CN104271602B - 双特异性抗体 - Google Patents
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Abstract
本申请提供双特异性抗体,其由单链单元和单价单元组成,其中该单链单元针对免疫细胞具有特异性,该单价单元针对肿瘤细胞或微生物具有特异性。该单链单元包含与Fc片段融合的单链可变片段(scFv)且该单价单元包含轻链和重链对。本申请还提供双特异性抗体的制备方法,这些抗体的药学用途和诊断用途。
Description
背景技术
双特异性抗体(BsAb)为具有两种不同结合特异性的抗体或抗体类分子。BsAb广泛应用于生物医学,尤其是针对肿瘤的免疫治疗中。目前,对于免疫治疗研究的一个关注焦点为如何利用BsAb的细胞介导的细胞毒性来杀死肿瘤细胞。BsAb可设计为同时靶向作用于肿瘤细胞和效应细胞,同时激发效应细胞使其杀灭肿瘤细胞。
BsAb可通过例如化学工程、细胞工程以及基因工程的方法制备。基因工程的优势在于能够容易地改造抗体,使得能够设计和生产许多不同形式的双特异性抗体片段,包括双体,串联的(tanderm)ScFv和单链双体及其衍生物(参见Jin和Zhu,于“the design andengineering of IgG-Like bispecific antibodies”,RE Kontermann(编),Bispecificantibodies)。由于这些BsAb不具有IgG Fc结构域,因此它们的小的尺寸使得它们渗透进入肿瘤的能力增强,但它们在体内具有相当短的半衰期并且缺乏ADCC作用,该作用与抗体的恒定区相关联。
为了增强稳定性和治疗能力,对重链进行重组基因改造以促进它们的异二聚化并获得较高的含Fc的IgG类双特异性抗体的产量。已经有几种合理的设计方案用于改造抗体CH3链用于异二聚化,即,二硫键、盐桥、杵-臼(knobs-into-holes)。在并置的位置处产生杵(knob)和臼(hole)的基础在于该杵和臼相互作用将有助于形成异二聚体,然而杵-杵和臼-臼相互作用因有利的相互作用缺失而不利于形成同二聚体。尽管该杵-臼方案解决了重链同二聚化问题,但这没有解决来自两种不同抗体的轻链和重链之间的错配问题。虽然有可能对于两种不同抗体识别相同的轻链,但使用具有相同轻链的两种抗体序列构建BsAb的可能性非常小。
因此需要提供更好的易于制备的BsAb,并且该BsAb具有较好的临床稳定性和效力和/或减弱的系统毒性。
发明内容
技术问题
本申请的一个实施例提供了一种抗体,该抗体包含:(a)轻链-重链对,该轻链-重链对针对肿瘤细胞或微生物具有特异性;和(b)融合肽,该融合肽包含单链可变片段(scFv)和具有CH2结构域和CH3结构域的Fc片段,其中该融合肽针对免疫细胞具有特异性。
技术解决方案
在某些方面,该轻链-重链对针对肿瘤抗原具有特异性。一方面,该肿瘤抗原选自:EGFR、Her2、EpCAM、CD20、CD30、CD33、CD47、CD52、CD133、CEA、gpA33、粘蛋白、TAG-72、CIX、PSMA、叶酸盐结合蛋白、GD2、GD3、GM2、VEGF、VEGFR、整合素(Integrin)、αVβ3、α5β1、ERBB2、ERBB3、MET、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、RANKL、FAP和肌腱蛋白(Tenascin)。一方面,该轻链-重链对针对较对应的非肿瘤细胞而言在肿瘤细胞上过表达的蛋白具有特异性。
在某些方面,该轻链-重链对针对病毒或细菌具有特异性。一方面,该轻链-重链对针对内毒素具有特异性。
在某些方面,该免疫细胞选自T细胞、B细胞、单核细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、树突细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞、嗜曙红细胞、嗜碱细胞和肥大细胞。
在某些方面,该融合肽针对以下抗原具有特异性,该抗原选自CD3、CD16、CD19、CD28和CD64。
在某些方面,该轻链通过二硫键与该重链结合。在某些方面,该重链通过一个或多个二硫键与该融合肽结合。一方面,该重链包含人或者人源化的(humanized)Fc片段。一方面,该重链的Fc片段包含人IgG Fc片段。一方面,该融合肽的Fc片段包含人或者人源化的Fc片段。一方面,该融合肽的Fc片段包含人IgG Fc片段。
在某些方面,与野生型抗体片段相比,该重链和/或该融合肽的Fc片段包含一处或多处替换,该替换在该重链和Fc片段之间形成离子键。一方面,这些替换选自表1。
在某些方面,与野生型抗体片段相比,该重链和/或该融合肽的Fc片段包含一处或多处替换,该替换在该重链和Fc片段之间形成杵-臼结构配对。一方面,这些替换选自表2。
在某些方面,该CH2结构域位于该scFv片段和CH3结构域之间。一方面,该融合肽不包含CH1结构域。
在一个实施例中,本申请还提供一种包含上述任一实施例中的抗体的组合物。一方面,载体为药物载体。
另一实施例提供了一种复合体,该复合体包含与一个或多个抗原结合的上述任一实施例中的抗体。
本申请进一步提供了一种抗体的制备方法,该方法包括:将(a)轻链-重链对和(b)融合肽混合,该轻链-重链对针对免疫细胞具有特异性,且该融合肽包含单链可变片段(scFv)和具有CH2结构域和CH3结构域的Fc片段,其中该融合肽对于肿瘤细胞具有特异性。一方面,本申请提供一种可通过该方法获得的抗体。
附图说明
图1显示了本申请的双特异性抗体的一个实施例的结构;
图2显示了图1双特异性抗体的每条链的表达载体的构造;
图3为1%琼脂糖凝胶电泳图:泳道M:DL2000指示物(marker);泳道1:赫赛汀(Herceptin)VH;泳道2:赫赛汀VL;泳道3:人IgG1CH区域(CH1+铰链+Fc);泳道4:人IgCL;
图4为1%琼脂糖凝胶电泳图:泳道M:DL1000DNA指示物;泳道1:人源化的OKT3(HOKT3)VH-接头;泳道2:接头-HOKT3VL;
图5为1%琼脂糖凝胶电泳图:泳道M:DL10000DNA指示物;泳道1:HOKT3单链;
图6-8为用于定点诱变的质粒的限制图谱;
图9显示了6%凝胶SDS-PAGE图和蛋白质印记(Western blot)图。样品为293F细胞上清液。泳道M:蛋白指示物;泳道1:赫赛汀mAb;泳道2:T366W修饰的HOKT3单链+Y407A修饰的赫赛汀重链+赫赛汀轻链;泳道3:T366W K392D和K409D修饰(TKK)的HOKT3单链+D356KD399K Y407A修饰(DDY)的赫赛汀重链+赫赛汀轻链;泳道4:K392D和K409D修饰(KK)的HOKT3单链+D356K D399K修饰(DD)的赫赛汀重链+赫赛汀轻链;泳道5:T366W K392D和K409D修饰(TKK)的HOKT3单链+L368R D399K Y407A修饰(LDY)的赫赛汀重链+赫赛汀轻链;泳道6:T366W K392D和K409D修饰(TKK)的HOKT3单链+D399KY407A修饰(DY)的赫赛汀重链+赫赛汀轻链;
图10显示了6%SDS-PAGE凝胶电泳,并用考马斯亮蓝染色结果,该图显示:泳道M:蛋白标记物;泳道1:纯化的MSBODY;泳道2:赫赛汀;泳道3:HOKT3单链;
图11显示了抗Her2X抗CD3MSBODY结合至BT474细胞(A)和外周血单核细胞(PBMC)(B)的细胞表面结合的流式细胞分析,其中,灰线:PBS对照;黑实线:MSBODY;黑虚线:赫赛汀;
图12包括四张显示细胞聚集的显微镜图片;
图13显示抗体介导的细胞毒性;
图15A-E显示了实施例4中检测的某些抗体的结构。A:MSBODY;B:SMBODY;C:SSBODY;D:赫赛汀单链抗体;E:HOKT3单链抗体;
图16A-B显示了将抗Her2x抗CD3MSBODY和SMBODY结合至BT474细胞(A)和PBMC细胞(B)的结合情况;
图17显示了MSBODY比SMBODY对BT474细胞具有更高的结合活性;
图18显示了热挑战分析的结果;
图19显示了抗体介导的对BT474、MCF-7和MDA-MB-231细胞的细胞毒性的结果。
具体实施方式
定义
应注意非明确数量的实体限定应指一或多个(种)该实体;例如,“双特异性抗体”应理解为表示一或多个(种)双特异性抗体。同样地,非明确数量限定的、术语“一个或多个”和“至少一个”本文中可互换使用。
本文使用的术语“多肽”用于包括单数的“多肽”以及复数的“多肽”,并且也指通过酰胺键(也称为肽键)线性连接的单体(氨基酸)组成的分子。术语“多肽”是指两个或多个氨基酸的任一条或多条链,而不是指特定长度的该产物。因此、肽、二肽、三肽、寡肽、“蛋白”、“氨基酸链”、或任何指两个或多个氨基酸组成的一条或多条链的其他术语都包括在“多肽”的定义中,且术语“多肽”可代替这些术语的任何一个或与它们互换使用。术语“多肽”也用于指多肽的表达后修饰的产物,包括但不限于糖基化、乙酰化、磷酸化、酰胺化、通过已知的保护基/阻断基衍生化、蛋白水解裂解或通过非自然产生的氨基酸的修饰。多肽可衍生自天然的生物源或通过重组技术生产,但不一定由指定核酸序列翻译而成。其可以任何方式产生,包括通过化学合成方式。
本文使用的关于细胞、核酸(如DNA或RNA)的术语“分离的”,是指分别从其他的以天然来源的大分子存在的DNA或RNA分离的分子。本文使用的术语“分离的”也指通过重组DNA技术生产时基本不含细胞材料,病毒材料或培养基的核酸或肽,或经化学合成制备时基本不含化学前体或其他化学品。此外,“分离的核酸”是指包括非自然产生为片段的核酸片段,且这些片段自然状态下不存在。本文中术语“分离的”也用于指从其他细胞蛋白或组织分离的细胞或多肽。分离的多肽是指包括纯化的和重组的多肽。
本文使用的术语“重组”,在涉及多肽或多核苷酸时指自然状态下不存在的多肽或多核苷酸的形式,其中一个非限制性的例子,可以通过将通常不会一起出现的多核苷酸或多肽组合在一起来实现。
“同源性”或“同一性”或“相似性”是指两个肽链分子之间或两个核酸分子之间的序列相似程度。同源性可通过比较每个序列中的位置来测定,可通过比对来进行比较。当在被比较的序列中的位置上有相同的碱基或氨基酸时,在该位置上的分子为同源的。多个序列之间的同源度为这些序列共有的配对或同源位点数量的函数。“无关的”或“非同源的”序列与本申请的序列之一之间具有少于40%的同源性,但优选小于25%的同源性。
多核苷酸或多核苷酸区域(或多肽或多肽区域)与另一序列具有一定的百分比(例如,60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%)的“序列同一性”是指,在比对时,在这两个序列比较时该百分比的碱基(或氨基酸)是相同的。此种比对和百分比同源性或序列同一性,可使用本领域中已知的软件程序测定,例如,通过Ausubel等人编的(2007)Current Protocols in Molecular Biology描述的那些软件。优选地,使用默认参数用于比对。BLAST是一种比对程序,使用默认参数。具体地,程序为BLASTN和BLASTP,使用如下默认参数:Genetic code=standard;filter=none;strand=both;cutoff=60;expect=10;Matrix=BLOSUM62;Descriptions=50sequences;sort by=HIGH SCORE;Databases=non-redundant,GenBank+EMBL+DDBJ+PDB+GenBank CDS translations+SwissProtein+SPupdate+PIR。这些程序的详细信息,可于以下互联网地址获得:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi,2008年5月21日最后一次访问。生物学等效的多核苷酸是具有上面提到的特定百分比的同源性,并编码具有相同或相似的生物活性多肽的多核苷酸。
术语“等效核酸或多核苷酸”是指与该核酸的核苷酸序列或其互补序列具有一定程度的同源性,或序列同一性的核苷酸序列的核酸。双链核酸的同源物是指包含特定核苷酸序列的核酸,该特定核苷酸序列具有与另一核酸或其互补序列具有一定程度的同源性。一方面,某核酸的同系物(homologs)能够与该核酸或其互补序列杂交。同样地,“等效的多肽”是指与参考多肽的氨基酸序列具有一定程度的同源性,或序列同一性的多肽。在一些方面,该序列同一性至少为约70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%。在某些方面,该等效序列保留了参考序列的活性(例如,抗原表位结合)或结构(例如,盐桥)。
杂交反应可以在不同的“严格”条件下进行。通常,低严格杂交反应于约40℃在约10×SSC或同等离子强度/温度的溶液中进行。中等严格杂交通常在约50℃于约6×SSC中进行,高度严格杂交反应通常在约60℃于约1×SSC中进行。杂交反应也可在本技术领域的技术人员熟知的“生理条件”下进行。生理条件的一个非限制性例子是细胞中通常存在的温度,离子强度,pH值和Mg2+浓度。
多核苷酸由4个核苷酸碱基组成的特定序列组成:腺嘌呤(A),胞嘧啶(C),鸟嘌呤(G),胸腺嘧啶(T),在该多核苷酸为RNA时尿嘧啶(U)替换胸腺嘧啶。因此,术语“多核苷酸序列”是多核苷酸分子按字母顺序排列的表示。该字母顺序表示可以被输入到计算机的数据库中,该计算机中有中央处理单元,并且用于生物信息学应用,如功能基因组学和同源性检索。术语“多态性”是指共存有多于一种形式的基因或其一部分。基因的一部分具有至少两种不同的形式,即,两种不同的核苷酸序列时,该基因的该部分被称为“基因的多态区域”。多态区域可以是单核苷酸,其同一性在不同的等位基因中不同。
