CN103282781A - 用于移液管的可编程操纵的设备和方法 - Google Patents
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Abstract
本发明一般涉及用于以可编程的方式操纵实验室移液管的设备和方法。本发明涉及一种这样的装置和方法:允许用户指示设备执行特定的过程;识别将使用的耗材的类型、位置和身份;操纵用于执行液体处理的多个移液管;在其实行期间和在其实行之后监控该过程;生成多个动作的详细报告。本发明的其他方面包括:优化移液管的液体分配性能;利用视觉来监控和控制单独的动作;利用现实增强软件界面虚拟化方案定义;将系统集成在常规实验室环境工作流中。
Description
相关申请数据的交叉引用
本申请要求2010年11月23日提交的美国临时专利申请序列号为61/416,546的权益,该申请的全部内容通过引用的方式并入本文。
技术领域
本发明涉及化学、生物以及生化过程或生化反应的自动化领域。更具体地,本发明公开了用于以可编程方式操纵移液管的设备和方法。
背景技术
传统上和历史上,液体处理构成了跨多个产业所进行的大部分生化、化学以及生物测试的基本构建块。
实质上,液体处理定义为:让一个样品与另一个样品接触的操作(有时采用重复方式),该操作能够对将要使用的两种样品中的至少一种样品进行量化。尽管事实上液体的狭隘定义严格地表明材料处于液体的形式,但在下文中我们提到的液体处理是将处于固态(例如,粉末)、液态或气态-或处于这些状态的任何混合形式(例如,包含像细胞培养液和乳液等混合在一起的固体和液体或像凝胶等混合在一起的气体和液体的异构样品)的材料进行处理的通用操作。
在液体处理领域中,大多数解决方案可以通过不同的性能等级来表征,其中这些性能是根据用户感兴趣的不同方面来限定的,并且如下这些性能构成了应用的原因:例如,灵活性、易用性、生产量、再现性、可追溯性以及成本效益。灵活性定义为:在宽的体积范围内以及对于液体的不同特性(还涉及其他特性和要求)处理异构过程的能力。易用性定义为:采用该方法时需要最少培训的性质,以及将用户的意图更快和更直观地转化成正确且期望的操作。特别是,将用户的意图转化为执行所期望的操作(而在操作的执行期间无需直接的涉入)也被称为可编程性。生产量定义为:在适当时间单位内能够执行的独立过程、部分从属过程或完全从属过程的量。再现性定义为:在任何原因的情况下相同方案的不同实施之间的最小偏差。再现性可以由相同的操作者或设备在同一时刻或在不同的时刻执行方案来进行评估,但它还可以包括由不同的操作者或不同的设备产生的偏差(特别是,当相对于由用户定义的目标性能进行评估时),该偏差也称为精度。例如,生物过程中的精度不足可能由用于液体处理步骤的定时的慢钟产生-或由液体处理设备的容积刻度尺的不正确的刻度产生。可追溯性定义为:保持已经实施的实际过程的记录用于后验分析和验证的性质,该实际过程包括在方案执行期间诸如可能的故障或失误等不可预知的事件。成本效益定义为:对液体处理装置的购买、用户培训、耗材成本、维护成本、运行成本、维修成本以及在液体处理装置的使用寿命结束时的报废成本等组成的成本进行加权和。
现今,由操作员手动地执行液体处理,或者利用不同类型的自动设备进行液体处理。
在大多数常规实验室环境中,利用允许对所输送的样品做定量测定的工具(定义为移液管)进行液体处理。在液体的情况下,通常的做法是利用样品的体积来估计样品的量。因此,通常利用容积可调的移液管执行手动液体处理,该容积可调的移液管能够将液体以操作者预先定义的已知量从一个容器输送到另一个容器中。在下文中,我们将移液管定义为可用的液体处理工具,并且移液管最初设计用于手动液体处理的程序,或至少部分设想用于该应用或仅受启发将该工具用于这个目的。还应提到的是,在市场上可以买到两种类型的移液管:电子移液管和机械移液管。虽然电子移液管在标度和人类工程学方面具有一些优势,但是机械移液管因为经济、实施性、坚固、较低廉且易于操作等优点仍然占据很大一部分市场。最重要的是,机械移液管已经成为与非常精确的标准(例如ISO8655标准)相应的行业标准工具。人体工程学的差异主要涉及例如出于吸出液体、分配、混合以及弹出吸头的目的由操作者拇指施加在移液管本身上的力(也定义为拇指动作)。在下文中,涉及移液管的所有动作称为移液管的操纵。
在大多数情况下,出于避免污染的目的,移液管通常通过吸头与样品相接触,吸头是耗材,其旨在避免移液管本身与液体的直接接触-否则将不可避免地会将不希望的分子输送到不希望的地方。吸头的使用在工业和科研环境中已经成为标准的做法,吸头具有多种可用的类型,并且可由客户根据它们的最大容积、是否具有过滤器、分子的表面吸收特性、材料、品牌以及最终成本来选择。移液管吸头可以被认为是特定的移液管配件,或者作为实验室设备中的定义为耗材的较大类的一部分,该耗材包括通常在液体处理和生物或化学反应领域中使用的其他微孔板、管、Eppendorf管、微管、真空采集管、过滤器、容器、小盒、小瓶以及瓶等。
近年来,制药、生物技术、化工、医疗保健及相关行业已经越来越多地采用自动化解决方案来进行各种反应和分析。这些自动化设备的好处包括:在高生产量时的再现性、速度、容量以及减少最终成本,能够使一些用户用有限的人工干预来进行大量反应,以及通常并行进行多个反应。
自动化设备通常与需要较高生产能力的实验室相关,因为当需要进行大量的处理时,自动化设备的尺寸、成本以及操作的复杂性吸引用户使用它们。然而,当严格需要再现性和可追溯性的特征时(比如在医疗保健和诊断的部门中),自动化设备有时也用于低生产量和中生产量的环境中。
医疗保健部门中的应用实例在于异构生物流体的处理,该异构生物流体定义为:具有从宏观层面上在视觉上可选择的不同成分的生物或化学流体。已知的实例包括:例如出于使白细胞层与红细胞和血浆(血清)相分离的目的,在分馏之后处理分离的血液。通过手动移液管从管中提取白细胞层是非常不可靠的、不精确的、困难的和耗时的操作。因此,血站采用高度复杂的专用自动化系统,如由Quilla等人所描述的自动化系统(国际流行病学期刊2008年第37期第51-55页(International Journal of Epidemiology2008;37:i51-i55)上的文章),其解决了在生产量高时所需要的精度和可重复操作的问题。然而,如在医院和分析实验室等较小的临床环境中,处理数量较少的患者样品将有益于以较有限的生产量获得相同再现性的优点。
自动化设备的成本往往与它们的机械复杂性相关:确保在大面积上具有精确和可重复的运动则需要精密的机械,该精密的机械包括占有很大重量的不变形的金属框架,从而最终使得这些系统不可运输并且制造成本高昂。重量和尺寸对运行成本也具有很大的影响,因为不得不由专门人员在现场进行维护、修理、培训以及升级。此外,重的系统意味着需要更强的电机和更高的电流吸收,从而使得它们的设计更复杂并且制造成本高昂。更不用说设备的便携性以及易于集成到现有实验室等方面。
