WO2018230304A1 - 改変型グルコース脱水素酵素 - Google Patents

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WO2018230304A1
WO2018230304A1 PCT/JP2018/020118 JP2018020118W WO2018230304A1 WO 2018230304 A1 WO2018230304 A1 WO 2018230304A1 JP 2018020118 W JP2018020118 W JP 2018020118W WO 2018230304 A1 WO2018230304 A1 WO 2018230304A1
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amino acid
position corresponding
glucose dehydrogenase
seq
acid sequence
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PCT/JP2018/020118
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本田 通済
浩一 眞田
涼 竹中
高史 宅見
昴洸 藤井
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池田食研株式会社
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    • C40B40/08Libraries containing RNA or DNA which encodes proteins, e.g. gene libraries

Definitions

  • the present invention relates to a glucose dehydrogenase, a polynucleotide encoding the enzyme, a method for producing the enzyme, a method for measuring glucose using the enzyme, a measuring reagent composition, a biosensor, and the like.
  • Measurement of glucose (blood glucose) concentration in blood is mainly important in blood glucose control of diabetic patients.
  • biosensors are widely used as blood glucose measurement devices using enzymes.
  • Glucose oxidase and glucose dehydrogenase are known as enzymes that can be used in biosensors.
  • glucose oxidase has a problem that measurement errors occur due to dissolved oxygen in the blood.
  • glucose dehydrogenases flavin-binding glucose dehydrogenases derived from eukaryotic cells are not affected by dissolved oxygen, do not require the addition of coenzymes, and are excellent in substrate specificity. It is useful as an enzyme for use (Patent Documents 1 to 5).
  • the present invention provides a highly thermostable glucose dehydrogenase, a polynucleotide encoding the enzyme, a method for producing the enzyme, a method for measuring glucose using the enzyme, a measurement reagent composition, and a biosensor. Furthermore, a measurement reagent composition and a method for producing a biosensor are provided.
  • the present inventor has found that a modified glucose dehydrogenase having an excellent property of high thermal stability can be obtained by modifying a part of amino acids constituting a protein such as a wild-type glucose dehydrogenase. It was. Furthermore, the inventors have found that the enzyme can be efficiently produced using a polynucleotide encoding the enzyme, and that glucose can be measured using the enzyme, and the present invention has been achieved.
  • the present invention relates to the following aspects.
  • Aspect 2 In the amino acid sequence of any one of a) to c) described in Aspect 1, The amino acid at the position corresponding to S71 is serine, glycine or asparagine, the amino acid at the position corresponding to G72 is glycine, the amino acid at the position corresponding to Q169 is glutamine, tyrosine or phenylalanine, and the position corresponding to G183
  • the amino acid at the position corresponding to S188 is glycine or asparagine
  • the amino acid at the position corresponding to G210 is glycine, the amino acid at the position corresponding to A221 is alanine or serine, and corresponds to S269
  • the amino acid at the position is serine, the amino acid at the position corresponding to N346 is asparagine or alanine, the amino acid at the position corresponding to S427 is serine or alanine, and the amino acid at the position corresponding to S429 is serine.
  • Ri is an amino acid phenylalanine at the position corresponding to F521, or of the amino acid position corresponding to V567 is valine, comprising at least one amino acid substitution, The modified glucose dehydrogenase according to aspect 1.
  • the amino acid at the position corresponding to S71 is aspartic acid
  • the amino acid at the position corresponding to G72 is alanine
  • the amino acid at the position corresponding to Q169 is cysteine
  • the amino acid at the position corresponding to G183 is lysine
  • the position corresponding to S188 is an amino acid phenylalanine at the position corresponding to F521, or of the amino acid position corresponding to V567 is valine, comprising at least one amino acid substitution,
  • the amino acid at the position corresponding to G210 is cysteine
  • the amino acid at the position corresponding to A221 is tyrosine
  • the amino acid at the position corresponding to S269 is valine
  • the amino acid at the position corresponding to N346 is lysine
  • the amino acid at the position corresponding to S427 is valine
  • the amino acid at the position corresponding to S429 is valine
  • the amino acid at the position corresponding to F521 is tryptophan or tyrosine
  • the amino acid at the position corresponding to V567 is alanine, cysteine, glycine, Methionine, glutamine, seri Or those substituted threonine
  • the modified glucose dehydrogenase according to the aspect 1 or 2.
  • a method for producing a modified glucose dehydrogenase comprising culturing the transformed cell of aspect 7 and collecting the modified glucose dehydrogenase from the obtained culture.
  • a glucose measurement reagent composition comprising the modified glucose dehydrogenase according to any one of aspects 1 to 4.
  • a biosensor for measuring glucose comprising the modified glucose dehydrogenase according to any one of aspects 1 to 4.
  • the present invention it is possible to use a modified glucose dehydrogenase having excellent thermostability. Furthermore, the modified glucose dehydrogenase of the present invention can be efficiently produced, and stable production is possible even in a biosensor production process including a heating process.
  • modified glucose dehydrogenase refers to an enzyme having glucose dehydrogenase activity in which a part of an amino acid constituting a wild-type protein such as glucose dehydrogenase is substituted with another amino acid ( Glucose dehydrogenase).
  • an amino acid residue may be expressed by one-letter code.
  • an amino acid substitution for substituting serine corresponding to position 71 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 with aspartic acid is represented as S71D.
  • the modified glucose dehydrogenase of the present invention is an amino acid sequence comprising the above wild-type protein, the amino acid sequences represented by SEQ ID NO: 2, S71, G72, Q169, G183, S188, G210, A221, S269, N346. , S427, S429, F521 or V567 at least one amino acid substitution is included.
  • amino acid sequence of glucose dehydrogenase before modification As an example of the amino acid sequence of glucose dehydrogenase before modification (wild type), the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or 3, or an amino acid sequence having homology with the sequence, having glucose dehydrogenase activity Amino acid sequence of a protein.
  • amino acid sequence shown by sequence number 3 is an amino acid sequence which does not contain a signal sequence among the amino acid sequences shown by sequence number 2.
  • amino acid sequences constituting the above wild-type protein for example, L2G906 (SEQ ID NO: 24), T0LBU8 (SEQ ID NO: 25), A0A1Q8RY40 (SEQ ID NO: 26), N4VGS5 (public sequences on UniProt)
  • amino acid sequences constituting the above wild-type protein for example, L2G906 (SEQ ID NO: 24), T0LBU8 (SEQ ID NO: 25), A0A1Q8RY40 (SEQ ID NO: 26), N4VGS5 (public sequences on UniProt)
  • SEQ ID NO: 27 sequences of SEQ ID NO: 27
  • R1EZF7 SEQ ID NO: 28
  • amino acid sequences having homology with the sequences for example, L2G906 (SEQ ID NO: 24), T0LBU8 (SEQ ID NO: 25), A0A1Q8RY40 (SEQ ID NO: 26), N4VGS5 (public sequences on UniProt)
  • the modified glucose dehydrogenase of the present invention is (A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 3, 24, 25, 26, 27 or 28, (B) an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 3, 24, 25, 26, 27 or 28, or (c) SEQ ID NO: 2, 3 Amino acid sequence having homology with the amino acid sequence shown by 24, 25, 26, 27 or 28, At least one amino acid substitution among amino acids at positions corresponding to S71, G72, Q169, G183, S188, G210, A221, S269, N346, S427, S429, F521 or V567 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 Is a protein having an amino acid sequence comprising
  • a deletion, substitution or addition of one or several amino acids is preferably at most 60, more preferably at most 55, 50, 40, 30, 20, 10, or 5 Amino acid deletion, substitution and / or addition.
