ES2352849T3 - Procedimiento para almacenar adn usando quitosano, y productos que utilizan los procedimientos. - Google Patents
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Abstract
Un procedimiento para almacenar ADN en forma de complejo de quitosano/ADN preparado mezclando una disolución de ADN y una disolución de quitosano hidrosoluble, en el que el ADN es ADN genómico de animales, plantas, hongos, bacterias y virus, y el quitosano hidrosoluble tiene un grado de desacetilación del 60% o superior, y un peso molecular de 10 kDa a 500 kDa.
Description
Procedimiento para almacenar ADN usando
quitosano, y productos que utilizan los procedimientos.
La presente invención se refiere a un
procedimiento para almacenar ADN, un procedimiento para analizar el
ADN almacenado por el procedimiento anteriormente mencionado y a
productos que utilizan los procedimientos. Más concretamente, la
invención se refiere a un procedimiento para almacenar ADN en un
estado estabilizado a temperatura ambiente durante un tiempo
prolongado, a un procedimiento para analizar el ADN almacenado por
el procedimiento mencionado anteriormente y a una tarjeta de ID de
ADN, tal como una tarjeta de ADN, fabricada de papel o una tarjeta
de ADN fabricada de plástico, que se producen usando los
procedimientos de almacenamiento y análisis anteriormente
mencionados.
La suma de todos los genes presentes en los
organismos se denomina genomas. Se ha informado que el genoma
humano está compuesto por 3 mil millones de bases y que tiene
aproximadamente 30.000 genes. Recientemente, se ha completado el
proyecto genoma humano, desarrollado para decodificar las secuencias
de bases de todo el genoma humano, permitiendo de este modo acceder
a trascendentales mejoras en el diagnóstico y tratamiento de
enfermedades refractarias a los tratamientos, usando genes. Por así
decirlo, ha comenzado la era de la medicina personalizada y de las
medicina predictiva.
Los fenómenos de la vida están determinados por
tres cuestiones: (1) la información genética del ADN genómico, (2)
la transcripción de los genes y (3) las proteínas expresadas. Para
entender y analizar los fenómenos de la vida, y para desarrollar
procedimientos para diagnosticar y tratar enfermedades, es
importante analizar con precisión las tres cuestiones anteriormente
mencionadas. La suma de genes de un individuo se denomina genes o
genomas y, por consiguiente, la suma de los genes transcritos (es
decir, el ADNm) y la suma de las proteínas expresadas en un
individuo se denominan transcriptoma y proteoma, respectivamente.
Recientemente, los estudios sobre análisis automatizados de tal
información integral progresan de manera activa. Para la
automatización de los análisis, resulta útil una micromatriz o un
biochip en particular, y los ejemplos representativos de los mismos
incluyen un chip de ADN y un chip de proteínas.
Como procedimientos generales para el análisis
cualitativo y cuantitativo de la información genética del ADN
genómico, pueden mencionarse el análisis de hibridación, el análisis
de secuenciación, las micromatrices o chips de ADN, o similares,
por medio de PCR, PCR-RFLP (PCR de Polimorfismos de
Longitud de Fragmentos de Restricción), clonación y producción de
bibliotecas, transferencia southern o similares (Sambrook, J. &
Russell, D.W., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring
Harbor Press, (2001)).
Cuando se analiza el ADN de una persona, es
posible comprender la salud de la persona y dar un diagnóstico de
si la persona contrajo diversas enfermedades tales como cáncer o
infecciones, así como predecir la posibilidad de que en el futuro
presente brotes de enfermedades genéticas y la transmisión a los
hijos de dicha persona. Además, el análisis de ADN es el modo más
exacto para probar la identidad y el parentesco de una persona, tal
como la paternidad. También resulta útil para demostrar líneas o
árboles genealógicos. Por esa razón, el análisis de ADN se ha
utilizado de manera inevitable como medio en la medicina forense y
para discriminar la idoneidad en la donación de médula ósea, otros
órganos internos o similares. Además, el análisis de polimorfismos
de nucleótido único (SNP) puede ayudar a predecir la posibilidad que
se presenten en el futuro brotes de enfermedades, reacciones a
fármacos o similares.
Cuando se reconoció la necesidad de almacenar el
ADN para pruebas de ADN futuras, cada país ha establecido
fácilmente bancos de ADN, y el número de muestras en el banco de ADN
tiende a aumentar en gran parte debido a el almacenamiento de ADN
relacionado con los seguros de viajes o seguros de accidentes,
almacenamiento del ADN de las fuerzas armadas de EEUU o similares.
Sin embargo, el almacenamiento del ADN personal en una organización
nacional o en una organización comercial, puede tener un problema
tal como el uso inadecuado de la información genética personal. Por
otra parte, para almacenar el ADN de manera segura durante un tiempo
prolongado por medio de la tecnología existente, se necesitan
congeladores y reactivos específicos y, por consiguiente, el coste
para almacenar el ADN es importante.
De hecho, cuando el ADN separado y purificado a
partir de una célula se deja en reposo a temperatura ambiente,
puede presentarse el problema de la rápida degradación del ADN o la
segmentación por desoxirribonucleasa (DNAsa). Por consiguiente,
resulta importante un procedimiento para almacenar ADN para estudios
de genes. Actualmente, como procedimientos para almacenar o
transportar ADN, que se utilizan ampliamente, pueden mencionarse un
procedimiento para almacenar ADN en estado líquido purificando el
ADN separado del fluido corporal tal como sangre, células o
tejidos; un procedimiento de almacenamiento en un congelador; un
procedimiento de almacenamiento mediante liofilización; un
procedimiento de almacenamiento en alcohol
2-propílico; y similares (por ejemplo, Madisen y
col., J. Med. Genetics, 27(2), 1987, páginas.
379-390). Sin embargo, en estos procedimientos hay
muchas desventajas desde el punto de vista de costes y de pérdidas.
El procedimiento para almacenar el ADN purificado en estado líquido
resulta fácil para usar el ADN inmediatamente, pero existe el
problema de que el ADN se daña fácilmente cuando se almacena
durante un tiempo prolongado. El procedimiento para almacenar en un
congelador y el procedimiento de liofilización tienen el problema
de que el ADN puede dañarse por la repetida congelación y
descongelación en el proceso de utilización de la muestra. Además,
el procedimiento de almacenamiento usando un reactivo tal como
alcohol también resulta problemático en el proceso de pretratamiento
y postratamiento, así como otros procedimientos. Por otra parte, el
problema más importante en los procedimientos anteriores es que el
ADN debe purificarse primero del fluido corporal, tal como sangre,
para el almacenamiento.
Los procedimientos descritos anteriormente para
almacenar el ADN requieren equipamientos especiales, costosos,
tales como congeladores de temperatura ultra baja, nitrógeno
líquido, y similares. Por consiguiente, no resultan ventajosos
porque los procedimientos pueden imponer una carga desde el punto de
vista económico, los procedimientos requieren procesos de
pretratamiento y postratamiento cuando se reutiliza el ADN
almacenado para el análisis, y el procedimiento podría dañar el ADN
por los repetidos procesos de congelación y descongelación.
Además de los procedimientos mencionados
anteriormente, se introducen varios productos comercializados tales
como una tarjeta FTA o una tarjeta fabricada por Whatman plc., y
similares, con el fin de almacenar ADN de plásmido a temperatura
ambiente (por ejemplo, documento
US-A-5985327 publicado el 16 de
noviembre de 1999). Sin embargo, este procedimiento tiene
limitaciones en cuanto a su eficacia, y se sugiere almacenar el ADN
a -15ºC o a -20ºC en lugar de a temperatura ambiente, por
consiguiente no hay una gran ventaja sobre los procedimientos
originales, más bien resulta bastante desfavorable en lo que
respecta al aumento de costes.
Por consiguiente, es un objeto importante en el
campo de la genética molecular y la medicina desarrollar un posible
procedimiento para proteger el ADN de la descomposición por
desoxirribonucleasas por medio de la formación de un enlace estable
con el ADN, almacenar el ADN en un estado estabilizado a temperatura
ambiente, y además para aplicar directamente a los estudios y
análisis que usan ADN. Los procedimientos de almacenamiento ideales
deben incluir: (1) un procedimiento para almacenar de manera estable
a temperatura ambiente sin que se produzca degradación del ADN; (2)
un procedimiento que sea simple; (3) un procedimiento que sea
rentable; (4) el almacenamiento del ADN no debe ser sólo para el
mismo ADN separado y purificado, sino también para muestras que
contienen fluido corporal, tal como sangre y ADN diversos, que no
tengan daños en el ADN; (5) diversas muestras de ADN deben
almacenarse en un espacio limitado; (6) un individuo debe poder
almacenar su ADN personal; y (7) no debe haber ningún problema en
los análisis de los diversos genes en el futuro, y estas pruebas
genéticas deben ser útiles para el diagnóstico real o para
estudios. Sin embargo, no se han introducido hasta ahora los
procedimientos o productos que satisfagan estas condiciones, y no
se han podido hallar informes sobre productos para almacenar el ADN
personal junto con la información genética de las personas.
El quitosano es un polímero que se produce
biológicamente y que tiene excelentes características de
estabilidad, biodegradabilidad e idoneidad en un cuerpo vivo, y se
utiliza ampliamente en el campo de la medicina. Cuando el quitosano
se trata con un ácido, forma una sal de quitosano hidrosoluble que
pasa a tener una fuerte carga positiva, por consiguiente, en los
últimos años, se ha señalado a la sal de quitosano como un medio
importante de administración de fármacos, proteínas y moléculas de
ADN. En particular, las formas hidrosolubles del quitosano forman
un fuerte enlace con el ADN, que es una sustancia aniónica, para la
protección del ADN. Por consiguiente, el quitosano hidrosoluble
puede servir como una sustancia medio para administrar genes.
El quitosano es un copolímero de glucosamina y
N-acetilglucosamina y se obtiene a partir de la
quitina. La quitina se encuentra de manera abundante en crustáceos
tales como cangrejos y gambas, y es una sustancia de polímeros
naturales de mayor abundancia junto con la celulosa. Quitosano es un
término genérico de los polímeros catiónicos que se obtiene
sometiendo la quitina a desacetilación con una base fuerte
(Errington N., Harding S.E., Varum K.M., Illum L., Int. J. Biol.
Macromol., 15, 1123-1127 (1993)).
El quitosano no se disuelve a pH neutro o
básico, mientras que forma sales de quitosano o quitosano catiónico
cuando reacciona con ácidos tales como ácido glutámico, ácido
clorhídrico, ácido láctico o similares. La sal de quitosano se
disuelve en agua, y su solubilidad es proporcional al grado de
desacetilación y al pH. En el caso del quitosano hidrosoluble, se
transforma en un compuesto cargado positivamente por adición de un
protón a un grupo amina. Además, el quitosano hidrosoluble puede
pasar a un estado liofilizado.
El quitosano hidrosoluble tiene propiedades de
formación de una película o un gel con una fuerte carga positiva.
Al respecto, el quitosano se utiliza en purificadores para aguas muy
sucias, metales pesados y agua potable, y en sustancias
antifúngicas. También se lo utiliza como materia prima de bebidas,
alimentos saludables y cosméticos. Además, el quitosano se utiliza
como un medio importante en el campo farmacéutico. Por ejemplo, el
quitosano se utiliza muy ampliamente para la administración de
vacunas, para la administración de ADN, para facilitar la
administración de proteínas, péptidos y fármacos por medio de la
producción por purificación y un sistema de liberación controlada
del fármaco, un gel, una película, un agente humectante, un agente
de recubrimiento, una microesfera, una microcápsula, bioadhesivos y
una membrana mucosa, y similares (Illum L., Pharmaceutical Research,
15, 1326-1331 (1998)).
El quitosano es muy seguro y no muestra efectos
secundarios causados por inmunización. Cuando el quitosano se
absorbe en un cuerpo vivo, se degrada por medio de lisozima a
N-acetilglucosamina, tras lo que se utiliza en la
síntesis de glicoproteínas, y a continuación el residuo resultante
se descarga en forma de dióxido de carbono (Chandy T., Sharma CP.,
Biomat. Art. Cells Art. Org., 18, 1-24 (1990)).
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La propiedad más importante del quitosano
hidrosoluble o del quitosano catiónico según la invención es que
forma un fuerte enlace con el ADN, que es una sustancia aniónica, de
modo que puede utilizarse como una protección y un medio de
administración de ADN, a saber, como una sustancia para la
administración de genes. En el experimento de utilización de un ADN
de plásmido, se informa que el quitosano funciona conservando el ADN
de manera estable sin descomposición por medio de nucleasas de ADN,
tales como DNasa I y DNasa II, y que cuando se inyecta un complejo
de quitosano y ADN de plásmido en una célula cultivada in
vitro, provoca la expresión de un gen administrado (Lee M., Nah
J-W., Kwon Y., Koh J.J., Jo K.S., Kim S.W.,
Pharmaceutical Research, 18 (4), 427-531 (2001)).
El efecto de administración del gen está determinado por (1) el peso
molecular del quitosano y (2) la relación del quitosano al ADN, en
particular, la relación nitrógeno/fosfato de la molécula con fosfato
del ADN aniónico a la molécula con nitrógeno del quitosano
catiónico (Borchard G., Advanced Drug Delivering Reviews, 52,
145-150 (2001)).
Está informado que cuando un ADN de plásmido se
deja en reposo a temperatura ambiente como tal, el ADN de plásmido
se descompone durante varias horas; sin embargo, cuando un ADN de
plásmido se mantiene en forma de un complejo con quitosano, es
posible almacenar el ADN de plásmido durante 3 meses o más (Leong
K.W., Mao H.Q., Turong-Lee V.L., Roy K., Walsh
S.M., August J.T., J. controlled ReI., 53, 183-193
(1998)). Mientras tanto, ha habido un informe que indica que cuando
un complejo de quitosano y ADN de plásmido se almacena en estado
liofilizado, el efecto de administración del gen puede mantenerse
hasta después de 4 semanas (Mao H.Q., Turong-Lee
V.L., August J.T., Leong K.W., Proc. Intl. Symp. Control. ReI.