术语“多核苷酸”和“寡核苷酸”可以互换使用,并涉及任何长度的核苷酸的聚合物形式,无论是脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸或其类似物。多核苷酸可以有任何三维结构,并且可以具有任何已知或未知的功能。以下为多核苷酸的非限制性实施例:基因或基因片段(例如,探针,引物,EST或SAGE标签),外显子,内含子,信使RNA(mRNA),转移RNA,核糖体RNA,核酶,cDNA,dsRNA,siRNA,miRNA,重组多核苷酸,分支多核苷酸,质粒,载体,单独的任意序列的DNA,单独的任意序列的RNA,核酸探针和引物。多核苷酸可以包括修饰的核苷酸,如甲基化的核苷酸和核苷酸类似物。如果存在,则在多核苷酸的装配之前或之后对碱基结构进行修饰。该核苷酸序列可以被非核苷酸成分中断。多核苷酸可在聚合后进一步修饰,如用标记成分结合。该术语也指双链和单链分子。除非另外指出或要求,否则本申请的多核苷酸的任一实施例既包括双链形式也包括已知的两条互补单链形式或预计成为双链形式的情况。
术语“编码”在其应用于多核苷酸时指被认为“编码”某一多肽的多核苷酸,以其天然的状态或由本领域技术人员熟知的方法操作时,它可以被转录和/或翻译以产生该多肽的mRNA和/或其片段。反义链是此种核酸的互补物,该编码序列可以由其推导出。
本文使用的术语“可检测的标签“指可直接或间接检测的化合物或组合物,该化合物或组合物直接或间接地结合至待检测的组合物(例如,多核苷酸或蛋白质,该蛋白如抗体)以获得“有标签的”组合物。该术语还包括,结合至该多核苷酸的序列,其通过插入序列的表达提供信号,如绿色荧光蛋白(GFP)等。该标签自身可被检测(例如放射性同位素标签或荧光标签)或者,在酶标签情况下,可催化底物化合物或组合物的化学改变,该改变可被检测。该标签可用于小规模检测或更适于高通量筛选。同样地,合适的标签包括但不限于放射性同位素、荧光染料、化学发光化合物、染料、和蛋白(包括酶)。该标签可仅被检测,也可被定量。仅被检测的反应通常包括仅能证实其存在的反应,其中可被定量的反应通常包括具有可定量的(例如可通过数字报告的)值例如强度、极化和/或其他性质的反应。在发光或荧光分析中,可检测的反应可直接使用与分析成分相关的实际上涉及结合的发光体或荧光基团,或间接使用与另一(例如报告分子或指示剂)成分连接的发光体或荧光基团。
本文使用的,“抗体”或者“抗原结合多肽”指特定识别并结合抗原的多肽或多肽复合体。抗体可为整个抗体也可为任何抗原结合片段或者其单链。因此术语“抗体”包括含有特定分子的任何蛋白或肽,该特定分子含有至少一部分的免疫球蛋白分子,该免疫球蛋白分子具有结合至抗原的生物活性。此种情况的实例包括但不限于,重链或轻链或其配体结合部分的互补决定区(CDR),重链或轻链可变区,重链或轻链恒定区,框架(FR)区或其任何部分,或结合蛋白的至少一部分。
本文使用的术语“抗体片段”或“抗原结合片段”为抗体的一部分,该抗体例如F(ab')2、F(ab)2、Fab'、Fab、Fv、scFv等。不管结构如何,与相同的抗原结合的抗体片段被认为是完整抗体。术语“抗体片段”包括适配体、适配体对映体(spiegelmers)和双体(diabodies)。术语“抗体片段”也包括任何合成的或基因改造的蛋白,它们与抗体一样可结合至特定的抗原以形成复合体。
“单链可变片段”或“scFv”指免疫球蛋白的重链(VH)和轻链(VL)的可变区域的融合蛋白。在某些方面,这些区域用10至约25个氨基酸的短接头肽连接。该接头可富含甘氨酸以具有柔性,也含有丝氨酸或苏氨酸以具有可溶性,且能将VH的N-末端连接至VL的C末端,反过来也一样。该蛋白质保留了原始的免疫球蛋白的特性,只是去除了恒定区并引入了接头。ScFv分子为本领域已知的,且描述于美国专利5,892,019中。
术语抗体包括多种宽泛类别的多肽,这些多肽可被生化识别。本领域技术人员应理解重链分为gamma、mu、alpha、delta、及epsilon(, , , , )并具有一些亚类(例如,1-4)。该链的性质决定了抗体的“类”,如IgG,IgM,IgA,IgG,或者IgE。免疫球蛋白亚类(同型)例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgG5等被很好表征并在功能上具有特异性。本领域技术人员参考本申请可容易识别这些类和同型的每一种修饰形式,因此,这些形式在本申请范围内。所有免疫球蛋白类明确地在本申请的范围内,下列讨论通常将针对免疫球蛋白分子的IgG类。关于IgG,标准免疫球蛋白分子包含两个相同的轻链多肽(它们的分子量约为23,000道尔顿)和两个相同的重链多肽(它们的分子量为53,000-70,000)。这四条链通常经二硫键以“Y”型连接在一起,其中轻链在“Y”结构的口部开始支撑重链,并延伸穿过可变区。
本申请的抗体、抗原结合多肽、它们的变体或衍生物包括但不限于,多克隆抗体、单克隆抗体、多特异性抗体、人抗体、人源化的抗体、灵长类化的(primatized)抗体、或嵌合抗体、单链抗体、抗原表位结合片段,例如,Fab、Fab'和F(ab')2、Fd、Fvs、单链Fvs(scFv)、单链抗体、二硫键连接的Fvs(sdFv)、包含VL结构域或VH结构域的片段、由Fab表达库产生的片段、和抗独特型(idiotypic)(抗-Id)抗体(包括,例如,本文公开的抗Id抗体至LIGHT抗体)。本申请的免疫球蛋白分子或抗体分子可为任何类型的(例如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、免疫球蛋白分子的任何类(例如IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、IgAl和IgA2)或亚类。
轻链分为kappa或lambda(,)。每类重链均可结合kappa或lambda轻链。通常,轻链和重链共价地结合在一起,且当这些免疫球蛋白由杂交瘤、B细胞或基因改造的宿主细胞产生时,两条重链的“尾部”部分通过共价二硫键或非共价连接结合在一起。在该重链中,氨基酸序列从Y型结构的叉端的N末端向每条链的底部C末端延伸。
轻链和重链两者都分成结构区和功能同源区。术语“恒定”和“可变的”为功能上的使用。在此,应认识到轻链可变结构域(VL)和重链可变结构域(VH)同时决定了抗原识别和特异性。相反地,轻链恒定结构域(CK)和重链恒定结构域(CH1,CH2或CH3)提供了重要的生物学性质,例如分泌、经胎盘的流动性、Fc受体结合,补体结合等。通常恒定区结构域的数量随着远离抗体的抗原结合位点或氨基端的末端位置而增加。N末端部分为可变区,而在C末端部分为恒定区;CH3和CK结构域实际上分别包含重链和轻链的羧基末端。
如上所述,该可变区域使得抗体能选择性识别并特异性结合抗原上的抗原表位。即,抗体的VK结构域和VH结构域,或互补决定区(CDR)的亚类组合形成定义三维抗原结合位点的可变区域。这种四价抗体结构形成了抗原结合位点,该抗原结合位点存在于Y构型的每个臂的末端。更具体地,该抗原结合位点被每个VH和VK链(即,CDR-H1,CDR-H2,CDR-H3,CDR-L1,CDR-L2和CDR-L3)上的三个CDR定义。在一些实例中,例如,某些衍生自骆驼种或基于骆驼免疫球蛋白改造的免疫球蛋白,完整的免疫球蛋白分子可仅由重链组成,而没有轻链。参见,例如,Hamers-Casterman等,Nature363:446-448(1993)。
自然产生的抗体中,存在于每个抗原结合域中的六个“互补决定区”或“CDR”是短的,非连续的氨基酸序列,它们具有特定的定位以形成抗原结合结构域,对于抗体假定其三维构型处于水环境中。该抗原结合结构域的其余氨基酸,称为“框架”区,具有更少的分子内可变性。该框架区主要采用β-折叠片构型,且CDR形成环,该环连接该β-折叠片结构,有时形成该β-折叠片结构的一部分。因此,框架区用于形成支架,该支架使CDR通过链内的、非共价作用在正确方向上定位。由该定位的CDR形成的抗原结合域定义了互补于免疫活性抗原表位的表面。该互补表面促进了抗体与其同源表位的非共价结合。本领域技术人员可对分别包括CDR和框架区的氨基酸针对任何给定的重链或轻链可变区容易地识别,因为它们已经被明确定义(参见,“Sequences of Proteins of Immunological Interest,”Kabat,E.,等,美国卫生和公共服务部(U.S.Department of Health and Human Services,),(1983);Chothia和Lesk,J.MoI.Biol.,196:901-917(1987),其在此通过引用以全文形式结合至本文)。
在本技术领域内使用和/或可接受的情况下,一个术语有两个或两个以上定义时,本文使用的术语的定义用于包括所有的含义,除非明确说明与此相反。一个具体的例子为,使用术语“互补决定区”(“CDR”)来描述在重链和轻链多肽的可变区中都存在的非连续的抗原结合位点。这种具体区域由Kabat等描述于美国卫生和公共服务部,“Sequences ofProteins of Immunological Interest”(1983)和由Chothia等描述与J.MoI.Biol.196:901-917(1987)中,其通过全文引用结合至本文。根据Kabat和Chothia的定义,CDR包括相互比较时重叠的氨基酸残基,或氨基酸亚结构。然而,每种关于抗体或其变体的CDR的定义的应用都将在本文定义和使用的术语的范围内。包含如以上引用的每一篇参考文献定义的CDR的合适的氨基酸残基列于下表中作为比较。包含特定CDR的精确残基数将随该CDR的序列和大小变化。如果给定该抗体的可变区氨基酸序列,则本领域技术人员通常可确定哪些残基包含特定CDR。
[表1]
Kabat | Chothia | |
CDR-H1 | 31-35 | 26-32 |
CDR-H2 | 50-65 | 52-58 |
CDR-H3 | 95-102 | 95-102 |
CDR-L1 | 24-34 | 26-32 |
CDR-L2 | 50-56 | 50-52 |
CDR-L3 | 89-97 | 91-96 |
Kabat等也定义了用于可变结构域序列的编号系统,该系统适用于任一种抗体。本领域技术人员可毫无疑义地将该“Kabat编号”系统用于任何可变结构域序列,而不依赖于该序列自身之外的任何实验数据。本文使用的“Kabat编号”是指Kabat等描述的编号系统,其内容记载于美国卫生和公共服务部,“Sequence of Proteins of ImmunologicalInterest”(1983)。
除了上表,Kabat编号系统描述的CDR区如下:CDR-H1在大约31号氨基酸处开始(即,第一半胱氨酸残基后约9个残基),包括约5-7个氨基酸,并在下一个色氨酸残基处终止。CDR-H2在CDR-H1的末端后第15个残基处开始,包括约16-19个氨基酸,并在下一个精氨酸或赖氨酸残基处终止。CDR-H3在CDR-H2的末端后约第33个氨基酸残基处开始;包括3-25个氨基酸;并在序列W-G-X-G处终止,其中X为任意氨基酸。CDR-L1在约残基24处开始(即,在半胱氨酸残基之后);包括大约10-17个残基;并终止于下一个色氨酸残基。CDR-L2在CDR-L1的末端后约16个残基后开始,并包括约7个残基。CDR-L3在CDR-L2的末端后约第33个残基处开始(即,在半胱氨酸残基之后);包括约7-11个残基,并在序列F或W-G-X-G处终止,其中X为任意氨基酸。
本文描述的抗体可来自任何动物源,包括鸟和哺乳动物。优选地,抗体为人、鼠、驴、兔、山羊、豚鼠、骆驼、驼马、马或鸡的抗体。在另一个实施例中,可变区可来自于软骨鱼(condricthoid)(例如,来自鲨鱼)。
本文使用的术语“重链恒定区”包括来自免疫球蛋白重链的氨基酸序列。包含重链恒定区的多肽至少包含以下一种∶CH1结构域,铰链(例如,上部铰链区、中间铰链区,和/或下部铰链区)结构域,CH2结构域,CH3结构域,或其变体或片段。例如,本申请中使用的抗原结合多肽可包含具有CH1结构域的多肽链;具有CH1结构域、至少一部分的铰链结构域和CH2结构域的多肽;具有CH1结构域和CH3结构域的多肽链;具有CH1结构域、至少一部分铰链结构域和CH3结构域的多肽链,或者具有CH1结构域,至少一部分铰链结构,CH2结构域,和CH3结构域的多肽链。在另一个实施例中,本申请的多肽包括具有CH3结构域的多肽链。另外,在本申请中使用的抗体可能缺少至少一部分CH2结构域(例如,所有的或一部分的CH2结构域)。如上文所述,但本技术领域的普通技术人员应理解,重链恒定区可能会被修改,使得它们在氨基酸序列上与天然存在的免疫球蛋白分子不同。
本文所公开的抗体的重链恒定区可以来自于不同的免疫球蛋白分子。例如,多肽的重链恒定区可以包含来自IgGl分子的CH1结构域和来自IgG3的分子的铰链区。在另一例子中,重链恒定区可以包含铰链区,该铰链区部分来自IgGl分子,且部分地来自IgG3分子。在另一例子中,重链部分可包含嵌合铰链,该嵌合铰链一部分来自IgGl分子,并且一部分来自IgG4分子。
本文使用的术语“轻链恒定区”包括来自抗体轻链的氨基酸序列。优选地,所述轻链恒定区包括恒定kappa结构域和恒定lambda结构域中的至少一个。
