CN104805071A - 一种草莓基因组dna的提取方法 - Google Patents

一种草莓基因组dna的提取方法 Download PDF

Info

Publication number
CN104805071A
CN104805071A CN201510047761.7A CN201510047761A CN104805071A CN 104805071 A CN104805071 A CN 104805071A CN 201510047761 A CN201510047761 A CN 201510047761A CN 104805071 A CN104805071 A CN 104805071A
Authority
CN
China
Prior art keywords
volume
chloroform
isoamyl alcohol
ctab
strawberry
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201510047761.7A
Other languages
English (en)
Inventor
苗立祥
张豫超
蒋桂华
杨肖芳
肖金平
王月志
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Zhejiang Academy of Agricultural Sciences
Original Assignee
Zhejiang Academy of Agricultural Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Zhejiang Academy of Agricultural Sciences filed Critical Zhejiang Academy of Agricultural Sciences
Priority to CN201510047761.7A priority Critical patent/CN104805071A/zh
Publication of CN104805071A publication Critical patent/CN104805071A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Landscapes

  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

本发明涉及分子生物学技术领域,公开了一种草莓基因组DNA的提取方法,用液氮将样品麿成粉末,加入CTAB提取液,55~65℃水浴后冷却至室温,加入醋酸钾后冰浴,再加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,混匀,离心,再在所得上清液中加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,混匀、静置、离心分离得上清液;在上清液中加入异丙醇后,离心得沉淀物;离心后去除上清液,加入含RNase的TE缓冲液在37℃水浴,然后加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,混匀、静置、离心分离得上清液,向上清液中加入醋酸钠和无水乙醇后,离心去除上清液,向沉淀中加入TE缓冲液溶解沉淀,即为草莓基因组DNA溶液。本发明综合了CTAB和SDS提取方法的特点,最终得到高糖多酚类植物草莓高质量的基因组DNA。

