培養フラスコまたはローラーボトル内で培養してもよい。腹水内に産生されたモノクローナル抗体の精製は、硫酸アンモニウム沈殿の後ゲル排除クロマトグラフィーを用いて行い得る。あるいはまた、タンパク質Aまたはタンパク質Gに対する抗体の結合に基づくアフィニティクロマトグラフィを使用し得る。
実施例73:特異的抗体を用いたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの精製
ネイティブまたは組換えPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO2
1718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを、タンパク質精製の分野におけるさまざまな標準的な手法によって精製し得る。例えば、プロPRO69122、プロPRO204、プロPRO214、プロPRO222、プロPRO234、プロPRO265、プロPRO309、プロPRO332、プロPRO342、プロPRO356、プロPRO540、プロPRO618、プロPRO944、プロPRO994、プロPRO1079、プロPRO1110、プロPRO1122、プロPRO1138、プロPRO1190、プロPRO1272、プロPRO1286、プロPRO1295、プロPRO1309、プロPRO1316、プロPRO1383、プロPRO1384、プロPRO1431、プロPRO1434、プロPRO1475、プロPRO1481、プロPRO1568、プロPRO1573、プロPRO1599、プロPRO1604、プロPRO1605、プロPRO1693、プロPRO1753、プロPRO1755、プロPRO1777、プロPRO1788、プロPRO1864、プロPRO1925、プロPRO1926、プロPRO3566、プロPRO4330、プロPRO4423、プロPRO36935、プロPRO4977、プロPRO4979、プロPRO4980、プロPRO4981、プロPRO5801、プロPRO5995、プロPRO6001、プロPRO6095、プロPRO6182、プロPRO7170、プロPRO7171、プロPRO7436、プロPRO9912、プロPRO9917、プロPRO37337、プロPRO37496、プロPRO19646、プロPRO21718、プロPRO19820、プロPRO21201、プロPRO20026、プロPRO20110、プロPRO23203またはプロPRO35250ポリペプチド、成熟PRO69122、成熟PRO204、成熟PRO214、成熟PRO222、成熟PRO234、成熟PRO265、成熟PRO309、成熟PRO332、成熟PRO342、成熟PRO356、成熟PRO540、成熟PRO618、成熟PRO944、成熟PRO994、成熟PRO1079、成熟PRO1110、成熟PRO1122、成熟PRO1138、成熟PRO1190、成熟PRO1272、成熟PRO1286、成熟PRO1295、成熟PRO1309、成熟PRO1316、成熟PRO1383、成熟PRO1384、成熟PRO1431、成熟PRO1434、成熟PRO1475、成熟PRO1481、成熟PRO1568、成熟PRO1573、成熟PRO1599、成熟PRO1604、成熟PRO1605、成熟PRO1693、成熟PRO1753、成熟PRO1755、成熟PRO1777、成熟PRO1788、成熟PRO1864、成熟PRO1925、成熟PRO1926、成熟PRO3566、成熟PRO4330、成熟PRO4423、成熟PRO36935、成熟PRO4977、成熟PRO4979、成熟PRO4980、成熟PRO4981、成熟PRO5801、成熟PRO5995、成熟PRO6001、成熟PRO6095、成熟PRO6182、成熟PRO7170、成熟PRO7171、成熟PRO7436、成熟PRO9912、成熟PRO9917、成熟PRO37337、成熟PRO37496、成熟PRO19646、成熟PRO21718、成熟PRO19820、成熟PRO21201、成熟PRO20026、成熟PRO20110、成熟PRO23203または成熟PRO35250ポリペプチドまたはプレPRO69122、プレPRO204、プレPRO214、プレPRO222、プレPRO234、プレPRO265、プレPRO309、プレPRO332、プレPRO342、プレPRO356、プレPRO540、プレPRO618、プレPRO944、プレPRO994、プレPRO1079、プレPRO1110、プレPRO1122、プレPRO1138、プレPRO1190、プレPRO1272、プレPRO1286、プレPRO1295、プレPRO1309、プレPRO1316、per−PRO1383、プレPRO1384、プレPRO1431、プレPRO1434、プレPRO1475、プレPRO1481、プレPRO1568、プレPRO1573、プレPRO1599、プレPRO1604、プレPRO1605、プレPRO1693、プレPRO1753、プレPRO1755、プレPRO1777、プレPRO1788、プレPRO1864、プレPRO1925、プレPRO1926、プレPRO3566、プレPRO4330、プレPRO4423、プレPRO36
