DE10019058A1 - Detektion von Variationen des DNA-Methylierungsprofils - Google Patents

Detektion von Variationen des DNA-Methylierungsprofils

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DE10019058A1
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Abstract

Die Erfindung beschreibt einen Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, die Verwendung derselben zum Nachweis von Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung, eine medizinische Vorrichtung, welche einen Satz von Oligonukleotiden verwendet, ein Verfahren zur Untersuchung des Methylierungszustandes eines Individuums sowie ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung der Eintrittswahrscheinlichkeit einer gesundheitlichen Beeinträchtigung eines Individuums. DOLLAR A Derartige Erkrankungen können sein: DOLLAR A - unerwünschte Arzneimittelwirkungen DOLLAR A - Krebserkrankungen DOLLAR A - CNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheit DOLLAR A - aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen DOLLAR A - klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen DOLLAR A - psychische Störungen und Persönlichkeitsstörungen DOLLAR A - Demenz und/oder assoziierte Syndrome DOLLAR A - kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung DOLLAR A - Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes DOLLAR A - Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems DOLLAR A - Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz DOLLAR A - Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess DOLLAR A - Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen...

Description

Die Erfindung betrifft einen Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, die Verwendung derselben zum Nachweis von Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung, eine medizinische Vorrichtung, welche einen Satz von Oligonukleotiden verwendet, ein Verfahren zur Untersuchung des Methylierungszustandes eines Individuums sowie ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung der Eintrittswahrscheinlichkeit einer gesundheitlichen Beeinträchtigung eines Individuums.
Die nach den methodischen Entwicklungen der letzten Jahre in der Molekularbiologie gut studierten Beobachtungsebenen sind die Gene selbst, die Übersetzung dieser Gene in RNA und die daraus entstehenden Proteine. Wann im Laufe der Entwicklung eines Individuums welches Gen angeschaltet wird und wie Aktivieren und Inhibieren bestimmter Gene in bestimmten Zellen und Geweben gesteuert wird, ist mit Ausmaß und Charakter der Methylierung der Gene bzw. des Genoms korrelierbar. Insofern korrelieren pathogene Zustände mit einem veränderten Methylierungsmuster einzelner Gene oder des Genoms. Die vorliegende Erfindung beschreibt Sätze von Oligomeren und Verfahren zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, die mit nachteiligen Ereignissen für Patienten/Individuen oder aber bestimmten Krankheiten in Zusammenhang stehen.
5-Methylcytosin ist die häufigste kovalent modifizierte Base in der DNA eukaryotischer Zellen. Sie spielt beispielsweise eine Rolle in der Regulation der Transkription, beim genetischen Imprinting und in der Tumorgenese. Die Identifizierung von 5-Methylcytosin als Bestandteil genetischer Information ist daher von erheblichem Interesse. 5- Methylcytosin-Positionen können jedoch nicht durch Sequenzierung identifiziert werden, da 5-Methylcytosin das gleiche Basenpaarungsverhalten aufweist wie Cytosin. Darüber hinaus geht bei einer PCR-Amplifikation die epigenetische Information, welche die 5- Methylcytosine tragen, vollständig verloren.
Eine relativ neue und die mittlerweile am häufigsten angewandte Methode zur Untersuchung von DNA auf 5-Methylcytosin beruht auf der spezifischen Reaktion von Bisulfit mit Cytosin, das nach anschließender alkalischer Hydrolyse in Uracil umgewandelt wird, welches in seinem Basenpaarungsverhalten dem Thymidin entspricht. 5-Methylcytosin wird dagegen unter diesen Bedingungen nicht modifiziert. Damit wird die ursprüngliche DNA so umgewandelt, dass Methylcytosin, welches ursprünglich durch sein Hybridisierungsverhalten vom Cytosin nicht unterschieden werden kann, jetzt durch "normale" molekularbiologische Techniken als einzig verbliebenes Cytosin beispielsweise durch Amplifikation und Hybridisierung oder Sequenzierung nachgewiesen werden kann. Der Stand der Technik, was die Empfindlichkeit betrifft, wird durch ein Verfahren definiert, welches die zu untersuchende DNA in einer Agarose-Matrix einschließt, dadurch die Diffusion und Renaturierung der DNA (Bisulfit reagiert nur an einzelsträngiger DNA) verhindert und alle Fällungs- und Reinigungsschritte durch schnelle Dialyse ersetzt (Olek, A. et al., Nucl. Acids. Res. 1996, 24, 5064-5066). Mit dieser Methode können einzelne Zellen untersucht werden, was das Potential der Methode veranschaulicht. Allerdings werden bisher nur einzelne Regionen bis etwa 3000 Basenpaare Länge untersucht, eine globale Untersuchung von Zellen auf Tausenden von möglichen Methylierungsanalysen ist nicht möglich. Allerdings kann auch dieses Verfahren keine sehr kleinen Fragmente aus geringen Probenmengen zuverlässig analysieren. Diese gehen trotz Diffusionsschutz durch die Matrix verloren.
Eine Übersicht über die weiteren bekannten Möglichkeiten, 5-Methylcytosine nachzuweisen, kann aus dem folgenden Übersichtsartikel entnommen werden: Rein, T., DePamphilis, M. L., Zorbas, H., Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2255.
Die Bisulfit-Technik wird bisher bis auf wenige Ausnahmen (z. B. Zechnigk, M. et al., Eur. J. Hum. Gen. 1997, 5, 94-98) nur in der Forschung angewendet. Immer aber werden kurze, spezifische Stücke eines bekannten Gens nach einer Bisulfit-Behandlung amplifziert und entweder komplett sequenziert (Olek, A. und Walter, J., Nat. Genet. 1997, 17, 275-276) oder einzelne Cytosin-Positionen durch eine "Primer-Extension-Reaktion" (Gonzalgo, M. L. und Jones, P. A., Nucl. Acids Res. 1997, 25, 2529-2531, WO-Patent 9500669) oder einen Enzymschnitt (Xiong, Z. und Laird, P. W., Nucl. Acids. Res. 1997, 25, 2532-2534) nachgewiesen. Zudem ist auch der Nachweis durch Hybridisierung beschrieben worden (Olek et al., WO 99 28498).
Weitere Publikationen, die sich mit der Anwendung der Bisulfit-Technik zum Methylierungsnachweis bei einzelnen Genen befassen, sind: Xiong, Z. und Laird, P. W. (1997), Nucl. Acids Res. 25, 2532; Gonzalgo, M. L. und Jones, P. A. (1997), Nucl. Acids Res. 25, 2529; Grigg, S. und Clark, S. (1994), Bioassays 16, 431; Zeschnik, M. et al. (1997), Human Molecular Genetics 6, 387, Teil, R. et al. (1994), Nucl. Acids Res. 22, 695; Martin, V. et al. (1995), Gene 157, 261; WO 97 46705, WO 95 15373 und WO 45560.
Eine Übersicht über den Stand der Technik in der Oligomer Array Herstellung läßt sich aus einer im Januar 1999 erschienenen Sonderausgabe von Nature Genetics (Nature Genetics Supplement, Volume 21, January 1999), der dort zitierten Literatur und dem US- Patent 5994065 über Methoden zur Herstellung von festen Trägern für Zielmoleküle wie Oligonukleotide bei vermindertem nichtspezifischem Hintergrundsignal entnehmen. Für die Abtastung eines immobilisierten DNA-Arrays sind vielfach fluoreszent markierte Sonden verwendet worden. Die Detektion der Fluoreszenz der hybridisierten Sonden erfolgt beispielsweise über eine Konfokaloptik.
Neuere Verfahren zum Nachweis von Mutationen, die prinzipiell nach der Bisulphit- Behandlung der DNA-Probe mit einigen Modifikationen auch zur Methylierungsanalyse eingesetzt werden können, sind im folgenden aufgeführt:
Als ein Spezialfall der Sequenzierung ist die Einzelbasen-Primer-Ermreiterung (Genetic Bit Analysis) erwähnenswert (Head, SR., Rogers, YH., Parikh K., Lan, G., Anderson, S., Goelet, P., Boycejacino MT., Nucleic Acids Research. 25(24): 5065-5071, 1997; Picoult- Newberg, L., Genome Res. 9(2): 167-174, 1999). Eine kombinierte Amplifikation und Sequenzierung wird in US-Patent 5928906 beschrieben, wo eine basenspezifische Terminierung auf Matrixmolekülen eingesetzt wird. Ein weiteres Verfahren setzt eine Ligase/Polymerasereaktion für die Identifikation von Nukleotiden ein (US-Patent 5952174).
Genomische DNA wird durch Standardmethoden aus DNA von Zell-, Gewebe- oder sonstigen Versuchsproben gewonnen. Diese Standardmethodik findet sich in Referenzen wie Fritsch und Maniatis eds., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 1989.
Gegenwärtig ist es nicht Stand der Technik, grosse Mengen von Proben hinsichtlich einer Vielzahl von für Krankheiten bedeutsamen Methylierungspositionen zu untersuchen.
Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es, Sätze von Oligomersonden, welche an Gene binden, die für nachteilige Ereignisse für Patienten oder bestimmte Krankheitsgruppen von Bedeutung sind, so zusammenzustellen, dass umfassende prognostische Aussagen für den jeweiligen Patienten durch Analyse des jeweiligen Methylierungszustandes dieser Gene möglich werden. Die dabei erfassten Daten werden zu Methylierungsmustern zusammengefasst. Des weiteren soll ein Verfahren geschaffen werden, welches die Analyse von Methylierungspositionen in grossem Umfang unter Verwendung der erwähnten Oligomersonden ermöglicht.
Die Aufgabe wird erfindungsgemäß durch einen Satz von Nukleotidsonden und ein Verfahren zur Untersuchung des Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums. Mit Hilfe des Satzes von Oligonukleotidsonden und/oder des Verfahrens wird das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe der Gene nachgewiesen. Aus dem Methylierungsmuster ergibt sich durch Abgleich mit Methylierungsmustern in einer Datenbank, welche bereits bestimmten Phänotypen, Prognosen oder Effekten auf den Patienten zugeordnet sind, eine Diagnose.
