WO2011115218A1 - フィルム型培地による微生物検査方法およびこの微生物検査方法に用いる画像取込ツ－ル - Google Patents

フィルム型培地による微生物検査方法およびこの微生物検査方法に用いる画像取込ツ－ル Download PDF

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WO2011115218A1
WO2011115218A1 PCT/JP2011/056416 JP2011056416W WO2011115218A1 WO 2011115218 A1 WO2011115218 A1 WO 2011115218A1 JP 2011056416 W JP2011056416 W JP 2011056416W WO 2011115218 A1 WO2011115218 A1 WO 2011115218A1
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WO
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image data
film
original image
type medium
correction
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Application number
PCT/JP2011/056416
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English (en)
French (fr)
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和雄 白岩
信一 和久
洋一 遠山
Original Assignee
株式会社エルメックス
有限会社ミギー
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Publication date
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    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
    • Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation

Definitions

  • the present invention relates to a microorganism inspection method using a film-type medium and an image capturing tool used in the microorganism inspection method.
  • the film-type medium comprises a base sheet, a frame formed on the base sheet, a culture layer provided in the frame, and a cover sheet that covers the culture layer. It is known to be disclosed in Patent Documents 1 to 4 listed below.
  • the culture layer is inoculated with a sample, covered with a cover sheet, incubated at a predetermined temperature for a predetermined time, and this is put into a colony counting device, and then incubated.
  • the number of colonies generated can be counted, and the number of general viable bacteria and coliform bacteria in the sample can be measured.
  • the present inventors have replaced the incubating film-type culture medium with a dedicated expensive colony counting device and analyzing it with a skilled operator, and instead of using a general-purpose inexpensive flatbed scanner or digital camera. Using this, anyone examined the microbe inspection easily and at low cost. With the widespread use of digital cameras, various products are now being offered at a very low price by various companies, and their operations are easy, so colonies can be counted just by using them on the user side. Once implemented, it can be easily introduced not only in large-scale laboratories but also in small-scale laboratories and emerging countries that do not have laboratories.
  • the problem to be solved by the present invention is that the user side uses an inexpensive and versatile flatbed scanner or digital camera, and in the case of a scanner, an image data medium is placed on an incubated film type medium.
  • a digital camera it is necessary to construct a new system that can obtain accurate colony count measurement results simply by placing a film-type medium vertically on a tripod and taking a picture. .
  • Another problem to be solved by the present invention is that it is suitably used when image data is captured by placing a film-type culture medium that has been incubated in the above system on a flatbed scanner or taking a picture with a digital camera. To provide a tool for capturing image data.
  • the present invention according to claim 1 is directed to an original image obtained by transmitting original image data of a film-type medium after incubating a specimen in a culture layer of the film-type medium by data transmission from a user.
  • the present invention according to claim 2 is the microorganism testing method according to claim 1, wherein the first correction step is specified from position information included in the original image data. And the measurement step counts the number of colonies in the image area corresponding to the culture layer of the film-type medium in the rectangle after being corrected in the first correction step. It is characterized by doing.
  • the second correction step includes a process of correcting the brightness of each pixel of the original image data, and the measurement The step is characterized in that it is determined that the pixel indicates the presence of a colony when the corrected lightness is greater than a threshold value.
  • the second correction step further includes a process of correcting the hue of each pixel of the original image data, and the measuring step Is characterized by determining the bacterial species of a colony based on the corrected hue, and counting the number of colonies for each bacterial species based on the corrected lightness.
  • the original image data is obtained from a tray on which one or a plurality of the incubated film-type mediums are mounted.
  • the image data to be drawn, the position information used for the correction process in the first correction step and the color chart and the gray scale chart used for the correction process in the second correction step are both displayed in advance on the tray. It is characterized by being.
  • the present invention according to claim 6 is the microorganism testing method using the film-type medium according to any one of claims 1 to 4, wherein the original image data includes one or more of the incubated film-type medium, the film-type medium, Is image data drawn including a chart sheet prepared as a separate body, and positional information used for correction processing in the first correction step is displayed in advance on each film-type medium, and the second The color chart and the gray scale chart used for the correction process in the correction step are preliminarily displayed on the chart sheet.
  • the original image data is image data describing one or a plurality of the incubated film-type culture media.
  • the position information used for the correction process in the first correction step and the color chart and the gray scale chart used for the correction process in the second correction step are both displayed in advance on each film type medium.
  • the original image data includes the one or more of the incubated film-type medium and the first correction.
  • the first original image data describing the position information used for the correction process in the step
  • the second original image data describing the color chart and the gray scale chart used for the correction process in the second correction step.
  • the original image data acquisition step includes a first original image data acquisition step for acquiring the first original image data and a second original image data acquisition step for acquiring the second original image data. Each time the first original image data is acquired in the first original image data acquisition step, the first correction step is performed.
  • the first correction image data is created for each of the first original image data, and the second correction step is performed based on the second original image data acquired in the second original image data acquisition step.
  • the second correction image data is created by applying the processing result to the first correction image data in a unified manner.
  • the present invention according to claim 9 is an image capturing tool used when a user captures the original image data in the microorganism testing method using the film-type medium according to claim 5, wherein the image capturing tool is the tray.
  • the tray is provided with a plurality of culture medium storage portions to which the incubated film type culture medium can be mounted, and the position information, the color chart and the gray scale chart are displayed in advance.
  • the present invention according to claim 10 is an image capture tool used when a user captures the original image data in the microorganism testing method using the film-type medium according to claim 6, wherein the image capture tool is An image capturing tool comprising: the position information displayed in advance on a film-type medium; and the chart sheet prepared separately from the film-type medium.
  • position information used for correction processing in the first correction step is also displayed in advance on the chart sheet.
  • the present invention according to claim 12 is an image capture tool used when a user captures the original image data in the microorganism testing method using the film-type medium according to claim 7, wherein the image capture tool An image capturing tool comprising the position information displayed on the film-type medium itself, the color chart and the gray scale chart.
  • the present invention according to claim 13 is an image capturing tool used when a user captures the first original image data in the microorganism testing method using the film-type medium according to claim 8, wherein the image capturing tool is used.
  • the tray includes a plurality of culture medium storage portions to which the incubated film type culture medium can be mounted, and the position information is displayed in advance.
  • an inexpensive and highly versatile flat bed scanner or digital camera is used on the user side, and in the case of a scanner, image data is captured by placing an incubated film-type medium on the digital camera.
  • the film-type culture medium is placed vertically on a tripod and photographed to acquire the original image data, and by sending this to an analysis center equipped with a processing server, an accurate colony count measurement result can be acquired.
  • an image capture tool for facilitating the user's task of capturing image data using a scanner or digital camera. Therefore, the user can easily use the image capture tool. Image data can be acquired.
  • the processing server receives image data captured from a large number of users using a variety of devices (scanners and digital cameras), and may include misalignment (tilt) when capturing the image data.
  • misalignment tilt
  • the analysis by the colony counting system and related software provided in the processing server is performed. Because it is converted into corrected image data suitable for the user, even if there are variations due to the model of the image capture device on the user side or the positional deviation at the time of image capture, this is eliminated and accurate colony count measurement is performed The result can be obtained.
  • the user of the original image data transmission source can confirm this on the display of the PC and can save the data as necessary.
  • FIG. 3 is a plan view showing an embodiment of a tray (image capturing tool used in the microorganism testing method using the film-type medium of the present invention) on which a predetermined number of incubated film-type mediums can be placed.
  • FIG. 2A is a cross-sectional view taken along line AA. It is a schematic block diagram of the microbe inspection system by the film type culture medium by this invention. It is a figure which shows the rough processing flow when performing colony count processing in this system.
  • FIG. 3 is a plan view showing a state in which an incubated film-type medium is placed and accommodated in each medium accommodating portion of the tray of FIG.
  • FIG. 6 is a plan view showing another embodiment of a tray (an image capturing tool used in the microorganism testing method using the film-type medium of the present invention) on which a predetermined number of incubated film-type medium can be placed. It is a top view which shows the tray by the modification of the tray of FIG.
  • This film-type medium 10 is provided with a base sheet 11, a frame 12 formed on the base sheet 11, and a frame 12, similarly to known ones shown in Patent Documents 1 to 4. And a cover sheet 14 that covers the culture layer 13.
  • the base sheet 11 is made of, for example, polyethylene terephthalate (PET).
  • PET polyethylene terephthalate
  • the frame 12 is formed in a circular shape by, for example, a hot melt resin, and a culture layer 13 in which a gelling agent is blended with, for example, polyvinylpyrrolidone (PVP) is provided therein.
  • PVP polyvinylpyrrolidone
  • a transparent soft film such as OPP is used for the cover sheet 14.
  • the cover sheet 14 is cut into approximately the same size as the base sheet 11 and used at the upper edge portion of the base sheet 11. -It is adhered by a glue.
  • a dilution rate entry column 15 for entering the dilution rate of the sample incubated in the culture layer 13 by a mark formula, and optional sample information by a mark formula.
  • Sample information entry column 16 to be specified each film type medium 10 is specified (and therefore a sample number that is incubated in the culture layer 13 of the film type medium 10 is specified). 17 is printed and displayed.
  • the dilution rate may be included in the sample information entry column as one of the sample information. In this case, it is not necessary to provide the dilution rate display column 15.
  • sample information such as medium type and expiration date
  • data that can be shared by many samples rather than data specific to each sample is provided and printed and displayed as a sample information bar code 18. Also good.
  • a predetermined amount for example, 1 mL
  • a specimen diluted at a predetermined dilution rate is injected into the culture layer 13, and then placed in an incubator for a predetermined temperature (for example, 36 ° C.) and a predetermined period (for example) (For example, 48 hours)
  • a predetermined temperature for example, 36 ° C.
  • a predetermined period for example, 48 hours
  • Incubate as an image capture tool used when the user captures the original image data prior to the colony counting process.
  • the tray 20 is configured to be capable of placing and accommodating six film-type culture media 10, 10,..., And is a base 21 formed from a resin such as PET into a flat plate of a predetermined size (A4, etc.). Are formed with a predetermined number of medium accommodating portions 22, 22... Corresponding to the shape and size of the film type medium 10 (the shape and size of the base sheet 11). In this example, as shown in the figure, a total of six medium accommodating portions 22, 22... Formed in 3 stages ⁇ 2 rows are provided.
  • a rectangular accommodating portion 22 having a size slightly smaller than the outer size of the film-type medium 10 is recessed at a predetermined location of the base 21, and the lower portion of the outer peripheral edge is outward.
  • the locking groove 23 having approximately the same thickness (depth) and approximately the same outer dimension (outer diameter) as the film type medium 10 is provided around the film type medium 10.
  • the film-type culture medium 10 can be placed and accommodated in the accommodation part 22 by fitting the film-type culture medium 10 into the accommodation part 22 and fitting the outer peripheral edge thereof into the locking groove 23.
  • the film-type medium 10 once stored in the storage unit 22 in this way is held in the storage unit 22 without dropping even if the tray 20 is turned upside down after that, the film is taken in at the time of image capture.
  • the operation of setting the tray 20 on which the mold medium 10 is placed and stored in the scanner in an inverted state can be easily performed.
  • the structure shown in FIG. 3 is merely an example of a structure that can be employed to hold the film-type medium 10 accommodated in the accommodating portion 22 without dropping even when the tray 20 is turned upside down.
  • any other structure may be adopted as long as it satisfies the above.
  • a part of the accommodating portion 22, for example, an engaging claw protruding inward from the center of each side is protruded on the surface side of the tray 20, and the engaging claw is used as a drop-off preventing piece when the tray is turned over. be able to.
  • a rectangular opening having substantially the same dimensions as the outer dimensions of the film-type medium 10 may be formed in the tray 20 to serve as the medium containing portion 22.
  • the tray 20 is turned over and placed on the scanner platen, and then the incubated rectangular film-type medium 10 is turned upside down in the opening of each medium container 22. Use as if fitted.
  • the rectangular film type culture medium 10 that has been incubated is inserted into the opening of each medium container 22 of the tray 20 placed face up on a desk or the like. .
  • the base 21 has position recognitions c24a to 24d displayed at the four corners of the margins of the medium accommodating portions 22, 22.
  • One of these four position recognition markers, the lower left position recognition marker 24c in FIG. 3, is an inverted marker for top and bottom recognition, and the other three position recognition markers 24a, 24b, It is printed in a color different from 24d (for example, the reversal marker 24c is black with respect to the white position recognition markers 24a, 24b, and 24d), and the brightness is clearly different (details will be described later).
  • the color chart 25 and the gray scale chart 26 are displayed on the base 21 by using the blank space between the medium storage sections 22 and 22 at each stage.
  • the color chart 25 is a so-called color sample array table, and is displayed as a color array including 12 basic colors excluding the gray scale. In this example, an 18 color chart 25 is employed.
  • the gray scale chart 26 is a gradation display of light and dark achromatic colors from white to black.
  • the color chart 25 and the gray scale chart 26 may be printed and displayed at the predetermined positions on the base 21, or commercially available ones may be attached.