“轻链-重链对”是指轻链和重链的集合,它们可通过轻链的CL结构域和CH1结构域之间的二硫键形成二聚体。
如前面所指出的,各种免疫球蛋白类的恒定区的亚基结构和三维结构是已知的。本文使用的,术语“VH结构域”包括免疫球蛋白重链的氨基末端可变结构域,而术语“CH1结构域”包括免疫球蛋白重链的第一(多数为氨基末端)恒定区。CH1结构域邻近VH结构域并且是免疫球蛋白重链分子的铰链区的氨基末端。
本文使用的术语“CH2结构域”包括一部分的重链分子,该部分范围,例如,从抗体的约残基244到残基360,使用常规的编号方案(残基244至360,Kabat编号系统;和残基231-340,EU编号系统;见Kabat等,美国卫生和公共服务部,“Sequences of Proteins ofImmunological Interest”(1983)。CH2结构域是独特的,因为它与另一个结构域配对不紧密。相反,两个N-连接的支链的糖链插入至完整的天然IgG分子的两个CH2结构域之间。有文献记载,CH3结构域从CH2结构域延伸至IgG分子的C-末端,并包含约108个残基。
本文使用的术语“铰链区”包括重链分子的将CH1结构域连接至CH2结构域的那一部分。该铰链区包含约25个残基并且是柔性的,从而使两个N-末端抗原结合区独立地移动。铰链区可分为三个不同的结构域:上部、中部、和下部铰链结构域(Roux等人,J.Immunol161:4083(1998))。
本文使用的术语“二硫键”包括两个硫原子之间形成的共价键。氨基酸半胱氨酸含有巯基,该巯基可以与第二个巯基形成二硫键或桥连。在大多数天然存在的IgG分子中,CH1和CK区由二硫键连接并且两个重链由两个二硫键连接,在对应于使用Kabat编号系统的239和242处(位置226或229,EU编号系统)连接。
本文使用的术语“嵌合的抗体”将用于指以下任何抗体:其中其免疫反应区或位点得自或来自第一物种且其恒定区(该恒定区可以是完整的,部分的或根据本申请修改过的)得自第二物种。在某些实施例中靶结合区或位点将来自非人类来源(例如小鼠或灵长类)且恒定区来自人。
本文使用的“百分比人源化”通过以下方式计算:测定人源化的结构域和种系结构域之间的框架氨基酸差值的数量(即,非CDR差),用氨基酸总数减去该数量,然后除以氨基酸总数,再乘以100。
所谓“特异性结合”或“对…有特异性”,通常意味着抗体通过它的抗原结合结构域结合抗原表位,并且该结合使得抗原结合结构域和抗原表位之间必须有一些互补性。根据这个定义,抗体被认为是“特异性结合”至抗原表位,当它结合到该抗原表位时,经抗原结合结构域的结合比结合至随机的,不相关的抗原表位更容易。本文中使用术语“特异性”以确定某一抗体结合至特定抗原表位的亲和力。例如,抗体“A”可能被视为对于一给定的抗原表位比抗体“B”具有更高的特异性,或抗体“A”可被说成是结合至抗原表位“C”比其对于相关抗原表位“D”具有更高的特异性。
本文使用的术语“治疗”(“treat”或“treatment”)是指治疗性治疗和预防或防治措施,其中对于受试者进行防止或减慢(减轻)不良的生理变化或疾病,如癌症的发展。有益的或所需的临床结果包括但不限于,减轻症状,降低疾病的程度、稳定(例如使其不恶化)疾病的状态,延迟或减缓疾病发展,改善或缓和疾病状态,并缓解(无论是部分或全部),无论可否被检测到。“治疗”也可指与不接受治疗时的预计生存期相比能延长生存期。那些需要治疗的状况包括那些已经具有病症或症状以及那些容易具有病症或症状或那些将对病症或症状进行预防的情况。
所谓“受试者”或“个体”或“动物”或“患者”或“哺乳动物”是指任何受试者,特别是哺乳动物受试者,它们需要进行诊断,预后或治疗。哺乳动物受试者包括人类,家养动物,农场动物,动物园,运动场,或宠物,如狗,猫,豚鼠,兔,大鼠、小鼠,老鼠,马,牛(cattle),奶牛(cows)等。
本文使用的短语,如“需要治疗的患者”或“需要治疗的受试者”包括例如哺乳动物受试者,这些受试者将受益于本申请使用的抗体和组合物的给药,例如进行检测,诊断程序和/或治疗。
双特异性抗体
本申请的一个实施例提供了一种异二聚体抗体,该抗体包含两个不同的抗原结合多肽单元。在某些方面,该异二聚体与其对应的同二聚体大小不同,可利用大小上的区别来促进分离异二聚体和同二聚体。
在某些方面,这两个抗原结合多肽单元之一包含类似于野生型抗体的轻链-重链对。在整个本申请中,该单元也称为“单价单元”。在某些方面,其他抗原结合多肽单元包含单链可变片段(scFv)。这样的scFv可融合至抗体的恒定片段(Fc)。在本申请全文中此融合肽也被称为“单链单元”。
令人惊奇的是,本申请证明这种非对称的抗体是稳定的并具有高的抗原结合效率。这是令人意外的,因为已经证实在生理条件下即使是单链抗体的同二聚体都是不稳定的。例如,Ahmad等的“scFv Antibody:Principles and Clinical Application,”Clinicaland Developmental Immunology,2012:980250(2012),显示基于scFv的IgG类抗体不稳定,并且需要进一步改造以减少聚集并提高稳定性。
另外,因为具有非对称性,异二聚体具有与由其中任一抗原结合多肽单元组成的同二聚体所不同的分子量。基于异二聚体和同二聚体之间的分子量差异,可以容易地将需要的异二聚体与同二聚体分离。
能够容易地将异二聚体与同二聚体分离对于制备双特异性抗体是特别有利的,该双特异性抗体中两个抗原结合多肽的每一个对于不同的抗原表位均具有特异性。这是因为两种类型的同二聚体(即,包含单价单元或单链单元的同二聚体)都不具有所需的双重特异性,而该异二聚体能提供该双重特异性。
在一个实施例中,此种双特异性抗体针对肿瘤细胞或微生物具有特异性且对于免疫细胞具有特异性,这使得肿瘤细胞或微生物能靠近免疫细胞,通过活性免疫反应导致肿瘤细胞或微生物被消除。
在一个特定方面,该单价单元对于肿瘤细胞或微生物有特异性,且该单链单元对于免疫细胞有特异性。有这样排列的特异性的不对称的双特异性抗体也被称为“单价单链双特异性抗体”或“MSBODY”。与此相反,一种非对称的双特异性抗体,其中该单价单元具有对于免疫细胞的特异性,且该单链单元具有对于肿瘤细胞或微生物的特异性,该非对称的双特异性抗体称为“SMBODY”。另一种双特异性抗体具有两个单链单元,其中一个具有对于肿瘤细胞或微生物的特异性,而另一个具有对于免疫细胞的特异性,该抗体称为“SSBODY”。
本申请的一个意外发现是,即使MSBODY和SMBODY具有相同的结合基序和相似的分子量,但在结合到靶肿瘤细胞时,MSBODY表现出比SMBODY更高的稳定性和亲和力。在这种情况下,有趣的是,虽然抗Her/抗CD3MSBODY和SMBODY对Her2高表达细胞BT474产生了相似的细胞毒性,但MSBODY结构显示出对于低Her2表达乳腺癌细胞系(包括MCF-7和MDA-MB-231)的更高细胞毒性。并非所有表达肿瘤抗原的肿瘤细胞都一定高水平表达该抗原,因此MSBODY的这种能力在临床应用中显示出独特的优势。
因此,在一个实施例中,提供的抗体包含:(a)轻链-重链对,其具有对于肿瘤细胞的特异性;及(b)融合肽,其包含单链可变片段(scFv)和Fc片段,该Fc片段包括CH2结构域和CH3结构域,其中该融合肽具有对于免疫细胞的特异性。
在另一实施例中,提供的抗体包含:(a)轻链-重链对,其对于微生物具有特异性,如GP120对于HIV,HA2对于流感,及志贺样毒素2B对于大肠杆菌(E.Coli);和(b)融合肽,其包含单链可变片段(scFv)和Fc片段,该Fc片段含有CH2结构域和CH3结构域,其中该融合肽对于免疫细胞具有特异性。
图1显示出本申请的双特异性抗体一个实施例。该抗体的左半部分(单价单元)是由轻链(6)和重链(3和4)组成。
图1中还显示,一方面,所述轻链(6)包括CL结构域和VL结构域,VLa,靶向于抗原表位“a”。同样地,除了含有推定的CH2和CH3结构域,该重链还包含CH1结构域和VH结构域,VHa,其也靶向于抗原表位“a”。一方面,该轻链和重链通过二硫键结合,例如,在CL和CH1之间。
图1中还显示了该单链单元,其包含单链Fv(scFv)片段(5)和恒定区(3),该恒定区包括CH2和CH3。该scFv片段由VL(VLb)和VH(VHb)结构域组成,它们都靶向于抗原表位“b”,该抗原表位“b”不同于抗原表位“a”。
在某些方面,该单价单元的重链通过一个或多个二硫键结合至融合肽。一方面,该一个或多个二硫键形成于该CH1(或VLb)和CH2结构域之间的铰链区的氨基酸残基之间。
在某些方面,该单链单元的CH2结构域位于scFv片段和CH3结构域之间。换句话说,该scFv片段连接于该Fc片段的CH2末端。在某些方面,该单链单元不包含CH1结构域。
一方面,该单价单元和单链单元之一或两者都包含人抗体序列或人源化的序列。例如,在一个方面,该单价单元的重链包含人或人源化的Fc片段。在一个具体的方面,该重链的Fc片段包含人IgG Fc片段。
同样地,在一个方面,该融合肽的Fc片段包含人或人源化的Fc片段。在一个具体的方面,该融合肽的Fc片段包含人IgG Fc片段。
可对抗体进行修改以进一步稳定或提高抗体的活性。比如,在一个方面,与野生型的抗体片段相比,该单价单元重链的Fc片段和/或该融合肽的Fc片段可包含一处或多处替换,这些替换之间形成离子键。
一方面,该Fc片段之一含有一处或多处替换,经在生理条件下有正电荷的氨基酸残基替换,而另一Fc片段包含一处或多处替换,经一个或多个在生理条件下具有负电荷的氨基酸残基替换。一方面,该带正电的氨基酸残基可为精氨酸(R),组氨酸(H)或赖氨酸(K)。另一方面,该带负电荷的氨基酸残基可为天冬氨酸(D)或谷氨酸(E)。可被替换的氨基酸残基包括,但不限于,D356、E357、L368、K370、K392、D399和K409。下表1列出这些替换的组合的非限制性实例。
表1.导致在单价单元和单链单元之间形成离子键的氨基酸替换的组合
组合编号 | 一个Fc上的替换 | 另一Fc上的替换 |
1 | D356K D399K | K392D K409D |
2 | E357R L368R | K370D K409D |
3 | E357R L368K | K370D K409D |
4 | E357R D399K | K370D K409D |
5 | E357R | K370D |
6 | L368R D399K | K392D K409D |
7 | L368K D399K | K392D K409D |
8 | L368R D399K | K409D |
9 | L368K D399K | K409D |
10 | L368R | K409D |
11 | L368K | K409D |
12 | K370D K409D | E357R D399K |
13 | K370D K409D | E357R L368R |
14 | K370D K409D | E357R L368K |
15 | K370D K409D | E357R D399K |
16 | K370D K409D | E357R L368R |
17 | K370D K409D | E357R L368K |
18 | K370D | E357R |
19 | K370D | E357R |
20 | K392D K409D | D356K D399K |
21 | K392D K409D | L368R D399K |
22 | K392D K409D | L368K D399K |
23 | K392D K409D | D399K |
24 | D399K | K392D K409D |
25 | D399K | K409D |
26 | K409D | L368R |
27 | K409D | L368K |
28 | K409D | L368R D399K |
29 | K409D | L368K D399K |
30 | K409D | L368R |
31 | K409D | L368K |
32 | K409D | L368R D399K |
33 | K409D | L368K D399K |
34 | K409D | D399K |
在某些方面,与野生型的抗体片段比较,该单价单元重链的Fc片段和/或该融合肽的Fc片段可包含一处或多处替换,这些替换之间形成杵-臼结构对。杵-臼构型在本领域中是已知的。参见,例如Ridgway等的“‘Knob-into-holes’engineering of antibodyCH3domains for heavy chain heterodimerization,”Protein Engineering9(7):617-21(1996)。
一方面,一个Fc片段上的K366被相对较大的氨基酸残基替换,如酪氨酸(Y)或色氨酸(W)替换。然后,另一Fc片段上的Y407可被相对较小的氨基酸残基替换,如苏氨酸(T),丙氨酸(A)或缬氨酸(V)。下表2显示了这些替换的组合的一些非限制性实例。
表2.导致在单价单元和单链单元之间形成杵-臼结构对的氨基酸替换的组合
组合编号 | 一个Fc上的替换 | 另一Fc上的替换 |
1 | T366W | Y407A |
2 | T366W | Y407V |
3 | T366Y | Y407A |
4 | T366Y | Y407V |
在某些方面,该抗体可包含离子键或杵-臼结构或两者都有。下表3显示了在这方面的一些实施例。
表3.氨基酸替换的组合
组合编号 | 一个Fc上的替换 | 另一Fc上的替换 |
1 | K370D | E357R |
2 | K409D | L368R |
