JP2019000020A - 改変型グルコース脱水素酵素 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】 野生型のグルコース脱水素酵素等のタンパク質を構成する一部のアミノ酸を改変することにより得られる、熱安定性が高いという優れた特性を有する改変型グルコース脱水素酵素、該酵素をコードするポリヌクレオチド、該酵素の製造方法、該酵素を用いたグルコースの測定方法、測定試薬組成物及びバイオセンサ、並びに、該測定試薬組成物及びバイオセンサの製造方法等。
【選択図】図1
Description
以下のa)〜c)の何れかのアミノ酸配列において、
a)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列、
b)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは26に示されるアミノ酸配列において1〜数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列、又は
c)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の類似性を有するアミノ酸配列、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列から成る、
改変型グルコース脱水素酵素。
[態様2]
態様1に記載のa)〜c)の何れかのアミノ酸配列において、
S71に対応する位置のアミノ酸がセリン、グリシンもしくはアスパラギンであり、G72に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、Q169に対応する位置のアミノ酸がグルタミン、チロシンもしくはフェニルアラニンであり、G183に対応する位置のアミノ酸がグリシンもしくはアスパラギンであり、S188に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、G210に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、A221に対応する位置のアミノ酸がアラニンもしくはセリンであり、S269に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、N346に対応する位置のアミノ酸がアスパラギンもしくはアラニンであり、S427に対応する位置のアミノ酸がセリンもしくはアラニンであり、S429に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、F521に対応する位置のアミノ酸がフェニルアラニンであり、又はV567に対応する位置のアミノ酸がバリンであるアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含む、
態様1記載の改変型グルコース脱水素酵素。
[態様3]
配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換が、
S71に対応する位置のアミノ酸がアスパラギン酸に、G72に対応する位置のアミノ酸がアラニンに、Q169に対応する位置のアミノ酸がシステインに、G183に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S188に対応する位置のアミノ酸がバリンに、G210に対応する位置のアミノ酸がシステインに、A221に対応する位置のアミノ酸がチロシンに、S269に対応する位置のアミノ酸がバリンに、N346に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S427に対応する位置のアミノ酸がバリンに、S429に対応する位置のアミノ酸がバリンに、F521に対応する位置のアミノ酸がトリプトファンもしくはチロシンに、又はV567に対応する位置のアミノ酸がアラニン、システイン、グリシン、メチオニン、グルタミン、セリンもしくはスレオニンに置換されたものである、
態様1又は2記載の改変型グルコース脱水素酵素。
[態様4]
0.1Mリン酸緩衝液(pH6.0)中で45℃、30分間処理後の残存活性について、野生型酵素より高い残存活性を有する、態様1〜3の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素。
[態様5]
態様1〜4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素をコードするポリヌクレオチド。
[態様6]
態様5記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
[態様7]
態様6記載のベクターを用いて形質転換された形質転換細胞。
[態様8]
態様7の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型グルコース脱水素酵素を採取することを特徴とする、改変型グルコース脱水素酵素の製造方法。
[態様9]
態様1〜4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素を使用するグルコース測定方法。
[態様10]
態様1〜4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定試薬組成物。
[態様11]
態様1〜4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定用バイオセンサ。
(a)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列、
(b)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列
又は
(c)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列と相同性を有するアミノ酸配列、
において、配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列を有するタンパク質である。