Description

一种草莓基因组DNA的提取方法
技术领域
本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及一种草莓基因组DNA的提取方法。
背景技术
草莓是一种蔷薇科多年生草本植物,一年可以多次开花结果,是我国冬季重要的一种时令水果。草莓叶片和果实中含有丰富的多糖、蛋白质、酚酸、维生素等次生物,这让它具有了较高的利用价值,但同时给其基因组DNA的提取也带来了较大的困难。因为这些粘性极强的次生物会与DNA共沉淀或者捆绑在一起,严重影响了DNA质量,导致后续的扩增、酶切等分子生物学难以进行。
高质量基因组DNA的提取分离是分子生物学研究的基础,常用的基因组DNA最基本的提取方法有:CTAB法和SDS法,其它如试剂盒法、高盐法等都是在这2种方法的基础上进行的改良或简化。这几种方法对极细嫩的组织会有效,但对于老叶片,果实,往往最后得到的DNA样品非常粘稠,提取的DNA样品由于含有大量的次生物不易溶于TE缓冲液,缠搅在其中的粘性物致使DNA检测时上样困难、电泳困难。凝胶电泳检测显示DNA得率很低,上样孔或样道非常亮(见图1~2)。因此,开发一种适合草莓DNA提取的方法,能大大方便地进行分子生物学操作。
发明内容
本发明针对现有中的缺点,公开了一种草莓基因组DNA的提取方法。
为了解决上述技术问题,本发明通过下述技术方案得以解决。
一种草莓基因组DNA的提取方法,包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55~65℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5~10ml预热后的CTAB提取液,在55~65℃下保温30~60分钟,其间晃动3~4次使其混合,得到混合物Ⅰ;在粉末中加入预热过的CTAB提取液,在60~65℃下保温30~60分钟,晃动3~4次,使其充分混合。
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4~1/3,冰浴条件下放置1-2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2-5℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含40~100μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应30~60min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30~60min,然后在2-5℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
作为优选,步骤(1)中,CTAB提取液包括,1-3%(m/V)的CTAB,80-120mM的Tris-HCl,10-25mM的EDTA,1-2M的NaCl和1-3%的PVP;CTAB提取液的pH值为7.5-8.5。
作为优选,CTAB提取液包括,2%(m/V)的CTAB,100mM的Tris-HCl,20mM的EDTA,1.4M的NaCl和2%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.0。
作为优选,将CTAB提取液在110-120℃灭菌20-40min,使用时在每100mlCTAB提取液中加入1-3ml的β-巯基乙醇。 
作为优选,步骤(7)中,乙醇为无水乙醇。
作为优选,氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
作为优选,离心时,转速控制在10000~12000rpm,离心10~15分钟。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:本发明综合了CTAB法和SDS提取方法的特点,利用CTAB的高裂解力和去除多糖的效果,加上SDS法提取DNA中的,高盐浓度(醋酸钾)和降低温度(冰上保温)的办法沉淀除去蛋白质和多糖(在低温条件下醋酸钾与蛋白质及多糖结合成不溶物),离心除去沉淀后,上清液中的DNA用氯仿/异戊醇抽提,反复抽提后用异丙醇沉淀,再用Rnase去除RNA后用氯仿/异戊醇抽提,再用乙醇沉淀水相中的DNA,得到高质量的与杂质彻底分离的草莓基因组DNA。经检测用本发明方法得到的草莓基因组DNA质量较高;用该草莓基因组DNA进行PCR扩增,得到较好的扩增结果。进而,本发明解决了草莓次生物含量高导致的高质量DNA提取困难的问题。
附图说明
图1是传统CTAB法提取的草莓DNA凝胶电泳检测图片。
图2是传统SDS法提取的草莓DNA凝胶电泳检测图片。
图3是本发明方法提取的草莓DNA凝胶电泳检测图片。
图4是本发明方法提取的DNA的检测草莓镶脉病毒的凝胶电泳检测图片。
图5是本发明、传统CTAB法、传统SDS法提取的草莓DNA凝胶电泳检测结果对比图。
具体实施方式
实施例1
一种草莓基因组DNA的提取方法,CTAB提取液包括,1%(m/V)的CTAB,80mM的Tris-HCl,10mM的EDTA,1M的NaCl和1%的PVP;CTAB提取液的pH值为7.5。将CTAB提取液在110℃灭菌20min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入1ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5ml预热后的CTAB提取液,在55℃下保温30分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4,冰浴条件下放置1h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含40μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应30min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30min,然后在2℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
图1和图2分别是传统CTAB和SDS法提取草莓DNA的方法,从图1、图2中可以看出,这两种方法提取的DNA带型弥散、降解严重;由于多糖等物质含量丰富,导致点样孔比较亮,DNA无法迁移,OD260/280值在1左右;在用TE溶解时,混合溶液黏稠,用移液枪精确移取困难,当用大量TE溶解后,导致浓度过低,一般无法满足酶切需求。图3是用本专利方法提取的草莓DNA,从图中可以看出,所提取的草莓DNA带型整齐,点样孔干净,OD260/280比值在1.8附近。用本方法提取达赛拉克草莓叶片DNA后,检测了草莓镶脉病毒的情况,从图4电泳结果可以看出,PCR电泳好,点样孔也干净,是一种比较理想的提取草莓DNA的方法。
由此可见,本发明方法得到的草莓基因组DNA质量较高;用该草莓基因组DNA进行PCR扩增,得到较好的扩增结果。
实施例2
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,3%(m/V) 的CTAB,80-120mM的Tris-HCl,25mM的EDTA,2M的NaCl和3%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.5。将CTAB提取液在120℃灭菌40min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入3ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到65℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入10ml预热后的CTAB提取液,在65℃下保温60分钟,其间晃动4次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/3,冰浴条件下放置2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在5℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在5℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含100μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应60min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在5℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在5℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的 体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置60min,然后在5℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例3
