KR20180035779A - 단백질분해의 이미드계 조절인자 및 관련된 이용 방법 - Google Patents

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KR20180035779A
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앤드류 피. 크루
한칭 동
징 왕
이민 치앤
캠 시우
메이종 진
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Abstract

본 발명은 이미드계 화합물뿐만 아니라 이들을 포함하는 이작용성 화합물에 관한 것으로, 이들은 표적화된 유비퀴틴화의 조절인자로서, 특히 본 발명에 따른 이작용성 화합물에 의해 분해되고 그리고/또는 다르게는 저해되는 다양한 폴리펩타이드 및 다른 단백질의 저해제로서 유용성을 발견한다. 특히, 본 발명은 표적 단백질이 그 단백질의 분해(및 저해)를 시행하기 위해 유비퀴틴 리가제에 근접하여 배치되도록, 한쪽 단부에 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제에 결합하는 리간드를 그리고 타단부에 표적 단백질에 결합하는 모이어티를 함유하는 화합물을 제공한다. 거의 모든 유형의 표적화된 폴리펩타이드의 분해/저해와 일치하는 넓은 범위의 약리학적 활성을 나타내는 화합물이 합성될 수 있다.

Description

단백질분해의 이미드계 조절인자 및 관련된 이용 방법
관련 출원에 대한 상호 참조
본 출원은 미국 가출원 일련번호 61/979,351(출원일: 2014년 4월 14일, 발명의 명칭: "IMIDE-BASED MODULATORS OF PROTEOLYSIS AND ASSOCIATED METHODS OF USE")에 대한 우선권의 유익을 주장하고, 또한 미국 가출원 일련번호 62/171,090(출원일: 2015년 6월 4일, 발명의 명칭: "IMIDE-BASED MODULATORS OF PROTEOLYSIS AND ASSOCIATED METHODS OF USE")에 대한 우선권의 유익을 주장하는, 미국 정규 출원 일련번호 14/686,640(출원일: 2015년 4월 14일)의 유익을 주장하는, 미국 출원 일련번호 14/792,414(출원일: 2015년 7월 6일) 및 미국 가출원 일련번호 62/171,090호(출원일: 2015년 6월 4일)의 유익을 주장하며, 이들 기초 출원은 모두 참고로 그들의 전문이 편입된다.
발명의 기술분야
본 발명은 이미드계 화합물뿐만 아니라 이를 포함하는 이작용성 화합물, 그리고 연관된 이용 방법을 제공한다. 이작용성 화합물은, 특히 본 발명에 따른 이작용성 화합물에 의해 분해되고/되거나 다르게는 저해되는 다양한 폴리펩타이드 및 다른 단백질에 관하여, 표적화된 유비퀴틴화의 조절인자로서 유용하다.
대부분의 소분자 약물은 치밀하고 충분히 규정된 포켓 내에서 효소 또는 수용체에 결합한다. 다른 한편, 단백질-단백질 상호작용은, 주지의 사실로서, 그들의 큰 접촉 표면 및 관련된 얕은 홈 또는 편평한 계면으로 인해 소분자를 이용하여 표적화하기 어렵다. E3 유비퀴틴 리가제(이들 중에서 수 백개가 인간에서 알려져 있음)는 유비퀴틴화에 대한 기질 특이성을 부여하고, 그리고 이런 이유로, 일정한 단백질 기질에 대한 그들의 특이성으로 인해 일반적인 프로테아좀 저해제보다 더욱 매력적인 치료 표적이다. E3 리가제의 리간드의 개발은, 부분적으로 이들이 틀림없이 단백질-단백질 상호작용을 교란시킨다는 사실로 인해 상당히 어려운 것으로 입증되었다. 하지만, 최근에 이들 리가제에 결합하는 특정한 리간드가 개발되었다. 예를 들어, 첫 번째 소분자 E3 리가제 저해제인 누툴린(nutlin)의 발견 이후로, E3 리가제를 표적으로 하는 추가 화합물이 보고되긴 했지만, 이러한 분야는 충분히 개발되지 않은 상태로 남아있다.
치료 잠재력을 갖는 한 가지 E3 리가제는 폰 히펠 린다우(von Hippel-Lindau: VHL) 종양 억제인자이다. VHL은 기질 인식 아단위/E3 리가제 복합체 VCB(이것은 엘론긴 B 및 C를 포함함), 및 쿨린-2(Cullin-2) 및 Rbx1을 포함하는 복합체를 포함한다. VHL의 1차 기질은 낮은 산소 수준에 대한 응답으로 유전자, 예를 들면, 친혈관형성 성장 인자 VEGF 및 적혈구 유도 사이토킨 에리트로포이에틴을 상향조절하는 전사 인자인 저산소증 유도성 인자 1α(HIF-1α)이다. 본 발명자들은 암, 만성 빈혈 및 허혈에서 중요한 표적인 E3 리가제, VCB의 기질 인식 아단위에 대한 폰 히펠 린다우(VHL)의 첫 번째 소분자 리간드를 생성하였고, 그리고 상기 화합물이 VHL의 주요 기질인 전사 인자 HIF-1α의 결합 방식을 모방한다는 것을 확인해주는 결정 구조를 획득하였다.
세레블론(cereblon)은 인간에서 CRBN 유전자에 의해 인코딩되는 단백질이다. CRBN 오쏠로그는 식물에서부터 인간까지 고도로 보존되는데, 이것은 이의 생리학적 중요성을 강조한다. 세레블론은 손상된 DNA 결합 단백질 1(DDB1), 쿨린-4A(CUL4A), 그리고 쿨린 1의 조절인자(ROC1)와 E3 유비퀴틴 리가제 복합체를 형성한다. 이러한 복합체는 다수의 다른 단백질을 유비퀴틴화시킨다. 완전하게 석명되어 있지 않은 기전을 통해, 표적 단백질의 세레블론 유비퀴틴화는 증가된 수준의 섬유모세포 성장 인자 8(FGF8) 및 섬유모세포 성장 인자 10(FGF10)을 유발한다. FGF8은 이어서 다수의 발달 과정, 예를 들면, 사지 및 청각 소포 형성을 조절한다. 순 결과는 이러한 유비퀴틴 리가제 복합체가 태아에서 사지 생장에 중요하다는 것이다. 세레블론의 부재에서, DDB1은 DNA 손상-결합 단백질로서 기능하는 DDB2와 복합체를 형성한다.
다수의 면역학적 징후의 치료를 위해 승인된 탈리도마이드는 또한, 다발성 골수종을 비롯한 일정한 종양 질환의 치료를 위해 승인되었다. 다발성 골수종 이외에도, 탈리도마이드 및 여러 이의 유사체는 또한 다양한 다른 유형의 암을 치료하는데 이용하기 위해 현재 연구 중에 있다. 탈리도마이드의 항종양 활성의 정밀한 기전이 여전히 부상 중에 있긴 하지만, 혈관형성을 저해하는 것으로 알려져 있다. 이미드의 생물학을 논의하는 최근 문헌은 [Lu et al Science 343, 305 (2014)] 및 [Kroenke et al Science 343, 301 (2014)]을 포함한다.
유의미하게는, 탈리도마이드 및 이의 유사체, 예를 들면, 포말리도마이드 및 레날리도마이드는 세레블론에 결합하는 것으로 알려져 있다. 이들 제제는 세레블론에 결합하여, 다발성 골수종 성장에 필수적인 전사 인자인 이카로스(Ikaros)(IKZF1) 및 아이올로스(Aiolos)(IKZF3)의 유비퀴틴화 및 분해를 유도하는 복합체의 특이성을 변경한다. 실제로, 세레블론의 더욱 높은 발현은 다발성 골수종의 치료에서 이미드 약물의 효력에서 증가에 연결되었다.
