EA032685B1 - Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных соединений зеараленона, полинуклеотид, выделенный из него, а также содержащая полипептид добавка, его применение, а также способ - Google Patents

Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных соединений зеараленона, полинуклеотид, выделенный из него, а также содержащая полипептид добавка, его применение, а также способ Download PDF

Info

Publication number
EA032685B1
EA032685B1 EA201690471A EA201690471A EA032685B1 EA 032685 B1 EA032685 B1 EA 032685B1 EA 201690471 A EA201690471 A EA 201690471A EA 201690471 A EA201690471 A EA 201690471A EA 032685 B1 EA032685 B1 EA 032685B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
seq
polypeptide
zearalenone
zen
amino acid
Prior art date
Application number
EA201690471A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201690471A1 (ru
Inventor
Себастьян Фрухауф
Михаэла Тамхесль
Мартин Пфеффер
Дитер Молль
Герд Шатцмаир
Ева Мария Биндер
Original Assignee
Эрбер Акциенгезелльшафт
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=51662974&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=EA032685(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Эрбер Акциенгезелльшафт filed Critical Эрбер Акциенгезелльшафт
Publication of EA201690471A1 publication Critical patent/EA201690471A1/ru
Publication of EA032685B1 publication Critical patent/EA032685B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/18Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23KFODDER
    • A23K10/00Animal feeding-stuffs
    • A23K10/10Animal feeding-stuffs obtained by microbiological or biochemical processes
    • A23K10/14Pretreatment of feeding-stuffs with enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23KFODDER
    • A23K50/00Feeding-stuffs specially adapted for particular animals
    • A23K50/30Feeding-stuffs specially adapted for particular animals for swines
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23KFODDER
    • A23K50/00Feeding-stuffs specially adapted for particular animals
    • A23K50/70Feeding-stuffs specially adapted for particular animals for birds
    • A23K50/75Feeding-stuffs specially adapted for particular animals for birds for poultry
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23KFODDER
    • A23K50/00Feeding-stuffs specially adapted for particular animals
    • A23K50/80Feeding-stuffs specially adapted for particular animals for aquatic animals, e.g. fish, crustaceans or molluscs
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L3/00Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs
    • A23L3/34Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs by treatment with chemicals
    • A23L3/3454Preservation of foods or foodstuffs, in general, e.g. pasteurising, sterilising, specially adapted for foods or foodstuffs by treatment with chemicals in the form of liquids or solids
    • A23L3/3463Organic compounds; Microorganisms; Enzymes
    • A23L3/3571Microorganisms; Enzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y301/00Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
    • C12Y301/01Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2002/00Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/80Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in fisheries management
    • Y02A40/81Aquaculture, e.g. of fish
    • Y02A40/818Alternative feeds for fish, e.g. in aquacultures

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Birds (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Marine Sciences & Fisheries (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Insects & Arthropods (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Fodder In General (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • General Preparation And Processing Of Foods (AREA)
  • Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

Полипептид, гидролитически расщепляющий зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона и представляющий собой гидролазу с аминокислотной последовательностью из группы последовательностей SEQ ID NO: 1-15 или ее функциональным вариантом, причем идентичность последовательности между функциональным вариантом и по меньшей мере одной из аминокислотных последовательностей составляет по меньшей мере 40%, добавка, содержащая полипептид, а также изолированный выделенный полинуклеотид, кодирующий полипептид, и способ гидролитического расщепления полипептидом зеараленона и/или по меньшей мере одного производного соединения зеараленона.