同一性は、GENETYX(株式会社ゼネティックス製)のアミノ酸配列同士のホモロジー解析により算出されたidentityの値に基づく。
100mM リン酸カリウム緩衝液(pH6.0)1.00mL、1M D−グルコース溶液1.00mL、3mM 2,6−ジクロロフェノールインドフェノール(以下DCIPという)0.14mL及び3mM 1−メトキシ−5−メチルフェナジウムメチルサルフェイト0.20mL及び超純水0.61mLを混合し、37℃で10分間保温後、酵素溶液0.05mLを添加し、反応を開始した。反応開始時から5分間、酵素反応の進行に伴う600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量(ΔA600)を測定し、直線部分から次式に従い酵素活性を算出した。この際、酵素活性は、37℃、pH6.0で1分間に1μmolのDCIPを還元する酵素量を1Uと定義した。
尚、式中の3.0は反応試薬+酵素溶液の液量(mL)、10.8はpH6.0におけるDCIPのモル吸光係数、1.0はセルの光路長(cm)、0.05は酵素溶液の液量(mL)、ΔA600blankは酵素の希釈溶液を酵素溶液の代わりに添加して反応開始した場合の600nmにおける吸光度の1分間あたりの減少量を表す。
(フラビン結合型野生型グルコース脱水素酵素(GLD)の取得)
GLD生産菌の探索を行った結果、Glomerella fructigena NBRC5951の培養上清にGLD活性が確認できた。
パインデックス(松谷化学工業社製)4%(w/v)、脱脂大豆(昭和産業社製)1%(w/v)、コーンスティープリカー(サンエイ糖化社製)1%(w/v)、リン酸二水素カリウム(ナカライテスク社製)0.5%(w/v)、硫酸マグネシウム七水和物(ナカライテスク社製)0.05%(w/v)及び水からなる液体培地をpH6.0に調整し、10mLを太試験管に入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、前記GLD生産菌を接種し、25℃で72時間振とう培養した後、さらしを用いて、湿菌体を回収した。
(1)で取得した湿菌体200mgを−80℃で凍結した後、ISOGENII(ニッポンジーン社製)を用いて100μgの全RNAを抽出した。
(2)で取得したRNAから、逆転写酵素およびアダプター配列付きオリゴdTプライマーを用いた逆転写反応によりcDNAライブラリーを調製した。反応試薬は、SMARTer RACE cDNA Amplification kit(タカラバイオ社製)を使用し、反応条件は説明書記載のプロトコールに準じて行った。
(3)で取得したcDNAライブラリーを鋳型とし、GLD遺伝子取得用プライマー対を用いてPCRを行った。その結果、GLD遺伝子の内部配列と思われるPCR産物が確認された。前記PCR産物を精製し、DNA Ligation Kit(タカラバイオ社製)を用いて、T−vector PMD20(タカラバイオ社製)にライゲーションした。
公知文献1(Aspergillus属の異種遺伝子発現系、峰時俊貴、化学と生物、38、12、831−838、2000)に記載してあるアスペルギルス・オリゼ由来のアミラーゼ系の改良プロモーターを使用してプラスミドベクターを調製した。最終的に、本プロモーターの下流に配列番号1に記載のGLD遺伝子を結合させて、該遺伝子が発現可能なプラスミドベクターを調製した。
(部位特異的変異を導入した改変型GLD遺伝子を持つ形質転換体の取得)
GLD遺伝子に変異を導入するために、下記のようなオリゴヌクレオチドをデザインし、合成した。これらの塩基配列は配列番号1に記載の塩基配列を元に決定した。
プライマーG72A :5’-CAGCCCCTCTGCCTACGGACTGGCCTTTGGTACCG-3’(配列番号5)
プライマーQ169C :5’-ACCTACATCCCTGAGTGCCACGGTACCTCTGGTCCTCTC-3’(配列番号6)
プライマーG183K :5’-GTCGGCTGGAAGTCCAAGGGTGTCGAGAAGTCCTTCGTC-3’(配列番号7)
プライマーS188V :5’-GGCGGTGTCGAGAAGGTTTTCGTCGACGTCTTGAACCAG-3’(配列番号8)
プライマーG210C :5’-CTGAAGGACATTGCTTGCGGAGACATGGTCGGCTGGAAC-3’(配列番号9)
プライマーA221Y :5’-CTGGAACATCTACCCCTACACCCTGGACACTGCTCTTC-3’(配列番号10)
プライマーS269V :5’-GCTGAGGCCACCGCCGTTGGAGTTCTCGTCAAGGACAAG-3’(配列番号11)
プライマーN346K :5’-CAGACCAGCTCCAAGAAATTCACCGGTGTCACCACCTTC-3’(配列番号12)
プライマーS427V :5’-ACCCCTGCCGGTTCTGTTTTCTCCACCGAGTACTGGGCC-3’(配列番号13)
プライマーS429V :5’-GCCGGTTCTTCCTTCGTTACCGAGTACTGGGCCCTCCTG-3’(配列番号14)
プライマーF521W :5’-GAACTACCGCTCCAACTGGCACCCCGTCGGCACCAC-3’(配列番号15)
プライマーF521Y :5’-AACTACCGCTCCAACTATCACCCCGTCGGCACCACCGCC-3’(配列番号16)
プライマーV567A :5’-TTTGCGGCCACCTTGCCTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号17)
プライマーV567G :5’-GTTTGCGGCCACCTTGGGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号18)
プライマーV567M :5’-GTTTGCGGCCACCTTATGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号19)
プライマーV567Q :5’-GTTTGCGGCCACCTTCAGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号20)