BRD4는 다수의 질병 환경, 특히 암에서의 새로운 표적으로서의 잠재력으로 인해 학계와 약제학 업계에서 상당한 주목을 받아왔다. BRD4는 브로모도메인 및 가외 말단 도메인(bromodomain and extra-terminal domain: BET) 패밀리에 속하며, 이는 N-말단에서 2개의 브로모도메인(BD 도메인) 및 C-말단에서 가외말단 도메인(ET 도메인)을 특징으로 한다(J. Shi, et al. Molecular cell, 54 (2014) 728-736 및 A.C. Belkina, et al., Nat. Rev. Cancer, 12 (2012) 465-477). 2개의 BD 도메인은 히스톤 단백질의 N-말단 후미에서 아세틸화-라이신 잔기를 인식하고 이와 상호 작용하고; ET 도메인은 아직 완전히 특징규명되어 있지 않고, 다양한 전사 조절자를 동원함에 있어서 비계 기능을 수행하는 것으로 대부분 간주된다. 따라서, BRD4는 특정 게놈 유전자 좌에 관련된 전사 조절 인자를 동원함으로써 유전자 발현 조절에 핵심적인 역할을 한다. BRD4가 c-MYC, Bcl-xL 및 BCL-6과 같은 중요한 종양 유전자의 상류에 종종 존재하는 수퍼 인핸서 영역에 우선적으로 위치되고, 이들의 발현 조절에 중요한 역할을 한다는 여러 연구가 확립되어 있다(J. Loven, et al., Cell, 153 (2013) 320-334 및 B. Chapuy, et al., Cancer Cell, 24 (2013) 777-790). BRD4는, 필수 발암 유전자의 발현 조절에 중추적인 역할을 하기 때문에, 중심선 암종, AML, MM, BL 및 전립선암을 포함한 여러 암종에서 유망한 치료 표적으로서 등장한다(J. Loven, et al., Cell, 153 (2013) 320-334; J. Zuber, et al., Nature, 478 (2011) 524-528; J.E. Delmore, et al., Cell, 146 (2011) 904-917; J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674; A. Wyce, et al., Oncotarget, 4 (2013) 2419-2429; I.A. Asangani, et al., Nature, 510 (2014) 278-282; 및 C.A. French, et al., Oncogene, 27 (2008) 2237-2242). 특정 종양 유전자에 근접한 BRD4의 명확히 높은 점유도는 정상 조직을 보존하면서 종양 세포의 특정 표적화를 허용할 수 있는 잠재적 치료창을 제공한다. 특히, BRD4는 대다수의 인간 암의 발생 및 유지에 기여하지만 여전히 논쟁의 여지가 없는 c-MYC를 표적화하는 대체 전략의 역할을 할 수 있다(J.E. Delmore, et al., Cell, 146 (2011) 904-917; J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674; M.G. Baratta, et al., PNAS, 112 (2015) 232-237; 및 M. Gabay, et al., Cold Spring Harb Perspect Med. (2014) 4:a014241).
JQ1, iBET 및 OTX15와 같은 소분자 BRD4 저해제의 개발은 BL을 비롯하여 다양한 암의 전임상 모델에서 유망한 치료 잠재력을 입증하였다(J. Loven, et al., Cell, 153 (2013) 320-334; B. Chapuy, et al., Cancer Cell, 24 (2013) 777-790; J.E. Delmore, et al., Cell, 146 (2011) 904-917; J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674; I.A. Asangani, et al., Nature, 510 (2014) 278-282; M.G. Baratta, et al., PNAS, 112 (2015) 232-237; M. Boi, et al., Clin . Cancer Res., (2015) 21(7):1628-38; 및 A. Puissant, et al., Cancer discovery, 3 (2013) 308-323). 실제로, BRD4 저해제는 상이한 마우스 종양 모델에서 양호한 내약성을 갖는 다양한 항종양 활성을 나타내었으며, 놀랍지 않게 JQ1과 같은 BRD4 저해제에 대한 높은 민감성은, c-MYC에 의해 유도된 BL을 비롯하여, 상이한 종양 유형에서 c-MYC 및 N-MYC 중 한쪽의 높은 수준과 연관되어 있었다. 거의 모든 BL 사례는 IgH의 상류에 위치된 슈퍼 인핸서(슈퍼-인핸서)의 조절 하에 이를 배치하는 c-myc 유전자 전좌를 포함하므로, 비정상적으로 높은 수준의 c-MYC 발현, 종양 발생 및 유지 관리를 유발한다(K. Klapproth, et al., British journal of haematology, 149 (2010) 484-497).
현재 4가지 BET 브로모도메인 저해제가 중간 선암 및 혈액학적 악성 종양(CPI-0610, NCT01949883, GSK525762, NCT01587703, OTX015, NCT01713582, TEN-010, NCT01987362)에 주로 초점을 맞추어 I상 임상 시험 중이다. BRD4 억제제를 사용한 전임상 연구는 종종 100nM 내지 1uM 범위의 IC50 값을 갖지만 BL 세포주에서 c-MYC 및 증식 억제에 대한 그들의 가치를 입증한다(JA Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674 및 M. Ceribelli, et al., PNAS, 111 (2014) 11365-11370). 따라서 BRD4 저해제의 급속한 성장에도 불구하고, BRD4의 효과는 고무적이었지만, 재해제가 비교적 높은 농도를 필요로 하고 그 효과는 세포 분열을 억제하는 것이기 때문에 이상적이지 못하다.
질환, 특히 과형성 및 암, 예를 들면, 다발성 골수종에 대한 효과적인 치료가 당해 분야에서 여전히 필요하다. 하지만, 비특이적 효과, 그리고 일정한 부류의 단백질, 예를 들면, 전사 인자를 표적으로 하고 이들을 완전히 조정하는 능력 없음은 효과적인 항암제의 개발에 대한 장애로서 남아있다. 따라서, 세레블론의 기질 특이성에 영향력을 발휘하거나 또는 이를 강력하게 만들고, 그리고 이와 동시에, 넓은 범위의 단백질 부류가 특이적으로 표적화되고 조정될 수 있도록 "조정 가능한" 소분자 치료제는 치료제로서 매우 유용할 것이다.
본 개시내용은 내인성 단백질을 분해를 위한 E3 유비퀴틴 리가제로 동원하는 기능을 하는 이작용성 화합물, 및 이를 이용하는 방법을 기술한다. 특히, 본 개시내용은 다양한 폴리펩타이드 및 다른 단백질의 표적화된 유비퀴틴화의 조절인자로서의 유용성을 발견하는 이작용성 또는 단백질분해 표적화 키메라(PROTAC) 화합물을 제공하는데, 이들은 이후, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 이작용성 화합물에 의해 분해되고/되거나 다르게는 저해된다. 본 명세서에서 제공된 화합물의 이점은 사실상 임의의 단백질 부류 또는 패밀리로부터 표적화된 폴리펩타이드의 분해/저해와 일치하는 넓은 범위의 약리학적 활성이 가능하다는 것이다. 이에 더하여, 본 발명은 질환 상태, 예를 들면, 암, 예를 들면, 다발성 골수종의 치료 또는 개선을 위하여 유효량의 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물을 이용하는 방법을 제공한다.
따라서, 일 양상에 있어서 본 발명은 본 명세서에서 기술된 바와 같은 신규한 이미계 화합물을 제공한다.
추가의 양상에서, 본 발명은 이작용성 또는 PROTAC 화합물을 제공하는데, 이들은 표적 단백질/폴리펩타이드가 그 단백질의 분해(및 저해)를 달성하기 위해 유비퀴틴 리가제에 근접하여 위치되도록, E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티(즉, E3 유비퀴틴 리가제에 대한 리간드 또는"ULM"기), 및 표적 단백질에 결합하는 모이어티(즉, 단백질/폴리펩타이드 표적화 리간드 또는 "PTM"기)를 포함한다. 바람직한 실시형태에서, ULM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티(즉, "CLM")이다. 예를 들어, 이작용성 화합물의 구조는 다음과 같이 묘사될 수 있다:
Figure pct00001
본 명세서에서 예시된 바와 같은 PTM 및 CLM 모이어티의 개별 위치뿐만 아니라 이들의 번호는 단지 실례로서만 제공되고 이들 화합물을 어떤 방식으로도 한정하도록 의도되지 않는다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 이작용성 화합물은 각각의 기능적 모이어티의 번호 및 위치가 필요에 따라 변할 수 있도록 합성될 수 있다.
소정의 실시형태에 있어서, 이작용성 화합물은 화학적 링커("L")를 더 포함한다. 이 예에서, 이작용성 화합물의 구조는 다음과 같이 묘사될 수 있다:
Figure pct00002
여기서 PTM은 단백질/폴리펩타이드 표적화 모이어티이고, L은 링커이며, 그리고 CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티이다.
