KR20180056766A - 뉴클레오티드 조성물 및 이의 방법 - Google Patents

뉴클레오티드 조성물 및 이의 방법 Download PDF

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데이비드 찰스 도넬 버틀러
세투마드하반 디바카라메논
크리스토퍼 제이 프랜시스
마리아 데이비드 프랭크-카메네츠키
나오키 이와모토
건량 루
수브라마니안 마라판
미나
찬드라 바르게스
그레고리 엘 버딘
하이린 양
제이슨 징신 장
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Abstract

무엇보다도, 본 개시는 디자인된 올리고뉴클레오티드, 조성물, 및 이의 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 전사물의 변경된 스플라이싱을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 낮은 독성을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 개선된 단백질 결합 프로파일을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 개선된 전달을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 개선된 흡수를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물을 사용하여 질환을 치료하는 방법을 제공한다.

Description

뉴클레오티드 조성물 및 이의 방법
관련 출원의 참조 인용
본 출원은 2015 년 10 월 9 일자 출원된 미국 가출원 제 62/239,839 호, 2016 년 5 월 4 일자 출원된 제 62/331,961 호, 및 2016 년 5 월 4 일자 출원된 제 62/331,966 호에 대한 우선권을 주장하며, 상기 문헌은 각각 그 전문이 본원에 참조로 인용된다.
올리고뉴클레오티드는 치료, 진단, 연구 및 나노물질 적용에 있어서 유용하다. 치료를 위한 자연 발생 핵산 (예를 들어, 비(非)개질된 DNA 또는 RNA) 의 사용은, 예를 들어 세포외 및 세포내 뉴클레아제에 대한 이의 불안정성 및/또는 이의 불량한 세포 침투 및 분포로 인해 제한될 수 있다. 신규하고 개선된 올리고뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 조성물, 예컨대 신규한 안티센스 및 siRNA 올리고뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 조성물에 대한 요구가 존재한다.
개요
무엇보다도, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드의 구조 요소, 예컨대 염기 서열, 화학적 개질 (예를 들어, 당, 염기 및/또는 뉴클레오티드간 연결 (internucleotidic linkage) 의 개질, 및 이의 패턴), 및/또는 입체화학 (예를 들어, 백본 키랄 중심의 입체화학 (키랄 뉴클레오티드간 연결), 및/또는 이의 패턴) 이, 올리고뉴클레오티드 특성, 예를 들어 단백질 결합 특성, 예를 들어 안정성, 스플라이싱 (splicing)-변경 능력 등에 의해 중재될 수 있는, 활성, 독성에 유의한 영향을 미칠 수 있다는 인식을 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 제어된 구조 요소, 예를 들어 제어된 화학적 개질 및/또는 제어된 백본 입체화학 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물이, 비제한적으로, 특정 활성, 독성 등을 포함하여 예상치 못한 특성을 제공한다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드 특성, 예를 들어 활성, 독성 등이, 화학적 개질 (예를 들어, 당, 염기, 뉴클레오티드간 연결의 개질 등), 키랄 구조 (예를 들어, 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학 및 이의 패턴 등), 및/또는 이들의 조합에 의해 조절될 수 있다는 것을 입증한다.
특히, 일부 구현예에서, 본 개시는 전사물의 스플라이싱을 변경하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 전사물, 예컨대 프리-mRNA (pre-mRNA) 의 스플라이싱은, 전사물이 다수의 고등 진핵생물에서 이의 생물학적 기능을 수행하기 위한 필수적인 단계이다. 스플라이싱 과정에서의 결함 및/또는 불충분함은 생물학적 기능에 영향을 미치고/미치거나 병리학적 결과를 초래할 수 있다. 예를 들어, 다수의 인간 유전 질환은 스플라이싱 결함을 야기하는 돌연변이에 의해 유발되며, 다수의 질환이 명백한 돌연변이에 기인하지 않는 스플라이싱 결함과 관련이 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 특히 본 개시에 기재된 화학적 개질 및/또는 입체화학 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 통한 스플라이싱의 표적화가, 질환-관련 비정상 스플라이싱을 효과적으로 교정하고/하거나, 목적하는 생성물, 예를 들어 새로운 목적하는 생물학적 기능을 보수, 복원 또는 부가할 수 있는 mRNA, 단백질 등을 유도하는 유익한 스플라이싱을 도입 및/또는 증강시킬 수 있다는 것을 인식한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, DMD 의 돌연변이된 엑손 51 의 내포 (inclusion) 는 하나 이상의 다운스트림 엑손의 프레임시프트 (frameshift), 조기 종결 코돈 및/또는 결실을 야기할 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는 보다 짧지만 부분 관능성인 디스트로핀 (dystrophin) 이 생성될 수 있도록 해독 프레임을 복원하기 위하여, DMD 의 엑손 51 을 효과적으로 스킵핑 (skipping) 하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 보다 짧지만 부분 관능성인 디스트로핀이 생성될 수 있도록 해독 프레임을 복원하기 위하여, DMD 의 돌연변이 엑손 51 을 효과적으로 스킵핑하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 및 방법은, 목적하지 않는 스플라이싱 생성물의 수준을 효과적으로 감소시키기 위하여, 전사물의 스플라이싱을 변경시킬 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 프레임시프트 및/또는 조기 종결 코돈을 갖는 mRNA 를 생성하기 위하여 하나 이상의 프리-mRNA 의 엑손을 스킵핑함으로써, 제공된 조성물 및 방법은 효과적으로 유전자를 녹다운시키며; 일부 구현예에서, 이러한 유전자는 돌연변이 유전자이다. 당업자는, 제공된 기술 (올리고뉴클레오티드, 조성물, 방법 등) 이, 또한 질환 및/또는 병태를 치료하기 위하여, 본 개시에 따라, 다른 DMD 엑손, 또는 다른 전사물의 하나 이상의 엑손, 예를 들어 US 7,534,879 에 기재된 및 이에 참조로 인용된 것들의 엑손 스킵핑에 이용될 수 있다는 것을 인식하다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 화학적 개질, 입체화학 및 이들의 조합이, 비제한적으로, 전사물의 스플라이싱을 조절하는 이의 능력을 포함하여 올리고뉴클레오티드 조성물의 특성을 개선시키는데 사용될 수 있다는 인식을 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드에 의한 전사물의 스플라이싱 개선에 유용한 화학적 개질 및 이의 패턴을 제공한다.
무엇보다도, 본 개시는, 입체화학이 올리고뉴클레오티드 조성물에 의한 전사물의 스플라이싱 조절에 사용될 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 특성, 예를 들어 전사물의 스플라이싱을 변경시키는 이의 능력을 개선시키기 위한 화학적 개질 및 입체화학의 조합을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 기준 (reference) 조건 (예를 들어, 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재 (예를 들어, 동일한 염기 서열, 동일한 화학적 개질 등을 갖는 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 조성물, 또 다른 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 등), 및 이들의 조합) 과 비교하여, 하나 이상의 목적하는 생물학적 효과, 예를 들어 목적하는 단백질의 생성 증가, 프레임시프트 돌연변이 및/또는 조기 종결 코돈을 갖는 mRNA 의 생성에 의한 유전자의 녹다운, 프레임시프트 돌연변이 및/또는 조기 종결 코돈 등을 갖는 mRNA 를 발현하는 유전자의 녹다운을 전달할 수 있는 변경된 스플라이싱을 제공하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 기준 조건과 비교하여, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 놀랍게도 효과적이다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과 (예를 들어, 목적하는 mRNA, 단백질 등의 증가된 수준, 목적하지 않는 mRNA, 단백질 등의 감소된 수준에 의해 측정 시) 는, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50 또는 100 배 초과로 증강될 수 있다.
본 개시는 낮은 독성을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 이의 방법을 제공하고자 하는 시도를 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 감소된 독성을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 감소된 면역 반응을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드에 의해 유도된 다양한 독성이 보체 활성화와 관련이 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 감소된 보체 활성화를 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 대안적인 경로를 통한 감소된 보체 활성화를 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 전형적인 경로를 통한 감소된 보체 활성화를 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 감소된 약물-유도성 혈관 손상을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 감소된 주사 부위 염증을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 당업자에게 널리 공지되어 실시되는 하나 이상의 검정, 예를 들어 본원에 기재된 바와 같은 완전 활성화 생성물, 단백질 결합 수준의 평가 등을 통해 평가될 수 있다.
일부 구현예에서, 본 개시는 hTLR9 활성의 증강된 길항작용을 갖는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 특정 질환, 예를 들어 DMD 는, 예를 들어 근육 조직에서의 염증과 관련이 있다. 일부 구현예에서, 제공된 기술 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드, 조성물, 방법 등) 은, 염증과 관련된 하나 이상의 병태 및/또는 질환에 유익할 수 있는 hTLR9 안타고니스트 활성 및 (예를 들어, DMD 의 돌연변이 엑손 51 (또는 유전자형에 따른 다른 엑손) 의 엑손-스킵핑을 통해) 증강된 활성을 갖는 단백질을 모두 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및/또는 이의 조성물은, 엑손-스킵핑 능력 및 hTLR9 안타고니스트 활성 둘 모두를 제공한다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 지질 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, 지질과 콘쥬게이트된 올리고뉴클레오티드) 는, 예상치 못하게 높은 엑손-스킵핑 효율 및 hTLR9 안타고니스트 활성을 제공한다. 일부 구현예에서, 선결된 수준의, 하나 이상의 지질 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, 지질과 콘쥬게이트된 올리고뉴클레오티드) 를 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 예상치 못하게 높은 엑손-스킵핑 효율 및 hTLR9 안타고니스트 활성을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드 특성, 예를 들어 활성, 독성 등이, 화학적 개질을 통해 조절될 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 개질된 당 모이어티, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결, 또는 이들의 조합을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드 (first plurality of oligonucleotides) 를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 하나 이상의 개질된 당 모이어티, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결, 또는 이들의 조합을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 본 개시는 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공하며; 일부 구현예에서, 본 개시는 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공하며; 일부 구현예에서, 본 개시는 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공하며; 일부 구현예에서, 본 개시는 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 개질된 당 모이어티, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 수준이 선결되어 있고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결에서 공통 입체화학 배열을 공유한다는 점에서 키랄 제어된 것이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50 개 또는 그 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결에서 공통 입체화학 배열 (이는 각각 독립적으로 Rp 또는 Sp 임) 을 공유하고; 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결에서 공통 입체화학 배열을 공유한다. 일부 구현예에서, 조성물 중 선결된 수준의 올리고뉴클레오티드가 공통 입체화학 배열 (독립적으로 Rp 또는 Sp) 을 공유하는 키랄 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결로 지칭된다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 선결된 수준의 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 특정 예시 조성물의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50 개 또는 그 이상의 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결을 포함하며; 일부 구현예에서, 적어도 5 개의 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고; 일부 구현예에서, 적어도 10 개의 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고; 일부 구현예에서, 적어도 10 개의 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고; 일부 구현예에서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 키랄 제어된 것이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하고, 천연 포스페이트 연결은 포함하지 않으며, 코어는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 임의로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 코어는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 코어는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 코어는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 천연 포스페이트 연결은 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 윙은 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 치환된 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 본 개시에 기재된 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 2'-개질된 것이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-R1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-F 이다. 보다 상세하게 기재된 바, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 초과의 유형의 당 개질을 포함할 수 있고; 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2'-F 및 2'-OR1 개질을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2'-F 및 2'-OMe 개질을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2'-F 및 2'-OMe 개질을 모두, 및 포스포로티오에이트 및 천연 포스페이트 연결을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 예를 들어 포스포로티오에이트 연결은 키랄 제어된 것이다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 제공된 조성물은 보다 낮은 독성을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 보다 낮은 보체 활성화를 갖는다.
일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 단백질 결합 프로파일, 예를 들어 저하된 유해한 단백질 결합 및/또는 증가된 유익한 단백질 결합을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 단백질 결합 프로파일을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공하는 것을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물의 개선된 전달 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드 조성물에 의한 단백질 결합이 화학적 개질, 입체화학 또는 이들의 조합을 통해 조절될 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 조성물에 의한 단백질 결합은 개질된 뉴클레오티드간 연결의 혼입에 의해 조절될 수 있다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결의 증가된 백분율은 특정 단백질에 대한 올리고뉴클레오티드의 증가된 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결의 천연 포스페이트 연결로의 대체는, 특정 단백질에 대한 감소된 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결의 개질된 뉴클레오티드간 연결로의 대체는, 특정 단백질에 대한 증가된 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 특정 화학적 개질은 특정 단백질에 대한 증가된 단백질 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 특정 화학적 개질은 특정 단백질에 대한 감소된 단백질 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 동일한 종류의 상이한 화학적 개질은 상이한 단백질 결합을 제공한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 2'-MOE 는 2'-OMe 와 비교하여 감소된 단백질 결합을 제공한다 (적어도 특정 맥락에서 - 예를 들어, 서열, 입체화학 등).
무엇보다도, 본 개시는, 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 제제가, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 사슬 내 개별적인 백본 키랄 중심의 입체화학적 구조에서, 서로 상이한 다수의 별개의 화학적 엔티티를 함유한다는 인식을 포함한다. 백본 키랄 중심의 입체화학의 제어가 없으면, 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 제제는 미결된 수준의 올리고뉴클레오티드 입체이성질체를 포함하는 비(非)제어된 조성물을 제공한다. 이러한 입체이성질체는 동일한 염기 서열 및/또는 화학적 개질을 가질 수 있지만, 이들은 적어도 이의 상이한 백본 입체화학으로 인해 화학적 엔티티가 상이하고, 본원에서 입증된 바와 같은 상이한 특성, 예를 들어 활성, 독성, 분포 등을 가질 수 있다. 무엇보다도, 본 개시는 관심있는 올리고뉴클레오티드의 특정 입체이성질체이거나 이를 함유하는 키랄 제어된 조성물을 제공하며; 키랄 비제어된 조성물과 대조적으로, 키랄 제어된 조성물은 올리고뉴클레오티드의 특정 입체이성질체를 선결된 수준으로 포함한다. 일부 구현예에서, 특정 입체이성질체는, 예를 들어 이의 염기 서열, 이의 길이, 이의 백본 연결의 패턴 및 이의 백본 키랄 중심의 패턴에 의해 정의될 수 있다. 당업계에서 이해되고 있는 바와 같이, 일부 구현예에서, 염기 서열은 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오시드 잔기의 (예를 들어, 아데닌, 시토신, 구아노신, 티민 및 우라실과 같은 표준 자연 발생 뉴클레오티드와 비교하여, 당 및/또는 염기 구성성분의) 동일성 및/또는 개질 상태, 및/또는 이러한 잔기의 하이브리드화 (hybridization) 특징 (즉, 특정 상보적 잔기와 하이브리드할 수 있는 능력) 을 나타낼 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드 내 특정 키랄 구조의 내포 및/또는 위치를 통해 달성되는 특성 개선 (예를 들어, 개선된 활성, 보다 낮은 독성) 이, 화학적 개질, 예를 들어 특정 백본 연결, 잔기 개질 등의 사용을 통해 (예를 들어, 특정 유형의 개질된 포스페이트 [예를 들어, 포스포로티오에이트, 치환된 포스포로티오에이트 등], 당 개질 [예를 들어, 2'- 개질 등] 및/또는 염기 개질 [예를 들어, 메틸화 등] 의 사용을 통해) 달성되는 것들에 필적하거나, 그 보다 더 우수할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 특정 화학적 개질 (예를 들어, 2'-F, 2'-OMe, 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결, 지질 콘쥬게이션 등) 을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이, 예상치 못하게 높은 엑손-스킵핑 효율을 나타낸다는 것을 입증한다.
무엇보다도, 본 개시는, 입체화학이 올리고뉴클레오티드 조성물의 독성을 조절하는데 사용될 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 동일한 염기 서열 및 화학적 개질을 공유하는 올리고뉴클레오티드의 상응하는 스테레오랜덤 (또는 키랄 비제어된) 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 보다 낮은 독성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 보다 많은 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 보다 낮은 독성을 갖는다. 일부 구현예에서, 단일 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결을 갖는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 다른 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 및/또는 동일한 염기 서열 및 화학적 개질을 공유하는 올리고뉴클레오티드의 상응하는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 증가된 독성을 갖는다. 일부 구현예에서, 단일 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결은 서열의 중간이 있다. 일부 구현예에서, 5'- 및/또는 3'-말단에 하나 이상의 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 보다 낮은 독성을 제공한다. 일부 구현예에서, 5'- 및/또는 3'-말단에 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 보다 낮은 독성을 제공한다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 치환된 포스포로티오에이트 연결이다.
무엇보다도, 본 개시는, 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 특성 (예를 들어, 활성, 독성, 분포, 약동학 등) 이, 임의로 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 다른 특징 (예를 들어, 화학적 개질, 개질의 패턴, 예컨대 연결 패턴, 뉴클레오시드 개질 패턴, 지질 또는 다른 모이어티에의 콘쥬게이션 등) 의 조정/최적화와 조합으로, 이의 백본 키랄 중심의 패턴을 최적화함으로써 조정될 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 특성 (예를 들어, 활성, 독성 등) 이, 임의로 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 다른 특징 (예를 들어, 화학적 개질, 개질의 패턴, 예컨대 연결 패턴, 뉴클레오시드 개질 패턴 등) 의 조정/최적화와 조합으로, 이의 백본 키랄 중심의 패턴을 최적화함으로써 조정될 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 화학적 개질, 예컨대 뉴클레오시드 및 뉴클레오티드간 연결의 개질이, 증강된 특성을 제공할 수 있다는 것을 인식하고 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 화학적 개질 및 입체화학의 조합이 예상치 못한 크게 개선된 특성 (예를 들어, 활성, 독성, 분포, 약동학 등) 을 제공할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 화학적 개질 및 입체화학의 조합이 예상치 못한 크게 개선된 특성 (예를 들어, 활성, 독성, 분포, 약동학 등) 을 제공할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 화학적 조합, 예컨대 당, 염기 및/또는 뉴클레오티드간 연결의 개질은, 입체화학 패턴과 조합되어, 낮은 독성, 보다 양호한 단백질 결합 프로파일 등을 포함하여, 놀랍게도 증강된 특성을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 것이고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 당 모이어티의 2'-개질, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결, 및 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 것이고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 당 모이어티의 2'-개질, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결, 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결의 조합을 포함하고, 여기서 5'- 및/또는 3'-말단 뉴클레오티드간 연결은 키랄이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-말단 뉴클레오티드간 연결은 모두 키랄이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-말단 뉴클레오티드간 연결은 모두 키랄이고 Sp 이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 것이고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 당 모이어티의 2'-개질, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결, 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 및 (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 임) 의 입체화학 패턴의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 치환된 포스포로티오에이트 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙 및 코어 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 갖고, 여기서 코어 영역은 하나 이상의 당 모이어티 및/또는 윙 영역에 있지 않는 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 갖고, 여기서 코어 영역은 하나 이상의 당 모이어티 및 윙 영역에 있지 않는 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 갖고, 여기서 코어 영역은 윙 영역에 있지 않은 하나 이상의 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 갖고, 여기서 코어 영역은 윙 영역에 있지 않는 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서의 각각의 당 모이어티는 개질된 것이다. 당 개질의 예는, 비제한적으로, 본 개시에 기재된 것들을 포함하여 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 코어는 키랄 제어된 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, Sp 또는 Rp 배열의 포스포로티오에이트) 및 키랄이 아닌 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, 포스포디에스테르 또는 포스포로디티오에이트) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 Sp 배열의 키랄 제어된 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 및 키랄이 아닌 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, 포스포디에스테르 또는 포스포로디티오에이트) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 개질된 당 모이어티를 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 뉴클레오시드에 뒤따르는 각각의 뉴클레오티드간 연결은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙은 키랄 제어된 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, Sp 또는 Rp 배열의 포스포로티오에이트) 및 키랄이 아닌 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, 포스포디에스테르 또는 포스포로디티오에이트) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 Sp 배열의 키랄 제어된 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 및 키랄이 아닌 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, 포스포디에스테르 또는 포스포로디티오에이트) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 뉴클레오시드에 뒤따르는 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 예를 들어, WV-1111 참조. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 키랄 제어된 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, Sp 또는 Rp 배열의 포스포로티오에이트) 및 연결 인에서 키랄이 아닌 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, 포스포디에스테르 또는 포스포로디티오에이트) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 Sp 배열의 키랄 제어된 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 및 연결 인에서 키랄이 아닌 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결 (예를 들어, 포스포디에스테르 또는 포스포로디티오에이트) 을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 블록머 (blockmer) 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 알트머 (altmer) 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 블록을 포함하는 알트머이다. 일부 구현예에서, 블록머 또는 알트머는 화학적 개질 (존재 또는 부재 포함), 예를 들어 염기 개질, 당 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질, 입체화학 등에 의해 정의될 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 천연 포스페이트 연결을 포함하는 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 천연 포스페이트 연결을 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록은 본원에 기재된 바와 같은 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 블록은 백본 키랄 중심의 동일한 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록은 백본 키랄 중심의 상이한 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록은 상이한 길이 및/또는 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록은 동일한 길이 및/또는 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록은 동일한 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 블록은 동일한 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단에 제 1 블록 (5'-블록), 및 3'-말단에 제 2 블록 (3'-블록) 을 포함하고, 이들은 각각 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-블록은 각각 독립적으로 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-블록은 각각 독립적으로 적어도 4 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-블록은 각각 독립적으로 적어도 5 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-블록은 각각 독립적으로 적어도 6 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-블록은 각각 독립적으로 적어도 7 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록 내 개질된 뉴클레오티드간 연결은 연속적이다. 일부 구현예에서, 5'-블록의 각각의 연결은 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 5'-블록의 각각의 연결은 독립적으로 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 5'-블록의 각각의 연결은 독립적으로 키랄 제어된 것이다. 일부 구현예에서, 5'-블록의 각각의 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 3'-블록의 각각의 연결은 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 3'-블록의 각각의 연결은 독립적으로 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 3'-블록의 각각의 연결은 독립적으로 키랄 제어된 것이다. 일부 구현예에서, 3'-블록의 각각의 연결은 Sp 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 당 개질을 포함하는 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 2'-F 개질 (2'-F 블록) 을 포함하는 하나 이상의 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 연속적인 2'-F 개질을 포함하는 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록은 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록은 4 개 이상의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록은 5 개 이상의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록은 6 개 이상의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록은 7 개 이상의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 2'-OR1 개질 (2'-OR1 블록) 을 포함하는 하나 이상의 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2'-F 및 2'-OR1 블록을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2'-F 및 2'-OR1 의 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단에 제 1 의 2'-F 블록, 및 3'-말단에 제 2 의 2'-F 블록을 포함하고, 이들은 각각 독립적으로 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 개질을 포함하며; 일부 구현예에서, 이들은 각각 독립적으로 4 개 이상의 2'-F 개질을 포함하며; 일부 구현예에서, 이들은 각각 독립적으로 5 개 이상의 2'-F 개질을 포함하며; 일부 구현예에서, 이들은 각각 독립적으로 6 개 이상의 2'-F 개질을 포함하며; 일부 구현예에서, 이들은 각각 독립적으로 7 개 이상의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 5'-블록의 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 5'-블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 3'-블록의 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 3'-블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 2'-OR1 블록, 및 임의로 5' 와 3' 2'-F 블록 사이에 하나 이상의 2'-F 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 2'-OR1 블록, 및 5' 와 3' 2'-F 블록 사이에 하나 이상의 2'-F 블록을 포함한다 (예를 들어, WV-3407, WV-3408 등).
일부 구현예에서, 블록은 입체화학 블록이다. 일부 구현예에서, 블록은, 블록의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 Rp 인 Rp 블록이다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 Rp 블록이다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 Rp 블록이다. 일부 구현예에서, 블록은, 블록의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 Sp 인 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Rp 및 Sp 블록을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 Rp 블록을 포함하지만, Sp 블록은 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 Sp 블록을 포함하지만, Rp 블록은 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 각각의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인 하나 이상의 PO 블록을 포함한다.
일부 구현예에서, 5'-블록은, 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 5'-블록은, 각각의 뉴클레오티드간 연결이 개질된 뉴클레오티드간 연결이고, 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 5'-블록은, 각각의 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트 연결이고, 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 4 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 5 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 6 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-블록은 7 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은, 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 3'-블록은, 각각의 뉴클레오티드간 연결이 개질된 뉴클레오티드간 연결이고, 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 3'-블록은, 각각의 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트 연결이고, 각각의 당 모이어티가 2'-F 개질을 포함하는 Sp 블록이다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 4 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 5 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 6 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-블록은 7 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함한다.
일부 구현예에서, 영역 또는 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오시드의 유형에는, 특정 유형의 뉴클레오티드간 연결, 예를 들어 천연 포스페이트 연결, 개질된 뉴클레오티드간 연결, Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결, Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결 등이 뒤따른다. 일부 구현예에서, A 에는 Sp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, A 에는 Rp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, A 에는 천연 포스페이트 연결 (PO) 이 뒤따른다. 일부 구현예에서, U 에는 Sp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, U 에는 Rp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, U 에는 천연 포스페이트 연결 (PO) 이 뒤따른다. 일부 구현예에서, C 에는 Sp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, C 에는 Rp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, C 에는 천연 포스페이트 연결 (PO) 이 뒤따른다. 일부 구현예에서, G 에는 Sp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, G 에는 Rp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, G 에는 천연 포스페이트 연결 (PO) 이 뒤따른다. 일부 구현예에서, C 및 U 에는 Sp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, C 및 U 에는 Rp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, C 및 U 에는 천연 포스페이트 연결 (PO) 이 뒤따른다. 일부 구현예에서, A 및 G 에는 Sp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, A 및 G 에는 Rp 가 뒤따른다. 일부 구현예에서, A 및 G 에는 천연 포스페이트 연결 (PO) 이 뒤따른다. 예를 들어, WV-1111, WV-1112, WV-XXX1 등 참조.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 개질된 당 모이어티 및 비개질된 당 모이어티를 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대로 2'-OMe 개질된 당 모이어티 및 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 예를 들어, WV-1112, WV-1113 등 참조.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 개질된 당 모이어티 및/또는 비개질된 당 모이어티를 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 개질된 당 모이어티 및 비개질된 당 모이어티를 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 개질된 당 모이어티를 포함하는 교대 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 상이한 개질된 당 모이어티를 포함하는 교대 블록을 포함하고, 여기서 개질된 당 모이어티는 상이한 2'-개질을 포함한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 각각, 2'-OMe 및 2'-F 를 포함하는 교대 블록을 포함한다. 예를 들어, WV-1712, WV1713, WV-1714 등 참조.
일부 구현예에서, 영역 또는 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오시드의 유형은, 임의로 또 다른 유형의 뉴클레오시드와 비교하여 상이한 개질을 갖는 것으로 개질된다. 일부 구현예에서, 영역 또는 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오시드의 유형은, 또 다른 유형의 뉴클레오시드와 비교하여 상이한 개질을 갖는 것으로 개질된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-F 개질을 포함하고, 퓨린 뉴클레오시드는 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 다른 구현예에서, 피리미딘 뉴클레오시드는 2'-OMe 개질을 포함하고, 퓨린 뉴클레오시드 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, G 및 C 는 한 유형의 당 개질을 갖고, A 및 U 는 또 다른 유형의 당 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, G 및 C 는 2'-OMe 개질을 포함하고, A 및 U 는 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, G 및 C 는 2'-F 개질을 포함하고, A 및 U 는 2'-OMe 개질을 포함한다.
일부 구현예에서, 비개질된 당 모이어티에 뒤따르는 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 비개질된 당 모이어티 이후의 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 비개질된 당 모이어티 이후의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 비개질된 당 모이어티 이후의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티에 뒤따르는 뉴클레오티드간 연결은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티에 뒤따르는 각각의 뉴클레오티드간 연결은 천연 포스페이트 연결이다. 예를 들어, WV-1111, WV1112 등 참조.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 3'-뉴클레오티드간 연결이 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 하나 이상의 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고, Rp 이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고, Sp 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 3'-뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 하나 이상의 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 반복 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Sp)m(Rp)n 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 SpRp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 SpSpRp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 SpRpRp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 RpRpSp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Rp)n(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Np)t(Rp)n(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(전부 Rp 또는 전부 Sp)-(Rp/Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp)-(전부 Sp)-(Rp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)-(전부 Sp)-(Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)-(전부 Rp)-(Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-((Sp)m(Rp)n 반복)-(Rp/Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(SpSpRp 반복)-(Rp/Sp) 를 포함한다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(전부 Rp 또는 전부 Sp)-(Rp/Sp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)-(전부 Sp)-(Sp) 이다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp)-(전부 Sp)-(Rp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)-(전부 Rp)-(Sp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-((Sp)m(Rp)n 반복)-(Rp/Sp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(SpSpRp 반복)-(Rp/Sp) 이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 낮은 독성을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 단백질 결합 프로파일을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 알부민에 대한 개선된 결합을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 낮은 독성 및 특정 목적하는 단백질에 대한 개선된 결합을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 낮은 독성 및 특정 목적하는 단백질에 대한 개선된 결합을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 동시에 동일한 수준의, 또는 크게 증강된, 안정성 및/또는 활성, 예를 들어 보다 양호한 표적-절단 패턴, 보다 양호한 표적-절단 효율, 보다 양호한 표적 특이성 등을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 전사물에서 표적 서열에 상보적인 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, 기준 조건은 상기 조성물의 부재이다. 일부 구현예에서, 기준 조건은 기준 조성물의 존재이다. 기준 다수의 올리고뉴클레오티드 (reference plurality of oligonucleotides) 를 포함하는 기준 조성물의 예는, 본 개시에 광범위하게 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 비교하여 상이한 구조 요소 (화학적 개질, 입체화학 등) 를 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 제제이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 입체이성질체의 혼합물이며, 제공된 조성물은 하나의 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 동일한 염기 서열을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 동일한 화학적 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 동일한 당 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 동일한 염기 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 동일한 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 제공된 조성물 중 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 동일한 입체화학을 갖지만, 상이한 화학적 개질, 예를 들어 염기 개질, 당 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질 등을 갖는다.
스플라이싱 시스템의 예는 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 시스템은, 관련 표적 전사물의 스플라이싱을 달성하기에 충분한 구성성분을 포함하는 생체내 또는 시험관내 시스템이다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 시스템은 스플라이세오솜 (spliceosome) (예를 들어, 단백질 및/또는 이의 RNA 구성성분) 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 시스템은 세포 소기관 멤브레인 (예를 들어, 핵 멤브레인) 및/또는 세포 소기관 (예를 들어, 핵) 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 시스템은 세포 또는 이의 집단이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 시스템은 조직이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 시스템은 유기체, 예를 들어 동물, 예를 들어 포유류, 예컨대 마우스, 랫트, 원숭이, 인간 등이거나 이를 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 전사물에서 표적 서열에 상보적인 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하거나; 또는
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은, 윙에서 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 적어도 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은, 연결 윙에서 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 적어도 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
윙 영역은 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은, 이의 3'-말단, 또는 코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은, 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은, 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
각각의 윙 영역은 적어도 하나의 개질된 당 모이어티를 포함하고;
각각의 코어 영역은 적어도 하나의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 갖는 것으로 정의된 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 조성물 중 선결된 수준의 올리고뉴클레오티드가 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다는 점에서 단일 올리고뉴클레오티드의 실질적으로 순수한 제제인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 특징으로 하는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 동일한 염기 서열 및 길이를 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 특징으로 하는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 조성물 중 적어도 약 10% 의 올리고뉴클레오티드가 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다는 점에서 단일 올리고뉴클레오티드의 실질적으로 순수한 제제인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 공통 코어 영역을 포함하는, 선결된 수준의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 및 임의로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고,
공통 코어 영역은:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 각각의 윙 영역은 독립적으로 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 4 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 5 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 6 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 7 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 내 각각의 당 모이어티는 개질된 것이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 개질은 LNA 당 개질이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질은 LNA 당 개질이다. 일부 구현예에서, 윙 내 각각의 뉴클레오티드간 연결은 키랄 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 내 각각의 뉴클레오티드간 연결은 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드의 수준, 예컨대 다수의 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드 등) 의 수준은, 선결된다. 예를 들어, 당업자에 의해 쉽게 이해될 수 있는 바와 같이, 다수의 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 다수의 올리고뉴클레오티드를 선결된 수준으로 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하는 염기 서열, 및 30 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하는 염기 서열, 및 40 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하는 염기 서열, 및 50 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하는 염기 서열, 및 30 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하는 염기 서열, 및 40 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하는 염기 서열, 및 50 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하는 염기 서열, 및 30 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하는 염기 서열, 및 40 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하는 염기 서열, 및 50 개 이하의 염기의 길이를 갖는다.
일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖는다.
일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 하나의 키랄 제어된 중심을 포함한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 적어도 15 개의 인접한 염기를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기의 길이를 갖고, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 각각 Sp 배열의 포스포로티오에이트인 적어도 5 개의 키랄 제어된 중심을 포함한다. 일부 구현예에서, 미스매치는 2 개의 서열이 최대로 정렬되고 비교될 때의 염기 서열 또는 길이 간의 차이이다. 비제한적인 예로서, 미스매치는, 한 서열의 특정 위치에서의 염기와 또 다른 서열의 상응하는 위치에서의 염기 사이에 차이가 존재하는 경우, 카운트된다. 따라서, 미스매치는, 예를 들어 한 서열의 위치가 특정 염기 (예를 들어, A) 를 갖고, 다른 서열 상의 상응하는 위치가 상이한 염기 (예를 들어, G, C 또는 U) 를 갖는 경우, 카운트된다. 미스매치는 또한, 예를 들어 한 서열의 위치가 염기 (예를 들어, A) 를 갖고, 다른 서열 상의 상응하는 위치가 염기를 갖지 않거나 (예를 들어, 그 위치가 포스페이트-당 백본을 포함하지만 염기를 포함하지 않는 비(非)염기성 뉴클레오티드인 경우), 또는 그 위치가 스킵핑되는 경우, 카운트된다. 어느 서열에서의 (또는 센스 또는 안티센스 가닥에서의) 단일-가닥 닉 (nick) 은 미스매치로 카운트되지 않을 수 있고, 예를 들어 한 서열이 서열 5'-AG-3' 를 포함하면, 다른 서열은 A 와 G 사이에 단일-가닥 닉을 갖는 서열 5'-AG-3' 를 포함하는 경우, 미스매치는 카운트되지 않을 수 있다. 염기 개질은 일반적으로 미스매치로서 간주되지 않고, 예를 들어 한 서열이 C 를 포함하고, 다른 서열이 동일한 위치에서 개질된 C (예를 들어, 2'-개질) 를 포함하는 경우, 미스매치는 카운트되지 않을 수 있다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 하기를 포함한다:
Figure pct00001
(여기서 O 는 비(非)키랄 중심이고, S 는 Sp 배열의 키랄 중심임). 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 하기로부터 선택된다:
Figure pct00002
(여기서 O 는 비키랄 중심이고, S 는 Sp 배열의 키랄 중심임). 일부 구현예에서, 비키랄 중심은 포스포디에스테르 (천연 포스페이트 연결) 이다. 일부 구현예에서, Sp 배열의 키랄 중심은 Sp 포스포로티오에이트 연결이다.
일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 10 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 11 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 12 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 13 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 14 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 15 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 16 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 17 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 18 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 19 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 19 개 이하의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 18 개 이하의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 17 개 이하의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 16 개 이하의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 15 개 이하의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 14 개 이하의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 14 내지 18 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 13 내지 19 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 12 내지 20 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 11 내지 21 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 0 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 1 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 2 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 3 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 4 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 5 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 6 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 7 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 0 내지 7 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 1 내지 6 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 2 내지 5 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 3 내지 4 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 1 내지 6 개의 포스포디에스테르, 및 13 내지 19 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 포스포디에스테르는 임의로 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 임의로 인접하거나 인접하지 않다.
일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 10 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 11 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 12 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 13 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 14 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 15 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 16 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 17 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 18 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 적어도 19 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 19 개 이하의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 18 개 이하의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 17 개 이하의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 16 개 이하의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 15 개 이하의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 14 개 이하의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 14 내지 18 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 13 내지 19 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 12 내지 20 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 11 내지 21 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 0 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 1 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 2 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 3 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 4 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 5 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 6 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 7 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 0 내지 7 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 1 내지 6 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 2 내지 5 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 3 내지 4 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 공통 패턴은 1 내지 6 개의 포스포디에스테르, 및 13 내지 19 개의 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 포스포디에스테르는 임의로 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 연결은 임의로 인접하거나 인접하지 않다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 5 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 6 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 7 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 8 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 9 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 10 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 11 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 12 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 13 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 14 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 15 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 16 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 17 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 18 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 19 개의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 8 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 7 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 6 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 5 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 4 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 3 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 2 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Rp 배열의 1 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 8 개 이하의 뉴클레오티드간 연결 (비제한적인 예로서, 포스포디에스테르) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 7 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 6 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 5 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 4 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 3 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 2 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 키랄이 아닌 1 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 10 개의 뉴클레오티드간 연결, 및 키랄이 아닌 8 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 11 개의 뉴클레오티드간 연결, 및 키랄이 아닌 7 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 12 개의 뉴클레오티드간 연결, 및 키랄이 아닌 6 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 13 개의 뉴클레오티드간 연결, 및 키랄이 아닌 6 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 14 개의 뉴클레오티드간 연결, 및 키랄이 아닌 5 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 Sp 배열의 적어도 15 개의 뉴클레오티드간 연결, 및 키랄이 아닌 4 개 이하의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Sp 배열의 뉴클레오티드간 연결은 임의로 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, Rp 배열의 뉴클레오티드간 연결은 임의로 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 키랄이 아닌 뉴클레오티드간 연결은 임의로 인접하거나 인접하지 않다.
윙 및 코어는 임의의 구조 요소에 의해 정의될 수 있다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 뉴클레오시드 개질에 의해 정의되고, 여기서 윙은 코어 영역이 갖지 않는 뉴클레오시드 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 개질의 윙-코어 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 개질의 코어-윙 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 개질의 윙-코어-윙 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 당 모이어티의 개질에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 염기 모이어티의 개질에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 당 모이어티는 코어 영역에서 발견되지 않는 동일한 2'-개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 당 모이어티는 코어 영역에서의 임의의 당 개질과 상이한 동일한 2'-개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖고, 코어 영역은 2'-개질을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 윙이 존재하는 경우, 윙 영역에서의 각각의 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖지만, 제 1 윙 영역에서의 공통 2'-개질은 제 2 윙 영역에서의 공통 2'-개질과 동일하거나 상이할 수 있다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 백본 뉴클레오티드간 연결의 패턴에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 윙은 코어에서 발견되지 않는, 뉴클레오티드간 연결의 유형 및/또는 뉴클레오티드간 연결의 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 천연 포스페이트 연결을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 5'-말단에 대한 윙의 5'-말단에서의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 3'-말단에 대한 윙의 3'-말단에서의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 윙은 적어도 3 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 4 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 5 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 6 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 3 개의 연속적인 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 4 개의 연속적인 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 5 개의 연속적인 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 6 개의 연속적인 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 연속적인 2'-F 개질 중 하나를 갖는 각각의 뉴클레오티드 단위의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 연속적인 2'-F 개질 중 하나를 갖는 각각의 뉴클레오티드 단위의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 연속적인 2'-F 개질 중 하나를 갖는 각각의 뉴클레오티드 단위의 뉴클레오티드간 연결은 Sp 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 코어는 하기 중 임의의 둘 이상을 포함한다: 2'-F 개질, 2'-OR1 개질, 또는 2'-OH. 일부 구현예에서, 코어는 하기 중 임의의 둘 이상을 포함한다: 2'-F 개질, 2'-OMe 개질, 또는 2'-OH. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 1 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 1 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 1 개의 2'-F 개질 및 적어도 1 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 1 개의 2'-F 개질 및 적어도 2 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 2'-F 개질 및 적어도 1 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 2'-F 개질 및 적어도 2 개의 2'-OMe 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 및/또는 윙에서의 2'-F 개질은 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 코어 및/또는 윙에서의 2'-OMe 개질은 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 코어 및/또는 윙에서의 2'-OH 는 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙은 적어도 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙은 적어도 하나의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 당 모이어티는 개질된 것이다. 일부 구현예에서, 윙 당 모이어티는 코어 영역에 존재하지 않는 개질에 의해 개질된 것이다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 이의 말단 중 하나 또는 둘 모두에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 이의 5'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 이의 3'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 이의 5'- 및 3'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 코어의 5'-말단에 있고, 윙은 이의 5'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 코어의 5'-말단에 있고, 윙은 이의 3'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 코어의 5'-말단에 있고, 윙은 이의 5'- 및 3'-말단 둘 모두에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 코어의 3'-말단에 있고, 윙은 이의 5'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 코어의 3'-말단에 있고, 윙은 이의 3'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 코어의 3'-말단에 있고, 윙은 이의 5'- 및 3'-말단 둘 모두에서 개질된 뉴클레오티드간 연결만을 갖는다.
일부 구현예에서, 코어 영역 내 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 것이다. 일부 구현예에서, 코어 영역 내 각각의 뉴클레오티드간 연결은 키랄이다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 의 백본 키랄 중심의 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 백본 키랄 중심의 패턴은, (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 임) 의 백본 키랄 중심의 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 백본 키랄 중심의 패턴은, (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 임) 이다. 무엇보다도, 일부 구현예에서 상기와 같은 패턴은, 표적 서열, 예를 들어 RNA 서열의 제어된 절단을 제공하거나 증강시킬 수 있다.
일부 구현예에서, 윙은 적어도 4 개의 포스포로티오에이트 (포스포로티오에이트 연결) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 5 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 적어도 6 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 5 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 6 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 포스포디에스테르 (천연 포스페이트 연결) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 5 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 6 개의 포스포디에스테르를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 1 개의 포스포디에스테르 및 적어도 1 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 1 개의 포스포디에스테르 및 적어도 2 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 포스포디에스테르 및 적어도 1 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 포스포디에스테르 및 적어도 2 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 포스포디에스테르 및 적어도 3 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 포스포디에스테르 및 적어도 2 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 포스포디에스테르 및 적어도 3 개의 포스포로티오에이트를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 및/또는 하나 또는 둘 모두의 윙에서의 포스포디에스테르는 임의로 인접하거나 인접하지 않다. 일부 구현예에서, 코어 및/또는 하나 또는 둘 모두의 윙에서의 포스포로티오에이트는 임의로 인접하거나 인접하지 않다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 백본 인 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은, 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 선결된 수준으로 함유한다는 점에서 키랄 제어된 것인 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
올리고뉴클레오티드 유형은:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다.
상기 기재되고 당업계에서 이해되는 바와 같이, 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오시드 잔기의 (예를 들어, 아데닌, 시토신, 구아노신, 티민 및 우라실과 같은 표준 자연 발생 뉴클레오티드와 비교하여, 당 및/또는 염기 구성성분의) 동일성 및/또는 개질 상태, 및/또는 이러한 잔기의 하이브리드화 특징 (즉, 특정 상보적 잔기와 하이브리드할 수 있는 능력) 을 나타낼 수 있다.
일부 구현예에서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형은 하기에 의해 정의될 수 있다:
1A) 염기 동일성;
1B) 염기 개질의 패턴;
1C) 당 개질의 패턴;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴.
따라서, 일부 구현예에서, 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기를 공유할 수 있으나, 염기 개질 및/또는 당 개질의 패턴이 상이할 수 있다. 일부 구현예에서, 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 및 염기 개질의 패턴 (예를 들어, 염기 개질의 부재 포함) 을 공유할 수 있으나, 당 개질의 패턴이 상이할 수 있다.
일부 구현예에서, 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는, 이들이 동일한 염기 서열 (길이 포함), 당 및 염기 모이어티에 대한 화학적 개질의 동일한 패턴, 백본 연결의 동일한 패턴 (예를 들어, 천연 포스페이트 연결, 포스포로티오에이트 연결, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결, 및 이들의 조합의 패턴), 백본 키랄 중심의 동일한 패턴 (예를 들어, 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴), 및 백본 인 개질의 동일한 패턴 (예를 들어, 뉴클레오티드간 인 원자 상의 개질의 패턴, 예컨대 -S-, 및 화학식 I 의 -L-R1) 을 갖는다는 점에서 동일하다.
일부 구현예에서, 본 개시는 복수의 (예를 들어, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개 초과) 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물, 및 특히 복수의 (예를 들어, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개 초과) 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 또는 라세미 제제에서, 적어도 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 90:10, 95:5, 96:4, 97:3, 또는 98:2 미만의 부분입체선택성 (diastereoselectivity) 으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 90:10, 95:5, 96:4, 97:3, 또는 98:2 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 95:5 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 96:4 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 97:3 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 98:2 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 99:1 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에서 키랄 뉴클레오티드간 연결의 부분입체선택성은, 모델 반응, 예를 들어 이량체가 키랄 뉴클레오티드간 연결과 동일한 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 이량체의 5'-뉴클레오시드가 키랄 뉴클레오티드간 연결의 5'-말단에 대한 뉴클레오시드와 동일하고, 이량체의 3'-뉴클레오시드가 키랄 뉴클레오티드간 연결의 3'-말단에 대한 뉴클레오시드와 동일한 조건과 본질적으로 동일하거나 필적한 조건 하에서의 이량체의 형성을 통해 측정될 수 있다.
무엇보다도, 본 개시는, 특성, 예를 들어 활성, 독성 등을 최적화하기 위한 올리고뉴클레오티드 조성물 및 기술을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물의 독성을 저하시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물의 투여와 관련된 면역 반응을 저하시키는 방법을 제공한다 (즉, 조성물 중 올리고뉴클레오티드에 대한 바람직하지 않은 면역 반응이, 예를 들어 필적한 또는 동일한 뉴클레오티드 서열의 뉴클레오티드의 기준 조성물을 이용하여 관찰된 것에 비해 감소되도록, 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여함). 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물의 투여와 관련된 보체 활성화를 저하시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물의 단백질 결합 프로파일을 개선시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물에 의해 특정 단백질에 대한 결합을 증가시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물에 의해 특정 단백질에 대한 결합을 증가시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물의 전달을 증강시키는 방법을 제공한다. 무엇보다도, 본 개시는, 일부 구현예에서, 이의 표적으로의 올리고뉴클레오티드의 최적의 전달에는, 올리고뉴클레오티드가 목적하는 위치로 수송될 수 있도록 하는 특정 단백질에 대한 올리고뉴클레오티드 결합과, 올리고뉴클레오티드가 이의 목적하는 기능, 예를 들어 이의 표적과의 하이브리드화, 이의 표적의 절단, 번역의 저해, 전사물 프로세싱의 조절 등을 수행하도록 특정 단백질로부터 적절하게 방출될 수 있도록 하는 올리고뉴클레오티드 방출의 균형이 수반된다는 인식을 포함한다. 본 개시에 예시된 바와 같이, 본 개시는, 무엇보다도, 올리고뉴클레오티드 특성의 개선이 화학적 개질 및/또는 입체화학을 통해 달성될 수 있다는 것을 인식한다.
본원에 기재된 바와 같은, 제공된 조성물 및 방법은 전사물의 스플라이싱을 변경할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 및 방법은, 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건과 비교하여, 전사물의 개선된 스플라이싱 패턴을 제공한다. 개선은 임의의 목적하는 생물학적 기능의 개선일 수 있다. 일부 구현예에서, 예를 들어 DMD 에서, 개선은, 개선된 생물학적 활성을 갖는 디스트로핀 단백질이 생성되는 mRNA 의 생성이다. 일부 다른 구현예에서, 예를 들어, 개선은, 강제 스플라이싱-유도성 넌센스-매개 붕괴 (DSD-NMD) 를 통해 종양 진행, 악성 종양 및 혈관신생을 완화시키는 STAT3, HNRNPH1 및/또는 KDR 의 하향 조절이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법으로서, 표적 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건과 비교하여 변경되는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 표적 전사물로부터 한 세트의 스플라이싱된 생성물을 생성하는 방법으로서,
상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 생성된 세트와 상이한 한 세트의 스플라이싱된 생성물을 생성시키는데 충분한 양으로, 시간 동안, 및 조건 하에서, 표적 전사물을 함유하는 스플라이싱 시스템을, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물과 접촉시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
당업계에 널리 공지된 바와 같이, 다수의 질환 및/또는 병태는 전사물 스플라이싱과 관련이 있다. 예를 들어, [Garcia-Blanco, et al., Alternative splicing in disease and therapy, Nat. Biotechnol . 2004 May;22(5):535-46]; [Wang, et al., Splicing in disease: disruption of the Splicing code and the decoding machinery, Nat. Rev. Genet. 2007 Oct;8(10):749-61]; [Havens, et al., Targeting RNA splicing for disease therapy, Wiley Interdiscip . Rev. RNA. 2013 May-Jun;4(3):247-66] 참조. 일부 구현예에서, 본 개시는 질환의 치료 또는 예방을 위한 조성물 및 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 본원에 기재된 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 전사물에서 표적 서열에 상보적인 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료 또는 예방하는 방법으로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료 또는 예방하는 방법으로서,
상기 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 질환은, 제공된 조성물의 투여 후, 하나 이상의 스플라이싱된 전사물이 새로운 유익한 기능을 보수, 복원 또는 도입하는 것이다. 예를 들어, DMD 에서, 하나 이상의 엑손의 스킵핑 후, 디스트로핀의 기능은, 절단되었지만 (부분적으로) 활성인 버전을 통해, 복원 또는 부분적으로 복원될 수 있다. 일부 구현예에서, 질환은, 제공된 조성물의 투여 후, 하나 이상의 스플라이싱된 전사물이 보수되고, 유전자가 유전자 전사물의 스플라이싱을 변경시킴으로서 효과적으로 녹다운되는 것이다.
일부 구현예에서, 질환은 듀켄 근이영양증이다. 일부 구현예에서, 질환은 척수근 위축증이다. 일부 구현예에서, 질환은 암이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 뉴클레오티드 서열이 표적 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 공통 염기 서열을 포함하는 공통 염기 서열을 공유하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하여 질환을 치료하는 방법으로서,
개선은, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 올리고뉴클레오티드 조성물로서 사용하는 것을 포함하는 것이며,
상기 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 뉴클레오티드 서열이 표적 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 공통 염기 서열을 포함하는 공통 염기 서열을 공유하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하여 질환을 치료하는 방법으로서,
개선은, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 올리고뉴클레오티드 조성물로서 사용하는 것을 포함하는 것이며,
상기 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 공통 서열은 표 A1 로부터 선택되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 서열은 표 A1 로부터 선택되는 서열이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하고 키랄 제어된, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이며,
상기 조성물은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 하나 이상의 개질된 당 모이어티 중 적어도 하나가 결여되어 있는 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이고;
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 올리고뉴클레오티드가 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이고,
상기 조성물은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 하나 이상의 개질된 당 모이어티 중 적어도 하나가 결여되어 있는 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 각각 공통 염기 서열을 갖고 개질된 당 모이어티를 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을, 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법으로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 동일한 공통 염기 서열을 갖지만 개질된 당 모이어티는 갖지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 각각 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을, 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법으로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 동일한 공통 염기 서열을 갖지만 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법으로서,
상기 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 상이한 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물, 또는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 감소된 독성은 감소된 보체 활성화이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 감소된 보체 활성화를 포함한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 감소된 보체 활성화이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 대안적인 경로를 통한 감소된 보체 활성화를 포함한다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 전염증 반응을 유도할 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는 염증을 감소시키는 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 전염증 반응을 감소시키는 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 제공된 조성물을 사용하여 주사 부위 염증을 감소시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 제공된 조성물을 사용하여 약물-유도성 혈관 손상을 감소시키는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는 방법으로서,
상기 조성물은, 각각 또한 공통 염기 서열을 갖지만,
기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하고/하거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가, 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖고/갖거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다는 점에서
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 구조적으로 상이한, 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 기준 조성물과 비교하여, 감소된 주사 부위 염증을 나타내는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 주사 부위 염증을 특징으로 하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는 방법으로서,
상기 조성물은, 각각 또한 공통 염기 서열을 갖지만,
기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하고/하거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가, 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖고/갖거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다는 점에서
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 구조적으로 상이한, 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 기준 조성물과 비교하여, 변경된 단백질 결합을 나타내는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 변경된 단백질 결합을 특징으로 하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는 방법으로서,
상기 조성물은, 각각 또한 공통 염기 서열을 갖지만,
기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하고/하거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가, 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖고/갖거나
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다는 점에서
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 구조적으로 상이한, 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 기준 조성물과 비교하여, 개선된 전달을 나타내는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 개선된 전달을 특징으로 하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하기로부터 선택되는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물을 제공한다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 및 WV-3546. 일부 구현예에서, 본 개시는 하기로부터 선택되는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물을 제공한다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, 및 WV-2530. 일부 구현예에서, 본 개시는 하기의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 또는 WV-3546. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-887 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-892 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-896 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-1714 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2444 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2445 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2526 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2527 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2528 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2530 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2531 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2578 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2580 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-2587 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3047 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3152 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3472 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3473 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3507 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3508 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3509 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3510 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3511 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3512 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3513 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3514 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3515 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3545 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3546 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 당업자에 의해 쉽게 이해될 수 있는 바와 같이, 상기와 같은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 선결된 수준의 WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 또는 WV-3546 을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드의 서열이 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물을 제공한다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 및 WV-3546. 일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드의 서열이 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물을 제공한다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, 및 WV-2530.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3545 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3546 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-887 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-892 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-896 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-1714 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2444 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2445 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2526 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2527 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2528 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2530 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2531 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2578 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2580 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-2587 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3047 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3152 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3472 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3473 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3507 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3508 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 WV-3509 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3510 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3511 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3512 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3513 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3514 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 지질에 콘쥬게이트된 WV-3515 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 표 중 임의의 것으로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드가 지질에 콘쥬게이트된, 표 중 임의의 것으로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 25 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 35 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 45 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 55 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 60 개 이하의 염기 길이이다.
일부 구현예에서, 지질은 지방산이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 지방산에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지방산은 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 개 또는 그 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 10 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 11 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 12 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 13 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 14 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 15 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 16 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 17 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 18 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 19 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 20 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 21 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 22 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 23 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 24 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 25 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 26 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 27 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 28 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 29 개 이상의 탄소 원자를 포함한다. 일부 구현예에서, 지방산은 30 개 이상의 탄소 원자를 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 스테아르산 또는 투르비나르산이다. 일부 구현예에서, 지질은 스테아르산이다. 일부 구현예에서, 지질은 투르비나르산이다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 미치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 미치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 미치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (DHA 또는 시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일.
일부 구현예에서, 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되지 않는다.
일부 구현예에서, 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 지질은 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 링커는 -L- 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 콘쥬게이트는 Ac-[-LLD-(RLD)a]b 의 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하기의 구조를 갖는 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
Ac-[-LLD-(RLD)a]b 또는 [(Ac)a-LLD]b-RLD
[식 중,
Ac 는 올리고뉴클레오티드 사슬 ([H]b-Ac 는 올리고뉴클레오티드임) 이고;
a 는 1-1000 이고;
b 는 1-1000 이고;
각각의 LLD 는 독립적으로 링커 모이어티이고;
각각의 RLD 는 독립적으로 지질 모이어티 또는 표적 구성성분임].
일부 구현예에서, 본 개시는 하기의 구조를 갖는 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
Ac-[-LLD-(RLD)a]b 또는 [(Ac)a-LLD]b-RLD
[식 중,
Ac 는 올리고뉴클레오티드 사슬 ([H]b-Ac 는 올리고뉴클레오티드임) 이고;
a 는 1-1000 이고;
b 는 1-1000 이고;
각각의 LLD 는 독립적으로 공유 결합, 또는 임의 치환된, C1-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 TLD, 또는 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
각각의 RLD 는 독립적으로 임의 치환된, C1-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
TLD 는:
Figure pct00003
의 구조를 갖고;
W 는 O, S 또는 Se 이고;
X, Y 및 Z 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, -N(-L-R1)-, 또는 L 이고;
L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
R1 은 할로겐, R, 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나, 또는
2 개의 R' 는, 그 개입 원자와 함께 취해져, 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기임].
일부 구현예에서, [H]b-Ac (여기서 b 는 1-1000 임) 는 표 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, [H]b-Ac 는 표 2 의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, [H]b-Ac 는 표 3 의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, [H]b-Ac 는 표 4 의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, [H]b-Ac 는 지질 모이어티를 포함하지 않는, 표 4 의 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, TLD 에서 P 는 P* 이다. 일부 구현예에서, 콘쥬게이트는 [(Ac)a-LLD]b-RLD 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 콘쥬게이트는 (Ac)a-LLD-RLD 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, a 는 1-100 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-50 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-40 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-30 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-20 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-15 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-10 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-9 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-8 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-7 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-6 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-5 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-4 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-3 이다. 일부 구현예에서, a 는 1-2 이다. 일부 구현예에서, a 는 1 이다. 일부 구현예에서, a 는 2 이다. 일부 구현예에서, a 는 3 이다. 일부 구현예에서, a 는 4 이다. 일부 구현예에서, a 는 5 이다. 일부 구현예에서, a 는 6 이다. 일부 구현예에서, a 는 7 이다. 일부 구현예에서, a 는 8 이다. 일부 구현예에서, a 는 9 이다. 일부 구현예에서, a 는 10 이다. 일부 구현예에서, a 는 10 초과이다. 일부 구현예에서, b 는 1-100 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-50 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-40 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-30 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-20 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-15 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-10 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-9 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-8 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-7 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-6 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-5 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-4 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-3 이다. 일부 구현예에서, b 는 1-2 이다. 일부 구현예에서, b 는 1 이다. 일부 구현예에서, b 는 2 이다. 일부 구현예에서, b 는 3 이다. 일부 구현예에서, b 는 4 이다. 일부 구현예에서, b 는 5 이다. 일부 구현예에서, b 는 6 이다. 일부 구현예에서, b 는 7 이다. 일부 구현예에서, b 는 8 이다. 일부 구현예에서, b 는 9 이다. 일부 구현예에서, b 는 10 이다. 일부 구현예에서, b 는 10 초과이다. 일부 구현예에서, 콘쥬게이트는 Ac-LLD-RLD 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, Ac 는 이의 당, 염기 및/또는 뉴클레오티드간 연결 모이어티 중 하나 이상을 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, Ac 는 이의 5'-OH (5'-O-) 를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, Ac 는 이의 3'-OH (3'-O-) 를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 콘쥬게이션 전, Ac-(H)b (Ac 의 원자가에 따라 b 는 1-1000 의 정수임) 는, 본원에 기재된 바와 같은 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 표 중 어느 하나에 기재된 것들 중 하나이다. 일부 구현예에서, LLD 는 -L- 이다. 일부 구현예에서, LLD 는 포스포로티오에이트기를 포함한다. 일부 구현예에서, LLD 는 -C(O)NH-(CH2)6-OP(=O)(S-)-O- 이다. 일부 구현예에서, -C(O)NH 말단은 RLD 에 연결되고, -O- 말단은, 예를 들어 5'- 또는 3'-말단을 통해 올리고뉴클레오티드에 연결된다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10, C15, C16, C17, C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24, 또는 C25 내지 C20, C21, C22, C23, C24, C25, C26, C27, C28, C29, C30, C35, C40, C45, C50, C60, C70, 또는 C80 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10 -80 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C20 -80 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10 -70 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C20 -70 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10 -60 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C20 -60 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10 -50 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C20 -50 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10 -40 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C20 -40 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C10 -30 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 은 임의 치환된 C20 -30 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10, C15, C16, C17, C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24, 또는 C25 내지 C20, C21, C22, C23, C24, C25, C26, C27, C28, C29, C30, C35, C40, C45, C50, C60, C70, 또는 C80 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10 -80 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C20 -80 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10 -70 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C20 -70 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10 -60 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C20 -60 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10 -50 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C20 -50 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10 -40 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C20 -40 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C10 -30 지방족이다. 일부 구현예에서, RLD 는 미치환된 C20 -30 지방족이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 이상의 부가적인 구성성분을 추가로 포함하는, 상기 조성물 중 어느 하나이다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에의 지질의 콘쥬게이션은, 올리고뉴클레오티드의 적어도 하나의 특성을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 개선된 특성에는, 증가된 활성 (예를 들어, 유해한 엑손의 바람직한 스킵핑을 유도하는 증가된 능력), 감소된 독성, 및/또는 조직에 대한 개선된 분포가 포함된다. 일부 구현예에서, 조직은 근육 조직이다. 일부 구현예에서, 조직은 골격근, 비복근, 삼두근, 심장 또는 횡격막이다. 일부 구현예에서, 개선된 특성은 감소된 hTLR9 아고니스트 활성을 포함한다. 일부 구현예에서, 개선된 특성은 hTLR9 안타고니스트 활성을 포함한다. 일부 구현예에서, 개선된 특성은 증가된 hTLR9 안타고니스트 활성을 포함한다.
일반적으로, 본원에 기재된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 조성물의 특성은 임의의 적절한 검정을 사용하여 평가될 수 있다. 상이한 조성물 (예를 들어, 입체제어된 vs 비(非)입체제어된, 및/또는 상이한 입체제어된 조성물) 에 대한 상대적인 독성 및/또는 단백질 결합 특성은, 전형적으로 바람직하게는 동일한 검정으로, 일부 구현예에서는 실질적으로 동시에, 및 일부 구현예에서는 종래의 결과를 참조로 측정된다.
당업자는 특정 올리고뉴클레오티드 조성물에 대한 적절한 검정을 알아 차릴 것이고/것이거나 이를 용이하게 개발할 수 있을 것이다. 본 개시는, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 조성물 거동의 하나 이상의 특징, 예를 들어 보체 활성화, 주사 부위 염증, 단백질 결합 등을 평가하는데 유용할 수 있는 특정한 특정 검정의 설명을 제공한다.
예를 들어, 올리고뉴클레오티드 조성물의 독성 및/또는 단백질 결합 특성의 평가에 유용할 수 있는 특정한 검정은, 본원에 기재된 및/또는 예시된 임의의 검정을 포함할 수 있다.
정의
지방족: 본원에서 사용된 바, 용어 "지방족" 또는 "지방족기" 는, 완전히 포화되거나 하나 이상의 불포화 단위를 함유하는 직쇄 (즉, 비분지형) 또는 분지형, 치환 또는 미치환 탄화수소 사슬, 또는 완전히 포화되거나 하나 이상의 불포화 단위를 함유하지만 분자의 나머지에 대한 단일 부착 지점을 갖는 방향족이 아닌 (또한 본원에서 "카르보사이클", "지환족" 또는 "시클로알킬" 로 나타냄), 모노시클릭 탄화수소 또는 바이시클릭 또는 폴리시클릭 탄화수소를 의미한다. 일부 구현예에서, 지방족기는 1-50 개의 지방족 탄소 원자를 함유한다. 달리 명시되지 않는 한, 지방족기는 1-10 개의 지방족 탄소 원자를 함유한다. 일부 구현예에서, 지방족기는 1-6 개의 지방족 탄소 원자를 함유한다. 일부 구현예에서, 지방족기는 1-5 개의 지방족 탄소 원자를 함유한다. 다른 구현예에서, 지방족기는 1-4 개의 지방족 탄소 원자를 함유한다. 또 다른 구현예에서, 지방족기는 1-3 개의 지방족 탄소 원자를 함유하고, 또 다른 구현예에서, 지방족기는 1-2 개의 지방족 탄소 원자를 함유한다. 일부 구현예에서, "지환족" (또는 "카르보사이클" 또는 "시클로알킬") 은, 완전히 포화되거나 하나 이상의 불포화 단위를 함유하지만 분자의 나머지에 대한 단일 부착 지점을 갖는 방향족이 아닌, 모노시클릭 또는 바이시클릭 C3-C10 탄화수소를 나타낸다. 일부 구현예에서, "지환족" (또는 "카르보사이클" 또는 "시클로알킬") 은, 완전히 포화되거나 하나 이상의 불포화 단위를 함유하지만 분자의 나머지에 대한 단일 부착 지점을 갖는 방향족이 아닌, 모노시클릭 C3-C6 탄화수소를 나타낸다. 적합한 지방족기에는, 비제한적으로, 선형 또는 분지형, 치환 또는 미치환 알킬, 알케닐, 알키닐기 및 이의 혼성체, 예컨대 (시클로알킬)알킬, (시클로알케닐)알킬 또는 (시클로알킬)알케닐이 포함된다.
알킬렌: 용어 "알킬렌" 은, 2가 알킬기를 나타낸다. "알킬렌 사슬" 은 폴리메틸렌기, 즉 -(CH2)n- (여기서, n 은 양의 정수, 바람직하게는 1 내지 6, 1 내지 4, 1 내지 3, 1 내지 2, 또는 2 내지 3 임) 이다. 치환 알킬렌 사슬은 하나 이상의 메틸렌 수소 원자가 치환기로 대체된 폴리메틸렌기이다. 적합한 치환기에는 치환된 지방족기에 대하여 하기 기재되는 것들이 포함된다.
알케닐렌: 용어 "알케닐렌" 은, 2가 알케닐기를 나타낸다. 치환된 알케닐렌 사슬은 하나 이상의 수소 원자가 치환기로 대체된, 하나 이상의 이중 결합을 함유하는 폴리메틸렌기이다. 적합한 치환기에는 치환된 지방족기에 대하여 하기 기재되는 것들이 포함된다.
동물: 본원에서 사용된 바, 용어 "동물" 은, 동물 왕국의 임의의 구성원을 나타낸다. 일부 구현예에서, "동물" 은 임의의 발달 단계에서의 인간을 나타낸다. 일부 구현예에서, "동물" 은 임의의 발달 단계에서의 비(非)인간 동물을 나타낸다. 특정 구현예에서, 비인간 동물은 포유류 (예를 들어, 설치류, 마우스, 랫트, 토끼, 원숭이, 개, 고양이, 양, 소, 영장류 및/또는 돼지) 이다. 일부 구현예에서, 동물에는, 비제한적으로, 포유류, 조류, 파충류, 양서류, 어류 및/또는 벌레류가 포함된다. 일부 구현예에서, 동물은 형질전환 동물, 유전자 조작된 동물 및/또는 클론일 수 있다.
대략: 본원에서 사용된 바, 숫자에 관련하여, 용어 "대략" 또는 "약" 은, 일반적으로 달리 명시되거나 문맥에서 달리 명백하지 않는 한, 숫자의 어느 방향으로든 (초과 또는 미만) 5%, 10%, 15% 또는 20% 범위 내에 있는 숫자가 포함되는 것으로 여겨진다 (상기 숫자가 가능한 값의 0% 미만 또는 100% 초과일 경우는 제외함). 일부 구현예에서, 투여량에 관련하여, 용어 "약" 의 사용은 ±5 mg/kg/일을 의미한다.
아릴: 단독으로, 또는 "아르알킬", "아르알콕시" 또는 "아릴옥시알킬" 에서 보다 큰 잔기의 일부로서 사용되는, 용어 "아릴" 은, 총 5 내지 14 개의 고리원을 갖는 모노시클릭 및 바이시클릭 고리계를 나타내고, 여기서 계에서 적어도 하나의 고리는 방향족이고, 계에서 각각의 고리는 3 내지 7 개의 고리원을 함유한다. 용어 "아릴" 은 용어 "아릴 고리" 와 상호 교환적으로 사용될 수 있다. 본 개시의 특정 구현예에서, "아릴" 은, 비제한적으로, 페닐, 바이페닐, 나프틸, 안트라실 등이 포함되는 방향족 고리계를 나타내고, 이는 하나 이상의 치환기를 포함할 수 있다. 또한, 본원에서 사용된 바, 용어 "아릴" 의 범주 내에 포함되는 것은, 방향족 고리가 하나 이상의 비(非)방향족 고리에 융합된 기, 예컨대 인다닐, 프탈리미딜, 나프티미딜, 페난트리디닐 또는 테트라히드로나프틸 등이다.
특징적 부분: 본원에서 사용된 바, 구절 단백질 또는 폴리펩티드의 "특징적 부분" 은, 아미노산의 연속 스트레치 (continuous stretch), 또는 아미노산의 연속 스트레치의 집합을 함유하는 것 (이는 함께 단백질 또는 폴리펩티드의 특징임) 이다. 각각 상기 연속 스트레치는 일반적으로 적어도 2 개의 아미노산을 함유할 수 있다. 나아가, 당업자는 전형적으로 적어도 5, 10, 15, 20 개 또는 그 이상의 아미노산이 단백질의 특징화에 요구된다는 것을 이해할 것이다. 일반적으로, 특징적 부분은, 상기 명시된 서열 동일성 이외에, 관련 비손상 (intact) 단백질과 하나 이상의 기능적 특징을 공유하는 것이다.
특징적 서열: "특징적 서열" 은 폴리펩티드 또는 핵산의 패밀리의 모든 구성원에서 확인되기 때문에, 당업자에 의해 패밀리의 구성원을 정의하는데 사용될 수 있는 서열이다.
특징적 구조 요소: 용어 "특징적 구조 요소" 는, 폴리펩티드, 소분자 또는 핵산의 패밀리의 모든 구성원에서 확인되기 때문에, 당업자에 의해 패밀리의 구성원을 정의하는데 사용될 수 있는 특유의 구조 요소 (예를 들어, 코어 구조, 펜던트 모이어티의 집합, 서열 요소 등) 를 나타낸다.
필적한 (comparable): 용어 "필적한" 은, 수득된 결과 또는 관찰된 현상의 비교가 가능하도록, 서로 충분히 유사한 조건 또는 환경의 둘 (또는 그 이상) 의 세트를 기재하기 위하여 본원에서 사용된다. 일부 구현예에서, 조건 또는 환경의 필적한 세트는, 다수의 실질적으로 동일한 특징, 및 하나 또는 적은 수의 다양한 특징에 의해 특징지어진다. 당업자는 상이한 세트의 조건 또는 환경 하에서 수득된 결과 또는 관찰된 현상에 있어서의 차이가, 변화되는 특징의 변화를 나타내거나 또는 이에 의해 야기되는 타당한 결론을 보증하는데 충분한 수 및 유형의 실질적으로 동일한 특징에 의해 특징지어질 때, 조건의 세트가 서로 필적하다는 것을 이해할 것이다.
투여 요법 (dosing regimen): 본원에서 사용된 바, "투여 요법" 또는 "치료 요법" 은, 전형적으로 기간에 의해 분리되는, 대상에 대하여 개별적으로 투여되는 일련의 단위 투여량 (전형적으로 하나 초과) 을 나타낸다. 일부 구현예에서, 주어진 치료제는 하나 이상의 투여량을 포함할 수 있는 권장된 투여 요법을 갖는다. 일부 구현예에서, 투여 요법은 각각이 동일한 길이의 기간에 의해 서로 분리되는 다수의 투여량을 포함하고; 일부 구현예에서, 투여 요법은 다수의 투여량 및 개별적인 투여량을 분리하는 적어도 2 개의 상이한 기간을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 요법 내의 모든 투여량은 동일한 단위 투여량을 갖는다. 일부 구현예에서, 투여 요법 내의 상이한 투여량은 상이한 양을 갖는다. 일부 구현예에서, 투여 요법은 제 1 투여량으로의 제 1 투여, 이어서 제 1 투여량과 상이한 제 2 투여량으로의 하나 이상의 추가 투여를 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 요법은 제 1 투여량으로의 제 1 투여, 이어서 제 1 투여량과 동일한 제 2 투여량으로의 하나 이상의 추가 투여를 포함한다.
등가 작용제: 본 개시를 이해하는 당업자는, 본 개시의 맥락에서 유용한 작용제의 범주가 본원에 구체적으로 언급 또는 예시된 것에 제한되지 않는다는 것을 이해할 것이다. 특히, 당업자는 활성제가 전형적으로 코어 및 부착된 펜던트 모이어티로 이루어진 구조를 갖는다는 것을 인식할 것이고, 나아가 상기 코어 및/또는 펜던트 모이어티의 단순한 변형이 작용제의 활성을 유의하게 변경시키지 않을 것이라는 것을 이해할 것이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 필적한 3차원 구조 및/또는 화학 반응성 특징을 갖는 기로의 하나 이상의 펜던트 모이어티의 치환은, 모 (parent) 기준 화합물 또는 부분과 등가인 치환된 화합물 또는 부분을 생성시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 펜던트 모이어티의 부가 또는 제거는 모 기준 화합물과 등가인 치환 화합물을 생성시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 예를 들어 적은 수의 결합 (전형적으로 5, 4, 3, 2 또는 1 개 이하의 결합, 및 종종 단일 결합만) 의 부가 또는 제거에 의한 코어 구조의 변경은, 모 기준 화합물과 등가인 치환 화합물을 생성시킬 수 있다. 다수의 구현예에서, 등가 화합물은, 예를 들어 하기 기재되는 바와 같은 일반적 반응식에 예시된 방법에 의해 또는 이의 변형에 의해, 용이하게 이용 가능한 출발 물질, 시약 및 통상적인 또는 제공된 합성 절차를 사용하여 제조될 수 있다. 이러한 반응에서, 여기서는 언급되지 않았지만, 공지된 그 자체의 변형의 사용이 또한 가능할 수 있다.
등가 투여량: 용어 "등가 투여량" 은, 동일한 생물학적 결과에 영향을 미치는 상이한 약학적 활성제의 투여량을 비교하기 위하여 본원에서 사용된다. 두 가지 상이한 작용제의 투여량은, 이들이 필적한 수준 또는 범위의 생물학적 결과를 달성하는 경우에, 본 개시에 따라 서로 "등가" 인 것으로 간주된다. 일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 상이한 약학적 작용제의 등가 투여량은, 본원에 기재된 바와 같은 시험관내 및/또는 생체내 검정을 사용하여 측정된다. 일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 하나 이상의 리소좀 활성화제는 기준 리소좀 활성화제의 투여량에 대하여 등가인 투여량으로 이용되고; 일부 상기와 같은 구현예에서, 상기 목적을 위한 기준 리소좀 활성화제는 소분자 알로스테릭 활성화제 (예를 들어, 피라졸피리미딘), 이미노당 (예를 들어, 이소파고민), 항산화제 (예를 들어, n-아세틸-시스테인), 및 세포 트래픽킹 (trafficking) 의 조절제 (예를 들어 Rab1a 폴리펩티드) 로 이루어진 군으로부터 선택된다.
헤테로지방족: 용어 "헤테로지방족" 은, C, CH, CH2 또는 CH3 로부터 선택되는 하나 이상의 단위가, 독립적으로 헤테로원자로 대체된 지방족기를 나타낸다. 일부 구현예에서, 헤테로지방족기는 헤테로알킬이다. 일부 구현예에서, 헤테로지방족기는 헤테로알케닐이다.
헤테로아릴: 단독으로, 또는 더 큰 모이어티, 예를 들어 "헤테로아르알킬" 또는 "헤테로아르알콕시" 의 일부로서 사용되는, 용어 "헤테로아릴" 및 "헤테로아르-" 는, 5 내지 10 개의 고리 원자, 바람직하게는 5, 6 또는 9 개의 고리 원자를 갖고; 시클릭 배열에 공유된 6, 10, 또는 14 개의 π 전자를 갖고; 탄소 원자 이외에 1 내지 5 개의 헤테로원자를 갖는 기를 나타낸다. 용어 "헤테로원자" 는, 질소, 산소, 또는 황을 나타내고, 질소 또는 황의 임의의 산화된 형태 및 염기성 질소의 임의의 4차화된 형태를 포함한다. 헤테로아릴기에는, 비제한적으로, 티에닐, 푸라닐, 피롤릴, 이미다졸릴, 피라졸릴, 트리아졸릴, 테트라졸릴, 옥사졸릴, 이속사졸릴, 옥사디아졸릴, 티아졸릴, 이소티아졸릴, 티아디아졸릴, 피리딜, 피리다지닐, 피리미디닐, 피라지닐, 인돌리지닐, 퓨리닐, 나프티리디닐, 및 프테리디닐이 포함된다. 본원에서 사용된 바, 용어 "헤테로아릴" 및 "헤테로아르-" 는, 또한 헤테로방향족 고리가 하나 이상의 아릴, 지환족 또는 헤테로시클릴 고리에 융합된 기를 포함하고, 여기서 부착 지점 또는 라디칼은 헤테로방향족 고리 상에 존재한다. 비제한적인 예로는, 인돌릴, 이소인돌릴, 벤조티에닐, 벤조푸라닐, 디벤조푸라닐, 인다졸릴, 벤즈이미다졸릴, 벤즈티아졸릴, 퀴놀릴, 이소퀴놀릴, 신놀릴닐, 프탈라지닐, 퀴나졸리닐, 퀴녹살리닐, 4H-퀴놀리지닐, 카르바졸릴, 아크리디닐, 페나지닐, 페노티아지닐, 페녹사지닐, 테트라히드로퀴놀리닐, 테트라히드로이소퀴놀리닐 및 피리도[2,3-b]-1,4-옥사진-3(4H)-온이 포함된다. 헤테로아릴기는 모노- 또는 바이시클릭일 수 있다. 용어 "헤테로아릴" 은 용어 "헤테로아릴 고리", "헤테로아릴기" 또는 "헤테로방향족" 과 상호 교환적으로 사용될 수 있고, 임의의 이러한 용어는 임의 치환된 고리를 포함한다. 용어 "헤테로아르알킬" 은, 헤테로아릴로 치환된 알킬기를 나타내고, 여기서 알킬 및 헤테로아릴 부분은 독립적으로 임의 치환된다.
헤테로원자: 용어 "헤테로원자" 는 산소, 황, 질소, 인, 붕소, 셀레늄 또는 규소 (예컨대, 질소, 붕소, 셀레늄, 황, 인, 또는 규소의 임의의 산화된 형태; 임의의 염기성 질소의 4차화된 형태 또는; 헤테로시클릭 고리의 치환 가능한 질소, 예를 들어 N (3,4-디히드로-2H-피롤릴의 경우), NH (피롤리디닐의 경우) 또는 NR+ (N-치환 피롤리디닐의 경우) 포함) 를 의미한다.
헤테로사이클: 본원에서 사용된 바, 용어 "헤테로사이클", "헤테로시클릴", "헤테로시클릭 라디칼" 및 "헤테로시클릭 고리" 는, 상호 교환적으로 사용되며, 포화 또는 부분 불포화되고, 탄소 원자 이외에, 상기 정의된 바와 같은 헤테로원자를 하나 이상, 바람직하게는 1 내지 4 개 갖는, 안정한 3- 내지 7-원 모노시클릭 또는 7-10-원 바이시클릭 헤테로시클릭 모이어티를 나타낸다. 헤테로사이클의 고리 원자에 대한 언급에서 사용되는 경우, 용어 "질소" 에는 치환된 질소가 포함된다. 예로서, 산소, 황 또는 질소로부터 선택되는 0-3 개의 헤테로원자를 갖는 포화 또는 부분 불포화 고리에서, 질소는 N (3,4-디히드로-2H-피롤릴의 경우), NH (피롤리디닐의 경우), 또는 NR+ (N-치환 피롤리디닐의 경우) 일 수 있다.
헤테로시클릭 고리는 안정한 구조를 유도하는 임의의 헤테로원자 또는 탄소 원자에서 이의 펜던트 기에 부착될 수 있고, 임의의 고리 원자는 임의 치환될 수 있다. 이러한 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 라디칼의 예에는, 비제한적으로, 테트라히드로푸라닐, 테트라히드로티오페닐, 피롤리디닐, 피페리디닐, 피롤리닐, 테트라히드로퀴놀리닐, 테트라히드로이소퀴놀리닐, 데카히드로퀴놀리닐, 옥사졸리디닐, 피페라지닐, 디옥사닐, 디옥솔라닐, 디아제피닐, 옥사제피닐, 티아제피닐, 모르폴리닐 및 퀴누클리디닐이 포함된다. 용어 "헤테로사이클", "헤테로시클릴", "헤테로시클릴 고리", "헤테로시클릭기", "헤테로시클릭 모이어티" 및 "헤테로시클릭 라디칼" 은 본원에서 상호 교환적으로 사용되고, 또한 헤테로시클릴 고리가 하나 이상의 아릴, 헤테로아릴 또는 지환족 고리에 융합된 기, 예컨대 인돌리닐, 3H-인돌릴, 크로마닐, 페난트리디닐, 또는 테트라히드로퀴놀리닐을 포함하고, 여기서 부착 지점 또는 라디칼은 헤테로시클릴 고리 상에 존재한다. 헤테로시클릴기는 모노- 또는 바이시클릭일 수 있다. 용어 "헤테로시클릴알킬" 은 헤테로시클릴로 치환된 알킬기를 나타내고, 여기서 알킬 및 헤테로시클릴 부분은 독립적으로 임의 치환된다.
복강내: 본원에서 사용된 구절 "복강내 투여" 및 "복강내로 투여된" 은, 대상의 복막 내로의 화합물 또는 조성물의 투여를 나타내는, 당업계에서 이해되는 의미를 갖는다.
시험관내: 본원에서 사용된 바, 용어 "시험관내" 는, 유기체 (예를 들어, 동물, 식물 및/또는 미생물) 내에서가 아니라, 인공적 환경, 예를 들어 시험관 또는 반응 용기, 세포 배양 등에서 일어나는 이벤트를 나타낸다.
생체내: 본원에서 사용된 바, 용어 "생체내" 는, 유기체 (예를 들어, 동물, 식물 및/또는 미생물) 내에서 일어나는 이벤트를 나타낸다.
저급 알킬: 용어 "저급 알킬" 은, C1 -4 직쇄 또는 분지형 알킬기를 나타낸다. 저급 알킬기의 예는, 메틸, 에틸, 프로필, 이소프로필, 부틸, 이소부틸 및 tert-부틸이다.
저급 할로알킬: 용어 "저급 할로알킬" 은, 하나 이상의 할로겐 원자로 치환된 C1-4 직쇄 또는 분지형 알킬기를 나타낸다.
임의 치환된: 본원에 기재된 바, 본 개시의 화합물은 "임의 치환된" 모이어티를 함유할 수 있다. 일반적으로, 용어 "치환된" 은, 용어 "임의로" 가 선행하든지 선행하는지 여부에 관계 없이, 지정된 모이어티의 하나 이상의 수소가 적합한 치환기로 대체된 것을 의미한다. 달리 지시되지 않는 한, "임의 치환된" 기는 기의 각각의 치환 가능한 위치에서 적합한 치환기를 가질 수 있고, 임의의 주어진 구조에서 하나 초과의 위치가 명시된 기로부터 선택되는 하나 초과의 치환기로 치환될 수 있는 경우, 치환기는 모든 위치에서 동일 또는 상이할 수 있다. 본 개시에 의해 구상되는 치환기의 조합은 바람직하게는 안정한 또는 화학적으로 실현 가능한 화합물의 형태를 유도하는 것이다. 본원에서 사용된 바, 용어 "안정한" 은, 이의 제조, 검출, 및 특정 구현예에서 이의 회수, 정제, 및 본원에 개시된 목적 중 하나 이상을 위한 사용을 가능하게 하는 조건에 적용될 때, 실질적으로 변경되지 않는 화합물을 나타낸다.
"임의 치환된" 기의 치환 가능한 탄소 원자 상에의 적합한 1가 치환기는, 독립적으로 할로겐; -(CH2)0-4R°; -(CH2)0-4OR°; -O(CH2)0-4Ro, -O-(CH2)0-4C(O)OR°; -(CH2)0-4CH(OR°)2; -(CH2)0-4SR°; -(CH2)0-4Ph (이는 R° 로 치환될 수 있음); -(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph (이는 R° 로 치환될 수 있음); -CH=CHPh (이는 R° 로 치환될 수 있음); -(CH2)0-4O(CH2)0-1-피리딜 (이는 R° 로 치환될 수 있음); -NO2; -CN; -N3; -(CH2)0-4N(R°)2; -(CH2)0-4N(R°)C(O)R°; -N(R°)C(S)R°; -(CH2)0-4N(R°)C(O)NR°2; -N(R°)C(S)NR°2; -(CH2)0-4N(R°)C(O)O-R°; -N(R°)N(R°)C(O)R°; -N(R°)N(R°)C(O)NR°2; -N(R°)N(R°)C(O)O-R°; -(CH2)0-4C(O)R°; -C(S)R°; -(CH2)0-4C(O)OR°; -(CH2)0-4C(O)SR°; -(CH2)0-4C(O)OSiR°3; -(CH2)0-4OC(O)R°; -OC(O)(CH2)0-4SR, -SC(S)SR°; -(CH2)0-4SC(O)R°; -(CH2)0-4C(O)NR°2; -C(S)NR°2; -C(S)SR°; -SC(S)SR°, -(CH2)0-4OC(O)NR°2; -C(O)N(OR°)R°; -C(O)C(O)R°; -C(O)CH2C(O)R°; -C(NOR°)R°; -(CH2)0-4SSR°; -(CH2)0-4S(O)2R°; -(CH2)0-4S(O)2OR°; -(CH2)0-4OS(O)2R°; -S(O)2NR°2; -(CH2)0-4S(O)R°; -N(R°)S(O)2NR°2; -N(R°)S(O)2R°; -N(OR°)R°; -C(NH)NR°2; -P(O)2R°; -P(O)R°2; -OP(O)R°2; -OP(O)(OR°)2; -SiR°3; -OSiR°3; -(C1 -4 직쇄 또는 분지형 알킬렌)O-N(R°)2; 또는 -(C1 -4 직쇄 또는 분지형 알킬렌)C(O)O-N(R°)2 이고, 여기서 각각의 R° 은 하기 정의되는 바와 같이 치환될 수 있고, 독립적으로 수소, C1 -6　지방족, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, -CH2-(5-6 원 헤테로아릴 고리), 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리이거나, 또는 상기 정의에도 불구하고, R° 의 2 개의 독립적 발생은, 그 개재된 원자(들)과 함께 취해져, 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 3-12-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 모노- 또는 바이시클릭 고리 (이는 하기 정의되는 바와 같이 치환될 수 있음) 를 형성한다.
R° 상에의 적합한 1가 치환기 (또는 R° 의 2 개의 독립적 발생을 그 개재된 원자와 함께 취함으로써 형성된 고리) 는, 독립적으로 할로겐, -(CH2)0-2R●, -(할로R●), -(CH2)0-2OH, -(CH2)0-2OR●, -(CH2)0-2CH(또는●)2; -O(할로R●), -CN, -N3, -(CH2)0-2C(O)R●, -(CH2)0-2C(O)OH, -(CH2)0-2C(O)OR●, -(CH2)0-2SR●, -(CH2)0-2SH, -(CH2)0-2NH2, -(CH2)0-2NHR●, -(CH2)0-2NR● 2, -NO2, -SiR● 3, -OSiR● 3, -C(O)SR●, -(C1 -4 직쇄 또는 분지형 알킬렌)C(O)O-R●, 또는 -SSR● 이고, 여기서 각각의 R● 은 미치환되거나, 또는 "할로" 가 선행하는 경우 하나 이상의 할로겐으로만 치환되고, 독립적으로 C1 -4　지방족, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리로부터 선택된다. R° 의 포화 탄소 원자 상에의 적합한 2가 치환기에는 =O 및 =S 가 포함된다.
"임의 치환된" 기의 포화 탄소 원자 상에의 적합한 2가 치환기에는 하기가 포함된다: =O, =S, =NNR* 2, =NNHC(O)R*, =NNHC(O)OR*, =NNHS(O)2R*, =NR*, =NOR*, -O(C(R* 2))2-3O- 또는 -S(C(R* 2))2-3S- (여기서, R* 의 각각의 독립적 발생은, 수소, C1-6　지방족 (이는 하기 정의된 바와 같이 치환될 수 있음), 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 미치환 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리로부터 선택된다. "임의 치환된" 기의 인접한 치환 가능한 탄소에 결합되는 적합한 2가 치환기에는, 하기가 포함된다: -O(CR* 2)2-3O- (여기서, R* 의 각각의 독립적 발생은, 수소, C1 -6　지방족 (이는 하기 정의되는 바와 같이 치환될 수 있음), 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 미치환 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리로부터 선택됨).
R* 의 지방족기 상에의 적합한 치환기에는, 할로겐 -R●, -(할로R●), -OH, -OR●, -O(할로R●), -CN, -C(O)O-H, -C(O)O-R●, -NH2, -NHR●, -NR● 2, 또는 -NO2 가 포함되고, 여기서 각각의 R● 은 미치환되거나, 또는 "할로" 가 선행하는 경우 하나 이상의 할로겐으로만 치환되고, 독립적으로 C1 -4　지방족, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리이다.
"임의 치환된" 기의 치환 가능한 질소 상에의 적합한 치환기에는, -R†, -NR† 2, -C(O)R†, -C(O)O-R†, -C(O)C(O)R†, -C(O)CH2C(O)R†, -S(O)2R†, -S(O)2NR† 2, -C(S)NR† 2, -C(NH)NR† 2, 또는 -N(R†)S(O)2R† 가 포함되고, 여기서 각각의 R† 은 독립적으로 수소, C1 -6 지방족 (이는 하기 정의되는 바와 같이 치환될 수 있음), 미치환 -OPh, 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 미치환 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리이거나, 또는 상기 정의에도 불구하고, R† 의 2 개의 독립적인 발생은, 그 개재된 원자(들)과 함께 취해져, 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 미치환 3-12-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 모노- 또는 바이시클릭 고리를 형성한다.
R† 의 지방족기 상에의 적합한 치환기는, 독립적으로 할로겐, -R●, -(할로R●), -OH, -OR●, -O(할로R●), -CN, -C(O)OH, -C(O)OR●, -NH2, -NHR●, -NR● 2, 또는 -NO2 이고, 여기서 각각의 R● 은 미치환되거나, 또는 "할로" 가 선행되는 경우 하나 이상의 할로겐으로만 치환되고, 독립적으로 C1 -4　지방족, -CH2Ph, -O(CH2)0-1Ph, 또는 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 0-4 개의 헤테로원자를 갖는 5-6-원 포화, 부분 불포화, 또는 아릴 고리이다.
경구: 본원에서 사용된 바, 구절 "경구 투여" 및 "경구로 투여된" 은, 화합물 또는 조성물의 입에 의한 투여를 나타내는, 당업계에서 이해되는 의미를 갖는다.
비경구: 본원에서 사용된 바, 구절 "비경구 투여" 및 "비경구로 투여된" 은, 일반적으로 주사에 의한, 장관 및 국소 투여 이외의 투여 방식을 나타내는, 당업계에서 이해되는 의미를 갖고, 비제한적으로, 정맥내, 근육내, 동맥내, 척추 강내, 관절내, 안와내, 심장내, 피부내, 복강내, 경기관 (transtracheal), 피하, 표피하, 관절내 (intraarticulare), 피막하, 지주막하, 척수내, 및 흉골내 주사 및 주입이 포함된다.
부분 불포화: 본원에서 사용된 바, 용어 "부분 불포화" 는, 적어도 하나의 이중 또는 삼중 결합을 포함하는 고리 모이어티를 나타낸다. 용어 "부분 불포화" 는 복수의 불포화 부위를 갖는 고리를 포함하는 것으로 이해되지만, 본원에 정의된 바와 같은 아릴 또는 헤테로아릴 모이어티를 포함하는 것으로 의도되지는 않는다.
약학적 조성물: 본원에서 사용된 바, 용어 "약학적 조성물" 은, 하나 이상의 약학적으로 허용 가능한 담체와 함께 제형화된, 활성제를 나타낸다. 일부 구현예에서, 활성제는 관련 집단에 투여될 때, 선결된 치료 효과를 달성하는 통계적으로 유의한 확률을 나타내는 치료 요법에서, 투여에 적절한 단위 투여량으로 존재한다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 하기에 대하여 적합화된 것들을 포함하여, 고체 또는 액체 형태로의 투여를 위해 특별히 제형화될 수 있다: 경구 투여, 예를 들어 드렌치 (drench) (수성 또는 비(非)수성 용액 또는 현탁액), 정제, 예를 들어 볼, 설하 및 전신 흡수로 표적화된 것, 볼루스, 분말, 과립, 혀에의 적용을 위한 페이스트; 비경구 투여, 예를 들어 살균 용액 또는 현탁액 또는 서방형 제형으로서, 예를 들어 피하, 근육내, 정맥내 또는 경막외 주사; 국소 적용, 예를 들어 크림, 연고, 또는 피부, 폐 또는 구강에 적용되는 서방형 패치 또는 스프레이; 질내 또는 직장내, 예를 들어 질 좌약, 크림 또는 발포체; 설하; 안구; 경피; 또는 비강, 폐 및 기타 점막 표면.
약학적으로 허용 가능한: 본원에서 사용된 바, 구절 "약학적으로 허용 가능한" 은, 타당한 의료적 판단의 범주 내에서, 과다한 독성, 자극, 알레르기 반응, 또는 기타 문제 또는 합병증이 없고, 합리적인 유익/위험 비율에 비례하는, 인간 및 동물의 조직과 접촉되어 사용하기에 적합한, 화합물, 물질, 조성물 및/또는 투여 형태를 나타낸다.
약학적으로 허용 가능한 담체: 본원에서 사용된 바, 용어 "약학적으로 허용 가능한 담체" 는, 하나의 장기, 또는 신체의 일부로부터 또 다른 장기 또는 신체의 일부로, 대상 화합물을 운반 또는 수송하는데 관여하는, 약학적으로 허용 가능한 물질, 조성물 또는 비히클, 예컨대 물질을 캡슐화하는 액체 또는 고체 충전제, 희석제, 부형제 또는 용매를 의미한다. 각각의 담체는 제형의 다른 성분과 상용 가능하고, 환자에게 유해하지 않는다는 의미에서 "허용 가능" 해야 한다. 약학적으로 허용 가능한 담체로서 작용할 수 있는 물질의 일부 예에는, 하기가 포함된다: 당, 예컨대 락토오스, 글루코오스 및 수크로오스; 전분, 예컨대 옥수수 전분 및 감자 전분; 셀룰로오스, 및 이의 유도체, 예컨대 소듐 카르복시메틸 셀룰로오스, 에틸 셀룰로오스 및 셀룰로오스 아세테이트; 분말화 트래거캔스; 맥아; 젤라틴; 탈크; 부형제, 예컨대 코코아 버터 및 좌약 왁스; 오일, 예컨대 땅콩유, 면실유, 홍화유, 참깨유, 올리브유, 옥수수유 및 대두유; 글리콜, 예컨대 프로필렌 글리콜; 폴리올, 예컨대 글리세린, 소르비톨, 만니톨 및 폴리에틸렌 글리콜; 에스테르, 예컨대 에틸 올레에이트 및 에틸 라우레이트; 한천; 완충액, 예컨대 마그네슘 히드록시드 및 알루미늄 히드록시드; 알긴산; 무발열성 (pyrogen-free) 물; 등장성 염수; 링거 용액; 에틸 알코올; pH 완충 용액; 폴리에스테르, 폴리카르보네이트 및/또는 폴리무수물; 및 약학 제형에서 이용되는 기타 비독성 상용 가능한 물질.
약학적으로 허용 가능한 염: 본원에서 사용된 바, 용어 "약학적으로 허용 가능한 염" 은, 약학적 맥락에서 사용하기에 적절한 상기 화합물의 염, 즉 타당한 의료적 판단의 범주 내에서 지나친 독성, 자극, 알레르기 반응 등 없이, 합리적인 유익/위험 비율에 비례하여, 인간 및 하등 동물의 조직과 접촉되어 사용하기에 적합한 염을 나타낸다. 약학적으로 허용 가능한 염은 당업계에 널리 공지되어 있다. 예를 들어, S. M. Berge 등은 [J. Pharmaceutical Sciences, 66: 1-19 (1977)] 에서 상세하게 약학적으로 허용 가능한 염을 기재하였다. 일부 구현예에서, 약학적으로 허용 가능한 염에는, 비제한적으로, 비독성 산 부가 염이 포함되고, 이는 무기산, 예컨대 염산, 브롬화 수소산, 인산, 황산 및 과염소산 또는 유기산, 예컨대 아세트산, 말레산, 타르타르산, 시트르산, 숙신산 또는 말론산을 이용하거나, 또는 이온 교환과 같은 당업계에서 사용되는 다른 방법을 사용하여 형성된 아미노기의 염이다. 일부 구현예에서, 약학적으로 허용 가능한 염에는, 비제한적으로, 아디페이트, 알기네이트, 아스코르베이트, 아스파르테이트, 벤젠술포네이트, 벤조에이트, 바이술페이트, 보레이트, 부티레이트, 캄포레이트, 캄포르술포네이트, 시트레이트, 시클로펜탄프로피오네이트, 디글루코네이트, 도데실술페이트, 에탄술포네이트, 포르메이트, 푸마레이트, 글루코헵토네이트, 글리세로포스페이트, 글루코네이트, 헤미술페이트, 헵타노에이트, 헥사노에이트, 히드로요오다이드, 2-히드록시-에탄술포네이트, 락토비오네이트, 락테이트, 라우레이트, 라우릴 술페이트, 말레이트, 말레에이트, 말로네이트, 메탄술포네이트, 2-나프탈렌술포네이트, 니코티네이트, 니트레이트, 올레에이트, 옥살레이트, 팔미테이트, 파모에이트, 펙티네이트, 퍼술페이트, 3-페닐프로피오네이트, 포스페이트, 피크레이트, 피발레이트, 프로피오네이트, 스테아레이트, 숙시네이트, 술페이트, 타르트레이트, 티오시아네이트, p-톨루엔술포네이트, 운데카노에이트, 발레레이트 염 등이 포함된다. 대표적인 알칼리 또는 알칼리 토금속 염에는, 소듐, 리튬, 포타슘, 칼슘, 마그네슘 등이 포함된다. 일부 구현예에서, 약학적으로 허용 가능한 염에는, 적절한 경우, 비독성 암모늄, 4차 암모늄, 및 반대이온 (counterion), 예컨대 할라이드, 히드록시드, 카르복실레이트, 술페이트, 포스페이트, 니트레이트, 탄소수 1 내지 6 의 알킬, 술포네이트 및 아릴 술포네이트를 사용하여 형성된 아민 양이온이 포함된다.
프로드러그 ( prodrug ): 본원에서 사용되고 당업계에서 이해되는 바와 같은, 일반적 용어 "프로드러그" 는, 유기체에 투여될 때, 신체 내에서 대사되어 관심 활성 (예를 들어, 치료적 또는 진단적) 작용제를 전달하는 엔티티이다. 전형적으로, 이러한 대사작용은 활성제가 형성되도록, 적어도 하나의 "프로드러그 모이어티" 의 제거를 포함한다. 각종 형태의 "프로드러그" 가 당업계에 공지되어 있다. 이러한 프로드러그의 예로서, 하기를 참조한다:
a) Design of Prodrugs, H. Bundgaard, 편집 (Elsevier, 1985) 및 Methods in Enzymology, 42:309-396, K. Widder, et al. 편집 (Academic Press, 1985);
b) Prodrugs and Targeted Delivery, J. Rautio 편집 (Wiley, 2011);
c) A Textbook of Drug Design and Development, Krogsgaard-Larsen 편집;
d) Bundgaard, Chapter 5 "Design and Application of Prodrugs", H. Bundgaard, p. 113-191 (1991);
e) Bundgaard, Advanced Drug Delivery Reviews, 8:1-38 (1992);
f) Bundgaard, et al., Journal of Pharmaceutical Sciences, 77:285 (1988); 및
g) Kakeya, et al., Chem . Pharm . Bull., 32:692 (1984).
본원에 기재된 기타 화합물에 있어서, 프로드러그는 다양한 형태, 예를 들어 결정 형태, 염 형태 등 중 임의의 형태로 제공될 수 있다. 일부 구현예에서, 프로드러그는 이의 약학적으로 허용 가능한 염으로서 제공된다.
보호기: 본원에서 사용된 바, 용어 "보호기" 는, 당업계에 널리 공지되어 있고, 그 전체가 본원에 참조로 인용되는 [Protecting Groups in Organic Synthesis, T. W. Greene and P. G. M. Wuts, 3rd edition, John Wiley & Sons, 1999] 에 상세하게 기재된 것들이 포함된다. 또한, Chapter 2 전체가 본원에 참조로 인용되는 [Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, Serge L. Beaucage et al. 편집 06/201] 에 기재된 뉴클레오시드 및 뉴클레오티드 화학에 특히 적합화된 보호기들이 포함된다. 적합한 아미노-보호기에는, 메틸 카르바메이트, 에틸 카르바메이트, 9-플루오레닐메틸 카르바메이트 (Fmoc), 9-(2-술포)플루오레닐메틸 카르바메이트, 9-(2,7-디브로모)플루오로에닐메틸 카르바메이트, 2,7-디-t-부틸-[9-(10,10-디옥소-10,10,10,10-테트라히드로티옥산틸)]메틸 카르바메이트 (DBD-Tmoc), 4-메톡시페나실 카르바메이트 (Phenoc), 2,2,2-트리클로로에틸 카르바메이트 (Troc), 2-트리메틸실릴에틸 카르바메이트 (Teoc), 2-페닐에틸 카르바메이트 (hZ), 1-(1-아다만틸)-1-메틸에틸 카르바메이트 (Adpoc), 1,1-디메틸-2-할로에틸 카르바메이트, 1,1-디메틸-2,2-디브로모에틸 카르바메이트 (DB-t-BOC), 1,1-디메틸-2,2,2-트리클로로에틸 카르바메이트 (TCBOC), 1-메틸-1-(4-바이페닐)에틸 카르바메이트 (Bpoc), 1-(3,5-디-t-부틸페닐)-1-메틸에틸 카르바메이트 (t-Bumeoc), 2-(2'- 및 4'-피리딜)에틸 카르바메이트 (Pyoc), 2-(N,N-디시클로헥실카르복사미도)에틸 카르바메이트, t-부틸 카르바메이트 (BOC), 1-아다만틸 카르바메이트 (Adoc), 비닐 카르바메이트 (Voc), 알릴 카르바메이트 (Alloc), 1-이소프로필알릴 카르바메이트 (Ipaoc), 신나밀 카르바메이트 (Coc), 4-니트로신나밀 카르바메이트 (Noc), 8-퀴놀릴 카르바메이트, N-히드록시피페리디닐 카르바메이트, 알킬디티오 카르바메이트, 벤질 카르바메이트 (Cbz), p-메톡시벤질 카르바메이트 (Moz), p-니트로벤질 카르바메이트, p-브로모벤질 카르바메이트, p-클로로벤질 카르바메이트, 2,4-디클로로벤질 카르바메이트, 4-메틸술피닐벤질 카르바메이트 (Msz), 9-안트릴메틸 카르바메이트, 디페닐메틸 카르바메이트, 2-메틸티오에틸 카르바메이트, 2-메틸술포닐에틸 카르바메이트, 2-(p-톨루엔술포닐)에틸 카르바메이트, [2-(1,3-디티아닐)]메틸 카르바메이트 (Dmoc), 4-메틸티오페닐 카르바메이트 (Mtpc), 2,4-디메틸티오페닐 카르바메이트 (Bmpc), 2-포스포니오에틸 카르바메이트 (Peoc), 2-트리페닐포스포니오이소프로필 카르바메이트 (Ppoc), 1,1-디메틸-2-시아노에틸 카르바메이트, m-클로로-p-아실옥시벤질 카르바메이트, p-(디히드록시보릴)벤질 카르바메이트, 5-벤즈이속사졸릴메틸 카르바메이트, 2-(트리플루오로메틸)-6-크로모닐메틸 카르바메이트 (Tcroc), m-니트로페닐 카르바메이트, 3,5-디메톡시벤질 카르바메이트, o-니트로벤질 카르바메이트, 3,4-디메톡시-6-니트로벤질 카르바메이트, 페닐(o-니트로페닐)메틸 카르바메이트, 페노티아지닐-(10)-카르보닐 유도체, N'-p-톨루엔술포닐아미노카르보닐 유도체, N'-페닐아미노티오카르보닐 유도체, t-아밀 카르바메이트, S-벤질 티오카르바메이트, p-시아노벤질 카르바메이트, 시클로부틸 카르바메이트, 시클로헥실 카르바메이트, 시클로펜틸 카르바메이트, 시클로프로필메틸 카르바메이트, p-데실옥시벤질 카르바메이트, 2,2-디메톡시카르보닐비닐 카르바메이트, o-(N,N-디메틸카르복사미도)벤질 카르바메이트, 1,1-디메틸-3-(N,N-디메틸카르복사미도)프로필 카르바메이트, 1,1-디메틸프로피닐 카르바메이트, 디(2-피리딜)메틸 카르바메이트, 2-푸라닐메틸 카르바메이트, 2-요오도에틸 카르바메이트, 이소보르닐 카르바메이트, 이소부틸 카르바메이트, 이소니코티닐 카르바메이트, p-(p'-메톡시페닐아조)벤질 카르바메이트, 1-메틸시클로부틸 카르바메이트, 1-메틸시클로헥실 카르바메이트, 1-메틸-1-시클로프로필메틸 카르바메이트, 1-메틸-1-(3,5-디메톡시페닐)에틸 카르바메이트, 1-메틸-1-(p-페닐아조페닐)에틸 카르바메이트, 1-메틸-1-페닐에틸 카르바메이트, 1-메틸-1-(4-피리딜)에틸 카르바메이트, 페닐 카르바메이트, p-(페닐아조)벤질 카르바메이트, 2,4,6-트리-t-부틸페닐 카르바메이트, 4-(트리메틸암모늄)벤질 카르바메이트, 2,4,6-트리메틸벤질 카르바메이트, 포름아미드, 아세트아미드, 클로로아세트아미드, 트리클로로아세트아미드, 트리플루오로아세트아미드, 페닐아세트아미드, 3-페닐프로판아미드, 피콜린아미드, 3-피리딜카르복사미드, N-벤조일페닐알라닐 유도체, 벤즈아미드, p-페닐벤즈아미드, o-니트로페닐아세트아미드, o-니트로페녹시아세트아미드, 아세토아세트아미드, (N'-디티오벤질옥시카르보닐아미노)아세트아미드, 3-(p-히드록시페닐)프로판아미드, 3-(o-니트로페닐)프로판아미드, 2-메틸-2-(o-니트로페녹시)프로판아미드, 2-메틸-2-(o-페닐아조페녹시)프로판아미드, 4-클로로부탄아미드, 3-메틸-3-니트로부탄아미드, o-니트로신나미드, N-아세틸메티오닌 유도체, o-니트로벤즈아미드, o-(벤조일옥시메틸)벤즈아미드, 4,5-디페닐-3-옥사졸린-2-온, N-프탈이미드, N-디티아숙신이미드 (Dts), N-2,3-디페닐말레이미드, N-2,5-디메틸피롤, N-1,1,4,4-테트라메틸디실릴아자시클로펜탄 부가물 (STABASE), 5-치환 1,3-디메틸-1,3,5-트리아자시클로헥산-2-온, 5-치환 1,3-디벤질-1,3,5-트리아자시클로헥산-2-온, 1-치환 3,5-디니트로-4-피리돈, N-메틸아민, N-알릴아민, N-[2-(트리메틸실릴)에톡시]메틸아민 (SEM), N-3-아세톡시프로필아민, N-(1-이소프로필-4-니트로-2-옥소-3-피롤린-3-일)아민, 4차 암모늄 염, N-벤질아민, N-디(4-메톡시페닐)메틸아민, N-5-디벤조수베릴아민, N-트리페닐메틸아민 (Tr), N-[(4-메톡시페닐)디페닐메틸]아민 (MMTr), N-9-페닐플루오레닐아민 (PhF), N-2,7-디클로로-9-플루오레닐메틸렌아민, N-페로세닐메틸아미노 (Fcm), N-2-피콜릴아미노 N'-옥시드, N-1,1-디메틸티오메틸렌아민, N-벤질리덴아민, N-p-메톡시벤질리덴아민, N-디페닐메틸렌아민, N-[(2-피리딜)메시틸]메틸렌아민, N-(N',N'-디메틸아미노메틸렌)아민, N,N'-이소프로필리덴디아민, N-p-니트로벤질리덴아민, N-살리실리덴아민, N-5-클로로살리실리덴아민, N-(5-클로로-2-히드록시페닐)페닐메틸렌아민, N-시클로헥실리덴아민, N-(5,5-디메틸-3-옥소-1-시클로헥세닐)아민, N-보란 유도체, N-디페닐보린산 유도체, N-[페닐(펜타카르보닐크로뮴- 또는 텅스텐)카르보닐]아민, N-구리 킬레이트, N-아연 킬레이트, N-니트로아민, N-니트로소아민, 아민 N-옥시드, 디페닐포스핀아미드 (Dpp), 디메틸티오포스핀아미드 (Mpt), 디페닐티오포스핀아미드 (Ppt), 디알킬 포스포라미데이트, 디벤질 포스포라미데이트, 디페닐 포스포라미데이트, 벤젠술펜아미드, o-니트로벤젠술펜아미드 (Nps), 2,4-디니트로벤젠술펜아미드, 펜타클로로벤젠술펜아미드, 2-니트로-4-메톡시벤젠술펜아미드, 트리페닐메틸술펜아미드, 3-니트로피리딘술펜아미드 (Npys), p-톨루엔술폰아미드 (Ts), 벤젠술폰아미드, 2,3,6,-트리메틸-4-메톡시벤젠술폰아미드 (Mtr), 2,4,6-트리메톡시벤젠술폰아미드 (Mtb), 2,6-디메틸-4-메톡시벤젠술폰아미드 (Pme), 2,3,5,6-테트라메틸-4-메톡시벤젠술폰아미드 (Mte), 4-메톡시벤젠술폰아미드 (Mbs), 2,4,6-트리메틸벤젠술폰아미드 (Mts), 2,6-디메톡시-4-메틸벤젠술폰아미드 (iMds), 2,2,5,7,8-펜타메틸크로만-6-술폰아미드 (Pmc), 메탄술폰아미드 (Ms), β-트리메틸실릴에탄술폰아미드 (SES), 9-안트라센술폰아미드, 4-(4',8'-디메톡시나프틸메틸)벤젠술폰아미드 (DNMBS), 벤질술폰아미드, 트리플루오로메틸술폰아미드 및 페나실술폰아미드가 포함된다.
적합하게 보호된 카르복실산에는, 비제한적으로, 실릴-, 알킬-, 알케닐-, 아릴- 및 아릴알킬-보호된 카르복실산이 추가로 포함된다. 적합한 실릴기의 예에는, 트리메틸실릴, 트리에틸실릴, t-부틸디메틸실릴, t-부틸디페닐실릴, 트리이소프로필실릴 등이 포함된다. 적합한 알킬기의 예에는, 메틸, 벤질, p-메톡시벤질, 3,4-디메톡시벤질, 트리틸, t-부틸, 테트라히드로피란-2-일이 포함된다. 적합한 알케닐기의 예에는 알릴이 포함된다. 적합한 아릴기의 예에는 임의 치환된 페닐, 바이페닐 또는 나프틸이 포함된다. 적합한 아릴알킬기의 예에는 임의 치환된 벤질 (예를 들어, p-메톡시벤질 (MPM), 3,4-디메톡시벤질, O-니트로벤질, p-니트로벤질, p-할로벤질, 2,6-디클로로벤질, p-시아노벤질), 및 2- 및 4-피콜릴이 포함된다.