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,2%(m/V)的CTAB,100mM的Tris-HCl,20mM的EDTA,1.4M的NaCl和2%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.0。将CTAB提取液在121℃灭菌30min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入2ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到50℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入8ml预热后的CTAB提取液,在60℃下保温45分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的7/24,冰浴条件下放置1.5h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在4℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含80μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应45min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30~60min,然后在4℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例4
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,1.3%(m/V)的CTAB,82mM的Tris-HCl,15mM的EDTA,1.2M的NaCl和1.3%的PVP;CTAB提取液的pH值为8。将CTAB提取液在112℃灭菌21min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入1.3ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55.5℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5。5ml预热后的CTAB提取液,在55.5℃下保温32分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4,冰浴条件下放置1.2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含42μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应32min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置32min,然后在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例5
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,2.8%(m/V)的CTAB,112mM的Tris-HCl,23mM的EDTA,1.8M的NaCl和2.9%的PVP;CTAB提取液的pH值为8。将CTAB提取液在118℃灭菌39min, 使用时在每100ml CTAB提取液中加入2.9ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到62℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5.5ml预热后的CTAB提取液,在62℃下保温59分钟,其间晃动4次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/3,冰浴条件下放置1.8h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含98μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应55min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的 体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置55min,然后在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例6
一种草莓基因组DNA的提取方法,包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5ml预热后的CTAB提取液,在55℃下保温30分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4,冰浴条件下放置1.2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2℃,转速控制在11000rpm,离心12分钟,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5(4)℃,转速控制在11000rpm,离心12分钟;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含50μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应36min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃, 转速控制在11000rpm,离心14钟,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃,转速控制在11000rpm,离心12分钟,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和无水乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入无水乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;
-20℃放置55min,然后在4.5℃,转速控制在11000rpm,离心14分钟,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例7
(1)在1g草莓老叶片中加入液氮研磨成粉末;
(2)在草莓叶片粉末中加入65℃、9mL的CTAB提取液,然后加入180μlβ-巯基乙醇充分混匀,在65℃水浴下保温40分钟,其间晃动4次,使其充分混匀,得混合物Ⅰ;
(3)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入3ml的5M醋酸钾溶液,冰上放置1h;
(4)再加入12ml氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,再在4℃下,12000rpm下离心分离10分钟,取出上清液放置于新的离心管中;在上清液中再次加入12ml氯仿/异戊醇混合液,混匀后4℃离心,取上清液10ml于新的离心管,得到中间相Ⅰ;
(5)向步骤(4)中的中间相Ⅰ中加入6.777ml异丙醇,充分混匀,4℃下,12000rpm下离心分离10分钟,去上清,留沉淀物;
(6)向步骤(5)所得的沉淀物中加600μl含50μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,充分融解,37℃水浴30min,得到混合物Ⅱ;
(7)向步骤(6)的混合物Ⅱ中加入600μl的氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,在4℃下12000rpm下离心分离10分钟,取上清液550μl,再加入550μl氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,在4℃下12000rpm下离心分离10分钟,取上清液500μl于新的离心管中,得到中间相Ⅱ;
(8)向步骤(7)中的中间相Ⅱ中加入,50μl 3M醋酸钠和1000μl无水乙醇,-20℃放置1h,
然后在4℃下12000rpm下离心15分钟;去上清,沉淀物再用1ml 75%的无乙醇洗涤2次;离心去除上清液,沉淀物即为基因组DNA;
(9)将步骤(8)所得DNA在无菌工作台上吹干残留乙醇,然后向沉淀物中加入100μl TE,溶解后所得混合物即为草莓基因组DNA。
总之,以上所述仅为本发明的较佳实施例,凡依本发明申请专利范围所作的均等变化与修饰,皆应属本发明专利的涵盖范围。