935、プレPRO4977、プレPRO4979、プレPRO4980、プレPRO4981、プレPRO5801、プレPRO5995、プレPRO6001、プレPRO6095、プレPRO6182、プレPRO7170、プレPRO7171、プレPRO7436、プレPRO9912、プレPRO9917、プレPRO37337、プレPRO37496、プレPRO19646、プレPRO21718、プレPRO19820、プレPRO21201、プレPRO20026、プレPRO20110、プレPRO23203またはプレPRO35250ポリペプチドを、対象のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに特異的な抗体を用いたイムノアフィニティクロマトグラフィーによって精製する。一般に、イムノアフィニティカラムは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250ポリペプチド抗体を活性化したクロマトグラフィー樹脂に共有結合によってカップリングさせることにより構成されている。
ネイティブまたは組換えPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO2
1718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを、タンパク質精製の分野におけるさまざまな標準的な手法によって精製し得る。例えば、プロPRO69122、プロPRO204、プロPRO214、プロPRO222、プロPRO234、プロPRO265、プロPRO309、プロPRO332、プロPRO342、プロPRO356、プロPRO540、プロPRO618、プロPRO944、プロPRO994、プロPRO1079、プロPRO1110、プロPRO1122、プロPRO1138、プロPRO1190、プロPRO1272、プロPRO1286、プロPRO1295、プロPRO1309、プロPRO1316、プロPRO1383、プロPRO1384、プロPRO1431、プロPRO1434、プロPRO1475、プロPRO1481、プロPRO1568、プロPRO1573、プロPRO1599、プロPRO1604、プロPRO1605、プロPRO1693、プロPRO1753、プロPRO1755、プロPRO1777、プロPRO1788、プロPRO1864、プロPRO1925、プロPRO1926、プロPRO3566、プロPRO4330、プロPRO4423、プロPRO36935、プロPRO4977、プロPRO4979、プロPRO4980、プロPRO4981、プロPRO5801、プロPRO5995、プロPRO6001、プロPRO6095、プロPRO6182、プロPRO7170、プロPRO7171、プロPRO7436、プロPRO9912、プロPRO9917、プロPRO37337、プロPRO37496、プロPRO19646、プロPRO21718、プロPRO19820、プロPRO21201、プロPRO20026、プロPRO20110、プロPRO23203またはプロPRO35250ポリペプチド、成熟PRO69122、成熟PRO204、成熟PRO214、成熟PRO222、成熟PRO234、成熟PRO265、成熟PRO309、成熟PRO332、成熟PRO342、成熟PRO356、成熟PRO540、成熟PRO618、成熟PRO944、成熟PRO994、成熟PRO1079、成熟PRO1110、成熟PRO1122、成熟PRO1138、成熟PRO1190、成熟PRO1272、成熟PRO1286、成熟PRO1295、成熟PRO1309、成熟PRO1316、成熟PRO1383、成熟PRO1384、成熟PRO1431、成熟PRO1434、成熟PRO1475、成熟PRO1481、成熟PRO1568、成熟PRO1573、成熟PRO1599、成熟PRO1604、成熟PRO1605、成熟PRO1693、成熟PRO1753、成熟PRO1755、成熟PRO1777、成熟PRO1788、成熟PRO1864、成熟PRO1925、成熟PRO1926、成熟PRO3566、成熟PRO4330、成熟PRO4423、成熟PRO36935、成熟PRO4977、成熟PRO4979、成熟PRO4980、成熟PRO4981、成熟PRO5801、成熟PRO5995、成熟PRO6001、成熟PRO6095、成熟PRO6182、成熟PRO7170、成熟PRO7171、成熟PRO7436、成熟PRO9912、成熟PRO9917、成熟PRO37337、成熟PRO37496、成熟PRO19646、成熟PRO21718、成熟PRO19820、成熟PRO21201、成熟PRO20026、成熟PRO20110、成熟PRO23203または成熟PRO35250ポリペプチドまたはプレPRO69122、プレPRO204、プレPRO214、プレPRO222、プレPRO234、プレPRO265、プレPRO309、プレPRO332、プレPRO342、プレPRO356、プレPRO540、プレPRO618、プレPRO944、プレPRO994、プレPRO1079、プレPRO1110、プレPRO1122、プレPRO1138、プレPRO1190、プレPRO1272、プレPRO1286、プレPRO1295、プレPRO1309、プレPRO1316、per−PRO1383、プレPRO1384、プレPRO1431、プレPRO1434、プレPRO1475、プレPRO1481、プレPRO1568、プレPRO1573、プレPRO1599、プレPRO1604、プレPRO1605、プレPRO1693、プレPRO1753、プレPRO1755、プレPRO1777、プレPRO1788、プレPRO1864、プレPRO1925、プレPRO1926、プレPRO3566、プレPRO4330、プレPRO4423、プレPRO36