  • the user sets the tray 20 on which the incubated film-type medium 10 is placed and stored on the glass platen of the flatbed scanner 30 (hereinafter simply referred to as “scanner”). Then, scanning is performed according to the usage of the scanner 30. Then, the scanned image data is transmitted from the PC 40 connected to the scanner 30 via a parallel port or USB to the analysis center 50 through a network NET such as the Internet.
  • a network NET such as the Internet.
  • the user acquires the image data using the scanner 30, but as described above, the image data captured by the digital camera may be acquired.
  • the tray 20 on which the film-type medium 10 that has been incubated is placed and accommodated is photographed with a digital camera from the front using a tripod, a stand, or the like as necessary, and the image data is recorded on an SD card or USB As above, the data is transmitted to the analysis center 50.
  • the film-type medium 10, the tray 20 for placing and storing the incubated film-type medium 10, and the scanner 30 or the digital for taking in the image data of the tray 20 are used. It is only necessary to provide a PC 40 that can be connected to the network NET environment for enabling data transmission / reception between the camera and the scanner 30 or the digital camera as well as data analysis with the analysis center 50.
  • a PC 40 that can be connected to the network NET environment for enabling data transmission / reception between the camera and the scanner 30 or the digital camera as well as data analysis with the analysis center 50.
  • the acquisition of image data is a general-purpose product that is commercially available at a low cost and can be easily obtained. Scanners and digital cameras can be used regardless of the model, and a system can be constructed with almost no new cost burden.
  • the analysis center 50 receives data via the network NET and the web server 51 from the user PC 40 and the web server 51 that executes data transmission / reception with the user PC 40 via the network NET.
  • a processing server 52 that counts colonies after correcting the scan image data as described below, and a database 53 that stores colony count data after processing by the processing server 52 are provided. I have.
  • the user interface is an application that runs on a browser such as JAVA (registered trademark) applet or FLASH (registered trademark), and the user does not need to install special software.
  • Predetermined software can be downloaded from a predetermined web site to the PC 40 in an environment where a network NET connection is established with the web server 51.
  • the user uses the film-type medium 10 shown in FIG. 1 and drops a predetermined amount (for example, 1 mL) of a specimen diluted at a predetermined dilution rate onto the culture layer 13 with a sterile pipette or the like.
  • the mold medium 10 is placed in an incubator and incubated at a predetermined temperature (for example, 36 ° C.) and for a predetermined period (for example, 48 hours) (FIG. 5: S1).
  • Each film type medium 10 is previously displayed with a serial number as a two-dimensional code 17, and data indicating the type of medium, expiry date, and other specimen information of the culture layer 13 of the medium 10 is displayed in advance. It is displayed as a code 18 or displayed by a user writing in the sample information entry field 16.
  • the dilution rate of the sample incubated in the culture layer 13 of each film type medium 10 is displayed in the dilution rate entry column 15 (or the sample information entry column 16) as written by the user.
  • the incubated film type medium 10 is placed and accommodated in the medium accommodating portion 22 of the tray 20 (FIG. 5: S2). Since the tray 20 of this example has six medium storage units 22, a maximum of six film-type mediums 10 can be placed and stored, thereby simultaneously incubating a maximum of six film-type mediums 10 with an incubated sample. Can be analyzed.
  • FIG. 6 shows a tray 20 in which the incubated film-type medium 10 is placed and accommodated in each of the six medium accommodating portions 22.
  • the glass medium 10 of the flat bed scanner 30 (hereinafter simply referred to as “scanner”) is placed in a state in which the tray 20 is turned over, that is, the film type medium 10 placed and accommodated in the tray 20 through the transparent cover 14. It is set in the scanner 30 so as to face the table (FIG. 5: S3).
  • the image data (original image data) obtained in this way is two-dimensional image data substantially similar to the tray plan view shown in FIG.
  • the original image data is acquired using the scanner 30, but as described above, the tray 20 in which the incubated film-type medium 10 is placed and accommodated in each of the medium accommodating portions 22 is obtained by a digital camera.
  • Original image data may be acquired by photographing. In this case, it is preferable to use a tripod or the like to shoot with a digital camera arranged on a perpendicular line from the tray center to the tray 20.
  • the acquired original image data is transmitted from the user PC 40 connected to the scanner 30 or the digital camera to the analysis center 50 via the network NET (FIG. 5: S5).
  • the original image data may be temporarily stored in a recording medium such as an SD card and transmitted to the analysis center 50 from the user PC.
  • the analysis center 50 corrects the received original image data by the processing server 52 and counts the colonies (FIG. 5: S6).
  • the colony count data acquired as a result of the analysis by the processing server 52 is used as measurement result data uniquely associated with a color image (an image in which colonies can be confirmed) displaying the culture medium to be examined.
  • the user can know in real time the analysis results such as the types of colonies and the number of bacteria present in the medium contained in the specimen after incubation in each film-type medium 10, and the database
  • the data stored in 53 can be obtained at any time through the network NET.
  • Such a system is preferably constructed as so-called cloud computing for the convenience of the user (see FIG. 4).
  • the user is not aware of the server group (including the database) provided by the analysis center 50 and downloads the software for processing in advance. There is an advantage that it can be executed with the same feeling as if it is processed on its own PC 40 without having to perform the processing. Further, the image processing and UI application source provided by the analysis center 50 can be maintained or upgraded at any time, so that the user can always receive the latest service.
  • a billing system according to the usage time of this service by the user. That is, a user who wants to use this service registers in advance and obtains a customer ID, and then accesses the web server 51 of the analysis center 50 from the PC 40 through the network NET. Download and activate the software for using the service, and enter the customer ID on the required screen. As a result, the use of this service is started.
  • the tray 20 on which the incubated film-type medium 10 is placed and stored is set in the scanner 30 (FIG. 5: S3), and the original image data is acquired. (FIG. 5: S4), this is uploaded to the analysis center 40 (FIG. 5: S5), and an analysis process (FIG. 5: S7) by the processing server 52 of the analysis center 40 is awaited.
  • the colony count data obtained by the analysis is stored in the web server 51 and displayed on the screen of the transmission source user PC 30 (FIG. 5: S7). Stop using the service.
  • the user is charged a service usage fee according to the time from the start of use of this service to the end of use.
  • the user wishes to perform additional processing such as analyzing the colony count data as the analysis result (pass / fail judgment) or creating a report, download other software necessary for the processing.
  • the user may be charged an additional service usage fee according to the usage time.
  • the contents of the service provided to the user (number of culture media for colony count processing, presence / absence of additional processing such as pass / fail judgment and report creation, etc.) ) May be adopted.
  • the charging system it is possible to execute the charging system with various short-term and long-term contracts such as charging for each unit processing, monthly payment or annual lump sum payment.
  • the colonies on the image are recognized by comparing the brightness of each pixel. That is, the brightness is measured for each pixel in the processed image data, and it is determined that a pixel having a brightness greater than a predetermined threshold indicates the presence of a colony.
  • the image data obtained by scanning the incubated film-type medium 10 by the user's hand-held scanner 30 and the image data taken by the hand-held digital camera are directly analyzed as the original image data. It is sent to the center 50.
  • the model and specification used by the user for acquiring the original image data cannot be specified, and the original image data uploaded from various users using various devices has the resolution and Individual differences in image quality are extremely large. Therefore, in order to measure an accurate colony count, it is required to determine the brightness of pixels in the processed image data based on a uniform standard.
  • TTC is added by adding TTC (triphenyltetrazolium chloride) to the culture medium. Reduced to produce red TPF (triphenylformazan) and observed as a red colony.
  • Staphylococcus aureus degrades the enzyme substrate X-Phos (5 bromo 4 chloro 3 indolyl phosphate) with acid phosphatase Generate an indigo of The coliform group reacts with the ⁇ -galactosidase of the coliform group as an enzyme substrate in the medium to react with X-Gal (5 bromo 4 chloro 3 indolyl ⁇ -galactosidase) or Magenta-Gal (5 bromo 6 chloro 3 indolyl ⁇ -galactosidase). Hydrolysis and oxidative polymerization produce reddish purple or purple bromochloroindigo, and ⁇ -glucuronidase specifically possessed by E. coli is the enzyme substrate X-GLUC (5 bromo 4 chloro 3 indolyl ⁇ -glucuronidase) as described above. Decomposes to produce blue bromochloroindigo.
  • the tray 20 when the user sets the tray 20 in the scanner 30 in order to acquire the original image data (FIG. 5: S3), the tray 20 may not be set at the correct position or may be set in an inclined state. It is also necessary to consider the possibility that errors in position and tilt are included in.
  • the processing server 52 performs processing for correcting the inclination of the original image data by the position recognition markers 24a to 24d included in the acquired original image data, and further, By referring to the color chart 25 and the gray scale chart 26 included in the corrected image data, a process for minimizing individual differences in hue and brightness of the original image data is performed. These processes are performed in FIG. 5: S6, and details thereof will be described with reference to the flowchart of FIG.
  • original image data obtained by the user with the scanner 30 and uploaded to the web server 51 is obtained (FIG. 7: S61).
  • the original image data includes individual differences such as brightness and hue associated with the model dependency of the scanner 30 used by the user, inclinations when the tray 20 is set on the scanner 30, and the like. Inconsistent factors such as misalignment are included.
  • a process of correcting the inclination of the original image data acquired in FIG. 7: S61 is performed (FIG. 7: S62).
  • This processing is performed by detecting the positions in the original image data of the position recognition markers 24a to 24d printed in the four corner margins of the tray 20.
  • the position recognition markers 24a to 24d are composed of a circle and a crosshair displayed in the circle
  • the luminance of each pixel of the original image data increases with a predetermined condition as it goes outward. It is determined whether or not it changes, and it is determined that a pixel satisfying this condition is located at the center position (coordinates) of the position recognition markers 24a to 24d.
  • each pixel of the original image data is converted from the RGB color system to luminance (Y) by a known conversion formula.
  • luminance Y
  • the difference in luminance between the two pixels is smaller than a predetermined threshold, it is determined that they have the same luminance. Then, the following determination is performed for each pixel of the original image data.
  • the luminance value range is set to 0 to 255.
  • the luminance is examined while moving from the vertical to a plurality of angular directions around the target pixel.
  • the center moves, the center brightness once becomes a different value and then becomes the same as the center brightness again. If the distances (radius) in the four directions coincide with each other, a circle obtained from the center and the radius is assumed (FIG. 8 (a )).
  • the circle reaches the circumference in four directions at intervals of 90 degrees (FIG. 8B).
  • the pixel is the center of the position recognition markers 24a to 24d.
  • the inverted marker 24c for top and bottom recognition is displayed in white at the center, and the other position recognition markers 24a, 24b, and 24d are displayed in black at the center. Therefore, among those determined as position recognition markers, those having the luminance of the central pixel equal to or higher than a predetermined threshold (for example, the intermediate value of the above range) are determined as the white display top / bottom recognition reversal marker 24c.
  • a predetermined threshold for example, the intermediate value of the above range
  • the corrected image data A obtained by the above processing is a pixel obtained by converting the pixel coordinates (X1, Y1) in the rectangle R of the original image data into correction coordinates (X2, Y2) in the rectangle R ′ obtained by correcting the inclination. For example, even if the original image data obtained from the user is tilted as shown in FIG. 9A, the corrected image data corrected in tilt as shown in FIG. -A is obtained.
  • the corrected image data A is trimmed into a rectangle having no inclination determined by the size (width and height) and the center coordinates (cx, cy), as is clear from equation (2).
  • the processing server 52 includes an area of the incubated film-type medium 10 in the tray 20 (that is, an area of the medium container 22), an area of the culture layer 13 included in each incubated film-type medium 10, a color chart 25, and a gray scale chart 26. And the relative position (logical coordinates) data in which the color display areas in these charts are associated with the rectangles specified by the position recognition markers 24a to 24d in advance. Therefore, even when the user does not set the tray 20 at the correct position when capturing the original image data, or the accuracy of the model used at that time is low, each area can be accurately grasped. .
  • the rectangle of the corrected image data obtained by correcting the tilt by the above processing is also upside down, but in this case, it becomes the vertex of the rectangle. Since it can be determined from the positional relationship (coordinates) of the reverse marker 24c among the four position recognition markers 24a to 24d that the top and bottom are reversed in the original image data, the obtained corrected image data is further rotated 180 degrees.
  • the corrected image data A is obtained by correcting the top and bottom.
  • position recognition markers 24a to 24d are provided at the four corners, and the inclination correction process is performed after specifying the rectangle R from the pixel coordinates of the position markers 24a to 24d in the original image data.
  • the specific configuration of the position markers 24a to 24d is not limited as long as the coordinate position and the conscription system can be specified based on the change.
  • a black frame surrounding the outer edge of the tray 20, a quadrangle, an isosceles triangle displayed at the four corners, a “+” mark, or the like may be used for the position correction processing as position information (mark).
  • image quality correction processing is performed on the corrected image data A (FIG. 7: S63).
  • the image data acquired by the scanner 30 is represented by the RGB color system in which each pixel data is represented once by hue (H), lightness (L), and saturation (S).
  • the image quality correction processing can be performed by converting to the HLS color system, performing image quality correction by comparison with the table value and linear interpolation, and then converting again to the RGB color system.
