ES2562959T3 - Tienopirimidinas que contienen un grupo alquilo sustituido para composiciones farmacéuticas - Google Patents

Tienopirimidinas que contienen un grupo alquilo sustituido para composiciones farmacéuticas Download PDF

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Phillip Black
Wesley Blackaby
Ian Linney
Matthias Austen
John Danilewicz
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Abstract

Un compuesto de fórmula general**Fórmula** en la que X es CH o N, R1 es un átomo de hidrógeno o halógeno o CN o un alquilo C1-3 o un grupo CONH2, R2 es un grupo alquilo C1-6 de cadena lineal o ramificada que está sustituido independientemente con uno o dos átomos de flúor, o uno o dos grupos trifluorometilo, tetrahidropiranilo, ciclopropilo, H2N-CO-, R5NHCO- o (R5)2-NCO-, en la que el grupo ciclopropilo mencionado anteriormente puede estar sustituido con uno o dos F o -CH2-CN, y en la que los dos grupos R5 junto con el átomo de N al cual están unidos pueden formar un anillo de 4 a 8 miembros, en el que un átomo de carbono puede estar remplazado por O, S, SO, SO2 y/o que puede estar sustituido con OH, NH2, N(alquilo C1-3)2, NH(alquilo C1-3), CF3 o alquilo C1-3. o un grupo alquilo C2-6 de cadena lineal o ramificada que está independientemente sustituido en la posición 2 a 6 con uno o dos grupos hidroxi, alcoxi C1-3, amino, CN, R5NH-, (R5)2N-, R5OCONH-, R5CONH-, R5SO2NH-, R5NHCONH-, en los que R5 es un grupo alquilo C1-5, preferentemente un grupo alquilo C1-4, más preferentemente Me, i-Pr o t-Bu, cada uno opcionalmente sustituido con un grupo CF3, NH2, NH(alquilo C1-3), N(alquilo C1-3)2 o MeO-, y en los que los átomos de hidrógeno de cualquiera de los restos NH mencionados anteriormente pueden estar reemplazados por metilo, R3 es un grupo alquilo C1-2 y R4 es un grupo carboxi, alcoxi C1-3-carbonilo, -CONH2, -CONHR7, -CONH-OR7, -CONH-SO2R7 o -CO-NH-L-R6, en el que L es -(CH2)n-, -CH2-C≡C-CH2, o R6 es OH, -NH2, -NHR7, -N(R7)2, -NH-CO2R7 o una amina cíclica de 3 a 6 miembros, tal como pirrolidina o piperidina, n es 2 o 3 y R7 es alquilo C1-4, preferentemente metilo, o una de sus sales farmacéuticamente aceptable.

Description

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fluoroarabina, gemcitabina, tioguanina, capecitabina, combinaciones tales como adriamicina/daunorrubicina, arabinósido de citosina/citarabina, 4-HC, u otras fosfamidas.
Otros compuestos particularmente preferidos son compuestos tales como clemastina, difenhidramina, dimenhidrinato, prometazina, cetirizina, astemizol, levocabastina, loratidina, terfenadina, ácido acetilsalicílico, salicilato sódico, salsalato, diflunisal, ácido salicilsalicílico, mesalazina, sulfasalazina, osalazina, acetaminofeno, indometacina, sulindaco, etodolaco, tolmetina, ketorolaco, betametasona, budesonida, ácido cromoglicínico, dimeticona, simeticona, domperidona, metoclopramid, acemetacina, oxaceprol, ibuprofeno, naproxeno, ketoprofeno, flubriprofeno, fenoprofeno, oxaprozina, ácido mefenámico, ácido meclofenámico, fenilbutazona, oxifenbutazona, azapropazona, nimesulida, metamizol, leflunamida, eforicoxib, lonazolaco, misoprostol, paracetamol, aceclofenaco, valdecoxib, parecoxib, celecoxib, propifenazona, codeína, oxaprozina, dapsona, prednisona, prednisolona, triamcinolona, dexibuprofeno, dexametasona, flunisolida, albuterol, salmeterol, terbutalina, teofilina, cafeína, naproxeno, sulfato de glucosamina, etanorcept, ketoprofeno, adalimumab, ácido hialurónico, indometacina, dimaleato de proglumetacina, hidroxicloroquina, cloroquina, infliximab, etofenamato, auranofina, oro, cloruro de [224Ra]radio, ácido tiaprofénico, dexketoprofeno(trometamol), cloprednol, aurotiomalato sódico, aurotioglucosa, colchicina, alopurinol, probenecid, sulfinpirazona, benzbromarona, carbamazepina, lornoxicam, fluorocortolona, diclofenaco, efalizumab, idarrubicina, doxorrubicina, bleomicina, mitomicina, dactinomicina, daptomicina, citarabina, fluorouracilo, fluoroarabina, gemcitabina, tioguanina, capecitabina, adriamidina/daunorrubicina, arabonósido de citosina/citarabina, 4-HC, u otras fosfamidas, penicilamina, una preparación de ácido hialurónico, arteparona, glucosamina, MTX, fragmentos soluble del receptor de TNF (tales como etanorcept (Enbrel)) y anticuerpos contra TNF (tales como infliximab (Remicade), natalizumab (Tysabri) y adalimumab (Humira)).
Los expertos en la materia apreciarán que los compuestos de la invención y el agente terapéutico adicional pueden formularse en una forma de dosificación única, o pueden presentarse en formas deferentes de dosis y puede administrarse de forma concomitante (es decir, a la misma vez) o secuencialmente.
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención pueden estar en cualquier forma adecuada para el procedimiento pretendido de administración.
Los compuestos de la presente invención pueden administrarse por vía oral, parenteral, tal como broncopulmonar, subcutánea, intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, intratecal, transdérmica, transmucosa, subdural, local o tópica mediante iontoforesis, sublingual, por pulverización de inhalación, aerosol o rectal y similares en formulaciones monodosis que comprenden opcionalmente excipientes farmacéuticamente aceptables convencionales.
Los excipientes que pueden usarse en la formulación de las composiciones farmacéuticas de la presente invención comprenden medios, vehículos, diluyentes, disolventes tales como alcoholes monohídricos tales como etanol, isopropanol y alcoholes polihídricos tales como glicoles y aceites comestibles tales como aceite de soja, aceite de coco, aceite de oliva, aceite de cártamo, aceite de algodón, ésteres oleosos tales como oleato de etilo, miristato de isopropilo; aglutinantes, adyuvantes, solubilizantes, agentes espesantes, estabilizantes, disgregantes, emolientes, agentes lubricantes, agentes tamponantes, emulsionantes, agentes humectantes, agentes de suspensión, agentes edulcorantes, colorantes, aromas, agentes de recubrimiento, conservantes, antioxidantes, agentes de procesamiento, modificadores del suministro de fármacos y potenciadores tales como fosfato de calcio, estearato de magnesio, talco, monosacáridos, disacáridos, almidón, gelatina, celulosa, metilcelulosa, carboximetil celulosa sódica, dextrosa, hidroxipropil-β-ciclodextrina, polivinilpirrolidona, ceras de bajo punto de fusión, resinas de intercambio iónico.
Otros excipientes farmacéuticamente aceptables adecuados se describen en Remington’s Pharmaceutical Sciences, 15ª Ed., Mack Publishing Co., Nueva Jersey (1991).
Las formas de dosificación para administración oral incluyen comprimidos, cápsulas, grageas, píldoras, obleas, gránulos, líquidos orales tales como jarabes, suspensiones, soluciones, emulsiones, polvo para reconstitución.
Las formas de dosificación para administración parenteral incluyen soluciones o emulsiones acuosas u oleaginosas para infusión, soluciones acuosas u oleaginosas, suspensiones o emulsiones para jeringas de inyección prellenadas, y/o polvos para reconstitución.
Las formas de dosificación para administración local/tópica comprenden insuflaciones, aerosoles, aerosoles de dosis medida, sistemas terapéuticos transdérmicos, parches medicinales, supositorios rectales, y/u óvulos.
