BG107275A - Селективно антитяло за свързан с туморнекрозисния фактор лиганд рецептор, причиняващо апоптоза, и използването му - Google Patents

Description

ОБЛАСТ НА ТЕХНИКАТА

Настоящото изобретение се отнася до антитяло, поддаващо се на специфично свързване с единичен тип свързан с тумор-некрозис фактора (тук обозначено като “TNF” - tumor necrosis factor) лиганд рецептор, причиняващ апоптоза (тук обозначено като “TRAIL” - TNF related apoptosisinducing ligand), по специално до моноклонално антитяло, което причинява апоптоза в клетки in vivo и in vitro, проявяващи единичния тип рецептор и терапии базиращи се на това.

ПРЕДШЕСТВАЩО СЪСТОЯНИЕ НА ТЕХНИКАТА

TRAIL е елемент от семейството на TNF протеините, които включват също така TNF-α и Fas лиганд (1). Тези протеини са мощни причинители на апоптоза. До момента са идентифицирани пет рецептора за TRAIL, два от които DR4 (TRAIL-R1) и DR5 (TRAIL-R2) (2-7) могат да преобразуват сигнала за апоптоза, докато другите три DcRl (TRAIL-R3), DcR2 (TRAILR4) и остеопротегерин (OPG) не преобразуват сигнала за апоптоза (8-12). Всичките пет рецептора за TRAIL имат обща отличителна хомология на техните екстрацелуларни лиганд свързващи области. Подобно на Fas и TNF рецептора I (тук наречен “TNFRI”) интрацелуларните сегменти на DR4 и DR5 съдържат мъртва област и преобразуват сигнала за апоптоза през пътека, която обхваща Fas - свързания протеин на мъртва зона (тук наречен “FADD”) и каспаза 8 (6, 7). В добавка към преобразуването на сигнала за апоптоза рецепторите DR4 и DR5 могат също така да активират пътека, която обхваща NFkb (6, 7).

Показаните биологичните функции на TRAIL включват способността на TRAIL селективно да причинява апоптоза на трансформирани туморни клетки с нормални клетки, които са съответно резистентни на TRAILмедиираната апоптоза (13-15). Тази селективност подсказва, че за разлика от Fas лиганда приложението на TRAIL е свързано с много ниски нива на токсичност, както е показано чрез физиологичното приложение на TRAIL при животински модел без да се причини значителна токсичност (13). Така TRAIL се явява мощен агент за причиняване на апоптоза, подходящ за лечение на рак и други заболявания, свързани с абнормална клетъчна пролиферация. TRAIL се явява също така мощен агент за причиняване на апоптоза, подходящ за лечение на автоимунни и възпалителни заболявания. Беше показано, че TRAIL-медиираната апоптоза участва в активно причинената клетъчна смърт на Т клетки и служи като алтернативен механизъм на Fas лиганд (16, 17). TRAIL-медиираната апоптоза може също да функционира при причиняването на апоптоза на T клетки и други възпалителни клетки (18), играе роля при унищожителната активност на NK клетките (19-21) и има имуномодулаторната функция на дендритни клетки (22, 23). Така TRAIL-медиираната апоптоза може да функционира също при имунопривилегороване и имунонаблюдение.

Системата TRAIL рецептор е комплексна и включва поне два рецептори на смъртта DR4 и DR5 и поне два не-апоптонични рецептора DcRl и DcR2. Всички тези рецептори имат не само обща висока хомология на аминокиселинна последователност, но също проявяват и сходен афинитет за свързване с TRAIL (2-12). Способността на рецепторите DcRl и DcR2 да се съревновават за свързване с TRAIL, без причиняване на апоптоза подсказва, че те могат да действат като рецептори-примамки, които блокират или модулират активността на TRAIL лиганд. Освен това бе съобщено, че нетрансформираните клетки проявяват по-високи нива на рецептори - примамки, отколкото трансформираните клетки. Поради тази причина се предполага, че диференциалната модулация на експресията на рецепторите на смъртта и рецепторите-примамки може да представлява

ключов регулиращ механизъм, който да определя податливостта на клетките към TRAIL-медиираната апоптоза поради на липсата на моноклонални антитела със специфични рецептори (2). Въпреки, че експресията и функциите на DR4 и DR5 са изследвани дълго, липсата на моноклонални антитела със специфични рецептори пречи на по-нататъшното развитие. Експресията на клетъчната повърхност на DR5 не е документирана. Съобщава се, че е генериран панел от анти-TRAIL рецептор антитела, които могат да причинят апоптоза при клетки на меланома in vitro, но само след имобилизация на антителата, да се повиши на крослинкинга, като в някои случаи клетките изискват култивиране с актиномицин D (24). Генерирани са няколко антитела aHTH-DR5 (24). Въпреки това, генерираните преди моноклонални aHTH-DR5 антитела имат ниска активност при причиняване на апоптоза in vitro, дори и при условията на крослинкинг. Не се съобщава за активност in vivo. Тези антитела не са използвани за изследване на експресията на клетъчната повърхнина на TRAIL рецептори (24). Така че налице е необходимост от селективно моноклонално антитяло за всеки специфичен TRAIL рецептор, което може не само да се свърже с рецептора на клетъчната повърхност, но и мощно да причини апоптоза при различни видове абнормални клетки, включително туморни клетки както in vivo, така и in vitro без необходимост от крослинкинг или имобилизация. Такъв вид антитела не само ще представляват потенциален терапевтичен агент, но също така могат да намерят приложение като диагностично средство за функционален анализ на TRAIL рецептор. Определено съществува необходимост от антитела, специфични за всеки от рецепторите на смъртта DR4 и DR5.

По време на развитието или прогресията за много заболявания често се случва клетките да не се унищожават. При много автоимунни заболявания и възпалителни състояния клетките, активиращи оцеляването атакуват нормалните тъкани или клетки. По-нататъшното развитие на туморогенезиса и пролиферативното образуване на панус при ревматоидния артрит се характеризират с неконтролирана пролиферация на клетките. Така

недостатъчната апоптоза води до развитие на заболяването и използването на лиганд, причиняващ апоптоза или агонистично моноклонално антитяло за усилване на апоптозата се считат за потенциална терапевтична стратегия за елиминиране на тези нежелани клетки.

Например ревматоидния артрит (оттук нататък ще го наричаме “RA”) е срещано човешко авто-имунно заболяване. Установеното схващане за патофизиологията на RA е, че авто-имунните Т клетки и В клетки поставят началото на възпалителна реакция в ставите, което задейства хиперпролиферация на синовиосите. Като резултат от хиперпролиферацията на синовиалните клетки металопротеините (тук наричани “MMPs”) се свръхпроизвеждат, което по-нататък води до ерозивно разрушаване на хрущяла и костта, което от своя страна е характеристика на RA (25). Така контролът на хиперпролиферацията на възпалителните синовиални клетки е ключова стъпка при лечението на RA. Молекулярният механизъм за хиперпролиферацията на синовиалните клетки е все още непознат. Въпреки, че хиперпролиферираните синовиални клетки не са злокачествени и не са трансформирани, в много научни статии се предполага, че те имат общи признаци с трансформираните клетки (46). Тези клетки, така наречените “проявяващи трансформация синовиосити” се отличават с плътен неравен ендоплазмичен ретикулум, множество неправилни нуклеи и промени във вретеновидно оформения скелет на клетката. Предполага се, че обединяването на онкогените и гените с вирусен произход може да бъде първоначалният тласък за трансформирания вид на RA синовиални клетки (46).

Поне два аспекта на RA подсказват че дисрегулираната апоптоза може да допринесе до болестен процес и това терапевтично предизвикване на апоптоза може да бъде ефективно лечение: неуспехът за премахване на активираните Т-клетки подсказва, че е налице погрешна активно причинена клетъчна смърт на тези Т-клетки, което е процес, който обхваща Fasмедиираната апоптоза, а хиперпролиферативното естество на RA синовиалните клетки е спомагателен фактор в по-късните стадии на RA

патофизиологията. Доказано е наистина, че приложението на антитяло анти - Fas при възпалена става възпрепятства развитието на хроничен артрит при опитните трансгенетични мишки, което е животински модел на човешки RA (26). Освен това локализираната трансдукция с Fas лиганд ген чрез аденовирусен вектор е ефективна при превенцията на колагенно причинени артрити (27). Възпрепятстването на пролиферацията на възпалените синовиални клетки чрез увеличаването на Fas-медиираната апоптоза са наблюдава и при двата случая. Въпреки, че Fas лиганд е мощен причинител на апоптоза при RA синовиални клетки прилагането на терапия при хора с Fas-медиираната лиганд апоптоза е ограничена поради леталната токсичност за черния дроб. Така апоптозата, причинена чрез TRAIL рецептор представлява по-безопасна и по-ефективна терапия за лечение на RA, отколкото апоптоза, причинена чрез Fas лиганд.

Апоптозата, причинена чрез TRAIL рецептор представлява също така по-безопасна и по-ефективна терапия за лечение на рак, отколкото апоптозата, причинена чрез Fas лиганд. TRAIL-медиираната апоптоза е известна като специфично причинена апоптоза на трансформирани туморни клетки, без да се засягат нормалните клетки. Показано е, че системното приложение на тримеризиран разтворим TRAIL, който не причинява токсичност при експерименталните животни може да причини регресия при имплантираните тумори (13, 28). Неговият потенциал като допълнителна терапия към традиционните методи за лечение се подсилва и от последните заключения, че експресията на DR5 и възприемчивостта към апоптоза, причинена чрез TRAIL при гръдните ракови клетки се увеличава от радиацията, което показва, че в комбинация с радиация при лечение на рак ефективността на TRAIL би се увеличила (29).

Като допълнение генното кодиране на TRAIL рецептор DR5 е картографирано на хромозома 8р21-22, разположение с висока честота на мутации при някои ракови клетки (30). Съобщава се, че поне два вида туморни клетки, при рак на белите дробове (31) и рак на главата и шията (32) проявяват мутации в мъртвия домейн на гена DR5. Така съществува необходимост от антитела анти4Ж5 за изследването на рака, за се определи ефекта от промените в епитопа на рецептора при развитието и прогресията на рака. Освен това функционалността на мутациите на TRAIL рецептора може да се окаже полезно клинично диагностично средство, ако се използва заедно с други био-маркери за ранно откриване на рак и като предвестник на туморна агресивност.

ТЕХНИЧЕСКА СЪЩНОСТ НА ИЗОБРЕТЕНИЕТО

Разкрито е антитяло, което разпознава TRAIL рецептор DR5 и което причинява апоптоза в клетки, проявяваща DR5 in vivo. Допълнително е разкрито антитяло, което разпознава DR5 без да разпознава нито DR4, нито DcRl и DcR2. Подробно е описано моноклонално антитяло, произведено от хибридома.

Методът, предмет на изобретението позволява възпрепятстване на клетъчна пролиферация чрез излагане на клетката на терапевтично количество от антитяло, способно да се свързва с DR5. Също така е разкрит фармакологичен състав, който включва терапевтично количество моноклонално антитяло, активно срещу DR5, фармацевтично приемлив носител и контейнер, съдържащ антитялото и носителя. Освен това изобретението описва използването на антитяло, разпознаващо DR5 за подготвяне на терапия за селективна апоптоза при абнормални или дисрегулирани клетки.

Антитялото, описано в настоящето изобретение си взаимодейства с лиганд рецептор на тумор-некрозис фактор, като DR4, DR5, DcRl, DcR2 и OPG, причинявайки апоптоза на клетки, проявяващи този рецептор. Разкрито е антитяло, което може селективно да се прикрепва към епитопа на лиганд рецептора на тумор-некрозис фактор.

Настоящото изобретение представя лечение на заболявания, свързани с апоптоза чрез метод, който включва излагането на определена тъкан, имаща свързано с апоптоза заболяване на терапевтично количество от антитялото от изобретението.

Описан е синтезиран протеин, който включва аминокиселинна последователност на антигенен TRAIL рецептор, имащ поне десет бази, сдвоена към протеин имуноглобулин или фрагмент от него, способен да извлича имунен отговор от субекта.

Настоящото изобретение представя метод за генна терапия, при която клетка-примамка се пренася чрез нуклеотидно киселинна последователност на TRAIL рецептор във вектор експресия, така че TRAIL рецепторът се проявява на клетката-примамка. След това клеткатапримамка се излага на антитяло, което селективно се прикрепва към TRAIL рецептора.

Представени са нуклеотидно кииселинни и аминокиселинни последователности, кодиращи тежките и леките вериги имуноглобулини на антитялото, което е селективно към DR5. Подробно са описани също така

вектори, които включват нуклеотидно киселинната последователност от изобретението и клетки гостоприемник, трансформирани с вектора от изобретението.

Настоящото изобретение представя клетка гостоприемник, произвеждаща хуманизиран TRA-8.

Описан е процес за произвеждане на хуманизирано DR5 антитяло, при който гостоприемника е трансформиран чрез нуклеотидно киселинни последователности, кодиращи лека верига на хуманизиран имуноглобулин и тежка верига на хуманизиран имуноглобулин, след което трансформирания гостоприемник се инкубира за предварително определен период от време.

Описан е също така процес за възпрепятстване на клетъчна пролиферация, който включва контактуването на клетка-примамка с фармацевтично ефективно количество от хуманизирано антитяло DR5.

Представено е търговско оборудване на причиняване на клетъчна смърт, което включва хуманизирано антитяло TRA-8, селективно към DR5, пакетирано в подходящ контейнер заедно с инструкции за употреба.

ОПИСАНИЕ НА ПРИЛОЖЕНИТЕ ФИГУРИ

Фигура 1: Характеристика на TRA-8. (а) Способност за прикрепване на TRA-8: Анализ Western blot (горен панел): Рекомбинантни синтезирани протеини от семейството на TNFR, изпитани с TRA-8 или анти-човешки IgG. Позиция 1 - DR5/hIgGl синтезиран протеин (имуноген); Позиция 2 DR4/hIgGl (TRAIL-R1); Позиция 3 - DR5/hIgGl; Позиция 4: TRAIL-R3 (DcR-l)/hIgGl; Позиция 5: TRAIL-R4(DcR-2)/hIgGl; Позиция 6: CD95/hIgGl; Позиция 7: разтворим TNFRI. Анализ ELISA (долен панел): Позициите отговарят на тези от Western blot, освен номер 8, която е миши DR5/hIgGl синтезиран протеин. (Ь) Свързваща активност на разтворим TRAIL и TRA-8 към DR5 и DR4: Върху съдовете ELISA са нанесени DR5/hIgGl (ляв панел) или DR4/hIgGl (среден панел) и след това инкубирани с TRAIL или TRA-8. (с) Течен цитометричен анализ на повърхностната експресия на DR5. Клетките cos-7, пренесени чрез вектора експресия pcDNA3, съдържащ пълната дължина DR5 cDNA (защрихована хистограма), DR4 cDNA (не защрихована хистограма, непрекъсната линия) или празен вектор (не защрихована хистограма, прекъсната линия). Четирийсет и осем часа след пренасянето клетките са оцветени с TRA-8, последван от PE-свързан анти-миши IgGl. (d) Действителна имунохистохимична реактивност към DR5: Цитоспин пластове от Cos-7 клетки, пренесени чрез експресия DR5 или контролен вектор, оцветени с TRA-8 48 часа след пренасянето, (е) Унищожителна способност на TRA-8: инкубирани са Jurkat клетки с посочените концентрации TRA-8. Жизнеспособността на клетките е определена чрез изключващите анализи ATPLite, МТТ и PI след култивиране за една нощ. Резултатите от анализите ATPLite и МТТ са представени като процент от контролната среда, а резултатите от анализа PI като процент от PI отрицателни клетки, (f) Анализ Western blot на каспаза активност: Jurkat клетките са инкубирани с 500ng/ml TRA-8 за определено време. Клетъчните лизати са разделени чрез

15% SDS-PAGE, замърсени и изпитани с анти - каспаза антитела. Стрелките посочват прилепените подединици на всяка каспаза. (g) Анализ на инхибирането на каспаза: Jurkat клетките са инкубирани с 50ng/ml TRA-8 за една нощ при наличието на различни концентрации от посочени каспаза инхибитори. Жизнеспособността на клетките е определена чрез анализа ATPLite.

Фигура 2: Експресия на клетъчна повърхност на DR5 и податливост на DR5-MeflHHpaHa апоптоза. Клетъчни линии от нормални Т и В клетки, току-що изолирани от периферална кръв, Т клетки (а и а’), глиома (Ь и Ь’), клетка от рак на простата (е) и В клетка (d) са инкубирани с TRA-8 или мише IgGl контролно изотопно антитяло, следвани от PE-съединени кози анти-миши IgGl. Не защрихованите хистограми представят контролното изотопно антитяло, а защрихованите хистограми представят оцветяването с TRA-8. Апоптозата е определена чрез анализа ATPLite след инкубация за една нощ с разтворим TRAIL (бели точки) или TRA-8 (черни точки), както е показано в a, b’ nd.

Фигура За’: Клетъчна линия на Т клетка U937 е инкубирана с TRA-8 или мише IgGl контролно изотопно антитяло. Апоптозата е определена чрез анализа ATPLite след инкубация за една нощ с разтворим TRAIL (бели точки) или TRA-8 (черни точки).

Фигура 3: Клетъчни линии от глиома (Ь) и рак на простатата (с) са инкубирани е TRA-8 или мише IgGl контролно изотопно антитяло. Апоптозата е определена чрез анализа ATPLite след инкубация за една нощ с разтворим TRAIL (бели точки) или TRA-8 (черни точки).

Фигура 4 представлява серия графики, показващи клетъчната жизнеспособност на човешки Jurkat клетки след излагането им на посочените концентрации на (А) видове антитела TRA-1, -8 и -10 и (В) TRAIL при наличието на фиксирани концентрации на видове от изобретеното антитяло, изобразено на фигура 4А.

Фигура 5: Експресия на DR5 при нормални и ракови тъкани: Хомогенезата при нормални и ракови тъкани е изследвана с TRA-8 и установена чрез хемилуминисценция. (а) Анализ Western blot на протеин DR5 при нормални тъкани; Позиция 1 - яйчник; позиция 2 - мозък; позиция 3 - бял дроб; позиция 4 - бъбрек; позиция 5 - далак; позиция 6 - тестиси; позиция 7 - яйчник; позиция 8 - сърце; позиция 9 - панкреас. (Ь) Анализ Western blot на протеин DR5 при ракови тъкани. Изпитани са петна от ракова тъкан, съдържаща рак от яйчник (позиция 1), бял дроб (позиция 2), черен дроб (позиция 3), ректум (позиция 4), шийка (позиция 5), кожа (позиция 6), тестиси (позиция 7), щитовидна жлеза (позиция 8), матка (позиция 10), стомах (позиция 11), ларингофаринкс (позиция 12) и панкреас (позиция 13). Имунохистохимия на нормални човешки тъкани (с) и ракови тъкани (d). Замразените секции са имунооцветени с TRA-8.

Фигура 6: Туморна активност на TRA-8. SCID мишки са ваксинирани подкожно с клетки 1321N1. Мишките са инжектирани интравенозно с единична доза от 100 μ g TRA-8 на втория ден след туморното ваксиниране (а) или с три дози от 100 pg TRA-8, започвайки 7 дни след туморното ваксиниране (Ь). Растежа на тумора е определен чрез претегляне и изследван хистологично чрез Н&Е оцветяване. Снимките показват жизнеспособен прираст на тумора при контролните мишки, но не и при мишките, третирани с TRA-8 (с., горен панел) и Н&Е оцветяването на тумора (с., долен панел). SCID мишките са инжектирани интравенозно с 10⁶ Jurkat клетки и са третирани с единична доза TRA-8 на втория ден след инжектирането. Седем дни по-късно клетките на далака са отделени, оцветени с анти-човешко CD3 антитяло и анализирани чрез течен цитометричен анализ (d) или чрез имунохистохимия (е).

Фигура 7 показва експресия на клетъчна повърхност на DR5 в RA (А) и ОА (В) синовиални клетки. Първично култивирани синовиални клетки 1 X 10⁶ са оцветени с афинитетно пречистен TRA-8, последван от РЕсвързано козе анти-мише IgGl антитяло. Чрез FACSvantage са анализирани 10 000 жизнеспособни клетки.

Фигура 8 представлява серия графики, показващи клетъчната жизнеспособност като функция на причинената апоптоза чрез концентрации от TRAIL и TRA-8 на характерни видове от RA (А) и ОА (В) синовиални клетки с различни концентрации на рекомбинантен разтворим TRAIL (бели точки) или афинитетно пречистен TRA-8 (черни точки). Клетъчната жизнеспособност се изразява като процент от срт на третираните клетки спрямо срт на нетретираните клетки.

Фигура 9 представлява серия графики, показващи зависимостта на каспаза от DR5-мeдииpaнaτa апоптоза при RA синовиални клетки. Инкубирани са RA синовиални клетки (RA512) с 50 ng/ml разтворим Fas лиганд (бели квадратчета), анти-Fas антитяло (СН-11) (черни квадратчета), разтворим TRAIL (бели точки) или анти-ОИЗ антитяло (TRA-8) (черни точки) при наличието на различни концентрации от каспаза инхибитори. След една нощ клетъчната жизнеспособност е определена чрез ATPLite.

Фигура 10А представлява електрофоретичен гел-шифт анализ, показващ Nfkb активност. Клетки RA1016 са инкубирани с 20 ng/ml TNF-a, 59 ng/ml разтворим TRAIL или 50 ng/ml TRA-8 за посоченото време преди да са били подложени на електрофореза. Фигури 10 В и С са графики, показващи произвеждането на ММР-1 и ММР-3. От посочените RA синовиални клетки 1X10⁶ са инкубирани с дадените концентрации на TNF-a (бели точки), TRAIL (бели триъгълници) или TRA-8 (черни точки). След като културата пренощува е отделен супернатанта, плаващ на повърхността. Нивата на MMPs в плаващите култури са определени чрез ELISA.

Фигура 11. TRA-8 не причинява хепатоцелуларна токсичност, (а) Тъкан от нормален черен дроб, която не проявява DR5. Потопени в парафин секции на две нормални тъкани от черен дроб, една хепатоцелуларна карциномна тъкан, и цитоспин препарат на HepG2 клетки, приготвени за Н&Е оцветяване и съответстващите замразени секции са оцветени с TRA-8. (Ь) Течен цитометричен анализ на експресията на клетъчната повърхност на DR5. Хепатоцити, изолирани от две нормални тъкани от черен дроб и от случай на тъкан с хепатоцелуларен карцином и клетки HepG2 са оцветени с TRA-8, анти-Fas антитяло (DX2) или контролно изотопно антитяло.

Защрихованите хистограми посочват оцветяването с TRA-8 или DX2, а незащрихованите са на съответстващите им контролни изотопи.

Фигура 12. TRAIL, а не TRA-8 причинява хепатоцелуларна токсичност. Свежи нормални човешки хепатоцити се поддържат в среда на хепатоцитна култура, (а) Апоптозата на хепатоцитите е причинена с 1 pg/ml разтворим TRAIL плюс крослинкер или TRA-8 за посоченото време. Клетъчната жизнеспособност е определена чрез ATPLite. Резултатите са представени в процент жизнеспособни клетки, сравнени с контролна среда. Защрихованите правоъгълници показват TRAIL, а черните правоъгълници посочват TRA-8. (Ь) Кондензирани нуклеи от хепатоцит са оцветени с Hoechst 33352 и анализирани чрез течна цитометрия. (с) Ефект на циклохексамид на хепатоцит апоптоза. Хепатоцитите са култивирани в контролна среда или с 1 μ g/ml TRAIL или TRA-8 при наличието (защриховани правоъгълници) или липсата (бели правоъгълници) на 1 pg/ml хиклохексимид за 8 часа. Клетъчната жизнеспособност е определена чрез ATPLite. Резултатите са представени чрез +/- SEM за трите култури при двата опита, (d) Сравняване на податливостта на нормални хепатоцити към DR5 и Fas-медиирана апоптоза. Току що изолирани хепатоцити са инкубирани с посочените концентрации на разтворим TRAIL, TRA-8, разтворим FasL или анти-Fas mAb СН11 за 6 часа. Клетъчната жизнеспособност е определена чрез анализ ATPLite. Резултатите са представени като процент жизнеспособни клетки, сравнени с контролна среда. За нормалните хепатоцити са представени mean±SEM на четири нормални индивида. Резултатите за хепатоцелуларни карциномни клетки от един пациент и клетки HepG2 са представени като средна величина за трите култури.

Фигура 13. TRAIL причинява хепатит. В6 мишки са интравенозно ваксинирани с 10⁹ pfu аденовирусен вектор, кодиращ пълната дължина на човешки TRAIL под контрола на презаписващ елемент “Tet-on”. Експресията на TRAIL е причинена от посочената доза тетрациклин. (а) Анализ Northern blot на експресията на човешки TRAIL при черен дроб. 24 часа след ваксинирането на вектора и въвеждането на тетрациклин е изолиран цял RNA от черен дроб и изпробван с човешки TRAIL cDNA или β-актин. (b) Серумни нива на AST. Серумните нива на AST са определени 24 часа след преобразуването на TRAIL, (с) TRAIL-медиирана клетъчна смърт на хепатоцити, инфектирани с аденовирусен вектор: мишки В6 са интравенозно ваксинирани с причинен от тетрациклин аденовирусен вектор. 48 часа след ваксинирането са изолирани хепатоцити от ваксинирани и неваксинирани контролни мишки и инкубирани с посочените концентрации на TRAIL за 8 часа (ляв панел). Клетъчната жизнеспособност на хепатоцитите с определена чрез анализ ATPLite. Мишки, ваксинирани с аденовирусен вектор като по-горе се инжектират интравенозно с 10 pg разтворим човешки TRAIL 48 часа по-късно. Серумните нива на AST са измерени на 24-ия час след инжектирането на TRAIL (десен панел), (d и е) Хистологичен анализ на пораженията на черния дроб, причинени от TRAIL. Дробовете са отделени 24 часа (d) или 7 дни (е) след преобразуването с TRAIL. Потопените в парафин секции са оцветени Н&Е и фотографирани при увеличение 100 пъти (горен пател) и 400 пъти (долен панел).

Фигура 14 представлява серия от графики, показващи че активираните Т клетки и В клетки, пречистени от човешки РВМС проявяват повишени нива на DR5, което е определено чрез течна цитометрия за неактивирани (незапълнена графика) и активирани (запълнена графика) клетки.

Фигура 15 представлява графика на жизнеспособността като функция на концентрациите на TRA-8 за пречистените Т клетки и В клетки, илюстрирани на фигура 14, които са били стимулирани за 48 часа с антиCD3 или анти-μ, с активирани и поразени клетки, отделени чрез различна плътност на Ficoll-Paque. Жизнеспособността е определена чрез анализ ATPLite.

Фигура 16 представлява хистограма и скица на течна цитометрия, показващи експресията на CD3 при регулирана лимфоцитна популация на

NK клетки, NOD/SCID мишки, на които е направено кръвопускане, инжектирани с човешки РВМС и TRA-8 или IgG (контролни).

Фигура 17 показва CD3 и TUNEL оцветени целуларни микрографи на тъкан от далак на мишка, както е описано в пример 13.

Фигура 18 показва цитотоксични схеми за хронична лимфолитична левкемия (CCL) и нормални В човешки клетки при наличието на TRA-8, BIS VIII и комбинациите между тях.

ПРИМЕРИ ЗА ИЗПЪЛНЕНИЕ

Неуспехът при унищожаване на клетките са дължи на недостатъци в

системата за причиняване на апоптоза, което се отдава например на експресия или функция на лиганда, рецептора или интрацелуларното регулиране и молекулите като изпълнителен орган. Настоящото изобретение предлага метод за коригиране на несъвършената система за причиняване на апоптоза, като в същото време изяснява специфични недостатъци, присъщи на тази система.

Настоящото изобретение е свързано с нов клас моноклонални антитела, които имат селективна in vivo и in vitro активност за причиняване на апоптоза срещу определени TRAIL рецептори, включително DR5, DR4, DcRl и DcR2. Настоящото изобретение има приложение като реагент при проучванията на сигнали за апоптоза, а също така като терапия, ефективна срещу клетки проявяващи TRAIL рецептори, като за пример са включени широк обхват от ракови клетки, дисрегулация на системата за апоптоза и абнормално пролиферирани синовиални клетки при автоимунни заболявания. Антителата, описани в настоящото изобретение са специфични за свързване с определени видове TRAIL рецептори въпреки хомологията между тях. Изобретените антитела позволяват целенасочена апоптоза само на тези клетки, изразяващи целевия TRAIL рецептор или алтернативно блокиращи TRAIL апоптоза на клетки, изразяващи целевия рецептор.

Ahth-DR5 моноклоналното антитяло от настоящото изобретение служи като мощен причинител на апоптоза на клетки, проявяващи DR5 in vitro и като мощен причинител на апоптоза in vivo. Хуманизирани фрагментарни CDR последователности, трансплантирани върху основа от хуманизирано антитяло и синтезиран протеин от aHTH-DR5 антитела на настоящото изобретение проявяват сходни качества за апоптоза.

Към настоящия момент не е познато моноклонално антитяло, което да се свързва с клетъчната повърхност DR5 и да причинява апоптоза на клетки проявяващи DR5 както in vitro, така и in vivo при липсата на крослинкер. Настоящото изобретение включва aHTH-DR5 антитяло, действащо като терапевтичен агент при животински модели на заболявания като например кръстосани животни или in vivo. Въпреки, че не е показано разтворимия TRAIL да е ефективен при причиняването на апоптоза на туморни клетки in vivo, проявената унищожителна активност е много ниска като се изискват често големи и повтарящи се дози (13). TRA-8, едно от серията aHTH-DR5 антитела според настоящото изобретение е фармацевтично ефективен и при животни, носещи човешки DR5 трансген и също имат приложение при създаването на модел за изследване на ролята на DR5 и TRAIL.

Антитялото, описано в настоящото изобретение, създадено против TRAIL рецептора е отделено от експериментално животно. Чрез хуманизиране на антитялото от настоящото изобретение за поддържане на свързващата активност на рецептора, докато предизвиква намалена и терапевтично приемлива имунна реакция в човешкия организъм като терапевтичен агонист или антагонист за даден TRAIL рецептор се използва хуманизирано антитяло анти-TRAIL рецептор. Настоящото изобретение е ефективно като in vivo терапия, тъй като не се изисква вторичен крослинкинг на антитялото анти-TRAIL рецептор.

Настоящото изобретение не е само единично антитяло анти-TRAIL рецептор, което има агонистичен или антагонистичен апоптоза ефект. Поскоро за създаване на синергистично лечение две или повече антитела анти

TRAIL рецептор са приведени в контакт с клетъчна култура in vitro или тъкан in vivo. Например клетъчна линия глиома U87 и кръвни клетъчни линии U937 и Molt-4 отговарят за подлагането на агонистични антитела aHTH-DR4 и aHTH-DR5 на синергистично въздействие, докато подлагането само на агонистично антитяло анти-4Ж5 дава ограничен успех за причиняването на апоптоза.

Антагонистичните антитела анти-TRAIL рецептор имат приложение в настоящото изобретение, тъй като антитялото е специфично за свързване с един от рецепторите примамки DcRl, DcR2 или OPG. Избирателното блокиране на рецептора примамка с антитялото от настоящото изобретение има ефект на изместване на равновесно свързаните TRIAL при типове клетки, проявяващи рецептори-примамка към тези TRAIL рецептори, способни да преобразуват апоптоза сигнала. Така при друга комбинирана терапия от настоящото изобретение свързаното към рецептора-примамка антитяло изостря чувствителността на изразяващата клетка към агонистичния апоптоза сигнал, преобразуващ свързването на TRAIL рецептора.

В друг пример настоящото изобретение предоставя метод за изясняване на агонистични и антагонистични епитопи на даден TRAIL рецептор. Освен това според настоящото изобретение са изяснени полиморфизмите между индивидите, свързани с даден TRAIL рецептор чрез използването на панел от моноклонални антитела, всяко от които има различаваща се променлива или CDR зона. Отличителния панел на моноклоналните антитела позволява способността да се дефинират агонистични и антагонистични епитопи и полиморфизми. Така панелът от моноклонални антитела има приложение за откриване на лекарства и / или е субект на проучвания за склонността към заболяване.

Друго приложение на настоящото изобретение включва синтезирани протеини, съдържащи антигенен фрагмент от TRAIL рецептор, свързан към протеин имуноглоболин, полипептид или фрагменти от тях. Фрагментът от TRAIL рецептор е дефиниран като съдържащ достатъчен брой бази за предизвикване на имуногенетичен отговор на естествен TRAIL рецептор, проявен върху клетъчната повърхност. Фрагментът от синтезирания TRAIL рецептор включва поне десет аминокиселини. Синтезираният протеин имуноглобулин или фрагмент от него тук е дефиниран като включващ естествен или синтетичен протеин или полипептиден сегмент, съдържащ достатъчен брой от амино киселинни бази за активиране на имуногенен каскаден отговор в субекта. Имуногенът от настоящото изобретение, съдържащ синтез на фрагмент от TRAIL рецептор, свързан с фрагмент имуноглоболин се използва при терапия in vivo за предизвикване на антитяло анти - TRAIL рецептор в субекта.

В друг пример настоящото изобретение намира приложение като генна терапия. В този аспект на изобретението целевите клетки се преобразуват с вектор, носещ изразима последователност, съответстваща на TRAIL рецептора. Векторът е конвенционален и избран въз основа на целева клетка, податлива на този вектор. За пояснение векторите на генна терапия включват аденовирус pAdCMV5. Върху целевите клетки примамки или тъкан, изразяващи преобразувания TRAIL рецептор клетките или тъканта се подлагат на антитяло от настоящото изобретение, специфично за свързване на преобразувания TRAIL рецептор. Антитялото анти-TRAIL рецептор е и агонист и антагонист, а освен това и съвместимо с желания терапевтичен резултат.

Антителата от настоящото изобретение са също ефикасни във връзка с изостряне на чувствителността. Използваният тук сенсибилизатор е формулиран така, че включва всеки стимул, който причинява апоптоза, включително ултравиолетова светлина, органични молекули от класа на бизондолмалеимидите, тежки метали и разновидност на свободни радикали.

Във връзка с терапията на злокачествени заболявания TRA-8 може да причини апоптоза на повечето TRAIL-чувствителни туморни клетки по каспаза-зависим начин при отсъствието на вторичен крослинкинг. TRA-8 показва силна туморна активност in vivo. Способността на TRA-8 да причинява апоптоза при повечето TRAIL-чувствителни клетки

потвърждава, че само DR5 е достатъчен за да се задейства апоптоза. Повечето описани тук туморни клетки проявяват клетъчна повърхност DR5 и тяхната податливост към причинена клетъчна смърт чрез TRA-8, сравнена с тяхната податливост към TRAIL показва, че DR5 е първичния рецептор на смъртта за TRAIL-медиирана апоптоза при повечето туморни клетки. Така диференциалната експресия на DR5 при нормални и ракови клетки е ефикасна за избирателността на TRAIL-медиираната апоптоза. TRA-8 пропуска рецепторите примамки, за да предизвика TRAIL-медиирана апоптоза. Само малка част от TRAIL-резистентните туморни клетки са чувствителни към TRA-8, което обаче показва че рецепторите примамки не играят главна роля при устойчивостта на туморните клетки към TRAILмедиирана апоптоза.

Въпреки, че предишни проучвания са показали, че физиологичното приложение на разтворимата форма на TRAIL при животни не предизвиква туморна регресия без да се причини токсичност ³’ ⁴’ ²², свързаната чрез мембрана форма на човешки TRAIL причинява поражения на черния дроб при мишки, което е показано тук. Хепатичната токсичност на TRAIL обаче е по-слаба, отколкото тази от Fas лиганд, което е демонстрирано чрез послабата податливост на нормални хепатоцити към TRAIL-причинени поражения в сравнение с Fas лиганд и поради липсата на леталност на TRAIL in vivo. Така титруването на TRAIL има приложение при терапията на рака.

Както е подробно описано тук отсъствието на достатъчни нива от експресията на протеина DR5 чрез нормални хепатоцити е показано и се свързва с устойчивост на хепатоцитите към TRA-8 причинена апоптоза. Крослинкинга на DR5 с моноклонално антитяло е недостатъчен за организиране на хомополимерични форми на рецептора на смъртта, способен да задейства апоптоза. Опитите с мармозетки не показват случаи на хепатична токсичност при приложението на TRA-8. Така агонистичното моноклонално анти-4Ж5 антитяло е по-избирателно и по-безопасно, отколкото разтворимия TRAIL като терапевтичен агент.

Като обект на анализ настоящото изобретение е подходящо за откриване на малки зони от злокачествени клетки, които все още проявяват нормална клетъчна морфология. Оцветена клетъчна секция на човешки ракови клетки, включително от бял дроб, простата и черен дроб с означени антитела според настоящото изобретение навременно идентифицира канцерогенни клетки. Наблюдава се, че тези ракови клетки проявяват много високи нива на DR5 в сравнение с нормални клетки от същия тип. Така настоящото изобретение има приложение за чувствителен скрининг метод за ранните злокачествени стадии при тъкани, включващи поне бял дроб, простата и черен дроб. Терапевтичния процес, описан тук подробно е за възпрепятстване на абнормалната клетъчна пролиферация, свързана със заболявания като например злокачествен рак или лимфатични левкемии.

Настоящото изобретение, описано тук е с характеристики на античовешко DR5 моноклонално антитяло, обозначено като TRA-8 с АТСС номер РТА-1428. Оценява се, че описаните техники и резултати, отнасящи се до агонистичното анти-човешко DR-5 антитяло TRA-8 се разпростират изцяло и са приложими при антагонистичните DR5 антитела, също като антителата, създадени срещу DR4, DcRl и DcR2, действащи по агонистичен и антагонистичен начин.

Нивата на експресия рецептор за апоптоза като Fas не корелират

непременно с податливостта на клетките към апоптоза. За TRAILмедиираната апоптоза се предполага, че експресията на рецепторите примамки за TRAIL влияе на податливостта на клетките. Още повече, предполага се, че DR5 трябва да се свърже с DR4 за ефективно преобразуване на сигнала за апоптоза през FADD и каспаза пътека 8. Наличността на агонистично моноклонално анти-DRS антитяло е позволила оценяване на регулирането на сигнализирането на DR5 и съответно неговата роля при TRAIL-медиираната апоптоза. Сравнението на податливостта на клетките към TRA-8-медиираната апоптоза спрямо тяхната податливост на TRAIL-медиираната апоптоза представлява поглед отвътре на ролята на

DR5 при TRAIL-медиираната апоптоза и механизмите, които могат да въздействат на податливостта.

Това предимство в повечето случаи се прилага при хуманизираните анти-4Ж5 антитела от настоящото изобретение. В следващите примери е описано подробно получаването на молекулярен клон на антитяло от DR5 чрез известни техники. Рекомбинантната DNA методология (33) тук се прилага, за да се изградят нуклеотидно киселинни последователности, които кодират молекула на моноклонално антитяло или антиген, свързващ област от него.