  • Amino acid sequences having “homology” means that similarity is preferably at least 90% or 95%, more preferably at least 96%, 97%, 98% or 99% amino acid sequence, or identity. Preferably it means at least 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 98% or 99% amino acid sequence.
  • the expression “position corresponding to S71, G72, Q169, G183, S188, G210, A221, S269, N346, S427, S429, F521 or V567 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 in the amino acid sequence of glucose dehydrogenase” Is the 71st serine, the 72nd glycine, the 169th glutamine, the 183rd glycine, the 188th serine when the first amino acid methionine (M) of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is the first , 210th glycine, 221nd alanine, 269th serine, 346th asparagine, 427th serine, 429th serine, 521st phenylalanine, or 567th valine, the amino acid corresponding to SEQ ID NO: 2 For alignment with Ri can be identified. For example, the corresponding position can be specified as shown in FIG.
  • the amino acid at the corresponding position is preferably serine, glycine or asparagine corresponding to S71, preferably glycine corresponding to G72, and glutamine, tyrosine or phenylalanine corresponding to Q169.
  • G183 corresponds to glycine or asparagine
  • S188 preferably corresponds to serine
  • G210 preferably corresponds to glycine
  • amino acid substitution For amino acid substitution, S71D, G72A, Q169C, G183K, S188V, G210C, A221Y, S269V, N346K, S427V, S429V, F521W or F521Y, or V567A, V567C, V567G, V567M, V567Q, 567S, V567Q, V567S Is preferred. That is, the amino acid at the position corresponding to S71 corresponds to aspartic acid, the amino acid at the position corresponding to G72 corresponds to alanine, the amino acid at the position corresponding to Q169 corresponds to cysteine, the amino acid at the position corresponding to G183 corresponds to lysine, and S188.
  • the amino acid at the position corresponding to G210 is cysteine
  • the amino acid at the position corresponding to A221 is tyrosine
  • the amino acid at the position corresponding to S269 is valine
  • the amino acid at the position corresponding to N346 is lysine.
  • the amino acid at the position corresponding to S427 is valine
  • the amino acid at the position corresponding to S429 is valine
  • the amino acid at the position corresponding to F521 is tryptophan or tyrosine
  • the amino acid at the position corresponding to V567 is alanine, cysteine, Glycine, methionine, glutami , Serine or threonine, it is preferably substituted at least one position.
  • the modified glucose dehydrogenase of the present invention preferably has a high residual activity compared to the residual activity of the glucose dehydrogenase activity of the wild-type enzyme.
  • the residual activity of each enzyme means the ratio of the activity after treatment to the activity before treatment at 45 ° C. for 30 minutes in 0.1M phosphate buffer (pH 6.0).
  • the ratio of the residual activity of the modified glucose dehydrogenase of the present invention to the residual activity of the wild-type enzyme is more preferably 102% or more, further preferably 110% or more, particularly preferably 120% or more, and particularly preferably 130% or more. .
  • the polynucleotide of the present invention is a polynucleotide encoding the modified glucose dehydrogenase according to any one of embodiments 1 to 4.
  • the polynucleotide may be a sequence containing an intron or may be cDNA.
  • mutation into the polynucleotide which codes the amino acid sequence shown by sequence number 2, 3, 24, 25, 26, 27 or 28 or the amino acid sequence which has homology with this amino acid sequence can be illustrated.
  • the polynucleotide of the present invention can be easily prepared by a known method. For example, publicly known using an appropriate primer set with a polynucleotide encoding an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 3, 24, 25, 26, 27 or 28 or an amino acid sequence having homology with the amino acid sequence as a template These can be prepared by introducing mutations using various PCR methods. Or you may synthesize
  • the polynucleotide may be a codon usage optimized according to the transformed cell.
  • the sequence described in SEQ ID NO: 1 may be synthesized.
  • a gene that encodes an amino acid sequence having similarity and / or identity by hitting a homology search such as BLAST (blastp or tblastn) to the public sequence using the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 Sequences can also be used as templates.
  • Primers can be designed from the above public sequences and amplified by PCR or RT-PCR using the DNA or RNA of the strain derived from the gene sequence as a template. It can also be obtained from strains of the same species or genus as the strain derived from the public sequence. Alternatively, it can be synthesized artificially from public sequence information.
  • the similarity is preferably at least 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99%.
  • the identity is preferably at least 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 92%, 95%, 98% or 99%.
  • the sequence described in SEQ ID NO: 1 is a base sequence encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, which is the amino acid sequence of wild-type glucose dehydrogenase.
  • the recombinant vector of the present invention is a cloning vector or an expression vector, and the vector is appropriately selected and contains the polynucleotide of the present invention as an insert.
  • the insert may contain an intron when the host is a eukaryotic cell.
  • the expression vector may be either a prokaryotic expression vector or a eukaryotic expression vector, and examples thereof include a pUC system, pBluescript II, pET expression system, pGEX expression system, pCold expression system, etc. Preferred vectors.
  • a polynucleotide that contributes to the expression of chaperone, lysozyme, etc. can be introduced into the same and / or different vector as the polynucleotide of the present invention.
  • Examples of the transformed cells of the present invention include prokaryotic cells such as Escherichia coli and Bacillus subtilis, eukaryotic cells such as fungi (yeast, Aspergillus genus Ascomycetes, basidiomycetes, etc.), insect cells, mammalian cells and the like. And can be obtained by transformation with the vector of the present invention.
  • Recombinant modified glucose dehydrogenase can be produced by collecting modified glucose dehydrogenase from a culture obtained by culturing the transformed cells of the present invention.
  • a normal microbial culture medium can be used for culture of the modified glucose dehydrogenase-producing bacterium used in the present invention.
  • a synthetic medium and a natural medium can be used as long as they contain moderate amounts of carbon sources, nitrogen sources, vitamins, inorganic substances, and other micronutrients required by microorganisms to be used.
  • the carbon source glucose, sucrose, dextrin, starch, glycerin, molasses and the like can be used.
  • Nitrogen sources include inorganic salts such as ammonium chloride, ammonium nitrate, ammonium sulfate, and ammonium phosphate, amino acids such as DL-alanine and L-glutamic acid, nitrogen content such as peptone, meat extract, yeast extract, malt extract, corn steep liquor, etc. Natural products can be used. As vitamins, riboflavin, pyridoxine, niacin (nicotinic acid), thiamine and the like can be used. As the inorganic substance, monosodium phosphate, disodium phosphate, monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, magnesium sulfate, ferric chloride and the like can be used. Furthermore, compounds necessary for adjusting protein expression may be added as appropriate.
  • inorganic salts such as ammonium chloride, ammonium nitrate, ammonium sulfate, and ammonium phosphate
  • amino acids such as DL-alanine and L-g
  • the culture for obtaining the modified glucose dehydrogenase of the present invention is usually preferably carried out under aerobic conditions by a method such as shaking culture or aeration stirring.
  • culture conditions suitable for production of the modified glucose dehydrogenase may be set.
  • the culture temperature is preferably 20 to 50 ° C. and pH 4 to pH 8, and the pH may be adjusted during the culture in consideration of productivity.
  • the culture period is preferably in the range of 2 days to 10 days, but if the production volume is increased by fed-batch culture or continuous culture, the period can be extended within a range where productivity is determined to be optimal.
  • an ordinary protein production method can be used. For example, after first cultivating a modified glucose dehydrogenase-producing bacterium, a culture supernatant is obtained by centrifugation. Alternatively, cultured cells are obtained, the cultured microorganisms are crushed by an appropriate method, and a supernatant is obtained from the crushed liquid by centrifugation or the like. Next, the modified glucose dehydrogenase contained in these supernatants can be purified by an ordinary protein purification method to obtain a purified enzyme. For example, it can be purified by combining purification operations such as ultrafiltration, salting out, solvent precipitation, heat treatment, dialysis, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, gel filtration, and affinity chromatography.