적합한 히드록실 보호기에는, 메틸, 메톡실메틸 (MOM), 메틸티오메틸 (MTM), t-부틸티오메틸, (페닐디메틸실릴)메톡시메틸 (SMOM), 벤질옥시메틸 (BOM), p-메톡시벤질옥시메틸 (PMBM), (4-메톡시페녹시)메틸 (p-AOM), 구아이아콜메틸 (GUM), t-부톡시메틸, 4-펜테닐옥시메틸 (POM), 실록시메틸, 2-메톡시에톡시메틸 (MEM), 2,2,2-트리클로로에톡시메틸, 비스(2-클로로에톡시)메틸, 2-(트리메틸실릴)에톡시메틸 (SEMOR), 테트라히드로피라닐 (THP), 3-브로모테트라히드로피라닐, 테트라히드로티오피라닐, 1-메톡시시클로헥실, 4-메톡시테트라히드로피라닐 (MTHP), 4-메톡시테트라히드로티오피라닐, 4-메톡시테트라히드로티오피라닐 S,S-디옥시드, 1-[(2-클로로-4-메틸)페닐]-4-메톡시피페리딘-4-일 (CTMP), 1,4-디옥산-2-일, 테트라히드로푸라닐, 테트라히드로티오푸라닐, 2,3,3a,4,5,6,7,7a-옥타히드로-7,8,8-트리메틸-4,7-메타노벤조푸란-2-일, 1-에톡시에틸, 1-(2-클로로에톡시)에틸, 1-메틸-1-메톡시에틸, 1-메틸-1-벤질옥시에틸, 1-메틸-1-벤질옥시-2-플루오로에틸, 2,2,2-트리클로로에틸, 2-트리메틸실릴에틸, 2-(페닐셀레닐)에틸, t-부틸, 알릴, p-클로로페닐, p-메톡시페닐, 2,4-디니트로페닐, 벤질, p-메톡시벤질, 3,4-디메톡시벤질, o-니트로벤질, p-니트로벤질, p-할로벤질, 2,6-디클로로벤질, p-시아노벤질, p-페닐벤질, 2-피콜릴, 4-피콜릴, 3-메틸-2-피콜릴 N-옥시도, 디페닐메틸, p, p'-디니트로벤즈히드릴, 5-디벤조수베릴, 트리페닐메틸, α-나프틸디페닐메틸, p-메톡시페닐디페닐메틸, 디(p-메톡시페닐)페닐메틸, 트리(p-메톡시페닐)메틸, 4-(4'-브로모펜아실옥시페닐)디페닐메틸, 4,4',4"-트리스(4,5-디클로로프탈이미도페닐)메틸, 4,4',4"-트리스(레불리노일옥시페닐)메틸, 4,4',4"-트리스(벤조일옥시페닐)메틸, 3-(이미다졸-1-일)비스(4',4"-디메톡시페닐)메틸, 1,1-비스(4-메톡시페닐)-1'-피레닐메틸, 9-안트릴, 9-(9-페닐)잔테닐, 9-(9-페닐-10-옥소)안트릴, 1,3-벤조디티올란-2-일, 벤즈이소티아졸릴 S,S-디옥시도, 트리메틸실릴 (TMS), 트리에틸실릴 (TES), 트리이소프로필실릴 (TIPS), 디메틸이소프로필실릴 (IPDMS), 디에틸이소프로필실릴 (DEIPS), 디메틸텍실실릴 (dimethylthexylsilyl), t-부틸디메틸실릴 (TBDMS), t-부틸디페닐실릴 (TBDPS), 트리벤질실릴, 트리-p-자일릴실릴, 트리페닐실릴, 디페닐메틸실릴 (DPMS), t-부틸메톡시페닐실릴 (TBMPS), 포르메이트, 벤조일포르메이트, 아세테이트, 클로로아세테이트, 디클로로아세테이트, 트리클로로아세테이트, 트리플루오로아세테이트, 메톡시아세테이트, 트리페닐메톡시아세테이트, 페녹시아세테이트, p-클로로페녹시아세테이트, 3-페닐프로피오네이트, 4-옥소펜타노에이트 (레불리네이트), 4,4-(에틸렌디티오)펜타노에이트 (레불리노일디티오아세탈), 피발로에이트, 아다만토에이트, 크로토네이트, 4-메톡시크로토네이트, 벤조에이트, p-페닐벤조에이트, 2,4,6-트리메틸벤조에이트 (메시토에이트), 알킬 메틸 카르보네이트, 9-플루오레닐메틸 카르보네이트 (Fmoc), 알킬 에틸 카르보네이트, 알킬 2,2,2-트리클로로에틸 카르보네이트 (Troc), 2-(트리메틸실릴)에틸 카르보네이트 (TMSEC), 2-(페닐술포닐) 에틸 카르보네이트 (Psec), 2-(트리페닐포스포니오) 에틸 카르보네이트 (Peoc), 알킬 이소부틸 카르보네이트, 알킬 비닐 카르보네이트, 알킬 알릴 카르보네이트, 알킬 p-니트로페닐 카르보네이트, 알킬 벤질 카르보네이트, 알킬 p-메톡시벤질 카르보네이트, 알킬 3,4-디메톡시벤질 카르보네이트, 알킬 o-니트로벤질 카르보네이트, 알킬 p-니트로벤질 카르보네이트, 알킬 S-벤질 티오카르보네이트, 4-에톡시-1-나프틸 카르보네이트, 메틸 디티오카르보네이트, 2-요오도벤조에이트, 4-아지도부티레이트, 4-니트로-4-메틸펜타노에이트, o-(디브로모메틸)벤조에이트, 2-포르밀벤젠술포네이트, 2-(메틸티오메톡시)에틸, 4-(메틸티오메톡시)부티레이트, 2-(메틸티오메톡시메틸)벤조에이트, 2,6-디클로로-4-메틸페녹시아세테이트, 2,6-디클로로-4-(1,1,3,3-테트라메틸부틸)페녹시아세테이트, 2,4-비스(1,1-디메틸프로필)페녹시아세테이트, 클로로디페닐아세테이트, 이소부티레이트, 모노숙시노에이트, (E)-2-메틸-2-부테노에이트, o-(메톡시카르보닐)벤조에이트, α-나프토에이트, 니트레이트, 알킬 N,N,N',N'-테트라메틸포스포로디아미데이트, 알킬 N-페닐카르바메이트, 보레이트, 디메틸포스피노티오일, 알킬 2,4-디니트로페닐술페네이트, 술페이트, 메탄술포네이트 (메실레이트), 벤질술포네이트 및 토실레이트 (Ts) 가 포함된다. 1,2- 또는 1,3-디올을 보호하는 경우, 보호기는 메틸렌 아세탈, 에틸리덴 아세탈, 1-t-부틸에틸리덴 케탈, 1-페닐에틸리덴 케탈, (4-메톡시페닐)에틸리덴 아세탈, 2,2,2-트리클로로에틸리덴 아세탈, 아세토니드, 시클로펜틸리덴 케탈, 시클로헥실리덴 케탈, 시클로헵틸리덴 케탈, 벤질리덴 아세탈, p-메톡시벤질리덴 아세탈, 2,4-디메톡시벤질리덴 케탈, 3,4-디메톡시벤질리덴 아세탈, 2-니트로벤질리덴 아세탈, 메톡시메틸렌 아세탈, 에톡시메틸렌 아세탈, 디메톡시메틸렌 오르토 에스테르, 1-메톡시에틸리덴 오르토 에스테르, 1-에톡시에틸리딘 오르토 에스테르, 1,2-디메톡시에틸리덴 오르토 에스테르, α-메톡시벤질리덴 오르토 에스테르, 1-(N,N-디메틸아미노)에틸리덴 유도체, α-(N,N'-디메틸아미노)벤질리덴 유도체, 2-옥사시클로펜틸리덴 오르토 에스테르, 디-t-부틸실릴렌기 (DTBS), 1,3-(1,1,3,3-테트라이소프로필디실록사닐리덴) 유도체 (TIPDS), 테트라-t-부톡시디실록산-1,3-디일리덴 유도체 (TBDS), 시클릭 카르보네이트, 시클릭 보로네이트, 에틸 보로네이트 및 페닐 보로네이트가 포함된다.
일부 구현예에서, 히드록실 보호기는, 아세틸, t-부틸, t-부톡시메틸, 메톡시메틸, 테트라히드로피라닐, 1-에톡시에틸, 1-(2-클로로에톡시)에틸, 2-트리메틸실릴에틸, p-클로로페닐, 2,4-디니트로페닐, 벤질, 벤조일, p-페닐벤조일, 2,6-디클로로벤질, 디페닐메틸, p-니트로벤질, 트리페닐메틸 (트리틸), 4,4'-디메톡시트리틸, 트리메틸실릴, 트리에틸실릴, t-부틸디메틸실릴, t-부틸디페닐실릴, 트리페닐실릴, 트리이소프로필실릴, 벤조일포르메이트, 클로로아세틸, 트리클로로아세틸, 트리플루오로아세틸, 피발로일, 9-플루오레닐메틸 카르보네이트, 메실레이트, 토실레이트, 트리플레이트, 트리틸, 모노메톡시트리틸 (MMTr), 4,4'-디메톡시트리틸, (DMTr) 및 4,4',4"-트리메톡시트리틸 (TMTr), 2-시아노에틸 (CE 또는 Cne), 2-(트리메틸실릴)에틸 (TSE), 2-(2-니트로페닐)에틸, 2-(4-시아노페닐)에틸 2-(4-니트로페닐)에틸 (NPE), 2-(4-니트로페닐술포닐)에틸, 3,5-디클로로페닐, 2,4-디메틸페닐, 2-니트로페닐, 4-니트로페닐, 2,4,6-트리메틸페닐, 2-(2-니트로페닐)에틸, 부틸티오카르보닐, 4,4',4"-트리스(벤조일옥시)트리틸, 디페닐카르바모일, 레불리닐, 2-(디브로모메틸)벤조일 (Dbmb), 2-(이소프로필티오메톡시메틸)벤조일 (Ptmt), 9-페닐잔텐-9-일 (픽실 (pixyl)) 또는 9-(p-메톡시페닐)잔틴-9-일 (MOX) 이다. 일부 구현예에서, 각각의 히드록실 보호기는, 아세틸, 벤질, t-부틸디메틸실릴, t-부틸디페닐실릴 및 4,4'-디메톡시트리틸로부터 독립적으로 선택된다. 일부 구현예에서, 히드록실 보호기는 트리틸, 모노메톡시트리틸 및 4,4'-디메톡시트리틸기로 이루어진 군으로부터 선택된다.
일부 구현예에서, 인 보호기는 올리고뉴클레오티드 합성 전반에 걸쳐 뉴클레오티드간 인 연결에 부착되는 기이다. 일부 구현예에서, 인 보호기는 뉴클레오티드간 인 연결의 황 원자에 부착된다. 일부 구현예에서, 인 보호기는 뉴클레오티드간 포스포로티오에이트 연결의 산소 원자에 부착된다. 일부 구현예에서, 인 보호기는 뉴클레오티드간 포스페이트 연결의 산소 원자에 부착된다. 일부 구현예에서, 인 보호기는 2-시아노에틸 (CE 또는 Cne), 2-트리메틸실릴에틸, 2-니트로에틸, 2-술포닐에틸, 메틸, 벤질, o-니트로벤질, 2-(p-니트로페닐)에틸 (NPE 또는 Npe), 2-페닐에틸, 3-(N- tert -부틸카르복사미도)-1-프로필, 4-옥소펜틸, 4-메틸티오-l-부틸, 2-시아노-1,1-디메틸에틸, 4-N-메틸아미노부틸, 3-(2-피리딜)-1-프로필, 2-[N-메틸-N-(2-피리딜)]아미노에틸, 2-(N-포르밀,N-메틸)아미노에틸, 4-[N-메틸-N-(2,2,2-트리플루오로아세틸)아미노]부틸이다.
단백질: 본원에서 사용된 바, 용어 "단백질" 은, 폴리펩티드 (즉, 펩티드 결합에 의해 서로 연결된 2 개 이상의 아미노산의 스트링) 를 나타낸다. 일부 구현예에서, 단백질에는 자연 발생 아미노산만이 포함된다. 일부 구현예에서, 단백질에는 하나 이상의 비(非)자연 발생 아미노산 (예를 들어, 인접한 아미노산과 하나 이상의 펩티드 결합을 형성하는 모이어티) 이 포함된다. 일부 구현예에서, 단백질 사슬의 하나 이상의 잔기는 비(非)아미노산 모이어티 (예를 들어, 글리칸 등) 를 함유한다. 일부 구현예에서, 단백질에는, 예를 들어 하나 이상의 디술피드 결합에 의해 연결되거나 또는 다른 방법에 의해 결합된, 하나 초과의 폴리펩티드 사슬이 포함된다. 일부 구현예에서, 단백질은 L-아미노산, D-아미노산 또는 둘 모두를 함유하고; 일부 구현예에서, 단백질은 당업계에 공지된 하나 이상의 아미노산 개질물 또는 유사체를 함유한다. 유용한 개질에는, 예를 들어 말단 아세틸화, 아미드화, 메틸화 등이 포함된다. 용어 "펩티드" 는 일반적으로 약 100 개 미만의 아미노산, 약 50 개 미만의 아미노산, 20 개 미만의 아미노산 또는 10 개 미만의 아미노산 길이를 갖는 폴리펩티드를 나타내는데 사용된다. 일부 구현예에서, 단백질은 항체, 항체 단편, 이의 생물학적 활성 부분 및/또는 이의 특징적 부분이다.
샘플: 본원에서 사용된 바와 같은 "샘플" 은, 특정 유기체 또는 그로부터 수득된 물질이다. 일부 구현예에서, 샘플은 본원에 기재된 바와 같은 관심 공급원으로부터 수득되거나 유도된 생물학적 샘플이다. 일부 구현예에서, 관심 공급원은 유기체, 예컨대 동물 또는 인간이다. 일부 구현예에서, 생물학적 샘플은 생물학적 조직 또는 유체를 포함한다. 일부 구현예에서, 생물학적 샘플은 골수; 혈액; 혈액 세포; 복수 (ascites); 조직 또는 미세침 생검 샘플; 세포-함유 체액; 자유 부유 (free floating) 핵산; 가래; 침; 소변; 뇌척수액, 복막액; 흉수; 대변; 림프; 부인과 유체; 피부 표본; 질 표본; 경구 표본; 코 표본; 세척물 또는 세정물, 예컨대 도관 세정물 또는 세기관지 세정물; 흡인물; 찰과표본 (scraping); 골수 시편; 조직 생검 시편; 수술 시편; 배설물, 기타 체액, 분비물 및/또는 배출물; 및/또는 이들로부터의 세포 등이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 생물학적 샘플은 개체로부터 수득된 세포이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 샘플은 임의의 적절한 방법에 의해 관심 공급원으로부터 직접 수득된 "1차 샘플" 이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 1차 생물학적 샘플은 생검 (예를 들어, 미세침 흡인물 또는 조직 생검), 수술, 체액 (예를 들어 혈액, 림프, 배설물 등) 의 채집 등으로 이루어진 군으로부터 선택된 방법에 의해 수득된다. 일부 구현예에서, 문맥상 명백할 수 있는 바와 같이, 용어 "샘플" 은 1차 샘플을 가공 (예를 들어, 하나 이상의 구성성분의 제거 및/또는 이에의 하나 이상의 작용제의 첨가) 에 의해 수득된 제제를 나타낸다. 예를 들어, 여과는 반투과성 막을 사용한다. 이러한 "가공된 샘플" 은, 예를 들어 mRNA 의 증폭 또는 역전사, 특정 구성성분의 단리 및/또는 정제 등과 같은 기술에 1차 샘플을 적용함으로써 수득되거나, 샘플로부터 추출되는 핵산 또는 단백질을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 샘플은 유기체이다. 일부 구현예에서, 샘플은 식물이다. 일부 구현예에서, 샘플은 동물이다. 일부 구현예에서, 샘플은 인간이다. 일부 구현예에서, 샘플은 인간 이외의 유기체이다.
입체화학적 이성질체 형태: 본원에서 사용된 바, 구절 "입체화학적 이성질체 형태" 는, 동일한 결합 순서로 결합된 동일한 원자로 구성되지만, 상호 교환 가능하지 않은 상이한 3차원 구조를 갖는 상이한 화합물을 나타낸다. 본 개시의 일부 구현예에서, 제공된 화학적 조성물은 화합물의 개별적인 입체화학적 이성질체 형태의 순수한 제제이거나 이를 포함할 수 있고; 일부 구현예에서, 제공된 화학적 조성물은 화합물의 2 개 이상의 입체화학적 이성질체 형태의 혼합물이거나 이를 포함할 수 있다. 특정 구현예에서, 이러한 혼합물은 상이한 입체화학적 이성질체 형태를 동일한 양으로 함유하고; 특정 구현예에서, 상기 혼합물은 2 개 이상의 상이한 입체화학 이성질체 형태를 상이한 양으로 함유한다. 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 모든 부분입체이성질체 및/또는 거울상이성질체를 함유할 수 있다. 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 모든 부분입체이성질체 및/또는 거울상이성질체보다 적게 함유할 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시의 화합물의 특정 거울상이성질체를 목적하는 경우, 이는, 예를 들어 비대칭 합성, 또는 키랄 보조제를 이용한 유도체화에 의해 제조될 수 있으며, 여기서 수득한 부분입체이성질체 혼합물이 분리되고, 보조기가 절단되어, 순수한 목적하는 거울상이성질체가 제공된다. 대안적으로, 분자가 아미노와 같은 염기성 관능기를 함유하는 경우, 부분입체이성질체 염은 적절한 광학 활성 산을 이용하여 형성되고, 예를 들어 분별 결정화에 의해 분리된다.
대상: 본원에서 사용된 바, 용어 "대상" 또는 "시험 대상" 은, 제공된 화합물 또는 조성물이 본 개시에 따라, 예를 들어 실험, 진단, 예방 및/또는 치료 목적으로 투여되는, 임의의 유기체를 나타낸다. 전형적인 대상에는, 동물 (예를 들어 포유류, 예컨대 마우스, 랫트, 토끼, 비인간 영장류 및 인간; 곤충류; 벌레류 등) 및 식물이 포함된다. 일부 구현예에서, 대상은 질환, 장애 및/또는 병태를 앓고/앓거나, 이에 걸리기 쉬울 수 있다.
실질적으로: 본원에서 사용된 바, 용어 "실질적으로" 는, 관심 특징 또는 특성의 전체 또는 거의 전체의 범위 또는 정도를 나타내는 정성적 상태를 나타낸다. 생물학 분야의 당업자는, 생물학적 및 화학적 현상이, 절대적 결과를 완료하고/하거나 완료에 이르거나, 또는 절대적 결과를 달성하거나 이를 회피하게 되는 경우가 거의 없다는 것을 이해할 것이다. 따라서, 본원에서 용어 "실질적으로" 는 다수의 생물학적 및/또는 화학적 현상에 내재하는 완성도의 잠재적 부족을 포착하기 위하여 사용된다.
앓고 있는: 질환, 장애 및/또는 병태를 "앓고 있는" 개체는, 질환, 장애 및/또는 병태의 하나 이상의 증상을 갖는 것으로 진단되고/되거나 이를 나타낸다.
걸리기 쉬운: 질환, 장애 및/또는 병태에 "걸리기 쉬운" 개체는, 일반 대중의 구성원보다 질환, 장애 및/또는 병태가 발병할 위험성이 높은 개체이다. 일부 구현예에서, 질환, 장애 및/또는 병태에 걸리기 쉬운 개체는, 질환, 장애 및/또는 장애를 갖는 것으로 진단되지 않을 수 있다. 일부 구현예에서, 질환, 장애 및/또는 병태에 걸리기 쉬운 개체는, 질환, 장애 및/또는 병태의 증상을 나타낼 수 있다. 일부 구현예에서, 질환, 장애 및/또는 병태에 걸리기 쉬운 개체는, 질환, 장애 및/또는 병태의 증상을 나타내지 않을 수 있다. 일부 구현예에서, 질환, 장애 및/또는 병태에 걸리기 쉬운 개체는, 질환, 장애 및/또는 병태가 발병할 수 있다. 일부 구현예에서, 질환, 장애 및/또는 병태에 걸리기 쉬운 개체는, 질환, 장애 및/또는 병태가 발병하지 않을 수 있다.
전신(적): 본원에서 사용된 바, 구절 "전신 투여", "전신으로 투여된", "말초 투여" 및 "말초로 투여된" 은, 화합물 또는 조성물이 수용자의 전신에 들어가도록 투여하는 단계을 나타내는, 당업계에서 이해되는 의미를 갖는다.
호변이성질체 형태: 본원에서 사용된 바, 구절 "호변이성질체 형태" 는, 용이한 상호 전환이 가능한 유기 화합물의 상이한 이성질체 형태를 기재하는데 사용된다. 호변이성질체는 단일 결합 및 인접한 이중 결합의 스위치에 의해 동반되는, 수소 원자 또는 양성자의 형식적 이동에 의해 특징지어질 수 있다. 일부 구현예에서, 호변이성질체는 양성자성 호변이성 (즉, 양성자의 재배치) 으로부터 유도될 수 있다. 일부 구현예에서, 호변이성질체는 원자가 호변이성 (즉, 전자 결합의 신속한 재구성) 으로부터 유도될 수 있다. 모든 이러한 호변이성질체 형태는 본 개시의 범주 내에 포함되는 것으로 의도된다. 일부 구현예에서, 화합물의 호변이성질체 형태는 서로 이동성 평형 상태로 존재하기 때문에, 별도의 성분을 제조하려는 시도는 혼합물의 형성을 유도한다. 일부 구현예에서, 화합물의 호변이성질체 형태는 분리 가능한 및 단리 가능한 화합물이다. 본 개시의 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 단일 호변이성질체 형태의 순수한 제제이거나 이를 포함하는 것으로 제공될 수 있다. 본 개시의 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 2 개 이상의 호변이성질체 형태의 혼합물로서 제공될 수 있다. 특정 구현예에서, 이러한 혼합물은 상이한 호변이성질체 형태를 동일한 양으로 함유하고; 특정 구현예에서, 이러한 혼합물은 화합물의 2 개 이상의 상이한 호변이성질체 형태를 상이한 양으로 함유한다. 본 개시의 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 모든 호변이성질체 형태를 함유할 수 있다. 본 개시의 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 모든 호변이성질체 형태보다 적게 함유할 수 있다. 본 개시의 일부 구현예에서, 화학적 조성물은 화합물의 하나 이상의 호변이성질체 형태를, 상호 전환의 결과로서 시간에 따라 변하는 양으로 함유할 수 있다. 본 개시의 일부 구현예에서, 호변이성은 케토-에놀 호변이성이다. 화학 분야의 당업자는, 케노-에놀 호변이성질체가 화학 업계에 공지된 임의의 적합한 시약을 사용하여 "트랩핑" (즉, "에놀" 형태를 유지하도록 화학적으로 개질됨) 되어 에놀 유도체를 제공하고, 이어서 당업계에 공지된 하나 이상의 적합한 기술을 사용하여 단리될 수 있다는 것을 인식할 것이다. 달리 명시되지 않는 한, 본 개시는, 순수한 형태로 또는 서로의 혼합물로, 관련 화합물의 모든 호변이성질체 형태를 포함한다.
치료제: 본원에서 사용된 바, 구절 "치료제" 는, 대상에 투여될 때, 치료적 효과를 갖고/갖거나 목적하는 생물학적 및/또는 약물학적 효과를 이끌어내는 임의의 작용제를 나타낸다. 일부 구현예에서, 치료제는 질환, 장애 및/또는 병태의 하나 이상의 증상 또는 특징을 완화, 개선, 경감, 저해, 예방, 개시 지연, 중증도 감소 및/또는 발생 감소시키는데 사용될 수 있는 임의의 물질이다.
치료적 유효량: 본원에서 사용된 바, 용어 "치료적 유효량" 은, 치료적 요법의 일부로서 투여될 때, 목적하는 생물학적 반응을 이끌어내는 물질 (예를 들어, 치료제, 조성물 및/또는 제형) 의 양을 의미한다. 일부 구현예에서, 물질의 치료적 유효량은, 질환, 장애 및/또는 병태를 앓고 있거나 이에 걸리기 쉬운 대상에게 투여될 때, 질환, 장애 및/또는 병태를 치료, 진단, 예방 및/또는 개시 지연시키는데 충분한 양이다. 당업자에 의해 이해될 수 있는 바와 같이, 물질의 유효량은 목적하는 생물학적 종점으로서 상기와 같은 인자, 전달되는 물질, 표적 세포 또는 조직 등에 따라 매우 가변적일 수 있다. 예를 들어 질환, 장애 및/또는 병태를 치료하기 위한 제형 중 화합물의 유효량은, 질환, 장애 및/또는 병태의 하나이상의 증상 또는 특징을 완화, 개선, 경감, 저해, 예방, 개시 지연, 중증도 감소 및/또는 발생 감소시키는 양이다. 일부 구현예에서, 치료적 유효량은 단일 투여량으로 투여되고; 일부 구현예에서는, 복수의 단위 투여량이 치료적 유효량을 전달하는데 요구된다.
치료하다: 본원에서 사용된 바, 용어 "치료하다", "치료" 또는 "치료하는" 은, 질환, 장애 및/또는 병태의 하나 이상의 증상 또는 특징을 부분적으로 또는 완전히 완화, 개선, 경감, 저해, 예방, 개시 지연, 중증도 감소 및/또는 발생 감소시키는데 사용되는 임의의 방법을 나타낸다. 치료는 질환, 장애 및/또는 병태의 징후를 나타내지 않는 대상에게 투여될 수 있다. 일부 구현예에서, 치료는, 예를 들어 질환, 장애 및/또는 병태와 관련된 병리학이 발병될 위험성을 감소시킬 목적으로, 질환, 장애 및/또는 병태의 초기 징후만을 나타내는 대상에게 투여될 수 있다.
불포화: 본원에서 사용된 바, 용어 "불포화" 는, 모이어티가 하나 이상의 불포화 단위를 갖는 것을 의미한다.
단위 투여량: 본원에서 사용된 바, 표현 "단위 투여량" 은, 약학적 조성물의 물리적 별개의 단위 및/또는 단일 투여량으로서 투여되는 양을 나타낸다. 다수의 구현예에서, 단위 투여량은 선결된 양의 활성제를 함유한다. 일부 구현예에서, 단위 투여량은 작용제의 전체 단일 투여량을 함유한다. 일부 구현예에서, 총 단일 투여량을 달성하기 위해, 하나 초과의 단위 투여량이 투여된다. 일부 구현예에서, 의도된 효과를 달성하기 위하여, 복수의 단위 투여량의 투여가 요구되거나, 요구될 것으로 예상된다. 단위 투여량은, 예를 들어 선결된 양의 하나 이상의 치료제, 선결된 양의 하나 이상의 고체 형태의 치료제, 선결된 양의 하나 이상의 치료제를 함유하는 서방형 제형 또는 약물 전달 장치 등을 함유하는 액체 (예를 들어, 허용 가능한 담체) 의 부피일 수 있다. 단위 투여량은 치료제(들) 이외에 임의의 다양한 구성성분을 포함하는 제형으로 존재할 수 있다고 이해될 수 있다. 예를 들어, 허용 가능한 담체 (예를 들어, 약학적으로 허용 가능한 담체), 희석제, 안정화제, 완충액, 보존제 등이, 상기 기재된 바와 같이 포함될 수 있다. 다수의 구현예에서, 특정 치료제의 총 적절한 일일 투여량은, 일부 또는 다수의 단위 투여량을 포함할 수 있고, 예를 들어 타당한 의료적 판단의 범주 내에서 주치의에 의해 결정될 수 있다고 당업자에 의해 이해될 수 있다. 일부 구현예에서, 임의의 특정 대상 또는 유기체에 대한 특정 유효 투여량 수준은, 치료하고자 하는 장애 및 장애의 중증도; 이용된 특정 활성 화합물의 활성; 이용된 특정 조성물; 대상의 연령, 체중, 일반 건강상태, 성별 및 식이; 투여 시간 및 이용된 특정 활성 화합물의 배출 속도; 치료의 지속기간; 이용된 특정 화합물(들)과 조합으로 또는 동시에 사용되는 약물 및/또는 부가적인 치료법, 및 의료 분야에 널리 공지된 인자를 포함하는 다양한 인자에 따라 가변적일 수 있다.
야생형: 본원에서 사용된 바, 용어 "야생형" 은, "정상적" (돌연변이, 질환에 걸린, 변경된 등과 대조적인) 상태 또는 상황에서 자연적으로 발견되는 구조 및/또는 활성을 갖는 엔티티를 나타내는, 당업계에서 이해되는 의미를 갖는다. 당업자는 야생형 유전자 및 폴리펩티드가 종종 복수의 상이한 형태 (예를 들어, 대립 유전자) 로 존재한다는 것을 이해할 것이다.
핵산: 용어 "핵산" 에는, 임의의 뉴클레오티드, 이의 유사체 및 이의 중합체가 포함된다. 본원에서 사용된 바, 용어 "폴리뉴클레오티드" 는, 임의의 길이의 뉴클레오티드, 리보뉴클레오티드 (RNA) 또는 데옥시리보뉴클레오티드 (DNA) 의 중합체성 형태를 나타낸다. 이러한 용어는 분자의 1차 구조를 나타내며, 따라서 이중- 및 단일-가닥 DNA, 및 이중- 및 단일-가닥 RNA 가 포함된다. 이러한 용어에는, 등가물로서, 뉴클레오티드 유사체 및 개질된 폴리뉴클레오티드, 예컨대 비제한적으로, 메틸화, 보호 및/또는 캡핑된 뉴클레오티드 또는 폴리뉴클레오티드로부터 제조된 RNA 또는 DNA 의 유사체가 포함된다. 상기 용어에는, 폴리- 또는 올리고-리보뉴클레오티드 (RNA), 및 폴리- 또는 올리고-데옥시리보뉴클레오티드 (DNA); 핵염기 및/또는 개질된 핵염기의 N-글리코시드 또는 C-글리코시드로부터 유도된 RNA 또는 DNA; 당 및/또는 개질된 당으로부터 유도된 핵산; 및 포스페이트 브릿지 및/또는 개질된 인-원자 브릿지 (또한 본원에서 "뉴클레오티드간 연결" 로 나타냄) 로부터 유도된 핵산이 포함된다. 상기 용어에는, 핵염기, 개질된 핵염기, 당, 개질된 당, 포스페이트 브릿지 또는 개질된 인 원자 브릿지의 임의의 조합을 함유하는 핵산이 포함된다. 예로는, 비제한적으로, 리보오스 모이어티를 함유하는 핵산, 데옥시리보오스 모이어티를 함유하는 핵산, 리보오스 및 데옥시 리보오스 모이어티를 모두 함유하는 핵산, 리보오스 및 개질된 리보오스 모이어티를 모두 함유하는 핵산이 포함된다. 접두사 폴리- 는 2 내지 약 10,000 개의 뉴클레오티드 단량체 단위를 함유하는 핵산을 나타내고, 여기서 접두사 올리고- 는 2 내지 약 200 개의 뉴클레오티드 단량체 단위를 함유하는 핵산을 나타낸다.
뉴클레오티드: 본원에서 사용된 바, 용어 "뉴클레오티드" 는, 헤테로시클릭 염기, 당 및 하나 이상의 포스페이트기 또는 인-함유 뉴클레오티드간 연결로 이루어진, 폴리뉴클레오티드의 단량체성 단위를 나타낸다. 자연 발생 염기 (구아닌 (G), 아데닌 (A), 시토신 (C), 티민 (T) 및 우라실 (U)) 는 퓨린 또는 피리미딘의 유도체이지만, 자연 및 비자연 발생하는 염기 유사체도 또한 포함된다고 이해되어야 한다. 자연 발생 당은 펜토오스 (5-탄소 당) 데옥시리보오스 (이는 DNA 를 형성함) 또는 리보오스 (이는 RNA 를 형성함) 이지만, 자연 및 비자연 발생 당 유사체도 또한 포함된다고 이해되어야 한다. 뉴클레오티드는 뉴클레오티드간 연결을 통해 연결되어, 핵산 또는 폴리뉴클레오티드를 형성한다. 다수의 뉴클레오티드간 연결이 당업계에 공지되어 있다 (예컨대, 비제한적으로, 포스페이트, 포스포로티오에이트, 보라노포스페이트 등). 인공 핵산에는, PNA (펩티드 핵산), 포스포트리에스테르, 포스포로티오네이트, H-포스포네이트, 포스포라미데이트, 보라노포스페이트, 메틸포스포네이트, 포스포노아세테이트, 티오포스포노아세테이트 및 천연 핵산의 포스페이트 백본의 기타 변이체, 예컨대 본원에 기재된 것들이 포함된다.
뉴클레오시드: 용어 "뉴클레오시드" 는, 핵염기 또는 개질된 핵염기가 당 또는 개질된 당에 공유 결합된 모이어티를 나타낸다.
당: 용어 "당" 은, 폐쇄형 및/또는 개방형 단당류를 나타낸다. 당에는, 비제한적으로, 리보오스, 데옥시리보오스, 펜토푸라노오스, 펜토피라노오스 및 헥소피라노오스 모이어티가 포함된다. 본원에서 사용된 바, 상기 용어는 해당 중합체가 핵산 유사체, 글리콜 핵산 ("GNA") 의 백본을 형성하는, 글리콜과 같은 통상적인 당 분자 대신에 사용되는 구조적 유사체를 또한 포함한다.
개질된 당: 용어 "개질된 당" 은, 당을 대체할 수 있는 모이어티를 나타낸다. 개질된 당은 당의 공간 배열, 전자 특성 또는 일부 다른 물리화학적 특성을 모방한다.
핵염기: 용어 "핵염기" 는, 하나의 핵산 가닥을 또 다른 상보적 가닥에 서열 특이적 방식으로 결합하는 수소-결합에 관여하는 핵산의 일부를 나타낸다. 가장 통상적인 자연 발생 핵염기는, 아데닌 (A), 구아닌 (G), 우라실 (U), 시토신 (C) 및 티민 (T) 이다. 일부 구현예에서, 자연 발생 핵염기는 개질된 아데닌, 구아닌, 우라실, 시토신 또는 티민이다. 일부 구현예에서, 자연 발생 핵염기는 메틸화된 아데닌, 구아닌, 우라실, 시토신 또는 티민이다. 일부 구현예에서, 핵염기는 "개질된 핵염기", 예를 들어 아데닌 (A), 구아인 (G), 우라실 (U), 시토신 (C) 및 티민 (T) 이외의 핵염기이다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 메틸화 아데닌, 구아닌, 우라실, 시토신 또는 티민이다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 핵염기의 공간 배열, 전자 특성 또는 일부 다른 물리화학적 특성을 모방하고, 하나의 핵산 가닥을 또 다른 것에 서열 특이적 방식으로 결합하는 수소-결합의 특성을 보유한다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 올리고뉴클레오티드 듀플렉스 (duplex) 의 활성 또는 세포내 효소에 의한 인식, 용융 거동에 실질적으로 영향을 주지 않으면서, 5 개의 자연 발생 염기 모두 (우라실, 티민, 아데닌, 시토신 또는 구아닌) 와 쌍을 이룰 수 있다.
키랄 리간드: 용어 "키랄 리간드" 또는 "키랄 보조제" 는, 키랄이며, 반응이 특정한 입체선택성으로 수행될 수 있도록 반응에 혼입될 수 있는 모이어티를 나타낸다.
축합제: 축합 반응에서, 용어 "축합제" 는, 덜 반응성인 부위를 활성화시키고, 또 다른 시약에 의한 공격에 더 취약하게 만드는 시약을 나타낸다. 일부 구현예에서, 상기 또 다른 시약은 친핵체이다.
차단기 (blocking group): 용어 "차단기" 는, 관능기의 반응성을 차폐하는 기를 나타낸다. 관능기는 이후 차단기의 제거에 의해 비(非)차폐될 수 있다. 일부 구현예에서, 차단기는 보호기이다.
모이어티: 용어 "모이어티" 는, 분자의 특정 분절 또는 관능기를 나타낸다. 화학적 모이어티는 종종 분자에 포매 또는 부가된 화학적 엔티티로 인식된다.
고체 지지체: 용어 "고체 지지체" 는, 핵산의 합성을 가능하게 하는 임의의 지지체를 나타낸다. 일부 구현예에서, 상기 용어는 핵산을 합성하기 위해 수행되는 반응 단계에서 이용된 매질 중에서 불용성이고, 반응성기를 포함하도록 유도체화된, 중합체 또는 유리를 나타낸다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 고도로 가교된 폴리스티렌 (Highly Cross-linked Polystyrene, HCP) 또는 제어된 기공 유리 (Controlled Pore Glass, CPG) 이다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 제어된 기공 유리 (CPG) 이다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 제어된 기공 유리 (CPG) 및 고도로 가교된 폴리스티렌 (HCP) 의 하이브리드 지지체이다.
연결 모이어티: 용어 "연결 모이어티" 는, 임의로 말단 뉴클레오시드와 고체 지지체 사이, 또는 말단 뉴클레오시드와 또 다른 뉴클레오시드, 뉴클레오티드, 또는 핵산 사이에 위치된 임의의 모이어티를 나타낸다.
DNA 분자: "DNA 분자" 는, 그 단일-가닥 형태 또는 이중-가닥 나선으로의 데옥시리보뉴클레오티드 (아데닌, 구아닌, 티민 또는 시토신) 의 중합체성 형태를 나타낸다. 이러한 용어는 단지 분자의 1차 및 2차 구조만을 나타내며, 이를 임의의 특정 3차 형태로 제한하지 않는다. 따라서, 이러한 용어에는, 특히 선형 DNA 분자 (예를 들어, 제한 단편), 바이러스, 플라스미드 및 염색체에서 발견되는 이중-가닥 DNA 가 포함된다. 특정 이중-가닥 DNA 분자 구조의 논의에서, 서열은 DNA 의 비(非)전사 가닥 (즉, mRNA 에 대하여 서열 상동성을 갖는 가닥) 을 따라 5' → 3' 방향으로만 서열을 제공하는 일반적 통례에 따라 본원에서 기재될 수 있다.
코딩 서열: DNA "코딩 서열" 또는 "코딩 영역" 은, 적절한 발현 제어 서열의 제어 하에 위치되는 경우, 생체내에서 폴리펩티드로 전사 및 번역되는 이중-가닥 DNA 서열이다. 코딩 서열의 경계 ("개방형 해독 프레임 (open reading frame)" 또는 "ORF") 는 5' (아미노) 말단에서의 출발 코돈 및 3' (카르복실) 말단에서의 번역 중단 코돈에 의해 결정된다. 코딩 서열에는, 비제한적으로, 원핵 서열, 진핵 mRNA 로부터의 cDNA, 진핵 (예를 들어 포유류) DNA 로부터의 게놈 DNA 서열 및 합성 DNA 서열이 포함된다. 폴리아데닐화 신호 및 전사 종결 서열은, 일반적으로 코딩 서열에 대해 3' 에 위치된다. 용어 "비(非)코딩 서열" 또는 "비코딩 영역" 은 아미노산으로 번역되지 않는 폴리뉴클레오티드 서열의 영역 (예를 들어, 5' 및 3' 미번역 영역) 을 나타낸다.
해독 프레임: 용어 "해독 프레임" 은, 이중 가닥 DNA 분자의 6 개의 가능한 해독 프레임 (각 방향으로 3 개) 중 하나를 나타낸다. 해독 프레임은 어느 코돈이 DNA 분자의 코딩 서열 내의 아미노산을 인코딩하는데 사용되는지를 결정한다.
안티센스 (antisense): 본원에서 사용된 바, "안티센스" 핵산 분자는, 단백질을 인코딩하는 "센스 (sense)" 핵산에 상보적인, 예를 들어 이중-가닥 cDNA 분자의 코딩 가닥에 상보적이거나, mRNA 서열에 상보적이거나, 또는 유전자의 코딩 가닥에 상보적인 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 따라서, 안티센스 핵산 분자는 센스 핵산 분자에 수소 결합을 통해 결합할 수 있다.
워블 위치 (wobble position): 본원에서 사용된 바, "워블 위치" 는, 코돈의 제 3 위치를 나타낸다. 일부 구현예에서, 코돈의 워블 위치 내 DNA 분자에서의 돌연변이는, 아미노산 수준에서의 잠재성 (silent) 또는 보존성 (conservative) 돌연변이를 유도한다. 예를 들어, 글리신을 인코딩하는 4 개의 코돈, 즉, GGU, GGC, GGA 및 GGG 가 있고, A, U, C 및 G 로부터 선택된 임의의 기타 뉴클레오티드에 대한 임의의 워블 위치 뉴클레오티드의 돌연변이는, 인코딩된 단백질의 아미노산 수준의 변화를 유도하지 않기 때문에, 잠재성 치환이다.
잠재성 치환: "잠재성 치환" 또는 "잠재성 돌연변이" 는, 코돈 내의 뉴클레오티드가 개질되지만, 코돈에 의해 인코딩된 아미노산 잔기의 변화는 초래하지 않는 것이다. 예로는, 코돈의 제 3 위치, 및 특정 코돈, 예컨대 코돈 "CGG" (이는, AGG 로 돌연변이되는 경우, 여전히 Arg 를 인코딩함) 의 제 1 위치에서의 돌연변이가 포함된다.
유전자: 본원에서 사용된 바, 용어 "유전자", "재조합 유전자" 및 "유전자 구조체" 는, 단백질 또는 이의 일부를 인코딩하는 DNA 분자, 또는 DNA 분자의 일부를 나타낸다. DNA 분자는 단백질을 인코딩하는 개방형 해독 프레임을 (엑손 서열로서) 함유할 수 있고, 추가로 인트론 서열을 포함할 수 있다. 본원에서 사용된 바, 용어 "인트론" 은, 단백질로 번역되지 않으며, 일부의 경우 (모든 경우에서가 아님), 엑손 사이에서 발견되는, 주어진 유전자에 존재하는 DNA 서열을 나타낸다. 유전자는 당업계에 널리 공지된 바와 같이, 하나 이상의 프로모터, 인핸서, 리프레서 및/또는 기타 조절 서열에 작동 가능하게 연결되어 (또는 이를 포함할 수 있음), 유전자의 활성 또는 발현을 조절하는 것이 바람직할 수 있다.
상보적 DNA: 본원에서 사용된 바, "상보적 DNA" 또는 "cDNA" 는, mRNA 의 역전사에 의해 합성되고, 이로부터 개재 서열 (인트론) 이 제거된 재조합 폴리뉴클레오티드를 포함한다.
상동성: "상동성" 또는 "동일성" 또는 "유사성" 은, 2 개의 핵산 분자 사이의 서열 유사성을 나타낸다. 상동성 및 동일성은 각각 비교의 목적으로 정렬될 수 있는 각각의 서열에서의 위치를 비교함으로써 측정될 수 있다. 비교된 서열에서 동등한 위치가 동일한 염기에 의해 점유되는 경우, 분자는 그 위치에서 동일하고; 동등한 부위가 동일한 또는 유사한 핵산 잔기 (예를 들어 입체적 및/또는 전자적 성질이 유사함) 에 의해 점유되는 경우, 분자는 그 위치에서 상동성 (유사성) 이 있는 것으로 언급될 수 있다. 상동성/유사성 또는 동일성의 백분율로서의 표현은 비교된 서열에 의해 공유된 위치에서 동일한 또는 유사한 핵산의 수의 함수를 나타낸다. "비(非)관련" 또는 "비(非)상동성" 인 서열은 본원에 기재된 서열과 40% 미만의 동일성, 35 % 미만의 동일성, 30% 미만의 동일성 또는 25 % 미만의 동일성을 공유한다. 두 서열의 비교에 있어서, 잔기 (아미노산 또는 핵산) 의 부재 또는 추가 잔기의 존재는 또한 동일성 및 상동성/유사성을 감소시킨다.
일부 구현예에서, 용어 "상동성" 은, 유사한 기능 또는 모티프를 갖는 유전자를 식별하는데 사용되는 서열 유사성의 수학적 기반 비교를 기재한다. 본원에 기재된 핵산 서열은 공용 데이터베이스에 대한 검색을 수행하기 위한, 예를 들어 다른 패밀리 구성원, 관련 서열 또는 동족체를 식별하기 위한 "쿼리 (query) 서열" 로서 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 이러한 검색은 [Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10] 의 NBLAST 및 XBLAST 프로그램 (버전 2.0) 을 사용하여 수행될 수 있다. 일부 구현예에서, BLAST 뉴클레오티드는 본 개시의 핵산 분자와 상동성인 뉴클레오티드 서열을 수득하기 위하여 NBLAST 프로그램, 스코어=100, 단어 길이=12 로 수행될 수 있다. 일부 구현예에서, 비교 목적으로 얼라인먼트 갭을 수득하기 위하여, Gapped BLAST 가 [Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25(17):3389-3402] 에 기재된 바와 같이 이용될 수 있다. BLAST 및 Gapped BLAST 프로그램을 이용하는 경우, 각각의 프로그램 (예를 들어, XBLAST 및 BLAST) 의 디폴트 파라미터가 사용될 수 있다 (www.ncbi.nlm.nih.gov 참조).
동일성: 본원에서 사용된 바, "동일성" 은, 서열이 서열 매칭을 최대화하기 위하여, 즉 갭 및 삽입을 고려하여 정렬될 때, 2 개 이상의 서열 내 상응하는 위치에서의 동일한 뉴클레오티드 잔기의 백분율을 의미한다. 동일성은, 비제한적으로, 하기에 기재된 것을 포함하여, 공지된 방법에 의해 용이하게 계산될 수 있다: [Computational Molecular Biology, Lesk, A. M., ed., Oxford University Press, New York, 1988]; [Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D. W., ed., Academic Press, New York, 1993]; [Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A. M., and Griffin, H. G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994]; [Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987]]; 및 [Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991]; 및 [Carillo, H., and Lipman, D., SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988)]. 동일성을 측정하는 방법은 시험된 서열 사이의 가장 큰 매칭을 제공하도록 디자인된다. 나아가, 동일성을 측정하는 방법은 공용으로 이용 가능한 컴퓨터 프로그램으로 코드화된다. 두 서열 사이의 동일성을 측정하는 컴퓨터 프로그램 방법에는, 비제한적으로, GCG 프로그램 패키지 ([Devereux, J., et al., Nucleic Acids Research 12(1): 387 (1984))], BLASTP, BLASTN, 및 FASTA ([Altschul, S. F. et al., J. Molec. Biol. 215: 403-410 (1990)] 및 [Altschul et al. Nuc. Acids Res. 25: 3389-3402 (1997)]) 가 포함된다. BLAST X 프로그램은 NCBI 및 다른 공급원으로부터 공용으로 이용 가능하다 ([BLAST Manual, Altschul, S., et al., NCBI NLM NIH Bethesda, Md. 20894]; [Altschul, S., et al., J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1990)]). 널리 공지된 스미스 워터맨 (Smith Waterman) 알고리즘 (algorithm) 이 또한 동일성을 측정하는데 사용될 수 있다.
이종(성): DNA 서열의 "이종" 영역은, 자연에서 더 큰 서열과 관련하여 발견되지 않는, 더 큰 DNA 서열 내 식별 가능한 DNA 분절이다. 따라서, 이종 영역이 포유류 유전자를 인코딩하는 경우, 유전자는 일반적으로 공급원 유기체의 게놈에서 포유류 게놈 DNA 에 플랭크 (flank) 되지 않는 DNA 에 의해 플랭크될 수 있다. 이종 코딩 서열의 또 다른 예는, 코딩 서열 그 자체가 자연에서 발견되지 않는 서열 (예를 들어, 게놈 코딩 서열이 비개질 유전자와 상이한 코돈 또는 모티프를 갖는 합성 서열 또는 인트론을 함유하는 cDNA) 이다. 대립 유전자 변이 또는 자연 발생 돌연변이 이벤트는 본원에 정의된 바와 같은 DNA 의 이종 영역을 유발시키지 않는다.
전이 돌연변이 (transition mutation): 용어 "전이 돌연변이" 는, 피리미딘 (시티딘 (C) 또는 티미딘 (T)) 이 또 다른 피리미딘으로 대체되거나, 또는 퓨린 (아데노신 (A) 또는 구아노신 (G)) 이 또 다른 퓨린으로 대체되는, DNA 서열에서의 염기 변화를 나타낸다.
전환 돌연변이 (transversion mutation): 용어 "전환 돌연변이" 는, 피리미딘 (시티딘 (C) 또는 티미딘 (T)) 이 퓨린 (아데노신 (A) 또는 구아노신 (G)) 으로 대체되거나, 또는 퓨린이 피리미딘으로 대체되는, DNA 서열에서의 염기 변화를 나타낸다.
올리고뉴클레오티드: 용어 "올리고뉴클레오티드" 는, 핵염기, 개질된 핵염기, 당, 개질된 당, 포스페이트 브릿지, 또는 개질된 인 원자 브릿지 (또한 본원에서, 본원에 추가로 정의된 "뉴클레오티드간 연결" 로 언급됨) 의 임의의 조합을 함유하는, 뉴클레오티드 단량체의 중합체 또는 올리고머를 나타낸다.
올리고뉴클레오티드는 단일-가닥 또는 이중-가닥일 수 있다. 본원에서 사용된 바, 용어 "올리고뉴클레오티드 가닥" 은, 단일-가닥 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 단일-가닥 올리고뉴클레오티드는 이중-가닥 영역을 가질 수 있고, 이중-가닥 올리고뉴클레오티드는 단일-가닥 영역을 가질 수 있다. 올리고뉴클레오티드의 예에는, 비제한적으로, 구조 유전자, 제어 및 종결 영역을 포함하는 유전자, 자기-복제 시스템, 예컨대 바이러스 또는 플라스미드 DNA, 단일-가닥 및 이중-가닥 siRNA 및 기타 RNA 간섭 시약 (RNAi 작용제 또는 iRNA 작용제), shRNA, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 리보자임, 마이크로RNA, 마이크로RNA 모방체, 수페르미르 (supermir), 압타머 (aptamer), 안티미르 (antimir), 안타고미르 (antagomir), Ul 어답터, 3중-형성 올리고뉴클레오티드, G-4중 올리고뉴클레오티드, RNA 활성화제, 면역-자극 올리고뉴클레오티드, 및 디코이 (decoy) 올리고뉴클레오티드가 포함된다.
RNA 간섭을 유도하는데 효과적인 이중-가닥 및 단일-가닥 올리고뉴클레오티드는, 또한 본원에서 siRNA, RNAi 작용제, 또는 iRNA 작용제로서 언급된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드를 유도하는 이러한 RNA 간섭은, RNAi-유도된 잠재성 복합체 (RISC) 로서 공지된 세포질 다중-단백질 복합체와 결합된다. 다수의 구현예에서, 단일-가닥 및 이중-가닥 RNAi 작용제는, 내인성 분자, 예를 들어 Dicer 에 의해 절단되어, RISC 기계에 들어가 표적 서열, 예를 들어 표적 mRNA의 RISC 매개 절단에 관여할 수 있는, 더 작은 올리고뉴클레오티드를 생성할 수 있도록 충분히 길다.
본 개시의 올리고뉴클레오티드는 다양한 길이일 수 있다. 특정 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 200 개의 뉴클레오티드 길이 범위일 수 있다. 각종 관련 구현예에서, 단일-가닥, 이중-가닥 및 삼중-가닥의 올리고뉴클레오티드는, 약 4 내지 약 10 개의 뉴클레오티드, 약 10 내지 약 50 개의 뉴클레오티드, 약 20 내지 약 50 개의 뉴클레오티드, 약 15 내지 약 30 개의 뉴클레오티드, 약 20 내지 약 30 개의 뉴클레오티드 길이 범위일 수 있다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 약 9 내지 약 39 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 4 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 5 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 6 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 7 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 8 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 9 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 10 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 11 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 12 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 15 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 20 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 25 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 30 개의 뉴클레오티드 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 18 개의 뉴클레오티드 길이의 상보적 가닥의 듀플렉스이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 21 개의 뉴클레오티드 길이의 상보적 가닥의 듀플렉스이다.
뉴클레오티드간 연결: 본원에서 사용된 바, 구절 "뉴클레오티드간 연결" 은, 일반적으로 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드 단위 사이의 인-함유 연결을 나타내고, 상기 및 본원에서 사용된 바와 같은 "당간 연결" 및 "인 원자 브릿지" 와 상호 교환 가능하다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드간 연결은 자연 발생 DNA 및 RNA 분자에서 발견되는 바와 같은, 포스포디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드간 연결은 "개질된 뉴클레오티드간 연결" 이고, 여기서 포스포디에스테르 연결의 각각의 산소 원자는 임의로 및 독립적으로 유기 또는 무기 모이어티로 대체된다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 유기 또는 무기 모이어티는, 비제한적으로, =S, =Se, =NR', -SR', -SeR', -N(R')2, B(R')3, -S-, -Se- 및 -N(R')- 로부터 선택되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 하기에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드간 연결은 포스포트리에스테르 연결, 포스포로티오에이트 디에스테르 연결
Figure pct00004
, 또는 개질된 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다. 뉴클레오티드간 연결은 연결 내 산 또는 염기 모이어티의 존재로 인해, 주어진 pH 에서 음이온 또는 양이온으로서 존재할 수 있다고 당업자에 의해 이해된다.
달리 명시되지 않는 한, 올리고뉴클레오티드 서열과 함께 사용될 때, s, s1, s2, s3, s4, s5, s6 및 s7 은 각각 독립적으로 하기 예시된 바와 같은, 하기의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다.
Figure pct00005
Figure pct00006
Figure pct00007
예를 들어, (Rp, Sp)-ATsCs1GA 는, 1) T 와 C 사이에 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결
Figure pct00008
; 및 2) C 와 G 사이에
Figure pct00009
의 구조를 갖는 포스포로티오에이트 트리에스테르 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 달리 명시되지 않는 한, 올리고뉴클레오티드 서열에 선행하는 Rp/Sp 지정은, 순차적으로 올리고뉴클레오티드 서열의 5' 에서 3' 로의 뉴클레오티드간 연결에서 키랄 연결 인 원자의 배열을 기재한다. 예를 들어, (Rp, Sp)-ATsCs1GA 에 있어서, T 와 C 사이의 "s" 연결에서의 인은 Rp 배열을 갖고, C 와 G 사이의 "s1" 연결에서의 인은 Sp 배열을 갖는다. 일부 구현예에서, "전부-(Rp)" 또는 "전부-(Sp)" 는 올리고뉴클레오티드의 모든 키랄 연결 인 원자가, 각각, 동일한 Rp 또는 Sp 배열을 갖는 것을 나타내는데 사용된다. 예를 들어, 전부-(Rp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC 는 올리고뉴클레오티드의 모든 키랄 연결 인 원자가 Rp 배열을 갖는다는 것을 나타내고; 전부-(Sp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC 는 올리고뉴클레오티드의 모든 키랄 연결 인 원자가 Sp 배열을 갖는다는 것을 나타낸다.
올리고뉴클레오티드 유형: 본원에서 사용된 바, 구절 "올리고뉴클레오티드 유형" 은, 특정 염기 서열, 백본 연결의 패턴 (즉, 뉴클레오티드간 연결 유형의 패턴, 예를 들어 포스페이트, 포스포로티오에이트 등), 백본 키랄 중심의 패턴 (즉 연결 인 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴), 및 백본 인 개질의 패턴 (예를 들어, 화학식 I 의 "-XLR1" 기의 패턴) 을 갖는 올리고뉴클레오티드를 정의하는데 사용된다. 공통으로 지정된 "유형" 의 올리고뉴클레오티드는 서로 구조적으로 동일하다.
당업자는, 본 개시의 합성 방법이 올리고뉴클레오티드 가닥의 각각의 뉴클레오티드 단위가 연결 인 및/또는 연결 인에서의 특정 개질, 및/또는 특정 염기, 및/또는 특정 당에서 특정한 입체화학을 갖도록 하기 위하여 사전에 디자인 및/또는 선택될 수 있도록, 올리고뉴클레오티드 가닥의 합성 동안 어느 정도의 제어를 제공한다는 것을 이해할 것이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 가닥은 연결 인에서 입체중심의 특정 조합을 갖도록 사전에 디자인 및/또는 선택된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 가닥은 연결 인에서 개질의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 결정된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 가닥은 염기의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 선택된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 가닥은 상기 구조적 특징 중 하나 이상의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 선택된다. 본 개시는 다수의 올리고뉴클레오티드 분자를 포함하거나 이로 이루어진 조성물 (예를 들어, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물) 을 제공한다. 일부 구현예에서, 모든 이러한 분자는 동일한 유형 (즉, 구조적으로 서로 동일함) 을 갖는다. 하지만, 다수의 구현예에서, 제공된 조성물은 상이한 유형의 다수의 올리고뉴클레오티드를, 전형적으로 선결된 상대적 양으로 포함한다.
키랄 제어: 본원에서 사용된 바, "키랄 제어" 는, 올리고뉴클레오티드 가닥내에서 모든 키랄 연결 인의 입체화학적 지정을 제어하는 능력을 나타낸다. 구절 "키랄 제어된 올리고뉴클레오티드" 는 키랄 연결 인에 대하여 단일 부분입체이성질체 형태로 존재하는 올리고뉴클레오티드를 나타낸다.
키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물: 본원에서 사용된 바, 구절 "키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물" 은, 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형을 선결된 수준으로 함유하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 나타낸다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 초과의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 복수의 올리고뉴클레오티드 유형의 혼합물을 포함한다. 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 예는 본원에 추가로 기재되어 있다.
키랄적으로 순수한: 본원에서 사용된 바, 구절 "키랄적으로 순수한" 은, 모든 올리고뉴클레오티드가 연결 인에 대하여 단일 부분입체이성질체 형태로 존재하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 기재하는데 사용된다.
키랄적으로 균일한: 본원에서 사용된 바, 구절 "키랄적으로 균일한" 은, 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 입체화학을 갖는, 올리고뉴클레오티드 분자 또는 유형을 기재하는데 사용된다. 예를 들어, 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 Rp 입체화학을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 키랄적으로 균일하다. 마찬가지로, 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 Sp 입체화학을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 키랄적으로 균일하다.
선결된: 선결된 것은, 예를 들어 무작위적으로 발생하거나 달성되는 것과 반대로서, 의도적으로 선택되는 것을 의미한다. 당업자는, 본 명세서를 읽음으로써, 본 개시가 제공된 조성물 내 제조 및/또는 내포를 위한 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 선택을 가능하게 하고, 나아가 임의로 선택된 특정 상대적 양으로, 정확하게 선택된 특정 유형의 제어된 제조를 가능하게 하여, 제공된 조성물이 제조되도록 하는, 신규하고 놀라운 기술을 제공한다는 것을 이해할 것이다. 상기 제공된 조성물은 본원에 기재된 바와 같이 "선결된" 것이다. 특정 개별 올리고뉴클레오티드 유형을 함유할 수 있는 조성물은, 이들이 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 의도적으로 생성하도록 제어될 수 없는 공정을 통해 생성되었기 때문에, "선결된" 조성물이 아니다. 일부 구현예에서, 선결된 조성물은 의도적으로 재현될 수 있는 것이다 (예를 들어, 제어된 공정의 반복을 통해서).
연결 인: 본원에서 사용된 바, 구절 "연결 인" 은, 언급되는 특정 인 원자가 뉴클레오티드간 연결에 존재하는 인 원자이고, 이러한 인 원자가 자연 발생 DNA 및 RNA 에서 일어나는 바와 같은 뉴클레오티드간 연결의 포스포디에스테르의 인 원자에 해당한다는 것을 나타내는데 사용된다. 일부 구현예에서, 연결 인 원자는 개질된 뉴클레오티드간 연결에 존재하고, 여기서 포스포디에스테르 연결의 각각의 산소 원자는 임의로 및 독립적으로 유기 또는 무기 모이어티로 대체된다. 일부 구현예에서, 연결 인 원자는 화학식 I 의 P* 이다. 일부 구현예에서, 연결 인 원자는 키랄이다. 일부 구현예에서, 키랄 연결 인 원자는 화학식 I 의 P* 이다.
P-개질: 본원에서 사용된 바, 용어 "P-개질" 은, 입체화학적 개질 이외의 연결 인에서의 임의의 개질을 나타낸다. 일부 구현예에서, P-개질은 연결 인에 공유결합으로 부착된 펜던트 모이어티의 부가, 치환 또는 제거를 포함한다. 일부 구현예에서, "P-개질" 은 -X-L-R1 (여기서, X, L 및 R1 은 독립적으로 본원 및 하기에 정의되고 기재된 바와 같음) 이다.
블록머 (b lockmer ): 본원에서 사용된 바, 용어 "블록머" 는, 각각의 개별 뉴클레오티드 단위를 특징짓는 구조적 특징의 패턴이, 뉴클레오티드간 인 연결에서 공통 구조적 특징을 공유하는 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위의 존재를 특징으로 하는 올리고뉴클레오티드 가닥을 나타낸다. 공통 구조적 특징은 연결 인에서의 공통 입체화학 또는 연결 인에서의 공통 개질을 의미한다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드간 인 연결에서의 공통 구조적 특징을 공유하는 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위는, "블록" 으로서 언급된다.
일부 구현예에서, 블록머는 "입체블록머 (stereoblockmer)" 이고, 예를 들어 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위는 연결 인에서 동일한 입체화학을 갖는다. 상기와 같은 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위는 "입체블록 (stereoblock)" 을 형성한다. 예를 들어 (Sp, Sp)-ATsCs1GA 는, 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위, Ts 및 Cs1 이 연결 인에서 동일한 입체화학 (둘 모두 Sp) 을 갖기 때문에 입체블록머이다. 동일한 올리고뉴클레오티드 (Sp, Sp)-ATsCs1GA 에서, TsCs1 은 블록을 형성하고, 이는 입체블록이다.
일부 구현예에서, 블록머는, 예를 들어 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 개질을 갖는 "P-개질 블록머 (P-modification blockmer)" 를 형성한다. 상기와 같은 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위는 "P-개질 블록" 을 형성한다. 예를 들어, (Rp, Sp)-ATsCsGA 는 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위, Ts 및 Cs 가 동일한 P-개질 (즉, 둘 모두 포스포로티오에이트 디에스테르임) 을 갖기 때문에 P-개질 블록머이다. (Rp, Sp)-ATsCsGA 의 동일한 올리고뉴클레오티드에서, TsCs 는 블록을 형성하고, 이는 P-개질 블록이다.
일부 구현예에서, 블록머는, 예를 들어 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 입체화학 및 동일한 개질을 갖는 "연결 블록머" 이다. 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위는 "연결 블록" 을 형성한다. 예를 들어, (Rp, Rp)-ATsCsGA 는 적어도 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위, Ts 및 Cs 가 동일한 입체화학 (둘 모두 Rp) 및 P-개질 (둘 모두 포스포로티오에이트) 을 갖기 때문에 연결 블록머이다. (Rp, Rp)-ATsCsGA 의 동일한 올리고뉴클레오티드에서, TsCs 는 블록을 형성하고, 이는 연결 블록이다.
일부 구현예에서, 블록머는 입체블록, P-개질 블록 및 연결 블록으로부터 독립적으로 선택되는 하나 이상의 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 블록머는 하나의 블록에 대한 입체블록머, 및/또는 또 다른 블록에 대한 P-개질 블록머 및/또는 또 다른 블록에 대한 연결 블록머이다. 예를 들어, (Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Sp, Sp, Sp)-AAsTsCsGsAs1Ts1Cs1Gs1ATCG 는, 입체블록 AsTsCsGsAs1 (연결 인에서 전부 Rp) 또는 Ts1Cs1Gs1 (연결 인에서 전부 Sp) 에 대한 입체블록머, P-개질 블록 AsTsCsGs (전부 s 연결) 또는 As1Ts1Cs1Gs1 (전부 s1 연결) 에 대한 P-개질 블록머, 또는 연결 블록 AsTsCsGs (연결 인에서 전부 Rp 및 전부 s 연결) 또는 Ts1Cs1Gs1 (연결 인에서 전부 Sp 및 전부 s1 연결) 에 대한 연결 블록머이다.
알트머 ( altmer ): 본원에서 사용된 바, 용어 "알트머" 는, 각각의 개별 뉴클레오티드 단위를 특징짓는 구조적 특징의 패턴이, 올리고뉴클레오티드 가닥의 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위가 뉴클레오티드간 인 연결에서 특정 구조적 특징을 공유하지 않는 것을 특징으로 하는 올리고뉴클레오티드 가닥을 나타낸다. 일부 구현예에서, 알트머는 반복 패턴을 포함하도록 디자인된다. 일부 구현예에서, 알트머는 반복 패턴을 포함하지 않도록 디자인된다.
일부 구현예에서, 알트머는, 예를 들어 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 입체화학을 갖지 않는, "입체알트머 (stereoaltmer)" 이다. 예를 들어 (Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC.
일부 구현예에서, 알트머는, 예를 들어 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 개질을 갖지 않는, "P-개질 알트머" 이다. 예를 들어, 전부-(Sp)-CAs1GsT (여기서, 각각의 연결 인은 다른 것과 상이한 P-개질을 가짐).
일부 구현예에서, 알트머는, 예를 들어 2 개의 연속적인 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 입체화학 또는 동일한 개질을 갖지 않는, "연결 알트머" 이다. 예를 들어, (Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Rp, Sp)-GsCs1CsTs1CsAs1GsTs1CsTs1GsCs1TsTs2CsGs3CsAs4CsC.
유니머 ( unimer ): 본원에서 사용된 바, 용어 "유니머" 는, 각각의 뉴클레오티드 단위를 특징짓는 구조적 특징의 패턴이, 가닥 내의 모든 뉴클레오티드 단위가 뉴클레오티드간 인 연결에서 하나 이상의 공통 구조적 특징을 공유하는 올리고뉴클레오티드 가닥을 나타낸다. 공통 구조적 특징은 연결 인에서의 공통 입체화학 또는 연결 인에서의 공통 개질을 의미한다.
일부 구현예에서, 유니머는, 예를 들어 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 입체화학을 갖는, "입체유니머" 이다. 예를 들어, 전부-(Sp)-CsAs1GsT (여기서, 모든 연결은 Sp 인을 가짐).
일부 구현예에서, 유니머는, 예를 들어 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 동일한 개질을 갖는, "P-개질 유니머" 이다. 예를 들어, (Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp, Sp, Rp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC (여기서, 모든 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 디에스테르임).
일부 구현예에서, 유니머는, 예를 들어 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에 동일한 입체화학 및 동일한 개질을 갖는, "연결 유니머" 이다. 예를 들어, 전부-(Sp)-GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGsCsAsCsC (여기서, 모든 뉴클레오티드간 연결은 Sp 연결 인을 갖는 포스포로티오에이트 디에스테르임).
갭머 (gapmer): 본원에서 사용된 바, 용어 "갭머" 는, 올리고뉴클레오티드 가닥의 하나 이상의 뉴클레오티드간 인 연결이, 예를 들어 자연 발생 DNA 또는 RNA 에서 발견되는 바와 같은 포스페이트 디에스테르 연결인 것을 특징으로 하는 올리고뉴클레오티드 가닥을 나타낸다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 가닥의 하나 초과의 뉴클레오티드간 인 연결은 자연 발생 DNA 또는 RNA 에서 발견되는 바와 같은 포스페이트 디에스테르 연결이다. 예를 들어, 전부-(Sp)-CAs1GsT (여기서, C 와 A 사이의 뉴클레오티드간 연결은 포스페이트 디에스테르 연결임).
스킵머 ( skipmer ): 본원에서 사용된 바, 용어 "스킵머" 는, 올리고뉴클레오티드 가닥의 하나 걸러서의 뉴클레오티드간 인 연결이, 예를 들어 자연 발생 DNA 또는 RNA 에서 발견되는 바와 같은 포스페이트 디에스테르 연결이고, 올리고뉴클레오티드 가닥의 하나 걸러서의 뉴클레오티드간 인 연결이 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 갭머의 유형을 나타낸다. 예를 들어, 전부-(Sp)-AsTCs1GAs2TCs3G.
본 개시의 목적을 위하여, 화학 원소는 원소 주기율표, CAS 버전, Handbook of Chemistry and Physics, 67th Ed., 1986-87, 내부 표지에 따라 식별된다.
본 개시의 화합물 및 조성물과 관련하여 본원에 기재된 방법 및 구조는, 또한 이러한 화합물 및 조성물의 약학적으로 허용 가능한 산 또는 염기 부가 염, 및 모든 입체 이성질체 형태에 적용된다.
도 1. 도 1 은, Δ48-50 결실을 갖는 인간 DMD 환자 유래 섬유아세포 (del48-50 을 갖는 DMD 세포) 에서, 엑손 51 스킵핑을 유도하는 올리고뉴클레오티드의 상대적 활성을 나타낸다. 결과는 랜도머 (randomer) WV-942 에 대하여 정규화되었다. 이용된 Taqman 검정은 엑손 51 이 스킵된 DMD 전사물을 특이적으로 검출한다.
도 2. 도 2 는, Δ48-50 결실을 갖는 인간 DMD 환자 유래 섬유아세포에서, 엑손 51 스킵핑을 유도하는 올리고뉴클레오티드의 상대적 활성을 나타낸다. 결과는 미처리 대조군에 대하여 정규화되었다. 이용된 Taqman 검정은 엑손 51 이 스킵된 DMD 전사물을 특이적으로 검출한다.
도 3a 내지 3f. 도 3a 내지 3f 는, 올리고뉴클레오티드 처리 유무 하의 분화된 인간 DMD 섬유아세포에서, 미처리 대조군과 비교한 근육 분화 마커의 발현을 나타낸 것이다. DMD, DES, MYOD1, MYOG, MYH1 및 RYR1 에 대하여 특이적인 Taqman 검정을 사용하였다.
도 4. C3a 보체 활성화의 시간 경과의 예. 올리고뉴클레오티드 농도: 330 ㎍/mL; 37 ℃.
도 5. Bb 보체 활성화의 시간 경과의 예. 올리고뉴클레오티드 농도: 330 ㎍/mL; 37 ℃.
도 6. 알부민 결합 예.
도 7a 및 7b. 각종 올리고뉴클레오티드: WV395 및 WV884 내지 WV897 의 서열 및 화학. 접미사 .01 및 .02 는 배치 번호를 나타낸다. 이는 2'-OMe 개질을 포함하는, 스테레오퓨어 (키랄적으로 순수한) 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함한다.
도 8a 및 8b. 인간 디스트로핀의 엑손 51 의 스킵핑을 유도하는 각종 올리고뉴클레오티드의 능력. 8b 는 3 회 이상의 반복 검증을 포함하는, 데이터의 편집본이다. 대조군: WV-942, WV-1714, 및 미처리군; 농도: 10uM; 지속 기간: 분화 배지에서 4 일; 처리는 짐노틱 (gymnotic) 이었음 (트랜스펙션 시약 미포함); 세포: Del 48-50 [(디스트로핀 결실 엑손 48-50) 을 갖는 환자로부터의 1차 인간 근육아세포, DL 589.2 (디스트로핀 결실 엑손 51-55)].
도 9a 및 9b. WV-2095 내지 WV-2109 를 포함하는 각종 올리고뉴클레오티드의 윙 상에서의 PS (포스포로티오에이트) 및 2'-F 의 조성. WV-2106 내지 WV-2109 는 헤미머이다.
도 10a 및 10b. 디스트로핀의 엑손 51 의 스킵핑을 유도하는 각종 올리고뉴클레오티드의 능력. 도 10b 는 WV-1714 에 대한 부가적인 데이터를 나타낸다. 이러한 실험에서의 음성 대조군인, WV-1683 은, 마우스 엑손 23 을 표적으로 한다.
도 11a 및 11b. 각종 올리고뉴클레오티드, WV-1108 및 WV-2381 내지 WV-2395 의 서열 및 화학. 이들은 윙에 PS (포스포로티오에이트) 및 코어에 PO (포스포디에스테르) 를 갖는다.
도 12. 디스트로핀의 엑손 51 의 스킵핑을 유도하는 각종 올리고뉴클레오티드의 능력. 대조군: WV-942 (드리사퍼센 (Drisapersen), 스테레오랜덤) 및 미처리군; 농도: 10uM; 지속 기간: 분화 배지에서 4 일; 세포: Del 48-50; 처리는 짐노틱이었음 (트랜스펙션 시약 미포함).
도 13a 및 13b. 각종 올리고뉴클레오티드, WV-2366 내지 WV-2370 의 서열 및 화학. 이들은 윙에 Sp 입체구조의 포스포로티오에이트 및 코어에 PO (포스포디에스테르) 를 갖는다.
도 14. 디스트로핀의 엑손 51 의 스킵핑을 유도하는 각종 올리고뉴클레오티드의 능력. 대조군: WV-942 및 미처리군; 농도: 10uM; 지속 기간: 분화 배지에서 4 일; 세포: Del 48-50; 처리는 짐노틱이었음 (트랜스펙션 시약 미포함).
도 15. WV-2313 내지 WV-2320, 및 WV-2223 내지 WV-2230 을 포함하는, 20-mer 또는 25-mer 인, 각종 올리고뉴클레오티드의 서열 및 화학.
도 16. 인간 (H) 및 마우스 (M) 디스트로핀 서열과 비교한, WV-2313 내지 WV-2320, 및 WV-2223 내지 WV-2230 을 포함하는, 20-mer 또는 25-mer 인, 각종 올리고뉴클레오티드의 서열의 위치.
도 17. 디스트로핀의 엑손 51 의 스킵핑을 유도하는 각종 올리고뉴클레오티드의 능력. 대조군: WV-942 및 미처리군; 농도: 10uM; 지속 기간: 분화 배지에서 4 일; 세포: Del 48-50; 처리는 짐노틱이었음 (트랜스펙션 시약 미포함).
도 18. 짐노틱 전달을 통해 전달된 (지질에 콘쥬게이트되지 않은), 또는 지질에 콘쥬게이트된 (표 5 에 열거된), 활성 화합물인 올리고뉴클레오티드 WV-942 에 의해 중재된 엑손 스킵핑.
도 19. 짐노틱 전달을 통해 전달된 (지질에 콘쥬게이트되지 않은), 또는 지질에 콘쥬게이트된, 올리고뉴클레오티드 WV-942 의, 비복근, 심장 및 사두근 근육 조직에의 전달과 관련된 생체내 약동학 (PK) 데이터. 시험된 물품은 표 4 에 열거되어 있다. 왼쪽에서 오른쪽으로: WV-942, WV-2588, WV-2581, WV-2582, WV-2584, WV-2585, WV-2586 및 WV-2587.
도 20. 짐노틱 전달을 통해 전달된 (지질에 콘쥬게이트되지 않은), 또는 지질에 콘쥬게이트된, WV-942 의, 비복근, 심장 및 사두근 및 횡격막 근육 조직에의 전달과 관련된 생체내 약동학 (PK) 데이터. 왼쪽에서 오른쪽으로: WV-942, WV-2588, WV-2581, WV-2582, WV-2584, WV-2585, WV-2586 및 WV-2587.
도 21. 상이한 조직 (사두근 및 횡격막) 에서의 지질 콘쥬게이트에 대한 표준 곡선.
도 22. 상이한 조직 (심장 및 비복근) 에서의 지질 콘쥬게이트에 대한 표준 곡선.
도 23. 활성 화합물에의 콘쥬게이션을 위한 지질 및 링커 구조의 예. 약어: Oligo: 예시 올리고뉴클레오티드.
도 24. 도 24 는, WV-942 (드리사퍼센) 과 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 2'-F 윙, 및 PO 또는 Rp 코어를 갖는 스테레오퓨어 올리고뉴클레오티드의 효능을 나타낸다. 처리는 10 μM, 짐노틱 처리였다.
도 25. 도 25 는, WV-942 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 스테레오퓨어 올리고뉴클레오티드의 효능을 나타낸다. 2 가지 상이한 투여량, 3 μM 및 10 μM 에 대한 데이터가 제시되어 있다. 왼쪽 아래는 2'-F 및 2'-OMe 개질의 상이한 패턴을 갖는 스테레오랜도머 (stereorandomer) 이다. 우측 아래는 스테레오퓨어 올리고뉴클레오티드이다.
도 26. 도 26 은, WV-942 와 비교하여 배수 변화로 나타낸; 각종 올리고뉴클레오티드의 효능을 나타낸다. 2 가지 상이한 투여량, 3 μM 및 10 μM 에 대한 데이터가 제시되어 있다.
도 27a 내지 27o. 도 27a 내지 27o 는, 올리고뉴클레오티드: WV887, WV892, WV896, WV1714, WV2444, WV2445, WV2526, WV2527, WV2528, 및 WV2530 에 대한 액체 크로마토그래피 및 질량 스펙트럼 데이터를 나타낸다. 접미사 (01), (02), .01 및 .02 는 배치 번호를 나타낸다.
도 28. 도 28 은, WV-942 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 3 가지 상이한 투여량, 1 μM, 3 μM 및 10 μM 에 대한 데이터가 제시되어 있다. 스킵핑 효율은 일반적으로 농도가 증가함에 따라 증가한다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함).
도 29. 도 29 는, WV-942 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 0.3 μM 내지 30 μM 의 상이한 투여량에 대한 데이터가 제시되어 있다. 스킵핑 효율은 일반적으로 농도가 증가함에 따라 증가한다. WV-3545 (PO 및 C6 아미노 링커에 의해 스테아르산에 콘쥬게이트된 WV-3473) 및 WV-3546 (PO 및 C6 아미노 링커에 의해 투르비나르산에 콘쥬게이트된 WV-3473) (둘 모두 올리고뉴클레오티드-지질 콘쥬게이트를 함유함) 는, 보다 높은 효율을 나타내었다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함). 실험은 삼중으로 수행하였고, 평균 데이터를 제시하였다.
도 30. 도 30 은, 제공된 올리고뉴클레오티드의 일부 예가 시험된 조건 하에서 hTLR9 아고니스트 활성을 갖지 않는다는 것을 나타낸다. 실험은 삼중으로 수행하였고, 평균 데이터를 제시하였다.
도 31. 도 31 은, 각종 제공된 올리고뉴클레오티드가 올리고뉴클레오티드 ODN2006 의 hTLR9 아고니스트 활성에 대항 (및 hTLR9 를 길항) 할 수 있다는 것을 나타낸다. 제시된 바와 같이, 지질 (예를 들어, 스테아르산 (WV-3545) 또는 투르비나르산 (WV-3546)) 및 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, WV-3473 (WV-3545 및 WV-3546)) 의 콘쥬게이트는, 유의하게 증가된 hTLR9 안타고니스트 활성을 갖는다. 아고니스트성 올리고뉴클레오티드 ODN2006 의 농도는 0.3 μM 으로 일정하게 유지시켰다. 각각의 올리고뉴클레오티드를 하기와 같이 농도를 감소시키면서 시험하였다: 5, 2.5, 1.25, 0.6, 0.3, 0.15 및 0.075 μM (왼쪽에서 오른쪽으로). 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함). 실험은 삼중으로 수행하였고, 평균 데이터를 제시하였다.
도 32. 도 32 는, 각종 올리고뉴클레오티드가 올리고뉴클레오티드 ODN2006 의 hTLR9 아고니스트 활성에 대항 (및 hTLR9 를 길항) 할 수 있다는 것을 나타낸다. 제시된 바와 같이, 지질 (예를 들어, 스테아르산 (WV-3545) 또는 투르비나르산 (WV-3546)) 및 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, WV-3473 (WV-3545 및 WV-3546)) 의 콘쥬게이트는, 유의하게 증가된 hTLR9 안타고니스트 활성을 갖는다. neg: 음성 대조군 (완충제 만). ODN2006c: CpG 서열이 GpC 로 대체된 아고니스트 대조군. PMO: 에테플러센 (eteplirsen). 아고니스트성 올리고뉴클레오티드 ODN2006 의 농도는 0.3 μM 으로 일정하게 유지시켰다. 각각의 올리고뉴클레오티드를 하기와 같이 농도를 감소시키면서 시험하였다: 5, 2.5, 1.25, 0.6, 0.3, 0.15 및 0.075 μM (왼쪽에서 오른쪽으로). 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함). 실험은 삼중으로 수행하였고, 평균 데이터를 제시하였다.
도 33. 도 33 은, WV-942 및 PMO (에테플러센) 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 스킵핑 효율은 일반적으로 농도가 증가함에 따라 증가한다. 0.1 μM 내지 10 μM 의 상이한 투여량에 대한 데이터가 제시되어 있다. DMD del48-50 세포가 사용되었다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함).
도 34. 도 34 는, WV-942 및 PMO (에테플러센) 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 스킵핑 효율은 일반적으로 농도가 증가함에 따라 증가한다. 3 가지 상이한 투여량, 1 μM, 3 μM 및 10 μM 에 대한 데이터가 제시되어 있다. DMD del48-50 세포가 사용되었다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함). neg: 음성 대조군.
도 35. 도 35 는, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 스킵핑 효율은 일반적으로 농도가 증가함에 따라 증가한다. 4 가지 상이한 투여량, 1 μM, 3 μM, 10 μM 및 30 μM 에 대한 데이터가 제시되어 있다. DMD del48-50 세포가 사용되었다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함).
도 36. 도 36 은, WV-942 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 10 μM 의 투여량에 대한 데이터가 제시되어 있다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함). DMD del48-50 세포가 사용되었다.
도 37. 도 37 은, WV-942 와 비교하여, 인간 디스트로핀의 엑손 51 을 스킵핑하는 특정 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 스킵핑 효율의 예를 나타낸다. 2 가지 투여량, 3 μM (오른쪽 컬럼) 및 10 μM (왼쪽 컬럼) 에 대한 데이터가 제시되어 있다. 처리는 짐노틱이었다 (트랜스펙션 시약 미포함). 시험된 조건 하에서, 지질 콘쥬게이션은 스킵핑 효율을 증가시켰다.
도 38a 내지 38d. 도 38a 내지 38d 는, 각종 근육 조직: 비복근 (도 38a); 삼두근 (도 38b); 심장 (도 38c); 및 횡격막 (도 38d) 에서의 올리고뉴클레오티드 분포의 예를 나타낸다.
합성 올리고뉴클레오티드는 다양한 적용에서 유용한 분자적 툴 (tool) 을 제공한다. 예를 들어, 올리고뉴클레오티드는 치료, 진단, 연구 및 나노물질 적용에 있어서 유용하다. 자연 발생 핵산 (예를 들어, 비개질된 DNA 또는 RNA) 의 사용은, 예를 들어 엔도- 및 엑소-뉴클라아제에 대한 이의 민감성에 의해 제한된다. 따라서, 이러한 단점을 피하기 위하여 각종 합성 대응물이 개발되어 왔다. 이에는, 무엇보다도, 이러한 분자를 분해에 덜 민감하게 만들고 올리고뉴클레오티드의 다른 특성을 개선시키는, 화학적 개질, 예를 들어 염기 개질, 당 개질, 백본 개질 등을 함유하는 합성 올리고뉴클레오티드가 포함된다. 화학적 개질은 또한 특정한 목적하지 않는 효과, 예컨대 증가된 독성 등을 유도할 수 있다. 구조적 관점에서, 뉴클레오티드간 포스페이트 연결에 대한 개질은 키랄성을 도입하고, 올리고뉴클레오티드의 특정한 특성은 올리고뉴클레오티드의 백본을 형성하는 인 원자의 입체배치에 의해 영향을 받을 수 있다. 예를 들어, 시험관내 연구는, 안티센스 뉴클레오티드의 특성, 예컨대 결합 친화성, 상보적 RNA 에 대한 서열 특이적 결합, 뉴클라아제에 대한 안정성이, 특히, 백본의 키랄성 (예를 들어, 인 원자의 입체배치) 에 의해 영향을 받는다는 것을 보여주었다.
무엇보다도, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드의 구조 요소, 예컨대 염기 서열, 화학적 개질 (예를 들어, 당, 염기 및/또는 뉴클레오티드간 연결의 개질, 및 이의 패턴), 및/또는 입체화학 (예를 들어, 백본 키랄 중심의 입체화학 (키랄 뉴클레오티드간 연결), 및/또는 이의 패턴) 이, 특성, 예를 들어 단백질 결합 특성, 안정성, 스플라이싱-변경 능력 등에 의해 중재될 수 있는 활성, 독성에 유의한 영향을 미칠 수 있다는 인식을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 특성은 화학적 개질 (염기, 당, 및/또는 뉴클레오티드간 연결의 개질) 및/또는 입체화학 (백본 키랄 중심의 패턴) 을 최적화함으로써 조정될 수 있다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제어된 구조 요소, 예를 들어 제어된 화학적 개질 및/또는 제어된 백본 입체화학 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물이, 비제한적으로 본원에 기재된 특성을 포함하여, 예상치 못한 특성을 제공한다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 화학적 개질 (예를 들어, 염기 개질, 당 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질 등) 을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 조성물은, 개선된 특성, 예컨대 개선된 스플라이싱-변경 능력, 보다 낮은 독성, 또는 개선된 단백질 결합 프로파일, 및/또는 개선된 전달 등을 갖는다. 특히, 일부 구현예에서, 본 개시는 전사물의 스플라이싱을 변경하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 전사물의 스플라이싱을 개선시키기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 및 방법에 의해 변경된 전사물 스플라이싱은, 예를 들어 목적하지 않는 생물학적 기능이 억제 또는 제거될 수 있도록 스플라이싱 생성물을 개질시킴에 의한, 목적하는 및/또는 개선된 생물학적 기능을 갖는 생성물의 생성, 및/또는 목적하지 않는 생성물의 녹다운을 포함한다.
일부 구현예에서, 전사물은 프리-mRNA 이다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 생성물은 성숙 RNA 이다. 일부 구현예에서, 스플라이싱 생성물은 RNA 이다. 일부 구현예에서, 변경은 하나 이상의 엑손의 스킵핑을 포함한다. 일부 구현예에서, 전사물의 스플라이싱은, 엑손 스킵핑이 엑손 스킵핑의 부재와 비교하여 개선된 유익한 활성을 갖는 mRNA 및 단백질의 수준을 증가시킨다는 점에서, 개선된다. 일부 구현예에서, 프레임시프트를 야기하는 엑손이 스킵된다. 일부 구현예에서, 목적하지 않는 돌연변이를 포함하는 엑손이 스킵된다. 일부 구현예에서, 조기 종결 코돈을 포함하는 엑손이 스킵된다. 목적하지 않는 돌연변이는 단백질 서열의 변화를 야기하는 돌연변이일 수 있으며; 이는 또한 잠재성 돌연변이일 수 있다. 일부 구현예에서, 목적하지 않는 SNP 를 포함하는 엑손이 스킵된다.
일부 구현예에서, 전사물의 스플라이싱은, 엑손 스킵핑이 엑손 스킵핑의 부재와 비교하여 목적하지 않는 활성을 갖는 mRNA 및 단백질의 수준을 저하시킨다는 점에서, 개선된다. 일부 구현예에서, 표적은, 하나 이상의 엑손을 스킵핑함으로써, 조기 종결 코돈 및/또는 프레임시프트 돌연변이를 야기하는 엑손 스킵핑을 통해 녹다운된다.
해독 프레임 정정은 결실의 측면에 있는 1 또는 2 개의 엑손의 스킵핑, 넌센스 돌연변이를 함유하는 인-프레임 (in-frame) 엑손의 스킵핑, 또는 중복된 엑손의 스킵핑에 의해 달성된다.
일부 구현예에서, 본 개시는 스플라이싱의 변경, 예를 들어 엑손 스킵핑에 의해, CAG 반복과 같은 특정 목적하지 않는 반복을 감소시키는 조성물 및 방법을 제공한다 (예를 들어 [Evers, et al., Targeting several CAG expansion diseases by a single antisense oligonucleotide, PLoS One. 2011;6(9):e24308. doi: 10.1371/journal.pone.0024308]; [Mulders, et al., Triplet-repeat oligonucleotide-mediated reversal of RNA toxicity in myotonic dystrophy, Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Aug 18;106(33):13915-20] 등 참조). 표적의 예에는, 비제한적으로, HTT, ATXN3, DMPK, CNBP, AR, C9ORF72 (가족성 전측두엽 치매 및 근위축성 측색 경화증에 대한 표적) 및 하기에 열거된 것들이 포함된다:
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일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 제공된 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는, 염기 개질, 당 개질, 및/또는 뉴클레오티드간 연결 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 염기 개질 및 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 염기 개질 및 뉴클레오티드간 연결 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 당 개질 및 뉴클레오티드간 연결 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 염기 개질, 당 개질, 및 뉴클레오티드간 연결 개질을 포함한다. 화학적 개질, 예컨대 염기 개질, 당 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질 등의 예는, 비제한적으로, 본 개시에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 개질된 염기는 치환된 A, T, C, G 또는 U 이다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2-F 개질이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이며, 여기서 R1 은 임의 치환된 알킬이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 브릿지된 바이시클릭 또는 폴리시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 5-20 개의 고리 원자를 갖는 브릿지된 (bridged) 바이시클릭 또는 폴리시클릭 고리이며, 하나 이상의 고리 원자는 임의로 및 독립적으로 헤테로원자이다. 고리 구조의 예는, BNA, LNA 등에서 발견되는 것들과 같이 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 천연 포스페이트 연결을 모두 포함하는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물은, 개선된 특성, 예를 들어 활성 및 독성 등을 제공한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 치환된 포스포로티오에이트 연결이다.
무엇보다도, 본 개시는, 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 제제가, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 사슬 내 개별적인 백본 키랄 중심의 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이한 다수의 별개의 화학적 엔티티를 함유한다는 인식을 포함한다. 백본 키랄 중심의 입체화학의 제어가 없으면, 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 제제는, 미결된 수준의 올리고뉴클레오티드 입체이성질체를 포함하는 비제어된 조성물을 제공한다. 이러한 입체이성질체는 동일한 염기 서열을 가질 수 있지만, 이들은 적어도 이의 상이한 백본 입체화학으로 인해 화학적 엔티티가 상이하고, 본원에서 입증된 바와 같이, 상이한 특성, 예를 들어 활성, 독성, 분포 등을 가질 수 있다. 무엇보다도, 본 개시는 관심있는 올리고뉴클레오티드의 특정 입체이성질체이거나 이를 함유하는 신규한 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 특정 입체이성질체는, 예를 들어 이의 염기 서열, 이의 길이, 이의 백본 연결의 패턴, 및 이의 백본 키랄 중심의 패턴에 의해 정의될 수 있다. 당업계에서 이해되는 바와 같이, 일부 구현예에서, 염기 서열은 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오시드 잔기의 (예를 들어, 아데닌, 시토신, 구아노신, 티민 및 우라실과 같은 표준 자연 발생 뉴클레오티드와 비교하여, 당 및/또는 염기 구성성분의) 동일성 및/또는 개질 상태, 및/또는 상기와 같은 잔기의 하이브리드화 특징 (즉, 특정 상보적 잔기와 하이브리드할 수 있는 능력) 을 나타낼 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는, 당 개질, 예를 들어 윙 영역에서 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는, 당 개질을 갖지 않는 중간 영역, 예를 들어 코어 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학적으로 동일한, 예를 들어 이들은 동일한 염기 서열, 뉴클레오시드 개질의 동일한 패턴 (존재하는 경우, 당 및 염기 모이어티에 대한 개질), 백본 키랄 중심의 동일한 패턴, 및 백본 인 개질의 동일한 패턴을 갖는, 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 선결된 수준으로 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 본 개시는, 무엇보다도, 특정 올리고뉴클레오티드의 개별적인 입체이성질체가 서로 상이한 안정성 및/또는 활성 (예를 들어, 기능적 및/또는 독성 특성) 을 나타낼 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 내 특정 키랄 구조의 내포 및/또는 위치를 통해 달성되는 특성 개선은, 특정 백본 연결, 잔기 개질 등의 사용을 통해 (예를 들어, 특정 유형의 개질된 포스페이트 [예를 들어, 포스포로티오에이트, 치환된 포스포로티오에이트 등], 당 개질 [예를 들어, 2'-개질 등], 및/또는 염기 개질 [예를 들어, 메틸화 등] 의 사용을 통해) 달성되는 것들에 필적하거나, 그 보다 더 우수할 수 있다. 무엇보다도, 본 개시는, 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 특성 (예를 들어, 활성, 독성 등) 이, 임의로 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 다른 특징 (예를 들어, 연결 패턴, 뉴클레오시드 개질 패턴 등) 의 조정/최적화와 조합으로, 이의 백본 키랄 중심의 패턴을 최적화함으로써 조정될 수 있다는 것을 인식한다. 본 개시의 각종 예에서 예시된 바와 같이, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 개선된 특성, 예컨대 보다 낮은 독성, 개선된 단백질 결합 프로파일, 개선된 전달 등을 나타낼 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 증가된 수준의 하나 이상의 동위원소를 함유한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 하나 이상의 원소, 예를 들어 수소, 탄소, 질소 등의 하나 이상의 동위원소로 라벨된다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는, 풍부한 수준의 듀테륨을 함유하는, 염기 개질, 당 개질, 및/또는 뉴클레오티드간 연결 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 위치에서 듀테륨으로 라벨된다 ( -1H 의 -2H 로의 대체). 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된 임의의 모이어티 (예를 들어, 표적 모이어티, 지질 등) 의 하나 이상의 1H 이, 2H 로 치환된다. 상기와 같은 올리고뉴클레오티드는, 본원에 기재된 임의의 조성물 또는 방법에 사용될 수 있다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 특성은 입체화학 (백본 키랄 중심의 패턴) 및 화학적 개질 (염기, 당, 및/또는 뉴클레오티드간 연결의 개질) 을 최적화함으로써 조정될 수 있다. 무엇보다도, 본 개시는, 입체화학이 화학적 개질을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 특성을 추가로 개선시킬 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드가 뉴클레오시드 개질, 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 천연 포스페이트 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 예를 들어, WV-1092 (mG*SmGmCmAmC*SA*SA*SG*SG*SG*SC*SA*SC*RA*SG*SmAmCmUmU*SmC) 는, 2'-OMe 개질, 이의 5'- 및 3'-윙 영역에 포스페이트 및 포스포로티오에이트 연결, 및 이의 코어 영역에 포스포로티오에이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 예상치 못하게 올리고뉴클레오티드의 특성을 크게 개선시키는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 놀랍게도 낮은 독성을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 놀랍게도 개선된 단백질 결합 프로파일을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 놀랍게도 증강된 전달을 제공한다. 일부 구현예에서, 특정한 특성 개선, 예컨대 보다 낮은 독성, 개선된 단백질 결합 프로파일, 및/또는 증강된 전달 등은, 다른 특성, 예를 들어 활성, 특이성 등을 희생시키지 않고 달성된다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 보다 낮은 독성, 개선된 단백질 결합 프로파일, 및/또는 증강된 전달, 및 개선된 활성, 안정성, 및/또는 특이성 (예를 들어, 표적-특이성, 절단 부위 특이성 등) 을 제공한다. 개선된 활성 (예를 들어, 증강된 절단 속도, 증가된 표적-특이성, 절단 부위 특이성 등) 의 예에는, 비제한적으로, WO/2014/012081 및 WO/2015/107425 에 기재된 것들이 포함된다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 증가된 안정성을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 증가된 활성을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 증가된 안정성 및 활성을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 낮은 독성을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 낮은 면역 반응을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 낮은 보체 활성화를 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 대안적인 경로를 통한 놀랍게도 낮은 보체 활성화를 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 개선된 단백질 결합 프로파일을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 증가된 특정 단백질에 대한 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 놀랍게도 증강된 전달을 제공한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 임) 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함하며, 여기서 n 은 1 이고, t >1 이고, m > 2 이다. 일부 구현예에서, m > 3 이다. 일부 구현예에서, m > 4 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 하나 이상의 비(非)키랄 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 화학적 개질, 예컨대 뉴클레오시드 및 뉴클레오티드간 연결의 개질이, 증강된 특성을 제공할 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 화학적 개질 및 입체화학의 조합이, 예상치 못한 크게 개선된 특성 (예를 들어, 생체활성, 선택성 등) 을 제공할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 화학적 조합, 예컨대 당, 염기 및/또는 뉴클레오티드간 연결의 개질은, 입체화학 패턴, 예를 들어 (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 과 조합되어, 놀랍게도 증강된 특성을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 것이고, 하나 이상의 당 모이어티의 2'-개질, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결, 하나 이상의 포스포로티오에이트 연결, 및 (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 임) 의 입체화학 패턴의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, n 은 1 이고, t >1 이고, m > 2 이다. 일부 구현예에서, m > 3 이다. 일부 구현예에서, m > 4 이다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Sp)m 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 바와 같은 하나 이상의 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 바와 같은 하나 이상의 2'-F 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m, (Sp)t(Rp)n, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함하고, 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 바와 같은 하나 이상의 2'-OR 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Sp)t(Rp)n 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Np)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은, 임의로 (Sp)t 를 갖는 섹션과 (Sp)m 을 갖는 섹션 사이에 n 개의 비키랄 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및/또는 스테레오랜덤 (비키랄 제어된) 키랄 뉴클레오티드간 연결을 갖는, (Sp)t(Sp)m 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 사이에 n 개의 비키랄 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결이 존재한다. 일부 구현예에서, 사이에 n 개의 스테레오랜덤 키랄 뉴클레오티드간 연결이 존재한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 패턴은 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 1 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 2 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 2 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 3 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 4 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 5 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 6 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 7 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 8 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 9 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 10 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 11 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 12 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 13 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 14 초과이다. 일부 구현예에서, t 및 m 은 각각 독립적으로 15 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 1 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 2 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 2 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 3 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 4 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 5 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 6 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 7 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 8 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 9 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 10 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 11 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 12 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 13 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 14 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 15 초과이다. 일부 구현예에서, t 는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 이다. 일부 구현예에서, t 는 1 이다. 일부 구현예에서, t 는 2 이다. 일부 구현예에서, t 는 2 이다. 일부 구현예에서, t 는 3 이다. 일부 구현예에서, t 는 4 이다. 일부 구현예에서, t 는 5 이다. 일부 구현예에서, t 는 6 이다. 일부 구현예에서, t 는 7 이다. 일부 구현예에서, t 는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 9 이다. 일부 구현예에서, t 는 10 이다. 일부 구현예에서, t 는 11 이다. 일부 구현예에서, t 는 12 이다. 일부 구현예에서, t 는 13 이다. 일부 구현예에서, t 는 14 이다. 일부 구현예에서, t 는 15 이다. 일부 구현예에서, m 은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 1 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 2 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 2 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 3 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 4 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 5 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 6 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 7 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 8 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 9 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 10 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 11 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 12 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 13 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 14 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 15 초과이다. 일부 구현예에서, m 은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 이다. 일부 구현예에서, m 는 1 이다. 일부 구현예에서, m 는 2 이다. 일부 구현예에서, m 는 2 이다. 일부 구현예에서, m 는 3 이다. 일부 구현예에서, m 는 4 이다. 일부 구현예에서, m 는 5 이다. 일부 구현예에서, m 는 6 이다. 일부 구현예에서, m 는 7 이다. 일부 구현예에서, m 는 8 이다. 일부 구현예에서, m 는 9 이다. 일부 구현예에서, m 는 10 이다. 일부 구현예에서, m 은 11 이다. 일부 구현예에서, m 은 12 이다. 일부 구현예에서, m 은 13 이다. 일부 구현예에서, m 은 14 이다. 일부 구현예에서, m 은 15 이다. 일부 구현예에서, t=m 이다. 일부 구현예에서, n 은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 1 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 2 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 2 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 3 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 4 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 5 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 6 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 7 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 8 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 9 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 10 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 11 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 12 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 13 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 14 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 15 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 또는 20 이다. 일부 구현예에서, n 은 1 이다. 일부 구현예에서, n 은 2 이다. 일부 구현예에서, n 은 2 이다. 일부 구현예에서, n 은 3 이다. 일부 구현예에서, n 은 4 이다. 일부 구현예에서, n 은 5 이다. 일부 구현예에서, n 은 6 이다. 일부 구현예에서, n 은 7 이다. 일부 구현예에서, n 은 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 9 이다. 일부 구현예에서, n 은 10 이다. 일부 구현예에서, n 은 11 이다. 일부 구현예에서, n 은 12 이다. 일부 구현예에서, n 은 13 이다. 일부 구현예에서, n 은 14 이다. 일부 구현예에서, n 은 15 이다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 하기를 포함한다:
Figure pct00011
(여기서 O 는 비키랄 뉴클레오티드간 연결이고, S 는 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결임). 일부 구현예에서, 비키랄 중심은 포스포디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, Sp 배열의 키랄 중심은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 하기로부터 선택된다:
Figure pct00012
(여기서 O 는 비키랄 뉴클레오티드간 연결이고, S 는 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결임). 일부 구현예에서, 비키랄 중심은 포스포디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, Sp 배열의 키랄 중심은 포스포로티오에이트 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 5'-말단 영역, 예를 들어 5'-윙은, S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS, 또는 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 S 는 Sp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 5'-말단 영역, 예를 들어 5'-윙은, S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS, 또는 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 (5'-말단) 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 각각의 S 는 Sp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 2'-개질은 동일하다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 3'-말단 영역, 예를 들어 3'-윙은, S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS, 또는 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 S 는 Sp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 3'-말단 영역, 예를 들어 3'-윙은, S, SS, SSS, SSSS, SSSSS, SSSSSS, 또는 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 마지막 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 마지막 (3'-말단) 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 마지막 S 는 마지막 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 마지막 S 는 마지막 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 마지막 S 는 마지막 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 마지막 S 는 마지막 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 마지막 S 는 마지막 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 각각의 S 는 Sp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 나타낸다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는, 독립적으로 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 2'-개질은 동일하다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 본원에 기재된 바와 같은, 5'-말단 영역, 예를 들어 5'-윙, 및 3'-말단 영역, 예를 들어, 3'-말단 윙을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 -F 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 -F 의 입체화학 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 첫 번째 S 는 제공된 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드간 연결을 나타내고, 3'-말단 영역은 SSSSSSS 의 입체화학 패턴을 포함하며, 여기서 5'- 또는 3'-말단 영역에 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 5'-말단과 3'-말단 영역 사이에 중간 영역, 예를 들어 코어 영역을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 5'-말단과 3'-말단 영역 사이에 중간 영역, 예를 들어 코어 영역을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 각각의 당 모이어티가 독립적으로 2'-OR1 개질을 포함하는, 하나 이상의 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 2'-F 개질을 포함하지 않는 하나 이상의 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 하나 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 하나 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 하나 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 하나 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 중간 영역은 하나 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역, 예를 들어 5'-윙에 -F 를 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 3 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 4 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 5 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 6 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 7 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 8 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 9 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 10 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 3 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 4 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 5 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 6 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 7 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 8 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 9 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 10 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 3 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 4 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 5 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 6 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 7 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 8 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 9 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에 -F 를 포함하는 10 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 첫 번째 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역, 예를 들어 3'-윙에 -F 를 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 3 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 4 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 5 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 6 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-윙을 포함하는 7 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 9 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 10 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 3 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 4 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 5 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 6 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 7 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 8 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 9 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 10 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 2 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 3 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 4 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 5 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 6 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 7 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 8 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 9 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에 -F 를 포함하는 10 개 이상의 연속적인 뉴클레오티드 단위를 포함하며, 여기서 연속적인 뉴클레오티드 단위의 마지막 뉴클레오티드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드 단위이다. 일부 구현예에서, -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함하는 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, -F 를 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 -F 를 포함하는 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, -F 를 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 바와 같은 5'-말단 및 3'-말단 영역을 모두 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 키랄 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 키랄 제어된 키랄 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 전사물에 결합하여, 전사물의 스플라이싱 패턴을 변화시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 도 35, 36, 37, 38 등에 기재된 바와 같은, 하나 이상의 적합한 조건 하에서, 비슷한 올리고뉴클레오티드보다 큰 효율을 갖는 엑손의 엑손-스킵핑을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 스킵핑 효율은, 예를 들어 도 35, 36, 37, 38 등에 기재된 바와 같은, 하나 이상의 적합한 조건 하에서, 비슷한 올리고뉴클레오티드보다 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 110%, 120%, 130%, 140%, 150%, 160%, 170%, 180%, 190% 더 크거나, 또는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 30, 40, 50 또는 그 이상의 배수이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 2'-F 개질이, 무엇보다도, 엑손-스킵핑 효율을 개선시킬 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 5'- 및 3'-말단에서의 Sp 뉴클레오티드간 연결이, 무엇보다도, 올리고뉴클레오티드 안정성을 개선시킬 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 천연 포스페이트 연결 및/또는 Rp 뉴클레오티드간 연결이, 무엇보다도, 시스템으로부터 올리고뉴클레오티드의 제거를 개선시킬 수 있다는 것을 입증한다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 당업계에 공지된 각종 검정이 본 개시에 따른 상기와 같은 특성을 평가하는데 이용될 수 있다.
일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 다수의 올리고뉴클레오티드는 하기를 포함하는 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다:
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(여기서 O 는 비키랄 뉴클레오티드간 연결이고, S 는 Sp 뉴클레오티드간 연결임). 일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열 또는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 15 개의 인접한 염기를 포함하거나 이로 이루어진 공통 염기 서열을 공유하고, 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, SSSS 를 포함하는 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖고 (여기서 S 는 Sp 배열의 포스포로티오에이트 연결임), Rp 배열의 포스포로티오에이트, 포스포디에스테르, 또는 포스포로디티오에이트 중 하나 이상을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열 또는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 15 개의 인접한 염기를 포함하거나 이로 이루어진 공통 올리고뉴클레오티드의 염기 서열을 갖고, 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, SSSS 의 서열을 포함하는 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖고 (여기서 S 는 Sp 배열의 포스포로티오에이트임), Rp 배열의 포스포로티오에이트, 포스포디에스테르, 또는 포스포로디티오에이트 중 하나 이상을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열 또는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 15 개의 인접한 염기를 포함하거나 이로 이루어진 공통 올리고뉴클레오티드의 염기 서열을 갖고, 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, Sp 배열의 4 개의 포스포로티오에이트를 포함하는 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖고 (여기서 Sp 배열의 4 개의 포스포로티오에이트는 인접하거나 인접하지 않을 수 있음), Rp 배열의 포스포로티오에이트, 포스포디에스테르, 또는 포스포로디티오에이트 중 하나 이상을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열 또는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 15 개의 인접한 염기를 포함하거나 이로 이루어진 공통 올리고뉴클레오티드의 염기 서열을 갖고, 40 개 이하의 염기의 길이를 갖고, Sp 배열의 5 개의 포스포로티오에이트를 포함하는 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖고 (여기서 Sp 배열의 5 개의 포스포로티오에이트는 인접하거나 인접하지 않을 수 있음), Rp 배열의 포스포로티오에이트, 포스포디에스테르, 또는 포스포로디티오에이트 중 2 개 이상을 추가로 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 LNA 당 개질이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 적어도 하나는 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬임), 적어도 하나는 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 적어도 하나는 2'-F 이고, 적어도 하나는 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬임), 적어도 하나는 2'-F 이고, 적어도 하나는 2'-OR1 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 5% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 10% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 15% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 20% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 25% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 30% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 35% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 40% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 45% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 50% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 55% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 60% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 65% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 70% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 75% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 80% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 85% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 90% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 95% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 각각의 당 모이어티는 개질된다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 LNA 당 개질이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 적어도 하나는 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬임), 적어도 하나는 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 적어도 하나는 2'-F 이고, 적어도 하나는 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 각각의 당 개질은 독립적으로 2'-OR1 또는 2'-F 이며 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬임), 적어도 하나는 2'-F 이고, 적어도 하나는 2'-OR1 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개 이상의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 1 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다F. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드 다음에 개질된 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드는 개질된 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드 다음에 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시뉴클레오시드 다음에 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드는 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시드는 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드 다음에 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시뉴클레오시드 다음에 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드는 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시드는 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 2'-F 개질된 당 모이어티 및 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 2'-F 개질된 당 모이어티 및 2'-OMe 개질된 당 모이어티, 예를 들어 [(2'-F)(2'-OMe)]x, [(2'-OMe)(2'-F)]x 등을 포함하며, 여기서 x 는 1-50 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 2'-F 및 2'-OMe 개질의 적어도 2 개의 쌍을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 포스포디에스테르 및 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결, 예를 들어 [(PO)(PS)]x, [(PS)(PO)]x 등을 포함하며, 여기서 x 는 1-50 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 포스포디에스테르 및 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결의 적어도 2 개의 쌍을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
제공된 올리고뉴클레오티드는 다양한 수의 천연 포스페이트 연결을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 천연 포스페이트 연결이다.
일부 구현예에서, 코어 영역은 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 8 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 9 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 11 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 12 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 13 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 14 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 2 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 3 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 4 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 5 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 6 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 7 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 8 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 9 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 10 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 11 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 12 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 13 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 14 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 15 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하거나, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 5% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 10% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 15% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 20% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 25% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 30% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 35% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 40% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 45% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 50% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 55% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 60% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 65% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 70% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 75% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 80% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 85% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 90% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 당 모이어티의 95% 이상은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 각각의 당 모이어티는 개질된다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개 이상의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 1 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 11 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 12 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 13 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 14 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다F. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드 다음에 개질된 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드는 개질된 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드 다음에 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시뉴클레오시드 다음에 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드는 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시드는 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드 다음에 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시뉴클레오시드 다음에 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결이 뒤따른다. 일부 구현예에서, 2'-개질을 포함하는 뉴클레오시드는 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다. 일부 구현예에서, 2'-F 를 포함하는 뉴클레오시드는 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결에 앞서있다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
제공된 올리고뉴클레오티드는 다양한 수의 천연 포스페이트 연결을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 천연 포스페이트 연결이다.
제공된 올리고뉴클레오티드는 다양한 수의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 8 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 9 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 9 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 8 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 7 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 6 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 3 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 95% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 90% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 85% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 80% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 70% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 60% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 50% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 40% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 30% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 20% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 9 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 8 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 7 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 6 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 3 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 95% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 90% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 85% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 80% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 70% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 60% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 50% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 40% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 30% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 20% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 각각의 당 모이어티는 독립적으로 개질된다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 목적하지 않는 표적 및/또는 생물학적 기능이 억제되도록, 전사물 스플라이싱을 변경시킨다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 경우 제공된 조성물은 또한 하이브리드화 후 전사물의 절단을 유도할 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 목적하는 표적 및/또는 생물학적 기능이 증강되도록, 전사물 스플라이싱을 변경시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은, 화학적 개질, 입체화학 및/또는 이들의 조합의 혼입에 의해, 접촉 후 표적 전사물의 절단을 효과적으로 억제 또는 방지한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 5% 는 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 10% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 20% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 30% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 40% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 50% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 60% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 70% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 80% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 85% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 90% 이상은 개질된 당 모이어티이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 95% 이상은 개질된 당 모이어티이다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 9 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 8 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 7 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 6 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 4 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 3 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 2 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 95% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 90% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 85% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 80% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 70% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 60% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 50% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 40% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 30% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 9 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 8 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 7 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 6 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 4 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 3 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 2 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 95% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 90% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 85% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 80% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 70% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 60% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 50% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 40% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 30% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 각각의 당 모이어티는 독립적으로 개질된다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 5% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 10% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 20% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 30% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 40% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 50% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 60% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 70% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 80% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 85% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 90% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 95% 는 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 9 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 8 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 7 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 6 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 4 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 3 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 2 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 95% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 90% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 85% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 80% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 70% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 60% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 50% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 40% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 30% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 10% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 5% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 DNA 뉴클레오티드를 포함하지 않는다. DNA 뉴클레오티드는, 당 모이어티가 비개질된 DNA 당 모이어티이고, 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 3 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 4 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 6 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 7 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 8 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 9 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 10 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 11 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 12 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 13 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 14 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 15 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 20 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 25 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함한다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 3 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 4 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 6 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 7 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 8 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 9 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 10 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 11 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 12 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 13 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 14 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 15 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 20 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 25 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함한다.