소정의 바람직한 실시형태에서, E3 유비퀴틴 리가제는 세레블론이다. 따라서, 소정의 추가의 실시형태에서, 이작용성 화합물의 CLM은 화학적 모이어티, 예를 들면, 이미드, 아마이드, 티오아마이드, 티오이미드 유래된 모이어티를 포함한다. 추가의 실시형태에서, CLM은 프탈이미도기 또는 이의 유사체 또는 유도체를 포함한다. 다른 추가의 실시형태에서, CLM은 프탈이미도-글루타르이미드기 또는 이의 유사체 또는 유도체를 포함한다. 또 다른 실시형태에서, CLM은 탈리 도마이드, 레날리도마이드, 포말리도마이드, 그리고 이들의 유사체 또는 유도체로 구성된 군의 구성원을 포함한다.
소정의 실시형태에 있어서, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물은 다수의 CLM, 다수의 PTM, 다수의 화학적 링커 또는 이들의 조합을 포함한다.
추가의 양상에서, 본 발명은 유효량의 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물 또는 이의 염 형태, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 치료적 조성물을 제공한다. 치료적 조성물은 환자 또는 대상체, 예를 들면, 동물, 예를 들면, 인간에서 단백질 분해를 조정하고, 그리고 분해된 단백질을 통해 조정되는 질환 상태 또는 병태를 치료하거나 또는 개선하는데 이용될 수 있다. 소정의 실시형태에 있어서, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 치료적 조성물은 질환, 예를 들면, 암의 치료 또는 개선을 위해 관심 대상 단백질의 분해를 유발하는데 이용될 수 있다. 또 다른 양상에서, 본 발명은 세포에서 표적 단백질을 유비퀴틴화시키는/분해시키는 방법을 제공한다. 소정의 실시형태에 있어서, 상기 방법은 바람직하게는, 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같이 링커 모이어티를 통해 연결된 CLM 및 PTM을 포함하는 본 명세서에서 기술된 바와 같은 이작용성 화합물을 투여하는 것을 포함하고, 여기서 CLM은 PTM에 커플링되고, 그리고 여기서 CLM은 유비퀴틴 경로 단백질(예를 들어, 유비퀴틴 리가제, 바람직하게는 E3 유비퀴틴 리가제, 예컨대, 세레블론)을 인식하고 PTM은 표적 단백질이 유비퀴틴 리가제에 근접하여 위치될 때 표적 단백질의 분해가 발생하도록 표적 단백질을 인식하고, 따라서 표적 단백질의 효과의 저하/저해 및 단백질 수준의 제어를 유발한다. 본 발명에 의해 제공된 단백질 수준의 제어는 질환 상태 또는 병태의 치료를 제공하는 데, 이것은 환자의 세포에서 표적 단백질의 수준을 낮춤으로써 표적 단백질을 통해 조정된다.
추가의 양상에서, 본 발명은 CLM의 결합 친화도를 평가하기 위한(즉, 결정 및/또는 계측하기 위한) 방법을 제공한다. 소정의 실시형태에 있어서, 상기 방법은 관심 대상 시험 제제 또는 화합물, 예를 들면, 이미드 모이어티를 갖는 제제 또는 화합물, 예를 들면, 프탈이미도기, 프탈이미도-글루타르이미드기, 유도체화된 탈리도마이드, 유도체화된 레날리도마이드 또는 유도체화된 포말리도마이드를 제공하고, 그리고 세레블론에 결합하고/하거나 세레블론의 활성을 저해하는 것으로 알려진 작용제 또는 화합물과 비교하여 시험 제제 또는 화합물의 세레블론 결합 친화도 및/또는 저해 활성을 비교하는 것을 포함한다.
또 다른 양상에서, 본 발명은 대상체 또는 환자, 예컨대, 동물, 예를 들면, 인간에서 질환, 장애 또는 이의 증상을 치료하거나 또는 개선하기 위한 방법을 제공하고, 상기 방법은 유효량, 예컨대, 치료적 유효량의 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물 또는 이의 염 형태, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 조성물을 치료가 필요한 대상체에 투여하는 것을 포함하고, 여기서 상기 조성물은 대상체에서 상기 질환 또는 장애 또는 이의 증상을 치료하거나 또는 개선하는데 효과적이다.
다른 양상에서, 본 기술내용은 본 발명에 따른 화합물을 이용하여 생물학적 시스템에서 관심 대상 단백질의 분해의 효과를 확인하기 위한 방법을 제공한다.
전술한 일반적인 유용성 분야는 단지 실례로서만 제공되고 본 개시내용 및 첨부된 청구범위의 범주를 제한하는 것으로 의도되지 않는다. 본 발명의 조성물, 방법 및 과정과 관련된 추가의 목적 및 이점은 본 청구범위, 설명, 그리고 실시예에 비추어 당업자에 의해 인지될 것이다. 예를 들어, 본 발명의 다양한 양상 및 실시형태는 많은 조합으로 활용될 수 있는데, 이들 모두 본 설명에 의해 명시적으로 예기된다. 이들 추가의 이점, 목적 및 실시형태는 본 발명의 범위 내에 명시적으로 포함된다. 본 발명의 배경을 조명하고, 그리고 특정 사례에서, 실시에 관한 추가의 상세를 제공하기 위해 본 명세서에서 이용된 간행물 및 다른 자료는 참고로 편입된다.
본 명세서에 편입되고 본 명세서의 일부를 구성하는 첨부 도면은 본 발명의 여러 실시형태를 예시하고, 그리고 상세한 설명과 함께, 본 발명의 원리를 설명하는 역할을 한다. 이들 도면은 단지 본 발명의 실시형태를 예증하는 것을 목적으로 하고 본 발명을 한정하는 것으로 해석되지 않는다. 게다가 본 발명의 목적, 특징 및 이점은 본 발명의 예시적인 실시형태를 나타내는 첨부 도면과 함께 다음의 상세한 설명으로부터 명백해질 것이며, 여기서:
도 1a 및 도 1b. PROTAC 기능에 대한 일반적인 원리의 예시. (a) 예시적인 PROTAC는 단백질 표적화 모이어티(PTM; 어둡게 음영된 직사각형), 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티(ULM; 밝게 음영된 삼각형), 및 임의로, PTM을 ULM에 커플링시키거나 또는 결박하는 링커 모이어티(L; 흑색 라인)를 포함한다. (b)는 본 명세서에서 기술된 바와 같은 PROTAC의 기능적 이용을 예증한다. 간단히 말하면, ULM은 특정한 E3 유비퀴틴 리가제를 인식하고 이에 결합되고, 그리고 PTM은 표적 단백질에 결합되고 이를 동원하여 E3 유비퀴틴 리가제에 근접시킨다. 전형적으로, E3 유비퀴틴 리가제는 E2 유비퀴틴-접합 단백질로 복합화되고, 그리고 단독으로 또는 E2 단백질을 통해서 아이소펩타이드 결합을 통해 표적 단백질 상에서 라이신에 유비퀴틴(어두운 원)의 부착을 촉매작용한다. 다중유비퀴틴화된 단백질(오른쪽 끝)은 이후, 세포의 프로테오좀 기구에 의한 분해를 위해 표적화된다.
도 2. PROTAC 기술을 이용해서 설계된 키메라 화합물, A825. A825는 테트라옥사테트라데칸 링커를 통해서 E3 유비퀴틴 리가제 세레블론 동원 모이어티(포말리도마이드의 유도체)에 연결된 BRD4 결합 모이어티(OTX-15의 유도체)를 함유한다.
도 3a, 도 3b, 도 3c, 도 3d, 도 3e, 도 3f, 도 3g, 도 3h, 및 도 3i. 웨스턴 블롯 영상은 BL 세포주에 대한 소분자 BRD4 저해제(JQ1 및 OTX-15)의 세포 효과를 나타낸다. JQ1 및 OTX-15는 나말와(NAMALWA) 세포(a) 및 라모스 세포(Ramos cell)(b)에서 용량-의존적 방식으로 BRD4를 초래한다. OTX-15는 CA-46 세포(c) 및 다우디 세포(DAUDI cell)(d)에서 용량-의존적 방식으로 BRD4 축적을 초래한다. JQ1 및 OTX-15는 나말와 세포(e) 및 라모스 세포(f)에서 유의하지만 불완전한 c-Myc 억제를 초래한다. (g) JQ1에 의한 c-Myc 억제 효과는 가역적이다. 나말와 세포(h) 및 라모스 세포(i)에서 JQ1 및 OTX-15에 의한 c-Myc 억제 효과는 가역적이다.
