EA037019B1 - Пептид, который связывается с молекулой главного комплекса гистосовместимости, нуклеиновая кислота, вектор экспрессии, клетка-хозяин, активированный цитотоксический т-лимфоцит, антитело и их применение в качестве лекарственного средства для лечения рака - Google Patents
Пептид, который связывается с молекулой главного комплекса гистосовместимости, нуклеиновая кислота, вектор экспрессии, клетка-хозяин, активированный цитотоксический т-лимфоцит, антитело и их применение в качестве лекарственного средства для лечения рака Download PDFInfo
- Publication number
- EA037019B1 EA037019B1 EA201792409A EA201792409A EA037019B1 EA 037019 B1 EA037019 B1 EA 037019B1 EA 201792409 A EA201792409 A EA 201792409A EA 201792409 A EA201792409 A EA 201792409A EA 037019 B1 EA037019 B1 EA 037019B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- cancer
- cell
- cells
- peptide
- tumor
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 350
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title claims abstract description 244
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 title claims abstract description 216
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 84
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 title claims abstract description 40
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 36
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 34
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 34
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 title claims description 41
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 title claims description 41
- 238000011282 treatment Methods 0.000 title claims description 24
- 239000003814 drug Substances 0.000 title claims description 18
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 title claims description 17
- 230000027455 binding Effects 0.000 title description 28
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 169
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 77
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims abstract description 66
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims abstract description 12
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 claims description 135
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 claims description 129
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 claims description 125
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 65
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 62
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 62
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 62
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 22
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 21
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims description 19
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 claims description 19
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 claims description 14
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 claims description 13
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 claims description 12
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 12
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 12
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 claims description 12
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 claims description 12
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 11
- 208000001333 Colorectal Neoplasms Diseases 0.000 claims description 10
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 claims description 9
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 6
- 206010017993 Gastrointestinal neoplasms Diseases 0.000 claims description 4
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 4
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 3
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 3
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 claims description 2
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 claims description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 abstract description 36
- 239000000203 mixture Substances 0.000 abstract description 18
- 230000005975 antitumor immune response Effects 0.000 abstract description 6
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 abstract description 5
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 abstract description 4
- 230000001024 immunotherapeutic effect Effects 0.000 abstract description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 146
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 94
- -1 clones Substances 0.000 description 91
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 90
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 86
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 83
- 102100021435 Macrophage-stimulating protein receptor Human genes 0.000 description 65
- 101710196759 Macrophage-stimulating protein receptor Proteins 0.000 description 64
- 101000809126 Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5 Proteins 0.000 description 60
- 102100038443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5 Human genes 0.000 description 60
- 101000605434 Homo sapiens Phospholipid phosphatase 2 Proteins 0.000 description 59
- 102100038120 Phospholipid phosphatase 2 Human genes 0.000 description 59
- 101000825726 Homo sapiens Structural maintenance of chromosomes protein 4 Proteins 0.000 description 56
- 102100022842 Structural maintenance of chromosomes protein 4 Human genes 0.000 description 56
- 101000730000 Homo sapiens Late secretory pathway protein AVL9 homolog Proteins 0.000 description 54
- 102100032642 Late secretory pathway protein AVL9 homolog Human genes 0.000 description 54
- 102100027896 Cytochrome b-c1 complex subunit 7 Human genes 0.000 description 52
- 101001060428 Homo sapiens Cytochrome b-c1 complex subunit 7 Proteins 0.000 description 52
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 41
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 41
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 40
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 38
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 38
- 230000006870 function Effects 0.000 description 37
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 36
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 35
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 34
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 31
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 30
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 description 28
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 27
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 26
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 23
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 23
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 21
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 20
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 19
- 230000033115 angiogenesis Effects 0.000 description 18
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 18
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 18
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 17
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 17
- 102100026071 Olfactomedin-4 Human genes 0.000 description 16
- 101710109505 Olfactomedin-4 Proteins 0.000 description 16
- 102000007537 Type II DNA Topoisomerases Human genes 0.000 description 16
- 108010046308 Type II DNA Topoisomerases Proteins 0.000 description 16
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 16
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 16
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 16
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 16
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 16
- 230000004044 response Effects 0.000 description 16
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 16
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 16
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 16
- 108010076502 Matrix Metalloproteinase 11 Proteins 0.000 description 15
- 102100028847 Stromelysin-3 Human genes 0.000 description 15
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 15
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 15
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 15
- 102000002734 Collagen Type VI Human genes 0.000 description 14
- 108010043741 Collagen Type VI Proteins 0.000 description 14
- 102100029986 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Human genes 0.000 description 14
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 14
- 239000000306 component Substances 0.000 description 14
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 14
- 239000000047 product Substances 0.000 description 14
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 14
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 14
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 13
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 13
- 102000019298 Lipocalin Human genes 0.000 description 13
- 108050006654 Lipocalin Proteins 0.000 description 13
- 101710100969 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 description 13
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 13
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 13
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 13
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 13
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 13
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 13
- 230000008569 process Effects 0.000 description 13
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 13
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 12
- 102000001301 EGF receptor Human genes 0.000 description 12
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 12
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 12
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 12
- 208000006265 Renal cell carcinoma Diseases 0.000 description 12
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 12
- 101710081835 Transmembrane protease serine 4 Proteins 0.000 description 12
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 12
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 12
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 12
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 12
- 238000003197 gene knockdown Methods 0.000 description 12
- 108010005465 AC133 Antigen Proteins 0.000 description 11
- 102000005908 AC133 Antigen Human genes 0.000 description 11
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 11
- 208000005623 Carcinogenesis Diseases 0.000 description 11
- 108060006698 EGF receptor Proteins 0.000 description 11
- 101000684208 Homo sapiens Prolyl endopeptidase FAP Proteins 0.000 description 11
- 102100023832 Prolyl endopeptidase FAP Human genes 0.000 description 11
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 11
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 11
- 102100032471 Transmembrane protease serine 4 Human genes 0.000 description 11
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 11
- 230000036952 cancer formation Effects 0.000 description 11
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 11
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 11
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 11
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 11
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 11
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 11
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 11
- 102000003984 Aryl Hydrocarbon Receptors Human genes 0.000 description 10
- 108090000448 Aryl Hydrocarbon Receptors Proteins 0.000 description 10
- 108010026988 CCAAT-Binding Factor Proteins 0.000 description 10
- 108010003101 ClC-3 channel Proteins 0.000 description 10
- 102100034477 H(+)/Cl(-) exchange transporter 3 Human genes 0.000 description 10
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 10
- 102100032431 Kinetochore protein Nuf2 Human genes 0.000 description 10
- 102100027998 Macrophage metalloelastase Human genes 0.000 description 10
- 108010076501 Matrix Metalloproteinase 12 Proteins 0.000 description 10
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 10
- 102000043366 Wnt-5a Human genes 0.000 description 10
- 208000010749 gastric carcinoma Diseases 0.000 description 10
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 10
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 10
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 10
- 201000000498 stomach carcinoma Diseases 0.000 description 10
- 102100039864 ATPase family AAA domain-containing protein 2 Human genes 0.000 description 9
- 108010062802 CD66 antigens Proteins 0.000 description 9
- 101150012716 CDK1 gene Proteins 0.000 description 9
- 102100024533 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 9
- 108010060385 Cyclin B1 Proteins 0.000 description 9
- 108010058544 Cyclin D2 Proteins 0.000 description 9
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 9
- 102100030340 Ephrin type-A receptor 2 Human genes 0.000 description 9
- 108010091824 Focal Adhesion Kinase 1 Proteins 0.000 description 9
- 102100037813 Focal adhesion kinase 1 Human genes 0.000 description 9
- 102100024185 G1/S-specific cyclin-D2 Human genes 0.000 description 9
- 102100032340 G2/mitotic-specific cyclin-B1 Human genes 0.000 description 9
- 101000887284 Homo sapiens ATPase family AAA domain-containing protein 2 Proteins 0.000 description 9
- 101001050567 Homo sapiens Kinesin-like protein KIF2C Proteins 0.000 description 9
- 101000590482 Homo sapiens Kinetochore protein Nuf2 Proteins 0.000 description 9
- 101001023271 Homo sapiens Laminin subunit gamma-2 Proteins 0.000 description 9
- 101000804792 Homo sapiens Protein Wnt-5a Proteins 0.000 description 9
- 102100023424 Kinesin-like protein KIF2C Human genes 0.000 description 9
- 102100035159 Laminin subunit gamma-2 Human genes 0.000 description 9
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 9
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 9
- 102100030169 Tetraspanin-1 Human genes 0.000 description 9
- 101710151653 Tetraspanin-1 Proteins 0.000 description 9
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 9
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 9
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 9
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 9
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 9
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 9
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 9
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 9
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 9
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 9
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 9
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 9
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 9
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 9
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 9
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 9
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 9
- 108010047866 ribonucleotide reductase M2 Proteins 0.000 description 9
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 9
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 9
- 102000019063 CCAAT-Binding Factor Human genes 0.000 description 8
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 description 8
- 102100032952 Condensin complex subunit 3 Human genes 0.000 description 8
- 101710113864 Heat shock protein 90 Proteins 0.000 description 8
- 102000008949 Histocompatibility Antigens Class I Human genes 0.000 description 8
- 101000914324 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Proteins 0.000 description 8
- 101000942622 Homo sapiens Condensin complex subunit 3 Proteins 0.000 description 8
- 101000610551 Homo sapiens Prominin-1 Proteins 0.000 description 8
- 101000837565 Homo sapiens Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S Proteins 0.000 description 8
- 102100022875 Hypoxia-inducible factor 1-alpha Human genes 0.000 description 8
- 102000015636 Oligopeptides Human genes 0.000 description 8
- 108010038807 Oligopeptides Proteins 0.000 description 8
- 102100040120 Prominin-1 Human genes 0.000 description 8
- 102100028718 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S Human genes 0.000 description 8
- 239000002585 base Substances 0.000 description 8
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 8
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 8
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 8
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 8
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 8
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 description 8
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 description 8
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 8
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 8
- 230000011278 mitosis Effects 0.000 description 8
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 description 8
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 8
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 8
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 8
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 8
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 8
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 8
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 description 8
- 102100032282 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 Human genes 0.000 description 7
- 108091007504 ADAM10 Proteins 0.000 description 7
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 7
- 102100025473 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6 Human genes 0.000 description 7
- 102100032857 Cyclin-dependent kinase 1 Human genes 0.000 description 7
- 102100039673 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 Human genes 0.000 description 7
- 102100038085 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L Human genes 0.000 description 7
- 102100030280 G-protein coupled receptor 39 Human genes 0.000 description 7
- 101710108858 G-protein coupled receptor 39 Proteins 0.000 description 7
- 102100037854 G1/S-specific cyclin-E2 Human genes 0.000 description 7
- 102100034051 Heat shock protein HSP 90-alpha Human genes 0.000 description 7
- 101000590281 Homo sapiens 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 Proteins 0.000 description 7
- 101000914326 Homo sapiens Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6 Proteins 0.000 description 7
- 101000810389 Homo sapiens Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L Proteins 0.000 description 7
- 101000738575 Homo sapiens G1/S-specific cyclin-E2 Proteins 0.000 description 7
- 101001046870 Homo sapiens Hypoxia-inducible factor 1-alpha Proteins 0.000 description 7
- 102100026517 Lamin-B1 Human genes 0.000 description 7
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 7
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 7
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 7
- 101150005816 PLK4 gene Proteins 0.000 description 7
- 230000018199 S phase Effects 0.000 description 7
- 102100032802 Tetraspanin-8 Human genes 0.000 description 7
- 101710151636 Tetraspanin-8 Proteins 0.000 description 7
- 230000021164 cell adhesion Effects 0.000 description 7
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 7
- 210000003793 centrosome Anatomy 0.000 description 7
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 7
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 7
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 7
- 108010052263 lamin B1 Proteins 0.000 description 7
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 7
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 7
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 7
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 7
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 7
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 7
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000014870 Collagen Type XII Human genes 0.000 description 6
- 108010039001 Collagen Type XII Proteins 0.000 description 6
- 102100024364 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 8 Human genes 0.000 description 6
- 102100023317 DnaJ homolog subfamily C member 10 Human genes 0.000 description 6
- 206010051066 Gastrointestinal stromal tumour Diseases 0.000 description 6
- 102100036769 Girdin Human genes 0.000 description 6
- 102100028972 HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain Human genes 0.000 description 6
- 108090000100 Hepatocyte Growth Factor Proteins 0.000 description 6
- 102000003745 Hepatocyte Growth Factor Human genes 0.000 description 6
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 description 6
- 101000832767 Homo sapiens Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 8 Proteins 0.000 description 6
- 101001071367 Homo sapiens Girdin Proteins 0.000 description 6
- 101000994788 Homo sapiens Ras GTPase-activating-like protein IQGAP3 Proteins 0.000 description 6
- 101000800116 Homo sapiens Thy-1 membrane glycoprotein Proteins 0.000 description 6
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 description 6
- 102100026753 Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase Human genes 0.000 description 6
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 6
- 102000029749 Microtubule Human genes 0.000 description 6
- 108091022875 Microtubule Proteins 0.000 description 6
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 6
- 108010014971 PDZ-binding kinase Proteins 0.000 description 6
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 description 6
- 108090000708 Proteasome Endopeptidase Complex Proteins 0.000 description 6
- 102000004245 Proteasome Endopeptidase Complex Human genes 0.000 description 6
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 6
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 6
- 102100034417 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP3 Human genes 0.000 description 6
- 102000005039 SLC6A6 Human genes 0.000 description 6
- 108060007765 SLC6A6 Proteins 0.000 description 6
- 208000000102 Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck Diseases 0.000 description 6
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 6
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 6
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 6
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 6
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 6
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 6
- 102000015694 estrogen receptors Human genes 0.000 description 6
- 108010038795 estrogen receptors Proteins 0.000 description 6
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 6
- 201000011243 gastrointestinal stromal tumor Diseases 0.000 description 6
- 229920002674 hyaluronan Polymers 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 6
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 6
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 6
- 239000000463 material Substances 0.000 description 6
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 6
- 210000004688 microtubule Anatomy 0.000 description 6
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 6
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 102000016914 ras Proteins Human genes 0.000 description 6
- 108010014186 ras Proteins Proteins 0.000 description 6
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 6
- 150000003839 salts Chemical group 0.000 description 6
- 241000894007 species Species 0.000 description 6
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 6
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 6
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 6
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 6
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 6
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 6
- KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-Acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O3)C(O)=O)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)NC(C)=O)[C@@H](C(O)=O)O1 KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N 0.000 description 5
- 108010022579 ATP dependent 26S protease Proteins 0.000 description 5
- 108091006112 ATPases Proteins 0.000 description 5
- 102000057290 Adenosine Triphosphatases Human genes 0.000 description 5
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 5
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 5
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 5
- 108050006400 Cyclin Proteins 0.000 description 5
- 101710106279 Cyclin-dependent kinase 1 Proteins 0.000 description 5
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 5
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 108010075704 HLA-A Antigens Proteins 0.000 description 5
- 101000868273 Homo sapiens CD44 antigen Proteins 0.000 description 5
- 101000908042 Homo sapiens DnaJ homolog subfamily C member 10 Proteins 0.000 description 5
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 5
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 5
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101150033450 NUF2 gene Proteins 0.000 description 5
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 5
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 description 5
- 101150052863 THY1 gene Proteins 0.000 description 5
- 102100033523 Thy-1 membrane glycoprotein Human genes 0.000 description 5
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 5
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 5
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 5
- 230000009087 cell motility Effects 0.000 description 5
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 5
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 5
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 5
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 5
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 5
- 229960003160 hyaluronic acid Drugs 0.000 description 5
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 5
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 5
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 5
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 5
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 5
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 description 5
- 201000002740 oral squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 5
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 5
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 5
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 5
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 5
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 5
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 5
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 5
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 5
- 210000002536 stromal cell Anatomy 0.000 description 5
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 230000002381 testicular Effects 0.000 description 5
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 5
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 5
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 5
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 5
- 102000029791 ADAM Human genes 0.000 description 4
- 108091022885 ADAM Proteins 0.000 description 4
- ORILYTVJVMAKLC-UHFFFAOYSA-N Adamantane Natural products C1C(C2)CC3CC1CC2C3 ORILYTVJVMAKLC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000015735 Beta-catenin Human genes 0.000 description 4
- 108060000903 Beta-catenin Proteins 0.000 description 4
- 102100032912 CD44 antigen Human genes 0.000 description 4
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 description 4
- 102100039219 Centrosome-associated protein CEP250 Human genes 0.000 description 4
- 101710110151 Centrosome-associated protein CEP250 Proteins 0.000 description 4
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 description 4
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 4
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 4
- 108010068192 Cyclin A Proteins 0.000 description 4
- 102100024458 Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A Human genes 0.000 description 4
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 4
- 101150076616 EPHA2 gene Proteins 0.000 description 4
- 230000006782 ER associated degradation Effects 0.000 description 4
- 108010055196 EphA2 Receptor Proteins 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- 101000721661 Homo sapiens Cellular tumor antigen p53 Proteins 0.000 description 4
- 101000823316 Homo sapiens Tyrosine-protein kinase ABL1 Proteins 0.000 description 4
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010022238 Integrin beta4 Proteins 0.000 description 4
- 102000012334 Integrin beta4 Human genes 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- 208000007433 Lymphatic Metastasis Diseases 0.000 description 4
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 4
- 102000043136 MAP kinase family Human genes 0.000 description 4
- 108091054455 MAP kinase family Proteins 0.000 description 4
- 102100030412 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 description 4
- 206010027459 Metastases to lymph nodes Diseases 0.000 description 4
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 4
- 101100545330 Mus musculus Znf598 gene Proteins 0.000 description 4
- 102000002020 Protease-activated receptors Human genes 0.000 description 4
- 108050009310 Protease-activated receptors Proteins 0.000 description 4
- 108091008611 Protein Kinase B Proteins 0.000 description 4
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 4
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 4
- 102100028873 Sodium- and chloride-dependent taurine transporter Human genes 0.000 description 4
- 108010012901 Succinate Dehydrogenase Proteins 0.000 description 4
- 102000019259 Succinate Dehydrogenase Human genes 0.000 description 4
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 4
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 4
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 4
- 102100022596 Tyrosine-protein kinase ABL1 Human genes 0.000 description 4
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 description 4
- 102000006076 ZNF598 Human genes 0.000 description 4
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 4
- 238000011319 anticancer therapy Methods 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 4
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 4
- 210000002230 centromere Anatomy 0.000 description 4
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 description 4
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 4
- 210000004292 cytoskeleton Anatomy 0.000 description 4
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 4
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 4
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 4
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 4
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 4
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000007705 epithelial mesenchymal transition Effects 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 230000007954 hypoxia Effects 0.000 description 4
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 4
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 4
- 230000002637 immunotoxin Effects 0.000 description 4
- 229940051026 immunotoxin Drugs 0.000 description 4
- 239000002596 immunotoxin Substances 0.000 description 4
- 231100000608 immunotoxin Toxicity 0.000 description 4
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 4
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 4
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 4
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 4
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 4
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 4
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 4
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 4
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 4
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 4
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 4
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 4
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 4
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 102000027426 receptor tyrosine kinases Human genes 0.000 description 4
- 108091008598 receptor tyrosine kinases Proteins 0.000 description 4
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 4
- 102000004413 ribosomal protein S11 Human genes 0.000 description 4
- 108090000930 ribosomal protein S11 Proteins 0.000 description 4
- 238000005204 segregation Methods 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 4
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 4
- 108010017629 taurine transporter Proteins 0.000 description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 4
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 4
- 230000005748 tumor development Effects 0.000 description 4
- HGUFODBRKLSHSI-UHFFFAOYSA-N 2,3,7,8-tetrachloro-dibenzo-p-dioxin Chemical compound O1C2=CC(Cl)=C(Cl)C=C2OC2=C1C=C(Cl)C(Cl)=C2 HGUFODBRKLSHSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NHJVRSWLHSJWIN-UHFFFAOYSA-N 2,4,6-trinitrobenzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=C([N+]([O-])=O)C=C([N+]([O-])=O)C=C1[N+]([O-])=O NHJVRSWLHSJWIN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 3
- 102100032187 Androgen receptor Human genes 0.000 description 3
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 3
- 101100268645 Caenorhabditis elegans abl-1 gene Proteins 0.000 description 3
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 3
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 3
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 3
- 108010025464 Cyclin-Dependent Kinase 4 Proteins 0.000 description 3
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 3
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 3
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 3
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 3
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100021242 Dymeclin Human genes 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 102100036443 Epiplakin Human genes 0.000 description 3
- 108010089790 Eukaryotic Initiation Factor-3 Proteins 0.000 description 3
- 102100034295 Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A Human genes 0.000 description 3
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 3
- 102000006354 HLA-DR Antigens Human genes 0.000 description 3
- 108010058597 HLA-DR Antigens Proteins 0.000 description 3
- 108010088652 Histocompatibility Antigens Class I Proteins 0.000 description 3
- 101000817629 Homo sapiens Dymeclin Proteins 0.000 description 3
- 101000851943 Homo sapiens Epiplakin Proteins 0.000 description 3
- 101001015006 Homo sapiens Integrin beta-4 Proteins 0.000 description 3
- 101000972278 Homo sapiens Mucin-6 Proteins 0.000 description 3
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 3
- 102100033000 Integrin beta-4 Human genes 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- 206010064912 Malignant transformation Diseases 0.000 description 3
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Malonic acid Chemical compound OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 3
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 3
- 102000005741 Metalloproteases Human genes 0.000 description 3
- 108010006035 Metalloproteases Proteins 0.000 description 3
- 102100022493 Mucin-6 Human genes 0.000 description 3
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 3
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 3
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 3
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 3
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 3
- 102000007999 Nuclear Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010089610 Nuclear Proteins Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108090000526 Papain Proteins 0.000 description 3
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 3
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 102100036691 Proliferating cell nuclear antigen Human genes 0.000 description 3
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 3
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 3
- 101150058540 RAC1 gene Proteins 0.000 description 3
- 102100022122 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 Human genes 0.000 description 3
- 102100030267 Serine/threonine-protein kinase PLK4 Human genes 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 3
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 3
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 3
- 108010040002 Tumor Suppressor Proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000001742 Tumor Suppressor Proteins Human genes 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 3
- 230000009471 action Effects 0.000 description 3
- 108010080146 androgen receptors Proteins 0.000 description 3
- 230000005809 anti-tumor immunity Effects 0.000 description 3
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 3
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 3
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 3
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 3
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 3
- 238000002619 cancer immunotherapy Methods 0.000 description 3
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 description 3
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 3
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 3
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 3
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 3
- 230000012292 cell migration Effects 0.000 description 3
- 208000019065 cervical carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 3
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 3
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 3
- DQLATGHUWYMOKM-UHFFFAOYSA-L cisplatin Chemical compound N[Pt](N)(Cl)Cl DQLATGHUWYMOKM-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 3
- 229960004316 cisplatin Drugs 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 108010057108 condensin complexes Proteins 0.000 description 3
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 3
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000000172 cytosol Anatomy 0.000 description 3
- 230000034994 death Effects 0.000 description 3
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 3
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 3
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 3
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 3
- 230000008482 dysregulation Effects 0.000 description 3
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 3
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 3
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 3
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 3
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 3
- 108010028930 invariant chain Proteins 0.000 description 3
- 210000002415 kinetochore Anatomy 0.000 description 3
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- 230000036212 malign transformation Effects 0.000 description 3
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 3
- 210000002901 mesenchymal stem cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 229940055729 papain Drugs 0.000 description 3
- 235000019834 papain Nutrition 0.000 description 3
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 230000002028 premature Effects 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 3
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 3
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 3
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 3
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 3
- NPCOQXAVBJJZBQ-UHFFFAOYSA-N reduced coenzyme Q9 Natural products COC1=C(O)C(C)=C(CC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)C(O)=C1OC NPCOQXAVBJJZBQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000007634 remodeling Methods 0.000 description 3
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 3
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 3
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 3
- 230000035882 stress Effects 0.000 description 3
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 3
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 3
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 3
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 description 3
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 description 3
- JVJFIQYAHPMBBX-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxynonenal Chemical compound CCCCCC(O)C=CC=O JVJFIQYAHPMBBX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 2
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 2
- 230000007730 Akt signaling Effects 0.000 description 2
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000036170 B-Cell Marginal Zone Lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 102100021663 Baculoviral IAP repeat-containing protein 5 Human genes 0.000 description 2
- 102100037676 CCAAT/enhancer-binding protein zeta Human genes 0.000 description 2
- 210000001239 CD8-positive, alpha-beta cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 108010034798 CDC2 Protein Kinase Proteins 0.000 description 2
- 101150090583 COL6A3 gene Proteins 0.000 description 2
- 108050007957 Cadherin Proteins 0.000 description 2
- 102000011068 Cdc42 Human genes 0.000 description 2
- 108050001278 Cdc42 Proteins 0.000 description 2
- 108091006146 Channels Proteins 0.000 description 2
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ACTIUHUUMQJHFO-UHFFFAOYSA-N Coenzym Q10 Natural products COC1=C(OC)C(=O)C(CC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)=C(C)C1=O ACTIUHUUMQJHFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000012422 Collagen Type I Human genes 0.000 description 2
- 108010022452 Collagen Type I Proteins 0.000 description 2
- 206010053138 Congenital aplastic anaemia Diseases 0.000 description 2
- 102000036364 Cullin Ring E3 Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108091007045 Cullin Ring E3 Ligases Proteins 0.000 description 2
- 102000016736 Cyclin Human genes 0.000 description 2
- 102000002554 Cyclin A Human genes 0.000 description 2
- 102100025191 Cyclin-A2 Human genes 0.000 description 2
- 102100036252 Cyclin-dependent kinase 4 Human genes 0.000 description 2
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 2
- 230000033616 DNA repair Effects 0.000 description 2
- QSJXEFYPDANLFS-UHFFFAOYSA-N Diacetyl Chemical compound CC(=O)C(C)=O QSJXEFYPDANLFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 description 2
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101800001224 Disintegrin Proteins 0.000 description 2
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 2
- 108010014258 Elastin Proteins 0.000 description 2
- 102000016942 Elastin Human genes 0.000 description 2
- 102000005593 Endopeptidases Human genes 0.000 description 2
- 108010059378 Endopeptidases Proteins 0.000 description 2
- 102000050554 Eph Family Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108091008815 Eph receptors Proteins 0.000 description 2
- 102400001368 Epidermal growth factor Human genes 0.000 description 2
- 101800003838 Epidermal growth factor Proteins 0.000 description 2
- 206010061850 Extranodal marginal zone B-cell lymphoma (MALT type) Diseases 0.000 description 2
- 201000004939 Fanconi anemia Diseases 0.000 description 2
- GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N Fluorouracil Chemical compound FC1=CNC(=O)NC1=O GHASVSINZRGABV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000010190 G1 phase Effects 0.000 description 2
- 230000010337 G2 phase Effects 0.000 description 2
- 102000013446 GTP Phosphohydrolases Human genes 0.000 description 2
- 108091006109 GTPases Proteins 0.000 description 2
- 206010061968 Gastric neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 108010026132 Gelatinases Proteins 0.000 description 2
- 102000013382 Gelatinases Human genes 0.000 description 2
- 208000032612 Glial tumor Diseases 0.000 description 2
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 208000017891 HER2 positive breast carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 2
- 241000590002 Helicobacter pylori Species 0.000 description 2
- 102100031573 Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Human genes 0.000 description 2
- 101000777663 Homo sapiens Hematopoietic progenitor cell antigen CD34 Proteins 0.000 description 2
- 101001076292 Homo sapiens Insulin-like growth factor II Proteins 0.000 description 2
- 101000990902 Homo sapiens Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 description 2
- 101000995046 Homo sapiens Nuclear transcription factor Y subunit alpha Proteins 0.000 description 2
- 101000994790 Homo sapiens Ras GTPase-activating-like protein IQGAP2 Proteins 0.000 description 2
- 101001059454 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase MARK2 Proteins 0.000 description 2
- 101000582914 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase PLK4 Proteins 0.000 description 2
- 101001050288 Homo sapiens Transcription factor Jun Proteins 0.000 description 2
- 101000733249 Homo sapiens Tumor suppressor ARF Proteins 0.000 description 2
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 2
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010050332 IQ motif containing GTPase activating protein 1 Proteins 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 206010061523 Lip and/or oral cavity cancer Diseases 0.000 description 2
- 206010025323 Lymphomas Diseases 0.000 description 2
- 201000003791 MALT lymphoma Diseases 0.000 description 2
- 108010015302 Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 description 2
- 102100028389 Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Human genes 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AIJULSRZWUXGPQ-UHFFFAOYSA-N Methylglyoxal Chemical compound CC(=O)C=O AIJULSRZWUXGPQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PCLIMKBDDGJMGD-UHFFFAOYSA-N N-bromosuccinimide Chemical compound BrN1C(=O)CCC1=O PCLIMKBDDGJMGD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000002454 Nasopharyngeal Carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 206010061306 Nasopharyngeal cancer Diseases 0.000 description 2
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- 102100034408 Nuclear transcription factor Y subunit alpha Human genes 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 208000037273 Pathologic Processes Diseases 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000001107 Phosphatidate Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108010069394 Phosphatidate Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091000120 Plakin Proteins 0.000 description 2
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 2
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 2
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 2
- 102000052575 Proto-Oncogene Human genes 0.000 description 2
- 108700020978 Proto-Oncogene Proteins 0.000 description 2
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100033810 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase Human genes 0.000 description 2
- 108020004518 RNA Probes Proteins 0.000 description 2
- 239000003391 RNA probe Substances 0.000 description 2
- 102100034419 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 Human genes 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108700005075 Regulator Genes Proteins 0.000 description 2
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 2
- 102000000395 SH3 domains Human genes 0.000 description 2
- 108050008861 SH3 domains Proteins 0.000 description 2
- 206010039491 Sarcoma Diseases 0.000 description 2
- 102100028904 Serine/threonine-protein kinase MARK2 Human genes 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010002687 Survivin Proteins 0.000 description 2
- 108010008125 Tenascin Proteins 0.000 description 2
- 102000007000 Tenascin Human genes 0.000 description 2
- 208000024313 Testicular Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 102100023132 Transcription factor Jun Human genes 0.000 description 2
- 108700025716 Tumor Suppressor Genes Proteins 0.000 description 2
- 102000044209 Tumor Suppressor Genes Human genes 0.000 description 2
- 101710102803 Tumor suppressor ARF Proteins 0.000 description 2
- 206010064390 Tumour invasion Diseases 0.000 description 2
- 101150078148 UQCRB gene Proteins 0.000 description 2
- 108010005656 Ubiquitin Thiolesterase Proteins 0.000 description 2
- 102000005918 Ubiquitin Thiolesterase Human genes 0.000 description 2
- 102000006275 Ubiquitin-Protein Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010083111 Ubiquitin-Protein Ligases Proteins 0.000 description 2
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 2
- 108700020467 WT1 Proteins 0.000 description 2
- 101150084041 WT1 gene Proteins 0.000 description 2
- 102100022748 Wilms tumor protein Human genes 0.000 description 2
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000035508 accumulation Effects 0.000 description 2
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 2
- 150000008043 acidic salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 2
- 230000002730 additional effect Effects 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 description 2
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 2
- 125000003368 amide group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 description 2
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 2
- 230000031016 anaphase Effects 0.000 description 2
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 2
- 208000036878 aneuploidy Diseases 0.000 description 2
- 231100001075 aneuploidy Toxicity 0.000 description 2
- RDOXTESZEPMUJZ-UHFFFAOYSA-N anisole Chemical compound COC1=CC=CC=C1 RDOXTESZEPMUJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002424 anti-apoptotic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 2
- 229940041181 antineoplastic drug Drugs 0.000 description 2
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 description 2
- 210000003567 ascitic fluid Anatomy 0.000 description 2
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 2
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 2
- 208000006673 asthma Diseases 0.000 description 2
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 210000002469 basement membrane Anatomy 0.000 description 2
- 108010081355 beta 2-Microglobulin Proteins 0.000 description 2
- 102000015736 beta 2-Microglobulin Human genes 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 201000008275 breast carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- 230000009400 cancer invasion Effects 0.000 description 2
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 description 2
- 230000021235 carbamoylation Effects 0.000 description 2
- 108700021031 cdc Genes Proteins 0.000 description 2
- 101150073031 cdk2 gene Proteins 0.000 description 2
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 2
- 230000004709 cell invasion Effects 0.000 description 2
- 210000004718 centriole Anatomy 0.000 description 2
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 2
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 2
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000017471 coenzyme Q10 Nutrition 0.000 description 2
- ACTIUHUUMQJHFO-UPTCCGCDSA-N coenzyme Q10 Chemical compound COC1=C(OC)C(=O)C(C\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CCC=C(C)C)=C(C)C1=O ACTIUHUUMQJHFO-UPTCCGCDSA-N 0.000 description 2
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 2
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 2
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 2
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 2
- 230000037029 cross reaction Effects 0.000 description 2
- XVOYSCVBGLVSOL-UHFFFAOYSA-N cysteic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CS(O)(=O)=O XVOYSCVBGLVSOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 2
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 2
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 2
- 230000002074 deregulated effect Effects 0.000 description 2
- 208000024334 diffuse gastric cancer Diseases 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- OQALFHMKVSJFRR-UHFFFAOYSA-N dityrosine Chemical compound OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C(C=2C(=CC=C(CC(N)C(O)=O)C=2)O)=C1 OQALFHMKVSJFRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 2
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 2
- 210000003162 effector t lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 229920002549 elastin Polymers 0.000 description 2
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 2
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 2
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 229940116977 epidermal growth factor Drugs 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000010265 fast atom bombardment Methods 0.000 description 2
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- 229960002949 fluorouracil Drugs 0.000 description 2
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 2
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 2
- 210000001156 gastric mucosa Anatomy 0.000 description 2
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 2
- 125000000291 glutamic acid group Chemical group N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)* 0.000 description 2
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 2
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 229940037467 helicobacter pylori Drugs 0.000 description 2
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 229920001519 homopolymer Polymers 0.000 description 2
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 2
- 125000001165 hydrophobic group Chemical group 0.000 description 2
- 230000007124 immune defense Effects 0.000 description 2
- 229940124452 immunizing agent Drugs 0.000 description 2
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 2
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 2
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 2
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 2
- 230000016507 interphase Effects 0.000 description 2
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 2
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 108010028309 kalinin Proteins 0.000 description 2
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 2
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 2
- 208000012987 lip and oral cavity carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 2
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 238000002595 magnetic resonance imaging Methods 0.000 description 2
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 2
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N malic acid Chemical compound OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000002752 melanocyte Anatomy 0.000 description 2
- 206010027191 meningioma Diseases 0.000 description 2
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 2
- 208000004141 microcephaly Diseases 0.000 description 2
- 210000003632 microfilament Anatomy 0.000 description 2
- 210000004088 microvessel Anatomy 0.000 description 2
- 230000002438 mitochondrial effect Effects 0.000 description 2
- 230000004899 motility Effects 0.000 description 2
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 2
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 201000011216 nasopharynx carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 2
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 238000002414 normal-phase solid-phase extraction Methods 0.000 description 2
- 230000005937 nuclear translocation Effects 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 201000008968 osteosarcoma Diseases 0.000 description 2
- 230000036542 oxidative stress Effects 0.000 description 2
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 2
- 201000008129 pancreatic ductal adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000005298 paramagnetic effect Effects 0.000 description 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 230000009054 pathological process Effects 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- OJUGVDODNPJEEC-UHFFFAOYSA-N phenylglyoxal Chemical compound O=CC(=O)C1=CC=CC=C1 OJUGVDODNPJEEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 2
- 230000009805 platelet accumulation Effects 0.000 description 2
- 108010056274 polo-like kinase 1 Proteins 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 2
- 230000027317 positive regulation of immune response Effects 0.000 description 2
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 2
- 201000001514 prostate carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 2
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 2
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 2
- 230000000722 protumoral effect Effects 0.000 description 2
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 2
- 238000007347 radical substitution reaction Methods 0.000 description 2
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 2
- 206010038038 rectal cancer Diseases 0.000 description 2
- 150000004508 retinoic acid derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 230000007441 retrograde transport Effects 0.000 description 2
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N salicylic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1O YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003001 serine protease inhibitor Substances 0.000 description 2
- 102000034285 signal transducing proteins Human genes 0.000 description 2
- 108091006024 signal transducing proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000030938 small GTPase Human genes 0.000 description 2
- 108060007624 small GTPase Proteins 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 2
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 2
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 2
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 2
- 238000011272 standard treatment Methods 0.000 description 2
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 2
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 2
- XOAAWQZATWQOTB-UHFFFAOYSA-N taurine Chemical compound NCCS(O)(=O)=O XOAAWQZATWQOTB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000005931 tert-butyloxycarbonyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(OC(*)=O)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 2
- 230000007838 tissue remodeling Effects 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 231100000167 toxic agent Toxicity 0.000 description 2
- 239000003440 toxic substance Substances 0.000 description 2
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 2
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 2
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 2
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 description 2
- 229940035936 ubiquinone Drugs 0.000 description 2
- 230000034512 ubiquitination Effects 0.000 description 2
- 238000010798 ubiquitination Methods 0.000 description 2
- 108020005087 unfolded proteins Proteins 0.000 description 2
- VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N uroanthelone Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)C(C)C)[C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CS)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(C)C)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 VBEQCZHXXJYVRD-GACYYNSASA-N 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- OPCHFPHZPIURNA-MFERNQICSA-N (2s)-2,5-bis(3-aminopropylamino)-n-[2-(dioctadecylamino)acetyl]pentanamide Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCN(CC(=O)NC(=O)[C@H](CCCNCCCN)NCCCN)CCCCCCCCCCCCCCCCCC OPCHFPHZPIURNA-MFERNQICSA-N 0.000 description 1
- JBFQOLHAGBKPTP-NZATWWQASA-N (2s)-2-[[(2s)-4-carboxy-2-[[3-carboxy-2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]propanoyl]amino]butanoyl]amino]-4-methylpentanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)C(CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN JBFQOLHAGBKPTP-NZATWWQASA-N 0.000 description 1
- YUXKOWPNKJSTPQ-AXWWPMSFSA-N (2s,3r)-2-amino-3-hydroxybutanoic acid;(2s)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O.C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O YUXKOWPNKJSTPQ-AXWWPMSFSA-N 0.000 description 1
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M .beta-Phenylacrylic acid Natural products [O-]C(=O)\C=C\C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M 0.000 description 1
- DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 1,1-ethanedithiol Chemical compound CC(S)S DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PORPENFLTBBHSG-MGBGTMOVSA-N 1,2-dihexadecanoyl-sn-glycerol-3-phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP(O)(O)=O)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC PORPENFLTBBHSG-MGBGTMOVSA-N 0.000 description 1
- ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 1-Hydroxybenzotriazole Chemical compound C1=CC=C2N(O)N=NC2=C1 ASOKPJOREAFHNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide Chemical compound CCN=C=NCCCN(C)C LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OJYIBEYSBXIQOP-UHFFFAOYSA-N 1-methoxy-4-[2-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]benzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(C)(C)C1=CC=C(OC)C=C1 OJYIBEYSBXIQOP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZIIUUSVHCHPIQD-UHFFFAOYSA-N 2,4,6-trimethyl-N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]benzenesulfonamide Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1S(=O)(=O)NC1=CC=CC(C(F)(F)F)=C1 ZIIUUSVHCHPIQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KFDPCYZHENQOBV-UHFFFAOYSA-N 2-(bromomethyl)-4-nitrophenol Chemical compound OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1CBr KFDPCYZHENQOBV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VUCNQOPCYRJCGQ-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(hydroxymethyl)phenoxy]acetic acid Chemical class OCC1=CC=C(OCC(O)=O)C=C1 VUCNQOPCYRJCGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IZQAUUVBKYXMET-UHFFFAOYSA-N 2-bromoethanamine Chemical compound NCCBr IZQAUUVBKYXMET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JQPFYXFVUKHERX-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxy-2-cyclohexen-1-one Natural products OC1=CCCCC1=O JQPFYXFVUKHERX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CQOQDQWUFQDJMK-SSTWWWIQSA-N 2-methoxy-17beta-estradiol Chemical compound C([C@@H]12)C[C@]3(C)[C@@H](O)CC[C@H]3[C@@H]1CCC1=C2C=C(OC)C(O)=C1 CQOQDQWUFQDJMK-SSTWWWIQSA-N 0.000 description 1
- OTXNTMVVOOBZCV-UHFFFAOYSA-N 2R-gamma-tocotrienol Natural products OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C)(C)CCC2=C1 OTXNTMVVOOBZCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WHNPOQXWAMXPTA-UHFFFAOYSA-N 3-methylbut-2-enamide Chemical compound CC(C)=CC(N)=O WHNPOQXWAMXPTA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AKJHMTWEGVYYSE-AIRMAKDCSA-N 4-HPR Chemical compound C=1C=C(O)C=CC=1NC(=O)/C=C(\C)/C=C/C=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C AKJHMTWEGVYYSE-AIRMAKDCSA-N 0.000 description 1
- 102100026726 40S ribosomal protein S11 Human genes 0.000 description 1
- 101710131778 40S ribosomal protein S11 Proteins 0.000 description 1
- XAUDJQYHKZQPEU-KVQBGUIXSA-N 5-aza-2'-deoxycytidine Chemical compound O=C1N=C(N)N=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 XAUDJQYHKZQPEU-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 1
- 102100026802 72 kDa type IV collagenase Human genes 0.000 description 1
- 101710151806 72 kDa type IV collagenase Proteins 0.000 description 1
- 102000041115 AAA ATPase family Human genes 0.000 description 1
- 108091060940 AAA ATPase family Proteins 0.000 description 1
- 102100031585 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Human genes 0.000 description 1
- 208000024893 Acute lymphoblastic leukemia Diseases 0.000 description 1
- 208000036764 Adenocarcinoma of the esophagus Diseases 0.000 description 1
- 208000003200 Adenoma Diseases 0.000 description 1
- 206010001233 Adenoma benign Diseases 0.000 description 1
- 102100033312 Alpha-2-macroglobulin Human genes 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102400000068 Angiostatin Human genes 0.000 description 1
- 108010079709 Angiostatins Proteins 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- 102100021569 Apoptosis regulator Bcl-2 Human genes 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000228212 Aspergillus Species 0.000 description 1
- 244000186140 Asperula odorata Species 0.000 description 1
- 208000000848 Autosomal recessive primary microcephaly Diseases 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- 231100000699 Bacterial toxin Toxicity 0.000 description 1
- 101150049556 Bcr gene Proteins 0.000 description 1
- 206010060999 Benign neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 description 1
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 description 1
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 210000003359 CD4-positive helper T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 206010006895 Cachexia Diseases 0.000 description 1
- 102000000905 Cadherin Human genes 0.000 description 1
- 101001082567 Caenorhabditis elegans Hypoxia-inducible factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101100314454 Caenorhabditis elegans tra-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000005701 Calcium-Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010045403 Calcium-Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000000584 Calmodulin Human genes 0.000 description 1
- 108010041952 Calmodulin Proteins 0.000 description 1
- 102100025570 Cancer/testis antigen 1 Human genes 0.000 description 1
- 208000017897 Carcinoma of esophagus Diseases 0.000 description 1
- 102000016289 Cell Adhesion Molecules Human genes 0.000 description 1
- 108010067225 Cell Adhesion Molecules Proteins 0.000 description 1
- 102000005483 Cell Cycle Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010031896 Cell Cycle Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010089448 Cholecystokinin B Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000009016 Cholera Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010049048 Cholera Toxin Proteins 0.000 description 1
- 108091060290 Chromatid Proteins 0.000 description 1
- 102100039095 Chromatin-remodeling ATPase INO80 Human genes 0.000 description 1
- 208000037088 Chromosome Breakage Diseases 0.000 description 1
- 208000006545 Chronic Obstructive Pulmonary Disease Diseases 0.000 description 1
- 108090000317 Chymotrypsin Proteins 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N Cinnamic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N 0.000 description 1
- 101100007328 Cocos nucifera COS-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150088103 Col12a1 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010052360 Colorectal adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 239000004971 Cross linker Substances 0.000 description 1
- JPVYNHNXODAKFH-UHFFFAOYSA-N Cu2+ Chemical compound [Cu+2] JPVYNHNXODAKFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000002427 Cyclin B Human genes 0.000 description 1
- 108010068150 Cyclin B Proteins 0.000 description 1
- 108010060387 Cyclin B2 Proteins 0.000 description 1
- 108010058546 Cyclin D1 Proteins 0.000 description 1
- 102000013701 Cyclin-Dependent Kinase 4 Human genes 0.000 description 1
- 102100024462 Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B Human genes 0.000 description 1
- 102100027350 Cysteine-rich secretory protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 201000003883 Cystic fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 102000008142 Cytochrome P-450 CYP1A1 Human genes 0.000 description 1
- 108010074918 Cytochrome P-450 CYP1A1 Proteins 0.000 description 1
- 102000002004 Cytochrome P-450 Enzyme System Human genes 0.000 description 1
- 108010015742 Cytochrome P-450 Enzyme System Proteins 0.000 description 1
- 101710112752 Cytotoxin Proteins 0.000 description 1
- 150000008574 D-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- XUIIKFGFIJCVMT-GFCCVEGCSA-N D-thyroxine Chemical compound IC1=CC(C[C@@H](N)C(O)=O)=CC(I)=C1OC1=CC(I)=C(O)C(I)=C1 XUIIKFGFIJCVMT-GFCCVEGCSA-N 0.000 description 1
- 102000003915 DNA Topoisomerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000323 DNA Topoisomerases Proteins 0.000 description 1
- 230000000970 DNA cross-linking effect Effects 0.000 description 1
- 230000005778 DNA damage Effects 0.000 description 1
- 231100000277 DNA damage Toxicity 0.000 description 1
- 102100024829 DNA polymerase delta catalytic subunit Human genes 0.000 description 1
- 102100024823 DNA polymerase delta subunit 2 Human genes 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 230000008265 DNA repair mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 102100033587 DNA topoisomerase 2-alpha Human genes 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- ZBNZXTGUTAYRHI-UHFFFAOYSA-N Dasatinib Chemical compound C=1C(N2CCN(CCO)CC2)=NC(C)=NC=1NC(S1)=NC=C1C(=O)NC1=C(C)C=CC=C1Cl ZBNZXTGUTAYRHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000001477 Deubiquitinating Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108010093668 Deubiquitinating Enzymes Proteins 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 208000002699 Digestive System Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 241000255925 Diptera Species 0.000 description 1
- 206010061819 Disease recurrence Diseases 0.000 description 1
- 101710086702 DnaJ homolog subfamily C member 10 Proteins 0.000 description 1
- 108700003861 Dominant Genes Proteins 0.000 description 1
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 description 1
- 101100072149 Drosophila melanogaster eIF2alpha gene Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 102100023275 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710116362 E3 ubiquitin-protein ligase sina Proteins 0.000 description 1
- 238000008157 ELISA kit Methods 0.000 description 1
- 102000015782 Electron Transport Complex III Human genes 0.000 description 1
- 108010024882 Electron Transport Complex III Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 101100059559 Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) nimX gene Proteins 0.000 description 1
- 206010014561 Emphysema Diseases 0.000 description 1
- 102100038132 Endogenous retrovirus group K member 6 Pro protein Human genes 0.000 description 1
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 101710116743 Ephrin type-A receptor 2 Proteins 0.000 description 1
- 108010043945 Ephrin-A1 Proteins 0.000 description 1
- 102000020086 Ephrin-A1 Human genes 0.000 description 1
- 208000006168 Ewing Sarcoma Diseases 0.000 description 1
- 108091029865 Exogenous DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010007457 Extracellular Signal-Regulated MAP Kinases Proteins 0.000 description 1
- 101150109369 FANCI gene Proteins 0.000 description 1
- 102000009842 Fibril-Associated Collagens Human genes 0.000 description 1
- 108010020305 Fibril-Associated Collagens Proteins 0.000 description 1
- 102100037362 Fibronectin Human genes 0.000 description 1
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 1
- 101710181403 Frizzled Proteins 0.000 description 1
- 102000005698 Frizzled receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010045438 Frizzled receptors Proteins 0.000 description 1
- 241000956293 Fulda Species 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 108090000045 G-Protein-Coupled Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000003688 G-Protein-Coupled Receptors Human genes 0.000 description 1
- 102100024165 G1/S-specific cyclin-D1 Human genes 0.000 description 1
- 102100037858 G1/S-specific cyclin-E1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033201 G2/mitotic-specific cyclin-B2 Human genes 0.000 description 1
- 108010027920 GTPase-Activating Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018898 GTPase-Activating Proteins Human genes 0.000 description 1
- 229910052688 Gadolinium Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000008526 Galium odoratum Nutrition 0.000 description 1
- 102000052874 Gastrin receptors Human genes 0.000 description 1
- 201000003741 Gastrointestinal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 206010051635 Gastrointestinal tract adenoma Diseases 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091006068 Gq proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000052606 Gq-G11 GTP-Binding Protein alpha Subunits Human genes 0.000 description 1