Diese Aufgabe wird erfindungsgemäß durch einen Satz von Nukleotidsonden gemäss einem oder mehrerer der Ansprüche gelöst. Weiterhin kann zur Lösung der Aufgabe ein Verfahren oder eine Vorrichtung genutzt werden, welche einen Satz der erwähnten Nukleotidsonden enthält. Vorteilhafte Ausführungen der Erfindung sind in den jeweiligen Unteransprüchen gekennzeichnet.
Der erfindungsgemässe Satz von Oligonukleotidsonden oder eine Vorrichtung welche diesen enthält dient vorzugsweise zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Konsequenzen von folgenden nachteiligen Ereignissen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von folgenden nachteiligen Ereignissen besteht:
unerwünschte Arzneimittelwirkungen
Krebserkrankungen
CNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheit
aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen
klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen
psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen
Demenz und/oder assoziierte Syndrome
kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems
Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen
endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit
Kopfschmerzen oder
sexuelle Fehlfunktion.
Diese Aufzählung ist nicht abschliessend und dem Fachmann ist klar, dass mittels der erfinderischen Idee jede Erkrankung oder Fehlfunktion eines Organismus oder Individuums anwendbar ist.
Die Oligomersonden umfassen Sequenzen, welche an die Gene binden, die mit diesen nachteiligen Ereignissen in Zusammenhang stehen. Die Oligomersonden binden an die Sequenzen, wie sie nach einer Behandlung der DNA-Probe vorliegen, welche nicht methyliertes Cytosin in Uracil umwandelt. Die Gene sind in den Ansprüchen detailliert aufgeführt. Erfindungsgemäss gehören diese Gene zu mindestens einer der folgenden Proteinfunktionen: Enzyme, Transport, Lagerung, Struktur, Immunität, nervale Transmission, Wachstum und Differenzierung.
In folgenden wird das Verfahren beschrieben, dass für eine Bewertung, ob bei einem Patienten, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe nachteilige Ereignisse eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, den Satz der Oligomersonden verwendet. Im ersten Schritt entnimmt man eine DNA-Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen ein nachteiliges Ereignis diagnostiziert wurde bzw. in der Kontrollgruppe nicht diagnostiziert wurde. Die mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits vorbehandelten DNA-Proben werden im zweiten Schritt des Verfahrens zum Nachweis von relevanten Genvarianten hinsichtlich der DNA- Methylierung mit einen Satz von Oligonukleotiden als Sonden hybridisiert, die innerhalb der jeweiligen Zielgruppe von Genen an nach der Bisulfitbehandlung vorliegende Sequenzen binden, in denen eine Cytosin Methylierung potentiell vorliegen kann. Es ergibt ein Hybridisierungsmuster, welches im dritten Schritt des Verfahrens in ein Methylierungsmuster der Gene der jeweiligen DNA-Probe übersetzt wird.
Gleichermassen würde man vorgehen, wollte man ein Modell zur Bewertung von Risiken für Patienten oder Patientengruppen erarbeiten.
Erfindungsgemäss gehören diese Gene zu mindestens einer der folgenden Proteinfunktionen: Enzyme, Transport, Lagerung, Struktur, Immunität, nervale Transmission, Wachstum und Differenzierung. Die besagten Gene stehen in Zusammenhang mit einer Vielzahl von nachteiligen Ereignissen, dazu gehören:
unerwünschte Arzneimittelwirkungen
Krebserkrankungen
ZNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheit
aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen
klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen
psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen
Demenz und/oder assoziierte Syndrome
kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems
Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen
endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit
Kopfschmerzen oder
sexuelle Fehlfunktion
Die Oligonukleotidsonden sind dadurch gekennzeichnet, dass sie zu DNA-Sequenzen der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung vorliegt, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorzugsweise eine Behandlung mit Natriumbisulfit.
Im letzten Schritt des Verfahrens wird die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster berechnet und die Häufigkeiten der Allele bei Patienten und Individuen mit nachteiligen Ereignissen und der entsprechenden Kontrollgruppe verglichen.
Bevorzugt wird mindestens einer der Schritte des Verfahrens mit einem Computer ausgeführt.
In einer bevorzugten Variante des Verfahrens wird das Methylierungsmuster eines Individuums wird mit den bereits in der Datenbank vorhandenen Einträgen oder einem daraus abgeleiteten Modelt verglichen, um daraus das Risiko des Eintritts von nachteiligen Ereignissen zu bewerten.
Der Satz von Oligonukleotiden besteht bevorzugt aus Oligonukleotiden, die an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind. Dieser Träger besteht aus Silizium, Glas, Polystrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold.
Zum Nachweis der Genvarianten hinsichtlich Methylierung und unterschiedlicher Genexpression wird bevorzugt eine medizintechnische Vorrichtung verwendet, welche den besagten Satz von Oligonukleotiden enthält.
In einer bevorzugten Variante des Verfahrens verwendet man einen besagten Oligonukleotidsatz oder eine Vorrichtung, die selbigen enthält, zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen oder nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention oder infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
In einer bevorzugten Variante des Verfahrens verwendet man einen besagten Oligonukleotidsatz oder eine Vorrichtung zur Vorhersage wahrscheinlicher Symptome bei Eintritt der oben aufgeführten nachteiligen Ereignisse und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
In einer weiteren bevorzugten Variante des Verfahrens verwendet man einen besagten Oligonukleotidsatz oder eine Vorrichtung für folgende Ziele:
Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien
Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsagemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen
Optimierung der therapeutischen Intervention
Weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Kit zur Durchführung eines Assays, mit dem man das Risiko eines Patienten oder Individuums einschätzen kann, nachteilige Ereignisse zu erfahren. Dieses Kit umfasst Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von relevanten Variationen hinsichtlich DNA-Methylierung der oben aufgeführten Gene in einer Probe von genomischer DNA. Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren sind ebenso enthalten, wie ein Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, unerwünschte Ereignisse zu erfahren.
Nachfolgend werden in den einzelnen Punkten 1 bis 400 die jeweils zu einem Krankheitsbild oder zu einer Störung des Wohlbefindens eines Individuums im Zusammenhang stehenden Gene erwähnt.
Erfindungsgemäß beansprucht sind daher Sätze von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, wobei die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen. Die jeweiligen Gene sind im Einzelnen aufgezählt, nämlich in Punkt 1 unerwünschte Arzneimittelwirkungen, in Punkt 26 Krebserkrankungen, in Punkt 51 ZNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheiten, in Punkt 76 aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen, in Punkt 101 klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen, in Punkt 126 Demenz und/oder assoziierte Syndrome, in Punkt 151 psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen, in Punkt 176 kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung, in Punkt 201 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes, in Punkt 226 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems, in Punkt 251 Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz, in Punkt 276 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess, in Punkt 301 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen, in Punkt 326 endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit, in Punkt 351 Kopfschmerzen oder in Punkt 376 sexuelle Fehlfunktion.
In den jeweils folgenden Unterpunkten sind die vorteilhaften Weiterbildungen der Sätze von Oligonukleotiden offenbart.
Ferner wird jeweils die erfindungsgemäße Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis der Genvarianten hinsichtlich der DNA- Methylierung offenbart.
Ferner wird eine erfindungsgemäße medizintechnische Vorrichtung offenbart, mit den in den jeweiligen Punkten angegebenen Merkmalen.
Ein erfindungsgemäßes Verfahren zur Untersuchung des DNA-Methylierungsprofils wird offenbart, ebenso die erfindungsgemäße Verwendung der Sätze der Oligonukleotide oder der medizintechnischen Vorrichtung zur Prognose oder Behandlung der jeweiligen Störung des Individuums.
Ferner wird eine erfindungsgemäßes Modell zur Bewertung der Eintrittswahrscheinlichkeit der jeweiligen Fehlfunktion oder Erkrankung offenbart.
1. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit unerwünschten Arzneimittelwirkungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
2. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
3. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
4. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukieotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
5. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 4, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
6. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 5, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
7. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 6, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
8. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 7, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
9. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 8, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
10. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
11. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
12. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
13. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
14. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von unerwünschten Arzneimittelwirkungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von unerwünschten Arzneimittelwirkungen besteht.
15. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß mindestens reinem der Punkte 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen von unerwünschten Arzneimittelwirkungen infolge einer therapeutischen Intervention.
16. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes der einer Vorrichtung gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken oder von unerwünschten Arzneimittelwirkungen infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
17. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher Symptome bei Eintritt von unerwünschten Arzneimittelwirkungen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
18. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
19. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
20. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
21. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe unerwünschte Arzneimittelwirkungen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine unerwünschte Arzneimittelwirkung diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von unerwünschte Arzneimittelwirkungen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Nebenwirkungen zu erhalten.
22. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts unerwünschter Arzneimittelwirkungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 21 erstellten Modell vergleicht.
23. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 13, 21 und 22, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
24. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 1, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
25. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums nachteilige Ereignisse zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 1 bis 6 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, unerwünschte Ereignisse zu erfahren.
26. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit dem Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs in Zusammenhang stehen, umfasst:
27. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 26, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
28. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 26, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
29. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 26, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
30. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 29, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
31. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 30, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
32. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 31, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
33. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 32, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
34. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 33, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
35. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
36. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten, als Indikation für ein höheres Risiko eines Patienten oder Individuums, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
37. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 enthält, zur Prognose und zum Management von Patienten, die an dem Risiko leiden, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
38. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
39. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an dem Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs leiden.
40. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
41. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
42. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
43. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
44. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Generierung eines Models, um das Risiko für Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen einzuschätzen, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
45. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
46. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sich das Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs entwickeln wird oder wahrscheinlich eintreten wird, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuuen, bei welchen Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Krebs ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs zu erhalten.
47. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 46 erstellten Modell vergleicht.
48. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 38, 46 und 47; wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
49. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 26, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
50. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 26 bis 32 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
51. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Symptomen und Konsequenzen von CNS- Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit in Zusammenhang stehen, umfasst:
52. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 51, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
53. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 51, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
54. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 51, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
55. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 54, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
56. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 55, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
57. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 56, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
58. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 57, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
59. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 58, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
60. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
61. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten, als Indikation für ein höheres Risiko der Entwicklung von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit oder für den Patienten oder das Individuum, Symptome und Konsequenzen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erfahren.
62. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung, ob ein Patient oder Individuum möglicherweise CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit entwickelt oder für den Patienten oder das Individuum die Wahrscheinlichkeit besteht, Symptome und Konsequenzen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erfahren.
63. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
64. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten oder Individuen, die von einem erhöhten Risiko von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit betroffen sind.
65. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
66. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
67. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
68. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
69. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Generierung eines Models zur Bewertung des Risikos der Entwicklung von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit.
70. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
71. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe ein erhöhtes Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit auftritt oder wahrscheinlich auftreten wird, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allefe mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erhalten.
72. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 71 erstellten Modell vergleicht.
73. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte - 63, 71 und 72, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
74. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 51, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
75. Ein gestalteter Assay zur Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Symptome und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu entwickeln; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 51 bis 56 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu entwickeln.
76. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
77. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 76, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
78. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 76, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
79. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 76, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
80. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 79, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entspreche 99999 00070 552 001000280000000200012000285919988800040 0002010019058 00004 99880nd vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
81. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 80, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
82. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 81, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
83. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 82, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
84. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 83, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
85. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 84 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
86. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
87. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
88. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
89. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen besteht.
90. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen oder von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen infolge einer therapeutischen Intervention.
91. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
92. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
93. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 für die Prognose oder das Management von Patienten, die an sich entwickelnden aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen leiden oder für besagte Störungen zur Risikogruppe gehören.
94. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
95. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
96. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sich entwickelnde aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuuen, bei welchen aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen zu erhalten.
97. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts aggressiver Symptome oder Verhaltensstörungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 96 erstellten Modell vergleicht.
98. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 88, 96 und 97, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
99. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 76, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
100. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 76 bis 81 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Induviduums beschreibt, aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen zu erfahren.
101. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit den Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung in Zusammenhang stehen, umfasst:
102. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 101, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
103. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 101, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
104. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 101, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
105. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 104, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
106. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 105, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
107. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 106, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
108. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 107, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
109. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 108, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
110. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
111. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
112. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
113. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
114. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung besteht.
115. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
116. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
117. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiterer Symptome.
118. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
119. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
120. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
121. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuuen, bei welchen Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erhalten.
122. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 121 erstellten Modell vergleicht.
123. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 113, 121 und 122, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
124. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 101, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
125. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 101 bis 106 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erfahren.
126. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Demenz und/oder assoziierten Syndromen in Zusammenhang stehen, umfasst:
127. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 126, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
128. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 126, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
129. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 126, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
130. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 129, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
131, Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 130, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
132. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 131, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
133. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 132, wobei die Oligonukieotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
134. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 133, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
135. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
136. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
137. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
138. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
139. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Demenz und/oder assoziierten Syndromen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen besteht.
140. Die Verwendung eines Oügonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
141. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
142. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
143. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
144. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
145. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
146. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Demenz und/oder assoziierte Syndrome eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Demenz und/oder assoziierte Syndrome diagnostiziert wurden;
  • a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Demenz und/oder assoziierten Syndromen ausgeschlossen wurde;
  • b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134;
  • c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen zu erhalten.
147. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 146 erstellten Modell vergleicht.
148. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 138, 146 und 147, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
149. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß tunkt 1 126, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
150. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Demenz und/oder assoziierte Syndrome zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 126 bis 131 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Demenz und/oder assoziierte Syndrome zu erfahren.
151. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
152. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 151, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
153. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 151, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
154. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 151, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
155. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 154, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
156. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte ist bis 155, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
157. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 156, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
158. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 157, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
159. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 158, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
160. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
161. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
162. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
163. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
164. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Symptomen und Folgen von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen besteht.
165. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
166. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
167. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
168. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
169. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
170. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
171. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen auftreten werden oder wahrscheinlich auftreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erhalten.
172. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts psychotischer Störungen und Persönlichkeitsstörungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 171 erstellten Modell vergleicht.
173. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 163, 171 und 172, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
174. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 151, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
175. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 151 bis 156 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • a) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erfahren.
176. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Störung in Zusammenhang stehen, umfasst:
177. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 176, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
178. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 176, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
179. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 176, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
180. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 179, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
181. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 180, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
182. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 181, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
183. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 182, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht. 184. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 183, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
185. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
186. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukjeotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
187. Eirte medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
188. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
189. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung besteht.
190. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
191. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
192. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
193. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
194. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
195. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 1176 bis 184 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
196. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 1176 bis 184;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b);
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhaltenen Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erhalten.
197. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 196 erstellten Modell vergleicht.
198. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 188, 196 und 197, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
199. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 176, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
200. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehifunktion oder Schädigung zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 176 bis 181 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erfahren.
201. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts in Zusammenhang stehen, umfasst:
202. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 201, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
203. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 201, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
204. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 201, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
205. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 204, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
206. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 205, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
207. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 206, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
208. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 207, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
209. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 208, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
210. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
211. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
212. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
213. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
214. Die Verwendung eines Oügonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Prognose Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts besteht.
215. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
216. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
217. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der. Punkte 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
218. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
219. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
220. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
221. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen,bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erhalten. 222. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 221 erstellten Modell vergleicht.
223. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 213, 221 und 222, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
224. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 201, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
225. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkte 201 bis 206 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erfahren.
226. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems in Zusammenhang stehen, umfasst:
227. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 226, 226, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
228. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 227, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
229. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 228, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
230. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 229, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
231. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 230, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
232. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 231, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
233. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 232, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
234. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 233, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
235. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
236. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
237. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
238. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
239. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die klinische oder soziale Konsequenzen erfahren, die sich aus Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems ergeben oder bei welchen das Risiko von klinischen oder sozialen Konsequenzen besteht, die sich aus Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems.
240. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
241. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
242. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
243. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
244. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
245. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
246. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erhalten.
247. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 246 erstellten Modell vergleicht.
248. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 238, 246 und 247, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
249. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 226, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
250. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten i 226 bis 231 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erfahren.
251. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz in Zusammenhang stehen, umfasst:
252. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt; 251, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
253. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 251, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
254. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 251, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
255. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 254, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
256. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 255, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
257. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der'Punkte 251 bis 256, in welchem die Ofigonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
258. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 257, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
259. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 258, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
260. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
261. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
262. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
263. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
264. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz besteht.
265. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
266. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
267. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
268. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
269. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
270. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
271. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz diagnostiziert wurden;
  • a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen,bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz ausgeschlossen wurde;
  • b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte '251 bis 259;
  • c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erhalten. 272. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 271 erstellten Modell vergleicht.
273. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 263, 271 und 272, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
274. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 251, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
275. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 251 bis 256 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erfahren.
276. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess in Zusammenhang stehen, umfasst:
277. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 276, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
278. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 276, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
279. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 276, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
280. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 279, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
281. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 280, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
282. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 281, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
283. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 282, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
284. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 283, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
285. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
286. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
287. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
288. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
289. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess besteht.
290. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
291. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
292. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
293. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
294. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
295. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
296. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, weiches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erhalten.
297. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 296 erstellten Modell vergleicht.
298. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 288, 296 und 297, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
299. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 276, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
300. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 276 bis 281 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erfahren.
301. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit einer Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen in Zusammenhang stehen, umfasst:
302. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 301, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
303. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 301, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
304. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 301, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
305. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 304, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
306. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 305, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
307. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 306, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
308. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der I Punkte 301 bis 307, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
309. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 308, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
310. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
311. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
312. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
313. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist; indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
314. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen besteht.
315. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
316. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
317. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
318. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
319. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
320. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
321. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erhalten.
322. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 321 erstellten Modell vergleicht.
323. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 313, 321 und 322, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
324. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 301, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
325. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 301 bis 306 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erfahren.
326. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung in Zusammenhang stehen, umfasst:
327. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 326, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
328. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 326, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
329. Satz von Oligonukleotiden nach Äunkt 326, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
330. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 329, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
331. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 330, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
332. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 331, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
333. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 332, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
334. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der. Punkte 326 bis 333, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
335. Die Verwendung eines Sätzen von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
336. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
337. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
338. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte, 326 bis 334 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
339. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit besteht.
340. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
341. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme s 19394 00070 552 001000280000000200012000285911928300040 0002010019058 00004 19275pezifischer Medikamente.
342. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
343. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
344. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
345. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der. Punkte 326 bis 334 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
346. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe eine endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhaltenen Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erhalten.
347. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 346 erstellten Modell vergleicht.
348. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 338, 346 und 347, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
349. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 326, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
350. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 326 bis 331 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erfahren.
351. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Kopfschmerzen in Zusammenhang stehen, umfasst:
352. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 351, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
353. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1 351, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
354. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 351, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
355. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 354, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
356. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 355, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
357. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 356, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
358. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 357, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
359. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 358, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
360. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
361. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
362. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
363. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
364. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer den Punkte 351 bis 359 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von Kopfschmerzen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Kopfschmerzen besteht.
365. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
366. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
367. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
368. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
369. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
370. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
371. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Kopfschmerzen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen; bei welchen Kopfschmerzen diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Kopfschmerzen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Kopfschmerzen zu erhalten.
372. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts unerwünschter Arzneimittelwirkungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 371 erstellten Modell vergleicht.
373. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 363, 371 und 372, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
374. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 351, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
375. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Kopfschmerzen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 351 bis 356 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Kopfschmerzen zu erfahren.
376. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit sexueller Fehlfunktion in Zusammenhang stehen, umfasst:
377. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 376, 376, in Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
378. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 376, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
379. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 376, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
380. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 379, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
381. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 380, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
382. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 381, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
383. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 382, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
384. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 383, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
385. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
386. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
387. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
388. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
389. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von sexuellen Fehlfunktionen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von sexuellen Fehlfunktionen besteht.
390. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
391. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
392. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
393. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
394. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
395. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
396. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sexuelle Fehlfunktionen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen sexuelle Fehlfunktionen diagnostiziert wurden;
  • a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von sexuellen Fehlfunktionen ausgeschlossen wurde;
  • b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384;
  • c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von sexuellen Fehlfunktionen zu erhalten.
397. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts sexueller Fehlfunktionen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 396 erstellten Modell vergleicht.
398. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer den Punkte 388, 396 und 397, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
399. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 376, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
400. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums sexuelle Fehlfunktionen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 376 bis 381 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, sexuelle Fehlfunktionen zu erfahren.

Claims (540)

nsprüche<
1. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit unerwünschten Arzneimittelwirkungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
2. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 1, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
3. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 1, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
4. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 1, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
5. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 4, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
6. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 5, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
7. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 6, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
8. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 7, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
9. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 8, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
10. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
11. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
12. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
13. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
14. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von unerwünschten Arzneimittelwirkungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von unerwünschten Arzneimittelwirkungen besteht.
15. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen von unerwünschten Arzneimittelwirkungen infolge einer therapeutischen Intervention.
16. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken oder von unerwünschten Arzneimittelwirkungen infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
17. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher Symptome bei Eintritt von unerwünschten Arzneimittelwirkungen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
18. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
19. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
20. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
21. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe unerwünschte Arzneimittelwirkungen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine unerwünschte Arzneimittelwirkung diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von unerwünschte Arzneimittelwirkungen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 1 bis 9;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Nebenwirkungen zu erhalten.
22. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts unerwünschter Arzneimittelwirkungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 21 erstellten Modell vergleicht.
23. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 13, 21 und 22, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
24. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 1, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
25. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums nachteilige Ereignisse zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 1 bis 6 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, unerwünschte Ereignisse zu erfahren.
26. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit dem Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs in Zusammenhang stehen, umfasst:
27. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 26, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
28. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 26, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
29. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 26, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
30. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 29, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
31. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 30, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
32. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 31, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
33. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 32, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel; Silber oder Gold besteht.
34. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 33, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
35. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
36. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten, als Indikation für ein höheres Risiko eines Patienten oder Individuums, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
37. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 enthält, zur Prognose und zum Management von Patienten, die an dem Risiko leiden, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
38. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
39. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an dem Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs leiden.
40. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
41. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
42. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
43. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
44. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 zur Generierung eines Models, um das Risiko für Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen einzuschätzen, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
45. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
46. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sich das Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs entwickeln wird oder wahrscheinlich eintreten wird, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Krebs ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 26 bis 34;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs zu erhalten.
47. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 46 erstellten Modell vergleicht.
48. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 38, 46 und 47, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
49. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 26, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
50. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 26 bis 32 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
51. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Symptomen und Konsequenzen von CNS- Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit in Zusammenhang stehen, umfasst:
52. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 51, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
53. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 51, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
54. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 51, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
55. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 54, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
56. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 55, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
57. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 56, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
58. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 57, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
59. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 58, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
60. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
61. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten, als Indikation für ein höheres Risiko der Entwicklung von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit oder für den Patienten oder das Individuum, Symptome und Konsequenzen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erfahren.
62. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung, ob ein Patient oder Individuum möglicherweise CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit entwickelt oder für den Patienten oder das Individuum die Wahrscheinlichkeit besteht, Symptome und Konsequenzen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erfahren.
63. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
64. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten oder Individuen, die von einem erhöhten Risiko von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit betroffen sind.
65. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
66. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
67. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
68. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
69. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 zur Generierung eines Models zur Bewertung des Risikos der Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit.
70. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
71. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe ein erhöhtes Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit auftritt oder wahrscheinlich auftreten wird, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 51 bis 59;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgeerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erhalten.
72. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgeerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 71 erstellten Modell vergleicht.
73. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 63, 71 und 72, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
74. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 51, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
75. Ein gestalteter Assay zur Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Symptome und Folgeerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu entwickeln; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen; wie sie definiert sind in den Ansprüchen 51 bis 56 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgeerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu entwickeln.
76. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
77. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 76, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
78. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 76, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
79. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 76, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
80. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 79, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
81. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 80, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
82. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 81, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
83. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 82, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
84. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 83, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
85. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 84 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
86. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
87. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
88. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
89. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen besteht.
90. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen oder von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen infolge einer therapeutischen Intervention.
91. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
92. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
93. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 für die Prognose oder das Management von Patienten, die an sich entwickelnden aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen leiden oder für besagte Störungen zur Risikogruppe gehören.
94. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
95. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
96. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sich entwickelnde aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen zu erhalten.
97. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts aggressiver Symptome oder Verhaltensstörungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 96 erstellten Modell vergleicht.
98. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 88, 96 und 97, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
39. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 76, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
100. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 76 bis 81 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen zu erfahren.
101. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit den Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung in Zusammenhang stehen, umfasst:
102. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 101, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
103. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 101, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
104. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 101, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
105. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 104, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
106. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 105, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
107. Satz von Oligonukleotide gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 106, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
108. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 107, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
109. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 108, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
110. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
111. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
112. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
113. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
114. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung besteht.
115. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
116. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
117. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiterer Symptome.
118. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
119. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
120. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
121. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 101 bis 109;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erhalten.
122. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 121 erstellten Modell vergleicht.
123. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 113, 121 und 122, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
124. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 101, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulhts durchgeführt wird.
125. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 101 bis 106 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erfahren.
126. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Demenz und/oder assoziierten Syndromen in Zusammenhang stehen, umfasst:
127. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 126, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
128. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 126, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
129. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 126, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
130. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 129, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
131. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 130, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
132. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 131, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
133. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 132, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
134. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 133, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
135. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
136. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
137. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
138. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
139. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Demenz und/oder assoziierten Syndromen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen besteht.
140. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
141. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
142. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
143. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
144. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
145. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
146. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Demenz und/oder assoziierte Syndrome eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Demenz und/oder assoziierte Syndrome diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Demenz und/oder assoziierten Syndromen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 126 bis 134;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen zu erhalten.
147. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 146 erstellten Modell vergleicht.
148. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 138, 146 und 147, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
149. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 126, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
150. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Demenz und/oder assoziierte Syndrome zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 126 bis 131 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Demenz und/oder assoziierte Syndrome zu erfahren.
151. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
152. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 151, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
153. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 151, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
154. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 151, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
155. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 154, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
156. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 155, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
157. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 156, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
158. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 157, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
159. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 158, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
160. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
161. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
162. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
163. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
164. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Symptomen und Folgen von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen besteht.
165. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
166. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
167. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
168. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
169. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
170. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
171. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen auftreten werden oder wahrscheinlich auftreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 151 bis 159;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methyfierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erhalten.
172. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts psychotischer Störungen und Persönlichkeitsstörungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 171 erstellten Modell vergleicht.
173. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 163, 171 und 172, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
174. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 151, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
175. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 151 bis 156 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erfahren.
176. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Störung in Zusammenhang stehen, umfasst:
177. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 176, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
178. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 176, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
179. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 176, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
180. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 179, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
181. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 180, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
182. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 181, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
183. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 182, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
184. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 183, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
185. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
186. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
187. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
188. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
189. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung besteht.
190. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
191. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
192. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
193. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
194. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
195. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
196. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 176 bis 184;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhaltenen Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erhalten.
197. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 196 erstellten Modell vergleicht.
198. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 188, 196 und 197, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
199. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 176, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
200. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 176 bis 181 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt; Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erfahren.
201. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts in Zusammenhang stehen, umfasst:
202. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 201, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
203. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 201, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
204. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 201, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
205. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 204, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
206. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 205, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
207. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 206, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
208. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 207, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
209. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 208, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
210. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
211. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 enthält, zur Verwendung iri einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
212. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
213. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
214. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts besteht.
215. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
216. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
217. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
218. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
219. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
220. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
221. Ein Verfahren zur Erstellung eines Models zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 201 bis 209;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erhalten.
222. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 221 erstellten Modell vergleicht.
223. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 213, 221 und 222, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
224. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 201, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
225. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 201 bis 206 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erfahren.
226. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems in Zusammenhang stehen, umfasst:
227. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 226, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
228. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 227, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
229. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 228, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
230. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 229, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
231. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 230, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
232. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 231, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
233. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 232, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
234. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 233, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
235. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
236. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
237. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
238. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
239. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die klinische oder soziale Konsequenzen erfahren, die sich aus Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems ergeben oder bei welchen das Risiko von klinischen oder sozialen Konsequenzen besteht, die sich aus Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems.
240. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
241. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
242. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
243. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
244. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen; Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
245. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
246. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA-Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erhalten.
247. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 246 erstellten Modell vergleicht.
248. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 238, 246 und 247, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
249. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 226, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
250. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 226 bis 231 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt,
  • d) Fehlfunktionen, Schädigung der Erkrankung des Atmungssystems zu erfahren.
251. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz in Zusammenhang stehen, umfasst:
252. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 251, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
253. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 251, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
254. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 251, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
255. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 254, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
256. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 255, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
257. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 256, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
258. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 257, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
259. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 258, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
260. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
261. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
262. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
263. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
264. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz besteht.
265. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
266. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
267. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
268. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
269. D 99999 00085 552 0010002800000002000120002857350718000405914915550758 0002010019058 00004 50710ie Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
270. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
271. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 251 bis 259;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erhalten.
272. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 271 erstellten Modell vergleicht.
273. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 263, 271 und 272, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
274. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 251, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
275. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 251 bis 256 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erfahren.
276. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess in Zusammenhang stehen, umfasst:
277. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 276, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
278. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 276, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
279. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 276, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
280. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 279, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
281. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 280, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
282. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 281, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
283. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 282, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
284. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 283, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
285. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
286. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
287. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
288. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
289. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess besteht.
290. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
291. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
292. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
293. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
294. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
295. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
296. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 276 bis 284;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erhalten.
297. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 296 erstellten Modell vergleicht.
298. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 288, 296 und 297, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
299. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 276, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
300. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 276 bis 281 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erfahren.
301. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit einer Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen in Zusammenhang stehen, umfasst:
302. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 301, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
303. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 301, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
304. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 301, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
305. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 304, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
306. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 305, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
307. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 306, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
308. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 307, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
309. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 308, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
310. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
311. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
312. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
313. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
314. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen besteht.
315. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
316. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
317. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
318. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
319. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
320. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
321. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 301 bis 309;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erhalten.
322. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 321 erstellten Modell vergleicht.
323. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 313, 321 und 322, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
324. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 301, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
325. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 301 bis 306 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erfahren.
326. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung in Zusammenhang stehen, umfasst:
327. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 326, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
328. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 326, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
329. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 326, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
330. Satz von Oligonukleotiden für die Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 329, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
331. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 330, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
332. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 331, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
333. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 332, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
334. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 333, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
335. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
336. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
337. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatr gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
338. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
339. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit besteht.
340. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
341. Die Verwendung eines Oügonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
342. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
343. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
344. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
345. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
346. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe eine endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit diagnostiziert wurde;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 326 bis 334;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhaltenen Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erhalten.
347. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 346 erstellten Modell vergleicht.
348. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 338, 346 und 347, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
349. Ein Satz von Oligonukleotitsonden gemäß Anspruch 326, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
350. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 326 bis 331 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erfahren.
351. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Kopfschmerzen in Zusammenhang stehen, umfasst:
352. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 351, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
353. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 351, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
354. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 351, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
355. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 354, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
356. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 355, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
357. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 356, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
358. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 357, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
359. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 358, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
360. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
361. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
362. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
363. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
364. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von Kopfschmerzen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Kopfschmerzen besteht.
365. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
366. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
367. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
368. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
369. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
370. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
371. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Kopfschmerzen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
  • a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Kopfschmerzen diagnostiziert wurden;
  • b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Kopfschmerzen ausgeschlossen wurde;
  • c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 351 bis 359;
  • d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Kopfschmerzen zu erhalten.
372. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts unerwünschter Arzneimittelwirkungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 371 erstellten Modell vergleicht.
373. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 363, 371 und 372, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
374. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 351, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
375. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Kopfschmerzen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 351 bis 356 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Kopfschmerzen zu erfahren.
376. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit sexueller Fehlfunktion in Zusammenhang stehen, umfasst:
377. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 376, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.
378. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 376, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.
379. Satz von Oligonukleotiden nach Anspruch 376, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.
380. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 379, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.
381. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 380, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.
382. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 381, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.
383. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 382, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.
384. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 383, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.
385. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.
386. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.
387. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.
388. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.
389. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von sexuellen Fehlfunktionen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von sexuellen Fehlfunktionen besteht.
390. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.
391. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.
392. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.
393. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.
394. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.
395. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.
396. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sexuelle Fehlfunktionen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen sexuelle Fehlfunktionen diagnostiziert wurden;
  • a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von sexuellen Fehlfunktionen ausgeschlossen wurde;
  • b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 376 bis 384;
  • c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
  • d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
  • e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von sexuellen Fehlfunktionen zu erhalten.
397. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts sexueller Fehlfunktionen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 396 erstellten Modell vergleicht.
398. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 388, 396 und 397, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.
399. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Anspruch 376, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.
400. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums sexuelle Fehlfunktionen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
  • a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Ansprüchen 376 bis 381 in einer Probe von genomischer DNA.
  • b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
  • c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, sexuelle Fehlfunktionen zu erfahren.
Die Erfindung betrifft einen Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, die Verwendung derselben zum Nachweis von Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung, eine medizinische Vorrichtung, welche einen Satz von Oligonukleotiden verwendet, ein Verfahren zur Untersuchung des Methylierungszustandes eines Individuums sowie ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung der Eintrittswahrscheinlichkeit einer gesundheitlichen Beeinträchtigung eines Individuums.Die nach den methodischen Entwicklungen der letzten Jahre in der Molekularbiologie gut studierten Beobachtungsebenen sind die Gene selbst, die Übersetzung dieser Gene in RNA und die daraus entstehenden Proteine. Wann im Laufe der Entwicklung eines Individuums welches Gen angeschaltet wird und wie Aktivieren und Inhibieren bestimmter Gene in bestimmten Zellen und Geweben gesteuert wird, ist mit Ausmaß und Charakter der Methylierung der Gene bzw. des Genoms korrelierbar. Insofern korrelieren pathogene Zustände mit einem veränderten Methylierungsmuster einzelner Gene oder des Genoms. Die vorliegende Erfindung beschreibt Sätze von Oligomeren und Verfahren zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, die mit nachteiligen Ereignissen für Patienten/Individuen oder aber bestimmten Krankheiten in Zusammenhang stehen.5-Methylcytosin ist die häufigste kovalent modifizierte Base in der DNA eukaryotischer Zellen. Sie spielt beispielsweise eine Rolle in der Regulation der Transkription, beim genetischen Imprinting und in der Tumorgenese. Die Identifizierung von 5-Methylcytosin als Bestandteil genetischer Information ist daher von erheblichem Interesse. 5- Methylcytosin-Positionen können jedoch nicht durch Sequenzierung identifiziert werden, da 5-Methylcytosin das gleiche Basenpaarungsverhalten aufweist wie Cytosin. Darüber hinaus geht bei einer PCR-Amplifikation die epigenetische Information, welche die 5- Methylcytosine tragen, vollständig verloren.Eine relativ neue und die mittlerweile am häufigsten angewandte Methode zur Untersuchung von DNA auf 5-Methylcytosin beruht auf der spezifischen Reaktion von Bisulfit mit Cytosin, das nach anschließender alkalischer Hydrolyse in Uracil umgewandelt wird, welches in seinem Basenpaarungsverhalten dem Thymidin entspricht. 5-Methylcytosin wird dagegen unter diesen Bedingungen nicht modifiziert. Damit wird die ursprüngliche DNA so umgewandelt, dass Methylcytosin, welches ursprünglich durch sein Hybridisierungsverhalten vom Cytosin nicht unterschieden werden kann, jetzt durch "normale" molekularbiologische Techniken als einzig verbliebenes Cytosin beispielsweise durch Amplifikation und Hybridisierung oder Sequenzierung nachgewiesen werden kann. Der Stand der Technik, was die Empfindlichkeit betrifft, wird durch ein Verfahren definiert, welches die zu untersuchende DNA in einer Agarose-Matrix einschließt, dadurch die Diffusion und Renaturierung der DNA (Bisulfit reagiert nur an einzelsträngiger DNA) verhindert und alle Fällungs- und Reinigungsschritte durch schnelle Dialyse ersetzt (Olek, A. et al., Nucl. Acids. Res. 1996, 24, 5064-5066). Mit dieser Methode können einzelne Zellen untersucht werden, was das Potential der Methode veranschaulicht. Allerdings werden bisher nur einzelne Regionen bis etwa 3000 Basenpaare Länge untersucht, eine globale Untersuchung von Zellen auf Tausenden von möglichen Methylierungsanalysen ist nicht möglich. Allerdings kann auch dieses Verfahren keine sehr kleinen Fragmente aus geringen Probenmengen zuverlässig analysieren. Diese gehen trotz Diffusionsschutz durch die Matrix verloren.Eine Übersicht über die weiteren bekannten Möglichkeiten, 5-Methylcytosine nachzuweisen, kann aus dem folgenden Übersichtsartikel entnommen werden: Rein, T., DePamphilis, M. L., Zorbas, H., Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2255.Die Bisulfit-Technik wird bisher bis auf wenige Ausnahmen (z. B. Zechnigk, M. et al., Eur. J. Hum. Gen. 1997, 5, 94-98) nur in der Forschung angewendet. Immer aber werden kurze, spezifische Stücke eines bekannten Gens nach einer Bisulfit-Behandlung amplifziert und entweder komplett sequenziert (Olek, A. und Walter, J., Nat. Genet. 1997, 17, 275-276) oder einzelne Cytosin-Positionen durch eine "Primer-Extension-Reaktion" (Gonzalgo, M. L. und Jones, P. A., Nucl. Acids Res. 1997, 25, 2529-2531, WO-Patent 9500669) oder einen Enzymschnitt (Xiong, Z. und Laird, P. W., Nucl. Acids. Res. 1997, 25, 2532-2534) nachgewiesen. Zudem ist auch der Nachweis durch Hybridisierung beschrieben worden (Olek et al., WO 99 28498).Weitere Publikationen, die sich mit der Anwendung der Bisulfit-Technik zum Methylierungsnachweis bei einzelnen Genen befassen, sind: Xiong, Z. und Laird, P. W. (1997), Nucl. Acids Res. 25, 2532; Gonzalgo, M. L. und Jones, P. A. (1997), Nucl. Acids Res. 25, 2529; Grigg, S. und Clark, S. (1994), Bioassays 16, 431; Zeschnik, M. et al. (1997), Human Molecular Genetics 6, 387, Teil, R. et al. (1994), Nucl. Acids Res. 22, 695; Martin, V. et al. (1995), Gene 157, 261; WO 97 46705, WO 95 15373 und WO 45560.Eine Übersicht über den Stand der Technik in der Oligomer Array Herstellung läßt sich aus einer im Januar 1999 erschienenen Sonderausgabe von Nature Genetics (Nature Genetics Supplement, Volume 21, January 1999), der dort zitierten Literatur und dem US- Patent 5994065 über Methoden zur Herstellung von festen Trägern für Zielmoleküle wie Oligonukleotide bei vermindertem nichtspezifischem Hintergrundsignal entnehmen. Für die Abtastung eines immobilisierten DNA-Arrays sind vielfach fluoreszent markierte Sonden verwendet worden. Die Detektion der Fluoreszenz der hybridisierten Sonden erfolgt beispielsweise über eine Konfokaloptik.Neuere Verfahren zum Nachweis von Mutationen, die prinzipiell nach der Bisulphit- Behandlung der DNA-Probe mit einigen Modifikationen auch zur Methylierungsanalyse eingesetzt werden können, sind im folgenden aufgeführt:
Als ein Spezialfall der Sequenzierung ist die Einzelbasen-Primer-Ermreiterung (Genetic Bit Analysis) erwähnenswert (Head, SR., Rogers, YH., Parikh K., Lan, G., Anderson, S., Goelet, P., Boycejacino MT., Nucleic Acids Research. 25(24): 5065-5071, 1997; Picoult- Newberg, L., Genome Res. 9(2): 167-174, 1999). Eine kombinierte Amplifikation und Sequenzierung wird in US-Patent 5928906 beschrieben, wo eine basenspezifische Terminierung auf Matrixmolekülen eingesetzt wird. Ein weiteres Verfahren setzt eine Ligase/Polymerasereaktion für die Identifikation von Nukleotiden ein (US-Patent 5952174).Genomische DNA wird durch Standardmethoden aus DNA von Zell-, Gewebe- oder sonstigen Versuchsproben gewonnen. Diese Standardmethodik findet sich in Referenzen wie Fritsch und Maniatis eds., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 1989.Gegenwärtig ist es nicht Stand der Technik, grosse Mengen von Proben hinsichtlich einer Vielzahl von für Krankheiten bedeutsamen Methylierungspositionen zu untersuchen.Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es, Sätze von Oligomersonden, welche an Gene binden, die für nachteilige Ereignisse für Patienten oder bestimmte Krankheitsgruppen von Bedeutung sind, so zusammenzustellen, dass umfassende prognostische Aussagen für den jeweiligen Patienten durch Analyse des jeweiligen Methylierungszustandes dieser Gene möglich werden. Die dabei erfassten Daten werden zu Methylierungsmustern zusammengefasst. Des weiteren soll ein Verfahren geschaffen werden, welches die Analyse von Methylierungspositionen in grossem Umfang unter Verwendung der erwähnten Oligomersonden ermöglicht.Die Aufgabe wird erfindungsgemäß durch einen Satz von Nukleotidsonden und ein Verfahren zur Untersuchung des Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums. Mit Hilfe des Satzes von Oligonukleotidsonden und/oder des Verfahrens wird das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe der Gene nachgewiesen. Aus dem Methylierungsmuster ergibt sich durch Abgleich mit Methylierungsmustern in einer Datenbank, welche bereits bestimmten Phänotypen, Prognosen oder Effekten auf den Patienten zugeordnet sind, eine Diagnose.Diese Aufgabe wird erfindungsgemäß durch einen Satz von Nukleotidsonden gemäss einem oder mehrerer der Ansprüche gelöst. Weiterhin kann zur Lösung der Aufgabe ein Verfahren oder eine Vorrichtung genutzt werden, welche einen Satz der erwähnten Nukleotidsonden enthält. Vorteilhafte Ausführungen der Erfindung sind in den jeweiligen Unteransprüchen gekennzeichnet.Der erfindungsgemässe Satz von Oligonukleotidsonden oder eine Vorrichtung welche diesen enthält dient vorzugsweise zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Konsequenzen von folgenden nachteiligen Ereignissen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von folgenden nachteiligen Ereignissen besteht:
unerwünschte Arzneimittelwirkungen
Krebserkrankungen
CNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheit
aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen
klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen
psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen
Demenz und/oder assoziierte Syndrome
kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems
Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen
endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit
Kopfschmerzen oder
