JP7421801B2 - フラビン結合型グルコース脱水素酵素 - Google Patents
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Description
[1]以下の(a)、(b)又は(c)のアミノ酸配列を有し、かつグルコース脱水素酵素活性を有するタンパク質:
(a)配列番号3、6、15又は16に示されるアミノ酸配列;
(b)配列番号3、6、15又は16に示されるアミノ酸配列において1~3個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列;
(c)配列番号3もしくは15に示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性、又は配列番号6もしくは16に示されるアミノ酸配列と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列。
[2][1]に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
[3][2]に記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
[4][2]に記載のポリヌクレオチドを含む形質転換細胞。
[5][4]に記載の細胞を培養し、培養物からフラビン結合型グルコース脱水素酵素を採取することを特徴とするフラビン結合型グルコース脱水素酵素の製造方法。
[6][5]記載の製造方法によって得られたフラビン結合型グルコース脱水素酵素。
[7][1]又は[6]記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素を使用する、グルコースの測定方法。
[8][1]又は[6]記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素を含む、グルコース測定試薬組成物。
[9][1]又は[6]記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素を含む、グルコース測定用バイオセンサ。
(a)配列番号3、6、15又は16に示されるアミノ酸配列。
(b)配列番号3、6、15又は16に示されるアミノ酸配列において1~3個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列。
(c)配列番号3もしくは15に示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の同一性、又は配列番号6もしくは16に示されるアミノ酸配列と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列。
該酵素は、好ましくは(a)、(b)又は(c)のアミノ酸配列からなり、かつグルコース脱水素酵素活性を有するタンパク質である。
(1)作用:電子受容体存在下で、グルコースを酸化する反応を触媒する酵素である。
(2)可溶性である。
(3)酸素を実質的に電子受容体としない。
(i)前記(a)、(b)又は(c)に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド。
(ii)配列番号1、2、4又は5に示される塩基配列を有するポリヌクレオチド。
(iii)配列番号1、2、4又は5に示される塩基配列において3、6又は9個の塩基が欠失又は付加されたポリヌクレオチド。又は配列番号1、2、4又は5に示される塩基配列において1~10個、好ましくは多くとも9個、8個、6個、5個、4個、3個もしくは2個の塩基が置換された塩基配列を有するポリヌクレオチド。
(iv)配列番号1、2、4又は5に示される塩基配列と同一性を有する塩基配列を有するポリヌクレオチド。
前記同一性は、少なくとも90%、92%又は95%が好ましく、少なくとも97%、98%又は99%がより好ましい。
100mMリン酸カリウム緩衝液(pH6.0)1.00mL、1M D-グルコース溶液1.00mL、3mM 2,6-ジクロロフェノールインドフェノール(以下DCIPという)0.14mL及び3mM 1-メトキシ-5-メチルフェナジウムメチルサルフェイト0.20mL及び超純水0.61mLを混合し、37℃で10分間保温後、酵素溶液0.05mLを添加し、反応を開始した。反応開始時から5分間、酵素反応の進行に伴う600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量(ΔA600)を測定し、直線部分から次式に従い酵素活性を算出した。この際、酵素活性は、37℃、pH6.0で1分間に1μmolのDCIPを還元する酵素量を1Uと定義した。