- 108060003393 Granulin Proteins 0.000 description 1
- 108060005986 Granzyme Proteins 0.000 description 1
- 102000001398 Granzyme Human genes 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 101150009006 HIS3 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100028976 HLA class I histocompatibility antigen, B alpha chain Human genes 0.000 description 1
- 102100028971 HLA class I histocompatibility antigen, C alpha chain Human genes 0.000 description 1
- 108010058607 HLA-B Antigens Proteins 0.000 description 1
- 108010052199 HLA-C Antigens Proteins 0.000 description 1
- 101100285983 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) htpX gene Proteins 0.000 description 1
- 206010019375 Helicobacter infections Diseases 0.000 description 1
- 241000901309 Helicobacter pylori UMB_G1 Species 0.000 description 1
- 208000002250 Hematologic Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100026122 High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Human genes 0.000 description 1
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 description 1
- 102100038885 Histone acetyltransferase p300 Human genes 0.000 description 1
- 108010033040 Histones Proteins 0.000 description 1
- 102000006947 Histones Human genes 0.000 description 1
- 101000777636 Homo sapiens ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000971171 Homo sapiens Apoptosis regulator Bcl-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000856237 Homo sapiens Cancer/testis antigen 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001033682 Homo sapiens Chromatin-remodeling ATPase INO80 Proteins 0.000 description 1
- 101000980932 Homo sapiens Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A Proteins 0.000 description 1
- 101000726255 Homo sapiens Cysteine-rich secretory protein 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000909198 Homo sapiens DNA polymerase delta catalytic subunit Proteins 0.000 description 1
- 101000909189 Homo sapiens DNA polymerase delta subunit 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000932009 Homo sapiens DNA polymerase delta subunit 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000801505 Homo sapiens DNA topoisomerase 2-alpha Proteins 0.000 description 1
- 101001115394 Homo sapiens Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000851181 Homo sapiens Epidermal growth factor receptor Proteins 0.000 description 1
- 101100066427 Homo sapiens FCGR1A gene Proteins 0.000 description 1
- 101000738568 Homo sapiens G1/S-specific cyclin-E1 Proteins 0.000 description 1
- 101100395310 Homo sapiens HLA-A gene Proteins 0.000 description 1
- 101000882390 Homo sapiens Histone acetyltransferase p300 Proteins 0.000 description 1
- 101001034652 Homo sapiens Insulin-like growth factor 1 receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001043594 Homo sapiens Low-density lipoprotein receptor-related protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 101001039199 Homo sapiens Low-density lipoprotein receptor-related protein 6 Proteins 0.000 description 1
- 101000990912 Homo sapiens Matrilysin Proteins 0.000 description 1
- 101000578784 Homo sapiens Melanoma antigen recognized by T-cells 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001132878 Homo sapiens Motilin receptor Proteins 0.000 description 1
- 101001133056 Homo sapiens Mucin-1 Proteins 0.000 description 1
- 101001103036 Homo sapiens Nuclear receptor ROR-alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000603877 Homo sapiens Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000588345 Homo sapiens Nuclear transcription factor Y subunit gamma Proteins 0.000 description 1
- 101000613565 Homo sapiens PRKC apoptosis WT1 regulator protein Proteins 0.000 description 1
- 101000983170 Homo sapiens Proliferation-associated protein 2G4 Proteins 0.000 description 1
- 101001098560 Homo sapiens Proteinase-activated receptor 2 Proteins 0.000 description 1
- 101001113471 Homo sapiens Proteinase-activated receptor 4 Proteins 0.000 description 1
- 101001010819 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3 Proteins 0.000 description 1
- 101000864800 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase Sgk1 Proteins 0.000 description 1
- 101000884271 Homo sapiens Signal transducer CD24 Proteins 0.000 description 1
- 101000684919 Homo sapiens Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000713170 Homo sapiens Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000951145 Homo sapiens Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000874160 Homo sapiens Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 101000847159 Homo sapiens Testis-specific gene 13 protein Proteins 0.000 description 1
- 101000904152 Homo sapiens Transcription factor E2F1 Proteins 0.000 description 1
- 101001103033 Homo sapiens Tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR2 Proteins 0.000 description 1
- 101150065069 Hsp90b1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000701024 Human betaherpesvirus 5 Species 0.000 description 1
- 102100027735 Hyaluronan mediated motility receptor Human genes 0.000 description 1
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 1
- 206010021137 Hypovolaemia Diseases 0.000 description 1
- 108050009527 Hypoxia-inducible factor-1 alpha Proteins 0.000 description 1
- 108010031794 IGF Type 1 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000038455 IGF Type 1 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 102000009786 Immunoglobulin Constant Regions Human genes 0.000 description 1
- 108010009817 Immunoglobulin Constant Regions Proteins 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000012745 Immunoglobulin Subunits Human genes 0.000 description 1
- 108010079585 Immunoglobulin Subunits Proteins 0.000 description 1
- 238000012404 In vitro experiment Methods 0.000 description 1
- 102100025092 Insulin receptor substrate 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710201820 Insulin receptor substrate 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100039688 Insulin-like growth factor 1 receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100025947 Insulin-like growth factor II Human genes 0.000 description 1
- 108090000957 Insulin-like growth factor-binding protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100027636 Insulin-like growth factor-binding protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 1
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 1
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 1
- 108010036012 Iodide peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 108010066420 Iron-Regulatory Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018434 Iron-Regulatory Proteins Human genes 0.000 description 1
- 206010069755 K-ras gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 102000011782 Keratins Human genes 0.000 description 1
- 108010076876 Keratins Proteins 0.000 description 1
- 102000010638 Kinesin Human genes 0.000 description 1
- 108010063296 Kinesin Proteins 0.000 description 1
- 102000019293 Kinesin-like proteins Human genes 0.000 description 1
- 108050006659 Kinesin-like proteins Proteins 0.000 description 1
- 101710088208 Kinetochore protein Nuf2 Proteins 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 125000000174 L-prolyl group Chemical group [H]N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[C@@]1([H])C(*)=O 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 239000002067 L01XE06 - Dasatinib Substances 0.000 description 1
- 239000005536 L01XE08 - Nilotinib Substances 0.000 description 1
- 108010085895 Laminin Proteins 0.000 description 1
- 102000007547 Laminin Human genes 0.000 description 1
- 108010000851 Laminin Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000002297 Laminin Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010047294 Lamins Proteins 0.000 description 1
- 241000134253 Lanka Species 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000019850 Lipid phosphate phosphohydrolase 2 Human genes 0.000 description 1
- 108091016355 Lipid phosphate phosphohydrolase 2 Proteins 0.000 description 1
- 108010051335 Lipocalin-2 Proteins 0.000 description 1
- 102000013519 Lipocalin-2 Human genes 0.000 description 1
- 102100021926 Low-density lipoprotein receptor-related protein 5 Human genes 0.000 description 1
- 108010010995 MART-1 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 101150105382 MET gene Proteins 0.000 description 1
- 108700005092 MHC Class II Genes Proteins 0.000 description 1
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 1
- PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N Maleimide Chemical compound O=C1NC(=O)C=C1 PEEHTFAAVSWFBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 208000035346 Margins of Excision Diseases 0.000 description 1
- 102100030417 Matrilysin Human genes 0.000 description 1
- 108010016160 Matrix Metalloproteinase 3 Proteins 0.000 description 1
- 208000000172 Medulloblastoma Diseases 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 1
- 108010040897 Microfilament Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000002151 Microfilament Proteins Human genes 0.000 description 1
- 102000009664 Microtubule-Associated Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010020004 Microtubule-Associated Proteins Proteins 0.000 description 1
- DMUAPQTXSSNEDD-QALJCMCCSA-N Midecamycin Chemical compound C1[C@](O)(C)[C@@H](OC(=O)CC)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](N(C)C)[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@H]([C@H](OC(=O)CC)CC(=O)O[C@H](C)C/C=C/C=C/[C@H](O)[C@H](C)C[C@@H]2CC=O)OC)O[C@@H]1C DMUAPQTXSSNEDD-QALJCMCCSA-N 0.000 description 1
- 108090000744 Mitogen-Activated Protein Kinase Kinases Proteins 0.000 description 1
- 102000004232 Mitogen-Activated Protein Kinase Kinases Human genes 0.000 description 1
- 102100024193 Mitogen-activated protein kinase 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100023482 Mitogen-activated protein kinase 14 Human genes 0.000 description 1
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 1
- 102000005431 Molecular Chaperones Human genes 0.000 description 1
- 102100033818 Motilin receptor Human genes 0.000 description 1
- 241000713333 Mouse mammary tumor virus Species 0.000 description 1
- 102100034256 Mucin-1 Human genes 0.000 description 1
- 101000978776 Mus musculus Neurogenic locus notch homolog protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 208000033776 Myeloid Acute Leukemia Diseases 0.000 description 1
- VIHYIVKEECZGOU-UHFFFAOYSA-N N-acetylimidazole Chemical compound CC(=O)N1C=CN=C1 VIHYIVKEECZGOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100031924 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 Human genes 0.000 description 1
- 101710149292 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 Proteins 0.000 description 1
- 108010057466 NF-kappa B Proteins 0.000 description 1
- 102000003945 NF-kappa B Human genes 0.000 description 1
- 108091061960 Naked DNA Proteins 0.000 description 1
- 229930193140 Neomycin Natural products 0.000 description 1
- 102000014413 Neuregulin Human genes 0.000 description 1
- 108050003475 Neuregulin Proteins 0.000 description 1
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 1
- 208000009277 Neuroectodermal Tumors Diseases 0.000 description 1
- 101001111233 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) NADH-ubiquinone oxidoreductase 9.5 kDa subunit Proteins 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091093105 Nuclear DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100022201 Nuclear transcription factor Y subunit beta Human genes 0.000 description 1
- 102100031719 Nuclear transcription factor Y subunit gamma Human genes 0.000 description 1
- 206010030137 Oesophageal adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 1
- 108010070519 PAR-1 Receptor Proteins 0.000 description 1
- 102000032626 PAR-1 Receptor Human genes 0.000 description 1
- 108091008606 PDGF receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000038030 PI3Ks Human genes 0.000 description 1
- 108091007960 PI3Ks Proteins 0.000 description 1
- 102100040853 PRKC apoptosis WT1 regulator protein Human genes 0.000 description 1
- 206010033701 Papillary thyroid cancer Diseases 0.000 description 1
- 102000057297 Pepsin A Human genes 0.000 description 1
- 108090000284 Pepsin A Proteins 0.000 description 1
- 229940122985 Peptide agonist Drugs 0.000 description 1
- 101800001442 Peptide pr Proteins 0.000 description 1
- 206010072360 Peritumoural oedema Diseases 0.000 description 1
- 102000011420 Phospholipase D Human genes 0.000 description 1
- 108090000553 Phospholipase D Proteins 0.000 description 1
- 102000015439 Phospholipases Human genes 0.000 description 1
- 108010064785 Phospholipases Proteins 0.000 description 1
- 102000030412 Plakin Human genes 0.000 description 1
- 231100000742 Plant toxin Toxicity 0.000 description 1
- 102000011653 Platelet-Derived Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108030005449 Polo kinases Proteins 0.000 description 1
- 239000004952 Polyamide Substances 0.000 description 1
- 102100024168 Polymerase delta-interacting protein 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010068086 Polyubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102100037935 Polyubiquitin-C Human genes 0.000 description 1
- 108010015078 Pregnancy-Associated alpha 2-Macroglobulins Proteins 0.000 description 1
- 102100026531 Prelamin-A/C Human genes 0.000 description 1
- 108010049395 Prokaryotic Initiation Factor-2 Proteins 0.000 description 1
- 102100026899 Proliferation-associated protein 2G4 Human genes 0.000 description 1
- 102100037132 Proteinase-activated receptor 2 Human genes 0.000 description 1
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 description 1
- 102000016611 Proteoglycans Human genes 0.000 description 1
- 108010045292 Proto-Oncogene Proteins c-abl Proteins 0.000 description 1
- 102000005663 Proto-Oncogene Proteins c-abl Human genes 0.000 description 1
- 108010087776 Proto-Oncogene Proteins c-myb Proteins 0.000 description 1
- 102000009096 Proto-Oncogene Proteins c-myb Human genes 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 101710105014 Putative serine protease Proteins 0.000 description 1
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091008103 RNA aptamers Proteins 0.000 description 1
- 230000004570 RNA-binding Effects 0.000 description 1
- 102100031426 Ras GTPase-activating protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 108050004017 Ras GTPase-activating protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102100034418 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP2 Human genes 0.000 description 1
- 101000973406 Rattus norvegicus Nuclear transcription factor Y subunit beta Proteins 0.000 description 1
- 102000004278 Receptor Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 description 1
- 108090000873 Receptor Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 description 1
- 208000015634 Rectal Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000007660 Residual Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 201000000582 Retinoblastoma Diseases 0.000 description 1
- 101100394989 Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) hisI gene Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108010041388 Ribonucleotide Reductases Proteins 0.000 description 1
- 102000000505 Ribonucleotide Reductases Human genes 0.000 description 1
- 102000002278 Ribosomal Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010000605 Ribosomal Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 description 1
- 101100450706 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) HIF1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004487 Satellite DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010022999 Serine Proteases Proteins 0.000 description 1
- 102000012479 Serine Proteases Human genes 0.000 description 1
- 102100031463 Serine/threonine-protein kinase PLK1 Human genes 0.000 description 1
- 101710183229 Serine/threonine-protein kinase PLK4 Proteins 0.000 description 1
- 102100030070 Serine/threonine-protein kinase Sgk1 Human genes 0.000 description 1
- 102000008847 Serpin Human genes 0.000 description 1
- 108050000761 Serpin Proteins 0.000 description 1
- 102100038081 Signal transducer CD24 Human genes 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 102100023153 Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100030416 Stromelysin-1 Human genes 0.000 description 1
- 102100038014 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 102100035726 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700005078 Synthetic Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 1
- 108091005735 TGF-beta receptors Proteins 0.000 description 1
- 108090000925 TNF receptor-associated factor 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100034779 TRAF family member-associated NF-kappa-B activator Human genes 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 1
- 206010057644 Testis cancer Diseases 0.000 description 1
- 102100032808 Testis-specific gene 13 protein Human genes 0.000 description 1
- 108010055044 Tetanus Toxin Proteins 0.000 description 1
- NYTOUQBROMCLBJ-UHFFFAOYSA-N Tetranitromethane Chemical compound [O-][N+](=O)C([N+]([O-])=O)([N+]([O-])=O)[N+]([O-])=O NYTOUQBROMCLBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700031126 Tetraspanins Proteins 0.000 description 1
- 102000043977 Tetraspanins Human genes 0.000 description 1
- RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N Thiophosphoric acid Chemical group OP(O)(S)=O RYYWUUFWQRZTIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 1
- 102000003790 Thrombin receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000166 Thrombin receptors Proteins 0.000 description 1
- 208000024770 Thyroid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- AUYYCJSJGJYCDS-LBPRGKRZSA-N Thyrolar Chemical compound IC1=CC(C[C@H](N)C(O)=O)=CC(I)=C1OC1=CC=C(O)C(I)=C1 AUYYCJSJGJYCDS-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- 101710183280 Topoisomerase Proteins 0.000 description 1
- 102100024026 Transcription factor E2F1 Human genes 0.000 description 1
- 102000016715 Transforming Growth Factor beta Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 1
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010078814 Tumor Suppressor Protein p53 Proteins 0.000 description 1
- 102100039094 Tyrosinase Human genes 0.000 description 1
- 108060008724 Tyrosinase Proteins 0.000 description 1
- 102100039616 Tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR2 Human genes 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- 102000018390 Ubiquitin-Specific Proteases Human genes 0.000 description 1
- 108010066496 Ubiquitin-Specific Proteases Proteins 0.000 description 1
- 208000011608 Undifferentiated carcinoma of stomach Diseases 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- JXLYSJRDGCGARV-WWYNWVTFSA-N Vinblastine Natural products O=C(O[C@H]1[C@](O)(C(=O)OC)[C@@H]2N(C)c3c(cc(c(OC)c3)[C@]3(C(=O)OC)c4[nH]c5c(c4CCN4C[C@](O)(CC)C[C@H](C3)C4)cccc5)[C@@]32[C@H]2[C@@]1(CC)C=CCN2CC3)C JXLYSJRDGCGARV-WWYNWVTFSA-N 0.000 description 1
- 101150109862 WNT-5A gene Proteins 0.000 description 1
- 208000008383 Wilms tumor Diseases 0.000 description 1
- 102000013814 Wnt Human genes 0.000 description 1
- 108050003627 Wnt Proteins 0.000 description 1
- 108700020483 Wnt-5a Proteins 0.000 description 1
- 210000001766 X chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 241000269368 Xenopus laevis Species 0.000 description 1
- 108010048626 Y-Box-Binding Protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 102000036861 Zinc-dependent endopeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108091006982 Zinc-dependent endopeptidases Proteins 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N [3-[hydroxy(2-hydroxyethoxy)phosphoryl]oxy-2-[(e)-octadec-9-enoyl]oxypropyl] (e)-octadec-9-enoate Chemical compound CCCCCCCC\C=C\CCCCCCCC(=O)OCC(COP(O)(=O)OCCO)OC(=O)CCCCCCC\C=C\CCCCCCCC HMNZFMSWFCAGGW-XPWSMXQVSA-N 0.000 description 1
- 210000001015 abdomen Anatomy 0.000 description 1
- 210000000683 abdominal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 description 1
- KRHYYFGTRYWZRS-BJUDXGSMSA-N ac1l2y5h Chemical compound [18FH] KRHYYFGTRYWZRS-BJUDXGSMSA-N 0.000 description 1
- 150000001242 acetic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 238000005903 acid hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 1
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000004026 adhesive bonding Methods 0.000 description 1
- 210000001789 adipocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 150000001447 alkali salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000013566 allergen Substances 0.000 description 1
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 1
- 102000015395 alpha 1-Antitrypsin Human genes 0.000 description 1
- 108010050122 alpha 1-Antitrypsin Proteins 0.000 description 1
- 229940024142 alpha 1-antitrypsin Drugs 0.000 description 1
- RZFHLOLGZPDCHJ-DLQZEEBKSA-N alpha-Tocotrienol Natural products Oc1c(C)c(C)c2O[C@@](CC/C=C(/CC/C=C(\CC/C=C(\C)/C)/C)\C)(C)CCc2c1C RZFHLOLGZPDCHJ-DLQZEEBKSA-N 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000003862 amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 230000019552 anatomical structure morphogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000002491 angiogenic effect Effects 0.000 description 1
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 1
- 229940045799 anthracyclines and related substance Drugs 0.000 description 1
- 230000006909 anti-apoptosis Effects 0.000 description 1
- 230000002001 anti-metastasis Effects 0.000 description 1
- 230000003443 anti-oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 230000030741 antigen processing and presentation Effects 0.000 description 1
- 230000014102 antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005735 apoptotic response Effects 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002029 aromatic hydrocarbon group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- FZCSTZYAHCUGEM-UHFFFAOYSA-N aspergillomarasmine B Natural products OC(=O)CNC(C(O)=O)CNC(C(O)=O)CC(O)=O FZCSTZYAHCUGEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGPYEHKOIGNJKV-UHFFFAOYSA-N asulam Chemical compound COC(=O)NS(=O)(=O)C1=CC=C(N)C=C1 VGPYEHKOIGNJKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003305 autocrine Effects 0.000 description 1
- 230000006472 autoimmune response Effects 0.000 description 1
- 230000035578 autophosphorylation Effects 0.000 description 1
- 210000003050 axon Anatomy 0.000 description 1
- 230000003376 axonal effect Effects 0.000 description 1
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000000688 bacterial toxin Substances 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 108010056708 bcr-abl Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004441 bcr-abl Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000006399 behavior Effects 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002306 biochemical method Methods 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000004791 biological behavior Effects 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 1
- 125000004744 butyloxycarbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 101150114014 cagA gene Proteins 0.000 description 1
- AXCZMVOFGPJBDE-UHFFFAOYSA-L calcium dihydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[Ca+2] AXCZMVOFGPJBDE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000920 calcium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 229910001861 calcium hydroxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 108010086826 calponin Proteins 0.000 description 1
- 102000006783 calponin Human genes 0.000 description 1
- 230000004712 cancer cell adhesion Effects 0.000 description 1
- 239000003560 cancer drug Substances 0.000 description 1
- 230000005907 cancer growth Effects 0.000 description 1
- 208000035269 cancer or benign tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000008758 canonical signaling Effects 0.000 description 1
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 210000001043 capillary endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000003518 caustics Substances 0.000 description 1
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 1
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 description 1
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 230000017455 cell-cell adhesion Effects 0.000 description 1
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 1
- 210000003679 cervix uteri Anatomy 0.000 description 1
- 230000001876 chaperonelike Effects 0.000 description 1
- 230000002925 chemical effect Effects 0.000 description 1
- 125000003636 chemical group Chemical group 0.000 description 1
- 230000006328 chemical modification of amino acids Effects 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N chloramine T Chemical compound [Na+].CC1=CC=C(S(=O)(=O)[N-]Cl)C=C1 VDQQXEISLMTGAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001805 chlorine compounds Chemical class 0.000 description 1
- 210000004756 chromatid Anatomy 0.000 description 1
- 230000010428 chromatin condensation Effects 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 210000001726 chromosome structure Anatomy 0.000 description 1
- 229960002376 chymotrypsin Drugs 0.000 description 1
- 235000013985 cinnamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229930016911 cinnamic acid Natural products 0.000 description 1
- 210000002806 clathrin-coated vesicle Anatomy 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 201000010989 colorectal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000000536 complexating effect Effects 0.000 description 1
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 1
- 238000002591 computed tomography Methods 0.000 description 1
- 238000004624 confocal microscopy Methods 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 230000006552 constitutive activation Effects 0.000 description 1
- 230000037011 constitutive activity Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 210000004441 cop-coated vesicle Anatomy 0.000 description 1
- 229910001431 copper ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000009223 counseling Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- XLJMAIOERFSOGZ-UHFFFAOYSA-M cyanate Chemical compound [O-]C#N XLJMAIOERFSOGZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- OILAIQUEIWYQPH-UHFFFAOYSA-N cyclohexane-1,2-dione Chemical compound O=C1CCCCC1=O OILAIQUEIWYQPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002559 cytogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000021953 cytokinesis Effects 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 239000002619 cytotoxin Substances 0.000 description 1
- 229960002448 dasatinib Drugs 0.000 description 1
- 230000032459 dedifferentiation Effects 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 239000012649 demethylating agent Substances 0.000 description 1
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009504 deubiquitination Effects 0.000 description 1
- 125000004386 diacrylate group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001982 diacylglycerols Chemical class 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 description 1
- 125000004989 dicarbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000000378 dietary effect Effects 0.000 description 1
- FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N diethyl pyrocarbonate Chemical compound CCOC(=O)OC(=O)OCC FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002249 digestive system Anatomy 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 150000002019 disulfides Chemical class 0.000 description 1
- 238000012137 double-staining Methods 0.000 description 1
- 230000007783 downstream signaling Effects 0.000 description 1
- 229960004679 doxorubicin Drugs 0.000 description 1
- 229940000406 drug candidate Drugs 0.000 description 1
- 108010037623 eIF-2 Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102000010982 eIF-2 Kinase Human genes 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 238000001493 electron microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000001437 electrospray ionisation time-of-flight quadrupole detection Methods 0.000 description 1
- 210000002308 embryonic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002121 endocytic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008290 endocytic mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000006274 endogenous ligand Substances 0.000 description 1
- 229940066758 endopeptidases Drugs 0.000 description 1
- 230000026721 endothelial cell chemotaxis Effects 0.000 description 1
- 210000003038 endothelium Anatomy 0.000 description 1
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 1
- 230000029578 entry into host Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N eosin Chemical compound [Na+].OC(=O)C1=CC=CC=C1C1=C2C=C(Br)C(=O)C(Br)=C2OC2=C(Br)C(O)=C(Br)C=C21 YQGOJNYOYNNSMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000012803 ephrin Human genes 0.000 description 1
- 108060002566 ephrin Proteins 0.000 description 1
- 230000008995 epigenetic change Effects 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 208000028653 esophageal adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000003238 esophagus Anatomy 0.000 description 1
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M ethanesulfonate Chemical compound CCS([O-])(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- VJJPUSNTGOMMGY-MRVIYFEKSA-N etoposide Chemical compound COC1=C(O)C(OC)=CC([C@@H]2C3=CC=4OCOC=4C=C3[C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@@H]4O[C@H](C)OC[C@H]4O3)O)[C@@H]3[C@@H]2C(OC3)=O)=C1 VJJPUSNTGOMMGY-MRVIYFEKSA-N 0.000 description 1
- 229960005420 etoposide Drugs 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000004265 eukaryotic small ribosome subunit Anatomy 0.000 description 1
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 1
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 1
- 230000000763 evoking effect Effects 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000004744 fabric Substances 0.000 description 1
- 229950003662 fenretinide Drugs 0.000 description 1
- 239000010408 film Substances 0.000 description 1
- 238000009093 first-line therapy Methods 0.000 description 1
- 230000004992 fission Effects 0.000 description 1
- 238000002594 fluoroscopy Methods 0.000 description 1
- 239000012458 free base Substances 0.000 description 1
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 description 1
- UIWYJDYFSGRHKR-UHFFFAOYSA-N gadolinium atom Chemical compound [Gd] UIWYJDYFSGRHKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OTXNTMVVOOBZCV-YMCDKREISA-N gamma-Tocotrienol Natural products Oc1c(C)c(C)c2O[C@@](CC/C=C(\CC/C=C(\CC/C=C(\C)/C)/C)/C)(C)CCc2c1 OTXNTMVVOOBZCV-YMCDKREISA-N 0.000 description 1
- 238000013110 gastrectomy Methods 0.000 description 1
- 201000006585 gastric adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 238000003209 gene knockout Methods 0.000 description 1
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 1
- 230000004153 glucose metabolism Effects 0.000 description 1
- 108010017007 glucose-regulated proteins Proteins 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 150000002313 glycerolipids Chemical class 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 208000024908 graft versus host disease Diseases 0.000 description 1
- 239000007952 growth promoter Substances 0.000 description 1
- 201000000459 head and neck squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 210000000301 hemidesmosome Anatomy 0.000 description 1
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 description 1
- 229940022353 herceptin Drugs 0.000 description 1
- 239000000833 heterodimer Substances 0.000 description 1
- 238000005734 heterodimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 229920000140 heteropolymer Polymers 0.000 description 1
- 230000000971 hippocampal effect Effects 0.000 description 1
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 229940099552 hyaluronan Drugs 0.000 description 1
- KIUKXJAPPMFGSW-MNSSHETKSA-N hyaluronan Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)C1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H](C(O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O3)C(O)=O)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)NC(C)=O)[C@@H](C(O)=O)O1 KIUKXJAPPMFGSW-MNSSHETKSA-N 0.000 description 1
- 108010003425 hyaluronan-mediated motility receptor Proteins 0.000 description 1
- 239000000017 hydrogel Substances 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 1
- 229920001600 hydrophobic polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000009610 hypersensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000001146 hypoxic effect Effects 0.000 description 1
- KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N imatinib Chemical compound C1CN(C)CCN1CC1=CC=C(C(=O)NC=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)C=C1 KTUFNOKKBVMGRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000008004 immune attack Effects 0.000 description 1
- 230000037451 immune surveillance Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 1
- 230000002055 immunohistochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000012151 immunohistochemical method Methods 0.000 description 1
- 238000011532 immunohistochemical staining Methods 0.000 description 1
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 1
- 238000012405 in silico analysis Methods 0.000 description 1
- 238000011503 in vivo imaging Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 231100000268 induced nephrotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000006882 induction of apoptosis Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000003999 initiator Substances 0.000 description 1
- 101150071126 ino80 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 230000005732 intercellular adhesion Effects 0.000 description 1
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 1
- 210000004347 intestinal mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 210000004966 intestinal stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 230000002601 intratumoral effect Effects 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N iodoacetic acid Chemical compound OC(=O)CI JDNTWHVOXJZDSN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000017712 iodothyronine deiodinase Human genes 0.000 description 1
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000741 isoleucyl group Chemical group [H]N([H])C(C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])C(=O)O* 0.000 description 1
- 238000005304 joining Methods 0.000 description 1
- 210000002510 keratinocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 210000005053 lamin Anatomy 0.000 description 1
- 229910052747 lanthanoid Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002602 lanthanoids Chemical class 0.000 description 1
- 210000001069 large ribosome subunit Anatomy 0.000 description 1
- 210000000867 larynx Anatomy 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 238000012317 liver biopsy Methods 0.000 description 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000005229 liver cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000019423 liver disease Diseases 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 201000005296 lung carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000001926 lymphatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001365 lymphatic vessel Anatomy 0.000 description 1
- 108010089256 lysyl-aspartyl-glutamyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 210000003126 m-cell Anatomy 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 1
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 1
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000001840 matrix-assisted laser desorption--ionisation time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 230000008627 meiotic prophase Effects 0.000 description 1
- 230000008099 melanin synthesis Effects 0.000 description 1
- 230000010291 membrane polarization Effects 0.000 description 1
- 150000002730 mercury Chemical class 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 208000010658 metastatic prostate carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- UZKWTJUDCOPSNM-UHFFFAOYSA-N methoxybenzene Substances CCCCOC=C UZKWTJUDCOPSNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCQGVFNHUATAJY-UHFFFAOYSA-N methyl 2-[methyl(prop-2-enoyl)amino]acetate Chemical compound COC(=O)CN(C)C(=O)C=C ZCQGVFNHUATAJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N methyl p-hydroxycinnamate Natural products OC(=O)C=CC1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 1
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 description 1
- 210000003879 microtubule-organizing center Anatomy 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000004065 mitochondrial dysfunction Effects 0.000 description 1
- 230000002297 mitogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 229940125645 monoclonal antibody drug Drugs 0.000 description 1
- 210000005088 multinucleated cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000003387 muscular Effects 0.000 description 1
- 208000025113 myeloid leukemia Diseases 0.000 description 1
- CMWYAOXYQATXSI-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylformamide;piperidine Chemical compound CN(C)C=O.C1CCNCC1 CMWYAOXYQATXSI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005445 natural material Substances 0.000 description 1
- 230000001338 necrotic effect Effects 0.000 description 1
- 238000013188 needle biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000014399 negative regulation of angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000006654 negative regulation of apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 230000017095 negative regulation of cell growth Effects 0.000 description 1
- 229960004927 neomycin Drugs 0.000 description 1
- 230000010309 neoplastic transformation Effects 0.000 description 1
- 201000008026 nephroblastoma Diseases 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 229960001346 nilotinib Drugs 0.000 description 1
- HHZIURLSWUIHRB-UHFFFAOYSA-N nilotinib Chemical compound C1=NC(C)=CN1C1=CC(NC(=O)C=2C=C(NC=3N=C(C=CN=3)C=3C=NC=CC=3)C(C)=CC=2)=CC(C(F)(F)F)=C1 HHZIURLSWUIHRB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 102000037979 non-receptor tyrosine kinases Human genes 0.000 description 1
- 108091008046 non-receptor tyrosine kinases Proteins 0.000 description 1
- 230000008759 noncanonical signaling Effects 0.000 description 1
- 210000000633 nuclear envelope Anatomy 0.000 description 1
- 230000025308 nuclear transport Effects 0.000 description 1
- 230000006911 nucleation Effects 0.000 description 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 1
- 230000000269 nucleophilic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011580 nude mouse model Methods 0.000 description 1
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 1
- 230000005853 oncogenic activation Effects 0.000 description 1
- 230000006548 oncogenic transformation Effects 0.000 description 1
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 208000020717 oral cavity carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000005305 organ development Effects 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- JMANVNJQNLATNU-UHFFFAOYSA-N oxalonitrile Chemical compound N#CC#N JMANVNJQNLATNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010068338 p38 Mitogen-Activated Protein Kinases Proteins 0.000 description 1
- 230000020477 pH reduction Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N papa-hydroxy-benzoic acid Natural products OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000010198 papillary carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000002023 papillomaviral effect Effects 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 208000007312 paraganglioma Diseases 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 229940111202 pepsin Drugs 0.000 description 1
- 239000000816 peptidomimetic Substances 0.000 description 1
- 229930192851 perforin Natural products 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 235000020030 perry Nutrition 0.000 description 1
- 229960002087 pertuzumab Drugs 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 1
- 150000003905 phosphatidylinositols Chemical class 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 1
- 239000003123 plant toxin Substances 0.000 description 1
- 210000004508 polar body Anatomy 0.000 description 1
- 229920002647 polyamide Polymers 0.000 description 1
- 208000022131 polyp of large intestine Diseases 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 238000002600 positron emission tomography Methods 0.000 description 1
- GKKCIDNWFBPDBW-UHFFFAOYSA-M potassium cyanate Chemical compound [K]OC#N GKKCIDNWFBPDBW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 201000001729 primary autosomal recessive microcephaly Diseases 0.000 description 1
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 1
- 208000029340 primitive neuroectodermal tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000000861 pro-apoptotic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003640 procarcinogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 230000002384 proinvasive effect Effects 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- 208000023958 prostate neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 1
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 1
- 239000012474 protein marker Substances 0.000 description 1
- 230000009822 protein phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 230000016434 protein splicing Effects 0.000 description 1
- 230000004063 proteosomal degradation Effects 0.000 description 1
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 238000011472 radical prostatectomy Methods 0.000 description 1
- 239000002516 radical scavenger Substances 0.000 description 1
- 238000011470 radical surgery Methods 0.000 description 1
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 1
- 239000000941 radioactive substance Substances 0.000 description 1
- 238000011127 radiochemotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000007420 reactivation Effects 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000001953 recrystallisation Methods 0.000 description 1
- 208000020615 rectal carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000001275 rectum cancer Diseases 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000006722 reduction reaction Methods 0.000 description 1
- 238000005932 reductive alkylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000012385 regulation of binding Effects 0.000 description 1
- 230000022983 regulation of cell cycle Effects 0.000 description 1
- 230000037425 regulation of transcription Effects 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 208000023504 respiratory system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000028617 response to DNA damage stimulus Effects 0.000 description 1
- 230000000284 resting effect Effects 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 101150042484 rps11 gene Proteins 0.000 description 1
- 229960004889 salicylic acid Drugs 0.000 description 1
- 208000020989 salivary duct carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000003079 salivary gland Anatomy 0.000 description 1
- 235000015598 salt intake Nutrition 0.000 description 1
- 230000036573 scar formation Effects 0.000 description 1
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 1
- 230000009758 senescence Effects 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- ZFRKQXVRDFCRJG-UHFFFAOYSA-N skatole Natural products C1=CC=C2C(C)=CNC2=C1 ZFRKQXVRDFCRJG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 1
- 239000004055 small Interfering RNA Substances 0.000 description 1
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 1
- 210000001812 small ribosome subunit Anatomy 0.000 description 1
- 101150106760 smc-4 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000000391 smoking effect Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000021595 spermatogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000020347 spindle assembly Effects 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 1
- 239000012730 sustained-release form Substances 0.000 description 1
- 230000032312 synaptic target recognition Effects 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960003080 taurine Drugs 0.000 description 1
- 201000003120 testicular cancer Diseases 0.000 description 1
- 229940118376 tetanus toxin Drugs 0.000 description 1
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 1
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 1
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 1
- 201000002510 thyroid cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000001685 thyroid gland Anatomy 0.000 description 1
- 208000030045 thyroid gland papillary carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 229940034208 thyroxine Drugs 0.000 description 1
- XUIIKFGFIJCVMT-UHFFFAOYSA-N thyroxine-binding globulin Natural products IC1=CC(CC([NH3+])C([O-])=O)=CC(I)=C1OC1=CC(I)=C(O)C(I)=C1 XUIIKFGFIJCVMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000017423 tissue regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000003325 tomography Methods 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000000844 transformation Methods 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000014621 translational initiation Effects 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 108091005703 transmembrane proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000035160 transmembrane proteins Human genes 0.000 description 1
- 229960000575 trastuzumab Drugs 0.000 description 1
- 238000001665 trituration Methods 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 1
- 230000005747 tumor angiogenesis Effects 0.000 description 1
- 230000005760 tumorsuppression Effects 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940121358 tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 239000005483 tyrosine kinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 229940040064 ubiquinol Drugs 0.000 description 1
- QNTNKSLOFHEFPK-UPTCCGCDSA-N ubiquinol-10 Chemical compound COC1=C(O)C(C)=C(C\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CC\C=C(/C)CCC=C(C)C)C(O)=C1OC QNTNKSLOFHEFPK-UPTCCGCDSA-N 0.000 description 1
- 102000028434 ubiquinone binding Human genes 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 208000010570 urinary bladder carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 1
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 1
- 230000006459 vascular development Effects 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 229960003048 vinblastine Drugs 0.000 description 1
- JXLYSJRDGCGARV-XQKSVPLYSA-N vincaleukoblastine Chemical compound C([C@@H](C[C@]1(C(=O)OC)C=2C(=CC3=C([C@]45[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]6(CC)C=CCN([C@H]56)CC4)(O)C(=O)OC)N3C)C=2)OC)C[C@@](C2)(O)CC)N2CCC2=C1NC1=CC=CC=C21 JXLYSJRDGCGARV-XQKSVPLYSA-N 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 238000007794 visualization technique Methods 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 description 1
- 150000003722 vitamin derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000036642 wellbeing Effects 0.000 description 1
- 239000002676 xenobiotic agent Substances 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000011722 γ-tocotrienol Substances 0.000 description 1
- OTXNTMVVOOBZCV-WAZJVIJMSA-N γ-tocotrienol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2O[C@@](CC/C=C(C)/CC/C=C(C)/CCC=C(C)C)(C)CCC2=C1 OTXNTMVVOOBZCV-WAZJVIJMSA-N 0.000 description 1
- 235000019150 γ-tocotrienol Nutrition 0.000 description 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/1703—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- A61K38/1709—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- A61K38/39—Connective tissue peptides, e.g. collagen, elastin, laminin, fibronectin, vitronectin, cold insoluble globulin [CIG]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
- A61K38/46—Hydrolases (3)
- A61K38/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- A61K38/4886—Metalloendopeptidases (3.4.24), e.g. collagenase
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/46—Cellular immunotherapy
- A61K39/461—Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
- A61K39/4611—T-cells, e.g. tumor infiltrating lymphocytes [TIL], lymphokine-activated killer cells [LAK] or regulatory T cells [Treg]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
- C07K14/70539—MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
- C07K16/2833—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/06—Animal cells or tissues; Human cells or tissues
- C12N5/0602—Vertebrate cells
- C12N5/0634—Cells from the blood or the immune system
- C12N5/0636—T lymphocytes
- C12N5/0638—Cytotoxic T lymphocytes [CTL] or lymphokine activated killer cells [LAK]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
- G01N33/5044—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics involving specific cell types
- G01N33/5047—Cells of the immune system
- G01N33/505—Cells of the immune system involving T-cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/515—Animal cells
- A61K2039/5158—Antigen-pulsed cells, e.g. T-cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/57—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2
- A61K2039/572—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the type of response, e.g. Th1, Th2 cytotoxic response
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/58—Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation
- A61K2039/585—Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation wherein the target is cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2510/00—Genetically modified cells
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
Abstract
Изобретение относится к пептидам, нуклеиновым кислотам и клеткам для применения в иммунотерапевтических методах. В частности, изобретение относится к иммунотерапии рака. Изобретение относится далее к опухолеассоциированным цитотоксическим пептидным эпитопам Т-клеток (ЦТЛ), в отдельности или в комбинации с другими опухолеассоциированными пептидами, которые служат как активные фармацевтические ингредиенты композиций вакцины, стимулирующей противоопухолевые иммунные ответы. Изобретение относится к 95 новым пептидным последовательностям и их вариантам, полученным из молекул HLA I класса человеческих опухолевых клеток, которые могут быть применены в вакцинных композициях с целью вызывания противоопухолевых иммунных ответов.
Description
Настоящее изобретение относится к пептидам, нуклеиновым кислотам и клеткам для применения в иммунотерапевтических методах. В частности, настоящее изобретение относится к иммунотерапии рака. Настоящее изобретение относится далее к опухолеассоциированным эпитопам Т-клеток CD8'. в отдельности или в комбинации с другими опухолеассоциированными пептидами, которые служат как активные фармацевтические ингредиенты композиций вакцины, стимулирующей противоопухолевые иммунные ответы. Настоящее изобретение относится к 33 новым пептидным последовательностям и их вариантам, образованным из молекул HLA класса I человеческих опухолевых клеток, которые могут быть использованы в вакцинных композициях в целях вызывания противоопухолевых иммунных ответов, в частности ответов цитотоксических Т-клеток (ЦТЛ).
Уровень техники
Рак желудка является заболеванием, при котором злокачественные клетки формируются в слизистой оболочке желудка. Рак желудка может развиваться в любой части желудка и может распространяться по всему желудку и проникать в другие органы, в частности пищевод, легкие и печень. Рак желудка занимает четвертое место по частоте распространения в мире, в 2002 году этот диагноз был поставлен в 930000 случаев. Это заболевание связано с высокой смертностью (~800 000 случаев в год), из-за чего оно является второй по частоте причиной летального исхода от рака после рака легких. Оно более распространено среди мужчин и возникает чаще в странах Азии и развивающихся странах. (http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs297/en/).
На него приходится ежегодно 2% (25 500 случаев) всех новых случаев заболевания раком в США, однако данное заболевание больше распространено в других странах. Это самый распространенный вид рака в Корее, на который приходится 20,8% всех злокачественных новообразований. В Японии рак желудка остается наиболее распространенным видом рака у мужчин. В США диагноз рак желудка ежегодно ставится около 13000 мужчин и 8000 женщин, большинству из которых больше 70 лет.
Рак желудка занимает четвертое место по частоте распространения в мире после рака легких, молочной железы, рака толстой и прямой кишки. Кроме того, рак желудка продолжает быть второй по частоте причиной летального исхода от рака. По прогнозу Американского общества по борьбе с раком число новых случаев заболевания в 2007 году предположительно составило 1 млн, около 70% из которых приходится на развивающиеся страны и с ними связано около 800000 летальных исходов (http://www.cancer.org/downloads/STT/Global_Facts_and_Figures_2007_rev2.pdf).
В отношении частоты заболеваемости по всему миру существуют колоссальные географические различия. Наиболее высокий процент распространения заболевания приходится на Азию и части Южной Америки, наиболее низкий - на Северную Америку. Наиболее высокий уровень смертности зарегистрирован в Чили, Японии, Южной Америке и в странах бывшего Советского Союза.
Зачастую диагноз рака желудка ставится на поздней стадии, так как скрининговое обследование не проводится в большинстве стран мира, за исключением Японии (и в ограниченной степени в Корее), где обнаружение зачастую происходит на ранней стадии. Таким образом, это продолжает оставаться наиболее сложной задачей для специалистов здравоохранения. Фактором риска для заболевания раком желудка является бактериальная инфекция Helicobacter pylori (H. pylori), курение, потребление соли в больших количествах и другие факторы, связанные с питанием. Небольшое число случаев рака желудка (1-3%) связаны с синдромом наследственной предрасположенности к раку желудка. Мутации гена Е-кадхерина происходят приблизительно у 25% семей с аутосомным доминантным геном предрасположенности к раку желудка диффузного вида. Этот подвид рака желудка получил название наследственный диффузный рак желудка. Целесообразным может быть проведение генетического консультирования и принятие во внимание профилактической гастрэктомии в юном возрасте при бессимптомном протекании усечения зародышевой линии.
Стенки желудка состоят из трех слоев тканей: слизистого (глубинного) слоя, мышечного (среднего) слоя и серозного (крайнего) слоя. Рак желудка развивается в клетках, выстилающих слизистую оболочку, и распространяется во время роста во внешние слои. Применяются четыре стандартных способа лечения. Лечение рака желудка может включать хирургическую операцию, химиотерапию, лучевую терапию или химиолучевую терапию. Операция является основным способом лечения рака желудка. Целью операции является проведение полной резекции с отрицательным хирургическим краем (резекция типа R0). Однако приблизительно 50% пациентов, больных местно-распространенным раком желудка, не могут быть подвергнуты резекции типа R0. Тип R1 указывает на микроскопические признаки неполной резекции (положительные края); и R2 указывает на макроскопические признаки неполной резекции, но без отдаленного распространения заболевания. Исход для пациента зависит от стадии рака во время постановки диагноза (Руководство по клинической практике в онкологии Национальной онкологической сети США (NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology™).
Процент выживаемости в течение 5 лет в случае радикальной резекции составляет 30-50% для пациентов на II стадии заболевания и 10-25% для пациентов на III стадии заболевания. Для этих пациентов существует высокая вероятность появления локальных и системных рецидивов. Метастазы появляются у 80-90% лиц, больных раком желудка, а показатель шестимесячной выживаемости равен 65% для тех, кому диагноз был поставлен на ранних стадиях, и менее 15% для тех, кому диагноз был поставлен на
- 1 037019 поздних стадиях.
Таким образом, до сих пор существует потребность в новом, эффективном и безопасном способе лечения рака желудка, карциномы предстательной железы, карцином полости рта, плоскоклеточной карциномы полости рта (OSCC), острой миелоидной лейкемии (AML), вызываемом Н. pylori MALT-лимфомы, карциномы толстого кишечника/колоректального рака, глиобластомы, немелкоклеточного рака легких (NSCLC), карциномы шейки матки, рака молочной железы человека, рака предстательной железы, рака толстого кишечника, рака поджелудочной железы, протоковой аденокарциномы поджелудочной железы, рака яичника, почечно-клеточной карциномы, рака печени, опухолей головного мозга различных фенотипов; лейкемии, такой как острая лимфобластная лейкемия (ALL); рака легких, саркомы Юинга, эндометриального рака, плоскоклеточной карциномы головы и шеи, эпителиального рака гортани, карциномы пищевода, карциномы ротовой полости, карциномы мочевого пузыря, карцином яичника, почечно-клеточной карциномы, атипической менингиомы, папиллярной карциномы щитовидной железы, опухолей головного мозга, карциномы слюнного протока, рака шейки матки, экстранодальных T/NK-клеточных лимфом, нехожкинской лимфомы и злокачественных солидных опухолей легких и молочной железы, а также других видов опухолей, в целях улучшения самочувствия пациентов без применения химиотерапевтических средств или же других препаратов, которые могут вызывать серьезные побочные эффекты.
В настоящее изобретение включены пептиды, которые стимулируют иммунную систему и выполняют функцию противоопухолевых препаратов неинвазивного способа воздействия.
Краткое изложение сущности изобретения
Стимуляция иммунных ответов зависит от присутствия антигенов, распознающихся иммунной системой хозяина как чужеродные. Открытие существования опухолеассоциированных антигенов повысило возможность использования иммунной системы хозяина для вмешательства в рост опухоли. Различные механизмы объединения обеих ветвей иммунной системы, как гуморальной, так и клеточной, исследуются в настоящее время для иммунотерапии рака.
Специфические элементы клеточных иммунных ответов способны к специфическому распознаванию и уничтожению опухолевых клеток. Выделение цитотоксических Т-клеток (ЦТЛ) из популяций опухоль-инфильтрирующих клеток или из периферической крови предполагает, что такие клетки играют важную роль в природной иммунной защите против рака. В частности, CD8-положительные Т-клетки (TCD8'). которые распознают молекулы I класса главного комплекса гистосовместимости (MHC) с пептидами, состоящими обычно из 8-10 аминокислотных остатков, образованных из белков или дефектных рибосомных продуктов (DRIP), находящихся в цитозоли, играют важную роль в этом ответе. Молекулы MHC человека называются также человеческими лейкоцитарными антигенами (HLA).
Существуют два класса молекул MHC: молекулы MHC I класса, встречающиеся на большинстве клеток, имеющих ядро. Молекулы MHC состоят из альфа-тяжелой цепи и бета-2-микроглобулина (рецепторы MHC класса I) или альфа- и бета-цепи (рецепторы MHC класса II) соответственно. Их трехмерная конформация образует связывающую бороздку, которая используется для нековалентного взаимодействия с пептидами. MHC класса I презентируют пептиды, образующиеся при протеолитическом расщеплении преимущественно эндогенных белков, продуктов DRIP и более крупных пептидов. Молекулы MHC II класса могут встречаться преимущественно на профессиональных антигенпрезентирующих клетках (АПК). В первую очередь они презентируют пептиды экзогенных или трансмембранных белков, которые поглощаются АПК в период эндоцитоза и впоследствии процессируются. Комплексы из пептида и молекул MHC I класса распознаются CD8-положительными цитотоксическими Т-лимфоцитами, несущими подходящий Т-клеточный рецептор (ТКР), тогда как комплексы из пептида и молекул MHC II класса распознаются CD4-положительными хелперными Т-клетками, несущими подходящий ТКР. Хорошо известно, что ТКР, пептид и MHC часто встречаются в стехиометрическом соотношении 1:1:1.
Для того чтобы пептид инициировал (вызывал) клеточный иммунный ответ, он должен связываться с молекулой MHC. Этот процесс зависит от аллеля молекулы MHC и специфических полиморфизмов аминокислотной последовательности пептида. Пептиды, связывающиеся с MHC I класса, как правило, имеют 8-12 аминокислотных остатков в длину и обычно содержат два консервативных остатка (якори) в их последовательности, которые взаимодействуют с соответствующей связывающей бороздкой молекулы MHC. Таким образом, каждый аллель MHC имеет связывающий мотив, определяющий, какие пептиды могут специфически связываться со связывающей бороздкой.
В зависящей от MHC I класса иммунной реакции пептиды не только должны быть в состоянии связываться с конкретными молекулами MHC I класса, экспрессируемыми опухолевыми клетками, но они также должны распознаваться Т-клетками, несущими специфические Т-клеточные рецепторы (ТКР).
Антигены, которые распознаются опухолевыми специфическими ЦТЛ, т.е. их эпитопы, могут быть молекулами, образованными из любого класса белков, таких как ферменты, рецепторы, факторы транскрипции и т.д., которые экспрессируются и по сравнению с не измененными клетками того же происхождения находятся в повышенном количестве в клетках соответствующей опухоли.
- 2 037019
Актуальная классификация опухолеассоциированных антигенов (ТАА) включает следующие основные группы:
a) Раково-тестикулярные антигены: первые в истории идентифицированные ТАА, которые могут распознаваться Т-клетками, принадлежат к этому классу, называвшемуся первоначально раковотестикулярные антигены (СТ), так как его члены экспрессируются в отличных по гистологической структуре опухолях человека, а среди нормальных тканей - только в сперматоцитах/сперматогониях семенника и изредка в плаценте. Так как клетки семенника не экспрессируют молекулы HLA I и II класса, то эти антигены не могут быть распознаны Т-клетками в нормальных тканях и поэтому могут рассматриваться как иммунологически опухолеспецифические. Хорошо известными примерами антигенов СТ являются члены семейства MAGE или NY-ESO-1.
b) Антигены дифференциации: данные ТАА встречаются в опухолевых и нормальных тканях, из которых образуется опухоль; большинство из них обнаружено в меланомах и нормальных меланоцитах. Многие из этих линиеспецифических белков меланоцитов участвуют в биосинтезе меланина и поэтому не являются опухолеспецифическими, однако, несмотря на это, они широко применяются в противораковой терапии. Примеры включают, но без ограничения, тирозиназу и Melan-A/MART-1 для меланомы или PSA для рака предстательной железы.
c) Гиперэкспрессированные ТАА: гены, кодирующие широко экспрессированные ТАА, были обнаружены в отличных по гистологической структуре опухолях, а также во многих нормальных тканях, в основном с более низким уровнем экспрессии. Возможно, что многие эпитопы, процессируемые и потенциально презентируемые нормальными тканями, находятся ниже порогового уровня для распознавания Т-клетками, в то время как их гиперэкспрессия в опухолевых клетках может инициировать противораковый ответ, нарушая установившуюся ранее толерантность. Известными примерами ТАА этого класса являются Her-2/neu, сурвивин, теломераза или WT1.
d) Опухолеспецифические антигены: данные уникальные ТАА образуются в результате мутаций нормальных генов (таких как β-катенин, CDK4 и т.д.). Некоторые из этих молекулярных изменений ассоциированы с неопластической трансформацией и/или прогрессией. Опухолеспецифические антигены, как правило, способны вызвать сильные иммунные ответы, не вызывая риска аутоиммунных реакций по отношению к нормальным тканям. С другой стороны, данные ТАА в большинстве случаев имеют отношение только к определенной опухоли, на которой они были идентифицированы, и обычно не являются общими для многих отдельных опухолей.
e) ТАА, образующиеся в результате аномальных посттрансляционных модификаций: такие ТАА могут образоваться из белков, которые не являются ни специфическими, ни гиперэкспрессированными в опухолях, однако, несмотря на это, становятся опухолеассоциированными в ходе посттрансляционных процессов, происходящих преимущественно в опухолях. Примеры для этого класса возникают в результате изменения характера гликозилирования, приводящего к появлению новых эпитопов в опухолях, как в случае MUC1, или при таких как белковый сплайсинг во время деградации, который может или может не быть опухолеспецифическим.
f) Онковирусные белки: данные ТАА являются вирусными белками и могут играть ведущую роль в онкогенном процессе, и, так как они являются чужеродными (не человеческого происхождения), они могут провоцировать Т-клеточный ответ. Примерами таких белков являются вирусные белки человеческой папилломы типа 16, Е6 и Е7, которые экспрессированы в клетках карциномы шейки матки.
Для того чтобы белки были распознаны цитотоксическими Т-лимфоцитами в качестве опухолеспецифического или -ассоциированного антигена и чтобы они могли использоваться в терапии, должны выполняться особые предварительные требования. Антиген должен экспрессироваться преимущественно опухолевыми клетками и не экспрессироваться или экспрессироваться в сравнительно малом количестве здоровыми тканями. Далее желательно, чтобы соответствующий антиген не только присутствовал в каком-либо виде опухоли, но и также имел высокую концентрацию (т.е. число копий соответствующего пептида на клетку). Опухолеспецифические и опухолеассоциированные антигены часто образованы из белков, напрямую задействованных в трансформации нормальной клетки в опухолевую, в связи с функцией, например, при контроле клеточного цикла или подавлении апоптоза. Кроме того, нисходящие мишени белков, непосредственно являющихся причиной трансформации, могут быть представлены в повышенном количестве и, таким образом, опосредованно опухолеассоциированными. Такие опосредованно опухолеассоциированные антигены могут также быть мишенями вакцинационного подхода (Singh-Jasuja H., Emmerich N.P., Rammensee H.G., Cancer Immunol. Immunoether. 2004 Mar; 453(3):18795). В обоих случаях необходимо, чтобы эпитопы присутствовали в аминокислотной последовательности антигена, поскольку такой пептид (иммуногенный пептид), который образован из опухолеассоциированного антигена, должен вести in vitro или in vivo к Т-клеточному ответу.
По существу, любой пептид, способный связываться с молекулой MHC, может выполнять функцию Т-клеточного эпитопа. Предварительным условием для индукции Т-клеточного ответа in vitro или in vivo является присутствие Т-клетки с соответствующим ТКР и отсутствие иммунологической толерантности к данному конкретному эпитопу.
- 3 037019
Поэтому опухолеассоциированные антигены (ТАА) являются отправным пунктом для разработки противораковой вакцины. Методы идентификации и характеристики ТАА основаны на использовании
ЦТЛ, которые могут быть выделены из крови пациентов или здоровых субъектов, или же они могут быть основаны на генерировании дифференциальных транскрипционных профилей или дифференциальных паттернов пептидной экспрессии между опухолевыми и нормальными тканями.
Однако идентификация генов, гиперэкспрессированных в опухолевых тканях или человеческих опухолевых клеточных линиях или же селективно экспрессированных в таких тканях или клеточных линиях, не дает точной информации об использовании антигенов, транскрибированных с данных генов, в иммунотерапии. Это обусловлено тем, что только отдельная субпопуляция эпитопов этих антигенов подходит для такого применения, так как Т-клетка с соответствующим ТКР должна быть в наличии, и необходимо, чтобы отсутствовала или была минимальной иммунологическая толерантность к этому конкретному эпитопу. Поэтому важно выбрать лишь те пептиды из гиперэкспрессированных или селективно экспрессированных белков, которые презентируются в соединении с молекулами MHC, против которых может быть обнаружена функциональная Т-клетка. Такая функциональная Т-клетка определяется как Т-клетка, которая при стимуляции специфическим антигеном может быть распространена посредством клонирования и способна к выполнению эффекторных функций (эффекторная Т-клетка).
Т-хелперные клетки играют важную роль в управлении эффекторной функцией ЦТЛ в противоопухолевом иммунитете. Эпитопы Т-хелперных клеток, инициирующие ответы Т-хелперных клеток типа TH1, поддерживают эффекторные функции CD8-положительных киллерных Т-клеток, которые включают цитотоксические функции, направленные против опухолевых клеток, проявляющих опухолеассоциированные комплексы из пептидов и MHC на их клеточной поверхности. Таким образом, опухолеассоциированные пептидные эпитопы Т-хелперных клеток, одни или в комбинации с другими опухолеассоциированными пептидами, могут служить в качестве активных фармацевтических ингредиентов вакцинных композиций, которые стимулируют противоопухолевые иммунные ответы.
Краткое описание чертежей
Фиг. 1. Пример масс-спектра CDC2-001, демонстрирующий его презентацию на образце первичной опухоли GC2464. Анализ с помощью ЖХ-МС с системой ионизации в наноэлектроспрее (NanoESI-LCMS) производили на пептидном пуле, элюированном из образца ткани РЖ 2464.
A: Масс-хроматограмма для m/z 597,3501±0,001 Да, z=2 показывает пик пептида со временем удержания 151,63 мин.
В: Выявленный пик в масс-хроматограмме при 151,63 мин обнаружен сигналом для m/z 597,3501 на масс-спектре.
С: Индуцированный столкновением масс-спектр затухания из выбранного предшественника m/z 597,3501, записанный при эксперименте NanoESI-LCMS при заданном времени удержания, подтвердил присутствие CDC2-001 в опухолевом образце GC2464.
D: Шаблон фрагментации синтетического контрольного пептида CDC2-001 записывали и сравнивали с шаблонами фрагментации генерированных природных пептидов TUMAP, представленных на фиг. 1С для верификации последовательности.
Фиг. 2. Профили экспрессии мРНК выбранных белков в нормальных тканях и 25 образцах тканей рака желудка:
a) CDC2 (идентификатор набора проб: 203213_at);
b) ASPM (идентификатор набора проб: 219918_s_at)
Фиг. 3. Отдельные результаты пептид-специфической иммуногенности in vitro пептидов TUMAP I класса. CD8+ Т-клетки примировали с помощью искусственных АПК, нагруженных релевантным (левая секция) и нерелевантным пептидом (правая секция) соответственно. После трех циклов стимуляции обнаружение клеток, реагирующих с пептидом, производилось с помощью двойного окрашивания релевантными и нерелевантными А*2402-мультимерами. Среди показанных клеток проводили гейтирование живых лимфоцитов CD8+, и цифрами на точках обозначена процентная доля мультимер-положительных клеток.
Подробное описание изобретения
Все термины, используемые в контексте данного изобретения, если не указано иное, имеют значения, данные ниже. Понятие пептид в контексте настоящего описания обозначает серии аминокислотных остатков, связанных друг с другом типично пептидными связями между альфа-аминными и карбонильными группами смежных аминокислот. Предпочтительно, чтобы пептиды имели длину в 9 аминокислот, но они могут быть короче, длиной в 8 аминокислот, и длиннее - 10, 11, 12, 13 или 14 аминокислот в длину.
Понятие олигопептид в контексте настоящего описания обозначает серии аминокислотных остатков, связанных один с другим типично пептидными связями между альфа-аминными и карбонильными группами смежных аминокислот. Длина олигопептида не особенно важна для изобретения до тех пор, пока в нем сохраняются надлежащие эпитоп или эпитопы. Олигопептиды, как правило, состоят из менее чем примерно 30 аминокислотных остатков в длину и более чем примерно 14 аминокислот в длину.
- 4 037019
Понятие полипептид обозначает серии аминокислотных остатков, связанных один с другим типично пептидными связями между альфа-аминными и карбонильными группами смежных аминокислот.
Длина полипептида не особенно важна для изобретения до тех пор, пока сохраняются надлежащие эпитопы. В отличие от понятий пептид или олигопептид, понятие полипептид введено для обозначения молекул, содержащих более чем приблизительно 30 аминокислотных остатков.
Пептид, олигопептид, белок или полинуклеотид, кодирующий такую молекулу, является иммуногенным (и, таким образом, иммуногеном в рамках настоящего изобретения), если он способен индуцировать иммунный ответ. В контексте настоящего изобретения иммуногенность получает более специфическое определение, как способность индуцировать Т-клеточный ответ. Таким образом, иммуноген будет представлять собой молекулу, которая способна индуцировать иммунный ответ, и, в случае настоящего изобретения, молекулу, способную индуцировать Т-клеточный ответ.