  • each color of the color chart 25 printed and displayed on the tray 20 is numbered from 1 in the order of hue, and a color comparison table is created by associating the reference value and the measurement value with each color. It is stored in a memory provided in the server 52.
  • An example of the color comparison table is shown in Table 1.
  • each color of the gray scale chart 26 printed and displayed on the tray 20 is numbered from 1 in order of lightness, and the gray scale comparison table is associated with the reference value and the measured value. Are created and stored in a memory provided in the processing server 52.
  • An example of a gray scale comparison table is shown in Table 2.
  • the reference value is obtained from the RGB color system by acquiring the data of each color of the color chart 25 and each color of the gray scale chart 26 with a specific scanner as a reference beforehand. This is a value converted to the HLS color system.
  • the measured values are obtained from the RGB color system for each pixel of the color chart 25 included in the original image data uploaded from the user PC 40 and each pixel of the portion corresponding to each color (grayscale) of the grayscale chart. This is a value converted to the HLS color system.
  • the data of each color is a value obtained by averaging the RGB elements of a plurality of pixels included in the area.
  • the corrected hue value h can be obtained, for example, as follows by referring to the color comparison table described above.
  • the hue value range is 1 to 360.
  • n that satisfies H ′ n ⁇ H ⁇ H ′ n + 1 is incremented from 1 and found.
  • the corrected hue value h is obtained from the following formula.
  • the corrected lightness value l can be obtained in substantially the same manner as described above with reference to the gray scale comparison table described above.
  • the corrected image data B in which the image quality correction processing is further performed on the corrected image data A whose inclination has been corrected to eliminate individual differences in image quality depending on the model.
  • the culture layer to be inspected can be obtained by grasping the relative coordinates in the corrected image data A, even if the user has a positional deviation at the time of capturing the original image data or an accuracy error of the device used. 13 and charts 25, 26 and other areas requiring analysis can be accurately specified.
  • the dependence on the purple-purple to purple colonies of the coliforms and A blue colony can be discriminated by the threshold of hue, and the number of colonies can be measured for each bacterial species, and further, it can be distinguished from foreign matters such as residues contained in the culture layer 13.
  • the processing server 52 performs a colony count process for the corrected image data B (FIG. 7: S64). Specifically, the number of colonies included in each culture layer image region is determined for each bacterial species as necessary while moving the culture layer 13 specified by relative coordinates in the rectangle of the corrected image data B in a predetermined order. ) To measure.
  • This colony counting process can be carried out using a colony counting system “Isac / iSac” (registered trademark) provided by Elmex Co., Ltd., the applicant of the present invention. The detailed explanation is omitted.
  • the corrected image data A is obtained by correcting the inclination (FIG. 7: S62), and then the corrected image is corrected based on the corrected image data A.
  • Data B final corrected image data
  • the order of this correction processing is not limited, and the obtained original image data is first subjected to image quality correction processing and then the next.
  • the tilt correction process may be performed.
  • the image quality correction process may be performed for the area corresponding to the culture layer 13 and the areas corresponding to the color scale 25 and the gray scale 26 in the original image data, as described above, the inclination correction process is first performed to perform these corrections. It is preferable to perform the image quality correction process after accurately specifying the region.
  • the plurality of incubated film-type culture media 10 are placed and accommodated on the tray 20 to acquire the original image data.
  • only one or a few film-type culture media are often inspected.
  • the waste on the original image data to be processed increases, and the convenience of using the tray 20 is reduced.
  • An embodiment of the present invention suitable for such a case will be described in detail below.
  • the tray 20 capable of mounting and accommodating the plurality of film-type culture media 10 used in Example 1 is not used, but is used for performing tilt correction in the processing server 52 (FIG. 7: S62).
  • the position recognition markers 24a to 24d and the color chart 25 and the gray scale chart 26 used for image quality correction (FIG. 7: S63) must be included in the original image data acquired by the processing server.
  • a chart sheet 27 (FIG. 10) on which the color chart 25 and the gray scale chart 26 are displayed is used as a tool for image quality correction.
  • the color chart 25 and the gray scale chart 26 may be the same as those displayed on the tray 20 in the first embodiment.
  • position recognition markers 28a to 28d are displayed in advance at the four corners of the peripheral margin, and one of them 28c is an inverted marker for top and bottom recognition.
  • the position recognition markers 19a to 19d are displayed in advance at the four corners of the peripheral margin as the film-type culture medium 10A. Is an inverted marker for top and bottom recognition (FIG. 11).
  • the position recognition markers 19a to 19d and 28a to 28d may be substantially the same as the position recognition markers 24a to 24d displayed on the tray 20 in the first embodiment.
  • the tray 20 on which the position recognition markers 24a to 24d, the color chart 25, and the gray scale chart 26 are displayed in advance in the first embodiment is used.
  • the position recognition markers 19a to 19d displayed in advance on the film type medium 10A and the position recognition markers displayed in advance on the chart sheet 27 prepared separately from the film type medium 10A are used.
  • the image capturing tool composed of 28a to 28d, a color chart 25, and a gray scale chart 26 is used.
  • the colony counting process according to this embodiment can also be performed in the same manner as in Example 1 described above. That is, the film type culture medium 10A with the position recognition markers 19a to 19d is incubated under predetermined conditions (FIG. 5: S1), and this one or a few incubated film type culture media 10A are provided with the position recognition markers 28a to 28d.
  • the sheet is turned upside down and set on the glass platen of the scanner 30 (FIG. 5: S3). Thereafter, the processing of FIG. 5: S4 to S7 is executed in the same manner.
  • the chart sheet 27 may be left on the scanner 30, and the incubated film-type culture media 10A may be replaced and scanned.
  • the original image data may be obtained by photographing with a digital camera instead of the scanner 30 as in the case of the first embodiment.
  • the original image data transmitted from the user PC 40 to the processing server 52 via the web server 51 is displayed on the position recognition markers 19a to 19d and the chart sheet 27 displayed at the four corners of the film type medium 10A. Since the color chart 25 and the gray scale chart 26 are included, the inclination correction processing (FIG. 7: S62) and the image quality correction processing (FIG. 7: S63) are performed using these, and the original image data is not dependent on the model. Individual differences can be minimized. Since these correction processes can be performed in the same manner as described above with reference to FIG.
  • the positions of the incubated film-type medium 10A and the chart sheet 27 and the respective regions are determined by the position recognition markers 19a to 19d.
  • 28a to 28d are automatically recognized at the relative positions in the rectangular image data, and the arrangement of the film-type medium 10A and the chart sheet 27 in the original image data is arbitrary.
  • the processing server 52 can perform the inclination correction process (FIG. 7: S62) and the image quality correction process (FIG. 7: S63).
  • the chart sheet 27 displays both the color chart 25 and the grayscale chart 26, but separate chart sheets may be created and used for the color chart 25 and the grayscale chart 26. good. When using separate chart sheets, it is necessary to display a position recognition marker on each chart sheet.
  • This embodiment is a modification of Example 2 described above, and uses a film-type medium 10B (FIG. 13) that displays a color chart 25 and a grayscale chart 26 in addition to the position recognition markers 19a to 19d.
  • this film-type medium 10B includes the function of the tray 20 in Example 1 described above in the film-type medium itself. That is, in this embodiment, the position recognition markers 19a to 19d constituting the image capturing tool used when the user captures the original image data, the color chart 25, and the gray scale chart 26 are all film-type medium 10B itself. Is displayed in advance.
  • the original image data acquired from the user by the processing server 52 is used to perform an inclination correction process (FIG. 7: S62).
  • Position information that is, position recognition markers 24a to 24d or a predetermined rectangle
  • image quality information color chart 25, gray scale chart 26
  • FIG. 7: S63 image quality correction processing
  • the tilt correction not only the variation factor due to the model dependency inherent in the model of the scanner 30 or the like used when capturing the original image data but also when the user captures the original image data. Since a position shift or the like may occur when the incubated film type medium storage tray 20 or the incubated film type mediums 10A and 10B are set in the scanner 30, it is necessary to correct the inclination every time in order to perform an accurate colony counting process. Therefore, the original image data acquired from the user needs to always include position information for performing this inclination correction.
  • the colony counting process in the system configuration in this case is as shown in the flow of FIG. 5, but as a specific process performed in S6, FIG. 7:
  • the original image data acquired in S61 is the incubation film type medium. It consists of first original image data including position information necessary for tilt correction together with imaging data, and second original image data including image quality information necessary for image quality correction. And when a user requests colony counting processing by the processing server 52 for a series of incubated film-type culture media, the second original data is sent only once before or after the first original image data is sequentially transmitted as much as necessary. What is necessary is just to transmit image data.
  • the image quality correction information (color chart 25, gray scale chart 26) is not required for the first original image data. Therefore, when sequentially taking in the first original image data, the film-type medium 10A (FIG. 10) used in Example 2 is used, and when taking in the second original image data (first or last one). (Only once) can use the chart sheet 27 (FIG. 11) used in Example 2 described above. That is, in this case, as shown in FIG. 12, the film-type medium 10A and the chart sheet 27 are not set on the scanner 30 and the image is captured, but when the first original image data is sequentially captured, the culture is performed. An arbitrary number of film-type culture media 10A after incubation in the layer 13 are set in the scanner 30 to capture an image, and when the second original image data is captured once, only the chart sheet 27 is set and the image is captured. .
  • the processing server 52 sequentially acquires first original image data including positional information necessary for tilt correction together with imaging data of the incubated film-type medium (FIG. 14: S601), and the first original image data.
  • Each of the tilt correction processes is performed to obtain corrected image data A that is tilt-corrected for each first original image data (FIG. 14: S602). Since the tilt correction process at this time can be performed in the same manner as described above, description thereof is omitted.
  • second original image data including image quality correction information is obtained (FIG. 14: S603), and image quality correction processing is performed based on this (FIG. 14: S604). Since the image quality correction processing at this time can be performed in the same manner as described above, description thereof is omitted.
  • This image quality correction processing result is applied to all corrected image data A in a unified manner to obtain corrected image data B (FIG. 14: S605). As a result, the image quality variation factor due to the model dependence of the user device is eliminated, so that accuracy in the subsequent colony counting process (FIG. 14: S606) is ensured.
  • the first original image data is sequentially acquired and then the second original image data is acquired.
  • the second original image data is first acquired and the image quality processing result is retained.
  • a processing flow may be employed in which the first original image data sequentially acquired thereafter is tilt-corrected and the image quality processing result is applied in a unified manner.
  • both the color chart 25 and the gray scale chart 26 may be displayed on one chart sheet 27 as shown in FIG.
  • the scale chart 26 may be created as a separate chart sheet.
  • the configuration of the chart sheet 27 is arbitrary, and position information (marks such as position recognition markers 28a to 28d) for performing the above-described inclination correction processing (FIG. 14: S602) is obtained. It may have any configuration as long as it has an image quality correction process (FIG. 14: S605) described above.
  • FIG. 15 shows a tray 60 that can be used in the fourth embodiment.
  • the tray 60 is configured so that a predetermined number of film-type culture media 10 (FIG. 1) can be placed and accommodated, and a base formed into a predetermined size (A4, etc.) flat plate from a resin sheet such as PET or cardboard.
  • 61 are provided with medium storage portions 62, 62... Having a shape and size corresponding to the shape and size of the film-type medium 10 in a predetermined position and arrangement.
  • a total of eight culture media storage portions 62, 62 in order to be able to mount and store a maximum of eight film-type culture media 10, a total of eight culture media storage portions 62, 62.
  • Slits 63a and 63b are formed at one diagonal position of each medium storage section 62, and the film type medium 10 is brought into a predetermined position by inserting the diagonal part of the incubated film type medium 10 into these slits 63a and 63b. I try to keep it. Since the diagonal portion is inserted and held in the slits 63a and 63b, it can be securely held without falling off even if it is turned over when set in the scanner 30.
  • one of the slits 63a is cut out in an arc shape to facilitate the insertion of the corners of the film-type medium 10.
  • the shapes of the slits 63a and 63b are arbitrary and are not particularly limited. Alternatively, such a slit may be omitted, and the incubated film-type medium 10 may be attached to the medium container 62 with a double-sided tape, an adhesive, or the like.
  • the outer peripheral portion of the tray 60 is a black frame portion 64, and a black strip portion 65 is similarly formed at the center.
  • the tray 20 of the first embodiment is provided with position recognition markers 24a to 24d (FIG. 2), and is used as position information when the processing server 52 corrects the inclination of the first original image data (FIG. 7: S62).
  • the position recognition markers 24a to 24d are omitted, and instead, a frame portion 64 is provided and used as position information for tilt correction.
  • the luminance change when each pixel included in the first original image data is moved in a predetermined direction is surrounded by the frame portion 64.
  • the rectangle R to be identified can be specified, and even if the rectangle R in the first original image data is inclined or distorted by the same method as described above with reference to FIGS. Correct correction processing can be performed. It is also possible to perform the tilt correction process using the central strip 65 as position information.
  • FIG. 16 shows a tray 70 according to a modification of the tray 60 of the fifth embodiment. Similar to the tray 60, the tray 70 is also configured to be able to place and receive a predetermined number of film-type culture media 10 (FIG. 1).
  • a flat plate of a predetermined size (A4 or the like) made of a resin sheet such as PET or cardboard Are formed in a predetermined position and arrangement on a base 71 formed in a shape.
