CN104805071A - 一种草莓基因组dna的提取方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及分子生物学技术领域,公开了一种草莓基因组DNA的提取方法,用液氮将样品麿成粉末,加入CTAB提取液,55~65℃水浴后冷却至室温,加入醋酸钾后冰浴,再加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,混匀,离心,再在所得上清液中加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,混匀、静置、离心分离得上清液;在上清液中加入异丙醇后,离心得沉淀物;离心后去除上清液,加入含RNase的TE缓冲液在37℃水浴,然后加入等体积的氯仿/异戊醇混合液,混匀、静置、离心分离得上清液,向上清液中加入醋酸钠和无水乙醇后,离心去除上清液,向沉淀中加入TE缓冲液溶解沉淀,即为草莓基因组DNA溶液。本发明综合了CTAB和SDS提取方法的特点,最终得到高糖多酚类植物草莓高质量的基因组DNA。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物学技术领域,尤其涉及一种草莓基因组DNA的提取方法。
背景技术
草莓是一种蔷薇科多年生草本植物,一年可以多次开花结果,是我国冬季重要的一种时令水果。草莓叶片和果实中含有丰富的多糖、蛋白质、酚酸、维生素等次生物,这让它具有了较高的利用价值,但同时给其基因组DNA的提取也带来了较大的困难。因为这些粘性极强的次生物会与DNA共沉淀或者捆绑在一起,严重影响了DNA质量,导致后续的扩增、酶切等分子生物学难以进行。
高质量基因组DNA的提取分离是分子生物学研究的基础,常用的基因组DNA最基本的提取方法有:CTAB法和SDS法,其它如试剂盒法、高盐法等都是在这2种方法的基础上进行的改良或简化。这几种方法对极细嫩的组织会有效,但对于老叶片,果实,往往最后得到的DNA样品非常粘稠,提取的DNA样品由于含有大量的次生物不易溶于TE缓冲液,缠搅在其中的粘性物致使DNA检测时上样困难、电泳困难。凝胶电泳检测显示DNA得率很低,上样孔或样道非常亮(见图1~2)。因此,开发一种适合草莓DNA提取的方法,能大大方便地进行分子生物学操作。
发明内容
本发明针对现有中的缺点,公开了一种草莓基因组DNA的提取方法。
为了解决上述技术问题,本发明通过下述技术方案得以解决。
一种草莓基因组DNA的提取方法,包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55~65℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5~10ml预热后的CTAB提取液,在55~65℃下保温30~60分钟,其间晃动3~4次使其混合,得到混合物Ⅰ;在粉末中加入预热过的CTAB提取液,在60~65℃下保温30~60分钟,晃动3~4次,使其充分混合。
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4~1/3,冰浴条件下放置1-2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2-5℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含40~100μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应30~60min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30~60min,然后在2-5℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
作为优选,步骤(1)中,CTAB提取液包括,1-3%(m/V)的CTAB,80-120mM的Tris-HCl,10-25mM的EDTA,1-2M的NaCl和1-3%的PVP;CTAB提取液的pH值为7.5-8.5。
作为优选,CTAB提取液包括,2%(m/V)的CTAB,100mM的Tris-HCl,20mM的EDTA,1.4M的NaCl和2%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.0。
作为优选,将CTAB提取液在110-120℃灭菌20-40min,使用时在每100mlCTAB提取液中加入1-3ml的β-巯基乙醇。
作为优选,步骤(7)中,乙醇为无水乙醇。
作为优选,氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
作为优选,离心时,转速控制在10000~12000rpm,离心10~15分钟。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:本发明综合了CTAB法和SDS提取方法的特点,利用CTAB的高裂解力和去除多糖的效果,加上SDS法提取DNA中的,高盐浓度(醋酸钾)和降低温度(冰上保温)的办法沉淀除去蛋白质和多糖(在低温条件下醋酸钾与蛋白质及多糖结合成不溶物),离心除去沉淀后,上清液中的DNA用氯仿/异戊醇抽提,反复抽提后用异丙醇沉淀,再用Rnase去除RNA后用氯仿/异戊醇抽提,再用乙醇沉淀水相中的DNA,得到高质量的与杂质彻底分离的草莓基因组DNA。经检测用本发明方法得到的草莓基因组DNA质量较高;用该草莓基因组DNA进行PCR扩增,得到较好的扩增结果。进而,本发明解决了草莓次生物含量高导致的高质量DNA提取困难的问题。
附图说明
图1是传统CTAB法提取的草莓DNA凝胶电泳检测图片。
图2是传统SDS法提取的草莓DNA凝胶电泳检测图片。
图3是本发明方法提取的草莓DNA凝胶电泳检测图片。
图4是本发明方法提取的DNA的检测草莓镶脉病毒的凝胶电泳检测图片。
图5是本发明、传统CTAB法、传统SDS法提取的草莓DNA凝胶电泳检测结果对比图。
具体实施方式
实施例1
一种草莓基因组DNA的提取方法,CTAB提取液包括,1%(m/V)的CTAB,80mM的Tris-HCl,10mM的EDTA,1M的NaCl和1%的PVP;CTAB提取液的pH值为7.5。将CTAB提取液在110℃灭菌20min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入1ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5ml预热后的CTAB提取液,在55℃下保温30分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4,冰浴条件下放置1h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含40μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应30min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30min,然后在2℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