Для Т-клеточного эпитопа необходим короткий пептид, который связан с рецептором MHC I класса, образующим трехчленный комплекс (альфа-цепь MHC класса I, бета-2-микроглобулин и пептид), который может быть распознан Т-клеткой, несущей подходящий Т-клеточный рецептор, связывающийся с комплексом MHC/пептид с подходящей аффинностью. Пептиды, связывающиеся с молекулами MHC I класса, как правило, имеют длину в 8-14 аминокислот и в особенности, как правило, длину в 9 аминокислот.
У человека имеется три различных генетических локуса, которые кодируют молекулы MHC I класса (молекулы MHC человека называются также человеческими лейкоцитарными антигенами (HLA)): HLA-A, HLA-B и HLA-C. HLA-A*01, HLA-A*02 и HLA-A*024 являются примерами различных аллелей MHC I класса, которые могут экспрессироваться из этих локусов.
Таблица 1. Частоты экспрессии F HLA*A024 и наиболее частые серотипы HLA*A02402. Частоты экспрессии выведены из частот гаплотипа Gf среди населения США, адаптированных из публикации (Mori et al., 1017-27) с использованием формулы Харди-Вейнберга F=1-(1-Gf)2. Более подробная информация представлена в работе (Chanock et al., 1211-23).
Таблица 1
Частоты экспрессии HLA*24 и серотипов А*2402 по всему миру
Аллель Популяция | Фенотип, рассчитанный из частоты аллеля | |
А*24 | Филиппины | 65% |
А*24 | Русские | 61% |
А*240 | ненцы Япония | 59% |
2 А*24 | Малайзия | 58% |
А*240 | Филиппины | 54% |
2 А*24 | Индия | 47% |
А*24 | Южная | 40% |
А*24 | Корея Шри-Ланка | 37% |
А*24 | Китай | 32% |
А*240 | Индия | 29% |
2 А*24 | Западная | 22% |
А*24 | Австралия США | 22% |
А*24 | Россия, | 20% |
А*24 | Самара Южная | 20% |
А*24 | Америка Европа | 18% |
Используемая в контексте данного описания ссылка на последовательность ДНК включает как однонитевую, так и двунитевую ДНК. Таким образом, специфическая последовательность, если в контексте не указано иное, относится к однонитевой ДНК такой последовательности, дуплексу такой последовательности с его комплементом (двунитевая ДНК) и комплементу такой последовательности. Понятие кодирующая область относится к тому участку гена, который в естественных или обычных условиях кодирует продукт экспрессии того гена в его естественном геномном окружении, т.е. участку, кодирую- 5 037019 щему in vivo нативный продукт экспрессии гена.
Кодирующая область может быть из не мутировавшего (нормального), мутировавшего или измененного гена или может даже быть из последовательности ДНК или же гена, целиком синтезированного в лаборатории с использованием методов, хорошо известных специалистам области синтеза ДНК.
Понятие нуклеотидная последовательность относится к гетерополимеру дезоксирибонуклеотидов.
Нуклеотидная последовательность, кодирующая конкретный пептид, олигопептид или полипептид, может быть встречающейся в природе или может быть синтезирована. В целом сегменты ДНК, кодирующие пептиды, полипептиды и белки данного изобретения, собраны из фрагментов кДНК и коротких олигонуклеотидных линкеров или же из серий олигонуклеотидов для получения синтетического гена, который способен экспрессироваться в рекомбинантной транскрипционной единице, включающей регуляторные элементы, образованные из микробного или вирусного оперона.
Понятие продукт экспрессии означает полипептид или белок, являющийся природным продуктом трансляции гена любой последовательности нуклеиновой кислоты, которая кодирует эквиваленты, образующиеся в результате вырождения генетического кода и, таким образом, кодирует ту/те же самую(ые) аминокислоту(ы).
Понятие фрагмент, если относится к кодирующей последовательности, означает участок ДНК, включающий меньше чем полную кодирующую область, продукт экспрессии которого по существу сохраняет ту же самую биологическую функцию или активность, что и продукт экспрессии полной кодирующей области.
Понятие сегмент ДНК относится к полимеру ДНК в виде отдельного фрагмента или в качестве компонента более крупной конструкции ДНК, которая была образована из ДНК, выделенной по меньшей мере один раз по существу в чистой форме, т.е. без контаминирующих эндогенных материалов и в количестве или с концентрацией, позволяющих идентификацию, манипуляцию и восстановление сегмента и его составных нуклеотидных последовательностей стандартными биохимическими методами, например с использованием вектора для клонирования. Такие сегменты предлагаются в форме открытой рамки считывания, не прерываемой внутренними нетранслированными последовательностями или интронами, которые обычно присутствуют в эукариотических генах. Последовательности нетранслированной ДНК могут присутствовать по нисходящей от открытой рамки считывания, где она не интерферирует с манипуляцией или экспрессией кодирующих областей.
Понятие праймер означает короткую последовательность нуклеиновой кислоты, которая может быть спарена с одной нитью ДНК с получением свободного конца 3'ОН, на котором ДНК-полимераза начинает синтез дезоксирибонуклеотидной цепи.
Понятие промотор означает участок ДНК, задействованный в связывании РНК-полимеразы для инициации транскрипции.
Понятие выделенный означает, что материал удален из его исходного окружения (к примеру, естественного окружения, если он встречается в природе). Например, встречающийся в природе полинуклеотид или полипептид, представленный в живых организмах, не является выделенным, но тот же самый полинуклеотид или полипептид, отделенный от некоторых или всех сосуществующих материалов природной системы, является выделенным. Такие полинуклеотиды могли быть частью вектора и/или такие полинуклеотиды или полипептиды могли быть частью композиции и все-таки могли быть выделены, так что такой вектор или композиция не является частью своего естественного окружения.
Полинуклеотиды и рекомбинантные или иммуногенные полипептиды, раскрытые в соответствии с настоящим изобретением, могут также быть в очищенной форме. Понятие очищенный не требует абсолютной чистоты; скорее оно предназначено для дачи относительного определения и может включать препараты с высокой очисткой или препараты только с частичной очисткой в соответствии с тем, как эти термины понимаются специалистами соответствующей области. Например, отдельные клоны, выделенные из библиотеки кДНК, как обычно очищались до электрофоретической чистоты. Очистка исходного материала или природного материала от примесей по меньшей мере на один порядок величины, предпочтительно два или три порядка и более предпочтительно четыре или пять порядков величины определенно рассматривается в изобретении. Более того, определенно рассматривается заявленный полипептид, чистота которого составляет предпочтительно 99,999% или по меньшей мере 99,99 или 99,9% и даже желательно 99% или более по массе.
Нуклеиновые кислоты и продукты экспрессии полипептида, раскрываемые в соответствии с настоящим изобретением, в равной степени, как и векторы экспрессии, содержащие такие нуклеиновые кислоты и/или такие полипептиды, могут быть в обогащенной форме. Используемый здесь термин обогащенный означает, что концентрация материала по меньшей мере приблизительно в 2, 5, 10, 100 или 1000 раз выше его естественной концентрации (например), преимущественно 0,01%, по массе, предпочтительно по меньшей мер, около 0,1% по массе. Рассматриваются также обогащенные препараты с концентрацией примерно 0,5, 1, 5, 10 и 20% по массе. Последовательности, конструкции, векторы, клоны и другие материалы, включенные в настоящее изобретение, могут быть предпочтительно в обогащенной форме или выделенными.
- 6 037019
Понятие активный фрагмент означает фрагмент, который дает иммунный ответ (т.е. обладает иммуногенной активностью), если он введен отдельно или факультативно с подходящим адъювантом животному, такому как млекопитающее, например кролику или мыши, также включая человека; таковой иммунный ответ принимает форму стимуляции ответа Т-клетки у животного-реципиента, такого как человек. Альтернативно, активный фрагмент может также быть использован для инициации ответа Т -клетки in vitro.
В контексте настоящего описания понятия участок, сегмент и фрагмент, если они использованы по отношению к полипептидам, относятся к непрерывной последовательности остатков, таких как аминокислотные остатки, последовательность которых формирует подкласс более крупной последовательности. Например, если полипептид был подвергнут обработке любой из известных эндопептидаз, таких как трипсин или химотрипсин, то полученные в результате такой обработки олигопептиды будут представлять участки, сегменты или фрагменты исходного полипептида. Это означает, что любой таковой фрагмент будет обязательно содержать как часть его аминокислотной последовательности сегмент, фрагмент или участок, который по существу идентичен, если не в точности идентичен последовательности SEQ ID NO: 1 по 33, которая соответствует встречающимся в природе или материнским белкам последовательностей с SEQ ID NO: 1 по 33. При использовании по отношению к полинуклеотидам эти понятия относятся к продуктам, полученным при обработке указанных полинуклеотидов любой из известных эндонуклеаз.
В соответствии с настоящим изобретением понятие процентная доля идентичности или идентичный с процентной долей, если оно относится к последовательности, означает, что последовательность сравнивается с заявленной или описанной последовательностью после выравнивания сравниваемой последовательности (Сравниваемая последовательность) с описанной или заявленной последовательностью (Контрольная последовательность). Процентная доля идентичности определяется затем по следующей формуле:
Процентная доля идентичности=100[I-(C/R)], где С является числом различий между Контрольной последовательностью и Сравниваемой последовательностью по длине выравнивания между Контрольной последовательностью и Сравниваемой последовательностью, где (i) каждое основание или аминокислота в Контрольной последовательности, которые не имеют соответствующего выравненного основания или аминокислоты в Сравниваемой последовательности; и (ii) каждая брешь в Контрольной последовательности; и (iii) каждое выравненное основание или аминокислота в Контрольной последовательности, которые отличаются от выравненного основания или аминокислоты в Сравниваемой последовательности, представляют собой различие; и
R - это число оснований или аминокислот в Контрольной последовательности по длине выравнивания со Сравниваемой последовательностью с любой брешью, образующейся в Контрольной последовательности, считающейся также за основание или аминокислоту.
Если существует выравнивание между Сравниваемой последовательностью и Контрольной последовательностью, для которых процентная доля идентичности, по расчетам выше, приблизительного равна или выше установленной минимальной Процентной доли идентичности, тогда Сравниваемая последовательность имеет установленную минимальную процентную долю идентичности с Контрольной последовательностью, если даже могут существовать выравнивания, в которых подсчитанная здесь выше Процентная доля идентичности меньше, чем установленная Процентная доля идентичности.
Исходные пептиды, раскрываемые в данном описании, могут быть модифицированы путем замены одного или нескольких остатков в различных, возможно отобранных, участках по длине пептидной цепи, если не заявлено иное. Такие замены могут носить консервативный характер, например, где одна аминокислота заменяется аминокислотой с похожей структурой и характеристиками, так же как при замене гидрофобной аминокислоты на другую гидрофобную аминокислоту. Еще более консервативным будет замена аминокислот одинакового или похожего размера и химического характера, такое как при замене лейцина на изолейцин. В исследованиях вариаций последовательностей внутри семейств встречающихся в природе гомологичных белков определенные замены аминокислот допускаются чаще, чем другие, и они часто связаны со сходствами по размеру, заряду, полярности и гидрофобности между исходной аминокислотой и ее заменой; и таковой является основа определения консервативных замен.
Консервативные замены определены в контексте настоящего описания как обмены внутри одной из последующих пяти групп:
группа 1 - малые, алифатические, неполярные или слабополярные остатки (Ala, Ser, Thr, Pro, Gly);
группа 2 - полярные, отрицательно заряженные остатки и их амиды (Asp, Asn, Glu, Gln);
группа 3 - полярные, положительно заряженные остатки (His, Arg, Lys);
группа 4 - крупные, алифатические, неполярные остатки (Met, Leu, Ile, Val, Cys);
группа 5 - крупные, ароматические остатки (Phe, Tyr, Trp).
Менее консервативные замены могут охватывать замену одной аминокислоты другой, имеющей похожие характеристики, но отличающейся в какой-то степени по размеру, как в случае замены аланина
- 7 037019 остатком изолейцина. Высоконеконсервативные замены могут охватывать замену кислой аминокислоты другой, которая имеет полярность, или даже такой, которая имеет основной характер. Такие радикальные замены не могут, однако, быть отвергнуты как потенциально неэффективные из-за того, что химические эффекты не полностью предсказуемы, и радикальные замены могут неожиданно привести к благоприятным эффектам, не предсказуемых исходя из обычных химических принципов.
Разумеется, в таких заменах могут участвовать другие структуры, отличающиеся от обычных L-аминокислот. Таким образом, D-аминокислоты могут быть заменены L-аминокислотами, обычно встречающимися в антигенных пептидах по изобретению и также охватываемыми настоящим раскрытием сущности изобретения. Кроме того, аминокислоты, содержащие нестандартные R-группы (т.е. R-группы, отличающиеся от обнаруженных в повсеместно встречающихся 20 аминокислотах природных белков), могут быть также использованы в целях замены для получения иммуногена и иммуногенных полипептидов в соответствии с настоящим изобретением.
Если были произведены замены на более чем одной позиции с получением пептида с практически эквивалентной или большей антигенной активностью, чем та, что определена ниже, то комбинации таких замен будут проанализированы для определения того, приведут ли эти комбинации замен к дополнительным или синергетическим эффектам по отношению к антигенности пептида. По большей части замены должны производиться не более чем на четырех позициях внутри пептида одновременно.
Понятие Т-клеточный ответ означает специфическую пролиферацию и активацию эффекторных функций, индуцированных пептидом in vitro или in vivo. Для ЦТЛ, рестриктированных по MHC I класса, эффекторными функциями может быть лизис клеток-мишеней, нагруженных пептидом, нагруженных предшественником пептида или клеток-мишеней, естественно презентирующих пептид; секреция цитокинов, предпочтительно интерферона-гамма, TNF-альфа или ИЛ-2, индуцированная пептидом; секреция эффекторных молекул, предпочтительно гранзимов или перфоринов, индуцированная пептидом, или дегрануляция.
Предпочтительно, чтобы ЦТЛ, специфичные для пептида с SEQ ID NO: 1 по 33, были испытаны относительно замещенных пептидов; концентрация пептида, при которой замещенные пептиды достигают половины максимального роста лизиса относительно фона, составляет не более чем около 1 мМ, предпочтительно не более чем около 1 мкМ, более предпочтительно не более чем около 1 нМ и еще более предпочтительно не более чем около 100 пМ и наиболее предпочтительно не более чем около 10 пМ. Также предпочтительно, чтобы замещенный пептид распознавался ЦТЛ более чем одного индивида, по меньшей мере двух и более предпочтительно трех индивидов.
Таким образом, эпитопы настоящего изобретения могут быть идентичны встречающимся в природе опухолеассоциированным или опухолеспецифическим эпитопам или могут включать эпитопы, отличающиеся не более чем 4 остатками от контрольного пептида, при условии, что они имеют по существу идентичную антигенную активность.
Иммунотерапевтические подходы в лечении.
Стимуляция иммунных ответов зависит от присутствия антигенов, распознаваемых иммунной системой хозяина как чужеродные. Открытие существования опухолеассоциированных антигенов повысило сейчас возможность использования иммунной системы хозяина для вмешательства в рост опухоли. Различные механизмы объединения обеих ветвей иммунной системы, как гуморальной, так и клеточной, исследуются в настоящее время для иммунотерапии рака.
Отдельные элементы клеточных иммунных ответов способны к специфическому распознаванию и уничтожению опухолевых клеток. Выделение цитотоксических Т-клеток (ЦТЛ) из популяций опухольинфильтрирующих клеток или из периферической крови позволяет предположить, что такие клетки играют важную роль в природной иммунной защите против рака. В частности, CD8-положuтельные Т-клетки, которые распознают молекулы I класса главного комплекса гистосовместимости (MHC), связанные с пептидами, имеющими обычно 8-12 аминокислотных остатков, образованных из белков или дефектных рибосомных продуктов (DRIP), находящихся в цитозоли, играют важную роль в этом ответе. Молекулы MHC человека также являются человеческими лейкоцитарными антигенами (HLA).
Молекулы MHC I класса могут встречаться на большинстве клеток, имеющих ядро, которые презентируют пептиды, образующиеся после протеолитического расщепления преимущественно эндогенных, цитозольных или ядерных белков, DRIPS, и более крупных пептидов. Однако пептиды, образованные из эндосомальных компартментов или экзогенных источников, также часто встречаются на молекулах MHC I класса. Этот неклассический способ презентации классом I в литературе называется кросспрезентацией.
Для того чтобы белки были распознаны цитотоксическими Т-лимфоцитами в качестве опухолеспецифического или -ассоциированного антигена и чтобы они могли использоваться в терапии, должны выполняться особые предварительные требования. Антиген должен быть экспрессирован преимущественно опухолевыми клетками, а не здоровыми тканями или в сравнительно малом объеме. Далее желательно, чтобы соответствующий антиген не только присутствовал в каком-либо виде опухоли, но и также имел высокую концентрацию (т.е. число копий соответствующего пептида на клетку). Опухолеспецифические и опухолеассоциированные антигены часто образованы из белков, напрямую задействованных в транс- 8 037019 формации нормальной клетки в опухолевую, в связи с функцией, например, при контроле клеточного цикла или в апоптозе. В дополнение также нисходящие мишени белков, непосредственно являющихся причиной трансформации, могут быть представлены в повышенном количестве и, таким образом, косвенно опухолеассоциированными. Такие косвенно опухолеассоциированные антигены могут также быть мишенями вакцинационного подхода. В обоих случаях необходимо присутствие эпитопов в аминокислотной последовательности антигена, поскольку такой пептид (иммуногенный пептид), который образован из опухолеассоциированного антигена, должен вести in vitro или in vivo к Т-клеточному ответу.
В основном любой пептид, способный связываться с молекулой MHC, может выполнять функцию Т-клеточного эпитопа. Предварительным условием для индукции Т-клеточного ответа in vitro или in vivo является присутствие Т-клетки с соответствующим ТКР и отсутствие иммунологической толерантности к данному конкретному эпитопу.
Поэтому опухолеассоциированные антигены (ТАА) являются отправным пунктом для разработки противораковой вакцины. Методы идентификации и характеристики ТАА основаны на использовании ЦТЛ, которые могут быть выделены у пациентов или здоровых субъектов, или же они основаны на генерировании различных профилей транскрипции или различном характере экспрессии пептидов опухолевыми и нормальными тканями (Lemmel et al., 450-54; Weinschenk et al., 5818-27).
Однако идентификация генов, гиперэкспрессированных в опухолевых тканях или человеческих опухолевых клеточных линиях или же селективно экспрессированных в таких тканях или клеточных линиях, не дает точной информации об использовании антигенов, транскрибированных с данных генов, в иммунотерапии. Это обусловлено тем, что только отдельная субпопуляция эпитопов этих антигенов подходит для такого применения, так как Т-клетка с соответствующим ТКР должна быть в наличии, и необходимо, чтобы отсутствовала или была минимальной иммунологическая толерантность к этому конкретному эпитопу. Поэтому важно выбрать лишь те пептиды из гиперэкспрессированных или селективно экспрессированных белков, которые презентируются в соединении с молекулами MHC, против которых может быть обнаружена функциональная Т-клетка. Такая функциональная Т-клетка определяется как Т-клетка, которая при стимуляции конкретным антигеном может быть клонирована и способна выполнять эффекторные функции (эффекторная Т-клетка).
Т-хелперные клетки играют важную роль в управлении эффекторной функцией ЦТЛ в противоопухолевом иммунитете. Эпитопы Т-хелперных клеток, инициирующие ответы Т-хелперных клеток типа ТН1, поддерживают эффекторные функции CD8-положuтельных киллерных Т-клеток, которые включают цитотоксические функции, направленные против опухолевых клеток, проявляющих комплексы опухолеассоциированный пептид/MHC на их клеточной поверхности. Таким образом, эпитопы опухолеассоциированных пептидов Т-хелперных клеток, одни или в комбинации с другими опухолеассоциированными пептидами, могут служить в качестве активных фармацевтических ингредиентов вакцинных композиций, которые стимулируют противоопухолевые иммунные ответы.
Так как оба вида ответов, зависящие от CD8 и от CD4, вносят свой вклад в противоопухолевый эффект сообща и синергически, то идентификация и характеристика опухолеассоциированных антигенов, распознаваемых как CD8-положuтельными ЦТЛ (молекула MHC I класса), так и CD4-положuтельными ЦТЛ (молекула MHC II класса), являются важными при разработке противоопухолевых вакцин. Поэтому задачей настоящего изобретения является предложение композиций пептидов, которые содержат пептиды, связывающиеся с комплексами MHC любого класса.
Ввиду серьезных побочных эффектов и расходов, связанных с лечением рака, крайне необходимы улучшенные методы прогнозирования и диагностики. Поэтому существует необходимость в идентификации других факторов, представляющих собой биомаркеры рака вообще и рака желудка в частности. Кроме того, существует необходимость в идентификации факторов, которые могут быть использованы при лечении рака вообще и рака желудка в частности.
Более того, не существует стандартного способа лечения пациентов, больных раком желудка с биохимическим рецидивом после радикальной простатэктомии, обычно вызываемым резидуальным остатком опухоли in situ при наличии локально прогрессирующего роста опухоли. Желательны были бы новые терапевтические подходы, которые бы сопровождались низкой смертностью с адекватной терапевтической эффективностью по сравнению с имеющимися на данный момент терапевтическими подходами.
В настоящем изобретении предложены пептиды, которые пригодны для лечения рака желудка и других видов опухолей, которые гиперэкспрессируют пептиды по изобретению. Как показал массспектрометрический анализ образцов первичного рака желудка человека, эти пептиды презентировались в естественных условиях молекулами HLA (см. пример 1 и фиг. 1).
Исходный ген, из которого образованы пептиды, был представлен в гиперэкспрессированном состоянии при раке желудка, почечно-клеточной карциноме, раке толстой кишки, немелкоклеточной карциноме легких, аденокарциноме, раке предстательной железы, доброкачественных новообразованиях и злокачественной меланоме по сравнению с нормальными тканями (см. пример 2, и фиг. 2), демонстрирующие высокую степень взаимосвязи пептида с опухолью, т.е. эти пептиды эти пептиды в большом количестве презентируются на опухолевой ткани, но не на нормальных тканях.
- 9 037019
Связанные с HLA пептиды могут распознаваться иммунной системой, специфически Т-лимфоцитами/Т-клетками. Т-клетки могут разрушать клетки, презентирующие распознанный комплекс HLA/пептид; к примеру, опухолевые клетки рака желудка, презентирующие полученные пептиды.
Все пептиды настоящего изобретения, которые были совместимы с методикой валидации, см. пример 3, как было показано, в состоянии стимулировать Т-клеточные ответы (см. пример 3 и фиг. 3). Таким образом, эти пептиды пригодны для генерирования иммунного ответа в организме пациента для уничтожения опухолевых клеток. Иммунный ответ у пациента может быть индуцирован при непосредственном введении описанных пептидов или подходящих веществ-предшественников (к примеру, удлиненных пептидов, белков или нуклеиновых кислот, кодирующих эти пептиды) пациенту, в идеальном случае в комбинации с веществом, усиливающим иммуногенность (т.е. адъювантом). От иммунного ответа, вызванного такой терапевтической вакцинацией, может ожидаться, что он будет высокоспецифическим против опухолевых клеток, так как целевые пептиды настоящего изобретения не презентируются на нормальных тканях со сравнимыми количествами копий, предотвращая, тем самым, риск нежелательных аутоиммунных реакций против нормальных клеток у пациента.
Фармацевтические композиции включают пептиды как в свободной форме, так и в форме фармацевтически приемлемой соли. Используемое в контексте настоящего изобретения понятие фармацевтически приемлемая соль относится к производным раскрытых в изобретении пептидов, причем пептид модифицирован путем получения кислотных или основных солей агента. Например, кислотные соли получают из свободного основания (как правило, где нейтральная форма лекарственного средства имеет нейтральную группу -NH2) с применением реакции с подходящей кислотой. Подходящие кислоты для получения кислотных солей включают как органические кислоты, например уксусную кислоту, пропионовую кислоту, гликолевую кислоту, пировиноградную кислоту, щавелевую кислоту, оксиянтарную кислоту, малоновую кислоту, янтарную кислоту, малеиновую кислоту, фумаровую кислоту, винную кислоту, лимонную кислоту, бензойную кислоту, коричную кислоту, миндальную кислоту, метансульфоновую кислоту, этансульфоновую кислоту, p-толуолсульфокислоту, салициловую кислоту и т.п., так и неорганические кислоты, например хлористоводородную кислоту, бромистоводородную кислоту, серную кислоту, азотную кислоту, фосфорную кислоту и т.п. И наоборот, приготовление основных солей кислотных компонентов, которые могут присутствовать на пептиде, приготовляются при использовании фармацевтически приемлемого основания, такого как гидроксид натрия, гидроксид калия, гидроксид аммония, гидроксид кальция, триметиламин и т.п.
В одном особенно предпочтительном варианте осуществления фармацевтические композиции включают пептиды в виде солей уксусной кислоты (ацетаты) или соляной кислоты (хлориды).
Кроме того, пептиды настоящего изобретения пригодны не только для лечения рака, но и также в качестве диагностических средств. Так как пептиды были получены из клеток рака желудка и так как было определено, что данные пептиды не присутствуют в нормальных тканях, то эти пептиды могут быть использованы для диагностики наличия рака.
Присутствие заявленных пептидов на тканевых биоптатах может помочь патоморфологу в постановке диагноза рака. Выявление конкретных пептидов с помощью антител, масс-спектрометрии или других методов, известных из уровня техники, могут дать знать патоморфологу, что ткань является злокачественной или воспаленной или же пораженной заболеванием вообще. Присутствие групп пептидов может позволить классифицировать или выделить подклассы пораженных тканей.
Выявление пептидов на образцах пораженной заболеванием ткани может позволить принять решение о целесообразности терапии, воздействующей на иммунную систему, в особенности если Т-лимфоциты, как известно или ожидается, задействованы в механизме действия. Отсутствие экспрессии MHC является хорошо описанным механизмом, при котором инфицированные или злокачественные клетки уклоняются от иммунного контроля. Таким образом, присутствие пептидов показывает, что этот механизм не используется проанализированными клетками.
Пептиды могут использоваться в анализе ответов лимфоцитов против этих пептидов, таких как Т-клеточные ответы или ответы антител против пептида или пептида в комплексе с молекулами MHC. Такие иммунные ответы лимфоцитов могут использоваться в качестве прогностических маркеров для принятия решения о дальнейших этапах терапии. Данные иммунные ответы могут также использоваться в качестве суррогатных маркеров в иммунотерапевтических подходах, направленных на индуцирование ответов лимфоцитов с помощью различных средств, например вакцинации белком, нуклеиновыми кислотами, аутологичными материалами, адоптивным переносом лимфоцитов. В условиях, когда проводится генная терапия, в целях оценки побочных эффектов могут быть проанализированы ответы лимфоцитов на пептиды. Мониторинг реакций лимфоцитов может также быть ценным инструментом для последующих обследований после трансплантации, к примеру, для выявления реакций хозяин против трансплантата и трансплантат против хозяина.
Пептиды могут использоваться для генерации и разработки специфических антител к комплексам MHC/пептид. Они могут быть использованы в терапии, нацеливающей токсины или радиоактивные вещества на пораженную ткань. Другим видом использования данных антител может быть нацеливание радионуклидов на пораженную ткань в целях визуализации, такой как PET (позитронно-эмиссионная
- 10 037019 томография). Это может помочь в обнаружении небольших метастазов или в определении размера и точной локализации пораженных тканей.
Кроме того, пептиды могут быть использованы для подтверждения диагноза рака, поставленного патологом, на основании биоптата.
В табл. 2 описаны пептиды в соответствии с настоящим изобретением, соответствующие им SEQ ID NO и исходные белки, из которых могут быть образованы данные пептиды. Все пептиды связываются с аллелями HLA А*024.
Таблица 2
Пептиды настоящего изобретения
SEQ ID NO: | Код пептида | Последовате льность | Исходный белок (белки) |
1 | CDC2-001 | LYQILQGIVF | CDK1 |
2 | ASPM-002 | SYNPLWLRI | ASPM |
3 | UCHL5-001 | NYLPFIMEL | UCHL5 |
4 | МЕТ-006 | SYIDVLPEF | МЕТ |
5 | PROM1-001 | SYIIDPLNL | PROM1 |
VWSDVTPLT | |||
6 | ММР11-001 | F | ММР11 |
7 | MST1R-001 | NYLLYVSNF | MST1R |
8 | NFYB-001 | VYTTSYQQI | NFYB |
9 | SMC4-001 | HYKPTPLYF | SMC4 |
YYNAAGFNK | |||
10 | UQCRB-001 | L | UQCRB |
РРАР2С- | |||
11 | 001 | AYLVYTDRL | РРАР2С |
12 | AVL9-001 | FYISPVNKL | AVL9 |
13 | NUF2-001 | VYGIRLEHF | NUF2 |
14 | ABL1-001 | TYGNLLDYL | ABL1 |
15 | MUC6-001 | NYEETFPHI | MUC6 |
16 | ASPM-001 | RYLWATVTI | ASPM |
17 | ЕРНА2-005 | VYFSKSEQL | ЕРНА2 |
18 | ММРЗ-001 | VFIFKGNQF | ММРЗ |
19 | NUF2-002 | RFLSGIINF | NUF2 |
20 | PLK4-001 | QYASRFVQL | PLK4 |
21 | ATAD2-002 | KYLTVKDYL | ATAD2 |
COL12A1- | |||
22 | 001 | VYNPTPNSL | COL12A1 |
COL6A3- | |||
23 | 001 | SYLQAANAL | COL6A3 |
24 | FANCI-001 | FYQPKIQQF | FANCI |
25 | RPS11-001 | YYKNIGLGF | RPS11 |
26 | ATAD2-001 | AYAIIKEEL | ATAD2 |
27 | ATAD2-003 | LYPEVFEKF | ATAD2 |
HSP90B1- | KYNDTFWK | ||
28 | 001 | EF | HSP90B1 |
29 | SIAH2-001 | VFDTAIAHLF | SIAH2 |
30 | SLC6A6-001 | VYPNWAIGL | SLC6A6 |
31 | IQGAP3-001 | VYKWGNLL | IQGAP3 |
32 | ERBB3-001 | VYIEKNDKL | ERBB3 |
33 | KIF2C-001 | IYNGKLFDLL | KIF2C |
- 11 037019
Другие интересующие пептиды HLAA*024 по изобретению
SEQ ID NO: 34 | Код пептида CCDC88A-001 | Последовательн ость QYIDKLNEL | Исходный белок (белки) CCDC88A |
35 | CCNB1-003 | MYMTVSIIDRF | CCNB1 |
36 | CCND2-001 | RYLPQCSYF | CCND2 |
37 | CCNE2-001 | IYAPKLQEF | CCNE2 |
СЕАСАМ1, | |||
СЕАСАМ5, | |||
38 | СЕА-010 | IYPDASLLI | СЕАСАМ6 |
39 | CLCN3-001 | VYLLNSTTL | CLCN3 |
40 | DNAJC10-001 | IYLEVIHNL | DNAJC10 |
41 | DNAJC10-002 | AYPTVKFYF | |
EIF2S3, | |||
42 | EIF2S3-001 | IFSKIVSLF | LOC255308 |
EIF3L, | |||
43 | EIF3L-001 | YYYVGFAYL | LOC340947 |
44 | ЕРРК1-001 | RYLEGTSCI | ЕРРК1 |
45 | ERBB2-001 | TYLPTNASLSF | ERBB2 |
46 | GPR39-001 | SYATLLHVL | GPR39 |
47 | ITGB4-001 | DYTIGFGKF | ITGB4 |
48 | LCN2-001 | SYNVTSVLF | LCN2 |
LOC642502, | |||
49 | SDHC-001 | SYLELVKSL | SDHC |
50 | РВК-001 | SYQKVIELF | РВК |
51 | POLD3-001 | LYLENIDEF | POLD3 |
52 | PSMD14-001 | VYISSLALL | PSMD14 |
53 | РТК2-001 | RYLPKGFLNQF | РТК2 |
54 | RPS11-001 | YYKNIGLGF | RPS11 |
55 | TSPAN1-002 | VYTTMAEHF | TSPAN1 |
56 | ZNF598-001 | DYAYLREHF | ZNF598 |
57 | ADAM 10-001 | LYIQTDHLFF | ADAM 10 |
58 | ММР12-001 | TYKYVDINTF | ММР12 |
59 | RRM2-001 | YFISHVLAF | RRM2 |
60 | TMPRSS4-001 | VYTKVSAYL | TMPRSS4 |
61 | TSPAN8-001 | VYKETCISF | TSPAN8 |
В другом варианте осуществления этого изобретения раскрыты пептиды против рака желудка, связывающиеся с HLA А*02. Для индивидов, являющихся А*02-и/или А*24-положительными, смеси раскрытых в изобретении пептидов могут применяться для лечения рака желудка. Предпочтительными являются смеси из 2 до 20 пептидов и смеси из 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 и 20 пептидов.
- 12 037019
SEQ ID NO: | Код пептида | Последовательн ость | Исходный белок (белки) |
62 | DIO2-001 | ALYDSVILL | DIO2 |
63 | IGF2BP3-001 | KIQEILTQV | IGF2BP3 |
64 | LMNB1-001 | LADETLLKV | LMNB1 |
65 | WNT5A-001 | AMSSKFFLV | WNT5A |
66 | FAP-003 | YVYQNNIYL | FAP |
67 | COPG-001 | VLEDLEVTV | COPG, COPG2, TSGA13 |
68 | COL6A3-002 | FLLDGSANV | COL6A3 |
69 | COL6A3-003 | NLLDLDYEL | COL6A3 |
70 | COL6A3-004 | FLIDSSEGV | COL6A3 |
71 | PSMC2-001 | ALDEGDIAL | PSMC2 |
72 | UBE2S-001 | ALNEEAGRLLL | UBE2S |
73 | KIF11-001 | ILSPTWSI | KIF11 |
74 | ADAM8-001 | KLLTEVHAA | ADAM8 |
75 | CCNB1-001 | ALVQDLAKA | CCNB1 |
76 | CDC6-001 | ILQDRLNQV | CDC6 |
77 | F2R-001 | TLDPRSFLL | F2R |
78 | OLFM4-001 | TLDDLLLYI | OLFM4 |
79 | THY1-001 | SLLAQNTSWLL | THY1 |
80 | CEP250-001 | SLAEVNTQL | CEP250 |
81 | HIF1A-001 | ALDGFVMVL | HIF1A |
82 | KRAS-001 | GVDDAFYTL | KRAS |
83 | MET-001 | YVDPVITSI | MET |
84 | NCAPG-001 | YLLSYIQSI | NCAPG |
85 | NCAPG-002 | QIDDVTIKI | NCAPG |
86 | TOP-004 | YLYGQTTTYL | TOP2A |
87 | TOP-005 | KLDETGNSL | TOP2A |
88 | LAMC2-002 | RLDDLKMTV | LAMC2 |
89 | AHR-001 | LTDEILTYV | AHR |
90 | CCNB1-002 | ILIDWLVQV | CCNB1 |
91 | CEACAM6-001 | VLYGPDVPTI | CEACAM6 |
92 | COPB1-001 | SIFGEDALANV | COPB1 |
93 | HMMR-001 | KLLEYIEEI | HMMR |
94 | TPX2-001 | KILEDVVGV | TPX2 |
TOP2A, | |||
95 | TOP-001 | KIFDEILVNA | TOP2B |
Белок цикла клеточного деления 2 (CDC2.)
Сериновая/треониновая киназа CDC2, также известная как Cdkl (циклин-зависимая киназа 1), играет ключевую роль в контроле клеточного цикла. Он известен как основной регулятор перехода от G2 к фазе М. В конце интерфазы он связывается с циклинами А-типа. После разрушения ядерной оболочки циклины А-типа заменяются циклином В, который образует фактор стимуляции митоза (MPF) с Cdc2. MPF необходим для прохождения клетками фазы митоза.
Функция белка Cdc2 в митозе не является избыточной и не может быть компенсирована активностью других Cdks, таких как Cdk2, 4 и 6. Напротив, об Cdc2 сообщалось, что он задействован в других фазах клеточного цикла, таких как переход G1-S, и он способен заменить Cdks периода интерфазы. Таким образом, как было предложено, Cdc2 является единственным Cdk, незаменимым для клеточного цикла.
Гиперэкспрессия Cdc2 была обнаружена при нескольких видах рака и часто соотносилась с плохим прогнозом. Среди них находятся карцинома предстательной железы, карциномы ротовой полости, плоскоклеточные карциномы ротовой полости (OSCC), острая миелоидная лейкемия (AML) (Qian et al., 2009), H.pylori-индуцированная MALT-лимфома (Banerjee et al., 217-25) и карцинома толстой кишки (Yasui et al., 36-41). При раке желудка сообщалось о гиперэкспрессии и/или повышенной активности, и это может его причиной. Ингибиторы Cdc2 и другие белки Cdks рассматривали в качестве кандидатов для лекарственных средств для лечение рака (Shapiro, 1770-83).
- 13 037019
Белок, ассоциированный с аномальной веретеновидной микроцефалией (ASPM).
Аномальный ген белка веретена деления (ASPM), ассоциированный с микроцефалией, является человеческим ортологом гена ахроматического веретена дрозофилы (asp). Он принимает участие в регуляции развития нервных клеток, и его мутации приводят к первичной аутосомной рецессивной микроцефалии. Во время митоза ASPM локализован на полюсах веретена деления. Гиперэкспрессия ASPM была предложена в качестве маркера и потенциальной терапевтической мишени при глиобластоме. Опосредованный siPHK нокдаун ингибирует пролиферацию опухолевых клеток и нейрональных стволовых клеток. Гиперэкспрессия ASPM может также предсказывать усиленный инвазивный/метастатический потенциал, быстрый рецидив опухоли и плохой прогноз при почечно-клеточной карциноме. ASPM экспрессикуется в повышенном количестве в иммортализованных клетках и в тканях немелкоклеточного рака легких (Jung, Choi, и Kim 703-13).
Матричные металлопротеазы 3 (ММР3).
MMP3, называемый также прохелатиназой или стромелизином 1, является эндопептиназой, которая расщепляет компоненты внеклеточного матрикса (ЕСМ), такие как фибронектин, ламинин, эластин, центральный белок протеогликанов и неспиральные цепи коллагенов. ММР важны во время нескольких физиологических процессов, требующих перегруппировку ЕСМ, таких как миграция клеток во время эмбриогенеза, ремоделирование тканей, васкуляризация, инволюция молочной железы и заживление ран. MMP3 также играет роль в накоплении тромбоцитов. Патологические состояния с увеличением экспрессии и секреции MMP3 включают аутоиммунные воспалительные процессы и рак.
MMP3 экспрессируется в избытке клетками некоторых видов опухолей и играет важную роль при эпителиально-мезенхимальном переходе (ЭМП). Он также может вносить свой вклад на ранних стадиях онкогенеза, инициируя эпигенетические изменения, которые приводят к появлению злокачественного фенотипа (Lochter et al., 180-93). Полиморфизмы промоторной области MMP3, которые связаны с уровнями экспрессии, как было показано, оказывают влияние на степень риска и прогноз при некоторых видах рака, таких как аденокарцинома пищевода (Bradbury et al., 793-98) и плоскоклеточная карцинома полости рта (Vairaktaris et al., 4095-100) (Liu et al., 430-35). Н.pylori-положительным пациентам, больным раком желудка, с повышенным уровнем сыворотки MMP3- и ММР7 наблюдалась более высокая инвазия лимфатических узлов и более короткая выживаемость. В когорте из 74 пациентов, больных раком желудка, MMP3 экспрессировался в 27% случаев (Murray et al., 791-97).
с-Met.
c-Met является посредником потенциально онкогенной активности фактора роста гепатоцитов, фактора HGF/scatter, в том числе содействия клеточному росту, подвижности, выживаемости, деградации внеклеточного матрикса и ангиогенеза. Связывание HGF активирует нисходящие сигнальные пути, включая Ras, фосфатидилиноситол 3'-киназу, фосфолипазу Cy, и активированные митогеном каскады реакций, связанные с протеинкиназой (Dong et al., 5911-18; Furge et al., 10722-27; Furge, Zhang, and Vande Woude, 5582-89; Montesano et al., 355-65; Naldini et al., 501-04; Ponzetto et al., 4600-08). c-Met экспрессируется преимущественно в эпителиальных клетках. Онкогенная активация c-Met (также и в неэпителиальных злокачественных тканях) может быть результатом амплификации/гиперэкспрессии, активирующих мутаций, приобретения HGF/c-Met аутокринных петель или конститутивного фосфорилирования (Di Renzo et al., 147-54; Ferracini et al., 739-49;Fischer et al., 733-39; Koochekpour et al., 5391-98;Li et al., 8125-35; Maulik et al., 41-59;Qian et al., 589-96; Ramirez et al., 635-44; Tuck et al., 225-32) (Nakaigawa et al., 3699-705). Конститутивная активация c-Met в организме трансгенных мышей с избыточной HGFэкспрессией способствует онкогенезу широкого спектра (Takayama et al., 701-06; Wang et al., 1023-34). Выключение гена МЕТ приводит к ингибированию роста опухоли и метастазирования (Corso et al., 684-93). Амплификация МЕТ была связана с прогрессией рака желудка у человека (Lin et al., 5680-89). (Yokozaki, Yasui, и Tahara, 49-95).
Убиквитин карбоксил-терминальная гидролаза L5 (UCHL5) UCHL5, известная также как убиквитин С-терминальная гидролаза (UCH37) или INO80R, является ассоциированной с протеасомой деубиквитиназой. Она разбивает на части связанные с белком полиубиквитиновые цепи на дистальном конце путем расщепления изопептидной связи между С-концевыми Cys76 и Lys48 (Nishio et al., 855-60). В ядре UCHL5 соединена с хроматин-ремоделирующим комплексом Ino80. После связывания с протеасомой она активируется и может управлять процессом транскрипции или репарации ДНК, что, как предполагается, опосредовано INO80 и протеасомой.
Убиквитин-специфические протеазы, подобные UCHL5, задействованы в нескольких процессах, таких как контроль прохождения клеточного цикла, дифференциация, репликация и репарация ДНК, транскрипция, контроль качества белков, иммунный ответ и апоптоз. Возможно, UCHL5 может способствовать злокачественной трансформации. Ее активность, как было продемонстрировано, повышена в тканях карциномы шейки матки человека по сравнению с соседней нормальной тканью. Она способна деубиквитинировать и, тем самым, стабилизировать рецептор TGF-бета и его медиаторы нисходящих путей, транскрипционные факторы Smad, тем самым активируя сигнальные каскады, активируемые TGF-бета. Активация сигнальных каскадов с участием TGF-бета может выступать в качестве промотора опухолевого роста на поздних стадиях рака, хотя он обладает двоякой функцией и может также высту- 14 037019 пать в качестве супрессора роста опухоли на ранних стадиях и до инициации (Bierie и Moses, 29-40;
Horton et al., 138-43; Wicks et al., 8080-84; Wicks et al., 761-63).
Макрофаг-стимулирующий белковый рецептор (MST1R).
Рецептор MST1R (также известный под названием RON) является членом семейства Met присутствующих на поверхности клеток рецепторов тирозинкиназ, и он в первую очередь экспрессируется на эпителиальных клетках и макрофагах. Рецептор MST1R может вызывать клеточную миграцию, инвазию, пролиферацию и выживание клетки в ответ на его лиганд. Онкогенные свойства были продемонстрированы in vitro, в равной степени как in vivo в моделях с животными, и он часто дерегулирован при раковых заболеваниях человека (Dussault и Bellon, 2009). Клинические исследования показали, что гиперэкспрессия MST1R связана с плохим прогнозом и метастазами. Экспрессия MST1R значительна в тканях карциномы желудка и соответствующей паранеопластической ткани, однако она не наблюдается в нормальной слизистой оболочке желудка (Zhou et al., 236-40). Нокдаун рецептора MST1R в раковых клетках приводит к снижению хемотаксиса эндотелиальных клеток in vitro и к снижению роста опухоли и уменьшению плотности микрососудов после ортотопической трансплантации в предстательную железу in vivo. Опосредованный РНК нокдаун MST1R в клеточной линии высокоонкогенного рака толстой кишки приводил к снижению пролиферации в сравнении с контрольными клетками.
Кинезинподобный белок (KIF2C).
KIF2C является деполимеразой микротрубочек, регулирующей их правильное соединение с кинетохорами во время образования веретена деления. Он важен для хромосомной сегрегации во время анафазы и может потребоваться для координации начала разделения сестринских центромеров. Неправильное присоединение микротрубочек к кинетохорам приводит к неправильному расхождению хромосом и анеуплоидии, которая наблюдается в большинстве солидных опухолей (Maney et al., 67-131; Moore и Wordeman 537-46). KIF2C экспрессируется в избытке в раковых клетках молочной железы (Shimo et al., 62-70), толстой кишки, в клетках колоректального рака и рака желудка (Nakamura et al., 543-49). Клеточная линия рака желудка (AZ521), которая стабильно экспрессировала KIF2C, проявляла повышенную пролиферацию и миграцию по сравнению с клетками с имитированной трансфекцией. Повышенная экспрессия KIF2C в клетках рака желудка может быть ассоциирована с инвазией лимфатических сосудов, метастазами лимфатических узлов и плохим прогнозом. Лечение рака молочной железы короткими интерферирующими РНК против KIF2C ингибировало рост раковых клеток.
Белки 4 поддержания структуры хромосом (SMC4).
Белки, поддерживающие структуру хромосом SMC, являются хромосомными АТФ-азами, которые играют роль в организации структур высшего порядка в хромосомах и их динамики. Белок SMC4 является центральным компонентом комплекса конденсина, который играет роль при конденсации хроматина, а также связан с ядрышковой сегрегацией, репарацией ДНК и сохранением хроматинового скелета. Было обнаружено, что ген SMC4 экспрессируется на высоком уровне в тканях нормальной предстательной железы и слюнной железы, очень слабо - в тканях толстой кишки, поджелудочной железы и кишечника и вообще не экспрессируются в других тканях. Экспрессия РНК на высоком уровне наблюдалась во многих клеточных линиях рака и видах рака, включая рак молочной железы, предстательной железы, толстой кишки и поджелудочной железы (Egland et al., 5929-34).
Рецептор 2 эфрина типа-А (ЕРАН2).
Рецепторы Eph являются уникальным семейством рецепторных тирозинкиназ (RTK), которые играют ведущую роль в формировании органов и систем эмбриона, нейронном нацеливании и развитии сосудистой системы во время нормального эмбриогенеза. Стимуляция EphA2 его лигандом (ephrin-A1) приводит к автофосфорилированию EphA2, стимуляция обращает вспять онкогенную трансформацию. Рецепторы Eph и их лиганды, эфрины, часто экспрессируются в избытке во множестве видов рака. EphA2 часто экспрессируется в избытке и имеет функциональные изменения в клетках агрессивных опухолей и, как считается, способствует росту опухоли посредством повышения клеточной адгезии внеклеточного матрикса, безъякорного роста и ангиогенеза. Избыточная экспрессия EphA2 и EphrinA-1 была продемонстрирована в клетках карциномы желудка, и она была взаимосвязана с глубиной инвазии опухоли, стадиями опухоли по классификации TNM, метастазами в лимфатических узлах и плохим прогнозом (Yuan исоавт. 2410-17).
ATAD2.
Белок ATAD2 (также известен как ANCCA) - это новый член семейства АТФаз ААА+. Он усиливает транскрипционную активность андрогенного рецептора (AR) и эстрогенного рецептора (ER), что приводит к транскрипции генов, включая IGF1R, IRS-2, SGK1, и выживанию (AR) и циклина D1, c-myc и E2F1 (ER) соответственно. Он также усиливает транскрипционную активность с-Myc.
Экспрессия ATAD2 имеет высокий уровень в клетках некоторых видов опухолей, таких как рак молочной железы, рак предстательной железы и остеосаркома. Такая экспрессия связана с плохим прогнозом.
AVL9.
Неожиданным образом, данный белок был обнаружен в качестве белка-источника. О белке AVL9 и функции соответствующего гена имеется лишь очень скудная и ограниченная информация.
- 15 037019
Коллаген альфа-1 (XII) (COL12A1).
Коллаген альфа-1 (XII) является белком, аминокислотную последовательность альфа-1 цепи которого у человека кодирует ген COL12A1. Этот ген кодирует альфа-цепь коллагена типа XII, члена семейства коллагенов FACIT (ассоциированные с фибриллами коллагены с прерываемыми тройными спиралями). Коллаген типа XII является гомотримером, взаимосвязанным, как было обнаружено, с коллагеном типа I. Как считается, эта взаимосвязь модифицирует взаимодействие коллагена типа I с фибриллами и окружающим матриксом. Были идентифицированы альтернативные сплайс-варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы.
Коллаген альфа-3(VI) (COL6A3).
Ген COL6A3 кодирует цепь альфа-3, одну из трех альфа-цепей коллагена типа VI. Как было продемонстрировано, белковые домены связываются с белками внеклеточного матрикса, что представляет собой взаимодействие, объясняющее значимость этого коллагена в организации компонентов матрикса. Ремоделирование внеклеточного матрикса посредством гиперэкспрессии коллагена типа VI вносит свой вклад в приобретение клетками рака яичника резистентности к цисплатину. Присутствие коллагена типа VI соотносилось со степенью злокачественности опухоли, прогностическим фактором для рака яичника (Sherman-Baust et al., 377-86). Ген COL6A3 экспрессирован в избытке в клетках колоректальных опухолей (Smith et al., 1452-64), карциноме слюнной железы (Leivo et al., 104-13) и по-разному экспрессирован в клетках рака желудка (Yang et al., 1033-40). COL6A3 был идентифицирован в качестве одного из семи генов с опухолеспецифическими вариантами сплайсинга. Оцененные опухолеспецифические изменения в сплайсинге были высоко согласованными, позволяя сделать четкое подразделение на нормальные и раковые образцы, в некоторых случаях даже на стадии опухолей (Thorsen et al., 1214-24).
Анемия Фанкони, комплементационная группа I (FANCI).
Белок FANCI локализуется в хроматин в ответ на повреждение ДНК и задействован в механизмах репарации ДНК (Smogorzewska et al., 289-301). Мутации гена FANCI приводят к анемии Фанкони, генетически гетерогенному рецессивному нарушению, характеризующемуся цитогенетической нестабильностью, гиперчувствительностью к агентам, сшивающим ДНК, увеличением разрывов хромосом и дефектной репарацией ДНК. Альтернативный сплайсинг FANCI приводит к двум транскрипционным вариантам, кодирующим различные изоформы.
Белок теплового шока массой 90 кДа, бета, член 1 (HSP90B1).
HSP90 (известный также как регулируемый глюкозой белок 94, Grp94), член 1, является человеческим шаперонным белком. Он участвует в ассоциированных с ЭР (эндоплазматический ретикулум) процессах: трансляции, контроле качества белков и ЭР-ассоциированной деградацией (ERAD), ЭР-чувствительности к стрессу и связывании кальция/удерживании кальция в ЭР (Christianson et al., 27282; Fu и Lee, 741-44). HSP90 содержит последовательность KDEL, типичную для удерживаемых в ЭР белков, однако она также встречается на поверхности опухолевых клеток (Altmeyer et al., 340-49), в равной степени как и вне клеток. Также известно, что белки HSP (белки теплового шока) высвобождаются из некротических (но не апоптотических) клеток и клеток, подвергаемых различным видам стресса, таких как тепловой шок и оксидативный стресс, и их можно выявить в кровообращении (Basu et al., 153946; Tsan и Gao 274-79). Вне клеток белок HSP90 моделирует (в основном стимулирует) иммунные ответы и задействован в презентации антигенов. На клеточной поверхности он может выполнять роль рецептора для вхождения патогена и/или для передачи сигнала (Cabanes et al., 2827-38). В случае опухолеспецифической экспрессии на поверхности клеток или высвобождения он может вызывать противоопухолевый иммунитет (Zheng et al., 6731-35). Основанные на HSP90 вакцины, как было показано, иммунизируют против рака и инфекционных заболеваний как в рамках профилактического, так и терапевтического введения (обзор дан в работе (Bolhassani и Rafati, 1185-99; Castelli et al., 227-33; Murshid, Gong и Calderwood, 1019-30)).
Однако белок HSP90 может также рассматриваться в качестве мишени для противоопухолевой терапии, поскольку 1) он соотносится с прогрессией опухоли и ведет к резистентности по отношению к апоптозу, также и при лучевой терапии или химиотерапии, и 2) он экспрессирован в избытке во многих видах опухолей, включая РЖ, остеосаркому (Guo et al., 62-67), карциному молочной железы (Hodorova et al., 31-35). Гиперэкспрессия белка HSP90 связана с агрессивным поведением опухоли и плохим прогнозом при РЖ (Wang, Wang, и Ying 35-41; Zheng et al., 1042-49). Снижение уровня белка HSP90 при РЖ приводит к апоптозу раковых клеток (Sheu, Liu и Lan, e1096).
Muc6.
Muc6 экспрессируется клетками слизистой оболочки. Его основной функцией, как считается, является защита легкоуязвимых поверхностей эпителия от вреда, наносимого постоянным воздействием широкого спектра эндогенных едких или протеолитических агентов (Toribara et al., 1997). Muc6 может также играть роль при эпителиальном органогенезе (Reid и Harris, 1999). Экспрессия Muc6 была обнаружена на нормальной слизистой оболочке желудка. Этот белок экспрессируется в избытке при некоторых видах рака, таких как аденома и карцинома кишечника, карцинома легких (Hamamoto et al., 891-96), колоректальные полипы (Bartman et al., 210-18) и карцинома молочной железы (Pereira et al., 210-13), тогда как он не экспрессируется в соответствующих нормальных тканях. Высокая экспрессия Muc6 в раковых
- 16 037019 опухолях слизистой оболочки, как предполагается, выступает в качестве барьера для распространения рака, приводя к менее агрессивному биологическому поведению (Matsukita et al., 26-36). Экспрессия Muc6 была ниже в клетках карцином желудка, чем в клетках аденом или нормальных слизистых тканях, и обратно пропорционально взаимосвязана с размером опухоли, глубиной инвазии, инвазией лимфатических сосудов и вен, метастазами лимфатических узлов и стадиями по классификации UICC. Снижение уровня Muc6 может благоприятствовать злокачественной трансформации эпителиальных клеток желудка, лежать в основе роста, инвазии, метастазов и дифференциации карцином желудка (Zheng et al., 81723). Существующие данные указывают также на то, что инфекция Helicobacter pylori, одна из наиболее частых причин карциномы желудка, связана с пониженной экспрессией Muc6 (Kang et al., 29-35;Wang и Fang 425-31).
