FI112094B - Förbättrat förfarande för kvantifiering av nukleinsyra - Google Patents

Förbättrat förfarande för kvantifiering av nukleinsyra Download PDF

Info

Publication number
FI112094B
FI112094B FI951082A FI951082A FI112094B FI 112094 B FI112094 B FI 112094B FI 951082 A FI951082 A FI 951082A FI 951082 A FI951082 A FI 951082A FI 112094 B FI112094 B FI 112094B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
nucleic acid
sample
analyzed
amount
rna
Prior art date
Application number
FI951082A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI951082A0 (sv
FI951082A (sv
Inventor
Tim Kievits
Marinus Gerardus Joh Beuningen
Thomas Augustinus Maria Beumer
Original Assignee
Akzo Nobel Nv
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Akzo Nobel Nv filed Critical Akzo Nobel Nv
Publication of FI951082A0 publication Critical patent/FI951082A0/sv
Publication of FI951082A publication Critical patent/FI951082A/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI112094B publication Critical patent/FI112094B/sv

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6865—Promoter-based amplification, e.g. nucleic acid sequence amplification [NASBA], self-sustained sequence replication [3SR] or transcription-based amplification system [TAS]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851—Quantitative amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701—Specific hybridization probes
    • C12Q1/702—Specific hybridization probes for retroviruses
    • C12Q1/703—Viruses associated with AIDS

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (17)