在其它的自动化系统之中,液体处理过程的一项极重要的要求是相对于最新技术水平的已验证方案的实际再现性。由于大多数的化验开发是通过手动液体处理进行的,因此显而易见的是,手动液体处理所形成的结果通常构成了用于给定液体处理系统的参考。然而,对于本领域技术人员熟知的是(例如,Pandya等人在药学与生物医学分析期刊2010年第53期第623-630页(Pandya et al.-Journal ofPharmaceutical and Biomedical Analysis53,2010,pg.623-630)上的文章),手动液体处理特别是会漏掉可追溯性、精确性和再现性。出现这种情况部分是由工具刻度和性能造成的,因为总的来说它是人性的结果和人之间的指令的传播(包括培训)。此外,手动液体处理工具的低购置成本不应该掩盖因需要具有操作员而产生的巨大的操作成本。手动液体处理工具尤其还会出现如下情况:即,由于涉及移液管的重复操作会给肌肉骨骼系统引入很大的负担,可能导致与工作相关的疾病的后果。因此,一个操作员的潜在生产能力不得不受到限制,以使如累积性创伤失调(CTDs)和重复性负担损伤(RSIs)等不同病症发生的风险降到最低。明显的是,人们期望从专业环境中完全除去这些风险;然而,用自动液体处理系统直接替代人的手工操作会与各种活动中所需要的必要的灵活性产生冲突,并且由于自动化基础设施的采用和运行需要承担巨大的初始成本,所以还会与经济性因素产生冲突。总之,现有的证据表明:在手动液体处理操作和自动液体处理系统之间存在差距,但它们最终会以不同的方式实现液体处理目标,并且在实用性上不会重叠。本发明解决了这个差距,并提供了一种有用的工具来研究环境和行业。
液体处理系统的另一个关键要求在于它的可运输性,以及在实验室中的小空间的使用性。可运输性使用户能够获得较低的最终成本,可避免系统的现场安装以及现场支持和维护。具有小占地面积和较轻重量的系统允许其安装在常规实验室环境中,而无需特定的基础设施,并且能更好地集成到现有实验室的工作流中。此外,较轻重量的系统使用较少的电流,从而在电力供应受限的区域中能够使用电池或太阳能。
作为移液管,包括用于手动液体处理目的的最新技术水平的设计方案,一些现有技术的总结包括:
Gilson等人(US3827305)教导了一种具有可调容积机构的助手移液管;
Magnussen等人(US4905526)教导了一种电辅助移液管;
Scordato等人(US4821586)教导了计算机控制的移液管的实例;
Gilson等人(US6158292)教导了一种用于液体处理移液管的吸头弹出系统;
Cronenberg等人(US6977062)教导了一种包括吸头识别方法的自动吸头移除系统;
作为自动液体处理系统、它们的工程方案以及它们的概念设计,一些现有技术的总结如下:
Gilman等人(US2003/0225477)公开了一种模块化的仪器装置和用于处理实验室器具的方法。
Pfost等人(US5104621)公开了一个自动化的多用途分析化学处理中心和实验室工作站。
Shumate等人(US6372185)公开了一种液体化学分配方法和装置。
Bjornson等人(US2006/0127281)公开了一种具有集成的液位和/或气泡检测的移液装置。
Kowalski等人(US5139744)公开了一种具有模块识别装置的自动化实验室工作站。
作为其他方案,在低生产量时将自动化集成到专用系统中,或描述特定应用的专用系统,现有技术包括:
Zucchelli等人(US7152616)教导了用于流体的可编程微尺度操纵的设备和方法;
Blanton等人(US7601300)教导了一种用于在诊断环境中以低生产量处理测试样品的紧凑型集成系统。
Clark等人(US5482861)教导了一种自动化连续和随机存取的分析系统;
Wegrzyn等人(US2004/0241872)教导了一种光学检测液体处理机器人系统;
Ruddock等人(US7105129)教导了一种使用供电式砧的孔板的液体处理机器人。
总的来说,现有技术的一个缺点是一直难以使灵活性(以完全可编程和可配置的设备的形式)与简单性(以低成本制造和低成本运行的形式)和再现性(自动液体处理系统的特性)相协调。
本发明满足了如下需要,即需要灵活的、可重复的、可追溯的方案来进行液体处理,同时提高了手动操作的优点并带来了以较低成本实现自动化的好处。
发明内容
本发明涉及一种用于以可编程的方式操纵移液管的装置和方法:我们对利用这些方法的系统和设备定义为液体处理机器人或简单的机器人。
因此,在本发明的一个方面中,由装置操作多个移液管,该装置包括多个移液管;至少一个臂部,其操纵多个移液管中的至少一个移液管;以及一个软件界面,其允许定义将执行的液体处理方案并控制臂部的行为。
在本发明的另一个方面中,公开了一种用于通过手动移液管执行液体处理的方法,该手动移液管通过机械臂自动操作来实现抓握合适的吸头、设置正确的分配体积、抽吸所需量的液体、分配所需量的液体、弹出吸头。
在本发明的另一个方面中,出于液体处理的目的,使用摄像机通过从多个角度和位置成像平台区域来,同时通过耗材的形状、尺寸、颜色、高度、条形码、显著特征对耗材进行识别、测量和定位。
在本发明的另一个方面中,摄像机集成在液体处理装置中,并且与控制移液管运动的臂部一起移动,从而能够使用视觉来识别耗材并且利用来自图像的位置信息来精确地掌握移液管与耗材定位的相对位置。
在本发明的另一个方面中,一种用于处理生物或化学流体的设备,该设备包括平台区域,该平台区域包括多个在给定位置中的耗材,其中所述给定位置被组集成灵活有序的构造。
在本发明的另一个方面中,一种用于液体处理机器人中的移液管的容积校准的方法,该方法通过以下步骤来实现:将多个预设量的样品分配到至少一个容器中、通过估计被分配的样品的实际量、以及通过将校准的想法并入到软件界面中而不对移液管进行修改。
在本发明的另一个方面中,一种用于改善液体处理机器人中的移液管的容积再现性的方法,该方法通过以下方式来实现:控制拇指动作的速度,所述拇指动作的速度被调制为体积的函数、移液管活塞位置的函数以及被使用液体分类的函数。
在本发明的另一个方面中,一种用于改善液体处理机器人的容积再现性的方法,该方法通过以下方式来实现:包括至少一个测量湿度或温度或压力的传感器并且基于传感器的信息改善移液管的校准。
在本发明的另一个方面中,一种用于操纵液体处理机器人中的移液管的方法,该方法通过以下方式来实现:通过优先先验且实时地测量拇指致动压力作为拇指位置的函数,并且在之后仅基于拇指的位置和速度控制拇指动作。
在本发明的另一个方面中,一种用于操纵移液管的方法,包括测量拇指动作压力作为拇指位置的函数,并且仅基于它的位置操作拇指。
在本发明的另一个方面中,一种用于处理生物或化学流体的装置,该装置包括承载耗材的平台,其中,该平台为可折叠的类型或自组装的类型。
在本发明的另一个方面中,一种用于处理生物或化学流体的方法,在该方法中:允许摄像机对移液管吸头进行成像,相同的吸头对于光线部分透明,其中,出于核实、体积确定、跟踪和质量控制的目的,摄像机能够目测吸头内部的液体,并且摄像机所捕捉的图像能够估计吸头中所含的液体体积。
在本发明的另一个方面中,一种用于处理如分离的血液或分离的牛奶或含有细胞的流体或珠载液体或悬浮液或乳液等异构生物流体的方法,在该方法中:机械臂允许操纵移液管,允许摄像机对移液管吸头进行成像,允许摄像机对生物流体进行成像,其中,从图像中提取并使用吸头相对于各种生物流体成分的相对位置,以控制移液管在某一位置的抽吸和分配。
在本发明的另一个方面中,一种用于处理液体处理机器人中的生物或化学流体的方法,该方法包括:通过摄像机对相对于耗材的移液管吸头同时成像,以及使用图像中的信息以确定吸头相对于耗材在空间中的相对位置来操纵移液管。
在本发明的另一个方面中,一种用于确定容器中的液面的方法,该方法包括:对液体外部目标成像,以及在朝液体表面移动时比较相同目标的图像,其中,通过液体与目标的接触而获得的目标图像中的变化允许确定液面相对于目标的位置。