Белок кинетохора Nuf2.
Ген NUF2 (CDCA-1) кодирует белок, который очень похож на дрожжевой белок Nuf2, компонент консервативного белкового комплекса, связанного с центромерой. Дрожжевой Nuf2 исчезает из центромеры во время мейотической профазы, когда центромеры теряют свою связь с полярными тельцами веретена деления, и играет регуляторную роль в хромосомной сегрегации. Было продемонстрировано, что csiPHK сурвивина и hNuf2 производят временный нокдаун своих мРНК, вызывая образование многоядерных клеток и клеточную смерть за счет митотического блока соответственно (Nguyen et al., 394-403). Nuf2 и Hec1 требуются для организации стабильных сайтов связывания плюс-конца микротрубочек на внешней пластине, которые необходимы для сохранения стабильных сил, направленных к полюсам, необходимых для биологической ориентации на кинетохорах (DeLuca et al., 519-31).
Было обнаружено, что белок Nuf2 экспрессируется в избытке в опухолях NSCLC, что связано с плохим прогнозом (Hayama et al., 10339-48), и тканях рака шейки матки (Martin et al., 333-59). На удаленных хирургической резекцией тканях рака желудка (диффузного типа, 6; кишечного типа, 4) два варианта белка NUF2 были в повышенном количестве. Предполагается, что варианты альтернативного сплайсинга, выявленные в этом исследовании, могут быть потенциально пригодны в качестве диагностических маркеров и/или новых мишеней для противораковой терапии (Ohnuma et al., 57-68).
Было обнаружено, что siPHK-опосредованный нокдаун NUF2 ингибирует клеточную пролиферацию и индукцию апоптоза при NSCLC, раке яичников, раке шейки матки, раке желудка, колоректальном раке и глиоме (Kaneko et al., 1235-40).
Липидная фосфат-фосфогидролаза 2 (PPAP2C).
Фосфатазы фосфатидной кислоты (PAP) преобразуют фосфатидную кислоту в диацилглицерин и принимают участие как в синтезе глицеролипидов de novo, так и в передаче активированного рецептором передачи сигнала, опосредованного фосфолипазой D. Сообщалось о трех вариантах альтернативного сплайсинга транскриптов, кодирующих различные изоформы. Активность PPAP2C повышена в трансформированных первичных зрелых мезенхимных стволовых клетках (MSC) взрослого человека и тканях многочисленных видов рака человека. Возможно, он требуется для повышения клеточной пролиферации. Гиперэкспрессия PPAP2C, но не каталитически неактивного мутанта, вызывала преждевременное вхождение в S-фазу, сопровождавшееся преждевременным накоплением циклина А. Нокдаун приводит к снижению клеточной пролиферации за счет задержания вхождения в фазу S (Flanagan et al., 249-60).
40S рибосомальный белок S11 (RPS11).
Рибосомы состоят из малых субъединиц 40S и больших субъединиц 60S. Вместе эти субъединицы образованы 4 видами РНК и приблизительно 80 различными по структуре белками. Ген RPS11 кодирует рибосомальный белок, который является компонентом субъединицы 40S. RPS11 был среди шести генов, обнаруженных во время скрининга на фекальные маркеры на основе РНК для диагностики колоректального рака. Он был обнаружен только в фекальных колоноцитах пациента, больного раком (Yajima et al., 1029-37).
E3 убиквитин-лигаза Seven in absentia, гомолога 2 (SIAH2) SIAH2 является убиквитин-лигазой E3. Среди его субстратов находятся бета-катенин, TRAF2 и DCC (удален в клетках колоректального рака) (Habelhah et al., 5756-65; Hu и Fearon, 724-32; Nakayama, Qi, и Ronai, 443-51). SIAH2 ведет также к деградации ядерного белка repp86, приводя к отмене задержки в митозе, вызванного гиперэкспрессией этого белка (Szczepanowski et al., 485-90). SIAH2 имеет свойства, способствующие как развитию опухоли, так и метастазов по меньшей мере посредством двух сигнальных путей, обзор которых приводится в работе (Nakayama, Qi и Ronai, 443-51): во-первых, он приводит к убиквитинированию и деградации белков в сигнальном каскаде гипоксии, который ведет к повышенной транскрипционной активности индуцируемых при гипоксии факторов (HIF) (Nakayama, Q и Ronai, 443-51) (Calzadon et al., 85-91). Во-вторых, он подавляет Sprouty2, специфический ингибитор сигнальной реакции Ras/ERK. Активность SIAH2 взаимосвязана с развитием опухоли поджелудочной железы, скорее всего, за счет его положительного влияния на Ras-сигнальный путь (Nakayama, Qi и Ronai 443-51).
Хотя роль SIAH2 при раке отчасти противоречива, в некоторых сообщениях показана связь низких уровней SIAH2 с плохим прогнозом или ответом на терапию (Confalonieri et al., 2959-68) (Jansen et al., 263-71), другие же указывают на его онкогенную функцию (Frasor et al., 13153-57). Ингибирование SIAH2 рассматривали в качестве противораковой терапии, так как он, как было продемонстрировано,
- 17 037019 ингибирует рост ксенотрансплантатов в моделях меланомы мыши (Qi et al., 16713-18; Shah et al., 799808), клеточных линий рака легких человека, трансплантированных голым мышам (Ahmed et al., 160629).
Натрий- и хлорзависимый транспортер таурина (SLC6A6) SLC6A6 является натрий- и хлорзависимым транспортером таурина (TauT) (Han et al., 2006). Мыши с нокаутом по гену тауринового транспортера (taut-/-) страдают от хронических заболеваний печени из-за недостаточности таурина, что может включать митохондриальную дисфункцию (Warskulat et al., 2006). Экспрессию SLC6A6 репрессирует ген-супрессор опухоли р53, и трансактивируют протоонкогены, такие как WT1, c-Jun и c-Myb. Избыточная экспрессия SLC6A6 защищает клетки почек от нефротоксичности, вызываемой цисплатином (Han et al., 2006; Han и Chesney, 2009). Экспрессия мРНК SLC6A6 поддерживалась на высоком уровне фактором некроза опухоли альфа (TNF-альфа) в клетках Caco-2 кишечного эпителия человека (Mochizuki et al., 2005).
Убихинон-связывающий белок комплекса убихинол-цитохром-с-оксиредуктаза (UQCRB).
Белок, кодируемый геном UQCRB, является частью комплекса убихинол-цитохром-соксидоредуктазы. Он связывается с убихиноном и участвует в переносе электронов. Мутации этого гена связаны с недостаточностью митохондриального комплекса III. Был описан псевдоген на Х-хромосоме.
Ген UQCRB может быть потенциальным онкогеном или геном-супрессором опухоли при аденокарциноме протока поджелудочной железы (Harada et al., 13-24). Как было обнаружено, он экспрессируется в избытке клетками почечно-клеточной карциномы (Jia et al., 1133-39)
Рецептор 3 человеческого эпидермального фактора роста (ERBB3).
ERBB3 кодирует члена семейства рецепторов эпидермального фактора роста (EGFR) рецепторных тирозинкиназ. Он активируется нейрегулинами, другими ERBB и рецепторами, не принадлежащими к ERBB, в равной степени как и другими киназами и новыми механизмами. По нисходящей он взаимодействует, главным образом, с фосфоинозитол-3-киназой/АКТ-каскадом, определяющим выживание клеток/митогенным каскадом, но и также с GRB, SHC, SRC, ABL, rasGAP, SYK и регулятором транскрипции ЕВР1 (Sithanandam и Anderson, 413-48). Гиперэкспрессия ERBB3 была выявлена в клетках многих видов рака, включая рак желудка, при котором он может быть основной причиной заболевания и отрицательно влиять на прогноз (Kobayashi et al., 1294-301) (Slesak et al., 2727-32). (Zhang et al., 2112-18) обнаружили, что гиперэкспрессия ERBB3 может возникать более часто при диффузном типе (26,2%) рака желудка, чем при кишечном типе (5,0%). В обоих типах гиперэкспрессия соотносилась с плохим прогнозом. Подходы для нацеливания на ERBB3 в рамках противораковой терапии включают аптамеры РНК к внеклеточному домену (Chen et al., 9226-31), блокирование экспрессии его генов синтетическими факторами транскрипции (Lund et al., 9082-91), низкомолекулярные ингибиторы, как изомер витамина Е γ-токотриенол (Samant и Sylvester 563-74), микроРНК (Scott et al., 1479-86) и siPHK (Sithanandam et al., 1847-59).
Проминин 1 (Prom1).
Функция: Проминин-1, называемый также CD133, был идентифицирован как молекула, специфическая для CD34+ кроветворных клеток-предшественников (Yin et al., 1997), и, как было показано позже, он является маркером для нормальных стволовых клеток и раковых стволовых клеток (РСК) различных тканей. Он находится в основном на выступах плазматической мембраны и может участвовать в организации топологии мембраны или в сохранении липидной композиции плазматической мембраны. Предполагалось, что сплайсинговая изоформа проминина-1, называемая АС133-2, в которой отсутствует небольшой экзон из 27 аминокислот, может представлять собой даже лучший маркер стволовых клеток (Mizrak et al., 2008; Bidlingmaier et al., 2008).
Обычно только небольшой процент опухолевых клеток является положительным для проминина-1, как это ожидалось для маркера РСК. В зависимости от вида опухоли число положительных клеток на опухолевую массу достигает от 1 до 15% и в большинстве случаев составляет около 2%.
Проминин-1 имел взаимосвязь с образованием опухоли, ангиогенезом и устойчивостью к химическому воздействию (Zhu et al., 2009а) (Bruno et al., 2006; Hilbe et al., 2004) (Bertolini et al., 2009). Однако проминин-1-положительные клетки могут быть доступны для иммунной системы, так как они могут быть уничтожены NK-клетками (Castriconi et al., 2007; Pietra et al., 2009) и цитотоксическими Т-клетками (Brown et al., 2009).
Как было продемонстрировано, что при многих видах рака проминин-1-положительные клетки являются функциональным маркером РСК и экспрессия была часто связана с плохим прогнозом, до сих пор существует множество противоречий. В некоторых сообщениях утверждается, что он не является ни необходимым, ни достаточным для идентификации РСК (Cheng et al., 2009; Wu и Wu, 2009). Вероятно, комбинация проминина-1 с другими молекулами, такими как CD44, или даже комбинации из множества компонентов, такие как Prom1(+), CD34(+), CD44(+), CD38(-), CD24(-) служат лучшими маркерами РСК (Zhu et al., 2009b; Fulda и Pervaiz, 2010).
Предположение об экспрессии Prom1 при диффузном РЖ было основано на анализе in silico (Katoh и Katoh, 2007), о гиперэкспрессии при РЖ в сравнении с нормальной тканью желудка сообщалось в работе (Smith et al., 2008). Однако (Boegl и Prinz, 2009) сообщали, что уровень экспрессии проминина-1
- 18 037019 был пониженным при РЖ, в частности на поздних стадиях, и заявляли, что экспрессия проминина-1 скорее взаимосвязана с ангиогенезом, который также снижается на поздних стадиях, чем с ростом опухоли.
В исследовании с использованием клеточных линий РЖ (Takaishi et al., 2009) утверждается, что CD44, а не проминин-1 является маркером РСК при РЖ.
Матричная металлопротеиназа 11 (ММР11).
Подобно другим ММР, ММР11 - это эндопептидаза, задействованная в процессах, требующих ремоделирования тканей, таких как развитие, заживление ран и образование шрамов. Возможно, она также отрицательно регулирует гомеостаз жиров посредством снижения дифференциации адипоцитов. В отличие от других ММР, она не в состоянии расщеплять обычные молекулы внеклеточного матрикса, за исключением коллагена VI. Однако были идентифицированы другие субстраты, такие как альфа-2макроглобулин, определенные ингибиторы серинпротеазы (серпины), включая альфа-1 антитрипсин, белок-1, связывающий инсулиноподобный фактор роста, и рецептор ламинина. При раке ММР11 в основном экспрессируется клетками стромы, окружающими ткани опухоли. Это было продемонстрировано для многочисленных видов опухолей. Утверждалось, что ММР11 экспрессируется в избытке клетками стромы наиболее инвазивных карцином человека, но редко клетками сарком и других неэпителиальных опухолей. В большинстве, но не во всех случаях, ММР11 экспрессируется клетками стромы, непосредственно граничащими с опухолью, тогда как сами опухолевые клетки, нормальные ткани и стромальные клетки, расположенные далеко от опухоли, остаются отрицательными. Более высокие уровни ММР11 соотносятся со злокачественным фенотипом/более высокой инвазивностью и плохим прогнозом. Однако в клетках папиллярных карцином щитовидной железы экспрессия ММР11 была обратно пропорциональна агрессивным характеристикам. ММР11 была обнаружена в опухолевой ткани в равной степени, как в сыворотке пациентов, страдающих раком желудка, и уровень экспрессии соотносился с метастазами (Yang et al.). Более того, (Deng et al., 274-81) показали, что ММР11 высоко экспрессируется линиями опухолевых клеток и первичными опухолями рака желудка - в отличие от других видов рака не исключительно в строме - и что она, по-видимому, усиливает пролиферацию опухолевых клеток.
Ядерный транскрипционный фактор Y бета-субъединица (NFYB).
NFYB, называемый также CBF-B или CBF-A является, помимо NFYA и NFYC, частью гетеротримерного базального фактора транскрипции NF-Y (также ССААТ-связывающий фактор или CBF), который связывается с участками ССААТ - или противоположными участками, ATTGG, называемыми Yбокс - в промоторных и энхансерных областях многочисленных генов. Среди генов-мишеней NF-Y находятся гены MHC II класса, бета-рецептор PDGF, несколько белков теплового шока, ген hMLH1 репарации ошибочно спаренных нуклеотидов и топоизомераза II альфа.
NFYB не является классическим онкогеном, однако его функция может иметь значение для онкогенеза. Во-первых, многие гены клеточного цикла, такие как циклин А, циклин В1, Aurora А и cdk1, являются мишенями NF-Y Клетки задерживаются на фазе G2/М без действия NFYB. (Park et al.) показывают, что повышенное количество циклина В2 и других связанных с клеточным циклом генов при колоректальной аденокарциноме вызвано активностью NF-Y/ Во-вторых, активность NF-Y препятствует апоптозу. Клетки без NF-Y подвергаются апоптозу из-за активации р53 и снижения транскрипции антиапоптотических генов, содержащих ССААТ-боксы в своих промоторах, таких как Bcl-2 (Benatti et al., 1415-28). В-третьих, его онкогенные свойства усиливаются в комбинации с другими факторами транскрипции. Например, мутировавший р53 связывается с белками NF-Y и p300, увеличивая экспрессию NF-Yиндуцированных генов клеточного цикла.
Abl1.
Протеин-тирозинкиназа С-Abl перемещается между ядерным и цитоплазматическим компартментами. Ядерный с-Abl задействован в ингибировании клеточного роста и апоптозе, тогда как цитоплазматический с-Abl может играть роль в динамике, связанной с актином, при морфогенезе, а также в сигнальных реакциях, вызванных внеклеточными стимулами, такими как факторы роста и лиганды интегринов. Цитоплазматический с-Abl, как сообщалось, способствует митогенезу.
Активность белка с-Abl регулируется отрицательно ее доменом SH3, и делеция домена SH3 превращает Abl1 в онкоген. При хронической миелоидной лейкемии (ХМЛ) ген активируется посредством транслокации внутри гена Bcr (область точек разрыва) на хромосоме 22. Этот слитый белок Bcr-Abl перемещается в цитозоль и позволяет клеткам пролиферировать без регуляции цитокинами (Zhao et al.). Активность с-Abl также повышена в случае солидных опухолей, как это было продемонстрировано для карцином молочной железы и NSCLC. Гиперэкспрессии недостаточно, и для конститутивной активности киназ требуется фосфорилирование белка. В клетках рака молочной железы фосфорилирование с-Abl вызывается тирозинкиназами плазматической мембраны, включая членов семейства SFK, EGFR и рецептор IGF-1. Слитые белки Abl не были обнаружены в солидных опухолях (Lin и Arlinghaus, 2008). Было продемонстрировано, что Abl экспрессируют клетки карциномы желудка и связанные с ней микрососуды, позволяя предположить его возможное участие в ангиогенезе. Примечательно, что присутствующий в Н.pylori цитотоксин-ассоциированный ген А (CagA) приводит к активации с-Abl, который, следовательно, фосфорилирует EGFR и, таким образом, блокирует эндоцитоз EGFR (Bauer, Bartfeld и Meyer, 156-69). Несколько ингибиторов тирозинкиназы являются более или менее специфическими для Abl.
- 19 037019
Иматиниб (Gleevec) применяется в качестве терапии первой линии при ХМЛ и был также одобрен для лечения пациентов, имеющих желудочно-кишечные стромальные опухоли на поздних стадиях (GIST), так как его мишенью также является KIT (Pytel et al., 66-76) (Croom и Perry, 2003). Другие ингибиторы, используемые для лечения рака, - дазатиниб и нилотиниб (Pytel et al., 66-76) (Deremer, Ustun и Natarajan
1956-75).
Polo-подобная киназа 4 (Plk4).
Члены семейства киназ Polo (Plk1-4) важны во время деления клетки, регулируя несколько стадий митоза. Plk4 является организатором процесса образования и дупликации центриолей (RodriguesMartins et al., 1046-50). Тогда как Plk1 отчетливо является онкогеном, функция Plk4 при раке двузначна. Пониженный уровень в равной степени как и гиперэкспрессия Plk4 была связана с заболеванием раком у человека, мышей и мух (Cunha-Ferreira et al., 43-49). К примеру, при колоректальном раке была обнаружена гиперэкспрессия Plk4, однако у небольшой группы пациентов наблюдался сильно пониженный уровень Plk4 (Macmillan et al., 729-40). Это может объясняться тем фактом, что как гиперэкспрессия, так и недостаток Plk4 приводят к образованию дефектных центриолей, результатом чего становятся аномальное количество и структура центросом, которые зачастую обнаруживаются в опухолевых клетках и способствуют отклонениям от обычного течения в митотическом цикле, что вызывает неправильное расхождение хромосом и анеуплоидию (Peel et al., 834-43). (Kuriyama et al., 2014-23). (Korzeniewski et al., 6668-75).
Белок 3, активирующий ГТФазу, имеющий IQ-мотив (IQGAP3).
IQGAP участвуют в сигнальных путях клеток, так же как и в формировании архитектуры цитоскелета и в клеточной адгезии. Они имеют домен с последовательностью, сходной с RasGAPs и, соответственно, связываются с малыми ГТФазами. Однако (и вопреки своему названию) ни один из них не обладает ГТФаза-активирующей активностью. Для генов IQGAP1 и IQGAP2 было показано, что они стабилизируют связь ГТФазы с Rac1 и Cdc42, и, как предполагалось, IQGAP3 стабилизирует активированный Ras (Nojima et al., 971-78; White, Brown и Sacks 1817-24). С помощью своего IQ-домена они связываются с кальцием/кальмодулином, а с помощью кальпонин-гомологичного домена - с актиновыми филаментами (White, Brown и Sacks 1817-24). (Wang et al., 567-77) сообщают, что IQGAP3 экспрессируются в головном мозге, где он ассоциируется с актиновыми филаментами, а также с Rac1 и Cdc42. Он накапливается на периферических участках аксонов и способствует Rac1/Ccd42-заβисимому разрастанию аксонов. IQGAP участвуют в развитии рака. IQGAP1 рассматривается как онкоген. Он усиливает связанные с раком сигнальные пути, такие как МАР-киназа, бета-катенин и VEGF-опосредованные сигнальные пути, и экспрессируется в избытке при многих видах опухолей. IQGAP2, как предполагается, скорее играет роль супрессора опухоли, и он был обнаружен в пониженном количестве при раке желудка с плохим прогнозом (White, Brown и Sacks, 1817-24). О IQGAP3 имеется мало информации. (Skawran et al., 505-16) обнаружили, что он находится среди генов, которые имеют значительно повышенный уровень экспрессии в клетках почечно-клеточной карциномы. В двух исследованиях сообщается, что IQGAP3 специфически экспрессируют пролиферирующие клетки (Ki67+) тонкого кишечника, толстой кишки и печени мыши (Nojima et al., 971-78) (Kunimoto et al., 621-31).
Биспиральный домен, содержащий 88а (CCDC88A).
CCDC88A является актин-связывающим субстратом Akt, который играет роль при организации актиновых структур и Akt-зависимой подвижности клеток в фибробластах. Сигнальный путь CCDC88A/Akt также необходим для VEGF-опосредованного постнеонатального ангиогенеза.
CCDC88A экспрессируется также в больших количествах клетками различных злокачественных тканей человека, включая карциномы молочной железы, толстой кишки, легких и шейки матки. Он играет важную роль в прогрессии опухоли с аберрантной активацией Akt-сигнального пути.
Циклин В1 (CCNB1).
CCNB1 индуцируется во время G2/M фазы митоза и формирует митоз-стимулирующий фактор (MPF) вместе с циклинзависимой киназой 1 (Cdk1)/Cdc2. Гиперэкспрессия была обнаружена в ряде различных видов рака и зачастую ассоциировалась с плохим прогнозом, например, при раке молочной железы (Aaltonen et al., 2009; Agarwal et al., 2009; Suzuki et al., 2007), медуллобластоме (de et al., 2008), немелкоклеточном раке легких (Cooper et al., 2009), раке шейки матки (Zhao et al., 2006) и других. Он был одним из генов, входящих в генетическую сигнатуру из 11 генов, которая, как было выявлено, предсказывает короткий временной интервал до начала рецидива заболевания у пациентов с 12 различными видами рака (Glinsky, 2006). Специфической информации для рака желудка найдено не было.
Циклин D2 (CCND2).
CCND2 связывается и активирует, как и другие циклины D-типа (D1 и D3), циклинзависимую киназу 4 (Cdk4) или Cdk6. Это необходимо для перехода из G1 в S-фазу. Было обнаружено, что CCND2 экспрессируется в избытке клетками многих опухолей, включая опухоли семенника и яичников (Sicinski et al., 1996), гематологические злокачественные заболевания (Hoglund et al., 1996; Gesk et al., 2006) и рак желудка, который может быть вызван инфекцией Н.pylori, и ассоциируется с плохим прогнозом (Yu et al., 2003). (Yu et al., 2001) (Oshimo et al., 2003) (Takano et al., 1999) (Takano et al., 2000).
- 20 037019
Циклин Е2 (CCNE2).
CCNE2 связывается и активирует, как и другие циклины Е-типа, CCNE1, Cdk2. Эта активность достигает своего пика при переходе G1 в S-фазу. В здоровом состоянии CCNE2 не обнаруживается в покоящихся клетках и может встречаться только в активно делящихся тканях (Payton и Coats, 2002). Зачастую он аберрантно экспрессируется клетками при раке, например при раке молочной железы, и соотносится с плохим прогнозом (Desmedt et al., 2006; Ghayad et al., 2009; Payton et al., 2002; Sieuwerts et al., 2006) и при метастатическом раке предстательной железы (Wu et al., 2009).
Связанные с раковоэмбриональным антигеном молекулы клеточной адгезии 1, 5 и 6 (СЕАСАМ 1, 5 и 6).
СЕАСАМ - это прикрепленные к мембране гликопротеины, которые опосредуют взаимодействия между клетками и активируют сигнальные пути интегринов (Chan и Stanners, 2007). Они также могут служить рецепторами для патогенов, таких как E.coli (Berger et al., 2004) (Hauck et al., 2006), и быть задействованы в регуляции иммунной реакции (Shao et al., 2006).
СЕАСАМ5 и СЕАСАМ6 имеют проканцерогенное воздействие. Они ингибируют аноикоз (Ordonez et al., 2000), стимулируют развитие метастазов (Marshall, 2003; Ordonez et al., 2000) и разрушают поляризацию клеточных мембран и архитектуру тканей (Chan и Stanners, 2007). Роль СЕАСАМ1 при раке двузначна. Он может быть супрессором на ранних стадиях и активно участвовать в образовании метастазов, ускользании опухоли от иммунного надзора и ангиогенезе на поздних стадиях (Hokari et al., 2007; Liu et al., 2007; Moh и Shen, 2009). Его функциональная роль зависит от изоформы, так как СЕАСАМ1 встречается в 11 вариантах сплайсинга, соотношение которых определяет исход сигнальной реакции (Gray-Owen и Blumberg, 2006; Leung et al., 2006; Neumaier et al., 1993; Nittka et al., 2008). Соотношение вариантов сплайсинга может изменяться при заболевании раком (Gaur et al., 2008).
СЕАСАМ5 или СЕАСАМ6 или оба варианта экспрессируются в избытке клетками вплоть до 70% всех видов опухолей человека, что часто связанно с плохим прогнозом (Chan и Stanners, 2007; Chevinsky, 1991). Сыворотка СЕАСАМ5 является известным клиническим маркером для карциномы толстой и прямой кишки, высокие уровни указывают на плохой прогноз или рецидивы (Chevinsky, 1991; Goldstein и Mitchell, 2005). Также он предлагался в качестве маркера для других видов, включая рак желудка, однако с ограниченной прогностической силой (Victorzon et al., 1995). При раке СЕАСАМ1 может быть представлен в пониженном или повышенном количестве в зависимости от вида опухоли (Kinugasa et al., 1998) (Dango et al., 2008) (Simeone et al., 2007). (Han et al., 2008) обнаружили повышенные уровни СЕАСАМ5 и СЕАСАМ6 в девяти видах раковых клеточных линий, тогда как СЕАСАМ1 выявлен не был. Напротив, анализ образцов первичных опухолей 222 пациентов показал либо цитоплазматическое, либо мембранное окрашивание для СЕАСАМ1. Связанная с мембраной форма соотносилась с повышенным ангиогенезом (Zhou et al., 2009). Исследование, проведенное (Kinugasa et al., 1998), также показало наличие повышенного уровня при аденокарциномах желудка.
В клетках некоторых видов опухолей уровень СЕАСАМ1 понижен, что приводит к понижению уровня VEGF, a VEGF или гипоксия могут индуцировать СЕАСАМ1 в непосредственно граничащем эндотелии. Соответственно, моноклональное антитело против СЕАСАМ1 блокировало VEGFиндуцированное образование капилляроподобных структур эндотелия (Oliveira-Ferrer et al., 2004; Tilki et al., 2006; Ergun et al., 2000).
Помимо прочих, для подходов, основанных на использовании вакцин, в качестве мишени для противораковых лекарственных препаратов испытаниям подвергался в особенности СЕАСАМ5. Эти исследования показали, что СЕАСАМ5 может быть мишенью клеточных иммунных реакций (Cloosen et al., 2007; Marshall, 2003). Обзор Т-клеточных эпитопов СЕАСАМ5 приводится в работе (Sarobe et al., 2004).
Хлоридный канал 3 (CLCN3).
CLCN3 является CI-каналом, который может быть гейтирован по объему и активно участвовать в регуляторном снижении объема (RVD), что происходит как реакция на увеличение клеточного объема в ходе клеточного цикла или в условиях гипоосмоса (Lemonnier et al., 2004; Sardini et al., 2003). Однако по этому поводу ведется противоречивая дискуссия (Wang et al., 2004), и активируемый во время апоптоза канал, уменьшающий объем, отличается от CLCN3 (Okada et al., 2006).
Экспрессия CLCN3 изменяется во время клеточного цикла, ее пик приходится на S-фазу (Wang et al., 2004). Потоки CLCN3 могут быть важны в связанных с раком процессах для видов опухолей, при которых повышен уровень CLCN36, таких как глиома. Опухолевые клетки должны справляться с повышением пролиферационного объема, реагировать на гипоосмотические условия, например при перитуморальном отеке (Ernest et al., 2005; Olsen et al., 2003; Sontheimer, 2008).
Более того, сообщалось, что CLCN3 усиливает резистентность к этопозиду, увеличивая подкисление позднего эндоцитического компартмента (Weylandt et al., 2007).
siPHK-опосредованный нокдаун CLCN3 снижал уровень миграции клеток носоглоточной карциномы in vitro (Мао et al., 2008).
DNAJC10.
DNAJC10 является членом надмолекулярного комплекса ЭР-ассоциированной деградации (ERAD), который распознает и разворачивает неправильно свернутые белки в целях эффективной реализации ре
- 21 037019 троградного пути их ядерной транслокации (Ushioda et al., 2008). Как было показано, уровень этого белка был повышен при почечно-клеточной карциноме (Cunnea et al., 2007). Нокдаун DNAJC10 с помощью siPHK в клетках нейроэктодермальных опухолей усиливал апоптотический ответ на химиотерапевтический препарат фенретинид (Corazzari et al., 2007). Было продемонстрировано, что ERdj5 снижает выживаемость клеток нейробластомы при снижении реакции на присутствие несвернутых белков (UPR) (Thomas и Spyrou, 2009).
Эукариотический фактор инициации трансляции 2, гамма-субъединица 3 (EIF2S3).
EIF2S3 - самая крупная субъединица белкового комплекса (EIF2), производящая рекрутинг инициаторной метионил-тРНК в рибосомальную субъединицу 40S (Clemens, 1997). Действие киназ, которые снижают активность EIF, таких как РНК-зависимая протеинкиназа (PKR), может иметь проапоптический характер и подавлять рост опухоли (Mounir et al., 2009). При раке желудка сообщалось о более высоких уровнях фосфорилированного и нефосфорилированного EIF2 и наблюдалось перераспределение в ядро. Это нарушение регуляции указывает на причастность eIF2alpha к заболеванию желудочно-кишечным раком (Lobo et al., 2000).
Эукариотический фактор инициации трансляции 3, субъединица L (EIF3L)
EIF3L является одной из 10-13 субъединиц EIF3, которые связаны с малой рибосомальной субъединицей. EIF3 играет роль в предупреждении преждевременного связывания большой рибосомальной субъединицы. EIF3L находится среди пяти субъединиц, о которых сообщалось, что они не обязательны для образования EIF3 (Masutani et al., 2007). Скрининг библиотеки антисмысловых последовательностей позволяет предположить, что низкий уровень экспрессии EIF3L усиливает антионкогенную активность 5-флуороурацила в клетках почечно-клеточной карциномы (Doh, 2008).
Эпиплакин 1 (EPPK1).
EPPK1 является геном семейства плакинов со многими неизвестными функциями. О генах плакина известно, что они задействованы в соединении филаментов цитоскелета и их заякоривании на зоне склеивания плазматических мембран (Yoshida et al., 2008).
Рецептор 39, спаренный с G-белком (GPR39).
GPR39 - это рецептор, связанный с Gq-белком, который, как считается, задействован в работе желудочно-кишечного тракта и в процессах метаболизма (Yamamoto et al., 2009). Его сигнальный каскад активирует цАМФ и факторы транскрипции (Hoist et al., 2004). Эндогенным лигандом для GPR39, вероятно, является цинк (Chen и Zhao, 2007). GPR39 является новым ингибитором клеточной смерти, который, возможно, может представлять собой терапевтическую мишень и иметь причастность к процессам, охватывающим апоптоз и стресс эндоплазматического ретикулума, такой как рак (Dittmer et al., 2008). Было выявлено, что GPR39 экспрессируется на высоком уровне в микроматрицах на основе как клеточной линии почки человеческих эмбрионов HFK, так и ксенотрансплантатов опухоли Вильмса с обогащением клеточной популяции опухолевыми клетками, по характеристикам схожими со стволовыми (Metsuyanim et al., 2009), и в клеточной линии гиппокампа, устойчивой к различным стимуляторам клеточной смерти (Dittmer et al., 2008).
ERBB2/HER2/NEU.
ERBB3 является членом семейства рецепторных тирозинкиназ. Его лиганд неизвестен, но он является предпочтительным партнером по гетеродимеризации для других рецепторов семейства HER (Olayioye, 2001). В карциномах HER2 выступает в качестве онкогена в основном из-за высокого уровня амплификации гена, вызывающего гиперэкспрессию белка в клеточной мембране и последующее приобретение злокачественной клеткой выгодных ей свойств (Slamon et al., 1989). Гиперэкспрессия наблюдалась в конкретном процентном соотношении во многих видах рака, включая рак желудка. В основном это связано с плохим прогнозом (Song et al., 2010) (Yonemura et al., 1991) (Uchino et al., 1993) (Mizutani et al., 1993).
ERBB2 является мишенью моноклональных антител препарата трастузумаб (торговое название Герцептин (Herceptin)), который предлагали в качестве возможного лечения для пациентов, имеющих НЕР2-положительный рак желудка на поздней стадии, в комбинации с химиотерапией (Meza-Junco et al., 2009; Van Cutsem et al., 2009). Другой препарат на основе моноклональных антител, пертузумаб, который ингибирует димеризацию рецепторов HER2 и HER3, находится на последних стадиях клинических испытаний (Kristjansdottir и Dizon, 2010). Селективная гиперэкспрессия HER2 и HER3 в двух гистологических типах рака желудка (диффузного и кишечного типа) тесно взаимосвязана с плохим прогнозом (Zhang et al., 2009).
Бета-4 интегрин (ITGB4).
Интегрины опосредуют межклеточную адгезию, в равной степени как и двунаправленную передачу регуляторных сигналов из клетки в клетку. Субъединица интегрин бета-4 гетеродимеризуется с субъединицей альфа-6. Возникающий в результате интегрин способствует образованию гемидесмосом между внутриклеточным кератиновым цитоскелетом и базальной мембраной (Giancotti, 2007). Интегрин бета-4 имеет двоякую функцию при раке, так как он может опосредовать стабильную адгезию, с одной стороны, и проинвазивные сигнальные реакции (включая сигнальные пути Ras/Erk и PI3K) и ангиогенез, с другой стороны (Giancotti, 2007; Raymond et al., 2007). Он экспрессируется в избытке клетками многих опухо
- 22 037019 лей, в равной степени как и ангиогенными клетками эндотелия, и зачастую соотносится с прогрессией и метастазами. О высоких уровнях сообщалось в случае рака желудка, в особенности в поражающих строму клетках (Giancotti, 2007; Tani et al., 1996). Однако его уровень был пониженным в недифференцированной карциноме желудка, так как опухоль распространилась глубже, вероятно, вследствие постепенного эпителиально-мезенхимального перехода, поскольку бета-4 интегрин является эпителиальным интегрином (Yanchenko et al., 2009).
Липокалин (LCN2).
LCN2 или желатиназа-ассоциированный липокалин нейтрофилов (NGAL) является регуляторным белком железа, который существует как мономер, гомодимер или как гетеродимер с дисульфидной связью с ММР9 (Coles et al., 1999; Kjeldsen et al., 1993). Уровень экспрессии повышен в нескольких видах рака, ассоциируясь в некоторых случаях с прогрессией. С точки зрения механизма это может стабилизировать ММР9 и изменять Е-кадхерин-опосредованную межклеточную адгезию, тем самым усиливая инвазию. Комплексы ММР-9 и LCN2 соотносились с ухудшением выживаемости при раке желудка (Kubben et al., 2007) (Hu et al., 2009). Хотя наблюдался четкий благоприятный развитию опухоли эффект во многих опухолях человека, некоторые клинические исследования показали, что LCN2 может ингибировать стимулирующий неоплазмы фактор HIF-1-альфа, фосфорилирование FA-киназы, а также синтез VEGF, таким образом позволяя предположить, что в альтернативных условиях LCN2 также, как это ни парадоксально, оказывает противоопухолевое и антиметастатическое влияние на новообразования, например, в толстой кишке, яичнике и поджелудочной железе. (Bolignano et al., 2009; Tong et al., 2008), LCN2 может быть пригоден для ингибирования ангиогенеза, связанного с опухолью, в дополнение к подавлению опухолевых метастазов в раковых заболеваниях, при которых происходит активация ras (Venkatesha et al., 2006).
Комплекс сукцинатдегидрогеназы, субъединица С (SDHC).
SDHC является одной из четырех кодируемых ядром субъединиц сукцинатдегидрогеназы (митохондриальный комплекс II), которая перемещает электроны из сукцината в убиквинон с получением фумарата и убихинола. Недостаток сукцинатдегидрогеназы может вызвать желудочно-кишечные стромальные опухоли (GIST) (McWhinney et al., 2007). Наследственные желудочно-кишечные стромальные опухоли могут быть вызваны мутациями в генах субъединицы SDHB, SDHC и SDHD, и параганглиомы в брюшной полости, связанные с желудочно-кишечными опухолями, могут возникать исключительно в результате мутаций в SDHC (Pasini et al., 2008). Белковый продукт мутантного SDHC у трансгенных мышей вызывает окислительный стресс и может участвовать в повреждении ядерной ДНК, мутагенезе и, в конечном итоге, онкогенезе (Ishii et al., 2005). Сукцинатдегидрогеназа рассматривается как супрессор опухоли (Baysal, 2003; Gottlieb and Tomlinson, 2005). Пониженные уровни этого ферментативного комплекса могут привести к онкогенезу (Eng et al., 2003).
Киназа с PDZ-связывающим мотивом (PBK).
PBK является MEK3/6-связанной MAPKK, которая активирует р38 MAP киназу, например, после рецепторов фактора роста (Abe et al., 2000; Ayllon и O'connor, 2007). JNK может быть вторичной мишенью (Oh et al., 2007). Поскольку у взрослых PBK экспрессируется в семеннике (см. ниже), то было высказано предположение, что она участвует в сперматогенезе (Abe et al., 2000; Zhao et al., 2001). Кроме того, она способствует пролиферации и резистентности к апоптозу опухолевых клеток. Она фосфорилируется и активируется во время митоза, который необходим для образования веретена деления и цитокинеза (Gaudet et al., 2000; Matsumoto et al., 2004; Park et al., 2009) (Abe et al., 2007). Другие функции, способствующие росту и направленные против апоптоза, включают ограничение экспрессии р53 и фосфорилирование гистонов (Park et al., 2006; Zykova et al., 2006) (Nandi et al., 2007). PBK был классифицирован как раково-тестикулярный антиген (Abe et al., 2000; Park et al., 2006), и, как было выявлено, он экспрессируется в избытке при многих видах рака.
ДНК-полимераза, дельта 3, вспомогательная субъединица (POLD3).
Комплекс ДНК-полимеразы дельта задействован в репликации и репарации ДНК. Он состоит из ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA), фактора репликации мульти-субъединицы С, и 4 субъединиц полимеразного комплекса: POLD1, POLD2, POLD3 и POLD4 (Liu и Warbrick, 2006). POLD3 играет ведущую роль в эффективной реактивации PCNA во время циклов диссоциации и ассоциации POL-дельта во время стадии элонгации репликации ДНК (Masuda et al., 2007).
26S протеасома (просома, макропен), не АТФазная субъединица 14 (PSMD14) PSMD14 является компонентом 26S протеасомы. Она входит в комплекс 19S (19S cap; PA700), который отвечает за деубиквитинирование субстрата во время протеасомной деградации (Spataro et al., 1997). Гиперэкспрессия PSMD14 в клетках млекопитающих влияет на клеточную пролиферацию и реакцию на цитотоксические препараты, такие как винбластин, цисплатин и доксорубицин (Spataro et al., 2002). Подавление PSMD14 в клетках HeLa с помощью siPHK приводило к снижению жизнеспособности клетки и увеличению уровня полиубиквитинированного белка (Gallery et al., 2007). Снижение уровня PSMD14 с помощью siPHK имело существенное влияние на жизнеспособность клеток, вызывая задержку клеток на фазе G0-G1, что в конце концов приводит к старению (Byrne et al., 2010).
- 23 037019
26S протеасома (просома, макропен), АТФазная субъединица 2 (PSMC2).
PSMC2 является частью системы 26S протеасомы. Это член семейства АТФаз ААА, который проявляет шаперон-подобную активность. Эта субъединица, как было продемонстрировано, взаимодействует с несколькими базальными факторами транскрипции, так что в дополнение к участию в функциях протеасомы, эта субъединица может участвовать в регуляции транскрипции. Было продемонстрировано, что в скелетной мышце 26S протеасомная система может активироваться с помощью TNF-альфа (Tan et al., 2006). У HBx трансгенных мышей, которые являются носителями регуляторного гена HBx гепатита В в своей зародышевой линии и у которых развивается почечно-клеточная карцинома, PSMC2 и другие протеасомные субъединицы экспрессируются на высоком уровне в опухолевых тканях (Cui et al., 2006). Уровни мРНК для субъединицы АТФазы PSMC2 комплекса 19S повышались при раковой кахексии (Combaret et al., 1999).
Протеин-тирозинкиназа 2 (PTK2).
PTK2 является нерецепторной тирозинкиназой, которая моделирует сигнальные пути интегрина и может способствовать опухолевому росту, прогрессии и метастазам ((Giaginis et al., 2009); (Hauck et al., 2002); (Zhao и Guan, 2009)). Было сделано предположение, что PTK2 является маркером онкогенеза и прогрессирования рака (Su et al., 2002; Theocharis et al., 2009; Jan et al., 2009). Гиперэкспрессия и/или повышенная активность имеется в широком спектре видов рака человека, включая рак желудка. PTK2 также передает сигналы по нисходящей от рецептора гастрина, который содействует пролиферации клеток рака желудка (Li et al., 2008b). Как было показано, 8% карцином желудка являлись носителями вируса Эпштейна-Барра (EBV). Для инфицированных вирусом EBV подлиний клеточной линии рака желудка человека было характерно повышенное фосфорилирование с участием PTK2 (Kassis et al., 2002). Уровень фосфорилирования PTK2-тирозина в клетках эпителия желудка снижается в случае cagA-положительного продукта Helicobacter pylori.
Тетраспанин 1 (TSPAN1) и тетраспанин 8 (TSPAN8).
TSPAN1 и TSPAN8 принадлежат к семье тетраспанинов, которые характеризуются четырьмя трансмембранными доменами и внутриклеточным N- и С-концом и которые играют роль во множестве процессов, включая клеточную адгезию, подвижность, активацию и опухолевую инвазию. Они часто образуют крупные молекулярные комплексы с другими белками, такими как интегрины на клеточной поверхности (Tarrant et al., 2003; Serru et al., 2000). Функции TSPAN1 до сих пор неизвестны и могут играть роль в секреции (Scholz et al., 2009). TSPAN1 гиперэкспрессируется клетками нескольких видов рака и зачастую соотносится со стадией, прогрессией и худшим клиническим исходом. Примечательно, что о нем сообщалось, что он экспрессирован в избытке в 56,98% из 86 случаев карциномы желудка, и гиперэкспрессия положительно соотносилась с клинической стадией, инфильтрацией и статусом лимфатических узлов и отрицательно соотносилась с уровнем выживаемости и степенью дифференциации опухоли (Chen et al., 2008). О TSPAN8 сообщалось как о связанном с метастазами гене во многих видах опухолей (PMID: 16467180). При раке желудочно-кишечного тракта экспрессия TSPAN8 связана с плохим прогнозом (PMID: 16849554).
Белок цинковые пальцы 598 (ZNF598).
ZNF598 - это цинковый палец с еще не известной функцией.
Дизинтегрин и металлопротеиназа 10 (ADAM 10) ADAM10 играет роль при ангиогенезе, развитии и онкогенезе. Они гиперэкспрессируются в карциноме желудка. Селективные ингибиторы ADAM-10 проходят сейчас клинические исследования для лечения рака. (PMID: 19408347).
Матричная металлопротеиназа 12 (ММР12).
ММР12 - это цинкзависимая эндопептидаза, которая расщепляет эластин и множество других матричных и нематричных белков и задействована в миграции макрофагов и ингибировании ангиогенеза (Chakraborti et al., 2003; Chandler et al., 1996; Sang, 1998). Она также играет роль в патологических процессах с разрушением тканей, таких как астма, эмфизема и хроническое обструктивное заболевание легких (ХОБЛ), ревматоидный артрит и рост опухоли (Cataldo et al., 2003; Wallace et al., 2008). Обсуждается применение ингибиторов ММР12 в качестве препаратов для лечения указанных заболеваний (Churg et al., 2007; Norman, 2009). ММР12 зачастую экспрессируется в избытке при раке, где ее функции неоднозначны. Наряду с тем, что она может быть задействована в растворении матрикса и, таким образом, возникновении метастазов, она также может ингибировать рост опухоли посредством выработки ангиостатина, который отрицательно воздействует на ангиогенез. Об усиленной экспрессии ММР12 сообщалось для РЖ, и, как было показано, это имеет благоприятное влияние: она отрицательно соотносится с плотностью микрососудов, VEGF, степенью дифференциации опухоли, инвазией в кровеносные сосуды, метастазами в лимфатических узлах и рецидивами. Пациенты с избыточной экспрессией ММР12 демонстрировали существенно лучшую выживаемость (Cheng et al., 2010; Zhang et al., 2007b; Zhang et al., 2007а).
Рибонуклеотидная редуктаза М2 (RRM2).
RRM2 является одной из субъединиц рибонуклеотидной редуктазы, которая образует дезоксирибонуклеотиды из рибонуклеотидов. Гиперэкспрессия RRM2 наблюдалась в опухолях, включая рак желудка, и она усиливает метастатический потенциал (PMID: 18941749) (PMID: 19250552) Нокдаун RRM2 за счет siPHK замедлял рост опухоли у различных биологических видов (мышь, крыса, обезьяна)
- 24 037019 (PMID: 17929316; PMID: 17404105).
Трансмембранная протеаза, серин 4 (TMPRSS4).
TMPRSS4 представляет собой трансмембранную серин-протеазу типа II, обнаруженную на клеточной поверхности, которая высоко экспрессирована в тканях нескольких видов опухолей, включая рак поджелудочной железы, толстой кишки и желудка. Биологические функции TMPRSS4 при раке до сих пор не известны. TMPRSS4 имеет четыре сплайсинговых варианта (Scott et al., 2001; Sawasaki et al., 2004). Экспрессия в карциноме яичника соотносилась со стадией (Sawasaki et al., 2004). Уровень TMPRSS4 сильно повышен в тканях рака легких, и нокдаун TMPRSS4 за счет siPHK с помощью введения малой интерферирующей РНК в клеточные линии рака легких и толстой кишки был связан со снижением клеточной инвазии и адгезии клеток матрикса, в равной степени как и моделированием клеточной пролиферации (Jung et al., 2008).
Йодотиронин-дейодиназа, типа II (DIO2).
DIO2 преобразует прогормон тироксин (Т4) в биологически активный 3,3',5-трийодтиронин (T3). Он высоко экспрессируется в щитовидной железе, и было выявлено, что его экспрессия и/или его активность дерегулирована при раке щитовидной железы (de Souza Meyer et al., 2005) (Arnaldi et al., 2005). Однако он также был обнаружен в других тканях, таких как нормальные ткани легких и ткани рака легких (Wawrzynska et al., 2003), и опухолях головного мозга (Murakami et al., 2000).
Ген белка, связывающего мРНК инсулиноподобного фактора роста 2 (IGF2BP3).
IGF2BP3 в первую очередь присутствует в ядре, где он связывается с мРНК гена IGF2 и подавляет его транскрипцию. Он играет роль в эмбриогенезе, и уровень его экспрессии снижается во взрослых тканях. В опухолевых клетках уровень его экспрессии может быть повышенным, и, таким образом, он рассматривается как онкофетальный белок (Liao et al., 2005). Его избыточная экспрессия была выявлена в клетках многих видов рака, включая рак желудка, что связано с плохим прогнозом (Jeng et al., 2009), (Jiang et al., 2006). Пептиды, полученные из IGF2BP3, были испытаны в клинических исследованиях вакцин (Копо et al., 2009).
Ламин В1 (LMNB1).
Ламин В1 является белком ядерного ламинного матрикса, и он участвует в обеспечении стабильности клеточного ядра, в хроматиновых структурах и в экспрессии генов. На ранних стадиях апоптоза ламин расщепляется (Neamati et al., 1995), (Sato et al., 2008b; Sato et al., 2008а; Sato et al., 2009). LMNB1 экспрессируется до некоторой степени, по существу, всеми нормальными соматическим клетками, и предварительные исследования указывают, что его уровень может быть пониженным во время патологических процессов при некоторых видах рака, включая рак желудка (Moss et al., 1999). В других видах рака, таких как почечно-клеточная карцинома, был выявлен повышенный уровень LMNB1, который положительно соотносился со стадией развития опухоли, размером и числом пораженных лимфоузлов (Lim et al., 2002).
Семейство сигнальных белков типа Wingless вирусов MMTV, имеющих интеграционные сайты, член 5А.
WNT5A является секретируемым сигнальным белком, участвующим в процессах развития и онкогенезе. Канонический сигнальный путь с участием WNT5A за счет рецепторов Frizzled и LRP5/LRP6 ведет к сохранению стволовых клеток/предшественников, тогда как неканонический сигнальный путь с участием WNT5A за счет рецепторов Frizzled и ROR2/PTK/RYK контролирует полярность тканей, клеточную адгезию или движение, например, в месте контакта опухоли и стромы, приводя к инвазии (Katoh и Katoh, 2007). Он может выступать в роли супрессора опухоли в некоторых видах рака, однако экспрессируется на высоком уровне в других видах, включая рак желудка, где он содействует прогрессии и метастазам и приводит к плохому прогнозу (Li et al., 2010), (Yamamoto et al., 2009), (Kurayoshi et al., 2006).
Белок активации фибробластов, альфа (FAP).
FAP является интегральной мембранной желатиназой. Его предполагаемая серин-протеазная активность может играть роль при контроле роста фибробластов или в эпителиально-мезенхимальных взаимодействиях во время развития, репарации тканей и эпителиального онкогенеза (Scanlan et al., 1994). FAP играет важную роль в росте опухоли, метастазах и ангиогенезе посредством клеточной адгезии и миграционных процессов, в равной степени как и быстрой деградации компонентов внеклеточного матрикса (ЕСМ). Он присутствует на опухолевых клетках, поражающих ЕСМ, в реактивных фибробластах, связанных с раком, и эндотелиальных клетках, задействованных в ангиогенезе, но не в неактивных клетках того же типа. (Dolznig et al., 2005; Kennedy et al., 2009; Rettig et al., 1993; Rettig et al., 1994; Scanlan et al., 1994; Zhang et al., 2010). Экспрессия FAP была выявлена в клетках рака желудка и была связана со стромальными фибробластами (Zhi et al., 2010), (Chen et al., 2006), (Mori et al., 2004; Okada et al., 2003). В модели с мышами было показано, что FAP-экспрессирующие клетки являются обязательным иммуносупрессивным компонентом опухолевого микроокружения (Kraman et al., 2010). В экспериментах по противоопухолевой вакцинации на моделях с мышами FAP успешно использовали в качестве мишени для CD8+ и CD4+ Т-клеточных ответов (Loeffler et al., 2006; Wen et al., 2010),(Lee et al., 2005), (Fassnacht et al., 2005).
Коатомерный комплекс белков, субъединица гамма (COPG).
- 25 037019
Коатомерный комплекс белков, субъединица гамма 2 (COPG2).
Коатомерный комплекс белков, субъединица бета 1 (СОРВ1).
COPG, COPG2 и СОРВ1 являются субъединицами коатомерного комплекса, называемого также комплексом белков оболочки 1 (COPI), который связан с не покрытыми клатрином везикулами. COPIпокрытые везикулы опосредуют ретроградный транспорт из аппарата Гольджи, назад в ЭР и транспорт внутри аппарата Гольджи (Watson et al., 2004). Они также могут быть задействованы в антероградном транспорте (Nickel et al., 1998). Ретроградный перенос регулирует, помимо прочего, EGF (эпидермальный фактор роста)-зависимый ядерный транспорт рецептора EGFR, который связывается с COPG (Wang et al., 2010). Было показано, что COPG был экспрессирован в избытке в клетках рака легких и связанных с раком легких эндотелиальных клетках капилляров (Park et al., 2008).
Последовательность повсеместно экспрессированного COPG2 на 80% идентична GOPG (Blagitko et al., 1999). COPG2 может образовывать СОР I-подобный комплекс вместо GOPG, который, вероятно, является функционально излишним (Futatsumori et al., 2000).
Нокдаун СОРВ1 в клеточной линии, экспрессирующей ген трансмембранного регулятора при муковисцидозе (CFTR), позволяет предположить, что коатомерный комплекс задействован в транспорте CRTR в плазматическую мембрану (Denning et al., 1992) (Bannykh et al., 2000).
Убиквитин-конъюгирующий фермент E2S (UBE2S).
UBE2S является вспомогательным фактором комплекса, стимулирующего анафазу (АРС), E3 убиквитинлигазой, которая регулирует выход из митотического цикла и фазы G1 при нацеливании на регуляторы клеточного цикла. UBE2S удлиняют убиквитиновые цепи после того, как субстраты прошли предварительное убиквитинирование другими компонентами (Wu et al., 2010). UBE2S также нацеливается на белок VHL для протеасомной деградации, тем самым стабилизируя HIF-альфа (Lim et al., 2008) и, возможно, способствуя пролиферации, эпителиально-мезенхимальному переходу и возникновению метастазов (Chen et al., 2009) (Jung et al., 2006). UBE2S экспрессируется в избытке в нескольких формах рака.
Член семейства кинезинов 11 (KIF11).
KIF11 необходим для образования биполярного митотического веретена. Его повышенные уровни были выявлены в нескольких видах рака, зачастую сопряженные с клинико-патологическими параметрами (Liu et al., 2010) (Peyre et al., 2010). Небольшие молекулы ингибиторов KIF11, такие как S-mриmил-Lцистеин (STLC), разработанные как потенциальные противораковые средства, задерживают клетки в фазе митоза и способствуют апоптозу раковых клеток (Tsui et al., 2009) (Wiltshire et al., 2010) (Ding et al., 2010). В клинических условиях было показано, что ингибиторы KIF11 проявляют лишь незначительную активность (Каап et al., 2010; Tunquist et al., 2010; Wiltshire et al., 2010; Zhang и Xu, 2008).
Домен 8 дезинтегрина и металлопротеиназы (ADAM8).
Сначала ADAM8 рассматривали как иммуноспецифический ADAM, но он был обнаружен и на других видах клеток, зачастую при условиях, включающих воспаление и ремоделирование ЕСМ, включая рак и такие заболевания дыхательных путей, как астма (Koller et al., 2009). Многие виды ADAM, включая ADAM8, экспрессируют клетки злокачественных опухолей человека, в которых они участвуют в регуляции активности фактора роста и функций интегрина, способствуя росту клеток и инвазии, хотя точные механизмы их действия на данный момент не ясны (Mochizuki и Okada 2007). В опухолях желудка мышей наблюдался повышенный уровень ADAM8 и других видов ADAM, вероятно, в связи с усилением передачи сигналов рецептором EGFR (Oshima et al., 2011).
Гомолог 6 цикла клеточного деления (S.cerevisiae) (CDC6).