Description

Изобретение относится к полипептиду для гидролитического расщепления зеараленона и/или по меньшей мере одного производного соединения зеараленона, к изолированному полинуклеотиду, кодирующему полипептид такого рода, к добавке, содержащей полипептид такого рода, к применению полипептида такого рода, а также к способу для гидролитического расщепления зеараленона и/или по меньшей мере одного производного соединения зеараленона.
Микотоксины представляют собой вторичные метаболиты, продуцируемые нитевидными грибами. Важным представителем микотоксинов является распространенный во всем мире зеараленон (ZEN), ранее известный как токсин F-2, продуцируемый большинством грибов рода Fusarium. Эти грибы поражают, в частности, культурные растения, такие как различные виды зерновых, причем, как правило, грибковое поражение появляется перед сбором урожая, при этом рост грибов или продуцирование микотоксинов может происходить перед хранением или при ненадлежащем хранении, а также после сбора урожая. FAO оценивает, что во всем мире 25% сельскохозяйственных продуктов загрязнены микотоксинами, что ведет к значительным экономическим потерям. Во время исследования, проведенного в недавнее время, во всем мире с января 2009 года по декабрь 2011 года в целом была проанализирована 23 781 проба, причем 81% оказался положительным по меньшей мере на один микотоксин и 45% оказались положительными на ZEN. ZEN был найден также во всех регионах мира как во всех испытуемых зерновых и фуражных классах, таких как, например, кукуруза, соевая мука, пшеница, пшеничные отруби, DDGS (высушенная барда), так и в готовых кормовых смесях с частотой до 100%.
ZEN представляет собой нестероидный, эстрогенный макроциклический лактон, синтезируемый вследствие обмена веществ с участием поликетидов, имеющий структурную формулу
и называемый по номенклатуре ИЮПАК (2Е,1^)-15,17-дигидрокси-11-метил-12оксабицикло[12.4.0]октадека-1(18),2,14,16-тетраен-7,13-дион.
Однако в природе встречается также большое число производных соединений ZEN, которые образуются благодаря ферментативной или химической модификации ZEN. Примерами тому являются гликозидные или сульфатсодержащие конъюгаты ZEN, которые образуются вследствие метаболизма в грибах, растениях или млекопитающих, а также метаболиты ZEN, которые образуются, в частности, в организме человека или животного. В последующем тексте под производными соединениями ZEN понимают как встречающиеся в природе, так и получающиеся вследствие химического или биохимического синтеза конъюгаты ZEN или метаболиты ZEN и предпочтительно α-зеараленол (α-ZEL; (2E,7R,11S)-7,15,17тригидрокси-11-метил-12-оксабицикло[12.4.0]октадека-1(18),2,14,16-тетраен-13-он), β-зеараленол (βZEL; (2E,7S,11S)-7,15,17-тригидрокси-11-метил-12-оксабицикло [12.4.0]октадека-1(18),2,14,16-тетраен13-он), α-зеараланол (α-ZAL; (7R, 1^)-7,15,17-тригидрокси-11-метил-12-оксабицикло [12.4.0] октадека1(18),14,16-триен-13-он), β-зеараланол (β-ZAL; (7S, 11 S)-7,15,17-тригидрокси-11-\1ети.1-12оксабицикло[12.4.0]октадека-1(14),15,17-триен-13-он), зеараленон-14-сульфат (Z14S; [(2E, 11 S)-15гидрокси-11-метил-7,13-диоксо-12-оксабицикло[12.4.0]октадека-1(18),2,14,16-тетраен-17ил]гидросульфат), зеараленон-14-гликозид (Z14G; (2E,11 S)-15-гидрокси-11-метил-17-[(3R,4S,5S,6R)3,4,5-тригидрокси-6-(гидроксиметил)тетрагидропиран-2-ил]окси-12-оксабицикло[12.4.0]октадека1(18)2,14,16-тетраен-7,13-дион), а также зеараланон (ZAN; (1^)-15,17-дигидрокси-11-метил-12оксабицикло[12.4.0]октадека-1(18),14,16-триен-7,13-дион).
ZEN, также как и производные соединения ZEN, в первую очередь α-ZEL, β-ZEL, Z14S, α-ZAL, βZAL, Z14G и ZAN, вследствие своей высокой химической и физической стабильности могут быть обнаружены также в переработанных пищевых продуктах или кормах, таких, как, например, хлеб или пиво.
ZEN связывается с рецептором эстрогена и может обуславливать гормональные расстройства, причем он абсорбируется непосредственно после орального приема и превращается млекопитающими в два стереоизомерных метаболита α-ZEL или β-ZEL. При этом, например, α-ZEL, а также α-ZAL или ZAN, оказывают эстрогенное действие намного более сильное, чем ZEN. Конъюгированные производные соединения ZEN иногда проявляют эстрогенизм более низкий, чем ZEN, однако из этих производных соединений ZEN в пищеварительном тракте может вновь высвобождаться ZEN.
Хотя ZEN обладает относительно низкой острой токсичностью и имеет значение оральной LD50 до 20000 мг/на кг массы тела, при длительном приеме может встречаться подострое и/или начальное хроническое токсическое действие, такое как, например, тератогенное, карциногенное, эстрогенное и иммуносупрессивное действие у животных или людей. Корм, загрязненный ZEN, ведет к нарушениям развития у млекопитающих, причем свиньи, в особенности молодые животные, являются крайне чувствительными по отношению к ZEN. Концентрации ZEN в корме больше 0,5 млн-1 ведут к нарушениям развития, причем, например, концентрации больше 1,5 млн-1 могут вести к гиперэстрогенизму у свиней, а концентра
- 1 032685 ции ZEN больше 12 млн1 были ответственными за выкидыши у крупного рогатого скота. Так как зеараленон быстро абсорбируется слизистыми оболочками, в частности слизистой оболочкой желудка, а также полости рта, то необходима немедленная и, в первую очередь, количественная дезактивация. Уже через 30 мин после перорального введения ZEN он может быть обнаружен в крови. При этом применение изолированных ферментов по сравнению с микроорганизмами имеет преимущества, заключающиеся в более высокой удельной активности или в более быстром действии. Вследствие вредного действия ZEN в Европейском Союзе установлены обязательные верхние границы содержания ZEN в пищевых продуктах, а также рекомендованы верхние границы содержания ZEN в кормах (№ EC: 1881/2006).
Первичная стратегия для уменьшения загрязнения ZEN пищевых продуктов или кормов состоит в ограничении роста грибов, например, за счет соблюдения надлежащей сельскохозяйственной практики. С этой целью, в частности, семенной материал освобождают от вредителей и грибкового поражения, а сельскохозяйственные отходы своевременно удаляют с полей. При этом благодаря применению фунгицидов может быть уменьшен рост грибов в условиях поля. После сбора урожай должен храниться с остаточной влажностью меньше 15% и при низкой температуре для предотвращения роста грибов. При этом продукт, затронутый грибковым поражением, должен быть удален перед дальнейшей переработкой. Несмотря на этот перечень мероприятий I. Rodriges и K. Naehrer (2012) сообщили, что даже в регионах с наивысшими сельскохозяйственными стандартами, таких как США и Центральная Европа, в период с 2009 по 2011 год соответственно 29 и 39% проверенных проб кукурузы были загрязнены ZEN.
Другие возможности удаления ZEN из кормовых или пищевых продуктов предоставляет адсорбция или трансформация микотоксина. Для этого необходимо, чтобы связь микотоксина с адсорбентом была сильной и специфической в широкой области значений pH и оставалась стабильной в течение всего процесса пищеварения в желудочно-кишечном тракте. Хотя некоторые из адсорбентов небиологического происхождения, такие как, например, активированный уголь, силикаты или синтетические полимеры, такие, как холестирамин, могут быть эффективно использованы в случае афлатоксинов, их применение в случае других микотоксинов является ограниченным. Существенный недостаток адсорбирующих агентов представляет собой неспецифическая связь с другими молекулами, которые частным порядком являются существенными для питания. Адсорбенты биологического происхождения, такие как, например, дрожжи или дрожжевые экстракты, в литературе также описаны, однако имеют похожие ограничения как и адсорбенты небиологического происхождения.
Детоксификация ZEN за счет физической и химической обработки также ограничена. ZEN не может быть эффективно деактивирован термической обработкой, однако содержание ZEN может быть уменьшено экструдированием и обработкой окислительными агентами, например в течение 16 ч при 80°C 10%-ным раствором пероксида водорода, на 83,9%. Применение способов экструзии и окислительных агентов, таких как озон или пероксид водорода, при производстве кормов и пищевых продуктов является ограниченным вследствие высоких расходов, потери качества, относительно низкой эффективности и низкой специфичности.
Биотрансформация ZEN посредством микроорганизмов, таких как, например, штаммы Trichosporon mycotoxinivorans, Gliocladium roseum или Bacillus subtilis, или выделенных из них ферментов, таких как гидролазы или пероксидазы, описана, например, E. Vekiru et al. в Appl. and Environ. Microb., 2010, 76, 7, 2353-2359.
Из EP 0938575 B1 известны свойства бактерий вида Rhodococcus и Nocardia, предпочтительно R.globerulus, R.erythropolis и N.globerula в отношении расщепления ZEN.
Из WO 02/076205 может быть получена информация о расщепляющем ZEN действии ферментов, выделенных из Gliocladium roseum, в частности α/β-гидролазы, зеараленонгидролазы-1 (ZHD1), которая катализирует разложение ZEN посредством каталитической триады.
Из WO 2012/113827 можно получить информацию о рекомбинантных зеараленонгидролазах, а именно о расщепляющих ZEN ферментах, которые остаются стабильными в желудочно-кишечном тракте, в частности там описаны такие микроорганизмы, как Thermobifidia fusca, Streptomyces exfoliatus, Acidovorans delafieldii и Streptomyces sp.
Полипептиды или ферменты, которые могут гидролизовать ZEN и/или по меньшей мере одно производное соединение ZEN, также могут быть обозначены как зеараленонгидролазы.
Используемые далее термины относятся к профессиональному языку и соответственно, если не указано иное, используются в традиционном значении. Так, например, термин полинуклеотид относится к любым видам генетического материала любых длин и последовательностей, таких как, например, одинарная спираль и двойная спираль молекул ДНК и РНК, включая регуляторные элементы, структурные элементы, группы генов, плазмиды, полные геномы и их фрагменты. Термин полипептид охватывает белки, такие как, например, ферменты, антитела, а также полипептиды, содержащие до 500 аминокислот, такие как, например, пептидные ингибиторы, белковые домены, а также короткие полипептиды с малыми длинами последовательностей, например меньше 10 аминокислот, такие как рецепторы, лиганды, пептидные гормоны, метки и т.п. Термин позиция в полинуклеотиде или полипептиде относится к отдельному, специфическому основанию или аминокислоте в последовательности полинуклеотида или полипептида.
- 2 032685
Таким образом, настоящее изобретение направлено на разработку полипептида, с которым удается ZEN и/или по меньшей мере одно производное соединение ZEN быстро и надежно трансформировать в гидролизованный ZEN и/или в гидролизованные производные соединения ZEN. С целью решения этой задачи настоящее изобретение, по существу, отличается тем, что полипептид представляет собой гидролазу с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы последовательностей SEQ ID NO: 115, или ее функциональным вариантом, причем идентичность последовательности между функциональным вариантом и по меньшей мере одной из аминокислотных последовательностей составляет по меньшей мере 40%.
Термин идентичность последовательности соответственно настоящему изобретению относится к процентной идентичности последовательности. Для аминокислотных и нуклеотидных последовательностей идентичность последовательности может быть определена визуально, но предпочтительно ее рассчитывают посредством компьютерной программы. Сравнение последовательностей осуществляют также внутри участков последовательностей, причем в качестве участка следует понимать непрерывную последовательность опорной последовательности, и предпочтительно охватывают консервативную область последовательности.
В данном случае идентичность последовательностей устанавливают посредством программы NCBI BLAST (Basic Local Alignment Search Tool (программа поиска основных локальных выравниваний)), предпочтительно программы BLASTP в случае полипептидов и программы BLASTN в случае полинуклеотидов, которые доступны для использования на интернет-странице National Center for Biotechnology Information (NCBI; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Таким образом, две или несколько последовательностей можно сравнивать друг с другом по алгоритму Altschul et al. (1997, Nucleic. Acids. Res., 25:33893402). С этой целью в настоящем изобретении была использована программа в версии от 15 мая 2013 года. В качестве программных установок были приняты базовые установки и, в частности, для выравнивания аминокислотных последовательностей: max target sequence (максимальное число целевых последовательностей)=100; expected threshold (ожидаемый порог)=10; word size (длина слова)=3; matrix (матрица)=BLOSOM62; gap costs (штрафы за разрыв) = Existence (существование): 11; Extention (продолжение): 1; computational adjustment (вычислительная корректировка)=Conditional compositional score matrix adjustment (условная композиционная корректировка матрицы счета); а также для Word Size (длина слова) при выравнивании нуклеотидных последовательностей: 11; Expect value (ожидаемая значимость): 10; Gap costs (штрафы за разрыв): Existence (существование) = 5, Extension (продолжение) = 2; Filter (фильтр)=low complexity activated (активирована сложность низкого уровня); Match/Mismatch Scores (счет соответствий/несоответствий): 2, -3; Filter String (строка фильтра): L; m.
Выражения функциональный вариант полипептида или функциональный вариант относятся, вопервых, к аллельным вариантам полипептида и к функциональным фрагментам полипептида, а вовторых, к модификации полипептида, причем ферментативная функция, по существу, не изменяется. Термин аллельный вариант относится к полипептиду, который возникает благодаря одной или нескольким случайно происходящим в природе мутациям нуклеотидной последовательности и способствует изменению аминокислотной последовательности, причем на его ферментативную функцию влияние не оказывается. Модификации могут представлять собой, например, C- или N-концевые слияния с полипептидами или мутированные полипептиды, причем мутации могут быть получены заменой, вставкой или удалением по меньшей мере одной аминокислоты, предпочтительно сайт-специфическим мутагенезом или случайным мутагенезом, рекомбинацией и/или любым другим биоинженерным способом. Термины замена, инсерция и делеция являются традиционными в генной инженерии и используются специалистами в данной области техники в традиционно понимаемом значении. Выражение функциональный фрагмент относится к части или к частичной последовательности полипептида или к части или к частичной последовательности его функционального варианта, причем ферментативная функция по существу сохраняется. Ферментативная функция, по существу, сохраняется тогда, когда неизмененным остается механизм ферментативной реакции, т.е. микотоксин гидролизуется благодаря одному и тому же сайту, а удельная остаточная активность функционального варианта составляет по меньшей мере 5%, преимущественно по меньшей мере 10% и предпочтительно по меньшей мере 50% в расчете на изначальный полипептид. В случае полипептидов с аминокислотными последовательностями с SEQ ID NO: 1-15 речь идет о функциональных аллельных вариантах друг с другом или одного и того же фермента, причем последовательности соответственно происходят из различных микроорганизмов. Это ясно видно из близкого сродства друг к другу, различимым образом определяемого по процентной идентичности последовательностей, а также из того факта, что все полипептиды воздействуют на ZEN и производные соединения ZEN по одному и тому же механизму разложения.
На основе сходства между собой аминокислотных последовательностей полипептидов с SEQ ID NO: 1-15 обеспечивается возможность того, что функциональный вариант одного из этих полипептидов обладает идентичностью последовательности по меньшей мере на 40% больше, чем один из задействованных полипептидов с SEQ ID NO: 1-15.
Благодаря выбору аминокислотной последовательности такого рода или ее функционального варианта обеспечивается поразительно быстрый и полный гидролиз ZEN и/или по меньшей мере одного про
- 3 032685 изводного соединения ZEN.
Согласно другому предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения полипептид содержит аминокислотную последовательность, которая содержит по меньшей мере один консервативный участок аминокислотной последовательности или его функциональный вариант, причем функциональный вариант участка аминокислотной последовательности имеет идентичность последовательности по меньшей мере 70%, предпочтительно по меньшей мере 84%, более предпочтительно по меньшей мере 92% и наиболее предпочтительно по меньшей мере 98% и по меньшей мере один консервативный участок аминокислотной последовательности выбран из группы аминокислотных последовательностей от +24 до + 50, от +52 до +77, от +79 до +87, от +89 до +145, от +150 до + 171, от +177 до +193, от +223 до +228, от +230 до +237, от + 239 до +247, от +249 до +255, от +257 до +261, от +263 до +270, от +272 до +279, от +297 до +301, от +303 до +313, от +24 до 328, от +1 до +328 последовательности с SEQ ID NO: 1. Благодаря наличию по меньшей мере одного консервативного участка аминокислотной последовательности такого рода удается разработать полипептид, который наряду с быстрым и полным гидролизом ZEN и/или по меньшей мере одного производного соединения ZEN обладает также особенно высокой активностью по сравнению с известными в настоящее время полипептидами, разлагающими ZEN.
Стабильно хорошие результаты удалось достигнуть тогда, когда соответственно другому варианту осуществления настоящего изобретения функциональный вариант содержал по меньшей мере одну модификацию аминокислоты, выбранную из группы замен, делеций и инсерций одной или нескольких аминокислот.
Благодаря дальнейшей разработке настоящего изобретения, так что полипептид характеризуется удельной активностью, равной по меньшей мере 0,01 ед./мг, преимущественно по меньшей мере 0,1 ед./мг и предпочтительно по меньшей мере 1 ед./мг, и/или константой KM гидролитического расщепления ZEN, равной не более 50 мкМ, преимущественно не более 3,5 мкМ и предпочтительно не более 0,5 мкМ, и/или константой kcat гидролитического расщепления ZEN, равной по меньшей мере 0,05 с-1, преимущественно по меньшей мере 0,6 с-1 и предпочтительно по меньшей мере 5 с-1, и/или константой vmax гидролитического расщепления ZEN, равной по меньшей мере 0,00001 мкМ-1ю-1, преимущественно по меньшей мере 0,0001 мкМ-1ю-1 и предпочтительно по меньшей мере 0,001 мкМ-1ю-1, ZEN и/или производные соединения ZEN могут быть особенно быстро и полностью гидролизованы и предпочтительно детоксифицированы.
Согласно другому предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения полипептид содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы последовательностей SEQ ID NO: 2, 5-7, 9, 11, 12 и 15, или ее функциональный вариант, причем функциональный вариант имеет по меньшей мере 40% идентичности последовательности по сравнению по меньшей мере с одной из аминокислотных последовательностей, а pH-зависимая стабильность полипептида при pH 5,0 составляет по меньшей мере 15%, предпочтительно 50% и особенно предпочтительно по меньшей мере 90%. Благодаря другому варианту осуществления такого рода может быть обеспечено то, что полипептид будет расщеплять или детоксифицировать зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона также и в кислой среде, такой как, например, среда, имеющаяся в желудках млекопитающих. При этом pH-зависимую стабильность полипептидов определяют как процентную остаточную активность полипептидов при pH 5,0 по отношению к активности при соответствующем оптимальном значении pH.
Согласно другому предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения полипептид содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы последовательностей SEQ ID NO: 1, 2, 5-7, 9, 11 и 15, или ее функциональный вариант, причем функциональный вариант имеет по меньшей мере 40% идентичности последовательности по сравнению по меньшей мере с одной из аминокислотных последовательностей, а полипептид обладает наиболее высокой ферментативной активностью в температурном интервале от 30 до 75°C, предпочтительно от 38 до 55°C и особенно предпочтительно от 38 до 52°C. Благодаря другому варианту осуществления такого рода по настоящему изобретению обеспечивается то, что зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона также и при мезофильных температурах, как, в частности, в случае температуры тела человека и сельскохозяйственных животных, гидролизуется или детоксифицируется полипептидом. Температуру, при которой полипептид обладает наибольшей ферментативной активностью, определяют как значение температурного оптимума полипептида.
Согласно другому предпочтительному варианту осуществления настоящего изобретения полипептид содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы последовательностей SEQ ID NO: 1, 5, 6, 9, 11, 12 и 15, или ее функциональный вариант, причем функциональный вариант имеет по меньшей мере 40% идентичности последовательности по сравнению по меньшей мере с одной из аминокислотных последовательностей, а полипептид является термически стабильным до температуры 90°C, предпочтительно 75°C и особенно предпочтительно 60°C. Благодаря этому обеспечивается то, что полипептид и собственно его ферментативная функция остаются, по существу, неизмененными при повышенной тепловой нагрузке, которая может иметь место, например, во время транспортировки в контейнере или во время гранулирования кормов. Термическую стабильность полипептидов определяют как температуру, при которой полипептиды после 15-минутной предварительной инкубации обладают 50%
- 4 032685 ной остаточной активностью по сравнению с активностью при соответствующем значении температурного оптимума.
Полипептид может быть выбран так, чтобы он представлял собой α/β-гидролазу, которая является приемлемой для независящего от кислорода и в отсутствие кофакторов гидролитического расщепления сложноэфирной группировки зеараленона и/или производных соединений ZEN, и содержал катализирующую гидролитическое расщепление аминокислотную триаду, состоящую из серина, аминокислоты с кислой реакцией, выбранной из глутаминовой кислоты и аспарагиновой кислоты и предпочтительно из аспарагиновой кислоты, а также из гистидина, и представляющую собой каталитическую триаду, например S128, D264 и H303, причем позиционирование приведено относительно SEQ ID NO: 1.
Гидролиз ZEN и производных соединений ZEN каждым из полипептидов с SEQ ID NO: 1-15 происходит по сложноэфирной группе зеараленона или его производных соединений согласно следующему механизму реакции:
Гидролиз ZEN до неядовитого гидролизованного зеараленона (HZEN) или гидролизованных производных соединений ZEN происходит благодаря полипептидам по настоящему изобретению и предпочтительно α/β-гидролазам. Последующее декарбоксилирование HZEN до декарбоксилированного гидролизованного ZEN (DHZEN) или декарбоксилированных гидролизованных производных соединений ZEN происходит, как правило, спонтанно.
В частности, посредством указанной ранее каталитической триады удается полностью гидролизовать ZEN и производные соединения ZEN, причем реакция разложения характеризуется хорошей pHзависимой стабильностью, в частности в случае значений pH в кислой области.
Неожиданно было выявлено, что с полипептидом, который на участке последовательности, состоящем из 3 аминокислот перед серином и 3 аминокислот после серина указанной ранее каталитической триады, содержит по меньшей мере одну полярную аминокислоту, выбранную из Y, Q, N, T, K, R, E, D, и по меньшей мере одну неполярную аминокислоту, выбранную из F, M, L, I, V, A, G, P, удается достигать стабильно хорошие результаты и, кроме того, улучшить по меньшей мере одну ферментативнокинетическую характеристику.
В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения полипептид имеет по меньшей мере одну мутацию аминокислотной последовательности относительно SEQ ID NO: 1 по меньшей мере в одной из следующих позиций: 22, 23, 25, 26, 27, 29, 31, 32, 35, 37, 42, 43, 46, 51, 53, 54, 57, 60, 69, 72, 73, 78, 80, 84, 88, 95, 97, 99, 114, 118, 119, 123, 132, 141, 146, 148, 149, 154, 163, 164, 165,
169, 170, 172, 176, 180, 182, 183, 190, 191, 194, 196, 197, 198, 201, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 212,
213, 214, 216, 217, 220, 221, 222, 229, 231, 233, 238, 240, 244, 245, 246, 248, 249, 251, 254, 256, 260, 262,
263, 266, 269, 271, 277, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 292, 296, 298, 302, 307, 308, 309, 311, 314,
317, 319, 321, 323, 325 и 326. Эти позиции следуют из различий последовательности полипептида с SEQ ID NO: 1 и особенно активных полипептидов с SEQ ID NO: 2-6, имеющих с этой последовательностью высокую степень идентичности. Благодаря тому, что полипептид с SEQ ID NO: 1 изменяют по меньшей мере в одной из этих позиций так, что получают варианты аминокислот последовательностей SEQ ID NO: 2-6 в этой позиции, удается показать, что эти позиции оказывают значительное влияние на ферментативно-кинетические характеристики полипептида, при этом комбинации последовательности SEQ ID NO: 1 с одной из последовательностей SEQ ID NO: 2-6, имеющих высокую степень идентичности последовательности, ведут к более высокой активности.
Согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения полипептид имеет в аминокислотной последовательности по меньшей мере одну мутацию, выбранную из группы: D22A, S23Q, S23L, N25D, I26V, F27Y, F27H, S29P, R31A, F32Y, R35K, R35Q, V37A, V42I, V43T, F46Y, S51E, S51D, D53G, N54M, N54R, L57V, L60I, S69G, P72E, V73A, A78S, N80H, F84Y, I88L, T95S, T97A, R99K, I114M, I118V, K119R, V123I, L132V, A141S, I146V, I146L, A148G, A149V, A154P, P163T, A164T, Y165C, Y165H, V169I, L170R, A172G, A176M, A176V, Y180F, D182T, F183Y, I190V, G191S, K194T, K194E, F196Y, V197C, V197R, E198R, E198S, K201D, K201G, P204S, P204A, A205S, K206P, A207M, M208A, Q209R, L210A, L210S, AP212, T213V, P214A, E216T, E216G, A217I, N220H, L221M, K222R, K222Q, G229A, A231V, F233W, F233Y, F233H, A238G, H240N, H240S, D244E, R245Q, M246L, S248T, S248N, S248G,
Q249R, K251N, I254V, I256L, A260M, T262D, T262G, I263T, E266D, E269H, E269N, L271V, L277E,
E280A, E280L, H281R, H281Q, A282V, Q283R, D284L, D284R, I285L, I286M, R287E, R287D, R292K,
R292T, Q296A, Q296E, H298V, L302S, L307Q, F308S, D309A, A311P, A314V, L317F, S319Q, S319P,
S319R, S321A, S321T, T323A, P325A, A326P, относительно SEQ ID NO: 1. Полипептидом такого рода удается полностью гидролизовать и предпочтительно детоксифицировать ZEN в течение короткого времени, причем удельная активность полипептида составляет по меньшей мере 6,00 ед./мг, преимущест
- 5 032685 венно по меньшей мере 7,00 ед./мг и предпочтительно по меньшей мере 8,00 ед./мг. Размерность ед. или также единица представляет собой меру абсолютной каталитической активности и определяется по гидролизу 1 мкмоль ZEN в минуту при 32°C в 50 мМ буферном растворе Tris-HCl (pH 8,2), причем под каталитической активностью понимают ферментативное превращение субстрата в определенных условиях реакции, а под удельной активностью понимают соотношение каталитической активности и массовой концентрации полипептида (масса на единицу объема).
Благодаря тому что полипептид сформирован так, что содержится по меньшей мере один из следующих аминокислотных мотивов с SEQ ID NO: 32-50, удается разработать полипептиды, которые имеют удельную активность по меньшей мере 7,00 ед./мг и предпочтительно по меньшей мере 8,00 ед./мг. Неожиданно оказалось, что, когда содержится по меньшей мере один из следующих аминокислотных мотивов с последовательностью с SEQ ID NO: 51-58, ферментативная активность полипептида, например, по сравнению с мотивом, содержащим 7 аминокислот, еще больше повышается. Еще более высокая удельная активность достигается тогда, когда содержится по меньшей мере один из следующих аминокислотных мотивов с последовательностью с SEQ ID NO: 59-69.
Согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения полипептид имеет по меньшей мере одну консервативную замену аминокислоты по меньшей мере в одной позиции, причем консервативная замена аминокислоты выбрана из замен G на A или A на G, S, или V на I, L, A, T, S, или I на V, L, M, или L на I, M, V, или M на L, I, V, или P на A, S, N, или F на Y, W, H, или Y на F, W, H, или W на Y, F, H, или R на K, E, D, или K на R, E, D, или H на Q, N, S, или D на N, E, K, R, Q, или E на Q, D, K, R, N, или S на T, A, или T на S, V, A, или C на S, T, A, или N на D, Q, H, S, или Q на E, N, H, K, R. При этом выражение консервативная замена аминокислоты относится к замене одной аминокислоты другой аминокислотой, которая рассматривается специалистами в данной области техники в качестве консервативной, то есть обладающей похожими специфическими свойствами. Такие специфические свойства представляют собой, например, размеры, полярность, гидрофобность, заряд или константа pKs аминокислоты. Под консервативной мутацией понимают, например, замену одной аминокислоты с кислой реакцией другой аминокислотой с кислой реакцией, одной аминокислоты с щелочной реакцией другой аминокислотой с щелочной реакцией или одной аминокислоты с полярным характером другой аминокислотой с полярным характером.
Консервативной заменой аминокислот такого рода удается получать функциональные варианты полипептидов, удельная активность которых по сравнению с исходным полипептидом приблизительно равна по силе, однако предпочтительно выше по меньшей мере на 0,1 ед./мг.
Настоящее изобретение направлено также на разработку изолированного полинуклеотида, с которым удается получить полипептид для быстрого и надежного гидролитического расщепления ZEN и/или по меньшей мере одного производного соединения ZEN.
С целью решения этой задачи настоящее изобретение отличается тем, что изолированный полинуклеотид содержит нуклеотидную последовательность, которая кодирует полипептид, причем полипептид обладает свойством гидролизовать зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона, и нуклеотидная последовательность кодирует по меньшей мере один полипептид по любому из пп.1-11 и/или нуклеотидная последовательность имеет степень идентичности последовательности по меньшей мере с одной из последовательностей, выбранных из группы последовательностей SEQ ID NO: 16-31, причем выбранная нуклеотидная последовательность составляет по меньшей мере 40%, и/или нуклеотидная последовательность в среднежестких условиях гибридизуется по меньшей мере одной нуклеотидной последовательностью, выбранной из группы последовательностей SEQ ID NO: 16-31, и/или ее частичной последовательностью по меньшей мере из 200 нуклеотидов и предпочтительно по меньшей мере из 100 нуклеотидов, и/или комплементарной цепью нуклеотидной последовательности или ее частичной последовательностью.
Сверхэкспрессирующие нуклеотидные последовательности, предпочтительно их триплеты (кодоны), изменяются, как правило, в зависимости от клетки-хозяина, так что отклонение кодона оптимизируется в зависимости от клетки-хозяина. Результат этого состоит в том, что полинуклеотиды со степенью идентичности последовательности значительно меньше 80%, а также меньше 70% или меньше 60% также могут кодировать один и тот же полипептид. Сравнение последовательностей для определения степени идентичности последовательности должно осуществляться также внутри участков последовательностей, причем участок следует понимать в качестве непрерывной последовательности опорной последовательности. Длина участков последовательностей в случае нуклеотидных последовательностей, как правило, составляет от 15 до 600.
Посредством предложенных изолированных нуклеотидных последовательностей или участков последовательностей удается генерировать зонды из нуклеиновых кислот, длина которых, как правило, составляет по меньшей мере 15, 30, или 40 нуклеотидов. Благодаря таким зондам, которые, как правило, дополнительно метят, например, посредством 3H, 32P, 35S, биотина или авидина, могут быть при применении стандартных способов идентифицированы нуклеотидные последовательности, которые кодируют полипептиды с разлагающим действием в отношении ZEN и/или производных соединений ZEN. В качестве исходного материала для идентификации таких последовательностей могут быть использованы, на
- 6 032685 пример, ДНК, РНК или кДНК отдельных микроорганизмов, геномные библиотеки ДНК или библиотеки кДНК.
Для нуклеотидных последовательностей или нуклеотидных зондов с длинами по меньшей мере в 100 нуклеотидов среднежесткие условия определяют как предгибридизацию и гибридизацию при 42°C в 5-кратном буферном растворе Na-ЭДТА с добавкой NaCl (SSPE, 0,9M NaCl, 60 мМ NaH2PO4, 6 мМ ЭДТА), содержащем 0,3% додецилсульфата натрия (SDS), 200 мкг/мл дефрагментированной и денатурированной ДНК спермиев лосося и 35% формамида, с последующим осуществлением саузерн-блоттинга в стандартных условиях, причем материал носителя в конце промывают три раза по 15 мин 2-кратным натрийхлоридно-цитратным буферным раствором SSC, 300 мМ NaCl и 30 мМ тринатрийцитрата, 0,2% SDS) при 55°C.
Для нуклеотидных последовательностей или нуклеотидных зондов с длинами от 15 до 100 нуклеотидов среднежесткие условия определяют как предгибридизацию и гибридизацию в буферном растворе, в который входят 0,9М NaCl, 0,09M раствор Tris-HCl с pH 7,6, 6 мМ ЭДТА, 0,5% NP-40, 1-кратный раствор Денхардта, 1 мМ пирофосфата натрия, 1 мМ дигидрофосфата натрия, 0,1 мМ АТФ и 0,2 мг/мл РНК дрожжей, причем предгибридизацию и гибридизацию осуществляют при температуре ниже расчетной температуры плавления (Tm) на значение от 5 до 10°C, причем Tm определяют расчетом по Bolton и McCarthy (1962, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 48:1390). Затем осуществляют саузерн-блоттинг в стандартных условиях (J. Sambrook, E.F. Fritsch und T. Maniatis, 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor, New York). Материал носителя в конце промывают один раз в течение 15 мин 6-кратным буферным раствором SCC, содержащим 0,1% SDS, и два раза по 15 мин 6-кратным буферным раствором SSC соответственно при температуре ниже расчетной Tm на значение от 5 до 10°C.
Настоящее изобретение направлено также на разработку добавки, с которой достигается быстрое и надежное гидролитическое расщепление ZEN и/или по меньшей мере одного производного соединения ZEN в определенной или сложной матрице, такой как, например, корма или пищевые продукты.
С целью решения этой задачи разработана добавка, гидролитически расщепляющая зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона, причем добавка содержит по меньшей мере один полипептид с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы последовательностей SEQ ID NO: 1-15, или ее функциональным вариантом, причем идентичность последовательности между функциональным вариантом и по меньшей мере одной из аминокислотных последовательностей составляет по меньшей мере 40%, и при необходимости содержит вспомогательные вещества.
С добавкой такого рода достигается биохимическое превращение ZEN и/или по меньшей мере одного производного соединения ZEN в гидролизованный ZEN и/или гидролизованное производное соединение ZEN. Эта добавка может быть использована также, например, для стереоселективного гидролиза ZEN и/или производных соединений ZEN в промышленном масштабе.
В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения добавка сформирована так, что вспомогательные вещества выбирают по меньшей мере из одного инертного носителя, а также при необходимости из других компонентов, таких как витамины и/или минеральные вещества, и/или ферменты, и/или другие компоненты для детоксификации микотоксинов. Благодаря применению добавки такого рода, например, в кормах или пищевых продуктах может быть обеспечено то, что содержащееся при некоторых условиях количество ZEN и/или производных соединений ZEN безопасно гидролизуется и предпочтительно детоксифицируется так, что вредное действие на организм субъекта, употребляющего этот корм или пищевой продукт, не оказывается.
При этом полипептид по настоящему изобретению может находиться также в ферментной композиции, которая наряду по меньшей мере с одним полипептидом по настоящему изобретению дополнительно содержит по меньшей мере один фермент, который, например, участвует в разложении протеинов, такой как, например, протеазы, или участвует в метаболизме крахмала или волокон, или жиров, или гликогена, такой как, например, амилаза, целлюлаза или глюканаза, а также, например, гидролазы, липолитические ферменты, маннозидазы, оксидазы, оксидоредуктазы, фитазы, ксиланазы и/или их комбинации.
Другие аспекты применения настоящего изобретения относятся к ферментным композициям, которые наряду по меньшей мере с одним полипептидом по настоящему изобретению дополнительно содержат по меньшей мере один компонент для детоксификации микотоксинов, такой как разлагающий микотоксины фермент, такой как, например, афлатоксиноксидаза, эрготамингидролазы, эрготаминамидазы, зеараленонэстеразы, зеараленонлактоназы, охратоксинамидазы, фумонизинкарбоксилэстеразы, фумонизинаминотрансферазы, аминополиоламинооксидазы, дезоксиниваленолэпоксидгидролазы, и/или содержат по меньшей мере один разлагающий микотоксины микроорганизм, такой как Bacillus subtilis, и/или по меньшей мере один связывающий микотоксины компонент, например бактериальные клеточные стенки или неорганические материалы, такие как бентонит.
Согласно особенно предпочтительному другому варианту осуществления настоящего изобретения полипептид содержится в добавке в концентрации не более 10000 ед./г, предпочтительно не более 1000 ед./г, более предпочтительно не более 100 ед./г и наиболее предпочтительно не более 10 ед./г, благодаря
- 7 032685 чему удается ZEN и/или производные соединения ZEN быстро и, в частности, уже перед их резорбцией в теле субъекта, употребляющего загрязненный корм или пищевой продукт, предпочтительно млекопитающего, превращать в нетоксичные или малотоксичные метаболиты, предпочтительно в HZEN и DHZEN.
Согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения полипептид находится в капсулированной или покрытой форме, причем для капсулирования или покрывания могут быть использованы стандартные способы, такие как, например, способы, описанные в WO 92/12645. Благодаря капсулированию или покрыванию удается транспортировать полипептид без изменения, в частности без разложения и повреждения, к месту его применения, так что только после растворения защитной оболочки, например, в пищеварительном тракте животных полипептид начинает действовать, вследствие чего может быть достигнуто еще более целенаправленное, быстрое и полное разложение ZEN и/или производных соединений ZEN также и в кислых, обогащенных протеазой и анаэробных средах. При этом благодаря капсулированию или покрыванию удается повысить также термическую стабильность полипептидов в добавке.
Настоящее изобретение относится также к применению добавки для гидролитического расщепления зеараленона и/или по меньшей мере одного производного соединения зеараленона в кормах предпочтительно для свиней, домашней птицы и аквакультуры, в пищевых продуктах или в высушенной барде. Благодаря применению добавки по настоящему изобретению удается гидролизовать или детоксифицировать ZEN и/или производные соединения ZEN, содержащиеся в пищевом продукте или в корме, или в высушенной барде, причем детоксикация такого рода достигается уже при концентрации полипептидов около 1 ед./г загрязненного корма или пищевого продукта.
Настоящее изобретение направлено также на разработку способа, с которым удается обеспечить быстрое и надежное гидролитическое расщепление ZEN и/или по меньшей мере одного производного соединения ZEN.
С целью решения этой задачи способ осуществляют так, что зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона гидролизуют полипептидом с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы последовательностей SEQ ID NO: 1-15, или ее функциональным вариантом, причем идентичность последовательности между функциональным вариантом и по меньшей мере одной из аминокислотных последовательностей составляет по меньшей мере 40%.
Согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения способ осуществляют так, что полипептид используют в одной из добавок по настоящему изобретению.
Согласно другому предпочтительному варианту способ осуществляют так, что полипептид или добавку прибавляют к корму или пищевому продукту, загрязненному зеараленоном и/или по меньшей мере одним производным соединением зеараленона, так что загрязненный корм или пищевой продукт приводится в контакт с влагой, а полипептид или добавка гидролизуют зеараленон и/или по меньшей мере одно производное соединение зеараленона, содержащиеся в загрязненном корме или пищевом продукте. В случае влажных кормов или пищевых продуктов, таких как пульпы или кашицы, гидролиз зеараленона и/или по меньшей мере одного производного соединения зеараленона будет происходить во влажном корме или пищевом продукте перед оральным приемом. Благодаря такому способу может быть обеспечено то, что вредящее действие зеараленона и производных соединений зеараленона на человека и животное устраняется в значительной степени. При этом в качестве влаги понимают присутствие воды или водосодержащих жидкостей, причем в их число входят также, например, слюна или другие жидкости, имеющиеся в пищеварительном тракте. В качестве пищеварительного тракта понимают полость рта, глотку (зев), пищевод и желудочно-кишечный тракт или их эквиваленты, причем в случае животных могут использоваться разные термины или в пищеварительном тракте животных могут отсутствовать отдельные компоненты.
Способ по настоящему изобретению может быть осуществлен также в варианте, когда корм или пищевой продукт гранулируют перед оральным приемом.
Согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения способ осуществляют так, что гидролизуется по меньшей мере 70%, преимущественно по меньшей мере 80% и предпочтительно по меньшей мере 90% зеараленона и/или по меньшей мере одного производного соединения зеараленона. Благодаря этому может быть предотвращено подострое и/или начальное хроническое токсическое действие, такое как, например, тератогенное, карциногенное, эстрогенное и иммуносупрессивное действие у животных или людей.
В последующем описании настоящее изобретение более подробно поясняется примерами осуществления и фигурами. На фигурах показано на фиг. 1 показаны зависимости от времени степени разложения ZEN и увеличения количества метаболитов HZEN и DHZEN в случае полипептида с SEQ ID NO: 1, причем на фиг. 1A полипептид не имеет метки, на фиг. 1B полипептид имеет C-концевую метку 6His, а на фиг. 1C имеет N-концевую метку 6His;
на фиг. 2 - кинетика согласно уравнению Михаэлиса-Ментен в случае полипептида с SEQ ID NO: I;
на фиг. 3 - зависимости от времени степени разложения ZEN и увеличения количества метаболитов
- 8 032685
HZEN и DHZEN в случае очищенных полипептидов с SEQ ID NO: 1 (фиг. 3A), 2 (фиг. 3B), (фиг. 3C), 6 (фиг. 3D), 7 (фиг. 3E), 9 (фиг. 3F), (фиг. 3G), (фиг. 3H) и 15 (фиг. 3I), причем все последовательности имеют C-концевую метку 6His.
Пример 1. Модификация, клонирование и экспрессия полинуклеотидов, кодирующих полипептиды, которые могут гидролитически расщеплять ZEN и/или по меньшей мере одно производное соединение ZEN.
Замены, инсерции или делеции аминокислот осуществляли мутацией нуклеотидных последовательностей посредством ПЦР с применением набора Quick-change Site-directed Mutagenesis Kits (компания Stratagene) согласно инструкции. Альтернативно этому были использованы также полные нуклеотидные последовательности (компания GeneArt). Нуклеотидные последовательности, генерированные с использованием набора для мутагенеза посредством ПЦР или полученные от компании GeneArt, необязательно дополнительно имели на аминокислотном уровне C- или N-концевую метку 6His и стандартными способами были интегрированы в экспрессирующие векторы для экспрессии в E.coli или P.pastoris, трансформированы в E.coli или P.pastoris, а также экспрессированы в E.coli или P.pastoris (J.M. Cregg, Pichia Protocols, second Edition, ISBN-10: 1588294293, 2007; J. Sambrook et al. 2012, Molecular Cloning, A Laboratory Manual 4th Edition, Cold Spring Harbor), причем для этой задачи может быть использована также любая другая приемлемая клетка-хозяин.
Термин экспрессирующий вектор относится к конструкции ДНК, которая в состоянии экспрессировать ген in vivo или in vitro. В частности, под конструкциями ДНК понимают также конструкции, которые являются приемлемыми для переноса нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид, в клетку-хозяин, чтобы там быть интегрированной в геном или свободно находиться в экстрахромосомальном пространстве и внутриклеточно экспрессировать нуклеотидную последовательность, кодирующую полипептид, и при необходимости для вывода полипептида из клетки.
Термин клетка-хозяин относится ко всем клеткам, которые содержат сверхэкспрессирующую нуклеотидную последовательность или экспрессирующий вектор и могут продуцировать полипептид по настоящему изобретению. В частности, под прокариотическими и/или эукариотическими клетками предпочтительно понимают P.pastoris, E.coli, Bacillus subtilis, Streptomyces, Hansenula, Trichoderma, Lactobacillus, Aspergillus, клетки растений и/или споры Bacillus, Trichoderma или Aspergillus.
Для определения каталитических свойств полипептидов использовали растворимый клеточный лизат в случае E.coli или надосадочную жидкость культуры в случае P.pastoris. Для определения констант KM, vmax, kcat и удельной активности полипептиды селективно концентрировали стандартными способами в хроматографических колонках с насадкой из никельсефарозы. Определение концентрации белка осуществляли стандартными способами, например способом BCA (Pierce BCA Protein Assay KitProd # 23225), однако предпочтительно определяли фотометрически с удельными коэффициентами поглощения для соответствующих белков, рассчитываемыми по программе ProtParam, доступной для использования по интернет-адресу http://web.expasy.org/protparam (Gasteiger E. et al.; Protein Identification and Analysis Tools on the ExPASy Server; (In) John M. Walker (ed): The Proteomics Protocols Handbook, Humana Press, 2005, p. 571-607).
Пример 2. Определение идентичности последовательности и консервативных участков аминокислотной последовательности.
Определение процентной идентичности последовательности по всей длине полипептидов с аминокислотными последовательностями с SEQ ID NO: 1-15 относительно друг друга (табл. 1) осуществляли по программе BLAST (Basic Local Alignment Search Tool (программа поиска основных локальных выравниваний)) и предпочтительно по программе BLASTP, которыми можно воспользоваться на интернетстранице National Center for Biotechnology Information (NCBI; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Таким образом, две или несколько последовательностей можно сравнивать друг с другом по алгоритму Altschul et al. (1997, Nucleic. Acids. Res., (1997) 25:3389-3402). В качестве программных установок были приняты базовые установки и предпочтительно: max target sequence (максимальное число целевых последовательностей)=100; expected threshold (ожидаемый порог)=10; word size (длина слова)=3; matrix (матрица)=BLOSOM62; gap costs (штрафы за разрыв)=Existence (существование): 11; Extention (продолжение): 1; computational adjustment (вычислительная корректировка)=Conditional compositional score matrix adjustment (условная композиционная корректировка матрицы счета).
Для определения консервативных участков аминокислотных последовательностей полипептиды с SEQ ID NO: 1-6, имеющими идентичность последовательности по меньшей мере 70% по сравнению друг с другом, сравнивали посредством компьютерной программы COBALT (J.S. Papadopoulos und R. Agarwala, 2007, COBALT: constraint-based alignment tool for multiple protein sequences, Bioinformatics 23:107379) с использованием стандартных параметров и предпочтительно следующих параметров: (Gap penalties (штрафы за разрыв): -11, -1; End-Gap Penalties (штрафы за окончание разрыва): -5, -1; Use RPS BLAST (использование RPS BLAST): on (включено); Blast E-value (ожидаемая значимость): 0,003; Find Conserved columns and Recompute (нахождение консервативных столбцов и перерасчет): on (включено); use query Clusters (использование запроса кластеров): on (включено); word size (длина слова): 4; max Cluster distance (максимальное расстояние между кластерами): 0,8; Alphabet (алфавит): regular
- 9 032685 (нормальный); Homology conversation setting (задание связи гомологии): 3 bits (3 бита)). Результат этого анализа характеризует консервативные аминокислоты. В качестве консервативных участков аминокислотных последовательностей были определены следующие области, состоящие по меньшей мере из 5 следующих друг за другом консервативных аминокислот, а именно участки по сравнению с последовательностью с SEQ ID NO: 1: A - с позиции + 24 до позиции +50, B - с позиции +52 до позиции +77, C - с позиции +79 до позиции +87, D - с позиции +89 до позиции +145, Е - с позиции + 150 до позиции +171, F - с позиции +177 до позиции +193, G - с позиции +223 до позиции +228, H - с позиции +230 до позиции +237, I - с позиции +239 до позиции +247, J - с позиции +249 до позиции +255, K - с позиции +257 до позиции +261, L - с позиции +263 до позиции +270, M - с позиции +272 до позиции +279, N - с позиции +297 до позиции +301 и O - с позиции +303 до позиции +313.
Определение процентной идентичности последовательностей полипептидов по сравнению друг с другом, а также консервативных участков аминокислотных последовательностей отдельных полипептидов относительно консервативных участков аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 1 осуществляли соответственно описанному ранее. Результаты представлены в табл. 1 и 2.
Таблица 1 Процентная идентичность последовательностей полипептидов по сравнению друг с другом
SEQ ID NO: 1 SEQ ID NO: 2 SEQ ID NO: 3 SEQ ID NO: 4 SEQ ID NO: 5 SEQ ID NO: 6 SEQ ID NO: 7
SEQ ID NO: 1 70% 71% 71% 71% 71% 64%
SEQ ID NO: 2 70% 81% 83% 81% 83% 63%
SEQ ID NO: 3 71% 81% 95% 99% 92% 60%
SEQ ID NO: 4 71% 83% 95% 95% 95% 60%
SEQ ID NO: 5 71% 81% 99% 95% 93% 60%
SEQ ID NO: 6 71% 83% 92% 95% 93% 61%
SEQ ID NO: 7 64% 63% 60% 60% 60% 61%
SEQ ID NO: 8 57% 54% 54% 53% 53% 53% 53%
SEQ ID NO: 9 50% 50% 53% 53% 53% 55% 51%
SEQ ID NO: 10 55% 52% 55% 54% 55% 53% 52%
SEQ ID NO: 11 53% 51% 53% 51% 51% 52% 54%
SEQ ID NO: 12 50% 49% 50% 50% 50% 49% 51%
SEQ ID NO: 13 55% 49% 51% 51% 51% 52% 54%
SEQ ID NO: 14 73% 65% 69% 70% 69% 68% 80%
SEQ ID NO: 15 79% 68% 71% 71% 71% 72% 63%
- 10 032685
SEQ ID NO: 8 SEQ ID NO: 9 SEQ ID NO: 10 SEQ ID NO: 11 SEQ ID NO: 12 SEQ ID NO: 13 SEQ ID NO: 14 SEQ ID NO: 15
SEQ ID NO: 1 57% 50% 55% 53% 50% 55% 73% 79%
SEQ ID NO: 2 54% 50% 52% 51% 49% 49% 65% 68%
SEQ ID NO: 3 54% 53% 55% 53% 50% 51% 69% 71%
SEQ ID NO: 4 53% 53% 54% 51% 50% 51% 70% 71%
SEQ ID NO: 5 53% 53% 55% 51% 50% 51% 69% 71%
SEQ ID NO: 6 53% 55% 53% 52% 49% 52% 68% 72%
SEQ ID NO: 7 53% 51% 52% 54% 51% 54% 80% 63%
SEQ ID NO: 8 50% 49% 51% 49% 48% 83% 51%
SEQ ID NO: 9 50% 51% 52% 69% 51% 67% 51%
SEQ ID NO: 10 49% 51% 76% 52% 52% 63% 56%
SEQ ID NO: 11 41% 50% 76% 52% 51% 58% 52%
SEQ ID NO: 12 49% 52% 52% 52% 49% 71% 51%
SEQ ID NO: 13 48% 51% 52% 51% 49% 54% 53%
SEQ ID NO: 14 83% 67% 63% 58% 71% 55% 72%
SEQ ID NO: 15 51% 51% 56% 52% 51% 53% 72%
- 11 032685
Таблица 2
Процентная идентичность последовательностей консервативных участков аминокислотных последовательностей от A до O
Идентичность последовательности относительнс > SEQ ID
NO: : 1
Полипептид Участок A Участок В Участок С Участок D Участок Е Участок F
SEQ ID NO: 1 100% 100% 100% 100% 100% 100
SEQ ID NO: 2 59, 6% 76,9% 88,9% 87,7% 77,3% 76,5
SEQ ID NO: 3 63,0% 76,9% 77,8% 89,5% 86, 4% 76,5
SEQ ID NO: 4 63,0% 80,8% 77,8% 91,2% 86, 4% 76,5
SEQ ID NO: 5 63,0% 76,9% 77,8% 87,7% 86, 4% 76,5
SEQ ID NO: 6 63,0% 80,8% 77,8% 91,2% 86, 4% 76,5
SEQ ID NO: 7 44,7% 69,2% 77,8% 78,9% 68,2% 64,7
SEQ ID NO: 8 40,7% 50,0% 66,7% 82,5% 59, 1% 64,7
SEQ ID NO: 9 51,9% 57,7% 55,6% 73,7% 45,5% 58,8
SEQ ID NO: 10 44,4% 61,5% 77,8% 75,4% 47,8% 76,5
SEQ ID NO: 11 44,4% 50,0% 66,7% 71,9% 43,5% 58,8
SEQ ID NO: 12 51,9% 53,8% 55,6% 71,9% 50, 0% 58,8
SEQ ID NO: 13 18,5% 61,5% 55,6% 77,2% 54,5% 52,9
SEQ ID NO: 14 55,6% 69,2% 77,8% 84,2% 54,5% 52,9
SEQ ID NO: 15 74,1% 86,7% 88,9% 89,0% 77,3% 88,2
Идентичность последовательности относительнс ) SEQ ID
NO: : 1
Полипептид Участок Участок Участок Участок Участок Участок
G Η I J К L
SEQ ID NO: 1 100% 100% 100% 100% 100% 100%
SEQ ID NO: 2 100% 87,5% 66, 7% 85,7% 80,0% 75,0%
SEQ ID NO: 3 100% 87,5% 77,8% 57,1% 80,0% 75,0%
SEQ ID NO: 4 100% 87,5% 77,8% 57,1% 80,0% 75,0%
SEQ ID NO: 5 100% 87,5% 77,8% 57,1% 80,0% 75,0%
SEQ ID NO: 6 100% 75,0% 77,8% 85,7% 80,0% 87,5%
SEQ ID NO: 7 100% 87,5% 66, 7% 71, 4% 100% 50,0%
SEQ ID NO: 8 100% 62,5% 44,4% 57,1% 80,0% 62,5%
SEQ ID NO: 9 100% 12,5% 44,4% 42, 9% 60,0% 62,5%
SEQ ID NO: 10 100% 62,5% 55,6% 71, 4% 80,0% 50,0%
SEQ ID NO: 11 100% 50, 0% 55, 6% 57,1% 80,0% 50,0%
SEQ ID NO: 12 100% 12,5% 22,2% 57,1% 80,0% 52,5%
SEQ ID NO: 13 100% 50, 0% 44, 4% 57,1% 80,0% 75,0%
SEQ ID NO: 14 0% 8,3% 0% 14,3% 0% 25,0%
SEQ ID NO: 15 100% 87,5% 100% 85,7% 100% 75,0%
- 12 032685
Идентичность последовательности относительно SEQ ID NO: 1
Полипептид Участок M Участок N Участок О
SEQ ID NO: 1 100% 100% 100%
SEQ ID NO: 2 87,5% 80, 0% 81, 8%
SEQ ID NO: 3 87, 0% 80, 0% 81, 8%
SEQ ID NO: 4 87,5% 80, 0% 81, 8%
SEQ ID NO: 5 87,5% 80, 0% 81, 8%
SEQ ID NO: 6 87,5% 80, 0% 72,7%
SEQ ID NO: 7 75, 0% 40, 0% 36, 4%
SEQ ID NO: 8 75, 0% 60, 0% 54,5%
SEQ ID NO: 9 62,5% 40, 0% 54,5%
SEQ ID NO: 10 62,5% 40, 0% 54,5%
SEQ ID NO: 11 75, 0% 40, 0% 54,5%
SEQ ID NO: 12 100% 40, 0% 54,5%
SEQ ID NO: 13 50, 0% 40, 0% 63, 6%
SEQ ID NO: 14 6, 2% 0% 0%
SEQ ID NO: 15 87,5% 80, 0% 63, 6%
Пример 3. Гидролиз ZEN полипептидами в клеточных лизатах.
Для определения способности расщеплять ZEN в нетоксичные или малотоксичные метаболиты HZEN и DHZEN был получен полипептид с SEQ ID NO: 1, кодированный нуклеотидной последовательностью с SEQ ID NO: 17, в качестве таковой, и с C-или N-концевой меткой 6His в E.coli, как описано в примере 1. Полипептиды с аминокислотными последовательностями с SEQ ID NO: 2-15, которые были кодированы нуклеотидными последовательностями с SEQ ID NO: 18-31, были помечены меткой 6His только на C-концевом участке. 100 мл раствора культуры E.coli с оптической плотностью 2,0-2,5 (OD при 600 нм) разделяли центрифугированием при 4°C и ресуспендировали в 20 мл минеральной среды Бруннера (DSMZ microorganisms medium number 462, 2012). Клеточные суспензии после 3-кратной обработки во французском прессе при 20000 футах на кв. дюйм подвергали лизису. Полученные таким образом клеточные лизаты применяли с разбавлениями 1:10, 1:100 или 1:1000, которые получали с минеральной средой Бруннера, содержащей 0,1 мг/мл BSA (альбумин сыворотки крови крупного рогатого скота). Для опытов по разложению ZEN к 9,9 мл минеральной среды Бруннера, содержащей 0,1 мг/мл BSA, прибавляли 0,1 мл разбавленного клеточного лизата и 31 мкл исходного раствора субстрата ZEN. Таким образом, в итоге клеточные лизаты разбавляли с соотношением 1:1000, 1:10000 или 1:100000. В качестве исходного раствора субстрата ZEN использовали 2,08 мМ раствор ZEN (40 об.% ACN + 60 об.% H2O). Для получения этого раствора соответственно взвешивали и растворяли ZEN в кристаллической форме (стандарт биочистоты, компания Romer Labs, артикул № 001109, чистота не менее 98%). Расщепляемые смеси переносили в склянки вместимостью 25 мл и инкубировали при 25°C при встряхивании с частотой 100 об/мин в течение 120 ч. В моменты времени 0, 0,5, 1, 2, 5, 24, 47, 72 и 120 ч соответственно отбирали пробы объемом 1 мл, полипептиды инактивировали нагреванием в течение 10 мин при 99°C и хранили при -20°C. После размораживания проб нерастворимые компоненты отделяли центрифугированием. ZEN, HZEN и DHZEN анализировали способом ЖХ-МС-МС. С этой целью метаболиты хроматографически разделяли посредством колонки Phenomenex Luna C18(2) с размерами 250x3 мм и с частицами крупностью 5 мкм. В качестве элюента использовали смесь ацетонитрил-вода с концентрацией муравьиной кислоты 1 мл/л. УФ-сигнал регистрировали при 270 нм. В качестве средства ионизации использовали ионизацию электрораспылением (ИЭР). ZEN, HZEN и DHZEN количественно определяют посредством Qtrap-ЖХ-МС-МС (жидкостной хромато-масс-спектрометр с тройным квадруполем, компания Applied Biosystems) в расширенном режиме. Не позже чем через 24 ч ни в одной из смесей невозможно было уже обнаружить существенное количество ZEN. Преобладающая часть, более 80%, ZEN была превращена в HZEN или DHZEN.
