CN1314950A - 微生物和植物中的维生素c生产 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种产生维生素C(抗坏血酸,L-抗坏血酸,或AA)的生物合成方法。这类方法包括发酵经遗传修饰的微生物或植物来产生L-抗坏血酸。特别地,本发明涉及至少含有一个遗传修饰的微生物和植物的使用,目的在于增加一种涉及抗坏血酸生物合成路径的酶的活性。本发明还包括为提高抗坏血酸的生物合成性生产,对编码差向异构酶的核苷酸序列的使用,所述差向异构酶包括来源于L-抗坏血酸途径的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶以及它们的同系物。本发明也涉及遗传修饰的微生物,如可用于生产L-抗坏血酸的微藻类、细菌和酵母的菌株,和可用于生产可消耗的植物性食品的遗传修饰植物。
Description
发明领域
本发明涉及用经遗传修饰的微生物和植物生产维生素C(L-抗坏血酸)。特别地,本发明涉及将核苷酸糖差向异构酶用于在植物和微生物中进行抗坏血酸的生物生产。
发明背景
几乎所有的生命形式,包括植物和动物,或合成抗坏血酸(维生素C),或用它作营养物。抗坏血酸的用途被人认识首先是作为一种人和动物饮食的补充剂,用于防止坏血病。但抗坏血酸也影响人的生理功能,如铁的吸收,对寒冷的耐受,对肾上腺皮质的维持,伤口的痊愈,多糖和胶原的合成,软骨、牙质、骨、牙齿的形成,毛细管的维持,也是一种有用的抗毒剂。
作为一种饮食的补充剂,抗坏血酸可从天然资源中如蔷薇果(rosehips)中分离,也可通过L-山梨糖的氧化而化学合成,或由弱氧化醋杆菌对D-葡萄糖酸钙的有氧发酵产生。Considine,“抗坏血酸”,Van Nostr和氏百科全书(Van Nostr和`s Scientific Encyclopedia)第1卷,237-238页(1989)。抗坏血酸(主要是细胞内的)也已从微藻植株粉核小球藻的发酵中得到。见Skatrud的美国专利号5,001,059,该专利已转让给本发明的受让人。据信抗坏血酸在光合微生物的叶绿体中产生,用于中和光合作用中产生的高能电子。相应的,抗坏血酸的产生被认为是光合生物中的一种保护机制。
因此,能改善通过生物合成而产生抗坏血酸的能力的产物和方法有利于促进人类健康,也确实存在这方面的需要。
发明简述
本发明的一个实施方案涉及涉及一种在微生物中产生抗坏血酸或酯的方法。这种方法包括步骤:(a)培养带一种遗传修饰的微生物,该改良旨在增加选自下组的一种酶的活性:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶(phosphomannomutase),GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶;和(b)回收由该微生物产生的抗坏血酸或酯。优选的,所述遗传修饰是为了增加一种选自下组的酶的活性:GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。在本发明方法的一个实施方案中,该微生物进一步包括了降低一种酶活性的遗传修饰,该酶的底物不是GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,而是GDP-D-甘露糖。这种遗传修饰可以包括,如一种降低GDP-D-甘露糖脱氢酶作用的遗传修饰。
在一个实施方案中,所述遗传修饰是为了增强一种催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化的差向异构酶的作用,其中包括GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶。在一个实施方案中,所述差向异构酶结合NAPDH。在该方法的一个实施方案中,所述遗传修饰包括用表达该差向异构酶的重组核酸分子转化该微生物。这类差向异构酶的三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖(GDP-4-keto-6-deoxy-D-mannose)差向异构酶/还原酶的三级结构(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)相吻合。优选的,所述差向异构酶与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)三级结构中至少25%的Cα位点平均均方根偏差小于2.5埃,更优选小于1埃。
在一实施方案中,所述差向异构酶包含一个底物结合位点,该位点的三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)的底物结合位点的三级结构基本上相符。优选该底物结合位点的三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)的底物结合位点三级结构中至少25%的Cα位点平均均方根偏差小于约2.5埃。
在另一实施方案中,差向异构酶包含一个催化位点,该位点的三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)的催化位点的三级结构基本上相符。优选该催化位点的三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)的催化位点的三级结构中至少25%的Cα位点平均均方根偏差小于约1埃。优选该催化位点包括丝氨酸,酪氨酸,赖氨酸残基,在一实施方案中,丝氨酸,酪氨酸,赖氨酸残基三级结构的位置分别与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标表示的Ser107,Tyr136和Lys140残基的三级结构位置基本上相符。
在本方法的另一实施方案中,差向异构酶包含一个氨基酸序列,该序列用CLUSTAL匹配程序与SEQ ID NO:11匹配,其中该氨基酸序列中的氨基酸残基与至少50%,在另一实施方案中至少75%,和在又一方案中90%的在SEQ ID NO:11的non-Xaa残基有100%的相同。在另一实施方案中,差向异构酶包含一个氨基酸序列,该序列包含4个连续的氨基酸残基与从SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:8,SEQID NO:10这组中选出的氨基酸序列中至少4个连续的氨基酸残基100%相同。在另一实施方案中,重组核酸分子包括一个核酸序列,该序列包括至少约12个连续的核苷酸与从SEQ IDNO:1,SEQ IDNO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7,SEQ ID NO:9这组中选出的核酸序列中至少12个连续的核苷酸100%相同。
在本发明方法的另一实施方案中,差向异构酶包含一个氨基酸序列拥有一个特征结构:Gly-Xaa-Xaa-Gly-Xaa-Xaa-Gly。在另一实施方案中,重组核酸分子包括一个核酸序列,用Lipman-Pearson方法用Lipman-Pearson缺省参数测定,该序列与从SEQ ID NO:1,SEQ IDNO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7,SEQ ID NO:9这组中选出的核酸序列有至少15%相同,在另一实施方案中至少20%相同,在另一实施方案中至少25%相同。
在本发明方法的另一实施方案中,重组核酸分子包括一个核酸序列,该序列在严谨杂交条件下,与编码一种GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的核酸序列杂交。这种编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的核酸序列包括从SEQ ID NO:1,SEQ IDNO:3,SEQ ID NO:5选出的核酸序列,GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶包括从SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:4,SEQ IDNO:6这组中选出的一段氨基酸序列。
在本发明方法的一个实施方案中,微生物选自细菌,真菌,微藻。在一个实施方案中,这种微生物耐酸。优选的细菌包括,但不限于,固氮菌和假单胞菌。优选的真菌包括,但不限于,酵母,其中包括但不限于腌菜糖酵母。优选的微藻包括,但不限于,Prototheca和衣藻属的微藻,Prototheca的微藻特别优选。
在本发明方法的另一实施方案中,微生物是耐酸的,培养的步骤在pH低于约6.0,更优选在pH低于约5.5,还更优选在pH低于约5.0的条件下进行。在一个实施方案中,培养的步骤能在一个包括除了D-甘露糖以外碳源的发酵培养基中进行,在另一实施方案中,培养的步骤在一个包括葡萄糖的发酵培养基中进行。
在本发明方法的另一实施方案中,培养的步骤在限制镁(Mg)含量的发酵培养基中进行。优选的,培养的步骤在限制镁(Mg)含量的发酵培养基中进行。在一实施方案中,在细胞生长期,发酵培养基含镁少于0.5g/L,还更优选地,更优选地,在细胞生长期镁低于0.1g/L。
本发明的另一实施方案涉及产生抗坏血酸和它的酯的微生物。该微生物通过一个遗传修饰来增加一种从下面一组中选出的酶的活性,该组包括:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶,GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。优选地,遗传修饰增加一种酶的活性,该酶包括:GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。更优选地,增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
在一实施方案中,微生物已经遗传修饰以表达一个编码差向异构酶的重组核酸分子,该酶催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖的转化,具有一个三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的Cα位点平均均方根偏差小于2。5埃,小于1埃更优选,该差向异构酶/还原酶由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表。在另一实施方案中,微生物已经遗传修饰以表达一个编码差向异构酶的重组核酸分子,该酶催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖的转化,该酶包含一个氨基酸序列,用CLUSTAL匹配程序与SEQ ID NO:11匹配,这一氨基酸序列中的氨基酸残基与至少50%SEQ ID NO:11的non-Xaa残基有100%的相同。优选地微生物已在前面讨论的方法中公开。
本发明的另一实施方案涉及产生抗坏血酸和它的酯的植物。该植物通过一个遗传修饰来增加一种酶的活性,该酶选自:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶,GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。在一优选实施方案中,所述遗传修饰为增加一种选自下组的酶的活性:GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。在更优选的实施方案中,这类遗传修饰是增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
在一实施方案中,所述植物还包括降低一种酶的作用的遗传修饰,该酶是除了GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶以外的另一种以GDP-D-甘露糖为底物的酶。这类遗传修饰包括降低GDP-D-甘露糖脱氢酶作用的遗传修饰。这类植物也包括经遗传修饰表达一个重组核酸分子的植物,该重组核酸分子编码一种催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化的酶,该酶有一个三级结构与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(其由具有Brookhaven蛋白数据库登陆码1bws的原子坐标表示)三级结构中至少25%Cα位点的平均均方根偏差小于2.5埃。在另一实施方案中,这类植物已经遗传修饰以表达一种编码差向异构酶的重组核酸分子,该酶催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化,其中该酶包含一个应用CLUSTAL匹配程序可与SEQ ID NO:11匹配的氨基酸序列,该序列中的氨基酸残基与SEQ ID NO:11的至少50%非-Xaa残基有100%相同性。
在一实施方案中,产生本发明抗坏血酸或其酯的植物是微藻。优选的微藻包括但不限于Prototheca和衣藻属的微藻,尤其优选Prototheca微藻。在另一实施方案中,所述植物是高等植物,优选可消耗的高等植物。
附图简述
图1A显示植物中从葡萄糖到GDP-D-甘露糖的转化。
图1B显示植物中从GDP-D-甘露糖到L-半乳糖-1-磷酸的转化。
图1C显示植物中从L-半乳糖到L-抗坏血酸的转化。
图2A显示Prototheca中特定碳原子自葡萄糖开始的流向。
图2B显示Prototheca中特定碳原子自葡萄糖开始的流向。
图3显示自Prototheca moriformis ATCC 75669衍生的突变系,以及它们产L-抗坏血酸的能力。
图4条形图显示NA45-3细胞株在含各种浓度镁离子的培养基中生长后,重悬于含各种浓度镁离子的培养基中,其中的静息细胞引起的底物转化。
图5线性图显示Prototheca菌株培养物中特定抗坏血酸的形成与相同培养物的细胞提取物中GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶之特异性活性的关系。
图6线性图显示在两种菌株ATCC 75669和EMS13-4中特异性差向异构酶活性与镁的限制程度的关系。
图7描述由Barber提出的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的主要催化机制(1979,生物化学杂志(J.Biol.Chem),254:7600-7603)。
图8A描述GDP-D-甘露糖-4,6-脱氢酶的催化机制(将GDP-D-甘露糖转化为GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖)。
图8B描述GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的催化机制(将GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖转化为GDP-L-岩藻糖)。(Chang等,1988,生物化学杂志,263:1693-1697;Barber,1980,植物生理(Plant Physiol),66:326-329)。
发明详述
本发明涉及用于生产维生素C(抗坏血酸,L-抗坏血酸,或AA)的生物合成方法和微生物和植物的生产。这类方法包括发酵遗传修饰的微生物以产生L-抗坏血酸。特别是,本发明涉及编码差向异构酶的核苷酸序列的使用,包括L-抗坏血酸途径中内源性GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,及与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶或UDP-半乳糖-4-差向异构酶有结构同源性(如所编码的蛋白质的核苷酸/氨基酸序列和/或三级结构有同源性)的差向异构酶,以提高抗坏血酸的生物合成产量。本发明也涉及遗传修饰的微生物,如,用于生产L-抗坏血酸的微藻,细菌和酵母菌株,和用于生产可消费植物食品的经遗传修饰的植物。
本发明的一个实施方案涉及通过发酵遗传修饰的微生物生产L-抗坏血酸的方法。这类方法包括步骤:(a)在发酵培养基中培养带一种遗传修饰的微生物,以增加下面一种的酶的活性:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶,GDP-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶;和(b)回收由抗坏血酸或其酯。列出的不同酶代表在植物维生素C生物合成途径中涉及的酶。目前还不清楚由GDP-L-半乳糖磷酸化酶代表的酶是磷酸化酶还是焦磷酸化酶(即,GDP-L-半乳糖焦磷酸化酶)。因此,这里使用术语“GDP-L-半乳糖磷酸化酶”指GDP-L-半乳糖磷酸化酶或GDP-L-半乳糖焦磷酸化酶。在本发明的一个方面,本方法包括在一个在发酵培养基中培养带一种遗传修饰的微生物的步骤,以增加催化从GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖的差向异构酶的作用。本发明此方面将详述如下。
本发明的另一实施方案涉及一种经遗传修饰产生抗坏血酸或其酯的微生物。本发明的另一实施方案涉及一种经遗传修饰产生抗坏血酸或其酯的植物。经遗传修饰的微生物(如细菌、酵母、微藻)和植物(如高等植物,微藻)具有增加选自下组的一种酶额作用的遗传修饰:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖异构酶,GDP-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。在一个优选的实施方案中,经遗传修饰的微生物(如细菌,酵母,微藻)和植物(如高等植物,微藻)具有增加催化GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖之酶的作用的遗传修饰。在一个实施方案中,所述遗传修饰包括用上述差向异构酶转化微生物或植物。
为了通过本发明方法生产明显高产量的L-抗坏血酸,遗传修饰植物和/或微生物以增强L-抗坏血酸的生产。如本文所用,遗传修饰的植物(如高等植物或微藻)或微生物,如微藻(Prototheca,衣藻),大肠杆菌,或酵母是在其基因组内进行修饰(即突变或改变)和/或经重组技术(即遗传工程)改变其正常(即野生型或天然)形式。在优选的实施方案中,根据本发明遗传修饰的植物或微生物已通过重组技术改造。植物或微生物的遗传修饰可通过经典菌株发育和/或分子遗传学技术包括遗传工程技术来完成。这类技术已基本在此公开,并另公开在如Sambrook等,1989,分子克隆:实验室指南,冷泉港实验室出版社;Roessler,1995,植物脂类代谢,46-48页;Roessler等,1994,“燃料的生物转化(Bioconversion for fuels)”一书,Himmel等编,美国化学协会,Washington D.C.,255-70页)。这些文献均全文引入本文作为参考。
在一些实施方案中,经遗传修饰的植物或微生物可包括天然遗传变体,以及下述植物或微生物,其中对核酸进行了插入,删除或修饰,包括内源性基因突变(如核苷酸的插入,删除,取代,和/或颠换),所用方式使所述改造在植物或微生物中提供所需效果。如上述,遗传修饰的植物或微生物包括用重组技术改造的植物或微生物。
如本文所用,导致基因表达减少,对基因表达或对基因产物(即,由该基因编码的蛋白)的抑制增加,基因功能降低,或基因产物的功能降低的遗传修饰均可称为基因的(完全或部分)失活,删除,中断,阻断,下调,或作用降低。如导致编码蛋白功能降低的基因改造可以是蛋白编码基因的彻底删除(即该基因不存在,因此该蛋白不存在),编码蛋白的基因中导致蛋白不完整或不翻译(如该蛋白不表达)的突变,或基因中减弱或消除该蛋白天然功能(如所表达的蛋白减少或没有酶活性)的突变。
导致基因表达增加或功能增加的遗传修饰可称为基因的扩增,过量产生,过量表达,激活,增强,添加,上调或作用增强。另外,改变基因的表达,功能或活性的遗传修饰可影响特定代谢途径中其它基因的作用和它们表达产物的活性(如通过抑制或竞争)。在该实施方案中,特定基因和/或其产物的作用(如活性)可通过对同一代谢途径中另一基因的遗传修饰而影响(如上调或下调),或通过对以竞争,抑制,底物形成等方式影响目的途径的另一代谢途径中某基因的遗传修饰而影响。
通常,具有影响L-抗坏血酸生产的遗传修饰的植物或微生物具有至少一个遗传修饰,如上述,其导致与相同条件培养的野生型植物或微生物相比,L-抗坏血酸的产生途径中有变化。在L-抗坏血酸产生途径中的这类改造,改变了该植物或微生物产生L-抗坏血酸的能力。根据本发明,经遗传修饰的植物或微生物优选比同样条件下培养的野生型植物或微生物产生L-抗坏血酸的能力增强。
本发明基于本发明者对L-抗坏血酸(维生素C)在植物和微生物的生物合成途径的发现。在本发明之前,植物生产L-抗坏血酸的代谢途径没有完全阐明。本发明者证实L-抗坏血酸在植物,包括产L-抗坏血酸之微生物(如微藻)中的生产,是一种利用GDP-D-甘露糖并涉及糖磷酸酯和NDP-糖的途径。另外,本发明人惊讶地发现,在产L-抗坏血酸微藻包括Prototheca和Chlorella pyrenoidosa中,L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯均能快速转变成L-抗坏血酸。在植物中L-抗坏血酸产生的完整途径在图1A-1C中显示。更具体地,图1A显示了L-抗坏血酸的植物内产生过程,从甘露糖中间体产生GDP-D-甘露糖,而后GDP-D-甘露糖经GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶(也称作GDP-D-甘露糖-3,5-差向异构酶)转化为GDP-L-半乳糖(图1B),然后向L-半乳糖-1-P、L-半乳糖、L-半乳糖酸(任选)、L-半乳糖酸-γ-内酯、及L-抗坏血酸转化(图1C)。图1B还说明利用各种中间产物如GDP-D-甘露糖的另一途径。该途径的某些方面已另行公开(Wheeler等,1998,天然393:365-369),其全文引用作为参考。
L-抗坏血酸产生途径中能作为遗传修饰的目标而影响L-抗坏血酸生成的位点通常可划分为以下途径中的至少一种:(a)影响GDP-D-甘露糖产生的途径(如将一种碳源转化为GDP-D-甘露糖的途径);(b)将GDP-D-甘露糖转化为其它化合物的途径;(c)与GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶作用相关或位于其下游的途径;(d)与L-抗坏血酸生产途径中任何中间产物的生成竞争底物的途径,所述中间产物尤其指GDP-D-甘露糖,GDP-L-半乳糖,L-半乳糖-1-磷酸,L-半乳糖,L-半乳糖酸-γ-内酯,和/或L-抗坏血酸;和(e)抑制L-抗坏血酸生产途径中任何中间产物的生成的途径,所述中间产物尤其指GDP-D-甘露糖,GDP-L-半乳糖,L-半乳糖-1-磷酸,L-半乳糖,L-半乳糖酸-γ-内酯,和/或L-抗坏血酸。
本发明方法中有用的经遗传修饰的植物或微生物通常在L-抗坏血酸生产途径中至少有一个遗传修饰,其使得L-抗坏血酸产量增加。在一个实施方案中,经遗传修饰的植物或微生物至少有一个遗传修饰使得:(a)GDP-D-甘露糖的产量增加,(b)抑制GDP-D-甘露糖转化为除GDP-L-半乳糖以外的化合物的途径;(c)增强GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用;(d)增强GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶下游酶的作用;(e)抑制与L-抗坏血酸生产途径中任何中间产物的生成竞争底物的途径,尤其与GDP-D-甘露糖,GDP-L-半乳糖,L-半乳糖-1-磷酸,L-半乳糖,L-半乳糖酸-γ-内酯,和/或L-抗坏血酸竞争的途径;和(f)抑制对L-抗坏血酸生产途径中任何中间产物的生成造成抑制的途径,尤其抑制GDP-D-甘露糖,GDP-L-半乳糖,L-半乳糖-1-磷酸,L-半乳糖,L-半乳糖酸-γ-内酯,和/或L-抗坏血酸的途径。
经植物或微生物的遗传修饰增加GDP-D-甘露糖的生产可通过如过量表达诸如己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶(PMI),磷酸甘露糖变位酶(PMM),和/或GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GMP)来实现。对GDP-D-甘露糖转化为除GDP-L-半乳糖以外的化合物的途径进行抑制可通过如对多糖合成、GDP-D-鼠李糖合成、GDP-L-岩藻糖合成、和/或GDP-D-甘露糖醛酸合成的抑制来实现。增强L-抗坏血酸生成途径中GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶及其下游酶的效应的遗传修饰包括但不限于:过量表达该差向异构酶基因(即过量表达编码该差向异构酶基因或其同源基因(如下述)的重组核酸分子),和/或使内源基因或重组基因突变以增强该基因的表达),和/或过量表达L-抗坏血酸途径中该差向异构酶下游编码后续酶的基因。最后,对与L-抗坏血酸产生途径竞争或对其抑制的途径进行抑制可通过使对L-抗坏血酸途径中的酶,底物或产物造成抑制或形成竞争的酶,底物或产物被删除或突变来实现。
如上述,本发明方法中有用的经遗传修饰的植物或微生物在编码涉及L-抗坏血酸产生途径的酶的基因中有至少一个遗传修饰(如内源基因的突变或加入重组基因)。这类遗传修饰优选地增加(即增强)这类酶的作用以便与其它在相关代谢途径中的可能终产物相比,L-抗坏血酸优先产生。这类遗传修饰包括,但不限于编码这类酶的基因的过量表达,和删除,突变或编码这类酶的竞争物或抑制物的基因的下调。可对其基因进行遗传修饰的酶优选包括:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶(PMI),磷酸甘露糖变位酶(PMM),GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GMP),GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。更优选地,本发明有用的经遗传修饰的植物或微生物含有增加一种酶作用的遗传修饰,该酶选自:GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和/或L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。更优选地,本发明有用的经遗传修饰的植物或微生物有一个增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶作用的遗传修饰。这些酶和被这些酶催化的反应在图1A-1C中例示。
在本发明之前,因为不知道L-抗坏血酸生物合成(即产生)途径,先前的诱变和筛选努力局限于仅能检测非致死突变。本发明的一个实施方案涉及删除一个使L-抗坏血酸合成中碳原子的流向转向的关键竞争酶。如果该酶对于生长于葡萄糖上绝对必需,那么缺少该酶(因此增加流向L-抗坏血酸的碳碳原子)的突变体将不能存活也无法用在先筛选工作进行检测。其中一种酶是磷酸果糖酸酶(PFK)(图2A)。PFK是生长于葡萄糖上所必需的,并且是把碳从L-抗坏血酸生物合成中转出的关键步骤。PFK的删除将使得细胞无法在基于葡萄糖的培养基上生长。通过改变温度而筛选PFK失活的条件突变体,可以如在允许发酵条件下使细胞生长并实现对L-抗坏血酸的加工,而将温度变为非允许条件时L-抗坏血酸的产生(从葡萄糖)受抑制。此例中,温度的变化将阻止碳原子从葡萄糖经PFK进入糖酵解,从而使碳原子进入L-抗坏血酸代谢途径。该方法不仅为天然的产L-抗坏血酸生物所用,还为本文所述L-抗坏血酸重组系统(遗传工作的植物或微生物)所用。
了解L-抗坏血酸产生途径中限速酶的特性和机制可设计该酶的特异性抑制物,其也抑制生长。筛选这类抑制物抗性突变体可分离包含L-抗坏血酸途径的酶且具有更优化动力学特性的菌株。因此,本发明的一个实施方案是鉴定同时也抑制生长的酶抑制物。再用这些抑制物筛选能克服这类抑制作用并能高水平产生L-抗坏血酸的基因突变体。在该实施方案中,所获植物或微生物是非重组菌株,可在必要时通过重组技术进一步改造。在产L-抗坏血酸的重组菌株中,可用随机诱变和筛选作为增加L-抗坏血酸产量的最后步骤。
在另一个实施方案中,直接对产L-抗坏血酸生物进行遗传修饰。这样可利用此前经典菌株改良工作中获得的数据进行改造,且可能更重要的是,可利用经典菌株改良期间出现的不明良性突变体。此外,表达天然基因相对于异源基因几乎很少遇到问题。用于开发微藻遗传系统的最优化系统是针对莱因哈德衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)。优选地,对这类遗传修饰的生产型生物的开发包括:用克隆的选择标志基因如URA 3分离有特殊营养要求的突变体(与在酵母和真菌系统中用的Ura3突变体相似);或识别和克隆对有毒化合物有特异性抗性的基因(这与在细菌系统中使用抗生素抗性基因类似,而在酵母和其它真菌中,需要反复插入/删除标志基因,除非已开发了几种不同的选择标志);用于将DNA导入生产型生物并获得稳定转化和表达的转化系统;和一个(优选几个)在生物中高水平表达克隆的基因的启动子系统。
本发明的另一实施方案(详述如下)是将产L-抗坏血酸生物(即高等植物和微藻)中关键基因或等位变体及其同源基因放入便于分子遗传操作的植物或微生物中,包括内源产L-抗坏血酸的微生物和合适的植物。如可根据在低pH值时的生长要求(在葡萄糖上)鉴定适当的非致病生物(即耐酸生物,详述如下)。
可在任何适宜的宿主生物中重组生产的一个合适选择是编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶及其同系物,和任何在一级结构(即序列)或三级结构(即,三维)水平上,与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶,或UDP-半乳糖-4-差向异构酶有结构相似的其它差向异构酶。很多微生物即使不产生L-抗坏血酸也产生GDP-D-甘露糖作为外源多糖和糖蛋白生成的前体。下面将详细讨论本发明的这一部分。
参考图1A-1C,很多生物中至少含有从葡萄糖-6-磷酸到GDP-D-甘露糖途径的某些酶。实际上,诸如维涅兰德固氮菌和铜绿假单胞菌等细菌中包含整个序列,并构成外源多糖藻酸盐生物合成的早期步骤。因此有可能阻止这些生物产生L-抗坏血酸的唯一方式是GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的缺乏。在如此众多生物中PMI,PMM和GMP(见图1A)的存在显得重要的原因有二。第一,通过依靠已有的早期途径上的酶和加入需要的克隆基因(差向异构酶及可能的其它成分),这些生物本身可以作为L-抗坏血酸生产的可替换宿主。第二,编码PMI,PMM和GMP的基因可以克隆进入新的生物,在其中与克隆的差向异构酶一起编码从葡萄糖-6-磷酸到GDP-L-半乳糖的整个途径。
为了从不同生物中筛选基因组DNA或cDNA文库,并分离编码这些酶如GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的核酸分子,可使用各种标准分子和生化技术,如可以从诸如Prototheca等生物中纯化GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,测定其N末端氨基酸序列(必要时包括内部肽片段的序列),此信息可用于设计从该生物DNA中扩增基因片段所需的简并引物,然后用此片段作探针筛选文库,将与该探针杂交的片段克隆进该生物或其它适合的生产型生物。植物酶在细菌如大肠杆菌中以活性形式表达有许多先例。此外,酵母也适于开发L-抗坏血酸生产的异源系统。
应理解本发明公开了一种方法,其包括使用能在发酵过程中产生商业有效量的L-抗坏血酸的微生物的使用(即其产L-抗坏血酸的能力比在相同条件下培养的野生型微生物强)。该方法通过对L-抗坏血酸途径中蛋白的一种或多种编码基因进行遗传修饰,导致产生(表达)比相应野生型蛋白功能改变(如增加或降低)的蛋白。优选通过重组技术实施这类遗传修饰。本领域技术人员将倾向于,诸如用编码特定酶的核酸分子转化植物或微生物,而产生特定功能已如本文其它处所述改变(如产GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的能力增强)的遗传修饰植物或微生物,可以产生大量符合所需功能要求的微生物,虽然可能需依赖多种不同的遗传修饰。如在特定核酸序列上的不同随机核苷酸删除和/或取代可以产生相同的表型(如该序列编码的酶活性降低)。本发明包括任何这类遗传修饰,其导致具有本文所述特征的植物和微生物的产生。
在本发明发酵方法中优选使用的微生物是已如上述公开进行了遗传修饰的细菌,真菌或微藻。虽然本发明包括利用对途径中关键组分的认识及本文提供的指导进行了遗传修饰,从而可产生L-抗坏血酸的微生物,但对本发明有用的微生物更优选能生产L-抗坏血酸的微藻。还更优选对本发明有用的微生物是耐酸微生物,如Prototheca和衣藻。耐酸酵母和细菌已为本领域所知。耐酸微生物详述见下。具体优选的微藻包括Prototheca和衣藻,最优选Prototheca。所有已知的Prototheca种都产生L-抗坏血酸。通过Prototheca和衣藻类微藻生产抗坏血酸详述于:1998年8月11日颁发的美国专利号5,792,631,和1999年5月4日颁发的美国专利号5,900,370,均已全文引入作参考。本发明优选使用的细菌包括,但不限于固氮菌,假单胞菌和埃希氏菌,虽然耐酸细菌更优选。本发明优选使用的真菌包括酵母,更优选糖酵母属酵母。在本发明发酵方法中使用的微生物是也可称为生产型生物。根据本发明,微藻在本文中即可作为微生物也可作为植物。
按照本发明,用于遗传修饰的优选植物是适于被动物包括人消耗的植物。更优选这类植物是能天然产生L-抗坏血酸的植物,但其它植物也能通过这里提供的方法经遗传修饰生产L-抗坏血酸。
Prototheca和Chlorella pyrenoidosa的L-抗坏血酸生产途径将作为本发明的具体实施方案描述如下。优选其它植物,特别是其它微生物,具有相似的L-抗坏血酸途径和基因和该途径中结构和功能相似的蛋白。优选对不能天然产生L-抗坏血酸的植物和微生物本发明进行改造,以产生L-抗坏血酸。这样,下述与Prototheca和衣藻有关的原则也适用于其它植物和微生物,包括遗传修饰的植物和微生物。
本发明的一个实施方案中,L-抗坏血酸产生途径中的酶活性通过该途径中酶的放大表达(即过量表达)来增加,特别是,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,该差向异构酶的同系物,和/或该差向异构酶下游的酶。酶的过量表达可通过如导入编码此酶的重组核酸分子而实现。优选将编码L-抗坏血酸生产途径中酶的基因置于人工启动子的控制下。该启动子可以是任何启动子,只要其使酶的表达在该生产型生物中确保足量的L-抗坏血酸。优选的启动子是组成型(不是诱导型)启动子,这样也无需加入昂贵的诱导物。根据本发明,重组核酸分子的基因量(拷贝数)根据最大产量的要求而不同。在一个实施方案中,编码L-抗坏血酸生产途径中基因的重组核酸分子被整合进该微生物的染色体中。
本发明的另一实施方案提供一种微生物,其L-抗坏血酸产生途径中有一或多种酶与底物的亲和力增加。与底物亲和力增加的酶能由遗传修饰或蛋白质工程的适当方法产生。如基于计算机的蛋白质工程能用来设计具有更大的稳定性和对底物更大亲和力的差向异构酶蛋白。见如,Maulik等,1997,分子生物技术:治疗应用和策略,Wiley-Liss,Inc,全文引用作为参考。
编码L-抗坏血酸产生途径中蛋白的重组核酸分子能用任何适当的遗传修饰方法改造而增加或减少该蛋白的功能(即活性),如按所需增加L-抗坏血酸产量。例如,编码蛋白的重组核酸分子能通过任何方法如易错PCR实施核苷酸的插入,删除,和/或取代。在该方法中,该基因在特定条件下扩增,所述条件致使扩增所用DNA聚合酶产生高频掺入错误。于是,在PCR产物中得到高频率突变。通过检验突变基因致使待检微生物比携带非突变重组核酸分子的微生物L-抗坏血酸的生产增加的能力,可筛选基因突变体的增强的底物亲和力、增强的酶活性、或降低/增强的抑制能力。
本发明的另一实施方案包括一种微生物,其竞争性附反应受到阻碍,包括所有以GDP-D-甘露糖为底物但不产生L-抗坏血酸的反应。在一个优选的实施方案中,提供了与GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶竞争GDP-D-甘露糖底物的酶的编码基因完全或部分失活(作用降低)的微生物。这类酶包括GDP-D-甘露聚糖酶和/或GDP-D-甘露糖脱氢酶。如本文所用,基因的失活可指导致该基因活性(即表达或功能)降低,包括活性减弱或完全丧失的任何修饰。
如上述,通过本发明中遗传修饰微生物的发酵来生产L-抗坏血酸的一个具体优选方法包括在发酵培养基中培养微生物的步骤,该微生物具有使催化GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖的差向异构酶活性增加的遗传修饰。根据本发明,这类差向异构酶包括上述L-抗坏血酸途径中内源的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶和任何其它在一级结构(即序列)或三级结构(即三维)水平上,与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶,或UDP-半乳糖-4-差向异构酶有结构相似的差向异构酶。这类结构同源性在下文详述。优选这类差向异构酶能催化GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖。在一个实施方案中,所述遗传修饰包括用表达这类差向异构酶的重组核酸分子转化该微生物。
因此,本发明方法和生物中所含差向异构酶包括,在L-抗坏血酸天然生物合成途径中工作的内源差向异构酶(本文指GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶),GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶,和能催化GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖并与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶,或UDP-半乳糖-4-差向异构酶结构相似的任何其它差向异构酶。本发明能催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化的差向异构酶可以通过生化和功能特征以及结构特征来识别。如本发明差向异构酶能作用于GDP-D-甘露糖底物,更特别地,这类差向异构酶能催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化。需要理解这类能力不一定是差向异构酶在其内源(即天然)环境下作用的正常或天然的功能。如GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶在其天然环境中的正常条件下,催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-岩藻糖的转化而不直接作用于GDP-D-甘露糖(见图8A,B),但本发明是利用差向异构酶能或经改造后能催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化的能力生产抗坏血酸。因此,本发明包括:用于抗坏血酸生产中有期望酶活的,能具有这类期望酶活的,和/或能经改造或诱导具有这类期望酶活的差向异构酶。
在一个实施方案中,本发明的差向异构酶包括催化如图7所述反应的差向异构酶。在另一个实施方案中,本发明的差向异构酶包括催化如图8B描述的第一个反应中的差向异构酶。在一个实施方案中,本发明一个差向异构酶与NAPDH结合。在另一个实施方案中,本发明差向异构酶的酶活性依赖NAPDH。
如上所述,本发明人已发现在植物或微生物L-抗坏血酸生物合成途径中的一个关键酶是GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶(参见图1A-1C)。这里描述的本发明的一个实施方案是为了对该酶及其结构类似物进行改造以增加遗传工程植物和/或微生物的L-抗坏血酸产量。更具体地,L-抗坏血酸途径的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶和GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶被认为在序列和三级结构水平上是结构同系物;GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶被认为能在L-抗坏血酸生物合成途径中起作用;GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶或其同系物可能比GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶更能增加遗传修饰的植物和/或微生物中L-抗坏血酸的生产。而且,本发明人公开了用编码全部或部分GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的核苷酸序列作探针鉴定编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的基因。相似地,本发明人公开了用编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶基因的核苷酸序列设计寡核苷酸引物,用于经PCR鉴定并克隆编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的基因。
不束缚于理论,本发明人认为下列证据支持新概念:GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶在序列和/或三级结构水平上有显著的结构同源性,GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶和/或其同系物可用于抗坏血酸的生产和/或分离内源GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶。
虽然在本发明以前,并不知道GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶(也称为GDP-D-甘露糖-3,5-差向异构酶)在L-抗坏血酸生物合成中起关键作用,但它被描述成能总体上催化GDP-D-甘露糖和GDP-L-半乳糖的可逆反应(Barber,1971,Arch.Biochem.Biophys.147:619-623;Barber,1975,Arch.Biochem.Biophys.167:718-722;Barber,1979,生物化学杂志254:7600-7603;Hebda等,1979,Arch.Biochem.Biophys.194:496-502;Barber和Hebda,1982,酶学方法(Meth.Enzymol.) 83:522-525)。虽然有这些研究,但GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的特性一直未得到明确认识,其编码基因也没有被克隆和测序。自从Barber的开创性工作以后,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的活性由本申请的承让人在无色的微藻Prototheca moriformis中测到,在拟南芥和豌豆胚轴中也测到了(Wheeler等,1998,同上)。
Barber(1979,生物化学杂志,254:7600-7603)提出了部分纯化自衣藻Chlorella pyrenoidosa的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的机制。提出的GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖的整个转化过程包括:氧化C-4位的己糖基为酮基中间体,形成烯二醇(ene-diol),通过双键的再水化以及酮基的立体专一性还原在C-3和C-5位发生构象转化。提议的机制见图7。
基于Barber的工作,Feingold和Avigad(1980,植物生物化学,第3卷:糖;结构和功能,P.K.Stompf和E.E.Conn编,学术出版社(AcademicPress),NY)在提出的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的机制上作了更详细的阐述。该机制基于以下假设:差向异构酶包含紧密结合的NAD+,一个氢阴离子从底物(GDP-D-甘露糖)C-4转移到与酶结合的NAD+上从而把该酶转化为还原形式(NADH),产生酶-结合GDP-4-酮基-D-甘露糖。后者将通过烯二醇机制差向异构化。终产物(GDP-L-半乳糖)在将最初从C-4移去的氢阴离子立体专一的转移后,从酶上释放出来,同时产生氧化型的酶。
L-岩藻糖(6-脱氧-L-半乳糖)是细菌脂多糖,哺乳动物和植物的糖蛋白及植物细胞壁多糖的一个成分。L-岩藻糖从GDP-D-甘露糖经GDP-D-甘露糖-4,6-脱氢酶(一个依赖NAD(P)的酶),和一个双功能GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(依赖NADPH),在科学文献中也被称作GDP-岩藻糖合成酶的依次作用而重新合成(Rizzi等,1998,结构6:1453-1465;Somers等,1998,结构6:1601-1612)。L-岩藻糖的这一生物合成途径看起来是普遍的(Rizzi等,1998,结构6:1453-1465)。GDP-D-甘露糖-4,6-脱氢酶和GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的机制在图8A,B中显示(Chang等,1988,生物化学杂志,263:1693-1697;Barber,1980,植物生理学,66:326-329)。
将图7和图8A,B比较显示Barber提出的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的机制与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的反应机制类似。同样的机制也显示在两种TDP-6-脱氧-己糖自TDP-D-葡萄糖的生物合成中发生的差向异构反应中,这两种己糖是TDP-L-鼠李糖和TDP-6-脱氧-L-塔罗糖(Liu和Thorson,1994,微生物年鉴(Ann.Rev.Microbiol)48:223-256)。但在后一情形中,最终C-4的还原由该差向异构酶中分离的依赖NADPH的还原酶催化。这些还原酶具有对应于TDP-L-鼠李糖或TDP-6-脱氧-L-塔罗糖的立体专一性(Liu和Thorson,1994,微生物年鉴48:223-256)。
在上述所有机制中,在C-4的最终还原需要NAD(P)H(参见图8B)。在Hebda等的工作中(1979,Arch.Biochem.Biophys.194:496-502),报告C.pyrenoidosa的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的活性不需要NAD,NADP或NADH。奇怪的是,未检测NADPH。基于与图7和8A,B所示类似的机制,本发明人认为C.pyrenoidosa的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶可能在最后的还原步骤中需要NADPH。为什么体外没有加入NADPH可以测到活性还不知道,但NADPH与酶的紧密结合可以解释这一现象。另一方面,如果Feingold和Avigad提出的机制(1980,植物生物化学,卷3,101-170页:糖;结构和功能,P.K.Stompf和E.E.Conn编,学术出版社,NY)是正确的,这类产生于差向异构酶反应的第一个氧化步骤,被还原的酶结合的辅因子将在最后一步C-4位酮基还原醇的反应中作为电子源。这样在体外无需加入活性所需的外源还原辅因子。
最近,编码双功能GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的人基因被克隆出来并进行了序列分析(Tonetti等,1996,生物化学杂志,271:27274-27279)。人GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的氨基酸序列与大肠杆菌GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶有明显的同源性(29%)(Tonetti等,1998,Acta Cryst,D54:684-686;Somers等,1998,结构6:1601-1612,这里都全文引用作为参考)。Tonetti等和Somers等还发现了大肠杆菌GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶(也称为GDP-岩藻糖合成酶)的三级(三维)结构,并提到其与另一种酶UDP-半乳糖-4-差向异构酶(GalE)结构上显著同源。这些差向异构酶在序列水平上也有明显的同源性。既然编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的基因尚未克隆和测序,与编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的基因或编码UDP-半乳糖-4-差向异构酶的基因之间的同源性就没有揭示过。但是,基于GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶和GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶反应产物(即分别是GDP-L-半乳糖和GDP-6-脱氧-半乳糖[即GDP-L-岩藻糖])的相似性和相同的催化机制(图7和图8A,B),本发明人相信编码这些酶的基因会有很高程度的序列同源性和三级结构同源性。
GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶和GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶明显的结构同源性使GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶或其同系物可以在L-抗坏血酸生物合成途径中起作用,并且在遗传修饰的植物和/或微生物中GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶可能比GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶更能增加L-抗坏血酸的生产。而且,编码全部或部分GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的核苷酸序列可以用作识别编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的基因。同样的,编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶基因的核苷酸序列可用来设计寡核苷酸引物,用于经PCR识别并克隆编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的基因。
用GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶取代GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶在植物或微生物中增加L-抗坏血酸分生物合成的能力取决于GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶直接作用于GDP-D-甘露糖而形成GDP-L-半乳糖的能力。有证据显示该可能性确实存在。拟南芥murl突变体的GDP-D-甘露糖-4,6-脱氢酶活性缺失(Bonin等,1997,美国国家科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.)94:2085-2090)。这些突变体因此在GDP-L-岩藻糖的生物合成中受阻,结果植物气生部分的初生细胞壁中L-岩藻糖量低于正常情况的2%(Zablackis等,1996,科学272:1808-1810)。该murl突变体比野生型植物更脆弱,略微矮小,有正常的生活周期(Zablackis等,272:1808-1810)。当murl突变体在外源L-岩藻糖存在时生长,该植物中L-岩藻糖的含量恢复到野生型的水平(Bonin等,1997,美国国家科学院院报94:2085-2090)。有人(Zablackis等,1996,科学272:1808-1810)发现murl突变体在初生细胞壁的半纤维素木葡聚糖(xyloglucan)成分中含代替正常L-岩藻糖的L-半乳糖。在木葡聚糖成分中通常不会发现L-半乳糖,但在murl突变体中L-半乳糖部分代替了末端L-岩藻糖残基。Bonin等(1997,美国国家科学院院报94:2085-2090)推测在murl突变体缺乏GDP-D-甘露糖-4,6-脱氢酶时,通常参与L-岩藻糖合成的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶可直接利用GDP-D-甘露糖形成GDP-L-半乳糖。但另一种可能是涉及拟南芥L-抗坏血酸的生物合成的酶在murl突变体中合成GDP-L-半乳糖。如果这是真的,将意味着在野生型植物中,存在某些机制阻止L-抗坏血酸途径中形成的GDP-L-半乳糖进入细胞壁生物合成途径并取代GDP-L-岩藻糖(与之竞争)掺入木葡聚糖(因为L-半乳糖在野生型植物的初生细胞壁中不存在)。
因为GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶和GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶在反应机制上相似,并因为DP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶能直接作用于GDP-D-甘露糖形成GDP-L-半乳糖,本发明人相信编码所有针对GDP-D-甘露糖的差向异构酶和差向异构酶/还原酶的基因具有高度同源性。这样,本发明的一个方面涉及使用与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶或UDP-半乳糖-4-差向异构酶具有明显同源性(在一级,二级和/或三级结构水平)的任意差向异构酶(和编码它的核酸序列),目的在于增加L-抗坏血酸生物合成产量。
因此,如上所述,本发明的一个实施方案涉及在微生物中生产抗坏血酸或其酯的方法,包括培养一种经遗传修饰的微生物,该遗传修饰是要增加催化GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖的差向异构酶的作用。本发明也包括经遗传修饰的微生物和植物,对它们的遗传修饰是为了增加催化GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖的差向异构酶的作用。
按照本发明,在L-抗坏血酸生产途径中GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶作用的增加可以通过遗传修饰来实现,所述遗传修饰包括,但不限于过量表达GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶基因,其同源基因,或任何重组核酸序列,其编码的异构酶在一级结构(核酸或氨基酸序列)或三级结构(即三维蛋白)上与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶,或UDP-半乳糖-4-差向异构酶同源,如通过过量表达编码差向异构酶基因或其同源基因的重组核酸分子和/或通过突变内源基因或重组基因以增强该基因的表达。
根据本发明,在三级结构上与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构有同源性的酶是这样一种酶,它具有的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构基本相符(表12)。在另一个实施方案中,在三级结构上与GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构有同源性的酶是这样一种酶,它具有的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1GFS的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构基本相符。如本文所用,蛋白的“三级结构”或“三维结构”是可替换的术语,指组成该蛋白质三维空间的成分及其排列的方式。术语“基本符合”指差向异构酶至少有部分三级结构在空间上与一特定原子坐标组(如由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的那些)至少部分特定的三维构象充分相似,这样以该特定原子坐标组为基础估计确定该酶三维构象的原子坐标,就可对该酶至少该部分的三级结构模型化或计算(即,通过分子取代)。
更具体地,基本符合一组特定原子坐标的三级结构在至少约25%的Cα位点与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的三级结构相比,平均均方根偏差(RMSD)小于约2.5埃,更优选小于约2埃,按优选性递增,小于约1.5埃,小于约1埃,小于约0.5埃,最优选小于约0.3埃。在另一个实验方案中,基本符合一组特定原子坐标的三级结构在至少约50%的Cα位点与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的三级结构相比,具有上述平均均方根偏差(RMSD)。在另一个实验方案中,这类结构在至少约75%的Cα位点与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的三级结构相比,具有上述平均均方根偏差(RMSD)。在另一个实验方案中,这类结构在约100%的Cα位点与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的三级结构相比,具有上述平均均方根偏差(RMSD)。计算RMSD的方法在本领域为人所熟知。测定一种或多种蛋白三级结构同源性的不同软件在本技术领域为人所知,并可公开得到,如QUANTA(Molecular Simulations Inc。)
按本方法及本发明遗传修饰的生物,催化从GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化优选的差向异构酶有一个底物结合位点,其三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的底物结合位点的三级结构基本上相符。优选地,该酶底物结合位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶底物结合位点的三级结构相比,在至少25%的Cα位点中平均均方根偏差(RMSD)小于约2.5埃,更优选小于约2埃,按优选性递增,小于约1.5埃,小于约1埃,小于约0.5埃,最优选小于约0.3埃。在其它实验方案中,该差向异构酶底物结合位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶底物结合位点的三级结构相比,在至少50%的Cα位点中具有上述平均均方根偏差(RMSD)。在另一实验方案中,该差向异构酶底物结合位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶底物结合位点的三级结构相比,在至少75%的Cα位点中具有上述平均均方根偏差(RMSD)。在另一实验方案中,该差向异构酶底物结合位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶底物结合位点的三级结构相比,在约100%的Cα位点中具有上述平均均方根偏差(RMSD)。由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶底物结合位点的三级结构在Rizzi等,1998,同上中详述。另外,由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1GFS的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶底物结合位点的三级结构在Somers等,1998,同上中详述。
本发明另一优选的差向异构酶包含一个催化位点,其三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的催化位点的三级结构基本上相符。优选地,该差向异构酶催化位点的三级结构在至少25%的Cα位点上与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶催化位点的三级结构相比,平均均方根偏差小于约2.5埃,更优选小于约2埃,按优选性递增,小于约1.5埃,小于约1埃,小于约0.5埃,最优选小于约0.3埃。在其它实施方案中,该差向异构酶催化位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶催化位点的三级结构相比,在至少50%的Cα位点中具有上述平均均方根偏差(RMSD)。在另一实施方案中,该差向异构酶催化位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶催化位点的三级结构相比,在至少75%的Cα位点中具有上述平均均方根偏差(RMSD)。在又一实施方案中,该差向异构酶催化位点的三级结构与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶催化位点的三级结构相比,在约100%的Cα位点中具有上述平均均方根偏差(RMSD)。
在一个实施方案中,本发明包括的差向异构酶在其一个催化位点中包括丝氨酸,酪氨酸和赖氨酸残基。在一优选实施方案中,丝氨酸,酪氨酸,赖氨酸残基的三级结构位置分别与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的Ser107,Tyr136和Lys140残基的三级结构位置基本上相符。由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶催化位点的三级结构在Rizzi等,1998,同上中详述。另外,由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1GFS的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶催化位点的三级结构在Somers等,1998,同上中详述。
在一个更优选的实施方案中,上述“基本符合”可进一步定义为包括氨基酸侧链的原子。如本文所用,短语“共有氨基酸侧链”是指其为基本符合一组给定原子坐标的结构和确实由这类原子坐标代表的结构所共有。优选地,基本符合一组特定原子坐标的结构是在至少25%的共有氨基酸侧链上与由该组原子坐标代表的三级结构相比,平均均方根偏差(RMSD)小于约2.5埃,更优选小于约2埃,按优选性递增,小于约1.5埃,小于约1埃,小于约0.5埃,最优选小于约0.3埃。在另一实施方案中,基本符合一组特定原子坐标的结构是在至少50%的共有氨基酸侧链上与由该组原子坐标代表的三级结构相比,具有上述平均均方根偏差(RMSD),在又一实施方案中,该结构在至少75%的氨基酸侧链上与由该组原子坐标代表的三级结构相比,具有上述平均均方根偏差(RMSD),在又一实施方案中,该结构在约100%的氨基酸侧链上与由该组原子坐标代表的三级结构相比,具有上述平均均方根偏差(RMSD)。