도 4a, 도 4b, 도 4c, 도 4d, 도 4e, 도 4f, 및 도 4b. 웨스턴 블롯 영상은 BL 세포주에 대한 A825의 세포 효과를 나타낸다. A825에 의한 BRD4 분해는 나말와 세포(a) 및 CA-46 세포(b)에서 용량-의존적인 벨-형상 방식으로 일어난다. (c) 및 (d) A825에 의한 BRD4 분해는 신속하게 일어난다. (e) 및 (f) A825 처리에 의해 유도된 BRD4 분해는 세레블론에 의존적이다. (g) A825에 의한 BRD4 분해는 프로테아좀에 의해 매개된다.
도 5a, 도 5b, 도 5c, 도 5d, 도 5e, 및 도 5f. A825, JQ1, 및 OTX-15 처리에 의한 세포 효과의 비교. (a) 및 (b) A825에 의한 c-Myc 억제는 JQ1 및 OTX-15보다 더 유의하다. (c) c-Myc 단백질 수준은 JQ1 및 OTX-15에 비해서 A825에 의한 치료 후에 더 길게 억제된다. (d), (e) 및 (f) c-Myc 단백질 기능(SLC19A1 유전자 발현에 의해 평가됨)은 JQ1 및 OTX-15에 비해서 A825에 의한 치료 후에 더 길게 억제된다.
도 6a, 도 6b, 도 6c, 도 6d, 도 6e, 도 6f, 도 6g, 및 도 6h. A825, JQ1, 및 OTX-15에 의한 BL 세포주에 대한 항증식 효과의 비교. (a) 내지 (d) A825는 JQ1 및 OTX-15에 비해서 BL 세포주에 대한 우수한 항증식 효과를 지닌다. (e) A825는 JQ1 및 OTX-15에 비해서 더 길게 지속되는 증식 억제를 초래한다. (f) 포말리도마이드는 저-용량 A825 처리의 항증식 효과로부터 세포를 구제한다. (g) 포말리도마이드는 고-용량 A825 처리의 항증식 효과로부터 세포를 부분적으로 구제한다. (h) 포말리도마이드 단독은 BL 세포 증식에 대한 유의한 효과를 지니지 않는다.
도 7a 및 도 7b. A825, JQ1, 및 OTX-15 처리에 의한 BL 세포의 세포자멸사 효과의 비교. (a) A825는 JQ1 및 OTX-15에 비해서 BL 세포에서 더 유의한 세포자멸사 유도(카스파제 효과에 의해 모니터링됨)를 초래한다. (b) A825는 JQ1 및 OTX-15에 비해서 BL 세포에서 더 유의한 세포자멸사 유도(PARP 절단에 의해 모니터링됨)를 초래한다.
도 8a 및 도 8b. A825 처리에 의한 BRD4 분해를 위한 작용 모델의 기전을 나타낸 개략도. (a) 저 농도의 A825에 의해 처리된 세포는 BRD4 및 세레블론에 효과적으로 결합하여 "BRD4-A825-세레블론" 삼량체 복합체를 형성하고, 이것은 세포 내에서 효과적인 BDR4 분해를 유도한다. (b) 고농도의 A825에 의해 처리된 세포는 "BRD4-A825" 및 "A825-세레블론" 이량체를 형성하고 최적의 삼량체 형성 및 BRD4 분해를 방해한다.
다음은 당업자가 본 발명을 실시하는데 보조하기 위해 제공된 상세한 설명이다. 당업자는 본 발명의 사상 또는 범위로부터 벗어나지 않으면서 본 명세서에서 기술된 실시형태에서 변형 및 변이를 만들 수 있다. 본 명세서에서 언급된 모든 간행물, 특허 출원, 특허, 도면 및 기타 참고문헌은 전체적으로 참고로 명시적으로 편입된다.
E3 유비퀴틴 리가제 단백질, 예컨대, 세레블론 및 표적 단백질이 E3 유비퀴틴 리가제 단백질 및 표적 단백질에 결합하는 이작용성 또는 키메라 구조체에 의해 근접하여 위치되면, 이것이 표적 단백질을 유비퀴틴화시킨다는 놀랍고 예상치 못한 발견에 관계하는 조성물 및 방법이 여기에서 설명된다. 따라서 본 발명은 단백질 표적 결합 모이어티("PTM")에 커플링된 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티("ULM")를 포함하는 이런 화합물 및 조성물을 제공하는데, 이것은 선택된 표적 단백질의 유비퀴틴화를 유발하고, 이것은 차례로 프로테아좀에 의한 표적 단백질의 분해를 야기한다(도 1 참조). 본 발명은 또한, 조성물의 라이브러리 및 이의 용도를 제공한다.
달리 규정되지 않는 한, 본 명세서에서 이용된 모든 기술 용어와 과학 용어는 본 발명이 속하는 당해 분야의 평균적 기술자에 의해 통상적으로 이해되는 바와 동일한 의미를 갖는다. 본 명세서에서 이용된 용어는 특정 실시형태를 단지 설명하기 위한 것이고 본 발명을 한정하는 것으로 의도되지 않는다.
값의 범위가 제공되는 경우에, 문맥에서 명백하게 달리 명시되지 않는 한(예를 들어, 다수의 탄소 원자를 함유하는 기의 경우에, 이러한 경우에 범위 내에 속하는 각 탄소 원자 숫자가 제공됨), 상기 범위의 상한치와 하한치 사이에 하한치의 단위의 1/10까지 각 개재하는 값, 그리고 언급된 범위에서 임의의 다른 언급된 또는 개재하는 값은 본 발명의 범위 안에 포괄되는 것으로 이해된다. 이들 더욱 작은 범위의 상한치와 하한치는 더욱 작은 범위 내에 독립적으로 포함될 수 있고, 그리고 또한, 본 발명의 범위 안에 포괄되고, 언급된 범위 내에 임의의 특정적으로 배제된 한계에 종속된다. 언급된 범위가 한계 중에서 한쪽 또는 양쪽을 포함하는 경우에, 이들 포함된 한계의 한쪽 또는 양쪽을 배제하는 범위 역시 본 발명에서 포함된다.
다음의 용어가 본 발명을 설명하는데 이용된다. 용어가 본 명세서에서 특정적으로 규정되지 않는 사례에서, 상기 용어는 당업자에 의해 당해 분야에서 인식되는 의미가 제공되고 본 발명을 설명함에 있어서 문맥 내에서 이의 이용에 적용된다.
본 명세서에서 그리고 첨부된 청구범위에서 이용된 바와 같은 단수 표현은 문맥에서 명백하게 달리 지시되지 않는 한 상기 단수 표현의 문법적 대상 중에서 하나 또는 하나 이상(즉, 적어도 하나)을 지칭하기 위해 본 명세서에서 이용된다. 실례로서, "요소"는 하나의 요소 또는 하나 이상의 요소를 의미한다.
본 명세서에서 그리고 청구범위에서 이용된 바와 같이, 관용구 "및/또는"은 이렇게 연합된 요소, 즉, 일부 경우에 결합하여 존재하고 다른 경우에 분리적으로 존재하는 요소 중에서 "어느 하나 또는 둘 모두"를 의미하는 것으로 이해되어야 한다. "및/또는"으로 열거된 다수의 요소는 동일한 방식으로, 즉, 이렇게 연합된 요소 중에서 "하나 또는 그 이상"인 것으로 해석되어야 하다. 특정적으로 확인된 이들 요소에 관련된 또는 관련 없는지에 상관없이, "및/또는" 조항에 의해 특정적으로 확인된 요소 이외에, 다른 요소가 임의로 존재할 수 있다. 따라서, 비제한적 실례로서, 개방형 언어, 예를 들면, "포함하는"과 함께 이용될 때, "A 및/또는 B"에 대한 언급은 한 실시형태에서, A 단독(B 이외에 요소를 임의로 포함); 다른 실시형태에서, B 단독(A 이외에 요소를 임의로 포함); 또 다른 실시형태에서, A와 B 둘 모두(다른 요소를 임의로 포함) 등을 지칭할 수 있다.