На фиг. 1 можно видеть зависимость от времени степени разложения ZEN и увеличения количества HZEN, а также DHZEN на примере разбавленного с соотношением 1:10000 раствора клеточного лизата в случае полипептида с SEQ ID NO: 1 как без метки (фиг. 1A), так и с C-концевой меткой 6His (фиг. 1B) и
- 13 032685
N-концевой меткой 6His (фиг. 1C). Из этого ясно следует, что, во-первых, превращение ZEN происходит непосредственно и полностью, так как уже в первых пробах (0 ч), которые были отобраны непосредственно после начала опыта, почти невозможно было больше детектировать ZEN, и, во-вторых, вследствие присоединение C- или N-концевой метки не происходило существенной потери активности.
Пример 4. Гидролиз производных соединений ZEN полипептидами в клеточных лизатах.
Для определения способности полипептидов наряду с ZEN превращать в нетоксичные или малотоксичные метаболиты также и производные соединения ZEN получали полипептиды с SEQ ID NO: 1-15 с C-концевыми метками His, как и описанные в примере 3, а в качестве клеточных лизатов при разложении использовали соответствующие синтетические нуклеотидные последовательности с SEQ ID NO: 17-31.
Опыты по разложению осуществляли согласно описанию примера 3, причем каждый полипептид был испытан с каждым из производных соединений ZEN, выбранных из группы α-ZEL, β-ZEL, α-ZAL, βZAL, Z14G, Z14S и ZAN. Клеточные лизаты применяли с общим разбавлением 1:10000. В качестве исходного раствора субстрата вместо 2,08 мМ раствора ZEN (40 об.% ACN + 60 об.% H2O) применяли эквимолярные, т.е. 2,08 мМ растворы производных соединений ZEN. α-ZEL, β-ZEL, α-ZAL, β-ZAL и ZAN были получены от компании Sigma и применялись в качестве стандарта для анализа. Z14G и Z14S с чистотой по меньшей мере 90% были получены способами, описанными P. Krenn et al. (2007, Mykotoxin Research, 23, 4, 180-184) и M. Sulyok et al. (2007, Anal. Bioanal. Chem., 289, 1505-1523), и применялись в качестве стандарта для анализа. Другое отличие от примера 3 состояло в том, что отбирали только одну пробу и при этом через 24 ч. Уменьшение концентрации производных соединений ZEN в течение опыта по разложению количественно определяли способом ЖХ-МС-МС. α-ZEL, β-ZEL, Z14G и Z14S определяли способом M. Sulyok et al. (2010, Food Chemistry, 119, 408-416). α-ZAL, β-ZAL и ZAN определяли способом P. Songsermaskul et al. (2011, J. of Animal Physiol. and Animal Nutr., 97, 155-161). Неожиданно было выявлено, что во всех опытах по разложению через 24 ч инкубации в наличии оставалось только от 0 до максимально 13% исходного количества производных соединений ZEN.
Пример 5. Удельная активность и ферментативно-кинетические характеристики полипептидов и их вариантов.
Определение удельной активности полипептидов и их вариантов осуществляли фотометрически, причем у всех примененных полипептидов была C-концевая метка 6His. Получение, обогащение и очистку полипептидов или их вариантов осуществляли соответственно описанию примера 1. Разложение ZEN до HZEN определяли по уменьшению поглощения при длине волны 315 нм. Молярные коэффициенты поглощения [ε] ZEN и HZEN были определены экспериментально и составили 0,0078895 и 0,0030857 л^мкмоль-1юм-1. Коэффициенты поглощения сильно зависят от значений pH, поэтому определение активности следует осуществлять всегда точно при таком же значении pH и предпочтительно в такой же матрице. Измерения осуществляли в 50 мМ буферном растворе Tris-HCl с pH 8,2 в кварцевых кюветах в диапазоне длин волн от 200 до 2500 нм фотометром для видимой и ультрафиолетовой областей (Hitachi U-2001) при 32°C.
В качестве исходного раствора субстрата ZEN использовали 2,08 мМ раствор ZEN (40 об.% ACN + 60 об.% H2O). Для получения этого раствора соответственно взвешивали и растворяли ZEN в кристаллической форме (стандарт биочистоты, компания Romer Labs, артикул № 001109, чистота не менее 98%). Получали разбавления субстрата ZEN (0,79, 1,57, 2,36, 3,14, 4,71, 6,28, 7,85, 9,42, 10,99, 12,56, 14,13, 15,71, 17,28, 18,85 мкМ) с 50 мМ раствором Tris-HCl с pH 8,2. Растворы полипептидов разбавляли 50 мМ буферным раствором Tris-HCl с pH 8,2 до конечной концентрации около 70 нг/мл. Разбавления субстрата ZEN подогревали на водяной бане до 32°C.
К 100 мкл соответствующего разбавления субстрата ZEN прибавляли 0,2 мкл раствора полипептида и через 5 мин определяли поглощение, причем для любой комбинации раствор полипептида - разбавление субстрата ZEN осуществляли по меньшей мере двухкратное определение.
С учетом коэффициентов поглощения ZEN и HZEN по повышению поглощения во времени рассчитывали скорость реакции для каждой концентрации субстрата.
Термины константа KM или константа Михаэлиса-Ментен относятся к параметру для описания ферментативного сродства, выражаемому в [мкМ] или [мМ] и рассчитываемому посредством линеаризации по Хейнсу согласно H. Bisswang (2002, Enzyme Kinetics, ISBN 3-527-30343-X, Seite 19), причем для этого предпочтительно используют функцию Enzymkinetik, Single Substrat (кинетика ферментации, простой субстрат) программы SigmaPlot 12.0. Термины каталитическая постоянная ферментативной реакции или константа keat относятся к параметру для описания скорости превращения полипептида или фермента, выражаемому в [с-1] и предпочтительно рассчитываемому посредством функции Enzymkinetik, Single Substrat программы SigmaPlot 12.0. Параметр максимальная скорость ферментативной реакции или константа vmax выражают в [мкМ/с] или [мМ/с] и определяют аналогично константе KM посредством линеаризации по Хейнсу, причем для этого предпочтительно используют функцию Enzymkinetik, Single Substrat программы SigmaPlot 12.0.
Используя значения vmax и применяемой концентрации фермента, удельную активность рассчитывали по формуле
- 14 032685
Vmax [мкм/с] X 60 [с/мин]
Удельная активность [U/мг] =----------------------------концентрация фермента [мг/л] причем за единицу принимают гидролиз 1 мкмоль ZEN в минуту при 32°C в 50 мМ буферном растворе Tris-HCl с pH 8,2.
Далее приведены исходные данные для определения характеристик ферментативной реакции KM, vmax, kcat, а также удельной активности на примере полипептида с SEQ ID NO: 1. В табл. 3 приведены значения скорости реакции при соответствующих концентрациях субстрата ZEN, для которых на фиг. 2 представлены соответствующие графики Михаэлиса-Ментен, а в табл. 4 приведены соответствующие ферментативно-кинетические характеристики. Концентрация применяемого раствора фермента составляла 68 нг/л.
Таблица 3
Скорости реакции полипептида с SEQ ID NO: 1 при различных концентрациях ZEN
Разбавление субстрата ZEN, мкМ 1-е измерение скорости реакции, мкМ/с 2-е измерение скорости реакции, мкМ/с
0, 79 0,0073 0,0071
1,57 0,0087 0,0082
2,36 0,0095 0,0080
3, 14 0,0101 0,0073
4,71 0,0103 0,0087
6,28 0,0096 0,0088
7,85 0,0084 0,0088
9, 42 0,0111 0,0087
10, 99 0,0093 0,0081
12,56 0,0100 0,0086
14,13 0,0089 0,0101
15, 71 0,0089 0,0090
17,28 0,0100 0,0074
18, 85 0,0100 0,0085
Таблица 4
Ферментативно-кинетические характеристики полипептида с SEQ ID NO: 1
vmax, мкМ/с Км, мкМ kcat, С’1 Удельная активность, ед/мг
Измерение 1 2 1 2 1 2 1 2
Значение 0,00993 0,008756 0,2172 0,1898 5,44 4,79 8,76 7,73
Среднее значение 0,009343 0,2035 5,12 8,25
Значения удельной активности исследованных полипептидов составили 8,25 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 1, 10,56 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 2, 8,36 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 3, 8,33 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 4, 8,56 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 5, 9,95 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 6, 3,83 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 7, 2,57 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 8, 4,87 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 9, 5,12 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 10, 13,88 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 11, 2,78 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 12, 6,43 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 13, 3,33 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 14 и 7,76 ед./мг для последовательности SEQ ID NO: 15.
Значения удельной активности исследованных вариантов полипептидов приведены в табл. 5 и 6.
- 15 032685
Таблица 5 Удельная активность функциональных вариантов полипептида с SEQ ID NO: 1, консервативные участки аминокислотных последовательностей с одной или несколькими мутациями и идентичность последовательностей функциональных вариантов с исходной последовательностью с SEQ ID NO: 1
Мутации Мутации в области Идентичность по сравнению с SEQ ID NO: 1 Удельная активность, ед/мг
ZH1-A- 001 N25D А 99, 7% 8,10
ZH1-A- 002 F27Y А 99, 7% 7,93
ZH1-A- 003 F27H А 99, 7% 7,78
ZH1-A- 004 R35K А 99, 7% 8,98
ZH1-A- 005 R35Q А 99, 7% 8,56
ZH1-A- 006 N25D/S29P/V42I/V43T А 98,8% 7,84
ZH1-A- 007 126V/R31A/F32Y/F46Y А 98,8% 8,61
ZH1-A- S02 N25D/I26V/F27Y/S29Р/ R31A/F32Y/R35K/V37A/ V42I/V43T/F46Y А 96, 6% 8,73
ZH1-A- S03 N25D/I26V/F27H/S29P/ R31A/F32Y/R35Q/V42I/ V43T/F46Y А 97,0% 8,52
ZH1-B- 001 D53G В 99, 7% 8,10
ZH1-B- 002 N5 4M В 99, 7% 8,41
ZH1-B- 003 N54R В 99, 7% 8,33
ZH1-B- 004 S69G В 99, 7% 8,06
- 16 032685
ZHl-B- 005 P72E В 99, 7% 8, 65
ZH1-B- 006 P72R В 99, 7% 8,78
ZH1-B- S02 N54M/L57V/L60I/S69G/ P72E/V73A В 98,2% 8,51
ZH1-B- S03 D53G/N54R/L57V/L60I/ P72E/V73A В 98,2% 8,56
ZH1-B- S04 N54R/L57V/L60I/P72E/ V7 3A В 98,5% 8, 96
ZH1-B- S14 N54R/L58V/L59P/L60V/ T64G/P72R/G75P/L77P В 97, 6% 8, 68
ZH1-C- 001 N80H С 99, 7% 8,24
ZH1-C- 002 N80D С 99, 7% 8, 48
ZH1-C- 003 F84Y С 99, 7% 8, 65
ZH1-C- S06 N80H/F84Y С 9 9,4% 8,8 8
ZH1-C- S10 N80H/F84H С 99,4% 8,32
ZH1-C- S14 E79R/N80D С 99,4% 8, 45
ZH1-D- 001 T95S D 99, 7% 8,53
ZH1-D- 002 R99K D 99, 7% 8,25
ZH1-D- 003 V123I D 99, 7% 8,17
ZH1-D- 004 A125G D 99, 7% 8,36
ZH1-D- 005 G126A D 99, 7% 8, 41
ZH1-D- 006 G130A D 99, 7% 8, 69
ZH1-D- 007 G130V D 99, 7% 8,54
- 17 032685
ZHl-D- 008 G131A D 99, 7% 8,71
ZH1-D- 009 N127D D 99, 7% 8,29
ZH1-D- 010 N127Q D 99, 7% 8,34
ZH1-D- 011 A141S D 99, 7% 8, 67
ZH1-D- 012 F106W D 99, 7% 7,84
ZH1-D- 013 I118V D 99, 7% 8,37
ZH1-D- 014 I118V/V123L D 99,4% 8,55
ZH1-D- 015 I118V/K119R/L132V D 99,1% 8, 86
ZH1-D- 016 W96Q/F106W/L116G/ V122A D 98,8% 8, 65
ZH1-D- 017 Q91R/N105D/K119G/A141 S/M142K D 98,5% 8, 46
ZH1-D- S02 T95S/T97A/R99K/I118V/ V123I/L132V/A141S D 97,7% 8, 66
ZH1-D- S03 T95S/R99K/I118V/ K119R/L132V/A141S D 98,2% 9, 32
ZH1-D- S04 T95S/R99K/I118V/ L132V/A141S D 98,5% 9, 15
ZH1-D- S05 T95S/R99K/I114M/ I118V/K119R/L132V/ A141S D 97,7% 8, 84
ZH1-D- S07 R99G/A115D/K119G/ P121T/V123I/A125S/ L132V/L133V/S138A/ Y140F/A141S/M142L D 96, 3% 8,79
ZH1-D- S08 R93K/W96Q/R99G/D104N/ N105L/F106M/A115S/ V123I/A125S/G144N D 97,0% 8, 86
- 18 032685
ZHl-D- S09 R99G/S102N/D104N/N105 T/F106W/L110V/V111E/ A115D/K119G/V122T/ V123L/L132V/L133I/ S138A/M142K D 95,4% 8, 99
ZH1-D- S10 W96R/S102T/F1061/I114 L/A115S/L116G/K119G/ V122A/V123F/A125S/ A134S/Y140F/M142E D 96, 0% 9, 12
ZH1-D- Sll W96R/R99G/S102T/ F106V/I114L/A115D/ L116G/K119G/V122A/ V123F/A125S/N127L/ L133A/A134S/Y140F/ M142K D 95,1% 8,54
ZH1-D- S12 S94T/R99G/S102T/ N105I/L110V/A115D/ K119G/P121E/V122T/ V123L/V124I/L133I/ A134G/S138A/Y14OF/ M142K D 95,1% 8, 69
ZH1-D- S13 R93Q/R99G/N105T/ R112K/A115D/L116I/ A125S/N127L/L132V/ L133V/A134S/Y140F/ M142K D 96, 0% 8, 47
ZH1-D- S14 Q91R/W96R/N105D/ I114L/I118V/K119R/ V122A/L132V/L137S D 97,3% 8,55
ZH1-E- 001 Y165C E 99, 7% 8, 46
ZH1-E- 002 Y165H E 99, 7% 8,33
ZH1-E- 003 P163T E 99, 7% 7 , 95
ZH1-E- 004 A154P/Y165C E 99,4% 8,13
- 19 032685
ZHl-E- S02 P163T/A164T/Y165C/ V169I/L170R E 98,5% 8, 83
ZH1-E- S05 A154P/Y165H/L170R E 99,1% 9, 65
ZH1-F- 001 Y180F F 99, 7% 8,35
ZH1-F- 002 D182T F 99, 7% 8, 41
ZH1-F- 003 D182K F 99, 7% 8,19
ZH1-F- 004 Y180F/R181V/I190V F 99,1% 8,56
ZH1-F- S04 Y180F/D182T/F183Y/ I190V/G191S F 98,5% 8,56
ZH1-F- S06 Y180F/D182T/F183Y/ I190V F 98,8% 8, 64
ZH1-F- S10 E178A/R181V/D182К/ F183Y F 98,8% 7,55
ZH1-H- 001 T236K H 99, 7% 8,0 9
ZH1-H- 002 V237F H 99, 7% 8,11
ZH1-H- 003 E234G H 99, 7% 8,54
ZH1-H- S02 F233W H 99, 7% 8,37
ZH1-H- S03 F233Y H 99, 7% 8, 64
ZH1-H- S04 F233H H 99, 7% 8,36
ZH1-H- S06 A231V/F233Y H 99,4% 8,54
ZH1-H- S09 F232W/F233A/E234T/ G235D/L239A H 98,5% 8, 83
ZH1-I- 001 H240N I 99, 7% 8,54
ZH1-I- 002 H240S I 99, 7% 8,79
- 20 032685
ZHl-I- 003 D244E/R245Y I 99,4% 8, 42
ZH1-I- S02 D244E/R245Q/M246L I 99,1% 8,36
ZH1-I- S03 H240N/D244E I 99,4% 9,26
ZH1-I- S06 H240S/D244E I 99,4% 9, 02
ZH1-I- S07 L239Q/H240T/R245Y I 99,1% 8, 41
ZH1-J- 001 Q249R J 99, 7% 8,36
ZH1-J- 002 T252V J 99, 7% 7, 94
ZH1-J- S02 I254V J 99, 7% 8,55
ZH1-J- S03 Q249R/K251N/I254V J 99,1% 9, 03
ZH1-J- S07 T252V/I254M J 99,4% 7,81
ZH1-J- S10 T252V/I254V J 99,4% 7, 97
ZH1-K- S05 A2 60M К 99, 7% 8, 64
ZH1-K- Sll A260F К 99, 7% 8, 82
ZH1-K- S13 A260S К 99, 7% 9, 01
ZH1-L- 001 E266Y L 99, 7% 8, 46
ZH1-L- 002 E266D L 99, 7% 8,31
ZH1-L- 003 T262G L 99, 7% 8,32
ZH1-L- 004 T262D/E266D L 99,4% 8,56
ZH1-L- 005 T262G/I263T L 99,4% 8, 68
- 21 032685
ZHl-L- S02 E266D/E269H L 99,4% 8,59
ZH1-L- S04 I263T/E269N L 99,4% 8,73
ZH1-L- S06 E269N L 99, 7% 8, 69
ZH1-L- S13 E266Y/E269N L 99,4% 8,33
ZH1-M- 001 L274M M 99, 7% 8,29
ZH1-M- 002 L274C M 99, 7% 8,37
ZH1-M- S02 L277E M 99, 7% 8, 96
ZH1-M- S07 L274M/A279V M 99,4% 8,23
ZH1-M- S08 L274T/L277F M 99,4% 8, 63
ZH1-M- Sll L274C/L277I M 99,4% 8,51
ZH1-N- 001 H297L N 99, 7% 8,27
ZH1-N- 002 H298V/L302S N 99,4% 9, 03
ZH1-N- S02 H298V N 99, 7% 8, 94
ZH1-N- S09 H298L/P299D N 99,4% 8,37
ZH1-O- 001 L307Q 0 99, 7% 8, 62
ZH1-O- 002 F308S 0 99, 7% 8,57
ZH1-O- S02 L307Q/A311P 0 99,4% 8,34
ZH1-O- S03 L307Q/F308S 0 99,4% 8,74
ZH1-O- S06 L307Q/F308S/D309A 0 99,1% 9, 18
- 22 032685
ZHl- B/H-001 D53G/N54R/L57V/L60I/ P72E/V73A/F233V/ E234G/V237F B+H 97,3% 9,26
ZH1- C/D-001 N80H/F84Y/T95S/R99K/ I118V/K119R/L132V/ A141S C+D 97, 6% 9, 31
ZH1- D/K-001 T95S/T97A/R99K/I118V/ V123I/L132V/A141S/ A2 60M D+K 97, 6% 9,66
ZH1- D/M-001 T95S/T97A/R99K/I118V/ V123I/L132V/A141S/ L277E D+M 97, 6% 10,63
ZH1- K/N-001 A260M/H298V K+N 99, 4% 8, 94
ZH1- K/L-001 A260M/T262D/E266D/ E269H K+L 98, 8% 9, 03
ZH1- K/L-002 A260M/T262G/I263T/ E269N K+L 98, 8% 8, 84
ZH1- N/O-OOl Q296A/H298V/L307Q/ A311P N+O 98, 8% 9,26
ZH1- N/0-002 Q296E/H298V/L302S/ L307Q/F308S N+O 98,5% 9,46
ZH1- C/D/ J-001 N80H/F84Y/T95S/R99K/ I118V/L132V/A141S/ Q249R/K251N/I254V C+D+J 97, 0% 9, 97
ZH1- B/D/ K-001 D53G/N54R/L57V/L60I/ P72E/V73A/T95S/R99K/ I114M/I118V/K119R/ L132V/A141S/A260M B+D+K 95,7% 10,78
ZH-J/K/ L-001 I254V/I256L/A260M/ T262G/I263T/E269N J+K+L 98,2% 9, 11
ZH1- J/K/ LM-001 I254V/I256L/A260M/ T262D/E266D/E269Н/ L271V J+K+L+M 97,7% 9, 14
- 23 032685
ZHl- В/C/D/ J-002 E79R/N80D/D53G/N54R/ L57V/L60I/P72E/V73A/ W96R/R99G/S102T/ F106V/I114L/A115D/ L116G/K119G/V122A/ V123F/A125S/N127L/ L133A/A134S/Y140F/ M142K/T252V/I254V B+C+D+J 92,1% 11,31
ZH1- DEL-001 ΔΡ212 - 99, 7% 8,56
ZH1- DEL-002 AG5/AT 6/AR7/AS 8/АЕ9/ ΔΆ10/ΔΆ11/ADI2/ΔΆ13/ AA14/AT15/AQ16/ ΔΆ17/AR18/AQl9 - 95,4% 8,37
ZH1- DEL-003 AN327/AD328 - 99,4% 8,27
ZH1- A/B/C- 001 N25D/I26V/F27Y/S29Р/ R31A/F32Y/R35K/V37A/ V42I/V43T/F46Y/N54R/ L5 8V/L5 9P/L60V/T 64G/ P72R/G75P/L77P/R99G/ S102N/D104N/N105T/ F106W/L110V/V111E/ A115D/K119G/V122T/ V123L/L132V/L133I/ S138A/M142K A+B+C 89, 6% 9, 54
- 24 032685
ZH1- DEL/B/ С/D/ J-001 AG5/АТ6/AR7/AS 8/ΔΕ 9/ ΔΆ10/ΔΆ11/ADI2/ΔΆ13/ ΔΆ14/АТ15/AQ16/ΔΆ17/ ARI8/AQl9/ΔΡ212/ ΔΝ327/AD328/Е79R/ N80D/D53G/N54R/L57V/ L60I/P72E/V73A/W96R/ R99G/S102T/F106V/ I114L/A115D/L116G/ K119G/V122A/V123F/ A125S/N127L/L133A/ A134S/Y140F/M142K/ T252V/I254V B+C+D+J 86, 6% 11,52
ZH1- DEL/A/ B/C/D/ J-001 AG 5/АТ6/AR7/AS 8/АЕ9/ ΔΆ10/ΔΆ11/ADI2/ΔΆ13/ ΔΆ14/AT15/AQ16/ΔΆ17/ ARI8/AQl9/ΔΡ212/ AN327/AD328/N25D/ 126V/F27Y/S29P/R31A/ F32Y/R35K/V37A/V42I/ V43T/F46Y/E79R/N80D/ D53G/N54R/L57V/L60I/ P72E/V73A/W96R/R99G/ S102T/F106V/I114L/ A115D/L116G/K119G/ V122A/V123F/A125S/ N127L/L133A/A134S/ Y140F/M142K/T252V/ I254V A+B+C+ D+J 83,3% 10,92
ZH1-001 L302S - 99, 7% 8,31
Позиции мутаций указаны относительно аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 1. Идентичность последовательностей определена по программе BLAST соответственно описанию примера 2.
- 25 032685
Таблица 6
Значения удельной активности функциональных вариантов полипептида с SEQ ID NO: 2
Вариант Мутации Идентичность по сравнению с SEQ ID NO: 2 Удельная активность, ед/мг
ZH2-001 D3D(GTRSEAADAATQARQL) 93,6% 10, 15
ZH2-002 D8N/V9I/Y10F 99,0% 10, 42
ZH2-003 M37N/E55P/A56V/V101I/S124A/ F194FP/T146Р/Т147А/С148Y 97,0% 10,58
ZH2-004 S187P/S188A/P189K/M190A/ Al91M/R192Q/Y193L 97,7% 10, 43
ZH2-005 А262E/R263H/R265Q/L266D/ L267I/M268I/E269R 97,7% 10, 68
ZH2-006 D3D(GTRSEAADAATQARQL)/M37N/ E55P/A56V/V101I/S124A/F194FP/ Т146Р/Т147А/С148Y/S187Р/ SI88А/Р189К/М190А/А191М/ R192Q/Y193L/A262E/R263Н/ R265Q/L266D/L267I/M268I/E269R 86,1% 10,71
Позиции мутаций указаны относительно аминокислотной последовательности с SEQ ID NO: 2. Идентичность последовательностей определена по программе BLAST соответственно описанию примера 2.
Пример 6. Разложение ZEN и производных соединений ZEN в загрязненной кукурузе.
Для определения способности полипептидов в сложной матрице и при низких значениях pH разлагать ZEN и производные соединения ZEN, встречающиеся естественным образом, к загрязненной кукурузе прибавляли с различными концентрациями каждый из полипептидов с SEQ ID NO: 1-6 и контролировали разложение ZEN и производных соединений ZEN.
Загрязненную кукурузу измельчали и использовали в опытах по разложению, причем исходная смесь состояла из 1 г измельченной загрязненной кукурузы, 8,9 мл 100 мМ ацетатного буферного раствора с pH 4,0 и 0,1 мл раствора полипептида. Получали обогащенные и очищенные растворы полипептидов соответственно описанию примера 5, причем их разбавляли до концентраций 10, 100 или 1000 микроединица/мл. Таким образом, в исходной смеси применяли в абсолютном значении 1 микроединицу (=1 микроединица на грамм кукурузы), 10 микроединиц (=10 микроединиц на грамм кукурузы) или 100 микроединиц (=100 микроединиц на грамм кукурузы). Расщепляемые смеси переносили в склянки вместимостью 25 мл и при инкубировали при 37°C при встряхивании с частотой 100 об/мин. Перед прибавлением фермента или после 1-часовой инкубации соответственно отбирали пробы объемом 1 мл, полипептид инактивировали нагреванием в течение 10 мин при 99°C и пробы хранили при -20°C. После размораживания проб нерастворимые компоненты отделяли центрифугированием. Концентрации ZEN, а также производных соединений ZEN определяли способом ЖХ-МС-МС соответственно описанию M. Sulyok et al. (2007, Anal. Bioanal. Chem., 289, 1505-1523). Содержание ZEN и производных соединений ZEN в указанной кукурузе составляло 238 млрд-1 в случае ZEN, 15 млрд-1 в случае α-ZEL, 23 млрд-1 в случае β-ZEL, 32 млрд-1 в случае Z14G и 81 млрд-1 в случае Z14S. В табл. 7 представлено процентное уменьшение содержания ZEN и производных соединений ZEN в опытах по разложению.
- 26 032685
Таблица 7
Уменьшение содержания ZEN и производных соединений ZEN в процентах относительно начального содержания в опытах по разложению разными полипептидами в разных количествах
Полипептид Количество в исходной смеси ZEN a-ZEL β-ZEL Z14G Z14S
SEQ ID NO: 1 0,1 микроед. 83% >80% 70% 78% 80%
1 микроед. 96% >80% 76% >80% 92%
10 микроед. 97% >80% >85% >80% 94%
SEQ ID NO: 2 0,1 микроед. 87% >80% 73% >80% 84%
1 микроед. 97% >80% 78% >80% 90%
10 микроед. 99% >80% >85% >80% 96%
SEQ ID NO: 3 0,1 микроед. 79% 79% 67% 73% 75%
1 микроед. 85% >80% 72% 79% 82%
10 микроед. 92% >80% 78% >80% 88%
SEQ ID NO: 4 0,1 микроед. 82% 78% 65% 76% 80%
1 микроед. 89% >80% 73% >80% 86%
10 микроед. 93% >80% 82% >80% 91%
SEQ ID NO: 5 0,1 микроед. 79% 76% 66% 78% 80%
1 микроед. 83% >80% 73% >80% 81%
10 микроед. 91% >80% 79% >80% 86%
SEQ ID NO: 6 0,1 микроед. 93% >80% 75% >80% 90%
1 микроед. 95% >80% 82% >80% 92%
10 микроед. 98% >80% >85% >80% 96%
Пример 7. Добавки, содержащие полипептиды, для гидролитического расщепления ZEN и/или производных соединений ZEN.
Для получения добавок для гидролитического расщепления ZEN надосадочные жидкости после ферментации, содержащие экспрессированные P.pastoris полипептиды с SEQ ID NO: 1, 2, 6 и 13, посредством микрофильтрации и ультрафильтрации (граница отсечки: 10 кД) в стандартных условиях очищали и концентрировали до концентрации сухого вещества около 9 мас.%. Затем растворы, содержащие полипептиды, обрабатывали в распылительной сушилке, (Mini B290, компания Buchi) также в стандартных условиях до получения сухих порошков. Полученные четыре порошка далее обозначены как Z1, Z2, Z6 и Z13. Порошки Z1, Z2, Z6 или Z13 были смешаны в поворотном встряхивателе с бентонитом со средним размером частиц около 1 мкм в соотношении 1 мас.% добавки Z1, Z2, Z6 или Z13 и 99 мас.% бентонита. Полученные таким образом добавки были обозначены как добавки Z1.B, Z2.B, Z6.B и Z13.B. Порошки Z1, Z2, Z6 и Z13 также были смешаны в поворотном встряхивателе с бентонитом и концентратом витаминов и микроэлементов в соотношении 0,1 мас.% добавки Z1, Z2, Z6 или Z13, 0,9 мас.% концентрата витаминов и микроэлементов и 99 мас.% бентонита. Полученные таким образом добавки были обозначены как добавки Z1.BVS, Z2.BVS, Z6.BVS и Z13.BVS. Добавки Z1.BVS, Z2.BVS, Z6.BVS и Z13.BVS в расчете на 100 г содержали 200 мг сульфата железа, 50 мг сульфата меди, 130 мг оксида олова, 130 мг оксида марганца, 2,55 мг карбоната кальция, 160 мг витамина E, 6,5 мг витамина K3, 6,5 мг витамина B1, 1,14 мг витамина B2, 15 мг витамина B6, 0,15 мг витамина B12, 50 мг никотиновой кислоты, 30 мг пантотеновой кислоты и 5,3 мг фолиевой кислоты.
Добавки экстрагировали 50 мМ буферным раствором Tris-HCl с pH 8,2 в течение 30 мин и тем же самым буферным раствором разбавляли дальше так, чтобы конечная концентрация полипептида составила около 70 нг/мл.
Затем определяли расщепляющее зеараленон действие этих растворов соответственно описанию примера 5. Соответствующие значения активности составили 8,230 ед./г в случае Z1, 9,310 ед./г в случае Z2, 9,214 ед./г в случае Z6, 83 ед./г в случае Z1.B, 92 ед./г в случае Z2.B, 90 ед./г в случае Z2.C, 57 ед./г в случае Z13.B, 8 ед./г в случае Z1.BVS, 9 ед./г в случае Z2.BVS, 9 ед./г в случае Z6.BVS и 6 ед./г в случае Z13.BVS.
Способность разлагать производные соединения ZEN типа α-ZEL, β-ZEL, α-ZAL, β-ZAL, Z14G, Z14S и ZAN добавками Z1, Z2, Z6, Z13, Z1.B, Z2.B, Z6.B, Z13.B, Z1.BVS, Z2.BVS, Z6.BVS и Z13.BVS
- 27 032685 определяли соответственно описанию примера 4, однако вместо 100 мкл клеточного лизата применяли 100 мкл раствора полипептида с концентрацией полипептида около 70 нг/мл. После 6-часовой инкубации в форме негидролизованного производного соединения ZEN оставалось только не больше 15% от исходного количества.
Пример 8. Температурные оптимумы.
Для определения температурных оптимумов полипептидов с SEQ ID NO: 1, 2, 5, 6, 7, 9, 11, 12 и 15 их клонировали с C-концевой меткой 6His соответственно описанию примера 1, экспрессировали в E.coli и очищали. В предварительных испытаниях для каждого полипептида определяли концентрацию, при которой в опытных условиях (буферный раствор Теорелла-Стенхагена (Teorell und Stenhagen. Ein Universalpuffer fur den pH-Bereich 2,0 bis 12.0. Biochem. Ztschrft., 1938, 299: S. 416-419) при pH 7,5 и с содержанием 0,1 мг/мл BSA при 30°C) через 3 ч протекания опыта могло быть обеспечено полное превращение ZEN. Композиции применяли при найденных концентрациях в расщепляемых смесях для определения температурных оптимумов.
Испытания осуществляли в реакторе для ПЦР (компания Eppendorf) с функцией задания температурного градиента при значениях 20 +/- 10°C, 40 +/- 10°C и при необходимости 60 +/-10°C (10 значений температуры в соответствующей области; предварительно заданные значения температуры в реакторе для ПЦР). К исходным смесям прибавляли буферный раствор Теорелла-Стенхагена при соответствующем оптимальном значении pH, содержавший фермент с соответствующей концентрацией, а также 0,1 мг/мл BSA, и 5 млн-1 ZEN. В качестве отрицательных контрольных проб использовали исходные смеси, содержавшие 0,1 мг/мл BSA и 5 млн-1 ZEN без прибавления фермента. После инкубации в течение 0, 0,5, 1, 2 и 3 ч при соответствующей температуре инкубации отбирали пробы, инактивировали нагреванием в течение 10 мин при 99°C и хранили при -20°C. После размораживания пробы переносили во флаконы для ВЭЖХ. ZEN, HZEN и DHZEN анализировали способом ВЭЖХ-ДМД. С этой целью метаболиты хроматографически разделяли посредством колонки Zorbax SB-Aq C18 с размерами 4,6x150 мм и с частицами крупностью 5 мкм. В качестве элюента использовали смесь метанол-вода с 5 мМ ацетата аммония. УФ-сигнал регистрировали при 274 нм. Количественное определение метаболитов осуществляли с привлечением параллельно анализируемых стандартных образцов. Определение температурных оптимумов осуществляли по найденным подъемам кривых разложения, причем температуру, при которой наблюдался наибольший подъем, принимали в качестве температурного оптимума. Значения температурных оптимумов представлены в табл. 8.
Таблица 8
Температурные оптимумы полипептидов
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
NO: 1 NO: 2 NO: 5 NO: 6 NO: 7 NO: 9 NO: 11 NO: 12 NO: 15
38°С 41°C 50°C 51°C 31°C 35°C 50 °C 2 6° C 41 °C
Пример 9. Термическая стабильность.
Для определения термической стабильности полипептидов с SEQ ID NO: 1, 2, 5, 6, 7, 9, 11, 12 и 15 их клонировали с C-концевой меткой 6His соответственно описанию примера 1, экспрессировали в B.coli и очищали. Полипептиды инкубировали в реакторе для ПЦР с функцией задания градиента при соответствующем значении температурного оптимума +/- 10°C. Через 0, 15, 30 и 60 мин отбирали пробы каждой из исходных смесей при каждой из температур. Затем эти предварительно инкубированные пробы применяли в опытах по разложению в буферном растворе Теорелла-Стенхагена при соответствующем оптимальном значении pH и с содержанием 0,1 мг/мл BSA и 5 млн-1 ZEN в исходной смеси. В предварительных испытаниях для каждого полипептида определяли концентрацию, при которой в опытных условиях (буферный раствор Теорелла-Стенхагена при pH 7,5 и с содержанием 0,1 мг/мл BSA при 30°C) через 3 ч протекания опыта могло быть обеспечено полное превращение ZEN. Соответствующие найденные значения концентрации фермента применяли в исходных смесях. Исходные расщепляемые смеси инкубировали при 30°C. Отбор проб осуществляли после инкубации в течение 0, 0,5, 1, 2 и 3 ч. Затем полипептиды инактивировали нагреванием при 99°C в течение 10 мин и пробы хранили при -20°C. После размораживания пробы переносили во флаконы для ВЭЖХ и анализировали способом ВЭЖХ-ДМД соответственно описанию примера 8.