图1和图2分别是传统CTAB和SDS法提取草莓DNA的方法,从图1、图2中可以看出,这两种方法提取的DNA带型弥散、降解严重;由于多糖等物质含量丰富,导致点样孔比较亮,DNA无法迁移,OD260/280值在1左右;在用TE溶解时,混合溶液黏稠,用移液枪精确移取困难,当用大量TE溶解后,导致浓度过低,一般无法满足酶切需求。图3是用本专利方法提取的草莓DNA,从图中可以看出,所提取的草莓DNA带型整齐,点样孔干净,OD260/280比值在1.8附近。用本方法提取达赛拉克草莓叶片DNA后,检测了草莓镶脉病毒的情况,从图4电泳结果可以看出,PCR电泳好,点样孔也干净,是一种比较理想的提取草莓DNA的方法。
由此可见,本发明方法得到的草莓基因组DNA质量较高;用该草莓基因组DNA进行PCR扩增,得到较好的扩增结果。
实施例2
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,3%(m/V) 的CTAB,80-120mM的Tris-HCl,25mM的EDTA,2M的NaCl和3%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.5。将CTAB提取液在120℃灭菌40min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入3ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到65℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入10ml预热后的CTAB提取液,在65℃下保温60分钟,其间晃动4次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/3,冰浴条件下放置2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在5℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在5℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含100μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应60min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在5℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在5℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的 体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置60min,然后在5℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例3
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,2%(m/V)的CTAB,100mM的Tris-HCl,20mM的EDTA,1.4M的NaCl和2%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.0。将CTAB提取液在121℃灭菌30min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入2ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到50℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入8ml预热后的CTAB提取液,在60℃下保温45分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的7/24,冰浴条件下放置1.5h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在4℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含80μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应45min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30~60min,然后在4℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例4
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,1.3%(m/V)的CTAB,82mM的Tris-HCl,15mM的EDTA,1.2M的NaCl和1.3%的PVP;CTAB提取液的pH值为8。将CTAB提取液在112℃灭菌21min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入1.3ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55.5℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5。5ml预热后的CTAB提取液,在55.5℃下保温32分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4,冰浴条件下放置1.2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含42μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应32min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置32min,然后在2.5℃离心,转速控制在12000rpm,离心15分钟,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例5
一种草莓基因组DNA的提取方法,所使用的CTAB提取液包括,2.8%(m/V)的CTAB,112mM的Tris-HCl,23mM的EDTA,1.8M的NaCl和2.9%的PVP;CTAB提取液的pH值为8。将CTAB提取液在118℃灭菌39min, 使用时在每100ml CTAB提取液中加入2.9ml的β-巯基乙醇。所使用的氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到62℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5.5ml预热后的CTAB提取液,在62℃下保温59分钟,其间晃动4次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/3,冰浴条件下放置1.8h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含98μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应55min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的 体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置55min,然后在4.5℃离心,转速控制在10000rpm,离心10分钟,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例6