  • a total of six culture media storage portions 72, 72 in order to be able to place and store a maximum of six film-type culture media 10.
  • the tray 70 is configured as a combined type capable of placing and accommodating three different types of film-type media. That is, slits 73a to 73e are formed in each medium containing portion 72, the slit 73c is provided at a diagonal position of the slit 73b, and the slit 73d and the slit 73e are provided at a diagonal position of the slit 73a.
  • the first type film type medium 80A can be held using the slits 73a, 73b and 73c, and the second type film type medium 80B can be held using the slits 73a and 73d.
  • the third type of film-type medium 80C can be held using the slits 73a and 73e.
  • each of the film-type culture media 80A, 80B, and 80C is held in the media storage units 72 in the middle row on the right row, the lower row on the right row, and the lower row on the left row using these slits. It is shown. Since any one of the film-type culture media 80A, 80B, 80C is inserted into the slit at least one diagonal portion, it is firmly held without dropping even when turned over when set in the scanner 30 like the tray 60 described above. be able to.
  • the slits 73a and 73b on one side are formed in a straight line, and the slits 73c to 73e on the other side are formed in an arc shape to facilitate the insertion of the corners of the film type medium 10.
  • the shapes of -73e are arbitrary and are not particularly limited. Alternatively, such a slit may be omitted, and the film-type culture mediums 80A, 80B, and 80C may be attached to the corresponding sections in the respective culture medium storage units 72 with double-sided tape or adhesive.
  • the outer peripheral portion of the tray 70 is a black frame portion 74, and this is used as position information for tilt correction, which is the same as the tray 60 of the fifth embodiment, and the tilt correction processing at that time is also the same. Since there is, description is abbreviate
  • neither the tray 60 of the fifth embodiment nor the tray 70 of the sixth embodiment includes the top / bottom correction position information (the reverse marker 24c in the tray 10 of the first embodiment).
  • the top / bottom correction position information the reverse marker 24c in the tray 10 of the first embodiment.

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Abstract

【課題】ユーザが専用の機器や知識・経験を必要とせずに正確なコロニーカウント測定結果を取得することができるような新規なシステムを構築する。 【解決手段】培養層で検体をインキュベ－トした後のフィルム型培地１０をトレイ２０に載置した状態で汎用スキャナ３０やデジタルカメラを用いて取り込んだ元画像データをユーザから受信し、該元画像データの傾きおよび位置、さらには画質を補正して補正画像データを作成する。これにより元画像データの取り込みに使用した機器の仕様や取り込み時の位置ずれなどによる個体差を排除し、統一的な基準の下で正確なコロニーカウントを行うことができるようになる。ユーザは、元画像データ取込ツールとして、傾き補正に参照する位置認識マーカ２４ａ～２４ｄ、画質補正に参照するカラーチャート２５、グレースケールチャート２６などが表示されたトレイ２０を使用することができる。

Description

フィルム型培地による微生物検査方法およびこの微生物検査方法に用いる画像取込ツ－ル
　本発明は、フィルム型培地による微生物検査方法およびこの微生物検査方法に用いる画像取込ツ－ルに関する。
　近年ますます食品衛生に関する要求が高まっており、様々な国から食品の輸入・輸出が行われているグロ－バル環境の下で、食品の安心と安全は全世界の共通課題として今後より一層クロ－ズアップされるものと思われる。
　食品衛生検査の主要な一手段として、検体を培地で培養した後に検体内のコロニー数をカウントするコロニーカウント処理が広く行われている。この培地としては、古くからシャ－レに充填した寒天培地が使用されてきたが、近年、これに代えて、フィルムないしシ－ト状の乾燥培地の使用が徐々に普及してきている。このフィルム型培地は、基材シ－トと、該基材シ－ト上に形成される枠と、該枠内に設けられる培養層と、該培養層を被覆するカバ－シ－トとを有して構成されるものであり、下記特許文献１～４などに公知である。
特開平３－１５３７９号公報 特表平７－５０１９４３号公報 特表平９－５０８２７９号公報 特表２００４－５１５２３６号公報
　このようなフィルム型培地を用いることで、培養層に検体を接種した後、カバ－シ－トを被せて所定温度で所定時間インキュベ－トし、これをコロニーカウント装置に投入して、インキュベ－ト後の発生コロニー数をカウントして、検体中の一般生菌数、大腸菌群数などを測定することができる。
　しかしながら、フィルム型培地を用いたとしても、コロニーカウントのためのシグナル解析には専用の機器とオペレ－タの知識・経験を必要とする。
　そこで、本発明者らは、インキュベ－ト済のフィルム型培地を専用の高価なコロニーカウント装置に投入して熟練オペレ－タによって解析することに代えて、汎用の安価なフラットベッドスキャナやデジタルカメラを利用して誰でも簡便に且つ低コストで微生物検査を行うことについて検討した。フラットベッドスキャナはデジタルカメラの普及などに伴って現在では各社から多種多様な製品がきわめて安価に提供されており、その操作も容易であるから、ユ－ザサイドにおいてこれを用いるだけでコロニーカウント処理が行われるようになれば、大規模ラボのみならず、小規模ラボやラボを持たない新興国などにおいても容易に導入可能である。
　したがって、本発明が解決しようとする課題は、ユ－ザサイドでは安価で汎用性の高いフラットベッドスキャナやデジタルカメラを用い、スキャナの場合は、インキュベ－ト済のフィルム型培地を載せて画像デ－タを取り込み、デジタルカメラの場合は、三脚にて垂直にフィルム型培地を配置して撮影するだけで、正確なコロニーカウント測定結果を取得することができるような新規なシステムを構築することである。
　また、本発明が解決しようとするもう一つの課題は、上記システムにおいてインキュベ－ト済のフィルム型培地をフラットベッドスキャナに載せたりデジタルカメラで撮影して画像デ－タを取り込む際に好適に用いられる画像デ－タ取込用ツ－ルを提供することである。
　上記課題を解決するため、請求項１に係る本発明は、フィルム型培地の培養層で検体をインキュベ－トした後の該フィルム型培地の元画像データをユーザからのデータ送信によって取得する元画像データ取得ステップと、取得した元画像データの傾きを補正する第一の補正ステップと、取得した元画像データの画質を補正する第二の補正ステップと、これら第一および第二の補正ステップで得た補正画像データを用いて培養層中のコロニー数をカウントする測定ステップと、を含むことを特徴とするフィルム型培地による微生物検査方法である。
　請求項２に係る本発明は、請求項１記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記第一の補正ステップは、前記第一の補正ステップは、前記元画像データに含まれる位置情報から特定される矩形の傾き角度を補正する処理を含み、前記測定ステップは、前記第一の補正ステップで補正された後の矩形内においてフィルム型培地の培養層に対応する画像領域内でコロニー数をカウントすることを特徴とする。
　請求項３に係る本発明は、請求項１または２記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記第二の補正ステップは、前記元画像データの各画素を明度補正する処理を含み、前記測定ステップは、補正された明度が閾値より大きいときにその画素がコロニーの存在を示すものと判定することを特徴とする。
　請求項４に係る本発明は、請求項３記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記第二の補正ステップは、さらに前記元画像データの各画素を色相補正する処理を含み、前記測定ステップは、補正された色相を基にしてコロニーの菌種を判定し、補正された明度を基にして菌種ごとのコロニー数をカウントすることを特徴とする。
　請求項５に係る本発明は、請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地が装着されたトレイを描写する画像データであり、前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報および前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートがいずれも前記トレイにあらかじめ表示されていることを特徴とする。
　請求項６に係る本発明は、請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地と該フィルム型培地とは別体として用意されたチャートシートとを含めて描写する画像データであり、前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報は各フィルム型培地にあらかじめ表示されており、前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートは前記チャートシートにあらかじめ表示されていることを特徴とする。
　請求項７に係る本発明は、請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地を描写する画像データであり、前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報および前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートがいずれも各フィルム型培地にあらかじめ表示されていることを特徴とする。
　請求項８に係る本発明は、請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法において、前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地と共に前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報を描写する第一の元画像データと、前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートを描写する第二の元画像データとからなり、前記元画像データ取得ステップは、前記第一の元画像データを取得する第一の元画像データ取得ステップと、前記第二の元画像データを取得する第二の元画像データ取得ステップとからなり、前記第一の元画像データ取得ステップで前記第一の元画像データを取得する都度前記第一の補正ステップを行って第一の元画像データについて各々第一の補正画像データを作成し、前記第二の元画像データ取得ステップで取得した前記第二の元画像データに基づいて行われる前記第二の補正ステップの処理結果を各第一の補正画像データに一元的に適用して第二の補正画像データを作成することを特徴とする。
　請求項９に係る本発明は、請求項５記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールが前記トレイからなり、該トレイは、インキュベート済フィルム型培地を装着可能な培地収容部を複数備えると共に、前記位置情報と、前記カラーチャートおよびグレースケールチャートがあらかじめ表示されていることを特徴とする。