3 | K409D | L368K |
4 | K409D | L368R D399K |
5 | K409D | L368K D399K |
6 | K370D K409D | E357R D399K |
7 | K370D K409D | E357R L368R |
8 | K370D K409D | E357R L368K |
9 | T366W K370D | E357R Y407A |
10 | T366W K370D | E357R Y407V |
11 | T366W K409D | L368R Y407A |
12 | T366W K409D | L368R Y407V |
13 | T366W K409D | L368K Y407A |
14 | T366W K409D | L368K Y407V |
15 | T366W K409D | L368R D399K Y407A |
16 | T366W K409D | L368R D399K Y407V |
17 | T366W K409D | L368K D399K Y407A |
18 | T366W K409D | L368K D399K Y407V |
19 | T366W K409D | D399K Y407A |
20 | T366W K409D | D399K Y407V |
21 | T366W K392D K409D | D399K Y407A |
22 | T366W K392D K409D | D399K Y407V |
23 | T366W K392D K409D | D356K D399K Y407A |
24 | T366W K392D K409D | D356K D399K Y407V |
25 | T366W K370D K409D | E357R D399K Y407A |
26 | T366W K370D K409D | E357R D399K Y407V |
27 | T366W K370D K409D | E357R L368R Y407A |
28 | T366W K370D K409D | E357R L368R Y407V |
29 | T366W K370D K409D | E357R L368K Y407A |
30 | T366W K370D K409D | E357R L368K Y407V |
31 | T366W K392D K409D | L368R D399K Y407A |
32 | T366W K392D K409D | L368R D399K Y407V |
33 | T366W K392D K409D | L368K D399K Y407A |
34 | T366W K392D K409D | L368K D399K Y407V |
35 | E357R T366W | K370D Y407A |
36 | E357R T366W | K370D Y407V |
37 | T366W L368R | Y407A K409D |
38 | T366W L368R | Y407V K409D |
39 | T366W L368K | Y407A K409D |
40 | T366W L368K | Y407V K409D |
41 | T366W L368R D399K | Y407A K409D |
42 | T366W L368R D399K | Y407V K409D |
43 | T366W L368K D399K | Y407A K409D |
44 | T366W L368K D399K | Y407V K409D |
45 | T366W D399K | Y407A K409D |
46 | T366W D399K | Y407V K409D |
47 | T366W D399K | K392D Y407A K409D |
48 | T366W D399K | K392D Y407V K409D |
49 | T366W D356K D399K | K392D Y407A K409D |
50 | T366W D356K D399K | K392D Y407V K409D |
51 | E357R T366W D399K | K370D Y407A K409D |
52 | E357R T366W D399K | K370D Y407V K409D |
53 | E357R T366W L368R | K370D Y407A K409D |
54 | E357R T366W L368R | K370D Y407V K409D |
55 | E357R T366W L368K | K370D Y407A K409D |
56 | E357R T366W L368K | K370D Y407V K409D |
57 | T366W L368R D399K | K392D Y407A K409D |
58 | T366W L368R D399K | K392D Y407V K409D |
59 | T366W L368K D399K | K392D Y407A K409D |
60 | T366W L368K D399K | K392D Y407V K409D |
在某些方面,本申请的双特异性抗体的单价单元对于肿瘤细胞具有特异性。在一方面,该单价单元特异性识别肿瘤抗原。
“肿瘤抗原”是在肿瘤细胞中产生的抗原物质,即,它在宿主中触发免疫反应。肿瘤抗原用于鉴定肿瘤细胞,并在癌症治疗中用作可能的候选。身体中正常的蛋白质不是抗原。然而,在肿瘤发生过程中产生或过表达了某些蛋白质,从而显示为对于身体“外来”性。这可能包括很好地躲避免疫系统的正常蛋白,通常以极少量产生的蛋白质,通常仅在某些发育阶段中产生的蛋白,或其结构由于突变被修改的蛋白。
大量的肿瘤抗原在本领域中是已知的,并且可以容易地确定通过筛选鉴定新的肿瘤抗原。肿瘤抗原的非限制性实例包括EGFR、Her2、EpCAM、CD20、CD30、CD33、CD47、CD52、CD133、CEA、gpA33、粘蛋白、TAG-72、CIX、PSMA、叶酸结合蛋白、GD2、GD3、GM2、VEGF、VEGFR、整合素、αVβ3、α5β1、ERBB2、ERBB3、MET、IGF1R、EPHA3、TRAILR1、TRAILR2、RANKL、FAP和肌腱蛋白(Tenascin)。
在某些方面,该单价单元针对在肿瘤细胞上相对于对应的非肿瘤细胞过表达的蛋白具有特异性。这里所用的“对应的非肿瘤细胞”是指与肿瘤细胞的起源具有相同细胞类型的非肿瘤细胞。值得注意的是,这种蛋白质未必与肿瘤抗原不同。非限制性实例包括在大多数结肠癌,直肠癌,乳腺癌,肺癌,胰腺癌和胃肠道癌中过表达的癌胚抗原(CEA),海厄蛋白(heregulin)受体(HER-2,neu或c-erbB-2),它们通常在乳腺癌,卵巢癌,结肠癌,肺癌,前列腺癌和子宫颈癌中过表达;表皮生长因子受体(EGFR),其在一系列固体肿瘤,包括乳腺瘤,头和颈部肿瘤,非小细胞肺肿瘤和前列腺肿瘤中高表达;去唾液酸糖蛋白受体;转铁蛋白受体;丝氨酸蛋白酶抑制剂酶复合物受体,该受体于肝细胞上表达;成纤维细胞生长因子受体(FGFR),该受体于胰腺导管腺癌细胞中过表达;血管内皮生长因子受体(VEGFR),用于抗血管生成基因治疗;叶酸受体,该受体于90%的非粘液性卵巢癌中选择性过表达;细胞表面多糖蛋白质复合体;糖类受体;和多聚免疫球蛋白受体,该受体用于将基因传递至呼吸道上皮细胞,并有望用于治疗肺部疾病,如囊性纤维化。
在某些方面,单价单元对于微生物具有特异性。微生物的非限制性实例包括微生物表面受体和内毒素。内毒素的实例包括,但不限于,脂多糖(LPS)和脂寡糖(LOS)。
在某些方面,该单链单元对于免疫细胞具有特异性。一方面,该免疫细胞选自T细胞、B细胞、单核细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、树突细胞、吞噬细胞、自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞和肥大细胞。
一方面,该单链单元特异性地识别选自以下的抗原:CD3、CD16、CD19、CD28和CD64。
本文提供了双特异性配体中的每条多肽链的示例性序列。一方面,该单链单元的融合肽具有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。一方面,该单价单元的重链具有SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列。一方面,该单价单元的轻链具有SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列。
任何上述的抗体或多肽还可包括额外的多肽,例如,如本文所述的编码的多肽,抗体恒定区的信号肽,该信号肽用于指导分泌,或如本文所述的其他异源多肽。
本技术领域的普通技术人员还应当理解,本文所述的抗体可会被修改,以使得它们的氨基酸序列与天然存在的结合多肽不同,它们得自这些天然存在的结合多肽。例如,来自于指定的蛋白的多肽或氨基酸序列可与起始序列类似,例如,与起始序列具有一定百分比的同一性,例如,其可与起始序列有60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%的同一性。
此外,也可进行核苷酸或氨基酸替换,缺失,或插入以在“非必需”氨基酸区域进行保守替换或改变。例如,来自指定的蛋白质的多肽或氨基酸序列可与启动顺序相同,除了一个或多个独立的氨基酸的替换,插入,或缺失,例如,1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、15个、20个或更多独立的氨基酸替换,插入,或缺失。在某些实施例中,来自指定的蛋白质的多肽或氨基酸序列相对于起始序列有1至5个、1至10个、1至15个或1至20个独立的氨基酸的替换,插入,或缺失。
在某些实施例中,抗原结合多肽包含通常不与抗体结合的氨基酸序列或一个或多个基团。在下面更详细地描述了示例性的修改。例如,本申请的单链Fv抗体片段可包含柔性接头序列,或可以被修改以添加的官能基团(例如,聚乙二醇(PEG)、药物、毒素或标记物)。
本申请的抗体,其变体或衍生物包括被修改的衍生物,即,将任何类型的分子共价连接至抗体且该共价连接不会阻止抗体结合至抗原表位。例如,但不限于,该抗体可以被修改,例如,通过糖基化、乙酰化、PEG化、磷酸化、磷酸化、酰胺化、通过已知的保护/阻断基团衍生、蛋白水解裂解、连接到细胞配体或其他蛋白等。众多的化学修饰的任一种均可以通过已知的技术进行,包括,但不限于特定的化学裂解、乙酰化、甲酰化、衣霉素代谢合成等。此外,该抗体可以包含一种或多种非经典氨基酸酸。
在其它实施例中,本申请的抗原结合多肽可包含保守的氨基酸替换。
“保守氨基酸替换”是其中氨基酸残基被具有类似侧链的氨基酸残基替换。具有类似侧链的氨基酸残基家族已在本领域中定义,其包括碱性侧链(例如赖氨酸、精氨酸、组氨酸),酸性侧链(例如天冬氨酸,谷氨酸),不带电荷的极性侧链(例如,甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸),非极性侧链(例如,丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、色氨酸),β-支链的侧链(例如,苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳族侧链(例如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)。因此,免疫球蛋白多肽的非必需氨基酸残基优选被来自相同侧链家族的其他氨基酸残基替换。在另一实施例中,一串氨基酸可被结构上类似的串替换,后者在顺序上和/或侧链家族的组成上不同。
在下表中提供了的保守性氨基酸替换的非限制性实例,其中相似性得分为0或更高表示在这两个氨基酸之间有保守替换。
C | G | P | S | A | T | D | E | N | Q | H | K | R | V | M | I | L | F | Y | W | |
W | -8 | -7 | -6 | -2 | -6 | -5 | -7 | -7 | -4 | -5 | -3 | -3 | 2 | -6 | -4 | -5 | -2 | 0 | 0 | 17 |
Y | 0 | -5 | -5 | -3 | -3 | -3 | -4 | -4 | -2 | -4 | 0 | -4 | -5 | -2 | -2 | -1 | -1 | 7 | 10 | |
F | -4 | -5 | -5 | -3 | -4 | -3 | -6 | -5 | -4 | -5 | -2 | -5 | -4 | -1 | 0 | 1 | 2 | 9 | ||
L | -6 | -4 | -3 | -3 | -2 | -2 | -4 | -3 | -3 | -2 | -2 | -3 | -3 | 2 | 4 | 2 | 6 | |||
I | -2 | -3 | -2 | -1 | -1 | 0 | -2 | -2 | -2 | -2 | -2 | -2 | -2 | 4 | 2 | 5 | ||||
M | -5 | -3 | -2 | -2 | -1 | -1 | -3 | -2 | 0 | -1 | -2 | 0 | 0 | 2 | 6 | |||||