  • purification operations such as ultrafiltration, salting out, solvent precipitation, heat treatment, dialysis, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, gel filtration, and affinity chromatography.
  • the modified glucose dehydrogenase of the present invention can be used after drying. If the enzyme is not inactivated, the drying method is not limited, but it is preferable to obtain a lyophilized product by lyophilization. Buffering agents and stabilizers can be added in the drying step. You may grind
  • Glucose can be measured using the modified glucose dehydrogenase of the present invention.
  • the glucose measurement method of the present invention can quantify glucose in a test sample by including a step of bringing a test sample containing glucose into contact with the modified glucose dehydrogenase of the present invention.
  • the test sample is not particularly limited, for example, a biological sample can be exemplified, and blood samples, tears, saliva, urine, interstitial fluid and the like can be exemplified as specific examples.
  • the enzyme of the present invention is particularly useful for blood glucose measurement.
  • the present invention provides a production method for producing a glucose measurement reagent composition, a glucose measurement kit, or a glucose measurement biosensor using the modified glucose dehydrogenase of the present invention. Since the enzyme of the present invention has high substrate specificity and does not substantially use oxygen as an electron acceptor, it is hardly affected by other saccharides and dissolved oxygen in the measurement sample in glucose measurement. Therefore, it is possible to provide a glucose measurement reagent composition, a glucose measurement kit, or a glucose measurement biosensor that is hardly affected by other saccharides or dissolved oxygen, and glucose measurement with high measurement accuracy is possible.
  • the modified glucose measuring reagent composition of the present invention may be a reagent composition containing the modified glucose dehydrogenase of the present invention as an enzyme.
  • the amount of enzyme in the composition is not particularly limited as long as glucose in a sample can be measured, but the amount of enzyme per measurement is preferably about 0.01 to 100 U, more preferably about 0.05 to 50 U, more preferably 0.1 To about 20U is more preferable.
  • the composition preferably contains a buffer, and may contain other optional components known to those skilled in the art, such as stabilizers, to improve the thermal stability and storage stability of the enzyme and reagent components. preferable.
  • the component examples include bovine serum albumin (BSA) or ovalbumin, saccharides or sugar alcohols having no activity with the enzyme, carboxyl group-containing compounds, alkaline earth metal compounds, ammonium salts, sulfates, proteins, and the like.
  • BSA bovine serum albumin
  • a known substance that suppresses the influence of a contaminant substance that affects the measurement present in the test sample may be included in the measurement reagent.
  • the glucose measurement kit of the present invention may contain the reagent composition and a glucose standard solution.
  • the biosensor of the present invention may be any sensor that includes the modified glucose dehydrogenase of the present invention as an enzyme.
  • an electrochemical biosensor is manufactured by including a substrate, a counter electrode, a working electrode mediator, and the enzyme.
  • the mediator include proteinaceous electron mediators such as heme, ferricyanide compounds, quinone compounds, osmium compounds, phenazine compounds, and phenothiazine compounds.
  • proteinaceous electron mediators such as heme, ferricyanide compounds, quinone compounds, osmium compounds, phenazine compounds, and phenothiazine compounds.
  • the modified glucose dehydrogenase of the present invention can be used in a biobattery.
  • the biobattery according to the present invention includes an anode electrode that performs an oxidation reaction and a cathode electrode that performs a reduction reaction, and includes an electrolyte layer that separates the anode and the cathode as necessary.
  • An enzyme electrode containing the above-mentioned electron mediator and glucose dehydrogenase is used as an anode electrode, and electrons generated by oxidizing the substrate are taken out to the electrode and protons are generated.
  • an enzyme generally used for the cathode electrode may be used on the cathode side, for example, by using laccase, ascorbate oxidase or bilirubin oxidase, and reacting protons generated on the anode side with oxygen. Generate water.
  • the electrode generally used for a bio battery such as carbon, gold
  • the enzyme is preferably diluted as appropriate so that the final concentration is 0.15-0.6 U / mL.
  • the enzyme activity unit (U) of the enzyme is an enzyme activity that oxidizes 1 ⁇ mol of glucose per minute.
  • the enzyme activity of the modified glucose dehydrogenase of the present invention can be measured by the following method.
  • the amount of decrease per minute ( ⁇ A600) in absorbance at 600 nm accompanying the progress of the enzyme reaction was measured for 5 minutes from the start of the reaction, and the enzyme activity was calculated from the linear portion according to the following formula. At this time, the enzyme activity was defined as 1 U for the amount of enzyme that reduces 1 ⁇ mol of DCIP per minute at 37 ° C. and pH 6.0.
  • 3.0 is the amount of reaction reagent + enzyme solution (mL)
  • 10.8 is the molar extinction coefficient of DCIP at pH 6.0
  • 1.0 is the optical path length (cm) of the cell
  • 0.05 represents the amount of the enzyme solution (mL)
  • ⁇ A600 blank represents the amount of decrease in absorbance per minute at 600 nm when the reaction was started by adding a diluted enzyme solution instead of the enzyme solution.
  • Example 1 (Acquisition of flavin-binding wild-type glucose dehydrogenase (GLD)) As a result of searching for GLD-producing bacteria, GLD activity could be confirmed in the culture supernatant of Glomerella fructigena NBRC5951.
  • cDNA library was prepared from the RNA obtained in (2) by reverse transcription using reverse transcriptase and an oligo dT primer with an adapter sequence.
  • SMARTER RACE cDNA Amplification kit manufactured by Takara Bio Inc. was used, and the reaction conditions were performed according to the protocol described in the manual.
  • E. coli JM109 competent cell (manufactured by Takara Bio Inc.) was transformed by a known method.
  • a plasmid vector was extracted and purified from the obtained transformant using NucleoSpin Plasmid QuickPure (Takara Bio Inc.), and the base sequence of the insert was determined.
  • primers for elucidating the upstream and downstream sequences of the GLD gene were designed. Using these primers, 1758 bases of the full-length GLD gene from the start codon to the stop codon were elucidated by 5'RACE method and 3'RACE method. The gene sequence is shown in SEQ ID NO: 1.
  • Example 2 (Acquisition of transformant having modified GLD gene introduced with site-specific mutation)
  • the following oligonucleotides were designed and synthesized. These base sequences were determined based on the base sequence described in SEQ ID NO: 1.
  • Primer S71D 5'-ACGTGACCAGCCCCGACGGCTACGGACTGGCCTTTGG-3 '(SEQ ID NO: 4)
  • Primer G72A 5'-CAGCCCCTCTGCCTACGGACTGGCCTTTGGTACCG-3 '(SEQ ID NO: 5)
  • Primer Q169C 5'-ACCTACATCCCTGAGTGCCACGGTACCTCTGGTCCTCTC-3 '(SEQ ID NO: 6)
  • Primer G183K 5'-GTCGGCTGGAAGTCCAAGGGTGTCGAGAAGTCCTTCGTC-3 '(SEQ ID NO: 7)
  • Primer S188V 5'-GGCGGTGTCGAGAAGGTTTTCGTCGACGTCTTGAACCAG-3 '(SEQ ID NO: 8)
  • Primer G210C 5'-CTGAAGGACATTGCTTGCGGAGACATGGTCGGCTGGAAC-3 '(SEQ ID NO: 9)
  • Primer A221Y 5'-CTGGAACATCTACCCC
  • recombinant molds that produce each modified GLD were prepared.
  • the obtained recombinant strain was purified with Czapek-Dox solid medium.
  • Aspergillus oryzae NS4 strain was used as a host to be used. This strain can be obtained from the Alcohol Research Institute.