基本符合一组特定原子坐标的差向异构酶的三级结构可用合适的模型化计算机程序如MODELER(A.Sali和T.L.Blundell,分子生物学杂志,卷234:779-815,1993,如在InsightⅡ同源软件包(InsightⅡ(97.0),MSI,圣地亚哥)中实施的),使用诸如衍生自如下数据的信息而模型化:(1)该差向异构酶的氨基酸序列;(2)由该特定原子坐标组代表的蛋白质相关部分的具有三维构象的氨基酸序列;和(3)该特定三维构象的原子坐标。或,基本符合一特定原子坐标组的差向异构酶的三级结构可用分析该差向异构酶晶体结构时产生的数据来模型化。基本符合一特定原子坐标组的差向异构酶的三级结构也可用如分子取代这样的方法计算出来。分子取代的方法为本领域的技术人员熟知(主要见Bmnger,酶学方法,卷276,558-580页,1997;Navaza和Saludjian,酶学方法,卷276,581-594页,1997;Tong和Rossmann,酶学方法,卷276,594-611页,1997;和Bentley,酶学方法,卷276,611-619页,1997;这里全文引用每篇文献作为参考)并在软件程序如XPLOR(Brunger等,科学,卷235,458页1987)中运行。另外,可用主要由Sali,生物技术当前观点(Current Opinion in Biotechnology),卷6,437-451,1995所述的技术使结构模型化,并可在程序包如Homology 95.0(在Biosym/MSI,San Diego,CA提供的Insight Ⅱ程序中)中实施运算。使用Homology 95.0要求将已知三维结构的氨基酸序列与将要模型化的目标结构的氨基酸序列对比。对比可以是成对对比或包括其它相关序列的多序列对比(如用主要由Rost,酶学方法,卷266,525-539,1996所述的方法)以增加精确性。结构保守性区域可通过比较相关结构特征而鉴定,或通过检查已知结构和目标结构的序列同源性程度而鉴定。用已知结构的坐标指定目标结构的特定坐标。目标结构其它区域的坐标可利用如Brookhaven国家实验室,Upton,NY.支持的蛋白质数据库中找到的已知结构中的片段产生。目标结构侧链的构象可参照空间合理性并利用旋转异构体库及它们的出现频率来确定。(主要如Ponder和Richards,分子生物学杂志,卷193,775-791页,1987所述)。所得目标结构的模型可通过分子机制(诸如Biosym/MSI提供的Discover程序中所含)来精确确定以保证该模型在化学和构象上是合理的。
根据本发明,在核酸序列一级结构水平上与编码GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶或UDP-半乳糖-4-差向异构酶的核酸序列有同源性(即是其同系物)的差向异构酶包括下列核酸序列编码的任何酶:该序列与编码GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶或UDP-半乳糖-4-差向异构酶的核酸序列,优选选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQID NO:7或SEQ ID NO:9的序列有至少约15%,优选至少约20%,更优选至少约25%,甚至更优选至少约30%的同源性。相似的,与GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶或UDP-半乳糖-4-差向异构酶的氨基酸序列有同源性(即是其同源物)的差向异构酶包括具有下列氨基酸序列的任何酶:该序列与GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶或UDP-半乳糖-4-差向异构酶的氨基酸序列,优选选自SEQ ID NO:2,SEQID NO:4,SEQID NO:6,SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:10的序列有至少约15%,优选约20%,更优选约25%,甚至更优选30%的同源性。
根据本发明的一个实施方案,两个或多个核酸或氨基酸序列的同源性或相同百分比用本领域已知用于对比和/或计算相同百分比的方法计算。如为比较两个或多个上述序列的同源性/目同百分比,使用DNASTAR中的模块(DNASTAR,Inc.,Madison,Wisconsin)。具体地,为计算两个核酸或氨基酸序列的相同百分比,优选使用DNASTAR程序中MegAlign模块提供的Lipman-Person方法,参数如下(本文也称为Lipman-Pearson标准缺省参数):
(1)Ktuple=2
(2)空隙罚分=4
(3)空隙长度罚分=12
使用Lipman-Person方法和这些参数时,大肠杆菌GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶(SEQ ID NO:4)和人GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶(FX)(SEQ ID NO:6)的氨基酸序列相同百分比是27.7%,与Tonetti等1998,Acta Cryst.D54:684-686中记述的27%相同性相当。
根据本发明的另一个实施方案,对比两或多个核酸或氨基酸序列,以产生一个共有序列或评估这些序列上各种位点的相似性时,也可用同为DNASTAR中模块的CLUSTAL对比程序(如CLUSTAL,CLUSTAL V,CLUSTAL W),所用参数如下(本文也称为CLUSTAL标准缺省参数):
多重对比参数(即用于2个以上序列):
(1)空隙罚分=10
(2)空隙长度罚分=10;
成对对比参数(即用于两个序列):
(1)Ktuple=1;
(2)空隙罚分=3;
(3)窗=5;
(4)所保留的对角线(Diagonals saved)=5;
根据本发明,GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶可以是来自任何生物,包括拟南芥,大肠杆菌和人的GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶。编码拟南芥GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶的核酸序列这里由SEQ ID NO:1代表。SEQ ID NO:1编码的GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶具有这里由SEQ ID NO:2代表的氨基酸序列。编码大肠杆菌GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶的核酸序列这里由SEQID NO:3代表。SEQ ID NO:3编码的GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶具有这里由SEQ ID NO:4代表的氨基酸序列。编码人类GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶的核酸序列这里由SEQ ID NO:5代表。SEQID NO:5编码的GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶具有这里由SEQID NO:6代表的氨基酸序列。
根据本发明,UDP-半乳糖-4-差向异构酶可以是来自任何生物,包括大肠杆菌和人的UDP-半乳糖-4-差向异构酶。编码大肠杆菌UDP-半乳糖-4-差向异构酶的核酸序列这里由SEQ ID NO:7代表,SEQ ID NO:7编码的UDP-半乳糖-4-差向异构酶具有这里由SEQ ID NO:8代表的氨基酸序列。编码人类UDP-半乳糖-4-差向异构酶的核酸序列这里由SEQ ID NO:9代表,SEQID NO:9编码的UDP-半乳糖-4-差向异构酶具有这里由SEQ ID NO:10代表的氨基酸序列。
在一优选的实施方案中,本发明包括的差向异构酶具有一个氨基酸序列,该序列用诸如CLUSTAL对比程序与SEQ ID NO:11对比时,其中的氨基酸残基与SEQ ID NO:11的至少约50%,优选至少约75%,更优选至少约90%,甚至更优选至少约100%的非-Xaa残基100%相同。将100%匹配于SEQ ID NO:11的非-Xaa残基数除以SEQ ID NO:11中非-Xaa残基总数可得到与非-Xaa残基100%相同的残基的相同百分比。编码本发明差向异构酶的优选核酸序列包括下述核酸序列,其编码具有与SEQ ID NO:11有上述相同性之氨基酸序列的差向异构酶。使用CLUSTAL对比程序的这类对比是基于本文前面公开的相同参数。SEQ ID NO:11代表差向异构酶的一种共有氨基酸序列,其通过对比SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:4,SEQ IDNO:6,SEQ ID NO:8的氨基酸序列的至少部分而产生(如Somer等,1998,结构6:1601-1612所述)并几乎可用CLUSTAL重复。
在另一个实施方案中,属于本发明的差向异构酶包括在其催化位点含丝氨酸,酪氨酸和赖氨酸的差向异构酶。优选地,这类丝氨酸,酪氨酸和赖氨酸残基在该差向异构酶氨基酸序列上的位置是,用CLUSTAL对比程序对应于SEQ ID NO:11之共有序列的Ser105,Tyr134,Lys138位点,SEQ IDNO:2的Ser109,Tyr138,Lys142位点,SEQ ID NO:4的Ser107,Tyr136,Lys140位点,SEQ ID NO:6的Ser114,Tyr143,Lys147位点,SEQ ID NO:8的Ser124,Tyr149,Lys153位点,或SEQ ID NO:10的Ser132,Tyr157,Lys161位点。
在另一个实施方案中,具有同源于编码GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶之氨基酸序列的氨基酸序列的差向异构酶包括具有氨基酸基序:Gly-Xaa-Xaa-Gly-Xaa-Xaa-Gly的任何差向异构酶,该基序发现于,如SEQ ID NO:11之共有序列的位点8到14,SEQ ID NO:2的位点12到18,SEQ ID NO:4的位点10到16,SEQ ID NO:6的位点14到20,SEQ ID NO:8的位点7到13,SEQ ID NO:10的位点9到15。这类基序可通过用CLUSTAL对比程序与上面确认的氨基酸序列中的相同基序对比来鉴定。
在又一个实施方案中,本发明的差向异构酶包括底物结合位点含如下氨基酸残基的差向异构酶,所述氨基酸残基用CLUSTAL对比程序与SEQID NO:4的氨基酸位点Asn177,Ser178,Arg187,Arg209,Lys283,Asn165,Ser107,Ser108,Cys109,Asn133,Tyr136和His179中的至少50%可比。与位点Ser107,Tyr136,Asn165,Arg209的对比优选100%相同(即在对比参数下,残基完全匹配)。
在本发明的另一个实施方案中,本发明的差向异构酶包含至少4个连续氨基酸残基,其与选自SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:8,或SEQ ID NO:10的氨基酸序列中至少4个连续氨基酸残基100%相同,如以Lipman-Pearson标准缺省参数用Lipman-Pearson方法所测定或如以CLUSTAL标准缺省参数用CLUSTAL程序所对比的那样。本发明中术语“连续”指在不间断序列中连接。一个序列与另一个序列“100%相同”指第一个序列与第二个序列完全匹配,核苷酸或氨基酸之间没有空隙。
在本发明的另一个实施方案中,本发明的差向异构酶由如下核酸序列编码,该序列包含至少12个连续的核苷酸残基,其与选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7,或SEQ ID NO:10的核酸序列中至少12个连续的氨基酸残基100%相同,如以Lipman-Pearson标准缺省参数用Lipman-Pearson方法所测定或如以CLUSTAL标准缺省参数用CLUSTAL程序所对比的那样。
在本发明的另一个实施方案中,本发明的差向异构酶由如下核酸序列编码,该序列在严谨杂交条件下与选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQID NO:7或SEQ ID NO:9的核酸序列杂交。如本文使用的,严谨杂交条件指用核酸分子鉴定类似核酸分子的标准杂交条件。这类条件已公开,如在:Sambrook等,1989分子克隆:实验室指南,冷泉港实验室出版社,1989。Sambrook等,同上已全文引入作为参考(尤其见9.31-9.62页)。另外,用于计算适当杂交和洗脱条件以得到允许不同程度核苷酸错配的杂交的公式也已公开,如在Meinkoth等,1984,Anal.Biochem.138,267-284;Meinkoth等,同上已全文引入作为参考。
更具体地,本文的严谨杂交和洗脱条件指允许与杂交反应中作为探针的核酸分子有至少70%,更优选至少约75%,最优选至少约80%的序列相同性的核酸分子分离的条件。这类条件根据是进行DNA:RNA杂交还是DNA:DNA杂交而不同。DNA:DNA杂合体的理论解链温度比DNA:RNA杂合体低10℃。在具体实施方案中,DNA:DNA杂交的严谨条件包括在离子强度6XSSC(0.9M Na+)下,以约20℃到约35℃之间,更优选约28℃到约40℃之间,甚至更优选约35℃到约45℃之间的一个温度杂交。在具体实施方案中,DNA∶RNA的严谨杂交条件包括在离子强度6XSSC(0.9M Na+)下,以约30℃到约45℃之间,更优选约38℃到约50℃之间,甚至更优选约45℃到约55℃之间的一个温度杂交。这些值是基于超过100个核苷酸、0%甲酰胺和G+C含量约40%的分子的解链温度的计算结果。另外,Tm可如Sambrook等,同上,9.31到9.62页所述凭经验计算。
在本发明的另一个实施方案中,本发明的差向异构酶由选自SEQ IDNO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7,或SEQ ID NO:9的核酸序列或它们的片段编码,其中该片段编码的蛋白在诸如生理条件下能催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖的转化。在另一个实施方案中,本发明的差向异构酶包含选自SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:8,或SEQ ID NO:10的氨基酸序列或它们的片段,其中该片段能催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖的转化。需要理解编码这里确定的氨基酸序列的核酸序列因简并性可有所变化。如本文所用,核苷酸简并性指一个氨基酸可由不同核苷酸密码子编码。
本发明的一个实施方案涉及对催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化的差向异构酶的鉴定方法。优选地,该方法用于鉴定内源性(即在微生物和/或植物的天然L-抗坏血酸生物合成途径中)催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶。这类方法可包括以下步骤:(a)在严谨杂交条件下,使核酸分子源与长度为至少12个核苷酸的寡核苷酸接触,其中该寡核苷酸因其在严谨条件下与选自SEQ IDNO:1,SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:5的核酸序列杂交的能力而得以鉴定。(b)鉴定该核酸分子源中能在严谨杂交条件与该寡核苷酸杂交的核酸分子。通过这类方法鉴定的核酸分子可随后用标准分子生物学技术从该来源中分离。优选地,核酸分子源从具有抗坏血酸产生途径的微生物或植物中获得。这类核酸分子源可以是从生物分离出的和/或能通过与诸如探针或PCR引物等寡核苷酸杂交而筛选得到的任何核酸分子源。这类来源包括基因组和cDNA文库和分离的RNA。
为了从各种生物中筛选cDNA文库并分离编码GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶及相关差向异构酶等酶的核酸分子,可使用任何变化了的标准分子和生物化学技术。如可用GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶的核酸序列中最保守的区域设计寡核苷酸引物,优选简并引物,且这类引物可用于从分离自目的生物(如具有L-抗坏血酸途径的微生物或植物)的核酸(如基因组或cDNA文库)中经聚合酶链式反应(PCR)扩增出相同或相关的差向异构酶,包括该抗坏血酸途径的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶。相似的,可用GDP-4-酮基-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶的核酸序列中最保守的区域设计寡核苷酸引物,且这类探针可用于鉴定和分离基因组或cDNA文库中在低,中,或高严谨条件下与该探针杂交的核酸分子。
或者,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶可从诸如Prototheca等生物中纯化,N末端氨基酸序列可以被测定(包括内部肽段的序列),并且该信息能用于设计简并引物以从该生物cDNA扩增基因片段。该片段可随后用于探测该cDNA文库,并随后在该生物或其它合适的生产型生物中克隆出与该探针杂交的片段。植物酶在细菌如大肠杆菌中以活性形式表达已有大量先例。另外,酵母也是开发异源系统生产L-抗坏血酸的合适候选。
如上对根据本发明增加L-抗坏血酸途径中酶作用的论述,在本发明的一个实施方案中,催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化的差向异构酶的作用是通过扩大表达这类酶(即,过量表达)来实现的。差向异构酶的过量表达可以通过,如导入编码该差向异构酶的重组核酸分子来实现。编码本发明的差向异构酶的基因优选在人工启动子控制下克隆。该启动子可以是任何启动子,只要其使差向异构酶的表达水平能维持生产型生物中L-抗坏血酸的足够水平。优选的启动子是组成型(而不是诱导型)的启动子,因此无需加入昂贵的诱导剂。本发明重组核酸分子的基因量(拷贝数)根据最大产量的要求而不同。在一个实施方案中,编码本发明差向异构酶的重组核酸分子整合在该微生物的染色体中。
本发明的另一个实施方案提供了一种微生物,它具有一种或多种本发明的与其底物亲和力增强的差向异构酶。与其底物亲和力增强的差向异构酶能通过任何合适的遗传修饰或蛋白质工程产生。如基于计算机的的蛋白质工程能用来设计具有更大的稳定性和对底物更大亲和力的差向异构酶蛋白。见如,Maulik等,1997,分子生物技术:治疗应用和策略,Wiley-Liss,Inc.,这里全文引用作为参考。
如上面提到的,在本发明生产L-抗坏血酸的方法中,具有经遗传修饰的L-抗坏血酸生产途径的微生物在用于生产L-抗坏血酸的发酵培养基中培养。合适或有效的发酵培养基指培养本发明经遗传修饰的微生物时,能产生L-抗坏血酸的任何培养基。这类培养基通常为含水培养基,其中含可同化的碳源、氮源和磷酸源。这类培养基还可包含合适的盐,矿物质,金属和其它营养物质。如这里所述遗传修饰微生物的优势是,虽然这类遗传修饰能显著改变L-抗坏血酸的生产,但可通过对它们的设计使该生产生物不新增任何营养需求。因此,以葡萄糖作为唯一碳源的限盐(minimal-salt)培养基可用作发酵培养基。限盐-葡萄糖培养基在L-抗坏血酸发酵中的使用也有利于L-抗坏血酸产物的回收和纯化。
在本发明的一个操作模式中,发酵期间监测发酵培养基的碳源浓度,如葡萄糖浓度。发酵培养基的葡萄糖浓度能用已知技术监测,如使用葡萄糖氧化酶实验或高压液相色谱,它们可用于监测上清液如发酵培养基的无细胞成分中的葡萄糖浓度。如前面阐述的,碳源浓度应保持在发生细胞生长抑制的水平以下。以葡萄糖为碳源时,虽然这样的浓度可能在不同生物中不同,但葡萄糖浓度大于约60g/L时发生细胞生长抑制,并易于通过实验测定。相应的,当葡萄糖用作碳源时,发酵培养基中的葡萄糖浓度维持在约1g/L到约100g/L之间,更优选地,在约2g/L到约50g/L之间,还更优选地,在约5g/L到约20g/L之间。虽然碳源浓度可通过加入如一种基本纯的葡萄糖溶液而维持在所需的水平,但优选通过加入原始发酵培养基的等分试样来维持发酵培养基的碳源浓度。优选使用原始发酵培养基的等分试样,因为同时可维持培养基中其它营养物(如氮源和磷酸源)的浓度。同样,痕量金属浓度可通过在发酵培养基中加入痕量金属溶液的等分试样来维持。
在本发明发酵过程的一个实施方案中,如上所述制备发酵培养基。在发酵培养基中接种一定量的本发明遗传修饰微生物之活性培养物,其量足以在生长一定时间后能产生高密度细胞。通常细胞接种量按干重算为约0.1g/L到约15g/L,优选约0.5g/L到约10g/L,更优选约1g/L到约5g/L。而后继续培养细胞使其密度达到约10g/L到约100g/L,优选约20g/L到约80g/L,更优选约50g/L到约70g/L。微生物在发酵期间达到所需细胞密度的培养时间通常小于约200小时,优选小于约120小时,更优选小于约96小时。
本发明方法中有用的微生物可以用传统发酵模式培养,所述模式包括,但不限于,分批培养,补料分批培养和连续培养。但是,优选用补料分批培养的模式。这类情况下,发酵期间会耗尽培养基的某些成分。可用相对较高浓度的这类成分启动发酵过程,从而能培养更长时间再不得不加料。这些成分的优选范围在整个发酵期间通过在耗尽时加料来维持。发酵培养基中各成分的水平能通过,如定期取样发酵液并测定浓度来监测。另外,一旦开始了标准发酵程序,可在发酵期间根据已知水平定时加料。正如本领域技术人员所知,营养物消耗的速度在发酵期间随着培养基中细胞密度的增加而增加。而且,为了避免外源微生物进入发酵培养基,加料用本领域已知的无菌加料方法进行。另外,可在发酵期间加入少量消泡剂。
本发明人已测定,发酵培养基中高水平的镁可抑制L-抗坏血酸的生产,因为其抑制生产途径的早期酶,但途径中晚期(即从L-半乳糖到L-抗坏血酸)的酶并未受到消极影响(见实施例)。因此在本发明方法优选的一个实施方案中,培养的步骤在镁(Mg2+)受限制的发酵培养基中进行。甚而更优选地,在细胞生长期发酵时限制镁。优选地,在发酵的细胞生长期发酵培养基包含低于约0.5g/L的Mg2+,甚而更优选地,低于约0.2g/L的Mg2+,甚而更优选地,低于约0.1g/L的Mg2+。
发酵培养基的温度可以是任何适合生长和抗坏血酸产生的温度,并可根据所用生产微生物的生长要求调节。如在接种物接种发酵培养基之前,发酵培养基可以放到并维持在约20℃到约45℃的范围内,优选地温度在约25℃到约40℃的范围内,更优选地在约30℃到约38℃的范围内。
本发明另一实施方案补充和/或控制发酵培养基中的其它成分和参数,作为生产微生物维持和/或增加L-抗坏血酸的生产所必需。如在一实施方案中,监测发酵培养基中pH值的波动。在本发明的发酵方法中,pH值优选地维持在约pH 6.0到pH 8.0之间,更优选地,在约pH 7.0。在本发明的方法中,如果发酵培养基的起始pH是pH 7.0,将监测发酵培养基的pH值是否明显偏离pH 7.0,并通过如加入氢氧化钠进行相应的调整。在本发明一优选实施方案中,用于L-抗坏血酸生产的经遗传修饰的微生物包括耐酸的微生物。这类微生物包括,如Prototheca和小球藻属的微藻(见美国专利号5,792,631,同上和美国专利号5,900,370,同上)。
通过培养耐酸微生物生产抗坏血酸与已知生产抗坏血酸的方法相比具有明显的优势。优势之一是这类生物嗜酸,可在低pH下发酵,发酵培养基pH值通常低于约6。在此pH值下,该微生物在发酵中生产的胞外抗坏血酸相对比较稳定,因为在发酵培养基中氧对抗坏血酸的氧化速度降低了。相应的,用符合本发明方法的耐酸微生物生产L-抗坏血酸可获得高产率。另外,无需为避免抗坏血酸的氧化而将溶解氧控制在极低含量。此外,该优势还允许使用连续回收法,因为可处理胞外培养物以回收抗坏血酸产物。
因而当以耐酸微生物为生产微生物时,本方法可在低pH值时进行。该方法的好处在于,在低pH值时,由该微生物产生的胞外抗坏血酸的降解速度低于当发酵培养基的pH值较高时。如在发酵培养基中加入接种物之前,可调整发酵培养基的pH值,并在发酵期间继续监测。通常,将发酵培养基的pH值调整并维持在低于约6,优选低于5.5,更优选低于约5。可通过在发酵培养基中加入氨来控制发酵培养基的pH值。当用氨控制pH值时,氨也也可就便作为发酵培养基中的氮源。
为了维持细胞生长和细胞代谢以生成L-抗坏血酸,也可在发酵过程中使发酵培养基中维持一定的溶解氧含量。发酵培养基中氧的浓度可用已知方法测定,如通过氧探测电极的使用。氧可通过本领域已知方法加入发酵培养基,如通过搅拌或摇动来搅动培养基并通气。优选,发酵培养基中氧的浓度为培养基中氧饱和值的约20%到100%之间,氧饱和值是基于大气压和约30℃到40℃的温度范围内,发酵培养基中氧的溶解度。发酵期间氧浓度可能会周期性的下降到该范围以下,但并不会对发酵产生不良影响。
本发明的遗传修饰微生物经改造可产生显著量的胞外L-抗坏血酸。胞外L-抗坏血酸可用传统分离和纯化技术从发酵培养基中回收。如可过滤或离心发酵培养液去除微生物,细胞碎片和其它颗粒物质,L-抗坏血酸可从无细胞的上清液中用传统方法回收,诸如离子交换,层析,抽提,溶剂萃取,膜分离,电渗析,反向渗透,蒸馏,化学衍生和结晶。
Cayle的美国专利号4,595,659提供了这类L-抗坏血酸回收的一个实例(这里全文引用作为参考),其公开了发酵液经离子交换树脂吸附和洗脱而分离L-抗坏血酸,再脱色,蒸发并结晶的方法。另外,K.Shimiztu在Agr.Biol.Chem.31:346-353(1967)中描述了通过阴离子交换树脂连续多床提取系统从发酵液中分离结构相似的异抗坏血酸的方法,这里全文引用作为参考。
也可回收根据本发明产生的胞内L-抗坏血酸,其有各种用途。如可裂解微生物细胞,通过各种已知技术回收所释放的抗坏血酸。或可通过洗涤细胞,经渗滤等来提取抗坏血酸,从而回收胞内抗坏血酸。
经遗传修饰开发产L-抗坏血酸能力增强的微生物可用经典菌株开发技术和分子遗传技术,尤其重组技术(遗传工程)来实现。通常,L-抗坏血酸生产能力增加的微生物的产生策略是(1)使能负影响(如抑制)L-抗坏血酸生产的竞争或抑制途径的至少一个,优选多个失活或删除,更主要是(2)通过增加L-抗坏血酸生产途径中酶的编码基因的作用而扩大其生产。
在一个实施方案中,L-抗坏血酸生产能力增加之微生物的产生策略是通过增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用而扩大L-抗坏血酸的生产,如上述。该策略包括遗传修饰内源GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶以使L-抗坏血酸产量增加,和/或表达/过量表达催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖的转化的重组差向异构酶,包括表达重组GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶和/或其同源物,和其它重组差向异构酶如GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖-差向异构酶还原酶及与上面详述的差向异构酶有结构同源性的差向异构酶。
应理解生产生物可通过重组技术遗传修饰,其中将本文公开的编码L-抗坏血酸生产途径中蛋白的核酸分子转化至适当宿主中,该宿主与产生上述核酸分子的生物是植物界中的不同成员。如在本发明的一个实施方案中,将编码高等植物GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的重组核酸分子转化至微藻宿主中以过量表达该差向异构酶,并增加微藻类生产微生物中L-抗坏血酸的生产。
如前述,在一个实施方案中,经遗传修饰的微生物是已有核酸分子经核苷酸的删除,插入,取代,和/或倒位而被删除,插入,或修饰,使该微生物获得所需效应。优选遗传修饰之微生物经重组技术改造,如将分离的核酸分子导入微生物中。如遗传修饰之微生物可用编码目的蛋白(如期望增加表达的蛋白)的重组核酸分子转染。转染的核酸分子能保持在染色体外或整合到转染(即重组)的宿主细胞染色体的一个或多个位点上,其方式能维持表达。优选本发明宿主细胞一旦被核酸分子转染,则该核酸分子将整合到该宿主细胞基因组中。整合的突出优势在于核酸分子可在细胞中稳定维持。在优选的实施方案中,将整合的核酸分子可操作连接于能诱导该核酸分子的受控表达的转录控制序列(如下所述)上。
核酸分子可随机或定点地整合至宿主细胞基因组中。这类整合方法为本领域已知。如大肠杆菌菌株ATCC 47002包含使其不能维持携带ColE1复制起点之质粒的突变。当这类质粒转移至该菌株中时,对该质粒上遗传标记的选择导致该质粒整合到染色体上。这类菌株可用如在大肠杆菌lacZ基因之5`和3`末端之间含目的基因及选择标记的质粒转化。lacZ序列将接纳的DNA引导至染色体中lacZ基因上。lacZ位点的整合使编码β-半乳糖苷酶的完整lacZ基因被经目的基因打断的部分lacZ基因取代。可用β-半乳糖苷酶阴性筛选成功的整合体。
遗传修饰之微生物也可通过将核酸分子经噬菌体转导等方法导入受体细胞基因组而产生。使用重组技术和转导噬菌体技术产生本发明的多种不同遗传修饰微生物的方法为本领域所已知。
根据本发明,基因,如GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶基因,包括与天然差向异构酶基因相关的所有核酸序列,如控制该基因所编码差向异构酶蛋白的产生的调控序列(诸如,但不限于,转录,翻译或翻译后控制区域)和编码区本身。在另一实施方案中,基因,如GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶基因,可以是包含与指定GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶基因之核酸序列相似但不完全相同的序列的等位变体。具有指定核酸序列的GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶基因的等位变体,是在基因组中与具有该指定核酸序列的基因出现于基本相同位点,但因突变或重组等所致天然变异,而具有相似但不完全相同的序列的基因。等位变体的编码蛋白通常具有其对应基因之编码蛋白的相似活性。等位变体还包括该基因5`或3`非翻译区域(如调控区域)的改变。等位变体为本领域的技术人员所熟知并且可望发现于某种微生物或植物和/或两种或更多的微生物和植物中。
依据本发明,分离的核酸分子是取自其天然环境(即由于人为操作)的核酸分子。因此,“分离的”并不表明该核酸分子被纯化的程度。分离的核酸分子可包含DNA,RNA,或DNA或RNA的衍生物。核酸分子的大小并无限制,除了实用方面的限制,因为该核酸分子可能包含一个基因的一部分,一整个基因,或多个基因,或其部分。
本发明分离的核酸分子可从自然界以完整因或能与该基因形成稳定杂交体的部分基因形式分离得到。分离的核酸分子可用重组DNA技术(例如多聚酶链反应(PCR)扩增,克隆)或化学合成产生。分离的核酸分子包括天然核酸分子及其类似物,所述类似物包括,但不限于,天然等位变体和修饰的核酸分子(其中已有核苷酸的插入,删除,替换,和/或倒位使该微生物获得所需效应)。核酸序列的结构类似物在上面已有详述。优选的,核酸序列的类似物编码一种蛋白质其氨基酸序列非常相似于天然蛋白质的氨基酸序列,编码该类似物的核酸序列能够在严谨条件下与编码该天然蛋白质的核酸分子杂交(即,与编码该天然蛋白质氨基酸序列的核酸链互补)。核酸分子类似物编码蛋白质类似物。正如在此所用,类似蛋白包括的蛋白质其氨基酸已被删除(如肽等该蛋白质的截短形式),插入,倒位,取代和/或衍生(如通过糖基化,磷酸化,乙酰化,肉豆蔻酰化,异戊烯化(prenylation),棕榈酸化,酰胺化和/或添加糖基磷脂酰肌醇)以使该蛋白质和/或该微生物获得所需效应(例如增强或减弱蛋白质的作用)。
核酸分子类似物可利用许多方法产生,这些方法为本领域的技术人员所知(参见,例如Sambrook等,同上.)。例如核酸分子可利用多种技术进行修饰,这些技术包括,但不限于,经典的诱变技术和重组DNA技术,诸如指定点诱变,核酸分子经化学处理以诱导突变,利用限制酶裂解核酸片段,连接核酸片段,核酸序列选定区域的PCR扩增和/或诱变,寡聚核苷酸混合物的合成以及各组混合物的连接以“构建”核酸分子混合物及其组合。核酸分子类似物可选自修饰核酸的混合物,该核酸混合物通过筛选该核酸编码的蛋白质的功能和/或与野生型基因的杂交选出。
尽管术语“核酸分子”原义是指天然核酸分子而术语“核酸序列”原义是指核酸分子的核苷酸序列,这两个术语可交互使用,尤其是关系到能够编码涉及L-抗坏血酸产生路径的基因的核酸分子,或核酸序列时。
了解本发明的某些核酸分子的核酸序列使得本领域的技术人员可,例如(a)拷贝这些核酸分子和/或(b)获得包括至少一部分这样的核酸分子的核酸分子(例如核包括全长基因,全长编码区,调控序列,截短的编码区的酸分子)。这类核酸分子可通过多种方法获得,包括传统的克隆技术,该技术使用寡聚核苷酸探针筛选合适的文库或DNA和使用寡聚核苷酸引物对合适的文库或DNA进行PCR扩增。优选的进行筛选或从中扩增核酸分子的文库包括细菌和酵母基因组DNA文库,尤其是,微藻基因组DNA文库。克隆和扩增基因的技术公开在,例如Sambrook等,同上。
本发明包括一种重组载体,该载体包括至少一种本发明分离的核酸分子,该重组载体插入任何一种能够将该核酸分子引入本发明的宿主微生物的载体中。这样的载体可包含某些核酸序列,所述核酸序列并非天然与待插入载体的分离的核酸分子相邻。该载体可是RNA或DNA,通常为质粒。重组载体可用于克隆,测序,和/或核酸分子的其它处理。在此称重组分子并在下文予以更详细描述的一类重组载体可用于核酸分子的表达。优选的重组载体能够于转化的细菌细胞,酵母细胞,尤其微藻细胞中复制。
将核酸分子转化入细胞可采用任何一种方法完成,所述方法可将核酸分子插入细胞。转化技术包括,但不限于,转染,电穿孔,显微注射和biolistics。
重组细胞优选用一种或多种重组分子转化宿主细胞而产生,其中每一重组分子包括可操作地连接于含一或多个转录控制序列之表达载体的一或多种核酸分子。术语可操作地连接指以某种方式将核酸分子插入表达载体因而该核酸分子能够在被转化入宿主细胞后得到表达。此处所用的表达载体是能够转化宿主细胞并有效表达特定核酸分子的DNA或RNA载体。优选,该表达载体还能够在宿主细胞中复制。本发明中,表达载体通常为质粒。本发明的表达载体包括任何在酵母宿主细胞,细菌宿主细胞,以及优选的微藻宿主细胞中起作用(即指导基因表达)的载体。
本发明的核酸分子能够可操作地连接到包含调控序列的表达载体上,该调控序列包括转录控制序列,翻译控制序列,复制起点,以及其它相容于该重组细胞和控制本发明的核酸分子表达的调控序列。特别地,本发明的重组分子包括转录控制序列。转录控制序列是控制转录的开始,延长,和结束的序列。特别重要的转录控制序列是那些控制转录开始的序列,如启动子,增强子,操纵子和阻遏蛋白。适合的转录控制序列包括任何能在酵母细胞或细菌细胞或优选的,微藻细胞中发挥作用的转录控制序列。有多种这类转录控制序列为本领域的技术人员所知。
本领域技术人员可理解使用重组DNA技术能够改进转化的核酸分子的表达,通过操纵,例如宿主细胞中该核酸分子的拷贝数,那些核酸分子被转录的效率,所得转录子被翻译的效率,翻译后修饰的效率。可用于增加本发明的核酸分子表达的重组技术包括,但不限于,将核酸分子可操作地连接到高拷贝数的质粒上,将核酸分子整合到宿主细胞染色体上,将载体稳定序列添加入质粒,取代或修饰转录控制信号(例如启动子,操纵子,增强子),取代或修饰翻译控制信号,修饰本发明的核酸分子以适应宿主细胞的密码子使用,删除使转录子不稳定的序列,使用暂时性区分发酵期间重组细胞的生长与重组酶的产生的控制信号。本发明表达的重组蛋白的活性可通过将编码这类蛋白质的核酸分子裂解,修饰,或衍生得到改进。
下面提供的实验结果是为举例说明而不是限定本发明的范围。
实施例
实施例1
本实施例阐明植物中葡萄糖经GDP-D-甘露糖到L-抗坏血酸的途径。
由于本发明者以前已经揭示Prototheca从葡萄糖合成L-抗坏血酸(AA),所以值得检查一下培养物中葡萄糖的一些早期转化产物。过去,本发明者依据动物中公开的L-抗坏血酸合成路径和植物中的假设路径,注重葡萄糖到有机酸的路径。本发明者在此证实从葡萄糖到L-抗坏血酸的路径不涉及有机酸,但涉及糖的磷酸酯和核苷酸的二磷酸糖(NDP-糖)。
在本发明之前,已经知道所有细胞在合成多糖时首先合成NDP-糖。然后该糖部分组合成聚糖,而解离的NDP则进入再循环。已知有多种多糖,其命名通常是基于糖残基在聚糖中的相对比例。例如“半乳甘露糖”主要包含半乳糖,甘露糖仅占一小部分。本发明者从Prototheca菌株分离的“生物聚合物”经分析发现D-半乳糖占80%,鼠李糖(D-型还是L-型未定)占18%,L-阿拉伯糖占2%。本发明者在此提供实施例阐明组成Prototheca中生物聚合物的各种NDP-糖是如何形成的,以及L-抗坏血酸合成与生物聚合物中糖残基形式的NDP-糖形成之间有什么关联。
常见的NDP-糖UDP-葡萄糖显示在图2B。其由植物中UDP-D-葡萄糖焦磷酸化酶催化葡萄糖-1-P产生。植物可利用UDP-D-葡萄糖-4-差向异构酶将UDP-葡萄糖改变构像形成UDP-D-半乳糖。UDP-D-半乳糖的形成也可以是经半乳糖激酶将D-半乳糖磷酸化成D-半乳糖-1-P,D-半乳糖-1-P再经UDP-D-半乳糖焦磷酸化酶催化成UDP-D-半乳糖。这些已知路径被认为产生Prototheca生物聚合物中的D-半乳糖。UDP-L-阿拉伯糖可由下列已知反应产生,这些反应开始于UDP-D-葡萄糖氧化成UDP-D-葡萄糖醛酸(由UDP-D-葡萄糖脱氢酶催化),再脱羧形成UDP-D-木糖,然后差向异构成UDP-L-阿拉伯糖。如此产生生物聚合物中阿拉伯糖。已知UDP-L-鼠李糖产生于UDP-D-葡萄糖,因此Prototheca生物聚合物中所有三个糖部分都可从途经葡萄糖-1-P和UDP-葡萄糖的路径产生。此外,假如生物聚合物中的鼠李糖是D-鼠李糖,那么它就不是产生于UDP-D-葡萄糖,而是由GDP-D-甘露糖氧化而成(参见图1)。
GDP-D-鼠李糖通过将葡萄糖依次转化为D-葡萄糖-6-P,D-果糖-6-P,D-甘露糖-6-P,D-甘露糖-1-P,GDP-D-甘露糖,GDP-D-鼠李糖而形成。本发明者感兴趣之处在于这条途径通过GDP-D-甘露糖。植物中外源的甘露糖已知可被转化成D-甘露糖-6-P,然后可进入上述路径。本发明者培养的Prototheca细胞将D-甘露糖转化成L-抗坏血酸,与从葡萄糖转换相比相同或更有效(参见实施例4)。几年前就已经知道Chlorella pyrenoidosa中GDP-D-甘露糖由GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶催化为GDP-L-半乳糖的转化机制(参见,Barber,1971,Arch.Biochem.Biophys.147:619-623,在此全文引用作为参考)。本发明者在此已经发现Prototheca和Chlorella pyrenoidosa的菌株将L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯迅速转化成L-抗坏血酸。在本发明之前,已经知道有几种植物体系将L-半乳糖酸-γ-内酯转化成L-抗坏血酸,但还不知道这一步骤之前的合成步骤。根据公开发表的文献和现有实验依据,本发明者测定了植物L-抗坏血酸的生物合成路径经由GDP-D-甘露糖并涉及糖的磷酸酯和NDP-糖。推断的路径显示在图1。其中与本发明方法可利用的遗传修饰微生物的设计和生产有关的重要之处包括:
1.指引D-葡萄糖到D-果糖-6-P的酶是糖酵解途径的最初几个不明步骤中已知的酶。
2.涉及D-果糖-6-P转化为GDP-D-甘露糖的酶已在植物,酵母,和细菌,尤其维涅兰德固氮菌和铜绿假单胞菌中明确鉴定,它们转化GDP-D-甘露糖成GDP-D-甘露糖醛酸,其为藻酸盐的前体(参见如,SaCorreia等,1987,细菌学杂志(J.Bacteriol.)169:3224-3231;Koplin等,1992,细菌学杂志(J.Bacteriol.)174:191-199;Oesterhelt等,1996,植物科学(Plant Science)121:19-27;Feingold等,1980,植物生物化学(The Biochemistry of Plants):第3卷:糖,结构与功能,PK.Stampf和E.E.Conn编,学院出版社,纽约,页码:101-170;Smith等,1992,分子细胞生物学(Mol.Cell Biol.)12:2924-2930;Boles等,1994,欧洲医学杂志(Eur.J.Med.)220:83-96;Hashimoto等,1997,生物化学杂志(J.Biol.Chem.)272:16308-16314,均全文引用作为参考)。
3.Barber(1971,同上,和1975)在Chlorella pyrenoidosa中鉴定了将GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖和-半乳糖-1-P的酶活性。
4.本发明者在此揭示Prototheca细胞将L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯向L-抗坏血酸的快速转化。
5.L-半乳糖酸-γ-内酯与L-半乳糖酸可通过调节溶液的pH值而相互转化;加碱使该平衡倒向L-半乳糖酸,加酸使该平衡倒向内酯。除了这类非酶途径之外,细胞可能具有酶途径实现这一转化。
6.植物中,GDP-L-岩藻糖也可从GDP-D-甘露糖产生,假设其用于掺入多糖。Roberts(1971)用标记的D-甘露糖育种玉米根尖,发现多糖中有标记,特别是在D-甘露糖,L-半乳糖,和L-岩藻糖残基中。未在D-葡萄糖,D-半乳糖,L-阿拉伯糖,或D-木糖中检测到该标记。Prototheca和C.pyrenoidosa细胞有能力将L-岩藻糖(6-脱氧-L-半乳糖)转化为带二吡啶基的产物,该产物经HPLC检测不是L-抗坏血酸。本发明者相信该产物是L-抗坏血酸的6-脱氧类似物。
实施例2
本实施例显示在Prototheca中,类似其它植物(Loewus,F.A.1988.在:J.Priess(编),植物生物化学,14:85-107.纽约,学院出版社)以及衣藻Chlorellapyrenoidosa(Renstrom等,1983.植物科学通讯(Plant Sci.Lett.)28:299-305),抗坏血酸(AA)经由葡萄糖的生产通过能保留葡萄糖的碳骨架构像的生物合成途径进行。
菌株UV77-247在振荡烧瓶中以葡萄糖总量(40g/L)的10%为1-13C-标记葡萄糖的条件培养至中等细胞密度。按标准限制镁含量筛选方法培养(参见实施例3)。培养上清澄清后,去离子化以脱盐,冻干,经核磁共振(NMR)分析确定带13C标记之AA分子的位置。每种情况下,约85%的标记出现在AA的C-1位置,余下的大多数标记出现在AA的C-6位置。这充分表明AA从葡萄糖通过保留碳链构像的路径合成,即,葡萄糖的C-1变成了AA的C-1。这常见于植物(Loewus,F.A.1988.抗坏血酸及其代谢产物。在:植物生物化学J.Priess编,14:85-107.纽约,学院出版社)。另一方面,动物(Mapson,L.W.和F.A.Isherwood 1956.生物化学杂志(Biochem.J.)64:151-157;Loewus,F.A.1960.生物化学杂志(J.Biol.Chem.)235(4):937-939)和原生生物如眼虫属(Shigeoka,S.等,1979.营养学维生素学杂志(J.Nutr.Sci.Vitaminol.)25:299-307)中合成AA的路径涉及构像的倒置,即葡萄糖的C-1变成了AA的C-6。对路径中倒置/非倒置特点的证实是确定AA生物合成路径的重要步骤,因为两种路径需要不同的酶反应。AA中发现C-6标记被认为是由于葡萄糖的代谢及随后的糖元异生。糖酵解过程中葡萄糖的代谢通过丙糖-磷酸中间产物进行。此后,葡萄糖的C-1和C-6碳在生化意义上变得相当。己糖磷酸可由丙糖-磷酸经糖原异生过程产生,该过程基本上相反于降解途径。结果,C-1-标记的葡萄糖至丙糖-磷酸的代谢及随后的糖元异生将导致己糖磷酸分子的生成,且该分子的C-1或C-6被标记或两者都被标记。假如这些己糖磷酸是AA的前体,那么可预期AA会出现相似的标记。与该“同位素混合”一致的发现是,由1-13C-标记的葡萄糖衍生的蔗糖在1,6,1′和6′位出现标记。
葡萄糖还能够经戊糖磷酸途径代谢,其总的平衡方程式如下:
3葡萄糖-6-磷酸→2果糖-6-磷酸+甘油醛-3-磷酸+3二氧化碳
根据已知的生物化学知识,可预期葡萄糖每个碳的标记(表1左栏)将出现在表中所示其它分子的各位置,而这些模式将反映在由C-2和C-3标记的葡萄糖生成的AA中。
表1戊糖磷酸途径中葡萄糖代谢产物的预期碳标记
葡萄糖的标记碳 | 标记碳的位置 | |||
CO2 | F6P(1) | F6P(2) | G3P | |
1 | + | - | - | - |
2 | - | 1.3 | 1 | - |
3 | - | 2 | 2.3 | - |
4 | - | 4 | 4 | 1 |
5 | - | 5 | 5 | 2 |
6 | - | 6 | 6 | 3 |
加C-2或C-3标记的葡萄糖培养,分析所得培养物中回收的AA的标记模式(表2)。
表2细胞经2-13C和3-13C-葡萄糖培养后AA的标记模式
AA中的碳位置 | 培养后同位素信号的增加 | |
C-2标记的葡萄糖 | C-3标记的葡萄糖 | |
123456 | 1.010.00.502.20 | 0.40.99.92.80.20 |
上述数据再次提示从葡萄糖到AA保留了原有构像的途径。如用C-1标记葡萄糖进行的实验一样,约1/5的标记出现在与葡萄糖标记呈“镜像”的位置上(C-5对应于标记葡萄糖的C-2,C-4对应于标记葡萄糖的C-3),表明糖元异生的水平与以前观察到的结果一致。
其它位置出现的少量,但是明显的增长与戊糖磷酸途径中的流向一致。如以上预计,当细胞加2-13C葡萄糖培养后通过该途径的碳流将在位置1和3产生同位素增长,当细胞加3-13C葡萄糖培养后通过该途径的碳流将在位置2产生同位素增长。确实观察到了这样的结果。另预计,细胞加2-13C葡萄糖培养后C-1位的同位素增长为C-3位的2倍。这些数据表明有少量但可检测到的碳流通过戊糖磷酸途径。
实施例3
本实施例显示产生,筛选和分离Prototheca属突变体的方法,该突变体与起始菌株ATCC 75669相比AA生产力已改变。
ATCC编号75669,定名为Prototheca moriformis RSP1385(单细胞衣藻)依据国际公认的为专利程序目的保藏微生物的布达佩斯条约于1994年2月8日保藏于美国典型培养物保藏中心(ATCC),Rockville,马里兰,20852,美国。Prototheca种和菌株的初步筛选报道在美国专利号5,900,370,同上。表3列出了用于菌株生长和维持的培养基配方。发酵罐中的葡萄糖以一水葡萄糖方式提供并按无水形式计算。痕量金属溶液的配方见表4。标准生长温度是35℃。所有的微生物均无菌培养。
表3用于培养并维持Prototheca菌株的培养基所有用量除非特别指明均以g/l为单位
成分 | 液体 | 琼脂 | |||
标准 | 镁限制 | 斜面 | Ferrozine平板 | 标准平板 | |
磷酸二氢钾 | 1.3 | 1.3 | 2.0 | 0.27 | 2.0 |
磷酸氢二钾 | 3.8 | 3.8 | 2.0 | 1.4 | 2.0 |
二水柠檬酸三钠 | 7.7 | 7.7 | 2.6 | 1.3 | 2.6 |
七水硫酸镁 | 0.40 | 0.02 | 0.4 | 0.01 | 0.4 |
硫酸铵 | 3.7 | 3.7 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
痕量金属溶液 | 2ml | 2ml | 2ml | 2ml | 2ml |
七水硫酸亚铁 | 1.5mg | 4.5mg | 1.5mg | - | 1.5mg |
二水氯化钙 | - | 0.25 | - | - | - |
一水硫酸锰 | - | 0.08 | - | - | - |
酵母浸膏 | - | - | 2.5 | - | - |
琼脂 | - | - | 15 | 15(贵) | 15 |
高压灭菌前pH值 | 7.2 | 7.2 | 7.2 | 7.2 | 7.2 |
表4痕量金属溶液
化合物 | 分子量 | 各溶液浓度 | 每升工作液中各原液的ml |
蒸馏水 | - | - | 823 |
盐酸 | - | 浓 | 20 |
流水硫酸钴 | 237.9 | 24.0 | 6.5 |
硼酸 | 61.8 | 38.1 | 24 |
七水硫酸锌 | 287.5 | 35.3 | 50 |
一水硫酸锰 | 169.0 | 24.6 | 50 |
二水钼酸钠 | 242.0 | 23.8 | 2.0 |
二水氯化钙 | 147.0 | - | 11.4g |
二水硫酸钒 | 199.0 | 10.0 | 8.0 |
六水硝酸镍 | 290.8 | 5.0 | 8.0 |
亚硒酸钠 | 173.0 | 5.0 | 8.0 |
突变分离株需经下列一或多种试剂处理而产生:亚硝酸(NA);乙基甲烷磺酸盐(EMS);或紫外灯(UV)。通常,在标准液体培养基中培养的葡萄糖耗尽的细胞在25mM磷酸盐缓冲液,pH7.2中洗涤并重新悬浮,稀释成每mL约107个集落形成单位(cfu/mL),暴露在突变原中直到约99%的细胞都被杀死,避光培养4-8小时,然后涂布到标准琼脂培养基,或包含有不同试剂的琼脂培养基上。
随机挑取标准琼脂培养基上的一些突变菌落并传代到母板上。将其它分离板倒置于氯仿上以裂解菌落表面的细胞并让其释放AA。通过将2,6-二氯苯酚-吲哚苯酚(1.25g/L溶于70%乙醇)溶液喷洒于处理板上以检出释放的AA。AA将该兰色氧化还原染料还原成无色状态的能力是AA常规检验的依据(Omaye等,1979.酶学方法(Meth.Enzymol.)62:3-11.)。假如突变产生细胞产生的菌落的透明圈显著大于该组其它突变菌落的典型透明圈,则在母板上保留该菌落以进一步分析。其它突变产生细胞被涂布到培养板上,该培养板将AA检测系统直接融合进琼脂。该检测系统以AA将铁离子还原成亚铁离子的能力为依据。化合物ferrozine(3-(2-吡啶基)-5,6-双(4-苯基磺酸)-1,2,4-三吖嗪)在琼脂中与亚铁离子形成复合物并发生紫色反应。ferrozine琼脂配方见表3。颜色反应最深的菌落在母板上保留。当筛选不产生AA的菌株(阻断性突变体)时,挑选在相对深色菌落背景上挑选白色菌落。
进行试管培养物的初步筛选时,将母板细胞接种到16×125mm的试管中4mL限镁培养基中,试管在300rpm的转动培养架上以倾斜位置振荡培养4天。倒出培养3天和4天的培养物做AA测定和细胞密度测定。做AA测定时,培养物以1500xg离心5分钟,移出上清进行比色测定或高压液相色谱(HPLC)。有希望的分离株用试管培养重新测试。经过试管筛选的分离物用振荡烧瓶培养测试。
做烧瓶培养物的二次筛选时,细胞接种到带折流板的250mL振荡烧瓶中的50mL标准培养基中,180rpm的转动培养架上培养直到葡萄糖耗尽(24-48小时)。将第一系列培养物接种第二系列烧瓶,培养基为含足量镁的标准培养基,细胞密度为0.15A620,培养24小时。然后将培养物1/50稀释后转移到第三系列烧瓶中,培养基为限镁培养基,培养96小时。期间按要求从烧瓶取样做AA分析和细胞密度测定。做上清液AA分析的样品5000xg离心5分钟。做总培养物AA分析的样品离心前先以等量的5%三氯醋酸(TCA)提取15分钟。然后取上清液做比色测定或HPLC分析。
AA比色测定的方法,依据Omaye等(1979.酶学方法(Meth.Enzymol.)62:3-11)的方法稍加改动。取25μL上清液加到96-孔微孔板中,添加125μL显色剂。显色剂包括4份0.5%含水的2,2′-二吡啶基和1份溶于27%(v/v)o-磷酸的8.3mM硫酸铁铵,两种成份在使用前才混合。1小时后,读取520nm的吸收值。通过比较AA标准样品的吸收值换算出AA的浓度。
HPLC分析参照Running等(1994)的方法。上清液在Bio-Rad的HPX-87H有机酸柱(Bio-Rad Laboratories,Richmond,CA)上,以13mM硝酸做溶剂,室温下0.7mL/分钟的流速进行层析。使用Waters 441检测仪(Millipore Corp.,Milford,MA)在254nm检测,或使用Waters 481检测仪在245nm检测。该系统可区分AA的L-型和D-型同分异构体。
测定细胞密度的干重时,取5mL全培养物样品5000xg离心5分钟,用蒸馏水洗1次,细胞团洗入校准后的铝制称重盘中。让细胞在105℃干燥8-24小时。由差异计算出细胞重量。
表5显示Prototheca各种突变株合成AA的能力。
表5烧瓶筛选中各种Prototheca突变株的AA合成能力
菌株 | 限制镁培养期间特异性AA形成,mg AA/L/培养物A620 | |
培养2天 | 培养4天 | |
ATCC 75669 | 22 | 35 |
EMS 13-4 | 79 | 166 |
UV213-1 | 0 | 0 |
UV218-1 | 0 | 0 |
UV244-1 | 0 | 0 |
UV244-15 | 58 | 68 |
UV77-247 | 56 | 83 |
UV140-1 | 67 | 100 |
UV164-6 | 91 | 131 |
NA21-14 | 27 | 78 |
UV82-21 | 0 | 0 |
UV127-10 | 50 | 95 |
SP2-3 | 3 | 4 |
这些分离株的谱系在图3的家族树中以图形展示。定名为Protothecamotriformis EMS13-4(单细胞衣藻)的ATCC号___依据国际公认的为专利程序目的保藏微生物的布达佩斯条约于1999年5月25日保藏在美国典型培养物保藏中心(ATCC),10801 University Boulevard,Manassa,VA20110,USA。定名为Prototheca moriformis UV127-10(单细胞衣藻)的ATCC号___依据国际公认的为专利程序目的保藏微生物的布达佩斯条约于1999年5月25日保藏在美国典型培养物保藏中心(ATCC),10801 UniversityBoulevard,Manassa,VA 20110,USA。定名为Prototheca moriformis SP2-3(单细胞衣藻)的ATCC号___依据国际公认的为专利程序目的保藏微生物的布达佩斯条约于1999年5月25日保藏在美国典型培养物保藏中心(ATCC),10801 University Boulevard,Manassa,VA 20110,USA。
实施例4
下面的实施例显示Prototheca的生长和休眠细胞都能快速的将L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯转化为AA,Prototheca将D-甘露糖转化为AA的速度要比将D-葡萄糖转化为AA更快。
突变株UV77-247的振荡烧瓶培养物在标准液体培养基中培养至葡萄糖耗尽(表3)。细胞洗涤两次并悬浮在完全培养基中,该培养基的葡萄糖由下列化合物之一代替。细胞悬浮液在35℃振荡培养24小时,整个悬浮液如上用TCA提取并测定AA。
表6-8显示菌株UV77-247的生长和休眠细胞都能快速的将L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯转化为AA。这些实验中,D-果糖和D-半乳糖转化成AA的速度与D-葡萄糖相同,提示它们经由与D-葡萄糖相同的途径代谢为AA。文献中提到的作为AA生物合成中间产物的有机酸包括山梨糖醛酮(sorbosone)可被转换成AA,Saito等(1990植物生理学(Plant Physiol.)94:1496-1500)提示该山梨糖醛酮为中间产物。
表6菌株UV77-247的休眠细胞对化合物的转化
底物(50mM) | 总AA,mg/L | 相对于无底物对照组的AA |
L-半乳糖 | 965 | 623 |
L-半乳糖酸-γ-内酯 | 818 | 476 |
D-果糖 | 590 | 248 |
D-葡糖醛酮 | 589 | 247 |
D-葡萄糖 | 584 | 242 |
D-半乳糖 | 542 | 200 |
D-葡萄糖(10mM) | 388 | 46 |
D-葡萄糖酸内酯 | 382 | 40 |
D-葡萄糖酸-γ-内酯 | 366 | 24 |
D-葡糖醛酸 | 364 | 22 |
L-山梨糖醛酮 | 342 | 0 |
无底物 | 342 | 0 |
2-酮基-D-葡萄糖酸 | 341 | -1 |
D-异抗坏血酸(10mM) | 330 | -12 |
D-葡萄糖醛酸内酯 | 329 | -13 |
D-葡萄糖酸 | 309 | -33 |
D-半乳糖醛酸 | 297 | -45 |
L-idonate | 296 | -46 |
由于菌株UV77-247转化L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯到AA的速度比其转化葡萄糖的快得多,这提示这些化合物是AA生物合成路径中的中间产物而且是在葡萄糖“下游”的中间产物。
表7和表8的数据还显示,UV77-247的生长和休眠细胞转化D-甘露糖到AA的速度比转化葡萄糖的更快。
表7菌株UV77-247的休眠细胞所致化合物到AA的转化
化合物 | 抗坏血酸,mg/L | ||
25.5h | 30h | 47h | |
L-半乳糖 | 667 | 718 | 620 |
L-半乳糖酸-γ-内酯 | 644 | 681 | 749 |
D-葡糖醛酮 | 465 | 462 | 354 |
D-甘露糖 | 448 | 462 | 399 |
D-果糖 | 402 | 408 | 367 |
d-葡萄糖 | 395 | 404 | 351 |
D-半乳糖 | 352 | 361 | 337 |
无化合物 | 287 | 288 | 258 |
表8菌株UV77-247的生长细胞所致化合物到AA的转化
化合物 | 抗坏血酸,mg/L | A620 | AA/A620 | |||
25.5 h | 44 h | |||||
L-半乳糖 | 249 | 506 | 4.5 | 112 | ||
D-甘露糖 | 228 | 488 | 5.6 | 87 | ||
L-半乳糖酸-γ-内酯 | 214 | 342 | 5.0 | 68 | ||
D-葡萄糖 | 178 | 398 | 5.9 | 67 | ||
D-果糖 | 181 | 383 | 5.9 | 65 | ||
D-葡糖醛酮 | 176 | 362 | 5.7 | 64 | ||
D-半乳糖 | 185 | 380 | 5.9 | 64 | ||
无化合物 | 182 | 249 | 4.4 | 57 | ||
D-葡萄糖酸(K) | 178 | 262 | 5.0 | 52 | ||
L-idonate(Na) | 182 | 232 | 4.7 | 49 | ||
2-酮基-D-葡萄糖酸 | 182 | 255 | 5.3 | 48 | ||
2-脱氧-D-葡萄糖 | 181 | 227 | 4.8 | 47 | ||
D-葡萄糖酸内酯 | 165 | 218 | 5.0 | 44 | ||
D-葡萄糖酸(Na) | 173 | 241 | 5.6 | 43 | ||
L-葡萄糖酸-γ-内酯 | 152 | 195 | 5.0 | 39 | ||
L-山梨糖醛酮 | 178 | 160 | 4.7 | 34 | ||
D-葡萄糖酸-δ-内酯 | 130 | 190 | 5.7 | 33 | ||
D-半乳糖醛酸 | 130 | 180 | 6.0 | 30 |
这些细胞转化L-半乳糖,L-半乳糖酸-γ-内酯和D-甘露糖到AA的速度都比它们转化葡萄糖的快,提示甘露糖在AA生物合成路径中从葡萄糖开始向“下游”发挥作用。
实施例5
用上面描述的方法装配一系列突变体。有代表性的突变体的特异AA生成显示在表5中。这些分离株的谱系在图3的家族树中以图形展示。
这些分离株都检测了转换化合物的能力,所述化合物可被菌株UV77-247转换成AA。测试方法同实施例4。测试结果如表9所示。
表9AA合成能力不同的Prototheca突变株休眠细胞所致化合物向AA的转化
菌株 | 绝对AA,mg/L | |||||
缓冲液 | 葡萄糖 | L-半乳糖 | L-半乳糖酸-γ-内酯 | 甘露糖 | 果糖 | |
EMS 13-4 | 53 | 97 | 191 | 173 | 139 | ND |
UV127-10 | 45 | 140 | 213 | 140 | 128 | 143 |
SP2-3 | 19 | 19 | 204 | 146 | 24 | 27 |
NA21-14 | 61 | 80 | 147 | 158 | 118 | 115 |
UV82-21 | 15 | 16 | 183 | 175 | 18 | 17 |
UV213-1 | 16 | 15 | 170 | 135 | 17 | 16 |
UV218-1 | 16 | 18 | 136 | 176 | 19 | 21 |
UV244-1 | 16 | 16 | 164 | 162 | 16 | 16 |
UV244-15 | 26 | 77 | 30 | 21 | 94 | 89 |
UV244-16 | 28 | 64 | 53 | 53 | 53 | 66 |
ND表示未测定
这些结果提示,不能有效地将果糖和甘露糖转换成AA的这些菌株的突变性封闭点在途径中L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯之前(其上游)。
实施例6
下面的实施例显示镁抑制AA合成的早期步骤。
为了阐明镁是否确实抑制AA合成的问题,将菌株NA45-3(ATCC209681)培养在镁(Mg)含量受限制的培养基和镁含量充足的培养基中。定名为Prototheca moriformis NA45-3(来源:ATCC号75669的重复突变;真核藻类。Chlorophyta门,Chlorophyceae纲,Chloroccales目)的ATCC号209681依据国际公认的为专利程序目的保藏微生物的布达佩斯条约于1998年3月13日保藏在美国典型培养物保藏中心(ATCC),10801 University Boulevard,Manassas,VA 20110,USA。收集两种培养物的细胞并悬浮在限制Mg含量的培养基的无细胞上清液中,一半细胞悬浮液加入额外的镁达到富含镁的水平。4种条件下的测定方法如下。
表10用以检测镁对AA产生的效应的条件
条件 | 镁浓度,g/L | |
生长期间 | 测试期间 | |
1Mg>1Mg | 0.02 | 0.02 |
1Mg>10Mg | 0.02 | 0.2 |
10Mg>1Mg | 0.2 | 0.02 |
10Mg>10Mg | 0.2 | 0.2 |
将先前显示可合成AA的底物,即D-葡萄糖,D-葡糖醛酮,D-果糖,D-半乳糖,D-甘露糖,和L-半乳糖酸-γ-内酯,以20g/L的浓度加到4种细胞悬浮液中。24小时后测定累积的AA并与没有添加底物的对照组比较。结果显示在图4中。
当生长在限制镁(Mg)含量培养基中的细胞与低镁培养基(1Mg>1Mg条件)中底物温育时,与对照组相比都显示出明显而相似的AA累积。当这些细胞细胞在富含镁培养基(1Mg>10Mg条件)中温育时,除D-甘露糖和L-半乳糖酸-γ-内酯外的所有底物的AA累积都减少了约40%,提示1)D-葡萄糖,D-葡萄糖醛酮,D-果糖,和D-半乳糖转化成AA的限速步骤被镁抑制,或2)镁激活了一种酶使得这些底物被转换成其它的化合物,减少了用于合成AA的底物量。另一方面,D-甘露糖和L-半乳糖酸-γ-内酯的转换似乎不受悬浮液中镁浓度的影响,表明,或1)镁抑制的酶并未参与这些底物向AA的转化,或2)D-甘露糖和L-半乳糖酸-γ-内酯进入的路径远在可受需要镁的酶参与的副反应影响的某点下游。
当细胞培养在富含镁的培养基中生长时,从任何D-型糖转换出的AA极少,且与悬浮液中的镁浓度无关。然而,与细胞培养在限制镁(Mg)含量的培养基中相比,从L-半乳糖酸-γ-内酯转换成的AA却增加了。这提示合成路径早期的酶在富含镁的培养基中受到抑制。因此,D-型底物都有相似的表现,唯一例外的是从D-甘露糖到AA的转换,该转换显然不受镁的抑制。这意味着D-甘露糖进入AA生物合成路径之处不同于别的D-型糖。
图2A和图2B显示植物中葡萄糖的某些代谢结果。图中将碳转入糖酵解的第一个酶促步骤是果糖-6-P被磷酸果糖激酶(PFK)催化成果糖-1,6-2P。该反应基本上不可逆转,并引至熟知的TCA循环和氧化磷酸化,伴随着ATP和NADH/NADPH的生成。PFK绝对需要镁。假如镁受到限制,这一反应就可能减速并最终停止,阻止碳流参与糖酵解和以后的反应,并导致细胞在即使有过量的葡萄糖时也终止分裂。可希望果糖-6-P在这些条件下累积,用于图1和图2所示的AA合成路径。
实施例7
下面的实施例显示Protothca中AA的生产与AA途径中酶活性水平的关系。
磷酸甘露糖异构酶(PMI)测定
首先测定PMI活性(见图1)。10个代表不同AA生产力的菌株按标准培养以测定其AA-合成能力。细胞培养96h后收获进行限制镁(Mg)含量培养,用含50mM Tris/10mM MgCl2,pH7.5的缓冲液洗涤并重新悬浮。悬浮后的细胞用挤压(French Press)裂解,30,000xg离心30分钟,Sephadex G-25(Pharmacia PD-10柱)脱盐。通过添加不同量的提取物到含0.15U磷酸葡萄糖异构酶(EC 5.3.1.9),0.5U葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(EC 1.1.1.49),和1.0mMNADP的Tris/Mg缓冲液中逆向进行反应。反应通过添加3mM(终浓度)甘露糖-6-磷酸启动。最终反应体积为1.0mL。所有成份均溶解于Tris/Mg缓冲液中。读取A340/分钟的变化以判定活性。这些活性测定值减掉缺乏M-6-P底物的相同反应混合物的活性值。通过矫正反应物中蛋白质浓度计算特异性活性。初始提取物的蛋白质含量用Bradford方法测定,使用Bio-RadLaboratories(Hercules,CA)的试剂盒。所有酶和核苷酸均购自SigmaChemical Co.(St.Louis,MO)。