Bioact. Mater., 24, 671-772 (1997)).
No obstante, no se han informado hasta el
momento estudios sobre la posibilidad de almacenar de manera estable
ADN genómico grande de un mamífero con quitosano ni tampoco
estudios sobre la posibilidad de almacenar de manera estable el ADN
con quitosano durante un tiempo prolongado a temperatura ambiente.
Además, no se han fabricado productos producidos para almacenar ADN
usando quitosano. Tampoco se ha informado la posibilidad de
realizar un análisis de la expresión genética usando el ADN unido a
quitosano ni el tema de almacenar el ADN en una forma mixta de
quitosano y fluido corporal, en lugar del ADN solo, tal como la
sangre. Además, no se han lanzado productos para almacenar,
transportar y analizar el ADN genómico de un ser humano o un animal
usando quitosano, diferentes de los productos de la invención.
Un aspecto de la invención es que proporciona un
procedimiento para almacenar y transportar una muestra de ADN en un
estado estabilizado a temperatura ambiente usando quitosano
hidrosoluble.
Otro aspecto de la invención es que proporciona
un complejo de quitosano hidrosoluble y ADN estabilizado que puede
utilizarse en diversos procedimientos de análisis de ADN.
Otro aspecto de la invención, según el
procedimiento para almacenar ADN que usa quitosano de la invención,
es que proporciona una disolución de quitosano con una propiedad y
una concentración adecuadas, que puede formar un enlace estable con
el ADN para posibilitar el transporte y el almacenamiento del ADN
durante un tiempo prolongado a temperatura ambiente, el estudio y
el análisis el ADN de manera fácil y su fácil aplicación.
Aún otro aspecto de la invención es que
proporciona un procedimiento para la preparación de una tarjeta de
papel que contiene quitosano (una tarjeta de ADN) que puede
almacenar quitosano y ADN combinados en estado líquido y un número
de muestras de ADN en un espacio mínimo, un procedimiento para
realizar un análisis genético tal como PCR,
PCR-RFLP, clonación, análisis de secuencias y
transferencia southern, pruebas de micromatrices y similares, y un
procedimiento para separar el quitosano y el ADN de su estado
combinado. En este caso, la tarjeta de ADN puede clasificarse en
gran medida en Tipo 1 y Tipo 2: el Tipo 1 conserva el ADN mismo en
una tarjeta de papel que contiene quitosano, y el Tipo 2 conserva
la muestra biológica que contiene el ADN, tal como sangre, en lugar
del ADN mismo, en una tarjeta de papel que comprende quitosano y un
tampón de lisis celular. En ambos casos, el objetivo es almacenar
el ADN en estado estabilizado durante un tiempo prolongado a
temperatura ambiente y realizar diversos análisis genéticos a partir
de entonces, de ser necesario.
Otro aspecto de la invención es que proporciona
una tarjeta de identificación de ADN (tarjeta de ID de ADN) en la
que la muestra de ADN de un individuo se conserva en forma de una
mezcla con quitosano, y la información genética de un individuo
obtenida realizando pruebas tales como una pruebas genéticas para la
identificación personal, pruebas de genotipado HLA, o similares, se
guarda en una barra magnética o un chip en la tarjeta de plástico.
La tarjeta de ID de ADN de plástico puede utilizarse para almacenar
información personal tal como diferentes tarjetas de crédito y
tarjetas de débito, tarjetas de entrada a organizaciones
importantes, biopasaporte, fuerzas militares o similares, o para
compartir la información genética para un transplante de órganos,
tal como un transplante de médula ósea.
En la invención, se estudió un nuevo
procedimiento para almacenar ADN genómico grande de animales y
plantas, y como resultado, se confirmó que cuando el quitosano
hidrosoluble se mezcla con el ADN, se forma un enlace estable que
protege al ADN de la descomposición por las desoxirribonucleasas y
puede almacenarse durante un tiempo prolongado en un estado
estabilizado a temperatura ambiente, y de este modo se completa la
invención.
Las condiciones a alcanzar por los
procedimientos y los productos de la invención son las
siguientes:
1) El ADN debe almacenarse en un estado
estabilizado sin degradación a temperatura ambiente;
2) Las muestras de ADN del presente documento
deben incluir ADN genómico de seres humanos, animales, plantas y
bacterias;
3) el procedimiento debe ser simple y no debe
requerir equipamientos o instrumentos especiales para su uso;
4) el coste debe ser económico;
5) el almacenamiento del ADN no sólo debe ser
para el ADN mismo separado y purificado, sino también para las
muestras biológicas que contienen fluido corporal, tal como la
sangre y diversos ADN que no presenten daños en el ADN;
6) la muestra de ADN de almacenarse usando un
medio simple tal como un papel o una tarjeta;
7) debe almacenarse un número de muestras de ADN
en un espacio limitado;
8) un individuo debe poder almacenar su ADN
personal;
9) con respecto a las muestras de ADN, que se
almacenaron y transportaron mediante los procedimientos y productos
mencionados anteriormente, deben poder realizarse en las mismas
diversos análisis genéticos tales como PCR,
PCR-RFLP, hibridación, análisis de secuenciación,
análisis de SNP y similares, de manera precisa y simple incluso
después de un tiempo prolongado, y deben ser útiles para estudios
así como para diversos exámenes clínicos; y
10) la tarjeta de ID de ADN debe funcionar como
banco de ADN para almacenar el ADN personal y también para almacenar
junto con la misma la información genética de la persona.
\vskip1.000000\baselineskip
A continuación, en el presente documento se
describirá la invención de manera detallada en referencia a los
dibujos.
La Fig. 1 es un diagrama de bloques que ilustra
el proceso de fabricación y análisis de un producto unido de ADN y
quitosano hidrosoluble según la invención. Cuando se examinó el
proceso para fabricar el producto unido de ADN y quitosano
hidrosoluble, con referencia a la Fig. 1, en primer lugar, se
estableció la condición óptima para la unión del ADN y el quitosano
hidrosoluble, y se analizó el efecto de protección contra las
nucleasas de ADN y el cambio de movilidad de la mezcla de ADN y
quitosano (S101). A continuación, con respecto a la mezcla de ADN y
quitosano en estado líquido, se llevaron a cabo análisis de ensayos
de PCR y el efecto del almacenamiento del ADN (S102). Usando los
resultados anteriores, se fabricó la tarjeta de ADN de Tipo 1 y se
llevaron a cabo análisis de los ensayos de PCR y el efecto del
almacenamiento del ADN (S103). De la misma manera, se fabricó la
tarjeta de ADN de Tipo 2, y se llevaron a cabo análisis de los
ensayos de PCR y el efecto del almacenamiento del ADN (S104). Se
analizó la posibilidad de realizar análisis genéticos basándose en
las muestras almacenadas durante un tiempo prolongado en las
tarjetas de ADN de Tipo 1 y de Tipo 2 fabricadas anteriormente
(S105). Posteriormente, se fabricó un kit de PCR del tipo todo
incluido que contenía quitosano y se analizó la disponibilidad del
mismo (S106). A continuación, se fabricó una tarjeta de ID de ADN de
plástico (S107).
En la invención, para formar un complejo estable
con ADN, para proteger el ADN de la descomposición por medio de
desoxirribonucleasas, y para almacenar el ADN en un estado
estabilizado a temperatura ambiente, se usó una disolución de
quitosano hidrosoluble con una propiedad y concentración adecuadas,
una tarjeta de papel o un kit de PCR que contenía tal disolución y
una tarjeta de ID de ADN de plástico, y similares.
Resulta de preferencia que el quitosano
utilizado en la invención tenga un peso molecular de 10 a 500 kDa.
El quitosano que tiene peso molecular inferior a 10 kDa presenta
problemas para formar un enlace estable con el ADN, y el quitosano
que tiene peso molecular superior a 500 kDa puede interferir con el
análisis de la expresión del gen al usar el ADN. Además, resulta de
preferencia el quitosano con un grado de desacetilación del 60% o
superior, y cuando el grado de desacetilación es inferior al 60%, se
produce un problema en la solubilidad del quitosano con el agua,
por consiguiente resulta difícil formar un enlace estable con el
ADN. La concentración de una disolución acuosa de quitosano
preparada, en términos de relación de peso a volumen (peso/volumen),
es del 0,02% hasta el 1%, y de preferencia del 0,1%. La relación de
la mezcla al momento de mezclar una disolución acuosa de quitosano
y una disolución acuosa de ADN, en términos de la relación de peso
de quitosano en la disolución acuosa de quitosano al ADN en la
disolución acuosa de ADN, es de 1:0,5 o superior, y de preferencia
de 1:0,5 a 1:3 (Ejemplos 1 y 2).
El producto unido de ADN/quitosano según la
invención se conserva a una temperatura que va desde la temperatura
ambiente hasta -70ºC, que es un intervalo muy amplio, y se almacena
en un lugar oscuro sin humedad.
Mientras tanto, el ADN almacenado en una forma
unida con el quitosano hidrosoluble según la invención se conserva
de manera estable incluso si se produce degradación por
desoxirribonucleasas, por consiguiente puede utilizarse para
análisis genéticos (véase Ejemplo 2).
Según la invención, los ADN que pueden
almacenarse en una mezcla con quitosano incluyen ADN genómicos de
seres humanos, animales o plantas, y de bacterias. El tamaño del ADN
que puede almacenarse en una mezcla con quitosano varía desde varias
decenas a varios miles de millones de bases.
Mientras tanto, una mezcla líquida de ADN unido
con el quitosano hidrosoluble según la invención se conserva de
manera estable, y la eficacia de un procedimiento para conservar el
ADN de la invención se confirmó fácilmente realizando pruebas tales
como reacción en cadena de la polimerasa (PCR), clonación,
transferencia, análisis de secuenciación y similares.
Según la invención, puede prepararse una tarjeta
para almacenar ADN (tarjeta de ADN de Tipo 1) por medio de la
mezcla de una concentración apropiada de quitosano y un ácido úrico
(en concreto, la relación de volúmenes de la mezcla de 0,1% hasta
1% (p/v) de la disolución de quitosano hidrosoluble a la
concentración de 0,5 mM hasta 20 mM del ácido úrico es de 1:1), por
adsorción de la mezcla sobre un papel para transferencia y por
secado. Usando la tarjeta mencionada anteriormente, puede
almacenarse una cantidad de ADN durante un tiempo prolongado y
puede transportarse en un espacio mínimo a temperatura ambiente.
Como papel utilizado en la preparación de la tarjeta para almacenar
ADN, pueden utilizarse diversos papeles para cromatografía o papeles
para transferencia que pueden utilizarse en el comercio, y el
espesor del papel es de preferencia de aproximadamente 0,3 mm hasta
1,2 mm. La temperatura de almacenamiento adecuada de la tarjeta para
almacenar el ADN es la temperatura ambiente, pero es admisible
bajar la temperatura hasta -20ºC y hasta -70ºC, y es posible
almacenar a temperatura ambiente durante 6 meses o más (Ejemplo
5).
Cuando se lleva a cabo la PCR en la invención,
en el caso en el que la mezcla de ADN y quitosano es un líquido, se
utiliza la mezcla misma como molde, y en el caso en el que se
encuentre en forma de tarjeta, se corta un fragmento de la tarjeta
y se utiliza como plantilla para realizar un procedimiento general
de amplificación por PCR, clonación y de análisis de secuenciación.
Por consiguiente, se confirmó que el ADN se conservó de manera
suficientemente estable para llevar a cabo el procedimiento de
análisis genético usando el ADN almacenado según el procedimiento de
la invención (Ejemplo 5).
Según la invención, puede prepararse una tarjeta
para almacenar ADN (tarjeta de ADN de Tipo 2) por adsorción de una
mezcla de una disolución de quitosano apropiada con un tampón de
lisis celular que comprende Tris, EDTA, SDS y ácido úrico (en
concreto, Tris (8 mM), EDTA (0,5 mM), SDS (al 0,1% p/v) y ácido
úrico (2 mM)) sobre un papel para transferencia, y por secado.
Usando la tarjeta mencionada anteriormente, puede almacenarse el
ADN durante un tiempo prolongado y transportarse a temperatura
ambiente en un estado de muestra biológica que contiene ADN, tal
como la sangre (Ejemplo 6).
Mientras tanto, el ADN almacenado usando la
tarjeta de ADN de la invención se conserva de manera estable, y por
lo tanto pueden realizarse en el futuro pruebas tales como PCR,
PCR-RFLP, clonación, análisis de secuenciación y
similares (Ejemplos 7 a 10).
Además, para realizar la transferencia southern,
el complejo de ADN y quitosano debe separarse para que el ADN pueda
desplazarse en el gel de agarosa. Por consiguiente, el ADN se separa
usando una sal catiónica a base de sulfato que no daña el ADN y que
no tiene efectos sobre los resultados de la transferencia southern.
Ejemplos de la sal catiónica a base de sulfato mencionada
anteriormente incluyen dodecilsulfato de sodio (SDS), octilsulfato
de sodio (SOS) o bromuro de cetiltrimetil amonio (CTAB) (Ejemplo
9).
Como una aplicación del procedimiento de
almacenamiento de ADN usando quitosano de la invención, se preparó
un kit de PCR en el que se añadió la polimerasa Taq, un cebador,
dNTP y tampón, y similares, a un tubo con quitosano (tubo con todo
incluido), y se añadió una muestra tal como ADN o suero al tubo para
dar lugar a la reacción de PCR. De modo característico, este kit de
PCR puede utilizarse tanto para el almacenamiento del ADN como para
el ensayo de PCR (Ejemplo 11).