La cantidad del compuesto de la presente invención que puede combinarse con los excipientes para formular una forma de dosificación única variará según el huésped tratado y el modo particular de administración.
Las composiciones farmacéuticas de la invención pueden producirse de un modo conocido per se para los expertos en la materia como se describe, por ejemplo, en Remington’s Pharmaceutical Sciences, 15ª Ed., Mack Publishing Co., Nueva Jersey (1991).
En un aspecto adicional de la invención, se proporciona el uso de un compuesto de tienopirimidina de la presente
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enfermedad a tratarse, la actividad del compuesto particular aplicado, forma de dosificación, modo de aplicación y medicación concomitante. La cantidad terapéuticamente eficaz para una situación dada se determinará fácilmente por experimentación rutinaria y pertenece a las habilidades y criterio del clínico o médico habitual.
Abreviaturas
CDI:
carbonildiimidazol
TEA:
trietilamina
HATU:
hexafluorofosfato de (2-(7-aza-1H-benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tetrametiluronio)
TBTU:
2-(1H-benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tetrametiluroniotetrafluorborato
THF:
tetrahidrofurano
EE:
etilacetato
ACN:
acetonitrilo
EtOH:
etanol
MeOH:
metanol
DCM:
cloruro de metileno
DMF:
N,N-dimetilformamida
EtOAc:
acetato de etilo
HCl:
ácido clorhídrico
t-BuOH:
tert-butanol
DTAD:
azodicarboxilato de di-terc-butilo
DEAD:
azodicarboxilato de dietilo
DIAD:
azodicarboxilato de diisopropilo
LiHMDS:
hexametildisilazano de litio
DIPEA:
diisopropiletil amina
EDC:
1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)carbodiimida
TFA:
ácido trifluoro acético
Salmuera:
solución saturada de cloruro sódico en agua
ta:
temperatura ambiente
min:
minuto
Ejemplos
Intermedio I
2-(2-amino-5-fluorofenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
1.1 2-(5-fluoro-2-nitofenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
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Se disolvieron 2-nitro-5-fluorofenol (3,0 g) y terc-butil-N-(2-hidroxipropil)carbamato en THF (20 ml) y se añadieron trifenilfosfina (7,5 g) y di-terc-butil-azodicarboxilato. La reacción exotérmica se enfrió en un baño de hielo. Después la mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 2h. La mezcla se concentró a vacío y el residuo se purificó por medio de cromatografía (gel de sílice/diclorometano:éter de petróleo 1:2). Las fracciones se combinaron y se concentró a vacío. El residuo se disolvió en diclorometano y se lavó con NaOH 1 M. La fase orgánica se separó, se secó, se filtró y se concentró a vacío.
Rendimiento: 3,12 g Espectro de masas IEN: m/z = 315 (M+H)+
I.2: 2-(2-Amino-5-fluorofenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
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A una solución de 2-(5-fluoro-2-nitrofenoxi)propilcarbamato de terc-butilo (3,1 g) en MeOH (5 ml) se añadió paladio sobre carbono al 10 % (300 mg) y la mezcla de reacción se hidrogenó a temperatura ambiente a 50 psi (0,34 Mpa). El catalizador se filtró y el filtrado se concentró a vacío.
Rendimiento: 2,5 g Espectro de masas IEN: m/z = 285 (M+H)+
Intermedio II 2-Hidroxibutilcarbamato de terc-butilo
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Se disolvió 1-amino-2-butanol (1,0 g) en diclorometano (50,0 ml) y se añadió dicarbonato de di-(terc-butilo) (2,6 g). 10 La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 4h, después se lavó con NaOH 1 M. La fase orgánica se separó y se concentró a vacío.
Rendimiento: 1,8 g
Intermedio III 4-(4-Fluoro-2-hidroxifenilamino)-5-metil-tienol[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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15 Se combinaron éster metílico de ácido 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (0,5 g), 2-amino-5-fluorofenol (265,0 mg), ácido p-toluensulfónico monohidratado (75,0 mg) y dioxano (5,0 ml) en un tubo de microondas. La mezcla se calentó a 140 ºC durante 15 minutos bajo irradiación de microondas. Después la mezcla se dejó enfriar hasta temperatura ambiente y se formó un precipitado. El precipitado se recogió por medio de filtración, se lavó con dioxano, metanol y Et2O para dar lugar al compuesto del título.
20 Rendimiento: 605,0 g Espectro de masas IEN: m/z = 334 (M+H)+
Intermedio IV
4-(2-Hidroxipiridin-3-ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Preparado de forma análoga al ejemplo I-2 usando 4-(5-fluoro-2-nitrofenoxi)-2-metilpentan-2-ol. Rendimiento: 2,12 g
Espectro de masas IEN: m/z = 228 (M+H)+ Intermedio IX 2-(1.1.1-Trifluoropropan-2-iloxi)piridin-3-amina
IX. 1,3-Nitro-2-(1,1,1-trifluoropropan-2-iloxi)piridina
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Se disolvió 1,1,1-trifluoro-2-propanol (3,2 g) en THF (4,0 ml) y se enfrió hasta 0 ºC. Después, se añadió LiHMDS
10 (1 M en THF, 28,3 ml) gota a gota. La mezcla de reacción se agitó a 0 ºC durante 20 minutos. Una solución de 2fluoro-3-nitropiridina (4,0 g) en THF (1 ml) se añadió y la mezcla se agitó durante la noche. Se inactivó por medio de la adición de una solución saturada de NH4Cl y se extrajo con diclorometano. La fase orgánica se secó y se concentró a vacío.
Rendimiento: 6,24 g 15 Espectro de masas IEN: m/z = 237 (M+H)+
IX. 2 2-(1.1.1-Trifluoropropan-2-iloxi)piridin-3-amina
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Se disolvió 3-nitro-(1,1,1-trifluoropropan-2-iloxi)piridina (6,2 g) en metanol (500 ml) y se añadió níquel Raney (1,0 g). La mezcla de reacción se hidrogenó a temperatura ambiente y 5 bar. El catalizador se filtró y el filtrado se concentró 20 a vacío.
Rendimiento: 4,83 g Espectro de masas IEN: m/z = 207 (M+H)+
Intermedio X
2-(1,3-Difluoropropan-2-iloxi)-4-fluoroanilina
25 X. 1 2-(1,3-Difluoropropan-2-iloxi)-4-fluoro-1-nitrobenceno
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Preparado de forma análoga al ejemplo IX.1 usando 2,4-difluoronitrobenceno. Rendimiento: 11,96 g
X.2 2-(1,3-Difluoropropan-2-iloxi)-4-fluoroanilina
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5
Preparado de forma análoga al ejemplo IX.2
Rendimiento: Espectro de masas IEN:
4,42 g m/z = 206 (M+H)+
Intermedio XI
2-(2-Fluoroproxi)piridin-3-amina
10
XI.1 2-(2-Fluoropropoxi)-3-nitropiridina
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Se disolvió 2-fluoropropan-1-ol (93,6 mg) en THF (10 ml). Se añadió LiHMDS en THF (1 M; 1,2 ml) y la reacción se agitó durante 15 minutos. Después, se añadió una solución de 2-fluoro-3-nitro-piridina (142 mg) en THF y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche.
15 Un solución acuosa de K2CO3 (2 M; 750 µl) se añadió a la mezcla de reacción y se filtró sobre Alox B. El filtrado se concentró a vacío.
Rendimiento: 200 mg Tiempo de retención HPLC: 2,05 min. Procedimiento HPLC: 003_CC_ZQ6
20 XI.2 2-(2-Fluoropropoxi)piridin-3-amina
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Se disolvió 2-(2-fluoropropoxi)-3-nitropiridina (199,97 mg) en una mezcla de THF (10 ml) y metanol (5 ml). Se añadió Pd/C (20 mg) y la mezcla se hidrogenó a temperatura ambiente durante 4h y 3 bar. La mezcla se concentró a vacío.