  • transformants that produce wild-type GLD and S71D, N346K, S429V, F521W, V567A, V567C, V567G, V567M, V567Q, V567S, V567T, Q169C + G210C, G183K + V567A, S71D + V567C, G72A + V567C, A221Y + V567C, S269V + V567C, F521W + V567C, G72A + S188V + V567C, G72A + A221Y + V567C, G72A + S427V + V567C, G72A + F521CV, G72A + F521C + G567 Q169C + G210C, Q169C + G210C + V567C, Q169C + G210C + F521W, Q169C + G210C + F521Y, S188V + F521W + V
  • Example 3 Thermal stability evaluation of each modified GLD) Paindex 2% (made by Matsutani Chemical Industry Co., Ltd.) (w / v), tryptone 1% (made by BD) (w / v), potassium dihydrogen phosphate 0.5% (made by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) (w / V), magnesium sulfate heptahydrate 0.05% (w / v) (manufactured by Nacalai Tesque) and 10 mL of a liquid medium consisting of water are placed in a thick test tube (22 mm ⁇ 200 mm) and autoclaved at 121 ° C. for 20 minutes. did.
  • Example 2 Each of the transformants obtained in Example 2 was inoculated into a cooled liquid medium and cultured with shaking at 30 ° C. for 4 days. After completion of the culture, the supernatant was collected by centrifugation, and GLD activity was measured using a plate reader in accordance with the GLD activity measurement method described above. As a result, GLD activity was confirmed.
  • Each diluted culture supernatant was diluted to about 6.6 U / mL, and then 1 M phosphate buffer (pH 6.0) was added to a final concentration of 0.1 M.
  • Each sample was treated at 45 ° C. for 30 minutes, and the enzyme activity was measured by the aforementioned GLD activity measurement method for each of the samples before and after the treatment.
  • the ratio of the activity value after the treatment to the activity value before the treatment was calculated as the remaining activity (%), and the ratio (%) of the remaining activity of each modified GLD to the remaining activity of the wild type GLD was calculated. Shown in ⁇ 6.
  • the modified GLD has a higher residual activity than that of the wild-type GLD with respect to the residual activity before and after treatment at 45 ° C. for 30 minutes in 0.1 M phosphate buffer (pH 6.0). It was. That is, as compared with wild-type GLD, the modified GLD had improved thermal stability.
  • modified V567Q and V567M are larger than 100
  • the modified S71D, N346K, S429V, F521W and G183K + V567A are 110 or more
  • the modified V567T is 120 or more
  • modified S71D + V567C, A221Y + V567C, S269V + V567C, G72A + S427V + V567C, G72A + F521Y + V567C, Q169C + G210C + F521W and S71D + G72A + F521W + V567C are 140 or more
  • modified 567, V567G, V567S, G72A + V567C, G72A + S188V + V567C, G72A + Q169C + G210C, G72A + F521W + V567C and S188V + F521W + V567C are over 150
  • the present invention it is possible to use a modified glucose dehydrogenase having excellent thermostability. Furthermore, the modified glucose dehydrogenase of the present invention can be produced efficiently, and a biosensor including a heating step can be produced stably.

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Abstract

【課題】 血糖測定において用いる、より熱安定性の高い酵素等を提供すること。 【解決手段】 野生型のグルコース脱水素酵素等のタンパク質を構成する一部のアミノ酸を改変することにより得られる、熱安定性が高いという優れた特性を有する改変型グルコース脱水素酵素、該酵素をコードするポリヌクレオチド、該酵素の製造方法、該酵素を用いたグルコースの測定方法、測定試薬組成物及びバイオセンサ、並びに、該測定試薬組成物及びバイオセンサの製造方法等。

Description

改変型グルコース脱水素酵素
 本発明は、グルコース脱水素酵素、該酵素をコードするポリヌクレオチド、該酵素の製造方法、該酵素を用いたグルコースの測定方法、測定試薬組成物及びバイオセンサ等に関する。
 血液中のグルコース(血糖)濃度の測定は、主に糖尿病患者の血糖コントロールにおいて重要である。血糖測定において、酵素を利用した血糖測定機器として、バイオセンサが広く使われている。
 バイオセンサに使用可能な酵素として、グルコース酸化酵素やグルコース脱水素酵素が知られている。しかし、グルコース酸化酵素は、血中の溶存酸素により測定誤差が生じるという問題があった。グルコース脱水素酵素のうち、真核細胞由来のフラビン結合型グルコース脱水素酵素は、溶存酸素の影響を受けないこと、補酵素の添加を必要としないこと及び基質特異性に優れることから、バイオセンサ用の酵素として有用である(特許文献1~5)。
国際公開2004/058958号パンフレット 国際公開2006/101239号パンフレット 国際公開2008/001903号パンフレット 国際公開2009/084616号パンフレット 特許第5896375号公報
 血糖測定において、より熱安定性の高い酵素が求められていた。本発明は、熱安定性の高いグルコース脱水素酵素、該酵素をコードするポリヌクレオチド、該酵素の製造方法、該酵素を用いたグルコースの測定方法、測定試薬組成物及びバイオセンサを提供する。更に、測定試薬組成物及びバイオセンサの製造方法を提供する。
 本発明者は、野生型のグルコース脱水素酵素等のタンパク質を構成するアミノ酸の一部を改変することで、熱安定性が高いという優れた特性を有する改変型グルコース脱水素酵素を取得できることを見出した。更に、該酵素をコードするポリヌクレオチドを用いて該酵素を効率的に製造できるということ、及び該酵素を用いてグルコース測定が可能なことを見出し、本発明に至った。
 即ち、本発明は以下の各態様に係るものである。
[態様1]
 以下のa)~c)の何れかのアミノ酸配列において、
a)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列、
b)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは26に示されるアミノ酸配列において1~数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列、又は
c)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の類似性を有するアミノ酸配列、