본 명세서에서 그리고 청구범위에서 이용된 바와 같이, "또는"은 상기 규정된 바와 같은 "및/또는"과 동일한 의미를 갖는 것으로 이해되어야 하다. 예를 들어, 목록 내에 항목을 분리할 때, "또는" 또는 "및/또는"은 포괄적으로, 즉, 요소의 숫자 또는 목록 중에서 적어도 하나뿐만 아니라 하나 이상, 그리고, 임의로, 추가의 열거되지 않은 항목을 포함하는 것으로 해석될 것이다. 용어가 명확하게 반대로 지시되는 경우에만, 예를 들면, "중에서 단지 한 가지만" 또는 "중에서 정확하게 한 가지" 또는, 청구항에서 이용될 때, "구성되는"은 요소의 숫자 또는 목록 중에서 정확하게 하나의 요소의 포함을 지칭할 것이다. 일반적으로, 본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "또는"은 배타성의 용어, 예를 들면, "어느 하나," "중에서 한 가지", "중에서 단지 한 가지만", 또는 "중에서 정확하게 한 가지"에 의해 선행될 때에만, 배타적 대안(즉, "한 가지 또는 다른 것, 하지만 둘 모두는 아님")을 지시하는 것으로 해석될 것이다.
청구범위에서뿐만 아니라 본 명세서에서, 모든 이행성 관용구, 예를 들면, "포함하는", "포함하는", "보유하는", "갖는", "함유하는", "수반하는", "유지하는", "구성된" 등은 개방형, 즉, 포함하지만 이들에 한정되지 않는 것을 의미하는 것으로 이해된다. 단지 이행성 관용구 "구성되는" 및 "본질적으로 구성되는"만 각각, [United States Patent Office Manual of Patent Examining Procedures, Section 2111.03]에서 제시된 바와 같이 닫힌 또는 반-닫힌 이행성 관용구일 것이다.
본 명세서에서 그리고 청구범위에서 이용된 바와 같이, 하나 또는 그 이상의 요소의 목록에 관하여 관용구 "적어도 하나"는 요소의 목록 내에서 이들 요소 중에서 임의의 한 가지 또는 그 이상에서 선택되는 적어도 하나의 요소를 의미하는 것으로 이해되어야 하지만, 요소의 목록 내에 특정적으로 열거된 각각의 모든 요소 중에서 적어도 하나를 반드시 포함하는 것은 아니고 요소의 목록 내에 요소의 임의의 조합을 배제하지 않는다. 이러한 정의는 또 한, 특정적으로 확인된 이들 요소에 관련된 또는 관련 없는 지에 상관없이, 관용구 "적어도 하나"가 지칭하는 요소의 목록 내에 특정적으로 확인된 요소 이외에 요소가 임의로 존재할 수 있다는 것을 허용한다. 따라서, 비제한적 실례로서, "A 및 B 중에서 적어도 하나"(또는, 동등하게는, "A 또는 B 중에서 적어도 하나", 또는 동등하게는 "A 및/또는 B 중에서 적어도 하나")는 한 실시형태에서, 하나 이상을 임의로 포함하는 적어도 하나의 A, 하지만 B가 존재하지 않음(및 B 이외에 요소를 임의로 포함); 다른 실시형태에서, 하나 이상을 임의로 포함하는 적어도 하나의 B, 하지만 A가 존재하지 않음(및 A 이외에 요소를 임의로 포함); 또 다른 실시형태에서, 하나 이상을 임의로 포함하는 적어도 하나의 A, 그리고 하나 이상을 임의로 포함하는 적어도 하나의 B(및 다른 요소를 임의로 포함) 등을 지칭할 수 있다.
하나 이상의 단계 또는 행위를 포함하는 본 명세서에서 기술된 소정의 방법에서, 상기 방법의 단계 또는 행위의 순서는, 문맥에서 달리 지시되지 않는 한, 상기 방법의 단계 또는 행위가 언급되는 순서에 반드시 한정되지는 않는 것으로 또한 이해되어야 한다.
용어 "공동투여" 및 "공동투여하는" 또는 "병용 요법"은 치료적 제제들이 환자 내에 얼마간, 바람직하게는 유효량으로 동시에 존재하기만 하면, 동시 투여(2가지 또는 그 이상의 치료적 제제의 동시에 투여) 및 시간 가변 투여(추가의 치료적 제제 또는 작용제들의 투여와 상이한 시점에 하나 또는 그 이상의 치료적 제제의 투여) 둘 모두를 지칭한다. 소정의 바람직한 양상에 있어서, 본 명세서에서 기술된 화합물 중에서 1종 이상은 특히 항암제를 비롯한 적어도 1종의 추가의 생리활성제와 함께 공동투여된다. 특히 바람직한 양상에 있어서, 화합물의 공동투여는 항암 활성을 비롯한 상승적 활성 및/또는 요법을 유발한다.
본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "화합물"은, 달리 지시되지 않는 한, 본 명세서에서 개시된 임의의 특정한 화학적 화합물을 지칭하고, 그리고 이의 호변이성질체, 위치이성질체, 기하학적 이성질체, 그리고 적용 가능한 경우에, 광학 이 성질체(거울상이성질체) 및 다른 입체이성질체(부분입체이성질체)를 비롯한 입체이성질체뿐만 아니라 문맥에서 적용 가능한 경우에, 이의 약제학적으로 허용 가능한 염 및 유도체(전구약물 형태 포함)를 포함한다. 문맥에서 이의 이용 내에, 용어 화합물은 일반적으로, 단일 화합물을 지칭하지만, 개시된 화합물의 다른 화합물, 예를 들 면, 입체이성질체, 위치이성질체 및/또는 광학 이성질체(라세미 혼합물 포함)뿐만 아니라 특정한 거울상이성질체 또는 거울상이성질성이 풍부한 혼합물을 또한 포함할 수 있다. 상기 용어는 또한, 문맥에서 활성 부위에 화합물의 투여 및 전달을 용이하게 하도록 변형된 화합물의 전구약물 형태를 지칭한다. 본 발명 화합물을 설명함에 있어서, 그 중에서도 특히, 이들과 연관된 다양한 치환체 및 변수가 설명되는 것에 유의한다. 본 명세서에서 기술되는 분자는 아래에 전반적으로 설명된 바와 같은 안정된 화합물인 것으로 당업자에 의해 이해된다. 결합이 도시될 때, 이중 결합 및 단일 결합 둘 다가 도시된 화합물의 배경 내에서 표현된다.
용어 "유비퀴틴 리가제"는 특정한 기질 단백질에 유비퀴틴의 전달을 용이하게 하여, 분해를 위한 기질 단백질을 표적으로 하는 단백질의 패밀리를 지칭한다. 예를 들어, 세레블론은 단독으로 또는 E2 유비퀴틴-접합 효소와 합동으로 표적 단백질 상에서 라이신에 유비퀴틴의 부착을 유발하고, 그리고 차후에, 프로테아좀에 의한 분해를 위한 특정한 단백질 기질을 표적으로 하는 E3 유비퀴틴 리가제 단백질이다. 따라서, E3 유비퀴틴 리가제는 단독으로 또는 E2 유비퀴틴 접합 효소와 합동으로, 표적화된 단백질에 유비퀴틴의 전달을 책임진다. 일반적으로, 이러한 유비퀴틴 리가제는 두 번째 유비퀴틴이 첫 번째 유비퀴틴에 부착되고; 세 번째가 두 번째에 부착되는 등이 되도록 다중유비퀴틴화에 연루된다. 다중유비퀴틴화는 프로테아좀에 의한 분해를 위한 단백질을 표시한다. 하지만, 모노-유비퀴틴화에 한정되는 일부 유비퀴틴화 이벤트가 있는데, 여기서는 단지 단일 유비퀴틴만 유비퀴틴 리가제에 의해 기질 분자에 첨가된다. 모노-유비퀴틴화된 단백질은 분해를 위해 프로테아좀에 표적화되지 않지만, 그 대신에 예로서, 유비퀴틴에 결합할 수 있는 도메인을 갖는 다른 단백질에 결합함으로써 세포 위치 또는 기능이 변경될 수 있다. 더 복잡한 문제는 유비퀴틴 상에서 상이한 라이신이 E3에 의해 표적화되어 사슬이 만들어질 수 있다는 점이다. 가장 흔한 라이신은 유비퀴틴 사슬 상에서 Lys48이다. 이것은 프로테아좀에 의해 인식되는 다중유비퀴틴을 만드는데 이용되는 라이신이다.