Rendimiento: 153 mg Tiempo de retención de HPLC: 1,50 min Procedimiento HPLC: 002_CC_ZQ4
Intermedio XII
2-(1-Metoxipropan-2-iloxi)piridin-3-amina
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Se agitaron éster metílico de ácido 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (15,0 mg), 4-fluoro-2metoxianilina (9,5 g), ácido clorhídrico 4 M en dioxano (4,5 ml) y dioxano (100,0 ml) a 100 ºC durante la noche. Después la mezcla se filtró y el sólido se secó a vacío.
Rendimiento: 24,0 g Espectro de masas IEN: m/z = 348 (M+H)+
XVIII.2 Éster metílico de ácido 4-(4-fluoro-2-hidroxi-fenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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El producto resultante de XVIII.1 (24,0 g) se disolvió en DCM (500 ml) y se enfrió con un baño de hielo seco. A la
10 mezcla se añadió gota a gota lentamente tribromuro de boro (35 ml) y se agitó durante 30 min. La mezcla se dejó enfriar hasta temperatura ambiente durante la noche. Después la mezcla se enfrió con un baño de hielo seco. Se añadieron 100 ml de etanol gota a gota a la mezcla y se agitó durante 30 min. y se concentró.
El residuo se suspendió en metanol y se agitó a reflujo durante 1 hora.
La mezcla se filtró y se secó a vacío.
15 Rendimiento: 18,6 g Espectro de masas IEN: m/z = 334 (M+H)+ Tiempo de retención de HPLC: 2,16 min Procedimiento HPLC: 007_CC_ZQ5
XVIII.3 Éster metílico de ácido 4-[2-(1-terc-butoxicarbonil-etoxi)-4-fluoro-fenilamino]-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-620 carboxílico
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Al producto resultante de XVIII.2 (2,0 g) se añadió éster terc-butílico de ácido 2-bromopropiónico (1,4 g), carbonato de cesio (4,8 g) y ACN (50 ml). La mezcla se agitó a 60 ºC durante 2 horas. Después se añadió agua y la mezcla se filtró.
Rendimiento: 2,1 g Espectro de masas IEN: m/z = 462 (M+H)+
XVIII.4 Éster metílico de ácido 4-[2-(1-carboxi-etoxi)-4-fluoro-fenilamino]-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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Se disolvió 1,3-difluoro-propan-2-ol (4,2 g) bajo argón en THF (250 ml) y se enfrió a 0 ºC. Se añadió LiHMDS (28 ml) a la mezcla y se agitó a temperatura ambiente durante 1 hora. Después se enfrió la mezcla a 0 ºC y se añadió 3fluoro-4-nitrobenzonitrilo (1,95 ml) en porciones y se agitó durante 2 horas. La mezcla se vertió en agua y se extrajo con DCM. La fase orgánica se lavó con agua, se secó y se concentró.
Rendimiento: 4,9 g
XIX.2 4-Amino-3-(2-fluoro-1-fluorometil-etoxi)-benzonitrilo
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Se agitaron 3-(2-fluoro-1-fluorometil-etoxi)-4-nitro-benzonitrilo (1,45 g), cloruro de estaño (II) dihidratado (4,00 g) y 10 etanol (60 ml) a 100 ºC durante 2 horas. La mezcla se vertió en agua y se extrajo con DCM. La fase orgánica se lavó con agua, se secó y se concentró. Rendimiento: 1,04 g Intermedio XXIV Amida de ácido 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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XXIV.1 Éster metílico de ácido 5-amino-4-ciano-3-metil-tiofen-2-carboxílico
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A una mezcla de metilacetoacetato (80,9 ml), malonitrilo (49,5 g), azufre (24 g) en metanol (750 ml) se añadió morfolina (139,4 ml). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 10 min. Después la mezcla se agitó a 20 reflujo durante 3,5 horas. Después de ese tiempo la mezcla se enfrió con un baño de hielo y se filtró. El sólido se lavó con metanol y se secó en horno a 60 ºC.
Rendimiento: 88,2 g Espectro de masas IEN: m/z = 197 (M+H)+
XXIV.2 Éster metílico de ácido 5-metil-4-oxo-3,4-dihidro-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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Al producto de XXIV.1 (70 g) se añadió ácido fórmico (875 ml) y la mezcla se agitó a reflujo durante la noche. La mezcla se enfrió de nuevo, se vertió en agua con hielo y se filtró. El sólido se lavó con agua y una pequeña parte de metanol. Después el residuo se trituró con dietiléter.
Rendimiento: 72,98 g Espectro de masas IEN: m/z = 225 (M+H)+
XXIV.3 Ácido 5-metil-4-oxo-3,4-dihidro-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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El producto de XXIV.2 (1 g), hidróxido de sodio 4 M (5 ml) y metanol se agitaron a reflujo durante 1 hora. A 10 temperatura ambiente se añadieron 5 ml de ácido clorhídrico 4 M y la mezcla se filtró. El sólido se lavó con agua y se secó a 60 ºC en un horno durante la noche.
Rendimiento: 950 mg Espectro de masas IEN: m/z = 211 (M+H)+
XXIV.4 Cloruro de 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carbonilo
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Se añadió DMF (0,2 ml) a una mezcla del producto de XXIV.3 (1 g) y cloruro de tionilo (10 ml). La mezcla se agitó a reflujo durante 1 hora. Después la mezcla se concentró.
Rendimiento: 1,2 g
XXIV.5 Amida de ácido 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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El producto de XXIV.4 (1 g) se disolvió caliente en ACN (10 ml). La mezcla se añadió gota a gota a una solución enfriada en hielo de amoníaco condensado (20 ml) y se agitó durante 15 min. La mezcla se filtró. El sólido se lavó
con agua y se secó en horno a 50 ºC.
Rendimiento: Espectro de masas IEN: 25 Tiempo de retención HPLC: Procedimiento HPLC:
677 mg 0,766 mM2-SB m/z = 226 (M+H)+ in C18
Intermedio XXVI
3-(2-Amino-5-fluoro-fenoxi)-2-metil-butan-2-ol
XXVI.1 2-Metil-butan-2,3-diol
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Se disolvió 3-hidroxi-3-metil-2-butanon (5 ml) en etanol (20 ml). Se añadió PtO2 (100 mg) y la mezcla se hidrogenó a temperatura ambiente durante 4 h y 3 bar. La mezcla se concentró a vacío.
Rendimiento: 3,87 g
XXVI.2 3-(5-Fluoro-2-nitro-fenoxi)-2-metil-butan-2-ol
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Se preparó de forma análoga al ejemplo XX.2 usando el producto de XXVI.1 (0,9 ml).
Rendimiento: 1,7 g Espectro de masas IEN: m/z = 261 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,185 min Procedimiento HPLC: M2-SB-C18
XXVI.3 3-(2-Amino-5-fluoro-fenoxi)-2-metil-butan-2-ol
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Preparado de forma análoga al ejemplo XI.2 usando el producto de XXVI.2 (1,7 g).
Rendimiento: 1,45 g Espectro de masas IEN: m/z = 214 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 0,681 min Procedimiento HPLC: M2-SB-C18
Compuesto 1
2-(5-Fluoro-2-(5-metil-6-(metilcarbamoil)tieno[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)fenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
1.1 4-(2-(1-terc-butoxicarbonilamino)propan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Compuesto 2
2.1. Trifluoroacetato de 4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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5 Se disolvió 4-(2-(1-ter-butoxicarbonilamino)propan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxilato de metilo (500 mg) en una solución de ácido trifluoroacético al 25 % en diclorometano (10 ml). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 2h y después se concentró a vacío.
10
Rendimiento: Espectro de masas IEN: m/z = Tiempo de retención HPLC: Procedimiento HPLC: 460 mg 391 (M+H)+ 1,31 min A_9
Análogos adicionales de 2:
Los compuestos listados de la tabla 2 se sintetizaron de forma análoga al ejemplo 2.1 usando los correspondientes derivados protegidos BOC que se muestran en la Tabla 1.