 配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列から成る、
 改変型グルコース脱水素酵素。
[態様2]
 態様1に記載のa)~c)の何れかのアミノ酸配列において、
 S71に対応する位置のアミノ酸がセリン、グリシンもしくはアスパラギンであり、G72に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、Q169に対応する位置のアミノ酸がグルタミン、チロシンもしくはフェニルアラニンであり、G183に対応する位置のアミノ酸がグリシンもしくはアスパラギンであり、S188に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、G210に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、A221に対応する位置のアミノ酸がアラニンもしくはセリンであり、S269に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、N346に対応する位置のアミノ酸がアスパラギンもしくはアラニンであり、S427に対応する位置のアミノ酸がセリンもしくはアラニンであり、S429に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、F521に対応する位置のアミノ酸がフェニルアラニンであり、又はV567に対応する位置のアミノ酸がバリンであるアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含む、
 態様1記載の改変型グルコース脱水素酵素。
[態様3]
 配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換が、
 S71に対応する位置のアミノ酸がアスパラギン酸に、G72に対応する位置のアミノ酸がアラニンに、Q169に対応する位置のアミノ酸がシステインに、G183に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S188に対応する位置のアミノ酸がバリンに、G210に対応する位置のアミノ酸がシステインに、A221に対応する位置のアミノ酸がチロシンに、S269に対応する位置のアミノ酸がバリンに、N346に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S427に対応する位置のアミノ酸がバリンに、S429に対応する位置のアミノ酸がバリンに、F521に対応する位置のアミノ酸がトリプトファンもしくはチロシンに、又はV567に対応する位置のアミノ酸がアラニン、システイン、グリシン、メチオニン、グルタミン、セリンもしくはスレオニンに置換されたものである、
 態様1又は2記載の改変型グルコース脱水素酵素。
[態様4]
 0.1Mリン酸緩衝液(pH6.0)中で45℃、30分間処理後の残存活性について、野生型酵素より高い残存活性を有する、態様1~3の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素。
[態様5]
 態様1~4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素をコードするポリヌクレオチド。
[態様6]
 態様5記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
[態様7]
 態様6記載のベクターを用いて形質転換された形質転換細胞。
[態様8]
 態様7の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型グルコース脱水素酵素を採取することを特徴とする、改変型グルコース脱水素酵素の製造方法。
[態様9]
 態様1~4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素を使用するグルコース測定方法。
[態様10]
 態様1~4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定試薬組成物。
[態様11]
 態様1~4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定用バイオセンサ。
 本発明により、熱安定性に優れた改変型グルコース脱水素酵素を利用することが可能になった。更に、本発明の改変型グルコース脱水素酵素を効率的に製造できるようになり、加熱工程を含むバイオセンサ製造工程でも安定した製造が可能になった。
各配列のアライメントを示す図である。
 本明細書の“改変型グルコース脱水素酵素”とは、グルコース脱水素酵素等の野生型のタンパク質を構成するアミノ酸の一部が別のアミノ酸に置換された、グルコース脱水素酵素活性を有する酵素(グルコース脱水素酵素)である。
 本明細書ではアミノ酸残基を1文字表記で表現することがあり、例えば、配列番号2で示されるアミノ酸配列の71番目に対応するセリンをアスパラギン酸に置換するアミノ酸置換は、S71Dと表す。
 本発明の改変型グルコース脱水素酵素は、上記の野生型のタンパク質を構成するアミノ酸配列において、配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸置換を含む。
 改変前(野生型)のグルコース脱水素酵素のアミノ酸配列の例として、配列番号2もしくは3で示されるアミノ酸配列、又は該配列と相同性を有するアミノ酸配列であって、グルコース脱水素酵素活性を有するタンパク質のアミノ酸配列である。尚、配列番号3で示されるアミノ酸配列は、配列番号2で示されるアミノ酸配列のうち、シグナル配列を含まないアミノ酸配列である。更に、上記の野生型のタンパク質を構成するアミノ酸配列の例として、例えば、UniProtでの公開配列である、L2G906(配列番号24)、T0LBU8(配列番号25)、A0A1Q8RY40(配列番号26)、N4VGS5(配列番号27)及びR1EZF7(配列番号28)の配列、又は該配列と相同性を有するアミノ酸配列を例示できる。配列番号24~28のアミノ酸配列と配列番号2との類似性はそれぞれ99%、99%、98%、96%及び92%である。
 本発明の改変型グルコース脱水素酵素は、
(a)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列、
(b)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列
又は
(c)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列と相同性を有するアミノ酸配列、
において、配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列を有するタンパク質である。 
 1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたとは、好ましくは多くとも60個、より好ましくは多くとも55個、50個、40個、30個、20個、10個又は5個のアミノ酸の欠失、置換及び/又は付加である。
 アミノ酸配列が「相同性」を有するとは、類似性が好ましくは少なくとも90%又は95%、より好ましくは少なくとも96%、97%、98%又は99%のアミノ酸配列であること、又は同一性が好ましくは少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、98%又は99%のアミノ酸配列であることを意味する。
 類似性は、表1のスコア表(GENETYX(登録商標)の説明書 p.220 A.18 ホモロジースコア表 A.18.2 アミノ酸、参考文献:Atlas of Protein Sequence and Structure Vol.5 (1978))を用いて、アライメント時にスコアが0以上になる文字数÷アライメント長で算出された値である。配列解析ソフトである、GENETYX((登録商標)、株式会社ゼネティックス製)を用いて算出できる。詳細には、該ソフトを初期設定で使用し、アミノ酸配列同士のホモロジー解析を行い、Similarityとして算出される。
 同一性は、GENETYX(株式会社ゼネティックス製)のアミノ酸配列同士のホモロジー解析により算出されたidentityの値に基づく。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
 グルコース脱水素酵素のアミノ酸配列において「配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置」という表現は、配列番号2で示されるアミノ酸配列の開始アミノ酸であるメチオニン(M)を1番目とした場合の71番目のセリン、72番目のグリシン、169番目のグルタミン、183番目のグリシン、188番目のセリン、210番目のグリシン、221番目のアラニン、269番目のセリン、346番目のアスパラギン、427番目のセリン、429番目のセリン521番目のフェニルアラニン又は567番目のバリンに対応するアミノ酸を意味し、配列番号2との配列アライメントにより特定できる。例えば図1に示したように対応する位置を特定できる。
 対応する位置のアミノ酸は、S71に対応するのはセリン、グリシンもしくはアスパラギンであることが好ましく、G72に対応するのはグリシンであることが好ましく、Q169に対応するのはグルタミン、チロシンもしくはフェニルアラニンであることが好ましく、G183に対応するのはグリシンもしくはアスパラギンであることが好ましく、S188に対応するのはセリンであることが好ましく、G210に対応するのはグリシンであることが好ましく、A221に対応するのはアラニンもしくはセリンであることが好ましく、S269に対応するのはセリンであることが好ましく、N346に対応するのはアスパラギンもしくはアラニンであることが好ましく、S427に対応するのはセリンもしくはアラニンであることが好ましく、S429に対応するのはセリンであることが好ましく、F521に対応するのはフェニルアラニンであることが好ましく、V567に対応するのはバリンであることが好ましい。