在本发明的另一个方面中,一种用于确定关于包含在吸头架中的吸头的信息的方法,该方法包括:对吸头架进行成像以及对吸头架内的一个或多个标签进行识别,其中标签提供了关于吸头架内的吸头的数量、位置或类型的信息。
通过实施例及附图的详细说明,本发明的这些和其他优点、目的和特征将会变得更加清楚。还应理解的是,以上的概括性说明和以下的详细说明都是示例性的,而非限制本发明的范围。
附图说明
图1是示出了液体处理机器人的三维图;
图2示出了通过基于视觉的反馈设置所需移液管容积的细节;
图3示出了通过固定的夹具和移液管本身的运动来弹出吸头的方法;
图4示出了基于视觉追踪被使用的液体体积的细节;
图5示出了移液管吸头相对于其他耗材的基于视觉的相对定位的细节;
图6是示出了液体处理机器人第二实施例的三维图;
图7是描述手部的细节的三维图,该手部能够抓握移液管、致动吸液和分配、以及弹出吸头;
图8示出了基于多米诺块的多米诺平台的结构和构成;
图9示出了出于臂部位置三维定位的目的使用计算机视觉的一个实施例;
图10示出了臂部位置三维定位的能力和用于提高系统固有空间分辨率的方法的应用;以及
图11示出了出于将可用吸头定位在吸头架中的目的使用计算机视觉的一个实施例。
具体实施方式
本发明涉及移液管的操纵及其多个应用。出于说明的目的,附图以及说明书通常将解决此方案的装置称作为液体处理机器人。然而,本发明所公开的装置同样适用于液体处理领域中更普遍的实施例。
液体处理机器人的概述
液体处理机器人的总体结构包括少数几个元件,结构中的所有元件具有给定的功能作用。从本质上讲,液体处理机器人在某个平台的上方进行操作,该平台可包括或不包括机器人本身的基部。平台可以是物理部分,柔软的或坚硬的,也可以是没有定界的虚拟区域,例如属于实验室的工作台。平台还可以是多个较小单元(称为块)的物理组件,这些块结合在一起以形成较大的操作表面。液体处理机器人主体(也称为基部)给臂部提供了物体支撑,并且液体处理机器人主体可能包括像电源插头、通用开关、照明器、绞扭器、设置摄像机、臂部固定器、USB集线器、吸头废料托盘、移液管架、提手等额外的硬件。最重要的是,主体的目的是给臂部的运动提供一定的稳定支撑。臂部构成了主要的机电元件:它产生了手部在空间中的运动,主要是在二维表面的上方移动,但也能够提升和降低移液管以进行所需的移液管动作。臂部与主体相连接,并且该臂部可以包括手部,或者与手部相连接。手部构成了主体的与移液管接触的一部分,并且具有抓握移液管并将移液管放在移液管架上的可选能力。此外,手部可包含手部摄像机、出于吸液和分配目的而操纵移液管旋钮的功能、弹出吸头的功能以及出于设定所需容积目的而致动移液管的功能。该系统还配有软件界面,该软件界面的目的包括:控制臂部的运动、手部的动作、与摄像机进行通信并处理图像、以及尤其是出于可编程性目的和报告目的管理与用户的所有交互。
可能的液体处理机器人可以做成如图1所描述的那样。主体101可以是注塑成型的聚合物结构(整体的形式或者是各种部件的形式),主体101包括:有源元件(如电子设备和摄像机)和如优选地定位在下部104中的压载配重(固体或液体填充)等无源元件。在一些实施例中,主体可包括旨在提供额外稳定性的脚部(未示出)。在其他实施例中,主体可利用承载电池和接口定位在实验台上,但是主体还可设计使用在其他环境中,如使用在便携式工具领域中。在该图中,主体承载有压载物104、用于可移动吸头架103的容器、在位置102处的主体摄像机(用于容积设定以及可能用于针对入侵检测的平台区域监控和检查)、多个移液管插槽121(以容器或挂具或磁性托架的形式或以类似设计用来承载如105所示移液管的形式)。主体可包括如附图标记108所表示的提手,以及如附图标记109所表示的机械元件,该机械元件使得,例如通过允许更容易地接触吸头弹出按钮,更容易与移液管进行相互作用。主体可包括绞扭器122,该绞扭器定义为能够设定移液管容积的致动器。通常情况下,通过扭动移液管的旋钮来进行这个操作,但对于电子移液管,还可以通过例如远程蓝牙通信或物理电连结的电子方法来实现。应注意的是,额外的电子配件能够提高系统的优点:例如,通过对传感器信息进行集成和修正,温度传感器或压力传感器或湿度传感器(它们可能连接至USB集线器并且从软件界面直接读取)能够改善移液管的刻度。
平台区域106限定了液体处理机器人的工作表面,该平台区域106大于、小于或等于臂部的工作范围。平台区域可具有圆形形状、矩形形状或类似的形状。优选地,平台具有使用户能直观察觉正确定向的形状。平台可以是虚拟区域,例如由简单的照明限定的区域,还可以是柔垫(例如,硅垫,该硅垫能够很容易卷起来以减小其尺寸并且在放置在工作台上时恢复平坦的正形投影形状),或是刚性的金属板或聚合物板(包括木头或复合材料)。因为液体处理机器人的便携性构成了服务和支持操作的主要优点,所以重要的是要强调虚拟平台或可折叠平台的可能优点,从而使机器人的装运在成本方面的影响更加有效。此外,可折叠平台或虚拟平台在机器人未使用时能节省空间。平台可包含多个向用户或向系统本身提供特定信息的位置。例如,向用户提供的标签、警告、说明、注意事项以及免责声明,还有向系统本身提供的定位标记、条形码、编码符号、标签、基准点,以利用摄像机提高移液管和耗材的空间定位。可以将多个类型的耗材(例如,附图标记107所表示的微孔板)以自由的形式构造、或者是以固定或几乎固定的形式构造定位在平台上。固定的形式构造意味着将耗材精确地定位在给定的位置中,并且对于其定向不留有任何的选择余地,而几乎固定的形式构造表示耗材的近似区域,并且对于其定向在标称位置附近留有旋转和位移的选择余地。固定的形式构造可从插槽、导轨或类似方案中受益。在所有的构造中,绢网印花图形或印刷图形的存在能够便于用户对板进行定位工作,还能通过摄像机简化耗材定位的功能,并且给用户的感知提供秩序感,从而使相同方案的重复成为更简单的工作。可选地,可以使用不同的颜色完成印刷的图形和信息,从而使摄像机更具选择性地识别本文所述的一部分信息。
臂部(在该情况下定义为元件110和元件113之间的结构)包括多个致动器或具有类似功能的方案(例如,电机实际定位在臂部外侧的线缆驱动系统,或使用气缸作为致动器的气动系统)。在本实施例中,致动器选自于集成有齿轮减速和角度反馈的伺服电机的类别,从而允许将致动器设定在其主体和输出轴之间的给定角度处。在单一单元(例如,单元110)中,电源和串行通信链路(例如基于RS232、RS485或USB标准)的规定允许输入和输出不同的信息:输入的实例有所需的位置、运动的速度分布图、最大扭矩、角度接收窗;输出的实例有当前位置、当前速度、单元温度、单元状态以及可能的故障。臂部的运动主要发生在水平平面中,在耗材具有略微不同的高度时,臂部的运动在平坦且水平的工作台上进行典型的生化操作。然而,例如吸头的插入、液体的抽吸和分配均需要竖直运动。在此特定的实施例中,臂部主要是在水平平面中进行操作,并且臂部在竖向平面中具有较有限的偏移。实现所需位移的一种方法例如是依靠两个角度致动器(它们在水平平面中设定位置)和竖直线性致动器。在替代方案中,线性致动器的重量和复杂性能够让人想到其可由两个角度运动来替代,例如角度致动器112和角度致动器113,以允许利用通过同时运动保持移液管的空间定向来上下移动移液管。考虑到移液管的竖直状态是移液管具有更好容积性能的重要条件的事实,该特征可能是重要的。出于其他原因,可优选的是,增加角度致动器的数量以获得在水平平面中的运动。例如,在一些实施例中,期望的是,相对于方位角旋转来限定竖直移液管的定向:这自然意味着采用至少三个用于水平运动的致动器。障碍物或固定结构的设置还需要更多数量的致动器,例如如图1所示的四个致动器。考虑到实际应用和角度致动器性能,臂部构造的选择应遵循良好的工程实践和常识。