용어 "환자" 또는 "대상체"는, 본 발명에 따른 조성물로, 예방적 처치를 비롯한 치료가 제공되는 동물, 바람직하게 는 인간 또는 가축을 설명하기 위해 명세서 전반에서 이용된다. 특정한 동물, 예를 들면, 인간 환자에 특이적인 이들 감염, 병태 또는 질환 상태의 치료의 경우에, 용어 환자는 가축, 예를 들면, 개 또는 고양이 또는 경작용 동물, 예를 들면, 말, 소, 양 등을 비롯한 특정한 동물을 지칭한다. 일반적으로, 본 발명에서, 용어 환자는 달리 명시되지 않는 한 또는 상기 용어의 이용의 문맥으로부터 암시되지 않는 한 인간 환자를 지칭한다.
용어 "유효한"은 의도된 용도의 문맥 내에서 이용될 때, 의도된 결과를 달성하는 화합물, 조성물 또는 성분의 양을 설명하는데 이용된다. 용어 유효한은 본 출원에서 달리 설명되거나 또는 이용되는 모든 다른 유효량 또는 유효 농도 조건을 포함한다.
화합물 및 조성물
일 양상에 있어서, 본 발명은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티("CLM")인 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티("ULM")을 포함하는 화합물을 제공한다. 일 실시형태에서, CLM은 다음의 구조에 따라 화학적 링커(L)에 커플링된다:
(I) L-CLM
여기서 L은 화학적 링커기이고, 그리고 CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티이다. 본 명세서에서 예시된 화합물 내에 모이어티의 번호 및/또는 상대적 위치는 단지 실례로서만 제공된다. 당업자에 의해 이해되는 바와 같이, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물은 개별 기능적 모이어티의 임의의 원하는 번호 및/또는 상대적 위치로 합성될 수 있다.
용어 ULM 및 CLM은 문맥에서 달리 지시되지 않는 한 그들의 포괄적 의미에서 이용된다. 예를 들어, 용어 ULM은 세레블론에 결합하는 것들(즉, CLM)을 비롯한 모든 ULM을 포괄한다. 나아가, 용어 CLM은 모든 가능한 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티를 포괄한다.
다른 양상에서, 본 발명은 표적 단백질의 분해를 유도함으로써 단백질 활성을 조절하는데 유용한 이작용성 또는 다작용성 PROTAC 화합물을 제공한다. 소정의 실시형태에 있어서, 상기 화합물은, 예컨대, 표적 단백질에 결합하는 모이어티(즉, 단백질 표적화 모이어티 또는 "PTM")에 커플링된, 예컨대, 직접 또는 간접적으로 연결된 CLM을 포함한다. 소정의 실시형태에 있어서, CLM 및 PTM은 화학적 링커(L)를 통해서 연결되거나 또는 커플링된다. CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제를 인식하고, 그리고 PTM은 표적 단백질을 인식하고, 그리고 각각의 모이어티 및 이들의 표적의 상호작용은 표적 단백질을 유비퀴틴 리가제 단백질에 근접하여 배치함으로써 표적 단백질의 분해를 용이하게 한다. 예시적인 이작용성 화합물은 다음과 같이 묘사될 수 있다:
(II) PTM-CLM
소정의 실시형태에 있어서, 이작용성 화합물은 화학적 링커("L")를 더 포함한다. 예를 들어, 이작용성 화합물은 다음과 같이 묘사될 수 있다:
(III) PTM-L-CLM
여기서 PTM은 단백질/폴리펩타이드 표적화 모이어티이고, L은 링커이며, 그리고 CLM은 세레블론 E3 리가제 결합 모이어티이다.
소정의 실시형태에 있어서, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물은 복수의 PTM(동일하거나 상이한 단백질 표적을 표적화), 복수의 CLM, 하나 이상의 ULM(즉, 다른 E3 유비퀴틴 리가제에 특이적으로 결합하는 모이어티, 예를 들면, VHL) 또는 이들의 조합을 포함한다. 본 명세서에서 기술된 실시형태의 양상 중에서 한 가지에서, PTM, CLM, 그리고 ULM은 직접 또는 하나 또는 그 이상의 화학적 링커를 통해서 또는 이들의 조합에 의해 커플링될 수 있다. 화합물이 복수의 ULM을 갖는 추가의 실시형태에서, 이들 ULM은 동일한 E3 유비퀴틴 리가제를 위한 것일 수 있거나 또는 각 개별 ULM은 상이한 E3 유비퀴틴 리가제에 특이적으로 결합할 수 있다. 화합물이 복수의 PTM을 갖는 또 다른 추가의 실시형태에서, 이들 PTM은 동일한 표적 단백질에 결합할 수 있거나 또는 각 개별 PTM은 상이한 표적 단백질에 특이적으로 결합할 수 있다.
다른 실시형태에서, 본 발명은 직접 또는 화학적 링커 모이어티(L)를 통해서 커플링된 복수의 CLM을 포함하는 화합물을 제공한다. 예를 들어, 2개의 CLM을 갖는 화합물은 다음과 같이 묘사될 수 있다:
(IV) CLM-CLM 또는
(V) CLM-L-CLM
화합물이 다수의 CLM을 포함하는 소정의 실시형태에 있어서, 이들 CLM은 동일하다. 추가의 실시형태에서, 복수의 CLM을 포함하는 화합물은 직접 또는 화학적 링커(L)를 통해서 또는 둘 다에 의해 CLM에 커플링된 적어도 하나의 PTM을 더 포함한다. 소정의 추가의 실시형태에서, 복수의 CLM을 포함하는 화합물은 다수의 PTM을 더 포함한다. 다른 추가의 실시형태에서, 이들 PTM은 동일하거나 또는, 임의로, 상이하다. PTM이 상이한 또 다른 추가의 실시형태에서, 각각의 PTM은 동일한 단백질 표적에 결합할 수 있거나 또는 상이한 단백질 표적에 특이적으로 결합할 수 있다.
추가의 실시형태에서, 본 발명은 직접 또는 화학적 링커(L)를 통해서 또는 둘 다에 의해 커플링된 적어도 2개의 상이한 CLM을 포함하는 화합물을 제공한다. 예를 들어, 2개의 상이한 CLM을 갖는 이런 화합물은 다음과 같이 묘사될 수 있다:
(VI) CLM-CLM' 또는
(VII) CLM-L-CLM'
여기서 CLM'은 CLM과 구조적으로 상이한 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티를 지시한다. 소정의 실시형태에 있어서, 화합물은 복수의 CLM 및/또는 복수의 CLM'을 포함할 수 있다. 추가의 실시형태에서, 적어도 2개의 상이한 CLM, 복수의 CLM, 및/또는 복수의 CLM'을 포함하는 화합물은 직접 또는 화학적 링커를 통해서 또는 둘 다에 의해 CLM 또는 CLM'에 커플링된 적어도 하나의 PTM을 더 포함한다. 본 명세서에서 기술된 실시형태 중에서 한 가지에서, 적어도 2개의 상이한 CLM을 포함하는 화합물은 복수의 PTM을 더 포함할 수 있다. 다른 추가의 실시형태에서, PTM은 동일하거나 또는, 임의로, 상이하다. PTM이 상이한 또 다른 추가의 실시형태에서, 각각의 PTM은 동일한 단백질 표적에 결합할 수 있거나 또는 상이한 단백질 표적에 특이적으로 결합할 수 있다. 또 다른 추가의 실시형태에서, PTM 그 자체가 ULM 또는 CLM(또는 ULM' 또는 CLM')이다.
