CN115315443A - 抗sars-cov-2抗体和其用途 - Google Patents

抗sars-cov-2抗体和其用途 Download PDF

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Abstract

本发明提供经修饰的抗SARS‑COV‑2抗体或其抗原结合片段，其具有延长的半衰期和优化的免疫活性。本发明还揭露关于包括上述抗体或其抗原结合片段的药物组合物和一种用于治疗或预防人类患者的由SARS‑COV‑2感染所引起或与其有关的疾病的方法。

Description

抗SARS-COV-2抗体和其用途
交叉引用
本申请案主张2020年3月20日申请的申请案第CN202010203065.1号；2020年3月21日申请的PCT/CN2020/080532；2020年4月10日申请的PCT/CN2020/084097；2020年4月14日申请的PCT/CN2020/084805；和2020年8月12日申请的PCT/CN2020/108718的优先权；上述申请案以引用的方式并入本文中。
发明领域
本发明大体上涉及新型抗SARS-COV-2抗体、含有上述抗SARS-COV-2抗体的药物组合物和其用途。
背景技术
新冠状病毒SARS-CoV-2的近期爆发造成严重的全球健康紧急情况。SARS-CoV-2为正义单链RNA(+ssRNA)病毒，其属于β冠状病毒家族且与包含严重急性呼吸道综合征冠状病毒(SARS-CoV，也称作SARS-CoV-1)和中东呼吸道综合征冠状病毒(MERS-CoV)的其它病原性人类β冠状病毒共有大量的遗传和功能类似性。类似于其它冠状病毒，SARS-CoV-2具有四种结构蛋白，称为S(刺突)蛋白、E(包膜)蛋白、M(膜)蛋白和N(核衣壳)蛋白；S蛋白、E蛋白和M蛋白一起产生病毒包膜；包膜内部为与RNA基因组(～30kb)以连续的珠子串式构象结合的N蛋白。
刺突蛋白为负责让SARS-CoV-2病毒连接到宿主细胞膜的蛋白质，SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)识别且连接到宿主细胞的血管紧张素转化酶2(Angiotensin-converting enzyme 2(ACE2))受体以将其用作细胞进入的机制。总体ACE2结合机制在SARS-CoV-2 RBD与SARS-CoV RBD之间几乎相同，从而指示这些两种病毒之间的趋同ACE2结合演变。这表明RBD和ACE2相互作用的破坏将阻断SARS-CoV-2进入到目标细胞中。实际上，已显示少数此类靶向ACE2的破坏性药剂抑制SARS-CoV感染。然而，鉴于活体内ACE2的重要生理学作用，这些药剂可具有不理想的副作用。在另一方面，抗RBD抗体因此更有利。此外，在实验动物中基于SARS-CoV-RBD或MERS-CoV RBD的疫苗研究也已显示抑制病毒进入的强多克隆抗体反应。此类关键概念验证结果指示抗RBD抗体可能有效地阻断SARS-CoV-2进入。
目前没有SARS-CoV-2特异性治疗或疫苗可用，且目前用于SARS-CoV-2感染的现有检测措施既耗时又不灵敏。因此，迫切需要新型抗SARS-CoV-2抗体。
发明内容
在一个方面中，本发明涉及一种经修饰抗体或其抗原结合片段，其包括至少一种具有抗原结合亲和力的抗原结合域和共价连接的经修饰人类IgG恒定域，其中上述抗原结合亲和力包括SARS-CoV-2结合亲和力，上述抗原结合亲和力包括，相较于所述SARS-CoV-2结合亲和力，对SARS-CoV或MERS-CoV低至少50％或不可检测的结合亲和力，且其中上述经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号，相较于具有野生型人类IgG恒定域的抗体对FcRn的亲和力，上述经修饰抗体对FcRn的亲和力增加。
在另一方面中，本发明涉及一种药物组合物，其包括至少一种本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段、至少一种编码上述经修饰抗体或其抗原结合片段的核酸或其组合，和一种或多种药学上可接受的载剂。
在另一方面中，本发明涉及一种用于治疗或预防有需要的个体的疾病的方法，上述方法包括向上述个体施用有效剂量的本文所揭露的药物组合物中的任一者；
其中上述药物组合物经配置以向上述个体施用以在施用上述药物组合物之后，使上述经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在10μg/mL到3500μg/mL的治疗有效范围内，持续1天到12个月的范围内的时间段；且
其中上述个体感染有上述SARS-CoV-2，展现感染有上述SARS-CoV-2的一种或多种症状或具有感染有上述SARS-CoV-2的风险。
在另一方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其能够特异性结合到SARS-CoV-2且展现对SARS-CoV或MERS-CoV低至少50％或不可检测的结合。
在另一方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其具有一个或多个选自由以下组成的群组的特征：a)能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白且展现与SARS-CoV的刺突蛋白或MERS-CoV的刺突蛋白低至少50％的结合；b)能够特异性结合到包括SEQ ID NO:128的氨基酸序列的上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)；c)展现与包括SEQ ID NO:124的氨基酸序列的SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其水平为不可检测的或不超过与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合的50％；d)展现与包括SEQ ID NO:126的氨基酸序列的MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其水平为不可检测的或不超过与上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合的50％；e)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，其Kd值不超过1×10-7M，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量；f)展现结合到SARS-CoV的刺突蛋白的上述RBD或MERS-CoV的刺突蛋白的上述RBD，其Kd值为至少1×10-6M，如通过SPR所测量；g)能够展现在1μM下与2μM血管紧张素转化酶2(ACE2)受体至少30％的竞争以结合到以250的共振单位(RU)固定的SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，如通过SPR所测量；h)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，其中和活性的IC50值不超过100μg/ml(例如，不超过50μg/ml、不超过40μg/ml、不超过30μg/ml、不超过25μg/ml、不超过20μg/ml、不超过15μg/ml、不超过10μg/ml、不超过8μg/ml、不超过6μg/ml、不超过4μg/ml、不超过2μg/ml或不超过1μg/ml)，如通过假病毒中和检定所测量；和i)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，其中和活性的IC50值不超过1μg/ml(例如，不超过50ng/ml、不超过40ng/ml、不超过30ng/ml、不超过25ng/ml、不超过20ng/ml、不超过15ng/ml、不超过10ng/ml、不超过8ng/ml、不超过6ng/ml、不超过4ng/ml、不超过2ng/ml或不超过1ng/ml)，如通过使用病灶减少中和测试(focus reduction neutralization test(FRNT))方法进行的活病毒中和检定所测量。
在又一方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13。
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在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147和SEQ ID NO:148。
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在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:170和SEQ ID NO:171。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:180和SEQ ID NO:181。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:190和SEQ ID NO:191。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:200和SEQ ID NO:201。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:210和SEQ ID NO:211。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:220和SEQ ID NO:221。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:230和SEQ ID NO:231。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:240和SEQ ID NO:241。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:250和SEQ ID NO:251。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:260和SEQ ID NO:261。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:270和SEQ ID NO:271。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280和SEQ ID NO:281。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:290和SEQ ID NO:291。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:300和SEQ ID NO:301。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:310和SEQ ID NO:311。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:320和SEQ ID NO:321。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:330和SEQ ID NO:331。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:340和SEQ ID NO:341。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:350和SEQ ID NO:351。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:360和SEQ ID NO:361。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:370和SEQ ID NO:371。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:380和SEQ ID NO:381。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:390和SEQ ID NO:391。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:400和SEQ ID NO:401。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:410和SEQ ID NO:411。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:420和SEQ ID NO:421。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:430和SEQ ID NO:431。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:1的序列的重链CDR1(HCDR1)、包括SEQ ID NO:2的序列的重链CDR2(HCDR2)、包括SEQ ID NO:3的序列的重链CDR3(HCDR3)、包括SEQ ID NO:4的序列的轻链CDR1(LCDR1)、包括SEQ ID NO:5的序列的轻链CDR2(LCDR2)和包括SEQ ID NO:6的序列的轻链CDR3(LCDR3)。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:11的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:12的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:13的序列的HCDR3、包括SEQID NO:14的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:15的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:16的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:21的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:22的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:23的序列的HCDR3、包括SEQID NO:24的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:25的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:26的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:31的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:32的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:33的序列的HCDR3、包括SEQID NO:34的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:35的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:36的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:41的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:42的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:43的序列的HCDR3、包括SEQID NO:44的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:45的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:46的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:51的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:52的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:53的序列的HCDR3、包括SEQID NO:54的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:55的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:56的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:65的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:66的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:67的序列的HCDR3、包括SEQID NO:68的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:69的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:70的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:75的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:76的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:77的序列的HCDR3、包括SEQID NO:78的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:79的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:80的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:85的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:86的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:87的序列的HCDR3、包括SEQID NO:88的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:89的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:90的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:95的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:96的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:97的序列的HCDR3、包括SEQID NO:98的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:99的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:100的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:105的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107的序列的HCDR3、包括SEQID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:136的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或SEQ ID NO:448的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:146的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:147的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:148的序列的HCDR3、包括SEQID NO:149的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:150的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:151的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:156的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:157的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:158的序列的HCDR3、包括SEQID NO:159的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:160的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:161的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:166的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:167的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:168的序列的HCDR3、包括SEQID NO:169的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:170的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:171的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:176的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:177的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:178的序列的HCDR3、包括SEQID NO:179的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:180的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:181的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:186的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:187的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:188的序列的HCDR3、包括SEQID NO:189的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:190的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:191的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:196的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:197的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:198的序列的HCDR3、包括SEQID NO:199的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:200的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:201的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:206的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:207的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:208的序列的HCDR3、包括SEQID NO:209的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:210的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:211的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:216的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:217的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:218的序列的HCDR3、包括SEQID NO:219的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:220的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:221的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:226的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:227的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:228的序列的HCDR3、包括SEQID NO:229的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:230的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:231的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:236的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:237的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:238的序列的HCDR3、包括SEQID NO:239的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:240的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:241的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:246的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:247的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:248的序列的HCDR3、包括SEQID NO:249的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:250的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:251的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:256的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:257的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:258的序列的HCDR3、包括SEQID NO:259的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:260的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:261的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:266的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:267的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:268的序列的HCDR3、包括SEQID NO:269的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:270的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:271的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:276的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:277的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:278的序列的HCDR3、包括SEQID NO:279的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:280的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:281的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:286的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:287的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:288的序列的HCDR3、包括SEQID NO:289的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:290的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:291的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:296的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:297的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:298的序列的HCDR3、包括SEQID NO:299的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:300的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:301的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:306的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:307的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:308的序列的HCDR3、包括SEQID NO:309的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:310的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:311的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:316的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:317的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:318的序列的HCDR3、包括SEQID NO:319的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:320的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:321的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:326的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:327的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:328的序列的HCDR3、包括SEQID NO:329的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:330的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:331的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:336的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:337的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:338的序列的HCDR3、包括SEQID NO:339的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:340的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:341的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:346的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:347的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:348的序列的HCDR3、包括SEQID NO:349的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:350的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:351的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:356的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:357的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:358的序列的HCDR3、包括SEQID NO:359的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:360的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:361的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:366的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:367的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:368的序列的HCDR3、包括SEQID NO:369的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:370的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:371的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:376的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:377的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:378的序列的HCDR3、包括SEQID NO:379的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:380的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:381的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:386的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:387的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:388的序列的HCDR3、包括SEQID NO:389的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:390的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:391的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:396的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:397的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:398的序列的HCDR3、包括SEQID NO:399的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:400的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:401的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:406的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:407的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:408的序列的HCDR3、包括SEQID NO:409的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:410的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:411的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:416的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:417的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:418的序列的HCDR3、包括SEQID NO:419的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:420的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:421的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:426的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:427的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:428的序列的HCDR3、包括SEQID NO:429的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:430的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:431的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括来自包括选自由以下组成的群组的氨基酸序列的重链可变区的HCDR1、HCDR2和HCDR3：SEQ ID NO：7、17、27、37、47、57、61、71、81、91、101、111、142、152、162、172、182、192、202、212、222、232、242、252、262、272、282、292、302、312、322、332、342、352、362、372、382、392、402、412、422、432和449。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括来自包括选自由以下组成的群组的氨基酸序列的轻链可变区的LCDR1、LCDR2和LCDR3：SEQ ID NO：8、18、28、38、48、58、62、72、82、92、102、112、143、153、163、173、183、193、203、213、223、233、243、253、263、273、283、293、303、313、323、333、343、353、363、373、383、393、403、413、423和433。
本文所揭露的抗体和抗原结合片段的CDR边界可通过Kabat、IMGT、Chothia或Al-Lazikani的惯例界定或鉴定(Al-Lazikani,B.,Chothia,C.,Lesk,A.M.,J.Mol.Biol.,273(4),927(1997)；Chothia,C.等人,J Mol Biol.Dec 5；186(3):651-63(1985)；Chothia,C.和Lesk,A.M.,J.Mol.Biol.,196,901(1987)；Chothia,C.等人,Nature.Dec 21-28；342(6252):877-83(1989)；Kabat E.A.等人,Sequences of Proteins of immunologicalInterest,第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)；Marie-Paule Lefranc等人,Developmental and Comparative Immunology,27:55-77(2003)；Marie-Paule Lefranc等人,Immunome Research,1(3),(2005)；Marie-Paule Lefranc,Molecular Biology of B cells(第二版),第26章,481-514,(2015))。在一些实施例中，使用IMGT编号确定HCDR和LCDR。
在一些实施例中，使用Kabat编号确定HCDR和LCDR。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:437和SEQ ID NO:438。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:439、SEQ ID NO:440和SEQ ID NO:441。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:437的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:441的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:443和SEQ ID NO:444。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:445、SEQ ID NO:446和SEQ ID NO:447。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括：包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:443的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:446的序列的LCDR2和包括SEQID NO:447的序列的LCDR3。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括重链可变区，上述重链可变区包括选自由以下组成的群组的序列：SEQ ID NO：7、17、27、37、47、57、61、71、81、91、101、111、142、152、162、172、182、192、202、212、222、232、242、252、262、272、282、292、302、312、322、332、342、352、362、372、382、392、402、412、422和432，或与其具有至少80％序列一致性的同源序列。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括轻链可变区，上述轻链可变区包括选自由以下组成的群组的序列：SEQ ID NO：8、18、28、38、48、58、62、72、82、92、102、112、143、153、163、173、183、193、203、213、223、233、243、253、263、273、283、293、303、313、323、333、343、353、363、373、383、393、403、413、423和433，或与其具有至少80％序列一致性的同源序列。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括一对选自由以下组成的群组的重链可变区和轻链可变区序列：SEQ ID NO：7/8、17/18、27/28、37/38、47/48、57/58、61/62、71/72、81/82、91/92、101/102、111/112、142/143、152/153、162/163、172/173、182/183、192/193、202/203、212/213、222/223、232/233、242/243、252/253、262/263、272/273、282/283、292/293、302/303、312/313、322/323、332/333、342/343、352/353、362/363、372/373、382/383、392/393、402/403、412/413、422/423和432/433，或一对与其具有至少80％序列一致性但仍保持与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的特异性结合亲和力的同源序列。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段进一步包括免疫球蛋白恒定区。在一些实施例中，上述免疫球蛋白恒定区为人类免疫球蛋白的恒定区。在一些实施例中，上述免疫球蛋白恒定区为人类IgG的恒定区。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括人类IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、IgA2或IgM的重链恒定区。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括人类IgG1的重链恒定区。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括人类免疫球蛋白κ1轻链的恒定区。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括人类免疫球蛋白λ轻链的恒定区。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段包括一个或多个氨基酸残基取代或修饰，但仍保持与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的特异性结合亲和力。
在一些实施例中，上述抗体或抗原结合片段为亲和力变体、糖基化变体、半胱氨酸工程化变体或Fc变体。
在一些实施例中，糖基化变体包括在N297的突变(例如，N297A、N297Q或N297G)，例如以修饰糖基化位点。
在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个引起相对于野生型Fc增加的效应功能的氨基酸残基修饰或取代。在一些实施例中，Fc变体包括在Fc区的选自由以下组成的群组的位置中的一者或多者的一个或多个氨基酸取代：234、235、236、238、239、240、241、243、244、245、246、247、248、249、252、254、255、256、258、260、262、263、264、265、267、268、269、270、272、274、276、278、280、283、285、286、289、290、292、293、294、295、296、298、299、300、301、303、304、305、307、309、312、313、315、320、322、324、325、326、327、329、330、331、332、333、334、335、337、338、339、340、345、360、373、376、378、382、388、389、396、398、414、416、419、430、433、434、435、436、437、438、439和440，其中Fc区中的残基的编号为如Kabat中的EU索引的编号。在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：234Y、235Q、236A、236W、239D、239E、239M、243L、247I、267E、268D、268E、268F、270E、280H、290S、292P、298A、298D、298V、300L、305I、324T、326A、326D、326W、330L、330M、333S、332D、332E、333A、334A、334E、339D、339Q、345R、396L、430G、440Y和其任何组合。在一些实施例中，具有增加的效应功能的Fc变体包括选自由以下组成的群组的突变组合：a)S239D、I332E和A330L；b)F243L、R292P、Y300L、V305I和P396L；c)S239D和I332E；d)S239D、I332E和A330L；e)S298A、E333A和K334A；f)L234Y、L235Q、G236W、S239M、H268D、D270E和S298A(在一个重链中)和D270E、K326D、A330M和K334E(在对置重链中)；G236A、S239D和I332E；g)K326W和E333S；h)S267E、H268F和S324T；i)E345R、E430G和S440Y。
在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个引起相对于野生型Fc降低的效应功能的氨基酸残基修饰或取代。在一些实施例中，Fc变体包括在Fc区的选自由以下组成的群组的位置处的一个或多个氨基酸取代：220、226、229、233、234、235、236、237、238、267、268、269、270、297、309、318、320、322、325、328、329、330和331，其中Fc区中的残基的编号为如Kabat中的EU索引的编号。在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：220S、226S、228P、229S、233P、234V、234G、234A、234F、234A、235A、235G、235E、236E、236R、237A、237K、238S、267R、268A、268Q、269R、297A、297Q、297G、309L、318A、322A、325L、328R、330S、331S和其任何组合。在一些实施例中，具有降低的效应功能的Fc变体包括选自由以下组成的群组的突变组合：a)K322A、L234A和L235A；b)P331S、L234F和L235E；c)L234A和L235A；c)N297A；d)N297Q；e)N297G；f)L235E；g)L234A和L235A(IgG1)；h)F234A和L235A(IgG4)；i)H268Q、V309L、A330S和P331S(IgG2)；j)V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S和P331S(IgG2)。
在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个氨基酸残基修饰或取代，其引起在pH6.0下与新生儿Fc受体(FcRn)的结合亲和力改善同时在pH 7.4下保持最小结合，或引起抗体的血清半衰期增加。在一些实施例中，Fc变体包括在选自由以下组成的群组的位置处的一个或多个氨基酸取代：234(例如用F)、235(例如用Q)、238(例用有D)、250(例如用E或Q)、252(例如用L/Y/F/W或T)、254(例如用S或T)、256(例如用S/R/Q/E/D或T)、259(例如用I)、272(例如用A)、305(例如用A)、307(例如用A或P)、308(例如用F、C或P)、311(例如用A或R)、312(例如用A)、322(例如用Q)、328(例如用E)、331(例如用A)、378(例如用A)、380(例如用A)、382(例如用A)、428(例如用L或F)、432(例如用C)、433(例如用H/L/R/S/P/Q或K)、434(例如用H/F或Y或S或A或W)、435(例如用H)、436(例如用L)和437(例如用C)(所有位置通过Eu编号)。在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：234F、235Q、238D、250Q、252T、252Y、254T、256E、259I、272A、305A、307A、308F、311A、322Q、328E、331S、380A、428L、432C、433K、433S、434S、434Y、434F、434W、434A、435H、436L、437C和其任何组合。在一些实施例中，具有增加的血清半衰期或对FcRn改善的pH依赖性结合的Fc变体包括选自由以下组成的群组的突变组合：a)M428L和N434S；b)P238D和L328E；c)M252Y、S254T和T256E；d)L234F、L235Q、K322Q、M252T、S254T和T256E；e)M428L、V259I和V308F；f)H433K和N434Y；g)H433K和N434F；h)T250Q和M428L；i)T307A、E380A和N434A；和j)432C、433S、434W、435H、436L、437C。
在一些实施例中，取代或修饰中的至少一者处于CDR序列中的一者或多者中。在一些实施例中，取代或修饰中的至少一者处于重链可变区或轻链可变区的非CDR序列中的一者或多者中。在一些实施例中，取代中的至少一者为保守取代。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段为单克隆抗体、双特异性抗体、多特异性抗体、重组抗体、经标记抗体、二价抗体、抗个体基因型抗体、融合蛋白或二聚抗体或聚合抗体，或经修饰抗体(例如，糖基化抗体)。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段为双功能抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫键稳定的双功能抗体(ds diabody)、单链抗体分子(scFv)、scFv二聚体(二价双功能抗体)、双特异性scFv二聚体、多特异性抗体、重链抗体、骆驼化单域抗体(camelized single domain antibody)、纳米抗体(nanobody)、域抗体(domain antibody)或二价域抗体。在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段为完全人类抗体。
在一些实施例中，本发明的抗体或抗原结合片段连接到一个或多个缀合物部分。在一些实施例中，缀合物部分包括治疗剂、放射性同位素、可检测标记、药物动力学修饰部分或纯化部分。在一些实施例中，缀合物部分直接或经由连接子共价连接。
在一个方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其与本文所描述的抗体或其抗原结合片段竞争结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD。
在另一方面中，本发明提供双特异性抗体分子，其包括如本文所揭露的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段。
在某些实施例中，本文所提供的双特异性或二价抗体包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一抗原结合域源自选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。第二抗原结合域可源自任何适合的抗体。
在某些实施例中，本文所提供的双特异性抗体包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一和第二抗原结合域源自任何两种选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2B-1G5。
在某些实施例中，双特异性抗体分子具有至少两个具有不同特异性的独特抗原结合位点。
在某些实施例中，本文所提供的双特异性抗体分子能够结合到SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白上的不同抗原表位。在一些实施例中，两种或更多种抗体结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD中的不同抗原表位。
在某些实施例中，本文所提供的双特异性抗体分子具有针对SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白的RBD的第一抗原结合域特异性和针对第二抗原的第二抗原结合域特异性。
在另一方面中，本发明提供一种经分离多核苷酸，其编码如本文所描述的抗体或其抗原结合片段。
在一些实施例中，本发明的经分离多核苷酸包括选自由以下组成的群组的核苷酸序列：SEQ ID NO：9-10、19-20、29-30、39-40、49-50、59-60、63-64、73-74、83-84、93-94、103-104、113-114、144-145、154-155、164-165、174-175、184-185、194-195、204-205、214-215、224-225、234-235、244-245、254-255、264-265、274-275、284-285、294-295、304-305、314-315、324-325、334-335、344-345、354-355、364-365、374-375、384-385、394-395、404-405、414-415、424-425和434-435，或与其具有至少80％序列一致性的同源序列。
在一些实施例中，同源序列编码与由选自由以下组成的群组的任何核苷酸序列编码相同的蛋白质：SEQ ID NO：9-10、19-20、29-30、39-40、49-50、59-60、63-64、73-74、83-84、93-94、103-104、113-114、144-145、154-155、164-165、174-175、184-185、194-195、204-205、214-215、224-225、234-235、244-245、254-255、264-265、274-275、284-285、294-295、304-305、314-315、324-325、334-335、344-345、354-355、364-365、374-375、384-385、394-395、404-405、414-415、424-425和434-435。
在一个方面中，本发明提供一种载体，其包括本发明的经分离多核苷酸。在一些实施例中，上述载体为表达载体。
在一个方面中，本发明提供一种宿主细胞，其包括本发明的载体。
在一个方面中，本发明提供一种产生本发明的抗体或抗原结合片段的方法。在一些实施例中，上述方法包括在表达本发明的表达载体的条件下培养本发明的宿主细胞。在一些实施例中，本发明的方法进一步包括纯化由宿主细胞产生的抗体。
在一些实施例中，本文所揭露的药物组合物可包括两种或更多种本发明的抗体或抗原结合片段的组合。在一些实施例中，药物组合物包括两种或更多种单克隆抗体的组合，上述单克隆抗体中的每一者包括源自选自由以下组成的群组的抗体的重链CDR序列和轻链CDR序列：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。
在某些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括源自P2C-1F11的重链CDR序列和轻链CDR序列；和第二抗体，其包括源自抗体P2B-2F6的重链CDR序列和轻链CDR序列。在某些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括源自P2C-1F11的重链CDR序列和轻链CDR序列；和第二抗体，其包括源自抗体P2B-1G5的重链CDR序列和轻链CDR序列。
在一些实施例中，两种或更多种抗体或抗原结合片段结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD中的不同抗原表位。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1F11或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1A3、P2C-1C10、P2B-2F6、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1A3或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2B-2F6或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2A-1B3或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1A3、P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-2F6和P2A-1A10，或其抗原结合片段。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1C10或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1A3、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。
在一些实施例中，药物组合物包括编码抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段的多核苷酸和一种或多种药学上可接受的载剂。本发明进一步提供药物组合物，其包括编码两种或更多种抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段的组合的多核苷酸和一种或多种药学上可接受的载剂。在某些实施例中，多核苷酸包括表达载体。在某些实施例中，表达载体包括病毒载体或非病毒载体。在某些实施例中，表达载体适用于人类的基因疗法。在某些实施例中，表达载体包括DNA载体或RNA载体。
在一些实施例中，药物组合物进一步包括第二生物活性剂，例如第二治疗剂或第二预防剂。
在一个方面中，本发明提供一种用于检测SARS-CoV-2抗原的试剂盒，其包括本发明的抗体或抗原结合片段。在一些实施例中，上述试剂盒进一步包括对照试剂，其包括SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD。在一些实施例中，上述试剂盒进一步包括一组用于检测抗体或抗原结合片段与SARS-CoV-2抗原结合的复合物的试剂。
在一个方面中，本发明提供一种治疗个体的SARS-CoV-2感染的方法。本发明还提供一种治疗个体的与SARS-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法。在一些实施例中，上述方法包括向上述个体施用治疗有效量的抗体、抗原结合片段中的一者或多者，或一种或多种编码本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者的多核苷酸，或本发明的药物组合物。
在一个方面中，本发明提供一种预防个体的SARS-CoV-2感染的方法。本发明还提供一种预防个体的与SARS-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法。在一些实施例中，上述方法包括向上述个体施用预防有效量的抗体或抗原结合片段中的一者或多者，或本发明的药物组合物。
在某些实施例中，个体鉴定为具有包括突变体RBD的SARS-CoV-2的感染，上述突变体RBD包括位置K417、E484或N501处的至少一种突变或其任何组合，且其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。
在某些实施例中，位置K417处的突变选自K417N或K417T。在某些实施例中，位置E484处的突变为E484K。在某些实施例中，位置N501处的突变为N501Y。
在某些实施例中，抗体中和包括突变体RBD的SARS-CoV-2，其IC50不超过抗体中和包括具有SEQ ID NO:134的氨基酸序列的RBD的SARS-CoV-2的IC50的10倍(或不超过8倍、6倍、5倍、4倍、3倍、2倍、不超过150倍、不超过120％或不超过100％)，如通过假病毒中和检定所测量(例如，如本文所提供的实例中所描述)。
在一些实施例中，施用是经由经口、经鼻、静脉内、皮下或肌肉内施用。在一些实施例中，个体为人类。在一些实施例中，可通过例如转染技术，例如电穿孔或流体动力注射向个体施用本文所提供的多核苷酸。在一些实施例中，多核苷酸包括例如AAV的病毒载体，且可经由局部注射(例如，肌肉内、鼻内、皮内、皮下等)或全身性施用(例如静脉内施用)来施用。
在一些实施例中，上述方法进一步包括施用治疗有效量的可为治疗剂或预防剂的第二生物活性剂。在一些实施例中，第二治疗剂为抗病毒剂。在一些实施例中，抗病毒剂包括抗病毒肽、抗病毒抗体、抗病毒化合物、抗病毒细胞因子或抗病毒寡核苷酸。在一些实施例中，第二治疗剂为RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂、非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、嘌呤核苷、抗病毒干扰素、金刚烷抗病毒化合物或任何其它适合抗病毒剂。在一些实施例中，第二治疗剂为瑞德西韦(remdesivir)、氯奎(chloroquine)、羟氯奎(hydroxychloroquine)、咯匹那韦(lopinavir)、利托那韦(ritonavir)、APN01、法维拉韦(favilavir)、美沙拉嗪(mesalazine)、托瑞米芬(toremifene)、依普利酮(eplerenone)、帕罗西汀(paroxetine)、西罗莫司(sirolimus)、放线菌素d(dactinomycin)、依贝沙坦(irbesartan)、大黄素、巯基嘌呤、褪黑激素、奎纳克林(quinacrine)、卡维地洛(carvedilol)、秋水仙碱(colchicine)、樟脑、马烯雌酮(equilin)、羟甲烯龙(oxymetholone)、萘莫司他(nafamosta)、卡莫司他(camostat)、巴瑞替尼(baricitinib)、达卢那韦(darunavir)、利巴韦林(ribavirin)、加利司韦(galidesivir)、BCX-4430、阿比朵尔(Arbidol)、硝唑尼特(nitazoxanide)、其衍生物，或其任何组合。
在一个方面中，本发明提供一种检测样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量的方法。在一些实施例中，上述方法包括使上述样本与本发明的抗体或抗原结合片段中的一者或多者接触，和测定上述样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量。
在一个方面中，本发明提供本发明的抗体或抗原结合片段中的一者或多者在制造用于治疗或预防SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的药物中的用途。在一个方面中，本发明提供本发明的抗体或抗原结合片段中的一者或多者在制造用于预防、管理、治疗和/或缓解个体中由冠状病毒(例如SARs-COV-2)感染所引起或与其相关的疾病或病症和/或与所述冠状病毒感染相关的症状或呼吸道病状的药物中的用途。
在一个方面中，本发明提供本发明的抗体或抗原结合片段中的一者或多者在制造用于检测SARS-CoV-2感染的诊断试剂中的用途。
在一个方面中，本发明提供一种用于检测能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)的抗体的试剂盒，其包括含有氨基酸序列的多肽，上述氨基酸序列包括SEQ ID NO:128。在一些实施例中，多肽固定于基质上。在一些实施例中，上述试剂盒进一步包括一组用于检测抗体与多肽结合的复合物的试剂。
在一个方面中，本发明提供一种检测样本中能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的抗体的存在或量的方法，其包括使上述样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的多肽接触，和测定上述样本中抗体的存在或含量。在一些实施例中，样本中不存在抗体或样本中抗体的含量低于阈值表明个体更可能遭受疾病进展。
在另一方面中，本发明提供一种确定感染有SARS-CoV-2的个体的疾病进展可能性的方法，上述方法包括：使从个体获得的样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的多肽接触，和检测上述样本中抗体的存在或含量，其中上述抗体能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，其中当上述样本中的上述抗体不存在或低于阈值时，上述个体有可能经历疾病进展。
在又一方面中，本发明提供一种监测感染有SARS-CoV-2且接受治疗的个体的治疗反应的方法，上述方法包括：(i)使来自上述个体的样本与包括SEQ ID NO:128的氨基酸序列的肽接触；(ii)检测上述样本中抗体的第一含量，其中上述抗体能够特异性结合到上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD；和(iii)比较上述抗体的第一含量与在上述治疗之前上述个体中检测的上述抗体的第二含量；其中上述第一含量高于上述第二含量表明上述个体对上述治疗有反应。
在又一方面中，本发明提供一种中和个体中或活体外样本中的SARS-CoV-2的方法，其包括向上述个体或上述样本施用治疗有效量的本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者或本文所提供的药物组合物。
在又一方面中，本发明提供一种SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗体复合的晶体。在一些实施例中，与RBD复合的抗体包括SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区。在一些实施例中，与RBD复合的抗体包括SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ IDNO:112的轻链可变区。
在一些实施例中，晶体具有P212121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100000261
Figure BDA0003707502100000262
且
Figure BDA0003707502100000263
在一些实施例中，晶体具有C121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100000264
Figure BDA0003707502100000265
且
Figure BDA0003707502100000266
在一些实施例中，晶体具有C2空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100000267
Figure BDA0003707502100000268
且
Figure BDA0003707502100000269
在一些实施例中，晶体具有C2空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA00037075021000002610
Figure BDA00037075021000002611
且
Figure BDA00037075021000002612
在一些实施例中，晶体具有P212121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA00037075021000002613
Figure BDA00037075021000002614
且
Figure BDA00037075021000002615
图式简单说明
以下图式形成本说明书的一部分且包含以进一步展现本发明的某些方面。结合本文中呈现的特定实施例的详细描述参考这些图式中的一者或多者可更好地理解本发明。
图1A到图1F。对SARS-CoV-2具有特异性反应的血浆和B细胞的分析。通过ELISA分析血浆样本的连续稀释液与SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的(A)RBD的结合或(B)三聚刺突的结合，和(C)针对携带SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的包膜糖蛋白的假病毒的中和活性。还评估与SARS-CoV-2 NP蛋白的结合(A)。所有结果均源自至少两个独立实验。(D)用于分析和分离RBD特异性记忆B细胞的闸控策略以及(E和F)其在八个研究个体中的B细胞的总亚群和记忆亚群中的表示。样本视收集顺序而命名为A、B或C。FSC-W，正向散射宽度；FSC-A，正向散射面积；且SSC-A，侧面散射面积。
图2A到图2B。(A)通过个别个体或(B)在八个个体中分析SARS-CoV-2 RBD特异性抗体的重链库(repertoire)。(A)沿着水平条显示的每一个个体中的重链可变(VH)基因使用的分布和频率。针对所有研究个体中的每一个VH家族使用相同色彩方案。在经分离抗体中占主导的VH由其相应颜色框中的实际频率指示。在右侧显示了RBD结合抗体相对于所分离的总抗体的数量。(B)通过无根系统发生树(unrooted phylogenetic tree)分析的在八个个体中VH基因的丛集化和其与ELISA结合活性的关联。按比例绘制分支长度以使得可容易地评定序列相关性。来自同一研究个体的序列以相同颜色显示于分支尖端处。有色圆圈表示在OD 450值大于3时，结合到SARS-CoV-2 RBD的VH丛集的比例(浅橙色，>80％；浅黄色，60％-80％；浅绿色<60％)。显示了最高结合丛集的VH基因家族。
图3A到图3F。P#2抗体库中的特定重链和轻链家族的克隆扩增。(A)所有RBD结合抗体的VH(左)和VL 20(右)基因的谱系学分析。克隆扩增的VH和VL丛集配对且以三种不同颜色突出显示。按比例绘制分支长度以便于评估序列相关性。(B)到(C)基于体细胞超突变(SHM)和CDR3环路长度，关于其它VH和VL家族的成员的克隆扩增。对于VH(左)和VL(右)基因的饼图，半径表示CDR3环路长度且色标指示SHM的程度。沿着饼环显示了每一抗体的重链库和轻链库。(D)到(E)饼图中的重链和轻链的谱系分析。中心的数量表示RBD特异性抗体的数量。每一条带表示独特克隆且与其自身大小成比例。(F)来自IGHV3-53和IGHV3-66以及RBD结合子的不同HCDR3长度的计数。
图4A到图4V。通过假病毒和活SARS-CoV-2分析的抗体结合、与ACE2竞争和中和。(A)通过SPR测量的代表性mAb与SARS-CoV-2 RBD的结合动力学。黑线指示以实验方式导出的曲线，而灰线表示基于实验数据的拟合曲线。(B)通过SPR测量的结合到SARS-CoV-2 RBD的抗体和ACE2竞争。传感图显示在存在或不存在先前与每一代表性抗体一起培育的情况下ACE2与SARS-CoV-2 RBD的独特结合模式。(C和D)通过SARS-CoV-2 RBD结合检定分析的抗体中和。(E到R)通过假病毒检定分析的抗体中和。(S)到(T)通过活SARS-CoV-2中和检定分析的抗体中和，其中虚线指示病毒感染性降低50％。VRC01为HIV-1特异性抗体且在此用作阴性对照。(U)到(V)来自图4A到图4T中的研究的实际值的概述。抗体与RBD的结合通过Kd或通过与ACE2的竞争来呈现，其中“+++”指示>80％竞争；“++”指示50-80％；“+”指示20-50％；且“-”指示<20％。在假病毒和活SARS-CoV-2中和检定中所测试的IC50表示半抑制浓度，而IC80表示80％抑制浓度且IC90表示90％抑制浓度。仅抗体重链在左上角标明其家族名称、CDR3长度和相对于相应生殖系祖先序列的SHM。n.d.，未进行。
图5到图5T。2F6和P2C-1F11分别与SARS-CoV-2 RBD复合的晶体结构，和在抗体/SARS-CoV-2界面处确定的接触残基的列表。(A)2F6 Fab与SARS-CoV-2 RBD复合的整体结构。(B)2F6与SARS-CoV-2 RBD之间的关键相互作用。(C)2F6/RBD复合物与ACE2/RBD复合物(PDB ID：6M0J)比对。圆圈指示ACE2与2F6之间的不一致。(D)SARS-CoV-2刺突(PDB ID：6VSB)显示为分子表面，其中每一原聚体著色浅橙色、浅蓝色和浅绿色。2F6/RBD复合物可与刺突中的“上”RBD(淡橙色)和“下”RBD(浅蓝色)两者比对。2F6重链以紫红色著色，2F6轻链以黄色著色，SARS-CoV-2 RBD以青色著色，且ACE2以绿色著色。(E)在SARS-CoV-2/2F6界面处的接触残基。(F)P2C-1F11 Fab与SARS-CoV-2 RBD复合的整体结构。(G)在SARS-CoV-2/1F11界面处的接触残基。(H)到(K)分别针对抗体P22A-1D1、P5A-1D2、P5A-3C8和P2C-1F11显示了RBD和Fab复合物的总体结构、晶体结构以及与ACE2共享的RBD结合残基。(I)SARS-CoV-2 RBD上的Fab和ACE2的覆盖面积。抗原表位的颜色如图(H)中所描绘。ACE2的抗原表位以绿色著色。(J)(M)保守性HCDR1、HCDR2和不同HCDR3。RBD显示为表面。重链的CDR环路显示为条带。(N)在HCDR1和HCDR2处三种保守性酪氨酸之间的相互作用。(O)HCDR2-SGGS-区段与RBD之间的相互作用。氢键显示为黑色虚线且P5A-3C8/RBD复合物被用作图L和M中的一个实例。对于P22A-1D1(Q)、P5A-3C8(R)和P2C-1F11(S)，RBD上的Y505残基突起到轻链的楔形孔中，然而对于P5A-1D2(P)，Y505由于长HCDR3的结合而展示不同构形。(T)SARS-CoV-2 RBD与P22A-1D1、P5A-3C8、P5A-1D2、P2C-1F11之间的接触的概述(距离截止值
Figure BDA0003707502100000281
)。
图6A到图6C。对结合到细胞表面表达的三聚刺突蛋白的血浆的分析。(A)和(B)将用编码SARS-CoV-2、SARS-CoV或MERS-CoV的全长刺突的表达质粒转染的HEK 293T细胞与来自研究个体的恢复期血浆的1:100稀释液一起培育。细胞接着用经PE标记的抗人类IgG Fc二级抗体染色且通过FACS分析。阳性对照抗体包含靶向SARS-CoV刺突的RBD的S230和m396，和靶向MERS-CoV刺突的RBD的Mab-GD33。VRC01为靶向HIV-1包膜糖蛋白的阴性对照抗体。(C)抗原表位突变对抗体P22A-1D1、P5A-1D2、P5A-3C8、P2C-1F11和P2B-2F6的结合的影响。将细胞表面表达的SARS-CoV-2的野生型或突变型刺突糖蛋白与ACE2、测试抗体和对照抗体S2 mAb一起培育，随后用抗人类IgG Fc PE(针对鉴定的人类抗体)、抗小鼠IgG FITC(针对S2 mAb)或抗his PE(针对ACE2)二级抗体染色且通过FACS分析。P2B-2F6识别SARS-CoV-2RBD上与那些公开抗体不同的抗原表位，且在此用作针对刺突的S1蛋白的阳性对照。S2为对刺突的S2蛋白具有特异性的小鼠单克隆。显示闸控中的细胞百分比。引起结合减少超过80％的突变体是在针对公开抗体的灰色框内或在针对ACE2的橙色框内突出显示。减少百分比是通过MFI加权所测定，上述MFI加权通过乘以所选闸控中的阳性细胞的数量且相对于野生型和S2对照进行归一化。所示的数据来自至少两个独立实验。
图7A到图7K。经由FACS分析和分离的RBD特异性记忆B细胞(A)到(K)。重组RBD经Strep标签或His标签标记且单独或组合使用，以经由用抗生蛋白链菌素-APC和/或抗生蛋白链菌素-PE或抗His-APC和抗His-PE抗体染色来鉴定和分离RBD特异性单一B细胞。以框或椭圆形突出显示待分离的B细胞。样本视收集顺序而命名为A、B或C。FSC-W，正向散射宽度；FSC-A，正向散射面积；且SSC-A，侧面散射面积。
图8。经转染细胞的上清液中SARS-CoV-2 RBD特异性抗体的ELISA筛选。在顶部指示研究个体和采样的日期。样本根据收集顺序而命名为A、B或C。尽可能将针对每一样本测试的抗体排列于一个垂直列中。对于每一评估抗体，进行至少两次独立测量且邻近地呈现于同一行。结合活性是通过OD 450评定且通过右侧的色彩方案指示。对于OD 450值小于0.1，以灰色显示阴性(无结合活性)。
图9A到图9G。分别通过SPR和ELISA测量的经分离mAb与SARS-CoV-2 RBD的结合动力学。(A、B)对于SPR，将纯化的可溶性SARS-CoV-2 RBD、SARS-CoV RBD和MERS-CoV2 RBD共价固定到CM5传感器芯片上，随后注射五个不同浓度的个别抗体。黑线指示以实验方式导出的曲线，而灰线表示基于SPR实验数据的拟合曲线。对于ELISA分析，将重组SARS-CoV RBD和MERS-CoV2 RBD涂布于ELISA板上，且分别针对经SARS-CoV RBD和MERS-CoV2 RBD涂布的板评估每一抗体的连续稀释液并且在450nm和630nm的光学密度(OD)下记录其结合活性。(C到F)对于ELISA分析，S230用作针对SARS-COV的阳性对照抗体，MAB-GD33用作针对MERS-COV的阳性对照抗体，且VRC01用作阴性对照抗体。(G)通过SPR测量经分离mAb与SARS-CoV-2 RBD的结合动力学。
图10A到图10C。针对患者#2(A)、患者#1(B)以及患者#5、#22和#2(C)，通过SPR测量的结合到SARS-CoV-2 RBD的抗体和ACE2竞争。传感图显示在有(对应于“抗体+ACE2”的曲线)或没有(对应于“ACE2”的曲线)先前与每一种测试抗体一起培育的情况下，ACE2与SARS-CoV-2 RBD的不同结合模式。每一种抗体的竞争能力通过比较有或没有先前与抗体培育的ACE2的反应单位的降低水平来指示。
图11A到图11B。对结合到细胞表面表达的三聚刺突蛋白的抗体的分析。将用编码SARS-CoV-2、SARS-CoV或MERS-CoV的全长刺突的表达质粒转染的HEK 293T细胞与20μg/ml测试抗体一起培育(A)和(B)。细胞接着用经PE标记的抗人类IgG Fc二级抗体染色且通过FACS分析。阳性对照抗体包含靶向SARS-CoV刺突的RBD的S230和m396，和靶向MERS-CoV刺突的RBD的Mab-GD33。VRC01为靶向HIV-1包膜糖蛋白的阴性对照抗体。
图12A到图12D。通过病灶减少中和测试(FRNT)分析的针对活SARS-CoV-2的mAb的中和活性。针对活SARS-CoV-2感染测试每一种抗体的连续稀释液。其中和活性是通过由EliSpot读取器(Cellular Technology Ltd)计算的SARS-CoV-2病灶数量的减少表示(A)到(D)。
图13。经由通过SPR测量的竞争性结合绘制抗原表位图。当将测试抗体对依序施加到共价固定到CM5传感器芯片上的纯化SARS-CoV-2 RBD时，传感图显示不同结合模式。比较有或没有与先前抗体培育的反应单位的降低水平为用于确定两种mAb识别分开的或靠近的抗原表位的关键标准。
图14。来自公开克隆型的重链序列的CDR1到CDR3区的多重序列比对。包含抗体P22A-1D1、P5A-1D2、P5A-3C8和P2C-1F11以及IGVH3-53/3-66(用于所示的公开抗体的主要生殖系等位基因分配)。灰色字母显示来自生殖系的突变。
图15A到图15B。单次施用的抗体个别PK曲线拟合群体PK预测模型以及mAb1(A)和mAb2(B)的测量数据。实线：预测的中位数。虚线和圆点：个体中的测量浓度。阴影区表示第5到第95百分位数。
图16。在SARS-CoV-2活病毒微量中和检定中mAb1和mAb2组合的活体外中和活性。
图17A到图17B。在食蟹猕猴中在以10mg/kg单次IV灌注施用mAb1(A)和mAb2(B)之后的平均血清浓度曲线。
图18A到图18C。P2C-1F11(A)和P2B-1G5(B)对SARS-CoV-2变体的中和性能(IC50)。列出IC50值(C)。
图19。RBD-K417N-E484K-N501Y和P2C-1F11的复合物的数据收集和改进统计(分子置换)。
图20A到20C。针对P2C-1F11(A、B)和其它抗体(C)的抗体的中和和脱离的结构基础。
图21。P2C-1F11与突变体RBD-K417N-E484K-N501Y之间的分子相互作用。
图22。P2B-1G5和P2C-1F11中和的结构基础。
具体实施方式
在整个本发明中，冠词“一(a/an)”和“上述(the)”在本文中用于指一种或多于一种(即，至少一种)该冠词的文法对象。借助于实例，“一抗体”意指一种抗体或多于一种抗体。
所属领域的一般技术人员将从阅读以下详细描述开始更容易地理解所揭露组合物和方法的特征和优势。应了解，上文和下文为清楚起见而在单独实施例的情形下描述的所揭露组合物和方法的某些特征也可以单个实施例的组合形式提供。相反地，所揭露组合物和方法为了简便起见在单个实施例的情形下描述的各种特征也可单独或以任何子组合形式提供。另外，除非上下文另外特定陈述，否则单数形式的参考也可包含复数(例如，“一(a/an)”可是指一个或一个或多个)。
尽管在所陈述范围内的最小值和最大值均由字语“约”进行，但除非另外明确指示，否则在本申请案中指定的各种范围中的数值的使用陈述为近似值。以这种方式，高于和低于所陈述范围的微小变化可用于实现与范围内的值大体上相同的结果。此外，这些范围的揭露内容打算为包含最小值与最大值之间的每个数值的连续范围。
如本文中关于参考数值和其文法等效物所使用的术语“约”和其文法等效物可包含从该值加或减10％的值范围，例如从该值加或减10％、9％、8％、7％、6％、5％、4％、3％、2％或1％的值范围。举例来说，量“约10”包含9到11的量。
定义
抗体相关术语
如本文中所使用的术语“抗体”包含结合到特定抗原的任何免疫球蛋白、单克隆抗体、多克隆抗体、单价抗体、二价抗体、多价抗体、双特异性抗体、多特异性抗体。天然的完整抗体包括两个重(H)链和两个轻(L)链。哺乳动物的重链分为α、δ、ε、γ和μ，每个重链由一个可变区(VH)和一个第一、第二、第三和任选的第四恒定区(分别为CH1、CH2、CH3、CH4)组成；哺乳动物的轻链分为λ或κ，而每个轻链由一个可变区(VL)和一个恒定区组成。该抗体呈“Y”形，Y的茎部由两条重链的第二和第三恒定区组成，通过二硫键结合在一起。Y的每个臂包括与单个轻链的可变区和恒定区结合的单个重链的可变区和第一恒定区。轻链和重链的可变区负责与抗原结合。两条链的可变区一般包含三个高度可变的环，其被称为互补性决定区(CDRs)(轻链CDR包括LCDR1、LCDR2和LCDR3，重链CDR包括HCDR1、HCDR2、HCDR3)。
本文所公开的抗体和抗原结合片段的CDR边界可以按照Kabat、IMGT、Chothia或Al-Lazikani的惯例来定义或鉴定(Al-Lazikani,B.,Chothia,C.,Lesk,A.M.,《分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)》,273(4),927(1997)；Chothia,C.等人,《分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)》12月5日；186(3)：651-63(1985)；Chothia，C.和Lesk，A.M.，《分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)》,196,901(1987)；Chothia,C.et al.,《自然(Nature)》.12月21-28日；342(6252)：877-83(1989)；Kabat E.A.等人，《免疫学感兴趣的蛋白质序列(Sequences ofProteins of Immunological Interest)》，第五版，公共卫生服务部门，美国国家卫生研究院，Bethesda，Md.(1991)；Marie-Paule Lefranc等人，《发育与比较免疫学(Developmentaland Comparative Immunology)》，27:55-77(2003)；Marie-Paule Lefranc等人，《免疫组研究(Immunome Research)》，1(3)，(2005)；Marie-Paule Lefranc，《B细胞的分子生物学(Molecular Biology of B cells)》(第二版)，第26章，481-514,(2015))。三个CDRs夹在被称为框架区(FRs)的侧翼之间(轻链FR包括LFR1、LFR2、LFR3和LFR4，重链FR包括HFR1、HFR2、HFR3和HFR4)，所述FR比CDR更高度保守并且形成一个支架来支持高度变化的环。重链和轻链的恒定区域不参与抗原结合，但表现出各种效应功能。根据其重链恒定区的氨基酸序列，抗体被分配到不同的类别。抗体的五个主要类别或同型是IgA、IgD、IgE、IgG和IgM，它们的特点是分别存在α、δ、ε、γ和μ重链。几种主要的抗体类别又分为几个亚类，如IgG1(γ1重链)、IgG2(γ2重链)、IgG3(γ3重链)、IgG4(γ4重链)、IgA1(α1重链)或IgA2(α2重链)。
如本文所使用的术语“抗原结合片段”是指由抗体的一部分形成的抗体片段，所述抗体包括一个或多个CDR或任何其他与抗原结合但不包括完整的天然抗体结构的抗体片段。抗原结合片段的例子包括但不限于双特异抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv片段、二硫稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv)、二硫稳定的双特异抗体(dsdiabody)。单链抗体分子(scFv)，scFv二聚体(二价双特异抗体)，双特异性scFv二聚体，单链Fv-Fc抗体(scFv-Fc)，骆驼化单域抗体，纳米抗体，域抗体，和二价域抗体。抗原结合片段能够与母体抗体所结合的相同抗原结合。
如本文中所使用，“双特异性”抗体是指具有源自两种不同单克隆抗体的片段的人工抗体。双特异性抗体可结合到重叠抗原表位或两个不同抗原表位。两个抗原表位可存在于同一抗原上，或其可存在于两个不同抗原上。因此，术语“多特异性”抗体是指具有源自多个不同单克隆抗体的片段的人工抗体，且可能够结合到超过一个抗原表位。
如本文中所使用的术语“嵌合”意指具有源自一种物种的重链和/或轻链的一部分且上述重链和/或轻链的其余部分源自不同物种的抗体或抗原结合片段。
如本文中所使用的术语“抗原表位”是指抗体所结合的抗原上的特定原子或氨基酸基团。如果两种抗体展现对抗原的竞争性结合，那么其可结合抗原内的相同或紧密相关的抗原表位。抗原表位可为线性或构形的(即，包含间隔开的氨基酸残基)。举例来说，如果抗体或抗原结合片段使参考抗体与抗原的结合阻断至少50％、至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％或至少90％或至少95％，那么抗体或抗原结合片段可视为与参考抗体结合相同/紧密相关的抗原表位。阻断或竞争本发明的抗体或抗原结合片段与SARS-CoV-2的结合的能力通常指示待筛选的抗体或抗原结合片段结合到SARS-CoV-2上的抗原表位或结合位点，上述抗原表位或结合位点在结构上与由本发明的抗体或抗原结合片段免疫特异性识别的SARS-CoV-2上的结合位点重叠。替代地，这可指示待筛选的本发明的抗体或抗原结合片段结合到足够接近于由本发明的抗体或抗原结合片段免疫特异性识别的结合位点的抗原表位或结合位点，以在空间上或以其它方式抑制本发明的抗体或抗原结合片段与SARS-CoV-2的结合。
“Fab”对于一个抗体来说，是指由一条轻链(可变区和恒定区两者)通过二硫键与一条重链的可变区和第一恒定区结合而成的抗体部分。Fab的重链片段称为“Fd”。
“Fab'”是指包括部分铰链区的Fab片段。
“F(ab')2”是指Fab'的二聚体。“Fc”对于抗体(如IgG、IgA或IgD同种型)是指由第一条重链的第二和第三恒定域通过二硫键结合到第二条重链的第二和第三恒定域组成的抗体部分。对于IgM和IgE同种型的抗体来说，Fc还包括第四恒定域。抗体的Fc部分负责各种效应功能，如抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)，抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)和补体依赖性细胞毒性(CDC)，但不在抗原结合中起作用。
“Fv”对于一个抗体来说指的是抗体的最小片段，其带有完整的抗原结合位点。一个Fv片段由单个轻链的可变区和单个重链的可变区结合组成。
“单链Fv抗体”或“scFv”是指由一个轻链可变区和一个重链可变区直接或通过肽连接子序列相互连接的工程化抗体(Huston JS等人，《美国国家科学院院刊(Proc NatlAcad Sci USA)》，85:5879(1988))。
“ScFab”是指融合多肽，其中Fd经由多肽连接子连接到轻链，从而引起单链Fab片段(scFab)的形成。
“单链Fv-Fc抗体”或“scFv-Fc”是指由连接到抗体Fc区的scFv组成的工程化抗体。
“骆驼化单域抗体”、“重链抗体”或“HCAb”是指含有两个VH域且没有轻链的抗体(Riechmann L.和Muyldermans S.,《免疫学方法杂志(J Immunol Methods.)》12月10日；231(1-2)：25-38(1999)；Muyldermans S.,《生物技术杂志(J Biotechnol.)》，6月；74(4):277-302(2001)；WO94/04678；WO94/25591；美国专利号6,005,079)。重链抗体最初来自骆驼科(骆驼、单峰驼和美洲驼)。虽然没有轻链，但骆驼化的抗体有一个真实的抗原结合库(Hamers-Casterman C.等人，《自然(Nature)》.6月3日；363(6428):446-8(1993)；NguyenVK.等人，《免疫遗传学(Immunogenetics)》，4月；54(1):39-47(2002)；Nguyen VK.等人，《免疫学(Immunology)》，5月；109(1)：93-101(2003))。重链抗体的可变域(VHH域)代表了由适应性免疫反应产生的最小的已知抗原结合单元(Koch-Nolte F.等人，《美国实验生物学会联合会杂志(FASEB J.)》，11月；21(13)：3490-8。Epub 2007Jun 15(2007))。“纳米抗体”是指由一个重链抗体的VHH域和两个恒定域(CH2和CH3)组成的抗体片段。
“域抗体”是指仅含有重链可变区或轻链可变区的抗体片段。在某些情况下，两个或多个VH域由肽连接子共价接合以产生二价或多价域抗体。二价域抗体的两个VH域可靶向相同或不同抗原。
如本文中所使用的术语“价”是指给定分子中存在指定数量的抗原结合位点。术语“单价”是指仅具有一个单一抗原结合位点的抗体或抗原结合片段；且术语“多价”是指具有多个抗原结合位点的抗体或抗原结合片段。由此，术语“二价”、“四价”和“六价”分别表示抗原结合分子中存在两个结合位点、四个结合位点和六个结合位点。在一些实施例中，抗体或其抗原结合片段为二价。
“TriFab”是指由三个具有Fab官能团的单元构成的三价双特异性融合蛋白。TriFab具有两个与不对称Fab样部分融合的常规Fab。
“Fab-Fab”是指通过将第一Fab臂的Fd链融合到第二Fab臂的Fd链的N端而形成的融合蛋白。
“Fab-Fv”是指通过将重链可变域融合到Fd链的C端且将轻链可变域融合到轻链的C端而形成的融合蛋白。“Fab-dsFv”分子可通过在重链可变域与重链可变域之间引入域间二硫键而形成。
“scFv二聚体”为二价双功能抗体或双特异性scFv(BsFv)，其包括二聚的VH-VL(由肽连接子连接)与另一VH-VL部分，使得一个部分的VH与另一部分的VL协作且形成可靶向相同抗原(或抗原表位)或不同抗原(或抗原表位)的两个结合位点。
双特异性“scFv二聚体”为双特异性双功能抗体，其包括相关联的VH1-VL2(由肽连接子连接)与VL1-VH2(还由肽连接子连接)，使得VH1和VL1协作且VH2和VL2协作并且每一协作的配对具有不同抗原特异性。
“dsFv”是指二硫键稳定的Fv片段，其单条轻链的可变区与单条重链的可变区之间的键联为二硫键。在一些实施例中，“(dsFv)2”或“(dsFv-dsFv')”包括三条肽链：两个VH部分通过肽连接子(例如，长的可挠性连接子)连接，且经由二硫桥键分别结合到两个VL部分。在一些实施例中，dsFv-dsFv'具有双特异性，其中每一经二硫键配对的重链和轻链具有不同的抗原特异性。
“双链抗体(Bibody)”是指通过将scFv融合到轻链的C端(Fab-L-scFv)或Fd的C端(Fab-H-scFv)而形成的融合蛋白。
“三链抗体(Tribody)”是指通过将scFv融合到轻链和重链两者(Fab-(scFv)2)而形成的融合蛋白。
“MAb-Fv”或“IgG-Fv”是指通过将重链可变域(VH域)融合到一条Fc链的C端和VL域而形成的融合蛋白，上述VL域分开表达或融合到另一链的C端产生双特异性三价IgG-Fv(mAb-Fv)融合蛋白，其中Fv通过域间二硫键稳定。
“ScFab-Fc-scFv2”和“ScFab-Fc-scFv”是指通过将单链Fab与Fc和二硫键稳定的Fv域融合而形成的融合蛋白。
“附接IgG(Appended IgG)”是指其中Fab臂融合到IgG以形成双特异性(Fab)2-Fc格式的融合蛋白。其可与在具有或不具有连接子的情况下融合到IgG分子的C端或N端的Fab形成“IgG-Fab”或“Fab-IgG”。在某些实施例中，附接IgG可进一步修饰为IgG-Fab4格式(参见Brinkman等人,mAbs,9(2),第182-212页(2017))。
“DVD-Ig”是指通过将具有第二特异性的额外VH域和VL域融合到IgG重链和轻链而形成的双重可变域抗体。“CODV-Ig”是指一种相关格式，其中两个VH域和两个VL域以允许可变VH域-VL域的交叉配对的方式连接，其是(从N端到C端)以VH域A-VH域B和VL域B-VL域A的次序排列，或以VH域B-VH域A和VL域A-VL域B的次序排列。
“CrossMab”是指使未经修饰的轻链与对应未经修饰的重链配对以及使经修饰轻链与对应经修饰重链配对，从而产生轻链中的错配减少的抗体的技术。
“WuxiBody”是指包括具有抗体的可变域和TCR的恒定域的嵌合蛋白的双特异性抗体，其中TCR恒定域的次单元(例如α域和β域)通过工程化二硫键缔合(参见WO2019057122A1中的更多细节)。
“BiTE”为双特异性T细胞接合分子，其包括连接的在VL域-VH域定向上具有第一抗原特异性的第一scFv与在VH域-VL域定向上具有第二特异性的第二scFv。
“双特异抗体”或“dAb”包括具有两个抗原结合位点的小抗体片段，其中所述片段包括与同一多肽链中的VL域相连的VH域(VH-VL或VL-VH)(例如参见Holliger P.等人，《美国国家科学院院刊(Proc Natl Acad Sci USA)》，7月15日；90(14)：6444-8(1993)；EP404097；WO93/11161)。通过使用非常短的连接子，使同一链上的两个域之间配对，域被迫与另一链的互补域配对，从而产生两个抗原结合位点。这些抗原结合位点可以针对相同或不同的抗原(或抗原表位)。
“DART”为双功能抗体样实体，其具有连接到第二可变区的VL的第一可变区的VH，和连接到第一可变区的VL的第二可变区的VH。
“TandAb”为具有四个结合位点的双特异性融合蛋白，上述结合位点中的两者结合到第一抗原且其它两者结合到第二抗原。
“双特异性ds双功能抗体”为靶向两个不同抗原(或抗原表位)的双功能抗体。
当参考抗体使用时，术语“完全人类”是指直接源自人类或基于人类序列的抗体。当抗体源自或基于人类序列且随后经修饰时，其仍被视为如整个说明书中所使用的完全人类。换句话说，当参考抗体使用时，术语“完全人类”打算包含具有源自人类生殖系免疫球蛋白序列的可变区和恒定区或基于人类或人类淋巴球中发生且以某种形式修饰的可变区或恒定区的结合分子。因此，完全人类抗体可包含不由人类生殖系免疫球蛋白序列编码的氨基酸残基，包括取代和/或缺失(例如，通过例如活体外随机或位点特异性突变诱发或通过活体内体细胞突变引入的突变)。如本文中所使用的“基于”是指核酸序列可完全从模板复制，或具有轻微突变(例如通过易错PCR方法)，或以合成方式使模板完全匹配或具有轻微修饰的情形。基于人类序列的半合成分子也被视为如本文中所使用的人类。
其它术语
如本文所使用的术语“亲和力”是指免疫球蛋白分子(即抗体)或其片段与抗原之间的非共价作用的强度。
如本文所使用的术语“氨基酸”是指含有胺(-NH2)和羧(-COOH)官能团的有机化合物以及每个氨基酸特有的侧链。氨基酸的名称在本发明中也以标准的单字母或三字母代表示，这些代码概括如下。
氨基酸的名称 三字母代码 单字母代码
丙氨酸 Ala A
精氨酸 Arg R
天冬酰胺 Asn N
天冬氨酸 Asp D
半胱氨酸 Cys C
谷氨酸 Glu E
谷氨酰胺 Gln Q
甘氨酸 Gly G
组氨酸 His H
异亮氨酸 Ile I
亮氨酸 Leu L
赖氨酸 Lys K
甲硫氨酸 Met M
苯丙氨酸 Phe F
脯氨酸 Pro P
丝氨酸 Ser S
苏氨酸 Thr T
色氨酸 Trp W
酪氨酸 Tyr Y
缬氨酸 Val V
关于氨基酸序列的“保守取代”是指用具有含有类似生理化学特性的侧链的不同氨基酸残基置换氨基酸残基。举例来说，保守取代可在具有疏水性侧链的氨基酸残基(例如，Met、Ala、Val、Leu和Ile)中、具有中性亲水性侧链的残基(例如，Cys、Ser、Thr、Asn和Gln)中、在具有酸性侧链的残基(例如，Asp、Glu)中、在具有碱性侧链的氨基酸(例如，His、Lys和Arg)中或在具有芳香族侧链的残基(例如，Trp、Tyr和Phe)中进行。如所属领域中已知，保守取代一般不会引起蛋白质构形结构的显著变化，且因此可保持蛋白质的生物活性。
术语“诊断(diagnosis/diagnose/diagnosing)”是指病理状态、疾病或病状的鉴定，例如SARS-CoV-2感染的鉴定，或是指可受益于特定治疗方案的患有SARS-CoV-2感染的个体的鉴定。在一些实施例中，诊断含有SARS-CoV-2的存在或量的鉴定。在一些实施例中，诊断是指在个体中鉴定SARS-CoV-2感染。
如本文中所使用的“效应功能”是指由抗体的Fc区与其效应子(例如C1复合物和Fc受体)结合引起的生物活性。示范性效应功能包含：由抗体与C1复合物上的C1q的相互作用介导的补体依赖性细胞毒性(CDC)；由抗体的Fc区与效应细胞上的Fc受体的结合介导的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)；以及吞噬作用。可使用各种检定(例如Fc受体结合检定、C1q结合检定和细胞裂解检定)评估效应功能。
术语“抗体依赖性细胞介导的细胞毒性”和“ADCC”是指细胞介导的反应，其中表达FcR的非特异性细胞毒性细胞(例如，自然杀伤(NK)细胞、嗜中性粒细胞和巨噬细胞)识别目标细胞上的所结合抗体且随后造成目标细胞裂解。用于介导ADCC的初级细胞NK细胞仅表达FcγRIII，而单核细胞表达FcγRI、FcγRII和FcγRIII。FcR在造血细胞上的表达概述于Ravetch和Kinet,Annu.Rev.Immunol 9:457-92(1991)的第464页的表3中。
关于结合分子(例如抗体)和其结合配偶体(例如抗原)的相互作用的术语“特异性结合(specific binding/specifically binds)”意指相互作用视结合配偶体上的特定结构(例如，抗原决定子或抗原表位)的存在而定。换句话说，即使当结合配偶体存在于其它分子或生物体的混合物中时，抗体优先结合或识别结合配偶体。结合可通过共价或非共价相互作用或两者的组合介导。免疫特异性结合到抗原的抗体或其片段可与携带相同抗原表位的相关抗原交叉反应。特异性结合可通过结合亲和力表征，例如由Kd值(即，抗原与抗原结合分子之间的解离常量)表示。Kd可通过使用所属领域中已知的任何常规方法，包含(但不限于)放射免疫检定(RIA)、酶联免疫吸附检定(ELISA)、表面等离子体共振方法、微量热泳方法、HPLC-MS方法和流式细胞测量术(例如FACS)方法来测定。≤10-6M(例如，≤5×10-7M、≤2×10-7M、≤10-7M、≤5×10-8M、≤2×10-8M、≤10-8M、≤5×10-9M、≤4×10-9M、≤3×10-9M、≤2×10-9M或≤10-9M)的Kd值可指示抗体或其抗原结合片段与SARS-CoV-2(例如SARS-CoV-2的刺突蛋白，或SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域)之间的特异性结合。
如本文中所使用的“竞争结合到RBD”的能力是指SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段抑制SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与其结合配偶体(例如第二SARS-CoV-2抗体，或ACE2受体)之间的结合相互作用达到任何可检测程度的能力。在某些实施例中，竞争结合到SARS-CoV-2的抗体或抗原结合片段抑制SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与其结合配偶体之间的结合相互作用至少85％或至少90％。在某些实施例中，这种抑制可大于95％或大于99％。一般来说，竞争性抑制借助于检定来测量，其中将抗原组合物(即，包括SARS-CoV-2或其片段的组合物)与参考结合分子(例如本发明的抗体或抗原结合片段，或ACE受体(例如其重组结合部分))和待筛选的抗体或抗原结合片段掺合。通常，待筛选的抗体或抗原结合片段是以过量存在。基于ELISA和西方墨点法的协议适用于此类简单竞争研究。
在某些实施例中，抗体或抗原结合片段展现在1μM下与2μM血管紧张素转化酶2(ACE2)受体至少30％的竞争以结合到以250的共振单位(RU)固定的SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，如通过SPR所测量。
如本文中所使用的短语“宿主细胞”是指可引入或已引入外源性多核苷酸和/或载体的细胞。
术语“分离的”意指一种物质已通过人工从天然状态改变。如果自然界中出现“分离的”组合物或物质，那么其已被改变或从其原始环境去除，或两者均有发生。举例来说，天然存在于活动物中的多核苷酸或多肽不为“分离的”，但如果相同多核苷酸或多肽已与其天然状态的共存物质充分分离以便以大体上纯的状态存在，那么其为“分离的”。“分离的核酸序列”是指分离的核酸分子的序列。在某些实施例中，“分离的抗体或其抗原结合片段”是指纯度为至少60％、70％、75％、80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％的抗体或其抗原结合片段，上述纯度如通过电泳方法(例如，SDS-PAGE、等电聚焦、毛细管电泳)或色谱法(例如，离子交换色谱或逆相HPLC)测定。在一些实施例中，分离的抗体或抗原结合片段为重组蛋白或抗原结合片段。
如本文中所使用的术语“经修饰的抗体(modified antibody/modifiedantibodies)”或文法变化形式是指已修饰、生物工程化或与一个或多个修饰元件组合以使其不为天然存在的抗体的抗体。
如本文中所使用的术语“试剂盒”是指预定量的试剂与用于执行治疗法，或诊断或检测检定的说明书的封装组合。
如本文中关于本发明的抗体或抗原结合片段所使用的术语“中和”是指抑制SARS-CoV-2病毒感染目标细胞以进行复制的抗体或抗原结合片段，不论达成中和的机制如何。因此，中和可例如通过抑制SARS-CoV-2病毒或携带刺突蛋白的假SARS-CoV-2病毒连接或黏附到细胞表面，或通过在将病毒连接到目标细胞之后抑制病毒和细胞膜的融合，和其类似者来达成。用于测定中和活性的示范性检定描述于本文所提供的实例中。
在一些实施例中，抗体的中和活性可表示为抗体针对与ACE2的结合的半抑制浓度(IC50)。
如本文中所使用的术语“核酸”或“多核苷酸”是指单股或双股形式的脱氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)和其聚合物。除非另外指示，否则特定多核苷酸序列还隐含地涵盖其保守修饰的变体(例如简并密码子取代)、等位基因、异种同源物、SNP和互补序列以及明确指示的序列。具体来说，简并密码子取代可通过产生如下序列来达成：其中一个或多个所选(或全部)密码子的第三位置经混合碱基和/或脱氧肌苷残基取代(参见Batzer等人,Nucleic Acid Res.19:5081(1991)；Ohtsuka等人,J.Biol.Chem.260:2605-2608(1985)；和Rossolini等人,Mol.Cell.Probes 8:91-98(1994))。
关于氨基酸序列(或核酸序列)的“序列同一性百分比(％)”是指在比对序列并在必要时引入间隙后，候选序列中的氨基酸(或核酸)残基与参考序列中的氨基酸(或核酸)残基相同的百分比，以达到相同氨基酸(或核酸)的最大数量。氨基酸残基的保守替换可以也可以不被视为相同的残基。为了确定氨基酸(或核酸)序列同一性的百分比，可以使用公开的工具，例如BLASTN、BLASTp(可在美国国家生物技术信息中心(NCBI)的网站上找到，另见Altschul S.F.等人，《分子生物学杂志(J.Mol.Biol.)》,215:403-410(1990)；Stephen F.等人,《核酸研究(Nucleic Acids Res.)》,25:3389-3402(1997)),ClustalW2(可在欧洲生物信息学研究所的网站上找到，另见，Higgins D.G.等人,《酶学中的方法(Methods inEnzymology)》,266:383-402(1996)；Larkin M.A.等人,《生物信息学(Bioinformatics)》(Oxford,England),23(21):2947-8(2007)),和ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。本领域的技术人员可以使用该工具提供的默认参数，也可以根据比对的情况定制参数，例如，通过选择合适的算法。术语“多肽”或“蛋白质”意指通过肽键彼此连接的至少两个氨基酸的链带。多肽和蛋白质可包含除氨基酸以外的部分(例如，可经糖基化)和/或可以其它方式处理或修饰。所属领域的一般技术人员应了解“多肽”或“蛋白质”可为如通过细胞(含或不含信号序列)产生的完整多肽链，或可为其功能部分。一般技术者应进一步了解，多肽或蛋白质有时可包含超过一个多肽链，其例如通过一个或多个二硫键连接或通过其它手段缔合。术语也包含氨基酸聚合物，其中一个或多个氨基酸为对应天然存在的氨基酸和聚合物的化学类似物。术语“药学上可接受的”指示指定载剂、媒剂、稀释剂、赋形剂和/或盐通常在化学上和/或物理上与包括调配物的其它成分相容，且在生理学上与其接受体相容。当参考多肽(例如，抗体、抗原)或多核苷酸使用时，术语“重组”是指由重组方法产生的多肽或多核苷酸。“重组多肽”包含由重组多核苷酸表达的任何多肽。“重组多核苷酸”包含已通过引入至少一种外源性(即外源的，且通常为异源的)核苷酸或改变多核苷酸的至少一种天然核苷酸组分来修饰的任何多核苷酸，且无需包含所有编码序列或与编码序列自然相关的调节元件。“重组载体”是指非天然存在的载体，包含例如包括重组多核苷酸序列的载体。
如本文中所使用，术语“样本”是指获自或源自所关注个体的生物试样。样本含有例如基于物理、生物化学、化学和/或生理学特征进行表征和/或鉴定的细胞和/或其它分子实体。
术语“个体”包含人类和非人类动物。非人类动物包含所有脊椎动物，例如哺乳动物和非哺乳动物，例如非人类灵长类动物、小鼠、大鼠、猫、兔、绵羊、狗、牛、鸡、两栖动物和爬行动物。除另有说明外，否则术语“患者”或“个体”在本文中可互换使用。
如本文中所使用的疾病、病症或病状的术语“治疗(treating/treatment)”包含缓解疾病、病症或病状；减缓疾病、病症或病状的发展速率；减少或终止与疾病、病症或病状相关的症状；产生疾病、病症或病状的完全或部分消退；治愈疾病、病症或病状；或其某一组合。
如本文中所使用的疾病、病症或病状的术语“预防(prevent/preventing)”包含减缓疾病、病症或病状的发作；降低发展疾病、病症或病状的风险；预防或延缓与疾病、病症或病状相关的症状的发展；降低疾病、病症或病状之后续收缩或发展的严重程度；缓解相关症状；和诱导保护免受疾病、病症或病状影响的免疫。
如本文中所使用的术语“SARS-CoV-2病毒抗原”是指SARS-CoV-2病毒粒子或在SARS-CoV-2病毒粒子中发现的抗原(例如，包膜蛋白或刺突蛋白的蛋白质或蛋白质片段(包含刺突蛋白的胞外域或刺突蛋白的RBD)和其类似者)。刺突蛋白由S1蛋白(其含有RBD)和S2蛋白构成，其最初在一个蛋白质分子中直至通过蛋白酶裂解成S1和S2。