935、プレPRO4977、プレPRO4979、プレPRO4980、プレPRO4981、プレPRO5801、プレPRO5995、プレPRO6001、プレPRO6095、プレPRO6182、プレPRO7170、プレPRO7171、プレPRO7436、プレPRO9912、プレPRO9917、プレPRO37337、プレPRO37496、プレPRO19646、プレPRO21718、プレPRO19820、プレPRO21201、プレPRO20026、プレPRO20110、プレPRO23203またはプレPRO35250ポリペプチドを、対象のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに特異的な抗体を用いたイムノアフィニティクロマトグラフィーによって精製する。一般に、イムノアフィニティカラムは、抗PRO69122、抗PRO204、抗PRO214、抗PRO222、抗PRO234、抗PRO265、抗PRO309、抗PRO332、抗PRO342、抗PRO356、抗PRO540、抗PRO618、抗PRO944、抗PRO994、抗PRO1079、抗PRO1110、抗PRO1122、抗PRO1138、抗PRO1190、抗PRO1272、抗PRO1286、抗PRO1295、抗PRO1309、抗PRO1316、抗PRO1383、抗PRO1384、抗PRO1431、抗PRO1434、抗PRO1475、抗PRO1481、抗PRO1568、抗PRO1573、抗PRO1599、抗PRO1604、抗PRO1605、抗PRO1693、抗PRO1753、抗PRO1755、抗PRO1777、抗PRO1788、抗PRO1864、抗PRO1925、抗PRO1926、抗PRO3566、抗PRO4330、抗PRO4423、抗PRO36935、抗PRO4977、抗PRO4979、抗PRO4980、抗PRO4981、抗PRO5801、抗PRO5995、抗PRO6001、抗PRO6095、抗PRO6182、抗PRO7170、抗PRO7171、抗PRO7436、抗PRO9912、抗PRO9917、抗PRO37337、抗PRO37496、抗PRO19646、抗PRO21718、抗PRO19820、抗PRO21201、抗PRO20026、抗PRO20110、抗PRO23203または抗PRO35250ポリペプチド抗体を活性化したクロマトグラフィー樹脂に共有結合によってカップリングさせることにより構成されている。
ポリクローナル免疫グロブリンを、免疫血清から、硫酸アンモニウムでの沈殿、または固定化したタンパク質A(Pharmacia LKB Biotechnology,Piscataway,N.J.)上での精製のいずれかによって調製する。同様に、モノクローナル抗体を、マウス腹水から、硫酸アンモニウム沈殿または固定化したタンパク質A上でのクロマトグラフィーによって調製する。部分精製された免疫グロブリンを、CnBr活性化SEPHAROSE(商標)(Pharmacia LKB Biotechnology)などのクロマトグラフィー樹脂に共有結合させる。抗体を樹脂にカップリングさせ、樹脂をブロックし、誘導体樹脂を、製造業者の使用説明書に従って洗浄する。
かかるイムノアフィニティカラムは、可溶性形態のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを含む細胞由来の画分を調製することにより、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの精製に利用する。この調製物を、デタージェントの添加による分画遠心分離により得られた完全体細胞または亜細胞画分の可溶化によって、または当該技術分野でよく知られた他の方法によって誘導する。あるいはまた、シグナル配列を含む可溶性ポリペプチドを、有用な量で、該細胞を培養している培地中に分泌し得る。
可溶性PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO2320
3またはPRO35250ポリペプチド含有調製物をイムノアフィニティカラムに通し、カラムを、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの優先的吸収を可能にする条件下(例えば、デタージェントの存在下の高イオン強度バッファー)で洗浄する。次いで、カラムを、抗体/PRO69122、抗体/PRO204、抗体/PRO214、抗体/PRO222、抗体/PRO234、抗体/PRO265、抗体/PRO309、抗体/PRO332、抗体/PRO342、抗体/PRO356、抗体/PRO540、抗体/PRO618、抗体/PRO944、抗体/PRO994、抗体/PRO1079、抗体/PRO1110、抗体/PRO1122、抗体/PRO1138、抗体/PRO1190、抗体/PRO1272、抗体/PRO1286、抗体/PRO1295、抗体/PRO1309、抗体/PRO1316、抗体/PRO1383、抗体/PRO1384、抗体/PRO1431、抗体/PRO1434、抗体/PRO1475、抗体/PRO1481、抗体/PRO1568、抗体/PRO1573、抗体/PRO1599、抗体/PRO1604、抗体/PRO1605、抗体/PRO1693、抗体/PRO1753、抗体/PRO1755、抗体/PRO1777、抗体/PRO1788、抗体/PRO1864、抗体/PRO1925、抗体/PRO1926、抗体/PRO3566、抗体/PRO4330、抗体/PRO4423、抗体/PRO36935、抗体/PRO4977、抗体/PRO4979、抗体/PRO4980、抗体/PRO4981、抗体/PRO5801、抗体/PRO5995、抗体/PRO6001、抗体/PRO6095、抗体/PRO6182、抗体/PRO7170、抗体/PRO7171、抗体/PRO7436、抗体/PRO9912、抗体/PRO9917、抗体/PRO37337、抗体/PRO37496、抗体/PRO19646、抗体/PRO21718、抗体/PRO19820、抗体/PRO21201、抗体/PRO20026、抗体/PRO20110、抗体/PRO23203または抗体/PRO35250ポリペプチド結合を破壊する条件下(例えば、低pHバッファー(例えば、およそpH2〜3など)または高濃度のカオトロピック薬剤(例えば、尿素またはチオシアネートイオンなど))で溶出させ、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO71