 また、アミノ酸置換について、S71D、G72A、Q169C、G183K、S188V、G210C、A221Y、S269V、N346K、S427V、S429V、F521WもしくはF521Y、又はV567A、V567C、V567G、V567M、V567Q、V567SもしくはV567Tアラニンであることが好ましい。つまり、S71に対応する位置のアミノ酸がアスパラギン酸に、G72に対応する位置のアミノ酸がアラニンに、Q169に対応する位置のアミノ酸がシステインに、G183に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S188に対応する位置のアミノ酸がバリンに、G210に対応する位置のアミノ酸がシステインに、A221に対応する位置のアミノ酸がチロシンに、S269に対応する位置のアミノ酸がバリンに、N346に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S427に対応する位置のアミノ酸がバリンに、S429に対応する位置のアミノ酸がバリンに、F521に対応する位置のアミノ酸がトリプトファンもしくはチロシンに、又はV567に対応する位置のアミノ酸がアラニン、システイン、グリシン、メチオニン、グルタミン、セリンもしくはスレオニンに、少なくとも1箇所置換されていることが好ましい。
 本発明の改変型グルコース脱水素酵素は、野生型酵素が有するグルコース脱水素酵素活性の残存活性に比べて、高い残存活性を有するのが好ましい。尚、各酵素の残存活性は、0.1Mリン酸緩衝液(pH6.0)中で45℃、30分間処理する前の活性に対する処理後の活性の比を意味する。野生型酵素の残存活性に対する本発明の改変型グルコース脱水素酵素の残存活性の割合は、102%以上がより好ましく、110%以上がさらに好ましく、120%以上が特に好ましく、130%以上が特に好ましい。
 本発明のポリヌクレオチドは、態様1~4の何れかに記載の改変型グルコース脱水素酵素をコードするポリヌクレオチドである。該ポリヌクレオチドは、イントロンを含む配列であっても良く、cDNAでも良い。例えば、配列番号2、3、24、25、26、27又は28で示されるアミノ酸配列又は該アミノ酸配列と相同性を有するアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドに変異を導入したポリヌクレオチドが例示できる。
 本発明のポリヌクレオチドは、公知の方法で容易に調製することができる。例えば、配列番号2、3、24、25、26、27又は28で示されるアミノ酸配列又は該アミノ酸配列と相同性を有するアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを鋳型とし、適切なプライマーセットを用いた公知の各種PCR法を利用して、変異を導入することにより調製することができる。又は、人工的に合成しても良い。形質転換細胞に応じてコドンユーセージを最適化したポリヌクレオチドでも良い。
 鋳型となるポリヌクレオチドは、配列番号1に記載の配列を合成しても良い。又は、配列番号2記載のアミノ酸配列を用いて、公開配列に対して例えばBLAST(blastp又はtblastn)等のホモロジー検索を行って、ヒットした類似性及び/又は同一性を有するアミノ酸配列をコードする遺伝子配列も鋳型として利用できる。上記の公開配列からプライマーをデザインし、該遺伝子配列の由来株のDNA又はRNAを鋳型としてPCR又はRT-PCRにより増幅して得ることができる。公開配列の由来株と同種又は同属の株からも得ることができる。又は、公開配列情報から人工的に合成できる。類似性は、好ましくは少なくとも90%、95%、96%、97%、98%又は99%である。同一性は、好ましくは少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、98%又は99%である。尚、配列番号1に記載の配列は野生型のグルコース脱水素酵素のアミノ酸配列である配列番号2のアミノ酸配列をコードする塩基配列である。
 本発明の組換えベクターは、クローニングベクター又は発現ベクターであり、ベクターは適宜選択し、インサートとして本発明のポリヌクレオチドを含む。インサートは、宿主が真核細胞の場合、イントロンを含んでいても良い。発現ベクターとしては、原核細胞発現用ベクター又は真核細胞発現用ベクターの何れでも良く、pUC系、pBluescriptII、pET発現システム、pGEX発現システム、pCold発現システム等が例示できるが、タンパク質の大量発現が可能なベクターが好ましい。尚、必要に応じて、シャペロンやリゾチーム等の発現に寄与するポリヌクレオチドを、本発明のポリヌクレオチドと同一及び/又は別のベクターに導入することも可能である。
 本発明の形質転換細胞としては、例えば、大腸菌、枯草菌等の原核細胞や、真菌(酵母、アスペルギルス属等の子嚢菌、担子菌等)、昆虫細胞、哺乳動物細胞等の真核細胞等を使用することができ、本発明のベクターで形質転換させて得ることができる。
 本発明の形質転換細胞を培養して得られた培養物から改変型グルコース脱水素酵素を採取することによって、組換え改変型グルコース脱水素酵素を製造することができる。
 本発明で使用される改変型グルコース脱水素酵素生産菌の培養には、通常の微生物培養用培地が使用できる。例えば、炭素源、窒素源、ビタミン類、無機物、その他使用する微生物が必要とする微量栄養素を程よく含有するものであれば、合成培地、天然培地の何れでも使用可能である。炭素源としては、グルコース、スクロース、デキストリン、澱粉、グリセリン、糖蜜等が使用できる。窒素源としては、塩化アンモニウム、硝酸アンモニウム、硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機塩類、DL-アラニン、L-グルタミン酸等のアミノ酸類、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、麦芽エキス、コーンスティープリカー等の窒素含有天然物が使用できる。ビタミン類としては、リボフラビン、ピリドキシン、ナイアシン(ニコチン酸)、チアミン等が使用できる。無機物としては、リン酸一ナトリウム、リン酸二ナトリウム、リン酸一カリウム、リン酸二カリウム、硫酸マグネシウム、塩化第二鉄等が使用できる。更に、タンパク質の発現の調整に必要な化合物を適宜添加しても良い。
 本発明の改変型グルコース脱水素酵素を得るための培養は、通常、振盪培養や通気攪拌等の方法により好気的条件下で行うのが良い。改変型グルコース脱水素酵素生産菌の特性を踏まえて、改変型グルコース脱水素酵素の生産に適した培養条件に設定すれば良い。例えば、培養温度は20℃から50℃、且つpH4からpH8の範囲で行うのが好ましく、生産性を考慮して培養中にpH調整をしても良い。培養期間は2日から10日の範囲が好ましいが、流加培養や連続培養による生産量増大を行うのであれば、生産性が最適と判断される範囲で期間を延ばすことができる。この様な方法で培養することにより、培養物中に改変型グルコース脱水素酵素を生成蓄積することができる。
 培養物中から改変型グルコース脱水素酵素を得る方法は、通常のタンパク質の製造方法が利用できる。例えば、最初に改変型グルコース脱水素酵素生産菌を培養後、遠心分離により培養上清液を得る。又は培養菌体を得、適当な方法で該培養微生物を破砕し、破砕液から遠心分離等によって上清液を得る。次に、これらの上清液中に含まれる改変型グルコース脱水素酵素を、通常のタンパク質の精製方法で精製し、精製酵素を得ることができる。例えば、限外ろ過、塩析、溶媒沈殿、熱処理、透析、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、ゲルろ過、アフィニティークロマトグラフィー等の精製操作を組み合わせることによって精製できる。
 本発明の改変型グルコース脱水素酵素は乾燥して使用することができる。酵素が失活しなければ乾燥方法は制限されないが、凍結乾燥により、凍結乾燥品を得るのが好ましい。乾燥工程で、緩衝液剤及び安定化剤を添加することができる。乾燥後に粉砕して、粉末化し、粉末品にしても良い。
 本発明の改変型グルコース脱水素酵素を用いて、グルコースを測定することができる。本発明のグルコース測定方法は、グルコースを含む被検試料と本発明の改変型グルコース脱水素酵素とを接触させる工程を含むことにより、被検試料中のグルコースを定量できる。被検試料は特に限定されないが、例えば生体試料が例示でき、具体例として血液試料、涙、唾液、尿、間質液等が例示できる。本発明の酵素は、特に血糖測定に有用である。
 本発明は、本発明の改変型グルコース脱水素酵素を用いてグルコース測定試薬組成物、グルコース測定用キット又はグルコース測定用バイオセンサを製造する製造方法を提供する。本発明の酵素は基質特異性が高く、酸素を実質的に電子受容体としないため、グルコース測定において、測定試料中の他の糖類及び溶存酸素の影響を受け難い。よって、他の糖類や溶存酸素の影響を受け難いグルコース測定試薬組成物、グルコース測定用キット又はグルコース測定用バイオセンサが提供でき、測定精度の高いグルコース測定が可能である。
 本発明の改変型グルコース測定試薬組成物は、酵素として本発明の改変型グルコース脱水素酵素を含む試薬組成物であれば良い。該組成物中の酵素量は、試料中のグルコースを測定できれば特に限定されないが、1測定あたりの酵素量が0.01から100U程度が好ましく、0.05から50U程度がより好ましく、0.1から20U程度が更に好ましい。該組成物は、緩衝剤を含むことが好ましく、安定化剤等の当業者に公知の他の任意成分を適宜含有させ、該酵素や試薬成分の熱安定性や保存安定性を高めるのがより好ましい。前記成分としては、牛血清アルブミン(BSA)若しくは卵白アルブミン、該酵素と作用性のない糖類若しくは糖アルコール類、カルボキシル基含有化合物、アルカリ土類金属化合物、アンモニウム塩、硫酸塩、タンパク質等を例示できる。更に、被験試料中に存在する、測定に影響を与える夾雑物質の影響を抑える公知の物質を、該測定試薬に含ませても良い。本発明のグルコース測定用キットは、前記試薬組成物を含み、グルコース標準液を含ませても良い。