Además, la invención proporciona una tarjeta de
ID de ADN en la que se conserva la muestra de ADN de un individuo
en forma de mezcla con quitosano, y se guarda la información
genética de un individuo, obtenida realizando un ensayo genético
para la identificación personal o una prueba de genotipado de HLA en
una barra magnética en la tarjeta de plástico (Ejemplos 12 y 13).
La tarjeta de ID de ADN de plástico puede utilizarse como banco de
ADN personal así como un banco personal de información genética para
identificación personal, transplante de órganos personal,
diagnóstico clínico personal o similares.
La Fig. 1 es un diagrama de bloques que muestra
un procedimiento para producir y analizar un producto complejo de
ADN y quitosano hidrosoluble según la presente invención.
La Fig. 2 es una fotografía de la electroforesis
en un gel de agarosa al 0,8% para un complejo ADN/quitosano, que se
obtuvo mezclando ADN genómico aislado de monocito normal de adulto
en una concentración de 1 \mug/\mul y una disolución de
quitosano hidrosoluble en diversas concentraciones con diversas
relaciones (Carril 1: marcador de tamaño (1 kb), Carril 2: solamente
ADN, Carril 3: 0,02% (p/v) de la disolución de quitosano
hidrosoluble:disolución acuosa de ADN = 1:0,2, Carril 4: 0,02% (p/v)
de la disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:0,4,
Carril 5: 0,02% (p/v) de la disolución de quitosano:disolución
acuosa de ADN = 1:0,6, Carril 6: 0,1% (p/v) de la disolución de
quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:1, Carril 7: 0,1% (p/v) de la
disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:2, Carril 8:
0,1% (p/v) de la disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN =
1:3, Carril 9: 0,25% (p/v) de la disolución de quitosano:disolución
acuosa de ADN = 1:2,5:, Carril 10: 0,25% (p/v) de la disolución de
quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:5, Carril 11: 0,25% (p/v) de
la disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:7,5).
La Fig. 3 es una fotografía de la electroforesis
en gel de agarosa al 0,8% para un complejo ADN/quitosano, que se
obtuvo mezclando un ADN de plásmido
(pCMV-beta-galactosidasa) con un
tamaño de 4,0 kb en una concentración de 1 \mug/\mul y una
disolución de quitosano hidrosoluble en diversas concentraciones con
diversas relaciones (Carril 1: marcador de tamaño (1 kb), Carril 2:
solamente ADN, Carril 3: 0,02% (p/v) de la disolución de quitosano
hidrosoluble:disolución acuosa de ADN = 1:0,2, Carril 4: 0,02% (p/v)
de la disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:0,4,
Carril 5: 0,02% (p/v) de la disolución de quitosano:disolución
acuosa de ADN = 1:0,6, Carril 6: 0,1% (p/v) de la disolución de
quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:1, Carril 7: 0,1% (p/v) de la
disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:2, Carril 8:
0,1% (p/v) de la disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN =
1:3, Carril 9: 0,25% (p/v) de la disolución de quitosano:disolución
acuosa de ADN = 1:2,5: , Carril 10: 0,25% (p/v) de la disolución de
quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:5, Carril 11: 0,25% (p/v) de
la disolución de quitosano:disolución acuosa de ADN = 1:7,5).
La Fig. 4 es una fotografía que compara y
analiza un grado de escisión de ADN en un gel de agarosa al 1% por
tratamiento con desoxirribonucleasa (DNAsa I) para ADN genómico de
linfocito humano unido a quitosanos, y ADN no unido a quitosano
(Carril 1: marcador de tamaños (escalera de 1 kb), Carril 2:
solamente ADN, Carril 3: complejo quitosano/ADN, tras 20 minutos,
Carril 4: complejo quitosano/ADN, tras 40 minutos, Carril 5:
complejo quitosano/ADN, tras 60 minutos, Carril 6: ADN no unido a
quitosano, tras 20 minutos, Carril 7: ADN no unido a quitosano, tras
40 minutos, Carril 8: ADN no unido a quitosano, tras 60
minutos).
La Fig. 5 es una fotografía que representa los
resultados de la electroforesis en gel de agarosa al 0,8% de
realizar la PCR para genes de beta-Actina con un
molde de complejos de ADN/quitosano, que se obtuvo mezclando una
disolución de quitosano al 0,1% (p/v) y una concentración 1
\mug/\mul de una disolución acuosa de ADN genómico de leucocito
humano en una relación de volúmenes de 1:1, y el ADN genómico de
leucocito humano no unido a quitosano, respectivamente (Carril 1:
marcador de tamaño (100 pb), Carril 2: control negativo, Carril 3:
control positivo (se analizó directamente el ADN genómico de
leucocito), Carril 4: análisis tras depositar el ADN genómico sobre
la tarjeta de ADN (Tipo 1) y a continuación almacenarla a
temperatura ambiente durante un año, Carril 5: análisis tras
depositar sangre sobre la tarjeta de ADN (Tipo 2) y a continuación
almacenar a temperatura ambiente durante un año, Carril 6: análisis
tras adsorber sangre sobre el papel para transferencia y a
continuación almacenar a temperatura ambiente durante un año, y
Carril 7: análisis tras adsorber ADN genómico de leucocito sobre el
papel para transferencia y a continuación almacenar a temperatura
ambiente durante un año).
La Fig. 6 es una fotografía que representa los
resultados de la electroforesis en gel de agarosa al 0,8% de
realizar la PCR para genes de beta-Actina con un
molde de complejos de ADN/quitosano, que se obtuvo mezclando una
disolución de quitosano al 0,1% (p/v) y una concentración 1
\mug/\mul de una disolución acuosa de ADN genómico de leucocito
humano en una relación de volúmenes de 1:1, y ADN no unido a
quitosanos, que se almacenaron ambos durante varios tiempos y a
varias temperaturas (Carril 1: marcador de tamaño (100 pb), Carril
2: control negativo, Carril 3: control positivo (ADN que se aisló y
se purificó a partir de sangre, y a continuación se realizó
directamente la PCR para el mismo), Carril 4: solamente ADN que se
había almacenado a -70ºC durante tres meses, Carril 5: solamente ADN
que se había almacenado a temperatura ambiente durante una semana,
Carril 6: solamente ADN que se había almacenado a temperatura
ambiente durante un mes, Carril 7: complejo ADN/quitosano que se
había almacenado a temperatura ambiente durante tres semanas, Carril
8: complejo ADN/quitosano que se había almacenado a temperatura
ambiente durante tres meses, Carril 9: complejo ADN/quitosano que se
había almacenado a temperatura ambiente durante un año, Carril 10:
tarjeta de ADN de Tipo 1 con el ADN que se había goteado sobre la
misma, que se había almacenado a temperatura ambiente durante tres
semanas, y Carril 11: tarjeta de ADN de Tipo 1 con el ADN que se
había goteado sobre la misma, que se había almacenado a temperatura
ambiente durante tres meses).
La Fig. 7 es una fotografía de la electroforesis
en gel de agarosa que representa los resultados de comparar y
analizar cada una de las tarjetas de ADN por PCR, que se fabricaron
adsorbiendo quitosano en diferentes tipos de papeles de
transferencia y dejándolos secar para preparar la tarjeta de ADN de
Tipo 1, depositando ADN de leucocito de adulto normal en la misma
con una pipeta, y a continuación almacenándolas a temperatura
ambiente durante 6 meses (Carril 1: marcador de tamaño (100 pb),
Carril 2: control negativo, Carril 3: control positivo (ADN que se
aisló y se purificó directamente a partir de sangre), Carril 4:
tarjeta de ADN que se había tratado con disolución de quitosano al
0,02% sobre papel de transferencia de 0,3 mm de espesor, Carril 5
del ADN: tarjeta de ADN que se había tratado con disolución de
quitosano al 0,02% sobre papel de transferencia de 0,9 mm de
espesor, Carril 6: tarjeta de ADN que se había tratado con
disolución de quitosano al 0,1% sobre papel de transferencia de 0,3
mm de espesor, Carril 7: tarjeta de ADN que se había tratado con
disolución de quitosano al 0,1% sobre papel de transferencia de 0,9
mm de espesor, Carril 8: tarjeta de ADN que se había tratado con
disolución de quitosano al 0,25% sobre papel de transferencia de 0,3
mm de espesor, Carril 9: tarjeta de ADN que se había tratado con
disolución de quitosano al 0,25% sobre papel de transferencia de 0,9
mm de espesor, Carril 10: tarjeta de ADN sin tratamiento sobre el
papel de transferencia de 0,3 mm de espesor, y Carril 11: tarjeta de
ADN sin tratamiento sobre el papel de transferencia de 0,9 mm de
espesor.
La Fig. 8 muestra los resultados de una prueba
de genotipado usando el ensayo RFLP tras la PCR para una muestra de
ADN genómico humano, que se había almacenado usando quitosano
hidrosoluble y la tarjeta de ADN de Tipo 1 de la presente invención
((a): control positivo, una muestra de ADN aislada y purificada
directamente a partir de leucocito de adulto, (b): una muestra de
ADN aislada y purificada directamente a partir de leucocito de
adulto, y mezclada con la disolución de quitosano de la presente
invención, y almacenada a temperatura ambiente durante tres meses,
(c) una muestra de ADN aislada y purificada a partir de leucocito de
adulto, colocada en la tarjeta de ADN de Tipo 1 de la presente
invención para su almacenamiento, y almacenada a temperatura
ambiente durante un año) (Carriles 1 y 12: marcador de tamaño de 100
pb, Carril 11: marcador de tamaño de 25 pb, Carriles 2 y 3: ensayos
para gentes de Apolipoproteína E (apo E), Carriles 4 y 5: ensayos
para genes de angiotensinógeno (AGT), Carriles 6 y 7: ensayos para
genes de enzima de conversión de angiotensina (ACE), Carril 8:
ensayo para el gen del receptor 1 de angiotensina (AT1R), Carriles 9
y 10: ensayos para genes de óxido nítrico sintasa endotelial (eNOS),
y Carriles 13 y 14: ensayos para genes de MTHFR).
La Fig. 9 muestra los resultados de una prueba
de genotipado usando el ensayo PCR-RFLP para las
muestras de la tarjeta de ADN de Tipo 2 de la presente invención,
que se almacenaron absorbidas sobre la misma ((a): control positivo,
una muestra de ADN aislada y purificada directamente a partir de
leucocito de adulto, (b): una muestra de ADN que se produjo
adsorbiendo sangre de adulto sobre la tarjeta de ADN de Tipo 2 de la
presente invención y almacenándola a temperatura ambiente durante
tres meses, (c) una muestra de ADN que se produjo adsorbiendo sangre
de adulto en la tarjeta de ADN de Tipo 2 de la presente invención y
almacenándola a temperatura ambiente) (Carriles 1 y 8: marcadores de
tamaño de 100 pb, Carriles 7 y 15: marcadores de tamaño de 25 pb,
Carriles 2 y 3: genes de angiotensinógeno, Carriles 4 y 5: genes de
enzima de conversión de angiotensina (ACE), Carril 6: gen del
receptor 1 de angiotensina (AT1R), Carriles 9 y 10: genes de óxido
nítrico sintasa endotelial (eNOS), Carriles 11 y 12: Genes de MTHFR,
y Carriles 13 y 14: genes de Apolipoproteína E (Apo E)).
La Fig. 10 es un gráfico que representa los
resultados de la búsqueda del gen de APC (poliposis cólica
adenomatosa) por ensayo automático de secuenciación de bases, para
el que se realizó PCR, con un molde de ADN genómico de tejido cólico
de adulto, que se mezcló con la disolución de quitosano hidrosoluble
según el procedimiento de la presente invención, y se almacenó a
temperatura ambiente durante un mes, y cuyo producto se clonó.
La Fig. 11 es un gráfico que representa los
resultados de la búsqueda del gen p53 por ensayo automático de
secuenciación de bases, para el que se realizó PCR, con un molde de
ADN genómico de tejido de cáncer de pulmón, que se había depositado
sobre la tarjeta de ADN de la presente invención según el
procedimiento y se había almacenado a temperatura ambiente durante
tres meses, y cuyo producto se clonó.
La Fig. 12 es una fotografía de la
electroforesis en gel de agarosa que representa los resultados del
aislamiento de quitosano y el ADN de un complejo de quitosano y ADN
usando SDS (Carril 1: marcador de tamaño (100 pb), Carril 2:
solamente ADN, Carril 3: disolución de quitosano al 0,1%
(p/v)/disolución acuosa de ADN (1 \mug/\mul), Carril 4: complejo
de disolución de quitosano al 0,1% (p/v)/disolución acuosa de ADN (1
\mug/\mul), que se había tratado con SDS al 0,1% (p/v), Carril
5: complejo de disolución de quitosano al 0,1% (p/v)/disolución
acuosa de ADN (1 \mug/\mul), que se había tratado con SDS al 1%
(p/v), y Carril 6: complejo de disolución de quitosano al 0,1%
(p/v)/disolución acuosa de ADN (1 \mug/\mul), que se había
tratado con SDS al 5% (p/v).
La Fig. 13 es una fotografía de la realización
de la transferencia Southern para el gen K-ras con
un molde de un complejo ADN/quitosano, que se obtuvo mezclando una
disolución acuosa de ADN genómico (1 \mug/\mul) del tejido de
cáncer pancreático y disolución de quitosano al 0,1% (p/v) en una
relación de volúmenes de 1:1 según el procedimiento de la presente
invención, y almacenándolo a temperatura ambiente durante tres meses
(Carril 1: ADN del tejido de cáncer pancreático que se había
almacenado a temperatura ambiente durante un mes, Carril 2: un
complejo de ADN de tejido de cáncer pancreático/disolución de
quitosano que se había almacenado a temperatura ambiente durante un
mes, Carril 3: ADN obtenido de leucocito de sangre periférica de ser
humano normal, que se había almacenado a -70ºC durante un mes, y
Carril 4: ADN obtenido de leucocito de sangre periférica de ser
humano normal, que se había almacenado a temperatura ambiente
durante un mes).