1. Förfarande för kvantifiering av en analyserbar nukleinsyra i ett prov, kännetecknat av att det om- 5 fattar följande steg: - olika motsvarande mängder kända olika nukleinsy-rastrukturer tillsätts en förutbestämd prowolym, varvid varje struktur är urskiljbar frän de andra nukleinsyra-strukturerna och frän den analyserbara nukleinsyran, 10. provet underkastas nukleinsyraamplifikation ge- nom användning av amplifikationsreagenser, som förmär rea-gera med samma effekt bäde med den analyserbara nukleinsyran och med nukleinsyrastrukturerna, - de relativa mängderna av amplifierade molekyler, 15 som härstammar frän den analyserbara nukleinsyran och frän varje nukleinsyrastruktur bestams, - mängden analyserbar nukleinsyra i nämnda relativa mängder beräknas.
2. Förfarande enligt patentkrav 1, känneteck- ,, 2 0 nat av att nukleinsyrastrukturerna har samma sekvens som ; den analyserbara nukleinsyran, förutom att varje nuklein- » t · 'syrastruktur har en individuellt urskiljbar sekvens.
‘ ' 3. Förfarande enligt patentkrav 2, känneteck- * n at av att den individuellt urskiljbara sekvensen är en :,: * 25 randomiserad sekvens, som innehäller ca 20 nukleotider. v
·' 4. Förfarande enligt nägot av föregäende patent krav, kännetecknat av att nukleinsyrastrukturer till-sätts i mängdomräden, som skiljer sig frän varandra med en konstantfaktor. Il· 30
5. Förfarande enligt nägot av föregäende patent- krav, kännetecknat av att nukleinsyrastrukturer tili- • · ’··.* sätts i mängdomräden, som skiljer sig frän varandra med en ··· faktor 10.
6. Förfarande enligt patentkrav 1, känneteck-35 nat av att provet framställs genom att en känd mängd testvätska underkastas en nukleinsyraisolationsprocedur, 112094 34 varvid nukleinsyrastrukturerna sätts till testvätskan före nämnda testvätska underkastas nukleinsyraisolationsproce-duren.
7. Förfarande enligt patentkrav 6, känneteck-5 nat av att en känd mängd isolationskontrollsekvens till- sätts till provet efter det att testvätskan underkastats en nukleinsyraisolationsprocedur.
8. Förfarande enligt nägot av patentkraven 1-7, kännetecknat av att provet delas upp i flera än en 10 reaktionsvolym, till var och en av vilka sätts nukleinsy-rastrukturer i olika mängdomräden.
9. Förfarande enligt patentkrav 8, kännetecknat av att samma nukleinsyrastrukturer sätts till varje reaktionsvolym. 15
10. Förfarande enligt patentkrav 8 eller 9, kännetecknat av att mängdomrädena inte överlappar varandra.
11. Förfarande för kvantifiering av en analyserbar nukleinsyra i flera än ett prov, kännetecknat av 20 att varje prov underkastas förfarandet enligt patentkrav : 1, varvid samma nukleinsyrastrukturer används i alia prov , och mängderna av varje särskild nukleinsyrastruktur varie- rar.
12. Förfarande enligt patentkrav 11, känne-25 tecknat av att i varje prov används en nollmängd av en : : : nukleinsyrastruktur.
' ‘ ' 13. Förfarande för kvantifiering av en analyserbar nukleinsyra i en testvätskepanel, kännetecknat av att i I · * det omfattar följande steg: 30. en mängd nämnda testvätskor utspäds med en känd Λ faktor och prov tas av nämnda utspädda testvätskor, vilka innehäller en sädan mängd av den analyserbara nukleinsy- • I *;* ran, som antas vara inom ett visst omräde, <‘|’ - proven underkastas förfarandet enligt patentkrav 35 1, varvid mängderna av nukleinsyrastrukturer som tillsatts » > · till proven är inom nämnda omräde. 112094 35
14. Förfarande enligt patentkrav 13, kanne- tecknat av att det omfattar ytterligare steg för: - identifiering av proven, som innehäller en mängd av den analyserbara nukleinsyran, vilken är under nämnda 5 mängdomräden, - testvätskorna, varifrän nämnda prov härstammar, underkastas förfarandet enligt patentkrav 13, varvid nämnda mängder utspäds med en mindre faktor.
15. Förfarande enligt patentkrav 13, känne- 10 tecknat av att det omf attar ytterligare steg för: - identifiering av proven, som innehäller en mängd av den analyserbara nukleinsyran, vilken är över nämnda mängdomräden, - testvätskorna, varifrän nämnda prov härstammar, 15 underkastas förfarandet enligt patentkrav 13, varvid nämnda mängder utspäds med en större faktor.
16. Förfarande för kvantifiering av en analyserbar nukleinsyra i ett prov, kännetecknat av att det om-fattar följande steg: 20. tili ett prov sätts en mängd av en nukleinsyra- : struktur, varvid nämnda mängd antas vara i samma omräde som den mängd av den analyserbara nukleinsyran, som antas ,···( vara närvarande i nämnda prov, - provet underkastas nukleinsyraamplifikation ge- , 25 nom användning av amplifikationsreagenser, som förmär rea- ; · gera med samma effekt bäde med den analyserbara nukleinsy- ' ' ’ ran och med nukleinsyrastrukturerna, - de relativa mängderna av amplifierade molekyler, • som härstammar frän den analyserbara nukleinsyran och frän : ; 30 varje nukleinsyrastruktur bestäms, - mängden analyserbar nukleinsyra i nämnda relati- • » * va mängd beräknas, ( > ·;* - ett andra prov av samma testvätska underkastas förfarandet enligt patentkrav 1, varvid mängderna av de 35 tillsatta nukleinsyrastrukturerna är i samma omräde som 112094 36 den mängd av den analyserbara nukleinsyran som antas vara närvarande i det första provet.
17. Testsats för kvantifiering av nukleinsyra i ett prov med förfarandet enligt patentkrav 1, kanne-5 tecknad av att den innehäller olika nukleinsyrastruktu-rer, amplifikationsreagenser, vilka förmär reagera med nukleinsyrastrukturerna och den analyserbara nukleinsyran, en detektionssond för den amplifierade analyserbara nukleinsyran samt olika detektionssonder, som var för sig är 10 specifika för de olika amplifierade nukleinsyrastrukturerna . * 1 · * · · • · • · * » · * · • # • · * · · • 1 · 1 · • » » I I » · * · » • · · • · · • · • » • » t » • | » • » I ft » » 1
FI951082A 1993-07-09 1995-03-08 Förbättrat förfarande för kvantifiering av nukleinsyra FI112094B (sv)