Термическую стабильность определяли как температуру, при которой полипептиды после 15минутной предварительной инкубации обладали 50%-ной остаточной активностью по сравнению с температурным оптимумом. В качестве меры активности принимали подъем кривых разложения. Значения термической стабильности представлены в табл. 9.
- 28 032685
Таблица 9
Термическая стабильность полипептидов (50%-ная остаточная активность после 15-минутной предварительной инкубации)
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
NO: 1 NO: 2 NO: 5 NO: 6 NO: 7 NO: 9 NO: 11 NO: 12 NO: 15
38°С 34°C 54°C 61°C 28°C 44°C 55 °C 4 0°C 49 °C
Пример 10. Оптимальные значения pH.
Для определения оптимальных значений pH полипептидов с SEQ ID NO: 1, 2, 5, 6, 7, 9, 11, 12 и 15 их клонировали с C-концевой меткой 6His соответственно описанию примера 1, экспрессировали в E.coli и очищали. В предварительных испытаниях для каждого полипептида была определена концентрация, при которой в опытных условиях (буферный раствор Теорелла-Стенхагена при pH 7,5 и с содержанием 0,1 мг/мл BSA при 30°C) через 3 ч протекания опыта могло быть обеспечено полное превращение ZEN. Соответствующие значения концентрации фермента применяли в исходных смесях. Исходные расщепляемые смеси помещали в буферный раствор Теорелла-Стенхагена при значениях pH, равных 3,0, 4,0, 5,0, 5,5, 6,0, 6,5, 7,0, 7,5, 8,0, 8,5, 9,0, 9,5, 10,0, 11,0 и 12,0. Исходные расщепляемые смеси с 0,1 мг/мл BSA и 5 млн-1 ZEN инкубировали при 30°C. В качестве отрицательных контрольных проб использовали исходные смеси в буферном растворе Теорелла-Стенхагена при pH 3,0, pH 7,0 и pH 12,0 и с содержанием 0,1 мг/мл BSA и 5 млн-1 ZEN. Отбор проб осуществляли после инкубации в течение 0, 0,5, 1, 2 и 3 ч. Затем полипептиды инактивировали нагреванием при 99°C в течение 10 мин и пробы хранили при -20°C. После размораживания пробы переносили во флаконы для ВЭЖХ и анализировали способом ВЭЖХДМД соответственно описанию примера 8. Определение оптимальных значений pH осуществляли по найденным подъемам кривых разложения, причем значение pH, при котором наблюдался наибольший подъем, принимали в качестве оптимального значения pH. Оптимальные значения pH представлены в табл. 10.
Таблица 10
Оптимальные значения pH полипептидов
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
NO: 1 NO: 2 NO: 5 NO: 6 NO: 7 NO: 9 NO: 11 NO: 12 NO: 15
8,2 8,5 7,0-8,0 7,0-7,5 7,5-8,5 7,0-7,5 8,0 7,0- 7,5 7, 5
Пример 11. Стабильность при pH 5,0.
Для определения pH-зависимой стабильности полипептиды по примеру 10 инкубировали в буферном растворе Теорелла-Стенхагена при pH 5,0 и при соответствующем оптимальном значении pH в течение 1 ч при 25°C. Эти предварительно инкубированные пробы использовали в опытах по разложению с равными концентрациями соответствующего полипептида, использованными для определения оптимальных значений pH, в 100 мМ буферного раствора Tris-HCl при соответствующем оптимальном значении pH и с содержанием 0,1 мг/мл BSA и 5 млн-1 ZEN в исходной смеси. Исходные смеси инкубировали при соответствующем температурном оптимуме. Отбор проб осуществляли после инкубации в течение 0, 0,5, 1, 2 и 3 ч. Затем полипептиды инактивировали нагреванием при 99°C в течение 10 мин и пробы хранили при -20°C. После размораживания пробы переносили во флаконы для ВЭЖХ и анализировали способом ВЭЖХ-ДМД соответственно описанию примера 8. pH-зависимую стабильность определяли как процентную остаточную активность полипептидов при pH 5 по отношению к активности при соответствующем оптимальном значении pH. Значения pH-зависимой стабильности при pH 5,0 представлены в табл. 11.
Таблица 11 pH-зависимая стабильность полипептидов при pH 5,0
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
NO: 1 NO: 2 NO: 5 NO: 6 NO: 7 NO: 9 NO: 11 NO: 12 NO: 15
3% 17% 79% 80% 100% 22 δ 87% 98 δ 19 δ
Пример 12. Опыты по разложению ZEN.
Разложение ZEN до HZEN и DHZEN осуществляли на примере полипептидов с SEQ ID NO: 1, 2, 5, 6, 7, 9, 11, 12 и 15. Исходные расщепляемые смеси получали в буферном растворе Теорелла-Стенхагена при pH 7,5 и с содержанием 0,1 мг/мл BSA и 5 млн-1 ZEN. Исходные расщепляемые смеси инкубировали при 30°C. Отбор проб осуществляли после инкубации в течение 0, 0,5, 1, 2 и 3 ч. Затем полипептиды инактивировали нагреванием при 99°C в течение 10 мин и пробы хранили при -20°C. После размораживания пробы переносили во флаконы для ВЭЖХ и анализировали способом ВЭЖХ-ДМД соответственно описанию примера 8. Концентрацию полипептида выбирали так, чтобы полное разложение достигалось приблизительно через 3 ч. Кривые кинетики разложения представлены на фиг. 3, причем на оси у показаны концентрации ZEN, HZEN и DHZEN в микромолях в литре (мкмоль/л), а на оси x показаны дли
- 29 032685 тельность инкубации в часах (ч). мкМ означает микромолярный и соответствует размерности мкмоль/л.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> Эрбер Акциенгезелльшафт <120> Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных зеараленона <130> P05341PCT <160>69 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211>328 <212> ПРТ <213> Rhodococcus erythropolis <400>1
Met 1 Ala Glu Glu Gly Thr 5 Arg Ser Glu Ala Ala 10 Asp Ala Ala Thr 15 Gln
Ala Arg Gln Leu Pro Asp Ser Arg Asn Ile Phe Val Ser His Arg Phe
20 25 30
Pro Glu Arg Gln Val Asp Leu Gly Glu Val Val Met Asn Phe Ala Glu
35 40 45
Ala Gly Ser Pro Asp Asn Pro Ala Leu Leu Leu Leu Pro Glu Gln Thr
50 55 60
Gly Ser Trp Trp Ser Tyr Glu Pro Val Met Gly Leu Leu Ala Glu Asn
65 70 75 80
Phe His Val Phe Ala Val Asp Ile Arg Gly Gln Gly Arg Ser Thr Trp
85 90 95
Thr Pro Arg Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg
100 105 110
Phe Ile Ala Leu Val Ile Lys Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser
115 120 125
Ser Gly Gly Leu Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ala Met Pro Gly
130 135 140
Gln Ile Arg Ala Ala Leu Cys Glu Asp Ala Pro Phe Phe Ala Ser Glu
145 150 155 160
- 30 032685
Leu Val Pro Ala Tyr Gly His 165 Ser Val Leu 170 Gln Ala Ala Gly Pro 175 Ala
Phe Glu Leu Tyr Arg Asp Phe Leu Gly Asp Gln Trp Ser Ile Gly Asp
180 185 190
Trp Lys Gly Phe Val Glu Ala Ala Lys Ala Ser Pro Ala Lys Ala Met
195 200 205
Gln Leu Phe Pro Thr Pro Asp Glu Ala Pro Gln Asn Leu Lys Glu Tyr
210 215 220
Asp Pro Glu Trp Gly Arg Ala Phe Phe Glu Gly Thr Val Ala Leu His
225 230 235 240
Cys Pro His Asp Arg Met Leu Ser Gln Val Lys Thr Pro Ile Leu Ile
245 250 255
Thr His His Ala Arg Thr Ile Asp Pro Glu Thr Gly Glu Leu Leu Gly
260 265 270
Ala Leu Ser Asp Leu Gln Ala Glu His Ala Gln Asp Ile Ile Arg Ser
275 280 285
Ala Gly Val Arg Val Asp Tyr Gln Ser His Pro Asp Ala Leu His Met
290 295 300
Met His Leu Phe Asp Pro Ala Arg Tyr Ala Glu Ile Leu Thr Ser Trp
305 310 315 320
Ser Ala Thr Leu Pro Ala Asn Asp
325
<210> 2 <211> 308 <212> ПРТ <213> Streptomyces violaceusniger <400> 2
Met 1 Ala Asp Pro Ala Gln 5 Arg Asp Val Tyr 10 Val Pro His Ala Tyr 15 Pro
Glu Lys Gln Ala Asp Leu Gly Glu Ile Thr Met Asn Tyr Ala Glu Ala
20 25 30
Gly Glu Pro Asp Met Pro Ala Val Leu Leu Ile Pro Glu Gln Thr Gly
35 40 45
- 31 032685
Ser Trp 50 Trp Gly Tyr Glu Glu 55 Ala Met Gly Leu Leu 60 Ala Glu Asn Phe
His Val Tyr Ala Val Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Ser Ser Trp Ala
65 70 75 80
Pro Lys Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg Phe
85 90 95
Ile Ala Leu Val Val Lys Arg Pro Val Ile Val Ala Gly Asn Ser Ser
100 105 110
Gly Gly Val Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ser Met Pro Gly Gln
115 120 125
Val Arg Gly Ala Leu Cys Glu Asp Ala Pro Phe Phe Ala Ser Glu Leu
130 135 140
Val Thr Thr Cys Gly His Ser Ile Arg Gln Ala Ala Gly Pro Met Phe
145 150 155 160
Glu Leu Phe Arg Thr Tyr Leu Gly Asp Gln Trp Ser Val Gly Asp Trp
165 170 175
Thr Gly Tyr Cys Arg Ala Ala Asp Ala Ser Ser Ser Pro Met Ala Arg
180 185 190
Tyr Phe Val Ala Asp Glu Ile Pro Gln His Met Arg Glu Tyr Asp Pro
195 200 205
Glu Trp Ala Arg Ala Phe Trp Glu Gly Thr Val Ala Leu His Cys Pro
210 215 220
His Glu Gln Leu Leu Thr Gln Val Lys Thr Pro Val Leu Leu Thr His
225 230 235 240
His Met Arg Asp Ile Asp Pro Asp Thr Gly His Leu Val Gly Ala Leu
245 250 255
Ser Asp Glu Gln Ala Ala Arg Ala Arg Leu Leu Met Glu Ser Ala Gly
260 265 270
Val Lys Val Asp Tyr Ala Ser Val Pro Asp Ala Leu His Met Met His
275 280 285
Gln Phe Asp Pro Pro Arg Tyr Val Glu Ile Phe Thr Gln Trp Ala Ala
290 295 300
- 32 032685
Thr Leu Ala Ala
305 <210>3 <211>309 <212> ПРТ <213> Streptomyces coelicolor <400>3
Met 1 Val Thr Ser Pro 5 Ala Leu Arg Asp Val 10 His Val Pro His Ala 15 Tyr
Pro Glu Gln Gln Val Asp Leu Gly Glu Ile Thr Met Asn Tyr Ala Glu
20 25 30
Ala Gly Asp Pro Gly Arg Pro Ala Val Leu Leu Ile Pro Glu Gln Thr
35 40 45
Gly Ser Trp Trp Ser Tyr Glu Glu Ala Met Gly Leu Leu Ala Glu His
50 55 60
Phe His Val Tyr Ala Val Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Ser Ser Trp
65 70 75 80
Thr Pro Lys Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg
85 90 95
Phe Ile Ala Leu Val Val Arg Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser
100 105 110
Ser Gly Gly Val Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ser Met Pro Gly
115 120 125
Gln Ile Arg Gly Val Leu Cys Glu Asp Pro Pro Phe Phe Ala Ser Glu
130 135 140
Leu Val Pro Ala His Gly His Ser Val Arg Gln Gly Ala Gly Pro Val
145 150 155 160
Phe Glu Leu Phe Arg Thr Tyr Leu Gly Asp Gln Trp Ser Val Gly Asp
165 170 175
Trp Glu Gly Phe Arg Ser Ala Ala Asp Ala Ser Ala Ser Pro Met Ala
180 185 190
Arg Ser Phe Val Ala Asp Thr Ile Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp
195 200 205
- 33 032685
Pro Glu 210 Trp Ala Arg Ala Phe 215 Tyr Glu Gly Thr Val 220 Gly Leu Asn Cys
Pro His Glu Arg Met Leu Asn Arg Val Asn Thr Pro Val Leu Leu Thr
225 230 235 240
His His Met Arg Gly Thr Asp Pro Glu Thr Gly Asn Leu Leu Gly Ala
245 250 255
Leu Ser Asp Glu Gln Ala Ala Gln Val Arg Arg Leu Met Glu Ser Ala
260 265 270
Gly Val Lys Val Asp Tyr Glu Ser Val Pro Asp Ala Ser His Met Met
275 280 285
His Gln Ser Asp Pro Ala Arg Tyr Ala Glu Ile Leu Thr Pro Trp Thr
290 295 300
Ala Ala Leu Ala Pro
305
<210> 4
<211> 309
<212> ПРТ
<213> Streptomyces rapamycinicus
<400> 4
Met Val Thr Ser Pro Ala Leu Arg Asp Val His Val Pro His Ala Tyr
1 5 10 15
Pro Glu Gln Gln Val Asp Leu Gly Glu Ile Thr Met Asn Tyr Ala Glu
20 25 30
Ala Gly Asp Pro Asp Arg Pro Ala Val Leu Leu Ile Pro Glu Gln Thr
35 40 45
Gly Ser Trp Trp Ser Tyr Glu Glu Ala Met Gly Leu Leu Ala Glu His
50 55 60
Phe His Val Tyr Ala Val Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Ser Ser Trp
65 70 75 80
Thr Pro Lys Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg
85 90 95
Phe Ile Ala Leu Val Val Lys Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser
100 105 110
- 34 032685
Ser Gly Gly Val 115 Leu Ala Ala Trp 120 Leu Ser Ala Tyr Ser 125 Met Pro Gly
Gln Leu Arg Gly Val Leu Cys Glu Asp Pro Pro Phe Phe Ala Ser Glu
130 135 140
Leu Val Pro Ala His Gly His Ser Val Arg Gln Gly Ala Gly Pro Val
145 150 155 160
Phe Glu Leu Phe Arg Thr Tyr Leu Gly Asp Gln Trp Ser Val Ser Asp
165 170 175
Trp Glu Gly Phe Cys Arg Ala Ala Gly Ala Ser Ala Ser Pro Met Ala
180 185 190
Arg Ser Phe Val Ala Asp Gly Ile Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp
195 200 205
Pro Glu Trp Ala Arg Ala Phe His Glu Gly Thr Val Gly Leu Asn Cys
210 215 220
Pro His Glu Arg Met Leu Gly Arg Val Asn Thr Pro Val Leu Leu Thr
225 230 235 240
His His Met Arg Gly Thr Asp Pro Glu Thr Gly Asn Leu Leu Gly Ala
245 250 255
Leu Ser Asp Glu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Leu Leu Met Glu Ser Ala
260 265 270
Gly Val Arg Val Asp Tyr Glu Ser Val Pro Asp Ala Ser His Met Met
275 280 285
His Gln Ser Asp Pro Ala Arg Tyr Ala Glu Ile Phe Thr Arg Trp Ala
290 295 300
Ala Ala Leu Ala Pro
305 <210>5 <211>309 <212> ПРТ <213> Streptomyces lividans <400>5
Met Val Thr Ser Pro Ala Leu Arg Asp Val His Val Pro His Ala Tyr
5 1015
- 35 032685
Pro Glu Gln Gln 20 Val Asp Leu Gly Glu 25 Ile Thr Met Asn Tyr 30 Ala Glu
Ala Gly Asp Pro Gly Arg Pro Ala Val Leu Leu Ile Pro Glu Gln Thr
35 40 45
Gly Ser Trp Trp Ser Tyr Glu Glu Ala Met Gly Leu Leu Ala Glu His
50 55 60
Phe His Val Tyr Ala Val Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Ser Ser Trp
65 70 75 80
Thr Pro Lys Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg
85 90 95
Phe Met Ala Leu Val Val Arg Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser
100 105 110
Ser Gly Gly Val Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ser Met Pro Gly
115 120 125
Gln Ile Arg Gly Val Leu Cys Glu Asp Pro Pro Phe Phe Ala Ser Glu
130 135 140
Leu Val Pro Ala His Gly His Ser Val Arg Gln Gly Ala Gly Pro Val
145 150 155 160
Phe Glu Leu Phe Arg Thr Tyr Leu Gly Asp Gln Trp Ser Val Gly Asp
165 170 175
Trp Glu Gly Phe Arg Ser Ala Ala Gly Ala Ser Ala Ser Pro Met Ala
180 185 190
Arg Ser Phe Val Ala Asp Thr Ile Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp
195 200 205
Pro Glu Trp Ala Arg Ala Phe Tyr Glu Gly Thr Val Gly Leu Asn Cys
210 215 220
Pro His Glu Arg Met Leu Asn Arg Val Asn Thr Pro Val Leu Leu Thr
225 230 235 240
His His Met Arg Gly Thr Asp Pro Glu Thr Gly Asn Leu Leu Gly Ala
245 250 255
Leu Ser Asp Glu Gln Ala Ala Gln Ala Arg Arg Leu Met Glu Ser Ala
260 265 270
- 36 032685
Gly Val Lys Val Asp Tyr Glu Ser Val Pro Asp Ala Ser His Met Met
275 280 285
His Gln Ser Asp Pro Ala Arg Tyr Ala Glu Ile Leu Thr Pro Trp Ala
290 295 300
Ala Ala Leu Ala Pro
305 <210> 6 <211> 309 <212> ПРТ <213> Streptomyces coelicoflavus <400> 6
Met 1 Val Thr Ser Pro 5 Ala Leu Arg Asp Val 10 His Val Pro His Ala 15 Tyr
Pro Glu Gln Gln Val Asp Leu Gly Glu Ile Thr Met Asn Tyr Ala Glu
20 25 30
Ala Gly Asp Pro Asp Arg Pro Ala Val Leu Leu Ile Pro Glu Gln Thr
35 40 45
Gly Ser Trp Trp Ser Tyr Glu Glu Ala Met Gly Leu Leu Ser Glu His
50 55 60
Phe His Val Tyr Ala Val Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Ser Ser Trp
65 70 75 80
Thr Pro Lys Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg
85 90 95
Phe Ile Ala Leu Val Val Lys Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser
100 105 110
Ser Gly Gly Val Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ser Met Pro Gly
115 120 125
Gln Leu Arg Gly Val Leu Cys Glu Asp Pro Pro Phe Phe Ala Ser Glu
130 135 140
Leu Val Pro Ala His Gly His Ser Val Arg Gln Gly Ala Gly Pro Val
145 150 155 160
Phe Glu Leu Phe Arg Thr Tyr Leu Gly Asp Gln Trp Ser Val Gly Asp
165 170 175
- 37 032685
Trp Glu Gly Phe 180 Cys Arg Ala Ala Gly 185 Ala Ser Ala Ser Pro 190 Met Ala
Arg Ser Phe Val Ala Asp Gly Ile Pro Gln His Leu Gln Glu Tyr Asp
195 200 205
Pro Glu Trp Ala Arg Val Phe Tyr Glu Gly Thr Val Gly Leu Ser Cys
210 215 220
Pro His Glu Arg Met Leu Gly Gln Val Lys Thr Pro Val Leu Leu Thr
225 230 235 240
His His Met Arg Gly Ile Asp Pro Glu Thr Gly Asn Leu Leu Gly Ala
245 250 255
Leu Ser Asp Glu Gln Ala Leu Arg Ala Arg Arg Leu Met Asp Ser Ala
260 265 270
Gly Val Thr Val Asp Tyr Glu Ser Val Pro Asp Ala Ser His Met Met
275 280 285
His Gln Ser Ala Pro Ala Arg Tyr Val Glu Ile Phe Thr Arg Trp Ala
290 295 300
Ala Ala Leu Ala Pro
305
<210> 7
<211> 300
<212> ПРТ
<213> Rhodococcus triatome
<400> 7
Met 1 Pro His Asp Tyr 5 Glu Glu Lys Leu Val 10 Asp Leu Gly Glu Ile Asp 15
Leu Asn Tyr Ala Glu Ala Gly Ser Pro Asp Lys Pro Ala Leu Leu Leu
20 25 30
Ile Pro Ser Gln Ser Glu Ser Trp Trp Gly Tyr Glu Glu Ala Met Gly
35 40 45
Leu Leu Ala Glu Asp Tyr His Val Phe Ala Val Asp Met Arg Gly Gln
50 55 60
Gly Arg Ser Thr Trp Thr Pro Gly Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly
70 75 80
- 38 032685
Asn Asp Leu Val Arg 85 Phe Ile Asp Leu Val 90 Ile Gly Arg Thr Val 95 Ile
Val Ser Gly Asn Ser Ser Gly Gly Val Val Ala Ala Trp Leu Ala Ala
100 105 110
Phe Ser Leu Pro Gly Gln Val Arg Ala Ala Leu Ala Glu Asp Ala Pro
115 120 125
Phe Phe Ala Ser Glu Leu Asp Pro Lys Val Gly His Thr Ile Arg Gln
130 135 140
Ala Ala Gly His Ile Phe Val Asn Trp Arg Asp Tyr Leu Gly Asp Gln
145 150 155 160
Trp Ser Val Gly Asp Tyr Ala Gly Phe Leu Lys Ala Met Lys Ser Ser
165 170 175
Glu Val Pro Met Leu Arg Gln Val Pro Leu Pro Glu Thr Ala Pro Gln
180 185 190
Asn Leu Leu Glu Tyr Asp Pro Glu Trp Ala Arg Ala Phe Tyr Glu Gly
195 200 205
Thr Val Ala Gln Thr Cys Pro His Asp Tyr Met Leu Ser Gln Val Lys
210 215 220
Val Pro Met Leu Val Thr His His Ala Arg Met Ile Asp Glu Ala Thr
225 230 235 240
Ser Gly Leu Val Gly Ala Met Ser Asp Leu Gln Val Gln Lys Ala Ala
245 250 255
Glu Ile Ile Arg Gly Thr Gly Val Gln Val Asp Val Val Asp Leu Pro
260 265 270
Glu Ala Pro His Ile Leu His Gln Leu Ala Pro Lys Glu Tyr Val Glu
275 280 285
Ile Leu Asn Asn Trp Val Glu Lys Leu Pro Pro Val
290 295 300
<210> 8
<211> 307
<212> ПРТ
<213> Hirschia baltica
- 39 032685 <400> 8
Met 1 Ile Gln Asn Asn 5 Lys Thr Ala Pro Tyr 10 Lys Tyr Lys Glu Lys 15 Leu
Val Asp Leu Gly Glu Ile Lys Met Asn Tyr Ile Val Ala Gly Ala Asp
20 25 30
Val Ser Pro Ala Leu Leu Leu Ile Pro Gly Gln Thr Glu Ser Trp Trp
35 40 45
Gly Phe Glu Ala Ala Ile Glu Lys Leu Glu Ser Asn Phe Gln Val Phe
50 55 60
Ala Ile Asp Leu Arg Gly Gln Gly Lys Ser Thr Gln Thr Pro Gly Arg
65 70 75 80
Tyr Ser Leu Asn Leu Met Gly Asn Asp Leu Val Arg Phe Ile Ser Leu
85 90 95
Val Ile Lys Arg Pro Val Ile Val Ser Gly Asn Ser Ser Gly Gly Leu
100 105 110
Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ala Met Pro Asn Gln Ile Arg Ala
115 120 125
Ile His Cys Glu Asp Ala Pro Phe Phe Thr Ala Glu Lys Ala Pro Leu
130 135 140
Tyr Gly His Ala Ile Gln Gln Ala Ala Gly Pro Ile Phe Ser Leu Met
145 150 155 160
Ser Lys Phe Leu Gly Asp Gln Trp Ser Ile Asn Asn Trp Glu Gly Leu
165 170 175
Lys Ala Ala Gln Ala Lys Asp Thr His Pro Ala Asn Lys Met Ile Ser
180 185 190
Gln Val Glu Gln Pro Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp Pro Glu Trp
195 200 205
Gly Arg Ala Phe Ile Glu Gly Lys Phe Asn Leu Asn Ser Pro His His
210 215 220
Thr Leu Leu Ser Asp Ile Lys Thr Pro Met Leu Tyr Thr His His Met
225 230 235 240
Arg Phe Glu Asp Pro Gln Thr Gly Leu Leu Ile Gly Ala Thr Ser Asp
- 40 032685
245 250 255
Phe Gln Ala Ser 260 Lys Ile Lys Glu Ile 265 Ala Leu Lys Thr Gly 270 Asn Ser
Phe Glu Leu Ile Asp Ala Pro Asp Ala Phe His Ser Met His Glu Ala
275 280 285
Asp Pro Gln Arg Phe Val Asp Ile Leu Thr Ser Trp Ile Glu Arg Leu
290 295 300
Asn Leu Gln
305 <210> 9 <211> 321 <212> ПРТ <213> Nocardia brasiliensis <400> 9
Met 1 Gly Ile Ser Glu 5 Ala Ala Asp Arg Ala 10 Asp Thr Phe Val Ala 15 His
Lys Phe Glu Glu Gln Leu Val Asp Leu Gly Glu Ile Arg Met Asn Tyr
20 25 30
Val Ala Ala Gly Asp Pro Thr Ser Pro Ala Leu Leu Leu Ile Pro Ala
35 40 45
Gln Gly Glu Ser Trp Trp Gly Tyr Glu Asn Ala Ile Thr Leu Leu Ala
50 55 60
Asn Asp Phe Arg Val Phe Ala Ile Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Ser
65 70 75 80
Thr Trp Thr Pro Gly Arg Tyr Asn Leu Asn Thr Trp Gly Asn Asp Val
85 90 95
Glu Arg Phe Ile Asp Leu Val Ile Gly Arg Pro Thr Leu Val Ala Gly
100 105 110
Asn Ser Ser Gly Gly Val Ile Ala Ala Trp Leu Ala Ala Tyr Ala Lys
115 120 125
Pro Gly Gln Ile Arg Gly Ala Met Leu Glu Asp Pro Pro Leu Phe Ala
130 135 140
Ser Gln Ala Ala Pro Pro Tyr Gly Pro Gly Ile Met Gln Thr Leu Gly
- 41 032685
145 150 155160
Pro Ile Phe Val Leu 165 Trp Ala Lys Trp Leu 170 Gly Pro Gln Trp Ser 175 Val
Gly Asp Trp Asp Gly Met Val Ala Ala Ala Pro Arg Glu Leu Pro Glu
180 185 190
Phe Leu His Pro Gly Ile Ala Phe Leu Phe Gly Asp Gly Thr Gly Glu
195 200 205
Gly Ala Ala Ala Thr Pro Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp Pro Glu
210 215 220
Trp Ala Gln Ala Trp Ala Thr Asp Val Ala Asn Ala Gly Cys Asp His
225 230 235 240
Ala Thr Met Leu Ala Gln Asn Arg Val Pro Val Leu Leu Thr His His
245 250 255
Phe His Leu Thr Asp Pro Asp Thr Gly Gln Leu Met Gly Ala Met Thr
260 265 270
Asp Ile Gln Ala Gln Gln Ala Arg Arg Leu Leu Ala Ala Thr Gly Gln
275 280 285
Pro Val Thr Phe Thr Ala Leu Asp Ala Pro His Thr Met His Asp Pro
290 295 300
Glu Pro Glu Arg Tyr Phe Glu Val Leu Thr Glu Trp Ala Ser Ala Leu
305 310 315 320
Asp <210> 10 <211>319 <212> ПРТ <213> Mycobacterium vaccae <400>10
Met 1 Gly Arg Tyr Ala Gly Val 5 Phe Gly Pro 10 His Ala Pro Glu Ser 15 Thr
Tyr Val Gly His Ala Tyr Pro Glu Gln Leu Phe Asp Thr Gly Glu Val
20 25 30
Arg Leu Asn Tyr Ala Val Ala Gly Asp Ala Ser Ala Ser Pro Leu Leu
- 42 032685
Leu Ile 50 Pro Gly Gln Thr Glu 55 Ser Trp Trp Gly Tyr 60 Glu Pro Ala Met
Gly Leu Leu Ala Glu His Phe His Val His Ala Val Asp Leu Arg Gly
65 70 75 80
Gln Gly Arg Ser Thr Arg Thr Pro Arg Arg Tyr Thr Leu Asp Asn Ile
85 90 95
Gly Asn Asp Leu Val Arg Phe Leu Asp Gly Val Ile Gly Arg Pro Ala
100 105 110
Phe Val Ser Gly Leu Ser Ser Gly Gly Leu Leu Ser Ala Trp Leu Ser
115 120 125
Ala Phe Ala Glu Pro Gly Gln Val Leu Ala Ala Cys Tyr Glu Asp Pro
130 135 140
Pro Phe Phe Ser Ser Glu Leu Asp Pro Val Ile Gly Pro Gly Leu Met
145 150 155 160
Ser Thr Val Gly Pro Leu Phe Ala Leu Tyr Val Lys Tyr Leu Gly Asp
165 170 175
Gln Trp Ser Ile Gly Asp Trp Asp Gly Phe Val Ala Gly Ala Pro Gln
180 185 190
Glu Leu Ala Gly Trp Gln Ala His Val Ala Leu Ala Gly Gly Thr Ala
195 200 205
Glu Pro Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp Pro Glu Trp Gly Arg Ala
210 215 220
Phe Val Gly Gly Thr Phe Thr Thr Gly Cys Pro His Gln Val Met Leu
225 230 235 240
Ser Gln Val Lys Val Pro Val Leu Phe Thr His His Phe Arg Met Leu
245 250 255
Asp Asp Glu Ser Gly Ser Leu Ile Gly Ala Ala Thr Asp Asp Gln Ala
260 265 270
Ala Arg Val Val Glu Leu Val Glu Asn Ser Gly Ala Pro Leu Thr Tyr
275 280 285
- 43 032685
Arg Ser Phe Pro Met Met Gly His
290295
Ser Met His
Ala Gln Asp Pro Ala
300
Leu Phe Ala Gly Thr Leu Val Asp Trp Phe Thr Ala Ala Arg Ser 305 310315 <210> 11 <211>319 <212> ПРТ <213> Mycobacterium gilvum <400>11
Met 1 Gly Arg Tyr Ala Gly 5 Val Phe Gly Pro 10 His Ala Pro Glu Ala 15 Thr
Tyr Val Glu His Gly Tyr Pro Glu Arg Leu Phe Asp Thr Gly Glu Val
20 25 30
Gln Leu Asn Tyr Val Val Ala Gly Asp Ala Ala Ala Pro Pro Leu Leu
35 40 45
Leu Ile Pro Gly Gln Ser Glu Ser Trp Trp Gly Tyr Glu Ala Ala Ile
50 55 60
Pro Leu Leu Ala Arg His Phe His Val His Ala Val Asp Leu Arg Gly
65 70 75 80
Gln Gly Arg Ser Thr Arg Thr Pro Gly Arg Tyr Thr Leu Asp Asn Val
85 90 95
Gly Asn Asp Leu Val Arg Phe Leu Asp Gly Val Ile Gly Arg Pro Ala
100 105 110
Phe Val Ser Gly Leu Ser Ser Gly Gly Leu Ala Ser Ala Trp Leu Ser
115 120 125
Ala Phe Ala Lys Pro Gly Gln Val Val Ala Ala Cys Trp Glu Asp Pro
130 135 140
Pro Phe Phe Ser Ser Glu Thr Ala Pro Ile Val Gly Pro Pro Ile Thr
145 150 155 160
Asp Ser Ile Gly Pro Leu Phe Gly Met Trp Ala Arg Tyr Leu Gly Asp
165 170 175
Gln Trp Ser Val Gly Asp Trp Asp Gly Phe Val Ala Ala Val Pro Thr
180 185 190
- 44 032685
Glu Leu Ala 195 Asp Trp Gln Ala His 200 Val Ala Leu Val Val 205 Gly Thr Ala
Asp Pro Pro Gln Asn Leu Arg Glu Tyr Asp Pro Glu Trp Gly Lys Ala
210 215 220
Phe Ile Thr Gly Thr Phe Ala Ala Ser Cys Pro His His Val Met Leu
225 230 235 240
Ser Lys Val Lys Val Pro Val Leu Tyr Thr His His Phe Arg Met Ile
245 250 255
Asp Glu Gly Ser Gly Gly Leu Ile Gly Ala Cys Ser Asp Ile Gln Ala
260 265 270
Gly Arg Val Thr Gln Leu Ala Lys Ser Gly Gly Arg Ser Val Thr Tyr
275 280 285
Arg Ser Phe Pro Met Met Ala His Ser Met His Gly Gln Asp Pro Ala
290 295 300
Leu Phe Ser Glu Thr Leu Val Glu Trp Phe Ser Arg Phe Thr Gly
305 310 315
<210> 12 <211> 322 <212> ПРТ <213> Gordonia effusa <400> 12
Met 1 Pro Lys Ser Glu 5 Ala Ala Asp Arg Ala Asp 10 Ser Phe Val Ser 15 His
Asp Phe Lys Glu Asn Ile Val Asp Leu Gly Glu Ile Arg Met Asn Tyr
20 25 30
Val Val Gln Gly Asn Lys Lys Ser Pro Ala Leu Leu Leu Ile Pro Ala
35 40 45
Gln Gly Glu Ser Trp Trp Gly Tyr Glu Ala Ala Ile Pro Leu Leu Ala
50 55 60
Lys His Phe Gln Val Phe Ala Ile Asp Leu Arg Gly Gln Gly Arg Thr
65 70 75 80
Thr Trp Thr Pro Gly Arg Tyr Thr Leu Asp Ile Phe Gly Asn Asp Val
85 90 95
- 45 032685
Val Arg Phe Ile 100 Asp Leu Val Ile Gly Arg 105 Glu Thr Leu Ile 110 Ala Gly
Asn Ser Ser Gly Gly Leu Ile Gly Ala Trp Leu Ala Ala Phe Ala Lys
115 120 125
Pro Gly Gln Val Arg Ala Val Met Leu Glu Asp Pro Pro Leu Phe Ala
130 135 140
Ser Glu Ile Arg Pro Pro Tyr Gly Pro Gly Ile Trp Gln Gly Leu Gly
145 150 155 160
Pro Met Phe Ala Ala Trp Ala Lys Trp Leu Gly Pro Gln Trp Ser Ile
165 170 175
Gly Asp Trp Asp Gly Met Val Lys Ala Leu Pro Asp Glu Leu Pro Glu
180 185 190
Asp Leu Leu Pro Gly Ile Gly Phe Met Leu Gly Asp Gly Glu Ser Asp
195 200 205
Gly Ala Ala Pro Thr Pro Pro Gln His Leu Lys Glu Tyr Asp Pro Glu
210 215 220
Trp Gly Ala Ser Trp Ala Ser Gly Phe Ala Asn Thr Gly Cys Glu His
225 230 235 240
Glu Ala Val Ile Ser Gln Val Arg Val Pro Val Leu Leu Thr His His
245 250 255
Phe Arg Gln Ile Asn Glu Glu Thr Gly His Leu Met Gly Ala Leu Ser
260 265 270
Asp Leu Gln Ala Ala Gln Val Arg His Ile Ile Glu Glu Val Ala Gly
275 280 285
Gln Glu Val Thr Tyr Val Ser Leu Asp Ala Pro His Thr Met His Glu
290 295 300
Pro Gln Pro Glu Arg Tyr Thr Asp Val Leu Leu Asp Trp Val Lys Lys
305 310 315 320
Leu Gly
<210> 13
<211> 328
<212> ПРТ
- 46 032685 <213> Togninia minima <400> 13
Met 1 Asn Tyr Ala Thr Ala 5 Gly Ser Ser Asp 10 Lys Pro Ala Leu Leu 15 Leu
Val Pro Gly Gln Ser Glu Ser Trp Trp Gly Tyr Glu Met Ala Met Trp
20 25 30
Leu Leu Lys Asp Asp Tyr Gln Val Phe Ala Val Asp Met Arg Gly Gln
35 40 45
Gly Gln Ser Thr Trp Thr Pro Gly Arg Tyr Ser Leu Asp Thr Phe Gly
50 55 60
Asn Asp Leu Val Lys Phe Ile Asp Ile Val Ile Lys Arg Pro Val Val
65 70 75 80
Val Ser Gly Leu Ser Ser Gly Gly Val Val Ser Ala Trp Leu Ser Ala
85 90 95
Phe Ala Lys Pro Gly Gln Ile Arg Ala Ala Val Tyr Glu Asp Pro Pro
100 105 110
Leu Phe Ala Ser Gln Ser Lys Pro Ala Ile Gly Gln Ser Val Met Gln
115 120 125
Thr Val Ala Gly Pro Phe Phe Asn Leu Trp Tyr Lys Trp Leu Gly Ala
130 135 140
Gln Trp Thr Ile Gly Asp Gln Ala Gly Met Val Ala Ala Met Pro Lys
145 150 155 160
Glu Ile Pro Ala Trp Ile Leu Gln Tyr Leu Gly Asn Thr Thr Ser Gly
165 170 175
Pro Thr Gly Leu Asp Leu Thr Leu Asn Glu Tyr Asp Pro Glu Trp Gly
180 185 190
His Gly Phe Val Ser Gly Thr Val Asp Ala Thr Cys Asp His Glu Ala
195 200 205
Met Leu Thr His Val Lys Val Pro Val Leu Phe Thr His His Ser Arg
210 215 220
Ala Ile Asp Pro Tyr Thr Gly Asn Leu Ile Gly Ser Val Ser Asp Thr
225 230 235 240
- 47 032685
Gln Val Ser Tyr Ala 245 Gln Gly Leu Ile Thr 250 Thr Asn Gly Asn Gln 255 Ser
Phe Thr Leu Lys Asn Phe Pro Leu Ala Ser His Asp Met His Asn Ser
260 265 270
Asp Pro Ala Thr Tyr Val Ser Ala Ile Thr Thr Trp Met Ala Ser Leu
275 280 285
Gly Ile Gly Ser Ala Val Ile Pro Gly Pro Val Lys Val Ala Ser Ala
290 295 300
Ser Ala Gln Val Ser Ala Ala Ser Thr Ala Pro Pro Ser Cys Thr Ser
305 310 315 320
Thr Ser Ala Pro Ser Thr Gly His
325
<210> 14
<211> 280
<212> ПРТ
<213> Actinosynnema mirum
<400> 14
Met Thr Val Val Asp Pro Pro Ala Pro Arg Asp Phe Pro Glu Leu Leu
1 5 10 15
Val Asp Leu Gly Glu Val Val Leu Asn His Ala Glu Ala Gly Ser Pro
20 25 30
Asp Arg Pro Ala Leu Val Pro Val Pro Glu Gln Gly Gly Ser Trp Trp
35 40 45
Ser Tyr Glu Arg Val Met Pro Leu Pro Ala Arg Asp Phe His Val Phe
50 55 60
Ala Val Asp Leu Arg Gly Arg Gly Arg Ser Thr Arg Thr Pro Arg Arg
65 70 75 80
Tyr Ser Leu Asp Asp Phe Gly Asn Asp Leu Val Arg Phe Leu Ala Leu
85 90 95
Val Val Arg Arg Pro Ala Val Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Val
100 105 110
Leu Ala Ala Trp Ser Ser Ala Tyr Ala Met Pro Gly Gln Val Arg Ala
115 120 125
- 48 032685
Val Leu 130 Leu Glu Asp Pro Pro 135 Leu Phe Ser Ser Glu Leu 140 Thr Pro Val
Cys Gly Pro Gly Val Arg Gln Ala Ala Gly Pro Leu Phe Glu Leu Leu
145 150 155 160
Ser Thr His Leu Gly Asp Gln Trp Gly Gly Gly Arg Pro Gly Arg Val
165 170 175
His Gly Gly Val Pro Arg Leu Gly Leu Ala Ala Ala Ala Ala Val Arg
180 185 190
Val Ala Arg Arg Ala Ala Ala Thr Asp Ala Arg Gly Arg Pro Gly Ala
195 200 205
Ala Arg Gly Arg Pro Ala Gly Val Gly Gly Ala Ala Arg Arg Gly Arg
210 215 220
Gly Gly Arg Glu Arg Thr Gly Thr Thr Thr Val Leu Ser Gly Leu Thr
225 230 235 240
Gly Ser Arg Thr Ser Gly Thr Gly Arg Cys Arg Lys Pro Phe Arg Leu
245 250 255
Arg Gln Trp Trp Ala Gly Gly Ala Arg Gly Pro Pro Pro Pro Arg Gln