手部的设计可能会利用与应用至臂部的概念和组件类似的概念和组件。在所述实施例中,手部始于致动器114,该致动器114实际上是负责抓握移液管的致动器。抓取器(为清楚起见,未示出)可以是能够在移液管两侧上施加压力的简单爪形机构。抓取器还可以是单一的爪形机构,其中移动爪与对移液管保形的固定爪是相对的。在一般情况下,爪可具有保形的形状、平面形状或与移液管接触的有限数量的接触点。不同的设计具有不同的优点:根据本实施例,液体处理机器人可设计成处理单一类型的移液管,或设计成处理各种型号的移液管。明显的是,本领域技术人员不得不相应地构思爪部,并且对于不同的移液管他们的设想可能是不同的。手部还可包括摄像机123,一旦从主体插槽121中抓起移液管119,出于识别耗材及耗材的空间位置以及吸头120或移液管119的位置的目的,摄像机123将在不同的方向上独立地或依赖性地与移液管一起定向和移动。重要的是意识到,使用固定摄像机对生物或化学测试的典型平台表面特性成像而不太远离平台是比较具有挑战性的。因此,所提出的实施例表明了一种对上述问题的解决方案,该解决方案为对平台区域进行一系列图片成像,该一系列图片单独覆盖一部分有用表面。该图像能够通过合适的软件以嵌合体的方式重新合成,从而允许具有平台空间及其附近所含有的耗材的概观图像。通过摄像机或手部的倾斜或平移,合成图像还可允许具有相同平台或平台一部分的多个图像。出于获得立体信息的目的,可以很容易地利用该特征来重建至少部分三维信息。为了提取耗材高度方面的信息,该特征特别关联于可能需要移液管吸液和分配位置的正确设置。假定摄像机具有可调的焦距以及光学构造具有有限的焦深,还可通过使用摄像机的焦距信息来获得三维信息。这种方法允许通过目标本身的简单扫描和图像的空间对比分析来提取深度信息。彩色摄像机还可提供额外的信息,例如允许基于颜色的空间分布识别耗材和移液管或其他配件。手部还可包括拇指致动器115,其目的在于在移液管的操纵中致动具有类似于人类拇指功能的拇指116。拇指的运动可以是围绕轴线的简单的局部旋转,但重要的是要注意,提高拇指动作的精度(例如在其速度、位置和相对于人类拇指的压力灵敏度方面)能够在移液管的操纵中引入各种改进:例如,通过旋钮117的行程经由快速的抽吸/分配顺序提高液体混合、通过可重复位置的位移或速度分布图提高分配精度、以及通过压力反馈机构提高对移液管停止的检测。最后,拇指动作还取决于液体的性能,从而使移液管在具有粘性液体或异构样品的情况下工作在最佳状态下。作为另一个实例,快速且可重复的拇指动作能够提高液体动态分配的性能和可靠性,该动作定义为分配液体而不与容器已含有的液体物理接触。这种可能性能够实现手动移液管操作所不可能实现的性能(大大节省时间和吸头的使用)。由于结合了多种分配和吸液方法,并且可以对任意液体进行单独校准(如下所述),这证明液体处理机器人在能力和质量上可以轻松胜过手动操作者。
图6描述了液体处理机器人的第二实施例。塑料封闭件601构成并包含主体,该主体设计作为安装在基板602上的竖直结构。基板602具有给系统提供稳定性的用途,并且使系统独立于无论是由机器人本身或由外部因素诱发的支撑工作台的可能振动和晃动。主体601还包括用于执行容积设定程序的旋转致动器603。旋转致动器受到摄像机604的辅助,该摄像机604能够利用内部照明器605对设置在移液管606上的数字计数器进行成像。在本实施例中,主体601包含电子设备和机械结构:事实上,通过竖直提升肩部607的线性致动器(在本附图中不可见)来实现臂部的竖直运动,从而允许臂部所需的竖直行程。这样的结果是,臂部的功能限于手部608在水平平面中进行位移,而在主体601内部实现竖直运动。因此,不同于图1,臂部仅含有三个伺服电机609,该三个伺服电机609允许对预定区域进行完全覆盖。
图7示出了手部实施例的细节。两个伺服电机701和702辅助手部操纵移液管,包括抓握、弹出吸头、以及致动移液管旋钮705以进行液体的抽吸和分配。伺服电机701具有将所需压力施加在移液管旋钮705上的双重功能,包括压力反馈的监控和旋钮位置的监控,以确定移液管的停止。该双重功能通过凸轮来实现,其中凸轮704总是与伺服电机701的轴一起移动,而凸轮712仅在有限的角度范围内由凸轮704致动。凸轮704施加在凸轮712上的压力致动移液管上的按钮706,致使吸头709从移液管弹出。由伺服电机702致动另一凸轮:凸轮703对在楔状物707上滑动的杠杆(未示出)进行致动,楔状物707在转动时推动夹具708抵靠在移液管主体上并且产生对移液管的抓握。在移液管的另一侧上存有对称的机构,从而产生使移液管轴线与手部轴线对齐的对称夹持力。
重要的是,手部承载摄像机711和关联光源710。光的用途是在摄像机711的视场中施加均匀和恒定的照明,视场包括平台的鸟瞰、吸头709的成像以及在这种情况下的移液管末端713的成像。视场范围内具有这些元件允许测量这些目标在摄像机图像内的相对位置。事实上,透镜光学畸变的校正允许确定径向线(通过摄像机711的物镜),沿着该径向线物体位于视场中。因此,目标的横向位置能够通过估计目标的竖直位置来重建。可以采用以下不同的方式估计元件(例如,吸头末端)的竖直位置:利用透镜的焦距、通过相同目标与参考的已知竖直位置的接触(通过竖直运动的压力反馈感知)、利用未连接至手部的目标的多个位移图像、利用两个安装在手部上的摄像机的立体成像、利用已知尺寸的二维条形码的外观尺寸的测量结果、以及其他方法。
容积设定的详细描述
图2描述了一个可能的实施例,该实施例描述了用于在可调移液管中确定预设容积的方法和设备。在该附图中,摄像机203位于主体201的内部,在图1中已经描述了主体。摄像机定位成能够对指示移液管204的分配/吸液容积的移液管显示器215成像(该移液管显示器215在本图中不可见,因为它被移液管的主体覆盖了,但它例如在图3的位置313中表示出来了)。显然,为允许到达该位置,已经合理地设计了部分可见的臂部(致动器213和214)。摄像机可以从前面对显示器成像,或从任何方向上和任何平面中的某个角度(例如,从顶部或从底部、从左边或从右边)对显示器成像。摄像机可由人工照明辅助,或来自于环境或来自于液体处理机器人所含有的光源、或来自于自然光源。将显示器监控与调整移液管容积设定的能力结合起来非常有用。这由连接至旋钮绞扭器207的致动器206完成。致动器可以通过其角度位置来设置,也可以通过其角速度来设置。旋钮绞扭器是一个元件,优选地为弹性材料,其设计成通过旋钮抵靠在绞扭器上的简单压力将扭矩施加到旋钮上,从而允许(像对大多数移液管类型所做的那样)进行所需的移液管调整。在一些实施例中,绞扭器可以是具有刻进其主体的凹面(截去顶端的)锥体的橡胶型圆柱体:锥体形状允许保形地调整到不同大小的移液管旋钮。
吸头弹出的详细描述
图3示出了一个可能的实施例,该实施例描述了用于吸头弹出动作的装置和方法。显然,在液体处理机器人中,吸头插入到移液管上之后是吸头弹出。然而,在大多数现有的移液管中,当移液管主体已经插入到吸头中时,仅通过施加一定压力来完成吸头插入。很显然,这个操作在如图1所述的实施例中时可行的。关于吸头的弹出,可利用多种方案,该多个方案包括通过专用致动器致动弹出按钮的直接动作,该专用致动器最优选地位于液体机器人的手部中。然而,如图3所示,对于在图1中已经描述了的液体处理机器人实施例,有一种无需额外的致动器的经济型方案。臂部允许将具有如下构造的移液管303进行定位:即,移液管的弹出按钮305面向固定结构306,该固定结构306例如相对于主体结构301固定。弹出按钮305的致动由臂部本身所产生的力来实现,例如通过致动器309和致动器310的动作以使固定结构306和弹出按钮305中的一者推动另一者。这种方案可以节省至少一个致动器和减少手部的某种复杂性,从而产生一个更轻并且更可靠的方案。适当选择固定结构306的形状以允许在不同的空间位置中弹出吸头,期望的是,避免吸头累积在如图1所示的废料托盘103的有限区域中。