sexuelle Fehlfunktion.Diese Aufzählung ist nicht abschliessend und dem Fachmann ist klar, dass mittels der erfinderischen Idee jede Erkrankung oder Fehlfunktion eines Organismus oder Individuums anwendbar ist.Die Oligomersonden umfassen Sequenzen, welche an die Gene binden, die mit diesen nachteiligen Ereignissen in Zusammenhang stehen. Die Oligomersonden binden an die Sequenzen, wie sie nach einer Behandlung der DNA-Probe vorliegen, welche nicht methyliertes Cytosin in Uracil umwandelt. Die Gene sind in den Ansprüchen detailliert aufgeführt. Erfindungsgemäss gehören diese Gene zu mindestens einer der folgenden Proteinfunktionen: Enzyme, Transport, Lagerung, Struktur, Immunität, nervale Transmission, Wachstum und Differenzierung.In folgenden wird das Verfahren beschrieben, dass für eine Bewertung, ob bei einem Patienten, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe nachteilige Ereignisse eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, den Satz der Oligomersonden verwendet. Im ersten Schritt entnimmt man eine DNA-Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen ein nachteiliges Ereignis diagnostiziert wurde bzw. in der Kontrollgruppe nicht diagnostiziert wurde. Die mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits vorbehandelten DNA-Proben werden im zweiten Schritt des Verfahrens zum Nachweis von relevanten Genvarianten hinsichtlich der DNA- Methylierung mit einen Satz von Oligonukleotiden als Sonden hybridisiert, die innerhalb der jeweiligen Zielgruppe von Genen an nach der Bisulfitbehandlung vorliegende Sequenzen binden, in denen eine Cytosin Methylierung potentiell vorliegen kann. Es ergibt ein Hybridisierungsmuster, welches im dritten Schritt des Verfahrens in ein Methylierungsmuster der Gene der jeweiligen DNA-Probe übersetzt wird. Gleichermassen würde man vorgehen, wollte man ein Modell zur Bewertung von Risiken für Patienten oder Patientengruppen erarbeiten.Erfindungsgemäss gehören diese Gene zu mindestens einer der folgenden Proteinfunktionen: Enzyme, Transport, Lagerung, Struktur, Immunität, nervale Transmission, Wachstum und Differenzierung. Die besagten Gene stehen in Zusammenhang mit einer Vielzahl von nachteiligen Ereignissen, dazu gehören:
unerwünschte Arzneimittelwirkungen
Krebserkrankungen
ZNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheit
aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen
klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen
psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen
Demenz und/oder assoziierte Syndrome
kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems
Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess
Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen
endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit
Kopfschmerzen oder
sexuelle FehlfunktionDie Oligonukleotidsonden sind dadurch gekennzeichnet, dass sie zu DNA-Sequenzen der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung vorliegt, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorzugsweise eine Behandlung mit Natriumbisulfit.Im letzten Schritt des Verfahrens wird die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster berechnet und die Häufigkeiten der Allele bei Patienten und Individuen mit nachteiligen Ereignissen und der entsprechenden Kontrollgruppe verglichen.Bevorzugt wird mindestens einer der Schritte des Verfahrens mit einem Computer ausgeführt.In einer bevorzugten Variante des Verfahrens wird das Methylierungsmuster eines Individuums wird mit den bereits in der Datenbank vorhandenen Einträgen oder einem daraus abgeleiteten Modelt verglichen, um daraus das Risiko des Eintritts von nachteiligen Ereignissen zu bewerten.Der Satz von Oligonukleotiden besteht bevorzugt aus Oligonukleotiden, die an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind. Dieser Träger besteht aus Silizium, Glas, Polystrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold.Zum Nachweis der Genvarianten hinsichtlich Methylierung und unterschiedlicher Genexpression wird bevorzugt eine medizintechnische Vorrichtung verwendet, welche den besagten Satz von Oligonukleotiden enthält.In einer bevorzugten Variante des Verfahrens verwendet man einen besagten Oligonukleotidsatz oder eine Vorrichtung, die selbigen enthält, zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen oder nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention oder infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.In einer bevorzugten Variante des Verfahrens verwendet man einen besagten Oligonukleotidsatz oder eine Vorrichtung zur Vorhersage wahrscheinlicher Symptome bei Eintritt der oben aufgeführten nachteiligen Ereignisse und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.In einer weiteren bevorzugten Variante des Verfahrens verwendet man einen besagten Oligonukleotidsatz oder eine Vorrichtung für folgende Ziele:
Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien
Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsagemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen
Optimierung der therapeutischen InterventionWeiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Kit zur Durchführung eines Assays, mit dem man das Risiko eines Patienten oder Individuums einschätzen kann, nachteilige Ereignisse zu erfahren. Dieses Kit umfasst Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von relevanten Variationen hinsichtlich DNA-Methylierung der oben aufgeführten Gene in einer Probe von genomischer DNA. Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren sind ebenso enthalten, wie ein Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, unerwünschte Ereignisse zu erfahren.Nachfolgend werden in den einzelnen Punkten 1 bis 400 die jeweils zu einem Krankheitsbild oder zu einer Störung des Wohlbefindens eines Individuums im Zusammenhang stehenden Gene erwähnt.Erfindungsgemäß beansprucht sind daher Sätze von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA-Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, wobei die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen. Die jeweiligen Gene sind im Einzelnen aufgezählt, nämlich in Punkt 1 unerwünschte Arzneimittelwirkungen, in Punkt 26 Krebserkrankungen, in Punkt 51 ZNS-Fehlfunktionen, Schäden oder Krankheiten, in Punkt 76 aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen, in Punkt 101 klinische, psychologische und soziale Konsequenzen von Gehirnverletzungen, in Punkt 126 Demenz und/oder assoziierte Syndrome, in Punkt 151 psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen, in Punkt 176 kardiovaskuläre Krankheit, Fehlfunktion und Schädigung, in Punkt 201 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des gastrointestinalen Traktes, in Punkt 226 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Atmungssystems, in Punkt 251 Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz, in Punkt 276 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Abweichung im Entwicklungsprozess, in Punkt 301 Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen, in Punkt 326 endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit, in Punkt 351 Kopfschmerzen oder in Punkt 376 sexuelle Fehlfunktion. In den jeweils folgenden Unterpunkten sind die vorteilhaften Weiterbildungen der Sätze von Oligonukleotiden offenbart.Ferner wird jeweils die erfindungsgemäße Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis der Genvarianten hinsichtlich der DNA- Methylierung offenbart.Ferner wird eine erfindungsgemäße medizintechnische Vorrichtung offenbart, mit den in den jeweiligen Punkten angegebenen Merkmalen.Ein erfindungsgemäßes Verfahren zur Untersuchung des DNA-Methylierungsprofils wird offenbart, ebenso die erfindungsgemäße Verwendung der Sätze der Oligonukleotide oder der medizintechnischen Vorrichtung zur Prognose oder Behandlung der jeweiligen Störung des Individuums.Ferner wird eine erfindungsgemäßes Modell zur Bewertung der Eintrittswahrscheinlichkeit der jeweiligen Fehlfunktion oder Erkrankung offenbart. 1. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit unerwünschten Arzneimittelwirkungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
2. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.3. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.4. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukieotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.5. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 4, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.6. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 5, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.7. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 6, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.8. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 7, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht. 9. Satz von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 8, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.10. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.11. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.12. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.13. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.14. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von unerwünschten Arzneimittelwirkungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von unerwünschten Arzneimittelwirkungen besteht.15. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß mindestens reinem der Punkte 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen von unerwünschten Arzneimittelwirkungen infolge einer therapeutischen Intervention. 16. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes der einer Vorrichtung gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken oder von unerwünschten Arzneimittelwirkungen infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.17. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Vorhersage wahrscheinlicher Symptome bei Eintritt von unerwünschten Arzneimittelwirkungen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.18. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.19. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.20. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.21. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe unerwünschte Arzneimittelwirkungen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
22. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts unerwünschter Arzneimittelwirkungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 21 erstellten Modell vergleicht.23. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 13, 21 und 22, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.24. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 1, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.25. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums nachteilige Ereignisse zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
26. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit dem Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs in Zusammenhang stehen, umfasst:
27. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 26, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.28. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 26, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.29. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 26, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.30. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 29, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.31. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 30, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.32. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 31, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.33. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 32, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht. 34. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 33, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.35. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.36. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten, als Indikation für ein höheres Risiko eines Patienten oder Individuums, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.37. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 enthält, zur Prognose und zum Management von Patienten, die an dem Risiko leiden, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.38. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.39. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an dem Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs leiden.40. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.41. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.42. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.43. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.44. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Generierung eines Models, um das Risiko für Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen einzuschätzen, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.45. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.46. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sich das Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs entwickeln wird oder wahrscheinlich eintreten wird, welches folgende Schritte umfasst:
47. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Anspruch 46 erstellten Modell vergleicht.48. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 38, 46 und 47; wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.49. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 26, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.50. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln; besagtes Kit beinhaltend:
51. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Symptomen und Konsequenzen von CNS- Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit in Zusammenhang stehen, umfasst:
52. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 51, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.53. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 51, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.54. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 51, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.55. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 54, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.56. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 55, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.57. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 56, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.58. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 57, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.59. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 58, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.60. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.61. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten, als Indikation für ein höheres Risiko der Entwicklung von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit oder für den Patienten oder das Individuum, Symptome und Konsequenzen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erfahren. 62. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung, ob ein Patient oder Individuum möglicherweise CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit entwickelt oder für den Patienten oder das Individuum die Wahrscheinlichkeit besteht, Symptome und Konsequenzen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erfahren.63. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.64. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten oder Individuen, die von einem erhöhten Risiko von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit betroffen sind.65. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.66. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.67. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.68. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.69. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Generierung eines Models zur Bewertung des Risikos der Entwicklung von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit.70. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.71. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe ein erhöhtes Risiko zur Entwicklung von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit auftritt oder wahrscheinlich auftreten wird, welches folgende Schritte umfasst:
72. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 71 erstellten Modell vergleicht.73. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte - 63, 71 und 72, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.74. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 51, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.75. Ein gestalteter Assay zur Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Symptome und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu entwickeln; besagtes Kit beinhaltend:
76. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
77. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 76, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.78. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 76, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.79. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 76, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.80. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 79, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entspreche 99999 00070 552 001000280000000200012000285919988800040 0002010019058 00004 99880nd vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.81. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 80, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.82. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 81, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind. 83. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 82, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.84. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 83, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.85. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 84 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.86. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.87. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.88. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.89. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen besteht. 90. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen oder von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen infolge einer therapeutischen Intervention.91. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.92. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.93. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 für die Prognose oder das Management von Patienten, die an sich entwickelnden aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen leiden oder für besagte Störungen zur Risikogruppe gehören.94. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.95. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.96. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sich entwickelnde aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
97. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts aggressiver Symptome oder Verhaltensstörungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 96 erstellten Modell vergleicht.98. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 88, 96 und 97, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.99. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 76, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.100. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
101. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit den Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung in Zusammenhang stehen, umfasst:
102. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 101, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.103. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 101, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.104. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 101, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.105. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 104, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.106. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 105, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.107. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 106, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.108. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 107, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.109. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 108, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.110. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.111. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.112. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.113. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.114. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung besteht.115. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.116. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.117. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiterer Symptome.118. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.119. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.120. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.121. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
122. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 121 erstellten Modell vergleicht.123. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 113, 121 und 122, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.124. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 101, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.125. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
126. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Demenz und/oder assoziierten Syndromen in Zusammenhang stehen, umfasst:
127. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 126, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.128. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 126, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.129. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 126, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.130. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 129, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.131, Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 130, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.132. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 131, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.133. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 132, wobei die Oligonukieotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.134. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 133, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.135. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.136. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.137. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.138. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.139. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Demenz und/oder assoziierten Syndromen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen besteht.140. Die Verwendung eines Oügonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.141. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.142. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.143. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.144. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.145. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.146. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Demenz und/oder assoziierte Syndrome eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Demenz und/oder assoziierte Syndrome diagnostiziert wurden;147. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 146 erstellten Modell vergleicht.148. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 138, 146 und 147, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird. 149. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß tunkt 1 126, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.150. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Demenz und/oder assoziierte Syndrome zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
151. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen in Zusammenhang stehen, umfasst:
152. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 151, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.153. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 151, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.154. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 151, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.155. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 154, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.156. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte ist bis 155, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.157. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 156, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.158. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 157, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.159. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 158, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.160. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.161. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.162. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.163. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.164. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Symptomen und Folgen von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen besteht.165. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.166. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente. 167. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.168. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.169. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.170. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.171. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen auftreten werden oder wahrscheinlich auftreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
172. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts psychotischer Störungen und Persönlichkeitsstörungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 171 erstellten Modell vergleicht.173. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 163, 171 und 172, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.174. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 151, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.175. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.176. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Störung in Zusammenhang stehen, umfasst:
177. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 176, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.178. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 176, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.179. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 176, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.180. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 179, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.181. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 180, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.182. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 181, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.183. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 182, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht. 184. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 183, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.185. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.186. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukjeotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.187. Eirte medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.188. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.189. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung besteht. 190. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.191. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.192. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.193. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.194. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 176 bis 184 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.195. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 1176 bis 184 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.196. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
197. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 196 erstellten Modell vergleicht.198. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 188, 196 und 197, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.199. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 176, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.200. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehifunktion oder Schädigung zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
201. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts in Zusammenhang stehen, umfasst:
202. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 201, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.203. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 201, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.204. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 201, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.205. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 204, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.206. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 205, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen. 207. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 206, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.208. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 207, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.209. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 208, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.210. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.211. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.212. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.213. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.214. Die Verwendung eines Oügonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Prognose Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts besteht.215. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.216. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.217. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der. Punkte 201 bis 209 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.218. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.219. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.220. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.221. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
223. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 213, 221 und 222, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.224. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 201, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.225. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
226. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems in Zusammenhang stehen, umfasst:
227. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 226, 226, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.228. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 227, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.229. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 228, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.230. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 229, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.231. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 230, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.232. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 231, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.233. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 232, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht. 234. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 233, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.235. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.236. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.237. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.238. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.239. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die klinische oder soziale Konsequenzen erfahren, die sich aus Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems ergeben oder bei welchen das Risiko von klinischen oder sozialen Konsequenzen besteht, die sich aus Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems.240. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.241. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.242. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Ansprüche 226 bis 234 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.243. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.244. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.245. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.246. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
247. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 246 erstellten Modell vergleicht.248. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 238, 246 und 247, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.249. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 226, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.250. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
251. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz in Zusammenhang stehen, umfasst:
252. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt; 251, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.253. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 251, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.254. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 251, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.255. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 254, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.256. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 255, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.257. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der'Punkte 251 bis 256, in welchem die Ofigonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.258. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 257, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.259. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 258, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.260. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.261. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.262. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.263. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.264. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz besteht. 265. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.266. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.267. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.268. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.269. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.270. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 251 bis 259 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.271. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz diagnostiziert wurden;273. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 263, 271 und 272, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.274. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 251, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.275. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
276. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess in Zusammenhang stehen, umfasst:
277. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 276, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.278. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 276, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.279. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 276, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.280. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 279, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt. 281. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 280, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.282. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 281, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.283. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 282, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.284. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 283, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.285. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.286. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.287. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.288. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.289. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess besteht.290. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.291. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.292. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.293. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.294. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.295. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.296. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, weiches folgende Schritte umfasst:
297. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 296 erstellten Modell vergleicht.298. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 288, 296 und 297, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.299. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 276, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.300. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
301. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit einer Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen in Zusammenhang stehen, umfasst:
302. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 301, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.303. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 301, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.304. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 301, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.305. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 304, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.306. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 305, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.307. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 306, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.308. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der I Punkte 301 bis 307, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.309. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 308, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.310. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.311. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.312. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.313. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist; indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird. 314. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen besteht.315. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.316. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.317. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.318. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.319. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.320. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309 zur Optimierung der therapeutischen Intervention. 321. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
322. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 321 erstellten Modell vergleicht.323. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 313, 321 und 322, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.324. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 301, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird. 325. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
326. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung in Zusammenhang stehen, umfasst:
327. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 326, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.328. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 326, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.329. Satz von Oligonukleotiden nach Äunkt 326, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind. 330. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 329, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.331. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 330, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.332. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 331, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.333. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 332, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.334. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der. Punkte 326 bis 333, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.335. Die Verwendung eines Sätzen von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.336. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.337. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.338. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte, 326 bis 334 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.339. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit besteht.340. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.341. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme s 19394 00070 552 001000280000000200012000285911928300040 0002010019058 00004 19275pezifischer Medikamente.342. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.343. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.344. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.345. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der. Punkte 326 bis 334 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.346. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe eine endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
347. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 346 erstellten Modell vergleicht.348. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 338, 346 und 347, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird. 349. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 326, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.350. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums, endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
351. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit Kopfschmerzen in Zusammenhang stehen, umfasst:
352. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 351, in dem Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.353. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 1 351, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.354. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 351, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.355. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 354, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.356. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 355, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.357. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 356, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind. 358. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 357, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.359. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 358, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind.360. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.361. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.362. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.363. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.364. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer den Punkte 351 bis 359 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von Kopfschmerzen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von Kopfschmerzen besteht.365. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.366. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente.367. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.368. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.369. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.370. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.371. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe Kopfschmerzen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
372. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts unerwünschter Arzneimittelwirkungen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 371 erstellten Modell vergleicht.373. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer der Punkte 363, 371 und 372, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.374. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 351, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.375. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums Kopfschmerzen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
376. Satz von Oligonukleotiden als Sonden zur Detektion relevanter Variationen der DNA Methylierung in einer Zielgruppe von Genen, dadurch gekennzeichnet, dass die Oligonukleotide zur DNA-Sequenz der Zielgruppe von Genen komplementär sind oder ihnen entsprechen, wie sie nach einer chemischen Behandlung, welche nicht methylierte Cytosine in Uracil umwandelt, vorliegen, wobei die Zielgruppe im wesentlichen folgende Gene, welche mit sexueller Fehlfunktion in Zusammenhang stehen, umfasst:
377. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 376, 376, in Oligonukleotide mit bis zu 5% der aufgeführten Gene nicht enthalten sind.378. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 376, in dem Oligonukleotide mit mindestens 95% der aufgeführten Gene zusammen mit einer begrenzten Anzahl zusätzlicher nicht aufgeführter Oligonukleotide enthalten sind.379. Satz von Oligonukleotiden nach Punkt 376, in dem bis zu 5% der entsprechenden Oligonukleotide der aufgeführten Gene durch einen kompletten Satz von 25% anderer nicht aufgeführter Oligonukleotide ersetzt sind.380. Satz von Oligonukleotiden für eine Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 379, in welcher die chemisch vorbehandelte DNA Sequenz der nachzuweisenden Gene mindestens zu 95% mit der entsprechend vorbehandelten DNA Sequenz der Gene aus obiger Liste übereinstimmt.381. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 380, bestehend aus einer Untergruppe der Zielgruppe von Genen.382. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 381, in welchem die Oligonukleotide an bekannten Orten in einem rechtwinkligen oder hexagonalen Raster auf einem Träger angeordnet sind.383. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 382, wobei die Oligonukleotide auf einem Träger angeordnet sind, welcher aus Silizium, Glas, Polystyrol, Aluminium, Stahl, Eisen, Kupfer, Nickel, Silber oder Gold besteht.384. Satz von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 383, wobei die Oligonukleotidsonden über ihre Masse, Elektrostatik oder Fluoreszenz markiert sind. 385. Die Verwendung eines Satzes von Oligonukleotiden gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 in einer biologischen Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten hinsichtlich der DNA-Methylierung.386. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis besagter Genvarianten.387. Eine medizintechnische Vorrichtung, welche einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 enthält, zur Verwendung in einer Untersuchung zum Nachweis unterschiedlicher Genexpression.388. Ein Verfahren zur Untersuchung des DNA Methylierungsprofils eines Patienten oder Individuums, welche das Vorhandensein oder Fehlen der relevanten Methylierungsvarianten aus der Zielgruppe von Genen nachweist, indem eine chemisch vorbehandelte Nukleinsäureprobe von besagtem Patienten oder Individuum an einen Oligonukleotidsatz gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 hybridisiert wird und das Hybridisierungsmuster mit den Variationen in Beziehung gesetzt wird.389. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Prognose und Behandlungsplanung bei Patienten, die an den Folgen von sexuellen Fehlfunktionen leiden oder bei welchen das Risiko des Eintritts von sexuellen Fehlfunktionen besteht.390. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Folgen und nachteiliger Ereignisse infolge einer therapeutischen Intervention.391. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einr Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher therapeutischer Risiken und nachteiliger Ereignisse infolge der Einnahme spezifischer Medikamente. 392. Die Verwendung eines Oligonukleotidsatzes oder einer Vorrichtung gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Vorhersage wahrscheinlicher Muster von Krankheitssymptomen und der Wahrscheinlichkeit des Auftretens von Folgekrankheiten bzw. weiteren Symptomen.393. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 für die Entwicklung neuer Strategien bei der therapeutischen Intervention und in klinischen Studien.394. Die Verwendung eines Satzes oder Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Modellierung und Bewertung der Auswirkung von Krankheiten und Gesundheitsvorsorgemaßnahmen auf Individuen, Bevölkerungsgruppen, Patientengruppen und Populationen.395. Die Verwendung eines Satzes oder eines Gerätes gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384 zur Optimierung der therapeutischen Intervention.396. Ein Verfahren zur Erstellung eines Modells zur Bewertung, ob bei einem Patient, einem Individuum oder einer Bevölkerungsgruppe sexuelle Fehlfunktionen eintreten werden oder wahrscheinlich eintreten werden, welches folgende Schritte umfasst:
man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen sexuelle Fehlfunktionen diagnostiziert wurden;397. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts sexueller Fehlfunktionen trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 396 erstellten Modell vergleicht.398. Ein Verfahren gemäß einem oder mehrerer den Punkte 388, 396 und 397, wobei mindestens einer der Schritte von einem Computer ausgeführt wird.399. Ein Satz von Oligonukleotidsonden gemäß Punkt 376, wobei die chemische Vorbehandlung mittels der Lösung eines Bisulfits, Hydrogensulfits oder Disulfits durchgeführt wird.400. Ein gestalteter Assay für die Nutzung der Einschätzung des Risikos eines Patienten oder Individuums sexuelle Fehlfunktionen zu erfahren; besagtes Kit beinhaltend:
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine unerwünschte Arzneimittelwirkung diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von unerwünschte Arzneimittelwirkungen ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß mindestens einem der Punkte 1 bis 9;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Nebenwirkungen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 1 bis 6 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, unerwünschte Ereignisse zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuuen, bei welchen Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs diagnostiziert wurden;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Krebs ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 26 bis 34;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgeerscheinungen von Krebs zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 26 bis 32 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgeerscheinungen von Krebs zu entwickeln.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 51 bis 59;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allefe mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 51 bis 56 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgerscheinungen von CNS-Fehlfunktion, Beschädigung oder Krankheit zu entwickeln.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuuen, bei welchen aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 76 bis 85;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von aggressiven Symptomen oder Verhaltensstörungen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 76 bis 81 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Induviduums beschreibt, aggressive Symptome oder Verhaltensstörungen zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuuen, bei welchen Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung diagnostiziert wurden;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 101 bis 109;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 101 bis 106 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Folgen von klinischen, psychologischen und sozialen Konsequenzen einer Gehirnverletzung zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Demenz und/oder assoziierten Syndromen ausgeschlossen wurde;
b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 126 bis 134;
c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Demenz und/oder assoziierten Syndromen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 126 bis 131 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Demenz und/oder assoziierte Syndrome zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen diagnostiziert wurden;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 151 bis 159;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von psychotischen Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 151 bis 156 in einer Probe von genomischer DNA.
a) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, psychotische Störungen und Persönlichkeitsstörungen zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung diagnostiziert wurden;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 1176 bis 184;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b);
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhaltenen Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 176 bis 181 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome oder Konsequenzen von kardiovaskulärer Krankheit, Fehlfunktion oder Schädigung zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts diagnostiziert wurden;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen,bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 201 bis 209;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erhalten. 222. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 221 erstellten Modell vergleicht.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkte 201 bis 206 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Konsequenzen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Gastrointestinaltrakts zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 226 bis 234;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten i 226 bis 231 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Fehlfunktion, Schädigung oder Erkrankung des Atmungssystems zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen,bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz ausgeschlossen wurde;
b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte '251 bis 259;
c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erhalten. 272. Ein Verfahren zur Bewertung, ob ein bestimmtes Individuum das Risiko des Eintritts von Symptomen und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz trägt, wobei man das Methylierungsprofil mit dem gemäß Punkt 271 erstellten Modell vergleicht.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 251 bis 256 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Symptome und Folgen von Verletzung, Entzündung, Infektion, Immunität und/oder Rekonvaleszenz zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 276 bis 284;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 276 bis 281 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit des Körpers als Folge einer Abweichung im Entwicklungsprozess zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 301 bis 309;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch, um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von einer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 301 bis 306 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, eine Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit der Haut, der Muskeln, des Bindegewebes oder der Knochen zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen, bei welchen eine endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit diagnostiziert wurde;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 326 bis 334;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhaltenen Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von endokriner und metabolischer Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 326 bis 331 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, endokrine und metabolische Fehlfunktion, Schädigung oder Krankheit zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe von Patienten oder Individuen; bei welchen Kopfschmerzen diagnostiziert wurden;
b) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von Kopfschmerzen ausgeschlossen wurde;
c) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 351 bis 359;
d) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
e) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
f) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von Kopfschmerzen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 351 bis 356 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, Kopfschmerzen zu erfahren.
a) man entnimmt eine DNA Probe aus einer Kontrollgruppe von Individuen, bei welchen diagnostisch das Vorliegen von sexuellen Fehlfunktionen ausgeschlossen wurde;
b) man analysiert die in a) und b) erhaltenen Proben zur Bestimmung der DNA Methylierungsvariation innerhalb der Zielgruppe von Genen gemäß einem oder mehrerer der Punkte 376 bis 384;
c) man berechnet die Häufigkeit der Allele mit unterschiedlichem Methylierungsmuster in den Proben aus a) und b);
d) man vergleicht die Häufigkeiten der Allele in den Proben aus a) und b),
e) man führt eine statistische Analyse der unter e) erhalten Ergebnisse durch um ein Modell zur Bewertung des Risikos des Eintritts von sexuellen Fehlfunktionen zu erhalten.
a) Testmöglichkeiten auf Anwesenheit oder Abwesenheit von verschlüsselten relevanten polymorphen DNA-Variationen der Kerngruppe von Genen, wie sie definiert sind in den Punkten 376 bis 381 in einer Probe von genomischer DNA.
b) Reagenzien für den Gebrauch im Detektionsverfahren.
c) Script, das die Wahrscheinlichkeit eines Patienten oder Individuums beschreibt, sexuelle Fehlfunktionen zu erfahren.
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