Настоящото изобретение позволява изграждането на хуманизирани антитела анти-TRAIL рецептор, които да не причиняват реакция на човешко анти-мише антитяло (тук означено като “HAMA” - human anti-mouse antibody) (34), а да имат функцията на действащо антитяло-ефектор. Термините “човешки” и “хуманизиран”, които са използвани тук във връзка с антителата се отнасят до всяко антитяло, което се очаква да предизвика терапевтично приемлив слаб имуногенетичен отговор при човека.

Настоящото изобретение представя тежки и леки вериги имуноглобулини и хуманизирани тежки и леки вериги имуноглобулини за aHTH-DR5 антитяло, хуманизирано анти-DRS антитяло и TRA-8. Определени съкращения на пълната последователност тези протеини или гени изпълняват регулаторни или ензимни функции. Например нуклеотидно киселинна последователност, кодирана по тази причина може да бъде променена чрез заместване, добавяне, заличаване или мултимерна експресия, което създава функционално еквивалентни протеини или гени. Поради дегенерацията на кодираните нуклеотидно киселинни последователности другите последователности, които кодират по същество същите аминокиселинни последователности като естествено срещащите се протеини могат да се използват при приложението на настоящото изобретение. Включват се (без да се ограничават до тях) нуклеотидно киселинни последователности, включващи всички или части от нуклеотидно киселинните последователности, кодиращи горните полипептиди, които са изменени чрез заместване с различни кодони, които кодират функционално еквивалентен амино киселинен остатък в последователността, като така се създава незабележима промяна. Нуклеотидната последователност на имуноглобулина според настоящото изобретение позволява вариации на хомологията на последователността до 25%, изчислени чрез стандартни методи (“Current Methods in Sequence Comparison and Analysis”, Macromolecule Sequencing and Synthesis, Selected Methods and Applications, стр. 127 - 149, 1998, Alan R. Liss, Inc.), доколкото такъв вариант формира действително антитяло, което разпознава TRIAL рецептора DR5. Например един или повече аминокиселинни остатъка с полипептидна последователност могат да бъдат заместени чрез друга аминокиселина с подобна полярност, действаща като функционален еквивалент, което води до незабележима промяна. Заместителите на аминокиселината в последователността могат да бъдат подбрани от останалите елементи на класа, към който принадлежи аминокиселината. Например неполярните (хидрофобни) аминокиселини включват аланин, леуцин, изолеуцин, валин, пролин, фенилаланин, триптофан и метионин. Полярно неутралните аминокиселини включват глицин, серин, треонин, цистеин, тирозин, аспаргин и глутамин. Положително заредените (основни) аминокиселини включват аргинин, лизин и хистидин. Отрицателно заредените (киселинни) аминокиселини включват аспартанова киселина и глутаминова киселина. Също така в обхвата на настоящото изобретение са включени протеини или фрагменти или производни на тях, които са диференциално модифицирани по време или след транслацията, например чрез гликоразтваряне, протолитично разделяне, съединяване към молекула на антитяло или други клетъчни лиганди и т. н. В допълнение рекомбинантния вектор, кодиращ нуклеотидно киселинните последователности на антителата анти-DRS от настоящото изобретение може да бъде проектиран така, че да модифицира действието или експресията на вектора.

Освен това инхибиторът, който кодира нуклеотидно киселинната последователност in vivo или in vitro може да бъде изменян за създаване и/или премахване на транслация, иницииране и/или прекратяване на последователностите или за създаване на вариации в кодираните зони и/или формиране на нови ограничаващи ендо-нуклеотидни зони или да разруши вече съществуващите такива, за да се улесни по-нататъшната модификация in vitro. Може да бъде използвана всяка позната техника за мутагенезис, включваща без да се ограничава до in vitro насочен мутагенезис, J. Biol. Chem. 253:6551, използването на Таб линкери (фармация) т.н.

Данните от рентгенова кристалография показват, че антитялото имуноглобулин (fold) обикновено формира дълга цилиндрична структура, включваща два пласта от анти паралелни b-повърхности, всяка от които се състои от три или четири b-вериги. В променлива зона се групират заедно три кръга от всяка от V зоните на всяка от веригите Н и L, за да формират място, свързано с антиген. Всеки от тези кръгове е наречен допълваща детерминирана зона (complementarity determining region - “CDR”). Тези CDR имат най-високата изменчивост на амино киселинната последователност с антитялото. Частите от променливата зона, които не са част от CDR са наречени “структурни зони” (framework regions - “FR”) и в повечето случаи изпълняват роля при запазването на структурата на CDR. За предпочитане всички CDR от дадено антитяло се присаждат на антитялото аксептор, за да се запази зоната на свързване за епитопа на TRIAL рецептора. Установено е, че присаждането на част от цялото количество CDR на донор е действително осъществено. Изяснено е също, че присаждането в повечето случаи води до заместване на остатък с остатък от една аминокиселина или зона в друга. Въпреки това обаче, в някои случаи особено при трансфер на зона един или повече остатъка могат да бъдат добавени, изпуснати или заместени според изискванията и тези заличавания и вмъквания, така както и подходящите замествания и инверсии са известни на специалистите в областта.

Антитялото от настоящото изобретение е получено например чрез присаждане на всеки CDR от L и Н вериги, подединици на моноклоналното антитяло анти-TRIAL рецептор в съответстващата CDR зона на човешко

антитяло, във връзка с хуманизирането на мише моноклонално антитяло, ефективно срещу TRIAL рецептор.

Тук също така са генерирани и осъществени чрез известни техники фрагменти от антитялото, съдържащи идиотип на молекулата. Например за пояснение такива фрагменти включват: фрагмент от анти-TRAIL рецептор (АВ’)2, който може да се получи чрез разтваряне на пепсин от молекулата на антитялото, фрагменти от антитяло TRIAL рецептор АВ’, създадени чрез редукция на дисулфидни връзки на фрагмента от TRIAL рецептора (АВ’)2 и фрагмент от антитялото, което е генерирано чрез третиране на молекулата на антитялото с папаин и редуциращ агент.

В частност моноклоналното антитяло aHTH-DR5 TRA-8 може да бъде получено чрез култивиране на хибридома, което се получава чрез имунизация на мишка с човешка DR5 и в последствие съединяване на клетки от далака или клетки от лимфен възел на мишката с клетки на миша миелома.

За пояснение получаването на моноклонално антитяло включва

следните стъпки:

a) пречистване на биомакромолекула за използване като антиген;

b) приготвяне на клетки, създаващи антитяло: първо чрез инжектиране на антиген се имунизира животното, за да се определи кога да се отдели далака се извършва проба на концентрацията на антитялото при кървене на животното;

c) приготвяне на миелома клетки;

d) синтез на клетките, създаващи антитяло с миелома клетките;

e) селекция на хибридома, произвеждаща желаното антитяло;

f) приготвяне на единична клетка клон;

g) незадължително - култивиране на хибридома клетките или израстване на животните, в които ще се трансплантират хибридома клетките за получаване на голяма скала от моноклоналното антитяло;

h) на така полученото моноклонално се тестват биологичната активност и специфичност, или се прави анализ на маркера.

Процедурата за получаване на моноклонално антитяло aHTH-DR5 е описана подробно по-долу с позоваване на описаните стъпки. Този метод за получаване на антитялото от настоящото изобретение е предназначен само за пояснение на методите за получаване, без да се ограничава само в това. Могат да бъдат следвани и други познати процедури или след модификации на метода, например чрез използване на клетки, произвеждащи антитела,

различни от клетки от далак и миелома.

(а) Получаване на антиген

Рекомбинантен протеин (по нататък ще го наричаме “рекомбинантен човешки DR5”), който е ефективен като антиген се получава чрез преобразуване на клетки QBI-239A с експресията на вектор pAdDR5-IgG за синтезиране на протеин, включващ екстрацелуларен домейн на човешки DR5 и зона Fc на човешко антитяло IgGl (тук означено като “IgG”), (cf. РТА-1428), което се осъществява чрез използването на оборудване ADENOQuest (Quantum Biotechnologies Inc., Canada) и събиране и частично пречистване на продукта на експресията. Плазмидът pAdDR5-IgG е създаден чрез вмъкване на DNA кодиращ човешки DR5 и човешки IgG синтезиран протеин в pAdCMV5, който е векторна експресия за животински клетки. Тук също така са приложими и други вещества, като DNA кодиран DR5, векторът и гостоприемника.

Човешкият DR5 и IgG синтезиран протеин, получен при култивиране на супернатанта от клетки QBI-239A, преобразувани чрез вектор pAdDDR5IgG може да бъде частично пречистен чрез ProteinA-Sepharose афинитетна хроматография, ProteinG-Sepharose афинитетна хроматография или йонообменна хроматография, използваща стълба Resourse Q (търговско наименование; Фармация).

Друга възможност е използването като антиген на пречистен DR5, получен от клетъчните мембрани на човешки клетъчни линии. Тъй като първичната структура на DR5 е известна (cf. РТА-1428) чрез познат метод като например методът на Sanger може химически да се синтезира пептид, включващ амино киселинната последователност SEQ ID No.l и да се използва като антиген.

(Ь) Получаване на клетки, произвеждащи антитела.

С имуногена, получен при стъпка (а), смесен с помощно вещество, например помощно вещество на Freund или стипца се имунизира мишка. За пояснение са включени и други подходящи експериментални животни като плъхове, морски свинчета, зайци, кучета, пилета, коне, прасета, крави и овце.

Подходящия курс на приложение за имунизация на експериментални животни включва подкожно, интраперитонеално, интравенозно, интрадермално и мускулно инжектиране, като се предпочитат подкожните и интраперитонеалните инжекции.

При някои случаи имунизациите се провеждат чрез единична доза или чрез няколко последователни дози през подходящи интервали (за предпочитане от 1 до 5 седмици). Имунизираните животни се наблюдават за концентрация на антитела в тяхната сера и за източник на клетки, произвеждащи антитела се избира животно с достатъчно високи концентрация на антитела. Избирането на животно с висока концентрация прави по-нататъшния процес по-ефикасен. Клетките за последващия синтез обикновено се придобиват от животното от 3 до 5 дни след последната имунизация.

Методите за анализ на концентрацията на антитела включват различни добре познати техники, като радиоимуноанализ (който тук означаваме “RIA” - radioimmunoassay), имуноанализ на твърдата ензимна фаза (който тук наричаме “ELISA” - solid-phase enzyme immunoassay), флуоресцентен анализ на антитела и пасивен хемаглютиниращ анализ, като RIA и ELISA са предпочетени заради тяхната чувствителност, бързина, прецизност и възможност за автоматизиране.

Определянето на концентрацията на антителата може да се извърши например чрез ELISA, по следния начин. Първо, пречистен или частично пречистен DR5 се адсорбира в повърхността на твърда фаза, като съда 96 well ELISA, последван от блокиране на всяка оставаща повърхност към която DR5 не се е свързал с протеин, който не се отнася до антигена, например бувин серум албумин (BSA). След измиване повърхностите на колбите контактуват със серийно разредени образци от миша сера, за да се осигури свързване на антитялото aHTH-DR5 с образците на антигена. Като вторично антитяло, за свързване с мишето антитяло е добавено анти-мише антитяло, означено чрез ензим. След измиване е добавен ензимният субстрат и концентрацията на антитела е оценена чрез определяне на промяната в абсорбцията поради получаването на цвят, причинено от промяната на субстрата или нещо подобно.

(c) Получаване на миелома клетки.

Като източник на миелома клетки служат клетки от създадената миша клетъчна линия, включваща например мишка, резистентна към 8азагуанин, получена от BALB/c миелома вериги P3X63Ag8U.l (P3-U1), P3/NSI/l-Ag4-l(NS-l) (36). Sp2/0-Agl4 (SP-2) (37), P3X63Ag8.653 (653) (38) и P3X63Ag8 (X63) (39). Избраната линия клетки е серийно пренесена в подходяща среда, например 8-азагуанин. Средата 8-азагуанин включва IMDM (Iscove’s Modified Dulbecco Medium) или DMEM (Dulbecco’s, Modified Eagle Medium). Средата RPMI-1640 е допълнена c глутамин, 2меркаптоетанол, гентамицин, серум от ембрион на теле (означен с “FCS” fetal calf serum) и 8-азагуанин. След това клетките се прехвърлят в нормална среда като например ASF104 (Ajinomoto, К. К.), съдържаща 10% FCS, 3 или 4 дни преди синтеза за да се осигурят поне 2 х 10⁷ налични клетки в деня на синтеза.

(d) Клетъчен синтез

Лимфоцитите и плазма клетките, получени от всяка подходяща част на животното са клетки-първоизточник за произвеждане на антитела. За пояснение източниците на плазма клетките включват далак, лимфни възли, периферална кръв, както и всяка подходяща комбинация между тях, като най-разпространения източник са клетките от далак.

След последната допълнителна инжекция, при предварително зададена концентрация на антитела, тъканта в която се намират клетките за произвеждане на антитела се отделя от мишката. Най-популярната техника за синтез на клетки от далак с миелома клетките, получени в стъпка (с) включва полиетилен гликол.

Техниката на синтеза включва измиване на клетките от далак и миелома клетките с безсерумна среда (например RPMI 1640) или фосфатна неутрализирана сол (phosphate buffered saline - “PBS”) така, че съотношението между клетките от далак и миелома клетките да е приблизително между 5:1 и 10:1 и след това центрофугиране. След като супернатантът е изчистен и гранулираните клетки са достатъчно разделени, с разбъркване е добавена 1 ml безсерумна среда, съдържаща 50%(w/v) полиетилен гликол (m.w. 1,000 до 4,000). След това се добавя бавно 10 ml безсерумна среда и след това се центрофугира. Супернатантът се изчиства отново и гранулираните клетки се отлагат в подходящо количество от НАТ среда, съдържаща разтвор от хипоксантин, аминоптерин и тимидин (който е обозначен с “НАТ”) и миши интерлевкин-2 (който е обозначен с “IL-2”). След това суспензията е разпределена в колби с порции от културата (които за по-просто ще наричаме порции) и се инкубира при наличието на 5% v/v СО2 при 37°С за около 2 седмици, като е подходящо допълнително добавяне на НАТ среда.

(е) Селекция на хибридоми

Когато използвания род миелома е резистентен на 8-азагуанин, т. е. той е недостатъчен в ензима хипоксантин гуанин фосфорибосил трансферас (HGPRT), всички нестопени миелома клетки и всички сливания миеломамиелома не могат да оцелеят в НАТ среда. От друга страна сливанията на клетките, произвеждащи антитела една с друга, също като хибридомите на клетките, произвеждащи антитела с миелома клетки могат да оцелеят, като първите имат ограничен живот. Следователно последващата инкубация в НАТ среда води само до селекция на желаните хибридоми.

Получените, хибридоми израстват в колонии, които след това се пренасят в НАТ среда, в която липсва аминоптерин (НТ среда). След това за да се определи концентрацията на анти-Fas антитела например чрез ELISA се премахва аликвотна част от супернатанта. Когато описания синтезиран протеин е използван като ELISA антиген е необходимо също така да се елиминират клонингите, произвеждащи антитела, които са специфично прикрепени към Fc зоната на човешки IgGl. Наличието или липсата на такъв клонинг може да бъде установено чрез например ELISA, използвайки Fas-IgGl или IgG2 като антиген.

(f) Клониране

Хибридомите, за които беше показано, че произвеждат специфични антитела, като за определяне концентрацията на антителата е използван метод, подобен на описания в стъпка (Ь) след това се пренасят в друг съд за клониране. Подходящите методи за клониране включват: метод на ограниченото разреждане, при който хибридомите се разреждат така, че да се съдържа една клетка на една колба от съда и след това се култивират; метод на “слаб агар”, при който колониите се възстановяват след култивиране в среда “слаб агар”; метод на използване на микроманипулатор за отделяне на единична клетка за култивиране и метод “sort-a-clone”, при който единичните клетки се отделят чрез клетъчен сортировач.

Процесът на клониране например според метода на ограниченото разреждане се повтаря от 2 до 4 пъти за всяка колба показваща концентрация на антитела и клонингите, имащи устойчиви концентрации на антитела се избират като хибридоми, произвеждащи анти-DRS моноклонални антитела. Хибридомите, произвеждащи анти миши DR5 антитела се избират чрез метод, сходен на получаването на клетъчна линия, произвеждаща анти-DRS моноклонално антитяло.

Хибридомата мишка-мишка TRA-8, която е основа на антителата от настоящото изобретение е депозирана в American Type Culture Collection на 1 март 2000 г. под депозитен номер РТА-1428. Съответно получаването на антитяло чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 или чрез друга установена

хибридома може да се извърши като се следват описаните процедури, започвайки от стъпка (g), като стъпките от (а) до (f) се пропускат.

(g) Култивиране на хибридома за получаване на моноклонално антитяло

Хибридомата, получена чрез клониране се култивира в нормална среда, която не е НТ среда. Голяма по размер култура се получава чрез ролер бутилка за култивиране, посредством използването на големи бутилки за култивиране или чрез спинер култивиране. След това супернатанта от голямата по размер култура се събира и пречиства чрез подходящ метод, например гел филтрация, който е добре познат на специалистите в областта за да се получи aHTH-DR5 моноклонално антитяло, което е основата за антителата от настоящото изобретение. Хибридомата може да се отгледа също интраперитонеално в сингенеична мишка, като BALB/c мишка или nu/nu мишка, за да се получат ascites съдържащи анти-DRS моноклонално антитяло в големи количества. Стандартно за пречистване на събраните антитела се използва съществуващото оборудване за пречистване на моноклонално антитяло (например MabTrap GII Kit; Pharmacia).

Моноклоналните антитела получени по този начин имат висока специфичност за човешки DR5.

(h) Анализ на моноклонално антитяло

Подходящите методи за идентификация на изотипа и подкласа на моноклонално антитяло включват метод Ouchterlony, ELISA и RIA. За предпочитане е за идентификация да се използва търговско оборудване като например Mouse Typer Kit (търговско наименование: BioRad).

Количественото измерване на протеина може да се извърши чрез метода на Фолин-Лоури или чрез изчисления, базиращи се на абсорбирането на 280 nm (1,4 (OD280) = Имуноглобулин 1 mg/ml).

Идентификацията на епитопа, който моноклоналното тяло разпознава се извършва по следния начин. Първо, приготвят се различни частични структури от молекулата, които моноклоналното антитяло разпознава. Частичните структури се получават чрез метод, при който посредством /*·' '^йЦцГ

известни техники за олигопептичен синтез се получават различни частични пептиди от молекулата, както и чрез метода, при който DNA, кодиращ желания частичен полипептид се съединява с подходяща експресия плазмид или е изразен върху подходящ гостоприемник, например Е. coli. Обикновено двата метода се използват често в комбинация за описания погоре обект. Например чрез установените генно-инженерни техники могат да бъдат получени серии от полипептиди с подходящо намалени дължини, които действат в С- и N-край на протеина на антигена. Чрез установяването на това кой фрагмент реагира с антитялото може да се добие приблизителна идея за мястото на епитопа.

Епитопът се идентифицира по-точно чрез синтезиране на множество от по-малки олигопептиди, съответстващи към него или мутанти на пептид чрез използването на установените техники за олигопептиден синтез, за да се определи свойството за свързване на пептидите към aHTH-DR5 моноклонално антитяло, което е основа за получаването на антитялото от настоящото изобретение и съперничи на задържането на свързването на пептида на антигена с моноклонално антитяло. За получаване на голямо разнообразие от олигопептиди се използва стандартно разпространеното оборудване като например SPOTs Kit (Genosys Biotechnologies, Inc.) и различни видове оборудване за синтез на мултипин пептиди, базирани на методът за мултипин синтез (Chiron Corp.).

Антитялото от настоящото изобретение има различни функционални свойства, описани по-долу от а) до f), всяко от които се потвърждава например от тук описания метод.

а) Специфично свързване на TRA-8 към клетки, проявяващи човешки DR5.

Уникална особеност на настоящото изобретение е способността за свързване към клетъчната повърхност DR5. Това е демонстрирано чрез течен цитометричен анализ на клетки, проявяващи DR5. Първо, специфичната клетъчна повърхност, свързваща DR5 се потвърждава чрез COS-7 клетки, преобразувани а пълната дължина cDNA, кодираща човешки

DR5. Характерно е, че TRA-8 разпознава само клетки COS-7 преобразувани с DR5, но не и празен контролен вектор или вектор, кодиращ DR4. Второ, тествани са три различни източника на злокачествени туморни клетки: кръвни, глиома и рак на простатата. Повечето от тези трансформирани туморни клетки са проявили значителни нива на клетъчна повърхност DR5, въпреки че нивата на експресия варират в широки граници. Трето, изпитани са два панела с човешки първични синовиални фибробласт клетки от пациенти с RA и ОА. Всички RA синовиални клетки са изразили значително по-високи нива на DR5 в сравнение с ОА клетки.

b) Причиняване на апоптоза на човешки злокачествени туморни клетки in vitro при отсъствието на крослинкинг.

Способността на антитялото, създадена от настоящото изобретение да разпознава TRIAL рецептор и директно да причинява апоптоза на злокачествени човешки туморни клетки се определя чрез анализ на жизнеспособността на клетките (ATPLite) по време на култивиране in vitro на клетки при различни концентрации от антитялото, и по-специално TRA8. Множеството от туморните клетки са податливи на причинена от TRA-8 апоптоза. При някои клетки TRA-8 проявява силна активност при причиняване на апоптоза, например TRA-8 може да причини апоптоза при човешки Jurkat клетки на нива от порядъка на pg/ml. Важно е, че причинената чрез TRA-8 апоптоза не изисква крослинкинг и при повечето клетки TRA-8 проявява по-силна активност за причиняване на апоптоза, отколкото рекомбинантния разтворим TRAIL при наличието на ускорител.

c) Туморна активност на TRA-8 in vivo.

Туморната активност на TRA-8 е изпитана при два човешки SCID туморни клетъчни модела. Първо, SCID мишки са ваксинирани интравенозно с човешки Jurkat левкемия клетки и третирани с единична доза (100 μ g) ТРА-8. Резултатите показват, че множеството от имплантираните Jurkat клетки са елиминирани от перифералната кръв и далака при третирането с TRA-8, което е определено чрез течен цитометричен анализ, а в случая и чрез имунохистохимична деформация на

Jurkat клетките. Второ, човешки астроцитома клетки 1321N1 са ваксинирани подкожно на SCID мишки и мишките, носители на тумор са третирани с единична доза TRA-8. Нарастването на имплантираните 1321N1 клетки се задържа значително при мишките, третирани с TRA-8, което е определено чрез размерите на тумора и хистологичен анализ.

d) Идентификация на RA синовиални клетки чрез TRA-8.

Първичните синовиални клетки, изолирани от 8 RA и 4 ОА пациенти са тествани за клетъчна експресия на DR5. TRA-8 е състояние позитивно да деформира всички RA клетки, като деформира негативно всички ОА клетки. Така RA се диференцира от ОА чрез повърхностната експресия на DR5, което е установено чрез TRA-8.

e) Причиняване на апоптоза при RA синовиални фибробласт клетки чрез TRA-8.

Способността на TRA-8 да причинява апоптоза на RA синовиални клетки се определя чрез анализ на клетъчната жизнеспособност по време на култивиране in vitro при наличието на различни концентрации на TRA-8. Всички RA клетки са проявили от високи до средни нива на податливост към 100 ng/ml от TRA-8. За сравнение всички ОА клетки са съществено резистентни на причинен чрез TRA-8 апоптоза. Важното е, че TRA-8 проявява по-добра активност за причиняване на апоптоза при RA синовиални клетки, отколкото разтворим TRAIL с ускорител. Освен това при сравнение с анти-Fas антитяло (CH-11) TRA-8 проявява по-добра селективност към RA синовиални клетки.

f) TRA-8 не предизвиква произвеждането на MMPs при RA синовиални клетки.

Установен е и ефекта на TRA-8 върху произвеждането на ММР1 и ММРЗ от синовиални клетки, тъй като TRA-8 има способността да предизвика NF-kb активност при RA синовиални клетки като TNA-a. Докато TNF-a причинява зависимо от дозата нарастване на MMPs TRA-8 е неспособен да предизвика каквото и да е произвеждане на MMPs и дори при някои концентрации TRA-8 леко намалява произвеждането на MMPs при RA синовиални клетки.

g) TRA-8 причинява многократно каспаза активиране.

Каспазите играят критична роля при причиняването на апоптоза.

Способността на TRA-8 да причинява каспаза активност е установена при човешки Jurkat клетки. Когато Jurkat клетките са инкубирани с ниска доза (50 ng.ml) от TRA-8, активирането на каспаза 8, каспаза 9 и каспаза 3 е наблюдавано най-рано 15 минути след инкубацията, което е показано чрез анализ Western blot и анализ на делението на каспаза. При условие че се подбере точния момент, броя и силата на каспаза активността на антителата от настоящото изобретение, включително показаното антитяло TRA-8 проявяват много по-добра активност отколкото които и да е познати антитела, които причиняват апоптоза, като например антитяло античовешки Fas (СН-11).

Антитялото от настоящото изобретение е субстанция, която има способността селективно да причинява апоптоза в патогенни клетки, което е показано при (е) и (g). Следователно то има приложение като профилактичен и терапевтичен агент при заболявания, свързани с неподходящо оцеляване на клетки или неподходяща пролиферация на клетки, като тези свързвани с дисрегулация на системите за апоптоза, включително системата Fas / Fas лиганд.

Способността на антитялото от настоящото изобретение да причинява апоптоза се потвърждава чрез култивиране на клетки като Jurkat клетъчна линия на човешка левкемия (American Type Culture No. TIB-152) и астроцитома клетъчна линия 1321N1 в среда, към която са добавени тестови образци, а нормата на оцеляването е определена например чрез анализ ATPLite.

Антитялото от настоящото изобретение, особено aHTH-DR5 антителата, имащи почти същата имуногенност към човека, както човешките антитела се използват като агент за профилактика или лечение на заболявания, свързвани с неподходящо оцеляване или пролиферация на клетки, включително тези, свързвани с дисрегулация на системите за апоптоза при авто-имунни заболявания, като например системична липус еритематоза, болест на Хашимото, ревматоиден артрит, реакция за отхвърляне на трансплантанта от приемателя (graft-versus host), синдром на Сьогрен, злокачествена анемия, болест на Адисон, склеродерма, синдром на Гудпасча, болест на Крон, авто-имунна хемолитична анемия, стерилитет, миастениа гравис, множествена склероза, болест на Базедов, тромбопениа пурпура, инсулино-зависим диабет мелитус, алергия, атопична болест, артериосклероза, миокардити, кардиомиопатия, гломеруларни нефрити, хипопластична анемия, отхвърляне след трансплантация на орган и многобройни злокачествени заболявания на бял дроб, простата, черен дроб, яйчник, лимфни и гръдни тъкани.

Този профилактичен или терапевтичен агент може да бъде прилаган под различни форми. Подходящите модели за приложение включват орално приложение чрез таблетки, капсули, гранули, прахове и сиропи или парентерално приложение чрез инжекции, капкови инжекции и свещички.

Антитялото или терапевтичния агент могат да бъдат прилагани орално, ректално, интерцистернално, интравентрикуларно, интракраниално (интрачерепно), интракапсулно, интравагинално, парентерално (интравенозно, интрамускулно или подкожно), локално (пудри, унгвенти или капки), чрез интраперитонеално инжектиране, трансдермално, чрез инхалация или като спрей за уста или нос. Точното количество на необходимото антитяло или терапевтичен агент варира при пациентите, като зависи от възраст, тегло и общо състояние на пациента, степен на заболяването, което се лекува, разположение и размер на тумора, отделните използвани съставки, режима на приложението и така нататък. Подходящото количество може да бъде определено от специалистите чрез рутинно експериментиране при дадените тук инструкции. Типичните единични дози от антитялото са в границите на 0.1-10,000 микрограма, за предпочитане между 1 и 100 микрограма. Типичните концентрации на антитялото в носителя са от порядъка на 0.2 до 2000 нанограма за получен милилитър.

Според предвидения метод на приложение антитялото или терапевтичния агент могат да бъдат във фармацевтична композиция като твърда, полутвърда или течна форма, например таблетки, свещички, хапчета, капсули, прахчета, сиропи или суспензии, за препоръчване под формата на единична доза, подходяща за еднократно приложение. Композициите включват ефективно количество от избрания субстрат в комбинация с фармацевтично приемлив носител и като допълнение могат да

включват други медицински агенти, носители или разредители. “Фармацевтично приемлив” означава материал, който не е неподходящ биологично или по-друг начин, който може да бъде приложен на пациент заедно с избрания субстрат без да се причинят значителни нежелани биологични ефекти или вредни взаимодействия с който и да е от останалите компоненти на фармацевтичната композиция, в която се съдържа.

Композициите, подходящи за парентерално инжектиране може да включват физиологично приемливи стерилни водни или неводни разтвори, дисперсии, суспензии или емулсии и стерилни прахове за влагане в стерилни разтвори или дисперсии за инжектиране. Примерите за подходящи

водни или неводни носители, разредители, разтворители или ексципиенти включват вода, етанол, полиоли (пропиленгликол, полиетиленгликол, глицерол и т.н.), подходящи смеси от тях, растителни мазнини (като зехтин) и органични естери за инжектиране като етил олеат. Подходящата флуидност може да бъде постигната чрез използването например на покритие като лецитин, чрез запазване на нужния размер на частиците при случаи на разпръскване и чрез използването на повърхностно активни вещества.

Тези композиции може също така да включват и помощни средства като консервиращи, овлажняващи, емулсиращи и диспенсиращи агенти. Предотвратяването на действието на микроорганизми може да се осъществи чрез различни антибактериални и антифунгални агенти, например парабени, хлоробутанол, фенол, сорбинова киселина и т.н. Също така може да се включат и изотонични агенти като захари, натриев хлорид и т.н. Продължителна абсорбция на фармацевтичната форма за инжектиране може да се осъществи чрез използването на агенти, забавящи абсорбцията, например алуминиев моностеарат и желатин.

Твърдите дозировъчни форми за орално приложение включват капсули, таблетки, хапчета, прахове и гранули. При такива твърди форми активната съставка е примесена с поне един обичаен инертен ексципиент (или носител) като натриев цитрат или дикалциев фосфат или (а) филтри или разредители като нишесте, лактоза, захароза, глюкоза, манитол и силициева киселина; (Ь) свързващи вещества, например карбоксиметилцелулоза, алигнати, желатин, поливинилпиролидон, захароза и акация; (с) овлажнители като например глицерол; (d) дезинтегриращи агенти като агар-агар, калциев карбонат, нишесте от картофи или тапиока, алгинова киселина, някои комплекси силикати и натриев карбонат; (е) вещества, забавящи разтварянето, например парафин; (f) ускорители на абсорпцията, например четвъртични амониеви съставки; (g) овлажняващи агенти, например цетилов алкохол и глицерол моностеарат; (h) адсорбенти, например каолин и бентонит и (i) смазочни материали, например талк, калциев стеарат, магнезиев стеарат, твърди полиетилен гликоли, натриев лаурил сулфат или смеси от тях. При капсулите, таблетките и хапчетата дозировъчните форми могат да включват също така неутрализиращи агенти.

Твърдите композиции от този тип могат да бъдат прилагани и като филтри при меко и твърдо запълнени желатинови капсули чрез използването на ексципиенти като лактоза или млечна захар, а така също и полиетиленгликоли с високо молекулно тегло и т. н.

Твърдите дозировъчни форми като таблетки, дражета, капсули, хапчета и гранули могат да се приготвят с покрития и обвивки като например ентерични покрития и други известни в тази област. Те могат да съдържат затъмняващи агенти или композиция, която оставя активната съставка или съставки в определена част от чревния тракт за задържане.

Примери за използваните вложени композиции са полимерични субстанции и восъци. Активните съставки могат да бъдат също в микрокапсулирана форма и ако е подходящо с един или повече от изброените ексципиенти.

Течните дозировъчни форми за орално приложение включват фармацевтично приемливи емулсии, разтвори, суспензии, сиропи и еликсири. В добавка към активните съставки течните дозировъчни форми могат да съдържат обичайно използваните инертни разредители като вода или други разтворители, разтварящи агенти и емулгатори, например етилов алкохол, изопропилов алкохол, етилов карбонат, етилов ацетат, бензилов алкохол, бензилов бензоат, пропиленгликол, 1,3-бутиленгликол, диметилформамид, масла, по-специално масло от семена на памук, фъстъчено масло, масло от пшеничен зародиш, зехтин, боброва мас и масло от сусам, глицерол, тетрахидрофурфурилов алкохол, полиетиленгликоли и мастно киселинни естери на сорбитан или смеси на тези субстанции и т. н.

Наред с тези инертни разредители композицията може да включва също помощни вещества като овлажняващи агенти, емулгиращи и суспендиращи агенти, подсладители, овкусители и парфюмиращи агенти.

Като допълнение към активните съставки суспензиите могат да съдържат суспендиращи агенти, като например етоксил изостеарил алкохоли, естери на полиоксиетилен сорбитол и сорбитан; микрокристалинна целулоза, алуминиев метахидрооксид, бентонит, агарагар и трагакант или смеси от тези субстанции и т. н.

Най-подходящите композиции за ректално приложение са свещички, които могат да се приготвят чрез смесване на съставките от настоящото изобретение с подходящи не дразнещи ексципиенти или носители като какаово масло, полиетилен гликол или восък за свещи, които са твърди при външни температури и течни при температурата на тялото и поради това се топят в ректума или вагиналната кухина, като освобождават активната съставка.

Дозировъчните форми за локално приложение на съставката от настоящото изобретение включват унгвенти, прахове, спрей и инхаланти.

Активната съставка е примесена при стерилни условия с физиологично приемлив носител и необходимите консерванти, неутрализатори или пропеланти. Също така в обхвата на настоящото изобретение попадат и офталмологичните форми, очни унгвенти, прахове и разтвори.

Терминът “фармацевтично приемливи соли, естери, амиди и помощни вещества”, който се използва тук се отнася до тези карбоксилни соли, амино киселинни добавъчни соли, естери, амиди и помощни вещества а така също и цвитерионични форми от съставките на настоящото изобретение, изборът на които е направен чрез компетентно медицинско решение и които са подходящи за приложение при контакт с тъкани на пациенти без прекомерна токсичност, раздразнение, алергична реакция и т.н., за които коефициентът полза/риск е приемлив и които са ефективни за предназначението си. Терминът “соли” се отнася съответно до нетоксични, неорганично и органично киселинни добавъчни соли от съставките от настоящото изобретение. Тези соли могат да се получат по време на последното изолиране и пречистване на съставките или чрез отделна реакция на пречистената съставка в нейната свободна базова форма с подходяща органична или неорганична киселина и изолиране на солта от тази форма. Тук се включват хидробромидни, хидрохлоридни, сулфатни, бисулфатни, нитратни, ацетатни, оксалатни, валератни, олеатни, палмитатни, стеаратни, лауратни, татратни, нафтилат мезилатни, глюкохептонатни, лактобионатни, метан сулфонатни, лаурилсулфонатови соли и т.н. Те могат да включват катиони, базирани на алкални и алкалоидни земни метали като натрий, литий, калий, калций, магнезий и т.н., а също така и нетоксичен амоний, четвъртичен амоний и аминни катиони, включващи без да се ограничават до амоний, тетраметиламоний, тетраетиламоний, метиламин, диметиламин, триметиламин, тритиламин и т.н. (Виж например S. S. Barge et al., “Pharmaceutical Salts,” J. Pharm. Sci., 1977, 66:1-19).

Терминът “помощни BeinecTBa”(“prodrugs”) се отнася до съставки, които бързо се трансформират in vivo за да произведат изходните съставки от горната формула, например чрез хидролиза в кръвта. Пълната дискусия е дадена в “Pro-drugs as Novel Delivery Systems”, T. Higuchi и V. Stella, Vol. 14 на A.C.S. Symposium Series и в Bioreversible Carriers in Drug Design, Edward B. Roche, American Pharmaceutical Association and Pergamon Press, 1987.

Целевата клетка е клетка от животно, като например човекоподобен и не човекоподобен примат, плъх, мишка, морско свинче, заек, коза, овца, крава, кон, пиле, прасе, мармозетка и пор.

В допълнение антитялото или терапевтичния агент от настоящото изобретение могат да съществуват в неразтворими, така както и в разтворими форми с фармацевтично приемливи разтворители като вода, етанол и т.н. Най-общо за целите на настоящото изобретение се счита, че разтворимите форми са еквивалентни на неразтворимите форми.

Молекулите на антитялото са пречистени чрез известни техники, като амино абсорпция или амино-афинитетна хроматография, хроматографски техники като течна хроматография под високо налягане или комбинации между тях.

Един друг аспект на настоящото изобретение включва фармацевтичен продукт, който се използва за доставяне на биологично активното антитяло анти-TRAIL рецептор или хуманизирано антитяло анти-TRAIL рецептор при гръбначни. Фармацевтичният продукт включва фармацевтично ефективно количество от антитялото анти-TRAIL рецептор или фрагменти от него, фармацевтично приемлив носител и контейнер, съдържащ стерилно носителя и антитялото.

В един от примерите за изпълнение фармацевтично ефективно количество от антитяло aHTH-DR5 забавя клетъчната пролиферация при контакт с целева клетка. Фармацевтично ефективното количество от антитялото, разпознаващо DR5 или хуманизираното антитяло, разпознаващо DR5 е количество, което приложено на пациента е достатъчно да причини желания ефект. Желаният ефект от приложението на фармацевтично ефективното количество от антителата, разпознаващи DR5 включва смърт на целевата клетка, забавяне на растежа на целевата клетка, стимулация на

DR5, свързване към DR5 и нарастване на NFkB нивата или активността в целева клетка. Целева клетка е клетка, която проявява DR5 и включва например абнормално нарастващи клетки и тумори като папиломи и брадавици, рак на гърдата, рак на дебелото черво, хепатоми, левкемии, рак на бял дроб, меланома, миеломи, остеосаркоми, рак на яйчниците, рак на панкреаса, рак на глава и врат, рак на щитовидната жлеза, рак на матката и тумори на мозъка като например астроцитома. In vivo целевата клетка е клетка на пациент в патологично състояние, включително и при пациенти с абнормална или дисрегулирана клетъчна пролиферация като злокачествен или доброкачествен рак и ревматоиден артрит.

В друг от примерите целевата клетка е също в контакт с терапевтичен агент.

Терапевтичен агент е състав или композиция, ефективен при подобряване на патологично състояние. Примерите за терапевтичен агент включват антиракови състави.

Антираков състав е състав или композиция, ефективни при забавянето или спирането на растежа на абнормално нарастваща клетка. Фармацевтично ефективно количество антиракова съставка е количество, приложено на пациент, което е достатъчно да причини забавяне или спиране на растежа на абнормално нарастващи клетки. Примерите за антиракови състави включват: блеомицин, карбоплатин, хлорамбуцил, цисплатин, колхицин, циклофосфамид, даунорубицин, дактиномицин, диетилстилбестрол доксорубицин, етопосид, 5-флуороурацил, флоксиридин, мелфалан, метотрексат, митомицин, 6-меркаптопурин, тенипозид, 6тиогуанин, винкристин и винбластин. Други примери за антиракови състави и терапевтични агенти са дадени в The Merck Manual of Diagnosis and Therapy, 15то издание, Ed. Berkow et al., eds., 1987. Rahway, N. J. и Sladek et al. Metabolism and Action of Anti-Cancer Drugs, 1987, Powis et al. eds., Taylor and Francis, New York, N.Y.