如本文所使用的术语“载体”是指一种载体，其中可操作地插入遗传元件以实现该遗传元件的表达，如产生由遗传元件编码的蛋白质、RNA或DNA，或复制遗传元件。载体可用于转化、转导或转染宿主细胞，以使其携带的遗传元件在宿主细胞内表达。载体的例子包括质粒、噬菌体、粘粒、人工染色体，如酵母人工染色体(YAC)、细菌人工染色体(BAC)或P1衍生的人工染色体(PAC)，噬菌体，如λ噬菌体或M13噬菌体，以及动物病毒。载体可以包含各种控制表达的元件，包括启动子序列、转录起始序列、增强子子序列、可选择元件和报告基因。此外，载体还可以包含一个复制原点。载体还可以包括帮助其进入细胞的材料，包括但不限于病毒颗粒、脂质体或蛋白质包衣。一个载体可以是一个表达载体或一个克隆载体。本发明提供的载体(如表达载体)含有本文提供的编码抗体的核酸序列或其抗原结合片段，至少一个与核酸序列可操作连接的启动子(如SV40、CMV、EF-1a)，以及至少一个选择标记。
抗SARS-CoV-2抗体
在一个方面中，本发明提供抗SARS-CoV-2抗体和其抗原结合片段。
在一些实施例中，本发明涉及一种经修饰抗体或其抗原结合片段，其包括至少一种具有抗原结合亲和力的抗原结合域和共价连接的经修饰人类IgG恒定域，其中上述抗原结合亲和力包括SARS-CoV-2结合亲和力，相较于上述SARS-CoV-2结合亲和力，上述抗原结合亲和力包括比SARS-CoV或MERS-CoV低至少50％的结合亲和力或包括不可检测的结合亲和力，且其中上述经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号，相较于具有野生型人类IgG恒定域的抗体对FcRn的亲和力，上述经修饰抗体对FcRn的亲和力增加。
经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号，可称为YTE域或YTE域Fc。
在一些情况下，抗原结合亲和力可包括：
a)对SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合亲和力，其对SARS-CoV的刺突蛋白或MERS-CoV的刺突蛋白的结合亲和力低至少50％；
b)对包括SEQ ID NO:128的氨基酸序列的上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)的结合亲和力；
c)对包括SEQ ID NO:124的氨基酸序列的上述SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合亲和力，其水平为不可检测的或不超过对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的上述结合亲和力的50％；
d)对包括SEQ ID NO:126的氨基酸序列的上述MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合亲和力，其水平为不可检测的或不超过对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的上述结合亲和力的50％；
e)对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的结合亲和力，其Kd值不超过1×10- 7M，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量；
f)对上述SARS-CoV的刺突蛋白的上述RBD或MERS-CoV的刺突蛋白的上述RBD的结合亲和力，其Kd值为至少1×10-6M，如通过SPR所测量；
g)展现在1μM下与2μM血管紧张素转化酶2(ACE2)受体至少30％的竞争以结合到以250的共振单位(RU)固定的上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，如通过SPR所测量；
h)对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的结合亲和力，其在IC50值下的中和活性不超过100μg/ml(例如，不超过50μg/ml、不超过40μg/ml、不超过30μg/ml、不超过25μg/ml、不超过20μg/ml、不超过15μg/ml、不超过10μg/ml、不超过8μg/ml、不超过6μg/ml、不超过4μg/ml、不超过2μg/ml或不超过1μg/ml)，如通过假病毒、活病毒微量中和、灭火病毒中和检定或其组合所测量；
i)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，其在IC50值下的中和活性不超过1μg/ml(例如，不超过50ng/ml、不超过40ng/ml、不超过30ng/ml、不超过25ng/ml、不超过20ng/ml、不超过15ng/ml、不超过10ng/ml、不超过8ng/ml、不超过6ng/ml、不超过4ng/ml、不超过2ng/ml或不超过1ng/ml)，如通过活病毒中和检定使用病灶减少中和测试(FRNT)方法所测量，或
其组合。
在一些情况下，抗原结合亲和力可选自由以下组成的群组：
a)对SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合亲和力，其对SARS-CoV的刺突蛋白或MERS-CoV的刺突蛋白的结合亲和力低至少50％；
b)对包括SEQ ID NO:128的氨基酸序列的上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)的结合亲和力；
c)对包括SEQ ID NO:124的氨基酸序列的上述SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合亲和力，其水平为不可检测的或不超过对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的上述结合亲和力的50％；
d)对包括SEQ ID NO:126的氨基酸序列的上述MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合亲和力，其水平为不可检测的或不超过对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的上述结合亲和力的50％；
e)对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的结合亲和力，其Kd值不超过1×10-7M，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量；
f)对上述SARS-CoV的刺突蛋白的上述RBD或MERS-CoV的刺突蛋白的上述RBD的结合亲和力，其Kd值为至少1×10-6M，如通过SPR所测量；
g)展现在1μM下与2μM血管紧张素转化酶2(ACE2)受体至少30％的竞争以结合到以250的共振单位(RU)固定的上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，如通过SPR所测量；
h)对上述SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD的结合亲和力，其在IC50值下的中和活性不超过100μg/ml，如通过假病毒、活病毒、微量中和、灭活病毒中和检定或其组合所测量；
i)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的上述RBD，其在IC50值下的中和活性不超过1μg/ml(例如，不超过50ng/ml、不超过40ng/ml、不超过30ng/ml、不超过25ng/ml、不超过20ng/ml、不超过15ng/ml、不超过10ng/ml、不超过8ng/ml、不超过6ng/ml、不超过4ng/ml、不超过2ng/ml或不超过1ng/ml)，如通过活病毒中和检定使用病灶减少中和测试(FRNT)方法所测量；
和其组合。
在一些实施例中，本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体和抗原结合片段能够特异性结合到SARS-CoV-2。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段以如通过SPR所测量的不超过10-7M的Kd值特异性结合到SARS-CoV-2。
在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段能够以如通过SPR所测量的不超过1×10-7M(例如，不超过5×10-7M、不超过2×10-7M、不超过10-7M、不超过5×10-8M、不超过2×10-8M、不超过10-8M、不超过5×10-9M、不超过4×10-9M、不超过3×10-9M、不超过2×10-9M或不超过10-9M)的Kd值结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD。
在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段以显著较低的亲和力或程度结合到SARS-CoV的刺突蛋白的RBD或MERS-CoV的刺突蛋白的RBD。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段展现以如通过SPR所测量的至少1×10-6M(例如，至少2×10-6M、至少5×10-6M、至少10-5M)的Kd值结合到SARS-CoV的刺突蛋白的RBD或MERS-CoV的刺突蛋白的RBD。
在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段不可检测地结合到SARS-CoV或MERS-CoV。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段对SARS-CoV或MERS-CoV展现比在等效检定条件下对SARS-CoV-2的结合低至少50％(例如，至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％)的结合或展现不可检测的结合。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白，且对SARS-CoV的刺突蛋白或MERS-CoV的刺突蛋白展现比在等效检定条件下对SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合低至少50％(例如，至少55％、至少60％、至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％)的结合。在某些实施例中，SARS-CoV-2的刺突蛋白的全长可包括SEQ ID NO:134的氨基酸序列，其任选地由SEQID NO:135的多核苷酸序列编码。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段能够特异性结合到包括SEQ ID NO:128的氨基酸序列的SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段展现与包括SEQ ID NO:124的氨基酸序列的SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其水平为不可检测的或不超过在等效检定条件下与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合的50％(例如，不超过45％、40％、35％、30％、25％、20％、15％、10％、5％、2％、1％)。在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段展现与包括SEQ ID NO:126的氨基酸序列的MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其水平为不可检测的或不超过在等效检定条件下与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合的50％(例如，不超过45％、40％、35％、30％、25％、20％、15％、10％、5％、2％、1％)。
在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段能够展现在1μM下与2μMACE2受体至少30％的竞争以结合到以250的RU固定的SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，如通过SPR所测量。举例来说，SARS-CoV-2 RBD可经由氨基固定到CM5传感器芯片以得到约250的最终RU。1μM本文所提供的抗体或其抗原结合片段可注射到芯片上直至达到结合稳态。可注射2μM的人类ACE2或人类ACE2肽酶域持续60秒。可通过在存在和不存在抗体培育的情况下反应单位的比较来确定阻断效力。用于SPR的仪器和试剂盒可以在例如Biacore T200，GEHealthcare商购。
在某些实施例中，本文所提供的抗体和其抗原结合片段能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，其在IC50值下的中和活性不超过100μg/ml(例如，不超过90μg/ml、80μg/ml、70μg/ml、60μg/ml、50μg/ml、40μg/ml、30μg/ml、20μg/ml、10μg/ml、5μg/ml、2μg/ml、1μg/ml、0.5μg/ml、0.2μg/ml、0.1μg/ml、0.05μg/ml、0.03μg/ml)，如通过假病毒中和检定所测量。假病毒中和检定为所属领域中已知的，且一般涉及产生表达报道体基因和所关注病毒蛋白(例如SEQ ID NO:134的SARS-CoV-2的全长刺突蛋白)的假病毒。本文所提供的抗体和其抗原结合片段可与假病毒一起培育，且可经由报道基因测定假病毒的效价。IC50为抗体或其抗原结合片段在检定中可抑制假病毒效价的50％的浓度。
说明性抗SARS-CoV-2抗体
在某些实施例中，本发明提供SARS-CoV-2抗体和其抗原结合片段，其包括来自本文所提供的选自以下的抗体的重链可变区和轻链可变区的一个或多个(例如1、2、3、4、5或6个)CDR：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。
在某些实施例中，本发明提供SARS-CoV-2抗体和其抗原结合片段，其包括一个或多个(例如1、2、3、4、5或6个)CDR，上述CDR包括选自由以下组成的群组的序列：SEQ ID NO：1-6、11-16、21-26、31-36、41-46、51-56、65-70、75-80、85-90、95-100、105-110、136-141、146-151、156-161、166-171、176-181、186-191、196-201、206-211、216-221、226-231、236-241、246-251、256-261、266-271、276-281、286-291、296-301、306-311、316-321、326-331、336-341、346-351、356-361、366-371、376-381、386-391、396-401、406-411、416-421、426-431、136/137/448/139/140/141、436-441和442-447。
如本文中所使用的抗体“P2A-1A8”是指具有含有SEQ ID NO:7的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:8的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2A-1A9”是指具有含有SEQ ID NO:17的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:18的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2A-1A10”是指具有含有SEQ ID NO:27的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:28的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2A-1B3”是指具有含有SEQ ID NO:37的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:38的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-2F6”是指具有含有SEQ ID NO:47的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:48的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-2G4”是指具有含有SEQ ID NO:57的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:58的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-2G11”是指具有含有SEQ ID NO:61的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:62的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2C-1A3”是指具有含有SEQ ID NO:71的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:72的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2C-1C8”是指具有含有SEQ ID NO:81的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:82的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2C-1C10”是指具有含有SEQ ID NO:91的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:92的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2C-1D5”是指具有含有SEQ ID NO:101的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:102的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2C-1F11”是指具有含有SEQ ID NO:111的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:112的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-1G5”是指具有含有SEQ ID NO:142或449的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:143的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-1A1”是指具有含有SEQ ID NO:152的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:153的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2C-1D7”是指具有含有SEQ ID NO:162的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:163的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-1A10”是指具有含有SEQ ID NO:172的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:173的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-1D9”是指具有含有SEQ ID NO:182的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:183的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-1E4”是指具有含有SEQ ID NO:192的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:193的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P2B-1G1”是指具有含有SEQ ID NO:202的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:203的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P4A-2D9”是指具有含有SEQ ID NO:212的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:213的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-2G7”是指具有含有SEQ ID NO:222的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:223的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-3C8”是指具有含有SEQ ID NO:232的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:233的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1D2”是指具有含有SEQ ID NO:242的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:243的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-2F11”是指具有含有SEQ ID NO:252的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:253的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-2E1”是指具有含有SEQ ID NO:262的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:263的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1C8”是指具有含有SEQ ID NO:272的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:273的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P1A-1C10”是指具有含有SEQ ID NO:282的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:283的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P4A-1H6”是指具有含有SEQ ID NO:292的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:293的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P4B-1F4”是指具有含有SEQ ID NO:302的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:303的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1B6”是指具有含有SEQ ID NO:312的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:313的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1B8”是指具有含有SEQ ID NO:322的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:323的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1B9”是指具有含有SEQ ID NO:332的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:333的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1D1”是指具有含有SEQ ID NO:342的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:343的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-1D10”是指具有含有SEQ ID NO:352的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:353的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-2D11”是指具有含有SEQ ID NO:362的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:363的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-2G9”是指具有含有SEQ ID NO:372的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:373的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-2H3”是指具有含有SEQ ID NO:382的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:383的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-3A1”是指具有含有SEQ ID NO:392的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:393的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-3A6”是指具有含有SEQ ID NO:402的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:403的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-3B4”是指具有含有SEQ ID NO:412的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:413的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P5A-3C12”是指具有含有SEQ ID NO:422的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:423的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
如本文中所使用的抗体“P22A-1D1”是指具有含有SEQ ID NO:432的序列的重链可变区和含有SEQ ID NO:433的序列的轻链可变区的单克隆完全人类抗体。
下表1显示以下抗体的CDR氨基酸序列：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。
表1. 42种抗体的CDR氨基酸序列
Figure BDA0003707502100000501
Figure BDA0003707502100000511
Figure BDA0003707502100000521
Figure BDA0003707502100000531
Figure BDA0003707502100000541
Figure BDA0003707502100000551
下表2显示选自以下的抗体的重链和轻链可变区氨基酸序列：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1且对应核酸编码序列示于表3中。
表2. 42种抗体的可变区氨基酸序列
Figure BDA0003707502100000552
Figure BDA0003707502100000561
Figure BDA0003707502100000571
Figure BDA0003707502100000581
Figure BDA0003707502100000591
Figure BDA0003707502100000601
Figure BDA0003707502100000611
表3. 42种抗体的可变区核苷酸序列
Figure BDA0003707502100000612
Figure BDA0003707502100000621
Figure BDA0003707502100000631
Figure BDA0003707502100000641
Figure BDA0003707502100000651
Figure BDA0003707502100000661
Figure BDA0003707502100000671
Figure BDA0003707502100000681
Figure BDA0003707502100000691
Figure BDA0003707502100000701
Figure BDA0003707502100000711
Figure BDA0003707502100000721
Figure BDA0003707502100000731
Figure BDA0003707502100000741
Figure BDA0003707502100000751
Figure BDA0003707502100000761
Figure BDA0003707502100000771
Figure BDA0003707502100000781
Figure BDA0003707502100000791
Figure BDA0003707502100000801
Figure BDA0003707502100000811
Figure BDA0003707502100000821
替代地，本文所提供的抗体和其抗原结合片段包括IgG4或IgG2同种型的恒定区，其具有降低或耗乏的效应功能。在某些实施例中，抗SARS-COV-2抗体或其抗原结合片段包括野生型人类IgG1 Fc区，其包括SEQ ID NO:115的序列或其它野生型人类IgG1等位基因。
表4显示以下单克隆抗体的重链和轻链恒定区的氨基酸序列：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1，其中以下抗体具有λ轻链(具有SEQ ID NO:116的λ轻链恒定区序列)：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2F6、P2B-2G4、P2B-2G11、P2C-1D5、P2B-1G5、P2B-1A1、P2B-1D9、P2B-1E4、P5A-2G7、P5A-1D2、P5A-2E1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A6和P5A-3B4，以下抗体具有κ轻链(具有SEQ ID NO:117的κ轻链恒定区序列)：P2A-1A10、P2A-1B3、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1F11、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-3C8、P5A-2F11、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-3A1、P5A-3C12和P22A-1D1，且所有42种抗体具有相同重链恒定区(SEQ ID NO:115)。
表4.恒定区的氨基酸和核酸序列
Figure BDA0003707502100000831
Figure BDA0003707502100000841
Figure BDA0003707502100000851
在一些实施例中，当表达本发明的抗体时，可添加信号肽，这些信号肽可在抗体分泌期间通过宿主细胞部分或全部去除。在某些实施例中，为了表达26种本发明的示范性抗体，当表达重链时包含信号肽(SEQ ID NO:130：MGWSCIILFLVATATGVHS)，当表达轻链时包含信号肽(SEQ ID NO:131:MGWSCIILFLVATATGSWA)。
在本说明书结束时随附的表11和表11A显示本申请案中所提及或使用的序列和SEQ ID NO。
抗体变体
在某些实施例中，本文所提供的抗体或其抗原结合片段包括上文表1中所提供的CDR序列中的一者或多者、表2中所提供的重链可变区或轻链可变区的非CDR序列中的一者或多者和/或表4中的恒定区(例如Fc区)的一个或多个突变，但仍保持与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的特异性结合亲和力。这些突变也称作以下抗体或其抗原结合片段的变体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12、P22A-1D1。如本文中所使用的“突变”或“经突变”包含氨基酸序列或多核苷酸序列的取代、插入和/或缺失。在某些实施例中，突变中的至少一者(或全部)包括保守取代。
在某些实施例中，变体包括1、2或3个与上文表1中所列出的序列(或那些序列)具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性的CDR序列，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于其亲本抗体的水平下具有结合亲和力。
在某些实施例中，变体包括一个或多个与上文表2中所列出的序列(或那些序列)具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性的可变区序列，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于其亲本抗体的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。在一些实施例中，已在上文表2中所列出的可变区序列中突变总共1到10个氨基酸。在一些实施例中，突变发生在非CDR序列中(例如在FR中)。在一些实施例中，突变为保守取代。
在某些实施例中，本发明提供以下抗体的变体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12或P22A-1D1，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的HCDR1序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的HCDR2序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的HCDR3序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的LCDR1序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的LCDR2序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的LCDR3序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于其亲本抗体的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，本文所提供的抗体变体包括：HCDR1，其在表1中所列出的亲本抗体的HCDR1序列中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在表1中所列出的亲本抗体的HCDR2序列中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在表1中所列出的亲本抗体的HCDR3序列中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR1，其在表1中所列出的亲本抗体的LCDR1序列中具有不超过2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在表1中所列出的亲本抗体的LCDR2序列中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在表1中所列出的亲本抗体的LCDR3序列中具有不超过3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于其亲本抗体的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，本文所提供的抗体变体包括：
a)至少一个重链CDR序列，其在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
b)至少两个重链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
c)三个重链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
d)至少一个轻链序列，其在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
e)至少两个轻链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
f)三个轻链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于其亲本抗体的水平下具有结合亲和力。
在某些实施例中，本文所提供的抗体变体保留其亲本抗体的至少部分(或全部)互补位。如本文中所使用，关于抗体的术语“互补位”是指与抗原直接接触且形成可变区的抗原结合位点的抗体的可变区上的一组氨基酸残基。互补位通常包括一个或多个CDR序列中的氨基酸残基或由其组成。
在某些实施例中，本发明提供抗体P2B-2F6的变体，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:41具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:42具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:43具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:44具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:45具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:46具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2B-2F6的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P2B-2F6的抗体变体包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:41中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:42中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:43中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQID NO:44中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:45中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:46中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2B-2F6的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P2B-2F6的变体保留抗体P2B-2F6的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。在某些实施例中，抗体P2B-2F6的互补位包括或由以下组成：HCDR1的Y27、S28、S30、S31和Y33；HCDR2的H54；HCDR3的G102、I103、V105、V106和P107；和/或LCDR1的G31、Y32和N33；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQID NO:47，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:48。
在某些实施例中，抗体P2B-2F6的变体保留抗体P2B-2F6的至少部分互补位。举例来说，抗体P2B-2F6的变体保留抗体P2B-2F6的互补位的残基的至少60％、至少70％、至少80％或至少90％。在某些实施例中，抗体P2B-2F6的变体在抗体P2B-2F6的互补位中包括一个或多个突变(例如保守取代)。在某些实施例中，抗体P2B-2F6的变体在抗体P2B-2F6的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个突变(例如取代)。在某些实施例中，抗体P2B-2F6的变体在抗体P2B-2F6的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个保守取代。
在某些实施例中，本发明提供抗体P2C-1F11的变体，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:105或436具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:106或437具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:107或438具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:108或439具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:109或440具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:110或441具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2C-1F11的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P2C-1F11的抗体变体包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:105中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:106中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:107中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR1，其在SEQ ID NO:108中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:109中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:110中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2C-1F11的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P2C-1F11的变体保留抗体P2C-1F11的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。在某些实施例中，抗体P2C-1F11的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、I27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；HCDR3的R97、L99、V100、V101、Y102和D105；和/或LCDR1的S28、S30和Y33；其中重链中的残基的编号是根据SEQ ID NO:111，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:112。
在某些实施例中，抗体P2C-1F11的变体保留抗体P2C-1F11的至少部分互补位。举例来说，抗体P2C-1F11的变体保留抗体P2C-1F11的互补位的残基的至少60％、至少70％、至少80％或至少90％。在某些实施例中，抗体P2C-1F11的变体在抗体P2C-1F11的互补位中包括一个或多个突变或取代(例如保守取代)。在某些实施例中，抗体P2C-1F11的变体在抗体P2C-1F11的互补位中包括不超过6、5、4、3、2或1个突变(例如取代)。在某些实施例中，抗体P2C-1F11的变体在抗体P2C-1F11的互补位中包括不超过6、5、4、3、2或1个保守取代。在某些实施例中，抗体P2C-1F11的变体至少保留抗体P2C-1F11的HCDR2的Y52和LCDR1的Y33。
在某些实施例中，本发明提供抗体P2B-1G5的变体，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:136或442具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:137或443具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:138或444或448具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:139或445具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:140或446具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:141或447具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2B-1G5的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P2B-1G5的抗体变体包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:136或442中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:137或443中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:138或444中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:139或445中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:140或446中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:141或447中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2B-1G5的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，本发明提供抗体P22A-1D1的变体，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:426具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:427具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:428具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:429具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:430具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:431具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P22A-1D1的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P22A-1D1的抗体变体包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:426中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:427中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:428中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:429中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ IDNO:430中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:431中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P22A-1D1的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P22A-1D1的变体保留抗体P22A-1D1的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。在某些实施例中，抗体P22A-1D1的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、F27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；重链框架区3的Y58；HCDR3的R97、R99、D100、Y101、Y102和D105；LCDR1的Q27、G28、I29、S30和Y32；LCDR2的S67；和/或LCDR3的H90、L91、N92和Y94；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:432，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:433。
在某些实施例中，抗体P22A-1D1的变体保留抗体P22A-1D1的至少部分互补位。举例来说，抗体P22A-1D1的变体保留抗体P22A-1D1的互补位的残基的至少60％、至少70％、至少80％或至少90％。在某些实施例中，抗体P22A-1D1的变体在抗体P22A-1D1的互补位中包括一个或多个突变(例如保守取代)。在某些实施例中，抗体P22A-1D1的变体在抗体P22A-1D1的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个突变(例如取代)。在某些实施例中，抗体P22A-1D1的变体在抗体P22A-1D1的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个保守取代。
在某些实施例中，本发明提供抗体P5A-1D2的变体，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:236具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:237具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:238具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:239具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:240具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:241具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-1D2的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P5A-1D2的抗体变体包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:236中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:237中具有不超过9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:238中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:239中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQID NO:240中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:241中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-1D2的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P5A-1D2的变体保留抗体P5A-1D2的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。在某些实施例中，抗体P5A-1D2的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、F27、I28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；重链框架区3的Y58和R87；HCDR3的R97、L99、Q100、V101、G102、A103、T104和D106；LCDR1的A31和Y33；和/或LCDR3的S95；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:242，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:243。
在某些实施例中，抗体P5A-1D2的变体保留抗体P5A-1D2的至少部分互补位。举例来说，抗体P5A-1D2的变体保留抗体P5A-1D2的互补位的残基的至少60％、至少70％、至少80％或至少90％。在某些实施例中，抗体P5A-1D2的变体在抗体P5A-1D2的互补位中包括一个或多个突变(例如保守取代)。在某些实施例中，抗体P5A-1D2的变体在抗体P5A-1D2的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个突变(例如取代)。在某些实施例中，抗体P5A-1D2的变体在抗体P5A-1D2的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个保守取代。
在某些实施例中，本发明提供抗体P5A-3C8的变体，其中上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:226具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:227具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:228具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:229具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:230具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:231具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-3C8的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P5A-3C8的抗体变体包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:226中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:227中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:228中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:229中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ IDNO:230中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:231中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-3C8的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
在某些实施例中，抗体P5A-3C8的变体保留抗体P5A-3C8的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。在某些实施例中，抗体P5A-3C8的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、F27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；重链框架区3的Y58；HCDR3的R97、L99、Q100、E101和H102；和LCDR1的G28、I29、S30、S31和Y32；LCDR2的S67；轻链框架区3的G68；LCDR3的H90、L91、N92、S93和Y94；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:232，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:233。
在某些实施例中，抗体P5A-3C8的变体保留抗体P5A-3C8的至少部分互补位。举例来说，抗体P5A-3C8的变体保留抗体P5A-3C8的互补位的残基的至少60％、至少70％、至少80％或至少90％。在某些实施例中，抗体P5A-3C8的变体在抗体P5A-3C8的互补位中包括一个或多个突变(例如保守取代)。在某些实施例中，抗体P5A-3C8的变体在抗体P5A-3C8的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个突变(例如取代)。在某些实施例中，抗体P5A-3C8的变体在抗体P5A-3C8的互补位中包括不超过5、4、3、2或1个保守取代。
抗体或其抗原结合片段的变体可保持其亲本抗体与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合特异性，或可进一步具有一个或多个通过突变赋予的所需特性。举例来说，变体可具有改善的抗原结合亲和力、改善的糖基化模式、降低的糖基化风险、减少的脱氨基作用、降低或耗乏的效应功能、改善的呈pH依赖性方式的FcRn受体结合、增加的药物动力学半衰期、pH敏感性和/或对缀合的相容性(例如一个或多个引入的半胱氨酸残基)。此类变体也称为亲和力变体、糖基化变体、半胱氨酸变体、Fc变体等，其如下进行更详细地描述。
a)亲和力变体
亲和力变体可在如上文表1中所提供的一个或多个CDR序列、本文所提供的一个或多个框架(FR)序列或上文表2中所提供的重链或轻链可变区序列中含有修饰或取代。所属领域的技术人员基于上文表1中的CDR序列和上文表2中的可变区序列可容易地鉴定FR序列，因为在所属领域中众所周知，在可变区中CDR区通过两个FR区侧接。
亲和力变体保持亲本抗体的与SARS-COV-2的刺突蛋白的RBD的特异性结合亲和力，或甚至相对于亲本抗体具有改善的与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的特异性结合亲和力。可使用所属领域中已知的各种方法来达成这个目的。举例来说，可生成抗体变体库(例如Fab或scFv变体)且用噬菌体展示技术表达，且接着针对与SARS-COV-2的刺突蛋白的RBD的结合亲和力对其进行筛选。另举例来说，可使用计算机软件虚拟模拟抗体与SARS-COV-2的刺突蛋白的RBD的结合，且鉴定抗体上形成结合界面的氨基酸残基。在取代中可避开此类残基以便防止结合亲和力降低，或作为取代的目标以提供更强结合。
在某些实施例中，本文所提供的亲和力变体在一个或多个CDR序列和/或一个或多个FR序列中包括一个或多个氨基酸残基取代。
b)糖基化变体
本文所提供的抗SARS-COV-2抗体和抗原结合片段还涵盖糖基化变体，其可获得以提高或降低抗体或其抗原结合片段的糖基化程度。
抗体或其抗原结合片段可以包括一个或多个修饰，所述修饰引入或去除一个糖基化位点。糖基化位点是一个具有侧链的氨基酸残基，碳水化合物分子(如寡糖结构)可以连接到该位点。抗体的糖基化通常是N-连接或O-连接的。N-连接指的是将碳水化合物分子连接到天冬酰胺残基的侧链上，例如天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸等三肽序列中的天冬酰胺残基，其中X是除脯氨酸之外的任何氨基酸。O-连接糖基化是指将N-乙酰半乳糖胺、半乳糖或木糖中的一种糖连接到一个羟基氨基酸上，最常见的是连接到丝氨酸或苏氨酸。去除一个原生的糖基化位点可以方便地完成，例如，通过改变氨基酸序列，使上述三肽序列(对于N-连接糖基化位点)或丝氨酸或苏氨酸残基(对于O-连接糖基化位点)中的一个被替换。通过引入这样的三肽序列或丝氨酸或苏氨酸残基，可以用类似的方式创建一个新的糖基化位点。
在某些实施例中，本文所提供的抗SARS-COV-2抗体和抗原结合片段包括在N297(例如N297A、N297Q或N297G)的突变以去除糖基化位点。
c)半胱氨酸工程化变体
本文所提供的抗SARS-COV-2抗体和抗原结合片段还涵盖半胱氨酸工程化变体，其包括一个或多个引入的游离半胱氨酸氨基酸残基。
游离半胱氨酸残基是指不属于二硫桥的部分。半胱氨酸工程化变体有助于在工程化半胱氨酸部位与例如细胞毒性和/或成像化合物、标签或放射性同位素等缀合，例如通过马来酰亚胺或卤代乙酰。工程化抗体或其抗原结合片段以引入自由半胱氨酸残基的方法在本领域是已知的，例如参见WO2006/034488。
d)Fc变体
如本文所提供的抗SARS-COV-2抗体和抗原结合片段还包括Fc变体，所述变体在其Fc区和/或铰链区包括一个或多个氨基酸残基修饰或替代，例如，用来提供改变的效应子功能如ADCC、ADCP和CDC。用于通过抗体工程化来改变抗体的ADCP活性的方法为所属领域中已知的，参见例如Shields RL.等人，《生物化学杂志(J Biol Chem.)》，2001.276(9):6591-604；Idusogie EE.等人，《免疫学杂志(J Immunol.)》，2000.164(8)：4178-84；Steurer W.等人，《免疫学杂志(J Immunol.)》，1995,155(3):1165-74；Idusogie EE.等人,《免疫学杂志(J Immunol.)》，2001,166(4):2571-5；Lazar GA.等人,《美国国家科学院院刊(PNAS)》,2006,103(11):4005-4010；Ryan MC.等人,《分子癌症疗法(Mol.Cancer Ther.)》,2007,6:3009-3018；Richards JO,等人,《分子癌症疗法(Mol Cancer Ther.)》2008,7(8):2517-27；Shields R.L.等人,《生物化学杂志(J.Biol.Chem)》,2002,277:26733-26740；Shinkawa T.等人,《生物化学杂志(J.Biol.Chem)》,2003,278:3466-3473。
如本文所提供的抗体的CDC活性也可以改变，例如，通过改善或减少C1q结合和/或CDC(例如，参见WO99/51642；Duncan&Winter，《自然(Nature)》,322:738-40(1988)；美国专利号:5,648,260；美国专利号:5,624,821)；以及WO94/29351关于Fc区变体的其他例子。一个或多个选自Fc区氨基酸残基329、331和322的氨基酸可以被替换成不同的氨基酸残基，以改变Clq的结合和/或减少或取消补体依赖性细胞毒性(CDC)(参见Idusogie等人的美国专利号：6194551)。一个或多个氨基酸的替换也可以被引入以改变抗体固定补体的能力(参见Bodmer等人的PCT出版物WO 94/29351)。
术语“抗体依赖性细胞吞噬作用”和“ADCP”是指通过结合到免疫球蛋白Fc区的吞噬免疫细胞(例如，巨噬细胞、嗜中性粒细胞和树突状细胞)完全或部分地内化包覆抗体的细胞或粒子的过程。用于通过抗体工程化来改变抗体的ADCP活性的方法为所属领域中已知的，参见例如Kellner C等人,《输血医学和血液疗法(Transfus Med Hemother)》,(2017)44:327-336和Chung AW等人,《艾滋病(AIDS)》,(2014)28:2523-2530。
Fc变体的实例为所属领域中已知的，参见例如Wang等人,《蛋白细胞(ProteinCell)》2018,9(1):63-73和Kang等人,《实验与分子医学(Exp&Mol.,Med.)》(2019)51:138，其全文并入本文中。
i)效应功能增强的Fc变体
在某些实施例中，相对于野生型Fc(例如IgG1的Fc)，本文所提供的Fc变体对Fcγ受体(例如，FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)和/或FcγRIII(CD16))具有增加的ADCC和/或增加的亲和力。在某些实施例中，Fc变体包括Fc区的以下位置中的一者或多者的一个或多个氨基酸取代：234、235、236、238、239、240、241、243、244、245、246、247、248、249、252、254、255、256、258、260、262、263、264、265、267、268、269、270、272、274、276、278、280、283、285、286、289、290、292、293、294、295、296、298、299、300、301、303、304、305、307、309、312、313、315、320、322、324、325、326、327、329、330、331、332、333、334、335、337、338、339、340、345、360、373、376、378、382、388、389、396、398、414、416、419、430、433、434、435、436、437、438、439和440(参见Presta的WO 00/42072、Lazar的WO2006/019447和WO2016/196228，其全文并入本文中)，其中Fc区中的残基的编号为如Kabat中的EU索引的编号(参见Kabat E.A.等人,Sequences of Proteins of immunological Interest,第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991))。效应功能增加的示范性取代包含但不限于234Y、235Q、236A、236W、239D、239E、239M、243L、247I、268D、267E、268D、268E、268F、270E、280H、290S、292P、298A、298D、298V、300L、305I、324T、326A、326D、326W、330L、330M、333S、332D、332E、298A、333A、334A、334E、326A、247I、339D、339Q、345R、280H、290S、298D、298V、243L、292P、300L、396L、305I、396L、430G、440Y或其任何组合(例如239D/332E、239D/332E/330L、236A/332E、236A/239D/332E、268F/324T、267E/268F、267E/324T和267E/268F/324T)(参见WO2016/196228；Richards等人(2008)Mol.Cancer Therap.7:2517；Moore等人(2010)mAbs 2:181；和Strohl(2009)Current Opinion in Biotechnology 20:685-691)。
位置256、290、298、333、334和339处的特异性突变显示改善与FcγRIII的结合。另外，以下组合突变显示改善FcγRIII结合：一条重链中的T256A/S298A、S298A/E333A、S298A/K224A、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、S298A/E333A/K334A和L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A，和对置重链中的D270E/K326D/A330M/K334E(具有增强的FcγRIII结合和ADCC活性)。与FcγRIIIa具有强烈增强的结合的其它Fc变体包含具有S239D/I332E和S239D/I332E/A330L突变的变体，其显示对FcγRIIIa的亲和力增加最大、FcγRIIb结合减少和强细胞毒性活性；和具有L235V、F243L、R292P、Y300L、V305I和P396L突变的变体，其展现增强的FcγRIIIa和同时增强的ADCC活性。(参见Lazar等人(2006)Proc.Nat'l Acad Sci.(USA)103:4005；Awan等人(2010)Blood 115:1204；Desjarlais&Lazar(2011)Exp.Cell Res,Stavenhagen等人(2007)Cancer Res 67:8882)。可引入增加与Clq的结合的修饰以便增强CDC活性。示范性修饰包含IgG2中的K326(例如，K326W)和/或E333修饰，或IgGl中的单独或任何组合的S267E/H268F/S324T修饰(参见Idusogie等人(2001)J.Immunol.166:2571,Moore等人(2010)mAbs 2:181)。其它示范性修饰包含K326W/E333S、S267E/H268F/S324T和E345R/E430G/S440Y。
ii)效应功能降低的Fc
在某些实施例中，本文所提供的Fc变体相对于野生型Fc(例如IgG1的Fc)具有降低的效应功能，且包括在Fc区的选自由以下组成的群组的位置处的一个或多个氨基酸取代：220、226、229、233、234、235、236、237、238、267、268、269、270、297、309、318、320、322、325、328、329、330和331(参见WO2016/196228；Richards等人(2008)Mol.Cancer Therap.7:2517；Moore等人(2010)mAbs 2:181；和Strohl(2009)Current Opinion in Biotechnology20:685-691)，其中Fc区中的残基的编号为如Kabat中的EU索引的编号。效应功能降低的示范性取代包含但不限于220S、226S、228P、229S、233P、234V、234G、234A、234F、234A、235A、235G、235E、236E、236R、237A、237K、238S、267R、268A、268Q、269R、297A、297Q、297G、309L、318A、322A、325L、328R、330S、331S，或其任何组合(参见WO2016/196228；和Strohl(2009)Current Opinion in Biotechnology 20:685-691)。
在某些实施例中，本文所提供的Fc变体具有IgG1同种型且包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：，或其任何组合(例如L234A/L235A)。在某些实施例中，本文所提供的Fc变体具有IgG2同种型，且包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：H268Q、V309L、A330S、P331S、V234A、G237A、P238S、H268A和其任何组合。在某些实施例中，本文所提供的Fc变体具有IgG4同种型，且包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：S228P、F234A、L235E、L235A、G237A、E318A、N297A、N297Q、N297G和其任何组合。在某些实施例中，本文所提供的Fc变体是IgG4同型的，并且包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：S228P、F234A、L235E、L235A、G237A、E318A、N297A、N297Q、N297G和其任何组合。在某些实施例中，本文所提供的抗SARS-COV-2抗体和抗原结合片段具有IgG2/IgG4交叉同种型。IgG2/IgG4交叉同种型的实例描述于Rother RP等人,《自然生物技术(NatBiotechnol)》，25:1256-1264(2007)中。
iii)与FcRn的结合改变的Fc
在某些实施例中，Fc变体包括一个或多个在pH 6.0下改善与新生儿Fc受体(FcRn)的结合亲和力同时在pH 7.4下保持最小结合的氨基酸取代。此类变体可具有延长的药物动力学半衰期，因为其在酸性pH下结合到FcRn，这使其以免于在溶酶体中降解且接着经易位并且释放到细胞外。工程化抗体和其抗原结合片段以改善与FcRn的结合亲和力的方法为所属领域中熟知的，参见例如Vaughn,D.等人,Structure,6(1):63-73,1998；Kontermann,R.等人,Antibody Engineering,第1卷,第27章:Engineering of the Fc region forimproved PK,由Springer出版,2010；Yeung,Y.等人,Cancer Research,70:3269-3277(2010)；Hinton,P.等人,J.Immunology,176:346-356(2006)；Petkova等人(2006)Int.Immunol.18:1759、Ball Acqua等人Journal of Immunology 2002,169:5171-5180、Dall'Acqua WF.等人,J Biol Chem.281:23514-23524(2006)；Zalevsky J等人,NatBiotechnol.；28:157-159(2010)；WO 2009/086320；US 6,277,375；US 6,821,505；WO 97/34631；和WO 2002/060919。
当施用时可引起抗体的血清半衰期增加的Fc修饰的非限制性实例包含例如在选自以下的一个或多个位置的取代：234(例如用F)、235(例如用Q)、238(例如用D)、250(例如用E或Q)、252(例如用L/Y/F/W或T)、254(例如用S或T)、256(例如用S/R/Q/E/D或T)、259(例如用I)、272(例如用A)、305(例如用A)、307(例如用A或P)、308(例如用F、C或P)、311(例如用A或R)、312(例如用A)、322(例如用Q)、328(例如用E)、331(例如用A)、378(例如用A)、380(例如用A)、382(例如用A)、428(例如用L或F)、432(例如用C)、433(例如用H/L/R/S/P/Q或K)、434(例如用H/F或Y或S或A或W)、435(例如用H)、436(例如用L)和437(例如用C)(所有位置通过EU编号)(参见WO2016049000A2；WO2020052692；WO2016196228)。在一些实施例中，Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：234F、235Q、238D、250Q、252T、252Y、254T、256E、259I、272A、305A、307A、308F、311A、322Q、328E、331S、380A、428L、432C、433K、433S、434S、434Y、434F、434W、434A、435H、436L、437C，和其任何组合。在一些实施例中，Fc修饰包括选自以下的修饰中的一者或数对或数组：a)428L(例如M428L)和434S(例如N434S)取代；428L、259I(例如V259I)和308F(例如V308F)取代；b)433K(例如H433K)和434(例如，N434Y或N434F)取代；c)252Y、254T和256E(例如，M252Y、S254T和T256E)取代；d)250Q和428L取代(例如，T250Q和M428L)；e)307A、380A和434A取代(例如，T307A、E380A和N434A)；f)P238D和L328E取代；g)L234F、L235Q、K322Q、M252T、S254T和T256E取代；和h)和L432C、H433S、N434W、Y436L和T437C取代。
在一些实施例中，杂交IgG同种型可用于增加抗体的FcRn结合和半衰期。杂交Ig可由两个或更多个同种型生成。举例来说，IgGl/IgG3杂交变体可通过用来自IgG3的两种同种型不同的位置处的氨基酸取代CH2和/或CH3区中的IgGl位置来构筑。在一些实施例中，杂交Ig可包括一个或多个本文所揭露的修饰(例如取代)。
抗原结合片段
本文还提供抗SARS-CoV-2抗原结合片段。在一些实施例中，本文所提供的抗体和抗原结合片段包括重链可变域的全部或一部分和/或轻链可变域的全部或一部分。
抗原结合片段的各种类型为所属领域中已知的，且可基于本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体进行研发，包含例如示范性抗体(其CDR示于上文表1中且可变序列示于表2和3中)和其不同变体(例如亲和力变体、糖基化变体、Fc变体、半胱氨酸工程化变体等)。
在某些实施例中，本文所提供的抗SARS-CoV-2抗原结合片段为双功能抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫键稳定的双功能抗体(ds diabody)、单链抗体分子(scFv)、scFv二聚体(二价双功能抗体)、双特异性scFv二聚体、多特异性抗体、重链抗体、骆驼化单域抗体、纳米抗体、域抗体和二价域抗体。
可以使用各种技术来生产这种抗原结合片段。说明性的方法包括，完整抗体的酶解(例如，参见Morimoto等人，《生物化学和生物物理方法杂志(Journal of Biochemicaland Biophysical Methods)》24：107-117(1992)；和Brennan等人，《科学(Science)》，229：81(1985))，通过宿主细胞如大肠杆菌重组表达(例如，对于Fab，Fv和ScFv抗体片段)，如上所述从噬菌体显示库中筛选(例如。和两个Fab'-SH片段的化学偶联以形成F(ab')2片段(Carter等人，《生物/科技(Bio/Technology)》10:163-167(1992))。其他生产抗体片段的技术对于本领域的熟练人员来说是显而易见的。
在某些实施例中，所述抗原结合片段是scFv。scFv的产生在例如WO 93/16185；美国专利号：5,571,894和5,587,458中描述。ScFv可以在氨基端或羧基端与效应蛋白融合，以提供一个融合蛋白(例如，见《抗体工程(Antibody Engineering》，Borrebaeck编辑)。
在某些实施例中，如本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段是二价、四价、六价或多价的。任何超过二价的分子都被认为是多价的，包括例如三价、四价、六价等等。
如果两个结合位点都是特异性地与同一抗原或同一表位结合，则二价分子可以是单特异性的。在某些实施例中提供了比单价对应物更强的抗原或表位的结合。类似的，一个多价分子也可以是单价的。在某些实施方案中，在二价或多价抗原结合分子中，结合位点的第一价和结合位点的第二价在结构上相同(即具有相同的序列)，或在结构上不同(即具有不同的序列，尽管有相同的特异性)。
如果两个结合点对不同或重叠的抗原或表位具有特异性，那么二价分子也可以是双特异性的。这也适用于多价分子。例如，当两个结合位点对第一种抗原(或抗原表位)是单特异性的，而第三个结合位点对第二种抗原(或表位)是特异性的，则三价分子可以是双特异性。
双特异性(或二价)抗体或抗原结合片段
在另一方面中，本发明提供双特异性(或二价)抗体分子，其包括如本文所揭露的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段。在某些实施例中，本文所提供的双特异性(或二价)抗体包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一抗原结合域源自选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。第二抗原结合域可源自任何适合的抗体。
在某些实施例中，本文所提供的双特异性(或二价)抗体包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一和第二抗原结合域源自任何两种选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。可组合来自上述42种抗体的任何两种单克隆抗体，如同两种抗体的每一种和每种可能的组合已个别地阐述于本文中一般。在某些实施例中，本文所提供的双特异性(或二价)抗体包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一和第二抗原结合域源自任何两种选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2B-2F6、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。可组合来自上述32种抗体的任何两种单克隆抗体，如同两种抗体的每一种和每种可能的组合已个别地阐述于本文中一般。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2A-1A8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2A-1A9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2B-2G11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2A-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2A-1B3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2C-1D5。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1F11和P2C-1F11。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2A-1A9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2B-2G11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2A-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2A-1B3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A8和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和2B-2G11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2A-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2A-1B3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A9和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2A-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2A-1B3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G11和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2A-1B3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1A10和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1B3和P2B-2F6。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1B3和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1B3和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1B3和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1B3和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2A-1B3和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2F6和P2B-2G4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2F6和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2F6和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2F6和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2F6和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G4和P2C-1A3。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G4和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G4和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2B-2G4和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1A3和P2C-1C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1A3和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1A3和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1C8和P2C-1C10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自P2C-1C8和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1C10和P2C-1D5。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2B-1G5。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2B-1A1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2C-1D7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2B-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2B-1D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1F11和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2B-1G5。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2B-1A1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2C-1D7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2B-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2B-1D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-2F6和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P2B-1A1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P2C-1D7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P2B-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P2B-1D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G5和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P2C-1D7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P2B-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P2B-1D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A1和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P2B-1A10。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P2B-1D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2C-1D7和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P2B-1D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1A10和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P2B-1E4。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1D9和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P2B-1G1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1E4和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P4A-2D9。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P2B-1G1和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P4A-2D9和P5A-2G7。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P4A-2D9和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P4A-2D9和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P4A-2D9和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P4A-2D9和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P4A-2D9和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2G7和P5A-3C8。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2G7和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2G7和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2G7和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2G7和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-3C8和P5A-1D2。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-3C8和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-3C8和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-3C8和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-1D2和P5A-2F11。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-1D2和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-1D2和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2F11和P5A-2E1。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2F11和P5A-1C8。
在某些实施例中，第一和第二抗原结合域分别源自或来自P5A-2E1和P5A-1C8。
在某些实施例中，双特异性抗体分子可具有至少两个具有不同特异性的独特抗原结合位点。在某些实施例中，本文所提供的双特异性抗体分子能够结合到SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白上的不同抗原表位。在一些实施例中，本文所提供的双特异性抗体分子包括源自两种或更多种本文所提供的抗体的抗原结合片段。在一些实施例中，两种或更多种抗体结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD中的不同抗原表位。在一些实施例中，两种或更多种抗体在与SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白的RBD的结合时相对于彼此的竞争性不超过70％(或不超过60％，或不超过50％)。在某些实施例中，双特异性抗体包括源自P2C-1F11的第一抗原结合域和源自选自由以下组成的群组的抗体的第二抗原结合域：P2C-1A3、P2C-1C10、P2B-2F6、P2B-1G5和P2A-1B3。在某些实施例中，双特异性抗体包括源自P2C-1A3的第一抗原结合域和源自选自由以下组成的群组的抗体的第二抗原结合域：P2C-1F11和P2A-1B3。在某些实施例中，双特异性抗体包括源自P2B-2F6的第一抗原结合域和源自选自由以下组成的群组的抗体的第二抗原结合域：P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-1G5和P2A-1B3。在某些实施例中，双特异性抗体包括源自P2A-1B3的第一抗原结合域和源自选自由以下组成的群组的抗体的第二抗原结合域：P2C-1A3、P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-2F6和P2A-1A10。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1C10或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1A3、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。
如本文中关于抗原结合域所使用的术语“源自”意指抗原结合域包括如本文所揭露的指定单克隆抗体或其变体的至少一个重链CDR序列(例如包括重链CDR3或三个重链CDR)或至少一个轻链CDR序列(例如包括轻链CDR3或三个重链CDR)。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域包括如本文所揭露的指定单克隆抗体或其变体的重链CDR序列，和/或如本文所揭露的指定单克隆抗体或其变体的轻链CDR序列。在某些实施例中，第一和第二抗原结合域包括如本文所揭露的指定单克隆抗体或其变体的重链可变区序列，和/或如本文所揭露的指定单克隆抗体或其变体的轻链可变区序列。特定单克隆抗体的所有CDR序列和可变区序列提供于本发明的表1和2中。
在某些实施例中，本文所提供的双特异性抗体分子具有针对SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白的RBD的第一抗原结合域特异性和针对第二抗原的第二抗原结合域特异性。在某些实施例中，第二抗原可为例如SARS-CoV-2的刺突蛋白、S2蛋白(即，其从刺突蛋白裂解)、SARS-CoV-2的核衣壳蛋白上的RBD外部的抗原表位，或替代地第二抗原可为人类免疫细胞，例如T细胞巨噬细胞、自然杀伤细胞或抗原呈现细胞上的抗原。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子是基于“完整”抗体，例如完整IgG或IgG样分子的格式。此类双特异性抗体的实例包含(但不限于)由四源杂交瘤(quadroma)细胞株产生的那些双特异性抗体。在另一实施例中，双特异性IgG样分子可为附接IgG，其通过使具有第一特异性的IgG的轻链或重链的氨基端或羧基端附接有具有第二特异性的额外抗原结合单元来工程化。附接抗原结合单元可为例如单域抗体(例如未配对的VL或VH，或VHH(即，重链抗体的重链可变域))、配对的抗体可变域(例如Fv或scFv)或工程化蛋白质骨架。附接IgG的实例包含(但不限于)双重可变域(DVD)-Ig，其具有融合到第一重链的VH的第二重链可变域(VH)和融合到IgG的第一轻链的第二可变轻链域(VL)。当第一VH/VL和第二VH/VL经选择以结合到两个不同抗原时，DVD-Ig可为双特异性的。在某些实施例中，双特异性IgG或IgG样分子对于每一抗原可为单价的且可通过在单一宿主细胞中共表达两个轻链和两个重链来产生。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子可为基于可变域的小型重组双特异性格式(例如单域抗体、Fv和Fab)，其可缺少抗体恒定域的一些或所有。小型重组双特异性格式的实例包含(但不限于)串联单链可变片段分子(taFv)、双功能抗体(Db)、单链双功能抗体(scDb)和这些的各种其它衍生物(参见如Byrne H.等人(2013)TrendsBiotech,31(11):621-632所描述的双特异性抗体格式)、BiTE(双特异性T细胞接合子)、DART以及TandAb。在某些实施例中，两种抗原结合部分可通过肽连接子连接。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子呈选自双特异性IgG样抗体(BsIgG)的双特异性格式，包括CrossMab；DAF(二合一(two-in-one))；DAF(四合一(four-in-one))；DutaMab；DT-IgG；杵-臼(Knobs-in-holes)共享LC；杵-臼组合件；电荷对；Fab臂交换；SEED体；三功能单抗(Triomab)；LUZ-Y；Fcab；κ-λ体(kappa-lamda-body)；和正交Fab(Orthogonal Fab)。对于双特异性抗体格式的详细描述，请参见Spiess C.、Zhai Q.和Carter P.J.(2015)Molecular Immunology 67:95-106，其以全文引用的方式并入本文中。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子呈选自具有额外抗原结合部分的IgG附接的抗体的双特异性格式，其由以下组成：DVD-IgG；IgG(H)-scFv；scFv-(H)IgG；IgG(L)-scFv；scFV-(L)IgG；IgG(L,H)-Fv；IgG(H)-V；V(H)-IgG；IgG(L)-V；V(L)-IgG；IgG-scFab；2scFv-IgG；IgG-2scFv；scFv4-Ig；scFv4-Ig；和Zybody(参见同上)。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子呈选自以下的双特异性格式：WuxiBody(WuXi Biologics，参见WO2019057122A1，其全文并入本文中)；三功能单抗；杂交融合瘤(四源杂交瘤)；多特异性抗运载蛋白平台(Pieris)；双功能抗体；单链双功能抗体；串联单链Fv片段；TandAb，三特异性Ab(Affimed)；Darts(双重亲和力再靶向(dualaffinity retargeting)；Macrogenics)；双特异性Xmabs(Xencor)；双特异性T细胞接合子(Bites；Amgen；55kDa)；三重抗体(Triplebodies)；三链抗体(Fab-scFv)；融合蛋白(CreativeBiolabs)；多官能重组抗体衍生物；Duobody平台(Genmab)；锁钥结构平台(Dockand lock platform)；臼包杵(Knob into hole；KIH)平台；人类化双特异性IgG抗体(REGN1979)(Regeneron)；Mab2双特异性抗体(F-Star)；DVD-Ig(双重可变域免疫球蛋白)(Abbvie)；κ-λ体；TBTI(四价双特异性串联Ig)；和CrossMab。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子呈选自包含以下的双特异性抗体片段的形式：纳米抗体；纳米抗体-HAS；BiTE；双功能抗体；DART；TandAb；sc双功能抗体(scDiabody)；sc双功能抗体-CH3；双功能抗体-CH3；三重抗体；微型抗体(Miniantibody)；微抗体(Minibody)；TriBi微抗体；scFv-CH3 KIH；Fab-scFv；scFv-CH-CL-scFv；F(ab')2；F(ab')2-scFv2；scFv-KIH；Fab-scFv-Fc；四价HCAb；sc双功能抗体-Fc；双功能抗体-Fc；串联scFv-Fc；和胞内抗体(参见同上)。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子呈双特异性形式，例如锁钥结构；ImmTAC；HSAbody；sc双功能抗体-HAS；和串联scFv-Toxin(参见同上)。
在某些实施例中，如本文中所提供的双特异性抗体分子是基于选自包含以下的双特异性抗体缀合物的形式，包括IgG-IgG；Cov-X-Body；和scFv1-PEG-scFv2(参见同上)。
可用所属领域中已知的任何适合的方法制造本文所提供的双特异性抗体分子。在常规方法中，具有不同抗原结合特异性的两个免疫球蛋白重链-轻链对可以重组方式共表达于宿主细胞中以产生双特异性抗体(参见例如Milstein和Cuello,Nature,305:537(1983))，随后通过亲和性色谱纯化。
也可使用重组方法，其中编码针对两种特异性的抗体重链可变域的序列分别融合到免疫球蛋白恒定域序列，随后插入表达载体，上述表达载体与针对轻链序列的表达载体共转染到适合宿主细胞以重组表达双特异性抗体(参见例如WO 94/04690；Suresh等人,Methods in Enzymology,121:210(1986))。类似地，scFv二聚体也可以重组方式构筑且从宿主细胞表达(参见例如Gruber等人,J.Immunol.,152:5368(1994).)。
可由双特异性抗体，例如通过蛋白质裂解或通过化学连接生成双特异性抗体分子。举例来说，可制备抗体的抗原结合片段(例如Fab')且将其转化为Fab'-硫醇衍生物，且随后混合并且与另一转化的具有不同抗原特异性的Fab'衍生物反应，以形成双特异性抗体分子(参见例如Brennan等人,Science,229:81(1985))。
在某些实施例中，双特异性抗体分子可经工程化以促进两个不同抗原结合位点的重链异二聚化。在某些实施例中，在界面处修饰Fc区，使得可形成杵-臼缔合以促进异二聚化。如本文中所使用，“臼包杵(Knob-into-hole)”是指两个多肽(例如CH3域)之间的相互作用，其中一个多肽由于存在具有庞大侧链的氨基酸残基(例如酪氨酸或色氨酸)而具有突起(即，“杵”)，且另一多肽具有其中小侧链氨基酸残基驻存(例如丙氨酸或苏氨酸)的空腔(即，“臼”)，且突起可定位于空腔中以便促进两个多肽的相互作用，从而形成异二聚体或复合物。生成具有臼包杵的多肽的方法为所属领域中已知的，例如如美国专利号：5,731,168中所描述。
在一些实施例中，可将“带电荷对”引入Fc多肽中以静电操纵朝向异二聚化的形成。示范性对包含与D221R/P228R/K409R配对的D221E/P228E/L368E和与C220R/E224R/P228R/K409R配对的C220E/P228E/368E(参见Gunasekaran等人,2010,J.Biol.Chem.285(25):19637.)。
在一些实施例中，两个Fc多肽链的结合界面可经工程化以使得在异二聚体配置中，残基与具有类似物理性质的残基相互作用(例如，极性残基与极性残基相互作用，或疏水性残基与疏水性残基相互作用)，而在均二聚体配置中，残基与具有不同物理性质的残基相互作用。示范性修饰包含在位置364、368、399、405、409、411或其任何组合处的取代(参见例如WO2014/145806、WO2014/110601、WO2016/086186、WO2016/086189、WO2016/086196和WO2016/182751)。
在一些实施例中，双特异性抗体分子可经工程化以减少两个不同轻链可变区与两个不同重链可变区的随机配对。在一些实施例中，双特异性抗体分子包括能够与两个重链可变区配对的共同轻链。在一些其它实施例中，将一条重链的CH1域与对应轻链的恒定区(CL)交换(例如CrossMab技术中所应用的交换)。在一些其它实施例中，将突变引入Fab片段的CH1-CL界面和/或VH-VL界面中，以便强迫轻链与对应重链的正确配对。在一些其它实施例中，一个抗原结合域中的CH1域和CL域经TCR恒定域置换，以使第一抗原结合域的重链与第二抗原结合域的轻链之间的错配降到最低(例如WuxiBody技术中所应用的错配)。
在一些实施例中，本发明的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中抗原结合域可包括：
a.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3；
b.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13；
c.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:23；
d.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32和SEQ ID NO:33；
e.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42和SEQ ID NO:43；
f.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:53；
g.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66和SEQ ID NO:67；
h.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76和SEQ ID NO:77；
i.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86和SEQ ID NO:87；
j.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:97；
k.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:106和SEQ IDNO:107；
l.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:437和SEQ IDNO:438；
m.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:106和SEQ IDNO:438；
n.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ IDNO:138；
o.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ IDNO:448；
p.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:443和SEQ IDNO:444；
q.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:137和SEQ IDNO:444；
r.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147和SEQ IDNO:148；
s.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:157和SEQ IDNO:158；
t.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:167和SEQ IDNO:168；
u.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:177和SEQ IDNO:178；
v.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:187和SEQ IDNO:188；
w.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:197和SEQ IDNO:198；
x.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:207和SEQ IDNO:208；
y.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:217和SEQ IDNO:218；
z.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227和SEQ IDNO:228；
aa.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:237和SEQ IDNO:238；
bb.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:246、SEQ ID NO:247和SEQ IDNO:248；
cc.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:257和SEQ IDNO:258；
dd.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:267和SEQ IDNO:268；
ee.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277和SEQ IDNO:278；
ff.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:287和SEQ IDNO:288；
gg.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:297和SEQ IDNO:298；
hh.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:307和SEQ IDNO:308；
ii.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:317和SEQ IDNO:318；
jj.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:327和SEQ IDNO:328；
kk.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:337和SEQ IDNO:338；
ll.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:347和SEQ IDNO:348；