La Fig. 14 es un diagrama de flujo que muestra
un procedimiento para preparar una tarjeta de ID de ADN de plástico
que se fabricó usando la tarjeta de ADN de la presente
invención.
La Fig. 15 es un esquema que muestra un
procedimiento para identificar el genotipo personal usando 15
combinaciones de pruebas STR (repeticiones cortas en tándem), y
preparar un perfil del genotipo personal, y codificar los datos del
genotipo personal. Es un esquema de un ejemplo de la tarjeta de ID
de ADN de plástico de la presente invención.
La Fig. 16 es un esquema que muestra que la
tarjeta de ADN de Tipo 1 o de Tipo 2 se incorpora en la parte
interior de la tarjeta de PVC en el procedimiento de preparación de
la tarjeta de ID de ADN de la presente invención.
La Fig. 17 es un esquema de un ejemplo de la
tarjeta de ID de ADN de plástico de la presente invención.
La Fig. 18 es un esquema de un ejemplo de
codificación de la información en la tarjeta de ID de ADN de la
presente invención.
\newpage
La Fig. 19 muestra los resultados de la
comparación de amplificaciones por PCR del gen eNOS, que es uno de
los genes de enfermedades geriátricas, en una tarjeta de ID de ADN
de plástico (para sangre) que se preparó a temperatura elevada y
presión elevada, cuando la sangre y el ADNg se almacenaron en la
tarjeta de ID de ADN de plástico (Carriles 1 y 7: marcadores de
tamaño (100 pb), Carril 2: tarjeta de ID de ADN sobre la que se
había depositado sangre (para sangre), Carril 3: tarjeta de ID de
ADN sobre la que se había depositado ADNg (para sangre), Carril 4:
tarjeta de ID de ADN (para sangre) sobre la que se había depositado
sangre, y un revestimiento de plástico, Carril 5: tarjeta de ID de
ADN (para sangre) sobre la que se había depositado ADNg, y un
revestimiento de plástico, y Carril 6: control negativo).
La Fig. 20 muestra los resultados de las
amplificaciones por PCR del gen eNOS, que es uno de los genes de
enfermedades geriátricas, usando tarjetas de ID de ADN de plástico,
que se trataron con temperatura elevada sin presión de manera
artificial en el laboratorio, y las que se prepararon de manera
práctica a temperatura elevada y a presión elevada, cambiando el
tiempo para colocar la muestra (Carril 1: tarjeta de ID de ADN para
ADN en la que el ADN se había cargado a temperatura ambiente, Carril
2: tarjeta de ID de ADN para ADN en la que el ADN se había cargado
tras la combustión a 180ºC durante 30 minutos, Carril 3: tarjeta de
ID de ADN para ADN en la que el ADN se había cargado tras la
combustión a 180ºC durante 1 hora, Carril 4: tarjeta de ID de ADN
que se había tratado a 180ºC durante 1 hora tras cargar el ADN a
temperatura ambiente, Carril 5: tarjeta de ID de ADN que se había
tratado a 180ºC durante 30 minutos tras cargar el ADN, Carril 6:
tarjeta de ID de ADN que se había tratado a 180ºC durante 1 hora
tras cargar el ADN, Carril 7: tarjeta de ID de ADN para sangre, que
se había producido a presión elevada (125 bares) y temperatura
elevada (180ºC), y cargada a continuación con sangre, Carril 8:
tarjeta de ID de ADN para sangre, que se había producido a presión
elevada (125 bares) y temperatura elevada (180ºC), y cargada a
continuación con ADN, Carril 9: tarjeta de ID de ADN para sangre,
que se había cargado con sangre y a continuación preparado a presión
elevada (125 bares) y temperatura elevada (180ºC), Carril 10:
tarjeta de ID de ADN para sangre, que se había cargado con ADN, y a
continuación preparado a presión elevada (125 bares) y temperatura
elevada (180ºC)).
La Fig. 21 muestra los resultados de la
amplificación por PCR del gen eNOS, que es uno de los genes de
enfermedades geriátricas, usando una tarjeta de ID de ADN de
plástico que se había preparado a temperatura elevada y presión
elevada, específicamente, un fragmento de tarjeta para ADN y para
sangre, cuyo ADNg 150 n\mug/\mul y sangre se habían depositado,
respectivamente, cambiando la cantidad depositada, y a continuación
almacenado (Carril 1: control negativo, Carril 2: control positivo
(ADNg de sangre), Carril 3: tarjeta de ID de ADN (para ADN) en la
que el ADNg (5 1) se había cargado a temperatura ambiente, Carril 4:
tarjeta de ID de ADN (para ADN) en la que se había cargado el ADNg
(10 1), Carril 5: tarjeta de ID de ADN (para ADN) en la que se había
cargado el ADNg (50 1), Carril 6: tarjeta de ID de ADN (para ADN) en
la que se había cargado sangre (10 1), Carril 7: tarjeta de ID de
ADN (para ADN) en la que se
había cargado sangre (50 1), Carril 8: tarjeta de ID de ADN (para ADN) en la que se había cargado sangre (100 1).
había cargado sangre (50 1), Carril 8: tarjeta de ID de ADN (para ADN) en la que se había cargado sangre (100 1).
La Fig. 22 muestra los resultados de la
amplificación por PCR del gen de la óxido nítrico sintasa endotelial
(eNOS), que es uno de los genes de enfermedades geriátricas, usando
una muestra conservada en tarjetas de ID de ADN que se prepararon a
temperatura elevada y presión elevada, en las que algunos de los
fragmentos de las tarjetas se trataron con un tampón de lavado como
un proceso de pretratamiento en la amplificación por PCR, y otros no
se trataron (Carriles 1 y 10: marcadores de tamaño de 100 pb, Carril
2: control negativo, Carril 3: fragmento de tarjeta que se había
producido tratando una tarjeta de recogida en la que se había
almacenado ADN, con un tampón de lavado a temperatura ambiente
durante cuatro días, Carril 4: fragmento de tarjeta que se había
producido tratando una tarjeta de recogida en la que se había
almacenado ADN, y que contenía BPB (azul de bromofenol) con un
tampón de lavado a temperatura ambiente durante cuatro días, Carril
5: fragmento de tarjeta que se había producido tratando una tarjeta
de ID de ADN de plástico en la que se había almacenado ADN, con un
tampón de lavado tras dejarla a temperatura ambiente durante cuatro
días, Carril 6: fragmento de tarjeta que se había producido
depositando complejo de quitosano al 0,1%/ADN sobre papel de 3 mm,
esterilizándolo con autoclave, dejándolo a temperatura ambiente
durante cuatro días, y tratándolo con un tampón de lavado, Carril 7:
fragmento de tarjeta que se había producido depositando complejo de
quitosano al 0,1%/ADN sobre una tarjeta de recogida, dejándola a
temperatura ambiente durante cuatro días, y tratándola con un tampón
de lavado, Carril 8: fragmento de tarjeta que se había producido
depositando complejo de quitosano al 0,1%/ADN sobre una tarjeta de
recogida con BPB, dejándola a temperatura ambiente durante cuatro
días, y tratándola con un tampón de lavado, Carril 9: fragmento de
tarjeta que se había producido depositando complejo de quitosano al
0,1%/ADN sobre una tarjeta de ID de ADN de plástico, dejándola a
temperatura ambiente durante cuatro días, y tratándola con un tampón
de lavado, Carril 11: fragmento de tarjeta que se había producido
almacenando una tarjeta de recogida en la que se había almacenado
ADN como sangre a temperatura ambiente durante cuatro días, sin
tratarla con un tampón de lavado, Carril 12: fragmento de tarjeta
que se había producido almacenando una tarjeta de recogida con BPB
en la que se había almacenado ADN como sangre a temperatura ambiente
durante cuatro días, sin tratarla con un tampón de lavado, Carril
13: fragmento de tarjeta que se había producido almacenando una
tarjeta de ID de ADN de plástico en la que se había almacenado ADN
como sangre a temperatura ambiente durante cuatro días y sin
tratarla con un tampón de lavado, Carril 14: fragmento de tarjeta
que se había producido depositando complejo de quitosano al 0,1%/ADN
sobre papel de 3 mm, esterilizándolo con autoclave, dejándolo a
temperatura ambiente durante cuatro días, y sin tratarlo con un
tampón de lavado, Carril 15: fragmento de tarjeta que se había
producido depositando complejo de quitosano al 0,1%/ADN sobre una
tarjeta de recogida, esterilizándola con autoclave, dejándola a
temperatura ambiente durante cuatro días, y sin tratarla con un
tampón de lavado, Carril 16: fragmento de tarjeta que se había
producido depositando complejo de quitosano al 0,1%/ADN sobre una
tarjeta de recogida con BPB, dejándola a temperatura ambiente
durante cuatro días, y sin tratarla con un tampón de lavado, Carril
17: fragmento de tarjeta que se había producido depositando complejo
de quitosano al 0,1%/ADN sobre una tarjeta de ID de ADN de plástico,
dejándola a temperatura ambiente durante cuatro días, y sin tratarla
con un tampón de lavado.
\vskip1.000000\baselineskip
La presente invención se ilustrará además con
los siguientes ejemplos. No obstante, el alcance de la presente
invención no se limita a los mismos.
\vskip1.000000\baselineskip
Para establecer las propiedades, la
concentración y la condición de mezcla adecuadas del quitosano para
formar un complejo estable cuando se mezcla con ADN, se mezcló
quitosano hidrosoluble de diferentes concentraciones con el ADN
total aislado a partir de monocito de sangre de adulto normal en
diferentes relaciones, y a continuación se llevó a cabo el ensayo
de cambio de movilidad del ADN unido al quitosano a través de
electroforesis en gel de agarosa. Además, se llevó a cabo el ensayo
de cambio de movilidad del ADN unido al quitosano de la misma
manera que para el ADN genómico de tejido hepático de ratón y ADN de
plásmido (pCMV-beta-galactosidasa)
con un tamaño de 4,0 kb. El procedimiento para el experimento y los
resultados son los siguientes.
\vskip1.000000\baselineskip
Se aisló el ADN total de la célula de leucocito
de adulto normal, el experimento se realizó usando agua tridestilada
según un procedimiento conocido (Sambrook J & Russell DW,
Molecular cloning: a laboratory manual, Cold Spring Harbor Press.
2001: 7.1-7.88).
Se recogió sangre periférica venosa en un tubo
que contenía citrato de sodio (tubo vaccutainer CTAD, Nº de
catálogo #367946, Becton & Dickinson, EEUU), y se separó el
plasma y la capa leucocitaria de monocitos por centrifugación. El
ADN de monocitos, de los que la mayoría son linfocitos, se aisló
usando un minikit para ADN de sangre QIAamp (Qiagen, Alemania) en el
siguiente procedimiento.
Se colocaron 20 \mul de proteína cinasa K
(proteasa de QIAGEN) en un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml, de
manera consecutiva se añadieron al mismo 200 \mul de la capa
leucocitaria y 200 \mul de tampón AL y se mezcló por medio de
vórtice durante 15 segundos. Se dejó en reposo a 56ºC durante 10
minutos y se centrifugó para recoger la disolución pegada al tapón
del tubo. Se añadieron al tubo 200 \mul de etanol, se mezcló por
medio de vórtice durante 15 segundos y se añadió toda la disolución
a una columna de centrifugación de QIAamp que se centrifugó a 8.000
rpm durante un minuto. A continuación, se insertó un tubo de
recogida de 2 ml en la columna, a éste se le añadieron 500 \mul
de un tampón AW1 y se centrifugó nuevamente a 8.000 rpm durante un
minuto. El filtrado obtenido de esta manera se desechó, se
proporcionó un nuevo tubo y se centrifugó además a velocidad máxima
durante un minuto. Una vez más, se insertó un nuevo tubo de
microcentrífuga de 1,5 ml, se añadieron al mismo 200 \mul de agua
destilada o de un tampón AE, se dejó en reposo a temperatura
ambiente durante un minuto y a continuación se centrifugó a 8.000
rpm durante un minuto para eluir el ADN. Se midió la concentración
del ADN aislado de esta manera usando un espectrofotómetro, y se
compararon las relaciones A260/A280 para hallar la pureza de ADN
aislado. En esta etapa, la pureza del ADN debe ser tal que A260/280
sea de 1,6 a 1,8 tras la medición con espectrofotómetro. A partir
del procedimiento anterior, puede obtenerse una media de 6 \mug
de ADN puro partiendo de 200 \mul de sangre humana.
\vskip1.000000\baselineskip
Si un quitosano hidrosoluble es un producto cuyo
grado de desacetilación es del 60% o superior y el peso molecular
es de 10 kDa a 500 kDa, puede utilizarse para las aplicaciones de la
presente invención, específicamente para formar un complejo estable
con ADN. Muchos productos de quitosano hidrosoluble que corresponden
a éstos están disponibles comercialmente. Entre ellos, en la
presente invención, se adquirió un producto de quitosano
hidrosoluble cuya tasa de desacetilación media es del 90,1% y cuyo
peso medio molecular promedio es de aproximadamente 300 kDa, de
Jakwang Co. Ltd. (Ansungsi, República de Corea), y se disolvió en
agua tridestilada esterilizada. Además de este quitosano, pueden
usarse otros quitosanos hidrosoluble que tengan propiedades
similares.
\vskip1.000000\baselineskip
Se disolvió el quitosano hidrosoluble en agua
tridestilada esterilizada, y se preparó en diferentes
concentraciones desde 0,02% hasta 0,05%, 0,1%, 0,25%, 0,5% y 1% en
peso frente a la relación de volumen (p/v) para la prueba. Aquí, el
ADN se diluyó con agua tridestilada esterilizada hasta las
concentraciones de 500 n\mug/\mul y 1 \mug/\mul, y a
continuación se utilizó.