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP93202015 1993-07-09
EP93202015 1993-07-09
EP93203424 1993-12-06
EP93203424 1993-12-06
EP9402295 1994-07-08
PCT/EP1994/002295 WO1995002067A1 (en) 1993-07-09 1994-07-08 Improved method for the quantification of nucleic acid

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI951082A0 FI951082A0 (sv) 1995-03-08
FI951082A FI951082A (sv) 1995-03-08
FI112094B true FI112094B (sv) 2003-10-31

Family

ID=26133903

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI951082A FI112094B (sv) 1993-07-09 1995-03-08 Förbättrat förfarande för kvantifiering av nukleinsyra

Country Status (10)

Country Link
JP (1) JP3594598B2 (sv)
KR (1) KR100312800B1 (sv)
AT (1) ATE178946T1 (sv)
AU (1) AU668659B2 (sv)
CA (1) CA2143857C (sv)
DE (1) DE69417863T2 (sv)
DK (1) DK0662156T3 (sv)
ES (1) ES2131699T3 (sv)
FI (1) FI112094B (sv)
WO (1) WO1995002067A1 (sv)

Families Citing this family (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH09505464A (ja) * 1993-09-22 1997-06-03 イゲン，インコーポレーテッド 自立性配列複製電気化学発光核酸測定法
CA2159044A1 (en) * 1994-09-26 1996-03-27 Falko-Guenter Falkner Method of quantitating nucleic acids
CA2223241C (en) * 1995-06-07 2009-11-17 Gen-Probe Incorporated Methods and kits for determining pre-amplification levels of a nucleic acid target sequence from post-amplification levels of product
US5710029A (en) * 1995-06-07 1998-01-20 Gen-Probe Incorporated Methods for determining pre-amplification levels of a nucleic acid target sequence from post-amplification levels of product
US5705365A (en) * 1995-06-07 1998-01-06 Gen-Probe Incorporated Kits for determining pre-amplification levels of a nucleic acid target sequence from post-amplification levels of product
GB9519638D0 (en) * 1995-09-26 1995-11-29 Dynal As Method
US5795722A (en) * 1997-03-18 1998-08-18 Visible Genetics Inc. Method and kit for quantitation and nucleic acid sequencing of nucleic acid analytes in a sample
US5939262A (en) 1996-07-03 1999-08-17 Ambion, Inc. Ribonuclease resistant RNA preparation and utilization
US5677124A (en) * 1996-07-03 1997-10-14 Ambion, Inc. Ribonuclease resistant viral RNA standards
US6143496A (en) 1997-04-17 2000-11-07 Cytonix Corporation Method of sampling, amplifying and quantifying segment of nucleic acid, polymerase chain reaction assembly having nanoliter-sized sample chambers, and method of filling assembly
FR2765590B1 (fr) * 1997-07-01 2002-08-09 Pasteur Institut Methode de semi-quantification d'alleles
WO2000000638A2 (en) * 1998-06-26 2000-01-06 Akzo Nobel N.V. Tagging of rna amplicons generated by transcription-based amplification
EP1013776A1 (en) * 1998-12-22 2000-06-28 Universiteit van Amsterdam A sensitive assay for the detection or quantitation of human cytomegalovirus nucleic acid
GB9902422D0 (en) * 1999-02-03 1999-03-24 Lgc Teddington Limited Reference material for nucleic acid amplification
JP4796252B2 (ja) * 1999-07-23 2011-10-19 ジェン−プローブ・インコーポレーテッド ポリヌクレオチド増幅方法
AT409383B (de) * 1999-12-22 2002-07-25 Baxter Ag Verfahren zur detektion und quantifizierung von nukleinsäuren in einer probe
US7790368B1 (en) 2000-09-22 2010-09-07 Hitachi, Ltd. Method for analyzing nucleic acid
US6312929B1 (en) * 2000-12-22 2001-11-06 Cepheid Compositions and methods enabling a totally internally controlled amplification reaction
JP5564795B2 (ja) * 2009-01-06 2014-08-06 株式会社島津製作所 Ｄｎａ定量方法、及び遺伝子解析方法
JP2011062119A (ja) 2009-09-16 2011-03-31 Seiko Epson Corp 生体試料定量用チップ
EP2678452B1 (en) * 2011-02-25 2016-02-24 Novartis AG Exogenous internal positive control for virus detection
KR102108855B1 (ko) 2017-10-30 2020-05-12 한국표준과학연구원 안정동위원소 표지 핵산을 내부표준물질로 활용하는 핵산 정량 방법 및 이의 용도