　請求項１０に係る本発明は、請求項６記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールは、前記フィルム型培地にあらかじめ表示された前記位置情報と、前記フィルム型培地とは別体として用意された前記チャートシートとからなることを特徴とする画像取込ツール。
　請求項１１に係る本発明は、請求項１０記載の画像取込ツールにおいて、前記チャートシートにも前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報があらかじめ表示されていることを特徴とする。
　請求項１２に係る本発明は、請求項７記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールが、あらかじめ前記フィルム型培地自体に表示された前記位置情報と前記カラーチャートおよびグレースケールチャートとからなることを特徴とする画像取込ツール。
　請求項１３に係る本発明は、請求項８記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記第一の元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールが前記トレイからなり、該トレイは、インキュベート済フィルム型培地を装着可能な培地収容部を複数備えると共に、前記位置情報があらかじめ表示されていることを特徴とする。
　本発明によれば、ユ－ザサイドでは安価で汎用性の高いフラットベッドスキャナやデジタルカメラを用い、スキャナの場合は、インキュベ－ト済のフィルム型培地を載せて画像デ－タを取り込み、デジタルカメラの場合は、三脚にて垂直にフィルム型培地を配置して撮影して元画像データを取得し、これを処理サーバを備える解析センターに送信するだけで、正確なコロニーカウント測定結果を取得することができる。したがって、大規模ラボのみならず、小規模ラボやラボを持たない新興国などにおいても容易に微生物検査を行うことができ、きわめて利便性が高い。
　さらに、本発明によれば、ユーザがスキャナやデジタルカメラを用いて画像データを取り込む作業を容易にするための画像取込ツールが提供されるので、ユーザはこの画像取込ツールを用いて、簡単に画像データを取得することができる。
　処理サーバには多数のユーザから多種多様な機器（スキャナやデジタルカメラ）を用いて取り込まれた画像データが送られ、画像データ取込の際の位置ずれ（傾き）なども含まれる可能性があるが、取得した元画像データの傾きを補正する第一の補正ステップと、取得した元画像データの画質を補正する第二の補正ステップとを通じて、処理サーバが備えるコロニーカウントシステムや関連ソフトウェアでの解析に適した補正画像データに変換されるので、ユーザサイドにおける画像取込機器の機種や画像取込時の位置ずれなどに起因するバラツキがあっても、これを解消して、正確なコロニーカウント測定結果を得ることができる。元画像データ送信元のユーザは、これをＰＣのディスプレイ上で確認し、必要に応じてデータ保存することができる。
本発明で用いるフィルム型培地の一例を示す斜視図である。 インキュベ－ト済フィルム型培地を所定個数載置可能なトレイ（本発明のフィルム型培地による微生物検査方法で用いる画像取込ツ－ル）の一実施形態を示す平面図である。 図２Ａ－Ａ切断線による断面図である。 本発明によるフィルム型培地による微生物検査システムの概略構成図である。 本システムにおいてコロニーカウント処理を行うときの概略的な処理フロ－を示す図である。 図２のトレイの各培地収容部にインキュベ－ト済フィルム型培地を載置収容した状態の平面図である。 本システムにおいて解析センタの処理サーバで実行される処理のフローチャートである。 この処理中の傾き補正処理についての説明図である。 この処理において使用される元画像データ（ａ）と傾き補正処理後の画像データ（ｂ）を示す説明図である。 本発明のフィルム型培地による微生物検査方法で用いる画像取込ツールの別の実施形態において使用されるチャートシートの平面図である。 この実施形態において図１０のチャートシートと共に使用されるフィルム型培地を示す平面図である。 この実施形態においてユーザがスキャナまたはデジタルカメラで取り込んだ元画像データの一例を示す説明図である。 本発明のフィルム型培地による微生物検査方法で用いる画像取込ツールのさらに別の実施形態において用いられるフィルム型培地を示す平面図である。 他の実施形態によるシステムにおいて解析センタの処理サーバで実行される処理のフローチャートである。 インキュベ－ト済フィルム型培地を所定個数載置可能なトレイ（本発明のフィルム型培地による微生物検査方法で用いる画像取込ツ－ル）の他実施形態を示す平面図である。 図１５のトレイの変形例によるトレイを示す平面図である。
　まず、本発明で用いるフィルム型培地の一例について図１を参照して説明する。このフィルム型培地１０は、特許文献１～４に示される公知のものと同様に、基材シ－ト１１と、基材シ－ト１１上に形成される枠１２と、枠１２内に設けられる培養層１３と、培養層１３を被覆するカバ－シ－ト１４とを有して構成される。
　基材シ－ト１１はたとえばポリエチレンテレフタレ－ト（ＰＥＴ）で形成される。枠１２はたとえばホットメルト樹脂などにより円形に形成され、その中に、たとえばポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）にゲル化剤を配合した培養層１３が設けられる。カバ－シ－ト１４にはたとえばＯＰＰなどの透明軟質フィルムが用いられ、本例では基材シ－ト１１と略同サイズにカットして用いて基材シ－ト１１の上端縁部分にラミネ－トなどにより接着されている。
　本例のフィルム型培地１０の基材シ－ト１１には、培養層１３でインキュベ－トした検体の希釈率をマーク式で記入する希釈率記入欄１５、任意の検体情報をマーク式で記入する検体情報記入欄１６、各フィルム型培地１０を特定する（したがって該フィルム型培地１０の培養層１３でインキュベ－トした検体を特定する）シリアルナンバ－が格納されたシリアルナンバ－バ－コ－ド１７が印刷表示されている。希釈率は検体情報の一つとして検体情報記入欄に含めても良く、この場合は希釈率表示欄１５を設ける必要はない。また、検体情報のうち培地種別や消費期限などの各検体に固有のデ－タではなく多数の検体に共用できるデ－タについては、検体情報バ－コ－ド１８を設けて印刷表示しても良い。
　このフィルム型培地１０を使用して、所定の希釈率で希釈した所定量（たとえば１ｍＬ）の検体を培養層１３に注入した後、孵卵器に入れて所定温度（たとえば３６℃）および所定期間（たとえば４８時間）インキュベ－トし、インキュベ－ト後のコロニー数をカウントするが、このコロニーカウント処理を行うに先立ってユーザが元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールとして、インキュベ－ト済フィルム型培地１０を所定個数載置可能なトレイ２０を使用することが好ましい。このトレイ２０の一例について図２を参照して説明する。
　このトレイ２０は、６個のフィルム型培地１０，１０・・・を載置収容可能に構成されており、ＰＥＴなどの樹脂から所定サイズ（Ａ４など）の平板状に成形されたベ－ス２１には、フィルム型培地１０の形状およびサイズ（基材シ－ト１１の形状およびサイズ）に対応した所定数の培地収容部２２，２２・・・が形成されている。本例では、図示のように、３段×２列に形成された計６個の培地収容部２２，２２・・・を有している。
　具体的には、図３に示すように、フィルム型培地１０の外寸より若干小さい寸法の矩形収容部２２をベ－ス２１の所定箇所に凹設すると共に、その外周縁下方部を外側に向けて切除して、フィルム型培地１０と略同一の厚さ（深さ）および略同一の外寸（外径）を有する係止溝２３を周設する。このような構成において、フィルム型培地１０を収容部２２に嵌め込んでその外周縁を係止溝２３に嵌着させることにより、フィルム型培地１０を収容部２２に載置収容可能である。また、このようにして一旦収容部２２に収容されたフィルム型培地１０は、その後にトレイ２０を裏返しても脱落することなく収容部２２内に保持されるので、画像取込の際に、フィルム型培地１０を載置収容したトレイ２０を裏返した状態でスキャナにセットする作業を簡単に行うことができる。
　なお、図３に示す構造は、トレイ２０を裏返したときにも収容部２２に収容されたフィルム型培地１０を脱落させずに保持するために採用し得る構造の一例にすぎず、同様の作用を果たすものであれば他の任意の構造を採用して良いことはもちろんである。たとえば、トレイ２０の表面側に収容部２２の一部、たとえば各辺の中央から内方に突出する係合爪を突出させておき、これら係合爪をトレイ裏返し時の脱落防止片として使用することができる。
　また、フィルム型培地１０の外寸法と略同寸法の矩形開口をトレイ２０に形成して培地収容部２２としても良い。この構成にあっては、スキャナで画像取込するときは、トレイ２０を裏返してスキャナの原稿台に置いた後、各培地収容部２２の開口内にインキュベート済の矩形フィルム型培地１０を裏返して嵌め込むようにして使用する。デジタルカメラで使用する場合は裏返す必要はなく、机などの上に表向きにして配置したトレイ２０の各培地収容部２２の開口内にインキュベート済の矩形フィルム型培地１０を表向きに嵌め込むようにして使用する。
　また、ベ－ス２１には、これら培地収容部２２，２２・・・の余白部の四隅に各々位置認識ｃ２４ａ～２４ｄが表示されている。これら４つの位置認識マ－カのうちの一つ、図３において左下の位置認識マ－カ２４ｃは天地認識用の反転マ－カであり、他の３つの位置認識マ－カ２４ａ，２４ｂ，２４ｄとは異なる色（たとえば白色の位置認識マ－カ２４ａ，２４ｂ，２４ｄに対して反転マ－カ２４ｃは黒色）に印刷されていて輝度が明確に異なるものとされている（詳細は後述）。
　さらに、ベ－ス２１には、各段の培地収容部２２，２２間の余白部を利用して、カラ－チャ－ト２５とグレ－スケ－ルチャ－ト２６が表示されている。カラ－チャ－ト２５はいわゆる色見本配列表であり、グレ－スケ－ルを除く基本１２色を含むカラ－配列として表示されている。本例では１８色のカラ－チャ－ト２５が採用されている。グレ－スケ－ルチャ－ト２６は白から黒までの無彩色を明暗で階調表示したものである。これらカラ－チャ－ト２５およびグレ－スケ－ルチャ－ト２６はベ－ス２１上の上記所定箇所に印刷して表示しても良いし、市販されているものを貼着しても良い。
　次に、このトレイを用いて行うコロニーカウント処理システムの概要について図４を参照して説明する。
　このシステムにおいて、ユ－ザは、インキュベ－ト済のフィルム型培地１０を載置収容したトレイ２０を裏返した状態でフラットベッドスキャナ３０（以下単に「スキャナ」と言う。）のガラス原稿台にセットして、該スキャナ３０の用法に従ってスキャンする。そして、このスキャン画像デ－タを、スキャナ３０にパラレルポ－トやＵＳＢなどを介して接続されているＰＣ４０からインタ－ネットなどのネットワ－クＮＥＴを通じて解析センタ５０に送信する。
　なお、この図ではユーザがスキャナ３０を用いて画像データを取得しているが前述したように、デジタルカメラによる撮影画像データを取得しても良い。この場合は、インキュベ－ト済のフィルム型培地１０を載置収容したトレイ２０を、必要に応じて三脚やスタンドなどを使用して正面からデジタルカメラで撮影し、その画像データをＳＤカードやＵＳＢを介して上記同様に解析センタ５０に送信する。
　したがって、ユ－ザにおいては、フィルム型培地１０と、インキュベ－ト済のフィルム型培地１０を載置収容するためのトレイ２０と、このトレイ２０の画像デ－タを取り込むためのスキャナ３０またはデジタルカメラと、スキャナ３０またはデジタルカメラに接続されると共に解析センタ５０とのデ－タ送受信を可能にするためのネットワ－クＮＥＴ環境に接続可能なＰＣ４０を備えるだけで良い。ここで、ＰＣ４０およびネットワ－クＮＥＴ環境は既にほとんどのユ－ザが所持および設定済であり、画像データの取得についても既述したように安価に市販されていて容易に入手可能な汎用的なスキャナやデジタルカメラを機種を問わずに使用することができ、新たなコスト負担をほとんど必要とせずにシステム構築が可能である。
　解析センタ５０は、ネットワ－クＮＥＴを介してユ－ザＰＣ４０とのデ－タ送受信を実行するウエブサ－バ５１と、ユ－ザＰＣ４０からネットワ－クＮＥＴおよびウエブサ－バ５１を介して受信したスキャン画像デ－タを後述のようにして補正した上でコロニーカウントする処理サ－バ５２と、処理サ－バ５２で処理した後のコロニーカウントデ－タを保存するデ－タベ－ス５３を備えている。
　ここで、ユ－ザインタ－フェ－ス（ＵＩ）はＪＡＶＡ（登録商標）アプレットやＦＬＡＳＨ（登録商標）などのブラウザ上で動作するアプリケーションとし、ユーザは特別なソフトウェアをスト－ルする必要なしに、ウエブサ－バ５１とネットワ－クＮＥＴ接続されている環境において所定のウエブサイトから所定のソフトウェアをＰＣ４０にダウンロ－ドすることができる。
　次に、図４のシステム構成においてコロニーカウント処理を行うときの概略的なフロ－を図５を参照して説明する。
　前述したように、ユ－ザは、図１のフィルム型培地１０を用い、所定の希釈率で希釈された検体を滅菌ピペットなどで培養層１３に所定量（たとえば１ｍＬ）滴下した後、このフィルム型培地１０を孵卵器に入れて所定温度（たとえば３６℃）および所定期間（たとえば４８時間）インキュベ－トする（図５：Ｓ１）。
　各フィルム型培地１０にはあらかじめシリアルナンバ－が二次元コ－ド１７として表示され、また、該培地１０の培養層１３の培地種類や消費期限その他の検体情報を示すデ－タがあらかじめバ－コ－ド１８として表示され、あるいは検体情報記入欄１６にユ－ザが書き込むことによって表示されている。また、各フィルム型培地１０の培養層１３でインキュベ－トした検体の希釈率がユ－ザによる書き込みで希釈率記入欄１５（または検体情報記入欄１６）に表示されている。
　そして、インキュベ－ト済のフィルム型培地１０をトレイ２０の培地収容部２２に載置収容する（図５：Ｓ２）。本例のトレイ２０は６個の培地収容部２２を有するので、最大６個のフィルム型培地１０を載置収容可能であり、これによって同時に最大６個のフィルム型培地１０についてインキュベ－ト済検体を解析処理することができる。
　図６には、６個の培地収容部２２の各々にインキュベ－ト済フィルム型培地１０を載置収容したトレイ２０が示されている。