mm.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:357和SEQ IDNO:358；
nn.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:367和SEQ IDNO:368；
oo.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:377和SEQ IDNO:378；
pp.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:387和SEQ IDNO:388；
qq.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:397和SEQ IDNO:398；
rr.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:407和SEQ IDNO:408；
ss.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:417和SEQ IDNO:418；
tt.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:427和SEQ IDNO:428；或
其组合。
在一些实施例中，上文所揭露的经修饰抗体或抗原结合片段，其中抗原结合域包括：
a.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6；
b.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16；
c.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26；
d.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35和SEQ ID NO:36；
e.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45和SEQ ID NO:46；
f.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56；
g.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69和SEQ ID NO:70；
h.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:79和SEQ ID NO:80；
i.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89和SEQ ID NO:90；
j.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99和SEQ ID NO:100；
k.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:109和SEQ IDNO:110；
l.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:439、SEQ ID NO:440和SEQ IDNO:441；
m.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:140和SEQ IDNO:141；
n.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:445、SEQ ID NO:446和SEQ IDNO:447；
o.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150和SEQ IDNO:151；
p.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160和SEQ IDNO:161；
q.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:170和SEQ IDNO:171；
r.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:180和SEQ IDNO:181；
s.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:190和SEQ IDNO:191；
t.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:200和SEQ IDNO:201；
u.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:210和SEQ IDNO:211；
v.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:220和SEQ IDNO:221；
w.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:230和SEQ IDNO:231；
x.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:240和SEQ IDNO:241；
y.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:250和SEQ IDNO:251；
z.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:260和SEQ IDNO:261；
aa.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:270和SEQ IDNO:271；
bb.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280和SEQ IDNO:281；
cc.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:290和SEQ IDNO:291；
dd.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:300和SEQ IDNO:301；
ee.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:310和SEQ IDNO:311；
ff.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:320和SEQ IDNO:321；
gg.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:330和SEQ IDNO:331；
hh.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:340和SEQ IDNO:341；
ii.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:350和SEQ IDNO:351；
jj.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:360和SEQ IDNO:361；
kk.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:370和SEQ IDNO:371；
ll.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:380和SEQ IDNO:381；
mm.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:390和SEQ IDNO:391；
nn.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:400和SEQ IDNO:401；
oo.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:410和SEQ IDNO:411；
pp.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:420和SEQ IDNO:421；
qq.1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:430和SEQ IDNO:431；或
其组合。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中抗原结合域可包括：
a.包括SEQ ID NO:1的序列的重链CDR1(HCDR1)、包括SEQ ID NO:2的序列的重链CDR2(HCDR2)、包括SEQ ID NO:3的序列的重链CDR3(HCDR3)、包括SEQ ID NO:4的序列的轻链CDR1(LCDR1)、包括SEQ ID NO:5的序列的轻链CDR2(LCDR2)和包括SEQ ID NO:6的序列的轻链CDR3(LCDR3)；
b.包括SEQ ID NO:11的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:12的序列的HCDR2、包括SEQID NO:13的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:14的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:15的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:16的序列的LCDR3；
c.包括SEQ ID NO:21的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:22的序列的HCDR2、包括SEQID NO:23的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:24的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:25的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:26的序列的LCDR3；
d.包括SEQ ID NO:31的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:32的序列的HCDR2、包括SEQID NO:33的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:34的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:35的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:36的序列的LCDR3；
e.包括SEQ ID NO:41的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:42的序列的HCDR2、包括SEQID NO:43的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:44的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:45的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:46的序列的LCDR3；
f.包括SEQ ID NO:51的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:52的序列的HCDR2、包括SEQID NO:53的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:54的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:55的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:56的序列的LCDR3；
g.包括SEQ ID NO:65的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:66的序列的HCDR2、包括SEQID NO:67的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:68的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:69的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:70的序列的LCDR3；
h.包括SEQ ID NO:75的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:76的序列的HCDR2、包括SEQID NO:77的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:78的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:79的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:80的序列的LCDR3；
i.包括SEQ ID NO:85的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:86的序列的HCDR2、包括SEQID NO:87的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:88的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:89的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:90的序列的LCDR3；
j.包括SEQ ID NO:95的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:96的序列的HCDR2、包括SEQID NO:97的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:98的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:99的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:100的序列的LCDR3；
k.包括SEQ ID NO:105的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3；
l.包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:437的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:441的序列的LCDR3；
m.包括SEQ ID NO:105或436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106或437的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107或438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108或439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109或440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110或441的序列的LCDR3；
n.包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3；
o.包括SEQ ID NO:136的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3；
p.包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:443的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:447的序列的LCDR3；
q.包括SEQ ID NO:136或442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137或443的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448或444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139或445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140或446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141或447的序列的LCDR3；
r.包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3；
s.包括SEQ ID NO:146的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:147的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:148的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:149的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:150的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:151的序列的LCDR3；
t.包括SEQ ID NO:156的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:157的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:158的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:159的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:160的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:161的序列的LCDR3；
u.包括SEQ ID NO:166的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:167的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:168的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:169的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:170的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:171的序列的LCDR3；
v.包括SEQ ID NO:176的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:177的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:178的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:179的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:180的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:181的序列的LCDR3；
w.包括SEQ ID NO:186的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:187的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:188的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:189的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:190的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:191的序列的LCDR3；
x.包括SEQ ID NO:196的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:197的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:198的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:199的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:200的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:201的序列的LCDR3；
y.包括SEQ ID NO:206的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:207的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:208的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:209的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:210的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:211的序列的LCDR3；
z.包括SEQ ID NO:216的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:217的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:218的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:219的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:220的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:221的序列的LCDR3；
aa.包括SEQ ID NO:226的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:227的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:228的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:229的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:230的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:231的序列的LCDR3；
bb.包括SEQ ID NO:236的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:237的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:238的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:239的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:240的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:241的序列的LCDR3；
cc.包括SEQ ID NO:246的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:247的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:248的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:249的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:250的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:251的序列的LCDR3；
dd.包括SEQ ID NO:256的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:257的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:258的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:259的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:260的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:261的序列的LCDR3；
ee.包括SEQ ID NO:266的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:267的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:268的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:269的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:270的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:271的序列的LCDR3；
ff.包括SEQ ID NO:276的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:277的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:278的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:279的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:280的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:281的序列的LCDR3；
gg.包括SEQ ID NO:286的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:287的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:288的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:289的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:290的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:291的序列的LCDR3；
hh.包括SEQ ID NO:296的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:297的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:298的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:299的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:300的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:301的序列的LCDR3；
ii.包括SEQ ID NO:306的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:307的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:308的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:309的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:310的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:311的序列的LCDR3；
jj.包括SEQ ID NO:316的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:317的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:318的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:319的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:320的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:321的序列的LCDR3；
kk.包括SEQ ID NO:326的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:327的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:328的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:329的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:330的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:331的序列的LCDR3；
ll.包括SEQ ID NO:336的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:337的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:338的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:339的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:340的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:341的序列的LCDR3；
mm.包括SEQ ID NO:346的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:347的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:348的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:349的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:350的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:351的序列的LCDR3；
nn.包括SEQ ID NO:356的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:357的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:358的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:359的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:360的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:361的序列的LCDR3；
oo.包括SEQ ID NO:366的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:367的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:368的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:369的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:370的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:371的序列的LCDR3；
pp.包括SEQ ID NO:376的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:377的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:378的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:379的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:380的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:381的序列的LCDR3；
qq.包括SEQ ID NO:386的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:387的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:388的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:389的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:390的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:391的序列的LCDR3；
rr.包括SEQ ID NO:396的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:397的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:398的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:399的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:400的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:401的序列的LCDR3；
ss.包括SEQ ID NO:406的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:407的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:408的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:409的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:410的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:411的序列的LCDR3；
tt.包括SEQ ID NO:416的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:417的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:418的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:419的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:420的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:421的序列的LCDR3；
uu.包括SEQ ID NO:426的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:427的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:428的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:429的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:430的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:431的序列的LCDR3；或
其组合。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中抗原结合域可包括：
包括SEQ ID NO:105或436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106或437的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107或438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108或439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109或440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110或441的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:105的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQID NO:107的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:437的序列的HCDR2、包括SEQID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:441的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:136或442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137或443的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448或444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139或445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140或446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141或447的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:136的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQID NO:138或448的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:443的序列的HCDR2、包括SEQID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:447的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3；
或其组合。
在一些实施例中，经修饰抗体可包括第一抗原结合域，其包括：
包括SEQ ID NO:105或436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106或437的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107或438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108或439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109或440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110或441的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:105的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQID NO:107的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:437的序列的HCDR2、包括SEQID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:441的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的序列的HCDR2、包括SEQID NO:438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的序列的LCDR3；
和第二抗原结合域，其包括：
包括SEQ ID NO:136或442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137或443的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448或444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139或445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140或446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141或447的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:136的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQID NO:138或448的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:443的序列的HCDR2、包括SEQID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:447的序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的序列的HCDR2、包括SEQID NO:444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的序列的LCDR3；
且其中抗体包括经修饰人类IgG恒定域，其包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或抗原结合其片段，其中经修饰抗体或抗原结合片段在活体内，例如在人类个体中的半衰期(T1/2)可在50到120天的范围内。经修饰抗体或抗原结合片段的半衰期(T1/2)可在50到120天、60到120天、70到120天、80到120天、90到120天、100到120天或110到120天的范围内。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中经修饰抗体在抗原结合域、人类IgG恒定域、经修饰抗体的轻链、经修饰抗体的重链或其组合中可包括至少一个氨基酸后续取代。在一些情况下，后续取代可包括将半胱氨酸残基取代为非半胱氨酸残基。在一些情况下，半胱氨酸残基可经丝氨酸残基取代。在一些实施例中，经修饰抗体可包括C106S取代，其中半胱氨酸106在重链可变区HCDR3中经丝氨酸取代(根据国际免疫遗传学系统(international ImMunoGeneTics system；IMGT)独特编号进行编号)。在一些实施例中，C106S取代的HCDR3包括SEQ ID NO:448的氨基酸序列。视所界定的CDR边界而定，C106S取代可在HCDR3区的外部，例如当HCDR3基于Kabat编号确定时，在这种情况下C106S取代将在框架区中。
在一些实施例中，经修饰抗体可包括具有抗原结合亲和力和共价连接的经修饰人类IgG恒定域的抗原结合域，其中抗原结合亲和力包括表1中所列出的LCDR中的至少一者和HCDR中的至少一者，其中经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代(根据如Kabat中的EU索引进行编号)，和C106S取代，其中胱氨酸106在重链可变区HDR3中经丝氨酸取代(根据国际免疫遗传学系统(IMGT)独特编号进行编号)。在一些实施例中，经修饰抗体可包括具有抗原结合亲和力和共价连接的经修饰人类IgG恒定域的抗原结合域，其中抗原结合亲和力包括HCDRSEQ ID No.:136、SEQ ID No.:137、SEQ ID No.:138、LCDR SEQ ID No.:139、SEQ ID.No.:140和SEQ ID.No.:141(P2B-1G5)，其中经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代(根据如Kabat中的EU索引进行编号)，和C106S取代，其中胱氨酸106在重链可变区中经丝氨酸取代(根据国际免疫遗传学系统(IMGT)独特编号进行编号)。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段可进一步包括一种或多种后续修饰的抗体，上述后续修饰的抗体选自：第一后续修饰的抗体，其包括两个各自对SARS-CoV-2具有相同或不同亲和力的抗原结合域；第二后续修饰的抗体，其包括对SARS-CoV-2具有结合亲和力的第一抗原结合域和对与SARS-CoV-2不同的第二病原体具有结合亲和力的第二抗原结合域；第三后续修饰的抗体，其包括两个各自对第二病原体具有结合亲和力的抗原结合域；或其组合。术语“对SARS-CoV-2的不同亲和力”是指可结合到SARS-CoV-2的不同抗原表位或结合位点的亲和力、可结合到SARS-CoV-2的同一抗原表位或结合位点的不同亲和力水平，或其组合。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中对第二病原体的结合亲和力可选自对以下的亲和力：SARS-CoV、MERS-CoV、一种或多种细菌、一种或多种真菌、一种或多种病毒、一种或多种寄生虫、其部分或其组合。
在一些实施例中，本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中经修饰抗体或其抗原结合片段为单链抗体、双功能抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫键稳定的双功能抗体(dsdiabody)、单链抗体分子(scFv)、scFv二聚体(二价双功能抗体)、双特异性scFv二聚体、多特异性抗体、重链抗体、骆驼化单域抗体、纳米抗体、域抗体或二价域抗体，如上下文所揭露。
竞争性结合、晶体结构和抗原表位
在一个方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其与本文所描述的抗体或其抗原结合片段竞争结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD。
与本文所提供的抗体或抗原结合片段竞争结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的抗体或抗原结合片段包含(但不限于)结合到本文所提供的抗体或抗原结合片段结合的抗原表位或结合位点，或结合到足够接近的抗原表位或结合位点的抗体、抗体片段和其它结合剂。优选地，本发明的竞争性抗体或抗原结合片段在以过量存在时，将使本文所提供的抗体或抗原结合片段与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的特异性结合抑制至少10％，优选至少25％，更优选至少50％，且最优选至少75％-90％或甚至更大。鉴定与本发明的抗体或抗原结合片段结合到大约、大体上、基本上相同或相同的抗原表位的一种或多种竞争性抗体或抗原结合片段为直接的技术问题。由于竞争性结合分子的鉴定是相较于参考结合分子(例如本发明的抗体或抗原结合片段)来确定，应理解，为了鉴定与参考结合分子结合到相同或大体上相同的抗原表位的竞争性结合分子，实际上不需要以任何方式确定参考结合分子和竞争性结合分子所结合的抗原表位。
在一个方面中，本发明提供一种SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗体复合的晶体。在某些实施例中，在晶体中与RBD复合的抗体为本文所提供的任何抗体，或其抗原结合片段(例如Fab片段)。
在一些实施例中，本文所提供的晶体包括与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD复合的抗体P2B-2F6的Fab片段。在一些实施例中，晶体由P212121空间群组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100001301
且
Figure BDA0003707502100001302
在一些实施例中，本文所提供的晶体包括与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD复合的抗体P2C-1F11的Fab片段。在一些实施例中，晶体具有C121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100001303
且
Figure BDA0003707502100001304
在一些实施例中，本文所提供的晶体包括与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD复合的抗体P22A-1D1的Fab片段。在一些实施例中，晶体具有C2空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100001305
且
Figure BDA0003707502100001306
在一些实施例中，本文所提供的晶体包括与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD复合的抗体P5A-1D2的Fab片段。在一些实施例中，晶体具有C2空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100001307
且
Figure BDA0003707502100001308
在一些实施例中，本文所提供的晶体包括与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD复合的抗体P5A-3C8的Fab片段。在一些实施例中，晶体具有P212121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100001311
且
Figure BDA0003707502100001312
对结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的抗体的X射线晶体学分析可用于确定抗体抗原表位。特定地说，可以这种方式通过在抗体互补位残基的
Figure BDA0003707502100001313
内确定SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD上的残基来鉴定抗原表位。在另一方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD上的抗原表位，其中抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个)选自以下的残基：K444、G446、G447、N448、Y449、N450、L452、V483、E484、G485、F490和S494，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括Y449、L452和F490。在某些实施例中，抗原表位包括Y449和G446。在某些实施例中，本文所提供的抗体或其抗原结合片段对SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合亲和力(Kd)不超过50nM(例如，不超过40nM、不超过30nM、不超过20nM、不超过10nM或不超过5nM)，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量。
在另一方面中，本发明提供一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD上的抗原表位，其中抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个)选自以下的残基：Y453、L455、F456、R457、K458、S459、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489、Q493、G502、Y505、R403、T415、G416、K417、D420和Y421，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个)选自以下的残基：Y453、L455、F456、R457、K458、S459、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489、Q493、G502和Y505，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括或进一步包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个或六个)选自以下的残基：R403、T415、G416、K417、D420和Y421，其中残基编号是根据SEQ IDNO:134。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个、十二个)选自以下的残基：T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个)选自以下的残基：T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、N487、Y489、Q493和Y505，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个)选自以下的残基：T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个、十一个或十二个)选自以下的残基：T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个或七个)选自以下的残基：L455、K458、Y473、A475、G476、S477和N487。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个、四个、五个、六个或七个)选自以下的残基：T415、G416、K417、D420、Y421、K458和N460。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个或至少两个Y449和G446。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个或四个)选自以下的残基：K417、Y421、L455和F456。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个(至少两个、三个或四个)选自以下的残基：F456、N487、Y489和Q493。在某些实施例中，抗原表位包括L455。在某些实施例中，抗原表位包括至少一个或至少两个选自Y421和D420的残基。在某些实施例中，抗原表位包括Y421。在某些实施例中，抗原表位包括Y505。在某些实施例中，抗原表位包括Y421A和F456A，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括T415A、Y473A和N487A，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括K417A、D420A、L455A、R457A、N460A和Y489A，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，抗原表位包括T415A、Y421A、L455A、F456A、R457A、Y473A、N487A、Y489A和Y505A，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，本文所提供的抗体或其抗原结合片段对SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合亲和力(Kd)不超过50nM(例如，不超过40nM、不超过30nM、不超过20nM或不超过10nM或不超过5nM)，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量。
在一方面中，本发明提供一种用于引起SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的晶体的一部分的结构的图形三维表示的展示的计算机实施方法，其中上述方法包括：通过用指令编程的计算机系统引起上述图形三维表示的上述展示，上述指令用于将结构坐标转换成上述结构的上述图形三维表示且展示上述图形三维表示，其中上述图形三维表示是通过将上述结构坐标转换成上述结构的上述图形三维表示而产生，其中上述结构坐标包括上述晶体的上述部分的主链原子的结构坐标，其中上述晶体的上述部分包括RBD结合位点，且其中上述晶体具有空间群对称性P212121或C121。
在另一方面中，本发明提供一种机器可读数据存储媒体，其包括用机器可读指令编码的数据存储材料，上述机器可读指令：(a)将数据转换成SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的晶体的一部分的结构的图形三维表示；和(b)引起上述图形三维表示的展示；其中上述数据包括界定RBD结合位点的氨基酸的主链原子的结构坐标；且其中晶体或结构同源物具有空间群对称性P212121或C121。
在另一方面中，本发明提供一种用于展示SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与如本文中所提供的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的晶体的一部分的结构的三维图形表示的计算机系统，其包括：(a)机器可读数据存储媒体，其包括编码有机器可读数据的数据存储材料，其中上述数据包括界定RBD结合位点的氨基酸的主链原子的结构坐标，其中晶体具有空间群对称性P212121或C121；(b)工作存储器；(c)中央处理单元，其耦合到上述工作存储器和上述机器可读数据存储媒体以用于将上述机器可读数据处理成上述三维图形表示；和(d)显示器，其耦合到上述中央处理单元以用于展示上述三维图形表示。
对于上文所列的方面，在某些实施例中，RBD包括如SEQ ID NO:124中所示的氨基酸序列。在某些实施例中，抗体包括一对如表2中所列出的重链可变区和轻链可变区，或其同源序列(例如具有至少80％序列一致性)。在某些实施例中，抗体包括：a)SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区；或b)SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ IDNO:112的轻链可变区；或c)SEQ ID NO:432的重链可变区和SEQ ID NO:433的轻链可变区；或d)SEQ ID NO:242的重链可变区和SEQ ID NO:243的轻链可变区；或e)SEQ ID NO:232的重链可变区和SEQ ID NO:233的轻链可变区。在某些实施例中，结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的K444、G446、G447、N448、Y449、N450、L452、V483、E484、G485、F490和/或S494，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的Y453、L455、F456、R457、K458、S459、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489、Q493、G502、Y505、R403、T415、G416、K417、D420和/或Y421，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和/或Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、N487、Y489、Q493和/或Y505，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和/或Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和/或Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。
在另一方面中，本发明提供一种筛选可为SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合分子的分子的方法，其包括：(a)针对三维模型以计算方式筛选媒介物以鉴定RBD的潜在结合分子；其中三维模型包括SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的晶体的至少一部分的三维模型；其中三维模型是通过用于产生适用于鉴定媒介物的晶体的三维模型的计算机算法由晶体的结构坐标的至少一部分生成，上述媒介物为RBD的潜在结合分子。
在某些实施例中，晶体包括含有氨基酸序列SEQ ID NO:124或其同源序列的多肽，例如源自突变体SARS-CoV-2的多肽。在某些实施例中，晶体进一步包括抗体或其抗原结合片段，其包括一对如表2中所列出的重链可变区和轻链可变区，或其同源序列(例如具有至少80％序列一致性)。在某些实施例中，晶体进一步包括抗体或其抗原结合片段，其包括：a)SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区，或b)SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ ID NO:112的轻链可变区，其中晶体使x射线衍射以确定原子坐标为
Figure BDA0003707502100001341
Figure BDA0003707502100001342
或更佳的分辨率。
一种用于获得关于分子或分子复合物的结构信息的方法，其包括将SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的结构坐标的至少一部分应用于分子或分子复合物的晶体结构的X射线衍射图，以使得产生分子或分子复合物的至少一部分的三维电子密度图。在某些实施例中，晶体包括含有氨基酸序列SEQ IDNO:124或其同源序列的多肽，例如源自突变体SARS-CoV-2的多肽。在某些实施例中，晶体进一步包括抗体或其抗原结合片段，其包括一对如表2中所列出的重链可变区和轻链可变区，或其同源序列(例如具有至少80％序列一致性)。在某些实施例中，晶体进一步包括抗体或其抗原结合片段，其包括：a)SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区，或b)SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ ID NO:112的轻链可变区，其中晶体使x射线衍射以确定原子坐标为
Figure BDA0003707502100001351
或更佳的分辨率。
缀合物
在一些实施例中，抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段进一步包括一个或多个缀合物部分。缀合物部分为可直接或经由连接子或经由另一缀合物部分连接到抗体或其抗原结合片段的部分。经考虑，各种缀合物部分可连接到本文所提供的抗体或其抗原结合片段(参见例如“缀合物疫苗(Conjugate Vaccines)”,Contributions to Microbiology andImmunology,J.M.Cruse和R.E.Lewis,Jr.(编辑),Carger Press,New York,(1989))。这些缀合物部分可通过共价结合、亲和力结合、嵌入、协同结合(coordinate binding)、复合(complexation)、缔合(association)、掺合(blending)或添加以及其它方法连接到抗体或其抗原结合片段。
在某些实施例中，本文所提供的抗体或其抗原结合片段可经工程化以在可用于结合到一个或多个缀合物部分的抗原表位结合部分外含有特定位点。举例来说，此类位点可包含一个或多个反应性氨基酸残基(例如半胱氨酸或组氨酸残基)，以有助于与缀合物部分的共价键联。
此类缀合物部分的实例包含(但不限于)治疗剂、放射性同位素、可检测标记、药物动力学修饰部分或纯化部分。在一些实施例中，缀合物部分包括清除修饰剂(例如延长半衰期的聚合物，如PEG)、化疗剂、毒素、放射性同位素、镧系元素、可检测标签(例如发光标签、荧光标签、酶底物标签)、DNA烷基化剂、拓扑异构酶抑制剂、微管蛋白粘合剂、纯化部分或其它抗癌药物。
可检测标签的例子可包括荧光标签(如荧光素、罗丹明、丹宁、藻红素或德克萨斯红)、酶底物标签(如辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、荧光素酶、葡聚糖酶、溶菌酶、糖氧化酶或-D-半乳糖苷酶)、放射性同位素(如123I、124I、125I、131I、35S、3H、111In、112In、14C、64Cu、67Cu、86Y、88Y、90Y、177Lu、211At、186Re、188Re、153Sm、212Bi和32P，其他镧系元素)、发光标签、色素基团、地高辛、生物素/阿维丁、DNA分子或黄金进行检测。
在某些实施例中，缀合部分可以是一种有助于增加抗体半衰期的清除调节剂。说明性的例子包括水溶性聚合物，如PEG、羧甲基纤维素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、乙二醇/丙二醇的共聚物等等。聚合物可以是任何分子量的，也可以是支链或不支链的。连接在抗体上的聚合物的数量可以不同，如果连接了一个以上的聚合物，它们可以是相同或不同的分子。在某些实施例中，缀合部分可以是一个纯化部分，如磁珠。在某些实施例中，如本文所提供的抗体或其抗原结合片段被用作缀合物的基础。
多核苷酸和重组方法
本发明提供编码本文所提供的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段的经分离多核苷酸。使用常规程序(例如，通过使用能够特异性地结合到编码抗体的重链和轻链的基因的寡核苷酸探针)，例如从B细胞容易地分离和定序编码单克隆抗体的DNA。也可通过合成方法获得编码DNA。
使用所属领域中已知的重组技术，可将编码抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段的经分离多核苷酸插入到载体中，用于进一步克隆(DNA的扩增)或用于表达(即，表达载体)。许多载体为可用的。载体组分通常包含(但不限于)以下中的一者或多者：信号序列、复制起点、一种或多种标记基因、增强子元件、启动子(例如SV40、CMV、EF-1α)和转录终止序列。
本发明提供了包含如本文所提供的分离的多核苷酸的载体。在某些实施例中，本文提供的多核苷酸编码抗体或其抗原结合片段，至少一个与核酸序列可操作连接的启动子(例如SV40、CMV、EF-1a)，以及至少一个选择标记。载体的例子包括但不限于逆转录病毒(包括慢病毒)、腺病毒、腺相关病毒、疱疹病毒(如单纯疱疹病毒)、痘病毒、杆状病毒、乳头瘤病毒、乳头病毒(如SV40)、λ噬菌体和M13噬菌体、质粒pcDNA3.3、pMD18-T、pOptivec、pCMV、pEGFP、pIRES、pQD-Hyg-Seu、pALTER、pBAD、pcDNA、pCal、pL、pET、pGEMEX、pGEX、pCI、pEGFT、pSV2。pFUSE,pVITRO,pVIVO,pMAL,pMONO,pSELECT,pUNO,pDUO,Psg5L,pBABE,pWPXL,pBI,p15TV-L,pPro18,pTD,pRS10,pLexA,pACT2。2,pCMV-SCRIPT.RTM,pCDM8,pCDNA1.1/amp,pcDNA3.1,pRc/RSV,PCR 2.1,pEF-1,pFB,pSG5,pXT1,pCDEF3,pSVSPORT,pEF-Bos等等。
包含编码抗体或其抗原结合片段的多核苷酸序列的载体可以被引入宿主细胞进行克隆或基因表达。用于克隆或表达这里的载体中的DNA的合适宿主细胞是上述的原核生物、酵母或高等真核生物细胞。适用于此目的的原核生物包括真菌，如革兰氏阴性或革兰氏阳性生物，例如，肠杆菌科，如埃希氏杆菌属(如大肠杆菌)、肠杆菌属、埃尔文氏菌、克雷伯氏菌、变形杆菌、沙门氏菌(如伤寒沙门氏菌)、沙雷氏菌(如马氏沙雷氏菌)和志贺氏菌以及杆菌(如枯草杆菌和地衣杆菌)、假单胞菌(如铜绿假单胞菌)和链霉菌。
除原核生物外，真核微生物如丝状真菌或酵母也是抗SARS-CoV-2抗体编码载体的合适克隆或表达宿主。在低等真核生物宿主微生物中，酿酒酵母或普通面包酵母是最常用的。然而，其他一些属、种和菌株也是常用的，在本文中也是有用的，如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)；克鲁维酵母菌属宿主(kluyveromyces(例如乳酸克鲁维酵母(K.lactis)、脆壁克鲁维酵母(K.fragilis(ATCC 12,424))、保加利亚克鲁维酵母(K.bulgaricus(ATCC 16,045))、wickeramii克鲁维酵母(ATCC 24,178)、克鲁雄酵母菌(K.waltii(ATCC 56,500))、果蝇克鲁维酵母(K.drosophilarum(ATCC 36,906))、耐热克鲁维酵母(K.thermotolerans)和马克思克鲁维酵母(K.marxianus))；耶氏酵母菌属(yarrowia(EP 402,226))；毕赤酵母(Pichia pastoris(EP 183,070))；假丝酵母(Candida)；瑞氏木霉(Trichoderma reesia(EP 244,234))；粗糙脉孢菌(Neurosporacrassa)；许旺酵母属(Schwanniomyces(例如西方许旺酵母(Schwanniomycesoccidentalis)))；以及丝状真菌(例如粗糙脉孢菌、青霉菌、弯颈霉属)和曲霉属真菌宿主(例如构巢曲霉(A.nidulans)和黑曲霉(A.niger))。
用于表达本文所提供的糖基化抗体或其抗原片段的合适宿主细胞来自多细胞生物。无脊椎动物细胞的例子包括植物和昆虫细胞。许多杆状病毒株和变体以及相应的允许性昆虫宿主细胞来自宿主，如草地贪夜蛾(毛虫)、埃及伊蚊(蚊子)、白纹伊蚊(蚊子)、黑腹果蝇(果蝇)和家蚕，已经被确认。各种用于转染的病毒株是公开的，例如苜蓿银纹夜蛾NPV的L-1变体和家蚕NPV的Bm-5株，这样的病毒可以根据本发明用作此处的病毒，特别是用于草地贪夜蛾细胞的转染。棉花、玉米、马铃薯、大豆、牵牛花、番茄和烟草的植物细胞培养物也可以作为宿主来利用。
然而，对脊椎动物细胞的兴趣最大，脊椎动物细胞的培养繁殖(组织培养)已成为一种常规程序。有用的哺乳动物宿主细胞系的例子是由SV40转化的猴肾CV1系(COS-7，ATCCCRL 1651)；人类胚胎肾系(293或293细胞亚克隆在悬浮培养中生长，Graham等人，J.GenVirol.36:59(1977))；小仓鼠肾细胞(BHK，ATCC CCL 10)；中国仓鼠卵巢细胞/-DHFR(CHO，Urlaub等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4216(1980))；小鼠塞尔托里细胞(TM4，Mather，Biol.Reprod.23:243-251(1980))；猴肾细胞(CV1 ATCC CCL 70)；非洲绿猴肾细胞(VERO-76，ATCC CRL-1587)；人宫颈癌细胞(HELA，ATCC CCL 2)；犬肾细胞(MDCK，ATCC CCL 34)。水牛大鼠肝细胞(BRL 3A，ATCC CRL 1442)；人肺细胞(W138，ATCC CCL 75)；人肝细胞(HepG2，HB 8065)；小鼠乳腺肿瘤(MMT 060562，ATCC CCL51)；TRI细胞(Mather et al.,AnnalsN.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982))；MRC 5细胞；FS4细胞；和人肝癌系(Hep G2)。在一些实施例中，宿主细胞是哺乳动物培养的细胞系，如CHO、BHK、NS0、293及其衍生物。
用上述表达或克隆载体转化宿主细胞以生产抗SARS-CoV-2抗体，并在传统的营养培养基中培养，所述培养基经过适当修改以诱导启动子、选择转化体或扩增编码理想序列的基因。在另一个实施例中，所述抗体可通过本领域已知的同源重组产生。在某些实施例中，宿主细胞能够产生本文提供的抗体或其抗原结合片段。
本发明还提供了一种表达本文所提供的抗体或其抗原结合片段的方法，包括在表达本发明的载体的条件下培养本文提供的宿主细胞。用于生产本文所提供的抗体或其抗原结合片段的宿主细胞可以在各种培养基中培养。市售的培养基如Ham’s F10(Sigma)、最低要素培养基(Minimal Essential Medium(MEM))，(Sigma)、RPMI-1640(Sigma)和杜尔贝科改良伊格尔培养基(Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium(DMEM)，Sigma))都适合培养宿主细胞。此外，Ham等人，Meth.Enz.，58:44(1979),Barnes等人,分析生物化学(Anal.Biochem.),102:255(1980),美国专利号：4,767,704；4,657,866；4,927,762；4,560,655；or 5,122,469；WO 90/03430；WO 87/00195；or美国再公告专利号：30,985中描述的任何培养基可以作为宿主细胞的培养基。这些培养基中的任何一种可根据需要补充激素和/或其他生长因子(如胰岛素、转铁蛋白或表皮生长因子)、盐类(如氯化钠、钙、镁和磷酸盐)、缓冲剂(如HEPES)。核苷酸(如腺苷和胸苷)，抗生素(如GENTAMYCINTM药物)，微量元素(定义为最终浓度通常在微摩尔范围内的无机化合物)，以及葡萄糖或同等能量来源。任何其他必要的补充剂也可以以本领域技术人员已知的适当浓度加入。培养条件，如温度、pH值等，是以前用于选择表达的宿主细胞的条件，对于本领域的技术人员来说是显而易见的。
当使用重组技术时，抗体可以在细胞内、在细胞周质间隙产生或直接分泌到培养基中。如果抗体是在细胞内产生的，作为第一步，颗粒状的碎片，无论是宿主细胞还是裂解的片段，都要被去除，例如通过离心或超滤。Carter等人，Bio/Technology 10:163-167(1992)描述了一种分离分泌到大肠杆菌周质空间的抗体的程序。简而言之，在醋酸钠(pH3.5)、EDTA和苯甲基磺酰氟(PMSF)的存在下，细胞浆被解冻约30分钟。细胞碎片可以通过离心法去除。当抗体分泌到培养基中时，来自这种表达系统的上清液通常首先使用市面上的蛋白质浓缩过滤器进行浓缩，例如Amicon或Millipore Pellicon超滤装置。蛋白酶抑制剂如PMSF可被包括在上述任何步骤中以抑制蛋白分解，并且抗生素可被包括以防止外来污染物的生长。
从细胞中制备的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段可以用例如羟基磷酸盐色谱法、凝胶电泳法、透析法、DEAE-纤维素离子交换色谱法、硫酸铵沉淀法、盐析法和亲和色谱法进行纯化，其中亲和色谱法是首选的纯化技术。
在某些实施例中，固定在固相上的蛋白A被用来进行抗体及其抗原结合片段的免疫亲和纯化。蛋白A作为亲和配体的适用性取决于抗体中存在的任何免疫球蛋白Fc结构域的种类和同种型。蛋白A可以用来纯化基于人类γ1、γ2或γ4重链的抗体(Lindmark等人，J.Immunol.Meth.62:1-13(1983)).所有的小鼠同种型和人γ3推荐使用蛋白G(Guss等人，EMBO J.5:1567 1575(1986))。亲和配体所附着的基质通常是琼脂糖，但也有其他基质。机械上稳定的基质如可控孔玻璃或聚(苯乙烯二乙烯基)苯，可以实现比琼脂糖更快的流速和更短的处理时间。当抗体包括一个CH3结构域时，Bakerbond ABXTM树脂(J.T.Baker,Phillipsburg,N.J.)可用于纯化。其他的蛋白质纯化技术，如在离子交换柱上分馏、乙醇沉淀、反相HPLC、二氧化硅色谱、肝素SEPHAROSETM色谱、阴离子或阳离子交换树脂(如聚天冬氨酸柱)、色谱聚焦、SDS-PAGE和硫酸铵沉淀等，也可以根据要回收的抗体来使用。
在任何初步纯化步骤之后，由感兴趣的抗体和污染物组成的混合物可以进行低pH值的疏水相互作用色谱，使用pH值在2.5-4.5之间的洗脱缓冲液，最好在低盐浓度下进行(例如约0-0.25M盐)。
药物组合物
本发明进一步提供一种药物组合物，其包括本文所揭露的经修饰抗体或其抗原结合片段中的至少一者或多者、至少一种编码经修饰抗体或其抗原结合片段的核酸或其组合，和一种或多种药学上可接受的载剂。
在一些实施例中，药物组合物包括两种或更多种本发明的抗体或抗原结合片段的组合。在一些实施例中，药物组合物包括两种或更多种单克隆抗体的组合，上述单克隆抗体中的每一者包括源自选自由以下组成的群组的抗体的重链CDR序列和轻链CDR序列：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。在一些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括源自P2C-1F11的重链CDR序列和轻链CDR序列；和第二抗体，其包括源自抗体P2B-2F6的重链CDR序列和轻链CDR序列。
在一些实施例中，两种或更多种抗体或其抗原结合片段结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD中的不同抗原表位。在某些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括P2C-1F11或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1A3、P2C-1C10、P2B-2F6、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在某些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括P2C-1A3或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在某些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括P2B-2F6或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在某些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括P2A-1B3或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1A3、P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-2F6和P2A-1A10，或其抗原结合片段。在一些实施例中，药物组合物包括：第一抗体，其包括P2C-1C10或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1A3、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。
本发明进一步提供药物组合物，其包括编码抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段的多核苷酸和一种或多种药学上可接受的载剂。本发明进一步提供药物组合物，其包括编码两种或更多种抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段的组合的多核苷酸和一种或多种药学上可接受的载剂。
本发明进一步提供药物组合物，其包括：表达载体，包括编码抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段中的一者或多者的多核苷酸；和一种或多种药学上可接受的载剂。
在某些实施例中，表达载体包括病毒载体或非病毒载体。病毒载体的实例包含(但不限于)腺相关病毒(AAV)载体、慢病毒载体、逆转录病毒载体和腺病毒载体。非病毒载体的实例包含(但不限于)裸DNA、质粒、胞外体、mRNA等。在某些实施例中，表达载体适用于人类的基因疗法。用于基因疗法的适合载体包含例如腺相关病毒(AAV)或腺病毒载体。在某些实施例中，表达载体包括DNA载体或RNA载体。在某些实施例中，药学上可接受的载剂为聚合赋形剂，例如但不限于微球体、微胶囊、聚合微胞和树状体。本发明的多核苷酸或多核苷酸载体可通过所属领域中已知的方法囊封、黏附于基于聚合物的组分或涂布于基于聚合物的组分上(参见例如W.Heiser,Nonviral gene transfer techniques,由Humana Press出版,2004；美国专利6025337；Advanced Drug Delivery Reviews,57(15):2177-2202(2005))。
在一些实施例中，药物组合物进一步包括第二生物活性剂，例如第二治疗剂或第二预防剂。
用于本文发明的药物组合物的可接受载剂可包括，例如，药学上可接受的液体、凝胶或固体载体、水基媒载体、非水基载体、抗菌剂、等渗剂、缓冲剂、抗氧化剂、麻醉剂、悬浮/分散剂、封存或螯合剂、稀释剂、佐剂、赋形剂或无毒辅助物质、本领域已知的其他成分，或其各种组合。
合适的成分可以包括，例如，抗氧化剂、填料、粘合剂、崩解剂、缓冲剂、防腐剂、润滑剂、调味剂、增稠剂、着色剂、乳化剂或稳定剂，如糖和环糊精。合适的抗氧化剂可包括，例如，蛋氨酸、抗坏血酸、EDTA、硫代硫酸钠、铂、过氧化氢酶、柠檬酸、半胱氨酸、硫代甘油、硫代乙醇、硫代山梨醇、丁基羟胺、丁基羟基甲苯和/或丙基没食子酸。如本文所揭露的，在包含抗体或其抗原结合片段和本文所提供的缀合物的组合物中加入一种或多种抗氧化剂如蛋氨酸，可减少抗体或其抗原结合片段的氧化。这种氧化的减少可以防止或减少结合亲和力的丧失，从而提高抗体的稳定性并最大限度地延长保质期。因此，在某些实施例中提供了药物组合物，其中包括本文所揭露的一种或多种抗体或其抗原结合片段和一种或多种抗氧化剂，如蛋氨酸。进一步提供了通过将抗体或抗原结合片段与一种或多种抗氧化剂如蛋氨酸混合来防止本文提供的抗体或抗原结合片段的氧化、延长其保质期和/或提高其功效的方法。
为了进一步说明，药品可接受的载剂可以包括，例如，水性载体，如氯化钠注射液、林格氏注射液、等渗葡萄糖注射液、无菌水注射液、或葡萄糖和乳酸林格氏注射液。非水性载体如植物来源的固定油、棉籽油、玉米油、芝麻油或花生油，抑菌或杀菌浓度的抗菌剂、等渗剂如氯化钠或葡萄糖、缓冲剂如磷酸盐或柠檬酸缓冲剂、抗氧化剂如硫酸氢钠、局部麻醉剂如盐酸普鲁卡因、悬浮剂和分散剂如羧甲基纤维素钠、羟丙基甲基纤维素或聚乙烯吡咯烷酮、乳化剂如聚山梨酯80(TWEEN-80)、封存或螯合剂如EDTA(乙二胺四乙酸)或EGTA(乙二醇四乙酸)、乙醇、聚乙二醇、丙二醇、氢氧化钠、盐酸、柠檬酸或乳酸。用作载剂的抗菌剂可以添加到多剂量容器的药物组合物中，这些抗菌剂包括苯酚或甲酚、汞、苯甲醇、氯丁醇、对羟基苯甲酸甲酯和丙酯、硫柳汞、苯扎氯铵和苯乙基氯化铵。合适的辅料可包括，例如，水、盐水、葡萄糖、甘油或乙醇。合适的无毒辅助物质可包括例如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂、稳定剂、可溶性增强剂，或诸如乙酸钠、山梨糖醇单月桂酸酯、油酸三乙醇胺或环糊精等制剂。
药物组合物可以是液体溶液、悬浮液、乳剂、药丸、胶囊、片剂、缓释制剂或粉末。口服制剂可以包括标准载体，如药用等级的甘露醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、糖精钠、纤维素、碳酸镁等。
药物组合物的形式视多个标准，包含(但不限于)投药途径、疾病程度或施用的剂量而定。药物组合物可经调配用于静脉内、经口、经鼻、经直肠、经皮或肌肉内施用。举例来说，用于静脉内施用的剂型可调配为冻干粉末或流体调配物；用于经鼻施用的剂型可适宜地调配为气溶胶、溶液、滴剂、凝胶或干燥粉末。根据所需投药途径，药物组合物可以锭剂、胶囊、丸剂、糖衣药丸、散剂、颗粒、药囊、扁囊剂、口含锭、悬浮液、乳液、溶液、糖浆、气溶胶(呈固体形式或在液体介质中)、喷雾剂、吸入剂或栓剂形式调配。在某些实施例中，药物组合物被配制成可注射组合物。注射用药物组合物可以以任何常规形式制备，例如液态溶液、悬浮液、乳剂，或适合生成液态溶液、悬浮液或乳剂的固态形式。注射用制剂可包括准备用于注射的无菌和/或非解热性溶液、准备在使用前与溶剂结合的无菌干性可溶性产品，如冻干粉，包括皮下注射片、准备用于注射的无菌悬浮液、准备在使用前与载体结合的无菌干性不溶性产品，以及无菌和/或非解热性乳剂。溶液可以是水溶液或非水溶液。
在某些情况下，单位剂量的肠外制剂被包装在安瓿、小瓶或带针头的注射器中。所有用于肠外给药的制剂都应是无菌的，并且不具有热敏性，这在本领域是已知的和实践的。
在某些实施例中，无菌的冻干粉剂是通过将本文所揭露的抗体或抗原结合片段溶解在合适的溶剂中而制备的。溶剂可以包含一种赋形剂，它可以提高粉末或由粉末制备的重组溶液的稳定性或其他药学成分。可使用的赋形剂包括但不限于水、葡萄糖、山梨醇、果糖、玉米糖浆、木糖醇、甘油、葡萄糖、蔗糖或其他合适的药剂。在一个实施例中，溶剂可含有pH值约为中性的缓冲剂，如柠檬酸盐、磷酸钠或磷酸钾或本领域技术人员已知的其他此类缓冲剂。随后对溶液进行无菌过滤，然后在本领域技术人员已知的标准条件下进行冻干，就可以获得理想的配方。在一个实施例中，所得的溶液将被分配到小瓶中进行冻干。每个小瓶可以包含单个剂量或多个剂量的抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段或其组合物。超过一个剂量或一组剂量所需的数量(如约10％)的小瓶是可以接受的，以便于准确提取样品和准确计量。冻干粉可以在适当的条件下储存，如在约4℃至室温下。
将冻干粉剂与注射用水重新混合，可提供用于肠外给药的配方。在一个实施例中，将无菌和/或无热解的水或其他适合的液体载体加入到冻干粉中进行重组。准确的量取决于所选择的治疗方法，可以根据经验来确定。
本文所揭露的药物组合物可以10mg/mL到150mg/mL的范围内的浓度包括经修饰抗体或其抗原结合片段。可基于总蛋白质浓度、抗体特定蛋白质浓度或其组合来测定经修饰抗体或其抗原结合片段的浓度。所属领域的技术人员已知的用于测量蛋白质浓度的典型测量方法可为适合的。
在一些实施例中，药物组合物可经配置以经由静脉内注射(IV)、肌肉内注射(IM)、皮下(SC)注射或其组合向个体施用。
在一些实施例中，药物组合物可被配置用于预防不具有SARS-CoV-2的症状或没有SARS-CoV-2的已知感染的个人，或治疗患者的疾病，上述治疗患者为任何年龄的有症状的非住院个人或患有由SARS-CoV-2感染所引起的COVID-19的成年人，60岁和更年长，具有选自以下条件中的至少一者的任何年龄的人：抽烟；具有其中CD4计数<200个细胞/mm3的HIV感染的外源性或内源性免疫抑止；在与药物组合物施用之前的30天内每日接受等效于泼尼松(prednisone)的皮质类固醇≥20mg持续至少14个连续日；在与药物组合物施用之前的90天内接受一种或多种生物制剂治疗剂、一种或多种免疫调节剂、癌症化学疗法；患有慢性肺疾病，慢性哮喘；身体质量指数[BMI]>35的肥胖症；具有选自以下的COVID-19症状：发热、咳嗽、喉咙痛、不适、头痛、肌肉痛、恶心、呕吐、腹泻、味觉和嗅觉的丧失或其组合；具有呼吸短促、呼吸困难或异常胸部成像，具有临床评估或成像期间的下部呼吸道疾病的证据；具有在海平面的室内空气中≥94％的血氧饱和度(SpO2)；具有SARS-CoV-2的感染的严重症状，具有在海平面的室内空气中<94％的SpO2，具有<300mmHg的氧气动脉分压与吸入氧气分数的比率(PaO2/FiO2)、每分钟>30次呼吸的呼吸道频率、>50％的肺浸润；具有抗体依赖性增强(ADE)的活性症状；具有抗体依赖性增强(ADE)的病史；对抗体治疗过敏；为需要支持管理SARS-CoV-2的严重感染的并发症以及来自长期住院的并发症的医院住院病人，上述SARS-CoV-2的严重感染的并发症选自肺炎、低氧血症型呼吸衰竭/ARDS、败血症和败血性休克、心肌病和心律不整、急性肾损伤，上述来自长期住院的并发症包括继发性细菌和真菌感染、血栓栓塞、胃肠道出血、危重病多发性神经病/肌病；或其组合。
在一些实施例中，药物组合物可进一步包括一种或多种生物活性剂，其可包括选自以下的治疗剂或预防剂：抗病毒剂、抗病毒肽、抗病毒抗体、抗病毒化合物、抗病毒细胞因子、抗病毒寡核苷酸、RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂、非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、嘌呤核苷、抗病毒干扰素、金刚烷抗病毒化合物、瑞德西韦、氯奎、羟氯奎、咯匹那韦、利托那韦、APN01、法维拉韦、美沙拉嗪、托瑞米芬、依普利酮、帕罗西汀、西罗莫司、放线菌素d、依贝沙坦、大黄素、巯基嘌呤、褪黑激素、奎纳克林、卡维地洛、秋水仙碱、樟脑、马烯雌酮、羟甲烯龙、萘莫司他、卡莫司他、巴瑞替尼、达卢那韦、利巴韦林、加利司韦、BCX-4430、阿比朵尔、硝唑尼特、其一种或多种衍生物，或其任何组合。在一些情况下，药物组合物可进一步包括英利昔单抗(infliximab)、阿巴珠单抗(abalizumab)、乌司奴单抗(ustekinumab)、例如甲氨喋呤、6MP、硫唑嘌呤(azathioprine)的免疫调节剂，或其组合。
治疗或预防的方法
本发明还提供治疗个体的SARs-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法，其包括向个体施用治疗有效量的本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者，或一种或多种编码本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者的多核苷酸，或本文所提供的药物组合物。
在某些实施例中，治疗有效量可为在所治疗个体或群体中有效降低SARs-COV-2效价，或缓解SARS-CoV-2感染的一种或多种疾病症状、病毒血症或任何其它可测量表达的量，不论通过诱导与任何临床上可测量程度的SARs-COV-2感染相关的症状的消退或抑制其进展。可在肺中，例如通过痰样本中SARs-COV-2的浓度或来自哺乳动物的肺的灌洗物来测量SARs-COV-2效价的降低。疾病症状的缓解可通过医师或其它熟练医疗保健提供者通常用以评定该症状的严重程度或进展状态的任何临床测量来评定。与SARs-COV-2感染相关的示范性症状包含(但不限于)发热、干咳、呼吸短促、胸部疼痛或压力、新的意识模糊或不能唤醒、蓝色唇部或面部、嗅觉丧失和/或味觉丧失。
需要治疗的个体包含例如已经感染有SARS-CoV-2(症状性或无征状)或罹患有由SARS-CoV-2感染引起的病状的那些个体。从SARS-CoV-2的感染部分或全部恢复的个体可能也需要治疗。在某些实施例中，个体为人类。
本发明还提供预防个体的SARs-CoV-2感染或与SARs-COV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法，其包括向个体施用预防有效量的本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者，或一种或多种编码本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者的多核苷酸，或本文所提供的药物组合物。预防涵盖抑制或减少SARS-CoV-2的扩散或抑制或降低与SARS-CoV-2的感染相关的症状中的一者或多者的发作、发展或进展。
在某些实施例中，预防有效量可为有效中和呼吸道、肺和/或其它受影响区域(例如眼睛、鼻子和口腔)中的SARs-COV-2以便阻断感染，或有效改善与SARs-COV-2感染相关的至少一种症状的量。症状是否已改善可通过医师或其它熟练医疗保健提供者通常用以评定该症状的严重强度或进展状态的任何临床测量来评定或在某些情况下将改善住院需求。
需要预防的个体包含例如预防SARS-CoV-2感染的那些个体，或具有SARS-CoV-2感染风险的那些个体。在某些实施例中，个体为人类。
如本文中所使用的术语“与SARS-COV-2感染相关的疾病、病症或病状”包含由SARs-COV-2感染所引起或与其有关的那些疾病、病症或病状，例如上部或下部呼吸道感染、咽炎、肺炎、气管支气管炎、细支气管炎、支气管炎、急性呼吸窘迫综合征、腹泻和任何相关感染或发炎性病症。
在某些实施例中，如本文中所使用的SARS-CoV-2可包含包括突变体RBD的SARS-CoV-2。最近已出现SARS-CoV-2的新变体且在刺突蛋白中已获得突变。已鉴定出RBD的某些突变使得病毒变体能够获得对靶向RBD的某些中和抗体的抗性。然而，本发明人意外地发现，本文所提供的某些抗体不受RBD的突变影响，且保持针对突变病毒变体的大部分中和活性或至少部分中和活性。
在某些实施例中，如本文中所使用的SARS-CoV-2包括位置K417、E484或N501或其任何组合处的至少一种突变，且其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。在某些实施例中，如本文中所使用的SARS-CoV-2包括位置N501处的至少一种突变。在某些实施例中，位置N501处的突变为N501Y。
在某些实施例中，如本文中所使用的SARS-CoV-2包括或进一步包括位置K417处的至少一种突变。在某些实施例中，位置K417处的突变选自K417N或K417T。
在某些实施例中，如本文中所使用的SARS-CoV-2包括或进一步包括位置E484处的至少一种突变。在某些实施例中，位置E484处的突变为E484K。
在某些实施例中，本文所提供的抗体能够以与中和具有野生型RBD的SARS-CoV-2相当的IC50中和具有如本文所揭露的突变体RBD的SARS-CoV-2。在某些实施例中，抗体中和包括突变RBD的SARS-CoV-2，其IC50不超过抗体中和包括具有SEQ ID NO:134的氨基酸序列的RBD的SARS-CoV-2的IC50的10倍(或不超过8倍、6倍、5倍、4倍、3倍、2倍)，上述RBD，如通过假病毒中和检定所测量。
在某些实施例中，此类抗体包含(但不限于)P2C-1F11和P2B-1G5，或包括P2C-1F11或P2B-1G5的6个CDR的集合的任何抗体或抗原结合片段。
在某些实施例中，在本文所提供的用于治疗或预防个体的SARs-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法中，抗体包括P2C-1F11、P2B-1G5或如本文中所提供的P2C-1F11的变体或如本文中所提供的P2B-1G5的变体的6个CDR序列的集合。
在某些实施例中，如本文中所提供的P2C-1F11的变体至少保留抗体P2C-1F11的HCDR2的Y52和LCDR1的Y33。已发现，抗体P2C-1F11的HCDR2的Y52和LCDR1的Y33保持与RBD中K417处的突变残基的结合，且因此认为适用于中和在位置K417、E484、N501或其任何组合处具有一个或多个突变的SARS-CoV-2。
本文所提供的治疗或预防方法也适用于通过在个体中转移编码抗体产物或其片段的多核苷酸序列进行基因疗法，使得多核苷酸可在个体中表达以在活体内产生抗体。可通过例如适用于施用裸多核苷酸的转染技术，例如电穿孔和流体动力注射向个体施用本文所提供的多核苷酸。对于呈病毒载体(例如AAV)形式的多核苷酸，其可经由局部注射(例如，肌肉内、鼻内、皮内、皮下等)或全身性施用(例如静脉内施用)施用。
在某些实施例中，方法可包括向个体施用治疗有效量或预防有效量的本文所提供的抗体(或其抗原结合片段)中的两者或更多者的组合。在某些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括源自P2C-1F11的重链CDR序列和轻链CDR序列；和第二抗体，其包括源自抗体P2B-2F6的重链CDR序列和轻链CDR序列。在某些实施例中，两种或更多种抗体或其抗原结合片段结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD中的不同抗原表位。在某些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1F11；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1A3、P2C-1C10、P2B-2F6、P2B-1G5和P2A-1B3。在某些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1A3；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在某些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2B-2F6；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段。在某些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2A-1B3；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1A3、P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-2F6和P2A-1A10，或其抗原结合片段。在一些实施例中，两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1C10或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P5A-3C8、P5A-1D2、P22A-1D1、P2C-1A3、P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。
如本文所提供的抗体或其抗原结合片段可通过本领域已知的任何途径施用，例如，肠外(如皮下、腹膜内、静脉注射包括静脉输液、肌肉注射或皮内注射)或非肠外(如口服、鼻内、眼内、舌下、直肠或局部)途径。
在一些实施例中，本发明涉及一种用于治疗或预防有需要的个体的疾病的方法，上述方法可包括向上述个体施用有效剂量的本文所揭露的药物组合物中的任一者；
其中上述药物组合物可经配置以向上述个体施用以在施用上述药物组合物之后，使经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在10μg/mL到3500μg/mL的治疗有效范围内，持续1天到12个月的范围内的时间段；且
其中上述个体可感染有SARS-CoV-2，展现感染有SARS-CoV-2的一种或多种症状或具有感染有SARS-CoV-2的风险。
本文所揭露的方法可用于预防具有受感染的风险的个体的SARS-CoV-2感染，上述个体例如可与患有或曾患有伴有或不伴有症状的SARS-CoV-2感染的另一个人接触的健康个人、向患有或曾患有伴有或不伴有症状的SARS-CoV-2感染的另一个人提供病例或处理与其相关的材料的个人，例如医疗保健人员、紧急情况响应者、医学诊断服务人员、高级家庭服务提供者或其组合。
在一些实施例中，在个体感染有SARS-CoV-2之前，在个体展现感染SARS-CoV-2的任何症状或其组合之前，可向不具有SARS-CoV-2的症状或没有SARS-CoV-2的已知感染的个体施用药物组合物。
在一些实施例中，药物组合物可经配置以向个体施用以在施用之后，使经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在10μg/mL到1500μg/mL的治疗有效范围内，持续3到12个月的范围内的时间段，且其中施用为单次施用。在一些实施例中，药物组合物可经配置以向个体施用以使经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在以下治疗有效范围内：10μg/mL到1500μg/mL、20μg/mL到1500μg/mL、30μg/mL到1500μg/mL、40μg/mL到1500μg/mL、50μg/mL到1500μg/mL、60μg/mL到1500μg/mL、70μg/mL到1500μg/mL、80μg/mL到1500μg/mL、90μg/mL到1500μg/mL、100μg/mL到1500μg/mL、150μg/mL到1500μg/mL、200μg/mL到1500μg/mL、300μg/mL到1500μg/mL、400μg/mL到1500μg/mL、500μg/mL到1500μg/mL、600μg/mL到1500μg/mL、700μg/mL到1500μg/mL、800μg/mL到1500μg/mL、900μg/mL到1500μg/mL、1000μg/mL到1500μg/mL、1100μg/mL到1500μg/mL、1200μg/mL到1500μg/mL、1300μg/mL到1500μg/mL或1400μg/mL到1500μg/mL，其中这些范围的揭露内容打算为包含最小值与最大值之间的每个值的连续范围。在一些实施例中，在施用药物组合物之后，时间段可在3到12个月、4到12个月、5到12个月、6到12个月、7到12个月、8到12个月、9到12个月、10到12个月或11到12个月的范围内，且其中施用可为单次施用。经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度在一天内达到上文所提及的范围且可在上文所提及的范围内维持上文所揭露的指示时间段。
在一些实施例中，个体可为不具有SARS-CoV-2的症状或没有SARS-CoV-2的已知感染的个人，或治疗患者，其为患有由SARS-CoV-2感染所引起的COVID-19的有症状的非住院成年人，60岁和更年长，具有选自以下条件中的至少一者的任何年龄的人：抽烟；具有其中CD4计数<200个细胞/mm3的HIV感染的外源性或内源性免疫抑止；在与药物组合物施用之前的30天内每日接受等效于泼尼松的皮质类固醇≥20mg持续至少14个连续日；在与药物组合物施用之前的90天内接受一种或多种生物制剂治疗剂、一种或多种免疫调节剂、癌症化学疗法；患有慢性肺疾病，慢性哮喘；身体质量指数[BMI]>35的肥胖症；具有选自以下的COVID-19症状：发热、咳嗽、喉咙痛、不适、头痛、肌肉痛、恶心、呕吐、腹泻、味觉和嗅觉的丧失或其组合；具有呼吸短促、呼吸困难或异常胸部成像，具有临床评估或成像期间的下部呼吸道疾病的证据；具有在海平面的室内空气中≥94％的血氧饱和度(SpO2)；具有SARS-CoV-2的感染的严重症状，具有在海平面的室内空气中<94％的SpO2，具有<300mmHg的氧气动脉分压与吸入氧气分数的比率(PaO2/FiO2)、每分钟>30次呼吸的呼吸道频率、>50％的肺浸润；具有抗体依赖性增强(ADE)的活性症状；具有抗体依赖性增强(ADE)的病史；对抗体治疗过敏；为需要支持管理SARS-CoV-2的严重感染的并发症以及来自长期住院的并发症的医院住院病人，上述SARS-CoV-2的严重感染的并发症选自肺炎、低氧血症型呼吸衰竭/ARDS、败血症和败血性休克、心肌病和心律不整、急性肾损伤，上述来自长期住院的并发症包括继发性细菌和真菌感染、血栓栓塞、胃肠道出血、危重病多发性神经病/肌病；或其组合。
在一些实施例中，个体可为60岁和更年长、65岁和更年长、70岁和更年长、75岁和更年长、80岁和更年长、85岁和更年长或90岁和更年长的个人。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，药物组合物可经配置以向个体施用以在施用施用之后，使经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在30μg/mL到3500μg/mL的治疗有效范围内，持续1到4周的范围内的时间段，且其中施用为单次施用。在一些实施例中，药物组合物可经配置以向个体施用以使经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在以下治疗有效范围内：10μg/mL到3500μg/mL、20μg/mL到3500μg/mL、30μg/mL到3500μg/mL、40μg/mL到3500μg/mL、50μg/mL到3500μg/mL、60μg/mL到3500μg/mL、70μg/mL到3500μg/mL、80μg/mL到3500μg/mL、90μg/mL到3500μg/mL、100μg/mL到3500μg/mL、150μg/mL到3500μg/mL、200μg/mL到3500μg/mL、300μg/mL到3500μg/mL、400μg/mL到3500μg/mL、500μg/mL到3500μg/mL、600μg/mL到3500μg/mL、700μg/mL到3500μg/mL、800μg/mL到3500μg/mL、900μg/mL到3500μg/mL、1000μg/mL到3500μg/mL、1100μg/mL到3500μg/mL、1200μg/mL到3500μg/mL、1300μg/mL到3500μg/mL、1400μg/mL到3500μg/mL、1500μg/mL到3500μg/mL、1600μg/mL到3500μg/mL、1700μg/mL到3500μg/mL、1800μg/mL到3500μg/mL、1900μg/mL到3500μg/mL、2000μg/mL到3500μg/mL、2100μg/mL到3500μg/mL、2200μg/mL到3500μg/mL、2300μg/mL到3500μg/mL、2400μg/mL到3500μg/mL、2500μg/mL到3500μg/mL、2600μg/mL到3500μg/mL、2700μg/mL到3500μg/mL、2800μg/mL到3500μg/mL、2900μg/mL到3500μg/mL、3000μg/mL到3500μg/mL、3100μg/mL到3500μg/mL、3200μg/mL到3500μg/mL、3300μg/mL到3500μg/mL或3400μg/mL到3500μg/mL，其中这些范围的揭露内容打算为包含最小值与最大值之间的每个值的连续范围。在一些实施例中，时间段可在施用药物组合物之后的1到4周、2到4周或3到4周的范围内，且其中施用可为单次施用。经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度在一天内达到上文所提及的范围且可在上文所提及的范围内维持上文所揭露的指示时间段。
在一些实施例中，可施用药物组合物以紧接在施用之后(例如1天到数天或1到4周)，维持经修饰抗体或其抗原结合片段的高血浆浓度(例如30μg/mL到3500μg/mL)，以治疗患有SARS-CoV-2感染的疾病或症状的患者。在一些实施例中，可施用药物组合物以维持经修饰抗体或其抗原结合片段的所需血浆浓度(例如10μg/mL到1500μg/mL)且在所需范围内维持3到12个月，以防止个人感染有SARS-CoV-2。如本文中所使用，对于患者的血液中经修饰抗体或其抗原结合片段的浓度，“血浆浓度”或“血清浓度”可互换使用。
在一些实施例中，经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度可为活体外IC90的约100-300倍，持续至少3到6周以治疗具有SARS-CoV-2感染或SARS-CoV-2感染的症状的患者。在一些实施例中，经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度可为活体外IC90的约10-50倍，持续至少6个月以预防SARS-CoV-2感染或SARS-CoV-2感染的症状。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，经修饰抗体或其抗原结合片段可经配置以在个体中具有50到120天的范围内的半衰期(T1/2)。在一些实施例中，个体中的半衰期(T1/2)可在50到120天、60到120天、70到120天、80到120天、90到120天、100到120天或110到120天的范围内。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，药物组合物可经配置以在150mg/m2到5000mg/m2范围内向个体施用。在一些情况下，可在以下剂量范围内向个体施用药物组合物：150到5000mg/m2、200到5000mg/m2、300到5000mg/m2、400到5000mg/m2、500到5000mg/m2、600到5000mg/m2、700到5000mg/m2、800到5000mg/m2、900到5000mg/m2、1000到5000mg/m2、1200到5000mg/m2、1400到5000mg/m2、1600到5000mg/m2、1800到5000mg/m2、2000到5000mg/m2、2200到5000mg/m2、2400到5000mg/m2、2600到5000mg/m2、2800到5000mg/m2、3000到5000mg/m2、3200到5000mg/m2、3400到5000mg/m2、3600到5000mg/m2、3800到5000mg/m2、4000到5000mg/m2、4200到5000mg/m2、4400到5000mg/m2、4600到5000mg/m2或4800到5000mg/m2，其中这些范围的揭露内容打算为包含最小值与最大值之间的每个值的连续范围。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，药物组合物可经配置以在300mg到8000mg范围内向个体施用。在一些情况下，可在以下范围内向个体施用药物组合物：300到8000mg、400到8000mg、500到8000mg、600到8000mg、700到8000mg、800到8000mg、900到8000mg、1000到8000mg、1200到8000mg、1400到8000mg、1600到8000mg、1800到8000mg、2000到8000mg、2500到8000mg、3000到8000mg、3500到8000mg、4000到8000mg、4500到8000mg、5000到8000mg、5500到8000mg、6000到8000mg、6500到8000mg、7000到8000mg或7500到8000mg。在一些情况下，可在个体体重的以下范围内向个体施用药物组合物：5到150mg/kg、10到150mg/kg、15到150mg/kg、20到150mg/kg、25到150mg/kg、30到150mg/kg、35到150mg/kg、40到150mg/kg、45到150mg/kg、50到150mg/kg、55到150mg/kg、60到150mg/kg、65到150mg/kg、70到150mg/kg、75到150mg/kg、80到150mg/kg、85到150mg/kg、90到150mg/kg、95到150mg/kg、100到150mg/kg、110到150mg/kg、120到150mg/kg、130到150mg/kg或140到150mg/kg。
在一些实施例中，药物组合物可经配置以具有浓度在10mg/mL到150mg/mL范围内的经修饰抗体。在一些情况下，药物组合物可经配置以具有经修饰抗体，其浓度为10mg/mL到150mg/mL、20mg/mL到150mg/mL、30mg/mL到150mg/mL、40mg/mL到150mg/mL、50mg/mL到150mg/mL、60mg/mL到150mg/mL、70mg/mL到150mg/mL、80mg/mL到150mg/mL、90mg/mL到150mg/mL、100mg/mL到150mg/mL、110mg/mL到150mg/mL、120mg/mL到150mg/mL、130mg/mL到150mg/mL或140mg/mL到150mg/mL。浓度可为抗体在药物组合物中总蛋白质浓度。