일부 구현예에서, 기준 조건과 비교하여, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 놀랍게도 효과적이다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과 (예를 들어, 목적하는 mRNA, 단백질 등의 증가된 수준, 목적하지 않는 mRNA, 단백질 등의 감소된 수준에 의해 측정됨) 는, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 또는 100 배 초과로 증강될 수 있다. 일부 구현예에서, 변화는 기준 조건과 비교하여 목적하는 mRNA 수준의 증가에 의해 측정된다. 일부 구현예에서, 변화는 기준 조건과 비교하여 목적하지 않는 mRNA 수준의 감소에 의해 측정된다. 일부 구현예에서, 기준 조건은 올리고뉴클레오티드 처리의 부재이다. 일부 구현예에서, 기준 조건은 동일한 염기 서열 및 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 조성물이다.
일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 2 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 3 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 4 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 5 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 6 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 7 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 8 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 9 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 10 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 11 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 12 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 13 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 14 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 15 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 20 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 25 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 30 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 35 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 40 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 45 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 50 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 60 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 70 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 80 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 90 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 100 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 200 배 초과로 증강된다. 일부 구현예에서, 목적하는 생물학적 효과는 500 배 초과로 증강된다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개의 윙 영역 및 하나의 코어 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-윙-3' 구조를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-윙-3' 갭머 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 상이하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 화학적 개질이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 2'-개질이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 뉴클레오티드간 연결 개질이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 영역은 백본 키랄 중심의 패턴이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 연결의 패턴이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 연결 유형의 패턴의 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 인 개질의 패턴이 동일하다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 윙 및 하나의 코어 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-3' 헤미머 구조를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-3' 헤미머 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-코어-윙-3' 헤미머 구조를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-코어-윙-3' 헤미머 구조를 갖는다.
윙 영역은, 윙 영역이 코어 영역과 상이한 구조적 특징을 함유한다는 점에서, 코어 영역과 구별될 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 윙 영역은, 이들이 상이한 당 개질, 염기 개질, 뉴클레오티드간 연결, 뉴클레오티드간 연결 입체화학 등을 갖는다는 점에서 코어 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 윙 영역은, 이들이 당의 상이한 2'-개질을 갖는다는 점에서 코어 영역과 상이하다.
일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다.
일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개의 윙 및 하나의 코어 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-윙-3' 구조를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-윙-3' 갭머 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 상이하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 화학적 개질이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 2'-개질이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 뉴클레오티드간 연결 개질이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 키랄 중심의 패턴이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 연결의 패턴이 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 연결 유형의 패턴의 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 백본 인 개질의 패턴이 동일하다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나의 윙 및 하나의 코어 영역을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-3' 헤미머 구조를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-윙-코어-3' 헤미머 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-코어-윙-3' 헤미머 구조를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-코어-윙-3' 헤미머 구조를 갖는다.
윙 영역은, 윙 영역이 코어 영역과 상이한 구조적 특징을 함유한다는 점에서, 코어 영역과 구별될 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 윙 영역은, 이들이 상이한 당 개질, 염기 개질, 뉴클레오티드간 연결, 뉴클레오티드간 연결 입체화학 등을 갖는다는 점에서, 코어 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 윙 영역은, 이들이 당의 상이한 2'-개질을 갖는다는 점에서, 코어 영역과 상이하다.
일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다.
일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 윙 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 5'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다. 일부 구현예에서, 3'-윙 영역과 코어 영역 사이의 뉴클레오티드간 연결은 코어 영역의 부분으로 간주된다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 이상의 뉴클레오시드를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 전사물에서 표적 서열에 상보적인 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하거나; 또는
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은, 윙에서 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 적어도 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은, 윙에서 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 적어도 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
윙 영역은 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하거나, 또는 코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 -F 를 포함하는, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 -F 를 포함하는, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 및 임의로 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 및 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위 (여기서 연속적인 뉴클레오시드 단위의 첫 번째 뉴클레오시드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오시드 단위임), 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 및 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위 (여기서 연속적인 뉴클레오시드 단위의 마지막 뉴클레오시드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오시드 단위임) 를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 및 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위 (여기서 연속적인 뉴클레오시드 단위의 첫 번째 뉴클레오시드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오시드 단위임), 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 및 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위 (여기서 연속적인 뉴클레오시드 단위의 마지막 뉴클레오시드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오시드 단위임) 를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위 (여기서 연속적인 뉴클레오시드 단위의 첫 번째 뉴클레오시드 단위는 올리고뉴클레오티드의 첫 번째 뉴클레오시드 단위임), 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 개 또는 그 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 및 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위 (여기서 연속적인 뉴클레오시드 단위의 마지막 뉴클레오시드 단위는 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오시드 단위임), 및 2'-OR1 개질 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1-6 지방족임) 을 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 당 모이어티를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 2 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 3 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 4 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 5 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 6 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 7 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 8 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 9 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 10 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 2 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 3 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 4 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 5 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 6 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 7 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 8 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 9 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2'-F 를 포함하는 10 개 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함한다.
일부 구현예에서, 연속적인 뉴클레오시드 단위는 각각 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결에 앞서있고/있거나 뒤따른다. 일부 구현예에서, 연속적인 뉴클레오시드 단위는 각각 독립적으로 포스포로티오에이트 연결에 앞서있고/있거나 뒤따른다. 일부 구현예에서, 연속적인 뉴클레오시드 단위는 각각 독립적으로 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결에 앞서있고/있거나 뒤따른다. 일부 구현예에서, 연속적인 뉴클레오시드 단위는 각각 독립적으로 키랄 제어된 포스포로티오에이트 연결에 앞서있고/있거나 뒤따른다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- a 의 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 2 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 3 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 4 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 5 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 6 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 7 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 8 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 9 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 영역은 10 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 2 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 3 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 4 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 5 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 6 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 7 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 8 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 9 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 영역은 10 개 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선결된 수준의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- a 의 구조를 갖는다.
본 개시에 제시된 바와 같이, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 한다. 일부 구현예에서, 목적하는 스플라이싱 생성물은 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 100%, 또는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18 ,19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000 배 또는 그 이상 증가된다. 일부 구현예에서, 목적하는 스플라이싱 기준은 기준 조건 하에서 존재하지 않는다 (예를 들어, 정량적 PCR 에 의해 신뢰성있게 검출될 수 없음). 일부 구현예에서, 본 개시에 예시된 바와 같이, 제공된 조성물 중 다수의 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 수준은, 선결된다.
일부 구현예에서, 각각 하기의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
5'-[Nu5]z1-[Num]z2-[Nu3]z3-3'
[식 중,
각각의 Nu5 는 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 Nu3 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 NuS 는 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
각각의 NuF 는 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위임].
일부 구현예에서, 각각 하기의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
5'-[Nu5]z1-[Num]z2-[Nu3]z3-3'
[식 중,
각각의 Nu5 는 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 Nu3 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 NuS 는 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
각각의 NuF 는 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 구조적으로 동일함].
일부 구현예에서, 각각 하기의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
5'-[NuS]z1-[Num]z2-[NuS]z3-3'
[식 중,
각각의 NuS 는 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위임].
일부 구현예에서, 각각 하기의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
5'-[NuS]z1-[Num]z2-[NuS]z3-3'
[식 중,
각각의 NuS 는 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 구조적으로 동일함].
일부 구현예에서, 각각 하기의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
5'-[NuF]z1-[Num]z2-[NuF]z3-3'
[식 중,
각각의 NuF 는 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 는 독립적으로 뉴클레오티드 단위임].
일부 구현예에서, 각각 하기의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다:
5'-[NuF]z1-[Num]z2-[NuF]z3-3'
[식 중,
각각의 NuF 는 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 구조적으로 동일함].
일부 구현예에서, Ac 는 -5'-[Nu5]z1-[Num]z2-[Nu3]z3-3' 이다. 일부 구현예에서, Ac 는 -5'-[NuS]z1-[Num]z2-[NuS]z3-3' 이다. 일부 구현예에서, Ac 는 -5'-[NuF]z1-[Num]z2-[NuF]z3-3' 이다.
일부 구현예에서, 적어도 하나의 Nu5 는 NuS 이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Nu3 은 NuS 이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Nu5 는 NuS 이고, 적어도 하나의 Nu3 은 NuS 이다. 일부 구현예에서, 각각의 Nu5 및 Nu3 는 독립적으로 NuS 이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Nu5 는 NuF 이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Nu3 은 NuF 이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Nu5 는 NuF 이고, 적어도 하나의 Nu3 은 NuF 이다. 일부 구현예에서, 각각의 Nu5 및 Nu3 은 독립적으로 NuF 이다.
일부 구현예에서, NuS 는 화학식 I 의 구조를 갖는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 화학식 I- a 의 구조를 갖는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고, Sp 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고, Sp 이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고, Rp 이다. 일부 구현예에서, 각각의 개질된 뉴클레오티드간 연결은 키랄 제어된 것이고, Rp 이다. 일부 구현예에서, 각각의 NuS 는 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 NuS 는 키랄 제어된 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 NuS 는 키랄 제어된 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 NuS 는 키랄 제어된 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 -F 를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 -F 를 포함하는 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-F 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 NuS 는 2'-F 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-R1 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 지방족이다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-MOE 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 2'-OMe 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, NuF 는 -F 를 포함하는 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 2'-F 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 NuF 는 2'-F 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 화학식 I 의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuS 는 화학식 I- a 의 구조를 갖는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 키랄 제어된, Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 키랄 제어된 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 키랄 제어된 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, NuF 는 2'-F 포스포로티오에이트 단위이다. 일부 구현예에서, NuF 는 키랄 제어된 2'-F 포스포로티오에이트 단위이다. 일부 구현예에서, NuF 는 키랄 제어된 Sp 2'-F 포스포로티오에이트 단위이다. 일부 구현예에서, 각각의 NuF 는 키랄 제어된 Sp 2'-F 포스포로티오에이트 단위이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- a 의 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, Num 는 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 지방족이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 2'-OMe 개질된 당 모이어티를 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 2'-F 는 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 키랄 제어된 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 키랄 제어된 Rp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 키랄 제어된 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 키랄 제어된 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, Num 는 키랄 제어된 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 키랄 제어된 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 키랄 제어된 Rp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 키랄 제어된 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 키랄 제어된 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Num 는 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 적어도 하나의 Num 는 키랄 제어된 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- a 의 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, NuS, NuF 및 Num 는 각각 독립적으로
Figure pct00014
의 구조를 가지며, 여기서 BNu 는 임의 치환된 핵염기이고; 각각의 RNu 는 독립적으로 R1, R', -L-R1, 또는 -L-R' 이고, 여기서 R1, R', 및 L 은 각각 독립적으로 정의되고 기재된 바와 같고; LNu5 는 공유 결합이거나, 또는 올리고뉴클레오티드의 5'-말단에 있는 경우, RNu 이고; 및 LNu3 은 화학식 I 의 구조를 갖는 뉴클레오티드간 연결이거나, 또는 올리고뉴클레오티드의 3'-말단에 있는 경우, RNu 이다. 일부 구현예에서, NuS, NuF 및 Num 는 각각 독립적으로
Figure pct00015
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, BNu 는 임의 치환된 A, T, C, G 및 U 이다. 일부 구현예에서, 2 개의 RNu 기는 그 개입 원자와 함께 취해져, 고리 시스템을 형성한다. 일부 구현예에서, 2'-RNu 는 2'-OR1 이고, 일부 구현예에서, 2'-OMe, 2'-MOE 등이다. 일부 구현예에서, 2'-RNu 는 2'-F 이다. 일부 구현예에서, LNu5 는 공유 결합이다. 일부 구현예에서, LNu5 는 5'-OH 또는 보호된 5'-OH 이다. 일부 구현예에서, LNu3 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, LNu3 은 3'-OH 또는 보호된 3'-OH 이다.
일부 구현예에서, z1 은 0 이 아니다. 일부 구현예에서, z3 은 0 이 아니다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 0 이 아니다. 일부 구현예에서, z1, z2 및 z3 의 합은 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50 또는 그 이상이다. 일부 구현예에서, z1, z2, 및 z3 의 합은 15 이상이다. 일부 구현예에서, z1, z2, 및 z3 의 합은 16 이상이다. 일부 구현예에서, z1, z2, 및 z3 의 합은 17 이상이다. 일부 구현예에서, z1, z2, 및 z3 의 합은 18 이상이다. 일부 구현예에서, z1, z2, 및 z3 의 합은 19 이상이다. 일부 구현예에서, z1, z2, 및 z3 의 합은 20 이상이다.
일부 구현예에서, z1 은 0 이다. 일부 구현예에서, z1 은 1 이다. 일부 구현예에서, z1 은 2 이다. 일부 구현예에서, z1 은 3 이다. 일부 구현예에서, z1 은 4 이다. 일부 구현예에서, z1 은 5 이다. 일부 구현예에서, z1 은 6 이다. 일부 구현예에서, z1 은 7 이다. 일부 구현예에서, z1 은 8 이다. 일부 구현예에서, z1 은 0 이다. 일부 구현예에서, z1 은 10 이다. 일부 구현예에서, z1 은 1 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 2 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 3 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 4 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 5 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 6 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 7 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 8 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 0 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 10 이상이다.
일부 구현예에서, z2 는 0 이다. 일부 구현예에서, z2 는 1 이다. 일부 구현예에서, z2 는 2 이다. 일부 구현예에서, z2 는 3 이다. 일부 구현예에서, z2 는 4 이다. 일부 구현예에서, z2 는 5 이다. 일부 구현예에서, z2 는 6 이다. 일부 구현예에서, z2 는 7 이다. 일부 구현예에서, z2 는 8 이다. 일부 구현예에서, z2 는 0 이다. 일부 구현예에서, z2 는 10 이다. 일부 구현예에서, z2 는 1 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 2 이상이다.. 일부 구현예에서, z2 는 3 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 4 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 5 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 6 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 7 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 8 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 0 이상이다. 일부 구현예에서, z2 는 10 이상이다.
일부 구현예에서, z3 은 0 이다. 일부 구현예에서, z3 은 1 이다. 일부 구현예에서, z3 은 2 이다. 일부 구현예에서, z3 은 3 이다. 일부 구현예에서, z3 은 4 이다. 일부 구현예에서, z3 은 5 이다. 일부 구현예에서, z3 은 6 이다. 일부 구현예에서, z3 은 7 이다. 일부 구현예에서, z3 은 8 이다. 일부 구현예에서, z3 은 0 이다. 일부 구현예에서, z3 은 10 이다. 일부 구현예에서, z3 은 1 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 2 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 3 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 4 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 5 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 6 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 7 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 8 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 0 이상이다. 일부 구현예에서, z3 은 10 이상이다.
일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 2 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 3 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 4 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 5 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 6 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 7 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 8 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 9 이상이다. 일부 구현예에서, z1 및 z3 은 각각 독립적으로 10 이상이다. 일부 구현예에서, z1 은 z3 과 동일하다.
일부 구현예에서, [Nu5]z1 은 5'-윙이다. 일부 구현예에서, [NuS]z1 은 5'-윙이다. 일부 구현예에서, [NuF]z1 은 5'-윙이다. 일부 구현예에서, [Num]z2 는 코어이다. 일부 구현예에서, [Nu3]z3 은 3'-윙이다. 일부 구현예에서, [NuS]z3 은 3'-윙이다. 일부 구현예에서, [NuF]z3 은 3'-윙이다. 일부 구현예에서, [Nu5]z1 은 5'-윙이고, [Num]z2 는 코어이고, [Nu3]z3 은 5'-윙이다. 일부 구현예에서, [NuS]z1 은 5'-윙이고, [Num]z2 는 코어이고, [NuS]z3 은 5'-윙이다. 일부 구현예에서, [NuF]z1 은 5'-윙이고, [Num]z2 는 코어이고, [NuF]z3 은 5'-윙이다.
일부 구현예에서, [Nu5]z1 은 5'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [NuS]z1 은 5'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [NuF]z1 은 5'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [Num]z2 는 중간 영역이다. 일부 구현예에서, [Nu3]z3 은 3'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [NuS]z3 은 3'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [NuF]z3 은 3'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [Nu5]z1 은 5'-말단 영역이고, [Num]z2 는 중간 영역이고, [Nu3]z3 은 5'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [NuS]z1 은 5'-말단 영역이고, [Num]z2 는 중간 영역이고, [NuS]z3 은 5'-말단 영역이다. 일부 구현예에서, [NuF]z1 은 5'-말단 영역이고, [Num]z2 는 중간 영역이고, [NuF]z3 은 5'-말단 영역이다.
조성물의 예는, WV-1497 (mG*mGmCmAmC*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*mAmCmUmU*mC) 이고, 여기서 코어 영역은 *A*A*G*G*G*C*A*C*A*G* 이고, 코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은 mG*mGmCmAmC 이고, 코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은 mAmCmUmU*mC 이다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 5'-말단에 대한 윙 영역은 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 예를 들어, WV-1497 에서, mG*mGmCmAmC 는 코어 영역 (*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*) 의 5'-말단에 대한 윙이고, 이는 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결 (mG*mGmC mAmC ) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 3'-말단에 대한 윙 영역은 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 예를 들어, WV-1497 에서, mAmCmUmU*mC 는 코어 영역 (*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*) 의 3'-말단에 대한 윙이고, 이는 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 개질된 뉴클레오티드간 연결 ( mAmC mUmU*mC) 을 포함한다. WV-3507 은, 연속적인 Sp 2'-F 포스포로티오에이트 뉴클레오티드 단위를 포함하는 5'-말단 및 3'-말단 영역 (이는 또한 WV-3507 의 고리로 간주될 수 있음), 및 천연 포스페이트 연결 및 2'-OMe 당 개질을 포함하는 중간 영역 (이는 또한 WV-3507 의 코어 영역으로 간주될 수 있음) 을 포함하는 올리고뉴클레오티드 예이다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2 개의 윙 및 하나의 코어 영역을 갖는다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 상이하다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결 또는 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결 또는 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결 또는 개질된 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결 또는 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 2 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 3 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 4 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 5 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 6 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 7 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 8 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 9 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 10 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 11 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 12 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 13 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 14 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 15 개 또는 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 천연 포스페이트 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 천연 포스페이트 연결이다.
일부 구현예에서, 코어 영역은 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 8 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 9 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 11 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 12 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 13 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 14 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 2 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 3 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 4 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 5 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 6 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 7 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 8 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 9 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 10 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 11 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 12 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 13 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 14 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 15 개 또는 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 5% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 10% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 15% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 20% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 25% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 30% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 35% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결의 40% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 45% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 50% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 55% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 60% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 65% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 70% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 75% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 80% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 85% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 90% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 뉴클레오티드간 연결의 95% 이상은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 갖는 것으로 정의된 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 조성물 중 선결된 수준의 올리고뉴클레오티드가 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다는 점에서 단일 올리고뉴클레오티드의 실질적으로 순수한 제제인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이는 공통 염기 서열로서 지칭될 수 있다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 뉴클레오시드 개질, 예를 들어 당 개질, 염기 개질 등의 동일한 패턴을 가질 수 있다. 일부 구현예에서, 뉴클레오시드 개질의 패턴은 위치 및 개질의 조합으로 나타낼 수 있다. 예를 들어, WV-1092 의 경우, 뉴클레오시드 연결의 패턴은, 5'-말단에서 3'-말단으로, 5 x 2'-OMe (당 모이어티 상의 2'-OMe 개질)-DNA (당 모이어티 상의 2'-개질이 없음)-5 x 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 백본 연결의 패턴은 각각의 뉴클레오티드간 연결의 위치 및 유형（예를 들어, 포스페이트, 포스포로티오에이트, 치환된 포스포로티오에이트 등）을 포함한다. 예를 들어, WV-1092 의 경우, 백본 연결의 패턴은 1 x PS(포스포로티오에이트)-3 x PO (포스페이트)-11 x PS-3 x PO-1 x PS 이다. 올리고뉴클레오티드의 백본 키랄 중심의 패턴은 5' 에서 3' 로의 연결 인 입체화학 (Rp/Sp) 의 조합에 의해 지정될 수 있다. 예를 들어, WV-1092 는 1S-3PO (포스페이트)-8S-1R-2S-3PO-1S 의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 모든 비키랄 연결 (예를 들어, PO) 은 생략될 수 있다. 상기 예시된 바와 같이, 비키랄 연결의 위치는, 예를 들어 백본 연결의 패턴으로부터 수득될 수 있다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 특징으로 하는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 동일한 염기 서열 및 길이를 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 또는 라세미 제제는, 전형적으로 임의의 키랄 보조제, 키랄 개질 시약, 및/또는 키랄 촉매의 사용 없이, 뉴클레오티드 단량체의 비-입체선택적 및/또는 저-입체선택적 커플링에 의해 제조된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 (또는 키랄 비제어된) 제조에서, 모든 또는 대부분의 커플링 단계는, 커플링 단계가 증강된 입체선택성을 제공하도록 특이적으로 수행되지 않는다는 점에서, 키랄 제어되지 않는다. 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제조의 예는, 당업계에 널리 공지된 방법인, 테트라에틸티우람 디술피드 또는 (TETD) 또는 3H-1,2-벤소디티올-3-온 1,1-디옥시드 (BDTD) 를 이용하여 통상적으로 사용되는 포스포라미다이트 올리고뉴클레오티드 합성으로부터 포스파이트 트리에스테르의 황화를 통한, 포스포로티오에이트 올리고뉴클레오티드의 제조이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제는 실질적 라세미 올리고뉴클레오티드 조성물 (또는 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드 조성물) 을 제공한다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드 단량체의 적어도 하나의 커플링은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드 단량체의 적어도 2 개의 커플링은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드 단량체의 적어도 3 개의 커플링은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드 단량체의 적어도 4 개의 커플링은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드 단량체의 적어도 5 개의 커플링은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 뉴클레오티드 단량체의 각각의 커플링은 독립적으로 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 스테레오랜덤 또는 라세미 제제에서, 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 3 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 4 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 5 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 약 60:40, 70:30, 80:20, 85:15, 90:10, 91:9, 92:8, 97:3, 98:2, 또는 99:1 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 60:40 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 70:30 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 80:20 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 90:10 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 91:9 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 92:8 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 93:7 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 94:6 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 95:5 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 96:4 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 97:3 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 98:2 미만이다. 일부 구현예에서, 부분입체선택성은 약 99:1 미만이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 커플링은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 커플링은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 3 개의 커플링은약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 4 개의 커플링은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 5 개의 커플링은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링은 독립적으로 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 3 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 4 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 적어도 5 개의 뉴클레오티드간 연결은 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 약 90:10 미만의 부분입체선택성을 갖는다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결, 예컨대 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결은 90:10 이상의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결, 예컨대 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결은 90:10 이상의 부분입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 선택성은 91:9 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 92:8 이다. 일부 구현예에서, 선택성은 97:3 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 94:6 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 95:5 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 96:4 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 97:3 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 98:2 이상이다. 일부 구현예에서, 선택성은 99:1 이상이다.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 일부 구현예에서, 커플링 또는 연결의 부분입체선택성은 동일하거나 필적한 조건 하에서 이량체 형성의 부분입체선택성을 통해 평가될 수 있으며, 여기서 이량체는 동일한 5'- 및 3'-뉴클레오시드 및 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 예를 들어, WV-1092 mG*SmGmCmAmC*SA*SA*S G * SG *S G*SC*SA*SC*RA*SG*SmAmCmUmU*SmC 에서 밑줄 그어진 커플링 또는 연결의 부분입체선택성은, 동일하거나 필적한 조건, 예를 들어 단량체, 키랄 보조제, 용매, 활성화제, 온도 등 하에서의 2 개의 G 모이어티의 커플링으로부터 평가될 수 있다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 갖는 것으로 정의된 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은, 조성물 중 적어도 약 10% 의 올리고뉴클레오티드가 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다는 점에서, 단일 올리고뉴클레오티드의 실질적으로 순수한 제제인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 상기 조성물은 동일한 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 단일 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부한, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 상기 조성물은 동일한 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해,
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 공유하는 단일 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부한, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 특징으로 하는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은, 동일한 염기 서열 및 길이를 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴 및 염기 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴 및 뉴클레오시드 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 동일한 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 백본 인 개질의 공통 패턴 및 당 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 백본 인 개질의 공통 패턴 및 염기 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 백본 인 개질의 공통 패턴 및 뉴클레오시드 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일하다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 올리고뉴클레오티드 유형이 아닌 조성물 중 올리고뉴클레오티드가 상기 올리고뉴클레오티드 유형의 제조 방법, 일부의 경우, 특정 정제 절차 후로부터의 불순물인, 올리고뉴클레오티드 유형의 실질적으로 순수한 제제이다.
일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 20% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 25% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 30% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 35% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 40% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 45% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 50% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 55% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 60% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 65% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 70% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 75% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 80% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 85% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 90% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 92% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 94% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 95% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 적어도 약 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 조성물 중 약 99% 초과의 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 순도는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 조성물 중 올리고뉴클레오티드의 백분율로서 표현될 수 있다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴 및 뉴클레오시드 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴 및 당 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴 및 염기 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는, 백본 인 개질의 공통 패턴 및 뉴클레오시드 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드는 동일하다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 백본 인 개질의 공통 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 상기 조성물은 올리고뉴클레오티드 유형이:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 선결된 수준으로 함유한다는 점에서 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물이다.
상기 기재되고 당업계에서 이해되는 바와 같이, 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 올리고뉴클레오티드 내 뉴클레오시드 잔기의 (예를 들어, 아데닌, 시토신, 구아노신, 티민 및 우라실과 같은 표준 자연 발생 뉴클레오티드와 비교하여, 당 및/또는 염기 구성성분의) 동일성 및/또는 개질 상태, 및/또는 상기와 같은 잔기의 하이브리드화 특징 (즉, 특정 상보적 잔기와 하이브리드할 수 있는 능력) 을 나타낼 수 있다.
일부 구현예에서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형은 하기에 의해 정의될 수 있다:
1A) 염기 동일성;
1B) 염기 개질의 패턴;
1C) 당 개질의 패턴;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴.
따라서, 일부 구현예에서, 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기를 공유할 수 있으나, 그 염기 개질 및/또는 당 개질의 패턴이 상이할 수 있다. 일부 구현예에서, 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 및 염기 개질의 패턴 (예를 들어, 염기 개질의 부재 포함) 을 공유할 수 있으나, 당 개질의 패턴이 상이할 수 있다.
일부 구현예에서, 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는, 이들이 동일한 염기 서열 (길이 포함), 당 및 염기 모이어티에 대한 화학적 개질의 동일한 패턴, 백본 연결의 동일한 패턴 (예를 들어, 천연 포스페이트 연결, 포스포로티오에이트 연결, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결, 및 이들의 조합의 패턴), 백본 키랄 중심의 동일한 패턴 (예를 들어, 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴), 및 백본 인 개질의 동일한 패턴 (예를 들어, 뉴클레오티드간 인 원자 상의 개질의 패턴, 예컨대 -S-, 및 화학식 I 의 -L-R1) 을 갖는다는 점에서 동일하다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 순도는, 올리고뉴클레오티드 유형의 조성물 중 올리고뉴클레오티드의 백분율로서 표현된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 10% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 20% 의 올리고뉴클레오티드는 동일한 올리고뉴클레오티드 유형이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 30% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 40% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 50% 의 올리고뉴클레오티드는 동일한 올리고뉴클레오티드 유형이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 60% 의 올리고뉴클레오티드는 동일한 올리고뉴클레오티드 유형이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 70% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 80% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 90% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 92% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 94% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 95% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 96% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 97% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 98% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 적어도 약 99% 의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 순도는 이의 제조 방법에서 각각의 커플링 단계의 입체선택성에 의해 제어될 수 있다. 일부 구현예에서, 커플링 단계는 60% 의 입체선택성 (예를 들어, 부분입체선택성) 을 갖는다 (커플링 단계로부터 형성된 신규한 뉴클레오티드간 연결의 60% 가 의도된 입체화학을 가짐). 상기와 같은 커플링 단계 후, 형성된 신규한 뉴클레오티드간 연결은 60% 순도를 갖는 것으로 나타낼 수 있다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 60% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 70% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 80% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 85% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 90% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 91% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 92% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 93% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 94% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 95% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 96% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 97% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 98% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 99% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 99.5% 이상의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 커플링 단계는 사실상 100% 의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 커플링 단계는, 분석법 (예를 들어, NMR, HPLC 등) 에 의해 커플링 단계로부터의 모든 검출 가능한 생성물이 의도된 입체선택성을 갖는다는 점에서, 사실상 100% 의 입체선택성을 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에서 키랄 뉴클레오티드간 연결의 부분입체선택성은, 모델 반응, 예를 들어 이량체가 키랄 뉴클레오티드간 연결과 동일한 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 이량체의 5'-뉴클레오시드가 키랄 뉴클레오티드간 연결의 5'-말단에 대한 뉴클레오시드와 동일하고, 이량체의 3'-뉴클레오시드가 키랄 뉴클레오티드간 연결의 3'-말단에 대한 뉴클레오시드와 동일한 조건과 본질적으로 동일하거나 필적한 조건 하에서의 이량체의 형성을 통해 측정될 수 있다 (예를 들어, fU*S fU * SfC *SfU 의 경우, fU*SfC 의 이량체를 통해). 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 제제 중 n 개의 뉴클레오티드간 연결을 갖는 특정 유형의 올리고뉴클레오티드의 백분율은, SE1*SE2*SE3*…SEn 으로 계산될 수 있으며, 여기서 SE1, SE2, SE3,…, SEn 는 독립적으로 첫 번째, 두 번째, 세 번째,…, 및 n 번째 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체선택성이다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물에서, (1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는) 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의, 적어도 0.5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의, 적어도 0.5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 백분율은 0.5% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 1% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 2% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 3% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 4% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 5% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 6% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 7% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 8% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 9% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 10% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 20% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 30% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 40% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 50% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 60% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 70% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 75% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 80% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 81% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 82% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 83% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 84% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 85% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 86% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 87% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 88% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 89% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 90% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 91% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 92% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 93% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 94% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 95% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 96% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 97% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 98% 이상이다. 일부 구현예에서, 백분율은 99% 이상이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 특정 유형의 올리고뉴클레오티드는, 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 제제 (특정 유형의 올리고뉴클레오티드는 전형적으로 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 1/2n 의 분획을 갖는 것으로 간주되고 (여기서 n 은 키랄 뉴클레오티드간 연결의 수임), 및 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖지만 특정 올리고뉴클레오티드 유형은 아닌 올리고뉴클레오티드는, 전형적으로 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 [1-(1/2n)] 의 분획을 갖는 것으로 간주됨) 와 비교하여, 5 배 이상 풍부하다 (특정 유형의 올리고뉴클레오티드는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 5*(1/2n) 의 분획을 가지거나 (여기서 n 은 키랄 뉴클레오티드간 연결의 수임); 또는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖지만 특정 올리고뉴클레오티드 유형은 아닌 올리고뉴클레오티드는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 [1-(1/2n)]/5 이하임). 일부 구현예에서, 풍부함 (enrichment) 은 20 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 30 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 40 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 50 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 60 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 70 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 80 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 90 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 100 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 200 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 300 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 400 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 500 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 600 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 700 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 800 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 900 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 1,000 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 2,000 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 4,000 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 8,000 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 10,000 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 20,000 배 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 (1.5)n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 (1.6)n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 (1.7)n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 (1.1)n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 (1.8)n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 (1.9)n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 2n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 3n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 4n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 5n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 6n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 7n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 8n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 9n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 10n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 15n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 20n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 25n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 30n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 40n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 50n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은 100n 이상이다. 일부 구현예에서, 풍부함은, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드 중 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드의 분획의 증가에 의해 측정된다. 일부 구현예에서, 풍부함은, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드 중, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖지만 특정 올리고뉴클레오티드 유형은 아닌 올리고뉴클레오티드의 분획의 증가에 의해 측정된다.
무엇보다도, 본 개시는, 올리고뉴클레오티드 구조 요소의 조합 (예를 들어, 화학적 개질, 백본 연결, 백본 키랄 중심, 및/또는 백본 인 개질의 패턴) 이, 놀랍게도 개선된 특성, 예컨대 생체활성을 제공할 수 있다는 것을 인식한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 하나 이상의 윙 영역 및 공통 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 선결된 수준으로 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 및 임의로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 공통 코어 영역은:
1) 공통 염기 서열 및 길이;
2) 백본 연결의 공통 패턴; 및
3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴
을 갖고, 여기서 지질이 임의로 및 독립적으로 다수 중 하나 이상의 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되는, 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역에는 없는 구조적 특징을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 임의의 구조 요소, 예를 들어 염기 개질 (예를 들어, 메틸화된/비메틸화된, 위치 1 에서의 메틸화/위치 2 에서의 메틸화 등), 당 개질 (예를 들어, 개질된/비개질된, 2'-개질/또 다른 유형의 개질, 하나의 유형의 2'-개질/또 다른 유형의 2'-개질 등), 백본 연결 유형 (예를 들어, 포스페이트/포스포로티오에이트, 포스포로티오에이트/치환된 포스포로티오에이트 등), 백본 키랄 중심 입체화학 (예를 들어, 전부 Sp/전부 Rp, (SpRp) 반복/전부 Rp 등), 백본 인 개질 유형 (예를 들어, s1/s2, s1/s3 등) 등에 의해 정의될 수 있다.
일부 구현예에서, 윙 및 코어는 뉴클레오시드 개질에 의해 정의되고, 여기서 윙은 코어 영역은 갖지 않는 뉴클레오시드 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 당 개질에 의해 정의되고, 여기서 윙은 코어 영역은 갖지 않는 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-개질이다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-OR1이다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 당 개질은 2'-OMe 이다. 부가적으로 당 개질의 예는 본 개시에 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 뉴클레오티드간 연결에 의해 정의되고, 여기서 윙은 코어 영역은 갖지 않는 뉴클레오티드간 연결 유형 (예를 들어, 천연 포스페이트 연결, 개질된 뉴클레오티드간 연결의 유형 등) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 뉴클레오티드간 연결에 의해 정의되고, 여기서 윙은 코어와 상이한 백본 연결의 패턴을 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 윙-코어 구조 (헤미머) 를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 개질의 윙-코어 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 코어-윙 구조 (또 다른 유형의 헤미머) 를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 개질의 코어-윙 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조 (갭머) 를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오시드 개질의 윙-코어-윙 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 당 모이어티의 개질에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 윙 및 코어는 염기 모이어티의 개질에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 당 모이어티는 코어 영역에서 발견되지 않는 동일한 2'-개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 당 모이어티는 코어 영역에서의 임의의 당 개질과는 상이한, 동일한 2'-개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 당 개질을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서 각각의 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖고, 코어 영역은 2'-개질을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 윙이 존재하는 경우, 각각의 윙은 그 고유의 개질에 의해 정의된다. 일부 구현예에서, 각각의 윙은 그 고유의 특징적인 당 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙은 코어와는 구별되는, 동일한 특징적인 당 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 당 모이어티는 동일한 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서의 각각의 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖지만, 제 1 윙 영역에서의 공통 2'-개질은 제 2 윙 영역에서의 공통 2'-개질과 동일하거나 상이할 수 있다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서의 각각의 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖고, 제 1 윙 영역에서의 공통 2'-개질은 제 2 윙 영역에서의 공통 2'-개질과 동일하다. 일부 구현예에서, 윙 영역에서의 각각의 당 모이어티는 동일한 2'-개질을 갖고, 제 1 윙 영역에서의 공통 2'-개질은 제 2 윙 영역에서의 공통 2'-개질과 상이하다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 안티센스 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, 키로메르센 (chiromersen)) 이다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 siRNA 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 안타고미르, 마이크로RNA, 프리-마이크로RNA, 안티미르, 수페르미르, 리보자임, Ul 어답터, RNA 활성화제, RNAi 작용제, 디코이 올리고뉴클레오티드, 트리플렉스 형성 올리고뉴클레오티드, 압타머 또는 아쥬반트일 수 있는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 안티센스 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 안타고미르 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 마이크로RNA 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 프리-마이크로RNA 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 안티미르 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 수페르미르 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 리보자임 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 Ul 어답터 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 RNA 활성화제 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 RNAi 작용제 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 디코이 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 트리플렉스 형성 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 압타머 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 아쥬반트 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 하나 이상의 개질된 백본 연결, 염기 및/또는 당을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 또는 25 개의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 5 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 6 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 7 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 8 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 9 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 10 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 11 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 12 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 13 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 14 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 15 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 16 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 17 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 18 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 19 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 20 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 21 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 22 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 23 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 24 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 25 개 이상의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 적어도 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다. 키랄, 개질된 포스페이트 연결의 예는, 상기 및 본원에 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 적어도 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 의, Sp 배열의 키랄, 개질된 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 80% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 85% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 90% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 91% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 92% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 93% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 94% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 95% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 96% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 97% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 98% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 약 99% 초과의 입체화학적 순도를 갖는다.
일부 구현예에서, 상기와 같이 제공된 순도는, 조성물이 부분적으로 키랄 제어된, 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결일 수 있다.
일부 구현예에서, 키랄, 개질된 포스페이트 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결, 즉, 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 적어도 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 모든 키랄, 개질된 포스페이트 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 또는 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 10% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 20% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 30% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 40% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 50% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 60% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 70% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 80% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 95% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 또는 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 10% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 20% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 30% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 40% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 50% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 60% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 70% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 80% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 적어도 약 95% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 또는 90% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 10% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 20% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 30% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 40% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 50% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 60% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 70% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 80% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 90% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 약 95% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 단지 하나의 Rp 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 단지 하나의 Rp 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 키랄 포스포로티오에이트 디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 키랄 포스포로티오에이트 디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 키랄 포스포로티오에이트 디에스테르 연결이고, 단지 하나만 Rp 이다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 하나 이상의 개질된 염기를 함유하는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는 개질된 염기를 함유하지 않는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 개질된 염기의 예는 상기 및 본원에 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 2 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 3 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 4 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 5 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 6 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 7 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 8 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 9 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 2 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 3 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 4 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 5 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 6 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 7 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 8 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 9 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 2 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 3 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 4 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 5 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 6 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 7 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 8 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 9 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 적어도 10 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 2 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 3 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 4 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 5 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 6 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 7 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 8 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 9 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 10 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 8 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 9 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 10 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 11 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 12 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 13 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 14 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 15 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 16 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 17 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 18 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 19 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 20 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 21 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 22 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 23 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 24 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 25 개의 염기의 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 (및/또는 입체화학적으로 순수한) 제제는, 적어도 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 또는 75 개의 염기의, 공통 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 당 모이어티에서 개질된 하나 이상의 잔기를 함유하는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 당 모이어티의 2' 위치에서 개질된 (본원에서 "2'-개질" 로서 언급됨) 하나 이상의 잔기를 함유하는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 상기와 같은 개질의 예는, 상기 및 본원에 기재된 바와 같고, 비제한적으로, 2'-OMe, 2'-MOE, 2'-LNA, 2'-F, FRNA, FANA, S-cEt 등이 포함된다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 2'-개질된 하나 이상의 잔기를 함유하는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2'-O-메톡시에틸 (2'-MOE)-개질된 잔기인 잔기를 하나 이상 함유한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 어떠한 2'-개질도 함유하지 않는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 어떠한 2'-MOE 잔기도 함유하지 않는 올리고뉴클레오티드이다. 즉, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 MOE-개질되지 않는다. 당 개질의 부가적인 예는 본 개시에 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어 또는 코어-윙 (헤미머, 또한 본원에서 일반적으로, 각각 X-Y 또는 Y-X 로서 표시됨) 의 일반적인 모티프를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 (갭머, 또한 본원에서 일반적으로 X-Y-X 로서 표시됨) 의 일반적인 모티프를 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 코어 "Y" 부분에 존재하지 않는 특정 개질을 갖는 하나 이상의 잔기를 함유한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 코어 "Y" 부분에 존재하지 않는 특정 뉴클레오시드 개질을 갖는 하나 이상의 잔기를 함유한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 코어 "Y" 부분에 존재하지 않는 특정 염기 개질을 갖는 하나 이상의 잔기를 함유한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 코어 "Y" 부분에 존재하지 않는 특정 당 개질을 갖는 하나 이상의 잔기를 함유한다. 당 개질의 예는 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 당 개질은 본원에 참조로서 인용된 US9006198 에 기재된 개질로부터 선택되는 개질이다. 당 개질의 부가적인 예는 본 개시에 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 각각의 윙은 코어 부분에 존재하지 않는 2' 개질을 갖는 하나 이상의 잔기를 함유한다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이고, 여기서 R1 은 본 개시에 정의되고 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y 로서 표시되는 윙-코어 모티프, 또는 Y-X 로서 표시되는 코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 당 개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 동일한 특정 유형의 당 개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y-X 로서 표시되는 윙-코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 각각의 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 당 개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 동일한 특정 유형의 당 개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y 로서 표시되는 윙-코어 모티프, 또는 Y-X 로서 표시되는 코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 동일한 특정 유형의 2'-개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y 로서 표시되는 윙-코어 모티프를 갖고, 여기서 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 동일한 특정 유형의 2'-개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Y-X 로서 표시되는 코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 동일한 특정 유형의 2'-개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y-X 로서 표시되는 윙-코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 각각의 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 동일한 특정 유형의 2'-개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y 로서 표시되는 윙-코어 모티프를 갖고, 여기서 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Y-X 로서 표시되는 코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y-X 로서 표시되는 윙-코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 각각의 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y-X 로서 표시되는 윙-코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 각각의 "X" 부분에서의 잔기는 특정 유형의 2'-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y-X 로서 표시되는 윙-코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 각각의 "X" 부분에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기가 아니다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 X-Y-X 로서 표시되는 윙-코어-윙 모티프를 갖고, 여기서 각각의 "X" 부분에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기이고, 코어 "Y" 부분에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드이다. 관련 분야의 당업자는 상기 및 본원에 기재된 모든 상기와 같은 2'-개질이, 상기와 같은 X-Y, Y-X 및/또는 X-Y-X 모티프의 맥락에서 고려된다는 것을 인지할 것이다.
일부 구현예에서, 윙은 1 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 염기의 길이를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙은 1 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개의 염기의 길이를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하며, 여기서 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결은 연속적이다. 일부 구현예에서, 윙은 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 연결은 천연 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 윙은 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 각각의 윙은 독립적으로 키랄 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하며, 여기서 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결은 연속적이다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 3 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 4 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 5 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 6 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 7 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 8 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 9 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 10 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 11 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 12 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 13 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 14 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 15 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 16 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 17 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 18 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 19 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 20 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 4 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 5 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 6 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 7 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 8 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 9 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 10 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 11 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 12 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 13 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 14 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 15 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 16 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 17 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 18 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 19 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 20 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 하나의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 2 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 3 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 4 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 5 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 6 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 7 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 8 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 9 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 10 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 11 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 12 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 13 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 14 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 15 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 16 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 17 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 18 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 19 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 20 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 4 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 5 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 6 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 7 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 8 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 9 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 10 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 11 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 12 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 13 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 14 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 15 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 16 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 17 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 18 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 19 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 20 개의 연속적인 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 2 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 3 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 4 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 5 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 6 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 7 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 8 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 9 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 11 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 12 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 13 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 14 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 15 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 16 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 17 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 18 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 19 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 20 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 4 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 5 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 6 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 7 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 8 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 9 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 11 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 12 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 13 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 14 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 15 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 16 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 17 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 18 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 19 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 20 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 하나의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 2 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 3 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 4 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 5 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 6 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 7 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 8 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 9 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 10 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 11 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 12 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 13 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 14 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 15 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 16 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 17 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 18 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 19 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 적어도 20 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 하나의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 2 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 4 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 5 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 6 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 7 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 8 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 9 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 10 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 11 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 12 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 13 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 14 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 15 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 16 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 17 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 18 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 19 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 독립적으로 20 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 코어의 5'-말단에 있다 (5'-말단 윙). 일부 구현예에서, 윙은 코어의 3'-말단에 있다 (3'-말단 윙). 예를 들어, WV-1092 (mG*SmGmCmAmC*SA*SA*SG*SG*SG*SC*SA*SC*RA*SG*SmAmCmUmU*SmC) 에서, mG*SmGmCmAmC 는 5'-말단 윙이고, *SA*SA*SG*SG*SG*SC*SA*SC*RA*SG*S 는 코어이고, mAmCmUmU*SmC 는 3'-말단 윙이다.
일부 구현예에서, 5'-말단 윙은 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 예를 들어, WV-1092 는, 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 윙, 및 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 윙을 갖는다.
일부 구현예에서, 5'-말단 윙은, 5'-말단 윙에서 (3'-말단에 대한) 개질된 뉴클레오티드간 연결 다음에 2 개 이상의 뉴클레오시드를 연결하는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 예를 들어, 5'-말단 윙 mG*SmGmCmAmC 은, 5'-말단 윙에서 개질된 뉴클레오티드간 연결 다음에 4 개의 뉴클레오시드 (mGmCmAmC) 를 연결하는 3 개의 천연 포스페이트 연결을 갖는, 개질된 뉴클레오티드간 연결 (mG * S mG) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은, 5'-말단 윙 (예를 들어, mG*SmG*SmCmAmC 에서 mG * S mG 및 mG * S mC) 에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및/또는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결이 뒤따르는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은, 5'-말단 윙에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은, 5'-말단 윙에서 하나 이상의 연속적인 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 예를 들어, 5'-말단 윙 mG*SmGmCmAmC 은, 이의 3'-말단 (mG*SmGmC mAmC ) 에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 3'-말단 윙은, 3'-말단 윙에서 (5'-말단에 대하여) 개질된 뉴클레오티드간 연결 앞에 2 개 이상의 뉴클레오시드를 연결하는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 예를 들어, 3'-말단 윙 mAmCmUmU*SmC 은, 3'-말단 윙에서 개질된 뉴클레오티드간 연결 앞에 4 개의 뉴클레오시드 (mAmCmUmU) 를 연결하는 3 개의 천연 포스페이트 연결을 갖는, 개질된 뉴클레오티드간 연결 (mU * S mC) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은, 3'-말단 윙 (예를 들어, mAmCmU*SmU*SmC 에서 mU * S mU 및 mU * S mC) 에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 앞서있는, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및/또는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결이 앞서있는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은, 3'-말단 윙에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은, 3'-말단 윙에서 하나 이상의 연속적인 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 예를 들어, mAmCmUmU*SmC 의 구조를 갖는 3'-말단 윙은 이의 5'-말단 ( mAmC mUmU*SmC) 에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 갖는다.
일부 구현예에서, 하나 이상은 하나이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 2 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 3 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 4 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 5 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 6 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 7 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 8 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 9 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 10 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 하나이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 2 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 3 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 4 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 5 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 6 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 7 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 8 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 9 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상은 적어도 10 이다.
일부 구현예에서, 윙은 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은 윙의 5'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은 윙의 5'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 5'-말단 윙은 윙의 5'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은 윙의 3'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은 윙의 3'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 3'-말단 윙은 윙의 3'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다.
일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 내 모든 포스페이트 연결은 연속적이고, 윙 내 임의의 2 개의 포스페이트 연결 사이에 비(非)포스페이트 연결이 존재하지 않는다.
일부 구현예에서, 윙 및 코어를 연결하는 연결은 연결, 예를 들어 연결 화학, 연결 입체화학 등을 기재할 때, 코어의 일부로 간주된다. 예를 들어, WV-1092, mG*SmGmCmAmC *S A*SA* SG * SG * SG *SC*SA*SC*RA* SG * S mAmCmUmU*SmC 에서, 밑줄 그어진 연결은 코어 (볼드체) 의 일부로서 간주될 수 있고, 이의 5'-윙 (당 모이어티 상에 2'-OMe 를 가짐) 은 이의 5'-말단에서 하나의 단일 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖고, 이의 3'-윙 (당 모이어티 상에 2'-OMe 를 가짐) 은 이의 3'-말단에서 하나의 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖고, 이의 코어는 당에 2'-개질을 갖지 않는다.
일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 개질된 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 치환된 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 개질된 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 화학식 I 의 구조를 갖는 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 치환된 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 5'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다.
일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 개질된 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 치환된 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 개질된 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 화학식 I 의 구조를 갖는 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 치환된 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 3'-뉴클레오티드간 연결은 각각, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다.
일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 모두, 개질된 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 모두, 화학식 I 의 구조를 갖는 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 모두, 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 모두, 치환된 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 2 개의 뉴클레오티드간 연결은 모두, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 뉴클레오티드간 연결은 각각, 개질된 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 뉴클레오티드간 연결은 각각, 화학식 I 의 구조를 갖는 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 뉴클레오티드간 연결은 각각, 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 뉴클레오티드간 연결은 각각, 치환된 포스포로티오에이트 연결이다. 일부 구현예에서, 2'-개질 없이 당 모이어티에 연결된 뉴클레오티드간 연결은 각각, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다.
일부 구현예에서, 2'-개질 없는 당 모이어티는 천연 DNA 뉴클레오시드에서 발견되는 당 모이어티이다.
일부 구현예에서, 윙-코어-윙 구조의 경우, 5'-말단 윙은 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 구조의 경우, 5'-말단 윙은 윙의 5'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 구조의 경우, 3'-말단 윙은 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 구조의 경우, 3'-말단 윙은 윙의 3'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 구조의 경우, 각각의 윙은 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 구조의 경우, 각각의 윙은 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 여기서 5'-말단 윙은 이의 5'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고; 3'-말단 윙은 이의 3'-말단에서 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 3'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 3'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-윙 둘 모두에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-윙 둘 모두에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이고, 3'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이고, 3'-윙에서 유일한 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다.
일부 구현예에서, 윙은 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 및 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 및 적어도 2 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 및 2 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결, 및 3 개의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, (코어에 대한) 5'-윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 하나는 이의 5'-말단에 및 다른 하나는 이의 3'-말단에 있고, 그 사이에 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, (코어에 대한) 5'-윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 하나는 이의 5'-말단에 및 다른 하나는 이의 3'-말단에 있고, 그 사이에 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, (코어에 대한) 3'-윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 하나는 이의 3'-말단에 및 다른 하나는 이의 3'-말단에 있고, 그 사이에 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, (코어에 대한) 3'-윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 하나는 이의 3'-말단에 및 다른 하나는 이의 3'-말단에 있고, 그 사이에 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는다.
일부 구현예에서, 5'-윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 하나는 이의 5'-말단에 및 다른 하나는 이의 3'-말단에 있고, 그 사이에 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖고, 3'-윙은 이의 3'-말단에서 단지 하나의 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, (코어에 대한) 5'-윙은 단지 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 하나는 이의 5'-말단에 및 다른 하나는 이의 3'-말단에 있고, 그 사이에 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖고, 3'-윙은 이의 3'-말단에서 단지 하나의 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 그 고유의 입체화학을 갖는다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 모두 동일한 입체화학을 갖는다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 모두 상이한 입체화학을 갖는다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 모두 Rp 이다. 일부 구현예에서, 5'-윙에서 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 모두 Sp 이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-윙에서 키랄 뉴클레오티드간 연결은 동일한 입체화학을 갖는다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-윙에서 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-윙에서 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 5'- 및 3'-윙에서 키랄 뉴클레오티드간 연결은 상이한 입체화학을 갖는다.
일부 구현예에서, 키랄, 개질된 포스페이트 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결, 즉, 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 적어도 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 의, 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 모든 키랄, 개질된 포스페이트 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 10% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 20% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 30% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 40% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 50% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 60% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 70% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 80% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 95% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 1 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 2 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 3 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 4 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 5 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 6 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 7 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 8 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 9 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 2 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 3 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 4 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 5 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 6 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 7 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 8 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 9 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 10% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 20% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 30% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 40% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 50% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 60% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 70% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 80% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 95% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를갖는다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 10% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 20% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 30% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 40% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 50% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 60% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 70% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 80% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 90% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 약 95% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 단지 하나의 Rp 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 단지 하나의 Rp 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 1 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 2 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 3 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 4 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 5 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 6 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 7 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 8 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 9 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 2 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 3 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 4 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 5 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 6 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 7 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 8 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 9 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 을 7 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다F. 일부 구현예에서, 윙은 24 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드를 이용하여 수행된 시험관내 연구는, 핵산의 세포 내로의 짐노틱 도입 (트랜스펙션 시약 미포함) 으로 수행되었다. 일부 구현예에서, 실험 데이터는, 2'-개질의 효과가 올리고뉴클레오티드의 세포 내로의 도입 방식에 독립적이지 않은 것으로 나타났다. 일부 구현예에서, 예를 들어, 전체 2'-F 개질된 일부 올리고뉴클레오티드는, 특히 저 농도의 (트랜스펙션 시약으로) 트랜스펙션될 때, 보다 높은 효능을 갖는다.
일부 구현예에서, 코어 영역은 1 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 2 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 3 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 4 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 5 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 6 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 7 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 8 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 9 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 10 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25 개 또는 그 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 11 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 12 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 13 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 14 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 15 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 16 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 17 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 18 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 19 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 20 개 이상의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 20 개 초과의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 2 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 3 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 4 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 5 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 6 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 7 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 8 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 9 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 10 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 11 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 12 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 13 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 14 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 15 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 16 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 17 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 18 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 19 개의 염기의 길이를 갖는다. 특정 구현예에서, 코어 영역은 20 개의 염기의 길이를 갖는다.
일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 각각의 코어 연결은 개질된 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 코어는 적어도 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 5 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 6 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 7 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 8 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 9 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 10 개의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 5 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 6 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 7 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 8 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 9 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 10 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 11 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 12 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 13 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 14 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 15 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 16 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 17 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 18 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 19 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 20 개의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 독립적으로 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 각각의 코어 연결은 키랄 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 코어는 적어도 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 3 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 4 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 5 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 6 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 7 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 8 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 9 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 10 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 11 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 12 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 13 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 14 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 15 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 16 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 17 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 18 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 19 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 적어도 20 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 코어는 하나의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 2 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 3 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 4 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 5 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 6 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 7 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 8 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 9 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 10 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 11 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 12 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 13 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 14 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 15 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 16 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 17 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 18 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 19 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 20 개의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 각각의 m, n, t 및 Np 는 독립적으로 본 개시에 정의되고 기재된 바와 같음) 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m, 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)m(Rp)n 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)m(Rp)n (여기서 m > 2 이고, n 은 1 임) 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Rp)n(Sp)m 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 이고, n 은 1 임) 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Np)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Np)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 이고, n 은 1 임) 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Np)t(Rp)n(Sp)m (여기서 t > 2 이고, m > 2 이고, n 은 1 임) 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 m > 2 이고, n 은 1 임) 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 (Sp)t(Rp)n(Sp)m (여기서 t > 2 이고, m > 2 이고, n 은 1 임) 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는다. 무엇보다도, 본 개시는, 일부 구현예에서, 상기와 같은 패턴이 표적 서열, 예를 들어 RNA 서열의 제어된 절단, 개선된 절단 속도, 선택성 등을 제공하고/하거나 증강시킬 수 있다는 것을 입증한다. 백본 키랄 중심의 패턴의 예는 본 개시에 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 코어 영역에서 60% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 65% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 66% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 67% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 70% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 75% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 80% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 85% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 90% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 95% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다.
일부 구현예에서, 코어 영역에서 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다.
일부 구현예에서, 적어도 1 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 3 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 4 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 5 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 6 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 7 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp. 일부 구현예에서, 적어도 8 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 9 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 10 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 11 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 12 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 13 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 14 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 15 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 16 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 17 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 18 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 19 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 20 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 21 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Sp 이다. 일부 구현예에서, Sp 뉴클레오티드간 연결은 연속적이다.
일부 구현예에서, 코어 영역에서 60% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 65% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 66% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 67% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 70% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 75% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 80% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 85% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 코어 영역에서 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다.
일부 구현예에서, 적어도 1 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 3 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 4 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 5 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 6 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 7 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 8 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 9 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 10 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 11 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 12 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 13 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 14 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 15 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 16 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 17 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 18 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 19 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 20 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 21 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 코어 영역 뉴클레오티드간 연결은 Rp 이다. 일부 구현예에서, Rp 뉴클레오티드간 연결은 연속적이다.
일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 6 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 7 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 8 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 9 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 11 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 12 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 13 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 14 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 16 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 17 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 18 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 19 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 21 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 22 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 23 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 24 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 30 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 35 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OMe 이다.
일부 구현예에서, 코어는 하나 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 2 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 3 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 4 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 5 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 6 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티. 일부 구현예에서, 코어는 7 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 8 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 9 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 10 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 11 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 12 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 13 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 14 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 15 개 또이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 16 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 17 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 18 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 19 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 20 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 21 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 22 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 23 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 24 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 25 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 30 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어는 35 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OMe 이다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 1 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 2 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 3 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 4 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 5 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 6 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 7 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 8 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 9 개의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 2 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 3 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 4 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 5 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 6 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 7 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 8 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 윙 영역의 적어도 약 9 개의 연속적인 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다티. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 2'-개질된 당 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 1 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개의 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개의 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙은 하나의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 2 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 3 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 4 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 5 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 6 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 7 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 8 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 9 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 10 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 11 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 12 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 13 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 14 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 15 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 16 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 17 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 18 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 19 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 20 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 21 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 22 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 23 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 24 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 25 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 30 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙은 35 개의 연속적인 2'-F 를 포함한다.
일부 구현예에서, 윙-코어-윙 (즉, X-Y-X) 모티프는, 예를 들어 5-10-4 와 같은 숫자로 표시되며, 이는 코어의 5'-말단에 대한 윙이 5 개의 염기의 길이이고, 코어 영역은 10 개의 염기의 길이이고, 코어의 3'-말단에 대한 윙 영역은 4 개의 염기의 길이라는 것을 의미한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는, 예를 들어, 2-16-2, 3-14-3, 4-12-4, 5-10-5, 2-9-6, 3-9-3, 3-9-4, 3-9-5, 4-7-4, 4-9-3, 4-9-4, 4-9-5, 4-10-5, 4-11-4, 4-11-5, 5-7-5, 5-8-6, 8-7-5, 7-7-6, 5-9-3, 5-9-5, 5-10-4, 5-10-5, 6-7-6, 6-8-5, 및 6-9-2 등 중 임의의 것이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 7-7-6 이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 8-7-5 이다.
일부 구현예에서, 윙-코어 모티프는 5-15, 6-14, 7-13, 8-12, 9-12 등이다. 일부 구현예에서, 코어-윙 모티프는 5-15, 6-14, 7-13, 8-12, 9-12 등이다.
일부 구현예에서, 상기와 같은 윙-코어-윙 (즉, X-Y-X) 모티프의 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오시드간 연결은 전부 키랄, 개질된 포스페이트 연결이다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 윙-코어-윙 (즉, X-Y-X) 모티프의 제공된 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오시드간 연결은 전부 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 윙-코어-윙 모티프의 제공된 올리고뉴클레오티드의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 적어도 약 10, 20, 30, 40, 50, 50, 70, 80, 또는 90% 의 키랄, 개질된 포스페이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 윙-코어-윙 모티프의 제공된 올리고뉴클레오티드의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 적어도 약 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 또는 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 윙-코어-윙 모티프의 제공된 올리고뉴클레오티드의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 적어도 약 10, 20, 30, 40, 50, 50, 70, 80, 또는 90% 의, Sp 입체구조의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 각각의 윙 영역은 임의로 키랄, 개질된 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 각각의 윙 영역은 임의로 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 각각의 윙 영역은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 2 개의 윙 영역은 동일한 뉴클레오티드간 연결 입체화학을 갖는다. 일부 구현예에서, 2 개의 윙 영역은 상이한 뉴클레오티드간 연결 입체화학을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙에서 각각의 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 키랄 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 임의로 키랄, 개질된 포스페이트 뉴클레오티드간 연결을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 임의로 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 갖는다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 포함하며, 여기서 반복 패턴은 (Sp)m Rp 또는 Rp(Sp)m (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 포함하며, 여기서 반복 패턴은 (Sp)m Rp 또는 Rp(Sp)m (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 포함하며, 여기서 반복 패턴은 (Sp)m Rp (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 포함하며, 여기서 반복 패턴은 Rp(Sp)m (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 (Sp)m Rp 또는 Rp(Sp)m (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 (Sp)m Rp (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 Rp(Sp)m (여기서 m 은 1-50 임) 이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 33% 이상의 뉴클레오티드간 연결을 S 입체구조로 포함하는 모티프이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 50% 이상의 뉴클레오티드간 연결을 S 입체구조로 포함하는 모티프이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 66% 이상의 뉴클레오티드간 연결을 S 입체구조로 포함하는 모티프이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 RpRpSp 및 SpSpRp 로부터 선택되는 반복 삼중 모티프이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 RpRpSp 반복이다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 뉴클레오티드간 연결 입체화학의 반복 패턴을 가지며, 여기서 반복 패턴은 SpSpRp 반복이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m Rp 또는 Rp(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 Rp(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m Rp 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, m 은 2 이다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 Rp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)2 Rp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Rp)2 Rp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 RpSpRp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 SpRpRp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)2 Rp 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m Rp 또는 Rp(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 Rp(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m Rp 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, m 은 2 이다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 Rp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)2 Rp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Rp)2 Rp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 RpSpRp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 SpRpRp(Sp)2 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)2 Rp 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
본원에 정의된 바, m 은 1-50 이다. 일부 구현예에서, m 은 1 이다. 일부 구현예에서, m 은 2-50 이다. 일부 구현예에서, m 은 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 2 이다. 일부 구현예에서, m 은 3 이다. 일부 구현예에서, m 은 4 이다. 일부 구현예에서, m 은 5 이다. 일부 구현예에서, m 은 6 이다. 일부 구현예에서, m 은 7 이다. 일부 구현예에서, m 은 8 이다. 일부 구현예에서, m 은 9 이다. 일부 구현예에서, m 은 10 이다. 일부 구현예에서, m 은 11 이다. 일부 구현예에서, m 은 12 이다. 일부 구현예에서, m 은 13 이다. 일부 구현예에서, m 은 14 이다. 일부 구현예에서, m 은 15 이다. 일부 구현예에서, m 은 16 이다. 일부 구현예에서, m 은 17 이다. 일부 구현예에서, m 은 18 이다. 일부 구현예에서, m 은 19 이다. 일부 구현예에서, m 은 20 이다. 일부 구현예에서, m 은 21 이다. 일부 구현예에서, m 은 22 이다. 일부 구현예에서, m 은 23 이다. 일부 구현예에서, m 은 24 이다. 일부 구현예에서, m 은 25 이다. 일부 구현예에서, m 은 25 초과이다.
일부 구현예에서, 반복 패턴은 (Sp)m(Rp)n 이고, 여기서 n 은 1-10 이고, m 은 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m(Rp)n 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m(Rp)n 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 반복 패턴은 (Rp)n(Sp)m 이고, 여기서 n 은 1-10 이고, m 은 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Rp)n(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Rp)n(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, (Rp)n(Sp)m 은 (Rp)(Sp)2 이다. 일부 구현예에서, (Sp)n(Rp)m 은 (Sp)2(Rp) 이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m(Rp)n(Sp)t 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 반복 패턴은 (Sp)m(Rp)n(Sp)t 이고, 여기서 n 은 1-10 이고, t 는 1-50 이고, m 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)m(Rp)n(Sp)t 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 반복 패턴은 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이고, 여기서 n 은 1-10 이고, t 는 1-50 이고, m 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 반복 패턴은 (Np)t(Rp)n(Sp)m 이고, 여기서 n 은 1-10 이고, t 는 1-50 이고, Np 는 독립적으로 Rp 또는 Sp 이고, m 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Np)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Np)t(Rp)n(Sp)m 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 반복 패턴은 (Np)m(Rp)n(Sp)t 이고, 여기서 n 은 1-10 이고, t 는 1-50 이고, Np 는 독립적으로 Rp 또는 Sp 이고, m 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 백본 키랄 중심의 패턴이 (Np)m(Rp)n(Sp)t 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 코어 영역에서 백본 키랄 중심의 패턴이 (Np)m(Rp)n(Sp)t 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, Np 는 Rp 이다. 일부 구현예에서, Np 는 Sp 이다. 일부 구현예에서, 모든 Np 는 동일하다. 일부 구현예에서, 모든 Np 는 Sp 이다. 일부 구현예에서, 적어도 하나의 Np 는 다른 Np 와 상이하다. 일부 구현예에서, t 는 2 이다.
본원에 정의된 바, n 은 1-10 이다. 일부 구현예에서, n 은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 1 이다. 일부 구현예에서, n 은 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 1 이다. 일부 구현예에서, n 은 2 이다. 일부 구현예에서, n 은 3 이다. 일부 구현예에서, n 은 4 이다. 일부 구현예에서, n 은 5 이다. 일부 구현예에서, n 은 6 이다. 일부 구현예에서, n 은 7 이다. 일부 구현예에서, n 은 8 이다. 일부 구현예에서, n 은 9 이다. 일부 구현예에서, n 은 10 이다.
본원에 정의된 바, t 는 1-50 이다. 일부 구현예에서, t 는 1 이다. 일부 구현예에서, t 는 2-50 이다. 일부 구현예에서, t 는 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 4, 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 5, 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 6, 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 7 또는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 2 이다. 일부 구현예에서, t 는 3 이다. 일부 구현예에서, t 는 4 이다. 일부 구현예에서, t 는 5 이다. 일부 구현예에서, t 는 6 이다. 일부 구현예에서, t 는 7 이다. 일부 구현예에서, t 는 8 이다. 일부 구현예에서, t 는 9 이다. 일부 구현예에서, t 는 10 이다. 일부 구현예에서, t 는 11 이다. 일부 구현예에서, t 는 12 이다. 일부 구현예에서, t 는 13 이다. 일부 구현예에서, t 는 14 이다. 일부 구현예에서, t 는 15 이다. 일부 구현예에서, t 는 16 이다. 일부 구현예에서, t 는 17 이다. 일부 구현예에서, t 는 18 이다. 일부 구현예에서, t 는 19 이다. 일부 구현예에서, t 는 20 이다. 일부 구현예에서, t 는 21 이다. 일부 구현예에서, t 는 22 이다. 일부 구현예에서, t 는 23 이다. 일부 구현예에서, t 는 24 이다. 일부 구현예에서, t 는 25 이다. 일부 구현예에서, t 는 25 초과이다.
일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 2 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 3 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 4 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 5 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 6 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 7 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 8 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 9 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 10 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 11 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 12 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 13 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 14 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 15 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 16 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 17 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 18 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 19 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 20 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 21 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 22 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 23 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 24 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 중 적어도 하나는 25 초과이다.
일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 2 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 3 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 4 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 5 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 6 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 7 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 8 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 9 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 10 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 11 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 12 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 13 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 14 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 15 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 16 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 17 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 18 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 19 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 는 각각 20 초과이다.
일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 3 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 4 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 5 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 6 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 7 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 8 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 9 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 10 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 11 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 12 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 13 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 14 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 15 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 16 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 17 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 18 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 19 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 20 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 21 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 22 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 23 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 24 초과이다. 일부 구현예에서, m 및 t 의 합은 25 초과이다.
일부 구현예에서, n 은 1 이고, m 및 t 중 적어도 하나는 1 초과이다. 일부 구현예에서, n 은 1 이고, m 및 t 는 각각 독립적으로 1 초과이다. 일부 구현예에서, m>n 및 t>n 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)2 Rp(Sp)2 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)2 Rp(Sp)2 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 SpRp(Sp)2 이다. 일부 구현예에서, (Np)t(Rp)n(Sp)m 은 (Np)t Rp(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, (Np)t(Rp)n(Sp)m 은 (Np)2 Rp(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, (Np)t(Rp)n(Sp)m 은 (Rp)2 Rp(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, (Np)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)2 Rp(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, (Np)t(Rp)n(Sp)m 은 RpSpRp(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, (Np)t(Rp)n(Sp)m 은 SpRpRp(Sp)m 이다.
일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 SpRpSpSp 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)2 Rp(Sp)2 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)3 Rp(Sp)3 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)4 Rp(Sp)4 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)t Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 SpRp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)2 Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)3 Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)4 Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)t(Rp)n(Sp)m 은 (Sp)5 Rp(Sp)5 이다.
일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)2 Rp(Sp)2 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)3 Rp(Sp)3 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)4 Rp(Sp)4 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)m Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)2 Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)3 Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)4 Rp(Sp)5 이다. 일부 구현예에서, (Sp)m(Rp)n(Sp)t 는 (Sp)5 Rp(Sp)5 이다.
일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 하나의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 하나의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 하나의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 하나의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 단지 하나의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역 모티프는 적어도 2 개의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 2 개의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 2 개의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 3 개의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 3 개의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 3 개의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 3 개의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프의 코어 영역은 적어도 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개의 Rp 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역과 상이한, 당 모이어티의 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역과 상이한, 동일한 유형의 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역에 존재하지 않는, 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역에 존재하지 않는, 2'-F 의 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역과 상이한, 2'-F 의 수준을 포함한다. 일부 구현예에서, 수준은 2'-F 개질의 수에 의해 측정되는 절대값이다. 일부 구현예에서, 수준은 2'-F 개질의 백분율에 의해 측정되는 상대값이다. 일부 구현예에서, 윙 영역은, 상기와 같은 2'-개질의 수 및/또는 백분율에 의해 측정 시, 코어 영역에 존재하는 2'-개질을 보다 적게 함유한다는 점에서, 코어 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역에서 보다 적은 2'-OR1 개질을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은 코어 영역에서 보다 적은 2'-OMe 개질을 함유한다. 일부 구현예에서, 윙 영역은, 상기와 같은 2'-개질의 수 및/또는 백분율에 의해 측정 시, 코어 영역에 존재하는 비개질된 당 모이어티를 보다 적게 함유한다는 점에서, 코어 영역과 상이하다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하며, 예를 들어 제공된 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역과 상이한, 당 모이어티의 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역과 상이한, 동일한 유형의 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역에 존재하지 않는, 2'-F 를 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역에 존재하지 않는, 2'-F 의 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역과 상이한, 2'-F 의 수준을 포함한다. 일부 구현예에서, 수준은 2'-F 개질의 수에 의해 측정되는 절대값이다. 일부 구현예에서, 수준은 2'-F 개질의 백분율에 의해 측정되는 상대값이다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은, 상기와 같은 2'-개질의 수 및/또는 백분율에 의해 측정 시, 코어 영역에 존재하는 2'-개질을 보다 적게 함유한다는 점에서, 코어 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역에서 보다 적은 2'-OR1 개질을 함유한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은 코어 영역에서 보다 적은 2'-OMe 개질을 함유한다. 일부 구현예에서, 각각의 윙 영역은, 상기와 같은 2'-개질의 수 및/또는 백분율에 의해 측정 시, 코어 영역에 존재하는 비개질된 당 모이어티를 보다 적게 함유한다는 점에서, 코어 영역과 상이하다.
특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-개질된 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-OR1-개질된 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-F-개질된 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-OMe-개질된 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 코어 영역에서 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-개질된 잔기이고, 코어 영역에서 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드 잔기이고, 코어 영역에서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-OR1-개질된 잔기이고, 코어 영역에서 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드 잔기이고, 코어 영역에서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기이고, 코어 영역에서 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드 잔기이고, 코어 영역에서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 윙 영역에서의 잔기는 2'-OMe-개질된 잔기이고, 코어 영역에서 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드 잔기이고, 코어 영역에서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결이다.
일부 구현예에서, "X" 윙 영역에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기가 아니다. 특정 구현예에서, 윙-코어 모티프는, "X" 윙 영역에서의 잔기가 2'-MOE-개질된 잔기가 아닌 모티프이다. 특정 구현예에서, 코어-윙 모티프는, "X" 윙 영역에서의 잔기가 2'-MOE-개질된 잔기가 아닌 모티프이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는, 각각의 "X" 윙 영역에서의 잔기가 2'-MOE-개질된 잔기가 아닌 모티프이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 "X" 윙 영역에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기가 아니다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 코어 "Y" 영역에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드 잔기이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 특정 구현예에서, 윙-코어-윙 모티프는 5-10-5 모티프이고, 여기서 각각의 "X" 윙 영역에서의 잔기는 2'-MOE-개질된 잔기가 아니고, 코어 "Y" 영역에서의 잔기는 2'-데옥시리보뉴클레오시드이고, 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 키랄, 개질된 포스페이트 연결은 키랄 포스포로티오에이트 연결, 즉, 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 적어도 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 100% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 모든 키랄, 개질된 포스페이트 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 10% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 20% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 30% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 40% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 50% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 60% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 70% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 80% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 95% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Sp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 10% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 20% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 30% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 40% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 50% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 60% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 70% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 80% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 90% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 적어도 약 95% 의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 코어 영역의 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 10% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 20% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 30% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 40% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 50% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 60% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 70% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 80% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 90% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역의 약 95% 미만의 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결은 Rp 입체구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 단지 하나의 Rp 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 코어 영역은 단지 하나의 Rp 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 여기서 모든 뉴클레오티드간 연결은 키랄 포스포로티오에이트 뉴클레오티드간 연결이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 블록머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 알트머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 교대 블록을 포함하는 알트머이다. 일부 구현예에서, 블록머 또는 알트머는 화학적 개질 (존재 또는 부재 포함), 예를 들어 염기 개질, 당 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질, 입체화학 등에 의해 정의될 수 있다. 블록 및/또는 교대 단위에 대한 화학적 개질, 입체화학 및 이의 패턴의 예에는, 비제한적으로, 본 개시에 기재된 것들, 예컨대 윙, 코어, 올리고뉴클레오티드 등에 대하여 기재된 것들이 포함된다. 일부 구현예에서, 블록머는 ..SS..RR..SS..RR..의 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 알트머는 SRSRSRSR 의 패턴을 포함한다.
일부 구현예에서, 예를 들어 윙, 코어, 블록의 백본 키랄 중심의 패턴은 하나 이상의 (Rp)p(Sp)x(Rp)q(Sp)y 를 포함하며, 여기서 p, x, q, y 는 각각 독립적으로 0-50 이고, p + q >0 이고, x+y >0 이다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)m(Rp)n, (Rp)n(Sp)m, (Np)t(Rp)n(Sp)m 또는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 반복 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Sp)m(Rp)n 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 SpRp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 SpSpRp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 SpRpRp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 RpRpSp 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Rp)n(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Np)t(Rp)n(Sp)m 이다. 일부 구현예에서, 반복 단위는 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 이다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)x-(전부 Rp 또는 전부 Sp)-(Rp/Sp)y 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(전부 Rp 또는 전부 Sp)-(Rp/Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp)x-(전부 Sp)-(Rp)y 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp)-(전부 Sp)-(Rp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)x-(전부 Rp)-(Sp)y 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)-(전부 Rp)-(Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)x-(반복 (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp)y 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(반복 (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp) 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)x-(반복 SpSpRp)-(Rp/Sp)y 를 포함한다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(반복 SpSpRp)-(Rp/Sp) 를 포함한다.
일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)x-(전부 Rp 또는 전부 Sp)-(Rp/Sp)y 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(전부 Rp 또는 전부 Sp)-(Rp/Sp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp)x-(전부 Sp)-(Rp)y 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp)-(전부 Sp)-(Rp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)x-(전부 Rp)-(Sp)y. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Sp)-(전부 Rp)-(Sp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)x-(반복 (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp)y 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(반복 (Sp)m(Rp)n)-(Rp/Sp) 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)x-(반복 SpSpRp)-(Rp/Sp)y 이다. 일부 구현예에서, 백본 키랄 중심의 제공된 패턴은 (Rp/Sp)-(반복 SpSpRp)-(Rp/Sp) 이다.
당업자는, 표적 전사물의 각종 영역이 제공된 조성물 및 방법에 의해 표적화될 수 있다는 것을 이해한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 인트론 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 엑손 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 인트론 및 엑손 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 스플라이싱 부위에 걸쳐있는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은, 5' 스플라이스 부위, 분지점 서열 (BPS), 폴리피리미딘 택 (py tact), 3' 스플라이스 부위, 인트론 스플라이싱 사일런서 (silencer) (ISS), 엑손 스플라이싱 사일런서 (ESS), 인트론 스플라이싱 인핸서 (enhancer) (ISE), 및/또는 엑손 스플라이싱 인핸서에서 발견되거나 이를 포함하는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 인트론 서열이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 엑손 서열이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은 스플라이싱 부위에 걸쳐있는 서열이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은, 5' 스플라이스 부위, 분지점 서열 (BPS), 폴리피리미딘 택 (py tact), 3' 스플라이스 부위, 인트론 스플라이싱 사일런서 (ISS), 엑손 스플라이싱 사일런서 (ESS), 인트론 스플라이싱 인핸서 (ISE), 및/또는 엑손 스플라이싱 인핸서에서 발견되거나 이를 포함하는 서열이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염기 서열은, 분지점 서열 (BPS), 폴리피리미딘 택 (py tact), 인트론 스플라이싱 사일런서 (ISS), 엑손 스플라이싱 사일런서 (ESS), 인트론 스플라이싱 인핸서 (ISE), 및/또는 엑손 스플라이싱 인핸서에서 발견되는 서열이다.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은, 무엇보다도, 다수의 핵산 중합체를 표적화할 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 핵산 서열의 전사물을 표적으로 할 수 있고, 여기서 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열) 은 전사물 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 서열에 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 서열에 상보적인 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 서열에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 서열에 100% 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 서열에 100% 상보적인 서열이다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 표적 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 표적 서열에 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 표적 서열에 % 상보적인 서열이다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 표적 서열에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 표적 서열에 100% 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 표적 서열에 100% 상보적인 서열이다.
일부 구현예에서, 본 개시에 기재된 바와 같이, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 신규한 절단 패턴, 보다 높은 절단 속도, 보다 높은 절단 정도, 보다 높은 절단 선택성 등을 제공할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 개체 또는 개체군 내 존재하는 하나 이상의 유사 서열을 갖는 표적 핵산 서열로부터의 전사물을 선택적으로 억제 (예를 들어, 절단) 할 수 있으며, 표적 및 이의 유사 서열은 각각 유사 서열에 대하여 표적 서열을 정의하는 특징적 서열 요소인 특이적 뉴클레오티드를 함유한다. 일부 구현예에서, 예를 들어, 표적 서열은 유전자의 카피 또는 야생형 대립유전자이고, 유사 서열은 매우 유사한 염기 서열, 예를 들어 SNP, 돌연변이 등을 갖는 서열을 갖는 서열이고; 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 유사 서열에 대하여 표적 서열을 정의하며: 예를 들어, 표적 서열이 rs362307 에서 T (상응하는 RNA 에서 U; 비(非)질환 유발 대립유전자의 경우 C) 를 갖는 헌팅턴병-유발 대립유전자인 경우, 특징적 서열은 이러한 SNP 를 포함한다.
일부 구현예에서, 유사 서열은 표적 서열과 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 초과의 서열 상동성을 갖는다. 일부 구현예에서, 표적 서열은 하나 이상의 돌연변이 및/또는 SNP 를 포함하는 핵산 서열의 질환 유발 카피이고, 유사 서열은 질환을 유발하지 않는 카피 (야생형) 이다. 일부 구현예에서, 표적 서열은 돌연변이를 포함하며, 여기서 유사 서열은 상응하는 야생형 서열이다. 일부 구현예에서, 표적 서열은 돌연변이 대립유전자이며, 유사 서열은 야생형 대립유전자이다. 일부 구현예에서, 표적 서열은 질환 유발 대립유전자와 관련된 SNP 를 포함하며, 유사 서열은 질환 유발 대립유전자와 관련이 없는 동일한 SNP 를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 공통 염기 서열에 상보적인 표적 서열의 영역은, 유사 서열의 상응하는 영역과 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 초과의 서열 상동성을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 공통 염기 서열에 상보적인 표적 서열의 영역은, 5 개 미만, 4 개 미만, 3 개 미만, 2 개 미만, 또는 단지 1 개의 염기쌍에서 유사 서열의 상응하는 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 공통 염기 서열에 상보적인 표적 서열의 영역은, 단지 돌연변이 부위 또는 SNP 부위에서만 유사 서열의 상응하는 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 공통 염기 서열에 상보적인 표적 서열의 영역은, 단지 돌연변이 부위에서만 유사 서열의 상응하는 영역과 상이하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 공통 염기 서열에 상보적인 표적 서열의 영역은, 단지 SNP 부위에서만 유사 서열의 상응하는 영역과 상이하다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이다.
일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 돌연변이이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 돌연변이를 포함한다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 돌연변이이다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 점 돌연변이이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 점 돌연변이를 포함한다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 점 돌연변이이다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 SNP 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 SNP 를 포함한다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소는 SNP 이다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은, 표적 서열의 유사 서열과 100% 일치하지 않는 표적 서열과 100% 일치한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 핵산 서열의 질환 유발 카피 또는 대립유전자에서의 돌연변이와 일치하지만, 돌연변이 부위에서의 비(非)질환 유발 카피 또는 대립유전자와 일치하지 않으며; 일부 다른 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 핵산 서열의 질환 유발 대립유전자에서의 SNP 와 일치하지만, 상응하는 부위에서의 비질환 유발 대립유전자와 일치하지 않는다. 일부 구현예에서, 코어에서 공통 염기 서열은, 표적 서열의 유사 서열과 100% 일치하지 않는 표적 서열과 100% 일치한다. 예를 들어, WV-1092 에서, 이의 공통 염기 서열 (및 이의 코어에서 이의 공통 염기 서열) 은, rs362307 에서 질환 유발 U 와 일치하지만, 비질환 유발 (야생형) C 와 일치하지 않는다.
무엇보다도, 본 개시는, 염기 서열이 올리고뉴클레오티드 특성에 영향을 미칠 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 염기 서열은 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드가, 예를 들어 RNase H 가 관련되는 경로를 통해 표적을 억제하는데 이용되는 경우, 표적의 절단 패턴에 영향을 미칠 수 있으며: 예를 들어, 구조적으로 유사한 (전부 포스포로티오에이트 연결, 전부 스테레오랜덤) 올리고뉴클레오티드가, 상이한 절단 패턴을 가질 수 있는 상이한 서열을 갖는다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 비(非)스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 조성물 (예를 들어, 본 개시에 제공된 특정 올리고뉴클레오티드 조성물) 의 공통 염기 서열은, DNA 올리고뉴클레오티드 조성물 (예를 들어, ONT-415) 또는 스테레오랜덤 전부-포스포로티오에이트 올리고뉴클레오티드 조성물 (예를 들어, WV-905) 에 적용되는 경우, DNA 의 절단 패턴 (DNA 절단 패턴) 및/또는 스테레오랜덤 전부-포스포로티오에이트 조성물의 절단 패턴 (스테레오랜덤 절단 패턴) 이 특징적 서열 요소 내 또는 그 부근에서 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 내부 또는 부근에서의 절단 부위는 공통 서열의 코어 영역에 상보적인 서열 내에 있다. 일부 구현예에서, 내부 또는 부근에서의 절단 부위는 공통 서열의 코어 영역에 100% 상보적인 서열 내에 있다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은, 이의 DNA 절단 패턴으로 특징적 서열 요소 내 또는 그 부근에서 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 특징적 서열 요소 내에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 특징적 서열 요소의 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 특징적 서열 요소의 돌연변이 또는 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 돌연변이 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 스테레오랜덤 절단 패턴으로 특징적 서열 요소 내 또는 그 부근에서 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 스테레오랜덤 절단 패턴으로 특징적 서열 요소 내에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 스테레오랜덤 절단 패턴으로 특징적 서열 요소의 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 스테레오랜덤 절단 패턴으로 특징적 서열 요소의 돌연변이 또는 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 스테레오랜덤 절단 패턴으로 돌연변이 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 스테레오랜덤 절단 패턴으로 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 및/또는 스테레오랜덤 절단 패턴으로 특징적 서열 요소의 돌연변이 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 및/또는 스테레오랜덤 절단 패턴으로 돌연변이 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 돌연변이 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 돌연변이 부근에서의 절단 부위는 돌연변이에 있으며, 즉 절단 부위는 돌연변이된 뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결에 있다 (예를 들어, 돌연변이가 GGG A CGTCTT 의 표적 서열에서 A 에 있는 경우, 절단은 A 와 C 사이에 있음). 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이고, 여기서 0 개는 돌연변이 부위에서의 절단을 의미한다 (예를 들어, 돌연변이가 GGG A CGTCTT 의 표적 서열에서 A 에 있는 경우, 0 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 경우에 있어서, 절단은 A 와 C 사이에 있으며; 돌연변이로부터 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 G 와 A 사이, 또는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 C 와 G 사이에 있음). 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0, 1, 2, 3, 또는 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 또는 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 또는 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0, 1, 2, 또는 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 또는 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 또는 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0, 1, 또는 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 0, 1, 또는 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 0, 1, 또는 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0 또는 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 0 또는 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 0 또는 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 0 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 하나의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 하나의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 하나의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 5' 쪽으로 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 돌연변이로부터 3' 쪽으로 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 및/또는 스테레오랜덤 절단 패턴으로 특징적 서열 요소의 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 및/또는 스테레오랜덤 절단 패턴으로 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 이의 DNA 절단 패턴으로 SNP 부근에 절단 부위를 갖는 염기 서열이다. 일부 구현예에서, SNP 부근에서의 절단 부위는 SNP 에 있으며, 즉 절단 부위는 SNP 에서 뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결에 있다 (예를 들어, rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrU rGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC (rs362307 볼드체로 됨) 를 포함하는 G*G*C*A*C*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*A*C*T*T*C, WV-905 의 표적의 경우, 절단은 볼드체로 된 rU 와 그 바로 뒤에 있는 밑줄 그어진 rG 사이에 있음). 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이며, 여기서 0 개는 SNP 에서의 절단을 의미한다 (예를 들어, rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrU rGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC (rs362307 볼드체로 됨) 를 포함하는 G*G*C*A*C*A*A*G*G*G*C*A*C*A*G*A*C*T*T*C, WV-905 의 표적에 대하여, 0 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어진 경우, 절단은 볼드체로 된 rU 와 그 바로 뒤에 있는 밑줄 그어진 rG 사이에 있고; SNP 로부터 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어진 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 rG 와 rU 사이 (밑줄 그어짐: rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrG rU rGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC), 또는 SNP 의 3'-말단에 대하여 rG 와 rC 사이 (밑줄 그어짐: rUrUrUrGrGrArArGrUrCrUrGrU rGrCrCrCrUrUrGrUrGrCrCrC)) 에 있다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 4, 또는 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0, 1, 2, 3, 또는 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 또는 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 3, 또는 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0, 1, 2, 또는 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 0, 1, 2, 또는 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 0, 1, 2, 또는 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0, 1, 또는 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 0, 1, 또는 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 0, 1, 또는 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0 또는 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 0 또는 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 0 또는 1 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 0 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 하나의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 하나의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 하나의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 5' 쪽으로 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 부근에서의 절단 부위는 SNP 로부터 3' 쪽으로 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 절단 부위이다. 예를 들어, WV-905 서열의 스테레오랜덤 절단 패턴은 SNP 에 있는 (CUGU 와 GCCC 사이), 2 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 (GUCU 와 GUGC 사이, 및 GUGC 와 CCUU 사이), 3 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 (UGCC 와 CUUG 사이); 4 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 (GCCC 와 UUGU 사이, 및 AAGU 와 CUGU 사이), 및 5 개의 뉴클레오티드간 연결이 떨어져 있는 (CCCU 와 UGUG 사이) 절단 부위를 갖는다.
일부 구현예에서, 특징적 서열 요소 내 또는 그 부근에서의, 예를 들어 돌연변이, SNP 등의 부근에서의 절단 부위는, DNA 및/또는 스테레오랜덤 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소 내 또는 그 부근에서의 절단 부위는 DNA 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 특징적 서열 요소 내 또는 그 부근에서의 절단 부위는 스테레오랜덤 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 돌연변이 부근에서의 절단 부위는 DNA 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 돌연변이 부근에서의 절단 부위는 스테레오랜덤 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, SNP 부근에서의 절단 부위는 DNA 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, SNP 부근에서의 절단 부위는 스테레오랜덤 절단 패턴의 주요 절단 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 공통 서열의 코어 영역에 상보적인 서열 내에 있다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 공통 서열의 코어 영역에 100% 상보적인 서열 내에 있다.
일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 가장 많거나, 또는 2 번째, 3 번째, 4 번째 또는 5 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 가장 많거나, 또는 2 번째, 3 번째 또는 4 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 가장 많거나, 또는 2 번째 또는 3 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 가장 많거나, 또는 2 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 가장 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 2 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 3 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 4 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 5 번째로 많은 절단을 갖는 부위이다.
일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 5% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 10% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 15% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 20% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 25% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 30% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 35% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 40% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 45% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 50% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 55% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 60% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 65% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 70% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 75% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 80% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 85% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 90% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 91% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 92% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 93% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 94% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 95% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 96% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 97% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 98% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 99% 초과의 절단이 일어나는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 100% 의 절단이 일어나는 부위이다.
일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 5% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 10% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 15% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 20% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 25% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 30% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 35% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 40% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 45% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 50% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 55% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 60% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 65% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 70% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 75% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 80% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 85% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 90% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 91% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 92% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 93% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 94% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 95% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 96% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 97% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 98% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 99% 초과의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 주요 절단 부위는 100% 의 표적이 절단되는 부위이다. 일부 구현예에서, 절단 패턴은 어떠한 부위도 절대 절단 역치 수준에 이르지 않는 바와 같이 주요 절단 부위를 갖지 않을 수 있다.
당업자가 이해하는 바와 같이, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법은 당업자에게 공지된 바와 같은 각종 용도를 갖는다. 제공된 조성물, 및 이의 특성 및 용도를 평가하는 방법 또한, 당업자에 널리 공지되어 있고 실행되고 있다. 특성, 용도, 및/또는 방법의 예에는, 비제한적으로, WO/2014/012081 및 WO/2015/107425 에 기재된 것들이 포함된다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 핵산 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 핵산 서열에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 유발 핵산 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 유발 핵산 서열에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 유발 핵산 서열의 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 질환 유발 핵산 서열과 비질환 유발 핵산 서열을 구별한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 유발 핵산 서열의 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 질환 유발 핵산 서열과 비질환 유발 핵산 서열을 구별한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 관련 핵산 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 관련 핵산 서열에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 관련 핵산 서열의 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 질환 관련 핵산 서열과 비질환 관련 핵산 서열을 구별한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 질환 관련 핵산 서열의 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 질환 관련 핵산 서열과 비질환 관련 핵산 서열을 구별한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 유전자에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 유전자에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 유전자의 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 유전자와 상동성을 공유하는 유사 서열과 유전자를 구별한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 유전자의 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 유전자와 상동성을 공유하는 유사 서열과 유전자를 구별한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 유전자의 특징적 서열 요소에 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 유전자의 다른 카피, 예를 들어 유전자의 야생형 카피, 유전자의 또 다른 돌연변이 카피 등에서 발견되지 않는 돌연변이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 표적 유전자의 특징적 서열 요소에 100% 상보적인 서열이거나 이를 포함하며, 상기 특징적 서열은 유전자의 다른 카피, 예를 들어 유전자의 야생형 카피, 유전자의 또 다른 돌연변이 카피 등에서 발견되지 않는 돌연변이를 포함한다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 SNP 를 포함하는 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 SNP 를 포함하는 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함하고, 공통 염기 서열은 질환과 관련이 있는 SNP 에 100% 상보적이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 헌팅턴병-관련 (또는 -유발) 대립유전자와 관련된 SNP 에 100% 상보적이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 다수의 헌팅턴병 환자에 있어서 rs362307 에서 질환 유발 대립유전자에 100% 상보적인, WV-1092 의 서열이다. 일부 구현예에서, SNP 는 rs362307 이다. 일부 구현예에서, SNP 는 rs7685686 이다. 일부 구현예에서, SNP 는 rs362268 이다. 일부 구현예에서, SNP 는 rs362306 이다. 일부 구현예에서, SNP 부위의 또 다른 예는, 본 개시에 개시된 임의의 헌팅틴 부위일 수 있다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하며, 여기서 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열은 적어도 15 개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 U 는 공통 염기 서열에서 T 로 대체되며, 또는 그 역으로 대체된다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCCTCAGTCTGCTTCGCACC 에서 발견되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCCTCAGTCTGCTTCGCACC 에서 발견되는 서열을 포함하며, 여기서 GCCTCAGTCTGCTTCGCACC 에서 발견되는 서열은 적어도 15 개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCCTCAGTCTGCTTCGCACC 이다.
일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 에서 발견되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 에서 발견되는 서열을 포함하며, 여기서 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 에서 발견되는 서열은 적어도 15 개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGGCACAAGGGCACAGACTT 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCACAAGGGCACAGACTTCC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CACAAGGGCACAGACTTCCA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 ACAAGGGCACAGACTTCCAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGGCACAGACTTCCAAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 에서 발견되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 에서 발견되는 서열을 포함하며, 여기서 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 에서 발견되는 서열은 적어도 15 개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAGCAGCTGCAACCTGGCAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AGCAGCTGCAACCTGGCAAC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCAGCTGCAACCTGGCAACA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAGCTGCAACCTGGCAACAA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AGCTGCAACCTGGCAACAAC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCTGCAACCTGGCAACAACC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGGCCAACAGCCAGCCTGCA 에서 발견되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGGCCAACAGCCAGCCTGCA 에서 발견되는 서열을 포함하며, 여기서 GGGCCAACAGCCAGCCTGCA 에서 발견되는 서열은 적어도 15 개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGGCCAACAGCCAGCCTGCA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGGCCAACAGCCAGCCTGCA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGCCAACAGCCAGCCTGCAG 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GCCAACAGCCAGCCTGCAGG 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CCAACAGCCAGCCTGCAGGA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAACAGCCAGCCTGCAGGAG 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AACAGCCAGCCTGCAGGAGG 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 ATTAATAAATTGTCATCACC 에서 발견되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 ATTAATAAATTGTCATCACC 에서 발견되는 서열을 포함하며, 여기서 ATTAATAAATTGTCATCACC 에서 발견되는 서열은 적어도 15 개의 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 ATTAATAAATTGTCATCACC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 ATTAATAAATTGTCATCACC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCA 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AGGAAGAUGGCAUUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGAAGAUGGCAUUUC 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAAGAUGGCAUUUCU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUC 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAUUUC 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAUUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUUUC 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGCA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AGGAAGAUGGCAUUU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGAAGAUGGCAUUUC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAAGAUGGCAUUUCU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAUUUC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUUUCU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUUU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCAUUU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAUUUC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AGGAAGAUGGCAUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGC 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCA 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGAAGAUGGCAUUU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAAGAUGGCAUUUC 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGAUGGCAUUUCU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AGGAAGAUGGCAUU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 UCAAGGAAGAUGGC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 CAAGGAAGAUGGCA 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGGAAGAUGGCAU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GGAAGAUGGCAUUU 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 GAAGAUGGCAUUUC 이다. 일부 구현예에서, 공통 염기 서열은 AAGAUGGCAUUUCU 이다.
일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 단일 올리고뉴클레오티드에서 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 단일 올리고뉴클레오티드에서 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다.
일부 구현예에서, 본 개시의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 염기 모이어티를 포함한다. 당업자에게 공지되어 있고 본 개시에 기재된 바와 같이, 각종 개질은 당 및/또는 모이어티에 도입될 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 개질은 US9006198, WO2014/012081 및 WO/2015/107425 에 기재된 개질이며, 이들 각각의 당 및 염기 개질은 본원에 참조로서 인용된다.
일부 구현예에서, 당 개질은 2'-개질이다. 통상적으로 사용되는 2'-개질은, 비제한적으로, 2'-OR1 을 포함하고, 여기서 R1 은 수소가 아니다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-OR 이고, 여기서 R 은 임의 치환된 지방족이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-OMe 이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-O-MOE 이다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 특정 키랄적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결의 내포 및/또는 위치가 개질된 백본 연결, 염기, 및/또는 당의 사용을 통해 달성된 것보다 우수하거나 그에 필적한 안정성 개선을 제공할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 제공된 단일 올리고뉴클레오티드는 당에서 개질을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 제공된 단일 올리고뉴클레오티드는 당의 2'-위치에서 개질을 갖지 않는다 (즉, 2'-위치에서의 2 개의 기는 -H/-H 또는 -H/-OH 임). 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 제공된 단일 올리고뉴클레오티드는 어떠한 2'-MOE 개질도 갖지 않는다.
일부 구현예에서, 2'-개질은 당 모이어티의 2'-탄소를 당 모이어티의 또 다른 탄소에 연결하는 -O-L- 또는 -L- 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 당 모이어티의 2'-탄소를 당 모이어티의 4'-탄소에 연결하는 -O-L- 또는 -L- 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 S-cEt 이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 LNA 모이어티이다.
일부 구현예에서, 2'-개질은 -F 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 FANA 이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 FRNA 이다.
일부 구현예에서, 당 개질은 5'-개질, 예를 들어, R-5'-Me, S-5'-Me 등이다.
일부 구현예에서, 당 개질은 당 고리의 크기를 변화시킨다. 일부 구현예에서, 당 개질은 FHNA 에서의 당 모이어티이다.
일부 구현예에서, 당 개질은 또 다른 시클릭 또는 비(非)시클릭 모이어티로 대체된다. 상기와 같은 모이어티의 예는, 비제한적으로 모르폴리오 (임의로 이의 포스포로디아미데이트 연결과 함께), 글리콜 핵산 등에 사용된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있다,
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 25% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 30% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 35% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 40% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 45% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 50% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 55% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 60% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 65% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 70% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 75% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 80% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 85% 를 Sp 배열로 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 이의 뉴클레오티드간 연결의 적어도 약 90% 를 Sp 배열로 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 TkTk mCkAGTmCATGAmCTkTmCk mCk 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아니며, 여기서 각각의 뉴클레오시드에 뒤따르는 아래첨자 'k' 는 (S)-cEt 개질을 나타내고, R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결이고, S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결이고, 각각의 mC 는 5-메틸 시토신 개질된 뉴클레오시드이고, 모든 뉴클레오시드간 연결은 RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR 및 SSSSSSSSSS 로부터 선택되는 입체화학 패턴을 갖는 포스포로티오에이트 (PS) 이다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 단일 올리고뉴클레오티드는 TkTk mCkAGTmCATGAmCTTk mCk mCk 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아니며, 여기서 각각의 뉴클레오시드에 뒤따르는 아래첨자 'k' 는 (S)-cEt 개질을 나타내고, R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결이고, S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결이고, 각각의 mC 은 5-메틸 시토신 개질된 뉴클레오시드이고, 모든 코어 뉴클레오시드간 연결은 RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR 및 SSSSSSSSSS 로부터 선택되는 입체화학 패턴을 갖는 포스포로티오에이트 (PS) 이다.
키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 및 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물
본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드, 및 높은 미정제 순도 및 높은 부분입체이성질 순도를 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드, 및 높은 미정제 순도를 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드, 및 높은 부분입체이성질 순도를 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 올리고뉴클레오티드 유형이 아닌 조성물 중의 올리고뉴클레오티드가 상기 올리고뉴클레오티드 유형의 제조 방법으로부터의, 일부의 경우, 특정 정제 절차 후의 불순물인, 올리고뉴클레오티드 유형의 실질적으로 순수한 제제이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 연결 인에 대하여 하나 이상의 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 구조를 갖는 하나 이상의 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 연결 인에 대하여 하나 이상의 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결, 및 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 구조를 갖는 하나 이상의 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결, 및 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I- c 의 구조를 갖는 하나 이상의 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결, 및 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 상기 올리고뉴클레오티드는 본 출원에 기재된 바와 같은 입체선택적 올리고뉴클레오티드 합성을 사용하여, 키랄 연결 인에 대하여 사전-디자인된 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결을 형성함으로써 제조된다. 예를 들어, (Rp/Sp, Rp/Sp, Rp/Sp, Rp, Rp, Sp, Sp, Sp, Sp, Sp Sp, Sp, Sp, Sp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp)-d[GsCsCsTsCsAsGsTsCsTsGsCsTsTsCsGs1Cs1As1CsC] 의 올리고뉴클레오티드의 하나의 예에서, 처음 3 개의 뉴클레오티드간 연결은 종래의 올리고뉴클레오티드 합성 방법을 사용하여 구축되고, 부분입체이성질체적으로 순수한 뉴클레오티드간 연결은 본 출원에 기재된 바와 같은 입체화학적 제어를 이용하여 구축된다. 뉴클레오티드간 연결 (화학식 I 의 구조를 갖는 것들 포함) 의 예는, 하기에 추가로 기재된다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 입체화학 및/또는 상이한 P-개질을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 특정 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 특정 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖고, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 특정 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖고, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드가 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 포스포로티오에이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 특정 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖고, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드가 적어도 하나의 포스포로티오에이트 트리에스테르 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 특정 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖고, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드가 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 포스포로티오에이트 트리에스테르 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
특정 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다:
Figure pct00016
[식 중, 각각의 변수는 하기에 정의되고 기재된 바와 같음]. 일부 구현예에서, 화학식 I 의 연결은 키랄이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 올리고뉴클레오티드 내 화학식 I 의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 올리고뉴클레오티드 내 화학식 I 의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 -X-L-R1 을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 올리고뉴클레오티드 내 화학식 I 의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 X 를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학식 I 의 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 올리고뉴클레오티드 내 화학식 I 의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 -L-R1 을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는 제공된 조성물 중의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는, 공통 염기 서열 및 길이, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 갖는 제공된 조성물 중의 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는 키랄 제어된 조성물 중의 올리고뉴클레오티드이고, 상기 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 상기 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 공통 염기 서열, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 공유하는 선결된 수준의 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 조성물 중의 올리고뉴클레오티드이고, 상기 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 상기 공통 염기 서열, 백본 연결의 공통 패턴, 및 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 공유한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 입체화학 및/또는 상이한 P-개질을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 입체화학을 갖고, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 구조의 적어도 일부가 교대 입체화학의 반복 패턴을 특징으로 하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 P-개질을 갖는, 즉, 이의 -XLR1 모이어티에서 상이한 X 원자를 갖고/갖거나, 이의 -XLR1 모이어티에서 상이한 L 기를 갖고/갖거나, 이의 -XLR1 모이어티에서 상이한 R1 원자를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 내 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결이 서로에 대하여 상이한 입체화학 및/또는 상이한 P-개질을 갖고, 올리고뉴클레오티드가 하기 화학식으로 표시되는 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다:
[SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny]
[식 중:
각각의 RB 는 독립적으로 연결 인에서 R 배열을 갖는 뉴클레오티드 단위의 블록을 나타내고;
각각의 SB 는 독립적으로 연결 인에서 S 배열을 갖는 뉴클레오티드 단위의 블록을 나타내고;
각각의 n1-ny 는 0 (zero) 또는 정수이고, 단, 적어도 하나의 홀수 n 및 적어도 하나의 짝수 n 은, 올리고뉴클레오티드가 서로에 대하여 상이한 입체화학을 갖는 적어도 2 개의 개별적인 뉴클레오티드간 연결을 포함하도록, 0 이 아니어야 하고;
n1-ny 의 합은 2 내지 200 이고, 일부 구현예에서 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 또는 그 이상으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하한과, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 및 200 으로 이루어진 군으로부터 선택되는 상한 사이에 있고, 상한은 하한보다 더 큼].
일부 상기와 같은 구현예에서, 각각의 n 은 동일한 값을 갖고; 일부 구현예에서, 각각의 짝수 n 은 서로 짝수 n 과 동일한 값을 갖고; 일부 구현예에서, 각각의 홀수 n 은 서로 홀수 n 과 동일한 값을 갖고; 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 짝수 n 은 서로 상이한 값을 갖고; 일부 구현예에서, 적어도 2 개의 홀수 n 은 서로 상이한 값을 갖는다.
일부 구현예에서, 적어도 2 개의 인접한 n 은, 제공된 올리고뉴클레오티드가 동일한 길이의 S 입체화학 연결 및 R 입체화학 연결의 인접한 블록을 포함하도록, 서로 동일하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 동일한 길이의 S 및 R 입체화학 연결의 반복 블록을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 S 및 R 입체화학 연결의 반복 블록을 포함하고, 여기서 적어도 2 개의 상기 블록은 서로 상이한 길이를 갖고; 일부 상기와 같은 구현예에서, 각각의 S 입체화학 블록은 동일한 길이를 갖고, 임의로 서로 동일한 길이를 가질 수 있는 각각의 R 입체화학 길이와는 상이한 길이를 갖는다.
일부 구현예에서, 적어도 2 개의 스킵 (skip)-인접한 n 은, 제공된 올리고뉴클레오티드가 서로 길이가 동일하고 다른 입체화학 연결의 블록에 의해 분리되는 제 1 입체화학 연결의 적어도 2 개의 블록을 포함하도록 서로 동일하며, 여기서 분리 블록은 제 1 입체화학의 블록과 동일한 길이 또는 상이한 길이를 가질 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 말단에서 연결 블록과 연관된 n 은 동일한 길이를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 동일한 연결 입체화학의 말단 블록을 갖는다. 일부 상기와 같은 구현예에서, 말단 블록은 다른 연결 입체화학의 중간 블록에 의해 서로 분리된다.
일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 입체블록머이다. 일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 스테레오스킵머 (stereoskipmer) 이다. 일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 스테레오알트머 (stereoaltmer) 이다. 일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 갭머이다.
일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 임의의 상기 기재된 패턴을 갖고, 추가로 P-개질의 패턴을 포함한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 스테레오스킵머 및 P-개질 스킵머이다. 일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 입체블록머 및 P-개질 알트머이다. 일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는 스테레오알트머 및 P-개질 블록머이다.
일부 구현예에서, 화학식 [SBn1RBn2SBn3RBn4...SBnxRBny] 의 제공된 올리고뉴클레오티드는, 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드이다:
Figure pct00017
[식 중,
P* 는 비대칭 인 원자이고, Rp 또는 Sp 이며;
W 는 O, S 또는 Se 이고;
X, Y 및 Z 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, -N(-L-R1)-, 또는 L 이고;
L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나: 또는
2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
각각의
Figure pct00018
는 독립적으로 뉴클레오시드에의 연결을 나타냄].
일부 구현예에서, L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고;
R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나; 또는
동일한 질소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하거나, 또는
동일한 탄소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌, 또는 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
각각의
Figure pct00019
는 독립적으로 뉴클레오시드에의 연결을 나타낸다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 인 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 포스포로티오에이트 또는 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 2 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 3 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 4 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 5 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 상기와 같은 개질된 뉴클레오티드간 인 연결의 예는 본원에 추가로 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 상이한 뉴클레오티드간 인 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 2 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 3 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 4 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 5 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 상기와 같은 개질된 뉴클레오티드간 인 연결의 예는 본원에 추가로 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결은 예를 들어 반응의 입체선택성을 제어하는데 사용되는 키랄 보조제를 포함한다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결은 키랄 보조제를 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결은 대상에의 투여 때까지 및/또는 투여 중에 의도적으로 유지된다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 고체 지지체에 연결된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 고체 지지체로부터 절단된다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 2 개의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 2 개의 연속적인 포스포로티오에이트 트리에스테르 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 블록머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 입체블록머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 P-개질 블록머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 연결 블록머이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 알트머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 스테레오알트머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 P-개질 알트머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 연결 알트머이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 유니머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 스테레오유니머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 P-개질 유니머이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 연결 유니머이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 갭머이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 스킵머이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다:
Figure pct00020
[식 중,
P* 는 비대칭 인 원자이고, Rp 또는 Sp 이며;
W 는 O, S 또는 Se 이고;
X, Y 및 Z 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, -N(-L-R1)-, 또는 L 이고;
L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나; 또는
2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
각각의
Figure pct00021
는 독립적으로 뉴클레오시드에의 연결을 나타냄].
일부 구현예에서, L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고;
R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나; 또는
동일한 질소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하거나, 또는
동일한 탄소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌, 또는 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
각각의
Figure pct00022
는 독립적으로 뉴클레오시드에의 연결을 나타낸다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 인 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 포스포로티오에이트 또는 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 2 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 3 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 4 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 5 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 개질된 뉴클레오티드간 인 연결의 예는 본원에 추가로 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 상이한 뉴클레오티드간 인 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 하나의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 2 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 3 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 적어도 4 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, P* 는 비대칭 인 원자이고, Rp 또는 Sp 이다. 일부 구현예에서, P* 는 Rp 이다. 다른 구현예에서, P* 는 Sp 이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 각각의 P* 가 독립적으로 Rp 또는 Sp 인, 화학식 I 의 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 각각의 P* 가 Rp 인, 화학식 I 의 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 각각의 P* 가 Sp 인, 화학식 I 의 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 P* 가 Rp 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 P* 가 Sp 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 P* 가 Rp 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결, 및 P* 가 Sp 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, W 는 O, S, 또는 Se 이다. 일부 구현예에서, W 는 O 이다. 일부 구현예에서, W 는 S 이다. 일부 구현예에서, W 는 Se 이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, W 가 O 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, W 가 S 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, W 가 Se 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, W 가 O 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, W 가 S 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, R 은 수소이다. 일부 구현예에서, R 은 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 C1-C6 지방족이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 C1-C6 알킬이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 헥실이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 펜틸이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 부틸이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 프로필이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 에틸이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 메틸이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, R 은 치환 페닐이다. 일부 구현예에서, R 은 페닐이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 카르보시클릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 C3-C10 카르보시클릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 모노시클릭 카르보시클릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 시클로헵틸이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 시클로헥실이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 시클로펜틸이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 시클로부틸이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 시클로프로필이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 바이시클릭 카르보시클릴이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 아릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 바이시클릭 아릴 고리이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 헤테로아릴이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 황, 또는 산소로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 치환 5-6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 황, 또는 산소로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 미치환 5-6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다.
일부 구현예에서, R 은 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다.
일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 선택되는 1 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 피롤릴, 푸라닐, 또는 티에닐로부터 선택된다.
일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-원 헤테로아릴 고리이다. 특정 구현예에서, R 은 1 개의 질소 원자, 및 황 또는 산소로부터 선택되는 부가적인 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-원 헤테로아릴 고리이다. R 기의 예로는, 임의 치환된 피라졸릴, 이미다졸릴, 티아졸릴, 이소티아졸릴, 옥사졸릴 또는 이속사졸릴이 포함된다.
일부 구현예에서, R 은 1-3 개의 질소 원자를 갖는 6-원 헤테로아릴 고리이다. 다른 구현예에서, R 은 1-2 개의 질소 원자를 갖는 임의 치환된 6-원 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 2 개의 질소 원자를 갖는 임의 치환된 6-원 헤테로아릴 고리이다. 특정 구현예에서, R 은 1 개의 질소를 갖는 임의 치환된 6-원 헤테로아릴 고리이다. R 기의 예로는, 임의 치환된 피리디닐, 피리미디닐, 피라지닐, 피리다지닐, 트리아지닐, 또는 테트라지닐이 포함된다.
특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 8-10 원 바이시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 다른 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 인돌릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 아자바이시클로[3.2.1]옥타닐이다. 특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 아자인돌릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 벤즈이미다졸릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 벤조티아졸릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 벤즈옥사졸릴이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 인다졸릴이다. 특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다.
특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 다른 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 퀴놀리닐이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 이소퀴놀리닐이다. 하나의 양태에 있어서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 퀴나졸린 또는 퀴녹살린이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 헤테로시클릴이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 치환된 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 미치환된 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다.
일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 헤테로시클릴이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6 원 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 2 개의 산소 원자를 갖는 임의 치환된 6 원 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다.