一种草莓基因组DNA的提取方法,包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5ml预热后的CTAB提取液,在55℃下保温30分钟,其间晃动3次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4,冰浴条件下放置1.2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2℃,转速控制在11000rpm,离心12分钟,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5(4)℃,转速控制在11000rpm,离心12分钟;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含50μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应36min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2.5℃, 转速控制在11000rpm,离心14钟,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在4℃,转速控制在11000rpm,离心12分钟,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和无水乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入无水乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;
-20℃放置55min,然后在4.5℃,转速控制在11000rpm,离心14分钟,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
实施例7
(1)在1g草莓老叶片中加入液氮研磨成粉末;
(2)在草莓叶片粉末中加入65℃、9mL的CTAB提取液,然后加入180μlβ-巯基乙醇充分混匀,在65℃水浴下保温40分钟,其间晃动4次,使其充分混匀,得混合物Ⅰ;
(3)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入3ml的5M醋酸钾溶液,冰上放置1h;
(4)再加入12ml氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,再在4℃下,12000rpm下离心分离10分钟,取出上清液放置于新的离心管中;在上清液中再次加入12ml氯仿/异戊醇混合液,混匀后4℃离心,取上清液10ml于新的离心管,得到中间相Ⅰ;
(5)向步骤(4)中的中间相Ⅰ中加入6.777ml异丙醇,充分混匀,4℃下,12000rpm下离心分离10分钟,去上清,留沉淀物;
(6)向步骤(5)所得的沉淀物中加600μl含50μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,充分融解,37℃水浴30min,得到混合物Ⅱ;
(7)向步骤(6)的混合物Ⅱ中加入600μl的氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,在4℃下12000rpm下离心分离10分钟,取上清液550μl,再加入550μl氯仿/异戊醇混合液,充分混匀,在4℃下12000rpm下离心分离10分钟,取上清液500μl于新的离心管中,得到中间相Ⅱ;
(8)向步骤(7)中的中间相Ⅱ中加入,50μl 3M醋酸钠和1000μl无水乙醇,-20℃放置1h,
然后在4℃下12000rpm下离心15分钟;去上清,沉淀物再用1ml 75%的无乙醇洗涤2次;离心去除上清液,沉淀物即为基因组DNA;
(9)将步骤(8)所得DNA在无菌工作台上吹干残留乙醇,然后向沉淀物中加入100μl TE,溶解后所得混合物即为草莓基因组DNA。
总之,以上所述仅为本发明的较佳实施例,凡依本发明申请专利范围所作的均等变化与修饰,皆应属本发明专利的涵盖范围。
Claims (7)
1.一种草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:包括以下步骤,
(1)将CTAB提取液预热到55~65℃,每1g草莓果实或叶片粉末中加入5~10ml预热后的CTAB提取液,在55~65℃下保温30~60分钟,其间晃动3~4次使其混合,得到混合物Ⅰ;
(2)将步骤(1)中的混合物Ⅰ中加入5M的醋酸钾溶液,加入醋酸钾溶液的体积为步骤(1)中CTAB提取液体积的1/4~1/3,冰浴条件下放置1-2h,得到混合物Ⅱ;
(3)再加入氯仿/异戊醇混合液,加入的氯仿/异戊醇混合液与混合物Ⅱ等体积;混合后在2-5℃离心,收集上清液;在上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心;重复步骤(3)中操作,直至上清液中无杂质为止,得到中间相Ⅰ;
(4)向步骤(3)所得的中间相Ⅰ中加入异丙醇,加入异丙醇的体积为中间相Ⅰ体积的2/3,产生絮状沉淀,离心得到沉淀物;
(5)向步骤(4)中得到的沉淀物中加入含40~100μg/ml核糖核酸酶的TE缓冲液,然后在37℃的水浴中反应30~60min,得到混合物Ⅱ;
(6)向混合物Ⅱ中加入混合物Ⅱ等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,取上清液;向上清液中加入与上清液等体积的氯仿/异戊醇混合液,在2-5℃离心,重复步骤(6)中操作,直至上清液中中无杂质为止,得到中间相Ⅱ;
(7)取步骤(6)所得的中间相Ⅱ,加入3M醋酸钠和乙醇,加入醋酸钠的体积为中间相Ⅱ体积的1/10,加入乙醇的体积为中间相Ⅱ体积的2倍;-20℃放置30~60min,然后在2-5℃离心,收集沉淀物;
(8)向步骤(7)所得的沉淀物中加入TE缓冲液,溶解后即得草莓基因组DNA。
2.根据权利要求1所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:步骤(1)中,CTAB提取液包括,1-3%(m/V)的CTAB,80-120mM的Tris-HCl,10-25mM的EDTA,1-2M的NaCl和1-3%的PVP;CTAB提取液的pH值为7.5-8.5。
3.根据权利要求2所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:CTAB提取液包括,2%(m/V)的CTAB,100mM的Tris-HCl,20mM的EDTA,1.4M的NaCl和2%的PVP;CTAB提取液的pH值为8.0。
4.根据权利要求2或3所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:将CTAB提取液在110-120℃灭菌20-40min,使用时在每100ml CTAB提取液中加入1-3ml的β-巯基乙醇。
5.根据权利要求1所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:步骤(7)中,乙醇为无水乙醇。
6.根据权利要求5所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:氯仿/异戊醇混合液中,氯仿和异戊醇的体积比为24:1。
7.根据权利要求1所述的草莓基因组DNA的提取方法,其特征在于:离心时,转速控制在10000~12000rpm,离心10~15分钟。
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