在本文所揭露的方法的一些情况下，药物组合物可经由静脉内注射(IV)、肌肉内注射(IM)、皮下(SC)注射或其组合向个体施用。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，有效剂量可通过给药工艺测定，上述给药工艺可包括基于所计算或测量的药物动力学(PK)测定浓度进展数据，测试经修饰抗体或其抗原结合片段在测试时间段内的血浆浓度、在预测时间段内的经预测血浆浓度或其组合且基于浓度进展数据产生有效剂量。在一些实施例中，有效剂量可通过预测时间段内的经预测血浆浓度测定，其中经预测血浆浓度可通过在测量时间段内测量经修饰抗体在选自灵长类动物或人类的个体中的实际血浆浓度以产生测量的浓度数据且内插和外插测量的浓度数据以在所选预测时间段内产生经预测血浆浓度来产生。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，有效剂量可经选择以在施用之后3到12个月内使血浆浓度维持在10μg/mL到1500μg/mL的范围内。此类有效剂量可适用于预防个体的疾病持续延长的时间段，例如3到12个月。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，有效剂量可经选择以在施用之后1天到2个月内使血浆浓度维持在1500μg/mL到3500μg/mL的范围内。此类高有效剂量可适用于治疗疾病持续较短时间段，例如1天到60天。
在本文所揭露的方法的一些实施例中，药物组合物进一步包括一种或多种后续修饰的抗体，上述后续修饰的抗体选自：第一后续修饰的抗体，其包括两个各自对SARS-CoV-2具有相同或不同亲和力的抗原结合域；第二后续修饰的抗体，其包括对SARS-CoV-2具有结合亲和力的第一抗原结合域和对与SARS-CoV-2不同的第二病原体具有结合亲和力的第二抗原结合域；第三后续修饰的抗体，其包括两个各自对第二病原体具有相同或不同的结合亲和力的抗原结合域；或其组合。如上文所提及，术语“对SARS-CoV-2的不同亲和力”是指可结合到SARS-CoV-2的不同抗原表位或结合位点的亲和力、可结合到SARS-CoV-2的同一抗原表位或结合位点的不同亲和力水平，或其组合。对第二病原体的结合亲和力可选自对以下的结合亲和力：对SARS-CoV、MERS-CoV、一种或多种细菌、一种或多种真菌、一种或多种病毒、一种或多种寄生虫、其部分或其组合。
在本文所揭露的方法的一些实施例中可进一步包括向个体同时或依序施用药学上有效量的一种或多种生物活性剂与药物组合物，其中生物活性剂包括选自以下的治疗剂或预防剂：抗病毒剂、抗病毒肽、抗病毒抗体、抗病毒化合物、抗病毒细胞因子、抗病毒寡核苷酸、RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂、非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、嘌呤核苷、抗病毒干扰素、金刚烷抗病毒化合物、瑞德西韦氯奎、羟氯奎、咯匹那韦、利托那韦、APN01、法维拉韦、美沙拉嗪、托瑞米芬、依普利酮、帕罗西汀、西罗莫司、放线菌素d、依贝沙坦、大黄素、巯基嘌呤、褪黑激素、奎纳克林、卡维地洛、秋水仙碱、樟脑、马烯雌酮、羟甲烯龙、萘莫司他、卡莫司他、巴瑞替尼、达卢那韦、利巴韦林、加利司韦、BCX-4430、阿比朵尔、硝唑尼特、其一种或多种衍生物，或其任何组合。
在一些实施例中，本文所提供的抗体或其抗原结合片段可单独或组合施用治疗有效量的第二生物活性剂。第二生物活性剂可为治疗剂或预防剂。
在一些实施例中，第二治疗剂为抗病毒剂。在一些实施例中，抗病毒剂包括抗病毒肽、抗病毒抗体、抗病毒化合物、抗病毒细胞因子或抗病毒寡核苷酸。在一些实施例中，抗病毒剂为RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂、非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、嘌呤核苷、抗病毒细胞因子(例如干扰素)、金刚烷抗病毒化合物、抗RBD抗体、抗S1抗体、抗S2抗体、冠状病毒蛋白M、N或E的siRNA靶向mRNA(中国专利申请案CN101173275和CN1648249)、siRNA靶向复制酶和RNA聚合酶区(美国专利申请案US20050004063)、RNA适体(韩国专利申请案KR2009128837和KR 2012139512)、核糖核酸酶(日本专利申请案JP2007043942)、反义寡核苷酸(PCT专利申请案WO2005023083)，或任何其它适合的抗病毒剂。在某些实施例中，抗病毒化合物选自由以下组成的群组：瑞德西韦、氯奎、羟氯奎、咯匹那韦、利托那韦、APN01、法维拉韦美沙拉嗪、托瑞米芬、依普利酮、帕罗西汀、西罗莫司、放线菌素d、依贝沙坦、大黄素、巯基嘌呤、褪黑激素、奎纳克林、卡维地洛、秋水仙碱、樟脑、马烯雌酮、羟甲烯龙、萘莫司他、卡莫司他、巴瑞替尼、达卢那韦、利巴韦林、加利司韦、BCX-4430、阿比朵尔、硝唑尼特、其衍生物，或其任何组合。针对SARS-CoV-2的可能适用的抗病毒剂的更多实例由C.Liu等人,ACS Cent.Sci.2020,6,3,315-331综述，其全文并入本文中。
在某些实施例中，第二生物活性剂(例如预防剂)可为SARS-CoV-2疫苗(例如，Moderna的mRNA-1273、能够表达SARS-CoV-2免疫原的基于AAV的疫苗)、抗体(例如针对SARS-CoV-2)、淋巴介质、造血生长因子(例如IL-2、IL-3、IL-7和IL-15)，其可例如用以增加与抗体相互作用的效应细胞的数量或活性。
在某些实施例中，第二生物活性剂可包括激素疗法、免疫疗法和抗炎剂。
在某些这些实施例中，本文所提供的抗体或其抗原结合片段可与一种或多种额外生物活性剂同时施用，且在某些这些实施例中，抗体或其抗原结合片段和额外治疗剂可作为同一药物组合物的一部分施用。然而，与另一生物活性剂“组合”施用的抗体或其抗原结合片段不必与上述药剂同时施用或与上述药剂在同一组合物中施用。在另一药剂之前或之后施用的抗体或其抗原结合片段被认为是与该药剂"联合"施用，因为该短语在此使用，即使该抗体或抗原结合片段和第二药剂是通过不同途径施用。在可能的情况下，与本文所揭露的抗体或其抗原结合片段联合施用的额外生物活性剂是根据额外治疗剂的产品信息表中所列的时间表，或根据《医师案头参考手册2003》(Physicians'Desk Reference,57thEd；医学经济公司；ISBN:1563634457；57th edition(11月2002))或本领域内众所周知的方案施用。
本文所揭露的经修饰抗体、药物组合物和方法的一种优势为经修饰抗体或其抗原结合片段包括至少一种具有抗原结合亲和力的抗原结合域和共价连接的经修饰人类IgG恒定域，其中经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号，相较于具有野生型人类IgG恒定域的抗体对FcRn的亲和力，上述经修饰抗体对FcRn的亲和力增加。此类抗体在活体内可具有延长的半衰期。不希望受特定理论或机制束缚，申请人认为对FcRn的亲和力增加可帮助抗体逃脱胞内降解且增加抗体再循环，从而增加个体血流中残留的抗体预防或治疗疾病的量。
本文所揭露的经修饰抗体、药物组合物和方法的另一优势为经修饰抗体对属于免疫球蛋白超家族的人类Fcγ受体(FcγR)可具有降低的亲和力。对人类FcγR的亲和力降低可帮助减少某些免疫反应副作用，例如抗体依赖性增强(ADE)。
病毒检测的方法
在另一方面中，本发明提供一种检测样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量的方法。在一些实施例中，SARS-CoV-2病毒抗原包括刺突蛋白，或包括SARS-CoV-2病毒粒子。在一些实施例中，方法包括使样本与本文所揭露的抗体或抗原结合片段接触，和测定样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量。
在某些实施例中，本文所揭露的抗SARS-CoV-2抗体用于诊断罹患病症(例如SARS-CoV-2感染)的个体的方法中，上述方法包括：通过使样本与本发明的抗SARS-CoV-2抗体接触且检测所结合抗体的存在来测定从个体获得的样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量。
可使用疑似含有SARS-CoV-2病毒的任何样本。在一些实施例中，适合样本可获自个体的呼吸道，例如上部呼吸道鼻咽拭子(NP)、口咽拭子(OP)、痰、下部呼吸道抽吸物、支气管肺泡灌洗样本、鼻咽洗液、鼻咽抽吸物、鼻抽吸物、鼻交换、咽喉交换、支气管肺泡灌洗液(BALF)、来自呼吸道或来自肺的细胞或组织样本，和其类似者。在一些实施例中，适合样本可为体液样本，例如全血样本、血清样本或血浆样本。在一些实施例中，适合样本可为尿液样本或大便样本。
样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或含量可基于检测本文所揭露的抗体或其抗原结合片段所结合的病毒抗原的复合物的存在或含量来测定。任何适合的方法均可用于此类检测，例如通过免疫检定，例如免疫组织化学(IHC)、免疫荧光(IF)、免疫墨点法(例如西方墨点法)、流式细胞测量术(例如FACSTM)、酶联免疫吸附检定(ELISA)、酶免疫检定(EIA)和放射免疫检定(RIA)。
关于免疫程序和免疫检定程序的综述，参见Basic and Clinical Immunology(Stites&Terr编,第7版1991)。此外，可在若干配置中的任一者中进行免疫检定，上述配置广泛综述于Enzyme Immunoassay(Maggio编,1980)；和Harlow&Lane,同上。关于通用免疫检定的综述，还参见Methods in Cell Biology:Antibodies in Cell Biology,第37卷(Asai编,1993)；Basic and Clinical Immunology(Stites&Terr编,第7版1991)。
在某些实施例中，本文所揭露的抗体或其抗原结合片段经可检测地标记，或未经标记，但可与可检测地标记的第二分子(例如，可检测地标记的二级抗体)反应。
在某些实施例中，本文所揭露的抗体或其抗原结合片段可固定于固体基质上。固定可经由共价连接或非共价连接(例如包覆)。固体基质的实例包含多孔和无孔材料、乳胶粒子、磁性粒子、微粒、条带、珠粒、膜、微量滴定孔和塑料管。固相材料和可检测地标记的方法的选择可基于所需检定格式性能特征来确定。
SARS-CoV-2抗原的含量可例如通过正规化为对照值或标准曲线来测定。对照值可为预定的，或同时进行测定。
本文所提供的用于测量SARS-CoV-2抗原含量的检定和方法可经调适或优化以用于自动及半自动系统或定点照护(point of care)检定系统。
抗体检测的方法
在另一方面中，本发明提供一种检测样本中能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的抗体的存在或量的方法，其包括使样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的多肽接触，和测定样本中抗体的存在或含量。在一些实施例中，样本中不存在抗体或样本中抗体的含量低于阈值指示个体更可能遭受疾病进展。
在另一方面中，本发明提供一种确定或预测感染有SARS-CoV-2的个体的疾病进展可能性的方法，上述方法包括：使从个体获得的样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的多肽接触，和检测样本中抗体的存在或含量，其中抗体能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，其中当样本中的抗体不存在或低于阈值时，个体有可能经历疾病进展。
感染有SARS-CoV-2的个体可产生抵抗SARS-CoV-2抗原的抗体。由人类免疫系统产生的此类抗体为多克隆的，且可结合到SARS-CoV-2的不同抗原或抗原表位。在不希望受任何理论束缚的情况下，本发明人意外地发现，对SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD具有特异性的抗体的存在或含量可指示个体的疾病进展的可能性。本发明人发现能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的抗体(“RBD特异性抗体”)能够与ACE2受体有效竞争以结合到RBD，且还提供SARS-CoV-2病毒中和活性。此类RBD特异性抗体的存在可与对SARS-CoV-2的有效免疫反应相关，且此类RBD特异性抗体在体内的效价可与SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的预后相关。
RBD特异性抗体含量的阈值可为预定的。阈值是指RBD特异性抗体的水平，高于上述水平，样本评分为对RBD特异性抗体呈阳性。举例来说，阈值可为一水平，高于上述水平，样本评分为对SARS-CoV-2具有足够中和活性。如果RBD特异性抗体的含量低于阈值，那么其可指示个体的保护性免疫不足，且因此指示疾病进展的可能性。相比之下，如果样本中的RBD特异性抗体含量达到或高于阈值，那么其可指示个体的保护性免疫，且因此不大可能遭受疾病进展。
可使用疑似含有抗体的任何样本。在一些实施例中，适合样本可获自血液，例如全血样本、血清样本或血浆样本。在一些实施例中，上述样本是获自疑似患有、罹患有SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状，或处于SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的治疗下的个体。
包括SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的多肽可用于本文提供的方法中以检测个体中RBD特异性抗体的存在或含量。在某些实施例中，SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD包括含有SEQID NO:128的氨基酸序列。在某些实施例中，多肽可进一步包括标签。示范性标签包含(但不限于)6xHis标签或其融合物，例如SEQ ID NO:132或SEQ ID NO:133。包括RBD的多肽可通过重组方法(例如，通过原核表达系统或真核表达系统)，或化学合成(例如，通过固相合成或溶液合成方法)来产生。固相合成方法由Merrifield描述于J.A.C.S.85:2149-2154(1963)中，或标准溶液合成方法描述于Bodanszky等人的“Peptide Synthesis”,第二版,JohnWiley and Sons,1976中。可通过所属领域中已知的方法纯化多肽。可采用蛋白质纯化的各种方法且此类方法为所属领域中已知的并且描述于例如Deutscher,Methods inEnzymology,182(1990)；Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,Springer-Verlag,New York(1982)中。所选的纯化步骤将视例如所使用的生产工艺的性质和所产生的本申请案的特定多肽而定。
样本中RBD特异性抗体的存在或含量可基于检测RBD特异性抗体所结合的RBD的复合物的存在或含量来测定。任何适合的方法均可用于此类检测，例如通过免疫检定，例如免疫组织化学(IHC)、免疫荧光(IF)、免疫墨点法(例如西方墨点法)、流式细胞测量术(例如FACSTM)、酶联免疫吸附检定(ELISA)、酶免疫检定(EIA)和放射免疫检定(RIA)，如上文所描述。
在某些实施例中，包括SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的多肽可固定于固体基质上。固定可经由共价连接或非共价连接(例如包覆)。可使疑似含有RBD特异性抗体的样本与所结合多肽接触。在适合的培育时段之后，即足以允许经由形成抗体-抗原复合物来捕捉RBD特异性抗体的时间段。在洗涤掉任何未反应的材料之后，可添加对所捕捉抗体具有特异性的检测抗体，这可产生可检测信号以允许检测所捕捉抗体。结果可通过简单地观测可见信号进行定性，或可通过与含有已知量的可检测信号的对照样本相比较进行定量。
在另一方面中，本发明提供一种监测感染有SARS-CoV-2且接受治疗的个体的治疗反应的方法，上述方法包括：(i)使来自上述个体的样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的肽接触；(ii)检测上述样本中抗体的第一含量，其中上述抗体能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD；和(iii)比较上述抗体的第一含量与在上述治疗之前上述个体中检测的上述抗体的第二含量；其中上述第一含量高于上述第二含量指示上述个体对上述治疗有反应。
在一个实施例中，样本是获自任何治疗之前的个体或患者。在另一实施例中，在治疗(例如抗病毒治疗)期间或之后获得测试样本。
在一个方面中，本发明提供一种用于检测能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)的抗体的试剂盒，其包括含有氨基酸序列的多肽，上述氨基酸序列包括SEQ ID NO:128。在一些实施例中，多肽固定于基质上。在一些实施例中，上述试剂盒进一步包括一组用于检测抗体与多肽结合的复合物的试剂。
试剂盒
在某些实施例中，本发明提供一种试剂盒，其包括本文所提供的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者。在某些实施例中，本文所揭露的试剂盒为治疗试剂盒。在某些实施例中，本文所揭露的试剂盒为诊断试剂盒。
如有需要，此类试剂盒可进一步包含各种常规试剂盒组分中的一者或多者，例如具有一种或多种药学上可接受的载体的容器、额外容器等，如对于所属领域的技术人员而言将为显而易见的。试剂盒中也可包含呈插页或标签形式的指示待施用的组分的数量、投药指南和/或用于混合组分的指南的说明书。
在某些实施例中，在抗体用酶标记的情况下，试剂盒将包含酶所需的基质和辅因子(例如提供可检测发色团或荧光团的基质前体)。另外，可包含其它添加剂，例如稳定剂、缓冲剂(例如阻断缓冲液或裂解缓冲液)和其类似者。各种试剂的相对量可广泛变化以提供大体上优化检定灵敏度的试剂溶液中的浓度。特定地说，试剂可以干燥粉末(通常冻干)形式提供，包含赋形剂，其一旦溶解将提供具有适当浓度的试剂溶液。
还提供诊断或检测试剂和包括一种或多种此类试剂的试剂盒以用于多种检测检定，包含例如免疫检定，例如ELISA(夹心型或竞争形式)。试剂盒的组分可预附接到固体支撑物，或可在使用试剂盒时施加到固体支撑物的表面。在一些实施例中，信号产生构件可预先与本发明的抗体相关，或在使用前可能需要与一种或多种组分，例如缓冲剂、抗体-酶缀合物、酶基质或其类似者组合。试剂盒也可包含额外试剂，例如用于减少与固相表面的非特异性结合的阻断剂、洗涤剂、酶基质和其类似者。固相表面可呈管、珠粒、微量滴定板、微球体或适用于固定蛋白质、肽或多肽的其它材料的形式。在特定方面中，催化化学发光或发色产物形成或化学发光或发色基质还原的酶为信号产生构件的组分。此类酶为所属领域中熟知的。试剂盒可包括本文所描述的捕捉剂和检测试剂中的任一者。任选地试剂盒也可包括用于进行本发明的方法的说明书。
也可制备本文所揭露的检测试剂盒，其包括本文所揭露的抗体或抗原结合片段中的至少一者以及使用组合物作为检测试剂的说明书。用于此类试剂盒中的容器通常可包括至少一个小瓶、试管、烧瓶、瓶子、注射器或其它适合容器，检测组合物中的一者或多者可放置于其中，且优选进行适当等分。本文所揭露的试剂盒通常还将包含用于严密地容纳小瓶以便商业出售的构件，例如使所需小瓶保持在内的注塑或吹塑塑料容器。在放射性标记、发色、荧光生成或其它类型的可检测标记或检测构件包含于试剂盒内的情况下，标记试剂可提供于与检测组合物自身相同的容器中，或可替代地置于其中可放置且适当等分此第二组合物的第二不同容器构件中。替代地，检测试剂可制备于单一容器构件中，且在大多数情况下，试剂盒还将通常包含用于严密地容纳小瓶以便商业出售和/或便于封装和递送的构件。
还提供用于进行本文所描述的检测或监测方法的装置或设备。此类设备可包含其中可输入样本的腔室或管、任选地包含阀或泵以引导样本流穿过装置的流体处理系统、任选的将血浆或血清与血液分离的过滤器、用于添加捕捉剂或检测试剂的混合腔室和任选的用于检测与捕捉剂免疫复合物结合的可检测标记的量的检测装置。样本流可为被动的(例如，通过毛细管、流体静力或一旦添加样本则不需要进一步操纵装置的其它力)或主动的(例如，通过施加经由机械泵、电渗透泵、离心力或增加气压所产生的力)或通过主动力与被动力的组合。
提供以下实例是为了更好地说明所声明的发明，而不能解释为限制本发明的范围。下面描述的所有具体组合物、材料和方法，全部或部分都属于本发明的范围。这些具体的组合物、材料和方法不是为了限制本发明，而只是为了说明属于本发明范围的具体实施例。本领域的技术人员可以开发出同等的组合物、材料和方法，而不需要行使发明能力也不会偏离本发明的范围。可以理解的是在这里描述的程序中可以有许多变化，同时仍然保持在本发明的范围内。本发明人的意图是这些变化都包括在本发明的范围内。
实例1
材料和方法
患者和血液样本。参与总共八名感染有SARS-CoV-2的年龄为10岁到66岁的患者(表5)。也包含来自健康对照的血浆样本。在这些八名患者中，六名患者(P#1到P#4、P#8和P#16)经由个人问诊具有暴露病史且两名患者与来自暴露区的个体具有直接接触。四名个体(P#1到P#4)为所感染的家族丛集(P#1到P#5)的一部分且随后在返回到深圳之后将感染传播到P#5。所有患者在症状发作之后三到九天均在深圳第三人民医院住院，其为用于治疗COVID-19感染患者的指定城市医院。所有患者均呈现有发热、疲乏和干咳且三名患者(P#1、P#2和P#5)出现重度肺炎。四名患者(P#1、P#2、P#5和P#22)为60岁或更年长的，其中三名患者(P#1、P#2和P#22)患有潜在疾病，例如高血压。SARS-CoV-2感染状态由鼻咽拭子和咽喉拭子试样的RT-PCR验证。无患者具有可检测的A型流感、B型流感、呼吸道融合病毒(RSV)或腺病毒共感染。胸部计算机断层扫描显示了不同程度的双侧肺片状阴影或不透明度。所有患者接受干扰素和利巴韦林和/或甲基泼尼松龙(methylprednisolone)治疗，恢复且除在医院时死于疾病的P#1以外均离开。在住院和随访问诊期间收集单个(P#1、P#3、P#5、P#8、P#16和P#22)或连续(P#2和P#4)血液样本且利用Ficoll-Hypaque梯度(GE Healthcare)离心将其分离成血浆和外周血单核细胞(PBMC)。在存储于-80℃下之前，将所有血浆样本在56℃下热灭活1h。将PBMC维持于冷冻培养基中且存储于液氮中直至使用。
来自SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的重组RBD和三聚刺突以及受体ACE2。使用如先前所描述的Bac-to-Bac杆状病毒系统(Invitrogen)表达MERS-CoV、SARS-CoV和SARS-CoV-2的重组RBD和三聚刺突以及人类ACE2的N端肽酶域(残基Ser19-Asp615)(Gui,M.等人Cell Res 27,119-129(2017)；Song,W.等人PLoS Pathog 14,e1007236-e1007236(2018)；Wang,N.等人Cell Res 23,986-993(2013)；Jiang,L.等人Sci Transl Med 6,234ra259-234ra259(2014)；Zhang,S.等人Cell Rep 24,441-452(2018))。MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的氨基酸序列示于SEQ ID NO:126中，且多核苷酸序列示于SEQ ID NO:127中。MERS-CoV的刺突蛋白的胞外域的氨基酸序列示于SEQ ID NO:123中。SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的氨基酸序列示于SEQ ID NO:124中，且多核苷酸序列示于SEQ ID NO:125中。SARS-CoV的刺突蛋白的胞外域的氨基酸序列示于SEQ ID NO:122中。SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的氨基酸序列示于SEQ ID NO:128中，且多核苷酸序列示于SEQ ID NO:129中。SARS-CoV-2的刺突蛋白的胞外域的氨基酸序列示于SEQ ID NO:121中。将刺突蛋白的胞外域融合到人工序列以使得能够在活体外形成三聚刺突结构。
将含有gp67分泌信号肽(SEQ ID NO:130)和C端六组氨酸标签(SEQ ID NO:132)或条带标签的SARS-CoV-2 RBD(残基Arg319-Phe541)插入到pFastBac-Dual载体(Invitrogen)中且转移到DH10Bac组分细胞中。萃取穿梭载体(bacmid)且使用CellfectinII试剂(Invitrogen)进一步转染到Sf9细胞中。从转染的上清液采集重组病毒且扩增以产生高效价病毒原液。接着病毒用于感染High Five细胞以供RBD和三聚刺突表达。从上清液采集所分泌的RBD和三聚刺突且通过如先前所报道的凝胶过滤色谱进行纯化(Gui,M.等人Cell Res 27,119-129(2017)；Song,W.等人PLoS Pathog 14,e1007236-e1007236(2018)；Wang,N.等人Cell Res 23,986-993(2013)；Jiang,L.等人Sci Transl Med 6,234ra259-234ra259(2014)；Zhang,S.等人Cell Rep 24,441-452(2018))。
对结合到RBD、三聚刺突和NP蛋白质的血浆和抗体的ELISA分析。将源自SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的重组RBD和三聚刺突以及SARS-CoV-2NP蛋白(Sino Biological,Beijing)稀释到0.5μg/ml或2μg/ml的最终浓度，接着涂布于96孔板上且在4℃下培育过夜。样本用PBS-T(含有0.05％Tween 20的PBS)洗涤且在室温下用阻断缓冲液(含有5％脱脂牛奶和2％BSA的PBS)阻断1h。向板中添加连续稀释的血浆样本或经分离的mAb，且在37℃下培育1h。接着将每一孔与用HRP(ZSGB-BIO,Beijing)和TMB基质(Kinghawk,Beijing)标记的二级抗人类IgG一起培育且在450nm和630nm下通过分光光度计测量光学密度(OD)。将来自健康个体的连续稀释血浆或针对SARS-CoV、MERS-CoV或HIV-1的mAb用作对照。
通过FACS分离RBD特异性单一B细胞。如先前所描述分选RBD特异性单一B细胞(Kong,L.等人Immunity 44,939-950(2016)；Wu,X.等人Science 329,856-861(2010))。简单地说，收集来自感染和恢复期的个体的PBMC且将其与抗体和RBD混合物一起培育以鉴定RBD特异性B细胞。混合物由上文所描述的CD19-PE-Cy7、CD3-Pacific Blue、CD8-PacificBlue、CD14-Pacific Blue、CD27-APC-H7、IgG-FITC(BD Biosciences)和重组RBD-Strep或RBD-His组成。进行三个连续染色步骤。第一染色为于50μl磷酸盐缓冲盐水(PBS)中的活/死可固定死细胞染色试剂盒(LIVE/DEAD Fixable Dead Cell Stain Kit)(Invitrogen)，其在室温下应用20分钟以排除死细胞。第二染色在4℃下利用抗体和RBD混合物持续额外30min。在4℃下持续30min的第三染色涉及：靶向RBD的Strep标签的抗生蛋白链菌素-APC(eBioscience)和/或抗生蛋白链菌素-PE(BD Biosciences)，或靶向RBD的His标签的抗his-APC和抗his-PE抗体(Abcam)。洗涤所染色的细胞且在经由70μm细胞网状物(BDBiosciences)筛滤之前将其再悬浮于PBS中。将RBD特异性单一B细胞闸控为CD19+CD3-CD8-CD14-IgG+RBD+且分选到含有每孔20μl裂解缓冲液(5μl的5×第一股缓冲液、0.5μl的RNaseout、1.25μl的0.1M DTT(Invitrogen)和0.0625μl的Igepal(Sigma)的96孔PCR板中。接着将板在干冰上速冻且存储于-80℃下直至RT反应。
单克隆抗体(mAb)的单一B细胞PCR、克隆和表达。IgG重链和轻链可变基因是通过巢式PCR扩增且克隆于线性表达卡匣或表达载体中以产生如先前所描述的完全IgG1抗体(Liao,H.-X.等人J Virol Methods,2009；Tiller,T.等人J.Immunol Methods,2008)。具体来说，所有含有标签序列的第二轮PCR引子用于通过重叠PCR产生线性Ig表达卡匣。含有特定限制酶切割位点的独立引子对(重链，5'-AgeI/3'-SalI；κ链，5'-AgeI/3'-BsiWI；和λ链，5'-AgeI/3'-XhoI)用于扩增所克隆的PCR产物。将PCR产物纯化且克隆到含有人类IgG1的恒定区的抗体表达载体的主链中。人类IgG1的重链恒定区的DNA序列阐述于SEQ ID NO:118中，且人类IgG1的重链恒定区的氨基酸序列示于SEQ ID NO:115中。将配对的重链和轻链表达卡匣的重叠PCR产物共转染到生长于24孔板中的293T细胞(ATCC)中。抗原特异性ELISA用于检测经转染的培养物上清液与SARS-CoV-2 RBD的结合能力。通过用等量的配对的重链和轻链质粒瞬时转染293F细胞(Life Technologies)来产生单克隆抗体。
具体来说，表4显示包含以下的单克隆抗体的重链和轻链恒定区的氨基酸序列和编码DNA序列：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。以下抗体具有λ轻链：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2F6、P2B-2G4、P2B-2G11、P2C-1D5、P2B-1G5、P2B-1A1、P2B-1D9、P2B-1E4、P5A-2G7、P5A-1D2、P5A-2E1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A6和P5A-3A6，且λ恒定区的氨基酸序列和编码DNA序列分别示于SEQ ID NO:116和SEQ ID NO:119中。以下抗体具有κ轻链：P2A-1A10、P2A-1B3、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1F11、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-3C8、P5A-2F11、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-3A1、P5A-3C12和P22A-1D1，且κ恒定区的氨基酸序列和编码DNA序列分别示于SEQ ID NO:117和SEQ ID NO:120中。
培养物上清液中的抗体是根据制造商的方案，通过亲和性色谱使用蛋白A珠粒管柱(National Engineering Research Center for Biotechnology,Beijing)纯化。浓度由BCA蛋白质检定试剂盒(Thermo Scientific)测定。也包含SARS-CoV、MERS-CoV和HIV-1mAb作为对照。合成先前通过其它法(Zhu,Z.等人Proc Natl Acad Sci USA 104,12123-12128(2007))分离的SARS-CoV抗体(S230和m396)，在293T细胞中表达且通过蛋白A色谱纯化。根据先前所报道来衍生MERS-CoV抗体(Mab-GD33)(Niu,P.等人J Infect Dis 218,1249-1260(2018))。HIV-1抗体VRC01为靶向包膜糖蛋白40的CD4结合位点的从患者直接分离的广泛中和抗体。
通过SPR测量的抗体结合动力学、抗原表位定位和与受体ACE2的竞争。通过SPR(Biacore T200,GE Healthcare)分析mAb与SARS-CoV-2 RBD的结合动力学和亲和力。具体来说，将经纯化的RBD在10mM乙酸钠缓冲液(pH 5.0)中经由氨基共价固定到CM5传感器芯片，最终RU约250。SPR检定在HEPE缓冲液中以30ml/min的流动速率运行。传感图用BIA评估软件(GE Healthcare)拟合于1:1结合模型中。对于抗原表位定位，依序注射两种不同抗体且监测结合活性，以确定两种mAb是否识别到分开的或紧密定位的抗原表位。为确定与人类ACE2肽酶域的竞争，SARS-CoV-2 RBD经由氨基固定到CM5传感器芯片，最终RU约250。将抗体(1μM)注射到芯片上直至达到结合稳态。接着注射如上文所产生和纯化的ACE2(2μM)，持续60秒。通过在存在和不存在先前抗体培育的情况下反应单位的比较来确定阻断效力。
对结合到细胞表面表达的三聚刺突蛋白的血浆和抗体的分析。将HEK 293T细胞用编码SARS-CoV-2、SARS-CoV或MERS-CoV的全长刺突的表达质粒转染且在37℃下培育36h。使用胰蛋白酶从板去除细胞且将其分配到96孔板中用于个别染色。细胞在以下中的每一者之间用200μl染色缓冲液(具有2％热灭活FBS的PBS)洗涤两次。将细胞与血浆的1:100稀释液或20μg/ml单克隆抗体在室温下于100μl染色缓冲液中染色30分钟。接着细胞用PE标记的抗人类IgG Fc二级抗体(Biolegend)以1:20稀释度在室温下于50μl染色缓冲液中染色30分钟。最后，再悬浮细胞且用FACS Calibur仪器(BD Biosciences,USA)和FlowJo 10软件(FlowJo,USA)进行分析。还染色不具有转染的HEK 293T细胞作为背景对照。靶向SARS-CoV刺突的RBD的S230和m396(Zhu,Z.等人Proc Natl Acad Sci USA 104,12123-12128(2007))和靶向MERS-CoV刺突的RBD的Mab-GD33(Niu,P.等人J Infect Dis218,1249-1260(2018))用作阳性初级抗体对照，而靶向HIV-1env的VRC01(Wu,X.等人Science 329,856-861(2010))用作不相关的初级抗体对照。
针对假病毒和活SARS-CoV-2的mAb的中和活性。SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV假病毒是通过将表达萤火虫荧光素酶(pNL43R-E-荧光素酶)的人类免疫缺乏病毒主链和编码相应全长S蛋白的pcDNA3.1(Invitrogen)表达载体共转染到293T细胞(ATCC)中来产生(Wang,N.等人Cell Res 23,986-993(2013)；Jiang,L.等人Sci Transl Med 6,234ra259-234ra259(2014)；Jia,W.等人Emerg Microbes Infect 8,760-772(2019)；Zhang,L.等人JMed Virol 78,1-8(2006))。48h之后收集病毒上清液。病毒效价测量为以相对光单位计的荧光素酶活性(Bright-Glo荧光素酶检定载体系统，Promega Biosciences)。源自人类免疫缺乏病毒(HIV)-1的对照包膜糖蛋白和其对应假病毒是以相同方式产生。对照mAb包含针对HIV-1 40的VRC01；针对SARS-CoV的S230和m396(Zhu,Z.等人Proc Natl Acad Sci USA104,12123-12128(2007))；以及针对MERS-CoV 43的Merb-GD33。通过将假病毒与纯化mAb的连续稀释液在37℃下一起培育1h来进行中和检定。将Huh7细胞(ATCC)(每孔约1.5×104个)一式两份地添加到病毒-抗体混合物中。在暴露于病毒-抗体混合物之后48h，使用GraphPadPrism 6(GraphPad Software Inc.)由荧光素酶活性确定所评估mAb的半最大抑制浓度(IC50)，数据示于表6和表7a、7b和7c中。
针对活SARS-CoV-2的mAb的中和活性。在经认证的生物安全3级实验室中进行SARS-CoV-2病灶减少中和测试(FRNT)。进行测试抗体的连续稀释，将其与75μl的SARS-CoV-2(8×103个病灶形成单位/毫升，FFU/ml)混合于96孔微孔板中且在37℃下培育1小时。接着将混合物转移到接种有Vero E6细胞的96孔板中，且使其在37℃下吸收1小时。接着在添加叠对培养基(100μl含有1.6％羧甲基纤维素，CMC的MEM)之前，去除接种物。接着将板在37℃下培育24小时。细胞用4％多聚甲醛溶液固定30min，且去除重叠物。细胞经0.2％Triton X-100渗透且在添加HRP缀合的山羊抗兔IgG(H+L)抗体(Jackson ImmunoResearch)之前，在室温下与交叉反应性兔抗SARS-CoV-N IgG(Sino Biological,Inc)一起培育1小时。将细胞在室温下进一步培育。反应物用KPL TrueBlue过氧化酶基质(Seracare Life Sciences Inc)显影。使用EliSpot读取器(Cellular Technology Ltd)计算SARS-CoV-2病灶的数量。
mAb的基因家族使用和谱系学分析。程式IMGT/V-QUEST(http://www.imgt.org/IMGT_vquest/vquest)用于分析每一抗体克隆的生殖系基因、体细胞超突变(SHM)的生殖系分歧(divergence)或程度、框架区(FR)和互补决定区3(CDR3)的环路长度。使用BioEdit序列分析包装中的Clustal W比对IgG重链和轻链可变基因(https://bioedit.software.informer.com/7.2/)。使用MEGA X(跨计算平台的分子进化遗传学分析(Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms))，通过最大概度法(Maximum Likelihood method)进行谱系学分析。为了清楚起见，呈现系统树的若干形式，数据示于表9a、表9b、图4U和图4V中。
抗体产生。如先前所描述进行抗体的产生(Jiang,L.等人Sci Transl Med 6,234ra259-234ra259(2014)；Zhang,Q.等人Sci Rep 6,25856-25856(2016))。将编码经分离抗体的重链和轻链的基因分开克隆到含有IgG1恒定区的表达载体中，且使用聚乙烯亚胺(PEI)(Sigma)将载体瞬时转染到HEK293T细胞或293F细胞中。72h后，收集分泌到上清液中的抗体且通过蛋白A琼脂糖凝胶(GE Healthcare)捕捉。洗脱所结合抗体且使用Superdex200高效管柱(GE Healthcare)通过凝胶过滤色谱进一步纯化。纯化抗体用于结合或中和检定中。
结晶和数据收集。将SARS-CoV-2 RBD分别以1:1.2的摩尔比与P2B-2F6、P5A-1D2、P5A-3C8或P22A-1D1的Fab片段混合，在4℃下培育2h且通过凝胶过滤色谱进一步纯化。在HBS缓冲液(10mM HEPES，pH 7.2，150mM NaCl)中浓缩到约10mg/mL的纯化复合物用于结晶。在18℃下使用沉滴式蒸气扩散法(sitting-drop vapor-diffusion method)，通过混合0.2μL蛋白质与0.2μL储集溶液来进行筛选试验。在0.2M甲酸镁二水合物、0.1M乙酸钠三水合物(pH 4.0)、18％PEG5000mme中成功地获得晶体。使用类似工艺分别获得SARS-CoV-2 RBD与P2C-1F11、P5A-1D2、P5A-3C8或P22A-1D1的Fab片段的纯化复合物。对于P2C-1F11，在0.2M甲酸镁二水合物、0.1M乙酸钠三水合物(pH 4.0)、18％PEG5000mme中；对于P5A-1D2，在0.2M氯化镁六水合物、0.1M Tris(pH 8.5)、3.4M 1,6-己二醇中；对于P5A-3C8，在0.2M硫酸锂单水合物、0.1M HEPES(pH 7.5)、25％w/v PEG 3350中；以及对于P22A-1D1，在0.1M氯化钾、0.1MNaHEPES(pH 7.0)、15％PEG 5000MME中分别成功地获得晶体。收集晶体，将其短暂浸没于具有20％甘油的母液中，且在液氮中快速冷冻。在100K和
Figure BDA0003707502100001651
的波长下，在上海同步加速器研究设施(Shanghai Synchrotron Research Facility；SSRF)的BL17U光束线上收集衍射数据。用水族箱管线自动处理衍射数据，且数据处理统计资料列于表10a和表10b和表10c中。(McCoy,A.J.等人Journal of applied crystallography 40,658-674,(2007))。
结构确定和改进。通过分子置换法用CCP4套件中的PHASER确定结构(Cohen,S.X.等人Acta crystallographica.Section D,Biological crystallography 64,49-60,(2008))。搜索模型为SARS-CoV-2 RBD结构(PDB ID：6M0J)和具有最高序列一致性的PDB中可用的重链和轻链可变域的结构。分别使用COOT和PHENIX进行后续模型建立和改进(Emsley,P.&Cowtan,K.Acta crystallographica.Section D,Biologicalcrystallography 60,2126-2132,(2004)；Adams,P.D.等人Actacrystallographica.Section D,Biological crystallography 58,1948-1954,(2002))。最终Ramachandran统计：对于最终RBD-P2C-1F11复合物结构，90.02％有利，8.24％允许和1.74％异常值。最终Ramachandran统计：对于最终RBD-P22A-1D1复合物结构，95％有利，3.9％允许和0.81％异常值；最终Ramachandran统计：对于最终RBD-P5A-1D2复合物结构，94.23％有利，5.44％允许和0.32％异常值；最终Ramachandran统计：对于最终RBD-P5A-3C8复合物结构，97％有利，3.1％允许和0.33％异常值。结构改进统计列于表10a和表10b中。使用PyMOL生成所有结构图式(Janson,G.,Zhang,C.,Prado,M.G.&Paiardini,A.Bioinformatics(Oxford,England)33,444-446,(2017))。
对结合到细胞表面表达的野生型和突变型刺突蛋白的抗体的分析。遵循制造商的说明书，使用QuickChange定点突变诱发试剂盒(Agilent 210518)进行单一丙氨酸突变。将HEK 293T细胞用编码野生型或突变型全长SARS-Cov-2的表达质粒转染且在37℃下培育36h。使用胰蛋白酶从板去除细胞且将其分配到96孔板中用于个别染色。将细胞在以下培育或洗涤步骤中保持在4℃下或冰上。细胞在以下中的每一者之间用200μL冰冷染色缓冲液(具有2％热灭活FBS的PBS)洗涤两次。将细胞与10μg/mL ACE2蛋白质或2μg/mL单克隆抗体在100μL染色缓冲液中染色1h。接着用以下二级抗体中的一者染色细胞：针对ACE2的抗hisPE(Miltyni 130120787)、针对nAb的抗人类IgG Fc PE(Biolegend 410718)或针对S2 mAb(MP 08720401)的抗小鼠IgG Fc FTIC(ThermoFisher A10673)。最后，再悬浮细胞且用FACSCalibur仪器(BD Biosciences,USA)和FlowJo 10软件(FlowJo,USA)进行分析。染色不具有模拟转染的HEK 293T细胞作为背景对照。
实例2
这个实例说明对SARS-CoV-2 RBD具有特异性反应的人类血浆和B细胞的鉴定。
在深圳的早期爆发期间收集来自八个感染SARS-CoV-2和恢复期的个体的横截面和纵向血液样本(参见表5)。样本依据患者编号命名且视收集顺序而命名为A、B或C。六名患者(P#1到P#4、P#8和P#16)具有暴露区的旅行史且其余两名患者(P#5和P#22)与来自暴露区的那些患者具有直接接触。P#1到P#5为具有深圳市首次记载的SARS-CoV-2的人传人(human-to-human transmission)病例的家族丛集。除尽管强化干预但死于疾病的P#1以外，所有个体均恢复且从医院离开。为了分析抗体结合，将连续血浆稀释液施加到酶联免疫吸附检定(ELISA)板，上述板涂布有源自SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的重组RBD或三聚刺突或来自SARS-CoV-2的重组NP。使用抗人类IgG二级抗体在450nm的光学密度(OD)下观测结合活性。在个体和来自相同个体的样本中发现不同程度的结合。来自P#1、P#2、P#5和P#16的样本表明与SARS-CoV-2 RBD和NP两者的结合高于其余样本(图1A)。在早期感染期间九天内从P#2收集的三个连续血浆样本显示了与SARS-CoV-2 RBD和NP类似的结合且在感染过程中保持相对稳定。出人意料地，几乎没有检测到SARS-CoV RBD与MERS-CoV RBD之间的交叉反应性(图1A)，尽管阳性对照抗体的识别较强。然而，在ELISA(图1B)和细胞表面染色(图6A到图6C)两者中检测到针对来自SARS-CoV和MERS-CoV的三聚刺突的强交叉反应性。除P#4A外的所有样本表明与SARS-CoV三聚刺突的交叉结合的显著水平，而仅来自P#1、P#2和P#4B的那些样本交叉识别MERS-CoV三聚刺突(图1B)。血浆样本中无一者对源自菌株BG505的HIV-1包膜三聚体具有反应性。(Sanders,R.W.等人J Virol 76,8875-8889,(2002))。还评估用于中和携带SARS-CoV-2、SARS-CoV或MERS-CoV的刺突蛋白的假病毒的相同血浆样本。与抗体结合结果一致，在个体中发现不同程度的针对SARS-CoV-2的中和活性(图1C)。然而，针对SARS-CoV和MERS-CoV的交叉中和相当小，因为测试的所有血浆样本(包含健康对照血浆)具有可忽略的中和水平(图1C)。对于任何针对携带HIV-1包膜MG04的假病毒对照的血浆样本，未发现可检测中和(图1C)。综合而言，这些结果表明，不管实质性序列和结构类似性如何，但来自SARS-CoV-2、SARS-CoV和MERS-CoV的RBD可能为免疫学上不同的。因此，RBD以外的区域可能有助于观测到的针对SARS-CoV和MERS-CoV刺突蛋白的交叉反应性。
具有一系列闸控策略的流式细胞测量术用于研究SARS-CoV-2特异性B细胞反应和识别荧光标记的RBD探针的标识B细胞(图1D和图7A到图7K)。如图1E到图1F中所示，RBD特异性B细胞在总B细胞群体中占约0.005-0.065％且在存储器亚群中占0.023-0.329％。RBD特异性B细胞的数量在P#2、P#5、P#16和P#22中相对较高(图1E到图1F)，这似乎与对应血浆样本与SARS-CoV-2 RBD和三聚刺突蛋白的结合活性良好相关(图1A和图1B)。然而，样本P#1A表明RBD特异性B细胞反应最小，不管高阶血浆结合如何。由于P#1为唯一死于疾病的患者，这种高血浆结合活性和低含量的RBD特异性B细胞的二分法有可能为快速疾病进展的替代标记物。
实例3
这个实例说明针对SARS-CoV-2 RBD的单一B细胞抗体的克隆和分析。
将实例2中所鉴定的RBD结合B细胞分离成单细胞悬浮液用于克隆和评估mAb反应(图1D和图7A到图7K)。免疫球蛋白重链和轻链是通过RT-PCR使用巢式引子扩增。将扩增产物克隆到线性表达卡匣中以产生如先前所描述的完全IgG1抗体(Kong,L.等人Immunity44,939-950(2016)；Liao,H.-X.等人J Virol Methods 158,171-179)。在个体中B细胞克隆的数量在10到106之间变化(图8)。个别IgG是通过线性表达卡匣的转染产生且通过ELISA测试SARS-CoV-2 RBD反应性。平均而言，百分的五十五的抗体克隆具有反应性，但在不同个体之间存在极大可变性(图8)。在358种抗体中，发现206种抗体特异性结合到SARS-CoV-2RBD，且通过B细胞克隆和定序，获得165个不同序列(表9)。这些206种抗体表明结合活性的显著差异。举例来说，来自样本P#2B、P#2C、P#4A、P4#B、P#5A、P#16A和P#22A的大量抗体具有远超过4.0的OD 450值，而来自样本P#1A的那些抗体中无一者超出4.0。来自P#3A和P#8A的抗体太少而不能作出有意义的评估(图8)。此外，来自不同研究个体的样本还表明重链可变基因(VH)使用的实质性差异(图2A)。举例来说，P#1样本由VH3-53、3-13和1-69主导，其分别占整个VH库的约21.4％、14.3％和14.3％。来自P#2和P#5的样本在其VH使用的分佈和频率方面更多样化。然而，在研究个体中无单一或一组VH家族突出，从而表明患者对SARS-CoV-2感染具有免疫学上不同的反应。这种假设是通过所有206个VH序列的谱系学分析支持，上述VH序列与其对应结合活性叠加，如图2B中所呈现。在多个重链家族中广泛地分佈高结合丛集(80％丛集，其中OD 450>3)。实际上，大部分高结合抗体是通过P#2、P#4和P#5中的特定VH家族的克隆扩增得到。类似地，中等(60-80％丛集，其中OD 450>3)结合丛集和低(<60％丛集，其中OD 450>3)结合丛集也广泛分佈且各自由不均衡表示的VH基因家族组成。
由于P#2显示出大量RBD结合抗体且为唯一具有三个连续血液样本的患者，因此对P#2抗体进行了更详细表征。在来自P#2的总共69种抗体中，大部分(59％)分散在各个分支中且其余部分(41％)克隆扩增成三个主要丛集(图3A)。来自三个时间点(A、B、C)的抗体似乎不归并而是在其间相互交错，表明其在早期感染期间高度相关。显著富集三个克隆且各自占整个测试库的12到14％之间(图3A)。其重链可变区属于VH1-2*06、VH3-48*02和VH3-9*01家族。对应轻链κ(Igk)属于2-40*01/2D-40*01、3-20*01，且对应轻链λ(Igl)属于具有相应的接合区段κ4(Jk4)、Jk5和接合区段λ1(Jl1)的2-14*02(表9)。更重要地，在所有三个样本中鉴定出这些克隆扩增的抗体，指示其在感染期间经强选择。当在每一丛集内比较其表示时，VH1-2*06和VH3-9*01似乎从约33％增加到45％，而在三个时间点内VH3-48*02从33％降低到9％，尽管克隆数量对于统计显著性而言太少。关注的是，VH1-2*06的体细胞超突变(SHM)或生殖系分歧为0％且此丛集在研究时段期间保持。然而，相较于69个VH序列中的2.2％±3.3％的总体平均值，VH3-48*02的SHM达到高达9.6％且VH3-9*01的SHM达到3.8％。此外，与69个VH序列中的16±4aa的总体平均值相比，VH1-2*06、VH3-48*02和VH3-9*01的CDR3长度分别为19aa、16aa和23aa。来自VH3-9*01丛集的最长CDR3的紧密检查揭示了酪氨酸的丰富度，指示与周围残基的可能的氢键结和疏水相互作用。这些结果阐明在早期感染期间RBD特异性抗体的克隆扩增和广泛多样性以及其在控制SARS-CoV-2感染方面的潜在作用。
此外，我们还进行基因体分析且比较13种mAb(P22A-1D1、P5A-1B9、P5A-2G7、P5A-2G9、P5A-1D1、P5A-1B8、P5A-1D2、P5A-3B4、P5A-3C8、P5A-3C12、P2C-1F11、P2B-2F6和P2B-1A10)中的重链可变基因(VH)和κ或λ轻链可变(VK/VL)基因使用，其中在实例6中的假病毒中和分析中鉴定的IC50最小。在这些13种mAb中，发现7种使用IGHV3-53/3-66且主要与IGK1-9*01配对(表9b)。七个中的四个源自P#5(P5A-1D1、P5A-1B8、P5A-1D2和P5A-3C8)，而两个源自P#2(P2C-1F11和P2B-1A10)且一个源自P#22(P22A-1D1)。在主要中和剂中来自不同个体的此类高发病率(53.8％)指示IGHV3-53/3-66表示一种针对SARS-CoV-2的主要和公开的抗体反应(图3B到图3E)。这个结果与近期报道一致，上述近期报道也已认识到IGHV3-53/3-66在SARS-CoV-2患者中的不均衡的高发病率(Barnes等人,2020；Yuan等人,2020)。此外，抗体的CDR3长度在9到15之间变化，在所鉴定的总165个RBD特异性抗体中位于较短范围内(图3F)。其体细胞超突变(SHM)通常较低且重链(P22A-1D1)或轻链(P5A-1B8和P2C-1F11)的一些体细胞超突变达到0％。
实例4
在以下实例中进一步定义本发明。应理解，这些实例尽管指示本发明的优选实施例时，但仅以说明的方式给出。根据以上论述和这些实例，所属领域的技术人员可确定本发明的基本特征，且在不脱离本发明的精神和范围的情况下可对本发明作出各种改变和修改以使其适应各种用途和条件。
这个实例说明针对SARS-CoV-2 RBD的抗体的结合特性。
基于其在系统树上的表示和分佈，选择69个P#2抗体序列中的13个以供进一步分析(图3A，星形)。五个P#1A抗体克隆用作对照。与SARS-CoV-2 RBD的表面等离子体共振(SPR)显示出P#2抗体具有范围介于1.38到21.29nM的解离常量(Kd)，而P#1的那些解离常量范围为8.48到260.50nM或根本检测不到(图4U和图9A到图9B)。SHM似乎与Kd不相关；在VH和VL基因两者中具有0％分歧的一些生殖系克隆(P2A-1A10、P2B-2G4、P2C-1A3和P2C-1E1)具有范围介于2.47到21.19nM的Kd值，其与具有较高水平的SHM的克隆的Kd值(1.38到17.57nM)相当(图4U)。来自三个克隆扩增丛集的代表性克隆(P2A-1A8、P2A-1A10和P2A-1B3)的Kd在4.65到8.91nM之间跨越，表明其扩增可不由亲和力成熟驱动。也测试抗体P2B-1G5的RBD结合，且Kd值为0.1nM(表7a)。接着，测量每一抗体与ACE2的竞争以结合到SARS-CoV-2 RBD(图4B、图4U、图4V和图10A到图10B)。具体来说，RBD共价固定于CM5传感器芯片上且首先经抗体饱和且接着用可溶性ACE2流过。每一抗体的竞争能力测量为ACE2与RBD结合的降低百分比。如(图4U、图10A、图10B)中所示，所评估的抗体与ACE2展现出各种竞争能力。最有力的为P2C-1F11。来自克隆扩增丛集的三种代表性抗体中的两者(P2A-1A10和P2A-1B3)也具有强降低。第三代表性(P2A-1A8)仅显示出轻度降低。尽管Kd值明显，但许多抗体与ACE2仅具有有限的竞争力，从而表明结合亲和力不预测ACE2竞争能力。也测试抗体P2B-1G5的ACE2竞争，且显示17.54％的与ACE2的竞争(表7a)。来自P#1的对照抗体与ACE2展现出甚至更低的竞争力。出人意料地，除P1A-1C7(Kd＝4.85μM)外，所测试的抗体中无一者展现出与SARS-CoV和MERS-CoV RBD的交叉结合，其中仅检测到与SARS-CoV RBD的有限交叉反应性(图9A到图9F)。
还鉴定另一组13种中和抗体(参见实例5)。这些中和抗体对SARS-CoV-2 RBD展现出高但不同的结合亲和力，通过表面等离子体共振(SPR)所测量(图9G和表9b)。最关注的是，在主要13种中和抗体中，发现7种中和抗体使用IGHV3-53/3-66且主要与IGK1-9*01配对(表9b)。七个中的四个源自P#5(P5A-1D1、P5A-1B8、P5A-1D2和P5A-3C8)，而两个源自P#2(P2C-1F11和P2B-1A10)且一个源自P#22(P22A-1D1)(图3D到3E)。在主要中和剂中来自不同个体的此类高发病率(53.8％)指示IGHV3-53/3-66表示一种针对SARS-CoV-2的主要和公开的抗体反应。此外，其CDR3长度在9到15之间变化，在所鉴定的总165个RBD特异性抗体中位于较短范围内(图3F)。其体细胞超突变(SHM)通常较低且重链(P22A-1D1)或轻链(P5A-1B8和P2C-1F11)的一些体细胞超突变达到0％。近期报道也已认识到IGHV3-53/3-66在SARS-CoV-2患者中的不均衡的高发病率(Barnes等人,2020；Yuan等人,2020)。
这些13种mAb对SARS-CoV-2 RBD展现出高但不同的结合亲和力，通过表面等离子体共振(SPR)所测量(图10C和表9b)。除P2B-1A10外，全部均展示单数字或更小纳摩尔的结合亲和力。除P5A-3B4之外，这些mAb与ACE2在结合到SARS-CoV-2 RBD时具有强竞争性能力，表明其可能的中和机制(图10C和表9b)。
实例5
这个实例说明针对携带SARS-CoV-2的刺突蛋白的慢病毒的抗体的中和特性。
对于第一组抗体P2A-1A8、P2A-1A9、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2B-2G11、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5和P2C-1F11，测试RBD结合和假病毒中和活性。与竞争能力结果一致，中和活性显著变化，其中IC50值在0.03到>50μg/ml的范围内(图4C到图4M)。在这第一组抗体内，P2C-1F11、P2B-2F6和P2C-1A3最有效，其中IC50分别为0.03、0.05和0.63μg/ml。总体而言，ACE2竞争容量与中和活性良好相关，尽管这种相关性在一些情况下并不准确。值得注意地，未发现针对携带SARS-CoV或MERS-CoV的全长刺突的假病毒的交叉中和或具有三聚SARS-CoV和MERS-CoV刺突的细胞表面染色的交叉中和(图11A到图11B)。
还测试抗体P2B-1G5的假病毒中和活性，其中IC50值为0.11μg/ml。结果示于表7a中。
进一步使用第二组抗体P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P2B-1G1、P5A-1C8、P5A-2F11、P5A-2E1、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4和P4A-2D9测试假病毒中和活性。结果显示大部分这些抗体有效，且发现抗体P2B-1G5、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-1C8、P5A-2F11、P2B-1A1、P2C-1D7和P2B-1A10的IC50均低于1μg/ml(表7b)。
也使用第三组以下抗体测试假病毒中和活性：P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。结果显示大部分这些抗体有效，且发现以下抗体的IC50均低于1μg/ml：P4A-1H6、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。以下抗体最有效：P5A-1B9、P22A-1D1、P5A-1D1、P5A-1B8、P5A-2G9、P5A-3B4和P5A-3C12，其中IC50小于0.1μg/ml(分别为0.0014、0.0038、0.0096、0.0115、0.0158、0.0993和0.0996μg/ml)。
通过概述使用假病毒进行的初始筛选结果，我们鉴定13种mAb(P22A-1D1、P5A-1B9、P5A-2G7、P5A-2G9、P5A-1D1、P5A-1B8、P5A-1D2、P5A-3B4、P5A-3C8、P5A-3C12、P2C-1F11、P2B-2F6和P2B-1A10)，其中IC50在0.0014μg/mL到0.0996μg/mL范围内(图4N到图4R)。然而，其余抗体的IC50在0.1μg/mL与50μg/mL或更高之间跨越(表7d)。
我们在第一组抗体中选择针对假病毒的主要七种有效中和抗体以使用病灶减少中和测试(FRNT)分析其对活SARS-CoV-2的抑制活性(图4S和图12A到图12D)。与其相应假病毒检定发现一致，P2C-1F11、P2B-2F6和P2C-1A3展现出最有效的中和活性，其中IC50分别为0.03、0.41和0.28μg/ml(图4U)。其余抗体展现出中等中和活性，其中IC50在1.64到35.87μg/ml范围内(图4U)。基于病灶减少中和测试(FRNT)，进一步鉴定的主要13种中和抗体对活SARS-CoV-2也展现出强抑制活性(图4T)。举例来说，最优选抗体P5A-1B9的IC50达到低至0.0043μg/mL且IC80达到0.0441μg/mL，比第一组中测试的那些抗体的效力大至少10倍(图4V)。
为确定这些抗体是否竞争SARS-CoV-2 RBD上的类似抗原表位，总共六种具有相对强ACE2竞争性能力和中和性能的抗体且使用SPR以成对竞争方式分析。如表8和图13中所示，在抗体对中发现不同程度的竞争。举例来说，P2C-1A3对具有强降低能力的所测试的所有抗体具有竞争性(图13)。在另一方面，P2C-1F11与其它抗体的竞争性较小，且特定地说仅与P2C-1C10具有最小竞争性。P2B-2F6(另一有效中和抗体)与所测试的所有抗体广泛地竞争。这些结果指示所分析的抗体识别重叠和不同的抗原表位两者。不同mAb可因此经由不同机制发挥其中和活性。
也使用SPR以成对竞争方式分析抗体P2B-1G5与P2C-1F11。结果示于表7a中，这表明P2B-1G5仅与P2C-1F11具有最小竞争性。将C106S取代引入P2B-1G5中，且显示出C106S取代的变体在RBD结合、假病毒检定以及中和检定中展现与亲本抗体相当的活性。
实例6
这个实例说明抗体中和的结构基础。
测定第一组抗体中的主要三种最有效中和抗体(P2C-1F11、P2B-2F6和P2C-1A3)的晶体结构。其中，结合到SARS-CoV-2 RBD的P2B-2F6 Fab和P2C-1F11 Fab能够形成晶体，且其结构是在2.85埃的分辨率下解析(图5A和图5F)。
抗体P2B-2F6主要使用重链与RBD相互作用，且互补位区域由14个来自重链的残基(HCDR1的Y27、S28、S30、S31和Y33；HCDR2的H54；HCDR3的G102、I103、V105、V106和P107)和3个来自轻链的残基(LCDR1的G31、Y32和N33)组成(图5E)。RBD上的内埋表面积(buriedsurface area)为534A2且识别的抗原表位残基全部来自RBD的受体结合模体(receptor-binding motif；RBM)，包含残基K444、G446、G447、N448、Y449、N450、L452、V483、E484、G485、F490和S494(图5E)。通过P2B-2F6进行的SARS-CoV-2识别主要由RBD残基Y449、L452和F490周围的疏水相互作用驱动(图5B)。RBD-P2B-2F6和RBD-ACE2晶体结构的结构叠加指示P2B-2F6的结合将与ACE2发生冲突(图5C)。在P2B-2F6轻链(残基R56、S58、G59、R63、S78、G79)与ACE2(残基D67、K68、A71、K74、E110、K114)之间将发生冲突。通过P2B-2F6和ACE2识别的重叠残基仅包含G446和Y449，这主要是由于其在接近RBD时的角度差异。然而，预期P2B-2F6与RBD的高亲和力结合(5.14nM)(其与RBD与ACE2之间的结合亲和力(4.70nM)相当)阻止受体ACE2接合，进一步通过SPR分析中P2B-2F6的高ACE2竞争效率(在图4O中为98.80％，第二列)支持。我们还将RBD-P2B-2F6晶体结构叠加到SARS-COV-2刺突三聚体的cryo-EM结构上，其中RBD具有两种不同的“上”构形和“下”构形。不同于仅结合“上”RBD的ACE2，P2B-2F6 Fab能够结合到“上”构形和“下”构形的RBD而不与刺突三聚体中的两个其它单体发生冲突(图5D)。因此，我们表明P2B-2F6中和的结构基础依赖于与受体ACE2在刺突结合时的直接竞争。
抗体P2C-1F11主要使用重链与RBD相互作用，且互补位区域由17个来自重链的残基(HCDR1的G26、I27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；HFR3的Y58；HCDR3的R97、L99、V100、V101、Y102和D105)和4个来自轻链的残基(LFR1的I2；LCDR1的S28、S30和Y33)组成(图5G)。RBD上的内埋表面积示于图5G中，且所识别的23个抗原表位残基位于SARS-CoV-2 RBD的RBM(Y453、L455、F456、R457、K458、S459、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489、Q493、G502和Y505)和核心(R403、T415、G416、K417、D420和Y421)中(图5G)。氢键结相互作用的网络(18个在重链与RBD之间和2个在轻链与RBD之间)在1F11识别SARS-CoV-2时占主导。
还分别在
Figure BDA0003707502100001731
和
Figure BDA0003707502100001732
的分辨率下确定P22A-1D1、P5A-3C8和P5A-1D2与SARS-CoV-2 RBD复合的晶体结构(图5H和表10c)。其使用抗体P2C-1F11
Figure BDA0003707502100001733
以用于面对面比较(head to head comparison)。如图5H、5I、5J和5K中所示，这些四种抗体(P22A-1D1、P5A-3C8、P5A-1D2和P2C-1F11)以几乎相同的接近角结合到RBD。所估计的与ACE2的碰撞体积为大概约
Figure BDA0003707502100001734
(图5H)，与显示与ACE2竞争结合到SARS-CoV-2 RBD的强能力的生物化学数据一致(表9b)。抗体P22A-1D1、P5A-3C8、P5A-1D2和P2C-1F11的重链在RBD上共享类似内埋表面。所估计的面积对于P22A-1D1为
Figure BDA0003707502100001735
对于P5A-3C8为
Figure BDA0003707502100001736
对于P5A-1D2为
Figure BDA0003707502100001737
且对于P2C-1F11为
Figure BDA0003707502100001738
(图5I)。相比之下，轻链的内埋表面积截然不同。P22A-1D1
Figure BDA0003707502100001739
和P5A-3C8
Figure BDA00037075021000017310
显著大于P5A-1D2
Figure BDA00037075021000017311
和P2C-1F11
Figure BDA00037075021000017312
(图5I)。将较大内埋区域翻译成更多的抗原表位残基。举例来说，P22A-1D1和P5A-3C8在RBD上具有28个和31个抗原表位残基，而P5A-1D2和P2C-1F11分别具有22个和23个抗原表位残基(图5S)。此外，这些抗体的抗原表位与RBD上的ACE2结合残基显著重叠。在RBD上的17个ACE2结合残基中，P22A-1D1共享15个，P5A-3C8共享16个，P5A-1D2共享10个，且P2C-1F11共享11个(图5L)。与RBD上的结合残基类似的接近角和RBD上的结合残基的大重叠表明这些四种公开抗体在结合到SARS-CoV-2方面类似于ACE2。P5A-1D2、P5A-3C8和P22A-1D1/SARS-CoV-2RBD复合物的坐标和结构因子文件分别以寄存编号7CHO、7CHP、7CHS寄存于蛋白质数据库(Protein Data Bank；PDB)中。
如实例3中所描述，发现四种抗体P22A-1D1、P5A-3C8、P5A-1D2和P2C-1F11均使用IGHV3-53或IGHV3-66(表9b)。除一个残基以外，IGHV3-53和IGHV3-66共享相同的生殖系氨基酸序列。因此，预期四种抗体主要经由重链中的残基共有其与RBD的结合特征。如图5M中所示，全部三个HCDR参与这些四种抗体与RBD的结合。重链序列比对显示出HCDR1和HCDR2为高度保守的，而HCDR3为截然不同的(图5P到图5S)。值得注意的是，P5A-1D2具有比其余三种抗体(11个残基)更长的HCDR3(15个残基)。
抗体P22A-1D1主要使用重链与RBD相互作用，且互补位区域由17个来自重链的残基(G26、F27、T28、S31、N32、Y33、H52、S53、G54、S56、Y58、R97、R99、D100、Y101、Y102和D105)和10个来自轻链的残基(Q27、G28、I29、S30、Y32、S67、H90、L91、N92和Y94)组成(图5T)。RBD上的内埋表面积示于图5T中，且所识别的18个抗原表位残基位于SARS-CoV-2 RBD(T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和Q493)中(图5T)。
抗体P5A-1D2主要使用重链与RBD相互作用，且互补位区域由20个来自重链的残基(G26、F27、I28、S31、N32、Y33、Y52、S53、G54、S56、Y58、R87、R97、L99、Q100、V101、G102、A103、T104和D106)和3个来自轻链的残基(A31、Y33、S95)组成(图5T)。RBD上的内埋表面积示于图5T中，且所识别的20个抗原表位残基位于SARS-CoV-2 RBD(T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、N487、Y489、Q493和Y505)中(图5T)。
抗体P5A-3C8主要使用重链与RBD相互作用，且互补位区域由16个来自重链的残基(G26、F27、T28、S31、N32、Y33、Y52、S53、G54、S56、Y58、R97、L99、Q100、E101和H102)和12个来自轻链的残基(G28、I29、S30、S31、S67、G68、H90、L91、N92、S93和Y94)组成(图5T)。RBD上的内埋表面积示于图5T中，且所识别的19个抗原表位残基位于SARS-CoV-2 RBD(T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和Q493)中(图5T)。
抗体P2C-1F11主要使用重链与RBD相互作用，且互补位区域由16个来自重链的残基(G26、I27、T28、S31、N32、Y33、Y52、S53、G54、S56、R97、L99、V100、V101、Y102和D105)和3个来自轻链的残基(S28、S30和Y33)组成(图5T)。RBD上的内埋表面积示于图5T中，且所识别的19个抗原表位残基位于SARS-CoV-2 RBD(T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和Q493)中(图5T)。
在共享的HCDR1-RBD界面中，保守HCDR1残基G26、F27、T28/I28、S31、N32和Y33与RBD残基L455、K458、Y473、A475、G476、S477和N487相互作用。在共享的HCDR2-RBD界面中，相互作用主要经由HCDR2残基Y52、S53、G54、S56和Y58以及RBD残基T415、G416、K417、D420、Y421、K458和N460介导。特定地说，四种抗体共有的一种独特特征为在与RBD形成疏水相互作用和亲水相互作用的网络时使三个保守酪氨酸(Y33、Y52和Y58)参与(图5N)。举例来说，Y33与RBD K417、Y421、L455和F456形成广泛的疏水相互作用(图5N)。其侧链-OH还与RBDL455的主链氧原子形成保守氢键(图5N)。另一独特和共有的特征为由HCDR2中的-SGGS-区段介导的相互作用。除经由凡得瓦尔力(Van der Waals force)的紧密接触之外，还在开端S53与末端S56之间与RBD Y421和D420分别发生特定的氢键结相互作用(图5O)。另外，RBDY421还与G44的主链N原子形成保守氢键(图5O)。
不管共同和共有的特征如何，四种抗体还由于其序列和结构变化而展现出一些微小差异。P22A-1D1、P5A-3C8和P2C-1F11具有相同的11-残基长HCDR3，但实际序列不同。举例来说，P22A-1D1中的-RDYYG-经P5A-3C8中的-LQEHG-置换且经P2C-1F11中的-LVVYG-置换(表9b)。因此，尽管与同一RBD残基(例如F456、N487、Y489和Q493)相互作用，但在介导此类相互作用时HCDR3中的特定残基为不同的。相较于其它三者，P5A-1D2具有含有15个残基的相对较长HCDR3(图5K和表9b)，从而提供更多残基以与RBD相互作用。举例来说，P5A-1D2HCDR3的尖端处的T104与RBD Y505具有相互作用，这在其它三个HCDR3-RBD界面中不存在(图5K)。RBD Y505实际上由P22A-1D1、P5A-3C8和P2C-1F11的轻链识别，且似乎充当轻链结合的锚定残基(图5P到图5S)。然而，P5A-1D2的长HCDR3的识别引起Y505的侧链构形显著改变，排除了Y505充当P5A-1D2轻链结合的锚定物(图5P到图5S)。
为了进一步剖析抗原表位残基对公开抗体的结合的影响，我们对公开抗体中共有的15个抗原表位残基进行了单点丙氨酸扫描突变诱发。所有突变刺突成功地表达于HEK293T细胞的表面上，如通过经由流式细胞测量术的对照S2抗体的中值荧光强度(medianfluorescence intensity；MFI)所测量。然而，在15个突变残基中，12个突变残基引起四种公开抗体的结合减少超过80％，尽管一些抗体比其它抗体更敏感(图6C，以灰色框突出显示)。举例来说，Y421A和F456A对所有四种公开抗体具有广泛影响，而T415A、Y473A和N487A对四种公开抗体中的三者具有广泛影响。在另一方面，K417A、D420A、L455A、R457A、N460A和Y489A仅降低四种抗体中的两者的结合。特定地说，相比于其余三种抗体，Y505A似乎对P5A-1D2具有更深远的影响。这可能是由于Y505在经由如上文所说明的HCDR3的尖端处的T104进行的重链识别中的重要性。综合而言，这些结果指示，不管其总体类似性如何，在四种公开抗体中确实存在一些微小差异，这可对其在结合活性和中和活性方面的微小差异做出解释。最后，15个突变残基中的9个还引起ACE2与表面表达的棘状糖蛋白的结合显著减少。以橙色框突出显示这些残基，包含T415A、Y421A、L455A、F456A、R457A、Y473A、N487A、Y489A和Y505A。这些残基对ACE2和公开抗体的共同影响支持上述结构分析(图5H到图5L)。
实例7
健康成年个体中的半衰期和人类PK结果。
测定单克隆抗体(mAb)在典型70kg个体中的半衰期：
mAb T1/2＝23.2天(具有野生型人类恒定域Fc的mAb)
mAb-YTE T1/2＝89.5天(具有YTE恒定域Fc的mAb)
构筑且产生mAb1和mAb2抗体以分别含有抗原结合域P2C-1F11和P2B-1G5。两种抗体含有经修饰人类IgG恒定域，其包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号。
在根据机构审查委员会(institutional review board；IRB)批准的方案(IRB批准号(025)-02和(026)-02，Ethical Committee of the Beijing Ditan Hospital，Capital Medical University)获得同意之后，健康人类成年个体是以特定剂量施用抗体。在指定时间点获取血液样本。mAb1和mAb2血清浓度的定量是使用经验证的夹心ELISA方法，使用可商购的His标签SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域作为捕捉试剂，和用辣根过氧化酶标记的可商购的小鼠抗人类IgG Fc抗体作为检测试剂进行。
进行三种剂量水平：第1组(750mg)、第2组(1500mg)和第3组(3000mg)。
使用已建立的人类群体PK模型，使用蒙地卡罗模拟(Monte Carlo simulation)测量和预测不同剂量水平的mAb1和mAb2 PK曲线。对于每一组，预测中值以实线示于图15A到图15B中。虚线和点表示个体中的测量浓度。阴影区表示第5到第95百分位数。
实例8
中和作用。
使用病灶减少中和测试(FRNT)方法测量针对活病毒SARS-CoV-2的单独或组合的mAb1和mAb2的中和活性。两种抗体展现有效抗病毒活性且两种抗体的组合在中和活SARS-CoV-2病毒时展现出中等累加效应(图16)。
实例9
活体内药物动力学检定。
在分别向雄性和雌性未经治疗的食蟹猕猴以10mg/kg IV灌注施用mAb1和mAb2 60分钟之后，表征mAb1和mAb2单剂量PK(n＝3只动物/性别组)。根据批准方案进行动物研究。
在给药前，输注结束后5分钟、30分钟、1小时、2小时、4小时、8小时、24小时、48小时、72小时、96小时、120小时、168小时、240小时、336小时、504小时、672小时、840小时、1008小时、1176小时和1344小时收集血液样本。在给药前，输注结束后336小时、504小时、672小时、840小时、1008小时、1176小时和1344小时收集抗药物抗体(ADA)样本。通过ELISA方法测定血清样本中的mAb1或mAb2的浓度。使用经验证的ECL方法测定所收集样本中的ADA反应程度。药物动力学非房室分析(non-compartmental analyses；NCA)是基于IV灌注起始时间的时间。
食蟹猕猴中的mAb1和mAb2的药物动力学(PK)数据示于图17A(mAb1)和图17B(mAb2)中。mAb1在剂量水平下未显示出明显的性别差异。在单次10mg/kg IV剂量之后，血清mAb1和mAb2浓度以双相方式下降，具有指示线性消除的浓度-时间曲线。
实例10
假病毒中和检定
在假病毒中和检定中，P2C-1F11几乎不受UK501Y.V1(在RBD中含有N501Y突变)、SA501Y.V2(在RBD中含有K417N、E484K、N501Y突变)和BR501Y.V3(RBD中的K417T、E484K和N501Y突变)突变株的影响，P2B-1G5亦如此(图18)。我们随后研究能够维持对变体的中和的P2C-1F11的结构基础。我们在
Figure BDA0003707502100001771
的分辨率下测定了P2C-1F11所结合的携带K417N-E484K-N501Y突变的SARS-CoV-2 RBD(RBD-3M)的晶体结构(PDB ID：7E8M)(图19)。与我们先前报道的在
Figure BDA0003707502100001781
下野生型RBD与P2C-1F11的晶体结构(PDB ID：7CDI)相比，我们发现三种突变并不改变P2C-1F11与RBD的总体结合模式(图20)，如通过所有581个Cα原子的
Figure BDA0003707502100001782
rmsd值所证明。然而，鉴定到若干微妙变化。一种变化与残基417的相互作用力有关且其它变化与501处的残基的相互作用力有关。类似于其它I类和RBS-A类抗体，P2C-1F11经由疏水相互作用和氢键相互作用结合到野生型K417。这主要由其重链生殖系残基Y33和Y52介导。K417N突变将减少这些相互作用，但仅经Y52与突变N417之间的一个氢键置换(图20B和图21)。此外，不同于I类或RBS-A类中的那些，P2C-1F11在天冬氨酸(D)与K417之间不形成盐桥相互作用(图20B和20C)。因此，相比于I类或RBS-A类中的那些(例如在此处研究的P5A-1D2、P22A-1D1、CB6和在别处表征的CC12.1、CC12.3、COVA2-04以及COVA2-07)，K417N突变将对P2C-1F11的破坏性较小。K417N-E484K-N501Y突变不位于P2B-1G5的抗原表位上，且我们假设由这些突变诱导的构形变化导致P2B-1G5对SA501Y.V2的中和性能降低6倍(图22)。
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鉴于本发明，本文中所揭露和主张的所有组合物和方法均可在无不当实验的情况下制备和执行。虽然已根据优选实施例描述本发明的组合物和方法，但所属领域的技术人员应显而易知，可在不脱离本发明的概念、精神和范围的情况下对上述方法施加变化和在本文所描述的方法的步骤或步骤顺序中施加变化。更具体来说，显而易见的是，化学上和生理学上均相关的某些药剂可取代本文所描述的药剂，同时达成相同或类似结果。对所属领域的技术人员显而易见的所有此类类似取代和修改均视为在如由随附权利要求书所定义的本发明的精神、范围和概念内。
本发明的经编号实施例
在以下经编号实施例中阐明本发明涵盖的其它主题：
1.一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其能够特异性结合到SARS-CoV-2，且展现比对SARS-CoV或MERS-CoV低至少50％的结合或展现不可检测的结合。
2.一种经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其具有一个或多个选自由以下组成的群组的特征：
a)能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白且展现比对SARS-CoV的刺突蛋白或MERS-CoV的刺突蛋白低至少50％的结合；
b)能够特异性结合到包括SEQ ID NO:128的氨基酸序列的SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)；
c)展现与包括SEQ ID NO:124的氨基酸序列的SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其水平为不可检测的或不超过与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合的50％；
d)展现与包括SEQ ID NO:126的氨基酸序列的MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其水平为不可检测的或不超过与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合的50％；
e)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，其Kd值不超过1×10-7M，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量；
f)展现与SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合或MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合，其Kd值为至少1×10-6M，如通过SPR所测量；
g)能够展现在1μM下与2μM血管紧张素转化酶2(ACE2)受体至少30％的竞争以结合到以250的共振单位(RU)固定的SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，如通过SPR所测量；和
h)能够结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，其在IC50值下的中和活性不超过100μg/ml，如通过假病毒中和检定所测量。
3.一种能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的经分离或重组抗体或其抗原结合片段，其包括：
a)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3；
b)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13；
c)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:23；
d)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32和SEQ ID NO:33；
e)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42和SEQ ID NO:43；
f)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:53；
g)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66和SEQ ID NO:67；
h)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76和SEQ ID NO:77；
i)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86和SEQ ID NO:87；
j)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:97；
k)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:106和SEQ IDNO:107；
l)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:437和SEQ IDNO:438；
m)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:106和SEQ IDNO:438；
n)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ IDNO:138；
o)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ IDNO:448；
p)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:443和SEQ IDNO:444；
uu.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:137和SEQ IDNO:444；
q)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147和SEQ IDNO:148；
r)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:157和SEQ IDNO:158；
s)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:167和SEQ IDNO:168；
t)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:177和SEQ IDNO:178；
u)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:187和SEQ IDNO:188；
v)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:197和SEQ IDNO:198；
w)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:207和SEQ IDNO:208；
x)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:217和SEQ IDNO:218；
y)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227和SEQ IDNO:228；
z)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:237和SEQ IDNO:238；
aa)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:246、SEQ ID NO:247和SEQ IDNO:248；
bb)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:257和SEQ IDNO:258；
cc)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:267和SEQ IDNO:268；
dd)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277和SEQ IDNO:278；
ee)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:287和SEQ IDNO:288；
ff)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:297和SEQ IDNO:298；
gg)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:307和SEQ IDNO:308；
hh)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:317和SEQ IDNO:318；
ii)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:327和SEQ IDNO:328；
jj)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:337和SEQ IDNO:338；
kk)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:347和SEQ IDNO:348；
ll)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:357和SEQ IDNO:358；
mm)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:367和SEQ IDNO:368；
nn)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:377和SEQ IDNO:378；
oo)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:387和SEQ IDNO:388；
pp)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:397和SEQ IDNO:398；
qq)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:407和SEQ IDNO:408；
rr)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:417和SEQ IDNO:418；或
ss)1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:427和SEQ IDNO:428。
4.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：
a)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6；
b)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16；
c)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26；
d)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35和SEQ ID NO:36；
e)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45和SEQ ID NO:46；
f)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56；
g)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69和SEQ ID NO:70；
h)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:79和SEQ ID NO:80；和
i)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89和SEQ ID NO:90；
j)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99和SEQ ID NO:100；
k)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:109和SEQ IDNO:110；
l)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:439、SEQ ID NO:440和SEQ IDNO:441；
m)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:140和SEQ IDNO:141；
n)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:445、SEQ ID NO:446和SEQ IDNO:447；
o)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150和SEQ IDNO:151；
p)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160和SEQ IDNO:161；
q)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:170和SEQ IDNO:171；
r)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:180和SEQ IDNO:181；
s)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:190和SEQ IDNO:191；
t)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:200和SEQ IDNO:201；
u)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:210和SEQ IDNO:211；
v)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:220和SEQ IDNO:221；
w)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:230和SEQ IDNO:231；
x)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:240和SEQ IDNO:241；
y)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:250和SEQ IDNO:251；
z)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:260和SEQ IDNO:261；
aa)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:270和SEQ IDNO:271；
bb)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280和SEQ IDNO:281；
cc)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:290和SEQ IDNO:291；
dd)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:300和SEQ IDNO:301；
ee)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:310和SEQ IDNO:311；
ff)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:320和SEQ IDNO:321；
gg)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:330和SEQ IDNO:331；
hh)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:340和SEQ IDNO:341；
ii)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:350和SEQ IDNO:351；
jj)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:360和SEQ IDNO:361；
kk)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:370和SEQ IDNO:371；
ll)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:380和SEQ IDNO:381；
mm)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:390和SEQ IDNO:391；
nn)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:400和SEQ IDNO:401；
oo)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:410和SEQ IDNO:411；
pp)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:420和SEQ IDNO:421；或
qq)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:430和SEQ IDNO:431。
5.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：
a)包括SEQ ID NO:1的序列的重链CDR1(HCDR1)、包括SEQ ID NO:2的序列的重链CDR2(HCDR2)、包括SEQ ID NO:3的序列的重链CDR3(HCDR3)、包括SEQ ID NO:4的序列的轻链CDR1(LCDR1)、包括SEQ ID NO:5的序列的轻链CDR2(LCDR2)和包括SEQ ID NO:6的序列的轻链CDR3(LCDR3)；
b)包括SEQ ID NO:11的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:12的序列的HCDR2、包括SEQID NO:13的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:14的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:15的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:16的序列的LCDR3；
c)包括SEQ ID NO:21的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:22的序列的HCDR2、包括SEQID NO:23的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:24的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:25的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:26的序列的LCDR3；
d)包括SEQ ID NO:31的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:32的序列的HCDR2、包括SEQID NO:33的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:34的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:35的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:36的序列的LCDR3；
e)包括SEQ ID NO:41的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:42的序列的HCDR2、包括SEQID NO:43的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:44的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:45的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:46的序列的LCDR3；
f)包括SEQ ID NO:51的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:52的序列的HCDR2、包括SEQID NO:53的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:54的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:55的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:56的序列的LCDR3；
g)包括SEQ ID NO:65的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:66的序列的HCDR2、包括SEQID NO:67的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:68的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:69的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:70的序列的LCDR3；
h)包括SEQ ID NO:75的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:76的序列的HCDR2、包括SEQID NO:77的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:78的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:79的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:80的序列的LCDR3；
i)包括SEQ ID NO:85的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:86的序列的HCDR2、包括SEQID NO:87的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:88的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:89的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:90的序列的LCDR3；
j)包括SEQ ID NO:95的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:96的序列的HCDR2、包括SEQID NO:97的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:98的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:99的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:100的序列的LCDR3；
k)包括SEQ ID NO:105或436的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106或437的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107或438的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108或439的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109或440的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110或441的序列的LCDR3；
l)包括SEQ ID NO:136或442的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137或443的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448或444的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139或445的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140或446的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141或447的序列的LCDR3；
m)包括SEQ ID NO:146的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:147的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:148的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:149的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:150的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:151的序列的LCDR3；
n)包括SEQ ID NO:156的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:157的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:158的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:159的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:160的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:161的序列的LCDR3；
o)包括SEQ ID NO:166的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:167的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:168的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:169的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:170的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:171的序列的LCDR3；
p)包括SEQ ID NO:176的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:177的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:178的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:179的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:180的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:181的序列的LCDR3；
q)包括SEQ ID NO:186的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:187的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:188的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:189的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:190的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:191的序列的LCDR3；
r)包括SEQ ID NO:196的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:197的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:198的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:199的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:200的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:201的序列的LCDR3；
s)包括SEQ ID NO:206的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:207的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:208的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:209的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:210的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:211的序列的LCDR3；
t)包括SEQ ID NO:216的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:217的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:218的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:219的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:220的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:221的序列的LCDR3；
u)包括SEQ ID NO:226的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:227的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:228的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:229的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:230的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:231的序列的LCDR3；
v)包括SEQ ID NO:236的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:237的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:238的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:239的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:240的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:241的序列的LCDR3；
w)包括SEQ ID NO:246的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:247的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:248的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:249的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:250的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:251的序列的LCDR3；
x)包括SEQ ID NO:256的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:257的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:258的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:259的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:260的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:261的序列的LCDR3；
y)包括SEQ ID NO:266的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:267的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:268的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:269的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:270的序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:271的序列的LCDR3；
z)包括SEQ ID NO:276的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:277的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:278的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:279的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:280的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:281的序列的LCDR3；