尚、式中の3.0は反応試薬+酵素溶液の液量(mL)、10.8はpH6.0におけるDCIPのモル吸光係数、1.0はセルの光路長(cm)、0.05は酵素溶液の液量(mL)、ΔA600blankは酵素の希釈溶液を酵素溶液の代わりに添加して反応開始した場合の600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量を表す。
(フラビン結合型グルコース脱水素酵素(GLD)のクローニング)
GLD生産菌の探索を行った結果、Zygorhynchus exponens Burgeff var.exponens NBRC100517及びHyphomucor sp.RD055426の培養上清にGLD活性が確認できた。Z.exponens Burgeff var.exponens NBRC100517由来GLDをZeGLD、H.sp.RD055426由来GLDをHsGLDとする。
パインデックス(松谷化学工業社製)4%(w/v)、脱脂大豆(昭和産業社製)1%(w/v)、コーンスティープリカー(サンエイ糖化社製)1%(w/v)、リン酸二水素カリウム(ナカライテスク社製)0.5%(w/v)、硫酸マグネシウム七水和物(ナカライテスク社製)0.05%(w/v)及び水からなる液体培地をpH6.0に調整し、各10mLを2本の太試験管に入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、前記GLD生産菌を各々接種し、25℃で72時間振とう培養した後、さらしを用いて、各湿菌体を回収した。
(1)で取得した湿菌体各200mgを-80℃で凍結した後、バイオマッシャーII(ニッピ社製)中で、200mM Tris‐HCl(pH8.0)、50mM EDTA、200mM NaCl、1% N-lauroyl sarcosine sodium saltからなるBufferを0.5 mL添加し、菌体破砕をおこなった。菌体破砕後は破砕液上清に対し、フェノール・クロロホルム処理、エタノール沈殿を行い、各ゲノムDNAを取得した。
(2)で取得した各ゲノムDNAを鋳型とし、GLD遺伝子取得用プライマー対を用いてそれぞれPCRを行った。その結果、各GLD遺伝子の内部配列と思われるPCR産物が確認された。尚、前記プライマー対は、本発明者らが、種々のGLD遺伝子取得用に設計したプライマーである。前記各PCR産物を精製し、DNA Ligation Kit(タカラバイオ社製)を用いて、T-vector pMD20(タカラバイオ社製)にライゲーションした。
(1)で取得した各湿菌体200mgを-80℃で凍結した後、ISOGENII(ニッポンジーン社製)を用いて各100μgの全RNAを抽出した。
(4)で取得した各全RNAから、逆転写酵素およびアダプター配列付きオリゴdTプライマーを用いた逆転写反応により各cDNAライブラリーを調製した。反応試薬は、SMARTer RACE cDNA Amplification kit(タカラバイオ社製)を使用し、反応条件は説明書記載のプロトコールに準じて行った。
公知文献1(Aspergillus属の異種遺伝子発現系、峰時俊貴、化学と生物、38、12、831-838、2000)に記載してあるアスペルギルス・オリゼ由来のアミラーゼ系の改良プロモーターを使用してプラスミドベクターを調製した。最初に、(5)で取得したcDNAライブラリーを鋳型とし、各GLD遺伝子を含むPCR産物をそれぞれ取得した。ZeGLD遺伝子を含むPCR産物の取得には下記のF6309-Ori(配列番号7)及びF6309-R-1st(配列番号8)のプライマー対を使用した。またHsGLD遺伝子を含むPCR産物の取得には、下記のF6292-Ori(配列番号10)及びF6292-R-1st(配列番号11)のプライマー対を使用した。次に、前記PCR産物を鋳型とし、ベクター挿入用のZeGLD遺伝子、及びHsGLD遺伝子を調製した。ZeGLD遺伝子の調製には下記のF6309-Ori(配列番号7)及びF6309-R-2nd(配列番号9)のプライマー対を、HsGLD遺伝子の調製には下記のF6292-Ori(配列番号10)及びF6292-R-2nd(配列番号12)のプライマー対を使用した。
5’-(CCGCAGCTCGTCAAA)ATGAAGATCTCTGCTGCTATCG-3’
(括弧内:転写増強因子)
F6309-R-1st(配列番号8):
5’-((GTTCATTTA))AAGATTATTTTGCTTCT-3’
(二重括弧内:pSENSベクター配列)
F6309-R-2nd(配列番号9):
5’-((GTTACGCTTCTAGAGCATGCGTTCATTTA))AAGATTATTTTGCTT-3’
(二重括弧内:pSENSベクター配列、下線部:制限酵素部位(SphI))
F6292-Ori(配列番号10):
5’-(CCGCAGCTCGTCAAA)ATGAAAATCTCTGCTGCTATTG-3’
(括弧内:転写増強因子)
F6292-R-1st(配列番号11):
5’-((GTTCATTTA))GTGCTTTTTGTAAGTAGAC-3’