특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 특정 구현예에서, R 은 옥시라닐, 옥세타닐, 테트라히드로푸라닐, 테트라히드로피라닐, 옥세파네일, 아지리디네일, 아제티디네일, 피롤리디닐, 피페리디닐, 아제파닐, 티이라닐, 티에타닐, 테트라히드로티오페닐, 테트라히드로티오피라닐, 티에파닐, 디옥솔라닐, 옥사티올라닐, 옥사졸리디닐, 이미다졸리디닐, 티아졸리디닐, 디티올라닐, 디옥사닐, 모르폴리닐, 옥사티아닐, 피페라지닐, 티오모르폴리닐, 디티아닐, 디옥세파닐, 옥사제파닐, 옥사티에파닐, 디티에파닐, 디아제파닐, 디히드로푸라노닐, 테트라히드로피라노닐, 옥세파노닐, 피롤리디노닐, 피페리디노닐, 아제파노닐, 디히드로티오페노닐, 테트라히드로티오피라노닐, 티에파노닐, 옥사졸리디노닐, 옥사지나노닐, 옥사제파노닐, 디옥솔라노닐, 디옥사노닐, 디옥세파노닐, 옥사티올리노닐, 옥사티아노닐, 옥사티에파노닐, 티아졸리디노닐, 티아지나노닐, 티아제파노닐, 이미다졸리디노닐, 테트라히드로피리미디노닐, 디아제파노닐, 이미다졸리딘디오닐, 옥사졸리딘디오닐, 티아졸리딘디오닐, 디옥솔란디오닐, 옥사티올란디오닐, 피페라진디오닐, 모르폴린디오닐, 티오모르폴린디오닐, 테트라히드로피라닐, 테트라히드로푸라닐, 모르폴리닐, 티오모르폴리닐, 피페리디닐, 피페라지닐, 피롤리디닐, 테트라히드로티오페닐, 또는 테트라히드로티오피라닐이다. 일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다.
특정 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-6 원 부분 불포화 모노시클릭 고리이다. 특정 구현예에서, R 은 임의 치환된 테트라히드로피리디닐, 디히드로티아졸릴, 디히드로옥사졸릴, 또는 옥사졸리닐기이다.
일부 구현예에서, R 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 8-10 원 바이시클릭 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 인돌리닐이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 이소인돌리닐이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 1,2,3,4-테트라히드로퀴놀린이다. 일부 구현예에서, R 은 임의 치환된 1,2,3,4-테트라히드로이소퀴놀린이다.
일부 구현예에서, 각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나; 또는
동일한 질소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하거나, 또는
동일한 탄소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성한다.
일부 구현예에서, R' 는 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이고, 여기서 R 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, R' 는 -R- 이고, 여기서 R 은 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R' 는 수소이다.
일부 구현예에서, R' 는 -C(O)R 이고, 여기서 R 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R' 는 -CO2R 이고, 여기서 R 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R' 는 -SO2R 이고, 여기서 R 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, 동일한 질소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, 동일한 탄소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성한다.
일부 구현예에서, -Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌, 또는 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이다.
일부 구현예에서, -Cy- 는 임의 치환된 페닐렌이다. 일부 구현예에서, -Cy- 는 임의 치환된 카르보시클릴렌이다. 일부 구현예에서, -Cy- 는 임의 치환된 아릴렌이다. 일부 구현예에서, -Cy- 는 임의 치환된 헤테로아릴렌이다. 일부 구현예에서, -Cy- 는 임의 치환된 헤테로시클릴렌이다.
일부 구현예에서, X, Y 및 Z 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, -N(-L-R1)-, 또는 L 이고, 여기서 L 및 R1 은 각각 독립적으로 상기 정의되고 하기 기재되는 바와 같다.
일부 구현예에서, X 는 -O- 이다. 일부 구현예에서, X 는 -S- 이다. 일부 구현예에서, X 는 -O- 또는 -S- 이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 X 가 -O- 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 X 가 -S- 인, 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 X 가 -O- 인 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결, 및 X 가 -S- 인 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 X 가 -O- 인 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결, 및 X 가 -S- 인 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결, 및 L 이 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌인 화학식 I 의 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체된다.
일부 구현예에서, X 는 -N(-L-R1)- 이다. 일부 구현예에서, X 는 -N(R1)- 이다. 일부 구현예에서, X 는 -N(R')- 이다. 일부 구현예에서, X 는 -N(R)- 이다. 일부 구현예에서, X 는 -NH- 이다.
일부 구현예에서, X 는 L 이다. 일부 구현예에서, X 는 공유 결합이다. 일부 구현예에서, X 는 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체된다. 일부 구현예에서, X 는 임의 치환된 C1-C10 알킬렌 또는 C1-C10 알케닐렌이다. 일부 구현예에서, X 는 메틸렌이다.
일부 구현예에서, Y 는 -O- 이다. 일부 구현예에서, Y 는 -S- 이다.
일부 구현예에서, Y 는 -N(-L-R1)- 이다. 일부 구현예에서, Y 는 -N(R1)- 이다. 일부 구현예에서, Y 는 -N(R')- 이다. 일부 구현예에서, Y 는 -N(R)- 이다. 일부 구현예에서, Y 는 -NH- 이다.
일부 구현예에서, Y 는 L 이다. 일부 구현예에서, Y 는 공유 결합이다. 일부 구현예에서, Y 는 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체된다. 일부 구현예에서, Y 는 임의 치환된 C1-C10 알킬렌 또는 C1-C10 알케닐렌이다. 일부 구현예에서, Y 는 메틸렌이다.
일부 구현예에서, Z 는 -O- 이다. 일부 구현예에서, Z 는 -S- 이다.
일부 구현예에서, Z 는 -N(-L-R1)- 이다. 일부 구현예에서, Z 는 -N(R1)- 이다. 일부 구현예에서, Z 는 -N(R')- 이다. 일부 구현예에서, Z 는 -N(R)- 이다. 일부 구현예에서, Z 는 -NH- 이다.
일부 구현예에서, Z 는 L 이다. 일부 구현예에서, Z 는 공유 결합이다. 일부 구현예에서, Z 는 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체된다. 일부 구현예에서, Z 는 임의 치환된 C1-C10 알킬렌 또는 C1-C10 알케닐렌이다. 일부 구현예에서, Z 는 메틸렌이다.
일부 구현예에서, L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체된다.
일부 구현예에서, L 은 공유 결합이다. 일부 구현예에서, L 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체된다.
일부 구현예에서, L 은 -L1-V- 의 구조를 갖고, 여기서:
L1 은
Figure pct00023
,
C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, C1-C6 헤테로알킬렌, 헤테로시클릴렌 및 헤테로아릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
V 는 -O-, -S-, -NR'-, C(R')2, -S-S-, -B-S-S-C-,
Figure pct00024
, 또는 C1-C6 알킬렌, 아릴렌, C1-C6 헤테로알킬렌, 헤테로시클릴렌 및 헤테로아릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 기로부터 선택되고;
A 는 =O, =S, =NR', 또는 =C(R')2 이고;
B 및 C 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, -NR'-, -C(R')2-, 또는 C1-C6 알킬렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로시클릴렌, 또는 헤테로아릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, L1 은,
Figure pct00025
이다.
일부 구현예에서, L1 은
Figure pct00026
이고, 여기서 고리 Cy' 는 임의 치환된 아릴렌, 카르보시클릴렌, 헤테로아릴렌, 또는 헤테로시클릴렌이다. 일부 구현예에서, L1 은 임의 치환된
Figure pct00027
이다. 일부 구현예에서, L1 은
Figure pct00028
이다.
일부 구현예에서, L1 은 X 에 연결된다. 일부 구현예에서, L1 은
Figure pct00029
로부터 선택되는 임의 치환된 기이고, 황 원자는 V 에 연결된다. 일부 구현예에서, L1 은
Figure pct00030
로부터 선택되는 임의 치환된 기이고, 탄소 원자는 X 에 연결된다.
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00031
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
Figure pct00032
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고; 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00033
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
Figure pct00034
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성함].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00035
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00036
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 임].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00037
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00038
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 임].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00039
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
Figure pct00040
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00041
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
Figure pct00042
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00043
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00044
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00045
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00046
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00047
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
Figure pct00048
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고; 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00049
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
Figure pct00050
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고; 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00051
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00052
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
R' 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00053
[식 중,
E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00054
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
D 는 =N-, =C(F)-, =C(Cl)-, =C(Br)-, =C(I)-, =C(CN)-, =C(NO2)-, =C(CO2-(C1-C6 지방족))-, 또는 =C(CF3)- 이고;
R' 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00055
[식 중, 페닐 고리는 임의 치환됨]. 일부 구현예에서, 페닐 고리는 치환되지 않는다. 일부 구현예에서, 페닐 고리는 치환된다.
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00056
[식 중, 페닐 고리는 임의 치환됨]. 일부 구현예에서, 페닐 고리는 치환되지 않는다. 일부 구현예에서, 페닐 고리는 치환된다.
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00057
[식 중,
Figure pct00058
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성함].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00059
[식 중,
G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고;
Figure pct00060
는 단일 또는 이중 결합이고;
2 개의 RL1 은 이들에 결합되는 2 개의 탄소 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, C3-C10 카르보시클릭, 헤테로아릴 또는 헤테로시클릭 고리를 형성함].
일부 구현예에서, E 는 -O-, -S-, -NR'- 또는 -C(R')2- 이고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, E 는 -O-, -S-, 또는 -NR'- 이다. 일부 구현예에서, E 는 -O-, -S-, 또는 -NH- 이다. 일부 구현예에서, E 는 -O- 이다. 일부 구현예에서, E 는 -S- 이다. 일부 구현예에서, E 는 -NH- 이다.
일부 구현예에서, G 는 -O-, -S-, 또는 -NR' 이고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, G 는 -O-, -S-, 또는 -NH- 이다. 일부 구현예에서, G 는 -O- 이다. 일부 구현예에서, G 는 -S- 이다. 일부 구현예에서, G 는 -NH- 이다.
일부 구현예에서, L 은 -L3-G- 이고, 여기서:
L3 은 임의 치환된 C1-C5 알킬렌 또는 알케닐렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)2-, 또는
Figure pct00061
로 대체되고;
여기서 G, R' 및 고리 Cy' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, L 은 -L3-S- 이고, 여기서 L3 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은 -L3-O- 이고, 여기서 L3 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은 -L3-N(R')- 이고, 여기서 L3 및 R' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은 -L3-NH- 이고, 여기서 L3 및 R' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, L3 은 임의 치환된 C5 알킬렌 또는 알케닐렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)2-, 또는
Figure pct00062
로 대체되고, R' 및 고리 Cy' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L3 은 임의 치환된 C5 알킬렌이다. 일부 구현예에서, -L3-G- 는
Figure pct00063
이다.
일부 구현예에서, L3 은 임의 치환된 C4 알킬렌 또는 알케닐렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)2-, 또는
Figure pct00064
로 대체되고, R' 및 Cy' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L3-G- 은
Figure pct00065
이다.
일부 구현예에서, L3 은 임의 치환된 C3 알킬렌 또는 알케닐렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)2-, 또는
Figure pct00066
로 대체되고, R' 및 Cy' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L3-G- 는
Figure pct00067
이다.
일부 구현예에서, L 은
Figure pct00068
이다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00069
이다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00070
이다.
일부 구현예에서, L3 은 임의 치환된 C2 알킬렌 또는 알케닐렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -S(O)-, -S(O)2-, 또는
Figure pct00071
로 대체되고, R' 및 Cy' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L3-G- 는
Figure pct00072
이고, 여기서 G 및 Cy' 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00073
이다.
일부 구현예에서, L 은 -L4-G- 이고, 여기서 L4 는 임의 치환된 C1-C2 알킬렌이고; G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은 -L4-G- 이고, 여기서 L4 는 임의 치환된 C1-C2 알킬렌이고; G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고; G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은 -L4-G- 이고, 여기서 L4 는 임의 치환된 메틸렌이고; G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고; G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은 -L4-G- 이고, 여기서 L4 는 메틸렌이고; G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고; G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은 -L4-G- 이고, 여기서 L4 은 임의 치환된 -(CH2)2- 이고; G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고; G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은 -L4-G- 이고, 여기서 L4 는 -(CH2)2- 이고; G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고; G 는 R1 에 연결된다.
일부 구현예에서, L 은
Figure pct00074
이고, 여기서 G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고, G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00075
이고, 여기서 G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고, G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00076
이고, 여기서 G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같고, G 는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00077
이고, 여기서 황 원자는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00078
이고, 여기서 산소 원자는 R1 에 연결된다.
일부 구현예에서, L 은
Figure pct00079
이고, 여기서 G 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형, C1-C9 알킬렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 R' 및 -Cy- 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 임의 치환된 C1-C6 알킬렌이다. 일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 임의 치환된 C1-C6 알케닐렌이다. 일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 임의 치환된 C1 -C6 알킬렌이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알케닐렌, 아릴렌, 또는 헤테로아릴렌으로 대체된다. 일부 구현예에서, RL3 은 임의 치환된 -S-(C1-C6 알케닐렌)-, -S-(C1-C6 알킬렌)-, -S-(C1-C6 알킬렌)-아릴렌-(C1-C6 알킬렌)-, -S-CO-아릴렌-(C1-C6 알킬렌)-, 또는 -S-CO-(C1-C6 알킬렌)-아릴렌-(C1-C6 알킬렌)- 이다.
일부 구현예에서, L 은
Figure pct00080
이다.
일부 구현예에서, L 은
Figure pct00081
이다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00082
이다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00083
이다.
일부 구현예에서, 상기 및 본원에 기재된 L 구현예에서 황 원자는 X 에 연결된다. 일부 구현예에서, 상기 및 본원에 기재된 L 구현예에서 황 원자는 R1 에 연결된다.
일부 구현예에서, R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C10 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, R1 은 수소이다. 일부 구현예에서, R1 은 할로겐이다. 일부 구현예에서, R1 은 -F 이다. 일부 구현예에서, R1 은 -Cl 이다. 일부 구현예에서, R1 은 -Br 이다. 일부 구현예에서, R1 은 -I 이다.
일부 구현예에서, R1 은 R 이고, 여기서 R 은 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, R1 은 수소이다. 일부 구현예에서, R1 은 C1-C50 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C50 지방족이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C10 지방족이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C6 지방족이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C6 알킬이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 헥실이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 펜틸이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 부틸이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된, 선형 또는 분지형 프로필이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 에틸이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 메틸이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, R1 은 치환 페닐이다. 일부 구현예에서, R1 은 페닐이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 카르보시클릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C3-C10 카르보시클릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 모노시클릭 카르보시클릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 시클로헵틸이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 시클로헥실이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 시클로펜틸이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 시클로부틸이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 시클로프로필이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 바이시클릭 카르보시클릴이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C50 폴리시클릭 탄화수소이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C50 폴리시클릭 탄화수소이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된
Figure pct00084
이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00085
이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된
Figure pct00086
이다.
일부 구현예에서, R1 은 하나 이상의 임의 치환된 폴리시클릭 탄화수소 모이어티를 포함하는 임의 치환된 C1-C50 지방족이다. 일부 구현예에서, R1 은 하나 이상의 임의 치환된 폴리시클릭 탄화수소 모이어티를 포함하는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 하나 이상의 임의 치환된
Figure pct00087
를 포함하는 임의 치환된 C1-C50 지방족이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00088
이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00089
이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00090
이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00091
이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00092
이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 아릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 바이시클릭 아릴 고리이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 헤테로아릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 황, 또는 산소로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 치환 5-6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 황, 또는 산소로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 미치환 5-6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다.
일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6 원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다.
일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 선택되는 1 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-원 모노시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 피롤릴, 푸라닐, 또는 티에닐로부터 선택된다.
일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-원 헤테로아릴 고리이다. 특정 구현예에서, R1 은 1 개의 질소 원자, 및 황 또는 산소로부터 선택되는 부가적인 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-원 헤테로아릴 고리이다. R1 기의 예에는, 임의 치환된 피라졸릴, 이미다졸릴, 티아졸릴, 이소티아졸릴, 옥사졸릴 또는 이속사졸릴이 포함된다.
일부 구현예에서, R1 은 1-3 개의 질소 원자를 갖는 6-원 헤테로아릴 고리이다. 다른 구현예에서, R1 은 1-2 개의 질소 원자를 갖는 임의 치환된 6-원 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 2 개의 질소 원자를 갖는 임의 치환된 6-원 헤테로아릴 고리이다. 특정 구현예에서, R1 은 1 개의 질소 원자를 갖는 임의 치환된 6-원 헤테로아릴 고리이다. R1 기의 예에는, 임의 치환된 피리디닐, 피리미디닐, 피라지닐, 피리다지닐, 트리아지닐, 또는 테트라지닐이 포함된다.
특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 8-10 원 바이시클릭 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 다른 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 인돌릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 아자바이시클로[3.2.1]옥타닐이다. 특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 아자인돌릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 벤즈이미다졸릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 벤조티아졸릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 벤즈옥사졸릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 인다졸릴이다. 특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 3 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5,6-융합된 헤테로아릴 고리이다.
특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 다른 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 퀴놀리닐이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 이소퀴놀리닐이다. 하나의 양태에 있어서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6,6-융합된 헤테로아릴 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 퀴나졸린 또는 퀴녹살린이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 헤테로시클릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 치환된 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 미치환된 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 헤테로시클릴이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 6 원 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 2 개의 산소 원자를 갖는 임의 치환된 6 원 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다.
특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 3-7 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 특정 구현예에서, R1 은 옥시라닐, 옥세타닐, 테트라히드로푸라닐, 테트라히드로피라닐, 옥세파네일, 아지리디네일, 아제티디네일, 피롤리디닐, 피페리디닐, 아제파닐, 티이라닐, 티에타닐, 테트라히드로티오페닐, 테트라히드로티오피라닐, 티에파닐, 디옥솔라닐, 옥사티올라닐, 옥사졸리디닐, 이미다졸리디닐, 티아졸리디닐, 디티올라닐, 디옥사닐, 모르폴리닐, 옥사티아닐, 피페라지닐, 티오모르폴리닐, 디티아닐, 디옥세파닐, 옥사제파닐, 옥사티에파닐, 디티에파닐, 디아제파닐, 디히드로푸라노닐, 테트라히드로피라노닐, 옥세파노닐, 피롤리디노닐, 피페리디노닐, 아제파노닐, 디히드로티오페노닐, 테트라히드로티오피라노닐, 티에파노닐, 옥사졸리디노닐, 옥사지나노닐, 옥사제파노닐, 디옥솔라노닐, 디옥사노닐, 디옥세파노닐, 옥사티올리노닐, 옥사티아노닐, 옥사티에파노닐, 티아졸리디노닐, 티아지나노닐, 티아제파노닐, 이미다졸리디노닐, 테트라히드로피리미디노닐, 디아제파노닐, 이미다졸리딘디오닐, 옥사졸리딘디오닐, 티아졸리딘디오닐, 디옥솔란디오닐, 옥사티올란디오닐, 피페라진디오닐, 모르폴린디오닐, 티오모르폴린디오닐, 테트라히드로피라닐, 테트라히드로푸라닐, 모르폴리닐, 티오모르폴리닐, 피페리디닐, 피페라지닐, 피롤리디닐, 테트라히드로티오페닐, 또는 테트라히드로티오피라닐이다. 일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5 원 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다.
특정 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-2 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 5-6 원 부분 불포화 모노시클릭 고리이다. 특정 구현예에서, R1 은 임의 치환된 테트라히드로피리디닐, 디히드로티아졸릴, 디히드로옥사졸릴, 또는 옥사졸리닐기이다.
일부 구현예에서, R1 은 질소, 산소, 또는 황으로부터 독립적으로 선택되는 1-4 개의 헤테로원자를 갖는 임의 치환된 8-10 원 바이시클릭 포화 또는 부분 불포화 헤테로시클릭 고리이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 인돌리닐이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 이소인돌리닐이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 1,2,3,4-테트라히드로퀴놀린이다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 1,2,3,4-테트라히드로이소퀴놀린이다.
일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C10 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C10 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1-C10 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00093
Figure pct00094
이다.
일부 구현예에서, R1 은 CH3-,
Figure pct00095
이다.
일부 구현예에서, R1 은 L 에 연결되는 말단 임의 치환된 -(CH2)2- 모이어티를 포함한다. 상기와 같은 R1 기의 예는 하기에 도시된 바와 같다:
Figure pct00096
일부 구현예에서, R1 은 L 에 연결되는 말단 임의 치환된 -(CH2)- 모이어티를 포함한다. 상기와 같은 R1 기의 예는 하기에 도시된 바와 같다:
Figure pct00097
.
일부 구현예에서, R1 은 -S-RL2 이고, 여기서 RL2 은 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, R' 및 -Cy- 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 -S-RL2 이고, 여기서 황 원자는 L 기 내 황 원자와 연결된다.
일부 구현예에서, R1 은 -C(O)-RL2 이고, 여기서 RL2 은 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, R' 및 -Cy- 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 -C(O)-RL2 이고, 여기서 카르보닐기는 L 기 내 G 와 연결된다. 일부 구현예에서, R1 은 -C(O)-RL2 이고, 여기서 카르보닐기는 L 기 내 황 원자와 연결된다.
일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 알킬이다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 알케닐이다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 알키닐이다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -Cy- 또는 -C(O)- 로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -Cy- 로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 헤테로시클릴렌으로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 아릴렌으로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 헤테로아릴렌으로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C3-C10 카르보시클릴렌으로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 2 개의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -Cy- 또는 -C(O)- 로 대체된다. 일부 구현예에서, RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 2 개의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -Cy- 또는 -C(O)- 로 대체된다. RL2 기의 예는 하기에 도시된 바와 같다:
Figure pct00098
.
일부 구현예에서, R1 은 수소, 또는
Figure pct00099
Figure pct00100
, -S-(C1-C10 지방족), C1-C10 지방족, 아릴, C1-C6 헤테로알킬, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00101
또는 -S-(C1-C10 지방족) 이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00102
이다.
일부 구현예에서, R1 은 -S-(C1-C6 지방족), C1-C10 지방족, C1-C6 헤테로지방족, 아릴, 헤테로시클릴 및 헤테로아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00103
이다.
일부 구현예에서, 상기 및 본원에 기재된 R1 구현예에서의 황 원자는 상기 및 본원에 기재된 L 구현예에서의 황 원자, G, E, 또는 -C(O)- 모이어티와 연결된다. 일부 구현예에서, 상기 및 본원에 기재된 R1 구현예에서의 -C(O)- 모이어티 는 상기 및 본원에 기재된 L 구현예에서의 황 원자, G, E, 또는 -C(O)- 모이어티와 연결된다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 상기 및 본원에 기재된 L 구현예 및 R1 구현예의 임의의 조합이다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 -L3-G-R1 이고, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 -L4-G-R1 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 -L3-G-S-RL2 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 -L3-G-C(O)-RL2 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은
Figure pct00104
이고, 여기서 RL2 는 임의 치환된 C1-C9 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고, 각각의 G 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 -RL3-S-S-RL2 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, -L-R1 은 -RL3-C(O)-S-S-RL2 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00106
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00107
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00108
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00109
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00110
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00111
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00112
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00113
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00114
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00115
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00116
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00117
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00118
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00119
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00120
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00121
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00122
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00123
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00124
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00125
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, L 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00126
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -X-L-R1 은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00127
[식 중,
페닐 고리는 임의 치환되고,
R1 및 X 는 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, -L-R1 은
Figure pct00128
Figure pct00129
이다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기이다:
Figure pct00130
일부 구현예에서, -L-R1 은 CH3-,
Figure pct00131
이다.
일부 구현예에서, -L-R1 은
Figure pct00132
이다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 X 에 연결되는 말단 임의 치환된 -(CH2)2- 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, -L-R1 은 X 에 연결되는 말단 -(CH2)2- 모이어티를 포함한다. 상기와 같은 -L-R1 모이어티의 예는 하기에 도시된 바와 같다:
Figure pct00133
일부 구현예에서, -L-R1 은 X 에 연결되는 말단 임의 치환된 -(CH2)- 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, -L-R1 은 X 에 연결되는 말단 -(CH2)- 모이어티를 포함한다. 상기와 같은 -L-R1 모이어티의 예는 하기에 도시된 바와 같다:
Figure pct00134
일부 구현예에서, -L-R1 은 하기이다:
Figure pct00135
일부 구현예에서, -L-R1 은 CH3-,
Figure pct00136
이고;
X 는 -S- 이다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 CH3-,
Figure pct00137
이고;
X 는 -S- 이고, W 는 O 이고, Y 는 -O- 이고, Z 는 -O- 이다.
일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00138
, 또는 -S-(C1-C10 지방족) 이다.
일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00139
이다.
일부 구현예에서, X 는 -O- 또는 -S- 이고, R1 은
Figure pct00140
, 또는 -S-(C1-C10 지방족) 이다.
일부 구현예에서, X 는 -O- 또는 -S- 이고, R1 은
Figure pct00141
,
-S-(C1-C10 지방족) 또는 -S-(C1-C50 지방족) 이다.
일부 구현예에서, L 은 공유 결합이고, -L-R1 은 R1 이다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 수소가 아니다.
일부 구현예에서, -X-L-R1 은,
Figure pct00142
Figure pct00143
,
-S-(C1-C10 지방족) 또는 -S-(C1-C50 지방족) 인, R1 이다.
일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00144
의 구조를 갖고, 여기서
Figure pct00145
모이어티는 임의 치환된다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00146
이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00147
이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00148
이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00149
의 구조를 갖고, 여기서 X' 는 O 또는 S 이고, Y' 는 -O-, -S- 또는 -NR'- 이고,
Figure pct00150
모이어티는 임의 치환된다. 일부 구현예에서, Y' 는 -O-, -S- 또는 -NH- 이다. 일부 구현예에서,
Figure pct00151
는
Figure pct00152
이다. 일부 구현예에서,
Figure pct00153
는
Figure pct00154
이다. 일부 구현예에서,
Figure pct00155
는
Figure pct00156
이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00157
의 구조를 갖고, 여기서 X' 는 O 또는 S 이고,
Figure pct00158
모이어티는 임의 치환된다. 일부 구현예에서,
Figure pct00159
는
Figure pct00160
이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00161
이고, 여기서
Figure pct00162
는 임의 치환된다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00163
이고, 여기서
Figure pct00164
는 치환된다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00165
이고, 여기서
Figure pct00166
는 미치환된다.
일부 구현예에서, -X-L-R1 은 R1-C(O)-S-Lx-S- 이고, 여기서 Lx 는
Figure pct00167
및
Figure pct00168
로부터 선택되는 임의 치환된 기이다. 일부 구현예에서, Lx 는
Figure pct00169
및
Figure pct00170
이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은 (CH3)3C-S-S-Lx-S- 이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은 R1-C(=X')-Y'-C(R)2-S-Lx-S- 이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은 R-C(=X')-Y'-CH2-S-Lx-S- 이다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은
Figure pct00171
이다.
당업자에 의해 이해될 수 있는 바와 같이, 본원에 기재된 다수의 -X-L-R1 기는 절단 가능하고, 대상에의 투여 후 -X- 로 전환될 수 있다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은 절단 가능하다. 일부 구현예에서, -X-L-R1 은 -S-L-R1 이고, 대상에의 투여 후 -S- 로 전환된다. 일부 구현예에서, 전환은 대상의 효소에 의해 촉진된다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 투여 후 -S-L-R1 기가 -S- 로 전환되는지 여부를 측정하는 방법은, 약물 대사 및 약동학의 연구에 사용되는 것을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있고 실행되고 있다.
일부 구현예에서, 화학식 I 의 구조를 갖는 뉴클레오티드간 연결은 하기이다:
Figure pct00172
.
일부 구현예에서, 화학식 I 의 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- a 의 구조를 갖는다:
Figure pct00173
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, 화학식 I 의 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- b 의 구조를 갖는다:
Figure pct00174
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, 화학식 I 의 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I- c 의 구조를 갖는 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결이다:
Figure pct00175
[식 중,
P* 는 비대칭 인 원자이고, Rp 또는 Sp 이며;
L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고;
R1 은 할로겐, R 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)-, 또는 -C(O)O- 로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나; 또는
동일한 질소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하거나, 또는
동일한 탄소 상의 2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌, 또는 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고;
각각의
Figure pct00176
는 독립적으로 뉴클레오시드에의 연결을 나타내고;
L 이 공유 결합인 경우, R1 은 -H 가 아님].
일부 구현예에서, 화학식 I 의 구조를 갖는 뉴클레오티드간 연결은 하기이다:
Figure pct00177
Figure pct00178
일부 구현예에서, 화학식 I- c 의 구조를 갖는 뉴클레오티드간 연결은 하기이다:
Figure pct00179
일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결, 및 화학식 I-a, I-b, 또는 I- c 를 갖는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 I- a 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 I- b 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 I- c 의 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 포스포로티오에이트이다. 화학식 I 의 구조를 갖는 뉴클레오티드간 연결의 예는, 비제한적으로, US 20110294124, US 20120316224, US 20140194610, US 20150211006, US 20150197540, WO 2015107425, PCT/US2016/043542, 및 PCT/US2016/043598 (이들은 각각 본원에 참조로서 인용됨) 에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있다.
뉴클레오티드간 연결의 비제한적인 예에는, 또한 비제한적으로, 하기 중 임의의 것에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 기재된 것들이 포함된다: [Gryaznov, S.; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143], [Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983], [Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630], [Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531], [Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256], [Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226], [Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81], [Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966], [Ts'o et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220], 및 [Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006].
제공된 기술의 올리고뉴클레오티드는 다양한 길이를 가질 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50 개 또는 그 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50 개 또는 그 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 40, 50 개 또는 그 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 16 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 26 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 27 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 28 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 29 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 40 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 50 개 이상의 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 15mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티는 16mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 17mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 18mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 19mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 20mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 21mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 22mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 23mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 24mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 26mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 27mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 28mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 29mer 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30mer 이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 화학식 I- c 의 구조를 갖는 적어도 하나의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 화학식 I- c 의 구조를 갖는 적어도 2 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 화학식 I- c 의 구조를 갖는 적어도 3 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 화학식 I- c 의 구조를 갖는 적어도 4 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 뉴클레오티드간 연결 및 화학식 I- c 의 구조를 갖는 적어도 5 개의 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 하나 이상의 U 가 T 로 대체된, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 와 50% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 와 60% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 와 70% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 와 80% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 와 90% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 와 95% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 본원에 기재된 백본 연결의 패턴, 백본 키랄 중심의 패턴, 및/또는 백본 인 개질의 패턴를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 하나 이상의 T 가 U 로 치환된, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 GGCACAAGGGCACAGACTTC 와 50% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 GGCACAAGGGCACAGACTTC 와 60% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 GGCACAAGGGCACAGACTTC 와 70% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 GGCACAAGGGCACAGACTTC 와 80% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 GGCACAAGGGCACAGACTTC 와 90% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 상기 서열이 GGCACAAGGGCACAGACTTC 와 95% 초과의 동일성을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 키랄 연결 인을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I- c 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I- c 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00180
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00181
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00182
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 에서 발견되는 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00183
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 키랄 연결 인을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I- c 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I- c 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00184
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00185
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00186
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00187
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 키랄 연결 인을 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I- c 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I-c 의 구조를 갖는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00188
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00189
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00190
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 뉴클레오티드간 연결이
Figure pct00191
인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 연결 인이 Rp 인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 특정 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드가 RNA 서열을 포함하고, 각각의 T 가 독립적으로 및 임의로 U 로 대체된다는 것이, 당업자에 의해 이해된다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 연결 인이 Rp 인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 연결 인이 Sp 인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 연결 인이 Sp 인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 블록머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 입체블록머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 P-개질 블록머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 연결 블록머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 알트머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 스테레오알트머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 P-개질 알트머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 연결 알트머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 유니머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 스테레오유니머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 P-개질 유니머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 연결 유니머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 갭머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드가 스킵머인, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 시토신이 임의로 및 독립적으로 5-메틸시토신으로 대체된, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 적어도 하나의 시토신이 임의로 및 독립적으로 5-메틸시토신으로 대체된, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 GGCACAAGGGCACAGACTTC 의 서열을 갖는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 각각의 시토신이 임의로 및 독립적으로 5-메틸시토신으로 대체된, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는, 하나 이상의 뉴클레오티드가 "자동방출" 하기 쉬운 인 개질을 포함하도록 디자인된다. 즉, 특정 조건 하에서, 특정 인 개질은, 이것이 올리고뉴클레오티드로부터 자가-절단되어, 예를 들어 포스페이트 디에스테르, 예컨대 자연 발생 DNA 및 RNA 에서 발견되는 바와 같은 것들을 제공하도록 디자인된다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 인 개질은 -O-L-R1 의 구조를 갖고, 여기서 L 및 R1 은 각각 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 자동방출 기는 모르폴리노기를 포함한다. 일부 구현예에서, 자동방출 기는 작용제를 뉴클레오티드간 인 링커로 전달하는 능력을 특징으로 하며, 상기 작용제는, 예를 들어 탈황화와 같은 인 원자의 추가의 개질을 용이하게 한다. 일부 구현예에서, 작용제는 물이고, 추가의 개질은 자연 발생 DNA 및 RNA 에서 발견되는 포스페이트 디에스테르를 형성하기 위한 가수분해이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는, 수득되는 약학적 특성이 인에서의 하나 이상의 특정 개질을 통해 개선되도록 디자인된다. 특정 올리고뉴클레오티드가 뉴클라아제에 의해 신속하게 분해되고, 세포질 세포막을 통해 불량한 세포 흡수를 나타낸다는 것은, 당업계에 널리 기재되어 있다 ([Poijarvi-Virta et al., Curr. Med. Chem. (2006), 13(28);3441-65]; [Wagner et al., Med. Res. Rev. (2000), 20(6):417-51]; [Peyrottes et al., Mini Rev. Med. Chem. (2004), 4(4):395-408]; [Gosselin et al., (1996), 43(1):196-208]; [Bologna et al., (2002), Antisense & Nucleic Acid Drug Development 12:33-41]). 예를 들어, [Vives et al., Nucleic Acids Research (1999), 27(20):4071-76] 에서는, tert-부틸 SATE 프로-올리고뉴클레오티드가 모 (parent) 올리고뉴클레오티드와 비교하여 현저하게 증가된 세포 침투를 나타낸다는 것을 발견하였다.
일부 구현예에서, 연결 인에서의 개질은, 비제한적으로, 하기 표 1 에 열거된 것들을 포함하는, 하나 이상의 에스테라아제, 뉴클라아제, 및/또는 시토크롬 P450 효소에 의해, 포스페이트 디에스테르, 예컨대 자연 발생 DNA 및 RNA 에 존재하는 것들로 변형될 수 있는 이의 능력을 특징으로 한다.
Figure pct00192
일부 구현예에서, 인에서의 개질은 이것이 프로드러그로서 작용하는 것을 특징으로 하는 P-개질 모이어티를 유도하며, 예를 들어 P-개질 모이어티는 제거 전 목적하는 위치로의 올리고뉴클레오티드의 전달을 용이하게 한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 연결 인에서의 PEG화 (PEGylation) 로부터 유도된다. 관련 분야의 당업자는, 다양한 PEG 사슬 길이가 유용하고, 사슬 길이의 선택이 PEG화에 의해 달성되도록 추구되는 결과에 의해 일부 결정될 것이라는 것을 인식할 것이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, PEG화는 RES 흡수를 감소시키고, 올리고뉴클레오티드의 생체내 순환 수명을 연장시키기 위하여 이루어진다.
일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 PEG화 시약은 약 300 g/mol 내지 약 100,000 g/mol 의 분자량을 갖는다. 일부 구현예에서, PEG화 시약은 약 300 g/mol 내지 약 10,000 g/mol 의 분자량을 갖는다. 일부 구현예에서, PEG화 시약은 약 300 g/mol 내지 약 5,000 g/mol 의 분자량을 갖는다. 일부 구현예에서, PEG화 시약은 약 500 g/mol 의 분자량을 갖는다. 일부 구현예에서, PEG화 시약은 약 1000 g/mol 의 분자량을 갖는다. 일부 구현예에서, PEG화 시약은 약 3000 g/mol 의 분자량을 갖는다. 일부 구현예에서, PEG화 시약은 약 5000 g/mol 의 분자량을 갖는다.
특정 구현예에서, PEG화 시약은 PEG500 이다. 특정 구현예에서, PEG화 시약은 PEG1000 이다. 특정 구현예에서, PEG화 시약은 PEG3000 이다. 특정 구현예에서, PEG화 시약은 PEG5000 이다.
일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 PK 인핸서, 예를 들어, 지질, PEG화 지질 등으로서 작용하는 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 세포 진입 및/또는 엔도좀 탈출을 촉진시키는 작용제, 예컨대 막-파과성 지질 또는 펩티드로서 작용하는 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 표적 작용제로서 작용하는 것을 특징으로 한다. 일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 표적 작용제이거나 이를 포함한다. 본원에서 사용된 바, 구절 "표적 작용제" 는 관심 페이로드 (payload) (예를 들어, 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 조성물) 와 관련이 있고, 또한 관심 페이로드가 표적 작용제와 관련되는 경우에, 관심 페이로드가 표적 작용제와 관련이 없는 다른 비교 가능한 조건 하에서 관찰된 것보다 실질적으로 큰 범위로 관심 표적 부위에 표적화되도록, 관심 표적 부위와 상호작용하는 엔티티이다. 표적 작용제는, 예를 들어 소 분자 모이어티, 핵산, 폴리펩티드, 탄수화물 등을 포함하는 각종 화학적 모이어티 중 임의의 것이거나, 이를 포함할 수 있다. 표적 작용제는 [Adarsh et al., "Organelle Specific Targeted Drug Delivery - A Review", International Journal of Research in Pharmaceutical and Biomedical Sciences, 2011, p. 895] 에 의해 추가로 기재되어 있다.
상기와 같은 표적 작용제의 예로는, 비제한적으로, 단백질 (예를 들어, 트랜스페린 (Transferrin)), 올리고펩티드 (예를 들어, 시클릭 및 비(非)시클릭 RGD-함유 올리고펩티드), 항체 (단클론성 및 다클론성 항체, 예를 들어, IgG, IgA, IgM, IgD, IgE 항체), 당 / 탄수화물 (예를 들어, 단당류 및/또는 올리고당류 (만노오스, 만노오스-6-포스페이트, 갈락토오스 등)), 비타민 (예를 들어, 엽산), 또는 기타 작은 생체분자가 포함된다. 일부 구현예에서, 표적 모이어티는 스테로이드 분자 (예를 들어, 콜산, 데옥시콜산, 데히드로콜산을 포함하는 담즙산; 코르티손; 다이곡시제닌; 테스토스테론; 콜레스테롤; 양이온성 스테로이드, 예컨대 코르티손 고리의 3-위치에서 이중 결합을 통해 부착된 트리메틸아미노메틸 히드라지드기를 갖는 코르티손) 이다. 일부 구현예에서, 표적 모이어티는 친지성 분자 (예를 들어, 지환식 탄화수소, 포화 및 불포화 지방산, 왁스, 테르펜 및 폴리지환식 탄화수소, 예컨대 아다만틴 및 버크민스터풀러렌 (buckminsterfullerene)) 이다. 일부 구현예에서, 친지성 분자는 테르페노이드, 예컨대 비타민 A, 레티노산, 레티날 또는 데히드로레티날이다. 일부 구현예에서, 표적 모이어티는 펩티드이다.
일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 화학식 -X-L-R1 의 표적 작용제이고, 여기서 X, L, 및 R1 은 각각 상기 화학식 I 에 정의된 바와 같다.
일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 세포 특이적 전달을 용이하게 하는 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 상기 기재된 카테고리 중 하나 이상에 속하는 것을 특징으로 한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 PK 인핸서 및 표적 리간드로서 작용한다. 일부 구현예에서, P-개질 모이어티는 프로드러그 및 엔도좀 탈출 작용제로서 작용한다. 관련 분야의 당업자는 본 개시에 의해 다수의 다른 상기와 같은 조합이 가능하며 고려된다는 것을 인식할 것이다.
일부 구현예에서, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴기, 또는 이의 2가 또는 다가 기는, C3-C30 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴기, 또는 이의 2가 및/또는 다가 기이다.
핵염기
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드에 존재하는 핵염기는 천연 핵염기 또는 천연 핵염기로부터 유도된 개질된 핵염기이다. 이의 예에는, 비제한적으로, 아실 보호기에 의해 보호된 이의 각각의 아미노기를 갖는 우라실, 티민, 아데닌, 시토신 및 구아닌, 2-플루오로우라실, 2-플루오로시토신, 5-브로모우라실, 5-요오도우라실, 2,6-디아미노퓨린, 아자시토신, 피리미딘 유사체, 예컨대 유사이소시토신 및 유사우라실 및 기타 개질된 핵염기, 예컨대 8-치환 퓨린, 잔틴 또는 하이포잔틴 (마지막 두 개는 자연 분해 생성물임) 이 포함된다. 개질된 핵염기의 예는, [Chiu and Rana, RNA, 2003, 9, 1034-1048, Limbach et al. Nucleic Acids Research, 1994, 22, 2183-2196], 및 [Revankar and Rao, Comprehensive Natural Products Chemistry, vol. 7, 313] 에 개시되어 있다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 치환된 우라실, 티민, 아데닌, 시토신, 또는 구아닌이다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는, 예를 들어 수소 결합 및/또는 염기쌍 형성의 측면에서, 우라실, 티민, 아데닌, 시토신, 또는 구아닌의 기능적 대체물이다. 일부 구현예에서, 핵염기는 임의 치환된 우라실, 티민, 아데닌, 시토신, 5-메틸시토신, 또는 구아닌이다. 일부 구현예에서, 핵염기는 우라실, 티민, 아데닌, 시토신, 5-메틸시토신, 또는 구아닌이다.
일부 구현예에서, 개질된 염기는 임의 치환된 아데닌, 시토신, 구아닌, 티민, 또는 우라실이다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 독립적으로 하기와 같은, 하나 이상의 개질에 의해 개질된, 아데닌, 시토신, 구아닌, 티민 또는 우라실이다:
(1) 핵염기는 아실, 할로겐, 아미노, 아지드, 알킬, 알케닐, 알키닐, 아릴, 헤테로알킬, 헤테로알케닐, 헤테로알키닐, 헤테로시클릴, 헤테로아릴, 카르복실, 히드록실, 비오틴, 아비딘, 스트렙타비딘, 치환된 실릴, 및 이들의 조합으로부터 독립적으로 선택되는, 하나 이상의 임의 치환된 기로 개질됨;
(2) 핵염기의 하나 이상의 원자는 독립적으로 탄소, 질소 또는 황으로부터 선택되는 상이한 원자로 대체됨;
(3) 핵염기 내 하나 이상의 이중 결합은 독립적으로 수소첨가됨; 또는
(4) 하나 이상의 아릴 또는 헤테로아릴 고리는 독립적으로 핵염기에 삽입됨.
하기 일반식으로 표시되는 화합물이 또한 개질된 핵염기로서 고려된다:
Figure pct00193
[식 중, R8 은 탄소수 1 내지 15 의 지방족, 아릴, 아르알킬, 아릴옥실알킬, 카르보시클릴, 헤테로시클릴 또는 헤테로아릴기로부터 선택되는 임의 치환된 선형 또는 분지형 기이고, 단지 예로서, 메틸, 이소프로필, 페닐, 벤질, 또는 페녹시메틸기가 포함되고; R9 및 R10 은 각각 독립적으로 선형 또는 분지형 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로시클릴 및 헤테로아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기임].
개질된 핵염기는 또한 하나 이상의 아릴 고리, 예컨대 페닐 고리가 첨가된, 확장된-크기의 핵염기를 포함한다. Glen Research 카탈로그 (www.glenresearch.com)]; [Krueger AT et al, Acc . Chem . Res., 2007, 40, 141-150]; [Kool, ET, Acc . Chem . Res., 2002, 35, 936-943]; [Benner S.A., et al., Nat. Rev. Genet., 2005, 6, 553-543]; [Romesberg, F.E., et al., Curr . Opin . Chem. Biol ., 2003, 7, 723-733]; [Hirao, I., Curr . Opin . Chem . Biol ., 2006, 10, 622-627] 에 기재된 핵염기 대체물은 본원에 기재된 핵산의 합성에 유용한 것으로서 고려된다. 이러한 확장된-크기의 핵염기의 일부 예가, 하기에 제시되어 있다:
Figure pct00194
.
본원에서, 개질된 핵염기는 또한 고려되는 핵염기는 아니지만, 비제한적으로, 코린- 또는 포르피린-유래 고리와 같은 기타 모이어티인 구조를 포함한다. 포르피린-유래 염기 대체물은 [Morales-Rojas, H and Kool, ET, Org . Lett ., 2002, 4, 4377-4380] 에 기재되어 있다. 하기에 제시된 것은 염기 대체물로서 사용될 수 있는 포르피린-유래 고리의 예이다:
Figure pct00195
.
일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 임의 치환된, 하기의 구조 중 어느 하나를 갖는다:
Figure pct00196
일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 형광이다. 상기와 같은 형광 개질된 핵염기의 예에는, 하기 제시된 바와 같은, 페난트렌, 피렌, 스틸벤, 이속산틴, 이소잔토프테린, 테르페닐, 테르티오펜, 벤조테르티오펜, 쿠마린, 루마진, 테더드 스틸벤 (tethered stillbene), 벤조-우라실 및 나프토-우라실이 포함된다:
Figure pct00197
.
일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 미치환된다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 치환된다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는, 이것이 예를 들어 헤테로원자, 알킬기, 또는 형광 모이어티, 비오틴 또는 아비딘 모이어티에 연결되는 연결 모이어티, 또는 기타 단백질 또는 펩티드를 함유하도록 치환된다. 일부 구현예에서, 개질된 핵염기는 가장 전형적인 의미에서 핵염기가 아니지만, 핵염기와 유사하게 기능하는 "범용 염기 (universal base)" 이다. 상기와 같은 범용 염기의 대표적 예는 3-니트로피롤이다.
일부 구현예에서, 기타 뉴클레오시드가 또한 본원에 개시된 방법에서 사용될 수 있고, 개질된 핵염기 또는 개질된 당에 공유 결합된 핵염기를 혼입하는 뉴클레오시드를 포함한다. 개질된 핵염기를 혼입하는 뉴클레오시드의 일부 예에는 하기가 포함된다: 4-아세틸시티딘; 5-(카르복시히드록실메틸)우리딘; 2'-O-메틸시티딘; 5-카르복시메틸아미노메틸-2-티오우리딘; 5-카르복시메틸아미노메틸우리딘; 디히드로우리딘; 2'-O-메틸유사우리딘; 베타,D-갈락토실퀘오신; 2'-O-메틸구아노신; N 6-이소펜테닐아데노신; 1-메틸아데노신; 1-메틸유사우리딘; 1-메틸구아노신; 1-메틸이노신; 2,2-디메틸구아노신; 2-메틸아데노신; 2-메틸구아노신; N 7-메틸구아노신; 3-메틸-시티딘; 5-메틸시티딘; 5-히드록시메틸시티딘; 5-포르밀시토신; 5-카르복실시토신; N 6-메틸아데노신; 7-메틸구아노신; 5-메틸아미노에틸우리딘; 5-메톡시아미노메틸-2-티오우리딘; 베타,D-만노실퀘오신; 5-메톡시카르보닐메틸우리딘; 5-메톡시우리딘; 2-메틸티오-N 6-이소펜테닐아데노신; N-((9-베타,D-리보푸라노실-2-메틸티오퓨린-6-일)카르바모일)트레오닌; N-((9-베타,D-리보푸라노실퓨린-6-일)-N-메틸카르바모일)트레오닌; 우리딘-5-옥시아세트산 메틸에스테르; 우리딘-5-옥시아세트산 (v); 유사우리딘; 퀘오신; 2-티오시티딘; 5-메틸-2-티오우리딘; 2-티오우리딘; 4-티오우리딘; 5-메틸우리딘; 2'-O-메틸-5-메틸우리딘; 및 2'-O-메틸우리딘.
일부 구현예에서, 뉴클레오시드는 6'-위치에서 (R) 또는 (S)-키랄성을 갖는 6'-개질된 바이시클릭 뉴클레오시드 유사체를 포함하고, 미국 특허 제 7,399,845 호에 기재된 유사체를 포함한다. 다른 구현예에서, 뉴클레오시드는 5'-위치에서 (R) 또는 (S)-키랄성을 갖는 5'-개질된 바이시클릭 뉴클레오시드 유사체를 포함하고, 미국 특허 공보 제 20070287831 호에 기재된 유사체를 포함한다.
일부 구현예에서, 핵염기 또는 개질된 핵염기는 하나 이상의 생체분자 결합 모이어티, 예를 들어 항체, 항체 단편, 비오틴, 아비딘, 스트렙타비딘, 수용체 리간드 또는 킬레이트 모이어티를 포함한다. 다른 구현예에서, 핵염기 또는 개질된 핵염기는 5-브로모우라실, 5-요오도우라실 또는 2,6-디아미노퓨린이다. 일부 구현예에서, 핵염기 또는 개질된 핵염기는 형광 또는 생체분자 결합 모이어티로의 치환에 의해 개질된다. 일부 구현예에서, 핵염기 또는 개질된 핵염기 상의 치환기는 형광 모이어티이다. 일부 구현예에서, 핵염기 또는 개질된 핵염기 상의 치환기는 비오틴 또는 아비딘이다.
특정한 상기 언급된 개질된 핵염기 및 기타 개질된 핵염기의 제조를 교시하는 대표적인 미국 특허에는, 비제한적으로, 상기 나타낸 미국 특허 제 3,687,808 호 및 미국 특허 제 4,845,205; 5,130,30; 5,134,066; 5,175,273; 5,367,066; 5,432,272; 5,457,187; 5,457,191; 5,459,255; 5,484,908; 5,502,177; 5,525,711; 5,552,540; 5,587,469; 5,594,121; 5,596,091; 5,614,617; 5,681,941; 5,750,692; 6,015,886; 6,147,200; 6,166,197; 6,222,025; 6,235,887; 6,380,368; 6,528,640; 6,639,062; 6,617,438; 7,045,610; 7,427,672; 및 7,495,088 호가 포함되며, 이들은 각각의 개질된 핵염기, 당, 및 뉴클레오티드간 연결은 본원에 참조로서 인용된다.
일부 구현예에서, 염기는 임의 치환된 A, T, C, G 또는 U 이고, 여기서 하나 이상의 -NH2 는 독립적으로 및 임의로 -C(-L-R1)3 로 대체되고, 하나 이상의 -NH- 는 독립적으로 및 임의로 -C(-L-R1)2- 로 대체되고, 하나 이상의 =N- 는 독립적으로 및 임의로 -C(-L-R1)- 로 대체되고, 하나 이상의 =CH- 는 독립적으로 및 임의로 =N- 로 대체되고, 하나 이상의 =O 는 독립적으로 및 임의로 =S, =N(-L-R1), 또는 =C(-L-R1)2 로 대체되고, 여기서 2 개 이상의 -L-R1 은 임의로 그 개입 원자와 함께 취해져 0-10 개의 헤테로원자 고리 원자를 갖는 3-30 원 바이시클릭 또는 폴리시클릭 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, 개질된 염기는 임의 치환된 A, T, C, G 또는 U 이고, 여기서 하나 이상의 -NH2 는 독립적으로 및 임의로 -C(-L-R1)3 로 대체되고, 하나 이상의 -NH- 는 독립적으로 및 임의로 -C(-L-R1)2- 로 대체되고, 하나 이상의 =N- 는 독립적으로 및 임의로 -C(-L-R1)- 로 대체되고, 하나 이상의 =CH- 는 독립적으로 및 임의로 =N- 로 대체되고, 하나 이상의 =O 는 독립적으로 및 임의로 =S, =N(-L-R1), 또는 =C(-L-R1)2 로 대체되고, 여기서 2 개 이상의 -L-R1 은 임의로 그 개입 원자와 함께 취해져 0-10 개의 헤테로원자 고리 원자를 갖는 3-30 원 바이시클릭 또는 폴리시클릭 고리를 형성하고, 여기서 개질된 염기는 천연의 A, T, C, G 및 U 와 상이하다. 일부 구현예에서, 염기는 임의 치환된 A, T, C, G 또는 U 이다. 일부 구현예에서, 개질된 염기는 치환된 A, T, C, G 또는 U 이고, 여기서 개질된 염기는 천연의 A, T, C, G 및 U 와 상이하다.
일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유사체는 하기 중 임의에 기재된 임의의 개질된 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유사체이다: [Gryaznov, S; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143]; [Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110]; [Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5]; [Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146]; [Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983]; [Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273]; [Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630]; [Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222]; [Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531]; [Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256]; [Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226]; [Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp. 1: 241-242]; [Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76]; [Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226]; [Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73]; [Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433]; [Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8]; [Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404]; [Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197]; [Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81]; [Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396]; [Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966]; [Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13]; [Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318]; [Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581]; [Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299]; [Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47]; [Seth, Punit P; Siwkowski, Andrew; Allerson, Charles R; Vasquez, Guillermo; Lee, Sam; Prakash, Thazha P; Kinberger, Garth; Migawa, Michael T; Gaus, Hans; Bhat, Balkrishen; et al. From Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554]; [Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248]; [Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39]; [Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079]; [Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131]; [Ts'o et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220]; [Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338]; [Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006]; WO 20070900071; WO 20070900071; 또는 WO 2016/079181.
핵염기의 예는 또한 US 20110294124, US 20120316224, US 20140194610, US 20150211006, US 20150197540, WO 2015107425, PCT/US2016/043542, 및 PCT/US2016/043598 에 기재되어 있고, 상기 문헌은 각각 본원에 참조로서 인용된다.
당
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 천연 당 모이어티 이외에 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다.
가장 통상적인 자연 발생 뉴클레오티드는 핵염기 아데노신 (A), 시토신 (C), 구아닌 (G), 및 티민 (T) 또는 우라실 (U) 에 연결된 리보오스 당으로 구성된다. 또한 뉴클레오티드 내 포스페이트기 또는 연결 인이 당 또는 개질된 당의 다양한 위치에서 연결될 수 있는 개질된 뉴클레오티드가 고려된다. 비제한적인 예로서, 포스페이트기 또는 연결 인은 당 또는 개질된 당의 2', 3', 4' 또는 5' 히드록실 모이어티에 연결될 수 있다. 본원에 기재된 바와 같은 개질된 핵염기를 혼입하는 뉴클레오티드가 또한 이러한 맥락에서 고려된다. 일부 구현예에서, 비(非)보호된 -OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오티드 또는 개질된 뉴클레오티드가 본 개시의 방법에 따라 사용된다.
기타 개질된 당은 또한 제공된 올리고뉴클레오티드 내에 혼입될 수 있다. 일부 구현예에서, 개질된 당은 하기 중 하나를 포함하는 2' 위치에서의 치환기를 하나 이상을 함유한다: -F; -CF3, -CN, -N3, -NO, -NO2, -OR', -SR', 또는 -N(R)2 (여기서, 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음); -O-(C1-C10 알킬), -S-(C1-C10 알킬), -NH-(C1-C10 알킬), 또는 -N(C1-C10 알킬)2; -O-(C2-C10 알케닐), -S-(C2-C10 알케닐), -NH-(C2-C10 알케닐), 또는 -N(C2-C10 알케닐)2; -O-(C2-C10 알키닐), -S-(C2-C10 알키닐), -NH-(C2-C10 알키닐), 또는 -N(C2-C10 알키닐)2; 또는 -O-(C1-C10 알킬렌)-O-(C1-C10 알킬), -O-(C1-C10 알킬렌)-NH-(C1-C10 알킬) 또는 -O-(C1-C10 알킬렌)-NH(C1-C10 알킬)2, -NH-(C1-C10 알킬렌)-O-(C1-C10 알킬), 또는 -N(C1-C10 알킬)-(C1-C10 알킬렌)-O-(C1-C10 알킬) (여기서, 알킬, 알킬렌, 알케닐 및 알키닐은 치환 또는 미치환될 수 있음). 치환기의 예에는, 비제한적으로, -O(CH2)nOCH3, 및 -O(CH2)nNH2 (여기서, n 은 1 내지 약 10 임), MOE, DMAOE, DMAEOE 가 포함된다. 또한, WO 2001/088198; 및 [Martin et al., Helv . Chim . Acta, 1995, 78, 486-504] 에 기재된 개질된 당이 본원에서 고려된다. 일부 구현예에서, 개질된 당은 치환된 실릴기, RNA 절단기, 리포터기, 형광 라벨, 삽입제 (intercalator), 핵산의 약동학적 특성을 개선시키는 기, 핵산의 약력학적 특성을 개선시키는 기, 또는 유사한 특성을 갖는 기타 치환기로부터 선택되는 하나 이상의 기를 포함한다. 일부 구현예에서, 개질은 당 또는 개질된 당의 2', 3', 4', 5', 또는 6' 위치 중 하나 이상에서, 예컨대 3'-말단 뉴클레오티드 상의 당의 3' 위치 또는 5'-말단 뉴클레오티드의 5' 위치에서 이루어진다. 일부 구현예에서, RNA 는, 2' 위치에서, 2'-OH, 또는 2'-OMe 를 포함하는 2'-OR1 (여기서 OR1 은 임의 치환된 알킬임) 를 갖는 당을 포함한다.
일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-F 이다.
일부 구현예에서, 리보오스의 2'-OH 는 하기 중 하나를 포함하는 치환기로 대체된다: -H, -F; -CF3, -CN, -N3, -NO, -NO2, -OR', -SR', 또는 -N(R)2 (여기서, 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음); -O-(C1-C10 알킬), -S-(C1-C10 알킬), -NH-(C1-C10 알킬), 또는 -N(C1-C10 알킬)2; -O-(C2-C10 알케닐), -S-(C2-C10 알케닐), -NH-(C2-C10 알케닐), 또는 -N(C2-C10 알케닐)2; -O-(C2-C10 알키닐), -S-(C2-C10 알키닐), -NH-(C2-C10 알키닐), 또는 -N(C2-C10 알키닐)2; 또는 -O-(C1-C10 알킬렌)-O-(C1-C10 알킬), -O-(C1-C10 알킬렌)-NH-(C1-C10 알킬) 또는 -O-(C1-C10 알킬렌)-NH(C1-C10 알킬)2, -NH-(C1-C10 알킬렌)-O-(C1-C10 알킬), 또는 -N(C1-C10 알킬)-(C1-C10 알킬렌)-O-(C1-C10 알킬) (여기서, 알킬, 알킬렌, 알케닐 및 알키닐은 치환 또는 미치환될 수 있음). 일부 구현예에서, 2'-OH 는 -H 로 대체된다 (데옥시리보오스). 일부 구현예에서, 2'-OH 는 -F 로 대체된다. 일부 구현예에서, 2'-OH 는 -OR' 로 대체된다. 일부 구현예에서, 2'-OH 는 -OMe 로 대체된다. 일부 구현예에서, 2'-OH 는 -OCH2CH2OMe 로 대체된다.
개질된 당은 또한 잠금 핵산 (locked nucleic acid (LNA)) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 당 탄소 원자 상의 2 개의 치환기는 함께 취해져 2가 모이어티를 형성한다. 일부 구현예에서, 2 개의 치환기는 2 개의 상이한 당 탄소 원자 상에 존재한다. 일부 구현예에서, 형성된 2가 모이어티는 본원에 정의된 바와 같은 -L- 의 구조를 가진다. 일부 구현예에서, -L- 은 -O-CH2- 이고, 여기서 -CH2- 는 임의 치환된다. 일부 구현예에서, -L- 는 -O-CH2- 이다. 일부 구현예에서, -L- 은 -O-CH(Et)- 이다. 일부 구현예에서, -L- 은 당 모이어티의 C2 와 C4 사이에 있다. 일부 구현예에서, 잠금 핵산은 하기 제시된 구조를 갖는다. 하기의 구조의 잠금 핵산이 제시되며, 여기서 Ba 는 본원에 기재된 바와 같은 핵염기 또는 개질된 핵염기를 나타내고, R2s 는 -OCH2C4'- 이다.
Figure pct00198
일부 구현예에서, 개질된 당은, 예를 들어 [Seth et al., J Am Chem Soc. 2010 October 27; 132(42): 14942-14950] 에 기재된 바와 같은 ENA 이다. 일부 구현예에서, 개질된 당은 XNA (제노핵산) 에서 발견되는 것 중 임의의 것이며, 예를 들어 아라비노오스, 무수헥시톨, 트레오스, 2'플루오로아라비노오스 또는 시클로헥센이다.
개질된 당은 펜토푸라노실 당 대신에 시클로부틸 또는 시클로펜틸 모이어티와 같은 당 모방체를 포함한다. 상기 개질된 당 구조의 제조를 교시하는 대표적 미국 특허에는, 비제한적으로, 미국 특허 제 4,981,957; 5,118,800; 5,319,080; 및 5,359,044 호가 포함된다. 고려되는 일부 개질된 당에는, 리보오스 고리 내의 산소 원자가 질소, 황, 셀레늄 또는 탄소로 대체된 당이 포함된다. 일부 구현예에서, 개질된 당은 리보오스 고리 내의 산소 원자가 질소로 대체되고, 질소가 알킬기 (예를 들어 메틸, 에틸, 이소프로필 등) 으로 임의 치환된, 개질된 리보오스이다.
개질된 당의 비제한적인 예에는, 글리세롤 핵산 (GNA) 유사체를 형성하는 글리세롤이 포함된다. GNA 유사체의 하나의 예는 하기 제시된 바와 같고, 이는 [Zhang, R et al., J. Am. Chem . Soc ., 2008, 130, 5846-5847]; [Zhang L, et al., J. Am. Chem . Soc ., 2005, 127, 4174-4175] 및 [Tsai CH et al., PNAS, 2007, 14598-14603 (X = O-)] 에 기재되어 있다:
Figure pct00199
.
GNA 유래 유사체, 포르밀 글리세롤의 혼합 아세탈 아미날 기반의 가요성 핵산 (FNA) 의 또 다른 예는, [Joyce GF et al., PNAS, 1987, 84, 4398-4402] 및 [Heuberger BD and Switzer C, J. Am. Chem . Soc ., 2008, 130, 412-413] 에 기재되어 있고, 하기에 제시된 바와 같다:
Figure pct00200
.
개질된 당의 추가적인 비제한적인 예에는, 헥소피라논실 (6' → 4'), 펜토피라노실 (4' → 2'), 펜토피라노실 (4' → 3'), 또는 테트로푸라노실 (3' → 2') 당이 포함된다. 일부 구현예에서, 헥소피라노실 (6' → 4') 당은 하기 화학식 중서 어느 하나를 갖는다:
Figure pct00201
[식 중, XS 는 본원에 기재된 P-개질 기 "-XLR1" 에 해당하고, Ba 는 본원에 정의된 바와 같음].
일부 구현예에서, 펜토피라노실 (4' → 2') 당은 하기 화학식 중 어느 하나를 갖는다:
Figure pct00202
[식 중, XS 는 본원에 기재된 P-개질 기 "-XLR1" 에 해당하고, Ba 는 본원에 정의된 바와 같음].
일부 구현예에서, 펜토피라노실 (4' → 3') 당은 하기 화학식 중 어느 하나를 갖는다:
Figure pct00203
[식 중, XS 는 본원에 기재된 P-개질 기 "-XLR1" 에 해당하고 Ba 는 본원에 정의된 바와 같음].
일부 구현예에서, 테트로푸라노실 (3' → 2') 당은 하기 화학식 중 어느 하나를 갖는다:
Figure pct00204
[식 중, XS 는 본원에 기재된 P-개질 기 "-XLR1" 에 해당하고, Ba 는 본원에 정의된 바와 같음].
일부 구현예에서, 개질된 당은 하기 화학식 중 어느 하나를 갖는다:
Figure pct00205
[식 중, XS 는 본원에 기재된 P-개질 기 "-XLR1" 에 해당하고, Ba 는 본원에 정의된 바와 같음].
일부 구현예에서, 당 모이어티 내 하나 이상의 히드록실기는 임의로 및 독립적으로 할로겐, R', -N(R')2, -OR', 또는 -SR' 로 대체되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, 당 모방체는 하기 예시된 바와 같고, 여기서 XS 는 본원에 기재된 P-개질 기 "-XLR1" 에 해당하고, Ba 는 본원에 정의된 바와 같고, X1 은 -S-, -Se-, -CH2-, -NMe-, -NEt- 또는 -NiPr- 로부터 선택된다.
Figure pct00206
.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 당의 적어도 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50% 또는 그 이상 (예를 들어, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 그 이상) (포괄적) 는 개질된다. 일부 구현예에서, 단지 퓨린 잔기만 개질된다 (예를 들어, 약 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50% 또는 그 이상 [예를 들어, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 그 이상] 의 퓨린 잔기가 개질됨). 일부 구현예에서, 단지 피리미딘 잔기만 개질된다 (예를 들어, 약 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50% 또는 그 이상 [예를 들어, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 그 이상] 의 피리미딘 잔기가 개질됨). 일부 구현예에서, 퓨린 및 피리미딘 잔기는 모두 개질된다.
개질된 당 및 당 모방체는, 비제한적으로 하기를 포함하는, 당업계에 공지된 방법에 의해 제조될 수 있다: [A. Eschenmoser, Science (1999), 284:2118]; [M. Bohringer et al, Helv. Chim. Acta (1992), 75:1416-1477]; [M. Egli et al, J. Am. Chem. Soc. (2006), 128(33):10847-56]; [A. Eschenmoser in Chemical Synthesis: Gnosis to Prognosis, C. Chatgilialoglu and V. Sniekus, Ed., (Kluwer Academic, Netherlands, 1996), p.293]; [K.-U. Schoning et al, Science (2000), 290:1347-1351]; [A. Eschenmoser et al, Helv. Chim. Acta (1992), 75:218]; [J. Hunziker et al, Helv. Chim. Acta (1993), 76:259]; [G. Otting et al, Helv. Chim. Acta (1993), 76:2701]; [K. Groebke et al, Helv. Chim. Acta (1998), 81:375]; 및 [A. Eschenmoser, Science (1999), 284:2118]. 2' 개질에 대한 개질은 [Verma, S. et al. Annu . Rev. Biochem . 1998, 67, 99-134] 및 그 안의 모든 참고문헌에서 확인할 수 있다. 리보오스에 대한 특정 개질은 하기 문헌에서 확인할 수 있다: 2'-플루오로 ([Kawasaki et. al., J. Med . Chem ., 1993, 36, 831-841]), 2'-MOE ([Martin, P. Helv . Chim . Acta 1996, 79, 1930-1938]), "LNA" ([Wengel, J. Acc . Chem . Res. 1999, 32, 301-310]). 일부 구현예에서, 개질된 당은 PCT 공보 제 WO2012/030683 호 (이는 본원에 참조로서 인용됨) 에 기재되고, 본원에 도시된 것 중 임의의 것이다. 일부 구현예에서, 개질된 당은 하기 중 임의의 것에 기재된 임의의 개질된 당이다: [Gryaznov, S; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3143]; [Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110]; [Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5]; [Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146]; [Jones et al. J. Org. Chem. 1993, 58, 2983]; [Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273]; [Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630]; [Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222]; [Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531]; [Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256]; [Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 226]; [Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp. 1: 241-242]; [Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76]; [Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226]; [Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73]; [Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433]; [Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett. 38 (50): 8735-8]; [Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404]; [Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197]; [Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81]; [Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396]; [Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966]; [Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13]; [Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318]; [Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581]; [Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299]; [Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47]; [Seth, Punit P; Siwkowski, Andrew; Allerson, Charles R; Vasquez, Guillermo; Lee, Sam; Prakash, Thazha P; Kinberger, Garth; Migawa, Michael T; Gaus, Hans; Bhat, Balkrishen; et al. From Nucleic Acids Symposium Series (2008), 52(1), 553-554]; [Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248]; [Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39]; [Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079]; [Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131]; [Ts'o et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988, 507, 220]; [Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338]; [Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4006]; WO 20070900071; WO 20070900071; 또는 WO 2016/079181.
일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 임의 치환된 펜토오스 또는 헥소오스 모이어티이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 임의 치환된 펜토오스 모이어티이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 임의 치환된 헥소오스 모이어티이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 임의 치환된 리보오스 또는 헥시톨 모이어티이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 임의 치환된 리보오스 모이어티이다. 일부 구현예에서, 개질된 당 모이어티는 임의 치환된 헥시톨 모이어티이다.
일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결 및/또는 당의 예는, 예를 들어 하기로부터 선택된다:
Figure pct00207
Figure pct00208
Figure pct00209
일부 구현예에서, R1 은 정의되고 기재된 바와 같은 R 이다. 일부 구현예에서, R2 는 R 이다. 일부 구현예에서, Re 는 R 이다. 일부 구현예에서, Re 는 H, CH3, Bn, COCF3, 벤조일, 벤질, 피렌-1-일카르보닐, 피렌-1-일메틸, 2-아미노에틸이다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결 및/또는 당의 예는 하기에 기재된 것들로부터 선택된다: [Ts'o et al. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1988 , 507, 220]; [Gryaznov, S.; Chen, J.-K. J. Am. Chem. Soc. 1994 , 116, 3143]; [Mesmaeker et al. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994 , 33, 226]; [Jones et al. J. Org. Chem. 1993 , 58, 2983]; [Vasseur et al. J. Am. Chem. Soc. 1992 , 114, 4006]; [Van Aerschot et al. 1995 Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 34: 1338]; [Hendrix et al. 1997 Chem. Eur. J. 3: 110]; [Koshkin et al. 1998 Tetrahedron 54: 3607-3630]; [Hyrup et al. 1996 Bioorg. Med. Chem. 4: 5]; [Nielsen et al. 1997 Chem. Soc. Rev. 73]; [Schultz et al. 1996 Nucleic Acids Res. 24: 2966]; [Obika et al. 1997 Tetrahedron Lett.　38　(50): 8735-8]; [Obika et al. 1998 Tetrahedron Lett. 39: 5401-5404]; [Singh et al. 1998 Chem. Comm. 1247-1248]; [Kumar et al. 1998 Bioo. Med. Chem. Let. 8: 2219-2222]; [Nielsen et al. 1997 J. Chem. Soc. Perkins Transl. 1: 3423-3433]; [Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 6078-6079]; [Seth et al. 2010 J. Org. Chem. 75: 1569-1581]; [Singh et al. 1998 J. Org. Chem. 63: 10035-39]; [Sorensen 2003 Chem. Comm. 2130-2131]; [Petersen et al. 2003 TRENDS Biotech. 21: 74-81]; [Rajwanshi et al. 1999 Chem. Commun. 1395-1396]; [Jepsen et al. 2004 Oligo. 14: 130-146]; [Morita et al. 2001 Nucl. Acids Res. Supp. 1: 241-242]; [Morita et al. 2002 Bioo. Med. Chem. Lett. 12: 73-76]; [Morita et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 2211-2226]; [Koizumi et al. 2003 Nuc. Acids Res. 12: 3267-3273]; [Lauritsen et al. 2002 Chem. Comm. 5: 530-531]; [Lauritsen et al. 2003 Bioo. Med. Chem. Lett. 13: 253-256]; WO 20070900071; [Seth et al., Nucleic Acids Symposium Series　(2008),　52(1),　553-554]; [Seth et al. 2009 J. Med. Chem. 52: 10-13]; [Seth et al. 2012 Mol. Ther-Nuc. Acids. 1, e47]; [Pallan et al. 2012 Chem. Comm. 48: 8195-8197]; [Seth et al. 2010 J. Med. Chem. 53: 8309-8318]; [Seth et al. 2012 Bioo. Med. Chem. Lett. 22: 296-299]; WO 2016/079181; US 6,326,199; US 6,066,500; 및 US 6,440,739 (이들 각각의 염기 및 당 개질은 본원에 참조로서 인용됨).
올리고뉴클레오티드
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 선결된 수준의 하나 이상의 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형을 함유하고, 여기서 올리고뉴클레오티드 유형은 하기에 의해 정의된다: 1) 염기 서열; 2) 백본 연결 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 P-개질의 패턴. 일부 구현예에서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형은 하기에 의해 정의될 수 있다: 1A) 염기 동일성; 1B) 염기 개질의 패턴; 1C) 당 개질의 패턴; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 P-개질의 패턴. 일부 구현예에서, 동일한 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일하다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 유니머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 P-개질 유니머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 스테레오유니머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Rp 입체배치의 스테레오유니머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Sp 입체배치의 스테레오유니머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 알트머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 P-개질 알트머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 스테레오알트머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 블록머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 P-개질 블록머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 입체블록머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 갭머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 스킵머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 헤미머이다. 일부 구현예에서, 헤미머는, 5'-말단 또는 3'-말단이 올리고뉴클레오티드의 나머지가 갖지 않는 구조적 특징을 보유하는 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 5'-말단 또는 3'-말단은 2 내지 20 개의 뉴클레오티드를 갖거나 포함한다. 일부 구현예에서, 구조적 특징은 염기 개질이다. 일부 구현예에서, 구조적 특징은 당 개질이다. 일부 구현예에서, 구조적 특징은 P-개질이다. 일부 구현예에서, 구조적 특징은 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학이다. 일부 구현예에서, 구조적 특징은 염기 개질, 당 개질, P-개질, 또는 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학, 또는 이들의 조합이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 헤미머는 5'-말단 서열의 각각의 당 모이어티가 공통 개질을 공유하는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 헤미머는 3'-말단 서열의 각각의 당 모이어티가 공통 개질을 공유하는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 5' 또는 3' 말단 서열의 공통 당 개질은 올리고뉴클레오티드 내 임의의 다른 당 모이어티와 공유되지 않는다. 일부 구현예에서, 헤미머의 예는 하나의 말단에서 치환 또는 미치환 2'-O-알킬 당 개질된 뉴클레오시드, 바이시클릭 당 개질된 뉴클레오시드, β-D-리보뉴클레오시드 또는 β-D-데옥시리보뉴클레오시드 (예를 들어 2'-MOE 개질된 뉴클레오시드, 및 LNA™ 또는 ENA™ 바이시클릭 당 개질된 뉴클레오시드) 의 서열, 및 또 다른 말단에서 상이한 당 모이어티를 갖는 뉴클레오시드의 서열 (예컨대 치환 또는 미치환 2'-O-알킬 당 개질된 뉴클레오시드, 바이시클릭 당 개질된 뉴클레오시드 또는 천연의 뉴클레오시드) 을 포함하는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 유니머, 알트머, 블록머, 갭머, 헤미머 및 스킵머 중 하나 이상의 조합이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 유니머, 알트머, 블록머, 갭머, 및 스킵머 중 하나 이상의 조합이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 알트머 및 갭머이다. 일부 구현예에서, 제공된 뉴클레오티드는 갭머 및 스킵머이다. 화학적 및 합성 분야의 당업자는, 다수의 패턴의 기타 조합이 가능하며, 이는 본 개시의 방법에 따라 제공된 올리고뉴클레오티드를 합성하는데 요구되는 구성요소들의 상업적 이용 가능성 및/또는 합성 접근성에 의해서만 제한된다는 것을 인지할 것이다. 일부 구현예에서, 헤미머 구조는 유리한 이점을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 서열에서 개질된 당 모이어티를 포함하는 5'-헤미머이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 서열에서 개질된 2'-당 모이어티를 포함하는 5'-헤미머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오시드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 LNA 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 핵염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 천연 핵염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 개질된 핵염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 5-메틸시티딘; 5-히드록시메틸시티딘, 5-포르밀시토신, 또는 5-카르복실시토신을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 5-메틸시티딘을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 당을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 자연 발생 DNA 및 RNA 에서 발견되는 하나 이상의 임의 치환된 당을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 리보오스 또는 데옥시리보오스를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 리보오스 또는 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 리보오스 또는 데옥시리보오스 모이어티의 하나 이상의 히드록실기는 임의로 및 독립적으로 할로겐, R', -N(R')2, -OR' 또는 -SR' 로 대체되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 할로겐, R' -N(R')2, -OR' 또는 -SR' 로 치환되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 할로겐으로 치환된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 하나 이상의 -F 할로겐으로 치환된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 -OR' 로 치환되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 -OR' 로 치환되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 지방족이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 -OR' 로 치환되고, 여기서 각각의 R' 는 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알킬이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 -OMe 로 치환된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 임의 치환된 데옥시리보오스를 포함하고, 여기서 데옥시리보오스의 2' 위치는 임의로 및 독립적으로 -O-메톡시에틸로 치환된다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 단일-가닥 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하이브리드된 올리고뉴클레오티드 가닥이다. 특정 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 부분 하이브리드된 올리고뉴클레오티드 가닥이다. 특정 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 완전히 하이브리드된 올리고뉴클레오티드 가닥이다. 특정 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 이중-가닥 올리고뉴클레오티드이다. 특정 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 삼중-가닥 올리고뉴클레오티드이다 (예를 들어, 트리플렉스).
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 키메라이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 DNA-RNA 키메라, DNA-LNA 키메라 등이다.
일부 구현예에서, WO2012/030683 에 도시된 올리고뉴클레오티드를 포함하는 구조 중 어느 하나는, 본 개시의 방법에 따라 개질되어 이의 키랄 제어된 변이체를 제공할 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서 키랄 제어된 변이체는 연결 인 중 임의의 하나 이상에서의 입체화학적 개질 및/또는 연결 인 중 임의의 하나 이상에서의 P-개질을 포함한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, WO2012/030683 의 올리고뉴클레오티드의 특정 뉴클레오티드 단위는 뉴클레오티드 단위의 연결 인에서 입체화학적으로 개질되고/되거나 뉴클레오티드 단위의 연결 인에서 P-개질되도록 사전 선택된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 도면에 도시된 구조 중 어느 하나이다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 도면에 도시된 구조 중 어느 하나의 변이체 (예를 들어, 개질된 버전) 이다. WO2012/030683 의 개시는 그 전문이 본원에 참조로서 인용된다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 치료제이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 안티센스 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 항원 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 디코이 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 DNA 백신의 일부이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 면역조절 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 면역자극 올리고뉴클레오티드 및 면역저해 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 아쥬반트이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 압타머이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 리보자임이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 데옥시리보자임 (DNAzyme 또는 DNA 효소) 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 siRNA 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 마이크로RNA 또는 miRNA 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 ncRNA (비(非)코딩 RNA), 예컨대 긴 비코딩 (lncRNA) 및 작은 비코딩 RNA, 예컨대 piwi-상호작용 RNA (piRNA) 이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 구조적 RNA, 예를 들어 tRNA 에 상보적이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 핵산 유사체, 예를 들어, GNA, LNA, PNA, TNA 및 모르폴리노이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 P-개질된 프로드러그이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 프라이머이다. 일부 구현예에서, 프라이머는 핵산을 증폭시키기 위한 폴리머라아제-기반 연쇄 반응 (즉, PCR) 에의 사용을 위한 것이다. 일부 구현예에서, 프라이머는 PCR 의 임의의 공지된 변형, 예컨대 역전사 PCR (RT-PCR) 및 실시간 PCR 에의 사용을 위한 것이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 RNase H 활성화를 조절하는 능력을 갖는 것으로 특징지어진다. 예를 들어, 일부 구현예에서 RNase H 활성화는 입체제어된 포스포로티오에이트 핵산 유사체의 존재에 의해 조절되고, 천연 DNA/RNA 는 Rp 입체 이성질체보다 더 또는 동등하게 민감하며, 이는 결국 상응하는 Sp 입체 이성질체보다 더 민감하다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 단백질의 활성을 간접적으로 또는 직접적으로 증가 또는 감소시키거나, 단백질의 발현을 저해 또는 증진시키는 능력을 갖는 것으로 특징지어진다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 세포 증식, 바이러스 복제 및/또는 임의의 기타 세포 신호전달 과정의 제어에 유용하다는 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 200 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 180 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 160 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 140 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 120 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 100 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 90 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 80 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 70 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 60 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 50 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 40 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 30 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 29 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 28 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 27 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 26 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 25 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 24 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 23 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 22 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 21 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 2 내지 약 20 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 200 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 180 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 160 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 140 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 120 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 100 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 90 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 80 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 70 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 60 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 50 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 40 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 30 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 29 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 28 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 27 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 26 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 25 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 24 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 23 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 22 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 21 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 4 내지 약 20 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5 내지 약 10 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 10 내지 약 30 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 15 내지 약 25 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 또는 25 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 2 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 3 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 4 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 5 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 6 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 7 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 8 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 9 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 10 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 11 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 12 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 13 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 14 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 15 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 16 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 17 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 18 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 19 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 20 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 21 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 22 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 23 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 24 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 25 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 기타 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 30 개의 뉴클레오티드 단위 길이이다. 일부 기타 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 18 개의 뉴클레오티드 단위 길이의 상보적 가닥의 듀플렉스이다. 일부 기타 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 적어도 21 개의 뉴클레오티드 단위 길이의 상보적 가닥의 듀플렉스이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 5'-말단 및/또는 3'-말단은 개질된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 5'-말단 및/또는 3'-말단은 말단 캡 모이어티로 개질된다. 말단 캡 모이어티를 포함하는, 상기와 같은 개질의 예는, 본원 및 당업계에 광범위하게 기재되어 있고, 예를 들어 비제한적으로, US 특허 출원 공보 US 2009/0023675A1 에 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 1) 공통 염기 서열 및 길이, 2) 백본 연결의 공통 패턴, 및 3) 백본 키랄 중심의 공통 패턴을 특징으로 하는 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는, 동일한 화학적 구조를 갖는다. 예를 들어, 이들은 동일한 염기 서열, 뉴클레오시드 개질의 동일한 패턴, 백본 연결의 동일한 패턴 (즉, 뉴클레오티드간 연결 유형의 패턴, 예를 들어 포스페이트, 포스포로티오에이트 등), 백본 키랄 중심의 동일한 패턴 (즉 연결 인 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴), 및 백본 인 개질의 동일한 패턴 (예를 들어, 화학식 I 의 "-XLR1" 기의 패턴) 을 갖는다.
올리고뉴클레오티드 및 조성물의 예
일부 구현예에서, 본 개시는 당업계에 공지된 각종 목적에 유용한, 올리고뉴클레오티드 및/또는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 특성, 예를 들어 활성, 독성 등을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 조성물의 비제한적인 예는 하기에 열거되어 있다:
Figure pct00210
Figure pct00211
일부 구현예에서, * 은 단지 스테레오랜덤 포스포로티오에이트 연결을 나타내고; *S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결을 나타내고, *R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결을 나타내고; 모든 비(非)라벨된 연결은 천연 포스페이트 연결이고, 염기 앞의 m 은 2'-OMe 를 나타내고; 염기 다음의 eo 는 2'-MOE 를 나타낸다.
Figure pct00212
Figure pct00213
Figure pct00214
Figure pct00215
Figure pct00216
Figure pct00217
Figure pct00218
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Figure pct00234
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Figure pct00236
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Figure pct00238
Figure pct00239
Figure pct00240
Figure pct00241
Figure pct00242
Figure pct00243
Figure pct00244
Figure pct00245
Figure pct00246
Figure pct00247
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Figure pct00251
Figure pct00252
Figure pct00253
Figure pct00254
Figure pct00255
Figure pct00256
Figure pct00257
Figure pct00258
Figure pct00259
Figure pct00260
약어:
2
Figure pct00261
: 2'
5Ceo: 5-메틸 2'-메톡시에틸 C
C6: C6 아미노 링커 (L001, -NH-(CH2)6- (여기서 -NH- 는 Mod (-C(O)- 를 통해) 또는 -H 에 연결되고, -(CH2)6- 는, 예를 들어 포스포디에스테르 (표에서 O 또는 PO 로서 예시됨), 포스포로티오에이트 (표에서 키랄 제어되지 않은 포스포로티오에이트의 경우 * 로서 예시됨; 키랄 제어되고 Sp 배열을 갖는 경우, *S, S, 또는 Sp, 및 키랄 제어되고 Rp 배열을 갖는 경우, *R, R, 또는 Rp), 또는 포스포로디티오에이트 (표에서 PS2 또는 : 로 예시됨) 를 통해 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-말단에 연결됨. 또한, C6 링커 또는 C6 아민 링커로서 지칭될 수 있음)
eo: 2'-MOE
Exon: 디스트로핀의 엑손
F, f: 2'-F
Lauric (Mod013 에서), Myristic (Mod014 에서), Palmitic (Mod005), Stearic (Mod015 에서), Oleic (Mod016 에서), Linoleic (Mod017 에서), alpha-Linoleinc (Mod018 에서), gamma-Linolenic (Mod019 에서), DHA (Mod006 에서), Turbinaric (Mod020 에서), Dilinoleic (Mod021 에서), TriGlcNAc (Mod024 에서), 트리알파만노오스 (TrialphaMannose) (Mod026 에서), 모노술폰아미드 (MonoSulfonamide) (Mod 027 에서), 트리술폰아미드 (TriSulfonamide) (Mod029 에서), Lauric (Mod030 에서), Myristic (Mod031 에서), Palmitic (Mod032 에서), 및 Stearic (Mod033 에서): 라우르산 (Mod013 에서), 미리스트산 (Mod014 에서), 팔미트산 (Mod005 에서), 스테아르산 (Mod015), 올레산 (Mod016 에서), 리놀레산 (Mod017 에서), 알파-리놀레산 (Mod018 에서), 감마-리놀레산 (Mod019 에서), 도코사헥사엔산 (Mod006 에서), 투르비나르산 (Mod020 에서), 디리놀레일에 대한 알코올 (Mod021 에서), TriGlcNAc 에 대한 산 (Mod024 에서), 트리알파만노오스에 대한 산 (Mod026 에서), 모노술폰아미드에 대한 산 (Mod 027 에서), 트리술폰아미드에 대한 산 (Mod029 에서), 라우릴 알코올 (Mod030 에서), 미리스틸 알코올 (Mod031 에서), 팔미틸 알코올 (Mod032 에서), 및 스테아릴 알코올 (Mod033 에서), 각각, 아미드기, C6 아미노 링커, 포스포디에스테르 연결 (PO), 및/또는 포스포로티오에이트 연결 (PS) 을 통해 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이트됨: Mod013 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 라우르산), Mod014 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 미리스트산), Mod005 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 팔미트산), Mod015 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 스테아르산), Mod016 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 올레산), Mod017 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 리놀레산), Mod018 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 알파-리놀렌산), Mod019 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 감마-리놀렌산), Mod006 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 DHA), Mod020 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 투르비나르산), Mod021 (PO 또는 PS 를 갖는 알코올 (하기 참조)), Mod024 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 산 (하기 참조)), Mod026 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 산 (하기 참조)), Mod027 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 산 (하기 참조)), Mod029 (C6 아미노 링커 및 PO 또는 PS 를 갖는 산 (하기 참조)), Mod030 (PO 또는 PS 를 갖는 라우릴 알코올), Mod031 (PO 또는 PS 를 갖는 미리스틸 알코올), Mod032 (PO 또는 PS 를 갖는 팔미틸 알코올), 및 Mod033 (PO 또는 PS 를 갖는 스테아릴 알코올), 표에 제시된 각각의 올리고뉴클레오티드에 대하여 PO 또는 PS 를 가짐
(예를 들어, 아미드기, C6, 및 PO 를 통해 WV-3473 의 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이트된 WV-3473 라우르산:
Mod013L001fU *SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (설명), OO SSSSSSOSOSSOOSSSSSS (입체화학), 및/또는 WV-3473, 라우르산, C6 PO 링커 (참고);
PS 를 통해 WV-3473 의 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이트된 WV-3557 스테아릴 알코올:
Mod033 * fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (설명), X SSSSSSOSOSSOOSSSSSS (입체화학), 및/또는 WV-3473, Stearic PS (참고); 및
아미드기, C6, 및 PS 를 통해 WV-3473 의 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이트된 WV-4106 스테아르산:
Mod015L001 * fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (설명), OX SSSSSSOSOSSOOSSSSSS (입체화학), 및/또는 WV-3473, C6 PS 링커, 스테아르산 (참고)).
콘쥬게이션을 위한 모이어티, 및 시약 예 (이들 중 다수는 이미 공지된 것이며, 시판되거나 본 개시에 따른 공지된 기술을 사용하여 용이하게 제조될 수 있음, 예를 들어, 라우르산 (Mod013 의 경우), 미리스트산 (Mod014 의 경우), 팔미트산 (Mod005 의 경우), 스테아르산 (Mod015 의 경우), 올레산 (Mod016 의 경우), 리놀레산 (Mod017 의 경우), 알파-리놀렌산 (Mod018 의 경우), 감마-리놀렌산 (Mod019 의 경우), 도코사헥사엔산 (Mod006 의 경우), 투르비나르산 (Mod020 의 경우), 디리놀레일에 대한 알코올 (Mod021 의 경우), 라우릴 알코올 (Mod030 의 경우), 미리스틸 알코올 (Mod031 의 경우), 팔미틸 알코올 (Mod032 의 경우), 스테아릴 알코올 (Mod033 의 경우) 등) 는, 하기에 열거되어 있음.
m: 2'-OMe
NA: 이용 가능하지 않음; 이러한 용어는 일반적으로 음성 대조군에 대하여 사용됨
OMe: 2'-OMe
O, PO: 포스포디에스테르 (포스페이트), 또는 Mod 및 L001 과 함께 사용되는 경우, -C(O)- (Mod 과 L001 을 연결함, 예를 들어, Mod013L001 fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU (설명), O OSSSSSSOSOSSOOSSSSSS (입체화학) 및/또는 WV-3473, 라우르산, C6 PO 링커 (참고). 참고: 두 번째 O O O SSSSSSOSOSSOOSSSSSS (입체화학) 는, 올리고뉴클레오티드 사슬의 L001 과 5'-O- 를 연결하는 포스포디에스테르 연결을 나타냄:
Mod013 L001fU *SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU)
*, PS: 포스포로티오에이트
PS2, : : 포스포로디티오에이트 (예를 들어, WV-3078, 여기서 콜론 (:) 은 포스포로디티오에이트를 나타냄)
*R, R, Rp: Rp 입체구조의 포스포로티오에이트
*S, S, Sp: Sp 입체구조의 포스포로티오에이트
WV, W V-: WV-
X: 포스포로티오에이트 스테레오랜덤
모이어티 예 (예를 들어, 지질 모이어티, 표적 구성성분 등) 및 제공된 올리고뉴클레오티드를 제조하기 위한 콘쥬게이션을 위한 제조 시약 예 (예를 들어, 산, 알코올 등), 예를 들어 본 개시에 따라 상기와 같은 모이어티를 포함하는 표 1-4 의 올리고뉴클레오티드 예에는, 하기가 포함됨:
Mod005 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 팔미트산
Figure pct00262
Mod005L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00263
Mod006 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 DHA
Figure pct00264
Mod006L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00265
Mod013 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 라우르산
Figure pct00266
Mod013L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00267
Mod014 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 미리스트산
Figure pct00268
Mod014L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00269
Mod015 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 스테아르산
Figure pct00270
Mod015L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00271
Mod016 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 올레산
Figure pct00272
Mod016L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00273
Mod017 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 리놀레산
Figure pct00274
Mod 017L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00275
Mod018 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 알파-리놀렌산
Figure pct00276
Mod018L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00277
Mod019 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 감마-리놀렌산
Figure pct00278
Mod019L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00279
Mod020 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 투르비나르산
Figure pct00280
Mod020L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00281
Mod021 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐) 및 알코올
Figure pct00282
Mod024 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 산
Figure pct00283
Mod024L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00284
Mod026 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 산
Figure pct00285
Mod026L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00286
Mod027 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 산
Figure pct00287
Mod027L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00288
Mod029 (L001 의 -NH- 에 연결되는 -C(O)- 를 가짐) 및 산
Figure pct00289
Mod029L001 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐)
Figure pct00290
Mod030 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐) 및 라우릴 알코올
Figure pct00291
Mod031 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐) 및 미리스틸 알코올
Figure pct00292
Mod032 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐) 및 팔미틸 알코올
Figure pct00293
Mod033 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결되는 PO 또는 PS 를 가짐) 및 스테아릴 알코올
Figure pct00294
일부 구현예에서, Mod024 및/또는 Mod 026 의 경우, 히드록실기는 올리고뉴클레오티드 사슬에의 콘쥬게이션 전 및/또는 동안 임의로 AcO- 로서 보호되고, 히드록실기는, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 절단 및/또는 탈보호 동안 탈보호된다:
Figure pct00295
출원인은, 상기 제시된 표에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 WV-3546 (Mod020L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU) 의 구조를 제시하는 방식의 예가, -C(O)- ( O OSSSSSSOSOSSOOSSSSSS) 를 통해 -NH-(CH2)6- 의 -NH- 에 연결되는 지질 모이어티 (Mod020,
Figure pct00296
) 로서 제시될 수 있다는 점에 주목하며, 여기서 -(CH2)6- 는 포스포디에스테르 연결 (OOSSSSSSOSOSSOOSSSSSS) 을 통해 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-말단에 연결된다. 당업자는, 제공된 올리고뉴클레오티드가 다수의 상이한 방식으로 (각각의 방식에서 단위의 조합이 동일한 올리고뉴클레오티드를 제공함), 지질, 링커 및 올리고뉴클레오티드 사슬 단위의 조합으로서 제시될 수 있다는 것을 이해한다. 예를 들어, WV-3546 은, Ac-[-LLD-(RLD)a]b (여기서 a 는 1 이고, b 는 1 임) 의 구조를 갖고, -C(O)-NH-(CH2)6-OP(=O)(OH)-O- (여기서 -C(O)- 는 RLD 에 연결되고, -O- 는 Ac 에 연결됨 (올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 로서) 의 링커 LLD 를 통해 이의 올리고뉴클레오티드 사슬 (Ac) 부분에 연결되는
Figure pct00297
의 지질 모이어티 RLD 를 갖는 것으로 간주될 수 있으며; 다수의 대안적인 방식 중 하나는, RLD 가
Figure pct00298
이고, LLD 가 -NH-(CH2)6-OP(=O)(OH)-O- (여기서 -NH- 는 RLD 에 연결되고, -O- 는 Ac 에 연결됨 ( 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 로서) 인 것이다.
올리고뉴클레오티드는 본 개시에 따른 다양한 방법을 사용하여 제조 및 특징분석되었다. MS 데이터의 예는 하기에 제시되어 있다:
Figure pct00299
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 2A-2E 에 열거된 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 2B-2E 에 열거된 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 WV-1092 를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 WV-888 을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 WV-892 를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 WV-942 를 갖는다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티는 표 2 에서의 다수의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티는 표 2A-2E 에서의 다수의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티는 표 2B-2E 에서의 다수의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 다수의 WV-1092 이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 다수의 WV-888 이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 다수의 WV-892 이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 다수의 WV-896 이다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티는 표 4 에서의 다수의 올리고뉴클레오티드이다.
일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 3 으로부터 선택되는 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3 으로부터 선택되는 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3 으로부터 선택되는 패턴을 포함하며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다. 일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 3A-3E 로부터 선택되는 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 3B-3E 로부터 선택되는 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3A-3E 로부터 선택되는 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3B-3E 로부터 선택되는 패턴을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3A-3E 로부터 선택되는 패턴을 포함하며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3B-3E 로부터 선택되는 패턴을 포함하며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다.
일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 3 으로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3 으로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3 으로부터 선택되며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다. 일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 3A-3E 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 3B-3E 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3A-3E 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3B-3E 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3A-3E 로부터 선택되며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 3B-3E 로부터 선택되며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다.
일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 4 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 4 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 4 로부터 선택되며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다. 일부 구현예에서, 화학적 개질 패턴은 표 4 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 4 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 제공된 입체화학 패턴은 표 4 로부터 선택되며, 여기서 숫자 (통상적으로 아래 첨자) 는 독립적으로 및 임의로 변경된다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 표 2-4 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 에 표 2 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 표 3 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 표 4 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 표 2-4 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 표 2 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 표 3 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 표 4 에 열거된 임의의 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 선결된 수준을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 선결된 수준을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 선결된 수준을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 선결된 수준을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 특성 예는, 예를 들어 도 1 내지 38 등에 입증되어 있다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 서열은 하기 중 임의의 하나 이상을 포함한다: 염기 서열 (길이 포함); 당 및 염기 모이어티에 대한 화학적 개질의 패턴; 백본 연결의 패턴; 천연 포스페이트 연결, 포스포로티오에이트 연결, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결, 및 이들의 조합의 패턴; 백본 키랄 중심의 패턴; 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴; 백본 인 개질의 패턴; 뉴클레오티드간 인 원자 상의 개질의 패턴, 예컨대 -S-, 및 화학식 I 의 -L-R1.
일부 구현예에서, 본 개시는 다수의 제공된 올리고뉴클레오티드를 포함하거나 이로 이루어진 조성물 (예를 들어, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물) 을 제공한다. 일부 구현예에서, 모든 상기와 같은 제공된 올리고뉴클레오티드는 동일한 유형을 가지며, 즉, 모두 동일한 염기 서열, 백본 연결의 패턴 (즉, 뉴클레오티드간 연결 유형의 패턴, 예를 들어, 포스페이트, 포스포로티오에이트 등), 백본 키랄 중심의 패턴 (즉 연결 인 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴), 및 백본 인 개질의 패턴 (예를 들어, 화학식 I 의 "-XLR1" 기의 패턴) 을 갖는다. 일부 구현예에서, 동일한 유형의 모든 올리고뉴클레오티드는 동일하다. 하지만, 다수의 구현예에서, 제공된 조성물은, 전형적으로 선결된 상대량으로, 다수의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 화학 및 약학 분야의 당업자는, 제공된 조성물 중 제공된 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 유형의 각각의 선택 및 그 양이 조성물의 의도된 용도에 따라 달라질 것이라는 것을 인지할 것이다. 즉, 관련 분야의 당업자는, 조성물에 함유된 제공된 올리고뉴클레오티드의 유형 및 양이, 조성물이 전체로서 특정 바람직한 특징 (예를 들어, 생물학적으로 바람직한, 치료적으로 바람직한 등) 을 갖게 하도록 하는, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 디자인할 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 2 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 3 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 4 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 5 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 6 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 7 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 8 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 9 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 10 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 15 가지 이상의 제공된 올리고뉴클레오티드 유형의 조합을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 소정량의 Rp 배열의 키랄적으로 균일한 미포메르센 및 소정량의 Sp 배열의 키랄적으로 균일한 미포메르센의 조합이다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 소정량의 Rp 배열의 키랄적으로 균일한 미포메르센, 소정량의 Sp 배열의 키랄적으로 균일한 미포메르센, 및 소정량의 목적하는 부분입체이성질체 형태의 하나 이상의 키랄적으로 순수한 미포메르센의 조합이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 유형은 WO/2014/012081 및 WO/2015/107425 에 기재된 것들로부터 선택되고, 이들 각각의 올리고뉴클레오티드, 올리고뉴클레오티드 유형, 올리고뉴클레오티드 조성물, 및 방법은 본원에 참조로서 인용된다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 WO/2014/012081 및 WO/2015/107425 에 기재된 것들로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 본원에 개시된 임의의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물에관한 것이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 개시된 임의의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 개시된 임의의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 개시된 임의의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 개시된 임의의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물에 관한 것이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 임의의 올리고뉴클레오티드와 관련된 조성물 또는 방법으로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물 또는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2-4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 2 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 3 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 4 에 열거된 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 서열은 하기 중 하나 이상을 포함한다: 염기 서열 (길이 포함); 당 및 염기 모이어티에 대한 화학적 개질의 패턴; 백본 연결의 패턴; 천연 포스페이트 연결, 포스포로티오에이트 연결, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결, 및 이들의 조합의 패턴; 백본 키랄 중심의 패턴; 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴; 백본 인 개질의 패턴; 뉴클레오티드간 인 원자 상의 개질의 패턴, 예컨대 -S-, 및 화학식 I 의 -L-R1.
일부 실험에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 드리사퍼센 및/또는 에테플러센과 비교할 때, 놀랍게도 높은 활성을 제공하였다. 예를 들어, WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, 및 WV-2530 및 그 외 다수의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 각각 본 개시, 예를 들어 각종 도면 등에서 입증된 바와 같이, 드리사퍼센 및/또는 에테플러센과 비교하여, 디스트로핀에서 엑손의 스킵핑을 중재하는데 있어 우수한 능력, 일부 구현예에서 수 배 높은 능력을 나타내었다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하기로부터 선택되는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물에 관한 것이다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 및 WV-3546. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 조성물에 관한 것이다: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 및 WV-3546.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열 WV-896 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3545 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3546 의 서열을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 25 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 35 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 45 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 55 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 60 개 이하의 염기 길이이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3545 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3546 의 서열로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물로서, 여기서 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 지질은 스테아르산 또는 투르비나르산이다. 일부 구현예에서, 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에의 지질의 콘쥬게이션은 올리고뉴클레오티드의 적어도 하나의 특성을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 특성은 증가된 활성 (예를 들어, 유해한 엑손의 바람직한 스킵핑을 유도하는 증가된 능력), 감소된 독성, 또는 조직에 대한 개선된 분포이다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 활성을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 독성을 감소시킨다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 hTLR9 아고니스트 활성을 감소시킨다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 hTLR9 안타고니스트 활성을 증가시킨다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 하나 이상의 표적 조직에의 전달을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 조직은 근육 조직이다. 일부 구현예에서, 조직은 골격근, 비복근, 삼두근, 심장 또는 횡격막이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 25 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 30 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 35 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 40 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 45 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 50 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 55 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 60 개 이하의 염기 길이이다. 일부 구현예에서, U 는 T 로 대체되며, 또는 그 역으로 대체된다.
일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하며, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하며, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하며, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 미치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 미치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 미치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 각종 구현예에서, 지질은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일. 일부 구현예에서, 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되지 않는다. 일부 구현예에서, 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에의 지질의 콘쥬게이션은 놀랍게도 올리고뉴클레오티드의 적어도 하나의 특성을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 특성 은 증가된 활성 (예를 들어, 유해한 엑손의 바람직한 스킵핑을 유도하는 증가된 능력), 감소된 독성, 또는 조직에 대한 개선된 분포이다. 일부 구현예에서, 조직은 근육 조직이다. 일부 구현예에서, 조직은 골격근, 비복근, 삼두근, 심장 또는 횡격막이다. 일부 구현예에서, 지질 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 미셀 (micelle) 을 형성한다. 일부 구현예에서, 개선된 특성의 예는, 예를 들어 도면 중 하나 이상에 입증되어 있다.
일부 구현예에서, 마우스에서 올리고뉴클레오티드의 예들을 검정할 때, 시험된 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, WV-3473, WV-3545, WV-3546, WV-942 등) 는 시험된 양, 예를 들어, 10 mg/kg, 30 mg/kg 등으로, 수컷 C57BL/10ScSndmdmdx 마우스 (4-5 주령) 의 꼬리 정맥을 통해 정맥 주사된다. 일부 구현예에서, 조직은 시험된 시간에서, 예를 들어 주사 후 일차로, 예를 들어 2, 7 및/또는 14 일차 등에서 수확되고, 일부 구현예에서 액체 질소 중에 신선-동결되고, 분석될 때까지 -80 ℃ 에서 보관된다.
본 개시에 따라 올리고뉴클레오티드 수준을 평가하기 위하여 다양한 검정이 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 하이브리드-ELISA 를 사용하여, 시험 물질의 연속 희석액을 사용하여 조직 내 올리고뉴클레오티드 수준을 표준 곡선으로서 정량화한다: 예를 들어, 절차 예에서, 말레산 무수물 활성화 96 웰 플레이트 (Pierce 15110) 를, 2.5% NaHCO3 (Gibco, 25080-094) 중 500 nM 로의 50 ㎕ 의 포획 프로브 (capture probe) 로 37 ℃ 에서 2 시간 동안 코팅하였다. 이어서, 플레이트를 PBST (PBS + 0.1% Tween-20) 로 3 회 세정하고, 5% 무지방 우유-PBST 로 37 ℃ 에서 1 시간 동안 차단시켰다. 시험 물질 올리고뉴클레오티드를 매트릭스로 연속 희석시켰다. 이러한 표준을 본래의 샘플과 함께, 모든 샘플 중 올리고뉴클레오티드 양이 100 ng/mL 미만이 되도록, 용해 완충액 (4 M 구아니딘; 0.33% N-라우릴 사르코신; 25 mM 소듐 시트레이트; 10 mM DTT) 으로 희석시켰다. 20 ㎕ 의 희석된 샘플을 PBST 중에 용해된 333 nM 검출 프로브 180 ㎕ 와 혼합한 후, PCR 기기에서 변성시켰다 (65 ℃, 10 min, 95 ℃, 15 min, 4 C ∞). 50 ㎕ 의 변성된 샘플을 차단된 (blocked) ELISA 플레이트에 3중으로 분포시키고, 4 ℃ 에서 밤새 인큐베이션하였다. PBST 의 3 회 세정 후, PBST 중의 1:2000 스트렙타비딘-AP 를 웰 당 50 ㎕ 첨가하고, 1 시간 동안 실온에서 인큐베이션하였다. PBST 로의 철저한 세정 후, 100 ㎕ 의 AttoPhos (Promega S1000) 를 첨가하고, 암실에서 실온에서 10 min 동안 인큐베이션하고, 플레이트 판독기 (Molecular Device, M5) 형광 채널: Ex435 nm, Em555 nm 상에서 판독하였다. 샘플 중 올리고뉴클레오티드를 4-매개변수 회귀에 의해 표준 곡선에 따라 계산하였다.
본 개시에 기재 및 입증된 바와 같이, 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 조직에 대한 전달을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 근육에 대한 전달을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션은 지방산과의 콘쥬게이션을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 투르비나르산과 콘쥬게이션된다. 일부 구현예에서, 투르비나르산과의 콘쥬게이션은 근육에의 올리고뉴클레오티드 전달 개선에 특히 효과적이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 WV-3473 은, 혈장 및 조직 균질물 둘 모두에서 안정하다.
올리고뉴클레오티드 및 조성물의 제조 방법의 예
제공된 올리고뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법은, 비제한적으로 WO/2010/064146, WO/2011/005761, WO/2013/012758, WO/2014/010250, US2013/0178612, WO/2014/012081, WO/2015/107425, PCT/US2016/043542, 및 PCT/US2016/043598 에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있으며, 이의 방법 및 시약은 각각 본원에 참조로서 인용된다.
무엇보다도, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 및 하나 이상의 특정 뉴클레오티드 유형을 포함하는 키랄 제어된 조성물의 제조 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본원에서 사용된 바, 구절 "올리고뉴클레오티드 유형" 은, 특정 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 백본 키랄 중심의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴 (예를 들어, "-XLR1" 기) 을 갖는 올리고뉴클레오티드를 정의한다. 공통으로 지정된 "유형" 의 올리고뉴클레오티드는 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 백본 키랄 중심의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴에 대하여 서로 구조적으로 동일하다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 동일하다.
일부 구현예에서, 본 개시에 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 상응하는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 혼합물과 상이한 특성을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 혼합물과 상이한 친지성을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 HPLC 에서 상이한 체류 시간을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 상응하는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 혼합물과 유의하게 상이한 피크 (peak) 체류 시간을 가질 수 있다. 당업계에서 일반적으로 실행되는 HPLC 를 사용하는 올리고뉴클레오티드 정제 중, 특정 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 완전히는 아니더라도 크게 소실될 것이다. 당업계에서 일반적으로 실행되는 HPLC 를 사용하는 올리고뉴클레오티드 정제 중, 특정 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 완전히는 아니더라도 크게 소실될 것이다. 결과 중 하나는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 혼합물 중 특정 부분입체이성질체 (특정 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드) 가 검정에서 시험되지 않는다는 것이다. 또다른 결과는, 배치마다, 불가피한 기계적 오류 및 인간의 실수로 인해, 추정상 "순수한" 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드는, 조성물 중 부분입체이성질체 및 그의 상대량 및 절대량이 배치마다 상이하다는 점에서 일관성이 없는 조성물을 가질 수있다는 것이다. 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드가 키랄 제어된 방식으로 단일 부분입체이성질체로서 합성되고, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이 선결된 수준의 하나 이상의 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형을 포함하기 때문에, 본 개시에 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 및 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 상기와 같은 문제점을 극복한다.
화학 및 합성 분야의 당업자는, 본 개시의 합성 방법이, 올리고뉴클레오티드의 각각의 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서의 특정 입체화학 및/또는 연결 인에서의 특정 개질, 및/또는 특정 염기, 및/또는 특정 당을 갖도록 사전에 디자인 및/또는 선택될 수 있도록, 제공된 올리고뉴클레오티드의 합성의 각각의 단계 중 어느 정도의 제어를 제공한다는 것을 이해할 것이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 뉴클레오티드간 연결의 연결 인에서 입체중심의 특정 조합을 갖도록 사전에 디자인 및/또는 선택된다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법을 사용하여 제조되는 제공된 올리고뉴클레오티드는 연결 인 개질의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 결정된다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법을 사용하여 제조되는 제공된 올리고뉴클레오티드는 염기의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 결정된다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법을 사용하여 제조되는 제공된 올리고뉴클레오티드는 당의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 결정된다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법을 사용하여 제조되는 제공된 올리고뉴클레오티드는 상기 구조적 특징 중 하나 이상의 특정 조합을 갖도록 디자인 및/또는 결정된다.
본 개시의 방법은 고도의 키랄 제어를 나타낸다. 예를 들어, 본 개시의 방법은 제공된 올리고뉴클레오티드 내 모든 단일 연결 인의 입체화학적 배열의 제어를 용이하게 한다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 미포메르센 유니머인 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 Rp 배열의 미포메르센 유니머인 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 Sp 배열의 미포메르센 유니머인 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물, 즉, 개별적인 올리고뉴클레오티드 유형을 선결된 수준으로 함유하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 초과의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 다수의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함한다. 본 개시에 따라 제조되는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 예가 본원에 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 연결 인의 배열에 대하여 키랄적으로 순수한 미포메르센 조성물을 제공한다. 다시 말해서, 일부 구현예에서, 본 개시의 방법은, 미포메르센이 연결 인의 배열에 대하여 단일 부분입체이성질체의 형태로 조성물 중에 존재하는 미포메르센의 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 연결 인의 배열에 대하여 키랄적으로 균일한 미포메르센 조성물을 제공한다. 다시 말해서, 일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 조성물 내 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인의 배열에 대하여 동일한 입체화학을 갖는, 예를 들어 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 Rp 배열을 갖거나, 또는 모든 뉴클레오티드 단위가 연결 인에서 Sp 배열을 갖는, 미포메르센의 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 50% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 55% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 60% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 65% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 70% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 75% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 80% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 85% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 90% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 91% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 92% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 93% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 94% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 95% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 96% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 97% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 98% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 99% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 99.5% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 99.6% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 99.7% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 99.8% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 약 99.9% 초과로 순수하다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 적어도 약 99% 초과로 순수하다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 단일 올리고뉴클레오티드 유형을 포함하도록 디자인된 조성물이다. 특정 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 50% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 50% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 50% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 55% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 60% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 65% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 70% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 75% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 80% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 85% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 90% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 91% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 92% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 93% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 94% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 95% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 96% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 97% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 98% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 99% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 99.5% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 99.6% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 99.7% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 99.8% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 약 99.9% 부분입체이성질체적으로 순수하다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물은 적어도 약 99% 부분입체이성질체적으로 순수하다.
무엇보다도, 본 개시는 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 (스테레오랜덤 또는 라세미가 아니라) 제조의 시도를 인식한다. 무엇보다도, 본 개시는 복수의 (예를 들어, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개 초과) 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드, 및 특히 복수의 (예를 들어, 5, 6, 7, 8, 9, 또는 10 개 초과) 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 제조를 위한 방법 및 시약을 제공한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 또는 라세미 제조에서, 적어도 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 90:10, 95:5, 96:4, 97:3, 또는 98:2 미만의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 90:10, 95:5, 96:4, 97:3, 또는 98:2 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 95:5 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 96:4 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 97:3 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 98:2 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 입체선택적 또는 키랄 제어된 제조의 경우, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결은 99:1 초과의 부분입체선택성으로 형성된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에서 키랄 뉴클레오티드간 연결의 부분입체선택성은 모델 반응, 예를 들어 본질적으로 동일하거나 필적한 조건 하에서 이량체의 형성을 통해 측정될 수 있으며, 여기서 이량체는 키랄 뉴클레오티드간 연결과 동일한 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 이량체의 5'-뉴클레오시드는 키랄 뉴클레오티드간 연결의 5'-말단에 대한 뉴클레오시드와 동일하고, 이량체의 3'-뉴클레오시드는 키랄 뉴클레오티드간 연결의 3'-말단에 대한 뉴클레오시드와 동일하다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 복수의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함하도록 디자인된 조성물이다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법은, 사전 선택된 양의 임의의 하나 이상의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 유형이 임의의 하나 이상의 기타 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 유형과 혼합되어 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 형성할 수 있도록, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 라이브러리의 생성을 가능하게 한다. 일부 구현예에서, 사전 선택된 양의 올리고뉴클레오티드 유형은 상기 기재된 부분입체이성질체적 순도 중 어느 하나를 갖는 조성물이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하기 단계를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 제조 방법을 제공한다:
(1) 커플링;
(2) 캡핑;
(3) 개질;
(4) 탈차단 (debloking); 및
(5) 목적하는 길이가 달성될 때까지 단계 (1) - (4) 의 반복.