プライマーV567S :5’-GTTTGCGGCCACCTTAGCTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号21)
プライマーV567T :5’-GTTTGCGGCCACCTTACGTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号22)
プライマーV567C :5’-GTTTGCGGCCACCTTTGTTCCACTCTCTACGCCATTGCC-3’(配列番号23)
(各改変型GLDの熱安定性評価)
パインデックス2%(松谷化学工業社製)(w/v)、トリプトン1%(BD社製)(w/v)、リン酸二水素カリウム0.5%(和光純薬工業社製)(w/v)、硫酸マグネシウム七水和物0.05%(w/v)(ナカライテスク社製)及び水からなる液体培地10mLを太試験管(22mm×200mm)に入れ、121℃、20分間オートクレーブした。冷却した液体培地に、実施例2で取得した各形質転換体を植菌し、30℃で4日間振とう培養した。培養終了後、遠心して上清を回収し、前述のGLD活性測定法に準じ、プレートリーダーを用いてGLD活性を測定したところ、GLD活性が確認できた。
Claims (11)
- 以下のa)〜c)の何れかのアミノ酸配列において、
a)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列、
b)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28に示されるアミノ酸配列において1〜数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列、又は
c)配列番号2、3、24、25、26、27もしくは28で示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の類似性を有するアミノ酸配列、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含むアミノ酸配列から成る、
改変型グルコース脱水素酵素。 - 請求項1に記載のa)〜c)の何れかのアミノ酸配列において、
S71に対応する位置のアミノ酸がセリン、グリシンもしくはアスパラギンであり、G72に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、Q169に対応する位置のアミノ酸がグルタミン、チロシンもしくはフェニルアラニンであり、G183に対応する位置のアミノ酸がグリシンもしくはアスパラギンであり、S188に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、G210に対応する位置のアミノ酸がグリシンであり、A221に対応する位置のアミノ酸がアラニンもしくはセリンであり、S269に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、N346に対応する位置のアミノ酸がアスパラギンもしくはアラニンであり、S427に対応する位置のアミノ酸がセリンもしくはアラニンであり、S429に対応する位置のアミノ酸がセリンであり、F521に対応する位置のアミノ酸がフェニルアラニンであり、又はV567に対応する位置のアミノ酸がバリンであるアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換を含む、
請求項1記載の改変型グルコース脱水素酵素。 - 配列番号2で示されるアミノ酸配列のS71、G72、Q169、G183、S188、G210、A221、S269、N346、S427、S429、F521又はV567に対応する位置のアミノ酸のうち、少なくとも1つのアミノ酸置換が、
S71に対応する位置のアミノ酸がアスパラギン酸に、G72に対応する位置のアミノ酸がアラニンに、Q169に対応する位置のアミノ酸がシステインに、G183に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S188に対応する位置のアミノ酸がバリンに、G210に対応する位置のアミノ酸がシステインに、A221に対応する位置のアミノ酸がチロシンに、S269に対応する位置のアミノ酸がバリンに、N346に対応する位置のアミノ酸がリジンに、S427に対応する位置のアミノ酸がバリンに、S429に対応する位置のアミノ酸がバリンに、F521に対応する位置のアミノ酸がトリプトファンもしくはチロシンに、又はV567に対応する位置のアミノ酸がアラニン、システイン、グリシン、メチオニン、グルタミン、セリンもしくはスレオニンに置換されたものである、
請求項1又は2記載の改変型グルコース脱水素酵素。 - 0.1Mリン酸緩衝液(pH6.0)中で45℃、30分間処理後の残存活性について、野生型酵素より高い残存活性を有する、請求項1〜3の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素。
- 請求項1〜4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項5記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
- 請求項6記載のベクターを用いて形質転換された形質転換細胞。
- 請求項7の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型グルコース脱水素酵素を採取することを特徴とする、改変型グルコース脱水素酵素の製造方法。
- 請求項1〜4の何れか1項に記載の改変型グルコース脱水素酵素を使用するグルコース測定方法。
- 請求項1〜4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定試薬組成物。
- 請求項1〜4の何れかに1項記載の改変型グルコース脱水素酵素を含むグルコース測定用バイオセンサ。
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