260 265 270
Ile Arg Ala Asp Val Arg Thr Arg
275 280
<210> <211> <212> <213> 15 326 ПРТ Kutzneria albida
<400> 15
Met 1 Ser Val Pro Val 5 Thr Pro Ser Ala Arg 10 Asn Val Phe Val Pro 15 His
Ala Phe Pro Glu Lys Gln Ile Asp Leu Gly Glu Val Val Leu Asn Tyr
20 25 30
Ala Glu Ala Gly Thr Pro Asp Lys Pro Ala Leu Leu Leu Leu Pro Glu
35 40 45
Gln Thr Gly Ser Trp Trp Ser Tyr Glu Pro Ala Met Gly Leu Leu Ala
50 55 60
- 49 032685
Glu 65 His Phe His Val Phe 70 Ala Val Asp Leu Arg 75 Gly Gln Gly Arg Ser 80
Thr Trp Thr Pro Gly Arg Tyr Ser Leu Asp Asn Phe Gly Asn Asp Leu
85 90 95
Val Arg Phe Ile Ala Leu Ala Ile Arg Arg Pro Val Val Val Ala Gly
100 105 110
Cys Ser Ser Gly Gly Val Leu Ala Ala Trp Leu Ser Ala Tyr Ala Leu
115 120 125
Pro Gly Gln Ile Arg Gly Ala Leu Cys Glu Asp Ala Pro Leu Phe Ala
130 135 140
Ser Glu Leu Thr Pro Ala His Gly His Gly Val Arg Gln Gly Ala Gly
145 150 155 160
Pro Val Phe Glu Leu Tyr Arg Asp Tyr Leu Gly Asp Gln Trp Ser Val
165 170 175
Gly Asp Trp Ala Gly Leu Val Ala Ala Ala Gln Ala Ser Pro Ala Lys
180 185 190
Met Met Ser Leu Phe Lys Met Pro Gly Glu Pro Pro Gln Asn Leu Arg
195 200 205
Glu Tyr Asp Pro Glu Trp Ala Arg Val Phe Phe Glu Gly Thr Val Gly
210 215 220
Leu His Cys Pro His Asp Arg Met Leu Ser Gln Val Lys Thr Pro Val
225 230 235 240
Leu Ile Thr His His Ala Arg Thr Thr Asp Pro Glu Thr Gly Glu Phe
245 250 255
Leu Gly Ala Leu Ser Glu Leu Gln Ala Glu Arg Ala Gln Ala Ile Ile
260 265 270
Arg Ala Ala Gly Val Pro Val Asp Tyr Gln Ser Phe Pro Asp Ala Ala
275 280 285
His Ala Met His Thr Thr Glu Pro Ala Arg Tyr Ala Ala Val Leu Thr
290 295 300
Ala Trp Ala Ala Lys Leu Pro Pro Val Ala Asp Thr Ser Pro Ser Ala
305 310 315 320
- 50 032685
Ala Ala Ser Ala His Val
325 <210> 16 <211> 987 <212> DNA <213> Rhodococcus erythropolis <220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 1
<400> 16
atggccgaag aaggaactag gtccgaagca gcggatgctg ccacacaagc gagacagcta 60
cccgattcgc ggaacatctt tgtctcgcac cgatttccgg aaaggcaggt cgatctcggt 120
gaagtggtga tgaacttcgc ggaggcgggc tctccggaca acccggcact gctcctcctc 180
cccgagcaga ccgggtcgtg gtggagttac gagccagtga tgggtcttct ggcagagaac 240
tttcatgtct ttgccgtcga tatccgtggg caaggtcgca gtacctggac gccacggcga 300
tacagcctgg acaacttcgg caatgatctg gtgcgtttca tcgctctggt catcaagcgc 360
cctgtcgtcg tggcagggaa ctcctcgggg gggctgctgg ccgcctggct ctcggcgtac 420
gcgatgcccg gccagatccg tgcagcattg tgtgaggacg caccgttctt tgcgtcggag 480
ttggtccccg catacggtca ctcggttctg caggcggcgg gtccggcatt cgagttgtac 540
cgggacttcc tcggggacca gtggtcgatt ggggactgga aagggttcgt tgaggcagcc 600
aaagcgtcgc cggcaaaggc tatgcaatta tttccgaccc cggatgaggc gccgcagaat 660
ctcaaggaat acgacccgga atgggggcgc gcattcttcg aagggactgt ggcactgcac 720
tgcccacacg acaggatgct ctcgcaagtc aagacaccaa ttctcatcac tcaccacgcg 780
cggacgatcg accccgagac gggcgagctg ttgggcgcgc tctccgacct tcaggcagag 840
catgcgcagg acatcattcg gtctgcgggc gttcgggtgg actatcagtc gcaccccgac 900
gcgcttcaca tgatgcatct gttcgatccc gctcgttacg cggagatctt gacatcctgg 960
tccgcaacac tgcctgcgaa cgactag 987
<210> 17 <211> 987 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<400> 17
- 51 032685
atggcagaag aaggcacccg tagcgaagca gcagatgcag caacccaggc acgtcagctg 60
ccggatagcc gtaacatttt tgttagccat cgttttccgg aacgtcaggt tgatctgggt 120
gaagttgtta tgaattttgc agaagcaggt agtccggata atccggcatt actgctgctg 180
ccggaacaga ccggtagttg gtggtcttat gaaccggtta tgggtctgct ggcagaaaac 240
tttcatgttt ttgcagttga tattcgtggt cagggtcgta gcacctggac accgcgtcgt 300
tatagcctgg ataattttgg taatgatctg gtgcgtttta ttgccctggt tattaaacgt 360
ccggttgttg ttgcaggtaa tagcagcggt ggcctgctgg ctgcatggct gagcgcctat 420
gcaatgcctg gtcagattcg tgcagcactg tgtgaagatg caccgttttt tgcaagcgaa 480
ctggttcctg cctatggtca tagcgttctg caggcagcag gtccggcatt tgaactgtat 540
cgtgattttc tgggtgatca gtggtcaatt ggtgattgga aaggttttgt tgaagcagca 600
aaagcaagtc cggctaaagc aatgcagctg tttccgacac cggatgaagc accgcagaat 660
ctgaaagaat atgatccgga atggggtcgt gcattttttg aaggcaccgt tgcactgcat 720
tgtccgcatg atcgtatgct gagccaggtt aaaaccccga ttctgattac ccatcatgca 780
cgtaccatcg atccggaaac cggtgaactg ctgggtgcac tgagtgatct gcaggccgaa 840
catgcacagg atattattcg tagtgccggt gttcgtgttg attatcagag ccatcctgat 900
gcactgcaca tgatgcacct gtttgatccg gcacgttatg cagaaattct gaccagttgg 960
agcgcaaccc tgcctgcaaa tgattaa 987
<210> 18 <211> 927 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 2 <400> 18
atggcagatc cggcacagcg tgatgtttat gttccgcatg catatccgga aaaacaggca 60
gatctgggtg aaattaccat gaattatgcc gaagccggtg aacctgatat gcctgcagtt 120
ctgctgattc cggaacagac cggtagttgg tggggttatg aagaagcaat gggtctgctg 180
gcagaaaact ttcatgttta tgcagttgat ctgcgtggtc agggtcgtag cagctgggca 240
ccgaaacgtt atagcctgga taattttggt aatgatctgg tgcgttttat tgccctggtt 300
gttaaacgtc cggttattgt tgcaggtaat agcagcggtg gtgttctggc agcatggctg 360
- 52 032685
agcgcatata gcatgcctgg tcaggttcgt ggtgcactgt gtgaagatgc accgtttttt 420
gcaagcgaac tggttaccac ctgtggtcat agcattcgtc aggcagcagg tccgatgttt 480
gaactgtttc gtacctatct gggcgatcag tggtcagttg gtgattggac cggctattgt 540
cgtgcagcag atgcaagcag cagcccgatg gcacgttatt ttgttgcaga tgaaattccg 600
cagcacatgc gtgaatatga tccggaatgg gcacgtgcat tttgggaagg caccgttgca 660
ctgcattgtc cgcatgaaca gctgctgacc caggttaaaa caccggtgct gctgacacat 720
cacatgcgcg atattgatcc tgataccggt catctggttg gtgccctgag tgatgaacag 780
gcagcccgtg cacgtctgct gatggaaagt gccggtgtta aagttgatta tgcaagcgtt 840
ccggatgcac tgcacatgat gcaccagttt gatccgcctc gttatgttga aatctttacc 900
cagtgggcag caaccctggc agcataa 927
<210> 19 <211> 930 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность
<220> <223> ОРС была кодон- -оптимизирована и, таким образом, отличалась
от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 3
<400> 19
atggttacca gtccggcact gcgtgatgtt catgttccgc atgcatatcc ggaacagcag 60
gttgatctgg gtgaaattac catgaattat gccgaagccg gtgatccggg tcgtccggca 120
gttctgctga tcccggaaca gaccggtagt tggtggtctt atgaagaagc aatgggtctg 180
ctggcagaac attttcatgt ttatgcagtt gatctgcgtg gtcagggtcg tagcagctgg 240
accccgaaac gttatagcct ggataatttt ggtaatgatc tggtgcgttt tattgccctg 300
gttgttcgtc gtccggttgt tgttgcaggt aatagcagcg gtggtgttct ggcagcatgg 360
ctgagcgcat atagcatgcc tggtcagatt cgtggtgtgc tgtgtgaaga tccgcctttt 420
tttgcaagcg aactggttcc ggcacatggt catagcgttc gtcagggtgc aggtccggtt 480
tttgaactgt ttcgtaccta tctgggcgat cagtggtcag ttggtgattg ggaaggtttt 540
cgtagcgcag cagatgcaag cgcaagcccg atggcacgta gctttgttgc agataccatt 600
ccgcagcatc tgaaagaata tgatccggaa tgggcacgtg cattttatga aggcaccgtt 660
ggtctgaatt gtccgcatga acgtatgctg aatcgtgtta atacaccggt gctgctgacc 720
catcacatgc gtggcaccga tccggaaacc ggtaatctgc tgggtgcact gagtgatgaa 780
- 53 032685 caggcagcac aggtgcgtcg tctgatggaa agtgccggtg ttaaagttga ttatgaaagc gttccggatg caagccacat gatgcaccag agcgatccgg cacgttatgc agaaattctg accccgtgga ccgcagcact ggcaccgtaa
840
900
930 <210> 20 <211> 930 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 4 <400> 20
atggttacca gtccggcact gcgtgatgtt catgttccgc atgcatatcc ggaacagcag 60
gttgatctgg gtgaaattac catgaattat gccgaagccg gtgatcctga tcgtccggca 120
gttctgctga tcccggaaca gaccggtagt tggtggtcat atgaagaagc aatgggtctg 180
ctggcagaac attttcatgt ttatgcagtt gatctgcgtg gtcagggtcg tagcagctgg 240
accccgaaac gttatagcct ggataatttt ggtaatgatc tggtgcgttt tattgccctg 300
gttgttaaac gtccggttgt tgttgcaggt aatagcagcg gtggtgttct ggcagcatgg 360
ctgagcgcat atagcatgcc tggtcagctg cgtggtgtgc tgtgtgaaga tccgcctttt 420
tttgcaagcg aactggttcc ggcacatggt catagcgttc gtcagggtgc aggtccggtt 480
tttgaactgt ttcgtaccta tctgggcgat cagtggtcag ttagcgattg ggaaggtttt 540
tgtcgtgcag ccggtgcaag cgcaagcccg atggcacgta gctttgttgc agatggtatt 600
ccgcagcatc tgaaagaata tgatccggaa tgggcacgtg catttcatga aggcaccgtt 660
ggtctgaatt gtccgcatga acgtatgctg ggtcgtgtta atacaccggt gctgctgacc 720
catcatatgc gtggcaccga tccggaaacc ggtaatctgc tgggtgcact gagtgatgaa 780
caggcagcac aggcacgtct gctgatggaa agtgccggtg ttcgtgttga ttatgaaagc 840
gttccggatg caagccatat gatgcaccag agcgatccgg cacgttatgc agaaatcttt 900
acccgttggg cagcagccct ggcaccgtaa 930
<210> 21 <211> 930 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась
- 54 032685 от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 5
<400> 21
atggttacca gtccggcact gcgtgatgtt catgttccgc atgcatatcc ggaacagcag 60
gttgatctgg gtgaaattac catgaattat gccgaagccg gtgatccggg tcgtccggca 120
gttctgctga tcccggaaca gaccggtagt tggtggtctt atgaagaagc aatgggtctg 180
ctggcagaac attttcatgt ttatgcagtt gatctgcgtg gtcagggtcg tagcagctgg 240
accccgaaac gttatagcct ggataatttt ggtaatgatc tggtgcgttt tatggcactg 300
gttgttcgtc gtccggttgt tgttgcaggt aatagcagcg gtggtgttct ggcagcatgg 360
ctgagcgcat atagcatgcc tggtcagatt cgtggtgtgc tgtgtgaaga tccgcctttt 420
tttgcaagcg aactggttcc ggcacatggt catagcgttc gtcagggtgc aggtccggtt 480
tttgaactgt ttcgtaccta tctgggcgat cagtggtcag ttggtgattg ggaaggtttt 540
cgtagcgcag ccggtgcaag cgcaagcccg atggcacgta gctttgttgc agataccatt 600
ccgcagcatc tgaaagaata tgatccggaa tgggcacgtg cattttatga aggcaccgtt 660
ggtctgaatt gtccgcatga acgtatgctg aatcgtgtta atacaccggt gctgctgacc 720
catcacatgc gtggcaccga tccggaaacc ggtaatctgc tgggtgcact gagtgatgaa 780
caggcagcac aggcacgtcg tctgatggaa agtgccggtg ttaaagttga ttatgaaagc 840
gttccggatg caagccacat gatgcaccag agcgatccgg cacgttatgc agaaattctg 900
accccgtggg cagcagccct ggcaccgtaa 930
<210> 22 <211> 930 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 6 <400> 22
atggttacca gtccggcact gcgtgatgtt catgttccgc atgcatatcc ggaacagcag 60
gttgatctgg gtgaaattac catgaattat gccgaagccg gtgatcctga tcgtccggca 120
gttctgctga tcccggaaca gaccggtagt tggtggtctt atgaagaagc aatgggtctg 180
- 55 032685
ctgagcgaac attttcatgt ttatgcagtt gatctgcgtg gtcagggtcg tagcagctgg 240
accccgaaac gttatagcct ggataatttt ggtaatgatc tggtgcgttt tattgccctg 300
gttgttaaac gtccggttgt tgttgcaggt aatagcagcg gtggtgttct ggcagcatgg 360
ctgagcgcat atagcatgcc tggtcagctg cgtggtgtgc tgtgtgaaga tccgcctttt 420
tttgcaagcg aactggttcc ggcacatggt catagcgttc gtcagggtgc aggtccggtt 480
tttgaactgt ttcgtaccta tctgggcgat cagtggtcag ttggtgattg ggaaggtttt 540
tgtcgtgcag ccggtgcaag cgcaagcccg atggcacgta gctttgttgc agatggtatt 600
ccgcagcatc tgcaagaata tgatccggaa tgggcacgtg ttttttatga aggcaccgtt 660
ggtctgagct gtccgcatga acgtatgctg ggtcaggtta aaacaccggt gctgctgacc 720
catcacatgc gtggtatcga tccggaaacc ggtaatctgc tgggtgcact gagtgatgaa 780
caggccctgc gtgcacgtcg tctgatggat agtgccggtg ttaccgttga ttatgaaagc 840
gttccggatg caagccacat gatgcaccag agcgcaccgg cacgttatgt tgaaatcttt 900
acccgttggg cagcagccct ggcaccgtaa 930
<210> 23 <211> 903 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 7 <400> 23
atgccgcacg attatgaaga aaaactggtt gatctgggcg aaatcgatct gaattatgca 60
gaagcaggta gtccggataa accggcactg ctgctgattc cgagccagag cgaaagttgg 120
tggggctatg aagaagcaat gggtctgctg gccgaagatt atcatgtttt tgcagttgat 180
atgcgtggtc agggtcgtag cacctggaca ccgggtcgtt atagcctgga taattttggt 240
aatgatctgg tgcgctttat cgatctggtt attggtcgta ccgttattgt tagcggtaat 300
agcagcggtg gtgttgttgc agcatggctg gcagcattta gcctgcctgg tcaggttcgt 360
gcagcactgg cagaagatgc accgtttttt gcaagcgaac tggacccgaa agtgggtcat 420
accattcgtc aggcagcagg tcatattttt gttaactggc gtgattatct gggtgatcag 480
tggtcagttg gtgattatgc aggttttctg aaagcaatga aaagcagcga agttccgatg 540
ctgcgtcagg ttccgctgcc ggaaaccgca ccgcagaatc tgctggaata tgatccggaa 600
- 56 032685 tgggcacgtg cattttatga aggcaccgtt gcacagacct gtccgcatga ttatatgctg 660 agccaggtta aagtgcctat gctggttacc catcatgcac gtatgattga tgaagcaacc 720 agcggtctgg ttggtgcaat gagcgatctg caggttcaga aagcagcaga aattattcgt 780 ggcaccggtg ttcaggttga tgttgttgat ctgccggaag caccgcatat tctgcatcag 840 ctggcaccga aagaatatgt ggaaattctg aataactggg tggaaaaact gcctccggtt 900 taa 903 <210> 24 <211> 924 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 8 <400> 24
atgatccaga acaataaaac cgcaccgtat aaatacaaag aaaaactggt tgatctgggc 60
gaaatcaaaa tgaactatat tgttgccggt gcagatgtta gtccggcact gctgctgatt 120
ccgggtcaga ccgaaagttg gtggggtttt gaagcagcaa ttgagaaact ggaaagcaac 180
tttcaggtgt ttgcaattga tctgcgtggt cagggtaaaa gcacccagac accgggtcgt 240
tatagcctga atctgatggg taatgatctg gttcgtttta ttagcctggt tattaaacgt 300
ccggttattg ttagcggtaa tagcagcggt ggtctgctgg cagcatggct gagcgcctat 360
gcaatgccga atcagattcg tgcaattcat tgtgaagatg caccgttttt taccgcagaa 420
aaagcaccgc tgtatggtca tgcaattcag caggcagcag gtccgatttt tagcctgatg 480
agcaaatttc tgggtgatca gtggtcaatt aacaattggg aaggtctgaa agcagcacag 540
gcaaaagata cccatccggc aaacaaaatg attagccagg ttgaacagcc tccgcagcat 600
ctgaaagaat atgatccgga atggggtcgt gcatttattg aaggcaaatt taacctgaac 660
agtccgcatc ataccctgct gagcgacatt aaaaccccga tgctgtatac ccatcacatg 720
cgttttgaag atccgcagac aggtctgctg attggtgcaa ccagcgattt tcaggcaagc 780
aaaatcaaag aaattgccct gaaaaccggc aatagcttcg aactgattga tgcaccggat 840
gcatttcata gtatgcatga agccgatccg cagcgttttg ttgatattct gaccagctgg 900
attgaacgtc tgaatctgca gtaa 924
- 57 032685 <210> 25 <211> 966 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 9 <400>25 atgggtatta gcgaagcagc agatcgtgca gatacctttg ttgcacataa atttgaagaa60 cagctggttg atctgggtga aattcgtatg aattatgttg cagccggtga tccgaccagt120 ccggcactgc tgctgattcc ggcacagggt gaaagttggt ggggttatga aaatgcaatt180 accctgctgg caaatgattt tcgtgttttt gcaattgatc tgcgtggtca gggtcgtagc240 acctggacac cgggtcgtta taatctgaat acctggggta atgatgtgga acgctttatt300 gatctggtta ttggtcgtcc gaccctggtt gcaggtaata gcagcggtgg tgttattgca360 gcatggctgg cagcctatgc aaaaccgggt cagattcgtg gtgcaatgct ggaagatccg420 cctctgtttg caagccaggc agcaccgcct tatggtccgg gtattatgca gaccctgggt480 ccgatttttg ttctgtgggc aaaatggctg ggtccgcagt ggtcagttgg tgattgggat540 ggtatggttg cagcggcacc gcgtgaactg ccggaatttc tgcatccggg tatcgcattt600 ctgtttggtg atggcaccgg tgaaggtgca gcagcaaccc ctccgcagca tctgaaagaa660 tatgatccgg aatgggcaca ggcatgggca accgatgttg caaatgcagg ttgtgatcat720 gcaaccatgc tggcacagaa tcgtgttccg gttctgctga cccatcattt tcatctgacc780 gatccggata caggccagct gatgggtgca atgaccgata ttcaggcaca gcaggcacgt840 cgtctgctgg cagcaaccgg tcagccggtt acctttaccg cactggatgc accgcatacc900 atgcatgatc ctgaacctga acgttatttt gaagttctga ccgaatgggc aagtgcactg960 gattaa966 <210> 26 <211>960 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature
- 58 032685 <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 10
<400> 26
atgggtcgtt atgccggtgt ttttggtccg catgcaccgg aaagcaccta tgttggtcat 60
gcatatccgg aacaactgtt tgataccggt gaagttcgtc tgaattatgc agttgccggt 120
gatgcaagcg caagtccgct gctgctgatt ccgggtcaga ccgaaagttg gtggggttat 180
gaaccggcaa tgggtctgct ggcagaacat tttcatgttc atgcagttga tctgcgtggt 240
cagggtcgta gcacccgtac accgcgtcgt tataccctgg ataatattgg taatgatctg 300
gtgcgttttc tggatggtgt tattggtcgt ccggcatttg ttagcggtct gagcagcggt 360
ggtctgctga gcgcatggct gagcgccttt gcagaaccgg gtcaggttct ggcagcatgt 420
tatgaagatc cgcctttttt tagcagcgaa ctggacccgg tgattggtcc gggtctgatg 480
agcaccgttg gtccgctgtt tgcactgtat gttaaatatc tgggtgatca gtggtcaatt 540
ggtgattggg atggttttgt tgcaggcgca ccgcaagaac tggcaggttg gcaggcacat 600
gttgcactgg caggcggtac agcagaaccg cctcagcatc tgaaagaata tgatccggaa 660
tggggtcgtg catttgttgg tggcaccttt accaccggtt gtccgcatca ggttatgctg 720
agccaggtta aagttccggt tctgtttacc catcattttc gtatgctgga tgatgaaagc 780
ggtagcctga ttggtgcagc aaccgatgat caggcagcac gtgttgttga actggttgaa 840
aatagtggtg caccgctgac ctatcgtagc tttccgatga tgggtcatag tatgcatgca 900
caagatccgg cactgtttgc aggcaccctg gttgattggt ttaccgcagc acgtagctaa 960
<210> 27 <211> 960 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 11 <400> 27
atgggtcgtt atgccggtgt ttttggtccg catgcaccgg aagcaaccta tgttgaacat 60
ggttatccgg aacgtctgtt tgataccggt gaagtgcagc tgaattatgt tgttgccggt 120
gatgcagcag caccgcctct gctgctgatt ccgggtcaga gcgaaagttg gtggggttat 180
gaagcagcaa ttccgctgct ggcacgtcat tttcatgttc atgcagttga tctgcgtggt 240
cagggtcgta gcacccgtac accgggtcgc tataccctgg ataatgttgg taatgatctg 300
- 59 032685
gtgcgttttc tggatggtgt tattggtcgt ccggcatttg ttagcggtct gagcagcggt 360
ggtctggcaa gcgcatggct gagcgcattt gcaaaaccgg gtcaggttgt tgcagcatgt 420
tgggaagatc cgcctttttt tagcagcgaa accgcaccga ttgttggtcc gcctattacc 480
gatagcattg gtccgctgtt tggtatgtgg gcacgttatc tgggtgatca gtggtcagtt 540
ggtgattggg atggttttgt tgccgcagtt ccgaccgaac tggcagattg gcaggcacat 600
gttgcactgg ttgttggcac cgcagatcct ccgcagaatc tgcgtgaata tgatccggaa 660
tggggtaaag catttattac cggcaccttt gcagcaagct gtccgcatca tgttatgctg 720
agcaaagtta aagttccggt tctgtatacc catcactttc gcatgattga tgaaggtagt 780
ggtggtctga ttggtgcatg tagcgatatt caggcaggtc gtgttaccca gctggcaaaa 840
tcaggtggtc gtagcgttac ctatcgtagc tttccgatga tggcacatag catgcatggt 900
caagatccgg cactgtttag cgaaaccctg gttgaatggt ttagccgttt taccggttaa 960
<210> 28 <211> 969 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 12
<400> 28
atgccgaaaa gcgaagcagc agatcgtgca gatagctttg ttagccatga tttcaaagaa 60
aacattgtgg atctgggcga aatccgcatg aattatgttg ttcagggcaa caaaaaaagt 120
ccggcactgc tgctgattcc ggcacagggt gaaagttggt ggggttatga agcagcaatt 180
ccgctgctgg caaaacattt tcaggttttt gcaattgatc tgcgtggtca gggtcgtacc 240
acctggacac cgggtcgtta taccctggat atttttggta atgatgtggt gcgctttatc 300
gatctggtta ttggtcgtga aaccctgatt gcaggtaata gcagcggtgg tctgattggt 360
gcatggctgg cagcatttgc aaaaccgggt caggttcgtg cagttatgct ggaagatccg 420
cctctgtttg caagcgaaat tcgtccgcct tatggtccgg gtatttggca gggtctgggt 480
ccgatgtttg cagcatgggc aaaatggctg ggtccgcagt ggtcaattgg tgattgggat 540
ggtatggtta aagcactgcc ggatgaactg ccggaagatc tgctgcctgg tattggtttt 600
atgctgggtg atggtgaaag tgatggtgca gcaccgaccc ctccgcagca tctgaaagaa 660
tatgatccgg aatggggtgc aagctgggca agcggttttg ccaataccgg ttgtgaacat 720
- 60 032685 gaagcagtta ttagccaggt gcgtgttccg gttctgctga cccatcattt tcgtcagatt 780 aatgaagaaa ccggtcatct gatgggtgca ctgagcgatc tgcaggcagc acaggttcgt 840 catatcattg aagaagttgc aggtcaagag gttacctatg ttagcctgga tgcaccgcat 900 accatgcatg aaccgcagcc ggaacgttat accgatgttc tgctggattg ggttaaaaaa 960 ctgggttaa 969 <210> 29 <211> 987 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 13 <400> 29
atgaattatg caaccgcagg tagcagcgat aaaccggcac tgctgctggt tccgggtcag 60
agcgaaagtt ggtggggtta tgaaatggca atgtggctgc tgaaagatga ttatcaggtt 120
tttgcagttg atatgcgtgg tcagggtcag agtacctgga caccgggtcg ttatagcctg 180
gatacctttg gtaatgatct ggtgaaattc atcgatatcg tgattaaacg tccggttgtt 240
gttagcggtc tgagcagcgg tggtgttgtg agcgcatggc tgagcgcatt tgcaaaacct 300
ggtcagattc gtgcagcagt ttatgaagat ccgcctctgt ttgcaagcca gagcaaaccg 360
gcaattggtc agagtgttat gcagaccgtt gcaggtccgt tttttaacct gtggtataaa 420
tggctgggtg cacagtggac cattggtgat caggcaggta tggttgcagc aatgccgaaa 480
gaaattccgg catggattct gcagtatctg ggtaatacca ccagtggtcc gaccggtctg 540
gatctgacac tgaatgaata tgatccggaa tggggtcatg gttttgttag tggcaccgtt 600
gatgcaacct gtgatcatga agcaatgctg acccatgtta aagttccggt tctgtttacc 660
catcatagcc gtgcaattga tccgtatacc ggtaatctga ttggtagcgt tagcgatacc 720
caggttagct atgcacaggg tctgattacc accaatggca atcagagctt taccctgaaa 780
aactttccgc tggcaagcca tgatatgcat aattctgatc cggcaaccta tgttagcgca 840
attaccacct ggatggcaag cctgggtatt ggtagtgcag ttattccggg tccggttaaa 900
gttgcaagcg caagcgcaca ggttagcgca gcaagcaccg caccgcctag ctgtaccagc 960
accagcgcac cgagcaccgg tcattaa 987
<210> 30
- 61 032685 <211> 843 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> ОРС была кодон-оптимизирована и, таким образом, отличалась от последовательности ДНК, встречающейся в природе.
<220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 14 <400> 30
atgaccgttg ttgatccgcc tgcaccgcgt gattttccgg aactgctggt tgatctgggt 60
gaagttgttc tgaatcatgc agaagcaggt agtccggatc gtccggcact ggttccggtg 120
ccggaacagg gtggtagttg gtggtcttat gaacgtgtta tgccgctgcc tgcacgcgat 180
tttcatgttt ttgcagttga tctgcgtggt cgtggtcgta gcacccgtac accgcgtcgt 240
tatagcctgg atgattttgg taatgatctg gttcgttttc tggccctggt tgttcgccgt 300
ccggcagttg ttgcaggtaa tagcagcggt ggtgttctgg cagcatggtc aagcgcctat 360
gcaatgcctg gtcaggttcg tgcagttctg ctggaagatc cgcctctgtt tagcagcgaa 420
ctgacaccgg tttgtggtcc gggtgttcgt caggcagcag gtccgctgtt tgaactgctg 480
agcacccatc tgggcgatca gtggggtggt ggtcgtccgg gtcgtgttca tggtggcgtt 540
ccgcgtctgg gtctggcagc cgcagcagca gttcgtgttg cacgtcgtgc agcagcaacc 600
gatgcacgtg gtcgccctgg tgcagcacgt ggacgtcctg ccggtgttgg tggtgcagct 660
cgtcgcggtc gcggtggtcg tgaacgcacc ggtacaacca ccgttctgag cggtctgacc 720
ggtagccgta ccagcggcac cggtcgttgt cgtaaaccgt ttcgtctgcg tcagtggtgg 780
gcaggcggtg cccgtggtcc tcctccgcct cgtcagattc gcgcagatgt tcgtacccgt 840
taa 843 <210> 31 <211> 981 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<221> misc_feature <223> Искусственная последовательность ДНК, кодирующая полипептид с SEQ ID NO: 15 <400> 31 atgagcgttc aaacaaattg ccggcattac cggttacccc atctgggtga tgctgctgcc gagcgcacgt agtggttctg ggaacagacc aatgtttttg aattatgcag ggtagttggt ttccgcatgc aagcaggtac ggtcttatga atttccagag accggataaa accggcaatg
120
180
- 62 032685
ggtctgctgg cagaacattt tcatgttttt gcagttgatc tgcgtggtca gggtcgtagc 240
acctggacac cgggtcgtta tagcctggat aattttggta atgatctggt gcgttttatt 300
gcactggcaa ttcgtcgtcc ggttgttgtt gcaggttgta gcagcggtgg tgttctggca 360
gcatggctga gcgcctatgc actgcctggt cagattcgtg gtgcactgtg tgaagatgca 420
ccgctgtttg caagcgaact gacaccggca catggtcatg gtgttcgtca gggtgcaggt 480
ccggtttttg aactgtatcg tgattatctg ggcgatcagt ggtcagttgg tgattgggca 540
ggtctggttg cagcagcaca ggcaagtccg gcaaaaatga tgagcctgtt taaaatgcct 600
ggtgaaccgc ctcagaatct gcgtgaatat gatccggaat gggcacgtgt tttttttgaa 660
ggcaccgttg gtctgcattg tccgcatgat cgtatgctga gccaggttaa aacaccggtt 720
ctgattaccc atcatgcacg taccaccgat ccggaaaccg gtgaatttct gggtgcactg 780
agcgaactgc aggcagaacg tgcacaggcc attattcgtg cagccggtgt tccggttgat 840
tatcagagct ttccggatgc agcacatgca atgcatacca cagaaccggc acgttatgca 900
gcagttctga ccgcatgggc agcaaaactg cctccggttg cagataccag cccgtcagca 960
gcagcaagcg cacatgttta a 981
<210> 32 <211> 7 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(7) <400> 32
Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly
5
<210> <211> <212> <213> 33 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 33
- 63 032685
Arg Thr Ile Asp Pro Glu Thr
1 5
<210> <211> <212> <213> 34 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 34
Asp Ala Leu His Met Met His
1 5
<210> <211> <212> <213> 35 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 35
Ala Gly Asp Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 36 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 36
Ala Gly Asp Ser Ser Leu Gly
1 5
<210> 37
- 64 032685
<211> <212> <213> 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 37
Ala Gly Gln Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 38 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 38
Ala Gly His Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 39 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 39
Ala Gly Ser Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 40 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
- 65 032685
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 40
Ser Gly Asn Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 41 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 41
Ser Gly Asp Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 42 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 42
Ser Gly Gln Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> <211> <212> <213> 43 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
- 66 032685 <400>43
Ser Gly His Ser Ser Gly Gly <210>44 <211>7 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(7) <400>44
Ser Gly Ser Ser Ser Gly Gly <210>45 <211>7 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(7) <400>45
Arg Thr Ile Asp Pro Glu Thr <210>46 <211>7 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(7) <400> 46
Arg Asp Ile Asp Pro Asp Thr
5
- 67 032685
<210> <211> <212> <213> 47 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 47
Arg Gly Thr Asp Pro Glu Thr
1 5
<210> <211> <212> <213> 48 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 48
Arg Gly Ile Asp Pro Glu Thr
1 5
<210> <211> <212> <213> 49 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 49
Asp Ala Leu His Met Met His
1 5
<210> <211> <212> <213> 50 7 ПРТ Искусственная последовательность
<220>
- 68 032685
<223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(7)
<400> 50
Asp Ala Ser His Met Met His
1 5
<210> <211> <212> <213> 51 11 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(11)
<400> 51
Val Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Leu Leu
1 5 10
<210> <211> <212> <213> 52 11 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(11)
<400> 52
Ile Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Val Leu
1 5 10
<210> <211> <212> <213> 53 11 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(11)
- 69 032685 <400>53
His Ala Arg Thr Ile Asp Pro Glu Thr Gly Glu
510 <210>54 <211> 11 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(11) <400>54
His Met Arg Asp Ile Asp Pro Asp Thr Gly His
510 <210>55 <211> 11 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(11) <400>55
His Met Arg Gly Thr Asp Pro Glu Thr Gly Asn
510 <210>56 <211> 11 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(11) <400> 56
His Pro Asp Ala Leu His Met Met His Leu Phe
5 10
- 70 032685 <210> 57 <211> 11 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(11) <400>57
Val Pro Asp Ala Leu His Met Met His Gln Phe
510 <210>58 <211> 11 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(11) <400>58
Val Pro Asp Ala Ser His Met Met His Gln Ser
510
<210> <211> <212> <213> 59 21 ПРТ Искусственная последовательность
<220> <223> аминокислотный мотив
<220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(21) <400>59
Ile Lys Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Leu Leu
5 1015
Ala Ala Trp Leu Ser <210> 60
- 71 032685 <211> 21 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(21) <400> 60
Val Lys Arg Pro Val Ile Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Val Leu
5 10 15
Ala Ala Trp Leu Ser
<210> 61
<211> 21
<212> ПРТ
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> аминокислотный мотив
<220>
<221> ПЕПТИД
<222> (1)..(21) 1
<400> 61
Val Arg Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Val Leu
1 5 10 15
Ala Ala Trp Leu Ser
<210> 62
<211> 21
<212> ПРТ
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> аминокислотный мотив
<220>
<221> ПЕПТИД
<222> (1)..(21) 1
<400> 62
Val Lys Arg Pro Val Val Val Ala Gly Asn Ser Ser Gly Gly Val Leu
1 5 10 15
- 72 032685
Ala Ala Trp Leu Ser <210> 63 <211> 21 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(21) <400>63
Ile Leu Ile Thr His His Ala Arg Thr Ile Asp Pro Glu Thr Gly Glu
5 1015
Leu Leu Gly Ala Leu <210>64 <211> 21 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(21) <400>64
Val Leu Leu Thr His His Met Arg Asp Ile Asp Pro Asp Thr Gly His
5 1015
Leu Val Gly Ala Leu <210>65 <211> 21 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность <220>
<223> аминокислотный мотив <220>
<221> ПЕПТИД <222> (1)..(21)
- 73 032685 <400> 65
Val Leu Leu Thr His His Met Arg Gly Thr Asp Pro Glu Thr Gly Asn
5 10 15
Leu Leu Gly Ala Leu
<210> 66
<211> 21
<212> ПРТ
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> аминокислотный мотив
<220>
<221> ПЕПТИД
<222> (1)..(21)
<400> 66
Val Leu Leu Thr His His Pro Asp Ala Leu His Met Met His Leu Phe
1 5 10 15
Leu Leu Gly Ala Leu
<210> 67
<211> 21
<212> ПРТ
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> аминокислотный мотив
<220>
<221> ПЕПТИД
<222> (1)..(21)
<400> 67
Val Asp Tyr Gln Ser His Pro Asp Ala Leu His Met Met His Leu Phe
1 5 10 15
Asp Pro Ala Arg Tyr
<210> <211> <212> <213> 68 21 ПРТ Искусственная последовательность
<220>
- 74 032685
<223> аминокислотный мотив
<220> <221> <222> ПЕПТИД (1)..(21)
<400> 68
Val Asp Tyr Ala Ser Val Pro Asp Ala Leu His Met Met His
5 10
Gln Phe
Asp Pro Pro Arg Tyr <210> 69 <211> 21 <212> ПРТ <213> Искусственная последовательность
<220>
<221> ПЕПТИД
<222> (1)..(21)
<400> 69
Val Asp Tyr Glu Ser Val Pro Asp Ala Ser His Met Met His Gln Ser
1 5 10 15
Ala Pro Ala Arg Tyr