제공된 방법을 기재할 때, 단어 "사이클" 은 당업자에 의해 이해되는 바와 같은 그것의 통상의 의미를 갖는다. 일부 구현예에서, 한 차례의 단계 (1)-(4) 가 사이클로서 언급된다.
일부 구현예에서, 본 개시는 하기 단계를 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법을 제공한다:
(a) 소정량의 제 1 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공하는 단계; 및
(b) 임의로 소정량의 하나 이상의 부가적인 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 제공하는 단계.
일부 구현예에서, 제 1 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 유형이다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 부가적인 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 본원에 기재된 바와 같은 하나 이상의 올리고뉴클레오티드 유형이다.
관련 화학 및 합성 분야의 당업자는, 본 개시의 방법을 사용하여 합성될 때, 제공된 올리고뉴클레오티드의 구조적 변형 및 입체화학적 배열에 대한 융통성 및 제어의 정도를 인지할 것이다. 예를 들어, 제 1 사이클의 완료 후, 후속 사이클은, 제 1 사이클 핵염기 및/또는 당과 상이한 핵염기 및/또는 당을 포함하는 그 후속 사이클에 대하여 개별적으로 선택되는 뉴클레오티드 단위를 사용하여 수행될 수 있다. 마찬가지로, 후속 사이클의 커플링 단계에서 사용되는 키랄 보조제는 제 1 사이클에서 사용되는 키랄 보조제와 상이하여, 제 2 사이클은 상이한 입체화학적 배열의 인 연결을 생성할 수 있다. 일부 구현예에서, 새롭게 형성된 뉴클레오티드간 연결에서 연결 인의 입체화학은 입체화학적으로 순수한 포스포라미다이트를 사용함으로써 제어된다. 부가적으로, 후속 사이클의 개질 단계에서 사용되는 개질 시약은 제 1 또는 이전 사이클에서 사용되는 개질 시약과 상이할 수 있다. 이러한 반복적 조립 접근법의 누적 효과는, 제공된 올리고뉴클레오티드의 각각의 구성성분이 구조적으로 및 배열적으로 고도로 조절될 수 있다는 것이다. 이러한 접근법의 부가적인 이점은, 캡핑 단계가, 그렇지 않은 경우, 제공된 올리고뉴클레오티드의 단리를 극히 도전적으로 만들 수 있는 "n-1" 분순물, 및 특히 보다 긴 길이의 올리고뉴클레오티드의 형성을 최소화시킨다는 점이다.
일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 제조 방법의 사이클의 예는, 본 개시에 기재된 예시적인 반응식에 예시되어 있다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 제조 방법의 사이클의 예는, 반응식 I 에 예시되어 있다. 일부 구현예에서,
Figure pct00300
는 고체 지지체, 및 임의로 고체 지지체에 부착된 성장하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 일부를 나타낸다. 예시된 키랄 보조제는 하기 화학식 3- I 의 구조를 가지며;
Figure pct00301
하기에 추가로 기재된다. "Cap" 은 캡핑 단계에 의해 질소 원자에 도입되는 임의의 화학적 모이어티이고, 일부 구현예에서, 아미노 보호기이다. 당업자는, 제 1 사이클에 있어서, 시작될 때는 고체 지지체에 부착된 단지 하나의 뉴클레오시드만이 존재할 수 있고, 사이클 퇴장은 임의로 탈차단 전에 수행될 수 있다는 것을 이해한다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, BPRO 는 올리고뉴클레오티드 합성에서 사용되는 보호된 염기이다. 상기 도시된 반응식 I 의 사이클의 각각의 단계는 하기에 추가로 기재된다.
반응식 I. 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 합성.
Figure pct00302
고체 지지체 상에서의 합성
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 합성은 고체상에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체 상에 존재하는 반응성 기는 보호된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체 상에 존재하는 반응성 기는 비(非)보호된다. 올리고뉴클레오티드 합성 중, 고체 지지체는 개별적인 뉴클레오티드 단위를 이용한 성장하는 올리고뉴클레오티드 사슬의 단계적 신장이 달성되도록, 수 개의 합성 사이클에서 각종 시약으로 처리된다. 고체 지지체에 직접 연결되어 있는 사슬의 말단에 있는 뉴클레오시드 단위는, 본원에서 사용된 바, "제 1 뉴클레오시드" 로 명명된다. 제 1 뉴클레오시드는 링커 모이어티, 즉 CPG, 중합체 또는 기타 고체 지지체와 뉴클레오시드 사이에서 공유 결합을 갖는 2가 라디칼을 통해, 고체 지지체에 결합된다. 링커는 올리고뉴클레오티드 사슬을 조립하기 위해 수행되는 합성 사이클 중에 온전하게 유지되고, 사슬 조립 후 절단되어 지지체로부터 올리고뉴클레오티드를 유리시킨다.
고체-상 핵산 합성을 위한 고체 지지체에는, 예를 들어, 미국 특허 제 4,659,774, 5,141,813, 4,458,066 호; Caruthers 미국 특허 제 4,415,732, 4,458,066, 4,500,707, 4,668,777, 4,973,679, 및 5,132,418 호; Andrus et al. 미국 특허 제 5,047,524, 5,262,530 호; 및 Koster 미국 특허 제 4,725,677 호 (RE34,069 로서 재발행됨) 에 기재된 지지체가 포함된다. 일부 구현예에서, 고체상은 유기 중합체 지지체이다. 일부 구현예에서, 고체상은 무기 중합체 지지체이다. 일부 구현예에서, 유기 중합체 지지체는 폴리스티렌, 아미노메틸 폴리스티렌, 폴리에틸렌 글리콜-폴리스티렌 그래프트 공중합체, 폴리아크릴아미드, 폴리메타크릴레이트, 폴리비닐알코올, 고도로 가교된 중합체 (HCP), 또는 기타 합성 중합체, 탄수화물, 예컨대 셀룰로오스 및 전분 또는 기타 중합체성 탄수화물, 또는 기타 유기 중합체 및 임의의 공중합체, 복합 재료 또는 상기 무기 또는 유기 재료의 조합이다. 일부 구현예에서, 무기 중합체 지지체는 실리카, 알루미나, 제어된 폴리글라스 (controlled polyglass) (CPG) (이는 실리카겔 지지체임), 또는 아미노프로필 CPG 이다. 기타 유용한 고체 지지체에는, 불소 고체 지지체 (예를 들어, WO/2005/070859 참고), 장쇄 알킬아민 (LCAA) 제어된 기공 유리 (CPG) 고체 지지체 (예를 들어, [S. P. Adams, K. S. Kavka, E. J. Wykes, S. B. Holder and G. R. Galluppi, J. Am. Chem . Soc ., 1983, 105, 661-663]; [G. R. Gough, M. J. Bruden and P. T. Gilham, Tetrahedron Lett., 1981, 22, 4177-4180] 참조) 를 포함한다. 막 지지체 및 중합체성 막 (예를 들어, Innovation and Perspectives in Solid Phase Synthesis, Peptides, Proteins and Nucleic Acids, ch 21 pp 157-162, 1994, Ed. Roger Epton 및 미국 특허 제 4,923,901 호 참조) 이 또한 핵산의 합성에 유용하다. 일단 형성되면, 막은 핵산 합성에 사용하기 위하여 화학적으로 관능화될 수 있다. 관능기의 막에의 부착에 더하여, 일부 구현예에서는 막과 합성된 사슬 사이의 입체 장애를 최소화하기 위하여, 막에 부착된 링커 또는 스페이서기의 사용이 또한 사용된다.
기타 적합한 고체 지지체에는, 고체상 방법에서 사용하기에 적합한 것으로 당업계에 일반적으로 공지된 것들이 포함되고, 예를 들어, PrimerTM 200 지지체로서 판매되는 유리, 제어된 기공 유리 (CPG), 옥살릴-제어된 기공 유리 (예를 들어, [Alul, et al., Nucleic Acids Research, 1991, 19, 1527] 참조), TentaGel Support-아미노폴리에틸렌글리콜 유도된 지지체 (예를 들어, [Wright, et al., Tetrahedron Lett., 1993, 34, 3373] 참조), 및 Poros-폴리스티렌/디비닐벤젠의 공중합체가 포함된다.
표면 활성화된 중합체는 몇몇의 고체 지지체 매체 상에서의 천연 및 개질된 핵산 및 단백질의 합성에서의 사용에 대하여 입증되었다. 고체 지지체 재료는 온전성을 상실하지 않으면서 임의의 수반되는 조작을 거치기에 충분한 유연성, 및 충분한 아민 함량을 갖는, 다공성이 적합하게 균일한 임의의 중합체일 수 있다. 적합한 선택되는 재료의 예에는, 나일론, 폴리프로필렌, 폴리에스테르, 폴리테트라플루오로에틸렌, 폴리스티렌, 폴리카르보네이트, 및 니트로셀룰로오스가 포함된다. 연구자의 디자인에 따라, 기타 재료가 고체 지지체로서의 역할을 할 수 있다. 일부 디자인을 고려하여, 예를 들어, 코팅된 금속, 특히 금 또는 백금이 선택될 수 있다 (예를 들어, 미국 공보 제 20010055761 호 참고). 올리고뉴클레오티드 합성의 하나의 구현예에서, 예를 들어, 뉴클레오시드는 히드록실 또는 아미노 잔기로 관능화된 고체 지지체에 고정될 수 있다. 대안적으로, 고체 지지체는 유도체화되어 산 불안정 트리알콕시트리틸기, 예컨대 트리메톡시트리틸기 (TMT) 를 제공한다. 이론에 구속되지 않으면서, 트리알콕시트리틸 보호기의 존재는 DNA 합성기에서 통상적으로 사용되는 조건 하에 초기 탈트리틸화를 가능하게 할 것으로 예상된다. 수성 암모니아 함유 용액 중 올리고뉴클레오티드 재료의 보다 신속한 방출을 위하여, 디글리코에이트 링커가 임의로 지지체에 도입된다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 대안적으로 5' → 3' 방향으로 합성된다. 일부 구현예에서, 핵산은 성장하는 핵산의 5' 말단을 통해 고체 지지체에 부착되어, 이의 3' 기를 반응, 즉 5'-뉴클레오시드 포스포라미다이트를 사용하는 반응 또는 효소 반응 (예를 들어 뉴클레오시드 5'-트리포스페이트를 사용하는 결찰 및 중합) 에 제시한다. 5' → 3' 합성을 고려할 때, 본 개시의 반복적 단계는 변하지 않은 채로 유지된다 (즉 키랄 인 상에의 캡핑 및 개질).
연결 모이어티
연결 모이어티 또는 링커는 임의로 유리된 (free) 친핵성 모이어티를 포함하는 화합물에 고체 지지체를 연결시키는데 사용된다. 적합한 링커로는, 예컨대 고체상 합성 기술에서 초기 뉴클레오시드 분자의 관능기 (예를 들어, 히드록실기) 에 고체 지지체를 연결하는 역할을 하는, 단분자가 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티는 숙시남산 링커, 또는 숙시네이트 링커 (-CO-CH2-CH2-CO-), 또는 옥살릴 링커 (-CO-CO-) 이다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티 및 뉴클레오시드는 에스테르 결합을 통해 함께 결합된다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티 및 뉴클레오시드는 아미드 결합을 통해 함께 결합된다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티는 뉴클레오시드를 또 다른 뉴클레오티드 또는 핵산에 연결시킨다. 적합한 링커는, 예를 들어, [Oligonucleotides And Analogues A Practical Approach, Ekstein, F. Ed., IRL Press, N.Y., 1991, Chapter 1] 및 [Solid-Phase Supports for Oligonucleotide Synthesis, Pon, R. T., Curr . Prot . Nucleic Acid Chem., 2000, 3.1.1-3.1.28] 에 개시되어 있다.
링커 모이어티는 유리된 친핵성 모이어티를 포함하는 화합물을 또 다른 뉴클레오시드, 뉴클레오티드, 또는 핵산에 연결시키는데 사용된다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티는 포스포디에스테르 연결이다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티는 H-포스포네이트 모이어티이다. 일부 구현예에서, 연결 모이어티는 본원에 기재된 바와 같은 개질된 인 연결이다. 일부 구현예에서, 범용 링커 (UnyLinker) 가 올리고뉴클레오티드를 고체 지지체에 부착시키는데 사용된다 (Ravikumar et al., Org . Process Res. Dev .,　2008,　12　(3), 399-410). 일부 구현예에서, 기타 범용 링커가 사용된다 (Pon, R. T., Curr . Prot . Nucleic Acid Chem., 2000, 3.1.1-3.1.28). 일부 구현예에서, 각종 직교 링커 (예컨대 디술피드 링커) 가 사용된다 (Pon, R. T., Curr . Prot . Nucleic Acid Chem., 2000, 3.1.1-3.1.28).
무엇보다도, 본 개시는, 링커가 올리고뉴클레오티드 합성에 이용되는 일련의 반응 조건에 적합하도록 선택 또는 디자인될 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 분해를 회피하고, 탈황화를 회피하기 위하여, 보조기는 탈보호 전에 선택적으로 제거된다. 일부 구현예에서, DPSE 기는 F- 이온에 의해 선택적으로 제거될 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 예를 들어 MeCN 중 0.1M TBAF, THF 또는 MeCN 중 0.5M HF-Et3N 등의 DPSE 탈보호 조건 하에서 안정한 링커를 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 링커는 SP 링커이다. 일부 구현예에서, 본 개시는, SP 링커가, 예를 들어 MeCN 중 0.1M TBAF, THF 또는 MeCN 중 0.5M HF-Et3N 등의 DPSE 탈보호 조건 하에서 안정하고; 또한, 예를 들어 MeCN 중 om1M DBU 과 같은 무수 염기성 조건 하에서 안정하다는 것을 입증한다.
Figure pct00303
일부 구현예에서, 링커의 예는 하기와 같다:
Figure pct00304
.
일부 구현예에서, 숙시닐 링커, Q-링커 또는 옥살릴 링커는 F- 를 사용하는 하나 이상의 DPSE-탈보호 조건에 대하여 안정하지 않다.
일반적 조건 - 합성용 용매
제공된 올리고뉴클레오티드의 합성은 일반적으로 비양성자성 유기 용매 중에서 수행된다. 일부 구현예에서, 용매는, 예를 들어 아세토니트릴과 같은 니트릴 용매이다. 일부 구현예에서, 용매는, 예를 들어 피리딘과 같은 염기성 아민 용매이다. 일부 구현예에서, 용매는, 예를 들어 테트라히드로푸란과 같은 에테르성 용매이다. 일부 구현예에서, 용매는, 예를 들어 디클로로메탄과 같은 할로겐화 탄화수소이다. 일부 구현예에서, 용매의 혼합물이 사용된다. 특정 구현예에서, 용매는 상기 기재된 부류의 용매 중 임의의 하나 이상의 혼합물이다.
일부 구현예에서, 비양성자성 유기 용매가 염기성이 아닌 경우, 염기가 반응 단계에서 존재한다. 염기가 존재하는 일부 구현예에서, 염기는, 예를 들어 피리딘, 퀴놀린, 또는 N,N-디메틸아닐린과 같은 아민 염기이다. 기타 아민 염기의 예에는, 피롤리딘, 피페리딘, N-메틸 피롤리딘, 피리딘, 퀴놀린, N,N-디메틸아미노피리딘 (DMAP), 또는 N,N-디메틸아닐린이 포함된다.
일부 구현예에서, 염기는 아민 염기 이외의 것이다.
일부 구현예에서, 비양성자성 유기 용매는 무수이다. 일부 구현예에서, 무수 비양성자성 유기 용매는 새로 증류된 것이다. 일부 구현예에서, 새로 증류된 무수 비양성자성 유기 용매는, 예를 들어 피리딘과 같은 염기성 아민 용매이다. 일부 구현예에서, 새로 증류된 무수 비양성자성 유기 용매는, 예를 들어 테트라히드로푸란과 같은 에테르성 용매이다. 일부 구현예에서, 새로 증류된 무수 비양성자성 유기 용매는, 예를 들어 아세토니트릴과 같은 니트릴 용매이다.
키랄 시약/키랄 보조제
일부 구현예에서, 키랄 시약은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 제조에서 입체선택성을 부여하는데 사용된다. 다수의 상이한 키랄 시약 (당업자 및 본원에서 또한 키랄 보조제로서 언급됨) 은, 본 개시의 방법에 따라 사용될 수 있다. 상기와 같은 키랄 시약의 예는, 본원 및 상기 참조된 Wada I, II 및 III 에 기재되어 있다. 특정 구현예에서, 키랄 시약은 Wada I 에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 본 개시의 방법에 따라 사용되는 키랄 시약은 하기 화학식 3-I 을 갖는다:
Figure pct00305
식 중, W1 및 W2 는 -O-, -S-, 또는 -NG5- 중 임의의 것이고, U1 및 U3 은, 존재하는 경우, U2 에, 또는 r 이 0 인 경우 서로, 단일, 이중 또는 삼중 결합을 통해 결합되는 탄소 원자이다. U2 는 -C-, -CG8-, -CG8G8-, -NG8-, -N-, -O-, 또는 -S- 이고, 여기서 r 은 0 내지 5 의 정수이고, 2 개 이하의 헤테로원자가 인접한다. U2 중 임의의 하나가 C 인 경우, 삼중 결합은 C 인 U2 의 제 2 인스턴스 사이에, 또는 U1 또는 U3 중 하나에 형성되어야 한다. 유사하게, U2 중 임의의 하나가 CG8 인 경우, 이중 결합은 -CG8- 또는 -N- 인 U2 의 제 2 인스턴스 사이에, 또는 U1 또는 U3 중 하나에 형성된다.
일부 구현예에서, -U1(G3G4)-(U2)r-U3(G1G2)- 는 -CG3G4-CG1G2- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -CG3=CG1- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -C≡C- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -CG3=CG8-CG1G2- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -CG3G4-O-CG1G2- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -CG3G4-NG8-CG1G2- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -CG3G4-N-CG2- 이다. 일부 구현예에서, -U1-(U2)r-U3- 는 -CG3G4-N=C G8-CG1G2- 이다.
본원에 정의된 바, G1, G2, G3, G4, G5, 및 G8 은 독립적으로 수소, 또는 알킬, 아르알킬, 시클로알킬, 시클로알킬알킬, 헤테로시클릴, 헤테로아릴, 및 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이거나; 또는 G1, G2, G3, G4, 및 G5 중 2 개는 G6 이다 (이는 함께 취해져, 모노시클릭 또는 폴리시클릭이고, 융합 또는 비융합된, 약 20 개 이하의 고리 원자를 갖는 임의 치환된, 포화, 부분 불포화 또는 불포화 카르보시클릭 또는 헤테로원자-함유 고리를 형성함). 일부 구현예에서, 이와 같이 형성된 고리는 옥소, 티옥소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 헤테로아릴, 또는 아릴 모이어티로 치환된다. 일부 구현예에서, 2 개의 G6 이 함께 취해져 형성된 고리가 치환되는 경우, 이는 반응 중에 입체선택성을 부여하기에 충분히 벌키한 모이어티로 치환된다.
일부 구현예에서, 2 개의 G6 이 함께 취해져 형성된 고리는 임의 치환된 시클로펜틸, 피롤릴, 시클로프로필, 시클로헥세닐, 시클로펜테닐, 테트라히드로피라닐, 또는 피페라지닐이다. 일부 구현예에서, 2 개의 G6 이 함께 취해져 형성된 고리는 임의 치환된 시클로펜틸, 피롤릴, 시클로프로필, 시클로헥세닐, 시클로펜테닐, 테트라히드로피라닐, 피롤리디닐, 또는 피페라지닐이다.
일부 구현예에서, G1 은 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, G1 은 페닐이다. 일부 구현예에서, G2 는 메틸 또는 수소이다. 일부 구현예에서, G1 은 임의 치환된 페닐이고, G2 는 메틸이다. 일부 구현예에서, G1 은 페닐이고, G2 는 메틸이다.
일부 구현예에서, r 은 0 이다.
일부 구현예에서, W1 은 -NG5- 이다. 일부 구현예에서, G3 및 G4 중 하나는 G5 와 함께 취해져 임의 치환된 피롤리디닐 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, G3 및 G4 중 하나는 G5 와 함께 취해져 피롤리디닐 고리를 형성한다.
일부 구현예에서, W2 는 -O- 이다.
일부 구현예에서, 키랄 시약은 화학식 3-AA 의 화합물이다:
Figure pct00306
[식 중, 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같음].
화학식 3-AA 의 일부 구현예에서, W1 및 W2 는 독립적으로 -NG5-, -O-, 또는 -S- 이고; G1, G2, G3, G4, 및 G5 는 독립적으로 수소, 또는 알킬, 아르알킬, 시클로알킬, 시클로알킬알킬, 헤테로시클릴, 헤테로아릴, 또는 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이거나; 또는 G1, G2, G3, G4, 및 G5 중 2 개는 G6 이고 (이는 함께 취해져, 모노시클릭 또는 폴리시클릭이고, 융합 또는 비융합된, 약 20 개 이하의 고리 원자를 갖는 임의 치환된 포화, 부분 불포화 또는 불포화 카르보시클릭 또는 헤테로원자-함유 고리를 형성함), G1, G2, G3, G4, 및 G5 중 4 개 이하는 G6 이다. 화학식 3-I 의 화합물과 유사하게, G1, G2, G3, G4, 또는 G5 중 임의의 것은 옥소, 티옥소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 헤테로아릴, 또는 아릴 모이어티로 임의 치환된다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 치환은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 제조에서 입체선택성을 유도한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00307
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00308
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00309
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00310
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00311
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00312
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00313
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00314
의 구조를 갖는다.
일부 구현예에서, W1 은 -NG5 이고, W2 는 O 이고, G1 및 G3 은 각각 독립적으로 수소 또는 C1 -10 지방족, 헤테로시클릴, 헤테로아릴 및 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고, G2 는 -C(R)2Si(R)3 이고, G4 및 G5 는 함께 취해져, 모노시클릭 또는 폴리시클릭이고, 융합 또는 비융합된, 약 20 개 이하의 고리 원자를 갖는 임의 치환된 포화, 부분 불포화 또는 불포화 헤테로원자-함유 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, 각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다. 일부 구현예에서, G2 는 -C(R)2Si(R)3 이고, 여기서 -C(R)2- 는 임의 치환된 -CH2- 이고, -Si(R)3 의 R 은 각각 독립적으로 C1 -10 지방족, 헤테로시클릴, 헤테로아릴 및 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 적어도 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 C1 -10 알킬이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 적어도 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 페닐이고, 다른 2 개의 R 은 각각 독립적으로 임의 치환된 C1 -10 알킬이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 C1 -10 알킬이고, 다른 2 개의 R 은 각각 독립적으로 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, G2 는 임의 치환된 -CH2Si(Ph)(Me)2 이다. 일부 구현예에서, G2 는 임의 치환된 -CH2Si(Me)(Ph)2 이다. 일부 구현예에서, G2 는 -CH2Si(Me)(Ph)2 이다. 일부 구현예에서, G4 및 G5 는 함께 취해져 하나의 질소 원자 (여기에 G5 가 부착됨) 를 함유하는 임의 치환된 포화 5-6 원 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, G4 및 G5 는 함께 취해져 하나의 질소 원자를 함유하는 임의 치환된 포화 5-원 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, G1 은 수소이다. 일부 구현예에서, G3 은 수소이다. 일부 구현예에서, G1 및 G3 은 둘 모두 수소이다.
일부 구현예에서, 키랄 시약은 하기 화학식 중 하나를 갖는다:
Figure pct00315
.
일부 구현예에서, 키랄 시약은 아미노알코올이다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 아미노티올이다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 아미노페놀이다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 (S)- 및 (R)-2-메틸아미노-1-페닐에탄올, (1R, 2S)-에페드린, 또는 (1R, 2S)-2-메틸아미노-1,2-디페닐에탄올이다.
본 개시의 일부 구현예에서, 키랄 시약은 하기 화학식 중 하나의 화합물이다:
Figure pct00316
.
본원에서 입증된 바, 키랄 뉴클레오티드간 연결의 제조에 사용되는 경우, 입체선택성을 수득하기 위하여 일반적으로 입체화학적으로 순수한 키랄 시약이 이용된다. 무엇보다도, 본 개시는 기재된 구조를 갖는 것들을 포함하는 입체화학적으로 순수한 키랄 시약을 제공한다.
키랄 시약, 예를 들어, 화학식 Q 로 표시되는 이성질체 또는 이의 입체이성질체, 화학식 R 의 선택은, 연결 인에서의 키랄성의 특정 제어를 가능하게 한다. 따라서, Rp 또는 Sp 배열은 각각의 합성 사이클에서 선택되어, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 전체적인 3차원 구조의 제어를 가능하게 할 수 있다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 전부 Rp 입체중심을 갖는다. 본 개시의 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 전부 Sp 입체중심을 갖는다. 본 개시의 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드에서 각각의 연결 인은 독립적으로 Rp 또는 Sp 이다. 본 개시의 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드에서 각각의 연결 인은 독립적으로 Rp 또는 Sp 이며, 적어도 하나는 Rp 이고, 적어도 하나는 Sp 이다. 일부 구현예에서, Rp 및 Sp 중심의 선택은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드에 특정 3차원 상부구조를 부여하기 위하여 이루어진다. 상기와 같은 선택의 예는 본원에 추가로 상세하게 기재된다.
일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 키랄 시약은 상기 도시된 사이클에서 특정 단계에서 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 연결 인의 개질 단계 동안 키랄 시약을 제거하는 것이 바람직하다. 일부 구현예에서, 연결 인의 개질 단계 전 키랄 시약을 제거하는 것이 바람직하다. 일부 구현예에서, 연결 인의 개질 단계 후 키랄 시약을 제거하는 것이 바람직하다. 일부 구현예에서, 키랄 시약이 제 2 커플링 (및 마찬가지로 부가적인 후속 커플링 단계) 동안 성장하는 올리고뉴클레오티드 상에 존재하지 않도록, 제 1 커플링 단계가 일어난 후, 하지만 제 2 커플링 단계가 일어나기 전에, 키랄 시약을 제거하는 것이 바람직하다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 연결 인의 개질 후, 하지만 후속 사이클이 시작되기 전에 일어나는 "탈차단" 반응 동안에 제거된다. 제거를 위한 방법 및 시약은 본원에 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 키랄 보조제의 제거는 반응식 I 에 예시된 바와 같이, 개질 및/또는 탈차단 단계를 수행할 때, 달성된다. 키랄 보조제 제거를 개질 및 탈차단과 같은 기타 변형과 함께 조합하는 것이 유리할 수 있다. 당업자는 절약된 단계/변형이, 예를 들어, 특히 장쇄의 올리고뉴클레오티드의 경우, 수율 및 생성물 순도에 대한 전체적인 합성의 효율을 개선시킬 수 있다는 것을 이해할 것이다. 키랄 보조제가 개질 및/또는 탈차단 동안 제거되는 하나의 예는, 반응식 I 에 예시되어 있다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법에 따라 사용되는 키랄 시약은, 특정 조건 하에서 제거 가능한 것을 특징으로 한다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 키랄 시약은 산성 조건 하에서 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 특정 구현예에서, 키랄 시약은 약산성 조건 하에서 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 특정 구현예에서, 키랄 시약은 E1 제거 반응에 의해 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다 (예를 들어, 산성 조건 하에서 키랄 시약 상에의 양이온 중간체의 형성으로 인해 제거가 일어나, 키랄 시약이 올리고뉴클레오티드로부터 절단되는 것을 야기함). 일부 구현예에서, 키랄 시약은 E1 제거 반응에 부응하거나 이를 용이하게 할 수 있는 것으로 인식되는 구조를 갖는 것을 특징으로 한다. 관련 분야의 당업자는 상기와 같은 제거 반응을 거치기 쉬운 것으로 고안될 수 있는 것이 어떠한 구조인지를 인식할 것이다.
일부 구현예에서, 키랄 시약은 친핵체를 이용하여 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 아민 친핵체를 이용하여 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 아민 이외의 친핵체를 이용하여 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다.
일부 구현예에서, 키랄 시약은 염기를 이용하여 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 아민을 이용하여 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다. 일부 구현예에서, 키랄 시약은 아민 이외의 염기를 이용하여 제거될 수 있는 이의 능력에 대하여 선택된다.
부가적인 키랄 보조제 및 이의 용도는, 예를 들어 하기에서 확인할 수 있다: Wada I (JP4348077; WO2005/014609; WO2005/092909), Wada II (WO2010/064146), Wada III (WO2012/039448), Chiral Control (WO2010/064146) 등.
활성화
비키랄 H-포스포네이트 모이어티는 제 1 활성화 시약으로 처리되어 제 1 중간체를 형성한다. 하나의 구현예에서, 제 1 활성화 시약은 축합 단계 동안 반응 혼합물에 첨가된다. 제 1 활성화 시약의 사용은 반응 조건, 예컨대 반응에 사용되는 용매에 따라 달라진다. 제 1 활성화 시약의 예는, 포스겐, 트리클로로메틸 클로로포르메이트, 비스(트리클로로메틸)카르보네이트 (BTC), 옥살릴 클로라이드, Ph3PCl2, (PhO)3PCl2 , N,N'-비스(2-옥소-3-옥사졸리디닐)포스피닉 클로라이드 (BopCl), 1,3-디메틸-2-(3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일)-2-피롤리딘-1-일-1,3,2-디아자포스폴리디늄 헥사플루오로포스페이트 (MNTP), 또는 3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일-트리스(피롤리딘-1-일)포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyNTP) 이다.
비키랄 H-포스포네이트 모이어티의 예는 상기 반응식에 제시된 화합물이다. DBU 는 1,8-디아자바이시클로[5.4.0]운데크-7-엔이다. H+DBU 는, 예를 들어 암모늄 이온, 알킬암모늄 이온, 헤테로방향족 이미늄 이온, 또는 헤테로시클릭 이미늄 이온이며, 이들 중 임의의 것은 1차, 2차, 3차 또는 4차, 또는 1가 금속 이온이다.
키랄 시약과의 반응
제 1 활성화 단계 후, 활성화된 비키랄 H-포스포네이트 모이어티를 화학식 (Z-I) 또는 (Z-I') 로 표시되는 키랄 시약과 반응시켜, 화학식 (Z-Va), (Z-Vb), (Z-Va'), 또는 (Z-Vb') 의 키랄 중간체를 형성한다.
입체특이적 축합 단계
화학식 Z-Va ((Z-Vb), (Z-Va'), 또는 (Z-Vb')) 의 키랄 중간체는 제 2 활성화 시약 및 뉴클레오시드로 처리되어, 축합된 중간체를 형성한다. 뉴클레오시드는 고체 지지체 상에 존재할 수 있다. 제 2 활성화 시약의 예는, 4,5-디시아노이미다졸 (DCI), 4,5-디클로로이미다졸, 1-페닐이미다졸륨 트리플레이트 (PhIMT), 벤즈이미다졸륨 트리플레이트 (BIT), 벤즈트리아졸, 3-니트로-1,2,4-트리아졸 (NT), 테트라졸, 5-에틸티오테트라졸 (ETT), 5-벤질티오테트라졸 (BTT), 5-(4-니트로페닐)테트라졸, N-시아노메틸피롤리디늄 트리플레이트 (CMPT), N-시아노메틸피페리디늄 트리플레이트, N-시아노메틸디메틸암모늄 트리플레이트이다. 화학식 Z-Va ((Z-Vb), (Z-Va'), 또는 (Z-Vb')) 의 키랄 중간체는 단량체로서 단리될 수 있다. 통상적으로, Z-Va ((Z-Vb), (Z-Va'), 또는 (Z-Vb')) 의 키랄 중간체는 단리되지 않고, 뉴클레오시드 또는 개질된 뉴클레오시드와 함께 동일한 포트 (pot) 에서 반응을 거쳐 키랄 포스파이트 화합물, 축합된 중간체를 제공한다. 다른 구현예에서, 방법이 고체상 합성을 통해 수행되는 경우, 화합물을 포함하는 고체 지지체는 부산물, 불순물, 및/또는 시약으로부터 여과된다.
캡핑 단계
최종 핵산이 이량체보다 더 큰 경우, 미반응 -OH 모이어티는 차단기로 캡핑되고, 화합물 내 키랄 보조제 또한 차단기로 캡핑되어 캡핑된 축합된 중간체를 형성할 수 있다. 최종 핵산이 이량체인 경우, 캡핑 단계는 필수적이지 않다.
개질 단계
화합물은 친전자체와의 반응에 의해 개질된다. 캡핑된 축합된 중간체로 개질 단계가 수행될 수 있다. 일부 구현예에서, 개질 단계는 황 친전자체, 셀레늄 친전자체 또는 보론화제를 사용하여 수행된다. 개질 단계의 예는, 산화 및 황화 단계이다.
상기 방법의 일부 구현예에서, 황 친전자체는 하기 화학식 중 하나를 갖는 화합물이다:
S8 (화학식 Z-B), Zz1-S-S-Zz2, 또는 Zz1-S-Vz-Zz2
[식 중, Zz1 및 Zz2 는 독립적으로 알킬, 아미노알킬, 시클로알킬, 헤테로시클릭, 시클로알킬알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 헤테로아릴옥시, 아실, 아미드, 이미드, 또는 티오카르보닐이거나, 또는 Zz1 및 Zz2 는 함께 취해져 치환 또는 미치환될 수 있는 3 내지 8 원 지환식 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고; Vz 는 SO2, O, 또는 NRf 이고; Rf 는 수소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 또는 아릴임].
상기 방법의 일부 구현예에서, 황 친전자체는 하기 화학식 Z-A, Z-B, Z-C, Z-D, Z-E, 또는 Z-F 의 화합물이다:
Figure pct00317
.
일부 구현예에서, 황화 시약은 3-페닐-1,2,4-디티아졸린-5-온이다.
일부 구현예에서, 셀레늄 친전자체는 하기 화학식 중 하나를 갖는 화합물이다:
Se (화학식 Z-G), Zz3-Se-Se-Zz4, 또는 Zz3-Se-Vz-Zz4
[식 중, Zz3 및 Zz4 는 독립적으로 알킬, 아미노알킬, 시클로알킬, 헤테로시클릭, 시클로알킬알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 헤테로아릴옥시, 아실, 아미드, 이미드, 또는 티오카르보닐이거나, 또는 Zz3 및 Zz4 는 함께 취해져 치환 또는 미치환될 수 있는 3 내지 8 원 지환식 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고; Vz 는 SO2, S, O, 또는 NRf 이고; Rf 는 수소, 알킬, 알케닐, 알키닐, 또는 아릴임].
일부 구현예에서, 셀레늄 친전자체는 하기 화학식 Z-G, Z-H, Z-I, Z-J, Z-K, 또는 Z-L 의 화합물이다.
Figure pct00318
일부 구현예에서, 보론화제는 보란-N,N-디이소프로필에틸아민 (BH3 DIPEA), 보란-피리딘 (BH3 Py), 보란-2-클로로피리딘 (BH3 CPy), 보란-아닐린 (BH3 An), 보란-테트라히드로피이란 (BH3 THF), 또는 보란-디메틸술피드 (BH3 Me2S) 이다.
일부 구현예에서, 개질 단계 후, 키랄 보조기는 성장하는 올리고뉴클레오티드 사슬로부터 떨어진다. 일부 구현예에서, 개질 단계 후, 키랄 보조기는 뉴클레오티드간 인 원자에 연결된 채로 유지된다.
상기 방법의 일부 구현예에서, 개질 단계는 산화 단계이다. 상기 방법의 일부 구현예에서, 개질 단계는 본 출원에서 상기 기재된 바와 유사한 조건을 사용하는 산화 단계이다. 일부 구현예에서, 산화 단계는, 예를 들어 JP 2010-265304 A 및 WO2010/064146 에 개시된 바와 같다.
사슬 신장 사이클 및 탈보호 단계
캡핑된 축합된 중간체는 성장하는 핵산 사슬의 5'-말단에서 차단기를 제거함으로써 탈차단되어, 화합물을 제공한다. 화합물은 임의로 사슬 신장 사이클에 재입장하여 축합된 중간체, 캡핑된 축합된 중간체, 개질된 캡핑된 축합된 중간체, 및 5'-탈보호된 개질된 캡핑된 중간체를 형성한다. 한 차례의 사슬 신장 사이클 후에, 5'-탈보호된 개질된 캡핑된 중간체는 키랄 보조제 리간드 및 기타 보호기, 예를 들어 핵염기, 개질된 핵염기, 당 및 개질된 당 보호기의 제거에 의해 추가로 탈차단되어, 핵산을 제공한다. 다른 구현예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오시드는 본원에 기재된 바와 같은 이전의 사슬 신장 사이클로부터의 중간체이다. 또 다른 구현예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오시드는 또 다른 공지된 핵산 합성 방법으로부터 수득된 중간체이다. 고체 지지체가 사용되는 구현예에서, 인-원자 개질된 핵산은, 이어서 고체 지지체로부터 절단된다. 특정 구현예에서, 핵산은 정제 목적을 위하여 고체 지지체 상에 부착된 채로 남겨지고, 이어서 정제 후에 고체 지지체로부터 절단된다.
또 다른 구현예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오시드는 또 다른 공지된 핵산 합성 방법으로부터 수득된 중간체이다. 또 다른 구현예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오시드는 본 출원에 기재된 바와 같은 또 다른 공지된 핵산 합성 방법으로부터 수득된 중간체이다. 또 다른 구현예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오시드는 반응식 I 에 예시된 하나 이상의 사이클을 포함하는 또 다른 공지된 핵산 합성 방법으로부터 수득된 중간체이다. 또 다른 구현예에서, 5'-OH 모이어티를 포함하는 뉴클레오시드는 반응식 I-b, I-c 또는 I-d 에 예시된 하나 이상의 사이클을 포함하는 또 다른 공지된 핵산 합성 방법으로부터 수득된 중간체이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 출발 재료로서 안정하고 상업적으로 입수가능한 재료를 사용하는 올리고뉴클레오티드 합성 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 비키랄 출발 재료를 사용하여 입체제어된 인 원자-개질된 올리고뉴클레오티드 유도체를 제조하는 올리고뉴클레오티드 합성 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 탈보호 단계 하에서 분해를 야기하지 않는다. 나아가, 상기 방법은 인 원자-개질된 올리고뉴클레오티드 유도체를 제조하기 위하여 특정 캡핑제가 요구되지 않는다.
축합 시약
본 개시의 방법에 따라 유용한 축합 시약 (CR) 은 하기 일반식 중 임의의 하나를 갖는다:
Figure pct00319
[식 중, Z1, Z2, Z3, Z4, Z5, Z6, Z7, Z8, 및 Z9 는 독립적으로 알킬, 아미노알킬, 시클로알킬, 헤테로시클릭, 시클로알킬알킬, 헤테로시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 또는 헤테로아릴옥시로부터 선택되는 임의로 치환된 기이거나, 또는 Z2 및 Z3, Z5 및 Z6, Z7 및 Z8, Z8 및 Z9, Z9 및 Z7, 또는 Z7 및 Z8 및 Z9 는 함께 취해져 3 내지 20 원 지환식 또는 헤테로시클릭 고리를 형성하고; Q- 는 반대 음이온이고; LG 는 이탈기임].
일부 구현예에서, 축합 시약 CR 의 반대 이온은 Cl-, Br-, BF4 -, PF6 -, TfO-, Tf2N-, AsF6 -, ClO4 -, 또는 SbF6 - 이고, 여기서 Tf 는 CF3SO2 이다. 일부 구현예에서, 축합 시약 CR 의 이탈기는 F, Cl, Br, I, 3-니트로-1,2,4-트리아졸, 이미다졸, 알킬트리아졸, 테트라졸, 펜타플루오로벤젠, 또는 1-히드록시벤조트리아졸이다.
본 개시의 방법에 따라 사용되는 축합 시약의 예에는, 비제한적으로, 펜타플루오로벤조일 클로라이드, 카르보닐디이미다졸 (CDI), 1-메시틸렌술포닐-3-니트로트리아졸 (MSNT), 1-에틸-3-(3'-디메틸아미노프로필)카르보디이미드 히드로클로라이드 (EDCI-HCl), 벤조트리아졸-1-일옥시트리스(디메틸아미노)포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyBOP), N,N'-비스(2-옥소-3-옥사졸리디닐)포스피닉 클로라이드 (BopCl), 2-(1H-7-아자벤조트리아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 (HATU), 및 O-벤조트리아졸-N,N,N',N'-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트 (HBTU), DIPCDI; N,N'-비스(2-옥소-3-옥사졸리디닐)포스피닉 브로마이드 (BopBr), 1,3-디메틸-2-(3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일)-2-피롤리딘-1-일-1,3,2-디아자포스폴리디늄 헥사플루오로포스페이트 (MNTP), 3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일-트리스(피롤리딘-1-일)포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyNTP), 브로모트리피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyBrOP); O-(벤조트리아졸-1-일)-N,N,N',N'-테트라메틸우로늄 테트라플루오로보레이트 (TBTU); 및 테트라메틸플루오로포름아미디늄 헥사플루오로포스페이트 (TFFH) 가 포함된다. 특정 구현예에서, 축합 시약 CR 의 반대 이온은 Cl-, Br-, BF4 -, PF6 -, TfO-, Tf2N-, AsF6 -, ClO4 -, 또는 SbF6 - 이고, 여기서 Tf 는 CF3SO2 이다.
일부 구현예에서, 축합 시약은 1-(2,4,6-트리이소프로필벤젠술포닐)-5-(피리딘-2-일) 테트라졸리드, 피발로일 클로라이드, 브로모트리스피롤리디노포스포늄 헥사플루오로포스페이트, N,N'-비스(2-옥소-3-옥사졸리디닐) 포스피닉 클로라이드 (BopCl), 또는 2-클로로-5,5-디메틸-2-옥소-1,3,2-디옥사포스피난이다. 일부 구현예에서, 축합 시약은 N,N'-비스(2-옥소-3-옥사졸리디닐)포스피닉 클로라이드 (BopCl) 이다. 일부 구현예에서, 축합 시약은 WO/2006/066260 에 기재된 것들로부터 선택된다.
일부 구현예에서, 축합 시약은 1,3-디메틸-2-(3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일)-2-피롤리딘-1-일-1,3,2-디아자포스폴리디늄 헥사플루오로포스페이트 (MNTP), 또는 3-니트로-1,2,4-트리아졸-1-일-트리스(피롤리딘-1-일)포스포늄 헥사플루오로포스페이트 (PyNTP) 이다:
Figure pct00320
.
뉴클레오시드 커플링 파트너의 염기 및 당의 선택
본원에 기재된 바, 본 개시의 방법에 따라 사용되는 뉴클레오시드 커플링 파트너는 서로 동일하거나 서로 상이할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 합성에 사용되는 뉴클레오시드 커플링 파트너는, 서로 동일한 구조 및/또는 입체화학적 배열을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 합성에 사용되는 각각의 뉴클레오시드 커플링 파트너는, 올리고뉴클레오티드의 특정한 기타 뉴클레오시드 커플링 파트너와 동일한 구조 및/또는 입체화학적 배열을 갖지 않는다. 본 개시의 방법에 따라 사용되는 핵염기 및 당의 예는 본원에 기재되어 있다. 관련 화학 및 합성 분야의 당업자는, 본원에 기재된 핵염기 및 당의 임의의 조합이 본 개시의 방법에 따른 사용을 위해 고려된다는 것을 인식할 것이다.
커플링 단계
본 개시에 따라 사용되는 커플링 절차 및 키랄 시약 및 축합 시약의 예는, 특히, Wada I (JP4348077; WO2005/014609; WO2005/092909), Wada II (WO2010/064146), Wada III (WO2012/039448), 및 Chiral Control (WO2010/064146) 개략되어 있다. 본 개시에 따라 사용되는 키랄 뉴클레오시드 커플링 파트너는 또한 본원에서 "와다 아미다이트 (Wada amidite)" 로서 언급된다. 일부 구현예에서, 커플링 파트너는
Figure pct00321
의 구조를 갖고, 여기서 BPRO 는 보호된 핵염기이다. 일부 구현예에서, 커플링 파트너는
Figure pct00322
의 구조를 갖고, 여기서 BPRO 는 보호된 핵염기이다. 일부 구현예에서, 커플링 파트너는
Figure pct00323
의 구조를 갖고, 여기서 BPRO 는 보호된 핵염기이고, R1 은 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, 커플링 파트너는
Figure pct00324
의 구조를 갖고, 여기서 BPRO 는 보호된 핵염기이고, R1 은 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬이다. 일부 구현예에서, R1 은 Me 이다.
커플링 파트너로서의 키랄 포스포라미다이트의 예는 하기에 도시된 바와 같다:
Figure pct00325
.
부가적인 예는 Chiral Control (WO2010/064146) 에 기재되어 있다.
커플링 파트너의 합성에 사용되는 방법 중 하나는 하기 반응식 II 에 도시되어 있다.
반응식 II. 커플링 파트너 합성의 예.
Figure pct00326
일부 구현예에서, 커플링 단계는 커플링을 수행하기에 적합한 조건 하에서, 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드 단위의 유리 히드록실기를 뉴클레오시드 커플링 파트너와 반응시키는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 커플링 단계는 탈차단 단계에 선행된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 성장하는 올리고뉴클레오티드의 5' 히드록실기는 차단되고 (즉, 보호되고), 후속으로 뉴클레오시드 커플링 파트너와 반응하기 위하여 탈차단되어야 한다.
일단 성장하는 올리고뉴클레오티드의 적절한 히드록실기가 탈차단되면, 지지체는 세정되고 키랄 시약을 포함하는 용액 및 활성화제를 포함하는 용액의 전달을 위한 제제 중에서 건조된다. 일부 구현예에서, 키랄 시약 및 활성화제는 동시에 전달된다. 일부 구현예에서, 동시전달은 용액 중 소정량의 키랄 시약 (예를 들어, 포스포라미다이트 용액), 및 용액 (예를 들어, CMPT 용액) 중 소정량의 활성화제를, 극성 비양성자성 용매, 예컨대 니트릴 용매 (예를 들어, 아세토니트릴) 중에서 전달하는 것을 포함한다.
일부 구현예에서, 커플링 단계는 키랄 포스파이트 생성물이 부분입체이성질체 초과량 (diastereomeric excess) > 95% 으로 존재하는 미정제 생성물 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 키랄 포스파이트 생성물은 부분입체이성질체 초과량 > 96% 로 존재한다. 일부 구현예에서, 키랄 포스파이트 생성물은 부분입체이성질체 초과량 > 97% 로 존재한다. 일부 구현예에서, 키랄 포스파이트 생성물은 부분입체이성질체 초과량 > 98% 로 존재한다. 일부 구현예에서, 키랄 포스파이트 생성물은 부분입체이성질체 초과량 > 99% 로 존재한다.
캡핑 단계:
제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 제조 방법은 캡핑 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 캡핑 단계는 단일 단계이다. 일부 구현예에서, 캡핑 단계는 2 단계이다. 일부 구현예에서, 캡핑 단계는 2 단계 초과이다.
일부 구현예에서, 캡핑 단계는 키랄 보조제의 유리 아민의 캡핑 및 임의의 잔류 미반응 5' 히드록실기의 캡핑 단계를 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 보조제의 유리 아민 및 미반응 5' 히드록실기는 동일한 캡핑기로 캡핑된다. 일부 구현예에서, 키랄 보조제의 유리 아민 및 미반응 5' 히드록실기는 상이한 캡핑기로 캡핑된다. 특정 구현예에서, 상이한 캡핑기로의 캡핑은 올리고뉴클레오티드의 합성 동안 하나의 캡핑기가 다른 것에 비해 선택적으로 제거되는 것을 가능하게 한다. 일부 구현예에서, 상기 2 가지 기 모두의 캡핑은 동시에 일어난다. 일부 구현예에서, 상기 2 가지 기 모두의 캡핑은 반복적으로 일어난다.
특정 구현예에서, 캡핑은 반복적으로 일어나고, 유리 아민을 캡핑하는 제 1 단계, 이어서 유리된 5' 히드록실기를 캡핑하는 제 2 단계를 포함하고, 여기서 유리 아민 및 5' 히드록실기는 둘 모두 동일한 캡핑기로 캡핑된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 키랄 보조제의 유리 아민은 무수물 (예를 들어, 페녹시아세트산 무수물, 즉, Pac2O) 을 사용하여 캡핑되고, 그 후 5' 히드록실기가 동일한 무수물로 캡핑된다. 특정 구현예에서, 동일한 무수물을 이용한 5' 히드록실기의 캡핑은 상이한 조건 하에서 (예를 들어, 하나 이상의 부가적 시약 존재 하에서) 일어난다. 일부 구현예에서, 5' 히드록실기의 캡핑은 에테르성 용매 중 아민 염기 (예를 들어, THF 중 NMI (N-메틸이미다졸)) 의 존재 하에서 일어난다. 구절 "캡핑기" 는 본원에서 구절 "보호기" 및 "차단기" 와 상호교환적으로 사용된다.
일부 구현예에서, 아민 캡핑기는 중간체 포스파이트 종의 재배열 및/또는 분해를 방지하도록 아민을 효과적으로 캡핑하는 것을 특징으로 한다. 일부 구현예에서, 캡핑기는 뉴클레오티드간 연결 인의 분자내 절단을 방지하기 위하여 키랄 보조제의 아민을 보호하는 이의 능력에 대하여 선택된다.
일부 구현예에서, 5' 히드록실기 캡핑기는 "쇼트머 (shortmer)", 예를 들어, 제 1 사이클에서는 반응하는데 실패하지만, 그 후 하나 이상의 후속 사이클에서 반응하는 올리고뉴클레오티드 사슬의 반응으로부터 발생하는, "n-m" (m 및 n 은 정수이고, m<n 이고; n 은 표적화된 올리고뉴클레오티드 내 염기의 개수임) 불순물의 발생을 방지하도록 히드록실기를 효과적으로 캡핑하는 것을 특징으로 한다. 상기와 같은 쇼트머, 특히 "n-1" 의 존재는 미정제 올리고뉴클레오티드의 순도에 유해한 영향을 미치고, 올리고뉴클레오티드의 최종 정제를 오래 지속되고 일반적으로 저-수율로 만든다.
일부 구현예에서, 특정 캡은 특정 조건 하에서 특정 유형의 반응을 용이하게 하는 경향성에 기반하여 선택된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 캡핑기는 성장하는 올리고뉴클레오티드로부터 캡 및/또는 보조제를 절단하는, E1 제거 반응을 용이하게 하는 능력에 대하여 선택된다. 일부 구현예에서, 캡핑기는 성장하는 올리고뉴클레오티드로부터 캡 및/또는 보조제를 절단하는, E2 제거 반응을 용이하게 하는 능력에 대하여 선택된다. 일부 구현예에서, 캡핑기는 성장하는 올리고뉴클레오티드로부터 캡 및/또는 보조제를 절단하는, β-제거 반응을 용이하게 하는 능력에 대하여 선택된다.
개질 단계:
본원에서 사용된 바, 구절 "개질하는 단계", "개질 단계" 및 "P-개질 단계" 는 상호교환적으로 사용되고, 일반적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 설치하는데 사용되는 임의의 하나 이상의 단계를 나타낸다. 일부 구현예에서, 개질된 뉴클레오티드간 연결은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 본 개시의 P-개질 단계는 제공된 올리고뉴클레오티드의 조립이 완료된 후 보다는 제공된 올리고뉴클레오티드의 조립 동안에 일어난다. 따라서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 각각의 뉴클레오티드 단위는 뉴클레오티드 단위가 설치되는 사이클 동안 연결 인에서 개별적으로 개질될 수 있다.
일부 구현예에서, 적합한 P-개질 시약은 황 친전자체, 셀레늄 친전자체, 산소 친전자체, 보론화 시약, 또는 아지드 시약이다.
예를 들어, 일부 구현예에서, 셀레늄 시약은 원소 셀레늄, 셀레늄 염, 또는 치환된 디셀레니드이다. 일부 구현예에서, 산소 친전자체는 원소 산소, 퍼옥시드, 또는 치환된 퍼옥시드이다. 일부 구현예에서, 보론화 시약은 보란-아민 (예를 들어, N,N-디이소프로필에틸아민 (BH3·DIPEA), 보란-피리딘 (BH3·Py), 보란-2-클로로피리딘 (BH3·CPy), 보란-아닐린 (BH3·An)), 보란-에테르 시약 (예를 들어, 보란-테트라히드로푸란 (BH3·THF)), 보란-디알킬술피드 시약 (예를 들어, BH3·Me2S), 아닐린-시아노보란, 또는 트리페닐포스핀-카르보알콕시보란이다. 일부 구현예에서, 아지드 시약은 후속 환원을 거쳐 아민기를 제공할 수 있는 아지드기를 포함한다.
일부 구현예에서, P-개질 시약은 본원에 기재된 바와 같은 황화 시약이다. 일부 구현예에서, 개질 단계는 포스포로티오에이트 연결 또는 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결을 제공하는 인의 황화를 포함한다. 일부 구현예에서, 개질 단계는 화학식 I 의 뉴클레오티드간 연결을 갖는 올리고뉴클레오티드를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 황화 시약, 및 그의 제조 방법, 및 용도를 제공한다.
일부 구현예에서, 상기와 같은 황화 시약은 티오술포네이트 시약이다. 일부 구현예에서, 티오술포네이트 시약은 하기 화학식 S- I 의 구조를 갖는다:
Figure pct00327
[식 중,
Rs1 은 R 이고;
R, L 및 R1 은 각각 독립적으로 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, 황화 시약은 비스(티오술포네이트) 시약이다. 일부 구현예에서, 비스(티오술포네이트) 시약은 하기 화학식 S- II 의 구조를 갖는다:
Figure pct00328
[식 중, 각각의 Rs1 및 L 은 독립적으로 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같음].
상기에서 일반적으로 정의된 바, Rs1 은 R 이고, 여기서 R 은 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 지방족, 아릴, 헤테로시클릴 또는 헤테로아릴이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 알킬이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 알킬이다. 일부 구현예에서, R s1 은 메틸이다. 일부 구현예에서, R s1 은 시아노메틸이다. 일부 구현예에서, R s1 은 니트로메틸이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 아릴이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 p-니트로페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 p-메틸페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 p-클로로페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 o-클로로페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 2,4,6-트리클로로페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 펜타플루오로페닐이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 헤테로시클릴이다. 일부 구현예에서, Rs1 은 임의 치환된 헤테로아릴이다.
일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00329
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00330
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00331
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00332
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00333
(o-ClPheTS) 이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00334
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00335
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00336
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00337
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00338
이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00339
(a-CF3MTS) 이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00340
(a-CF3TS) 이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00341
(a-CHF2TS) 이다. 일부 구현예에서, Rs1-S(O)2S- 은
Figure pct00342
(a-CH2FTS) 이다.
일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이다. 일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 임의 치환된 C1-C6 알킬렌이다. 일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 임의 치환된 C1-C6 알케닐렌이다. 일부 구현예에서, L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 여기서 RL3 은 하나 이상의 메틸렌 단위가 임의로 및 독립적으로 임의 치환된 C1-C6 알케닐렌, 아릴렌, 또는 헤테로아릴렌으로 대체된 임의 치환된 C1 -C6 알킬렌이다. 일부 구현예에서, RL3 은 임의 치환된 -S-(C1-C6 알케닐렌)-, -S-(C1-C6 알킬렌)-, -S-(C1-C6 알킬렌)-아릴렌-(C1-C6 알킬렌)-, -S-CO-아릴렌-(C1-C6 알킬렌)-, 또는 -S-CO-(C1-C6 알킬렌)-아릴렌-(C1-C6 알킬렌)- 이다. 일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 L 은 -S-RL3- 또는 -S-C(O)-RL3- 이고, 황 원자는 R1 에 연결된다.
일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 L 은 알킬렌, 알케닐렌, 아릴렌 또는 헤테로아릴렌이다.
일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 L 은
Figure pct00343
이다. 일부 구현예에서, L 은
Figure pct00344
Figure pct00345
이고, 여기서 황 원자는 R1 에 연결된다. 일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 R1 은
Figure pct00346
이다. 일부 구현예에서, R1 은
Figure pct00347
이고, 여기서 황 원자는 L 에 연결된다. 일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 L 은
Figure pct00348
이고, 여기서 황 원자는 R1 에 연결되고; R1 은
Figure pct00349
이고, 여기서 황 원자는 L 에 연결된다.
일부 구현예에서, 황화 시약은 S-I 또는 S- II 의 구조를 갖고, 식 중 R1 은 -S-RL2 이고, 여기서 RL2 는 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, RL2 는 -S-(C1-C6 알킬렌)-헤테로시클릴, -S-(C1-C6 알케닐렌)-헤테로시클릴, -S-(C1-C6 알킬렌)-N(R')2, -S-(C1-C6 알킬렌)-N(R')3 로부터 선택되는 임의 치환된 기이고, 여기서 각각의 R' 는 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L-R1 은 -RL3-S-S-RL2 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, -L-R1 은 -RL3-C(O)-S-S-RL2 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 상기 정의되고 본원에 기재된 바와 같다.
화학식 S- II 의 비스(티오술포네이트) 시약의 예는, 하기에 도시되어 있다:
Figure pct00350
.
일부 구현예에서, 황화 시약은 하기 화학식 중 하나를 갖는 화합물이다:
S8, Rs2-S-S-Rs3, 또는 Rs2-S-Xs-Rs3
[식 중,
Rs2 및 Rs3 은 각각 독립적으로 지방족, 아미노알킬, 카르보시클릴, 헤테로시클릴, 헤테로시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 헤테로아릴옥시, 아실, 아미드, 이미드, 또는 티오카르보닐로부터 선택되는 임의 치환된 기이거나; 또는
Rs2 및 Rs3 은 이들에 결합되는 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
Xs 는 -S(O)2-, -O-, 또는 -N(R')- 이고;
R' 는 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같음].
일부 구현예에서, 황화 시약은 S8,
Figure pct00351
Figure pct00352
이다. 일부 구현예에서, 황화 시약은 S8,
Figure pct00353
이다. 일부 구현예에서, 황화 시약은
Figure pct00354
이다.
황화 시약의 예는 하기에 도시되어 있다:
Figure pct00355
Figure pct00356
일부 구현예에서, 제공된 황화 시약은 H-포스포네이트를 개질하는데 사용된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, H-포스포네이트 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 Wada I 또는 Wada II 의 방법을 사용하여 합성되고, 화학식 S-I 또는 S- II 의 황화 시약을 사용하여 개질된다:
Figure pct00357
[식 중, 각각의 RS1, L, 및 R1 은 상기 및 본원에 기재되고 정의된 바와 같음].
일부 구현예에서, 본 개시는 하기 단계를 포함하는, 포스포로티오에이트 트리에스테르의 합성 방법을 제공한다:
i) 하기의 구조의 H-포스포네이트를 실릴화 시약과 반응시켜, 실릴옥시포스포네이트를 제공하는 단계:
Figure pct00358
[식 중, W, Y, 및 Z 는 각각 상기 및 본원에 기재되고 정의된 바와 같음];
ii) 실릴옥시포스포네이트를 하기의 구조 S-I 또는 S- II 의 황화 시약과 반응시켜, 포스포로티오트리에스테르를 제공하는 단계:
Figure pct00359
.
일부 구현예에서, 뉴클레오티드간 연결에 개질을 도입하는데 황화 시약 대신 셀레늄 친전자체가 사용된다. 일부 구현예에서, 셀레늄 친전자체는 하기 화학식 중 하나를 갖는 화합물이다:
Se, Rs2-Se-Se-Rs3, 또는 Rs2-Se-Xs-Rs3
[식 중,
Rs2 및 Rs3 은 각각 독립적으로 지방족, 아미노알킬, 카르보시클릴, 헤테로시클릴, 헤테로시클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, 알킬옥시, 아릴옥시, 헤테로아릴옥시, 아실, 아미드, 이미드, 또는 티오카르보닐로부터 선택되는 임의 치환된 기이거나; 또는
Rs2 및 Rs3 은 이들에 결합되는 원자와 함께 취해져 임의 치환된 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
Xs 는 -S(O)2-, -O-, 또는 -N(R')- 이고;
R' 는 상기 및 본원에 정의되고 기재된 바와 같음].
다른 구현예에서, 셀레늄 친전자체는 Se, KSeCN,
Figure pct00360
의 화합물이다. 일부 구현예에서, 셀레늄 친전자체는 Se 또는
Figure pct00361
이다.
일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 황화 시약은 황화 동안 인에 전달되는 모이어티가 단일 황 원자 (예를 들어, -S- 또는 =S) 가 아니라 치환된 황 (예를 들어, -SR) 인 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 황화 시약은, 시약의 활성이, 시약을 특정 전자 구인성 또는 공여성 기로 개질함으로써 조정 가능한 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 황화 시약은 결정질인 것을 특징으로 한다. 일부 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 황화 시약은 고도의 결정도를 갖는 것을 특징으로 한다. 특정 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 황화 시약은, 예를 들어 재결정화를 통해 시약의 정제가 용이한 것을 특징으로 한다. 특정 구현예에서, 본 개시에 따라 사용되는 황화 시약은 황-함유 불순물이 실질적으로 없는 것을 특징으로 한다. 일부 구현예에서, 황-함유 불순물이 실질적으로 없는 황화 시약은 증가된 효율을 나타낸다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결을 포함한다. 상기와 같은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 합성하기 위하여, 하나 이상의 개질 단계가 임의로 산화 단계로 대체되어 상응하는 포스페이트 디에스테르 연결을 설치한다. 일부 구현예에서, 산화 단계는 통상의 올리고뉴클레오티드 합성과 유사한 방식으로 수행된다. 일부 구현예에서, 산화 단계는 I2 의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 산화 단계는 I2 및 피리딘의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 산화 단계는 THF/피리딘/물 (70:20:10 - v/v/v) 공용매 시스템 중 0.02 M I2 의 사용을 포함한다. 사이클의 예는 반응식 I-c 에 도시되어 있다.
일부 구현예에서, 포스포로티오에이트는 황화 시약, 예를 들어 3-페닐-1,2,4-디티아졸린-5-온에 의한 황화를 통해 직접적으로 형성된다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트의 직접 설치 후, 키랄 보조기는 뉴클레오티드간 인 원자에 부착된 채로 유지된다. 일부 구현예에서, 키랄 보조제의 제거를 위한 부가적인 탈보호 단계 (예를 들어, DPSE-유형 키랄 보조제의 경우, TBAF, HF-Et3N 등을 사용하여) 요구된다.
일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 합성하기 위하여 포스포로티오에이트 전구체가 사용된다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 포스포로티오에이트 전구체는
Figure pct00362
이다. 일부 구현예에서,
Figure pct00363
은, 사이클 퇴장 후, 표준 탈보호/방출 절차 동안 포스포로티오에이트 디에스테르 연결로 전환된다. 예가 하기에 추가로 도시되어 있다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결 및 하나 이상의 포스포로티오에이트 디에스테르 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 포스페이트 디에스테르 연결 및 하나 이상의 포스포로티오에이트 디에스테르 연결을 포함하고, 여기서 적어도 하나의 포스페이트 디에스테르 연결은 3' → 5' 로 합성될 때 모든 포스포로티오에이트 디에스테르 연결 다음에 설치된다. 상기와 같은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 합성하기 위하여, 일부 구현예에서, 하나 이상의 개질 단계가 임의로 산화 단계로 대체되어 상응하는 포스페이트 디에스테르 연결을 설치하고, 포스포로티오에이트 전구체가 각각의 포스포로티오에이트 디에스테르 연결에 대하여 설치된다. 일부 구현예에서, 목적하는 올리고뉴클레오티드 길이가 달성된 후, 포스포로티오에이트 전구체는 포스포로티오에이트 디에스테르 연결로 전환된다. 일부 구현예에서, 사이클 퇴장 동안 또는 후의 탈보호/방출 단계는 포스포로티오에이트 전구체를 포스포로티오에이트 디에스테르 연결로 전환시킨다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 전구체는 베타-제거 경로에 의해 제거될 수 있는 능력을 갖는 것을 특징으로 한다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 전구체는
Figure pct00364
이다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 합성 동안 포스포로티오에이트 전구체, 예를 들어
Figure pct00365
를 사용하는 이점 중 하나는,
Figure pct00366
이 특정 조건에서 포스포로티오에이트보다 더 안정하다는 점이다.
일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 전구체는 본원에 기재된 바와 같은 인 보호기, 예를 들어 2-시아노에틸 (CE 또는 Cne), 2-트리메틸실릴에틸, 2-니트로에틸, 2-술포닐에틸, 메틸, 벤질, o-니트로벤질, 2-(p-니트로페닐)에틸 (NPE 또는 Npe), 2-페닐에틸, 3-(N-tert-부틸카르복사미도)-1-프로필, 4-옥소펜틸, 4-메틸티오-l-부틸, 2-시아노-1,1-디메틸에틸, 4-N-메틸아미노부틸, 3-(2-피리딜)-1-프로필, 2-[N-메틸-N-(2-피리딜)]아미노에틸, 2-(N-포르밀,N-메틸)아미노에틸, 4-[N-메틸-N-(2,2,2-트리플루오로아세틸)아미노]부틸이다. 예는 하기에 추가로 도시되어 있다.
상기 언급된 바와 같이, 일부 구현예에서, 황화는 성장하는 올리고뉴클레오티드로부터 키랄 시약을 절단하는 조건 하에서 일어난다. 일부 구현예에서, 황화는 성장하는 올리고뉴클레오티드로부터 키랄 시약을 절단하지 않는 조건 하에서 일어난다.
일부 구현예에서, 황화 시약은 적합한 용매 중에 용해되고, 컬럼에 전달된다. 특정 구현예에서, 용매는 극성 비양성자성 용매, 예컨대 니트릴 용매이다. 일부 구현예에서, 용매는 아세토니트릴이다. 일부 구현예에서, 황화 시약의 용액은 황화 시약 (예를 들어, 본원에 기재된 바와 같은 티오술포네이트 유도체) 을 니트릴 용매 (예를 들어, 아세토니트릴) 중 BSTFA (N,O-비스-트리메틸실릴-트리플루오로아세트아미드) 와 혼합함으로써 제조된다. 일부 구현예에서, BSTFA 는 포함되지 않는다. 예를 들어, 본 발명자들은, 비교적 반응성이 큰 일반식 Rs2-S-S(O)2-Rs3 의 황화 시약이 종종 BSTFA 의 부재 하에서 황화 반응에 성공적으로 참여할 수 있다는 것을 발견하였다. 하나의 예를 들자면, 본 발명자들은 Rs2 가 p-니트로페닐이고, Rs3 이 메틸인 경우에 BSTFA 가 요구되지 않는다는 것을 입증하였다. 본 개시를 고려하여, 당업자는 BSTFA 가 요구되지 않는 기타 상황 및/또는 황화 시약을 용이하게 결정할 수 있을 것이다.
일부 구현예에서, 황화 단계는 실온에서 수행된다. 일부 구현예에서, 황화 단계는 저온에서, 예컨대 약 0 ℃, 약 5 ℃, 약 10 ℃, 또는 약 15 ℃ 에서 수행된다. 일부 구현예에서, 황화 단계는 약 20 ℃ 초과의 승온에서 수행된다.
일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 120 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 90 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 60 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 30 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 25 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 20 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 15 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 1 분 내지 약 10 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 5 분 내지 약 60 분 동안 진행된다.
일부 구현예에서, 황화 반응은 약 5 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 10 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 15 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 20 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 25 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 30 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 35 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 40 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 45 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 50 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 55 분 동안 진행된다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 약 60 분 동안 진행된다.
예상외로, 본 개시의 방법에 따라 제조되는 특정 황화 개질 생성물이 예상외로 안정하다는 것을 발견하였다. 일부 구현예에서, 예상외로 안정한 생성물은 포스포로티오에이트 트리에스테르이다. 일부 구현예에서, 예상외로 안정한 생성물은 화학식 I- c 의 구조를 갖는 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드이다.
관련 분야의 당업자는 본원에 기재된 황화 방법 및 본원에 기재된 황화 시약이 또한 Wada II (WO2010/064146) 에 기재된 바와 같은 H-포스포네이트 올리고뉴클레오티드 개질의 맥락에서 유용하다는 것을 인식할 것이다.
일부 구현예에서, 황화 반응은 적어도 약 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 또는 98% 의 단계적 황화 효율을 갖는다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 98% 이상의 순도를 갖는 미정제 디뉴클레오티드 생성물 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 90% 이상의 순도를 갖는 미정제 테트라뉴클레오티드 생성물 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 70% 이상의 순도를 갖는 미정제 도데카뉴클레오티드 생성물 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 황화 반응은 50% 이상의 순도를 갖는 미정제 아이코사뉴클레오티드 생성물 조성물을 제공한다.
일단 연결 인의 개질 단계가 완료되면, 올리고뉴클레오티드는 사이클 재입장을 위한 준비로서 또 다른 탈차단 단계를 거친다. 일부 구현예에서, 키랄 보조제는 황화 후 온전하게 유지되고, 사이클 재입장 전에 필수적으로 일어나는 후속 탈차단 단계 동안 탈차단된다. 탈차단, 커플링, 캡핑, 및 개질 과정은 성장하는 올리고뉴클레오티드가 목적하는 길이에 도달할 때까지 반복되고, 목적하는 길이에 도달했을 때 올리고뉴클레오티드는 고체 지지체로부터 즉시 절단되거나 또는 정제 목적을 위하여 지지체에 부착된 채로 남아있다가 이후에 절단될 수 있다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 보호기는 하나 이상의 뉴클레오티드 염기 상에 존재하고, 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단 및 염기의 탈보호는 단일 단계로 일어난다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 보호기는 하나 이상의 뉴클레오티드 염기 상에 존재하고, 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단 및 염기의 탈보호는 하나 초과의 단계로 일어난다. 일부 구현예에서, 지지체로부터의 절단 및 탈보호는 염기성 조건 하에서, 예를 들어 하나 이상의 아민 염기를 사용하여 일어난다. 특정 구현예에서, 하나 이상의 아민 염기는 프로필 아민을 포함한다. 특정 구현예에서, 하나 이상의 아민 염기는 피리딘을 포함한다.
일부 구현예에서, 지지체로부터의 절단 및/또는 탈보호는 약 30 ℃ 내지 약 90 ℃ 의 승온에서 일어난다. 일부 구현예에서, 지지체로부터의 절단 및/또는 탈보호는 약 40 ℃ 내지 약 80 ℃ 의 승온에서 일어난다. 일부 구현예에서, 지지체로부터의 절단 및/또는 탈보호는 약 50 ℃ 내지 약 70 ℃ 의 승온에서 일어난다. 일부 구현예에서, 지지체로부터의 절단 및/또는 탈보호는 약 60 ℃ 의 승온에서 일어난다. 일부 구현예에서, 지지체로부터의 절단 및/또는 탈보호는 주위 온도에서 일어난다.
정제 절차의 예는 본원에 기재되어 있고/있거나 관련 분야에 일반적으로 공지되어 있다.
주목할 만한 것은, 각각의 사이클 동안 성장하는 올리고뉴클레오티드로부터 키랄 보조제의 제거가 적어도 하기 이유에 있어서 유익하다는 것이다: (1) 잠재적으로 민감성인 관능기가 인 상에 설치되는 경우, 보조제는 올리고뉴클레오티드 합성의 마지막에 별도의 단계에서 제거될 필요가 없음; (2) 부반응을 거치고/거치거나 후속 화학을 방해하는 경향이 있는 불안정한 인-보조제 중간체가 회피됨. 따라서, 각각의 사이클 동안 키랄 보조제의 제거는 전체적 합성을 더욱 효율적으로 만든다.
사이클의 맥락에서 탈차단 단계가 상기 기재되어 있지만, 부가적인 일반적 방법이 하기에 포함되어 있다.
탈차단 단계
일부 구현예에서, 커플링 단계는 탈차단 단계에 선행된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 성장하는 올리고뉴클레오티드의 5' 히드록실기는 차단되고 (즉, 보호되고), 후속으로 뉴클레오시드 커플링 파트너와 반응하기 위하여 탈차단되어야 한다.
일부 구현예에서, 차단기의 제거를 위하여 산성화가 사용된다. 일부 구현예에서, 산은 브뢴스테드 산 (Brønsted acid) 또는 루이스 산이다. 유용한 브뢴스테드 산은 pKa (물 중 25 ℃) 값이 유기 용매 또는 물 (80% 아세트산의 경우) 중 -0.6 (트리플루오로아세트산) 내지 4.76 (아세트산) 인, 카르복실산, 알킬술폰산, 아릴술폰산, 인산 및 이의 유도체, 포스폰산 및 이의 유도체, 알킬포스폰산 및 이의 유도체, 아릴포스폰산 및 이의 유도체, 포스핀산, 디알킬포스핀산, 및 디아릴포스핀산이다. 산성화 단계에서 사용되는 산의 농도 (1 내지 80%) 는 산의 산도에 의존한다. 강산 조건은 퓨리닐 또는 피리미디닐 염기가 리보오스 고리 및 또는 기타 당 고리로부터 절단되는 탈퓨린화/탈피리미딘화를 초래할 것이기 때문에, 산 강도에 대한 고려가 이루어져야 한다. 일부 구현예에서, 산은 Ra1COOH, Ra1SO3H, Ra3SO3H,
Figure pct00367
로부터 선택되고, 식 중 Ra1 및 Ra2 는 각각 독립적으로 수소 또는 임의로 치환된 알킬 또는 아릴이고, Ra3 은 임의로 치환된 알킬 또는 아릴이다.
일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 루이스 산에 의해 달성된다. 상기와 같은 유용한 루이스 산의 예는 Zn(Xa)2 이고, 여기서 Xa 는 Cl, Br, I, 또는 CF3SO3 이다.
일부 구현예에서, 산성화 단계는 축합된 중간체로부터 퓨린 모이어티를 제거하지 않으면서 차단기를 제거하는데 효과적인 소정량의 브뢴스테드 또는 루이스 산의 첨가를 포함한다.
산성화 단계에서 유용한 산에는 또한, 비제한적으로, 유기 용매 중 10% 인산, 유기 용매 중 10% 염산, 유기 용매 중 1% 트리플루오로아세트산, 유기 용매 중 3% 디클로로아세트산 또는 트리클로로아세트산, 또는 물 중 80% 아세트산이 포함된다. 이러한 단계에서 사용되는 임의의 브뢴스테드 또는 루이스 산의 농도는, 산의 농도가 당 모이어티로부터 핵염기의 절단을 야기하는 농도를 초과하지 않도록 선택된다.
일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 1% 트리플루오로아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 약 0.1% 내지 약 8% 트리플루오로아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 3% 디클로로아세트산 또는 트리클로로아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 약 0.1% 내지 약 10% 디클로로아세트산 또는 트리클로로아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 3% 트리클로로아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 유기 용매 중 약 0.1% 내지 약 10% 트리클로로아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 물 중 80% 아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 물 중 약 50% 내지 약 90%, 또는 약 50% 내지 약 80%, 약 50% 내지 약 70%, 약 50% 내지 약 60%, 약 70% 내지 약 90% 아세트산의 첨가를 포함한다. 일부 구현예에서, 산성화는 산성 용매에의 양이온 스캐빈저 (scavenger) 의 추가 첨가를 포함한다. 특정 구현예에서, 양이온 스캐빈저는 트리에틸실란 또는 트리이소프로필실란일 수 있다. 일부 구현예에서, 차단기는 유기 용매 중 1% 트리플루오로아세트산의 첨가를 포함하는 산성화에 의해 탈차단된다. 일부 구현예에서, 차단기는 유기 용매 중 3% 디클로로아세트산의 첨가를 포함하는 산성화에 의해 탈차단된다. 일부 구현예에서, 차단기는 유기 용매 중 3% 트리클로로아세트산의 첨가를 포함하는 산성화에 의해 탈차단된다. 일부 구현예에서, 차단기는 디클로로메탄 중 3% 트리클로로아세트산의 첨가를 포함하는 산성화에 의해 탈차단된다.
특정 구현예에서, 본 개시의 방법은 합성기에서 완료되고, 성장하는 올리고뉴클레오티드의 히드록실기의 탈차단 단계는 소정량의 용매를 합성기 컬럼에 전달하는 것을 포함하며, 상기 컬럼은 올리고뉴클레오티드가 부착되어 있는 고체 지지체를 함유한다. 일부 구현예에서, 용매는 할로겐화 용매 (예를 들어, 디클로로메탄) 이다. 특정 구현예에서, 용매는 소정량의 산을 포함한다. 일부 구현예에서, 용매는 소정량의 유기산, 예를 들어 트리클로로아세트산을 포함한다. 특정 구현예에서, 산은 약 1% 내지 약 20% w/v 의 양으로 존재한다. 특정 구현예에서, 산은 약 1% 내지 약 10% w/v 의 양으로 존재한다. 특정 구현예에서, 산은 약 1% 내지 약 5% w/v 의 양으로 존재한다. 특정 구현예에서, 산은 약 1 내지 약 3% w/v 의 양으로 존재한다. 특정 구현예에서, 산은 약 3% w/v 의 양으로 존재한다. 히드록실기의 탈차단 방법은 본원에 추가로 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 산은 디클로로메탄 중에 3% w/v 로 존재한다.
일부 구현예에서, 키랄 보조제는 탈차단 단계 전에 제거된다. 일부 구현예에서, 키랄 보조제는 탈차단 단계 동안 제거된다.
일부 구현예에서, 사이클 퇴장은 탈차단 단계 전에 수행된다. 일부 구현예에서, 사이클 퇴장은 탈차단 단계 후에 수행된다.
차단기/보호기 제거를 위한 일반적 조건
핵염기 또는 당 모이어티 상에 위치된 관능기, 예컨대 히드록실 또는 아미노 모이어티는, 통상적으로 합성 동안 차단 (보호) 기 (모이어티) 로 차단되고, 후속으로 탈차단된다. 일반적으로, 차단기는 분자의 화학적 관능기를 특정 반응 조건에 대하여 불활성으로 만들고, 이후에 분자의 나머지를 실질적으로 손상시키지 않으면서, 분자 내에서 상기와 같은 관능기로부터 제거될 수 있다 (예를 들어, Green and Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 2nd Ed., John Wiley & Sons, New York, 1991 참조). 예를 들어, 아미노기는 질소 차단기, 예컨대 프탈이미도, 9-플루드레닐메톡시카르보닐 (FMOC), 트리페닐메틸술페닐, t-BOC, 4,4'-디메톡시트리틸 (DMTr), 4-메톡시트리틸 (MMTr), 9-페닐잔틴-9-일 (Pixyl), 트리틸 (Tr), 또는 9-(p-메톡시페닐)잔틴-9-일 (MOX) 로 차단될 수 있다. 카르복실기는 아세틸기로서 보호될 수 있다. 히드록시기는, 예컨대 테트라히드로피라닐 (THP), t-부틸디메틸실릴 (TBDMS), 1-[(2-클로로-4-메틸)페닐]-4-메톡시피페리딘-4-일 (Ctmp), 1-(2-플루오로페닐)-4-메톡시피페리딘-4-일 (Fpmp), 1-(2-클로로에톡시)에틸, 3-메톡시-1,5-디카르보메톡시펜탄-3-일 (MDP), 비스(2-아세톡시에톡시)메틸 (ACE), 트리이소프로필실릴옥시메틸 (TOM), 1-(2-시아노에톡시)에틸 (CEE), 2-시아노에톡시메틸 (CEM), [4-(N-디클로로아세틸-N-메틸아미노)벤질옥시]메틸, 2-시아노에틸 (CN), 피발로일옥시메틸 (PivOM), 레부닐옥시메틸 (ALE) 로 보호될 수 있다. 기타 대표적 히드록실 차단기가 기재되어 있다 (예를 들어, [Beaucage et al., Tetrahedron, 1992, 46, 2223] 참조). 일부 구현예에서, 히드록실 차단기는 산-불안정 기, 예컨대 트리틸, 모노메톡시트리틸, 디메톡시트리틸, 트리메톡시트리틸, 9-페닐잔틴-9-일 (Pixyl) 및 9-(p-메톡시페닐)잔틴-9-일 (MOX) 이다. 화학적 관능기는 또한 이들을 전구체 형태로 포함시킴으로써 차단될 수 있다. 따라서, 아지도기는 아민으로 용이하게 전환되기 때문에, 아지도기는 아민의 차단된 형태로 간주될 수 있다. 핵산 합성에서 이용되는 추가의 대표적 보호기는 공지되어 있다 (예를 들어 [Agrawal et al., Protocols for Oligonucleotide Conjugates, Eds., Humana Press, New Jersey, 1994, Vol. 26, pp. 1-72] 참조).
핵산으로부터 차단기를 제거하는 각종 방법이 공지되어 있고 사용된다. 일부 구현예에서, 모든 차단기가 제거된다. 일부 구현예에서, 일부 차단기가 제거된다. 일부 구현예에서, 특정 차단기를 선택적으로 제거하기 위하여 반응 조건이 조정될 수 있다.
일부 구현예에서, 핵염기 차단기는, 존재하는 경우, 제공된 올리고뉴클레오티드의 조립 후 산성 시약을 이용하여 절단 가능하다. 일부 구현예에서, 핵염기 차단기는, 존재하는 경우, 산성 조건 하에서도 염기성 조건 하에서도 절단 가능하지 않고, 예를 들어 플루오라이드 염 또는 불화수소산 복합체를 이용하여 절단가능하다. 일부 구현예에서, 핵염기 차단기는, 존재하는 경우, 제공된 올리고뉴클레오티드의 조립 후 염기 또는 염기성 용매 존재 하에서 절단 가능하다. 특정 구현예에서, 하나 이상의 핵염기 차단기는 제공된 올리고뉴클레오티드의 조립 후 염기 또는 염기성 용매 존재 하에서 절단 가능하지만, 제공된 올리고뉴클레오티드의 조립 동안 일어나는 하나 이상의 조기 탈보호 단계의 특정 조건에 대하여 안정한 것을 특징으로 한다.
일부 구현예에서, 핵염기를 위한 차단기는 요구되지 않는다. 일부 구현예에서, 핵염기를 위한 차단기가 요구된다. 일부 구현예에서, 특정 핵염기는 하나 이상의 차단기가 요구되지만, 다른 핵염기는 하나 이상의 차단기가 요구되지 않는다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 합성 후 고체 지지체로부터 절단된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 피리딘 중 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 피리딘 중 20% 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 무수 피리딘 중 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 무수 피리딘 중 20% 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 극성 비양성자성 용매, 예컨대 아세토니트릴, NMP, DMSO, 술폰, 및/또는 루티딘의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단은 용매, 예를 들어 극성 비양성자성 용매, 및 하나 이상의 1차 아민 (예를 들어, C1 -10 아민), 및/또는 하나 이상의 메톡실아민, 히드라진, 및 순수한 무수 암모니아의 사용을 포함한다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 탈보호는 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 탈보호는 피리딘 중 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 탈보호는 피리딘 중 20% 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서 올리고뉴클레오티드의 탈보호는 무수 피리딘 중 프로필아민의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 탈보호는 무수 피리딘 중 20% 프로필아민의 사용을 포함한다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 절단 동안 탈보호된다.
일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 실온에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 승온에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 30 ℃, 40 ℃, 50 ℃, 60 ℃, 70℃, 80 ℃, 90 ℃ 또는 100 ℃ 초과에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 30 ℃, 40 ℃, 50 ℃, 60 ℃, 70℃, 80 ℃, 90 ℃ 또는 100 ℃ 에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 40-80 ℃ 에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 50-70 ℃ 에서 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 60 ℃ 에서 수행된다.
일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 0.1 시간, 1 시간, 2 시간, 5 시간, 10 시간, 15 시간, 20 시간, 24 시간, 30 시간, 또는 40 시간 초과 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 0.1-5 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 3-10 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 5-15 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 10-20 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 15-25 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 20-40 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 2 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 5 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 10 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 15 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 18 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 24 시간 동안 수행된다.
일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 실온에서, 0.1 시간, 1 시간, 2 시간, 5 시간, 10 시간, 15 시간, 20 시간, 24 시간, 30 시간, 또는 40 시간 초과 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 실온에서, 약 5-48 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 실온에서, 약 10-24 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 실온에서, 약 18 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 승온에서, 0.1 시간, 1 시간, 2 시간, 5 시간, 10 시간, 15 시간, 20 시간, 24 시간, 30 시간, 또는 40 시간 초과 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 승온에서, 약 0.5-5 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 60 ℃ 에서, 약 0.5-5 시간 동안 수행된다. 일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 약 60 ℃ 에서, 약 2 시간 동안 수행된다.
일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 올리고뉴클레오티드의 절단, 또는 올리고뉴클레오티드의 탈보호는, 프로필아민의 사용을 포함하고, 실온 또는 승온에서, 0.1 시간, 1 시간, 2 시간, 5 시간, 10 시간, 15 시간, 20 시간, 24 시간, 30 시간, 또는 40 시간 초과 동안 수행된다. 조건의 예는, 피리딘 중 20% 프로필아민, 실온에서, 약 18 시간 동안, 및 피리딘 중 20% 프로필아민, 60 ℃ 에서, 약 18 시간 동안이다.
일부 구현예에서, 고체 지지체로부터의 절단 전에, 키랄 보조기가 뉴클레오티드간 인 원자에 여전히 부착되어 있는 경우, 이를 제거하는 단계가 수행된다. 일부 구현예에서, 예를 들어 하나 이상의 DPSE 유형 키랄 보조기는 올리고뉴클레오티드 합성 사이클 동안 뉴클레오티드간 인 원자에 부착된 채로 유지된다. 잔류 키랄 보조기의 제거에 적합한 조건은 당업계에 널리 공지되어 있다 (예를 들어, Wada I, Wada II, Wada III, Chiral Control 등에 기재된 것들). 일부 구현예에서, DPSE 유형 키랄 보조제를 제거하기 위한 조건은, TBAF 또는 HF-Et3N, 예를 들어 MeCN 중 0.1M TBAF, THF 또는 MeCN 중 0.5M HF-Et3N 등이다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 링커가 키랄 보조기의 제거 과정 동안 절단될 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 보조기 제거 동안 보다 우수한 안정성을 제공하는 SP 링커와 같은 링커를 제공한다. 무엇보다도, 본 개시에 의해 제공된 특정 링커는 개선된 수율 및/또는 순도를 제공한다.
일부 구현예에서, 활성화제는 "Wada" 활성화제이며, 즉, 활성화제는 상기 언급된 Wada I, II, 또는 III 문헌 중 임의의 하나로부터이다.
활성화기의 예가 하기에 도시되어 있다:
Figure pct00368
.
일부 구현예에서, 활성화 시약은 하기로부터 선택된다:
Figure pct00369
.
일부 구현예에서, 사이클의 예는 반응식 I-b 에 도시되어 있다.
반응식 I-b. 포스포로티오에이트 연결의 설치.
Figure pct00370
일부 구현예에서, 사이클의 예는 반응식 I-c 에 예시되어 있다.
반응식 I-c. 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 내 포스페이트 디에스테르 및 개질된 뉴클레오티드간 연결 둘 모두의 설치.
Figure pct00371
반응식 I-c 에서, 고체 지지체 (C-1) 상의 올리고뉴클레오티드 (또는 뉴클레오티드, 또는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 갖는 올리고뉴클레오티드) 는 포스포라미다이트 C-2 와 커플링된다. 커플링 및 캡핑 후, 산화 단계가 수행된다. 탈차단 후, 포스페이트 디에스테르 연결이 형성된다. 사이클 생성물 C-3 은 사이클 C 에 재입장하여 더 많은 포스페이트 디에스테르 연결을 설치하거나, 또는 다른 사이클에 입장하여 다른 유형의 뉴클레오티드간 연결을 설치하거나, 또는 사이클을 퇴장한다.
일부 구현예에서, 비키랄적으로 순수한 포스포라미다이트가 반응식 I-c 에서 C-2 대신 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, DMTr 로 보호된 β-시아노에틸포스포라미다이트가 사용된다. 일부 구현예에서, 사용되는 포스포라미다이트는 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00372
.
일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체의 사용은 합성 동안 올리고뉴클레오티드의 안정성을 증가시킨다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체의 사용은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 합성의 효율을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체의 사용은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 합성의 수율을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체의 사용은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 합성의 생성물 순도를 개선시킨다.
일부 구현예에서, 상기 언급된 방법에서 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체는
Figure pct00373
이다. 일부 구현예에서,
Figure pct00374
은 탈보호/방출 동안 포스포로티오에이트 디에스테르 연결로 전환된다. 일부 구현예에서, 사이클의 예는 반응식 I-d 에 도시되어 있다. 더 많은 예가 하기에 도시되어 있다.
반응식 I-d. 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 합성에서의 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체.
Figure pct00375
반응식 I-d 에 나타난 바와 같이, 포스포로티오에이트 및 포스페이트 디에스테르 연결은 모두 동일한 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드에 혼입될 수 있다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 제공된 방법은 포스포로티오에이트 디에스테르 및 포스페이트 디에스테르가 연속적이 되도록 요구되지 않고 - 상기 기재된 바와 같은 사이클을 사용하여 이들 사이에 다른 뉴클레오티드간 연결을 형성할 수 있다. 반응식 I-d 에서, 포스포로티오에이트 디에스테르 연결 대신 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체,
Figure pct00376
가 설치된다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 대체는, 특정 단계, 예를 들어 산화 단계 동안 증가된 합성 효율을 제공하였다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체의 사용은 일반적으로 합성 및/또는 저장 동안 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 안정성을 개선시킨다. 사이클 퇴장 후, 탈보호/방출 동안, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체는 포스포로티오에이트 디에스테르 연결로 전환된다. 일부 구현예에서, 심지어는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 내에 포스페이트 디에스테르 연결이 존재하지 않거나, 또는 합성 동안 산화 단계가 요구되지 않는 경우에도, 포스포로티오에이트 디에스테르 전구체를 사용하는 것이 유익하다.
반응식 I-c 에서와 같이, 일부 구현예에서, 비-키랄적으로 순수한 포스포라미다이트가 산화 단계를 포함하는 사이클에 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, DMTr 로 보호된 β-시아노에틸포스포라미다이트가 사용된다. 일부 구현예에서, 사용되는 포스포라미다이트는 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00377
.
일부 구현예에서, 본 개시의 방법은 특정 올리고뉴클레오티드 유형이 풍부한 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 10% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 20% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 30% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 40% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 50% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 60% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 70% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 80% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 90% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 미정제 조성물의 적어도 약 95% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 1% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 2% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 3% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 4% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 5% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 10% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 20% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 30% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 40% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 50% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 60% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 70% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 80% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 90% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 적어도 약 95% 가 특정 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다.
일부 구현예에서, 사이클의 예가 하기 반응식 I-e 에 도시되어 있다.
반응식 I-e. PhMe 키랄 보조제를 사용하는 사이클의 예.
Figure pct00378
일부 구현예에서, X 는 H 또는 2'-개질이다. 일부 구현예에서, X 는 H 또는 -OR1 이고, 여기서 R1 은 수소가 아니다. 일부 구현예에서, X 는 H 또는 -OR1 이고, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬이다. 일부 구현예에서, X 는 H 이다. 일부 구현예에서, X 는 -OMe 이다. 일부 구현예에서, X 는 -OCH2CH2OCH3 이다. 일부 구현예에서, X 는 -F 이다.
일부 구현예에서, 사이클의 예가 반응식 I-f 에 도시되어 있다.
반응식 I-f. DPSE 키랄 보조제를 사용하는 사이클의 예.
Figure pct00379
일부 구현예에서, X 는 H 또는 2'-개질이다. 일부 구현예에서, X 는 H 또는 -OR1 이고, 여기서 R1 은 수소가 아니다. 일부 구현예에서, X 는 H 또는 -OR1 이고, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬이다. 일부 구현예에서, X 는 H 이다. 일부 구현예에서, X 는 -OMe 이다. 일부 구현예에서, X 는 -OCH2CH2OCH3 이다. 일부 구현예에서, X 는 -F 이다.
올리고뉴클레오티드의 화학적 개질 및 입체화학의 완전한 제어를 제공하기 위하여 상이한 유형의 사이클이 조합될 수 있다는 것이, 당업자에 의해 이해된다. 일부 구현예에서, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 합성 방법은 하나 이상의 사이클 A-F 를 함유할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 DPSE-유형 키랄 보조제를 사용하는 적어도 하나의 사이클을 포함한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 제공된 올리고뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은
Figure pct00380
의 구조를 갖는 제공된 키랄 시약을 제공하는 것을 포함하며, 여기서 W1 은 -NG5 이고, W2 는 O 이고, G1 및 G3 은 각각 독립적으로 수소, 또는 C1 -10 지방족, 헤테로시클릴, 헤테로아릴 및 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고, G2 는 -C(R)2Si(R)3 이고, G4 및 G5 는 함께 취해져, 모노시클릭 또는 폴리시클릭이고, 융합 또는 비융합된, 약 20 개 이하의 고리 원자를 갖는 임의 치환된 포화, 부분 불포화 또는 불포화 헤테로원자-함유 고리를 형성하고, 여기서 각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 시약은
Figure pct00381
의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은
Figure pct00382
의 구조를 갖는 키랄 시약으로부터의 모이어티를 포함하는 포스포라미다이트를 제공하는 것을 포함하며, 여기서 -W1H 및 -W2H, 또는 히드록실 및 아미노기는, 포스포라미다이트의 인 원자와 함께 결합을 형성한다. 일부 구현예에서, -W1H 및 -W2H, 또는 히드록실 및 아미노기는, 예를 들어
Figure pct00383
에서, 포스포라미다이트의 인 원자와 함께 결합을 형성한다. 일부 구현예에서, 포스포라미다이트는 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00384
Figure pct00385
. 일부 구현예에서, R 은 보호기이다. 일부 구현예에서, R 은 DMTr 이다. 일부 구현예에서, G2 는 -C(R)2Si(R)3 이고, 여기서 -C(R)2- 은 임의 치환된 -CH2- 이고, -Si(R)3 의 각각의 R 은 각각 독립적으로 C1 -10 지방족, 헤테로시클릴, 헤테로아릴 및 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 적어도 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 C1 -10 알킬이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 적어도 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 페닐이고, 다른 2 개의 R 은 각각 독립적으로 임의 치환된 C1 -10 알킬이다. 일부 구현예에서, -Si(R)3 중 하나의 R 은 독립적으로 임의 치환된 C1 -10 알킬이고, 다른 2 개의 R 은 각각 독립적으로 임의 치환된 페닐이다. 일부 구현예에서, G2 는 임의 치환된 -CH2Si(Ph)(Me)2 이다. 일부 구현예에서, G2 는 임의 치환된 -CH2Si(Me)(Ph)2 이다. 일부 구현예에서, G2 는 -CH2Si(Me)(Ph)2 이다. 일부 구현예에서, G4 및 G5 는 함께 취해져 하나의 질소 원자 (여기에 G5 가 부착됨) 를 함유하는 임의 치환된 포화 5-6 원 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, G4 및 G5 는 함께 취해져 하나의 질소 원자를 함유하는 임의 치환된 포화 5-원 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, G1 은 수소이다. 일부 구현예에서, G3 은 수소이다. 일부 구현예에서, G1 및 G3 은 둘 모두 수소이다. 일부 구현예에서, G1 및 G3 은 둘 모두 수소이고, G2 는 -C(R)2Si(R)3 이고, 여기서 -C(R)2- 은 임의 치환된 -CH2- 이고, -Si(R)3 의 각각의 R 은 독립적으로 C1 -10 지방족, 헤테로시클릴, 헤테로아릴 및 아릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이고, G4 및 G5 는 함께 취해져 하나의 질소 원자를 함유하는 임의 치환된 포화 5-원 고리를 형성한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 플루오로-함유 시약을 제공하는 것을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 플루오로-함유 시약은, 합성 후, 올리고뉴클레오티드로부터 키랄 시약, 또는 키랄 시약으로부터 형성된 생성물을 제거한다. -SiR3 기를 제거하기 위한 F- 공급원을 비롯한, 각종 공지된 플루오로-함유 시약, 예를 들어 TBAF, HF3-Et3N 등이, 본 개시에 따라 이용될 수 있다. 일부 구현예에서, 플루오로-함유 시약은 농축된 암모니아와 같은 종래의 방법과 비교하여 보다 우수한 결과, 예를 들어 보다 짧은 처리 시간, 보다 낮은 온도, 보다 적은 탈황화 등을 제공한다. 일부 구현예에서, 특정 플루오로-함유 시약에 대하여, 본 개시는 개선된 결과, 예를 들어 키랄 시약 (또는 올리고뉴클레오티드 합성 동안 이로부터 형성된 생성물) 의 제거 동안 지지체로부터 올리고뉴클레오티드의 보다 적은 절단을 위한 링커를 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 링커는 SP 링커이다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 키랄 시약 (또는 올리고뉴클레오티드 합성 동안 이로부터 형성된 생성물) 의 제거 동안 절단을 제어하기 위하여, HF-NR3 와 같은 HF-염기 복합체가 이용될 수 있다는 것을 입증하였다. 일부 구현예에서, HF-NR3 은 HF-NEt3 이다. 일부 구현예에서, HF-NR3 은 종래의 링커, 예를 들어 숙시닐 링커의 사용을 가능하게 한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 선택된 표적 서열에 대한 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서, 상기 방법은 각각 표적 서열에 상보적인 염기 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조를 포함하는 제조 방법을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 약학적으로 허용 가능한 담체를 제공하는 것을 추가로 포함한다.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 제공된 올리고뉴클레오티드는 또한 본 개시에 따라 제공된 시약 및 방법을 사용하여 공지된 용액상 합성을 통해 제조될 수 있다.
생물학적 적용 및 사용예
본원에 기재된 바와 같이, 제공된 조성물 및 방법은 전사물의 스플라이싱을 변경할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 및 방법은, 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건으로부터의 패턴인 기준 패턴과 비교하여, 전사물의 개선된 스플라이싱 패턴을 제공한다. 개선은 임의의 목적하는 생물학적 기능의 개선일 수 있다. 일부 구현예에서, 예를 들어, DMD 에서, 개선은 개선된 생물학적 활성을 갖는 디스트로핀 단백질이 생성되는 mRNA 의 생성이다. 일부 다른 구현예에서, 예를 들어, 개선은 강제 스플라이싱-유도성 넌센스-매개 붕괴 (DSD-NMD) 를 통해 종양 진행, 악성 종양, 및 혈관신생을 완화시키는 STAT3, HNRNPH1 및/또는 KDR 의 하향 조절이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법으로서, 표적 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건과 비교하여 변경되는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 표적 전사물로부터 한 세트의 스플라이싱된 생성물을 생성하는 방법으로서,
상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 생성된 세트와 상이한 한 세트의 스플라이싱된 생성물을 생성시키는데 충분한 양으로, 시간 동안, 및 조건 하에서, 표적 전사물을 함유하는 스플라이싱 시스템을, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물과 접촉시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다.
당업계에 널리 공지된 바와 같이, 다수의 질환 및/또는 병태는 전사물 스플라이싱과 관련이 있다. 예를 들어, [Garcia-Blanco, et al., Alternative splicing in disease and therapy, Nat. Biotechnol . 2004 May;22(5):535-46]; [Wang, et al., Splicing in disease: disruption of the Splicing code 및 the decoding machinery, Nat. Rev. Genet. 2007 Oct;8(10):749-61]; [Havens, et al., Targeting RNA splicing for disease therapy, Wiley Interdiscip . Rev. RNA. 2013 May-Jun;4(3):247-66]; [Perez, et al., Antisense mediated splicing 조절 for inherited metabolic diseases: challenges for delivery, Nucleic Acid Ther. 2014 Feb;24(1):48-56] 등 참조. 부가적인 표적 및/또는 질환의 예는, [Xiong, et al., The human splicing code reveals new insights into the genetic determinants of disease, Science. 2015 Jan 9;347(6218):1254806. doi: 10.1126/science.1254806] 에 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 비제한적으로 본 개시에 인용된 참고 문헌에 기재된 것들을 포함하여, 질환을 치료 또는 예방하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 본원에 기재된 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료 또는 예방하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 전사물에서 표적 서열에 상보적인 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료 또는 예방하는 방법으로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료 또는 예방하는 방법으로서,
상기 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 질환은, 제공된 조성물의 투여 후, 하나 이상의 스플라이싱된 전사물이 새로운 유익한 기능을 보수, 복원 또는 도입하는 것이다. 예를 들어, DMD 에서, 하나 이상의 엑손의 스킵핑 후, 디스트로핀의 기능은 절단되었지만 (부분적으로) 활성인 버전을 통해 복원, 또는 부분적으로 복원될 수 있다. 다른 예에는, 비제한적으로 표 ES1, ES2, 또는 ES3 에 열거된 것들이 포함된다. 일부 구현예에서, 표적은 "이상 스플라이싱의 보정 (Correction of Aberrant Splicing)" 으로 표 ES3 에 열거된 것이다.
일부 구현예에서, 질환은, 제공된 조성물의 투여 후, 하나 이상의 스플라이싱된 전사물이 보수되고, 유전자 전사물의 스플라이싱을 변경시킴으로써 유전자가 효과적으로 녹다운되는 것이다. 이의 예에는, 비제한적으로 표 ES1, ES2, 또는 ES3 에 열거된 것들이 포함된다. 일부 구현예에서, 표적은 "유해 유전자 발현의 녹다운 (Knockdown of Detrimental Gene Expression)" 으로 표 ES3 에 열거된 것이다.
일부 구현예에서, 질환은 듀켄 근이영양증이다. 일부 구현예에서, 질환은 척수근 위축증이다. 일부 구현예에서, 질환은 암이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 뉴클레오티드 서열이 표적 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 공통 염기 서열을 포함하는 공통 염기 서열을 공유하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하여 질환을 치료하는 방법으로서,
개선은, 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 올리고뉴클레오티드 조성물로서 사용하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 뉴클레오티드 서열이 표적 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 공통 염기 서열을 포함하는 공통 염기 서열을 공유하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하여 질환을 치료하는 방법으로서,
개선은, 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 올리고뉴클레오티드 조성물로서 사용하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 서열은 표 ES1 로부터 선택되는 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 공통 서열은 표 ES1 로부터 선택되는 서열이다. 일부 구현예에서, 공통 서열은 표 ES1, ES2, 및 ES3 으로부터 선택되는 임의의 유전자의 전사물에서 발견되는 서열이다.
치료될 수 있는 질환의 예에는, 비제한적으로 표 ES2 및 ES3 에 기재된 것들이 포함된다. 일부 구현예에서, 질환은 듀켄 근이영양증이다. 일부 구현예에서, 질환은 척수근 위축증이다. 일부 구현예에서, 질환은 암이다.
듀켄 근이영양증의 경우, 스킵핑을 위한 돌연변이 및/또는 적합한 DMD 엑손의 예는, 비제한적으로 US 특허 No. 8,759,507, US 특허 No. US 8,486,907, 및 이들에 인용된 참고 문헌에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 스킵된 엑손은 엑손 2, 29, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51 및 53 으로부터 선택된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 2 는 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 29 는 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 40 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 41 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 42 는 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 43 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 44 는 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 45 는 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 46 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 47 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 48 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 49 는 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 50 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 51 은 스킵된다. 일부 구현예에서, DMD 의 엑손 53 은 스킵된다. 일부 구현예에서, 스킵된 엑손은, 이의 내포가 DMD 의 목적하는 기능을 감소시키는, 임의의 엑손이다. 일부 구현예에서, 스킵된 엑손은, 이의 스킵핑이 DMD 의 목적하는 기능을 증가시키는, 임의의 엑손이다.
일부 구현예에서, DMD 전사물의 엑손 스킵핑을 위하여, 또는 DMD 의 치료를 위하여, 제공된 다수의 올리고뉴클레오티드의 서열은 표 ES1 로부터 선택되는 DMD 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, 서열은 US 특허 No. 8,759,507 의 SEQ ID Nos 1-30 중 하나를 포함한다. 일부 구현예에서, 서열은 US 특허 No. US 8,486,907 의 SEQ ID Nos 1-211 중 하나를 포함한다. 일부 구현예에서, DMD 전사물의 엑손 스킵핑을 위하여, 또는 DMD 의 치료를 위하여, 제공된 다수의 올리고뉴클레오티드의 서열은 표 ES1 로부터 선택되는 DMD 서열이다. 일부 구현예에서, 서열은 US 특허 No. 8,759,507 의 SEQ ID Nos 1-30 중 하나이다. 일부 구현예에서, 서열은 US 특허 No. US 8,486,907 의 SEQ ID Nos 1-211 중 하나이다. 일부 구현예에서, 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 를 포함한다. 일부 구현예에서, 서열은 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이다. 일부 구현예에서, 서열은 CTCCAACATCAAGGAAGATGGCATTTCTAG 를 포함한다. 일부 구현예에서, 서열은 CTCCAACATCAAGGAAGATGGCATTTCTAG 이다. 일부 구현예에서, 서열은 표 2B 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 서열은 표 2C 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 서열은 표 2D 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 서열은 표 2E 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 서열은 하기에 기재된 것이다: [Kemaladewi, et al., Dual exon skipping in myostatin and dystrophin for Duchenne muscular dystrophy, BMC Med Genomics. 2011 Apr 20;4::36. doi: 10.1186/1755-8794-4-36]; 또는 [Malerba et al., Dual Myostatin and Dystrophin Exon Skipping by Morpholino Nucleic Acid Oligomers Conjugated to a Cell-penetrating Peptide Is a Promising Therapeutic Strategy for the Treatment of Duchenne Muscular Dystrophy, Mol Ther Nucleic Acids. 2012 Dec 18;1:e62. doi: 10.1038/mtna.2012.54].
일부 구현예에서, 질환 치료는, 이의 전사물 스플라이싱을 변경시킴에 의한 유전자 기능의 녹다운을 포함한다. 질환 및 표적 유전자의 예에는, 비제한적으로 표 ES3 에 열거된 것들, 특히 "유해 유전자 발현의 녹다운" 으로 라벨된 것들이 포함된다.
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표 ES2.
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일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는데 필적한 효과를 갖는 다른 비교 가능한 기준 올리고뉴클레오티드 조성물의 투여량 및/또는 빈도보다 낮은 투여량 및/또는 빈도로 투여된다. 일부 구현예에서, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는데 필적한 효과를 갖는 다른 비교 가능한 스테레오랜덤 기준 올리고뉴클레오티드 조성물의 투여량 및/또는 빈도보다 낮은 투여량 및/또는 빈도로 투여된다. 목적하는 경우, 제공된 조성물은 이의 보다 낮은 독성으로 인해 보다 높은 투여량/빈도로 투여될 수 있다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물의 특성, 예를 들어, 활성, 독성 등이 화학적 개질 및/또는 입체화학에 의해 최적화될 수 있다는 것을 인식한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 화학적 개질 및 입체화학을 통해 올리고뉴클레오티드 특성을 최적화하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 낮은 독성을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 조성물 및 그 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 낮은 독성 및 증강된 활성 (예를 들어, 표적-저해 효율, 특이성, 절단 속도, 절단 패턴 등) 을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 조성물 및 그 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 단백질 결합 프로파일을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 조성물 및 그 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 단백질 결합 프로파일 및 증강된 활성을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 조성물 및 그 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 전달 및 증강된 활성을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 조성물 및 그 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은, 예를 들어 기준 조성물과 비교할 때, 낮은 독성을 갖는다. 당업계에 널리 공지된 바와 같이, 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 세포, 조직, 유기체 등에 투여될 때, 독성을 유도할 수 있다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 목적하지 않는 면역 반응을 유도할 수 있다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 보체 활성화를 유도할 수 있다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 보체의 대안적인 경로의 활성화를 유도할 수 있다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 염증을 유도할 수 있다. 무엇보다도, 보체 시스템은 세포를 손상시킬 수 있기 때문에 잠재적인 부상을 감소시키기 위하여 조절되어야 하는, 강력한 세포용해 활성을 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드-유도성 혈관 손상은, 예를 들어 약학적 용도를 위한 올리고뉴클레오티드의 개발에 있어서의 반복되는 도전이다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드가 높은 투여량으로 투여될 때 염증의 주요 원인은 대안적인 보체 캐스케이드의 활성화를 수반한다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 포스포로티오에이트-함유 올리고뉴클레오티드와 관련이 있는 공통의 도전이며, 또한 선천적 면역 세포 활성화를 유도하는 포스포로티오에이트의 일부 서열의 잠재성도 존재한다. 일부 구현예에서, 사이토카인 방출은 올리고뉴클레오티드의 투여와 관련이 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 인터류킨-6 (IL-6) 단핵구 화학 유인제 단백질 (MCP-1) 및/또는 인터류킨-12 (IL-12) 에서의 증가가 관찰된다. 예를 들어, [Frazier, Antisense Oligonucleotide Therapies: The Promise and the Challenges from a Toxicologic Pathologist’s Perspective. Toxicol Pathol., 43: 78-89, 2015]; 및 [Engelhardt, et al., Scientific and Regulatory Policy Committee Points-to-consider Paper: Drug-induced Vascular Injury Associated with Nonsmall Molecule Therapeutics in Preclinical Development: Part 2. Antisense Oligonucleotides. Toxicol Pathol. 43: 935-944, 2015] 참조.