 本発明のバイオセンサは、酵素として本発明の改変型グルコース脱水素酵素を含むセンサであれば良い。例えば、電気化学式バイオセンサは、基板、対極、作用極メディエータ及び前記酵素を備えることによって作製される。メディエータは、ヘム等の蛋白質性電子メディエータ、フェリシアン化化合物、キノン系化合物、オスミウム系化合物、フェナジン系化合物、フェノチアジン系化合物等が例示できる。この他に、イオン変化、発色強度、pH変化等を検知する方式のバイオセンサも構築可能である。該バイオセンサを用いてグルコース測定が可能である。
 更に本発明の改変型グルコース脱水素酵素は、バイオ電池に用いることができる。本発明のバイオ電池は、酸化反応を行うアノード極及び還元反応を行うカソード極から構成され、必要に応じてアノードとカソードを隔離する電解質層を含んで構成される。上記の電子メディエータ及びグルコース脱水素酵素を含む酵素電極をアノード電極に使用し、基質を酸化することによって生じた電子を電極に取り出すと共に、プロトンを発生させる。一方、カソード側には、一般的にカソード電極に使用される酵素を使用すれば良く、例えばラッカーゼ、アスコルビン酸オキシダーゼ又はビリルビンオキシダーゼを使用し、アノード側で発生させたプロトンを酸素と反応させることによって水を生成させる。電極としては、カーボン、金、白金族金属等、一般的にバイオ電池に使用される電極を用いることができる。
 本酵素の活性測定においては、該酵素を、好ましくは終濃度0.15-0.6U/mLになるように適宜希釈して用いる。尚、該酵素の酵素活性単位(U)は1分間に1μmolのグルコースを酸化する酵素活性である。本発明の改変型グルコース脱水素酵素の酵素活性は、次の方法で測定できる。
(グルコース脱水素酵素(GLD)活性測定法)
 100mM リン酸カリウム緩衝液(pH6.0)1.00mL、1M D-グルコース溶液1.00mL、3mM 2,6-ジクロロフェノールインドフェノール(以下DCIPという)0.14mL及び3mM 1-メトキシ-5-メチルフェナジウムメチルサルフェイト0.20mL及び超純水0.61mLを混合し、37℃で10分間保温後、酵素溶液0.05mLを添加し、反応を開始した。反応開始時から5分間、酵素反応の進行に伴う600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量(ΔA600)を測定し、直線部分から次式に従い酵素活性を算出した。この際、酵素活性は、37℃、pH6.0で1分間に1μmolのDCIPを還元する酵素量を1Uと定義した。
 グルコース脱水素酵素(GLD)活性(U/mL)=(-(ΔA600-ΔA600blank)×3.0×酵素の希釈倍率)/(10.8×1.0×0.05)
 尚、式中の3.0は反応試薬+酵素溶液の液量(mL)、10.8はpH6.0におけるDCIPのモル吸光係数、1.0はセルの光路長(cm)、0.05は酵素溶液の液量(mL)、ΔA600blankは酵素の希釈溶液を酵素溶液の代わりに添加して反応開始した場合の600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量を表す。
 以下、実施例に則して本発明を更に詳しく説明する。尚、本発明の技術的範囲はこれらの記載によって何等制限されるものではない。又、本明細書中に引用される文献に記載された内容は、本明細書の一部として本明細書の開示内容を構成するものである。
[実施例1]
(フラビン結合型野生型グルコース脱水素酵素(GLD)の取得)
 GLD生産菌の探索を行った結果、Glomerella fructigena NBRC5951の培養上清にGLD活性が確認できた。
(1)菌体培養
 パインデックス(松谷化学工業社製)4%(w/v)、脱脂大豆(昭和産業社製)1%(w/v)、コーンスティープリカー(サンエイ糖化社製)1%(w/v)、リン酸二水素カリウム(ナカライテスク社製)0.5%(w/v)、硫酸マグネシウム七水和物(ナカライテスク社製)0.05%(w/v)及び水からなる液体培地をpH6.0に調整し、10mLを太試験管に入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、前記GLD生産菌を接種し、25℃で72時間振とう培養した後、さらしを用いて、湿菌体を回収した。
(2)全RNAの単離
 (1)で取得した湿菌体200mgを-80℃で凍結した後、ISOGENII(ニッポンジーン社製)を用いて100μgの全RNAを抽出した。
(3)cDNAライブラリーの調製
 (2)で取得したRNAから、逆転写酵素およびアダプター配列付きオリゴdTプライマーを用いた逆転写反応によりcDNAライブラリーを調製した。反応試薬は、SMARTer RACE cDNA Amplification kit(タカラバイオ社製)を使用し、反応条件は説明書記載のプロトコールに準じて行った。
(4)GLD遺伝子のクローニング
 (3)で取得したcDNAライブラリーを鋳型とし、GLD遺伝子取得用プライマー対を用いてPCRを行った。その結果、GLD遺伝子の内部配列と思われるPCR産物が確認された。前記PCR産物を精製し、DNA Ligation Kit(タカラバイオ社製)を用いて、T-vector PMD20(タカラバイオ社製)にライゲーションした。
 得られたプラスミドベクターを用い、公知の方法で大腸菌JM109コンピテントセル(タカラバイオ社製)を形質転換した。得られた形質転換体からNucleoSpin Plasmid QuickPure(タカラバイオ社製)を用いてプラスミドベクターを抽出・精製し、インサートの塩基配列を決定した。決定した塩基配列を基に、GLD遺伝子の上流及び下流配列を解明するためのプライマーを設計した。これらのプライマーを用いて5’RACE法及び3’RACE法によって、開始コドンから終止コドンまでの全長GLD遺伝子1758塩基を解明した。該遺伝子配列を配列番号1に示した。
(5)野生型グルコース脱水素酵素(GLD)遺伝子を含むプラスミドベクターの調製
 公知文献1(Aspergillus属の異種遺伝子発現系、峰時俊貴、化学と生物、38、12、831-838、2000)に記載してあるアスペルギルス・オリゼ由来のアミラーゼ系の改良プロモーターを使用してプラスミドベクターを調製した。最終的に、本プロモーターの下流に配列番号1に記載のGLD遺伝子を結合させて、該遺伝子が発現可能なプラスミドベクターを調製した。
[実施例2]
(部位特異的変異を導入した改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体の取得)
GLD遺伝子に変異を導入するために、下記のようなオリゴヌクレオチドをデザインし、合成した。これらの塩基配列は配列番号1に記載の塩基配列を元に決定した。
プライマーS71D :5’-ACGTGACCAGCCCCGACGGCTACGGACTGGCCTTTGG-3’(配列番号4)
プライマーG72A :5’-CAGCCCCTCTGCCTACGGACTGGCCTTTGGTACCG-3’(配列番号5)
プライマーQ169C :5’-ACCTACATCCCTGAGTGCCACGGTACCTCTGGTCCTCTC-3’(配列番号6)
プライマーG183K :5’-GTCGGCTGGAAGTCCAAGGGTGTCGAGAAGTCCTTCGTC-3’(配列番号7)
プライマーS188V :5’-GGCGGTGTCGAGAAGGTTTTCGTCGACGTCTTGAACCAG-3’(配列番号8)
プライマーG210C :5’-CTGAAGGACATTGCTTGCGGAGACATGGTCGGCTGGAAC-3’(配列番号9)
プライマーA221Y :5’-CTGGAACATCTACCCCTACACCCTGGACACTGCTCTTC-3’(配列番号10)
プライマーS269V :5’-GCTGAGGCCACCGCCGTTGGAGTTCTCGTCAAGGACAAG-3’(配列番号11)
プライマーN346K :5’-CAGACCAGCTCCAAGAAATTCACCGGTGTCACCACCTTC-3’(配列番号12)
プライマーS427V :5’-ACCCCTGCCGGTTCTGTTTTCTCCACCGAGTACTGGGCC-3’(配列番号13)
プライマーS429V :5’-GCCGGTTCTTCCTTCGTTACCGAGTACTGGGCCCTCCTG-3’(配列番号14)
プライマーF521W :5’-GAACTACCGCTCCAACTGGCACCCCGTCGGCACCAC-3’(配列番号15)
プライマーF521Y :5’-AACTACCGCTCCAACTATCACCCCGTCGGCACCACCGCC-3’(配列番号16)
プライマーV567A :5’-TTTGCGGCCACCTTGCCTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号17)
プライマーV567G :5’-GTTTGCGGCCACCTTGGGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号18)
プライマーV567M :5’-GTTTGCGGCCACCTTATGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号19)
プライマーV567Q :5’-GTTTGCGGCCACCTTCAGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号20)
プライマーV567S :5’-GTTTGCGGCCACCTTAGCTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号21)
プライマーV567T :5’-GTTTGCGGCCACCTTACGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号22)
プライマーV567C :5’-GTTTGCGGCCACCTTTGTTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号23)