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Compuesto 3 4-(4-Fluoro-2-(1-(metilsulfonamido)propan-2-iloxi)fenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
3.1. 4-(4-Fluoro-(2-(1-metilsulfonamido)propan-2-iloxi)fenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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A una solución de trifluoroacetato de 4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxilato de metilo (80 mg) y trietilamina (55 µl) en diclorometano (1,5 ml) se añadió cloruro de metanosulfonilo (16 µl). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Después la reacción se interrumpió con agua y
metanol. La fase orgánica se separó y se concentró a vacío.
10
Rendimiento: Espectro de masas IEN: m/z = Tiempo de retención HPLC: Procedimiento HPLC: 68 mg 469 (M+H)+ 1,99 min A_9
Análogos adicionales del compuesto 3:
Los compuestos listados en la tabla 3 se sintetizaron de forma análoga al ejemplo 3.1 usando la amina apropiada y 15 el correspondiente cloruro.
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Compuesto 4
Tri-fluoroacetato de 4-(2-(1-dimetilamino)propan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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5 Se disolvió trifluoroacetato de 4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxilato de metilo (100 mg) en THF (2,5 ml). Se añadió NaOH (4 M; 55 µl) y formaldehído al 37 % en agua (55 µl). La mezcla se agitó unos pocos minutos. Después se añadió triacetoxiborohidrato de sodio (220 mg) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 4 h. Después la mezcla se concentró a vacío. El residuo se disolvió en diclorometano y se lavó con NaOH acuoso (1 M). La fase orgánica se separó y se concentró a vacío. El producto se
10 purificó por medio de cromatografía-RP (agua con ácido trifluoroacético al 0,2 %/metanol 72-100 %) para obtener el compuesto del título.
Rendimiento: 83 mg Espectro de masas IEN: m/z = 419 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,32 min
15 Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 5
2-(2-(6-Carbamoil-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)-5-fluorofenoxi)propilcarbamato de terc-butilo
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Se disolvió ácido 4-(2-(1-terc-butoxicarbonilamino)propan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6
20 carboxílico (250 mg) y TBTU (170 mg) en DMF (3 ml) y se añadió trietilamina (190 µl). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 10 min, después se añadieron 0,5 ml de amoníaco concentrado. La reacción se agitó durante 2 h. Después la mezcla de reacción se concentró a vacío y se purificó por medio de cromatografía-RP (agua con ácido trifluoroacético al 2 %/metanol 72-100 %) para proporcionar el compuesto del título.
Rendimiento: 55 mg
25 Espectro de masas IEN: m/z = 476 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,80 min Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 6
Trifluoroacetato de (R) y (S)-4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-630 carboxamida
6.1. 2-(2-(6-Carbamoil-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)-5-fluorofenoxi)propilcarbamato de (R) y (S)-terc-butilo
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Enantiómero B
Rendimiento: 11 mg Espectro de masas IEN: m/z = 376 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,16 min Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 7
Trifluoroacetato de ácido 4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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Sintetizado de forma análoga al ejemplo 2-1 a partir de ácido 4-(2-(1-terc-butoxicarbonil-amino)propan-2-iloxi)-410 fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico.
Rendimiento: 89 mg Espectro de masas IEN: m/z = 377 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,26 min Procedimiento HPLC: A_9
15 Compuesto 8
4-(4-Fluoro-2-(1-(3,3,3-trifluoropropilamino)propan-2-iloxi)fenilamino-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida
8.1. Trifluoroacetato de 4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida
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Se disolvió 2-(2-(6-carbamoil-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)-5-fluorofenoxi)propilcarbamato de terc-butilo 20 (740 mg) en diclorometano (20 ml) y se añadió ácido trifluoroacético (4 ml) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La reacción se concentró a vacío para proporcionar el compuesto del título.
Rendimiento: 667 mg Espectro de masas IEN: m/z = 376 (M+H)+
8.2. 4-(4-Fluoro-2-(1-(3,3,3-trifluoropropilamino)propan-2-ilopi)fenilamino-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida
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Se disolvió 2,2,2-trifluoroacetato de 4-(2-(1-Aminopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxamida (200 mg) en THF (20 ml) y se añadieron tampón a pH 5 (2 ml), 3,3,3-trifluoropropanal (50,4 mg) y cianoborohidruro de sodio (30,8 mg).
5 La reacción se agitó a temperatura ambiente durante 4 días. El residuo se diluyó con 10 ml de agua, después el disolvente orgánico se evaporó. La fracción acuosa residual se extrajo con acetato de etilo. La fase orgánica se separó, se secó y se concentró a vacío.
Rendimiento: 190 mg Espectro de masas IEN: m/z = 472 (M+H)+ 10 Tiempo de retención HPLC: 1,38 min Procedimiento HPLC: A_10
Compuesto 9
Clorhidrato de 4-(2-(2-aminoetoxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
9.1. 4-(2-(2-(Terc-butoxicarbonilamino)etoxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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15
Se suspendieron 4-(4-fluoro-2-hidroxifenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (80,0 mg), Bocamino-etanol (50,0 mg) y trifenilfosfina ligada a polímero (240,0 mg) en THF (3,0 ml). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 5 min. Después se añadió azodicarboxilato de di-terc-butilo (165,0 mg) y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. A esta reacción se añadió celite, la mezcla resultante se filtró a
20 través de celite y el filtrado se concentró a vacío. El residuo se purificó por medio de cromatografía-RP (agua con ácido trifluoro-acético al 0,2 %/metanol 59-100 %)
Rendimiento: 25,0 mg Espectro de masas IEN: m/z = 477 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 2,12 min
25 Procedimiento HPLC: A_9
9.2 Clorhidrato de 4-(2-(2-aminoetoxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
imagen61
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Sintetizado de forma análoga al ejemplo 9.2 usando 4-(2-(1-(terc-butoxicarbonilamino)butan-2-iloxi)-4fluorofenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo.
Rendimiento: 21 mg
5 Espectro de masas IEN: m/z = 405 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,38 min Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 11
Clorhidrato de 4-(2-(1-aminopropan-2-iloxi)-piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
10 11.1 4-(2-(1-Terc-butoxicarbonilamino)propan-2-iloxi)piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Preparado de forma análoga al ejemplo 9.1 usando 4-(2-hidroxipiridin-3-ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6carboxilato de metilo y N-(2-hidroxipropil)-carbamato de terc-butilo.
Rendimiento: 65 mg Espectro de masas IEN: m/z = 474 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,97 min Procedimiento HPLC: A_9
11.2 Clorhidrato de 4-(2-(1-aminopropan-2iloxi)-piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Preparado de forma análoga al ejemplo 9.2 usando 4-(2-(1-terc-butoxicarbonil-amino)-propan-2-iloxi)piridin-3ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo.
Rendimiento: 14 mg Espectro de masas IEN: m/z = 374 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,29 min Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 12
Clorhidrato de 4-(2-(4-aminobutan-2iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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10 Se disolvió éster metílico de ácido 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (1,25 g), 3-(2-amino-5fluorofenoxi)butilcarbamato de terc-butilo (1,7 g) y ácido p-toloilsulfónico (175 mg) en dioxano (30 ml) y la solución se calentó a reflujo durante la noche. Después la mezcla de reacción se concentró a vacío. El residuo se trató con ácido trifluoroacético al 25 % en diclorometano y se agitó a temperatura ambiente durante 1 h. La solución se concentró a vacío y el residuo se disolvió en diclorometano y se lavó con bicarbonato sódico. La fase orgánica se separó, se
15 secó y se concentró a vacío. El residuo se trituró con Et2O y el precipitado se filtró.
Rendimiento: 2,14 g Espectro de masas IEN: m/z = 405 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,36 min Procedimiento HPLC: A_9
20 Compuesto 13
4-(4-Fluoro-2-(4-(metilsulfonamido)butan-2iloxi)fenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Se disolvieron clorhidrato de 4-(2-(4-aminobutan-2iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (80 mg) y trietilamina (65 µl) en diclorometano (1,5 ml) y se añadió cloruro de metanosulfonilo (18 µl). La
25 mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Después la mezcla se diluyó con agua y algo de etanol. La fase orgánica se separó y se concentró a vacío. El residuo se purificó por medio de cromatografía-RP (agua con ácido trifluoroacético al 0,2 %/metanol 59-100 %).