磷酸甘露糖变位酶(PMM)测定
磷酸甘露糖变位酶在同样的菌株中以方法相同测定,不过这些测定反应混合物还含有0.25mM葡萄糖-1,6-二磷酸,0.5U商品PMI,而且反应通过添加3.0mM(终浓度)甘露糖-1-磷酸而不是甘露糖-6-磷酸来启动。
磷酸果糖激酶(PFK)测定
为了证明在限制镁(Mg)含量培养条件下AA浓度的升高是由于正常代谢时糖酵解(PFK)真正第一步的活性减弱导致碳源的分流,还对这些菌株进行测定以证实该酶活性的存在。细胞的培养,洗涤和裂解同前。提取物在脱盐前100,1000xg离心90分钟。接下来进行的反应要添加不同量的提取物到Tris/Mg缓冲液中,该缓冲液含有1.5mM二硫苏糖醇,0.86U醛缩酶(EC 4.1.2.13),1.4 Uα-甘油磷酸脱氢酶(EC 1.1.1.8),14U丙糖磷酸异构酶(EC 5.3.1.1),0.11mM NADH,和1.0mM ATP。反应的启动靠添加5mM(终浓度)果糖-6-磷酸。最终反应体积为1.0mL。所有成份均溶解于Tris/Mg缓冲液中。读取A340/分钟的变化以判定活性。这些活性测定值减掉没有F-6-P底物的相同反应混合物的活性值。通过矫正反应物中蛋白质浓度计算出特异的活性。初始提取物的蛋白质含量测定方法同上。
GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶(GMP)测定
同样这些突变株还测定了假设途径中的下一种酶,GMP。不同菌株按标准培养在限制镁(Mg)含量培养基(43-48小时后收获进行限制镁(Mg)含量培养)和富含镁培养基(在葡萄糖耗尽之前收获所有细胞)中。细胞洗涤后重新悬浮在50mM磷酸缓冲液,pH7.0中,其含有20%(v/v)甘油和0.1M氯化纳(3mL缓冲液/g细胞湿重),用French press裂解。初提物15,000xg离心15分钟。接下来进行的反应要添加不同量的提取物到50mM磷/4mM氯化镁缓冲液中,该缓冲液含有1mM GTP。反应的启动靠添加1mM(终浓度)甘露糖-1-磷酸。最终反应体积为0.1mL。反应混合物在30℃温育10分钟,滤过0.45umPVDF注射滤器,用HPLC分析GDP-甘露糖。使用SupelcosilSAX1柱(4.6×250mm),使用的溶剂梯度(1mL/分钟)为:A-6mM磷酸钾,pH3.6;B-500mM磷酸钾,pH4.5。梯度为:0-3分钟,100%A;3-10分钟,79%A;10-15分钟,29%A。柱的温度为30℃。对显示酶活性与蛋白质的含量成比例的两次测定进行平均。不含底物和不含提取物的对照也进行了测定。通过矫正反应物中蛋白质浓度计算出特异的活性。初始提取物的蛋白质含量测定方法同上。
GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶测定
进一步的试验测定了假设途径中下一种酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的活性。菌株按标准培养,43-48小时后收获进行限制镁(Mg)含量培养,洗涤,重新悬浮在缓冲液中,该缓冲液含有50mM MOPS/5mMEDTA,pH7.2。洗涤后的细胞团在French press中裂解,20,000xg离心20分钟。同前面一样进行蛋白质测定并将蛋白质浓度系列稀释,成0.4-2.2mg蛋白质/mL。每份取50μL稀释液加到10μL 6.3mM GDP-D-甘露糖中,该GDP-D-甘露糖底物的一部分在其甘露糖部分大都标记上14C。该底物稀释到反应混合物中之前的放射活性为16μCi/mL。反应进行10分钟后终止,将20μL混合物移入微型离心管,管中含有20μL 250mM三氟乙酸(TFA),该TFA含有D-甘露糖和L-半乳糖各1.0g/L。密封这些离心管并煮沸10分钟,冷却后,在Beckman MicrofugeE离心60秒,每种水解产物取出5μL点样到20×20cm塑料背衬的EM Science Silica gel 60薄层平板(#5748/7)上,用钝针头制成1cm的泳道。干燥后,平板在乙酸乙酯∶异丙醇∶水为65∶22.3∶12.7的条件下进行2.5小时的层析共两次(两次之间平板需干燥)。用溶解在含0.89M硫酸和0.17mM冰醋酸的62%乙醇溶液中的0.5%对甲氧基苯甲醛吹干,然后105℃加热约15分钟,使平板干燥,然后才能观察游离糖的斑点。将L-半乳糖和D-甘露糖的斑点从平板上裁下用闪烁计数器(Beckman 2800型)计数。零时对照计数时,取每种提取物的稀释液16.7μL加到23.3μL上述的标记底物中,该底物已用TFA/甘露糖/半乳糖溶液按1∶7稀释。
表11总结了待检菌株5种酶的测定结果,及它们的特异性AA生成。
表11特定Prototheca突变株的特异性酶活性(mU)*
菌株 | AA特异性形成 | PMI | PMM | PFK | GMP | 差向异构酶 | |
限制镁 | 富含镁 | ||||||
UV164-6 | 78.4 | 0.79 | |||||
EMS 13-4 | 73.7 | 10.8 | 69.6 | 13.5 | 2.6 | 6.8 | 0.78 |
UV140-1 | 69.9 | 0.78 | |||||
NA45-3 | 61.4 | 0.58 | |||||
UV77-247 | 44.4 | 0.52 | |||||
UV127-10 | 40.1 | 11.1 | 45.8 | 24.4 | 4.3 | 5.9 | 0.39 |
UV244-15 | 24.5 | 14.3 | 41.5 | 3.1 | 5.3 | 0.42 | |
NA21-14 | 23.6 | 12.1 | 60.3 | 47.4 | 2.4 | 7.6 | 0.27 |
ATCC75669 | 21.9 | 0.28 | |||||
UV244-16 | 5.0 | 16.5 | 85.6 | 4.3 | 5.2 | ||
SP2-3 | 2.0 | 17.7 | 47.0 | 64.5 | 2.0 | 7.5 | 0.03 |
UV218-1 | 0.4 | 15.9 | 72.1 | 2.7 | 7.0 | 0.83 | |
UV213-1 | 0.1 | 19.7 | 47.7 | 32.6 | 3.2 | 6.7 | 0.60 |
UV82-21 | 0.0 | 14.6 | 70.6 | 30.4 | 4.1 | 7.5 | 0.15 |
UV244-1 | 0.0 | 18.2 | 51.1 | 5.5 | 12 | 0.15 |
*单位:PMI和PMM,每分钟每mg蛋白还原的nmol NADP;PFK,每分钟每mg蛋白氧化的nmol NADH;GMP,每分钟每mg蛋白产生的nmolGDP-D-甘露糖;差向异构酶,每分钟每mg蛋白产生的nmol GDP-L-半乳糖。
显示在酶活性与AA合成能力之间密切相关的唯一酶是GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶。这一相关表示在图5中。所有产生可检出量AA的菌株都可检测到差向异构酶活性。反过来却不是这样:有4个菌株没有或很少合成AA却有明显的差向异构酶活性。这些菌株可能具有影响差向异构酶下游之酶步骤的突变。由于所有试验菌株都能够从L-半乳糖和L-半乳糖酸-γ-内酯合成AA(参见实施例4和5),这4株突变株的遗传损伤应在GDP-L-半乳糖和游离的L-半乳糖之间。
实施例8
下面的实施例显示GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶活性与两菌株受镁限制程度的关系,所述两菌株一为未诱变的亲本株ATCC 75669,一为最佳AA生产菌株之一,EMS 13-(ATCC__)。
每种菌株按标准培养在4个烧瓶中。4天之内两菌株每隔24小时收获1份培养物进行限镁培养。每个菌株还有1个烧瓶于24小时收获后进行富镁培养。收获时所有培养物都有葡萄糖剩余。图6以图表显示EMS13-4和ATCC 75669在限镁培养时的AA生产力和差向异构酶活性。EMS13-4的差向异构酶活性在各时间点都明显高于ATCC 75669中的。随着EMS13-4的镁限制增加,其AA生产力与差向异构酶活性也同时迅速提高。ATCC 75669中随着镁的限制增加,AA生产力略有提高,但差向异构酶活性不受影响。
实施例9
下面的实施例显示用两种大肠杆菌菌株的提取物做差向异构酶实验的结果,这两种菌株克隆了大肠杆菌GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶的基因。
大肠杆菌K12 wca基因簇决定胆烷酸的生成;wcaG编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖-差向异构酶/还原酶。
大肠杆菌wcaG序列(SEQ ID NO:3的核苷酸4-966)经PCR扩增自大肠杆菌W3110基因组DNA,该扩增使用引物WG EcoRⅠ5(5′TAGAATTCAGTAAACAACGAGTTTTTATTGCTGG3′;SEQ ID NO:12)和WG Xhol 3(5′AACTCGAGTTACCCCCAAAGCGGTCTTGATTC 3′;SEQ IDNO:13)。该973-bp PCR扩增产物被连接入载体pPCR-Script SK(+)(Stratagene,LaJolla,CA)。该质粒的973-bp ExoRⅡ/XhoⅠ片段被插入pGEX-5X-1(Amersham Pharmacia Biotech,Piscataway,NJ)的ExoRⅡ/XhoⅠ位点,以构建pSW67-1质粒。质粒pGEX-5X-1是GST基因融合载体,其将一个26-kDa的GST部分加在目的蛋白的N-末端。大肠杆菌BL21(DE3)经pSW67-1和pGEX-5X-1转化,产生菌株BL21(DE3)/pSW67-1和BL21(DE3)/pGEX-5X-1。
大肠杆菌wcaG序列(核苷酸SEQ ID NO:3的1-966)也经PCR扩增自大肠杆菌W3110的基因组DNA,该扩增使用引物WG EcoRⅠ5-2(5′CTGGAGTCGAATTCATGAGTAAACAACGAG 3′;SEQ ID NO:14)和WGPstⅠ 3(5′AACTGCAGTTACCCCCGAAAGCGGTCTTGATTC 3′;SEQ ID NO:15)。该976-bp PCR扩增产物被连接入载体pPCR-Script(Stratagene)。该质粒的976-bp ExoRⅡ/PstⅠ片段被插入表达载体pPKK223-3(AmershamPharmacia Biotech)的ExoRⅡ/PstⅠ位点,以构建pSW75-2质粒。大肠杆菌JM105经pKK223-3和pSW75-2转化,产生菌株JM105/pKK223-3和JM105/pSW75-2。
6个菌株全部以双份振荡培养在37℃的2 x YTA培养基中直到600nm的光密度达到0.8-1.0(约3小时)。2 x YTA培养基包含16g/L胰蛋白胨,10g/L酵母浸膏,5g/L氯化纳和100mg/L氨苄青霉素。每种培养物通过加异丙基β-D-硫代半乳糖吡喃糖苷(IPTG)到终浓度1mM加以诱导。12份培养物全部再培养4小时,用0.9%NaCl洗涤,然后将细胞冷冻在-80℃。在用细胞团制备提取物之前,每份培养物取少量进行质粒DNA小量制备以证实这些菌株中存在相应的质粒。每种培养物的蛋白制剂还进行SDS凝胶电泳以证实与预期相应大小的蛋白的表达。冷冻细胞团解冻后,重新悬浮在pH7.2的2.5mL MOPS/EDTA缓冲液中,在French press中(10,000psi)裂解,20,000x g离心20分钟,同前上测定蛋白并稀释成0.01,0.1,1.0和3mg/mL蛋白。
菌株BL21(DE3)/pGEX-5X-1经诱导得到26-kDa蛋白质的高水平表达,表明有天然GST蛋白质的合成。菌株BL21(DE3)/pSW67-1经诱导得到62-kDa蛋白质的高水平表达,表明与wcaG基因产物(36k)融合之天然GST蛋白(26k)的合成。该融合蛋白的等分试样用蛋白酶Factor Xa(New Engl和Biolabs,Beverly,MA)处理,该酶在GST/wcaG结合点附近裂解。菌株JM105/p SW75-2经诱导得到36-kDa蛋白质的高水平表达,表明有wcaG基因产物的合成。在菌株JM105/pKK223-3中未检测到这类蛋白(只有载体)。
然后在实施例7所述标准差向异构酶试验中检验提取物,以测定包含wcaG产物的任何提取物是否都能将GDP-D-甘露糖转化为GDP-L-半乳糖。待测提取物是:
BL21(DE3)组
1.BL21(DE3)未诱导
2.BL21(DE3)经1mM IPTG诱导
3.BL21(DE3)/pGEX-5X-1未诱导
4.BL21(DE3)/PGEX-5X-1经1mM IPTG诱导
5.BL21(DE3)/pSW67-1未诱导
6.BL21(DE3)/pSW67-1经1mM IPTG诱导;融合蛋白完整
7.BL21(DE3)/pSW67-1经1mM IPTG诱导;GST部分被裂解
JM105组
1.JM105未诱导
2.JM105经1mM IPTG诱导
3.JM105/pKK223-3未诱导
4.JM105/pKK223-3经1mM IPTG诱导
5.JM105/pSW75-2未诱导
6.JM105/pSW75-2经1mM IPTG诱导
BL21(DE3)组的提取物1和7与JM105组的提取物1和6经预试检测GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶样活性。在此起始实验中,无一份样品检测到差向异构酶活性。此时,这样的结果可有几种可能性。第一,可能wcaG基因产物不能催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化,尽管还需检测另几个参数才能下此结论。第二,可能该检测条件适合检测内源性GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的活性,而wcaG基因产物没有GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶样活性。因此,应当检测不同的条件。另外,还需要进行重复试验以证实预试条件的准确性。第三,尽管BL21(DE3)和JM105克隆株合成了预期大小的蛋白质,但是尚未对该构建体进行测序以确认wcaG基因产物的正确编码序列并因此排除可能使wcaG基因产物失活的PCR失误或克隆失误。第四,克隆序列产生的蛋白质具有全长,但没有活性,如由于错误的三级结构(折叠)。第五,基因过度表达,致使不可溶性失活蛋白产物(包涵体)的累积。将来的试验将尝试证实该构建体具有或可诱导而具有催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化的能力,以及利用该序列分离内源性GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的能力。
表12提供了Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标。
表12HEADER 差向异构酶/还原酶 27-SEP-98 1BWSTITLE 大肠埃希菌的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖TITLE 2 差向异构酶/还原酶的结晶结构。该酶TITLE 3 为GDP-L-岩藻糖的生物合成中的关键酶COMPND MOL_ID:1;COMPND 2 分子: GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶COMPND 3 中国:A;COMPND 4 遗传修饰:有;CCMPND 5 生物学单位:同型二聚体SOURCE MOL_ID:1;SOURCE 2 生物体学名:大肠埃希菌:SOURCE 3 表达系统:大肠埃希菌KEYWDS 差向异构酶/还原酶,GDP-L-岩藻糖生物合成EXPDTA X-线衍射AUTHOR DE M.RIZZITONETTIFLQRAREVDAT 1 13-JAN-99 1BWS 0JRNL 作者 DE D.RIZZITONETTIVIGEVANISTURLABISSOFLORAJRNL 标题 大肠杆菌的GDP-4-酮基-6-脱氧-JRNL 标题 2 甘露糖差向异构酶/还原酶,GDP-L-JRNL 标题 3 岩藻糖生物合成中的一种关键酶JRNL 标题 4 展示RED蛋白同系物超家族的JRNL 标题 5 结构特征JRNL REF 结构(伦敦) 1998JRHL REFN 9999REMARK 1REMARK 2REMARK 2 分辨率2.2埃REMARK 3REMARK 3 详述REMARK 3 程序 :TNTREMRK 3 作者 :TRONRUDTEN EYCK,MATTHEWSREMARK 3REMARK 3 详述所用数据REMARK 3 分辨率上限(埃)2.2REMARK 3 分辨率下限(埃):15.0REMARK 3 临界值 (SIGMA(F));0.0REMARK 3 完整性范围 (%);99.7REMARK 3 反射数 ;24481REMARK 3REMARK 3 使用超过sigma临界值的数据REMARK 3 交叉有效方法:无REMARK 3 自由R值检测组选择:0REMARK 3 R值(工作组+检测组):0REMARK 3 R值(工作组):03 自由R值:0REMARK 3 自由R值检测组大小(%):0REMARK 3 自由R值检测组计数:0REMARK 3REMARK 3 使用所有数据,无SIGMA界值REMARK 3 R值(工作组+检测组,无界值):0REMARK 3 R值(工作组,无界值):0.202REMARK 3 自由R值(无界值):0.287REMARK 3 自由R值检测组大小(%,无界值):0REMARK 3 自由R值检测组计数(无界值):0REMARK 3 反射总数(无界值):0REMARK 3REMARK 3 详述时所用的非氢原子数REMARK 3 蛋白质原子数:2527REMARK 3 核酸原子数:0REMARK 3 其它原子数:109REMARK 3REMARK 3 WILSON B VALUE (FROM FCALC,A**2):0REMARK 3REMARK 3 与理论值的RMS偏差RMS重量计数REMARK 3 键长(A):0.016;0;0REMARK 3 键角(度):1.65;0;0REMARK 3 折射角(度):0;0;0REMARK 3 PSEUDOROTATION ANGLES (度) 0;0;0.REMARK 3 TRIGONAL CARBON PLANES (A):0;0;0;REMARK 3 GENERAL PLANES (A):0;0;0;REMARK 3 同位素的温度(A**2):0;0;0REMARK 3 非化学健连接(A):0;0;0REMARK 3REMARK 3 错误的手性中心(计数):无REMARK 3REMARK 3 主要解决模式REMARK 3 所用方法:无REMARK 3 KSQL ;无REMARK 3 BSOL ;无REMARK 3REMARK 3 限制库REMARK 3 立体化学:无REMARK 3 同位素的温度限制:无REMARK 3REMARK 3 其它限制:无REMARK 4REMARK 4 1BWS COMPLIES WITH FORMAT V.2.2,16-DEC-1996REMARK 5REMARK 5 警告REMARK 5 1BWS:这是第1层发布REMARK 5REMARK 5 请注意该路径是在保藏者检查并认可REMARK 5 后发布的,无PDB人员介入REMARK 5 辅助文件AUXIBWS.RPT可得自PDBFTRREMARK 5 服务器且可通过3DB浏览器进入REMARK 5 THE FILE CONTAINS THE OUTPUT OF THE PROGRAM WHAT CHECK ANDREMARK 5 OTHER DIAGNOSTICS.REMARK 5REMARK 5 该路径中使用的命名法,包括HET残基名称和HET ATOMREMARK 5 名称均未被PDB处理员标准化当该标准化完成并得到REMARK 5 保藏者认可后将很快发布第2层路径REMARK 5 该第2层路径将与适当的REVDAT记录一起REMARK 5 作为第一个的校正使用REMARK 5REMARK 5REMARK 5 进一步资料包括检查该REMARK 5 路径时所用的有效标准REMARK 5 和指示数据组均可从PDBREMARK 5 网址HTTP:/WWW.PDB.BNT.GOV得到REMARK 200REMARK 200 实验详细资料REMARK 200 实验类型:X射线衍射REMARK 200 数据采集日:1997年8月REMARK 200 温度(绝对温标):120REMARK 200 PH:6.5REMARK 200 所用结晶数:1REMARK 200REMARK 200 同步加速器(有/无):无REMARK 200 放射源:无REMARK 200 光束:无REMARK 200 X-射线生成仪型号:RIGAKU RU200REMARK 200 单色或LAUE(M/L):MREMARK 200 波长或波长范围(A):15418REMARK 200 单色仪:无REMARK 200 光学仪器:无REMARK 200REMARK 200 DETECTOR TYPE :IMAGE PLATEREMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER :RAXISREMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE :MOSFIMREMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE :SCALAREMARK 200REMARK 200 单反射数: 24481REMARK 200 分辨率上限(A):2.2REMARK 200 分辨率下限(A):15.0REMARK 200 否定标准(SIGMA(I)):无REMARK 200REMARK 200 OVERALL.REMARK 200 完整性范围(%):99.7REMARK 200 数据重复:4.3REMARK 200 R合并(I):0.057REMARK 200 R SYM (I):0REMARK 200 <I/SIGMA(I)>用于数据设置 :13.6REMARK 200REMARK 200 最高分辨率范围内REMARK 200 分辨率上限(A):无REMARK 200 分辨率下限(A):无REMARK 200 完整性范围(%):无REMARK 200 范围内的数据重复:无REMARK 200 R范围合并(I):无REMARK 200 R SYM FOR SHELL (I):无REMARK 200 <I/SIGMA(I)>FOR SHELL :无REMARK 200REMARK 200 衍射方法:无REMARK 200 用于测定结构的方法:MIRREMARK 200 所用软件:无REMARK 200 启始模式:无REMARK 200REMARK 200 REMARK:NULLREMARK 280REMARK 280 结晶REMARK 280 溶剂含量,VS(%):0REMARK 280 MATTHEWS 系数2VM(埃)**3/DA):0REMARK 280REMARK 280 结晶条件:无REMARK 290REMARK 290 晶体构象对称REMARK 290 空间组对称操作符:P3221REMARK 290REMARK 290 SYMOP 对称REMARK 290 NNNMMM 操作符REMARK 290 1555 X,Y,ZREMARK 290 2555 -Y,X-Y,Z+2/3REMARK 290 3555 Y-X,-X,Z+1/3REMARK 290 4555 Y,X,-ZREMARK 290 5555 X-Y,-Y,1/3-ZREMARK 290 6555 -X,Y-X,2/3-ZREMARK 290REMARK 290 WHERE NNN->操作编码REMARK 290 MMM->翻译载体REMARK 290REMARK 290 结晶对称转化REMARK 290 以下为ATOM/HETATM转化REMARK 290 该路径中产生晶体构象的记录REMARK 290 相关分子REMARK 290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY1 2-0.500045-0.865974 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY2 2 0.866077-0.499955 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 50.58553REMARK 290 SMTRY1 3-0.499955 0.865974 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY2 3-0.866077-0.500045 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 1.000000 25.29276REMARK 290 SMTRY1 4-0.500045 0.865922 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY2 4 0.866077 0.500045 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY1 5 1.000000 0.000104 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY2 5 0.000000-1.000000 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY3 5 0.000000 0.000000-1.000000 25.29276REMARK 290 SMTRY1 6-0.499955-0.866026 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY2 6-0.866077 0.499955 0.000000 0.00000REMARK 290 SMTRY3 6 0.000000 0.000000-1.000000 50.58553REMARK 290REMARK 290 REMARK:NULLREMARK 465REMARK 465 忽略的残基REMARK 465 以下残基不位于REMARK 465 实验(M=模式编号;RES=残基名称:C=链REMARK 465 识别码;SSSEQ=序列编号;I=插入密码:REMARK 46SREMARK 465 M RES C SSSEOIREMARK 465 MET A 1REMARK 465 SER A 2REMARK 465 ASP A 317REMARK 465 ARG A 318REMARK 465 PHE A 319REMARK 465 ARG A 320REMARK 465 GLY A 321REMARK 800REMARK 800 位点REMARK 800 位点特征:CATREMARK 800 位点描述:REMARK 800 催化性残基REMARK 800REMARK 800 位点特征:CATREMARK 800 位点描述:REMARK 800 催化性残基REMARK 800REMARK 800 位点特征:CATREMARK 800 位点描述:REMARK 800 催化性残基REMARK 800DBREF 1BWS A 3 316 SWS P320S5 FCL ECOLISEORES 1 A 321 MET SER LYS GLN ARG VAL PHE ILE ALA GLY HIS ARG GLYSEORES 2 A 321 MET VAL GLY SER ALA ILE ARG ARG GLN LEU GLU GLN ARGSEORES 4 A 321 ASN LEU LEU ASP SER ARG ALA VAL HIS ASP PHE PHE ALASEORES 5 A 321 SER GLU ARG ILE ASP GLN VAL TYR LEU ALA ALA ALA LYSSEORES 6 A 321 VAL GLY GLY ILE VAL ALA ASN ASN THR TYR PRO ALA ASPSEORES 7 A 321 PHE ILE TYR GLN ASN MET MET ILE GLU SER ASN ILE ILESEORES 8 A 321 HIS ALA ALA HIS GLN ASN ASP VAL ASN LYS LEU LEU PHESEORES 9 A 321 LEU GLY SER SER CYS ILE TYR PRO LYS LEU ALA LYS GLNSEORES 10 A 321 PRO MET ALA GLU SER GLU LEU LEU GLN GLY THR LEU GLUSEORES 11 A 321 PRO THR ASN GLU PRO TYR ALA ILE ALA LYS ILE ALA GLYSEORES 12 A 321 ILE LYS LEU CYS GLU SER TYR ASN ARG GLN TYR GLY ARGSEORES 13 A 321 ASP TYR ARG SER VAL MET PRO THR ASN LEU TYR GLY PROSEORES 14 A 321 HIS ASP ASN PHE HIS PRO SER ASN SER HIS VAL ILE PROSEORES 15 A 321 ALA LEU LEU ARG ARG PHE HIS GLU ALA THR ALA GLN ASNSEORES 16 A 321 ALA PRO ASP VAL VAL VAL TRP GLY SER GLY THR PRO METSEORES 17 A 321 ARG GLU PHE LEU HIS VAL ASP ASP MET ALA ALA ALA SERSEORES 18 A 321 ILE HIS VAL MET GLU LEU ALA HIS GLU VAL TRP LEU GLUSEORES 20 A 321 GLY VAL ASP CYS THR ILE ARG ASP VAL ALA GLN THR ILESEOPES 21 A 321 ALA LYS VAL VAL GLY TYR LYS GLY ARG VAL VAL PHE ASPSEORES 22 A 321 ALA SER LYS PRO ASP GLY THR PRO ARG LYS LEU LEU ASPSEORES 24 A 321 SER LEU GLU ALA GLY LEU ALA SER THR TYR GLN TRP PHESEORES 25 A 321 LEU GLU ASN GLN ASP ARG PHE ARG GLYHET NDP 1 0HETNAM NDP烟酰胺腺嘌吟二核苷磷酸HETSYN NDP NADPFORMUL 2 NDP C21 H23 N7 O17 P3 3-FORMUL 3 HOH *109(H2 O1)HELIX 1 1 MET A 14 GLN A 25 1 12HELIX 2 2 SER A 44 GLU A 54 1 11HELIX 3 3 ILE A 69 THR A 74 1 6HELIX 4 4 PRO A 76 ASN A 97 1 22HELIX 5 5 SER A 108 ILE A 110 5 3HELIX 6 6 GLU A 121 GLU A 123 5 3HELIX 7 7 GLU A 134 TYR A 154 1 21HELIX 8 8 VAL A 180 ALA A 193 1 14HELIX 9 9 VAL A 214 GLU A 226 1 13HELIX 10 10 HIS A 229 GLU A 234 1 6HELIX 11 11 ILE A 253 VAL A 264 1 12HELIX 12 12 THR A 288 GLN A 292 1 5HELIX 13 13 LEU A 301 GLU A 314 1 14SHEET 1 A 6 VAL A 29 VAL A 32 0SHEET 2 A 6 GLN A 4 ALA A 9 1 N GLN A 4 O GLU A 30SHEET 3 A 6 GLN A 58 LEU A 61 1 N GLN A 58 O PHE A 7SHEET 4 A 6 LYS A 101 LEU A 105 1 N LYS A 101 O VAL A 59SHEET 5 A 6 ASP A 157 PRO A 163 1 N ASP A 157 O LEU A 102SHEET 6 A 6 ILE A 243 VAL A 245 1 N ILE A 243 O MET A 162SHEET 1 B 2 ASN A 165 TYR A 167 0SHEET 2 B 2 PHE A 211 HIS A 213 1 N LEU A 212 O ASN A 165SHEET 1 C 2 ASP A 198 TRP A 202 0SHEET 2 C 2 ARG A 269 ASP A 273 1 N ARG A 269 O VAL A 199SITE 1 CAT 1 TYR 136SITE 2 CAT 1 LYS 140SITE 3 CAT 1 SER 107CRYST1 104.200 104.200 75.880 90.00 90.00 120.00 P 32 2 1 6ORIGX1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000SCALE1 0.009597 0.005541 0.000000 0.00000SCALE2 0.000000 0.011081 0.000000 0.00000SCALE3 0.000000 0.000000 0.013179 0.00000HETATM 1 O HOH 1 55.652-16.806 22.535 1.00 8.73 OHETATM 2 O HOH 3 58.494-10.639 18.740 1.00 13.17 OHETATM 3 O HOH 4 58,230-11.715 27.770 1.00 19.07 OHETATM 4 O HOH 5 57.252 -3.759 30.107 1.00 11.21 OHETATM 5 O HOH 6 58.298-10.011 25.527 1.00 15.74 OHETATM 6 O HOH 7 49.321 6.583 38.815 1.00 19.33 OHETATM 7 O HOH 8 53.785 -4.262 22.464 1.00 10.94 OHETATM 8 O HOH 10 74.652 2.888 9.141 1.00 17.80 OHETATM 9 O HOH 11 49.761 0.826 32.896 1.00 22.02 OHETATM 10 O HOH 12 55.530 -11.162 28.526 1.00 11.39 OHETATM 11 O HOH 13 75.027 7.034 27.353 1.00 16.30 OHETATM 12 O HOH 14 49.994 -2.314 11.032 1.00 21.33 OHETATM 13 O HOH 15 61.323 -8.959 29.657 1.00 22.84 OEETATM 14 O HOH 16 61.029 -11.560 29.131 1.00 21.24 OHETATM 15 O HOH 17 50.684 5.881 10.130 1.00 15.88 OHETATM 16 O HOH 18 64.506 -6.302 32.989 1.00 21.05 OHETATM 17 O HOH 19 57.856 -16.398 25.085 1.00 22.86 OHETATM 18 O HOH 20 38.979 26.536 19.070 1.00 21.08 OHETATM 19 O HOH 21 38.042 33.487 21.909 1.00 19.01 OHETATM 20 O HOH 24 38.172 35.775 20.827 1.00 33.46 OHETATM 21 O HOH 25 70.916 -11.128 15.244 1.00 31.37 OHETATM 22 O HOH 26 54.205 19.360 28.396 1.00 35.76 OHETATM 23 O HOH 27 50.436 2.654 16.783 1.00 12.25 OHETATM 24 O HOH 28 69.692 19.108 38.979 1.00 49.77 OHETATM 25 O HOH 29 56.432 -8.877 19.303 1.00 22.52 OHETATM 26 O HOH 30 60.832 3.415 42.349 1.00 17.39 OHETATM 27 O HOH 31 53.889 -12.706 29.764 1.00 22.40 OHETATM 28 O HOH 32 37.887 26.373 28.058 1.00 18.09 OHETATM 29 O HOH 33 49.201 11.173 26.867 1.00 33.95 OHETATM 30 O HOH 34 46.762 -0.278 31.394 1.00 20.63 OHETATM 31 O HOH 35 41.731 27.568 43.302 1.00 27.39 OHETATM 32 O HOH 36 66.827 11.202 28.929 1.00 13.23 OHETATM 33 O HOH 37 46.834 14.396 40.819 1.00 46.02 OHETATM 34 O HOH 38 61.342 1.064 43.868 1.00 26.68 OHETATM 35 O HOH 42 70.597 16.422 37.837 1.00 19.26 OHETATM 36 O HOH 44 72.275 -9.089 33.407 1.00 22.11 OHETATM 37 O HOH 45 42.685 34.461 33.955 1.00 17.32 OHETATM 38 O HOH 46 53.480 13.394 38.364 1.00 20.19 OHETATM 39 O HOH 47 56.085 21.757 44.744 1.00 33.50 OHETATM 40 O HOH 48 35.741 32.691 23.517 1.00 19.49 OHETATM 41 O HOH 49 40.458 36.700 34.312 1.00 34.53 OHETATM 42 O HOH 50 75.440 7.267 29.948 1.00 18.07 OHETATM 43 O HOH 51 47.476 18.347 20.851 1.00 34.16 OHETATM 44 O HOH 53 52.837 -16.344 19.587 1.00 25.92 OHETATM 45 O HOH 55 46.415 9.073 20.108 1.00 31.91 OHETATM 46 O HOH 57 45.912 35.170 36.133 1.00 35.55 OHETATM 47 O HOH 58 60.247 -2.880 41.919 1.00 16.85 OHETATM 48 O HOH 60 64.974 6.086 24.501 1.00 32.16 OHETATM 49 O HOH 61 52.103 4.683 4.978 1.00 35.72 OHETATM 50 O HOH 62 50.888 40.154 36.463 1.00 38.35 OHETATM 51 O HOH 63 44.373 31.233 37.336 1.00 20.07 OHETATM 52 O HOH 64 57.280 27.757 42.451 1.00 21.74 OHETATM 53 O HOH 65 58.409 23.769 45.517 1.00 58.42 OHETATM 54 O HOH 66 68.690 -11.764 35.335 1.00 57.07 OHETATM 55 O HOH 67 42.746 25.153 23.465 1.00 27.05 OHETATM 56 O HOH 68 53.638 -16.457 32.292 1.00 31.71 OHETATM 57 O HOH 69 33.390 41.716 31.408 1.00 29.92 OHETATM 58 O HOH 70 57.768 17.897 42.434 1.00 25.75 OHETATM 59 O HOH 71 75 647 9.164 11.766 1.00 35.13 OHETATM 60 O HOH 72 62.032 33.292 44.749 1.00 46.18 OHETATM 61 O HOH 73 47.310 14.312 34.285 1.00 31.18 OHETATM 62 O HOH 74 79.660 -3.947 15.913 1.00 34.63 OHETATM 63 O HOH 75 46.929 5.343 4.550 1.00 23.14 OHETATM 64 O HOH 76 73.475 12.039 28.412 1.00 27.26 OHETATM 65 O HOH 77 46.297 -6.982 30.032 1.00 43.41 OHETATM 66 O HOH 78 68.528 -3.422 40.869 1.00 38.47 OHETATM 67 O HOH 79 62.080 -1.448 42.803 1.00 24.60 OHETATM 68 O HOH 80 65.330 18.150 40.726 1.00 41.00 OHETATM 69 O HOH 81 51.775 16.128 37.607 1.00 25.11 OHETATM 70 O HOH 83 54.266 28.682 43.313 1.00 27.61 OHFTATM 71 O HOH 85 73.291 -15.479 20.603 1.00 37.54 OHETATM 72 O HOH 86 34.760 21.479 28.544 1.00 43.87 OHETATM 73 O HOH 87 37.326 24.131 29.677 1.00 24.47 OHETATM 74 O HOH 88 65.168 20.148 6.735 1.00 26.10 OHETATM 75 O HOH 89 59.196 12.089 13.630 1.00 25.24 OHETATM 76 O HOH 91 66.576 -6.235 40.279 1.00 43.11 OHETATM 77 O HOH 93 37.339 29.394 25.515 1.00 27.56 OHETATM 78 O HOH 94 52.339 -17.014 42.271 1.00 48.96 OHETATM 79 O HOH 95 40.511 32.927 31.717 1.00 22.46 OHETATM 80 O HOH 96 78.580 13.121 34.138 1.00 27.98 OHETATM 81 O HOH 97 65.090 15.704 34.876 1.00 18.96 OHETATM 82 O HOH 99 84.562 2.951 27.181 1.00 35.92 OHETATM 83 O HOH 100 50.386 9.761 9.646 1.00 23.18 OHETATM 84 O HOH 101 67.649 -0.851 38.764 1.00 24.99 OHETATM 85 O HOH 102 44.001 4.293 34.315 1.00 31.13 OHETATM 86 O HOH 103 59.386 -5.071 26.211 1.00 29.10 OHETATM 87 O HOH 104 77.364 4.745 41.506 1.00 35 32 OHETATM 88 O HOH 105 59.034 21.201 32.414 1.00 23.43 OHETATM 89 O HOH 106 42.463 34.698 14.327 1.00 38.86 OHETATM 90 O HOH 107 70.217 14.292 20.864 1.00 42.39 OHETATM 91 O HOH 108 76.999 8.130 25.862 1.00 32.91 OHETATM 92 O HOH 109 49.766 29.937 22.173 1.00 42.52 OHETATM 93 O HOH 110 72.473 13.536 38.823 1.00 33.32 OHETATM 94 O HOH 111 64.328 -12.084 38.608 1.00 37.99 OHETATM 95 O HOH 112 60.161 16.382 42.682 1.00 35.68 OHETATM 96 O HOH 113 47.602 13.639 27.016 1.00 26.01 OHETATM 97 O HOH 115 64.606 11.644 40.107 1.00 30.33 OHETATM 98 O HOH 116 61.231 -15.137 27.255 1.00 38.76 OHETATM 99 O HOH 117 65.324 -11.223 35.098 1.00 30.45 OHETATM 100 O HOH 119 56.602 17.219 44.932 1.00 36.53 OHETATM 101 O HOH 120 37.564 19.860 23.135 1.00 31.27 OHETATM 102 O HOH 121 64.845 5.057 21.132 1.00 45.57 OHETATM 103 O HOH 123 63.391 16.801 26.898 1.00 38.46 OHETATM 104 O HOH 124 42.567 6.134 32.635 1.00 31.56 OHETATM 105 O HOH 125 72.485 13.236 35.059 1.00 29.61 OHETATM 106 O HOH 126 65.229 3.650 44.032 1.00 36.86 OHETATM 107 O HOH 127 37.089 7.148 31.083 1.00 39.58 OHETATM 108 O HOH 128 73.327 10.546 12.123 1.00 34.97 OHETATM 109 O HOH 129 74.450 10.299 26.598 1.00 30.80 OHETATM 110 AO5* NDP A 1 67.524 13.055 26.692 1.00 36.42 OHETATM 111 AC5* NDP A 1 68.089 12.297 25.614 1.00 9.30 CHETATM 112 AC4* NDP A 1 69.601 12.124 25.858 1.00 27.73 CHETATM 113 AO4* NDP A 1 70.193 11.258 24.848 1.00 22.87 OHETATM 114 AC3* NDP A 1 70.484 13.390 25.873 1.00 17.83 CHETATM 115 AO3* NDP A 1 71.192 13.436 27.066 1.00 16.11 OHETATM 116 AC2* NDP A 1 71.373 13.220 24.626 1.00 11.46 CHETATM 117 AO2* NDP A 1 72.623 13.886 24.655 1.00 31.96 OHETATM 118 AC1* NDP A 1 71.510 11.702 24.656 1.00 19.02 CHETATM 119 O3 NDP A 1 65.336 13.590 26.129 1.00 20.59 OHETATM 120 NO5* NDP A 1 63.536 11.943 26.448 1.00 28.99 OHETATM 121 NC5* NDP A 1 64.328 10.843 25.957 1.00 24.89 CHETATM 122 NC4* NDP A 1 63.467 9.646 25.686 1.00 31.79 CHETATM 123 NO4* NDP A 1 62.837 9.337 26.908 1.00 28.82 OHETATM 124 NC3* NDP A 1 62.340 9.837 24.665 1.00 11.50 CHETATM 125 NO3* NDP A 1 62.891 9.402 23.461 1.00 28.60 OHETATM 126 NC2* NDP A 1 61.152 8.996 25.138 1.00 28.11 CHETATM 127 NO2* NDP A 1 60.881 7.662 24.715 1.00 24.30 OHETATM 128 NC1* NDP A 1 61.547 8.875 26.580 1.00 35.35 CHETATM 129 AP2* NDP A 1 73.104 15.069 23.823 1.00 32.96 PHETATM 130 AOP1 NDP A 1 74.500 15.308 24.308 1.00 37.84 OHETATM 131 AOP2 NDP A 1 72.797 14.925 22.348 1.00 36.66 OHETATM 132 AOP3 NDP A 1 72.163 16.217 23.958 1.00 31.97 OHETATM 133 AP NDP A 1 66.660 14.257 26.393 1.00 26.17 XXHETATM 134 AO1 NDP A 1 66.886 14.795 25.047 1.00 15.31 XXHETATM 135 AO2 NDP A 1 66.439 15.207 27.521 1.00 34.39 XXHETATM 136 AN9 NDP A 1 71.820 11.224 23.353 1.00 13.63 XXHETATM 137 AC8 NDP A 1 71.104 11.316 22.200 1.00 12.41 XXHETATM 138 AN7 NDP A 1 71.758 10.835 21.161 1.00 15.71 XXHETATM 139 AC5 NDP A 1 72.933 10.313 21.710 1.00 16.17 XXHETATM 140 AC6 NDP A 1 74.053 9.657 21.140 1.00 31.35 XXHETATM 141 AN6 NDP A 1 74.165 9.464 19.819 1.00 12.59 XXHETATM 142 AN1 NDP A 1 75.078 9.280 21.942 1.00 17.56 XXHETATM 143 AC2 NDP A 1 74.971 9.578 23.251 1.00 15.44 XXHETATM 144 AN3 NDP A 1 74.027 10.302 23.889 1.00 24.82 XXHETATM 145 AC4 NDP A 1 73.036 10.653 23.047 1.00 17.48 XXHETATM 146 NP NDP A 1 64.183 13.106 27.191 1.00 25.47 NHETATM 147 NO1 NDP A 1 63.142 14.169 27.253 1.00 28.69 NHETATM 148 NO2 NDP A 1 64.837 12.643 28.492 1.00 24.32 NHETATM 149 NN1 NDP A 1 60.598 9.775 27.109 1.00 23.63 NHETATM 150 NC2 NDP A 1 60.143 10.905 26.442 -99.00 78.36 NHETATM 151 NC3 NDP A 1 59.070 11.648 27.007 -99.00100.00 NHETATM 152 NC7 NDP A 1 58.497 13.017 26.528 -99.00100.00 NHETATM 153 NO7 NDP A 1 59.358 13.703 25.972 -99.00100.00 NHETATM 154 NN7 NDP A 1 57.207 13.400 26.912 -99.00 84.38 NHETATM 155 NC4 NDP A 1 58.442 11.146 28.137 -99.00100.00 NHETATM 156 NC5 NDP A 1 58.912 9.963 28.754 -99.00100.00 NHETATM 157 NC6 NDP A 1 59.951 9.266 28.147 -99.00100.00 NATOM 158 N LYS A 3 76.227 -5.632 44.315 1.00 61.49 NATOM 159 CA LYS A 3 76.152 -4.302 43.684 1.00 58.00 CATOM 160 C LYS A 3 75.985 -4.421 42.171 1.00 52.79 CATOM 161 O LYS A 3 76.921 -4.737 41.419 1.00 44.76 OATOM 162 CB LYS A 3 77.359 -3.417 44.030 1.00 59.74 CATOM 163 CG LYS A 3 77.011 -1.944 44.314 1.00 50.87 CATOM 164 CD LYS A 3 78.208 -1.161 44.894 1.00 61.21 CATOM 165 CE LYS A 3 77.855 -0.377 46.186 1.00100.00 CATOM 166 NZ LYS A 3 78.857 -0.401 47.343 1.00 70.61 NATOM 167 N GLN A 4 74.746 -4.242 41.747 1.00 45.15 NATOM 168 CA GLN A 4 74.408 -4.326 40.347 1.00 37.18 CATOM 169 C GLN A 4 74.983 -3.166 39.561 1.00 34.93 CATOM 170 0 GLN A 4 75.127 -2.050 40.087 1.00 28.48 OATOM 171 CB GLN A 4 72.915 -4.445 40.221 1.00 34.65 CATOM 172 CG GLN A 4 72.456 -5.854 40.584 1.00 31.82 CATOM 173 CD GLN A 4 72.570 -6.788 39.405 1.00 79.25 CATOM 174 OE1 GLN A 4 72.165 -6.452 38.286 1.00100.00 OATOM 175 NE2 GLN A 4 73.206 -7.925 39.623 1.00 80.24 NATOM 176 N ARG A 5 75.475 -3.495 38.375 1.00 27.16 NATOM 177 CA ARG A 5 76.146 -2.546 37.483 1.00 39.16 CATOM 178 C ARG A 5 75.191 -2.018 36.433 1.00 38.22 CATOM 179 O ARG A 5 74.938 -2.698 35.438 1.00 32.44 OATOM 180 CB ARG A 5 77.398 -3.163 36.826 1.00 41.76 CATOM 181 CG ARG A 5 78.692 -2.954 37.663 1.00 37.34 CATOM 182 CD ARG A 5 80.015 -3.236 36.876 1.00 32.99 CATOM 183 NE ARG A 5 81.036 -2.203 37.125 1.00 25.71 NATOM 184 CZ ARG A 5 81.617 -1.488 36.169 1.00 32.53 CATOM 185 NH1 ARG A 5 81.293 -1.704 34.904 1.00 40.07 NATOM 186 NH2 ARG A 5 82.516 -0.551 36.474 1.00100.00 NATOM 187 N VAL A 6 74.743 -0.773 36.659 1.00 32.08 NATOM 188 CA VAL A 6 73.715 -0.082 35.881 1.00 28.89 CATOM 189 C ZAL A 6 74.161 1.021 34.897 1.00 29.37 CATOM 190 O VAL A 6 74.745 2.041 35.274 1.00 22 50 OATOM 191 CB VAL A 6 72.577 0.378 36.813 1.00 23.52 CATOM 192 CG1 VAL A 6 71.366 0.960 36.006 1.00 20.29 CATOM 193 CG2 VAL A 6 72.108 -0.852 37.644 1.00 18.45 CATOM 194 N PHE A 7 73.948 0.749 33.615 1.00 22.92 NATOM 195 CA PHE A 7 74.267 1.710 32.573 1.00 27.15 CATOM 196 C PHE A 7 72.975 2.423 32.192 1.00 20.24 CATOM 197 O PHE A 7 71.994 1.788 31.815 1.00 20.71 OATOM 198 CB PHE A 7 74.864 1.004 31.374 1.00 18.98 CATOM 199 CG PHE A 7 74.916 1.836 30.115 1.00 21.83 CATOM 200 CD1 PHE A 7 75.521 3.087 30.108 1.00 19.36 CATOM 201 CD2 PHE A 7 74.483 1.284 28.886 1.00 23.50 CATOM 202 CE1 PHE A 7 75.614 3.828 28.902 1.00 27.52 CATOM 203 CE2 PHE A 7 74.548 1.996 27.685 1.00 19.33 CATOM 204 CZ PHE A 7 75.128 3.255 27.673 1.00 18 59 CATOM 205 N ILE A 8 72.959 3.727 32.454 1.00 18.75 NATOM 206 CA ILE A 8 71.844 4.588 32.112 1.00 14.25 CATOM 207 C ILE A 8 72.337 5.351 30.909 1.00 11.22 CATOM 208 O ILE A 8 73.259 6.165 30.998 1.00 17.76 OATOM 209 CB ILE A 8 71.507 5.605 33.212 1.00 14.15 CATOM 210 CG1 ILE A 8 71.356 4.949 34.582 1.00 8.24 CATOM 211 CG2 ILE A 8 70.183 6.342 32.874 1.00 16.85 CATOM 212 CD1 ILE A 8 71.091 5.961 35.707 1.00 10.32 CATOM 213 N ALA A 9 71.896 4.906 29.752 1.00 16.42 NATOM 214 CA ALA A 9 72.256 5.559 28.513 1.00 18.74 CATOM 215 C ALA A 9 71.530 6.913 28.511 1.00 28.45 CATOM 216 O ALA A 9 70.411 7.032 29.045 1.00 22.39 OATOM 217 CB ALA A 9 71.808 4.731 27.311 1.00 14.43 CATOM 218 N GLY A 10 72.199 7.922 27.940 1.00 20.06 NATOM 219 CA GLY A 10 71.706 9.284 27.911 1.00 18.62 CATOM 220 C GLY A 10 71.407 9.819 29.305 1.00 16.40 CATOM 221 O GLY A 10 70.379 10.448 29.481 1.00 17.36 OATOM 222 N HIS A 11 72.295 9.581 30.272 1.00 10.32 NATOM 223 CA HIS A 11 72.068 9.966 31.688 1.00 13.90 CATOM 224 C HIS A 11 72.008 11.504 31.916 1.00 21.52 CATOM 225 O HIS A 11 71.700 11.994 32.983 1.00 13.22 OATOM 226 CB HIS A 11 73.153 9.350 32.581 1.00 14.88 CATOM 227 CG HIS A 11 74.502 9.948 32.326 1.00 23.73 CATOM 228 ND1 HIS A 11 75.239 9.648 31.197 1.00 24.90 NATOM 229 CD2 HIS A 11 75.167 10.952 32.956 1.00 16.35 CATOM 230 CE1 HIS A 11 76.317 10.407 31.170 1.00 22.54 CATOM 231 NE2 HIS A 11 76.271 11.240 32.197 1.00 17.56 NATOM 232 N ARG A 12 72.310 12.288 30.908 1.00 22.31 NATOM 233 CA ARG A 12 72.147 13.693 31.122 1.00 18.90 CATOM 234 C ARG A 12 70.851 14.244 30.495 1.00 26.34 CATOM 225 O ARG A 12 70.572 15.426 30.604 1.00 25.37 OATOM 236 CB ARG A 12 73.352 14.418 30.587 1.00 25.93 CATOM 237 CG ARG A 12 74.582 13.943 31.279 1.00 53.87 CATOM 238 CD ARG A 12 75.757 14.619 30.699 1.00 32.53 CATOM 239 NE ARG A 12 76.359 15.576 31.605 1.00 69.90 NATOM 240 CZ ARG A 12 76.971 16.675 31.178 1.00100.00 CATOM 241 NH1 ARG A 12 77.001 16.948 29.867 1.00100.00 NATOM 242 NH2 ARG A 12 77.526 17.508 32.056 1.00100.00 NATCM 243 N GLY A 13 70.078 13.420 29.800 1.00 18.25 NATOM 244 CA GLY A 13 68.802 13.904 29.258 1.00 16.50 CATOM 245 C GLY A 13 67.849 14.144 30.428 1.00 18.88 CATOM 246 O GLY A 13 68.202 13.902 31.624 1.00 14.04 OATOM 247 N MET A 14 66.653 14.632 30.103 1.00 16.00 NATOM 248 CA MET A 14 65.688 14.981 31.128 1.00 13.49 CATOM 249 C MET A 14 65.293 13.760 31.901 1.00 14.02 CATOM 250 O MET A 14 65.408 13.713 33.145 1.00 17.06 OATOM 251 CB MET A 14 64.442 15.605 30.524 1.00 11.57 CATOM 252 CG MET A 14 63.320 15.628 31.559 1 00 20.77 CATOM 253 SD MET A 14 61.926 16.766 31.110 1.00 29.16 SATOM 254 CE MET A 14 62.527 17.108 29.574 1.00 30.68 CATOM 255 N VAL A 15 64.798 12.769 31.158 1.00 25.23 NATOM 256 CA VAL A 