 実施例1で取得した野生型GLD遺伝子(配列番号1)を含むプラスミドと、実施例2で合成したプライマー、及びプライマーと相補的なオリゴヌレオチドを用い、QuikChangeII Site-Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE社製)を用いて、キットに添付されている実験手順に従って変異導入したプラスミドを取得した。作製したプラスミドを用いて、大腸菌JM109株(タカラバイオ社製)を形質転換した後、得られた形質転換体を培養して、集菌した菌体からillustra plasmidPrep Midi Flow Kit(GEヘルスケア社製)を用いてプラスミドを抽出した。
 抽出したプラスミドを用いて、公知文献2(Biosci.Biotech.Biochem.,61(8),1367-1369,1997)及び公知文献3(清酒用麹菌の遺伝子操作技術、五味勝也、醸協、494-502、2000)に記載の方法に準じて、各改変GLDを生産する組換えカビ(アスペルギルス・オリゼ)を作製した。得られた組換え株をCzapek-Dox固体培地で純化した。使用する宿主としては、アスペルギルス・オリゼNS4株を使用した。本菌株は、独立行政法人酒類総合研究所で分譲されているものが入手可能である。
 最終的に、野生型GLDを産生する形質転換体(カビ)と、S71D、N346K、S429V、F521W、V567A、V567C、V567G、V567M、V567Q、V567S、V567T、Q169C+G210C、G183K+V567A、S71D+V567C、G72A+V567C、A221Y+V567C、S269V+V567C、F521W+V567C、G72A+S188V+V567C、G72A+A221Y+V567C、G72A+S427V+V567C、G72A+F521W+V567C、G72A+F521Y+V567C、G72A+Q169C+G210C、Q169C+G210C+V567C、Q169C+G210C+F521W、Q169C+G210C+F521Y、S188V+F521W+V567C、A221Y+F521W+V567C又はS71D+G72A+F521W+V567Cのアミノ酸置換を有する各改変型GLDを産生する形質転換体(カビ)が得られた。
[実施例3]
(各改変型GLDの熱安定性評価)
 パインデックス2%(松谷化学工業社製)(w/v)、トリプトン1%(BD社製)(w/v)、リン酸二水素カリウム0.5%(和光純薬工業社製)(w/v)、硫酸マグネシウム七水和物0.05%(w/v)(ナカライテスク社製)及び水からなる液体培地10mLを太試験管(22mm×200mm)に入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、実施例2で取得した各形質転換体を植菌し、30℃で4日間振とう培養した。培養終了後、遠心して上清を回収し、前述のGLD活性測定法に準じ、プレートリーダーを用いてGLD活性を測定したところ、GLD活性が確認できた。
 得られた各培養上清を約6.6U/mLになるように希釈した後、終濃度0.1Mになるように1Mリン酸緩衝液(pH6.0)を添加した。該各試料を45℃、30分処理し、処理前と処理後のサンプルについて各々前述のGLD活性測定法で酵素活性を測定した。処理前の活性値に対する処理後の活性値の比を各々残存活性(%)として算出し、さらに野生型GLDの残存活性に対する各改変型GLDの残存活性の割合(%)を算出し、表2~6に示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
 上記より、0.1Mリン酸緩衝液(pH6.0)中で45℃、30分間処理した前後の残存活性について、上記改変型GLDは何れも、野生型GLDより高い残存活性を有することが分かった。つまり、野生型GLDと比較して、上記の改変型GLDは何れも熱安定性が向上していた。詳細には、野生型の残存活性(%)を100とした場合に、改変型V567Q及びV567Mは100より大きく、改変型S71D、N346K、S429V、F521W及びG183K+V567Aは110以上、改変型V567Tは120以上、改変型S71D+V567C、A221Y+V567C、S269V+V567C、G72A+S427V+V567C、G72A+F521Y+V567C、Q169C+G210C+F521W及びS71D+G72A+F521W+V567Cは140以上、改変型V567C、V567G、V567S、G72A+V567C、G72A+S188V+V567C、G72A+Q169C+G210C、G72A+F521W+V567C及びS188V+F521W+V567Cは150以上、改変型V567A、F521W+V567C、A221Y+F521W+V567C及びQ169C+G210C+F521Yは160以上、改変型Q169C+G210C、G72A+A221Y+V567C、Q169C+G210C+V567Cは170以上だった。
 本発明により、熱安定性に優れた改変型グルコース脱水素酵素を利用することが可能になった。更に、本発明の改変型グルコース脱水素酵素は効率的に製造することが出来、加熱工程を含むバイオセンサを安定して製造することが可能になった。

Claims (11)

  1.  以下のa)~c)の何れかのアミノ酸配列において、
    a)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列、
    b)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28に示されるアミノ酸配列において1~数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列、又は
    c)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の類似性を有するアミノ酸配列、
     配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列から成る、
     改変型グルコース脱水素酵素。
  2.  請求項1に記載のa)~c)の何れかのアミノ酸配列において、
     S71に対応する位置のアミノ酸がセリン、グリシンもしくはアスパラギンであり、G72に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、Q169に対応する位置のアミノ酸がグルタミン、チロシンもしくはフェニルアラニンであり、G183に対応する位置のアミノ酸がグリシンもしくはアスパラギンであり、S188に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、G210に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、A221に対応する位置のアミノ酸がアラニンもしくはセリンであり、S269に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、N346に対応する位置のアミノ酸がアスパラギンもしくはアラニンであり、S427に対応する位置のアミノ酸がセリンもしくはアラニンであり、S429に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、F521に対応する位置のアミノ酸がフェニルアラニンであり、又はV567に対応する位置のアミノ酸がバリンであるアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含む、
     請求項1記載の改変型グルコース脱水素酵素。
  3.  配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換が、
     S71に対応する位置のアミノ酸がアスパラギン酸に、G72に対応する位置のアミノ酸がアラニンに、Q169に対応する位置のアミノ酸がシステインに、G183に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S188に対応する位置のアミノ酸がバリンに、G210に対応する位置のアミノ酸がシステインに、A221に対応する位置のアミノ酸がチロシンに、S269に対応する位置のアミノ酸がバリンに、N346に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S427に対応する位置のアミノ酸がバリンに、S429に対応する位置のアミノ酸がバリンに、F521に対応する位置のアミノ酸がトリプトファンもしくはチロシンに、又はV567に対応する位置のアミノ酸がアラニン、システイン、グリシン、メチオニン、グルタミン、セリンもしくはスレオニンに置換されたものである、
     請求項1又は2記載の改変型グルコース脱水素酵素。
  4.  0.1Mリン酸緩衝液(pH6.0)中で45℃、30分間処理後の残存活性について、野生型酵素より高い残存活性を有する、請求項1~3の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素。
  5.  請求項1~4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素をコードするポリヌクレオチド。
  6.  請求項5記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
  7.  請求項6記載のベクターを用いて形質転換された形質転換細胞。
  8.  請求項7の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型グルコース脱水素酵素を採取することを特徴とする、改変型グルコース脱水素酵素の製造方法。
  9.  請求項1~4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素を使用するグルコース測定方法。
  10.  請求項1~4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定試薬組成物。
  11.  請求項1~4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定用バイオセンサ。
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