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4942124A (en) * 1987-08-11 1990-07-17 President And Fellows Of Harvard College Multiplex sequencing
ES2214472T3 (es) * 1991-08-02 2004-09-16 Biomerieux B.V. Cuantificacion de acidos nucleicos.
FR2683827B1 (fr) * 1991-11-15 1994-03-04 Institut Nal Sante Recherc Medic Procede de determination de la quantite d'un fragment d'adn d'interet par une methode d'amplification enzymatique.

Also Published As

Publication number Publication date
ATE178946T1 (de) 1999-04-15
CA2143857C (en) 2005-09-20
FI951082A0 (sv) 1995-03-08
JPH08501222A (ja) 1996-02-13
DE69417863D1 (de) 1999-05-20
ES2131699T3 (es) 1999-08-01
AU668659B2 (en) 1996-05-09
JP3594598B2 (ja) 2004-12-02
WO1995002067A1 (en) 1995-01-19
DK0662156T3 (da) 1999-10-25
FI951082A (sv) 1995-03-08
AU7492894A (en) 1995-02-06
CA2143857A1 (en) 1995-01-19
KR100312800B1 (ko) 2002-02-28
DE69417863T2 (de) 1999-10-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
FI112094B (sv) Förbättrat förfarande för kvantifiering av nukleinsyra
US5837501A (en) Nucleic acid quantitation by co-amplification of target with multiple internal controls
Mulder et al. Rapid and simple PCR assay for quantitation of human immunodeficiency virus type 1 RNA in plasma: application to acute retroviral infection
Carter et al. Ultrarapid detection of SARS-CoV-2 RNA using a reverse transcription–free exponential amplification reaction, RTF-EXPAR
JP4022600B2 (ja) 核酸増幅効率の決定方法
Brechtbuehl et al. A rapid real-time quantitative polymerase chain reaction for hepatitis B virus
EP3594360A1 (en) Colorimetric detection of nucleic acid amplification
US20030157499A1 (en) Method of assessing the amount of nucleic acid in a sample
JP6126381B2 (ja) 標的核酸の検出方法及びキット
JP2002530090A (ja) 核酸の定量的検出方法
US20020137039A1 (en) 5&#39; Nuclease nucleic acid amplification assay having an improved internal control
EP3018218A1 (en) Methods and compositions for quantitative detection of nucleic acid sequences over an extended dynamic range
Romano et al. NASBA: a novel, isothermal detection technology for qualitative and quantitative HIV-1 RNA measurements
Kellner et al. Scalable, rapid and highly sensitive isothermal detection of SARS-CoV-2 for laboratory and home testing
JP4559074B2 (ja) 複数分析物の測定方法
JP3224566B2 (ja) Ｄｎａポリメラーゼの定量方法およびそれに有用な試験キット
WO1993002215A1 (en) Quantitative nucleic acid amplification
JP2010017127A (ja) 標的核酸比率推定方法
CN115803456A (zh) 利用特定人工核苷酸序列的假阳性判断用组合物及利用其的假阳性判断方法
CN111254224A (zh) 一种定量检测人类嗜t淋巴细胞病毒前病毒的方法
Young et al. A reverse-transcription competitive PCR assay based on chemiluminescence hybridization for detection and quantification of hepatitis C virus RNA
CN112899349B (zh) 同时检测一种或多种靶标核酸的可视化核酸检测方法及其应用
CN114085926A (zh) Abcb1基因c3435t的snp位点多态性的引物和探针、试剂盒及检测方法
JP5481841B2 (ja) サイトケラチン１９ｍＲＮＡの測定方法
EP0662156B1 (en) Improved method for the quantification of nucleic acid

Legal Events

Date Code Title Description
MA Patent expired