15 64.439 11.468 31.738 1.00 20.90 CATOM 257 C VAL A 15 65.654 10.713 32.378 1.00 17.26 CATOM 258 O VAL A 15 65.590 10.239 33.524 1.00 18.41 OATOM 259 CB VAL A 15 63.752 10.550 30.680 1.00 23.25 CATOM 260 CG1 VAL A 15 63.330 9.253 31.310 1.00 15.71 CATOM 261 CG2 VAL A 15 62.528 11.193 30.183 1.00 13.40 CATOM 262 N GLY A 16 66.784 10.642 31.665 1.00 20.39 NATCM 263 CA GLY A 16 67.941 9.904 32.186 1.00 19.54 CATOM 264 C GLY A 16 68.522 10.432 33.492 1.00 29.29 CATOM 265 O GLY A 16 68.896 9.659 34.434 1.00 16.91 OATOM 266 N SER A 17 68.64~ 11.755 33.499 1.00 12.53 NATOM 267 CA SER A 17 69.154 12.460 34.650 1.00 21.93 CATOM 268 C SER A 17 68.209 12.214 35.818 1.00 13.35 CATOM 269 O SER A 17 68.677 11.957 36.915 1.00 24.19 OATOM 270 CB SER A 17 69.378 13.942 34.333 1.00 15.52 CATOM 271 OG SER A 17 68.153 14.619 34.372 1.00 22.95 OATOM 272 N ALA A 18 66.896 12.143 35.590 1.00 17 52 NATOM 273 CA ALA A 18 65.991 11.828 36.729 1.00 13.14 CATOM 274 C ALA A 18 66.220 10.393 37.307 1.00 19.29 CATOM 275 O ALA A 18 66.149 10.150 38.522 1.00 16.94 OATOM 276 CB ALA A 18 64.460 12.046 36.334 1.00 14.33 CATOM 277 N ILE A 19 66.484 9.432 36.430 1.00 20.80 NATOM 278 CA ILE A 19 66.705 8.078 36.900 1.00 18.08 CATOM 279 C ILE A 19 67.975 8.090 37.730 1.00 16.09 CATOM 280 O ILE A 19 68.018 7.530 38.820 1.00 20.73 OATOM 281 CB ILE A 19 66.804 7.079 35.710 1.00 17.58 CATOM 282 CG1 ILE A 19 65.444 6.812 35.162 1.00 10.09 CATOM 283 CG2 ILE A 19 67.309 5.666 36.133 1.00 21.60 CATOM 284 CD1 ILE A 19 65.528 6.361 33.741 1.00 19.05 CATOM 285 N ARG A 20 68.984 8.771 37.198 1.00 18.13 NATOM 286 CA ARG A 20 70.286 8.897 37.836 1.00 20.25 CATOM 287 C ARG A 20 70.231 9.491 39.242 1.00 30.62 CATOM 288 O ARG A 20 70.957 9.091 40.129 1.00 33.00 OATOM 289 CB ARG A 20 71.201 9.743 36.957 1.00 11.71 CATOM 290 CG ARG A 20 72.610 9.781 37.449 1.00 23.79 CATOM 291 CD ARG A 20 72.881 11.107 38.060 1.00 36.76 CATOM 292 NE ARG A 20 74.297 11.443 38.062 1.00 48.34 NATOM 293 CZ ARG A 20 74.990 11.841 36.988 1.00100.00 CATOM 294 NH1 ARG A 20 74.393 11.931 35.808 1.00100.00 NATOM 295 NH2 ARG A 20 76.289 12.139 37.076 1.00100.00 NATOM 296 N ARG A 21 69.368 10.461 39.439 1.00 22.10 NATOM 297 CA ARG A 21 69.216 11.052 40.750 1.00 17.45 CATOM 298 C ARG A 21 68.721 10.007 41.730 1.00 26.71 CATOM 299 O ARG A 21 69.147 10.001 42.885 1.00 30.27 OATOM 300 CB ARG A 21 68.142 12.144 40.708 1.00 17.93 CATOM 301 CG ARG A 21 68.682 13.522 40.321 1.00 27.57 CATOM 302 CD ARG A 21 67.586 14.599 40.130 1.00 23.02 CATOM 303 NE ARG A 21 67.619 15.000 38.743 1.00 55.12 NATOM 304 CZ ARG A 21 66.538 15.103 37.995 1.00 10.55 CATOM 305 NH1 ARG A 21 65.343 14.974 38.552 1.00 29.80 NATOM 306 NH2 ARG A 21 66.665 15.435 36.715 1.00 61.45 NATOM 307 N GLN A 22 67.713 9.223 41.345 1.00 27.48 NATOM 308 CA GLN A 22 67.167 8.257 42.313 1.00 24.79 CATOM 309 C GLN A 22 68.137 7.127 42.547 1.00 31.37 CATOM 310 O GLN A 22 68.394 6.724 43.685 1.00 27.47 OATOM 311 CB GLN A 22 65.818 7.706 41.894 1.00 17.11 CATOM 312 CG GLN A 22 64.921 8.745 41.243 1.00 66.14 CATOM 313 CD GLN A 22 63.425 8.456 41.397 1.00 41.27 CATOM 314 OE1 GLN A 22 63.002 7.329 41.762 1.00 29.34 OATOM 315 NE2 GLN A 22 62.610 9.464 41.046 1.00 20.12 NATOM 316 N LEU A 23 68.697 6.652 41.448 1.00 27.99 NATOM 317 CA LEU A 23 69.649 5.575 41.500 1.00 24.48 CATOM 318 C LEU A 23 70.828 5.971 42.334 1.00 28.87 CATOM 319 O LEU A 23 71.288 5.218 43.165 1.00 30.79 OATOM 320 CB LEU A 23 70.036 5.107 40.089 1.00 22.72 CATOM 321 CG LEU A 23 68.966 4.072 39.658 1.00 26.16 CATOM 322 CD1 LEU A 23 69.271 3.083 38.481 1.00 24.80 CATOM 323 CD2 LEU A 23 68.427 3.284 40.835 1.00 22.91 CATOM 324 N GLU A 24 71.279 7.192 42.153 1.00 28.77 NATOM 325 CA GLU A 24 72.419 7.675 42.909 1.00 33.79 CATOM 326 C GLU A 24 72.363 7.388 44.412 1.00 35.94 CATOM 327 O GLU A 24 73.381 7.140 45.031 1.00 39.07 OATOM 328 CB GLU A 24 72.647 9.165 42.653 1.00 36.21 CATOM 329 CG GLU A 24 74.068 9.482 42.243 1.00 42.54 CATOM 330 CD GLU A 24 74.158 10.689 41.333 1.00 89.51 CATOM 331 OE1 GLU A 24 73.386 11.663 41.549 1.00 43.21 OATOM 332 OE2 GLU A 24 74.994 10.646 40.398 1.00 66.28 OATOM 333 N GLN A 25 71.182 7.422 45.000 1.00 45.70 NATOM 334 CA GLN A 25 71.039 7.152 46.432 1.00 47.57 CATOM 335 C GLN A 25 70.887 5.669 46.740 1.00 67.34 CATOM 336 O GLN A 25 70.285 5.286 47.726 1.00 74.06 OATOM 337 CB GLN A 25 69.783 7.842 46.905 1.00 51.85 CATOM 338 CG GLN A 25 69.500 9.084 46.109 1.00 44.91 CATOM 339 CD GLN A 25 68.419 9.913 46.742 1.00100.00 CATOM 340 OE1 GLN A 25 68.271 9.947 47.972 1.00100.00 OATOM 341 NE2 GLN A 25 67.624 10.602 45.911 1 00100.00 NATOM 342 N ARG A 26 71.322 4.831 45.825 1.00 75.37 NATOM 343 CA ARG A 26 71.182 3.407 46.026 1.00 74.87 CATOM 344 C ARG A 26 72.568 2.791 46.147 1.00 74.08 CATOM 345 O ARG A 26 73.440 2.997 45.289 1.00 77.00 OATOM 346 CB ARG A 26 70.390 2.790 44.885 1.00 52.44 CATOM 347 CG ARG A 26 68.916 2.927 45.070 1.00 43.51 CATOM 348 CD ARG A 26 68.428 1.752 45.864 1.00 40.70 CATOM 349 NE ARG A 26 67.200 1.176 45.338 1.00 42.33 NATOM 350 CZ ARG A 26 67.126 0.508 44.196 1.00 32.07 CATOM 351 NH1 ARG A 26 68.215 0.324 43.486 1.00 44.02 NATOM 352 NH2 ARG A 26 65.968 0.017 43.771 1.00 77.32 NATOM 353 N GLY A 27 72.778 2.114 47.266 1.00 46.30 NATOM 354 CA GLY A 27 74.060 1.531 47.549 1.00 46.82 CATOM 355 C GLY A 27 74.140 0.165 46.923 1.00 55.45 CATOM 356 O GLY A 27 75.204 -0.453 46.877 1.00 64.43 OATOM 357 N ASP A 28 73.017 -0.315 46.428 1.00 40.98 NATOM 358 CA ASP A 28 73.016 -1.647 45.861 1.00 40.35 CATOM 359 C ASP A 28 73.266 -1.536 44.400 1.00 39.55 CATOM 360 O ASP A 28 73.109 -2.518 43.654 1.00 48.80 OATOM 361 CB ASP A 28 71.680 -2.335 46.127 1.00 47.80 CATOM 362 CG ASP A 28 70.503 -1.373 46.064 1.00 35.34 CATOM 363 OD1 ASP A 28 70.705 -0.140 46.095 1.00 39.23 OATOM 364 OD2 ASP A 28 69.383 -1.870 45.872 1.00 69.86 OATOM 365 N VAL A 29 73.651 -0.329 43.996 1.00 31.03 NATOM 366 CA VAL A 29 73.881 -0.050 42.591 1.00 28.44 CATOM 367 C VAL A 29 75.166 0.676 42.281 1.00 28.00 CATOM 368 O VAL A 29 75.505 1.699 42.892 1.00 34.83 OATOM 369 CB VAL A 29 72.696 0.760 42.000 1.00 30.68 CATOM 370 CG1 VAL A 29 72.935 1.088 40.549 1.00 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ARG A 36 76.937 12.465 21.846-99.00 49.47 CATOM 428 CD ARG A 36 76.020 13.515 21.232-99.00 63.09 CATOM 429 NE ARG A 36 75.528 13.124 19.915-99.00 75.23 NATOM 430 CZ ARG A 36 74.381 13.549 19.391-99.00 91.44 CATOM 431 NH1 ARG A 36 73.605 14.375 20.079-99.00 79.32 NATOM 432 NH2 ARG A 36 74.009 13.144 18.185-99.00 78.73 NATOM 433 N ASP A 37 80.217 12.677 24.063 1.00 41.30 NATOM 434 CA ASP A 37 81.606 12.710 23.601 1.00 44.91 CATOM 435 C ASP A 37 82.410 11.481 24.043 1.00 24.99 CATOM 436 O ASP A 37 83.211 10.978 23.261 1.00 42.22 OATOM 437 CB ASP A 37 82.347 14.048 23.718-99.00 47.07 CATOM 438 CG ASP A 37 81.881 14.887 24.876-99.00 62.99 CATOM 439 OD1 ASP A 37 80.679 14.839 25.204-99.00 64.45 OATOM 440 OD2 ASP A 37 82.711 15.638 25.429-99.00 69.84 OATOM 441 N GLU A 38 82.129 10.950 25.235 1.00 19.39 NATOM 442 CA GLU A 38 82.790 9.717 25.682 1.00 27.84 CATOM 443 C GLU A 38 82.203 8.527 24.901 1.00 37.14 CATOM 444 O GLU A 38 82.873 7.511 24.699 1.00 35.04 OATOM 445 CB GLU A 38 82.691 9.435 27.207 1.00 25.18 CATOM 446 CG GLU A 38 83.116 10.549 28.183 1.00 37.45 CATOM 447 CD GLU A 38 82.807 10.212 29.655 1.00 21.13 CATOM 448 OE1 GLU A 38 81.623 9.997 30.014 1.00 55.97 OATOM 449 OE2 GLU A 38 83.757 9.978 30.419 1.00 98.78 OATOM 450 N LEU A 39 80.948 8.610 24.478 1.00 25.52 NATOM 451 CA LEU A 39 80.440 7.483 23.739 1.00 18.17 CATOM 452 C LEU A 39 79.291 7.764 22.825 1.00 20.34 CATOM 453 O LEU A 39 78.152 7.810 23.259 1.00 26.35 OATOM 454 CB LEU A 39 80.123 6.313 24.657 1.00 14.56 CATOM 455 CG LEU A 39 79.410 5.075 24.058 1.00 19.52 CATOM 456 CD1 LEU A 39 80.205 4.392 22.994 1.00 18.84 CATOM 457 CD2 LEU A 39 78.890 4.051 25.084 1.00 17.41 CATOM 458 N ASN A 40 79.598 7.880 21.543 1.00 16.73 NATOM 459 CA ASN A 40 78.548 7.971 20.540 1.00 21.55 CATOM 460 C ASN A 40 77.798 6.649 20.308 1.00 24 53 CATOM 461 O ASN A 40 78.328 5.720 19.688 1.00 19.96 OATOM 462 CB ASN A 40 79.130 8.367 19.216 1.00 18.45 CATOM 463 CG ASN A 40 78.054 8.727 18.225 1.00 42.19 CATOM 464 OD1 ASN A 40 78.327 9.093 17.080 1.00 38.89 OATOM 465 ND2 ASN A 40 76.827 8.730 18.697 1.00 23.71 NATOM 466 N LEU A 41 76.543 6.622 20.754 1.00 21.08 NATOM 467 CA LEU A 41 75.649 5.465 20.650 1.00 15.03 CATOM 468 C LEU A 41 75.225 5.068 19.213 1.00 18.22 CATOM 469 O LEU A 41 74.681 3.971 18.980 1.00 15.72 OATOM 470 CB LEU A 41 74.426 5.705 21.532 1.00 15.85 CATOM 471 CG LEU A 41 74.822 6.029 22.974 1.00 21.90 CATOM 472 CD1 LEU A 41 73.604 6.413 23.749 1.00 20.59 CATOM 473 CD2 LEU A 41 75.481 4.796 23.609 1.00 17.97 CATOM 474 N LEU A 42 75.542 5.916 18.238 1.00 12.45 NATOM 475 CA LEU A 42 75.256 5.607 16.831 1.00 15.99 CATOM 476 C LEU A 42 76.290 4.680 16.280 1.00 26.18 CATOM 477 O LEU A 42 76.066 4.039 15.257 1.00 22.41 OATOM 478 CB LEU A 42 75.282 6.873 15.984 1.00 17.85 CATOM 479 CG LEU A 42 74.180 7.854 16.399 1.00 30.70 CATOM 480 CD1 LEU A 42 74.318 9.184 15.704 1.00 24.31 CATOM 481 CD2 LEU A 42 72.764 7.241 16.208 1.00 31.13 CATOM 482 N ASP A 43 77.462 4.705 16.911 1.00 26.87 NATOM 483 CA ASP A 43 78.579 3.875 16.486 1.00 19.29 CATOM 484 C ASP A 43 78.583 2.519 17.163 1.00 13.33 CATOM 485 O ASP A 43 79.051 2.348 18.297 1.00 18.75 OATOM 486 CB ASP A 43 79.870 4.580 16.776 1.00 31.06 CATOM 487 CG ASP A 43 81.083 3.758 16.380 1.00 30.68 CATOM 488 OD1 ASP A 43 80.971 2.551 16.082 1.00 32.36 OATOM 489 OD2 ASP A 43 82.187 4.308 16.499 1.00 37.83 OATOM 490 N SER A 44 78.139 1.544 16.377 1.00 16.89 NATOM 491 CA SER A 44 77.978 0.173 16.789 1.00 17.67 CATOM 492 C SER A 44 79.237 -0.463 17.392 1.00 20.40 CATOM 493 O SER A 44 79.206 -1.126 18.444 1.00 26.27 OATOM 494 CB SER A 44 77.504 -0.617 15.581 1.00 13.85 CATOM 495 OG SER A 44 76.800 -1.740 16.063 1.00 43.83 OATOM 496 N ARG A 45 80.335 -0.301 16.682 1.00 15.63 NATOM 497 CA ARG A 45 81.616 -0.788 17.154 1.00 19.94 CATOM 498 C ARG A 45 81.910 -0.225 18.521 1.00 29.48 CATOM 499 O ARG A 45 82.244 -0.937 19.457 1.00 27.65 OATOM 500 CB ARG A 45 82.684 -0.261 16.203 1.00 27.46 CATOM 501 CG ARG A 45 83.463 -1.338 15.495 1.00 92.03 CATOM 502 CD ARG A 45 84.854 -1.418 16.077 1.00100.00 CATOM 503 NE ARG A 45 85.636 -2.533 15.527 1.00100.00 NATOM 504 CZ ARG A 45 86.092 -3.570 16.236 1.00100.00 CATOM 505 NH1 ARG A 45 85.791 -3.695 17.547 1.00100.00 NATOM 506 NH2 ARG A 45 86.773 -4.544 15.642 1.00100.00 NATOM 507 N ALA A 46 81.772 1.090 18.629 1.00 31.04 NATOM 508 CA ALA A 46 82.045 1.743 19.881 1.00 24.72 CATOM 509 C ALA A 46 81.111 1.176 20.899 1.00 17.73 CATOM 510 O ALA A 46 81.512 0.825 22.027 1.00 22.73 OATOM 511 CB ALA A 46 81.839 3.221 19.751 1.00 27.16 CATOM 512 N VAL A 47 79.835 1.119 20.531 1.00 17.54 NATOM 513 CA VAL A 47 78.878 0.608 21.508 1.00 21.41 CATOM 514 C VAL A 47 79.262 -0.812 21.914 1.00 30.25 CATOM 515 O VAL A 47 79.192 -1.202 23.097 1.00 15.85 OATOM 516 CB VAL A 47 77.470 0.668 20.989 1.00 18.59 CATOM 517 CG1 VAL A 47 76.503 0.042 22.012 1.00 16.88 CATOM 518 CG2 VAL A 47 77.115 2.096 20.756 1.00 16.28 CATOM 519 N HIS A 48 79.692 -1.585 20.920 1.00 21.00 NATOM 520 CA HIS A 48 80.028 -2.969 21.192 1.00 20.17 CATOM 521 C HIS A 48 81.268 -3.079 22.117 1.00 32.98 CATOM 522 O HIS A 48 81.289 -3.850 23.102 1.00 28.20 OATOM 523 CB HIS A 48 80.063 -3.801 19.855 1.00 14.93 CATOM 524 CG HIS A 48 78.686 -4.172 19.338 1.00 26.67 CATOM 525 ND1 HIS A 48 78.085 -5.394 19.600 1.00 28.83 NATOM 526 CD2 HIS A 48 77.758 -3.448 18.659 1.00 25.56 CATOM 527 CE1 HIS A 48 76.887 -5.430 19.043 1.00 20.08 CATOM 528 NE2 HIS A 48 76.660 -4.260 18.475 1.00 25.22 NATOM 529 N ASP A 49 82.217 -2.170 21.902 1.00 22.62 NATOM 530 CA ASP A 49 83.455 -2.169 22.674 1.00 24.23 CATOM 531 C ASP A 49 83.171 -1.899 24.122 1.00 38.72 CATOM 532 O ASP A 49 83.708 -2.551 25.027 1.00 35.44 OATOM 533 CB ASP A 49 84.396 -1.112 22.127 1.00 30.29 CATOM 534 CG ASP A 49 84.991 -1.503 20.775 1.00 52.45 CATOM 535 OD1 ASP A 49 85.007 -2.726 20.449 1.00 42.67 OATOM 536 OD2 ASP A 49 85.416 -0.587 20.029 1.00 73.76 OATOM 537 N PHE A 50 82.294 -0.929 24.324 1.00 32.19 NATOM 538 CA PHE A 50 81.902 -0.550 25.649 1.00 29.76 CATOM 539 C PHE A 50 81.299 -1.765 26.359 1.00 30.31 CATOM 540 O PHE A 50 81.715 -2.124 27.449 1.00 29.22 OATOM 541 CB PHE A 50 80.892 0.610 25.576 1.00 23.82 CATOM 542 CG PHE A 50 80.137 0.843 26.859 1.00 19.13 CATOM 543 CD1 PHE A 50 80.740 1.515 27.931 1.00 20.14 CATOM 544 CD2 PHE A 50 78.835 0.360 27.018 1.00 13.99 CATOM 545 CE1 PHE A 50 80.034 1.742 29.129 1.00 25.81 CATOM 546 CE2 PHE A 50 78.114 0.553 28.212 1.00 22.84 CATOM 547 CZ PHE A 50 78.698 1.276 29.259 1.00 23.40 CATOM 548 N PHE A 51 80.280 -2.367 25.768 1.00 21.75 NATOM 549 CA PHE A 51 79.655 -3.451 26.457 1.00 22.61 CATOM 550 C PHE A S1 80.646 -4.603 26.612 1.00 34.01 CATOM 551 O PHE A 51 80.550 -5.401 27.590 1.00 25.28 OATOM 552 CB PHE A 51 78.389 -3.898 25.751 1.00 22.63 CATOM 553 CG PHE A 51 77.158 -3.140 26.170 1.00 27.58 CATOM 554 CD1 PHE A 51 76.426 -3.525 27.280 1.00 21.78 CATOM 555 CD2 PHE A 51 76.663 -2.100 25.380 1.00 39.55 CATOM 556 CE1 PHE A 51 75.267 -2.796 27.662 1.00 28.34 CATOM 557 CE2 PHE A 51 75.492 -1.403 25.734 1.00 14.47 CATOM 558 CZ PHE A 51 74.797 -1.744 26.878 1.00 14.55 CATOM 559 N ALA A 52 81.576 -4.706 25.659 1.00 26.43 NATOM 560 CA ALA A 52 82.587 -5.793 25.714 1.00 29.44 CATOM 561 C ALA A 52 83.687 -5.560 26.768 1.00 43.76 CATOM 562 O ALA A 52 84.502 -6.446 27.022 1.00 40.33 OATOM 563 CB ALA A 52 83.228 -6.049 24.344 1.00 24.25 CATOM 564 N SER A 53 83.702 -4.382 27.385 1.00 31.96 NATOM 565 CA SER A 53 84.705 -4.090 28.377 1.00 21.06 CATOM 566 C SER A 53 84.196 -3.625 29.709 1.00 26.41 CATOM 567 O SER A 53 84.985 -3.492 30.611 1.00 36.12 0ATOM 568 CB SER A 53 85.709 -3.088 27.843 1.00 14.22 CATOM 569 OG SER A 53 85.140 -1.807 27.790 1.00 56.90 OATOM 570 N GLU A 54 82.892 -3.431 29.874 1.00 22.38 NATOM 571 CA GLU A 54 82.380 -2.893 31.139 1.00 17.27 CATOM 572 C GLU A 54 81.584 -3.735 32.118 1.00 26.32 CATOM 573 O GLU A 54 81.229 -3.281 33.191 1.00 37.43 OATOM 574 CB GLU A 54 81.677 -1.563 30.906 1.00 27.30 CATOM 575 CG GLU A 54 82.573 -0.543 30.262 1.00 44.77 CATOM 576 CD GLU A 54 83.669 -0.142 31.194 1.00 86.31 CATOM 577 OE1 GLU A 54 83.392 -0.232 32.428 1.00 50.11 OATOM 578 OE2 GLU A 54 84.785 0.198 30.692 1.00 50.99 OATOM 579 N ARG A 55 81.268 -4.971 31.804 1.00 29.63 NATOM 580 CA ARG A 55 80.636 -5.748 32.854 1.00 33.32 CATOM 581 C ARG A 55 79.347 -5.149 33.378 1.00 38.45 CATOM 582 O ARG A 55 79.214 -4.897 34.576 1.00 40.18 OATOM 583 CB ARG A 55 81.621 -5.875 34.045 1.00 57.61 CATOM 584 CG ARG A 55 82.666 -7.028 33.960 1.00100.00 CATOM 585 CD ARG A 55 82.805 -7.805 35.305 1.00100.00 CATOM 586 NE ARG A 55 82.838 -9.270 35.146 1.00100.00 NATOM 587 CZ ARG A 55 83.206 -10.129 36.102 1.00100.00 CATOM 588 NH1 ARG A 55 83.583 -9.681 37.301 1.00100.00 NATOM 589 NH2 ARG A 55 83.208 -11.440 35.855 1.00100.00 NATOM 590 N ILE A 56 78.367 -5.029 32.491 1.00 42.25 NATOM 591 CA ILE A 56 77.064 -4.434 32.794 1.00 25.49 CATOM 592 C ILE A 56 75.982 -5.474 33.244 1.00 20.18 CATOM 593 O ILE A 56 75.897 -6.579 32.704 1.00 24.74 OATOM 594 CB ILE A 56 76.672 -3.512 31.531 1.00 26.89 CATOM 595 CG1 ILE A 56 77.643 -2.301 31.442 1.00 18.30 CATOM 596 CG2 ILE A 56 75.214 -3.016 31.549 1.00 19.84 CATOM 597 CD1 ILE A 56 77.998 -1.936 30.026 1.00 60.42 CATOM 598 N ASP A 57 75.166 -5.133 34.237 1.00 16.84 NATOM 599 CA ASP A 57 74.040 -5.999 34.630 1.00 16.33 CATOM 600 C ASP A 57 72.676 -5.451 34.123 1.00 28.40 CATOM 601 O ASP A 57 71.836 -6.198 33.657 1.00 25.50 OATOM 602 CB ASP A 57 74.009 -6.194 36.164 1.00 16.94 CATOM 603 CG ASP A 57 75.369 -6.720 36.703 1.00 34.27 CATOM 604 OD1 ASP A 57 75.875 -7.729 36.141 1.00 31.76 OATOM 605 OD2 ASP A 57 76.040 -6.007 37.499 1.00 28.36 OATOM 606 N GLN A 58 72.443 -4.152 34.220 1.00 28.91 NATOM 607 CA GLN A 58 71.183 -3.590 33.755 1.00 25.68 CATOM 608 C GLN A 58 71.425 -2.364 32.881 1.00 23.21 CATOM 609 O GLN A 58 72.403 -1.620 33.067 1.00 18.16 OATOM 610 CB GLN A 58 70.342 -3.151 34.946 1.00 33.14 CATOM 611 CG GLN A 58 69.798 -4.241 35.807 1.00 30.00 CATOM 612 CD GLN A 58 69.226 -3.712 37.105 1.00 27.18 CATOM 613 OE1 GLN A 58 68.722 -2.601 37.161 1.00 31.20 OATOM 614 NE2 GLN A 58 69.455 -4.436 38.186 1.00 16.89 NATOM 615 N VAL A 59 70.496 -2.138 31.961 1.00 18.35 NATOM 616 CA VAL A 59 70.562 -0.998 31.045 1.00 15.59 CATOM 617 C VAL A 59 69.238 -0.240 31.039 1.00 26.28 CATOM 618 O VAL A 59 68.178 -0.820 30.762 1.00 19.51 OATOM 619 CB VAL A 59 70.707 -1.456 29.601 1.00 15.32 CATOM 620 CG1 VAL A 59 70.477 -0.274 28.649 1.00 11.93 CATOM 621 CG2 VAL A 59 72.080 -2.111 29.364 1.00 15.83 CATOM 622 N TYR A 60 69.306 1.064 31.293 1.00 21.71 NATOM 623 CA TYR A 60 68.113 1.927 31.197 1.00 21.40 CATOM 624 C TYR A 60 68.289 2.756 29.928 1.00 18.69 CATOM 625 O TYR A 60 69.250 3.532 29.796 1.00 15.51 OATOM 626 CB TYR A 60 68.021 2.817 32.413 1.00 17.24 CATOM 627 CG TYR A 60 67.493 2.131 33.658 1.00 19.71 CATOM 628 CD1 TYR A 60 68.345 1.583 34.586 1.00 21.14 CATOM 629 CD2 TYR A 60 66.154 2.223 33.991 1.00 20.16 CATOM 630 CE1 TYR A 60 67.835 1.080 35.794 1.00 19.11 CATOM 631 CE2 TYR A 60 65.648 1.698 35.163 1.00 10.77 CATOM 632 CZ TYR A 60 66.476 1.094 36.054 1.00 20.07 CATOM 633 OH TYR A 60 65.921 0.585 37.248 1.00 16.04 OATOM 634 N LEU A 61 67.491 2.452 28.916 1.00 17.46 NATOM 635 CA LEU A 61 67.685 3.053 27.585 1.00 20.17 CATOM 636 C LEU A 61 67.003 4.412 27.409 1.00 23.36 CATOM 637 O LEU A 61 65.925 4.526 26.799 1.00 14.86 OATOM 638 CB LEU A 61 67.267 2.060 26.485 1.00 14.78 CATOM 639 CG LEU A 61 68.117 2.142 25.208 1.00 15.52 CATOM 640 CD1 LEU A 61 67.815 1.010 24.109 1.00 7.75 CATOM 641 CD2 LEU A 61 68.087 3.541 24.580 1.00 15.20 CATOM 642 N ALA A 62 67.656 5.434 27.956 1.00 20.35 NATOM 643 CA ALA A 62 67.120 6.784 27.963 1.00 18.55 CATOM 644 C ALA A 62 67.779 7.739 26.949 1.00 18.57 CATOM 645 O ALA A 62 67.455 8.924 26.920 1.00 24.31 OATOM 646 CB ALA A 62 67.071 7.377 29.439 1.00 11.69 CATOM 647 N ALA A 63 68.681 7.231 26.101 1.00 14.09 NATOM 648 CA ALA A 63 69.249 8.095 25.052 1.00 12.84 CATOM 649 C ALA A 63 68.310 8.005 23.877 1.00 27.00 CATOM 650 O ALA A 63 67.845 6.916 23.511 1.00 24.51 OATOM 651 CB ALA A 63 70.665 7.660 24.634 1.00 4.89 CATOM 652 N ALA A 64 68.076 9.148 23.262 1.00 21.05 NATOM 653 CA ALA A 64 67.202 9.286 22.086 1.00 13.50 CATOM 654 C ALA A 64 67.435 10.664 21.416 1.00 28.08 CATOM 655 O ALA A 64 67.987 11.600 22.021 1.00 26.63 OATOM 656 CB ALA A 64 65.642 9.171 22.518 1.00 7.63 CATOM 657 N LYS A 65 66.953 10.781 20.182 1.00 23.98 NATOM 658 CA LYS A 65 66.966 12.012 19.409 1.00 20.47 CATOM 659 C LYS A 65 65.488 12.443 19.551 1.00 24.37 CATOM 660 O LYS A 65 64.594 11.807 18.976 1.00 20.29 OATOM 661 CB LYS A 65 67.317 11.658 17.951 1.00 25.59 CATOM 662 CG LYS A 65 66.808 12.630 16.923 1.00 27.54 CATOM 663 CD LYS A 65 67.518 13.926 17.169 1.00 21.08 CATOM 664 CE LYS A 65 67.316 14.905 16.029 1.00 55.15 CATOM 665 NZ LYS A 65 67.876 16.263 16.392 1.00 81.63 NATOM 666 N VAL A 66 65.228 13.362 20.485 1.00 22.47 NATOM 667 CA VAL A 66 63.873 13.850 20.755 1.00 18.99 CATOM 668 C VAL A 66 63.711 15.343 20.394 1.00 31.44 CATOM 669 O VAL A 66 64.665 16.107 20.460 1.00 34.61 OATOM 670 CB VAL A 66 63.440 13.623 22.204 1.00 16.66 CATOM 671 CG1 VAL A 66 64.269 12.623 22.869 1.00 15.01 CATOM 672 CG2 VAL A 66 63.379 14.904 22.950 1.00 19.21 CATOM 673 N GLY A 67 62.514 15.755 19.994 1.00 18.03 NATOM 674 CA GLY A 67 62.298 17.149 19.614 1.00 14.90 CATOM 675 C GLY A 67 60.792 17.518 19.585 1.00 32.35 CATOM 676 O GLY A 67 59.922 16.666 19.888 1.00 18.88 OATOM 677 N GLY A 68 60.503 18.787 19.256 1.00 23.21 NATOM 678 CA GLY A 68 59.132 19.288 19.183 1.00 23.83 CATOM 679 C GLY A 68 58.540 19.137 17.771 1.00 19.31 CATOM 680 O GLY A 68 59.165 18.550 16.870 1.00 30.64 OATOM 681 N ILE A 69 57.343 19.684 17.588 1.00 15.20 NATOM 682 CA ILE A 69 56.595 19.632 16.317 1.00 16.80 CATOM 683 C ILE A 69 57.387 20.153 15.112 1.00 19.33 CATOM 684 O ILE A 69 57.425 19.519 14.061 1.00 14.66 OATOM 685 CB ILE A 69 55.257 20.432 16.480 1.00 30.11 CATOM 686 CG1 ILE A 69 54.271 19.683 17.385 1.00 24.27 CATOM 687 CG2 ILE A 69 54.610 20.749 15.181 1.00 47.53 CATOM 688 CP1 ILE A 69 53.259 20.608 18.056 1.00 85.71 CATOM 689 N VAL A 70 58.010 21.327 15.269 1.00 23.03 NATOM 690 CA VAL A 70 58.797 21.913 14.183 1.00 19.34 CATOM 691 C VAL A 70 59.983 21.011 13.840 1.00 24.42 CATOM 692 O VAL A 70 60.335 20.829 12.662 1.00 24.14 OATOM 693 CB VAL A 70 59.304 23.404 14.467 1.00 21.37 CATOM 694 CG1 VAL A 70 60.137 23.907 13.281 1.00 17.79 CATOM 695 CG2 VAL A 70 58.136 24.410 14.678 1.00 15.74 CATOM 696 N ALA A 71 60.621 20.450 14.861 1.00 19.68 NATOM 697 CA ALA A 71 61.782 19.617 14.572 1.00 16.57 CATOM 698 C ALA A 71 61.427 18.289 13.910 1.00 23.36 CATOM 699 O ALA A 71 61.980 17.923 12.849 1.00 21.84 OATOM 700 CB ALA A 71 62.685 19.439 15.805 1.00 9.36 CATOM 701 N ASN A 72 60.463 17.598 14.511 1.00 16.80 NATOM 702 CA ASN A 72 59.998 16.357 13.923 1.00 18.84 CATOM 703 C ASN A 72 59.608 16.539 12.440 1.00 23.87 CATOM 704 O ASN A 72 59.919 15.696 11.593 1.00 21.52 OATOM 705 CB ASN A 72 58.835 15.806 14.738 1.00 8.60 CATOM 706 CG ASN A 72 59.309 15.013 15.911 1.00 23.75 CATOM 707 OD1 ASN A 72 59.558 13.809 15.810 1.00 23.98 OATOM 708 ND2 ASN A 72 59.572 15.701 16.996 1.00 9.96 NATOM 709 N ASN A 73 58.931 17.647 12.138 1.00 23.07 NATOM 710 CA ASN A 73 58.521 17.971 10.761 1.00 26.05 CATOM 711 C ASN A 73 59.665 18.454 9.817 1.00 26.95 CATOM 712 O ASN A 73 59.613 18.276 8.569 1.00 22.13 OATOM 713 CB ASN A 73 57.383 19.001 10.800 1.00 14.86 CATOM 714 CG ASN A 73 56.015 18.349 10.987 1.00 19.88 CATOM 715 OD1 ASN A 73 55.620 17.468 10.217 1.00 27.02 OATOM 716 ND2 ASN A 73 55.322 18.732 12.051 1.00 20.78 NATOM 717 N THR A 74 60.710 19.029 10.419 1.00 18.69 NATOM 718 CA THR A 74 61.845 19.540 9.657 1.00 10.07 CATOM 719 C THR A 74 62.968 18.548 9.375 1.00 21.00 CATOM 720 O THR A 74 63.537 18.561 8.289 1.00 11.75 OATOM 721 CB THR A 74 62.411 20.746 10.306 1.00 29.10 CATOM 722 OG1 THR A 74 61.370 21.714 10.457 1.00 23.24 OATOM 723 CG2 THR A 74 63.541 21.299 9.452 1.00 21.63 CATOM 724 N TYR A 75 63.230 17.636 10.310 1.00 17.10 NATOM 725 CA TYR A 75 64.267 16.620 10.112 1.00 9.07 CATOM 726 C TYR A 75 63.733 15.203 10.318 1.00 6.17 CATOM 727 O TYR A 75 64.143 14.542 11.267 1.00 15.58 OATOM 728 CB TYR A 75 65.302 16.825 11.188 1.00 11.89 CATOM4 729 CG TYR A 75 65.779 18.234 11.252 1.00 27.12 CATOM 730 CD1 TYR A 75 66.712 18.696 10.321 1.00 28.46 CATOM 731 CD2 TYR A 75 65.234 19.151 12.173 1.00 24.83 CATOM 732 CE1 TYR A 75 67.117 20.045 10.305 1.00 28.34 CATOM 733 CE2 TYR A 75 65.652 20.523 12.180 1.00 21.00 CATOM 734 CZ TYR A 75 66.593 20.940 11.234 1.00 45.42 CATOM 735 OH TYR A 75 67.066 22.230 11.215 1.00 35.37 OATOM 736 N PRO A 76 62.759 14.775 9.532 1.00 13.30 NATOM 737 CA PRO A 76 62.185 13.438 9.742 1.00 14.64 CATOM 738 C PRO A 76 63.209 12.264 9.618 1.00 14.40 CATOM 739 O PRO A 76 63.157 11.335 10.409 1.00 20.54 OATOM 740 CB PRO A 76 61.055 13.366 8.709 1.00 7.83 CATOM 741 CG PRO A 76 61.447 14.388 7.617 1.00 12.61 CATOM 742 CD PRO A 76 62.068 15.504 8.455 1.00 11.18 CATOM 743 N ALA A 77 64.163 12.339 8.681 1.00 15.25 NATOM 744 CA ALA A 77 65.206 11.312 8.538 1.00 6.79 CATOM 745 C ALA A 77 66.053 11.166 9.820 1.00 17.22 CATOM 746 O ALA A 77 66.306 10.069 10.292 1.00 18.74 OATOM 747 CB ALA A 77 66.097 11.601 7.330 1.00 9.04 CATOM 748 N ASP A 78 66.466 12.267 10.424 1.00 10.92 NATOM 749 CA ASP A 78 67.256 12.191 11.659 1.00 11.87 CATOM 750 C ASP A 78 66.572 11.486 12.827 1.00 16.09 CATOM 751 O ASP A 78 67.212 10.741 13.601 1.00 18.07 OATOM 752 CB ASP A 78 67.578 13.609 12.088 1.00 19.16 CATOM 753 CG ASP A 78 68.424 14.325 11.068 1.00 26.82 CATOM 754 OD1 ASP A 78 68.836 13.694 10.044 1.00 33.93 OATOM 755 OD2 ASP A 78 68.673 15.514 11.316 1.00 32.06 OATOM 756 N PHE A 79 65.279 11.771 12.975 1.00 14.70 NATOM 757 CA PHE A 79 64.471 11.192 14.044 1.00 20.69 CATOM 758 C PHE A 79 64.224 9.707 13.876 1.00 20.22 CATOM 759 O PHE A 79 64.269 8.987 14.862 1.00 22.37 OATOM 760 CB PHE A 79 63.144 11.933 14.219 1.00 27.38 CATOM 761 CG PHE A 79 63.264 13.218 14.990 1.00 28.59 CATOM 762 CD1 PHE A 79 63.137 13.230 16.386 1.00 27.49 CATOM 763 CD2 PHE A 79 63.509 14.415 14.325 1.00 28.20 CATOM 764 CE1 PHE A 79 63.281 14.413 17.109 1.00 21.76 CATOM 765 CE2 PHE A 79 63.625 15.593 15.037 1.00 31.48 CATOM 766 CZ PHE A 79 63.509 15.582 16.439 1.00 26.31 CATOM 767 N ILE A 80 63.942 9.249 12.650 1.00 10.79 NATOM 768 CA ILE A 80 63.828 7.795 12.410 1.00 18.12 CATOM 769 C ILE A 80 65.197 7.052 12.432 1.00 10.97 CATOM 770 O ILE A 80 65.406 6.090 13.195 1.00 8.92 OATOM 771 CB ILE A 80 62.944 7.408 11.148 1.00 17.41 CATOM 772 CG1 ILE A 80 62.651 5.886 11.105 1.00 10.16 CATOM 773 CG2 ILE A 80 63.583 7.888 9.901 1.00 17.46 CATOM 774 CD1 ILE A 80 61.722 5.410 9.980 1.00 7.30 CATOM 775 N TYR A 81 66.151 7.539 11.658 1.00 11.18 NATOM 776 CA TYR A 81 67.488 6.902 11.630 1.00 15.06 CATOM 777 C TYR A 81 68.237 6.782 12.959 1.00 16.83 CATOM 778 O TYR A 81 68.714 5.702 13.383 1.00 16.74 OATOM 779 CB TYR A 81 68.384 7.599 10.616 1.00 9.43 CATOM 780 CG TYR A 81 69.749 6.966 10.541 1.00 22.54 CATOM 781 CD1 TYR A 81 69.963 5.824 9.747 1.00 22.37 CATOM 782 CD2 TYR A 81 70.818 7.466 11.299 1.00 18.07 CATOM 783 CE1 TYR A 81 71.202 5.163 9.746 1.00 15.02 CATOM 784 CE2 TYR A 81 72.080 6.893 11.201 1.00 17.37 CATOM 785 CZ TYR A 81 72.255 5.698 10.472 1.00 24.27 CATOM 786 OH TYR A 81 73.491 5.063 10.409 1.00 19.57 OATOM 787 N GLN A 82 68.385 7.918 13.612 1.00 11.39 NATOM 788 CA GLN A 82 69.193 7.930 14.810 1.00 12.23 CATOM 789 C GLN A 82 68.544 7.089 15.834 1.00 14.18 CATOM 790 O GLN A 82 69.180 6.415 16.631 1.00 11.35 OATOM 791 CB GLN A 82 69.280 9.354 15.291 1.00 18.73 CATOM 792 CG GLN A 82 69.986 10.209 14.250 1.00 13.54 CATOM 793 CD GLN A 82 70.285 11.617 14.736 1.00 26.00 CATOM 794 OE1 GLN A 82 70.410 11.850 15.927 1.00 22.99 OATOM 795 NE2 GLN A 82 70.404 12.561 13.808 1.00 16.59 NATOM 796 N ASN A 83 67.235 7.181 15.869 1.00 11.35 NATOM 797 CA ASN A 83 66.549 6.408 16.860 1.00 13.71 CATOM 798 C ASN A 83 66.623 4.902 16.557 1.00 21.43 CATOM 799 O ASN A 83 66.831 4.101 17.463 1.00 12.10 OATOM 800 CB ASN A 83 65.132 6.945 17.074 1.00 13.51 CATOM 801 CG ASN A 83 65.131 8.245 17.871 1.00 28.91 CATOM 802 OD1 ASN A 83 65.628 8.263 18.990 1.00 22.28 OATOM 803 ND2 ASN A 83 64.756 9.354 17.237 1.00 20.17 NATOM 804 N MET A 84 66.592 4.517 15.290 1.00 15.63 NATOM 805 CA MET A 84 66.704 3.101 15.007 1.00 15.66 CATOM 806 C MET A 84 68.054 2.588 15.348 1.00 14.66 CATOM 807 O MET A 84 68.148 1.514 15.902 1.00 11.45 OATOM 808 CB MET A 84 66.418 2.815 13.563 1.00 17.59 CATOM 809 CG MET A 84 64.911 2.894 13.220 1.00 14.40 CATOM 810 SD MET A 84 64.638 2.811 11.387 1.00 15.99 SATOM 811 CE MET A 84 65.164 1.105 10.952 1.00 8.90 CATOM 812 N MET A 85 69.098 3.338 15.024 1.00 11.20 NATOM 813 CA MET A 85 70.468 2.879 15.321 1.00 11.67 CATOM 814 C MET A 85 70.779 2.831 16.774 1.00 13.04 CATOM 815 O MET A 85 71.359 1.893 17.265 1.00 15.26 OATOM 816 CB MET A 85 71.525 3.798 14.693 1.00 15.07 CATOM 817 CG MET A 85 71.530 3.726 13.173 1.00 32.01 CATOM 818 SD MET A 85 71.918 2.027 12.487 1.00 37.79 SATOM 819 CE MET A 85 73.379 1.801 13.320 1.00 15.94 CATOM 820 N ILE A 86 70.471 3.892 17.481 1.00 13.92 NATOM 821 CA ILE A 86 70.760 3.893 18.912 1.00 12.58 CATOM 822 C ILE A 86 70.159 2.662 19.591 1.00 21.61 CATOM 823 O ILE A 86 70.813 1.981 20.362 1.00 18.68 OATOM 824 CB ILE A 86 70.225 5.189 19.606 1.00 11.84 CATOM 825 CG1 ILE A 86 70.978 6.429 19.119 1.00 19.78 CATOM 826 CG2 ILE A 86 70.435 5.132 21.112 1.00 6.59 CATOM 827 CD1 ILE A 86 70.505 7.694 19.772 1.00 20.37 CATOM 828 N GLU A 87 68.893 2.383 19.316 1.00 18.78 NATOM 829 CA GLU A 87 68.263 1.237 19.930 1.00 14.00 CATOM 830 C GLU A 87 68.797 -0.116 19.454 1.00 15.93 CATOM 831 O GLU A 87 69.017 -0.991 20.268 1.00 11.04 OATOM 832 CB GLU A 87 66.734 1.324 19.900 1.00 14.89 CATOM 833 CG GLU A 87 66.085 1.327 18.538 1.00 28.96 CATOM 834 CD GLU A 87 64.635 1.922 18.544 1.00 11.12 CATOM 835 OE1 GLU A 87 64.307 2.801 19.376 1.00 25.46 OATOM 836 OE2 GLU A 87 63.845 1.547 17.663 1.00 29.87 OATOM 837 N SER A 88 69.054 -0.259 18.155 1.00 16.18 NATOM 838 CA SER A 88 69.650 -1.482 17.569 1.00 19.52 CATOM 839 C SER A 88 71.029 -1.792 18.160 1.00 22.54 CATOM 840 O SER A 88 71.313 -2.929 18.592 1.00 13.80 OATOM 841 CB SER A 88 69.815 -1.326 16.023 1.00 14.61 CATOM 842 OG SER A 88 68.551 -1.201 15.355 1.00 15.41 OATOM 843 N ASN A 89 71.884 -0.773 18.143 1.00 22.63 NATOM 844 CA ASN A 89 73.227 -0.869 18.693 1.00 27.23 CATOM 845 C ASN A 89 73.195 -1.363 20.134 1.00 21.34 CATOM 846 O ASN