Rendimiento: 33 mg Espectro de masas IEN: m/z = 483 (M+H)+ 30 Tiempo de retención HPLC: 1,94 min Procedimiento HPLC: A_9
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Compuesto 14
Trifluoroacetato de 4-(2-(dimetilamino)butan-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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5 Preparado de forma análoga al ejemplo 4.1 usando clorhidrato de 4-(2-(4-aminobutan-2iloxi)-4-fluorofenilamino)-5metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo.
Rendimiento: 53 mg Espectro de masas IEN: m/z = 433 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,38 min
10 Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 15
Trifluoroacetato de 4-(2-((4-aminobutan-2iloxi)piridin-3ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
15.1 4-(2-((4-((Terc-butoxicarbonil)amino)butan-2iloxi)piridin-3ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Preparado de forma análoga al ejemplo 1.1 usando éster metílico de ácido 4-cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxílico y 3-(3-aminopiridin-2iloxi)butilcarbamato de terc-butilo.
Rendimiento: 1 g Espectro de masas IEN: m/z = 488 (M+H)+
20 15.2 Trifluoroacetato de 4-(2-((4-aminobutan-2iloxi)piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
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Preparado de forma análoga al ejemplo 1.2 a partir de trifluoroacetato de 4-(2-((4-aminobutan-2iloxi)piridin-3ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo.
Rendimiento: 100 mg
5 Espectro de masas IEN: m/z = 388 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,26 min Procedimiento HPLC: A_10
Compuesto 16
Bis-trifluoroacetato de 4-(2-(4-aminobutan-2-iloxi)piridin-3-ilamino)-N-(3-dimetilamino)propil)-5-metiltieno[2,310 d]pirimidin-6-carboxamida
16.1 Ácido 4-(2-(4-(terc-butoxicarbonilamino)butan-2iloxi)piridin-3ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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Se disolvió 4-(2-(4-(terc-butoxicarbonilamino)butan-2iloxi)piridin-3ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (600 mg) en metanol (10 ml) y se añadió NaOH (1 M; 2,5 ml). La mezcla de reacción se calentó a reflujo
15 durante 15 minutos. Después se enfrió a temperatura ambiente y se añadió HCl (1 M; 2,5 ml). El metanol se evaporó y el residuo se disolvió en diclorometano. La mezcla se lavó con agua. La fase orgánica se secó y se concentró a vacío. El residuo se trituró con Et2O.
Rendimiento: 390 mg Espectro de masas IEN: m/z = 474 (M+H)+
20 16.2 Trifluoroacetato de ácido 4-(2-(4-aminobutan-2iloxi)piridin-3ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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Compuesto 24 4-(2-(1,3-Difluoropropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-N-(metilsulfonil)tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida
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Se disolvió ácido 4-(2-(1,3-difluoropropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
5 (197 mg), 4-dimetilaminopiridina (76 mg) y clorhidrato de 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)carbodiimida (125 mg) en diclorometano (20 ml). Se añadió metanosulfonamida (59,5 mg) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante 24h. La mezcla se lavó con solución de KHSO4. La fase orgánica se separó, se secó y se concentró a vacío. El residuo se purificó por medio de cromatografía (diclorometano:metanol:NH3 80:20:1). Las fracciones se recogieron y se trituraron con éter diisopropílico.
10 Rendimiento: 57 mg Espectro de IEN: m/z = 475 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 3,11 min Procedimiento HPLC: AC 1
Compuesto 25
15 Clorhidrato de N-((trans)-2-aminociclopropil)-4-(2-(1,3-difluoropropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metiltieno[2,3d]pirimidin-6-carboxamida
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Se disolvió (trans)-2-(4-(2-(1,3-difluoropropan[2,3-d]pirimidin-6-carboxamido)ciclopropil carbamato de terc-butilo (130 mg) en dioxano (8 ml) y se añadió una solución de HCl en dioxano (4 M; 1,34 ml). La reacción se agitó a 20 temperatura ambiente durante la noche. Se añadió éter dietílico y el precipitado se filtró y se lavó con Et2O para proporcionar el compuesto del título.
Rendimiento: 97 mg Espectro de IEN: m/z = 452 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 2,10 min
25 Procedimiento HPLC: AC 1
Compuesto 26
N-(3-(Dimetilamino)propil-4-(4-fluoro-(2-((tetrahidro-2H-piran-4-il)metoxi)fenilamino)-5-metil-tieno[2.3-dlpirimidin-6carboxamida
26.1 Metil-4-(4-fluoro-2-((tetrahidro-2-H-piran-4-il)metoxi)fenilamino-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato Se disolvió 4-(4-fluoro-2-hidroxifenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (100 mg) en DMF (2 ml). Se añadieron 4-bromometiltetrahidropirano (107 mg) y carbonato de potasio (83 mg). La reacción se agitó a 60 ºC durante la noche. Después la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc y se lavó con agua y salmuera. El disolvente se retiró a vacío y el residuo se trituró con Et2O.
imagen91
Rendimiento: 130 mg Espectro de IEN: m/z = 432 (M+H)+
26.2 Ácido 4-(4-fluoro-2-((tetrahidro-2-H-piran-4-il)metoxi)fenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
imagen92
10 Se disolvió metil-4-(4-fluoro-2-((tetrahidro-2-H-piran-4-il)metoxi)fenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato (82 mg) y NaOH (2 M; 0,5 ml) en etanol (2 ml). La reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Después la reacción se diluyó con diclorometano y HCl (2 M). La suspensión se filtró, se lavó con salmuera y éter. El residuo se secó a vacío sobre P2O5.
Rendimiento: 41 mg
15 26.3 N-(3-(Dimetilamino)propil-4-(4-fluoro-2-((tetrahidro-2-H-piran-4-il)metoxi)fenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin6-carboxamida
imagen93
Se añadió HATU (36 mg) a una solución de ácido 4-(4-fluoro-2-((tetrahidro-2-H-piran-4-il)metoxi)fenilamino)-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (36 mg) y DIPEA (17 µl) en DMF (1 ml). La mezcla de reacción se agitó
20 durante 40 min a temperatura ambiente. Después se añadió 3-(dimetilamino)propilamina (49 µl). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Se diluyó con EtOAc y se lavó con agua y salmuera. La fase orgánica se concentró a vacío. El residuo se suspendió en Et2O, se filtró y se secó.
Rendimiento: 40 mg Espectro masas IEN: m/z = 502 (M+H)+
25
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Compuesto 29.4:
Preparado de forma análoga al ejemplo 29.3 usando ácido 4-(2-(2-hidroxietoxi)piridin-3-ilamino)-5-metiltieno[2,3d]pirimidin-6-carboxílico y la correspondiente amina.
Estructura
Nombre Rendimiento Masa Tiempo de Retención Procedimiento HPLC Amina
Clorhidrato de N-(3-(dimetilamino)propil)-4-(2-(2-hydroxietoxi) piridin-3-ilamino)-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6carboxamida
26 mg 431 1,54 004_CC_ ZQ6
Compuesto 30 4-(2-(2,2-Difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida.
30.1 Metil-4-(2-(2,2-difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato
imagen100
Preparado de forma análoga al ejemplo 28.1 a partir de 2-(2,2-difluoroetoxi)piridin-3-amina (171 mg) y éster metílico 10 de ácido cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (190 mg).
Rendimiento: 376 mg Tiempo de retención HPLC: 2,35 min Procedimiento HPLC: 002_CC_ZQ4
30.2 Ácido 4-(2-(2,2-difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
imagen101
15
Preparado de forma análoga al ejemplo 28.2 a partir de metil-4-(2-(2,2-difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato (376 mg).
Rendimiento: 220 mg Espectro de masas IEN: m/z = 367 (M+H)+ 20 Tiempo de retención HPLC: 1,91 min Procedimiento HPLC: 007_CC_ZQ7
30.4 4-(2-(2,2-Difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida
imagen102
Preparado de forma análoga al ejemplo 28.3 a partir de ácido 4-(2-(2,2-difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (36,6 mg) y amoníaco en dioxano (0,5 M; 2 ml).