aa)包括SEQ ID NO:286的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:287的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:288的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:289的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:290的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:291的序列的LCDR3；
bb)包括SEQ ID NO:296的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:297的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:298的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:299的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:300的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:301的序列的LCDR3；
cc)包括SEQ ID NO:306的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:307的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:308的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:309的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:310的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:311的序列的LCDR3；
dd)包括SEQ ID NO:316的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:317的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:318的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:319的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:320的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:321的序列的LCDR3；
ee)包括SEQ ID NO:326的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:327的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:328的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:329的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:330的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:331的序列的LCDR3；
ff)包括SEQ ID NO:336的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:337的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:338的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:339的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:340的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:341的序列的LCDR3；
gg)包括SEQ ID NO:346的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:347的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:348的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:349的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:350的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:351的序列的LCDR3；
hh)包括SEQ ID NO:356的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:357的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:358的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:359的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:360的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:361的序列的LCDR3；
ii)包括SEQ ID NO:366的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:367的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:368的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:369的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:370的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:371的序列的LCDR3；
jj)包括SEQ ID NO:376的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:377的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:378的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:379的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:380的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:381的序列的LCDR3；
kk)包括SEQ ID NO:386的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:387的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:388的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:389的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:390的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:391的序列的LCDR3；
ll)包括SEQ ID NO:396的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:397的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:398的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:399的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:400的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:401的序列的LCDR3；
mm)包括SEQ ID NO:406的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:407的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:408的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:409的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:410的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:411的序列的LCDR3；
nn)包括SEQ ID NO:416的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:417的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:418的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:419的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:420的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:421的序列的LCDR3；或
oo)包括SEQ ID NO:426的序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:427的序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:428的序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:429的序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:430的序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:431的序列的LCDR3。
6.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其包括一对选自由以下组成的群组的重链可变区和轻链可变区序列：SEQ ID NO：7/8、17/18、27/28、37/38、47/48、57/58、61/62、71/72、81/82、91/92、101/102、111/112、142/143、152/153、162/163、172/173、182/183、192/193、202/203、212/213、222/223、232/233、242/243、252/253、262/263、272/273、282/283、292/293、302/303、312/313、322/323、332/333、342/343、352/353、362/363、372/373、382/383、392/393、402/403、412/413、422/423和432/433，或一对与其具有至少80％序列一致性但仍保持与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合特异性的同源序列。
7.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为以下抗体的变体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12或P22A-1D1，上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的HCDR1序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的HCDR2序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的HCDR3序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的LCDR1序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的LCDR2序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与表1中所列出的亲本抗体的LCDR3序列具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
其保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于其亲本抗体的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
8.根据实施例7所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：HCDR1，其在表1中所列出的亲本抗体的HCDR1序列中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在表1中所列出的亲本抗体的HCDR2序列中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在表1中所列出的亲本抗体的HCDR3序列中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR1，其在表1中所列出的亲本抗体的LCDR1序列中具有不超过2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在表1中所列出的亲本抗体的LCDR2序列中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在表1中所列出的亲本抗体的LCDR3序列中具有不超过3、2或1个氨基酸突变。
9.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：
a)至少一个重链CDR序列，其在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
b)至少两个重链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
c)三个重链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
d)至少一个轻链序列，其在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
e)至少两个轻链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代，或
f)三个轻链CDR序列，其各自在表1中所列出的亲本抗体的重链CDR序列中具有不超过3、2或1个氨基酸取代。
10.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为抗体P2B-2F6的变体且包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:41具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:42具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:43具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:44具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:45具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:46具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
其保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2B-2F6的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
11.根据实施例10所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:41中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:42中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:43中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:44中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:45中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:46中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变。
12.根据实施例10或11所述的抗体或其抗原结合片段，其保留抗体P2B-2F6的全部或至少部分互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。
13.根据实施例12所述的抗体或其抗原结合片段，其中抗体P2B-2F6的互补位包括或由以下组成：HCDR1的Y27、S28、S30、S31和Y33；HCDR2的H54；HCDR3的G102、I103、V105、V106和P107；以及LCDR1的G31、Y32和N33，其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:47，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:48。
14.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为抗体P2C-1F11的变体，上述变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:105或436具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:106或436具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:107或438具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:108或439具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:109或440具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:110或441具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
其保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2C-1F11的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
15.根据实施例14所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:105或436中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:106或436中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:107或438中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR1，其在SEQ ID NO:108或439中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:109或440中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQID NO:110或441中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P2C-1F11的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
16.根据实施例14所述的抗体或其抗原结合片段，其保留抗体P2C-1F11的全部或至少部分互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。
17.根据实施例16所述的抗体或其抗原结合片段，其中抗体P2C-1F11的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、I27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；HCDR3的R97、L99、V100、V101、Y102和D105；以及LCDR1的S28、S30和Y33，其中重链中的残基的编号是根据SEQ ID NO:111，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:112。
17-1.根据实施例17所述的抗体或其抗原结合片段，其中抗体P2C-1F11的所保留互补位至少包括抗体P2C-1F11的HCDR2的Y52和LCDR1的Y33。
18.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为抗体P22A-1D1的变体，其中变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:426具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:427具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:428具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:429具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:430具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:431具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P22A-1D1的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
19.根据实施例18所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:426中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:427中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:428中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:429中具有不超过5、4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQID NO:430中具有不超过1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:431中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P22A-1D1的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
20.根据实施例18所述的抗体或其抗原结合片段，其保留抗体P22A-1D1的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。
21.根据实施例20所述的抗体或其抗原结合片段，其中抗体P22A-1D1的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、F27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；重链框架区3的Y58；HCDR3的R97、R99、D100、Y101、Y102和D105；LCDR1的Q27、G28、I29、S30和Y32；LCDR2的S67；和/或LCDR3的H90、L91、N92和Y94；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ IDNO:432，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:433。
22.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为抗体P5A-1D2的变体，其中变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:236具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:237具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:238具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:239具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:240具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:241具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-1D2的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
23.根据实施例22所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:236中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:237中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:238中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:239中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:240中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:241中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-1D2的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
24.根据实施例22所述的抗体或其抗原结合片段，其保留抗体P5A-1D2的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。
25.根据实施例24所述的抗体或其抗原结合片段，其中抗体P5A-1D2的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、F27、I28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；重链框架区3的Y58和R87；HCDR3的R97、L99、Q100、V101、G102、A103、T104和D106；LCDR1的A31和Y33；和/或LCDR3的S95；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:242，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:243。
26.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为抗体P5A-3C8的变体，其中变体包括：
a)重链CDR1(HCDR1)序列，其与SEQ ID NO:226具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
b)重链CDR2(HCDR2)序列，其与SEQ ID NO:227具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
c)重链CDR3(HCDR3)序列，其与SEQ ID NO:228具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
d)轻链CDR1(LCDR1)序列，其与SEQ ID NO:229具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
e)轻链CDR2(LCDR2)序列，其与SEQ ID NO:230具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，和/或
f)轻链CDR3(LCDR3)序列，其与SEQ ID NO:231具有至少80％(例如至少85％、88％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％)序列一致性，且
同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-3C8的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
27.根据实施例26所述的抗体或其抗原结合片段，其包括：HCDR1，其在SEQ ID NO:226中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；HCDR2，其在SEQ ID NO:227中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；HCDR3，其在SEQ ID NO:228中具有不超过6、5、4、3、2或1个氨基酸取代；LCDR1，其在SEQ ID NO:229中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变；LCDR2，其在SEQ ID NO:230中具有不超过3、2或1个氨基酸突变；和/或LCDR3，其在SEQ ID NO:231中具有不超过4、3、2或1个氨基酸突变，且同时保持与SARS-COV-2的结合特异性，任选地在类似于或甚至高于抗体P5A-3C8的水平下对SARS-COV-2具有结合亲和力。
28.根据实施例26所述的抗体或其抗原结合片段，其保留抗体P5A-3C8的全部互补位，同时抗体的互补位外部的氨基酸残基中的一者或多者可经突变。
29.根据实施例28所述的抗体或其抗原结合片段，其中抗体P5A-3C8的互补位包括或由以下组成：HCDR1的G26、F27、T28、S31、N32和Y33；HCDR2的Y52、S53、G54和S56；重链框架区3的Y58；HCDR3的R97、L99、Q100、E101和H102；和LCDR1的G28、I29、S30、S31和Y32；LCDR2的S67；轻链框架区3的G68；LCDR3的H90、L91、N92、S93和Y94；其中重链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:232，且轻链CDR中的残基的编号是根据SEQ ID NO:233。
30.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其进一步包括免疫球蛋白恒定区、任选的人类免疫球蛋白恒定区或任选的人类IgG恒定区。
31.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其进一步包括一个或多个氨基酸残基突变但仍保持与SARS-CoV-2的结合特异性，任选地保持与SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合亲和力。
32.根据实施例31所述的抗体或其抗原结合片段，其为亲和力变体、糖基化变体、半胱氨酸工程化的变体或Fc变体。
33.根据实施例32所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括一个或多个引起相对于野生型Fc增加的效应功能的氨基酸残基修饰或取代。
34.根据实施例33所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括在Fc区的以下位置中的一者或多者处的一个或多个氨基酸取代：234、235、236、238、239、240、241、243、244、245、246、247、248、249、252、254、255、256、258、260、262、263、264、265、267、268、269、270、272、274、276、278、280、283、285、286、289、290、292、293、294、295、296、298、299、300、301、303、304、305、307、309、312、313、315、320、322、324、325、326、327、329、330、331、332、333、334、335、337、338、339、340、345、360、373、376、378、382、388、389、396、398、414、416、419、430、433、434、435、436、437、438、439和440，其中Fc区中的残基的编号为如Kabat中的EU索引的编号。
35.根据实施例34所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：234Y、235Q、236A、236W、239D、239E、239M、243L、247I、267E、268D、268E、268F、270E、280H、290S、292P、298A、298D、298V、300L、305I、324T、326A、326D、326W、330L、330M、333S、332D、332E、298A、333A、334A、334E、339D、339Q、345R、396L、430G、440Y，或其任何组合。
36.根据实施例33所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括一个或多个引起相对于野生型Fc降低的效应功能的氨基酸残基修饰或取代。
37.根据实施例36所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括在Fc区的选自由以下组成的群组的位置处的一个或多个氨基酸取代：220,226,229,233,234,235,236,237,238,267,268,269,270,297,309,318,320,322,325,328,329,330和331，其中Fc区中的残基的编号为如Kabat中的EU索引的编号。
38.根据实施例36所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：220S,226S,228P,229S、233P、234V、234G、234A、234F、234A、235A、235G、235E、236E、236R、237A、237K、238S、267R、268A、268Q、269R、297A、297Q、297G、309L、318A、322A、325L、328R、330S、331S，和其任何组合。
39.根据实施例33所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括一个或多个氨基酸残基修饰或取代，其引起血清半衰期改善或在pH 6.0下与新生儿Fc受体(FcRn)的结合亲和力改善，同时在pH 7.4下保持最小结合。
40.根据实施例39所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括选自由以下组成的群组的位置处的一个或多个氨基酸取代：234、235、238、250、252、254、256、259、272、305、307、308、311、312、322、328、331、378、380、382、428、432、433、434、435、436和437(所有位置通过EU编号)。
41.根据实施例40所述的抗体或其抗原结合片段，其中Fc变体包括一个或多个选自由以下组成的群组的氨基酸取代：234F、235Q、238D、250Q、252T、252Y、254T、256E、259I、272A、305A、307A、308F、311A、322Q、328E、331S、380A、428L、432C、433K、433S、434S、434Y、434F、434W、434A、435H、436L、437C，和其任何组合。
42.根据实施例31所述的抗体或其抗原结合片段，其中上述取代或修饰中的至少一者处于CDR序列中的一者或多者中，和/或处于重链可变区或轻链可变区的非CDR序列中的一者或多者中。
43.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其为单克隆抗体、双特异性抗体、多特异性抗体、重组抗体、嵌合抗体、经标记抗体、二价抗体、抗个体基因型抗体、融合蛋白、二聚抗体或聚合抗体，或经修饰抗体(例如，糖基化抗体)。
44.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其为双功能抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫键稳定的双功能抗体(ds diabody)、单链抗体分子(scFv)、scFv二聚体(二价双功能抗体)、双特异性scFv二聚体、多特异性抗体、重链抗体、骆驼化单域抗体、纳米抗体、域抗体或二价域抗体。
45.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其为双特异性的且包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一抗原结合域和第二抗原结合域源自任何两种选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1。
46.根据实施例45所述的抗体或其抗原结合片段，其中第一抗原结合域和第二抗原结合域：
a)分别源自P2C-1F11和P2B-2F6；
b)分别源自P2C-1F11和P2A-1A8；
c)分别源自P2C-1F11和P2A-1A9；
d)分别源自P2C-1F11和P2B-2G11；
e)分别源自P2C-1F11和P2A-1A10；
f)分别源自P2C-1F11和P2A-1B3；
g)分别源自P2C-1F11和P2B-2G4；
h)分别源自P2C-1F11和P2C-1A3；
i)分别源自P2C-1F11和P2C-1C8；
j)分别源自P2C-1F11和P2C-1C10；
k)分别源自P2C-1F11和P2C-1D5；
l)分别源自P2A-1A8和P2A-1A9；
m)分别源自P2A-1A8和P2B-2G11；
n)分别源自P2A-1A8和P2A-1A10；
o)分别源自P2A-1A8和P2A-1B3；
p)分别源自P2A-1A8和P2B-2F6；
q)分别源自P2A-1A8和P2B-2G4；
r)分别源自P2A-1A8和P2C-1A3；
s)分别源自P2A-1A8和P2C-1C8；
t)分别源自P2A-1A8和P2C-1C10；
u)分别源自P2A-1A8和P2C-1D5；
v)分别源自P2A-1A9和2B-2G11；
w)分别源自P2A-1A9和P2A-1A10；
x)分别源自P2A-1A9和P2A-1B3；
y)分别源自P2A-1A9和P2B-2F6；
z)分别源自P2A-1A9和P2B-2G4；
aa)分别源自P2A-1A9和P2C-1A3；
bb)分别源自P2A-1A9和P2C-1C8；
cc)分别源自P2A-1A9和P2C-1C10；
dd)分别源自P2A-1A9和P2C-1D5；
ee)分别源自P2B-2G11和P2A-1A10；
ff)分别源自P2B-2G11和P2A-1B3；
gg)分别源自P2B-2G11和P2B-2F6；
hh)分别源自P2B-2G11和P2B-2G4；
ii)分别源自P2B-2G11和P2C-1A3；
jj)分别源自P2B-2G11和P2C-1C8；
kk)分别源自P2B-2G11和P2C-1C10；
ll)分别源自P2B-2G11和P2C-1D5；
mm)分别源自P2A-1A10和P2A-1B3；
nn)分别源自P2A-1A10和P2B-2F6；
oo)分别源自P2A-1A10和P2B-2G4；
pp)分别源自P2A-1A10和P2C-1A3；
qq)分别源自P2A-1A10和P2C-1C8；
rr)分别源自P2A-1A10和P2C-1C10；
ss)分别源自P2A-1A10和P2C-1D5；
tt)分别源自P2A-1B3和P2B-2F6；
uu)分别源自P2A-1B3和P2B-2G4；
vv)分别源自P2A-1B3和P2C-1A3；
ww)分别源自P2A-1B3和P2C-1C8；
xx)分别源自P2A-1B3和P2C-1C10；
yy)分别源自P2A-1B3和P2C-1D5；
zz)分别源自P2B-2F6和P2B-2G4；
aaa)分别源自P2B-2F6和P2C-1A3；
bbb)分别源自P2B-2F6和P2C-1C8；
ccc)分别源自P2B-2F6和P2C-1C10；
ddd)分别源自P2B-2F6和P2C-1D5；
eee)分别源自P2B-2G4和P2C-1A3；
fff)分别源自P2B-2G4和P2C-1C8；
ggg)分别源自P2B-2G4和P2C-1C10；
hhh)分别源自P2B-2G4和P2C-1D5；
iii)分别源自P2C-1A3和P2C-1C8；
jjj)分别源自P2C-1A3和P2C-1C10；
kkk)分别源自P2C-1A3和P2C-1D5；
lll)分别源自P2C-1C8和P2C-1C10；
mmm)分别源自P2C-1C8和P2C-1D5；或
nnn)分别源自P2C-1C10和P2C-1D5。
47.根据实施例1或2所述的抗体或其抗原结合片段，其为双特异性的且包括第一抗原结合域和第二抗原结合域，其中第一抗原结合域和第二抗原结合域源自任何两种选自由以下组成的群组的单克隆抗体：P2C-1F11、P2B-2F6、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1，或其变体。
48.根据实施例47所述的抗体或其抗原结合片段，其中第一抗原结合域和第二抗原结合域：
a)分别源自P2C-1F11(或其变体)和P2B-1G5(或其变体)；
b)分别源自P2C-1F11和P2B-1A1；
c)分别源自P2C-1F11和P2C-1D7；
d)分别源自P2C-1F11和P2B-1A10；
e)分别源自P2C-1F11和P2B-1D9；
f)分别源自P2C-1F11和P2B-1E4；
g)分别源自P2C-1F11和P2B-1G1；
h)分别源自P2C-1F11和P4A-2D9；
i)分别源自P2C-1F11和P5A-2G7；
j)分别源自P2C-1F11和P5A-3C8；
k)分别源自P2C-1F11和P5A-1D2；
l)分别源自P2C-1F11和P5A-2F11；
m)分别源自P2C-1F11和P5A-2E1；
n)分别源自P2C-1F11和P5A-1C8；
o)分别源自P2B-2F6和P2B-1G5；
p)分别源自P2B-2F6和P2B-1A1；
q)分别源自P2B-2F6和P2C-1D7；
r)分别源自P2B-2F6和P2B-1A10；
s)分别源自P2B-2F6和P2B-1D9；
t)分别源自P2B-2F6和P2B-1E4；
u)分别源自P2B-2F6和P2B-1G1；
v)分别源自P2B-2F6和P4A-2D9；
w)分别源自P2B-2F6和P5A-2G7；
x)分别源自P2B-2F6和P5A-3C8；
y)分别源自P2B-2F6和P5A-1D2；
z)分别源自P2B-2F6和P5A-2F11；
aa)分别源自P2B-2F6和P5A-2E1；
bb)分别源自P2B-2F6和P5A-1C8；
cc)分别源自P2B-1G5和P2B-1A1；
dd)分别源自P2B-1G5和P2C-1D7；
ee)分别源自P2B-1G5和P2B-1A10；
ff)分别源自P2B-1G5和P2B-1D9；
gg)分别源自P2B-1G5和P2B-1E4；
hh)分别源自P2B-1G5和P2B-1G1；
ii)分别源自P2B-1G5和P4A-2D9；
jj)分别源自P2B-1G5和P5A-2G7；
kk)分别源自P2B-1G5和P5A-3C8；
ll)分别源自P2B-1G5和P5A-1D2；
mm)分别源自P2B-1G5和P5A-2F11；
nn)分别源自P2B-1G5和P5A-2E1；
oo)分别源自P2B-1G5和P5A-1C8；
pp)分别源自P2B-1A1和P2C-1D7；
qq)分别源自P2B-1A1和P2B-1A10；
rr)分别源自P2B-1A1和P2B-1D9；
ss)分别源自P2B-1A1和P2B-1E4；
tt)分别源自P2B-1A1和P2B-1G1；
uu)分别源自P2B-1A1和P4A-2D9；
vv)分别源自P2B-1A1和P5A-2G7；
ww)分别源自P2B-1A1和P5A-3C8；
xx)分别源自P2B-1A1和P5A-1D2；
yy)分别源自P2B-1A1和P5A-2F11；
zz)分别源自P2B-1A15和P5A-2E1；
aaa)分别源自P2B-1A1和P5A-1C8；
bbb)分别源自P2C-1D7和P2B-1A10；
ccc)分别源自P2C-1D7和P2B-1D9；
ddd)分别源自P2C-1D7和P2B-1E4；
eee)分别源自P2C-1D7和P2B-1G1；
fff)分别源自P2C-1D7和P4A-2D9；
ggg)分别源自P2C-1D7和P5A-2G7；
hhh)分别源自P2C-1D7和P5A-3C8；
iii)分别源自P2C-1D7和P5A-1D2；
jjj)分别源自P2C-1D7和P5A-2F11；
kkk)分别源自P2B-1A15和P5A-2E1；
lll)分别源自P2B-1A1和P5A-1C8；
mmm)分别源自P2B-1A10和P2B-1D9；
nnn)分别源自P2B-1A10和P2B-1E4；
ooo)分别源自P2B-1A10和P2B-1G1；
ppp)分别源自P2B-1A10和P4A-2D9；
qqq)分别源自P2B-1A10和P5A-2G7；
rrr)分别源自P2B-1A10和P5A-3C8；
sss)分别源自P2B-1A10和P5A-1D2；
ttt)分别源自P2B-1A10和P5A-2F11；
uuu)分别源自P2B-1A10和P5A-2E1；
vvv)分别源自P2B-1A10和P5A-1C8；
www)分别源自P2B-1D9和P2B-1E4；
xxx)分别源自P2B-1D9和P2B-1G1；
yyy)分别源自P2B-1D9和P4A-2D9；
zzz)分别源自P2B-1D9和P5A-2G7；
aaaa)分别源自P2B-1D9和P5A-3C8；
bbbb)分别源自P2B-1D9和P5A-1D2；
cccc)分别源自P2B-1D9和P5A-2F11；
dddd)分别源自P2B-1D9和P5A-2E1；
eeee)分别源自P2B-1D9和P5A-1C8；
ffff)分别源自P2B-1E4和P2B-1G1；
gggg)分别源自P2B-1E4和P4A-2D9；
hhhh)分别源自P2B-1E4和P5A-2G7；
iiii)分别源自P2B-1E4和P5A-3C8；
jjjj)分别源自P2B-1E4和P5A-1D2；
kkkk)分别源自P2B-1E4和P5A-2F11；
llll)分别源自P2B-1E4和P5A-2E1；
mmmm)分别源自P2B-1E4和P5A-1C8；
nnnn)分别源自P2B-1G1和P4A-2D9；
oooo)分别源自P2B-1G1和P5A-2G7；
pppp)分别源自P2B-1G1和P5A-3C8；
qqqq)分别源自P2B-1G1和P5A-1D2；
rrrr)分别源自P2B-1G1和P5A-2F11；
ssss)分别源自P2B-1G1和P5A-2E1；
tttt)分别源自P2B-1G1和P5A-1C8；
uuuu)分别源自P4A-2D9和P5A-2G7；
vvvv)分别源自P4A-2D9和P5A-3C8；
wwww)分别源自P4A-2D9和P5A-1D2；
xxxx)分别源自P4A-2D9和P5A-2F11；
yyyy)分别源自P4A-2D9和P5A-2E1；
zzzz)分别源自P4A-2D9和P5A-1C8；
aaaaa)分别源自P5A-2G7和P5A-3C8；
bbbbb)分别源自P5A-2G7和P5A-1D2；
ccccc)分别源自P5A-2G7和P5A-2F11；
ddddd)分别源自P5A-2G7和P5A-2E1；
eeeee)分别源自P5A-2G7和P5A-1C8；
fffff)分别源自P5A-3C8和P5A-1D2；
ggggg)分别源自P5A-3C8和P5A-2F11；
hhhhh)分别源自P5A-3C8和P5A-2E1；
iiiii)分别源自P5A-3C8和P5A-1C8；
jjjjj)分别源自P5A-1D2和P5A-2F11；
kkkkk)分别源自P5A-1D2和P5A-2E1；
lllll)分别源自P5A-1D2和P5A-1C8；
mmmmm)分别源自P5A-2F11和P5A-2E1；
nnnnn)分别源自P5A-2F11和P5A-1C8；
ooooo)分别源自P5A-2E1和P5A-1C8。
49.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其为完全人类抗体。
50.根据前述实施例中任一项所述的抗体或其抗原结合片段，其连接到一个或多个缀合物部分。
51.根据实施例50所述的抗体或其抗原结合片段，其中缀合物部分包括治疗剂、放射性同位素、可检测标记、药物动力学修饰部分或纯化部分，且任选地缀合物部分直接或经由连接子共价连接。
52.一种抗体或其抗原结合片段，其与根据实施例1至44中任一项所述的抗体或其抗原结合片段竞争结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD。
53.一种经分离多核苷酸，其编码根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段。
54.根据实施例53所述的经分离多核苷酸，其包括选自由以下组成的群组的核苷酸序列：SEQ ID NO：9-10,19-20,29-30,39-40,49-50,59-60,63-64,73-74,83-84,93-94,103-104,113-114,144-145,154-155,164-165,174-175,184-185,194-195,204-205,214-215,224-225,234-235,244-245,254-255,264-265,274-275,284-285,294-295,304-305,314-315,324-325,334-335,344-345,354-355,364-365,374-375,384-385,394-395,404-405,414-415,424-425和434-435，或与其具有至少80％序列一致性的同源序列。
55.根据实施例54所述的经分离多核苷酸，其中上述同源物序列编码与由选自由以下组成的群组的任何核苷酸序列编码相同的蛋白质：SEQ ID NO：9-10、19-20、29-30、39-40、49-50、59-60、63-64、73-74、83-84、93-94、103-104、113-114、144-145、154-155、164-165、174-175、184-185、194-195、204-205、214-215、224-225、234-235、244-245、254-255、264-265、274-275、284-285、294-295、304-305、314-315、324-325、334-335、344-345、354-355、364-365、374-375、384-385、394-395、404-405、414-415、424-425和434-435。
56.一种载体，其包括根据实施例53至55中任一项所述的经分离多核苷酸，任选地上述载体为表达载体。
57.一种宿主细胞，其包括根据实施例56所述的载体。
58.一种药物组合物，其包括根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段和药学上可接受的载剂，或包括根据权利要求书53所述的多核苷酸和药学上可接受的载剂。
59.根据实施例58所述的药物组合物，其包括两种或更多种根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段和药学上可接受的载剂的组合。
60.根据实施例59所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体或其抗原结合片段结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD中的不同抗原表位。
61.根据实施例60所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体包括第一抗体和选自由以下组成的群组的第二抗体：P2A-1A8、P2A-1A9、P2B-2G11、P2A-1A10、P2A-1B3、P2B-2F6、P2B-2G4、P2C-1A3、P2C-1C8、P2C-1C10、P2C-1D5、P2C-1F11、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1、P5A-1C8、P1A-1C10、P4A-1H6、P4B-1F4、P5A-1B6、P5A-1B8、P5A-1B9、P5A-1D1、P5A-1D10、P5A-2D11、P5A-2G9、P5A-2H3、P5A-3A1、P5A-3A6、P5A-3B4、P5A-3C12和P22A-1D1，或其抗原结合片段。
62.根据实施例60所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体包括第一抗体和选自由以下组成的群组的第二抗体：P2C-1F11、P2B-2F6、P2B-1G5、P2B-1A1、P2C-1D7、P2B-1A10、P2B-1D9、P2B-1E4、P2B-1G1、P4A-2D9、P5A-2G7、P5A-3C8、P5A-1D2、P5A-2F11、P5A-2E1和P5A-1C8，或其抗原结合片段。
63.根据实施例60所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1F11或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1A3、P2C-1C10、P2B-2F6、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段，任选地上述药物组合物包括：第一抗体，其包括源自P2C-1F11的重链CDR序列和轻链CDR序列；和第二抗体，其包括源自抗体P2B-2F6的重链CDR序列和轻链CDR序列。
64.根据实施例60所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2C-1A3或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1F11和P2A-1B3，或其抗原结合片段。
65.根据实施例60所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2B-2F6或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-1G5和P2A-1B3，或其抗原结合片段。
66.根据实施例60所述的药物组合物，其中两种或更多种抗体包括：第一抗体，其包括P2A-1B3或其抗原结合片段；和第二抗体，其选自由以下组成的群组：P2C-1A3、P2C-1C10、P2C-1F11、P2B-2F6和P2A-1A10，或其抗原结合片段。
67.一种产生根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段的方法，其包括在表达根据实施例56所述的载体的条件下培养根据实施例57所述的宿主细胞。
68.根据实施例67所述的方法，其进一步包括纯化由宿主细胞产生的抗体。
69.一种用于检测SARS-CoV-2抗原的试剂盒，其包括根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段。
70.根据实施例69所述的试剂盒，其进一步包括含有SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的对照试剂，任选地上述试剂盒进一步包括一组用于检测抗体或抗原结合片段与SARS-CoV-2抗原结合的复合物的试剂。
71.一种治疗个体的SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法，其包括向个体施用治疗有效量的根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者，或根据实施例53至55中任一项所述的多核苷酸中的一者或多者，或根据实施例56所述的载体中的一者或多者，或根据实施例58至66中任一项所述的药物组合物。
72.一种预防个体的SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的方法，其包括向个体施用治疗有效量的根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者，或根据实施例53至55中任一项所述的多核苷酸中的一者或多者，或根据实施例56所述的载体中的一者或多者，或根据实施例58至66中任一项所述的药物组合物。
73.根据实施例71或72所述的方法，其中施用是经由经口、经鼻、静脉内、皮下或肌肉内施用。
74.根据实施例73所述的方法，其中个体为人类。
75.根据实施例71至74中任一项所述的方法，其进一步包括施用治疗有效量的第二生物活性剂，任选地上述第二生物活性剂为治疗剂或预防剂。
76.根据实施例75所述的方法，其中治疗剂为抗病毒剂，任选地上述抗病毒剂包括抗病毒肽、抗病毒抗体、抗病毒化合物、抗病毒细胞因子或抗病毒寡核苷酸。
77.一种检测样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量的方法，其包括使样本与根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者接触，和测定样本中SARS-CoV-2病毒抗原的存在或量。
78.一种根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者在制造用于治疗SARS-CoV-2感染或与SARs-CoV-2感染相关的疾病、病症或病状的药物中的用途。
79.一种根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者在制造用于检测SARS-CoV-2感染的诊断试剂中的用途。
80.一种用于检测能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)的抗体的试剂盒，其包括含有氨基酸序列的多肽，上述氨基酸序列包括SEQ ID NO:128。
81.根据实施例80所述的试剂盒，其中多肽固定在基质上。
82.根据实施例81所述的试剂盒，其进一步包括一组用于检测抗体与多肽结合的复合物的试剂。
83.一种检测样本中能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的抗体的存在或量的方法，其包括使样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的多肽接触，和测定样本中抗体的存在或含量。
84.根据实施例83所述的方法，其中样本中不存在抗体或样本中抗体的含量低于阈值指示个体更可能遭受疾病进展。
85.一种确定感染有SARS-CoV-2的个体的疾病进展可能性的方法，上述方法包括：使从个体获得的样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的多肽接触，和检测样本中抗体的存在或含量，其中抗体能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD，
其中当样本中的抗体不存在或低于阈值时，个体可能经历疾病进展。
86.一种监测感染有SARS-CoV-2且接受治疗的个体的治疗反应的方法，上述方法包括：
(i)使来自个体的样本与包括含有SEQ ID NO:128的氨基酸序列的肽接触；
(ii)检测样本中抗体的第一含量，其中抗体能够特异性结合到SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD；和
(iii)比较抗体的第一含量与在治疗之前个体中所检测的抗体的第二含量；
其中第一含量高于第二含量指示个体对上述治疗有反应。
87.一种中和个体中或活体外样本中的SARS-CoV-2的方法，其包括向个体或样本施用治疗有效量的根据实施例1至52中任一项所述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者，或根据实施例58至66中任一项所述的药物组合物。
88.一种SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗体复合的晶体。
89.根据实施例88所述的晶体，上述晶体具有P212121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100002131
且
Figure BDA0003707502100002132
上述晶体具有C121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100002133
且
Figure BDA0003707502100002134
上述晶体具有C2空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100002135
且
Figure BDA0003707502100002136
上述晶体具有C2空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100002137
且
Figure BDA0003707502100002138
或上述晶体具有P212121空间群或由其组成，其中单位晶胞尺寸为
Figure BDA0003707502100002139
且
Figure BDA00037075021000021310
Figure BDA00037075021000021311
90.根据实施例88所述的晶体，其中抗体包括SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQID NO:48的轻链可变区。
91.根据实施例88所述的晶体，其中抗体包括SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQID NO:112的轻链可变区。
92.根据实施例88所述的晶体，其中抗体包括SEQ ID NO:432的重链可变区和SEQID NO:433的轻链可变区。
93.根据实施例88所述的晶体，其中抗体包括SEQ ID NO:242的重链可变区和SEQID NO:243的轻链可变区。
94.根据实施例88所述的晶体，其中抗体包括SEQ ID NO:232的重链可变区和SEQID NO:233的轻链可变区。
95.一种用于引起SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的晶体的一部分的结构的图形三维表示展示的计算机实施方法，其中上述方法包括：
通过用指令编程的计算机系统引起上述图形三维表示的上述展示，上述指令用于将结构坐标转换成上述结构的上述图形三维表示且展示上述图形三维表示，
其中上述图形三维表示是通过将上述结构坐标转换成上述结构的上述图形三维表示而产生，
其中上述结构坐标包括上述晶体的上述部分的主链原子的结构坐标，
其中上述晶体的上述部分包括RBD结合位点，且
其中上述晶体具有空间群对称性P212121或C121。
96.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中RBD包括如SEQ ID NO:124中所示的氨基酸序列，且抗体包括：a)SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区；或b)SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ ID NO:112的轻链可变区；或c)SEQ ID NO:432的重链可变区和SEQ ID NO:433的轻链可变区；或d)SEQ ID NO:242的重链可变区和SEQ IDNO:243的轻链可变区；或e)SEQ ID NO:232的重链可变区和SEQ ID NO:233的轻链可变区。
97.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的K444、G446、G447、N448、Y449、N450、L452、V483、E484、G485、F490和/或S494，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。
98.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的Y453、L455、F456、R457、K458、S459、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489、Q493、G502、Y505、R403、T415、G416、K417、D420和/或Y421，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。
99.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：RBD的T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和/或Q493，其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。
100.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中结构坐标包括对应于以下的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、N487、Y489、Q493和/或Y505，其中残基编号是根据SEQID NO:134。
101.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中结构坐标包括对应于以下RBD的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：T415、G416、K417、D420、Y421、Y453、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和/或Q493，其中残基编号是根据SEQID NO:134。
102.根据实施例95所述的计算机实施方法，其中结构坐标包括对应于以下RBD的氨基酸残基的主链原子的结构坐标：T415、G416、K417、D420、Y421、L455、F456、R457、K458、N460、Y473、Q474、A475、G476、S477、F486、N487、Y489和/或Q493，其中残基编号是根据SEQID NO:134。
103.一种机器可读数据存储媒体，其包括用机器可读指令编码的数据存储材料，上述机器可读指令用于：
(a)将数据转换成SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的晶体的一部分的结构的图形三维表示；和
(b)引起上述图形三维表示的展示；
其中上述数据包括界定RBD结合位点的氨基酸的主链原子的结构坐标；且其中晶体或结构同源物具有空间群对称性P212121或C121。
104.一种筛选可为SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD的结合分子的分子的方法，其包括：
(a)针对三维模型以计算方式筛选媒介物以鉴定RBD的潜在结合分子；
其中三维模型包括SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗SARS-CoV-2或其抗原结合片段复合的晶体的至少一部分的三维模型；
其中三维模型是通过用于产生适用于鉴定媒介物的晶体的三维模型的计算机算法由晶体的结构坐标的至少一部分生成，上述媒介物为RBD的潜在结合分子；
其中晶体包括含有氨基酸序列SEQ ID NO:124的多肽，且进一步包括抗体，上述抗体包括：a)SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区，或b)SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ ID NO:112的轻链可变区；且
其中晶体使x射线衍射以确定原子坐标为
Figure BDA0003707502100002161
或更佳的分辨率。
105.一种用于获得关于分子或分子复合物的结构信息的方法，其包括将SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD与抗SARS-CoV-2抗体或其抗原结合片段复合的结构坐标的至少一部分应用于分子或分子复合物的晶体结构的X射线衍射图，以使得产生分子或分子复合物的至少一部分的三维电子密度图；
其中晶体包括含有氨基酸序列SEQ ID NO:124的多肽，且进一步包括抗体，上述抗体包括：a)SEQ ID NO:47的重链可变区和SEQ ID NO:48的轻链可变区，或b)SEQ ID NO:111的重链可变区和SEQ ID NO:112的轻链可变区，
其中晶体使x射线衍射以确定原子坐标为
Figure BDA0003707502100002162
或更佳的分辨率。
106.一种包括经修饰抗体或其抗原结合片段和一种或多种药学上可接受的载剂的组合物用于制造治疗或预防疾病的药物的用途，其中组合物包括上述经修饰抗体或其上述抗原结合片段，上述经修饰抗体或其抗原结合片段包括至少一种具有抗原结合亲和力的抗原结合域和共价连接的经修饰人类IgG恒定域，其中上述抗原结合亲和力包括SARS-CoV-2结合亲和力，相较于上述SARS-CoV-2结合亲和力，上述抗原结合亲和力包括比SARS-CoV或MERS-CoV低至少50％的结合亲和力或包括不可检测的结合亲和力，且其中上述经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，上述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号，相较于具有野生型人类IgG恒定域的抗体对FcRn的亲和力，上述经修饰抗体对FcRn的亲和力增加，且其中上述疾病由上述SARS-CoV-2所引起或与上述个体的上述SARS-CoV-2的感染有关。
107.根据实施例106所述的用途，其中上述个体为患有由SARS-CoV-2感染所引起的COVID-19有症状的非住院成年人，为60岁和更年长，为具有选自以下条件中的至少一者的任何年龄的人：抽烟；具有患有其中CD4计数<200个细胞/mm3的HIV感染的外源性或内源性免疫抑止；在治疗之前的30天内每日接受等效于泼尼松的皮质类固醇≥20mg持续至少14个连续日；在治疗之前的90天内用一种或多种生物制剂治疗剂、一种或多种免疫调节剂、癌症化学疗法治疗；患有慢性肺疾病，慢性哮喘；身体质量指数[BMI]>35的肥胖症；选自以下的COVID-19症状：发热、咳嗽、喉咙痛、不适、头痛、肌肉痛、恶心、呕吐、腹泻、味觉和嗅觉的丧失或其组合；具有呼吸短促、呼吸困难或异常胸部成像，具有临床评估或成像期间的下部呼吸道疾病的证据；具有在海平面的室内空气中≥94％的血氧饱和度(SpO2)；具有上述SARS-CoV-2的感染的严重症状，具有在海平面的室内空气中<94％的SpO2，具有<300mmHg的氧气动脉分压与吸入氧气分数的比率(PaO2/FiO2)、每分钟>30次呼吸的呼吸道频率、>50％的肺浸润；抗体依赖性增强(ADE)的活性症状；抗体依赖性增强(ADE)的病史；对抗体治疗过敏；为需要支持管理选自肺炎的上述SARS-CoV-2的严重感染的并发症的医院住院病人；具有低氧血症型呼吸衰竭/ARDS、败血症和败血性休克、心肌病和心律不整、急性肾损伤和来自长期住院的并发症，包括继发性细菌和真菌感染、血栓栓塞、胃肠道出血、危重病多发性神经病/肌病；或其组合。
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Figure BDA0003707502100002261
表6.来自2号患者的12种抗体的中和活性
Figure BDA0003707502100002271
Figure BDA0003707502100002281
Figure BDA0003707502100002291
*IC50<50μg/ml的抗体被定义为特异性中和抗体。
表7a
Figure BDA0003707502100002301
表7b
抗体 IC<sub>50</sub>(μg/ml)
P5A-2G7 0.016
P5A-3C8 0.024
P5A-1D2 0.035
P2B-1G1 4.224
P5A-1C8 0.434
P5A-2F11 0.633
P5A-2E1 6.972
P2B-1A1 0.687
P2C-1D7 0.212
P2B-1A10 0.349
P2B-1D9 3.121
P2B-1E4 5.963
P4A-2D9 1.543
表7c.假病毒中和
Figure BDA0003707502100002302
表7d.选中的165种抗体的IC50在0.1μg/ml和50μg/ml之间，甚至更高
Figure BDA0003707502100002311
Figure BDA0003707502100002321
Figure BDA0003707502100002331
Figure BDA0003707502100002341
表8.通过与SARS-CoV-2 RBD竞争性结合的单克隆抗体表位图谱
Figure BDA0003707502100002351
n.a.:不适用
表9a.单克隆抗体的基因家族分析
Figure BDA0003707502100002361
Figure BDA0003707502100002371
Figure BDA0003707502100002381
使用IMGT/V-QUEST程序分析基因种系、互补决定区(CDR)3长度和体细胞超突变(SHM)。CDR3的长度是由氨基酸序列计算的。SHM的频率是由突变的核苷酸计算出来的。
Figure BDA0003707502100002391
表10a.数据集合和细化统计(分子替代)
Figure BDA0003707502100002401
*每个结构的外部晶振(xtal)数量应在脚注中注明。*括号内的数值是最高分辨率的外壳的数值。
表10b.数据集合和细化统计(分子替代)
Figure BDA0003707502100002411
*每个结构的外部晶振(xtal)数量应在脚注中注明。*括号内的数值是最高分辨率的外壳的数值。
表10c.数据集合和细化统计(分子替代)
Figure BDA0003707502100002421
*一个晶体的数据
*括号内的数值是最高分辨率的外壳的数值。
表11.本申请中提到或使用的所有序列
Figure BDA0003707502100002431
Figure BDA0003707502100002441
Figure BDA0003707502100002451
Figure BDA0003707502100002461
Figure BDA0003707502100002471
Figure BDA0003707502100002481
Figure BDA0003707502100002491
Figure BDA0003707502100002501
Figure BDA0003707502100002511
Figure BDA0003707502100002521
Figure BDA0003707502100002531
Figure BDA0003707502100002541
Figure BDA0003707502100002551
Figure BDA0003707502100002561
Figure BDA0003707502100002571
Figure BDA0003707502100002581
Figure BDA0003707502100002591
Figure BDA0003707502100002601
Figure BDA0003707502100002611
Figure BDA0003707502100002621
Figure BDA0003707502100002631
Figure BDA0003707502100002641
Figure BDA0003707502100002651
Figure BDA0003707502100002661
Figure BDA0003707502100002671
Figure BDA0003707502100002681
Figure BDA0003707502100002691
Figure BDA0003707502100002701
Figure BDA0003707502100002711
Figure BDA0003707502100002721
Figure BDA0003707502100002731
Figure BDA0003707502100002741
Figure BDA0003707502100002751
表11.本申请中提到或使用的所有序列
Figure BDA0003707502100002761
序列表
<110> 腾盛华创医药技术（北京）有限公司（TSB THERAPEUTICS (BEIJING) CO. LTD.）
<120> 抗SARS-COV-2抗体和其用途
<130> 072106-8001CN01
<160> 449
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 1
Gly Phe Ala Phe Asp Asp Tyr Ala
1 5
<210> 2
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 2
Ser Thr Trp Asn Ser Gly Thr Ile
1 5
<210> 3
<211> 23
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 HCDR3
<222> (1)..(23)
<400> 3
Ala Lys Leu Gly Gly Tyr Ser Asp Tyr Asp Tyr Pro Arg Pro Gly Asp
1 5 10 15
His Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
20
<210> 4
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 4
Ser Ser Asp Val Gly Ser Tyr Asn Leu
1 5
<210> 5
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 5
Asp Val Asn Xaa
1
<210> 6
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 6
Arg Ser Tyr Thr Asp Ser Asn Thr Tyr Val
1 5 10
<210> 7
<211> 130
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 VH
<222> (1)..(130)
<400> 7
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Asp Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ala Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ser Thr Trp Asn Ser Gly Thr Ile Ala Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Lys Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Thr Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Gly Gly Tyr Ser Asp Tyr Asp Tyr Pro Arg Pro Gly Asp
100 105 110
His Tyr Tyr Gly Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val
115 120 125
Ser Ser
130
<210> 8
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 VL
<222> (1)..(110)
<400> 8
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Ser Tyr
20 25 30
Asn Leu Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Val Pro Lys Leu
35 40 45
Leu Ile Tyr Asp Val Asn Lys Arg Pro Ser Gly Ile Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Arg Ser Tyr Thr Asp Ser
85 90 95
Asn Thr Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
100 105 110
<210> 9
<211> 390
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 VHnu
<222> (1)..(390)
<400> 9
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggagac ttggtacagc ctggcaggtc cctgagactc 60
tcctgcgcag cctctggatt cgcctttgat gattatgcca tgcactgggt ccggcaagct 120
ccagggaagg gcctggagtg ggtctcaggt agtacttgga atagtgggac catagcctat 180
gcggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa gtccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag aactgaggac acggccttat attactgtgc aaagttgggg 300
ggctacagtg actacgatta cccgaggccg ggagaccact attacggttt ggacgtctgg 360
ggccaaggga ccacggtcac cgtctcctca 390
<210> 10
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A8 VLnu
<222> (1)..(330)
<400> 10
cagtctgccc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgatgttggg agttataacc ttgtctcctg gtaccaacag 120
cacccaggca aagtccccaa actcttgatt tatgatgtca ataagcggcc ctcagggatt 180
tccaatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg acgaggctga ttattactgc agatcatata cagacagcaa cacttatgtc 300
ttcggaactg ggaccaaggt caccgtccta 330
<210> 11
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9/P2B-2G11 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 11
Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr Ala
1 5
<210> 12
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9/P2B-2G11 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 12
Ile Ser Trp Asn Gly Gly Ile Ile
1 5
<210> 13
<211> 17
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9/P2B-2G11 HCDR3
<222> (1)..(17)
<400> 13
Ala Lys Val Ala Gly Arg Gly Asp Tyr Asp Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp
1 5 10 15
Val
<210> 14
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9/P2B-2G11 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 14
Ser Ser Asn Ile Gly Ala Gly Tyr Asp
1 5
<210> 15
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9/P2B-2G11 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 15
Gly Asn Asn Xaa
1
<210> 16
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9/P2B-2G11 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 16
Gln Ser Tyr Asp Ser Ser Leu Ser Gly Ser Val
1 5 10
<210> 17
<211> 124
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9 VH
<222> (1)..(124)
<400> 17
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Val Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Asn Gly Gly Ile Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Thr Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Ala Gly Arg Gly Asp Tyr Asp Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 18
<211> 111
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9 VL
<222> (1)..(111)
<400> 18
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Gly Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Gly
20 25 30
Tyr Asp Val His Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Leu Ile Tyr Gly Asn Asn Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Thr Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Ser Tyr Asp Ser Ser
85 90 95
Leu Ser Gly Ser Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 19
<211> 372
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9 VHnu
<222> (1)..(372)
<400> 19
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggcaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatgcca tgcactgggt ccggcaagtt 120
ccagggaagg gcctggagtg ggtctcaggt attagttgga atggtggtat cataggctac 180
gcggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagac ttccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agctgaggac acggccttgt attactgtgc aaaagtcgcg 300
ggaagggggg attacgacta ttactatggt atggacgtct ggggccaagg gaccacggtc 360
accgtctcct ca 372
<210> 20
<211> 333
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A9 VLnu
<222> (1)..(333)
<400> 20
cagtctgtgc tgacgcagcc gccctcagtg tctggggccc cagggcagag ggtcaccatc 60
tcctgcactg ggagcagctc caacatcggg gcaggttatg atgtacactg gtaccagcaa 120
cttccaggaa cagcccccaa actcctcatc tatggtaaca acaatcgccc ctcaggggtc 180
cctgaccgat tctctggctc caagtctggc acctcagcct ccctggccat cactgggctc 240
caggctgagg atgaggctga ttattactgc cagtcctatg acagcagcct gagtggttcg 300
gtattcggcg gagggaccaa gctgaccgtc cta 333
<210> 21
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 21
Gly Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr Tyr
1 5
<210> 22
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 22
Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr
1 5
<210> 23
<211> 19
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 HCDR3
<222> (1)..(19)
<400> 23
Ala Arg Val Pro Tyr Cys Ser Ser Thr Ser Cys His Arg Asp Trp Tyr
1 5 10 15
Phe Asp Leu
<210> 24
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 LCDR1
<222> (1)..(12)
<400> 24
Gln Ser Leu Leu Asp Ser Asp Asp Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 25
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 25
Thr Leu Ser Xaa
1
<210> 26
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 26
Met Gln Arg Ile Glu Phe Pro Leu Thr
1 5
<210> 27
<211> 126
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 VH
<222> (1)..(126)
<400> 27
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Arg Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Val Pro Tyr Cys Ser Ser Thr Ser Cys His Arg Asp Trp Tyr
100 105 110
Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 28
<211> 113
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 VL
<222> (1)..(113)
<400> 28
Asp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Asp Ser
20 25 30
Asp Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Leu Ser Tyr Arg Ala Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys
65 70 75 80
Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln
85 90 95
Arg Ile Glu Phe Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 29
<211> 378
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 VHnu
<222> (1)..(378)
<400> 29
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc ggctactata tgcactgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggacgg atcaacccta acagtggtgg cacaaactat 180
gcacagaagt ttcagggcag ggtcaccatg accagggaca cgtccatcag cacagcctac 240
atggagctga gcaggctgag atctgacgac acggccgtgt attactgtgc gagagtcccc 300
tattgtagta gtaccagctg ccatcgggac tggtacttcg atctctgggg ccgtggcacc 360
ctggtcactg tctcctca 378
<210> 30
<211> 339
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1A10 VLnu
<222> (1)..(339)
<400> 30
gatattgtga tgacccagac tccactctcc ctgcccgtca cccctggaga gccggcctcc 60
atctcctgca ggtctagtca gagcctcttg gatagtgatg atggaaacac ctatttggac 120
tggtacctgc agaagccagg gcagtctcca cagctcctga tctatacgct ttcctatcgg 180
gcctctggag tcccagacag gttcagtggc agtgggtcag gcactgattt cacactgaaa 240
atcagcaggg tggaggctga ggatgttgga gtttattact gcatgcaacg tatagagttt 300
ccgctcactt tcggcggagg gaccaaggtg gagatcaaa 339
<210> 31
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 31
Gly Phe Ser Phe Asn Arg Tyr Ser
1 5
<210> 32
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 32
Ile Ser Ala Ser Gly Asn Thr Ile
1 5
<210> 33
<211> 16
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 HCDR3
<222> (1)..(16)
<400> 33
Ala Arg Pro Ala Met Val Arg Glu Gly Thr Tyr Asn Trp Phe Asp Pro
1 5 10 15
<210> 34
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 LCDR1
<222> (1)..(7)
<400> 34
Gln Ser Val Ser Asn Asp Tyr
1 5
<210> 35
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 35
Tyr Ala Ser Xaa
1
<210> 36
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 36
Gln Gln Tyr Gly Asp Ser Pro Pro Ile Thr
1 5 10
<210> 37
<211> 123
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 VH
<222> (1)..(123)
<400> 37
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Ser Phe Asn Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Asn Trp Leu Arg Gln Thr Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu
35 40 45
Ser Tyr Ile Ser Ala Ser Gly Asn Thr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Thr Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Asp Asp Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Pro Ala Met Val Arg Glu Gly Thr Tyr Asn Trp Phe Asp Pro
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 38
<211> 109
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 VL
<222> (1)..(109)
<400> 38
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Tyr Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Gly Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Asp Ser Pro
85 90 95
Pro Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 39
<211> 369
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 VHnu
<222> (1)..(369)
<400> 39
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctcagactc 60
tcctgtgtcg cctctggatt ctccttcaat cgatatagta tgaattggct ccgccagact 120
ccacggaagg ggctggagtg gctttcatac atcagtgcca gtggaaacac catatactac 180
gctgactctg tgaggggccg attcaccacc tccagagaca atgccaagaa cacactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgcg agacgacgac acggctgtct atttctgtgc gcgacccgct 300
atggttcggg aggggaccta caactggttc gacccctggg gccagggaac cctggtcacc 360
gtctcctca 369
<210> 40
<211> 327
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2A-1B3 VLnu
<222> (1)..(327)
<400> 40
gaaattgtgt tgacgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 60
ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc aacgactact tagcctggta ccagcagaaa 120
cctggccagg ctcccaggct cctcatctac tatgcatcca gcagggccac tggcatccca 180
gacaggttca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag 240
cctggagatt ctgcagtgta ttactgtcag cagtatggtg actcacctcc gatcaccttc 300
ggccaaggga cacgactgga gattaaa 327
<210> 41
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 HCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 41
Gly Tyr Ser Ile Ser Ser Gly Tyr Tyr
1 5
<210> 42
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 42
Ile Tyr His Ser Gly Ser Thr
1 5
<210> 43
<211> 20
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 HCDR3
<222> (1)..(20)
<400> 43
Ala Arg Ala Val Val Gly Ile Val Val Val Pro Ala Ala Gly Arg Arg
1 5 10 15
Ala Phe Asp Ile
20
<210> 44
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 44
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 45
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 45
Glu Val Ser Xaa
1
<210> 46
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 46
Ser Ser Tyr Ala Gly Ser Asn Asn Leu Val
1 5 10
<210> 47
<211> 127
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 VH
<222> (1)..(127)
<400> 47
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Tyr Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Ile Gly Ser Ile Tyr His Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu
50 55 60
Lys Thr Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser
65 70 75 80
Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ala Val Val Gly Ile Val Val Val Pro Ala Ala Gly Arg Arg
100 105 110
Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 48
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 VL
<222> (1)..(110)
<400> 48
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Glu Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Val Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Ala Gly Ser
85 90 95
Asn Asn Leu Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 49
<211> 381
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 VHnu
<222> (1)..(381)
<400> 49
caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcggagac cctgtccctc 60
acctgcactg tctctggtta ctccatcagc agtggttact actggggctg gatccggcag 120
cccccaggga aggggctgga gtggattggg agtatctatc atagtgggag cacctactac 180
aacccgtccc tcaagactcg agtcaccata tcagtagaca cgtccaagaa ccagttctcc 240
ctgaagctga gctctgtgac cgccgcagac acggccgtct attactgtgc gagagcggtg 300
gtagggattg tagtagtacc agctgccggt cgtcgggctt ttgatatctg gggccaaggg 360
acaatggtca ccgtctcctc a 381
<210> 50
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2F6 VLnu
<222> (1)..(330)
<400> 50
cagtctgccc tgactcagcc tccctccgcg tccgggtctc ctggacagtc agtcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacag 120
cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgaggtca gtaagcggcc ctcaggggtc 180
cctgatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccgt ctctgggctc 240
caggctgagg atgaggctga ttattactgc agctcatatg caggcagcaa caatttggtg 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 51
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 51
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly
1 5
<210> 52
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 52
Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5
<210> 53
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 53
Ala Arg Gly Ala Ala Met Val Trp Leu Asp Tyr
1 5 10
<210> 54
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 54
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 55
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 55
Asp Val Ser Xaa
1
<210> 56
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 56
Cys Ser Tyr Ala Gly Ser Tyr Thr Phe Val Val
1 5 10
<210> 57
<211> 118
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 VH
<222> (1)..(118)
<400> 57
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Ala Ala Met Val Trp Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 58
<211> 111
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 VL
<222> (1)..(111)
<400> 58
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Arg Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Cys Ser Tyr Ala Gly Ser
85 90 95
Tyr Thr Phe Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 59
<211> 354
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 VHnu
<222> (1)..(354)
<400> 59
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaggggca 300
gctatggttt ggcttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 60
<211> 333
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G4 VLnu
<222> (1)..(333)
<400> 60
cagtctgccc tgactcagcc tcgctcagtg tccgggtctc ctggacagtc agtcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgatgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacag 120
cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgatgtca gtaagcggcc ctcaggggtc 180
cctgatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg atgaggctga ttattactgc tgctcatatg caggcagcta cactttcgtg 300
gtattcggcg gagggaccaa gctgaccgtc cta 333
<210> 61
<211> 124