화학적 개질 및/또는 입체화학을 제어함으로써, 본 개시는 개선된 올리고뉴클레오티드 조성물 및 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 화학적 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 염기 개질, 당 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질, 또는 이들의 임의의 조합을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 염기 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 당 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 당 모이어티 상의 2'-개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 2'-개질이 독성을 저하시킬 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드에의 하나 이상의 천연 포스페이트 연결의 혼입이, 독성을 저하시킬 수 있다는 것을 입증한다. 천연 포스페이트 연결은 올리고뉴클레오티드의 다양한 위치에 혼입될 수 있다. 일부 구현예에서, 천연 포스페이트 연결은 윙 영역, 또는 5'- 또는 3'-말단에 근접한 영역에 혼입된다. 일부 구현예에서, 천연 포스페이트 연결은 올리고뉴클레오티드의 중간에 혼입된다. 일부 구현예에서, 천연 포스페이트 연결은 코어 영역에 혼입된다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 입체화학이, 단독으로 또는 화학적 개질과 조합으로, 독성을 조절할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 입체화학이, 단독으로 또는 화학적 개질과 조합으로, 면역 반응을 조절할 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 입체화학이, 단독으로 또는 화학적 개질과 조합으로, 보체 활성화를 조절할 수 있다는 것을 입증한다. 놀랍게도, 개별적인 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이, 상응하는 스테레오랜덤 조성물, 및/또는 또 다른 개별적인 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여, 극적으로 상이한 독성 프로파일, 예를 들어 보체 활성화를 가질 수 있다는 것을 발견하였다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 입체화학이, 단독으로 또는 화학적 개질과 조합으로, 대안적인 경로를 통한 보체 활성화를 조절할 수 있다는 것을 입증한다. 화학적 개질, 입체화학 및 이의 패턴의 예는, 본 개시에 광범위하게 기재되어 있고, 이들은 조합으로 사용될 수 있다. 조성물 및 방법의 예도 또는 본 개시에 광범위하게 기재되어 있다. 당업자는, 본원에 기재된 방법 및 조성물이, 기준 조성물과 비교하여, 보체 활성화를 포함하는 면역 반응을 증가 또는 감소시키는데 사용될 수 있다는 것을 이해한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하고 키랄 제어된, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이고, 상기 조성물은 하나 이상의 개질된 당 모이어티 중 적어도 하나가 결여되어 있는 것을 제외하고는 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이고;
올리고뉴클레오티드 조성물은, 올리고뉴클레오티드가 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이고;
올리고뉴클레오티드 조성물은, 올리고뉴클레오티드가 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것이고, 상기 조성물은 하나 이상의 개질된 당 모이어티 중 적어도 하나가 결여되어 있는 것을 제외하고는 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 각각 공통 염기 서열을 갖고 개질된 당 모이어티를 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을, 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법으로서,
올리고뉴클레오티드 조성물은, 동일한 공통 염기 서열을 갖지만 개질된 당 모이어티는 갖지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 각각 공통 염기 서열을 갖고, 하나 이상의 천연 포스페이트 연결 및 하나 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을, 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법으로서,
올리고뉴클레오티드 조성물은, 동일한 공통 염기 서열을 갖지만 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법으로서,
키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 상이한 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물, 또는 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 다른 비교 가능한 기준 조성물을 이용하여 관찰되는 적어도 하나의 검정으로 시험했을 때, 감소된 독성을 특징으로 하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 감소된 독성은 감소된 보체 활성화이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 감소된 보체 활성화를 포함한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 감소된 보체 활성화이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 감소된 독성은 대안적인 경로를 통한 감소된 보체 활성화를 포함한다. 일부 구현예에서, 독성은 보체 활성화의 수준 측정을 통해 평가될 수 있다. 일부 구현예에서, 변경된 보체 활성화는 보체 활성화 시 단백질의 수준 변화를 검출하는 검정으로 관찰된다. 일부 구현예에서, 변경된 보체 활성화는 하나 이상의 완전-활성화 관련 생성물의 존재, 절대적 수준 및 또는 상대적 수준을 검출하는 검정으로 관찰된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 혈청에서 관찰된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 인간 혈청에서 관찰된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 영장류 혈청에서 관찰된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 원숭이 혈청에서 관찰된다.
일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 60 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 50 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 40 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 30 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 25 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 20 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 15 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 10 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 9 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 8 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 7 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 6 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 5 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 4 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 3 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 2 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 1 분 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 30 초 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 20 초 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 10 초 이내에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 5 초 이내에 측정된다.
일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 5 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 10 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 15 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 20 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 25 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 30 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 35 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 40 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 45 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 50 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 55 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 60 분 후에 측정된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 올리고뉴클레오티드의 투여 후 다수의 시점에서, 예를 들어 올리고뉴클레오티드의 투여 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 70, 80, 90, 100, 110 및 120 분 후로부터 선택되는 2 개 이상의 시점에서 측정된다.
일부 구현예에서, 보체 활성화는 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 5% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 10% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 15% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 20% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 25% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 30% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 35% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 40% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 45% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 50% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 55% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 60% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 65% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 70% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 75% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 80% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 85% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 90% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 95% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 96% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 97% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 98% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 99% 이상 감소된다. 일부 구현예에서, 보체 활성화는 음성 대조군, 예를 들어 물, 보체 활성화를 유도하지 않는 완충액 등과 동일한 수준으로 감소된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 주사 부위 염증을 감소시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 유도된 혈관 손상을 감소시킨다.
독성을 평가하는데 사용될 수 있는 마커는, 당업계에 널리 공지되어 있다: 예를 들어, CH50 (전체 보체), 보체 분할 생성물 (예를 들어, Bb, C3a, C5a 등), MCP-1 및 CRP, 피브리노겐, 합토글로빈, 글로불린, 단백뇨, 알부민뇨, 안지오포이에틴-2, 엔도텔린-1, 에셀렉틴, 트롬보스폰딘-1, 혈관 표피 성장 인자 알파, 칼포닌-1, 메탈로프로테이나아제의 조직 저해제 1, 리포칼린 2, 사이토카인-유도성 호중구 화학 유인제 1, 알파-1 산 글리코단백질 1, 총 질소 산화물, 본 빌레브란트 ( Von Willebrands) 인자, 세포간 부착 분자 (ICAM), 혈관 세포 부착 분자-1 (VCAM-1), 인터류킨, 단핵구 주화성 단백질-1, 혈청 아밀로이드 A, CRP, 피브리노겐, 플라스미노겐 활성화제 저해제-1, 카베올린, 매트릭스 메탈로프로테이나아제 (MMP-1, MMP-3, 및 MMP-9), 혈관 표피 성장 인자, 트롬보모둘린, E-셀렉틴, P-셀렉틴, 보체 경로 분석 및 기타 염증 마커 (즉, CRP, MCP-1, MMP-3, 및/또는 기타 사이토카인 또는 케모카인), 내피 활성화 마커 (예를 들어, VCAM) 등. 예를 들어, [Frazier, Antisense Oligonucleotide Therapies: The Promise and the Challenges from a Toxicologic Pathologist's Perspective. Toxicol Pathol., 43: 78-89, 2015]; [Engelhardt, et al., Scientific and Regulatory Policy Committee Points-to-consider Paper: Drug-induced Vascular Injury Associated with Nonsmall Molecule Therapeutics in Preclinical Development: Part 2. Antisense Oligonucleotides. Toxicol Pathol. 43: 935-944, 2015] 등 참조. 일부 구현예에서, 마커는 보체 경로에서의 단백질이다. 일부 구현예에서, 마커는 대안적인 보체 경로에서의 단백질이다. 일부 구현예에서, 마커는 완전 활성화 동안 생성되는 단백질이다. 일부 구현예에서, 마커는 대안적인 경로를 통한 완전 활성화 동안 생성되는 단백질이다. 일부 구현예에서, 마커는 C3a, Bb, C4a, C5a, C5b, C6, C7, C8 및 C9 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 마커는 C4a, C5a, C5b, C6, C7, C8 및 C9 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 마커는 C3a, C4a, C5a 및 Bb 로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 마커는 C3a 또는 Bb 이다. 일부 구현예에서, 마커는 C3a 이다. 일부 구현예에서, 마커는 Bb 이다.
검정의 예는, 비제한적으로, 본 개시 및 하기에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있다: US2002/0082227; [Frazier, Antisense Oligonucleotide Therapies: The Promise and the Challenges from a Toxicologic Pathologist's Perspective. Toxicol Pathol., 43: 78-89, 2015]; [Engelhardt, et al., Scientific and Regulatory Policy Committee Points-to-consider Paper: Drug-induced Vascular Injury Associated with Nonsmall Molecule Therapeutics in Preclinical Development: Part 2. Antisense Oligonucleotides. Toxicol Pathol. 43: 935-944, 2015] 등.
본 개시는, 개별적인 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이 상이한 보체 활성화 프로파일을 가질 수 있다는 것을 입증한다. 일부 구현예에서, 전부 포스포로티오에이트 연결 및 중앙에 단일 Rp 를 갖는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 비교적 높은 보체 활성화를 나타낼 수 있다. 본 개시에서 제공된 바와 같이, 비제한적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결의 도입을 포함하는 각종 방법이, 이러한 올리고뉴클레오티드의 비교적 높은 보체 활성화를 감소시키는데 사용될 수 있다. 예를 들어, 도 4 및 5 참조.
제공된 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물은, 이의 개선된 특성, 예를 들어 낮은 독성, 높은 활성 등에 의해, 각종 질환의 치료에 특히 유용하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및/또는 방법은 보체 시스템과 관련된 표적을 감소시키는데 특히 유용하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및/또는 방법은, 존재하는 경우, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및/또는 방법 그 자체가, 기준 올리고뉴클레오티드, 조성물 및/또는 이의 방법과 비교하여, 단지 낮은 보체 활성화를 유도하기 때문에, 보체 시스템에서 표적의 수준을 감소시킴으로써 보체 활성화를 감소시키는데 특히 유용하다. 일부 구현예에서, 보체 시스템과 관련된 표적은, C1, C1a, C1r, C1s, C1q, MASP-1, MASP-2, C3, C3-전환효소, C3a, C3b, C3aR, C4b, C5, C5a, C5aR, 인자 B, 인자 D, 트롬빈, 플라스민, 칼리크레인, 또는 인자 XIIa 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및/또는 방법은, 신경염증 및 신경변성, 근육 염증, 탈수초화, 혈관염 및 신염과 같은 관련 질환의 개선된 치료를 제공할 수 있다. 일부 구현예에서, 질환은 보체와 관련된 희귀 질환이다; 예를 들어 [Reis et al., Applying complement therapeutics to rare diseases, Clinical Immunology (2015), doi: 10.1016/j.clim.2015.08.009] 참조. 일부 구현예에서, 본 개시는 C5 를 표적으로 하는 올리고뉴클레오티드의 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 C5 를 표적으로 하는 siRNA 조성물이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 인자 B 를 표적으로 하는 올리고뉴클레오티드의 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 루푸스 신염의 치료를 위하여 인자 B 를 표적으로 하는 조성물 및 방법을 제공한다. 인자 B 를 표적으로 하는 염기 서열의 예에는, 비제한적으로 [Grossman et al. Inhibition of the alternative complement pathway by antisense oligonucleotides targeting complement factor B improves lupus nephritis in mice. Immunobiology. 2015 Aug 10. pii: S0171-2985(15)30041-3. doi: 10.1016/j.imbio.2015.08.001] 에 기재된 것이 포함된다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 예를 들어 올리고뉴클레오티드의 화학적 개질 및/또는 입체화학을 조절함으로써, 올리고뉴클레오티드의 단백질 결합 특성을 조절하는 방법을 제공한다. 화학적 개질, 입체화학 및 이들의 조합의 예는, 본 개시에 광범위하게 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 단백질 결합 프로파일을 갖는 올리고뉴클레오티드및 이의 조성물를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는 방법으로서,
조성물은, 각각 또한 공통 염기 서열을 갖지만,
기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하고/하거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖고/갖거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다는 점에서
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 구조적으로 상이한, 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 기준 조성물과 비교하여, 변경된 단백질 결합을 나타내는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 변경된 단백질 결합을 특징으로 하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 유익한 단백질 결합을 증가시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 유해한 단백질 결합을 감소시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 유익한 단백질 결합을 증가시키고, 유해한 단백질 결합을 감소시킨다.
일부 구현예에서, 개선된 단백질 결합 프로파일은 독성을 저하시키고, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물의 활성을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 보체 경로의 음성 조절자에 대한 저하된 결합은 감소된 보체 활성화에 기여한다. 일부 구현예에서, 특정 단백질에 대한 저하된 결합은 보다 낮은 독성 및/또는 보다 양호한 활성과 관련이 있다. 일부 구현예에서, 특정 단백질에 대한 증가된 결합은 보다 낮은 독성 및/또는 보다 양호한 활성에 기여한다.
올리고뉴클레오티드에 의한, 각종 단백질, 예를 들어 혈청 단백질, 헤파린 술페이트-결합 단백질, 세포내 단백질 등에 대한 결합은, 본 개시에 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법을 사용하여 조절될 수 있다. 단백질의 예에는, 비제한적으로, 하기가 포함된다: 알부민, 보체 인자 H, 인자 IX, ApoE, 트롬빈, 인자 VIIIa, 헤파린 보조인자 II, 알파-2 마크로글로불린, 섬유아세포 성장 인자 1, 섬유아세포 성장 인자 2, 간세포 성장 인자/스캐터 (Scatter) 인자, 혈관 표피 성장 인자, 고 이동성 그룹 단백질 (High-Mobility Group Protein) B1, 시클로필린 (Cyclophilin) B, IL-8 (CXCL8), 혈소판 인자 4 (CXCL4), 기질 세포 유래 인자-1 (CXCL12), 단핵구 화학 유인제 단백질-1 (CCL2), 섬유아세포 성장 인자 수용체 1, 뉴로필린-1, 최종 당화 산물 (Advanced Glycation End Product) 용 수용체, 수용체 단백질 티로신 포스파타아제 시그마, Slit-2, ROBO1, 트롬빈, 항트롬빈, 단백질 C 저해제, 아밀로이드 전구체 단백질 1, 트롬보스폰딘-1, 아넥신 A2, PDGF BB, PC4/Sub1, RNF163/ZNF9, Ku70, Ku80, TCP1-알파, TCP1-베타, TCP1-엡실론, TCP1-감마, TCP1-세타, TCP1-델타, HSP90-AA1, HSP90-AB, HSP70-5/GRP78, HSPA1L, HSC70, ACTB, TBBB2C, 비멘틴, CArG 결합 인자, DHX30, EIF2S2, EIF4H, GRSF1, hnRNP D1L, hnRNPA1, hnRNPA2, hnRNPH1, hnRNPK, hnRNPQ, hnRNPU, hnRNPUL, ILF2, ILF3, KHSRP, La/SSB, NCL, NPM1, P54nrb, PSF, PSPC1, RHA, YBX1, ACLY, VARS, ANXA2, NDKA, 티미딜레이트 키나아제, JKBP1 델타 6, SHMT2, LRPPRC, NARS, ATAD3A, KCTD12, CD4, GP120, aMb2 (Mac-1), VDAC-1, Ago2 PAZ 도메인, RAGE, AIM2, DHX36, DHX9, DDX41, IFI16, RIG-I, MDA5, LRRFIP1　, DLM-1/ZBP1, TREX1, 라미닌, 및 피브로넥틴. 일부 구현예에서, 다수의 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 조성물은, 하나의 군의 단백질에 대한 동일한 결합 수준을 유지하고, 또 다른 군의 단백질에 대한 결합 수준을 감소시키고/감소시키거나, 또 다른 군의 단백질에 대한 결합 수준을 증가시키는 것을 포함하여, 복수의 단백질에 대한 결합을 동시에 조절할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 하나 이상의 혈청 단백질에 대한 증가된 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 혈청 단백질은 알부민이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 하나 이상의 헤파린 술페이트-결합 단백질에 대한 감소된 결합을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 하나 이상의 인자 H 에 대한 감소된 결합을 제공한다.
일부 구현예에서, 단백질 결합은 10% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 20% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 30% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 40% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 50% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 60% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 70% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 75% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 80% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 85% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 90% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 91% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 92% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 93% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 94% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 95% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 96% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 97% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 98% 초과로 감소된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 99% 초과로 감소된다.
일부 구현예에서, 단백질 결합은 10% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 20% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 30% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 40% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 50% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 60% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 70% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 80% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 90% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 100% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 150% 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 2 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 3 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 4 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 5 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 6 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 7 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 8 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 9 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 10 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 15 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 20 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 25 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 30 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 35 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 40 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 45 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 50 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 60 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 70 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 80 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 90 배 초과로 증가된다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 100 배 초과로 증가된다.
일부 구현예에서, 본 개시는 단백질 결합의 평가를 위한 검정을 제공한다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 알부민에 대한 결합에 의해 평가될 수 있다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 BSA 에 대한 결합에 의해 평가될 수 있다. 일부 구현예에서, 단백질 결합은 시험관내에서 평가될 수 있다. 부가적인 적합한 검정 당업계에 널리 공지되어 있다.
단백질 결합 프로파일을 개선시킬 수 있는 화학적 개질, 입체화학 및 이들의 조합은, 본 개시에 광범위하게 기재되어 있다. 일부 구현예에서, 보다 많은 개질된 뉴클레오티드간 연결은 단백질 결합을 증가시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 보다 많은 포스포로티오에이트 연결은 단백질 결합을 증가시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 보다 적은 개질된 뉴클레오티드간 연결은 단백질 결합을 감소시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 보다 적은 포스포로티오에이트 연결은 단백질 결합을 감소시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 보다 많은 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결은 단백질 결합을 증가시킨다. 일부 구현예에서, 보다 적은 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결은 단백질 결합을 감소시킨다. 일부 구현예에서, 보다 많은 개질된 염기는 단백질 결합을 증가시킨다. 일부 구현예에서, 보다 적은 개질된 염기는 단백질 결합을 감소시킨다. 일부 구현예에서, 하나의 유형의 당 개질은 다른 것들과 비교하여 단백질 결합을 증가시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 증가된 2'-MOE 함량은 2'-OMe 와 비교하여 단백질 결합을 감소시킨다. 본 개시는 단백질 결합 프로파일을 개선시키는 화학적 개질 및/또는 입체화학 패턴의 다수의 조합을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 단백질 결합 프로파일을 개선시키면서, 동시에 보다 낮은 독성 및/또는 보다 양호한 활성을 제공하는, 다수의 조합 화학적 개질 및/또는 입체화학 패턴을 제공한다. 이러한 개질, 입체화학, 또는 이들의 조합을 갖는 올리고뉴클레오티드 및 조성물의 예는, 본 개시에 기재되어 있다.
표적에의 올리고뉴클레오티드의 전달은 개선된 단백질 결합 프로파일로부터 유익을 얻을 수 있다. 일부 구현예에서, 특정 단백질에 대한 개선된 결합 특성은 표적 세포, 조직, 기관 또는 유기체로의 올리고뉴클레오티드의 운반을 용이하게 한다. 일부 구현예에서, 특정 단백질에 대한 개선된 결합 특성은, 표적 핵산 서열에 대한 하이브리드화, 표적 핵산 서열의 기능 저해, 표적 핵산 서열의 절단 등을 포함하는, 생물학적 기능을 수행할 수 있도록, 단백질 및 기타 분자로부터의 올리고뉴클레오티드의 방출을 촉진시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 올리고뉴클레오티드의 개선된 흡수를 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 올리고뉴클레오티드의 개선된 흡수를 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여하는 것을 포함하는 방법으로서,
조성물은, 각각 또한 공통 염기 서열을 갖지만,
기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하고/하거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖고/갖거나;
기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다는 점에서
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 구조적으로 상이한, 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 기준 조성물과 비교하여, 개선된 전달을 나타내는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 공통 뉴클레오티드 서열을 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 방법으로서,
개선은, 동일한 공통 뉴클레오티드 서열의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 개선된 전달을 특징으로 하는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 투여하는 것을 포함하는 것인 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 개선된 전신적 전달을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은 개선된 세포질 전달을 제공한다. 일부 구현예에서, 개선된 전달은 세포의 집단에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 개선된 전달은 조직에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 개선된 전달은 기관에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 개선된 전달은 유기체에 대한 것이다. 개선된 전달을 제공하는 구조 요소 (예를 들어, 화학적 개질, 입체화학, 이들의 조합 등), 올리고뉴클레오티드, 조성물 및 방법은, 본 개시에 광범위하게 기재되어 있다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 본 개시의 제공된 조성물과 접촉시킴으로써, 낮은 독성 없이, 세포, 조직, 및/또는 유기체에서의 표적 핵산의 수준을 감소시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 본 개시의 제공된 조성물과 접촉시킴으로써, 기준 조성물과 비교하여 낮은 독성 없이, 세포, 조직, 및/또는 유기체에서의 표적 핵산의 수준을 감소시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 본 개시의 제공된 조성물과 접촉시킴으로써, 유의한 보체 활성화 없이, 세포, 조직, 및/또는 유기체에서의 표적 핵산의 수준을 감소시키는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는, 본 개시의 제공된 조성물과 접촉시킴으로써, 기준 조성물과 비교하여 보다 낮은 보체 활성화로, 세포, 조직, 및/또는 유기체에서의 표적 핵산의 수준을 감소시키는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 개선된 특성, 예를 들어 독성, 활성 등을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 기준 조성물과 비교하여 보다 낮은 독성을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 기준 조성물과 비교하여 개선된 단백질 결합 프로파일을 갖는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법으로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 적어도 하나의 조성물을 제공하는 단계; 및
기준 조성물과 비교하여 독성을 평가하는 단계
를 포함하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법으로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 적어도 하나의 조성물을 제공하는 단계; 및
기준 조성물과 비교하여 보체 활성화를 평가하는 단계
를 포함하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법으로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 적어도 하나의 조성물을 제공하는 단계; 및
기준 조성물과 비교하여 단백질 결합 프로파일을 평가하는 단계
를 포함하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법으로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 적어도 하나의 조성물을 제공하는 단계; 및
기준 조성물과 비교하여 전달을 평가하는 단계
를 포함하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법으로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 적어도 하나의 조성물을 제공하는 단계; 및
기준 조성물과 비교하여 세포 흡수를 평가하는 단계
를 포함하는 방법을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 특성은 기준 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교된다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다.
일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 모든 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트인 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 전부 포스페이트 연결을 갖는 DNA 올리고뉴클레오티드 조성물이다.
일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열 및 동일한 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열 및 화학적 개질의 동일한 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열 및 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 키랄 비제어된 (또는 스테레오랜덤) 조성물이다.
일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열을 갖지만 상이한 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열, 염기 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖지만 상이한 당 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 보다 적은 2'-개질된 당 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열, 염기 개질, 당 개질을 갖지만 상이한 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 보다 많은 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는 올리고뉴클레오티드를 포함한다.
일부 구현예에서, 기준 조성물은 기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이한, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물로서, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 기준 조성물과 비교하여, 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖는 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이다.
일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은, 기준 조성물과 비교하여, 올리고뉴클레오티드 조성물의 올리고뉴클레오티드에서 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 하나 이상의 개질된 당 모이어티 중 적어도 하나가 결여되어 있는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 개질된 당 모이어티를 갖지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 화학적 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 또 다른 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은, 제공된 조성물에서 지질이 없는 필적한 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 스테레오랜덤 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 모든 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트인 올리고뉴클레오티드의 스테레오랜덤 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 전부 포스페이트 연결을 갖는 DNA 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열 및 동일한 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열 및 화학적 개질의 동일한 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열 및 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 키랄 비제어된 (또는 스테레오랜덤) 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열을 갖지만 상이한 화학적 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열, 염기 개질, 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖지만 상이한 당 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 보다 적은 2'-개질된 당 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 염기 서열, 염기 개질, 당 개질을 갖지만 상이한 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 보다 많은 뉴클레오티드간 연결 개질을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드가 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이한, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물로서, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 기준 조성물과 비교하여, 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖는 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드가 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은, 기준 조성물과 비교하여, 올리고뉴클레오티드 조성물의 올리고뉴클레오티드에서 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 하나 이상의 개질된 당 모이어티 중 적어도 하나가 결여되어 있는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 개질된 당 모이어티를 갖지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 공통 뉴클레오티드 서열을 갖지만 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 동일한 화학적 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 또 다른 입체이성질체의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 다수의 올리고뉴클레오티드가 전부 갖지 않는 하나 이상의 구조 요소 (예를 들어, 개질, 입체화학, 패턴 등) 을 포함한다. 상기와 같은 구조 요소는 본 개시에 기재된 임의의 것일 수 있다.
일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드의 상응하는 영역보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 각각의 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드의 상응하는 영역보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 각각의 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 개질된 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 3'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 각각의 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 많은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 3'-말단에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 각각의 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드는 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하다. 일부 구현예에서, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드는 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 염기 서열을 공유하는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 또 다른 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 오로지 포스포로티오에이트 연결만을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙을 갖고, 윙에서 보다 적은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙을 갖고, 윙에서 보다 적은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙을 갖고, 윙에서 보다 많은 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 5'- 및/또는 3'-말단에서 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 윙에 상응하는 영역에서 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 상응하는 윙 영역에서 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 하나 이상의 상기와 같은 천연 포스페이트 연결 위치에서 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 윙에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 하나 이상의 상기와 같은 천연 포스페이트 연결 위치에서 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 윙 영역을 포함하고, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 위치에서 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하는 3'-말단 윙 영역을 포함하고, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 위치에서 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 5'-말단 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 3'-말단에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 각각의 윙 영역에서 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드보다 적은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 다수 내 개별적인 올리고뉴클레오티드는 입체화학적 구조에 있어서 서로 상이하다. 일부 구현예에서, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드는 조성물의 다수의 올리고뉴클레오티드로 나타내어지는 구조와 상이한 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 기준 다수 내 적어도 일부의 올리고뉴클레오티드는 윙 영역 및 코어 영역을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 염기 서열을 공유하는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물은 또 다른 올리고뉴클레오티드 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 오로지 포스포로티오에이트 연결만을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 개질된 당 모이어티를 포함하며, 여기서 개질은 2'-OR1 이다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙을 갖고, 윙에서 보다 적은 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙을 갖고, 윙에서 보다 적은 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙을 갖고, 윙에서 보다 많은 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 메틸화 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 많은 2'-MOE 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 5'- 및/또는 3'-말단에서 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 윙에 상응하는 영역에서 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 상응하는 윙 영역에서 보다 적은 천연 포스페이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 하나 이상의 상기와 같은 천연 포스페이트 연결 위치에서 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙에 하나 이상의 상기와 같은 천연 포스페이트 연결 위치에서 포스포로티오에이트 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 천연 포스페이트 연결을 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 기준 조성물의 올리고뉴클레오티드는 윙-코어-윙 구조를 포함하지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 윙 영역을 포함하고, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 위치에서 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하는 3'-말단 윙 영역을 포함하고, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 위치에서 천연 포스페이트 연결을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드 -F 를 포함하는 보다 적은 뉴클레오티드 단위를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 보다 적은 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나의 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 단지 하나의 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 단지 하나의 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 2 개 이상의 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 조성물을 사용하여, 제공된 방법은 하나 초과의 표적을 표적으로 할 수 있다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 2 개 이상의 표적을 표적으로 한다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 올리고뉴클레오티드 유형을 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 2 개 이상의 미스매치를 표적으로 한다. 일부 구현예에서, 하나의 올리고뉴클레오티드 유형은 2 개 이상의 표적, 예를 들어 돌연변이를 표적으로 한다. 일부 구현예에서, 하나의 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드의 표적 영역은 2 개 이상의 "표적 부위", 예컨대 2 개의 돌연변이 또는 SNP 를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 임의로 개질된 염기 또는 당을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 어떠한 개질된 염기 또는 당도 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 어떠한 개질된 염기도 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 개질된 염기 및 당을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 개질된 염기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물 중 올리고뉴클레오티드는 개질된 당을 포함한다. 올리고뉴클레오티드에 있어서 개질된 염기 및 당은, 비제한적으로 본 개시에 기재된 것들을 포함하여, 당업계에 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 개질된 염기는 5-mC 이다. 일부 구현예에서, 개질된 당은 2'-개질된 당이다. 올리고뉴클레오티드 당의 적합한 2'-개질은 당업자에 의해 널리 공지되어 있다. 일부 구현예에서, 2'-개질은, 비제한적으로, 2'-OR1 을 포함하고, 여기서 R1 은 수소가 아니다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-OR1 이고, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 지방족이다. 일부 구현예에서, 2'-개질은 2'-MOE 이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-할로겐이다. 일부 구현예에서, 개질은 2'-F 이다. 일부 구현예에서, 개질된 염기 또는 당은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 활성, 안정성 및/또는 선택성을 추가로 증진시킬 수 있고, 이의 백본 키랄 중심의 공통 패턴은 예상치 못한 활성, 안정성 및/또는 선택성을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 어떠한 개질된 당도 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 어떠한 2'-개질된 당도 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 본 개시는 놀랍게도 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 사용함으로써, 개질된 당이 안정성, 활성, 및/또는 절단 패턴의 제어가 필요하지 않다는 것을 발견하였다. 나아가, 일부 구현예에서, 본 개시는 놀랍게도, 개질된 당 없는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이 안정성, 활성, 턴오버 및/또는 절단 패턴의 제어 면에서 보다 양호한 특성을 전달한다는 것을 발견하였다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 개질된 당을 갖지 않는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이 절단 생성물로부터 훨씬 더 빠르게 해리되고, 개질된 당을 갖는 올리고뉴클레오티드의 조성물보다 유의하게 증가된 턴오버를 제공한다는 것을 발견하였다.
본원에서 상세하게 논의된 바와 같이, 본 개시는, 무엇보다도, 조성물이 적어도 하나의 유형의 다수의 올리고뉴클레오티드를 함유하는 것을 의미하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 특정 "유형" 의 각각의 올리고뉴클레오티드 분자는, (1) 염기 서열; (2) 백본 연결의 패턴; (3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 (4) 백본 P-개질 모이어티의 패턴에 대하여, 사전선택된 (예를 들어, 선결된) 구조 요소로 구성된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 단일 합성 공정에서 제조된 올리고뉴클레오티드를 함유한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 단일 올리고뉴클레오티드 분자 내에 1 개 초과의 키랄 배열을 갖는 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드를 따라 상이한 잔기가 상이한 입체화학을 갖는) 올리고뉴클레오티드를 함유하고; 일부 상기와 같은 구현예에서, 상기 올리고뉴클레오티드는 1 개 초과의 키랄 배열을 갖는 개별적인 올리고뉴클레오티드 분자를 생성하기 위한 2차 컨쥬게이션 단계의 필요 없이, 단일 합성 공정으로 수득될 수 있다.
본원에 제공된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 조성물은, 비제한적으로, 전사, 번역, 면역 반응, 후성 유전학 등을 포함하여, 다수의 세포 과정 및 조직을 조정하는 작용제로서 사용될 수 있다. 또한, 본원에 제공된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 조성물은 연구 및/또는 진단 목적의 시약으로서 사용될 수 있다. 당업자는 본 개시의 설명이 특정 용도에 제한되지 않으며, 합성 올리고뉴클레오티드의 사용이 바람직한 임의의 상황에 적용될 수 있다는 것을 쉽게 인식할 것이다. 무엇보다도, 제공된 조성물은 각종 치료, 진단, 농업, 및/또는 연구 적용에 유용하다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 본원에 상세하게 기재된 바와 같은 하나 이상의 구조적 개질을 포함하는 올리고뉴클레오티드 및/또는 이의 잔기를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 이상의 핵산 유사체를 함유하는 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 비제한적으로, 펩티드 핵산 (PNA), 모르폴리노 및 잠금 핵산 (LNA), 글리콘 핵산 (GNA), 트레오스 핵산 (TNA), Xeno 핵산 (XNA), 및 이의 임의의 조합을 포함하는, 하나 이상의 인공 핵산 또는 잔기를 함유하는 올리고뉴클레오티드를 포함한다.
임의의 구현예에서, 본 개시는 유전자 발현, 면역 반응 등의 올리고뉴클레오티드-기반 조절에 유용하다. 따라서, 선결된 유형 (즉, 키랄 제어된, 및 임의로 키랄적으로 순수한) 의 올리고뉴클레오티드를 함유하는 본 개시의 스테레오-정의된 올리고뉴클레오티드 조성물이, 통상의 스테레오-랜덤 또는 키랄적으로 불순한 대응부 대신에 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 증강된 의도된 효과 및/또는 감소된 원치 않는 부작용을 나타낸다. 본 개시의 생물학적 및 임상적/치료적 적용의 특정 구현예는 하기에 명백하게 논의된다.
각종 투여 치료법이 제공된 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는데 이용될 수 있다. 일부 구현예에서, 다중 단위 투여량이 기간에 의해 분리되어, 투여된다. 일부 구현예에서, 제시된 조성물은 하나 이상의 투여량을 포함할 수 있는 권장되는 투여 치료법을 갖는다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 각각 동일한 길이의 기간에 의해 서로 분리되는 다수의 투여를 포함하고; 일부 구현예에서, 투여 치료법은 다수의 투여량 및 개별 투여를 분리하는 적어도 2 개의 상이한 기간을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법 내 모든 투여는 동일한 단위 투여량을 갖는다. 일부 구현예에서, 투여 치료법 내 상이한 투여는 상이한 양을 갖는다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 제 1 투여량으로의 제 1 투여, 이어서 제 1 투여량과 상이한 제 2 투여량으로의 하나 이상의 부가적인 투여를 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 제 1 투여량으로의 제 1 투여, 이어서 제 1 투여량 (또는 또 다른 이전 투여량) 과 동일 또는 상이한 제 2 (또는 후속) 투여량으로의 하나 이상의 부가적인 투여를 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 적어도 1 일 동안 적어도 하나의 단위 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 적어도 1 일, 및 때때로 1 일 초과의 기간에 걸쳐 1 회 초과의 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 적어도 1 주의 시간 기간에 걸쳐 복수의 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 기간은 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 또는 그 이상 (예를 들어, 약 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 또는 그 이상) 의 주이다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 1 주 초과 동안 주 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 또는 그 이상 (예를 들어, 약 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 또는 그 이상) 주 동안 1 주 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 2 주 초과 기간 동안 매 2 주 마다 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40 또는 그 이상 (예를 들어, 약 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 또는 그 이상) 주의 기간에 걸쳐 매 2 주 마다 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 1 개월 동안 1 개월 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 1 개월 초과 동안 1 개월 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 또는 그 이상의 개월 동안 1 개월 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 약 10 주 동안 1 주 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 약 20 주 동안 1 주 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 약 30 주 동안 1 주 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 투여 치료법은 26 주 동안 1 주 당 1 회 투여량을 투여하는 것을 포함한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 서열의 키랄 비제어된 (예를 들어, 스테레오랜덤) 올리고뉴클레오티드 조성물, 및/또는 동일한 서열의 상이한 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물에 대하여 이용되는 것과 상이한 투여 치료법에 따라 투여된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 제시된 시간 단위에 걸쳐 보다 낮은 수준의 총 노출을 달성하고, 1 회 이상 적은 단위 투여량을 포함하고/하거나 제시된 시간 단위에 걸쳐 보다 적은 투여 횟수를 포함하는, 동일한 서열의 키랄 비제어된 (예를 들어, 스테레오랜덤) 올리고뉴클레오티드 조성물의 것과 비교하여 감소된 투여 치료법에 따라 투여된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 서열의 키랄 비제어된 (예를 들어, 스테레오랜덤) 올리고뉴클레오티드 조성물의 투여보다 긴 시간 기간 동안 연장된 투여 치료법에 따라 투여된다. 이론에 제한되지 않으면서, 본 출원인은, 일부 구현예에서, 투여 사이의 보다 짧은 투여 치료법, 및/또는 보다 긴 기간은 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 개선된 안정성, 생체이용률 및/또는 효능 때문일 수 있다고 명시한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 상응하는 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 보다 긴 투여 치료법을 갖는다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물은 상응하는 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드 조성물과 비교하여 적어도 2 회의 투여 사이에 보다 짧은 기간을 갖는다. 이론에 제한되지 않으면서, 본 출원인은, 일부 구현예에서, 투여 사이의 보다 긴 투여 치료법, 및/또는 보다 짧은 기간이 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 개선된 안전성 때문일 수 있다고 명시한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 이의 낮은 독성으로 인해, 보다 높은 투여량 및/또는 보다 높은 빈도로 투여될 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 이의 개선된 전달 (및 다른 특성) 으로 인해, 생물학적 효과, 예를 들어 임상 효능을 달성하기 위하여 보다 적은 투여량 및/또는 보다 적은 빈도로 투여될 수 있다.
단일 투여는 다양한 양의 올리고뉴클레오티드를 함유할 수 있다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 적용에 따라 적합한 것으로 요망되는, 다양한 양의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 유형을 함유할 수 있다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를, 약 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 270, 280, 290, 300 또는 그 이상 (예를 들어, 약 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 또는 그 이상) mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 1 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 5 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 10 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 15 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 20 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 50 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 100 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 150 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 200 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 250 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 단일 투여는 한 유형의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드를 약 300 mg 함유한다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드보다, 단일 투여량, 및/또는 총 투여량에 있어서 보다 적은 양으로 투여된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 개선된 효능으로 인해 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드보다, 단일 투여량, 및/또는 총 투여량에 있어서 보다 적은 양으로 투여된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드보다, 단일 투여량, 및/또는 총 투여량에 있어서 보다 많은 양으로 투여된다. 일부 구현예에서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드는 개선된 안전성으로 인해 키랄 비제어된 올리고뉴클레오티드보다, 단일 투여량, 및/또는 총 투여량에 있어서 보다 많은 양으로 투여된다.
생물학적으로 활성인 올리고뉴클레오티드
본원에 사용되는 바와 같은 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 단일-가닥 및/또는 다중 가닥 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 단일-가닥 올리고뉴클레오티드는, 사용되는 경우, 심지어 단일-가닥 올리고뉴클레오티드도 적어도 부분적으로 이중-가닥 특성을 가질 수 있도록 하는 관련 조건 하에서 하이브리드할 수 있는 자가-상보적 부분을 함유한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물에 포함되는 올리고뉴클레오티드는 단일-가닥, 이중-가닥, 또는 삼중-가닥이다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물에 포함되는 올리고뉴클레오티드는 올리고뉴클레오티드 내에 단일-가닥 부분 및 다중-가닥 부분을 포함한다. 일부 구현예에서, 상기 명시된 바와 같이, 개별적인 단일-가닥 올리고뉴클레오티드는 이중-가닥 영역 및 단일-가닥 영역을 가질 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은, 구조 유전자, 유전자 제어 및/또는 종결 영역, 및/또는 자가-복제 시스템, 예컨대 바이러스 또는 플라스미드 DNA 의 가닥에 완전히 또는 부분적으로 상보적인 하나 이상의 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물에는, siRNA 또는 기타 RNA 간섭 시약 (RNAi 작용제 또는 iRNA 작용제), shRNA, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 자가-절단 RNA, 리보자임, 이의 단편 및/또는 이의 변이체 (예컨대, 펩티딜 트랜스퍼라아제 23S rRNA, RNase P, Group I 및 Group II 인트론, GIR1 분지화 리보자임, 리드자임 (Leadzyme), 헤어핀 (Hairpin) 리보자임, 해머해드 (Hammerhead) 리보자임, HDV 리보자임, 포유류 CPEB3 리보자임, VS 리보자임, glmS 리보자임, CoTC 리보자임 등), 마이크로RNA, 마이크로RNA 모방체, 수페르미르, 압타머, 안티미르, 안타고미르, Ul 어댑터, 트리플렉스-형성 올리고뉴클레오티드, RNA 활성화제, 긴 비-코딩 RNA, 짧은 비-코딩 RNA (예를 들어, piRNA), 면역조절성 올리고뉴클레오티드 (예컨대, 면역자극성 올리고뉴클레오티드, 면역저해성 올리고뉴클레오티드), GNA, LNA, ENA, PNA, TNA, 모르폴리노, G-사중체 (RNA 및 DNA), 항바이러스 올리고뉴클레오티드, 및 디코이 올리고뉴클레오티드이거나 또는 이들로서 작용하는 하나 이상의 올리고뉴클레오티드가 포함된다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 하나 이상의 하이브리드 (예를 들어, 키메라성) 올리고뉴클레오티드를 포함한다. 본 개시의 맥락에서, 용어 "하이브리드" 는 광범위하게 올리고뉴클레오티드의 혼합된 구조적 구성성분을 나타낸다. 하이브리드 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 (1) 단일 분자 내에 혼합된 부류의 뉴클레오티드, 예를 들어 부분 DNA 및 부분 RNA (예를 들어, DNA-RNA) 를 갖는 올리고뉴클레오티드 분자; (2) 상이한 부류의 핵산의 상보적 쌍, DNA:RNA 염기쌍은 분자내에서 또는 분자간에; 또는 둘 모두에서 일어날 수 있음; (3) 2 종류 이상의 백본 또는 뉴클레오티드간 연결을 갖는 올리고뉴클레오티드를 나타낼 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물에는 단일 분자 내에 하나 초과의 부류의 핵산 잔기를 포함하는 하나 이상의 올리고뉴클레오티드가 포함된다. 예를 들어, 본원에 기재된 임의의 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 DNA 부분 및 RNA 부분을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 비개질된 부분 및 개질된 부분을 포함할 수 있다.
제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은, 예를 들어 본원에 기재된 바와 같은 각종 개질 중 임의의 것을 함유하는 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 특정 개질은, 예를 들어 의도된 용도를 고려하여 선택된다. 일부 구현예에서, 이중-가닥 올리고뉴클레오티드 (또는 단일-가닥 올리고뉴클레오티드의 이중-가닥 부분) 중 하나 또는 양쪽 가닥을 개질시키는 것이 바람직하다. 일부 구현예에서, 2 개의 가닥 (또는 부분) 은 상이한 개질을 포함한다. 일부 구현예에서, 2 개의 가닥은 동일한 개질을 포함한다. 당업자는 본 개시의 방법에 의해 가능할 수 있는 개질의 정도 및 유형이 수많은 순열의 개질을 만들 수 있게 한다는 것을 인식할 것이다. 상기와 같은 개질의 예는 본원에 기재되어 있으며, 제한을 의미하지 않는다.
본원에 사용된 바, 구절 "안티센스 가닥" 은, 관심 표적 서열에 실질적으로 또는 100% 상보적인 올리고뉴클레오티드를 나타낸다. 구절 "안티센스 가닥" 은 2 개의 개별 가닥으로부터 형성되는 양쪽 올리고뉴클레오티드 뿐 아니라 헤어핀 또는 덤벨 유형 구조를 형성할 수 있는 단분자 올리고뉴클레오티드의 안티센스 영역을 포함한다. 용어 "안티센스 가닥" 및 "가이드 가닥" 은 본원에서 상호교환적으로 사용된다.
구절 "센스 가닥" 은 메신저 RNA 또는 DNA 의 서열과 같은 표적 서열로서, 전체적으로 또는 부분적으로, 동일한 뉴클레오시드 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드를 나타낸다. 용어 "센스 가닥" 및 "패신저 가닥" 은 본원에서 상호교환적으로 사용된다.
"표적 서열" 이란 그의 발현 또는 활성이 조절되는 임의의 핵산 서열을 의미한다. 표적 핵산은 DNA 또는 RNA, 예컨대 내인성 DNA 또는 RNA, 바이러스성 DNA 또는 바이러스성 RNA, 또는 유전자, 바이러스, 박테리아, 진균, 포유류 또는 식물에 의해 인코딩된 기타 RNA 일 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 서열은 질환 또는 장애와 관련이 있다. 본 개시에서 예시된 바와 같이, 일부 구현예에서, 표적 서열은 DMD 유전자의 일부이거나 이를 포함하며; 일부 구현예에서, 표적 서열은 DMD 프리-mRNA 의 일부이거나 이를 포함하며; 일부 구현예에서, 표적 서열은 DMD mRNA 의 일부이거나 이를 포함하며; 일부 구현예에서, 표적 서열은 DMD 유전자의 일부이며; 일부 구현예에서, 표적 서열은 DMD 프리-mRNA 의 일부이며; 및 일부 구현예에서, 표적 서열은 DMD mRNA 의 일부이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 표적 서열과 하이브리드한다.
"특이적으로 하이브리드화 가능한" 및 "상보적인" 은 핵산이 종래의 왓슨-크릭 (Watson-Crick) 또는 기타 비종래의 유형에 의해 또 다른 핵산 서열과 수소 결합(들)을 형성할 수 있다는 것을 의미한다. 본 개시의 핵 분자에 관하여, 그의 상보적 서열을 갖는 핵산 분자에 대한 결합 자유 에너지는 핵산의 관련 기능, 예를 들어 RNAi 활성을 진행시키기에 충분하다. 핵산 분자에 대한 결합 자유 에너지의 측정은 당업계에 널리 공지되어 있다 (예를 들어, [Turner et al, 1987, CSH Symp. Quant . Biol . LIT pp.123-133]; [Freier et al., 1986, Proc . Nat. Acad . Sci. USA 83:9373-9377]; [Turner et al., 1987, J. Am. Chem . Soc . 109:3783-3785]).
백분율 상보성은 제 2 핵산 서열과 수소 결합 (예를 들어, 왓슨-크릭 염기쌍 형성) 을 형성할 수 있는 핵산 분자 내 인접한 잔기의 백분율을 나타낸다 (예를 들어, 10 개 중 5, 6, 7, 8, 9, 10 개는 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 및 100% 상보적임). "완벽하게 상보적인" 또는 100% 상보성은 핵산 서열의 모든 인접한 잔기가 동일한 수의 제 2 핵산 서열 내 인접한 잔기와 수소 결합할 것이라는 것을 의미한다. 완벽하지 못한 상보성은 2 개의 가닥의 일부 (그러나 모두는 아님) 뉴클레오시드 단위가 서로 수소 결합할 수 있는 상황을 나타낸다. "실질적인 상보성" 은 비(非)상보적이 되도록 선택되는 오버행 (overhang) 과 같은 폴리뉴클레오티드 가닥의 영역을 제외하고, 90% 이상의 상보성을 나타내는 폴리뉴클레오티드 가닥을 나타낸다. 특이적 결합은, 특이적 결합을 목적으로 하는 조건 하에서, 예를 들어, 생체내 검정 또는 치료적 치료의 경우에는 생리학적 조건 하에서, 또는 시험관내 검정의 경우에는 이러한 검정법이 수행되는 조건 하에서, 비(非)표적 서열에 대한 올리고머성 화합물의 비특이적 결합을 회피하기 위해 충분한 정도의 상보성을 필요로 한다. 일부 구현예에서, 비표적 서열은 적어도 5 개의 뉴클레오티드가 상응하는 표적 서열과 상이하다.
치료제로서 사용되는 경우, 제공된 올리고뉴클레오티드는 약학적 조성물로서 투여된다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 치료적 유효량의 제공된 올리고뉴클레오티드, 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염, 및 약학적으로 허용 가능한 희석제, 약학적으로 허용 가능한 부형제, 및 약학적으로 허용 가능한 담체로부터 선택되는 하나 이상의 약학적으로 허용 가능한 비활성 성분을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 약학적 조성물은 정맥내 주사, 경구 투여, 구강 투여, 흡입, 비강 투여, 국소 투여, 안구 투여, 또는 귀 투여를 위하여 제형화된다. 추가의 구현예에서, 약학적 조성물은 정제, 환제, 캡슐, 액체, 흡입제, 비강 스프레이 용액, 좌제, 현탁액, 겔, 콜로이드, 분산액, 현탁액, 용액, 에멀젼, 연고, 로션, 점안액 또는 점이액이다.
약학적 조성물
치료법으로서 사용되는 경우, 본원에 기재된 제공된 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드 조성물은 약학적 조성물로서 투여된다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 치료적 유효량의 제공된 올리고뉴클레오티드, 또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염, 및 약학적으로 허용 가능한 희석제, 약학적으로 허용 가능한 부형제, 및 약학적으로 허용 가능한 담체로부터 선택되는 하나 이상의 약학적으로 허용 가능한 비활성 성분을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 중 제공된 올리고뉴클레오티드는 염, 바람직하게는 약학적으로 허용 가능한 염, 예를 들어 소듐 염, 암모늄 염 등으로서 존재할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드의 염은 2 개 이상, 예를 들어 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 중 음으로 하전된 산성기 (예를 들어, 포스페이트, 포스포로티오에이트 등) 의 수까지의 양이온을 포함한다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 정맥내 주사, 경구 투여, 구강 투여, 흡입, 경비 투여, 국소 투여, 안구 투여, 척수강내 투여, 또는 귀 투여를 위하여 제형화된다. 일부 구현예에서, 약학적 조성물은 정제, 환제, 캡슐, 액체, 흡입제, 비강 스프레이 용액, 좌제, 현탁액, 겔, 콜로이드, 분산액, 현탁액, 용액, 에멀젼, 연고, 로션, 점안액 또는 점이액이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 조성물을, 약학적으로 허용 가능한 부형제와 부가혼합하여 포함하는 약학적 조성물을 제공한다. 당업자는, 상기에 기재된, 약학적 조성물이 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드의 약학적으로 허용 가능한 염, 또는 이의 조성물을 포함한다는 것을 인식할 것이다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 예를 들어 다른 치료제 및/또는 의학적 절차와의 병용 요법을 위한 기술 (예를 들어, 조성물, 방법 등) 을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 및/또는 조성물은 하나 이상의 다른 치료제와 함께 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 제공된 올리고뉴클레오티드, 및 하나 이상의 다른 치료제를 포함한다. 일부 구현예에서, 하나 이상의 다른 치료제는, 조성물 중 제공된 올리고뉴클레오티드와 비교할 때, 하나 이상의 상이한 표적, 및/또는 표적에 대한 하나 이상의 상이한 메카니즘을 가질 수 있다. 일부 구현예에서, 치료제는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 치료제는 소분자 약물이다. 일부 구현예에서, 치료제는 단백질이다. 일부 구현예에서, 치료제는 항체이다. 다수의 치료제가 본 개시에 따라 이용될 수 있다. 예를 들어, DMD 에 대한 올리고뉴클레오티드는 유트로핀 생성을 조절하는 하나 이상의 치료제 (유트로핀 조절제) 와 함께 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 유트로핀 조절제는 유트로핀의 생성을 촉진시킨다. 일부 구현예에서, 유트로핀 조절제는 에주트로미드 (ezutromid) 이다. 일부 구현예에서, 유트로핀 조절제는
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또는 이의 약학적으로 허용 가능한 염이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 조성물은, 하나 이상의 다른 치료제 및/또는 의학적 절차 이전에, 이와 동시에, 또는 이후에 투여된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 조성물은 하나 이상의 다른 치료제 및/또는 의학적 절차와 동시에 투여된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 조성물은 하나 이상의 다른 치료제 및/또는 의학적 절차 이전에 투여된다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 조성물은 하나 이상의 다른 치료제 및/또는 의학적 절차 이후에 투여된다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 하나 이상의 다른 치료제를 포함한다.
각종 초분자성 나노담체는 핵산을 전달하는데 사용될 수 있다. 나노담체의 예에는, 비제한적으로, 리포좀, 양이온성 중합체 복합체 및 각종 중합체가 포함된다. 핵산과 각종 폴리양이온과의 복합체화는 세포내 전달을 위한 또 다른 접근법이고; 이는 PEG-화 폴리양이온, 폴리에틸렌아민 (PEI) 복합체, 양이온성 블록 공중합체, 및 덴드리머의 사용을 포함한다. PEI 및 폴리아미도아민 덴드리머를 포함하는 몇몇의 양이온성 나노담체는 엔도좀으로부터 내용물을 방출시키는 것을 돕는다. 다른 접근법은 중합체성 나노입자, 중합체 미셀 (micelle), 양자점 및 리포플렉스 (lipoplex) 의 사용을 포함한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는 또 다른 분자에 콘쥬게이트된다.
본원에 기재된 전달 전략의 예 이외에, 부가적인 핵산 전달 전략이 공지되어 있다.
치료 및/또는 진단 적용에서, 본 개시의 화합물은 전신 및 국소 또는 국부화 투여를 비롯한 각종 투여 방식을 위하여 제형화될 수 있다. 기법 및 제형은 일반적으로 [Remington, The Science and Practice of Pharmacy, (20th ed. 2000)] 에서 확인할 수 있다.
제공된 올리고뉴클레오티드 및 이의 조성물은 넓은 투여량 범위에 걸쳐 효과적이다. 예를 들어, 성인의 치료에서, 1 일 당 약 0.01 내지 약 1000 mg, 약 0.5 내지 약 100 mg, 약 1 내지 약 50 mg, 및 1 일 당 약 5 내지 약 100 mg 의 투여량이, 사용될 수 있는 투여량의 예이다. 정확한 투여량은 투여 경로, 화합물이 투여되는 형태, 치료하고자 하는 대상, 치료하고자 하는 대상의 체중, 및 담당의의 선호도 및 경험에 따라 다를 수 있다.
약학적으로 허용 가능한 염은 일반적으로 당업자에게 널리 공지되어 있고, 예를 들어, 비제한적으로, 아세테이트, 벤젠술포네이트, 베실레이트, 벤조에이트, 바이카르보네이트, 바이타르트레이트, 브로마이드, 칼슘 에데테이트, 카른실레이트, 카르보네이트, 시트레이트, 에데테이트, 에디실레이트, 에스톨레이트, 에실레이트, 푸마레이트, 글루셉테이트, 글루코네이트, 글루타메이트, 글리콜릴아르사닐레이트, 헥실레소르시네이트, 히드라바민, 히드로브로마이드, 히드로클로라이드, 히드록시나프토에이트, 요오다이드, 이세티오네이트, 락테이트, 락토비오네이트, 말레이트, 말레에이트, 만델레이트, 메실레이트, 무케이트, 납실레이트, 니트레이트, 파모에이트 (엠보네이트), 판토테네이트, 포스페이트/디포스페이트, 폴리갈락투로네이트, 살리실레이트, 스테아레이트, 서브아세테이트, 숙시네이트, 술페이트, 탄네이트, 타르트레이트, 또는 테오클레이트가 포함될 수 있다. 기타 약학적으로 허용 가능한 염은, 예를 들어 [Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000)] 에서 확인할 수 있다. 바람직한 약학적으로 허용 가능한 염에는, 예를 들어 아세테이트, 벤조에이트, 브로마이드, 카르보네이트, 시트레이트, 글루코네이트, 히드로브로마이드, 히드로클로라이드, 말레에이트, 메실레이트, 납실레이트, 파모에이트 (엠보네이트), 포스페이트, 살리실레이트, 숙시네이트, 술페이트, 또는 타르트레이트가 포함된다.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 약학적 용도를 위한 다수의 염으로 제형화될 수 있다. 일부 구현예에서, 염은 금속 양이온 염 및/또는 암모늄 염이다. 일부 구현예에서, 염은 올리고뉴클레오티드의 금속 양이온 염이다. 일부 구현예에서, 염은 올리고뉴클레오티드의 암모늄 염이다. 대표적인 알칼리 또는 알칼리 토금속 염에는, 소듐, 리튬, 포타슘, 칼슘, 마그네슘 등이 포함된다. 일부 구현예에서, 염은 올리고뉴클레오티드의 소듐 염이다. 일부 구현예에서, 약학적으로 허용 가능한 염에는, 적절한 경우, 제공된 올리고뉴클레오티드 내에 존재할 수 있는, 히드록시드, 카르복실레이트, 술페이트, 포스페이트, 니트레이트, 술포네이트, 포스포로티오에이트 등과 같은 반대이온과 함께 형성되는 비독성 암모늄, 4차 암모늄, 및 아민 양이온이 포함된다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 올리고뉴클레오티드의 염은, 올리고뉴클레오티드 내 하나 초과의 음이온이 존재할 수 있기 때문에, 하나 초과의 양이온, 예를 들어 소듐 이온을 함유할 수 있다.
치료되는 특정 병태에 따라, 상기와 같은 작용제는 액체 또는 고체 투여량 형태로 제형화될 수 있고, 전신적 또는 국소적으로 투여될 수 있다. 상기 작용제는, 예를 들어 당업자에게 공지된 바와 같은 정기적- 또는 지속적- 저 방출 형태로 전달될 수 있다. 제형화 및 투여를 위한 기법은 [Remington, The Science and Practice of Pharmacy (20th ed. 2000)] 에서 확인할 수 있다. 적합한 경로에는, 경구, 구강, 흡입 분무, 설하, 직장, 경피, 질내, 경점막, 비강 또는 장내 투여; 근육내, 피하, 척수내 주사 뿐 아니라, 경막내, 직접적 심실내, 정맥내, 관절내, 흉골내, 활액내, 간내, 병반내, 두개내, 복강내, 비강내, 또는 안내 주사를 비롯한 비경구 전달 또는 기타 전달 방식이 포함될 수 있다.
주사를 위하여, 본 개시의 작용제는 수용액, 예컨대 생리학적으로 적합한 완충액, 예컨대 행크 (Hank) 용액, 링거액 또는 생리학적 식염수 완충액 중에서 제형화되고 희석될 수 있다. 이러한 경점막 투여의 경우, 침투하고자 하는 장벽에 적합한 침투제가 제형에 사용될 수 있다. 상기와 같은 침투제는 일반적으로 당업계에 공지되어 있다.
전신 투여에 적합한 투여량으로 본 개시의 실시를 위하여 본원에 기재된 화합물을 제형화하기 위한 약학적으로 허용 가능한 불활성 담체의 사용은, 본 개시의 범주 내에 있다. 담체의 적절한 선택 및 적합한 제조 실시와 함께, 본 개시의 조성물, 특히, 용액으로서 제형화된 것은, 비경구로, 예컨대 정맥내 주사에 의해 투여될 수 있다.
화합물은 경구 투여에 적합한 투여량으로 당업계에 널리 공지된 약학적으로 허용 가능한 담체를 사용하여 용이하게 제형화될 수 있다. 상기와 같은 담체는, 본 개시의 화합물이 치료하고자 하는 대상 (예를 들어, 환자) 에 의한 경구 섭취를 위하여, 정제, 환제, 캡슐, 액체, 겔, 시럽, 슬러리, 현탁액 등으로서 제형화되는 것을 가능하게 한다.
비강 또는 흡입 전달을 위하여, 본 개시의 작용제는 또한 당업자에게 공지된 방법에 의해 제형화될 수 있고, 예를 들어, 비제한적으로, 가용화, 희석 또는 분산 물질, 예컨대 식염수, 방부제, 예컨대 벤질 알코올, 흡수 촉진제, 및 플루오로카본의 예가 포함될 수 있다.
특정 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 CNS 에 전달된다. 특정 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 뇌척수액에 전달된다. 특정 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 뇌 유조직에 투여된다. 특정 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 척수강내 투여, 또는 뇌실내 투여에 의해 동물/대상에 전달된다. 본원에 기재된, 중추 신경계 내 올리고뉴클레오티드 및 조성물의 넓은 분포는, 뇌실질내 투여, 척수강내 투여, 또는 뇌실내 투여를 이용하여 달성될 수 있다.
특정 구현예에서, 비경구 투여는 주사, 예를 들어, 시린지, 펌프 등에 의해 투여된다. 특정 구현예에서, 주사는 볼루스 주사이다. 특정 구현예에서, 주사는 조직, 예컨대 선조체, 꼬리, 피질, 해마 및 소뇌에 직접 투여된다.
특정 구현예에서, 약학적 작용제를 특이적으로 국부화하는 방법, 예컨대 볼루스 주사에 의한 방법은, 중앙 유효 농도 (EC50) 를 20, 25, 30, 35, 40, 45 또는 50 배 감소시킨다. 특정 구현예에서, 안티센스 화합물 중 약학적 작용제가 본원에 추가로 기재되어 있다. 특정 구현예에서, 표적화된 조직은 뇌 조직이다. 특정 구현예에서, 표적화된 조직은 선조체 조직이다. 특정 구현예에서, EC50 를 감소시키는 것은, 이것이 이를 필요로 하는 환자에서 약리학적 결과를 달성하는데 요구되는 용량을 감소시키기 때문에 바람직하다.
특정 구현예에서, 안티센스 올리고뉴클레오티드는 매월, 매 2 개월 마다, 매 90 일 마다, 매 3 개월 마다, 매 6 개월 마다 1 회, 1 년에 2 회 또는 1 년에 1 회 주사 또는 주입에 의해 전달된다.
본 개시에 사용하기에 적합한 약학적 조성물은, 활성 성분이 이의 의도된 목적을 달성하기에 유효한 양으로 함유된 조성물을 포함한다. 유효량의 측정은, 특히 본원에 제공된 상세한 개시를 고려하여, 당업자의 능력 내에 있다.
활성 성분 이외에, 상기 약학적 조성물은 약학적으로 사용될 수 있는 제제 로의 활성 화합물의 가공을 용이하게 하는 부형제 및 보조제를 포함하는 적합한 약학적으로 허용 가능한 담체를 함유할 수 있다. 경구 투여를 위해 제형화된 제제는 정제, 당의정, 캡슐, 또는 용액의 형태일 수 있다.
경구용 약학적 제제는 활성 화합물을 고체 부형제와 조합하고, 임의로 수득한 혼합물을 분쇄하고, 목적하는 경우, 정제 또는 당의정 코어를 수득하기 위해 적합한 보조제의 첨가 후, 과립의 혼합물을 가공함으로써 수득될 수 있다. 적합한 부형제는, 특히 충전제, 예컨대 락토오스, 수크로오스, 만니톨 또는 소르비톨을 포함하는 당; 셀룰로오스 제제, 예를 들어 옥수수 전분, 밀 전분, 쌀 전분, 감자 전분, 젤라틴, 트래거캔스 검, 메틸 셀룰로오스, 히드록시프로필메틸-셀룰로오스, 소듐 카르복시메틸-셀룰로오스 (CMC), 및/또는 폴리비닐피롤리돈 (PVP: 포비돈) 이다. 목적하는 경우, 붕해제, 예컨대 가교된 폴리비닐피롤리돈, 아가, 또는 알킨산 또는 이의 염, 예컨대 소듐 알기네이트가 첨가될 수 있다.
당의정 코어는 적합한 코팅과 함께 제공된다. 이를 위하여, 농축된 당 용액이 사용될 수 있고, 이는 임의로 아라비아 검, 탈크, 폴리비닐피롤리돈, 카르보폴 겔, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG), 및/또는 이산화티타늄, 락커 용액, 및 적합한 유기 용매 또는 용매 혼합물을 함유할 수 있다. 활성 화합물 용량의 상이한 조합을 식별 또는 특징화하기 위하여, 염료 또는 안료를 정제 또는 당의정 코팅에 첨가할 수 있다.
경구로 사용될 수 있는 약학적 제제에는, 젤라틴으로 제조된 푸시-핏 (push-fit) 캡슐 뿐 아니라, 젤라틴, 및 가소제, 예컨대 글리세롤 또는 소르비톨로 제조된 연질의, 밀봉 캡슐이 포함된다. 푸시-핏 캡슐은, 활성 성분을 충전제, 예컨대 락토오스, 결합제, 예컨대 전분, 및/또는 윤활제, 예컨대 탈크 또는 마그네슘 스테아레이트 및, 임의로 안정화제와 부가혼합하여 함유할 수 있다. 연질 캡슐에서, 활성 화합물은 적합한 액체, 예컨대 지방 오일, 액체 파라핀, 또는 액체 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 에 용해되거나 현탁될 수 있다. 또한, 안정화제가 첨가될 수 있다.
조성물은 활성 화합물을 지질과 조합함으로써 수득될 수 있다. 일부 구현예에서, 지질은 활성 화합물에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 활성 화합물에 콘쥬게이트되지 않는다. 일부 구현예에서, 지질은 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 각종 구현예에서, 지질은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일. 일부 구현예에서, 지질은 하기 중 임의의 구조를 갖는다:
Figure pct00404
각종 구현예에서, 활성 화합물은 임의의 올리고뉴클레오티드 또는 본원에 기재된 다른 핵산이다. 각종 구현예에서, 활성 화합물은 디스트로핀에서 엑손의 스킵핑을 중재할 수 있는 올리고뉴클레오티드이다. 각종 구현예에서, 활성 화합물은 디스트로핀에서 엑손 51 의 스킵핑을 중재할 수 있는 올리고뉴클레오티드이다. 각종 구현예에서, 활성 화합물은 표 2-4 에 열거된 임의의 핵산의 임의의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 서열의 핵산이다. 각종 구현예에서, 활성 화합물은 표 2 에 열거된 임의의 핵산의 임의의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 서열의 핵산이다. 각종 구현예에서, 활성 화합물은 표 3 에 열거된 임의의 핵산의 임의의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 서열의 핵산이다. 각종 구현예에서, 활성 화합물은 표 4 에 열거된 임의의 핵산의 임의의 서열을 포함하거나 이로 이루어진 서열의 핵산이다. 각종 구현예에서, 조성물은 지질 및 활성 화합물을 포함하고, 또 다른 지질, 및 표적 화합물 또는 모이어티로부터 선택되는 또 다른 구성성분을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 지질에는, 비제한적으로, 하기가 포함된다: 아미노 지질; 양쪽성 (amphoteric) 지질; 음이온성 지질; 아포지질단백질; 양이온성 지질; 저분자량 양이온성 지질; 양이온성 지질, 예컨대 CLinDMA 및 DLinDMA; 이온화 가능 양이온성 지질; 클로킹 (cloaking) 구성성분; 헬퍼 지질; 리포펩티드; 중성 지질; 중성 쌍성 (zwitterionic) 지질; 소수성 소분자; 소수성 비타민; PEG-지질; 하나 이상의 친수성 중합체로 개질된 비하전된 지질; 인지질; 1,2-디올레오일-sn-글리세로-3-포스포에탄올아민과 같은 인지질; 스테아레스 지질; 스테롤; 콜레스테롤; 및 표적 지질; 및 본원에 기재되거나 당업계에 보고된 임의의 다른 지질. 일부 구현예에서, 조성물은 지질, 및 또 다른 지질 또 다른 지질의 적어도 하나의 기능을 중재할 수 있는 또 다른 지질의 일부를 포함한다. 일부 구현예에서, 표적 화합물 또는 모이어티는 특정 세포 또는 조직, 또는 세포 또는 조직의 서브세트 (subset) 에 대하여 화합물 (예를 들어,지질 및 활성 화합물을 포함하는 조성물) 을 표적화할 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 모이어티는 특정 표적, 수용체, 단백질, 또는 기타 세포하 (subcellular) 구성성분의 세포- 또는 조직-특이적 발현의 이점을 취하도록 고안되고; 일부 구현예에서, 표적 모이어티는 세포 또는 조직에 대하여 조성물을 표적으로 하고/하거나 표적, 수용체, 단백질, 또는 기타 세포하 구성성분에 결합하는, 리간드 (예를 들어, 소분자, 항체, 펩티드, 단백질, 탄수화물, 압타머 등) 이다.
도 20 에 제시된 바와 같이, 활성 화합물의 전달을 위한 조성물의 제조에 사용하기 위한 특정 예시 지질은 활성 화합물의 기능을 가능하게 한다 (예를 들어, 이를 막거나 간섭하지 않음). 지질의 비제한적인 예에는 하기가 포함된다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일.
활성 화합물, 올리고뉴클레오티드 WV-942 를, 인간 DMD (듀켄 근이영양증) 근육아세포에서 이의 생물학적 활성에 대하여 시험하였다. 엑손 51 스킵핑의 부재 하에서, 단백질은 프레임시프트 돌연변이로 인해 심각하게 절단되어, 조기 종결 코돈을 유도한다. 드리사퍼센과 동일한 서열 및 화학적 성질을 갖는, 올리고뉴클레오티드 WV-942 (또한 킨드리사 (Kyndrisa), PRO051 및 GSK2402968 로 공지됨) 는, 엑손 51 의 스킵핑을 가능하게 하여, 엑손 51 이 결여된 프레임-보정된 디스트로핀 전사물의 생성을 가능하게 하는 것으로 의도된다. 본 개시에 제시된 바와 같이, 제공된 올리고뉴클레오티드는 WV-942 와 비교하여 놀랍게도 높은 스킵핑 효율을 제공할 수 있다.
본 개시에 기재된 바와 같이, 지질 콘쥬게이션, 예컨대 지방산과의 콘쥬게이션은, 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 특성을 개선시킬 수 있다. 실험예에서, 근아세포를 네이키드 (naked) WV-942 (어떤 지질에도 콘쥬게이트되지 않음), 또는 몇몇의 지질: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일 (하기 표 5 에 열거됨) 중 임의의 하나에 콘쥬게이트된 WV-942 로 처리하였다.
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일부 구현예에서, 결과의 예는, 활성 화합물, WV-942, 및 몇몇의 지질 (라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일) 중 임의의 것을 포함하는 조성물의 제조가 작용제의 생물학적 활성을 막지 않으며; 사실, 몇몇의 경우에 있어서, 지질의 첨가 시, 생물학적 활성이 수 배 증가되었다는 것을 입증하였다.
도 29 및 37 은, 지질과의 콘쥬게이션이 스킵핑 효율을 증가시킬 수 있다는 것을 보여주는 부가적인 예시 데이터를 포함한다. 도 29 는, 스테레오퓨어 올리고뉴클레오티드 WV-3473 이 스테아르산 (WV-3545 를 형성하기 위해) 또는 투르비나르산 (WV-3546 를 형성하기 위해) 에 콘쥬게이트되는 경우에 달성된, 증가된 스킵핑 효율을 보여준다. WV-3473 은, 5'- fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU-3' 이고, 여기서 *S 는 Sp 배열의 포스포로티오에이트 연결이고, f 는 2'-F 이고, m 은 2'-OMe 이고, 뉴클레오티드간 연결이 제시되지 않은 포스포디에스테르 연결을 갖고; WV-3545 는 5'- Mod015L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU-3' 이고, 이는 Mod015L001 이 C6 PO 링커를 갖는 스테아르산을 나타낸다는 것을 제외하고는, WV-3473 과 동일하고; WV-3546 은 5'- Mod020L001fU*SfC*SfA*SfA*SfG*SfG*SmAfA*SmGmA*SfU*SmGmGfC*SfA*SfU*SfU*SfU*SfC*SfU -3' 이고, 이는 Mod020L001 이 C6 PO 링커를 갖는 투르비나르산을 나타낸다는 것을 제외하고는, WV-3473 과 동일하다. 도 37 은, 지질과의 콘쥬게이션이 WV-942 (드리사퍼센) 의 스킵핑 효율을 증가시킨다는 것을 보여준다. WV-2578 내지 WV-2587 은, 각각, 하기와 같은 각종 지질 (여기서, 지방산) 에 콘쥬게이트된 WV-942 를 나타낸다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, DHA 산, 및 투르비나르산.
일부 구현예에서, 활성 화합물의 전달을 위한 조성물은, 목적에 따라, 활성 화합물을 특정 세포 또는 조직에 대하여 표적화할 수 있다. 일부 구현예에서, 활성 화합물의 전달을 위한 조성물은 활성 화합물을 근육 세포 또는 조직에 대하여 표적화할 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는 활성 화합물의 전달과 관련된 조성물 및 방법으로서, 조성물이 활성 화합물 지질을 포함하는 조성물 및 방법에 관한 것이다. 근육 세포 또는 조직에 대한 각종 구현예에서, 지질은 하기로부터 선택된다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일. 도 19 내지 23 에 제시된 바와 같이, 예시 조성물은 활성 화합물 (WV-942) 및 지질을 포함하는 것으로 제조되고, 이러한 조성물은 활성 화합물을 표적 세포 및 조직, 예를 들어 근육 세포 및 조직에 전달하는 것을 가능하게 하였다. 사용된 지질의 예에는, 스테아르산, 올레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA, 투르비나르산 및 디리놀레일산이 포함된다. 이러한 도면에서, "TBD" 는 특정 조성물이 전달에 효과적이지만, 다수의 결과가 표준 범위를 벗어나 있기 때문에, 최종 결과는 아직 결정되지 않았다는 것을 나타내지만; 도에서 "TBD" 로 표시된 조성물은 활성 화합물의 전달 시 효과적이었다.
도 19 에 제시된 바와 같이: 활성 화합물, 및 스테아르산, 올레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA 산 또는 투르비나르산 중 임의의 것을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 비복근 근육 조직에 전달할 수 있었다. 활성 화합물, 및 스테아르산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA 산, 또는 투르비나르산 중 임의의 것을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 심장 근육 조직에 전달할 수 있었다. 활성 화합물, 및 스테아르산, 올레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA 산 또는 투르비나르산 중 임의의 것을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 사두근 근육 조직에 전달할 수 있었다. 도 20 에 제시된 바와 같이: 활성 화합물, 및 스테아르산, 올레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA 산 또는 투르비나르산 중 임의의 것을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 비복근 근육 조직에 전달할 수 있었다. 활성 화합물, 및 스테아르산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA 산 또는 투르비나르산 중 임의의 것을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 심장 근육 조직에 전달할 수 있었다. 활성 화합물, 및 디리놀레일, 스테아르산, 올레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 시스-DHA 산 또는 투르비나르산 중 임의의 것을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 횡격막 근육 조직에 전달할 수 있었다.
따라서: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질, 및 활성 화합물을 포함하는 조성물은, 활성 화합물을 간외 세포 및 조직, 예를 들어 근육 세포 및 조직에 전달할 수 있다.
치료 또는 예방하고자 하는 특정 병태, 또는 질환 상태에 따라, 상기 병태를 치료 또는 예방하기 위해 통상적으로 투여되는 부가적인 치료제가, 본 개시의 올리고뉴클레오티드와 함께 투여될 수 있다. 예를 들어, 화학치료제 또는 기타 항-증식성 작용제는 증식성 질환 및 암의 치료를 위해 본 개시의 올리고뉴클레오티드와 조합될 수 있다. 공지된 화학치료제의 예에는, 비제한적으로, 아드리아마이신, 덱사메타손, 빈크리스틴, 시클로포스파미드, 플루오로우라실, 토포테칸, 탁솔, 인터페론, 및 백금 유도체가 포함된다.
지질
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 이상의 지질을 를 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드와 지질의 콘쥬게이션은, 예상치 못한 크게 개선된 특성 (예를 들어, 활성, 독성, 분포, 약동학 등) 을 중재할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Ac-[-LLD-(RLD)a]b 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 [(Ac)a-LLD]b-RLD 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, LLD, RLD, LLD 및 RLD 의 조합, 또는 -[-LLD-(RLD)a]b 는, 하나 이상의 지질 모이어티를 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 면역 반응을 중재하지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 도 30 의 조건 하에서, hTLR9 아고니스트 활성을 갖지 않는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 hTLR9 안타고니스트 활성을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 예를 들어 도 31 의 조건 하에서, hTLR9 아고니스트 활성에 대응한다 (counteract). 일부 구현예에서, 본 개시는, 동일한 비콘쥬게이트된 올리고뉴클레오티드와 비교하여, 콘쥬게이트가 예상치 못하게 높은 hTLR9 안타고니스트 활성을 나타내는, 지질에 콘쥬게이트된 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 예를 들어, 스테아르산 (WV-3545) 또는 투르비나르산 (WV-3473) 에 콘쥬게이트된 WV-3473 을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 WV-3545 및 WV-3546 은, 비콘쥬게이트된 WV-3473 에 비해 상당히 높은 정도로, ODN2006 의 hTLR9 아고니스트 활성을 길항하는 놀랍게도 높은 활성을 입증하였다. 예를 들어, 도 30 내지 32 참조.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드에 대한 지질의 콘쥬게이션은 분포 및/또는 약동학을 개선시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드에 대한 지질의 콘쥬게이션은 하기로부터 선택되는 약동학의 측정치 중 하나 이상을 개선시킨다: Cmax, 투여 후 약물의 피크 혈장 농도; tmax, Cmax 에의 도달 시간; Cmin, 다음 투여량이 투여되기 전 약물이 도달하는 최저 (골 (trough)) 농도; 소실 반감기, 약물의 농도가 원래 값의 절반에 도달하는데 요구되는 시간; 소실 속도 상수, 약물이 신체에서 제거되는 속도; 곡선 하 면적, 농도-시간 곡선의 적분 (단일 투여량 후 또는 안정 상태에서); 및 클리어런스 (clearance), 시간 당 약물의 혈장 제거된 부피. 임의의 특정 이론에 구애됨 없이, 본 개시는, 반감기와 같은 약동학 특징의 최적화가 최대화와 구별될 수 있다는 점에 주목한다. 일부 구현예에서, 일반적으로, 특정 약물은 목적하는 기능의 수행을 가능하게 하는데는 충분하며, 오프-표적 효과 및 다른 독성을 최소화는데 충분히 짧은 반감기를 갖는 것이 바람직할 수 있다. 일부 구현예에서, 최적화된 반감기는 독성을 최소화하면서 활성을 가능하게 하는데 충분히 길며; 연장된 또는 최대화된 반감기는 바람직하지 않을 수 있다. 무엇보다도, 본 개시는, 지질과의 콘쥬게이션이 생물학적 활성제의 반감기를 개선시킬 수 있다는 것을 보여준다. 도 38a 내지 38d 은, 각종 근육 조직에서의 올리고뉴클레오티드 (일부 지질에 콘쥬게이트된 것 포함) 의 분포 를 나타낸다. 시험된 근육에는 하기가 포함된다 비복근 (도 38a); 삼두근 (도 38b); 심장 (도 38c); 및 횡격막 (도 38d). 대조군 올리고뉴클레오티드 WV-942 는, 독성에 기여할 수 있는 바람직하지 않게 긴 반감기를 갖는 드리사퍼센과 등가이다. 시험 올리고뉴클레오티드 WV-3473 을 네이키드 동물에 투여하거나, 또는 지질에 콘쥬게이트하였다 (스테아르산, WV-3545; 또는 투르비나르산, WV-3546). 일부 검정에서, 지질에의 콘쥬게이션은, 이를 바람직하지 않게 긴 길이로 연장시키지 않으면서, 올리고뉴클레오티드의 반감기를 개선시켰다. 예를 들어, 도 38c 참조, 38 mg/kg 으로 투여된 올리고뉴클레오티드에의 스테아르산 또는 투르비나르산의 콘쥬게이션은, 특히 3 및 8 일차에서, 심장 조직으로의 분포를 증가시켰지만, 이를 바람직하지 않게 긴 반감기를 갖는 것으로 공지된 WV-942 의 수준으로 증가시키지는 않았다.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 이상의 지질을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 하나 이상의 지방산을 추가로 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 조성물 중 제공된 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 동일하거나 상이한 지질은 동일하거나 상이한 화학 및/또는 위치를 통해 하나의 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트될 수 있다. 일부 구현예에서, 조성물은 본원에 개시된 올리고뉴클레오티드 (비제한적인 예로서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물, 또는 올리고뉴클레오티드의 서열이 본원에 개시된 임의의 올리고뉴클레오티드의 서열이거나, 이를 포함하거나 또는 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물, 또는 올리고뉴클레오티드의 서열이 표 8 또는 본원의 임의의 다른 표 등에 개시된 임의의 올리고뉴클레오티드의 서열이거나, 이를 포함하거나 또는 이로 이루어진 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물) 및 지질을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 본원에 개시된 임의의 올리고뉴클레오티드의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 백본 키랄 중심의 패턴, 및/또는 화학적 개질의 패턴 (예를 들어, 염기 개질, 당 개질 등) 을 포함하고, 지질에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 본원에 개시된 올리고뉴클레오티드 및 지질을 포함하고, 여기서 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드 및 지질을 포함하는 조성물을 제공한다. 다수의 지질은 본 개시에 따라 제공된 기술에 이용될 수 있다.
일부 구현예에서, 지질은 RLD 기를 포함하고, 여기서 RLD 는 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 여기서:
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나, 또는:
2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, 지질은 RLD 기를 포함하고, 여기서 RLD 는 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 여기서:
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나, 또는:
2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, 지질은 RLD 기를 포함하고, 여기서 RLD 는 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 여기서:
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나, 또는:
2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 페닐, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴, 또는 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기이다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2- 및 -Cy- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체된다. 일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2- 및 -Cy- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체된다. 일부 구현예에서, RLD 는 탄소 및 수소 원자로 이루어진 탄화수소기이다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2- 및 -Cy- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체된다. 일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2- 및 -Cy- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체된다. 일부 구현예에서, RLD 는 탄소 및 수소 원자로 이루어진 탄화수소기이다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2- 및 -Cy- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체된다. 일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2- 및 -Cy- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체된다. 일부 구현예에서, RLD 는 탄소 및 수소 원자로 이루어진 탄화수소기이다.
RLD 의 지방족기는 다양한 적합한 길이일 수 있다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C80 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C75 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C70 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C65 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C60 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C50 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C40 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C35 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C30 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C25 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C24 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C23 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C21 이다. 일부 구현예에서, 이는 C12-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C13-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C14-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C15-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C16-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C17-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C18-C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10-C20 이다. 일부 구현예에서, 범위의 하한은 C10, C11, C12, C13, C14, C15, C16, C17, 또는 C18 이다. 일부 구현예에서, 범위의 상한은 C18, C19, C20, C21, C22, C23, C24, C25, C26, C27, C28, C29, C30, C35, C40, C45, C50, C55, 또는 C60 이다. 일부 구현예에서, 이는 C10 이다. 일부 구현예에서, 이는 C11 이다. 일부 구현예에서, 이는 C12 이다. 일부 구현예에서, 이는 C13 이다. 일부 구현예에서, 이는 C14 이다. 일부 구현예에서, 이는 C15 이다. 일부 구현예에서, 이는 C16 이다. 일부 구현예에서, 이는 C17 이다. 일부 구현예에서, 이는 C18 이다. 일부 구현예에서, 이는 C19 이다. 일부 구현예에서, 이는 C20 이다. 일부 구현예에서, 이는 C21 이다. 일부 구현예에서, 이는 C22 이다. 일부 구현예에서, 이는 C23 이다. 일부 구현예에서, 이는 C24 이다. 일부 구현예에서, 이는 C25 이다. 일부 구현예에서, 이는 C30 이다. 일부 구현예에서, 이는 C35 이다. 일부 구현예에서, 이는 C40 이다. 일부 구현예에서, 이는 C45 이다. 일부 구현예에서, 이는 C50 이다. 일부 구현예에서, 이는 C55 이다. 일부 구현예에서, 이는 C60 이다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 RLD 기를 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 2 개 이상의 RLD 기를 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 RLD 기를 포함하는 모이어티로서, 임의로 링커를 통해, 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 RLD 기를 포함하는 모이어티로서, 임의로 링커를 통해, 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 RLD 기로서, 임의로 링커를 통해, 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 2 개 이상의 RLD 기를 포함하는 모이어티로서, 임의로 링커를 통해, 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C40 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 C1 -2 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -2 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 메틸기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 메틸기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 미치환 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 미치환 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 2 개 이상의 임의 치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 C1 -2 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -2 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 메틸기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 메틸기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 미치환 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 미치환 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 2 개 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C80 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 임의 치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 임의 치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 C1 -2 지방족기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -2 지방족기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 하나 이상의 메틸기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 메틸기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 미치환 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬이다. 일부 구현예에서, 지질은 미치환 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 하나 이하의 임의 치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 2 개 이상의 임의 치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다.
일부 구현예에서, RLD 는 C10 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C10 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C11 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C11 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C12 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C12 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C13 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C13 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C14 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C14 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C15 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C15 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C16 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C16 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C17 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C17 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C18 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C18 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C19 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C19 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C20 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C20 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C21 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C21 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C22 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C22 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C23 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C23 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C24 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C24 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C25 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C25 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C26 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C26 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C27 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C27 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C28 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C28 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C29 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C29 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C30 포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 C30 부분 불포화 선형 지방족 사슬이거나 이를 포함한다.
일부 구현예에서, 지질은 RLD-OH 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 지질은 RLD-C(O)O-H 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, RLD 는 하기이다:
Figure pct00406
상기와 같은 RD 기를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 예는, 예를 들어 표 4 에 예시되어 있다. 일부 구현예에서, 지질은 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (DHA 또는 시스-DHA), 투르비나르산, 아라키돈산, 및 디리놀레일이다. 일부 구현예에서, 지질은 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (DHA 또는 시스-DHA), 투르비나르산, 및 디리놀레일이다. 일부 구현예에서, 지질은 하기의 구조를 갖는다:
Figure pct00407
이러한 지질과의 콘쥬게이션을 포함하는 올리고뉴클레오티드의 예는, 예를 들어 표 4 에 예시되어 있다.
일부 구현예에서, 지질은 하기 중 임의의 것이거나, 이를 포함하거나 이로 이루어진다: 적어도 부분적으로 소수성 또는 양친매성인 분자, 인지질, 트리글리세리드, 디글리세리드, 모노글리세리드, 지용성 비타민, 스테롤, 지방 및 왁스. 일부 구현예에서, 지질은 하기 중 임의의 것이다: 지방산, 글리세로지질, 글리세로인지질, 스핑고지질, 스테롤 지질, 프레놀 지질, 사카로지질, 폴리케티드, 및 기타 분자.
지질은 본 개시에 따른 다수의 유형의 방법을 통해 제공된 기술에 혼입될 수 있다. 일부 구현예에서, 지질은 제공된 올리고뉴클레오티드와 물리적으로 혼합되어 제공된 조성물을 형성한다. 일부 구현예에서, 지질은 올리고뉴클레오티드와 화학적으로 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 2 개 이상의 지질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 콘쥬게이트된 지질을 포함한다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 콘쥬게이트된 지질은 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 콘쥬게이트된 지질은 상이하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이하의 지질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 상이한 유형의 콘쥬게이트된 지질을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 동일한 유형의 지질을 포함한다.
지질은 임의로 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트될 수 있다. 당업계의 각종 유형의 링커가 본 개시에 따라 이용될 수 있다. 일부 구현예에서, 링커는 포스페이트기를 포함하고, 이는, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 합성에 이용되는 것과 유사한 화학을 통해 지질을 콘쥬게이트하는데 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 링커는 아미드, 에스테르, 또는 에테르기를 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 -LLD- 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, LLD 는
Figure pct00408
의 구조를 갖는 TLD 이고, 여기서 각각의 변수는 독립적으로 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, TLD 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 를 갖는 TLD 는 포스포로티오에이트 연결 (-OP(O)(S-)O-) 을 형성한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 를 갖는 TLD 는 Sp 포스포로티오에이트 연결을 형성한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 를 갖는 TLD 는 Rp 포스포로티오에이트 연결을 형성한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 를 갖는 TLD 는 포스페이트 연결 (-OP(O)(O-)O-) 을 형성한다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 를 갖는 TLD 는 포스포로디티오에이트 연결을 형성한다. 일부 구현예에서, LLD 는 -L-TLD- 이다. 일부 구현예에서, Y 는 -L- 에 연결되고, -Z- 는 공유 결합이므로, P 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 히드록실기에 직접 연결된다. 일부 구현예에서, P 는 5'-말단에의 히드록실 (5'-O-) 에 연결되어, 포스페이트기 (천연 포스페이트 연결) 또는 포스포로티오에이트기 (포스포로티오에이트 연결) 를 형성한다. 일부 구현예에서, 포스포로티오에이트 연결은 키랄 제어된 것이고, Rp 또는 Sp 일 수 있다. 달리 명시되지 않는 한, 링커에서 키랄 중심 (예를 들어, TLD 에서 P) 은 스테레오랜덤이거나 키랄 제어될 수 있고, 이는, 예를 들어 조성물이 키랄 제어된 것인지 여부를 결정하기 위한 백본 키랄 중심의 일부로서 간주되지 않는다. 일부 구현예에서, LLD 는 -NH-(CH2)6-TLD- 이다. 일부 구현예에서, LLD 는 -C(O)-NH-(CH2)6-TLD- 이다.
일부 구현예에서, 링커는 -L- 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드에의 콘쥬게이션 후, 지질은 -L-RLD 의 구조를 갖는 모이어티를 형성하고, 여기서 L 및 RLD 는 각각 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다.
일부 구현예에서, -L- 은 2가 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, -L- 은 포스페이트기를 포함한다. 일부 구현예에서, -L- 은 포스포로티오에이트기를 포함한다. 일부 구현예에서, -L- 은 -C(O)NH-(CH2)6-OP(=O)(S-)- 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, -L- 은 -C(O)NH-(CH2)6-OP(=O)(O-)- 의 구조를 갖는다.
지질은, 임의로 링커를 통해, 각종 적합한 위치에서 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트될 수 있다. 일부 구현예에서, 지질은 5'-OH 기를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 3'-OH 기를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 당 모이어티를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 염기를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 통해 혼입된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, 이의 5'-OH, 3'-OH, 당 모이어티, 염기 모이어티 및/또는 뉴클레오티드간 연결을 통해 독립적으로 콘쥬게이트되는 복수의 콘쥬게이트된 지질을 함유할 수 있다.
일부 구현예에서, 링커는 조성물의 2 개의 부분을 연결하는 모이어티이며; 비제한적인 예로서, 링커는 활성 화합물을 지질에 물리적으로 연결시킨다. 적합한 링커의 비제한적인 예에는 하기가 포함된다: 비하전된 링커; 하전된 링커; 알킬을 포함하는 링커; 포스페이트를 포함하는 링커; 분지형 링커; 비분지형 링커; 적어도 하나의 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 레독스 (redox) 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 포스페이트계 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 산 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 에스테르계 절단기를 포함하는 링커 및 적어도 하나의 펩티드계 절단기를 포함하는 링커.
일부 구현예에서, 지질은 임의로 링커 모이어티를 통해 활성 화합물에 콘쥬게이트된다. 당업자는 본 개시에 따라 지질을 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트시키기 위한 각종 기술이 이용될 수 있다는 것을 인식하고 있다. 예를 들어, 카르복실기를 포함하는 지질의 경우, 상기와 같은 지질은 카르복실기를 통해 콘쥬게이트될 수 있다. 일부 구현예에서, 지질은 -L- 의 구조를 갖는 링커를 통해 콘쥬게이트되고, 여기서 L 은 화학식 I 에서 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, L 은 포스페이트 디에스테르 또는 개질된 포스페이트 디에스테르 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 지질 콘쥬게이션에 의해 형성된 화합물은 (RLD-L-)x-(활성 화합물) 의 구조를 갖고, 여기서 x 는 1 또는 1 초과의 정수이고, RLD 및 L 는 각각 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같다. 일부 구현예에서, x 는 1 이다. 일부 구현예에서, x 는 1 초과이다. 일부 구현예에서, x 는 1-50 이다. 일부 구현예에서, 활성 화합물은 올리고뉴클레오티드이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 콘쥬게이트는 하기 구조를 갖는다:
Figure pct00409
일부 구현예에서, 링커는 하기로부터 선택된다: 비하전된 링커; 하전된 링커; 알킬을 포함하는 링커; 포스페이트를 포함하는 링커; 분지형 링커; 비분지형 링커; 적어도 하나의 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 레독스 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 포스페이트계 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 산 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 에스테르계 절단기를 포함하는 링커 및 적어도 하나의 펩티드계 절단기를 포함하는 링커. 일부 구현예에서, 링커는 -LLD- 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 링커는 -L- 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 링커는 화학식 I 의 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-LI- 이고, 여기서 LI 는 본원에 기재된 바와 같은 화학식 I 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=O)(SR1)-O- 이다. 일부 구현예에서, R1 은 -H 이고, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=O)(SH)-O- 이며, 일부 조건에서, 예를 들어 특정 pH 에서, -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=O)(S-)-O- 이다. 일부 구현예에서, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=S)(SR1)-O- 이다. 일부 구현예에서, R1 은 -H 이고, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=S)(SH)-O- 이며, 일부 조건에서, 예를 들어 특정 pH 에서, -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=S)(S-)-O- 이다. 일부 구현예에서, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=S)(OR1)-O- 이며, 여기서 R1 은 -CH2CH2CN 이다. 일부 구현예에서, 링커는 -C(O)NH-(CH2)6-O-P(=S)(SR1)-O- 이며, 여기서 R1 은 -CH2CH2CN 이다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 링커와 커플링되고, H-링커-올리고뉴클레오티드의 구조를 형성한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 지질에 콘쥬게이트되고, 지질-링커-올리고뉴클레오티드, 예를 들어 RLD-LLD-올리고뉴클레오티드의 구조를 형성한다. 일부 구현예에서, 링커의 -O- 말단은 올리고뉴클레오티드에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커의 -O- 말단은 5'-말단 올리고뉴클레오티드 (-O- 는 5'-OH 에서 산소임) 에 연결된다.
일부 구현예에서, 링커는 PO (포스포디에스테르 연결), PS (포스포로티오에이트 연결) 또는 PS2 (포스포로디티오에이트 연결) 를 포함한다. PS 링커를 포함하는 비제한적인 예는 하기에 제시되어 있다. 일부 구현예에서, 링커는 -O-P(O)(OH)-O- [포스포디에스테르], -O-P(O)(SH)-O- [포스포로티오에이트] 또는 -O-P(S)(SH)-O- [포스포로디티오에이트] 이다. 일부 구현예에서, 링커는 C6 아미노 모이어티 (-NH-(CH2)6-) 를 포함하고, 이는 하기에 예시되어 있다. 일부 구현예에서, 링커는 PO, PS, 또는 PS2 에 결합된 C6 아미노를 포함한다. 일부 구현예에서, 링커는 PO, PS, 또는 PS2 에 결합된 C6 아미노이다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(OH)- 이다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(OH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(O)(OH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(OH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(O)(OH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(OH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(O)(OH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 3'-O- 에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(SH)- 이다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(SH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(O)(SH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(SH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(O)(SH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(O)(SH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(O)(SH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 3'-O- 에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(S)(SH)- 이다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(S)(SH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(S)(SH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(S)(SH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(S)(SH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-O- 에 연결된다. 일부 구현예에서, 링커, 예를 들어 LLD 또는 L 은, -C(O)-NH--(CH2)6-P(S)(SH)- 이며, 여기서 -C(O)- 는 지질 모이어티에 연결되고, -P(S)(SH)- 는 올리고뉴클레오티드 사슬의 3'-O- 에 연결된다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 특정 pH 에서, -P(O)(OH)-, -P(O)(SH)-, -P(S)(SH)- 는, 각각, -P(O)(O-)-, -P(O)(S-)-, -P(S)(S-)- 로서 존재할 수 있다. 일부 구현예에서, 지질 모이어티는 RLD 이다.
Figure pct00410
각종 화학 및 링커가 본 개시에 따른 콘쥬게이션에 사용될 수 있다. 예를 들어, 지질, 표적 구성성분 등은, 고체상 상에서 또는 용액상 중에서 하기 기재되는 바와 같은 화학을 사용하여 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되어, 특정 제공된 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 표 4 에 기재된 것들이 제조될 수 있다 (WV-2538, WV-2733, WV-2734, WV-2578 내지 WV-2588, WV-2807, WV-2808, WV-3022 내지 WV-3027, WV-3029 내지 WV-3038, WV-3084 내지 WV-3089, WV-3357 내지 WV-3366, WV-3517, WV-3520, WV-3543 내지 WV-3560, WV-3753, WV-3754, WV-3820, WV-3821, WV-3855, WV-3856, WV-3976, WV-3977, WV-3979, WV-3980, WV-4106, WV-4107 등):
Figure pct00411
Figure pct00412
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드, 및 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하며 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되는 지질을 포함하는 조성물, 및 이러한 조성물에 관련된 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드, 및 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하며 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되는 지질을 포함하는 조성물, 및 이러한 조성물에 관련된 방법에 관한 것이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드, 및 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하며 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되지 않는 지질을 포함하는 조성물, 및 이러한 조성물에 관련된 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 올리고뉴클레오티드, 및 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하며 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되지 않는 지질을 포함하는 조성물, 및 이러한 조성물에 관련된 방법에 관한 것이다.
일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 아라키돈산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되지 않는다. 일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되지 않는다.
일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 아라키돈산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 아라키돈산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 직접 콘쥬게이트된다 (지질과 생물학적 활성제 사이에 개재된 링커 미포함). 일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 직접 콘쥬게이트된다 (지질과 생물학적 활성제 사이에 개재된 링커 미포함).
일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 아라키돈산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 간접적으로 콘쥬게이트된다 (지질과 생물학적 활성제 사이에 개재된 링커 포함). 일부 구현예에서, 조성물은 올리고뉴클레오티드, 및 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산, 및 디리놀레일로부터 선택되는 지질을 포함하고, 여기서 지질은 생물학적 활성제에 간접적으로 콘쥬게이트된다 (지질과 생물학적 활성제 사이에 개재된 링커 포함).
링커는 조성물의 2 개의 부분을 연결하는 모이어티이며, 비제한적인 예로서, 링커는 올리고뉴클레오티드와 지질을 물리적으로 연결시킨다.
적합한 링커의 비제한적인 예에는 하기가 포함된다: 비하전된 링커; 하전된 링커; 알킬을 포함하는 링커; 포스페이트를 포함하는 링커; 분지형 링커; 비분지형 링커; 적어도 하나의 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 레독스 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 포스페이트계 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 산 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 에스테르계 절단기를 포함하는 링커; 적어도 하나의 펩티드계 절단기를 포함하는 링커. 일부 구현예에서, 링커는 비하전된 링커 또는 하전된 링커이다. 일부 구현예에서, 링커는 알킬을 포함한다.
일부 구현예에서, 링커는 포스페이트를 포함한다. 각종 구현예에서, 포스페이트는 또한 브릿징 산소 (즉 포스페이트를 뉴클레오시드에 연결하는 산소) 의, 질소 (브릿지된 포스포로아미데이트), 황 (브릿지된 포스포로티오에이트) 및 탄소 (브릿지된 메틸렌포스포네이트) 로의 대체에 의해 개질될 수 있다. 대체는 어느 하나의 연결 산소 또는 연결 산소들 모두에서 일어날 수 있다. 일부 구현예에서, 브릿징 산소는, 탄소로 대체된 뉴클레오시드의 3'-산소이다. 일부 구현예에서, 브릿징 산소는 질소로 대체된 뉴클레오시드의 5'-산소이다. 각종 구현예에서, 포스페이트를 포함하는 링커는 하기 중 임의의 하나 이상을 포함한다: 포스포로디티오에이트, 포스포라미데이트, 브라노포스포노에이트, 또는 화학식 (I) 의 화합물:
Figure pct00413
[식 중, R3　은 OH, SH, NH2, BH3, CH3, C1 -6　알킬, C6 -10　아릴, C1 -6　알콕시 및 C6 -10 아릴옥시로부터 선택되고, 여기서 C1 -6　알킬 및 C6 -10 아릴은 미치환 또는 임의로 독립적으로 할로, 히드록실 및 NH2 로부터 독립적으로 선택되는 1 내지 3 개의 기로 치환되고; R4　는 O, S, NH, 또는 CH2 로부터 선택됨].
일부 구현예에서, 링커는 직접 결합, 또는 원자, 예컨대 산소 또는 황, 단위, 예컨대 NR1, C(O), C(O)NH, SO, SO2, SO2NH 또는 원자의 사슬, 예컨대 치환 또는 미치환 알킬, 치환 또는 미치환 알케닐, 치환 또는 미치환 알키닐, 아릴알킬, 아릴알케닐, 아릴알키닐, 헤테로아릴알킬, 헤테로아릴알케닐, 헤테로아릴알키닐, 헤테로시클릴알킬, 헤테로시클릴알케닐, 헤테로시클릴알키닐, 아릴, 헤테로아릴, 헤테로시클릴, 시클로알킬, 시클로알케닐, 알킬아릴알킬, 알킬아릴알케닐, 알킬아릴알키닐, 알케닐아릴알킬, 알케닐아릴알케닐, 알케닐아릴알키닐, 알키닐아릴알킬, 알키닐아릴알케닐, 알키닐아릴알키닐, 알킬헤테로아릴알킬, 알킬헤테로아릴알케닐, 알킬헤테로아릴알키닐, 알케닐헤테로아릴알킬, 알케닐헤테로아릴알케닐, 알케닐헤테로아릴알키닐, 알키닐헤테로아릴알킬, 알키닐헤테로아릴알케닐, 알키닐헤테로아릴알키닐, 알킬헤테로시클릴알킬, 알킬헤테로시클릴알케닐, 알킬헤테로시클릴알키닐, 알케닐헤테로시클릴알킬, 알케닐헤테로시클릴알케닐, 알케닐헤테로시클릴알키닐, 알키닐헤테로시클릴알킬, 알키닐헤테로시클릴알케닐, 알키닐헤테로시클릴알키닐, 알킬아릴, 알케닐아릴, 알키닐아릴, 알킬헤테로아릴, 알케닐헤테로아릴, 알키닐헤테로아릴을 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌은 O, S, S(O), SO2, N(R1)2, C(O), 절단 가능한 연결기, 치환 또는 미치환 아릴, 치환 또는 미치환 헤테로아릴, 치환 또는 미치환 헤테로시클릭에 의해 중단 또는 종결될 수 있고; R1 은 수소, 아실, 지방족 또는 치환된 지방족이다.
일부 구현예에서, 링커는 분지형 링커이다. 일부 구현예에서, 분지형 링커의 분지점은 적어도 3가일 수 있지만, 4가, 5가 또는 6가 원자, 또는 상기와 같은 다 원자가를 나타내는 기일 수 있다. 일부 구현예에서, 분지점은 -N, -N(Q)-C, -O-C, -S-C, -SS-C, -C(O)N(Q)-C, -OC(O)N(Q)-C, -N(Q)C(O)-C, 또는 -N(Q)C(O)O-C 이며; 여기서 Q 는 각각의 발생에 대하여 독립적으로 H 또는 임의 치환된 알킬이다. 다른 구현예에서, 분지점은 글리세롤 또는 글리세롤 유도체이다.
하나의 구현예에서, 링커는 하나 이상의 절단 가능한 연결기를 포함한다.
비제한적인 예로서, 절단 가능한 연결기는 세포 외부에서 충분히 안정할 수 있으나, 표적 세포 내로의 진입 시, 절단되어 링커가 함께 보유하는 2 개의 부분을 방출한다. 비제한적인 예로서, 절단 가능한 연결기는 표적 세포 또는 제 1 기준 조건 (이는, 예를 들어 세포내 조건을 모방하거나 나타내도록 선택될 수 있음) 하에서 대상의 혈액에서 보다, 또는 제 2 기준 조건 (이는, 예를 들어 혈액 또는 혈청에서 발견되는 조건을 모방하거나 나타내도록 선택될 수 있음) 하에서 적어도 10 배 또는 그 이상, 적어도 100 배 빠르게 절단된다. 절단 가능한 연결기는 절단 작용제, 예를 들어 pH, 레독스 전위 또는 분해된 분자의 존재에 영향을 받기 쉽다. 일반적으로, 절단 작용제는 혈청 또는 혈액에서 보다 세포 내부에서 보다 높은 수준 또는 활성으로 발견되거나 보다 우세하다. 상기와 같은 분해 작용제의 예에는, 하기가 포함된다: 특정 기질에 대하여 선택되거나 기질 특이성을 갖지 않는 레독스 작용제, 예를 들어, 산화성 또는 환원성 효소 또는 환원제, 예컨대 환원에 의해 레독스 절단 가능한 연결기를 분해할 수 있는 세포 내 존재하는 메르캅탄; 에스테라아제; 산성 환경을 생성할 수 있는 작용제 또는 엔도좀, 예를 들어 pH 5 이하로 유도하는 것; 일반적인 산으로서 작용함으로써 산 절단 가능한 연결기를 가수분해 또는 분해할 수 있는 효소, 펩티다아제 (이는 기질 특이적일 수 있음), 및 포스파타아제 포함.
비제한적인 예로서, 절단 가능한 연결기, 예컨대 디술피드 결합은 pH 에 민감할 수 있다. 인간 혈청의 pH 는 7.4 이지만, 평균 세포내 pH 는 약간 낮은 약 7.1-7.3 범위이다. 엔도좀은 5.5-6.0 범위의 보다 산성의 pH 를 갖고, 리소좀은 약 5.0 의 보다 더 산성의 pH 를 갖는다. 일부 링커는 목적하는 pH 에서 절단되어, 양이온성 지질을 리간드로부터 세포 내부, 또는 세포의 목적하는 구획으로 방출하는, 절단 가능한 연결기를 가질 수 있다.
비제한적인 예로서, 링커는 특정 효소에 의해 절단 가능한 절단 가능한 연결기를 포함할 수 있다. 링커에 혼입되는 절단 가능한 연결기의 유형은 표적화되는 세포에 따라 달라질 수 있다. 예를 들어, 간 표적 리간드는 에스테르기를 포함하는 링커를 통해 양이온성 지질에 연결될 수 있다. 간 세포에는 에스테라아제가 풍부하기 때문에, 링커는 에스테라아제가 풍부하지 않은 세포 유형에서 보다 간 세포에서 보다 효율적으로 절단될 수 있다. 에스테라아제가 풍부한 기타 세포 유형에는, 폐, 신피질, 및 고환이 포함된다.
비제한적인 예로서, 링커는 펩티드 결합을 함유할 수 있으며, 이는 펩티다아제가 풍부한 세포 유형, 예컨대 간 세포 및 활막세포를 표적으로 하는 경우에 사용될 수 있다.
비제한적인 예로서, 절단 가능한 연결기 후보의 적합성은, 후보 연결기를 절단하는 분해 작용제 (또는 조건) 의 능력을 시험함으로써 평가될 수 있다. 이는 또한 기타 비표적 조직과 접촉되는 경우 또는 혈액 내 절단을 저항하는 능력에 대하여, 후보 절단 가능한 연결기를 시험하는 것이 바람직할 것이다. 따라서, 제 1 및 제 2 조건 사이의 절단에 대한 상대적 민감성을 측정할 수 있는데, 여기서 제 1 조건은 표적 세포에서 절단을 나타내는 것으로 선택되고, 제 2 조건은 기타 조직 또는 생물학적 유체, 예를 들어, 혈액 또는 혈청에서 절단을 나타내는 것으로 선택된다. 평가는 무세포 시스템, 세포, 세포 배양, 기관 또는 조직 배양, 또는 전체 동물에서 수행될 수 있다. 무세포 또는 배양 조건에서 초기 평가를 수행하고, 전체 동물에서 추가의 평가를 확인하는 것이 유용할 수 있다. 비제한적인 예로서, 유용한 후보 화합물은 혈액 또는 혈청 (또는 세포외 조건을 모방하도록 선택된 시험관내 조건 하에서) 과 비교하여, 세포에서 (또는 세포내 조건을 모방하도록 선택된 시험관내 조건 하에서) 적어도 2, 4, 10 또는 100 배 빠르게 절단된다.
일부 구현예에서, 링커는 레독스 절단 가능한 연결기를 포함한다. 비제한적인 예로서, 절단 가능한 연결기의 한 부류는 환원 또는 산화 시 절단되는 레독스 절단 가능한 연결기이다. 환원적으로 절단 가능한 연결기의 비제한적인 예는 디술피드 연결기 (-S-S-) 이다. 절단 가능한 연결기 후보가 적합한 "환원적으로 절단 가능한 연결기" 인지, 또는 예를 들어 특정 올리고뉴클레오티드 모이어티 및 특정 표적 작용제와 함께 사용에 적합한지를 결정하기 위하여, 본원에 기재된 방법을 고려할 수 있다. 비제한적인 예로서, 후보는 세포, 예를 들어 표적 세포에서 관찰될 수 있는 절단 속도를 모방하는 당업계에 공지된 시약을 사용하여, 디티오트레이톨 (DTT), 또는 기타 환원제와 함께 인큐베이션에 의해 평가될 수 있다. 후보는 또한 혈액 또는 혈청 조건을 모방하도록 선택된 조건 하에서 평가될 수 있다. 비제한적인 예로서, 후보 화합물은 혈액에서 최대 10% 절단된다. 비제한적인 예로서, 유용한 후보 화합물은 혈액 (또는 세포외 조건을 모방하도록 선택된 시험관내 조건 하에서) 과 비교하여, 세포 (또는 세포내 조건을 모방하도록 선택된 시험관내 조건 하에서) 에서 적어도 2, 4, 10 또는 100 배 빠르게 분해된다. 후보 화합물의 절단 속도는 세포내 매질을 모방하도록 선택된 조건 하에서 및 세포외 매질을 모방하도록 선택된 조건과 비교하여, 표준 효소 동력학 검정을 사용하여 측정될 수 있다.
일부 구현예에서, 링커는 포스페이트기를 분해 또는 가수분해하는 작용제에 의해 절단되는 포스페이트계 절단 가능한 연결기를 포함한다. 세포에서 포스페이트기를 절단하는 작용제의 예는, 포스파타아제와 같은 세포 내 효소이다. 포스페이트계 연결기의 예는, -O-P(O)(ORk)-O-, -O-P(S)(ORk)-O-, -O-P(S)(SRk)-O-, -S-P(O)(ORk)-O-, -O-P(O)(ORk)-S-, -S-P(O)(ORk)-S-, -O-P(S)(ORk)-S-, -S-P(S)(ORk)-O-, -O-P(O)(Rk)-O-, -O-P(S)(Rk)-O-, -S-P(O)(Rk)-O-, -S-P(S)(Rk)-O-, -S-P(O)(Rk)-S-, -O-P(S)(Rk)-S- 이다. 부가적인 비제한적인 예는, -O-P(O)(OH)-O-, -O-P(S)(OH)-O-, -O-P(S)(SH)-O-, -S-P(O)(OH)-O-, -O-P(O)(OH)-S-, -S-P(O)(OH)-S-, -O-P(S)(OH)-S-, -S-P(S)(OH)-O-, -O-P(O)(H)-O-, -O-P(S)(H)-O-, -S-P(O)(H)-O-, -S-P(S)(H)-O-, -S-P(O)(H)-S-, -O-P(S)(H)-S- 이다. 부가적인 비제한적인 예는 -O-P(O)(OH)-O- 이다. 각종 구현예에서, Rk 는 OH, SH, NH2, BH3, CH3, C1 -6 알킬, C6 -10 아릴, C1 -6 알콕시 및 C6 -10 아릴-옥시 중 임의의 것이며, 여기서 C1 -6 알킬 및 C6 -10 아릴은 미치환되거나, 또는 임의로 독립적으로 할로, 히드록실 및 NH2 로부터 독립적으로 선택되는 1 내지 3 개의 기로 치환되고; R4 는 O, S, NH, 또는 CH2 로부터 선택된다.
일부 구현예에서, 링커는 산성 조건 하에서 절단되는 연결기인 산 절단 가능한 연결기를 포함한다. 비제한적인 예로서, 산 절단 가능한 연결기는 약 6.5 이하 (예를 들어, 약 6.0, 5.5, 5.0, 또는 그 이하) 의 pH 를 갖는 산성 환경에서, 또는 일반적인 산으로서 작용할 수 있는 효소와 같은 작용제에 의해 절단된다. 세포에서, 특히 낮은 pH 를 갖는 세포소기관, 예컨대 엔도좀 및 리소좀은 산 절단 가능한 연결기에 대한 절단 환경을 제공할 수 있다. 산 절단 가능한 연결기의 예에는, 비제한적으로, 히드라존, 에스테르, 및 아미노산의 에스테르가 포함된다. 산 절단 가능한 기는 일반식 -C=NN-, C(O)O-, 또는 -OC(O) 를 가질 수 있다. 부가적인 비제한적인 예에서, 에스테르의 산소에 부착된 탄소 (알콕시기) 가 아릴기, 치환된 알킬기, 또는 3차 알킬기, 예컨대 디메틸 펜틸 또는 t-부틸인 경우이다.
일부 구현예에서, 링커는 에스테르계 연결기를 포함한다. 비제한적인 예로서, 에스테르계 절단 가능한 연결기는 세포에서 에스테라아제 및 아미다아제와 같은 효소에 의해 절단된다. 에스테르계 절단 가능한 연결기의 예에는, 비제한적으로, 알킬렌, 알케닐렌 및 알키닐렌기의 에스테르가 포함된다. 에스테르 절단 가능한 연결기는 일반식 -C(O)O-, 또는 -OC(O)- 를 갖는다. 이러한 후보는 상기 기재된 바와 유사한 방법을 사용하여 평가될 수 있다.
일부 구현예에서, 링커는 펩티드계 절단기를 포함한다. 펩티드계 절단 가능한 연결기는 세포에서 펩티다아제 및 프로테아제와 같은 효소에 의해 절단된다. 펩티드계 절단 가능한 연결기는 올리고펩티드 (예를 들어, 디펩티드, 트리펩티드 등) 및 폴리펩티드를 수득하기 위하여 아미노산 사이에 형성된 펩티드 결합이다. 비제한적인 예로서, 펩티드계 절단 가능한 기는 아미드기 (--C(O)NH--) 를 포함하지 않는다. 아미드기는 임의의 알킬렌, 알케닐렌 또는 알키닐렌 사이에 형성될 수 있다. 펩티드 결합은 펩티드 및 단백질을 수득하기 위하여 아미노산 사이에 형성된 특정 유형의 아미드 결합이다. 비제한적인 예로서, 펩티드계 절단기는 펩티드 및 단백질을 수득하는 아미노산 사이에 형성된 펩티드 결합 (즉, 아미드 결합) 에 제한될 수 있으며, 이는 전체 아미드 관능기를 포함하지 않는다. 비제한적인 예로서, 펩티드계 절단 가능한 연결기는 일반식 -NHCHRAC(O)NHCHRBC(O)- (식 중, RA 및 RB 는 2 개의 인접한 아미노산의 R 기임) 을 가질 수 있다. 이러한 후보는 상기 기재된 바와 유사한 방법을 사용하여 평가될 수 있다.