Rendimiento: 18 mg
5 Espectro de masas IEN: m/z = 366 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 2,09 min Procedimiento HPLC: 004_CC_ZQ6
Análogos adicionales de 30:
Preparados de forma análoga al ejemplo 30.3 a partir de ácido 4-(2-(2,2-difluoroetoxi)piridin-3-ilamino)-510 metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico y la correspondiente amina.
imagen103
Compuesto 31 4-(2-(1-Etilamino)-1-oxopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxamida
31.1 Metil-4-(2-(1-terc-butoxi-1-oxopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato
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5 Se disolvió 4-(4-fluoro-2-hidroxifenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (100 mg) y carbonato de cesio (240 mg) en acetonitrilo (2 ml) y se añadió éster terc-butílico de ácido 2-bromopropiónico. La mezcla se agitó a 60 ºC durante 2h. Después la reacción se inactivó con agua y el precipitado se recogió por medio de filtración. La torta residual se lavó con agua y unas pocas gotas de metanol.
Rendimiento: 103 mg 10 Espectro de masas IEN: m/z = 462 (M+H)+
31.2 Ácido 2-(5-fluoro-2-(6-(metoxicarbonil)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)fenoxi)propanoico
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Preparado de forma análoga al ejemplo 8.1 usando metil-4-(2-(1-terc-butoxi-1-oxopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato (2,1 g) y ácido trifluoroacético al 50 % en diclorometano (20 ml).
Rendimiento: 1,9 mg Espectro de masas IEN: m/z = 406 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,96 min Procedimiento HPLC: A_9
31.3 Metil-4-(2-(1-etilamino)-1-oxopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato
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20
A una solución de ácido 2-(5-fluoro-2-(6-(metoxicarbonil)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)fenoxi)propanoico (500 mg) y TBTU (400 mg) en acetonitrilo (10 ml) se añadió trietilamina (430 µl). La mezcla se agitó durante 20 min. Después se añadió etilamina (2 M; 1,5 ml) y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Después la mezcla de reacción se diluyó con metanol y se purificó por medio de cromatografía.
25 Rendimiento: 360 mg Espectro de masas IEN: m/z = 433 (M+H)+
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Compuesto 32
4-(2-(1-(2-(Dimetilamino)etilamino)-1-oxopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
32.1 4-(2-(1-(2-(Dimetilamino)etilamino)-1-oxopropan-2-iloxi)-4-fluorofenilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxilato de metilo
imagen109
Preparado de forma análoga al ejemplo 32.3 a partir de ácido 2-(5-fluoro-2-(6-(metoxicarbonil)-5-metiltieno[2,3d]pirimidin-4-ilamino)fenoxi)propanoico (200 mg) y 2-dimetilaminoetilamina (70 µl).
Rendimiento: 136 mg
10 Espectro de masas IEN: m/z = 476 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 2,17 min Procedimiento HPLC: A_4
Compuestos 32.2 -32.35:
Etapa 1
15 Se disolvieron 4-(4-fluoro-2-hidroxifenilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (667 mg) y el correspondiente alcohol (por ejemplo, etilenglicol 3 eq = 372 mg) en THF (30 ml). Bajo atmósfera de nitrógeno, se añadieron trifenilfosfina (1,1 g) y azodicarboxilato de diisopropilo (844 µl) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante tres días. Se añadió una alícuota adicional del alcohol, azodicarboxilato de diisopropilo y trifenilfosfina y la reacción se agitó durante la noche. Después la mezcla de reacción se filtró y se lavó con
20 diclorometano:metanol 9:1. El filtrado se concentró a vacío y el residuo se purificó por medio de cromatografía para proporcionar los ésteres intermedios.
imagen110
Etapa 2:
Los ésteres intermedios (etapa 1) se disolvieron en una mezcla de metanol (10 ml)/THF (5 ml) y se añadió NaOH
25 (1 M; 5 ml). La reacción se agitó a temperatura ambiente durante tres días. El disolvente se concentró a vacío y el residuo se neutralizó con HCl (1 M; 5 ml) y el precipitado se recogió por medio de filtración. La torta filtrante se secó, se suspendió en acetonitrilo, se acidificó con HCl y se concentró a vacío para proporcionar los ácidos intermedios (a-I).
imagen111
Compuesto final
Producto intermedio R1 Tiempo de retención Procedimiento HPLC
32.2
a 2,69 004_CC_ZQ7
32.3
b 2,42 004_CC_ZQ6
32.4
c 2,76 004_CC_ZQ7
32.5
d 2,47 004_CC_ZQ7
32.6
e 2,8 004_CC_ZQ7
32.7
f 2,82 004_CC_ZQ7
32.8
g 2,55 004_CC_ZQ7
32.9
h 2,62 004_CC_ZQ7
32.10
i 2,86 004_CC_ZQ7
32.11
j 2,79 004_CC_ZQ7
(Continuación)
Compuesto final
Producto intermedio R1 Tiempo de retención Procedimiento HPLC
32.12
k 2,82 004_CC_ZQ7
32.13
l imagen112 2,68 003_CC_ZQ7
Etapa 3
Se disolvió el ácido y una base de Hünig (25 µl) en DMF (3 ml). Tras unos pocos minutos se añadió HATU (42 mg). A esta mezcla se añadió N,N-dimetil-1,3-propanodiamina (19 µl). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La mezcla se purificó por medio de cromatografía para proporcionar el compuesto 35.
imagen113
Los siguientes compuestos se sintetizaron de la siguiente manera: (Continuación) (Continuación)
Compuesto final
Producto intermedio NR2R3 Masa Tiempo de retención Procedimiento HPLC
32.14
a 456 1,98 002_CC_ZQ4
32.15
a imagen114 497 1,76 002_CC_ZQ4
32.16
b 486 1,78 002_CC_ZQ4
32.17
c 383 2,01 002_CC_ZQ4
32.18
c imagen115 427 2,00 002_CC_ZQ4
32.19
c 468 1,77 002_CC_ZQ4
Compuesto final
Producto intermedio NR2R3 Masa Tiempo de retención Procedimiento HPLC
32.20
d 453 2,07 002_CC_ZQ4
32.21
d 409 2,07 002_CC_ZQ4
32.22
d 494 1,82 002_CC_ZQ4
32.23
e 453 2,02 002_CC_ZQ4
32.24
e 494 1,79 002_CC_ZQ4
32.25
e 408 2,04 002_CC_ZQ4
32.26
f 464 1,80 002_CC_ZQ4
32.27
f 422 2,03 002_CC_ZQ4
32.28
f 378 2,05 002_CC_ZQ4
32.29
g 451 1,87 002_CC_ZQ4
32.30
g 407 1,89 002_CC_ZQ4
32.31
g 492 1,67 002_CC_ZQ4
32.32
h 363 1,97 002_CC_ZQ4
Compuesto final
Producto intermedio NR2R3 Masa Tiempo de retención Procedimiento HPLC
32.33
h 407 1,96 002_CC_ZQ4
32.34
h 448 1,73 002_CC_ZQ4
32.35
i 476 1,81 002_CC_ZQ4
32.36
i 435 2,06 002_CC_ZQ4
32.37
i 391 2,08 002_CC_ZQ4
32.38
j 500 1,80 002_CC_ZQ4
32.39
k 464 1,8 002_CC_ZQ4
32.40
l 514 2,71 003_CC_ZQ7
32.41
l 526 2,68 003_CC_ZQ7
32.42
l 540 2,81 003_CC_ZQ7
El ácido f y la base de Hünig (15 µl) se disolvieron en DMF (2 ml). Tras unos pocos minutos se añadió TBTU (21,2 mg). A esta mezcla se añadió la amina (0,07 mol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. La mezcla se purificó por medio de cromatografía.
imagen116
imagen117
33.3 Clorhidrato de 4-(2-((1-cianometil)ciclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-N-(3-(dimetilamino)propil)-5-metiltieno[2,3-dlpirimidin-6-carboxamida
imagen118
Preparado de forma análoga al ejemplo 32.3 usando ácido 4-(2-((1-(cianometil)ciclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-55 metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (42,5 mg) y N,N-dimetil-1,3-propanodiamina (17 mg).