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G11 VH
<222> (1)..(124)
<400> 61
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Asn Gly Gly Ile Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Thr Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Ala Gly Arg Gly Asp Tyr Asp Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 62
<211> 111
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G11 VL
<222> (1)..(111)
<400> 62
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Gly Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Gly
20 25 30
Tyr Asp Val His Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Leu Ile Tyr Gly Asn Asn Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Thr Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Ser Tyr Asp Ser Ser
85 90 95
Leu Ser Gly Ser Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 63
<211> 372
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G11 VHnu
<222> (1)..(372)
<400> 63
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggcaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatgcca tgcactgggt ccggcaagct 120
ccagggaagg gcctggagtg ggtctcaggt attagttgga atggtggtat cataggctat 180
gcggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagac ttccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgaa acctgaggac acggccttgt attactgtgc aaaagtcgcg 300
ggaagggggg attacgacta ctactacggt atggacgtct ggggccaagg gaccacggtc 360
accgtctcct ca 372
<210> 64
<211> 333
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-2G11 VLnu
<222> (1)..(333)
<400> 64
cagtctgtgc tgacgcagcc gccctcagtg tctggggccc cagggcagag ggtcaccatc 60
tcctgcactg ggagcagctc caacatcggg gcaggttatg atgtacactg gtaccagcaa 120
cttccaggaa cagcccccaa actcctcatc tatgggaaca acaatcggcc ctcaggggtc 180
cctgaccgat tctctggctc caagtctggc acctcagcct ccctggccat cactgggctc 240
caggctgagg atgaggctga ttattactgc cagtcctatg acagcagcct gagtggttcg 300
gtattcggcg gagggaccaa gctgaccgtc cta 333
<210> 65
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 65
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr Tyr
1 5
<210> 66
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 66
Ile Ser Ser Ser Gly Ser Thr Ile
1 5
<210> 67
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 HCDR3
<222> (1)..(12)
<400> 67
Ala Arg Asp Phe Ser His Gln Gln Leu Val Pro Ser
1 5 10
<210> 68
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 68
Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
1 5
<210> 69
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 69
Ala Ala Ser Xaa
1
<210> 70
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 70
Gln Gln Leu Asn Ser Tyr Pro Leu Thr
1 5
<210> 71
<211> 119
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 VH
<222> (1)..(119)
<400> 71
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Ile Ser Ser Ser Gly Ser Thr Ile Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Phe Ser His Gln Gln Leu Val Pro Ser Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 72
<211> 107
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 VL
<222> (1)..(107)
<400> 72
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Leu Asn Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 73
<211> 357
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 VHnu
<222> (1)..(357)
<400> 73
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtcaagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgagctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtagta gtggtagtac catatactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagggaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagatttt 300
tctcatcagc agctggtacc ttcctggggc cagggaaccc tggtcaccgt ctcctca 357
<210> 74
<211> 321
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1A3 VLnu
<222> (1)..(321)
<400> 74
gacatccagt tgacccagtc tccatccttc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc gggccagtca gggcattagc agttatttag cctggtatca gcaaaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctatgct gcatccactt tgcaaagtgg ggtcccatca 180
aggttcagcg gcagtggatc tgggacagaa ttcactctca caatcagcag cctgcagcct 240
gaagattttg caacttatta ctgtcaacag cttaatagtt acccgctcac tttcggcgga 300
gggaccaagg tggagatcaa a 321
<210> 75
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 75
Gly Phe Thr Phe Arg Ser Tyr Gly
1 5
<210> 76
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 76
Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5
<210> 77
<211> 13
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 HCDR3
<222> (1)..(13)
<400> 77
Ala Arg Asp Ile Glu Ile Val Val Val Asn Ile Asp Tyr
1 5 10
<210> 78
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 LCDR1
<222> (1)..(11)
<400> 78
Gln Ser Leu Val Tyr Ser Asp Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 79
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 79
Lys Val Ser Xaa
1
<210> 80
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 80
Met Gln Gly Thr His Trp Pro Tyr Thr
1 5
<210> 81
<211> 120
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 VH
<222> (1)..(120)
<400> 81
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Ile Glu Ile Val Val Val Asn Ile Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 82
<211> 112
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 VL
<222> (1)..(112)
<400> 82
Asp Val Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Leu Gly
1 5 10 15
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val Tyr Ser
20 25 30
Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asn Trp Phe Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Arg Arg Leu Ile Tyr Lys Val Ser Ile Trp Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Gly
85 90 95
Thr His Trp Pro Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 83
<211> 360
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 VHnu
<222> (1)..(360)
<400> 83
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagg agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atctggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagatata 300
gagatagtag tggtaaatat tgactactgg ggccagggaa ccctggtcac cgtctcctca 360
<210> 84
<211> 336
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C8 VLnu
<222> (1)..(336)
<400> 84
gatgttgtga tgactcagtc tccactctcc ctgcccgtca cccttggaca gccggcctcc 60
atctcctgca ggtctagtca aagcctcgta tacagtgatg gaaacaccta cttgaattgg 120
tttcagcaga ggccaggcca atctccaagg cgcctaattt ataaggtttc tatctgggac 180
tctggggtcc cagacagatt cagcggcagt gggtcaggca ctgatttcac actgaaaatc 240
agcagggtgg aggctgagga tgttggggtt tattactgca tgcaaggtac acactggccg 300
tacacttttg gccaggggac caagctggag atcaaa 336
<210> 85
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 85
Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr Ala
1 5
<210> 86
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 86
Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala
1 5
<210> 87
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 87
Ala Arg Val Val Thr Gly Tyr Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10
<210> 88
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 88
Gln Ser Val Ser Ser Tyr
1 5
<210> 89
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 89
Asp Ala Ser Xaa
1
<210> 90
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 LCDR3
<222> (1)..(8)
<400> 90
Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Ser
1 5
<210> 91
<211> 118
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 VH
<222> (1)..(118)
<400> 91
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Ile Ile Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Val Val Thr Gly Tyr Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 92
<211> 106
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 VL
<222> (1)..(106)
<400> 92
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Ser
85 90 95
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 93
<211> 354
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 VHnu
<222> (1)..(354)
<400> 93
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcatctgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaggg atcatcccta tctttggtac agcaaactac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggacg aatccacgag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagagtggta 300
acggggtact actttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 94
<211> 318
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1C10 VLnu
<222> (1)..(318)
<400> 94
gaaattgtgt tgacacagtc tccagccacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 60
ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc agctacttag cctggtacca acagaaacct 120
ggccaggctc ccaggctcct catctatgat gcatccaaca gggccactgg catcccagcc 180
aggttcagtg gcagtgggtc tgggacagac ttcactctca ccatcagcag cctagagcct 240
gaagattttg cagtttatta ctgtcagcag cgtagcaact ggccttcttt tggccagggg 300
accaagctgg agatcaaa 318
<210> 95
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 95
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe Ala
1 5
<210> 96
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 96
Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 97
<211> 14
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 HCDR3
<222> (1)..(14)
<400> 97
Ala Lys Asp Pro Asp Gly Ser Gly Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10
<210> 98
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 98
Asn Ile Gly Ser Lys Ser
1 5
<210> 99
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 99
Tyr Asp Ser Xaa
1
<210> 100
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 100
Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His His Val
1 5 10
<210> 101
<211> 121
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 VH
<222> (1)..(121)
<400> 101
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe
20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Asp Pro Asp Gly Ser Gly Ser Trp Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 102
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 VL
<222> (1)..(108)
<400> 102
Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Lys
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Tyr Asp Ser Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His
85 90 95
His Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
100 105
<210> 103
<211> 363
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 VHnu
<222> (1)..(363)
<400> 103
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttagc agctttgcca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagct attagtggta gtggtggtag cacatactac 180
gcagactccg tgaagggccg gttcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ttgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtat attactgtgc gaaagatccg 300
gatggttcgg ggagttggta ctttgactac tggggccagg gaaccctggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 104
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D5 VLnu
<222> (1)..(324)
<400> 104
tcctatgtgc tgactcagcc accctcagtg tcagtggccc caggaaagac ggccaggatt 60
acctgtgggg gaaacaacat tggaagtaaa agtgtgcact ggtaccagca gaagccaggc 120
caggcccctg tgctggtcat ctattatgat agcgaccggc cctcagggat ccctgagcga 180
ttctctggct ccaactctgg gaacaccgcc accctgacca tcagcagggt cgaagccggg 240
gatgaggccg actattactg tcaggtgtgg gatagtagta gtgatcatca tgtcttcgga 300
actgggacca aggtcaccgt ccta 324
<210> 105
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 105
Gly Ile Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 106
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 106
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 107
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 107
Ala Arg Asp Leu Val Val Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 108
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 LCDR1
<222> (1)..(7)
<400> 108
Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr
1 5
<210> 109
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 109
Gly Ala Ser Xaa
1
<210> 110
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 LCDR3
<222> (1)..(8)
<400> 110
Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Thr
1 5
<210> 111
<211> 117
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 VH
<222> (1)..(117)
<400> 111
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ile Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Leu Val Val Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 112
<211> 107
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 VL
<222> (1)..(107)
<400> 112
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 113
<211> 351
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 VHnu
<222> (1)..(351)
<400> 113
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggaat caccgtcagt agcaactaca tgaactgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcactt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggcagatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gttgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtgtatc actgtgcgag agatctggtg 300
gtatacggta tggacgtctg gggccaaggg accacggtca ccgtctcctc a 351
<210> 114
<211> 321
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 VLnu
<222> (1)..(321)
<400> 114
gaaattgtgt tgacgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 60
ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc agcagctact tagcctggta ccagcagaaa 120
cctggccagg ctcccaggct cctcatctat ggtgcatcca gcagggccac tggcatccca 180
gacaggttca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag 240
cctgaagatt ttgcagtgta ttactgtcag cagtatggta gctcacccac ttttggccag 300
gggaccaagc tggagatcaa a 321
<210> 115
<211> 330
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> Amino acid sequence of heavy chain constant region
<222> (1)..(330)
<400> 115
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu
225 230 235 240
Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 116
<211> 106
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> Amino acid sequence of lambda light chain constant region
<222> (1)..(106)
<400> 116
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 117
<211> 107
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> Amino acid sequence of appa light chain constant region
<222> (1)..(107)
<400> 117
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
1 5 10 15
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
20 25 30
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
35 40 45
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
50 55 60
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
65 70 75 80
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
85 90 95
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
100 105
<210> 118
<211> 990
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> Nucleic acid sequence of heavy chain constant region
<222> (1)..(990)
<400> 118
gcgtcgacca agggcccatc ggtcttcccc ctggcaccct cctccaagag cacctctggg 60
ggcacagcgg ccctgggctg cctggtcaag gactacttcc ccgaacccgt gacggtgtcg 120
tggaactcag gcgccctgac cagcggcgtg cacaccttcc cggctgtcct acagtcctca 180
ggactctact ccctcagcag cgtggtgacc gtgccctcca gcagcttggg cacccagacc 240
tacatctgca acgtgaatca caagcccagc aacaccaagg tggacaagaa agttgagccc 300
aaatcttgtg acaaaactca cacatgccca ccgtgcccag cacctgaact cctgggggga 360
ccgtcagtct tcctcttccc cccaaaaccc aaggacaccc tcatgatctc ccggacccct 420
gaggtcacat gcgtggtggt ggacgtgagc cacgaagacc ctgaggtcaa gttcaactgg 480
tacgtggacg gcgtggaggt gcataatgcc aagacaaagc cgcgggagga gcagtacaac 540
agcacgtacc gtgtggtcag cgtcctcacc gtcctgcacc aggactggct gaatggcaag 600
gagtacaagt gcaaggtctc caacaaagcc ctcccagccc ccatcgagaa aaccatctcc 660
aaagccaaag ggcagccccg agaaccacag gtgtacaccc tgcccccatc ccgggatgag 720
ctgaccaaga accaggtcag cctgacctgc ctggtcaaag gcttctatcc cagcgacatc 780
gccgtggagt gggagagcaa tgggcagccg gagaacaact acaagaccac gcctcccgtg 840
ctggactccg acggctcctt cttcctctac agcaagctca ccgtggacaa gagcaggtgg 900
cagcagggga acgtcttctc atgctccgtg atgcatgagg ctctgcacaa ccactacacg 960
cagaagagcc tctccctgtc tccgggtaaa 990
<210> 119
<211> 318
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> Nucleic acid sequence of lambda light chain constant region
<222> (1)..(318)
<400> 119
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gccaacaagg ccacactggt gtgtctcata agtgacttct acccgggagc cgtgacagtg 120
gcctggaagg cagatagcag ccccgtcaag gcgggagtgg agaccaccac accctccaaa 180
caaagcaaca acaagtacgc ggccagcagc tacctgagcc tgacgcctga gcagtggaag 240
tcccacagaa gctacagctg ccaggtcacg catgaaggga gcaccgtgga gaagacagtg 300
gcccctacag aatgttca 318
<210> 120
<211> 321
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> Nucleic acid sequence of kappa light chain constant region
<222> (1)..(321)
<400> 120
cgtacggtgg ctgcaccatc tgtcttcatc ttcccgccat ctgatgagca gttgaaatct 60
ggaactgcct ctgttgtgtg cctgctgaat aacttctacc ccagagaagc caaagtgcag 120
tggaaggtgg acaacgccct gcagagcgga aacagccagg aaagcgtgac agagcaggat 180
tccaaggatt ccacatacag cctgagcagc acactgacac tgtccaaggc cgactacgag 240
aagcacaagg tgtacgcctg cgaagtgaca caccagggac tgtcctcccc tgtgacaaag 300
agcttcaaca gaggagaatg c 321
<210> 121
<211> 1211
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of the extracellular domain of S protein of
SARS-CoV-2
<400> 121
Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val
1 5 10 15
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20 25 30
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50 55 60
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65 70 75 80
Asn Pro Val Leu Pro Phe Asn Asp Gly Val Tyr Phe Ala Ser Thr Glu
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Lys Ser Asn Ile Ile Arg Gly Trp Ile Phe Gly Thr Thr Leu Asp Ser
100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Tyr His Lys Asn Asn Lys Ser Trp Met Glu Ser Glu Phe Arg Val Tyr
145 150 155 160
Ser Ser Ala Asn Asn Cys Thr Phe Glu Tyr Val Ser Gln Pro Phe Leu
165 170 175
Met Asp Leu Glu Gly Lys Gln Gly Asn Phe Lys Asn Leu Arg Glu Phe
180 185 190
Val Phe Lys Asn Ile Asp Gly Tyr Phe Lys Ile Tyr Ser Lys His Thr
195 200 205
Pro Ile Asn Leu Val Arg Asp Leu Pro Gln Gly Phe Ser Ala Leu Glu
210 215 220
Pro Leu Val Asp Leu Pro Ile Gly Ile Asn Ile Thr Arg Phe Gln Thr
225 230 235 240
Leu Leu Ala Leu His Arg Ser Tyr Leu Thr Pro Gly Asp Ser Ser Ser
245 250 255
Gly Trp Thr Ala Gly Ala Ala Ala Tyr Tyr Val Gly Tyr Leu Gln Pro
260 265 270
Arg Thr Phe Leu Leu Lys Tyr Asn Glu Asn Gly Thr Ile Thr Asp Ala
275 280 285
Val Asp Cys Ala Leu Asp Pro Leu Ser Glu Thr Lys Cys Thr Leu Lys
290 295 300
Ser Phe Thr Val Glu Lys Gly Ile Tyr Gln Thr Ser Asn Phe Arg Val
305 310 315 320
Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn Leu Cys
325 330 335
Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val Tyr Ala
340 345 350
Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser Val Leu
355 360 365
Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val Ser Pro
370 375 380
Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Phe
385 390 395 400
Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln Thr Gly
405 410 415
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420 425 430
Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Asn
435 440 445
Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Pro Phe
450 455 460
Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Cys
465 470 475 480
Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Tyr Gly
485 490 495
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500 505 510
Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Pro Lys
515 520 525
Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe Asn Phe Asn
530 535 540
Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Glu Ser Asn Lys Lys Phe Leu
545 550 555 560
Pro Phe Gln Gln Phe Gly Arg Asp Ile Ala Asp Thr Thr Asp Ala Val
565 570 575
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Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Thr Ser Asn Gln Val
595 600 605
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610 615 620
His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Thr Trp Arg Val Tyr Ser Thr Gly Ser
625 630 635 640
Asn Val Phe Gln Thr Arg Ala Gly Cys Leu Ile Gly Ala Glu His Val
645 650 655
Asn Asn Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala Gly Ile Cys Ala
660 665 670
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675 680 685
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690 695 700
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705 710 715 720
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725 730 735
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740 745 750
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770 775 780
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820 825 830
Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile Ala Ala Arg Asp
835 840 845
Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu
850 855 860
Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala Leu Leu Ala Gly
865 870 875 880
Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile
885 890 895
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900 905 910
Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Gln Phe Asn
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Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser Thr Ala Ser Ala
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Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe Val Ser Asn
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<210> 122
<211> 1195
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of the extracellular domain of S protein of
SARS-CoV
<400> 122
Met Phe Ile Phe Leu Leu Phe Leu Thr Leu Thr Ser Gly Ser Asp Leu
1 5 10 15
Asp Arg Cys Thr Thr Phe Asp Asp Val Gln Ala Pro Asn Tyr Thr Gln
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50 55 60
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Ser Val Ile Ile Ile Asn Asn Ser Thr Asn Val Val Ile Arg Ala Cys
115 120 125
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Gly Thr Gln Thr His Thr Met Ile Phe Asp Asn Ala Phe Asn Cys Thr
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165 170 175
Gly Asn Phe Lys His Leu Arg Glu Phe Val Phe Lys Asn Lys Asp Gly
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Gly Ile Asn Ile Thr Asn Phe Arg Ala Ile Leu Thr Ala Phe Ser Pro
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Asn Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Lys Phe Pro Ser
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340 345 350
Ser Val Leu Tyr Asn Ser Thr Phe Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly
355 360 365
Val Ser Ala Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Ser Asn Val Tyr Ala
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450 455 460
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Tyr Gly Phe Tyr Thr Thr Thr Gly Ile Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val
485 490 495
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Phe Asn Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Pro Ser Ser Lys Arg
530 535 540
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Ser Val Arg Asp Pro Lys Thr Ser Glu Ile Leu Asp Ile Ser Pro Cys
565 570 575
Ala Phe Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Ala Ser Ser
580 585 590
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595 600 605
Ala Ile His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Ala Trp Arg Ile Tyr Ser Thr
610 615 620
Gly Asn Asn Val Phe Gln Thr Gln Ala Gly Cys Leu Ile Gly Ala Glu
625 630 635 640
His Val Asp Thr Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala Gly Ile
645 650 655
Cys Ala Ser Tyr His Thr Val Ser Leu Leu Arg Ser Thr Ser Gln Lys
660 665 670
Ser Ile Val Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala Asp Ser Ser Ile Ala
675 680 685
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Asn Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys Ala Asn Leu Leu Leu
725 730 735
Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg Ala Leu Ser Gly Ile
740 745 750
Ala Ala Glu Gln Asp Arg Asn Thr Arg Glu Val Phe Ala Gln Val Lys
755 760 765
Gln Met Tyr Lys Thr Pro Thr Leu Lys Tyr Phe Gly Gly Phe Asn Phe
770 775 780
Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Leu Lys Pro Thr Lys Arg Ser Phe Ile
785 790 795 800
Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala Asp Ala Gly Phe Met
805 810 815
Lys Gln Tyr Gly Glu Cys Leu Gly Asp Ile Asn Ala Arg Asp Leu Ile
820 825 830
Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu Leu Thr
835 840 845
Asp Asp Met Ile Ala Ala Tyr Thr Ala Ala Leu Val Ser Gly Thr Ala
850 855 860
Thr Ala Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile Pro Phe
865 870 875 880
Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly Val Thr Gln Asn
885 890 895
Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Gln Ile Ala Asn Gln Phe Asn Lys Ala
900 905 910
Ile Ser Gln Ile Gln Glu Ser Leu Thr Thr Thr Ser Thr Ala Leu Gly
915 920 925
Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn Thr Leu
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Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser Ser Val Leu Asn
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Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln Ile Asp
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Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala Ser Ala Asn Leu Ala Ala
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Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly Gln Ser Lys Arg Val Asp
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Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His Leu Met Ser Phe Pro Gln Ala Ala
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Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn His Thr Ser
1130 1135 1140
Pro Asp Val Asp Leu Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn Ala Ser Val
1145 1150 1155
Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys
1160 1165 1170
Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly Lys Tyr
1175 1180 1185
Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro
1190 1195
<210> 123
<211> 1290
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of the extracellular domain of S protein of
MERS-CoV
<400> 123
Met Ile His Ser Val Phe Leu Leu Met Phe Leu Leu Thr Pro Thr Glu
1 5 10 15
Ser Tyr Val Asp Val Gly Pro Asp Ser Val Lys Ser Ala Cys Ile Glu
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Val Asp Ile Gln Gln Thr Phe Phe Asp Lys Thr Trp Pro Arg Pro Ile
35 40 45
Asp Val Ser Lys Ala Asp Gly Ile Ile Tyr Pro Gln Gly Arg Thr Tyr
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Ser Asn Ile Thr Ile Thr Tyr Gln Gly Leu Phe Pro Tyr Gln Gly Asp
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His Gly Asp Met Tyr Val Tyr Ser Ala Gly His Ala Thr Gly Thr Thr
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Ala Asn Gly Phe Val Val Arg Ile Gly Ala Ala Ala Asn Ser Thr Gly
115 120 125
Thr Val Ile Ile Ser Pro Ser Thr Ser Ala Thr Ile Arg Lys Ile Tyr
130 135 140
Pro Ala Phe Met Leu Gly Ser Ser Val Gly Asn Phe Ser Asp Gly Lys
145 150 155 160
Met Gly Arg Phe Phe Asn His Thr Leu Val Leu Leu Pro Asp Gly Cys
165 170 175
Gly Thr Leu Leu Arg Ala Phe Tyr Cys Ile Leu Glu Pro Arg Ser Gly
180 185 190
Asn His Cys Pro Ala Gly Asn Ser Tyr Thr Ser Phe Ala Thr Tyr His
195 200 205
Thr Pro Ala Thr Asp Cys Ser Asp Gly Asn Tyr Asn Arg Asn Ala Ser
210 215 220
Leu Asn Ser Phe Lys Glu Tyr Phe Asn Leu Arg Asn Cys Thr Phe Met
225 230 235 240
Tyr Thr Tyr Asn Ile Thr Glu Asp Glu Ile Leu Glu Trp Phe Gly Ile
245 250 255
Thr Gln Thr Ala Gln Gly Val His Leu Phe Ser Ser Arg Tyr Val Asp
260 265 270
Leu Tyr Gly Gly Asn Met Phe Gln Phe Ala Thr Leu Pro Val Tyr Asp
275 280 285
Thr Ile Lys Tyr Tyr Ser Ile Ile Pro His Ser Ile Arg Ser Ile Gln
290 295 300
Ser Asp Arg Lys Ala Trp Ala Ala Phe Tyr Val Tyr Lys Leu Gln Pro
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Leu Thr Phe Leu Leu Asp Phe Ser Val Asp Gly Tyr Ile Arg Arg Ala
325 330 335
Ile Asp Cys Gly Phe Asn Asp Leu Ser Gln Leu His Cys Ser Tyr Glu
340 345 350
Ser Phe Asp Val Glu Ser Gly Val Tyr Ser Val Ser Ser Phe Glu Ala
355 360 365
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Arg Leu Val Phe Thr Asn Cys Asn Tyr Asn Leu Thr Lys Leu Leu Ser
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Leu Phe Ser Val Asn Asp Phe Thr Cys Ser Gln Ile Ser Pro Ala Ala
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Ile Ala Ser Asn Cys Tyr Ser Ser Leu Ile Leu Asp Tyr Phe Ser Tyr
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595 600 605
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625 630 635 640
Tyr Tyr Ser Asp Asp Gly Asn Tyr Tyr Cys Leu Arg Ala Cys Val Ser
645 650 655
Val Pro Val Ser Val Ile Tyr Asp Lys Glu Thr Lys Thr His Ala Thr
660 665 670
Leu Phe Gly Ser Val Ala Cys Glu His Ile Ser Ser Thr Met Ser Gln
675 680 685
Tyr Ser Arg Ser Thr Arg Ser Met Leu Lys Arg Arg Asp Ser Thr Tyr
690 695 700
Gly Pro Leu Gln Thr Pro Val Gly Cys Val Leu Gly Leu Val Asn Ser
705 710 715 720
Ser Leu Phe Val Glu Asp Cys Lys Leu Pro Leu Gly Gln Ser Leu Cys
725 730 735
Ala Leu Pro Asp Thr Pro Ser Thr Leu Thr Pro Arg Ser Val Arg Ser
740 745 750
Val Pro Gly Glu Met Arg Leu Ala Ser Ile Ala Phe Asn His Pro Ile
755 760 765
Gln Val Asp Gln Leu Asn Ser Ser Tyr Phe Lys Leu Ser Ile Pro Thr
770 775 780
Asn Phe Ser Phe Gly Val Thr Gln Glu Tyr Ile Gln Thr Thr Ile Gln
785 790 795 800
Lys Val Thr Val Asp Cys Lys Gln Tyr Val Cys Asn Gly Phe Gln Lys
805 810 815
Cys Glu Gln Leu Leu Arg Glu Tyr Gly Gln Phe Cys Ser Lys Ile Asn
820 825 830
Gln Ala Leu His Gly Ala Asn Leu Arg Gln Asp Asp Ser Val Arg Asn
835 840 845
Leu Phe Ala Ser Val Lys Ser Ser Gln Ser Ser Pro Ile Ile Pro Gly
850 855 860
Phe Gly Gly Asp Phe Asn Leu Thr Leu Leu Glu Pro Val Ser Ile Ser
865 870 875 880
Thr Gly Ser Arg Ser Ala Arg Ser Ala Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asp
885 890 895
Lys Val Thr Ile Ala Asp Pro Gly Tyr Met Gln Gly Tyr Asp Asp Cys
900 905 910
Met Gln Gln Gly Pro Ala Ser Ala Arg Asp Leu Ile Cys Ala Gln Tyr
915 920 925
Val Ala Gly Tyr Lys Val Leu Pro Pro Leu Met Asp Val Asn Met Glu
930 935 940
Ala Ala Tyr Thr Ser Ser Leu Leu Gly Ser Ile Ala Gly Val Gly Trp
945 950 955 960
Thr Ala Gly Leu Ser Ser Phe Ala Ala Ile Pro Phe Ala Gln Ser Ile
965 970 975
Phe Tyr Arg Leu Asn Gly Val Gly Ile Thr Gln Gln Val Leu Ser Glu
980 985 990
Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Lys Phe Asn Gln Ala Leu Gly Ala Met
995 1000 1005
Gln Thr Gly Phe Thr Thr Thr Asn Glu Ala Phe Gln Lys Val Gln
1010 1015 1020
Asp Ala Val Asn Asn Asn Ala Gln Ala Leu Ser Lys Leu Ala Ser
1025 1030 1035
Glu Leu Ser Asn Thr Phe Gly Ala Ile Ser Ala Ser Ile Gly Asp
1040 1045 1050
Ile Ile Gln Arg Leu Asp Val Leu Glu Gln Asp Ala Gln Ile Asp
1055 1060 1065
Arg Leu Ile Asn Gly Arg Leu Thr Thr Leu Asn Ala Phe Val Ala
1070 1075 1080
Gln Gln Leu Val Arg Ser Glu Ser Ala Ala Leu Ser Ala Gln Leu
1085 1090 1095
Ala Lys Asp Lys Val Asn Glu Cys Val Lys Ala Gln Ser Lys Arg
1100 1105 1110
Ser Gly Phe Cys Gly Gln Gly Thr His Ile Val Ser Phe Val Val
1115 1120 1125
Asn Ala Pro Asn Gly Leu Tyr Phe Met His Val Gly Tyr Tyr Pro
1130 1135 1140
Ser Asn His Ile Glu Val Val Ser Ala Tyr Gly Leu Cys Asp Ala
1145 1150 1155
Ala Asn Pro Thr Asn Cys Ile Ala Pro Val Asn Gly Tyr Phe Ile
1160 1165 1170
Lys Thr Asn Asn Thr Arg Ile Val Asp Glu Trp Ser Tyr Thr Gly
1175 1180 1185
Ser Ser Phe Tyr Ala Pro Glu Pro Ile Thr Ser Leu Asn Thr Lys
1190 1195 1200
Tyr Val Ala Pro Gln Val Thr Tyr Gln Asn Ile Ser Thr Asn Leu
1205 1210 1215
Pro Pro Pro Leu Leu Gly Asn Ser Thr Gly Ile Asp Phe Gln Asp
1220 1225 1230
Glu Leu Asp Glu Phe Phe Lys Asn Val Ser Thr Ser Ile Pro Asn
1235 1240 1245
Phe Gly Ser Leu Thr Gln Ile Asn Thr Thr Leu Leu Asp Leu Thr
1250 1255 1260
Tyr Glu Met Leu Ser Leu Gln Gln Val Val Lys Ala Leu Asn Glu
1265 1270 1275
Ser Tyr Ile Asp Leu Lys Glu Leu Gly Asn Tyr Thr
1280 1285 1290
<210> 124
<211> 222
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of the spike protein RBD of SARS-CoV
<400> 124
Arg Val Val Pro Ser Gly Asp Val Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn
1 5 10 15
Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Lys Phe Pro Ser Val
20 25 30
Tyr Ala Trp Glu Arg Lys Lys Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser
35 40 45
Val Leu Tyr Asn Ser Thr Phe Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val
50 55 60
Ser Ala Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Ser Asn Val Tyr Ala Asp
65 70 75 80
Ser Phe Val Val Lys Gly Asp Asp Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95
Thr Gly Val Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Met
100 105 110
Gly Cys Val Leu Ala Trp Asn Thr Arg Asn Ile Asp Ala Thr Ser Thr
115 120 125
Gly Asn Tyr Asn Tyr Lys Tyr Arg Tyr Leu Arg His Gly Lys Leu Arg
130 135 140
Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Asn Val Pro Phe Ser Pro Asp Gly Lys
145 150 155 160
Pro Cys Thr Pro Pro Ala Leu Asn Cys Tyr Trp Pro Leu Asn Asp Tyr
165 170 175
Gly Phe Tyr Thr Thr Thr Gly Ile Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Val
180 185 190
Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu Asn Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Pro
195 200 205
Lys Leu Ser Thr Asp Leu Ile Lys Asn Gln Cys Val Asn Phe
210 215 220
<210> 125
<211> 666
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Nucleic acid sequence of the spike protein RBD of SARS-CoV
<400> 125
cgggtggtgc ccagcggcga cgtggtgcgg ttccccaaca tcaccaacct gtgccccttc 60
ggcgaggtgt tcaacgccac caagttcccc agcgtgtacg cctgggagcg gaagaagatc 120
agcaactgcg tggccgacta cagcgtgctg tacaacagca ccttcttcag caccttcaag 180
tgctacggcg tgagcgccac caagctgaac gacctgtgct tcagcaacgt gtacgccgac 240
agcttcgtgg tgaagggcga cgacgtgcgg cagatcgccc ccggccagac cggcgtgatc 300
gccgactaca actacaagct gcccgacgac ttcatgggct gcgtgctggc ctggaacacc 360
cggaacatcg acgccaccag caccggcaac tacaactaca agtaccggta cctgcggcac 420
ggcaagctgc ggcccttcga gcgggacatc agcaacgtgc ccttcagccc cgacggcaag 480
ccctgcaccc cccccgccct gaactgctac tggcccctga acgactacgg cttctacacc 540
actaccggca tcggctacca gccctaccgg gtggtggtgc tgagcttcga gctgctgaac 600
gcccccgcca ccgtgtgcgg ccccaagctg agcaccgacc tgatcaagaa ccagtgcgtg 660
aacttc 666
<210> 126
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of the spike protein RBD of MERS-CoV
<400> 126
Val Glu Cys Asp Phe Ser Pro Leu Leu Ser Gly Thr Pro Pro Gln Val
1 5 10 15
Tyr Asn Phe Lys Arg Leu Val Phe Thr Asn Cys Asn Tyr Asn Leu Thr
20 25 30
Lys Leu Leu Ser Leu Phe Ser Val Asn Asp Phe Thr Cys Ser Gln Ile
35 40 45
Ser Pro Ala Ala Ile Ala Ser Asn Cys Tyr Ser Ser Leu Ile Leu Asp
50 55 60
Tyr Phe Ser Tyr Pro Leu Ser Met Lys Ser Asp Leu Ser Val Ser Ser
65 70 75 80
Ala Gly Pro Ile Ser Gln Phe Asn Tyr Lys Gln Ser Phe Ser Asn Pro
85 90 95
Thr Cys Leu Ile Leu Ala Thr Val Pro His Asn Leu Thr Thr Ile Thr
100 105 110
Lys Pro Leu Lys Tyr Ser Tyr Ile Asn Lys Cys Ser Arg Leu Leu Ser
115 120 125
Asp Asp Arg Thr Glu Val Pro Gln Leu Val Asn Ala Asn Gln Tyr Ser
130 135 140
Pro Cys Val Ser Ile Val Pro Ser Thr Val Trp Glu Asp Gly Asp Tyr
145 150 155 160
Tyr Arg Lys Gln Leu Ser Pro Leu Glu Gly Gly Gly Trp Leu Val Ala
165 170 175
Ser Gly Ser Thr Val Ala Met Thr Glu Gln Leu Gln Met Gly Phe Gly
180 185 190
Ile Thr Val Gln Tyr Gly Thr Asp Thr Asn Ser Val Cys Pro Lys Leu
195 200 205
<210> 127
<211> 624
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Nucleic acid sequence of the spike protein RBD of MERS-CoV
<400> 127
gtggagtgtg acttcagccc actgctgtct ggcacacctc cacaggtcta caacttcaag 60
agactggtgt tcaccaactg taactacaac ctgaccaaac tgctgtccct gttctctgtg 120
aatgacttca cttgtagcca gattagccct gctgccattg ccagcaactg ttactcctcc 180
ctgattctgg actacttctc ctacccactg agtatgaagt ctgacctgtc tgtgtcctct 240
gctggaccaa tcagccagtt caactacaag cagtccttca gcaacccaac ttgtctgatt 300
ctggctacag tgccacacaa cctgaccacc atcaccaagc cactgaaata ctcctacatc 360
aacaagtgta gcagactgct gtctgatgac aggacagagg tgccacaact agtgaatgcc 420
aaccaataca gcccatgtgt gagcattgtg ccaagcacag tgtgggagga tggagactac 480
tacaggaagc aacttagccc attggaggga ggaggctggc tggtggcatc tggcagcaca 540
gtggctatga cagaacaact ccaaatgggc tttggcatca cagtccaata tggcacagac 600
accaactctg tgtgtccaaa attg 624
<210> 128
<211> 223
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of the spike protein RBD of SARS-CoV-2
<400> 128
Arg Val Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn
1 5 10 15
Leu Cys Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val
20 25 30
Tyr Ala Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser
35 40 45
Val Leu Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val
50 55 60
Ser Pro Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp
65 70 75 80
Ser Phe Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln
85 90 95
Thr Gly Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr
100 105 110
Gly Cys Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly
115 120 125
Gly Asn Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys
130 135 140
Pro Phe Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr
145 150 155 160
Pro Cys Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser
165 170 175
Tyr Gly Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val
180 185 190
Val Val Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly
195 200 205
Pro Lys Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe
210 215 220
<210> 129
<211> 669
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Nucleic acid sequence of the spike protein RBD of SARS-CoV-2
<400> 129
cgcgtgcagc ccaccgagag catcgtgcgc ttccccaaca tcaccaacct gtgccccttc 60
ggcgaggtgt tcaacgccac ccgcttcgcc agcgtgtacg cctggaaccg caagcgcatc 120
agcaactgcg tggccgacta cagcgtgctg tacaacagcg ccagcttcag caccttcaag 180
tgctacggcg tgagccccac caagctgaac gacctgtgct tcaccaacgt gtacgccgac 240
agcttcgtga tccgcggcga cgaggtgcgc cagatcgccc ccggccagac cggcaagatc 300
gccgactaca actacaagct gcccgacgac ttcaccggct gcgtgatcgc ctggaacagc 360
aacaacctgg acagcaaggt gggcggcaac tacaactacc tgtaccgcct gttccgcaag 420
agcaacctga agcccttcga gcgcgacatc agcaccgaga tctaccaggc cggcagcacc 480
ccctgcaacg gcgtggaggg cttcaactgc tacttccccc tgcagagcta cggcttccag 540
cccaccaacg gcgtgggcta ccagccctac cgcgtggtgg tgctgagctt cgagctgctg 600
cacgcccccg ccaccgtgtg cggccccaag aagagcacca acctggtgaa gaacaagtgc 660
gtgaacttc 669
<210> 130
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Signal peptide
<400> 130
Met Gly Trp Ser Cys Ile Ile Leu Phe Leu Val Ala Thr Ala Thr Gly
1 5 10 15
Val His Ser
<210> 131
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Signal peptide
<400> 131
Met Gly Trp Ser Cys Ile Ile Leu Phe Leu Val Ala Thr Ala Thr Gly
1 5 10 15
Ser Trp Ala
<210> 132
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 6XHis Tag
<400> 132
His His His His His His
1 5
<210> 133
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Tag
<400> 133
Met Ser Tyr Tyr His His His His His His
1 5 10
<210> 134
<211> 1281
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Amino acid sequence of full length S protein of SARS-CoV-2
<400> 134
Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val
1 5 10 15
Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Leu Pro Pro Ala Tyr Thr Asn Ser Phe
20 25 30
Thr Arg Gly Val Tyr Tyr Pro Asp Lys Val Phe Arg Ser Ser Val Leu
35 40 45
His Ser Thr Gln Asp Leu Phe Leu Pro Phe Phe Ser Asn Val Thr Trp
50 55 60
Phe His Ala Ile His Val Ser Gly Thr Asn Gly Thr Lys Arg Phe Asp
65 70 75 80
Asn Pro Val Leu Pro Phe Asn Asp Gly Val Tyr Phe Ala Ser Thr Glu
85 90 95
Lys Ser Asn Ile Ile Arg Gly Trp Ile Phe Gly Thr Thr Leu Asp Ser
100 105 110
Lys Thr Gln Ser Leu Leu Ile Val Asn Asn Ala Thr Asn Val Val Ile
115 120 125
Lys Val Cys Glu Phe Gln Phe Cys Asn Asp Pro Phe Leu Gly Val Tyr
130 135 140
Tyr His Lys Asn Asn Lys Ser Trp Met Glu Ser Glu Phe Arg Val Tyr
145 150 155 160
Ser Ser Ala Asn Asn Cys Thr Phe Glu Tyr Val Ser Gln Pro Phe Leu
165 170 175
Met Asp Leu Glu Gly Lys Gln Gly Asn Phe Lys Asn Leu Arg Glu Phe
180 185 190
Val Phe Lys Asn Ile Asp Gly Tyr Phe Lys Ile Tyr Ser Lys His Thr
195 200 205
Pro Ile Asn Leu Val Arg Asp Leu Pro Gln Gly Phe Ser Ala Leu Glu
210 215 220
Pro Leu Val Asp Leu Pro Ile Gly Ile Asn Ile Thr Arg Phe Gln Thr
225 230 235 240
Leu Leu Ala Leu His Arg Ser Tyr Leu Thr Pro Gly Asp Ser Ser Ser
245 250 255
Gly Trp Thr Ala Gly Ala Ala Ala Tyr Tyr Val Gly Tyr Leu Gln Pro
260 265 270
Arg Thr Phe Leu Leu Lys Tyr Asn Glu Asn Gly Thr Ile Thr Asp Ala
275 280 285
Val Asp Cys Ala Leu Asp Pro Leu Ser Glu Thr Lys Cys Thr Leu Lys
290 295 300
Ser Phe Thr Val Glu Lys Gly Ile Tyr Gln Thr Ser Asn Phe Arg Val
305 310 315 320
Gln Pro Thr Glu Ser Ile Val Arg Phe Pro Asn Ile Thr Asn Leu Cys
325 330 335
Pro Phe Gly Glu Val Phe Asn Ala Thr Arg Phe Ala Ser Val Tyr Ala
340 345 350
Trp Asn Arg Lys Arg Ile Ser Asn Cys Val Ala Asp Tyr Ser Val Leu
355 360 365
Tyr Asn Ser Ala Ser Phe Ser Thr Phe Lys Cys Tyr Gly Val Ser Pro
370 375 380
Thr Lys Leu Asn Asp Leu Cys Phe Thr Asn Val Tyr Ala Asp Ser Phe
385 390 395 400
Val Ile Arg Gly Asp Glu Val Arg Gln Ile Ala Pro Gly Gln Thr Gly
405 410 415
Lys Ile Ala Asp Tyr Asn Tyr Lys Leu Pro Asp Asp Phe Thr Gly Cys
420 425 430
Val Ile Ala Trp Asn Ser Asn Asn Leu Asp Ser Lys Val Gly Gly Asn
435 440 445
Tyr Asn Tyr Leu Tyr Arg Leu Phe Arg Lys Ser Asn Leu Lys Pro Phe
450 455 460
Glu Arg Asp Ile Ser Thr Glu Ile Tyr Gln Ala Gly Ser Thr Pro Cys
465 470 475 480
Asn Gly Val Glu Gly Phe Asn Cys Tyr Phe Pro Leu Gln Ser Tyr Gly
485 490 495
Phe Gln Pro Thr Asn Gly Val Gly Tyr Gln Pro Tyr Arg Val Val Val
500 505 510
Leu Ser Phe Glu Leu Leu His Ala Pro Ala Thr Val Cys Gly Pro Lys
515 520 525
Lys Ser Thr Asn Leu Val Lys Asn Lys Cys Val Asn Phe Asn Phe Asn
530 535 540
Gly Leu Thr Gly Thr Gly Val Leu Thr Glu Ser Asn Lys Lys Phe Leu
545 550 555 560
Pro Phe Gln Gln Phe Gly Arg Asp Ile Ala Asp Thr Thr Asp Ala Val
565 570 575
Arg Asp Pro Gln Thr Leu Glu Ile Leu Asp Ile Thr Pro Cys Ser Phe
580 585 590
Gly Gly Val Ser Val Ile Thr Pro Gly Thr Asn Thr Ser Asn Gln Val
595 600 605
Ala Val Leu Tyr Gln Asp Val Asn Cys Thr Glu Val Pro Val Ala Ile
610 615 620
His Ala Asp Gln Leu Thr Pro Thr Trp Arg Val Tyr Ser Thr Gly Ser
625 630 635 640
Asn Val Phe Gln Thr Arg Ala Gly Cys Leu Ile Gly Ala Glu His Val
645 650 655
Asn Asn Ser Tyr Glu Cys Asp Ile Pro Ile Gly Ala Gly Ile Cys Ala
660 665 670
Ser Tyr Gln Thr Gln Thr Asn Ser Pro Arg Arg Ala Arg Ser Val Ala
675 680 685
Ser Gln Ser Ile Ile Ala Tyr Thr Met Ser Leu Gly Ala Glu Asn Ser
690 695 700
Val Ala Tyr Ser Asn Asn Ser Ile Ala Ile Pro Thr Asn Phe Thr Ile
705 710 715 720
Ser Val Thr Thr Glu Ile Leu Pro Val Ser Met Thr Lys Thr Ser Val
725 730 735
Asp Cys Thr Met Tyr Ile Cys Gly Asp Ser Thr Glu Cys Ser Asn Leu
740 745 750
Leu Leu Gln Tyr Gly Ser Phe Cys Thr Gln Leu Asn Arg Ala Leu Thr
755 760 765
Gly Ile Ala Val Glu Gln Asp Lys Asn Thr Gln Glu Val Phe Ala Gln
770 775 780
Val Lys Gln Ile Tyr Lys Thr Pro Pro Ile Lys Asp Phe Gly Gly Phe
785 790 795 800
Asn Phe Ser Gln Ile Leu Pro Asp Pro Ser Lys Pro Ser Lys Arg Ser
805 810 815
Phe Ile Glu Asp Leu Leu Phe Asn Lys Val Thr Leu Ala Asp Ala Gly
820 825 830
Phe Ile Lys Gln Tyr Gly Asp Cys Leu Gly Asp Ile Ala Ala Arg Asp
835 840 845
Leu Ile Cys Ala Gln Lys Phe Asn Gly Leu Thr Val Leu Pro Pro Leu
850 855 860
Leu Thr Asp Glu Met Ile Ala Gln Tyr Thr Ser Ala Leu Leu Ala Gly
865 870 875 880
Thr Ile Thr Ser Gly Trp Thr Phe Gly Ala Gly Ala Ala Leu Gln Ile
885 890 895
Pro Phe Ala Met Gln Met Ala Tyr Arg Phe Asn Gly Ile Gly Val Thr
900 905 910
Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn Gln Lys Leu Ile Ala Asn Gln Phe Asn
915 920 925
Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln Asp Ser Leu Ser Ser Thr Ala Ser Ala
930 935 940
Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn
945 950 955 960
Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser Ser Val
965 970 975
Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln
980 985 990
Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val
995 1000 1005
Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala Glu Ile Arg Ala Ser Ala Asn
1010 1015 1020
Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys Val Leu Gly Gln Ser Lys
1025 1030 1035
Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His Leu Met Ser Phe Pro
1040 1045 1050
Gln Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu His Val Thr Tyr Val
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Pro Ala Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala Ile Cys His
1070 1075 1080
Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe Val Ser Asn
1085 1090 1095
Gly Thr His Trp Phe Val Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu Pro Gln
1100 1105 1110
Ile Ile Thr Thr Asp Asn Thr Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp Val
1115 1120 1125
Val Ile Gly Ile Val Asn Asn Thr Val Tyr Asp Pro Leu Gln Pro
1130 1135 1140
Glu Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn
1145 1150 1155
His Thr Ser Pro Asp Val Asp Leu Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn
1160 1165 1170
Ala Ser Val Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu
1175 1180 1185
Val Ala Lys Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu
1190 1195 1200
Gly Lys Tyr Glu Gln Tyr Ile Lys Trp Pro Trp Tyr Ile Trp Leu
1205 1210 1215
Gly Phe Ile Ala Gly Leu Ile Ala Ile Val Met Val Thr Ile Met
1220 1225 1230
Leu Cys Cys Met Thr Ser Cys Cys Ser Cys Leu Lys Gly Cys Cys
1235 1240 1245
Ser Cys Gly Ser Cys Cys Lys Phe Asp Glu Asp Asp Ser Glu Pro
1250 1255 1260
Val Leu Lys Gly Val Lys Leu His Tyr Thr Trp Ser His Pro Gln
1265 1270 1275
Phe Glu Lys
1280
<210> 135
<211> 3846
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Nucleic acid sequence of full length S protein of SARS-CoV-2
<400> 135
atgttcgtgt tcctggtgct gctgcctctg gtgagcagcc agtgcgtgaa tctgaccacc 60
agaacccagc tgcctcctgc ctacaccaat agcttcacca gaggagttta ttatcccgat 120
aaggtgttca gaagtagtgt attacatagt acccaggacc tgttcctacc tttcttcagt 180
aacgtgacct ggttccacgc catccacgtg agcggcacca atggcaccaa gagattcgac 240
aatcctgtgc tgcctttcaa tgacggcgtg tacttcgcca gcaccgagaa gagcaatatc 300
atcagaggct ggatcttcgg caccaccttg gattccaaga ctcagagcct gctgattgta 360
aacaacgcta caaatgtggt gatcaaggtg tgcgagttcc agttctgcaa tgaccctttc 420
ctgggtgttt attatcataa gaacaacaag agctggatgg agagcgagtt ccgcgtatat 480
tcgtcggcta ataattgcac cttcgagtac gtgagccagc ctttcctgat ggacctggag 540
ggcaagcagg gcaatttcaa gaatctgaga gagttcgtgt tcaagaatat cgacggctac 600
ttcaagatct acagcaagca cacacccatt aatctggtga gagacctgcc tcagggcttc 660
agcgccctgg agcctctggt ggacctgcct atcggcatca atatcaccag attccagacc 720
ctgctggccc tgcacagatc atatcttaca ccaggcgatt cgtcaagcgg ttggaccgct 780
ggagctgcgg catattacgt gggctacctg cagcctagaa ccttcctgct gaagtacaat 840
gagaatggta cgataaccga cgcagttgat tgtgccctgg accctctgag cgagaccaag 900
tgcaccctga agagcttcac cgtggagaag ggcatctacc agaccagcaa tttcagagtg 960
cagcctaccg agagcatcgt gagattccct aatatcacca atctgtgccc tttcggcgag 1020
gtgttcaatg ccaccagatt cgccagcgtg tacgcatgga accgcaagcg gataagcaat 1080
tgcgtggccg actacagcgt gctgtacaat agcgccagct tcagcacctt caaatgttat 1140
ggtgtttcgc caacaaagct gaatgacctg tgcttcacca atgtgtacgc cgacagcttc 1200
gtgatcagag gcgacgaggt gagacagatc gcgccagggc agaccggcaa gatcgccgac 1260
tacaattaca agctgcctga cgacttcacc ggctgcgtga tcgcgtggaa ctctaacaat 1320
ctagattcga aagttggagg caattacaat tacctgtaca gactgttcag aaagagcaat 1380
ctgaagcctt tcgagagaga catcagcacc gagatctacc aggccggcag cacaccgtgt 1440
aatggcgtgg agggcttcaa ttgctacttc cctctgcaga gctacggctt ccagcctacc 1500
aatggcgtgg gctaccagcc ttacagagtg gtggtgctga gcttcgagct gctgcacgct 1560
cccgctaccg tgtgcggccc taagaagagc accaatctgg tgaagaataa gtgcgtgaat 1620
ttcaatttca atggtctaac tggaacgggc gtgctgaccg agagcaataa gaagtttctt 1680
ccctttcaac aattcggcag agacatcgcc gacaccacag atgctgtaag agaccctcag 1740
accctggaga tcctggacat cactccgtgt agcttcggcg gcgtgagcgt gatcacaccg 1800
ggtaccaata ccagcaatca ggtggccgtg ctgtaccagg acgtgaattg caccgaggtg 1860
cctgtggcca tccacgccga ccagctgact cccacttgga gggtatattc cacgggaagc 1920
aatgtgttcc agaccagagc cggctgcctg atcggcgccg agcacgtgaa taatagctac 1980
gagtgcgaca tccctatcgg cgccggcatc tgcgccagct accagaccca gaccaatagc 2040
cctagaagag ccagaagcgt ggccagccag agcatcatcg cctacaccat gagcctgggc 2100
gccgagaata gcgtggccta cagcaataat agcatcgcca tccctaccaa tttcaccatc 2160
agcgtgacca ccgaaatatt accagtctcc atgaccaaga ccagcgtgga ctgcaccatg 2220
tacatctgcg gcgacagcac cgagtgcagc aatctgctgc tgcagtacgg cagcttctgc 2280
acccagctga atagagccct gaccggcatc gccgtggagc aggacaagaa tacccaggag 2340
gtgttcgccc aggtgaagca gatctacaag actccgccga tcaaggactt cggcggcttc 2400
aatttcagcc aaatactccc agatccaagc aagcctagca agaggagctt catcgaggac 2460
ctgctgttca ataaggtgac cctggccgac gccggcttca tcaagcagta cggcgactgc 2520
ctaggtgata ttgcggcaag agacctgatc tgcgcccaga agtttaacgg tttgacagta 2580
ctacctcctc tgctgaccga cgagatgata gcacaatata cgtcggcatt gctcgctggc 2640
acgatcacat cgggctggac tttcggcgcc ggagcagcgt tgcaaatccc tttcgccatg 2700
cagatggcct acagattcaa tggcatcggc gtgacccaga atgtgctgta cgagaatcag 2760
aagctgatcg ccaatcagtt caatagcgcc atcggcaaga tccaggacag cctgagcagc 2820
accgccagcg ccctgggcaa gctgcaggac gtggtgaatc agaatgccca ggccctgaat 2880
accctggtga agcagctgag cagcaatttc ggcgccatca gtagtgtact caacgatatc 2940
ctgagcagac tggacaaggt ggaggccgag gtgcaaattg atcgtcttat tactggcaga 3000
ctgcagagcc tgcagaccta cgtgacccag cagctgatca gagccgccga gatcagagcc 3060
agcgccaatc tggccgccac caagatgagc gagtgcgtgc tgggccagag caagagagtg 3120
gacttctgcg gcaagggcta ccacctgatg agcttccctc agagcgctcc acatggcgtg 3180
gtgttcctgc acgtgaccta cgtgcctgcc caggagaaga atttcaccac cgcacccgca 3240
atctgccacg acggcaaggc ccacttccct agagagggcg tgttcgtgag caatggcacc 3300
cactggttcg tgacccagag aaatttctac gagcctcaga tcatcaccac cgacaatacc 3360
ttcgtgagcg gcaattgcga cgtggtgatc gggatagtca ataatactgt ctacgaccct 3420
ctgcagcctg agctggacag cttcaaggag gagctggaca agtacttcaa gaatcacacc 3480
agccctgacg tggacctcgg tgatatttcg ggaatcaatg ccagcgtggt gaatatccag 3540
aaggaaattg atcggctcaa cgaagtggcc aagaatctga atgagagcct gatcgacctg 3600
caggagctgg gcaagtacga gcagtacatc aagtggcctt ggtacatctg gctgggcttc 3660
atcgccggcc tgatcgccat cgtgatggtg accatcatgc tgtgctgcat gacctcctgt 3720
tgttcctgtt tgaaagggtg ttgttcgtgt gggtcctgct gcaagttcga cgaggacgac 3780
agcgagcctg tgctgaaggg cgtgaagctg cactacacct ggagccaccc tcagttcgag 3840
aagtga 3846
<210> 136
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 136
Gly Tyr Thr Phe Thr Thr Tyr Val
1 5
<210> 137
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 137
Ile Asn Thr Asn Thr Gly Asn Pro
1 5
<210> 138
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR3
<222> (1)..(12)
<400> 138
Ser Cys Glu Ile Thr Thr Leu Gly Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 139
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 139
Asn Ile Gly Ser Lys Ser
1 5
<210> 140
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 140
Tyr Asp Ser Xaa
1
<210> 141
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 141
Gln Val Trp Asp Ser Ile Ser Asp His Arg Val
1 5 10
<210> 142
<211> 119
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 VH
<222> (1)..(119)
<400> 142
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ser Glu Leu Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Thr Tyr
20 25 30
Val Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Thr Asn Thr Gly Asn Pro Thr Tyr Ala Gln Gly Phe
50 55 60
Thr Gly Arg Phe Val Phe Ser Leu Asp Thr Ser Val Ser Thr Ala Ser
65 70 75 80