71、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを収集する。
3またはPRO35250ポリペプチド含有調製物をイムノアフィニティカラムに通し、カラムを、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの優先的吸収を可能にする条件下(例えば、デタージェントの存在下の高イオン強度バッファー)で洗浄する。次いで、カラムを、抗体/PRO69122、抗体/PRO204、抗体/PRO214、抗体/PRO222、抗体/PRO234、抗体/PRO265、抗体/PRO309、抗体/PRO332、抗体/PRO342、抗体/PRO356、抗体/PRO540、抗体/PRO618、抗体/PRO944、抗体/PRO994、抗体/PRO1079、抗体/PRO1110、抗体/PRO1122、抗体/PRO1138、抗体/PRO1190、抗体/PRO1272、抗体/PRO1286、抗体/PRO1295、抗体/PRO1309、抗体/PRO1316、抗体/PRO1383、抗体/PRO1384、抗体/PRO1431、抗体/PRO1434、抗体/PRO1475、抗体/PRO1481、抗体/PRO1568、抗体/PRO1573、抗体/PRO1599、抗体/PRO1604、抗体/PRO1605、抗体/PRO1693、抗体/PRO1753、抗体/PRO1755、抗体/PRO1777、抗体/PRO1788、抗体/PRO1864、抗体/PRO1925、抗体/PRO1926、抗体/PRO3566、抗体/PRO4330、抗体/PRO4423、抗体/PRO36935、抗体/PRO4977、抗体/PRO4979、抗体/PRO4980、抗体/PRO4981、抗体/PRO5801、抗体/PRO5995、抗体/PRO6001、抗体/PRO6095、抗体/PRO6182、抗体/PRO7170、抗体/PRO7171、抗体/PRO7436、抗体/PRO9912、抗体/PRO9917、抗体/PRO37337、抗体/PRO37496、抗体/PRO19646、抗体/PRO21718、抗体/PRO19820、抗体/PRO21201、抗体/PRO20026、抗体/PRO20110、抗体/PRO23203または抗体/PRO35250ポリペプチド結合を破壊する条件下(例えば、低pHバッファー(例えば、およそpH2〜3など)または高濃度のカオトロピック薬剤(例えば、尿素またはチオシアネートイオンなど))で溶出させ、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO71
71、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを収集する。
実施例74:薬物スクリーニング
本発明は、さまざまな薬物スクリーニング手法のいずれかにおいて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはその結合フラグメントを用いることによる化合物のスクリーニングに特に有用である。かかる試験に使用されるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片は、溶液中で遊離、固相支持体に固定、細胞表面上に担持、または細胞内に局在のいずれかであり得る。薬物スクリーニング方法の一例では、組換え核酸で安定に形質転換された、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7
170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片を発現する真核生物または原核生物の宿主細胞を用いる。薬物は、競合的結合アッセイで、かかる形質転換細胞に対してスクリーニングする。かかる細胞は、バイアブルな状態または固定された形態のいずれかで、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片と試験対象の薬剤との複合体の形成を測定できる。あるいはまた、試験される薬剤によって引き起こされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとその標的細胞または標的受容体との複合体形成の減少を検査できる。
本発明は、さまざまな薬物スクリーニング手法のいずれかにおいて、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはその結合フラグメントを用いることによる化合物のスクリーニングに特に有用である。かかる試験に使用されるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片は、溶液中で遊離、固相支持体に固定、細胞表面上に担持、または細胞内に局在のいずれかであり得る。薬物スクリーニング方法の一例では、組換え核酸で安定に形質転換された、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7