En un tubo de centrífuga de 1,5 ml se mezcló la
disolución de ADN y las disoluciones de quitosano en diferentes
concentraciones como se describió anteriormente en diferentes
relaciones de volumen, y se dejaron en reposo a temperatura ambiente
durante 15 minutos para inducir la formación de un complejo.
\vskip1.000000\baselineskip
El complejo de ADN/quitosano obtenido por la
mezcla de una concentración 1 \mug/\mul de ADN genómico aislado
de monocito de adulto normal y ADN de plásmido, y las disoluciones
de quitosano hidrosoluble en diferentes concentraciones en
diferentes relaciones se cargaron en gel de agarosa al 0,8% según el
procedimiento anterior, y se sometieron a electroforesis a 100 V.
Los resultados se mostraron en las Figuras 2 y 3, respectivamente.
Los resultados mostraron que cuando se sometió el ADN solo, que no
estaba mezclado con quitosano, a electroforesis, el ADN se desplazó
normalmente y las bandas de ADNr se observaron a 18s y 28s, mientras
que cuando se mezcló una disolución acuosa de ADN (1 \mug/\mul)
con una disolución de quitosano al 0,02%, 0,1% ó 0,25%,
respectivamente en cada relación de volúmenes de 1:0,2, 1:1 ó 1:2,5
o más (en este momento, la relación en peso del quitosano y del ADN
en la mezcla es de 1:1 o más), el ADN se unió completamente al
quitosano de manera que nunca se desplazó sobre el gel de agarosa.
Por consiguiente, se tomó como patrón en el siguiente experimento
que la composición de un complejo de quitosano y ADN era tal que la
disolución de quitosano al 0,1% se mezclaba con la disolución de
ADN de una concentración de 1 \mug/\mul en una relación de
volúmenes de 1:1 (en esta etapa, la relación de peso de quitosano y
ADN en la mezcla es de 1:1). No obstante, esto sólo es un ejemplo
de composición, y la composición adecuada puede ser algo distinta
según las propiedades del producto de quitosano utilizado.
\vskip1.000000\baselineskip
Para determinar si el quitosano hidrosoluble
puede proteger el ADN de la desoxirribonucleasa (DNAsa), y
establecer las condiciones adecuadas, se trató el ADN que se había
tratado con una disolución de quitosano, y el ADN que no se había
tratado, con desoxirribonucleasa, respectivamente, y se observó el
efecto a través de la electroforesis en gel de agarosa.
El procedimiento y los resultados fueron los
siguientes. Se realizó el mismo experimento de manera repetida con
ADN genómico de linfocito humano y con ADN genómico de tejido
hepático de ratón.
Se separaron ocho tubos en dos grupos. En un
grupo, se mezcló el quitosano (20 g) disuelto en agua destilada y
ADN (10 g) se en un tubo de microcentrífuga (1,5 ml) para producir
un complejo. En el otro grupo, se añadió sólo ADN (10 g) al tubo,
sin quitosano. A cada uno de los tubos del primer y segundo grupo,
se le añadieron 5 \mul de desoxirribonucleasa (DNAsa I), que se
disolvió hasta una concentración de 1 unidad/l, y a continuación se
añadió agua destilada hasta un volumen final de 100 \mul. A
continuación, se mantuvieron para la reacción en un incubador a
37ºC durante 0 minutos, 20 minutos, 40 minutos y 60 minutos,
respectivamente. Inmediatamente tras finalizar la reacción, se
añadieron 25 \mul de la disolución de parada y se mezclaron bien
para inactivar la DNAsa I. A cada uno de los cuatro tubos en los
que se había inactivado la reacción, se añadieron 110 \mul de
tampón de TE (Tris 10 mM, EDTA 0,1 mM) y se mezclaron, a
continuación se mantuvieron para la reacción a 60ºC durante la
noche. A continuación, se añadieron 150 \mul de fenol/cloroformo y
se mezclaron por medio de vórtice durante un minuto, y se
centrifugaron a temperatura ambiente durante 5 a 8 minutos. A
continuación, se recogió el sobrenadante, se colocó en un tubo de
microcentrífuga y se extrajo. Se añadieron 300 \mul de EtOH
anhidro y 15 \mul de NH4OAc 3M a los mismos, y se dejaron en
reposo previamente a -70ºC en un congelador durante 20 a 30
minutos. A continuación, se centrifugó el resultante a 4ºC a 12.000
rpm durante 20 minutos, y el líquido se desechó por aspiración. Las
pellas sedimentadas se lavaron nuevamente con etanol al 70%, se
secaron y se disolvieron en 20 \mul de agua destilada, que no
tenía DNAsa. Se recogieron 10 (aproximadamente 1 \mug de ADN) del
resultante de los ocho tubos obtenidos de esta manera,
respectivamente, y se sometieron a electroforesis en gel de agarosa
al 1%. Los resultados se mostraron en la Fig. 4.
A partir de la Fig. 4, se encontró que el ADN
que no se había tratado con quitosano, estaba prácticamente
escindido 40 minutos después del tratamiento con DNAsa I, mientras
que el ADN que se había tratado con quitosano, no estaba escindido
40 minutos después del tratamiento con DNAsa, y la mayor parte
permanecía en los pocillos. Estos resultados muestran que si se
mezclan el quitosano y el ADN incluso en una relación de pesos de
1:0,5 según el procedimiento de la presente invención, también se
suprime con eficacia la escisión del ADN por una
desoxirribonucleasa, y el procedimiento según la presente invención
es eficaz para el almacenamiento del ADN.
\vskip1.000000\baselineskip
Usando el complejo líquido de quitosano
hidrosoluble y ADN preparado según los Ejemplos 1 y 2, se realizó
la PCR para determinar si el gen diana se amplificaba adecuadamente,
y para determinar de ese modo si el procedimiento para almacenar el
ADN de la presente invención no tiene efectos perjudiciales en el
ensayo genético, y para establecer las condiciones adecuadas para
usar el ADN almacenado por el procedimiento de almacenamiento de
ADN según la presente invención en reacciones de PCR. Se realizó la
PCR con la diana de cada gen de beta-Actina para el
ADN genómico de leucocito humano. El procedimiento y los resultados
fueron los siguientes.
\newpage
\global\parskip0.900000\baselineskip
La reacción de PCR se realizó usando 100 ng del
ADN sujeto como molde añadiendo 10 pmol del cebador directo y
cebador inverso del gen diana, respectivamente, y añadiendo a
continuación desoxinucleótido 2,5 mM (dNTPs), 1 unidad de
polimerasa Taq y 10 x tampón de polimerasa (KCl 500 mM,
Tris-Cl 100 mM, MgCl_{2} 15 mM, gelatina al
0,1%). La PCR se realizó usando un termociclador GeneAmp 2700
(Perkin-Elmer Biosystems, Inc., EEUU), en primer
lugar bajo la condición de: primero a 95ºC durante 5 minutos, a
continuación cuarenta veces bajo la condición de 95ºC durante 30
segundos, 55ºC durante 30 segundos y 72ºC durante 30 segundos y,
finalmente a 72ºC durante 7 minutos, para dar los productos de
PCR.
Con cada molde de las muestras de ADN genómico
de ser humano y de ratón preparados mezclando quitosano al 0,1% y
ADN (1 \mug/\mul) en una relación de volúmenes de 1:1, y el ADN
que no se había mezclado con quitosano, se llevó a cabo la PCR para
el gen de beta-Actina. Los resultados de la
electroforesis en gel de agarosa al 1,5% se mostraron en la Fig. 5.
Los que se habían mezclado con quitosano mostraron una fuerte banda
de ADN del gen de beta-Actina de un tamaño de 661
pb en el mismo nivel. Esto muestra que el medio mezclado con
quitosano de la presente invención no tiene efectos perjudiciales
en la PCR, y puede utilizarse de manera provechosa para buscar la
expresión del gen.
\vskip1.000000\baselineskip
A partir de los resultados anteriores, se
encontró que el quitosano hidrosoluble está unido prácticamente en
su totalidad al ADN, y conserva el ADN de manera estable del ataque
de la desoxirribonucleasa. En el presente ejemplo, se determinó que
cuando el complejo de quitosano hidrosoluble y ADN se almacenaba en
forma líquida a temperatura ambiente durante un período de tiempo
prolongado, el ADN almacenado se mantenía sin escindir haciendo
posible la realización de la amplificación y el ensayo genético.
Esto se llevó a cabo por medio de ensayos por PCR de la siguiente
manera.
Se mezcló 1 \mul de la disolución de quitosano
hidrosoluble al 0,1% (p/v) y 1 \mul del ADN genómico de monocito
de sangre de adulto normal (500 n\mug/\mul) para formar un
complejo, y se añadieron 8 \mul de agua destilada para ajustar el
volumen final a 10 \mul. De esta manera, se prepararon 24 muestras
en los tubos de centrífuga y se almacenaron a temperatura ambiente.
Se ajustó 1 \mul del mismo ADN de leucocito, que no se había
tratado con quitosano, a un volumen final de 10 \mul, para
preparar 9 muestras. Tres de estas muestras se almacenaron a -70ºC
y las seis muestras restantes se almacenaron a temperatura ambiente.
Para los ADN que se mezclaron con el quitosano hidrosoluble y se
almacenaron en el tubo a temperatura ambiente, se realizó la
reacción de PCR según el procedimiento del Ejemplo 3 para tres
muestras de ADN, respectivamente en los puntos temporales de una
semana, dos semanas, tres semanas, cuatro semanas, tres meses, seis
meses, nueve meses y un año, respectivamente para determinar si el
gen diana se amplificaba apropiadamente. Para las tres muestras que
se habían almacenado a -70ºC entre las muestras de ADN que no se
habían mezclado con quitosano, se llevó a cabo la PCR tras tres
meses, y para cada una de las tres muestras de ADN que se habían
almacenado a temperatura ambiente, se llevó a cabo la PCR tras tres
meses y un año, respectivamente. La Fig. 6 es una fotografía que
representa los resultados de la electroforesis en gel de agarosa al
0,8% para el gen de beta-Actina tras realizar la
PCR.
A partir de la Fig. 6, se encontró que cuando el
ADN se almacenaba en un tubo de microcentrífuga a temperatura
ambiente durante tres meses y durante un año, no unido al quitosano
(desnudo), el gen de beta-Actina, que es un gen
constitutivo, no se expresaba nunca. Por el contrario, cuando la
muestra del ADN se almacenó unida al quitosano en un tubo como un
líquido a temperatura ambiente durante una semana a un año, se
detectó claramente el gen de beta-Actina. Se
encontró que para la muestra de ADN que se había almacenado a -70ºC
sin unión al quitosano según el procedimiento convencional, la
cantidad de beta-Actina amplificada era similar a la
de la muestra de ADN que se almacenó unido al quitosano a
temperatura ambiente según el procedimiento de la presente
invención.
Tales resultados mostraron que el procedimiento
de almacenamiento de ADN en el líquido unido al quitosano
hidrosoluble según el procedimiento de la presente invención, puede
mantener el ADN estable durante al menos un año, que el ADN
almacenado no tiene problemas para ser utilizado en el ensayo de
PCR, y que el procedimiento puede almacenar el ADN de manera
estable de modo similar al procedimiento convencional de
almacenamiento del congelador de baja temperatura. La temperatura
de almacenamiento en el presente ejemplo varía desde la temperatura
ambiente hasta -70ºC. Resulta de preferencia el almacenamiento en un
lugar oscuro y en ausencia de humedad.
\vskip1.000000\baselineskip
Para almacenar y transportar ADN de múltiples
muestras a temperatura ambiente en un espacio mínimo, y para ayudar
con el ensayo automático, se ha desarrollado una tarjeta en la que
el quitosano se absorbe sobre un papel adecuado, que se denominó
tarjeta de ADN. La tarjeta de ADN se presenta en diferentes tipos, y
entre ellos, una tarjeta de papel cuyo uso es almacenar el ADN
mismo, se denominó tarjeta de ADN de Tipo 1.
\global\parskip1.000000\baselineskip
Para seleccionar la concentración más eficaz de
la disolución de quitosano hidrosoluble y el espesor adecuado del
papel, se realizó el siguiente experimento.
Se sumergieron diversos tipos de papeles para
transferencia en concentraciones de disolución de quitosano
hidrosoluble del 0,02%, 0,1% ó 0,25% (p/v) durante un período del
tiempo suficiente, y se secaron para utilizar en la producción de
tarjetas de ADN. En esta etapa, el papel se seleccionó de papeles
para transferencia que están disponibles en el comercio de
diferentes compañías tales como Whatman plc. (RU) o Schleicher &
Schuell GmbH (Alemania), y tenía un espesor adecuado. En la
presente invención, los papeles para transferencia de 0,3 mm, 0,9
mm y 1,2 mm de espesor se adquirieron de Whatman plc. y se
utilizaron. El tipo y tamaño de la tarjeta de ADN para almacenar el
ADN con quitosano puede prepararse de varias maneras dependiendo del
uso. El papel de transferencia sobre el que se adsorbió el
quitosano, se cortó del mismo tamaño de la placa de 24 pocillos, 96
pocillos y de 384 pocillos (placa multipocillos) (8,1 cm 12,3 cm),
que son por lo general muy utilizadas, y se imprimieron y marcaron
el pocillo y la partición sobre el papel como la placa. En cada uno
de los pocillos, se depositó una muestra de ADN con una pipeta, y se
almacenó durante una semana a un año o más a temperatura ambiente.
De esta manera, una tarjeta de ADN puede almacenar de 24 a 96, hasta
384 trozos de muestras de ADN.
Un procedimiento para producir la tarjeta de ADN
por inmersión en quitosano hidrosoluble es el siguiente.