A 89 73.795 -2.384 20.476 1.00 23.68 OATOM 847 CB ASN A 89 73.980 0.487 18.597 1.00 13.71 CATOM 848 CG ASN A 89 74.440 0.825 17.168 1.00 20.40 CATOM 849 OD1 ASN A 89 74.305 -0.006 16.255 1.00 14.93 OATOM 850 ND2 ASN A 89 74.937 2.067 16.960 1.00 13.32 NATOM 851 N ILE A 90 72.488 -0.646 20.979 1.00 16.55 NATOM 852 CA ILE A 90 72.437 -1.014 22.398 1.00 21.51 CATOM 853 C ILE A 90 71.876 -2.421 22.729 1.00 26.50 CATOM 854 O ILE A 90 72.384 -3.159 23.590 1.00 19.71 OATOM 855 CB ILE A 90 71.670 0.070 23.233 1.00 13.32 CATOM 856 CG1 ILE A 90 72.539 1.299 23.401 1.00 11.05 CATOM 857 CG2 ILE A 90 71.371 -0.445 24.637 1.00 7.54 CATOM 858 CD1 ILE A 90 71.749 2.597 23.668 1.00 20.71 CATOM 859 N ILE A 91 70.755 -2.733 22.114 1.00 14.98 NATOM 860 CA ILE A 91 70.047 -3.953 22.442 1.00 21.33 CATOM 861 C ILE A 91 70.927 -5.098 21.994 1.00 26.27 CATOM 862 O ILE A 91 71.211 -6.011 22.751 1.00 26.56 OATOM 863 CB ILE A 91 68.556 -3.930 21.814 1.00 20.39 CATOM 864 CG1 ILE A 91 67.692 -2.886 22.552 1.00 13.51 CATOM 865 CG2 ILE A 91 67.841 -5.316 21.845 1.00 11.31 CATOM 866 CD1 ILE A 91 66.320 -2.648 21.907 1.00 16.23 CATOM 867 N HIS A 92 71.446 -4.983 20.785 1.00 24.12 NATOM 868 CA HIS A 92 72.293 -6.015 20.243 1.00 26.71 CATOM 869 C HIS A 92 73.609 -6.251 21.071 1.00 29.30 CATOM 870 O HIS A 92 73.983 -7.366 21.443 1.00 18.58 OATOM 871 CB HIS A 92 72.561 -5.682 18.775 1.00 22.23 CATOM 872 CG HIS A 92 73.366 -6.720 18.077 1.00 26.32 CATOM 873 ND1 HIS A 92 72.798 -7.711 17.307 1.00 27.19 NATOM 874 CD2 HIS A 92 74.699 -6.978 18.106 1.00 21.95 CATOM 875 CE1 MIS A 92 73.755 -8.487 16.826 1.00 23.66 CATOM 876 NE2 HIS A 92 74.918 -8.062 17.296 1.00 17.36 NATOM 877 N ALA A 93 74.328 -5.187 21.333 1.00 15.66 NATOM 878 CA ALA A 93 75.530 -5.301 22.110 1.00 11.88 CATOM 879 C ALA A 93 75.222 -5.900 23.512 1.00 28.78 CATOM 880 O ALA A 93 75.912 -6.790 24.037 1.00 25.23 OATOM 881 CB ALA A 93 76.139 -3.959 22.221 1.00 6.30 CATOM 882 N ALA A 94 74.142 -5.442 24.113 1.00 18.82 NATOM 883 CA ALA A 94 73.777 -5.971 25.399 1.00 15.61 CATOM 884 C ALA A 94 73.593 -7.503 25.301 1.00 28.39 CATOM 885 O ALA A 94 74.133 -8.263 26.099 1.00 21.67 OATOM 886 CB ALA A 94 72.449 -5.279 25.911 1.00 18.46 CATOM 887 N HIS A 95 72.814 -7.966 24.329 1.00 26.35 NATOM 888 CA HIS A 95 72.551 -9.396 24.271 1.00 24.89 CATOM 889 C HIS A 95 73.845 -10.176 24.140 1.00 22.81 CATOM 890 O HIS A 95 74.077 -11.136 24.865 1.00 21.44 OATOM 891 CB HIS A 95 71.571 -9.778 23.129 1.00 22.39 CATOM 892 CG HIS A 95 71.554 -11.250 22.831 1.00 28.73 CATOM 893 ND1 HIS A 95 70.979 -12.182 23.682 1.00 22.83 NATOM 894 CD2 HIS A 95 72.159 -11.964 21.845 1.00 25.22 CATOM 895 CE1 HIS A 95 71.171 -13.397 23.196 1.00 22.72 CATOM 896 NE2 HIS A 95 71.911 -13.296 22.101 1.00 24.80 NATOM 897 N GLN A 96 74.709 -9.658 23.281 1.00 19.97 NATOM 898 CA GLN A 96 75.960 -10.299 22.917 1.00 22.27 CATOM 899 C GLN A 96 76.877 -10.353 24.086 1.00 26.58 CATOM 900 O GLN A 96 77.836 -11.093 24.088 1.00 24.17 OATOM 901 CB GLN A 96 76.642 -9.492 21.818 1.00 23.38 CATOM 902 CG GLN A 96 77.043 -10.299 20.596 1.00 61.06 CATOM 903 CD GLN A 96 78.033 -9.557 19.675 1.00 75.83 CATOM 904 OE1 GLN A 96 78.999 -8.941 20.131 1.00 56.89 OATOM 905 NE2 GLN A 96 77.815 -9.668 18.366 1.00100.00 NATOM 906 N ASN A 97 76.652 -9.500 25.060 1.00 22.15 NATOM 907 CA ASN A 97 77.537 -9.536 26.208 1.00 14.74 CATOM 908 C ASN A 97 76.732 -10.022 27.387 1.00 29.78 CATOM 909 O ASN A 97 77.049 -9.762 28.564 1.00 27.09 OATOM 910 CB ASN A 97 78.241 -8.201 26.462 1.00 12.93 CATOM 911 CG ASN A 97 79.260 -7.897 25.407 1.00 24.91 CATOM 912 OD1 ASN A 97 80.331 -8.518 25.375 1.00 57.17 OATOM 913 ND2 ASN A 97 78.839 -7.135 24.392 1.00 34.88 NATOM 914 N ASP A 98 75.666 -10.732 27.055 1.00 27.98 NATOM 915 CA ASP A 98 74.907 -11.361 28.089 1.00 29.25 CATOM 916 C ASP A 98 74.400 -10.379 29.164 1.00 37.53 CATOM 917 O ASP A 98 74.505 -10.634 30.367 1.00 36.42 OATOM 918 CB ASP A 98 75.791 -12.450 28.700 1.00 36.37 CATOM 919 CG ASP A 98 75.016 -13.712 29.053 1.00 88.62 CATOM 920 OD1 ASP A 98 73.775 -13.749 28.877 1.00 82.53 OATOM 921 OD2 ASP A 98 75.656 -14.670 29.542 1.00100.00 OATOM 922 N VAL A 99 73.879 -9.235 28.730 1.00 27.13 NATOM 923 CA VAL A 99 73.157 -8.351 29.635 1.00 21.57 CATOM 924 C VAL A 99 71.706 -8.868 29.530 1.00 16.15 CATOM 925 O VAL A 99 71.159 -9.088 28.422 1.00 19.47 OATOM 926 CB VAL A 99 73.264 -6.900 29.206 1.00 24.18 CATOM 927 CG1 VAL A 99 72.517 -6.015 30.198 1.00 14.58 CATOM 928 CG2 VAL A 99 74.720 -6.515 29.225 1.00 30.10 CATOM 929 N ASN A 100 71.149 -9.262 30.662 1.00 17.39 NATOM 930 CA ASN A 100 69.852 -9.925 30.613 1.00 25.77 CATOM 931 C ASN A 100 68.648 -9.034 30.910 1.00 24.95 CATOM 932 O ASN A 100 67.498 -9.377 30.582 1.00 20.88 OATOM 933 CB ASN A 100 69.846 -11.157 31.527 1.00 14.98 CATOM 934 CG ASN A 100 68.724 -12.112 31.180 1.00 20.38 CATOM 935 OD1 ASN A 100 68.737 -12.709 30.100 1.00 29.59 OATOM 936 ND2 ASN A 100 67.716 -12.240 32.076 1.00 16.35 NATOM 937 N LYS A 101 68.941 -7.923 31.584 1.00 17.91 NATOM 938 CA LYS A 101 67.970 -6.916 31.994 1.00 25.43 CATOM 939 C LYS A 101 68.107 -5.510 31.323 1.00 25.29 CATOM 940 O LYS A 101 69.151 -4.850 31.377 1.00 19.88 OATOM 941 CB LYS A 101 67.996 -6.807 33.521 1.00 29.28 CATOM 942 CG LYS A 101 67.464 -8.054 34.205 1.00 9.31 CATOM 943 CD LYS A 101 67.218 -7.719 35.668 1.00 38.93 CATOM 944 CE LYS A 101 66.206 -6.569 35.885 1.00 13.38 CATOM 945 NZ LYS A 101 64.750 -7.006 35.825 1.00 15.26 NATOM 946 N LEU A 102 67.013 -5.043 30.732 1.00 22.22 NATOM 947 CA LEU A 102 67.003 -3.744 30.092 1.00 15.40 CATOM 948 C LEU A 102 65.612 -3.115 30.156 1.00 18.55 CATOM 949 O LEU A 102 64.590 -3.811 30.102 1.00 18.92 OATOM 950 CB LEU A 102 67.465 -3.898 28.636 1.00 11.23 CATOM 951 CG LEU A 102 67.553 -2.711 27.651 1.00 15.51 CATOM 952 CD1 LEU A 102 68.628 -2.985 26.559 1.00 9.65 CATOM 953 CD2 LEU A 102 66.162 -2.407 26.995 1.00 13.10 CATOM 954 N LEU A 103 65.595 -1.798 30.318 1.00 17.05 NATOM 955 CA LEU A 103 64.356 -1.036 30.265 1.00 16.23 CATOM 956 C LEU A 103 64.346 -0.072 29.046 1.00 19.65 CATOM 957 O LEU A 103 65.215 0.789 28.875 1.00 19.68 OATOM 958 CB LEU A 103 64.099 -0.289 31.562 1.00 12.28 CATOM 959 CG LEU A 103 62.686 0.259 31.594 1.00 14.13 CATOM 960 CD1 LEU A 103 61.645 -0.822 31.902 1.00 10.31 CATOM 961 CD2 LEU A 103 62.646 1.360 32.601 1.00 12.30 CATOM 962 N PHE A 104 63.417 -0.333 28.140 1.00 16.41 NATOM 963 CA PHE A 104 63.215 0.486 26.956 1.00 18.32 CATOM 964 C PHE A 104 62.126 1.546 27.249 1.00 21.85 CATOM 965 O PHE A 104 61.168 1.271 27.992 1.00 18.36 OATOM 966 CB PHE A 104 62.796 -0.386 25.793 1.00 9.86 CATOM 967 CG PHE A 104 62.732 0.348 24.508 1.00 16.81 CATOM 968 CD1 PAE A 104 63.894 0.714 23.840 1.00 25.04 CATOM 969 CD2 PHE A 104 61.511 0.795 24.005 1.00 22.59 CATOM 970 CE1 PHE A 104 63.836 1.448 22.619 1.00 31.26 CATOM 971 CE2 PHE A 104 61.449 1.535 22.814 1.00 15.59 CATOM 972 CZ PHE A 104 62.625 1.895 22.139 1.00 11.67 CATOM 973 N LEU A 105 62.341 2.762 26.734 1.00 20.33 NATOM 974 CA LEU A 105 61.416 3.897 26.904 1.00 18.10 CATOM 975 C LEU A 105 60.711 4.237 25.634 1.00 17.04 CATOM 976 O LEU A 105 61.315 4.680 24.665 1.00 18.83 OATOM 977 CB LEU A 105 62.178 5.146 27.214 1.00 17.49 CATOM 979 CG LEU A 105 62.434 5.544 28.644 1.00 27.17 CATOM 979 CD1 LEU A 105 62.630 4.349 29.574 1.00 19.16 CATOM 980 CD2 LEU A 105 63.688 6.347 28.529 1.00 23.59 CATOM 981 N GLY A 106 59.407 4.153 25.652 1.00 20.66 NATOM 982 CA GLY A 106 58.679 4.536 24.455 1.00 21.03 CATOM 983 C GLY A 106 58.080 5.935 24.597 1.00 17.32 CATOM 984 O GLY A 106 58.690 6.858 25.113 1.00 26.89 OATOM 985 N SER A 107 56.831 6.047 24.219 1.00 22.05 NATOM 986 CA SER A 107 56.177 7.317 24.288 1.00 22.12 CATOM 987 C SER A 107 54.686 7.212 23.923 1.00 19.06 CATOM 988 O SER A 107 54.314 6.545 22.963 1.00 27.42 OATOM 989 CB SER A 107 56.882 8.232 23.300 1.00 20.99 CATOM 990 OG SER A 107 55.947 9.133 22.776 1.00 42.85 OATOM 991 N SER A 108 53.826 7.890 24.671 1.00 27.42 NATOM 992 CA SER A 108 52.382 7.947 24.339 1.00 26.43 CATOM 993 C SER A 108 52.144 8.259 22.842 1.00 30.97 CATOM 994 O SER A 108 51.242 7.709 22.217 1.00 33.46 OATOM 995 CB SER A 108 51.710 9.072 25.144 1.00 19.87 CATOM 996 OG SER A 108 52.495 10.266 25.071 1.00 70.88 OATOM 997 N CYS A 109 52.927 9.180 22.278 1.00 24.73 NATOM 998 CA CYS A 109 52.728 9.549 20.880 1.00 25.61 CATOM 999 C CYS A 109 52.970 8.482 19.815 1.00 21.29 CATOM 1000 O CYS A 109 52.967 8.737 18.623 1.00 31.31 OATOM 1001 CB CYS A 109 53.369 10.899 20.544 1.00 39.55 CATOM 1002 SG CYS A 109 55.153 11.077 20.847 1.00 49.24 SATOM 1003 N ILE A 110 53.101 7.264 20.258 1.00 18.31 NATOM 1004 CA ILE A 110 53.329 6.150 19.379 1.00 28.10 CATOM 1005 C ILE A 110 51 977 5.489 19.082 1.00 15.38 CATOM 1006 O ILE A 110 51.895 4.592 18.268 1.00 16.52 OATOM 1007 CB ILE A 110 54.154 5.153 20.206 1.00 40.45 CATOM 1008 CG1 ILE A 110 55.604 5.510 20.136 1.00 39.02 CATOM 1009 CG2 ILE A 110 53.879 3.715 19.875 1.00 61.33 CATOM 1010 CD1 ILE A 110 56.429 4.338 20.549 1.00 82.74 CATOM 1011 N TYR A 111 50.951 5.842 19.854 1.00 14.91 NATOM 1012 CA TYR A 111 49.630 5.227 19.678 1.00 13.96 CATOM 1013 C TYR A 111 48.956 5.831 18.459 1.00 20.40 CATOM 1014 O TYR A 111 49.302 6.933 18.056 1.00 11.71 OATOM 1015 CB TYR A 111 48.763 5.468 20.921 1.00 9.63 CATOM 1016 CG TYR A 111 49.117 4.550 22.065 1.00 14.94 CATOM 1017 CD1 TYR A 111 48.985 3.159 21.938 1.00 9.73 CATOM 1018 CD2 TYR A 111 49.755 5.038 23.216 1.00 14.96 CATOM 1019 CE1 TYR A 111 49.344 2.273 23.014 1.00 6.53 CATOM 1020 CE2 TYR A 111 50.146 4.155 24.272 1.00 13.66 CATOM 1021 CZ TYR A 111 49.873 2.787 24.171 1.00 17.86 CATOM 1022 OH TYR A 111 50.266 1.927 25.157 1.00 11.37 OATOM 1023 N PRO A 112 47.974 5.145 17.872 1.00 22.56 NATOM 1024 CA PRO A 112 47.279 5.743 16.721 1.00 23.44 CATOM 1025 C PRO A 112 46.589 7.111 16.988 1.00 17.82 CATOM 1026 O PRO A 112 46.197 7.453 18.115 1.00 19.72 OATOM 1027 CB PRO A 112 46.290 4.644 16.252 1.00 15.69 CATOM 1028 CG PRO A 112 46.895 3.343 16.769 1.00 22.83 CATOM 1029 CD PRO A 112 47.593 3.733 18.086 1.00 16.10 CATOM 1030 N LYS A 113 46.418 7.866 15.915 1.00 19.48 NATOM 1031 CA LYS A 113 45.793 9.167 15.994 1.00 23.50 CATOM 1032 C LYS A 113 44.396 9.077 16.655 1.00 34.28 CATOM 1033 O LYS A 113 44.046 9.887 17.524 1.00 46.14 OATOM 1034 CB LYS A 113 45.675 9.735 14.593 1.00 30.04 CATOM 1035 CG LYS A 113 46.219 11.124 14.477 1.00 43.78 CATOM 1036 CD LYS A 113 45.381 11.941 13.515 1.00100.00 CATOM 1037 CE LYS A 113 44.361 12.836 14.250 1.00100.00 CATOM 1038 NZ LYS A 113 43.480 13.625 13.304 1.00100.00 NATOM 1039 N LEU A 114 43.591 8.103 16.250 1.00 26.33 NATOM 1040 CA LEU A 114 42.267 7.957 16.833 1.00 20.65 CATOM 1041 C LEU A 114 42.083 6.792 17.760 1.00 18.44 CATOM 1042 O LEU A 114 41.002 6.278 17.918 1.00 34.04 OATOM 1043 CB LEU A 114 41.194 8.002 15.780 1.00 24.37 CATOM 1044 CG LEU A 114 41.587 9.122 14.830 1.00 40.86 CATOM 1045 CD1 LEU A 114 40.991 8.797 13.504 1.00 49.29 CATOM 1046 CD2 LEU A 114 41.139 10.512 15.300 1.00 26.85 CATOM 1047 N ALA A 115 43.103 6.473 18.527 1.00 29.00 NATOM 1048 CA ALA A 115 42.920 5.446 19.528 1.00 25.66 CATOM 1049 C ALA A 115 41.722 5.727 20.454 1.00 28.76 CATOM 1050 O ALA A 115 41.364 6.855 20.682 1.00 24.12 OATOM 1051 CB ALA A 115 44.177 5.272 20.326 1.00 16.86 CATOM 1052 N LYS A 116 41.137 4.675 20.998 1.00 30.21 NATOM 1053 CA LYS A 116 40.036 4.792 21.928 1.00 25.85 CATOM 1054 C LYS A 116 40.668 5.248 23.195 1.00 14.18 CATOM 1055 O LYS A 116 41.750 4.781 23.535 1.00 23.51 OATOM 1056 CB LYS A 116 39.369 3.415 22.116 1.00 22.05 CATOM 1057 CG LYS A 116 39.053 3.032 23.524 1.00 55.38 CATOM 1058 CD LYS A 116 37.963 1.955 23.549 1.00100.00 CATOM 1059 CE LYS A 116 37.120 1.953 24.835 1.00100.00 CATOM 1060 NZ LYS A 116 35.767 1.310 24.630 1.00100.00 NATOM 1061 N GLN A 117 40.021 6.208 23.856 1.00 18.23 NATOM 1062 CA GLN A 117 40.456 6.757 25.180 1.00 21.01 CATOM 1063 C GLN A 117 39.695 6.178 26.383 1.00 30.96 CATOM 1064 O GLN A 117 38.483 6.009 26.345 1.00 27.66 OATOM 1065 CB GLN A 117 40.215 8.263 25.179 1.00 11.32 CATOM 1066 CG GLN A 117 40.849 8.912 23.948 1.00 12.12 CATOM 1067 CD GLN A 117 42.404 8.823 23.954 1.00 24.10 CATOM 1068 OE1 GLN A 117 43.041 8.628 22.896 1.00 47.88 OATOM 1069 NE2 GLN A 117 43.001 8.953 25.131 1.00 14.24 NATOM 1070 N PRO A 118 40.374 5.992 27.499 1.00 30.02 NATOM 1071 CA PRO A 118 41.826 6.194 27.655 1.00 26.44 CATOM 1072 C PRO A 118 42.450 5.050 26.899 1.00 24.37 CATOM 1073 O PRO A 118 41.792 4.027 26.726 1.00 25.34 OATOM 1074 CB PRO A 118 42.055 5.994 29.167 1.00 23.89 CATOM 1075 CG PRO A 118 40.847 5.240 29.654 1.00 23.20 CATOM 1076 CD PRO A 118 39.695 5.519 28.709 1.00 15.79 CATOM 1077 N MET A 119 43.684 5.228 26.432 1.00 16.00 NATOM 1078 CA MET A 119 44.372 4.215 25.644 1.00 10.80 CATOM 1079 C MET A 119 45.062 3.083 26.444 1.00 23.61 CATOM 1080 O MET A 119 46.013 3.281 27.209 1.00 18.02 OATOM 1081 CB MET A 119 45.384 4.894 24.791 1.00 13.52 CATOM 1082 CG MET A 119 44.801 6.014 23.989 1.00 18.52 CATOM 1083 SD MET A 119 46.157 7.054 23.271 1.00 26.27 SATOM 1084 CE MET A 119 46.264 6.524 21.845 1.00 33.79 CATOM 1085 N ALA A 120 44.559 1.875 26.271 1.00 26.64 N NATOM 1086 CA ALA A 120 45.177 0.712 26.884 1.00 29.17 CATOM 1087 C ALA A 120 46.356 0.308 25.984 1.00 23.21 CATOM 1088 O ALA A 120 46.439 0.759 24.833 1.00 20.19 OATOM 1089 CB ALA A 120 44.169 -0.419 26.944 1.00 26.02 CATOM 1090 N GLU A 121 47.238 -0.553 26.507 1.00 12.30 NATOM 1091 CA GLU A 121 48.427 -1.009 25.788 1.00 9.45 CATOM 1092 C GLU A 121 48.070 -1.697 24.450 1.00 11.68 CATOM 1093 O GLU A 121 48.828 -1.670 23.450 1.00 14.84 OATOM 1094 CB GLU A 121 49.321 -1.883 26.715 1.00 16.74 CATOM 1095 CG GLU A 121 50.132 -1.122 27.763 1.00 18.14 CATOM 1096 CD GLU A 121 49.458 -1.000 29.137 1.00 13.00 CATOM 1097 OE1 GLU A 121 48.252 -1.294 29.276 1.00 20.79 OATOM 1098 OE2 GLU A 121 50.123 -0.521 30.080 1.00 17.86 OATOM 1099 N SER A 122 46.887 -2.273 24.409 1.00 11.79 NATOM 1100 CA SER A 122 46.427 -2.977 23.218 1.00 12.16 CATOM 1101 O SER A 122 46.030 -2.058 22.100 1.00 11.70 CATOM 1102 O SER A 122 45.717 -2.529 21.010 1.00 13.91 OATOM 1103 CB SER A 122 45.186 -3.781 23.568 1.00 21.50 CATOM 1104 OG SER A 122 44.143 -2.908 23.976 1.00 28.52 OATOM 1105 N GLU A 123 46.041 -0.754 22.341 1.00 14.65 NATOM 1106 CA GLU A 123 45.783 0.202 21.243 1 00 17.15 CATOM 1107 C GLU A 123 46.959 0.313 20.240 1.00 11.48 CATOM 1108 O GLU A 123 46.821 0.844 19.141 1.00 11.19 OATOM 1109 CB GLU A 123 45.481 1.600 21.805 1.00 21.66 CATOM 1110 CG GLU A 123 44.127 1.694 22.523 1.00 24.68 CATOM 1111 CD GLU A 123 42.984 1.374 21.585 1.00 35.56 CATOM 1112 OE1 GLU A 123 43.019 1.865 20.426 1.00 41.73 OATOM 1113 OE2 GLU A 123 42.158 0.497 21.940 1.00100.00 OATOM 1114 N LEU A 124 48.134 -0.185 20.618 1.00 14.02 NATOM 1115 CA LEU A 124 49.296 -0.082 19.740 1.00 15.32 CATOM 1116 C LEU A 124 49.082 -0.754 18.458 1.00 17.76 CATOM 1117 O LEU A 124 48.752 -1.917 18.445 1.00 18.91 OATOM 1118 CB LEU A 124 50.564 -0.680 20.362 1.00 18.07 CATOM 1119 CG LEU A 124 51.922 -0.222 19.803 1.00 21.52 CATOM 1120 CD1 LEU A 124 52.080 1.258 20.117 1.00 20.35 CATOM 1121 CD2 LEU A 124 53.042 -0.919 20.550 1.00 14.07 CATOM 1122 N LEU A 125 49.514 -0.071 17.409 1.00 18.44 NATOM 1123 CA LEU A 125 49.445 -0.564 16.052 1.00 19.92 CATOM 1124 C LEU A 125 48.034 -0.754 15.509 1.00 25.56 CATOM 1125 O LEU A 125 47.854 -1.188 14.364 1.00 18.26 OATOM 1126 CB LEU A 125 50.355 -1.800 15.840 1.00 20.79 CATOM 1127 CG LEU A 125 51.890 -1.511 15.778 1.00 17.21 CATOM 1128 CD1 LEU A 125 52.744 -2.649 16.316 1.00 19.95 CATOM 1129 CD2 LEU A 125 52.334 -1.219 14.338 1.00 5.81 CATOM 1130 N GLN A 126 47.027 -0.327 16.276 1.00 21.97 NATOM 1131 CA GLN A 126 45.652 -0.504 15.790 1.00 19.97 CATOM 1132 C GLN A 126 45.213 0.447 14.724 1.00 28.31 CATOM 1133 O GLN A 126 44.076 0.391 14.293 1.00 47.49 OATOM 1134 CB GLN A 126 44.652 -0.404 16.911 1.00 19.87 CATOM 1135 CG GLN A 126 44.949 -1.312 18.048 1.00 18.39 CATOM 1136 CD GLN A 126 44.319 -2.626 17.835 1.00 66.80 CATOM 1137 OE1 GLN A 126 44.064 -3.376 18.792 1.00 40.75 OATOM 1138 NE2 GLN A 126 44.015 -2.952 16.565 1.00 71.74 NATOM 1139 N GLY A 127 46.080 1.330 14.270 1.00 28.29 NATOM 1140 CA GLY A 127 45.627 2.260 13.252 1.00 23.31 CATOM 1141 C GLY A 127 46.662 3.315 12.953 1.00 22.90 CATOM 1142 O GLY A 127 47.755 3.254 13.474 1.00 25.30 OATOM 1143 N THR A 128 46.311 4.219 12.046 1.00 19.51 NATOM 1144 CA THR A 128 47.149 5.314 11.588 1.00 22.12 CATOM 1145 C THR A 128 47.705 6.219 12.695 1.00 22.60 CATOM 1146 O THR A 128 47.061 6.461 13.731 1.00 18.58 OATOM 1147 CB THR A 128 46.392 6.182 10.544 1.00 35.98 CATOM 1148 OG1 THR A 128 46.533 5.594 9.239 1.00 58.05 OATOM 1149 CG2 THR A 128 46.942 7.639 10.542 1.00 43.41 CATOM 1150 N LEU A 129 48.907 6.715 12.425 1.00 18.32 NATOM 1151 CA LEU A 129 49.674 7.534 13.356 1.00 16.76 CATOM 1152 C LEU A 129 49.504 8.959 12.967 1.00 4.89 CATOM 1153 O LEU A 129 49.232 9.260 11.814 1.00 16.14 OATOM 1154 CB LEU A 129 51.205 7.191 13.261 1.00 17.91 CATOM 1155 CG LEU A 129 51.769 5.804 13.752 1.00 18.21 CATOM 1156 CD1 LEU A 129 53.132 5.379 13.193 1.00 12.12 CATOM 1157 CD2 LEU A 129 51.683 5.532 15.251 1.00 3.89 CATOM 1158 N GLU A 130 49.816 9.827 13.917 1.00 10.23 NATOM 1159 CA GLU A 130 49.912 11.268 13.691 1.00 13.22 CATOM 1160 C GLU A 130 51.128 11.544 12.775 1.00 23.44 CATOM 1161 O GLU A 130 52.249 11.162 13.090 1.00 21.23 OATOM 1162 CB GLU A 130 50.150 11.979 15.035 1.00 18.48 CATOM 1163 CG GLU A 130 50.754 13.376 14.886 1.00 77.44 CATOM 1164 CD GLU A 130 49.833 14.328 14.121 1.00100.00 CATOM 1165 OE1 GLU A 130 48.588 14.205 14.340 1.00 36.19 OATOM 1166 OE2 GLU A 130 50.347 15.161 13.295 1.00 21.03 OATOM 1167 N PRO A 131 50.920 12.219 11.648 1.00 21.35 NATOM 1168 CA PRO A 131 52.023 12.409 10.731 1.00 14.78 CATOM 1169 C PRO A 131 53.201 13.132 11.265 1.00 14.98 CATOM 1170 O PRO A 131 54.325 12.847 10.853 1.00 20.99 OATOM 1171 CB PRO A 131 51.413 13.154 9.552 1.00 14.76 CATOM 1172 CG PRO A 131 50.071 13.485 9.949 1.00 20.99 CATOM 1173 CD PRO A 131 49.641 12.626 11.047 1.00 17.25 CATOM 1174 N THR A 132 52.986 14.095 12.159 1.00 18.77 NATOM 1175 CA THR A 132 54.131 14.838 12.689 1.00 16.44 CATOM 1176 C THR A 132 55.102 13.951 13.408 1.00 21.91 CATOM 1177 O THR A 132 56.317 14.088 13.234 1.00 24.17 OATOM 1178 CB THR A 132 53.716 15.907 13.606 1.00 23.45 CATOM 1179 OG1 THR A 132 52.976 16.883 12.850 1.00 31.15 OATOM 1180 CG2 THR A 132 54.969 16.519 14.341 1.00 9.28 CATOM 1181 N ASN A 133 54.551 12.970 14.122 1.00 28.59 NATOM 1182 CA ASN A 133 55.359 12.007 14.875 1.00 26.38 CATOM 1183 C ASN A 133 55.666 10.682 14.207 1.00 14.85 CATOM 1184 O ASN A 133 56.446 9.884 14.755 1.00 18.67 OATOM 1185 CB ASN A 133 54.661 11.699 16.168 1.00 23.70 CATOM 1186 CG ASN A 133 54.480 12.894 16.968 1.00 50.55 CATOM 1187 OD1 ASN A 133 53.354 13.272 17.252 1.00 40.07 OATOM 1188 ND2 ASN A 133 55.568 13.638 17.163 1.00 40.36 NATOM 1189 N GLU A 134 55.100 10.469 13.022 1.00 9.98 NATOM 1190 CA GLU A 134 55.237 9.210 12.365 1.00 9.66 CATOM 1191 C GLU A 134 56.648 8.530 12.274 1.00 13.86 CATOM 1192 O GLU A 134 56.814 7.388 12.706 1.00 22.89 OATOM 1193 CB GLU A 134 54.448 9.200 11.070 1.00 17.55 CATOM 1194 CG GLU A 134 54.750 7.930 10.227 1.00 20.89 CATOM 1195 CD GLU A 134 53.926 7.868 8.970 1.00 13.59 CATOM 1196 OE1 GLU A 134 52.678 7.738 9.085 1.00 35.28 OATOM 1197 OE2 GLU A 134 54.497 8.048 7.869 1.00 13.44 OATOM 1198 N PRO A 135 57.680 9.222 11.789 1.00 15.72 NATOM 1199 CA PRO A 135 59.014 8.600 11.699 1.00 18.91 CATOM 1200 C PRO A 135 59.544 8.174 13.073 1.00 18.68 CATOM 1201 O PRO A 135 60.072 7.069 13.271 1.00 15.69 OATOM 1202 CB PRO A 135 59.896 9.755 11.169 1.00 13.84 CATOM 1203 CG PRO A 135 59.036 10.514 10.350 1.00 9.78 CATOM 1204 CD PRO A 135 57.594 10.395 10.908 1.00 14.43 CATOM 1205 N TYR A 136 59.449 9.117 13.994 1.00 8.64 NATOM 1206 CA TYR A 136 59.873 8.915 15.324 1.00 13.27 CATOM 1207 C TYR A 136 59.056 7.728 15.907 1.00 16.84 CATOM 1208 O TYR A 136 59.578 6.903 16.658 1.00 12.90 OATOM 1209 CB TYR A 136 59.604 10.234 16.100 1.00 15.51 CATOM 1210 CG TYR A 136 59.912 10.168 17.614 1.00 18.26 CATOM 1211 CD1 TYR A 136 61.200 10.062 18.072 1.00 20.53 CATOM 1212 CD2 TYR A 136 58.904 10.150 18.568 1.00 17.38 CATOM 1213 CE1 TYR A 136 61.484 9.959 19.440 1.00 30.44 CATOM 1214 CE2 TYR A 136 59.184 10.084 19.953 1.00 9.85 CATOM 1215 CZ TYR A 136 60.476 9.949 20.377 1.00 20.65 CATOM 1216 OH TYR A 136 60.792 9.873 21.734 1.00 24.41 OATOM 1217 N ALA A 137 57.760 7.687 15.638 1.00 7.19 NATOM 1218 CA ALA A 137 56.923 6.633 16.227 1.00 12.68 CATOM 1219 C ALA A 137 57.345 5.265 15.737 1.00 15.21 CATOM 1220 O ALA A 137 57.425 4.272 16.488 1.00 14.58 CATOM 1221 CB ALA A 137 55.517 6.849 15.871 1.00 11.40 CATOM 1222 N ILE A 138 57.567 5.213 14.447 1.00 8.93 NATOM 1223 CA ILE A 138 57.954 3.971 13.831 1.00 11.77 CATOM 1224 C ILE A 138 59.246 3.494 14.492 1.00 16.20 CATOM 1225 O ILE A 138 59.307 2.377 14.970 1.00 13.79 OATOM 1226 CB ILE A 138 58.064 4.172 12.316 1.00 17.85 CATOM 1227 CG1 ILE A 138 56.680 4.473 11.757 1.00 28.21 CATOM 1228 CG2 ILE A 138 58.674 2.986 11.602 1.00 9.81 CATOM 1229 CD1 ILE A 138 55.695 3.376 11.970 1.00 18.17 CATOM 1230 N ALA A 139 60.243 4.361 14.625 1.00 11.54 NATOM 1231 CA ALA A 139 61.494 3.937 15.288 1.00 13.22 CATOM 1232 C ALA A 139 61.256 3.364 16.675 1.00 18.73 CATOM 1233 O ALA A 139 61.791 2.318 17.031 1.00 20.44 OATOM 1234 CB ALA A 139 62.434 5.073 15.390 1.00 13.62 CATOM 1235 N LYS A 140 60.397 4.033 17.448 1.00 16.36 NATOM 1236 CA LYS A 140 60.083 3.600 18.815 1.00 15.14 CATOM 1237 C LYS A 140 59.392 2.262 18.824 1.00 15.18 CATOM 1238 O LYS A 140 59.824 1.346 19.475 1.00 21.42 OATOM 1239 CB LYS A 140 59.193 4.606 19.525 1.00 17.86 CATOM 1240 CG LYS A 140 59.925 5.806 20.152 1.00 21.11 CATOM 1241 CD LYS A 140 61.208 5.478 20.958 1.00 16.75 CATOM 1242 CE LYS A 140 61.664 6.735 21.835 1.00 10.06 CATOM 1243 NZ LYS A 140 62.688 6.496 22.921 1.00 14.40 NATOM 1244 N ILE A 141 58.356 2.116 18.027 1.00 11.49 NATOM 1245 CA ILE A 141 57.703 0.828 17.977 1.00 17.92 CATOM 1246 C ILE A 141 58.729 -0.282 17.577 1.00 13.46 CATOM 1247 O ILE A 141 58.730 -1.374 18.148 1.00 13.92 OATOM 1248 CB ILE A 141 56.497 0.925 17.019 1.00 22.59 CATOM 1249 CG1 ILE A 141 55.466 1.906 17.557 1.00 17.61 CATOM 1250 CG2 ILE A 141 55.863 -0.411 16.700 1.00 10.49 CATOM 1251 CD1 ILE A 141 54.530 2.327 16.449 1.00 13.43 CATOM 1252 N ALA A 142 59.637 0.028 16.650 1.00 10.29 NATOM 1253 CA ALA A 142 60.657 -0.931 16.228 1.00 7.15 CATOM 1254 C ALA A 142 61.456 -1.301 17.456 1.00 16.58 CATOM 1255 O ALA A 142 61.839 -2.454 17.621 1.00 13.04 OATOM 1256 CB ALA A 142 61.604 -0.288 15.130 1.00 4.44 CATOM 1257 N GLY A 143 61.703 -0.307 18.316 1.00 9.56 NATOM 1258 CA GLY A 143 62.448 -0.525 19.527 1.00 5.15 CATOM 1259 C GLY A 143 61.770 -1.555 20.430 1.00 16.36 CATOM 1260 O GLY A 143 62.392 -2.482 20.967 1.00 14.11 OATOM 1261 N ILE A 144 60.476 -1.418 20.564 1.00 20.33 NATOM 1262 CA ILE A 144 59.725 -2.314 21.407 1.00 15.35 CATOM 1263 C ILE A 144 59.706 -3.732 20.859 1.00 19.84 CATOM 1264 O ILE A 144 59.836 -4.700 21.608 1.00 17.93 OATOM 1265 CB ILE A 144 58.317 -1.819 21.559 1.00 10.60 CATOM 1266 CG1 ILE A 144 58.311 -0.610 22.516 1.00 9.80 CATOM 1267 CG2 ILE A 144 57.410 -2.928 22.122 1.00 9.60 CATOM 1268 CD1 ILE A 144 57.022 0.076 22.517 1.00 18.32 CATOM 1269 N LYS A 145 59.520 -3.841 19.556 1.00 7.20 NATOM 1270 CA LYS A 145 59.459 -5.139 18.926 1.00 7.64 CATOM 1271 C LYS A 145 60.840 -5.788 18.931 1.00 15.32 CATOM 1272 O LYS A 145 60.923 -6.989 18.981 1.00 14.76 OATOM 1273 CB LYS A 145 58.891 -5.001 17.516 1.00 11.25 CATOM 1274 CG LYS A 145 57.414 -4.581 17.489 1.00 12.13 CATOM 1275 CD LYS A 145 56.642 -5.434 18.495 1.00 25.23 CATOM 1276 CE LYS A 145 55.189 -4.995 18.692 1.00 13.64 CATOM 1277 NZ LYS A 145 54.441 -6.111 19.392 1.00 11.94 NATOM 1278 N LEU A 146 61.934 -5.011 18.986 1.00 26.98 NATOM 1279 CA LEU A 146 63.261 -5.642 19.167 1.00 19.72 CATOM 1280 C LEU A 146 63.262 -6.316 20.542 1.00 18.20 CATOM 1281 O LEU A 146 63.590 -7.511 20.703 1.00 19.86 OATOM 1282 CB LEU A 146 64.398 -4.618 19.150 1.00 13.56 CATOM 1283 CG LEU A 146 64.895 -4.258 17.759 1.00 21.84 CATOM 1284 CD1 LEU A 146 65.672 -2.945 17.817 1.00 17.94 CATOM 1285 CD2 LEU A 146 65.745 -5.397 17.102 1.00 16.10 CATOM 1286 N CYS A 147 62.931 -5.523 21.548 1.00 7.91 NATOM 1287 CA CYS A 147 62.875 -6.064 22.893 1.00 9.14 CATOM 1288 C CYS A 147 62.072 -7.378 22.945 1.00 22.72 CATOM 1289 O CYS A 147 62.568 -8.401 23.383 1.00 16.90 OATOM 1290 CB CYS A 147 62.232 -5.058 23.809 1.00 12.63 CATOM 1291 SG CYS A 147 63.411 -3.823 24.316 1.00 15.02 SATOM 1292 N GLU A 148 60.823 -7.352 22.508 1.00 20.03 NATOM 1293 CA GLU A 148 60.016 -8.555 22.567 1.00 16.09 CATOM 1294 C GLU A 148 60.685 -9.715 21.802 1.00 22.61 CATOM 1295 O GLU A 148 60.651 -10.888 22.226 1.00 12.05 OATOM 1296 CB GLU A 148 58.597 -8.268 22.046 1.00 14.66 CATOM 1297 CG GLU A 148 57.864 -7.189 22.840 1.00 11.45 CATOM 1298 CD GLU A 148 56.471 -6.821 22.277 1.00 11.75 CATOM 1299 OE1 GLU A 148 56.117 -7.055 21.080 1.00 11.65 OATOM 1300 OE2 GLU A 148 55.728 -6.231 23.081 1.00 22.56 OATOM 1301 N SER A 149 61.368 -9.377 20.715 1.00 15.57 NATOM 1302 CA SER A 149 61.938 -10.428 19.887 1.00 10.21 CATOM 1303 C SER A 149 63.040 -11.245 20.502 1.00 15.83 CATOM 1304 O SER A 149 63.102 -12.458 20.291 1.00 12.72 OATOM 1305 CB SER A 149 62.270 -9.936 18.488 1.00 9.44 CATOM 1306 OG SER A 149 61.053 -9.650 17.782 1.00 15.91 OATOM 1307 N TYR A 150 63.910 -10.546 21.224 1.00 18.44 NATOM 1308 CA TYR A 150 65.065 -11.100 21.948 1.00 20.50 CATOM 1309 C TYR A 150 64.514 -11.848 23.158 1.00 21.87 CATOM 1310 O TYR A 150 64.939 -12.949 23.486 1.00 31.39 OATOM 1311 CB TYR A 150 66.005 -9.950 22.425 1.00 13.71 CATOM 1312 CG TYR A 150 66.994 -9.509 21.365 1.00 14.13 CATOM 1313 CD1 TYR A 150 66.611 -8.673 20.317 1.00 14.64 CATOM 1314 CD2 TYR A 150 68.288 -10.000 21.360 1.00 18.32 CATOM 1315 CE1 TYR A 150 67.487 -8.390 19.278 1.00 11.91 CATOM 1316 CE2 TYR A 150 69.198 -9.682 20.345 1.00 11.10 CATOM 1317 CZ TYR A 150 68.804 -8.900 19.326 1.00 20.95 CATOM 1328 OH TYR A 150 69.739 -8.685 18.333 1.00 27.73 OATOM 1319 N ASN A 151 63.536 -11.249 23.801 1.00 14.83 NATOM 1320 CA ASN A 151 62.903 -11.889 24.937 1.00 23.62 CATOM 1321 C ASN A 151 62.417 -13.244 24.410 1.00 28.53 CATOM 1322 O ASN A 151 62.630 -14.248 25.072 1.00 25.89 OATOM 1323 CB ASN A 151 61.655 -11.113 25.439 1.00 20.95 CATOM 1324 CG ASN A 151 61.988 -9.867 26.284 1.00 15.07 CATOM 1325 OD1 ASN A 151 61.126 -9.020 26.466 1.00 26.72 OATOM 1326 ND2 ASN A 151 63.231 -9.709 26.700 1.00 6.31 NATOM 1327 N ARG A 152 61.731 -13.249 23.259 1.00 19.91 NATOM 1328 CA ARG A 152 61.129 -14.465 22.687 1.00 17.62 CATOM 1329 C ARG A 152 62.090 -15.523 22.188 1.00 21.34 CATOM 1330 O ARG A 152 61.959 -16.687 22.542 1.00 15.44 OATOM 1331 CB ARG A 152 60.086 -14.148 21.610 1.00 15.30 CATOM 1332 CG ARG A 152 58.672 -13.754 22.157 1.00 17.22 CATOM 1333 CD ARG A 152 57.652 -13.297 21.049 1.00 9.11 CATOM 1334 NE ARG A 152 57.161 -14.419 20.241 1.00 21.05 NATOM 1335 CZ ARG A 152 57.159 -14.447 18.912 1.00 28.61 CATOM 1336 NH1 ARG A 152 57.590 -13.387 18.221 1.00 21.98 NATOM 1337 NH2 ARG A 152 56.717 -15.528 18.262 1.00 26.11 NATOM 1338 N GLN A 153 63.098 -15.104 21.434 1.00 16.54 NATOM 1339 CA GLN A 153 64.044 -16.036 20.842 1.00 9.74 CATOM 1340 C GLN A 153 65.082 -16.443 21.807 1.00 16.70 CATOM 1341 O GLN A 153 65.529 -17.545 21.763 1.00 24.35 OATOM 1342 CB GLN A 153 64.789 -15.372 19.714 1.00 8.99 CATOM 1343 CG GLN A 153 65.935 -16.225 19.116 1.00 4.63 CATOM 1344 CD GLN A 153 66.315 -15.637 17.762 1.00 14.17 CATOM 1345 OE1 GLN A 153 65.611 -14.763 17.254 1.00 12.53 OATOM 1346 NE2 GLN A 153 67.466 -16.024 17.228 1.00 13.38 NATOM 1347 N TYR A 154 65.566 -15.518 22.608 1.00 14.35 NATOM 1348 CA TYR A 154 66.677 -15.839 23.483 1.00 12.16 CATOM 1349 C TYR A 154 66.323 -15.930 24.954 1.00 19.06 CATOM 1350 O TYR A 154 67.185 -16.207 25.777 1.00 25.59 OATOM 1351 CB TYR A 154 67.829 -14.816 23.326 1.00 16.89 CATOM 1352 CG TYR A 154 68.418 -14.733 21.943 1.00 17.53 CATOM 1353 CD1 TYR A 154 69.259 -15.726 21.467 1.00 18.91 CATOM 1354 CD2 TYR A 154 68.080 -13.712 21.091 1.00 13.97 CATOM 1355 CE1 TYR A 154 69.782 -15.686 20.190 1.00 10.98 CATOM 1356 CE2 TYR A 154 68.621 -13.639 19.806 1.00 23.81 CATOM 1357 CZ TYR A 154 69.488 -14.634 19.380 1.00 23.08 CATOM 1358 OH TYR A 154 70.002 -14.619 18.118 1.00 23.87 OATOM 1359 N GLY A 155 65.080 -15.686 25.313 1.00 12.08 NATOM 1360 CA GLY A 155 64.747 -15.702 26.731 1.00 15.80 CATOM 1361 C GLY A 155 65.323 -14.498 27.580 1.00 33.97 CATOM 1362 O GLY A 125 65.491 -14.640 28.789 1.00 25.76 OATOM 1363 N ARG A 156 65.564 -13.318 26.981 1.00 25.91 NATOM 1364 CA ARG A 156 66.066 -12.146 27.734 