Claims (19)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Полипептид, способный расщеплять зеараленон и по меньшей мере одно производное соединение зеараленона, представляющий собой гидролазу с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 1 или ее функциональный вариант, причем последовательность функционального варианта идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 по меньшей мере на 84%.
  2. 2. Полипептид по п.1, содержащий по меньшей мере один консервативный участок или его функциональный вариант, причем аминокислотная последовательность варианта идентична по меньшей мере на 84%, более предпочтительно по меньшей мере на 92% и наиболее предпочтительно по меньшей мере на 98% и по меньшей мере один консервативный участок аминокислотной последовательности выбран из группы: от +24 до +50, от +52 до +77, от +79 до +87, от +89 до +145, от +150 до +171, от +177 до +193, от +223 до +228, от +230 до +237, от +239 до +247, от +249 до +255, от +257 до +261, от +263 до +270, от +272 до +279, от + 297 до +301, от +303 до +313, от +24 до 328, от +1 до +328 последовательности SEQ ID NO: 1.
  3. 3. Полипептид по п.1 или 2, отличающийся тем, что функциональный вариант характеризуется модификацией аминокислот, выбранной из замен, делеций и инсерций соответственно одной или нескольких аминокислот.
  4. 4. Полипептид по любому из пп.1, 2 или 3, отличающийся тем, что имеет удельную активность, равную по меньшей мере 0,01 ед./мг, преимущественно по меньшей мере 0,1 ед./мг и предпочтительно по меньшей мере 1 ед./мг, и/или имеет константу KM гидролитического расщепления зеараленона, равную не более 50 мкМ, преимущественно не более 3,5 мкМ и предпочтительно не более 0,5 мкМ, и/или имеет константу kcat гидролитического расщепления зеараленона, равную по меньшей мере 0,05 с-1, преимущественно по меньшей мере 0,6 с-1 и предпочтительно по меньшей мере 5 с-1, и/или имеет константу vmax гидролитического расщепления зеараленона, равную по меньшей мере 0,00001 мкМ-1ю-1, преимущественно по меньшей мере 0,0001 мкМ-1ю-1 и предпочтительно по меньшей мере 0,001 мкМ'1-с’1.
    - 75 032685
  5. 5. Полипептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что обладает наиболее высокой ферментативной активностью в температурном интервале от 30 до 75°C, предпочтительно от 38 до 55°C и особенно предпочтительно от 38 до 52°C.
  6. 6. Полипептид по любому из пп.1-4, отличающийся тем, что является термически стабильным до температуры 90°C, предпочтительно 75°C и особенно предпочтительно 60°C.
  7. 7. Полипептид по любому из пп.1-6, отличающийся тем, что имеет по меньшей мере одну мутацию в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 по меньшей мере в одной из позиций, выбранных из 22, 23, 25, 26, 27, 29, 31, 32, 35, 37, 42, 43, 46, 51, 53, 54, 57, 60, 69, 72, 73, 78, 80, 84, 88, 95, 97, 99, 114,
    118, 119, 123, 132, 141, 146, 148, 149, 154, 163, 164, 165, 169, 170, 172, 176, 180, 182, 183, 190, 191, 194,
    196, 197, 198, 201, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 212, 213, 214, 216, 217, 220, 221, 222, 229, 231, 233,
    238, 240, 244, 245, 246, 248, 249, 251, 254, 256, 260, 262, 263, 266, 269, 271, 277, 280, 281, 282, 283, 284,
    285, 286, 287, 292, 296, 298, 302, 307, 308, 309, 311, 314, 317, 319, 321, 323, 325 и 326.
  8. 8. Полипептид по п.7, отличающийся тем, что он имеет по меньшей мере одну мутацию в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, выбранную из D22A, S23Q, S23L, N25D, I26V, F27Y, F27H, S29P, R31A, F32Y, R35K, R35Q, V37A, V42I, V43T, F46Y, S51E, S51D, D53G, N54M, N54R, L57V, L60I, S69G, Р72Е, V73A, A78S, N80H, F84Y, I88L, T95S, T97A, R99K, I114M, I118V, K119R, V123I, L132V, A141S, I146V, I146L, A148G, A149V, A154P, P163T, A164T, Y165C, Y165H, V169I, L170R, A172G, A176M, A176V, Y180F, D182T, F183Y, I190V, G191S, K194T, K194E, F196Y, V197C, V197R, E198R, E198S, K201D, K201G, P204S, P204A, A205S, K206P, A207M, M208A, Q209R, L210A, L210S, AP212, T213V, P214A, E216T, E216G, A217I, N220H, L221M, K222R, K222Q, G229A, A231V, F233W, F233Y, F233H, A238G, H240N, H240S, D244E, R245Q, M246L, S248T, S248N, S248G, Q249R, K251N, I254V, I256L, A260M, T262D, T262G, I263T, E266D, E269H, E269N, L271V, L277E, E280A, E280L, H281R, H281Q, A282V, Q283R, D284L, D284R, I285L, I286M, R287E, R287D, R292K, R292T, Q296A, Q296E, H298V, L302S, L307Q, F308S, D309A, A311P, A314V, L317F, S319Q, S319P, S319R, S321A, S321T, T323A, P325A и A326P.
  9. 9. Полипептид по любому из пп.1-7, отличающийся тем, что он содержит по меньшей мере один из аминокислотных мотивов, выбранных из группы последовательностей SEQ ID NO: 32-69.
  10. 10. Полипептид по п.8, отличающийся тем, что полипептид содержит по меньшей мере одну консервативную замену аминокислоты по меньшей мере в одной позиции, причем указанная замена аминокислоты выбрана из замен G на A или A на G, S, или V на I, L, A, T, S, или I на V, L, M, или L на I, M, V, или M на L, I, V, или P на A, S, N, или F на Y, W, H, или Y на F, W, H, или W на Y, F, H, или R на K, E, D, или K на R, E, D, или H на Q, N, S, или D на N, E, K, R, Q, или E на Q, D, K, R, N, или S на T, A, или T на S, V, A, или C на S, T, A, или N на D, Q, H, S, или Q на E, N, H, K, R.
  11. 11. Добавка к кормам для свиней, домашней птицы или аквакультуры, к пищевым продуктам или к высушенной барде, способная гидролитически расщеплять зеараленон или по меньшей мере одно его производное, где добавка содержит по меньшей мере один полипептид по любому из пп.1-10 и вспомогательное вещество, включающее инертный носитель.
  12. 12. Добавка по п.11, отличающаяся тем, что вспомогательное вещество выбрано по меньшей мере из одного инертного носителя, а также при необходимости из других компонентов, таких как витамины, и/или минеральные вещества, и/или ферменты, и/или другие компоненты для детоксификации микотоксинов.
  13. 13. Добавка по п.11 или 12, отличающаяся тем, что содержит указанный полипептид по любому из пп.1-10 в концентрации не более 10000 ед./г, предпочтительно не более 1000 ед./г, более предпочтительно не более 100 ед./г и наиболее предпочтительно не более 10 ед./г.
  14. 14. Добавка по любому из пп.11-13, отличающаяся тем, что добавка находится в капсулированной или покрытой форме.
  15. 15. Применение добавки по любому из пп.11-14 для гидролитического расщепления зеараленона или по меньшей мере одного его производного в кормах, предпочтительно кормах для свиней, домашней птицы и аквакультуры, в пищевых продуктах или в высушенной барде.
  16. 16. Способ гидролитического расщепления зеараленона или по меньшей мере одного его производного, обеспечения контакта с полипептидом по любому из пп.1-10 и гидролитическое расщепление зеараленона или его производного.
  17. 17. Способ по п.16, отличающийся тем, что полипептид входит в состав добавки по любому из пп.11-14.
  18. 18. Способ по п.17, отличающийся тем, что полипептид или добавку добавляют к корму или пищевому продукту, загрязненному зеараленоном или по меньшей мере одним его производным.
  19. 19. Способ по любому из пп.16-18, отличающийся тем, что гидролизуется по меньшей мере 70%, преимущественно по меньшей мере 80% и предпочтительно по меньшей мере 90% зеараленона или по меньшей мере одного его производного.
EA201690471A 2013-08-28 2014-08-27 Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных соединений зеараленона, полинуклеотид, выделенный из него, а также содержащая полипептид добавка, его применение, а также способ EA032685B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ATA667/2013A AT514775B1 (de) 2013-08-28 2013-08-28 Polypeptid zur hydrolytischen Spaltung von Zearalenon und/oder Zearalenon Derivaten, isoliertes Polynukleotid davon sowie Zusatzstoff enthaltend das Polypeptid
PCT/AT2014/000164 WO2015027258A2 (de) 2013-08-28 2014-08-27 Polypeptid zur hydrolytischen spaltung von zearalenon und/oder zearalenon-derivaten, isoliertes polynukleotid davon sowie einen zusatzstoff enthaltendes polypeptid, verwendung desselben sowie verfahren