Se esterilizó un papel para transferencia de 0,3
mm de espesor de Whatman plc. y se secó en un autoclave a alta
temperatura. A continuación, se mezcló una disolución de quitosano
hidrosoluble en una concentración del 0,1% (p/v) y disolución de
ácido úrico 2 mM, que se habían producido previamente, en una
relación de volúmenes de 1:1, se sumer-
gió el papel durante un período de tiempo suficiente y a continuación se secó para producir la tarjeta de ADN
gió el papel durante un período de tiempo suficiente y a continuación se secó para producir la tarjeta de ADN
\hbox{de Tipo 1.}
En la tarjeta de ADN de Tipo 1 preparada como se
indicó anteriormente, se depositó ADN genómico humano, y se
conservó durante un período determinado. De la tarjeta de ADN
almacenado, en la que se había transferido y almacenado ADN de
genoma humano durante un largo tiempo, se tomó un fragmento de
tarjeta de aproximadamente 1 mm a 2 mm de diámetro usando un
punzón, un fórceps o una pinza, y se añadió a un tubo para realizar
la PCR. Con un molde de este fragmento de tarjeta, se realizó la
PCR para el gen de beta-Actina según el
procedimiento del Ejemplo 3. El procedimiento de esta reacción de
PCR fue el siguiente.
1. De una tarjeta de papel sumergida en
quitosano en la que se había almacenado ADN, se tomó un fragmento de
aproximadamente 1,2 mm de diámetro usando un punzón, etc. y se
añadió a un tubo para PCR.
2. Se añadieron 200 \mul de un tampón TE
(Tris-Cl 10 mM, EDTA 0,1 mM, pH = 8,0), se mezcló, y
a continuación se dejó a temperatura ambiente durante 5 minutos. A
continuación, se retiró completamente el tampón TE usando una
pipeta.
3. El segundo procedimiento se repitió dos
veces.
4. Se secó a temperatura ambiente durante 1 hora
o a 56ºC durante 10 minutos.
5. Al fragmento de tarjeta que se había tratado
por medio de los procedimientos anteriores, se le añadió una muestra
de PCR de una composición adecuada y el gen de beta Actina se
amplificó por PCR según el procedimiento del Ejemplo 3.
\vskip1.000000\baselineskip
La Fig. 7 muestra los resultados de una
fotografía del experimento de electroforesis en gel de agarosa, que
representa los resultados de la comparación y el análisis por medio
de PCR. Se encontró que para todas las tarjetas de ADN que se
habían producido por inmersión en una disolución de quitosano al
0,1%, el gen diana se expresaba fuertemente, y que cuanto mayor
espesor tuviera el papel, tal como 0,9 mm o 1,2 mm, más productos
de PCR se producían. Además, cuando se conservó adsorbido en la
tarjeta de ADN de la presente invención, el gen de
beta-Actina se amplificaba fuertemente en PCR
incluso tras un largo período, tal como tres meses a un año, a
temperatura ambiente, de manera similar al almacenamiento a
-70ºC.
Tales resultados muestran que cuando se
conservan en la tarjeta de ADN según la invención, múltiples
muestras de ADN diversas pueden conservarse de manera estable
incluso a temperatura ambiente durante mucho tiempo, y pueden
realizarse ensayos tras un período de tiempo prolongado. Por
consiguiente, se encontró que la tarjeta de ADN de la invención es
útil para almacenar y para transportar múltiples muestras de ADN
diversos manera simple a temperatura ambiente durante un período de
tiempo prolongado, y además es también útil para diversos ensayos
genéticos tales como PCR o secuenciación de bases como se mostró en
el presente ejemplo y en los siguientes ejemplos.
Esta tarjeta de ADN de Tipo 2 se produjo
adsorbiendo el quitosano y un tampón de lisis celular sobre
diferentes tipos de papeles para transferencia y secándolos. Esta
tarjeta de ADN de Tipo 2 se diseñó para ser utilizada en el
almacenamiento de muestras como líquido corporal que contiene
células, tal como la sangre, y para amplificarlas a continuación
por PCR para el ensayo genético. Sobre esta tarjeta de ADN de Tipo
2, se depositó sangre humana, y después de un determinado período de
tiempo, se comparó y analizó el rendimiento por medio de PCR.
La tarjeta de papel para transferencia preparada
como en el Ejemplo 5 se sumergió en la disolución de quitosano
hidrosoluble y el tampón de lisis celular durante un período de
tiempo suficiente y se secó para producir una tarjeta de ADN. En
esta etapa, los papeles para transferencia de 0,3 mm, 0,9 mm y 1,2
mm en espesor se adquirieron de Whatman plc. y se utilizaron. El
siguiente es un procedimiento para producir la tarjeta de ADN de
Tipo 2 para almacenamiento en forma de sangre.
Se esterilizó un papel para transferencia de 0,3
mm de espesor de Whatman plc. a alta temperatura y se secó. A
continuación, se mezcló la disolución de quitosano hidrosoluble en
una concentración del 0,1% (p/v) y el tampón de lisis celular (EDTA
0,5 mM, Tris-Cl 8 mM, ácido úrico 2 mM, SDS al 1%
(p/v)), que se habían producido previamente, en una relación de
volúmenes de 1:1, y se sumergió el papel durante un período de
tiempo suficiente, y a continuación se secó para producir la tarjeta
de ADN de Tipo 2.
De la tarjeta de ADN anterior, se tomó un
fragmento de la tarjeta de aproximadamente 1 mm a 2 mm de diámetro y
se añadió a un tubo para realizar la PCR como en el Ejemplo 5. Con
un molde de este fragmento de tarjeta, se llevó a cabo la PCR para
el gen de beta-Actina. El procedimiento para esta
reacción de PCR fue el siguiente.
1. De una tarjeta de papel sumergido en
quitosano en la que se conservó ADN, se tomó un fragmento de
aproximadamente 1,2 mm de diámetro usando un punzón, etc. y se
añadió a un tubo para PCR.
2. Se añadieron 200 \mul de una disolución de
lavado (reactivo de purificación GG; EDTA 0,5 mM,
Tris-Cl 8 mM, ácido úrico 2 mM, SDS al 1% (p/v)), se
mezcló y se dejó a temperatura ambiente durante 5 minutos. A
continuación, se retiró completamente la disolución de lavado usando
una pipeta.
3. El segundo procedimiento se repitió tres
veces.
4. A continuación, se añadieron 200 \mul de un
tampón TE (Tris-Cl 10 mM, EDTA 0,1 mM, pH = 8,0), se
mezcló y se dejó a temperatura ambiente durante 5 minutos. A
continuación, se retiró completamente el tampón TE usando una
pipeta.
5. El cuarto procedimiento se repitió dos o tres
veces.
6. Se secó a temperatura ambiente durante 1 hora
o a 56ºC durante 10 minutos.
7. Al fragmento de la tarjeta que se había
tratado por medio de los procedimientos anteriores, se le añadió una
muestra de PCR de una composición adecuada y se amplificó el gen de
beta-Actina por PCR del mismo modo que en el Ejemplo
2.
\vskip1.000000\baselineskip
Como resultado del experimento, se encontró que
para todas las tarjetas de ADN de Tipo 2, el gen diana se expresaba
fuertemente, y que cuanto mayor espesor tuviera el papel, tal como
0,9 mm ó 1,2 mm, más productos de PCR se producían. Además, cuando
se conservó adsorbido en la tarjeta de ADN de la presente invención,
el gen de beta-Actina se amplificaba fuertemente en
la PCR incluso tras un período de tiempo prolongado tal como tres
meses a un año a temperatura ambiente. Tales resultados muestran que
la muestra de ADN puede conservarse de manera estable a temperatura
ambiente durante un período de tiempo prolongado como sangre sin
necesidad de aislar y purificar el ADN cuando se conserva en la
tarjeta de ADN según la invención, y que pueden realizarse ensayos
con la misma después de un tiempo prolongado. Por consiguiente, se
encontró que la tarjeta de ADN de la invención es útil para
almacenar y transportar de manera fácil muestras de ADN en forma de
sangre a temperatura ambiente durante mucho tiempo, y además es
también útil para diversos ensayos genéticos tales como PCR o
similares.
\vskip1.000000\baselineskip
Se llevó a cabo la PCR para un complejo de
quitosano/ADN que se había almacenado como líquido a temperatura
ambiente durante un período de tiempo prolongado según el Ejemplo 4,
y se clonó el producto obtenido. A continuación, se determinó por
secuenciación de bases automática si el ADN almacenado según el
procedimiento de la invención podía mantenerse de manera estable y
utilizarse tras el almacenamiento.
Con un molde de una muestra de ADN genómico de
un tejido cólico de adulto, que se había almacenado como mezcla con
quitosano hidrosoluble al 0,1% según el procedimiento de la
invención a temperatura ambiente durante tres meses, se llevó a
cabo la PCR para el gen de poliposis cólica adenomatosa (APC). El
producto se clonó en un vector plasmídico y a continuación se buscó
nuevamente por secuenciación de bases. El procedimiento fue el
siguiente.
Es importante ajustar el producto de PCR del gen
a una concentración adecuada para utilizarlo como molde en la
reacción de secuenciación. En la invención, se usaron 10 ng del gen
de APC. A un tubo de PCR, se le añadió el producto de PCR de cada
exón del gen de APC, 3,2 pmol de cualquiera de los cebadores,
directo o inverso, y 8 \mul y de la mezcla de reacción (mezcla de
reacción lista del terminator; Perkin-Elmer, EEUU) y
se añadió agua destilada esterilizada hasta un volumen final de 20
\mul y se mezcló bien. Se llevó a cabo la reacción de
secuenciación por ciclos para la mezcla usando un termociclador
GeneAmp 2700, 25 veces a 96ºC durante 10 segundos, 50ºC durante 5
segundos y 60ºC durante 6 minutos. Se realizó la precipitación del
producto de reacción obtenido con etanol y se centrifugó para
eliminar el didesoxinucleótido marcado con fluorescencia (ddNTPs)
en el cebador libre y la mezcla de reacción (mezcla de reacción
lista del terminador) y se secó. El ADN obtenido de esta manera se
mezcló con una mezcla de formamida: EDTA 25 mM (pH 8,0): dextrano
azul y 10 \mul de un tampón de carga, y se desnaturalizó en agua
a ebullición durante 5 minutos. A continuación, se colocó la
muestra en hielo y se añadió la muestra de ADN desnaturalizado a
cada pocillo de las placas, que se habían tratado previamente con
gel "long ranger" al 5,5% (BMA, Nº de catálogo, EEUU). La
electroforesis se realizó durante 2 a 4 horas y la secuenciación de
bases se llevó a cabo usando un programa informático de un
secuenciador automático ABI Prism 377 (Perkin-Elmer
Biosystems,
EEUU).
EEUU).
Los resultados de la secuenciación automática de
bases para el gen de APC se muestran en la Fig. 10.
Como resultado de la secuenciación, se encontró
que el gen normal de APC se había amplificado exactamente y, por
consiguiente, el complejo líquido de ADN y quitosano, según el
procedimiento de la invención, conserva el ADN de manera estable
incluso tras el almacenamiento a temperatura ambiente durante un
tiempo prolongado para llevar a cabo la clonación y la
secuenciación de bases, que significa que es también útil para las
pruebas de mutación del gen y para la investigación del cáncer.
\vskip1.000000\baselineskip
Se determinó si para la muestra de ADN
conservada adsorbida en la tarjeta de ADN a temperatura ambiente
durante un período de tiempo prolongado, podía llevarse a cabo de
manera adecuada la clonación para el producto obtenido por PCR y la
secuenciación automática de bases.
Con un molde de una muestra de ADN genómico de
un tejido de cáncer de pulmón humano, que se había almacenado
depositada sobre la tarjeta de ADN preparada según el Ejemplo 5
durante tres meses, se llevó a cabo la PCR para el gen supresor de
tumores p53. El producto se clonó en un vector plasmídico y a
continuación se buscó nuevamente por secuenciación automática de
bases. El procedimiento fue el mismo que el del Ejemplo 7. Los
resultados se muestran en la Fig. 11.
Como resultado, se encontró que el gen
mutagénico p53 se había amplificado exactamente (Fig. 11), y que
cuando el ADN se conservó usando la tarjeta de ADN preparada según
el procedimiento de la invención, el ADN se conservó permitiendo la
clonación y la secuenciación automática de bases a partir del mismo
incluso tras un período de tiempo prolongado, por consiguiente
resulta también útil para las pruebas de mutación del gen y para la
investigación del cáncer.
\vskip1.000000\baselineskip
Al analizar la presencia y la cantidad de un gen
específico por un ensayo de hibridación tal como la transferencia
Southern, y similares, usando un complejo de ADN y quitosano
almacenado según el procedimiento de la invención, el ADN unido al
quitosano no se desplaza en la electroforesis en gel de agarosa, por
lo que resulta difícil llevar a cabo un ensayo de transferencia.
Por consiguiente, para el ensayo de transferencia, la muestra de
ADN debe utilizarse con el quitosano eliminado. Por consiguiente, en
la invención, se ha establecido un procedimiento para eliminar el
quitosano sin dañar el ADN del ADN que está unido al quitosano.
Como se describió anteriormente, el quitosano
hidrosoluble es una sal catiónica y se une al ADN, de manera que el
quitosano puede aislarse del ADN por medio del tratamiento con una
sal catiónica fuerte como el sulfato de SDS (dodecilsulfato de
sodio), SOS (octilsulfato de sodio) y CTAB (bromuro de cetiltrimetil
amonio). En este caso, la sal catiónica no deber ser costosa y no
debe tener efecto en el ensayo de transferencia, sin producir daños
en el ADN. Por consiguiente, en la invención, se utilizó SDS (Sigma
Co., EEUU), que no es costoso y no tiene efecto en una reacción de
hibridación entre el ADN y la sonda.