1.00 14.13 CATOM 1365 C ARG A 156 64.971 -11.486 28.581 1.00 16.23 CATOM 1366 O ARG A 156 63.802 -11.919 28.583 1.00 22.61 OATOM 1367 CB ARG A 156 66.601 -11.124 26.750 1.00 13.16 CATOM 1368 CG ARG A 156 67.875 -11.570 26.099 1.00 15.18 CATOM 1369 CD ARG A 156 68.930 -11.418 27.121 1.00 26.42 CATOM 1370 NE ARG A 156 70.200 -11.912 26.633 1.00 21.25 NATOM 1371 CZ ARG A 156 71.092 -12.555 27.386 1.00 42.25 CATOM 1372 NH1 ARG A 156 70.870 -12.795 28.679 1.00 20.02 NATOM 1373 NH2 ARG A 156 72.221 -12.966 26.843 1.00 20.88 NATOM 1374 N ASP A 157 65.343 -10.446 29.321 1.00 16.00 NATOM 1375 CA ASP A 157 64.370 -9.749 30.166 1.00 16.20 CATOM 1376 C ASP A 157 64.444 -8.245 29.841 1.00 19.20 CATOM 1377 O ASP A 157 64.865 -7.429 30.650 1.00 10.71 OATOM 1378 CB ASP A 157 64.609 -10.061 31.652 1.00 16.50 CATOM 1379 CG ASP A 157 63.489 -9.560 32.566 1.00 26.45 CATOM 1380 OD1 ASP A 157 62.433 -9.060 32.108 1.00 26.82 OATOM 1381 OD2 ASP A 157 63.673 -9.653 33.784 1.00 21.88 OATOM 1382 N TYR A 158 64.038 -7.921 28.620 1.00 19.41 NATOM 1383 CA TYR A 158 64.099 -6.564 28.083 1.00 18.96 CATOM 1384 C TYR A 158 62.688 -5.977 28.127 1.00 22.62 CATOM 1385 O TYR A 158 61.854 -6.296 27.282 1.00 10.12 OATOM 1386 CB TYR A 158 64.562 -6.661 26.631 1.00 16.34 CATOM 1387 CG TYR A 158 65.982 -7.166 26.484 1.00 12.04 CATOM 1388 CD1 TYR A 158 66.789 -7.415 27.621 1.00 13.76 CATOM 1389 CD2 TYR A 158 66.544 -7.349 25.218 1.00 16.35 CATOM 1390 CE1 TYR A 158 68.135 -7.786 27.482 1.00 8.18 CATOM 1391 CE2 TYR A 158 67.886 -7.732 25.060 1.00 13.73 CATOM 1392 CZ TYR A 158 68.676 -7.942 26.186 1.00 24.45 CATOM 1393 OH TYR A 158 69.993 -8.338 25.997 1.00 14.36 OATOM 1394 N ARG A 159 62.423 -5.200 29.175 1.00 23.53 NATOM 1395 CA ARG A 159 61.105 -4.603 29.483 1.00 21.15 CATOM 1396 C ARG A 159 60.930 -3.172 28.878 1.00 23.55 CATOM 1397 O ARG A 159 61.911 -2.566 28.424 1.00 18.12 OATOM 1398 CB ARG A 159 60.891 -4.608 31.034 1.00 21.68 CATOM 1399 CG ARG A 159 60.986 -6.029 31.722 1.00 16.41 CATOM 1400 CD ARG A 159 61.135 -6.052 33.233 1.00 18.10 CATOM 1401 NE ARG A 159 61.305 -7.402 33.772 1.00 19.25 NATOM 1402 CZ ARG A 159 61.164 -7.720 35.058 1.00 36.67 CATOM 1403 NH1 ARG A 159 60.886 -6.776 35.962 1.00 15.32 NATOM 1404 NH2 ARG A 159 61.309 -8.986 35.448 1.00 11.79 NATOM 1405 N SER A 160 59.689 -2.661 28.859 1.00 24.44 NATOM 1406 CA SEP A 160 59.312 -1.393 28.200 1.00 21.59 CATOM 1407 C SER A 160 58.242 -0.577 28.950 1.00 25.07 CATOM 1408 O SER A 160 57.257 -1.127 29.454 1.00 17.02 OATOM 1409 CB SER A 160 58.719 -1.747 26.797 1.00 13.05 CATOM 1410 OG SER A 160 59.782 -1.897 25.885 1.00 37.57 OATOM 1411 N VAL A 161 58.378 0.742 28.927 1.00 21.01 NATOM 1412 CA VAL A 161 57.369 1.644 29.509 1.00 9.70 CATOM 1413 C VAL A 161 57.068 2.747 28.504 1.00 16.77 CATOM 1414 O VAL A 161 57.955 3.149 27.729 1.00 16.33 OATOM 1415 CB VAL A 161 57.806 2.248 30.862 1.00 17.94 CATOM 1416 CG1 VAL A 161 57.873 1.185 31.984 1.00 16.16 CATOM 1417 CG2 VAL A 161 59.137 2.992 30.750 1.00 21.10 CATOM 1418 N MET A 162 55.794 3.147 28.443 1.00 22.46 NATOM 1419 CA MET A 162 55.296 4.185 27.513 1.00 19.23 CATOM 1420 C MET A 162 54.880 5.312 28.397 1.00 25.19 CATOM 1421 O MET A 162 53.788 5.269 28.961 1.00 18.35 OATOM 1422 CB MET A 162 53.979 3.796 26.850 1.00 15.55 CATOM 1423 CG MET A 162 54.013 2.630 25.949 1.00 37.79 CATOM 1424 SD MET A 162 54.354 3.100 24.235 1.00 52.07 SATOM 1425 CE MET A 162 56.193 3.134 24.410 1.00 36.30 CATOM 1426 N PRO A 163 55.730 6.313 28.521 1.00 18.43 NATOM 1427 CA PRO A 163 55.390 7.472 29.337 1.00 17.76 CATOM 1428 C PRO A 163 54.300 8.384 28.667 1.00 21.23 CATOM 1429 O PRO A 163 54.208 8.448 27.433 1.00 15.20 OATOM 1430 CB PRO A 163 56.727 8.196 29.423 1.00 11.43 CATOM 1431 CG PRO A 163 57.352 7.874 28.031 1.00 13.99 CATOM 1432 CD PRO A 163 57.086 6.401 27.949 1.00 12.24 CATOM 1433 N THR A 164 53.478 9.060 29.478 1.00 13.95 NATOM 1434 CA THR A 164 52.581 10.121 28.963 1.00 25.82 CATOM 1435 C THR A 164 53.406 11.441 28.781 1.00 19.67 CATOM 1436 O THR A 164 54.633 11.393 28.868 1.00 13.97 OATOM 1437 CB THR A 164 51.373 10.391 29.903 1.00 25.51 CATOM 1438 OG1 THR A 164 50.470 11.321 29.267 1.00 14.77 OATOM 1439 CG2 THR A 164 51.818 10.886 31.298 1.00 9.06 CATOM 1440 N ASN A 165 52.751 12.589 28.556 1.00 14.99 NATOM 1441 CA ASN A 165 53.448 13.901 28.481 1.00 7.83 CATOM 1442 C ASN A 165 54.167 14.064 29.824 1.00 11.21 CATOM 1443 O ASN A 165 53.554 13.929 30.894 1.00 17.66 OATOM 1444 CB ASN A 165 52.434 15.061 28.416 1.00 14.48 CATOM 1445 CG ASN A 165 51.492 14.941 27.262 1.00 23.70 CATOM 1446 OD1 ASN A 165 51.939 14.800 26.129 1.00 22.37 OATOM 1447 ND2 ASN A 165 50.173 14.925 27.539 1.00 27.22 NATOM 1448 N LEU A 166 55.418 14.490 29.777 1.00 8.23 NATOM 1449 CA LEU A 166 56.187 14.604 30.994 1.00 14.40 CATOM 1450 C LEU A 166 56.629 16.017 31.120 1.00 25.05 CATOM 1451 O LEU A 166 56.624 16.718 30.125 1.00 25.09 OATOM 1452 CB LEU A 166 57.460 13.743 30.870 1.00 17.48 CATOM 1453 CG LEU A 166 57.423 12.218 30.652 1.00 16.63 CATOM 1454 CD1 LEU A 166 58.837 11 639 31.000 1.00 22.52 CATOM 1455 CD2 LEU A 166 56.336 11.539 31.514 1.00 7.46 CATOM 1456 N TYR A 167 57.146 16.391 32.300 1.00 19.78 NATOM 1457 CA TYR A 167 57.678 17.760 32.511 1.00 18.58 CATOM 1458 C TYR A 167 58.534 17.763 33.767 1.00 15.53 CATOM 1459 O TYR A 167 58.474 16.852 34.575 1.00 16.71 OATOM 1460 CB TYR A 167 56.509 18.778 32.665 1.00 18.33 CATOM 1461 CG TYR A 167 55.671 18.561 33.931 1.00 14.23 CATOM 1462 CD1 TYR A 167 54.624 17.618 33.977 1.00 13.35 CATOM 1463 CD2 TYR A 167 55.984 19.258 35.106 1.00 16.52 CATOM 1464 CE1 TYR A 167 53.889 17.446 35.146 1.00 21.17 CATOM 1465 CE2 TYR A 167 55.302 19.084 36.264 1.00 8.26 CATOM 1466 CZ TYR A 167 54.228 18.203 36.296 1.00 23.56 CATOM 1467 OH TYR A 167 53.526 18.078 37.504 1.00 22.81 OATOM 1468 N GLY A 168 59.334 18.797 33.952 1.00 16.59 NATOM 1469 CA GLY A 168 60.158 18.817 35.152 1.00 18.21 CATOM 1470 C GLY A 168 61.534 19.428 34.880 1.00 13.69 CATOM 1471 O GLY A 168 61.746 20.028 33.837 1.00 16.52 OATOM 1472 N PRO A 169 62.473 19.263 35.817 1.00 20.33 NATOM 1473 CA PRO A 169 63.801 19.822 35.656 1.00 16.07 CATOM 1474 C PRO A 169 64.430 19.353 34.387 1.00 27.18 CATOM 1475 O PRO A 169 64.305 18.186 33.981 1.00 21.23 OATOM 1476 CB PRO A 169 64.595 19.206 36.805 1.00 17.28 CATOM 1477 CG PRO A 169 63.649 18.919 37.830 1.00 19.89 CATOM 1478 CD PRO A 169 62.263 18.772 37.189 1.00 22.47 CATOM 1479 N HIS A 170 65.226 20.235 33.829 1.00 19.48 NATOM 1480 CA HIS A 170 65.952 19.877 32.638 1.00 25.56 CATOM 1481 C HIS A 170 65.096 19.707 31.428 1.00 29.15 CATOM 1482 O HIS A 170 65.553 19.091 30.479 1.00 29.71 OATOM 1483 CB HIS A 170 66.783 18.600 32.845 1.00 28.94 CATOM 1484 CG HIS A 170 67.703 18.671 34.034 1.00 33.88 CATOM 1485 ND1 HIS A 170 68.975 19.203 33.969 1.00 25.46 NATOM 1486 CD2 HIS A 170 67.518 18.298 35.326 1.00 34.77 CATOM 1487 CE1 HIS A 170 69.531 19.151 35.166 1.00 25.63 CATOM 1488 NE2 HIS A 170 68.673 18.603 36.008 1.00 31.72 NATOM 1489 N ASP A 171 63.881 20.245 31.440 1.00 21.52 NATOM 1490 CA ASP A 171 63.041 20.267 30.218 1.00 28.63 CATOM 1491 C ASP A 171 63.630 21.459 29.359 1.00 41.94 CATOM 1492 O ASP A 171 64.534 22.171 29.835 1.00 29.69 OATOM 1493 CB ASP A 171 61.552 20.558 30.602 1.00 26.40 CATOM 1494 CG ASP A 171 60.552 20.097 29.540 1.00 22.32 CATOM 1495 OD1 ASP A 171 60.890 20.067 28.325 1.00 32.03 OATOM 1496 OD2 ASP A 171 59.427 19.719 29.916 1.00 42.13 OATOM 1497 N ASN A 172 63.141 21.712 28.137 1.00 42.08 NATOM 1498 CA ASN A 172 63.616 22.893 27.388 1.00 35.95 CATOM 1499 C ASN A 172 62.665 24.056 27.674 1.00 33.71 CATOM 1500 O ASN A 172 61.586 24.102 27.104 1.00 32.69 OATOM 1501 CB ASN A 172 63.632 22.667 25.869 1.00 41.60 CATOM 1502 CG ASN A 172 63.807 23.987 25.086 1.00 39.09 CATOM 1503 OD1 ASN A 172 62.973 24.347 24.259 1.00 83.94 OATOM 1504 ND2 ASN A 172 64.855 24.740 25.418 1.00 65.07 NATOM 1505 N PHE A 173 63.021 24.953 28.583 1.00 31.93 NATOM 1506 CA PHE A 173 62.082 26.030 28.944 1.00 48.24 CATOM 1507 C PHE A 173 61.989 27.260 28.045 1.00 69.01 CATOM 1508 O PHE A 173 62.278 28.395 28.465 1.00 58.79 OATOM 1509 CB PHE A 173 62.225 26.459 30.390 1.00 43.43 CATOM 1510 CG PHE A 173 61.867 25.399 31.356 1.00 34.19 CATOM 1511 CD1 PHE A 173 62.810 24.488 31.751 1.00 24.68 CATOM 1512 CD2 PHE A 173 60.621 25.354 31.925 1.00 24.84 CATOM 1513 CE1 PHE A 173 62.524 23.548 32.682 1.00 23.64 CATOM 1514 CE2 PHE A 173 60.305 24.366 32.804 1.00 31.32 CATOM 1515 CZ PHE A 173 61.263 23.457 33.192 1.00 24.30 CATOM 1516 N HIS A 174 61.510 27.036 26.831 1.00 68.16 NATOM 1517 CA HIS A 174 61.401 28.109 25.871 1.00 64.53 CATOM 1518 C HIS A 174 59.973 28.221 25.400 1.00 71.58 CATOM 1519 O MIS A 174 59.309 27.186 25.249 1.00 73.20 OATOM 1520 CB HIS A 174 62.418 27.870 24.736 1.00 71.71 CATOM 1521 CG HIS A 174 63.835 27.868 25.229 1.00 92.29 CATOM 1522 ND1 HIS A 174 64.921 27.539 24.440 1.00100.00 NATOM 1523 CD2 HIS A 174 64.338 28.133 26.463 1.00100.00 CATOM 1524 CE1 HIS A 174 66.032 27.628 25.160 1.00100.00 CATOM 1525 NE2 HIS A 174 65.705 27.981 26.393 1.00100.00 NATOM 1526 N PRO A 175 59.469 29.461 25.262 1.00 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66.57 CATOM 1545 OD1 ASN A 177 59.095 22.216 23.476 1.00100.00 OATOM 1546 ND2 ASN A 177 60.099 22.546 25.464 1.00 35.61 NATOM 1547 N SER A 178 57.583 23.387 21.627 1.00 57.10 NATOM 1548 CA SER A 178 56.234 22.853 21.279 1.00 50.50 CATOM 1549 C SER A 178 55.557 22.159 22.491 1.00 76.24 CATOM 1550 O SER A 178 54.575 21.400 22.304 1.00 99.63 OATOM 1551 CB SER A 178 56.316 21.800 20.118 1.00 10.17 CATOM 1552 OG SER A 178 57.397 22.112 19.217 1.00 71.69 OATOM 1553 N HIS A 179 56.134 22.284 23.694 1.00 37.39 NATOM 1554 CA HIS A 179 55.569 21.587 24.855 1.00 30.96 CATOM 1555 C HIS A 179 54.961 22.616 25.767 1.00 21.93 CATOM 1556 O HIS A 179 55.641 23.598 26.138 1.00 25.17 OATOM 1557 CB HIS A 179 56.634 20.683 25.575 1.00 36.20 CATOM 1558 CG HIS A 179 56.973 19.419 24.835 1.00 42.90 CATOM 1559 ND1 HIS A 179 56.973 19.335 23.457 1.00 49.52 NATOM 1560 CD2 HIS A 179 57.323 18.190 25.278 1.00 52.42 CATOM 1561 CE1 HIS A 179 57.283 18.109 23.084 1.00 44.78 CATOM 1562 NE2 HIS A 179 57.500 17.393 24.168 1.00 50.49 NATOM 1563 N VAL A 180 53.661 22.454 26.038 1.00 19.14 NATOM 1564 CA VAL A 180 52.886 23.449 26.789 1.00 29.03 CATOM 1565 C VAL A 180 53.373 23.890 28.142 1.00 31.29 CATOM 1566 O VAL A 180 53.348 25.075 28.447 1.00 19.55 OATOM 1567 CB VAL A 180 51.403 23.115 26.914 1.00 35.47 CATOM 1568 CG1 VAL A 180 50.630 24.399 27.217 1.00 35.84 CATOM 1569 CG2 VAL A 180 50.923 22.550 25.663 1.00 36.11 CATOM 1570 N ILE A 181 53.684 22.935 29.005 1.00 26.57 NATOM 1571 CA ILE A 181 54.138 23.285 30.360 1.00 24.49 CATOM 1572 C ILE A 181 55.371 24.213 30.361 1.00 16.51 CATOM 1573 O ILE A 181 55.326 25.315 30.909 1.00 24.42 OATOM 1574 CB ILE A 181 54.285 22.018 31.264 1.00 20.20 CATOM 1575 CG1 ILE A 181 52.878 21.428 31.528 1.00 18.22 CATOM 1576 CG2 ILE A 181 55.014 22.315 32.581 1.00 13.37 CATOM 1577 CD1 ILE A 181 52.867 20.086 32.286 1.00 8.03 CATOM 1578 N PRO A 182 56.452 23.779 29.718 1.00 22.21 NATOM 1579 CA PRO A 182 57.664 24.605 29.640 1.00 22.07 CATOM 1580 C PRO A 182 57.379 25.852 28.828 1.00 24.18 CATOM 1581 O PRO A 182 57.811 26.949 29.210 1.00 18.35 OATOM 1582 CB PRO A 182 58.682 23.725 28.890 1.00 24.97 CATOM 1583 CG PRO A 182 57.925 22.473 28.471 1.00 25.77 CATOM 1584 CD PRO A 182 56.727 22.359 29.401 1.00 18.23 CATOM 1585 N ALA A 183 56.628 25.707 27.729 1.00 21.45 NATOM 1586 CA ALA A 183 56.261 26.896 26.943 1.00 21.66 CATOM 1587 C ALA A 183 55.464 27.900 27.811 1.00 26.10 CATOM 1588 O ALA A 183 55.773 29.091 27.856 1.00 19.50 OATOM 1589 CB ALA A 183 55.473 26.513 25.703 1.00 13.26 CATOM 1590 N LEU A 184 54.472 27.389 28.543 1.00 23.34 NATOM 1591 CA LEU A 184 53.642 28.215 29.401 1.00 19.05 CATOM 1592 C LEU A 184 54.312 28.693 30.655 1.00 21.91 CATOM 1593 O LEU A 184 54.017 29.771 31.158 1.00 19.71 OATOM 1594 CB LEU A 184 52.309 27.553 29.715 1.00 14.41 CATOM 1595 CG LEU A 184 51.342 27.595 28.525 1.00 23.42 CATOM 1596 CD1 LEU A 184 49.918 27.244 28.928 1.00 31.06 CATOM 1597 CD2 LEU A 184 51.380 28.896 27.690 1.00 21.73 CATOM 1598 N LEU A 185 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A 186 64.098 32.639 28.082 1.00100.00 NATOM 1617 N ARG A 187 56.234 31.544 29.310 1.00 20.96 NATOM 1618 CA ARG A 187 55.361 32.662 28.941 1.00 19.32 CATOM 1619 C ARG A 187 54.765 33.453 30.142 1.00 28.41 CATOM 1620 O ARG A 187 54.823 34.700 30.193 1.00 17.23 OATOM 1621 CB ARG A 187 54.270 32.223 27.957 1.00 17.05 CATOM 1622 CG ARG A 187 54.813 31.546 26.720 1.00 61.42 CATOM 1623 CD ARG A 187 53.696 31.244 25.757 1.00 44.57 CATOM 1624 NE ARG A 187 53.033 32.472 25.354 1.00 29.47 NATOM 1625 CZ ARG A 187 51.831 32.534 24.790 1.00 17.82 CATOM 1626 NH1 ARG A 187 51.136 31.427 24.544 1.00 24.95 NATOM 1627 NH2 ARG A 187 51.341 33.716 24.447 1.00 37.77 NATOM 1628 N PHE A 188 54.192 32.734 31.101 1.00 23.48 NATOM 1629 CA PHE A 188 53.604 33.399 32.259 1.00 21.24 CATOM 1630 C PHE A 188 54.638 34.080 33.095 1.00 21.39 CATOM 1631 O PHE A 188 54.394 35.126 33.626 1.00 23.90 OATOM 1632 CB PHE A 188 52.723 32.466 33.077 1.00 19.95 CATOM 1633 CG PHE A 188 51.389 32.215 32.435 1.00 22.28 CATOM 1634 CD1 PHE A 188 50.440 33.229 32.375 1.00 19.42 CATOM 1635 CD2 PHE A 188 51.144 31.038 31.734 1.00 23.82 CATOM 1636 CE1 PHE A 188 49.191 33.026 31.742 1.00 24.77 CATOM 1637 CE2 PHE A 188 49.936 30.826 31.057 1.00 20.17 CATOM 1638 CZ PHE A 188 48.945 31.815 31.068 1.00 23.14 CATOM 1639 N HIS A 189 55.831 33.513 33.118 1.00 24.15 NATOM 1640 CA HIS A 189 56.933 34.122 33.837 1.00 28.79 CATOM 1641 C HIS A 189 57.303 35.506 33.315 1.00 28.58 CATOM 1642 O HIS A 189 57.480 36.463 34.083 1.00 20.07 OATOM 1643 CB HIS A 189 58.148 33.268 33.641 1.00 31.38 CATOM 1644 CG HIS A 189 59.364 33.844 34.290 1.00 29.98 CATOM 1645 ND1 HIS A 189 59.548 33.833 35.658 1.00 31.00 NATOM 1646 CD2 HIS A 189 60.449 34.464 33.766 1.00 21.79 CATOM 1647 CE1 HIS A 189 60.722 34.371 35.945 1.00 24.04 CATOM 1648 NE2 HIS A 189 61.257 34.815 34.821 1.00 19.53 NATOM 1649 N GLU A 190 57.539 35.561 32.006 1.00 28.43 NATOM 1650 CA GLU A 190 57.876 36.816 31.324 1.00 27.72 CATOM 1651 C GLU A 190 56.725 37.829 31.437 1.00 32.56 CATOM 1652 O GLU A 190 56.949 38.995 31.717 1.00 27.06 OATOM 1653 CB GLU A 190 58.122 36.529 29.849 1.00 28.55 CATOM 1654 CG GLU A 190 59.150 35.461 29.614 1.00 35.29 CATOM 1655 CD GLU A 190 60.553 35.941 29.892 1.00 99.81 CATOM 1656 OE1 GLU A 190 60.913 36.037 31.085 1.00 86.56 OATOM 1657 OE2 GLU A 190 61.293 36.167 28.910 1.00100.00 OATOM 1658 N ALA A 191 55.493 37.391 31.196 1.00 32.67 NATOM 1659 CA ALA A 191 54.349 38.286 31.311 1.00 25.30 CATOM 1660 C ALA A 191 54.287 38.795 32.742 1.00 36.20 CATOM 1661 O ALA A 191 53.920 39.924 33.014 1.00 27.52 OATOM 1662 CB ALA A 191 53.055 37.563 31.000 1.00 16.48 CATOM 1663 N THR A 192 54.549 37.927 33.693 1.00 29.39 NATOM 1664 CA THR A 192 54.395 38.386 35.041 1.00 19.08 CATOM 1665 C THR A 192 55.420 39.494 35.298 1.00 44.78 CATOM 1666 O THR A 192 55.094 40.550 35.839 1.00 40.58 OATOM 1667 CB THR A 192 54.515 37.235 35.983 1.00 18.99 CATOM 1668 OG1 THR A 192 53.410 36.348 35.755 1.00 34.36 OATOM 1669 CG2 THR A 192 54.461 37.738 37.425 1.00 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57.45 OATOM 1706 OD2 ASP A 198 44.817 40.271 26.640 1.00 67.61 OATOM 1707 N VAL A 199 47.713 37.234 28.614 1.00 38.67 NATOM 1708 CA VAL A 199 48.499 36.226 27.901 1.00 27.79 CATOM 1709 C VAL A 199 47.462 35.469 27.065 1.00 25.88 CATOM 1710 O VAL A 199 46.460 35.023 27.598 1.00 24.22 OATOM 1711 CB VAL A 199 49.163 35.229 28.905 1.00 24.37 CATOM 1712 CG1 VAL A 199 49.874 34.047 28.160 1.00 20.28 CATOM 1713 CG2 VAL A 199 50.121 35.942 29.835 1.00 22.25 CATOM 1714 N VAL A 200 47.661 35.386 25.757 1.00 23.72 NATOM 1715 CA VAL A 200 46.701 34.694 24.903 1.00 23.99 CATOM 1716 C VAL A 200 47.167 33.286 24.499 1.00 22.85 CATOM 1717 O VAL A 200 48.321 33.108 24.166 1.00 29.77 OATOM 1718 CB VAL A 200 46.358 35.548 23.680 1.00 23.11 CATOM 1719 CG1 VAL A 200 45.561 34.737 22.598 1.00 16.25 CATOM 1720 CG2 VAL A 200 45.652 36.823 24.130 1.00 27.86 CATOM 1721 N VAL A 201 46.296 32.278 24.632 1.00 27.39 NATOM 1722 CA VAL A 201 46.588 30.893 24.265 1.00 9.63 CATOM 1723 C VAL A 201 45.653 30.529 23.165 1.00 19.63 CATOM 1724 O VAL A 201 44.452 30.755 23.312 1.00 17.61 OATOM 1725 CB VAL A 201 46.306 29.952 25.426 1.00 19.95 CATOM 1726 CG1 VAL A 201 46.703 28.519 25.054 1.00 20.85 CATOM 1727 CG2 VAL A 201 47.086 30.439 26.661 1.00 16.73 CATOM 1728 N TRP A 202 46.210 30.080 22.030 1.00 14.36 NATOM 1729 CA TRP A 202 45.422 29.693 20.865 1.00 18.97 CATOM 1730 C TRP A 202 44.495 28.572 21.313 1.00 36.22 CATOM 1731 O TRP A 202 44.934 27.694 22.057 1.00 31.46 OATOM 1732 CB TRP A 202 46.292 29.055 19.823 1.00 19.14 CATOM 1733 CG TRP A 202 47.243 29.894 19.066 1.00 33.65 CATOM 1734 CD1 TRP A 202 48.391 29.463 18.429 1.00 35.28 CATOM 1735 CD2 TRP A 202 47.126 31.282 18.772 1.00 39.90 CATOM 1736 NE1 TRP A 202 48.941 30.481 17.693 1.00 37.86 NATOM 1737 CE2 TRP A 202 48.228 31.624 17.922 1.00 38.35 CATOM 1738 CE3 TRP A 202 46.206 32.281 19.138 1.00 39.39 CATOM 1739 CZ2 TRP A 202 48.380 32.884 17.367 1.00 36.15 CATOM 1740 CZ3 TRP A 202 46.356 33.542 18.578 1.00 39.60 CATOM 1741 CH2 TRP A 202 47.428 33.828 17.684 1.00 40.99 CATOM 1742 N GLY A 203 43.245 28.564 20.842 1.00 25.59 NATOM 1743 CA GLY A 203 42.332 27.483 21.169 1.00 13.09 CATOM 1744 C GLY A 203 41.260 27.813 22.193 1.00 21.12 CATOM 1745 O GLY A 203 41.340 28.815 22.886 1.00 22.86 OATOM 1746 N SER A 204 40.270 26.919 22.262 1.00 16.88 NATOM 1747 CA SER A 204 39.163 26.979 23.192 1.00 18.36 CATOM 1748 C SER A 204 39.561 26.664 24.659 1.00 22.07 CATOM 1749 O SER A 204 38.888 27.096 25.604 1.00 34.39 OATOM 1750 CB SER A 204 38.053 25.998 22.740 1.00 9.99 CATOM 1751 OG SER A 204 38.237 24.695 23.291 1.00 16.37 OATOM 1752 N GLY A 205 40.562 25.813 24.854 1.00 12.42 NATOM 1753 CA GLY A 205 40.963 25.411 26.208 1.00 11.64 CATOM 1754 C GLY A 205 40.208 24.178 26.711 1.00 19.49 CATOM 1755 O GLY A 205 40.422 23.723 27.838 1.00 13.59 OATOM 1756 N THR A 206 39.292 23.683 25.881 1.00 15.38 NATOM 1757 CA THR A 206 38.432 22.594 26.281 1.00 10.80 CATOM 1758 C THR A 206 39.056 21.221 26.154 1.00 26.39 CATOM 1759 O THR A 206 38.564 20.267 26.737 1.00 23.28 OATOM 1760 CB THR A 206 37.124 22.562 25.460 1.00 12.86 CATOM 1761 OG1 THR A 206 37.438 22.395 24.082 1.00 13.12 OATOM 1762 CG2 THR A 206 36.348 23.840 25.620 1.00 10.62 CATOM 1763 N PRO A 207 40.101 21.083 25.354 1.00 21.10 NATOM 1764 CA PRO A 207 40.658 19.743 25.175 1.00 18.15 CATOM 1765 C PRO A 207 41.316 19.181 26.423 1.00 21.75 CATOM 1766 O PRO A 207 41.951 19.925 27.215 1.00 20.65 OATOM 1767 CB PRO A 207 41.638 19.909 24.013 1.00 17.51 CATOM 1768 CG PRO A 207 41.146 21.213 23.307 1.00 21.45 CATOM 1769 CD PRO A 207 40.698 22.062 24.431 1.00 23.44 CATOM 1770 N MET A 208 41.112 17.876 26.624 1.00 15.60 NATOM 1771 CA MET A 208 41.694 17.167 27.775 1.00 22.94 CATOM 1772 C MET A 208 43.058 16.427 27.579 1.00 21.90 CATOM 1773 O MET A 208 43.248 15.677 26.633 1.00 23.16 OATOM 1774 CB MET A 208 40.645 16.273 28.386 1.00 32.86 CATOM 1775 CG MET A 208 39.630 17.057 29.223 1.00 46.17 CATOM 1776 SD MET A 208 38.301 15.990 29.826 1.00 57.85 SATOM 1777 CE MET A 208 37.999 15.028 28.343 1.00 58.23 CATOM 1778 N ARG A 209 44.022 16.681 28.456 1.00 17.75 NATOM 1779 CA ARG A 209 45.318 16.042 28.324 1.00 19.88 CATOM 1780 C ARG A 209 45.871 15.534 29.639 1.00 16.92 CATOM 1781 O ARG A 209 45.433 15.946 30.697 1.00 16.58 OATOM 1782 CB ARG A 209 46.340 16.963 27.658 1.00 21.07 CATOM 1783 CG ARG A 209 45.980 17.478 26.275 1.00 22.57 CATOM 1784 CD ARG A 209 45.833 16.357 25.282 1.00 28.26 CATOM 1785 NE ARG A 209 45.586 16.819 23.906 1.00 23.15 NATOM 1786 CZ ARG A 209 44.420 16.742 23.267 1.00 34.52 CATOM 1787 NH1 ARG A 209 43.336 16.267 23.890 1.00 18.03 NATOM 1788 NH2 ARG A 209 44.339 17.175 22.012 1.00 29.78 NATOM 1789 N GLU A 210 46.878 14.675 29.547 1.00 20.87 NATOM 1790 CA GLU A 210 47.530 14.079 30.720 1.00 17.37 CATOM 1791 C GLU A 210 49.031 14.490 30.851 1.00 20.96 CATOM 1792 O GLU A 210 49.748 14.622 29.841 1.00 22.44 OATOM 1793 CB GLU A 210 47.400 12.562 30.571 1.00 16.26 CATOM 1794 CG GLU A 210 47.807 11.785 31.809 1.00 19.91 CATOM 1795 CD GLU A 210 48.057 10.304 31.531 1.00 27.81 CATOM 1796 OE1 GLU A 210 48.111 9.919 30.343 1.00 17.29 OATOM 1797 OR2 GLU A 210 48.268 9.540 32.494 1.00 21.63 OATOM 1798 N PHE A 211 49.504 14.712 32.084 1.00 14.02 NATOM 1799 CA PHE A 211 50.887 15.159 32.353 1.00 17.48 CATOM 1800 C PHE A 211 51.458 14.414 33.531 1.00 33.62 CATOM 1801 O PHE A 211 50.716 14.031 34.443 1.00 27.96 OATOM 1802 CB PHE A 211 50.933 16.677 32.644 1.00 17.78 CATOM 1803 CG PHE A 211 50.303 17.490 31.541 1.00 21.49 CATOM 1804 CD1 PHE A 211 51.009 17.676 30.320 1.00 17.36 CATOM 1805 CD2 PHE A 211 48.933 17.844 31.618 1.00 15.09 CATOM 1806 CE1 PHE A 211 50.399 18.334 29.237 1.00 16.37 CATOM 1807 CE2 PHE A 211 48.288 18.491 30.533 1.00 9.61 CATOM 1808 CZ PHE A 211 49.053 18.756 29.344 1.00 12.71 CATOM 1809 N LEU A 212 52.761 14.161 33.495 1.00 23.76 NATOM 1810 CA LEU A 212 53.405 13.448 34.603 1.00 21.24 CATOM 1811 C LEU A 212 54.772 14.053 34.898 1.00 14.00 CATOM 1812 O LEU A 212 55.519 14.398 33.985 1.00 13.99 OATOM 1813 CB LEU A 212 53.548 11.954 34.294 1.00 21.52 CATOM 1814 CG LEU A 212 54.033 11.039 35.406 1.00 21.09 CATOM 1815 CD1 LEU A 212 52.866 10.634 36.280 1.00 20.84 CATOM 1816 CD2 LEU A 212 54.768 9.829 34.832 1.00 13.18 CATOM 1817 N HIS A 213 55.023 14.302 36.175 1.00 9.60 NATOM 1818 CA HIS A 213 56.290 14.864 36.555 1.00 13.66 CATOM 1819 C HIS A 213 57.380 13.828 36.293 1.00 20.37 CATOM 1820 O MIS A 213 57.238 12.614 36.542 1.00 16.08 OATOM 1821 CB HIS A 213 56.280 15.250 38.002 1.00 18.72 CATOM 1822 CG HIS A 213 57.491 16.017 38.408 1.00 21.22 CATOM 1823 ND1 HIS A 213 58.703 15.406 38.656 1.00 24.29 NATOM 1824 CD2 HIS A 213 57.716 17.353 38.499 1.00 23.67 CATOM 1825 CE1 HIS A 213 59.615 16.331 38.917 1.00 19.13 CATOM 1826 NE2 HIS A 213 59.041 17.523 38.847 1.00 21.99 NATOM 1827 N VAL A 214 58.459 14.295 35.698 1.00 21.07 NATOM 1828 CA VAL A 214 59.532 13.383 35.361 1.00 19.23 CATOM 1829 C VAL A 214 60.067 12.523 36.551 1.00 27.20 CATOM 1830 O VAL A 214 60.604 11.444 36.359 1.00 22.23 OATOM 1831 CB VAL A 214 60.625 14.125 34.566 1.00 11.84 CATOM 1832 CG1 VAL A 214 61.390 15.199 35.485 1.00 8.52 CATOM 1833 CG2 VAL A 214 61.560 13.097 33.902 1.00 12.39 CATOM 1834 N ASP A 215 59.893 12.984 37.790 1.00 25.29 NATOM 1835 CA ASP A 215 60.406 12.228 38.936 1.00 18.19 CATOM 1836 C ASP A 215 59.530 11.023 39.230 1.00 13.85 CATOM 1837 O ASP A 215 59.988 9.981 39.666 1.00 17.44 OATOM 1838 CB ASP A 215 60.575 13.129 40.155 1.00 16.27 CATOM 1839 CG ASP A 215 61.859 13.979 40.068 1.00 30.73 CATOM 1840 OD1 ASP A 215 62.782 13.614 39.308 1.00 23.02 OATOM 1841 OD2 ASP A 215 61.957 15.029 40.730 1.00 26.00 OATOM 1842 N ASP A 216 58.276 11.136 38.863 1.00 20.08 NATOM 1843 CA ASP A 216 57.378 10.017 39.016 1.00 18.78 CATOM 1844 C ASP A 216 57.761 9.083 37.894 1.00 23.56 CATOM 1845 O ASP A 216 57.715 7.880 38.026 1.00 20.79 OATOM 1846 CB ASP A 216 55.912 10.457 38.821 1.00 17.18 CATOM 1847 CG ASP A 216 55.193 10.757 40.162 1.00 38.03 CATOM 1848 OD1 ASP A 216 55.503 10.119 41.223 1.00 26.02 OATOM 1849 OD2 ASP A 216 54.249 11.587 40.124 1.00 25.41 OATOM 1850 N MET A 217 58.092 9.653 36.755 1.00 18.11 NATOM 1851 CA MET A 217 58.394 8.785 35.636 1.00 22.41 CATOM 1852 C MET A 217 59.572 7.942 35.992 1.00 27.54 CATOM 1853 O MET A 217 59.579 6.752 35.710 1.00 20.86 OATOM 1854 CB MET A 217 58.637 9.592 34.345 1.00 21.24 CATOM 1855 CG MET A 217 59.478 8.918 33.287 1.00 16.37 CATOM 1856 SD MET A 217 58.962 7.412 32.473 1.00 30.51 SATOM 1857 CE MET A 217 57.465 7.608 32.391 1.00 19.57 CATOM 1858 N ALA A 218 60.561 8.562 36.623 1.00 19.09 NATOM 1859 CA ALA A 218 61.774 7.841 37.002 1.00 13.65 CATOM 1860 C ALA A 218 61.436 6.778 38.028 1.00 22.61 CATOM 1861 O ALA A 218 61.934 5.670 37.967 1.00 19.36 OATOM 1862 CB ALA A 218 62.809 8.780 37.579 1.00 12.23 CATOM 1863 N ALA A 219 60.605 7.109 39.000 1.00 19.34 NATOM 1864 CA ALA A 219 60.310 6.105 40.023 1.00 18.01 CATOM 1865 C ALA A 219 59.630 4.901 39.413 1.00 23.57 CATOM 1866 O ALA A 219 59.781 3.777 39.898 1.00 22.71 OATOM 1867 CB ALA A 219 59.387 6.678 41.083 1.00 10.11 CATOM 1868 N ALA A 220 58.753 5.174 38.454 1.00 18.99 NATOM 1869 CA ALA A 220 57.905 4.158 37.855 1.00 14.12 CATOM 1870 C ALA A 220 58.753 3.213 37.034 1.00 25.33 CATOM 1871 O ALA A 220 58.584 2.006 37.114 1.00 20.63 OATOM 1872 CB ALA A 220 56.796 4.798 37.023 1.00 8.53 CATOM 1873 N SER A 221 59.770 3.772 36.379 1.00 23.92 NATOM 1874 CA SER A 221 60.702 3.011 35.556 1.00 18.38 CATOM 1875 C SER A 221 61.537 1.989 36.353 1.00 20.90 CATOM 1876 O SER A 221 61.683 0.799 35.983 1.00 19.84 OATOM 1877 CB SER A 221 61.604 3.985 34.804 1.00 10.67 CATOM 1878 OG SER A 221 60.847 4.744 33.867 1.00 15.61 OATOM 1879 N ILE A 222 62.083 2.476 37.463 1.00 18.12 NATOM 1880 CA ILE A 222 62.866 1.644 38.381 1.00 21.56 CATOM 1881 C ILE A 222 62.020 0.554 39.068 1.00 29.10 CATOM 1882 O ILE A 222 62.504 -0.566 39.307 1.00 19.03 OATOM 1883 CB ILE A 222 63.467 2.516 39.432 1.00 24.56 CATOM 1884 CG1 ILE A 222 64.465 3.473 38.765 1.00 32.13 CATOM 1885 CG2 ILE A 222 64.129 1.671 40.500 1.00 28.26 CATOM 1886 CD1 ILE A 222 64.973 4.585 39.649 1.00 15.61 CATOM 1887 N HIS A 223 60.772 0.907 39.384 1.00 19.34 NATOM 1888 CA HIS A 223 59.829 -0.031 39.996 1.00 20.46 CATOM 1889 C HIS A 223 59.599 -1.097 38.964 1.00 24.82 CATOM 1890 O HIS A 223 59.723 -2.283 39.270 1.00 24.66 OATOM 1891 CB HIS A 223 58.465 0.637 40.359 1.00 19.53 CATOM 1892 CG HIS A 223 57.373 -0.333 40.759 1.00 28.64 CATOM 1893 ND1 HIS A 223 57.021 -0.564 42.082 1.00 24.16 NATOM 1894 CD2 HIS A 223 56.497 -1.062 40.004 1.00 30.39 CATOM 1895 CE1 HIS A 223 55.983 -1.399 42.112 1.00 30.39 CATOM 1896 NE2 HIS A 223 55.652 -1.727 40.869 1.00 28.13 NATOM 1897 N VAL A 224 59.354 -0.684 37.725 1.00 22.06 NATOM 1898 CA VAL A 224 59.111 -1.657 36.652 1.00 19.15 CATOM 1899 C VAL A 224 60.350 -2.490 36.333 1.00 25.89 CATOM 1900 O VAL A 224 60.282 -3.709 36.250 1.00 22.37 OATOM 1901 CB VAL A 224 58.559 -1.022 35.377 1.00 22.59 CATOM 1902 CG1 VAL A 224 58.512 -2.050 34.231 1.00 22.61 CATOM 1903 CG2 VAL A 224 57.161 -0.491 35.650 1.00 23.44 CATOM 1904 N MET A 225 61.499 -1.838 36.255 1.00 27.83 NATOM 1905 CA MET A 225 62.710 -2.577 36.004 1.00 23.69 CATOM 1906 C MET A 225 62.896 -3.678 37.071 1.00 31.95 CATOM 1907 O MET A 225 63.290 -4.805 36.785 1.00 24.33 OATOM 1908 CB MET A 225 63.902 -1.604 36.056 1.00 21.34 CATOM 1909 CG MET A 225 65.295 -2.296 35.999 1.00 17.83 CATOM 1910 SD MET A 225 65.750 -2.958 34.306 1.00 23.33 SATOM 1911 CE MET A 225 67.080 -1.896 33.785 1.00 16.46 CATOM 1912 N GLU A 226 62.644 -3.319 38.316 1.00 19.54 NATOM 1913 CA GLU A 226 62.988 -4.161 39.428 1.00 21.58 CATOM 1914 C GLU A 226 61.999 -5.200 39.918 1.00 30.77 CATOM 1915 O GLU A 226 62.308 -6.012 40.780 1.00 29.39 OATOM 1916 CB GLU A 226 63.613 -3.323 40.547 1.00 20.47 CATOM 1917 CG GLU A 226 64.937 -2.673 40.122 1.00 23.03 CATOM 1918 CD GLU A 226 65.504 -1.809 41.208 1.00 32.62 CATOM 1919 OE1 GLU A 226 64.721 -1.455 42.122 1.00 26.12 OATOM 1920 OE2 GLU A 226 66.711 -1.479 41.152 1.00 17.67 OATOM 1921 N LEU A 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1939 CG HIS A 229 61.284 -12.701 34.220 1.00 27.24 CATOM 1940 ND1 HIS A 229 61.060 -11.650 33.350 1.00 34.38 NATOM 1941 CD2 HIS A 229 61.292 -13.821 33.465 1.00 31.45 CATOM 1942 CE1 HIS A 229 60.992 -12.113 32.115 1.00 30.50 CATOM 1943 NE2 HIS A 229 61.124 -13.427 32.159 1.00 35.23 NATOM 1944 N GLU A 230 58.681 -13.161 37.140 1.00 20.24 NATOM 1945 CA GLU A 230 57.425 -13.895 37.209 1.00 29.41 CATOM 1946 C GLU A 230 56.181 -13.051 37.341 1.00 22.20 CATOM 1947 O GLU A 230 55.159 -13.359 36.679 1.00 17.78 OATOM 1948 CB GLU A 230 57.464 -14.997 38.274 1.00 38.51 CATOM 1949 CG GLU A 230 58.085 -14.582 39.567 1.00 63.09 CATOM 1950 CD GLU A 230 57.036 -14.473 40.661 1.00100.00 CATOM 1951 OE1 GLU A 230 55.859 -14.872 40.400 1.00100.00 OATOM 1952 OE2 GLU A 230 57.409 -14.003 41.768 1.00 81.48 OATOM 1953 N VAL A 231 56.272 -12.004 38.182 1.00 16.53 NATOM 1954 CA VAL A 231 55.202 -11.029 38.356 1.00 20.23 CATOM 1955 C VAL A 231 55.009 -10.164 37.102 1.00 24.45 CATOM 1956 O VAL A 231 53.864 -9.834 36.705 1.00 21.00 OATOM 1957 CB VAL A 231 55.541 -10.057 39.426 1.00 28.61 CATOM 1958 CG1 VAL A 231 54.362 -9.098 39.610 1.00 29.78 CATOM 1959 CG2 VAL A 231 55.881 -10.757 40.677 1.00 28.96 CATOM 1960 N TRP A 232 56.133 -9.798 36.486 1.00 17.17 NATOM 1961 CA TRP A 232 56.052 -9.044 35.262 1.00 21.52 CATOM 