V | -2 | -1 | -1 | -1 | 0 | 0 | -2 | -2 | -2 | -2 | -2 | -2 | -2 | 4 | ||||||
R | -4 | -3 | 0 | 0 | -2 | -1 | -1 | -1 | 0 | 1 | 2 | 3 | 6 | |||||||
K | -5 | -2 | -1 | 0 | -1 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 0 | 5 | ||||||||
H | -3 | -2 | 0 | -1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 2 | 3 | 6 | |||||||||
Q | -5 | -1 | 0 | -1 | 0 | -1 | 2 | 2 | 1 | 4 | ||||||||||
N | -4 | 0 | -1 | 1 | 0 | 0 | 2 | 1 | 2 | |||||||||||
E | -5 | 0 | -1 | 0 | 0 | 0 | 3 | 4 | ||||||||||||
D | -5 | 1 | -1 | 0 | 0 | 0 | 4 | |||||||||||||
T | -2 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | ||||||||||||||
A | -2 | 1 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||
S | 0 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||
P | -3 | -1 | 6 | |||||||||||||||||
G | -3 | 5 | ||||||||||||||||||
C | 12 |
在一些实施例中,所述抗体可以结合治疗剂、药物前体、肽、蛋白、酶、病毒、脂质、生物反应调节剂、药剂或PEG。
该抗体可以连接至或融合至治疗剂上,该治疗剂可包括可检测标记物,如放射性标记物、免疫调节剂、激素、酶、寡核苷酸、光活性治疗剂或诊断剂、细胞毒性剂,其可为药物或毒素,超声增强剂,非放射性标记物,它们的组合和其他这类本领域已知的成分。
通过将其偶联化学发光化合物,该抗体被可检测地标记。然后,通过检测化学反应过程中产生的发光来确定化学发光物标记的抗原结合多肽的存在。特别有用的化学发光物标记化合物的例子有鲁米诺、异鲁米诺、热性(theromatic)吖啶鎓酯、咪唑、吖啶鎓盐和草酸酯。
该抗体也可被可检测地标记,使用荧光发光金属如152Eu,或其他的镧系标记。这些金属可使用以下金属螯合基团连接到抗体上,如二亚乙基三胺五乙酸(DTPA)或乙二胺四乙酸(EDTA)。将多种基团连接至抗体的技术是公知的,参见,例如,Arnon等,“MonoclonalAntibodies For Immunotargeting Of Drugs In Cancer Therapy”,in MonoclonalAntibodies And Cancer Therapy,Reisfeld等(编.),pp.243-56(Alan R.Liss,Inc.(1985);Hellstrom等,“Antibodies For Drug Delivery”,in Controlled Drug Delivery(第二版),Robinson等(编),Marcel Dekker,Inc.,pp.623-53(1987);Thorpe,“AntibodyCarriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy:A Review”,in MonoclonalAntibodies'84:Biological And Clinical Applications,Pinchera等(编),pp.475-506(1985);“Analysis,Results,And Future Prospective Of The Therapeutic Use OfRadiolabeled Antibody In Cancer Therapy”,in Monoclonal Antibodies For CancerDetection And Therapy,Baldwin等(编),Academic Press pp.303-16(1985),以及Thorpe等,“The Preparation And Cytotoxic Properties Of Antibody-Toxin Conjugates”,Immunol.Rev.(52:119-58(1982)).。
编码抗体的多核苷酸和抗体制备方法
本申请还提供了编码本申请的抗体、其变体或衍生物的分离的多核苷酸或核酸分子。
例如,图2显示编码图1中显示的抗体的每一条肽链的3种多核苷酸的结构。
本文提供了编码双特异性配体中的每条多肽链的示例性序列。一方面,该单链单元的融合肽由SEQ ID NO:2的核酸序列编码。一方面,该单价单元的重链由SEQ ID NO:4的核酸序列编码。一方面,该单价单元的轻链由SEQ ID NO:6的核酸序列编码。
本申请的多核苷酸可以编码该抗原结合多肽、其变体或衍生物的整个重链和轻链可变区,以同样的多聚核苷酸分子或单独的多聚核苷酸分子编码。另外,本申请的多核苷酸可以编码该抗原结合多肽、其变体或衍生物的一部分重链和轻链可变区,以同样的多聚核苷酸分子或单独的多聚核苷酸分子编码。
抗体的制备方法在本技术领域是公知的,在此进行描述。在一些实施例中,本申请的抗原结合多肽的可变区和恒定区是完全人类的。完全人抗体可使用现有技术中描述的技术制备,并如本文所述。例如,抗特定抗原的完全人抗体可以通过将该抗原施用至转基因动物来制备,该转基因动物已被修改以产生此种响应抗原刺激的抗体,但其内源性基因座已被禁用。可以用来制造这种抗体的示例性的技术描述于美国专利:6,150,584、6,458,592、6,420,140,其全部内容通过引用并入本文。
在一些实施例中,所制备的抗体不会对待治疗的动物(例如人)产生有害的免疫反应。在一个实施例中,本申请的抗原结合多肽,其变体或衍生物经本领域公认的技术修改以降低其免疫原性。例如,抗体可以制成人源化的、灵长类化的、去免疫的、或嵌合的抗体。这些类型的抗体来自于非人类抗体,通常为是鼠或灵长类动物的抗体,该抗体保留或基本保留了亲本抗体的抗原结合性质,但它是在人体中免疫原性较低。这可以通过多种方法实现,包括(a)将整个非人类的可变结构域接枝到人恒定区以产生嵌合抗体;(b)将至少一部分的一种或多种非人类的互补决定区(CDR)接枝到人框架区和恒定区,保留或不保留关键框架残基,或(c)移植整个非人类可变结构域,但用与人类类似的部分通过替换表面残基将它们“遮盖”。这样的方法公开于Morrison等的Proc.Natl.Acad.Sci.USA57:6851-6855(1984);Morrison等的Adv.Immunol.44:65-92(1988);Verhoeyen等的Science239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.25:489-498(1991);Padlan,Molec.Immun.31:169-217(1994),和美国专利第5,585,089、5,693,761、5,693,762和6,190,370号,所有文件在此以全文通过引用结合至本文。
去免疫也可用于降低抗体的免疫原性。本文使用的,术语“去免疫”包括改变抗体以修改T细胞抗原表位(见,例如,国际申请公开号WO/9852976A1和WO/0034317A2)。例如,本申请对来自起始抗体的可变重链和可变轻链序列进行了分析,并制作了来自每个V区域的人T细胞抗原表位“图谱”,该图谱显示了互补性决定区(CDR)和该序列中的其它关键残基有关的抗原表位的位置。可对来自该T细胞抗原表位图谱的单个T细胞表位进行分析,以识别备选的氨基酸替换,其低风险改变最终抗体活性。本申请设计了一系列可选的可变重链和轻链序列,包括氨基酸替换的组合,并且这些序列随后合并至一系列结合多肽中。通常,产生12至24种不同的抗体,并对其测试结合性和/或功能性。然后将包括修改过的可变区和人恒定区的完整的重链和轻链基因克隆至表达载体中,将得到的质粒导入细胞系中用于产生整个抗体。然后将这些抗体通过合适的生化和生物学分析进行比较,并识别最佳变量。
本申请的抗原结合多肽的结合特异性可通过体外实验测得,例如免疫沉淀,放射免疫分析法(RIA)或酶联免疫吸附法(ELISA)。
或者,描述的制备单链单元的技术(美国专利4,694,778号;Bird,Science242:423-442(1988);Huston等的Proc.Natl.Acad.Sci.USA55:5879-5883(1988);和Ward等的Nature334:544-554(1989))可用于产生本申请的单链单元。经氨基酸桥连接Fv区的重链和轻链片段形成单链单元,获得单链融合肽。在大肠杆菌(E.coli)中合成功能性Fv片段的技术也可以使用(Skerra等的Science242:1038-1041(1988))。
可以用于产生单链Fvs(scFvs)和抗体的技术实例包括描述在美国专利第4,946,778号和5,258,498号;Huston等的Methods in Enzymology203:46-88(1991);Shu等的Proc.Natl.Sci.USA90:1995-1999(1993);和Skerra等的Science 240:1038-1040(1988)。对于某些应用,包括在人体内体内使用抗体和体外检测分析,可优选使用嵌合的、人源化的或人抗体。嵌合抗体为抗体的不同部分来自不同动物种类的分子,例如含有来自鼠单克隆抗体的可变区和人免疫球蛋白恒定区的抗体。嵌合抗体的制造方法是本领域已知的。见,例如,Morrison,Science229:1202(1985);Oi等的BioTechniques4:214(1986);Gillies等的J.Immunol.Methods125:191-202(1989);美国专利第5,807,715;4,816,567和4,816397号,其全部内容通过引用的方式并入本文。
人源化的抗体为来自于非人类物种的抗体分子,并且该抗体分子结合所需的抗原,该抗体分子具有一个或多个来自非人类物种的互补决定区(CDR)和来自人免疫球蛋白分子的框架区。通常,在人框架区中的框架残基将被来自CDR供体抗体的对应残基替换所改变,优选提高抗原结合能力。这些框架替换通过本领域已知的方法识别,例如,通过建立CDR和框架残基的相互作用模型,以鉴定对于抗原结合和序列比较重要的框架残基,以找出在特定位置的异常的框架残基。(见,例如,Queen等的美国专利第5,585,089号;Riechmann等的Nature332:323(1988),其全部内容通过引用并入本文)。可使用多种本领域已知的技术对抗体进行人源化,这些技术包括,例如,CDR-移植(EP239,400;PCT公开号WO91/09967;美国专利第5,225,539;5,530,101和5,585,089号),饰面(veneering)或表面置换(resurfacing)(EP592,106;EP519,596;Padlan,Molecular Immunology28(4/5):489-498(1991);Studnicka等的,Protein Engineering7(6):805-814(1994);Roguska等的Proc.Natl.Sci.USA91:969-973(1994)),和链改组(shuffling)(美国专利第5,565,332号,其全部内容通过引用结合至本文)。
完全人抗体对于人类患者的治疗是特别理想的。人抗体可以通过本领域已知的多种方法制备,包括使用来自人免疫球蛋白序列的抗体库的噬菌体展示方法。还参见,美国专利第4,444,887号和4,716,111号;和PCT公开号WO98/46645、WO 98/50433、WO98/24893、WO98/16654、WO96/34096、WO96/33735和WO91/10741,这些文件的每一个在此通过引用结合至本文。
也可以使用转基因小鼠产生人抗体,该转基因小鼠不能表达功能性内源性免疫球蛋白,但可以表达人免疫球蛋白基因。例如,可将人重链和轻链免疫球蛋白基因复合体随机地或通过同源重组导入至小鼠胚胎干细胞中。或者,除了人重链和轻链基因之外,还可将人可变区、恒定区和多变区导入至小鼠胚胎干细胞中。可通过同源重组将该小鼠重链和轻链免疫球蛋白基因非功能性地分别给予或同时引入人免疫球蛋白基因座。具体地,JH区的纯合缺失防止产生内源性抗体。修改后的胚胎干细胞展开并微注射到囊胚中以产生嵌合体小鼠。然后饲养嵌合体小鼠用于产生表达人抗体的纯合子后代。对该转基因小鼠用选定的抗原以正常的方式免疫,例如,使用所需的靶多肽的全部或一部分。针对该抗原的单克隆抗体可从经免疫的转基因小鼠用常规杂交瘤技术获得。该转基因小鼠携带的人免疫球蛋白转基因在B细胞分化过程中重新排列,并随后进行类别转化和体细胞突变。因此,使用该技术,能够产生治疗上有用的IgG、IgA、IgM和IgE抗体。生产人抗体的该技术的概述,见Lonberg和Huszar Int.Rev.Immunol.73:65-93(1995)。用于生产人抗体和人单克隆抗体的技术和用于生产此种抗体的技术方案的详细讨论,参见,如PCT公开号WO98/24893;WO96/34096;WO96/33735;美国专利第5,413,923;5,625,126;5,633,425;5,569,825;5,661,016;5,545,806;5,814,318;和5,939,598号,它们通过引用以全文形式结合至本文。此外,如Abgenix公司(Freemont,Calif.)和GenPharm((San Jose,Calif.)等公司能提供针对选定的抗原的人抗体,使用与上述类似的技术获得。