容积监控的详细描述
图4示出了实现容积监控和移液管操作的可追溯性的方法和设备的可能实施例。四个图像对应于由先前所述液体处理机器人中的摄像机拍摄的四个不同的快照,该摄像机可以是图1中的摄像机123或摄像机102。为了简化描述,从正交于移液管轴线的位置拍摄图像:然而,这不是严格所需的并且大多数视角都是可以的。图像可以显现部分或全部的移液管主体402和吸头401。如最左边的图像可见,空移液管的参考图像构成了参考,并且它还可以被临时存储或永久存储。应理解的是,该图像可以在臂部的参考位置处来拍摄,从而提供均匀和恒定的背景信息和照明。
在从图4左边算起的第二图像中,描述了根据可调移液管的容积设置已经装入给定量液体的吸头。对于本领域的技术人员明显的是,对于给定的吸头,每个设置的容积与液体弯月面403的给定位置相对应。因此,在这方面,弯月面的位置构成了指示移液管已经正确吸进所需量的液体的指示器。
相反,在分配操作之后,参考图像构成了逻辑参考,其中还可以以类似的方式检测存在的液滴或剩下的液体。在从图4左边算起的第三图像中,示出了未正确发生吸液的不合理的情况。可以看出,移液管中已经引入了空气泡405,从而移液管中所含有的实际液体体积相对于所需容积产生改变。根据气泡的原点,弯月面404可能处于正确的位置处(根据从图4左边算起的第二图像所做的参考来限定的位置),因此这表明吸头中的实际液体体积低于预期液体体积。液体的弯月面还可能在较高的水平上,例如表明在吸液之后已经形成了气泡,或者液体弯月面甚至还可以低于预期水平,这显示出在液体收集中存在严重的问题。在图4最右边的图像中示出了在实验室实践中发生的简单且实际的情况:移液管在抽吸液体时容器中缺乏液体、或吸头相对于液面的不正确的位置导致得益于移液管中所含的空气而抽吸部分液体。弯月面405很可能在正确的位置;然而,在位置407处可以看到第二液体-空气界面。用户可以利用所有这些不希望的情况,从而显著改善由测定所生成的数据的解释。在所有的情况中,图像包含有那些可能会在手动操作中损失的重要信息。这些有用的信息可以在线进行处理,为了试图重新获得这个过程,出于操作者监控和质量控制的目的,也可以脱机简单地存储这些有用的信息。总体而言,类似的成像构造可以用于控制吸头在耗材中相对于液面的位置。耗材的成像以及液面的识别可以确定液体和吸头之间的垂直距离,从而允许液体被精确地啜吸和分配。同样,相同的程序可以应用于吸液,特别是应用于液体处于垂直位置的情形,例如,在分离的血液对血浆/血清和红细胞之间的界面处的白细胞层进行抽吸的情况下。
视觉辅助吸头定位的详细描述
图5示出了一个可能的实施例,该实施例描述了用于实现吸头的视觉辅助定位的方法和装置。该图像对应于由摄像机拍摄的图像,该摄像机优选地连接至移液管的手部,例如图1所述的摄像机123。如果摄像机连接至移液管的手部,那么对连接至图1中吸头120的移液管119进行抓握则将产生图5中可见的移液管吸头504的可重复且恒定的位置。因此,这个信息已经构成了对于从手部恰当抓握移液管的重要控制。应理解的是,不同的移液管和不同的吸头能够产生不同的图像和形状,所以吸头的成像还代表了一种用于确保不会发生错误识别的可能方法。此外,如在图5所示的情况下,该图像可以含有视场内的额外目标。在本领域中众所周知的是,根据所利用的光学器件和传感器的类型以及它们与摄像机的明显距离,任何目标可以是清晰的,也可以是模糊的。臂部的能力是这样的:可以在所需的高度处操作臂部,这当然意味着在耗材和吸头之间的距离将设置为所需的值。在此条件下,能够根据如下方法识别吸头504相对于所需的孔位置507横向对齐:吸头503的轴线504在延长时将识别吸头进行竖直运动的轨迹(在实例中,吸头是竖直的,因为它通常应该是这样的)。然而,吸头相对于耗材的给定且特有的距离将限定在图像中的单个点处,当吸头定位在所识别孔的相同高度时,吸头将相交于该点。因此,可以通过以下方式实现吸头的相对水平对齐:通过在视场内对相同吸头进行成像,并且在成像平面中施加偏移(该点应当直接定位在所需目的地上),以及通过在不改变吸头与耗材的距离的情况下对臂部施加横向运动。应当注意的是,该方法还可用于存在光学畸变的情况,该光学畸变可以通过视觉分析的方法来全面纠正或通过经验对齐来纠正。
在另一个实施例中,例如可在图7中所看到的,摄像机可以在吸头接近液体表面时对吸头进行成像。相对于吸头远离液体的图像,吸头与液体接触的图像将改变吸头的图像,因此,例如出于在液体表面附近抽吸液体或分配液体的目的,可以使用这样的改变来识别吸头与液体表面相接触的位置。
可以通过对吸头或液体的合适照明来提高图像中的差异:只要吸头和液体相接触,吸头聚合物的折射率和液体的折射率就类似,因此,在沿材料表面的内反射的引导下,光线将形成通道而通过其他介质。可以很容易地识别出照明构造中的变化并且实现吸头-液体接触的检测。可以通过发光二极管或激光或在光的导向器(例如,光纤)的引导下实现特别适合于内反射利用的照明条件。
多米诺平台的详细描述
图8示出了一个平台构造的可能实施例。不同于图1所述的平台,通过称为块的托架以几何方式组织耗材,该块定义为能够保持一个或多个耗材的、可重复使用或不可重复使用的支架。块的特征是能够将它们组装成称为嵌合体的更大结构,其中嵌合体是根据一些具有某种预定义灵活性的预定义规则而组织成的块的平面组合体。在图8中,不同类型的块组装在一起:例如,块801是用于收集用过的吸头,块802设计用来包含和支撑不同类型的微管,块803用来保持和支撑吸头架,块804用来支撑采血管和诸如15mL、50mL等更大的管,以及块805包含微孔板。这些块没有详尽地涵盖所有的可能性。例如,块可以设计成同时承载如下物品:预加载的试剂、像吸头等特定的耗材、用于处理信息的条形码、管以及用于允许用户提供他们自己的样品的空耗材。在该最后的构造中,能够将一个多米诺块设想为不需要外部块的单一单元,其中外部块用于将多米诺平台处理制造成不彼此依靠的独立实验的集合。重要的是,多米诺块可以通过NFC、RFIDs、线性条形码、光学识别标记以及如806所示的二维码等信息来进行补充。例如,通过图7所述的摄像机711来提供额外信息,提供额外信息的目的是使系统能够轻松对块进行有效和非接触式的识别。提取多米诺块信息的其他方式是通过定位在它们侧面并与相邻块接触的电触头,以及通过电网络传播到其他块。多米诺平台的一个重要特征在于在能够组织和规定块的组装的同时能够使它的构造适应于用户的需求。事实上,多米诺块可以在其两侧上存有键,例如机械键或磁性键,从而避免用户不正确地组装多米诺块,并且利用将组件保持在一起的一些力来验证所选择的构造。键的一个实施例是机械构造,类似于在用于教育和游戏目的的LEGO玩具中实施的机械构造。另一个机构包括特定的磁性构造:例如,沿着设计成在“向下”的方向上定向的侧面,该侧面能够承载具有合适磁性构造的多块磁铁。作为吸引力的结果,构造SNS(南-北-南)中的磁极可以与具有NSN(北-南-北)的侧面中的磁极相匹配,而侧面NSN将推离侧面NSN(类似于将SNS侧面推靠在SNS侧面时的排斥力)。磁性构造的优点在于:验证所允许构造的吸引力,而排斥力将避免在错误的定向上组装块。这些磁力通过连接外部的参考结构还能够改善多米诺平台的整体组织。例如,在图8中,块807通过将SNS磁性构造与嵌入侧面809上的磁铁产生的NSN磁性构造相面对磁力地连接在机器人主体下方的基部上。同样,块808通过将SNS磁性构造与侧面810上的NSN磁性构造相面对磁力地连接在机器人基部的侧面810上的磁铁位置上。在该实例中,避免块旋转90度的是磁体之间的不同间距,相对于侧面809,磁体在侧面810上更短。出于相同的原因,多米诺平台中的块不能旋转180度或90度。