1962 C TRP A 232 55.388 -9.844 34.156 1.00 20.53 CATOM 1963 O TRP A 232 54.588 -9.306 33.380 1.00 24.31 OATOM 1964 CB TRP A 232 57.438 -8.644 34.801 1.00 29.88 CATOM 1965 CG TRP A 232 57.430 -7.843 33.500 1.00 27.65 CATOM 1966 CD1 TRP A 232 57.184 -6.464 33.356 1.00 25.42 CATOM 1967 CD2 TRP A 232 57.714 -8.336 32.169 1.00 27.75 CATOM 1968 NE1 TRP A 232 57.325 -6.095 32.033 1.00 22.53 NATOM 1969 CE2 TRP A 232 57.655 -7.203 31.279 1.00 25.11 CATOM 1970 CE3 TRP A 232 58.037 -9.603 31.640 1.00 22.72 CATOM 1971 CZ2 TRP A 232 57.917 -7.316 29.879 1.00 17.23 CATOM 1972 CZ3 TRP A 232 58.238 -9.720 30.223 1.00 25.97 CATOM 1973 CH2 TRP A 232 58.154 -8.581 29.368 1.00 22.07 CATOM 1974 N LEU A 233 55.749 -11.121 34.018 1.00 23.80 NATOM 1975 CA LEU A 233 55.141 -11.949 32.937 1.00 24.78 CATOM 1976 C LEU A 233 53.652 -12.118 33.122 1.00 24.51 CATOM 1977 O LEU A 233 52.865 -12.075 32.163 1.00 28.50 OATOM 1978 CB LEU A 233 55.765 -13.348 32.820 1.00 26.20 CATOM 1979 CG LEU A 233 57.250 -13.505 32.503 1.00 19.39 CATOM 1980 CD1 LEU A 233 57.745 -14.850 33.023 1.00 19.90 CATOM 1981 CD2 LEU A 233 57.561 -13.287 31.017 1.00 16.01 CATOM 1982 N GLU A 234 53.298 -12.343 34.372 1.00 25.45 NATOM 1983 CA GLU A 234 51.929 -12.523 34.822 1.00 30.04 CATOM 1984 C GLU A 234 51.128 -11.319 34.367 1.00 35.69 CATOM 1985 O GLU A 234 49.926 -11.390 34.052 1.00 28.25 OATOM 1986 CB GLU A 234 52.007 -12.468 36.344 1.00 37.30 CATOM 1987 CG GLU A 234 50.908 -13.133 37.118 1.00 45.39 CATOM 1988 CD GLU A 234 51.112 -12.881 38.601 1.00100.00 CATOM 1989 OE1 GLU A 234 52.240 -13.137 39.104 1.00 99.09 OATOM 1990 OE2 GLU A 234 50.211 -12.257 39.211 1.00100.00 OATOM 1991 N ASN A 235 51.802 -10.184 34.364 1.00 25.04 NATOM 1992 CA ASN A 235 51.109 -8.986 33.992 1.00 26.17 CATOM 1993 C ASN A 235 51.280 -8.494 32.571 1.00 30.46 CATOM 1994 O ASN A 235 50.824 -7.393 32.259 1.00 22.90 OATOM 1995 CB ASN A 235 51.427 -7.895 34.981 1.00 29.23 CATOM 1996 CG ASN A 235 50.878 -8.197 36.342 1.00 39.27 CATOM 1997 OD1 ASN A 235 49.722 -7.882 36.628 1.00 29.06 OATOM 1998 ND2 ASN A 235 51.653 -8.934 37.140 1.00 40.22 NATOM 1999 N THR A 236 51.935 -9.268 31.708 1.00 20.97 NATOM 2000 CA THR A 236 52.108 -8.795 30.344 1.00 22.30 CATOM 2001 C THR A 236 51.867 -9.943 29.419 1.00 29.74 CATOM 2002 O THR A 236 51.551 -11.033 29.895 1.00 21.23 OATOM 2003 CB THR A 236 53.545 -8.306 30.161 1.00 22.73 CATOM 2004 OG1 THR A 236 54.422 -9.325 30.636 1.00 21.23 OATOM 2005 CG2 THR A 236 53.801 -7.048 31.041 1.00 19.69 CATOM 2006 N GLN A 237 52.003 -9.699 28.109 1.00 22.23 NATOM 2007 CA GLN A 237 52.097 -10.783 27.122 1.00 16.69 CATOM 2008 C GLN A 237 53.335 -10.507 26.331 1.00 21.02 CATOM 2009 O GLN A 237 53.729 -9.362 26.204 1.00 22.19 OATOM 2010 CB GLN A 237 50.913 -10.999 26.189 1.00 8.23 CATOM 2011 CG GLN A 237 49.639 -11.096 26.904 1.00 21.04 CATOM 2012 CD GLN A 237 48.907 -9.862 26.606 1.00 62.07 CATOM 2013 OE1 GLN A 237 48.437 -9.712 25.460 1.00 59.32 OATOM 2014 NE2 GLN A 237 49.220 -8.847 27.388 1.00 37.82 NATOM 2015 N PRO A 238 54.002 -11.579 25.917 1.00 28.76 NATOM 2016 CA PRO A 238 55.275 -11.438 25.246 1.00 30.28 CATOM 2017 C PRO A 238 55.194 -10.643 23.958 1.00 29.08 CATOM 2018 O PRO A 238 56.181 -10.029 23.600 1.00 19.95 OATOM 2019 CB PRO A 238 55.733 -12.879 25.011 1.00 22.54 CATOM 2020 CG PRO A 238 54.898 -13.710 25.886 1.00 16.92 CATOM 2021 CD PRO A 238 53.626 -12.998 26.068 1.00 11.75 CATOM 2022 N MET A 239 54.041 -10.635 23.286 1.00 17.26 NATOM 2023 CA MET A 239 53.924 -9.807 22.104 1.00 17.85 CATOM 2024 C MET A 239 53.109 -8.509 22.362 1.00 18.63 CATOM 2025 O MET A 239 52.792 -7.741 21.419 1.00 16.82 OATOM 2026 CB MET A 239 53.460 -10.588 20.881 1.00 15.22 CATOM 2027 CG MET A 239 54.536 -11.534 20.261 1.00 12.90 CATOM 2028 SD MET A 239 53.994 -12.534 18.808 1.00 17.49 SATOM 2029 CE MET A 239 54.350 -11.357 17.422 1.00 13.12 CATOM 2030 N LEU A 240 52.847 -8.252 23.646 1.00 18.55 NATOM 2031 CA LEU A 240 52.159 -7.037 24.131 1.00 16.68 CATOM 2032 C LEU A 240 52.774 -6.733 25.493 1.00 11.82 CATOM 2033 O LEU A 240 52.124 -6.803 26.549 1.00 13.84 OATOM 2034 CB LEU A 240 50.645 -7.249 24.240 1.00 16.91 CATOM 2035 CG LEU A 240 49.646 -6.120 23.852 1.00 22.29 CATOM 2036 CD1 LEU A 240 48.968 -5.488 25.033 1.00 25.51 CATOM 2037 CD2 LEU A 240 50.070 -5.059 22.815 1.00 28.07 CATOM 2038 N SER A 241 54.076 -6.467 25.456 1.00 13.09 NATOM 2039 CA SER A 241 54.842 -6.315 26.682 1.00 24.20 CATOM 2040 C SER A 241 54.947 -4.938 27.377 1.00 30 52 CATOM 2041 O SER A 241 55.363 -4.854 28.547 1.00 17.02 OATOM 2042 CB SER A 241 56.247 -6.900 26.495 1.00 14.04 CATOM 2043 OG SER A 241 57.062 -6.144 25.598 1.00 13.95 OATOM 2044 N HIS A 242 54.661 -3.861 26.659 1.00 17.87 NATOM 2045 CA HIS A 242 54.894 -2.548 27.221 1.00 13.55 CATOM 2046 C HIS A 242 53.990 -2.254 28.373 1.00 13.70 CATOM 2047 O HIS A 242 52.974 -2.885 28.539 1.00 13.29 OATOM 2048 CB HIS A 242 54.826 -1.430 26.130 1.00 16.05 CATOM 2049 CG HIS A 242 53.595 -1.504 25.272 1.00 18.88 CATOM 2050 ND1 HIS A 242 52.591 -0.553 25.326 1.00 23.24 NATOM 2051 CD2 HIS A 242 53.165 -2.461 24.413 1.00 13.19 CATOM 2052 CE1 HIS A 242 51.629 -0.887 24.483 1.00 17.44 CATOM 2053 NE2 HIS A 242 51.962 -2.031 23.901 1.00 19.54 NATOM 2054 N ILE A 243 54.310 -1.203 29.095 1.00 15.84 NATOM 2055 CA ILE A 243 53.492 -0.809 30.192 1.00 19.10 CATOM 2056 C ILE A 243 53.336 0.714 30.191 1.00 23.23 CATOM 2057 O ILE A 243 54.312 1.406 30.385 1.00 12.10 OATOM 2058 CB ILE A 243 54.166 -1.273 31.482 1.00 24.62 CATOM 2059 CG1 ILE A 243 54.014 -2.783 31.576 1.00 25.60 CATOM 2060 CG2 ILE A 243 53.497 -0.665 32.735 1.00 17.37 CATOM 2061 CD1 ILE A 243 54.725 -3.365 32.714 1.00 14.82 CATOM 2062 N ASN A 244 52.112 1.217 .30.013 1.00 16.43 NATOM 2063 CA ASN A 244 51.824 2.689 30.038 1.00 18.99 CATOM 2064 C ASN A 244 52.252 3.292 31.348 1.00 18.83 CATOM 2065 O ASN A 244 51.965 2.727 32.405 1.00 19.58 OATOM 2066 CB ASN A 244 50.304 2.987 29.910 1.00 15.67 CATOM 2067 CG ASN A 244 49.768 2.702 28.517 1.00 14.57 CATOM 2068 OD1 ASN A 244 50.546 2.583 27.580 1.00 13.64 OATOM 2069 ND2 ASN A 244 48.443 2.491 28.393 1.00 10.16 NATOM 2070 N VAL A 245 52.800 4.499 31.326 1.00 13.50 NATOM 2071 CA VAL A 245 53.159 5.134 32.602 1.00 13.49 CATOM 2072 C VAL A 245 52.528 6.566 32.644 1.00 16.25 CATOM 2073 O VAL A 245 52.786 7.405 31.770 1.00 15.20 OATOM 2074 CB VAL A 245 54.754 5.163 32.810 1.00 21.07 CATOM 2075 CG1 VAL A 245 55.154 6.085 33.937 1.00 15.08 CATOM 2076 CG2 VAL A 245 55.280 3.817 33.143 1.00 15.82 CATOM 2077 N GLY A 246 51.696 6.843 33.649 1.00 14.03 NATOM 2078 CA GLY A 246 51.027 8.136 33.707 1.00 16.87 CATOM 2079 C GLY A 246 50.146 8.203 34.939 1.00 26.95 CATOM 2080 O GLY A 246 50.323 7.401 35.850 1.00 23.04 OATOM 2081 N THR A 247 49.207 9.161 34.963 1.00 21.44 NATOM 2082 CA THR A 247 48.232 9.276 36.063 1.00 21.39 CATOM 2083 C THR A 247 46.868 8.677 35.673 1.00 24.08 CATOM 2084 O THR A 247 46.069 8.306 36.508 1.00 21 03 OATOM 2085 CB THR A 247 47.988 10.730 36.404 1.00 22.24 CATOM 2086 OG1 THR A 247 47.409 11.389 35.265 1.00 18.62 OATOM 2087 CG2 THR A 247 49.275 11.378 36.724 1.00 18.99 CATOM 2088 N GLY A 248 46.583 8.651 34.384 1.00 24.95 NATOM 2089 CA GLY A 248 45.319 8.143 33.924 1.00 22.61 CATOM 2090 C GLY A 248 44.223 9.160 34.226 1.00 21.42 CATOM 2091 O GLY A 248 43.059 8.866 34.137 1.00 25.70 OATOM 2092 N VAL A 249 44.615 10.386 34.521 1.00 30.72 NATOM 2093 CA VAL A 249 43.673 11.464 34.827 1.00 26.09 CATOM 2094 C VAL A 249 43.747 12.596 33.786 1.00 32.70 CATOM 2095 O VAL A 249 44.853 13.006 33.387 1.00 26.92 OATOM 2096 CB VAL A 249 44.020 12.085 36.214 1.00 38.59 CATOM 2097 CG1 VAL A 249 43.225 13.324 36.470 1.00 36.11 CATOM 2098 CG2 VAL A 249 43.782 11.083 37.306 1.00 41.30 CATOM 2099 N ASP A 250 42.581 13.125 33.397 1.00 27.95 NATOM 2100 CA ASP A 250 42.488 14.232 32.439 1.00 20.64 CATOM 2101 C ASP A 250 42.611 15.581 33.155 1.00 27.63 CATOM 2102 O ASP A 250 42.188 15.783 34.308 1.00 26.23 OATOM 2103 CB ASP A 250 41.075 14.302 31.827 1.00 23.89 CATOM 2104 CG ASP A 250 40.768 13.180 30.850 1.00 39.52 CATOM 2105 OD1 ASP A 250 41.283 13.184 29.688 1.00 39.96 OATOM 2106 OD2 ASP A 250 39.767 12.501 31.153 1.00 45.34 OATOM 2107 N CYS A 251 43.029 16.566 32.388 1.00 20.12 NATOM 2108 CA CYS A 251 42.962 17.906 32.851 1.00 27.20 CATOM 2109 C CYS A 251 42.918 18.779 31.577 1.00 26.47 CATOM 2110 O CYS A 251 43.699 18.560 30.633 1.00 19.45 OATOM 2111 CB CYS A 251 44.148 18.157 33.778 1.00 34.86 CATOM 2112 SG CYS A 251 45.129 19.619 33.453 1.00 29.47 SATOM 2113 N THR A 252 41.932 19.673 31.494 1.00 14.85 NATOM 2114 CA THR A 252 41.834 20.588 30.335 1.00 21.21 CATOM 2115 C THR A 252 42.999 21.592 30.236 1.00 20.53 CATOM 2116 O THR A 252 43.657 21.926 31.249 1.00 15.24 OATOM 2117 CB THR A 252 40.506 21.407 30.329 1.00 32.08 CATOM 2118 OG1 THR A 252 40.460 22.304 31.447 1.00 19.26 OATOM 2119 CG2 THR A 252 39.309 20.495 30.372 1.00 13.91 CATOM 2120 N ILE A 253 43.228 22.095 29.024 1.00 14.81 NATOM 2121 CA ILE A 253 44.264 23.118 28.812 1.00 16.90 CATOM 2122 C ILE A 253 43.934 24.383 29.627 1.00 23.41 CATOM 2123 O ILE A 253 44.834 25.012 30.247 1.00 15.27 OATOM 2124 CB ILE A 253 44.404 23.452 27.302 1.00 24.05 CATOM 2125 CG1 ILE A 253 44.862 22.200 26.561 1.00 27.33 CATOM 2126 CG2 ILE A 253 45.473 24.479 27.077 1.00 9.22 CATOM 2127 CD1 ILE A 253 45.662 21.276 27.452 1.00 49.56 CATOM 2128 N ARG A 254 42.637 24.709 29.707 1.00 19.56 NATOM 2129 CA ARG A 254 42.228 25.865 30.522 1.00 19.41 CATOM 2130 C ARG A 254 42.712 25.713 31.970 1.00 18.10 CATOM 2131 O ARG A 254 43.311 26.616 32.515 1.00 13.89 OATOM 2132 CB ARG A 254 40.704 26.101 30.480 1.00 15.98 CATOM 2133 CG ARG A 254 40.282 27.378 31.255 1.00 9.96 CATOM 2134 CD ARG A 254 38.809 27.702 31.218 1.00 24.79 CATOM 2135 NE ARG A 254 38.498 28.414 29.997 1.00 29.42 NATOM 2136 CZ ARG A 254 38.693 29.723 29.794 1.00 59.85 CATOM 2137 NH1 ARG A 254 39.194 30.527 30.732 1.00 42.58 NATOM 2138 NH2 ARG A 254 38.377 30.245 28.620 1.00 18.44 NATOM 2139 N ASP A 255 42.406 24.564 32.586 1.00 20.22 NATOM 2140 CA ASP A 255 42.795 24.205 33.974 1.00 16.48 CATOM 2141 C ASP A 255 44.321 24.372 34.069 1.00 22.43 CATOM 2142 O ASP A 255 44.868 24.897 35.060 1.00 18.53 OATOM 2143 CB ASP A 255 42.478 22.686 34.157 1.00 19.17 CATOM 2144 CG ASP A 255 42.144 22.246 35.610 1.00 47.08 CATOM 2145 OD1 ASP A 255 41.780 23.090 36.429 1.00 49.66 OATOM 2146 OD2 ASP A 255 42.020 21.016 35.880 1.00 48.12 OATOM 2147 N LEU A 256 45.014 23.809 33.078 1.00 15.98 NATOM 2148 CA LEU A 256 46.465 23.844 33.069 1.00 21.76 CATOM 2149 C LEU A 256 47.020 25.275 33.076 1.00 16.79 CATOM 2150 O LEU A 256 47.825 25.697 33.946 1.00 15.24 OATOM 2151 CB LEU A 256 46.967 23.056 31.859 1.00 23.33 CATOM 2152 CG LEU A 256 48.491 23.100 31.765 1.00 26.80 CATOM 2153 CD1 LEU A 256 49.171 22.334 32.984 1.00 17.13 CATOM 2154 CD2 LEU A 256 49.040 22.724 30.346 1.00 15.42 CATOM 2155 N ALA A 257 46.520 26.048 32.140 1.00 13.77 NATOM 2156 CA ALA A 257 46.938 27.436 32.025 1.00 12.70 CATOM 2157 C ALA A 257 46.656 28.237 33.267 1.00 10.73 CATOM 2158 O ALA A 257 47.451 29.073 33.672 1.00 20.33 OATOM 2159 CB ALA A 257 46.208 28.073 30.834 1.00 13.34 CATOM 2160 N GLN A 258 45.470 28.080 33.835 1.00 12.40 NATOM 2161 CA GLN A 258 45.102 28.911 34.981 1.00 8.39 CATOM 2162 C GLN A 258 45.879 28.480 36.166 1.00 13.48 CATOM 2163 O GLN A 258 46.178 29.281 37.029 1.00 22.96 OATOM 2164 CB GLN A 258 43.614 28.761 35.305 1.00 16.12 CATOM 2165 CG GLN A 258 42.674 29.096 34.130 1.00 30.19 CATOM 2166 CD GLN A 258 42.574 30.585 33.781 1.00 37.29 CATOM 2167 OE1 GLN A 258 42.911 31.471 34.610 1.00 21.24 OATOM 2168 NE2 GLN A 258 42.021 30.876 32.572 1.00 15.94 NATOM 2169 N THR A 259 46.179 27.182 36.232 1.00 16.21 NATOM 2170 CA THR A 259 46.982 26.678 37.336 1.00 16.85 CATOM 2171 C THR A 259 48.410 27.186 37.233 1.00 20.56 CATOM 2172 O THR A 259 49.002 27.621 38.214 1.00 21.44 OATOM 2173 CB THR A 259 47.066 25.192 37.361 1.00 27.56 CATOM 2174 OG1 THR A 259 45.752 24.620 37.509 1.00 20.92 OATOM 2175 CG2 THR A 259 47.936 24.796 38.545 1.00 12.85 CATOM 2176 N ILE A 260 48.952 27.170 36.028 1.00 19.96 NATOM 2177 CA ILE A 260 50.292 27.704 35.839 1.00 23.01 CATOM 2178 C ILE A 260 50.313 29.180 36.225 1.00 31.73 CATOM 2179 O ILE A 260 51.211 29.627 36.993 1.00 25.90 OATOM 2180 CB ILE A 260 50.835 27.456 34.390 1.00 22.46 CATOM 2181 CG1 ILE A 260 51.153 25.940 34.232 1.00 24.12 CATOM 2182 CG2 ILE A 260 52.099 28.361 34.106 1.00 13.47 CATOM 2183 CD1 ILE A 260 51.501 25.443 32.810 1.00 12.58 CATOM 2184 N ALA A 261 49.280 29.910 35.764 1.00 15.35 NATOM 2185 CA ALA A 261 49.177 31.355 36.048 1.00 16.00 CATOM 2186 C ALA A 261 49.316 31.604 37.550 1.00 20.58 CATOM 2187 O ALA A 261 50.104 32.443 37.987 1.00 16.09 OATOM 2188 CB ALA A 261 47.832 31.958 35.487 1.00 13.65 CATOM 2189 N LYS A 262 48.551 30.843 38.323 1.00 11.50 NATOM 2190 CA LYS A 262 48.578 30.905 39.770 1.00 10.13 CATOM 2191 C LYS A 262 49.968 30.460 40.296 1.00 28.08 CATOM 2192 O LYS A 262 50.503 31.084 41.205 1.00 29.37 OATOM 2193 CB LYS A 262 47.453 30.032 40.335 1.00 12.50 CATOM 2194 CG LYS A 262 47.332 29.962 41.888 1.00 16.51 CATOM 2195 CD LYS A 262 46.092 29.092 42.371 1.00 46.61 CATOM 2196 CE LYS A 262 46.344 27.555 42.661 1.00 99.70 CATOM 2197 NZ LYS A 262 45.157 26.703 43.200 1.00 36.59 NATOM 2198 N VAL A 263 50.589 29.443 39.705 1.00 17.44 NATOM 2199 CA VAL A 263 51.915 29.039 40.171 1.00 18.72 CATOM 2200 C VAL A 263 52.997 30.170 39.997 1.00 32.12 CATOM 2201 O VAL A 263 53.871 30.412 40.834 1.00 21.18 OATOM 2202 CB VAL A 263 52.389 27.709 39.476 1.00 16.35 CATOM 2203 CG1 VAL A 263 53.920 27.518 39.647 1.00 11.83 CATOM 2204 CG2 VAL A 263 51.646 26.522 40.093 1.00 14.99 CATOM 2205 N VAL A 264 52.913 30.899 38.909 1.00 21.75 NATOM 2206 CA VAL A 264 53.917 31.877 38.653 1.00 19.81 CATOM 2207 C VAL A 264 53.719 33.208 39.377 1.00 35.79 CATOM 2208 O VAL A 264 54.632 34.032 39.482 1.00 28.99 OATOM 2209 CB VAL A 264 54.059 32.014 37.175 1.00 24.27 CATOM 2210 CG1 VAL A 264 54.728 33.269 36.822 1.00 33.58 CATOM 2211 CG2 VAL A 264 54.840 30.808 36.674 1.00 23.01 CATOM 2212 N GLY A 265 52.550 33.378 39.969 1.00 25.30 NATOM 2213 CA GLY A 265 52.241 34.620 40.636 1.00 24.14 CATOM 2214 C GLY A 265 51.730 35.694 39.632 1.00 35.03 CATOM 2215 O GLY A 265 51.773 36.911 39.962 1.00 33.71 OATOM 2216 N TYR A 266 51.294 35.257 38.428 1.00 26.25 NATOM 2217 CA TYR A 266 50.698 36.151 37.373 1.00 26.55 CATOM 2218 C TYR A 266 49.364 36.745 37.818 1.00 31.01 CATOM 2219 O TYR A 266 48.532 36.067 38.455 1.00 27.99 OATOM 2220 CB TYR A 266 50.501 35.463 36.008 1.00 24.31 CATOM 2221 CG TYR A 266 49.994 36.381 34.884 1.00 28.64 CATOM 2222 CD1 TYR A 266 50.670 37.582 34.542 1.00 35.05 CATOM 2223 CD2 TYR A 266 48.860 36.038 34.118 1.00 22.60 CATOM 2224 CE1 TYR A 266 50.212 38.434 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ASP A 273 41.557 32.536 21.214 1.00 22.33 CATOM 2279 C ASP A 273 40.896 31.365 20.493 1.00 25.67 CATOM 2280 O ASP A 273 41.539 30.570 19.793 1.00 17.81 OATOM 2281 CB ASP A 273 42.672 33.114 20.343 1.00 21.45 CATOM 2282 CG ASP A 273 42.131 33.626 18.990 1.00 26.89 CATOM 2283 OD1 ASP A 273 40.975 33.249 18.598 1.00 27.76 OATOM 2284 OD2 ASP A 273 42.838 34.421 18.327 1.00 30.06 OATOM 2285 N ALA A 274 39.589 31.284 20.649 1.00 15.59 NATOM 2286 CA ALA A 274 38.932 30.128 20.128 1.00 23.75 CATOM 2287 C ALA A 274 38.853 30.168 18.653 1.00 32.30 CATOM 2288 O ALA A 274 38.284 29.256 18.029 1.00 29.37 OATOM 2289 CB ALA A 274 37.567 29.905 20.777 1.00 18.87 CATOM 2290 N SER A 275 39.372 31.243 18.081 1.00 21.10 NATOM 2291 CA SER A 275 39.343 31.288 16.631 1.00 26.90 CATOM 2292 C SER A 275 40.390 30.300 16.116 1.00 43.37 CATOM 2293 O SER A 275 40.421 29.949 14.927 1.00 46.32 OATOM 2294 CB SER A 275 39.547 32.683 16.074 1.00 15.19 CATOM 2295 OG SER A 275 40.904 33.070 16.078 1.00 28.71 OATOm 2296 N 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ASP A 278 42.184 21.189 18.272 1.00 19.66 CATOM 2315 O ASP A 278 41.905 20.917 17.117 1.00 23.49 OATOM 2316 CB ASP A 278 40.636 22.241 19.971 1.00 15.09 CATOM 2317 CG ASP A 278 40.216 23.503 20.702 1.00 22.86 CATOM 2318 OD1 ASP A 278 41.113 24.254 21.096 1.00 25.18 OATOM 2319 OD2 ASP A 278 38.999 23.787 20.812 1.00 39.55 OATOM 2320 N GLY A 279 42.846 20.355 19.044 1.00 30.65 NATOM 2321 CA GLY A 279 43.229 19.034 18.546 1.00 33.78 CATOM 2322 C GLY A 279 42.115 18.099 18.944 1.00 38.10 CATOM 2323 O GLY A 279 40.963 18.517 19.068 1.00 47.52 OATOM 2324 N THR A 280 42.419 16.839 19.177 1.00 29.44 NATOM 2325 CA THR A 280 41.328 15.990 19.587 1.00 26.68 CATOM 2326 C THR A 280 40.889 16.439 20.972 1.00 23.52 CATOM 2327 O THR A 280 41.670 17.067 21.713 1.00 23.62 OATOM 2328 CB THR A 280 41.695 14.492 19.540 1.00 40.78 CATOM 2329 OG1 THR A 280 42.889 14.272 20.296 1.00 25.56 OATOM 2330 CG2 THR A 280 41.893 14.054 18.095 1.00 37.71 CATOM 2331 N PRO A 281 39.672 16.063 21.346 1.00 25.54 NATOM 2332 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2368 C LEU A 285 45.880 5.865 30.006 1.00 30.75 CATOM 2369 O LEU A 285 45.576 6.439 31.058 1.00 22.02 OATOM 2370 CB LEU A 285 48.229 6.389 29.585 1.00 15.85 CATOM 2371 CG LEU A 285 49.307 6.970 28.672 1.00 21.51 CATOM 2372 CD1 LEU A 285 50.703 6.705 29.122 1.00 15.15 CATOM 2373 CD2 LEU A 285 49.051 6.368 27.330 1.00 16.94 CATOM 2374 N ASP A 286 45.565 4.599 29.734 1.00 26.62 NATOM 2375 CA ASP A 286 44.945 3.726 30.698 1.00 10.90 CATOM 2376 C ASP A 286 46.128 3.055 31.498 1.00 20.54 CATOM 2377 O ASP A 286 46.991 2.372 30.938 1.00 23.38 OATOM 2378 CB ASP A 286 44.073 2.702 29.970 1.00 14.65 CATOM 2379 CG ASP A 286 43.409 1.699 30.943 1.00 24.60 CATOM 2380 OD1 ASP A 286 43.932 1.437 32.083 1.00 24.60 OATCM 2381 OD2 ASP A 286 42.316 1.231 30.583 1.00 26.03 OATOM 2382 N VAL A 287 46.230 3.317 32.791 1.00 15.44 NATOM 2383 CA VAL A 287 47.354 2.816 33.556 1.00 15.58 CATOM 2384 C VAL A 287 46.973 1.695 34.521 1.00 16.48 CATOM 2385 O VAL A 287 47.613 1.473 35.572 1.00 16.63 OATOM 2386 CB VAL A 287 48.101 4.006 34.260 1.00 29.84 CATOM 2387 CG1 VAL A 287 48.534 5.085 33.224 1.00 18.39 CATOM 2388 CG2 VAL A 287 47.173 4.670 35.258 1.00 37.79 CATOM 2389 N THR A 288 45.904 0.992 34.152 1.00 22.27 NATOM 2390 CA THR A 288 45.428 -0.152 34.956 1.00 19.34 CATOM 2391 C THR A 288 46.561 -1.177 35.227 1.00 27.47 CATOM 2392 O THR A 288 46.778 -1.586 36.365 1.00 24.87 OATOM 2393 CB THR A 288 44.288 -0.909 34.244 1.00 22.86 CATOM 2394 OG1 THR A 288 43.120 -0.096 34.106 1.00 24.84 OATOM 2395 CG2 THR A 288 43.916 -2.113 35.024 1.00 25.08 CATOM 2396 N ARG A 289 47.290 -1.585 34.179 1.00 26.08 NATOM 2397 CA ARG A 289 48.428 -2.506 34.319 1.00 16.92 CATOM 2398 C ARG A 289 49.405 -2.037 35.408 1.00 22.96 CATOM 2399 O ARG A 289 49.847 -2.790 36.275 1.00 23.03 OATOM 2400 CB ARG A 289 49.208 -2.607 32.976 1.00 12.43 CATOM 2401 CG ARG A 289 48.934 -3.804 32.103 1.00 29.39 CATOM 2402 CD ARG A 289 50.016 -4.102 31.037 1.00 25.88 CATOM 2403 NE ARG A 289 49.441 -4.996 30.020 1.00 17.26 NATOM 2404 CZ ARG A 289 50.053 -5.459 28.930 1.00 38.82 CATOM 2405 NH1 ARG A 289 51.306 -5.153 28.660 1.00 13.51 NATOM 2406 NH2 ARG A 289 49.400 -6.262 28.096 1.00 37.68 NATOM 2407 N LEU A 290 49.815 -0.786 35.306 1.00 26.60 NATOM 2408 CA LEU A 290 50.809 -0.254 36.219 1.00 25.42 CATOM 2409 C LEU A 290 50.324 -0.376 37.656 1.00 24.17 CATOM 2410 O LEU A 290 51.072 -0.759 38.574 1.00 19.94 OATOM 2411 CB LEU A 290 51.000 1.219 35.876 1.00 24.66 CATOM 2412 CG LEU A 290 52.281 2.019 36.066 1.00 24.67 CATOM 2413 CD1 LEU A 290 51.992 3.479 36.504 1.00 29.25 CATOM 2414 CD2 LEU A 290 53.450 1.335 36.788 1.00 15.82 CATOM 2415 N HIS A 291 49.093 0.075 37.868 1.00 30.10 NATOM 2416 CA HIS A 291 48.513 0.074 39.212 1.00 34.17 CATOM 2417 C HIS A 291 48.411 -1.367 39.730 1.00 43.41 CATOM 2418 O HIS A 291 48.621 -1.654 40.929 1.00 38.81 OATOM 2419 CB HIS A 291 47.113 0.674 39.143 1.00 28.01 CATOM 2420 CG HIS A 291 47.097 2.153 38.984 1.00 29.68 CATOM 2421 ND1 HIS A 291 48.242 2.921 39.015 1.00 35.63 NATOM 2422 CD2 HIS A 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LEU A 293 53.306 -4.170 35.836 1.00 28.25 CATOM 2441 CD2 LEU A 293 52.965 -6.110 37.439 1.00 47.81 CATOM 2442 N GLY A 294 51.316 -2.510 41.111 1.00 33.08 NATOM 2443 CA GLY A 294 51.488 -1.793 42.347 1.00 24.90 CATOM 2444 C GLY A 294 52.272 -0.512 42.326 1.00 29.31 CATOM 2445 O GLY A 294 53.070 -0.249 43.223 1.00 25.25 OATOM 2446 N TRP A 295 52.000 0.347 41.368 1.00 27.83 NATOM 2447 CA TRP A 295 52.687 1.623 41.385 1.00 19.45 CATOM 2448 C TRP A 295 51.684 2.731 41.081 1.00 25.79 CATOM 2449 O TRP A 295 50.765 2.527 40.297 1.00 20.43 OATOM 2450 CB TRP A 295 53.961 1.614 40.524 1.00 12.85 CATOM 2451 CG TRP A 295 54.750 2.911 40.618 1.00 23.04 CATOM 2452 CD1 TRP A 295 55.897 3.161 41.368 1.00 23.68 CATOM 2453 CD2 TRP A 295 54.415 4.159 39.979 1.00 20.72 CATOM 2454 NE1 TRP A 295 56.258 4.493 41.244 1.00 18.67 NATOM 2455 CE2 TRP A 295 55.389 5.113 40.373 1.00 20.95 CATOM 2456 CE3 TRP A 295 53.406 4.550 39.102 1.00 21.47 CATOM 2457 CZ2 TRP A 295 55.338 6.439 39.958 1.00 17.58 CATOM 2458 CZ3 TRP A 295 53.403 5.873 38.632 1.00 21.57 CATOM 2459 CH2 TRP A 295 54.368 6.787 39.058 1.00 19.45 CATOM 2460 N TYR A 296 51.709 3.797 41.884 1.00 25.17 NATOM 2461 CA TYR A 296 50.720 4.883 41.731 1.00 24.90 CATOM 2462 C TYR A 296 51.517 6.178 41.857 1.00 30.85 CATOM 2463 O TYR A 296 52.363 6.272 42.745 1.00 21.27 OATOM 2464 CB TYR A 296 49.654 4.813 42.840 1.00 25.18 CATOM 2465 CG TYR A 296 48.685 3.651 42.744 1.00 23.04 CATOM 2466 CD1 TYR A 296 49.078 2.343 43.088 1.00 31.62 CATOM 2467 CD2 TYR A 296 47.380 3.853 42.289 1.00 26.02 CATOM 2468 CE1 TYR A 296 48.203 1.268 42.935 1.00 24.42 CATOM 2469 CE2 TYR A 296 46.493 2.770 42.127 1.00 24.81 CATOM 2470 CZ TYR A 296 46.902 1.483 42.464 1.00 39.41 CATOM 2471 OH TYR A 296 45.984 0.434 42.337 1.00 66.19 OATOM 2472 N HIS A 297 51.324 7.123 40.924 1.00 20.95 NATOM 2473 CA MIS A 297 52.130 8.343 40.938 1.00 26.86 CATOM 2474 C HIS A 297 51.947 9.175 42.210 1.00 35.01 CATOM 2475 O HIS A 297 50.885 9.132 42.874 1.00 26.92 OATOM 2476 CB HIS A 297 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A 301 47.854 20.177 36.436 1.00 25.88 CATOM 2513 N GLU A 302 49.845 20.398 40.554 1.00 27.01 NATOM 2514 CA GLU A 302 50.053 21.636 41.280 1.00 37.72 CATOM 2515 C GLU A 302 51.410 21.618 41.996 1.00 29.99 CATOM 2516 O GLU A 302 52.245 22.514 41.798 1.00 27.15 OATOM 2517 CB GLU A 302 48.899 21.841 42.275 1.00 43.10 CATOM 2518 CG GLU A 302 49.061 23.061 43.174 1.00 90.85 CATOM 2519 CD GLU A 302 48.451 24.324 42.580 1.00100.00 CATOM 2520 OE1 GLU A 302 47.566 24.209 41.706 1.00100.00 OATOM 2521 OE2 GLU A 302 48.808 25.432 43.036 1.00 64.50 OATOM 2522 N ALA A 303 51.646 20.591 42.801 1.00 8.72 NATOM 2523 CA ALA A 303 52.937 20.455 43.459 1.00 15.03 CATOM 2524 C ALA A 303 54.102 20.355 42.450 1.00 19.85 CATOM 2525 O ALA A 303 55.104 21.090 42.553 1.00 22.24 OATOM 2526 CB ALA A 303 52.938 19.258 44.410 1.00 18.97 CATOM 2527 N GLY A 304 53.953 19.472 41.467 1.00 13.05 NATOM 2528 CA GLY A 304 54.970 19.321 40.448 1.00 8.94 CATOM 2529 C GLY A 304 55.239 20.621 39.695 1.00 20.31 CATOM 2530 O GLY A 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307 58.851 21.304 42.622 1.00 20.47 CATOM 2549 OG SER A 307 58.517 20.454 41.526 1.00 29.03 OATOM 2550 N THR A 308 58.849 22.631 39.735 1.00 27.31 NATOM 2551 CA THR A 308 59.458 22.738 38.413 1.00 22.89 CATOM 2552 C THR A 308 59.757 24.216 38.107 1.00 26.06 CATOM 2553 O THR A 308 60.819 24.546 37.591 1.00 29.89 OATOM 2554 CB THR A 308 58.536 22.115 37.318 1.00 18.72 CATOM 2555 OG1 THR A 308 58.356 20.714 37.545 1.00 20.17 OATOM 2556 CG2 THR A 308 59.094 22.330 35.923 1.00 12.37 CATOM 2557 N TYR A 309 58.846 25.118 38.453 1.00 28.20 NATOM 2558 CA TYR A 309 59.110 26.549 38.241 1.00 31.09 CATOM 2559 C TYR A 309 60.383 27.059 39.045 1.00 16.31 CATOM 2560 O TYR A 309 61.179 27.858 38.577 1.00 16.91 OATOM 2561 CB TYR A 309 57.819 27.373 38.533 1.00 31.19 CATOM 2562 CG TYR A 309 57.944 28.895 38.392 1.00 14.57 CATOM 2563 CD1 TYR A 309 58.397 29.457 37.224 1.00 17.51 CATOM 2564 CD2 TYR A 309 57.575 29.757 39.442 1.00 24.99 CATOM 2565 CE1 TYR A 309 58.527 30.801 37.100 1.00 18.41 CATOM 2566 CE2 TYR A 309 57.744 31.129 39.351 1.00 19.04 CATOM 2567 CZ TYR A 309 58.212 31.641 38.164 1.00 29.13 CATOM 2568 OH TYR A 309 58.300 33.004 37.966 1.00 28.22 OATOM 2569 N GLN A 310 60.560 26.579 40.260 1.00 15.41 NATOM 2570 CA GLN A 310 61.705 26.964 41.087 1.00 22.35 CATOM 2571 C GLN A 310 63.001 26.492 40.446 1.00 31.46 CATOM 2572 O GLN A 310 64.009 27.191 40.442 1.00 33.42 OATOM 2573 CB GLN A 310 61.587 26.335 42.482 1.00 17.67 CATOM 2574 CG GLN A 310 62.579 26.921 43.461 1.00 57.58 CATOM 2575 CD GLN A 310 62.287 28.370 43.782 1.00 65.14 OATOM 2576 OE1 GLN A 310 61.134 28.754 44.000 1.00 41.94 OATOM 2577 NE2 GLN A 310 63.330 29.194 43.801 1.00 99.09 NATOM 2578 N TRP A 311 62.957 25.321 39.830 1.00 28.76 NATOM 2579 CA TRP A 311 64.146 24.822 39.163 1.00 26.29 CATOM 2580 C TRP A 311 64.474 25.769 38.040 1.00 17.91 CATOM 2581 O TRP A 311 65.599 26.193 37.880 1.00 22.89 OATOM 2582 CB TRP A 311 63.938 23.383 38.643 1.00 27.53 CATOM 2583 CG TRP A 311 65.176 22.784 38.119 1.00 17.82 CATOM 2584 CD1 TRP A 311 66.132 22.090 38.826 1.00 20.21 CATOM 2585 CD2 TRP A 311 65.652 22.881 36.784 1.00 17.99 CATOM 2586 NE1 TRP A 311 67.197 21.776 37.992 1.00 20.39 NATOM 2587 CE2 TRP A 311 66.933 22.284 36.746 1.00 19.57 CATOM 2588 CE3 TRP A 311 65.141 23.461 35.621 1.00 20.26 CATOM 2589 CZ2 TRP A 311 67.686 22.236 35.599 1.00 14.25 CATOM 2590 CZ3 TRP A 311 65.901 23.446 34.501 1.00 18.59 CATOM 2591 CH2 TRP A 311 67.169 22.831 34.494 1.00 16.86 CATOM 2592 N PHE A 312 63.469 26.109 37.256 1.00 17.47 NATOM 2593 CA PHE A 312 63.665 27.064 36.179 1.00 20.14 CATOM 2594 C PHE A 312 64.224 28.371 36.733 1.00 18.33 CATOM 2595 O PHE A 312 65.080 29.024 36.104 1.00 24.76 OATOM 2596 CB PHE A 312 62.328 27.318 35.458 1.00 29.51 CATOM 2597 CG PHE A 312 62.328 28.544 34.603 1.00 28.52 CATOM 2598 CD1 PHE A 312 62.883 28.508 33.338 1.00 30.53 CATOM 2599 CD2 PHE A 312 61.825 29.758 35.104 1.00 29.31 CATOM 2600 CE1 PHE A 312 62.936 29.660 32.554 1.00 34.73 CATOM 2601 CE2 PHE A 312 61.900 30.904 34.362 1.00 38.40 CATOM 2602 CZ PHE A 312 62.432 30.860 33.063 1.00 40.73 CATOM 2603 N LEU A 313 63.697 28.787 37.876 1.00 22.46 NATOM 2604 CA LEU A 313 64.170 30.025 38.516 1.00 28.47 CATOM 2605 C LEU A 313 65.627 29.827 38.898 1.00 37.53 CATOM 2606 O LEU A 313 66.452 30.693 38.629 1.00 34.20 OATOM 2607 CB LEU A 313 63.375 30.410 39.783 1.00 20.44 CATOM 2608 CG LEU A 313 61.955 30.897 39.555 1.00 16.29 CATOM 2609 CD1 LEU A 313 61.499 31.399 40.871 1.00 15.94 CATOM 2610 CD2 LEU A 313 61.959 31.961 36.524 1.00 14.44 CATOM 2611 N GLU A 314 65.953 28.685 39.508 1.00 30.70 NATOM 2612 CA GLU A 314 67.353 28.432 39.875 1.00 24.15 CATOM 2613 C GLU A 314 68.291 28.149 38.703 1.00 36.34 CATOM 2614 O GLU A 314 69.485 28.047 38.890 1.00 43.10 OATOM 2615 CB GLU A 314 67.459 27.366 40.947 1.00 19.90 CATOM 2616 CG GLU A 314 66.634 27.754 42.141 1.00 27.37 CATOM 2617 CD GLU A 314 66.450 26.666 43.182 1.00 31.09 CATOM 2618 OE1 GLU A 314 67.157 25.648 43.085 1.00 59.60 OATOM 2619 OE2 GLU A 314 65.634 26.872 44.125 1.00 46.20 OATOM 2620 N ASN A 315 67.778 28.114 37.479 1.00 40.17 NATOM 2621 CA ASN A 315 68.637 27.802 36.343 1.00 37.76 CATOM 2622 C ASN A 315 68.383 28.578 35.112 1.00 43.75 CATOM 2623 O ASN A 315 68.591 28.001 34.047 1.00 39.15 OATOM 2624 CB ASN A 315 68.425 26.360 35.884 1.00 33.74 CATOM 2625 CG ASN A 315 69.028 25.383 36.801 1.00 53.18 CATOM 2626 OD1 ASN A 315 68.456 25.087 37.835 1.00 49.13 OATOM 2627 ND2 ASN A 315 70.239 24.926 36.479 1.00 97.72 NATOM 2628 N GLN A 316 67.852 29.803 35.197 1.00 49.87 NATOM 2629 CA GLN A 316 67.627 30.550 33.957 1.00 77.90 CATOM 2630 C GLN A 316 68.797 31.448 33.525 1.00100.00 CATOM 2631 O GLN A 316 69.272 31.387 32.375 1.00 51.33 OATOM 2632 CB GLN A 316 66.280 31.276 33.902 1.00 75.89 CATOM 2633 CG GLN A 316 65.683 31.589 35.231 1.00 80.97 CATOM 2634 CD GLN A 316 65.233 33.036 35.350 1.00 54.58 CATOM 2635 OE1 GLN A 316 64.881 33.699 34.367 1.00 46.46 OATOM 2636 NE2 GLN A 316 65.257 33.538 36.566 1.00 33.46 NTER 2637 GLN A 316CONECT 110 111CONECT 111 110 112CONECT 112 111 113 114CONECT 113 112 118CONECT 114 112 115 116CONECT 115 114CONECT 116 114 117 118CONECT 117 116 129CONECT 118 113 116CONECT 120 121CONECT 121 120 122CONECT 122 121 123 124CONECT 123 122 128CONECT 124 122 125 126CONECT 125 124CONECT 126 124 127 128CONECT 127 126CONECT 128 123 126CONECT 129 117 130 131 132CONECT 130 129CONECT 131 129CONECT 132 129MASTER 208 0 1 13 10 0 3 6 2636 1 22 25END
虽已详述本发明的各种实施方案,但显然本领域技术人员可对这些实施方案进行修改。然而,应当理解这些修改均包括在本发明的精神和范围内,如以下权利要求书中所要求。
序列表<110>Berry,Alan
Running,Jeffrey A.