170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片を発現する真核生物または原核生物の宿主細胞を用いる。薬物は、競合的結合アッセイで、かかる形質転換細胞に対してスクリーニングする。かかる細胞は、バイアブルな状態または固定された形態のいずれかで、標準的な結合アッセイに使用できる。例えば、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片と試験対象の薬剤との複合体の形成を測定できる。あるいはまた、試験される薬剤によって引き起こされるPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドとその標的細胞または標的受容体との複合体形成の減少を検査できる。
したがって、本発明は、薬物またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PR
O6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド関連の疾患または障害に影響を及ぼし得る任意の他の薬剤のスクリーニング方法を提供する。このような方法は、かかる薬剤をPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはその断片と接触させること、および(I)該薬剤とPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドもしくは断片との複合体の存在について、または(ii)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドもしくは断片を細胞との複合体の存在に
ついて、当該技術分野でよく知られた方法によってアッセイすることを含む。かかる競合的結合アッセイでは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片を、典型的には標識する。適当なインキュベーション後、遊離PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片を、結合された形態で存在するものから分離し、遊離または非複合体形成標識の量を、その特定の薬剤がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに結合する能力またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、P
RO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド/細胞複合体に干渉する能力の尺度とする。
O6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド関連の疾患または障害に影響を及ぼし得る任意の他の薬剤のスクリーニング方法を提供する。このような方法は、かかる薬剤をPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはその断片と接触させること、および(I)該薬剤とPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドもしくは断片との複合体の存在について、または(ii)PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドもしくは断片を細胞との複合体の存在に
ついて、当該技術分野でよく知られた方法によってアッセイすることを含む。かかる競合的結合アッセイでは、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片を、典型的には標識する。適当なインキュベーション後、遊離PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたは断片を、結合された形態で存在するものから分離し、遊離または非複合体形成標識の量を、その特定の薬剤がPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに結合する能力またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、P
RO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド/細胞複合体に干渉する能力の尺度とする。
薬物スクリーニングのための別の手法は、ポリペプチドに対して適当な結合親和性を有する化合物のハイスループットスクリーニングを提供し、WO84/03564(1984年9月13日に公開)に詳細に記載されている。簡単に述べると、多数の異なる小ペプチド試験化合物を、プラスチックピンまたはいずれかの他の表面などの固相基材上で合成する。PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに適用し、ペプチド試験化合物をPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと反応させ、洗浄する。結合されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO119