多米诺平台的一个重要优点在于:实验台的最优占用空间位于机器人主体的外部。事实上,与当今液体处理器的构造(其占用的工作台空间与所涉及实验的复杂性无关)相反,系统所占用的空间限于给定实验所需的空间。另外,当不使用系统时,允许所占用的工作台空间最小化,例如,通过在其他地方存储多米诺块,或通过将它们组装成竖直堆,从而只占用单一多米诺块的覆盖区。在一般情况下,用户可以根据用户的典型实验通过改变不同类型的块的量(该量是所需的并且不使用不必要的块)来利用不同的多米诺块。
臂部空间定位的详细描述
虽然用于定位的许多程序和方法对于本领域技术人员是已知的(包括精密机械和X-Y-Z直角坐标系机器人的编码器和解码器的使用),但是我们描述了一种利用安装在移动臂上的简单摄像机的特别适用于耗材的识别和定位的方法。在此所描述的摄像机和臂部的几何形状如图6所示,臂部609利用图7所示的夹具708连同摄像机711和相关的照明器710保持移液管608。图9表示摄像机711在某个块上方移动时拍摄的可能图像,出于在一个给定位置(例如,孔910)中吸液的目的,将精确地存取该图像。应当注意的是,提取移液管轴线在三维空间中相对于所需的移液位置的相对位置至关重要。已知移液管吸头的长度(例如,利用移液管的模型或利用包括与移液管吸头接触的感测在内的其他技术,利用图6摄像机604的立体成像、外部测量,以及其他方法),以及基于移液管吸头在摄像机视场内可见的事实(如在图7中,摄像机711通过使用合适的物镜,能够观看到移液管709),显然,一旦已知移液管吸头末端所在平面的换算比例,就可以在图像传感器的空间坐标(像素)中计算出移液管吸头末端相对于摄像机轴线的横向位置并且能够转换成真实空间的横向位移。可以以多种方式实现换算比例,该多种方式包括在相同平面中已知尺寸的二维码的使用。然而,图9示出了知道移液管吸头末端相对于摄像机的相对位置只是针对解决移液管吸头末端在孔910中定位这个问题的部分方案,因为还需要使位于给定偏移量(在真实空间中)的摄像机轴线(由交叉阴影线901示出)相对于耗材902进行移动。下面的方法示出了这样一个程序:该程序具有快速有力且能够补偿任何偏移并能局部调整每个单独块或小区域平台的优点。事实上,块911具有不同的特征。一个特征是提供有镜子903、904、905、906,这些镜子设置在与水平平面成45度角的平面上,并且从微孔板的侧面在向上的方向上反射图像。这些镜子允许对放置在微孔板竖直侧面上的任何用户标记条形码进行光学检测,该检测可以由摄像机711与应用有条形码的侧面无关地轻松地测量,并且如果用户条形码必须处于微孔板的给定侧上,则摄像机711还会潜在地检测任何微孔板的旋转。可以利用相同的条形码识别能力来检测应用在块911中的其他条形码(例如,在位置909和908中的条形码)。应当强调的是,出于增加系统的稳健性或增加摄像机将要读取的信息量的目的,对两个条形码的选择可以降低到选择单一条形码并且也可以扩展到多个条形码。安装在块911中的二维码定位在大约与孔高度相同的位置处,或定位在竖直平面中已知偏移量的位置处。条形码(例如,QR条形码)的读取还给用户提供了关于它的外观尺寸的信息,该外观尺寸是由摄像机在其空间中测量的尺寸(通常,沿传感器尺寸的方向以像素的形式测量)。因此,具有已知尺寸的条形码,或具有记录在条形码本身内容中的尺寸的条形码,允许定义空间换算比例,以对相同平面中由摄像机测量的任何距离转换成真实尺寸。可选择地,如果条形码的尺寸未知,那么位于已知距离的两个条形码可以用于相同目的,例如通过掌握条形码908和条形码909之间的距离。的确,对于具有未知像素形状的摄像机的情况,则不得不使用关于条形码角度的信息来提取合适的换算比例(其在图像传感器的两个方向上不同)。总之,测量单一二维码的尺寸和角度允许测量在相同平面中的或其临近平面中的条形码的距离。然而,一旦因为目标失真对摄像机图像进行纠正,则对于给定的摄像机和目标,换算比例就可以根据简单的投影规定随着距离的变化而变化。所以,通过已知步骤(例如,知道齿轮系数和马达竖直移动臂部的步骤)竖直移动摄像机所进行的竖直扫描允许利用内插和外推算法构建曲线,该曲线自动给用户提供对于给定摄像机和自条形码本身的目标之间的垂直距离。最终,可以以相反的方式使用相同的曲线来提取摄像机和条形码之间的实际距离,并且知道移液管吸头末端相对于摄像机的偏移量:这种逆解法可以解决移液管吸头末端相对于孔910竖直定位的问题。
同样,可以通过掌握在由箭头912和907所述的坐标系中孔910相对于条形码909的横向偏移量来计算摄像机轴线910相对于孔910的横向偏移量。这个偏移量对于每个模块都是特定的,并且能以适当的方式外部地或内部地存储到模块(例如,通过条形码数据内部的数据库,或通过RFID或NFC标签)中。为了实现臂部相对定位的目标,应当注意的是,通过对条形码角度、及其在传感器图像中的位置和先前所述的空间换算比例的测量,将摄像机轴线901定位在坐标系912和907中,其中摄像机坐标系和块的实际空间坐标系之间的转换变成由单一图像唯一识别。因此,把所有要素合在一起,通过安装在自动臂上的摄像机、使用由条形码提供的信息,本方法允许对移液管相对于给定耗材中的位置精确地相对定位。
事实上,还可以使用本方法来精确地确定将图6的伺服电机609的角度转化成一个块内的相对坐标的参数。在存在有臂部扭曲、弯曲、角度测定的缺陷、臂部的大小和尺寸不准确、组装误差的情况下,这种方法具有精确提高机械精度的优点,并且通常能提高再现性。总之,伺服电机角度的非线性的、不可逆的转化成真实空间中的摄像机位置取决于大量的外部参数,但这些外部参数是遵循基本三角法则的已知解析函数。然而,当局部计算时,这些参数中的许多参数会更加准确,例如,臂部的弯曲可以随着臂部构造(例如,臂部延长)的函数的变化而变化。在此所公开的方法是基于块911的多个图像(类似于图9的图像),其中这些图像移动了对于任何电机的已知的、局部的角度量,本方法允许创建一个在摄像机图像内测量的条形码的位置和角度的图像数据集。对于单一图像,使用之前所解释的参数,通过最小二乘法最小化算法,可以使在条形码坐标系912和907中的摄像机的理论位置和实际距离之间的距离最小化,因此,能够创建及在之后使用最优的局部转换。这个程序可以在臂部操作期间例如由理论位置和实际位置之间的较大差异被触发而随着时间快速地进行重复,以使系统保持高度的可重复性。图11示出了残差的实例,该残差可以通过单独改变图6所示的三个伺服电机609的角位置来获得,以获得一定数量的角设置(如图标所示,每个交叉线对应于一个单独电机的角度的修正)。图中的箭头表示残差,其定义为在已经应用先前提到的最小化程序之后,预期位置与摄像机测量的实际位置之间的偏差。箭头(放大了5倍,以使它们在图中可见)的大小表示系统定位中的误差。在此所述的方法可以将系统空间精度提高6倍,从而使平均残差从6mm(主要由机械系统和电子设备的精度决定)降低到小于1mm。