Severson,David K.
Burlingame,Richard P.<120>“微生物和植物中的维生素C生产”<130>3161-24-PCT<140>尚未被批准<141>1999-05-25<150>60/125,073<151>1999-03-17<150>60/125,054<151>1999-03-18<150>60/088,549<151>1998-06-08<160>15<170>PatentIn Ver.2.0<210>1<211>1583<212>DNA<213>拟南芥<220><221>CD5<222>(49)..(993)<400>1tagtctttaa tttcgcagcg tttttataat tgtgcagagg tttcgtcc atg tct gac 57
Met Ser Asp
1aaa tct gcc aaa atc ttc gtc gcg ggt cat cgt ggt ttg gtt gga tct 105Lys Ser Ala Lys Ile Phe Val Ala Gly His Arg Gly Leu Val Gly Ser
5 10 15gcc att gtc cgc aag ctt cag gaa caa ggt ttc acc aat ctc gtt ctt 153Ala Ile Val Arg Lys Leu Gln Glu Gln Gly Phe Thr Asn Leu Val Leu20 25 30 35aaa aca cac gcc gag ctt gat ctc act cgt caa gcc gat gtt gaa tcc 201Lys Thr His Ala Glu Leu Asp Leu Thr Arg Gln Ala AsP Val Glu Ser
40 45 50ttc ttt tct caa gag aag cca gtt tat gta atc cta gca gca gct aaa 249Phe Phe Ser Gln Glu Lys Pro Val Tyr Val Ile Leu Ala Ala Ala Lys
55 60 65gtt ggt ggt att cac gct aac aac acc tat cct gct gat ttc att ggt 297Val Gly Gly Ile His Ala Asn Asn Thr Tyr Pro Ala Asp Phe Ile Gly
70 75 80gtc aat ctc cag att cag acc aat gtg atc cac tct gca tat gag cac 345Val Asn Leu Gln Ile Gln Thr Asn Val Ile His Ser Ala Tyr Glu His
85 90 95ggt gtg aag aag ctt ctc ttc ctt gga tca tcc tgc att tac cct aaa 393Gly Val Lys Lys Leu Leu Phe Leu Gly Ser Ser Cys Ile Tyr Pro Lys100 105 110 115ttt gct cct cag cca att cct gag tct gct ttg tta aca gca tcg ctt 441Phe Ala Pro Gln Pro Ile Pro Glu Ser Ala Leu Leu Thr Ala Ser Leu
120 125 130gaa cca act aat gag tgg tat gct att gct aag atc gct ggg att aag 489Glu Pro Thr Asn Glu Trp Tyr Ala Ile Ala Lys Ile Ala Gly Ile Lys
135 140 145act tgt cag gct tat agg att cag cac gga tgg gat gca atc tct ggc 537Thr Cys Gln Ala Tyr Arg Ile Gln His Gly Trp Asp Ala Ile Ser Gly
150 155 160atg cct act aat ctc tat ggt cct aat gac aat ttc cac ccg gag tct 585Met Pro Thr Asn Leu Tyr Gly Pro Asn Asp Asn Phe His Pro Glu Ser
165 170 175cat gtg ctt cct gct ctt atg agg agg ttc cac gag gcg aaa gtg aat 633His Val Leu Pro Ala Leu Met Arg Arg Phe His Glu Ala Lys Val Asn180 185 190 195tgg agc gga gga agt tgt ggt gtg ggg tac aag gta gtc ccg ttg gaa 681Trp Ser Gly Gly Ser Cys Gly Val Gly Tyr Lys Val Val Pro Leu Glu
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245 250 255ggt ttt gaa ggg aag ctt gga tgg gat tgc act aag cca gat ggc aca 873Gly Phe Glu Gly Lys Leu Gly Trp Asp Cys Thr Lys Pro Asp Gly Thr260 265 270 275ccg agg aaa ctt atg gac agc tca aag ctc gcg tct ttg ggt tgg aca 921Pro Arg Lys Leu Met Asp Ser Ser Lys Leu Ala Ser Leu Gly Trp Thr
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310 315actattgagt ctcaggtaaa tcagcttatc accacattgt gatttaaacc tttctttgag 1083attcgagaat tgcttttttt tttatcaaaa ttgattcatt tagagataag acttgcttct 1143ttatacaaca ttgtctgagg aattttaatt ttggatctcc gagtatggtc tattattagc 1203tctcttctat acaaattatc aaaacagttg taagaagttt caagaaaaac atttgatatc 1263tcactaattt ggctatcctt gcaagttgca acgctaaaat gacaaataat gaattctcgg 1323cccaatgggc ttacacaagc cttgttaaag atagcgtgaa caaaacgcgg ctcactagcc 1383ctaacctgtc tctctttcgc ttaccttctt cttcgtcttc gttggctcag tcacttgact 1443tcacggcccg ctcaagctct gacacgaaac tcatttcaaa ttaatttaat aaaaccttaa 1503tcacaaaagg ggcaaaagca atcgccggcg attatgcctt ctcctccggt gccggagacg 1563gttgtgagcc aacccgttcg 1583<210>2<211>314<212>PRT<213>拟南芥<400>2Met Ser Asp Lys Ser Ala Lys Ile Phe Val Ala Gly His Arg Gly Leu1 5 10 15Val Gly Ser Ala Ile Val Arg Lys Leu Gln Glu Gln Gly Phe Thr Asn
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20 25 30tta cgc acc cgc gac gag ctg aac ctg ctg gac agc cgc gcc gtg cat 144Leu Arg Thr Arg Asp Glu Leu Asn Leu Leu Asp Ser Arg Ala Val His
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Met Gly Glu Pro Gln Gly Ser Met Arg Ile Leu Val
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260 265 270Val Asn Ala Phe Ser Lys Ala Cys Gly Lys Pro Val Asn Tyr His Phe
275 280 285Ala Pro Arg Arg Glu Gly Asp Leu Pro Ala Tyr Trp Ala Asp Ala Ser
290 295 300Lys Ala Asp Arg Glu Leu Asn Trp Arg Val Thr Arg Thr Leu Asp Glu305 310 315 320Met Ala Gln Asp Thr Trp His Trp Gln Ser Arg His Pro Gln Gly Tyr
325 330 335Pro Asp<210>9<211>1047<212>DNA<213>人类<220><221>CDS<222>(1)..(1047)<400>9atg gca gag aag gtg ctg gta aca ggt ggg gct ggc tac att ggc agc 48Met Ala Glu Lys Val Leu Val Thr Gly Gly Ala Gly Tyr Ile Gly Ser1 5 10 15cac acg gtg ctg gag ctg ctg gag gct ggc tac ttg cct gtg gtc atc 96His Thr Val Leu Glu Leu Leu Glu Ala Gly Tyr Leu Pro Val Val Ile
20 25 30gat aac ttc cat aat gcc ttc cgt gga ggg ggc tcc ctg cct gag agc 144Asp Asn Phe His Asn Ala Phe Arg Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Ser
35 40 45ctg cgg cgg gtc cag gag ctg aca ggc cgc tct gtg gag ttt gag gag 192Leu Arg Arg Val Gln Glu Leu Thr Gly Arg Ser Val Glu Phe Glu Glu
50 55 60atg gac att ttg gac cag gga gcc cta cag cgt ctc ttc aaa aag tac 240Met Asp Ile Leu Asp Gln Gly Ala Leu Gln Arg Leu Phe Lys Lys Tyr65 70 75 80agc ttt atg gcg gtc atc cac ttt gcg ggg ctc aag gcc gtg ggc gag 288Ser Phe Met Ala Val Ile His Phe Ala Gly Leu Lys Ala Val Gly Glu
85 90 95tcg gtg cag aag cct ctg gat tat tac aga gtt aac ctg acc ggg acc 336Ser Val Gln Lys Pro Leu Asp Tyr Tyr Arg Val Asn Leu Thr Gly Thr
100 105 110atc cag ctt ctg gag atc atg aag gcc cac ggg gtg aag aac ctg gtg 384Ile Gln Leu Leu Glu Ile Met Lys Ala His Gly Val Lys Asn Leu Val
115 120 125ttc agc agc tca gcc act gtg tac ggg aac ccc cag tac ctg ccc ctt 432Phe Ser Ser SerA la Thr Val Tyr Gly Asn Pro Gln Tyr Leu Pro Leu
130 135 140gat gag gcc cac ccc acg ggt ggt tgt acc aac cct tac ggc aag tcc 480Asp Glu Ala His Pro Thr Gly Gly cys Thr Asn Pro Tyr Gly Lys Ser145 150 155 160aag ttc ttc atc gag gaa atg atc cgg gac ctg tgc cag gca gac aag 528Lys Phe Phe Ile Glu Glu Met Ile Arg Asp Leu Cys Gln Ala Asp Lys
165 170 175act tgg aac gta gtg ctg ctg cgc tat ttc aac ccc aca ggt gcc cat 576Thr Trp Asn Val Val Leu Leu Arg Tyr Phe Asn Pro Thr Gly Ala His
180 185 190gcc tct ggc tgc att ggt gag gat ccc cag ggc ata ccc aac aac ctc 624Ala Ser Gly Cys Ile Gly Glu Asp Pro Gln Gly Ile Pro Asn Asn Leu
195 200 205atg cct tat gtc tcc cag gtg gcg atc ggg cga cgg gag gcc ctg aat 672Met Pro Tyr Val Ser Gln Val Ala Ile Gly Arg Arg Glu Ala Leu Asn
210 215 220gtc ttt ggc aat gac tat gac aca gag gat ggc aca ggt gtc cgg gat 720Val Phe Gly Asn Asp Tyr Asp Thr Glu Asp Gly Thr Gly Val Arg Asp225 230 235 240tac atc cat gtc gtg gat ctg gcc aag ggc cac att gca gcc tta agg 768Tyr Ile His Val Val Asp Leu Ala Lys Gly His Ile Ala Ala Leu Arg
245 250 255aag ctg aaa gaa cag tgt ggc tgc cgg atc tac aac ctg ggc acg ggc 816Lys Leu Lys Glu Gln Cys Gly Cys Arg Ile Tyr Asn Leu Gly Thr Gly
260 265 270aca ggc tat tca gtg ctg cag atg gtc cag gct atg gag aag gcc tct 864Thr Gly Tyr Ser Val Leu Gln Met Val Gln Ala Met Glu Lys Ala Ser
275 280 285ggg aag aag atc ccg tac aag gtg gtg gca cgg cgg gaa ggt gat gtg 912Gly Lys Lys Ile Pro Tyr Lys Val Val Ala Arg Arg Glu Gly Asp Val
290 295 300gca gcc tgt tac gcc aac ccc agc ctg gcc caa gag gag ctg ggg tgg 960Ala Ala Cys Tyr Ala Asn Pro Ser Leu Ala Gln Glu Glu Leu Gly Trp305 310 315 320aca gca gcc tta ggg ctg gac agg atg tgt gag gat ctc tgg cgc tgg 1008Thr Ala Ala Leu Gly Leu Asp Arg Met Cys Glu Asp Leu Trp Arg Trp
325 330 335cag aag cag aat cct tca ggc ttt ggc acg caa gcc tga 1047Gln Lys Gln Asn Pro Ser Gly Phe Gly Thr Gln Ala
340 345<210>10<211>348<212>PRT<213>人类<400>10Met Ala Glu Lys Val Leu Val Thr Gly Gly Ala Gly Tyr Ile Gly Ser1 5 10 15His Thr Val Leu Glu Leu Leu Glu Ala Gly Tyr Leu Pro Val Val Ile
20 25 30Asp Asn Phe His Asn Ala Phe Arg Gly Gly Gly Ser Leu Pro Glu Ser
35 40 45Leu Arg Arg Val Gln Glu Leu Thr Gly Arg Ser Val Glu Phe Glu Glu
50 55 60Met Asp Ile Leu Asp Gln Gly Ala Leu Gln Arg Leu Phe Lys Lys Tyr65 70 75 80Ser Phe Met Ala Val Ile His Phe Ala Gly Leu Lys Ala Val Gly Glu
85 90 95Ser Val Gln Lys Pro Leu Asp Tyr Tyr Arg Val Asn Leu Thr Gly Thr
100 105 110Ile Gln Leu Leu Glu Ile Met Lys Ala His Gly Val Lys Asn Leu Val
115 120 125Phe Ser Ser Ser Ala Thr Val Tyr Gly Asn Pro Gln Tyr Leu Pro Leu
130 135 140Asp Glu Ala His Pro Thr Gly Gly Cys Thr Asn Pro Tyr Gly Lys Ser145 150 155 160Lys Phe Phe Ile Glu Glu Met Ile Arg Asp Leu Cys Gln Ala Asp Lys
165 170 175Thr Trp Asn Val Val Leu Leu Arg Tyr Phe Asn Pro Thr Gly Ala His
180 185 190Ala Ser Gly Cys Ile Gly Glu Asp Pro Gln Gly Ile Pro Asn Asn Leu
195 200 205Met Pro Tyr Val Ser Gln Val Ala Ile Gly Arg Arg Glu Ala Leu Asn
210 215 220Val Phe Gly Asn Asp Tyr Asp Thr Glu Asp Gly Thr Gly Val Arg Asp225 230 235 240Tyr Ile His Val Val Asp Leu Ala Lys Gly His Ile Ala Ala Leu Arg
245 250 255Lys Leu Lys Glu Gln Cys Gly Cys Arg Ile Tyr Asn Leu Gly Thr Gly
260 265 270Thr Gly Tyr Ser Val Leu Gln Met Val Gln Ala Met Glu Lys Ala Ser
275 280 285Gly Lys Lys Ile Pro Tyr Lys Val Val Ala Arg Arg Glu Gly Asp Val
290 295 300Ala Ala Cys Tyr Ala Asn Pro Ser Leu Ala Gln Glu Glu Leu Gly Trp305 310 315 320Thr Ala Ala Leu Gly Leu Asp Arg Met Cys Glu Asp Leu Trp Arg Trp
325 330 335Gln Lys Gln Asn Pro Ser Gly Phe Gly Thr Gln Ala
340 345<210> 11<211> 317<212> PRT<213> 人工序列<220><223> 对人工序列的描述:共有序列<400> 11Xaa Xaa Arg Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Gly Xaa Xaa1 5 10 15Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
20 25 30Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
35 40 45Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Val Xaa Xaa Xaa Ala Xaa Xaa Xaa
50 55 60Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 65 70 75 80Asn Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
85 90 95Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
100 105 110Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Xaa
115 120 125Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Tyr Xaa Xaa Xaa Lys Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
130 135 140Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa145 150 155 160Xaa Xaa Asn Xaa Xaa Gly Xaa His Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
165 170 175Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
180 185 190Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Gly Xaa Xaa Xaa Arg Xaa
195 200 205Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp Xaa Ala Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
210 215 220Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa225 230 235 240Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
245 250 255Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Phe Xaa Xaa
260 265 270Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
275 280 285Xaa Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa
290 295 300Xaa Thr Xaa Xaa Trp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa305 310 315<210>12<211>34<212>DNA<213>大肠杆菌<400>12tagaattcag taaacaacga gtttttattg ctgg 34<210>13<211>32<212>DNA<213>大肠杆菌<400>13aactcgagtt acccccaaag cggtcttgat tc 32<210>14<211>30<212>DNA<213>大肠杆菌<400>14ctggagtcga attcatgagt aaacaacgag 30<210>15<211>33<212>DNA<213>大肠杆菌<400>15aactgcagtt acccccgaaa gcggtcttga ttc 33
Claims (72)
1.在微生物中生产抗坏血酸或其酯的方法,其包括培养微生物,所述微生物经遗传修饰增加了选自下组的一种酶的活性:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶,GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶;并回收所述抗坏血酸或其酯。
2.权利要求1的方法,其中所述遗传修饰可增加选自下组的一种酶的活性:GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。
3.权利要求1的方法,其中所述遗传修饰可增加催化GDP-D-甘露糖到GDP-L-半乳糖转化之酶的作用。
4.权利要求3的方法,其中所述遗传修饰可增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
5.权利要求3的方法,其中所述遗传修饰包括用表达该差向异构酶的重组核酸分子转化所述微生物。
6.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶具有基本符合由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶中三级结构的三级结构。
7.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶具有与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的Cα位点的平均均方根偏差小于约2.5埃的结构。
8.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶具有与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的Cα位点的平均均方根偏差小于约1埃的结构。
9.权利要求5中的方法,其中所述差向异构酶包括一底物结合位点,其三级结构基本符合由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶中底物结合位点的三级结构。
10.权利要求9的方法,其中所述底物结合位点具有与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的Cα位点的平均均方根偏差小于约2.5埃的三级结构。
11.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶包括一催化位点,其三级结构基本符合由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶中催化位点的三级结构。
12.权利要求11的方法,其中所述催化位点具有与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的C α位点的平均均方根偏差小于约2.5埃的三级结构。
13.权利要求11的方法,其中所述催化位点包含氨基酸残基丝氨酸、酪氨酸和赖氨酸。
14.权利要求11的方法,其中所述氨基酸残基丝氨酸、酪氨酸和赖氨酸的三级结构位置分别与由Broodhaven蛋白数据库登录码为1bws的原子坐标所代表的Ser107、Tyr136和Lys140的三级结构位置基本一致。
15.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶结合NADPH。
16.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶包含与SEQ ID NO:11用CLUSTAL对比排列程序可对比排列的氨基酸序列,其中该氨基酸序列中的氨基酸残基与SEQ IDNO:11中至少约50%的非Xaa残基有100%的同一性。
17.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶包含与SEQ ID NO:11用CLUSTAL对比排列程序可对比排列的氨基酸序列,其中该氨基酸序列中的氨基酸残基与SEQ ID NO:11中至少约75%的非Xaa残基有100%的同一性。
18.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶包含与SEQ ID NO:11用CLUSTAL对比排列程序可对比排列的氨基酸序列,其中该氨基酸序列中的氨基酸残基与SEQ ID NO:11中至少约90%的非Xaa残基有100%的同一性。
19.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶具有的氨基酸序列有至少4个连续氨基酸残基与选自SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:4,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:8和SEQ ID NO:10的氨基酸序列中至少4个连续氨基酸残基100%相同。
20.权利要求5的方法,其中所述重组核酸分子具有的核酸序列有至少12个连续核苷酸与选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:9的核酸序列中至少12个连续核苷酸100%相同。
21.权利要求5的方法,其中所述差向异构酶包含带有基序:Gly-Xaa-Xaa-Gly-Xaa-Xaa-Gly的氨基酸序列。
22.权利要求5的方法,其中所述重组核酸分子包含的核酸序列至少约15%等同于选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:9的核酸序列,如用Lipman-Pearson方法以Lipman-Person标准缺省参数所测定。
23.权利要求5的方法,其中所述重组核酸分子包含的核酸序列至少约20%等同于选自SEQID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:9的核酸序列,如用Lipman-Pearson方法以Lipman-Person标准缺省参数所测定。
24.权利要求5的方法,其中所述重组核酸分子包含的核酸序列至少约25%等同于选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3,SEQ ID NO:5,SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:9的核酸序列,如用Lipmain-Pearson方法以Lipman-Person标准缺省参数所测定。
25.权利要求5的方法,其中所述重组核酸分子包含与编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的核酸序列在严谨条件下杂交的核酸序列。
26.权利要求25的方法,其中所述编码GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶的核酸序列选自SEQ ID NO:1,SEQ ID NO:3和SEQID NO:5。
27.权利要求25的方法,其中所述GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶包含选自SEQ ID NO:22,SEQ ID NO:4和SEQID NO:6的氨基酸序列。
28.权利要求1的方法,其中所述微生物选自细菌、真菌和微藻。
29.权利要求1的方法,其中所述微生物耐酸。
30.权利要求1的方法,其中所述微生物为细菌。
31.权利要求30的方法,其中所述细菌选自固氮菌和假单胞菌。
32.权利要求1的方法,其中所述微生物为真菌。
33.权利要求32的方法,其中所述微生物为酵母。
34.权利要求33的方法,其中所述酵母选自Saccharomyces。
35.权利要求1的方法,其中所述微生物为微藻。
36.权利要求35的方法,其中所述微藻选自Prototheca和Chlorella。
37.权利要求36的方法,其中所述微藻选自Prototheca。
38.权利要求1的方法,其中所述微生物还包含一种遗传修饰,其可降低以GDP-D-甘露糖为底物之酶的作用,而不降低GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
39.权利要求38的方法,其中所述可降低以GDP-D-甘露糖为底物之酶的作用,而不降低GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用的遗传修饰是降低GDP-D-甘露糖脱氢酶的作用。
40.权利要求1的方法,其中所述微生物耐酸且所述培养步骤在pH小于约6.0的条件下实施。
41.权利要求1的方法,其中所述微生物耐酸且所述培养步骤在pH小于约5.5的条件下实施。
42.权利要求1的方法,其中所述微生物耐酸且所述培养步骤在pH小于约5.0的条件下实施。
43.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在限制镁(Mg)的发酵培养基中实施。
44.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在限制细胞生长期的Mg的发酵培养基中实施。
45.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在控制细胞生长期间Mg浓度小于约0.5g/L的发酵培养基中实施。
46.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在控制细胞生长期间Mg浓度小于约0.2g/L的发酵培养基中实施。
47.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在控制细胞生长期间Mg浓度小于约0.1g/L的发酵培养基中实施。
48.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在含除D-甘露糖以外的其它碳源的发酵培养基中实施。
49.权利要求1的方法,其中所述培养步骤在以葡萄糖为碳源的发酵培养基中实施。
50.一种产生抗坏血酸或其酯的微生物,其中该微生物具有增加选自下组之酶的作用的遗传修饰:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶,GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。
51.权利要求50的微生物,其中所述遗传修饰是增加选自GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶的一种酶的作用。
52.权利要求50的微生物,其中所述遗传修饰是增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
53.权利要求50的微生物,其中该微生物经遗传修饰而表达能编码催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化之差向异构酶的重组核酸分子,其中该差向异构酶具有与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的Cα位点的平均均方根偏差小于约2.5埃的结构。
54.权利要求50的微生物,其中该微生物选自细菌、真菌和微藻。
55.权利要求50的微生物,其中该微生物为细菌。
56.权利要求55的微生物,其中该细菌选自固氮菌和假单胞菌。
57.权利要求50的微生物,其中该微生物为真菌。
58.权利要求57的微生物,其中该真菌为酵母。
59.权利要求58的微生物,其中该酵母选自Saccharomyces。
60.一种产生抗坏血酸或其酯的植物,其中该植物具有增加选自下组之酶的作用的遗传修饰:己糖激酶,葡萄糖磷酸异构酶,磷酸甘露糖异构酶,磷酸甘露糖变位酶,GDP-D-甘露糖焦磷酸化酶,GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶。
61.权利要求60的植物,其中所述遗传修饰是增加选自GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶,GDP-L-半乳糖磷酸化酶,L-半乳糖-1-P-磷酸酶,L-半乳糖脱氢酶,和L-半乳糖酸-γ-内酯脱氢酶的一种酶的作用。
62.权利要求60的植物,其中所述遗传修饰是增加GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
63.权利要求60的植物,其中该植物经遗传修饰而表达能编码催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化之差向异构酶的重组核酸分子,其中该差向异构酶具有与由Brookhaven蛋白数据库登陆码为1bws的原子坐标代表的GDP-4-酮基-6-脱氧-D-甘露糖差向异构酶/还原酶三级结构中至少25%的Cα位点的平均均方根偏差小于约2.5埃的结构。
64.权利要求60的植物,其中该植物还包含一种遗传修饰,其可降低以GDP-D-甘露糖为底物之酶的作用,而不降低GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用。
65.权利要求60的植物,其中所述可降低以GDP-D-甘露糖为底物之酶的作用,而不降低GDP-D-甘露糖:GDP-L-半乳糖差向异构酶的作用的遗传修饰是降低GDP-D-甘露糖脱氢酶的作用。
66.权利要求60的植物,其中该植物为微藻。
67.权利要求66的植物,其中该植物选自Prototheca和Chlorella。
68.权利要求66的植物,其中该微藻选自Prototheca。
69.权利要求60的植物,其中该植物是高等植物。
70.权利要求60的植物,其中该植物可消费的高等植物。
71.一种产生抗坏血酸或其酯的微生物,其中该微生物经遗传修饰而表达能编码催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化之差向异构酶的一种重组核酸分子,其中该差向异构酶包含与SEQ ID NO:11用CLUSTAL对比排列程序可对比排列的氨基酸序列,其中该氨基酸序列中的氨基酸残基与SEQ ID NO:11中至少约50%的非Xaa残基有100%的同一性。
72.一种产生抗坏血酸或其酯的植物,其中该植物经遗传修饰而表达能编码催化GDP-D-甘露糖向GDP-L-半乳糖转化之差向异构酶的一种重组核酸分子,其中该差向异构酶包含与SEQ ID NO:11用CLUSTAL对比排列程序可对比排列的氨基酸序列,其中该氨基酸序列中的氨基酸残基与SEQID NO:11中至少约50%的非Xaa残基有100%的同一性。
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CN101978043B (zh) * | 2007-05-08 | 2013-06-19 | 贺利氏贵金属有限及两合公司 | 产生可用作抗癌药的蒽环类代谢物的遗传修饰菌株 |
CN101918571B (zh) * | 2007-11-19 | 2014-07-09 | 诺维信公司 | 产生发酵产物的方法 |
CN104004776A (zh) * | 2003-08-14 | 2014-08-27 | 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 | 对l-抗坏血酸进行微生物生产的方法 |
CN104372015A (zh) * | 2014-11-03 | 2015-02-25 | 青岛农业大学 | 花生维生素C合成相关基因AhPMM及其应用 |
CN107034142A (zh) * | 2008-11-28 | 2017-08-11 | 泰拉瑞亚控股公司 | 在异养型微生物中制备特制油 |
CN108384877A (zh) * | 2018-04-17 | 2018-08-10 | 南京农业大学 | BcGGP基因的InDel分子标记引物及应用 |
CN108611344A (zh) * | 2016-12-10 | 2018-10-02 | 中国科学院大连化学物理研究所 | AtAGM2与AtAGM3编码基因及酶的制备与应用 |
CN112708687A (zh) * | 2021-02-04 | 2021-04-27 | 瑞安市人民医院 | 肠道菌群在肝性脑病检测中的应用 |
CN113265434A (zh) * | 2021-05-19 | 2021-08-17 | 吉林大学 | 一种合成udp-半乳糖及合成半乳糖基化合物的方法 |
Families Citing this family (30)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20020100075A1 (en) * | 1999-03-29 | 2002-07-25 | Conklin Patricia L. | Transgenic plants with increased expression of VTC4 gene |
EP2275540B1 (en) | 1999-04-09 | 2016-03-23 | Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. | Method for controlling the activity of immunologically functional molecule |
JP2001145488A (ja) | 1999-11-19 | 2001-05-29 | Natl Inst Of Advanced Industrial Science & Technology Meti | シロイヌナズナ由来のgdp−4−ケト−6−デオキシ−d−マンノース−3,5−エピメラーゼ−4−レダクターゼ遺伝子 |
CN1311329A (zh) * | 2000-02-29 | 2001-09-05 | 复旦大学 | 一种新的多肽——人磷酸甘露糖异构酶16和编码这种多肽的多核苷酸 |
US7795002B2 (en) | 2000-06-28 | 2010-09-14 | Glycofi, Inc. | Production of galactosylated glycoproteins in lower eukaryotes |
US6630330B1 (en) * | 2000-08-02 | 2003-10-07 | Biopolo S.C.A.R.L. | Ascorbic acid production from yeast |
US6946292B2 (en) | 2000-10-06 | 2005-09-20 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Cells producing antibody compositions with increased antibody dependent cytotoxic activity |
MXPA03002974A (es) * | 2000-10-06 | 2004-05-05 | Kyowa Hakko Kogyo Kk | Celulas que producen composiciones de anticuerpo. |
FR2820973B1 (fr) * | 2001-02-19 | 2003-05-23 | Oreal | Composition comportant de la vitamine c preparee durant l'application, utilisation d'enzymes pour la formation de vitamine c a usage topique et procede de traitement cosmetique |
WO2002103001A1 (en) * | 2001-06-15 | 2002-12-27 | Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Vzw | Gdp-mannose-3',5'-epimerase and methods of use thereof |
US20040093621A1 (en) * | 2001-12-25 | 2004-05-13 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd | Antibody composition which specifically binds to CD20 |
US7691810B2 (en) | 2003-10-09 | 2010-04-06 | Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd | Method of producing recombinant antithrombin III composition |
JP2007535317A (ja) * | 2004-04-15 | 2007-12-06 | グライコフィ, インコーポレイテッド | 下等真核生物におけるガラクトシル化された糖タンパク質の産生 |
US20080305532A1 (en) * | 2005-02-11 | 2008-12-11 | Bastien Chevreux | Gene For Coenzyme Pqq Synthesis Protein B From Gluconobacter Oxydans |
EP2371967B1 (en) | 2005-03-18 | 2015-06-03 | DSM IP Assets B.V. | Production of carotenoids in oleaginous yeast and fungi |
US20060234360A1 (en) * | 2005-04-13 | 2006-10-19 | Paola Branduardi | Ascorbic acid production from D-glucose in yeast |
EP2078092A2 (en) | 2006-09-28 | 2009-07-15 | Microbia, Inc. | Production of carotenoids in oleaginous yeast and fungi |
MY154965A (en) * | 2007-06-01 | 2015-08-28 | Solazyme Inc | Production of oil in microorganisms |
US20100170144A1 (en) * | 2008-04-09 | 2010-07-08 | Solazyme, Inc. | Hydroprocessing Microalgal Oils |
CN104561150A (zh) | 2008-04-09 | 2015-04-29 | 索拉兹米公司 | 微生物生物质和微生物油的直接化学修饰 |
KR101916421B1 (ko) | 2010-05-28 | 2018-11-08 | 테라비아 홀딩스 인코포레이티드 | 종속영양 미생물유기체로부터 생성된 맞춤 오일 |
EP3521408B1 (en) | 2010-11-03 | 2021-12-22 | Corbion Biotech, Inc. | Genetically-engineered chlorella or prototheca microbe and oil produced therefrom |
MX351063B (es) | 2011-02-02 | 2017-09-29 | Terravia Holdings Inc | Aceites adaptados producidos a partir de microorganismos oleaginosos recombinantes. |
CN103608450A (zh) | 2011-05-06 | 2014-02-26 | 索拉兹米公司 | 基因工程改造的代谢木糖的微生物 |
JP6499577B2 (ja) | 2012-04-18 | 2019-04-10 | テラヴィア ホールディングス, インコーポレイテッド | 調整油 |
US9249252B2 (en) | 2013-04-26 | 2016-02-02 | Solazyme, Inc. | Low polyunsaturated fatty acid oils and uses thereof |
CA2925527A1 (en) | 2013-10-04 | 2015-04-09 | Solazyme, Inc. | Tailored oils |
EP3167053B1 (en) | 2014-07-10 | 2019-10-09 | Corbion Biotech, Inc. | Novel ketoacyl acp synthase genes and uses thereof |
EP3547826A4 (en) * | 2016-12-01 | 2020-05-20 | Arkansas State University-Jonesboro | METHOD FOR IMPROVING CHLOROPLASTIC FUNCTION AND INCREASING SEEDLING YIELD |
FR3061544B1 (fr) | 2016-12-30 | 2019-08-23 | Produits Berger | Bruleur a combustion catalytique en materiau poreux a performances de fonctionnement optimisees et flacon equipe d'un tel bruleur |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4595659A (en) * | 1983-10-20 | 1986-06-17 | Kraft, Inc. | Fermentation production of ascorbic acid from L-galactonic substrate |
AU1775299A (en) * | 1997-12-23 | 1999-07-19 | Ascorbex Limited | Plant galactose dehydrogenase |
-
1999
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- 1999-05-26 JP JP2000553608A patent/JP2002517256A/ja active Pending
- 1999-05-26 MX MXPA00012246A patent/MXPA00012246A/es unknown
- 1999-05-26 WO PCT/US1999/011576 patent/WO1999064618A1/en not_active Application Discontinuation
Cited By (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104004776A (zh) * | 2003-08-14 | 2014-08-27 | 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 | 对l-抗坏血酸进行微生物生产的方法 |
CN101978043B (zh) * | 2007-05-08 | 2013-06-19 | 贺利氏贵金属有限及两合公司 | 产生可用作抗癌药的蒽环类代谢物的遗传修饰菌株 |
CN101918571B (zh) * | 2007-11-19 | 2014-07-09 | 诺维信公司 | 产生发酵产物的方法 |
CN107034142A (zh) * | 2008-11-28 | 2017-08-11 | 泰拉瑞亚控股公司 | 在异养型微生物中制备特制油 |
CN104372015A (zh) * | 2014-11-03 | 2015-02-25 | 青岛农业大学 | 花生维生素C合成相关基因AhPMM及其应用 |
CN108611344A (zh) * | 2016-12-10 | 2018-10-02 | 中国科学院大连化学物理研究所 | AtAGM2与AtAGM3编码基因及酶的制备与应用 |
CN108384877A (zh) * | 2018-04-17 | 2018-08-10 | 南京农业大学 | BcGGP基因的InDel分子标记引物及应用 |
CN108384877B (zh) * | 2018-04-17 | 2021-05-07 | 南京农业大学 | BcGGP基因的InDel分子标记引物及应用 |
CN112708687A (zh) * | 2021-02-04 | 2021-04-27 | 瑞安市人民医院 | 肠道菌群在肝性脑病检测中的应用 |
CN112708687B (zh) * | 2021-02-04 | 2021-11-09 | 瑞安市人民医院 | 肠道菌群在肝性脑病检测中的应用 |
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Also Published As
Publication number | Publication date |
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