(二重括弧内:pSENSベクター配列)
F6292-R-2nd(配列番号12):
5’-((GTTACGCTTCTAGAGCATGCGTTCATTTA))GTGCTTTTTG-3’
(二重括弧内:pSENSベクター配列、下線部:制限酵素部位(SphI))
(6)で抽出した各プラスミドベクターを用いて、公知文献2(Biosci.Biotech.Biochem.,61(8),1367-1369,1997)及び公知文献3(清酒用麹菌の遺伝子操作技術、五味勝也、醸協、494-502、2000)に記載の方法に準じて、各GLDを生産する組換えカビ(アスペルギルス・オリゼ)をそれぞれ作製した。得られた各組換え株をCzapek-Dox固体培地で純化し、ZeGLD生産組換えカビ及びHsGLD生産組換えカビを取得した。使用する宿主としては、アスペルギルス・オリゼNS4株を使用した。本菌株は、独立行政法人酒類総合研究所で分譲されているものが入手可能である。
パインデックス4%(w/v)、脱脂大豆1%(w/v)、コーンスティープリカー1%(w/v)、リン酸二水素カリウム0.5%(w/v)、硫酸マグネシウム七水和物0.05%(w/v)及び水からなる液体培地をpH7.0に調整し、各10mLを2本の太試験管(22mm×200mm)に入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、(7)で取得した各組換えカビを植菌し、30℃で72時間振とう培養した。培養終了後、遠心して各上清を回収し、前述のGLD活性測定法でGLD活性を測定したところ、何れも本発明のGLD活性が確認できた。
シグナル予測プログラムSignalP4.1を用いて、配列番号6に記載のHsGLDアミノ酸配列におけるシグナル配列を予測した結果、1~20番目のアミノ酸がシグナル配列と予測された。予測シグナル配列を除いた配列番号16記載のアミノ酸配列をコードする遺伝子を増幅できるようにプライマー(配列番号13及び14)を設計し、(5)で取得したcDNAを鋳型にPCRを行った。得られたPCR産物を分泌型プラスミドベクターpGAPZα(ThermoFisher Scientific社製)に導入し、プラスミドベクターpGAPZα/HsGLDを取得した。該プラスミドベクターを大腸菌JM109株に導入して形質転換した。得られた形質転換体よりプラスミドを抽出し、該プラスミドベクター中のインサートの配列解析を行ったところ、HsGLD遺伝子である配列番号4記載の61番目以降のDNA配列(1848bp)を含む塩基配列が確認できた。
5’-(GCTGAAGCTGAATTC)CAATCACAAGGTACTACTAG-3’
(括弧内:pGAPZαベクター配列)
F6292-PP―R(配列番号14):
5’-(GAGTTTTTGTTCTAGA)TTAGTGCTTTTTGTAAGTAG-3’
(括弧内:pGAPZαベクター配列)
(9)で抽出したプラスミドベクター(pGAPZα/HsGLD)を酵母Pichia pastoris KM71Hに導入して形質転換した。導入は、公知文献(pGAPZ A,B,and C,pGAPZα A,B,and C、Thermo Fisher Scientific、Rev.Date:28 June 2010、Manual Part No.25-0174)に記載の条件に従って実施し、HsGLD生産組換え酵母を作成した。
イーストエクストラクト(BD社製)1.0%、ハイポリペプトン(日本製薬社製)2.0%、100mM リン酸カリウム緩衝液(pH6.0)、Yeast Nitrogen Base without Aminoacids(Sigma社製)1.34%、(+)‐ビオチン(和光純薬社製)0.00004%、グリセロール(ナカライテスク社製)1.0%からなるBMGY培地150mLを含む500mL容の坂口フラスコに入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、(10)で取得した組換え酵母を植菌し、30℃、120rpmで72時間振とう培養した。培養終了後、遠心して上清を回収し、前述のGLD活性測定法に準じ、プレートリーダー(モレキュラーデバイス社製)を用いてGLD活性を測定した結果、GLD活性が確認できた。
(フラビン結合型グルコース脱水素酵素(GLD)の取得)
(1)ZeGLD
実施例1の(8)に記載の液体培地150mLを500mL容の坂口フラスコに入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、実施例1の(7)で取得したZeGLD生産組換えカビを植菌し、30℃で72時間振とう培養して種培養液とした。前記と同様の培地組成にクロラムフェニコール(ナカライテスク社製)0.005%(w/v)及び消泡剤を添加した培地3.5Lを5L容ジャーファーメンターに入れ、121℃、30分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、前記種培養液を100mL植菌し、30℃、400rpm、1v/v/mで96時間培養した。培養終了後、培養液をろ布でろ過し、回収したろ液を遠心して上清を回収し、更にメンブレンフィルター(10μm、アドバンテック社製)でろ過して粗酵素液を回収した。