당업계에 보고된 임의의 링커가 사용될 수 있으며, 비제한적인 예로서, 하기에 기재된 것이 포함된다: U.S. 특허 출원 제 20150265708 호.
일부 구현예에서, 지질은 본 개시에 따라 당업계에 공지된 임의의 방법을 사용하여 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트된다.
지질을 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이션하는 절차의 비제한적인 예는, 실시예에 제공되어 있다. 예를 들어, 지질 (예를 들어, 스테아르산 또는 투르비나르산) 을 C6 PO 링커를 사용하여 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, WV-3473) 에 콘쥬게이트시켜, 하기를 제조할 수 있다: WV-3545, 5'- Mod015L001fU*fC*fA*fA*fG*fG*mAfA*mGmA*fU*mGmGfC*fA*fU*fU*fU*fC*fU -3' (여기서 Mod015L001 은 스테아르산 및 C6 PO 링커를 기반으로 함); 및 WV-3546, 5'- Mod020L001fU*fC*fA*fA*fG*fG*mAfA*mGmA*fU*mGmGfC*fA*fU*fU*fU*fC*fU -3' (여기서 Mod020L001 은 투르비나르산 및 C6 PO 링커를 기반으로 함); WV-3856, 5'- Mod015L001fU*fC*fA*fA*fG*fG*mAfA*mGfA*mUfG*mGfC*fA*fU*fU*fU*fC*fU -3' (여기서 Mod015L001 은 스테아르산 및 C6 PO 링커를 기반으로 함); 및 WV-3559, 5'- Mod020L001fU*fC*fA*fA*fG*fG*mAfA*mGfA*mUfG*mGfC*fA*fU*fU*fU*fC*fU -3' (여기서 Mod020L001 은 투르비나르산 및 C6 PO 링커를 기반으로 함). 이러한 올리고뉴클레오티드는 각종 시험관내 검정에서 효과적이다.
표적 구성성분
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 표적 구성성분 또는 모이어티를 추가로 포함한다. 표적 구성성분은 지질 또는 생물학적 활성제에 콘쥬게이트되거나 콘쥬게이트되지 않을 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 생물학적 활성제에 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 생물학적 활성제는 지질 및 표적 구성성분 둘 모두에 콘쥬게이트된다. 본원에 기재된 바와 같이, 일부 구현예에서, 생물학적 활성제는 제공된 올리고뉴클레오티드이다. 따라서, 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는, 지질 및 올리고뉴클레오티드 이외에, 표적 요소를 추가로 포함한다. 각종 표적 구성성분, 예를 들어 지질, 항체, 펩티드, 탄수화물 등이, 본 개시에 따라 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 Ac-[-LLD-(RLD)a]b 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 [(Ac)a-LLD]b-RLD 의 구조를 갖는다. 일부 구현예에서, LLD, RLD, LLD 및 RLD 의 조합 또는 -[-LLD-(RLD)a]b 는, 하나 이상의 표적 구성성분을 포함한다.
표적 구성성분은 본 개시에 따른 다수의 유형의 방법을 통해 제공된 기술에 혼입될 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 제공된 올리고뉴클레오티드와 물리적으로 혼합되어 제공된 조성물을 형성한다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 올리고뉴클레오티드와 화학적으로 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 2 개 이상의 표적 구성성분을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 콘쥬게이트된 표적 구성성분을 포함한다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 콘쥬게이트된 표적 구성성분은 동일하다. 일부 구현예에서, 2 개 이상의 콘쥬게이트된 표적 구성성분은 상이하다. 일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드는 하나 이하의 표적 구성성분을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 상이한 유형의 콘쥬게이트된 표적 구성성분을 포함한다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물의 올리고뉴클레오티드는 동일한 유형의 표적 구성성분을 포함한다.
표적 구성성분은 임의로 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트될 수 있다. 당업계의 각종 유형의 링커가 본 개시에 따라 이용될 수 있다. 일부 구현예에서, 링커는 포스페이트기를 포함하고, 이는, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 합성에 이용되는 것과 유사한 화학을 통해 표적 구성성분을 콘쥬게이트하는데 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 링커는 아미드, 에스테르, 또는 에테르기를 포함한다. 일부 구현예에서, 링커는 -L- 의 구조를 갖는다. 표적 구성성분은 지질과 비교하여 동일하거나 상이한 링커를 통해 콘쥬게이트될 수 있다.
표적 구성성분은, 임의로 링커를 통해, 각종 적합한 위치에서 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트될 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 5'-OH 기를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 3'-OH 기를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 하나 이상의 당 모이어티를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 하나 이상의 염기를 통해 콘쥬게이트된다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 하나 이상의 뉴클레오티드간 연결을 통해 혼입된다. 일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드는, 독립적으로 이의 5'-OH, 3'-OH, 당 모이어티, 염기 모이어티 및/또는 뉴클레오티드간 연결을 통해 콘쥬게이트되는, 복수의 콘쥬게이트된 표적 구성성분을 함유할 수 있다. 표적 구성성분 및 지질은 동일한, 이웃하는 및/또는 분리된 위치에서 콘쥬게이트될 수 있다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 올리고뉴클레오티드의 하나의 말단에 콘쥬게이트되고, 지질은 다른 말단에 콘쥬게이트된다.
일부 구현예에서, 표적 구성성분은 표적화된 세포의 표면 상에서 단백질과 상호작용한다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 상호작용은 표적화된 세포 내로의 내재화를 용이하게 한다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 폴리펩티드 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 항체를 포함한다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 항체이다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 저해제를 포함한다. 일부 구현예에서, 표적 구성성분은 소분자 저해제로부터의 모이어티이다. 일부 구현예에서, 저해제는 표적화된 세포의 표면 상의 단백질의 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 탄산무수화효소 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 표적 세포의 표면 상에서 발현되는 탄산무수화효소 저해제이다. 일부 구현예에서, 탄산무수화효소는 I, II, III, IV, V, VI, VII, VIII, IX, X, XI, XII, XIII, XIV, XV 또는 XVI 이다. 일부 구현예에서, 탄산무수화효소는 멤브레인 결합된다. 일부 구현예에서, 탄산무수화효소는 IV, IX, XII 또는 XIV 이다. 일부 구현예에서, 저해제는 IV, IX, XII 및/또는 XIV 에 대한 것이다. 일부 구현예에서, 저해제는 탄산무수화효소 III 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 탄산무수화효소 IV 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 탄산무수화효소 IX 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 탄산무수화효소 XII 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 탄산무수화효소 XIV 저해제이다. 일부 구현예에서, 저해제는 술폰아미드 (예를 들어, [Supuran, CT. Nature Rev Drug Discover 2008, 7, 168-181] 에 기재된 것들, 술폰아미드는 본원에 참조로서 인용됨) 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 저해제는 술폰아미드이다. 일부 구현예에서, 표적화된 세포는 근육 세포이다.
일부 구현예에서, 표적 구성성분은 본 개시에 정의되고 기재된 바와 같은 RLD 이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 RLD 를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 RLD 를 포함하는 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 RLD 를 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 RLD 를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00414
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00415
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00416
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00417
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00418
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
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이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00420
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
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이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00422
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
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이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
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이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
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이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00426
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00427
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는
Figure pct00428
이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, RLD 는 지질 모이어티이거나 이를 포함하는 표적 구성성분이다. 일부 구현예에서, X 는 O 이다. 일부 구현예에서, X 는 S 이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 각종 모이어티를 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이션하는 기술 (예를 들어, 시약, 방법 등) 을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 표적 구성성분을 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이션하는 기술을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 콘쥬게이션을 위한 표적 구성성분을 포함하는 산, 예를 들어 RLD-COOH 를 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 콘쥬게이션을 위한 링커, 예를 들어 LLD 를 제공한다. 당업자는, 다수의 공지된 및 널리 실시되는 기술이 본 개시에 따른 올리고뉴클레오티드 사슬과의 콘쥬게이션에 이용될 수 있다는 것을 이해한다. 일부 구현예에서, 제공된 산은
Figure pct00429
이다. 일부 구현예에서, 제공된 산은
Figure pct00430
이다. 일부 구현예에서, 제공된 산은
Figure pct00431
이다. 일부 구현예에서, 제공된 산은
Figure pct00432
이다. 일부 구현예에서, 제공된 산은, 표적 구성성분으로서 지질 모이어티를 제공할 수 있는 지방산이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 상기와 같은 산의 제조를 위한 방법 및 시약을 제공한다.
일부 구현예에서, 제공된 화합물, 예를 들어 시약, 생성물 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드, 아미다이트 등) 등은, 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 순수하다. 일부 구현예에서, 순도는 50% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 75% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 80% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 85% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 90% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 95% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 96% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 97% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 98% 이상이다. 일부 구현예에서, 순도는 99% 이상이다.
사용예
일부 구현예에서, 본 개시는 지질 및 생물학적 활성제를 포함하는 조성물의 용도를 포함한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 제공된 조성물을 투여하는 것을 포함하는, 생물학적 활성제를 표적 위치에 전달하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 생물학적 활성제를 세포에 전달한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 생물학적 활성제를 근육 세포에 전달한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 생물학적 활성제를 조직 내 세포에 전달한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 생물학적 활성제를 기관 내 세포에 전달한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 제공된 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하여, 생물학적 활성제를 대상 내 세포에 전달한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 생물학적 활성제를 세포질에 전달한다. 일부 구현예에서, 제공된 방법은 생물학적 활성제를 핵에 전달한다.
일부 구현예에서, 본 개시는, 근육 세포 또는 조직, 또는 포유류 (예를 들어, 인간 대상) 의 근육 세포 또는 조직으로의 생물학적 활성제의 전달과 관련된 방법으로서, 상기 방법은 생물학적 제제 및 지질, 하기로부터 선택되는 하나 이상의 부가적인 구성성분을 포함하는 조성물의 용도에 관한 것이다: 폴리뉴클레오티드, 염료, 끼어들기 약물 (intercalating agent) (예를 들어 아크리딘), 가교-링커 (예를 들어 소랄렌, 또는 미토마이신 C), 포르피린 (예를 들어, TPPC4, 텍사피린, 또는 사피린), 폴리시클릭 방향족 탄화수소 (예를 들어, 페나진, 또는 디히드로페나진), 인공 엔도뉴클레아제, 킬레이트제, EDTA, 알킬화제, 포스페이트, 아미노, 메르캅토, PEG (예를 들어, PEG-40K), MPEG, [MPEG]2, 폴리아미노, 알킬, 치환 알킬, 방사성라벨된 마커, 효소, 합텐 (예를 들어 비오틴), 수송/흡수 촉진제 (예를 들어, 아스피린, 비타민 E, 또는 엽산), 합성 리보뉴클레아제, 단백질, 예를 들어, 글리코단백질, 또는 펩티드, 예를 들어 보조리간드에 대한 특이적 친화성을 갖는 분자, 또는 항체, 예를 들어 항체, 호르몬, 호르몬 수용체, 비(非)펩티드성 종류, 지질, 렉틴, 탄수화물, 비타민, 보조 인자, 또는 약물. 일부 구현예에서, 본 개시는 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는 지질, 및 생물학적 활성제를 포함하는 조성물 또는 상기 조성물과 관련된 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는 지질, 및 생물학적 활성제를 포함하는 조성물 또는 상기 조성물과 관련된 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일로 이루어진 군으로부터 선택되는 지질 및 생물학적 활성제를 포함하는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제공하며, 여기서 조성물은 근육 세포 또는 조직, 또는 포유류 (예를 들어, 인간 대상) 의 근육 세포 또는 조직으로의 올리고뉴클레오티드의 전달에 적합하다. 일부 구현예에서, 생물학적 활성제는 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드이며, 제공된 조성물은 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 일부 구현예에서, 생물학적 활성제는 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 올리고뉴클레오티드이며, 제공된 조성물은 올리고뉴클레오티드의 비키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다.
일부 구현예에서, 본 개시는 생물학적 활성제를 세포 또는 조직에 전달하는 방법으로서, 생물학적 활성제 및 지질을 포함하는 조성물을 제공하는 단계; 및 세포 또는 조직을 상기 조성물과 접촉시키는 단계를 포함하는 방법에 관한 것이며; 일부 구현예에서, 본 개시는 생물학적 활성제를 대상에게 투여하는 방법으로서, 생물학적 활성제 및 지질을 포함하는 조성물을 제공하는 단계; 및 상기 조성물을 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법에 관한 것이다. 일부 구현예에서, 지질은 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 일부 구현예에서, 지질은 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함한다. 각종 구현예에서, 지질은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일. 일부 구현예에서, 생물학적 활성제는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다: 소분자, 펩티드, 단백질, CRISPR-Cas 시스템의 구성성분, 탄수화물, 치료제, 화학요법제, 백신, 핵산, 및 지질. 일부 구현예에서, 핵산은 올리고뉴클레오티드, 안티센스 올리고뉴클레오티드, RNAi 작용제, miRNA, 면역조절성 핵산, 압타머, Piwi-상호작용 RNA (piRNA), 소핵 소체 RNA (snoRNA), 리보자임, mRNA, lncRNA, ncRNA, 안티고미르 (예를 들어, miRNA, lncRNA, ncRNA 또는 다른 핵산에 대한 안타고니스트), 플라스미드, 벡터, 또는 이들의 일부이다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 핵산의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물이다. 각종 구현예에서, 간외 세포 또는 조직은 근육 세포 또는 조직이다. 각종 구현예에서, 근육-관련 장애는 근육감소증, 근육 운동 장애, 근육 소비-관련 장애, 근육 변성, 근육 약화, 근육 이상증, 듀켄 근이영양증, 심부전, 호흡 장애, 영양실조 및 질환으로 인한 골격근 변성, 손상된 인슐린-의존성 신호전달과 관련된 근육-관련 질환, 근위축성 측색 경화증, 척수근 위축증 및 척수 손상, 국소빈혈성 근육 질환이다. 일부 구현예에서, 본 개시는 핵산 (비제한적인 예로서, 올리고뉴클레오티드 또는 스테레오정의된 올리고뉴클레오티드) 을, 근육-관련 질환 또는 장애로 고통받고 있는 대상의 근육 세포 또는 조직에 투여하는 방법으로서, 지질 및 핵산을 포함하는 조성물을 제공하는 단계, 및 상기 조성물의 치료학적 유효량을 대상에게 투여하는 단계를 포함하는 방법에 관한 것이다.
일부 구현예에서, 생물학적 활성제는 올리고뉴클레오티드로서, 이의 서열이 세포 핵산에서의 표적화 요소와 실질적으로 상보적인 요소이거나 이를 포함하는 올리고뉴클레오티드이다. 일부 구현예에서, 표적화 요소는 근육 질환, 장애 또는 병태와 관련된 서열 요소이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 근육 질환, 장애 또는 병태는 DMD 이다. 일부 구현예에서, 세포 핵산은 전사물이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 세포 핵산은 1차 전사물이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 세포 핵산은 게놈 핵산이거나 이를 포함한다. 본 개시는, 특정 지질 및 기타 화합물이, 예를 들어 포유류 또는 인간 대상의 세포 및 조직에의 생물학적 활성제의 전달에 유용하다는 인식을 포함한다. 상기와 같은 제제를 전달하는 다수의 기술은 목적하는 세포 또는 조직을 표적화할 수 없다는 어려움을 겪을 수 있다.
간 이외의 조직에의 생물학적 활성제의 전달은 여전히 어렵다. Juliano 는, 임상 수준에서의 진보에도 불구하고, 특히 간외 부위에서의 생체내 올리고뉴클레오티드의 효과적인 전달은 중요한 과제로 남아있다고 보고하였다 [Juliano 2016 Nucl. Acids Res. Doi: 10.1093/nar/gkw236]. Lou 는 또한, 간 이외의 장기에의 siRNA 의 전달이 다수의 질환을 위한 기술을 사용하는데 있어서의 큰 장애물이라고 보고하였다 [Lou 2014 SciBX 7(48); doi:10.1038/scibx.2014.1394].
본 개시는, 특정 지질 및 기타 화합물이, 생물학적 활성제를, 비제한적인 예로서, 근육 세포 및 조직을 포함하는, 간 이외의 세포 및 조직을 포함하는 특정 세포 및 조직에 전달하는데 있어서 특히 효과적이라는 것을 포함하는, 특정한 놀라운 발견을 포함한다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 목적하지 않는 표적 및/또는 생물학적 기능이 억제되도록 전사물 스플라이싱을 변경시킨다. 일부 구현예에서, 상기와 같은 경우 제공된 조성물은 또한 하이브리드화 후 전사물의 절단을 유도할 수 있다.
일부 구현예에서, 제공된 조성물은 목적하는 표적 및/또는 생물학적 기능이 증강되도록 전사물 스플라이싱을 변경시킨다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물, 화학적 개질, 입체화학 및/또는 이들의 조합을 혼입함으로써, 접촉 후 표적 전사물의 절단을 효과적으로 억제 또는 방지한다.
일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다. 일부 구현예에서, 다수 중 각각의 올리고뉴클레오티드는 약 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함한다.
예시 구현예
일부 구현예에서, 본 개시는 하기 예시 구현예를 제공한다:
1. 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
2. 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 3'-말단 영역, 및 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 5'-말단 영역과 3'-영역 사이의 중간 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
3. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각 하기의 구조를 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물:
5'-[Nu5]z1-[Num]z2-[Nu3]z3-3'
[식 중,
각각의 Nu5 는 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 Nu3 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 NuS 는 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
각각의 NuF 는 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고;
여기서, 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개의 연속적인 Nu5 및 적어도 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개의 연속적인 Nu3 은 NuS 이고, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개의 Num 은 천연 포스페이트 연결 또는 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함함].
4. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각 5'-[NuS]z1-[Num]z2-[NuS]z3-3' 의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
5. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결의 첫 번째가 올리고뉴클레오티드의 제 1 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
6. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결의 마지막이 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
7. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 2 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
8. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 3 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
9. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 4 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
10. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 5 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
11. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 6 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
12. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 7 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
13. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단이 8 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
14. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 2 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
15. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 3 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
16. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 4 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
17. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 5 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
18. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 6 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
19. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 7 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
20. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단이 8 개 이상의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
21. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'- 및 3'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결이 각각 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
22. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결이 각각 포스포로티오에이트인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
23. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결이 각각 포스포로티오에이트인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
24. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결이 각각 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
25. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결이 각각 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
26. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 1 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
27. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
28. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
29. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
30. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
31. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 6 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
32. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 7 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
33. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 8 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
34. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 1 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
35. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 2 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
36. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 3 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
37. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 4 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
38. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 5 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
39. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 6 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
40. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 7 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
41. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 8 개 이상의 Rp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
42. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 1 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
43. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 2 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
44. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 3 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
45. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 4 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
46. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 5 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
47. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 6 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
48. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 7 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
49. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 8 개 이상의 Sp 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
50. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
51. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 1 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
52. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
53. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 3 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
54. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 4 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
55. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 5 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
56. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 6 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
57. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 8 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
58. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 9 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
59. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 10 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
60. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위가, -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
61. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위가, 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
62. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위가, -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
63. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단의 연속적인 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위가, 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
64. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위를 포함하는 하나 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
65. 구현예 64 에 있어서, 하나 이상의 뉴클레오티드 단위가 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
66. 구현예 64 또는 65 에 있어서, 하나 이상의 뉴클레오티드 단위가 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
67. 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 -F 를 포함하는 하나 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
68. 구현예 67 에 있어서, 각각 하기의 구조를 갖는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물:
5'-[Nu5]z1-[Num]z2-[Nu3]z3-3'
[식 중,
각각의 Nu5 는 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 Nu3 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고, 적어도 하나는 NuS 또는 NuF 이고;
각각의 NuS 는 독립적으로 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
각각의 NuF 는 독립적으로 -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위이고;
z1, z2 및 z3 은 각각 독립적으로 0-100 이고, 여기서 z1, z2 및 z3 중 적어도 하나는 0 이 아니고;
각각의 Num 은 독립적으로 뉴클레오티드 단위이고;
여기서 Nu5, Nu3, 및 Num 중 적어도 하나는 NuF 임].
69. 구현예 68 에 있어서, 적어도 하나의 Nu5 및 적어도 하나의 Nu3 이 NuF 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
70. 구현예 67-69 중 어느 하나에 있어서, 각각 5'-[NuS]z1-[Num]z2-[NuS]z3-3' 의 구조를 갖는, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
71. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuS 가 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
72. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuS 가 포스포로티오에이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
73. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
74. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
75. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuS 가 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
76. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuS 가 2'-F 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
77. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 2'-F 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
78. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 화학식 I 의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
79. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 포스포로티오에이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
80. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 키랄 제어된 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
81. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 NuF 가 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
82. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
83. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 2'-OR1 개질된 당 모이어티를 포함하고, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
84. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
85. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
86. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 키랄 제어된 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
87. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 키랄 제어된 Rp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
88. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 2'-OR1 개질된 당 모이어티 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬임), 및 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
89. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 2'-F 개질된 당 모이어티, 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
90. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 2'-F 개질된 당 모이어티, 및 키랄 제어된 Sp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
91. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 Num 이 2'-F 개질된 당 모이어티, 및 키랄 제어된 Rp 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
92. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, NuS, NuF 및 Num 이 각각 독립적으로 하기의 구조를 갖는 조성물:
Figure pct00433
[식 중,
BNu 는 임의 치환된 핵염기이고;
각각의 RNu 는 독립적으로 R1, R', -L-R1, 또는 -L-R' 이고, 여기서 R1, R', 및 L 은 각각 독립적으로 정의되고 기재된 바와 같고;
LNu5 는 공유 결합이거나, 또는 올리고뉴클레오티드의 5'-말단에 있는 경우, RNu 이고; 및
LNu3 은 화학식 I 의 구조를 갖는 뉴클레오티드간 연결이거나, 또는 올리고뉴클레오티드의 3'-말단에 있는 경우, RNu 임].
93. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, NuS, NuF 및 Num 이 각각 독립적으로
Figure pct00434
의 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
94. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, BNu 가 임의 치환된 A, T, C, G 및 U 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
95. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 NuS, NuF 및 Num 에서, 2 개의 RNu 기가 그 개입 원자와 함께 취해져 고리 시스템을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
96. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 NuS, NuF 및 Num 에서, 2'-RNu 가 2'-OR1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
97. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 NuS, NuF 및 Num 에서, 2'-RNu 가 2'-F 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
98. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, LNu5 가 5'-OH, 보호된 5'-OH, 또는 -O-, 또는 공유 결합인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
99. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, LNu3 이 화학식 I 의 구조, 3'-OH 또는 보호된 3'-OH 를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
100. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z1, z2 및 z3 의 합이 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 50 또는 그 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
101. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z1 이 4 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
102. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z1 이 5 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
103. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z1 이 6 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
104. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z2 가 4 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
105. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z2 가 5 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
106. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z2 가 6 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
107. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z3 이 4 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
108. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z3 이 5 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
109. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z3 이 6 이상인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
110. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, z1 이 z3 과 같은, 올리고뉴클레오티드 조성물.
111. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, [Nu5]z1, [NuS]z1, 또는 [NuF]z1 이 5'-윙 또는 5'-말단 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
112. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, [Nu5]z3, [NuS]z3, 또는 [NuF]z3 이 3'-윙 또는 3'-말단 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
113. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, [Num]z2 가 코어 또는 중간 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
114. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
115. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 3 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
116. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 4 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
117. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 5 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
118. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 6 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
119. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 7 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
120. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 8 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
121. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 9 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
122. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 10 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
123. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
124. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
125. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 3 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
126. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 4 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
127. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 5 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
128. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 6 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
129. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 7 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
130. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 8 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 5'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
131. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단의 연속적인 뉴클레오시드 단위의 첫 번째 뉴클레오시드 단위가 올리고뉴클레오티드의 제 1 뉴클레오시드 단위인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
132. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 각각 -F 를 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
133. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 2 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
134. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 3 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
135. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 4 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
136. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 5 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
137. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 6 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
138. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 7 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
139. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 -F 를 포함하는 8 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 3'-말단 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
140. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단의 연속적인 뉴클레오시드 단위의 마지막 뉴클레오시드 단위가 올리고뉴클레오티드의 마지막 뉴클레오시드 단위인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
141. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위가 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
142. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, -F 를 포함하는 뉴클레오시드 단위가 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
143. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, -F 를 포함하는 뉴클레오티드 단위가 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
144. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, -F 를 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위가, 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 경우, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
145. 구현예 143-144 중 어느 하나에 있어서, 개질된 뉴클레오티드간 연결이 키랄인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
146. 구현예 143-144 중 어느 하나에 있어서, 개질된 뉴클레오티드간 연결이 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
147. 구현예 143-146 중 어느 하나에 있어서, 개질된 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
148. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
149. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
150. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
151. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
152. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 6 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
153. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 7 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
154. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 8 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
155. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 9 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
156. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
157. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 11 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
158. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 12 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
159. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 13 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
160. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 14 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
161. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
162. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 16 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
163. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 17 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
164. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 18 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
165. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 19 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
166. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 20 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
167. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
168. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
169. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
170. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
171. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 6 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
172. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 개질된 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 화학식 I 의 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
173. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 개질된 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
174. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 각각의 키랄 개질된 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
175. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가:
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 동일한 올리고뉴클레오티드 유형을 갖는다는 점에서 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
176. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 2'-OR1 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
177. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 2'-OR1 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
178. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 2'-OR1 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
179. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 2'-OR1 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
180. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 2'-OR1 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
181. 구현예 176 내지 180 중 어느 하나에 있어서, R1 이 임의 치환된 C1 -6 지방족인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
182. 구현예 176 내지 180 중 어느 하나에 있어서, R1 이 메틸인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
183. 구현예 176 내지 182 중 어느 하나에 있어서, 2'-OR1 당 개질을 포함하는 뉴클레오티드 단위가 천연 포스페이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
184. 구현예 176 내지 183 중 어느 하나에 있어서, 2'-OR1 당 개질을 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위가 천연 포스페이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
185. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 전사물에서 표적 서열과 하이브리드화하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
186. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 염기 서열이 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
187. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드 조성물이, 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
188.
1) 전사물에서 표적 서열에 상보적인 공통 염기 서열을 갖고;
2) 하나 이상의 개질된 당 모이어티 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
189.
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
190. 구현예 188 또는 189 에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 수준이 선결된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
191. 구현예 2 에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 개질된 당 모이어티, 및 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
192. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
193. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
194. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
195. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
196. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 10 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
197. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
198. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
199. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
200. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 5% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
201. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 10% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
202. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 20% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
203. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 30% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
204. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 40% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
205. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 50% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
206. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 60% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
207. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 70% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
208. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 80% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
209. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 85% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
210. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 90% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
211. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 당 모이어티의 약 95% 이상이 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
212. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
213. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
214. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
215. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
216. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 9 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
217. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 8 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
218. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 7 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
219. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 6 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
220. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
221. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 4 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
222. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 3 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
223. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 2 개 이하의 연속적인 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
224. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
225. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
226. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
227. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
228. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5 개 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
229. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 95% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
230. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 90% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
231. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 85% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
232. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 80% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
233. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 70% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
234. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 60% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
235. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 50% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
236. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 40% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
237. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 30% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
238. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
239. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
240. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5% 이하의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
241. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 바이시클릭 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
242. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2 개의 고리 탄소 원자를 연결하는 -L- 또는 -O-L- 브릿지를 갖는 바이시클릭 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
243. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 4'-CH(CH3)-O-2' 브릿지를 갖는 바이시클릭 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
244. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 모르폴리노 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
245. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 모르폴리노 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
246. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
247. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OR1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
248. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OR1 이고, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
249. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-MOE 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
250. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OMe 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
251. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 S-cEt 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
252. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 FANA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
253. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 FRNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
254. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-F 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
255. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 R1 은 수소가 아닌, 올리고뉴클레오티드 조성물.
256. 구현예 1-243 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OR1 또는 2'-F 이며, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1-6 알킬이 아닌, 올리고뉴클레오티드 조성물.
257. 구현예 255-256 중 어느 하나에 있어서, 2'-OR1 이 2'-OMe 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
258. 구현예 255-257 중 어느 하나에 있어서, 2'-개질이 2'-F 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
259. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
260. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
261. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 당 개질이 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
262. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 각각의 당 모이어티가 독립적으로 개질된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
263. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
264. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
265. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
266. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
267. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 10 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
268. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
269. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
270. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
271. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 5% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
272. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 10% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
273. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 20% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
274. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 30% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
275. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 40% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
276. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 50% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
277. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 60% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
278. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 70% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
279. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 80% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
280. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 85% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
281. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 90% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
282. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드에서 뉴클레오티드간 연결의 약 95% 가 개질된 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
283. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
284. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
285. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
286. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
287. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 9 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
288. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 8 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
289. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 7 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
290. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 6 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
291. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
292. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 4 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
293. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 3 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
294. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 2 개 이하의 연속적인 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
295. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
296. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 9 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
297. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 8 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
298. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 7 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
299. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 6 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
300. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
301. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 4 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
302. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 3 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
303. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 2 개 이하의 연속적인 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
304. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
305. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
306. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
307. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
308. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5 개 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
309. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 25 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
310. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
311. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 15 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
312. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
313. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5 개 이하의 DNA 뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
314. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 95% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
315. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 90% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
316. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 85% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
317. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 80% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
318. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 70% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
319. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 60% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
320. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 50% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
321. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 40% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
322. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 30% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
323. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 20% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
324. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 10% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
325. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 약 5% 이하의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
326. 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하거나; 또는
각각의 윙 영역은 독립적으로 하나 이상의 개질된 당 모이어티를 포함하고, 코어 영역은 하나 이상의 비개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
327. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하고, 여기서
제 1 다수의 올리고뉴클레오티드는 동일한 염기 서열을 갖고;
각각의 윙은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결 및 임의로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고;
코어 영역은 독립적으로 2 개 이상의 염기의 길이를 갖고, 독립적으로 하나 이상의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
328. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어와 동일하거나 그 보다 낮은 백분율의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
329. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 코어와 동일하거나 그 보다 낮은 백분율의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
330. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어보다 낮은 백분율의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
331. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
332. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 하나 이상의 천연 포스페이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
333. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어의 5' 에 대한 윙이 이의 5'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
334. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어의 3' 에 대한 윙이 이의 3'-말단에서 개질된 뉴클레오티드간 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
335. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 윙에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
336. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어의 5' 에 대한 윙이 윙에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
337. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어의 5' 에 대한 윙이 윙에서 2 개 이상의 연속적인 천연 포스페이트 연결이 뒤따르는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
338. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 윙에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
339. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어의 3' 에 대한 윙이 윙에서 하나 이상의 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
340. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어의 3' 에 대한 윙이 윙에서 2 개 이상의 연속적인 천연 포스페이트 연결이 앞서있는 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
341. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 이의 3'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
342. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 이의 5'-말단에서 2 개의 뉴클레오시드 사이에 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
343. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 10% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
344. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 20% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
345. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 30% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
346. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 60% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
347. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 70% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
348. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 80% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
349. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 85% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
350. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 90% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
351. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수가 조성물 중 적어도 약 95% 의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
352. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서,
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
353. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하고, 여기서 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 염기 개질의 공통 패턴 및 당 개질의 패턴을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
354. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하고, 여기서 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드는 구조적으로 동일한 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
355. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 2 개의 윙 영역 및 코어 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
356. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이하의 개의 윙 영역 및 하나 이하의 코어 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
357. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 윙-코어-윙 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
358. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 윙-코어-윙 구조를 갖는 갭머인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
359. 구현예 1-282 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이하의 윙 영역 및 하나 이하의 코어 영역을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
360. 구현예 1-282 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 윙-코어 구조를 갖는 헤미머인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
361. 구현예 1-282 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 코어-윙 구조를 갖는 헤미머인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
362. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
363. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 20% 이하의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
364. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
365. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 20% 이하의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
366. 구현예 1-326 및 359-363 중 어느 하나에 있어서, 코어의 5'-말단에 대한 윙이 윙의 5'-말단에서 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
367. 구현예 1-326 및 359-363 중 어느 하나에 있어서, 코어의 3'-말단에 대한 윙이 윙의 3'-말단에서 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
368. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 단지 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 갖고, 윙의 다른 뉴클레오티드간 연결이 각각 천연 포스페이트 연결
Figure pct00435
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
369. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 키랄 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
370. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 키랄 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖고, 식 중 X 는 S 이고, Y 및 Z 는 O 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
371. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 키랄 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
372. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
373. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
374. 구현예 1-372 중 어느 하나에 있어서, 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Rp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
375. 구현예 1-371 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Rp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
376. 구현예 1-374 중 어느 하나에 있어서, 윙이 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
377. 구현예 1-374 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 Sp 포스포로티오에이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
378. 구현예 1-360, 362-374, 및 376-377 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 윙이 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
379. 구현예 1-360, 362-374, 및 376-378 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 윙이 윙의 5'-말단에서 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
380. 구현예 1-360, 362-374, 및 376-379 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 윙이 윙의 5'-말단에서 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖고, 윙의 다른 뉴클레오티드간 연결이 각각 천연 포스페이트 연결
Figure pct00436
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
381. 구현예 1-359, 361-374 및 376-377 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 윙이 윙의 3'-말단에서 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
382. 구현예 1-359, 361-374, 376-377 및 381 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 윙이 윙의 3'-말단에서 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
383. 구현예 1-359, 361-374, 376-377 및 381-382 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 공통 코어의 3'-말단에 있고, 윙이 윙의 3'-말단에서 Sp 포스포로티오에이트 연결을 갖고, 윙의 다른 뉴클레오티드간 연결이 각각 천연 포스페이트 연결
Figure pct00437
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
384. 구현예 1-372 및 374-383 중 어느 하나에 있어서, 윙이 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
385. 구현예 1-372 및 374-383 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 Rp 포스포로티오에이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
386. 구현예 1-360, 362-372 및 374-385 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 윙이 Rp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
387. 구현예 1-360, 362-372 및 374-386 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 윙이 윙의 5'-말단에서 Rp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
388. 구현예 1-360, 362-372 및 374-387 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 윙이 윙의 5'-말단에서 Rp 포스포로티오에이트 연결을 갖고, 윙의 다른 뉴클레오티드간 연결이 각각 천연 포스페이트 연결
Figure pct00438
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
389. 구현예 1-359, 361-372 및 374-385 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 윙이 Rp 포스포로티오에이트를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
390. 구현예 1-359, 361-372 및 374-385 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 윙이 윙의 3'-말단에서 Rp 포스포로티오에이트 연결을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
391. 구현예 1-359, 361-372 및 374-385 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 공통 코어의 3'-말단에 있고, 윙이 윙의 3'-말단에서 Rp 포스포로티오에이트 연결을 갖고, 윙의 다른 뉴클레오티드간 연결이 각각 천연 포스페이트 연결
Figure pct00439
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
392. 구현예 1-371 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 이의 5'-말단 뉴클레오티드간 연결이 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
393. 구현예 1-371 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 이의 5'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
394. 구현예 1-371 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 5'-말단에 있고, 이의 5'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
395. 구현예 1-371 및 392-394 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 이의 3'-말단 뉴클레오티드간 연결이 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
396. 구현예 1-371 및 392-394 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 이의 3'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Sp 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
397. 구현예 1-371 및 392-394 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어의 3'-말단에 있고, 이의 3'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Rp 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
398. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 독립적으로 천연 포스페이트 연결
Figure pct00440
을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
399. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 독립적으로 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결
Figure pct00441
을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
400. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 독립적으로 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 윙 내 모든 천연 포스페이트 연결이 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
401. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 천연 포스페이트 연결
Figure pct00442
을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
402. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
403. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
404. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
405. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
406. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 윙 내 모든 천연 포스페이트 연결이 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
407. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 윙 내 모든 천연 포스페이트 연결이 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
408. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 윙 내 모든 천연 포스페이트 연결이 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
409. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하고, 윙 내 모든 천연 포스페이트 연결이 연속적인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
410. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 5% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
411. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 10% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
412. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 20% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
413. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 30% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
414. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 40% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
415. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 50% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
416. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 60% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
417. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 70% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
418. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 80% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
419. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 90% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
420. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙에서 95% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
421. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 5% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
422. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 10% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
423. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 20% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
424. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 30% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
425. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 40% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
426. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 50% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
427. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 60% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
428. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 70% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
429. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 80% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
430. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 90% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
431. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙에서 95% 이상의 뉴클레오티드간 연결이 독립적으로 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
432. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 15 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
433. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 10 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
434. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 9 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
435. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 8 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
436. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 7 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
437. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 6 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
438. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 5 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
439. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 4 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
440. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 3 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
441. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 2 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
442. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 1 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
443. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 15 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
444. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 10 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
445. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 9 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
446. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 8 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
447. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 7 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
448. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 6 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
449. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 5 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
450. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 4 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
451. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 3 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
452. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 2 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
453. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 1 개 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
454. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 100% 미만의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
455. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 95% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
456. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 90% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
457. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 80% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
458. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 70% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
459. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 60% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
460. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 50% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
461. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 40% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
462. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 30% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
463. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 20% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
464. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 10% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
465. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 100% 미만의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
466. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 95% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
467. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 90% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
468. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 80% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
469. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 70% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
470. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 60% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
471. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 50% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
472. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 40% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
473. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 30% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
474. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 20% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
475. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 10% 이하의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
476. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결 및 화학식 I 의 구조를 갖는 개질된 포스페이트 연결로부터 독립적으로 선택되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
477. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙 영역의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결 및 포스포로티오에이트 연결로부터 독립적으로 선택되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
478. 구현예 1-361 중 어느 하나에 있어서, 윙 내 각각의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
479. 구현예 1-361 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙 내 각각의 뉴클레오티드간 연결이 천연 포스페이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
480. 구현예 1-361 중 어느 하나에 있어서, 윙 내 각각의 뉴클레오티드간 연결이 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
481. 구현예 1-361 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙 내 각각의 뉴클레오티드간 연결이 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
482. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 3 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
483. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 4 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
484. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 5 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
485. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 6 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
486. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 7 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
487. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 8 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
488. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 9 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
489. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나의 윙이 10 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
490. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 3 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
491. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 4 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
492. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 5 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
493. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 6 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
494. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 7 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
495. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 8 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
496. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 9 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
497. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 10 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
498. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 3 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
499. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 4 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
500. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 5 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
501. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 6 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
502. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 7 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
503. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 8 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
504. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 9 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
505. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 10 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
506. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 11 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
507. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 12 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
508. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 13 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
509. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 14 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
510. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 윙이 15 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
511. 구현예 1-482 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 동일한 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
512. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 코어에 대한 당 개질에 의해 정의되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
513. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙이 독립적으로 개질된 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
514. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙 당 모이어티가 독립적으로 개질된 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
515. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 고-친화성 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
516. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
517. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 바이시클릭 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
518. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2 개의 고리 탄소 원자를 연결하는 -L- 또는 -O-L- 브릿지를 갖는 바이시클릭 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
519. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 4'-CH(CH3)-O-2' 브릿지를 갖는 바이시클릭 당 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
520. 구현예 1-516 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OR1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
521. 구현예 1-516 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OR1 이고, 여기서 R1 은 임의 치환된 C1 -6 알킬인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
522. 구현예 1-516 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-MOE 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
523. 구현예 1-516 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 2'-OMe 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
524. 구현예 1-519 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 S-cEt 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
525. 구현예 1-516 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 FANA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
526. 구현예 1-516 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 2'-개질을 포함하고, 여기서 2'-개질은 FRNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
527. 구현예 1-515 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 5'-개질을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
528. 구현예 1-515 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티는가 R-5'-Me-DNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
529. 구현예 1-515 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 S-5'-Me-DNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
530. 구현예 1-515 중 어느 하나에 있어서, 개질된 당 모이어티가 FHNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
531. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 윙 당 모이어티가 개질된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
532. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙 내 모든 개질된 윙의 당 모이어티가 동일한 개질을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
533. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 모든 개질된 윙의 당 모이어티가 동일한 개질을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
534. 구현예 1-531 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 개질된 윙의 당 모이어티가 또 다른 개질된 윙의 당 모이어티와 상이한 올리고뉴클레오티드 조성물.
535. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 개질된 염기를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
536. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 윙이 2S-dT 를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
537. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 5 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
538. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 6 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
539. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 7 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
540. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 8 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
541. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 9 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
542. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 10 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
543. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 11 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
544. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 12 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
545. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 13 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
546. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 14 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
547. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 15 개 이상의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
548. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 5 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
549. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 6 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
550. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 7 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
551. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 8 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
552. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 9 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
553. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 10 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
554. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 11 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
555. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 12 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
556. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 13 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
557. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 14 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
558. 구현예 1-536 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 15 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
559. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 어떠한 2'-개질도 갖지 않는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
560. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 코어의 당 모이어티가 개질되지 않은 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
561. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역의 각각의 당 모이어티가 천연 DNA 당 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
562. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
563. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
564. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는 키랄 뉴클레오티드간 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
565. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는 키랄 뉴클레오티드간 연결이고, 식 중 X 는 S 이고, Y 및 Z 는 O 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
566. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 화학식 I 의 구조를 갖는 키랄 뉴클레오티드간 연결이고, 식 중 하나의 -L-R1 은 -H 가 아닌, 올리고뉴클레오티드 조성물.
567. 구현예 1-565 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역의 각각의 뉴클레오티드간 연결이 포스포로티오에이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
568. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 (Sp)m(Rp)n 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 이고, n 은 1-10 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
569. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 (Sp)m(Rp)n 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 이고, n 은 1-10 이고, m>n 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
570. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 (Sp)m(Rp)n 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이고, n 은 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
571. 구현예 1-567 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 (Rp)n(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 이고, n 은 1-10 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
572. 구현예 1-567 및 571 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 Rp(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
573. 구현예 1-567 및 571-572 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 Rp(Sp)2 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
574. 구현예 1-567 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 (Np)t(Rp)n(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 t 는 1-10 이고, n 은 1-10 이고, m 은 1-50 이고, 각각의 Np 는 독립적인 Rp 또는 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
575. 구현예 1-567 및 574 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 t 는 1-10 이고, n 은 1-10 이고, m 은 1-50 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
576. 구현예 1-567 및 574-575 중 어느 하나에 있어서, n 이 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
577. 구현예 1-567 및 574-576 중 어느 하나에 있어서, t 가 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
578. 구현예 1-567 및 574-577 중 어느 하나에 있어서, m 이 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
579. 구현예 1-567 및 574-578 중 어느 하나에 있어서, t 및 m 중 적어도 하나가 5 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
580. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 SpSpRpSpSp 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
581. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 50% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
582. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 60% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
583. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 70% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
584. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 80% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
585. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 90% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
586. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 키랄이고, 코어 영역이 단지 하나의 Rp 를 갖고, 코어 영역에서 다른 뉴클레오티드간 연결이 각각 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
587. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어에서 각각의 염기 모이어티가 개질되지 않은 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
588. 구현예 1-586 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 개질된 염기를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
589. 구현예 1-586 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 개질된 염기를 포함하고, 여기서 개질된 염기는 치환된 A, T, C 또는 G 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
590. 구현예 1-587 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역에서 각각의 염기 모이어티가 A, T, C 및 G 로부터 독립적으로 선택되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
591. 구현예 1-586 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 이의 포스페이트 연결이 독립적으로 포스포로티오에이트 연결로 대체된 DNA 서열인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
592. 구현예 326-591 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 구현예 1-325 중 어느 하나의 5'-말단 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
593. 구현예 326-592 중 어느 하나에 있어서, 3'-윙 영역이 구현예 1-325 중 어느 하나의 3'-말단 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
594. 구현예 326-593 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 구현예 1-325 중 어느 하나의 중간 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
595. 구현예 1-325 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단 영역이 구현예 326-591 중 어느 하나의 5'-윙 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
596. 구현예 1-325 및 595 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단 영역이 구현예 326-591 중 어느 하나의 3'-윙 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
597. 구현예 1-325 및 595-596 중 어느 하나에 있어서, 중간 영역이 구현예 326-591 중 어느 하나의 코어 영역인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
598. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 단일 가닥인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
599. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 안티센스 올리고뉴클레오티드, 안타고미르, 마이크로RNA, 프리-마이크로RNA, 안티미르, 수페르미르, 리보자임, Ul 어답터, RNA 활성화제, RNAi 작용제, 디코이 올리고뉴클레오티드, 트리플렉스 형성 올리고뉴클레오티드, 압타머 또는 아쥬반트인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
600. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 안티센스 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
601. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 10 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
602. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 11 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
603. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 12 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
604. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 13 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
605. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 14 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
606. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 15 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
607. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 16 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
608. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 17 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
609. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 18 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
610. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 19 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
611. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 20 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
612. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 21 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
613. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 22 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
614. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 23 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
615. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 24 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
616. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 25 개 초과의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
617. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 약 200 개 미만의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
618. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 약 150 개 미만의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
619. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 약 100 개 미만의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
620. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 약 50 개 미만의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
621. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 약 40 개 미만의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
622. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 약 30 개 미만의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
623. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 10 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
624. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 11 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
625. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 12 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
626. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 13 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
627. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 14 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
628. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 15 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
629. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 16 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
630. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 17 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
631. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 18 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
632. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 19 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
633. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 20 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
634. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 21 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
635. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 22 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
636. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 23 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
637. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 24 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
638. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 25 개의 염기의 길이를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
639. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 (Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
640. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 (Rp)p(Sp)x(Rp)q(Sp)y 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 p, x, q, y 는 각각 독립적으로 0-50 이고, p + q >0 이고, x+y >0 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
641. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 (Sp)m(Rp)n 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 이고, n 은 1-10 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
642. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 (Sp)m(Rp)n 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 이고, n 은 1-10 이고, m>n 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
643. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 (Sp)m(Rp)n 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서, m 은 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 이고, n 은 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
644. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 (Sp)m(Rp)n 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 2 이고, n 은 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
645. 구현예 1-640 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 (Rp)n(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 1-50 이고, n 은 1-10 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
646. 구현예 1-640 및 645 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 Rp(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 m 은 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
647. 구현예 1-640 및 645-646 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 Rp(Sp)2 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
648. 구현예 1-640 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 (Np)t(Rp)n(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 t 는 1-10 이고, n 은 1-10 이고, m 은 1-50 이고, 각각의 Np 는 독립적인 Rp 또는 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
649. 구현예 1-640 및 648 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 (Sp)t(Rp)n(Sp)m 을 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖고, 여기서 t 는 1-10 이고, n 은 1-10 이고, m 은 1-50 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
650. 구현예 1-649 중 어느 하나에 있어서, n 이 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
651. 구현예 1-640 및 648-649 중 어느 하나에 있어서, t 가 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
652. 구현예 1-650 중 어느 하나에 있어서, m 이 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
653. 구현예 1-640 및 649-651 중 어느 하나에 있어서, t 및 m 중 적어도 하나가 5 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
654. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 3 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
655. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 4 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
656. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 5 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
657. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 6 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
658. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 7 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
659. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 8 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
660. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 9 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
661. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, m 이 10 초과인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
662. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 코어 영역이 SpSpRpSpSp 를 포함하는 백본 키랄 중심의 패턴을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
663. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 (Sp)m(Rp)n 을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
664. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 2 개 이상의 교대 (Sp)m(Rp)n 을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
665. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 2 개 이상의 교대 (Sp)2(Rp) 을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
666. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 50% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
667. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 60% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
668. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 70% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
669. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 80% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
670. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 90% 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
671. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 각각의 뉴클레오티드간 연결이 키랄이고, 코어 영역이 단지 하나의 Rp 를 갖고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드에서 다른 뉴클레오티드간 연결은 각각 Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
672. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Rp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
673. 구현예 1-673 중 어느 하나에 있어서, 5'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
674. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단 뉴클레오티드간 연결이Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
675. 구현예 1-674 중 어느 하나에 있어서, 3'-말단 뉴클레오티드간 연결이 Sp 배열을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
676. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 블록머인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
677. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 알트머인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
678. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드 유형이 (Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp)-d[5mCs1As1Gs1Ts15mCs1Ts1Gs15mCs1Ts1Ts15mCs1G] 또는 (Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp)-Gs5mCs5mCsTs5mCsAsGsTs5mCsTsGs5mCsTsTs5mCsGs5mCsAs5mCs5mC (5R-(SSR)3-5R) 이 아니고, 여기서 밑줄 그어진 뉴클레오티드는 2'-O-MOE 개질된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
679. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 (Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp)-d[5mCs1As1Gs1Ts15mCs1Ts1Gs15mCs1Ts1Ts15mCs1G] 또는 (Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Sp, Sp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp, Rp)-Gs5mCs5mCsTs5mCsAsGsTs5mCsTsGs5mCsTsTs5mCsGs5mCsAs5mCs5mC (5R-(SSR)3-5R) 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아니고, 여기서 밑줄 그어진 뉴클레오티드는 2'-O-MOE 개질된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
680. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아닌, 올리고뉴클레오티드 조성물:
Figure pct00443
(여기서 소문자는 2'OMe RNA 잔기를 나타내고; 대문자는 2'OH RNA 잔기를 나타내고; 볼드체로 된 "s" 는 포스포로티오에이트 모이어티를 나타냄); 및
Figure pct00444
(여기서 소문자는 2'-OMe RNA 잔기를 나타내고; 대문자는 RNA 잔기를 나타내고; d = 2'-데옥시 잔기이고; "s" 는 포스포로티오에이트 모이어티를 나타냄); 및
Figure pct00445
(여기서 소문자는 2'-OMe RNA 잔기를 나타내고; 대문자는 RNA 잔기를 나타내고; d = 2'-데옥시 잔기이고; "s" 는 포스포로티오에이트 모이어티를 나타냄); 및
Figure pct00446
(여기서 소문자는 2'-OMe RNA 잔기를 나타내고; 대문자는 2'-F RNA 잔기를 나타내고; d = 2'-데옥시 잔기이고; "s" 는 포스포로티오에이트 모이어티를 나타냄); 및
Figure pct00447
.
681. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아닌, 올리고뉴클레오티드 조성물:
682. d[ARCSARCSARCSARCSARC], d[CSCSCSCRCRCSCSCSCSC], d[CSCSCSCSCSCSCRCRCSC] 및 d[CSCSCSCSCSCRCRCSCSC] (여기서 R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결이고, S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결임).
683. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아닌, 올리고뉴클레오티드 조성물: GGARTSGRTSTR mCSTCGA, GGARTRGSTSTR mCRTCGA, GGASTSGRTRTS mCSTCGA (여기서 R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결이고, S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결이고, 모든 다른 연결은 PO 이고, 각각의 mC 는 5-메틸시토신 개질된 뉴클레오시드임).
684. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 TkTk mCkAGTmCATGAmCTkTmCk mCk 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아니고, 여기서 각각의 뉴클레오시드에 이어지는 아래첨자 'k' 는 (S)-cEt 개질을 나타내고, R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결이고, S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결이고, 각각의 mC 는 5-메틸시토신 개질된 뉴클레오시드이고, 모든 뉴클레오시드간 연결은 RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR 및 SSSSSSSSSS 로부터 선택되는 입체화학 패턴을 갖는 포스포로티오에이트 (PS) 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
685. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 TkTk mCk AGT m CATGA m CTTk mCk mCk 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드가 아니고, 여기서 각각의 뉴클레오시드에 이어지는 아래첨자 'k' 는 (S)-cEt 개질을 나타내고, R 은 Rp 포스포로티오에이트 연결이고, S 는 Sp 포스포로티오에이트 연결이고, 각각의 mC 는 5-메틸시토신 개질된 뉴클레오시드이고, 밑줄 그어진 코어 내 모든 뉴클레오시드간 연결은 RSSSRSRRRS, RSSSSSSSSS, SRRSRSSSSR, SRSRSSRSSR, RRRSSSRSSS, RRRSRSSRSR, RRSSSRSRSR, SRSSSRSSSS, SSRRSSRSRS, SSSSSSRRSS, RRRSSRRRSR, RRRRSSSSRS, SRRSRRRRRR, RSSRSSRRRR, RSRRSRRSRR, RRSRSSRSRS, SSRRRRRSRR, RSRRSRSSSR, RRSSRSRRRR, RRSRSRRSSS, RRSRSSSRRR, RSRRRRSRSR, SSRSSSRRRS, RSSRSRSRSR, RSRSRSSRSS, RRRSSRRSRS, SRRSSRRSRS, RRRRSRSRRR, SSSSRRRRSR, RRRRRRRRRR 및 SSSSSSSSSS 로부터 선택되는 입체화학 패턴을 갖는 포스포로티오에이트 (PS) 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
686. 구현예 684 또는 685 에 있어서, (S)-cEt 개질을 포함하는 각각의 뉴클레오티드의 각각의 포스포로티오에이트 모이어티가 스테레오랜덤인 뉴클레오티드 조성물.
687. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
688. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
689. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
690. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
691. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 6 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
692. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 7 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
693. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 8 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
694. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 9 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
695. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 10 개 이상의 천연 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
696. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 2 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
697. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
698. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 4 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
699. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 5 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
700. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 6 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
701. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 7 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
702. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 8 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
703. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 9 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
704. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 10 개 이상의 개질된 포스페이트 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
705. 구현예 696-704 중 어느 하나에 있어서, 각각의 개질된 포스페이트 연결이 포스포로티오에이트 연결인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
706. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 개질된 염기를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
707. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 개질된 염기를 포함하고, 여기서 개질된 염기는 치환된 A, T, C, U 또는 G 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
708. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티에서 각각의 염기 모이어티가 A, T, C, U, 5-MeC 및 G 로부터 독립적으로 선택되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
709. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 90:10 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
710. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 90:10 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
711. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 95:5 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
712. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 96:4 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
713. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 97:3 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
714. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 98:2 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
715. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 98:2 초과의 부분입체이성질체 선택성으로 형성되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
716. 구현예 710-715 중 어느 하나에 있어서, 키랄 뉴클레오티드간 연결 형성을 위한 부분입체이성질체 선택성이 키랄 뉴클레오티드간 연결 및 뉴클레오시드를 포함하는 이량체 올리고뉴클레오티드를 키랄의 양 측면에 형성시킴으로써 측정되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
717. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 염기 서열이 표 ES3 으로부터 선택되는 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
718. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 염기 서열이의 염기 서열이 표 ES1 로부터 선택되는 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
719. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 염기 서열이 표 1-4 로부터 선택되는 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
720. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 염기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
721. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 염기 서열이 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 또는 25 개의 핵염기를 포함하는 디스트로핀 프리-mRNA 에서의 서열에 상보적인 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
722. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드 조성물이, 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하고, 여기서 전사물은 프리-mRNA 이고, 스플라이싱 생성물은 mRNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
723. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 스플라이싱 생성물의 상대적 수준이 변경되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
724. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 스플라이싱 생성물의 수준이 증가되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
725. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 스플라이싱 생성물의 수준이 감소되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
726. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 수준 및/또는 활성이 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 감소되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
727. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 절단된 형태의 수준이 증가되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
728. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 절단된 형태의 수준이 감소되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
729. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 연장된 형태의 수준이 증가되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
730. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 연장된 형태의 수준이 감소되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
731. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 2 개 이상의 상이한 스플라이스 형태의 상대적 및/또는 절대적 수준이 변형되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
732. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열이 표적 전사물의 인트론에서 발견되는 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
733. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열이 표적 전사물의 인트론에서 발견되는 서열인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
734. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열이 표적 전사물의 엑손에서 발견되는 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
735. 구현예 1-732 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열이 표적 전사물의 엑손에서 발견되는 서열인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
736. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열이 표적 전사물의 스플라이싱 부위를 포함하는 서열이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
737. 구현예 1-732 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드의 공통 염기 서열이 표적 전사물의 스플라이싱 부위를 포함하는 서열인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
738. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 표적 전사물이 디스트로핀 프리-mRNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
739. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 표적 전사물이 디스트로핀 프리-mRNA 이고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 디스트로핀 프리-mRNA 의 스플라이싱 생성물의 수준을 증가시키고, 엑손이 스킵핑되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
740. 구현예 739 에 있어서, 엑손 51, 53, 45, 50, 44, 52, 55, 또는 8 이 스킵핑되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
741. 구현예 739 에 있어서, 엑손 51 이 스킵핑되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
742. 구현예 1-737 중 어느 하나에 있어서, 표적 전사물이 MSTN 프리-mRNA 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
743. 구현예 742 에 있어서, 표적 전사물이 MSTN 프리-mRNA 이고, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 MSTN 프리-mRNA 의 스플라이싱 생성물의 수준을 증가시키고, 엑손이 스킵핑되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
744. 구현예 743 에 있어서, MSTN 의 엑손 2 가 스킵핑되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
745. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 선결된 수준을 갖고, 하나 이상의 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 기준 조건이 상기 조성물의 부재인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
746. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 선결된 수준을 갖고, 하나 이상의 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결을 포함하며, 기준 조건이 상기 조성물의 부재 및 기준 조성물의 존재인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
747. 구현예 746 에 있어서, 기준 조성물이 기준 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하고, 여기서 기준 다수의 올리고뉴클레오티드는 단지 기준 다수의 올리고뉴클레오티드가 키랄 제어된 뉴클레오티드간 연결을 함유하지 않는다는 점에서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드와 상이한 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
748. 구현예 745-746 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
749. 구현예 745-746 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 키랄 제어된 것이고, 기준 조성물은 단지 기준 조성물이 키랄 제어되지 않는다는 점에서 상기 조성물과 상이한 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
750. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 표 1-4 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 염기 개질 패턴을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
751. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 표 1-4 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 당 개질 패턴을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
752. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 표 1-4 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결 개질 패턴을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
753. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 표 1-4 로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 뉴클레오티드간 연결 입체화학 패턴을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
754. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 지질을 추가로 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
755. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 지질을 추가로 포함하고, 여기서 적어도 하나의 지질은 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
756. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 하나 이상의 올리고뉴클레오티드가 하나 이상의 지질에 콘쥬게이트되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
757. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 각각의 올리고뉴클레오티드가 독립적으로 하나 이상의 지질에 콘쥬게이트되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
758. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드가 WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 또는 WV-3546 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
759. WV-887 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
760. WV-892 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
761. WV-896 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
762. WV-1714 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
763. WV-2444 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
764. WV-2445 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
765. WV-2526 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
766. WV-2527 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
767. WV-2528 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
768. WV-2530 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
769. WV-2531 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
770. WV-2578 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
771. WV-2580 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
772. WV-2587 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
773. WV-3047 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
774. WV-3152 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
775. WV-3472 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
776. WV-3473 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
777. WV-3507 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
778. WV-3508 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
779. WV-3509 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
780. WV-3510 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
781. WV-3511 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
782. WV-3512 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
783. WV-3513 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
784. WV-3514 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
785. WV-3515 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
786. WV-3545 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
787. WV-3546 의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
788. 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 및 WV-3546.
789. 올리고뉴클레오티드의 서열이 하기로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드의 서열을 포함하거나 이로 이루어진, 올리고뉴클레오티드의 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 포함하는 조성물: WV-887, WV-892, WV-896, WV-1714, WV-2444, WV-2445, WV-2526, WV-2527, WV-2528, WV-2530, WV-2531, WV-2578, WV-2580, WV-2587, WV-3047, WV-3152, WV-3472, WV-3473, WV-3507, WV-3508, WV-3509, WV-3510, WV-3511, WV-3512, WV-3513, WV-3514, WV-3515, WV-3545, 및 WV-3546.
790. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
791. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
792. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
793. 올리고뉴클레오티드의 서열 WV-1714 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
794. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
795. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
796. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
797. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
798. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
799. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
800. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
801. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
802. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
803. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
804. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
805. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
806. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
807. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
808. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
809. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
810. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
811. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
812. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
813. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
814. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
815. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
816. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
817. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3545 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
818. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3546 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
819. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
820. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
821. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열을 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
822. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
823. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
824. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
825. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
826. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
827. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
828. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
829. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
830. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
831. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
832. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
833. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
834. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
835. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
836. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
837. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
838. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
839. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
840. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
841. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
842. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
843. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
844. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
845. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
846. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3545 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
847. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3546 의 서열로 이루어진, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
848. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-887 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
849. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-892 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
850. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-896 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
851. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-1714 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
852. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2444 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
853. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2445 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
854. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2526 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
855. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2527 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
856. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2528 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
857. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2530 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
858. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2531 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
859. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2578 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
860. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2580 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
861. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-2587 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
862. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3047 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
863. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3152 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
864. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3472 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
865. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3473 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
866. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3507 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
867. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3508 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
868. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3509 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
869. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3510 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
870. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3511 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
871. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3512 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
872. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3513 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
873. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3514 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
874. 올리고뉴클레오티드의 서열이 WV-3515 의 서열을 포함하거나 이로 이루어지고, 조성물이 지질을 추가로 포함하는, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물.
875. 구현예 789-874 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드의 서열이 하기 중 임의의 하나 이상을 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물: 염기 서열 (길이 포함), 당 및 염기 모이어티에 대한 화학적 개질의 패턴, 백본 연결의 패턴 (예를 들어, 천연 포스페이트 연결, 포스포로티오에이트 연결, 포스포로티오에이트 트리에스테르 연결, 및 이들의 조합의 패턴), 백본 키랄 중심의 패턴 (예를 들어, 키랄 뉴클레오티드간 연결의 입체화학 (Rp/Sp) 의 패턴), 및 백본 인 개질의 패턴 (예를 들어, 뉴클레오티드간 인 원자 상의 개질의 패턴, 예컨대 -S-, 및 화학식 I 의 -L-R1).
876. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 조성물.
877. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된 C10-C80 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
878. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
879. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
880. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 조성물.
881. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된 C10-C60 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
882. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
883. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
884. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기를 포함하고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고, 각각의 변수는 독립적으로 본원에 정의되고 기재된 바와 같은 올리고뉴클레오티드 조성물.
885. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된 C10-C40 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
886. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 임의 치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
887. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
888. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 미치환된 C10-C80 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
889. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
890. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
891. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 미치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
892. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이하의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
893. 구현예 1-891 중 어느 하나에 있어서, 지질이 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
894. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 미치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
895. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이하의 임의 치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
896. 구현예 1-894 중 어느 하나에 있어서, 지질이 둘 이상의 임의 치환된 C10-C60 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
897. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
898. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하나 이상의 C1 -4 지방족기로 임의 치환된, C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
899. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 미치환된 C10-C40 선형, 포화 또는 부분 불포화, 지방족 사슬을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
900. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 구조 RLD-COOH 또는 RLD-OH 를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
901. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하기로 이루어진 군으로부터 선택되는 올리고뉴클레오티드 조성물: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일.
902. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되지 않는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
903. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
904. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
905. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되고, 여기서 링커는 -LLD- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
906. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되고, 여기서 링커는 -NH-(CH2)6- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
907. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되고, 여기서 링커는 -C(O)-NH-(CH2)6-P(O)(O-)- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
908. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 링커를 통해 올리고뉴클레오티드에 콘쥬게이트되고, 여기서 링커는 -C(O)-NH-(CH2)6-P(O)(S-)- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
909. 구현예 907 또는 908 에 있어서, 지질이 아미드기 -C(O)-NH- 의 형성을 통해 링커에 연결되는 지방산이고, 올리고뉴클레오티드가 링커의 -P(O)(O-)- 또는 -P(O)(S-)- 와 함께 이의 5'-OH 또는 3'-OH 사이의 포스페이트 또는 포스포로티오에이트 연결의 형성을 통해 링커에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
910. 구현예 907 또는 908 에 있어서, 지질이 아미드기 -C(O)-NH- 의 형성을 통해 링커에 연결되는 지방산이고, 올리고뉴클레오티드가 링커의 -P(O)(O-)- 또는 -P(O)(S-)- 와 함께 이의 5'-OH 사이의 포스페이트 또는 포스포로티오에이트 연결의 형성을 통해 링커에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
911. 구현예 907 또는 908 에 있어서, 지질이 아미드기 -C(O)-NH- 의 형성을 통해 링커에 연결되는 지방산이고, 올리고뉴클레오티드가 링커의 -P(O)(O-)- 또는 -P(O)(S-)- 와 함께 이의 3'-OH 사이의 포스페이트 또는 포스포로티오에이트 연결의 형성을 통해 링커에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
912. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 표적 구성성분을 추가로 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
913. 하기의 구조를 갖는 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물:
Ac-[-LLD-(RLD)a]b, 또는 [(Ac)a-LLD]b-RLD
[식 중,
Ac 는 올리고뉴클레오티드 사슬 ([H]b-Ac 는 올리고뉴클레오티드임) 이고;
a 는 1-1000 이고;
b 는 1-1000 이고;
각각의 LLD 는 독립적으로 링커 모이어티이고;
각각의 RLD 는 독립적으로 지질 모이어티 또는 표적 구성성분임].
914. 하기의 구조를 갖는 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물:
Ac-[-LLD-(RLD)a]b, 또는 [(Ac)a-LLD]b-RLD
[식 중,
Ac 는 올리고뉴클레오티드 사슬 ([H]b-Ac 는 올리고뉴클레오티드임) 이고;
a 는 1-1000 이고;
b 는 1-1000 이고;
각각의 LLD 는 독립적으로 공유 결합, 또는 임의 치환된, C1-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 TLD, 또는 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
각각의 RLD 는 독립적으로 임의 치환된, C1-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
TLD 는:
Figure pct00448
의 구조를 갖고;
W 는 O, S 또는 Se 이고;
X, Y 및 Z 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, -N(-L-R1)-, 또는 L 이고;
L 은 공유 결합, 또는 임의 치환된, 선형 또는 분지형 C1-C10 알킬렌이고, 여기서 L 의 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
R1 은 할로겐, R, 또는 임의 치환된 C1-C50 지방족이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되고;
각각의 R' 는 독립적으로 -R-, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나: 또는
2 개의 R' 는 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리를 형성하고;
-Cy- 는 페닐렌, 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리이고;
각각의 R 은 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 카르보시클릴, 아릴, 헤테로아릴 및 헤테로시클릴로부터 선택되는 임의 치환된 기임].
915. 구현예 1-912 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 구현예 913-914 중 어느 하나의 조성물인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
916. 구현예 913-915 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드가 Ac-[-LLD-(RLD)a]b 의 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
917. 구현예 913-915 중 어느 하나에 있어서, 올리고뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드가 [(Ac)a-LLD]b-RLD 의 구조를 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
918. 구현예 913-917 중 어느 하나에 있어서, LLD, RLD, LLD 및 RLD 의 조합, 또는 -[-LLD-(RLD)a]b 가 하나 이상의 지질 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
919. 구현예 913-917 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가 하나 이상의 지질 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
920. 구현예 913-918 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 하나 이상의 지질 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
921. 구현예 913-917 중 어느 하나에 있어서, LLD, RLD, LLD 및 RLD 의 조합, 또는 -[-LLD-(RLD)a]b 가 하나 이상의 표적 구성성분을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
922. 구현예 913-917 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가 하나 이상의 표적 구성성분을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
923. 구현예 913-918 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 하나 이상의 표적 구성성분을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
924. 구현예 913-923 중 어느 하나에 있어서, b 가 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
925. 구현예 913-924 중 어느 하나에 있어서, a 가 1 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
926. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 하나 이상의 개질된 염기, 당, 또는 뉴클레오티드간 연결 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
927. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
928. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 하나 이상의 키랄 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, Ac 의 각각의 키랄 뉴클레오티드간 연결이 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
929. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac-[-LLD-(RLD)a]b, 또는 [(Ac)a-LLD]b-RLD 의 구조를 갖는 올리고뉴클레오티드가, Ac 의 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는 특정 유형을 갖는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
930. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드 사슬인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
931. 구현예 913-929 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 핵염기를 통해 LLD 에 연결되는, 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
932. 구현예 913-929 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 뉴클레오티드간 연결을 통해 LLD 에 연결되는, 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
933. 구현예 913-929 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 당 모이어티를 통해 LLD 에 연결되는, 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
934. 구현예 913-929 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 당 모이어티의 히드록실기 (-O-) 를 통해 LLD 에 연결되는, 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
935. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 이의 5'-O- 를 통해 LLD 에 연결되는, 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
936. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 임의의 표에 기재된 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
937. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-887 인 ([H]b-Ac 가 WV-887 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
938. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-892 인 ([H]b-Ac 가 WV-892 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
939. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-896 인 ([H]b-Ac 가 WV-896 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
940. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-1714 인 ([H]b-Ac 가 WV-1714 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
941. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2444 인 ([H]b-Ac 가 WV-2444 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
942. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2445 인 ([H]b-Ac 가 WV-2445 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
943. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2526 인 ([H]b-Ac 가 WV-2526 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
944. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2527 인 ([H]b-Ac 가 WV-2527 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
945. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2528 인 ([H]b-Ac 가 WV-2528 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
946. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2530 인 ([H]b-Ac 가 WV-2530 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
947. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2531 인 ([H]b-Ac 가 WV-2531 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
948. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2578 인 ([H]b-Ac 가 WV-2578 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
949. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2580 인 ([H]b-Ac 가 WV-2580 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
950. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-2587 인 ([H]b-Ac 가 WV-2587 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
951. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3047 인 ([H]b-Ac 가 WV-3047 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
952. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3152 인 ([H]b-Ac 가 WV-3152 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
953. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3472 인 ([H]b-Ac 가 WV-3472 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
954. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3473 인 ([H]b-Ac 가 WV-3473 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
955. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3507 인 ([H]b-Ac 가 WV-3507 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
956. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3508 인 ([H]b-Ac 가 WV-3508 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
957. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3509 인 ([H]b-Ac 가 WV-3509 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
958. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3510 인 ([H]b-Ac 가 WV-3510 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
959. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3511 인 ([H]b-Ac 가 WV-3511 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
960. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3512 인 ([H]b-Ac 가 WV-3512 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
961. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3513 인 ([H]b-Ac 가 WV-3513 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
962. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3514 인 ([H]b-Ac 가 WV-3514 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
963. 구현예 913-925 중 어느 하나에 있어서, Ac 가 LLD 및 RLD 에 연결된 WV-3515 인 ([H]b-Ac 가 WV-3515 임), 올리고뉴클레오티드 조성물.
964. 구현예 913-963 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 임의 치환된, C1-C10 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기, 또는 TLD 로 대체되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
965. 구현예 913-963 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 임의 치환된, C1-C10 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -Cy-, -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기, 또는 TLD 로 대체되고, 여기서 W 는 O 또는 S 이고, Y 및 Z 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, 또는 -L- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
966. 구현예 913-963 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 임의 치환된, C1-C10 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, -Cy-, -O-, -S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기, 또는 TLD 로 대체되고, 여기서 W 는 O 또는 S 이고, X 및 Y 는 각각 독립적으로 -O-, -S-, 또는 -L- 이고, Z 는 공유 결합인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
967. 구현예 913-965 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 Ac 의 히드록실기에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
968. 구현예 913-965 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 Ac 의 5'-OH 에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
969. 구현예 913-965 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 Ac 의 3'-OH 에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
970. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 R' 가 독립적으로 -R, -C(O)R, -CO2R, 또는 -SO2R 이거나; 또는
2 개의 R' 가 그 개입 원자와 함께 취해져 임의 치환된 C3-C14 모노시클릭, 바이시클릭 또는 폴리시클릭 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리 (0-10 개의 헤테로원자를 가짐) 를 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
971. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, -Cy- 가 C3-C14 모노시클릭, 바이시클릭 또는 폴리시클릭 카르보시클릴렌, 아릴렌, 헤테로아릴렌 및 헤테로시클릴렌 (0-10 개의 헤테로원자를 가짐) 으로부터 선택되는 임의 치환된 2가 고리인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
972. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 각각의 R 이 독립적으로 수소, 또는 C1-C6 지방족, 및 C3-C14 모노시클릭, 바이시클릭 또는 폴리시클릭 아릴, 카르보시클릭, 헤테로시클릭 또는 헤테로아릴 고리 (0-10 개의 헤테로원자를 가짐) 로부터 선택되는 임의 치환된 기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
973. 구현예 913-965 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 TLD 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
974. 구현예 913-965 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 -NH-(CH2)6-TLD- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
975. 구현예 913-965 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 -C(O)-NH-(CH2)6-TLD- 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
976. 구현예 975 에 있어서, -C(O)- 가 -RLD 에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
977. 구현예 913-976 중 어느 하나에 있어서, TLD 가 Ac 의 5'-O- 또는 3'-O- 에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
978. 구현예 913-977 중 어느 하나에 있어서, TLD 가 Ac 의 5'-O- 에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
979. 구현예 913-977 중 어느 하나에 있어서, TLD 가 Ac 의 3'-O- 에 연결되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
980. 구현예 913-979 중 어느 하나에 있어서, TLD 가 Ac 의 5'-O- 또는 3'-O- 와 함께 포스포로티오에이트 연결을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
981. 구현예 980 에 있어서, 포스포로티오에이트 연결이 키랄 제어된 것이고, Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
982. 구현예 980 에 있어서, 포스포로티오에이트 연결이 키랄 제어된 것이고, Rp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
983. 구현예 913-979 중 어느 하나에 있어서, TLD 가 Ac 의 5'-O- 또는 3'-O- 와 함께 포스페이트 연결을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
984. 구현예 913-963 중 어느 하나에 있어서, LLD 가 공유 결합인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
985. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 C1-C6 알킬렌, C1-C6 알케닐렌, -C≡C-, C1-C6 헤테로지방족 모이어티, -C(R')2-, -Cy-, -O-, -S-, -S-S-, -N(R')-, -C(O)-, -C(S)-, -C(NR')-, -C(O)N(R')-, -N(R')C(O)N(R')-, -N(R')C(O)-, -N(R')C(O)O-, -OC(O)N(R')-, -S(O)-, -S(O)2-, -S(O)2N(R')-, -N(R')S(O)2-, -SC(O)-, -C(O)S-, -OC(O)- 및 -C(O)O- 로부터 선택되는 임의 치환된 기로 대체되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
986. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -C(O)- 로 대체되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
987. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -C(O)- 로 대체되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
988. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기이고, 여기서 하나 이상의 메틸렌 단위는 임의로 및 독립적으로 -C(O)- 로 대체되는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
989. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30 개 또는 그 이상의 탄소 원자를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
990. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 RLD 가 표적 구성성분이거나 이를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
991. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 RLD 가 표적 구성성분인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
992. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 RLD 가 지질 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
993. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 적어도 하나의 RLD 가 지질 모이어티인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
994. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C80 포화 또는 부분 불포화 지방족기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
995. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C60 포화 또는 부분 불포화 지방족기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
996. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 임의 치환된, C10-C40 포화 또는 부분 불포화 지방족기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
997. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 미치환된 선형 또는 분지형 C10-C80 지방족기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
998. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 미치환된 선형 또는 분지형 C10-C60 지방족기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
999. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 미치환된 선형 또는 분지형 C10-C40 지방족기인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1000. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 팔미틸인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1001. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00449
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1002. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 라우릴인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1003. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 미리스틸인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1004. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가 스테아릴인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1005. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00450
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1006. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00451
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1007. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00452
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1008. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00453
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1009. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00454
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1010. 구현예 913-999 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00455
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1011. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00456
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1012. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00457
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1013. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00458
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1014. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00459
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1015. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00460
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1016. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00461
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1017. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00462
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1018. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00463
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1019. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00464
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1020. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00465
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1021. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00466
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1022. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00467
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1023. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00468
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1024. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00469
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1025. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00470
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1026. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00471
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1027. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00472
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1028. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00473
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1029. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00474
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1030. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00475
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1031. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00476
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1032. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00477
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1033. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00478
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1034. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00479
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1035. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00480
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1036. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00481
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1037. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00482
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1038. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00483
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1039. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00484
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1040. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00485
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1041. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00486
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1042. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00487
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1043. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00488
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1044. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00489
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1045. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00490
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1046. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00491
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1047. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00492
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1048. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00493
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1049. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00494
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1050. 구현예 913-993 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00495
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1051. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00496
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1052. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00497
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1053. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00498
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1054. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00499
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1055. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00500
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1056. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00501
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1057. 구현예 913-985 및 990-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00502
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1058. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00503
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1059. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00504
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1060. 구현예 913-985 및 990-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00505
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1061. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00506
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1062. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00507
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1063. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00508
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1064. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00509
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1065. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, RLD 가
Figure pct00510
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1066. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00511
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1067. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00512
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1068. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00513
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1069. 구현예 913-991 중 어느 하나에 있어서, -[-LLD-(RLD)a]b 가
Figure pct00514
인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1070. 구현예 1021-1050 및 1062-1069 중 어느 하나에 있어서, X 가 O 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1071. 구현예 1021-1050 및 1062-1069 중 어느 하나에 있어서, X 가 S 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1072. 구현예 1070 에 있어서, -O-P(O)(X-)- 가 Ac 의 5'-O- 에 연결되어 포스페이트 연결을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1073. 구현예 1070 에 있어서, -O-P(O)(X-)- 가 Ac 의 3'-O- 에 연결되어 포스페이트 연결을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1074. 구현예 1071 에 있어서, -O-P(O)(X-)- 가 Ac 의 5'-O- 에 연결되어 포스포로티오에이트 연결을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1075. 구현예 1071 에 있어서, -O-P(O)(X-)- 가 Ac 의 3'-O- 에 연결되어 포스포로티오에이트 연결을 형성하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1076. 구현예 1074 또는 1075 에 있어서, 포스포로티오에이트 연결이 키랄 제어된 것인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1077. 구현예 1074 또는 1075 에 있어서, 포스포로티오에이트 연결이 키랄 제어된 것이고, Sp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1078. 구현예 1074 또는 1075 에 있어서, 포스포로티오에이트 연결이 키랄 제어된 것이고, Rp 인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1079. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의, 적어도 0.5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 가, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1080. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 10% 이상이, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1081. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의, 적어도 0.5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 가, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1082. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 10% 이상이, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1083. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의, 적어도 0.5%, 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 가, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1084. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 1) 염기 서열; 2) 백본 연결의 패턴; 3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및 4) 백본 인 개질의 패턴에 의해 정의되는, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 10% 이상이, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1085. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 약학적으로 허용 가능한 염을 포함하는 약학적 조성물인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1086. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 올리고뉴클레오티드의 하나 이상의 약학적으로 허용 가능한 소듐 염을 포함하는 약학적 조성물인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1087. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 하나 이상의 다른 치료제를 추가로 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1088. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 하나 이상의 유트로핀 조절제를 추가로 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1089. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 조성물이 에주트로미드를 추가로 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1090. 상기 구현예 중 어느 하나의 조성물을 투여하는 것을 포함하는, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법으로서, 여기서 표적 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건과 비교하여 변경되는 방법.
1091. 표적 전사물로부터 한 세트의 스플라이싱된 생성물을 생성하는 방법으로서,
상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 생성된 세트와 상이한 한 세트의 스플라이싱된 생성물을 생성시키는데 충분한 양으로, 시간 동안, 및 조건 하에서, 표적 전사물을 함유하는 스플라이싱 시스템을, 상기 구현예 중 하나의 올리고뉴클레오티드 조성물과 접촉시키는 단계를 포함하는 방법.
1092. 상기 구현예 중 어느 하나의 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 질환을 치료하는 방법.
1093. 구현예 1092 에 있어서, 질환이 표 ES3 으로부터 선택되는 방법.
1094. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 질환이 듀켄 근이영양증인 방법.
1095. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 질환이 듀켄 근이영양증이고, 디스트로핀의 하나 이상의 엑손이 스킵핑되는 방법.
1096. 구현예 1092 에 있어서, 질환이 듀켄 근이영양증이고, MSTN 의 하나 이상의 엑손이 스킵핑되는 방법.
1097. 구현예 1095-1096 에 있어서, 질환이 듀켄 근이영양증이고, 디스트로핀의 엑손 51, 53, 45, 50, 44, 52, 55 및 8 중 하나 이상이 스킵핑되는 방법.
1098. 구현예 1095-1096 에 있어서, 질환이 듀켄 근이영양증이고, 디스트로핀의 엑손 51 이 스킵핑되는 방법.
1099. 구현예 1095-1096 에 있어서, 질환이 듀켄 근이영양증이고, MSTN 의 엑손 2 가 스킵핑되는 방법.
1100. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 유트로핀 조절을 포함하는 방법.
1101. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 유트로핀 조절제의 제공 및/또는 투여를 포함하는 방법.
1102. 구현예 1101 에 있어서, 유트로핀 조절제가 에주트로미드인 방법.
1103. 뉴클레오티드 서열이 표적 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 공통 염기 서열을 공유하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물을 투여함으로써 질환을 치료하는 방법에서,
개선은, 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 올리고뉴클레오티드 조성물로서 사용하는 것을 포함하는 것인 방법.
1104. 뉴클레오티드 서열이 표적 전사물에서 표적 서열에 상보적인, 공통 염기 서열을 공유하는 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는, 상기 구현예 중 어느 하나의 올리고뉴클레오티드 조성물과 전사물을 접촉시킴으로써 특정 표적 전사물의 전사물 스플라이싱을 변경하는 방법에서,
개선은, 전사물 스플라이싱 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 올리고뉴클레오티드 조성물로서 사용하는 것을 포함하는 것인 방법.
1105. 구현예 1103 또는 1104 에 있어서, 공통 염기 서열이 표 ES1 로부터 선택되는 서열을 포함하는 방법.
1106. 구현예 1103 또는 1104 에 있어서, 공통 염기 서열이 표 ES1 로부터 선택되는 서열인 방법.
1107. 구현예 1103 또는 1104 에 있어서, 공통 염기 서열이 표 1-4 로부터 선택되는 서열인 방법.
1108. 구현예 1103 또는 1104 에 있어서, 공통 염기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 인 방법.
1109. 구현예 1103 또는 1104 에 있어서, 공통 염기 서열이 CTCCAACATCAAGGAAGATGGCATTTCTAG 인 방법.
1110. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 개선이, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는데 필적한 효과를 갖는 다른 비교 가능한 스테레오랜덤 기준 올리고뉴클레오티드 조성물의 투여량 및/또는 빈도보다 낮은 투여량 및/또는 빈도로 입체제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는 것인 방법.
1111. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 조성물이 다른 비교 가능한 스테레오랜덤 기준 올리고뉴클레오티드 조성물로의 비슷한 투여량과 비교하여 감소된 부작용을 나타내는 방법.
1112. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물이 프리-mRNA 이고, 스플라이싱 생성물이 mRNA 인 방법.
1113. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 스플라이싱 생성물의 상대적 수준이 변경되는 방법.
1114. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 스플라이싱 생성물의 수준이 증가되는 방법.
1115. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 스플라이싱 생성물의 수준이 감소되는 방법.
1116. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 전사물에 의해 인코딩된 수준 및/또는 활성이 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 감소되는 방법.
1117. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 엑손이 스킵되어, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 절단된 형태의 수준이 증가되는 방법.
1118. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 엑손이 스킵되어, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 절단된 형태의 수준이 감소되는 방법.
1119. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 엑손이 스킵되어, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 연장된 형태의 수준이 증가되는 방법.
1120. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 하나 이상의 엑손이 스킵되어, 전사물에 의해 인코딩된 폴리펩티드의 연장된 형태의 수준이 감소되는 방법.
1121. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 스킵된 엑손이 하나 이상의 조기 종결 코돈을 포함하는 방법.
1122. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 스킵된 엑손이 프레임시프트 돌연변이를 포함하는 방법.
1123. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 스킵된 엑손이 돌연변이를 포함하지 않는 방법.
1124. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 변경된 스플라이싱이 보다 적게 확장된 반복을 갖는 mRNA 의 수준을 증가시키는 것을 포함하는 방법.
1125. 구현예 1114 에 있어서, 표적 전사물이 표 ES2 로부터 선택되는 전사물이고/이거나, 질환이 표 ES2 로부터 선택되는 질환인 방법.
1126. 구현예 1114 에 있어서, 표적 전사물이 디스트로핀의 전사물인 방법.
1127. 올리고뉴클레오티드 조성물을 규명 및/또는 특징분석하는 방법으로서,
상기 구현예 중 어느 하나의 적어도 하나의 조성물을 제공하는 단계;
기준 조성물과 비교하여 전사물의 스플라이싱 패턴을 평가하는 단계
를 포함하는 방법.
1128. 선택된 표적 서열에 대한 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서,
각각 표적 서열에 상보적인 염기 서열을 갖는, 상기 구현예 중 어느 하나의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 제조하는것을 포함하는 방법.
1129. 올리고뉴클레오티드를 하나 이상의 지질에 콘쥬게이션하는 것을 포함하는, hTLR9 아고니스트 활성을 감소시키는 방법.
1130. 올리고뉴클레오티드를 하나 이상의 지질에 콘쥬게이션하는 것을 포함하는, hTLR9 안타고니스트 활성을 증가시키는 방법.
1131. 구현예 1129 또는 1130 에 있어서, 콘쥬게이션이 구현예 913-1089 중 어느 하나의 조성물 또는, 이에 기재된 올리고뉴클레오티드를 제공하는 방법.
1132. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1133. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1134. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1135. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1136. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1137. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1138. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1139. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1140. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1141. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1142. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1143. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1144. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1145. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 3 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1146. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1147. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1148. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1149. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 5 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1150. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 6 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1151. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 6 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1152. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1153. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1154. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 3 개 이상의 연속적인 2'-F, 3'-말단에서 3 개 이상의 연속적인 2'-F, 및 5'-말단 2'-F 및 3'-말단 2'-F 개질 사이에 3 개 이상의 2'-OR 을 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1155. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 3 개 이상의 2'-F, 3'-말단에서 3 개 이상의 2'-F, 및 5'-말단 2'-F 및 3'-말단 2'-F 개질 사이에 3 개 이상의 2'-OR 을 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1156. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 5 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1157. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-말단에서 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1158. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 7 개 이상의 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1159. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 10 개의 뉴클레오티드 내에 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1160. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 3'-말단에서 7 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 당 개질의 공통 패턴을 공유하는 조성물 또는 방법.
1161. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-윙-코어-윙-3' 구조를 포함하며, 여기서 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 내지 10 개의 뉴클레오시드를 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 3 내지 10 개의 뉴클레오시드를 포함하는 조성물 또는 방법.
1162. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 다수의 올리고뉴클레오티드가 5'-윙-코어-3' 또는 5'-코어-윙-3' 구조를 포함하고, 여기서 각각의 윙 영역은 독립적으로 3 내지 10 개의 뉴클레오시드를 포함하고, 코어 영역은 독립적으로 3 내지 10 개의 뉴클레오시드를 포함하는 조성물 또는 방법.
1163. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1164. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 3 개 이상의 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1165. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 5 개 이상의 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1166. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 개 또는 그 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1167. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 3 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1168. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 5 개 이상의 연속적인 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1169. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 5'-윙 영역이 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 그 이상의 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1170. 상기 구현예 중 어느 하나의, 5'-윙 영역의 각각의 당이 2'-F 를 포함하는 조성물 또는 방법.
1171. 상기 구현예 중 어느 하나에 있어서, 지질이 하기로 이루어진 군으로부터 선택되는 조성물 또는 방법: 라우르산, 미리스트산, 팔미트산, 스테아르산, 올레산, 리놀레산, 알파-리놀렌산, 감마-리놀렌산, 도코사헥사엔산 (시스-DHA), 투르비나르산 및 디리놀레일.
1172. 상기 구현예 중 어느 하나에 기재된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 염.
1173. 상기 표 중 어느 하나에 기재된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 염.
1174. 표 4 에 기재된 올리고뉴클레오티드 또는 이의 염.
1175. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-887 인, 올리고뉴클레오티드.
1176. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-892 인, 올리고뉴클레오티드.
1177. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-896 인, 올리고뉴클레오티드.
1178. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-1714 인, 올리고뉴클레오티드.
1179. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2444 인, 올리고뉴클레오티드.
1180. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2445 인, 올리고뉴클레오티드.
1181. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2526 인, 올리고뉴클레오티드.
1182. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2527 인, 올리고뉴클레오티드.
1183. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2528 인, 올리고뉴클레오티드.
1184. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2530 인, 올리고뉴클레오티드.
1185. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2531 인, 올리고뉴클레오티드.
1186. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2578 인, 올리고뉴클레오티드.
1187. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2580 인, 올리고뉴클레오티드.
1188. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-2587 인, 올리고뉴클레오티드.
1189. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3047 인, 올리고뉴클레오티드.
1190. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3152 인, 올리고뉴클레오티드.
1191. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3472 인, 올리고뉴클레오티드.
1192. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3473 인, 올리고뉴클레오티드.
1193. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3507 인, 올리고뉴클레오티드.
1194. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3508 인, 올리고뉴클레오티드.
1195. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3509 인, 올리고뉴클레오티드.
1196. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3510 인, 올리고뉴클레오티드.
1197. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3511 인, 올리고뉴클레오티드.
1198. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3512 인, 올리고뉴클레오티드.
1199. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3513 인, 올리고뉴클레오티드.
1200. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3514 인, 올리고뉴클레오티드.
1201. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3515 인, 올리고뉴클레오티드.
1202. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3545 인, 올리고뉴클레오티드.
1203. 구현예 1173 또는 1174 에 있어서, 올리고뉴클레오티드가 WV-3546 인, 올리고뉴클레오티드.
1204. 구현예 1172-1204 중 어느 하나에 있어서, 염이 소듐 염인, 올리고뉴클레오티드.
1205. 구현예 1172-1204 중 어느 하나에 있어서, 염이 암모늄 염인, 올리고뉴클레오티드.
1206. 구현예 1172-1206 중 어느 하나에 있어서, 염이 2 개 이상의 양이온을 포함하는, 올리고뉴클레오티드.
1207. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00515
.
1208. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00516
.
1209. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00517
.
1210. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00518
.
1211. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00519
,
Figure pct00520
,
Figure pct00521
.
1212. 올리고뉴클레오티드와 하기의 콘쥬게이트인 화합물 및 또는 이의 염:
Figure pct00522
.
1213. 하기를 포함하는 올리고뉴클레오티드인 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00523
.
1214. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00524
.
1215. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00525
.
1216. 하기의 구조를 갖는 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00526
.
1217. 올리고뉴클레오티드와 하기의 콘쥬게이트인 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00527
.
1218. 올리고뉴클레오티드와 하기의 콘쥬게이트인 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00528
.
1219. 하기를 포함하는 올리고뉴클레오티드인 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00529
.
1220. 하기를 포함하는 올리고뉴클레오티드인 화합물 또는 이의 염:
Figure pct00530
.
1221. 구현예 1175-1220 중 어느 하나에 있어서, 화합물이 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 97% 또는 99% 의 순도를 갖는 화합물.
1222. 구현예 1175-1221 중 어느 하나에 있어서, 화합물이 90% 이상의 순도를 갖는 화합물.
1223. 구현예 1175-1222 중 어느 하나의 화합물을 포함하는 조성물.
예증
전술한 내용은 본 개시의 특정한 비제한적인 구현예에 대한 것이었다. 따라서, 본원에 기재된 본 개시의 구현예가 본 개시의 원리의 적용의 단지 예시인 것으로 이해되어야 한다. 예시된 구현예의 상세한 설명에 대한 본원의 참조는 특허청구범위를 제한하고자 의도된 것이 아니다.
제공된 올리고뉴클레오티드 및 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법은 당업계에 널리 공지되어 있으며, 비제한적으로, WO/2010/064146, WO/2011/005761, WO/2013/012758, WO/2014/010250, US2013/0178612, WO/2014/012081 및 WO/2015/107425 에 기재된 것들을 포함하며, 이들 각각의 방법 및 시약은 본원에 참조로서 인용된다. 본 출원인은 제공된 올리고뉴클레오티드의 제조를 위한 예시적인 방법을 기재한다.
본 개시의 이러한 및 다른 구현예의 기능 및 이점은 하기 기재되는 실시예로부터 더욱 완전히 이해될 것이다. 하기 실시예는 본 개시의 전체 범위를 예시하지는 않으나, 본 개시의 이점을 예시하는 것으로 의도된다.
실시예 1. 링커의 제조 예.
일부 구현예에서, SP 링커를 하기 반응식에 따라 제조하였다:
Figure pct00531
실시예 2. 올리고뉴클레오티드 및 조성물의 제조 방법 예.
약어
AMA: conc. NH3 - H2O 중 40% MeNH2 (1:1, v/v)
CMIMT: N-시아노메틸이미다졸륨 트리플레이트
DBU: 1,8-디아자바이시클로[5.4.0]운데크-7-엔
DCA: 디클로로아세트산
DCM: 디클로로메탄, CH2Cl2
DMTr: 4,4'-디메톡시트리틸
DVB: 디비닐벤젠
HCP: 고도로 가교된 폴리스티렌 (50% DVB 함유함, 비팽윤성 폴리스티렌)
MeIm: N-메틸이미다졸
MQ: "Milli-Q Reference" 로부터 입수한 물
PhIMT: N-페닐이미다졸륨 트리플레이트
POS: 3-페닐-1,2,4-디티아졸린-5-온
PS200: 프라이머 지지체 200, GE Healthcare 로부터 상업적으로 입수 가능함
PS5G: 프라이머 지지체 5G, GE Healthcare 로부터 상업적으로 입수 가능함
TBAF: 테트라부틸암모늄 플루오라이드
TBHP: tert-부틸히드로퍼옥시드
TEAA: 트리에틸암모늄 아세테이트
키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 합성을 위한 일반 절차 (1 μ mol 규모):
각종 유형의 고체 지지체 (다양한 뉴클레오시드 로딩을 포함함), 링커, 활성제 등을 사용할 수 있다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 HCP 이다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 PS5G 이다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 PS200 이다. 일부 구현예에서, 고체 지지체는 CPG 이다. 일부 구현예에서, DPSE-유형의 화학을 사용하여 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물을 제조하는 동안, SP-링커를 사용하였다. 일부 구현예에서, CMIMT 를 사용하였다.
올리고뉴클레오티드의 합성을 위한 절차의 예 (1 μmol 규모) 를 하기에 기재한다.
일부 구현예에서, 올리고뉴클레오티드의 자동화 고체상 합성을 하기 제시되는 사이클에 따라 HCP 폴리스티렌 고체 지지체 상에서 수행하였다. 합성 후, 수지를, 예를 들어, MeCN 중의 0.1M TBAF (1 mL) 로 실온에서 2 h 동안 (통상적으로 30 min 이면 충분함) 처리하고, MeCN 으로 세정하고, 건조시키고, AMA (1 mL) 를 45 ℃ 에서 30 min 동안 첨가하였다. 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 수지를 멤브레인 여과에 의해 제거하였다. 여과액을 약 1 mL 가 될 때까지 감압 하에서 농축시켰다. 잔류물을 1 mL 의 H2O 로 희석하고, AEX-HPLC 및 RP-UPLC-MS 로 분석하였다.
Figure pct00532
* 단량체는 이소-부티로니트릴 중에 용해시킴
분석 조건의 예:
1) RP-UPLC-MS
※ 시스템: Waters, Aquity UPLC I-Class, Xevo G2-Tof
※ 컬럼: Waters, BEH C18, 1.7 ㎛, 2.1 x 150 mm
※ 온도 & 유량: 55 ℃, 0.3 mL/min
※ 완충액: A: 0.1M TEAA; B: MeCN
※ 구배: %B: 1-30% / 30 min
2) AEX-HPLC
※ 시스템: Waters, Alliance e2695
※ 컬럼: Thermo, DNAPac PA-200, 4 x 250 mm
※ 온도 & 유량: 50 ℃, 1 mL/min
※ 완충액: A: 20mM NaOH; B: A + 1M NaClO4
※ 구배: %B: 10-50% / 30 min
올리고뉴클레오티드의 정제 절차의 예 (1 μmol 규모): 일부 구현예에서, 미정제 올리고를 하기 예시 조건에 따라 AEX-MPLC 로 정제하였다.
※ 시스템: AKTA Purifier-10
※ 컬럼: TOHSOH, DNA STAT, 4.6 x 100 mm
※ 온도 & 유량: 60 ℃, 0.5 mL/min
※ 완충액: A: 20mM Tris-HCl (pH 9.0) + 20% MeCN, B: A + 1.5M NaCl
※ 구배: %B: 20-70% / 25CV (2%/CV)
모든 분획을 분석용 AEX-HPLC 로 분석하고, 80% 초과의 순도의 키랄 올리고를 함유하는 분획을 하기 조건을 사용하여 Sep-Pak Plus tC18 (WAT036800) 로 보정 및 탈염화하였다:
1. 15 mL 의 MeCN 을 이용한 Sep-Pak Plus 의 컨디셔닝.
2. 15 mL 의 50% MeCN/MQ 를 이용한 카트리지 헹굼.
3. 30 mL 의 MQ 를 이용한 카트리지 평형화.
4. 샘플 로딩, 및 40 mL 의 MQ 로의 세정.
5. 10 mL 의 50% MeCN/MQ 를 이용한 키랄 올리고의 용리.
용리된 샘플을 감압 하에서 증발시켜 MeCN 을 제거하고, 동결건조시켰다. 생성물을 MQ (1 mL) 중에 용해시키고, 0.2 ㎛ 메쉬 시린지 필터로 여과하고, 분석하였다. UV 흡광도에 의한 수율 산출 후, 제제를 다시 동결건조시켰다.
일부 구현예에서, 이소-부티로니트릴 (또한 이소부티로니트릴, 2-메틸프로판니트릴, 2-메틸프로피오니트릴, 이소프로필 시아니드, 또는 IBN 로서 공지됨) 을, 예를 들어 키랄 포스포라미다이트를 용해시키기 위한 용매 또는 보조용매로서, 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법에 사용할 수 있다. 일부 구현예에서, 용매는 IBN 이거나 이를 포함한다. 일부 구현예에서, 용매는 IBN 및 ACN (아세토니트릴) 을 포함한다. 일부 구현예에서, 용매는 IBN 및 ACN 의 혼합물이다. 일부 구현예에서, IBN 의 특성은 (예를 들어, 또한 ACN 로서 공지된 아세토니트릴과 비교하여) 합성 사이클의 커플링 단계 동안 개선된 용해도 및/또는 증강된 반응성을 제공할 수 있다. 일부 구현예에서, 이러한 개선은, 아미다이트 용해에 요구되는 온도를, MeCN 에서의 용해도를 수득하는데 요구되는 것과 비교하여 보다 낮은 온도로 가능하게 할 뿐만 아니라, 다양한 IBN 용액 농도를 가능하게 하고, 아마도 보다 짧은 커플링 시간, 보다 효율적인 커플링, 및 보다 적게 생성된 폐기물을 유도할 수 있다. 일부 구현예에서, 합성 사이클의 커플링 단계는 이소-부티로니트릴및 아세토니트릴의 혼합물에서 수행될 수 있다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서, 이소-부티로니트릴을 포함하는 용매 중에 용해시킨 키랄 포스포라미다이트와, 뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드를 커플링시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서, 이소-부티로니트릴을 포함하는 용매 중의 키랄 포스포라미다이트와, 뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드를 커플링시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서, 이소-부티로니트릴 및 아세토니트릴을 포함하는 용매 중의 키랄 포스포라미다이트와, 뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드를 커플링시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 각종 구현예에서, 키랄 포스포라미다이트를 R-CN (여기서 R 은 임의로 알킬, 치환된 알킬, 시클로알킬 또는 아릴임) 의 구조를 갖는 화합물을 포함하는 용매 중에 용해시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 화학식 R-CN 의 화합물은 부티로니트릴, 프로피오니트릴, 발레로니트릴, 또는 헵틸 시아니드로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서, 화학식 R-CN 의 화합물을 포함하는 용매 중에 용해시킨 키랄 포스포라미다이트와, 뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드를 커플링시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 일부 구현예에서, 본 개시는 키랄 제어된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조 방법으로서, 화학식 R-CN 의 화합물을 하나 이상 포함하는 용매 중의 키랄 포스포라미다이트와, 뉴클레오티드 또는 올리고뉴클레오티드를 커플링시키는 단계를 포함하는 방법을 제공한다. 각종 구현예에서, 뉴클레오티드는 개질 또는 비개질된 것이다.
방법, 조건 및 시약의 예는, 예를 들어, JP 2002-33436, WO2005/092909, WO2010/064146, WO2012/039448, WO2011/108682, WO2014/010250, WO2014/010780, WO2014/012081, WO/2015/107425 등에 기재되어 있고, 이는 제공된 올리고뉴클레오티드 및/또는 조성물의 제조에 유용할 수 있다.
제공된 조성물은, 무엇보다도, 개선된 안정성 및 활성을 포함하는 개선된 특성을 나타내었다. 예를 들어, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 증가된 절단 속도, 증가된 선택성, 증강된 절단 패턴, 변경된 전사물의 스플라이싱 등을 제공하였다.
실시예 3. 제공된 조성물 및 방법은 스플라이싱을 변경시킴.
제공된 조성물은, 무엇보다도, 개선된 안정성 및 활성을 포함하는 개선된 특성을 나타내었다. 예를 들어, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물은 증가된 절단 속도, 증가된 선택성, 증강된 절단 패턴, 변경된 전사물의 스플라이싱 등을 제공하였다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물 및 방법은, 유익한 스플라이싱 생성물, 예컨대 mRNA 가 목적하는 유익한 생물학적 기능을 증가, 보수, 복원, 및/또는 부가하기 위하여 보다 높은 수준으로 생성될 수 있도록, 전사물의 스플라이싱을 변경시키는데 특히 효과적이다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 제공된 조성물 및 방법은, 엑손 51 이 스킵되지 않은 경우와 비교하여 개선된 생물학적 활성을 갖는 mRNA 및 단백질을 제공하기 위하여, DMD 의 질환 유발 엑손 51 을 스킵핑하는데 사용될 수 있다.
전사물의 스플라이싱을 평가하기 위한 검정은 당업계에 널리 공지되어 있고, 당업자에 의해 광범위하게 실시되고 있다. 예를 들어, 엑손 51 의 스킵핑 효율을 평가하기 위하여, 각종 검정, 예컨대 네스티드 (nested) PCR, qPCR, 정량적 RT-PCR 등이 이용될 수 있다. 일부 구현예에서, 검정은 네스티드 PCR 이다. 네스티드 PCR 을 위한 프로토콜의 예는 하기에 기재되어 있다.
네스티드 PCR 을 위하여, RNA 를 Invitrogen 사의 Superscript III One-Step RT-PCR 키트를 사용하여 역전사시켰다. 수득한 cDNA 를, 예를 들어 네스티드 PCR 을 위한 2 세트의 프라이머를 사용하여 순차적으로 증폭시켰다. PCR 생성물을 아가로오스 겔 상에서 검사 및 시각화하고, 제공된 조성물이 효과적으로 엑손 51 의 스킵핑을 제공하여 목적하는 mRNA 스플라이싱 변이체를 생성할 수 있다는 것을 입증하였다.
일부 구현예에서, 스플라이싱을 평가하기 위한 검정은 Taqman 검정이다. 일부 구현예에서, 스플라이싱을 평가하기 위한 검정은 Taqman 정량적 RT-PCR 검정이다. 프로토콜의 예는 하기에 기재되어 있다.
DMD 스킵핑을 위한 Taqman 검정의 절차: 전체 세포 RNA 를 먼저 ThermoFisher Scientific 사의 High-Capacity RNA-to-cDNA™ Kit 를 사용하여 공급업체가 제공한 프로토콜에 따라 cDNA 로 역전사시켰다. cDNA 중 스킵 및 비(非)스킵된 전사물을 ThermoFisher Scientific 사의 TaqMan® PreAmp Master Mix 을 사용하여 공급업체가 제공한 프로토콜에 따라 14 사이클 동안 예비-증폭시켰다. 증폭 절차는 10 min 동안 95 ℃, 그 후, 15 sec 동안 95 ℃ 의 14 사이클 및 4 min 동안 60 ℃ 였다. 그 후, 예비증폭된 cDNA 를 LightCycler 시스템 (Roche) 상에서 40 사이클 동안 분석하였다. 조건은 10 min 동안 95 ℃, 이어서 15 sec 동안 95 ℃ 의 40 사이클 및 1 min 동안 60 ℃ 였다. 각각의 반응액은 총 부피 20 ㎕ 로, 5 ㎕ 의 예비증폭된 cDNA, 0.5 ㎕ 의 스킵 또는 비스킵된 DMD 전사물용 Taqman assay, 0.5 ㎕ 의 내인성 대조군용 Taqman assay, 4 ㎕ 물 및 10 ㎕ 의 Taqman 유니버살 PCR 마스터 믹스 (Taqman universal PCR master mix) 을 함유하고 있었다. LightCycler 프로그램을 사용하여 데이터를 분석하여, Ct 값을 계산하였다. 내인성 대조군에는, HRPT1, GAPDH, 뿐 아니라, 근육 분화 마커, 예컨대 MyoD, 데스민, 미오게닌, 유트로핀, 미오신 중쇄, DMD 그 자체 등이 포함된다. 방법의 예는 또한 [Anthony et al., Exon skipping quantification by quantitative reverse-transcription polymerase chain reaction in Duchenne muscular dystrophy patients treated with the antisense oligomer eteplirsen, Hum Gene Ther Methods. 2012 Oct;23(5):336-45] 에 기재되어 있다.
통상의 TaqMan assay 는 Life Technologies 사에서 합성되었다. 서열의 예는 하기와 같다:
비스킵된 것 (엑손 51):
정방향: GTGATGGTGGGTGACCTTGAG
역방향: TTTGGGCAGCGGTAATGAG
프로브: CAAGCAGAAGGCAACAA
스킵된 것 (엑손 51):
정방향: TGAAAATAAGCTCAAGCAGACAAATC
역방향: GACGCCTCTGTTCCAAATCC
프로브: CAGTGGATAAAGGCAACA
데이터의 예가 하기 제시된다:
Figure pct00533
도면에서 상기 제시된 바와 같이, 제공된 조성물 및 방법은 전사물의 스플라이싱을 예상치 못한 수준으로 변경시킬 수 있다. 예를 들어, WV-888 은 놀랍게도 DMD 엑손 51 스킵핑을 거의 30 배로 증가시켰다! 추가로 개선된 활성을 포함하는, 부가적인 데이터는 도에 예시되어 있다.
실시예 4. 스킵핑을 평가하기 위한 검정의 예.
본 개시에 따른 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물의 특성을 평가하는데 각종 검정이 이용될 수 있다. 본 실시예는 그러한 예 중 하나를 기재한다.
세포 처리 및 RNA 추출: DMD 엑손 48-50 의 결실을 갖는 환자에서 유래된 1차 인간 근육아세포를, 근육 세포 증식 배지 (PromoCell GmbH, Heidelberg, Germany) 중에서, 37 ℃, 5% CO2 에서, 매트리겔 (matrigel) (BD Biosciences) 로 예비 코팅된 12-웰-플레이트 내에 웰 당 60x103 개의 세포의 밀도로 씨딩하였다. 다음날, 증식 배지를 시험하고자 하는 10 μM 올리고뉴클레오티드를 함유하는 근육 분화 배지 (5% 말 혈청을 포함하는 DMEM) 로 대체하였다. 세포를 4 일 동안 분화시켰다. 그 후, 분화 배지를 각각의 웰에서 제거하고, 500 ㎕ 의 Trizol 로 대체하였다. 전체 RNA 를 300 ㎕ 의 페놀/클로로포름으로 추출하고, 250 ㎕ 이소프로판올을 이용하여 침전시키고, 800 ㎕ 의 75% 에탄올로 세정하고, 최종적으로 50 ㎕ 의 RNase 가 없는 물에 용해시켰다.
DMD 스킵핑을 위한 네스티드 PCR 및 Taqman 검정 절차: 전체 세포 RNA 를 우선 ThermoFisher Scientific 사의 High-Capacity RNA-to-cDNA™ Kit 를 사용하여 공급업체에서 제공한 프로토콜에 따라 cDNA 로 역전사시켰다. 네스티드 PCR 을 위하여, 수득한 cDNA 를 네스티드 PCR 을 위한 2 세트의 프라이머를 사용하여 순차적으로 증폭시켰다. PCR 생성물을 아가로오스 겔 상에서 검사 및 시각화하였다. Taqman 검정에 대해서는, 상기 실시예에 절차의 예가 기재되어 있다.
도에서 실시예 데이터에 의해 입증된 바와 같이, 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물은 예상치 못하게 높은 스킵핑 효율을 포함하여, 크게 개선된 특성을 제공하였다.
실시예 5. 제공된 조성물 및 방법은 낮은 독성을 가짐.
무엇보다도, 제공된 조성물은 낮은 독성을 갖는다. 일부 구현예에서, 제공된 조성물은 본원에서 입증된 바와 같은 낮은 보체 활성화를 갖는다.
보체 활성화에 대한 올리고뉴클레오티드의 효과를 시노몰구스 (Cynomolgus) 원숭이 혈청에서 시험관내 측정하였다. 제 3 보체 구성성분인 C3 은, 보체 활성화의 전형적, 대안적 및 렉틴 경로에 대한 중심이다. 보체 활성화 동안, C3 은 단백질분해로 절단되어, 아나필라톡신성 (anaphylatoxic) 펩티드 C3a 의 방출을 유도한다. 대안적인 경로의 활성화 시, 인자 B 는 보체 인자 D 에 의해 절단되어, 비촉매 사슬 Ba 및 촉매 서브유닛 Bb 를 생성한다. 활성 서브유닛 Bb 는 C3b 과 결합하여, 대안적 경로 C3 전환효소를 형성하는, 세린 프로테아제이다.
3 마리의 개별적인 시노몰구스 수컷 원숭이로부터의 혈청을 풀링하고, 풀을 사용하였다. C3a 및 Bb 보체 활성화의 시간 경과는, 시노몰구스 원숭이 혈청 (1:10 비율, V/V) 에서 330ug/mL 의 최종 농도로 37 ℃ 에서 올리고뉴클레오티드를 인큐베이션하고, 지시된 시간 지점에서 분취액을 취함으로써 측정하였다. 특히, 올리고뉴클레오티드의 10 mg/mL 스톡 (stock) 9.24 ㎕ 를, 270.76 ㎕ 의 풀링된 (pooled) 혈청에 첨가하고, 37 ℃ 에서 인큐베이션하였다. 지시된 시간 지점에서, 20 ㎕ 분취액을 취하고, 2.2 ㎕ 의 18 mg/mL EDTA (Sigma-Aldrich) 을 첨가하여 반응을 즉시 종결시켰다.
투여량 반응 곡선을 위하여, 물 중의 올리고뉴클레오티드의 6 개의 1/3 연속 희석액 (10x 농축됨) 을 1 mg/mL 에서부터 제조하였다. 그 후, 2 ㎕ 의 희석된 올리고뉴클레오티드 용액을 18 ㎕ 의 시노몰구스 원숭이 혈청에 첨가하고, 37 ℃ 에서 인큐베이션하였다. 40 min 후, 2.2 ㎕ 의 18 mg/mL EDTA (Sigma-Aldrich) 를 첨가하여 반응을 즉시 종결시켰다. C3a 및 Bb 를 1:3000 (C3a) 및 1:40 (Bb) 희석에서 MicroVue C3a Plus 및 Bb Plus Enzyme Immunoassays (Quidel, San Diego, CA 사제) 를 사용하여 측정하였다.
결과의 예는 도 4-5 에 제시되어 있으며, 이는 제공된 조성물이 기준 조성물과 비교하여 유의하게 낮은 독성을 갖는다는 것을 입증하였다.
실시예 6. 단백질 결합 검정의 예.