Освен това антитялото от настоящото изобретение може да бъде комбинирано с други терапии, като химиотерапия и радиотерапия при лечението на злокачествени заболявания и терапевтичната ефикасност може да се увеличи чрез съставки, причиняващи апоптоза като бизиндолилмалеимид VIII.

В сравнение с публикуваното антитяло анти-DRS (24) активността за причиняване на апоптоза на показаното от настоящото изобретение антитяло TRA-8 е много силна и е в състояние да причини апоптоза на Jurkat клетки с нива от порядъка pg/ml in vitro и показва по-висока туморна активност в сравнение с известния от преди разтворим TRAIL. Инртравенозното приложение на единична доза TRA-8 е достатъчно да забави растежа на плътните туморни клетки и на кръвните туморни клетки, при които причиняването на туморна регресия in vivo с разтворим TRAIL изисква много високи дози (500 ug всеки ден в продължение на 10 дни). Антителата анти-TRAIL рецептор от настоящото изобретение се оказват също толкова безопасни, колкото разтворимия TRAIL, докато даденото в примерите TRA-8 не причинява апоптоза на нетрансформирани фибробластни клетки.

Векторите от настоящото изобретение включват нуклеотидно киселинна последователност, кодираща тежката или леката верига имуноглобулин на антитялото анти-DRS, оперативно свързано с регулаторен елемент като ускорител или увеличител. “Оперативно свързан” се отнася до подреждане на конфигурираните нуклеотидни последователности, така, че да изпълняват техните обичайни функции. Така, регулаторния елемент, оперативно свързан с нуклеотидна последователност, кодираща полипептид е в състояние да насочи презаписване, репликация и/или транслация на полипептида. За специалистите е познат като единичен вектор, опционно включващ кодирани последователности на леката и тежката верига имуноглобулин на антитяло DR-5.

Примерите, изложени по-долу са предназначени да пояснят методите и резултатите на настоящото изобретение. Тези примери не включват всички аспекти от изобретението, а по-скоро илюстрират представените методи и резултати. Също така тези примери не изключват еквиваленти и

варианти на настоящото изобретение, които са очевидни за специалистите в областта.

Пример 1. Получаване на антиген DR5

1.1 Клониране на DR5 cDNA

DNA, кодираща на човешки DR5 протеин се клонира чрез следния RT-PCR метод като се използва:

a) Шаблон

Цялата RNA на клетки HeLa е извлечена чрез TRIzol Reagent (GIBCO BRL). Шаблонът за PCR реакция използва cDNA, която е получена чрез използването на First-Strand cDNA synthesis kit (Amersharm Pharmacia Biotech) според инструкцията за употреба, приложена към комплекта.

b) PCR праймери

За PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери:

5’ - gacgatgcccgatctactttaaggg-3’ (DR5pl: SEQ ID No.l);

5’ - ccactgggtgatgttggatggg-3’ (DR5p2: SEQ ID No.2);

Ако не е посочено друго всички олигонуклеотиди в тези примери са синтезирани от Lifetechnologies. Всички олигонуклеотиди са съхранявани при -20°С след като са разтворени в дестилирана вода.

c) PCR реакция

Съставяне на разтвор за PCR реакция:

Шаблон cDNA, 5 μΐ от цялата 33 μΐ реакция праймер DR5pl, 10 pmol;

праймер DR5p2, 10 pmol;

х концентриран PCR буфер (доставя се с комплекта), 10 μΐ;

dNTPs (всеки 2.5 mM), 4 μΐ; и

Taq полимераза (Promega), 5 единици.

Към разтвора е прибавена стерилна дестилирана вода до обем от ΙΟΟμΙ. Ако не е посочено друго dNTPs е еквимоларна смес от dATP, dCTP, dGTP и DTTP (2.5 mM всеки).

PCR реакцията се провежда по следния начин. Първо разтворът се нагрява при температура 94°С за 2 минути, след което 40 пъти се повтаря цикъл от нагряване при 94 °C за 30 секунди, 52°С за 1 минута и 72°С за 3 минути. След извършването на тази процедура реакционният разтвор се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените DNA фрагменти, получени по този начин са отделени върху 1% агарозен гел, съдържащ 0.25 ug/ml етидиум бромид. Връзките, за които е установено, че съдържат желаните DNA фрагменти са премахнати чрез бръснач и DNA е възстановена чрез Gene Clean Kit (ВЮ101). Фрагментът DNA е клониран чрез ТА Cloning Kit (Invitrogen, СА), Това е

изпълнено по следния начин:

DNA фрагментът, възстановен от PCR реакционния разтвор заедно с 50 ng от pCR2.1 вектор, който се доставя с ТА Cloning Kit се смесва с 1 μΐ от 10 х лигазен реакционен буфер (6 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 тМ магнезиум хлорид, 5 тМ натриев хлорид, 7 тМ β-меркаптоетанол, 0.1 mM ATP, 2 тМ DTT, 1тМ спермидин и 0.1 mg/ml бувин серум албумин), към който са добавени 4 единици от T4DNA лигаза (μΐ). Обемът от сместа се допълва доЮ μΐ със стерилна дейонизирана вода и полученият лигазен разтвор се инкубира при 14°С за 15 часа. След това време 2 μΐ от реакционния лигазен разтвор се добавя към 50 μΐ от установения вид Е. coli TOPI OF, който се доставя с комплекта ТА cloning kit, според указанията на производителя, към който са добавени 2 μΐ от 0.5 М β-меркаптоетанол и получената смес се държи в лед за 30 минути, след това за 30 секунди при 42°С и отново в лед за 5 минути. След това към културата се добавя 500 μΐ среда, съдържаща 2% ν/ν триптон, 0.5% w/v екстракт от дрожди, 0.05% w/v натриев хлорид, 2.5 тМ калиев хлорид, 1 тМ магнезиум хлорид и 20 тМ глюкоза (наречено като среда “SOC”) и сместа се инкубира за 1 час при 37°С с разбъркване. След това време, културата се отделя върху съд с агар L-среда (1% ν/ν триптон,0.5% w/v екстракт от дрожди, 0.5% w/v натриев хлорид, 0.1% w/v глюкоза и 0.6% w/v бакто-агар (Difco)), съдържащ 100pg/ml. Колониите, резистентни на ампицилин, които се намират върху съда са селектират, изхвърлят се чрез платинена трансферна бримка и се култивират в Lхранителна среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин при 37°С за една нощ с разбъркване при 200 r.p.m. След инкубация клетките се събират чрез центрофугиране, от което чрез алкален метод се получава плазмид DNA. Фрагментът EcoRI-EcoRI DR5cDNA от така получения плазмид се субклонира в pcDNA3 плазмид (Invitrogen, СА). Изложена е пълната дължина на гена DR5 в pcDNA3 и тя съответства на публикуваната последователност. Така полученият плазмид е означен като плазмид pcDNA3-DR5.

1.2 Конструиране на DR5-IgG вектор на експресия

За да се получи разтворима форма на човешки DR5, при който липсва транс мембранен домейн се конструира плазмиден вектор на експресия. Този вектор е предназначен да кодира синтезирания протеин, включващ екстрацелуларен домейн на човешки DR5, синтезиран с човешки IgGl Fc DNA (41). DNA, кодираща човешки DR5 с липсващ транс мембранен домейн се получава чрез следната PCR реакция.

a) Шаблон

Използваният шаблон за PCR реакция е pcDNA3-DR5.

b) PCR праймери

Следните олигонуклеотидни праймери са синтезирани за PCR: 5’-gacgatgcccgatctactttaaggg-3’ (DR5pl:SEQ IDNo.l); 5-ggatccgtggacacattcgatgtc-3’ (DR5p3:SEQ IDNo.3);

Ако не е посочено друго всички олигонуклеотиди в тези примери са синтезирани от Lifetechnologies. Всички олигонуклоетиди са съхранявани при -20 °C след като са били разтворени в дестилирана вода.

c) PCR реакция

PCR реакцията се извършва и увеличените DNA се изолират, както е описано в пример 1.1 (е).

Полученият по този начин плазмид е означен като плазмид pCRADR5. Фрагментът BamHI-EcoRI, кодиращ човешки Fc фрагмент, който е възстановен от pmFas-hlhHIFc е субклониран в мултиклонинг позиции BamHI и EcoRI на pcDNA3. Полученият по този начин плазмид е означен като pcDNAFc. Освен това фрагментът BamHI-BamHI, кодиращ зоната на

човешки разтворим DR5, който е възстановен от pCR-ADR5 е субклониран в позиция BamHI на плазмида pcDNAFc. Полученият по този начин плазмид е означен като pcDNAADR5-Fc. Фрагментът EcoRI, кодиращ зоната Fc на човешкия разтворим DR5-4OBeniKH IgG Fc, който е възстановен от плазмида pcDNAADR5-Fc е непосредствено премахнат чрез фрагмент DNA полимераза Klenow (GIBCO BRL) и след това е субклониран във векторасовалка pAdCMV5 (Quantum Biotechnologies Inc., Canada), който е непосредствено премахнат след срязване с BamHI. Полученият по този начин плазмид е означен с pAdADR5-Fc.

1.3 Експресия и пречистване на човешки DR5-IgGl синтезиран протеин

Клетките QBI-293A (доставят се с комплекта ADENO-Quest Kit) се ко-преобразуват с pAdADR5-Fc и QBI-вирусна DNA (доставя се с комплекта ADENO-Quest Kit) чрез ADENO-Quest Kit, (Quantum Biotechnologies Inc., Canada) според указанията за употреба. Рекомбинантните вирусни петна са култивирани и наблюдавани за експресия на синтезирания протеин DR5-IgG чрез анализ ELISA на супернатанта. Позитивните петна са уголемени в клетки QBI-293A и съхранявани при -80°С като вирусен вид. Петдесет съда (150 mm) с QBI-293A клетки са преобразувани с pAdADR5-Fc рекомбинантен вирус при 10 m.o.i. (Множественост на инфекцията). Култивираната среда е събрана след преобразуване за 48 часа.

Преобразуваните клетки, имащи ген DR5-IgG нарастват до клетъчна гъстота от 1 х 10⁶ клетки/ml чрез инкубация в 500 ml на среда DMEM (GIBCO), съдържаща 10% v/v FCS при 37°С в атмосфера от 5% v/v СО₂ за два дни. След това културата се центрофугира (1,000 г.р.гп., 5 минути) и супернатанта се събира. Пречистването на DR5-IgG от супернатанта се извършва чрез ProteinA-Sepharose CL-4B афинитетна хроматография (Phatmacia) при следните условия:

стълб: ProteinA-Sepharose CL-4B стълб (размер на стълба 2 ml;

Pharmacia);

утаяващ буфер: 0.1 М глицин (pH 2.4), 0.15 М NaCl;

неутрализиращ буфер: IM Tris-HCl (pH 8.5).

След като целият супернатант е поставен в стълба се промива три пъти с 20 ml PBS и след това се добавя 10 пъти по 1 ml утаяващ буфер. Измерена е оптичната плътност на всяка утаена фракция (1 ml). Втората фракция и петата фракция (с OD28o>0.1) са събрани след добавянето на 100 μΐ неутрализиращ буфер, утайките се поставят отделно в диализна тръба, и се диализират чрез 1 литър PBS (pH 7.5) при 4°С. Буферът за диализа се сменя два пъти.

След това утайките се анализират за експресия на генния продукт DR5-IgG чрез ELISA. Първо, поставят се отделно 100 μΐ от всяка фракция в колби 96-well microplate (Costar) и се инкубират при 37°С за 1 час. След това разтвора в колбите се премахва и те се измиват три пъти с 100 μΐ /колба PBS, съдържащ 0.1% v/v Tween 20 (тук е обозначено като “PBS-Tween”). След измиването е добавен PBS, съдържащ 2% w/v бувин серум албумин (обозначен като “BSA”) в количество от 100 μ 1 /колба и след това съдовете се инкубират при 37°С за един час. След това време колбите се измиват три пъти със по 100 μΐ /колба от PBS-Tween, след което към всяка колба се добавя по 100 μΐ /колба от разтвор на анти-човешко IgGl моноклонално антитяло, разредено 1000 пъти с PBS-Tween и съдовете още веднъж се инкубира при 37°С за 1 час. След това колбите се измиват отново три пъти със 100 μΐ /колба от PBS-Tween. След това се добавя течна субстратна система (Sigma) от 3,3’ ,5,5’-Тетраметил-бензидин (тук се обозначава като “ТМВ”) в количество от 100 μΐ /колба и съдовете се оставят при стайна температура за 5 минути, след което реакцията се спира чрез добавяне на 100 μΐ /колба от 0.2Ν H2SO4. За да се пресметне концентрацията на свързаното антитяло е отчетена абсорбацията при всяка колба при 450 nm, като за контролно показание се използва абсорбацията при 650 nm. Абсорбацията е измерена чрез Микроплейт четец (Molecular Devices). Молекулното тегло на проявения DR5-IgGl синтезиран протеин е определено чрез анализ Western blotting, при който за откриването на антитялото в гела се използва анти-човешки IgGl mAb (Sigma).

Молекулното тегло на проявения DR5-IgGl синтезиран протеин е приблизително 50 kDa. Получената чистота е по-висока от 90%, което е изчислено чрез анализ с SDS-PAGE, протеина е разпознат чрез Coomassie синьо оцветяване.

Пример 2. Генериране на моноклонални антитела срещу човешки DR5

2.1 Имунизация

Женски мишки Balb/c (Jackson Laboratory, Bar Harbor, ME) на възраст от 6-8 седмици са имунизирани с афинитетно-пречистен синтезиран протеин DR5/hIgGl. За първата имунизация през лапите синтезираният протеин (50 μΐ) е емулгиран със стопроцентово помощно средство на Freund (Difco, Detroit, MI). След това мишките се поддържат с четири инжекции от 50 μΐ синтезиран протеин, прилаган без помощно средство през всеки следващ ден. Три дни след последната инжекция лимфоцитите от локалните лимфни възли се сливат с NS-1 миелома клетки и хибридомите се култивират в среда F104, допълнена с 10% ембрионален серум от теле. Позитивните хибридоми се селектират чрез ELISA, при който съдовете се покриват или с 1 pg/ml DR5/hIgGl или със същото количество от Fas/hlgGl като контрола. Изотипа на хибридомите е определен чрез ELISA посредством панел от миши Ig изотип-специфични кози антитела (Southern Biotechnology, Birmingham, AL). Моноклоналните антитела се пречистват чрез афинитетна хроматография чрез имобилизиран анти-миши IgGl или протеин G (Sigma).

2.2 Клетъчен синтез

На третия ден след поддържащото инжектиране локалните лимфни възли се отстраняват от мишката и се поставят в 10 ml безсерумна RPMI 1640 среда (GIBCO BRL), съдържаща 50 единици/ml пеницилин, 50pg/ml стрептомицин и 300 pg/ml L-глутаминова киселинна и се разрушават чрез преминаване на органа през мрежа, като за целта се използва шпатула (Cell Strainer; Falcon). Получената клетъчна суспензия се центрофугира, за да се гранулират клетките от локалните лимфни възли, които след това се измиват

два пъти в безсерумна RPMI среда. След това измитите клетки се ресуспендират в безсерумна RPMI среда и се преброяват.

Междувременно миелома клетките NS1 (American Type Culture Collection TIB-18) са нараснали до клетъчна гъстота не надвишаваща lxl0⁸ клетки/ml в ASF104 среда (Ajinomoto, К. К.), съдържаща 10% v/v FSC (Gibco BRL) (“ASF среда със серум”) при 37°С под 5% v/v СО₂ и по същия начин се разрушават, измиват, ресуспендират и преброяват.

Суспензия на NS1 клетки, съдържаща ЗхЮ⁷ клетки се смесва със суспензия от клетки на далак, съдържаща ЗхЮ⁸ клетки. Получената смес е центрофугирана и супернатанта се изхвърля. За клетъчния синтез се изпълняват следващите стъпки, като през това време пластмасовата туба, съдържаща гранулите се държи при температура от 37°С в стъкленица с топла вода.

След това в тубата бавно се добавя един ml 50% (w/v) полиетилен гликол 1500 (Boehringer Manheim), като през цялото време гранулите се разбъркват с върха на пипета. После на две порции се добавя бавно 1 ml безсерумна PRMI среда, предварително затоплена до 37°С, а след това още 7 ml безсерумна PRMI среда. След това получената смес се центрофугира, супернатанта се изхвърля и се добавя 10 ml HAT чрез леко разбъркване с върха на пипета. После се добавя 20 ml HAT среда, съдържаща 10% v/v FCS и суспензията се разпределя в колби за клетъчни култури 96-well microplates по 100 μΙ/колба и се инкубира при 37°С при атмосфера от 5% v/v СО2. След 7 или 8 дни за да се замени средата при всички колби, имащи жълтеникав оттенък се използвани по 100 μ 1/колба свежа НАТ среда. Синтезираните клетки от тези колби са клонирани чрез ограничено разреждане, което е описано по-долу.

2.3 Клониране чрез ограничено разреждане.

Тимуси от женски BALB/c мишки на възраст от 5 до 10 седмици (от Japan SLC, Inc.) се отстранени, разрушени през сито (Cell Strainer; Falcon), както е описано по-горе и разрушените клетки се измиват два пъти с НТ среда, съдържаща 10% v/v FCS. За да се получи захранваща клетъчна

суспензия в 30 ml НТ среда, съдържаща 10% v/v FCS се суспендира количество от тимусни клетки, съответстващо на клетки от една мишка. Приготвената синтезирана клетка, получена по-горе в пример 2.2 се разрежда с тази захранваща клетъчна суспензия от 10 до 100 пъти, след което се разрежда на няколко пъти със захранващата клетъчна суспензия, за да се получи суспензия с плътност на клетъчен синтез от 5, 1 и 0.5 клетки/ml. Така приготвените образци се разпределят в колбите за клетъчни култури 96-well microplates по 100 μΙ/колба и се инкубират за 5 дни при 37°С при 5% v/v СО2

2.4 Скрининг

Супернатантите от културата с растящите хибридоми се наблюдава чрез ELISA, като се използват съдове, покрити с 1 pg/ml DR5/hIgGl или същото количество Fas/hlgGl (41) като контрола. Свързаните антитела се откриват чрез хрян пероксидаза (НЯР)-сдвоен анти-миши имуноглобулин (Southern Biotechnology. Birmingham, AL) c TMB (Sigma, St Louis, MI) като субстрат. Пречистеният DR5/hIgGl в концентрация от 1 pg/ml или същото количество Fas/hlgGl се поставя в колба 96-well ELISA/RIA STRIP PLATE (Costar, NY). Съда се оставя да престои една нощ при температура от 4°С, за да се получи адсорбция на протеина върху повърхността на колбата. След това време разтворът в колбите се изхвърля и всяка колба се измива 3 пъти с PBS-Tween. След това към всяка колба се добавят 100 pl PBS, съдържащ 1% (w/v) бувин серум албумин (А3803; Sigma Chemicals Co.) и съдът се инкубира при 37°С за един час. След това колбите се измиват 3 пъти с PBSTween и към всяка колба се добавят 50 μ 1 от супернатанта от културата с растящите хибридоми. След това съдът се инкубира при 37°С за един час и колбите отново се измиват 4 пъти с PBS-Tween. След измиването към всяка колба се добавят 50 μ 1 от хрян пероксидаза, класифициран като антитяло кози анти-миши имуноглобулин (Southern Biotechnology. Birmingham, AL), разтворен 1000 пъти с PBS и съда отново се инкубира при 37°С за един час, като след това всички колби се измиват 4 пъти с PBS-Tween. После се добавя течна субстратна система 3,3’ , 5,5’-Тетраметил-бензидин (ТМВ) (Sigma) в количество от 100 μΐ/колба и съда се оставя да престои при стайна температура за 5 минути, след което реакцията се спира чрез добавянето на 100 μΐ/колба 0.2N H2SO4. Абсорбцията за всяка колба при 450 nm (контрола 650 nm) се измерва чрез микроплейт четец (Molecular Devices) и синтезираните клетки се селектират от образците, които имат абсорбция (450 nm - 650 nm, OD стойност; >0.5) видимо по-висока от тези, при които е добавен супернатант от синтезирани клетки (OD стойности; =0.03). Понататък супернатантът от културата с растящите хибридоми също се наблюдава функционално чрез измерване на интензивността при причиняване на апоптоза, като се използва Jurkat клетка. В съдове 96-well се добавят 50 μΐ RPMI среда, съдържаща Jurkat клетки (1000 клетки за колба) и 5 иМ Бизиндолулмалеимид VIII (BisVIII, Alexis, San Diego, СА) при наличието на 50 ul от супернатанта от културата с растящите хибридоми. Клетките се култивират в овлажняващ инкубатор при 37°С за една нощ. Апоптозата се определя чрез клетъчната жизнеспособност посредством комплекта ATPLite, според инструкциите на производителя (Packard Instruments) и образците се преброяват чрез Top Counter (Packard Instruments).

2.5 ELISA свързване на TRAIL и TRA-8 към рецепторите

Съдовете ELISA с покриват с 2 pg/ml DR4-Ig или DR5-Ig синтезиран протеин за една нощ. След блокиране с 3% BSA се добавят разтворимия TRAIL-FLAG или TRA-8 при посочените концентрации и се инкубират при 37°С за един час. Свързването на TRAIL или TRA-8 се установява чрез HRPсдвоено anti-Flag антитяло (Alexis) или съответно HRP-сдвоен анти-миши IgGl (Southern Biotechnology). Реакциите се развиват чрез ТМВ субстратен буфер и измерват чрез Benchmark Microplate Reader (BioRad). Стойностите Kd се оценяват чрез едностранно свързан модел от нелинейна регресия чрез GraphPad Prism софтуер (GraphPad Software, San Diego, СА). За сравнение с ELISA се добавят 100 ng/ml TRAIL-FLAG и се инкубират при наличието на различни концентрации на TRA-8. Свързването на TRAIL се определя като по-горе.

2.6 Клониране

Описаните стъпки в примери 2.3 и 2.4 се повтарят 5 пъти за клетките, селектирани в 2.4, като се осигурява селекцията на няколко хибридома

клонинги, всеки от които произвежда единично антитяло, което се свързва с DR5-IgG, без да се свързва с Fas-IgG. Като резултат от процедурата по селекция е получена хибридома мишка-мишка, означена като TRA-8 и антитяло, което се свързва към DR5-IgG, без да се свързва към Fas-IgG. Тази хибридома TRA-8 е депозирана в American Type Culture Collection на 1 март 2000 г. под номер РТА-1428.

След тестване с оборудване за изотип на моноклонално антитяло (Pierce) е установено, че подкласа на антитялото TRA-8, получено чрез хибридома мишка-мишка (тук е означено само като “TRA-8”) е IgGl, к.

Чрез използването на нашия човешки DR5-IgGl синтезиран протеин като имуноген чрез първоначален ELISA скрининг са получени седем клонинги на хибридоми, всеки от които е силно позитивен към DR5-IgG, без да е позитивен към Fas-IgG синтезиран протеин, което показва, че получените хибридоми произвеждат антитела, които разпознават екстрацелуларната зона от DR5, но не и Fc зоната на IgGl (данни не са показани).

2.7 Анализ Western blot

Филтри за Western blot анализ на хомогенността при нормална и ракова човешка тъкан се набавят чрез Geno Technology (St. Louis, МО). Всяка пътека се зарежда с равно количество протеин, както се установява чрез антитялото анти-Р-актин. Петната се изпитват с 1 pg/ml ТРА-8 за една нощ, след това с HRP-сдвоен кози анти-миши IgGl (Southern Biotechnology) при стайна температура за един час и се проявяват чрез хемилуминисценция.

2.8 Имунохистохимия

Човешките тъкани са получени от Tissue Procurement Center на UAB. Замразените разрези са фиксирани в 70% етанол, блокиран с 10% конски серум в PBS и след това инкубирани с 10 pg/ml афинитетно-пречистен TRA

при стайна температура за 60 минути. За визуализиране на реактивността е използван комплект анти-миши IgG ABC с диаминобензидин (Vector, Burlingame, СА) като колориметричен субстрат.

2.9 Анализ на каспаза активиране

Инкубирани са Jurkat клетки (1х10⁶/т1) с 500 ng/ml TRA-8. Върху 15% SDS-PAGE се отделят аликвотни (30pg от протеина) на клетъчния лизат, попиват се в найлонова мембрана и петната се изпитват с антитела анти-каспаза 8, 9 и 3 (BD Pharmingen, San Diego, СА), след това с HRPсдвоено вторично антитяло и хемилуминисцентна визуализация на разрязаните продукти. Комплектът за каспаза инхибитор са набавя от R&D Systems (Minneapolis, MN). Всеки каспаза инхибитор е добавен в културата при посочените концентрации.

Пример 3. Пречистване на моноклонално антитяло TRA-8.

Хибридомата мишка-мишка TRA-8 нараства до клетъчна гъстота от 1х10⁶ клетки/ml чрез инкубация в среда от 500 ml ASF, съдържаща 10% v/v FCS при 37°С под 5% v/v СО₂ за 5 дни. После културата се центрофугира (1,000 r.p.m., 5 минути) и супернатантът се отделя. Пречистването на TRA-8 от супернатанта се осъществява чрез ProteinG-Sepharose С1-4В афинитетна хроматография (Pharmacia) при следните условия:

стълб: ProteinG-Sepharose CL-4B стълб (размер на стълба 2 ml;

Pharmacia);

утаяващ буфер: 0.1 М глицин (pH 2.4), 0.15 MNaCl;

неутрализиращ буфер: 1 М Tris-HCl (р.Н 8.5).

След като целия супернатант се постави в стълба, той се измива три пъти с 20 ml от PBS и след това се добавя утаяващ буфер в обеми по 1 ml на 10 пъти. Измерена е оптичната плътност на всяка утаена фракция (1 ml). Фракциите от No.2 до No.5 са събрани отделно.

След като се добави 100 ul от неутрализиращия буфер утайките се слагат отделно в диализни тръби и се диализират чрез 1 литър PBS (pH 7.5) при 4°С. Диазлизният буфер се сменя два пъти. Тази проба се анализира за интензивност на антитялото aHTH-DR5 посредством ELISA, като се използва

човешки синтезиран протеин DR5-IgG, получен чрез описаните по-горе техники.

Пример 4. Получаване на антиген DR4, DR4-IgG вектор на експресия и анти-DRS моноклонално антитяло.

Процедурите от примери 1-3 се повтарят с DR4 модел cDNA и праймерите на мястото на описаните в пример 1, за да се получи DR4 антиген, който се използва както е посочено в примери 1.2-3 за получаване на моноклонално антитяло, специфично срещу DR4.

Пример 5. Моноклонални антитела срещу DcRl и DcR2

Моноклоналните антитела се свързват към рецепторите примамки DcRl и DcR2 чрез заместване на съответната cDNA и праймерите за да се създадат съответните антигени, описани в пример 1. Векторите на експресия за синтезите на DcRl или DcR2 с имуноглобулин G и резултантните пречистени моноклонални антитела се получават като в примери 2 и 3.

Пример 6. Специфичност на моноклонално антитяло

Тъй като всички рецептори за TRAIL и другите протеини от семейството на TNFR имат обща отличителна хомология, специфичността на даденото в примерите антитяло TRA-8 към DR5 е определена чрез анализ western blot, като се използват два различни човешки DR5-IgG синтезирани протеина и разтворими, рекомбинантни форми на другите свързани протеини. Първият DR5-Ig синтезиран протеин е конструиран чрез синтез на cDNA от остатъци 1-180 на екстрацелуларната част от DR5 и cDNA, кодираща константната зона на човешки IgGl. Синтезираната cDNA е клонирана в рекомбинантен аденовирусен вектор (Quantum Biotechnologies, Inc., Montreal, Canada). Проявения DR5/hHgGl синтезиран протеин, който има относително молекулно тегло 50 kDa е пречистен, като е използван анти-човешки IgG афинитетен стълб (Sigma, St Louis, МО). За анализа на специфичността western blot вторият рекомбинантен човешки DR5/IgGl синтезиран протеин (аа. 52-212), така както и синтезираните протеини TRAIL-R1, R3 и R4 се набавят от Alexis. Разтворимите форми на човешки Fas и INFR1 са осигурени със съдействието на д-р Карл Едуарде от Amagen,

Inc., Thousands Oaks, CA, USA. Използваните разтворими молекули рекомбинантни човешки DR4, DcRl, DcR2, TNFR1, R4 и Fas са човешки IgGl синтезирани протеини. 0.5 pg от всеки протеин е разделен чрез 10% SDS-PAGE и попит в нитроцелулозна мембрана. Попиването е блокирано с 5% сухо мляко в PBS при стайна температура за един час и изпитано с 1 pg/ml от пречистено моноклонално aHTH-DR5 антитяло (клон: TRA-8) или 1 pg/ml от HRP-сдвоен кози анти-човешки IgG при 4°С за една нощ. Като вторично антитяло за установяване на свързването на TRA-8 е използван хрян пероксидаза (НКР)-сдвоен кози анти-миши IgG. Попиването се проявява чрез хемилуминисценция.

За течен цитометричен анализ са използвани Cos-7 клетки, преобразувани с вектор pcDNA3 (Clontech, Palo Alto, СА), съдържащ пълната дължина DR5, DR4 или празен вектор. Пълната дължина cDNA, кодираща човешки TRAIL или миши Fas лиганд е клонирана в pTRE векторен поток от тетрациклин-контролируем промотор (Clontech). Понататък фрагментите Xhol-Hindlll на pTRE-hTRAIL или pTRE-mFasL са клонирани в аденовирусен вектор-совалка pAdBN (Quandum Biotechnologies, Inc.). 293-те клетки гостоприемник са ко-преобразувани с линеаризиран pAd-TRE-hTRAIL или pAd-TRE-mFasL и големия фрагмент DNA на аденовирус. Експресията на функционален човешки TRAIL или миши Fas лиганд от рекомбинантнте вирусни петна се наблюдава посредством анализ a⁵¹Cr-release с Jurkat клетки като целеви клетки.

TRA-8 реагира силно със синтезирания протеин DR5-IgG (~50 kDa), който се използва за имунизация, както е показано на фиг.la, DR5, #1 и слабо с втория синтезиран протеин DR5-IgG (~60 kD), както е показано на фиг.la, DR5, #2. Няма значително свързване на TRA-8 към DR4, DcRl, DcR2, Fas (CD95) или TNFRI. Тези резултатите показват, че TRA-8 разпознава епитопите, които са специфични за DR5, но това не се отнася до останалите елементи от фамилията.

TRA-8 не реагира с другите елементи от голямото семейство на TNF рецептора, като например Fas (CD95) и TNF рецептор I; TRA-8 не

взаимодейства с мишето съответствие на DR5, което е показано чрез коефициенти на оптична абсорбация за 450 nm и 650 nm, където са числата от долния панел с номера 1-7 (фиг. 1а, колона 8 от долния панел). Разтворимия TRAIL и TRA-8 са свързани сравнимо към неподвижния DR5 (фиг.lb, ляв панел). За разлика от това, TRAIL който е свързан към DR4, но не и към TRA-8 не проявява никаква активност за свързване към DR4 (фиг. lb, среден панел). Стойностите Kd за свързване на TRAIL и TRA-8 към DR5 са отчетени съответно при 59 пМ и 3 пМ. Важно е, че TRA-8 ефективно се съревновава с TRAIL при свързването към DR5, но не и към свързването с DR4, което е показано при сравнението ELISA (фиг. lb, десен панел). Тези резултати доказват специфичността на TRA-8 към човешки DR5.

TRA-8 е в състояние да разпознае експресия на клетъчната повърхност на DR5, чрез течен цитометричен анализ, показващ специфичното свързване към клетъчната повърхност на Cos-7 клетки, преобразувани с пълната дължина на човешки DR5, но не и Cos-7 клетки, преобразувани с DR4 или празен вектор (фиг.1с). По подобен начин имунохистохимията с TRA-8 показва реактивност с Cos-7 клетки, преобразувани с пълната дължина DR5 DNA, но не и с тези, преобразувани с контролен вектор (фиг.Id). TRA-8 не причинява апоптоза на не преобразувани Cos-7 клетки и PT-PCR на RNA от Cos-7 клетки, използващи

двойки праймери, кодиращи човешки DR5, които показват, че не са специфични PCR продукти. По-нататъшния функционален анализ, използващ човешки Jurkat клетки като клетки примамки показва, че при отсъствието на крослинкер TRA-8 силно причинява клетъчна смърт, което е доказано чрез три различни анализа на клетъчна жизнеспособност: ATPLite, МТТ и PI изключване (фиг.1е). Както е показано при анализа ATPLite повече от 50% от Jurkat клетките са унищожени при нива на TRA-8 от порядъка на нанограм. Интензивността за унищожаване на TRA-8 е специфична за DR5 и може да бъде блокирана от DR5-Ig, но не и от DR4-Ig синтезирани протеини (не са показани данни). Делението на каспаза 8, 9 и 3 може да бъде установено чрез анализ western blot най-рано 30 минути след третиране на Jurkat клетките (фиг.If) и клетъчната смърт на Jurkat клетките е изцяло забавена от основния каспаза инхибитор (Z-Vad) (фиг. lg). Отделните каспаза инхибитори за каспази 8, 3, 9 и 10 частично инхибират клетъчната смърт, което доказва, че TRA-8-медиираната клетъчна смърт е

преди всичко механизъм за апоптоза, зависим от каспаза.

Пример 7. Течен цитометричен анализ на експресията на клетъчната повърхност DR5: основен рецептор на смъртта при много тумори, но не и при нормални клетки.

Способността на TRA-8 да се свързва с DR5, проявена на клетъчната повърхност и специфичността на тази реакция е изследвана по-нататък чрез клетки COS-7 (American Type Culture Collection No. CRL-1651), преобразувани c вектор-експресия, съдържащ пълната дължина на човешки DR5 или DR4 cDNA или празен вектор като контрола. Като второ антитяло за установяване на свързването на TRA-8 е използван Phycoerythrin (РЕ) сдвоен анти-миши IgGl (Pharmingen). Измерена е флуорисценцията на 1х 10⁴ клетки чрез течен цитометър (FACSVantage) при следните условия:

Възбудена дължина на вълната: 488 nm;

Установена дължина на вълната: 600 nm.

Течният цитометричен анализ показва, че TRA-8 оцветява приблизително 30% от клетките COS-7, преобразувани с вектора DR5, както е показано на плътната хистограма на фиг.1с. Този процент съответства на ефективно преобразуване, което е установено чрез анализ на преобразуването чрез зелен флуоресцентен протеин (GFP) (данни не са изложени). TRA-8 не оцветява значително клетки, преобразувани както с DR4 (плътна хистограма), така и с контролен вектор (пунктирана хистограма), което доказва, че TRA-8 е специфичен за клетъчната повърхност DR-5.

Въпреки, че клетъчната експресия на DR5 при туморни клетки е обширно изследвана на mRNA нива (Rieger J. et al. l .FEBS Lett 1998 Mayl; 427(1); 124-8), повърхностната експресия на DR5 не е добре изяснена. (Gibson S.B. et al. l:Mol Cell Biol 2000 Jan; 20(l):205-12; Kim K. et al. 1: Clin

Cancer Res 2000 Feb; 6(2):335-46). По този начин наличността на моноклоналното антитяло aHTH-DR5 ни позволява да изследваме повърхностните нива на DR5 и да съпоставим експресията с податливостта на клетките към TRAIL-медиираната апоптоза. Следният панел от клетки (1 х 10⁶) е инкубиран с 10pg/ml с афинитетно-пречистен TRA-8 при стайна температура за 30 минути и след това оцветен с PE-сдвоен анти-миши IgGl (Pharmingen) за още 30 минути. Чрез FACS vantage течен цитометър са анализирани 10,000 жизнеспособни клетки при следните условия:

Възбудена дължина на вълната: 488 nm;

Установена дължина на вълната: 600 nm.

Петте тествани кръвни клетъчни линии са клетки Jurkat, СЕМ-6, Molt-4, Н-9 и U937. DR5 експресията е забележима на повърхностите на клетките Jurkat, СЕМ-6, Н-9 и U937, но както е показано на фиг.2а и 2а’ тя е съвсем незабележима на повърхността на клетките Molt-4. Въпреки, че високите нива на експресията на DR5 RNA са изследвани преди (43), анализът FACs доказва, че тези клетки не проявяват високи нива на повърхността на DR5. Това означава, че експресията на клетъчната повърхност на DR5 не съответства на транскрипционалната експресия на DR5, която не е неочаквано за този рецептор. Нивата на експресията на клетъчната повърхност на DR5 могат да бъдат специфични към произхода на клетката, тъй като повечето от клетките с кръвен произход проявяват ниски нива, докато повечето клетки от глиома и простата проявяват високи нива на DR5

Моноклоналното антитяло TRA-8 е използвано за да се определи ролята на DR5 при причиняването на TRAIL-медиирана апоптоза чрез изследване на експресията на неговата клетъчната повърхност при панел от различни типове човешки туморни клетки, така както и податливостта на тези клетки към TRAIL и TRA-8 -медиирана апоптоза. Т клетки от първична периферална кръв не проявяват значителни нива на DR5 на клетъчната повърхност и са резистентни към TRAIL и TRA-8 -медиирана апоптоза (фиг.2а, 2а’ и За’). Въпреки, че всичките пет тествани човешки клетъчни

линии от Т-левкемия проявяват забележими, макар и относително ниски нива на DR5 на клетъчната повърхност две от тях (Jurkat и СЕМ-6) са силно податливи на TRAIL и TRA-8 -медиирана апоптоза, което показва, че само DR5 е достатъчен да причини апоптоза на тези клетки. Клетките Molt-4 и U937 са частично податливи на TRAIL-медиирана апоптоза, но са относително резистентни на TRA-8-медиирана апоптоза, от което следва, че при преобразуването на сигнала за апоптоза трябва да бъдат включени и други TRAIL рецептори. Клетките Н-9 са резистентни към TRAIL и TRA-8 медиирана апоптоза, което играе ролята на преграда, осъществена чрез интрацелуларна анти-апоптоза пътека.

Панелът от клетки, включващ човешки злокачествени глиома клетъчни линии Hs683, U251MG, D3MG, D54MG, U373MG, CH235MG, U87 и нормални човешки астроцити е осигурен от д-р Янси Джилепси от отделението по неврохирургия на университета на Алабама в Бирмингам. Клетъчните линии от рак на простатата при човек са осигурени от д-р Уйлям Гризъл от отделението по патология на университета на Алабама в Бирмингам, който е получил тези клетъчни линии от American Type Culture Collection. Клетъчните линии с Т-клетки от човешка левкемия, В-клетки от лимфома, HepG2 Jurkat (American Type Culture Collection TIB-152) и CCRFCEM CEM-6 (American Type Culture Collection CCL-119); моноцит клетъчни линии, U937 (American Type Culture Collection CRL-2367) са закупени от American Type Culture Collection. Всички посочени клетъчни линии са култивирани в RPMI 1640, допълнена с 10% FCS. Човешката астроцитома клетъчна линия 1321N1 е осигурена с любезното съдействие на д-р Ричард Джоуп от отделението по психиатрия на университета на Алабама в Бирмингам и е култивирана в DMEM, допълнена с 5% FCS.