CDC6 необходим для ингибирования инициации репликации ДНК. Он находится в ядре во время фазы G1, но перемещается в цитоплазму в начале фазы S. CDC6 также регулирует активацию репликации в сверочной точке за счет взаимодействия с ATR (Yoshida et al., 2010). Нарушение регуляции CDC6 может вызвать инактивацию локуса INK4/ARF, кодирующего три важных гена-супрессора опухоли: p16INK4a и p15INK4b, оба являющихся активаторами сигнального пути ретинобластомы, и ARF, активатора р53 (Gonzalez et al., 2006). Нокдаун CDC6 с помощью siPHK мог предотвратить пролиферацию и способствовал апоптозу (Lau et al., 2006). CDC6 представлен в повышенном количестве в раковых клетках, включая рак желудка (Nakamura et al., 2007), (Tsukamoto et al., 2008).
Рецептор фактора коагуляции F2R II (тромбин) (F2R).
F2R, называемый также активируемым протеиназой рецептором (PAR1), является рецептором, связанным с G-белком. Сигналы PAR1, PAR2 и PAR4 могут регулировать высвобождение кальция или активацию митоген-активируемой протеинкиназы и вести к накоплению тромбоцитов, релаксации сосудов, клеточной пролиферации, высвобождению цитокинов и воспалению (Oikonomopoulou et al., 2010). Считается, что F2R задействован в пролиферации эндотелиальных и опухолевых клеток и в ангиогенезе, и он экспрессируется в избытке в инвазивных и метастатических опухолях многих видов. Уровни экспрессии напрямую соотносятся со степенью инвазивности рака (Garcia-Lopez et al., 2010) (Lurje et al., 2010). В клетках карциномы желудка активация F2R может запускать каскад реакций, которые способствуют росту и инвазии опухолевых клеток, например, гиперэкспрессию NF-kappaB, EGFR и тенасцина-С (TN-C) (Fujimoto et al., 2010). Соответственно, как было установлено, экспрессия F2R в клетках рака желудка соотносится с глубиной инвазии в стенки, диссеминацией в брюшной полости и плохим прогнозом
- 26 037019 (Fujimoto et al., 2008). Было описано мышиное моноклональное антитело (АТАР-2) к человеческому
PAR1, которое распознает эпитоп (SFLLRNPN) на N-конце рецептора тромбина, а также пептидный агонист рецептора PAR1 - пептид TFLLRNPNDK (Hollenberg и Compton 2002; Mari et al., 1996; Xu et al.,
1995)
Ольфактомедин 4 (OLFM4).
Белок OLFM4, функция которого во многом неизвестна, экспрессируется в избытке в воспаленном эпителии толстой кишки и в ряде различных опухолей человека, в особенности опухолей пищеварительной системы (Koshida et al., 2007). OLFM4 является стабильным маркером для стволовых клеток кишечника человека и метит субпопуляцию клеток колоректального рака (van der Flier et al., 2009). OLFM4 ингибирует способствующий апоптозу белок GRIM-19 (Zhang et al., 2004), (Huang et al., 2010), регулирует клеточный цикл и способствует переходу в S-фазу при пролиферации раковых клеток. Кроме того, OLFM4 связан с адгезией раковых клеток и метастазированием (Yu et al., 2011b). Усиленная гиперэкспрессия OLFM4 в клетках опухоли предстательной железы у мышей вела к более быстрому образованию опухоли у животных с сингенным трансплантатом (Zhang et al., 2004). Гиперэкспрессия OLFM4 была выявлена в РЖ (Aung et al., 2006). Ингибирование экспрессии OLFM4 могло индуцировать апоптоз в присутствии цитотоксических веществ в клетках рака желудка (Kim et al., 2010). Также повышенной была концентрация OLFM4 в сыворотке пациентов перед операцией с диагнозом РЖ в сравнении со здоровыми донорами (Oue et al., 2009). OLFM4 был идентифицирован в качестве нового гена-мишени для ретиноевых кислот (RA) и деметилирующего агента 5-аза-2'-дезоксицитидина. Было подтверждено, что эти два агента являются эффективными при лечении определенных пациентов, страдающих миелоидной лейкемией (Liu et al., 2010).
Thy-1 поверхностный клеточный антиген (Thy1).
Thy-1 (CD90) является заякоренным на GPI гликопротеином, выявленным во многих видах клеток, включая Т-клетки, нейроны, клетки эндотелия и фибробласты. Thy-1 участвует в таких процессах, как адгезия, обновление нервной ткани, рост опухоли, подавление опухоли, миграция, клеточная смерть и активация Т-клеток. (Rege и Hagood 2006b; Rege и Hagood 2006a), (Jurisic et al., 2010). Thy-1, повидимому, является маркером ангиогенеза у взрослых, но не на эмбриональной стадии (Lee et al., 1998). Более того, он рассматривался в качестве маркера для различных видов стволовых клеток (мезенхимальных стволовых клеток, стволовых клеток печени (овальные клетки) (Masson et al., 2006), стволовых клеток кератиноцитов (Nakamura et al., 2006) и кроветворных стволовых клеток (Yamazaki et al., 2009)). Уровень экспрессии Thy-1 повышен в нескольких видах рака, включая рак желудка и опухоли GIST, для которых его предлагали в качестве маркера (Yang и Chung 2008; Zhang et al., 2010), (Oikonomou et al., 2007).
Центросомный белок 250 кДа (Сер250).
Сер250 играет роль при когезии центров организации микротрубочек (Mayor et al., 2000). Его также называют центросомным Nek2-ассоциированным белком или C-Nap1, так как он локализуется совместно с серин/треонинкиназой Nek2 и является ее субстратом. Киназа Nek2 и ее субстраты регулируют сцепление центросом (Bahmanyar et al., 2008). В начале фазы митоза, когда центросомы разделяются для образования биполярного веретена, C-Nap1 фосфорилируется и затем отделяется от центросом. В экспериментах in vitro было продемонстрировано, что гиперэкспрессия Cep250 повреждает организацию микротрубочек на центросоме (Mayor et al., 2002).
Индуцируемый при гипоксии фактор-1, субъединица альфа (основной фактор транскрипции с доменом типа спираль-петля-спираль) (HIF1A).
HIF1A является чувствительной к кислороду субъединицей индуцируемого при гипоксии фактора (HIF) - транскрипционного фактора, активного в условиях гипоксии, свойственных для опухолей. Он опосредует транскрипцию более 60 генов, задействованных в процессах выживаемости, метаболизма глюкозы, инвазии, распространения метастазов и ангиогенеза (например, VEGF). Ген HIF1 экспрессируется в избытке клетками многих видов рака, что часто связано с плохим прогнозом, и он рассматривается как интересная мишень для фармакологических манипуляций (Griffiths et al., 2005; Quintero et al., 2004; Stoeltzing et al., 2004), (Zhong et al., 1999).
При раке желудка HIF1A участвует в ангиогенезе (Nam et al., 2011), соотносится с размером опухоли, более низкой дифференциацией, стадией опухоли, более короткой выживаемостью (Qiu et al., 2011) и метастазами (Wang et al., 2010), (Han et al., 2006; Kim et al., 2009; Oh et al., 2008; Ru et al., 2007). Также считается, что он приводит к возникновению резистентности к химиотерапевтическим средствам, таким как 5-FU, за счет ингибирования апоптоза, вызванного лекарственными препаратами, и снижения внутриклеточного накопления препарата (Nakamura et al., 2009), (Liu et al., 2008). HIF-1 альфа-ингибитор 2-метокси-эстрадиол в значительной степени снижал метастатические свойства клеток рака желудка (Rohwer et al., 2009).
Гомолог вирусного онкогена v-Ki-ras 2 саркомы крыс Кирстена (KRAS).
KRAS является членом надсемейства малых ГТФаз и протоонкогеном, задействованным на ранних этапах многих путей передачи сигналов, таких как МАРК- и АКТ-опосредованные пути, являющихся потенциально онкогенными. Одиночные замены аминокислот ведут к активации мутаций, результатом
- 27 037019 чего становится трансформированный белок, который играет ключевую роль в различных злокачественных образованиях, включая рак желудка (Capella et al., 1991). Онкогенные мутации KRAS редко встречаются при раке желудка. В одной разновидности рака желудка локус KRAS был амплифицирован, что приводило к гиперэкспрессии белка KRAS. Таким образом, амплификация гена, скорее всего, представляет собой молекулярную основу для избыточной активации KRAS при раке желудка (Mita et al., 2009). Аллели мутировавшего белка KRAS вносят свой вклад в индукцию VEGF, стимулируемую гипоксией (Kikuchi et al., 2009; Zeng et al., 2010). Мутировавший KRAS может быть также обнаружен в сыворотке или плазме пациентов, больных раком, и был, таким образом, предложен для использования в качестве легко доступного опухолевого маркера (Sorenson, 2000). Пептид KRAS-001 образован только из одного из двух вариантов сплайсинга - NP 004976 (188 аминокислот), а не сплайс-варианта - NP 203524 (189 аминокислот). Эти варианты сплайсинга различаются по последнему экзону, на котором локализован KRAS-001.
He-SMC субъединица G комплекса конденсина I (NCAPG).
NCAPG является частью комплекса конденсина I, который образован как белками семейства сохранения структурной целостности хромосом (SMC), так и не-SMC-белками. Он регулирует конденсацию и сегрегацию хромосом во время митоза (Seipold et al., 2009). Гиперэкспрессия NCAPG была обнаружена в многочисленных видах опухолей, включая носоглоточную карциному (Li et al., 2010), почечноклеточную карциному (Satow et al., 2010) и меланому (Ryu et al., 2007). В нормальных тканях наиболее высокий уровень экспрессии NCAPG наблюдается в семеннике. Он был предложен в качестве возможного маркера пролиферации и потенциального прогностического индикатора при раке (Jager et al., 2000).
ДНК-топоизомераза II альфа (ТОР2А) и ДНК-топоизомераза II бета (ТОР2В).
ТОР2А и ТОР2В кодируют высокогомологичные изоформы ДНК-топоизомеразы, которая контролирует и изменяет топологические состояния ДНК во время транскрипции и принимает участие в конденсации хромосом, разделении хроматид, репликации и транскрипции. Топоизомераза является мишенью нескольких противораковых препаратов, таких как антрациклин, а многочисленные ее мутации были связаны с резистентностью к лекарственным препаратам (Kellner et al., 2002), (Jarvinen и Liu, 2006). ТОР2А (не ТОР2В) необходима для клеточной пролиферации. Она находится по соседству с онкогеном HER2 и амплифицирована в значительном большинстве видов HER2-положительных опухолей молочной железы, но и также в видах без HER2-положительного статуса (Jarvinen и Liu, 2003) и во многих других видах опухолей. Для одной разновидности рака желудка также было установлено, что ТОР2А является амплифицированной и гиперэкспрессированной, зачастую одновременно с HER2 (Vans et al., 2002) (Liang et al., 2008).
Ламинин, гамма 2 (LAMC2).
Ламинины являются главными неколлагеновыми компонентами базальных мембран. Они задействованы в клеточной адгезии, дифференциации, миграции, сигнальных путях и метастазировании. Цепь гамма-2 вместе с цепями альфа-3 и бета-3 формируют ламинин-5. LAMC2 способствует инвазивному росту человеческих раковых клеток in vivo. Он высоко экспрессируется клетками человеческого рака на линии инвазии, и уровень экспрессии соотносится с плохим прогнозом (Tsubota et al., 2010). Образованный за счет ММР-2 продукт расщепления ламинина-5 способен к активации сигнального каскада EGFR и способствует клеточной подвижности (Schenk et al., 2003). При раке желудка LAMC2 может индуцироваться членами семейства EGFR или Wnt5a, и, как было показано, инвазивная активность зависит от LAMC2 (Tsubota et al., 2010), (Yamamoto et al., 2009).
Арил-углеводородный рецептор (AhR).
AhR связывается с планарными ароматическими атомами углеводорода, такими как ТХДД (2,3,7,8-тетрахлордибензо-р-диоксин), и опосредует транскрипцию генов, включая ферменты, метаболизирующие ксенобиотики, такие как ферменты цитохрома Р450. Он также играет роль в прохождении клеточного цикла (Barhoover et al., 2010). Считается, что AhR отчасти связан с активностью диоксина, стимулирующей развитие опухоли, поскольку ему присущи способствующие пролиферации и антиапоптотические функции, и он может привести к нарушению регуляции межклеточных контактов, дедифференциации и повышенной подвижности (Watabe et al., 2010), (Dietrich и Kaina 2010), (Marlowe et al., 2008). Экспрессия AhR может быть снижена за счет TGF-бета (Dohr и Abel, 1997; Wolff et al., 2001) и вызвана сигнальными путями Wnt или бета-катенина (Chesire et al., 2004). Гиперэкспрессия AhR была обнаружена во многих видах рака, включая рак желудка, где она соотносилась с частой экспрессией CYP1A1 (Ма et al., 2006). Экспрессия AhR и ядерная транслокация были выше в раковых опухолях желудка, чем в нормальных тканях, и экспрессия постепенно возрастала во время онкогенеза (Peng et al., 2009а). Активация сигнального пути AhR повышает инвазивный потенциал клеток рака желудка, скорее всего, за счет c-Jun-зависимой индукции ММР-9 (Peng et al., 2009b). В модели с мышами экспрессия конститутивно активного мутанта арил-гидроуглеводородного рецептора (CA-AhR) приводит к развитию опухолей желудка, соотносясь с повышенной смертностью (Andersson et al., 2002; Kuznetsov et al., 2005). Функция AhR при раке, по-видимому, носит неоднозначный характер, поскольку в некоторых исследованиях была также выявлена его активность по подавлению развития опухоли (Gluschnaider et al., 2010), (Fan et al., 2010).
- 28 037019
Рецептор гиалуронан-опосредованной подвижности (RHAMM) (HMMR).
HMMR может встречаться на клеточной поверхности, где он связывается с гиалуроновой кислотой (НА) и взаимодействует с НА-рецептором CD44. Данное взаимодействие играет роль в таких процессах, как клеточная подвижность, заживление ран и инвазия (Gares и Pilarski, 2000). Внутриклеточно HMMR связан с цитоскелетом, микротрубочками, центросомами и митотическим веретеном и играет роль в контроле целостности митотического веретена. HMMR экспрессируется в избытке несколькими видами раковых тканей (Sohr и Engeland, 2008). Предполагалось, что НА защищает раковые клетки от иммунной атаки. Уровень НА в сыворотке часто повышен у пациентов, имеющих метастазы (Delpech et al., 1997). HMMR был идентифицирован в качестве многообещающего опухолеассоциированного антигена и возможного прогностического индикатора при AML и ХЛЛ. Пептиды, полученные из HMMR, использовали в вакцинах против лейкемии. HMMR-001 в равной степени прошел испытания in vitro на иммуногенность, но не использовался для вакцинации (Tzankov et al., 2011), (Greiner et al., 2010; Schmitt et al., 2008; Tabarkiewicz и Giannopoulos, 2010), (Greiner et al., 2005). Гиперэкспрессия HMMR была также выявлена в нескольких других видах рака, и зачастую это было связано с плохим прогнозом. HMMR экспрессировался также в избытке при раке желудка, часто в комбинации с CD44, и было сделано предположение, что он способствует инвазии и развитию метастазов (Li et al., 999), (Li et al., 2000а) (Li et al., 2000b).
ТРХ2, ассоциированный с микротрубочками гомолог (Xenopus laevis) (TPX2).
TPRX2 - это белок, связанный с пролиферацией, экспрессируемый на фазах S-, G(2)- и М-клеточного цикла, который считается маркером пролиферации (Cordes et al., 2010).
Он необходим для нормальной нуклеации микротрубочек, например, для образования митотического веретена. ТРХ2 соединяется с геном Aurora А и активирует его (Bird и Hyman, 2008; Moss et al., 2009). Фосфорилирование ТРХ2 с Polo-подобной киназой 1 усиливает его способность активировать Aurora A (Eckerdt et al., 2009). ТРХ2 экспрессируется в избытке клетками многих видов опухолей и зачастую экспрессируется в избытке в комбинации с геном Aurora A (Asteriti et al., 2010). Примерами, в которых была выявлена чрезмерная экспрессия ТРХ2 (зачастую связанная с плохим прогнозом или более поздней стадией), являются менингиома (Stuart et al., 2010), рак легких (Kadara et al., 2009), (Lin et al., 2006; Ма et al., 2006), (Manda et al., 1999) и почечно-клеточная карцинома (Shigeishi et al., 2009b), (Satow et al., 2010), (Wang et al., 2003).
Настоящее изобретение поэтому относится к пептиду, включающему последовательность, которая выбирается из группы SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95, или его варианту, который по меньшей мере на 80% гомологичен SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95, или его варианту, который индуцирует Т-клеточную перекрестную реакцию с указанным пептидом, где указанный пептид не является полипептидом полной длины.
Настоящее изобретение далее относится к пептиду, включающему последовательность, которая выбирается из группы SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95, или его варианту, который по меньшей мере на 80% гомологичен SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95, где указанный пептид или его вариант имеет общую длину от 8 до 100, предпочтительно от 8 до 30 и, наиболее предпочтительно от 8 до 14 аминокислот.
Настоящее изобретение далее относится к пептидам, описанным ранее, имеющим способность связываться с молекулой главного комплекса гистосовместимости человека (MHC) I или II класса.
Настоящее изобретение далее относится к пептидам, описанным ранее, где пептид состоит или состоит по существу из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95.
Настоящее изобретение далее относится к пептидам, описанным ранее, где пептид модифицирован и/или включает непептидные связи.
Настоящее изобретение далее относится к пептидам, описанным ранее, где пептид является слитым белком, в частности, включающим N-терминальные аминокислоты антиген-ассоциированной инвариантной цепи (Ii) HLA-DR.
Настоящее изобретение далее относится к нуклеиновой кислоте, кодирующей описанные ранее пептиды, при условии, что пептид не является полностью человеческим белком.
Настоящее изобретение далее относится к нуклеиновой кислоте, описанной ранее, которая является ДНК, кДНК, ПНК, ЦНК, РНК или их комбинациями.
Настоящее изобретение далее относится к вектору экспрессии, способному экспрессировать описанную ранее нуклеиновую кислоту.
Настоящее изобретение далее относится к пептиду, описанному ранее, к нуклеиновой кислоте, описанной ранее, или к вектору экспрессии, описанному ранее, для применения в медицине.
Настоящее изобретение далее относится к клетке-хозяину, включающей нуклеиновую кислоту, описанную ранее, или вектор экспрессии, описанный ранее.
Настоящее изобретение далее относится к описанной клетке-хозяину, которая является антигенпрезентирующей клеткой.
Настоящее изобретение далее относится к описанной клетке-хозяину, где антигенпрезентирующая клетка является дендритной клеткой.
Настоящее изобретение далее относится к способу получения описанного пептида, причем способ
- 29 037019 включает культивацию описанной клетки-хозяина и выделение пептида из клетки-хозяина или его культуральной среды.
Настоящее изобретение далее относится к способу получения активированных цитотоксических Т-лимфоцитов (ЦТЛ) in vitro, причем способ включает контактирование ЦТЛ in vitro с нагруженными антигеном молекулами человеческого MHC I или II класса, экспрессированными на поверхности подходящей антигенпрезентирующей клетки на период времени, достаточного для активации антигенспецифическим образом указанных ЦТЛ, где указанный антиген является любым описанным пептидом.
Настоящее изобретение далее относится к описанному способу, где антиген нагружен на молекулы MHC I или II класса, экспрессированные на поверхности подходящей антигенпрезентирующей клетки при контактировании достаточного количества антигена с антигенпрезентирующей клеткой.
Настоящее изобретение далее относится к описанному способу, где антигенпрезентирующая клетка включает вектор экспрессии, способный экспрессировать указанный пептид, содержащий SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 33 или указанную вариантную аминокислотную последовательность.
Настоящее изобретение далее относится к активированным цитотоксическим Т-лимфоцитам (ЦТЛ), полученным описанным способом, которые селективно распознают клетку, которая аберрантно экспрессирует полипептид, включающий описанную аминокислотную последовательность.
Настоящее изобретение далее относится к способу уничтожения клеток-мишеней у пациента, чьи клетки-мишени аберрантно экспрессируют полипептид, включающий любую описанную аминокислотную последовательность, причем способ включает введение пациенту эффективного числа цитотоксических Т-лимфоцитов (ЦТЛ) в соответствии с определением.
Настоящее изобретение далее относится к применению любого описанного пептида, описанной нуклеиновой кислоты, описанного вектора экспрессии или описанного активированного цитотоксического Т-лимфоцита в качестве лекарственного средства или в производстве лекарственного средства.
Настоящее изобретение далее относится к описанному способу применения, где лекарственное средство является вакциной.
Настоящее изобретение далее относится к описанному способу применения, где лекарственное средство обладает активным противораковым действием.
Настоящее изобретение далее относится к описанному способу применения, где указанные раковые клетки являются клетками рака желудка, желудочно-кишечного тракта, колоректального рака, рака поджелудочной железы, легких или почек.
Настоящее изобретение далее относится к конкретным белкам-маркерам, которые могут быть использованы для прогнозирования рака желудка.
Кроме того, настоящее изобретение относится к применению этих новых мишеней для лечения рака.
Предложенные в контексте данного изобретения белки, кодируемые генами
ABL1, ADAM10, AHR, CCND2, CDC6, CDK1, СЕАСАМ1, СЕАСАМ5, СЕАСАМ6, СЕАСАМ6, COL6A3, EIF2S3, LOC255308, ЕРНА2, ERBB2, ERBB3, F2R, FAP, HMMR, HSP90B1, IGF2BP3, ITGB4, KIF2C, KRAS, LAMC2, LCN2, MET, ММР11, ММР12, ММРЗ, MST1R, NUF2, OLFM4, PROM1, RRM2, THY1, TMPRSS4, ТОР2А , TSPAN1, WNT5A, HIF1A и РТК2, как было описано в литературе, экспрессируются в избытке клетками рака желудка по сравнению с нормальными тканями желудка или другими жизненно важными тканями (к примеру, печени, почек, сердца).
Было показано, что белки, кодируемые генами
ABL1, ADAM10, ADAM8, AHR,
ASPM, ATAD2, CCDC88A, CCNB1, CCND2, CCNE2, CDC6, CDK1, СЕАСАМ1, СЕАСАМ5, СЕАСАМ6, СЕАСАМ6, CLCN3, COL6A3, ЕРНА2, ERBB2, ERBB3, F2R, FAP, HIF1A, HMMR, HSP90B1, IGF2BP3, IQGAP3, ITGB4, KIF11, KIF2C, KRAS, LAMC2, LCN2, MET, MMP11, ММРЗ, MST1R, MUC6, NCAPG, NFYB, NUF2, OLFM4, PBK, PLK4, PPAP2C, PROM1, PTK2, RRM2, SIAH2, THY1, TOP2A, TPX2, TSPAN1, TSPAN8, UBE2S, UCHL5 и WNT5A, играют важную роль в онкогенезе, так как они задействованы в злокачественной трансформации, клеточном росте, пролиферации, ангиогенезе или инвазии нормальной ткани. Также существуют некоторые доказательства активности, связанной с заболеванием раком, у белков, кодируемых генами DNAJC10, EIF2S3, EIF3L, POLD3, PSMC2, PSMD14 и TMPRSS4.
Было показано, что белки, кодируемые генами PROM1, WNT5A, SMC4, PPAP2C, GPR38, OLFM4 и THY1, экспрессируются в избытке и/или являются функционально важными в стволовых клетках и/или раковых стволовых клетках. PROM1 был предложен в качестве маркера стволовых клеток рака желудка, хотя данные противоречивы. Раковые стволовые клетки являются субпопуляцией опухолевых клеток с потенциалом самообновления, что необходимо для постоянного роста опухоли. Эти клетки находятся в специализированных и высокоорганизованных структурах, так называемых нишах раковых стволовых
- 30 037019 клеток, которые требуются для сохранения потенциала самообновления раковых стволовых клеток.
Было показано, что гиперэкспрессия белков
AHR, ASPM, ATAD2, CCNB1,
CCND2, CCNE2, CDK1 (CDC2), СЕАСАМ1, СЕАСАМ5, СЕАСАМ6, СЕАСАМ6,
COL6A3, ЕРНА2, ERBB2, ERBB3, F2R, FAP, HIF1A, HMMR.HSP90B1, IGF2BP3,
ITGB4, KIF11, KIF2C, KRAS, LAMC2, LCN2, LMNB1, MET, ММР11, ММРЗ, MST1R,
MUC6, NCAPG, NUF2, 0LFM4, РВК, РРАР2С, PROM1, РТК2, TMPRSS4, ТРХ2,
TSPAN1 и WNT5A в опухолях связана с поздними стадиями заболевания и плохим прогнозом для пациентов.
Поэтому в настоящем изобретении предложены способы идентификации животного, предпочтительно человека, который, скорее всего, болен раком желудка. В одном варианте осуществления установленная вероятность находится между 80 и 100%. Один таковой способ включает определение уровня по меньшей мере одного из белков MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 в опухолевом образце животного субъекта. В одном варианте осуществления образец изымается методом радикальной хирургии. В другом варианте осуществления образец изымается методом игольной биопсии.
Если уровень MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6, как установлено, в клетках выше на 20% или более относительно уровня, установленного в доброкачественных эпителиальных клетках того же самого образца, то у животного субъекта, скорее всего, имеется рак желудка.
Чем выше уровень различных белков группы, включающей MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, тем выше вероятность того, что будет установлено, что у животного субъекта имеется рак желудка.
В одном варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится in situ. В другом варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UqCrB или Muc6 производится in vitro. В другом отличном варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится in vivo. В предпочтительном варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится методом лазерной захватывающей микроскопии вместе с анализом Western blot.
В одном конкретном варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится с помощью антитела, специфического для MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6. В другом таком варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVl9, UQCRB или Muc6 производится с помощью ПЦР с праймером, специфическим для мРНК, кодирующей MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6. В еще одном варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится с помощью нуклеотидного зонда, специфического для мРНК, кодирующей MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6. В другом варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится с помощью анализа Northern blot. В другом варианте осуществления определение уровня MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 производится методом анализа с помощью защиты от рибонуклеазы. В других вариантах осуществления для выявления полипептидов MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 в жидкой пробе организма (такой как кровь, сыворотка, мокрота, моча или перитонеальная жидкость) могут быть использованы такие иммунологические методы, как твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA), радиоиммунный анализ (RIA) и иммунный блоттинг (Western blot). Биоптаты, тканевые и клеточные образцы (такие как из яичника, лимфатических узлов, соскобы эпителиальных клеток с поверхности яичника, биоптаты легких, биоптаты печени и любые жидкостные пробы, содержащие клетки (такие как перитонеальная жидкость, мокрота и плейральный секрет) могут быть проанализированы посредством дезагрегации и/или растворения ткани или клеточного образца и проведения иммуноанализа на присутствие полипептида, такого как ELISA, RIA или иммунного блоттинга (Western blotting). Такие клеточные или тканевые образцы могут быть также проанализированы методами на основе нуклеиновых кислот, к примеру полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) с амплификацией, гибридизации Нозерн-блоттинг или слот- или дот-блоттинг. Для визуализации распределения опухолевых клеток в образцах тканей для выявления полипептидных маркеров рака желудка или мРНК соответственно могут быть применены диагностические тесты, которые сохраняют структуру ткани, например иммуногистологическое окрашивание, in situ гибридизация РНК или in situ ОТ-ПЦР. Для локализации опухолевой массы in vivo могут применяться методы визуализации, такие как магнитно-резонансная томография (МРТ) посредством введения в субъект антитела, которое специфически связывается с полипептидами MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 (в особенности полипептидом, находящимся на клеточной поверхности), где антитело конъюгировано или по-другому связано с парамагнитным индикатором (или другой подходящей выявляемой единицей в зависимости от используемого
- 31 037019 метода визуализации); альтернативно, локализацию немеченного опухолевого маркер-специфического антитела можно определить с помощью вторичного антитела, связанного с выявляемой единицей.
Кроме того, в настоящем изобретении предложены химерные/слитые белки/пептиды, включающие полипептиды MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 и их фрагменты, включая функциональные, протеолитические и атигенные фрагменты.
Партнер по слиянию или сегменты гибридной молекулы адекватно обеспечивают эпитопы, которые стимулируют CD4' Т-клетки. Стимулирующие эпитопы CD4+ хорошо известны из уровня техники и включают те, что были идентифицированы в столбнячном токсине. В еще одном предпочтительном варианте осуществления пептид является слитым белком, в частности включающим
N-терминальные аминокислоты антиген-ассоциированной инвариантной цепи (Ii) HLA-DR. В одном варианте осуществления пептид по изобретению является усеченным белком человека или слитым белком белкового фрагмента и другого полипептидного участка при условии, что человеческий участок включает одну или более аминокислотную последовательность по изобретению.
Антитела к полипептидам MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6, к химерным/слитым белкам, включающим полипептиды MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6, в равной степени как и фрагменты полипептидов MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6, включая протеолитические и антигенные фрагменты, и к химерным/слитым белкам/пептидам, включая эти фрагменты, являются также предметом настоящего изобретения. Более того, способы использования таких антител для прогнозирования заболевания раком и рака желудка, в частности, также являются предметом настоящего изобретения.
Антитела по настоящему изобретению могут быть поликлональными антителами, моноклинальными антителами и/или химерными антителами. Бессмертные линии клеток, которые вырабатывают моноклональное антитело по настоящему изобретению, являются также частью настоящего изобретения.
Среднему специалисту данной области будет понятно, что в некоторых частных случаях более высокая экспрессия MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 в качестве опухолевого гена-маркера будет указывать на худший прогноз для субъекта, имеющего рак желудка. Например, относительно более высокие уровни экспрессии MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 могут указывать на относительно крупную первичную опухоль, более высокую тяжесть заболевания (к примеру, больше метастазов) или относительно более злокачественный фенотип опухоли.
Чем больше различных белков группы, включающей MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, экспрессированы в избытке, тем хуже прогноз.
Диагностические и прогностические способы по изобретению охватывают использование известных способов, к примеру, основанных на антителах способов выявления полипептидов MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, а также способов, основанных на гибридизации и/или амплификации нуклеиновых кислот для выявления мРНК MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6.
Кроме того, в связи с тем, что быстрое уничтожение опухолевых клеток часто приводит к образованию аутоантител, опухолевые маркеры рака желудка по изобретению могут использоваться в серологических анализах (например, в тесте ELISA для сыворотки субъекта) для обнаружения аутоантител против MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 у субъекта. Уровни полипептидспецифического аутоантитела для MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, которые по меньшей мере приблизительно в 3 раза выше (и предпочтительно по меньшей мере в 5 раз или 7 раз выше, наиболее предпочтительно по меньшей мере в 10 или 20 раз выше), чем в контрольном образце, являются признаком рака желудка.
Находящиеся на поверхности клетки, внутриклеточные и секретируемые полипептиды MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 могут быть также все использованы в анализе биоптатов, например ткани или клеточных образцов (включая клетки, полученные из жидкостных образцов, таких как перитонеальная жидкость), для определения, содержит ли тканевый или клеточный биоптат клетки рака желудка. Биоптат может быть проанализирован как интактная ткань или образец цельной клетки или же ткань или клеточный образец могут быть дисагрегированы и/или растворены, как это необходимо для конкретного вида используемого диагностического анализа. Например, биоптаты или образцы могут подвергаться цельнотканевому или цельноклеточному анализу для определения уровня полипептида или мРНК MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 in situ, например используя иммуногистохимический метод, гибридизацию мРНК in situ или ОТ-ПЦР in situ. Опытному специалисту известно, как приготавливать ткани или клетки к анализу для определения уровня полипептида или мРНК с использованием иммуногистохимических методов, таких как ELISA, иммунный блоттинг или равноценные методы, или же методов анализа уровня мРНК посредством аналитических методов, основанных на нуклеиновых кислотах, таких как ОТ-ПЦР, нозерн-гибридизация или слот- или дот-блоттинг.
Диагностические наборы для измерения уровней экспрессии MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6.
В настоящем изобретении предложено оборудование для обнаружения повышенного уровня экс- 32 037019 прессии MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 в качестве гена-маркера рака желудка у субъекта. Набор для выявления полипептидного маркера рака желудка предпочтительно содержит антитело, которое специфически связывается с выбранным полипептидным маркером рака желудка. Набор для выявления мРНК-маркера рака желудка предпочтительно содержит одну или более нуклеиновых кислот (к примеру, один или более олигонуклеотидный праймер или зонд, зонды ДНК, зонды РНК или матрицы для синтеза зондов РНК), которые специфически гибридизируются с мРНК MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6.
В частности, набор на основе антител может использоваться для выявления присутствия и/или определения уровня полипептида MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, который специфически связан с антителом или его иммунореактивным фрагментом. Набор может включать антитело, активное по отношению к антигену, и реагент для выявления продукта реакции антитела с антигеном. Такой набор может быть комплектом ELISA и может содержать контроль (например, специфицированное количество конкретного полипептидного маркера рака желудка), первичные и вторичные антитела, когда это целесообразно, и любые другие необходимые реагенты, такие как выявляемые элементы, субстраты ферментов и цветные реагенты, как описывалось выше. Диагностический набор альтернативно может быть набором для иммуноблоттинга, как правило включающим компоненты и реагенты, описываемые в настоящем изобретении.
Набор на основе нуклеиновой кислоты может использоваться для выявления и/или определения уровня экспрессии MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 посредством выявления и/или определения количества мРНК MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 в образце, таком как тканевый или клеточный биоптат. Например, набор для проведения ОТ-ПЦР для выявления повышенной экспрессии MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 предпочтительно содержит олигонуклеотидные праймеры, которых достаточно для проведения обратной транскрипции мРНК-маркера рака желудка до кДНК и амплификацию кДНК-маркера рака желудка посредством ПЦР, и будет также предпочтительно содержать матричные молекулы и праймеры для проведения соответствующих контрольных ПЦР-реакций, а также внутреннего контроля для количественного определения. Средний специалист данной области в состоянии отобрать подходящие праймеры для проведения реакций обратной транскрипции и ПЦР, а также соответствующие контрольные реакции, которые необходимо провести. Такое руководство приводится, например, в работе F. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, N.Y., 1997. Многочисленные разновидности ОТ-ПЦР известны из уровня техники. Целенаправленная доставка иммунотоксинов в MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 как до терапевтических мишеней может осуществляться как метод лечения или профилактики рака желудка. Например, молекула антитела, которая специфически связывается с находящимся на поверхности клетки полипептидом MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, может быть конъюгирована с радиоизотопом или другим токсическим соединением. Конъюгаты антител вводят в субъект, так что связывание антитела с родственным ему полипептидом рака желудка приводит к нацеленной доставке терапевтического соединения в клетки рака желудка, тем самым производя лечение рака яичника.
Терапевтическим элементом может быть токсин, радиоизотоп, лекарственное, химическое средство или белок (см., например, Bera et al., Pharmacokinetics and antitumor activity of a bivalent disulfide-stabilized Fv immunotoxin with improved antigen binding to erbB2 Cancer Res. 59:4018-4022 (1999)). Например, антитело может быть связано или конъюгировано с бактериальным токсином (например, токсин дифтерии, экзотоксин псевдомонас А, холерный токсин) или растительным токсином (например, рициновый токсин) для нацеленной доставки токсина к клетке, экспрессирующей MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6. Этот иммунотоксин может быть доставлен в клетку, и при соединении с находящимся на поверхности клетки полипептидным маркером рака желудка токсин, конъюгированный с антителом, специфическим для маркера рака желудка, будет доставлен в клетку.
Кроме того, для любого полипептида MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, для которого существует специфический лиганд (например, лиганд, который связывается с находящимся на поверхности клетки белком), может быть использован лиганд вместо антитела для нацеливания токсичного соединения на клетки рака желудка, как описывалось выше.
Понятие антитело используется в контексте данного изобретения в широком смысле и включает как поликлональные, так и моноклональные антитела. В дополнение к интактным молекулам иммуноглобулина в понятие антитела включены также фрагменты или полимеры таких молекул иммуноглобулина и гуманизированные версии молекул иммуноглобулина при условии, что они проявляют одно из желаемых свойств (например, специфически связываются с полипептидным маркером рака желудка, доставляют токсин к клетке рака желудка, экспрессирующей раковый ген-маркер рака желудка на повышенном уровне и/или ингибируют активность ракового полипептида-маркера), описанных в настоящем изобретении.
- 33 037019
Если возможно, антитела по изобретению могут быть куплены в коммерческих источниках. Антитела по изобретению могут быть также получены при использовании хорошо известных методов. Опытному специалисту будет понятно, что для получения антител по изобретению могут использоваться как полипептидные маркеры рака желудка полной длины, так и их фрагменты. Полипептид, необходимый для получения антитела по изобретению, может быть частично или полностью очищенным из природного источника или же может быть получен с использованием методики рекомбинантной ДНК. Например, кДНК, кодирующая полипептид MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 или его фрагмент, может быть экспрессирована в прокариотических клетках (например, бактерий) или эукариотических клетах (например, клетки дрожжей, насекомых или млекопитающих), после чего рекомбинантный белок может быть очищен и использован для получения препарата из моноклонального или поликлонального антитела, которое специфически связывается с полипептидным маркером рака желудка, использованным для получения антитела.
Специалисту данной области будет известно, что получение двух или более различных наборов моноклональных или поликлональных антител увеличивает вероятность получения антитела со специфичностью и аффинностью, необходимыми для предназначенного для него использования (например, ELISA, иммуногистохимия, визуализация in vivo, терапия на основе иммунотоксина). Антитела испытаны на желаемую для них активность с помощью известных методов в соответствии с целью применения антител (например, ELISA, иммуногистохимия, иммунотерапия и т.д.; для получения дальнейшей информации по генерированию и испытанию антител см., например, Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1988). A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1988). Например, антитела могут быть испытаны с помощью анализов ELISA, метода иммунного блоттинга (Western-blot), иммуногистохимического окрашивания законсервированных формальдегидом образцов рака желудка или замороженных тканевых срезов. После их первоначальной характеристики in vitro антитела, предназначаемые для терапевтического или диагностического применения in vivo, испытывают в соответствии с известными клиническими методами анализа.
Понятие моноклональное антитело в контексте настоящего изобретения обозначает антитело, полученное, по существу, из гомогенной популяции антител, т.е. отдельные антитела внутри популяции идентичны, за исключением возможных естественных мутаций, которые могут быть представлены в небольших количествах. Моноклональные антитела в контексте настоящего изобретения специфически включают химерные антитела, в которых участок тяжелой и/или легкой цепи идентичен или гомологичен с соответствующими последовательностями антител, полученных из конкретных видов или относящихся к конкретному классу или подклассу антител, в то время как остальная(ые) цепь(и) идентична(ы) или гомологична(ы) с соответствующими последовательностями антител, полученных из других видов или относящихся к другому классу или подклассу антител, в равной степени как и фрагменты таких антител, пока они проявляют желаемую антагонистическую активность (патент США № 4816567).
Моноклональные антитела по изобретению могут быть получены при использовании гибридомного метода. В рамках гибридомного метода мышь или другое подходящее животное-хозяин обычно иммунизируется иммунизирующим веществом, чтобы инициировать лимфоциты, которые вырабатывают или способны вырабатывать антитела, которые будут специфически связываться с иммунизирующим веществом. Альтернативно, лимфоциты могут быть иммунизированы in vitro.
Моноклональные антитела могут быть также получены с помощью методов с рекомбинантной ДНК, таких как описываемые в патенте США № 4816567. ДНК, кодирующая моноклональные антитела по изобретению, может быть легко выделена и секвенирована с помощью стандартных методик (например, при использовании олигонуклеотидных зондов, которые способны специфически связываться с генами, кодирующими тяжелые и легкие цепи мышиных антител).
In vitro методы также подходят для получения моновалентных антител. Расщепление антител для получения их фрагментов, в особенности Fab-фрагментов, может быть произведено при использовании стандартных техник, известных из уровня техники. К примеру, расщепление может производиться при использовании папаина. Примеры расщепления под воздействием папаина описываются в заявке WO 94/29348, опубликованной 22.12.1994, и в патенте США № 4342566. Расщепление антител под воздействием папаина обычно приводит к двум идентичным фрагментам, связывающимся с антигеном, называемым Fab-фрагментами, каждый из которых имеет отдельный антигенсвязывающий сайт и остаточный Fe-фрагмент. В результате воздействия пепсином получается фрагмент, который имеет два антигенкомбинирующих сайта и все еще способен к поперечной сшивке антигена.
Фрагменты антитела, как связанные с другими последовательностями, так и не связанные, могут также включать инсерции, делеции, замены или другие выбранные модификации конкретных участков или специфических аминокислотных остатков при условии, что активность фрагмента незначительно изменена или повреждена по сравнению с немодифицированным антителом или фрагментом антитела. Данные модификации могут внести некоторые дополнительные свойства, такие как добавление/удаление аминокислот, способных к дисульфидному связыванию, увеличение их биологической стойкости, изменение их секреторных характеристик и т.д. В любом случае фрагмент антитела должен обладать свойст- 34 037019 вом биоактивности, таким как активностью связывания, регуляцией связывания на связывающем домене и т.д. Функциональные или активные участки антитела могут быть идентифицированы при мутагенезе специфического участка белка с последующей экспрессией и контролем экспрессированного полипептида. Такие методы полностью очевидны для опытного специалиста данной области и могут включать сайт-специфический мутагенез нуклеиновой кислоты, кодирующей фрагмент антитела.
Антитела по изобретению могут далее включать гуманизированные антитела или человеческие антитела. Гуманизированные формы нечеловеческих (например, мышиных) антител - это химерные иммуноглобулины, иммуноглобулиновые цепи или их фрагменты (такие как Fv, Fab, Fab' или другие антигенсвязывающие субпоследовательности антител), которые содержат минимальную последовательность, полученную из нечеловеческого иммуноглобулина. Гуманизированные антитела включают человеческие иммуноглобулины (антитело-реципиент), в которых остатки из определяющего комплементарность участка (CDR) реципиента замещены остатками из CDR нечеловеческих видов (донорское антитело), таких как мыши, крысы или кролики, имеющими желаемую специфичность, аффинность и емкость. В некоторых случаях остатки Fv-каркаса (FR) человеческого иммуноглобулина замещены соответствующими нечеловеческими остатками. Гуманизированные антитела могут также включать остатки, которые не встречаются ни в антителе-реципиенте, ни в импортированном CDR или каркасных последовательностях. Как правило, гуманизированное антитело будет включать по сути все из по меньшей мере одного и, как правило, двух вариабельных доменов, в которых все или по существу все участки CDR соответствуют таковым из нечеловеческого иммуноглобулина, и все или по сути все из участков FR являются таковыми из консенсусной последовательности иммуноглобулина человека. Оптимально, чтобы гуманизированное антитело содержало также по меньшей мере часть константного участка иммуноглобулина (Fc), как правило, человеческого иммуноглобулина.
Способы гуманизации нечеловеческих антител хорошо известны из уровня техники. В целом, гуманизированное антитело имеет один или более аминокислотный остаток, введенный в него из источника, являющегося нечеловеческим. Такие нечеловеческие аминокислотные остатки называются часто импортированными остатками, которые обычно берутся из импортированного вариабельного домена. Гуманизация может быть по существу произведена посредством замены участков CDR или последовательностей CDR грызунов на соответствующие последовательности человеческого антитела. Соответственно, такие гуманизированные антитела являются химерными антителами (патент США № 4816567), где по существу менее чем один интактный человеческий вариабельный домен был заменен соответствующей последовательностью нечеловеческого вида. На практике гуманизированные антитела являются обычно человеческими антителами, в которых некоторые остатки CDR и, возможно, остатки FR заменены на остатки аналогичных сайтов антител грызунов.
Использоваться могут трансгенные животные (например, мыши), которые способны при иммунизации вырабатывать полный спектр человеческих антител при отсутствии выработки эндогенного иммуноглобулина. Например, было описано, что гомозиготная делеция гена участка присоединения тяжелой цепи антитела у химерных и мутантных мышей зародышевой линии приводит к полному ингибированию выработки эндогенных антител. Перенос генной матрицы иммуноглобулина клеток зародышевой линии человека в таких мутантных мышах зародышевой линии будет приводить к выработке человеческих антител с антигенной стимуляцией. Человеческие антитела могут быть также получены в библиотеках фагового дисплея.
Антитела по изобретению предпочтительно вводятся в субъект в фармацевтически приемлемом носителе. Подходящее количество фармацевтически приемлемой соли обычно используется в составе для усиления изотонности состава. Примеры фармацевтически приемлемых носителей включают физиологический раствор, раствор Рингера и раствор декстрозы. Уровень pH раствора составляет предпочтительно от около 5 до около 8 и более предпочтительно от около 7 до около 7,5. Кроме того, носители включают препараты пролонгированного высвобождения, такие как полупроницаемые матрицы твердых гидрофобных полимеров, содержащие антитело, матрицы которых имеют вид профилированных изделий, к примеру пленки, липосомы или микрочастицы. Для специалиста данной области будет очевидно, что определенные носители могут быть более предпочтительными в зависимости, например, от способа введения и концентрации вводимого антитела.
Антитела могут вводиться в субъект, пациенту или клетку посредством инъекции (например, внутривенно, внутрибрюшинно, подкожно, внутримышечно) или другими способами, такими как вливание, которое гарантирует доставку к кровотоку эффективным образом. Антитела также могут вводиться внутритуморальными или перитуморальными способами, чтобы вызвать локальные, а также и системные терапевтические эффекты. Предпочтительной является локальная или внутривенная инъекция.
Эффективная дозировка и график введения антител могут быть определены эмпирически, а принятие таковых решений под силу специалисту данной области. Специалистам данной области будет понятно, что дозировка антител, которые должны быть введены, будет варьироваться в зависимости, например, от субъекта, которому будет вводиться антитело, способа введения, конкретного типа используемого антитела и других вводимых медикаментов. Типичная дневная дозировка антитела, используемого отдельно, может варьироваться от около 1 мкг/кг вплоть до 100 мг/кг по весу тела или более в день, в
- 35 037019 зависимости от факторов, упоминаемых выше. После введения антитела для лечения рака желудка эффективность терапевтического антитела может быть оценена различными способами, известными компетентному специалисту данной области. Например, размер, количество и/или распределение рака желудка у субъекта, проходящего лечение, может контролироваться с помощью стандартных методов визуализации опухоли. Введенное в терапевтических целях антитело, которое блокирует рост опухоли, приводит к уменьшению размера и/или предотвращает развитие новых опухолей в сравнении с течением болезни, которое бы имело место без введения антитела, и является эффективным антителом для лечения раковых заболеваний.
Так как белки Abl1, ADAM10, AHR, CCND2, CDC6, CDK1, СЕАСАМ1, СЕАСАМ5, СЕАСАМ6, СЕАСАМ6, COL6A3, EIF2S3, LOC255308, ЕРНА2, ERBB2, ERBB3, F2R, FAR HMMR, HSP90B1, IGF2BP3, ITGB4, KIF2C, KRAS, LAMC2, LCN2, MET, MMP11, ММР12, MMP3, MST1R, NUF2, OLFM4, PROM1, RRM2, THY1, TMPRSS4, ТОР2А, TSPAN1, WNT5A, HIF1A и PTK2, как было показано, высокоэкспрессированы по меньшей мере в подвиде тканей рака желудка в сравнении с нормальными тканями, ингибирование их экспрессии может быть интегрировано в любую терапевтическую стратегию для лечения или профилактики рака желудка.
Принцип антисмысловой терапии основан на гипотезе, что последовательность-специфическое подавление генной экспрессии (посредством транскрипции или трансляции) может быть достигнуто при внутриклеточной гибридизации между геномной ДНК или мРНК и комплементарными антисмысловыми видами. Образование такого гибридного дуплекса нуклеиновых кислот интерферирует с транскрипцией геномной ДНК-мишени, кодирующей антиген, или процессингом/транспортом/трансляцией и/или стабильностью антигенной мРНК-мишени опухоли.
Антисмысловые нуклеиновые кислоты могут быть доставлены с использованием различных подходов. Например, антисмысловые олигонуклеотиды или антисмысловая РНК могут вводиться непосредственно (например, внутривенной инъекцией) в субъект в форме, которая позволяет поглощение опухолевыми клетками. Альтернативно, в клетки могут вводиться вирусные или плазмидные векторы in vivo, которые кодируют антисмысловую РНК (или фрагменты РНК). Антисмысловые эффекты также могут быть вызваны смысловыми последовательностями; однако степень фенотипических изменений крайне различна. Фенотипические изменения, индуцированные эффективной антисмысловой терапией, оценивались в соответствии с изменениями, например уровнями мРНК-мишени, уровнями белка-мишени и/или уровнями активности белка-мишени.
В конкретном примере ингибирование функции опухолевого маркера рака желудка с помощью генной терапии с применением антисмысловых конструкций может быть выполнено посредством прямого введения антисмыслового РНК-маркера рака желудка в субъект. Антисмысловой опухолевый РНКмаркер может быть получен и выделен с помощью любого стандартного метода, но наиболее просто его получить с помощью транскрипции in vitro с использованием антисмыслового опухолевого кДНКмаркера под контролем высокоэффективного промотора (например, Т7-промотора). Введение антисмыслового опухолевого РНК-маркера в клетки может быть произведено любым способом для прямого введения нуклеиновых кислот, описываемых ниже.
Альтернативная стратегия ингибирования функции MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 при использовании генной терапии включает внутриклеточную экспрессию антител к MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 или участка антител к MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6. Например, ген (или фрагмент гена), кодирующий моноклональное антитело, которое специфически связывается с полипептидом MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 и ингибирует его биологическую активность, помещают под транскрипционным контролем специфической (например, ткане- или опухоль-специфической) регуляторной последовательности генов внутрь вектора экспрессии нуклеиновой кислоты. Вектор вводится затем в субъект, так чтобы он поглощался клетками рака желудка или другими клетками, которые затем секретируют антитела к MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6 и, тем самым, блокируют биологическую активность полипептида MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6. Предпочтительно, если полипептиды MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 присутствуют на внеклеточной поверхности клеток рака желудка.
В способах, описываемых выше, которые включают введение и поглощение экзогенной ДНК в клетках субъекта (т.е. генную трансдукцию или трансфекцию), нуклеиновые кислоты по настоящему изобретению могут быть в форме обнаженной ДНК или же нуклеиновые кислоты могут быть в векторе для доставки нуклеиновых кислот к клеткам для ингибирования экспрессии белка-маркера желудочной опухоли. Вектор может представлять собой имеющийся в продаже препарат, такой как аденовирусный вектор (Quantum Biotechnologies, Inc. Laval, Квебек, Канада). Доставка нуклеиновой кислоты или вектора к клеткам может производиться посредством различных механизмов. Например, доставка может производиться с помощью липосомы с использованием имеющихся в продаже липосомных препаратов, таких как LIPOFECTIN, LIPOFECTAMINE (GIBCO-25 BRL, Inc., Gaithersburg, Md.), SUPERFECT (Qiagen, Inc. Хильден, Германия) и TRANSFECTAM (Promega Biotec, Inc., Madison, Wis.), в равной степени как и других липосом, разработанных в соответствии со стандартными процедурами уровня техники. Кроме того,
- 36 037019 нуклеиновая кислота или вектор в соответствии с настоящим изобретением могут быть доставлены in vivo посредством электропорации, технология для которой имеется в наличии в компании Genetronics,
Inc. (San Diego, штат Калифорния, США), в равной степени как и с помощью устройства
SONOPORATION machine (ImaRx Pharmaceutical Corp., Tucson, штат Аризона. США).
Одним из примеров является доставка вектора посредством вирусной системы, такой как ретровирусная векторная система, которая способна упаковывать рекомбинантный ретровирусный геном. Рекомбинантный ретровирус может быть затем использован для инфицирования и, таким образом, доставки в инфицированные клетки антисмысловой нуклеиновой кислоты, которая ингибирует экспрессию MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB или Muc6. Точный способ введения измененной нуклеиновой кислоты в клетки млекопитающего, разумеется, не ограничивается использованием ретровирусных векторов. Имеется широкий спектр других методик для данной процедуры, включая использование аденовирусных векторов, аденоассоциированных вирусных (AAV) векторов, лентивирусных векторов, псевдотипичных ретровирусных векторов. Также могут применяться методики физической трансдукции, такие как липосомная доставка и рецептор-опосредованные и другие эндоцитозные механизмы. Данное изобретение может быть использовано вместе с любым из этих или других, используемых обычно, способов генного переноса.
Антитела могут также применяться для диагностических анализов in vivo. Как правило, антитело помечают радионуклеотидом (таким как IHIn. 99Тс, 14С, 131I, 3Н, 32Р или 35S), так что опухоль может быть локализована с помощью иммуносцинтиграфии. В одном варианте осуществления антитела или их фрагменты связываются с внеклеточными доменами двух или более мишеней MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 при показателе аффинности (Kd) ниже чем 1x10 мкМ.
Антитела для диагностического применения могут помечаться зондами, подходящими для обнаружения различными способами визуализации. Способы обнаружения зондов включают, но без ограничения, флуоресценцию, свет, конфокальную и электронную микроскопию; магнитно-резонансную томографию и спректроскопии; флуороскопию, компьютерную томографию и позитронно-эмиссионную томографию. Подходящие зонды включают, но без ограничения, родамин, эозин и другие флуорофоры, радиоизотопы, золото, гадолиний и другие лантаноиды, парамагнитное железо, фтор-18 и другие позитронно-активные радионуклиды. Более того, зонды могут быть би- или мультифункциональными и обнаруживаться более чем одним из приведенных способов. Данные антитела могут быть помечены напрямую или опосредованно указанными зондами. Присоединение зондов к антителам включает ковалентное присоединение зонда, внедрение зонда в антитело и ковалентное присоединение комплексообразующего соединения для присоединения зонда, широко признанное среди прочих в данной области. Для иммуногистохимических исследований образец пораженной ткани может быть свежим или замороженным или может быть залит парафином и законсервирован таким консервантом, как формалин. Законсервированный или заделанный срез содержит образец, контактировавший с помеченным первичным антителом и вторичным антителом, где антитело используется для выявления экспрессии белков MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6 in situ.
В настоящем изобретении предложен, таким образом, пептид, включающий последовательность, которая выбирается из группы из SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95, или его вариант, который по меньшей мере на 85%, предпочтительно на 90% и более предпочтительно на 96% гомологичен SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95, или его вариант, который будет индуцировать Т-клеточную перекрестную реакцию с указанным пептидом.
Пептиды по изобретению обладают способностью связываться с молекулой главного комплекса гистосовместимости человека (MHC) класса I или II.
В контексте настоящего изобретения понятие гомологичный относится к степени идентичности между последовательностями двух аминокислотных последовательностей, т.е. пептидных или полипептидных последовательностей. Упоминавшееся ранее понятие гомология определяется при сравнении двух последовательностей, выравниваемых в оптимальных условиях со сравниваемыми последовательностями. Сравниваемые последовательности в контексте данного изобретения могут иметь инсерцию или делецию (например, разрыв и т.п.) в оптимальном выравнивании двух последовательностей. Такая гомология последовательности может быть подсчитана с помощью создания выравнивания, например, по алгоритму ClustalW. Широко распространено программное обеспечение для анализа последовательностей, в частности Vector NTI, GENETYX или аналитические инструменты, предоставляемые общественными банками данных.