吸头识别和定位的详细描述
液体处理仪器的特定问题是需要识别、定位、计算和处置称为吸头的液体处理耗材。许多不同类型的吸头以及典型的液体处理操作意味着在每个液体分配步骤之后对吸头进行废弃,以避免进一步污染。无论是手动操作还是自动化系统进行的液体处理,即使是对于相对简单的方案,其结果都是相当复杂的后勤。特别是,在实际进行操作之前,在一些规定中,移液管吸头在消毒和污染方面还具有严格的要求,结果是典型的实验室具有非常复杂的吸头管理后勤,这是由多种吸头类型、每个吸头对于每个设备和制造商的兼容性、以及与吸头相关的规格和包装的兼容性引起的。实质上,所有的仪器制造商给用户提供他们自己的吸头架(吸头架是将吸头组织在规则矩阵中的结构的统称),并且尝试提供可能的最大范围选择,以允许在任何仪器上进行任何操作。因此,吸头供应对于用户和仪器供应商来说变成了昂贵的活动。
在本文中,我们描述了一种新颖方案,该方案允许我们的机器人使用任何已经在实验室中使用的吸头。该方案完全独立于吸头架,例如含有吸头的托架。该方案还允许唯一地识别吸头,并且还允许知道吸头架中哪些吸头是可用的而不存在使用未使用的且新的吸头架启动操作的需求(即,大多数仪器所要求的需求)。以此方式,客户可以实现显著的经济性,同时还能在使用机器人的高质量耗材中获得最大的灵活性。
该方案在于利用俯视视觉来识别和定位吸头,例如通过图7的摄像机711来实现吸头的识别和定位。任何吸头架都可以像图11所示的吸头架那样定位在多米诺块中,该多米诺块实质上是能够承载绝大多数市面上销售的吸头架的简单盒子(可能具有防滑垫表面,以避免吸头架本身随着时间推移而进行所不希望的运动)。购买将吸头耗材组织在微孔板槽的相同几何构造中的吸头架很常见,例如隔开9mm的12×8吸头的矩形阵列。采用这样的构造,以便在我们需要处理如下各个方面时能够有效地使用吸头:吸头类型的识别、可用吸头的识别、与移液管末端接触的吸头上部的高度的确定。即使这些操作可以通过直接的图像处理(例如,用于识别形状和结构的基于视觉的算法)来进行,但是难以足够强大到能够对未知假定的数百个不同的构造和设计进行处理。
我们基于视觉的方案在于将两个按钮1101和1102插入到吸头架中。这两个按钮可以由用户在执行实验之前插入,也可以在对吸头进行高压灭菌以便进一步再使用之前插入,或在制造时插入。可以以不同的方式制造这两个按钮:作为将插入到对应类型吸头中的简单软木,或作为类似于吸头上部并具有大约相同外径的钝态短柱。按钮的顶部处需要条形码或类似的光学标记,该条形码是通过安装在臂部上的俯视摄像机来进行识别和定位的简单而稳健的方案。使用二维码的优点在于具有以下事实:它们会自动提供用于抓握吸头的精确竖直位置,并且还会提供正确的横向比例用于识别图像中的转换比例,从而允许重建空间尺寸。空间坐标需要用于以下两个方面:一是指导臂部的运动以便抓握吸头,二是计算和确定可用吸头的数量以及它们的定位。事实上,将会使用条形码1101和1102来限定吸头架的存有吸头的区域。在图11的实例中,位于由作为拐角的两个按钮限定的矩阵中的所有34个吸头会变成臂部拾取吸头的区域,该区域在图中用虚线矩形周界1103突出显示。对于本领域任何技术人员明显的是,选择合适的拐角则允许选择待使用的吸头架区域,并允许对可用吸头的数量进行计数(通过吸头之间的已知间距)。同样,条形码的内容会给系统提供关于寄存在特定架子中的吸头的类型的信息。在此利用两个条形码所描述的方法可以很容易地扩展到多个条形码和用于表示架子的用于吸头取出的可用部分的不同方法。因此,这种方法提供了在大致通用的吸头架中定位、识别以及计算吸头的方式,相同的原理还可用于部分信息的提取,例如与吸头识别方法相结合来发现吸头格式中的可能的孔(作为假设,在位置1104上缺少吸头)。
应当注意的是,相同的方法可以应用于不同类型的耗材,这意味着拾取操作具有同等优点:例如,在相同方法论的条件下,可以考虑使用用于液体处理目的的针。
软件界面的详细描述
软件界面(其为通称)构成了液体处理机器人的重要元件,该软件界面通常包括:软件包,该软件包用于与摄像机、致动器以及电子设备进行通信、用于控制和同步摄像机、致动器以及电子设备的操作、用于处理将发送和收集的信息、特别是用于与用户和外部信息源(例如,网站和服务器)进行交互。与用户的交互包括:在系统的可编程性方面,以及提供涉及液体处理过程的反馈方面,包括它的执行性能、故障、检查点。在一个可能的实施例中,通过USB控制液体处理机器人的摄像机和致动器,并且将USB集线器定位在主体的内部。在该实施例中,单一的USB连接线可以将构成用户界面的个人电脑或平板电脑与液体处理机器人本身相连接。在其他实施例中,出于避免必须要物理连接的目的,可以使用Wi-Fi连接。因此,控制软件可以利用USB驱动器和利用出于将开发降到最低目的的设置有单独元件的软件开发工具包,以及利用用于视觉处理和用于逆变换的类似一体化现有软件包,以对于移液管的给定位置(在角度和空间方面)确定一组致动器角度。
用户界面构成了软件的重要方面。摄像机能够捕捉过程的真实图像的实用性提出了使用基于虚拟现实的方法,其中在控制系统的屏幕上给用户提供信息,该信息部分产生于真实图像而部分来自于合成信息。以此方式,可以以用户更易掌握的方式遵守原始方案,从而提高操作者操作的过程并将可能的故障降低到最小。
在液体处理步骤的执行期间,软件界面还可以与用户进行交互。例如,方案可以规定机器人本身不能执行特定液体处理步骤,或类似分光谱测量、相分离、显微镜检查等操作。因此,软件界面将会触发对用户的干预(或简单地等待用户的干预),例如通过视觉指示器、挥动手部、听觉信号、电子邮件、SMS或给用户打电话。
软件的目的并不限于执行方案,它还能扩展到例如以提高硬件性能为目的的其他操作。例如,在本领域中公知的是,精确的移液管性能需要相同的频繁的校准,即涉及环境参数以及它们使用的性能。液体处理机器人可以以如下方式由软件控制来执行移液管校准程序:例如重复应用到耗材中的足够数量的分配步骤,以及监控(通过重量、比色法、荧光或类似技术)表示所分配体积的物理参数。应当注意的是,在液体处理机器人中,因为为了实现所需的体积,软件能够自动定义校准表并因此获知将要设置的实际体积,所以对物理调整移液管校准刻度没有严格要求。
现在已经描述了本发明的几个实施例,本领域技术人员应当明白的是,上述实施例仅仅是说明性的,而不是限制性的,它们仅作为示例的方式提出。许多修改和其他实施例都在本领域普通技术范围之内,并落入由所附权利要求及其等同物限定的本发明范围之内。本申请中所引用的任何参考的内容通过引用的方式并入本文。对于本发明及其实施例,可以选择使用这些文件的适当组件、程序以及方法。
Claims (62)
1.一种用于处理生物或化学流体的装置,包括:
多个移液管;
至少一个机械臂,以操纵至少一个移液管;以及
软件界面,其控制所述移液管的操纵。
2.根据权利要求1所述的装置,其中,
通过计算机视觉辅助所述操纵。
3.根据权利要求2所述的装置,其中,
通过视觉反馈辅助移液管体积的设置。
4.根据权利要求2所述的装置,其中,
通过视觉反馈辅助所述移液管的处理。
5.根据权利要求1所述的装置,其中,
所述多个移液管还能够用于手动液体处理操作。
6.根据权利要求1所述的装置,其中,
所述软件界面允许用于液体处理方案的编程。
7.根据权利要求1所述的装置,其中,
移液管的数量大于或等于一并且小于或等于六。
8.根据权利要求1所述的装置,其中,
所述机械臂的操纵包括所述移液管的运动、吸头插入和弹出、所需体积的设置、液体的抽吸和分配。
9.根据权利要求8所述的装置,其中,