Разтворимия рекомбинантен човешки TRAIL, закупен от Alexis Corporation (San Diego, СА) е синтезиран протеин, включващ екстрацелуларен домейн на човешки TRAIL (аа остатъци от 95 до 281), синтезиран при N-край към Flag-tag и 8 амино киселинен линкер пептид. За разлика от описания преди His-tagged TRAIL това отделно получаване на

TRAIL не причинява силен апоптоничен отговор при Jurkat клетките и се нуждае от антитялото анти-FLAG като крослинкер, за да се усили апоптозата. Антитялото анти-FLAG е също закупено от Alexis.

Всички от десетте тествани човешки злокачествени глиома клетъчни линии проявяват забележими нива на DR5 на клетъчната повърхност. Повечето проявяват от средни до високи нива на DR5, както е показано на фиг.2Ь. Три линии - D-54MG, U373MG и CH-235MG проявяват високи нива на DR5, докато шест линии - Hs-683, U251-MG, D37-MG, U87, SMK1 и 1321N1 проявяват средни нива на DR5. Само една клетъчна линия - Н-465 проявява ниски нива на DR5. Всички три клетъчни линии с клетки от рак на простатата проявяват високи нива на DR5, което е показано на фиг.2с.

Също като нормалните първични Т клетки, първичните В клетки не проявяват значителни нива на DR5 и не претърпяват апоптоза след третиране както с TRAIL, така и с TRA-8 (фиг.2с1). Още три тествани клетъчни линии (SKW6.4, ЕВ-3 и Raji) освен четирите В лимфома клетъчни линии проявяват относително високи нива на DR5 и са силно податливи на TRAIL и TRA-8 -медиирана апоптоза. Четвъртата клетъчна линия, Daudi проявява много ниски нива на DR5 и е много по-слабо податлива на TRAIL и TRA-8 -медиирана апоптоза. Въпреки, че първичните астроцити не проявяват забележими нива на DR5 на клетъчната повърхност (фиг.2Ь’), всички тествани четири глиома клетъчни линии проявяват високи нива на DR5. По-високото ниво на експресия на DR5 на глиома клетки спрямо Т и В клетки не се съпровожда със значително по-висока податливост към TRAIL и TRA-8 -медиирана апоптоза, което подсказва, че нивото на експресия на клетъчната повърхност на DR5 не е непременно свързано с нивото на апоптоза на туморни клетки. RT-PCR, който служи за установяване на нивата на сигналите на DR5, DR4 и DcR2 открива сигнали при всички тествани туморни клетки (таблица 1). Въпреки това, като цяло първичните нормални клетки са проявили относително ниски нива на DR5 в сравнение с трансформираните туморни клетки.

Таблица 1: RT-PCR анализ на експресията на TRAIL рецептор*

Клетки	DR5	DR4	DcR2
Първични Т клетки	<0.001	<o.ooi	0.015
Jurkat	0.10	<0.001	0.21
СЕМ-6	0.50	0.59	0.25
Molt-4	0.10	<0.001	0.05
Н-9	0.73	0.61	0.07
Първични В клетки	<0.001	<0.001	0.024
SKW6.4	0.95	0.66	0.45
ЕВЗ	0.40	<0.001	0.35
Raji	0.55	0.11	0.45
Daudi	0.73	0.36	0.63
Нормални астроцити	0.05	<0.001	0.12
SH683	0.56	0.96	0.14
U87	0.44	0.56	0.21
D54	1.15	0.46	0.12
1321N1	0.25	0.35	0.05

* Пълната RNA е изолирана от клетки и RT-PCR е изпълнен както е описано в “Методи”. PCR продуктите са отделени в 3% агарозен гел и анализирани чрез Fluor-S MAX Multilmager System (BioRad). Стойностите са представени като коефициент спрямо β-актин.

Пример 8. Причиняване на апоптоза in vitro при злокачествени клетки.

За да се установи дали TRA-8 причинява апоптоза при трансформирани клетки in vitro всички ОР5-позитивни туморни клетки са изследвани за тяхната податливост на апоптоза, причинен както от TRA-8, така и от TRAIL.

Целевите клетки (1 х 10³ на колба) се култивират върху съдове 96well при наличието на посочените концентрации от разтворим TRAIL плюс

крослинкер (Alexis) или TRA-8 при 37°С за една нощ. Клетъчната жизнеспособност е установена чрез (1) комплект ATPLite според инструкциите на производителя (Packard Instruments, Meriden, CT); (2) комплект MTT клетъчна пролиферация / жизнеспособност (Sigma) или (3) PI оцветяване на мъртвите клетки и анализ чрез течна цитометрия. В края на култивирането клетките са оцветени с 10pg/ml PI и PI отрицателните клетки са пропуснати като жизнеспособни клетки. За анализ на кондензирания нуклеи от хепотоцити клетките са оцветени с 10 ng/ml Hoechst 33352 (Молекулярни образци) и са анализирани чрез течна цитометрия.

Антитялото TRA-8 е годно да причини апоптоза при повечето от злокачествените човешки глиома клетъчни линии (9/10), при 2 от 3 клетъчни линии на ракови клетки от простата и при 2 от 4 ОР5-позитивни кръвни клетъчни линии. То не причинява апоптоза при клетъчната линия Molt-4, която проявява почти незабележими нива на DR5 на клетъчната

повърхност. Нивата на податливост на клетките към TRAIL-медиирана апоптоза обаче варират значително при различните клетъчни линии.

Изменчивостта на податливостта на клетките към антитялото TRA-8, причиняващо апоптоза навежда на извода, че въпреки, че е необходимо минимално ниво на експресия на DR5 на клетъчната повърхност нивото на експресията на DR5 на клетъчната повърхност не е непременно найсъщественото за податливостта и има и други фактори, които влияят на този процес. Въпреки, че всички глиома клетки обикновено проявяват значително по-високи нива на повърхностния DR5 отколкото кръвните клетки, податливостта на глиома клетките към причинена чрез TRA-8 апоптоза не нараства пропорционално в сравнение с кръвните клетки. Податливостта на пет от глиома клетъчни линии D-37MG, D54-MG, U373MG, CH235-MG и 1321N1 към TRA-8-медиирана апоптоза е висока и е равна на тяхната податливост към TRAIL-медиирана апоптоза, както е показано на фиг.ЗЬ. Две от глиома клетъчните линии Н-456 и SMK1 са помалко податливи на апоптоза, причинен чрез TRA-8. В случая с клетките Н456 повърхностната експресия на DR5 е ниска, въпреки това повърхностната експресия на DR5 при SMK1 е сходна на по-податливите клетъчни линии, от което следва, че при установяването на податливостта към TRAILмедиирана апоптоза играят роля и други механизми. Въпреки, че всичките

три клетъчни линии с клетки от рак на простата са проявили високи нива на DR5, клетките Du 145 са по-чувствителни към причинена чрез TRA-8 апоптоза, клетките РСЗ са частично чувствителни, докато клетките LnCAP са изцяло резистентни, което е показано на фиг.Зс. Измежду кръвните клетки е установено, че Jurkat и СЕМ-4 са много податливи на TRA-8 апоптоза, както е показано на фиг.2а, въпреки че е установено, че тези две клетъчни линии проявяват ниски нива на DR5. Въпреки, че DR5 е забележим при U937 клетки, тези клетки са резистентни на причинена чрез TRA-8 апоптоза. По подобен начин, въпреки, че клетките Н-9 проявяват забележими нива на DR5, те са резистентни на причинена чрез TRA-8 апоптоза. Тези резултати показват за наличието на регулаторни механизми, които влияят на DRS-медиираната апоптоза.

Както е описано в процедурите от примери 1-3 са получени допълнителни повърхностно свързващи антитела aHTH-DR5. Заедно с TRA-8 са изследвани две допълнителни aHTH-DR5 антитела, наречени TRA-1 и TRA-10, за да се сравни способността при причиняване на апоптоза и действие като агонист или обратно, да блокира TRAIL-медиираната апоптоза и така да действа като антагонист. За да се определи агонистичната и/или антагонистичната активност на трите антитела aHra-DR5, обозначени като TRA-1, ТРА-8 и TRA-10 за целеви клетки са използвани човешки Jutkat клетки. Както е показано на фиг.4 клетъчната жизнеспособност е около 90%, 70% и 20% за TRA-10, ТРА-8 и TRA-1, съответно след инкубация за една нощ с 2.5 pg/ml. TRA -8 причинява силен апоптоничен, зависим от дозата отговор, TRA-1 причинява само умерен апоптоничен отговор, a TRA-10 причинява само слаб отговор. Затова TRA-8 е класифицирано като агонистично aHTH-DR5 антитяло. На фиг.4 жизнеспособността на човешките Jutkat клетки е изобразена като функция на дозата на причинената чрез TRAIL апоптоза. TRA-10 блокира апоптозата при човешките Jurkat клетки в

значителна степен при изследване на причинена чрез TRAIL апоптоза при ниски дози. Така TRA-10 е класифициран като антагонистично aHTH-DR5 антитяло. TRA-1 е депозиран в American Type Culture Collection под депозитен номер РТА-1741. Така също и TRA-10 е депозиран в American Type Culture Collection под депозитен номер РТА-1742.

Податливостта на пет от глиома клетъчните линии D-37MG, D54MG, U373-MG, CH235-MG и 1321N1 на причинена чрез TRA-8 апоптоза е равна на тяхната податливост на TRAIL-медиираната апоптоза, както е показано на фиг.ЗЬ, което означава, че причинената чрез TRAIL апоптоза при тези клетки се осъществява преди всичко през DR5. Две от глиома клетъчните линии Hs683 и U251-MG са резистентни на причинена чрез TRAIL апоптоза, но са частично чувствителни на причинена чрез TRA-8 апоптоза, което означава, че функцията на рецепторите-примамка при тези клетки и това използване на антитялото TRA-8 шунтират този регулаторен механизъм. При клетъчни линии с рак на простатата, въпреки променливата чувствителност към апоптоза, причинена чрез TRA-8 и съответствието на чувствителността на клетките към апоптоза, причинена чрез TRAIL, означава че DR5 играе главна роля при TRAIL-медиираната апоптоза при ракови клетки от простатата. При кръвните клетки е установено, че Jurkat и СЕМ-6 са много податливи на TRA-8-медиираната, така и на TRAILмедиираната апоптоза. Нивото на апоптоза, причинено чрез TRA-8 е сравнимо с това, причинено чрез TRAIL, което е показано на фигури 2а и За’. Само една от глиома клетъчните линии — U87 и две от кръвните клетъчни линии - U937 и Molt-4 проявяват чувствителност към причинена чрез TRAIL апоптоза и са по-малко чувствителни или резистентни на причинена чрез TRA-8 апоптоза. Една клетъчна линия - Н-9 проявява забележими нива на DR5, но е резистентна на причинена чрез TRA-8 и TRAIL апоптоза. Докато за причиняване на апоптоза чрез TRA-8 са необходими минимални нива на експресия на DR5, нивата на експресия на DR5 не означават непременно податливост на клетките към TRA-8 медиираната апоптоза; рецепторите-примамки играят роля при

модулираното на TRAIL-медиираната апоптоза при някои клетки, но не играят главна роля при повечето тествани клетки, както се предполагаше до този момент; антитялото TRA-8 шунтира ефекта на рецепторите-примамки; при трансформирани клетки могат да се получат функционални мутации на рецептора DR5; и накрая при дефиниране на податливостта на клетките към TRAIL и DR5 -медиирана апоптоза интрацелуларните регулаторни механизми могат да бъдат поне толкова, ако не и по-важни, отколкото рецепторите примамки.

Проучванията до този момент са показали, че mRNA за DR5 е широко разпространена при нормалните тъкани⁷. За да се оцени експресията на DR5 на белтъчно ниво е изпитана хомогенезата на панел от нормална човешка тъкан ( Geno Technology, St. Louis, МО) c антитялото TRA-8 при анализ Western blot. От девет нормални човешки тъкани тъканта от мозък е слабо позитивна (фиг.5а, пътека 2). Протеинът DR5 не е забележим при TRA-8 реактивност в черния дроб (пътека 1), бял дроб (пътека 3), бъбрек (пътека 4), далак (пътека 5), тестиси (пътека 6), яйчник (пътека 7), сърце (пътека 8) или панкреас (пътека 9). За разлика от това всичките 13 човешки ракови тъкани са оцветени позитивно с TRA-8 (фиг.5Ь): рак на яйчник (пътека 1), бял дроб (пътека 2), черен дроб (пътека 3), ректум (пътека 4), шия (пътека 5), кожа (пътека 6), тестиси (пътека 7), щитовидна жлеза (пътека 8), матка (пътека 10), стомах (пътека 11), ларингофаринкс (пътека 12) и панкреас (пътека 13). Освен това имунохистохимията на нормални и ракови тъкани с TRA-8 потвърждава, че с изключение на няколко отделни позитивни клетки при далака експресията на DR5 при нормални тъкани от гърда, бял дроб и далак не е забележима (фиг.5с). Съответните ракови тъкани като дуктален индилтриран карцином на гърда, рак на белия дроб и лимфома са реагирали позитивно с TRA-8 (фиг.5с). От общо 22 изследвани ракови тъкани 5 от 6 от рак на гърдата, 2 от 2 на шия, 4 от 5 от рак на черен дроб, 5 от 8 от лимфома, 2 от 2 от рак на бял дроб и 2 от 2 от рак на простата са реагирали позитивно с TRA-8. Тези резултати са в съответствие с резултатите от течния цитометричен анализ и показват, че канцерогенните тъкани проявяват по-високи нива на протеина DR5, отколкото нормалните тъкани.

Пример 9. Туморна активност на TRA-8 in vivo.

Поради различни причини много агенти, които са изглеждали обещаващи при изследванията in vitro не се оказват ефикасни in vivo. Затова е важно да се провери ефикасността на TRA-8 и при животински модел in vivo. За да се извърши това анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 е приложено върху мишки, носители на човешки ксенографти, които проявяват човешката DR5 молекула. Използваните мишки са от 6 до 8 седмични NOD/SCID (Jackson Laboratory), които се ваксинират подкожно с човешки астроцитома клетки 1321N1 (1х10⁷) или се ваксинират интравенозно с човешки Jurkat клетки от левкемия (1х10⁶). На втория ден след туморната ваксинация мишките са ваксинирани интравенозно с TRA-8 (100 pg). Пет дни след третирането с TRA-8 нарастването на тумора 1321N1 е установено чрез размера и теглото на туморната маса. Нарастването на Jurkat клетките е установено чрез теглото на далака и процента на човешки CD3-позитивни Jurkat клетки в далака на ваксинираните животни. Взети са тъкани за биопсия и са изследвани хистологично.

Ранното третиране с единична интравенозна доза от 100 pg TRA-8 на първия ден след туморната ваксинация изцяло възпрепятства клетките 1321N1 от формиране на масивен тумор (фиг.ба). Късното третиране с три дози от 100 р g TRA-8 на първата седмица след туморната ваксинация намалява туморното тегло 4 пъти или повече (фиг.бЬ). При животни, третирани с TRA-8 в по-ранен момент туморна формация не се забелязва (фиг.бс, горен панел). Хистологичният анализ разкрива драматично дегенерирана туморна тъкан при животни, третирани с TRA-8 (фиг.бс, долен панел). По подобен начин лечението с TRA-8 инхибира разпространението на Jurkat клетките в далака, което се доказва чрез липсата на СОЗ-позитивни клетки в далака (фиг.бс!, бе). Хистологичният анализ на имплантирания тумор показва няколко отделни туморни клетки в меката тъкан при животни, третирани с TRA-8, докато контролния опит показва формиране на масивен тумор, което е показано на фиг.бс. При модел на Jurkat клетка броят на Jurkat клетките в далаците на третираните с TRA-8 животни е по-малък с 2% в сравнение с почти 10% в далака на контролните животни, което е доказано чрез течен цитометричен анализ на фиг.ба и CD3 оцветяване на фиг.бс.

Тези резултати потвърждават последните доказателства, че системното приложение на рекомбинантен TRAIL с крослинкинг инхибира нарастването на тумора in vivo (13). Това означава, че единична доза TRA-8 е силно ефективна при отстраняването на туморни клетки in vivo.

Тъй като анти-човешкото антитяло е използвано при миши модел, токсичността на третирането с TRA-8 не може да бъде определена. Въпреки това изследванията на приложението на TRAIL in vivo показват, че няма значителна токсичност, свързана с това лечение (13).

Пример 10. RA синовиалните клетки са податливи на причинена чрез TRAIL и TRA-8 апоптоза.

Повечето от досегашните изследвания на TRAIL-медиираната апоптоза са фокусирани върху злокачествени клетки. TRAIL-медиираната апоптоза според настоящото изобретение е също терапевтичена при автоимунни и възпалителни състояния като например RA.

10.1 Течен цитометричен анализ на експресията на клетъчната повърхност DR5 при RA синовиални клетки.

Експресията на DR5 при панел от осем първични култивирани синовиални клетки от пациенти с RA се сравнява с панел от осем първични култивирани синовиални клетки от пациенти с остеоартрит (ОА). Осемте човешки първични RA синовиални клетъчни култури RA-1014, RA-1016, RA-1021, RA-512, RA-707, RA-811, RA-716 и RA-929 са осигурени от д-р М. Отцуки (Sankyo Co. Ltd., Tokyo, Japan) и култивирани в DMEM, допълнена с 10% FCS, пеницилин, стрептомицин и глутамин. Седем от ОА синовиалните първични клетъчни култури са изолирани от синовиалните тъкани на ОА пациенти посредством стандартен колагенен метод и култивирани при същите условия. Междинния брой на всички първични клетки е под 10.

Експресията на DR5 е установена чрез анализ FACs, което е описано в пример 5.

Всички от първичните култури на RA клетки са проявили високи нива на повърхността DR5 и в нивата на експресия между тези синовиални

клетки, изолирани от различни пациенти има малки вариации, което е показано на фиг.7а. За разлика от това повърхностната експресия DR5 на повърхността на синовиални клетки, изолирани от ОА пациенти е много ниска или незабележима, както е показано на фиг.7Ь. Установено е, че вУ40-трансформираните синовиални клетки проявяват високи нива на DR5 в сравнение с тези, проявени от RA клетките. Обратно, нетрансформираните фибробластни клетки проявяват ниски нива на DR5, сравнени с тези, проявени от ОА клетки на фиг.7Ь.

10.2 Податливост на RA синовиални клетки към TRA-8 или TRAIL медиирана апоптоза.

Най-общо всички синовиални клетки, изолирани от RA пациенти са податливи на апоптоза, причинен чрез TRAIL и чрез антитялото анти4Ж5 и всички ОА клетки са резистентни на апоптоза, причинен чрез TRAIL и чрез антитялото aHTH-DR5, което е показано на фигури 8а, Ь. Тези изследвания показват, че антитялото TRA-8 се насочва към изменените клетки и ги предпочита пред нормалните клетки. Освен това моделът на податливостта или резистентността към апоптоза, причинена чрез TRAIL е свързан с този, причинен чрез антитялото анти4Ж5, което означава, че синовиалните клетки първо използват DR5 за да стартират TRAIL апоптоза.

Както бе описано при злокачествените клетки, податливостта към апоптоза, причинена чрез TRAIL или антитялото aHra-DR5 варира при RA синовиалните клетки, въпреки че проявяват сходни нива на DR5. RA-512 и RA-707 са най-податливи, тъй като над 80% от клетките умират при концентрации на TRAIL или TRA-8 под 20 ng/ml. RA-1014, RA-818, RA-716 и RA-929 са между тези със средна податливост към TRAIL или TRA-8 с почти 100% клетъчна смърт при наличие на високи концентрации (>50 ng/ml) на TRAIL или TRA-8. При клетки RA-1916 и RA1021 въпреки, че повечето от клетките (над 60%) умират при ниска доза на TRAIL или TRA8, част от тях оцеляват при високи концентрации на TRAIL или TRA-8, което показва, че субпопулацията от клетки е резистентна на TRAILмедиирана апоптоза. За разлика от това всички ОА клетки са по-малко податливи на причинена чрез TRAIL или TRA-8 апоптоза. При OA52F и OA69F загиват не повече от 60% от клетките, дори и при наличие на високи концентрации на TRAIL или TRA-8. Клетките ОА72М са изцяло резистентни на причинена чрез TRAIL или TRA-8 апоптоза.. Трансформираните синовиални клетки SV40 са също податливи на причинена чрез TRAIL или TRA-8 апоптоза (данни не са показани). Обратно на това не трансформираните фибробластни клетки се оказват резистентни към TRAIL и TRA-8.

Беше показано, че DR5 използва зависима от FADD/каспаза 9 пътека за да стартира апоптоза (44). За да се установи зависимостта от каспаза на DRS-медиирантаа апоптоза на RA синовиални клетки RA клетки са култивирани с TRAIL или антитялото анти-DRS при наличието на специфични каспаза инхибитори. От осем тествани каспаза инхибитори инхибиторите каспаза 6, 8 и 10 могат да инхибират апоптоза при RA синовиални клетки, причинен чрез TRAIL и DR5, както е показано на фиг.9, което означава, че тези три каспаза участват при DR5-MeanHpaHa апоптоза.

10.3 TRA-8 или TRAIL причиняват NF-кЬ активност при RA синовиални клетки без увеличаване на отслабването на MMRs.

Съществуват важни доказателства в подкрепа на концепцията, че има близка връзка между сигналите за апоптоза и сигналите за пролиферация (45). Установено е, че DR5 е в състояние да активира пътеката NF-кЬ в допълнение към преобразуването на сигнала за апоптоза и това NF-кЬ активиране може да преобразува анти-апоптоза сигнал. След това е проведен гел-шифт анализ. Клетките са стимулирани с 50 ng/ml от рекомбинантен разтворим TRAIL, Fas лиганд при наличието на 1 mg/ml ускорител или 50 ng/ml TRA-8 за посоченото време. Ядрените екстракти се получават и инкубират с двойно-оцветен [³²Р]-означен олиго-DNA образец.

Резултатите се анализират чрез cyclobe phospha-imager (TopCount NXT, Packard Instrument Company, CT). След като RA синовиалните клетки са инкубирани с TNF-α или TRAIL NF-кЬ е активиран в зависимост от времето. Антитялото TRA-8 е в състояние силно да активира NF-кЬ. За разлика от това Fas лиганд е неспособен да причини NF-кЬ активност, както е показано на фиг. 10а.

По този начин, въпреки че TRAIL и антитялото TRA-8 причиняват силен апоптоничен отговор при RA синовиални клетки те също така активират и NF-кЬ, като се смята, че тази NF-кЬ активност допринася за провъзпалителната роля на TNF-α при RA. Така, че е възможно TRAIL, като TNF-a да служи като провъзпалителен цитокин. За да се установи дали има подобен биологичен резултат за NF-кЬ активност, причинена чрез TRAIL и TNF-a, чрез ELISA е установена продукцията на MMPs. Синовиалните клетки са култивирани в среда самостоятелно или с 50 ng/ml интерлевкин 1 Ь, 10 ng/ml TNF-a, 50 ng/ml TRAIL или 50 ng/ml TRA-8 за една нощ. Нивата на ММР-1 и ММР-3 при супернатантите от културата се определят чрез комплекта ELISA.

Когато RA синовиалните клетки се инкубират с провъзпалителен цитокин, TNF-a или IL-lb продукцията на ММР-1, 3 и 13 се увеличава в сравнение с контролна среда, което е показано на фиг. 10 Ь, с. За разлика от това третирането с TRAIL или анти-DRS антитяло не е свързано с увеличено отслабване на MMPs.

Пример 11 А. Неуспех при причиняване на хепатоцелуларна токсичност.

За 24 часовите анализи на клетъчната жизнеспособност от In Vitro Technology (Baltimore, MD) са закупени пресни нормални хепатоцити в съдове 96-well . Хепатоцитите са култивирани в среда Hepatocyte Culture, съдържаща 1 pg/ml разтворим TRAIL или TRA-8. За 6 часовите анализи на жизнеспособността от пресни хирургически образци са изолирани нормални хепатоцити или хепатоцелуларни ракови клетки, събрани от UAB Център за набиране на тъкани. Всички реагенти за изолиране на човешките хепатоцити, включително хепатоцитен буфер за напръскване, среда за разтваряне, измиваща среда и прикрепваща среда са закупени от Gibco. Предметните стъкла с тъкани са разтворени в среда за разтваряне на хепатоцити при 37°С с разбъркване (50 rpm) за един час. Изолираните хепатоцити се събират чрез центрофугиране при ниска скорост (50 g, 3 мин.) и са измити с измиваща среда за хепатоцити шест пъти. Единична клетъчна суспензия от хепатоцити е култивирана в прикрепваща среда, съдържаща 10% FSC в съдове 96-well Matrigel (BD) за шест часа. Не прикачените хепатоцити се отстраняват чрез двойно измиване с предварително затоплена прикрепваща среда. След това прикачените хепатоцити се инкубират с различни концентрации от разтворим TRAIL или FasL при наличието на крослинкер - TRA-8 или CHI 1 за 6 часа.

TRAIL има поне два рецептора (DR4 и DR5), които са способни да причинят апоптоза. TRA-8 се използва за да се установи дали самостоятелен крослинкинг на DR5 е достатъчен за да се причини апоптоза при нормални хепатоцити. Експресията на DR5 на протеиново ниво се изследва първоначално при пет нормални човешки тъкани от черен дроб и пет тъкани от рак на черен дроб чрез имунихистохимия посредством TRA-8. Разрезите от нормалните чернодробни тъкани проявяват нормална архитектура и клетъчна морфология с Н&Е оцветяване (фиг. 11 а, горен панел в ляво). За разлика от това тъкан от човешки хепатоцелуларен карцином реагира позитивно в TRA-8 при образец, в съответствие както с клетъчна мембрана, така и с цитоплазмично присъствие на DR5 на канцерогенните клетки. Човешката хепатоцелуларна карциномна клетъчна линия HepG2 е също позитивна към DR5. Тези резултати се получават при всички пет нормални чернодробни тъкани и само една (чернодробен аденом) от петте тъкани от рак на черен дроб е DR-5 отрицателна. Резултати съвпадат с данните от Western blot, показани на фиг.5а, така, че наред с другите нормални тъкани нормалната тъкан от черен дроб не проявява значителни нива на протеина DR5. Анализът Western blot на изолирани, нормални човешки хепатоцити, изпробвани с TRA-8 не показва забележими нива на DR5.

Повърхностната клетъчна експресия DR5 на човешки хепатоцити чрез течен цитометричен анализ показва, че току що получените нормални хепатоцити не проявяват значителни нива на DR5 на клетъчната повърхност DR5 (фиг.lib, горни леви панели). Това не е установено и за нормални човешки хепатоцити, които са съхранени при ниски температури или поставени в краткотрайна култура. За разлика от това току що изолирани хепатоцелуларни карциномни клетки като клетки HepG2 проявяват DR5 на клетъчната повърхност. За сравнение при използването на Fas нормалните хепатоцити, хепатоцелуларните карциномни клетки и клетките HepG2 проявяват равни нива на Fas (фиг.1 lb, долни панели). Тези резултати са като тези, получени чрез имунохистохимия и Western blot и показват, че DR5 на клетъчната повърхност е силно изразена за канцерогенни клетки от черен дроб, но не и при нормални хепатоцити. Наличието на mRNA нива за DR4, DR5, DcRl и DcR2 при човешки хепатоцити, показано чрез RT-PCR²³ води до извода, че човешките хепатоцити могат да проявяват много ниски нива на протеина DR5, които са под прага за откриване чрез TRA-8.

За да се установи дали TRA-8 причинява хепатоцелуларна токсичност е изследвана податливостта на нормални човешки хепатоцити към апоптоза, причинена чрез TRA-8 и чрез разтворим TRAIL плюс крослинкер. Когато нормалните хепатоцити са култивирани при наличието на високи концентрации на TRAIL посредством анализите ATPLite (фиг. 12а) и МТТ се наблюдава намаляване на клетъчната жизнеспособност в зависимост от времето. TRAIL-медиираната клетъчна смърт при нормални хепатоцити би могла да се наблюдава най-рано четири часа след добавянето на TRAIL. В края на 24-часовото култивиране повече от 80% от хепатоцитите са унищожени от TRAIL. За разлика от това по време на същия период на култивиране TRA-8 не причинява значителна клетъчна смърт при нормалните хепатоцити. Кондензираният нуклеи, оцветен с Hoechst, характеристика на апоптозата е нараснал при третирането с TRAIL, но не и при третираните с TRA-8 хепатоцити (фиг.12Ь). Броят на апоптоничните хепатоцити е в съотношение с намаляващата клетъчна жизнеспособност, което е установено чрез анализа ATPLite, от което следва, че причинената чрез TRAIL-медиираната клетъчна смърт чрез апоптоза. Това се потвърждава и от способността на Z-VAD да инхибира TRAILмедииранарата токсичност на хепатоцитите. Тъй като циклохексимид е мощен ускорител на апоптоза, ефектът от тази съставка е проучен върху третирани с TRAIL и TRA-8 хепатоцити. По време на четири часовото култивиране циклохексамида значително ускорява клетъчната смърт на хепатоцитите чрез TRAIL при повече от 70% умъртвени хепатоцити чрез TRAIL при наличието на циклохексимид (фиг.12с). Въпреки това третирането с циклохексимид не може да ускори TRA-8-медиираната клетъчна смърт на хепатоцити. За да се сравнят характеристиките на апоптоза, причинена чрез TRA-8 с тези на апоптоза, причинена чрез TRAIL при хепатоцитите са инкубирани нормални хепатоцити и ракови клетки с различни концентрации от разтворим TRAIL с крослинкер или с TRA-8. По време на 6-часовия период за култивиране TRAIL причинява умерен апоптоничен отговор при нормалните хепатоцити. Над 20% от хепатоцитите са убити при наличието на 500 ng/ml TRAIL (фиг.12d, горе в ляво). Третирането с TRA-8 на нормални хепатоцити не предизвиква каквато и да е значителна клетъчна смърт през същия този период от време. За разлика от нормалните хепатоцити първичните хепатоцелуларни карциномни клетки (фиг.12d, горе в средата) и HepG2 клетки (фиг.12d, горе в дясно) са силно податливи на TRAIL и ТРА-8 -медиирана апоптоза. Над 80% от хепатоцелуларните карциномни клетки и почти 100% от клетките HepG2 са унищожени по време на осемчасовото култивиране. Тези резултати показват, че нормалните хепатоцити са изцяло резистентни на TRA-8медиирана апоптоза и са по-малко податливи на TRAIL-медиирана апоптоза, отколкото чернодробните раковите клетки. При използването на Fas лиганд и анти-Fas антитяло (СН-11) не съществува значителна разлика в податливостта на Fas-медиираната апоптоза между нормалните хепатоцити, хепатоцелуларните карциномни клетки и клетките HepG2 (фиг.12d, долни панели).

Сравнителен пример 11. Причиняване на хепатит in vivo чрез човешки мембранно свързан TRAIL

Между 8-10 седмични женски В6 мишки са интравенозно инжектирани с 109 pfu от Ad/hTRAIL с еднакъв брой на Ad/Tet-on. Мишките са захранени с различни концентрации тетрациклин чрез водата за пиене непосредствено след ваксинирането с аденивирусни вектори. Пораженията върху черния дроб са установени чрез серумните нива на AST, като е използван AST диагностичен комплект (Sigma). Експресията на TRAIL е определена чрез анализа Northern blot.

За да се установи дали мембранно свързаната форма на TRAIL причинява поражения на черния дроб in vivo е конструиран рекомбинантен аденовирусен вектор, кодиращ пълната дължина на човешки TRAIL (Ad/hTRAIL), чиято експресия е под контрола на тетрацилкин-промотер. Двайсет и четири часа след интравенозното ваксиниране на мишките В 6 с Ad/hTRAIL чрез анализа Northern blot е наблюдавана причинената чрез тетрациклин експресия на човешки TRAIL в черния дроб като зависимост от времето (фиг. 13а). Нивата на експресия на TRAIL съответстват с пораженията върху черния дроб, което е показано като зависимо от тетрацилкина нарастване на серумните нива на трансаминати отново в зависимост от времето (фиг.13Ь). Тъй като ваксинацията с аденовирусен вектор сама по себе си може да увеличи податливостта на хепатоцитите към TRAIL-медиираната апоптоза, хепатоцитите от мишки, ваксинирани с Ad/TRAIL са изолирани и тествани за TRAIL-медиирана клетъчна смърт. Не е открита значително нараснала клетъчна смърт на инфектираните с Ad/TRAIL хепатоцити в сравнение с тези на контролна мишка (фиг.13с, ляв панел). Освен това ваксинираните с Ad/TRAIL мишки не проявяват повишени поражения на черния дроб след интравенозно инжектиране на разтворим човешки TRAIL. Следователно хепатита, причинен чрез Ad/TRAIL е осъществен посредством високи нива на експресията на TRAIL в неговата мембранна форма. Хистологичния анализ на разрезите от черен дроб показва, че пораженията върху хепатоцитите са видими най-рано 24 часа след векторното ваксиниране (фиг. 13d) и се задържат поне 7 дни (фиг.13е). Тези патологични изменения в черния дроб са зависят също и от терацилкина и от дозата. Ранната фаза, 24 часа след третирането на причинените чрез TRAIL поражения на черния дроб се характеризира с фокусиране на некроза. На този етап не се наблюдава инфилтрация на възпалителни клетки, но се среща хеморагия. На седмия ден след ваксинирането се забелязват дифузни поражения на черния дроб с маркирана лобуларна дисарея, остра дегенерация на хепатоцитите с ирегуларно групирана цитоплазма и големи чисти пространства и забележими апоптоза и некроза. Характерна особеност на този етап е обширната инфилтрация на моно нуклеарни клетки. Тези резултати показват, че човешки TRAIL в неговата мембранна форма е състояние да причини поражения на черния дроб in vivo. Въпреки склонността на човешкия TRAIL да причини силен хепатит при мишки, той не предизвиква летален изход. За разлика от това мишките, ваксинирани със сходни контролирани от тетрациклкин вектори, кодиращи Fas лиганд развиват светкавичен хепатит с масивни апоптоза и некроза на хепатоцитите, придружени от тежка хеморагия и смъртност, които зависят от дозата на тетрациклина до 72 часа след ваксинацията. Степента на смъртност достига до 100% в рамките на 48 часа при тези подгрупи, получили 3 mg/ml или повече тетрациклин. За сравнение всички мишки, които са получили Ad/hTRAIL, без значение от дозата на тетрациклина са все още живи четири седмици след ваксинирането. Следователно in vivo мембранно свързаната форма на TRAIL е по-слаб причинител на хепатоцелуларни поражения, отколкото Fas лиганд. Това означава още, че TRAIL може да причини поражения на черния дроб чрез механизъм, който се различава от механизма, лежащ в основата на токсичността на Fas лиганд.

Пример 12. Активираните човешки Т и В клетки проявяват нараснали нива на DR5.

За да се установи дали DR5 играе роля при TRAIL-медиираната апоптоза на активирани Т и В клетки е изследвана клетъчната експресия на

DR5 върху неподвижни и активирани Т и В клетки чрез TRA-8. Не стимулираните човешки Т клетки в РВМС не проявяват значителни нива на DR5 (фиг. 14). 48 часа след стимулацията с анти-СОЗ или Con-А експресията на DR5 на клетъчната повърхност е значително нараснала. По същия начин не стимулираните В клетки проявяват много ниски нива на DR5. Стимулацията с анти-μ, а не с LPS води до нарастване на експресията на DR5 на клетъчната повърхност. Тези резултати показват, че активираните Т и В клетки проявяват по-високи нива на DR5 на клетъчната повърхност. Клетките са оцветени с 20 pg/ml TRA-8 и РЕ анти-миши IgGl.

Пример 13. Активираните Т и В клетки стават податливи на TRA-8-медиирана апоптоза.

За да се установи дали активираните Т и В клетки са податливи на TRA-8-медиирана апоптоза Т и В клетки от човешки РВМС се стимулират с анти-СОЗ или анти-μ за 48 часа. Жизнеспособните клетки и пролифериралите бластни клетки са събрани чрез градиентно центрофугиране и са инкубирани с различни концентрации на TRA-8. Не стимулираните Т и В клетки не са податливи на TRA-8-медиирана апоптоза (фиг. 15). Всички стимулирани Т и В клетки показват умерено нарастваща податливост към TRA-8-медиирана апоптоза, като 20% от клетките са унищожени от TRA-8 след култивиране за една нощ. Силно пролифериралите Т бластни клетки са дори по-податливи към TRA-8медиирана апоптоза. Повече от 70% от Т бластните клетки могат да бъдат унищожени от TRA-8. В сравнение с другите бластните В клетки са също по-податливи към TRA-8-медиирана апоптоза. Тези резултати показват, че активираните Т и В клетки са податливи на DR5-медиирана апоптоза.

Пример 14. TRA-8 намалява активираните Т клетки при човешки/SCID мишки.

За да се установи анти-Т клетъчната ефикасност на TRA-8 in vivo мишки NOD/SCID са интравенозно инжектирани с lxl 0⁸ човешки РВМС. Обикновено човешките Т клетки при SCID мишки се активират бързо в отговор на ксеногенетична стимулация. Човешки PBMC/SCID мишки се

инжектират интраперитонално с 100 pg TRA-8 и IgGl като контрола от деня на трансфера и ежедневно три дни след това. Пет дни след трансфера от далака са изолирани мононуклеарните клетки и са оцветени с анти-човешко CD3 антитяло, популацията на лимфоцитите преминава през течен цитометричен анализ и са анализирани CD3 човешки позитивните Т клетки. Приблизително 30% от далачните лимфоцити са човешки Т клетки, което е установено чрез оцветяването с анти-човешко CD3 при контролно третираните мишки. При третираните с TRA-8 мишки обаче (фиг. 16), между далачните лимфоцити са наблюдавани само няколко човешки Т клетки (помалко от 3%). Хистологичното изследване показва, че в далака на контролните мишки човешките Т клетки се осъществява репопулация само на няколко апоптонични клетки, което се забелязва чрез оцветяване TUNEL. За разлика от това в далака на третираните с TRA-8 мишки не се наблюдава репопулация с жизнеспособни човешки Т клетки, а по-скоро се забелязват много апоптонични клетки (фиг. 17). Тези резултати доказват, че TRA-8 притежава анти Т-клетъчна активност in vivo и показват приложението на изобретените антитела за лечение на GVH заболяване.

Пример 15 Антиракова терапевтична активност на TRA-8

15.1 Експресия на DR5 и функция при човешките ракови тъкани и клетъчни линии

i) Експресия на DR5 при човешки ракови тъкани чрез оцветяване с TRA-8. За да се установи дали раковите клетки и тъкани диференциално проявяват по-високи нива на DR5 с TRA-8 за имунохистохимия е оцветен панел от човешки ракови тъкани, включващ над 20 от рак на гърда, 6 на яйчник, 5 от дебело черво и 5 от простата. Множеството от тези ракови тъкани проявяват забележими DR5. Нивата на експресия на DR5 при тези ракови тъкани варират. Обикновено раковите тъкани проявяват по-високи нива на DR5, отколкото останалите. В допълнение експресията DR5 очевидно не е свързана с мутацията на р53.