0、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、当該技術分野でよく知られた方法によって検出する。また、精製したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを、前述の薬物スクリーニング手法における使用のために、直接プレート上にコートしてもよい。また、非中和抗体を用いてペプチドを捕捉し、固相支持体上に固定化してもよい。
0、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドは、当該技術分野でよく知られた方法によって検出する。また、精製したPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドを、前述の薬物スクリーニング手法における使用のために、直接プレート上にコートしてもよい。また、非中和抗体を用いてペプチドを捕捉し、固相支持体上に固定化してもよい。
本発明ではまた、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドに結合できる中和抗体が、試験化合物と、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PR
O1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはその断片に対する結合に関して特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイの使用が想定される。このようにして、該抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと1つ以上の抗原性決定基とを共有する任意のペプチドの存在を検出するために使用できる。
O1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドまたはその断片に対する結合に関して特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイの使用が想定される。このようにして、該抗体は、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドと1つ以上の抗原性決定基とを共有する任意のペプチドの存在を検出するために使用できる。
実施例75:合理的な薬物設計
合理的な薬物設計の目的は、目的の生物学的に活性なポリペプチド(すなわち、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド)または該ポリペプチドと相互作用する小分子、例えば、アゴニスト、アンタゴニストもしくはインヒビターの構造的類縁体を作製することである。これらの例のいずれかを用い、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PR
O1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのより活性または安定な形態である薬物またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの機能をインビボで増強もしくは干渉する薬物を創出し得る(Hodgson,Bio/Technology,9:19−21(1991)を参照)。
合理的な薬物設計の目的は、目的の生物学的に活性なポリペプチド(すなわち、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド)または該ポリペプチドと相互作用する小分子、例えば、アゴニスト、アンタゴニストもしくはインヒビターの構造的類縁体を作製することである。これらの例のいずれかを用い、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PR
O1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドのより活性または安定な形態である薬物またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの機能をインビボで増強もしくは干渉する薬物を創出し得る(Hodgson,Bio/Technology,9:19−21(1991)を参照)。
アプローチの一例において、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド、またはPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1
599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド−インヒビター複合体の3次元構造を、x線結晶学、コンピュータモデル設計または、最も典型的には、この2つのアプローチの組合せによって決定する。該分子の構造を解明するため、および活性部位(1つまたは複数)を決定するためには、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形状および電荷の両方が確認されなければならない。頻度は低いが、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの構造に関する有用な情報を、相同タンパク質の構造に基づいたモデル設計によって得ることができる。両方の場合において、関連する構造的情報は、類縁PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO186