通过一系列的抽吸和分配对所述移液管进行操纵允许进行液体的混合。
10.一种用于处理生物或化学流体的装置,包括:
摄像机,其安装在移动臂上并且能够成像;以及
平台区域,其包括多个耗材,
其中,由所述摄像机拍摄的所述平台区域的图像允许识别所述耗材并且相对于所述耗材定位所述移动臂。
11.根据权利要求10所述的装置,其中,
所述摄像机是立体摄像机。
12.根据权利要求10所述的装置,其中,
从多个位置或角度拍摄所述摄像机图像,从而允许通过所述图像的差异化分析来识别和定位所述耗材。
13.根据权利要求10所述的装置,其中,
微孔板被识别为两边具有预定比例的矩形。
14.根据权利要求10所述的装置,其中,
不同移液管的吸头根据通过成像测定的吸头直径来识别。
15.根据权利要求10所述的装置,其中,
使用所述图像的焦距信息来提取所述耗材的高度信息。
16.根据权利要求10所述的装置,其中,
不同耗材的精确彩色图用于识别耗材的目的。
17.根据权利要求10所述的装置,其中,
耗材通过定位在耗材托架上的标签来识别。
18.根据权利要求10所述的装置,其中,
通过所述图像内的标签的缺失评估耗材的存在。
19.根据权利要求10所述的装置,其中,
通过所述图像内的标签的重建位置、定向和尺寸中的至少一个属性提取所述移动臂相对于耗材的相对位置。
20.根据权利要求19所述的装置,其中,
所述标签是条形码。
21.根据权利要求19所述的装置,其中,
从已知真实尺寸的标签的图像中的外观尺寸重建从所述耗材到所述摄像机的距离。
22.根据权利要求19所述的装置,其中,
从具有已知距离的标签的外观相互距离来测量从所述耗材到所述摄像机的距离。
23.根据权利要求19所述的装置,其中,
从所述图像内的一个或多个标签的外观位置来测量所述摄像机相对于所述耗材的横向位置。
24.根据权利要求19所述的装置,其中,
通过所述图像内的单一标签的位置、尺寸和定向重建所述相对位置。
25.根据权利要求19所述的装置,其中,
从标签的所述相互距离提取关于所述耗材可用性的信息。
26.一种用于处理生物或化学流体的设备,包括:平台区域,所述平台区域包括在给定位置中的多个耗材,
其中,所述给定位置被组集成灵活有序的构造。
27.根据权利要求26所述的设备,其中,
灵活性在于耗材定位的数量和位置。
28.根据权利要求26所述的设备,其中,
所述有序的构造在于包括所述定位的限定定向。
29.根据权利要求26所述的设备,其中,
所述有序的构造通过磁力或机械键来实现。
30.根据权利要求26所述的设备,其中,
所述平台在所述设备本身的外面。
31.一种用于处理生物或化学流体的装置,包括:用于承载多个耗材的平台,
其中,所述平台是可折叠的类型或自组装的类型。
32.根据权利要求31所述的装置,其中,
所述平台相对于实验台是保形的。
33.根据权利要求31所述的装置,其中,
所述平台具有向用户表示耗材最佳定位的印刷信息。
34.一种通过机械臂操纵移液管来执行液体处理的方法,包括:
通过所述机械臂抓握移液管,
设置所述移液管的所需体积,
通过所述机械臂插入吸头,
通过所述机械臂弹出吸头,
通过所述机械臂移动所述移液管,
通过所述机械臂抽吸液体,以及
通过所述机械臂分配液体。
35.根据权利要求34所述的方法,其中,
执行分配时无需将所述吸头浸入到目标样品中。
36.一种用于液体处理机器人中的移液管的容积校准的方法,包括:
将多个预设体积的样品分配到至少一个耗材中;以及
估计被分配的样品的实际体积,
其中,将随后的校准想法并入到软件界面中而不对移液管进行物理修改。
37.一种用于改善液体处理机器人中的移液管的容积再现性的方法,包括:
致动用于抽吸和分配的拇指动作;
监控拇指位置、压力和速度中的至少一者;以及
将拇指位置、压力和速度中的至少一者调制为液体体积的函数和被使用液体的函数。
38.根据权利要求37所述的方法,其中,
所述拇指速度是所述拇指位置的函数。
39.根据权利要求37所述的方法,其中,
根据权利要求36所述的方法校准所述移液管。
40.一种用于改善液体处理机器人的容积再现性的方法,包括:至少一个测量湿度或温度或压力的传感器;
其中,容积校准基于传感器的信息。
41.一种用于操纵液体处理机器人中的移液管的方法,包括:
测量拇指压力作为拇指位置的函数;以及
控制拇指的位置和速度,以确定正确的拇指动作来进行抽吸和分配。
42.一种用于处理生物或化学流体的方法,包括:
通过摄像机对移液管吸头进行成像,所述移液管吸头对于光线至少部分透明,
其中,所形成的图像能够估计所述吸头中所含的实际液体体积。
43.根据权利要求42所述的方法,其中,
简单地存储所述图像,以在无需联机处理的情况下用于可能的后验检查。
44.根据权利要求42所述的方法,其中,
自动处理所述图像以用于液面检测。
45.一种用于处理异构生物流体的方法,包括:
通过液体处理机器人操纵移液管;
使用摄像机对吸头位置进行成像;以及
使用摄像机对所述生物流体内的分离进行成像,
其中,出于对分离的生物流体成分的抽吸和分配的目的,使用所述吸头相对于所述生物流体成分的相对位置来控制所述移液管的操纵。
46.根据权利要求45所述的方法,其中,
所述异构生物流体是分离的血液。
47.一种用于处理液体处理机器人中的生物或化学流体的方法,包括:
通过摄像机对移液管吸头和耗材进行同时成像,
其中,所形成的图像能够确定所述吸头相对于所述耗材的相对位置,以操纵所述移液管。
48.根据权利要求47所述的方法,
其中,使用了焦距信息。
49.根据权利要求47所述的方法,
其中,从连接至所述耗材的标签提取所述吸头的位置信息。
50.根据权利要求47所述的方法,
其中,所述摄像机是立体摄像机。
51.根据权利要求47所述的方法,
其中,利用所述摄像机相对于所述耗材的位移或倾斜所获得的多个图像来获得立体信息。
52.一种用于确定容器所含液面的方法,包括:
在目标未接触液体时,使用摄像机对所述目标进行成像;
使所述目标接近所述液面;以及
在所述目标即将与所述液面接触时,对所述目标进行成像,
其中,图像中的相对差异确定所述液体和所述目标之间发生接触。
53.根据权利要求52所述的方法,
其中,所述目标是吸头。
54.根据权利要求52所述的方法,
其中,所述液体或所述目标的图像因为光线内反射而变化。
55.根据权利要求54所述的方法,
其中,所述光线是由发光二极管或激光所产生的。
56.一种用于确定关于吸头架中的吸头的信息的方法,包括:
使用摄像机对吸头架进行成像;
识别定位在所述吸头架的吸头位置上的一个或多个标签;以及
处理一个或多个标签的位置,以获得空间信息,
其中,所述空间信息能够重建可用吸头的数量和位置。
57.根据权利要求56所述的方法,其中,
所述标签允许根据它的外观尺寸重建图像的空间比例。
58.根据权利要求56所述的方法,其中,
所述吸头被组织在阵列中,所述阵列具有在值2.25mm、4.5mm和9mm中选取的间距。
59.根据权利要求56所述的方法,其中,
所述标签代替所述吸头架内的一个或多个吸头。
60.根据权利要求56所述的方法,其中,
所述标签与所述吸头架内的一个或多个吸头相连接。
61.根据权利要求56所述的方法,其中,
通过具有至少一个由标签限定的拐角的多边形边界限定可用吸头的数量和位置。
62.根据权利要求56所述的方法,其中,
在图形图案、条形码、二维码、光源、彩色目标中选取所述标签。
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