Rendimiento: 42,7 mg Espectro de masas IEN: m/z = 480 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,69 min Procedimiento HPLC: 004_CC_ZQ6
10 Compuesto 33.4:
Preparado de forma análoga al ejemplo 32.3 usando ácido 4-(2-((1-(cianometil)ciclopropil)-metoxi)piridin-3-ilamino)5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico y amoníaco.
Estructura
Nombre Rendimiento Masa Tiempo de retención Procedimiento HPLC
imagen119
4-(2-((1-(cianometil)ciclopropil)metoxi)piridin3-ilamino)-5-metiltieno[2,3d]pirim idin-6-carboxamida 18,5 mg 395 2,00 004_CC_ZQ6
15 Compuesto 34
Clorhidrato de 4-(2-((2,2-difluorociclopropilmetoxi)piridin-3-ilamino)-N-(3-(dimetilamino)propil-5-metiltieno[2,3d]pirimidin-6-carboxamida
34.1 4-(2-((2,2-Difluorociclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo
imagen120
20 Preparado de forma análoga al ejemplo 32.1 usando 2-((2,2-difluorociclopropil)metoxi)piridin-3-amina (200 mg) y
éster metílico de ácido cloro-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (194 mg).
Rendimiento: 57 mg Tiempo de retención HPLC: 2,49 min Procedimiento HPLC: 004_CC_ZQ6
34.2 Ácido 4-(2-((2,2-difluorociclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
imagen121
Preparado de forma análoga al ejemplo 32 Etapa 2 usando 4-(2-(2,2-difluorociclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxilato de metilo (56 mg).
Rendimiento: 110 mg Tiempo de retención HPLC: 2,37 min Procedimiento HPLC: 004_CC_ZQ6
34.3 Clorhidrato de 4-(2-((2,2-difluorociclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-N-(3-dimetilamino)-5-metil-tieno[2,3d]pirimidin-6-carboxamida
imagen122
15 Preparado de forma análoga al ejemplo 32.3 a partir de ácido 4-(2-(2,2)difluorociclopropil)-metoxi)piridin-3-ilamino)-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (27 mg) y N,N-dimetil-1,3-propanodiamina (11 mg).
Rendimiento: 8,6 mg Espectro de masas IEN: m/z = 477 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,83 min
20 Procedimiento HPLC: 004_CC_ZQ6
Compuesto 34.4:
Preparado de forma análoga al ejemplo 32.3 usando ácido 4-(2-((2,2-difluorociclopropil)metoxi)piridin-3-ilamino)-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico.
Estructura
Nombre Rendimiento Masa Tiempo de retención Procedimient o HPLC
4-(2-((2,2difluorociclopropil)metoxi)-piridin-3ilamino)-5metiltieno[2,3d]pirimidin-6-carboxamida
4 mg 392 2,19 004_CC_ZQ6

Compuesto 39 Ácido 4-[2-(1-etilcarbamoil-etoxi)-4-fluoro-fenilamino]-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
imagen123
Al intermedio XVIII (0,36 g) en THF:metanol 1:1 (20 ml) se añadió hidróxido de sodio 1 M (2,00 ml) y se agitó a 50 ºC durante la noche. Después la mezcla se acidificó por medio de la adición de ácido clorhídrico y se concentró. El
residuo se diluyó con agua, se filtró y el sólido se lavó con dietiléter.
10
Rendimiento: Espectro de masas IEN: Tiempo de retención HPLC: Procedimiento HPLC: 0,30 g m/z = 419 (M+H)+ 2,65 min A_4
Compuesto 40
(3-Dimetil-amino-propil)-amida de ácido 4-[2(1-etilcarbamoil-etoxi)-4-fluoro-fenilamino]-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-615 carboxílico
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Preparado de forma análoga al ejemplo 5 usando ácido 4-[2-(1-etilcarbamoil-etoxi)-4-fluoro-fenilamino]-5metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (60 mg) y N,N-dimetil-1,3-propanodiamina (24 µl).
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El producto de 57.1 (115 mg) y TBTU (70 mg) se disolvieron en DMF (1,5 ml). Se añadió TEA (75 µl) y la mezcla se agitó durante 5 min a temperatura ambiente. Se añadió etanolamina (20 µl) y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Posteriormente, la mezcla se diluyó con metanol. La purificación se logró por medio de
5 cromatografía. Las fracciones combinadas se concentraron. Un mezcla de DCM:TFA = 50:50 se añadió al residuo y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 1 hora. Después la mezcla se concentró. Una solución de ácido clorhídrico se añadió y la mezcla se concentró.
Rendimiento: 70 mg Espectro de masas IEN: m/z = 491 (M+H)+
10 Tiempo de retención HPLC: 1,92 min Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 58
Éster metílico de ácido 4-{2-[1-(2-amino-etilcarbamoil)-etoxi]-4-fluoro-fenilamino}-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxílico
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58.1 Éster metílico de ácido 4-{2-[1-(2-terc-butoxicarbonilamino-etilcarbamoil)-etoxi-4-fluoro-fenilamino}-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
imagen138
Preparado de forma análoga al ejemplo 56.1 usando el producto de 55 (170 mg) y N-(2-aminoetil)carbamato de terc20 butilo (90 µl).
Rendimiento: 135 mg Espectro de masas IEN: m/z = 548 (M+H)+
58.2. Éster metílico de ácido 4-{2-[1-(2-amino-etilcarbamoil-etoxi]-4-fluoro-fenilamino}-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6carboxílico
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5
Preparado de forma análoga al ejemplo 56.2 usando el producto de 57.3 (170 mg).
Rendimiento: 28 mg Espectro de masas IEN: m/z = 448 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,83 min
10 Procedimiento HPLC: A_9
Compuesto 59
(2-Hidroxi-etil)amida de ácido 4-{2-[1-(2-amino-etilcarbamoil)-etoxi]-4-fluoro-fenilamino}-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin6-carboxílico
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15 59.1 Ácido 4-{2-[1-(2-terc-butoxicarbonilamino-etilcarbamoil)-etoxi]-4-fluoro-fenilamino}-5-metil-tieno[2,3-d]pirimidin-6carboxílico
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Preparado de forma análoga al ejemplo 57.1 usando el producto de 58 (90 mg).
Rendimiento: 73 mg Espectro de masas IEN: m/z = 534 (M+H)+
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Se agitaron amida de ácido 4-cloro-5-metil-tieno-[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico (intermedio XXIV) (100 mg), intermedio XXVI (120 mg) y ácido p-toluensulfónico (5 mg) en dioxano (2 ml) a 100 ºC durante 6 horas. Después, la mezcla se filtró. El sólido se lavó con metanol.
5 Rendimiento: 145 mg Espectro de masas IEN: m/z = 405 (M+H)+ Tiempo de retención HPLC: 1,245 min Procedimiento HPLC: M2-SB-C18
Compuesto 61
10 Éster metílico de ácido 4-[2-(1-etilcarbamoil-etoxi)-4-fluoro-fenilamino}-5-metiltieno[2,3-d]pirimidin-6-carboxílico
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Se disolvieron el producto de 55 (500 mg) y TBTU (400 mg) en ACN (10 ml). Se añadió TEA (430 µl) y la mezcla se agitó durante 20 min. a temperatura ambiente antes de añadir etilamina (1,5 ml). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante la noche. Después la mezcla se diluyó con metanol. La purificación se logró por medio de
15
cromatografía.