Специалист данной области будет в состоянии оценить, будут ли Т-клетки, индуцированные вариантом специфического пептида, способны к перекрестной реакции с самим пептидом (Fong et al., 880914); (Zaremba et al., 1805-14; Colombetti et al., 2730-38; Аррау et al., 4570-77).
Вариантом данной аминокислотной последовательности авторы изобретения обозначают, что боковые цепи, например, одного или двух аминокислотных остатков изменены (например, при их замещении боковой цепью другого встречающегося в природе аминокислотного остатка или какой-либо другой боковой цепью), так что пептид по-прежнему способен связываться с молекулой HLA, по существу, таким же путем, как и пептид, состоящий из данной аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 1
- 37 037019 по 33. Например, пептид может быть модифицирован таким образом, что он по меньшей мере сохранит, если не улучшит, способность взаимодействовать и связываться со связывающей бороздкой подходящей молекулы MHC, такой как HLA-A*02 или -DR, и, таким образом, он по меньшей мере сохранит, если не улучшит, способность связываться с ТКР активированных ЦДЛ.
Данные ЦТЛ могут затем вступать в перекрестную реакцию с клетками и уничтожать клетки, которые экспрессируют полипептид, который содержит природную аминокислотную последовательность родственного пептида, как определено в аспектах этого изобретения. По информации из научной литературы (Rammensee et al., 1997) и банков данных (Rammensee et al., 213-19) конкретные позиции связывающихся с HLA пептидов являются типичными якорными остатками, формирующими ключевую последовательность, подходящую к связывающему мотиву рецептора HLA, который определяется полярными, электрофизическими, гидрофобными и пространственными свойствами полипептидных цепей, образующих связывающую бороздку. Так, специалист данной области будет в состоянии модифицировать аминокислотные последовательности, представленные в SEQ ID NO: 1 по 95, сохраняя известные якорные остатки, и будет в состоянии определить, сохранят ли такие варианты способность связываться с молекулами MHC I или II класса. Варианты настоящего изобретения сохраняют способность связываться с ТКР активированных ЦТЛ, которые могут впоследствии вступать в перекрестную реакцию и уничтожать клетки, экспрессирующие полипептид, который содержит природную аминокислотную последовательность родственного пептида, как определено в аспектах настоящего изобретения.
Те аминокислотные остатки, которые необязательно вносят вклад во взаимодействие с Т-клеточным рецептором, могут быть модифицированы заменой на другую аминокислоту, включение которой, по существу, не влияет на реактивность Т-клетки и не устраняет связывание с соответствующим MHC. Таким образом, помимо данного условия, пептид по изобретению может быть любым пептидом (в обозначение которого авторы изобретения включают олигопептиды или полипептиды), который включает аминокислотные последовательности, или их участок, или их вариант, как дано.
- 38 037019
Таблица 3
- 39 037019
Y | L | |||||||||||
Y | I | |||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
MST1R-001 | Код пептида | N | Y | L | L | Y | V | S | N | F | ||
SEQ ID 7 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
NFYB-001 | Код пептида | V | Y | т | Т | S | Y | Q | Q | I | ||
SEQ ID 8 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
F | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | F | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
SMC4-001 | Код пептида | Н | Y | к | Р | Т | Р | L | Y | F | ||
SEQ ID 9 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
UQCRB-001 | Код пептида | Y | Y | N | А | А | G | F | N | К | L | |
SEQ ID 10 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
PPAP2C-001 | Код пептида | А | Y | L | V | Y | Т | D | R | L | ||
SEQ ID 11 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F |
- 40 037019
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
AVL9-001 | Код пептида | F | Y | I | S | Р | V | N | К | L | ||
SEQ ID 12 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
NUF2-001 | Код пептида | V | Y | G | I | R | L | Е | Н | F | ||
SEQ ID 13 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ABL1-001 | Код пептида | т | Y | G | N | L | L | D | Y | L | ||
SEQ ID 14 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
MUC-006 | Код пептида | N | Y | Е | Е | Т | F | Р | Н | I | ||
SEQ ID 15 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
L | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | L | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ASPM-001 | Код пептида | R | Y | L | W | А | Т | V | Т | I | ||
SEQ ID 16 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
L | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | L | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
EPHA2-005 | Код пептида | V | Y | F | S | К | S | Е | Q | L |
- 41 037019
- 42 037019
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
COL6A3-001 | Код пептида | S | Y | L | Q | А | А | N | А | L | ||
SEQ ID 23 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
FANCI-001 | Код пептида | F | Y | Q | Р | К | I | Q | Q | F | ||
SEQ ID 24 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
RSP11-001 | Код пептида | Y | Y | К | N | I | G | L | G | F | ||
SEQ ID 25 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ATAD2-001 | Код пептида | А | Y | А | I | I | К | Е | Е | L | ||
SEQ ID 26 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ATAD2-003 | Код пептида | L | Y | Р | Е | V | F | Е | К | F | ||
SEQ ID 27 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 |
- 43 037019
HSP90B1-001 | Код пептида | К | Y | N | D | Т | F | W | К | Е | F | |
SEQ ID 28 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
SIAH2-001 | Код пептида | V | F | D | Т | А | I | А | Н | L | F | |
SEQ ID 29 | Варианты | Y | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
Y | L | |||||||||||
Y | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
SLC6A6-001 | Код пептида | V | Y | Р | N | W | А | I | G | L | ||
SEQ ID 30 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
IQGAP3-001 | Код пептида | V | Y | К | V | V | G | N | L | L | ||
SEQ ID 31 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ERBB3-001 | Код пептида | V | Y | I | Е | К | N | D | К | L | ||
SEQ ID 32 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
KIF2C-001 | Код пептида | I | Y | N | G | К | L | F | D | L | L | |
SEQ ID 33 | Варианты | F | ||||||||||
F |
- 44 037019
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
I Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
CDC2-001 | Код пептида | L | Y | Q | I | L | Q | G | I | V | F | |
SEQ ID 1 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ASPM-002 | Код пептида | S | Y | N | Р | L | W | L | R | I | ||
SEQ ID 2 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
F | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | F | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
UCHL5-001 | Код пептида | N | Y | L | Р | F | I | М | Е | L | ||
SEQ ID 3 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
MET-006 | Код пептида | S | Y | I | D | V | L | Р | Е | F | ||
SEQ ID 4 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
PROM-001 | Код пептида | S | Y | I | I | D | Р | L | N | L | ||
SEQ ID 5 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I |
- 45 037019
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
MMP11-001 | Код пептида | V | W | S | D | V | Т | Р | L | Т | F | |
SEQ ID 6 | Варианты | Y | ||||||||||
F | ||||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
Y | L | |||||||||||
Y | I | |||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
MST1R-001 | Код пептида | N | Y | L | L | Y | V | S | N | F | ||
SEQ ID 7 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
NFYB-001 | Код пептида | V | Y | т | Т | S | Y | Q | Q | I | ||
SEQ ID 8 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
F | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | F | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
SMC4-001 | Код пептида | Н | Y | к | Р | Т | Р | L | Y | F | ||
SEQ ID 9 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
UQCRB-001 | Код пептида | Y | Y | N | А | А | G | F | N | К | L | |
SEQ ID 10 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I |
- 46 037019
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
PPAP2C-001 | Код пептида | А | Y | L | V | Y | Т | D | R | L | ||
SEQ ID 11 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
AVL9-001 | Код пептида | F | Y | I | S | Р | V | N | К | L | ||
SEQ ID 12 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
NUF2-001 | Код пептида | V | Y | G | I | R | L | Е | Н | F | ||
SEQ ID 13 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ABL1-001 | Код пептида | т | Y | G | N | L | L | D | Y | L | ||
SEQ ID 14 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
MUC-006 | Код пептида | N | Y | Е | Е | Т | F | Р | Н | I | ||
SEQ ID 15 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
L | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | L | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ASPM-001 | Код пептида | R | Y | L | W | А | Т | V | Т | I | ||
SEQ ID 16 | Варианты | F |
- 47 037019
F | ||||||||||||
L | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | L | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
EPHA2-005 | Код пептида | V | Y | F | S | К | S | Е | Q | L | ||
SEQ ID 17 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
MMP3-001 | Код пептида | V | F | I | F | К | G | N | Q | F | ||
SEQ ID 18 | Варианты | Y | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
Y | L | |||||||||||
Y | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
NUF2-002 | Код пептида | R | F | L | S | G | I | I | N | F | ||
SEQ ID 19 | Варианты | Y | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
Y | L | |||||||||||
Y | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
PLK4-001 | Код пептида | Q | Y | А | S | R | F | V | Q | L | ||
SEQ ID 20 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ATAD2-002 | Код пептида | К | Y | L | Т | V | К | D | Y | L | ||
SEQ ID 21 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F |
- 48 037019
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
COL12A1-001 | Код пептида | V | Y | N | Р | Т | Р | N | S | L | ||
SEQ ID 22 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
COL6A3-001 | Код пептида | S | Y | L | Q | А | А | N | А | L | ||
SEQ ID 23 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
FANCI-001 | Код пептида | F | Y | Q | Р | К | I | Q | Q | F | ||
SEQ ID 24 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
RSP11-001 | Код пептида | Y | Y | К | N | I | G | L | G | F | ||
SEQ ID 25 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ATAD2-001 | Код пептида | А | Y | А | I | I | К | Е | Е | L | ||
SEQ ID 26 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ATAD2-003 | Код пептида | L | Y | Р | Е | V | F | Е | К | F |
- 49 037019
SEQ ID 27 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
HSP90B1-001 | Код пептида | К | Y | N | D | Т | F | W | К | Е | F | |
SEQ ID 28 | Варианты | F | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | L | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | ||
SIAH2-001 | Код пептида | V | F | D | Т | А | I | А | Н | L | F | |
SEQ ID 29 | Варианты | Y | ||||||||||
L | ||||||||||||
I | ||||||||||||
Y | L | |||||||||||
Y | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
SLC6A6-001 | Код пептида | V | Y | Р | N | W | А | I | G | L | ||
SEQ ID 30 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
IQGAP3-001 | Код пептида | V | Y | К | V | V | G | N | L | L | ||
SEQ ID 31 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I | |||||||||||
Позиция | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | |||
ERBB3-001 | Код пептида | V | Y | I | Е | К | N | D | К | L | ||
SEQ ID 32 | Варианты | F | ||||||||||
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
KIF2C-001 SEQ ID 33 | Код пептида Варианты | Позиция | 1 I | LL LL С\| >- LL | 3 N | 4 G | 5 К | 6 L | 7 F | со Q | F I 9 L | 10 L |
F | ||||||||||||
I | ||||||||||||
F | F | |||||||||||
F | I |
Более длинные пептиды также могут быть пригодными. Также возможно, чтобы эпитопы MHC I класса, хотя они обычно имеют длину между 8-11 аминокислотами, генерировались при процессинге пептидов из более длинных пептидов или белков, включающих истинный эпитоп. Предпочтительно, чтобы остатки, которые примыкают к истинному эпитопу, по существу, не влияли на протеолитическое расщепление, необходимое для выявления истинного эпитопа во время процессинга.
Соответственно, в настоящем изобретении предложены также пептиды и варианты эпитопов MHC класса I, в которых указанный пептид или вариант имеет общую длину от 8 до 100, предпочтительно от 8 до 30 и наиболее предпочтительно от 8 до 14, а именно 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 аминокислот.
Разумеется, пептид или вариант в соответствии с настоящим изобретением будет обладать способностью связываться с молекулой главного комплекса гистосовместимости человека (MHC) I класса. Свя- 50 037019 зывание пептида или варианта с комплексом MHC может быть проверено способами, известными из уровня техники.
В особенно предпочтительном варианте осуществления изобретения пептид состоит или по существу состоит из аминокислотной последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95.
Состоящий по существу из подразумевает, что пептид в соответствии с настоящим изобретением, помимо последовательности в соответствии с любой из SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95 или одним из их вариантов, содержит дополнительные находящиеся на N- и/или С-конце фрагменты аминокислот, которые не являются по существу формирующими часть пептида, которая функционирует как эпитоп для эпитопа молекул MHC.
Тем не менее, эти фрагменты могут быть важны для обеспечения эффективного введения пептида в соответствии с настоящим изобретением в клетки. В одном варианте осуществления настоящего изобретения пептид является слитым белком, который включает, например, 80 N-терминальных аминокислот HLA-DR антиген-ассоциированной инвариантной цепи (p33, в дальнейшем Ii), как взятый из банка данных NCBI, инвентарный номер - GenBank Accession-number X00497.
Кроме того, пептид или вариант может быть далее модифицирован для улучшения стабильности и/или связывания с молекулами MHC в целях получения более сильного иммунного ответа. Методы для такой оптимизации пептидной последовательности хорошо известны из уровня техники и включают, например, введение реверсированных пептидных или непептидных связей.
В реверсированной пептидной связи аминокислотные остатки присоединены непептидными связями (-CO-NH-), а пептидная связь реверсируется. Такие ретро-инвертированные пептидомиметики могут быть получены методами, известными из уровня техники, например, такими, как описано в работе Meziere et al., (1997), J. Immunol. 159, 3230-3237, включенной в описание путем ссылки. Этот принцип охватывает получение псевдопептидов, содержащих изменения, которые охватывают остов, но не ориентацию боковых цепей. Meziere et al., (1997) показывают, что эти псевдопептиды пригодны для связывания с MHC и ответов Т-хелперных клеток. Ретро-инвертированные пептиды, которые содержат связи NH-CO вместо пептидных связей CO-NH, намного более устойчивы к протеолизу.
Непептидной связью, являются, например, -CH2-NH, -CH2S-, -CH2CH2-, -СН=СН-, -СОСН2-, -СН(ОН)СН2- и -CH2SO-. В патенте США № 4897445 предложен способ твердофазного синтеза непептидных связей (-CH2-NH) в полипептидных цепях, которые включают полипептиды, синтезированные с использованием стандартной методики, и непептидную связь, синтезированную при реакции аминоальдегида и аминокислоты в присутствии NaCNBH3.
Пептиды, включающие последовательности, описанные выше, могут быть синтезированы с дополнительными химическими группами, находящимися на их аминном и/или карбоксильном концах, для увеличения стабильности, биологической доступности и/или аффинности пептидов. Например, гидрофобные группы, такие как карбобензоксильные, дансильные или трет-бутилоксикарбонильные группы, могут быть добавлены к аминоконцам пептидов. Подобным образом, ацетильная группа или 9-фторенилметокси-карбонильная группа может быть введена в аминные концы пептидов. Кроме того, гидрофобная группа, трет-бутилоксикарбонильная или амидная группа может быть добавлена к карбоксильным концам пептидов.
Далее, все пептиды по изобретению могут быть синтезированы в целях изменения их пространственной конфигурации. Например, может быть использован D-изомер одного или более аминокислотных остатков пептида, а не обычный L-изомер. Более того, по меньшей мере один из аминокислотных остатков пептидов по изобретению может быть замещен одним из хорошо известных не встречающихся в природе аминокислотных остатков. Изменения, такие как данные, могут служить для повышения стабильности, биологической доступности и/или связывающих свойств пептидов по изобретению.
Подобным образом, пептид или вариант по изобретению может быть модифицирован химическим способом посредством реакции отдельных аминокислот как до, так и после синтеза пептида. Примеры таких модификаций хорошо известны из уровня техники и обобщаются, например, в работе R. Lundblad, Chemical Reagents for Protein Modification, 3rd ed. CRC Press, 2005, которая включена в описание путем ссылки. Химическая модификация аминокислот включает, но без ограничения, модификацию с помощью ацилирования, амидинирование, пиридоксилирование лизина, восстановительное алкилирование, тринитробензилирование аминных групп 2,4,6-тринитробензолсульфоновой кислотой (TNBS), амидную модификацию карбоксильных групп и сульфгидрильную модификацию с помощью окисления надмуравьиной кислотой цистеина до цистеиновой кислоты, образование ртутных производных, образование смешанных дисульфидов с другими тиоловыми соединениями, реакцию с малеимидом, карбоксиметилирование йодоуксусной кислотой или йодацетамидом и карбамоилирование цианатом при щелочном уровне pH, хотя не ограничиваясь ими. В этой связи специалист данной области может проконсультироваться с главой 15 в Current Protocols In Protein Science, Eds. Coligan et al., (John Wiley & Sons NY 19952000) для получения более обширной информации о методах, связанных с химической модификацией белков.
Вкратце, модификация, например, остатков аргинила в белках часто основана на реакции вицинальных дикарбонильных соединений, таких как фенилглиоксаль, 2,3-бутандион и 1,2-циклогександион,
- 51 037019 с образованием аддукта. Другим примером является реакция метилглиоксаля с остатками аргинина. Цистеин может быть модифицирован без сопутствующей модификации других нуклеофильных сайтов, таких как лизин и гистидин. В результате для модификации цистеина доступно большое число реагентов.
Веб-сайты компаний, таких как Sigma-Aldrich (http://www.sigma-aldrich.com), предоставляют информацию по специфическим веществам.
Также распространена селективная редукция дисульфидных связей в белках. Дисульфидные связи могут быть образованы и окислены во время тепловой обработки биофармацевтических средств.
K-реагент Вудворда может использоваться для модификации специфических остатков глютаминовой кислоты. N-(3-(Диметиламинопропил)-N-этилкарбодиимид может использоваться для образования внутримолекулярных поперечных связей между остатком лизина и остатком глютаминовой кислоты.
Например, диэтилпирокарбонат является реагентом для модификации остатков гистидила в белках. Гистидин может также быть модифицирован при использовании 4-гидрокси-2-ноненала.
Реакция остатков лизина и других α-аминных групп полезна, например, при связывании пептидов с поверхностями или поперечной сшивке (кросс-линкинг) белков/пептидов. Лизин является сайтом присоединения поли(этилен)гликоля и основным сайтом модификации при гликозилировании белков.
Остатки метионина в белках могут быть модифицированы с помощью, например, йодацетамида, бромэтиламина и хлорамина Т.
Тетранитрометан и N-ацетилимидазол могут быть использованы для модификации остатков тирозила. Поперечная сшивка через образование дитирозина может быть произведена с ионами перекиси водорода/меди.
В последних исследованиях по модификации триптофана используются N-бромсукцинимид, 2-гидрокси-5-нитробензилбромид или 3-бром-3-метил-2-(2-нитрофенилмеркаnmо)-3H-индол (BPNSскатол).
Успешная модификация терапевтических белков и пептидов с PEG (полиэтиленгликолем) часто связана с увеличением полупериода циркуляции при поперечной сшивке белков с глутаральдегидом, полиэтиленгликоль-диакрилатом и формальдегидом используется для получения гидрогелей. Химическая модификация аллергенов для иммунотерапии часто достигается при карбамоилировании цианатом калия.
Пептид или вариант, в котором пептид модифицирован или включает непептидные связи, является предпочтительным вариантом осуществления изобретения. Как правило, пептиды и варианты (по меньшей мере те, что содержат пептидные связи между аминокислотными остатками) могут быть синтезированы Fmoc-полиамидным способом твердофазного пептидного синтеза, как раскрыто у Lu et al. (1981) и в прилагающихся ссылках. Временная защита N-аминогруппы производится группой 9-флуоренилметилоксикарбонил (Fmoc). Повторное расщепление этой высокощелоче-лабильной защитной группы осуществляется при использовании 20% пиперидина в N,N-диметилформамиде. Функциональности боковой цепи могут быть защищены как их бутиловые эфиры (в случае серинтреонина и тирозина), бутиловые сложные эфиры (в случае глютаминовой кислоты и аспарагиновой кислоты), бутилоксикарбониловое производное (в случае лизина и гистидина), тритиловое производное (в случае цистеина) и производное 4-метокси-2,3,6-триметилбензолсульфонила (в случае аргинина). Где глютамин или аспарагин являются С-терминальными остатками, для защиты функциональности боковой амидо-цепи используется 4,4'-диметоксибензгидрильная группа. Твердофазный носитель основан на полимере полидиметилакриламида, состоящем из трех мономеров: диметилакриламида (остов-мономер), бисакрилоилэтилендиамина (кросс-линкер) и метилового эфира акрилоилсаркозина (функционализирующий агент). Использованным агентом с расщепляемым соединением пептид-смола является кислотнолабильное производное 4-гидроксиметилфеноксиуксусной кислоты. Все аминокислотные производные добавляются как их преформированные симметричные ангидридные производные за исключением аспарагина и глютамина, которые добавляются с применением метода обратного соединения, опосредованного N,N-дициклогексилкарбодиимид/1-гидроксибензотриазолом. Все реакции сочетания и снятия защитных групп отслеживались с помощью нингидрина, тринитробензолсульфоновой кислоты или технологии контроля изотином. После завершения синтеза пептиды отщепляются от смолы-носителя сопутствующим удалением защитных групп боковой цепи при обработке 95% трифторуксусной кислотой, содержащей 50% поглотителя примесей. Обычно используемые поглотители включают этандитиол, фенол, анизол и воду, окончательный выбор зависит от составляющих аминокислот синтезируемого пептида. Также возможна комбинация твердофазных и жидкофазных методов для синтеза пептидов (см., например, Bruckdorfer, Marder и Albericio et al., 29-43 и прилагаемые ссылки).
Трифторуксусную кислоту удаляют выпариванием в вакууме с последующим измельчением с диэтиловым эфиром для получения сырого пептида. Любые представленные поглотители удаляются простой технологией экстракции, которая при лиофилизации водной фазы позволяет получить сырой пептид без поглотителей. Реагенты для синтеза пептидов, как правило, имеются в наличии, например, в Calbiochem-Novabiochem (Великобритания) Ltd, Ноттингхэм, NG7 2QJ, Великобритания.
Очистка может быть произведена любой методикой или комбинацией таких методик, как рекристаллизация, эксклюзионная (по размеру) хроматография, ионообменная хроматография, хроматография
- 52 037019 гидрофобного взаимодействия и (обычно) обращенно-фазовая высокоэффективная жидкостная хроматография с использованием, к примеру, градиентного разделения в системе ацетонитрил/вода.
Анализ пептидов может быть произведен при использовании тонкослойной хроматографии, электрофореза, в частности капиллярного электрофореза, твердофазной экстракции (ТФЭ), обращеннофазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии, аминокислотного анализа после кислотного гидролиза и масс-спектрометрического анализа при бомбардировке быстрыми атомами (FAB), a также масс-спектрометрического анализа MALDI и ESI-Q-TOF.
В еще одном аспекте изобретения предлагается нуклеиновая кислота (например, полинуклеотид), кодирующая пептид или вариант пептида по изобретению. Полинуклеотид может быть, например, ДНК, кДНК, ПНК, ЦНК, РНК или их комбинациями, как одно-, так и/или двухнитевыми; природными или стабилизированными формами полинуклеотидов, таких как, например, полинуклеотиды с фосфоротиоатным остовом, и может содержать или не содержать интроны при условии, что полинуклеотид кодирует пептид. Разумеется, только пептиды, которые содержат встречающиеся в природе аминокислотные остатки, присоединенные встречающимися в природе пептидными связями, могут кодироваться полинуклеотидом. Еще в одном аспекте изобретения предложен вектор экспрессии, способный экспрессировать полипептид в соответствии с изобретением.
Был разработан ряд способов для связывания полинуклеотидов, в особенности ДНК, с векторами, например, с помощью дополнительных липких концов. К примеру, в сегмент ДНК могут быть добавлены дополнительные гомополимерные участки для внесения в вектор ДНК. Вектор и сегмент ДНК в таком случае соединены водородной связью между дополнительными гомополимерными концевыми участками, образуя рекомбинантные молекулы ДНК.
Синтетические линкеры, содержащие один или несколько сайтов рестрикции, обеспечивают альтернативный способ присоединения сегмента ДНК к векторам. Синтетические линкеры, содержащие ряд сайтов рестрикционной эндонуклеазы, имеются в продаже в различных источниках, включая International Biotechnologies Inc, New Haven, CN, США.
Желаемый способ модификации ДНК, кодирующей полипептид по изобретению, - это использование цепной реакции полимеразы, как раскрыто в работе (Saiki et al., (487-91)). Этот метод может быть использован для введения ДНК в подходящий вектор, например, при конструировании в подходящих сайтах рестрикции или же он может быть использован для модификации ДНК другими пригодными путями, известными из уровня техники. Если используются векторы, то предпочтительными являются оспенные или аденовирусные векторы.
Затем ДНК (или в случае ретровирусных векторов РНК) может экспрессироваться в подходящего хозяина для получения полипептида, включающего пептид или вариант по изобретению. Таким образом, ДНК, кодирующая пептид или вариант по изобретению, может быть использована в соответствии с известными техниками, модифицированная соответствующим образом с учетом раскрытых в данном описании идей, для создания вектора экспрессии, который затем используется для трансформации подходящей клетки-хозяина для экспрессии и получения полипептида по изобретению. Такие техники включают те, что раскрыты в патентах США № 4440859, 4530901, 4582800, 4677063, 4678751, 4704362, 4710463, 4757006, 4766075 и 4810648.
ДНК (или в случае ретровирусных векторов - РНК), кодирующая полипептид, представляющий собой соединение по изобретению, может быть присоединена к обширному ряду других последовательностей ДНК для введения в адекватного хозяина. ДНК-спутник будет зависеть от природы хозяина, способа введения ДНК хозяину и от того, желательно ли поддержание в эписомальной или интеграционной форме.
Как правило, ДНК вводится в вектор экспрессии, такой как плазмида, с соответствующей ориентацией и правильной рамкой считывания экспрессии. Если необходимо, то ДНК может быть соединена с адекватными нуклеотидными последовательностями, обеспечивающими координацию транскрипции и трансляции, распознаваемыми желательным хозяином, хотя такие контрольные элементы обычно имеются в векторе экспрессии. Вектор вводится затем хозяину стандартными способами. Как правило, не все хозяева трансформируются вектором. Поэтому будет необходимо выбрать трансформированные клетки-хозяева. Одна из техник отбора включает введение в вектор экспрессии последовательности ДНК с любыми необходимыми элементами контроля, которая кодирует выбранный признак в трансформированной клетке, такой как устойчивость к антибиотикам.
В качестве альтернативы ген для такого выбираемого признака может быть на другом векторе, который используется для котрансформации желаемой клетки-хозяина.
Клетки-хозяева, которые были трансформированы рекомбинантной ДНК по изобретению, культивируют затем в течение достаточного времени и при адекватных условиях, известных специалистам данной области, с учетом раскрытых в данном описании идей, что ведет к экспрессии полипептида, который после этого может быть выделен.
Известно множество систем экспрессии, включающих бактерии (например, Е.coli и Bacillus subtilis), дрожжи (например, Saccharomyces cerevisiae), мицелиальные грибы (например, Aspergillus spec), растительные клетки, клетки животных и насекомых. Предпочтительно, чтобы система была клетками млеко- 53 037019 питающих, такими как клетки СНО, имеющимися в наличии в АТСС Cell Biology Collection.
Типичная клеточная векторная плазмида млекопитающих для конститутивной экспрессии включает промотор CMV или SV40 с подходящим концевым участком поли-А и маркером устойчивости, таким как неомицин. Одним примером является pSVL, имеющимся в наличии в Pharmacia, Piscataway, NJ, США. Примером индуцируемого вектора экспрессии млекопитающих является pMSG, имеющийся также в наличии в Pharmacia. Пригодными плазмидными векторами дрожжей являются pRS403-406 и pRS413-416, и они, как правило, имеются в наличии в Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA 92037, США. Плазмиды pRS403, pRS404, pRS405 и pRS406 являются дрожжевыми интегрирующими плазмидами (YIps) и включают дрожжевые селектируемые маркеры HIS3, TRP1, LEU2 и URA3. Плазмиды pRS413-416 являются дрожжевыми центромерными плазмидами (Ycps). Основанные на промоторе CMV векторы (например, из Sigma-Aldrich) обеспечивают кратковременную или устойчивую экспрессию, цитоплазмическую экспрессию или секрецию и N-терминальную или С-терминальную маркировку в различных комбинациях FLAG, 3xFLAG, c-myc или МАТ. Данные слитые белки позволяют выявление, очистку и анализ рекомбинантного белка. Слияния с двойной меткой обеспечивают гибкость при выявлении.
Сильный промоторный регуляторный участок цитомегаловируса человека (CMV) стимулирует конститутивные уровни белковой экспрессии, достигающие 1 мг/л в клетках COS. Для менее активных клеточных линий белковые уровни обычно составляют ~0,1 мг/л. Присутствие точки начала репликации SV40 будет приводить к высоким уровням репликации ДНК в подверженных репликации SV40 клетках COS. Векторы CMV, например, могут содержать точку начала для репликации рМВ1 (производное pBR322) в бактериальных клетках, ген b-лактамазы для отбора устойчивости к ампициллину у бактерий, hGH polyA и точку начала f1 Векторы, содержащие лидерную последовательность препротрипсина (РРТ), могут направлять секрецию слитых белков FLAG в культуральную среду для очистки с использованием антител ANTI-FLAG, смол и чашек. Другие векторы и системы экспрессии для применения с различными клетками-хозяевами хорошо известны из уровня техники.
Настоящее изобретение относится также к клетке-хозяину, трансформированной с помощью полинуклеотидной векторной конструкции настоящего изобретения. Клетка-хозяин может быть как прокариотической, так и эукариотической. Бактериальные клетки могут быть предпочтительно прокариотическими клетками-хозяевами при некоторых условиях и обычно являются штаммом Е. coli, таким как, например, Е. coli штамма DH5, имеющимся в наличии в Bethesda Research Laboratories Inc., Bethesda, MD, США, и RR1, имеющимся в наличии в Американской коллекции типов культур (American Type Culture Collection (АТСС)), Rockville, MD, США (№ АТСС 31343). Предпочтительные эукариотические клеткихозяева включают дрожжи, клетки насекомых и млекопитающих, предпочтительно клетки позвоночных, таких как мышь, крыса, обезьяна или человеческие фибробластные клетки и клеточные линии толстого кишечника. Дрожжевые клетки-хозяева включают YPH499, YPH500 и YPH501, которые, как правило, имеются в наличии в Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA 92037, США. Предпочтительные клеткихозяева млекопитающих включают клетки яичника китайского хомяка (СНО), имеющиеся в наличии в АТСС как CCL61, NIH эмбриональные клетки швейцарской мыши NIH/3T3, имеющиеся в наличии в АТСС как CRL 1658, почечные клетки обезьяны COS-1, имеющиеся в наличии в АТСС как CRL 1650 и клетки 293, являющиеся эмбриональными клетками печени человека. Предпочтительными клетками насекомых являются клетки Sf9, которые могут трансфицироваться с помощью бакуловирусных векторов экспрессии. Обзор в отношении выбора подходящих клеток-хозяев для экспрессии представлен, например, в пособии авторов Paulina Balbas и Argelia Lorence Methods in Molecular Biology Recombinant Gene Expression, Reviews and Protocols, часть первая, второе издание, ISBN 978-1-58829262-9, и другой литературе, известной специалисту данной области.
Трансформация адекватных клеток-хозяев с помощью модели ДНК настоящего изобретения производится при помощи хорошо известных способов, которые обычно зависят от типа используемого вектора. Относительно трансформации прокариотических клеток-хозяев см., например, работу Cohen et al., (1972), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 69, 2110 и Sambrook et al., (1989), Molecular Cloning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Нью-Йорк. Трансформация дрожжевых клеток описывается в работе Sherman et al., (1986), Methods In Yeast Genetics, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, Нью-Йорк. Также подходит метод Бигса (Beggs) (1978), Nature, 275,104-109. Что касается клеток позвоночных, то подходящие для трансфекции таких клеток реагенты, например фосфат кальция и DEAE-декстран или липосомальные составы, имеются в наличии в Stratagene Cloning Systems или Life Technologies Inc., Gaithersburg, MD 20877, США. Электропорация также подходит для трансформации и/или трансфекции клеток и хорошо известна из уровня техники для трансформации дрожжевых клеток, бактериальных клеток, клеток насекомых и клеток позвоночных.
Успешно трансформированные клетки, т.е. клетки, которые содержат конструкцию ДНК настоящего изобретения, могут быть идентифицированы хорошо известными способами, такими как ПЦР. Альтернативно, наличие белка в супернатанте может выявляться с применением антител.
Следует понимать, что некоторые клетки-хозяева по изобретению подходят для получения пептидов по изобретению, например бактериальные, дрожжевые клетки и клетки насекомых. Тем не менее
- 54 037019 другие клетки-хозяева могут быть пригодны в конкретных терапевтических методах. Например, антигенпрезентирующие клетки, такие как дендритные клетки, могут с пользой быть использованы для экспрессии пептидов по изобретению так, что их можно будет нагружать на подходящие молекулы MHC.
Таким образом, в настоящем изобретении предложена клетка-хозяин, включающая нуклеиновую кислоту или вектор экспрессии в соответствии с изобретением.
В предпочтительном варианте осуществления клетка-хозяин является антигенпрезентирующей клеткой, в частности дендритной клеткой или антигенпрезентирующей клеткой. Для АПК, нагруженных рекомбинантным слитым белком, содержащим простатическую кислую фосфатазу (PAP), сейчас проводятся исследования в целях лечения рака предстательной железы (Sipuleucel-T) (Small E.J. et al., 67-74; Rini et al., 3089-94).
В другом аспекте изобретения предложен способ получения пептида или его варианта; причем способ включает культивацию клетки-хозяина и выделение пептида из клетки-хозяина или его культуральной среды.
В другом варианте осуществления пептид, нуклеиновая кислота или вектор экспрессии по изобретению используются в медицине. Например, пептид или его вариант может приготавливаться для внутривенной (i.v.) инъекции, подкожной (s.с.) инъекции, внутрикожной (i.d.) инъекции, внутрибрюшинной (i.p.) инъекции, внутримышечной (i.m.) инъекции. Предпочтительные способы введения пептидной инъекции включают s.c., i.d., i.p., i.m. и i.v. Предпочтительные способы введения инъекции ДНК включают i.d., i.m., s.c., i.p. и i.v. Вводиться могут, к примеру, дозы, объемом между 50 мкг и 1,5 мг, предпочтительно от 125 до 500 мкг пептида или ДНК и будут зависеть от соответствующего пептида или ДНК. Дозировка в данных пределах успешно использовалась в предыдущих клинических исследованиях (Brunsvig et al., 1553-64; Staehler et al., 2007).
Другой аспект настоящего изобретения включает способ получения активированных Т-клеток in vitro, причем способ включает контактирование Т-клеток in vitro с нагруженными антигеном молекулами MHC I или II класса человека, экспрессированными на поверхности подходящей антигенпрезентирующей клетки на период времени, достаточный для активации антигенспецифическим образом Т-клетки, где антиген является пептидом в соответствии с изобретением. Предпочтительно, если достаточное количество антигена применяется с антигенпрезентирующей клеткой.
Предпочтительно, если в клетке млекопитающих не имеется или имеется пониженный уровень или недостаточная функция пептидного транспортера ТАР. Подходящие клетки, в которых нет пептидного транспортера ТАР, включают Т2, RMA-S и клетки дрозофилы. ТАР - это транспортер, связанный с процессингом антигена.
Не способная нагружать пептидом клеточная линия Т2 человека имеется в наличии в American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852, США под каталоговым № CRL 1992; клеточная линия дрозофилы линия Schneider 2 имеется в наличии в АТСС под каталоговым № CRL 19863; клеточная линия мыши RMA-S описывается в работе Karre et al., 1985.
Предпочтительно, если указанная клетка-хозяин до трансфекции, по существу, не экспрессирует молекулы MHC I класса. Также предпочтительно, если клетка-стимулятор экспрессирует молекулу, важную для обеспечения сигнала костимуляции для Т-клеток, такую как любая из В7.1, В7.2, ICAM-1 и LFA 3. Последовательности нуклеиновых кислот многочисленных молекул MHC I класса и костимуляторных молекул общедоступны в банках данных GenBank и EMBL.
Аналогично, в случае использования эпитопа MHC I класса в качестве антигена, Т-клетки являются CD8-положительными ЦТЛ.
Если антигенпрезентирующая клетка трансфицирована для экспрессии такого эпитопа, то предпочтительно, чтобы клетка включала вектор экспрессии, способный экспрессировать пептид, содержащий SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 95 или их вариантную аминокислотную последовательность.
Для получения ЦТЛ in vitro могут быть использованы многие другие способы. Например, в способах, описанных в работах Peoples et al., (1995) и Kawakami et al., (1992), используются аутологичные опухоль-инфильтрующие лимфоциты при полуении ЦТЛ. Plebanski et al., (1995) для получения ЦТЛ используют аутологичные лимфоциты периферической крови (ЛПК). Jochmus et al., (1997) описывают получение аутологичных ЦТЛ посредством нагрузки пептидом или полипептидом на дендритны клеток или посредством инфицирования рекомбинантным вирусом. Hill et al., (1995) и Jerome et al., (1993) для получения аутологичных ЦТЛ используют В-клетки. Кроме того, для получения аутологичных ЦТЛ могут быть использованы макрофаги, нагруженные, пептидом или полипептидом или инфицированные рекомбинантным вирусом. S. Walter et al., (2003) описывают прайминг Т-клеток in vitro с использованием искусственных антигенпрезентирующих клеток (аАПК), что является также подходящим способом получения Т-клеток против выбранного пептида. В данном исследовании аАПК были получены при соединении преформированных комплексов MHC-пептид с поверхностью полистироловых частиц (микросферы) с помощью биохимического способа с биотином-стрептавидином. Данная система допускает точный контроль плотности MHC на аАПК, который позволяет селективно вызвать высоко- или низкоавидные антигенспецифические Т-клеточные ответы с высокой эффективностью в пробах крови. Кроме комплексов MHC-пептид аАПК должны нести другие белки с костимуляторной активностью, такие как
- 55 037019 антитела к CD28, соединенные с их поверхностью. Кроме того, такая основанная на аАПК система часто требует добавления соответствующих растворимых факторов, к примеру цитокинов, таких как интерлейкин-12.
При получении Т-клеток могут быть также использованы аллогенные клетки, и способ для этого подробно описывается в патентной заявке WO 97/26328, включенной в контекст путем ссылки. Например, кроме клеток дрозофилы и Т2-клеток, для презентации антигенов могут использоваться другие клетки, такие как клетки яичника китайского хомяка (СНО), бакуловирус-инфицированные клетки насекомых, бактерии, дрожжи, инфицированные осповакциной клетки-мишени. Кроме того, могут быть использованы растительные вирусы (см., например, работу Porta et al., (1994), в которой описывается развитие мозаичного вируса китайской вигны как высокопродуктивная система для презентации чужеродных пептидов).
Активированные Т-клетки, которые направлены против пептидов по изобретению, пригодны для терапии. Таким образом, в другом аспекте изобретения предложены активированные Т-клетки, получаемые вышеупомянутыми способами по изобретению.
Активированные Т-клетки, полученные с помощью приведенного выше способа, будут селективно распознавать клетку, которая аберрантно экспрессирует полипептид, включающий аминокислотную последовательность с SEQ ID NO: 1 по 95.
Предпочтительно, чтобы Т-клетка распознавала клетку при взаимодействии посредством ее ТКР с комплексом HLA/пептид (например, соединение). Т-клетки пригодны для способа уничтожения клетокмишеней у пациента, клетки-мишени которого аберрантно экспрессируют полипептид, включающий аминокислотную последовательность по изобретению, где пациенту вводится эффективное число активированных Т-клеток. Т-клетки, которые введены пациенту, могут быть получены от пациента и активироваться, как описывалось выше (т.е. они являются аутологичными Т-клетками). Альтернативно, Т-клетки получают не от пациента, а от другого индивида. Разумеется, предпочтительно, если индивид является здоровым индивидом. Здоровым индивидом авторы изобретения обозначают, что индивид имеет в общем хорошее здоровье, предпочтительно он имеет компетентную иммунную систему и, более предпочтительно, не страдает ни одним заболеванием, которые можно легко проконтролировать и выявить.
Клетками-мишенями для CD8-положительных Т-клеток in vivo в соответствии с настоящим изобретением могут быть клетки опухоли (которые иногда экспрессируют MHC класса I) и/или стромальные клетки, окружающие опухоль (опухолевые клетки) (которые иногда также экспрессируют MHC класса I (Dengjel et al., 4163-70)).
Т-клетки настоящего изобретения могут быть использованы в качестве активных ингредиентов в терапевтической композиции. Таким образом, в изобретении предложен также способ уничтожения клеток-мишеней у пациента, чьи клетки-мишени аберрантно экспрессируют полипептид, включающий аминокислотную последовательность по изобретению, причем способ включает введение пациенту эффективного числа Т-клеток, как определено выше.
Под понятием аберрантно экспрессированный авторы изобретения понимают, что полипептид гиперэкспрессирован по сравнению с нормальными уровнями экспрессии или что ген является молчащим в ткани, из которой образовалась опухоль, однако он экспрессирован в опухоли. Под понятием гиперэкспрессирован авторы изобретения понимают, что полипептид представлен на уровне, который по меньшей мере в 1,2 раза выше уровня, представленного в нормальной ткани; предпочтительно по меньшей мере в 2 раза и более предпочтительно по меньшей мере в 5 или 10 раз выше уровня, представленного в нормальной ткани.
Т-клетки могут быть получены способами, известными из уровня техники, к примеру, теми, что описаны выше.
Протоколы для этого т.н. адоптивного переноса Т-клеток хорошо известны из уровня техники, и с ними можно ознакомиться, например, в работах (Rosenberg et al., 850-54; Rosenberg et al., 2346-57; Dudley et al., 889-97; Yee et al., 1676-80; Dudley et al., 16168-73); обобщенных в (Gattinoni et al., 383-93) и (Morgan et al., 2006).
Любая молекула по изобретению, т.е. пептид, нуклеиновая кислота, вектор экспрессии, клетка, активированные ЦТЛ, Т-клеточный рецептор или нуклеиновая кислота, кодирующая его, пригодна для лечения нарушений, характеризующихся клетками, ускользающими от иммунного ответа. Поэтому любая молекула настоящего изобретения может применяться в качестве лекарственного средства или при изготовлении лекарственного средства. Молекула может быть использована сама по себе или в комбинации с другой(ими) молекулой(ами) по изобретению или известной(ыми) молекулой(ами).
Предпочтительно, если лекарственное средство настоящего изобретения является вакциной. Она может вводиться непосредственно пациенту, в пораженный орган или системно i.d., i.m., s.c, i.p. и i.v. или вноситься ex vivo в клетки, полученные от пациента, или в человеческую клеточную линию, которые затем могут вводиться пациенту или использоваться in vitro для селекции субпопуляции из иммунных клеток, полученных от пациента, которые после этого вновь вводятся пациенту. Если нуклеиновая кислота введена в клетки in vitro, то может быть полезно, чтобы клетки были трансфицированными, чтобы
- 56 037019 совместно экспрессировать иммуностимулирующие цитокины, такие как интерлейкин-2. Пептид может быть по существу чистым или комбинированным с иммуностимулирующим адъювантом (см. ниже), или использоваться в комбинации с иммуностимулирующими цитокинами, или же вводиться с подходящей системой доставки, например липосомами. Пептид может быть также конъюгирован с подходящим носителем, таким как гемоцианин фиссуреллы (KLH) или маннан (см. WO 95/18145 и Longenecker (1993)). Пептид может быть также меченым или может быть слитым белком или гибридной молекулой. Пептиды, последовательность которых дана в настоящем изобретении, как ожидается, стимулируют Т-клетки CD4 или CD8. Тем не менее, стимуляция CD8 ЦТЛ более эффективна в присутствии поддержки, предоставляемой CD4 хелперными Т-клетками. Таким образом, для эпитопов MHC I класса, которые стимулируют CD8 ЦТЛ, партнеры в слиянии или участки гибридной молекулы надлежащим образом предоставляют эпитопы, которые стимулируют CD4-положительные Т-клетки. CD4- и CD8-стимулирующие эпитопы хорошо известны из уровня техники и включают те, что были идентифицированы в настоящем изобретении.
В одном аспекте вакцина включает по меньшей мере один пептид, имеющий аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1 по 33, и по меньшей мере один дополнительный пептид, предпочтительно от 2 до 50, более предпочтительно от 2 до 25, еще более предпочтительно от 2 до 15 и наиболее предпочтительно 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или 13 пептидов. Пептид(ы) может(гут) быть образован(ы) из одного или более специфических ТАА и может(гут) связываться с молекулами MHC I класса.
Полинуклеотид может быть по существу чистым или содержаться в подходящем векторе или системе доставки. Нуклеиновая кислота может быть ДНК, кДНК, ПНК, ЦНК (циклогексанилнуклеиновая кислота), РНК или их комбинацией. Методы конструирования и введения такой нуклеиновой кислоты хорошо известны из уровня техники. Обзор представлен, к примеру, в работе (Pascolo et al., 117-22). Полинуклеотидные вакцины просто получить, однако способ действия этих векторов по индуцированию иммунного ответа понят не полностью. Подходящие векторы и системы доставки включают вирусные ДНК и/или РНК, такие как системы, которые основаны на аденовирусе, вирусе коровьей оспы, ретровирусах, вирусе герпеса, аденоассоциированном вирусе или гибридах, содержащих элементы более чем одного вируса. Невирусные системы доставки включают катионные липиды и катионные полимеры и хорошо известны из уровня техники в области доставки ДНК. Также может быть использована физическая доставка, такая как посредством генной пушки. Пептид или пептиды, закодированные нуклеиновой кислотой, могут быть слитым белком, например, с эпитопом, который стимулирует Т-клетки для соответствующего противоположного гипервариабельного участка (CDR), как описывается выше.
Лекарственное средство по изобретению может также включать один или более адъювант. Адъюванты - это вещества, которые неспецифически усиливают или потенцируют иммунный ответ (например, иммунные ответы, опосредованные ЦТЛ или хелперными Т-клетками (TH) на антиген) и могут, таким образом, рассматриваться как полезные в лекарственном средстве по настоящему изобретению. Подходящие адъюванты включают, но без ограничения, 1018 ISS, соли алюминия, Amplivax®, AS15, BCG, CP870,893, CpG7909, CyaA, dSLIM, флагеллин или лиганды TLR5, полученные из флагеллина, лиганд FLT3, GM-CSF, IC30, IC31, имиквимод (ALDARA®), резимиквимод, ImuFact IMP321, интерлейкины, такие как ИЛ-2, ИЛ-13, ИЛ-21, интерферон-альфа или бета или их пегилированные производные, IS Patch, ISS, ISCO MATRIX, иммуностимулирующие комплексы ISCOM, Juvlmmune, LipoVac, MALP2, MF59, монофосфорил липид А, Монтанид IMS 1312, Монтанид ISA 206, Монтанид ISA 50V, Монтанид ISA-51, эмульсии вода в масле и масло в воде, OK-432, ОМ-174, ОМ-197-МР-ЕС, ONTAK, OspA, векторная система PepTel®, основанные на поли-(лактид когликолиде) [PLG] и декстране микрочастицы, талактоферрин SRL172, виросомы и другие вирусоподобные частицы, YF-17D, VEGf trap, R848, бетаглюкан, Pam3Cys, стимулон Aquila QS21, который получают из сапонина, микобактериальные экстракты и синтетические имитаторы бактериальных клеточных стенок и другие запатентованные адъюванты, такие как Detox компании Ribi's, Quil или Superfos. Предпочтительными адъювантами являются такие, как адъювант Фрейнда или GM-CSF. Несколько иммунологических адъювантов (например, MF59), специфических для дендритных клеток, и их получение были описаны ранее (Allison and Krummel, 932-33). Также могут использоваться цитокины. Несколько цитокинов были непосредственно соотнесены с влиянием на миграцию дендритных клеток к лимфоидным тканям (например, TNF-α), ускоряя созревание дендритных клеток до эффективных, презентирующих антиген Т-лимфоцитам, клеток (например, GM-CSF, ИЛ-1 и ИЛ-4) (патент США № 5849589, отдельно включенный в описание во всей полноте путем ссылки) и действуя как иммуноадъюванты (например, ИЛ-12, ИЛ-15, ИЛ-23, ИЛ-7, IFN-альфа, IFNбета) (Gabrilovich 1996).
Об иммуностимулирующих олигонуклеотидах CpG также сообщалось, что они усиливают эффекты адъювантов в составе вакцин. Теоретически не связанные, CpG-олигонуклеотиды при активации врожденной (не приобретенной) иммунной системы действуют с помощью Toll-подобных рецепторов (TLR), в основном TLR9. Вызванная CpG активация TLR9 усиливает антигенспецифические гуморальные и клеточные ответы на широкий спектр антигенов, включая пептидные или белковые антигены, живые или
- 57 037019 убитые вирусы, вакцины из дендритных клеток, аутологичные клеточные вакцины и полисахаридные конъюгаты как в профилактических, так и терапевтических вакцинах. Более важно то, что улучшается созревание и дифференциация дендритных клеток, приводя к повышенной активации THj-клеток и интенсивной выработке цитотоксических Т-лимфоцитов (ЦТЛ) даже при отсутствии помощи CD4 Т-клеток. Активация TH1, вызванная стимуляцией TLR9, сохраняется даже в присутствии вакцинных адъювантов, таких как квасцы или неполный адъювант Фрейнда (IFA), которые обычно способствуют активации TH2. CpG-олигонуклеотиды проявляют даже большую адъювантную активность, если они входят в состав или вводятся в организм вместе с другими адъювантами или в таких составах, как микрочастицы, наночастицы, липидные эмульсии, или в подобных составах, которые в особенности необходимы для инициации сильного ответа, если антиген относительно слаб. Они также ускоряют иммунную реакцию и позволяют снизить дозы антигена приблизительно на два порядка в сравнении с ответами антитела на полную дозу вакцины без CpG в некоторых экспериментах (Krieg, 471-84). В патенте США № 6406705 В1 описывается комбинированное применение CpG-олигонуклеотидов, адъювантов, не включающих нуклеиновые кислоты, и антигена для вызывания антигенспецифического иммунного ответа. Антагонистом CpG TLR9 является dSLIM (иммуномодулятор со структурой типа двуцепочечный стебель-петля) компании Mologen (Берлин, Германия), который является предпочтительным компонентом фармацевтической композиции настоящего изобретения. Также могут быть использованы другие молекулы, связывающиеся с TLR, такие как РНК, связывающаяся c TLR 7, TLR 8 и/или TLR 9.
Другие примеры пригодных к использованию адъювантов включают, но без ограничения, химически модифицированные CpG (например, CpR, Idera), аналоги dsPHK, такие как поли(1:С) и их производные (например, AmpliGen®, Hiltonol®, поли-(ICLC), поли-tIC-R). поли-(1:С1211), бактериальные ДНК или РНК, отличные от CpG, a также иммуноактивные малые молекулы и антитела, такие как циклофосфамид, сунитиниб, бевацизумаб, целебрекс, NCX-4016, силденафил, тадалафил, варденафил, сорафениб, темозоломид, темсиролимус, XL-999, СР-547632, пазопаниб, VEGF Trap, ZD2171, AZD2171, антиCTLA4, другие антитела, нацеленные на основные структуры иммунной системы (например, антитела к CD40, TGF-бета, рецептору TNF-альфа) и SC58175, которые могут действовать терапевтически и/или как адъюванты. Количества и концентрации адъювантов и добавок, пригодных для использования в контексте настоящего изобретения, могут быть легко определены опытным специалистом без проведения излишних экспериментов.
Предпочтительными адъювантами являются имиквимод, резимиквимод, GM-CSF, циклофосфамид, сунитиниб, бевацизумаб, интерферон-альфа, олигонуклеотиды CpG и производные, поли-(1:С) и производные, РНК, силденафил и составы из твердых частиц с PLG или виросомы.
В предпочтительном варианте осуществления фармацевтической композиции в соответствии с изобретением адъювант выбран из группы, состоящей из колониестимулирующих факторов, таких как гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF, сарграмостим), имиквимод, резиквимод и интерферон-альфа.
В предпочтительном варианте осуществления для фармацевтической композиции в соответствии с изобретением адъювант выбран из группы, состоящей из колониестимулирующих факторов, таких как гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF, сарграмостим), имиквимод и резиквимод.
В предпочтительном варианте осуществления фармацевтической композиции в соответствии с изобретением адъювантом является имиквимод и резиквимод.
Эта композиция используется для парентерального введения, такого как подкожное, внутрикожное, внутримышечное или оральное введение. Для этого пептиды и, факультативно, другие молекулы растворяют или суспендируют в фармацевтически приемлемом, предпочтительно водном носителе. Кроме того, композиция может содержать такие вспомогательные вещества, как буферы, связующие агенты, разрушающие агенты, разбавители, ароматизаторы, смазывающие вещества и т.д. Пептиды могут быть также введены вместе с иммуностимулирующими веществами, такими как цитокины. Пространный список вспомогательных веществ, которые могут быть использованы в такой композиции, может быть взят, например, из работы A. Kibbe, Handbook of Pharmaceutical Excipients, 3. Ed., 2000, изд. American Pharmaceutical Association and pharmaceutical press. Композиция может использоваться для предупреждения, профилактики и/или лечения аденоматозных или раковых заболеваний. Отдельные примеры составов могут быть взяты, например, из EP 2113253.
В настоящем изобретении предложено лекарственное средство, которое пригодно для лечения рака, в частности рака желудка, почечно-клеточной карциномы, рака толстой кишки, немелкоклеточной карциномы легких, аденокарциномы, рака предстательной железы, доброкачественных новообразований и злокачественной меланомы.
В настоящем изобретении также предлагается набор, включающий:
(a) контейнер, который содержит фармацевтическую композицию, которая описана выше, в виде раствора или в лиофилизированной форме;
(b) факультативно, второй контейнер, содержащий разбавитель или восстанавливающий раствор для лиофилизированного состава; и
- 58 037019 (c) факультативно, инструкции по (i) применению раствора или (ii) восстановлению раствора и/или по применению лиофилизированного состава.
Кроме того, набор далее может включать один или более (iii) буферов, (iv) разбавителей, (v) фильтров, (vi) игл или (vii) шприцев. Контейнер является предпочтительно флаконом, ампулой, шприцем или пробиркой; и он может быть контейнером многоразового применения. Фармацевтическая композиция предпочтительно лиофилизирована.
Набор согласно настоящему изобретению предпочтительно включает лиофилизированный состав настоящего изобретения в подходящем контейнере и инструкции для его восстановления и/или по его применению. Подходящие контейнеры включают, например, флаконы, ампулы (например, двухкамерные ампулы), шприцы (такие как двухкамерные шприцы) и пробирки. Контейнер может быть сделан из разных материалов, таких как стекло или пластмасса. Предпочтительный набор и/или контейнер содержит инструкции на контейнере, которые дают указания для восстановления и/или применения. Например, на этикетке может быть указано, что лиофилизированный состав должен восстанавливаться до таких концентраций пептидов, как описано выше. На этикетке далее может быть указано, что состав применяется или предназначается для подкожного введения.