Leu Gln Ile Ser Ser Leu Lys Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Cys Glu Ile Thr Thr Leu Gly Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 143
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 VL
<222> (1)..(108)
<400> 143
Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Lys
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Tyr Asp Ser Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Gly Val Glu Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ile Ser Asp His
85 90 95
Arg Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 144
<211> 357
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 VHnu
<222> (1)..(357)
<400> 144
caggtgcagc tggtgcaatc tgggtctgag ttgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcact acctatgtta tgaattgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atcaacacca acactgggaa cccaacgtat 180
gcccagggct tcacaggacg gtttgtcttc tccttggaca cctctgtcag cacggcatct 240
ctgcagatca gcagcctaaa ggctgaggac actgccgtgt attactgttc gtgtgaaata 300
accaccttgg gcggtatgga cgtctggggc caagggacca cggtcaccgt ctcctca 357
<210> 145
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 VLnu
<222> (1)..(324)
<400> 145
tcctatgtgc tgactcagcc accctcagtg tcagtggccc caggaaagac ggccaggatt 60
acctgtgggg gaaacaacat tggaagtaaa agtgtgcact ggtaccagca gaagccaggc 120
caggcccctg tgctggtcat ctattatgat agcgaccggc cctcagggat ccctgagcga 180
ttctctggct ccaactctgg gaacacggcc accctgacca tcagcggggt cgaagccggg 240
gatgaggccg actattactg tcaggtgtgg gatagtatta gtgatcatcg ggtgttcggc 300
ggagggacca agctgaccgt ccta 324
<210> 146
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 146
Gly Gly Ser Ile Ser Ser Tyr Tyr
1 5
<210> 147
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 147
Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr
1 5
<210> 148
<211> 14
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 HCDR3
<222> (1)..(14)
<400> 148
Ala Arg Leu Glu Arg Asp Trp Pro Leu Asp Ala Phe Asp Ile
1 5 10
<210> 149
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 149
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 150
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 150
Asp Val Ser Xaa
1
<210> 151
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 151
Ser Ser Tyr Thr Ser Asn Asn Thr Phe Ala
1 5 10
<210> 152
<211> 120
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 VH
<222> (1)..(120)
<400> 152
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu Lys
50 55 60
Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Lys Gln Phe Ser Leu
65 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Leu Glu Arg Asp Trp Pro Leu Asp Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 153
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 VL
<222> (1)..(110)
<400> 153
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Phe
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Asn
85 90 95
Asn Thr Phe Ala Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 154
<211> 360
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 VHnu
<222> (1)..(360)
<400> 154
caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcggagac cctgtccctc 60
acctgcactg tctctggtgg ctccatcagt agttactact ggagctggat ccggcagccc 120
ccagggaagg gactggagtg gattgggtat atctattaca gtgggagcac caactacaac 180
ccctccctca agagtcgagt caccatatca gtagacacgt ccaagaagca gttctccctg 240
aagctgagct ctgtgaccgc tgcggacacg gccgtgtatt actgtgcgag gctcgaacga 300
gactggccac ttgatgcttt tgatatctgg ggccaaggga caatggtcac cgtctcctca 360
<210> 155
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A1 VLnu
<222> (1)..(330)
<400> 155
cagtctgccc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacag 120
cacccaggca aagcccccaa attcatgatt tatgatgtca gtaagcggcc ctcaggggtt 180
tctaatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg acgaggctga ttattactgc agctcatata caagcaacaa cactttcgcg 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 156
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 156
Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 157
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 157
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 158
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 HCDR3
<222> (1)..(12)
<400> 158
Ala Arg Glu Leu Tyr Glu Val Gly Ala Thr Asp Tyr
1 5 10
<210> 159
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 LCDR1
<222> (1)..(11)
<400> 159
Gln Ser Leu Val Tyr Ser Asp Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 160
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 160
Lys Val Ser Xaa
1
<210> 161
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 161
Met Gln Arg Tyr Thr Leu Ala Gly Val
1 5
<210> 162
<211> 118
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 VH
<222> (1)..(118)
<400> 162
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Glu Leu Tyr Glu Val Gly Ala Thr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 163
<211> 112
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 VL
<222> (1)..(112)
<400> 163
Asp Val Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Leu Gly
1 5 10 15
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val Tyr Ser
20 25 30
Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asn Trp Phe Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Arg Arg Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Trp Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Arg
85 90 95
Tyr Thr Leu Ala Gly Val Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100 105 110
<210> 164
<211> 354
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 VHnu
<222> (1)..(354)
<400> 164
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgcgag agaattgtac 300
gaagtgggag ctacggacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 165
<211> 336
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1D7 VLnu
<222> (1)..(336)
<400> 165
gatgttgtga tgactcagtc tccactctcc ctgcccgtca cccttggaca gccggcctcc 60
atctcctgca ggtctagtca aagcctcgta tacagtgatg gaaacaccta cttgaattgg 120
tttcagcaga ggccaggcca atctccaagg cgcctaattt ataaggtttc taactgggac 180
tctggggtcc cagacagatt cagcggcagt gggtcaggca ctgatttcac actgaaaatc 240
agcagggtgg aggctgagga tgttggggtt tattactgca tgcaacggta cacactggcc 300
ggcgttttcg gccctgggac caaagtggat atcaaa 336
<210> 166
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 166
Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 167
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 167
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 168
<211> 15
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 HCDR3
<222> (1)..(15)
<400> 168
Ala Arg Glu Gly Pro Lys Ser Ile Thr Gly Thr Ala Phe Asp Ile
1 5 10 15
<210> 169
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 169
Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
1 5
<210> 170
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 170
Asp Ala Ser Xaa
1
<210> 171
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 171
Gln Gln Tyr Asp Asn Leu Pro Met Tyr Thr
1 5 10
<210> 172
<211> 121
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 VH
<222> (1)..(121)
<400> 172
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Glu Gly Pro Lys Ser Ile Thr Gly Thr Ala Phe Asp Ile Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Ile Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 173
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 VL
<222> (1)..(108)
<400> 173
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Phe Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asp Asn Leu Pro Met
85 90 95
Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 174
<211> 363
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 VHnu
<222> (1)..(363)
<400> 174
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtttatt actgtgcgag agagggccca 300
aagtctatta cagggacggc ttttgatatc tggggccaag ggacaattgt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 175
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1A10 VLnu
<222> (1)..(324)
<400> 175
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc aggcgagtca ggacattagc aactatttta attggtatca gcagaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctacgat gcatccaatt tggaaacagg ggtcccatca 180
aggttcagtg gaagtggatc tgggacagat tttactttca ccatcagcag cctgcagcct 240
gaagatattg caacatatta ctgtcaacag tatgataatc tccccatgta cacttttggc 300
caggggacca agctggagat caaa 324
<210> 176
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 HCDR1
<222> (1)..(10)
<400> 176
Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser Gly Val Gly
1 5 10
<210> 177
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 177
Ile Tyr Trp Asp Asp Asp Lys
1 5
<210> 178
<211> 16
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 HCDR3
<222> (1)..(16)
<400> 178
Ala His Thr Arg Ile Leu Tyr Tyr Gly Ser Gly Ser Tyr Tyr Asp Tyr
1 5 10 15
<210> 179
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 LCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 179
Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Tyr
1 5
<210> 180
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 180
Ser Asn Asn Xaa
1
<210> 181
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 181
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Ser Gly Val Val
1 5 10
<210> 182
<211> 124
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 VH
<222> (1)..(124)
<400> 182
Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Val Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala Leu Ile Tyr Trp Asp Asp Asp Lys Tyr Tyr Ser Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Thr Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val
65 70 75 80
Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala His Thr Arg Ile Leu Tyr Tyr Gly Ser Gly Ser Tyr Tyr Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 183
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 VL
<222> (1)..(110)
<400> 183
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn
20 25 30
Tyr Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Ser Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Arg
65 70 75 80
Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu
85 90 95
Ser Gly Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 184
<211> 372
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 VHnu
<222> (1)..(372)
<400> 184
cagatcacct tgaaggagtc tggtcctacg ctggtgaaac ccacacagac cctcacgctg 60
acctgcacct tctctgggtt ctcactcagc actagtggag tgggtgtggg ctggatccgt 120
cagcccccag gaaaggccct ggagtggctt gcactcattt attgggatga tgataaatac 180
tacagcccat ctctgaagag caggctcacc atcaccaagg acacctccaa aaaccaggtg 240
gtccttacaa tgaccaacat ggaccctgtg gacacagcca catattactg tgcacacact 300
cgcatcttat actatggttc ggggagttat tatgactact ggggccaggg aaccctggtc 360
accgtctcct ca 372
<210> 185
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1D9 VLnu
<222> (1)..(330)
<400> 185
cagtctgtgc tgactcagcc accctcagcg tctgggaccc ccgggcagag ggtcaccatc 60
tcttgttctg gaagcagctc caacatcgga agtaattatg tatactggta ccagcagctc 120
ccaggaacgg cccccaaact cctcatctat agtaataatc agcggccctc aggggtccct 180
gaccgattct ctggctccaa gtctggcacc tcagcctccc tggccatcag tgggctccgg 240
tccgaggatg aggctgatta ttactgtgca gcatgggatg acagcctgag tggtgtggta 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 186
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 HCDR1
<222> (1)..(10)
<400> 186
Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser Gly Val Gly
1 5 10
<210> 187
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 187
Ile Tyr Trp Asp Asp Asp Lys
1 5
<210> 188
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 188
Ala His Gln Ile Val Ala Thr Ile Ile Asp Tyr
1 5 10
<210> 189
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 189
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 190
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 190
Asp Val Ser Xaa
1
<210> 191
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 191
Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Val Val
1 5
<210> 192
<211> 119
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 VH
<222> (1)..(119)
<400> 192
Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Val Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala Leu Ile Tyr Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Ser Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Thr Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val
65 70 75 80
Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala His Gln Ile Val Ala Thr Ile Ile Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 193
<211> 109
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 VL
<222> (1)..(109)
<400> 193
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95
Ser Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 194
<211> 357
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 VHnu
<222> (1)..(357)
<400> 194
cagatcacct tgaaggagtc tggtcctacg ctggtgaaac ccacacagac cctcacgctg 60
acctgcacct tctctgggtt ctcactcagc actagtggag tgggtgtggg ctggatccgt 120
cagcccccag gaaaggccct ggagtggctt gcactcattt attgggatga tgataagcgc 180
tacagcccat ctctgaagag caggctcacc atcaccaagg acacctccaa aaaccaggtg 240
gtccttacaa tgaccaacat ggaccctgtg gacacagcca catattactg tgcacaccaa 300
atagtggcta cgattattga ctactggggc cagggaaccc tggtcaccgt ctcctca 357
<210> 195
<211> 327
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1E4 VLnu
<222> (1)..(327)
<400> 195
cagtctgccc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacag 120
cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgatgtca gtaagcggcc ctcaggggtt 180
tctaatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg acgaggctga ttattactgc agctcatata caagcagcag cgtggtattc 300
ggcggaggga ccaagctgac cgtccta 327
<210> 196
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 196
Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 197
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 197
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 198
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 198
Ala Arg Asp Tyr Gly Asp Tyr Trp Phe Asp Pro
1 5 10
<210> 199
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 LCDR1
<222> (1)..(7)
<400> 199
Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr
1 5
<210> 200
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 200
Gly Ala Ser Xaa
1
<210> 201
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 201
Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Arg Thr
1 5
<210> 202
<211> 117
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 VH
<222> (1)..(117)
<400> 202
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Tyr Gly Asp Tyr Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 203
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 VL
<222> (1)..(108)
<400> 203
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro
85 90 95
Arg Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 204
<211> 351
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 VHnu
<222> (1)..(351)
<400> 204
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggcagatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gctgtgtatt actgtgcgag agactacggt 300
gactactggt tcgacccctg gggccaggga accctggtca ccgtctcctc a 351
<210> 205
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G1 VLnu
<222> (1)..(324)
<400> 205
gaaattgtgt tgacgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 60
ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc agcagctact tagcctggta ccagcagaaa 120
cctggccagg ctcccaggct cctcatctat ggtgcatcca gcagggccac tggcatccca 180
gacaggttca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag 240
cctgaagatt ttgcagtgta ttactgtcag cagtatggta gctcaccgag gacttttggc 300
caggggacca agctggagat caaa 324
<210> 206
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 206
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly
1 5
<210> 207
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 207
Ile Ser Asp Asp Gly Ser Asn Gln
1 5
<210> 208
<211> 21
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 HCDR3
<222> (1)..(21)
<400> 208
Ala Lys Arg Gly Gly Tyr Cys Ser Thr Thr Ser Cys Leu Val Arg Trp
1 5 10 15
Val Tyr Phe Asp Tyr
20
<210> 209
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 209
Gln Phe Ile Ser Ser Tyr
1 5
<210> 210
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 210
Ala Thr Ser Xaa
1
<210> 211
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 LCDR3
<222> (1)..(8)
<400> 211
Gln Gln Ser Tyr Asn Thr Leu Thr
1 5
<210> 212
<211> 128
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 VH
<222> (1)..(128)
<400> 212
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Ser Asp Asp Gly Ser Asn Gln Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Glu Ile Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Gly Gly Tyr Cys Ser Thr Thr Ser Cys Leu Val Arg Trp
100 105 110
Val Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 213
<211> 106
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 VL
<222> (1)..(106)
<400> 213
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Phe Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Thr Ser Ile Leu Gln Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Asn Thr Leu Thr
85 90 95
Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100 105
<210> 214
<211> 384
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 VHnu
<222> (1)..(384)
<400> 214
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccagtct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcagatg atggaagtaa tcaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctggaaatca acagcctgag agttgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaaggggc 300
ggatattgta gtactaccag ctgcctcgtt aggtgggtct actttgacta ctggggccag 360
ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 384
<210> 215
<211> 318
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P4A-2D9 VLnu
<222> (1)..(318)
<400> 215
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc gggcaagtca gttcattagc agctacttaa attggtatca gcagaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctatgct acatccattt tgcaaactgg ggtcccatca 180
aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240
gaagattttg caacttacta ctgtcaacag agttacaata cccttacttt cggccctggg 300
accaaagtcg atatcaaa 318
<210> 216
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 HCDR1
<222> (1)..(10)
<400> 216
Gly Asp Ser Val Ser Ser Gly Ser Tyr Tyr
1 5 10
<210> 217
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 217
Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr
1 5
<210> 218
<211> 20
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 HCDR3
<222> (1)..(20)
<400> 218
Ala Arg Glu Arg Cys Tyr Tyr Gly Ser Gly Arg Ala Pro Arg Cys Val
1 5 10 15
Trp Phe Asp Pro
20
<210> 219
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 219
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 220
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 220
Asp Val Ser Xaa
1
<210> 221
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 221
Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Leu Val Val
1 5 10
<210> 222
<211> 128
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 VH
<222> (1)..(128)
<400> 222
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Asp Ser Val Ser Ser Gly
20 25 30
Ser Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Glu Arg Cys Tyr Tyr Gly Ser Gly Arg Ala Pro Arg Cys
100 105 110
Val Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 223
<211> 111
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 VL
<222> (1)..(111)
<400> 223
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95
Ser Thr Leu Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 224
<211> 384
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 VHnu
<222> (1)..(384)
<400> 224
caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcggagac cctgtccctc 60
acctgcactg tctctggtga ctccgtcagc agtggtagtt actactggag ctggatccgg 120
cagcccccag ggaagggact ggagtggatt gggtatatct attacagtgg gagcaccaac 180
tacaacccct ccctcaagag tcgagtcacc atatcagtag acacgtccaa gaaccagttc 240
tccctgaagc tgagctctgt gaccgctgcg gacacggccg tgtattactg tgcgagagag 300
cgatgttact atggttcagg gagagccccc cgttgtgtct ggttcgaccc ctggggccag 360
ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 384
<210> 225
<211> 333
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G7 VLnu
<222> (1)..(333)
<400> 225
cagtctgccc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacaa 120
cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgatgtca gtaatcggcc ctcaggggtt 180
tctaatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg acgaggctga ttattactgc agctcatata caagcagcag cactctcgtg 300
gtattcggcg gagggaccaa gctgaccgtc cta 333
<210> 226
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 226
Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 227
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 227
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 228
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 228
Ala Arg Asp Leu Gln Glu His Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 229
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 229
Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
1 5
<210> 230
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 230
Ala Ala Ser Xaa
1
<210> 231
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 231
Gln His Leu Asn Ser Tyr Pro Pro Gly Tyr Thr
1 5 10
<210> 232
<211> 117
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 VH
<222> (1)..(117)
<400> 232
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Leu Gln Glu His Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 233
<211> 109
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 VL
<222> (1)..(109)
<400> 233
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln His Leu Asn Ser Tyr Pro Pro
85 90 95
Gly Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 234
<211> 351
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 VHnu
<222> (1)..(351)
<400> 234
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggaatg ggtctcattt atttatagcg gtggtagtac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgcgag agatctacag 300
gaacacggta tggacgtctg gggccaaggg accacggtca ccgtctcctc a 351
<210> 235
<211> 327
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C8 VLnu
<222> (1)..(327)
<400> 235
gacatccagt tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc gggccagtca gggcattagc agttatttag cctggtatca gcaaaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctatgct gcatccactt tgcaaagtgg ggtcccatca 180
aggttcagcg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag cctgcagcct 240
gaagattttg caacttatta ctgtcaacac cttaatagtt accctccggg gtacactttt 300
ggccagggga ccaagctgga gatcaaa 327
<210> 236
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 236
Gly Phe Ile Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 237
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 237
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 238
<211> 15
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 HCDR3
<222> (1)..(15)
<400> 238
Ala Arg Ala Leu Gln Val Gly Ala Thr Ser Asp Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10 15
<210> 239
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 239
Ser Ser Asn Ile Gly Ala Gly Tyr Asp
1 5
<210> 240
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 240
Gly Asn Ser Xaa
1
<210> 241
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 241
Gln Ser Cys Asp Ser Ser Leu Ser Val Val Val
1 5 10
<210> 242
<211> 121
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 VH
<222> (1)..(121)
<400> 242
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ile Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ile Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Asn Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Ala Leu Gln Val Gly Ala Thr Ser Asp Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 243
<211> 111
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 VL
<222> (1)..(111)
<400> 243
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Gly Ala Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Gly
20 25 30
Tyr Asp Val His Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Leu Ile Tyr Gly Asn Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Thr Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Thr Asp Tyr Tyr Cys Gln Ser Cys Asp Ser Ser
85 90 95
Leu Ser Val Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 244
<211> 363
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 VHnu
<222> (1)..(363)
<400> 244
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt catcgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcaatt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaacaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtatatt actgtgcgag agccctccag 300
gtgggagcta cttcggacta ctttgactac tggggccagg gaaccctggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 245
<211> 333
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D2 VLnu
<222> (1)..(333)
<400> 245
cagtctgtgc tgacgcagcc gccctcagtg tctggggccc cagggcagag ggtcaccatc 60
tcctgcactg ggagcagctc caacatcggg gcaggttatg atgtacactg gtaccagcaa 120
cttccaggaa cagcccccaa actcctcatc tatggtaaca gcaatcggcc ctcaggggtc 180
cctgaccgat tctctggctc caagtctggc acctcagcct ccctggccat cactgggctc 240
caggctgaag atgagactga ttattactgc cagtcctgtg acagcagcct gagtgttgtg 300
gtattcggcg gagggaccaa gctgaccgtc cta 333
<210> 246
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 246
Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Asp
1 5
<210> 247
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 247
Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr
1 5
<210> 248
<211> 15
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 HCDR3
<222> (1)..(15)
<400> 248
Ala Arg Tyr Ile Val Val Val Pro Ala Ala Lys Gly Phe Asp Pro
1 5 10 15
<210> 249
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 LCDR1
<222> (1)..(12)
<400> 249
Gln Ser Val Leu Tyr Ser Ser Asn Asn Lys Asn Tyr
1 5 10
<210> 250
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 250
Trp Ala Ser Xaa
1
<210> 251
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 251
Gln Gln Tyr Tyr Ser Thr Pro Leu Thr
1 5
<210> 252
<211> 122
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 VH
<222> (1)..(122)
<400> 252
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr Gly Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asn Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Tyr Ile Val Val Val Pro Ala Ala Lys Gly Phe Asp Pro Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 253
<211> 113
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 VL
<222> (1)..(113)
<400> 253
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Tyr Ser Thr Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 254
<211> 366
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 VHnu
<222> (1)..(366)
<400> 254
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc agttatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
actggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atgaacccta acagtggtaa cacaggctat 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accaggaaca cctccataag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagatatatt 300
gtagtagtac cagctgcaaa agggttcgac ccctggggcc agggaaccct ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 255
<211> 339
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2F11 VLnu
<222> (1)..(339)
<400> 255
gacatcgtga tgacccagtc tccagactcc ctggctgtgt ctctgggcga gagggccacc 60
atcaactgca agtccagcca gagtgtttta tacagctcca acaataagaa ctacttagct 120
tggtaccagc agaaaccagg acagcctcct aagctgctca tttactgggc atctacccgg 180
gaatccgggg tccctgaccg attcagtggc agcgggtctg ggacagattt cactctcacc 240
atcagcagcc tgcaggctga agatgtggca gtttattact gtcagcaata ttatagtact 300
cctctcactt tcggcggagg gaccaaggtg gagatcaaa 339
<210> 256
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 256
Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr Trp
1 5
<210> 257
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 257
Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr
1 5
<210> 258
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 HCDR3
<222> (1)..(12)
<400> 258
Ala Gln Thr Ser Val Thr Arg Asn Trp Phe Asp Pro
1 5 10
<210> 259
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 259
Asn Ile Gly Ser Lys Ser
1 5
<210> 260
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 260
Tyr Asp Ser Xaa
1
<210> 261
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 261
Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His Val Val
1 5 10
<210> 262
<211> 119
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 VH
<222> (1)..(119)
<400> 262
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Gln Thr Ser Val Thr Arg Asn Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 263
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 VL
<222> (1)..(108)
<400> 263
Ser Tyr Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ala Pro Gly Lys
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val
20 25 30
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
Tyr Asp Ser Asp Arg Pro Ser Gly Ile Pro Glu Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Asn Ser Gly Asn Thr Ala Thr Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Gly
65 70 75 80
Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Gln Val Trp Asp Ser Ser Ser Asp His
85 90 95
Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105
<210> 264
<211> 357
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 VHnu
<222> (1)..(357)
<400> 264
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc ccagacgtca 300
gtgactcgca actggttcga cccctggggc cagggaaccc tggtcaccgt ctcctca 357
<210> 265
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2E1 VLnu
<222> (1)..(324)
<400> 265
tcctatgtgc tgactcagcc accctcagtg tcagtggccc caggaaagac ggccaggatt 60
acctgtgggg gaaacaacat tggaagtaaa agtgtgcact ggtaccagca gaagccaggc 120
caggcccctg tgctggtcat ctattatgat agcgaccggc cctcagggat ccctgagcga 180
ttctctggct ccaactctgg gaacacggcc accctgacca tcagcagggt cgaagccggg 240
gatgaggccg actattactg tcaggtgtgg gatagtagta gtgatcatgt ggtattcggc 300
ggagggacca agctgaccgt ccta 324
<210> 266
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 266
Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Tyr
1 5
<210> 267
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 267
Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 268
<211> 22
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 HCDR3
<222> (1)..(22)
<400> 268
Ala Arg Ser Ala Arg Asp Tyr Tyr Asp Ser Ser Gly Tyr Tyr Tyr Arg
1 5 10 15
Ala Glu Tyr Phe Gln His
20
<210> 269
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 269
Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
1 5
<210> 270
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 270
Asp Ala Ser Xaa
1
<210> 271
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 271
Gln Gln Tyr Asp Asn Leu Pro Ser Ile Thr
1 5 10
<210> 272
<211> 129
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 VH
<222> (1)..(129)
<400> 272
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Ala Arg Asp Tyr Tyr Asp Ser Ser Gly Tyr Tyr Tyr Arg
100 105 110
Ala Glu Tyr Phe Gln His Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
115 120 125
Ser
<210> 273
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(108)
<223> P5A-1C8 VL
<400> 273
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asp Asn Leu Pro Ser
85 90 95
Ile Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 274
<211> 387
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 VHnu
<222> (1)..(387)
<400> 274
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtt 60
tcctgcaagg catctggata caccttcacc agctactata tgcactgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gatgggaata atcaacccta gtggtggtag cacaagctac 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accagggaca cgtccacgag cacagtctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gaggtcggcc 300
cgggattact atgatagtag tggttattac taccgcgctg aatacttcca gcactggggc 360
cagggcaccc tggtcaccgt ctcctca 387
<210> 275
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1C8 VLnu
<222> (1)..(324)
<400> 275
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc aggcgagtca ggacattagc aactatttaa attggtatca gcagaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctacgat gcatccaatt tggaaacagg ggtcccatca 180
aggttcagtg gaagtggatc tgggacagat tttactttca ccatcagcag cctgcagcct 240
gaagatattg caacatatta ctgtcaacag tatgataatc tcccctctat caccttcggc 300
caagggacac gactggagat taaa 324
<210> 276
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 276
Gly Gly Thr Ser Ser Phe Tyr Asp
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 277
Ile Ile Pro Arg Leu Asp Ile Ala
1 5
<210> 278
<211> 16
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 HCDR3
<222> (1)..(16)
<400> 278
Ala Arg Gly Arg Pro Gly Ser Glu Trp Ala Tyr Gly Pro Phe Asp Leu
1 5 10 15
<210> 279
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 KCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 279
Gln Ser Ser Arg Ala Trp
1 5
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 KCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 280
Lys Ala Ser Xaa
1
<210> 281
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 KCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 281
His Gln Tyr Asn Ser Ser Pro Phe Thr
1 5
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<211> 123
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 VH
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<400> 282
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Asn Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Gly Gly Gly Thr Ser Ser Phe Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Lys Ile Ile Pro Arg Leu Asp Ile Ala Asp Tyr Ala Gln Lys Ser
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Glu Leu Ser Ser Leu Lys Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Arg Pro Gly Ser Glu Trp Ala Tyr Gly Pro Phe Asp Leu
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 283
<211> 107
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 VL
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<400> 283
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ser Arg Ala Trp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Ser Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Tyr Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Asp Asp Ser Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Tyr Asn Ser Ser Pro Phe
85 90 95
Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Gln Ile Lys
100 105
<210> 284
<211> 369
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 VHnu
<222> (1)..(369)
<400> 284
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaacc cggggtcctc ggtgaaggtc 60
tcctgtaagg ctggtggagg cacctccagt ttctatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
cctggacaag ggcttgagtg gataggaaaa atcatcccta ggcttgatat agcagactac 180
gcacagaagt cccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag tacagtatac 240
ttggaattga gcagcctgaa gtcagacgac acggccgtgt atttctgtgc gagaggtcgg 300
ccgggttcgg agtgggcgta tggcccattt gacctctggg gccagggaac cctggtcacc 360
gtctcctca 369
<210> 285
<211> 321
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P1A-1C10 Vlnu
<222> (1)..(321)
<400> 285
gacatccaga tgacccagtc tccttccacc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc gggccagtca gagttctagg gcctggttgg cctggtatca gcagaaacca 120
gggaaagccc ctaaactcct gatctctaag gcgtctagtt tagaaagtgg ggtcccatca 180
aggttcagcg gcagtggata tgggacagaa ttcactctca ccatcagcag cctgcagcct 240
gatgattctg caacttatta ctgccaccag tataacagta gcccattcac tttcggccct 300
gggaccaaag tgcagatcaa a 321
<210> 286
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 286
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 287
Ile Ser Asp Asp Gly Ser Asn Gln
1 5
<210> 288
<211> 21
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 HCDR3
<222> (1)..(21)
<400> 288
Ala Lys Arg Gly Gly Tyr Cys Ser Thr Thr Ser Cys Leu Leu Arg Trp
1 5 10 15
Val Tyr Phe Asp Phe
20
<210> 289
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 289
Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
1 5
<210> 290
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent
<400> 290
Ala Ala Ser Xaa
1
<210> 291
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 LCDR3
<222> (1)..(8)
<400> 291
Gln Gln Ser Tyr Asn Thr Pro Thr
1 5
<210> 292
<211> 128
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 VH
<222> (1)..(128)
<400> 292
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ser Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Ser Asp Asp Gly Ser Asn Gln Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Gly Gly Tyr Cys Ser Thr Thr Ser Cys Leu Leu Arg Trp
100 105 110
Val Tyr Phe Asp Phe Trp Gly Gln Gly Thr Leu Ala Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 293
<211> 106
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 VL
<222> (1)..(106)
<400> 293
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Asn Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Asn Thr Pro Thr
85 90 95
Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100 105
<210> 294
<211> 384
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 VHnu
<222> (1)..(384)
<400> 294
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccagtct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcagatg atggaagtaa tcaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agttgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaaggggc 300
ggatattgta gtactaccag ctgcctcctt aggtgggtct actttgactt ctggggccag 360
ggaaccctgg ccaccgtctc ctca 384
<210> 295
<211> 318
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P4A-1H6 Vlnu
<222> (1)..(318)
<400> 295
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc gggcaagtca gagcattagc agctatttac attggtatca gcaaaaacca 120
gggaaagccc ctaacctcct gatctatgct gcatccagtt tgcaaagtgg ggtcccatca 180
aggttcagtg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag tctgcaacct 240
gaagactttg caacttacta ctgtcaacag agttacaata cccctacttt cggccctggg 300
accaaagtgg atatcaaa 318
<210> 296
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 296
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly
1 5
<210> 297
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 297
Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5
<210> 298
<211> 22
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 HCDR3
<222> (1)..(22)
<400> 298
Ala Lys Gly Pro Arg Tyr Ser Ser Ser Trp Tyr Ile Ser Leu Tyr Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 299
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 LCDR1
<222> (1)..(11)
<400> 299
Gln Ser Leu Val Tyr Ser Asp Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 300
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 300
Lys Val Ser Xaa
1
<210> 301
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 301
Met Gln Ala Thr His Trp Pro Leu Tyr Thr
1 5 10
<210> 302
<211> 129
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 VH
<222> (1)..(129)
<400> 302
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Ile Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Gly Pro Arg Tyr Ser Ser Ser Trp Tyr Ile Ser Leu Tyr Tyr
100 105 110
Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser
115 120 125
Ser
<210> 303
<211> 113
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 VL
<222> (1)..(113)
<400> 303
Asp Val Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Leu Gly
1 5 10 15
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val Tyr Ser
20 25 30
Asp Gly Asn Thr Tyr Leu Asn Trp Phe Gln Gln Arg Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Arg Arg Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Ala
85 90 95
Thr His Trp Pro Leu Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 304
<211> 387
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 VHnu
<222> (1)..(387)
<400> 304
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatca acagcctgag agctgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaagggcct 300
cggtatagca gcagctggta cataagcctt tactactact acggtatgga cgtctggggc 360
caagggacca cggtcaccgt ctcctca 387
<210> 305
<211> 339
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P4B-1F4 Vlnu
<222> (1)..(339)
<400> 305
gatgttgtga tgactcagtc tccactctcc ctgcccgtca cccttggaca gccggcctcc 60
atctcctgca ggtctagtca aagcctcgta tacagtgatg gaaacaccta cttgaattgg 120
tttcagcaga ggccaggcca atctccaagg cgcctaattt ataaggtttc taaccgggac 180
tctggggtcc cagacagatt cagcggcagt gggtcaggca ctgatttcac actgaaaatc 240
agcagggtgg aggctgagga tgttggggtt tattactgca tgcaagctac acactggccc 300
ctgtacactt ttggccaggg gaccaagctg gagatcaaa 339
<210> 306
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 306
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala
1 5
<210> 307
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 307
Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5
<210> 308
<211> 20
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 HCDR3
<222> (1)..(20)
<400> 308
Ala Arg Asp Gly Gln Ala Ile Thr Met Val Gln Gly Val Ile Gly Pro
1 5 10 15
Pro Phe Asp Tyr
20
<210> 309
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 309
Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
1 5
<210> 310
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 310
Asp Ala Ser Xaa
1
<210> 311
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 311
Gln Gln Tyr Asp Asn Leu Pro Tyr Thr
1 5
<210> 312
<211> 127
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 VH
<222> (1)..(127)
<400> 312
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Ser Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Gly Gln Ala Ile Thr Met Val Gln Gly Val Ile Gly Pro
100 105 110
Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 VL
<222> (1)..(107)
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asp Asn Leu Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
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<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 VHnu
<222> (1)..(381)
<400> 314
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
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ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
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<210> 315
<211> 321
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B6 Vlnu
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gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc aggcgagtca ggacattagc aactatttaa attggtatca gcagaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctacgat gcatccaatt tggaaacagg ggtcccatca 180
aggttcagtg gaagtggatc tgggacagat tttactttca ccatcagcag cctgcagcct 240
gaagatattg caacatatta ctgtcaacag tatgataatc tcccgtacac ttttggccag 300
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<210> 316
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
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Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
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<213> 人类
<220>
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<213> 人类
<220>
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<213> 人类
<220>
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<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
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<400> 320
Ala Ala Ser Xaa
1
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<213> 人类
<220>
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<220>
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50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Leu Asn Ser Tyr Pro Pro
85 90 95
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<212> DNA
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aggttcagcg gcagtggatc tgggacagaa ttcactctca caatcagcag cctgcagcct 240
gaagattttg caacttatta ctgtcaacag cttaatagtt accctccagc tttcggcgga 300
gggaccaagg tggagatcaa a 321
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B9 HCDR2
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Ile Ser Tyr Ser Gly Ser Thr
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<220>
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Gln Ser Val Leu Tyr Ser Ser Asn Asn Lys Asn Tyr
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B9 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B9 LCDR3
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1B9 VH
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1 5 10 15
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65 70 75 80
Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
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Ser Asn Gly Gln Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Gly Gln Pro Pro Asp Tyr
100 105 110
Trp Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<220>
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Lys
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<220>
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ccctccctca agagtcgagt caccatatca ctagacacgt ccaagaacca gttctccctg 240
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<210> 335
<211> 339
<212> DNA
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<220>
<221> P5A-1B9 Vlnu
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gacatcgtga tgacccagtc tccagactcc ctggctgtgt ctctgggcga gagggccacc 60
atcaactgca agtccagcca gagtgtttta tacagctcca acaataagaa ctacttagct 120
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<220>
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D1 HCDR2
<222> (1)..(7)
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Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
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<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D1 HCDR3
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<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D1 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 339
Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
1 5
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D1 LCDR2
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<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
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1
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<213> 人类
<220>
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<220>
<221> P5A-1D1 VH
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Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
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Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
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100 105 110
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<220>
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D1 VHnu
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ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
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<210> 345
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<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D1 Vlnu
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 HCDR1
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 HCDR2
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 HCDR3
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 349
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 350
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
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<210> 351
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 LCDR3
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Ser Ser Phe Thr Ser Ser Thr Thr Val Val Val
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<211> 128
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 VH
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<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 VL
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caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtcaagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctcaatt caccttcagt gactactcca tgacctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtttcatac attagtcaaa gtggtagtac catatactac 180
gcagactctg tgaagggccg attcaccatc tccagggaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaggtgtc 300
agcccatcct acgtttgggg gagttatcgt tccttgtacc actttgacta ctggggccag 360
ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 384
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<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-1D10 Vlnu
<222> (1)..(333)
<400> 355
cagtctgccc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacaa 120
cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgatgtca gtaatcggcc ctcaggggtt 180
tctaatcgct tctctgcctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg acgaggctga ttattactgc agctcattta caagcagcac cactgtcgtg 300
gtattcggcg gagggaccaa gctgaccgtc cta 333
<210> 356
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 356
Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr Trp
1 5
<210> 357
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 357
Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr
1 5
<210> 358
<211> 13
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 HCDR3
<222> (1)..(13)
<400> 358
Ala Arg Arg Asp Ser Thr Tyr Gly Gly Asn Thr Asp Tyr
1 5 10
<210> 359
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 LCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 359
Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Thr
1 5
<210> 360
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 360
Ser Asn Asn Xaa
1
<210> 361
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 361
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Asn Gly Val Val
1 5 10
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 VH
<222> (1)..(120)
<400> 362
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Asp Ser Thr Tyr Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 363
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 VL
<222> (1)..(110)
<400> 363
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn
20 25 30
Thr Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Ser Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Gln
65 70 75 80
Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu
85 90 95
Asn Gly Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 364
<211> 360
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 VHnu
<222> (1)..(360)
<400> 364
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacgggat 300
tcgacctacg gtggtaacac tgactactgg ggccagggaa ccctggtcac cgtctcctca 360
<210> 365
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2D11 Vlnu
<222> (1)..(330)
<400> 365
cagtctgtgc tgactcagcc accctcagcg tctgggaccc ccgggcagag ggtcaccatc 60
tcttgttctg gaagcagctc caacatcgga agtaatactg taaactggta ccagcagctc 120
ccaggaacgg cccccaaact cctcatctat agtaataatc agcggccctc aggggtccct 180
gaccgattct ctggctccaa gtctggcacc tcagcctccc tggccatcag tgggctccag 240
tctgaggatg aggctgatta ttactgtgca gcatgggatg acagcctgaa tggtgtggta 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 366
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 366
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Gly
1 5
<210> 367
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 367
Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys
1 5