Rendimiento: Espectro de masas IEN: Tiempo de retención HPLC: Procedimiento HPLC:
360 mg m/z = 433 (M+H)+ 1,89 min A_9
20 Se preparó el siguiente compuesto de forma análoga al ejemplo 61 usando el producto de 55 y la correspondiente amina.
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En un ejemplo, el sustrato de quinasa puede tener elementos, diseñados o endógenos, para facilitar su unión o detección para generar una señal que sea adecuada para el análisis del estado de fosforilación de los sustratos. Estos elementos pueden ser, aunque sin limitación, una molécula de biotina o derivado de la misma, un resto de glutatión-S-transferasa, un resto de seis o más restos consecutivos de histidina, una secuencia de aminoácidos o
5 hapteno para que funcione como marca epitópica, un fluorocromo, una enzima o fragmento enzimático. El sustrato de quinasa puede ligarse a estos u otros elementos con un brazo espaciador molecular para evitar la impedancia estérica.
En otro ejemplo, el sustrato de quinasa puede marcarse con un fluoróforo. La unión del reactivo al sustrato marcado en solución puede seguirse mediante la técnica de polarización de fluorescencia como se describe en la bibliografía.
10 En una variación de este ejemplo, una molécula de seguimiento fluorescente puede competir con el sustrato por el analito para detectar la actividad quinasa mediante una técnica que es conocida para los expertos en la materia como polarización de fluorescencia indirecta.
En otro ejemplo más, se usa gama-ATP radiactiva en la reacción de quinasa, y el efecto del agente de ensayo sobre la incorporación de fosfato radiactivo en el sustrato de ensayo se determina respecto a condiciones de control.
15 Se ha demostrado que los compuestos de la invención muestran bajos valores de CI50 en ensayos de selección biológica in vitro como se describe en el ejemplo 2a para la inhibición de la actividad quinasa de Mnk 1 y/o Mnk 2. La siguiente tabla contiene los resultados de ensayo para compuestos ejemplares.
Ejemplo
CI50 de MNK2 [nM] Ejemplo CI50 de MNK2 [nM]
1-2
52 20-2 25
1-3
342 20-3 59
1-4
294 21-2 15
1-5
459 21-3 11
2-1
70 21-4 54
2-2
41 21-5 42
2-3
50 21-6 12
2-4
23 21-7 24
3-1
41 21-8 20
3-2
204 22-3 296
3-3
18 23-1 78
3-4
261 23-2 6
3-5
443 23-3 4
4
3144 23-4 8
5
230 23-5 13
6-1
164 23-6 10
6-2
90 23-7 17
7
14 23-8 8
8-1
- 23-9 7
8-2
64 23-10 7
9-2
577 24 7
(Continuación) (Continuación)
Ejemplo
CI50 de MNK2 [nM] Ejemplo CI50 de MNK2 [nM]
10-2
229 25 12
11-2
418 26-3 790
12
52 27-2 33
13
90 27-3 58
13-2
471 27-4 73
13-3
677 28-3 26
13-4
898 28-4 78
14
1017 28-5 93
15-2
174 29-3 86
16-2
8 29-4 288
16-3
74 30-2 20
16-4
44 30-3 18
17
- 30-4 48
18-2
691 30-5 57
19-1
1526 31-3 77
19-2
1166 31-4 19
20-1
142 31-5 11
31-6
13 33 47
31-7
20 33-4 16
32-1
267 34 54
32-2
19 34-4 15
32-3
- 39 19
32-4
13 40 20
32-5
8 41 31
32-6
23 42 70
32.7
5 43 62
32-8
- 44 24
32-9
13 45 20
32-10
18 46 84
32-11
14 47 125
32-12
12 48 12
32-13
- 49 8
32-14
65 50 13
Ejemplo
CI50 de MNK2 [nM] Ejemplo CI50 de MNK2 [nM]
32-15
78 51 10
32-16
66 52 25
32-17
16 53 7
32-18
30 54 11
32-19
23 55 5403
32-20
19 56 314
32-21
8 57 110
32-22
36 58 119
32-23
26 59 29
32-24
25 60 37
32-25
13 61 77
32-26
7 62 267
32-27
7 63 17
32-28
3
32-29
170
32-30
56
32-31
146
32-32
27
32-33
65
32-34
69
32-35
35
32-36
25
32-37
8
32-38
26
32-39
35
32-40
13
32-41
25
32-42
12
32-43
12
32-44
6
32-45
11
Procedimientos de HPLC:
Procedimiento A_10
Waters ZQ 2000; bomba Waters 1515; detector Waters PDA 996; inyector Waters 2747 DAD 200-420 nm 5 fases móviles:
A: Agua con ácido fórmico al 0,10 %
B: Acetonitrilo con ácido fórmico al 0,10 % tiempo en minutos % A % B caudal en ml/min 0,00 95 5 1,50 2,00 0 100 1,50 2,50 0 100 1,50 2,60 95 5 1,50
Fase estacionaria: X-terra EM C18; 4,6 x 30 mm * 2,5 µm
10 Procedimiento AC1
Waters ZQ 2000; bomba Waters 1515; detector Waters PDA 996; inyector Waters 2747 DAD 210-420 nm fases móviles:
A: Agua con ácido fórmico al 0,10 % 15 B: Acetonitrilo con ácido fórmico al 0,10 % tiempo en minutos % A % B caudal en ml/min 0,00 95 5 1,00 0,10 95 5 1,00 3,10 2 98 1,00
4,50 2 98 1,00 5,00 95 5 1,00
Fase estacionaria: X-terra EM C18; 4,6x30mm*2,5 µm
Procedimiento A_9
(procedimiento de conmutación pos/neg)
20 Waters ZQ 2000; bomba Waters 1515; detector Waters PDA 996; inyector Waters 2747 DAD 200-420 nm
fases móviles:
A: Agua con ácido fórmico al 0,10 %
B: Acetonitrilo con ácido fórmico al 0,10 % tiempo en minutos % A % B caudal en ml/min 0,00 95 5 1,50 2,00 0 100 1,50 2,50 0 100 1,50 2,60 95 5 1,50
25
imagen149
imagen150
Procedimiento 003_CC_ZQ6
Los análisis de EM RP-HPLC se han realizado en un espectrómetro de masas Waters ZQ2000, Alliance 2695, PDA2996 HP1100 HPLC + DAD (intervalo de longitud de onda (nm): 210 a 500) y As 2700 Fases móviles:
5 A: Agua con TFA al 0,10 %
B: MeOH tiempo en minutos % A % B caudal en ml/min 0,00 95 5 1,50 1,3 0 100 1,50 3,00 0 100 1,50 3,40 95 5 1,50
Fase estacionaria: Waters, Sunfire, C18, 3,5 µm, 4,6 x 50 mm. Temperatura de columna: constante a 40 ºC. 10 Detección de serie de diodo es al intervalo de longitud de onda de 210-500 nm.
Procedimiento 004_CC_ZQ6
Los análisis de EM RP-HPLC se han realizado en un espectrómetro de masas Waters ZQ2000, Alliance 2695, PDA2996 HP1100 HPLC + DAD (intervalo de longitud de onda (nm): 210 a 500) y 2700 As Fases móviles:
15 A: Agua con TFA al 0,1 %
B: MeOH tiempo en minutos % A % B caudal en ml/min 0,00 80202 1,7 0 1002 2,5 0 1002 2,6 80202
Fase estacionaria: Waters, Sunfire, C18, 3,5 µm, 4,6 x 50 mm. Temperatura de columna: 60 ºC. 20 Detección de serie de diodo es al intervalo de longitud de onda de 210-500 nm.
Procedimiento 004_CC_ZQ7
Los análisis de EM RP-HPLC se han realizado en un espectrómetro de masas Waters ZQ2000, Alliance 2695, PDA2996 HP1100 HPLC + DAD (intervalo de longitud de onda (nm): 210 a 500) y 2700 As Fases móviles:
25 A: Agua con TFA al 0,15 %
B: MeOH tiempo en minutos % A % B caudal en ml/min 0,00 95 5 1,5 1,5 955 1,5 2,0 0 100 1,5
Fase estacionaria: Waters, Sunfire, C18, 3,5 µm, 4,6 x 50 mm. Temperatura de columna: 40 ºC.
imagen151

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