Контейнер с составом может быть ампулой многоразового использования, которая позволяет повторное введение (например, от 2-6 введений) восстановленного состава. Набор может дополнительно включать второй контейнер, включающий подходящий разбавитель (например, раствор бикарбоната натрия).
При смешивании разбавителя и лиофилизированного состава окончательная концентрация пептида в восстановленном составе составляет предпочтительно по меньшей мере 0,15 мг/мл/пептид (=75 мкг) и предпочтительно не более чем 3 мг/мл/пептид (=1500 мкг). Набор может дополнительно включать другие материалы, желательные с коммерческой и с точки зрения пользователя, включая другие буферы, разбавители, фильтры, иглы, шприцы и вкладыши в упаковку с инструкциями по применению.
Наборы по настоящему изобретению могут включать один контейнер, который содержит фармацевтический состав в соответствии с настоящим изобретением с другими компонентами или без них (например, других соединений или фармацевтических композиций этих других соединений) или может иметь отдельные контейнеры для каждого компонента.
Наборы по изобретению предпочтительно включают состав по изобретению, упакованный для применения в комбинации с совместным введением второго соединения (таким как адъювант (например, GM-CSF), химиотерапевтическое средство, натуральный продукт, гормон или антагонист, средства против ангиогенеза или ингибитора ангиогенеза; апоптоз-индуцирующие средства или хелаторы) или их фармацевтическую композицию. Компоненты набора до введения пациенту могут предварительно быть смешаны или же каждый компонент может находиться в индивидуальном контейнере. Компоненты набора могут быть предоставлены в виде одного или нескольких жидкостных растворов, предпочтительно водного раствора, более предпочтительно стерильного водного раствора. Компоненты набора также могут быть предоставлены в виде твердой формы, которая может быть превращена в жидкость при добавлении подходящих растворителей, которые, предпочтительным образом, предоставляются в другом, отдельном, контейнере.
Контейнер терапевтического набора может быть ампулой, пробиркой, колбой, флаконом, шприцем или любыми другими средствами, заключающими в себе твердое вещество или жидкость. Обычно, если имеются более одного компонента, набор содержит второй флакон или другой контейнер, который позволяет произвести отдельную дозировку. Набор может также содержать другой контейнер для фармацевтически приемлемой жидкости. Лечебный набор будет предпочтительно содержать аппарат (например, одну или более иглу, шприцы, пипетки для глаз, пипетки и т.д.), который обеспечивает введение веществ по изобретению, которые являются компонентами настоящего набора.
Настоящий состав подходит для введения пептидов любым приемлемым способом, таким как оральный (энтеральный), назальный, глазной, подкожный, внутрикожный, внутримышечный, внутривенный или трансдермальный способ. Предпочтительно, чтобы введение было s.c и наиболее предпочтительно i.d. Введение может производиться инфузионным насосом.
Поскольку пептиды по изобретению, полученные из MST1R, UCHL5, SMC4, NFYB, PPAP2C, AVL9, UQCRB и Muc6, были выделены из клеток рака желудка, лекарственное средство по изобретению предпочтительно применяется для лечения рака желудка.
Теперь настоящее изобретение будет описано с помощью последующих примеров, которые описывают его предпочтительные варианты осуществления, тем не менее не ограничивая ими изобретение. В соответствии с целями настоящего изобретения все цитаты описания включены в их целостности путем ссылки.
- 59 037019
Примеры
Пример 1.
Идентификация опухолеассоциированных пептидов, презентируемых на поверхности клетки.
Образцы тканей.
Опухолевые ткани пациентов были предоставлены Медицинским университетом префектуры Киото (KPUM), Киото, Япония, Школой медицины Осакского университета (OCU), Осака, Япония и Университетским госпиталем г. Тюбинген, Германия. Перед проведением хирургической операции было получено информированное согласие всех пациентов в письменной форме. Сразу же после операции ткани были подвергнуты шоковой заморозке в жидком азоте и хранились до изоляции TUMAP-пептидов при -80°С.
Выделение пептидов HLA из образцов тканей.
Пулы комплексов пептид-HLA из подвергнутых шоковой заморозке образцов тканей были получены методом иммунопреципитации из плотных тканей в соответствии с незначительно измененным протоколом (Falk et al., 1991; Seeger, F.H. et al., 1999) при использовании HLA-A, -В, -С-специфического антитела W6/32, HLA-А*02-специфического антитела ВВ7.2, CNBr-активированной сефарозы, кислотной обработки и ультрафильтрации.
Методы.
Полученные пулы комплексов пептид-HLA были разделены в соответствии с их гидрофобностью ОФ хроматографией (nanoAcquity UPLC system, Waters), и элюированные пептиды анализировали на гибридном масс-спектрометре LTQ-Orbitrap (ThermoFisher Scientific), снабженном источником ESI. Пулы пептидов загружали непосредственно на аналитическую микрокапиллярную колонку из плавленого кварца (75 мкм внутр.д.х250 мм) с материалом для обратнофазовой хроматографии 1,7 мкм С18 (Waters) с применением скорости потока в 400 нл/мин. Затем пептиды разделяли с использованием двухэтапного 180-минутного бинарного градиента от 10 до 33% В при скорости потока 300 нл/мин. Градиент был составлен из растворителя А (0,1% муравьиной кислоты в воде) и растворителя В (0,1% муравьиной кислоты в ацетонитриле). Позолоченный стеклянный капилляр (PicoTip, New Objective) использовали для введения в источник нано-ESI. Масс-спектрометр LTQ-Orbitrap работал в зависимом от данных режиме с применением стратегии TOP5. Вкратце, цикл сканирования начинался с полного сканирования с высокой точностью масс на спектрометре Orbitrap (R=30000), за чем следовало сканирование MS/MS на Orbitrap (R=7500) на 5 особенно многочисленных ионах-предшественниках с динамическим исключением отобранных ранее ионов. Тандемные масс-спектры интерпретировали на SEQUEST с дополнительным ручным управлением. Идентифицированную пептидную последовательность подтверждали сравнением генерированной картины фрагментации природного пептида с картиной фрагментации синтетического контрольного пептида с идентичной последовательностью. На фиг. 1 представлен образец спектра, полученный из опухолевой ткани для пептида CDC2-001, ассоциированного с MHC класса I, и его профиля элюции на системе UPLC.
Пример 2.
Профили экспрессии генов, кодирующих пептиды по изобретению.
Не все пептиды, идентифицированные как презентируемые на поверхности опухолевых клеток молекулами MHC, подходят для иммунотерапии, потому что большинство этих пептидов образованы из нормальных клеточных белков, экспрессируемых многими видами клеток. Только немногие из этих пептидов являются опухолеассоциированными и, вероятно, способны индуцировать Т-клетки с высокой специфичностью распознавания для опухоли, из которой они были получены. В целях идентификации таких пептидов и минимизации риска аутоиммунности, вызванной при вакцинации, авторы данного изобретения сосредоточили свое внимание на тех пептидах, которые получены из белков, гиперэкспрессированных на опухолевых клетках в сравнении с большинством нормальных тканей.
Идеальный пептид может быть получен из белка, являющегося уникальным для опухоли и не присутствующего ни в одной другой ткани. Для идентификации пептидов, которые образованы из генов с профилем экспрессии, близким к идеальному, идентифицированные пептиды соотносили с белками и генами соответственно, из которых они были образованы, и строили профили экспрессии этих генов.
Источники и приготовление РНК.
Хирургически удаленные образцы тканей были предоставлены различными клиническими центрами (см. пример 1) после получения письменной формы информированного согласия от каждого пациента. Образцы опухолевой ткани были мгновенно заморожены в жидком азоте после операции и гомогенизированы позже с помощью ступки и пестика в жидком азоте. Суммарная РНК была приготовлена из данных образцов с использованием реагента TRI (Ambion, Дармштадт, Германия) с последующей очисткой на RNeasy (QIAGEN, Хильден, Германия); оба метода осуществлялись в соответствии с указаниями производителей.
Суммарная РНК здоровых человеческих тканей была куплена (Ambion, Хантингдон, Великобритания; Clontech, Гейдельберг, Германия; Stratagene, Амстердам, Нидерланды; BioChain, Хейвард, Калифорния, США). РНК нескольких индивидов (от 2 до 123 индивидов) была смешана таким образом, что РНК каждого индивида имела равную массу. Лейкоциты были выделены из образцов крови 4 здоровых доб- 60 037019 ровольцев.
Качество и количество образцов суммарной РНК оцененивали на биоанализаторе Agilent 2100 (Agilent, Вальдбронн, Германия) с использованием набора RNA6000 Pico LabChip Kit (Agilent).
Эксперименты с микроматрицами.
Анализ экспрессии генов всех образцов РНК из опухолевой и нормальной ткани был произведен с помощью олигонуклеотидных микроматриц Affymetrix Human Genome (HG) U133A или HG-U133 Plus 2.0 (Affymetrix, Санта Клара, Калифорния, США). Все этапы были выполнены в соответствии с руководством Affymetrix. Вкратце, двухнитевую кДНК синтезировали из 5-8 мкг суммарной РНК с использованием Superscript RTII (Invitrogen) и олиго-dT-Т7 праймера (MWG Biotech, Эберсберг, Германия), как описывается в руководстве. Транскрипцию in vitro производили с использованием набора для мечения РНК-транскриптов BioArray High Yield RNA Transcript Labelling Kit (ENZO Diagnostics, Inc., Фармингейл, Нью-Йорк, США) для матриц U133A или набора GeneChip IVT Labelling Kit (Affymetrix) для матриц U133 Plus 2.0 с последующей фрагментацией, гибридизацией кРНК и окрашиванием стрептавидинфикоэритрином и биотинилированным антистрептавидиновым антителом (Molecular Probes, Лейден, Нидерланды). Изображения сканировали на Agilent 2500A GeneArray Scanner (U133A) или Affymetrix Gene-Chip Scanner 3000 (U133 Plus 2.0), а данные анализировали в программе GCOS (Affymetrix) с использованием настроек по умолчанию для всех параметров. Для нормализации использовались 100 служебных генов, предоставленных Affymetrix. Относительные значения экспрессии были подсчитаны из отношений зарегистрированных сигналов, полученных компьютерной программой, а значение для образца нормальной почки было произвольно задано значением 1,0.
Профили экспрессии исходных генов, предложенных в настоящем изобретении, которые в высокой степени гиперэкспрессированы в клетках рака желудка, представлены на фиг. 2.
Пример 3.
Иммуногенность in vitro для пептидов, презентируемых MHC I класса, в IMA941.
Для получения информации об иммуногенности пептидов TUMAP по настоящему изобретению были проведены исследования с использованием хорошо известных методов стимуляции, уже описанных в работе (Walter, S., Herrgen, L., Schoor, О., Jung, G., Wernet, D., Buhring, H.J., Rammensee, H.G., and Stevanovic, S.; 2003, Cutting edge: predetermined avidity of human CD8 T cells expanded on calibrated MHC/anti-CD28-coated microspheres, J. Immunol., 171, 4974-4978). С использованием этой системы была показана положительная иммуногенность (т.е. размножение специфических Т-клеток) для 47 из 54 проанализированных пептидов TUMAP, рестриктированных по HLA-A*2402, и для 3 из 3 проанализированных пептидов TUMAP по изобретению, рестриктированных по HLA-A*0201, демонстрируя, что эти пептиды являются Т-клеточными эпитопами, против которых у человека существуют CD8' Т-клеткипредшественники (табл. 4).
Прайминг CD8+ Т-клеток in vitro.
В целях проведения стимуляций in vitro искусственными антигенпрезентирующими клетками (иАПК), нагруженными комплексом пептид-MHC (pMHC) и антителом к CD28, сначала были выделены CD8 Т-клетки из свежего продукта лейкафереза HLA-A*24 или из лейкоцитарной пленки HLA-A*2 здоровых доноров, полученных из Банка крови г. Тюбингена, Германия.
CD8 Т-клетки, непосредственно обогащенные либо из продукта лейкафереза, либо из РВМС (мононуклеарные клетки периферической крови), сначала выделяли с помощью среды градиентного разделения стандартной плотности (РАА, Кёльбе, Германия). Выделенные CD8-лимфоциты или РВМС инкубировали до использования в Т-клеточной среде (ТСМ), состоящей из RPMI-Glutamax (Invitrogen, Карлсруэ, Германия) с добавлением 10% инактивированной нагреванием человеческой сыворотки АВ (PANBiotech, Эйденбах, Германия), 100 Ед/мл пенициллина/100 мкг/мл стрептомицина (Cambrex, Вервье, Бельгия), 1 мМ пирувата натрия (СС Pro, Нойштадт, Германия) и 20 мкг/мл гентамицина (Cambrex). Цитокины с концентрацией 2,5 нг/мл ИЛ-7 (PromoCell, Гайдельберг, Германия) и 10 Ед/мл ИЛ-2 (Novartis Pharma, Нюрнберг, Германия) также добавляли в среду ТСМ на этом этапе культивирования. Выделение лимфоцитов CD8+ производили методом позитивной селекции с помощью микросфер CD8 (Miltenyi Biotec, Бергиш-Гладбах, Германия).
Получение микросфер, покрытых pMHC/анти-CD28, Т-клеточные стимуляции и считывание производили, как описывалось ранее (Walter et al., 4974-78), с минимальными модификациями. Вкратце, были получены биотинилированные нагруженные пептидом рекомбинантные молекулы HLA-A*2402 и HLA-A*0201, без трансмембранного домена, и которые были биотинилированы на карбоксильном конце тяжелой цепи. Очищенный костимулированный IgG2a мыши к антителам человека CD28 Ab 9,3 (ung, Ledbetter, and Muller-Eberhard 4611-15) был биотинилирован химическим способом с использованием сульфо-N-гидроксисукцинимидобиотина, как рекомендуется изготовителем (Perbio, Бонн, Германия). Использованные микросферы представляли собой полистироловые частицы размером 5,6 мкм, покрытые стрептавидином (Bangs Laboratories, Иллиной/США). pMHC, использованные в качестве положительного и отрицательного контроля иммуногенности, были A*0201/MLA-001 (пептид ELAGIGILTV из модифицированного Melan-A/MART-1) и A*0201/DDX5-001 (YLLPAIVHI из DDX5) соответственно.
- 61 037019
800000 микросфер/200 мкл помещали в лунки 96-луночного планшета в присутствии 600 нг биотинилированных aHTu-CD28 и 200 нг релевантного биотин-pMHC (высокоплотные микросферы). Стимуляции были инициированы в 96-луночных планшетах при совместной инкубации 1х106 CD8+ Т-клеток с 2х 105 промытых микросфер с покрытием в 200 мкл среды ТСМ с добавлением 5 нг/мл ИЛ-12 (PromoCell) в течение 3-4 дней при 37°С, 5% CO2 и 95% относительной влажности. Половина среды была заменена на свежую ТСМ с добавлением 80 Ед/мл ИЛ-2, и инкубация была продолжена в течение 3-4 дней при 37°С. Данный цикл стимуляций производили в общей сложности три раза.
Наконец, проводили анализы мультимеров окрашиванием клеток с помощью флуоресцентных мультимеров А*0201 или А*2402 HLA (полученными, как описывается в работе {Altman, 1996 ALTMAN1996/id}) и клоном SK1 антитела CD8-FITC (BD, Гейлельберг, Германия) или дополнительно с помощью маркера жизнеспособности (веществом Live/dead-Aqua или - фиолетовым красителем (Invitrogen, Карлсруэ, Германия)), и измерения проводили на четырехцветном цитометре FACSCalibur (BD) или цитометре LSRII SORP (BD; 18 цветов, оснащенного синим (488 нм), фиолетовым (405 нм), красным (640 нм) и зеленым (532 нм) светофильтрами соответственно. Пептид-специфические клетки были подсчитаны как процентная доля всех CD8+ Т-клеток. Оценку результатов мультимерного анализа проводили с помощью компьютерной программы FlowJo (Tree Star, Орегон, США). Прайминг in vitro специфических мультимер-положительных CD8' лимфоцитов оценивали установкой подходящего дискриминационного окна и сравнением со стимуляциями отрицательного контроля. Иммуногенность для заданного антигена была определена, если было обнаружено, что по меньшей мере в одной подлежащей оценке простимулированной in vitro лунке одного здорового донора содержалась специфическая CD8' Т-клеточная линия после стимуляции in vitro (т.е. когда данная лунка содержала по меньшей мере 1% специфичных мультимер-положительных среди CD8-положительных Т-клеток) и процентная доля специфических мультимер-положительных клеток была по меньшей мере в 10 раз выше среднего значения стимуляций соответствующего отрицательного контроля (стимуляция несоответствующими и окрашивание соответствующими мультимерами) и клетки не находились на диагонали диаграммы).
Иммуногенность in vitro для пептидов IMA941.
Для 47 из 54 исследованных пептидов HLA-A*2402 и для 3 из 3 исследованных пептидов ИЬА-А*0201 могла быть продемонстрирована иммуногенность in vitro за счет получения пептидспецифических Т-клеточных линий. Пример результатов цитометрии после TUMAP-специфического мультимерного окрашивания для двух пептидов по изобретению показаны на фиг. 3 вместе с соответствующим отрицательным контролем. Результаты для 54 пептидов А*2402 и 3 А*0201 по изобретению обобщаются в табл. 4.
Результаты экспериментов по иммуногенности in vitro, проведенных фирмой Immatics, показывают процентную долю доноров и лунок с положительными результатами и лунок среди тех, что подлежали оценке. По меньшей мере четыре донора и 48 лунок каждого пептида подлежали оценке.
- 62 037019
Таблица 4
Иммуногенность пептидов HLA I класса по изобретению in vitro
№ последовательное ти | Антиген | Доноры положительных/ оцениваемых [%] | Лунки положительных/ оцениваемых [%] |
1 | CDC2-001 | 83 | 28 |
2 | ASPM-002 | 67 | 32 |
18 | ММРЗ-001 | 11 | 1 |
4 | МЕТ-006 | 67 | 21 |
3 | UCHL5-001 | 75 | 12 |
7 | MST1R-001 | 50 | 13 |
33 | KIF2C-001 | 17 | 2 |
9 | SMC4-001 | 73 | 10 |
17 | ЕРНА2-005 | 0 | 0 |
5 | PROM1-001 | 83 | 26 |
6 | ММР11-001 | 33 | 11 |
8 | NFYB-001 | 50 | 7 |
16 | ASPM-001 | 17 | 3 |
20 | PLK4-001 | 60 | 5 |
14 | ABL1-001 | 83 | 18 |
26 | ATAD2-001 | 33 | 3 |
21 | ATAD2-002 | 17 | 1 |
27 | ATAD2-003 | 0 | 0 |
12 | AVL9-001 | 100 | 31 |
22 | COL12A1-001 | 0 | 0 |
23 | COL6A3-001 | 0 | 0 |
24 | FANCI-001 | 17 | 1 |
28 | HSP90B1-001 | 50 | 7 |
15 | MUC6-001 | 83 | 22 |
13 | NUF2-001 | 100 | 50 |
19 | NUF2-002 | 50 | 6 |
11 | РРАР2С-001 | 83 | 29 |
25 | RPS11-001 | 17 | 3 |
29 | SIAH2-001 | 50 | 8 |
30 | SLC6A6-001 | 17 | 1 |
- 63 037019
10 | UQCRB-001 | 83 | 24 |
31 | IQGAP3-001 | 100 | 24 |
32 | ERBB3-001 | 83 | |
CCDC88A-001 | 0 | 0 | |
CCNB1-003 | 33 | 3 | |
CCND2-001 | 17 | 10 | |
CCNE2-001 | 0 | 0 | |
СЕА-010 | 40 | 3 | |
CLCN3-001 | 33 | 6 | |
DNAJC10-001 | 50 | 15 | |
DNAJC10-002 | 33 | 3 | |
EIF2S3-001 | 17 | 1 | |
EIF3L-001 | 100 | 29 | |
ЕРРК1-001 | 17 | 1 | |
GPR39-001 | 50 | 6 | |
ITGB4-001 | 67 | 20 | |
LCN2-001 | 17 | 1 | |
SDHC-001 | 33 | 3 | |
РВК-001 | 0 | 0 | |
POLD3-001 | 67 | 7 | |
PSMD14-001 | 17 | 1 | |
РТК2-001 | 17 | 4 | |
TSPAN1-002 | 17 | 1 | |
ZNF598-001 | 83 | 17 |
Приведенные ниже пептиды уже были описаны в других патентных заявках фирмы Immatics и включены в вакцины IMA901 (МЕТ-001 и ТОР-001), IMA910 (МЕТ-001 и ТОР-001) и IMA950 (IGF2BP3-001). Поскольку, например, пептид МЕТ-001 приводит к чрезвычайно хорошим реакциям in vivo, данные могут рассматриваться как сведения пригодности пептидов по изобретению для клинического применения.
№ последовательное ти | Антиген | донорская положительных/о цениваемых [%] | Лунки положительных/ оцениваемых [%] |
IGF2BP3-001 | 50 | 21 | |
МЕТ-001 | 67 | 42 | |
ТОР-001 | 40 | 10 |
- 64 037019
Список литературы
Ahmed, A. U., et al. Effect of disrupting seven-in-absentia homolog 2 function on lung cancer cell growth. J Natl.Cancer Inst. 100.22 (2008): 1606-29.
Allison, J. P. and M. F. Krummel. The Yin and Yang of T cell costimulation. Science 270.5238 (1995): 932-33.
Altmeyer, A., et al. Tumor-specific cell surface expression of the-KDEL containing, endoplasmic reticular heat shock protein gp96. Int J Cancer 69.4 (1996): 340-49.
Аррау, V., et al. Decreased specific CD8+ T cell cross-reactivity of antigen recognition following vaccination with Melan-A peptide. Eur.J Immunol. 36.7 (2006): 1805-14.
Banerjee, S. K., et al. Expression of cdc2 and cyclin B1 in Helicobacter pylori-associated gastric MALT and MALT lymphoma : relationship to cell death, proliferation, and transformation. Am J Pathol. 156.1 (2000): 217-25.
Bartman, A. E., et al. Aberrant expression of MUC5AC and MUC6 gastric mucin genes in colorectal polyps. Int J Cancer 80.2 (1999): 210-18.
Basu, S., et al. Necrotic but not apoptotic cell death releases heat shock proteins, which deliver a partial maturation signal to dendritic cells and activate the NF-kappa В pathway. Int Immunol. 12.11 (2000): 1539-46.
Bauer, B., S. Bartfeld, and T. F. Meyer. H. pylori selectively blocks EGFR endocytosis via the nonreceptor kinase c-Abl and CagA. Cell Microbiol. 11.1 (2009): 156-69.
Benatti, P, et al. A balance between NF-Y and p53 governs the pro- and anti-apoptotic transcriptional response. Nucleic Acids Res 36.5 (2008): 1415-28.
Bertolini, G., et al. Highly tumorigenic lung cancer CD133+ cells display stem-like features and are spared by cisplatin treatment. Proc Natl.Acad.Sci.U.S.A 106.38 (2009): 16281-86.
Bierie, B. and H. L. Moses. TGF-beta and cancer. Cytokine Growth Factor Rev. 17.1-2 (2006): 2940.
Bitoun, E. and К. E. Davies. The robotic mouse: unravelling the function of AF4 in the cerebellum. Cerebellum. 4.4 (2005): 250-60.
Bolhassani, A. and S. Rafati. Heat-shock proteins as powerful weapons in vaccine development. Expert.Rev.Vaccines. 7.8 (2008): 1185-99.
Borset, M., et al. The role of hepatocyte growth factor and its receptor c-Met in multiple myeloma and other blood malignancies. Leuk.Lymphoma 32.3-4 (1999): 249-56.
Bradbury, P. A., et al. Matrix metalloproteinase 1, 3 and 12 polymorphisms and esophageal adenocarcinoma risk and prognosis. Carcinogenesis 30.5 (2009): 793-98.
Brown, С. E., et al. Recognition and killing of brain tumor stem-like initiating cells by CD8+ cytolytic T cells. Cancer Research 69.23 (2009): 8886-93.
Bruckdorfer, T., O. Marder, and F. Albericio. From production of peptides in milligram amounts for research to multi-tons guantities for drugs of the future. Curr.Pharm.Biotechnol. 5.1 (2004): 29-43.
Brunsvig, P. E, et al. Telomerase peptide vaccination: a phase l/ll study in patients with non-small cell lung cancer. Cancer Immunol.Immunother. 55.12 (2006): 1553-64.
- 65 037019
Cabanes, D., et al. Gp96 is a receptor for a novel Listeria monocytogenes virulence factor, Vip, a surface protein. EMBO J 24.15 (2005): 2827-38.
Calzado, M. A., et al. An inducible autoregulatory loop between HIPK2 and Siah2 at the apex of the hypoxic response. Nat.Cell Biol. 11.1 (2009): 85-91.
Castelli, C., et al. Heat shock proteins: biological functions and clinical application as personalized vaccines for human cancer. Cancer Immunol.Immunother. 53.3 (2004): 227-33.
Castriconi, R., et al. Both CD133+ and C. Eur.J Immunol. 37.11 (2007): 3190-96.
Chanock, S. J., et al. HLA-A, -B, -Cw, -DQA1 and -DRB1 Alleles in a Caucasian Population from Bethesda, USA. Hum.Immunol. 65 (2004): 1211-23.
Chen, С. H., et al. Inhibition of heregulin signaling by an aptamer that preferentially binds to the oligomeric form of human epidermal growth factor receptor-3. Proc Natl.Acad.Sci.U.S.A 100.16 (2003): 9226-31.
Chen, Z. and J. J. O'Shea. Regulation of IL-17 production in human lymphocytes. Cytokine 41.2 (2008): 71-78.
Cho, S. O., et al. Helicobacter pylori in a Korean Isolate Expressed Proteins Differentially in Human Gastric Epithelial Cells. Dig.Dis.Sci. (2009).
Christianson, J. C., et al. OS-9 and GRP94 deliver mutant alphal-antitrypsin to the Hrd1-SEL1L ubiquitin ligase complex for ERAD. Nat.Cell Biol. 10.3 (2008): 272-82.
Cisek, L. J. and J. L. Corden. Phosphorylation of RNA polymerase by the murine homologue of the cell-cycle control protein cdc2. Nature 339.6227 (1989): 679-84.
Colombetti, S., et al. Prolonged TCR/CD28 engagement drives IL-2-independent T cell clonal expansion through signaling mediated by the mammalian target of rapamycin. J Immunol. 176.5 (2006): 2730-38.
Confalonieri, S., et al. Alterations of ubiquitin ligases in human cancer and their association with the natural history of the tumor. Oncogene 28.33 (2009): 2959-68.
Corso, S., et al. Silencing the MET oncogene leads to regression of experimental tumors and metastases. Oncogene 27.5 (2008): 684-93.
Сох, С. V., et al. Expression of CD133 on leukemia-initiating cells in childhood ALL. Blood 113.14 (2009): 3287-96.
Cunha-Ferreira, I., et al. The SCF/Slimb ubiquitin ligase limits centrosome amplification through degradation of SAK/PLK4. Curr.Biol. 19.1 (2009): 43-49.
DeLuca, J. G., et al. Hed and nuf2 are core components of the kinetochore outer plate essential for organizing microtubule attachment sites. Mol.Biol.Cell 16.2 (2005): 519-31.
Deng, H., et al. Matrix metalloproteinase 11 depletion inhibits cell proliferation in gastric cancer cells. Biochem.Biophys.Res Commun. 326.2 (2005): 274-81.
Dengjel, J., et al. Unexpected Abundance of HLA Class II Presented Peptides in Primary Renal Cell Carcinomas. Clin Cancer Res. 12.14 (2006): 4163-70.
Deremer, D. L., C. Ustun, and K. Natarajan. Nilotinib: a second-generation tyrosine kinase inhibitor for the treatment of chronic myelogenous leukemia. Clin Ther. 30.11 (2008): 1956-75.
- 66 037019
Di Renzo, M. F., et al. Overexpression and amplification of the met/HGF receptor gene during the progression of colorectal cancer. Clin.Cancer Res. 1.2 (1995): 147-54.
Dong, G., et al. Hepatocyte growth factor/scatter factor-induced activation of MEK and PI3K signal pathways contributes to expression of proangiogenic cytokines interleukin-8 and vascular endothelial growth factor in head and neck squamous cell carcinoma. Cancer Res. 61.15 (2001): 5911-18.
Dudley, Μ. E., et al. Cancer regression and autoimmunity in patients after clonal repopulation with antitumor lymphocytes. Science 298.5594 (2002): 850-54.
Dudley, Μ. E., et al. Adoptive cell transfer therapy following non-myeloablative but lymphodepleting chemotherapy for the treatment of patients with refractory metastatic melanoma. J.Clin.Oncol. 23.10 (2005): 2346-57.
Duong, C., et al. Pretreatment gene expression profiles can be used to predict response to neoadjuvant chemoradiotherapy in esophageal cancer. Ann Surg Oncol 14.12 (2007): 3602-09.
Egland, K. A., et al. High expression of a cytokeratin-associated protein in many cancers. Proc Natl.Acad.Sci.U.S.A 103.15 (2006): 5929-34.
Eramo, A., et al. Identification and expansion of the tumorigenic lung cancer stem cell population. Cell Death Differ 15.3 (2008): 504-14.
Esashi, F., et al. CDK-dependent phosphorylation of BRCA2 as a regulatory mechanism for recombinational repair. Nature 434.7033 (2005): 598-604.
Escobar, M. A., et al. Profiling of nuclear extract proteins from human neuroblastoma cell lines: the search for fingerprints. J Pediatr.Surg 40.2 (2005): 349-58.
Ferracini, R., et al. The Met/HGF receptor is over-expressed in human osteosarcomas and is activated by either a paracrine or an autocrine circuit. Oncogene 10.4 (1995): 739-49.
Fischer, J., et al. Duplication and overexpression of the mutant allele of the MET proto-oncogene in multiple hereditary papillary renal cell tumours. Oncogene 17.6 (1998): 733-39.
Flanagan, J. M., et al. Genomics screen in transformed stem cells reveals RNASEH2A, PPAP2C, and ADARB1 as putative anticancer drug targets. Mol.Cancer Ther. 8.1 (2009): 249-60.
Fong, L., et al. Altered peptide ligand vaccination with Flt3 ligand expanded dendritic cells for tumor immunotherapy. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 98.15 (2001): 8809-14.
Frasor, J., et al. Estrogen down-regulation of the corepressor N-CoR: mechanism and implications for estrogen derepression of N-CoR-regulated genes. Proc Natl.Acad.Sci.U.S.A 102.37 (2005): 13153-57.
Frew, I. J., et al. Generation and analysis of Siah2 mutant mice. Mol.Cell Biol. 23.24 (2003): 915061.
Fu, Y. and A. S. Lee. Glucose regulated proteins in cancer progression, drug resistance and immunotherapy. Cancer Biol.Ther. 5.7 (2006): 741-44.
Furge, K. A., et al. Suppression of Ras-mediated tumorigenicity and metastasis through inhibition of the Met receptor tyrosine kinase. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 98.19 (2001): 10722-27.
Furge, K. A., Y. W. Zhang, and G. F. Vande Woude. Met receptor tyrosine kinase: enhanced signaling through adapter proteins. Oncogene 19.49 (2000): 5582-89.
- 67 037019
Gattinoni, L., et al. Adoptive immunotherapy for cancer: building on success. Nat.Rev.lmmunol.
6.5 (2006): 383-93.
Gherardi, E. and M. Stoker. Hepatocyte growth factor-scatter factor: mitogen, motogen, and met.
Cancer Cells 3.6 (1991): 227-32.
Glen, A., et al. iTRAQ-facilitated proteomic analysis of human prostate cancer cells identifies proteins associated with progression. J Proteome.Res 7.3 (2008): 897-907.
Gnjatic, S., et al. NY-CO-58/KIF2C is overexpressed in a variety of solid tumors and induces frequent T cell responses in patients with colorectal cancer. Int J Cancer (2009).
Guo, W. C., et al. Expression and its clinical significance of heat shock protein gp96 in human osteosarcoma. Neoplasma 57.1 (2010): 62-67.
Habelhah, H., et al. Stress-induced decrease in TRAF2 stability is mediated by Siah2. EMBO J 21.21 (2002): 5756-65.
Hamamoto, A., et al. Aberrant expression of the gastric mucin MUC6 in human pulmonary adenocarcinoma xenografts. Int J Oncol 26.4 (2005): 891-96.
Harada, T, et al. Genome-wide analysis of pancreatic cancer using microarray-based techniques. Pancreatoloqy. 9.1-2 (2009): 13-24.
Harper, L. J., et al. Stem cell patterns in cell lines derived from head and neck squamous cell carcinoma. J Oral Pathol.Med 36.10 (2007): 594-603.
Hayama, S., et al. Activation of CDCA1-KNTC2, members of centromere protein complex, involved in pulmonary carcinogenesis. Cancer Research 66.21 (2006): 10339-48.
Hayashi, M., et al. High expression of HER3 is associated with a decreased survival in gastric cancer. Clinical Cancer Research 14.23 (2008): 7843-49.
Heike, M., et al. Expression of stress protein gp96, a tumor rejection antigen, in human colorectal cancer. Int J Cancer 86.4 (2000): 489-93.
Hodorova, I., et al. Gp96 and its different expression in breast carcinomas. Neoplasma 55.1 (2008): 31-35.
Horton, R. A., et al. A substrate for deubiquitinating enzymes based on time-resolved fluorescence resonance energy transfer between terbium and yellow fluorescent protein. Anal.Biochem. 360.1 (2007): 138-43.
House, С. M., A. Moller, and D. D. Bowtell. Siah proteins: novel drug targets in the Ras and hypoxia pathways. Cancer Research 69.23 (2009): 8835-38.
Howard, E. W., et al. Decreased adhesiveness, resistance to anoikis and suppression of GRP94 are integral to the survival of circulating tumor cells in prostate cancer. Clin Exp.Metastasis 25.5 (2008): 497-508.
Hu, G. and E. R. Fearon. Siah-1 N-terminal RING domain is required for proteolysis function, and C-terminal sequences regulate oligomerization and binding to target proteins. Mol.Cell Biol. 19.1 (1999): 724-32.
Huang, Y, et al. Characterization of GPR56 protein and its suppressed expression in human pancreatic cancer cells. Mol.Cell Biochem. 308.1-2 (2008): 133-39.
- 68 037019
Jansen, Μ. P., et al. Downregulation of SIAH2, an ubiquitin E3 ligase, is associated with resistance to endocrine therapy in breast cancer. Breast Cancer Res Treat. 116.2 (2009): 263-71.
Jia, H. L., et al. Gene expression profiling reveals potential biomarkers of human hepatocellular carcinoma. Clinical Cancer Research 13.4 (2007): 1133-39.
Jucker, M., et al. The Met/hepatocyte growth factor receptor (HGFR) gene is overexpressed in some cases of human leukemia and lymphoma. Leuk.Res. 18.1 (1994): 7-16.
Jung, G., J. A. Ledbetter, and H. J. Muller-Eberhard. Induction of cytotoxicity in resting human T lymphocytes bound to tumor cells by antibody heteroconjugates. Proc Natl Acad Sci U S A 84.13 (1987): 4611-15.
Jung, Η. M., S. J. Choi, and J. K. Kim. Expression profiles of SV40-immortalization-associated genes upregulated in various human cancers. J Cell Biochem. 106.4 (2009): 703-13.
Kaneko, N., et al. siRNA-mediated knockdown against CDCA1 and KNTC2, both frequently overexpressed in colorectal and gastric cancers, suppresses cell proliferation and induces apoptosis. Biochem.Biophys.Res Commun. 390.4 (2009): 1235-40.
Kang, Η. M., et al. Effects of Helicobacter pylori Infection on gastric mucin expression. J Clin Gastroenterol. 42.1 (2008):29-35.
Ko, M. A., et al. Plk4 haploinsufficiency causes mitotic infidelity and carcinogenesis. Nat.Genet. 37.8 (2005): 883-88.
Kobayashi, M., et al. Activation of ErbB3-PI3-kinase pathway is correlated with malignant phenotypes of adenocarcinomas. Oncogene 22.9 (2003): 1294-301.
Koochekpour, S., et al. Met and hepatocyte growth factor/scatter factor expression in human gliomas. Cancer Res. 57.23 (1997): 5391-98.
Korzeniewski, N., et al. Cullin 1 functions as a centrosomal suppressor of centriole multiplication by regulating polo-like kinase 4 protein levels. Cancer Research 69.16 (2009): 6668-75.
Krieg, A. M. Therapeutic potential of Toll-like receptor 9 activation. Nat.Rev.Druq Discov. 5.6 (2006): 471-84.
Kunimoto, K., et al. Involvement of IQGAP3, a regulator of Ras/ERK-related cascade, in hepatocyte proliferation in mouse liver regeneration and development. J Cell Physiol 220.3 (2009): 621-31.
Kuriyama, R., et al. Gamma-tubulin-containing abnormal centrioles are induced by insufficient Plk4 in human HCT116 colorectal cancer cells. J Cell Sci. 122.Pt 12 (2009): 2014-23.
Lee, H. S., et al. MUC1, MUC2, MUC5AC, and MUC6 expressions in gastric carcinomas: their roles as prognostic indicators. Cancer 92.6 (2001): 1427-34.
Leivo, I., et al. Characterization of gene expression in major types of salivary gland carcinomas with epithelial differentiation. Cancer Genet.Cytoqenet. 156.2 (2005): 104-13.
Lemmel, C., et al. Differential quantitative analysis of MHC ligands by mass spectrometry using stable isotope labeling. Nat.Biotechnol. 22.4 (2004): 450-54.
Li, G., et al. Downregulation of E-cadherin and Desmoglein 1 by autocrine hepatocyte growth factor during melanoma development. Oncogene 20.56 (2001): 8125-35.
- 69 037019
Lim, S. О., et al. Expression of heat shock proteins (HSP27, HSP60, HSP70, HSP90, GRP78,
GRP94) in hepatitis В virus-related hepatocellular carcinomas and dysplastic nodules. World J
Gastroenterol. 11.14 (2005): 2072-79.
Lin, W., et al. Tyrosine kinases and gastric cancer. Oncogene 19.49 (2000): 5680-89.
Liu, B. and Z. LI. Endoplasmic reticulum HSP90M (gp96, grp94) optimizes В-cell function via chaperoning integrin and TLR but not immunoglobulin. Blood 112.4 (2008): 1223-30.
Liu, S. Y, et al. Requirement of MMP-3 in anchorage-independent growth of oral squamous cell carcinomas. J Oral Pathol.Med 36.7 (2007): 430-35.
Lochter, A., et al. The significance of matrix metalloproteinases during early stages of tumor progression. Ann N.Y.Acad.Sci. 857 (1998): 180-93.
Lund, С. V., et al. Zinc finger transcription factors designed for bispecific coregulation of ErbB2 and ErbB3 receptors: insights into ErbB receptor biology. Mol.Cell Biol. 25.20 (2005): 9082-91.
Ma, S., et al. Identification and characterization of tumorigenic liver cancer stem/progenitor cells. Gastroenterology 132.7 (2007): 2542-56.
MacLeod, R. J., M. Hayes, and I. Pacheco. Wnt5a secretion stimulated by the extracellular calcium-sensing receptor inhibits defective Wnt signaling in colon cancer cells. Am J Physiol Gastrointest.Liver Physiol 293.1 (2007): G403-G411.
Macmillan, J. C., et al. Comparative expression of the mitotic regulators SAK and PLK in colorectal cancer. Ann Surq Oncol 8.9 (2001): 729-40.
Maney, T, et al. The kinetochore of higher eucaryotes: a molecular view. Int Rev.Cytol. 194 (2000): 67-131.
Martin, С. M., et al. Gene expression profiling in cervical cancer: identification of novel markers for disease diagnosis and therapy. Methods Mol.Biol. 511 (2009): 333-59.
Matsukita, S., et al. Expression of mucins (MUC1, MUC2, MUC5AC and MUC6) in mucinous carcinoma of the breast: comparison with invasive ductal carcinoma. Histopathology 42.1 (2003): 26-36.
Maulik, G., et al. Role of the hepatocyte growth factor receptor, c-Met, in oncogenesis and potential for therapeutic inhibition. Cytokine Growth Factor Rev. 13.1 (2002): 41-59.
Mizrak, D., M. Brittan, and M. Alison. CD133: molecule of the moment. J Pathol. 214.1 (2008): 3-9. Montesano, R., et al. Differential effects of hepatocyte growth factor isoforms on epithelial and endothelial tubulogenesis. Cell Growth Differ. 9.5 (1998): 355-65.
Monzani, E., et al. Melanoma contains CD133 and ABCG2 positive cells with enhanced tumourigenic potential. Eur.J Cancer 43.5 (2007): 935-46.
Moore, A. and L. Wordeman. The mechanism, function and regulation of depolymerizing kinesins during mitosis. Trends Cell Biol. 14.10 (2004): 537-46.
Morgan, R. A., et al. Cancer Regression in Patients After Transfer of Genetically Engineered Lymphocytes. Science (2006).
Mori, M., et al. HLAgene and haplotype frequencies in the North American population: the National Marrow Donor Program Donor Registry. Transplantation 64.7 (1997): 1017-27.
- 70 037019
Murray, G. I., et al. Matrix metalloproteinases and their inhibitors in gastric cancer. Gut 43.6 (1998): 791-97.
Murshid, A., J. Gong, and S. K. Calderwood. Heat-shock proteins in cancer vaccines: agents of antigen cross-presentation. Expert.Rev.Vaccines. 7.7 (2008): 1019-30.
Nakaigawa, N., et al. Inactivation of von Hippel-Lindau gene induces constitutive phosphorylation of MET protein in clear cell renal carcinoma. Cancer Res. 66.7 (2006): 3699-705.
Nakamura, Y, et al. Clinicopathological and biological significance of mitotic centromereassociated kinesin overexpression in human gastric cancer. Br.J Cancer 97.4 (2007): 543-49.
Nakayama, K., J. Qi, and Z. Ronai. The ubiquitin ligase Siah2 and the hypoxia response. Mol.Cancer Res 7.4 (2009): 443-51.
Naldini, L., et al. Hepatocyte growth factor (HGF) stimulates the tyrosine kinase activity of the receptor encoded by the proto-oncogene c-MET. Oncogene 6.4 (1991): 501-04.
Nguyen, Q. N., et al. Light controllable siRNAs regulate gene suppression and phenotypes in cells. Biochim.Biophys.Acta 1758.3 (2006): 394-403.
Nishio, K., et al. Crystal structure of the de-ubiquitinating enzyme UCH37 (human UCH-L5) catalytic domain. Biochem.Biophys.Res Commun. 390.3 (2009): 855-60.
Nojima, H., et al. IQGAP3 regulates cell proliferation through the Ras/ERK signalling cascade. Nat.Cell Biol. 10.8 (2008): 971-78.
Nomura, H., et al. Enhanced production of matrix metalloproteinases and activation of matrix metalloproteinase 2 (gelatinase A) in human gastric carcinomas. Int J Cancer 69.1 (1996): 9-16.
Nomura, H., et al. Network-based analysis of calcium-binding protein genes identifies Grp94 as a target in human oral carcinogenesis. Br.J Cancer 97.6 (2007): 792-801.
Ohnuma, S., et al. Cancer-associated splicing variants of the CDCA1 and MSMB genes expressed in cancer cell lines and surgically resected gastric cancer tissues. Surgery 145.1 (2009): 57-68.
Park, Y. H., et al. Capecitabine in combination with Oxaliplatin (XELOX) as a first-line therapy for advanced gastric cancer. Cancer Chemother.Pharmacol. (2007).
Pascolo, S., et al. The non-classical HLA class I molecule HFE does not influence the NK-like activity contained in fresh human PBMCs and does not interact with NK cells. Int.Immunol. 17.2 (2005): 117-22.
Peel, N., et al. Overexpressing centriole-replication proteins in vivo induces centriole overduplication and de novo formation. Curr.Biol. 17.10 (2007): 834-43.
Pereira, Μ. B., et al. Immunohistochemical study of the expression of MUC5AC and MUC6 in breast carcinomas and adjacent breast tissues. J Clin Pathol. 54.3 (2001): 210-13.
Pietra, G., et al. Natural killer cells kill human melanoma cells with characteristics of cancer stem cells. Int Immunol. 21.7 (2009): 793-801.
Poller, D. N., et al. Production and characterization of a polyclonal antibody to the c-erbB-3 protein: examination of c-erbB-3 protein expression in adenocarcinomas. J Pathol. 168.3 (1992): 275-80.
Pons, E., С. C. Uphoff, and H. G. Drexler. Expression of hepatocyte growth factor and its receptor c-met in human leukemia-lymphoma cell lines. Leuk.Res. 22.9 (1998): 797-804.
- 71 037019
Ponzetto, C., et al. A novel recognition motif for phosphatidylinositol 3-kinase binding mediates its association with the hepatocyte growth factor/scatter factor receptor. Mol.Cell Biol. 13.8 (1993):
4600-08.
Poppe, M., et al. Phosphorylation of Helicobacter pylori CagA by c-Abl leads to cell motility. Oncogene 26.24 (2007): 3462-72.
Pytel, D., et al. Tyrosine kinase blockers: new hope for successful cancer therapy. Anticancer Agents Med Chem. 9.1 (2009):66-76.
Qi, J., et al. The ubiquitin ligase Siah2 regulates tumorigenesis and metastasis by HIF-dependent and -independent pathways. Proc Natl.Acad.Sci.U.S.A 105.43 (2008): 16713-18.
Qian, C. N., et al. Met protein expression level correlates with survival in patients with late-stage nasopharyngeal carcinoma. Cancer Res. 62.2 (2002): 589-96.
Qian, Z., et al. Cytogenetic and genetic pathways in therapy-related acute myeloid leukemia. Chem.Biol.Interact. (2009).
Ramirez, R., et al. Over-expression of hepatocyte growth factor/scatter factor (HGF/SF) and the HGF/SF receptor (cMET) are associated with a high risk of metastasis and recurrence for children and young adults with papillary thyroid carcinoma. Clin Endocrinol.(Oxf) 53.5 (2000): 635-44.
Rammensee, H. G., et al. SYFPEITHI: database for MHC ligands and peptide motifs. Immunogenetics 50.3-4 (1999): 213-19.
Rammensee, H. G., J. Bachmann, and S. Stevanovic. MHC Ligands and Peptide Motifs. SpringerVerlag, Heidelberg, Germany, 1997.
Rappa, G., O. Fodstad, and A. Lorico. The stem cell-associated antigen CD133 (Prominin-1) is a molecular therapeutic target for metastatic melanoma. Stem Cells 26.12 (2008): 3008-17.
Richardson, G. D., et al. CD133, a novel marker for human prostatic epithelial stem cells. J Cell Sci. 117.Pt 16 (2004): 3539-45.
Rini, В. I., et al. Combination immunotherapy with prostatic acid phosphatase pulsed antigenpresenting cells (provenge) plus bevacizumab in patients with serologic progression of prostate cancer after definitive local therapy. Cancer 107.1 (2006): 67-74.
Rodrigues-Martins, A., et al. Revisiting the role of the mother centriole in centriole biogenesis. Science 316.5827 (2007): 1046-50.
Rosenberg, S. A., et al. A progress report on the treatment of 157 patients with advanced cancer using lymphokine-activated killer cells and interleukin-2 or high-dose interleukin-2 alone. N.Engl.J.Med. 316.15 (1987): 889-97.
Rosenberg, S. A., et al. Use of tumor-infiltrating lymphocytes and interleukin-2 in the immunotherapy of patients with metastatic melanoma. A preliminary report. N.Engl.J Med 319.25 (1988): 1676-80.
Rott, R., et al. Monoubiquitylation of alpha-synuclein by seven in absentia homolog (SIAH) promotes its aggregation in dopaminergic cells. J Biol.Chem. 283.6 (2008): 3316-28.
Rutella, S., et al. Cells with characteristics of cancer stem/progenitor cells express the CD133 antigen in human endometrial tumors. Clinical Cancer Research 15.13 (2009): 4299-311.
- 72 037019
Saiki, R. К., et al. Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Science 239.4839 (1988): 487-91.
Samant, G. V. and P. W. Sylvester. gamma-Tocotrienol inhibits ЕгЬВЗ-dependent PI3K/Akt mitogenic signalling in neoplastic mammary epithelial cells. Cell Prolif. 39.6 (2006): 563-74.
Sanidas, E. E., et al. Expression of the c-erbB-3 gene product in gastric cancer. Int J Cancer 54.6 (1993): 935-40.
Scott, G. K., et al. Coordinate suppression of ERBB2 and ERBB3 by enforced expression of microRNAmiR-125a or miR-125b. J Biol.Chem. 282.2 (2007): 1479-86.
Sergina, Ν. V., et al. Escape from HER-family tyrosine kinase inhibitor therapy by the kinaseinactive HER3. Nature 445.7126 (2007): 437-41.
Shah, M., et al. Inhibition of Siah2 ubiquitin ligase by vitamin КЗ (menadione) attenuates hypoxia and МАРК signaling and blocks melanoma tumorigenesis. Pigment Cell Melanoma Res 22.6 (2009): 799-808.
Shapiro, G. I. Cyclin-dependent kinase pathways as targets for cancer treatment. J Clin Oncol 24.11 (2006): 1770-83.
Sherman-Baust, C. A., et al. Remodeling of the extracellular matrix through overexpression of collagen VI contributes to cisplatin resistance in ovarian cancer cells. Cancer Cell 3.4 (2003): 37786.
Sheu, M. L., S. H. Liu, and К. H. Lan. Honokiol induces calpain-mediated glucose-regulated protein-94 cleavage and apoptosis in human gastric cancer cells and reduces tumor growth. PLoS.ONE. 2.10 (2007): e1096.
Shimo, A., et al. Involvement of kinesin family member 2C/mitotic centromere-associated kinesin overexpression in mammary carcinogenesis. Cancer Sci. 99.1 (2008): 62-70.
Singh, S. K., et al. Identification of a cancer stem cell in human brain tumors. Cancer Res. 63.18 (2003): 5821-28.
Singh, S. K., et al. Identification of human brain tumour initiating cells. Nature 432.7015 (2004): 396-401.
Sithanandam, G. and L. M. Anderson. The ERBB3 receptor in cancer and cancer gene therapy. Cancer Gene Ther. 15.7 (2008): 413-48.
Sithanandam, G., et al. Inactivation of ErbB3 by siRNA promotes apoptosis and attenuates growth and invasiveness of human lung adenocarcinoma cell line A549. Oncogene 24.11 (2005): 1847-59. Skawran, B., et al. Gene expression profiling in hepatocellular carcinoma: upregulation of genes in amplified chromosome regions. Mod.Pathol. 21.5 (2008): 505-16.
Slesak, B., et al. Expression of epidermal growth factor receptor family proteins (EGFR, c-erbB-2 and c-erbB-3) in gastric cancer and chronic gastritis. Anticancer Res 18.4A (1998): 2727-32.
Small, E. J., et al. Placebo-controlled phase III trial of immunologic therapy with sipuleucel-T (APC8015) in patients with metastatic, asymptomatic hormone refractory prostate cancer. J Clin Oncol. 24.19 (2006): 3089-94.
Smith, L. M., et al. CD133/prominin-1 is a potential therapeutic target for antibody-drug conjugates in hepatocellular and gastric cancers. Br.J Cancer 99.1 (2008): 100-09.
- 73 037019
Smith, M. J., et al. Analysis of differential gene expression in colorectal cancer and stroma using fluorescence-activated cell sorting purification. Br.J Cancer 100.9 (2009): 1452-64.
Smogorzewska, A., et al. Identification of the FANCI protein, a monoubiquitinated FANCD2 paralog required for DNA repair. Cell 129.2 (2007): 289-301.
Staehler, M., Stenzl, A., Dietrich, P. Y, Eisen, T, Haferkamp, A., Beck, J., Mayer, A., Walter, S., Singh-Jasuja, H., and Stief, C. A phase I study to evaluate safety, immunogenicity and anti-tumor activity of the multi-peptide vaccine IMA901 in renal cell carcinoma patients (RCC). Journal of Clinical Oncology, 2007 ASCO Annual Meeting Proceedings Part I Vol 25, No. 18S (June 20 Supplement), 2007: 5098. 6-20-2007.
Ref Type: Abstract
Stemmann, O., et al. Dual inhibition of sister chromatid separation at metaphase. Cell 107.6 (2001): 715-26.
Suetsugu, A., et al. Characterization of CD133+ hepatocellular carcinoma cells as cancer stem/progenitor cells. Biochem.Biophys.Res.Commun. 351.4 (2006): 820-24.
Suva, M. L., et al. Identification of Cancer Stem Cells in Ewing's Sarcoma. Cancer Research (2009).
Swallow, C. J., et al. Sak/Plk4 and mitotic fidelity. Oncogene 24.2 (2005): 306-12.
Szczepanowski, M., et al. Regulation of repp86 stability by human Siah2. Biochem.Biophys.Res Commun. 362.2 (2007): 485-90.
Tajima, Y, et al. Gastric and intestinal phenotypic marker expression in early differentiated-type tumors of the stomach: clinicopathologic significance and genetic background. Clinical Cancer Research 12.21 (2006):6469-79.
Takaishi, S., et al. Identification of gastric cancer stem cells using the cell surface marker CD44. Stem Cells 27.5 (2009): 1006-20.
Takayama, H., et al. Diverse tumorigenesis associated with aberrant development in mice overexpressing hepatocyte growth factor/scatter factor. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 94.2 (1997): 70106.
Teofili, L., et al. Expression of the c-met proto-oncogene and its ligand, hepatocyte growth factor, in Hodgkin disease. Blood 97.4 (2001): 1063-69.
Thorsen, K., et al. Alternative splicing in colon, bladder, and prostate cancer identified by exon array analysis. Mol.Cell Proteomics. 7.7 (2008): 1214-24.
Tirino, V, et al. The role of CD133 in the identification and characterisation of tumour-initiating cells in non-small-cell lung cancer. Eur.J Cardiothorac.Surq 36.3 (2009): 446-53.
Todaro, M., et al. Colon cancer stem cells dictate tumor growth and resist cell death by production of interleukin-4. Cell Stem Cell 1.4 (2007): 389-402.
Topol, L., et al. Wnt-5a inhibits the canonical Wnt pathway by promoting GSK-3-independent betacatenin degradation. J Cell Biol. 162.5 (2003): 899-908.
Toribara, N. W., et al. Human gastric mucin. Identification of a unique species by expression cloning. J Biol.Chem. 268.8 (1993): 5879-85.
- 74 037019
Tsan, M. F. and В. Gao. Heat shock protein and innate immunity. Cell Mol.Immunol. 1.4 (2004):
274-79.