й) Експресия на DR5 и функция при човешки ракови клетъчни линии (таблица 2). За експресия на DR5 на клетъчната повърхност и податливостта към причинена чрез TRA-8 апоптоза in vitro са изследвани 9 човешки клетъчни линии с рак на гърда, три клетъчни линии с рак на яйчник, три клетъчни линии с рак на дебело черво и три линии с рак на простата. 7 от 9 ракови линии на гърда, 3 от 3 ракови линии на яйчник, 3 от 3 ракови линии на дебело черво и 3 от 3 ракови линии на простата проявяват променливи нива на DR5 на клетъчната повърхност . От 9 ракови линии на гърда три са много податливи, три са средно и три са резистентни на TRA-8медиирана апоптоза. Всички три ракови линии от яйчник са много податливи. Една от трите ракови линии на дебело черво е много податлива, докато две имат средна сензитивност. Две от трите ракови линии от простата имат средна сензитивност, а една е резистентна.

Таблица 2. Експресия и функция на DR5 при човешки ракови клетки.

Клетъчна линия	Произход	Експресия1	Податливост2
2LMP	гърда	+	++++
LCC6	гърда	+++	++++
МВ468	гърда	+++	+++
МВ231	гърда	++	+++
ZR-75-1	гърда	+++	++
SKBR3	гърда	+	++
МВ453	гърда	++	+
ВТ474	гърда	+	-
DY36T2	гърда	-	-
Caov-3	яйчник	+	++++
OVCAR-3	яйчник	++	++++
Skov-3	яйчник	+	+++
WiDR	дебело черво	+++	++++
HST29	дебело черво	++	+++

Т84	дебело черво	+	++
РСЗ	простата	+++	++
LnCap	простата	+++	+
Du-145	простата	+++	+

Забележки: ¹ установено чрез течна цитометрия, клетките са оцветени с 20 pg/ml TRA-8 и са сравнени с контролно антитяло.² установено чрез анализ ATPLite. ++++ : над 80% унищожени, +++ : унищожени между 60-80%, ++ : унищожени между 40-60%, + : унищожени между 20-40%, : няма унищожени.

iii) Комбинирана цитотоксичност на TRA-8 с адриамицин. При няколко клетъчни линии от рак на гърда е изследван ефекта на адриамицин върху причиняването на апоптоза чрез TRA-8. Високите дози адриамицин проявяват адитивен ефект. Въпреки това обаче, при някои от резистентните към TRA-8 линии ниски дози от адриамицин синергистично увеличават причинената чрез TRA-8 апоптоза.

iv) Свързваща активност на TRA-8 към човешки ракови клетки in vitro и in vivo. Използван е радио изотоп, означен TRA-8. Свързващата активност на TRA-8 при клетъчна линия от рак на гърда е изследвана in vitro и in vivo при SCID мишки, имплантирани с тумор. Свързващата активност in vitro към раковите клетки е оценена като Kd стойност от 3 пМ, която е константа спрямо предишното измерване посредством ELISA и поне 50 пъти по-висока, отколкото при разтворимия TRAIL. In vivo TRA-8 е локализиран към имплантираните туморни тъкани.

15.2 Терапия с TRA-8 на хронична лимфолитична левкемия при NOD/SCID мишки.

Хроничната лимфолитична левкемия (CLL) е често разпространена форма на злокачественост на В клетки. Повечето злокачествени В клетки при CLL са с общ фенотип и са резистентни на различни влияния за апоптоза. При петима пациенти с CLL са изследвани експресията на DR5 и функцията на В клетките. Всички пациенти са имали висок брой на периферални В клетки, което е илюстрирано чрез повече от 95% CD 19+ В клетки при РВМС. В сравнение с нормалните първични В клетки CLL В клетките на всички пациенти са имали по-високи нива на DR5 клетъчната повърхност и са по-податливи на причинена чрез TRA-8 апоптоза in vitro. Колкото и да е неочаквано CLL В клетките са също чувствителни към причинена чрез бизиндомалеимид VIII (BisVIII) цитотоксичност. При последващото комбинирано третиране с TRA-8 и BisVIII почти 50% от CLL В клетките са унищожени, докато нормалните В клетки остават без реакция (фиг. 18). Трансферът на CLL В клетки в NOD/SCID мишки води до около 25-30% репопулирани CD 19+ В клетки в далака на мишките реципиенти пет дни след трансфера. Въпреки това при четири от пет пациента третирането с три дози от 100 μ g TRA-8 изцяло елиминира CCL В клетките в далака на реципиентните SCID мишки.Така TRA-8 самостоятелно или заедно с други субстанции е активен като терапевтичен агент при хронична лимфолитична левкемия.

Пример 16. cDNA клониране (1) Определяне на амино киселинните последователности на тежки и леки вериги TRA-8 на N-край

За да получи cDNA на тежката и леката верига на TRA-8 чрез познати способи се установяват амино киселинните последователности на тежката и леката верига на TRA-8 на N-край и гените TRA-8 се клонират.

Десет pg от разтвора, съдържащ анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 е подложен на електрофореза чрез SDS-полиакриламид гел (“SDS-PAGE”) при концентрация на гела от 12%, w/v, 100 V постоянно напрежение за 120 минути. След електрофорезата гелът се потопява в трансферен буфер 25 тМ Tris-HCI (pH 9.5), 20% метанол, 0.02% v/v SDS за 5 минути. След това съдържанието на протеини в гела се пренася върху поливинилид дифлуоридна мембрана (“PVDF мембрана”, размер на порите 0.45 um; Millipore, Japan), която е предварително накисната в трансферен буфер чрез апарат за оцветяване (KS-8451; Marysol) при 10 V постоянно напрежение, 4°С за 14 часа.

След това PVDF мембраната се измива с измиващ буфер 25 тМ NaCl, 10 тМ буфер от натриев борат (pH 8.0), след това се оцветява в оцветяващ разтвор (50% v/v метанол, 20% v/v оцетна киселина и 0.05% v/v Coomassie Brilliant Blue) за 5 минути, за да се локализират протеиновите връзки. След това PVDF мембраната се обезцветява с 90% v/v воден метанол и връзките, съответстващи на тежката верига, връзката с по-ниска мобилност и леката верига, връзката с по-висока мобилност, локализирана преди на PVDF мембраната са отстранени и измити с дейонизирана вода.

Амино киселинната последователност на тежката и леката верига на N-край се установяват чрез автоматизиран метод на Едман (Edman, Р., et. al., (1967), Eur. J. Biochem., 1, 80) посредством устройство за определяне на последователността на протеините с газова фаза (PPSQ-10; Shimadzu Seisakusyo, К. К.).

Амино киселинната последователност на връзката, съответстваща на тежката верига на N-край е определена по следния начин:

Glu-Val-Met-Leu-Val-Glu-Ser-Gly-Gly-Gly-Leu-Val-Lys-Pro-Gly-GlySer-Leu-Lys-Leu (SEQ ID No.4 от листинга c последователностите);

а на връзката, съответстваща на леката верига е определена по следния начин:

Asp-Ile-Val-Met-Thr-Gln-Ser-His-Lys-Phe-Met-Ser-Ser-Thr-Ser-ValGly-Asp-Arg-Val-Ser (SEQ ID No.5 от листинга c последователностите).

При сравняване на тези амино киселинни последователности с базата данни на амино киселинната последователност на антителата, получени от Kabat et al. (Kabat E. A., et al., (1991), в “Sequences of Immunological Interest Vol. II,” U. S. Department of Health and Human Services) се установява, че тежката (верига γΐ) и леката верига (верига к) на TRA-8 принадлежат съответно на подтипове 3d и 1.

(2) cDNA клониране

Въз основа на установеното до тук се синтезират олигонуклеотидни праймери, от които се очаква да хибридизират с части от 5’нетранслираните зони и в самите краища на 3’-транслираните зони на

гените, попадащи в тези миши подтипове. След това посредством следната комбинация на обратно презаписване и PCR (RT-PCR) са клонирани cDNA, кодиращи тежката и леката верига на TRA-8:

a) Шаблон

Цялата RNA на хибридомата TRA-8 (ATCC No. РТА-1428) е извлечена чрез TRIzol Reagent (GIBCO BRL). Шаблонът за PCR реакция използва cDNA, която е получена чрез First-Strand cDNA комплект за синтез (Amersham Pharmacia Biotech), съгласно инструкциите за използване.

b) PCR праймери

За PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери: 5'-cagcactgaacacggacccc-3' (H5NCS1: SEQ ID No. 6 от листинга с последователностите);

5'-aaaggtaatt tattgagaag-3' (H5NCS2: SEQ ID No. 7 от листинга c последователностите);

5'-cctcaccatg aacttcgggc-3' (H5SS1: SEQ ID No. 8 от листинга c последователностите);

5'-ctgttgtatg cacatgagac-3' (H5SS2: SEQ ID No. 9 от листинга c последователностите);

5'-gaagtgatgc tggtggagtc-3' (H5CS1: SEQ ID No. 10 от листинга c последователностите);

5'-agtgtgaagt gatgctggtg-3' (H5CS2: SEQ ID No. 11 от листинга c последователностите);

5'-tttaccagga gagtgggaga g-3' (H3CR: SEQ ID No. 12 от листинга c последователностите);

5'-tgcagagaca gtgaccagag-3' (H3 VR: SEQ ID No. 13 от листинга c последователностите);

5'-tgttcaggac cagcatgggc-3' (L5NCS1: SEQ ID No. 14 от листинга c последователностите);

5'-aagacatttt ggattctaac-3' (L5NCS2: SEQ ID No. 15 от листинга c последователностите);

5'-tateatgaag tctttgtatg-3' (L5SS1: SEQ ID No. 16 от листинга c последователностите);

5'-gatggagaca cattctcagg-3' (L5SS2: SEQ ID No. 17 от листинга c последователностите);

5'-gacattgtgatgacccagtc-3' (L5CS: SEQ ID No. 18 от листинга c последователностите); 5'-ttaacactca ttcctgttga-3' (L3CR: SEQ ID No. 19 от листинга c последователностите) и

5'-gactgggtca tcacaatgtc-3' (LCSR: SEQ ID No. 20 от листинга c последователностите);

Всички олигонуклеотиди в тези примери са синтезирани от Pharmacia Biotech, ако не е посочено друго. След като са разтворени е дестилирана вода всички олигонуклеотиди се съхраняват при -20°С.

с) PCR реакция

Състав на разтвора за PCR реакция:

шаблон cDNA, 5μ1 от общо разтвор 33 μΐ праймер 1,10 pmol;

праймер 2, 10 pmol;

х концентриран PCR буфер (набавя се с комплекта), 10 μΐ;

dNTPs (всеки 2.5 mM), 4 μΐ и

Taq полимераза (Promega), 5 единици.

Към разтвора се добавя стерилна дестилирана вода до 100 μΐ. Ако не е посочено друго dNTPs са еквимоларна смес от dATP, dCTP, dGTP и dTTP (всеки по 2.3 mM).

PCR реакцията се изпълнява по следния начин. Първо разтворът се нагрява при 94°С за 2 минути, след което се повтаря 40 пъти следния цикъл: нагряване при 94°С за 30 секунди, 52°С за 1 минута и 72°С за 3 минути. След приключване на цялата процедура реакционният разтвор се нагрява при 72°С за 10 минути.

Получените по този начин увеличени фрагменти DNA са разпределени върху 1% агарозен гел, съдържащ 0.25 pg/ml етидиум бромид. Връзките, за които е установено, че съдържат желаните фрагменти DNA са отстранени чрез бръснач и след това DNA е възстановена чрез Gene Clean kit

(BIO 101). Фрагментът DNA се клонира чрез pGEM-T Easy vector (Promega). Това става по следния начин:

Фрагментът DNA, възстановен от разтвора за PCR реакция, заедно с 50 ng pGEM-T Easy вектор (набавя се с комплекта) се смесва с 1 μΐ 10 х лигазен реакционен буфер (6 mM Tris-HCl (pH 7.5), 6 тМ магнезиев хлорид, 5 тМ натриев хлорид, 7 тМ β-меркаптоетанол, 0.1 mM ATP, 2 mM DTT, 1 тМ спермидин и 0.1 mg/ml бувин серум албумин), към който са добавени 4 единици Т4 DNA лигаза (1 μΐ). Обемът на цялата смес се допълва до 10 μΐ със стерилна дейонизирана вода и получения лигазен разтвор се инкубира при 14°С за 15 часа. След това 2 μΐ от лигазния разтвор се добавя към 50 μΐ от установения вид Е. coli JM109 (осигурява се с комплекта и се използва според инструкциите за употреба), към който са добавени 2 μ 1 0.5 Μ β меркаптоетанол и получената смес се държи в лед за 30 минути, след това при 42°С за 30 секунди и отново в лед за 5 минути. След това към културата се добавя 500 μ 1 среда, съдържаща 2% ν/ν триптон, 0.5% w/v екстракт от дрожди, 0.05% w/v натриев хлорид, 2.5 тМ калиев хлорид, 1 тМ магнезиев хлорид и 20 тМ глюкоза (обозначаваме го като среда “SOC”) и сместа се инкубира за 1 час при 37°С с разбъркване. След това културата се разстила върху съда с L-хранителна среда arap (1% ν/ν триптон, 0.5% w/v екстракт от дрожди, 0.5% w/v натриев хлорид, 0.1% w/v глюкоза и 0.6% w/v бакто-агар (Difco)), съдържаща 100 μ g/ml. Колониите, резистентни към ампицилин, които се появяват върху съда се селектират и се изхвърлят чрез платинена трансферна бримка и се култивират в L-хранителна среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин при 37°С за една нощ с разбъркване при 200 r.p.m. След инкубирането клетките се отделят чрез центрофугиране, от които чрез алкален метод се приготвя плазмида DNA. Полученият плазмид е означен като плазмид рН62 за тежката верига на TRA-8 и pL28 за леката верига на TRA-8. Преобразуваните видове Е. coli, приютяващи тези плазмиди, означени Е. coli JM109/pH62 и Е. coli JM109/pL28 са депозирани в International Patent Organizm Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukuba-shi, Ibakari

ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и имат депозитни номера FERM ВР-7560 и FERM ВР-7561. Нуклеотидните последователности на тези DNA, кодиращи тежката и леката верига на TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F., S, et al., (1977), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74:5463-5467) чрез DNA анализатор 3700 (ABI PRISM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Japan).

Нуклеотидните последователности на тежката и леката верига на TRA-8 са дадени като SEQ ID No.21 и No.22 от листинга с последователностите. Амино киселинните последователности на тежката и леката верига на TRA-8 са дадени като SEQ ID No.23 и No.24 от листинга с последователностите. Амино киселинните последователности на тежката и леката верига на TRA-8 на N-край, които са установени по-горе съвпадат точно. Когато амино киселинните последователности на тежката и леката верига се сравнят с базата данни от амино киселинни последователности на антитела се установява, че за тежката верига нуклеотиди с номера от 58 до 414 в SEQ ID No.21 образуват променливата зона, докато нуклеотиди с номера от 415 до 1392 в SEQ ID No.21 образуват постоянната зона. За леката верига нуклеотиди с номера от 64 до 387 от SEQ ID No.22 образуват променливата зона, а нуклеотиди е номера от 388 до 703 в SEQ ID No.22 образуват постоянната зона. Разположението и последователностите на CDR са изяснени и чрез сравняването на хомологиите с базата данни. Амино киселинните последователности на CDR1, CDR2 и CDR3 на тежката верига на TRA-8 са показани съответно в SEQ ID No. 25, No. 26 и No.27. Амино киселинните последователности на CDR1, CDR2 и CDR3 на леката верига на TRA-8 са показани съответно в SEQ ID No. 28, No. 29 и No.30.

Пример 17. Проектиране на хуманизирана версия на антитялото TRA-8 (1) Молекулярно моделиране на променлива зона на TRA-8.

Молекулярното моделиране на променливата зона на TRA-8 се извършва чрез метод, известен като хомологично моделиране (Methods in Enzymology, 203, 121-153, (1991)). Първичните последователности на

променливите зони на човешкия имуноглобулин, регистрирани в Базата данни за протеини (Nuc. Acid Res. 28, 235-242 (2000), за които са налице триизмерните структури, установени чрез рентгенова кристалография са сравнени със структурата на зоните на установения по-горе TRA-8. Като резултат са избрани 1NCD и 1HIL, защото имат най-висока хомология на последователностите на структурата зони съответно за леката и тежката верига на TRA-8. За получаване на “структурен модел” се генерира триизмерното устройство на структурните зони чрез комбиниране на координатите на 1NCD и 1HIL, които съответстват на леката и тежката вериги на TRA-8. Чрез използването на класификацията, установена от Chothia et al., CDRs на TRA-8 са класифицирани както следва: CDRLi, CDRL₂, CDRHi и CDRH2 принадлежат на канонични класове съответно 2, 1, 1, 3, a CDRL3 не принадлежи към никой от специфичните канонични класове. CDR бримките на CDRLi, CDRL2, CDRHi, CDRH2 са поставени в структурите, присъщи на техните съответни канонични класове и са интегрирани в структурния модел. CDRL3 е предназначен за структурата на клъстер 8А според класификацията на Thornton et al. (J. Mol. Biol., 263, 800815, (1996)) и CDRH3 е класифициран в k(8)C чрез правилото H3 (FEBS letter 455, 188-197 (1999)). След това характерните структури на CDRL3 и CDRH3 се интегрират в структурния модел.

Накрая се извършват енергийни изчисления, за да се получи правдоподобен молекулярен модел на променливата зона на TRA-8 и от гледна точка на енергията да се елиминират нежелани вътре-атомни връзки. Горната процедура се извършва чрез наличните обичайни системи за молекулярно моделиране ABM (Oxford Molecular Limited, Inc.). За получения молекулярен модел прецизността на структурата се изчислява допълнително чрез софтуер, PROCHECK (J. Appl. Cryst. (1993), 26, 283-291).

(2) Проектиране на амино киселинните последователности на хуманизиран TRA-8.

Изграждането на хуманизирани антитела TRA-8 се изпълнява чрез метод, който е известен с наименованието CDR графтинг (Proc., Natl. Acad.

Sci, USA 10029-10033 (1989)). Антитялото аксептор е избрано според амино киселинната хомология на структурната зона. Последователностите на структурната зона на TRA-8 се сравняват с всички човешки структурни последователности в базата данни с амино киселинните последователности на антитела на Кабат (Nuc. Acid Res. 29, 205-206 (2001)). За аксептор е избрано антитялото mAB59’CL поради неговата най-висока хомология на последователността от 80% за структурната зона. Амино киселинните остатъци в структурната зона на mAB59’CL се подреждат заедно с тези на TRA-8 и се идентифицират позициите с различни амино киселини. Разположението на тези остатъци се анализира чрез триизмерния модел на конструирания по-горе TRA-8 и остатъците на донорите, които трябва да бъдат присадени на аксептора са избрани чрез дадените от Queen et al. критерии (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 10029-10033 (1989)).

Хуманизираните последователности на TRA-8 са изградени както е описано в следващия пример чрез пренасяне на няколко донорни остатъци в антитялото аксептор mAB59’CL.

Пример 18. Изграждане на вектор експресия на тежката верига на хуманизираното антитяло (1) Изграждане на плазмид, носител на променливата зона DNA на тежката верига на хуманизирания TRA-8

За да се установи активността на хуманизирания TRA-8 се конструира плазмид, носител на променливата зона DNA на тежката верига на хуманизирания TRA-8. Трябва да се отбележи, че хуманизирането на TRA-8 не се ограничава само от тези примери.

Както е показано в SEQ ID No.31 от листинга с последователностите хуманизирането на амино киселинните последователности на тежката верига на мишето анти-човешко DR-5 антитяло TRA-8 води до заместване на 13-та амино киселина (лизин), 19-та амино киселина (лизин), 40-та амино киселина (треонин), 42-ра амино киселина (глутаминова киселина), 44-та амино киселина (агринин), 84-та амино киселина (серин), 88-та амино киселина (серин), 93-та амино киселина (метионин), 114-та амино киселина (треонин), 115-та амино киселина (леуцин) съответно с глутамин, агринин, аланин, глицин, глицин, аспаргинова киселина, аланин, валин, леуцин и валии.

Плазмидът, носител на DNA, кодираща тежката верига на променливата зона на хуманизирания TRA-8 (SEQ ID No.31 от листинга с последователностите) се изгражда по следния начин.

За изграждане на следните DNA последователности, всяка от които включва описаното по-горе се използва PCR:

Синтезирани са следните 12 олигонуклеотиди:

5'- ttggataagc ttggcttgac ctcaccatgg gatggagctg tatcatcctc ttcttggtag caacagctac aggtgtccac -3' (A; SEQ ID No. 32);

5'- tctgaagtaa tgctggtgga gtctggggga ggcttagtac agcctggagg gtccctgaga ctctcctgtg cagcctctgg -3' (B; SEQ ID No. 33);

5'- attcactttc agtagttatg taatgtcttg ggttcggcag gcaccaggga agggtctgga gtgggttgca accattagta -3' (C; SEQ ID No. 34);

5'- gtggtggtag ttacacctac tatccagaca gtgtgaaggg ccgattcacc atctccagag acaatgccaa gaacaccctg -3' (D; SEQ ID No. 35);

5'- tatctgcaaa tgaacagtct gagagcagag gacacggctg tttattactg tgcaagaagg ggtgactctatgattacgac -3' (E; SEQ ID No. 36);

5'- ggactactgg ggccaaggga ccctggtcac agtctcctca gcctc cacc aagggcccat cggtc-3'(F;SEQ ID No. 37);

5'- ctaccaagaa gaggatgata cagctccatc ccatggtgag gtcaagccaa gcttatccaa

-3'(G;SEQ ID No. 38);

5'- tctcagggac cctccaggct gtactaagcc tcccccagac tccaccagca ttacttcaga gtggacacct gtagctgttg -3' (H; SEQ ID No. 39);

5'- tccagaccct tccctggtgc ctgccgaacc caagacatta caiaactact gaaagtgaat ccagaggctg cacaggagag -3' (I; SEQ ID No. 40);

5'- ctctggagat ggtgaatcgg cccttcacac tgtctggata gtaggtgtaa ctaccaccac tactaatggt tgcaacccac -3' (J; SEQ ID No. 41);

5'- ccttcttgca cagtaataaa cagccgtgtc ctctgctctc agactgttca tttgcagata cagggtgttc ttggcattgt -3' (K; SEQ ID No. 42); и

5'- gaccgatggg cccttggtgg aggctgagga gactgtgacc agggtccctt ggccccagta gtccgtcgta atcatagagt cacc -3' (L; SEQ ID No. 43).

По описания по-горе начин са синтезирани следните 2 PCR праймери:

5'- ttggataagc ttggcttgac -3' (PI; SEQ ID No. 44); and

5'- gaccgatggg cccttggtgg a -3' (P2; SEQ ID No. 45).

Синтезът на DNA, кодираща полипептидна верига, включваща последователност за отделяне на сигнал, променлива зона на хуманизирана тежка верига на TRA-8 и 8 амино киселинни остатъка при N-край на зоната IgG-CHl се изпълнява чрез използване на комбинация от PCR.

Фрагментът DNA се получава по следния начин:

Състав на PCR реакционен разтвор:

олигонуклеотид А, 10 pmol;

олигонуклеотид В, 10 pmol;

олигонуклеотид С, 10 pmol;

олигонуклеотид D, 10 pmol;

олигонуклеотид Е, 10 pmol;

олигонуклеотид F, 10 pmol;

олигонуклеотид G, 10 pmol;

олигонуклеотид Н, 10 pmol;

олигонуклеотид I, 10 pmol;

олигонуклеотид!, 10 pmol;

олигонуклеотид К, 10 pmol;

олигонуклеотид L, 10 pmol;

олигонуклеотиден праймер Р1,2 μΜ;

олигонуклеотиден праймер Р2, 2 μΜ;

X пиробест буфер II, 10 μΜ;

dNTPs микс, 8 μΜ;

Пиробест DNA полимераза, 0.5 μΜ; и

Редестилирана вода до обем от 50 μΐ.

PCR реакцията се изпълнява по следния начин. Първо разтворът се нагрява при 94°C за 5 минути, след което 7 пъти се повтаря следния цикъл:

нагряване при 98°С за 10 секунди, 55°С за 30 секунди и 72°С за една минута. След приключването на тази процедура реакционният разтвор се нагрява при 72°С за 15 минути.

Към всеки от PCR продуктите се добавя равен обем фенолхлороформ (50% v/v фенол, накиснат във вода, 48% v/v хлороформ, 2% v/v изоамил алкохол) до 200 μ 1 и енергично се смесва за 1 минута. След това време сместа се центрофугира при 10, 000 X g, водния пласт възстановява и се смесва с равен обем от хлороформ-изоамил алкохол (96% v/v хлороформ и 4% v/v изоамил алкохол), който отново енергично се центрофугира при 10, 000 X g и водния слой се възстановява. Серията от стъпки, изброени в този параграф ще наричаме “фенол екстракция”.

След това във възстановения воден слой се извършва утаяване чрез етанол. Тук ще употребяваме термина “утаяване чрез етанол”, което включва добавяне чрез смесване на една десета обем от ЗМ натриев ацетат (pH 5.2) и 2.5 обемни единици от 100% етанол към разтвора, който се третира и замразяване на сместа чрез сух лед. След това получената смес се центрофугира при 10, 000 X g за да се възстанови DNA като утайка.

След фенол екстракцията и утаяването чрез етанол получената DNA утайка се изсушава във вакуум, разтваря се в минимум редестилирана вода и се разделя чрез електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид за да може да се разпознае DNA при UV светлина. DNA връзката, съответстваща на DNA на хуманизирания TRA-8 се отстранява чрез бръснач и се утаява от гела чрез Geneclean Spin Kit (Bio 101, СА, USA). След фенол екстракцията утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7, 500 X g, следва утаяване чрез етанол и накрая се разтваря в 5 μΐ дестилирана вода.

Всяка от извлечените DNA се клонира чрез pGEM-T Easy вектор (Promega) по следния начин:

Фрагментът DNA, възстановеният от PCR реакция, 5 μΐ;

X Taq полимераза буфер, 1 μΐ;

смес dNTPs, 1 μΐ;

Taq полимераза (5 единици/ml), 1 μΐ и редестилирана вода до обем 10 μΐ.

След като всеки от горните разтвори реагира при 70°C за 30 минути всеки DNA разтвор и pGEM-T Easy вектор се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Shuzo Co., Ltd.) според указанията на производителя.

След 4 часа инкубация при 15°C, 2 μ 1 от инкубирания разтвор се смесват с 100 μΐ от установения вид E.coli JM109 при клетъчна гъстота 1-2 х 10⁹ клетки/ml (Takara Shuzo Co. Ltd.) и сместа се поставя в лед за 30 минути, след това при 42°С за 30 секунди и отново в лед за 1 минута. После към сместа се добавят 500 μΐ от SOC среда (2% v/v триптон, 0.5 w/v екстракт от дрожди, 0.5% w/v натриев хлорид, 2.5 тМ калиев хлорид, 1 тМ магнезиев хлорид и 20 тМ глюкоза) и през следващия час се инкубира с разклащане. След това се изолират трансформираните видове и от тях се получава плазмид DNA, съгласно “Лабораторен наръчник за молекулярно клониране”. Нуклеотидните последователности на тези DNA, кодиращи тежката верига на хуманизиран TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F. S. et al., (1977), Proc. Natl. Acad, Sci, USA, 74:5463-5467) чрез 3700 DNA Анализатор (ABI PROSM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Japan).

Получените плазмиди са означени с рНВ14 (плазмида, носител на cDNA, кодираща тежката верига на хуманизирания TRA-8). Трансформирания вид Е coli, приютяващ тези плазмиди, означен като Е. Coli JM109/pHB14 е депозиран в International Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 3055466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и има депозитен номер FERM ВР-7556.

(2) Изграждане на плазмиди експресия, носители на променливата зона DNA на тежката верига на хуманизиран TRA-8

Рекомбинантните вектори експресия за животински клетки се изграждат чрез вмъкване на DNA, кодираща тежката верига на хуманизиран TRA-8 (клониран по-горе) по следния начин:

Един μ g от плазмид pSRHHH3 (Европейска патентна заявка ЕР 0909-816-А1), носител на тежката верига на променливата зона на хуманизираното анти-Fas моноклонално антитяло HFE7A и човешка постоянна зона на геномна DNA на IgGl, вектор експресия на клетки от бозайник се разтварят с рестрикционните ензими Hindlll и Apal и се разделят чрез електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид, за да се разпознае DNA при UV светлина. Векторните връзки на DNA, съдържащи човешка постоянна зона на геномна DNA на IgGl без променливата зона на тежката верига на хуманизиран HFE7A са отстранени чрез бръснач и се утаяват от гела чрез Geneclean Spin Kit (BIO 101, СА, USA). След фенол екстракция утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7,500 X g, следва утаяване чрез етанол, разтваря се в 5 μ 1 дестилирана вода и се дефосфорилизира чрез CIP. Полученият разтворен дефосфорилизиран плазмид (100 ng) се легира с 1 pg pHBl DNA фрагмент, съдържащ DNA, кодираща тежката верига на променливата зона на хуманизиран TRA-8, който също е разтворен с Hindlll и Apal чрез DNA Ligation Kit Version 2.2 (Takara Shuzo Co. Ltd.). След това легираната смес се използва за трансформиране на Е. coli Jml09, които се слагат върху LB агар съдове, съдържащи 50 pg/ml ампицилин.

Трансформантите, получени по този начин се култивират в 2 ml течна LB среда, съдържаща 50 pg/ml ампицилин при 37°С за една нощ и DNA плазмидът се извлича последователно от получената култура чрез алкален SDS метод.

За да се установи наличието или липсата на вмъкване на DNA, кодираща променливата зона на тежката верига на хуманизиран TRA-8 извлеченият DNA плазмид се разтваря с Hindlll и Apal и е подложен на електрофореза с 3% w/v агарозен гел. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектора се потвърждава чрез последователностите на DNA посредством анализатор на гении последователности (ABI Prism 3700 DNA Analyzer, Applied Biosystems).

Получената експресия на плазмид, носител на cDNA, кодиращ тежката верига на хуманизиран TRA-8 е означен рНВ 14-1.

Пример 19. Изграждане на вектор експресия за леката верига на хуманизираното антитяло.

(1) Изграждане на вектори за леките вериги на хуманизираните версии на антитялото TRA-8.

Както е показано в SEQ ID No.46 от листинга с последователностите при хуманизиране на амино киселинната последователност на леката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 8-та амино киселина (хистидин), 9-та амино киселина (лизин), 10-та амино киселина (фениламин), 11-та амино киселина (метионин), 13-та амино киселина (треонин), 20-та амино киселина (серии), 42-ра амино киселина (глутамин), 43-та (серин), 60-та амино киселина (аспартанова киселина), 63-та амино киселина (треонин), 77-ма амино киселина (аспаргинова киселина), 78-ма амино киселина (валии), 80-та амино киселина (серин), 83-та амино киселина (леуцин), 85-та амино киселина (аспартанова киселина), 87-ма амино киселина (фениламин), 99-та амино киселина (глицин), 103-та амино киселина (леуцин) и 108-ма амино киселина (аланин) от N-край на леката верига на амино киселинната последователност на TRA-8 са заменени съответно с пролин, серин, серин, леуцин, аланин, треонин, лизин, аланин, серин, серин, серин, леуцин, пролин, фениламин, треонин, тирозин, глутамин, валии и треонин. Получената последователност е означена с LM2.

Експресиите на плазмидите, носители на този тип хуманизирани амино киселинни последователности на леката верига на анти-човешкото DR5 антитяло TRA-8 се изграждат по следния начин:

1) Синтез на праймери за получаване на променливите и постоянните зони на леката верига на хуманизиран TRA-8.

Кодирането на DNA за полипептидната верига LM2 (SEQ ID No.46 от листинга с последователностите), всяка от които е синтез от променливата зона на леката верига на хуманизирано aHTH-DR5 антитяло TRA-8 и

постоянната зона на човешка lg лека верига (к верига) се синтезират чрез чрез PCR комбинации.

Следват 7AL1P (SEQ ID No.47) и 7ALCN (SEQ ID No.48), като за PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери: 5'- gtcccccaca gatgcagaca aagaacttgg agattgggtc atcacaatgt caccagtgga

-3' (HKSPR11; SEQ ID No. 49);

5'- ccaagttctt tgtctgcatc agtaggagac agggtcacca tcacctgc -3' (HKCDFll;SEQIDNo. 50);

5'- agtgtgccgg gtggatgccc agtaaatcag tagtttagga gctttccctg gtttctg -3' (HKCDR12; SEQ ID No. 51);

5'- tgggcatcca cccggcacac tggggtccca agcaggttta gtggcagt -3' (HKCDF22; SEQ ID No. 52);

5'- ataactacta tattgctgac agtaataggt tgcaaaatcc tccggctgca gactagagat ggt - 3’ (HKCDR22; SEQ ID No. 53) и

5'- cagcaatata gcagctatcg gacgttcggt caaggcacca aggtggaaat caaacggact gtg-3'(HKCF12; SEQ ID No. 54).

2) Изграждане на плазмид pCR3.1/M2-l (клониране на хуманизирана лека верига на TRA-8

Фрагментът LM2-DNA, както е дефиниран в SEQ ID No.55 от листинга с последователностите, кодиращ амино киселинната последователност, дефинирана в SEQ ID No.56 се получава чрез изпълняване на 2 PCR стъпки, вмъква се във вектор плазмид и се клонира в Е. coli.

а) Първа стъпка PCR

Фрагментът LM2-F1-DNA, кодиращ последователността за сигнализиране на секреция и частта от зоната FRL] с рестрикционен ензим Hind III на мястото на деление, добавен в 5’-край се получават при следните условия. Плазмидите шаблони pHSGHM17 и pSRPDHH се получават според описанието на Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pHSGHM17 DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1), 25 ng олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol олигонуклеотиден праймер HKSPR11, 50 pmol коктейл dNTPs, 5 μΐ х PCR буфер, 5 μΐ ampliTaq DNA полимераза (PerkinElmer), 2.5 единици

В описания разтвор се добавя редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва в PCR.

PCR топлинни условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния термичен цикъл: 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM2-F2-DNA, кодиращ частите за FRLi, CDRLi, FRL2 и CDRL2 се получава при следните условия:

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pL28 DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер HKCDF11, 50 pmol олигонуклеотиден праймер HKCDR12, 50 pmol коктейл dNTPs, 5 μΐ х PCR буфер, 5 μΐ ampliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

В описания разтвор се добавя редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва в PCR.

PCR топлинни условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния термичен цикъл: 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути; след това се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM2-F3-DNA, кодиращ CDRL2, FRL3 и част от CDRL3 се получава при следните условия:

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHH DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1), 25 ng олигонуклеотиден праймер HKCDF22, 50 pmol олигонуклеотиден праймер HKCDR22, 50 pmol коктейл dNTPs, 5 μΐ х PCR буфер, 5 μΐ ampliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

В описания разтвор се добавя редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва в PCR.

PCR топлинни условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния термичен цикъл: 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути; след това се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM2-F4-DNA, кодиращ CDRL3, FRL4 и постоянната зона с рестрикционен ензим EcoR I на мястото на деление, добавен в 3’край се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHH DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер HKCDF12, 50 pmol олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol коктейл dNTPs, 5 μΐ х PCR буфер, 5 μΐ ampliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

В описания разтвор се добавя редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва в PCR.

PCR топлинни условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния термичен цикъл: 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути; след това се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените след PCR DNA фрагменти се разделят чрез електрофореза с 5% гел полиакриламид. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml етидиум бромид за да се разпознае получената DNA при UV светлина. Откритите по този начин съответни DNA връзки се отстраняват чрез бръснач.

Ь) Втора PCR стъпка

LM2-DNA, при който описаните по-горе фрагменти LM2-F1-DNA, LM2-F2-DNA, LM2-F3-DNA и LM2-F4-DNA се синтезират се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

Гел фрагмент LM2-F1-DNA, получен в първа PCR стъпка,

Гел фрагмент LM2-F2-DNA, получен в първа PCR стъпка,

Гел фрагмент LM2-F3-DNA, получен в първа PCR стъпка,

Гел фрагмент LM2-F4-DNA, получен в първа PCR стъпка, олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol коктейл dNTPs, 5.0 μΐ х PCR буфер, 5.0 μΐ ampliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

В описания разтвор се добавя редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва в PCR.

PCR топлинни условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния термичен цикъл: 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути; след това се нагрява при 72°С за 10 минути.

Полученият по този начин фрагмент LM2-DNA се вмъква в плазмида pCD3.1DNA чрез Eukaryotic ТА cloning Kit (Invitrogen) според инструкциите на производителя и се внася в съответната Е. coli TOPI OF’, която се доставя с комплекта. Нуклеотидните последователности на тези DNA, кодиращи леката верига на хуманизиран TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F. S., et al. (1977), Proc. Natl. Acad, Sci. USA, 74:5463-5467) чрез 3700 DNA анализатор (ABI PRISM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Japan).

Получените плазмиди са означени с pCR3.1/M2-l (плазмидът, носител на cDNA, кодираща променливата зона на леката верига на хуманизиран TRA-8 и постоянна зона на леката верига на човешки Ig).

Полученият плазмид pCR3.1/M2-l, съдържащ фрагмента LM2-DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind III и EcoR I.

9Ί

Един μ g от клонирания плазмид pHSG399 DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind III и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани pHSG399 DNA и фрагмента LM2DNA, които са разтворени в рестрикционните ензими Hind III и EcoR I се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар среда, съдържаща 0.1 mM IPTG, 0.1% X-Gal и 50 pg/ml хлорамфеникол. Получените бели трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 50 pg/ml хлорамфеникол и от получената култура посредством алкален SDS метод се извлича плазмида DNA. Извлеченият DNA плазмид се разтваря с Hind III и EcoR I и след това чрез електрофореза с 1% агарозен гел се селектира клонът, носител на фрагмента LM2-DNA.

Като резултат от горната процедура се получават плазмид pHSG/M21-4, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизиран LM2 TRA-8 и постоянната зона на човешка IgK верига. Трансформантния род Е coli, приютяващ тези плазмиди, означен като Е. Coli DH5a/pHSG/M2-l-4 е депозиран в International Patent Organism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 11, Higashi 1 chome Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и има депозитен номер FERM ВР-7563.

3) Изграждане на плазмид pSR/M2-l (плазмид експресия за хуманизирана лека верига LM2 TRA-8).

Полученият плазмид pHSG/M2-l-4, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на хуманизираната лека верига LM2 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK се разтварят с рестрикционните ензими Hind III и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pSRPDHH DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0-909-816-А1) се разтваря с рестрикционните ензими Hind III и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани pSRPDHH DNA и фрагмента Hind III-EcoRI DNA,

получени от pHSG/M2-l-4 се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформират c легираната DNA и се разстилат в LB агар. Получените трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин и от получената култура чрез алкален SDS метод се извлича получения DNA плазмид. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектора pSRPDHH се потвърждава чрез последователностите на DNA, посредством генен анализатор на последователностите (ABI Prism 3700 DNA Analyzer; Applied Biosystems).