바람직한 실시형태에서, CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제(CRBN)의 리간드인 모이어티를 포함한다. 소정의 실시형태에 있어서, CLM은 "이미드" 부류의 분자로부터의 화학형을 포함한다. 소정의 추가의 실시형태에서, CLM은 프탈이미도기 또는 이의 유사체 또는 유도체를 포함한다. 다른 추가의 실시형태에서, CLM은 프탈이미도-글루타르이미드기 또는 이의 유사체 또는 유도체를 포함한다. 또 다른 실시형태에서, CLM은 탈리도마이드, 레날리도마이드, 포말리도마이드, 그리고 이들의 유사체 또는 유도체로 구성된 군의 구성원을 포함한다.
추가의 실시형태에서, 본 기술내용은 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물뿐만 아니라 이의 약제학적으로 허용 가능한 염 형태, 예를 들면, 산 및 염기 염 형태를 비롯하여 이들의 거울상이성질체, 부분입체이성질체, 용매화물 및 다형체를 제공한다.
네오 - 이미드 (Neo- imide ) 화합물
일 양상에 있어서, 기술내용은 세레블론 저해 및/또는 결합하는데 유용한 화합물을 제공한다. 소정의 실시형태에 있어서, 이 화합물은 하기 화학 구조로 이루어진 군으로부터 선택된다:
Figure pct00003
Figure pct00004
여기서,
W는 독립적으로 CH2, CHR, C=O, SO2, NH, 및 N-알킬기로 이루어진 군으로부터 선택되고;
X는 독립적으로 O, S 및 H2의 군으로부터 선택되며;
Y는 독립적으로 NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-사이클로알킬, N-헤테로사이클릴, O 및 S의 군으로부터 선택되고;
Z는 독립적으로, X 및 Z 둘 다가 H2일 수 없는 것을 제외하고 O 및 S 또는 H2의 군으로부터 선택되며;
G 및 G'은 독립적으로 H, 알킬, OH, R'으로 임의로 치환된 CH2-헤테로사이클릴, 및 R'으로 임의로 치환된 벤질의 군으로부터 선택되고;
Q1 내지 Q4는 R', N 또는 N-옥사이드로부터 독립적으로 선택된 기로 치환된 탄소 C를 나타내며;
A는 독립적으로 알킬, 사이클로알킬, Cl 및 F의 군으로부터 선택되고;
R은 -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, -아릴, -헤트아릴, -알킬, -사이클로알킬, -헤테로사이클릴, -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3를 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아니며;
R' 및 R"은 독립적으로 결합, H, 알킬, 사이클로알킬, 아릴, 헤트아릴, 헤테로사이클릴로부터 선택되고;
n은 1 내지 4의 정수이며;
Figure pct00005
은 입체특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체특이적일 수 있는 결합을 나타내고; 그리고
Rn은 1 내지 4개의 독립적인 작용기 또는 원자를 포함한다.
예시적인 CLM
본 명세서에 기술된 화합물의 임의의 것에 있어서, CLM은 이하의 군으로부터 선택된 화학 구조를 포함한다:
Figure pct00006
여기서,
W는 독립적으로 CH2, CHR, C=O, SO2, NH 및 N-알킬기로부터 선택되고;
X는 독립적으로 O, S 및 H2기로 이루어진 군으로부터 선택되며;
Y는 독립적으로 NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-사이클로알킬, N-헤테로사이클릴, O 및 S기로 이루어진 군으로부터 선택되고;
Z는 독립적으로, X 및 Z 둘 다가 H2일 수 없는 것을 제외하고 O 및 S 또는 H2의 군으로부터 선택되며;
G 및 G'은 독립적으로 H, 알킬, OH, R'으로 임의로 치환된 CH2-헤테로사이클릴, 및 R'으로 임의로 치환된 벤질의 군으로부터 선택되고;
Q1 내지 Q4는 R', N 또는 N-옥사이드로부터 독립적으로 선택된 기로 치환된 탄소 C를 나타내며;
A는 독립적으로 알킬, 사이클로알킬, Cl 및 F의 군으로부터 선택되고;
R은 -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, -아릴, -헤트아릴, -알킬, -사이클로알킬, -헤테로사이클릴, -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3를 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아니며;
R' 및 R"은 독립적으로 결합, H, 알킬, 사이클로알킬, 아릴, 헤트아릴, 헤테로사이클릴로부터 선택되고;
n은 1 내지 4의 정수이며;
Figure pct00007
은 입체특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체특이적일 수 있는 결합을 나타내고; 그리고
Rn은 1 내지 4개의 독립된 작용기 또는 원자를 포함하고, 그리고 임의로, 이들 중에서 하나는 PTM, 화학적 링커기(L), ULM, CLM(또는 CLM') 또는 이들의 조합에 공유 연결되도록 변형된다.
용어 "독립적으로"는 독립적으로 적용되는 변수가 각 적용마다 독립적으로 변한다는 것을 지시하기 위해 본 명세서에서 이용된다.
용어 "알킬"은, 이의 문맥 내에서, 선형, 분지-사슬 또는 환식의 완전히 포화된 탄화수소 라디칼 또는 알킬기, 바람직하게는 C1-C10, 더 바람직하게는 C1-C6, 대안적으로 C1-C3 알킬기를 의미하며, 이것은 임의로 치환된다. 알킬기의 예는, 특히, 메틸, 에틸, n-부틸, sec-부틸, n-헥실, n-헵틸, n-옥틸, n-노닐, n-데실, 아이소프로필, 2-메틸-프로필, 사이클로프로필, 사이클로-프로필-메틸, 사이클로부틸, 사이클로펜틸, 사이클로펜틸에틸, 사이클로헥실에틸 및 사이클로헥실이다. 소정의 실시형태에 있어서, 알킬기는 할로겐기(At, Br, Cl, F, 또는 I)로 단부-캐핑된다. 소정의 바람직한 실시형태에 있어서, 본 발명에 따른 화합물은 데할로게나제 효소에 공유 결합하는데 이용될 수 있다. 이들 화합물은 일반적으로, 원위 단부에서 할로겐 치환체(종종, 염소 또는 브로민)를 갖는 알킬기에서 종결되는 곁사슬(종종, 폴리에틸렌 글리콜기를 통해 연결됨)을 함유하는데, 이것은 이런 모이어티를 함유하는 화합물의 단백질로의 공유 결합을 유발한다.
용어 "알켄일"은 적어도 하나의 C=C 결합을 포함하는 선형, 분지-사슬 또는 환식 C2-C10(바람직하게는 C2-C6) 탄화수소 라디칼을 지칭한다.
용어 "알킨일"은 적어도 하나의 C=C 결합선형, 분지-사슬 또는 환식 C2-C10 (바람직하게는 C2-C6) 탄화수소 라디칼을 지칭한다.
용어 "알킬렌"은, 사용될 경우, -(CH2)n-기(n은 일반적으로 0 내지 6의 정수임)를 지칭하며, 이것은 임의로 치환될 수 있다. 치환된 경우, 알킬렌기는 바람직하게는 메틸렌기의 하나 이상에서 C1-C6 알킬기(사이클로프로필기 또는 t-부틸기 포함)로 치환되지만, 또한 1개 이상의 할로기, 바람직하게는 1 내지 3개의 할로기 또는 1 또는 2개의 하이드록실기, O-(C1-C6 알킬)기 또는 달리 본 명세서에 개시된 바와 같은 아미노산 곁사슬로 치환될 수 있다. 소정의 실시형태에 있어서, 알킬렌기는 우레탄 또는 알콕시기(또는 다른 기)로 치환될 수 있고, 이것은 (1 내지 10개, 바람직하게는 1 내지 6개, 종종 1 내지 4개의 에틸렌 글리콜 단위의) 폴리에틸렌 글리콜 사슬로 더 치환되지만, 단일 할로겐기, 바람직하게는 염소기로 치환된 알킬 사슬이 여기에(바람직하게는, 하지만 비배타적으로, 폴리에틸렌 글리콜 사슬의 원위 단부에서) 치환된다. 또 다른 실시형태에 있어서, 알킬렌(종종, 메틸렌)기는 아미노산 곁사슬기, 예를 들면, 자연 또는 비자연 아미노산, 예를 들면, 알라닌, β-알라닌, 아르기닌, 아스파라긴, 아스파르트산, 시스테인, 시스틴, 글루탐산, 글루타민, 글리신, 페닐알라닌, 히스티딘, 아이소류신, 라이신, 류신, 메티오닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 발린, 트립토판 또는 티로신의 곁사슬기로 치환될 수 있다.