Se almacenó un complejo de ADN/quitosano
obtenido mezclando una disolución de quitosano y un ADN de tejido
de cáncer pancreático, según el procedimiento de la invención, a
temperatura ambiente durante tres meses. A continuación, se
mezclaron 5 a 10 \mug del complejo ADN/quitosano con SDS al 5%
(p/v) y se sometió a electroforesis en gel de agarosa para la
transferencia Southern. Se realizó la transferencia Southern para el
gen K-ras por un procedimiento conocido (Sambrook J
& Russell DW, Molecular cloning: a laboratory manual, 2001). Los
resultados se mostraron en la Fig. 12 y Fig. 13,
respectivamente.
A partir de la Fig. 12, se encontró que en un
caso de electroforesis con SDS al 5%, se aislaron el ADN y el
quitosano y el ADN se desplazó en el gel.
Además, la Fig. 13 mostró en los resultados de
la transferencia Southern que el gen K-ras se había
expresado fuertemente para ambos ADN, el que se había almacenado a
-70ºC sin unión al quitosano y el ADN que se conservó bajo la forma
de quitosano/ADN durante 6 meses. Por consiguiente, se estableció un
procedimiento para realizar la transferencia Southern usando el ADN
almacenado durante un período de tiempo prolongado según el
procedimiento de almacenamiento de ADN de la invención. Además, se
encontró que el ADN almacenado según el procedimiento de la
invención es útil para un ensayo de hibridación.
\vskip1.000000\baselineskip
Se realizó la PCR para una muestra de ADN
genómico humano conservada usando la tarjeta de ADN de Tipo 1 de la
invención, y a continuación se probó si era posible realizar la
prueba de genotipado para la misma usando un ensayo RFLP
(polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción). Los
resultados del genotipado usando el ensayo RFLP tras la PCR de la
tarjeta de ADN de Tipo 1 se muestran en la Fig. 8. Además, se
investigó si era posible realizar el genotipado usando un ensayo de
PCR-RFLP para la muestra humana que se había
almacenado como sangre en la tarjeta de ADN de Tipo 2 de la
presente invención. Los resultados se muestran en la Fig. 9. Para
demostrar que la tarjeta de ADN de la invención puede utilizarse de
manera práctica en el diagnóstico de genes, se amplificó por PCR un
gen asociado con el ataque de enfermedades cardiovasculares, y se
trató con las siguientes enzimas de restricción específicas. Los
resultados se analizaron por medio de electroforesis. Como
resultado, se encontró que no tiene ningún problema en una búsqueda
con genotipos múltiples.
El presente ejemplo se describirá a continuación
en detalle.
Usando la tarjeta de ADN de Tipo 1 y la tarjeta
de ADN de Tipo 2 y la tarjeta de ID de ADN de plástico de la
invención, se prepararon los siguientes seis genes, que están
asociados con enfermedades geriátricas, respectivamente en un tubo
de PCR usando disoluciones de reacción como se muestra en la
siguiente tabla.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
El tubo de PCR que contenía la disolución de
reacción, que se había preparado como anteriormente, se añadió a un
termociclador PE2700 (Perkin Elmer, EEUU), y se realizó la
amplificación según cada gen de la siguiente manera.
1. Para el gen eNOS1/2, MTHFR1/2, AGT1/2, AT1R,
ACE1:
- 95ºC/5 min, 35 ciclos (95ºC/30 seg, 58ºC/30 seg, 72ºC/40 seg), 72ºC /10 min.
2. Para el gen ACE2 y APOE1/2:
- 95ºC/5 min, 35 ciclos (95ºC/30 seg, 65ºC/30 seg, 72ºC/40 seg), 72ºC /10 min.
\vskip1.000000\baselineskip
El producto de PCR obtenido de esta manera para
cada gen se confirmó realizando la electroforesis en el gel de
agarosa al 1,2% que contenía EtBr. El tamaño del producto de cada
gen se muestra en la siguiente Tabla 2.
\vskip1.000000\baselineskip
Para llevar a cabo el ensayo RFLP con el
producto de PCR obtenido de esta manera, primero, se purificaron los
productos de PCR de otros cinco genes (eNOS, MTHFR, AGT, AT1R y
APOE) excepto solamente el gen ACE usando un kit DNA Clean &
Concentrator (Zymo Research Corporation, CA. EEUU) de la siguiente
manera.
1. Al producto de PCR (aproximadamente 25 1), se
le añadió la disolución de unión del ADN en volumen doble, es decir,
50 \mul.
2. A una columna de centrifugación Zymo, que se
había proporcionado previamente, se le añadió toda la mezcla según
el punto 1 anterior y se centrifugó a 13.000 rpm durante 30
segundos.
3. Se retiró con una pipeta la disolución
recogida en un tubo de recogida.
4. Se añadió a la columna 200 \mul de un
tampón de lavado y se centrifugó a 13.000 rpm durante 30 segundos
(se repitió dos veces).
5. Se eliminó totalmente el tampón de lavado
restante centrifugándolo en un tubo vacío a 13.000 rpm durante 40
segundos.
6. Se retiró el tubo de recogida y se
proporcionó un tubo de microcentrífuga limpio de 1,5 ml para una
columna nueva, a continuación se añadieron al mismo 20 \mul de
agua tridestilada esterilizada y se centrifugó a 13.000 rpm durante
40 segundos para la elución. Como alternativa, puede utilizarse agua
tridestilada esterilizada calentada a 65ºC o similar.
\vskip1.000000\baselineskip
Para los productos de PCR que se purificaron y
se obtuvieron en el procedimiento anterior, se preparó una enzima de
restricción correspondiente para cada gen de la tabla siguiente bajo
la condición correspondiente a cada enzima de restricción. A
continuación, se mantuvieron para la reacción en un baño de agua a
37ºC durante 4 a 6 horas, y posteriormente, se investigó el riesgo
de cada gen por electroforesis en gel de agarosa al 2,5%.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Como una aplicación del procedimiento de
almacenamiento de ADN usando quitosano de la invención, se produjo
un kit de PCR en el que se añadió polimerasa Taq, un cebador, dNTP y
un tampón, y similares, a un tubo con quitosano (tubo con todo
incluido), y se añadió una muestra tal como ADN o suero al tubo para
dar lugar a una reacción de PCR. De manera característica, este kit
de PCR puede utilizarse tanto para el almacenamiento del ADN como
para el ensayo de PCR.
En el presente ejemplo, usando el ADN obtenido
de la sangre de pacientes con hepatitis tipo B, se investigó la
presencia del virus de hepatitis tipo B con el kit de PCR de la
invención. El kit también puede aplicarse al diagnóstico de cáncer
por medio del diagnóstico de un gen asociado al cáncer, o para el
diagnóstico de patógenos en virus de hepatitis tipo B o infección
por virus del papiloma humano, infecciones de transmisión sexual,
otras infecciones bacterianas y similares.
El uso del presente kit es el siguiente.
Se añadieron de 1 a 3 \mug de molde de ADN a
un tubo con todo incluido, que contenía 10 \mul de tampón de PCR
de una etapa 5 GG TM y polimerasa Taq tipo "hot start"
(AmpliTaq Gold, Perkin Elmer, EEUU), 2,0 \mul de mezcla de dNTP
10 mM, 1,0 \mul de cada uno de los cebadores, directo e inverso,
(5 pmol) del gen diana y una concentración de quitosano al 0,1%. Se
llenó el kit con agua destilada hasta un volumen total de 50 1, y
se mezcló bien, y a continuación se llevó a cabo la PCR. En primer
lugar, se llevó a cabo la reacción de transcripción inversa a 50ºC
durante 30 minutos, se realizó la desnaturalización a 95ºC durante
15 minutos, seguida por un total de 25 a 40 ciclos de 94ºC durante
un minuto, 53ºC durante 40 segundos y 72ºC durante un minuto, a
continuación se completó la amplificación de PCR con la reacción de
72ºC durante 10 minutos. Como resultado, se encontró la presencia
de ADN del virus de hepatitis Tipo B usando el kit de PCR de la
invención (no se adjuntan datos).
\vskip1.000000\baselineskip
La Fig. 14 es un diagrama de flujo que muestra
un procedimiento para preparar una tarjeta de ID de ADN de plástico
usando la tarjeta de ADN de la invención. Los procedimientos se
llevaron a cabo según el diagrama de flujo de la Fig. 14 para
desarrollar una tarjeta de ID de ADN de material plástico.
1. Recepción de la muestra personal transportada
tal como sangre o células orales, la tarjeta de ADN y similar, y
datos de fotografía personal (S201).
2. Aislamiento del ADN genómico de la muestra y
prueba de determinación del grupo sanguíneo (S202).
3. Ensayo de genotipo HLA usando el ADN genómico
extraído, prueba genes de identificación personal por STR y análisis
de los resultados (S203). La Fig. 15 es un esquema que muestra un
procedimiento de identificación del genotipo personal usando 15
combinaciones de pruebas STR, preparación del perfil de genotipo
personal y codificación de los datos del genotipo personal.
4. Incorporación de una tarjeta de ADN de papel
para adjuntar con la tarjeta de plástico, y preparación del marco de
la tarjeta de ID de ADN añadiendo calor y presión (S205). La Fig. 16
es un esquema que muestra la incorporación de la tarjeta de ADN de
Tipo 1 o Tipo 2 en una tarjeta de PVC en el proceso de preparación
de la tarjeta de ID de ADN de la invención. Como se muestra en la
Fig. 16, se coloca una capa blanda de PVC en la parte inferior, y se
coloca la tarjeta de ADN de Tipo 1 o Tipo 2 sobre la misma. A
continuación, se coloca la capa núcleo de PVC sobre la misma, que
tiene un agujero del tamaño de la tarjeta de ADN del papel (debe
prepararse un agujero del tamaño de la tarjeta debido al espesor de
la tarjeta de papel, y como el papel y el PVC están hechos de
sustancias diferentes entre sí, no se incorporan juntos en la
incorporación por calor. Específicamente, la tarjeta de papel se
inserta en este agujero). En su parte superior, se deja una capa
núcleo de PVC que tiene otros dos agujeros pequeños (son para
inyectar el ADN o la sangre en la tarjeta de ADN de papel, que debe
ubicarse en la tarjeta de papel, ya que prácticamente no queda
ningún espacio vacío desde la incorporación de la tarjeta por
calor). Finalmente, se coloca sobre la misma una capa blanda de PVC.
A continuación se calienta bajo alta presión (100 hasta 140 bares) a
alta temperatura, de 160 a 180ºC, durante 8 a 30 minutos para
incorporarlas. En esta etapa, la ubicación de la tarjeta de ADN de
papel es opuesta a la de la barra magnética, y también es opuesta a
la de la transcripción de la fotografía. La Fig. 17 es un esquema de
un ejemplo de tarjeta de ID de ADN de plástico de la invención.
5. Depósito del ADN personal o la sangre en la
tarjeta de ID de ADN de plástico y la tarjeta de almacenamiento,
producidas en S204 (S205). El depósito del ADN o la sangre en la
tarjeta de ID de ADN de plástico se lleva a cabo inyectando ADN o
sangre en la tarjeta de ID de ADN de papel a través del agujero de
la capa núcleo de PVC penetrando en la capa blanda de PVC usando una
aguja. Tras la inyección, el agujero causado por la aguja se bloquea
por medio de un holograma, etiqueta o similar.
6. Codificación de los datos analizados en la
barra magnética o en el chip de la tarjeta de ID de ADN de plástico
(S206). La barra magnética está normalmente constituida por tres
pistas. La primera pista es la pista en la que puede escribirse en
inglés, que tiene 78 bits disponibles. La segunda pista tiene 38
bits disponibles, y la tercera pista tiene 107 bits disponibles. Por
consiguiente, como se mostró en la Fig. 17, en la primera pista se
codifica una breve información personal (por ejemplo: cáncer de
próstata C61 o hipertrofia prostática benigna N40), y los resultados
de STR o del tipo HLA están codificados en la tercera pista. Sin
embargo, en caso de conexión con bancos o similares, el
procedimiento de codificación de la tarjeta de ID de ADN de plástico
es que la información genética queda registrada sólo en el servidor
principal y se codifica del modo que lo solicita el banco, y los
datos de información genética personal y similares se transmiten
desde este servidor principal usando un sistema POS. Este
procedimiento es para maximizar otras utilidades de la tarjeta de ID
de ADN de plástico de la invención (S206). La Fig. 18 es un esquema
de un ejemplo de información codificada en la tarjeta de ID de ADN
de la invención.
7. Transcripción de la fotografía personal y
breve información personal para grabarlas en la tarjeta de ID de ADN
de plástico mediante el procedimiento de estampado en relieve
(S207).
8. Ingreso de datos personales en un
superordenador (para servidor), asignación de código de ID personal
específico de la tarjeta de ID de ADN de plástico, y configuración
de la contraseña personal (S208).
9. Construcción y Operación del sistema POS para
permitir el acceso a la información a la persona según las
condiciones de mantenimiento de la seguridad usando una ID y una
contraseña, las que se graban en la tarjeta de ID de ADN de
plástico, localmente o en el extranjero, de ser necesario para cada
persona, hospital, organización o banco, o similares (S2019).
\vskip1.000000\baselineskip
La Fig. 15 es un esquema de un ejemplo de
tarjeta de ID de ADN de plástico de la invención. En el frente de
la tarjeta están grabados la fotografía personal y el nombre, breve
información personal (al nivel que un hospital pueda manejar de
manera inmediata en una emergencia) y la dirección. En el reverso de
la tarjeta, hay una banda magnética en la que está codificada la
información genética personal, y está diseñada para albergar la
firma y el sitio de almacenamiento del ADN.
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Se determinó si el gen podía amplificarse a
partir del ADN que se había almacenado en la tarjeta de ADN de
papel Tipo 1 o Tipo 2, que se había incorporado en una tarjeta de
ADN de plástico, que se ha había producido anteriormente mediante
el tratamiento a alta temperatura y alta presión, por amplificación
del gen eNOS, que es uno de los genes de enfermedades geriátricas,
mediante PCR. El procedimiento se llevó a cabo de la misma manera
que en el Ejemplo 10 anterior.