识别选定的抗原表位的完全人抗体也可使用被称为“导向选择”的技术产生。在该方法中,选定的非人类单克隆抗体,例如,小鼠抗体,用于引导识别相同抗原表位的完全人抗体的选择。(Jespers等的Bio/Technology72:899-903(1988)。还参见,美国专利第5,565,332号,其通过引用全文结合至本文)。
在另一实施例中,编码所需的单克隆抗体的DNA很容易地使用常规方法分离和测序(例如,通过使用寡核苷酸探针,该探针能够特异性结合至鼠抗体的重链和轻链的编码基因)。单独的和亚克隆的杂交瘤细胞作为这种DNA的首选来源。分离后,该DNA可置于表达载体中,然后将该载体转到原核或真核宿主细胞中,如大肠杆菌(E.coli)细胞,猴COS细胞,中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞,这些细胞不产生免疫球蛋白。更具体地,单独的DNA(可如本文所述进行合成)可用于克隆恒定区和可变区序列用于制备抗体,如Newman等于1995年1月25日提交的美国专利5,658,570,其在此通过引入结合至本文。本质上讲,这需要从选定的细胞中提取RNA,转化成cDNA,并通过PCR使用Ig特异性引物扩增。用于该目的的合适的引物也描述于美国专利5,658,570号中。如将在下面更详细地讨论的,表达所需的抗体的转化的细胞可相对大量地培养以提供临床上和商业应用上的免疫球蛋白。
此外,使用常规的重组DNA技术,本申请的抗原结合多肽的一个或多个CDR,可插入框架区内,例如,插入至人框架区以使非人类抗体人源化。该框架区可以是天然存在的或共有的框架区,且优选为人的框架区(见,例如,Chothia等的J.Mol.Biol.278:457-479(1998),人的框架区的列表)。优选地,该框架区和CDR的组合所产生的多核苷酸编码多肽,该多肽特异性地结合至所需多肽的至少一个抗原表位,例如,LIGHT。优选地,可在框架区内进行一个或多个氨基酸替换,并且,优选地,该氨基酸替换提高该抗体对抗原结合能力。此外,这种方法可用于获得一个或多个可变区半胱氨酸残基(该半胱氨酸残基参与链内二硫键形成)的氨基酸替换或缺失,这样产生缺乏一个或多个链内二硫键的抗体分子。其他对于该多核苷酸进行的改变都包含在本申请的范围内,并在现有技术范围内。
此外,可使用用于通过对来自小鼠抗体分子的基因剪接生产“嵌合抗体”的技术(Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA:851-855(1984);Neuberger等的Nature372:604-608(1984);Takeda等的Nature314:452-454(1985)),具有合适的抗原特异性,与具有合适生物活性的人抗体分子基因一起。如本文使用的,嵌合抗体为其中不同部分来自不同动物种类的分子,例如含有来自鼠单克隆抗体的可变区和人免疫球蛋白恒定区的抗体。
然而,另一种用于产生重组抗体的高效方法公开于Newman,Biotechnology10:1455-1460(1992)。具体地,该技术导致产生含有猴可变结构域和人恒定序列的灵长类化的抗体。该文件通过引用全文结合至本文中。此外,这种技术也被描述在共同转让的美国专利号5,658,570、5,693,780和5,756,096,其中每一篇通过引用并入本文。
或者,产生抗体的细胞系可使用本领域技术人员熟知的技术选择和培养。这样的技术描述在多种实验室手册和主要出版物中。在这方面,本文中适合使用的技术如下所述描述于Current Protocols in Immunology,Coligan等编,GreenPublishing Associatesand Wiley-Interscience,John Wiley和Sons,New York(1991),其通过引用以全文并入本文中,包括补充参考。
此外,本领域技术人员公知的标准技术可用于在编码本申请抗体的核苷酸序列中引入突变,包括,但不限于,定点诱变和PCR介导的突变,这产生氨基酸替换。优选地,所述变体(包括衍生物),相对于参考可变重链区,CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、轻链可变区、CDR-L1、CDR-L2或CDR-L3,编码少于50个氨基酸替换、少于40个氨基酸替换、少于30个氨基酸替换、少于25个氨基酸替换、少于20个氨基酸替换、少于15个氨基酸替换、少于10个氨基酸替换、少于5个氨基酸替换、少于4个氨基酸替换、少于3个氨基酸替换、或少于2个氨基酸替换。或者,可将沿着全部或部分的编码序列随机引入突变,例如通过饱和诱变,可对所得到的突变体针对生物活性筛选,以确定保留有活性的突变。
治疗和诊断方法
本文所述的,本申请的抗原结合多肽、变体或衍生物可用于与癌症或传染病相关的某些治疗和诊断方法中。
本申请还涉及基于抗体的治疗,此种治疗包括将本申请的双特异性抗体给予至患者,例如动物、哺乳动物和人,用于治疗本文描述的一种或多种疾病或状况。本申请的治疗化合物包括但不限于,本申请的抗体(包括如本文所述的它们的变体和衍生物)和核酸或编码本申请的抗体的多核苷酸(包括如本文所述的它们的变体和衍生物)。
本申请的抗体也可以用于治疗,抑制或预防疾病,病症或状况,包括恶性的疾病,病症,或与这样的疾病或病症相关的状况,如与增加细胞存活或抑制细胞凋亡相关的疾病,例如癌症(如滤泡淋巴瘤、具有p53基因突变的癌、激素依赖性肿瘤,包括但不限于结肠癌、心脏肿瘤、胰腺癌、黑色素瘤、视网膜母细胞瘤、胶质母细胞瘤、肺癌、肠道癌、睾丸癌、胃癌、神经母细胞瘤、粘液瘤、子宫肌瘤、淋巴瘤、内皮瘤、骨母细胞瘤、骨巨细胞瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、腺瘤、乳腺癌、前列腺癌、卡波济氏肉瘤和卵巢癌),自体免疫紊乱(如,多重硬化症、干燥综合症、格雷夫斯病(Grave's disease)、桥本氏甲状腺炎、自身免疫性糖尿病、胆汁性肝硬化、白塞氏病、克罗恩氏病、多肌炎、全身性红斑狼疮和免疫相关的肾小球肾炎、自身免疫性胃炎、自身免疫性血小板减少性紫癜和类风湿关节炎)和病毒感染(如疱疹病毒,痘病毒和腺病毒)、炎症、移植物抗宿主病(急性和/或慢性)、急性移植物排斥、和慢性移植物排斥。本申请的抗原结合多肽,其变体或衍生物用于抑制癌症的生长,发展和/或转移,特别是上面列出的或下面段落中列出的那些。
可以用本申请的抗体或其变体或衍生物治疗,预防,诊断和/或预测的与增加细胞存活相关的其他疾病或状况,包括但不限于,恶性肿瘤的发展和/或转移,以及相关疾病,如白血病(包括急性白血病(例如,急性淋巴细胞白血病,急性髓细胞白血病(包括粒细胞、早幼粒细胞、骨髓单核、单核细胞、红白血病))和慢性白血病(例如,慢性髓细胞性(粒细胞性)白血病和慢性淋巴细胞性白血病))、真性红细胞增多症、淋巴瘤(例如,何杰金氏病(Hodgkin's disease)和非何杰金氏病)、多发性骨髓瘤、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(Waldenstrom's macroglobulinemia)、重链病,和固体肿瘤包括,但不限于,肉瘤和癌,例如纤维肉瘤、粘液肉瘤、脂肪肉瘤、软骨肉瘤、骨肉瘤、脊索瘤、血管肉瘤、内皮肉瘤、淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、滑膜瘤、间皮瘤、尤因氏瘤、平滑肌肉瘤、横纹肌瘤、结肠癌、胰腺癌、乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌、鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳头状癌、乳头状腺癌、乳头状囊腺癌、髓样癌、支气管癌、肾细胞癌、肝癌、胆管细胞癌、绒毛膜上皮癌、精原细胞瘤、胚胎癌、肾母细胞瘤(Wilm's tumor)、宫颈癌、睾丸肿瘤、肺癌、小细胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神经胶质瘤、星形细胞瘤、髓母细胞瘤、颅咽管瘤、室管膜瘤、松果体瘤、血管母细胞瘤、少突胶质细胞瘤、听神经瘤、脑膜瘤(menangioma)、黑色素瘤、神经母细胞瘤和视网膜母细胞瘤。
本申请的抗体也可用于治疗由微生物引起的传染病,或用于杀死微生物,这通过靶向微生物和免疫细胞以消除该微生物来实现。一方面,所述微生物包括RNA病毒和DNA病毒的病毒、革兰氏阳性菌、革兰氏阴性细菌、原生动物或真菌。在下表4中提供了传染病及相关微生物的非限制性实施例。
表4.传染病和相关微生物源。
任何特定患者使用的具体的剂量和治疗方案将取决于多种因素,包括使用的特定抗原结合多肽、其变体或衍生物、患者的年龄、体重、总体健康状况、性别和饮食及给药时间、排泄率、药物组合、待治疗的具体疾病的严重程度。由医疗护理者对这些因素的判断在本技术领域内的普通技术范围内。用量也将取决于待治疗的个体病人,给药途径,制剂的类型,所使用的化合物的特征,疾病的严重程度和预期的效果。所用的量可通过本领域已知的药物学和药代动力学的原理决定。
给予抗原结合多肽、其变体或衍生物的方法包括但不限于皮内、肌内、腹膜内、静脉内、皮下、鼻内、硬膜外和口服途径。该抗原结合多肽或组合物可以通过任何方便的途径给药,例如通过输注或大剂量注射,通过上皮或粘膜与皮肤内层(例如,口腔粘膜,直肠和肠粘膜等)吸收,并且可以与其他生物活性剂一起给药。因此,本申请的含抗原结合多肽的药物组合物可被口服给药、直肠给药、非肠道给药、脑池内给药、阴道内给药、腹膜内给药、局部给药(如经粉剂、软膏、滴剂或透皮贴剂)、含服给药(bucally)或作为口腔或鼻腔喷剂。
本文使用的术语“非肠道”是指包括静脉内、肌内、腹膜内、胸骨内、皮下和关节内注射和输注的给药模式。
给药可以是全身或局部给药。此外,还可能需要的是通过任何合适的途径,包括脑室内和鞘内注射引入本申请的抗体进入中枢神经系统;脑室导管可促进脑室注射,例如,将导管连接到一个储液库,如奥玛耶(Ommaya)储液库。也可以肺部给药,例如,通过使用吸入器或雾化器,含雾化剂的配方进行。
还可能需要的是将本申请的抗原结合多肽或组合物局部给药至需要治疗的区域,这可通过,例如但不限于,在手术过程中局部灌注,局部应用,例如与手术后伤口敷料结合,通过注射、通过导管、通过栓剂、或通过植入物实现,所述植入物为多孔的、无孔的、或凝胶状材料、包括膜如塞拉斯提克(sialastic)膜或纤维。优选地,当给予本申请的蛋白质(包括抗体)时必须小心使用不吸收蛋白质的材料。
在另一实施例中,抗原结合多肽或组合物可以在囊泡中,特别是脂质体中递送(见Langer,1990,Science249:1527-1533;Treat等的in Liposomes in the Therapy ofInfectious Disease and Cancer,Lopez-Berestein和Fidler(编),Liss,New York,pp.353-365(1989);Lopez-Berestein,同上,pp.317-327;同上)。
在还另一实施例中,抗原结合多肽或组合物可通过控制释放系统递送。在一个实施例中,可使用泵(参见Sefton,1987,CRC Crit.Ref.Biomed.Eng.14:201;Buchwald等,1980,Surgery88:507;Saudek等,1989,N.Engl.J.Med.321:574)。在另一实施例中,可使用聚合物材料(参见,Medical Applications of Controlled Release,Langer和Wise(编),CRC Pres.Boca Raton,Fla.(1974);Controlled Drug Bioavailability,Drug ProductDesign and Performance,Smolen和Ball(编),Wiley,New York(1984);Ranger和Peppas,J.,1983,Macromol.Sci.Rev.Macromol.Chem.23:61;还参见Levy等的1985,Science228:190;During等,1989,Ann.Neurol.25:351;Howard等,1989,J.Neurosurg.71:105)。在还另一实施例中,控制释放系统可以被放置在治疗目标附近,即,大脑附近,因此需要全身剂量的一小部分(参见,例如,Goodson,in Medical Applications of Controlled Release,supra,vol.2,pp.115-138(1984))。其他控制释放系统讨论于Langer的综述中(1990,Science 249:1527-1533)。
在一个具体实施例中,本申请的组合物包含编码蛋白的核酸或多核苷酸,该核酸可以体内给予,以促进其编码的蛋白的表达,通过将其构建为合适的核酸表达载体的一部分并将其给予,以使其进入细胞内,例如,通过使用逆转录病毒载体(见美国专利第4,980,286号),或通过直接注射,或通过使用微粒轰击(如基因枪,Biolistic,Dupont),或用脂类或细胞表面受体或转染剂涂覆,通过将其连接至同源异型框类肽并施用,该同源异型框类肽已知能进入核内(见,例如,Joliot等,1991,Proc.Natl.Acad.Sci.USA88:1864-1868)等。或者,可将核酸经细胞内引入,并结合至宿主细胞DNA中,通过同源重组进行表达。