　次いで、このトレイ２０を裏返した状態、すなわちトレイ２０に載置収容したフィルム型培地１０が透明カバ－シ－ト１４を介してフラットベッドスキャナ３０（以下単に「スキャナ」と言う。）のガラス原稿台に向き合った状態にして、スキャナ３０にセットする（図５：Ｓ３）。
　そして、使用したスキャナ３０の通常の用法に従ってスキャニングして画像デ－タを取得する（図５：Ｓ４）。このようにして取得した画像デ－タ（元画像データ）は、図６に示されるトレイ平面図と実質的に同様の二次元画像デ－タである。
　なお、ここではスキャナ３０を用いて元画像データを取得しているが、前述したように、培地収容部２２の各々にインキュベ－ト済フィルム型培地１０を載置収容したトレイ２０をデジタルカメラで撮影することによって元画像データを取得しても良い。この場合は、三脚などを用いて、トレイ２０に対してトレイ中心からの垂線上に配置したデジタルカメラで撮影することが好ましい。
　取得した元画像デ－タを、スキャナ３０またはデジタルカメラに接続したユ－ザＰＣ４０からネットワ－クＮＥＴを介して解析センタ５０に送信する（図５：Ｓ５）。元画像データを一旦ＳＤカードなどの記録媒体に保存し、これをユーザＰＣから解析センタ５０に送信しても良い。解析センタ５０は、受信した元画像データを処理サ－バ５２で補正処理した上でコロニーカウントする（図５：Ｓ６）。
　処理サ－バ５２での解析の結果取得されたコロニーカウントデ－タは、検査対象の培地を表示したカラー画像（コロニーを確認できる画像）と一意に対応付けた計測結果データとして、解析センタ５０が備えるデ－タベ－ス５３に格納されると共に、ウエブサ－バ５１に収載されて送信元のユ－ザＰＣ４０に送信される（図５：Ｓ７）。これによりユ－ザは各フィルム型培地１０でインキュベ－ト後の検体に含まれる培地に存在するコロニーの種類や菌数などの解析結果をリアルタイムに知ることができ、また、デ－タベ－ス５３に格納されたデ－タをネットワ－クＮＥＴを通じていつでも取得することができる。
　このようなシステムは、いわゆるクラウドコンピュ－ティングとして構築することが、ユ－ザの利便性を図る上で好ましい形態である（図４参照）。ユ－ザは、解析センタ５０によって提供されるサ－ビスを該センタが備えるサ－バ群（デ－タベ－スも含む）を意識することなく、また処理のためのソフトウエアをあらかじめダウンロ－ドする必要もなしに、あたかも自らのＰＣ４０上で処理していると同様の感覚で実行できるメリットがある。また、解析センタ５０が提供する画像処理やＵＩアプリケーションのソ－スなどは随時保守またはアップグレ－ド可能であり、これによってユ－ザは常に最新のサ－ビスを受けることができる。
　より具体的には、ユ－ザによる本サ－ビスの利用時間に応じた課金システムを導入することが好ましい。すなわち、本サ－ビスの利用を希望するユ－ザは、あらかじめ登録して顧客ＩＤを取得した上で、ＰＣ４０からネットワ－クＮＥＴを通じて解析センタ５０のウエブサ－バ５１にアクセスして本サ－ビス利用のためのソフトウエアをダウンロ－ドして起動させ、所要の画面にて顧客ＩＤを入力する。これによって本サ－ビスの利用が開始される。
　その後、当該ソフトウエアによって画面表示される処理手順に従って、インキュベ－ト済フィルム型培地１０を載置収容したトレイ２０をスキャナ３０にセットし（図５：Ｓ３）、元画像デ－タを取得し（図５：Ｓ４）、これを解析センタ４０にアップロ－ドして（図５：Ｓ５）、解析センタ４０の処理サ－バ５２による解析処理（図５：Ｓ７）を待つ。解析によって得られたコロニーカウントデ－タはウエブサ－バ５１に収載され、送信元ユ－ザＰＣ３０に画面表示される（図５：Ｓ７）ので、ユ－ザはこれを確認して本サ－ビスの利用を終了する。
　上記において、本サ－ビスの利用開始から利用終了までの時間に応じたサ－ビス利用料がユ－ザに課金される。
　また、解析結果としてのコロニーカウントデ－タを分析（合否判定）や報告書作成などの追加処理をユ－ザが希望する場合は、該処理のために必要な別のソフトをダウンロ－ドして実行させることができ、その利用時間に応じた追加サ－ビス利用料をユ－ザに課金するようにしても良い。
　時間に応じた課金システムを採用することに代えて、またはこれと併用して、ユーザに提供するサービスの内容（コロニーカウント処理する培地数、上記合否判定や報告書作成などの追加処理の有無など）に応じた課金システムを採用しても良い。また、単位処理ごとに課金したり、月極や年間一括払いなど、各種の短期・長期契約で課金システムを実行することが可能である。
　ところで、コロニーカウント処理においては、画素ごとの明度を比較することによって画像上のコロニーを認識している。すなわち、処理画像データ中の各画素について明度を測定し、所定の閾値より大きい明度を有する画素がコロニーの存在を示すものと判断する。しかしながら、本システムではユ－ザが手持ちのスキャナ３０でインキュベ－ト済フィルム型培地１０をスキャニングして取得した画像データや、手持ちのデジタルカメラで撮影した画像データが元画像デ－タとしてそのまま解析センタ５０に送られてくる。処理サ－バ５２においては、ユーザが元画像デ－タ取得に使用した機種や仕様を特定することができず、様々な機器を用いて様々なユーザからアップロードされてくる元画像データは解像度や画質の個体差がきわめて大きいものとなっている。したがって、正確なコロニーカウント数を計測するためには、処理画像データ中の画素の明度を統一的な基準で判定することが要求される。
　また、フィルム型培地１０の培養層１３には検査対象とする菌種によって異なる培地が用いられ、たとえば一般生菌の場合は培地にＴＴＣ（トリフェニルテトラゾリウムクロライド）を含ませておくことによりＴＴＣを還元して赤色のＴＰＦ（トリフェニルフォルマザン）を生じさせて赤色集落として観察され、黄色ブドウ球菌は酸性フォスファターゼにより酵素基質Ｘ－Ｐｈｏｓ（５ブロモ4クロロ３インドリルフォスフェート）を分解して青色のインディゴを生成する。大腸菌群は培地中の酵素基質が大腸菌群の持つβ－ガラクトシダーゼに反応してＸ－Ｇａｌ（５ブロモ４クロロ３インドリルβ－ガラクトシダーゼ）またはＭａｇｅｎｔａ－Ｇａｌ（５ブロモ６クロロ３インドリルβ－ガラクトシダーゼ）を加水分解し、酸化重合を経て赤紫ないし紫色のブロモクロロインディゴを生成し、大腸菌は特異的に持つβ－グルクロニダーゼが酵素基質Ｘ－ＧＬＵＣ（５ブロモ４クロロ３インドリルβ－グルクロニダーゼ）を上記同様に分解して青色のブロモクロロインディゴを生成する。
　ここで、単一菌種のコロニー数を計測する場合や菌種を区別する必要なくトータルのコロニー数を把握すれば十分な場合であれば色の判定は必須ではないが、たとえば大腸菌群と大腸菌の両方を同じ培地でインキュベートする場合において各菌種ごとにコロニー数を計測するためには、大腸菌群の赤紫～紫の集落と大腸菌の青色集落とを判別しなければならない。しかしながら、前述のように、本システムにおいてユーザから処理サーバ５２にアップロードされる元画像データは画質の個体差がきわめて大きく、これらの異なる菌種の色相の閾値を正確に把握することができない。したがって、菌種ごとのコロニーカウント計測を正確に行うためには、処理画像データ中の画素の色相についても統一的な基準で判定することが要求される。また、培養層１３に含まれる残渣などの異物と測定対象微生物とを識別するためにも色相を補正することが好ましい。
　また、ユーザが元画像データを取得するためにトレイ２０をスキャナ３０にセットする（図５：Ｓ３）際に、正しい位置にセットされなかったり傾いた状態でセットされることがあり、元画像データに位置ずれや傾きの誤差が含まれている可能性も考慮しなければならない。
　そこで、本発明では、処理サ－バ５２は、取得した元画像デ－タに含まれる位置認識マ－カ２４ａ～２４ｄにより該元画像デ－タの傾きを補正する処理を行い、さらに、該補正後の画像デ－タに含まれるカラ－チャ－ト２５およびグレ－スケ－ルチャ－ト２６を参照することにより元画像デ－タの色相および明度の個体差を極小化する処理を行う。これらの処理は図５：Ｓ６で行われるが、その詳細を別途図７のフロ－を参照して説明する。
　まず、ユ－ザがスキャナ３０で取得してウエブサ－バ５１にアップロ－ドした元画像デ－タを取得する（図７：Ｓ６１）。既述したように、この元画像デ－タには、ユ－ザが使用したスキャナ３０の機種依存性に伴う明度や色相などの個体差や、トレイ２０をスキャナ３０にセットする際の傾きや位置ずれなどの不統一要因が含まれている。
　そこで、最初の補正処理として、図７：Ｓ６１で取得した元画像デ－タの傾きを補正する処理を行う（図７：Ｓ６２）。この処理は、トレイ２０の四隅余白部に印刷されている位置認識マ－カ２４ａ～２４ｄの元画像デ－タ中の位置を検出することによって行う。たとえば図５に示すように、位置認識マーカ２４ａ～２４ｄが円とその中に表示される十字線とで構成されている場合、元画像データの各画素について外側に向かうにつれて輝度が所定の条件で変化するか否かを判定し、この条件を満たす画素を位置認識マーカ２４ａ～２４ｄの中心位置（座標）にあるものと判断する。
　すなわち、元画像デ－タの各画素を公知の変換式によりＲＧＢ表色系から輝度（Ｙ）に変換する。ここで、２つの画素同士の輝度の差が所定の閾値より小さいときに、それらは同一の輝度を有するものと判断する。そして、元画像デ－タの各画素について、以下の判定をおこなう。なお、ここでは輝度値レンジを０～２５５としている。
　まず、対象画素を中心とし、垂直から複数の角度方向に移動しながら輝度を調べていく。移動するにつれて中心の輝度が一旦異なる値となった後に再び中心の輝度と同一になり、さらに４方向の距離（半径）が一致したら、中心と半径から得られる円を仮定する（図８（ａ））。
　さらに、対象画素から隣接する同一輝度の画素を次々に繋げていくと、９０度間隔の４方向で円周に到達する（図８（ｂ））。
　以上の条件が満たされた場合、その画素は位置認識マ－カ２４ａ～２４ｄの中心であると判断する。なお、本実施例で用いるトレイ２０においては、位置認識マ－カ２４ａ～２４ｄのうち天地認識用の反転マーカ２４ｃは中心が白色、その他の位置認識マーカ２４ａ，２４ｂ，２４ｄは中心が黒色で表示されているので、位置認識マーカと判断されたもののうち、中心画素の輝度が所定の閾値（たとえば上記レンジの中間値）以上のものを白色表示の天地認識用反転マ－カ２４ｃと判断する。
　各位置認識マ－カから同一輝度で伸びる線分の一つをさらに伸ばしていくと、４つの位置認識マ－カ２４ａ～２４ｄが一組になって、中心座標を（ｃｘ，ｃｙ）とする長方形が特定される（図８（ｃ））ので、このときの各位置認識マ－カ２４ａ～２４ｄの中心画素の座標（ｘ１，ｙ１），（ｘ２，ｙ２），（ｘ３，ｙ３），（ｘ４，ｙ４）からこの長方形Ｒの傾きθを求める（数１）。スキャナによる読み取り精度の問題やデジカメ撮影画像などの場合に４つの位置認識マーカ２４ａ～２４ｄの座標を頂点とする矩形が正しい長方形にならずに歪むことも考えられるが、その場合には近似値から長方形Ｒを仮定する。
　ユーザから取得した元画像データ中のすべての画素について、傾きθを逆方向に回転させた補正座標を求めることを繰り返す。元画像データの座標（Ｘ１，Ｙ１）の補正座標を（Ｘ２，Ｙ２）とし、傾き補正された長方形Ｒ’の幅をWIDTH、高さをHEIGHTとすると、数２が得られる。傾き補正後の長方形Ｒ’の頂点の座標は、左上頂点を原点として、右上頂点（WIDTH－１，０）、左下頂点（０，HEIGHT－１）、右下頂点（WIDTH－１，HEIGHT－１）で表すことができるので、この補正後の長方形Ｒ’の中の各座標（Ｘ２，Ｙ２）から逆に補正前の座標（Ｘ１，Ｙ１）を数２で求めていく。求めたＸ１，Ｙ１の値は公知の丸め処理により整数化したものである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000001
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000002
　上記処理によって得られた補正画像データＡは、元画像データの長方形Ｒ内の各画素座標（Ｘ１，Ｙ１）が傾き補正された長方形Ｒ’内の補正座標（Ｘ２，Ｙ２）に変換された画素の集合体であり、たとえばユ－ザから取得した元画像デ－タが図９（ａ）のように傾いていた場合であっても、図９（ｂ）のように傾き補正した補正画像デ－タＡが得られる。
　この補正画像デ－タＡは、数２から明らかなようにサイズ（幅と高さ）および中心座標（ｃｘ，ｃｙ）で定められる傾きのない長方形にトリミングされている。処理サーバ５２は、トレイ２０におけるインキュベート済フィルム型培地１０の領域（すなわち培地収容部２２の領域）および各インキュベート済フィルム型培地１０に含まれる培養層１３の領域、カラーチャート２５およびグレースケールチャート２６の領域ならびにこれらチャートにおける各色表示領域などを、あらかじめ位置認識マーカ２４ａ～２４ｄで特定される長方形に対応付けた相対的位置（論理座標）のデータを保有している。したがって、元画像データを取り込む際にユーザが正しい位置にトレイ２０をセットしなかったり、その際に用いた機種の精度が低いような場合であっても、各領域を正確に把握することができる。
　また、ユーザがトレイ２０を天地逆にしてスキャナ３０にセットしたような場合、上記処理により傾き補正して得られる補正画像データの長方形も天地逆になるが、この場合は、長方形の頂点となる４つの位置認識マーカ２４ａ～２４ｄにおける反転マーカ２４ｃの位置関係（座標）から元画像データにおいて天地が逆になっていると判断することができるので、得られた補正画像データをさらに１８０度回転させて天地補正したものとを補正画像データＡとする。
　なお、トレイ２０では四隅に位置認識マーカ２４ａ～２４ｄを設け、元画像データにおけるこれら位置マーカ２４ａ～２４ｄの画素座標から長方形Ｒを特定した上で傾き補正処理を行っているが、上記処理において明度変化に基づいて座標位置および徴兵系を特定できるものであれば位置マーカ２４ａ～２４ｄの具体的構成は問われない。たとえば、トレイ２０の外縁部を囲むように黒塗りされた枠や、四隅に表示した四角形や二等辺三角形あるいは「＋」印などを位置情報（目印）として傾き補正処理に用いても良い。
　次に、この補正画像デ－タＡについて画質補正処理を行う（図７：Ｓ６３）。一例として、スキャナ３０で取得した画像デ－タは各画素デ－タがＲＧＢ表色系によって表されているが、これを一旦色相（Ｈ）・明度（Ｌ）・彩度（Ｓ）により表現したＨＬＳ表色系に変換し、テ－ブル値との比較および線形補間して画質補正を行った後に再びＲＧＢ表色系に変換することで、画質補正処理を行うことができる。