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201690471A1 EA201690471A1 (ru) 2016-06-30
EA032685B1 true EA032685B1 (ru) 2019-07-31

Family

ID=51662974

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201891967A EA037776B1 (ru) 2013-08-28 2014-08-27 Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных соединений зеараленона, полинуклеотид, выделенный из него, а также содержащая полипептид добавка, его применение, а также способ
EA201690471A EA032685B1 (ru) 2013-08-28 2014-08-27 Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных соединений зеараленона, полинуклеотид, выделенный из него, а также содержащая полипептид добавка, его применение, а также способ

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201891967A EA037776B1 (ru) 2013-08-28 2014-08-27 Полипептид для гидролитического расщепления зеараленона и/или производных соединений зеараленона, полинуклеотид, выделенный из него, а также содержащая полипептид добавка, его применение, а также способ

Country Status (29)

Country Link
US (7) US10149489B2 (ru)
EP (8) EP3498830B1 (ru)
JP (3) JP6526671B2 (ru)
KR (2) KR102215533B1 (ru)
CN (6) CN110499304A (ru)
AT (1) AT514775B1 (ru)
AU (2) AU2014311244B2 (ru)
BR (2) BR112016004340B1 (ru)
CA (1) CA2922178C (ru)
CL (2) CL2016000464A1 (ru)
CR (2) CR20200234A (ru)
DK (7) DK3495474T3 (ru)
DO (1) DOP2016000051A (ru)
EA (2) EA037776B1 (ru)
EC (1) ECSP16012693A (ru)
ES (7) ES2675026T3 (ru)
HK (1) HK1226101A1 (ru)
HU (2) HUE038188T2 (ru)
IL (1) IL244144B (ru)
MX (1) MX371487B (ru)
MY (1) MY171604A (ru)
NI (1) NI201600028A (ru)
PE (2) PE20220389A1 (ru)
PH (1) PH12016500377A1 (ru)
PL (2) PL3495473T3 (ru)
PT (2) PT3039135T (ru)
SG (2) SG11201601355XA (ru)
UA (1) UA118681C2 (ru)
WO (2) WO2015027259A2 (ru)

Families Citing this family (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AT514775B1 (de) * 2013-08-28 2017-11-15 Erber Ag Polypeptid zur hydrolytischen Spaltung von Zearalenon und/oder Zearalenon Derivaten, isoliertes Polynukleotid davon sowie Zusatzstoff enthaltend das Polypeptid
AT516457B1 (de) * 2014-11-07 2017-03-15 Erber Ag Polypeptid zur enzymatischen Detoxifizierung von Zearalenon, sowie isoliertes Polynukleotid, sowie Zusatzstoff, Verwendung und Verfahren desselben
CN104788543B (zh) * 2015-04-13 2018-03-02 南昌大学 一种基于多肽的玉米赤霉烯酮抗体模拟物及其应用
CN104804070B (zh) * 2015-04-13 2018-03-02 南昌大学 可特异性结合玉米赤霉烯酮的多肽分子及其应用
PE20181026A1 (es) 2015-08-03 2018-06-27 Monsanto Technology Llc Metodos y composiciones para tolerancia a los herbicidas en plantas
US10378023B2 (en) 2015-09-01 2019-08-13 Monsanto Technology Llc Methods and compositions for herbicide tolerance in plants
EP3490366A4 (en) 2016-07-29 2020-04-22 Monsanto Technology LLC METHOD AND COMPOSITIONS FOR GENE EXPRESSION IN PLANTS
CN108251399B (zh) * 2016-12-29 2020-08-21 中粮营养健康研究院有限公司 伏马毒素降解酶、编码基因、重组载体、细胞、添加剂及其应用
BR112020002029A2 (pt) 2017-07-31 2020-10-06 Poet Research, Inc. remediação de toxinas em correntes de processo de biorrefinaria
CN109825484B (zh) * 2017-11-23 2022-06-28 吉林中粮生化有限公司 玉米赤霉烯酮水解酶zhd101突变体及利用该突变体水解玉米赤霉烯酮的方法
LU100899B1 (en) * 2018-07-31 2020-02-03 Erber Ag Means and methods for cleavage of zearalenone
CN110777128A (zh) * 2018-07-31 2020-02-11 奥地利商艾尔柏有限公司 用于裂解玉米赤霉烯酮的手段和方法
MX2021001168A (es) * 2018-07-31 2021-04-19 Erber Ag Medios y metodos para el clivaje de la zearalenona.
CN110029095B (zh) * 2019-04-15 2022-06-07 南京工业大学 一种玉米赤霉烯酮降解酶及其应用
CN110592046B (zh) * 2019-09-30 2022-03-15 湖北大学 玉米赤霉烯酮降解酶在水解玉米赤霉烯酮及其衍生物中的应用
CN110819608B (zh) * 2019-10-29 2022-03-15 湖北大学 一种玉米赤霉烯酮及其衍生物的水解方法
US20210403841A1 (en) * 2020-03-12 2021-12-30 Poet Research, Inc. Enzymatic degradation of mycotoxins during grain processing
MX2023003959A (es) * 2020-10-08 2023-05-25 DSM Austria GmbH Variantes de hidrolasa alfa/beta tetramerica con estabilidad a la temperatura incrementada y metodos de uso y produccion de las mismas.
CN112760300B (zh) * 2021-01-29 2022-08-30 潍坊康地恩生物科技有限公司 一种黄曲霉毒素降解酶突变体及其生产菌株
CN114774386B (zh) * 2022-03-11 2024-02-02 暨南大学 一种对胃蛋白酶抗性提高的玉米赤霉烯酮水解酶
CN114774385B (zh) * 2022-03-11 2024-02-02 暨南大学 一种对胰蛋白酶和胃蛋白酶抗性提高的玉米赤霉烯酮水解酶

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003053161A1 (de) * 2001-12-20 2003-07-03 Erber Aktiengesellschaft Mikroorganismus zur biologischen entgiftung von mykotoxinen, nämlich ochratoxinen und/oder zearalenonen, sowie verfahren und verwendung hiefür
WO2012113827A1 (en) * 2011-02-24 2012-08-30 Eucodis Bioscience Gmbh Feed processing enzymes

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK13491D0 (da) 1991-01-25 1991-01-25 Novo Nordisk As Anvendelse af et enzymholdigt granulat og fremgangsmaade til fremstilling af et forderstof i tabletform
US5846812A (en) * 1996-11-22 1998-12-08 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Zearalenone detoxification compositions and methods
JP2002536005A (ja) * 1999-02-10 2002-10-29 デーエスエム・ナムローゼ・フェンノートシャップ 飼料酵素含有粒状物
AR028977A1 (es) * 2000-07-13 2003-05-28 Syngenta Participations Ag Genes de lipoxigenasa, promotores, peptidos de transito y proteinas de los mismos
US6812380B2 (en) * 2001-03-27 2004-11-02 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods of zearalenone detoxification
WO2002099142A2 (de) * 2001-06-01 2002-12-12 Wilhelm Holzapfel Actinomyceten zum abbau von aflatoxin b1, ochratoxin a und/oder zearalenon
JP2004000130A (ja) * 2002-03-25 2004-01-08 Inst Of Physical & Chemical Res ゼアラレノン解毒酵素遺伝子及び該遺伝子を導入した形質転換体
US20060008888A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-12 Kragh Karsten M Polypeptide
KR101280811B1 (ko) 2010-11-15 2013-07-02 (주)진바이오텍 제아라레논 분해 활성을 갖는 미생물, 이를 이용한 제아라레논 분해 방법 및 사료첨가제
CN102199581B (zh) * 2011-03-31 2013-02-06 国家粮食局科学研究院 一种玉米赤霉烯酮毒素降解酶及其编码基因与应用
AT514775B1 (de) * 2013-08-28 2017-11-15 Erber Ag Polypeptid zur hydrolytischen Spaltung von Zearalenon und/oder Zearalenon Derivaten, isoliertes Polynukleotid davon sowie Zusatzstoff enthaltend das Polypeptid

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003053161A1 (de) * 2001-12-20 2003-07-03 Erber Aktiengesellschaft Mikroorganismus zur biologischen entgiftung von mykotoxinen, nämlich ochratoxinen und/oder zearalenonen, sowie verfahren und verwendung hiefür
WO2012113827A1 (en) * 2011-02-24 2012-08-30 Eucodis Bioscience Gmbh Feed processing enzymes

Non-Patent Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
"Cellulose Solvents: For Analysis, Shaping and Chemical Modification", vol. 1031, 26 February 2010, AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Washington, DC, ISBN: 9780841200074, ISSN: 00976156, article I. RODRIGUES, E. M. BINDER, G. SCHATZMAYR: "Microorganisms and their enzymes for detoxifying mycotoxins posing a risk to livestock animals", pages: 107 - 117, XP055103712, DOI: 10.1021/bk-2009-1031.ch008 *
DATABASE UniProt [online] "SubName: Full=Alpha/beta hydrolase {ECO:0000313|EMBL:EME22619.1};", XP002734871, retrieved from EBI *
DATABASE UniProt [online] "SubName: Full=Alpha/beta hydrolase fold containing protein {ECO:0000313|EMBL:AEM80235.1};", XP002732830, retrieved from EBI *
DATABASE UniProt [online] "SubName: Full=Hydrolase {ECO:0000313|EMBL:AHH94730.1};", XP002732829, retrieved from EBI *
DATABASE UniProt [online] "SubName: Full=Hydrolase {ECO:0000313|EMBL:EHN79176.1};", XP002734870, retrieved from EBI *
DATABASE UniProt [online] "SubName: Full=Uncharacterized protein {ECO:0000313|EMBL:ACU38472.1}; Flags: Precursor;", XP002734872, retrieved from EBI *
TAKAHASHI-ANDO N. ET AL.: "A novel lactonohydrolase responsible for the detoxification of zearalenone: enzyme purification and gene cloning", BIOCHEMICAL JOURNAL, PUBLISHED BY PORTLAND PRESS ON BEHALF OF THE BIOCHEMICAL SOCIETY., vol. 365, 1 July 2002 (2002-07-01), pages 1 - 6, XP002967677, ISSN: 0264-6021, DOI: 10.1042/BJ20020450 *
YUANSHAN YU; LIPING QIU; HUI WU; YUQIAN TANG; FURAO LAI; YIGANG YU: "Oxidation of zearalenone by extracellular enzymes fromSM04 into smaller estrogenic products", WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, KLUWER ACADEMIC PUBLISHERS, DO, vol. 27, no. 11, 26 April 2011 (2011-04-26), Do, pages 2675 - 2681, XP019959940, ISSN: 1573-0972, DOI: 10.1007/s11274-011-0741-3 *

Also Published As

Publication number Publication date
US10076125B2 (en) 2018-09-18
CR20160128A (es) 2016-08-03
AU2014311244A1 (en) 2016-03-17
BR122020001707B1 (pt) 2023-03-07
AT514775A1 (de) 2015-03-15
US11998027B2 (en) 2024-06-04
BR112016004340B1 (pt) 2023-02-07
SG11201601355XA (en) 2016-03-30
US11910807B2 (en) 2024-02-27
CN110527674A (zh) 2019-12-03
ES2843788T3 (es) 2021-07-20
NI201600028A (es) 2016-05-06
EP3495477A1 (de) 2019-06-12
US10149489B2 (en) 2018-12-11
EP3495476A1 (de) 2019-06-12
IL244144A0 (en) 2016-04-21
ECSP16012693A (es) 2018-09-30
ES2837422T3 (es) 2021-06-30
EP3039135B1 (de) 2018-04-04
EA037776B1 (ru) 2021-05-20
CN110499304A (zh) 2019-11-26
AU2020203904B2 (en) 2021-10-28
MX2016002636A (es) 2017-10-11
HUE052623T2 (hu) 2021-05-28
ES2840305T3 (es) 2021-07-06
US20160319258A1 (en) 2016-11-03
PT3495473T (pt) 2021-01-05
US20200375218A1 (en) 2020-12-03
KR20160044040A (ko) 2016-04-22
DK3495473T3 (da) 2021-01-04
DK3495476T3 (da) 2021-01-18
DOP2016000051A (es) 2016-06-15
EP3495473A1 (de) 2019-06-12
MY171604A (en) 2019-10-21
KR20200015842A (ko) 2020-02-12
JP2019088287A (ja) 2019-06-13
PE20160243A1 (es) 2016-05-10
WO2015027258A2 (de) 2015-03-05
PT3039135T (pt) 2018-07-09
ES2675026T3 (es) 2018-07-05
EP3498830B1 (de) 2020-10-07
DK3495477T3 (da) 2021-01-18
CN110499303A (zh) 2019-11-26
ES2840303T3 (es) 2021-07-06
EP3495473B1 (de) 2020-10-07
EP3495475B1 (de) 2020-09-30
CN106085983A (zh) 2016-11-09
CN105705637A (zh) 2016-06-22
EP3039135A2 (de) 2016-07-06
EP3495477B1 (de) 2020-10-14
PH12016500377A1 (en) 2016-05-02
CA2922178C (en) 2022-08-30
MX371487B (es) 2020-01-29
EP3039134B1 (de) 2019-03-06
JP2020127407A (ja) 2020-08-27
JP6526671B2 (ja) 2019-06-05
HUE038188T2 (hu) 2018-09-28
CL2016000464A1 (es) 2016-10-14
WO2015027259A2 (de) 2015-03-05
ES2840306T3 (es) 2021-07-06
EP3498830A1 (de) 2019-06-19
US10779556B2 (en) 2020-09-22
JP7138674B2 (ja) 2022-09-16
US11998028B2 (en) 2024-06-04
CA2922178A1 (en) 2015-03-05
DK3498830T3 (da) 2021-01-11
UA118681C2 (uk) 2019-02-25
EP3495474A1 (de) 2019-06-12
EP3495475A1 (de) 2019-06-12
WO2015027259A3 (de) 2015-04-23
EP3495474B1 (de) 2020-09-30
NZ717021A (en) 2022-03-25
JP2016528901A (ja) 2016-09-23
US20160345606A1 (en) 2016-12-01
AT514775B1 (de) 2017-11-15
US20220202045A1 (en) 2022-06-30
WO2015027258A3 (de) 2015-04-30
SG10201900355RA (en) 2019-02-27
KR102215533B1 (ko) 2021-02-15
AU2014311244B2 (en) 2020-07-02
US11324235B2 (en) 2022-05-10
BR112016004340A2 (pt) 2017-10-24
PE20220389A1 (es) 2022-03-18
EP3039134A2 (de) 2016-07-06
CN110527676A (zh) 2019-12-03
EP3495476B1 (de) 2020-10-14
ES2843204T3 (es) 2021-07-16
US20190124948A1 (en) 2019-05-02
EA201891967A1 (ru) 2019-02-28
CN110527675A (zh) 2019-12-03
DK3495474T3 (da) 2021-01-04
US20220287328A1 (en) 2022-09-15
CR20200234A (es) 2020-08-22
IL244144B (en) 2020-04-30
DK3039135T3 (en) 2018-07-16
HK1226101A1 (zh) 2017-09-22
KR102075752B1 (ko) 2020-02-10
AU2020203904A1 (en) 2020-07-02
CL2019001365A1 (es) 2019-08-16
PL3495473T3 (pl) 2021-05-04
PL3039135T3 (pl) 2018-10-31
EA201690471A1 (ru) 2016-06-30
DK3495475T3 (da) 2021-01-04
US20220322701A1 (en) 2022-10-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11998027B2 (en) Polypeptide for hydrolytic cleavage of zearalenone and/or zearalenone derivatives, isolated polynucleotide thereof as well as a polypeptide containing an additive, use of same as well as a process
RU2720517C2 (ru) Варианты полипептидов, расщепляющих фузариотоксины, содержащая их добавка, их применение и способ расщепления фузариотоксинов
CN106085983B (zh) 多肽,分离的其多核苷酸,以及包含多肽的添加剂、其用途及方法
NZ717021B2 (en) Polypeptide for hydrolytic cleavage of zearalenone and/or zearalenone derivatives, isolated polynucleotide thereof as well as a polypeptide containing an additive, use of same as well as a process

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ KG TJ TM