4、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド様分子を設計するため、または効率的なインヒビターを同定するために使用する。合理的な薬物設計の有用な例としては、Braxton and Wells,Biochemistry,31:7796−7801(1992)に示されたような改善された活性もしくは安定性を有する分子、またはAthauda et al.J.Biochem.,113:742−746(1993)に示されたような天然ペプチドのインヒビター、アゴニストもしくはアンタゴニストとして作用する分子が挙げられ得る。
599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド−インヒビター複合体の3次元構造を、x線結晶学、コンピュータモデル設計または、最も典型的には、この2つのアプローチの組合せによって決定する。該分子の構造を解明するため、および活性部位(1つまたは複数)を決定するためには、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの形状および電荷の両方が確認されなければならない。頻度は低いが、PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドの構造に関する有用な情報を、相同タンパク質の構造に基づいたモデル設計によって得ることができる。両方の場合において、関連する構造的情報は、類縁PRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO186
4、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチド様分子を設計するため、または効率的なインヒビターを同定するために使用する。合理的な薬物設計の有用な例としては、Braxton and Wells,Biochemistry,31:7796−7801(1992)に示されたような改善された活性もしくは安定性を有する分子、またはAthauda et al.J.Biochem.,113:742−746(1993)に示されたような天然ペプチドのインヒビター、アゴニストもしくはアンタゴニストとして作用する分子が挙げられ得る。
また、上記のようにして機能アッセイによって選択された標的特異的抗体を単離し、次いで、その結晶構造を解明することも可能である。このアプローチは、原理的には、その後の薬物設計の基礎となり得るファーマコアをもたらす。タンパク質結晶学は、機能性の薬理学的に活性な抗体に対する抗イデオタイプ抗体(抗id)を作製することにより、全く回避することが可能である。鏡像の鏡像として、抗idの結合部位は、元の受容体の類縁体であることが予測され得る。次いで、抗idを、化学的または生物学的に作製されたペプチドのバンクからペプチドを同定および単離するために使用できる。次いで、単離されたペプチドは、ファーマコアとしての役目を果たし得る。
本発明により、X線結晶学などの解析的研究を行うのに充分な量のPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO7171、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドが利用可能となり得る。また、本明細書に提供されたPRO69122、PRO204、PRO214、PRO222、PRO234、PRO265、PRO309、PRO332、PRO342、PRO356、PRO540、PRO618、PRO944、PRO994、PRO1079、PRO1110、PRO1122、PRO1138、PRO1190、PRO1272、PRO1286、PRO1295、PRO1309、PRO1316、PRO1383、PRO1384、PRO1431、PRO1434、PRO1475、PRO1481、PRO1568、PRO1573、PRO1599、PRO1604、PRO1605、PRO1693、PRO1753、PRO1755、PRO1777、PRO1788、PRO1864、PRO1925、PRO1926、PRO3566、PRO4330、PRO4423、PRO36935、PRO4977、PRO4979、PRO4980、PRO4981、PRO5801、PRO5995、PRO6001、PRO6095、PRO6182、PRO7170、PRO717
1、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドアミノ酸配列の知得により、x線結晶学の代わり、またはこれに加えてにコンピュータモデル設計手法が使用されるものに対する手引きが提供される。
1、PRO7436、PRO9912、PRO9917、PRO37337、PRO37496、PRO19646、PRO21718、PRO19820、PRO21201、PRO20026、PRO20110、PRO23203またはPRO35250ポリペプチドアミノ酸配列の知得により、x線結晶学の代わり、またはこれに加えてにコンピュータモデル設計手法が使用されるものに対する手引きが提供される。
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