実施例1の(11)に記載の方法で培養した培養上清を、分画分子量10,000の限外ろ過膜(ザルトリウス社製)を用いて、低分子成分を除去すると共に濃縮し、HsGLDサンプルとした。
(本発明のGLDの酵素化学的性質の検討)
実施例2で得られたZeGLD及びHsGLDの諸性質を調べた。
(1)吸収スペクトルの測定
ZeGLD及びHsGLDについて、D-グルコース添加前後の300-600nmにおける吸収スペクトルをプレートリーダー(SpectraMax Plus384、モレキュラーデバイス社製)を用いて測定した。その結果、何れのGLDも、波長360-380nm付近及び波長450-460nm付近に認められた吸収極大が、D-グルコース添加により消失したことから、本発明のGLDはフラビン結合型タンパク質であることが明らかになった。
1Mリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)0.2mL、1M D-グルコース2.0mL、25mM 4-アミノアンチピリン0.2mL、420mMフェノール0.2mL、1mg/mLペルオキシダーゼ0.2mL及び超純水0.2mLを混合し、混合液0.1mLを96穴プレートに入れ、25℃で5分間保温した。ZeGLD又はHsGLDを0.1mL添加し、反応を開始した。反応開始時から5分間、酵素反応の進行に伴う500nmにおける吸光度変化を前記プレートリーダーで測定し、GOD活性を調べた。尚、コントロールは、GLDの代わりに水を添加して反応を開始した。その結果、ZeGLD及びHsGLDは、何れもコントロールと同様に吸光度変化は見られなかった。
前記GLD活性測定法に準じ、基質に終濃度50mMのD-グルコース又はマルトースをそれぞれ用いて、各基質に対するZeGLD又はHsGLDの活性を測定した。D-グルコースに対する活性を100%とした場合のマルトースに対する活性を表1に示す。
(吸光度計によるグルコースの測定)
実施例2で得られたZeGLD及びHsGLDを用いて、前記GLD活性測定法に準じ、0、1、2、5、10、20、50又は100mM D-グルコースにおける、吸光度変化を測定した。各グルコース濃度における相対活性値を図1に示す。その結果、吸光度計を用いたD-グルコース測定において、D-グルコースの濃度依存的に活性の増加が見られたことから、本発明のGLDを用いてD-グルコースの定量が可能であることが示された。
Claims (8)
- 以下の(a)、(b)又は(c)のアミノ酸配列からなり、グルコース脱水素酵素活性を有し、かつ酸素を電子受容体としないフラビン結合型グルコース脱水素酵素:
(a)配列番号3もしくは15に示されるZygorhynchus exponens由来のアミノ酸配列、又は配列番号6もしくは16に示されるHyphomucor sp.由来のアミノ酸配列;
(b)配列番号3もしくは15に示されるZygorhynchus exponens由来のアミノ酸配列、又は配列番号6もしくは16に示されるHyphomucor sp.由来のアミノ酸配列において1~3個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列;
(c)配列番号3もしくは15に示されるZygorhynchus exponens由来のアミノ酸配列と少なくとも98%の同一性、又は配列番号6もしくは16に示されるHyphomucor sp.由来のアミノ酸配列と少なくとも98%の同一性を有するアミノ酸配列。 - 請求項1に記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項2に記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
- 請求項2に記載のポリヌクレオチドを含む形質転換細胞。
- 請求項4に記載の細胞を培養し、培養物からフラビン結合型グルコース脱水素酵素を採取することを特徴とするフラビン結合型グルコース脱水素酵素の製造方法。
- 請求項1記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素を使用する、グルコースの測定方法。
- 請求項1記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素を含む、グルコース測定試薬組成物。
- 請求項1記載のフラビン結合型グルコース脱水素酵素を含む、グルコース測定用バイオセンサ。
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