　まず、トレイ２０に印刷表示されているカラ－チャ－ト２５の各色に色相順に１から番号を付け、これに基準値と計測値とを対応付けてカラ－比較テ－ブルを作成し、処理サ－バ５２が備えるメモリに格納しておく。カラ－比較テ－ブルの一例を表１に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
　同様に、トレイ２０に印刷表示されているグレ－スケ－ルチャ－ト２６の各色に明度順に１から番号を付け、これに基準値と計測値とを対応付けてグレ－スケ－ル比較テ－ブルを作成し、処理サ－バ５２が備えるメモリに格納しておく。グレ－スケ－ル比較テ－ブルの一例を表２に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
　ここで、基準値は、あらかじめ基準とする特定のスキャナでカラ－チャ－ト２５の各色およびグレースケールチャート２６の各色のデ－タを取得し、上記（１）の処理によりＲＧＢ表色系からＨＬＳ表色系に変換した値である。計測値は、ユ－ザＰＣ４０からアップロ－ドされた元画像デ－タに含まれるカラーチャート２５の各色およびグレースケールチャートの各色（グレースケール）に対応する部分の各画素をＲＧＢ表色系からＨＬＳ表色系に変換した値である。
　なお、各色のデ－タとは、その領域に含まれる複数画素のＲＧＢ各要素を平均化した値とする。
　その後、画像デ－タの各画素をＨＬＳ表色系に変換した値Ｈ，Ｌ，Ｓについて、以下のようにして色相および明度を補正する。
　色相Ｈについては、前述のカラー比較テーブルを参照して、たとえば次のようにして補正色相値ｈを求めることができる。なお、ここでは色相値レンジを１～３６０としている。
　Ｈ≧Ｈ’ｍａｘのときは、
　　ｈ０＝Ｈｍａｘ
　　ｈ１＝Ｈ１＋３６０
　　ｈ’０＝Ｈ’ｍａｘ
　　ｈ’１＝Ｈ’１
であり、ここでもしも　ｈ’０ ＞ｈ’１ならば、ｈ’１＝ｈ’１＋３６０　とする。
　Ｈ＜Ｈ’１のときは、
　　ｈ０＝Ｈｍａｘ－３６０
　　ｈ１＝Ｈ１
　　ｈ’０＝Ｈ’ｍａｘ
　　ｈ’１＝Ｈ’１
であり、ここでもしも　ｈ’０ ＞ｈ’１ならば、ｈ’０＝ｈ’０－３６０　とする。
　上記以外の場合は、Ｈ’ｎ≦Ｈ＜Ｈ’ｎ＋１となるｎを１から増分して見つける。
　　ｈ０＝Ｈｎ
　　ｈ１＝Ｈｎ＋１
　　ｈ’０＝Ｈ’ｎ
　　ｈ’１＝Ｈ’ｎ＋１
　そして、次の数式から補正色相値ｈを求める。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000005
　ここで、もしも　ｈ＜０ならば、ｈ＝ｈ＋３６０　とする。もしも　ｈ＞３６０ならば、ｈ＝ｈ－３６０　とする。
　明度についても、前述のグレースケール比較テーブルを参照して、上記と略同様にして補正明度値ｌを求めることができる。
　このようにして補正されたＨＬＳ表色系の値であるｈ，ｌ，ｓ（ここでは彩度補正は行っていないのでｌ＝Ｌ）をＲＧＢ表色系の値に変換する。
　以上により、傾き補正された補正画像デ－タＡをさらに画質補正処理して機種依存による画質個体差を解消した補正画像デ－タＢを得ることができる。傾き補正を行うことで、ユーザが元画像データ取り込みの際の位置ずれや使用機器の精度誤差などがあっても、補正画像データＡ中の相対座標を把握することで、検査対象となる培養層１３やチャート２５，２６その他の解析を要する領域を正確に特定することができる。また、画質補正処理を行うことで、大腸菌群と大腸菌の両方を同じ培地でインキュベートするような場合であっても、機種依存性を排して、大腸菌群の赤紫～紫の集落と大腸菌の青色集落とを色相の閾値で判別することができ、各菌種ごとにコロニー数を計測することが可能となり、さらには培養層１３に含まれる残渣などの異物との識別も可能となる。
　処理サーバ５２は、この補正画像データＢについてコロニーカウント処理を行う（図７：Ｓ６４）。具体的には、補正画像データＢの長方形において相対座標で特定される培養層１３について、所定の順序で移動させながら、各培養層画像領域に含まれるコロニー数を（必要に応じて菌種ごとに）測定する。このコロニーカウント処理については、出願人である株式会社エルメックスが提供するコロニーカウンティングシステム「アイザック／ｉＳａｃ」（登録商標）などを使用して行うことができ、該処理自体は公知であるので、詳細な説明を省略する。
　なお、上記説明においては元画像データの補正処理として、まず傾きを補正して補正画像データＡを得た（図７：Ｓ６２）後に、この補正画像データＡを基にして画質補正して補正画像データＢ（最終的な補正画像データ）を得る（図７：Ｓ６３）ものとしているが、この補正処理の順序は限定的ではなく、取得した元画像データについて、最初に画質補正処理を行い、次に傾き補正処理を行っても良い。ただし、画質補正処理は元画像データ中の培養層１３に対応する領域およびカラースケール２５，グレースケール２６に対応する領域について行えば良いので、上記したように、まず傾き補正処理を行ってこれらの領域を正確に特定した上で画質補正処理を行うことが好ましい。
　以上の説明では、複数のインキュベート済みフィルム型培地１０をトレイ２０に載置収容して元画像データを取得するものとしたが、一またはごく少数のフィルム型培地だけを検査することが多い運用の場合は、処理する元画像データ上での無駄が多くなり、トレイ２０を使用することの利便性が薄れる。このような場合に適した本発明の実施形態について以下に詳述する。
　この実施形態では、既述実施例１で使用した複数のフィルム型培地１０を載置収容可能なトレイ２０を使用しないが、処理サーバ５２で傾き補正を行う（図７：Ｓ６２）ために使用する位置認識マーカ２４ａ～２４ｄと、画質補正を行う（図７：Ｓ６３）ために使用するカラーチャート２５およびグレースケールチャート２６が、処理サーバが取得する元画像データに含まれていなければならない。
　このため、まず画質補正用のツールとして、カラーチャート２５およびグレースケールチャート２６が表示されたチャートシート２７（図１０）を用いる。カラーチャート２５およびグレースケールチャート２６は、既述実施例１においてトレイ２０に表示されたものと同一であって良い。チャートシート２７には、周囲余白部の四隅に位置認識マーカ２８ａ～２８ｄがあらかじめ表示されており、そのうちの一つ２８ｃが天地認識用の反転マーカである。
　また、フィルム型培地１０Ａとして、既述実施例１で使用したフィルム型培地１０の構成に加えて、周囲余白部の四隅に位置認識マーカ１９ａ～１９ｄがあらかじめ表示されており、そのうちの一つ１９ｃが天地認識用の反転マーカである（図１１）。位置認識マーカ１９ａ～１９ｄ，２８ａ～２８ｄは、既述実施例１においてトレイ２０に表示された位置認識マーカ２４ａ～２４ｄと実質的に同一であって良い。
　すなわち、ユーザが元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールとして、既述実施例１では位置認識マーカ２４ａ～２４ｄと、カラーチャート２５およびグレースケールチャート２６とがあらかじめ表示されたトレイ２０を使用したが、この実施形態では、フィルム型培地１０Ａにあらかじめ表示された位置認識マーカ１９ａ～１９ｄと、このフィルム型培地１０Ａとは別体として用意されたチャートシート２７にあらかじめ表示された位置認識マーカ２８ａ～２８ｄとカラーチャート２５、グレースケールチャート２６とからなる該画像取込ツールを使用するものである。
　この実施形態によるコロニーカウント処理も、既述実施例１の場合と同様にして行うことができる。すなわち、位置認識マーカ１９ａ～１９ｄ付きのフィルム型培地１０Ａを用いて所定条件でインキュベートし（図５：Ｓ１）、この一またはごく少数のインキュベート済フィルム型培地１０Ａを、位置認識マーカ２８ａ～２８ｄ付きのチャートシート２７と共に、いずれも裏返した状態にしてスキャナ３０のガラス原稿台にセットする（図５：Ｓ３）。以下同様にして図５：Ｓ４～Ｓ７の処理を実行する。異なるインキュベート済フィルム型培地１０Ａを順次に処理する場合は、チャートシート２７はスキャナ３０に置いたままにして、インキュベート済フィルム型培地１０Ａを交換してスキャニングすれば良い。スキャナ３０に代えてデジタルカメラで撮影して元画像データを取得しても良いことも、既述実施例１で説明したと同様である。
　この場合も、ユーザＰＣ４０からウエブサーバ５１を介して処理サーバ５２に送信される元画像データには、フィルム型培地１０Ａの四隅に表示された位置認識マーカ１９ａ～１９ｄおよびチャートシート２７に表示されたカラーチャート２５，グレースケールチャート２６が含まれているので、これらを用いて傾き補正処理（図７：Ｓ６２）および画質補正処理（図７：Ｓ６３）を行って、元画像データの機種依存性ないし個体差を極小化することができる。これらの補正処理は図７を参照して既述したと同様にして行うことができるので、説明を省略する。
　既述実施例１で詳しく説明したように、インキュベート済フィルム型培地１０Ａおよびチャートシート２７の位置およびそれらの中の各領域（培養層１３やチャート内の各色など）は、位置認識マーカ１９ａ～１９ｄ，２８ａ～２８ｄで定義される長方形の画像データ中の相対位置で自動認識されるので、元画像データにおけるフィルム型培地１０Ａとチャートシート２７の配置は自由である。たとえば、スキャナ３０にインキュベート済フィルム型培地１０Ａとチャートシート２７とをセットする際に、これらをラフに並べて図１２に例示するような元画像データとして取得されたような場合であっても、各パーツそれぞれに設けられた位置認識マーカ１９ａ～１９ｄ，２８ａ～２８ｄを基にして処理サーバ５２が傾き補正処理（図７：Ｓ６２）および画質補正処理（図７：Ｓ６３）を行うことができる。
　なお、図１０ではカラーチャート２５とグレースケールチャート２６の両方が表示されたチャートシート２７とされているが、カラーチャート２５とグレースケールチャート２６とで別々のチャートシートを作成して使用しても良い。別々のチャートシートとする場合は、各チャートシートに位置認識マーカを表示させておく必要がある。
　この実施形態は既述実施例２の変形例であり、位置認識マーカ１９ａ～１９ｄに加えてカラーチャート２５およびグレースケールチャート２６をも表示したフィルム型培地１０Ｂ（図１３）を用いるものである。このフィルム型培地１０Ｂは、既述実施例１におけるトレイ２０の機能をフィルム型培地自体に包含させたものと言える。すなわち、この実施形態では、ユーザが元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールを構成する位置認識マーカ１９ａ～１９ｄと、カラーチャート２５およびグレースケールチャート２６が、いずれもフィルム型培地１０Ｂ自体にあらかじめ表示されている。
　このフィルム型培地１０Ｂを用いた場合の処理は既述実施例２と同様であるので、説明を省略する。
　既述実施形態では、処理サーバ５２がユーザから取得する各元画像データには、インキュベート済フィルム型培地１０，１０Ａ，１０Ｂの画像に加えて、傾き補正処理（図７：Ｓ６２）を行うための位置情報（すなわち位置認識マーカ２４ａ～２４ｄあるいは所定の長方形）および画質補正処理（図７：Ｓ６３）を行うための画質情報（カラーチャート２５，グレースケールチャート２６）が含まれている。したがって、処理サーバ５２は、ユーザから元画像データを取得する都度、その元画像データに基づいて傾き補正を行うと共に画質補正処理を行う。
　傾き補正については、元画像データ取込の際に使用するスキャナ３０などの機種が本来的・固有的に有している機種依存性による変動要因だけでなく、ユーザが元画像データを取り込むときにインキュベート済フィルム型培地収容トレイ２０やインキュベート済フィルム型培地１０Ａ，１０Ｂをスキャナ３０にセットする際の位置ずれなども起こり得るので、正確なコロニーカウント処理を行うためにはその都度傾き補正を行う必要があり、したがって、ユーザから取得する元画像データには常にこの傾き補正を行うための位置情報が含まれている必要がある。
　一方、画質補正については、ユーザが使用する機器の機種依存性による変動要因と、当該機器の経年による解像度などの性能変化を考慮すれば十分であり、ユーザから順次に送信されてくるインキュベート済フィルム型培地の画像データについてその都度画質補正処理を行う必要性に乏しいと考えられる。したがって、より簡便なシステム構成においては、たとえば既述したようにクラウドコンピューティングによるサービス提供を受けようとするユーザは、最初に使用機器の機種依存性に基づく画質補正に必要な情報を送信し、その後、傾き補正に必要な情報と共にインキュベート済フィルム型培地の画像データを順次に送信する。あるいは、逆に、傾き補正に必要な情報と共にインキュベート済フィルム型培地の画像データを順次に送信し終えた後に、使用機器の機種依存性に基づく画質補正に必要な情報を送信する。
　この場合のシステム構成におけるコロニーカウント処理は図５のフローに示される通りであるが、そのＳ６で行われる具体的処理として、図７：Ｓ６１で取得する元画像データは、インキュベート済フィルム型培地の撮像データと共に傾き補正用に必要な位置情報を含む第一の元画像データと、画質補正用に必要な画質情報を含む第二の元画像データとからなる。そして、ユーザは一連のインキュベート済フィルム型培地について処理サーバ５２によるコロニーカウント処理を依頼する場合、第一の元画像データを必要分だけ順次に送信する前または後に、一回だけ、第二の元画像データを送信すれば良い。
　上記のようにシステム構成した場合、第一の元画像データには画質補正用の情報（カラーチャート２５，グレースケールチャート２６）を必要としない。したがって、第一の元画像データを順次に取り込む際には既述実施例２で用いたフィルム型培地１０Ａ（図１０）を使用し、第二の元画像データを取り込む際（最初または最後の一回のみ）には既述実施例２で用いたチャートシート２７（図１１）を使用することができる。すなわち、この場合は、図１２に示すようにフィルム型培地１０Ａとチャートシート２７の両方をスキャナ３０にセットして画像を取り込むのではなく、第一の元画像データを順次に取り込む際には培養層１３でインキュベートした後のフィルム型培地１０Ａのみを任意数だけスキャナ３０にセットして画像を取り込み、第二の元画像データを一回取り込む際にはチャートシート２７のみをセットして画像を取り込む。
　この場合の具体的処理について、図１４のフローを参照して説明する。処理サーバ５２は、インキュベート済フィルム型培地の撮像データと共に傾き補正用に必要な位置情報を含む第一の元画像データを順次に取得し（図１４：Ｓ６０１）、これら第一の元画像データについて各々傾き補正処理を行って、各第一の元画像データについて傾き補正された補正画像データＡを得る（図１４：Ｓ６０２）。このときの傾き補正処理については既述したと同様にして行うことができるので、説明を省略する。