Claims (7)

1.一种草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55~65℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5~10ml预热后的CTAB提取液,在55~65℃下保温30~60分钟,其间晃动3~4次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4~1/3,冰浴条件下放置1-2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2-5℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含40~100μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应30~60min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30~60min,然后在2-5℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
2.根据权利要求1所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:步骤(1)中,CTAB提取液包括,1-3%(m/V)的CTAB,80-120mM的Tris-HCl,10-25mM的EDTA,1-2M的NaCl和1-3%的PVP;CTAB提取液的pH值为7.5-8.5。
3.根据权利要求2所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:CTAB提取液包括,2%(m/V)的CTAB,100mM的Tris-HCl,20mM的EDTA,1.4M的NaCl和2%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.0。
4.根据权利要求2或3所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:将CTAB提取液在110-120℃灭菌20-40min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入1-3ml的β-巯基乙醇。
5.根据权利要求1所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:步骤(7)中,乙醇为无水乙醇。
6.根据权利要求5所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
7.根据权利要求1所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:离心时,转速控制在10000~12000rpm,离心10~15分钟。
CN201510047761.7A 2015-01-30 2015-01-30 一种草莓基因组dna的提取方法 Pending CN104805071A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201510047761.7A CN104805071A (zh) 2015-01-30 2015-01-30 一种草莓基因组dna的提取方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201510047761.7A CN104805071A (zh) 2015-01-30 2015-01-30 一种草莓基因组dna的提取方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN104805071A true CN104805071A (zh) 2015-07-29

Family

ID=53690272

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201510047761.7A Pending CN104805071A (zh) 2015-01-30 2015-01-30 一种草莓基因组dna的提取方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN104805071A (zh)

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105505919A (zh) * 2016-01-25 2016-04-20 安徽农业大学 一种高效提取酥瓜基因组dna的方法
CN105505917A (zh) * 2015-12-31 2016-04-20 安诺优达基因科技(北京)有限公司 一种高质量果实基因组dna的提取方法及提取试剂盒
CN108486102A (zh) * 2018-05-23 2018-09-04 新疆农业大学 一种新疆洋葱野生近缘种花基因组dna的提取方法
CN109929922A (zh) * 2019-04-19 2019-06-25 贵州出入境检验检疫局检验检疫综合技术中心(贵州国际旅行卫生保健中心) 一种辣椒及制品中转基因成分检测及应用方法
CN111909926A (zh) * 2019-05-08 2020-11-10 青岛华大基因研究院 植物基因组dna的提取方法和测序方法及应用
CN113502286A (zh) * 2021-08-16 2021-10-15 天津诺禾致源生物信息科技有限公司 富含次生代谢物的植物组织中dna的提取方法
CN113549615A (zh) * 2021-08-30 2021-10-26 浙江大学 一种高质量草莓基因组dna的分离提取方法
CN117660443A (zh) * 2023-12-11 2024-03-08 南京派森诺基因科技有限公司 一种浆果果实基因组dna高质量提取方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101302509A (zh) * 2008-07-11 2008-11-12 东北林业大学 一种提取植物dna的方法
CN101486747A (zh) * 2009-02-20 2009-07-22 浙江省农业科学院 一种同时提取植物dna和rna的方法
CN102286460B (zh) * 2011-06-21 2012-12-05 湖南省宇秀生物科技有限公司 一种改进ctab法提取杏鲍菇中的dna
CN103667427A (zh) * 2012-09-07 2014-03-26 上海市农业科学院 用于鉴定草莓种质资源炭疽病抗性的引物序列及其鉴定方法

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101302509A (zh) * 2008-07-11 2008-11-12 东北林业大学 一种提取植物dna的方法
CN101486747A (zh) * 2009-02-20 2009-07-22 浙江省农业科学院 一种同时提取植物dna和rna的方法
CN102286460B (zh) * 2011-06-21 2012-12-05 湖南省宇秀生物科技有限公司 一种改进ctab法提取杏鲍菇中的dna
CN103667427A (zh) * 2012-09-07 2014-03-26 上海市农业科学院 用于鉴定草莓种质资源炭疽病抗性的引物序列及其鉴定方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
吕秀兰等: "几种果树高质量、高纯度基因组DNA快速大量提取方法的研究", 《中国园艺学会第九届学术年会论文集》 *
张璐璐等: "改良CTAB法提取草莓基因组DNA", 《现代园艺》 *