올리고뉴클레오티드를 증류수 중에 100 μM 로 희석하여, 스톡 용액을 제조하였다. 인간 혈청 알부민 (무지방산, 무글로불린, Sigma-Aldrich A3782) 을 PBST (1xPBS + 0.1% Tween) 을 이용하여 5 mg/mL 로 희석하였다. 올리고뉴클레오티드를 PBST 또는 5 mg/mL-알부민 용액에 100 배 희석하여, 1 μM 작업 용액을 제조하였다. 올리고뉴클레오티드-PBST 샘플은 초미세여과 후 올리고뉴클레오티드 회수 효율을 추정치를 제공하였고, 알부민-결합 용액의 플로우-쓰루 (flow-through) 에서 올리고뉴클레오티드 농도를 정규화하는데 사용되었다. 1 μM 작업 용액을 37 ℃ 에서 30 분 동안 인큐베이션하였다. 100 ㎕ 의 단백질/1 μM 올리고뉴클레오티드 복합체를 초미세여과 튜브 (Amicon Ultra 50 kDa 컷-오프 (cut-off), 재생 셀룰로오스) 에 넣고, 9,000 x g 에서 3 min 동안 원심분리하였다. 플로우-쓰루를 수집하고, 올리고뉴클레오티드의 존재에 대하여 검정하였다.
단일 가닥 올리고뉴클레오티드를 검출하기 위하여, OliGreen 염료를 사용하였다. 희석 완충액은 TE 였다. 각각의 올리고뉴클레오티드는 그 고유한 표준 곡선을 형성하였다. 올리고뉴클레오티드를 0.5 μM (100 μM 스톡으로부터의 200 x 희석) 로 희석한 후, 7 개의 1:1 연속 희석을 이중으로 실시하였다. 20 ㎕ 의 각각의 희석된 올리고뉴클레오티드 표준을 UV 투명 반-영역 96 웰 플레이트에 첨가하였다. 본래의 1 μM 올리고뉴클레오티드/PBST 및 1 μM 올리고뉴클레오티드/단백질을 포함하여, 초미세여과 플로우-쓰루의 모든 샘플을, 4 배의 희석에서 시작하여 1:1 연속 희석하였다. 20 ㎕ 의 각각의 샘플을 그 해당 표준에 따라 첨가하였다. Quant-iT OliGreen 염료 (Life Technologies, O7582) 를 200 배 희석하여 작업 용액을 만들었다. 20 ㎕ 의 OliGreen 작업 용액을 각각의 올리고뉴클레오티드 샘플과 혼합하고, 실온에서 인큐베이션하였다. 플레이트를 형광 마이크로플레이트 판독기 (여기 = 480 nm; 방출 = 520 nm) 를 사용하여 판독하였다.
올리고뉴클레오티드의 농도를 그 자체의 표준 곡선에 따라 계산하였다. 유리 (free) 올리고뉴클레오티드의 회수율을 하기와 같이 계산하였다: Roligo = CP-FT/CP-orig (Roligo 는 유리 올리고뉴클레오티드의 회수율이고; CP-FT 는 PBST-플로우-쓰루의 농도이고; CP- orig 는 본래 작업 용액의 농도임). 알부민 결합된 올리고뉴클레오티드 농도를 하기와 같이 정규화하였다: CA- UB = CA-FT/ Roligo (CA- UB 는 정규화된 알부민 비결합된 올리고 농도이고; CA-FT 는 알부민 처리된 샘플에서 플로우-쓰루 중 올리고뉴클레오티드의 측정된 농도임). 알부민 샘플에서 비결합된 유리 올리고뉴클레오티드의 백분율을 하기와 같이 계산하였다: PA- UB = 100* CA- UB/CA- orig (PA-UB 는 알부민 샘플의 비결합된 유리 올리고뉴클레오티드의 백분율이고; CA- orig 는 알부민 본래 작업 용액의 농도임). 결합% = 100 - PA- UB.
결과의 예는 도 6 에 제시되어 있다.
실시예 7. TLR9 아고니스트 및 안타고니스트 활성의 측정을 위한 검정의 예.
본 개시에 따른 제공된 조성물의 TLR9 활성을 검정하는데 각종 검정이 이용될 수 있다. 인간 TLR9 리포트 검정의 하나의 예에서, 인간 TLR9 유전자 및 NF-kB 유도성 분비된 배아 알칼리성 포스파타아제 (SEAP) 를 안정하게 과발현하는 HEK-Blue™ TLR9 세포를 Invivogen (San Diego, CA, USA) 사에서 입수하였다. 지시된 농도로 올리고뉴클레오티드를 96-웰-플레이트에 물 중 20 mL 의 최종 농도로 플레이팅하였다. 4x104 개의 HEK-Blue TLR9 세포를 SEAP 검출 배지 중에 180 mL 의 부피로 각각에 웰에 첨가하였다. 특정 실험에서, 올리고뉴클레오티드를 각종 농도의 TLR9 아고니스트 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드 ODN2006) 의 존재 또는 부재 하에서 첨가하고, 16 h 동안 배양을 지속하였다. 처리의 종결 시, OD 를 655 nM 에서 측정하였다. 결과를 포스페이트 완충된 염수 (PBS)-처리된 세포에 대한 NF-κB 활성화의 배수 변화로 표시하였다.
실시예 8. 제공된 올리고뉴클레오티드 및 조성물의 생체내 전달의 예.
생체내 올리고뉴클레오티드 처리의 예: 5 주령 mdx 마우스에 1 일차에 10 mg/mL 의 농도로 5mL/kg 를 i.v. 또는 피하로 투여하였다. 4 일 차에 (또는 목적하는 다른 날에), 모든 동물에서 말초 혈액 및 조직 수집을 모두 실시하였다. 혈장을 폴리프로필렌 튜브에 분취하고, -70 ℃ 에 보관하였다. 조직 수집을 위하여, 동물을 CO2 질식을 통해 마취시키고, PBS 를 사용하여 관류시켰다. 간, 신장, 비장, 심장, 흉부 횡격막, 비복근, 사두근 및 삼두근 조직을 또한 수집하였다. 조직을 급냉 (액체 질소 중에서) 시키고, -70 ℃ 에 보관하였다.
절차 예: 대조군 올리고뉴클레오티드 WV-942 및 시험하고자 하는 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, WV-2588, WV-2581, WV-2582, WV-2584, WV-2585, WV-2586, WV-2587 등) 의 생체내 생물학적 분포를, 5 주령의 C57BL/10ScSn-Dmd mdx /J 수컷 마우스 (Jackson Laboratory, Stock#001801) 에 단일 피하 투여한 후 시험하였다. 순응 및 연구 기간 전반 동안, 동물을 폴리카르보네이트 케이지에서 케이지 당 2 마리씩, 18 ℃ 내지 26 ℃ 및 30% 내지 70 % 습도에서 수용하였다. 하우징에는 Beta Chip® 및 Enviro-Dri 접촉 베딩이 포함되어 있었다. 표준 음식물 및 물을 임의로 공급하였다. 연구는, Final Rules of the Animal Welfare Act regulations (Code of Federal Regulations, Title 9), Public Health Service Policy on Humane Care and Use of Laboratory Animals from the Office of Laboratory Animal Welfare, 및 Guide for the Care and Use of Laboratory Animals from the National Research Council 의 모든 해당 섹션을 준수하였다. 이러한 연구에서 동물의 관리 또는 사용을 포함하는 프로토콜 및 임의의 개정 또는 절차는, 그러한 절차의 시작 전에 Testing Facility Institutional Animal Care and Use Committee 에 의해 검토 및 승인되었다. 연구 디자인의 예가 하기에 제시되어 있다 (동물의 수 (수컷): 3):
Figure pct00534
동물을 1 일차에 피하 주사 후 48 시간 (+ 1 시간) CO2 질식을 통해 안락사시켰다. 모든 동물을 PBS 를 사용하여 관류시켰다. 하기 수집된 조직 (간, 신장 2x, 비장, 심장, 흉부 횡격막, 비복근, 사두근, 및 삼두근) 을 PBS 로 가볍게 헹구고, 조심스럽게 블롯팅 건조시키고, 폴리프로필렌 튜브 내에서 급속 냉동 (액체 N2) 시키고, 추가 분석을 위한 가공 시까지 -70 ℃ 에서 보관하였다.
올리고뉴클레오티드 정량화: 간략하게, 각각의 마우스 조직을 칭량하고, 조직 용해 완충액 중에 용해시켰다.
ASO: 샌드위치 (Sandwich) 를 검출하기 위한 하이브리드화 검정
방법:
프로브: 포획 프로브: /5AmMC12/A+GA+AA+TG+CC+A; 검출 프로브: T+CT+TC+CT+TG+A/3Bio/
플레이트: Pierce® 아민-결합, 말레산 무수물 96-웰 플레이트를, 2.5% NaHCO3 중의 500 nM 로 희석된 포획 프로브로 37 ℃ 에서 적어도 1 시간 (또는 4 ℃ 에서 밤새) 코팅하였다. PBST (1 x PBS + 0.1% Tween-20) 로 세정한 후, 5% 무지방 우유/PBST 중에서 37 ℃ 에서 >1 시간 동안 차단하였다.
조직 샘플 제조: 조직 조각을 칭량하고, 4 부피의 용해 완충액을 조직에 첨가하여 조직 용해 완충액 (IGEPAL 0.5%, 100 mM NaCl, 5 mM EDTA, 10 mM Tris pH8, 프로테아제 K 300 ㎍/mL) 에서 0.2 g 조직/mL 을 달성하였다. Bullet Blender (NextAdvance) 를 이용하여 균질물을 생성하였다.
표준 곡선: 시험 물질을 비처리된 블랭크 (blank) 조직 균질물 (매트릭스) 에 10-50 ㎍/mL (50-250 ㎍/g 조직) 로 희석시켰다. 표준 물질을 추가로 8 개의 지점에 대하여 매트릭스와 1:1 로 연속 희석하여, 표준 곡선 시리즈를 형성하였다.
하이브리드-ELISA: 표준 곡선 샘플, 처리된 조직 균질물을 하이브리드화 완충액 (4 M 구아니딘; 0.33% N-라우릴 사르코신; 25 mM 소듐 시트레이트; 10 mM DTT) 으로 100-500 배 희석하였다. 20 ㎕ 의 희석된 조직 샘플을 PBST 중에 333 nM 로 희석된 검출 프로브 180 ㎕ 와 혼합하였다. 샘플을 하기 조건을 사용하여 변성시켰다: 65 ℃, 10 min; 95 ℃, 15 min; 4 ℃, ∞. 50 ㎕ /웰 변성된 샘플을 코팅된 96 웰에 첨가하였다. 4 ℃ 에서 밤새 인큐베이션하였다. 플레이트를 PBST 를 이용하여 3 회 세정하였다. PBST 중의 스트렙타비딘-AP 의 1:2000 희석액을 첨가하였다. 실온에서 1 시간 동안 인큐베이션하였다. 플레이트를 Molecular Device 플레이트 세정기 상에서 PBST 를 이용하여 5 회 x 2 사이클 세정하였다. 100 ㎕/웰 AttoPhos 기질을 첨가하였다. 10 min 동안 인큐베이션하고, Molecular Device M5 에서 형광 채널: Ex435nm, Em555nm 로 플레이트를 판독하였다. 20 min 에서 또 판독하였다. 올리고뉴클레오티드 농도를 선형 곡선 피트 또는 4-매개변수 곡선 피트를 사용하여 표준 곡선에 대하여 계산하였다.
시험 결과의 예는 도에 제시되어 있고, 이는 제공된 올리고뉴클레오티드가 개선된 특성 (예를 들어, 분포, 대사 등) 을 갖는다는 것을 입증한다.
실시예 9. 투르비나르산의 합성 예.
많은 유형의 산, 예를 들어 지방산이, 당업계에 널리 공지되어 있으며, 각종 유형의 개질을 혼입하기 위하여 본 개시에 따라 이용될 수 있다. 당업자는, 각종 지질, 예를 들어 지방산이 시판되고/되거나, 본 개시에 예시된 것들을 포함하여, 널리 공지되고 실시되는 기술 (예를 들어, 시약, 방법 등) 을 사용하여 제조될 수 있다는 것을 인식한다. 본 실시예는 투르비나르산의 제조를 기재한다.
Figure pct00535
투르비나르산 : (4E,8E,12E,16E)-4,8,13,17,21- 펜타메틸도코사 -4,8,12,16,20-펜타엔산의 합성. 투르비나르산은, 예를 들어 [Asari et al. 1989 J. Nat. Prod. 52: 1167-1169] 에 예전에 기재되었다.
2-히드록시-3- 브로모스쿠알렌 . THF (210 mL) 중의 스쿠알렌 (30.03 g, 73.1 mmol) 의 용액에, 물 (35 mL) 을 첨가한 후, 소량의 THF 를 적가하여, 아르곤 하에서 투명한 용액을 수득하였다. N-브로모숙신이미드 (15.62 g, 88 mmol) 를 0 ℃ 에서 분할하여 첨가하고, 반응 혼합물을 0 ℃ 에서 30 분 동안 및 실온에서 3 시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에서 제거하고, 염수 (500 mL) 를 첨가하고, EtOA (100 mL x 5) 로 추출하였다. 유기층을 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시키고, 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 헥산 → 헥산 중 50% EtOAc (생성물은 헥산 중 10-20% EtOAc 에서 생성됨) 로 용리하면서 ISCO (220 g 금 실리카겔 카트리지) 로 정제하여, 2-히드록시-3-브로모스쿠알렌 (9.92 g, 19.54 mmol, 26.7 % 수율) 을 담황색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00536
2,2-디메틸-3-((3E,7E,11E,15E)-3,7,12,16,20- 펜타메틸헤니코사 -3,7,11,15,19-펜타엔-1-일) 옥시란 . MeOH (360 mL) 중의 2-히드록시-3-브로모스쿠알렌 (9.72 g, 19.15 mmol) 의 용액에, K2CO3 (5.29 g, 38.3 mmol) 를 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 2 h 동안 교반하고, 여과한 후, 감압 하에서 농축시켰다. 그 후, 300 mL EtOAc 를 첨가하고, 여과하고, 농축시켜, 2,3-옥시도스쿠알렌 (8.38 g, 19.64 mmol, 100 % 수율) 을 무색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00537
(4E,8E,12E,16E)-4,8,13,17,21- 펜타메틸도코사 -4,8,12,16,20- 펜타에날 . 0 ℃ 의 물 (28 mL) 중의 과요오드산 (7.79 g, 34.2 mmol) 의 용액에, 디옥산 (65 mL) 중의 2,3-옥시도스쿠알렌 (8.10 g, 18.98 mmol) 의 용액을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 2 h 동안 교반하였다. 물 (150 mL) 를 첨가하고, EtOAc (3 x 100 mL) 로 추출하였다. 유기층을 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 헥산 → 헥산 중의 10% EtOAc (생성물은 헥산 중의 5-7% EtOAc 에서 생성됨) 로 용리하면서 ISCO (120 g 금 실리카겔 카트리지) 로 정제하여, (4E,8E,12E,16E)-4,8,13,17,21-펜타메틸도코사-4,8,12,16,20-펜타에날 (5.80 g, 15.08 mmol, 79 % 수율) 을 무색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00538
투르비나르산 . 황산 (8.2 mL), 이어서 소듐 디크로메이트 디히드레이트 (4.42 g, 14.82 mmol) 를 0 ℃ 에서 HPLC 물 (80 mL) 에 첨가하였다. 상기 크롬산 용액을 0℃ 에서 에틸 에테르 (115 mL) 중의 (4Z,8Z,12E,16E)-4,8,13,17,21-펜타메틸도코사-4,8,12,16,20-펜타에날 (5.70 g, 14.82 mmol) 의 용액에 적가하였다. 반응 혼합물을 0℃ 에서 2 h 동안 교반하였다. 2 h 후, TLC (3: 1 헥산/EtOAc) 는 반응이 완결되었음을 나타내었다. 반응 혼합물을 EtOAc (300 mL) 로 희석하고, 염수 (100 mL x 4) 로 세정하고, 무수물 상에서 건조시키고, 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 DCM → DCM 중의 5% MeOH 로 용리하면서 ISCO (80 g 실리카겔 카트리지) 로 정제하여, 투르비나르산을 무색 오일로서 수득하였다 (5.00 g, 84% 수율).
Figure pct00539
실시예 10. 1,7,14- 트리옥소 -12,12-비스((3-옥소-3-((3-(4- 술파모일벤즈아미도 )프로필)아미노) 프로폭시 ) 메틸 )-1-(4- 술파모일페닐 )-10-옥사-2,6,13- 트리아자옥타데칸 -18-산의 합성 예.
Figure pct00540
단계 1: THF (40 mL) 중의 디-tert-부틸 3,3'-((2-아미노-2-((3-(tert-부톡시)-3-옥소프로폭시)메틸)프로판-1,3-디일)비스(옥시))디프로파노에이트 (4.0 g, 7.91 mmol) 및 디히드로-2H-피란-2,6(3H)-디온 (0.903 g, 7.91 mmol) 의 용액을, 50 ℃ 에서 3 시간 동안 및 rt 에서 3 시간 동안 교반하였다. LC-MS 는, 목적하는 생성물임을 나타내었다. 용매를 증발시켜, 5-((9-((3-(tert-부톡시)-3-옥소프로폭시)메틸)-2,2,16,16-테트라메틸-4,14-디옥소-3,7,11,15-테트라옥사헵타데칸-9-일)아미노)-5-옥소펜탄산을 수득하고, 이를 정제 없이 다름 단계에 바로 사용하였다.
단계 2: DMF 중의 5-((9-((3-(tert-부톡시)-3-옥소프로폭시)메틸)-2,2,16,16-테트라메틸-4,14-디옥소-3,7,11,15-테트라옥사헵타데칸-9-일)아미노)-5-옥소펜탄산 (4.90 g, 7.91 mmol) 및 (브로모메틸)벤젠 (1.623 g, 9.49 mmol) 의 용액에, 무수 K2CO3 (3.27 g, 23.73 mmol) 를 첨가하였다. 혼합물을 40 ℃ 에서 4 h 동안 및 실온에서 밤새 교반하였다. 용매를 감압 하에서 증발시켰다. 반응 혼합물을 EtOAc 로 희석하고, 물로 세정하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 헥산 중 10% EtOAc → 헥산 중 50% EtOAc 로 용리하면서 ISCO 로 정제하여, 디-tert-부틸 3,3'-((2-(5-(벤질옥시)-5-옥소펜탄아미도)-2-((3-(tert-부톡시)-3-옥소프로폭시)메틸)프로판-1,3-디일)비스(옥시))디프로파노에이트 (5.43 g, 7.65 mmol, 97 % 수율) 를 무색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00541
단계 3: 포름산 (50 mL) 중의 디-tert-부틸 3,3'-((2-(5-(벤질옥시)-5-옥소펜탄아미도)-2-((3-(tert-부톡시)-3-옥소프로폭시)메틸)프로판-1,3-디일)비스(옥시))디프로파노에이트 (5.43 g, 7.65 mmol) 의 용액을, 실온에서 48 h 동안 교반하였다. LC-MS 는 반응이 완결되었음을 나타내었다. 용매를 감압 하에서 증발시켰다. 미정제 생성물을 포름산 (50 mL) 중에 재용해시키고, 실온에서 6 h 동안 교반하였다. LC-MS 는 반응이 완결되었음을 나타내었다. 용매를 감압 하에서 증발시키고, 감압 하에서 톨루엔 (3X) 과 함께 동시 증발시키고, 진공 하에서 건조시켜, 3,3'-((2-(5-(벤질옥시)-5-옥소펜탄아미도)-2-((2-카르복시에톡시)메틸)프로판-1,3-디일)비스(옥시))디프로판산 (4.22 g, 7.79 mmol, 100 % 수율) 을 백색 고체로서 수득하였다.
Figure pct00542
단계 4: 0 ℃ 의 DCM (60 mL) 및 DMF (15 mL) 중의 3,3'-((2-(5-(벤질옥시)-5-옥소펜탄아미도)-2-((2-카르복시에톡시)메틸)프로판-1,3-디일)비스(옥시))디프로판산 (4.10 g, 7.57 mmol) 및 HOBt (4.60 g, 34.1 mmol) 의 용액에, tert-부틸 (3-아미노프로필)카르바메이트 (5.94 g, 34.1 mmol), EDAC HCl 염 (6.53 g, 34.1 mmol) 및 DIPEA (10.55 mL, 60.6 mmol) 를 첨가하였다. 반응 혼합물을 0 ℃ 에서 15 분 동안 및 실온에서 20 h 동안 교반하였다. LC-MS 는 반응이 완결되었음을 나타내었다. EDAC HCl 염 (2.0 g) 및 tert-부틸 (3-아미노프로필)카르바메이트 (1.0 g) 를 반응 혼합물에 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 4 h 동안 교반하였다. 용매를 증발시켜 잔류물을 수득하고, 이를 EtOAc (300 mL) 중에 용해시키고, 물 (1X), 포화 소듐 바이카르보네이트 (2X), 10% 시트르산 (2X) 및 물로 세정하고, 소듐 술페이트 상에서 건조시키고, 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 DCM → DCM 중의 30% MeOH 로 용리하면서 ISCO (80 g 금 카트리지) 로 정제하여, 벤질 15,15-비스(13,13-디메틸-5,11-디옥소-2,12-디옥사-6,10-디아자테트라데실)-2,2-디메틸-4,10,17-트리옥소-3,13-디옥사-5,9,16-트라아자헤니코산-21-오에이트 5 (6.99 g, 6.92 mmol, 91 % 수율) 를 백색 고체로서 수득하였다.
Figure pct00543
단계 5: DCM (40 mL) 중의 벤질 15,15-비스(13,13-디메틸-5,11-디옥소-2,12-디옥사-6,10-디아자테트라데실)-2,2-디메틸-4,10,17-트리옥소-3,13-디옥사-5,9,16-트라아자헤니코산-21-오에이트 (1.84 g, 1.821 mmol) 의 용액에, 2,2,2-트리플루오로아세트산 (7.02 mL, 91 mmol) 을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 밤새 교반하였다. 용매를 증발시켜, 벤질 5-((1,19-디아미노-10-((3-((3-아미노프로필)아미노)-3-옥소프로폭시)메틸)-5,15-디옥소-8,12-디옥사-4,16-디아자노나데칸-10-일)아미노)-5-옥소펜타노에이트를 무색 오일로서 수득하였다. MS (ESI), 710.6 (M+H)+.
단계 6: DCM (40 mL) 중의 4-술파모일벤조산 (1.466 g, 7.28 mmol) 의 용액에, HATU (2.77 g, 7.28 mmol), 이어서 DMF (4.0 mL) 중의 벤질 5-((1,19-디아미노-10-((3-((3-아미노프로필)아미노)-3-옥소프로폭시)메틸)-5,15-디옥소-8,12-디옥사-4,16-디아자노나데칸-10-일)아미노)-5-옥소펜타노에이트 (1.293 g, 1.821 mmol) 를 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 5 h 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에서 증발시켜 잔류물을 수득하고, 이를 DCM → DCM 중의 50% MeOH 로 용리하면서 ISCO (40 g 금 컬럼) 로 정제하여, 벤질 1,7,14-트리옥소-12,12-비스((3-옥소-3-((3-(4-술파모일벤즈아미도)프로필)아미노)-프로폭시)메틸)-1-(4-술파모일페닐)-10-옥사-2,6,13-트리아자옥타데칸-18-오에이트 (0.36 g, 0.286 mmol, 16% 수율) 를 수득하였다.
Figure pct00544
단계 7: Ar 로 플러싱된 둥근 바닥 플라스크에, 10% Pd/C (80 mg, 0.286 mmol) 및 EtOAc (15 mL) 를 첨가하였다. 메탄올 (15 mL) 중의 벤질 1,7,14-트리옥소-12,12-비스((3-옥소-3-((3-(4-술파모일벤즈아미도)프로필)아미노)프로폭시)메틸)-1-(4-술파모일페닐)-10-옥사-2,6,13-트리아자옥타데칸-18-오에이트 (360 mg) 의 용액, 이어서 디에틸(메틸)실란 (0.585 g, 5.72 mmol) 을 적가하였다. 혼합물을 실온에서 3 시간 동안 교반하였다. LC-MS 는 반응이 완결되었음을 나타내었다. 반응액을 EtOAc 로 희석하고, 셀리트를 통해 여과하고, EtOAc 중의 20% MeOH 로 세정하고, 감압 하에서 농축시켜, 1,7,14-트리옥소-12,12-비스((3-옥소-3-((3-(4-술파모일벤즈아미도)프로필)-아미노)프로폭시)메틸)-1-(4-술파모일페닐)-10-옥사-2,6,13-트리아자옥타데칸-18-산 (360 mg, 100% 수율) 을 백색 고체로서 수득하였다.
Figure pct00545
실시예 11. 라우릴 알코올로부터의 2- 시아노에틸 ((6Z,9Z,28Z,31Z)- 헵타트리아콘타 -6,9,28,31- 테트라엔 -19-일) 디이소프로필포스포라미다이트 및 아미다이트의 합성 예.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 각종 알코올을 포스포라미다이트로 전환시키고, 본 개시에 따라 당업계에 공지된 기술을 사용하여 올리고뉴클레오티드 사슬에 콘쥬게이트시킬 수 있다. 본 실시예는, 예를 들어 Mod021 를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 제조에 사용될 수 있는, 2-시아노에틸 ((6Z,9Z,28Z,31Z)-헵타트리아콘타-6,9,28,31-테트라엔-19-일) 디이소프로필포스포라미다이트의 제조를 예시한다.
Figure pct00546
(9Z,12Z)- 옥타데카 -9,12- 디엔 -1-일 메탄술포네이트 (또는 리놀레일 메탄술포네이트 ) 의 합성. 0℃ 의 DCM (150 mL) 중의 리놀레일 알코올 (23.31 mL, 75 mmol) 및 트리에틸아민 (13.60 mL, 98 mmol) 의 용액에, 메탄술포닐 클로라이드 (6.39 mL, 83 mmol) 를 적가하였다. 반응 혼합물을 0℃ 에서 30 분 동안 및 실온에서 3 시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 DCM (200 mL) 으로 희석하고, 물, 포화 소듐 바이카르보네이트 및 염수로 세정하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시켰다. 용매를 농축시켜, 리놀레일 메탄술포네이트 (26.17 g, 100 % 수율) 를 황색빛 오일로서 수득하였다. 추가 정제 없이, 생성물을 다음 단계에 바로 사용하였다.
Figure pct00547
리놀레일 브로마이드의 합성 . 에테르 (800 mL) 중의 리놀레일 메탄술포네이트 (26 g, 75 mmol) 의 용액에, 마그네슘 브로마이드 에틸 에테레이트 (58.5 g, 226 mmol) 를 아르곤 하에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 2 h 동안 교반하였다. TLC 를 사용하여 반응 진행을 모니터링하였다. 완결되지 않은 경우, 부가적인 마그네슘 브로마이드 에틸 에테레이트 (14.5 g) 를 반응 혼합물에 첨가하고, 반응 혼합물을 실온에서 22 h 동안 교반하였다. TLC 는 반응이 완결되었음을 나타내었다 (9/1 헥산/EtOAc). 반응 혼합물을 여과하고, 에테르 (200 mL), 헥산 (100 mL) 으로 세정하고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 헥산 → 헥산 중의 10% EtOAc 로 용리하면서 ISCO (200 g 금 실리카겔 카트리지) 로 정제하여, 리놀레일 브로마이드 (22.8 g, 69.2 mmol, 92 % 수율) 를 무색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00548
디리놀레일 메탄올의 합성 . RB 플라스크 내 Mg (0.897 g, 36.9 mmol) 및 에테르 (20 mL) 의 현탁액에, RB 플라스크를 물 중에서 냉각시킴으로써 약한 환류 하에서 반응을 유지시키면서, 에테르 (25 mL) 중의 리놀레일 브로마이드 (10.0 g, 30.4 mmol) 를 적가하였다. 반응 혼합물을 35 ℃ 에서 1 시간 동안 교반하였다. 0 ℃ 의 상기 반응 혼합물에, 에테르 (30 mL) 중의 에틸 포르메이트 (1.013 g, 13.68 mmol) 를 10 분 동안 적가하고, 반응 혼합물을 실온에서 1.5 h 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 아이스 배쓰에서 냉각시키고, 물 (30 mL) 로 켄칭하고, 용액이 균질해질 때까지 10% H2SO4 (150 mL) 로 처리하고, 층을 분리하였다. 수성층을 에테르 (200 mL x 2) 로 추출하였다. 용매를 감압 하에서 증발시켜 잔류물을 수득하고, 이를 THF (50 mL) 및 1 N NaOH (30 mL) 중에 재용해시켰다. 반응 혼합물을 40 ℃ 에서 5 h 동안 교반하였다. TLC 를 사용하여, 반응 진행을 모니터링하였다. 완결되지 않은 경우, 1.5 g NaOH 를 반응 혼합물에 첨가하고, 반응 혼합물을 지속적으로 40 ℃ 에서 밤새 교반하였다. 반응 혼합물을 에테르 (2 x) 로 추출하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시키고, 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 헥산 → 헥산 중의 10% EtOAc 로 용리하면서 ISCO (120 g 금 실리카겔 카트리지) 로 정제하여, 디리놀레일 메탄올 (5.16 g, 9.76 mmol, 71.3 % 수율) 을 무색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00549
2- 시아노에틸 ((6Z,9Z,28Z,31Z)- 헵타트리아콘타 -6,9,28,31- 테트라엔 -19-일) 디이소프로필포스포라미다이트의 합성. 실온에서 무수 디클로로메탄 (30 mL) 중의 디리놀레일 메탄올 (2.5 g, 4.73 mmol) 의 용액에, DIPEA (4.12 mL, 23.63 mmol) 및 3-(클로로(디이소프로필아미노)포스피노)프로판니트릴 (1.180 mL, 5.67 mmol) 을 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 2 h 동안 교반하였다. 반응 혼합물에 EtOAc (300 mL) 를 첨가하고, 포화 소듐 바이카르보네이트로 세정하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시키고, 감압 하에서 농축시켜 잔류물을 수득하고, 이를 헥산 → 5% TEA 를 함유하는 헥산 중의 5% EtOAc 로 용리하면서 ISCO (40 g 금 실리카겔 카트리지) 로 정제하여, 2-시아노에틸 (6Z,9Z,28Z,31Z)-헵타트리아콘타-6,9,28,31-테트라엔-19-일 디이소프로필포스포라미다이트 (2.97 g, 4.07 mmol, 86 % 수율) 를 무색 오일로서 수득하였다.
Figure pct00550
라우릴 알코올로부터의 아미다이트의 합성. 아르곤 분위기 하에서, 실온에서, 60 mL 무수 DCM 중의 라우릴 알코올 (5.2 g, 28 mmol) 의 용액에, DIPEA (18 g, 140 mmol) 를 첨가하고, 5 분 동안 교반하였다. 이러한 용액에, 2-시아노에틸 N,N-디이소프로필클로로포스포라미다이트 (7.9 g, 33.5 mmol) 를 적가하고, 4 시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물로부터 용매를 감압 하에서 증발시키고, 300 mL 에틸 아세테이트로 희석하고, sat. NaHCO3 로 세정하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시켰다. 용매의 제거 및 ISCO 를 사용한 실리카겔 상에서의 컬럼 크로마토그래피 (80 g 통상의 실리카, 5% 트리에틸 아민 함유 헥산 중의 0-30% 에틸 아세테이트) 를 통해 생성물을 제공하였다. 수득한 생성물의 중량: 3.8 g (35%).
Figure pct00551
생성물을 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-OH 와 반응시키는 올리고뉴클레오티드 합성 화학을 사용하여, Mod030 을 혼입하는데 이용하였다. Mod031, Mod032, 및 Mod033 에 대하여 유사한 절차를 적용하였다.
실시예 12. Mod030-Mod033 에 대한 아미다이트의 합성 예
아르곤 분위기 하에서, 실온에서, 60 mL 무수 DCM 중의 라우릴 알코올 (5.2 g, 28 mmol) 의 용액에, DIPEA (18 g, 140 mmol) 를 첨가하고, 5 분 동안 교반하였다. 상기 용액에, 2-시아노에틸 N,N-디이소프로필클로로포스포라미다이트 (7.9 g, 33.5 mmol) 를 적가하고, 4 시간 동안 교반하였다. 용매를 반응 혼합물로부터 감압 하에서 증발시키고, 300 mL 에틸 아세테이트로 희석하고, sat. NaHCO3 로 세정하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시켰다. 용매를 제거하고, ISCO 를 사용하여 실리카겔 (80 g 일반 실리카, 5% 트리에틸 아민 함유 헥산 중의 0-30% 에틸 아세테이트) 상에서 컬럼 크로마토그래피하여, 생성물을 수득하였다. 수득된 생성물의 중량: 3.8 g (35%).
Figure pct00552
Mod031, Mod032 및 Mod033 에 대한 아미다이트를 동일한 절차를 사용하여 제조하였다. 이러한 아미다이트를 Mod030-Mod033 를 포함하는 올리고뉴클레오티드의 제조를 위한 합성 사이클에서 마지막 아미다이트로서 사용하였다.
실시예 13. Mod024 에 대한 산의 제조 예.
Figure pct00553
GlucNAc 산 1 (WO 2014/025805 A1) (1.88 g, 4.2 mmol) 및 HOBT (0.73 g, 5.4 mmol) 를, 무수 DMF-DCM 혼합물 (11+15 mL) 중에서 질소 하에서 실온에서 10 분 동안 교반하였다. HBTU (2.05 g, 5.4 mmol), 이어서 DIPEA (2.17 g, 16.8 mmol) 를 10 ℃ 에서 첨가하였다. 이러한 용액에, 트리-아민 염 2 (WO 2014/025805 A1) (1.38 g, 1.2 mmol) 을 첨가하고, 밤새 교반하였다. 용매를 진공 하에서 제거하고, 잔류물을 에틸 아세테이트 (200 mL) 중에 용해시켰다. 이러한 용액에, sat. 암모늄 클로라이드, sat. 소듐 클로라이드, sat. 소듐 바이카르보네이트 및 물 (1:1:1:1) 의 혼합물 100 ml 를 첨가하였다. 에틸 아세테이트 층은 초기에 혼탁하였다. 철저하게 진탕시킨 후, 층을 분리하였다. 수성층을 에틸 아세테이트 (x2) 로 추출하였다. 조합한 유기 분획을 염수로 세정하고, 무수 소듐 술페이트 상에서 건조시켰다. 감압 하에서 용매를 제거하여, 490 mg 의 미정제 생성물을 수득하였다. 이러한 생성물을 ISCO 기기 상에서 CC 로 정제하였다. 용리액은 DCM-메탄올 (DCM 중의 0-20% 메탄올) 이었다. 수득된 생성물의 양은 1.26 g (50%) 였다. LC-MS (+ mode): 1768 (M- 1GlucNAc), 1438 (M-2 GlucNAc), 1108 (M-3 GlucNAc), 1049 (M/2 +1).
Figure pct00554
아르곤 분위기 하에서, 7 mL 무수 메탄올 중의 벤질 에스테르 4 (0.25 g, 0.119 mmol) 의 용액에, 10% Pd/C (50 mg), 이어서 1.5 mL (9.4 mmol) 트리에틸실란 (TES) 을 적가하였다. 격렬한 반응이 시작되었고, RM 을 3 시간 동안 교반하였다. 생성물의 LC-MS 분석은 반응의 완결을 나타내었다. RM 을 셀리트를 통해 여과하고, 용매를 진공 하에서 제거하였다. 미정제 생성물을 에테르-메탄올 (3:1) 혼합물을 이용하여 분쇄하고 (X3), 진공 하에서 건조시켰다. 이러한 생성물 5 를 추가 정제 없이 올리고뉴클레오티드 사슬과의 콘쥬게이션에 사용하였고, 콘쥬게이션 후, 예를 들어 올리고뉴클레오티드의 절단 및/또는 탈보호 동안 히드록실기를 탈보호시켜 Mod024 를 혼입시켰다. 목적하는 경우, 다수의 프로토콜을 이용하여 5 에서의 히드록실기를 탈보호시켜, 산에 탈보호된 히드록실기를 제공할 수 있다.
Figure pct00555
Mod026 을 유사한 전략을 사용하여 혼입시켰다.
실시예 14. 콘쥬게이션을 위한 절차의 예 - 아미노기를 갖는 올리고뉴클레오티드 사슬의 제조.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 각종 기술, 예를 들어 링커, 방법, 관능기 등이, 지질 모이어티 및/또는 표적 구성성분을 포함하는 것들을 포함하여, 본 개시에 따른 제공된 올리고뉴클레오티드를 제조하는데 이용될 수 있다. 각종 모이어티, 예를 들어, 지질 모이어티, 표적 구성성분 등을 혼입하기 위한, 아미노기를 갖는 올리고뉴클레오티드의 제조를 위한 절차의 예가 하기에 제시되어 있다.
"지지체 상" 콘쥬게이션 전략
"지지체 상" 콘쥬게이션을 위한 5'-아미노-개질된 올리고뉴클레오티드의 제조를, MMT-아미노 C6 CE 포스포라미다이트 (ChemGenes Corporation catalog No. CLP-1563 또는 Glen Research catalog No. 10-1906) 를 사용하여, 이를 마지막 포스포라미다이트로서 첨가하고, 올리고뉴클레오티드 합성 화학을 사용하여 고체 지지체 상 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-OH 에 커플링시킴으로써 수행하였다. 커플링 후, 새롭게 형성된 연결을 임의로 산화시켜, 목적하는 경우, 올리고뉴클레오티드 합성 화학에 따라, 예를 들어 tert -부틸 히드로퍼옥시드 (예를 들어, 20:80 데칸/디클로로메탄 중의 1.1 M), I2 (예를 들어, 피리딘/물, THF/피리딘/물 등 중의) 등을 사용하여, 포스포디에스테르 연결을 제공하였다. 포스포로티오에이트 연결을 목적으로 하는 경우, PolyOrg Sulfa (예를 들어, 아세토니트릴 중의 0.1 M) 또는 DDTT (예를 들어, 피리딘 중의 0.1 M) 를 황화에 사용하였다. 그 후, 황색이 더 이상 관찰되지 않을 때까지, 올리고뉴클레오티드가 탈차단 시약 (예를 들어, 디클로로메탄 중의 3% 트리클로로아세트산, 톨루엔 중의 3% 디클로로아세트산 등) 과 함께 지지체 상에 있는 동안 MMT 보호기를 제거하였다. 그 후, 각종 화합물, 예를 들어 지방산, 당 산 등을 커플링시키고, 임의로 이어서 지지체로부터의 절단, 탈보호 및/또는 정제를 수행하였다.
"용액 중" 콘쥬게이션 전략
"용액 중" 콘쥬게이션을 위한 5'-아미노-개질된 올리고뉴클레오티드의 제조를, TFA-아미노 C6 CED 포스포라미다이트 (ChemGenes Corporation catalog No. CLP-1553 또는 Glen Research catalog No. 10-1916) 를 사용하여, 이를 마지막 포스포라미다이트로서 첨가하고, 올리고뉴클레오티드 합성 화학을 사용하여 고체 지지체 상 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-OH 에 커플링시킴으로써 수행하였다. 커플링 후, 새롭게 형성된 연결을 임의로 산화시켜, 목적하는 경우, 올리고뉴클레오티드 합성 화학에 따라, 예를 들어 tert -부틸 히드로퍼옥시드 (예를 들어, 20:80 데칸/디클로로메탄 중의 1.1 M), I2 (예를 들어, 피리딘/물, THF/피리딘/물 등 중의) 등을 사용하여, 포스포디에스테르 연결을 제공하였다. 포스포로티오에이트 연결을 목적으로 하는 경우, PolyOrg Sulfa (예를 들어, 아세토니트릴 중의 0.1 M) 또는 DDTT (예를 들어, 피리딘 중의 0.1 M) 를 황화에 사용하였다. 그 후, 아민-개질된 올리고뉴클레오티드를 지지체로부터 절단하고, 탈보호 및 정제하여, 콘쥬게이션을 위한 유리 아미노기를 갖는 생성물을 제공하였다. 통상적으로 TFA 기를 올리고뉴클레오티드의 절단 및 탈보호 동안 제거하였다. 그 후, 올리고뉴클레오티드를 콘쥬게이션에 이용하였다.
실시예 15. 고체 지지체 상에서의 콘쥬게이션을 위한 절차 예.
당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 다수의 널리 공지되고 실시되는 기술, 예를 들어 시약, 방법 등이, 본 개시에 따라, 지질 모이어티를 포함하는 것들을 포함하여, 제공된 올리고뉴클레오티드 조성물의 제조에 이용될 수 있다. 올리고뉴클레오티드에의 지질, 표적 구성성분 등의 콘쥬게이션의 예시를 위한, 2 가지 반응식의 예가 본 실시예 및 하기 실시예에 제공된다. 일부 구현예에서, RLD-COOH 는, 제공된 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 표 4 의 특정 예시 올리고뉴클레오티드에 예시된 바와 같은 RLD 를 제공하기 위한, 본원에 기재된 바와 같은 (제조된 및/또는 시판되는) 지방산이다. 일부 구현예에서, RLD-COOH 는, 제공된 올리고뉴클레오티드, 예를 들어 표 4 의 특정 예시 올리고뉴클레오티드에 예시된 바와 같은 RLD 를 제공하기 위한, 본원에 기재된 바와 같은 (제조된 및/또는 시판되는) 표적 구성성분을 포함하는 산이다.
고체 지지체 상에서의 콘쥬게이션을 위한 절차 예:
Figure pct00556
절차 예에서, 지질 산 (1 μmol, 1 eq.), HATU (0.9 eq), 디이소프로필에틸아민 (10 eq) 및 NMP (500 ㎕) 의 혼합물을, 3 mL 플라스틱 바이알 내에서 실온에서 10 분 동안, 진탕시켰다. 이러한 활성화된 산을 고체 지지체 (0.09 μmol, 0.9 eq) 상에 올리고뉴클레오티드 (예를 들어, 상기 실시예 참조) 를 함유하는 플라스틱 바이알 내로 피펫팅하였다. 바이알의 내용물을 철저하게 혼합하고, 12 시간 동안 철저하게 진탕시켰다. 이러한 시간 후, 상청액 NMP 을 주의하여 제거하였다. 고체 지지체를 아세토니트릴 (1 mL x 3) 로 세정하고, 스피트 백 (speed vac) 에서 건조시켰다. 암모늄 히드록시드 및 메틸 아민 (AMA) 의 1:1 혼합물 (1 mL) 을 첨가하고, 35 ℃ 에서 1 시간 동안 간헐적인 진탕을 수반하여 가열하였다. 1 시간 후, CPG 를 작은 여과 카트리지로 옮기고, 여과하고, DMSO (500 ㎕ x 2) 및 물 (1 mL x 3) 로 세정하였다. 여과액 및 세정액을 조합하고, 물을 사용하여 10 mL 로 희석시켰다. 이러한 용액을 0 ℃ 까지 냉각시키고, 용액의 pH 가 7.5 에 이를 때까지 빙초산으로 중화시켰다. (대안적으로, 건조된 고체 지지체를 60 ℃ 에서 12 시간 동안 35% NH4OH 로 처리하고, 냉각시키고, 여과하고, 빙초산을 이용하여 중화시킬 수 있다. 2'위치에서 플루오로 기를 함유한 올리고의 경우, 35% 암모늄 히드록시드 및 에탄올 (3:1) 의 혼합물을 40 ℃ 를 초과하지 않는 온도와 함께 사용하였다). 미정제 생성물을 UV 분광광도계, 역상 HPLC 및 LC-MS 로 분석하였다. 미정제 생성물의 정제를 RP-HPLC 로 수행하였다. HPLC 정제 후, 각각의 분획을 RP-HPLC 및 LC-MS 로 분석하였다. 순수한 분획을 조합하고, 용매를 진공 하에서 제거하였다 (스피드 백). 잔류물을 물 중에 용해시키고, C-18 카트리지 상에서 탈염시켰다 (트리에틸 암모늄 이온을 소듐 이온으로 대체시킴). 용매를 스피트 백 상에서 제거하고, 잔류물을 원심분리 필터 (Millipore 사의 Amicon Ultra-15) 를 통해 여과하고, 동결건조시키고, 분석하였다.
예를 들어, WV-2578 의 합성의 경우, 라우르산 (11.01 mg, 0.0549 mmol), HATU (19 mg, 0.050 mmol) 및 디이소프로필에틸 아민 (18 ㎕, 0.1 mmol) 의 혼합물을 500 ㎕ 의 무수 NMP 중에 용해시키고, 5 분 동안 철저하게 진탕시켰다. 이러한 활성화된 산을 고체 지지체 (70.5 mg, 0.005 mmol) 상에 올리고뉴클레오티드를 함유하는 플라스틱 바이알 내로 피펫팅하였다. 바이알의 내용물을 철저하게 혼합하고, 12 시간 동안 철저하게 진탕시켰다. 이러한 시간 후, 상청액 NMP 을 주의하여 제거하였다. 고체 지지체를 아세토니트릴 (1 mL x 3) 로 세정하고, 스피트 백에서 건조시켰다. 암모늄 히드록시드 및 메틸 아민 (AMA) 의 1:1 혼합물 (1 mL) 을 첨가하고, 35 ℃ 에서 1 시간 동안 간헐적인 진탕을 수반하여 가열하였다. 1 시간 후, CPG 를 작은 여과 카트리지로 옮기고, 여과하고, DMSO (500 ㎕ x 2) 및 물 (1 mL x 3) 로 세정하였다. 여과액 및 세정액을 조합하고, 물을 사용하여 10 mL 로 희석시켰다. 이러한 용액을 0 ℃ 까지 냉각시키고, 용액의 pH 가 7.5 에 이를 때까지 빙초산으로 중화시켰다. 미정제 생성물의 정제를 RP-HPLC 로 수행하였다. HPLC 정제 후, 각각의 분획을 RP-HPLC 및 LC-MS 로 분석하였다. 순수한 분획을 조합하고, 용매를 진공 하에서 제거하였다 (스피드 백). 잔류물을 물 중에 용해시키고, C-18 카트리지 상에서 탈염시켰다 (트리에틸 암모늄 이온을 소듐 이온으로 대체시킴). 용매를 스피트 백 상에서 제거하고, 잔류물을 원심분리 필터 (Millipore 사의 Amicon Ultra-15) 를 통해 여과하고, 동결건조시키고, 분석하였다. WV2578 의 평균 질량은 계산치: 7355, 확인치 (디콘볼루션된 질량 (deconvoluted mass)):7358 였다. 부가적인 예에는 하기가 포함된다:
Figure pct00557
실시예 생성물에는 하기가 포함된다 (총 OD 및 정제 후 지질 콘쥬게이트의 양):
Figure pct00558
실시예 16. 용액 중 콘쥬게이션을 위한 절차 예.
일부 구현예에서, 제공된 올리고뉴클레오티드를 용액상에서 제조하였다.
액체상에서의 콘쥬게이션을 위한 절차 예:
Figure pct00559
절차 예에서, 지질 산 (1 eq.), HATU (1 eq.) 및 DIPEA (10 eq.) 의 혼합물을 무수 AcCN (10 mL) 중에서 철저하게 혼합하고, 10 분 동안 유지시켰다. 이러한 활성화된 산을 물 (5 mL) 중의 올리고뉴클레오티드 (5 μmol) 에 첨가하고, 볼텍싱 상에서 철저하게 혼합하였다. 이러한 반응액을 1 시간 동안 진탕시켰다. 1 시간 후, 반응의 종결을 LC-MS 로 체크하였다 (통상적으로 반응은 1 시간 내에 완결되며; 그렇지 않은 경우, 추가의 산-HATU 복합체를 첨가하여 반응이 완결되게 할 수 있다). 아세토니트릴 및 물을 스피드 백 상에서 진공 하에서 제거하였다. 수득한 고체를 35% 암모늄 히드록시드 (15 mL) 로 처리하고, 60 ℃ 에서 12 시간 동안 진탕시키고; 2'플루오로 올리고뉴클레오티드의 경우에는, 35% 암모늄 히드록시드 및 에탄올의 3:1 혼합물을 탈보호에 사용하였다. 12 시간 후, 용매를 진공 하에서 제거하고, 물 (15 mL) 로 희석하고, LC-MS 및 RP-HPLC 로 분석하였다. 그 후, 미정제 생성물을 RP-HPLC 로 정제하고, 탈염시켰다.
예를 들어, WV-3546 의 합성의 경우, 투르비나르산 (7 mg, 0.0174 mmol), HATU (6.27 mg, 0.0165 mmol) 및 DIPEA (22.2 mg, 0.172 mmol) 를, 무수 AcCN (10 mL) 중에서 철저하게 혼합하고, 40 mL 플라스틱 바이알 내에서 5 분 동안 유지시켰다. 이러한 활성화된 산을 3.77 mL 물 중의 올리고뉴클레오티드 (80 mg, 0.0117 mmol) 에 첨가하고, 볼텍싱 상에서 철저하게 혼합하였다. 이러한 반응액을 2 시간 동안 진탕시켰다. 2 시간 후, 반응의 종결을 LC-MS 로 체크하였다 (반응이 완결되었다). 아세토니트릴 및 물을 스피드 백 상에서 진공 하에서 제거하였다. 수득한 고체를 암모니아 : 에탄올 혼합물 (3:1, 15 mL) 로 처리하고, 40 ℃ 에서 12 시간 동안 진탕시켰다. 12 시간 후, 용매를 진공 하에서 제거하고, 물 (~15 mL) 로 희석하고, LC-MS 로 분석하였다. 미정제 생성물을 RP-HPLC (물-아세토니트릴 시스템 (0-70% 아세토니트릴 중 50 mM 트리에틸 암모늄 아세테이트, 45 분), X 브릿지 분취용 C8 (19x250 mm 컬럼)) 로 정제하였다. WV3546 의 평균 질량, 계산치: 7295. 확인된 질량 (디콘볼루션된 질량) : 7295.
실시예 17. MMT - C6 -아미노 DPSE -L 아미다이트의 합성 예.
Figure pct00560
클로로옥사자포스폴리딘의 제조 : L-DPSE (37.1 g, 119 mmol) 를 무수 톨루엔 (150 mL) 과 함께 35 ℃ 에서 회전증발기에서 공비 증발시켜 건조시키고, 밤새 고 진공상태로 두었다. 그 후, 무수 톨루엔 (150 mL) 중에 용해된 상기 건조된 L- DPSE (37.1 g) 및 4-메틸모르폴린 (26.4 mL, 24.31 g, 240 mmol) 의 용액을, 아르곤 하에서 (출발 Temp: 0.6 ℃, Max: temp 14 ℃, 25 min 첨가) 캐눌라를 통해 3구 둥근 바닥 플라스크에 위치된 무수 톨루엔 (110 mL) 중의 트리클로로포스핀 (16.51 g, 10.49 mL, 120 mmol) 의 얼음 냉각 용액에 첨가하고, 반응 혼합물을 0 ℃ 에서 40 min 동안 교반하였다. 그 후, 침전된 백색 고체를 공간 필터 튜브 (Chemglass: Filter Tube, 24/40 Inner Joints, 80mm OD Medium Frit, Airfree, Schlenk) 를 사용하여 아르곤 하에서 진공 여과하였다. 용매를 회전증발기를 이용하여 아르곤 하에서 저온에서 (25 ℃), 이어서 진공 하에서 밤새 (~15 h) 건조시키고, 수득한 오일성 클로로옥사자포스폴리딘을 다음 단계에 사용하였다.
MMT - C6 -아미노 DPSE -L 아미다이트 : 6-(모노메톡시트리틸아미노)헥산-1-올 (7.0 g, 17.97 mmol) 을 먼저 무수 톨루엔 (50 ml) 으로의 공비 증발에 의해 건조시키고, 진공 하에서 밤새 건조시켰다. 그 후, 건조된 6-(모노메톡시트리틸아미노)헥산-1-올을 무수 THF (80 mL) 중에 용해시키고, 트리에틸아민 (9.0g, 90 mmol) 을 첨가한 후, 반응 용액을 -70 ℃ 까지 냉각시켰다. 이러한 냉각된 용액에, 무수 THF (50 mL) 중에 용해시킨 클로로옥사자포스폴리딘 (6.76 g, 17.97 mmol) 을 10 min 걸쳐 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온까지 서서히 가온시킨 후 (~1h), TLC 로 출발 물질이 완전히 전환되었음을 확인하였다. 그 후, 반응 혼합물을 적합한 여과 튜브를 사용하여 진공/아르곤 하에서 주의하여 여과하여, 침전된 고체를 제거하고, THF (80 mL) 로 세정하였다. 용액을 25 ℃ 에서 증발시키고, 수득한 오일성 잔류물을 5% TEA 를 포함하는 헥산-CH2Cl2 혼합물 중에 용해시키고, 헥산-EtOAc 혼합물 (5% TEA) 로 ISCO Combi-Flash system 220 g 실리카 컬럼 (이는 3 CV MeOH 로 예비-탈-활성화된 후, 에틸 아세테이트 (5% TEA) 3 CV 로 평형화됨) 을 사용하여 정제하였다. 순수한 분획을 수집하고, 농축시키고, 밤새 건조시켜, MMT-C6-아미노 DPSE-L 아미다이트를 무색 오일성 액체로서 수득하였다. 수율: 8.0g (62%). MS: 계산치: 728.38; +Ve 이온 모드에서 LCMS 분석에 의한 확인치 m/z : 729.54 (M+ 이온), 747.50 (M++18, H2O).
Figure pct00561
실시예 18. WV- 4107 의 제조 예.
제공된 올리고뉴클레오티드 기술을 사용하여, 고체 지지체 상에 및 그에 남아있는 모든 보호기 및 보조제를 갖는 WV-3473 에 대한 조건을 사용하여, 올리고뉴클레오티드를 제조하였다 (절단 및 탈보호되는 경우, WV-3473 을 제공할 수 있음). 절차 예에서, DPSE 화학 및 GE Primer Support 5G (2.1 g), 및 하기 사이클을 사용하였다:
Figure pct00562
마지막 사이클 후, 일부의 올리고뉴클레오티드를 QC 또는 다른 목적을 위하여 절단 및 탈보호시킬 수 있다. 절차 예에서, 지지체 상의 올리고뉴클레오티드를 아세토니트릴 중의 20% 디에틸아민의 6 컬럼 부피로 15 min 동안 세정한 후, 아세토니트릴 세정하였다. 지지체를 건조시킨 후, 3:1 디메틸포름아미드/물 중의 1 M 트리에틸아민 히드로플루오라이드 중에서 50 ℃ 에서 1-1.5 h 동안 인큐베이션하였다. 샘플을 여과하고, 아세토니트릴로 세정하고, 건조시켰다. 그 후, 지지체를 3:1 암모늄 히드록시드/에탄올 중에서 40 ℃ 에서 밤새 인큐베이션하였다.
WV-4107 의 제조의 경우, 마지막 사이클 후, DMT 보호기를 톨루엔 중의 3% 디클로로아세트산을 사용하여 제거하였다. 커플링 단계 동안, MMT-C6-아미노 DPSE-L 아미다이트 (이소부티로니트릴 중의 0.175 M) 및 CMIMT 활성화제 (아세토니트릴 중의 0.6) 를 8 min 의 접촉 시간으로 첨가하였다. 활성화제의 부피% 는 55% 였다. 아세토니트릴 중의 20% 1-메틸이미다졸 및 20/30/50 아세트산 무수물/2,6-루티딘/아세토니트릴을 이용하여 캡핑을 수행하였다. 아세토니트릴 중의 0.1 M PolyOrg Sulfa 를 사용하여 황화를 수행하였다.
그 후, 황색이 더 이상 관찰되지 않을 때까지, 올리고뉴클레오티드가 탈차단 시약 (톨루엔 중의 3% 디클로로아세트산) 과 함께 지지체 상에 있는 동안 MMT 보호기를 제거하여, WV-4191 을 제공하였다. 그 후, 스테아르산을 상기 기재된 절차를 사용하여 아민에 커플링시켰다. 지지체 상의 올리고뉴클레오티드를 아세토니트릴 중의 20% 디에틸아민으로 실온에서 30 min 동안 세정하고, 이어서 아세토니트릴 세정하였다. 지지체를 건조시킨 후, 3:1 디메틸포름아미드/물 중의 1 M 트리에틸아민 히드로플루오라이드 중에서 50 ℃ 에서 1-1.5 h 동안 인큐베이션하였다. 샘플을 여과하고, 아세토니트릴로 세정하고, 건조시켰다. 그 후, 지지체를 3:1 암모늄 히드록시드/에탄올 중에서 40 ℃ 에서 밤새 인큐베이션하였다. 미정제 생성물을 RP-HPLC 를 사용하여 추가로 정제하여, WV-4107 을 제공하였다.
실시예 19. Mod021 을 이용한 올리고뉴클레오티드의 제조 예.
올리고뉴클레오티드를 표준 시아노에틸 포스포라미다이트 화학을 사용하여 10 μmol 의 규모로 합성하고, WV-942 에 대한 조건을 사용하여 보호기와 함께 지지체 상에 남겨 두었다 (절단 및 탈보호되는 경우, WV-942 를 제공할 수 있음). DMT 보호기를 디클로로메탄 중의 3% 트리클로로아세트산을 사용하여 제거하였다. 그 후, 지질 아미다이트를 합성기에서 올리고뉴클레오티드의 5' 말단에 첨가하였다. 커플링 단계 동안, 동일한 부피의 지질 아미다이트 (예를 들어, 이소부티로니트릴 중의 0.1 M) 및 5-에틸티오 테트라졸 (예를 들어, 아세토니트릴 중의 0.5 M) 를, 예를 들어 5 min 의 접촉 시간으로 첨가하였다. 커플링 단계를 임의로 2 회 반복하였다. 피리딘 중의 0.1 M DDTT 를 사용하여 황화를 수행하였다. 올리고뉴클레오티드를 AMA 조건 (암모늄 히드록시드/40% 수성 메틸아민 1:1 v/v) 을 사용하여 절단 및 탈보호시켜, WV-2588 을 제공하였다.
실시예 20. Mod030 , Mod031 , Mod032 및 Mod033 을 이용한 올리고뉴클레오티드의 제조 예.
올리고뉴클레오티드를 WV-2735 에 대한 시아노에틸 포스포라미다이트 화학을 사용하여 합성하고, 보호기와 함께 지지체 상에 두었다 (절단 및 탈보호되는 경우, WV-2735 를 제공할 수 있음). 5'-DMT 보호기를 디클로로메탄 중의 3% 트리클로로아세트산을 사용하여 제거하였다. 그 후, 지질 아미다이트를 합성기에서 올리고뉴클레오티드의 5' 말단에 첨가하였다. 커플링 단계 동안, 동일한 부피의 지질 아미다이트 (이소부티로니트릴 중 또는 디클로로메탄 중의 0.1 M) 및 5-에틸티오 테트라졸 (아세토니트릴 중의 0.5 M) 를 10 min 의 접촉 시간으로 첨가하였다. 커플링 단계를 다시 반복하였다. THF/피리딘/물 중의 0.02 M I2 를 사용하여 산화를 수행하였다. 올리고뉴클레오티드를 아세토니트릴 세정에서 20% 디에틸아민으로 탈보호시킨 후, 이어서 아세토니트릴 세정하였다. 올리고뉴클레오티드를 지지체로부터 절단하고, 추가로 암모늄 히드록시드 중에서 50 ℃ 에서 밤새 탈보호시켰다.
생성물 올리고뉴클레오티드를 각종 화학 분석, 예를 들어 UV, HPLC-MS 등 (예를 들어 MS 데이터, 표 6 참조) 및 생물학적 검정, 예를 들어 본원에 기재된 것들로 특징분석하였다. 유사한 절차에 따라 및/또는 당업계에 널리 공지되고 실시되는 기술을 사용하여, 제공된 올리고뉴클레오티드의 다른 예가 본 개시에 따른 용이하게 제조 및 특징분석되었거나 될 수 있다.
등가물
본 개시의 일부 예시적 구현예를 기재하였지만, 전술한 것은 단지 예시적인 것이고 제한하려는 것이 아닌 것으로, 단지 예로서 제시된 것임이 당업자에게 명백하다. 다수의 변경 및 기타 예시적 구현예가 당업자의 재량 내에 있으며, 본 개시의 범주 내에 속하는 것으로 고려된다. 특히, 본원에 제시된 다수의 실시예가 방법 작용 또는 시스템 요소의 특정 조합을 포함하지만, 이들 작용 및 이들 요소는 동일한 목적을 수행하기 위한 다른 방식과 조합될 수 있다고 이해되어야 한다. 단지 하나의 구현예와 관련하여 논의된 작용, 요소 및 특징은, 다른 구현예에서 유사한 역할로부터 배제되는 것으로 의도되지 않는다. 나아가, 하기 청구범위에서 인용된 하나 이상의 수단 + 기능의 제한에 있어서, 상기 수단은 인용된 기능을 수행하기 위하여 본원에 개시된 수단에 제한되는 것으로 의도되는 것이 아니라, 인용된 기능을 수행하기 위한, 현재 공지된 및 이후 개발되는, 임의의 수단을 포함하는 것으로 의도된다.
청구범위 요소를 변형시키기 위한 청구범위에서 용어 "제 1", "제 2", "제 3" 등의 사용은, 그 자체로 수행되는 방법의 작용에서의 하나의 청구범위 요소의 또 다른 또는 일시적 순서에 대한, 우선순위, 우선함 또는 순서를 의미하는 것이 아니라, 특정 명칭을 갖는 하나의 청구범위 요소를 동일한 명칭을 갖는 또 다른 요소와 구별하기 위한 라벨 (단, 서수 용어를 사용함) 로서 사용된다. 유사하게, a), b) 등, 또는 i), ii) 등의 사용은, 그 자체로 청구범위에서 단계의 임의의 우선순위, 우선함 또는 단계의 순서를 의미하는 것이 아니다. 유사하게, 명세서에의 이들 용어의 사용은 그 자체로 임의의 요구되는 우선순위, 우선함 또는 순서를 의미하는 것이 아니다.
전술한 명세서는 당업자가 본 발명을 실시하기에 충분한 것으로 간주된다. 실시예는 본 발명의 하나의 양태의 하나의 예시로서 의도되고, 다른 기능적으로 등가인 구현예는 본 발명의 범주 내에 속하기 때문에, 본 개시는 제공된 실시예에 의해 그 범주가 제한되는 것이 아니다. 본원에 제시 및 기재된 것들 이외에 본 발명의 각종 변형이 전술한 설명으로부터 당업자에게 명백할 것이며, 이는 첨부된 청구범위의 범주 내에 속할 것이다. 본 발명의 이점 및 목적이 본 발명의 각각의 구현예에 반드시 포함되는 것은 아니다.
SEQUENCE LISTING <110> WAVE LIFE SCIENCES LTD. <120> OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF <130> 2010581-0311 <140> PCT/US2016/056123 <141> 2016-10-07 <150> 62/331,966 <151> 2016-05-04 <150> 62/331,961 <151> 2016-05-04 <150> 62/239,839 <151> 2015-10-09 <160> 1324 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1 gcctcagtct gcttcgcacc 20 <210> 2 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 2 gcctcagtct gcttcgcacc 20 <210> 3 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 3 aatcgatcga tcg 13 <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 4 gcctcagtct gcttcgcacc 20 <210> 5 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> 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oligonucleotide <400> 11 uuuggaaguc ugugcccuug ugccc 25 <210> 12 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 12 gcctcagtct gcttcgcacc 20 <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 13 gagcagctgc aacctggcaa 20 <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 14 gggcacaagg gcacagactt 20 <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 15 gcacaagggc acagacttcc 20 <210> 16 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 16 cacaagggca cagacttcca 20 <210> 17 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 17 acaagggcac agacttccaa 20 <210> 18 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 18 caagggcaca gacttccaaa 20 <210> 19 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 19 agcagctgca acctggcaac 20 <210> 20 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 20 gcagctgcaa cctggcaaca 20 <210> 21 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 21 cagctgcaac ctggcaacaa 20 <210> 22 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 22 agctgcaacc tggcaacaac 20 <210> 23 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 23 gctgcaacct ggcaacaacc 20 <210> 24 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 24 gggccaacag ccagcctgca 20 <210> 25 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 25 ggccaacagc cagcctgcag 20 <210> 26 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 26 gccaacagcc agcctgcagg 20 <210> 27 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 27 ccaacagcca gcctgcagga 20 <210> 28 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 28 caacagccag cctgcaggag 20 <210> 29 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 29 aacagccagc ctgcaggagg 20 <210> 30 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 30 attaataaat tgtcatcacc 20 <210> 31 <211> 16 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 31 ttcagtcatg acttcc 16 <210> 32 <211> 16 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 32 ttcagtcatg acttcc 16 <210> 33 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 33 gcctcagtct gcttcgcacc 20 <210> 34 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 34 ggcacaaggg cacagacttc 20 <210> 35 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 35 ccgtcgccct tcagcacgca 20 <210> 36 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 36 ccgtcgccct tcagcacgca 20 <210> 37 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 37 ccgtcgccct tcagcacgca 20 <210> 38 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 38 ccgtcgccct tcagcacgca 20 <210> 39 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 39 ccgtcgccct tcagcacgca 20 <210> 40 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 40 ccgtcgccct tcagcacgca 20 <210> 41 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 41 gtccctgaag atgtcaatgc 20 <210> 42 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 42 gtccctgaag atgtcaatgc 20 <210> 43 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 43 gtccctgaag atgtcaatgc 20 <210> 44 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 44 gtccctgaag atgtcaatgc 20 <210> 45 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 45 gtccctgaag atgtcaatgc 20 <210> 46 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 46 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 47 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 47 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 48 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 48 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 49 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 49 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 50 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 50 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 51 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 51 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 52 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 52 ggcacaaggg cacagacuuc 20 <210> 53 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 53 ggcacaaggg cacagacttc 20 <210> 54 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 54 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 55 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 55 tcaaggaaga tggcatttct 20 <210> 56 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 56 tcaaggaaga uggcatttct 20 <210> 57 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 57 ucaaggaaga tggcatuucu 20 <210> 58 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 58 tcaaggaaga tggcautucu 20 <210> 59 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 59 ucaaggaaga uggcatutcu 20 <210> 60 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 60 tcaaggaaga tggcauutcu 20 <210> 61 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 61 tcaaggaaga uggcauttcu 20 <210> 62 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 62 tcaaggaaga tggcatttcu 20 <210> 63 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 63 tcaaggaaga tggcauttcu 20 <210> 64 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 64 ucaaggaaga uggcatttcu 20 <210> 65 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 65 ggccaaacct cggcttacct 20 <210> 66 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 66 ggccaaaccu cggcuuaccu 20 <210> 67 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 67 ggccaaaccu cggcttacct 20 <210> 68 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial 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of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 72 ggccaaaccu cggcttaccu 20 <210> 73 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 73 ggccaaaccu cggcutaccu 20 <210> 74 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 74 agaaaugcca ucuuccuuga 20 <210> 75 <211> 30 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 75 cuccaacauc aaggaagaug gcauuucuag 30 <210> 76 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 76 accagaguaa cagucugagu aggag 25 <210> 77 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 77 caccagagua acagucugag uagga 25 <210> 78 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 78 ucaccagagu aacagucuga guagg 25 <210> 79 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 79 gucaccagag uaacagucug aguag 25 <210> 80 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 80 guugugucac cagaguaaca gucug 25 <210> 81 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 81 gguuguguca ccagaguaac agucu 25 <210> 82 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 82 agguuguguc accagaguaa caguc 25 <210> 83 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 83 cagguugugu caccagagua acagu 25 <210> 84 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 84 acagguugug ucaccagagu aacag 25 <210> 85 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 85 ccacagguug ugucaccaga guaac 25 <210> 86 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 86 accacagguu gugucaccag aguaa 25 <210> 87 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 87 aaccacaggu ugugucacca gagua 25 <210> 88 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 88 uaaccacagg uugugucacc agagu 25 <210> 89 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 89 guaaccacag guugugucac cagag 25 <210> 90 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 90 aguaaccaca gguuguguca ccaga 25 <210> 91 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 91 uaguaaccac agguuguguc accag 25 <210> 92 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 92 uuaguaacca cagguugugu cacca 25 <210> 93 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 93 cuuaguaacc acagguugug ucacc 25 <210> 94 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 94 ccuuaguaac cacagguugu gucac 25 <210> 95 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 95 uccuuaguaa ccacagguug uguca 25 <210> 96 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 96 guuuccuuag uaaccacagg uugug 25 <210> 97 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 97 aguuuccuua guaaccacag guugu 25 <210> 98 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 98 caguuuccuu aguaaccaca gguug 25 <210> 99 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 99 gcaguuuccu uaguaaccac agguu 25 <210> 100 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 100 ggcaguuucc uuaguaacca caggu 25 <210> 101 <211> 25 <212> RNA <213> 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25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 107 uuggagaugg caguuuccuu aguaa 25 <210> 108 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 108 uuuggagaug gcaguuuccu uagua 25 <210> 109 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 109 aguuuggaga uggcaguuuc cuuag 25 <210> 110 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 110 uaguuuggag auggcaguuu ccuua 25 <210> 111 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 111 cuaguuugga gauggcaguu uccuu 25 <210> 112 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 112 ucuaguuugg agauggcagu uuccu 25 <210> 113 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 113 uucuaguuug gagauggcag uuucc 25 <210> 114 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 114 cauuucuagu uuggagaugg caguu 25 <210> 115 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 115 gcauuucuag uuuggagaug gcagu 25 <210> 116 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 116 auggcauuuc uaguuuggag auggc 25 <210> 117 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 117 gaagauggca uuucuaguuu ggaga 25 <210> 118 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 118 aggaagaugg cauuucuagu uugga 25 <210> 119 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 119 aaggaagaug gcauuucuag uuugg 25 <210> 120 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 120 caaggaagau ggcauuucua guuug 25 <210> 121 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 121 caucaaggaa gauggcauuu cuagu 25 <210> 122 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 122 acaucaagga agauggcauu ucuag 25 <210> 123 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 123 aacaucaagg aagauggcau uucua 25 <210> 124 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 124 caacaucaag gaagauggca uuucu 25 <210> 125 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 125 cuccaacauc aaggaagaug gcauu 25 <210> 126 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 126 accuccaaca ucaaggaaga uggca 25 <210> 127 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 127 guaccuccaa caucaaggaa gaugg 25 <210> 128 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 128 agguaccucc aacaucaagg aagau 25 <210> 129 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 129 agagcaggua ccuccaacau caagg 25 <210> 130 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 130 cagagcaggu accuccaaca ucaag 25 <210> 131 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 131 cugccagagc agguaccucc aacau 25 <210> 132 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 132 ucugccagag cagguaccuc caaca 25 <210> 133 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 133 aucugccaga gcagguaccu ccaac 25 <210> 134 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 134 aaucugccag agcagguacc uccaa 25 <210> 135 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 135 aaaucugcca gagcagguac cucca 25 <210> 136 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 136 gaaaucugcc agagcaggua ccucc 25 <210> 137 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 137 ugaaaucugc cagagcaggu accuc 25 <210> 138 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 138 uugaaaucug ccagagcagg uaccu 25 <210> 139 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 139 cccgguugaa aucugccaga gcagg 25 <210> 140 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 140 ccaagcccgg uugaaaucug ccaga 25 <210> 141 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 141 uccaagcccg guugaaaucu gccag 25 <210> 142 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 142 guccaagccc gguugaaauc ugcca 25 <210> 143 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 143 ucuguccaag cccgguugaa aucug 25 <210> 144 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 144 uucuguccaa gcccgguuga aaucu 25 <210> 145 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 145 guucugucca agcccgguug aaauc 25 <210> 146 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 146 aguucugucc aagcccgguu gaaau 25 <210> 147 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 147 aaguucuguc caagcccggu ugaaa 25 <210> 148 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 148 uaaguucugu ccaagcccgg uugaa 25 <210> 149 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 149 guaaguucug uccaagcccg guuga 25 <210> 150 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 150 gguaaguucu guccaagccc gguug 25 <210> 151 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 151 cgguaaguuc uguccaagcc cgguu 25 <210> 152 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 152 ucgguaaguu cuguccaagc ccggu 25 <210> 153 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 153 gucgguaagu ucuguccaag cccgg 25 <210> 154 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 154 agucgguaag uucuguccaa gcccg 25 <210> 155 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 155 cagucgguaa guucugucca agccc 25 <210> 156 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 156 aaagccaguc gguaaguucu gucca 25 <210> 157 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 157 gaaagccagu cgguaaguuc ugucc 25 <210> 158 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 158 gucacccacc aucacccucu gugau 25 <210> 159 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 159 ggucacccac caucacccuc uguga 25 <210> 160 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 160 aaggucaccc accaucaccc ucugu 25 <210> 161 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 161 caaggucacc caccaucacc cucug 25 <210> 162 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 162 ucaaggucac ccaccaucac ccucu 25 <210> 163 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 163 cucaagguca cccaccauca cccuc 25 <210> 164 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 164 cuugaucaag cagagaaagc caguc 25 <210> 165 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 165 auaacuugau caagcagaga aagcc 25 <210> 166 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 166 aguaacaguc ugaguaggag 20 <210> 167 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 167 gaguaacagu cugaguagga 20 <210> 168 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 168 agaguaacag ucugaguagg 20 <210> 169 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 169 cagaguaaca gucugaguag 20 <210> 170 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 170 gucaccagag uaacagucug 20 <210> 171 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 171 ugucaccaga guaacagucu 20 <210> 172 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 172 gugucaccag aguaacaguc 20 <210> 173 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 173 ugugucacca gaguaacagu 20 <210> 174 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 174 uugugucacc agaguaacag 20 <210> 175 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 175 gguuguguca ccagaguaac 20 <210> 176 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 176 agguuguguc accagaguaa 20 <210> 177 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 177 cagguugugu caccagagua 20 <210> 178 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 178 acagguugug ucaccagagu 20 <210> 179 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 179 cacagguugu gucaccagag 20 <210> 180 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 180 ccacagguug ugucaccaga 20 <210> 181 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 181 accacagguu gugucaccag 20 <210> 182 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 182 aaccacaggu ugugucacca 20 <210> 183 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 183 uaaccacagg uugugucacc 20 <210> 184 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 184 guaaccacag guugugucac 20 <210> 185 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 185 aguaaccaca gguuguguca 20 <210> 186 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 186 cuuaguaacc acagguugug 20 <210> 187 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 187 ccuuaguaac cacagguugu 20 <210> 188 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 188 uccuuaguaa ccacagguug 20 <210> 189 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 189 uuccuuagua accacagguu 20 <210> 190 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 190 uuuccuuagu aaccacaggu 20 <210> 191 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 191 guuuccuuag uaaccacagg 20 <210> 192 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 192 aguuuccuua guaaccacag 20 <210> 193 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 193 gcaguuuccu uaguaaccac 20 <210> 194 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 194 ggcaguuucc uuaguaacca 20 <210> 195 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 195 uggcaguuuc cuuaguaacc 20 <210> 196 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 196 auggcaguuu ccuuaguaac 20 <210> 197 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 197 gauggcaguu uccuuaguaa 20 <210> 198 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 198 agauggcagu uuccuuagua 20 <210> 199 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 199 ggagauggca guuuccuuag 20 <210> 200 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 200 uggagauggc aguuuccuua 20 <210> 201 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 201 uuggagaugg caguuuccuu 20 <210> 202 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 202 uuuggagaug gcaguuuccu 20 <210> 203 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 203 guuuggagau ggcaguuucc 20 <210> 204 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 204 cuaguuugga gauggcaguu 20 <210> 205 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 205 ucuaguuugg agauggcagu 20 <210> 206 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 206 auuucuaguu uggagauggc 20 <210> 207 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 207 uggcauuucu aguuuggaga 20 <210> 208 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 208 gauggcauuu cuaguuugga 20 <210> 209 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 209 agauggcauu ucuaguuugg 20 <210> 210 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 210 aagauggcau uucuaguuug 20 <210> 211 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 211 aggaagaugg cauuucuagu 20 <210> 212 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 212 aaggaagaug gcauuucuag 20 <210> 213 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 213 caaggaagau ggcauuucua 20 <210> 214 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 214 acaucaagga agauggcauu 20 <210> 215 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 215 caacaucaag gaagauggca 20 <210> 216 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 216 uccaacauca aggaagaugg 20 <210> 217 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 217 ccuccaacau caaggaagau 20 <210> 218 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 218 agguaccucc aacaucaagg 20 <210> 219 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 219 cagguaccuc caacaucaag 20 <210> 220 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 220 agagcaggua ccuccaacau 20 <210> 221 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 221 cagagcaggu accuccaaca 20 <210> 222 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 222 ccagagcagg uaccuccaac 20 <210> 223 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 223 gccagagcag guaccuccaa 20 <210> 224 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 224 ugccagagca gguaccucca 20 <210> 225 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 225 cugccagagc agguaccucc 20 <210> 226 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 226 ucugccagag cagguaccuc 20 <210> 227 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 227 aucugccaga gcagguaccu 20 <210> 228 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 228 uugaaaucug ccagagcagg 20 <210> 229 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 229 cccgguugaa aucugccaga 20 <210> 230 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 230 gcccgguuga aaucugccag 20 <210> 231 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 231 agcccgguug aaaucugcca 20 <210> 232 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 232 ccaagcccgg uugaaaucug 20 <210> 233 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 233 uccaagcccg guugaaaucu 20 <210> 234 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 234 guccaagccc gguugaaauc 20 <210> 235 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 235 uguccaagcc cgguugaaau 20 <210> 236 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 236 cuguccaagc ccgguugaaa 20 <210> 237 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 237 ucuguccaag cccgguugaa 20 <210> 238 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 238 uucuguccaa gcccgguuga 20 <210> 239 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 239 guucugucca agcccgguug 20 <210> 240 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 240 aguucugucc aagcccgguu 20 <210> 241 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 241 aaguucuguc caagcccggu 20 <210> 242 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 242 uaaguucugu ccaagcccgg 20 <210> 243 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 243 guaaguucug uccaagcccg 20 <210> 244 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 244 gguaaguucu guccaagccc 20 <210> 245 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 245 cagucgguaa guucugucca 20 <210> 246 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 246 ccagucggua aguucugucc 20 <210> 247 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 247 ccaccaucac ccucugugau 20 <210> 248 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 248 cccaccauca cccucuguga 20 <210> 249 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 249 cacccaccau cacccucugu 20 <210> 250 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 250 ucacccacca ucacccucug 20 <210> 251 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 251 gucacccacc aucacccucu 20 <210> 252 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 252 ggucacccac caucacccuc 20 <210> 253 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 253 ucaagcagag aaagccaguc 20 <210> 254 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 254 uugaucaagc agagaaagcc 20 <210> 255 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 255 caaagaagau ggcauuucua guuug 25 <210> 256 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 256 gcaaagaaga uggcauuucu 20 <210> 257 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 257 ggccaaaccu cggcuuaccu gaaau 25 <210> 258 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 258 ucaaggaaga tggcauuucu 20 <210> 259 <211> 30 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 259 gccaacuggg agcuggagcg caccaaccag 30 <210> 260 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 260 ccuucccuga agguuccucc 20 <210> 261 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 261 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 262 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 262 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 263 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 263 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 264 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 264 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 265 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 265 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 266 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 266 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 267 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 267 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 268 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 268 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 269 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 269 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 270 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 270 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 271 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 271 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 272 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 272 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 273 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 273 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 274 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 274 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 275 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 275 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 276 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 276 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 277 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 277 tcaaggaaga tggcatttct 20 <210> 278 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 278 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 279 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 279 tcaaggaaga tggcatttct 20 <210> 280 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 280 tcaaggaaga tggcatttct 20 <210> 281 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 281 tcaaggaaga uggcatttct 20 <210> 282 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 282 ucaaggaaga tggcatuucu 20 <210> 283 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 283 tcaaggaaga tggcautucu 20 <210> 284 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 284 ucaaggaaga uggcatutcu 20 <210> 285 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 285 tcaaggaaga tggcauutcu 20 <210> 286 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 286 tcaaggaaga uggcauttcu 20 <210> 287 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 287 tcaaggaaga tggcatttcu 20 <210> 288 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 288 tcaaggaaga tggcauttcu 20 <210> 289 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 289 ucaaggaaga uggcatttcu 20 <210> 290 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 290 tcaaggaaga tggcatttcu 20 <210> 291 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 291 tcaaggaaga uggcatttct 20 <210> 292 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 292 ucaaggaaga tggcatuucu 20 <210> 293 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 293 tcaaggaaga tggcautucu 20 <210> 294 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 294 ucaaggaaga uggcatutcu 20 <210> 295 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 295 tcaaggaaga tggcauutcu 20 <210> 296 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 296 tcaaggaaga uggcauttcu 20 <210> 297 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 297 tcaaggaaga tggcatttcu 20 <210> 298 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 298 tcaaggaaga tggcauttcu 20 <210> 299 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 299 ucaaggaaga uggcatttcu 20 <210> 300 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 300 tcaaggaaga tggcatttcu 20 <210> 301 <211> 20 <212> RNA <213> 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Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 307 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 308 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 308 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 309 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 309 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 310 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 310 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 311 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 311 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 312 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 312 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 313 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 313 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 314 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 314 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 315 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 315 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 316 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 316 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 317 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 317 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 318 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 318 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 319 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 319 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 320 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 320 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 321 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 321 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 322 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 322 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 323 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 323 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 324 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 324 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 325 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 325 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 326 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 326 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 327 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 327 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 328 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 328 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 329 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 329 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 330 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 330 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 331 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial 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Synthetic oligonucleotide <400> 337 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 338 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 338 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 339 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 339 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 340 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 340 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 341 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 341 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 342 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 342 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 343 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 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uggcauuucu 20 <210> 362 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 362 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 363 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 363 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 364 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 364 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 365 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 365 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 366 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 366 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 367 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 367 ucaaggaaga uggcauuucu 20 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20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 426 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 427 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 427 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 428 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 428 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 429 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 429 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 430 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 430 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 431 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 431 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 432 <211> 20 <212> RNA 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Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 514 cgguaaguuc uguccaagcc cgguu 25 <210> 515 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 515 ucgguaaguu cuguccaagc ccggu 25 <210> 516 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 516 gucgguaagu ucuguccaag cccgg 25 <210> 517 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 517 agucgguaag uucuguccaa gcccg 25 <210> 518 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 518 cagucgguaa guucugucca agccc 25 <210> 519 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 519 aaagccaguc gguaaguucu gucca 25 <210> 520 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 520 gaaagccagu cgguaaguuc ugucc 25 <210> 521 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 521 gucacccacc aucacccucu gugau 25 <210> 522 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 522 ggucacccac caucacccuc uguga 25 <210> 523 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 523 aaggucaccc accaucaccc ucugu 25 <210> 524 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 524 caaggucacc caccaucacc cucug 25 <210> 525 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 525 ucaaggucac ccaccaucac ccucu 25 <210> 526 <211> 25 <212> RNA <213> Artificial 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Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 532 cagaguaaca gucugaguag 20 <210> 533 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 533 gucaccagag uaacagucug 20 <210> 534 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 534 ugucaccaga guaacagucu 20 <210> 535 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 535 gugucaccag aguaacaguc 20 <210> 536 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 536 ugugucacca gaguaacagu 20 <210> 537 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 537 uugugucacc agaguaacag 20 <210> 538 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial 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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 544 accacagguu gugucaccag 20 <210> 545 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 545 aaccacaggu ugugucacca 20 <210> 546 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 546 uaaccacagg uugugucacc 20 <210> 547 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 547 guaaccacag guugugucac 20 <210> 548 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 548 aguaaccaca gguuguguca 20 <210> 549 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 549 cuuaguaacc acagguugug 20 <210> 550 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 550 ccuuaguaac cacagguugu 20 <210> 551 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 551 uccuuaguaa ccacagguug 20 <210> 552 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 552 uuccuuagua accacagguu 20 <210> 553 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 553 uuuccuuagu aaccacaggu 20 <210> 554 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 554 guuuccuuag uaaccacagg 20 <210> 555 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 555 aguuuccuua guaaccacag 20 <210> 556 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 556 gcaguuuccu uaguaaccac 20 <210> 557 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 557 ggcaguuucc uuaguaacca 20 <210> 558 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 558 uggcaguuuc cuuaguaacc 20 <210> 559 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 559 auggcaguuu ccuuaguaac 20 <210> 560 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 560 gauggcaguu uccuuaguaa 20 <210> 561 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 561 agauggcagu uuccuuagua 20 <210> 562 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial 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Synthetic oligonucleotide <400> 568 ucuaguuugg agauggcagu 20 <210> 569 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 569 auuucuaguu uggagauggc 20 <210> 570 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 570 uggcauuucu aguuuggaga 20 <210> 571 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 571 gauggcauuu cuaguuugga 20 <210> 572 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 572 agauggcauu ucuaguuugg 20 <210> 573 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 573 aagauggcau uucuaguuug 20 <210> 574 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 623 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 624 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 624 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 625 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 625 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 626 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 626 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 627 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 627 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 628 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 628 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 629 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 629 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 630 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 630 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 631 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 631 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 632 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 632 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 633 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 633 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 634 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 634 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 635 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of 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Synthetic oligonucleotide <400> 647 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 648 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 648 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 649 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 649 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 650 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 650 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 651 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 651 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 652 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 652 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 653 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 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Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 714 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 715 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 715 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 716 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 716 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 717 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 717 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 718 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 718 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 719 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 719 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 720 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 720 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 721 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 721 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 722 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 722 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 723 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 723 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 724 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 724 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 725 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 725 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 726 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial 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uggcauuucu 20 <210> 836 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 836 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 837 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 837 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 838 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 838 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 839 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 839 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 840 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 840 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 841 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 841 ucaaggaaga uggcauuucu 20 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20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 848 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 849 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 849 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 850 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 850 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 851 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 851 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 852 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 852 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 853 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 853 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 854 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 854 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 855 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 855 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 856 <211> 30 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 856 gccaacuggg agcuggagcg caccaaccag 30 <210> 857 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 857 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 858 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 858 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 859 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 859 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 860 <211> 20 <212> RNA <213> 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Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 884 tagatagcta tatat 15 <210> 885 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 885 atagatagct atata 15 <210> 886 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 886 tatagatagc tatat 15 <210> 887 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 887 atatagatag ctata 15 <210> 888 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 888 gatatagata gctat 15 <210> 889 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 889 atagatagct at 12 <210> 890 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide 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Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 903 atatagatat ag 12 <210> 904 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 904 atagctatat agata 15 <210> 905 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 905 aaaaaatagc tatat 15 <210> 906 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 906 gttaaaaaaa atagc 15 <210> 907 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 907 aggaagttaa aaaaa 15 <210> 908 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 908 aataaaggaa gttaa 15 <210> 909 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide 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Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 922 ttgattttgt ct 12 <210> 923 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 923 tttttgattt tgtct 15 <210> 924 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 924 tttgattttg tc 12 <210> 925 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 925 ctttttgatt ttgtc 15 <210> 926 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 926 ttttgatttt gt 12 <210> 927 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 927 tttttgattt tg 12 <210> 928 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 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Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 966 tcataatgct gg 12 <210> 967 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 967 actttcataa tgctg 15 <210> 968 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 968 ttcataatgc tg 12 <210> 969 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 969 cactttcata atgct 15 <210> 970 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 970 tttcataatg ct 12 <210> 971 <211> 15 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 971 tcactttcat aatgc 15 <210> 972 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic 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Synthetic oligonucleotide <400> 997 cactttcata atgctgg 17 <210> 998 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 998 cactttcata atgctgg 17 <210> 999 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 999 cactttcata atgctgg 17 <210> 1000 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1000 cactttcata atgctgg 17 <210> 1001 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1001 cactttcata atgctgg 17 <210> 1002 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1002 cactttcata atgctgg 17 <210> 1003 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide 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21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1041 ccagcatttc ctgcaaatga g 21 <210> 1042 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1042 ccagcatttc ctgcaaatga g 21 <210> 1043 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1043 ccagcatttc ctgcaaatga g 21 <210> 1044 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1044 ccagcatttc ctgcaaatga g 21 <210> 1045 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1045 ccagcatttc ctgcaaatga g 21 <210> 1046 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1046 ccagcatttc ctgcaaatga g 21 <210> 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atgccagcat ttcctgcaaa tgaga 25 <210> 1053 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1053 atgccagcat ttcctgcaaa tgaga 25 <210> 1054 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1054 atgccagcat ttcctgcaaa tgaga 25 <210> 1055 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1055 atgccagcat ttcctgcaaa tgaga 25 <210> 1056 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1056 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1057 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1057 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1058 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1058 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1059 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1059 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1060 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1060 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1061 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1061 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1062 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1062 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1063 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1063 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1064 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1064 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1065 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1065 gctctatgcc agcatttcct gcaaa 25 <210> 1066 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1066 gtgatggtgg gtgaccttga g 21 <210> 1067 <211> 19 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1067 tttgggcagc ggtaatgag 19 <210> 1068 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1068 caagcagaag gcaacaa 17 <210> 1069 <211> 26 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1069 tgaaaataag ctcaagcaga caaatc 26 <210> 1070 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1070 gacgcctctg ttccaaatcc 20 <210> 1071 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1071 cagtggataa aggcaaca 18 <210> 1072 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1072 cagtctgctt cg 12 <210> 1073 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1073 gcctcagtct gcttcgcacc 20 <210> 1074 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1074 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1075 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1075 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1076 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1076 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1077 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1077 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1078 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1078 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1079 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1079 agcaaaacag gucuagaatt 20 <210> 1080 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1080 agcaaaacag gucuagaatt 20 <210> 1081 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1081 agcaaaacag gucuagaatt 20 <210> 1082 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1082 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1083 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1083 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1084 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1084 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1085 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1085 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1086 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1086 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1087 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1087 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1088 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1088 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1089 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1089 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1090 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1090 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1091 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1091 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1092 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1092 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1093 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1093 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1094 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1094 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1095 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1095 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1096 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1096 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1097 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1097 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1098 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1098 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1099 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1099 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1100 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1100 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1101 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1101 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1102 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1102 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1103 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1103 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1104 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1104 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1105 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1105 uucuagaccu guuuugcuut t 21 <210> 1106 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1106 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1107 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1107 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1108 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1108 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1109 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1109 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1110 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1110 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1111 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1111 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1112 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1112 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1113 <211> 21 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <223> Description of Combined DNA/RNA Molecule: Synthetic oligonucleotide <400> 1113 aagcaaaaca ggucuagaat t 21 <210> 1114 <211> 10 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1114 acacacacac 10 <210> 1115 <211> 10 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1115 cccccccccc 10 <210> 1116 <211> 10 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1116 cccccccccc 10 <210> 1117 <211> 10 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1117 cccccccccc 10 <210> 1118 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1118 ggatgttctc ga 12 <210> 1119 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1119 ggatgttctc ga 12 <210> 1120 <211> 12 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1120 ggatgttctc ga 12 <210> 1121 <211> 60 <212> DNA <213> Mus musculus <400> 1121 gtggttacta aggaaactgt catctccaaa ctagaaatgc catcttcttt gctgttggag 60 <210> 1122 <211> 60 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1122 gtggttacta aggaaactgc catctccaaa ctagaaatgc catcttcctt gatgttggag 60 <210> 1123 <211> 19 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1123 ucaaggaaga uggcauuuc 19 <210> 1124 <211> 18 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1124 ucaaggaaga uggcauuu 18 <210> 1125 <211> 19 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1125 caaggaagau ggcauuucu 19 <210> 1126 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1126 ggccaaaccu cggcuuaccu 20 <210> 1127 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1127 uucuguaagg uuuuuaugug 20 <210> 1128 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1128 auuucuguaa gguuuuuaug 20 <210> 1129 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1129 ccauuucugu aagguuuuua 20 <210> 1130 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1130 auccauuucu guaagguuuu 20 <210> 1131 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1131 cauccauuuc uguaagguuu 20 <210> 1132 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1132 ccauccauuu cuguaagguu 20 <210> 1133 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1133 gccauccauu ucuguaaggu 20 <210> 1134 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1134 agccauccau uucuguaagg 20 <210> 1135 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1135 cagccaucca uuucuguaag 20 <210> 1136 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1136 ucagccaucc auuucuguaa 20 <210> 1137 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1137 uucagccauc cauuucugua 20 <210> 1138 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1138 cuucagccau ccauuucugu 20 <210> 1139 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1139 acuucagcca uccauuucug 20 <210> 1140 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1140 aacuucagcc auccauuucu 20 <210> 1141 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1141 caacuucagc cauccauuuc 20 <210> 1142 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1142 ucaacuucag ccauccauuu 20 <210> 1143 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1143 aucaacuuca gccauccauu 20 <210> 1144 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1144 caucaacuuc agccauccau 20 <210> 1145 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1145 acaucaacuu cagccaucca 20 <210> 1146 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1146 aacaucaacu ucagccaucc 20 <210> 1147 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1147 gaaaacauca acuucagcca 20 <210> 1148 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1148 caggaaaaca ucaacuucag 20 <210> 1149 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1149 uuucaggaaa acaucaacuu 20 <210> 1150 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1150 cucuuucagg aaaacaucaa 20 <210> 1151 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1151 uuccucuuuc aggaaaacau 20 <210> 1152 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1152 gccauuccuc uuucaggaaa 20 <210> 1153 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1153 ggccauuccu cuuucaggaa 20 <210> 1154 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1154 aggccauucc ucuuucagga 20 <210> 1155 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1155 caggccauuc cucuuucagg 20 <210> 1156 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1156 gcaggccauu ccucuuucag 20 <210> 1157 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1157 ggcaggccau uccucuuuca 20 <210> 1158 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1158 gggcaggcca uuccucuuuc 20 <210> 1159 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1159 agggcaggcc auuccucuuu 20 <210> 1160 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1160 cagggcaggc cauuccucuu 20 <210> 1161 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1161 ccagggcagg ccauuccucu 20 <210> 1162 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1162 cccagggcag gccauuccuc 20 <210> 1163 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1163 ccccagggca ggccauuccu 20 <210> 1164 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1164 cccccagggc aggccauucc 20 <210> 1165 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1165 ucccccaggg caggccauuc 20 <210> 1166 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1166 aucccccagg gcaggccauu 20 <210> 1167 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1167 caucccccag ggcaggccau 20 <210> 1168 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1168 gcauccccca gggcaggcca 20 <210> 1169 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1169 agcauccccc agggcaggcc 20 <210> 1170 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1170 cagcaucccc cagggcaggc 20 <210> 1171 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1171 ucagcauccc ccagggcagg 20 <210> 1172 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1172 uucagcaucc cccagggcag 20 <210> 1173 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1173 uuucagcauc ccccagggca 20 <210> 1174 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1174 auuucagcau cccccagggc 20 <210> 1175 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1175 gauuucagca ucccccaggg 20 <210> 1176 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1176 ggauuucagc aucccccagg 20 <210> 1177 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1177 aggauuucag caucccccag 20 <210> 1178 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1178 caggauuuca gcauccccca 20 <210> 1179 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1179 ucaggauuuc agcauccccc 20 <210> 1180 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1180 uucaggauuu cagcaucccc 20 <210> 1181 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1181 uuucaggauu ucagcauccc 20 <210> 1182 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1182 uuuucaggau uucagcaucc 20 <210> 1183 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1183 uuuuucagga uuucagcauc 20 <210> 1184 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1184 uuuuuucagg auuucagcau 20 <210> 1185 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1185 guuuuuucag gauuucagca 20 <210> 1186 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1186 uguuuuuuca ggauuucagc 20 <210> 1187 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1187 cuguuuuuuc aggauuucag 20 <210> 1188 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1188 gcuguuuuuu caggauuuca 20 <210> 1189 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1189 agcuguuuuu ucaggauuuc 20 <210> 1190 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1190 gagcuguuuu uucaggauuu 20 <210> 1191 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1191 ugagcuguuu uuucaggauu 20 <210> 1192 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1192 uugagcuguu uuuucaggau 20 <210> 1193 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1193 uuugagcugu uuuuucagga 20 <210> 1194 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1194 guuugagcug uuuuuucagg 20 <210> 1195 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1195 uuguuugagc uguuuuuuca 20 <210> 1196 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1196 cauuguuuga gcuguuuuuu 20 <210> 1197 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1197 gcauuguuug agcuguuuuu 20 <210> 1198 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1198 ugcauuguuu gagcuguuuu 20 <210> 1199 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1199 cugcauuguu ugagcuguuu 20 <210> 1200 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1200 ucugcauugu uugagcuguu 20 <210> 1201 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1201 cucugcauug uuugagcugu 20 <210> 1202 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1202 acucugcauu guuugagcug 20 <210> 1203 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1203 uacucugcau uguuugagcu 20 <210> 1204 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1204 uuacucugca uuguuugagc 20 <210> 1205 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1205 cuuacucugc auuguuugag 20 <210> 1206 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1206 ucuuacucug cauuguuuga 20 <210> 1207 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1207 aucuuacucu gcauuguuug 20 <210> 1208 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1208 aaucuuacuc ugcauuguuu 20 <210> 1209 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1209 caaaucuuac ucugcauugu 20 <210> 1210 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1210 gauacaaauc uuacucugca 20 <210> 1211 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1211 gggtcagctg ccaatgctag 20 <210> 1212 <211> 15 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1212 ucaaggaaga uggca 15 <210> 1213 <211> 15 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1213 caaggaagau ggcau 15 <210> 1214 <211> 15 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1214 aaggaagaug gcauu 15 <210> 1215 <211> 15 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1215 aggaagaugg cauuu 15 <210> 1216 <211> 15 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1216 ggaagauggc auuuc 15 <210> 1217 <211> 15 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1217 gaagauggca uuucu 15 <210> 1218 <211> 18 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1218 caaggaagau ggcauuuc 18 <210> 1219 <211> 18 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1219 aaggaagaug gcauuucu 18 <210> 1220 <211> 16 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1220 aaggaagaug gcauuu 16 <210> 1221 <211> 17 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1221 caaggaagau ggcauuu 17 <210> 1222 <211> 17 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1222 aaggaagaug gcauuuc 17 <210> 1223 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1223 aggaagaugg cauu 14 <210> 1224 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1224 ucaaggaaga uggc 14 <210> 1225 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1225 caaggaagau ggca 14 <210> 1226 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1226 aaggaagaug gcau 14 <210> 1227 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1227 ggaagauggc auuu 14 <210> 1228 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1228 gaagauggca uuuc 14 <210> 1229 <211> 14 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1229 aagauggcau uucu 14 <210> 1230 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1230 ucaaggaaga uggcauuucu 20 <210> 1231 <211> 19 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1231 ucaaggaaga uggcauuuc 19 <210> 1232 <211> 18 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1232 ucaaggaaga uggcauuu 18 <210> 1233 <211> 19 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1233 caaggaagau ggcauuucu 19 <210> 1234 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1234 ggccaaaccu cggcuuaccu 20 <210> 1235 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1235 ggccaaaccu cggcuuaccu 20 <210> 1236 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1236 uucuguaagg uuuuuaugug 20 <210> 1237 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1237 auuucuguaa gguuuuuaug 20 <210> 1238 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1238 ccauuucugu aagguuuuua 20 <210> 1239 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1239 auccauuucu guaagguuuu 20 <210> 1240 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1240 cauccauuuc uguaagguuu 20 <210> 1241 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1241 ccauccauuu cuguaagguu 20 <210> 1242 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1242 gccauccauu ucuguaaggu 20 <210> 1243 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1243 agccauccau uucuguaagg 20 <210> 1244 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1244 cagccaucca uuucuguaag 20 <210> 1245 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1245 ucagccaucc auuucuguaa 20 <210> 1246 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1246 uucagccauc cauuucugua 20 <210> 1247 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1247 cuucagccau ccauuucugu 20 <210> 1248 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1248 acuucagcca uccauuucug 20 <210> 1249 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1249 aacuucagcc auccauuucu 20 <210> 1250 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1250 caacuucagc cauccauuuc 20 <210> 1251 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1251 ucaacuucag ccauccauuu 20 <210> 1252 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1252 aucaacuuca gccauccauu 20 <210> 1253 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1253 caucaacuuc agccauccau 20 <210> 1254 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1254 acaucaacuu cagccaucca 20 <210> 1255 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1255 aacaucaacu ucagccaucc 20 <210> 1256 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1256 gaaaacauca acuucagcca 20 <210> 1257 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1257 caggaaaaca ucaacuucag 20 <210> 1258 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1258 uuucaggaaa acaucaacuu 20 <210> 1259 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1259 cucuuucagg aaaacaucaa 20 <210> 1260 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1260 uuccucuuuc aggaaaacau 20 <210> 1261 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1261 gccauuccuc uuucaggaaa 20 <210> 1262 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1262 ggccauuccu cuuucaggaa 20 <210> 1263 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1263 aggccauucc ucuuucagga 20 <210> 1264 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1264 caggccauuc cucuuucagg 20 <210> 1265 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1265 gcaggccauu ccucuuucag 20 <210> 1266 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1266 ggcaggccau uccucuuuca 20 <210> 1267 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1267 gggcaggcca uuccucuuuc 20 <210> 1268 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1268 agggcaggcc auuccucuuu 20 <210> 1269 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1269 cagggcaggc cauuccucuu 20 <210> 1270 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1270 ccagggcagg ccauuccucu 20 <210> 1271 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1271 cccagggcag gccauuccuc 20 <210> 1272 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1272 ccccagggca ggccauuccu 20 <210> 1273 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1273 cccccagggc aggccauucc 20 <210> 1274 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1274 ucccccaggg caggccauuc 20 <210> 1275 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1275 aucccccagg gcaggccauu 20 <210> 1276 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1276 caucccccag ggcaggccau 20 <210> 1277 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1277 gcauccccca gggcaggcca 20 <210> 1278 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1278 agcauccccc agggcaggcc 20 <210> 1279 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1279 cagcaucccc cagggcaggc 20 <210> 1280 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1280 ucagcauccc ccagggcagg 20 <210> 1281 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1281 uucagcaucc cccagggcag 20 <210> 1282 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1282 uuucagcauc ccccagggca 20 <210> 1283 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1283 auuucagcau cccccagggc 20 <210> 1284 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1284 gauuucagca ucccccaggg 20 <210> 1285 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1285 ggauuucagc aucccccagg 20 <210> 1286 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1286 aggauuucag caucccccag 20 <210> 1287 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1287 caggauuuca gcauccccca 20 <210> 1288 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1288 ucaggauuuc agcauccccc 20 <210> 1289 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1289 uucaggauuu cagcaucccc 20 <210> 1290 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1290 uuucaggauu ucagcauccc 20 <210> 1291 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1291 uuuucaggau uucagcaucc 20 <210> 1292 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1292 uuuuucagga uuucagcauc 20 <210> 1293 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1293 uuuuuucagg auuucagcau 20 <210> 1294 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1294 guuuuuucag gauuucagca 20 <210> 1295 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1295 uguuuuuuca ggauuucagc 20 <210> 1296 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1296 cuguuuuuuc aggauuucag 20 <210> 1297 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1297 gcuguuuuuu caggauuuca 20 <210> 1298 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1298 agcuguuuuu ucaggauuuc 20 <210> 1299 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1299 gagcuguuuu uucaggauuu 20 <210> 1300 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1300 ugagcuguuu uuucaggauu 20 <210> 1301 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1301 uugagcuguu uuuucaggau 20 <210> 1302 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1302 uuugagcugu uuuuucagga 20 <210> 1303 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1303 guuugagcug uuuuuucagg 20 <210> 1304 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1304 uuguuugagc uguuuuuuca 20 <210> 1305 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1305 cauuguuuga gcuguuuuuu 20 <210> 1306 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1306 gcauuguuug agcuguuuuu 20 <210> 1307 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1307 ugcauuguuu gagcuguuuu 20 <210> 1308 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1308 cugcauuguu ugagcuguuu 20 <210> 1309 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1309 ucugcauugu uugagcuguu 20 <210> 1310 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1310 cucugcauug uuugagcugu 20 <210> 1311 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1311 acucugcauu guuugagcug 20 <210> 1312 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1312 uacucugcau uguuugagcu 20 <210> 1313 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1313 uuacucugca uuguuugagc 20 <210> 1314 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1314 cuuacucugc auuguuugag 20 <210> 1315 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1315 ucuuacucug cauuguuuga 20 <210> 1316 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1316 aucuuacucu gcauuguuug 20 <210> 1317 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1317 aaucuuacuc ugcauuguuu 20 <210> 1318 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1318 caaaucuuac ucugcauugu 20 <210> 1319 <211> 20 <212> RNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1319 gauacaaauc uuacucugca 20 <210> 1320 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1320 gggtcagctg ccaatgctag 20 <210> 1321 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1321 gggtcagctg ccaatgctag 20 <210> 1322 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1322 gggtcagctg ccaatgctag 20 <210> 1323 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1323 gggtcagctg ccaatgctag 20 <210> 1324 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <400> 1324 gggtcagctg ccaatgctag 20

Claims (42)

1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드 (first plurality of oligonucleotides) 를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고, 여기서:
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 (splicing) 시스템에서 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 올리고뉴클레오티드 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 1 항에 있어서, 기준 조건이 상기 올리고뉴클레오티드 조성물의 부재이고, 백본 키랄 중심의 패턴이 Rp 및 Sp 로부터 독립적으로 선택되는 적어도 2 개의 키랄 제어된 중심을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 2 항에 있어서, 백본 연결의 패턴이 포스포디에스테르, 포스포로티오에이트 및 포스포디티오에이트 연결로부터 선택되는 하나 이상의 백본 연결을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 3 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 각각 하나 이상의 당 개질을 추가로 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 4 항에 있어서, 당 개질이 2'-O-메틸, 2'-MOE, 2'-F, 모르폴리노 및 바이시클릭 당 모이어티로부터 선택되는 하나 이상의 개질을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 5 항에 있어서, 당 개질이 하나 이상의 2'-F 당 모이어티를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 6 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 각각:
1) 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 5'-말단 영역;
2) 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 3'-말단 영역; 및
3) 포스포디에스테르 연결을 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함하는, 5'-말단 영역과 3'-말단 영역 사이의 중간 영역
을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 7 항에 있어서, 5'-말단 영역이 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하지 않는 1 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하고; 3'-말단 영역이 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하지 않는 1 개 이상의 뉴클레오시드 단위를 포함하고/하거나; 중간 영역이 포스포디에스테르 연결을 포함하지 않는 1 개 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 7 항에 있어서, 2'-F 개질된 당 모이어티 및 5'-말단의 개질된 뉴클레오티드간 (internucleotidic) 연결을 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위 중 첫 번째가, 5'-말단으로부터 올리고뉴클레오티드의 첫 번째, 두 번째, 세 번째, 네 번째 또는 다섯 번째 뉴클레오시드 단위이고, 2'-F 개질된 당 모이어티 및 3'-말단의 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오시드 단위 중 마지막이, 올리고뉴클레오티드의 마지막, 마지막 두 번째, 마지막 세 번째, 마지막 네 번째, 또는 마지막 다섯 번째 뉴클레오시드 단위인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 9 항에 있어서, 5'-말단 영역이 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하고, 3'-말단 영역이 2'-F 개질된 당 모이어티를 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 10 항에 있어서, 5'-말단 또는 3'-말단 영역의 2'-F 개질된 당 모이어티 및 뉴클레오티드간 연결을 포함하는 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 연속적인 뉴클레오시드 단위의 뉴클레오시드 단위를 포함하는 각각의 뉴클레오티드 단위가, 개질된 뉴클레오티드간 연결을 포함하고, 중간 영역이 각각 독립적으로 포스포디에스테르 연결 및 2'-OR1 개질된 당 모이어티 (여기서 R1 은 임의 치환된 C1-6 알킬임) 를 포함하는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 개 또는 그 이상의 뉴클레오티드 단위를 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 2 항에 있어서, 염기 서열이 디스트로핀 (dystrophin) 유전자 또는 이의 보체의 20 개 염기 길이 부분으로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하고, 길이가 50 개 이하의 염기이고, 백본 키랄 중심의 패턴이 독립적으로 Rp 또는 Sp 의 적어도 3 개의 키랄 제어된 중심을 포함하고, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 디스트로핀 유전자의 엑손 (exon) 의 스킵핑 (skipping) 을 중재할 수 있는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 12 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 디스트로핀 유전자의 엑손 51 의 스킵핑을 중재할 수 있는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 4 항에 있어서, 염기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 서열로부터 5 개 이하의 미스매치를 갖는 서열을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 4 항에 있어서, 염기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열을 포함하는, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 4 항에 있어서, 염기 서열이 UCAAGGAAGAUGGCAUUUCU 의 염기 서열로 이루어진, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 1 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 하기와 같은, 올리고뉴클레오티드 조성물:
Figure pct00563

Figure pct00564

(여기서,
f 는 2'-F 개질이고;
m 은 2'-OME- 이고;
* 는 포스포로티오에이트이고;
*S 는 Sp 입체구조의 포스포로티오에이트이고;
*R 는 Rp 입체구조의 포스포로티오에이트이고;
Mod015L0001 은 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-말단 -O- 에 연결되는
Figure pct00565
이고; 및
Mod020L0001 은 올리고뉴클레오티드 사슬의 5'-말단 -O- 에 연결되는
Figure pct00566
임).
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-2530 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-2531 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3152 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3472 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3473 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3507 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3508 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3509 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3510 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3511 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3512 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3513 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3514 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3515 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3545 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 17 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 WV-3546 의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 1 항 내지 제 32 항 중 어느 한 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 10% 이상이, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
제 1 항 내지 제 32 항 중 어느 한 항에 있어서, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 염기 서열, 백본 연결의 패턴, 및 백본 인 개질의 패턴을 갖는 올리고뉴클레오티드의 10% 이상이, 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드인, 올리고뉴클레오티드 조성물.
1) 염기 서열;
2) 백본 연결의 패턴;
3) 백본 키랄 중심의 패턴; 및
4) 백본 인 개질의 패턴
에 의해 정의되는 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 제 1 다수의 올리고뉴클레오티드를 포함하는 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법으로서,
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은 동일한 염기 서열을 갖는 올리고뉴클레오티드의 실질적 라세미 제제에 비해, 상기 특정 올리고뉴클레오티드 유형의 올리고뉴클레오티드가 풍부하다는 점에서 키랄 제어된 것이고, 여기서:
상기 올리고뉴클레오티드 조성물은, 상기 조성물이 전사물 스플라이싱 시스템에서 표적 전사물과 접촉되는 경우, 전사물의 스플라이싱이 상기 올리고뉴클레오티드 조성물의 부재, 기준 조성물의 존재, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 기준 조건 하에서 관찰된 것과 비교하여 변경되는 것을 특징으로 하는, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법.
제 36 항에 있어서, 표적 전사물의 스플라이싱이 상기 올리고뉴클레오티드 조성물의 부재와 비교하여 변경되는, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법.
제 37 항에 있어서, 표적 전사물이 디스트로핀의 프리-mRNA 이고, 상기 변경은 하나 이상의 엑손이 상기 올리고뉴클레오티드 조성물의 부재에 비해 증가된 수준으로 스킵핑되는 것인, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법.
제 38 항에 있어서, 디스트로핀의 엑손 51 이 상기 올리고뉴클레오티드 조성물의 부재에 비해 증가된 수준으로 스킵핑되는 것인, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법.
구현예 1-1223 중 어느 하나의 조성물, 올리고뉴클레오티드, 방법 또는 화합물.
제 36 항에 있어서, 올리고뉴클레오티드 조성물이 제 1 항 내지 제 35 항 또는 제 40 항 중 어느 한 항의 올리고뉴클레오티드 조성물인, 표적 전사물의 스플라이싱을 변경하는 방법.
듀켄 (Duchenne) 근이영양증에 취약하거나 이를 앓고 있는 대상에게 제 1 항 내지 제 35 항 또는 제 40 항 중 어느 한 항의 올리고뉴클레오티드 조성물을 투여하는 것을 포함하는, 듀켄 근이영양증의 치료 방법.
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