Полученият плазмид експресия, носител на cDNA, кодираща леката верига на хуманизиран TRA-8 е означен с pSR/M2-l.

Пример 20. Получаване на хуманизирано антитяло

Преобразуването на клетки COS-7, т.е клетъчна линия произхождаща от бъбрек на маймуна с експресия на плазмиди за хуманизираната тежка верига TRA-8 и хуманизираната лека верига TRA-8, получени по-горе се извършва чрез FUGENE6 реагентни методи за преобразуване (Boehringer Mannheim Biochemica) според инструкциите на производителя.

Клетките COS-7 (American Type Culture Collection No. CRL-1651) ca нараснали до полу-сливане (3 x 10⁶ клетки/съд) в съд за култивиране (площ за култивиране: 57 cm²; Sumimoto Bakelite), съдържащ среда Dulbecco’s Modified Eagle (тук ще я наричаме “D-MEM”, Gibco BRL), допълнена с 10% ембрионален серум от крава (абревиатура “FCS”, Moregate).

Междувременно посредством центрофугиране в плътностен градиент на цезиев хлорид се смесват 10 μ g/съд (общо 5 съда) DNA плазмид експресия на тежката верига на хуманизиран DR5 иЮ pg/съд DNA плазмид експресия на леката верига на хуманизиран DR5, получени чрез алкален SDS метод, след това са утаени чрез етанол и се отлагат в 5 μΐ/съд dH2O.

След като 15р1/съд от реагент FUGENE6 за преобразуване се смесват с 180 μΐ/съд D-MEM без FCS, този FUGENE разтвор (180 μΐ/съд) се смесва с 5 μΐ/съд DNA разтвор, съдържащ ΙΟμΙ/съд DNA плазмид експресия на тежката верига на хуманизиран DR5 и 10 μΐ/съд DNA плазмид експресия на

леката верига на хуманизиран DR5. След 15 минутна инкубация при стайна температура получената суспензия плазмид (200 μ 1) се добавя към предварително приготвените съдове с COS-7. След инкубиране при 5% СОг при 37°С за 24 часа средата за култивиране се сменя с D-MEM, без FCS. След инкубиране при 5% СО2 при 37°С за 72 часа супернатанта от културата се възстановява за пречистване на продуктите от експресията в течни супернатанти. Посредством описания по-горе метод клетките COS-7 се преобразуват с всяка от следващите комбинации плазмиди:

(A) : без DNA плазмид (B) : копреобразуване отрНВ14-1 и pSR/M2-l

След това културата се центрофугира (1,000 r.p.m., 5 минути) и супернатанта се събира. Супернатантът се центрофугира отново (9,800 r.p.m., 15 минути) и филтрира през филтър 0.45 μ m (ADVANTEC TOYO DISMIC-25cs, Cat # 25CS045 AS). Пречистването на IgG от филтратите се осъществява чрез протеин G-POROS афинитетна хроматография (Allpied Biosystems) при следните условия:

HPLC: BioCAD 700Е (Applied Biosystems) стълб: ProteinG-ID сензорен филм (размер на стълба: 2.1 mmID х 30 mm LD, обем на основата: 0.1 ml; Cat # 2-1002-00, Applied Biosystems) утаяващ буфер: 0.1 Μ Глицин-HCl (р.Н 2.5) неутрализиращ буфер: IM Tris-HCl (pH 8.5) отчитане: 280 nm скорост на изтичане: 1 ml/min размер на фракцията: 0.5 ml/0.5min фракционна тръба: 1.5 ml полипропиленова микротръба температура: 4°С

След като всички филтрати се поставят в стълба, той се измива с 30 ml PBS (Sigma, Cat # 1000-3). Когато се постави утаяващия буфер се стартира фракционния колектор. Всяка фракционна микротръба съдържа предварително 55 μ 1 IM NaCl, 110 μΐ неутрализиращ буфер и 74 μ 1 от 2 mg/ml бувин серум албумин (Sigma, Cat # А-7030) в PBS. Фракциите от

100 номер 8 до номер 10 се събират и диализират посредством 1 литър PBS (РН 7.5) при 4°С за един ден чрез Slide-A lyzer (Pierce, Cat # 66450). Диализният буфер се сменя два пъти.

Проверката на експресията на хуманизираните антитела и

количествения анализ на продуктите на експресията в получените течни супернатанти от културата се извършва чрез ELISA с антитяло срещу човешки IgG.

Към всяка колба 96-well (MaxiSorp, Nunc) се добавя 100 μΐ козе античовешко IgG Fc специфично поликлонално антитяло (Kappel), разтворено в адсорпционен буфер с концентрация 0.5 pg/ml (0.05 М натриев хидрогенкарбонат, 0.02% натриев азид, pH 9.6) и съда се инкубира при 37°С за 2 часа, за да се осъществи адсорбция на антитялото. След това съда се измива пет пъти с 350 μ 1 PBS(-), съдържащ 0.05% Tween-20 (BioRad) (означено е нататък “PBS-Т”). След измиването към колбите се добавя супернатанта от културата, разреден с D-MEM, съдържащ 10% FCS и се инкубира при 37°С за 2 часа. След измиване отново с PBS-Т към всяка колба се добавя 100 μ 1 класифицирано като алкално фосфатазно козе античовешко IgG Fc специфично поликлонално антитяло (Jackson Immuno Research Lab.), разредено 10,000 пъти с PBS-Т и се инкубира при 37°С за 2 часа. След ново измиване с PBS-Т се добавя субстратния разтвор от рнитрофенил фосфат, получен посредством Alkaline Phosphatase Substrate Kit (Bio Rad) според инструкциите за използване. След инкубиране при 37°С от 0.5 до 1 час се измерва абсорбирането при 405 nm. В представените примери като базов модел за концентрация на хуманизираните DR5 антитела, съдържащи се в течните супернатанти на културата се използва човешки плазма имуноглобулин G подклас 1 (IgGl) (Biopure AG), разреден с D-MEM, съдържащ 10% FCS в дадени концентрации.

Като резултат експресията и пречистените продукти в супернатанта от културата се разпознават специфично с анти-човешко IgG антитяло. Количеството на човешкото IgG антитяло е 8.96 pg (800 μΐ).

101

Пример 21. Активност при причиняване на апоптоза на

хуманизирано антитяло

За да се изследва активността при причиняване на апоптоза на пречистеното хуманизирано антитяло TRA-8 се използват Jurkat клетки (ATCCNo. TIB-152).

В RPMI1640 среда с 10% FCS (Gibco BRL) се култивират Jurkat клетки при 37°С за 3 дни при наличието на 5% СО₂ и се разпределят във всяка колба от 96-well microplate (Sumitomo Bakelite) по 50 μΐ на колба. Хуманизирания TRA-8, получен в пример 20 се привежда до концентрация на крайния продукт от 100 ng/ml със среда RPMI1640, съдържаща 10% FCS, чрез оценка на концентрациите във флуидите според описания метод в пример 20. Всеки от разтворите на продуктите от експресията, така приведени до 100 ng/ml се използва за серийно разреждане чрез повтаряне на серийно разреждане 2 пъти с RPMI1640, съдържаща 10% FCS. Всеки от разредените разтвори на хуманизиран TRA-8 се добавя към всяка колба по 50 μΐ на колба. След реагиране при 37°С за 12 часа се добавя 50 μΐ от 25 μΜ PMS (феназин метосулфат; Sigma Chemical Co.), съдържащ 1 mg/ml ХТТ (2,3-bis[2-methoxy-4- nitro - 5 - sulfenil] - 2 H - tetrazolinum - 5 - carboxyaniride вътрешно комплексна сол; Sigma Chemical Co.) (при концентрации 250 mg/ml за ХТТ и 5 μΜ за PMS). След инкубиране за 3 часа е измерена абсорбацията при 450 пгп за всяка колба, за да се изчисли клетъчната жизнеспособност чрез способността за редукция на митихондрията като показател.

Жизнеспособността на клетките във всяка колба се изчислява по следната формула:

Жизнеспособност (%) = 100 х (а-b) / (с-Ь) където “а” е измереното в тест колба, “Ь” е измереното в колба без клетки и “с” е измереното в колба, без добавено антитяло.

Като резултат се доказва, че продуктът на експресия, получен в пример 20 (хуманизиран TRA-8) причинява апоптоза в клетки от Т лимфома клетъчна линия, проявяваща човешки DR5 антиген.

102

Пример 22. Реактивност на TRA-8 към различни DR5 молекули

За да се установи реактивността на TRA-8 към различни DR5 молекули се извършва проучване чрез активирани лимфоцити.

Първо, вземат се проби периферална кръв от човек (30 ml), мармозетка (3 ml) и маймуна cynomolgus (20 ml). Към кръвните проби е добавен 1 ml хепарин (Novoheparin; Novo) и след това се покриват бавно с еднакъв обем разтвор Fiscoll-Paque PLUS ((Amersham Pharmacia Biotech) със специфично тегло: 1.077 за всички проби с изключение на пробата от маймуна, при която специфичното тегло е 1.072) и се центрофугира при 1,700 r.p.m. за 30 минути, за да се получи фракция от мононуклеарни клетки от периферална кръв. Тази фракция от мононуклеарни клетки се измива два пъти с балансиран солен разтвор на Ханкс и след това се отлага в среда RPMI 1640 с 10% v/v FCS до клетъчна гъстота 1 х 10⁶ клетки/ml. Към получената суспензия се добавя phytohemagglutinin-P (РНА-Р, Sigma Chemicals, Co.) до концентрация 5 pg/ml и пробите се инкубират при 37°С при 5% v/v СО2 за 24 часа. После клетките се възстановяват чрез центрофугиране, измиват се и се ресуспендират в среда RPMI 1640, съдържаща 10% v/v FCS. След това към суспензията се добавя интерлевкин2 (Amersham Pharmacia Biotech) до концентрации 10 единици/ml, за да се активират възстановените клетки и се инкубира при 37°С при 5% v/v СО₂ за 72 часа.

Приготвеното активирано количество, за което е изчислено че съдържа 1 х 10^б активирани лимфоцитни клетки се поставя в тест тръба разредено в 50 μ 1 от 0.5, 1, 5, 10 μ g ТРА-8 в PBS или 50 μ 1 само PBS. Получената суспензия се оставя в лед за 1 час, след което клетките се измиват три пъти с кратни на 500 μΐ PBS, след което се отлагат в 50 μΐ от 20 pg/ml FITC-класифицирано като анти-мише IgG антитяло (Bioresource) в PBS. Чрез използването на клетките, отложени в 500 μΐ PBS като контрола чрез течен цитометър (FACSCalibur; Becton Dickinson) се измерват флуоресцентните интензитети.

103

Чрез флуоресцентната интензивност се установява разпределението на броя на получените клетки и се изчислява съотношението между броя на оцветените клетки спрямо броя на всички клетки. След това всяка Kd стойност се изчислява посредством концентрацията на TRA-8 и съотношението между броя на оцветените клетки спрямо броя на всички клетки. Всички честоти на реактивност на активираните лимфоцити от човек, мармозетка и маймуна са почти еднакви. Следователно TRA-8 може да се свързва към голям брой DR5 на примати, включително и при човек, за което е и неговото основно предназначение.

Пример 23. Изследване на повишаването на дозата на TRA-8 при мармозетки

Изследването на първоначалната токсичност при нарастване на дозата на TRA-8 се извършва, като се използват една мъжка и една женска мармозетка. През период от 7 дни се провеждат се три серии единично интравенозно дозиране. Дозата на TRA-8 е 50, 250 и 1250 р^индивид. 48 часа след третирането от феморалната вена се взема кръв и се приготвя плазма. Плазмените свойства aspartate aminotransferase и alanine aminotransferase се измерват чрез анализатор (FUJI DRI-CHEM: Fuji Film Medical Co. Ltd.). Всички кръвни проби се вземат без анестезия. Като резултат от биохимичното изследване на плазмата след третирането не са наблюдавани данни, показващи поражения на черния дроб.

Пример 24. Фармакологични изследвания in vitro и in vivo на TRA-8 срещу ракови клетки.

За да се установи дали TRA-8 е терапевтично ефикасен при анти ракова терапия се изследва унищожителната активност на TRA-8 in vitro при различни ракови клетъчни линии.

Различни ракови клетки (2-8 х 10³ клетки/50 μ 1) се култивират в PRMI1640 среда (за Jurkat клетки), DMEM среда (за НСТ-116), MEM-R (за WiDr) и DMEM-F12 (за COL2-Jck), доставени от Gibco BRL с 10% FCS (Gibco BRL) при 37°С в присъствието на 5% СО2 и се разпределят във всички колби от 96-well microplate (Sumitomo Bakelite). TRA-8 се привежда

104 до продукт с концентрация 100 ng/ml със среда, съдържаща 10% FCS. Разтворът на TRA-8 се използва, за да се направят няколко разреждания чрез повтаряне на серийни разреждания два пъти със среда, съдържаща 10% FCS. Всеки от разредените разтвори на TRA-8 се добавя във всяка колба по 50 μΐ на колба и се инкубира при 37°С. След реакция при 37°С за 72 часа се добавя 50 μ 1 от 25 μΜ PMS (феназин метосулфат; Sigma Chemical Co.), съдържащ 1 mg/ml ХТТ (концентрация 250 mg/ml за ХТТ и 5 μΜ за PMS). След инкубиране за 3 часа е измерена абсорбацията при 450 nm за всяка колба, за да се изчисли клетъчната жизнеспособност чрез способността за редукция на митихондрията като показател.

Жизнеспособността на клетките във всяка колба се изчислява по следната формула:

Жизнеспособност (%) = 100 х (а-b) / (с-Ь) където “а” е измереното в тест колба, “Ь” е измереното в колба без клетки и “с” е измереното в колба, без добавено антитяло.

Резултатите са показани в таблица 3.

Таблица 3

Клетки	ED50 (pg/ml)
Jurkat	0.001-0.01
НСТ-116	0.004-0.02
WiDr	0.007 - 0.03
COL2-Jck	2.28

Различните ракови клетъчни линии са със силно причинена апоптоза чрез TRA-8 при условия in vitro.

Тъй като TRA-8 не е реактивен към миши DR5 in vivo е установен анти туморния ефект на TRA-8 при голи мишки, трансплантирани с WiDr клетки. Античовешкото DR5 антитяло TRA-8 се прилага върху голи мишки, носители на човешки ксенографти, които проявяват човешка DR5 молекула.

105

Използваните мишки са 6 седмични BALb/c nude/nude мишки (женски от Clea Japan Inc.), в които са трансплантирани човешки клетъчни линии от рак на дебело черво WiDr (5mm³). Един ден след туморната трансплантация тези мишки се инжектират вътреставно с TRA-8 (5 pg/индивид) ежедневно 14 пъти. Нарастването на тумора WiDr се определя ежедневно чрез размера на туморната маса. Резултатите са показани в таблица 4:

Таблица 4

	8 дни	11 дни	15 дни	18 дни	22 дни	25 дни
Контрола (PBS)	196	249	469	584	833	1193
SD	±55	±77	±149	±230	±274	±419
TRA-8	158	97	155	195	365	530
SD	±78	±30	±60	±58	±91	±135

При този модел, докато всички нетретирани животни проявяват видимо нарастване на тумора, нарастването на тумора при животни третирани с TRA-8 се забавя, което се доказва от размера на тумора. Този резултат доказва, че TRA-8 е ефективен при унищожаването на туморни клетки in vivo.

Пример 25 Комбинирано изследване на TRA-8

От Ametican Tissue Culture Collection (ATCC) е набавена човешка клетъчна линия от рак на простата РС-3 , поддържана в Ф12-К хранителна среда (21127-022, Gibco BRL), съдържаща 10% ембрионален бувин серум (FBS, Нусюпе), 1% Ь-Глутамин-200 тМ (25030-149, Gibco BRL) и 0.5% разтвор пеницилин и стрептомицин (P-7539, Sigma). За следващия опит се използва средата RPMI 1640 (MED-008, IWAKI), допълнена с 10% FBS и 0.5% разтвор пеницилин и стрептомицин. Експоненциално нарастващите РС-3 клетки се събират чрез трипсинизация и се измиват два пъти с прясна среда. След това клетките се преброяват, ресуспендират в прясна среда при

106 гъстота 5 х 10⁴ клетки/ml и се разпределят на три в плоско дънни съда 96well (3598, Coming-Coster) до общ обем 100 μΙ/съд един ден преди началото на експеримента. В прясна среда се разрежда едно типично анти-раково лекарствено средство - Паклитаксел (169-18611, Wako), което е разтворено в диметилсулфооксид (10 mg/ml) и след това се добавя към съдовете 96-well, съдържащи по 50 μΙ/съд клетки. Концентрациите на диметилсулфооксид са по-малки от 0.1%. След инкубиране за 24 часа при 37°С в атмосфера с 5% СО₂ към съдовете се добавя TRA-8, разреден с прясна среда. След инкубирне за нови 24 часа към съдовете се добавя 50 μ 1 среда Minimum Essential (11095-098, Gibco, BRL), съдържаща 1 mg/ml XTT и 25 mM PMS и съдовете се инкубират за 6 часа. След това се измерва OD450 чрез SPECTRA МАХ 250 (Molecular Devices) и клетъчната жизнеспособност се изчислява по следния начин:

Клетъчна жизнеспособност (%) = (OD450 за колби, съдържащи клетки, третирани с Таксол и/или TRA-8 (агент/и) - OD450 за колби, които не съдържат нито клетки, нито агент) х 100 / (OD450 за колби, съдържащи клетки без агент - OD450 за колби, които не съдържат нито клетки, нито агент).

Резултатът от горния анализ за TRA-8 в комбинация с анти раковото лекарство Паклитаксел е следният. Паклитаксел намалява клетъчната жизнеспособност на РС-3 клетките, но повече от 40% от сигналите, сочещи за жизнеспособни ракови клетки остават в концентрации от над 200 пМ. Забележително е, че добавянето на 0.1 ng/ml от TRA-8 значително намалява клетъчната жизнеспособност на раковите клетки, над 10%, въпреки, че не се наблюдава намаляване на клетъчната жизнеспособност след единично приложение на TRA-8 при тази концентрация. Този резултат ясно доказва, че TRA-8 в комбинация с други анти ракови лекарствени средства проявява синергистична анти ракова активност .

Пример 26. Анализ на друг тип хуманизирани антитела на TRA-8 (1) Проектиране на хуманизирани антитела.

107

Конструирането на хуманизирана версия на TRA-8 се извършва чрез метод, известен като CDR графтинг. Антитялото mAB58’CL се използва като аксептор, както е описано в пример 3 и CDR зоните на антитялото TRA-8 се присаждат на аксептора. В структурната зона някои амино киселини се присаждат на аксептора както от TRA-8, така и от човешки последователности посредством критерии, установени от Queen et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 10029-10033, (1989)) и последователностите на хуманизирания TRA-8 се конструират по описания по-долу начин.

(2) Изграждане на плазмид, носител на тежката верига на променливата зона на DNA за друг тип хуманизиран или миши TRA-8

Както е показано на SEQ ID No.56 от листинга с последователностите хуманизирането тип Н1 на амино киселинните последователности на тежката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 3-та амино киселина (метионин), 13-та аминокиселина (лизин), 19-та амино киселина (лизин), 40-та амино киселина (треонин), 42-ра амино киселина (глутаминова киселина), 44-та амино киселина (агринин), 84-та амино киселина (серин), 88-ма амино киселина (серин), 93-та амино киселина (метионин), 114-та аминокиселина (треонин) и 115-та амино киселина (леуцин) съответно с глутамин, глутамин, агринин, аланин, глицин, глицин, аспаргинова киселина, аланин, валин, леуцин и валин.

Както е показано на SEQ ID No.59 от листинга с последователностите хуманизирането тип НЗ на амино киселинните последователности на тежката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 13-та амино киселина (лизин), 19-та амино киселина (лизин), 40-та амино киселина (треонин), 42-ра амино киселина (глутаминова киселина), 44-та амино киселина (агринин), 88-ма амино киселина (серин), 93-та амино киселина (метионин), 114-та амино киселина (треонин) и 115-та амино киселина (леуцин) съответно с глутамин, агринин, аланин, глицин, глицин, аланин, валин, леуцин и валин.

Както е показано на SEQ ID No.60 от листинга с последователностите хуманизирането тип Н4 на амино киселинните

108 последователности на тежката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 13-та амино киселина (лизин), 19-та амино киселина (лизин), 88-ма амино киселина (серин), 93-та амино киселина (метионин), 114-та амино киселина (треонин) и 115-та амино киселина (леуцин) съответно с глутамин, агринин, аланин, валин, леуцин и валии.

Както е показано на SEQ ID No.61 от листинга с последователностите плазмидът, носител на тежката верига на променливата зона на DNA на теоретичния TRA-8 е означен като “М тип”. Хуманизирания TRA-8, описан в примери 17 и 18 е означен като “Н2 тип”.

Плазмидът, носител на DNA, кодираща променливата зона на тежката верига на хуманизиран или теоретичен TRA-8 се изгражда по следния начин.

За изграждане на DNA последователности се използва PCR, всяка от който включва описаното до тук.

Синтезирани са следните 24 олигонуклеотиди:

5'- ttggataagc ttggcttgac ctcaccatgg gatggagctg tatcatcctc ttcttggtag caacagctac aggtgtccac -3' (A; SEQ ID No. 32);

5'- tctgaagtaa tgctggtgga gtctggggga ggcttagtac agcctggagg gtccctgaga ctctcctgtg cagcctctgg -3' (B; SEQ ID No. 33);

5'- tctgaagtac agctggtgga gtctggggga ggcttagtac agcctggagg gtccctgaga ctctcctgtg cagcctctgg -3¹ (B2; SEQ ID No. 57);

5'- tctgaagtaa tgctggtgga gtctggggga ggcttagtaa agcctggagg gtccctgaaa ctctcctgtg cagcctctgg -3' (B3; SEQ ID No. 66);

5'- attcactttc agtagttatg taatgtcttg ggttcggcag gcaccaggga agggtctgga gtgggttgca accattagta -3' (C; SEQ ID No. 34);

5'- attcactttc agtagttatg taatgtcttg ggttcggcag actccagaga agaggctgga gtgggttgca accattagta -3' (C2; SEQ ID No. 64);

5'- gtggtggtag ttacacctac tatccagaca gtgtgaaggg ccgattcacc atctccagag acaatgccaa gaacaccctg -3' (D; SEQ ID No. 35);

5'- tatctgcaaa tgaacagtct gagagcagag gacacggctg tttattactg tgcaagaagg

109 ggtgactcta tgattacgac -3' (E; SEQ ID No. 36);

5'- tatctgcaaa tgagcagtct gagagcagag gacacggctg tttattactg tgcaagaagg ggtgactctatgattacgac -3' (E2; SEQ ID No. 62);

5'- tatctgcaaa tgagcagtct gagatctgag gacacggcta tgtattactg tgcaagaagg ggtgactcta tgattacgac -3' (E3; SEQ ID No. 67);

5'- ggactactgg ggccaaggga ccctggtcac agtctcctca gcctccacc aagggcccat cggtc-3'(F; SEQ ID No.37);

5'- ggactactgg ggccaaggga ccactctcac agtctcctca gcctccacc aagggcccat cggtc-3'(F2; SEQ ID No. 68);

5'- ctaccaagaa gaggatgata cagctccatc ccatggtgag gtcaagccaa gcttatccaa -3'(G;SEQ IDNo.38);

5'- tctcagggac cctccaggct gtactaagcc tcccccagac tccaccagca ttacttcaga gtggacacct gtagctgttg -3' (H; SEQ ID No. 39);

5'- tctcagggac cctccaggct gtactaagcc tcccccagac tccaccagct gtacttcaga gtggacacct gtagctgttg -3' (H2; SEQ ID No. 58);

5'- tttcagggac cctccaggct ttactaagcc tcccccagac tccaccagca ttacttcaga gtggacacct gtagctgttg -3' (H3; SEQ ID No. 69);

5'- tccagaccct tccctggtgc ctgccgaacc caagacatta cataactact gaaagtgaat ccagaggctg cacaggagag -3' (I; SEQ ID No. 40);

5’ - tccagcctct tctctggagt ctgccgaacc caagacatta cataactact gaaagtgaat ccagaggctg cacaggagag -3' (12; SEQ ID No. 65);

5'- ctctggagat ggtgaatcgg cccttcacac tgtctggata gtaggtgtaa ctaccaccac tactaatggt tgcaacccac -3' (J; SEQ ID No. 41);

5'- ccttcttgca cagtaataaa cagccgtgtc ctctgctctc agactgttca tttgcagata cagggtgttc ttggcattgt -3' (K; SEQ ID No. 42);

5'- ccttcttgca cagtaataaa cagccgtgtc ctctgctctc agactgttca tttgcagata cagggtgttc ttggcattgt -3' (K2; SEQ ID No. 63);

5'- ccttcttgca cagtaataca tagccgtgtc ctcagatctc agactgctca tttgcagata cagggtgttc ttggcattgt -3' (K3; SEQ ID No. 70);

- gaccgatggg cccttggtgg aggctgagga gactgtgacc agggtccctt ggccccagta gtccgtcgta atcatagagt cacc -3' (L; SEQ ID No. 43) и

110

5'- gaccgatggg cccttggtgg aggctgagga gactgtgaga gtggtccctt ggccccagta gtccgtcgta atcatagagt cacc -3' (L2; SEQ ID No. 71).

По описания начин са синтезирани следните 2 PCR праймера:

5'- ttggataagc ttggcttgac -3' (PI; SEQ ID No. 44); и

5'- gaccgatggg cccttggtgg a -3' (P2; SEQ ID No. 45).

Синтезът на Hl тип DNA, кодираща полипептидна верига, включваща последователност за сигнализиране на секреция, променлива зона на тежката верига на хуманизиран TRA-8 и 8 амино киселинни остатъци в N-край на зоната IgG-CHl се изпълнява съответно чрез комбинации PCR.

Н1 тип DNA фрагмент се получава по следния начин.

Състав на PCR реакционен разтвор: олигонуклеотид А, 10 pmol;

олигонуклеотид В2,10 pmol;

олигонуклеотид С, 10 pmol;

олигонуклеотид D, 10 pmol;

олигонуклеотид Е, 10 pmol;

олигонуклеотид F, 10 pmol; олигонуклеотид G, 10 pmol;

олигонуклеотид Н2,10 pmol;

олигонуклеотид 1,10 pmol; олигонуклеотид J, 10 pmol;

олигонуклеотид К, 10 pmol; олигонуклеотид L, 10 pmol;

олигонуклеотиден праймер Р1,2 μΜ; олигонуклеотиден праймер Р2,2 μΜ;

X Пиробест буфер П, 10 μΐ;

dNTPs микс, 8 μΐ;

Пиробест DNA полимераза, 0.5 μΐ; и редестилирана вода до обем 50 μΐ;

PCR реакцията се изпълнява по следния начин. Първо разтворът се нагрява при 94°С за 5 минути, след което 7 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при

Ill

98°C за 10 секунди, 55°C за 30 секунди и 72°С за 1 минута. След извършване на тази процедура реакционния разтвор се нагрява при 72°С за 15 минути.

След фенол екстракция и утаяване чрез етанол получената утайка DNA се изсушава чрез вакуум, разтваря се в минимум дестилирана вода и се разделя посредством електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид, за да може да се разпознае DNA при UV светлина. DNA връзките, съответстващи на Н1 тип DNA се отстраняват чрез бръснач и се утаяват от гела чрез Geneclean Spin Kit (BIO 101, СА, USA). След фенол екстракцията утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7,500 X g, следва утаяване чрез етанол и накрая се разтваря в 5 μΐ дестилирана вода.

Синтезът на НЗ тип DNA, кодираща полипептидна верига, включваща

последователност за сигнализиране на секреция, променлива зона на тежката верига на хуманизиран TRA-8 и 8 амино киселинни остатъци в N-край на зоната IgG-CHl се изпълнява съответно чрез комбинации PCR.

НЗ тип DNA фрагмент се получава по следния начин.

Състав на PCR реакционен разтвор:

олигонуклеотид А, 10 pmol;

олигонуклеотид В, 10 pmol;

олигонуклеотид С, 10 pmol;

олигонуклеотид D, 10 pmol;

олигонуклеотид Е2,10 pmol;

олигонуклеотид F, 10 pmol;

олигонуклеотид G, 10 pmol;

олигонуклеотид Н, 10 pmol;

олигонуклеотид 1,10 pmol;

олигонуклеотид J, 10 pmol;

олигонуклеотид К2,10 pmol;

олигонуклеотид L, 10 pmol;

олигонуклеотиден праймер Р1,2 μΜ;

олигонуклеотиден праймер Р2,2 μΜ;

112

X Пиробест буфер П, 10 μΐ;

dNTPs микс, 8 μΐ;

Пиробест DNA полимераза, 0.5 μΐ; и редестилирана вода до обем 50 μΐ;

PCR реакцията се изпълнява по следния начин. Първо разтворът се нагрява при 94°С за 5 минути, след което 7 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 98 °C за 10 секунди, 55°С за 30 секунди и 72°С за една минута. След извършване на тази процедура реакционния разтвор се нагрява при 72°С за 15 минути.

След фенол екстракция и утаяване чрез етанол получената утайка DNA се

изсушава чрез вакуум, разтваря се в минимум дестилирана вода и се разделя посредством електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид, за да може да се разпознае DNA при UV светлина. DNA връзките, съответстващи на НЗ тип DNA се отстраняват чрез бръснач и се утаяват от гела чрез Geneclean Spin Kit След фенол екстракция утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7,500 X g, следва утаяване чрез етанол и накрая се разтваря в 5 μΐ дестилирана вода.

Синтезът на Н4 тип DNA, кодираща полипептидна верига, включваща последователност за сигнализиране на секреция, променлива зона на тежката верига на хуманизиран TRA-8 и 8 амино киселинни остатъци в N-край на зоната IgG-CHl се изпълнява съответно чрез комбинации PCR.

Н4 тип DNA фрагмент се получава по следния начин.

Състав на PCR реакционен разтвор:

олигонуклеотид А, 10 pmol; олигонуклеотид В, 10 pmol;

олигонуклеотид С2,10 pmol;

олигонуклеотид D, 10 pmol;

олигонуклеотид Е2,10 pmol;

олигонуклеотид F, 10 pmol; олигонуклеотид G, 10 pmol;

олигонуклеотид Н, 10 pmol; олигонуклеотид 12,10 pmol;

113 олигонуклеотид J, 10 pmol;

олигонуклеотид K2,10 pmol;

олигонуклеотид L, 10 pmol;

олигонуклеотиден праймер Pl, 2 μΜ; олигонуклеотиден праймер Р2,2 μΜ;

X Пиробест буфер П, 10 μΐ;

dNTPs микс, 8 μΐ;

Пиробест DNA полимераза, 0.5 μΐ; и редестилирана вода до обем 50 μΐ;

PCR реакцията се изпълнява по следния начин. Първо разтворът се нагрява при 94°С за 5 минути, след което 7 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 98°С за 10 секунди, 55°С за 30 секунди и 72°С за една минута. След извършване на тази процедура реакционния разтвор се нагрява при 72° С за 15 минути.

След фенол екстракция и утаяване чрез етанол получената утайка DNA се изсушава чрез вакуум, разтваря се в минимум дестилирана вода и се разделя посредством електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид, за да може да се разпознае DNA при UV светлина. DNA връзките, съответстващи на Н4 тип DNA се отстраняват чрез бръснач и се утаяват от гела чрез Geneclean Spin Kit. След фенол екстракция утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7,500 X g, следва утаяване чрез етанол и накрая разтваряне в 5 μΐ дестилирана вода

Синтезът на М тип DNA, кодираща полипептидна верига, включваща последователност за сигнализиране на секреция, променлива зона на тежката верига на теоретичен TRA-8 и 8 амино киселинни остатъци в N-край на зоната IgG-CHl се изпълнява съответно чрез комбинации PCR.

М тип DNA фрагмент се получава по следния начин.

Състав на PCR реакционен разтвор:

олигонуклеотид А, 10 pmol;

олигонуклеотид ВЗ, 10 pmol; олигонуклеотид С2,10 pmol;

олигонуклеотид D, 10 pmol;

114

олигонуклеотид ЕЗ, 10 pmol;

олигонуклеотид F2,10 pmol;

олигонуклеотид G, 10 pmol;

олигонуклеотид НЗ, 10 pmol;

олигонуклеотид 12,10 pmol;

олигонуклеотид J, 10 pmol;

олигонуклеотид КЗ, 10 pmol;

олигонуклеотид L2,10 pmol;

олигонуклеотиден праймер Р1,2 μΜ; олигонуклеотиден праймер Р2,2 μΜ;

X Пиробест буфер Π, 10 μΐ;

dNTPs микс, 8 μΐ;

Пиробест DNA полимераза, 0.5 μΐ; и редестилирана вода до обем 50 μΐ;

PCR реакцията се изпълнява по следния начин. Първо разтворът се нагрява при 94°С за 5 минути, след което 7 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 98°С за 10 секунди, 5SC за 30 секунди и 72°С за една минута. След извършване на тази процедура реакционния разтвор се нагрява при 72°С за 15 минути.

След фенол екстракция и утаяване чрез етанол получената утайка DNA се изсушава чрез вакуум, разтваря се в минимум дестилирана вода и се разделя посредством електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид, за да може да се разпознае DNA при UV светлина. DNA връзките, съответстващи на М тип DNA се отстраняват чрез бръснач и се утаяват от гела чрез Geneclean Spin Kit. След фенол екстракция утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7,500 X g, следва утаяване чрез етанол и накрая разтваряне в 5 μΐ дестилирана вода.

Всяка извлечена DNA (тип Н1, тип НЗ, тип Н4 и тип М) се клонира чрез pGEM-Easy вектор (Promega) по следния начин:

DNA фрагмент, възстановен от PCR реакция (Η 1, НЗ, Н4 или М), 5 μΐ;

XTaq полимераза буфер, 1 μΐ;

dNTPs смес 1 μΐ

115

Taq полимераза (5 единици / ml), 1 μΐ и редестилирана вода до обем 10 μΐ.

Както по-горе всеки разтвор реагира при 70°С за 30 минути, всеки DNA разтвор и pGEM-T Easy вектор се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Shuzo Co. Ltd.) според указанията на производителя.

След четири часова инкубация при 15°C 2 μΐ от инкубирания реакционен разтвор се смесват със 100 μ 1 от установения вид Е. Coli JM109 при клетъчна гъстота 1-2 х 10⁹ клетки/ml (Takara Shuzo Co. Ltd.) и сместа се държи в лед за 30 минути, след това при 42°С за 30 секунди и отново в лед за 1 минута. След това към сместа се добавят 500 μΐ SOC среда (2% v/v триптон, 0.5% w/v екстракт от дрожди, 0.05% w/v натриев хлорид, 2.5 mM w/v калиев хлорид, 1 тМ магнезиев хлорид и 20 тМ глюкоза) и се инкубира чрез разклащане през следващия час. Трансформантните видове се изолират и от тях се получава плазмид DNA, което е описано в “Молекулярно клониране: Лабораторен наръчник”. Нуклеотидната последователност на тази DNA, кодираща тежката верига на хуманизиран или миши TRA-8 се потвърждава чрез дидеокси метод (Sanger, F. S., et al., (1977), Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74:5463-5467) посредством 3700 DNA анализатор (ABI PRISM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Japan).

Получените плазмиди са означени рНА15 (плазмидьт, носител на cDNA, кодираща Hl-тип тежката верига на хуманизиран TRA-8), рНСЮ (плазмидьт, носител на cDNA, кодираща НЗ-тип тежката верига на хуманизиран TRA-8), pHD21 (плазмидьт, носител на cDNA, кодираща Н4-тип тежката верига на хуманизиран TRA-8) и рМП (плазмидьт, носител на cDNA, кодираща тежката верига на теоретичен TRA-8). Трансформантните видове Е. coli, приютяващи тези плазмиди, означени като Е. coli JM109/pHA15, Е. coli JM109/pHC10, Е. coli JM109/pHD21 и E. coli JM109/pMll са депозирани в International Patent Organism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и имат депозитни номера съответно: FERM ВР-7555, FERM ВР-7557, FERM ВР-7558 и FERM ВР7559.

116 (3) Изграждане на експресии на плазмиди, носители на променливата зона на тежката верига DNA на няколко типа хуманизран или миши TRA-8.

Рекомбинантен вектор експресия за животински клетки се конструира чрез вмъкване на DNA, кодираща тежката верига от тип Н1, НЗ и Н4 за хуманизиран и М за теоретичен TRA-8 (клониран според описаното по-горен) по следния начин.

Един pg от плазмид pSRHHH3 (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1), носител на променливата зона на тежката верига на хуманизирано анти-Fas моноклонално антитяло HFE7A и постоянна зона на геномна DNA на човешки

IgGl, вектор експресия за клетки от бозайници се разтварят с рестрикционните ензими Hindin и Apal и се разделят чрез електрофореза с 3% агарозен гел. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml воден разтвор на етидиум бромид, за да може да се разпознае DNA при UV светлина. DNA векторните връзки, съдържащи постоянна зона на геномна DNA на човешки IgG без променливата зона на тежката верига на хуманизиран HFE7A се отстраняват чрез бръснач и се утаяват от гела чрез Geneclean Spin Kit. След фенол екстракция утаената DNA се концентрира чрез центрофугиране при 7,500 X g, следва утаяване чрез етанол и накрая се разтваря в 5 μ 1 дестилирана вода и се дефосфорилизира чрез С1Р. Полученият разтворен, дефосфорилизиран плазмид (100 ng) се легира с 1 pg от DNA фрагменти рНА15, рНСТО, pHD21 или рМ11, съдържащи DNA, кодираща променливата зона на тежката верига на хуманизиран или теоретичен TRA-8, който също е разтворен с НнкПП и Apal чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Shuzo Co., Ltd.). Легираната смес се използва след това за трансформиране на Е. coli JM109, която се поставя върху LB агар съдове, съдържащи 50 μ g/ml ампицилин.

Трансформантите, получени по този метод се култивират в 2 ml течна LB среда, съдържаща 50 pg/ml ампицилин при 37°С за една нощ и след това плазмидът DNA се извлича от получената култура посредством алкален-SDS метод.

Извлеченият DNA плазмид се разрежда с Hindlll и Apal и се подлага на електрофореза с 3% w/v агарозен гел, за да се потвърди наличието или липсата на вмъкната DNA, кодираща променливата зона на тежката верига на хуманизиран или теоретичен TRA-8. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във

117 вектора се потвърждава от последователностите на DNA чрез генен анализатор на последователностите (ABI Prism 300 DNA Analizer, Applied Biosystems). Получените плазмиди експресия, носители на cDNA, кодиращи тежката верига на хуманизиран или теоретичен IRA-8 са означени съответно с рНА15-1, рНСЮ-З, pHD21-l ирМ11-1.