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 HCDR3
<222> (1)..(12)
<400> 368
Ala Arg Trp Phe His Thr Gly Gly Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10
<210> 369
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 369
Ser Asp Ile Asn Val Ser Ser Tyr Asn
1 5
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 LCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 370
Tyr Tyr Ser Asp Ser Asp Lys
1 5
<210> 371
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<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 371
Met Ile Trp Pro Ser Asn Ala Leu Tyr Val
1 5 10
<210> 372
<211> 119
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 VH
<222> (1)..(119)
<400> 372
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Phe His Thr Gly Gly Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 373
<211> 116
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 VL
<222> (1)..(116)
<400> 373
Gln Pro Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ser Ser Ala Ser Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Ala Arg Leu Thr Cys Thr Leu Pro Ser Asp Ile Asn Val Ser Ser
20 25 30
Tyr Asn Ile Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Pro Pro Arg Tyr
35 40 45
Leu Leu Tyr Tyr Tyr Ser Asp Ser Asp Lys Gly Gln Gly Ser Gly Val
50 55 60
Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Lys Asp Ala Ser Ala Asn Thr Gly Ile
65 70 75 80
Leu Leu Ile Ser Gly Leu Gln Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys
85 90 95
Met Ile Trp Pro Ser Asn Ala Leu Tyr Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys
100 105 110
Val Thr Val Leu
115
<210> 374
<211> 357
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 VHnu
<222> (1)..(357)
<400> 374
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagatggttc 300
cacacggggg ggtactttga ctactggggc cagggaaccc tggtcaccgt ctcctca 357
<210> 375
<211> 348
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2G9 Vlnu
<222> (1)..(348)
<400> 375
cagcctgtgc tgactcagcc accttcctcc tccgcatctc ctggagaatc cgccagactc 60
acctgcacct tgcccagtga catcaatgtt agtagctaca acatatactg gtaccagcag 120
aagccaggga gccctcccag gtatctcctg tactactact cagactcaga taagggccag 180
ggctctggag tccccagccg cttctctgga tccaaagatg cttcagccaa tacagggatt 240
ttactcatct ccgggctcca gtctgaggat gaggctgact attactgtat gatttggcca 300
agcaatgctc tttatgtctt cggaactggg accaaggtca ccgtccta 348
<210> 376
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 376
Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr Trp
1 5
<210> 377
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 377
Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr
1 5
<210> 378
<211> 13
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 HCDR3
<222> (1)..(13)
<400> 378
Ala Arg Arg Asp Ser Thr Tyr Gly Gly Asn Thr Asp Tyr
1 5 10
<210> 379
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 LCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 379
Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Thr
1 5
<210> 380
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 380
Ser Asn Asn Xaa
1
<210> 381
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 381
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Asn Gly Val Val
1 5 10
<210> 382
<211> 120
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 VH
<222> (1)..(120)
<400> 382
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Glu Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Asp Ser Thr Tyr Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 383
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 VL
<222> (1)..(110)
<400> 383
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn
20 25 30
Thr Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Ser Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Gln
65 70 75 80
Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu
85 90 95
Asn Gly Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 384
<211> 360
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 VHnu
<222> (1)..(360)
<400> 384
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaga agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacgggat 300
tcgacctacg gtggtaacac tgactactgg ggccagggaa ccctggtcac cgtctcctca 360
<210> 385
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-2H3 Vlnu
<222> (1)..(330)
<400> 385
cagtctgtgc tgactcagcc accctcagcg tctgggaccc ccgggcagag ggtcaccatc 60
tcttgttctg gaagcagctc caacatcgga agtaatactg taaactggta ccagcagctc 120
ccaggaacgg cccccaaact cctcatctat agtaataatc agcggccctc aggggtccct 180
gaccgattct ctggctccaa gtctggcacc tcagcctccc tggccatcag tgggctccag 240
tctgaggatg aggctgatta ttactgtgca gcatgggatg acagcctgaa tggtgtggta 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 386
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 386
Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 387
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 387
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 388
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 388
Ala Arg Asp Tyr Gly Asp Phe Tyr Phe Asp Tyr
1 5 10
<210> 389
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 LCDR1
<222> (1)..(7)
<400> 389
Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr
1 5
<210> 390
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 390
Gly Ala Ser Xaa
1
<210> 391
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 391
Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Arg Thr
1 5
<210> 392
<211> 117
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 VH
<222> (1)..(117)
<400> 392
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Tyr Gly Asp Phe Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 393
<211> 108
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 VL
<222> (1)..(108)
<400> 393
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro
85 90 95
Arg Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 394
<211> 351
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 VHnu
<222> (1)..(351)
<400> 394
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgcgag agactacggt 300
gacttttact ttgactactg gggccaggga accctggtca ccgtctcctc a 351
<210> 395
<211> 324
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A1 Vlnu
<222> (1)..(324)
<400> 395
gaaattgtgt tgacgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 60
ctctcctgca gggccagtca gagtgttagc agcagctact tagcctggta ccagcagaaa 120
cctggccagg ctcccaggct cctcatctat ggtgcatcca gcagggccac tggcatccca 180
gacaggttca gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag 240
cctgaagatt ttgcagtgta ttactgtcag cagtatggta gctcacctcg cacttttggc 300
caggggacca agctggagat caaa 324
<210> 396
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 396
Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr Ala
1 5
<210> 397
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 397
Ile Ser Trp Asn Ser Gly Thr Ile
1 5
<210> 398
<211> 27
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 HCDR3
<222> (1)..(27)
<400> 398
Ala Gly Gly Gly Thr Met Val Arg Gly Val Ile Ala Gly Gly Gly Thr
1 5 10 15
His Pro Val Asp Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20 25
<210> 399
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 LCDR1
<222> (1)..(9)
<400> 399
Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr
1 5
<210> 400
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 400
Asp Val Ser Xaa
1
<210> 401
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 LCDR3
<222> (1)..(10)
<400> 401
Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Val Val
1 5 10
<210> 402
<211> 134
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 VH
<222> (1)..(134)
<400> 402
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Ser Trp Asn Ser Gly Thr Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ile Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Gly Gly Gly Thr Met Val Arg Gly Val Ile Ala Gly Gly Gly Thr
100 105 110
His Pro Val Asp Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr
115 120 125
Thr Val Thr Val Ser Ser
130
<210> 403
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 VL
<222> (1)..(110)
<400> 403
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95
Ser Thr Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 404
<211> 402
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 VHnu
<222> (1)..(402)
<400> 404
gaagtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggcaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatgcca tgcactgggt ccggcaagct 120
ccagggaagg gcctggagtg ggtctcaggt attagttgga atagtggtac cataggctat 180
gcggactctg tgaagggccg attcatcatc tccagagaca acgccaagaa ctccctgtat 240
ctgcaaatga acagtctgag agctgaggac acggccttgt attactgtgc agggggtggt 300
actatggttc ggggagttat tgccggaggg ggaactcatc cggtggatga ctactacggt 360
atggacgtct ggggccaagg gaccacggtc accgtctcct ca 402
<210> 405
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3A6 Vlnu
<222> (1)..(330)
<400> 405
cagtctgccc tgactcagcc tgcctccgtg tctgggtctc ctggacagtc gatcaccatc 60
tcctgcactg gaaccagcag tgacgttggt ggttataact atgtctcctg gtaccaacaa 120
cacccaggca aagcccccaa actcatgatt tatgatgtca gtaatcggcc ctcaggggtt 180
tctaatcgct tctctggctc caagtctggc aacacggcct ccctgaccat ctctgggctc 240
caggctgagg acgaggctga ttattactgc agctcatata caagcagcag cactgtggta 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 406
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 406
Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr Trp
1 5
<210> 407
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 HCDR2
<222> (1)..(8)
<400> 407
Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr
1 5
<210> 408
<211> 13
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 HCDR3
<222> (1)..(13)
<400> 408
Ala Arg Arg Asp Ser Thr Tyr Gly Gly Asn Thr Asp Tyr
1 5 10
<210> 409
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 LCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 409
Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Thr
1 5
<210> 410
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 410
Ser Asn Asn Xaa
1
<210> 411
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 LCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 411
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Asn Gly Val Val
1 5 10
<210> 412
<211> 120
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 VH
<222> (1)..(120)
<400> 412
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Glu Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Asp Ser Thr Tyr Gly Gly Asn Thr Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 413
<211> 110
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 VL
<222> (1)..(110)
<400> 413
Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro Gly Gln
1 5 10 15
Arg Val Thr Ile Ser Cys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn
20 25 30
Thr Val Asn Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Ser Asn Asn Gln Arg Pro Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Lys Ser Gly Thr Ser Ala Ser Leu Ala Ile Ser Gly Leu Gln
65 70 75 80
Ser Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu
85 90 95
Asn Gly Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 414
<211> 360
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 VHnu
<222> (1)..(360)
<400> 414
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaagagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacgggat 300
tcgacctacg gtggtaacac tgactactgg ggccagggaa ccctggtcac cgtctcctca 360
<210> 415
<211> 330
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3B4 Vlnu
<222> (1)..(330)
<400> 415
cagtctgtgc tgactcagcc accctcagcg tctgggaccc ccgggcagag ggtcaccatc 60
tcttgttctg gaagcagctc caacatcgga agtaatactg taaactggta ccagcagctc 120
ccaggaacgg cccccaaact cctcatctat agtaataatc agcggccctc aggggtccct 180
gaccgattct ctggctccaa gtctggcacc tcagcctccc tggccatcag tgggctccag 240
tctgaggatg aggctgatta ttactgtgca gcatgggatg acagcctgaa tggtgtggta 300
ttcggcggag ggaccaagct gaccgtccta 330
<210> 416
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 HCDR1
<222> (1)..(10)
<400> 416
Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser Gly Val Gly
1 5 10
<210> 417
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 417
Ile Tyr Trp Asp Asp Asp Lys
1 5
<210> 418
<211> 19
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 HCDR3
<222> (1)..(19)
<400> 418
Ala His Ser Leu Phe Leu Thr Val Gly Tyr Ser Ser Ser Trp Ser Pro
1 5 10 15
Phe Asp Tyr
<210> 419
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 LCDR1
<222> (1)..(12)
<400> 419
Gln Ser Val Leu Tyr Ser Ser Asn Asn Lys Asn Tyr
1 5 10
<210> 420
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 420
Trp Ala Ser Xaa
1
<210> 421
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 LCDR3
<222> (1)..(9)
<400> 421
Gln Gln Tyr Tyr Ser Thr Pro His Thr
1 5
<210> 422
<211> 127
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 VH
<222> (1)..(127)
<400> 422
Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Val Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala Leu Ile Tyr Trp Asp Asp Asp Lys Arg Tyr Ser Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Thr Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val
65 70 75 80
Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala His Ser Leu Phe Leu Thr Val Gly Tyr Ser Ser Ser Trp Ser
100 105 110
Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 423
<211> 113
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 VL
<222> (1)..(113)
<400> 423
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Tyr Ser Thr Pro His Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 424
<211> 381
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 VHnu
<222> (1)..(381)
<400> 424
cagatcacct tgaaggagtc tggtcctacg ctggtgaaac ccacacagac cctcacgctg 60
acctgcacct tctctgggtt ctcactcagc actagtggag tgggtgtggg ctggatccgt 120
cagcccccag gaaaggccct ggagtggctt gcactcattt attgggatga tgataagcgc 180
tacagcccat ctctgaagag caggctcacc atcaccaagg acacctccaa aaaccaggtg 240
gtccttacaa tgaccaacat ggaccctgtg gacacagcca catattactg tgcacacagt 300
ttgtttctca cggtagggta tagcagcagc tggtcccctt ttgactactg gggccaggga 360
accctggtca ccgtctcctc a 381
<210> 425
<211> 339
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P5A-3C12 Vlnu
<222> (1)..(339)
<400> 425
gacatcgtga tgacccagtc tccagactcc ctggctgtgt ctctgggcga gagggccacc 60
atcaactgca agtccagcca gagtgtttta tacagctcca acaataagaa ctacttagct 120
tggtaccagc agaaaccagg acagcctcct aagctgctca tttactgggc atctacccgg 180
gaatccgggg tccctgaccg attcagtggc agcgggtctg ggacagattt cactctcacc 240
atcagcagcc tgcaggctga agatgtggca gtttattact gtcagcaata ttatagtact 300
cctcacactt ttggccaggg gaccaagctg gagatcaaa 339
<210> 426
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 HCDR1
<222> (1)..(8)
<400> 426
Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn Tyr
1 5
<210> 427
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 HCDR2
<222> (1)..(7)
<400> 427
Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr
1 5
<210> 428
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 HCDR3
<222> (1)..(11)
<400> 428
Ala Arg Asp Arg Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 429
<211> 6
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 LCDR1
<222> (1)..(6)
<400> 429
Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
1 5
<210> 430
<211> 4
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 LCDR2
<222> (1)..(3)
<220>
<221> misc_feature
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is absent.
<400> 430
Ala Ala Ser Xaa
1
<210> 431
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 LCDR3
<222> (1)..(8)
<400> 431
Leu His Leu Asn Ser Tyr Arg Thr
1 5
<210> 432
<211> 117
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 VH
<222> (1)..(117)
<400> 432
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Val Ser Ser Asn
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Arg Asp Arg Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 433
<211> 106
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 VL
<222> (1)..(106)
<400> 433
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Leu His Leu Asn Ser Tyr Arg Thr
85 90 95
Phe Gly Leu Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 434
<211> 351
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 VHnu
<222> (1)..(351)
<400> 434
gaggtgcagc tggtggagtc tggaggaggc ttgatccagc ctggggggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctgggtt caccgtcagt agcaactaca tgagctgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg ggctggagtg ggtctcagtt atttatagcg gtggtagcac atactacgca 180
gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatt ccaagaacac gctgtatctt 240
caaatgaaca gcctgagagc cgaggacacg gccgtgtatt actgtgcgag agatcgagac 300
tactacggta tggacgtctg gggccaaggg accacggtca ccgtctcctc a 351
<210> 435
<211> 318
<212> DNA
<213> 人类
<220>
<221> P22A-1D1 Vlnu
<222> (1)..(318)
<400> 435
gacatccagt tgacccagtc tccatccttc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgcc gggccagtca gggcattagc agttatttag cctggtatca gcaaaaacca 120
gggaaagccc ctaagctcct gatctatgct gcatccactt tgcaaagtgg ggtcccatca 180
aggtttagcg gcagtggatc tgggacagaa ttcactctca caatcagcag cctgcagcct 240
gaagattttg caacttatta ctgtctacac cttaatagtt acaggacgtt cggcctaggg 300
accaaggtgg aaatcaaa 318
<210> 436
<211> 5
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 HCDR1 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(5)
<400> 436
Ser Asn Tyr Met Asn
1 5
<210> 437
<211> 16
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 HCDR2 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(16)
<400> 437
Leu Ile Tyr Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly
1 5 10 15
<210> 438
<211> 9
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 HCDR3 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(9)
<400> 438
Asp Leu Val Val Tyr Gly Met Asp Val
1 5
<210> 439
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 LCDR1 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(12)
<400> 439
Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala
1 5 10
<210> 440
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 LCDR2 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(7)
<400> 440
Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr
1 5
<210> 441
<211> 8
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2C-1F11 LCDR3 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(8)
<400> 441
Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Thr
1 5
<210> 442
<211> 5
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR1 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(5)
<400> 442
Thr Tyr Val Met Asn
1 5
<210> 443
<211> 17
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR2 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(17)
<400> 443
Trp Ile Asn Thr Asn Thr Gly Asn Pro Thr Tyr Ala Gln Gly Phe Thr
1 5 10 15
Gly
<210> 444
<211> 10
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR3 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(10)
<400> 444
Glu Ile Thr Thr Leu Gly Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 445
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 LCDR1 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(11)
<400> 445
Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Lys Ser Val His
1 5 10
<210> 446
<211> 7
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 LCDR2 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(7)
<400> 446
Tyr Asp Ser Asp Arg Pro Ser
1 5
<210> 447
<211> 11
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 LCDR3 Based on Kabat Numbering
<222> (1)..(11)
<400> 447
Gln Val Trp Asp Ser Ile Ser Asp His Arg Val
1 5 10
<210> 448
<211> 12
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 HCDR3 Based on IMGT Numbering
<222> (1)..(12)
<400> 448
Ser Ser Glu Ile Thr Thr Leu Gly Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 449
<211> 119
<212> PRT
<213> 人类
<220>
<221> P2B-1G5 VH
<222> (1)..(119)
<400> 449
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ser Glu Leu Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Thr Tyr
20 25 30
Val Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Thr Asn Thr Gly Asn Pro Thr Tyr Ala Gln Gly Phe
50 55 60
Thr Gly Arg Phe Val Phe Ser Leu Asp Thr Ser Val Ser Thr Ala Ser
65 70 75 80
Leu Gln Ile Ser Ser Leu Lys Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Ser Glu Ile Thr Thr Leu Gly Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115

Claims (39)

1.一种经修饰抗体或其抗原结合片段，其包括至少一种具有抗原结合亲和力的抗原结合域和共价连接的经修饰人类IgG恒定域，其中所述抗原结合亲和力包括SARS-CoV-2结合亲和力，相较于所述SARS-CoV-2结合亲和力，所述抗原结合亲和力包括比SARS-CoV或MERS-CoV低至少50％的结合亲和力或包括不可检测的结合亲和力，且其中所述经修饰人类IgG恒定域包括氨基酸残基252处的酪氨酸取代、氨基酸残基254处的苏氨酸取代和氨基酸残基256处的谷氨酸取代，所述氨基酸残基根据如Kabat中的EU索引进行编号，相较于具有野生型人类IgG恒定域的抗体对FcRn的所述亲和力，所述经修饰抗体对FcRn的亲和力增加。
2.根据权利要求1所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述抗原结合亲和力包括：
a)对SARS-CoV-2的刺突蛋白的结合亲和力，其比对SARS-CoV的刺突蛋白或MERS-CoV的刺突蛋白的结合亲和力低至少50％；
b)对包括SEQ ID NO:128的所述氨基酸序列的所述SARS-CoV-2的刺突蛋白的受体结合域(RBD)的结合亲和力；
c)对包括SEQ ID NO:124的所述氨基酸序列的所述SARS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合亲和力，其水平为不可检测的或不超过对所述SARS-CoV-2的刺突蛋白的所述RBD的所述结合亲和力的50％；
d)对包括SEQ ID NO:126的所述氨基酸序列的所述MERS-CoV的刺突蛋白的RBD的结合亲和力，其水平为不可检测的或不超过对所述SARS-CoV-2的刺突蛋白的所述RBD的所述结合亲和力的50％；
e)对所述SARS-CoV-2的刺突蛋白的所述RBD的结合亲和力，其Kd值不超过1×10-7M，如通过表面等离子体共振(SPR)所测量；
f)对所述SARS-CoV的刺突蛋白的所述RBD或MERS-CoV的刺突蛋白的所述RBD的结合亲和力，其Kd值为至少1×10-6M，如通过SPR所测量；
g)展现在1μM下与2μM血管紧张素转化酶2(ACE2)受体至少30％的竞争以结合到以250的共振单位(RU)固定的所述SARS-CoV-2的刺突蛋白的所述RBD，如通过SPR所测量；
h)对所述SARS-CoV-2的刺突蛋白的所述RBD的结合亲和力，其在IC50值下的中和活性不超过100μg/ml，如通过假病毒、活病毒、微量中和、灭活病毒中和检定或其组合所测量；或
其组合。
3.根据权利要求1至2中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述抗原结合域包括：
a.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3；
b.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:13；
c.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:23；
d.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32和SEQ ID NO:33；
e.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42和SEQ ID NO:43；
f.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:53；
g.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66和SEQ ID NO:67；
h.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76和SEQ ID NO:77；
i.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:86和SEQ ID NO:87；
j.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:96和SEQ ID NO:97；
k.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:106和SEQ ID NO:107；
l.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:437和SEQ ID NO:438；
m.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:436、SEQ ID NO:106和SEQ ID NO:438；
n.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ ID NO:138；
o.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ ID NO:448；
p.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:443和SEQ ID NO:444；
q.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:442、SEQ ID NO:137和SEQ ID NO:444；
r.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:146、SEQ ID NO:147和SEQ ID NO:148；
s.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:156、SEQ ID NO:157和SEQ ID NO:158；
t.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:166、SEQ ID NO:167和SEQ ID NO:168；
u.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:176、SEQ ID NO:177和SEQ ID NO:178；
v.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:186、SEQ ID NO:187和SEQ ID NO:188；
w.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:196、SEQ ID NO:197和SEQ ID NO:198；
x.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:206、SEQ ID NO:207和SEQ ID NO:208；
y.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:216、SEQ ID NO:217和SEQ ID NO:218；
z.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:226、SEQ ID NO:227和SEQ ID NO:228；
aa.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:236、SEQ ID NO:237和SEQ ID NO:238；
bb.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:246、SEQ ID NO:247和SEQ ID NO:248；
cc.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:256、SEQ ID NO:257和SEQ ID NO:258；
dd.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:266、SEQ ID NO:267和SEQ ID NO:268；
ee.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:276、SEQ ID NO:277和SEQ ID NO:278；
ff.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:286、SEQ ID NO:287和SEQ ID NO:288；
gg.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:296、SEQ ID NO:297和SEQ ID NO:298；
hh.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:306、SEQ ID NO:307和SEQ ID NO:308；
ii.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:316、SEQ ID NO:317和SEQ ID NO:318；
jj.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:326、SEQ ID NO:327和SEQ ID NO:328；
kk.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:336、SEQ ID NO:337和SEQ ID NO:338；
ll.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:346、SEQ ID NO:347和SEQ ID NO:348；
mm.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:356、SEQ ID NO:357和SEQ ID NO:358；
nn.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:366、SEQ ID NO:367和SEQ ID NO:368；
oo.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:376、SEQ ID NO:377和SEQ ID NO:378；
pp.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:386、SEQ ID NO:387和SEQ ID NO:388；
qq.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:396、SEQ ID NO:397和SEQ ID NO:398；
rr.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:406、SEQ ID NO:407和SEQ ID NO:408；
ss.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:416、SEQ ID NO:417和SEQ ID NO:418；
tt.1、2或3个选自以下的重链CDR序列：SEQ ID NO:426、SEQ ID NO:427和SEQ ID NO:428；
与其具有至少80％序列一致性的序列；或
其组合。
4.根据权利要求1至2中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述抗原结合域包括：
a)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6；
b)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16；
c)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26；
d)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35和SEQ ID NO:36；
e)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45和SEQ ID NO:46；
f)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56；
g)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69和SEQ ID NO:70；
h)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:79和SEQ ID NO:80；和
i)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:89和SEQ ID NO:90；
j)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99和SEQ ID NO:100；
k)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:109和SEQ ID NO:110；
l)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:439、SEQ ID NO:440和SEQ ID NO:441；
m)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:139、SEQ ID NO:140和SEQ ID NO:141；
n)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:445、SEQ ID NO:446和SEQ ID NO:447；
o)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:149、SEQ ID NO:150和SEQ ID NO:151；
p)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:159、SEQ ID NO:160和SEQ ID NO:161；
q)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:169、SEQ ID NO:170和SEQ ID NO:171；
r)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:179、SEQ ID NO:180和SEQ ID NO:181；
s)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:189、SEQ ID NO:190和SEQ ID NO:191；
t)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:199、SEQ ID NO:200和SEQ ID NO:201；
u)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:209、SEQ ID NO:210和SEQ ID NO:211；
v)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:219、SEQ ID NO:220和SEQ ID NO:221；
w)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:229、SEQ ID NO:230和SEQ ID NO:231；
x)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:239、SEQ ID NO:240和SEQ ID NO:241；
y)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:249、SEQ ID NO:250和SEQ ID NO:251；
z)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:259、SEQ ID NO:260和SEQ ID NO:261；
aa)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:269、SEQ ID NO:270和SEQ ID NO:271；
bb)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:279、SEQ ID NO:280和SEQ ID NO:281；
cc)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:289、SEQ ID NO:290和SEQ ID NO:291；
dd)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:299、SEQ ID NO:300和SEQ ID NO:301；
ee)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:309、SEQ ID NO:310和SEQ ID NO:311；
ff)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:319、SEQ ID NO:320和SEQ ID NO:321；
gg)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:329、SEQ ID NO:330和SEQ ID NO:331；
hh)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:339、SEQ ID NO:340和SEQ ID NO:341；
ii)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:349、SEQ ID NO:350和SEQ ID NO:351；
jj)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:359、SEQ ID NO:360和SEQ ID NO:361；
kk)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:369、SEQ ID NO:370和SEQ ID NO:371；
ll)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:379、SEQ ID NO:380和SEQ ID NO:381；
mm)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:389、SEQ ID NO:390和SEQ ID NO:391；
nn)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:399、SEQ ID NO:400和SEQ ID NO:401；
oo)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:409、SEQ ID NO:410和SEQ ID NO:411；
pp)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:419、SEQ ID NO:420和SEQ ID NO:421；
qq)1、2或3个选自以下的轻链CDR序列：SEQ ID NO:429、SEQ ID NO:430和SEQ ID NO:431；
与其具有至少80％序列一致性的序列；或
其组合。
5.根据权利要求1至2中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述抗原结合域包括：
a.包括SEQ ID NO:1的所述序列的重链CDR1(HCDR1)、包括SEQ ID NO:2的所述序列的重链CDR2(HCDR2)、包括SEQ ID NO:3的所述序列的重链CDR3(HCDR3)、包括SEQ ID NO:4的所述序列的轻链CDR1(LCDR1)、包括SEQ ID NO:5的所述序列的轻链CDR2(LCDR2)和包括SEQID NO:6的所述序列的轻链CDR3(LCDR3)；
b.包括SEQ ID NO:11的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:12的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:13的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:14的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:15的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:16的所述序列的LCDR3；
c.包括SEQ ID NO:21的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:22的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:23的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:24的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:25的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:26的所述序列的LCDR3；
d.包括SEQ ID NO:31的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:32的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:33的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:34的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:35的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:36的所述序列的LCDR3；
e.包括SEQ ID NO:41的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:42的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:43的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:44的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:45的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:46的所述序列的LCDR3；
f.包括SEQ ID NO:51的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:52的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:53的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:54的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:55的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:56的所述序列的LCDR3；
g.包括SEQ ID NO:65的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:66的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:67的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:68的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:69的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:70的所述序列的LCDR3；
h.包括SEQ ID NO:75的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:76的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:77的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:78的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:79的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:80的所述序列的LCDR3；
i.包括SEQ ID NO:85的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:86的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:87的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:88的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:89的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:90的所述序列的LCDR3；
j.包括SEQ ID NO:95的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:96的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:97的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:98的所述序列的LCDR1、包括SEQ IDNO:99的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:100的所述序列的LCDR3；
k.包括SEQ ID NO:105或436的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106或437的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107或438的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108或439的所述序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109或440的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110或441的所述序列的LCDR3；
l.包括SEQ ID NO:105的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:109的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的所述序列的LCDR3；
m.包括SEQ ID NO:436的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:437的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:439的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:440的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:441的所述序列的LCDR3；
n.包括SEQ ID NO:436的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:109的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的所述序列的LCDR3；
o.包括SEQ ID NO:136或442的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137或443的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448或444的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139或445的所述序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140或446的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141或447的所述序列的LCDR3；
a.包括SEQ ID NO:136的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的所述序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的所述序列的LCDR3；
b.包括SEQ ID NO:442的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:443的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:445的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:446的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:447的所述序列的LCDR3；
c.包括SEQ ID NO:442的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:140的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的所述序列的LCDR3；
d.包括SEQ ID NO:146的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:147的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:148的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:149的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:150的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:151的所述序列的LCDR3；
e.包括SEQ ID NO:156的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:157的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:158的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:159的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:160的所述序列的LCDR2和所述包括SEQ ID NO:161的所述序列的LCDR3；
f.包括SEQ ID NO:166的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:167的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:168的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:169的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:170的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:171的所述序列的LCDR3；
g.包括SEQ ID NO:176的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:177的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:178的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:179的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:180的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:181的所述序列的LCDR3；
h.包括SEQ ID NO:186的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:187的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:188的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:189的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:190的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:191的所述序列的LCDR3；
i.包括SEQ ID NO:196的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:197的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:198的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:199的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:200的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:201的所述序列的LCDR3；
j.包括SEQ ID NO:206的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:207的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:208的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:209的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:210的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:211的所述序列的LCDR3；
k.包括SEQ ID NO:216的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:217的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:218的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:219的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:220的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:221的所述序列的LCDR3；
l.包括SEQ ID NO:226的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:227的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:228的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:229的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:230的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:231的所述序列的LCDR3；
m.包括SEQ ID NO:236的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:237的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:238的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:239的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:240的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:241的所述序列的LCDR3；
n.包括SEQ ID NO:246的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:247的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:248的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:249的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:250的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:251的所述序列的LCDR3；
o.包括SEQ ID NO:256的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:257的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:258的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:259的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:260的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:261的所述序列的LCDR3；
p.包括SEQ ID NO:266的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:267的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:268的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:269的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:270的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:271的所述序列的LCDR3；
q.包括SEQ ID NO:276的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:277的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:278的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:279的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:280的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:281的所述序列的LCDR3；
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s.包括SEQ ID NO:296的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:297的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:298的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:299的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:300的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:301的所述序列的LCDR3；
t.包括SEQ ID NO:306的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:307的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:308的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:309的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:310的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:311的所述序列的LCDR3；
u.包括SEQ ID NO:316的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:317的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:318的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:319的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:320的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:321的所述序列的LCDR3；
v.包括SEQ ID NO:326的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:327的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:328的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:329的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:330的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:331的所述序列的LCDR3；
w.包括SEQ ID NO:336的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:337的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:338的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:339的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:340的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:341的所述序列的LCDR3；
x.包括SEQ ID NO:346的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:347的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:348的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:349的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:350的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:351的所述序列的LCDR3；
y.包括SEQ ID NO:356的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:357的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:358的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:359的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:360的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:361的所述序列的LCDR3；
z.包括SEQ ID NO:366的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:367的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:368的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:369的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:370的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:371的所述序列的LCDR3；
aa.包括SEQ ID NO:376的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:377的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:378的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:379的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:380的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:381的所述序列的LCDR3；
bb.包括SEQ ID NO:386的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:387的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:388的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:389的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:390的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:391的所述序列的LCDR3；
cc.包括SEQ ID NO:396的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:397的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:398的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:399的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:400的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:401的所述序列的LCDR3；
dd.包括SEQ ID NO:406的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:407的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:408的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:409的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:410的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:411的所述序列的LCDR3；
ee.包括SEQ ID NO:416的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:417的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:418的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:419的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:420的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:421的所述序列的LCDR3；
ff.包括SEQ ID NO:426的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:427的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:428的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:429的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:430的所述序列的LCDR2、包括SEQ ID NO:431的所述序列的LCDR3；
与其具有至少80％序列一致性的序列；或
其组合。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述抗原结合域包括：
包括SEQ ID NO:105或436的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106或437的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107或438的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108或439的所述序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:109或440的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110或441的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:105的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:107的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:109的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:436的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:437的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:439的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:440的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:441的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:436的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:106的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:438的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:108的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:109的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:110的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:136或442的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137或443的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448或444的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139或445的所述序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140或446的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141或447的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:136的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:138或448的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的所述序列的LCDR1、包括SEQ ID NO:140的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:442的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:443的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:445的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:446的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:447的所述序列的LCDR3；
包括SEQ ID NO:442的所述序列的HCDR1、包括SEQ ID NO:137的所述序列的HCDR2、包括SEQ ID NO:444的所述序列的HCDR3、包括SEQ ID NO:139的所述序列的LCDR1、包括SEQID NO:140的所述序列的LCDR2和包括SEQ ID NO:141的所述序列的LCDR3；
与其具有至少80％序列一致性的序列；或
或其组合。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述经修饰抗体或所述抗原结合片段具有活体内50到120天的范围内的半衰期(T1/2)。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述经修饰抗体或所述抗原结合片段在所述抗原结合域、所述人类IgG恒定域、所述经修饰抗体的轻链、所述经修饰抗体的重链或其组合中包括至少一个氨基酸后续取代。
9.根据权利要求8所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述后续取代包括将半胱氨酸残基取代为非半胱氨酸残基。
10.根据权利要求9所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述半胱氨酸残基经丝氨酸残基取代。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其进一步包括选自以下的一种或多种后续修饰的抗体：第一后续修饰的抗体，其包括两个各自对所述SARS-CoV-2具有相同或不同亲和力的抗原结合域；第二后续修饰的抗体，其包括对所述SARS-CoV-2具有结合亲和力的第一抗原结合域和对与所述SARS-CoV-2不同的第二病原体具有结合亲和力的第二抗原结合域；第三后续修饰的抗体，其包括两个各自对所述第二病原体具有结合亲和力的抗原结合域；或其组合。
12.根据权利要求11所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中对所述第二病原体的所述结合亲和力选自对以下的结合亲和力：SARS-CoV、MERS-CoV、一种或多种细菌、一种或多种真菌、一种或多种病毒、一种或多种寄生虫、其部分或其组合。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的经修饰抗体或其抗原结合片段，其中所述经修饰抗体或其所述抗原结合片段为单链抗体、双功能抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fd、Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫键稳定的双功能抗体(ds diabody)、单链抗体分子(scFv)、scFv二聚体(二价双功能抗体)、双特异性scFv二聚体、多特异性抗体、重链抗体、骆驼化单域抗体(camelized singledomain antibody)、纳米抗体(nanobody)、域抗体(domain antibody)或二价域抗体。
14.一种药物组合物，其包括至少一种根据权利要求1至13中任一项所述的所述经修饰抗体或其抗原结合片段、至少一种编码所述经修饰抗体或其抗原结合片段的核酸或其组合，和一种或多种药学上可接受的载剂。
15.根据权利要求14所述的药物组合物，其中所述药物组合物以10mg/mL到150mg/mL的范围内的浓度包括所述经修饰抗体或其抗原结合片段。
16.根据权利要求14至15中任一项所述的药物组合物，其中所述药物组合物经配置以经由静脉内注射(IV)、肌肉内注射(IM)、皮下(SC)注射或其组合向个体施用。
17.根据权利要求14至16中任一项所述的药物组合物，其中所述药物组合物经配置以用于预防不具有所述SARS-CoV-2的症状或没有所述SARS-CoV-2的已知感染的个人，或对患者的治疗，所述患者为患有由SARS-CoV-2感染所引起的COVID-19的有症状的非住院成年人，60岁和更年长，具有选自以下条件中的至少一者的任何年龄的人：抽烟；具有其中CD4计数<200个细胞/mm3的HIV感染的外源性或内源性免疫抑止；在与所述药物组合物施用之前的30天内每日接受等效于泼尼松(prednisone)的皮质类固醇≥20mg持续至少14个连续日；在与所述药物组合物施用之前的90天内接受一种或多种生物制剂治疗剂、一种或多种免疫调节剂、癌症化学疗法；患有慢性肺疾病，慢性哮喘；身体质量指数[BMI]>35的肥胖症；具有选自以下的COVID-19症状：发热、咳嗽、喉咙痛、不适、头痛、肌肉痛、恶心、呕吐、腹泻、味觉和嗅觉的丧失或其组合；具有呼吸短促、呼吸困难或异常胸部成像，具有临床评估或成像期间的下部呼吸道疾病的证据；具有在海平面的室内空气中≥94％的血氧饱和度(SpO2)；具有所述SARS-CoV-2的所述感染的严重症状，具有在海平面的室内空气中<94％的SpO2，具有<300mmHg的氧气动脉分压与吸入氧气分数的比率(PaO2/FiO2)、每分钟>30次呼吸的呼吸频率、>50％的肺浸润；具有抗体依赖性增强(antibody-dependent enhancement(ADE))的活性症状；具有抗体依赖性增强(ADE)的病史；对抗体治疗过敏；为需要支持管理所述SARS-CoV-2的严重感染的并发症以及来自长期住院的并发症的医院住院病人，所述SARS-CoV-2的严重感染的并发症选自肺炎、低氧血症型呼吸衰竭/ARDS、败血症和败血性休克、心肌病和心律不整、急性肾损伤，所述来自长期住院的并发症包括继发性细菌和真菌感染、血栓栓塞、胃肠道出血、危重病多发性神经病/肌病；或其组合。
18.一种用于治疗或预防有需要的个体的疾病的方法，所述方法包括向所述个体施用有效剂量的根据权利要求14至17中任一项所述的所述药物组合物；
其中所述药物组合物经配置以向所述个体施用以在施用所述药物组合物之后，使所述经修饰抗体或其抗原结合片段的血浆浓度维持在10μg/mL到3500μg/mL的治疗有效范围内，持续1天到12个月的范围内的时间段；且
其中所述个体感染有所述SARS-CoV-2，展现感染有所述SARS-CoV-2的一种或多种症状或具有感染有所述SARS-CoV-2的风险。
19.根据权利要求18所述的方法，其中在所述个体感染有所述SARS-CoV-2之前，在所述个体展现感染所述SARS-CoV-2的任何症状或其组合之前，所述药物组合物向不具有所述SARS-CoV-2的症状或没有所述SARS-CoV-2的已知感染的所述个体施用。
20.根据权利要求19所述的方法，其中所述药物组合物经配置以向所述个体施用以在所述施用之后，使所述经修饰抗体或其抗原结合片段的所述血浆浓度维持在10μg/mL到1500μg/mL的治疗有效范围内，持续3到12个月的范围内的时间段，且其中所述施用为单次施用。
21.根据权利要求18所述的方法，其中所述个体为不具有所述SARS-CoV-2的症状或没有所述SARS-CoV-2的已知感染的个人，或治疗患者，其为患有由SARS-CoV-2感染所引起的COVID-19的有症状的非住院成年人，60岁和更年长，具有选自以下条件中的至少一者的任何年龄的人：抽烟；具有其中CD4计数<200个细胞/mm3的HIV感染的外源性或内源性免疫抑止；在与所述药物组合物施用之前的30天内每日接受等效于泼尼松的皮质类固醇≥20mg持续至少14个连续日；在与所述药物组合物施用之前的90天内接受一种或多种生物制剂治疗剂、一种或多种免疫调节剂、癌症化学疗法；患有慢性肺疾病，慢性哮喘；身体质量指数[BMI]>35的肥胖症；具有选自以下的COVID-19症状：发热、咳嗽、喉咙痛、不适、头痛、肌肉痛、恶心、呕吐、腹泻、味觉和嗅觉的丧失或其组合；具有呼吸短促、呼吸困难或异常胸部成像，具有临床评估或成像期间的下部呼吸道疾病的证据；具有在海平面的室内空气中≥94％的血氧饱和度(SpO2)；具有所述SARS-CoV-2的所述感染的严重症状，具有在海平面的室内空气中<94％的SpO2，具有<300mmHg的氧气动脉分压与吸入氧气分数的比率(PaO2/FiO2)、每分钟>30次呼吸的呼吸频率、>50％的肺浸润；具有抗体依赖性增强(ADE)的活性症状；具有抗体依赖性增强(ADE)的病史；对抗体治疗过敏；为需要对所述SARS-CoV-2的严重感染的并发症以及来自长期住院的并发症支持管理的医院住院病人，所述SARS-CoV-2的严重感染的并发症选自肺炎、低氧血症型呼吸衰竭/ARDS、败血症和败血性休克、心肌病和心律不整、急性肾损伤，所述来自长期住院的并发症包括继发性细菌和真菌感染、血栓栓塞、胃肠道出血、危重病多发性神经病变/肌病；或其组合。
22.根据权利要求21所述的方法，其中所述药物组合物经配置以向所述个体施用以在所述施用之后，使所述经修饰抗体或其抗原结合片段的所述血浆浓度维持在30μg/mL到3500μg/mL的治疗有效范围内，持续1到4周的范围内的时间段，且其中所述施用为单次施用。
23.根据权利要求18至22中任一项所述的方法，其中所述经修饰抗体或其所述抗原结合片段经配置以在所述个体中具有50到120天的范围内的半衰期(T1/2)。
24.根据权利要求18至23中任一项所述的方法，其中所述药物组合物经配置以在150mg/m2到5000mg/m2的范围内向所述个体施用。
25.根据权利要求18至24中任一项所述的方法，其中所述药物组合物经配置以在300mg到8000mg的范围内向所述个体施用。
26.根据权利要求18至25中任一项所述的方法，其中所述药物组合物经配置以具有浓度为10mg/mL到150mg/mL的范围内的所述经修饰抗体。
27.根据权利要求18至26中任一项所述的方法，其中所述药物组合物经由静脉内注射(IV)、肌肉内注射(IM)、皮下(SC)注射或其组合向所述个体施用。
28.根据权利要求18至27中任一项所述的方法，其中所述个体为60、70或80岁或更年长年龄的患者。
29.根据权利要求18至28中任一项所述的方法，其中所述有效剂量通过给药流程测定，所述给药流程包括浓度进展数据测定以及基于所述浓度进展数据产生所述有效剂量，所述浓度进展数据测定基于所述经修饰抗体或其所述抗原结合片段的所计算或测量的药物动力学(PK)、在测试时间段内测试血浆浓度、在预测时间段内的经预测血浆浓度或其组合。
30.根据权利要求29所述的方法，其中所述有效剂量经选择以在所述施用之后3到12个月内使所述血浆浓度维持在10μg/mL到1500μg/mL的范围内。
31.根据权利要求29所述的方法，其中所述有效剂量经选择以在所述施用之后1天到2个月内使所述血浆浓度维持在1500μg/mL到3500μg/mL的范围内。
32.根据权利要求18至31中任一项所述的方法，其中所述药物组合物进一步包括选自以下的一种或多种后续修饰的抗体：第一后续修饰的抗体，其包括两个各自对所述SARS-CoV-2具有相同或不同亲和力的抗原结合域；第二后续修饰的抗体，其包括对上述SARS-CoV-2具有结合亲和力的第一抗原结合域和对与上述SARS-CoV-2不同的第二病原体具有结合亲和力的第二抗原结合域；第三后续修饰的抗体，其包括两个各自对上述第二病原体具有相同或不同的结合亲和力的抗原结合域；或其组合。
33.根据权利要求32所述的方法，其中对上述第二病原体的所述结合亲和力选自对以下的结合亲和力：SARS-CoV、MERS-CoV、一种或多种细菌、一种或多种真菌、一种或多种病毒、一种或多种寄生虫、其部分或其组合。
34.根据权利要求18至33中任一项所述的方法，其中所述SARS-CoV-2包括突变体RBD，所述突变体RBD包括位置K417、E484或N501处的至少一种突变或其任何组合，且其中残基编号是根据SEQ ID NO:134。
35.根据权利要求34所述的方法，其中位置K417处的所述突变选自K417N或K417T。
36.根据权利要求34所述的方法，其中位置E484处的所述突变为E484K。
37.根据权利要求34所述的方法，其中位置N501处的所述突变为N501Y。
38.根据权利要求34至37中任一项所述的方法，其中所述抗体中和包括所述突变体RBD的所述SARS-CoV-2，其IC50不超过所述抗体中和包括具有SEQ ID NO:134的氨基酸序列的RBD的SARS-CoV-2的IC50的10倍(或不超过8倍、6倍、5倍、4倍、3倍、2倍、不超过150％、不超过120％或不超过100％)，如通过假病毒中和检定所测量。
39.根据权利要求18至38中任一项所述的方法，其进一步包括向所述个体同时或依序施用药学上有效量的一种或多种生物活性剂与所述药物组合物，其中所述生物活性剂包括选自以下的治疗剂或预防剂：抗病毒剂、抗病毒肽、抗病毒抗体、抗病毒化合物、抗病毒细胞因子、抗病毒寡核苷酸、RNA依赖性RNA聚合酶抑制剂、非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、嘌呤核苷、抗病毒干扰素、金刚烷抗病毒化合物、瑞德西韦(remdesivir)、氯奎(chloroquine)、羟氯奎(hydroxychloroquine)、咯匹那韦(lopinavir)、利托那韦(ritonavir)、APN01、法维拉韦(favilavir)、美沙拉嗪(mesalazine)、托瑞米芬(toremifene)、依普利酮(eplerenone)、帕罗西汀(paroxetine)、西罗莫司(sirolimus)、放线菌素d(dactinomycin)、依贝沙坦(irbesartan)、大黄素、巯基嘌呤、褪黑激素、奎纳克林(quinacrine)、卡维地洛(carvedilol)、秋水仙碱(colchicine)、樟脑、马烯雌酮(equilin)、羟甲烯龙(oxymetholone)、萘莫司他(nafamosta)、卡莫司他(camostat)、巴瑞替尼(baricitinib)、达卢那韦(darunavir)、利巴韦林(ribavirin)、加利司韦(galidesivir)、BCX-4430、阿比朵尔(Arbidol)、硝唑尼特(nitazoxanide)、其一种或多种衍生物，或其任何组合。
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