本申请的抗体的量,在治疗、抑制、和预防可以通过标准的临床技术确定的炎症,免疫或恶性疾病、病症或症状方面是有效的。此外,在体外实验中可以任选用量以帮助确定最佳的剂量范围。配方中使用的精确剂量也将取决于给药途径,和疾病、病症或状况的严重性,并应根据医生的判断和每个病人的具体情况确定。可从来自体外或动物模型试验系统的剂量-反应曲线推算出有效剂量。
作为一个一般命题,本申请的抗原结合多肽对于患者的给药剂量通常为0.1mg/kg至100mg/kg患者体重,在0.1mg/kg和20mg/kg患者体重之间,或1mg/kg至10mg/kg患者体重之间。一般来说,人抗体比来自其他物种的抗体在人体内有更长的半衰期,由于有对于外源多肽的免疫反应。因此,低剂量的人抗体,减少给药频率通常是允许的。另外,本申请的抗体的给药剂量和频率可通过加强抗体的吸收和组织渗透(例如,进入大脑)来降低,该加强通过修饰例如脂化来实现。
治疗感染或恶性的疾病,症状或病症的方法,该方法包括给予本申请抗体,该抗体的变体,该治疗通常在体外进行试验,然后在一个可以接受的动物模型中针对所期望的治疗或预防活性进行体内试验,然后用于人类。合适的动物模型,包括转基因动物,对于本领域的普通技术人员是公知的。例如,本文描述的用于证明抗原结合多肽的治疗效果的体外分析,包括抗原结合多肽对于细胞系或患者组织样本的作用效果。抗原结合多肽对细胞系和/或组织样本的作用效果可利用本领域技术人员已知的技术测定,这些技术例如本文其他地方所披露的分析。根据本申请,可以使用体外分析以确定是否特定的抗原结合多肽给药被指示,包括在体外细胞培养分析,其中患者组织样本在培养基中培养,并暴露于化合物或以其他方式给予化合物,观察这种化合物对于该组织样本的作用。
各种递送系统是已知的,并可用于给予本申请的抗体或编码本申请抗体的多核苷酸,例如,将其包封在脂质体,微粒,微胶囊中,能表达该化合物的重组细胞,受体介导的内吞作用(参见,例如,Wu和Wu,1987,J.Biol.Chem.262:4429-4432),构建核酸作为逆转录病毒或其他载体(construction of a nucleic acid as part of a retroviral or othervector)等。
另一实施例中,本申请的组合物与抗肿瘤剂,抗病毒剂,抗菌剂或抗生素剂或抗真菌剂。本领域已知的这些试剂的任一种可在本申请的组合物中给予。
在另一实施例中,本申请的组合物与化学治疗剂联合给药。可与本申请的组合物一起施用的化学治疗剂包括但不限于,抗生素衍生物(例如,阿霉素、博来霉素、柔红霉素和放线菌素D);抗雌激素(例如,他莫昔芬);抗代谢物(例如,氟尿嘧啶、5-FU、氨甲喋呤、氟尿苷、干扰素α-2b、谷氨酸、普卡霉素、巯基嘌呤和6-硫鸟嘌呤);细胞毒性剂(例如,亚硝脲氮芥、BCNU、环己亚硝脲、CCNU、阿糖胞苷、环磷酰胺、雌二醇氮芥、羟基脲、丙卡巴肼、丝裂霉素、白消安、顺铂和硫酸长春新碱),激素类(例如醋酸甲羟孕酮、雌莫司汀磷酸钠、乙炔雌二醇、雌二醇、醋酸甲地孕酮、甲基睾丸酮、己烯雌酚二磷酸酯、氯烯雌醚和睾内酯);氮芥衍生物(例如,美法兰、瘤可宁双氯乙基甲胺(氮芥)和塞替派);类固醇及其组合(如,倍他米松(bethamethasone)磷酸钠);及其他(例如,氮烯唑胺(dicarbazine)、天冬酰胺酶、米托坦、硫酸长春新碱、硫酸长春碱和鬼臼乙叉甙)。
在其他实施例中,本申请的组合物与细胞因子组合施用。可以与本申请的组合物共同施用的细胞因子包括,但不限于,IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-10、IL-12、IL-13、IL-15、抗CD40、CD40L和TNF-α。
在其他实施例中,本申请的组合物与其他的治疗或预防方案,例如,放射治疗组合施用。
组合物
本申请还提供了药物组合物。这样的组合物包括有效量的抗体和可接受的载体。在一个具体的实施例中,术语“药学上可接受的”是指由联邦或州政府的管理机构批准的或美国药典或其它普遍认可的药典中列出的用于在动物中,并且更具体地用于人类的情况。另外,“药学可接受载体”通常为无毒的固体,半固体或液体填充剂、稀释剂、封装材料或任何类型的制剂助剂。
术语“载体”是指用于实施治疗的稀释剂、佐剂、赋形剂或载体(vehicle)。这样的药物载体可以是无菌液体,例如水和油类,包括石油、动物油、植物油或合成来源的油类,如花生油、豆油、矿物油、芝麻油等。药物组合物静脉内给药时水是一种优选的载体。盐溶液和葡萄糖水溶液和甘油溶液也可以被用作液体载体,特别是用于注射溶液。合适的药物赋形剂包括淀粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明胶、麦芽糖(malt)、大米、面粉、白垩、硅胶、硬脂酸钠、单硬脂酸甘油酯、滑石、氯化钠、脱脂奶粉、甘油、丙烯、乙二醇、水、乙醇等。如有需要,该组合物也可以含有少量的润湿剂或乳化剂,或pH缓冲剂,如乙酸盐,柠檬酸盐或磷酸盐。抗菌剂如苄醇或羟苯甲酸甲酯,抗氧化剂如抗坏血酸或亚硫酸氢钠,螯合剂如乙二胺四乙酸,和调节张力的试剂如氯化钠或葡萄糖也可以使用。这些组合物可采取溶液、悬浮液、乳剂、片剂、丸剂、胶囊剂、粉剂、缓释制剂等形式。该组合物可以配制成栓剂,使用传统的粘合剂和载体如甘油三酯。口服配方可包括标准载体,例如药物级的甘露糖醇、乳糖、淀粉、硬脂酸镁、糖精钠、纤维素、碳酸镁等。合适的药物载体的实例描述于E.W.Martin,的Remington'sPharmaceutical Sciences中,通过引用结合至本文。这样的组合物包含治疗有效量的抗原结合多肽,优选以纯化形式,与合适量的载体一起,以便向患者提供合适施用的形式。配方应适合施用的模式。母本制剂可以封装在安瓿瓶,一次性注射器或玻璃或塑料制成的多剂量小瓶中。
在一个实施例中,所述组合物按照常规程序配制为适用于向人体静脉内给药的药物组合物。通常情况下,用于静脉内给药的组合物是无菌等渗含水缓冲液。在必要的情况下,该组合物还可以包含增溶剂和局部麻醉剂,如利多卡因,以在注射部位缓解疼痛。通常,这些成分单独或混合在一起供应,以单位剂量形式,例如,在一个密封的容器如安瓿瓶或指示活性剂的量的小袋(sachette)中以干燥的冻干粉末或无水浓缩物的形式。当组合物通过输注给药时,可以免去含有药用级无菌水或盐水的输液瓶。当组合物是通过注射给药时,可提供注射用无菌水或生理盐水的安瓿瓶,以便在给药前混合各成分。
本申请的化合物可以配制成中性或盐的形式。药学上可接受的盐包括与阴离子形成的那些盐,如来自盐酸、磷酸、乙酸、草酸、酒石酸等的盐,和与阳离子形成的那些盐,例如来自钠、钾、铵、钙、氢氧化铁、异丙胺、三乙胺、2-乙氨基乙醇、组氨酸、普鲁卡因等的盐。
实施例
实例1抗Her2/neu–抗CD3双特异性抗体的制备。
材料
抗人Her2的人源化的单克隆抗体赫赛汀的VL和VH的编码多核苷酸,抗人CD3人源化的单克隆抗体HOKT3的VL和VH的编码多核苷酸,IgG1重链恒定区CH1的编码多核苷酸,铰链的铰链区和Fc的编码多核苷酸,和CL的kappa链恒定区的多核苷酸得自于LifeTechnologiesInc.(Carlsbad,CA)。连接OKT3ScFv和VL和VH的接头序列(GGGGS)3使用常规方法合成。
方法和结果
1.表达载体的构建
pcDNA3.1(-)用作表达载体以制备赫赛汀重链表达构建。pcDNA3.1(+)Hygro用作表达载体以制备赫赛汀轻链表达构建和HOKT3单链构建。根据VL、VH、ScFv、CH1和Fc的序列以及pcDNA3.1(-)和pcDNA3.1(+)Hygro载体的多克隆位点设计引物(表5)。利用重叠延伸PCR法将VL和CL、VH和CH1、CH1和Fc、ScFv VL和VH、ScFv和Fc片段连接起来。
表5.PCR引物序列
VL、CL、VH和CH1的PCR扩增条件包括:在95℃孵育5分钟,然后25个循环:95℃变性30秒,56℃退火30秒,72℃延伸1分钟;以72℃闭合延伸10分钟。图3提供了显示PCR产物的凝胶图片。
Fc和ScFv的PCR扩增条件是相似的,除了在25个循环中的每一轮包括95℃变性1分钟,56℃退火1分钟,以及72℃延伸2分钟。图4提供了显示PCR产物的凝胶图片。
使用重叠延伸PCR将赫赛汀的VH和CH1、以及VL和CL连接。等量的回收VH和CH1,或VL和CL,及CH1和Fc彼此分别作为模板和引物使用。其他条件类似于常规PCR,进行2个循环条件为:95℃变性2分钟,55℃退火2分钟,72℃延伸2分钟。然后加入VH5'末端寡核苷酸引物和CL3'末端引物,按以下条件25个循环:95℃变性1分钟,56℃退火1分钟,72℃延伸2分钟。结束循环包括72℃延伸10分钟。
用于VH-CH1和Fc,ScFv和Fc的重叠延伸PCR连接的条件包括使用回收的VHCH1以及等量的Fc、ScFv和Fc作为模板和引物。最初的孵育包括2个循环的以下反应:95℃变性2分钟,55℃退火2分钟,以及72℃延伸3分钟。然后加入VH5'末端寡核苷酸引物和CL3'末端引物,然后按以下条件25个循环反应:95℃变性1分钟,56℃退火1分钟,72℃延伸3分钟。结束循环包括72℃延伸10分钟。图5提供了显示PCR产物的凝胶图片。
使用DNA片段回收试剂盒收集PCR产物,并且VH-CH1-Fc片段使用NheI和Xhol双酶切分离。然后将该片段插入至pcDNA3.1(-)载体并命名为pcDNA3.1(-)-Herceptin heavychain。同样地,用于HOKT3的ScFv-Fc片段(经Nhel和Xhol双酶切),赫赛汀的VL-CL片段(经Nhel和BamHI双酶切),也插入至pcDNA3.1(+)Hygro载体中并分别命名为pcDNA3.1(+)Hygro-HOKT3single chain和pcDNA3.1(+)Hygro-Herceptin light chain。
2.点突变
点突变利用试剂盒Site-Directed Mutagenesis Kit和pcDNA3.1(-)-Herceptin heavy chain和pcDNA3.1(+)Hygro-HOKT3single chainFc的引物(表6)进行。该反应按照试剂盒说明书进行。该突变通过测序确定(测序载体显示于图6-8中)。
表6.定点诱变引物序列
引物 | 序列 | SEQ ID NO. |
D356K-F | CCCCCATCCCGGAAGGAGCTGACCAAGA | 25 |
D356K-R | TCTTGGTCAGCTCCTTCCGGGATGGGGG | 26 |
E357R-F | CCCCCATCCCGGGATAGGCTGACCAAGAAC | 27 |
E357R-R | GTTCTTGGTCAGCCTATCCCGGGATGGGGG | 28 |
T366W-F | ACCAGGTCAGCCTGTGGTGCCTGGTCAAA | 29 |
T366W-R | TTTGACCAGGCACCACAGGCTGACCTGGT | 30 |
L368R-F | GTCAGCCTGACCTGCCGGGTCAAAGGCTTCTAT | 31 |
L368R-R | ATAGAAGCCTTTGACCCGGCAGGTCAGGCTGAC | 32 |
L368K-F | GTCAGCCTGACCTGCAAGGTCAAAGGCTTCTAT | 33 |
L368K-R | ATAGAAGCCTTTGACCTTGCAGGTCAGGCTGAC | 34 |
K370D-F | CTGACCTGCCTGGTCGATGGCTTCTATCCCAGC | 35 |
K370D-R | GCTGGGATAGAAGCCATCGACCAGGCAGGTCAG | 36 |
K392D-F | GGAGAACAACTACGATACCACGCCTCCCGT | 37 |
K392D-R | ACGGGAGGCGTGGTATCGTAGTTGTTCTCC | 38 |
D399K-F | CGCCTCCCGTGCTGAAGTCCGACGGCTCCTTC | 39 |
D399K-R | GAAGGAGCCGTCGGACTTCAGCACGGGAGGCG | 40 |
Y407A-F | TCCTTCTTCCTCGCCAGCAAGCTCACCGT | 41 |
Y407A-R | ACGGTGAGCTTGCTGGCGAGGAAGAAGGA | 42 |
Y407V-F | TCCTTCTTCCTCGTCAGCAAGCTCACCGT | 43 |
Y407V-R | ACGGTGAGCTTGCTGACGAGGAAGAAGGA | 44 |
K409D-F | CTTCCTCTACAGCGATCTCACCGTGGACA | 45 |
K409D-R | TGTCCACGGTGAGATCGCTGTAGAGGAAG | 46 |
下表7显示了抗Her2/neu–抗CD3双特异性抗体的每条链的序列。
表7.双特异性抗体的多肽序列和核酸序列
3.扩增
将重组质粒转化至大肠杆菌(E.coli)TOP10中。挑取单克隆并在含有100mg/L氨苄青霉素的LB培养基中生长,于37℃振荡条件下培养16小时。然后8000×g离心10分钟收集细菌。使用Tiangen内毒素试剂盒(endotoxin kit)分离质粒,将该质粒溶解于1ml洗脱EB缓冲液中。使用1.42ml异丙醇和0.42mlNaCl使质粒沉淀,然后用70%0.5ml乙醇洗涤两次,然后超净台中风干,然后溶解于灭菌超纯水(1mL)中。于OD260/280测量质粒浓度。OD260/280值位于1.8至1.9之间表明其为高纯的质粒DNA。