(4) Изграждане на вектори за хуманизираните леки вериги (4.1) Изграждане на вектор експресия за леката верига на хуманизираното антитяло (тип LM1)

Както е показано на SEQ ID No.72 от листинга с последователностите друг вид хуманизиране (тип LM1) на амино киселинните последователности на леката верига на мишето анти-човешки DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 3-та амино киселина (валин), 8-ма амино киселина (хистидин), 9-та амино киселина (лизин), 10-та амино киселина (фениламин), 11-та амино киселина (метионин), 13та амино киселина (треонин), 20-та амино киселина (серин), 42-ра амино киселина (глугамин), 43-та (серин), 60-та амино киселина (аспартанова киселина), 63-та амино киселина (треонин), 77-ма амино киселина (аспаргинова киселина), 78-ма амино киселина (валин), 80-та амино киселина (серин), 83-та амино киселина (леуцин), 85-та амино киселина (аспартанова киселина), 87-ма амино киселина (фениламин) и 99-та амино киселина (глицин), 103-та амино киселина (леуцин), 108-ма амино киселина (аланин) от N-край на амино киселинната последователност на леката верига на TRA-8 съответно с: глугамин, пролин, серин, серин, леуцин, аланин, треонин, лизин, аланин, серин, серин, серин, леуцин, пролин, фениламин, треонин, тирозин, глугамин, валин и треонин. Получената последователност е означена с LM1.

Плазмидите експресия, носители на този тип хуманизирана лека верига на амино киселинните последователности на анти-човешкото DR5 антитяло TRA-8 (тип LM1, SEQ ID No.72 от листинга с последователностите) се изграждат по следния начин:

1) Синтез на праймери за получаване на променливите и постоянните зони на леката верига на хуманизиран TRA-8 (тип LM1)

118

DNA кодирането за LM1 полипегггидна верига (SEQ ID No. 72 от листинга с последователностите), всяко от които е синтез от променливата зона на леката верига на хуманизирано анти-ОЯ5 антитяло TRA-8 (тип LM1) и постоянната зона на леката верига на човешки Ig (к верига) се синтезират чрез съответните комбинации PCR.

Следват 7AL1P (SEQ ID No. 47), 7ALCN (SEQ ID No. 48), HKCDF11 (SEQ ID No. 50), HKCDR12 (SEQ ID No. 51), HKCDF22 (SEQ ID No. 52), HKCDR22 (SEQ ID No, 53) и HKCF12 (SEQ ID No. 54).

3a PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери:

5'- gtcccccaca gatgcagaca aagaacttgg agattgggtc atctgaatgt caccagtgga -3' (HKSPR12;SEQIDNo.77).

2) Изграждане на плазмид pCR3.1/LMl-2 (клонинг на лека верига на хуманизиран TRA-8 тип LM1)

Фрагментът LM1-DNA, кодиращ амино киселинните последователности, дефинирани в SEQ ID No.72 се получава чрез изпълняване на 2 стъпки PCR, вмъкване във вектор плазмид и клониране в Е. coli.

а) Първа стъпка PCR

Фрагментът LM1-F1-DNA, кодиращ последователността за сигнализиране на секреция и частта от FRL] зоната с мястото на деление на рестрикционния ензим Hindin, добавени на 5’-край се получава при следните условия. Според описанието на Европейска патентна заявка ЕП 0 909 816 А1 се получава шаблона от плазмиди pHSGHM17 и pSRPDHH.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pHSGHMl 7 DNA, 25 ng;

олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol;

олигонуклеотиден праймер HKSPR12,50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза (PerkinElmer), 2.5 ед.

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

119

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM1-F2-DNA, кодиращ частите FRLi, CDRLi, FRL₂ и CDRL₂ се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pL28 DNA, 25 ng;

олигонуклеотаден праймер HKCDF11,50 pmol;

олигонуклеотаден праймер HKCDR12,50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза (PerkinElmer), 2.5 ед.

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μ! и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM1-F3-DNA, кодиращ частите CDRL₂, FRL3 и част от CDRL3 се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHHDNA, 25 ng;

олигонуклеотаден праймер HKCDF22,50 pmol;

олигонуклеотаден праймер HKCDR22,50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза (PerkinElmer), 2.5 ед.

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

120

Фрагментът LM1-F4-DNA, кодиращ частите CDRL₃, FRL4 и постоянната зона с рестрикционен ензим EcoR I на мястото на деление, добавен в 3’-край се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHH DNA, 25 ng;

олигонуклеотиден праймер HKCF12,50 pmol;

олигонуклеотаден праймер 7ALCN, 50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза (PerkinElmer), 2.5 ед.

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μ! и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените фрагменти DNA след PCR се разделят посредством електрофореза с 5% гел полиакриламид. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml етидиум бромид за да се разпознае получената DNA при UV светлина. Съответните връзка на така разпознатата DNA се отстраняват с бръснач.

Ь) Втора стъпка PCR

LM1-DNA, при която описаните по горе фрагменти LM1-F1-DNA, LM1-F2DNA, LM1-F3-DNA и LM1-F4-DNA се синтезират се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

Гел фрагмент LM1-F1-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM1-F2-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM1-F3-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM1-F4-DNA, получен в първа стъпка PCR, олигонуклеотиден праймер 7AL1P 50 pmol;

олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol;

dNTPs коктейл, 5.0 μΐ;

121

x PCR буфер5.0 μΐ; и amliTaq DNA полимераза, 2.5 ед.

Реакционния разтвор е този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Полученият по този начин фрагмент LM1-DNA се вмъква в плазмида pCR3.1DNA чрез Eukaryotic ТА cloning Kit (InVitrogen) според инструкциите на производителя и се въвежда в установена среда Е. coli TOPI OF’, която се доставя с комплекта. Нуклеотидните последователности на тези DNAs, кодиращи леката верига на хуманизиран TRA-8 (тип LM1) се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F. S. et al., (1977), Proc. Natl. Acad, Sci. USA, 74:5463-5467) чрез 3700 DNA анализатор (ABI PRISM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Япония).

Получените плазмиди са означени pCR3.1/LMl-2 (плазмидът, носител на cDNA, кодираща променливата зона на леката верига на хуманизиран TRA-8 (тип LM1) и постоянна зона на леката верига на човешки lg).

Полученият плазмид pCR3.1/LMl-2, съдържащ фрагмента LM1-DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pHSG399 DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани фрагменти pHSG299 DNA и LM1-DNA, които са разтворени с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I се легират посредством DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар среда, съд ържаща 0.1 mM IPTG, 0.1% X-Gal и 50 pg/ml хлорамфеницол (крайни концентрации). Получените бели трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 50 μ g/ml хлорамфеникол и от получената култура чрез алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Извлеченият плазмид DNA се разтваря с Hind Ш и EcoR I и след това клонът, носител на фрагмента LM1-DNA се селектира чрез електрофореза посредством 1% агарозен гел.

122

В резултат на горната процедура се получава плазмид pHSG/Ml-2-2, носител на синтезиран фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизиран LM1 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK. Трансформантният вид Е. coli, приютяващ тези плазмиди, означен като Е. coli DH5a/pHSG/M 1-2-2 е депозиран в International Patent Ogranism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukubashi, Ibaraki-ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и има депозитен номер FERM ВР-7562.

3) Изграждане на плазмид pSR/LMl-2 (плазмид експресия за хуманизирана лека верига на LM1TRA-8)

Полученият плазмид pSRPDHH DNA, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизирания LM1 TRA-8 и постоянната зона на човешка IgK верига се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един pg от клонирания плазмид pSRPDHH DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1) се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и се дефосфорилизира с CIP. Резултатните дефосфорилизирани фрагменти pSRPDHH DNA и Hind Ш-EcoRI, получени от pHSG/M 1-2-2 се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар. Получените трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин и от получената култура посредством алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектор pSRPDHH се потвърждава чрез последователностите на DNA чрез генен анализатор.

Полученият плазмид експресия, носител на cDNA, кодираща леката верига нахуманизиран LM1 TRA-8 е означенpSR/LMl-2.

(4.2) Изграждане на вектор експресия за леката верига на хуманизираното антитяло (тип LM3)

Както е показано в SEQ ID No.73 от листинга с последователностите друг вид хуманизиране (тип LM3) на амино киселинните последователности на леката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 8-ма

123 амино киселина (хистидин), 9-та амино киселина (лизин), 10-та амино киселина (фениламин), 11-та амино киселина (метионин), 13-та амино киселина (треонин), 20-та амино киселина (серин), 42-ра амино киселина (глутамин), 43-та амино киселина (серин), 77-ма амино киселина (аспаргинова киселина), 78-ма амино киселина (валин), 80-та амино киселина (серин), 83-та амино киселина (леуцин), 85та амино киселина (аспартанова киселина), 87-ма амино киселина (фениламин), 99та амино киселина (глицин), 103-та амино киселина (леуцин) и 108-ма амино киселина (аланин) от N-край на амино киселинната последователност на леката верига на TRA-8 съответно с: пролин, серин, серин, леуцин, аланин, треонин, лизин, аланин, серин, леуцин, пролин, фениламин, треонин, тирозин, глутамин, валин и треонин, Получената последователност е означена с LM3.

Плазмидите експресия, носители на този тип хуманизирана лека верига на амино киселинните последователности на анти-човешкото DR5 антитяло TRA-8 (тип LM3, SEQ ID No.73 от листинга с последователностите) се изграждат по следния начин:

1) Синтез на праймери за получаване на променливите и постоянните зони на леката верига на хуманизиран LM3 TRA-8

DNA кодирането за LM3 полипептидна верига (SEQ ID No.73 от листинга с последователностите), всяко от които е синтез от променливата зона на леката верига на хуманизирано aHTH-DR5 антитяло TRA-8 и постоянната зона на леката верига на човешки Ig (к верига) се синтезират съответно чрез комбинации PCR.

Следват 7AL1P (SEQ ID No.47) и 7ALCN (SEQ ID No.48), като за PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери:

5'- atctagttct cagagatgga gacagacaca atcctgctat gggtgctgct gctctgggtt ccagg -3' (MOD1F1; SEQ ID No. 78);

5'- cagcacccat agcaggattg tgtctgtctc catctctgag aactagatga gaggatgctt cttaagctt -3' (MOD1R1; SEQ ID No. 79);

5'- ctccactggt gacattgtga tgacccaatc tccaagttct ttgtctgcat ctgtggggga cagggtc

-3' (MOD1F22; SEQ ID No. 80);

5'- acttggagat tgggtcatca caatgtcacc agtggagcct ggaacccaga gcag-3' (MOD1R22; SEQ ID No. 81);

124

5'-accatcacct gcaaggccag tcaggatgtg ggtactgctg tagcctggta ccaacagaaa ccaggaa -3' (M0D1F3; SEQ ID No. 82);

5'- tacagcagta cccacatcct gactggcctt gcaggtgatg gtgaccctgt cccccacaga tgcagacaaa ga -3' (MOD1R3; SEQ ID No. 83);

5'- aagcacccaa actcctcatc tattgggcat ccacccggca cactggggtc ccagataggt ttacaggcag t -3' (MOD1F42; SEQ ID No. 84);

5'- cccagtgtgc cgggtggatg cccaatagat gaggagtttg ggtgcttttc ctggtttctg ttggtaccag gc -3' (MOD1R4; SEQ ID No, 85);

5'- gggtctggga cagacttcac cctcaccatc tctagtctgc agccggagga ttttgcaacc tat -3'(MOD1F5; SEQ ID No. 86);

5'- actagagatg gtgagggtga agtctgtccc agacccactg cctgtaaacc tatctgggac -3' (MOD1R52; SEQ ID No. 87);

5'- tactgtcagc aatatagcag ctatcggacg ttcggtcaag gcaccaaggt ggaaatc -3' (MODlF6;SEQIDNo.88);

5'- cgtccgatag ctgctatatt gctgacagta ataggttgca aaatcctccg gctgcac -3' (MOD 1R6; SEQ ID No. 89)

5'- aaacggactg tggctgcacc atctgtcttc atcttcccgc catctgatga g -3' (MOD1F7;

SEQ ID No. 90);

5'- gaagatgaag acagatggtg cagccacagt ccgtttgatt tccaccttgg tgccttgacc gaa -3' (MOD1R7; SEQ ID No. 91); и

5'- agatttcaac tgctcatcag atggcgggaa (LR17; SEQ ID No. 101).

2) Изграждане на плазмид pCR3.1/LM3-3-4-4 (клонинг на лека верига на хуманизиран TRA-8 тип LM3)

Фрагментът LM3-DNA, кодиращ амино киселинната последователност, която е дефинирана в SEQ ID No.73 се получава след извършване на две стъпки PCR, вмъкване в плазмид вектор и клониране в Е. coli.

а) Първа стъпка PCR

Фрагментът LM3-F31B-DNA, кодиращ последователността на зоната за сигнализиране на секреция с Hind III рестрикционен ензим на мястото на делението, добавен в 5’-край, FRL_b CDRLi, FRL₂ и CDRL₂, FRL₃, CDRL₃, FRL₄ и част от постоянната зона се получават при следните условия.

125

Състав на реакционния разтвор:

олигонуклеотиден праймер MOD1F1,5 pmol олигонуклеотиден праймер M0D1R1,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F22,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R22,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F3,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R3,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F42,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R4,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F5,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R52,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F6,5 pmol олигонуклеотиден праймер M0D1R6,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F7,50 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R7,5 pmol олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol олигонуклеотиден праймер LR17,50 pmol dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици.

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM3-F31C-DNA, кодиращ частта на постоянната зона с EcoR I ограничителен ензим на мястото на делението, добавен в 3’-край се получава при следните условия.

Шаблоните плазмида pSRPDHH се получават според описанието на

Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1.

Състав на реакционния разтвор:

126 плазмид pSRPDHH DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер M0D1F7,50 pmol олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol dNTPs коктейл, 5 μΐ;

χ PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици.

Реакционния разтвор е този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΙ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените фрагменти DNA след PCR се разделят посредством електрофореза с 5% гел полиакриламид. След електрофорезата телът се оцветява с 1 pg/ml етидиум бромид, за да се разпознае DNA при UV светлина. Откритите по този начин съответни DNA връзки се отстраняват чрез бръснач.

Ь) Втора PCR стъпка

LM3-DNA, при които описаните горе фрагменти LM3-F31B-DNA и LM3F31C-DNA се синтезират се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

Гел фрагмент LM3-F31B-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM1-F31C-DNA, получен в първа стъпка PCR, олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol;

олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици.

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

127

Полученият по този начин фрагмент LM3-DNA се вмъква в плазмида pCR3.1DNA чрез Eukaryotic ТА cloning Kit (InVitrogen) според инструкциите на производителя и се въвежда в установена среда Е. coli TOP10F’, която се доставя с комплекта. Нуклеотидните последователности на тези DNAs, кодиращи леката верига на хуманизиран LM3 TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F. S. et al., (1977), Proc. Natl. Acad, Sci. USA, 74:5463-5467) чрез 3700 DNA анализатор (ABI PRISM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Япония).

Получените плазмиди са означени pCR3.1/LM3-3-44 (плазмидът, носител на cDNA, кодираща променливата зона на леката верига на хуманизиран LM3 TRA-8 и постоянна зона на леката верига на човешки Ig).

Полученият плазмид pCR3.1/LM3-3-44, съдържащ фрагмента LM3-DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pHSG399 DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани фрагменти pHSG399 DNA и LM3-DNA, които са разтворени с рестрикционните ензими Hind III и EcoR I се легират посредством DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстилат в LB агар среда, съдържаща 0.1 тМ IPTG, 0.1% X-Gal и 50pg/ml хлорамфеницол (крайни концентрации). Получените бели трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 50 pg/ml хлорамфеникол и от получената култура чрез алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Извлеченият плазмид DNA се разтваря с Hind Ш и EcoR I и след това клонът, носител на фрагмента LM3-DNA се селектира чрез електрофореза посредством 1% агарозен гел.

В резултат на горната процедура се получава плазмид pHSG/M3-3-22, носител на синтезиран фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизиран LM3 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK. Трансформантният вид Е. coli, приютяващ тези плазмиди, означен като Е. coli DH5a/pHSG/M3-3-22 е депозиран в International Patent Ogranism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukuba

128 shi, Ibaraki-ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и има депозитен номер FERM ВР-7564.

3) Изграждане на плазмид pSR/LM3-3-44-10 (плазмид експресия за хуманизирана лека верига LM3 TRA-8).

Полученият плазмид pHSG/M3-3-22, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизирания LM3 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pSRPDHH DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1) се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и се дефосфорилизира с CIP. Резултатните дефосфорилизирани фрагменти pSRPDHH DNA и Hind Ш-EcoRI, получени от pHSG/M3-3-22 се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар. Получените трансформанги се култивират в течна LB среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин и от получената култура посредством алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектор pSRPDHH се потвърждава чрез последователностите на DNA чрез генен анализатор на последователностите.

Полученият плазмид експресия, носител на cDNA, кодираща леката верига на хуманизиран LM3 TRA-8 е означен pSR/LM3-3-44-10.

(43) Изграждане на вектор експресия за леката верига на хуманизираното антитяло (тип LM4)

Както е показано в SEQ ID No.74 от листинга с последователностите друг вид хуманизиране (тип LM4) на амино киселинните последователности на леката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 8-ма амино киселина (хистидин), 9-та амино киселина (лизин), 10-та амино киселина (фениламин), 11-та амино киселина (метионин), 13-та амино киселина (треонин), 20-та амино киселина (серии), 42-ра амино киселина (глугамин), 43-та амино киселина (серин), 77-ма амино киселина (аспаргинова киселина), 78-ма амино киселина (валин), 80-та амино киселина (серин), 83-та амино киселина (леуцин), 85та амино киселина (аспартанова киселина), 99-та амино киселина (глицин), 103-та

129 амино киселина (леуцин) и 108-ма амино киселина (аланин) от N-край на амино киселинната последователност на леката верига на TRA-8 съответно с: пролин, серии, серии, леуцин, аланин, треонин, лизин, аланин, серин, леуцин, пролин, фениламин, треонин, глутамин, валии и треонин, Получената последователност е означена с LM4.

Плазмидите експресия, носители на този тип хуманизирана лека верига на амино киселинните последователности на анти-човешкото DR5 антитяло TRA-8 (тип LM4) (SEQ ID No.74 от листинга с последователностите) се изграждат по следния начин:

1) Синтез на праймери за получаване на променливите и постоянните зони на леката верига на хуманизиран LM4 TRA-8

DNA кодирането за LM4 полипептидна верига (SEQ ID No.74 от листинга с последователностите), всяко от които е синтез от променливата зона на леката верига на хуманизирано анти-DRS антитяло IRA-8 и постоянната зона на леката верига на човешки Ig (к верига) се синтезират чрез съответните комбинации PCR.

Следват 7AL1P (SEQ ID No.47), 7ALCN (SEQ ID No.48), MOD1F1 (SEQ ID No.78), MOD1R1 (SEQ ID No.79), MOD1F22 (SEQ ID No.80), MOD1R22 (SEQ ID No. 81), MOD1F3 (SEQ ID No. 82), MOD1R3 (SEQ ID No. 83), MOD1F42 (SEQ ID No. 84), MOD1R4 (SEQ ID No. 85), MOD1F5 (SEQ ID No. 86), MOD1R52 (SEQ ID No. 87), MOD1F7 (SEQ ID No. 90) и MOD1R7 (SEQ ID No. 91), LR17 (SEQ ID No. 101), като за PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери:

5’- ttctgtcagc aatatagcag ctatcggacg ttcggtcaag gcaccaaggt ggaaatc -3' (MOD1F62; SEQ ID No. 92)

5'- cgtccgatag ctgctatatt gctgacagaa ataggttgca aaatcctccg gctgcag -3' (MOD1R62; SEQ ID No. 93)

2) Изграждане на плазмид pCR3.1/LM4-5-3 (клонинг на лека верига на хуманизиран TRA-8 тип LM4)

Фрагментът LM4-DNA, кодиращ амино киселинната последователност, която е дефинирана в SEQ ID No.74 се получава след извършване на две стъпки PCR, вмъкване в плазмид вектор и клониране в Е. coli.

а) Първа стъпка PCR

130

Фрагментът LM4-F41B-DNA, кодиращ последователността на зоната за сигнализиране на секреция с рестрикционен ензим Hind Ш на мястото на делението, добавен в 5’-край, FRL_b CDRL], FRL2 и CDRL2, FRL3, CDRL3, FRL4 и част от

постоянната зона се получават при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

олигонуклеотиден праймер MOD1F1,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R1,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F22,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R22,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F3,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R3,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F42,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R4,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F5,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R52,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F62,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R62,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F7,50 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R7,5 pmol олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol олигонуклеотиден праймер LR17,50 pmol dNTPs коктейл, 5 pl;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

131

Фрагментът LM4-F41C-DNA, кодиращ частта на постоянната зона с EcoR I ограничителен ензим на мястото на делението, добавен в 3’-край се получава при следните условия.

Шаблоните плазмиди pSRPDHH се получават според описанието на Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHH DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер MOD1F7,50 pmol олигонуклеотаден праймер 7ALCN, 50 pmol dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ;

amliTaq DNA полимераза 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените фрагменти DNA след PCR се разделят посредством електрофореза с 5% гел полиакриламид. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml етидиум бромид, за да се разпознае DNA при UV светлина. Откритите по този начин съответни DNA връзки се отстраняват чрез бръснач.

Ь) Втора PCR стъпка

LM4-DNA, при които описаните горе фрагменти LM4-F41B-DNA и LM4F41C-DNA се синтезират се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

Гел фрагмент LM4-F41B-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM4-F41 С-DNA, получен в първа стъпка PCR, олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol;

олигонуклеотаден праймер 7ALCN, 50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ;

132 amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μ! и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Полученият по този начин фрагмент LM4-DNA се вмъква в плазмида pCR3.1DNA чрез Eukaryotic ТА cloning Kit (InVitrogen) според инструкциите на производителя и се въвежда в установена среда Е. coli TOPI OF’, която се доставя с комплекта. Нуклеотидните последователности на тези DNAs, кодиращи леката верига на хуманизиран LM4 TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F. S. et al., (1977), Proc. Natl. Acad, Sci. USA, 74:5463-5467) чрез 3700 DNA анализатор (ABI PRISM; Perkin Elmer Applied Biosystems, Япония).

Получените плазмиди са означени pCR3.1/LM4-5-3 (плазмида, носител на cDNA, кодираща променливата зона на леката верига на хуманизиран LM4 TRA-8 и постоянна зона на леката верига на човешки Ig).

Полученият плазмид pCR3.1/LM4-5-3, съдържащ фрагмента LM4-DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pHSG399 DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани фрагменти pHSG399 DNA и LM4-DNA, които са разтворени с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I се легират посредством DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар среда, съдържаща 0.1 тМ IPTG, 0.1% X-Gal и 50 pg/ml хлорамфеницол (крайни концентрации). Получените бели трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 50 μ g/ml хлорамфеникол и от получената култура чрез алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Извлеченият плазмид DNA се разтваря с Hind Ш и EcoR I и след това клонът, носител на фрагмента LM4-DNA се селектира чрез електрофореза посредством 1% агарозен гел.

133

В резултат на горната процедура се получава плазмид pHSG/M4-5-3-l, носител на синтезиран фрагмент от променливата зона на леката верига на хуманизиран LM4 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK. Трансформантният вид Е. coli, приютяващ тези плазмиди, означен като Е. coli DH5a/pHSG/M4-5-3-l е депозиран в International Patent Ogranism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и има депозитен номер FERM ВР-7565.

3) Изграждане на плазмид pSR/LM4-5-3-3 (плазмид експресия за хуманизирана лека верига LM4 TRA-8).

Полученият плазмид pHSG/M4-5-3-l, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизирания LM4 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pSRPDHH DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1) се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и се дефосфорилизира с CIP. Резултатните дефосфорилизирани фрагменти pSRPDHH DNA и Hind Ш-EcoRI, получени от pHSG/M4-5-3-l се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар. Получените трансформанги се култивират в течна LB среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин и от получената култура посредством алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектор pSRPDHH се потвърждава чрез последователностите на DNA чрез генен анализатор на последователности (ABI Prism 3700 DNA Analyzer; Applied Biosystems).

Полученият плазмид експресия, носител на cDNA, кодираща леката верига на хуманизиран LM4 TRA-8 е означен pSR/LM4-5-3-3.

(4.4) Изграждане на вектор експресия за леката верига на хуманизираното антитяло (тип LM5)

Както е показано в SEQ ID No.75 от листинга с последователностите друг вид хуманизиране (тип LM5) на амино киселинните последователности на леката верига на мишето анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 води до заменяне на 8-ма

134

амино киселина (хистидин), 9-та амино киселина (лизин), 10-та амино киселина (фениламин), 11-та амино киселина (метионин), 13-та амино киселина (треонин), 20-та амино киселина (серин), 42-ра амино киселина (глугамин), 43-та амино киселина (серин), 77-ма амино киселина (аспаргинова киселина), 78-ма амино киселина (валин), 80-та амино киселина (серин), 83-та амино киселина (леуцин), 103-та амино киселина (леуцин) и 108—ма амино киселина (аланин) от N-край на амино киселинната последователност на леката верига на TRA-8 съответно с: пролин, серин, серин, леуцин, аланин, треонин, лизин, аланин, серин, леуцин, пролин, фениламин, валин и треонин, Получената последователност е означена с LM5.

Плазмидите експресия, носители на този тип хуманизирана лека верига на амино киселинните последователности на анти-човешкото DR5 антитяло TRA-8 (тип LM5) (SEQ ID No.75 от листинга с последователностите) се изграждат по следния начин:

1) Синтез на праймери за получаване на променливите и постоянните зони на леката верига на хуманизиран LM5 TRA-8

DNA кодирането за LM5 полипептидна верига (SEQ ID No.75 от листинга с последователностите), всяко от които е синтез от променливата зона на леката верига на хуманизирано aHra-DR5 антитяло TRA-8 и постоянната зона на леката верига на човешки lg (к верига) се синтезират съответно чрез комбинации PCR

Следват 7AL1P (SEQ ID No. 47), 7ALCN (SEQ ID No. 48), MOD1F1 (SEQ ID No. 78), MOD1R1 (SEQ ID No. 79), MOD1F22 (SEQ IDO No. 80), MOD1R22 (SEQ ID No. 81), MOD1F3 (SEQ ID No. 82), MOD1R3 (SEQ ID No. 83), MOD1F42 (SEQ ID No. 84), MOD1R4 (SEQ ID No. 85), MOD1R52 (SEQ ID No. 87), MOD1F7 (SEQ ID No. 90),hLR17 (SEQ ID No. 101), като за PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери:

5’ - gggtctggga cagacttcac cctcaccatc tctagtctgc agccggagga ttttgcagat tat -3’ (MOD1F52; SEQ ID No. 94)

5'- ttctgtcagc aatatagcag ctatcggacg ttcggtggag gcaccaaggt ggaaatc -3' (MODlF63;SEQIDNo.95)

5'- cgtccgatag ctgctatatt gctgacagaa ataatctgca aaatcctccg gctgcag -3'

135

(MOD1R63; SEQ ID No. 96)

5'- gaagatgaag acagatggtg cagccacagt ccgtttgatt tccaccttgg tgcctccacc gaa-3' (MOD1R72; SEQ ID No. 102)

2) Изграждане на плазмид pCR3.1/LM5-3-42 (клонинг на лека верига на хуманизиран TRA-8 тип LM5)

Фрагментът LM5-DNA, кодиращ амино киселинната последователност, която е дефинирана в SEQ ID No.75 се получава след извършване на две стъпки PCR, вмъкване във вектор плазмид и клониране в Е. coli.

а) Първа стъпка PCR

Фрагментът LM5-F51B-DNA, кодиращ последователността на зоната за сигнализиране за секреция с Hind Ш ресгрикционен ензим на мястото на делението, добавен в 5’-край, FRL_b CDRL_b FRL₂ и CDRL2, FRL3, CDRL3, FRL4 и част от

постоянната зона се получават при следните условия. Състав на реакционния разтвор:

олигонуклеотиден праймер MOD1F1,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R1,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F22,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R22,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F3,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R3,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F42,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R4,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F52,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R52,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F63,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R63,5 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1F7,50 pmol олигонуклеотиден праймер MOD1R72,5 pmol олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol олигонуклеотиден праймер LR17,50 pmol dNTPs коктейл, 5 μΐ;

136

x PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM5-F51C-DNA, кодиращ частта на постоянната зона с EcoR I ресгрикционен ензим на мястото на делението, добавен в 3’-край се получава при следните условия. Шаблоните плазмиди pSRPDHH се получават според описанието на Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHH DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер MOD1F7,50 pmol олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ;

amliTaq DNA полимераза 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените фрагменти DNA след PCR се разделят посредством електрофореза с 5% гел полиакриламид. След електрофорезата телът се оцветява с 1 pg/ml етидиум бромид, за да се разпознае DNA при UV светлина. Откритите по този начин съответни DNA връзки се отстраняват чрез бръснач.

Ь) Втора PCR стъпка

LM5-DNA, при които описаните горе фрагменти LM5-F51B-DNA и LM5F51C-DNA се синтезират се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

Ϊ?>Ί

Гел фрагмент LM5-F51B-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM5-F51C-DNA, получен в първа стъпка PCR, олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol;

олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ;

amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55 °C за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Полученият по този начин фрагмент LM5-DNA се вмъква в плазмида pCR3.1DNA чрез Eukaryotic ТА cloning Kit (InVitrogen) според инструкциите на производителя и се въвежда в установена среда Е. coli TOPI OF’, която се доставя с комплекта. Нуклеотидните последователности на тези DNAs, кодиращи леката верига на хуманизиран LM5 TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод (Sanger, F. S. et al., (1977), Proc. Natl. Acad, Sci. USA, 74:5463-5467) чрез 3700 DNA

анализатор.

Получените плазмиди са означени pCR3.1/LM5-3-42 (плазмидьт, носител на cDNA, кодираща променливата зона на леката верига на хуманизиран LM5 TRA-8 и постоянна зона на леката верига на човешки Ig).

Полученият плазмид pCR3.1/LM5-3-42, съдържащ фрагмента LM5-DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pHSG399 DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани фрагменти pHSG399 DNA и LM5-DNA, които са разтворени с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I се легират посредством DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар среда, съдържаща 0.1 mM IPTG, 0.1% X-Gal и 50 pg/ml хлорамфеницол (крайни концентрации). Получените

138

бели трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 50 μ g/ml хлорамфеникол и от получената култура чрез алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Извлеченият плазмид DNA се разтваря с Hind Ш и EcoR I и след това клонът, носител на фрагмента LM5-DNA се селектира чрез електрофореза посредством 1%гелагароза.

В резултат на горната процедура се получава плазмид pHSG/M5-3-27, носител на синтезиран фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизиран LM5 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK.

3) Изграждане на плазмид pSR/LM5-3-27-l (плазмид експресия за хуманизирана лека верига LM5 TRA-8).

Полученият плазмид pHSG/M5-3-27, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на леката верига на хуманизирания LM5 TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK се разтваря с рестрикционните ензими Hind III и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pSRPDHH DNA (Европейска патентна заявка ЕР 0 909 816 А1) се разтваря с рестрикционните еюими Hind Ш и EcoR I и се дефосфорилизира с CIP. Резултантните дефосфорилизирани фрагменти pSRPDHH DNA и Hind Ш-EcoRI, получени от pHSG/M5-3-27 се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар. Получените трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин и от получената култура посредством алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектор pSRPDHH се потвърждава чрез последователностите на DNA чрез генен анализатор (ABI Prism 3700 DNA Analyzer; Applied Biosystems).

Полученият плазмид експресия, носител на cDNA, кодираща леката верига на хуманизиран LM5 TRA-8 е означен pSR/LM5-3-27-l (4.5) Изграждане на вектор експресия за леката верига на хуманизираното антитяло (теоретичен тип).

Амино киселинната последователности на леката верига на теоретичен тип TRA-8, показана в SEQ ID No.76 от листинга с последователностите е означена LM6.

139

Плазмидите експресия, носители на този тип амино киселинни последователности на леката верига на хуманизираното анти-човешко DR5 антитяло TRA-8 (тип LM6) (SEQ ID No.75 от листинга с последователностите) се

изграждат по следния начин.

1) Синтез на праймери за получаване на променливите и постоянните зони на леката верига на хуманизиран LM6 TRA-8

DNA кодирането за LM6 полипептидна верига (SEQ ID No.75 от листинга с последователностите), всяка от които е синтез от променливата зона на леката верига на мише анги4Ж5 антитяло TRA-8 (LM6 тип) и постоянната зона на леката верига на човешки Ig (к верига) се синтезират съответно чрез комбинации PCR.

Следват 7AL1P (SEQ ID No. 47) и 7ALCN (SEQ ID No. 48), като за PCR са синтезирани следните олигонуклеотидни праймери:

5'- tgatgtggac atgaatttgt gagactgggt catcacaatg tcaccagtgg a -3' (HKSPR13;

SEQ ID No. 97);

5'- tgggttccag gctccactgg tgacattgtg atgacccagt ctcacaaatt c -3' (MVF11;

SEQ ID No. 98);

5'- aagacagatg gtgcagccac agcccgtttg atttccagct tggtgcctc -3' (MVR11; SEQ

ID No. 99); и

5'- aagctggaaa tcaaacgggc tgtggctgca ccatctgtct tcatc -3'(MCF11; SEQ ID

No. 100).

2) Изграждане на плазмид pCR3.1/LM6-l-16 (клониш на лека верига на хуманизиран TRA-8 тип LM6)

Фрагментът LM6-DNA, кодиращ амино киселинната последователност, която е дефинирана в SEQ ID No.75 се получава след извършване на две стъпки PCR, вмъкване във вектор плазмид и клониране в Е. coli.

а) Първа стъпка PCR

Фрагментът LM6-F1-DNA, кодиращ последователността за сигнализиране на секреция и част от зоната FRLi с рестрикционен ензим Hind Ш на мястото на делението, добавен в 5’-край се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pHSGHM17 DNA, 25 ng

140

олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol олигонуклеотиден праймер HKSPR13,50 pmol dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ; и amliTaq DNA полимераза (PerkinElmer), 2.5 ед.

Реакционния разтвор е този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM6-F2-DNA, кодиращ частта на FRL], CDRLi, FRL₂, CDRL2, FRL3, CDRL3, FRL4 и част от постоянната зона се получава при следните условия. Състав на реакционния разтвор:

плазмид pL28 DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер MVF 11,50 pmol олигонуклеотиден праймер MVR12,50 pmol dNTP коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ;

amliTaq DNA полимераза 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Фрагментът LM6-F3-DNA, кодиращ частта на FRL₄ и постоянната зона с рестрикционен ензим EcoR I на мястото на деленето, добавен в 3’-край се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

плазмид pSRPDHH DNA, 25 ng олигонуклеотиден праймер MCF11,50 pmol олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol

141

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

χ PCR буфер5 μΐ;

amliTaq DNA полимераза 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55 °C за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Увеличените фрагменти DNA след PCR се разделят посредством електрофореза с 5% гел полиакриламид. След електрофорезата гелът се оцветява с 1 pg/ml етидиум бромид, за да се разпознае DNA при UV светлина. Откритите по този начин съответни DNA връзки се отстраняват чрез бръснач.

Ь) Втора PCR стъпка

LM6-DNA, при които описаните горе фрагменти LM6-F1-DNA, LM6-F2DNA и LM6-F3-DNA се синтезират се получава при следните условия.

Състав на реакционния разтвор:

Гел фрагмент LM6-F1-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM6-F2-DNA, получен в първа стъпка PCR,

Гел фрагмент LM6-F3-DNA, получен в първа стъпка PCR, олигонуклеотиден праймер 7AL1P, 50 pmol;

олигонуклеотиден праймер 7ALCN, 50 pmol;

dNTPs коктейл, 5 μΐ;

х PCR буфер5 μΐ;

amliTaq DNA полимераза, 2.5 единици

Реакционния разтвор с този състав се допълва с редестилирана вода до обем от 50 μΐ и се използва за PCR.

PCR термични условия: нагряване при 94°С за 2 минути, след което 30 пъти се повтаря следния цикъл: нагряване при 94°С за 1 минута, 55°С за 1 минута и 72°С за 2 минути, след което разтворът се нагрява при 72°С за 10 минути.

Полученият по този начин фрагмент LM6-DNA се вмъква в плазмида pCR3.1DNA чрез Eukaryotic ТА cloning Kit (InVitrogen) според инструкциите на

142 производителя и се въвежда в установена среда Е. coli ТОР 1 OF’, която се доставя с комплекта. Нуклеотидните последователности на тези DNAs, кодиращи леката верига на хуманизиран TRA-8 се потвърждават чрез дидеокси метод чрез DNA

анализатор.

Получените плазмиди са означени pCR3.1/LM6-l-16 (плазмидьт, носител на cDNA, кодираща променливата зона на леката верига на миши TRA-8 и постоянна зона на леката верига на човешки Ig).

Полученият плазмид pCR3.1/LM6-l-16, съдържащ фрагмента LM6-DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pHSG399 DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и след това се дефосфорилизира с CIP. Получените дефосфорилизирани фрагменти pHSG399 DNA и LM6-DNA, които са разтворени с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I се легират посредством DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар среда, съдържаща 0.1 тМ IPTG, 0.1% X-Gal и 50 pg/ml хлорамфеникол (крайни концентрации). Получените бели трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 50 μ g/ml хлорамфеникол и от получената култура чрез алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Извлеченият плазмид DNA се разтваря с Hind III и EcoR I и след това клонът, носител на фрагмента LM6-DNA се селектира чрез електрофореза посредством 1% агарозен гел.

В резултат на горната процедура се получава плазмид pHSG/M6-M-l, носител на синтезиран фрагмент на променливата зона на леката верига на миши TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK. Трансформантният вид Е. coli, приютяващ тези плазмиди, означен като Е. coli DH5a/pHSG/M6-1-4-1 е депозиран в International Patent Ogranism Depositary, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 1-1, Higashi 1 chome Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305-5466, Япония на 20 април 2001 г. според Договора от Будапеща за депозит на микроорганизми и има депозитен номер FERM ВР-7566.

3) Изграждане на плазмид pSR/LM6-l-4-6 (плазмид експресия за лека верига на теоретичен тип LM6 TRA-8).

143

Полученият плазмид pHSG/LM6-1-4-1, носител на синтезирания фрагмент на променливата зона на леката верига на миши TRA-8 и постоянната зона на човешка верига IgK се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I.

Един μ g от клонирания плазмид pSRPDHH DNA се разтваря с рестрикционните ензими Hind Ш и EcoR I и се дефосфорилизира с CIP. Резултатните дефосфорилизирани фрагменти pSRPDHH DNA и Hind Ш-EcoRI, получени от pHSG/LM6-1-4-1 се легират чрез DNA Ligation Kit Version 2.0 (Takara Syuzo, Co. Ltd.). След това E. coli DH5a се трансформира c легираната DNA и се разстила в LB агар. Получените трансформанти се култивират в течна LB среда, съдържаща 100 pg/ml ампицилин и от получената култура посредством алкален SDS метод се извлича плазмид DNA. Вмъкването и ориентацията на желания DNA фрагмент във вектор pSRPDHH се потвърждава чрез последователностите на DNA чрез генен анализатор на последователностите.

Полученият плазмид експресия, носител на cDNA, кодираща леката верига на TRA-8 (теоретичен тип) е означен pSR/LM6-1-4-6.

(5) Получаване на няколко вида антитяло TRA-8 - хуманизиран или

теоретичен.