Cited By (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105505917A (zh) * 2015-12-31 2016-04-20 安诺优达基因科技(北京)有限公司 一种高质量果实基因组dna的提取方法及提取试剂盒
CN105505919A (zh) * 2016-01-25 2016-04-20 安徽农业大学 一种高效提取酥瓜基因组dna的方法
CN108486102A (zh) * 2018-05-23 2018-09-04 新疆农业大学 一种新疆洋葱野生近缘种花基因组dna的提取方法
CN109929922A (zh) * 2019-04-19 2019-06-25 贵州出入境检验检疫局检验检疫综合技术中心(贵州国际旅行卫生保健中心) 一种辣椒及制品中转基因成分检测及应用方法
CN111909926A (zh) * 2019-05-08 2020-11-10 青岛华大基因研究院 植物基因组dna的提取方法和测序方法及应用
CN113502286A (zh) * 2021-08-16 2021-10-15 天津诺禾致源生物信息科技有限公司 富含次生代谢物的植物组织中dna的提取方法
CN113549615A (zh) * 2021-08-30 2021-10-26 浙江大学 一种高质量草莓基因组dna的分离提取方法
CN117660443A (zh) * 2023-12-11 2024-03-08 南京派森诺基因科技有限公司 一种浆果果实基因组dna高质量提取方法
CN117660443B (zh) * 2023-12-11 2024-06-07 南京派森诺基因科技有限公司 一种浆果果实基因组dna高质量提取方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104805071A (zh) 一种草莓基因组dna的提取方法
CN101638651B (zh) 从富含多糖多酚及次生代谢物质的植物组织中提取总rna的方法
CN103756994A (zh) 一种适合富含多糖类植物的干燥叶片dna提取方法
CN105802957B (zh) 一种从煤层水样中提取微生物总dna的方法
CN103976453B (zh) 滁菊提取物、固体饮料、含片和食品添加剂及其制备方法
CN111500763A (zh) 与油茶种子油脂中棕榈油酸含量相关的snp分子标记及其应用
CN101914211A (zh) 一种从杜仲叶林萌生枝皮中提取杜仲胶的方法
CN101914526B (zh) 血清或血浆中微小rna的提取方法
CN101845436A (zh) 一种同时提取堆肥中总dna和rna的方法
CN104531679A (zh) 从干燥杏叶片中提取dna的方法
CN102732508B (zh) 一种花生基因组dna的提取方法
CN105002160A (zh) 中成药或含中药材保健品的dna的提取方法
CN101781646A (zh) 一种提取甘薯块根rna的方法及其应用
CN102796733A (zh) 一种安全快速提取茶树老叶片基因组dna的方法
CN105255857A (zh) 一种茶树dna的提取方法
CN103421764B (zh) 一种真菌病毒双链rna快速提取试剂盒及其应用
CN106636075A (zh) 一种铁皮石斛基因组dna的提取方法
CN102888396B (zh) 一种分离植物低分子量rna的方法
CN104152435A (zh) 一种适合微量樱桃叶片dna高效提取方法
CN104164421A (zh) 一种葡萄果皮rna的提取方法
CN104593356A (zh) 一种提取草莓rna的方法
CN104478987B (zh) 一种油棕叶片总蛋白质的专用提取液及提取方法
CN103724425B (zh) 一种重组人生长激素粗提中的提取方法
CN106282158A (zh) 一种从沙冬青提取高质量基因组dna的方法
CN105671032A (zh) 一种提取拟南芥种子中总rna的方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
EXSB Decision made by sipo to initiate substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20150729