4.在哺乳动物细胞293F中转染和表达MSBODY
在转染之前24小时,于37℃,8%CO2,130rpm条件下,将1×106的293F细胞接种于125ml烧瓶中的28ml的293freestyle培养基中。将100μl293fectin加入至1ml的OPtiMEM中,搅拌条件下,室温孵育5分钟。同时,重组质粒pcDNA3.1(+)Hygro-HOKT3single chain LDY,pcDNA3.1-Herceptin heavy chain TKK(-)和pcDNA3.1(+)Hygro-Herceptin light chain以3:2:1的比例混合。DNA总量为30μg,溶解于1ml OPtiMEM中。DNA和293fectin完全混合,并且总体积为2ml,在室温孵育15分钟。然后将该混合物加入至细胞培养物中。在37℃培养细胞,且培养箱中有5%CO2,以130rpm培养5天。通过SDS-PAGE和蛋白质印记检测细胞上清液中的抗体表达(图9)。该抗体,指MSBODY,包含对Her2/neu有特异性的单价轻链/重链单元,和对CD3有特异性的单链单元。
5.抗体纯化。
将细胞培养基于2000×g离心,收集上清并用0.22μm过滤器过滤。将收集的液体用10倍(以体积算)结合缓冲液(9.5mM NaH2PO4+40.5mM Na2HPO4,pH7.0)稀释,然后通过Sepharose Fast Flow protein A亲和色谱柱(购自GE公司,5ml体积)、FabAffinity KBPAgarose亲和填料(购自ACROBiosystems公司,5ml体积),和SP阳离子交换色谱柱(购自GE公司,10ml)进行纯化,依使用手册操作。将纯化的蛋白用6%凝胶SDS-PAGE和考马斯亮蓝染色检测(见图10)。
实施例2双特异性抗体的结合活性分析
抗Her2/neu-抗-CD3双特异性抗体(MSBODY)结合至有Her2和CD3的细胞的能力使用BT474和外周血单核细胞(PBMC)进行检测。
自细胞培养物中收集3×105的BT474细胞,并用50μlPBS、10nM赫赛汀或10nM双特异性抗体孵育。30分钟后,将细胞用1%FBS/PBS洗两次,然后与2.5μl PE标记的抗人IgG Fc混合。该混合物于室温下孵育30分钟,且该细胞再次用1%FBS/PBS洗涤。然后将该样品在FACS设备上进行检测。
如图11A所示,赫赛汀(黑虚线)和抗her2X抗CD3MSBODY(黑实线)双特异性抗体都结合至乳腺癌细胞系BT474,其中灰线为阴性对照。结果显示该双特异性抗体可有效地结合至Her2表达癌细胞。
外周血单核细胞(PBMC)也表达CD3。制备1.5×106PBMC细胞并用50μlPBS、12.5nMhOKT3或12.5nM双特异性抗体孵育。双特异性配体(黑实线)结合的PBMC细胞的丰度与HOKT3结合的细胞(黑虚线)一样高(图11B)。
实施例3双特异性抗体BT-474细胞的细胞毒性测试
BT-474细胞用作靶细胞,接种于96孔板(10000个细胞/孔)中。24小时后,加入分离的人PBMC(效应细胞),然后将该混合物与HOKT3抗体、MSBODY、人IgG蛋白或单独与PBS共孵育(40:1效应细胞-靶细胞(E-T)比)。图12提供了对于每种抗体的细胞聚集的图片。很明显对照组样品(PBS)和人IgG样品没有细胞聚集,而MSBODY诱导下具有与HOKT3相同数量的细胞聚集。
测量对于MSBODY、赫赛汀、HOKT3,和赫赛汀+HOKT3的抗体诱导的细胞毒性,使用人IgG作为对照。BT-474细胞(靶细胞)首先用5μM CFSE染色然后与人PBMC(效应细胞:E-T比:5:1)混合。将相同浓度的赫赛汀、HOKT3、赫赛汀+HOKT3、MSBODY和人IgG加入至细胞培养物中。孵育24小时后,收集细胞并用1μg/ml PI染色,使用流式细胞仪计数(MoFlo XDP,Beckman Coulter)。如果细胞被CFSE和PI二重染色则计为死细胞。以死细胞数量和细胞总量之间的比率计算细胞死亡率。以测量的细胞死亡率和自然细胞死亡率之间的差值来计算细胞毒性。结果显示于图13中,图13显示,与赫赛汀和HOKT3相比,甚至与赫赛汀和HOKT3组合比较,MSBODY导致产生最高的细胞毒性。
另一细胞毒性研究使用人T淋巴细胞作为效应细胞以及BT-474作为靶细胞进行。BT-474细胞首先用5μM CFSE染色。第二天,将人PBMC与50nM人IgG、赫赛汀+HOKT3、MSBODY或PBS混合,室温放置30分钟。将细胞用1%FBS-PBS洗涤两次,然后用20%FBS重悬。然后将处理的PBMC细胞加入至BT-474细胞中,以20:1、10:1、5:1、2.5:1和1.25:1的效靶比加入。将混合的细胞孵育48小时(图14)。然后将收集的细胞染色并计数。如图14所示,与同赫赛汀和HOKT3预混合的PBMC相比,孵育MSBODY的PBMC致死细胞量最大。
由此该实施例出乎意料地显示,MSBODY在导致细胞聚集方面和HOKT3同样有效,并且比赫赛汀和HOKT3两者都具有更高的细胞毒性。
实施例4抗体之间的比较
该实施例将MSBODY与其他类型的抗体进行比较,这些其他类型的抗体针对Her2/neu和CD3之一或两者都有特异性,该实施例显示MSBODY的出乎意料的高活性和高稳定性。
本实施例中测试的各种类型的抗体显示于图15A-E中。图15A显示了MSBODY,其中单价单元具有赫赛汀的VH和VL,且单链单元包含HOKT3的VH和VL。图15B中的抗体几乎为MSBODY的镜像,称为“SMBODY”。该SMBODY具有单价单元和单链单元,该单价单元包含HOKT3的VH和VL,且该单链单元含有赫赛汀的VH和VL。
图15C中的抗体,称为“SSBODY”,包含两个单链单元,一个具有赫赛汀的VH和VL,而另一个具有HOKT3的VH和VL。如图所示,MSBODY、SMBODY和SSBODY都包含任选的盐桥和“杵”-“臼”结构。
图15D显示了双单链抗体(称为“赫赛汀单链”),其中两个单链单元都包含赫赛汀的VH和VL。其中该抗体具有单一特异性。最后,图15E显示了一种双单链抗体,该抗体具有两个单链单元,该单链单元含有HOKT3的VH和VL,本文中其被称为“HOKT3单链”。
为了将MSBODY和SMBODY对Her2表达细胞的结合亲和力进行比较,将3×105BT-474细胞用不同稀释浓度的纯化的MSBODY或SMBODY于50μl的Dulbecco’s PBS+1%胎牛血清(1%FBS-PBS)缓慢搅拌下室温(RT)孵育30分钟。然后将细胞用1%FBS-PBS洗两次,并于50μl含10μg/ml PE偶联的小鼠抗人IgG Fc抗体(Biolegend,409304)的1%FBS-PBS中孵育30分钟。将细胞再洗两次,重悬于1%FBS-PBS中,并进行流式细胞检查。
在所述的结合分析中使用的BT-474细胞使用流式细胞仪(MoFlo XDP,BeckmanCoulter)分析以检测结合细胞的抗体(图16A和B)。使用(GraphPad Prism5)得到数值和图表分析。测定的平均荧光强度绘制成抗体浓度的函数以通过单点结合(One Site Binding)(双曲线)法测定Kd。结果显示于图17中,图17中显示在与Her2表达细胞结合方面MSBODY的亲和力约为SMBODY的两倍。
与SMBODY和多种单链抗体比较,MSBODY的热稳定性通过热挑战分析测量。赫赛汀、赫赛汀单链、MSBODY和SSBODY稀释至0.5mg/mL并于37℃至82℃之间的各种温度等级(5℃等级)放置一小时。
Her2蛋白(2.5μg/ml)于4℃孵育过夜然后用3%FBS处理2小时。用PBST洗3次之后,将抗体稀释至1nM并与Her2反应1小时。随后,将抗人IgG Fc-HRP(1:10K)加入并于反应温度放置半小时。然后将该样品用PBST洗涤5次并用TMB染色,在OD450处读数。图18显示了热挑战曲线。Y轴温度,T50,指示其中在热挑战之后仍有50%的抗体保留对于Her2的结合能力的温度。该结合曲线标准化为100%最大结合。可看出MSBODY比SMBODY、SSBODY和赫赛汀单链抗体保留了更高的热稳定性,这接近于完整尺寸的赫赛汀。该结果非常出乎意料,因为已知单链抗体是不稳定的。
测量MSBODY和SMBODY的抗体诱导的细胞毒性,使用人IgG作为对照。相对高水平地表达Her2蛋白的高Her2BT-474细胞,和相对低水平地表达Her2蛋白的低Her2细胞例如MCF-7和MDA-MB-231,首先用5μM CFSE染色,然后与人PBMC(效应细胞)混合(E-T比:5:1)。将相同浓度的MSBODY、SMBODY和人IgG加入至该细胞培养物中。孵育48小时后,收集细胞并用1μg/ml PI染色,使用流式细胞仪计数(MoFlo XDP,Beckman Coulter)。如果细胞被CFSE和PI双重染色则被计为死细胞。以死细胞数量和细胞总量之间的比率计算细胞死亡率。以测量的细胞死亡率和自然细胞死亡率之间的差值来计算细胞毒性。结果显示于图19中,图19中显示MSBODY和SMBODY都产生相似的对于高Her BT474细胞的细胞毒性。然而,该MSBODY显示了对于低Her2乳腺癌细胞系例如MCF-7和MDA-MB-231的显著更高的细胞毒性。
实施例5其它单价单链双特异性抗体的制备
上述实施例显示了制备和测试特异性单价单链双特异性抗体(MSBODY)的方法,该双特异性抗体包含对于Her2/neu有特异性的单价单元和对于CD3有特异性的单链单元。使用同样的方法,可制备和使用其他的此种MSBODY,且每种都具有识别肿瘤细胞的单价单元和识别效应细胞的单链单元。
例如,一种MSBODY可包含具有抗体的经修饰的轻链和重链的单价单元,此种抗体例如利妥昔单抗(rituximab),抗AC133抗体和西妥昔单抗(cetuximab)。利妥昔单抗序列的重链和轻链序列显示于下表中。
抗AC133抗体序列的重链和轻链序列显示于下表中。
西妥昔单抗的重链和轻链显示于下表中。
如上所述的每一条重链可被修饰以引入盐桥和/或“杵”进入“臼”中。此种修饰的实例显示于表1-3中。
本申请不限于所描述的具体实施例的范围内,这些具体实施例用作本申请的各个方面的单独描述,并且任何在功能上等同的组合物和方法都在本申请的范围内。对于本领域技术人员显而易见的是,可以对本申请的方法和组合物进行各种修改和变化而不脱离本申请的精神或范围。因此,应理解本申请覆盖了本申请的修改和变体,只要它们在所附权利要求及其等同物的范围内。
在本说明书中提到的所有出版物和专利申请在本文中均引用至此,其引用程度如同每个单独的出版物或专利申请被具体地和单独通过引用结合至此。
Claims (14)
1.一种抗体,为由一个单价单元和一个单链单元构成的异二聚体,其中:
(a)单价单元,针对肿瘤细胞有特异性的轻链-重链对,所述轻链-重链对针对肿瘤抗原具有特异性,所述肿瘤抗原为Her2,所述轻链通过二硫键和所述重链结合;和
(b)单链单元,由单链可变片段(scFv)和连接在该片段C端的具有CH2结构域和CH3结构域的Fc片段形成的融合肽,所述融合肽针对CD3具有特异性、并通过二硫键与所述重链结合,且所述单链可变片段从N端至C端依次包括抗体重链可变区、接头和抗体轻链可变区,其中抗体轻链可变区与Fc片段连接。
2.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,所述重链包含人或者人源化的Fc片段。
3.根据权利要求2所述的抗体,其特征在于,所述重链的Fc片段包含人IgG Fc片段。
4.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,所述融合肽的Fc片段包括人或者人源化的Fc片段。
5.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,所述融合肽的Fc片段包括人IgG Fc片段。
6.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,与野生型抗体片段相比,所述重链和/或所述融合肽的Fc片段包含一处或多处氨基酸替换,所述替换在所述重链和Fc片段之间形成离子键。
8.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,与野生型抗体片段相比,所述重链和/或所述融合肽的Fc片段包含一处或多处替换,所述替换在所述重链和Fc片段之间形成杵-臼结构配对。
9.根据权利要求8所述的抗体,其特征在于,所述替换选自下表:
10.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,所述抗体还包含可检测的标签。
11.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,所述CH2结构域位于所述scFv片段和CH3结构域之间。
12.根据权利要求1所述的抗体,其特征在于,所述融合肽不包含CH1结构域。
13.一种组合物,包含根据权利要求1-12中任一项所述的抗体和载体。
14.根据权利要求13所述的组合物,其特征在于,所述载体为药物载体。
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