　第一の元画像データの取得後、画質補正用の情報を含む第二の元画像データを取得し（図１４：Ｓ６０３）、これに基づいて画質補正処理を行う（図１４：Ｓ６０４）。このときの画質補正処理についても既述したと同様にして行うことができるので、説明を省略する。この画質補正処理結果を全ての補正画像データＡに一元的に適用して補正画像データＢを得る（図１４：Ｓ６０５）。これによってユーザ使用機器の機種依存性による画質変動要因が排除されるので、後のコロニーカウント処理（図１４：Ｓ６０６）における正確性が担保される。
　なお、図１４のフローでは第一の元画像データを順次取得した後に第二の元画像データを取得するものとしているが、最初に第二の元画像データを取得してその画質処理結果を保持しておき、その後に順次取得する第一の元画像データを傾き補正すると共に画質処理結果を一元適用する処理フローを採用しても良い。
　この場合に用いるチャートシート２７についても、図１１に示すようにカラーチャート２５とグレースケールチャート２６の両方が一つのチャートシート２７に表示されているものであっても良いし、カラーチャート２５とグレースケールチャート２６が別々のチャートシートとして作成されたものであっても良い。いずれの場合であってもチャートシート２７の構成は任意であり、既述の傾き補正処理（図１４：Ｓ６０２）を行うための位置情報（位置認識マーカ２８ａ～２８ｄなどの目印となるもの）を有し且つ既述の画質補正処理（図１４：Ｓ６０５）を行うことができるものであればいかなる構成を有するものであっても良い。
　図１５は上記実施例４において使用可能なトレイ６０を示す。このトレイ６０は、所定数のフィルム型培地１０（図１）を載置収容可能に構成されており、ＰＥＴなどの樹脂シートや厚紙などから所定サイズ（Ａ４など）の平板状に成形されたベース６１に、フィルム型培地１０の形状およびサイズに応じた形状およびサイズの培地収容部６２，６２・・・が所定の位置および配列で設けられている。本例では、最大８個のフィルム型培地１０を載置収容可能とするべく、４段×２列に形成された計８個の培地収容部６２，６２・・・を有している。
　各培地収容部６２の一つの対角線位置にスリット６３ａ，６３ｂが形成されていて、これらスリット６３ａ，６３ｂにインキュベート済のフィルム型培地１０の対角部を差し込むことによってフィルム型培地１０を所定位置に保持するようにしている。対角部をスリット６３ａ，６３ｂに差し込んで保持するので、スキャナ３０にセットする際に裏返しても脱落することなくしっかり保持することができる。図示例では一方のスリット６３ａを円弧状に切り抜いて形成することによってフィルム型培地１０の角部の挿入を容易にしているが、スリット６３ａ，６３ｂの形状は任意であり特に限定されない。あるいは、このようなスリットを省略し、インキュベート済のフィルム型培地１０を両面テープや接着剤などで培地収容部６２に貼り付けるようにしても良い。
　トレイ６０の外周部は黒塗りされた枠部６４とされ、中央には同様に黒塗りされた帯状部６５が形成されている。実施例１のトレイ２０には位置認識マーカ２４ａ～２４ｄが設けられ（図２）、処理サーバ５２が第一の元画像データの傾きを補正する（図７：Ｓ６２）際の位置情報として用いられるが、この実施例のトレイ６０では位置認識マーカ２４ａ～２４ｄが省略され、代わりに枠部６４を設けて傾き補正用の位置情報として用いるものとしている。この実施形態の場合においても、実施例１において説明したと同様に、第一の元画像データに含まれる各画素について所定方向に移動させたときの輝度変化を測定することによって枠部６４に囲まれる長方形Ｒを特定することができるので、図８（ｃ）および図９を参照して既述したと同様の手法により、第一の元画像データ中の長方形Ｒに傾きや歪みがあっても適正に補正処理することができる。また、中央の帯状部６５を位置情報として傾き補正処理を行うことも可能である。
　図１６は上記実施例５のトレイ６０の変形例によるトレイ７０を示す。このトレイ７０も、トレイ６０と同様に、所定数のフィルム型培地１０（図１）を載置収容可能に構成されており、ＰＥＴなどの樹脂シートや厚紙などから所定サイズ（Ａ４など）の平板状に成形されたベース７１に、フィルム型培地１０の形状およびサイズに応じた形状およびサイズの培地収容部７２，７２・・・が所定の位置および配列で設けられている。本例では、最大６個のフィルム型培地１０を載置収容可能とするべく、３段×２列に形成された計６個の培地収容部７２，７２・・・を有している。
　このトレイ７０は、３つの異なるタイプのフィルム型培地を載置収容可能な兼用型として構成されている。すなわち、各培地収容部７２にはスリット７３ａ～７３ｅが形成されていて、スリット７３ｃはスリット７３ｂの対角位置に設けられ、スリット７３ｄとスリット７３ｅはスリット７３ａの対角位置に設けられている。そして、第一のタイプのフィルム型培地８０Ａはスリット７３ａ，７３ｂおよび７３ｃを利用して保持可能であり、第二のタイプのフィルム型培地８０Ｂはスリット７３ａおよび７３ｄを利用して保持可能であり、第三のタイプのフィルム型培地８０Ｃはスリット７３ａおよび７３ｅを利用して保持可能である。図１６には、便宜的に、各１個のフィルム型培地８０Ａ，８０Ｂ，８０Ｃをこれらスリットを利用して右列中段、右列下段および左列下段の各培地収容部７２に保持した状態が示されている。いずれのフィルム型培地８０Ａ，８０Ｂ，８０Ｃも少なくとも一つの対角部がスリットに挿入されるので、既述のトレイ６０と同様にスキャナ３０にセットする際に裏返しても脱落することなくしっかり保持することができる。
　図示例では片側のスリット７３ａ，７３ｂを直線状に形成しながら、他側のスリット７３ｃ～７３ｅを円弧状に形成してフィルム型培地１０の角部の挿入を容易にしているが、各スリット７３ａ～７３ｅの形状は任意であり特に限定されない。あるいは、このようなスリットを省略し、フィルム型培地８０Ａ，８０Ｂ，８０Ｃを両面テープや接着剤などで各培地収容部７２における対応区画に貼り付けるようにしても良い。
　トレイ７０の外周部は黒塗りされた枠部７４とされ、これが傾き補正用の位置情報として用いられることについては上記実施例５のトレイ６０と同様であり、その際の傾き補正処理も同様であるので、説明を省略する。
　なお、実施例５のトレイ６０および実施例６のトレイ７０にはいずれも天地補正用の位置情報（実施例１のトレイ１０における反転マーカ２４ｃ）が含まれていないので、スキャナ３０へのセットやデジカメでの撮影時には、規定の天地が得られるように注意して画像取込を行う必要がある。もちろん、これらのトレイ６０，７０に天地補正用の位置情報を設けることも可能である。
１０，１０Ａ，１０Ｂ　フィルム型培地
　１１　基材シート
　１２　枠
　１３　培養層
　１４　カバーシート
　１５　希釈率記入欄
　１６　検体情報記入欄
　１７　シリアルナンバーバーコード
　１８　検体情報バーコード
　１９ａ～１９ｄ　位置認識マーカ
　１９ｃ　天地認識用の反転マーカ
２０　トレイ
　２１　ベース
　２２　フィルム型培地の収容部
　２３　係止溝
　２４ａ～２４ｄ　位置認識マーカ
　２４ｃ　天地認識用の反転マーカ
　２５　カラーチャート
　２６　グレースケールチャート
２７　チャートシート
３０　フラットベッドスキャナ
４０　ＰＣ
５０　解析センタ
　５１　ウエブサーバ
　５２　処理サーバ
　５３　データベース
６０　トレイ
　６１　ベース
　６２　フィルム型培地の収容部
　６３ａ，６３ｂ　スリット
　６４　枠部
　６５　帯状部
７０　トレイ
　７１　ベース
　７２　フィルム型培地の収容部
　７３ａ～７３ｅ　スリット
　７４　枠部
８０Ａ，８０Ｂ，８０Ｃ　フィルム型培地

Claims (13)

  1. フィルム型培地の培養層で検体をインキュベ－トした後の該フィルム型培地の元画像データをユーザからのデータ送信によって取得する元画像データ取得ステップと、取得した元画像データの傾きを補正する第一の補正ステップと、取得した元画像データの画質を補正する第二の補正ステップと、これら第一および第二の補正ステップで得た補正画像データを用いて培養層中のコロニー数をカウントする測定ステップと、を含むことを特徴とするフィルム型培地による微生物検査方法。
  2. 前記第一の補正ステップは、前記元画像データに含まれる位置情報から特定される矩形の傾き角度を補正する処理を含み、前記測定ステップは、前記第一の補正ステップで補正された後の矩形内においてフィルム型培地の培養層に対応する画像領域内でコロニー数をカウントすることを特徴とする請求項１記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  3. 前記第二の補正ステップは、前記元画像データの各画素を明度補正する処理を含み、前記測定ステップは、補正された明度が閾値より大きいときにその画素がコロニーの存在を示すものと判定することを特徴とする請求項１または２記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  4. 前記第二の補正ステップは、さらに前記元画像データの各画素を色相補正する処理を含み、前記測定ステップは、補正された色相を基にしてコロニーの菌種を判定し、補正された明度を基にして菌種ごとのコロニー数をカウントすることを特徴とする請求項３記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  5. 前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地が装着されたトレイを描写する画像データであり、前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報および前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートがいずれも前記トレイにあらかじめ表示されていることを特徴とする請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  6. 前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地と該フィルム型培地とは別体として用意されたチャートシートとを含めて描写する画像データであり、前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報は各フィルム型培地にあらかじめ表示されており、前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートは前記チャートシートにあらかじめ表示されていることを特徴とする請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  7. 前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地を描写する画像データであり、前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報および前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートがいずれも各フィルム型培地にあらかじめ表示されていることを特徴とする請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  8. 前記元画像データは、一または複数の前記インキュベート済フィルム型培地と共に前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報を描写する第一の元画像データと、前記第二の補正ステップにおける補正処理に用いられるカラーチャートおよびグレースケールチャートを描写する第二の元画像データとからなり、前記元画像データ取得ステップは、前記第一の元画像データを取得する第一の元画像データ取得ステップと、前記第二の元画像データを取得する第二の元画像データ取得ステップとからなり、前記第一の元画像データ取得ステップで前記第一の元画像データを取得する都度前記第一の補正ステップを行って第一の元画像データについて各々第一の補正画像データを作成し、前記第二の元画像データ取得ステップで取得した前記第二の元画像データに基づいて行われる前記第二の補正ステップの処理結果を各第一の補正画像データに一元的に適用して第二の補正画像データを作成することを特徴とする請求項１ないし４のいずれか記載のフィルム型培地による微生物検査方法。
  9. 請求項５記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールが前記トレイからなり、該トレイは、インキュベート済フィルム型培地を装着可能な培地収容部を複数備えると共に、前記位置情報と、前記カラーチャートおよびグレースケールチャートがあらかじめ表示されていることを特徴とする画像取込ツール。
  10. 請求項６記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールは、前記フィルム型培地にあらかじめ表示された前記所定の矩形と、前記フィルム型培地とは別体として用意された前記チャートシートとからなることを特徴とする画像取込ツール。
  11. 請求項１０記載の画像取込ツールにおいて、前記チャートシートにも前記第一の補正ステップにおける補正処理に用いられる位置情報があらかじめ表示されていることを特徴とする画像取込ツール。
  12. 請求項７記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールが、あらかじめ前記フィルム型培地自体に表示された前記位置情報と前記カラーチャートおよびグレースケールチャートとからなることを特徴とする画像取込ツール。
  13. 請求項８記載のフィルム型培地による微生物検査方法においてユーザが前記第一の元画像データを取り込む際に使用する画像取込ツールであって、該画像取込ツールが前記トレイからなり、該トレイは、インキュベート済フィルム型培地を装着可能な培地収容部を複数備えると共に、前記位置情報があらかじめ表示されていることを特徴とする画像取込ツール。
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