Tuck, A. B., et al. Coexpression of hepatocyte growth factor and receptor (Met) in human breast carcinoma. Am.J.Pathol. 148.1 (1996): 225-32.
Vairaktaris, E., et al. Association of-1171 promoter polymorphism of matrix metalloproteinase-3 with increased risk for oral cancer. Anticancer Res 27.6B (2007): 4095-100.
Vandenbroeck, К., E. Martens, and I. Alloza. Multi-chaperone complexes regulate the folding of interferon-gamma in the endoplasmic reticulum. Cytokine 33.5 (2006): 264-73.
Walter, S., et al. Cutting edge: predetermined avidity of human CD8 T cells expanded on calibrated MHC/anti-CD28-coated microspheres. J.Immunol. 171.10 (2003): 4974-78.
Wang, Q., et al. Overexpression of endoplasmic reticulum molecular chaperone GRP94 and GRP78 in human lung cancer tissues and its significance. Cancer Detect.Prev. 29.6 (2005): 54451.
Wang, R., et al. Activation of the Met receptor by cell attachment induces and sustains hepatocellular carcinomas in transgenic mice. J.Cell Biol. 153.5 (2001): 1023-34.
Wang, R. Q. and D. C. Fang. Effects of Helicobacter pylori infection on mucin expression in gastric carcinoma and pericancerous tissues. J Gastroenterol.Hepatol. 21.2 (2006): 425-31.
Wang, S., et al. IQGAP3, a novel effector of Rac1 and Cdc42, regulates neurite outgrowth. J Cell Sci. 120.Pt 4 (2007): 567-77.
Wang, X., et al. Immunolocalisation of heat shock protein 72 and glycoprotein 96 in colonic adenocarcinoma. Acta Histochem. 110.2 (2008): 117-23.
Wang, X. P, et al. Expression and significance of heat shock protein 70 and glucose-regulated protein 94 in human esophageal carcinoma. World J Gastroenterol. 11.3 (2005): 429-32.
Wang, X. P, et al. Correlation between clinicopathology and expression of heat shock protein 70 and glucose-regulated protein 94 in human colonic adenocarcinoma. World J Gastroenterol. 11.7 (2005): 1056-59.
Wang, X. P, Q. X. Wang, and X. P. Ying. Correlation between clinicopathology and expression of heat shock protein 72 and glycoprotein 96 in human gastric adenocarcinoma. Tohoku J Exp.Med 212.1 (2007): 35-41.
Weinschenk, T., et al. Integrated functional genomics approach for the design of patient-individual antitumor vaccines. Cancer Res. 62.20 (2002): 5818-27.
White, C. D., M. D. Brown, and D. B. Sacks. IQGAPs in cancer: a family of scaffold proteins underlying tumorigenesis. FEBS Lett. 583.12 (2009): 1817-24.
Wicks, S. J., et al. Reversible ubiquitination regulates the Smad/TGF-beta signalling pathway. Biochem.Soc Trans. 34.Pt 5 (2006): 761-63.
Wicks, S. J., et al. The deubiquitinating enzyme UCH37 interacts with Smads and regulates TGFbeta signalling. Oncogene 24.54 (2005): 8080-84.
Yajima, S., et al. Expression profiling of fecal colonocytes for RNA-based screening of colorectal cancer. Int J Oncol 31.5 (2007): 1029-37.
- 75 037019
Yang, L., et al. IL-21 and TGF-beta are required for differentiation of human T(H)17 cells. Nature (2008).
Yang, S., et al. Molecular basis of the differences between normal and tumor tissues of gastric cancer. Biochim.Biophys.Acta 1772.9 (2007): 1033-40.
Yao, D. F., et al. Abnormal expression of HSP gp96 associated with HBV replication in human hepatocellular carcinoma. Hepatobiliary.Pancreat.Dis.Int 5.3 (2006): 381-86.
Yasui, W., et al. Increased expression of p34cdc2 and its kinase activity in human gastric and colonic carcinomas. Int J Cancer 53.1 (1993): 36-41.
Yee, C., et al. Adoptive T cell therapy using antigen-specific CD8+ T cell clones for the treatment of patients with metastatic melanoma: in vivo persistence, migration, and antitumor effect of transferred T cells. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 99.25 (2002): 16168-73.
Yin, S., et al. CD133 positive hepatocellular carcinoma cells possess high capacity for tumoriqenicitv. Int.J Cancer 120.7 (2007): 1444-50.
Yokozaki, H., W. Yasui, and E. Tahara. Genetic and epigenetic changes in stomach cancer. Int Rev.Cytol. 204 (2001): 49-95.
Yuan, W., et al. Expression of EphA2 and E-cadherin in gastric cancer: correlated with tumor progression and lymphogenous metastasis. Pathol.Oncol Res 15.3 (2009): 473-78.
Yuan, W. J., et al. Over-expression of EphA2 and EphrinA-1 in human gastric adenocarcinoma and its prognostic value for postoperative patients. Dig.Dis.Sci. 54.11 (2009): 2410-17.
Zaremba, S., et al. Identification of an enhancer agonist cytotoxic T lymphocyte peptide from human carcinoembryonic antigen. Cancer Res. 57.20 (1997): 4570-77.
Zhang, X., R. M. Kedl, and J. Xiang. CD40 ligation converts TGF-beta-secreting tolerogenic CD48- dendritic cells into IL-12-secreting immunogenic ones. Biochem.Biophys.Res Commun. 379.4 (2009): 954-58.
Zhang, X. L., et al. Comparative study on overexpression of HER2/neu and HER3 in gastric cancer. World J Surg 33.10 (2009): 2112-18.
Zhao, C., et al. Hedgehog signalling is essential for maintenance of cancer stem cells in myeloid leukaemia. Nature (2009).
Zheng, H., et al. Cell surface targeting of heat shock protein gp96 induces dendritic cell maturation and antitumor immunity. J Immunol. 167.12 (2001): 6731-35.
Zheng, H., et al. MUC6 down-regulation correlates with gastric carcinoma progression and a poor prognosis: an immunohistochemical study with tissue microarrays. J Cancer Res Clin Oncol 132.12 (2006): 817-23.
Zheng, H. C., et al. Overexpression of GRP78 and GRP94 are markers for aggressive behavior and poor prognosis in gastric carcinomas. Hum.Pathol. 39.7 (2008): 1042-49.
Zhou, G., et al. 2D differential in-gel electrophoresis for the identification of esophageal scans cell cancer-specific protein markers. Mol.Cell Proteomics. 1.2 (2002): 117-24.
Zhou, L., et al. TGF-beta-induced Foxp3 inhibits T(H)17 cell differentiation by antagonizing RORgammat function. Nature 453.7192 (2008): 236-40.
Zhu, K. J., et al. Imiquimod inhibits the differentiation but enhances the maturation of human monocyte-derived dendritic cells. Int Immunopharmacol. 9.4 (2009): 412-17.
Claims (14)
1. Пептид, который связывается с молекулой главного комплекса гистосовместимости (MHC), выбранный из группы:
(а) пептид, состоящий из последовательности в соответствии с SEQ ID NO: 86; и (б) пептид в соответствии с (а), где указанный пептид включает непептидные связи.
2. Нуклеиновая кислота, кодирующая пептид по п.1 в соответствии с (а).
3. Вектор экспрессии, экспрессирующий нуклеиновую кислоту по п.2.
4. Клетка-хозяин, включающая нуклеиновую кислоту по п.2 или вектор экспрессии по п.3.
5. Клетка-хозяин по п.4, которая является антигенпрезентирующей клеткой.
6. Клетка-хозяин по п.5, где антигенпрезентирующая клетка является дендритной клеткой.
7. Способ получения активированных цитотоксических Т-лимфоцитов (ЦТЛ) in vitro, где способ включает контактирование ЦТЛ in vitro с нагруженными антигеном молекулами MHC I класса человека, экспрессированными на поверхности антигенпрезентирующей клетки в течение периода времени, достаточного для активации указанных ЦТЛ антигенспецифическим образом, где указанный антиген является пептидом по п.1(а).
8. Активированный цитотоксический Т-лимфоцит (ЦТЛ), полученный с помощью способа по п.7, который селективно распознает клетку, которая аберрантно экспрессирует полипептид, включающий аминокислотную последовательность, указанную в п.1(а).
9. Антитело, которое специфически связывается с комплексом MHC/пептид, включающим пептид по п.1(а).
10. Применение пептида по п.1 в качестве лекарственного средства для лечения рака.
11. Применение антитела по п.9 в качестве лекарственного средства для лечения рака.
12. Применение по п.10 или 11, где лекарственное средство представляет собой вакцину.
13. Применение по любому из пп.10-12, где указанный рак представляет собой рак желудка, рак желудочно-кишечного тракта, колоректальный рак, рак поджелудочной железы, рак легких или почек.
14. Применение пептида по п.1 in vitro для получения и разработки специфических антител к комплексам MHC/пептид.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US31570410P | 2010-03-19 | 2010-03-19 | |
GBGB1004551.6A GB201004551D0 (en) | 2010-03-19 | 2010-03-19 | NOvel immunotherapy against several tumors including gastrointestinal and gastric cancer |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201792409A2 EA201792409A2 (ru) | 2018-03-30 |
EA201792409A3 EA201792409A3 (ru) | 2018-07-31 |
EA037019B1 true EA037019B1 (ru) | 2021-01-27 |
Family
ID=42227949
Family Applications (8)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA202091251A EA202091251A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA202091250A EA202091250A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA202091241A EA202091241A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA201792409A EA037019B1 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Пептид, который связывается с молекулой главного комплекса гистосовместимости, нуклеиновая кислота, вектор экспрессии, клетка-хозяин, активированный цитотоксический т-лимфоцит, антитело и их применение в качестве лекарственного средства для лечения рака |
EA202091233A EA202091233A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA201690511A EA039357B1 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA201201306A EA024497B1 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Пептид, связывающийся с молекулой главного комплекса гистосовместимости человека i класса, и его применение для лечения рака |
EA202091242A EA202091242A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
Family Applications Before (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA202091251A EA202091251A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA202091250A EA202091250A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA202091241A EA202091241A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
Family Applications After (4)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA202091233A EA202091233A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA201690511A EA039357B1 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
EA201201306A EA024497B1 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Пептид, связывающийся с молекулой главного комплекса гистосовместимости человека i класса, и его применение для лечения рака |
EA202091242A EA202091242A3 (ru) | 2010-03-19 | 2011-03-15 | Новые способы иммунотерапии нескольких видов опухолей, в том числе рака желудочно-кишечного тракта и рака желудка |
Country Status (30)
Country | Link |
---|---|
US (24) | US10064913B2 (ru) |
EP (9) | EP3753570A1 (ru) |
JP (9) | JP5891181B2 (ru) |
KR (13) | KR101656913B1 (ru) |
CN (8) | CN112409451A (ru) |
AU (1) | AU2011229199B2 (ru) |
BR (1) | BR112012023692B1 (ru) |
CA (5) | CA2789857C (ru) |
CY (5) | CY1119366T1 (ru) |
DK (6) | DK3363456T3 (ru) |
EA (8) | EA202091251A3 (ru) |
ES (6) | ES2642562T3 (ru) |
GB (1) | GB201004551D0 (ru) |
HK (5) | HK1208174A1 (ru) |
HR (6) | HRP20150867T1 (ru) |
HU (6) | HUE033682T2 (ru) |
LT (5) | LT2845604T (ru) |
ME (3) | ME02229B (ru) |
MX (6) | MX2012010813A (ru) |
MY (2) | MY178651A (ru) |
NZ (7) | NZ711296A (ru) |
PH (2) | PH12016500949B1 (ru) |
PL (6) | PL3195873T3 (ru) |
PT (6) | PT2547354E (ru) |
RS (6) | RS60765B1 (ru) |
SG (4) | SG10201606771SA (ru) |
SI (6) | SI2845604T1 (ru) |
TW (9) | TWI681967B (ru) |
UA (3) | UA111711C2 (ru) |
WO (1) | WO2011113819A2 (ru) |
Families Citing this family (95)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7604662B2 (en) | 2007-07-13 | 2009-10-20 | Boston Scientific Scimed, Inc. | Endoprostheses containing boride intermetallic phases |
RS53782B1 (en) | 2008-10-01 | 2015-06-30 | Immatics Biotechnologies Gmbh | TUMOR-ASSOCIATED PEPTIDES PREPARED AND ANTI-CHANGE RESPONSE FOR GLIOBLASTOMA (GBM) AND OTHER CANCER TREATMENTS |
GB201004575D0 (en) * | 2010-03-19 | 2010-05-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Composition of tumor associated peptides and related anti cancer vaccine for the treatment of gastric cancer and other cancers |
GB201004551D0 (en) * | 2010-03-19 | 2010-05-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | NOvel immunotherapy against several tumors including gastrointestinal and gastric cancer |
EP2400035A1 (en) * | 2010-06-28 | 2011-12-28 | Technische Universität München | Methods and compositions for diagnosing gastrointestinal stromal tumors |
US9040046B2 (en) | 2011-01-31 | 2015-05-26 | Kai Xu | Sodium pump antibody agonists and methods of treating heart disease using the same |
UA114298C2 (uk) * | 2011-10-28 | 2017-05-25 | Онкотерапі Саєнс, Інк. | Пептид торк та вакцина, що його містить |
US10704021B2 (en) | 2012-03-15 | 2020-07-07 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustic perfusion devices |
CA3223380A1 (en) * | 2012-03-19 | 2013-09-26 | Stemline Therapeutics, Inc. | Methods for treating and monitoring the status of cancer |
HUE056350T2 (hu) | 2012-05-16 | 2022-02-28 | Stemline Therapeutics Inc | Rákos õssejt célzott rák elleni vakcinák |
EP2872532A4 (en) | 2012-07-10 | 2016-04-13 | Oncotherapy Science Inc | CDCA1-EPITOPPEPTIDES FOR TH1 CELLS AND VACCINES THEREWITH |
US20150285802A1 (en) | 2012-07-18 | 2015-10-08 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Methods for treating, preventing and predicting risk of developing breast cancer |
JP6212249B2 (ja) * | 2012-08-08 | 2017-10-11 | 学校法人 京都産業大学 | カルシウムポンプ制御物質のスクリーニング方法、並びに、メラニン色素合成阻害物質のスクリーニング方法 |
WO2014035695A1 (en) * | 2012-08-30 | 2014-03-06 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Anti-tumor t cell immunity induced by high dose radiation |
TWI777195B (zh) * | 2013-08-05 | 2022-09-11 | 德商伊瑪提克斯生物科技有限公司 | 新穎肽類,細胞及其用於治療多種腫瘤的用途,其製造方法及包含其等之醫藥組成物(三) |
HRP20211852T1 (hr) | 2013-08-05 | 2022-03-18 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Nova imunoterapija protiv nekoliko tumora, poput raka pluća, uključujući nsclc |
EP2876442A1 (en) * | 2013-11-22 | 2015-05-27 | Institut de Cancérologie de l'Ouest | Olfactomedin-4, neudesin and desmoplakin as biomarkers of breast cancer |
US9725710B2 (en) | 2014-01-08 | 2017-08-08 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustophoresis device with dual acoustophoretic chamber |
AU2015222917A1 (en) | 2014-02-27 | 2016-09-15 | Lycera Corporation | Adoptive cellular therapy using an agonist of retinoic acid receptor-related orphan receptor gamma and related therapeutic methods |
WO2015164826A2 (en) * | 2014-04-24 | 2015-10-29 | Rhode Island Hospital | ASPARTATE-β-HYDROXYLASE INDUCES EPITOPE-SPECIFIC T CELL RESPONSES IN TUMORS |
US10189777B2 (en) | 2014-05-05 | 2019-01-29 | Lycera Corporation | Benzenesulfonamido and related compounds for use as agonists of RORγ and the treatment of disease |
EP3140291A4 (en) | 2014-05-05 | 2018-01-10 | Lycera Corporation | Tetrahydroquinoline sulfonamide and related compounds for use as agonists of rory and the treatment of disease |
GB201408255D0 (en) * | 2014-05-09 | 2014-06-25 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel immunotherapy against several tumours of the blood, such as acute myeloid leukemia (AML) |
KR101644599B1 (ko) | 2014-10-14 | 2016-08-16 | 연세대학교 산학협력단 | 미토콘드리아 단백질 uqcrb 관련 질환 유전자발현 세포 구축 및 이를 활용한 uqcrb 기능조절 활성평가계 구축 |
MA40737A (fr) * | 2014-11-21 | 2017-07-04 | Memorial Sloan Kettering Cancer Center | Déterminants de la réponse d'un cancer à une immunothérapie par blocage de pd-1 |
GB201423361D0 (en) * | 2014-12-30 | 2015-02-11 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Method for the absolute Quantification of naturally processed HLA-Restricted cancer peptides |
US11000548B2 (en) | 2015-02-18 | 2021-05-11 | Enlivex Therapeutics Ltd | Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment |
US11304976B2 (en) | 2015-02-18 | 2022-04-19 | Enlivex Therapeutics Ltd | Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment |
US11497767B2 (en) | 2015-02-18 | 2022-11-15 | Enlivex Therapeutics R&D Ltd | Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment |
WO2016132366A1 (en) | 2015-02-18 | 2016-08-25 | Enlivex Therapeutics Ltd. | Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment |
US11596652B2 (en) | 2015-02-18 | 2023-03-07 | Enlivex Therapeutics R&D Ltd | Early apoptotic cells for use in treating sepsis |
US11318163B2 (en) | 2015-02-18 | 2022-05-03 | Enlivex Therapeutics Ltd | Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment |
MY190083A (en) | 2015-03-17 | 2022-03-25 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against pancreatic cancer and other cancers |
GB201504502D0 (en) * | 2015-03-17 | 2015-04-29 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against pancreatic cancer and other cancers |
CN107708811B (zh) | 2015-04-21 | 2021-04-30 | 恩立夫克治疗有限责任公司 | 治疗性汇集的血液凋亡细胞制剂与其用途 |
GB201507030D0 (en) * | 2015-04-24 | 2015-06-10 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Immunotherapy against lung cancers, in particular NSCLC |
US11377651B2 (en) | 2016-10-19 | 2022-07-05 | Flodesign Sonics, Inc. | Cell therapy processes utilizing acoustophoresis |
US11708572B2 (en) | 2015-04-29 | 2023-07-25 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustic cell separation techniques and processes |
EP3292119A4 (en) | 2015-05-05 | 2018-10-03 | Lycera Corporation | DIHYDRO-2H-BENZO[b][1,4]OXAZINE SULFONAMIDE AND RELATED COMPOUNDS FOR USE AS AGONISTS OF RORy AND THE TREATMENT OF DISEASE |
NL2014935B1 (en) | 2015-06-08 | 2017-02-03 | Applied Immune Tech Ltd | T cell receptor like antibodies having fine specificity. |
MX2017016134A (es) | 2015-06-11 | 2018-08-15 | Lycera Corp | Aril dihidro-2h-benzo[b][1,4]oxazina sulfonamida y compuestos relacionados para uso como agonistas de rory y el tratamiento de enfermedad. |
SG10202107374UA (en) * | 2015-06-19 | 2021-08-30 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy and methods for generating scaffolds for the use against pancreatic cancer and other cancers |
GB201510771D0 (en) * | 2015-06-19 | 2015-08-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy and methods for generating scaffolds for the use against pancreatic cancer |
PE20230321A1 (es) | 2015-07-01 | 2023-02-22 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Nuevos peptidos y nuevas combinaciones de peptidos para el uso en la inmunoterapia contra el cancer de ovario y otros tipos de cancer |
GB201511546D0 (en) | 2015-07-01 | 2015-08-12 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against ovarian cancer and other cancers |
GB201512369D0 (en) * | 2015-07-15 | 2015-08-19 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against epithelial ovarian cancer and other cancers |
US10130693B2 (en) * | 2015-08-28 | 2018-11-20 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Peptides, combination of peptides and scaffolds for use in immunotherapeutic treatment of various cancers |
TWI796642B (zh) | 2015-08-28 | 2023-03-21 | 德商英麥提克生物技術股份有限公司 | 用於多種癌症之免疫治療的新穎胜肽、胜肽的組合物及支架 |
GB201515321D0 (en) | 2015-08-28 | 2015-10-14 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides, combination of peptides and scaffolds for use in immunotherapeutic treatment of various cancers |
KR102601499B1 (ko) * | 2015-11-06 | 2023-11-13 | 연세대학교 산학협력단 | miRNA 발현 수준으로부터 UQCRB 관련 질병을 진단하는 방법 |
GB201521746D0 (en) * | 2015-12-10 | 2016-01-27 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against CLL and other cancers |
IL259931B2 (en) | 2015-12-16 | 2024-02-01 | Gritstone Bio Inc | Identification of neo-antigens, preparation, and use |
US11730761B2 (en) | 2016-02-18 | 2023-08-22 | Enlivex Therapeutics Rdo Ltd | Combination immune therapy and cytokine control therapy for cancer treatment |
GB201603568D0 (en) * | 2016-03-01 | 2016-04-13 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Efficient treatment options including peptides and combination of peptide and cell based medicaments for use in immunotherapy against urinary bladder cancer |
MA54832A (fr) * | 2016-03-01 | 2021-12-01 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Peptides, combinaison de peptides et médicaments à base de cellules destinés à être utilisés en immunothérapie contre le cancer de la vessie et d'autres cancers |
GB201603987D0 (en) | 2016-03-08 | 2016-04-20 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Uterine cancer treatments |
GB201604490D0 (en) | 2016-03-16 | 2016-04-27 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Peptides combination of peptides for use in immunotherapy against cancers |
GB201604458D0 (en) * | 2016-03-16 | 2016-04-27 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against cancers |
JP2019520038A (ja) | 2016-04-21 | 2019-07-18 | イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー | 黒色腫およびその他のがんに対する免疫療法 |
CA3021159A1 (en) * | 2016-04-21 | 2017-10-26 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Immunotherapy against melanoma and other cancers |
US11214789B2 (en) | 2016-05-03 | 2022-01-04 | Flodesign Sonics, Inc. | Concentration and washing of particles with acoustics |
KR20220044870A (ko) * | 2016-08-17 | 2022-04-11 | 이매틱스 바이오테크놀로지스 게엠베하 | T 세포 수용체 및 이를 사용하는 면역 요법 |
DE102016115246C5 (de) * | 2016-08-17 | 2018-12-20 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Neue t-zellrezeptoren und deren verwendung in immuntherapie |
ZA201900664B (en) | 2016-08-17 | 2021-09-29 | Paul Ehrlich Strasse 15 Tuebingen 72076 Germany | T cell receptors and immune therapy using the same |
WO2018094569A1 (zh) | 2016-11-22 | 2018-05-31 | 深圳华大基因研究院 | 多肽及其应用 |
WO2018098715A1 (zh) * | 2016-11-30 | 2018-06-07 | 深圳华大基因研究院 | 多肽及其应用 |
DE102016123893A1 (de) | 2016-12-08 | 2018-06-14 | Immatics Biotechnologies Gmbh | T-Zellrezeptoren mit verbesserter Bindung |
EP4317432A3 (en) | 2016-12-08 | 2024-04-17 | Immatics Biotechnologies GmbH | T cell receptors with improved pairing |
WO2018189148A1 (en) | 2017-04-10 | 2018-10-18 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Peptides and combination thereof for use in the immunotherapy against cancers |
CN111548405A (zh) * | 2017-04-10 | 2020-08-18 | 伊玛提克斯生物技术有限公司 | 用于癌症免疫治疗的肽及其肽组合物 |
AU2018298884A1 (en) | 2017-07-14 | 2020-02-27 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Improved dual specificity polypeptide molecule |
DE102017115966A1 (de) | 2017-07-14 | 2019-01-17 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Polypeptidmolekül mit verbesserter zweifacher Spezifität |
CN111465989B (zh) | 2017-10-10 | 2024-06-25 | 磨石生物公司 | 使用热点进行的新抗原鉴别 |
DE102017125888A1 (de) * | 2017-11-06 | 2019-05-23 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Neue konstruierte T-Zell-Rezeptoren und deren Verwendung in Immuntherapie |
DK3707159T3 (da) * | 2017-11-06 | 2023-04-11 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Hidtil ukendte modificerede t-cellereceptorer og immunterapi med anvendelse deraf |
CN111630602A (zh) | 2017-11-22 | 2020-09-04 | 磨石肿瘤生物技术公司 | 减少新抗原的接合表位呈递 |
AU2018385759B2 (en) | 2017-12-14 | 2021-10-21 | Flodesign Sonics, Inc. | Acoustic transducer driver and controller |
WO2020081537A1 (en) * | 2018-10-16 | 2020-04-23 | Texas Tech University System | Method to express, purify, and biotinylate eukaryotic cell-derived major histocompatibility complexes |
EP3976805A1 (en) | 2019-05-27 | 2022-04-06 | Immatics US, Inc. | Viral vectors and their use in adoptive cellular therapy |
DE102019114735A1 (de) * | 2019-06-02 | 2020-12-03 | PMCR GmbH | HLA-Tumorantigenpeptiden der Klasse I und II zur Behandlung von Mamma-/Brustkarzinomen |
CA3142386A1 (en) | 2019-06-06 | 2020-12-10 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Sorting with counter selection using sequence similar peptides |
KR102397922B1 (ko) * | 2020-02-19 | 2022-05-13 | 서울대학교 산학협력단 | 신규한 종양-관련 항원 단백질 olfm4 및 이의 용도 |
WO2022045768A1 (ko) | 2020-08-28 | 2022-03-03 | 계명대학교 산학협력단 | 당뇨병 치료제에 대한 약물반응성 예측용 마이크로 rna 바이오마커 및 이의 용도 |
US20240024438A1 (en) * | 2020-11-19 | 2024-01-25 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Methods and compositions comprising mhc class peptides |
DE102021100038A1 (de) | 2020-12-31 | 2022-06-30 | Immatics US, Inc. | Modifizierte cd8-polypeptide, zusammensetzungen und verfahren zu deren verwendung |
TW202241938A (zh) | 2020-12-31 | 2022-11-01 | 美商英麥提克斯股份有限公司 | Cd8多肽、組合物及其使用方法 |
MX2023012899A (es) | 2021-05-05 | 2023-11-08 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Polipeptidos de union a antigeno bma031 mejorados. |
CN114732898B (zh) * | 2022-04-01 | 2023-05-09 | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 | 一种CpG佐剂与抗原定点共价结合方法 |
WO2023212697A1 (en) | 2022-04-28 | 2023-11-02 | Immatics US, Inc. | Membrane-bound il-15, cd8 polypeptides, cells, compositions, and methods of using thereof |
WO2023212655A1 (en) | 2022-04-28 | 2023-11-02 | Immatics US, Inc. | Il-12 polypeptides, il-15 polypeptides, il-18 polypeptides, cd8 polypeptides, compositions, and methods of using thereof |
WO2023212691A1 (en) | 2022-04-28 | 2023-11-02 | Immatics US, Inc. | DOMINANT NEGATIVE TGFβ RECEPTOR POLYPEPTIDES, CD8 POLYPEPTIDES, CELLS, COMPOSITIONS, AND METHODS OF USING THEREOF |
WO2023215825A1 (en) | 2022-05-05 | 2023-11-09 | Immatics US, Inc. | Methods for improving t cell efficacy |
WO2024072954A1 (en) * | 2022-09-29 | 2024-04-04 | Jerome Canady Research Institute for Advanced Biological and Technological Sciences | Cold atmopsheric plasma treated pan-cancer epitope peptide within the collagen type vi a-3 (col6a3) protein as cancer vaccine |
WO2024077071A2 (en) * | 2022-10-05 | 2024-04-11 | The Johns Hopkins University | Nanoparticles for delivery of immunoregulatory materials to t cells |
CN116102468B (zh) * | 2023-02-22 | 2024-07-09 | 中国科学技术大学 | 靶向人脂质运载蛋白2的先导化合物或其药学上可接受的盐及其制备方法与应用 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6673549B1 (en) * | 2000-10-12 | 2004-01-06 | Incyte Corporation | Genes expressed in C3A liver cell cultures treated with steroids |
WO2009015842A2 (en) * | 2007-07-27 | 2009-02-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel immunogenic epitopes for immunotherapy |
Family Cites Families (69)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4440859A (en) | 1977-05-27 | 1984-04-03 | The Regents Of The University Of California | Method for producing recombinant bacterial plasmids containing the coding sequences of higher organisms |
US4704362A (en) | 1977-11-08 | 1987-11-03 | Genentech, Inc. | Recombinant cloning vehicle microbial polypeptide expression |
IN151589B (ru) | 1978-12-22 | 1983-05-28 | Biogen Nv | |
US4530901A (en) | 1980-01-08 | 1985-07-23 | Biogen N.V. | Recombinant DNA molecules and their use in producing human interferon-like polypeptides |
US4342566A (en) | 1980-02-22 | 1982-08-03 | Scripps Clinic & Research Foundation | Solid phase anti-C3 assay for detection of immune complexes |
US4678751A (en) | 1981-09-25 | 1987-07-07 | Genentech, Inc. | Hybrid human leukocyte interferons |
US4766075A (en) | 1982-07-14 | 1988-08-23 | Genentech, Inc. | Human tissue plasminogen activator |
US4582800A (en) | 1982-07-12 | 1986-04-15 | Hoffmann-La Roche Inc. | Novel vectors and method for controlling interferon expression |
US4816567A (en) | 1983-04-08 | 1989-03-28 | Genentech, Inc. | Recombinant immunoglobin preparations |
US4757006A (en) | 1983-10-28 | 1988-07-12 | Genetics Institute, Inc. | Human factor VIII:C gene and recombinant methods for production |
US4677063A (en) | 1985-05-02 | 1987-06-30 | Cetus Corporation | Human tumor necrosis factor |
US4810648A (en) | 1986-01-08 | 1989-03-07 | Rhone Poulenc Agrochimie | Haloarylnitrile degrading gene, its use, and cells containing the gene |
US4897445A (en) | 1986-06-27 | 1990-01-30 | The Administrators Of The Tulane Educational Fund | Method for synthesizing a peptide containing a non-peptide bond |
US6193969B1 (en) | 1993-06-03 | 2001-02-27 | Protherics Inc. | Antibody fragments in therapy |
AUPM322393A0 (en) | 1993-12-24 | 1994-01-27 | Austin Research Institute, The | Mucin carbohydrate compounds and their use in immunotherapy |
ATE244300T1 (de) | 1996-01-17 | 2003-07-15 | Imp College Innovations Ltd | Immunotherapie mit verwendung von zytotoxischen t lymphozyten (ctl) |
US5849589A (en) | 1996-03-11 | 1998-12-15 | Duke University | Culturing monocytes with IL-4, TNF-α and GM-CSF TO induce differentiation to dendric cells |
US6406705B1 (en) | 1997-03-10 | 2002-06-18 | University Of Iowa Research Foundation | Use of nucleic acids containing unmethylated CpG dinucleotide as an adjuvant |
US8299321B2 (en) | 1998-06-16 | 2012-10-30 | Monsanto Technology Llc | Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants and uses thereof for plant improvement |
CN1319133A (zh) * | 1998-09-25 | 2001-10-24 | 儿童医疗中心有限公司 | 选择性地调节蛋白激酶活性的短肽 |
AU3395900A (en) * | 1999-03-12 | 2000-10-04 | Human Genome Sciences, Inc. | Human lung cancer associated gene sequences and polypeptides |
CA2393738A1 (en) * | 1999-12-10 | 2001-06-14 | Epimmune Inc. | Inducing cellular immune responses to her2/neu using peptide and nucleic acid compositions |
JP4310104B2 (ja) | 2002-09-28 | 2009-08-05 | 英俊 猪子 | マイクロサテライト遺伝多型マーカを用いる遺伝子のマッピング方法 |
US20110131679A2 (en) | 2000-04-19 | 2011-06-02 | Thomas La Rosa | Rice Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement |
US20070067865A1 (en) | 2000-09-05 | 2007-03-22 | Kovalic David K | Annotated plant genes |
EP1317275A1 (de) * | 2000-09-06 | 2003-06-11 | Müller, Friederike | Arzneimittel mit einer für das rna-bindende koc-protein kodierenden dna-sequenz, einem koc-protein oder einer dna-sequenz des koc-promotors |
AU2001294943A1 (en) | 2000-10-02 | 2002-04-15 | Bayer Corporation | Nucleic acid sequences differentially expressed in cancer tissue |
USH2191H1 (en) | 2000-10-24 | 2007-06-05 | Snp Consortium | Identification and mapping of single nucleotide polymorphisms in the human genome |
WO2002036614A2 (en) * | 2000-11-01 | 2002-05-10 | Insight Biotechnology Limited | Peptides for use in the treatment of alzheimer's disease |
US7919467B2 (en) * | 2000-12-04 | 2011-04-05 | Immunotope, Inc. | Cytotoxic T-lymphocyte-inducing immunogens for prevention, treatment, and diagnosis of cancer |
AU2002311787A1 (en) * | 2001-03-28 | 2002-10-15 | Zycos Inc. | Translational profiling |
WO2002078516A2 (en) * | 2001-03-30 | 2002-10-10 | Corixa Corporation | Compositions and methods for the therapy and diagnosis of cancer |
WO2005024017A1 (en) | 2002-03-15 | 2005-03-17 | Monsanto Technology Llc | Nucleic acid molecules associated with oil in plants |
DE10225139A1 (de) | 2002-05-29 | 2004-02-26 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Verfahren zur Identifizierung von immunreaktiven Peptiden |
US20050221350A1 (en) | 2002-05-29 | 2005-10-06 | Toni Weinschenk | Method for identifying immunoreactive peptides |
AU2002368151A1 (en) * | 2002-08-13 | 2004-02-25 | Warner-Lambert Company Llc | Matrix metalloproteinase inhibitors and methods for identification of lead compounds |
US20060188889A1 (en) * | 2003-11-04 | 2006-08-24 | Christopher Burgess | Use of differentially expressed nucleic acid sequences as biomarkers for cancer |
WO2005049806A2 (en) * | 2003-03-14 | 2005-06-02 | Nuvelo, Inc. | Novel nucleic acids and polypeptides |
US20070037204A1 (en) * | 2003-08-08 | 2007-02-15 | Hiroyuki ABURANTAI | Gene overexpressed in cancer |
WO2005019258A2 (en) * | 2003-08-11 | 2005-03-03 | Genentech, Inc. | Compositions and methods for the treatment of immune related diseases |
US20070054278A1 (en) | 2003-11-18 | 2007-03-08 | Applera Corporation | Polymorphisms in nucleic acid molecules encoding human enzyme proteins, methods of detection and uses thereof |
WO2005072050A2 (en) * | 2004-01-27 | 2005-08-11 | Compugen Usa, Inc. | Novel nucleotide and amino acid sequences, and assays and methods of use thereof for diagnosis of breast cancer |
EP1568383A3 (en) | 2004-02-27 | 2005-11-16 | Antisense Pharma GmbH | Use of an oligonucleotide or its active derivative for the preparation of a pharmaceutical composition for inhibiting the formation of metastases in cancer treatment |
US20070039069A1 (en) | 2004-03-22 | 2007-02-15 | Rogers James A | Nucleic acid molecules associated with oil in plants |
ATE496142T1 (de) | 2004-03-23 | 2011-02-15 | Oncotherapy Science Inc | Verfahren zur diagnose von nicht-kleinzelligem lungenkrebs |
AT501014A1 (de) * | 2004-08-19 | 2006-05-15 | Kury & Zeillinger Oeg | Verfahren und kit zur diagnose einer krebserkrankung, verfahren zum feststellen des ansprechens eines patienten auf die behandlung einer krebserkrankung, therapeutikum zur prophylaxe oder behandlung einer krebserkrankung |
WO2006023598A2 (en) * | 2004-08-19 | 2006-03-02 | University Of Maryland, Baltimore | Prostate-specific antigen-derived mhc class ii-restricted peptides and their use in vaccines to treat or prevent prostate cancer |
WO2007005635A2 (en) * | 2005-07-01 | 2007-01-11 | Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Mitotic spindle protein aspm as a diagnostic marker for neoplasia and uses therefor |
ATE440107T1 (de) * | 2005-09-05 | 2009-09-15 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Tumorassoziierte peptide, die hla klasse i oder ii-moleküle binden, und anti-tumor impfstoffe |
EP1806359B1 (en) * | 2005-09-05 | 2010-03-17 | Immatics Biotechnologies GmbH | Tumor-associated peptides binding promiscuously to human leukocyte antigen (HLA) class II molecules |
GB0521958D0 (en) * | 2005-10-27 | 2005-12-07 | Ares Trading Sa | vWFA, collagen and kunitz domain containing protein |
DE102005052384B4 (de) * | 2005-10-31 | 2009-09-24 | Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V. | Verfahren zur Erkennung, Markierung und Behandlung von epithelialen Lungentumorzellen sowie Mittel zur Durchführung des Verfahrens |
US20090004213A1 (en) * | 2007-03-26 | 2009-01-01 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Combination therapy using active immunotherapy |
CN101765434B (zh) * | 2007-07-27 | 2014-12-17 | 伊玛提克斯生物技术有限公司 | 抗肿瘤相关肽及相关抗癌疫苗组合物 |
US7892770B2 (en) * | 2007-08-24 | 2011-02-22 | Van Andel Research Institute | Monoclonal antibody which binds cMet (HGFR) in formalin-fixed and paraffin-embedded tissues and related methods |
NZ562237A (en) * | 2007-10-05 | 2011-02-25 | Pacific Edge Biotechnology Ltd | Proliferation signature and prognosis for gastrointestinal cancer |
WO2009075883A2 (en) * | 2007-12-12 | 2009-06-18 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Glycoprotein cancer biomarker |
KR101184869B1 (ko) * | 2008-04-24 | 2012-09-20 | 이매틱스 바이오테크놀로지스 게엠베하 | 백신을 위한 인간 조직 적합성 항원(hla) 종류 i 또는 ii 분자에 결합하는 종양 관련 펩티드의 신규한 제형 |
SI2113253T1 (sl) * | 2008-04-30 | 2010-06-30 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Nove formulacije s tumorjem povezanih peptidov ki se vežejo na molekule humanega levkocitnega antigena HLA razreda I ali II za cepiva |
US8133686B2 (en) * | 2008-05-15 | 2012-03-13 | Van Andel Research Institute | IL-8 as a biomarker for sunitinib resistance |
TWI526219B (zh) * | 2008-06-19 | 2016-03-21 | 腫瘤療法 科學股份有限公司 | Cdca1抗原決定位胜肽及含此胜肽的疫苗 |
EP2337795A2 (en) * | 2008-10-01 | 2011-06-29 | Dako Denmark A/S | Mhc multimers in cancer vaccines and immune monitoring |
RS53782B1 (en) | 2008-10-01 | 2015-06-30 | Immatics Biotechnologies Gmbh | TUMOR-ASSOCIATED PEPTIDES PREPARED AND ANTI-CHANGE RESPONSE FOR GLIOBLASTOMA (GBM) AND OTHER CANCER TREATMENTS |
GB201004575D0 (en) | 2010-03-19 | 2010-05-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Composition of tumor associated peptides and related anti cancer vaccine for the treatment of gastric cancer and other cancers |
GB201019331D0 (en) * | 2010-03-19 | 2010-12-29 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Methods for the diagnosis and treatment of cancer based on AVL9 |
GB201004551D0 (en) | 2010-03-19 | 2010-05-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | NOvel immunotherapy against several tumors including gastrointestinal and gastric cancer |
GB201006360D0 (en) * | 2010-04-16 | 2010-06-02 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Method for differentially quantifying naturally processed HLA-restricted peptides for cancer, autoimmune and infectious diseases immunotherapy development |
GB201015765D0 (en) * | 2010-09-21 | 2010-10-27 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Use of myeloid cell biomarkers for the diagnosis of cancer |
GB201021289D0 (en) * | 2010-12-15 | 2011-01-26 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel biomarkers for a prediction of the outcome of an immunotherapy against cancer |
-
2010
- 2010-03-19 GB GBGB1004551.6A patent/GB201004551D0/en not_active Ceased
-
2011
- 2011-03-15 EP EP20179380.9A patent/EP3753570A1/en active Pending
- 2011-03-15 CA CA2789857A patent/CA2789857C/en active Active
- 2011-03-15 HU HUE15154344A patent/HUE033682T2/en unknown
- 2011-03-15 EP EP14184348.2A patent/EP2845604B1/en active Active
- 2011-03-15 SG SG10201606771SA patent/SG10201606771SA/en unknown
- 2011-03-15 RS RS20201054A patent/RS60765B1/sr unknown
- 2011-03-15 EA EA202091251A patent/EA202091251A3/ru unknown
- 2011-03-15 ES ES15154344.4T patent/ES2642562T3/es active Active
- 2011-03-15 EA EA202091250A patent/EA202091250A3/ru unknown
- 2011-03-15 KR KR1020127027196A patent/KR101656913B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 ME MEP-2015-122A patent/ME02229B/me unknown
- 2011-03-15 PL PL17157398T patent/PL3195873T3/pl unknown
- 2011-03-15 KR KR1020167023720A patent/KR101826460B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 HU HUE11711292A patent/HUE027036T2/en unknown
- 2011-03-15 CA CA2986969A patent/CA2986969C/en active Active
- 2011-03-15 MX MX2012010813A patent/MX2012010813A/es active IP Right Grant
- 2011-03-15 PT PT117112920T patent/PT2547354E/pt unknown
- 2011-03-15 EA EA202091241A patent/EA202091241A3/ru unknown
- 2011-03-15 PT PT141843482T patent/PT2845604T/pt unknown
- 2011-03-15 ES ES18156634T patent/ES2829375T3/es active Active
- 2011-03-15 KR KR1020187002782A patent/KR20180014848A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-03-15 DK DK18156634.0T patent/DK3363456T3/da active
- 2011-03-15 CA CA3076642A patent/CA3076642C/en active Active
- 2011-03-15 LT LTEP14184348.2T patent/LT2845604T/lt unknown
- 2011-03-15 ME MEP-2019-287A patent/ME03569B/me unknown
- 2011-03-15 CN CN202011079539.2A patent/CN112409451A/zh active Pending
- 2011-03-15 SG SG10201502093QA patent/SG10201502093QA/en unknown
- 2011-03-15 HU HUE17157398A patent/HUE045757T2/hu unknown
- 2011-03-15 PT PT172030967T patent/PT3329933T/pt unknown
- 2011-03-15 HU HUE17203096A patent/HUE050376T2/hu unknown
- 2011-03-15 NZ NZ711296A patent/NZ711296A/en unknown
- 2011-03-15 UA UAA201209114A patent/UA111711C2/uk unknown
- 2011-03-15 CA CA3206214A patent/CA3206214A1/en active Pending
- 2011-03-15 ES ES17157398T patent/ES2753206T3/es active Active
- 2011-03-15 CN CN201810105798.4A patent/CN108456242A/zh active Pending
- 2011-03-15 ME MEP-2017-87A patent/ME02692B/me unknown
- 2011-03-15 RS RS20201304A patent/RS60993B1/sr unknown
- 2011-03-15 BR BR112012023692A patent/BR112012023692B1/pt active IP Right Grant
- 2011-03-15 UA UAA201512437A patent/UA122047C2/uk unknown
- 2011-03-15 PT PT171573983T patent/PT3195873T/pt unknown
- 2011-03-15 KR KR1020227004088A patent/KR20220025133A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-03-15 KR KR1020207026532A patent/KR102324499B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 CN CN202011080378.9A patent/CN112409453A/zh active Pending
- 2011-03-15 KR KR1020197005246A patent/KR20190033577A/ko not_active Application Discontinuation
- 2011-03-15 SI SI201131182A patent/SI2845604T1/sl unknown
- 2011-03-15 SG SG2012065173A patent/SG183880A1/en unknown
- 2011-03-15 EP EP20179386.6A patent/EP3738606A1/en active Pending
- 2011-03-15 LT LTEP15154344.4T patent/LT2923708T/lt unknown
- 2011-03-15 HU HUE14184348A patent/HUE032402T2/en unknown
- 2011-03-15 EA EA201792409A patent/EA037019B1/ru unknown
- 2011-03-15 DK DK15154344.4T patent/DK2923708T3/en active
- 2011-03-15 CA CA2936642A patent/CA2936642C/en active Active
- 2011-03-15 NZ NZ708205A patent/NZ708205A/en unknown
- 2011-03-15 KR KR1020207026525A patent/KR102324498B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 LT LTEP17203096.7T patent/LT3329933T/lt unknown
- 2011-03-15 EP EP17157398.3A patent/EP3195873B1/en active Active
- 2011-03-15 PL PL11711292T patent/PL2547354T3/pl unknown
- 2011-03-15 KR KR1020217004319A patent/KR102361467B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 ES ES17203096T patent/ES2819861T3/es active Active
- 2011-03-15 DK DK17157398.3T patent/DK3195873T3/da active
- 2011-03-15 MY MYPI2012700609A patent/MY178651A/en unknown
- 2011-03-15 KR KR1020217004318A patent/KR102329791B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 SG SG10201710446PA patent/SG10201710446PA/en unknown
- 2011-03-15 PT PT181566340T patent/PT3363456T/pt unknown
- 2011-03-15 AU AU2011229199A patent/AU2011229199B2/en active Active
- 2011-03-15 DK DK17203096.7T patent/DK3329933T3/da active
- 2011-03-15 EP EP11711292.0A patent/EP2547354B1/en active Active
- 2011-03-15 WO PCT/EP2011/053863 patent/WO2011113819A2/en active Application Filing
- 2011-03-15 SI SI201131927T patent/SI3363456T1/sl unknown
- 2011-03-15 NZ NZ769435A patent/NZ769435A/en unknown
- 2011-03-15 NZ NZ72784111A patent/NZ727841A/en unknown
- 2011-03-15 DK DK14184348.2T patent/DK2845604T3/da active
- 2011-03-15 EP EP17203096.7A patent/EP3329933B1/en active Active
- 2011-03-15 CN CN201180014644.0A patent/CN102905721B/zh active Active
- 2011-03-15 RS RS20170553A patent/RS56070B1/sr unknown
- 2011-03-15 RS RS20150530A patent/RS54182B1/en unknown
- 2011-03-15 PL PL18156634T patent/PL3363456T3/pl unknown
- 2011-03-15 ES ES11711292.0T patent/ES2544529T3/es active Active
- 2011-03-15 CN CN202011079527.XA patent/CN112457390A/zh active Pending
- 2011-03-15 RS RS20170980A patent/RS56612B1/sr unknown
- 2011-03-15 KR KR1020237031847A patent/KR20230141886A/ko active Search and Examination
- 2011-03-15 SI SI201131913T patent/SI3329933T1/sl unknown
- 2011-03-15 EA EA202091233A patent/EA202091233A3/ru unknown
- 2011-03-15 KR KR1020207026527A patent/KR102388761B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 SI SI201131804T patent/SI3195873T1/sl unknown
- 2011-03-15 EP EP15154344.4A patent/EP2923708B1/en active Active
- 2011-03-15 PT PT151543444T patent/PT2923708T/pt unknown
- 2011-03-15 LT LT17157398T patent/LT3195873T/lt unknown
- 2011-03-15 KR KR1020207026524A patent/KR102388577B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 LT LTEP18156634.0T patent/LT3363456T/lt unknown
- 2011-03-15 KR KR1020207026530A patent/KR102324500B1/ko active IP Right Grant
- 2011-03-15 SI SI201131293T patent/SI2923708T1/sl unknown
- 2011-03-15 EA EA201690511A patent/EA039357B1/ru unknown
- 2011-03-15 NZ NZ601438A patent/NZ601438A/en unknown
- 2011-03-15 US US13/635,896 patent/US10064913B2/en active Active
- 2011-03-15 JP JP2012557522A patent/JP5891181B2/ja active Active
- 2011-03-15 RS RS20191340A patent/RS59554B1/sr unknown
- 2011-03-15 EA EA201201306A patent/EA024497B1/ru unknown
- 2011-03-15 DK DK11711292.0T patent/DK2547354T3/da active
- 2011-03-15 CN CN201510354965.5A patent/CN105001339B/zh active Active
- 2011-03-15 PL PL17203096T patent/PL3329933T3/pl unknown
- 2011-03-15 PL PL14184348T patent/PL2845604T3/pl unknown
- 2011-03-15 CN CN202011080388.2A patent/CN112430255A/zh active Pending
- 2011-03-15 SI SI201130546T patent/SI2547354T1/sl unknown
- 2011-03-15 ES ES14184348.2T patent/ES2626798T3/es active Active
- 2011-03-15 HU HUE18156634A patent/HUE051478T2/hu unknown
- 2011-03-15 CN CN202011079575.9A patent/CN112409452A/zh active Pending
- 2011-03-15 PL PL15154344T patent/PL2923708T3/pl unknown
- 2011-03-15 EA EA202091242A patent/EA202091242A3/ru unknown
- 2011-03-15 EP EP18156634.0A patent/EP3363456B1/en active Active
- 2011-03-15 NZ NZ769427A patent/NZ769427A/en unknown
- 2011-03-15 UA UAA201801266A patent/UA126787C2/uk unknown
- 2011-03-15 NZ NZ627877A patent/NZ627877A/en not_active IP Right Cessation
- 2011-03-15 EP EP16156192.3A patent/EP3058947A3/en not_active Withdrawn
- 2011-03-18 TW TW107110964A patent/TWI681967B/zh active
- 2011-03-18 TW TW109130850A patent/TWI768461B/zh not_active IP Right Cessation
- 2011-03-18 TW TW109130851A patent/TWI766361B/zh active
- 2011-03-18 TW TW104113109A patent/TWI621709B/zh active
- 2011-03-18 TW TW100109429A patent/TWI486445B/zh active
- 2011-03-18 TW TW109130852A patent/TWI766362B/zh active
- 2011-03-18 TW TW111118219A patent/TW202300509A/zh unknown
- 2011-03-18 TW TW108144354A patent/TWI715332B/zh not_active IP Right Cessation
- 2011-03-18 TW TW106141450A patent/TWI659967B/zh active
- 2011-03-18 US US13/051,665 patent/US9101585B2/en active Active
-
2012
- 2012-09-06 MY MYPI2016002170A patent/MY197710A/en unknown
- 2012-09-19 MX MX2020011674A patent/MX2020011674A/es unknown
- 2012-09-19 MX MX2020011672A patent/MX2020011672A/es unknown
- 2012-09-19 MX MX2020011675A patent/MX2020011675A/es unknown
- 2012-09-19 MX MX2020011673A patent/MX2020011673A/es unknown
- 2012-09-19 MX MX2015001606A patent/MX355074B/es unknown
-
2013
- 2013-07-10 HK HK15108854.1A patent/HK1208174A1/xx not_active IP Right Cessation
- 2013-07-10 HK HK18114534.4A patent/HK1255544A1/zh unknown
- 2013-07-10 HK HK13108075.6A patent/HK1180610A1/xx unknown
- 2013-07-10 HK HK16114573A patent/HK1226297A1/zh unknown
-
2015
- 2015-02-06 US US14/615,539 patent/US9717774B2/en active Active
- 2015-08-13 HR HRP20150867TT patent/HRP20150867T1/hr unknown
- 2015-08-25 JP JP2015165375A patent/JP6103608B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2015-10-20 HK HK15110276.7A patent/HK1210586A1/xx unknown
-
2016
- 2016-05-23 PH PH12016500949A patent/PH12016500949B1/en unknown
- 2016-08-05 JP JP2016154278A patent/JP6238258B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2017
- 2017-02-22 JP JP2017030876A patent/JP6535040B2/ja active Active
- 2017-05-04 CY CY20171100486T patent/CY1119366T1/el unknown
- 2017-05-12 HR HRP20170718TT patent/HRP20170718T1/hr unknown
- 2017-06-28 US US15/636,486 patent/US20170304399A1/en not_active Abandoned
- 2017-06-29 US US15/636,958 patent/US9895415B2/en active Active
- 2017-06-30 US US15/639,506 patent/US10357540B2/en active Active
- 2017-06-30 US US15/639,310 patent/US9993523B2/en active Active
- 2017-10-06 HR HRP20171504TT patent/HRP20171504T1/hr unknown
- 2017-10-10 CY CY20171101050T patent/CY1119739T1/el unknown
- 2017-11-22 JP JP2017224260A patent/JP6722644B2/ja active Active
-
2019
- 2019-05-22 US US16/419,818 patent/US10420816B1/en active Active
- 2019-07-03 US US16/502,268 patent/US10478471B2/en active Active
- 2019-09-24 PH PH12019502194A patent/PH12019502194A1/en unknown
- 2019-10-14 HR HRP20191859TT patent/HRP20191859T1/hr unknown
- 2019-10-18 CY CY20191101092T patent/CY1122235T1/el unknown
- 2019-12-13 US US16/714,098 patent/US10905741B2/en active Active
-
2020
- 2020-06-05 US US16/894,186 patent/US10898546B2/en active Active
- 2020-06-05 US US16/894,212 patent/US10933118B2/en active Active
- 2020-06-19 JP JP2020106497A patent/JP7107586B2/ja active Active
- 2020-06-19 JP JP2020106500A patent/JP7034505B2/ja active Active
- 2020-09-14 HR HRP20201467TT patent/HRP20201467T1/hr unknown
- 2020-09-22 CY CY20201100894T patent/CY1123447T1/el unknown
- 2020-11-02 HR HRP20201770TT patent/HRP20201770T1/hr unknown
- 2020-11-04 CY CY20201101040T patent/CY1123762T1/el unknown
-
2021
- 2021-01-28 US US17/161,253 patent/US11077171B2/en active Active
- 2021-02-05 JP JP2021017733A patent/JP7007504B2/ja active Active
- 2021-04-23 US US17/238,943 patent/US11850274B2/en active Active
- 2021-05-14 US US17/320,782 patent/US11883462B2/en active Active
- 2021-05-21 US US17/327,116 patent/US11839643B2/en active Active
- 2021-06-25 US US17/358,676 patent/US11969455B2/en active Active
- 2021-07-23 US US17/383,855 patent/US11957730B2/en active Active
- 2021-07-23 US US17/383,892 patent/US11975042B2/en active Active
- 2021-09-24 US US17/484,703 patent/US11273200B2/en active Active
- 2021-09-24 US US17/484,568 patent/US20220008506A1/en active Pending
- 2021-10-01 US US17/491,742 patent/US20220040259A1/en active Pending
- 2021-10-01 US US17/492,219 patent/US11298404B2/en active Active
-
2022
- 2022-04-29 US US17/733,260 patent/US11648292B2/en active Active
- 2022-07-06 JP JP2022108874A patent/JP2022141743A/ja active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6673549B1 (en) * | 2000-10-12 | 2004-01-06 | Incyte Corporation | Genes expressed in C3A liver cell cultures treated with steroids |
WO2009015842A2 (en) * | 2007-07-27 | 2009-02-05 | Immatics Biotechnologies Gmbh | Novel immunogenic epitopes for immunotherapy |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11298404B2 (en) | Immunotherapy against several tumors including gastrointestinal and gastric cancer |