Se incorporó la tarjeta de ADN de Tipo 1 y la
tarjeta de ADN de Tipo 2, respectivamente en una tarjeta de ID de
ADN de plástico que se había preparado a alta temperatura y alta
presión, para almacenar el ADN genómico humano y la sangre,
sumergidas en cada una de ellas. A continuación, utilizando estas
tarjetas de ID de ADN de plástico, se amplificó el gen eNOS, que es
uno de los genes de enfermedades geriátricas, por PCR para realizar
la comparación. Los resultados se mostraron en la Fig. 19. A través
de este experimento, se encontró que cuando se utilizaba en la
invención la tarjeta de ADN de Tipo 2 para absorber la sangre, la
muestra de sangre debía depositarse, y que primero debía quitarse
el revestimiento plástico de la tarjeta de ID de ADN de plástico en
la amplificación por PCR.
La Fig. 20 muestra los resultados de la
amplificación por PCR par el gen eNOS, que es uno de los genes de
enfermedades geriátricas, usando una tarjeta de ID de ADN de
plástico que se trató con alta temperatura sin presión
artificialmente en un laboratorio, y usando una que se preparó
prácticamente a alta temperatura y alta presión, para comparar el
caso en el que se añade una muestra antes de la preparación de la
tarjeta con el caso en el que se añade una muestra después de la
preparación de la tarjeta. A través de este experimento, los
resultados obtenidos mostraron que es mejor depositar una muestra en
la tarjeta de ID de ADN de plástico preparada previamente,
independientemente de que la muestra a almacenar sea ADN o
sangre.
Se pegó la tarjeta de ADN de Tipo 1 para
depositar ADN y la tarjeta de ADN de Tipo 2 para depositar sangre,
respectivamente en una tarjeta de plástico, que se preparó a alta
temperatura y alta presión para preparar una tarjeta de ID de ADN.
Para encontrar la concentración adecuada y la cantidad de muestras a
depositar en cada una de ellas, en el caso de ADN genómico, la
muestra de ADN se depositó en una concentración de 150 ng/? en
varios volúmenes utilizando la preparación de fragmento de tarjeta
como anteriormente, y se amplificó el gen eNOS por PCR y se ensayó.
Los resultados se mostraron en la Fig. 21. A través de este
experimento, se encontró que no es adecuado cargar la sangre en la
tarjeta de ADN de Tipo 1 (para ADN) y que pueden cargarse al menos
1,5 \mug o similar al depositar ADN.
Se comparó la diferencia y se analizó por
amplificación del gen eNOS, que es uno de los genes de enfermedades
geriátricas, por PCR, entre el caso en el que el fragmento de la
tarjeta se trató con un tampón de lavado como un proceso de
pretratamiento y el caso en el que no se realizó tratamiento en la
amplificación por PCR de la muestra conservada en una tarjeta de
ADN de plástico preparada a alta temperatura y alta presión. Los
resultados se mostraron en la Fig. 22. Como resultado, la
amplificación por PCR se realizó mejor cuando el fragmento de la
tarjeta no se había tratado previamente con un tampón de lavado en
la PCR utilizando una tarjeta de ID de ADN de plástico.
\vskip1.000000\baselineskip
El procedimiento de almacenamiento de ADN
utilizando quitosano hidrosoluble según la presente invención, es
excelente con respecto a la eficacia de almacenamiento del ADN, y
hace posible el almacenamiento del ADN de manera estable a
temperatura ambiente durante mucho tiempo a diferencia el
procedimiento convencional. Usando el presente procedimiento, es
posible almacenar y transportar ADN genómico de grandes plantas y
animales, y ADN genómico de hongos, bacterias y virus a temperatura
ambiente de manera estable durante un largo tiempo. El ADN
almacenado según el presente procedimiento es útil para todos los
ensayos genéticos tales como PCR y RFLP, clonación, secuenciación
de bases, transferencia Southern y similares. Además, puede
utilizarse ampliamente en un kit de PCR y similar, y es simple y
económico. Especialmente, la tarjeta de ADN de Tipo 1 de la
invención es muy útil para almacenar y transportar múltiples
muestras de ADN a temperatura ambiente durante mucho tiempo, y la
tarjeta de ADN de Tipo 2 puede almacenar diversas muestras
biológicas que contienen ADN, tales como la sangre, sin que se
produzcan daños en el ADN durante mucho tiempo a temperatura
ambiente. Además, para la muestra que se conserva en estas tarjetas
de ADN, pueden realizarse diversos ensayos genéticos, tales como
PCR y PCR-RFLP, hibridación, secuenciación de bases,
ensayos de SNP y similares, de forma precisa y simple incluso
después de un largo tiempo, que es muy útil en investigaciones
básicas y también en diversos tratamientos clínicos. Además, la
tarjeta de ID de ADN de la invención puede desempeñar una función de
banco de ADN que almacena las moléculas de ADN personales, y
también es útil para la identificación personal y el tratamiento
médico, tal como para trasplante de órganos y similares, también
mediante el almacenamiento de la información genética personal.
Claims (24)
1. Un procedimiento para almacenar ADN en forma
de complejo de quitosano/ADN preparado mezclando una disolución de
ADN y una disolución de quitosano hidrosoluble, en el que el ADN es
ADN genómico de animales, plantas, hongos, bacterias y virus, y el
quitosano hidrosoluble tiene un grado de desacetilación del 60% o
superior, y un peso molecular de 10 kDa a 500 kDa.
2. El procedimiento según la reivindicación 1,
en el que la concentración de una disolución acuosa de quitosano
hidrosoluble es del 0,02% (p/v) al 1% (p/v) y la relación de pesos
del quitosano hidrosoluble al ADN en la mezcla es de 1:0,5 o
superior.
3. El procedimiento según la reivindicación 1,
en el que la concentración de una disolución acuosa de quitosano
hidrosoluble es del 0,02% (p/v) al 0,25% (p/v), la concentración de
una disolución de ADN es de 1 \mug/\mul o inferior, y la
relación de pesos del quitosano hidrosoluble al ADN en la mezcla es
de 1:0,5 a 1:3.
4. El procedimiento según la reivindicación 1,
en el que el complejo del ADN y el quitosano se almacena a
temperaturas desde -70ºC hasta temperatura ambiente.
5. El procedimiento según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4, en el que el complejo de ADN unido a
quitosano se almacena en estado líquido.
6. Una tarjeta de ADN de tipo papel para
almacenar ADN, en la que la tarjeta de ADN se prepara por inmersión
en una composición que comprende quitosano hidrosoluble y ácido
úrico y por secado, y el ADN se conserva goteando una disolución de
ADN sobre la tarjeta a medida que el ADN se une con el quitosano
hidrosoluble, y el ADN es ADN genómico de animales, plantas, hongos,
bacterias o virus.
7. Una tarjeta de ADN de tipo papel para
almacenar ADN, en la que la tarjeta de ADN se prepara por inmersión
en una composición que comprende quitosano hidrosoluble y un tampón
de lisis celular que contiene ácido úrico y por secado, y el ADN se
almacena goteando muestra biológica que contiene ADN genómico sobre
la tarjeta a medida que el ADN se une con el quitosano
hidrosoluble.
8. La tarjeta de ADN de tipo papel según la
reivindicación 6 ó 7, en la que el papel es para transferencia o
cromatografía y el espesor del mismo es de 0,3 a 1,2 mm.
9. La tarjeta de ADN de tipo papel según la
reivindicación 6 ó 7, en la que la tarjeta está marcada con 6, 24,
96 ó 384 pocillos que tienen el tamaño de cada pocillo de un
diámetro de 12,3 cm x 8,1 cm, y la muestra de ADN o sangre se gotea
y almacena en cada pocillo.
10. La tarjeta de ADN de tipo papel según la
reivindicación 6, en la que la composición se prepara mezclando 0,1%
a 1% (p/v) de quitosano hidrosoluble con 0,5 mM a 20 mM de ácido
úrico en la relación de volúmenes 1:1.
11. La tarjeta de ADN de tipo papel según la
reivindicación 7, en la que el tampón de lisis celular comprende
Tris (8 mM), EDTA (0,5 mM), SDS (al 0,1% p/v) y ácido úrico (2
mM).
12. Un procedimiento para el ensayo de PCR sobre
la tarjeta de ADN que comprende las etapas de:
- a)
- añadir un fragmento de una tarjeta de ADN de la reivindicación 6 a un tubo de PCR;
- b)
- añadir un tampón TE (10 mM de Tris-Cl, 0,1 mM de EDTA, pH = 8,0) al tubo y dejar el tubo en reposo durante 5 minutos a temperatura ambiente tras la mezcla, y a continuación desechar el tampón TE usando una pipeta;
- c)
- repetir la etapa b) dos veces;
- d)
- secar el tubo durante 1 hora a temperatura ambiente o durante 10 minutos a 56ºC; y
- e)
- añadir las muestras de PCR al tubo y amplificar a través de PCR.
\vskip1.000000\baselineskip
13. Un procedimiento para el ensayo de PCR sobre
la tarjeta de ADN que comprende las etapas de:
- a)
- añadir un fragmento de la tarjeta de ADN de la reivindicación 7 a un tubo de PCR;
- b)
- añadir un tampón de lavado (reactivo de purificación GG; 0,5 mM de EDTA, 8 mM de Tris-Cl, 2 mM de ácido úrico, 1% (p/v) de SDS) al tubo y dejar el tubo en reposo durante 5 minutos a temperatura ambiente tras la mezcla, y a continuación desechar el tampón de lavado usando una pipeta;
- c)
- repetir la etapa b) tres veces;
- d)
- añadir un tampón TE (10 mM de Tris-Cl, 0,1 mM de EDTA, pH = 8,0) al tubo y dejar el tubo en reposo durante 5 minutos a temperatura ambiente tras la mezcla, y a continuación desechar el tampón TE usando una pipeta;
- e)
- repetir la etapa d) dos o tres veces;
- f)
- secar el tubo durante una hora a temperatura ambiente o durante 10 minutos a 56ºC; y
- g)
- añadir las muestras de PCR al tubo y amplificar a través de PCR.
\vskip1.000000\baselineskip
14. Un procedimiento para análisis, en el que el
ADN almacenado según el procedimiento de almacenamiento de la
reivindicación 5 o almacenado en una tarjeta de ADN según la
reivindicación 6 ó 7 se usa en PCR-RFLP, clonación,
síntesis de bibliotecas, análisis de secuenciación o transferencia
southern.
15. Un procedimiento para analizar ADN, en el
que el ADN separado de un complejo de quitosano/ADN en estado
líquido almacenado según el procedimiento de almacenamiento de la
reivindicación 5 o el complejo de quitosano/ADN almacenado en la
tarjeta de ADN según la reivindicación 6 ó 7 usando una sal
catiónica a base de sulfato se usa en el análisis genético.
16. El procedimiento para analizar ADN, según la
reivindicación 15, en el que las sales catiónicas a base de sulfato
incluyen SDS (dodecilsulfato de sodio), SOS (octilsulfato de sodio)
y CTAB (bromuro de cetiltrimetil amonio).
17. Un kit de PCR que comprende un tubo que
contiene oligo d(T), un cebador, DNA polimerasa Taq, una
disolución de tampón de reacción, dNTP y quitosano hidrosoluble, en
el que el tubo contiene además ADN genómico o la muestra de suero, y
el tubo se usa para llevar a cabo la PCR.
18. Una tarjeta de ID de ADN, en la que la
mezcla de quitosano y ADN genómico de un individuo se almacena en
una porción de la misma según el procedimiento de almacenamiento de
ADN de la reivindicación 1, y la información genética del individuo
se guarda en una barra magnética o en un chip incluido.
19. La tarjeta de ID de ADN según la
reivindicación 18, en la que el material básico de la tarjeta de ID
de ADN es un plástico.
20. Un procedimiento para la preparación de una
tarjeta de ID de ADN que comprende las etapas de:
- a)
- apilar las tarjetas de papel de ADN de la reivindicación 6 ó 7 sobre una capa blanda de PVC;
- b)
- apilar una primera capa núcleo de PVC, que tiene un agujero del mismo tamaño que la tarjeta de papel de ADN, en la tarjeta de papel de ADN;
- c)
- apilar una segunda capa núcleo de PVC, que tiene dos agujeros más pequeños que el agujero de la primera capa núcleo de PVC, sobre el agujero de la primera capa núcleo de PVC;
- d)
- apilar una capa blanda de PVC sobre la segunda capa núcleo de PVC; y
- e)
- añadir calor y presión a las capas apiladas para que se adhieran unas a otras por calor.
\vskip1.000000\baselineskip
21. La tarjeta de ID de ADN según la
reivindicación 19, que comprende:
una primera capa blanda de PVC; una tarjeta de
papel de ADN; una primera capa núcleo de PVC que tiene un agujero de
igual tamaño que el tamaño de la tarjeta de papel de ADN; una
segunda capa núcleo de PVC que tiene agujeros a través de los que se
gotea el ADN o las muestras biológicas que contienen ADN sobre la
tarjeta de papel de ADN; y una segunda capa blanda de PVC,
en la que la barra magnética está ubicada en el
lado opuesto al lado en el que se almacena el ADN o la muestra
biológica en la tarjeta de papel de ADN.
\vskip1.000000\baselineskip
22. La tarjeta de ID de ADN según la
reivindicación 21, en la que la información, el código de
enfermedades, el STR o tipo de HLA de un individuo están codificados
en la barra magnética.
23. La tarjeta de ID de ADN según la
reivindicación 18, en la que la cantidad de ADNg goteado en la
tarjeta de ID de ADN es de 1,5 \mug o mayor.
24. Un procedimiento para analizar por medio de
PCR la tarjeta de ID de ADN, en el que los fragmentos de la tarjeta
de ID de ADN de la reivindicación 18 se usan en la amplificación por
PCR sin recibir tratamiento con un tampón de lavado.
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