Преобразуването на клетки COS-7 се извършва чрез реагент методи FUGENE6 (Boehringer Mannheim Biochemica) според инструкциите за използване.

Клетките COS-7 (American Type Culture Collection No. CRL-1651) нарастват до полу-сливане (3 x 10⁶ клетки / съд) в съд за култивиране (площ за култивиране 57 cm , Sumitomo Bakelite), съдържащ среда Dulbecco’s Modified Eagle (означена “D-MEM”, Gibco BRL), допълнена c 10% ембрионален серум от крава (“FCS”; Moregate).

Междувременно посредством центрофугиране в плътностен градиент на цезиев хлорид се смесват 10 μ g/съд (общо 5 съда) DNA плазмид експресия на тежката верига на хуманизиран DR5 иЮ pg/съд DNA плазмид експресия на леката верига на хуманизиран DR5, получени чрез алкален SDS метод и след това са утаени чрез етанол и се отлагат в 5 μΙ/съд бНгО.

След като 15 μΙ/съд от FUGENE6 реагент за преобразуване се смесват с 180 μΙ/съд D-MEM без FCS този FUGENE разтвор (185 μΙ/съд) се смесва с 5 μΙ/съд DNA

144 разтвор, съдържащ 10 pg/съд от DNA плазмид експресия на тежката верига на хуманизиран DR5 и 10 pg/съд от DNA плазмид експресия на леката верига на хуманизиран DR5. След инкубиране за 15 минути при стайна температура получената суспензия плазмид (200 pl) се добавя към предварително приготвени съдове COS-7. След инкубиране при 5% СО₂ при 37°С за 24 часа средата за култивиране се сменя с D-MEM без FCS. След инкубиране при 5% СО₂ при 37°С за 72 часа супернатанта от културата се възстановява, за да се пречистят продуктите на експресията в течния супернатант. По описания по-горе метод клетките COS-7 се преобразуват чрез всяка от следните комбинации от плазмиди:

(A) : копреобразуване чрез рНА15-1 и pSR/LMl-2 (H1L1) (B) : копреобразуване чрез рНВ 14-1 npSR/M2-l (H2L2) (C) : копреобразуване чрез рНВ 14-1 HpSR/LM3-3-44-10(H2L3) (D) : копреобразуване чрез рНВ14-1 и pSR/LM4-5-3-3 (H2L4) (E) : копреобразуване чрез рНСЮ-З и pSR/M2-l (H3L2) (F) : копреобразуване чрез рНСЮ-З и pSR/LM3-3-44-10 (H3L3) (G) : копреобразуване чрез рНСЮ-З и pSR/LM4-5-3-3 (H3L4) (H) : копреобразуване чрез pHD21-1 и pSR/LM5-3-27-l (H4L5) (Ί): копреобразуване чрез рМ11-1 и pSR/LM6-l-4-6 (теоретичен)

След това културата се центрофугира (3,500 г.р.т., 15 минути) и супернатанта се събира. Супернатангьт се филтрира с 0.45 μ m филтър (ADVANTEC TOYO DISMIC-25 cs, Cat # 25 CS045 AS). Пречистването на IgG от филтратите се получава чрез Protein G-POROS афинитетна хроматография (Applied Biosystems) при следните условия:

HPLC система: BioCAD 700Е (Applied Biosystems) стълб: ProteinG-ID sensor cartridge (размер на стълба: 2.1 mmID х 30 mm LD, обем на дъното 0.1 ml; Applied Biosystems) утаяващ буфер: 0.1 М Glycin-HCl (pH 2.5) неутрализиращ буфер: 1M Tris-HCl (pH 8.5) отчитане: 280 nm скорост на изтичане: 1 ml/min

145

размер на фракцията: 0.5 ml/0.5 min фракционна тръба: 1.5 ml полипропиленова микротръба температура: 4°С

След като филтратите се поставят в стълба той се измива с 50 ml PBS (Sigma, Cat # 1000-3). При поставянето на утаяващия буфер се стартира фракционен колектор. Всяка фракционна микротръба съдържа предварително 55 μΐ от 1 М NaCl, 110 μΐ неутрализиращ буфер и 74 μΐ от 2 mg/ml бувин серум албумин (Sigma, Cat # А-7030) в PBS. Фракциите οτΝο.7 и Νο.8 се събират.

Проверката на експресията на хуманизираните антитела и количествения анализ на продуктите на експресията в получените течни супернатанти от културата се осъществяват чрез ELISA с антитяло срещу анти-човешки IgG.

Към всяка колба от 96-well (MaxiSorp, Nunc) се добавят 100 μΐ от козе античовешко IgG Fc специфично поликлонално антитяло (Kappel), разтворено до концентрация 0.5 pg/ml в адсорбционен буфер (0.05 М натриев хидрогенкарбонат, 0.02% натриев азид, pH 9.6) и съда се инкубира при 37°С за 2 часа, за да се получи адсорбция на антитялото. След това съда се измива пет пъти с 350 μΐ PBS-Т. След измиването към колбите се добавя супернатанта от културата, разреден с D-MEM, съдържаща 10% FCS и се инкубира при 37°С за 2 часа. След измиване отново с PBS-Т към всяка колба се добавя 100 μ 1 от класифицирано като фосфатазно алкално козе анти-човешко IgG Fc специфично поликлонално антитяло (Jackson Immuno Research Lab.), разтворено 10,000 пъти с PBS-Т и се инкубира при 37°С за 2 часа. След измиване отново с PBS-Т се добавя субстратен разтвор на р-нитрофенил фосфат, получен от Alkalin Phosphatase Substrate kit (Bio Rad) според инструкциите за използване. След инкубиране при 37°С от 0.5 до 1 час се измерва абсорбацията при 405 nm. В настоящите опити като еталон за концентрация на хуманизираните антитела DR5, съдържащи се в течните супернатанти от културата се използва човешки плазма имуноглобулин G подклас 1 (IgGl) (Biopure AG), разреден с DМЕМ, съдържащ 10% FCS в дадени концентрации.

Като резултат експресията и пречистените продукти от супернатанта на културата се разпознават специфично от анти-човешко IgG антитяло. Крайните концентрации на човешкото IgG антитяло са съответно 44.03 pg/ml (H1L1), 39.8

146 pg/ml (H2L2), 26.7 pg/ml (H2L3), 41.0 pg/ml (H2IA), 39.3 pg/ml (H3L2), 24.7 pg/ml (H3L3), 21.5 pg/ml (H3L4), 16.7 pg/ml (H4L5) и 18.3 pg/ml (теоретичен).

(6) Активност при причиняване на апоптоза на няколко типа хуманизирано

антитяло или теоретично антитяло

За да се установи активността при причиняване на апоптоза на пречистеното хуманизирано антитяло TRA-8 се използват Jurkat клетки (АТСС No. ΊΙΒ-152).

Jurkat клетки, култивирани в среда RPMU640 с 10% FCS (Gibco BRL) при 37°C за три дни при наличието на 5% СОь се разпределят по 50 pl във всяка колба от 96-well microplate (Sumitomo Bakelite). Хуманизирания TRA-8, получен в пример 26 се привежд а до концентрация на крайния продукт от 100 ng/ml със среда RPMI164O, съдържаща 10 % FCS, като измерването на концентрациите в течностите се извършва според метода, описан в пример 26. Всеки от разтворите в така получените продукти на експресия, приведен до 100 ng/ml се използва за получаването на серия разтваряния чрез повтаряне на серийни двукратни разреждания с RPMI1640, съдържаща 10 % FCS. Всеки от разредените разтвори на хуманизиран TRA-8 (HILI, H2L2, H2L3, H2L4, H3L3, H3L4 и H4L5) се добавя към всяка колба по 50 pl. След реагиране при 37°С за 12 часа се добавя 50 pl от 25 рМ PMS, съдържащ 1 mg/ml ХТТ (крайни концентрации от 250 pg/ml за ХТТ и 5 рМ за PMS). След инкубиране за 3 часа се измерва абсорбацията при 450 nm за всяка колба, за да се изчисли клетъчната жизнеспособност чрез способността за редукция на митохондрията като еталон.

Жизнеспособността на клетките във всяка колба се изчислява по следната формула:

Жизнеспособност (%) = 100 х (а-b) / (с-Ь) където “а” е измереното в тест колба, “Ь” е измереното в колба без клетки и “с” е измереното в колба, без добавено антитяло.

Като резултат се доказва, че тестваните хуманизирани антитела причиняват апоптоза при клетки от Т лимфома клетъчна линия, проявяваща човешки DR5 антиген.

147

Активността за причиняване на апоптоза на хуманизиран TRA-8 към РС-3 се изследва чрез добавяне на таксол съгласно метода, описан в пример 25.

Клетъчна линия от рак на простата при човек РС-3 (ATCC No.CRL-1435), получена от American Tissue Culture Collection (ATCC) се поддържа в хранителна среда F-12K (21127-022, Gibco BRL), съдържаща 10% ембрионален бувин серум (FBS, Нусюпе), 1% Т-Глутамин-200-тМ (25030-149, Gibco BRL) и 0.5% разтвор пеницилин стрептомицин (P-7539, Sigma). За следващия експеримент се използва среда RPMI1640 (MED-008, IWAKI), допълнена с 10% FBS и 0.5% разтвор пеницилин стрептомицин. Експоненциално нарастващите клетки РС-3 се събират чрез трипсинизация и се измиват два пъти с прясна среда. След това клетките се преброяват, ресуспендират в прясна среда при гъстота от 5 х 10⁴ клетки/ml и се разделят на три в плоскодьнни съдове 96-well (3598, Coming-Coster) до общ обем от 100 μ Рколба един ден преди началото на опита. Към съдовете 96-well, съдържащи по 50 μΙ/колба клетки се добавя типичното анти-раково лекарство Паклитаксел (169-18611, Wako), разтворено в диметилсулфооксид (10 mg/ml) и разредено в прясна среда. Крайните концентрации на диметилсулфоксида са помалки от 0.1%. След инкубация за 24 часа при 37°С при атмосфера 5% СОг хуманизираното антитяло TRA-8 (HILI, H2L2, H2L3, H2L4, H3L2, H3L3, H3L4 и H4L5), разредено в прясна среда се добавя към колбите. След инкубация за следващи 24 часа към колбите се добавя 50 μΐ среда Minimum Essential (11095-098, Gibco BRL), съдържаща 1 mg/ml XTT и 25 тМ и съдовете се инкубират за 6 часа. След това чрез ARVO HTS 1420 Multilabel Counter (Wallac Berthold) се измерва OD450 и клетъчната жизнеспособност се изчислява по следния начин:

Клетъчна жизнеспособност (%) - (OD450 за колби, съдържащи клетки, третирани с агент/и Таксол и хуманизиран TRA-8 (агент/и)) - (OD450 за колби, не съдържащи нито клетки нито агент) х 100 / (OD450 за колби, съдържащи клетки без агент - OD450 за колби, не съдържащи нито клетки нито агент).

Като резултат се доказва, че тестваните хуманизирани антитела причиняват апоптоза при човешки клетки от рак на простата, проявяващи човешки DR5 антиген.

148

Всички споменати в описанието патенти или публикации имат отношение към нивото на техниката, към което спада изобретението. По същия начин тези патенти и публикации са включени тук само за справка, като всяка конкретна публикация е означена отделно.

Настоящото изобретение не ограничава своя обхват до споменатия депозит и разкритите примери, чиято цел е да илюстрира някои от аспектите на изобретението и всички функционално еквивалентни примери попадат в обхвата на това изобретение. В обхвата на изобретението и приложените претенции попадат също така и различни модификации на изобретението, в добавка на описаните тук, които са очевидни за специалистите в областта.

ИЗПОЛЗВАНА ЛИТЕРАТУРА

1. Wiley SR, Schooley К, Smolak PJ, Din WS, Huang CP, Nicholl JK, Sutherland GR, Smith TD, Rauch C, Smith CA, et al. Immunity 1995 Dec;3(6):673-82

2. Pan G, O'Rourke K, Chinnaiyan AM, Gentz R, Ebner R, Ni J, Dixit VM Science 1997 Apr 4;276(5309): 111-3

3. Walczak H, Degli-Esposti MA, Johnson RS, Smolak PJ, Waugh JY, Boiani N, Timour MS, Gerhart MJ, Schooley KA, Smith CA, Goodwin RG, Rauch CT. EMBO J 1997 Sep l;16(17):5386-97

4. MacFarlane M, Ahmad M, Srinivasula SM, Femandes-Alnemri T, Cohen GM, Alnemri ES. J Biol Chem 1997 Oct 10;272(41):25417-20.

5. Degli-Esposti MA, Dougall WC, Smolak PJ, Waugh JY, Smith CA, Goodwin RG. Immunity 1997 Dec;7(6):813-20

6. Chaudhary PM, Eby M, Jasmin A₅ Bookwaiter A. Murray J. Hood L. Immunity 1997 Dec;7(6):821-30

7. Schneider P, Thome M, Bums K, Bodmer JL, Hofmann K, Kataoka T, Holler N, Tschopp J. Immunity 1997 Dec;7(6):831-6

149

8. Degli-Esposti MA, Smolak PJ, Walczak H, Waugh J, Huang CP, DuBose RF, Goodwin RG, Smith CA. J Exp Med 1997 Oct 6; 186(7): 1165-70

9. Sheridan JP, Marsters SA Pitti RM, Gurney A, Skubatch M, Baldwin D, Ramakrishnan L, Gray CL, Baker K, Wood WI, Goddard AD, Godowski P, Ashkenazi A. Science 1997 Aug 8/77(5327):818-21

10. Pan G, Ni J, Wei YF, Yu G, Gentz R, Dixit VM. Science 1997 Aug 8/77(5327):815-818

11. Marsters SA, Sheridan JP, Pitti RM Huang A, Skubatch M, Baldwin D, Yuan J, Gurney A, Goddard AD, Godowski P, Ashkenazi A. Curr Biol 1997 Dec 1 ;7(12): 1003-6

12. Emery JG, McDonnell P, Burke MB, Deen KC, Lyn S, Silverman C, Dul E, Appelbaum ER, Eichman C, DiPrinzio R, Dodds RA, James IE,

Rosenberg M, Lee JC, Young PR. J Biol Chem 1998 Jun 5/3(23): 14363-7

13. Walczak H, Miller RE, Ariail K, Gliniak B, Griffith TS, Kubin M, Chin W, Jones J, Woodward A, Le T, Smith C, Smolak P, Goodwin RG, Rauch CT, Schuh JC, Lynch DH. Nat Med 1999Feb;5(2): 157-63

14. Gazitt Y. Leukemia 1999Nov; 13(11): 1817-24

15. Rieger J, Naumann U, Glaser T, Ashkenazi A, Weller M. FEES Lett 1998 May 1;427(1): 124-8

16. Jeremias I, Herr I, Boehler T, Debatin KM. Eur J Immunol 1998 Jan;28(l): 14352

17. Martinez-Lorenzo MJ, Alava MA Gamen S, Kim KJ, Chuntharapai A, Pineiro A, Naval J, Anel A. Eur J Immunol 1998 Sep;28(9):2714-25

18. Phillips TA, Ni J, Pan G, Ruben SM, Wei YF, Pace JL, Hunt JS. J Immunol 1999 May 15;162(10):6053-9

19. Kayagaki N, Yamaguchi N, Nakayama M, Takeda K, Akiba H, Tsutsui H, Okamura H, Nakanishi K, Okumura K, Yagita H. J Immunol 1999 Aug 15;163(4):1906-13

20. Johnsen AC, Haux J, Steinkjer B, Nonstad U, Egeberg K, Sundan A, Ashkenazi A, EspevikT. Cytokine 1999 Sep;ll(9):664-72

21. Zamai L, Ahmad M, Bennett IM, Azzoni L, Alnemri ES, Perussia B. J Exp Med 1998 Dec21;188(12):2375-80

150

22. Fanger NA, Maliszewski CR, Schooley K, Griffith TS. J Exp Med 1999 Oct 18; 190(8): 1155-64

23. Griffith TS, Wiley SR, Kubin MZ, Sedger LM, Maliszewski CR, Fanger NA. J Exp Med 1999 Apr 19; 189(8): 1343-54

24. Griffith TS, Rauch CT, Smolak PJ, Waugh JY, Boiani N, Lynch DH, Smith CA, Goodwin RG, Kubin MZ. J. Immunology 1999 162: 2597-2605

25. Albani S and Carson DA, 1997 Arthritis and allied conditions, a textbook of rheumatology, 13^th edition, volume 2,979-992.

26. Fujisawa K, Asahara H, Okamoto K, Aono H, Hasunuma T, Kobata T, Iwakura Y, Yonehara S, Sumida T, and Nishioka K. J. Clin. Invest. 1996 98(2): 271-278

27. Zhang H, Yang Y, Horton JL, Samoilova EB, Judge TA, Turka LA, Wilson JM, and ChenY. 1997 J. Clin. Invest. 100(8), 1951-1957.

28. Roth W, Isenmann S, Naumann U, Kugler S, Bahr M, Dichgans J, Ashkenazi A, Weller M. Locoregional. Biochem Biophys Res Commun 1999Novl9;265(2):479-83

29. Chinnaiyan AM, Prasad U, Shankar S, Hamstra DA, Shanaiah M, Chenevert TL, Ross BD, Rehemtulla A. Proc. Natl. Acad. Sci. 2000 Feb 15; 97(4): 1754-1759

30. Arai T, Akiyama Y, Okabe S, Saito K, Iwai T, Yuasa Y. Cancer Lett 1998 Nov 27;133(2):197-204

31. Lee SH, Shin MS, Kim HS, Lee HK Park WS_; Kim SY, Lee JH. Han SY, Park JY, Oh RR, JangJJ, Han JY,LeeJY, Yoo NJ. Cancer Res 1999Nov 15;59(22):5683-5686

32. Pai SI, Wu GS, Ozoren N, Wu L, Jen J, Sidransky D, El-Deiry WS. 1998 Cancer Res Aug 15;58(16):3513-3518

33. Maniatis et al, 1982, Molecular Cloning, a Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harber, NY

34. Schroff et al, 1985 Cancer Res, 45,879-885.

35. Yelton, D. E, et al, 1978 Current Topics in Microbiology and Immunology,

81,1-7

36. Kohler, G, et al, 1976 European J. Immunology, 6,511-519

37. Shulman, M, et al, 1978 Nature, 276.269-270

38. Kearney, J. F, et al, 1979 J. Immunology, 123,1548-1550

39. Horibata, K. and Harris, A. W, 1975 Nature, 256,495-497

151

40. Sheridan JP, Marsters S A, Pitti RM, Gurney A, Skubatch Μ, B aidwin D, Ramakrishinan, Gray CL, Baker K, Wood WI, Goddaid AD, Godowski P, and Ashkenazi A, 1997 Science, 277,818-821.

41. Cheng J et al., 1994 Science, 263,1759-1762

42. Bendele AM et al., 1999 Clin Exp Rheumatol, 17(5), 553-560

43. Sheridan JP, Marsters AS, Pitti RM, Gumey A, Skubatch M, Baldwin D, Ramakrishnan L, Gray CJ, Baker K, Wood WI, Goddard AD, Godowski P, and Ashkenazi A. 1997 Science, 277,818-821.

44. Schneider P, Thome M, Bums K, Bodmer JL, Hofmann K, Kataoka T, Holler N,TschoppJ., 1997 Immunity Dec;7(6): 831-836.

45. Kennedy NJ, Kataoka T, Tschopp J, and Budd RC. 1999 J. Exp. Med. 1891-1896.

46. Miiler-Ladner U, Gay RE, and Gay S, 1997 Arthritis and allied conditions, a textbook of rheumatology, 13^th edition, Volume 1,243-254.

СЕЛЕКТИВНО АНТИТЯЛО ЗА СВЪРЗАН С ТУМОР- НЕКРОЗИС ФАКТОРА ЛИГАНД РЕЦЕПТОР, ПРИЧИНЯВАЩО АПОПТОЗА И ИЗПОЛЗВАНЕТО МУ

Claims (122)

1. ПАТЕНТНИ ПРЕТЕНЦИИ

   1. Пречистено антитяло, което се свързва с TRAIL рецептора DR5, характеризиращо се с това, че антитялото в разтворимата си форма при ниски концентрации има in vivo и in vitro активност за причиняване на клетъчна смърт в целеви клетки, проявяващи DR5.
2. 2. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че предизвиква клетъчна смърт in vitro при отсъствието на вторичен крослинкинг на антитялото.
3. 3. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че не причинява значителна клетъчна смърт на не-трансформирани фибробласт клетки.
4. 4. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че активността за причиняване на клетъчна смърт се характеризира с по-малка от 40% жизнеспособност на целевите клетки при концентрации от антитялото по-малки от 5 pg/ml.
5. 5. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че се свързва специфично с TRAIL рецептора DR5 и не се свързва с TRAIL рецепторите DR4, DcRl или DcR2, установено чрез анализа Western blot.
6. 6. Пречистено антитяло, съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че антитялото е моноклонално антитяло.
7. 7. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че DR5 е човешки DR5.
8. 8. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това че целевите клетки са възпалителни синовиални клетки.
9. 9. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че целевите клетки са ракови клетки.
10. 10. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че целевата клетка е активирана имунна клетка.
11. 11. Пречистено антитяло съгласно претенция 10, характеризиращо се с това, че имунната клетка е активиран лимфоцит.
12. 12. Пречистено антитяло съгласно претенция 10, характеризиращо се това, че имунната клетка с активирана NK клетка.
13. 13. Пречистено антитяло съгласно претенция 10, характеризиращо се с това, че имунната клетка е активирана дендритна клетка.
14. 14. Моноклонално антитяло имащо същата специфичност на епитопа като хибридомата мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
15. 15. Моноклонално антитяло получено чрез хибридомата мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
16. 16. Пречистено антитяло съгласно претенция 1, характеризиращо се с това, че антитялото е хуманизирано.
17. 17. Метод за селективно причиняване на клетъчна смърт на целеви клетки, проявяващи DR5, включващ контактуване на целевите клетки с терапевтично количество от антитялото от претенция 1.
18. 18. Метод съгласно претенция 17, характеризиращ се с това, че контактуването е in vivo.
19. 19. Метод съгласно претенция 17, характеризиращ се с това, че контактуването е in vitro.
20. 20. Метод съгласно претенция 17, характеризиращ се с това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са ракови клетки.
21. 21. Метод съгласно претенция 17, характеризиращ се с това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са възпалителни синовиални клетки.
22. 22. Метод съгласно претенция 17, характеризиращ се с това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са активирани имунни клетки.
23. 23. Метод съгласно претенция 22, характеризиращ се с това, че имунните клетки са активирани лимфоцити.
24. 24. Метод съгласно претенция 22, характеризиращ се с това, че имунните клетки са активирани NK клетки.
25. 25. Метод съгласно претенция 22, характеризиращ се това, че имунните клетки са активирани дендритни клетки.
26. 26. Метод за селективно причиняване на клетъчна смърт на целеви клетки, проявяващи DR5 включващ контактуване на целевите клетки с терапевтично количество от антитялото от претенция 16.
27. 27. Процес на инхибиране на пролиферацията на целевите клетки, проявяващи

    DR5, включващ контактуване на клетките с терапевтично количество от антитялото от претенция 1. 28. Процес съгласно претенция контактуването е in vivo. 27, характеризиращ се с това, че 29. Процес съгласно претенция 27, характеризиращ се с това, че

    контактуването е in vitro.
28. 30. Процес съгласно претенция 27, характеризиращ се това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са ракови клетки.
29. 31. Процес съгласно претенция 27, характеризиращ се това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са възпалителни синовиални клетки.
30. 32. Процес съгласно претенция 27, характеризиращ се това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са активирани имунни клетки.
31. 33. Процес съгласно претенция 32, характеризиращ се с това, че активираните имунни клетки са активирани лимфоцити.
32. 34. Процес съгласно претенция 21, характеризиращ се с това, че активираните имунни клетки са активирани NK клетки.
33. 35. Процес съгласно претенция 21, характеризиращ се с това, че активираните имунни клетки са активирани дендритни клетки.
34. 36. Процес съгласно претенция 21, характеризиращ се с това, че включва и контактуване на целевите клетки с терапевтичен агент.
35. 37. Метод съгласно претенция 36, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е химиотерапевтичен агент.
36. 38. Метод съгласно претенция 37, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е избран от групата, състояща се от блеомицин, карбоплатин, хлорамбуцил, цисплатин, колхицин, циклофосфамид, даунорубицин, актиномицин, диетилстилбестрол доксорубицин, етопозид, 5флуороурацил, флуоксидин, мелфалан, метотрексат, митомицин, 6 меркаптопурин, пакслитаксел, тенипозид, 6-тиогуанин, винкристин и винбластин.
37. 39. Метод съгласно претенция 37, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е доксорубицин.
38. 40. Метод съгласно претенция 37, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е метотрексат.
39. 41. Метод съгласно претенция 37, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е паклитаксел.
40. 42. Процес на инхибиране на пролиферацията на целеви клетки, проявяващи

    DR5, включващ контактуване на клетките с терапевтично количество от антитялото от претенция 16. 43. Процес съгласно претенция контактуването е in vivo. 42, характеризиращ се с това, че 44. Процес съгласно претенция 42, характеризиращ се с това, че

    контактуването е in vitro.
41. 45. Процес съгласно претенция 42, характеризиращ се с това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са ракови клетки.
42. 46. Процес съгласно претенция 42, характеризиращ се с това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са възпалителни синовиални клетки.
43. 47. Процес съгласно претенция 42, характеризиращ се с това, че целевите клетки, проявяващи DR5 са активирани имунни клетки.
44. 48.
45. 49.

    Процес съгласно претенция 47, характеризиращ се с това, че имунните клетки са активирани лимфоцити.

    Процес съгласно претенция 47, характеризиращ се с това, че имунните клетки са активирани NK клетки.
46. 50. Процес съгласно претенция 47, характеризиращ се това, че имунните клетки са активирани дендритни клетки.
47. 51. Процес съгласно претенция 42, който включва и контактуване на целевите клетки с терапевтичен агент.
48. 52. Метод съгласно претенция 51, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е химиотерапевтичен агент.
49. 53. Метод съгласно претенция 52, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е избран от групата, състояща се от блеомицин, карбоплатин, хлорамбуцил, цисплатин, колхицин, циклофосфамид, даунорубицин, актиномицин, диетилстилбестрол доксорубицин, етопозид, 5флуороурацил, флуоксидин, мелфалан, метотрексат, митомицин, 6меркаптопурин, пакслитаксел, тенипозид, 6-тиогуанин, винкристин и винбластин.
50. 54. Метод съгласно претенция 52, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е доксорубицин.
51. 55. Метод съгласно претенция 52, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е метотрексат.
52. 56. Метод съгласно претенция 52, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е паклитаксел.
53. 57. Състав, включващ фармацевтично ефективно количество от антитялото от претенция 1 и фармацевтично приемлив носител.
54. 58. Приложение на антитялото от претенция 1 за изготвяне на терапия за селективна клетъчна смърт на целеви или дисрегулирани клетки.
55. 59. Процес на лечение на пациент със заболяване, свързано с апоптоза включващ контактуване на целевата тъкан на пациента, проявяващ заболяване свързано с апоптоза с терапевтично количество от първото антитяло, съгласно претенция 1.
56. 60. Процес на лечение на пациент със заболяване, свързано с апоптоза включващ контактуване на целевата тъкан на пациента, проявяващ заболяване свързано с апоптоза с терапевтично количество от първото антитяло, съгласно претенция 16.
57. 61. Метод за лечение на пациент с рак, включващ приложение върху пациента на фармацевтично ефективно количество от антитялото от претенция 1, характеризиращ се с това, че фармацевтично ефективното количество от антитялото селективно причинява клетъчна смърт на ракови клетки.
58. 62. Метод съгласно претенция 61, включващ и приложението върху пациента на второ антитяло, което увеличава клетъчната смърт на ракови клетки.
59. 63. Метод съгласно претенция 61, включващ и приложението върху пациент на терапевтичен агент.
60. 64. Метод съгласно претенция 63, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е химиотерапевтичен агент.
61. 65. Метод съгласно претенция 64, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е избран от групата, състояща се от блеомицин, карбоплатин, хлорамбуцил, цисплатин, колхицин, циклофосфамид, даунорубицин, актиномицин, диетилстилбестрол доксорубицин, етопозид, 5флуороурацил, флуоксидин, мелфалан, метотрексат, митомицин, 6меркаптопурин, пакслитаксел, тенипозид, 6-тиогуанин, винкристин и винбластин.
62. 66. Метод съгласно претенция 64, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е доксирубицин.
63. 67. Метод съгласно претенция 64, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е метотрексат.
64. 68. Метод съгласно претенция 64, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е паклитаксел.
65. 69.
66. 70.
67. 71.
68. 72.
69. 73.
70. 74.
71. 75.

    Метод съгласно претенция 64, характеризиращ се с това, че включва и приложение върху пациента на радиационна терапия.

    Метод съгласно претенция 64, включващ и приложение върху пациента на терапевтичен агент и радиационна терапия.

    Метод за лечение на пациент с рак, включващ приложение върху пациента на фармацевтично ефективно количество от антитялото от претенция 16, характеризиращ се с това, че фармацевтично ефективното количество от антитялото селективно причинява клетъчна смърт на ракови клетки.

    Метод за лечение на пациент с възпалително заболяване или автоимунно заболяване, включващ приложение върху пациента на фармацевтично ефективно количество от антитялото от претенция 1, характеризиращ се с това, че фармацевтично ефективното количество антитялото селективно причинява клетъчна смърт на целеви клетки, имащи DR5 рецептори.

    Метод съгласно претенция 72, характеризиращ се с това, че целевите клетки са активирани имунни клетки.

    Метод съгласно претенция 73, характеризиращ имунни клетки са активирани лимфоцити.

    се това, че активираните

    Метод съгласно претенция 73, характеризиращ имунни клетки са активирани NK клетки.

    се това, че активираните
72. 76. Метод съгласно претенция 73, характеризиращ се с това, че активираните имунни клетки са активирани дендритни клетки.
73. 77. Метод съгласно претенция 72, характеризиращ се с това, че целевите клетки са възпалителни синовиални клетки.
74. 78. Метод съгласно претенция 72, включващ и приложение върху пациента на фармацевтично ефективно количество от второ антитяло, което увеличава клетъчната смърт на целевите клетки.
75. 79. Метод съгласно претенция 72, включващ и приложение върху пациента на фармацевтично ефективно количество терапевтичен агент.
76. 80. Метод съгласно претенция 79, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е бизиндолилмалеимид.
77. 81. Метод, съгласно претенция 79, характеризиращ се с това, че терапевтичния агент е метотрексат.
78. 82. Метод за лечение на пациент с възпалително заболяване или автоимунно заболяване, включващ приложение върху пациента на фармацевтично ефективно количество от антитялото от претенция 16, характеризиращ се с това, че фармацевтично ефективното количество от антитялото селективно причинява клетъчна смърт на целеви клетки.
79. 83. Метод за селективно причиняване на клетъчна смърт на целеви клетки, включващ следните стъпки:

    (a) преобразуване на целевите клетки с вектор, включващ нуклеотидно киселинната последователност на изразимия TRAIL рецептор;

    (b) експресия на тези клетки на TRAIL рецептор, кодиран чрез нуклеотидно киселинната последователност на същия TRAIL рецептор и (c) контактуване на същите клетки с антитяло, причиняващо клетъчна смърт, селективно за свързване със споменатия TRAIL рецептор.

    ¢-
80. 84. Метод съгласно претенция 83, характеризиращ се с това, че TRAIL рецептора е DR5 рецептор.
81. 85. Метод съгласно претенция 83, характеризиращ се с това, че антитялото е моноклонално антитяло със същата специфичност на епитопа, като хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
82. 86. Изолирана нуклеинова киселина, включваща нуклеотидна последователност, която кодира тежка верига имуноглобулин на антитяло, годно да се свърже с TRAIL рецептор DR5 и годно да причини клетъчна смърт на клетка с DR5 рецептори.
83. 87. Изолирана нуклеинова киселина, съгласно претенция 86, характеризираща се с това, че нуклеотидната последователност кодира тежка верига имуноглобулин, изразена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
84. 88. Изолирана нуклеинова киселина, съгласно претенция 86, характеризираща се с това, че нуклеотидната последователност кодира тежка верига имуноглобулин, изразена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече консервативни аминокиселинни замествания.
85. 89. Изолирана нуклеинова киселина, съгласно претенция 86, характеризираща се с това, че нуклеотидната последователност кодира тежка верига имуноглобулин, изразена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече амино-киселинни заличавания.
86. 90. Изолирана нуклеинова киселина, съгласно претенция 86, включваща нуклеотиди 1 - 1398 от SEQ ID NO: 21.
87. 91. Изолирана нуклеинова киселина, съгласно претенция 86, характеризираща се с това, че кодираната тежка верига имуноглобулин е хуманизирана.
88. 92. Изолирана нуклеинова киселина, съгласно претенция 91, характеризираща се с това, че кодираната хуманизирана тежка верига имуноглобулин включва амино-киселинни остатъци 1 - 119 от SEQ ID NO: 31.
89. 93. Вектор включващ нуклеиновата киселина от претенция 86 и регулаторен елемент оперативно свързан с нуклеиновата киселина.
90. 94. Култивирана клетка, включваща вектора от претенция 93.
91. 95. Пречистен полипептид включващ амино-киселинната последователност на тежка верига имуноглобулин на антитяло, годно да за свърже с TRAIL рецептора DR5 и годно да причини клетъчна смърт на клетка с DR5 рецептори.
92. 96. Пречистен полипептид съгласно претенция 95, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност е амино-киселинна последователност на тежката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
93. 97. Пречистен полипептид съгласно претенция 95, характеризиращ се това, че амино-киселинната последователност е амино-киселинна последователност на тежката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече консервативни амино-киселинни замествания.
94. 98. Пречистен полипептид съгласно претенция 95, характеризиращ се това, че амино-киселинната последователност е амино киселина на тежката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече амино-киселинни заличавания.
95. 99. Пречистен полипептид съгласно претенция 95, характеризиращ се това, че амино-киселинната последователност включва амино-киселинни остатъци 1-464 от SEQ ID N0:23.
96. 100. Пречистен пептид съгласно претенция 95, характеризиращ се с това, че тежката верига имуноглобулин е хуманизирана.
97. 101. Пречистен пептид съгласно претенция 100, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност на хуманизираната тежка верига имуноглобулин включва амино-киселинни остатъци 1-119 от SEQ ID N0:31.
98. 102. Пречистен пептид съгласно претенция 100, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност на хуманизираната тежка верига имуноглобулин включва амино-киселинни остатъци 1-119 от SEQ ID N0:31 с едно или повече консервативни замествания.
99. 103. Пречистен пептид съгласно претенция 100, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност на хуманизираната тежка верига имуноглобулин включва амино-киселинни остатъци 1-119 от SEQ ID N0:31 с едно или повече амино-киселинни заличавания.
100. 104. Изолирана нуклеинова киселина, включваща нуклеотидна последователност, която кодира лека верига имуноглобулин на антитяло, годно да се свърже с TRAIL рецептора DR5 и годно да причини клетъчна смърт на клетка с DR5 рецептори.
101. 105.Изолирана нуклеинова киселина съгласно претенция 104, характеризираща се с това, че нуклеотидната последователност кодира леката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
102. 106.Изолирана нуклеинова киселина съгласно претенция 104, характеризираща се с това, че нуклеотидната последователност кодира леката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече консервативни аминокиселинни замествания.
103. 107.Изолирана нуклеинова киселина съгласно претенция 104, характеризираща се с това, че нуклеотидната последователност кодира леката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече амино-киселинни заличавания.
104. 108. Изолирана нуклеинова киселина съгласно претенция 104 включваща нуклеотиди 1-705 от SEQ ID N0:22.
105. 109. Изолирана нуклеинова киселина съгласно претенция 104, характеризираща се с това, че кодираната лека верига имуноглобулин е хуманизирана.
106. 110. Изолирана нуклеинова киселина съгласно претенция 104, характеризираща се с това, че кодираната хуманизирана лека верига имуноглобулин включва амино-киселинни остатъци 1-213 от SEQ ID N0:46.
107. 111.Вектор включващ нуклеиновата киселина от претенция 104 и регулаторен елемент оперативно свързан с нуклеиновата киселина.
108. 112. Култивирана клетка включваща вектора от претенция 111.
109. 113. Пречистен полипептид включващ амино-киселинна последователност на лека верига имуноглобулин на антитяло, годно да се свърже с TRAIL рецептор DR5 и годно да причини клетъчна смърт на клетка с DR5 рецептори.
110. 114.Пречистен полипептид съгласно претенция 113, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност е амино-киселинна последователност на леката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428.
111. 115. Пречистен полипептид съгласно претенция 113, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност е амино-киселинна последователност на леката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече консервативни амино-киселинни замествания.
112. 116.Пречистен полипептид съгласно претенция 113, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност е амино-киселинна последователност на леката верига имуноглобулин, проявена чрез хибридома мишка-мишка TRA-8 с АТСС депозитен номер РТА-1428 с едно или повече амино-киселинни заличавания.
113. 117.Пречистен полипептид съгласно претенция 113, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност включва амино-киселинно остатъци 1-234 от SEQ ID N0:24.
114. 118.Пречистен пептид съгласно претенция 113, характеризиращ се това, че леката верига имуноглобулин е хуманизирана.
115. 119.Пречистен пептид съгласно претенция 118, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност на хуманизираната лека верига имуноглобулин включва амино-киселинно остатъци 1-213 от SEQ ID N0:46.
116. 120.Пречистен пептид съгласно претенция 118, характеризиращ се с това, че амино-киселинната последователност на хуманизираната лека верига имуноглобулин включва амино-киселинно остатъци 1-213 от SEQ ID N0:46 с едно или повече консервативни замествания.
117. 121.Пречистен полипептид съгласно претенция 118, характеризиращ се е това, че амино-киселинната последователност на хуманизираната лека верига имуноглобулин включва амино-киселинни остатъци 1-213 от SEQ ID N0:46 с едно или повече амино-киселинни заличавания.
118. 122.Процес за получаване на хуманизираното антитяло от претенция 16, включващ следните стъпки:

     (a) трансформиране на клетка гостоприемник с първи вектор, кодиращ хуманизирана лека верига имуноглобулин, хуманизирана тежка верига имуноглобулин или и двете;

     (b) по избор трансформиране на клетката гостоприемник с втори вектор, кодиращ леката верига или тежката верига от стъпка (а), ако един от първите вектори липсва;

     (c) инкубиране на трансформираната клетка гостоприемник при условия, които позволяват експресията на вектора или векторите и (d) изолиране на хуманизираното антитяло от клетката гостоприемник или среда от клетката гостоприемник.
119. 123.Търговски комплект за причиняване на апоптоза, включващ антитялото от претенция 1 в контейнер.
120. 124. Търговски комплект за причиняване на апоптоза, включващ антитялото от претенция 16 в контейнер.
121. 125. Процес за нарастване на NFkB нивата в клетка, включващ контактуване на клетката с ефективно количество от антитялото от претенция 1.
122. 126. Процес за нарастване на NFkB нивата в клетка, включващ контактуване на клетката с ефективно количество от антитялото от претенция 16.