용어 "비치환된"은 단지 수소 원자로만 치환된다는 것을 의미할 것이다. C0을 포함하는 탄소 원자의 범위는 탄소가 부재하고 H로 대체된다는 것을 의미한다. 따라서, C0-C6인 탄소 원자의 범위는 1, 2, 3, 4, 5 및 6개의 탄 소 원자를 포함하고, 그리고 C0의 경우에, H가 탄소를 대신한다.
용어 "치환된" 또는 "임의로 치환된"은 독립적으로(즉, 하나 이상의 치환체가 발생하는 경우에, 각 치환체는 다른 치환체와는 관계가 없음), 문맥 내에 분자 상에서 어디든지 탄소(또는 질소) 위치에서 하나 이상의 치환체(본 발명에 따른 화합물 내에 모이어티 상에서 독립적으로 최대 5개의 치환체, 바람직하게는 최대 3개의 치환체, 종종 1 또는 2개의 치환체; 그리고 그들 자체가 더 치환될 수 있는 치환체를 포함할 수 있음)를 의미할 것이고, 그리고 치환체로서 하이드록실, 티올, 카복실, 사이아노(C≡N), 나이트로(NO2), 할로겐(바람직하게는, 특히 알킬, 특히 메틸기, 예를 들면, 트라이플루오르메틸 상에서 1, 2 또는 3개의 할로겐), 알킬기(바람직하게는, C1-C10, 더욱 바람직하게는, C1-C6), 아릴(특히 페닐 및 치환된 페닐, 예를 들면, 벤질 또는 벤조일), 알콕시기(바람직하게는, 페닐 및 치환된 페닐을 비롯한 C1-C6 알킬 또는 아릴), 티오에터(C1-C6 알킬 또는 아릴), 아실(바람직하게는, C1-C6 아실), 알킬렌 에스터(바람직하게는 C1-C6 알킬 또는 아릴기로 치환되는 부착이 에스터기보다는 알킬렌기에 있도록)를 비롯한 에스터 또는 티오에스터(바람직하게는, C1-C6 알킬 또는 아릴), 바람직하게는, C1-C6 알킬 또는 아릴, 할로겐(바람직하게는, F 또는 Cl), 아민(알킬기가 1개 또는 2개 하이드록실기로 치환될 수 있는 C1-C6 알킬 아민 또는 C1-C6 디알킬 아민을 더욱 포함하는 5- 또는 6-원 환상 알킬렌 아민을 포함) 또는 임의로 치환된 -N(C0-C6 알킬)C(O)(O-C1-C6 알킬)기(이것은 단일 할로 겐, 바람직하게는 염소 치환체를 함유하는 알킬기가 더욱 결합되는 폴리에틸렌 글리콜 사슬로 임의로 치환될 수 있다), 히드라진, 아미도(이것은 바람직하게는 1개 또는 2개의 C1-C6 알킬기로 치환된다)(1개 또는 2개의 C1-C6 알킬기로 임의로 치환되는 카복스아마이드를 포함), 알칸올(바람직하게는, C1-C6 알킬 또는 아릴), 또는 알칸산(바람직하게는, C1-C6 알킬 또는 아릴)을 포함한다. 본 발명에 따른 치환체는 예로서 -SiR1R2R3기를 포함할 수 있는데, 여기서 R1 및 R2 각각은 본 명세에서 달리 설명된 바와 같고, 그리고 R3은 H 또는 C1-C6 알킬기이고, 바람직하게는 R1, R2, R3은 이러한 문맥에서 C1-C3 알킬기(아이소프로필 또는 t-부틸기 포함)이다. 전술한 기 각각은 치환된 모이어티에 직접적으로 연결될 수 있거나 또는 대안적으로, 치환체는 임의로 치환된 -(CH2)m- 또는 대안적으로 임의로 치환된 -(OCH2)m-, -(OCH2CH2)m- 또는 -(CH2CH2O)m-기를 통해, 치환된 모이어티(바람직하게는 아릴 또는 헤테로아릴 모이어티의 경우에)에 연결될 수 있고, 상기 기는 전술한 치환체 중에서 임의의 한 가지 또는 그 이상으로 치환될 수 있다. 알킬렌기 -(CH2)m- 또는 -(CH2)n-기 또는 다른 사슬, 예를 들면, 에틸렌 글리콜 사슬은 상기 확인된 바와 같이, 사슬 상에서 어디든지 치환될 수 있다. 알킬렌 기 상에서 바람직한 치환체는 할로겐 또는 -(CH2)m- 또는 -(CH2)n-(바람직하게는 C1-C3) 알킬기를 포함하고, 이들 기는 1개 또는 2개의 하이드록실기, 1개 또는 2개 에터기(O-C1-C6기), 최대 3개의 할로기(바람직하게는 F), 또는 본 명세에서 달리 설명된 바와 같은 아미노산의 곁사슬 및 임의로 치환된 아마이드(바람직하게는 앞서 설명된 바와 같이 치환된 카복스아마이드) 또는 우레탄기(종종, 1개 또는 2개의 C0-C6 알킬 치환체를 가짐, 상기 기(들)는 더욱 치환될 수 있음)로 임의로 치환될 수 있다. 소정의 실시형태에 있어서, 알킬렌기(종종, 단일 메틸렌기)는 1개 또는 2개의 임의로 치환된 C1-C6 알킬기, 바람직하게는 C1-C4 알킬기, 가장 흔히 메틸 또는 O-메틸기 또는 본 명세에서 달리 설명된 바와 같은 아미노산의 곁사슬로 치환된다. 본 발명에서, 분자 내 모이어티는 최대 5개의 치환체, 바람직하게는 최대 3개의 치환체로 임의로 치환될 수 있다. 가장 흔히, 본 발명에서 치환되는 모이어티는 1개 또는 2개의 치환체로 치환된다.
용어 "치환된"(각 치환체는 임의의 다른 치환체와는 관계가 없음)은 또한, 이의 이용의 문맥 내에서 C1-C6 알킬, C1-C6 알콕시, 할로겐, 아미도, 카복스아미도, 설폰아마이드를 비롯한 설폰, 케토, 카복시, C1-C6 에스터(옥시에스터 또는 카보닐에스터), C1-C6 케토, 우레탄 -O-C(O)-NR1R2 또는 -N(R1)-C(O)-O-R1, 나이트로, 사이아노 및 아민(특히, 1개 또는 2개의 하이드록실기로 임의로 치환될 수 있는 C1-C6 알킬렌-NR1R2, 모노- 또는 다이-C1-C6 알킬 치환된 아민 포함)을 의미할 것이다. 이들 기 각각은, 달리 지시되지 않는 한, 문맥 내에서, 1 내지 6개의 탄소 원자를 함유한다. 소정의 실시형태에 있어서, 바람직한 치환체는 치환체의 이용의 문맥에 따라서, 예로서 -NH-, -NHC(O)-, -O-, =O, -(CH2)m-(여기서, m 및 n은 문맥 내에서 1, 2, 3, 4, 5 또는 6임), -S-, -S(O)-, SO2- 또는 -NH-C(O)-NH-, -(CH2)nOH, -(CH2)nSH, -(CH2)nCOOH, C1-C6 알킬, -(CH2)nO-(C1-C6 알킬), -(CH2)nC(O)-(C1-C6 알킬), -(CH2)nOC(O)-(C1-C6 알킬), -(CH2)nC(O)O-(C1-C6 알킬), -(CH2)nNHC(O)-R1, -(CH2)nC(O)-NR1R2, -(OCH2)nOH, -(CH2O)nCOOH, C1-C6 알킬, -(OCH2)nO-(C1-C6 알킬), -(CH2O)nC(O)-(C1-C6 알킬), -(OCH2)nNHC(O)-R1, -(CH2O)nC(O)-NR1R2, -S(O)2-RS, -S(O)-RS(RS는 C1-C6 알킬 또는 -(CH2)m-NR1R2기임), NO2, CN 또는 할로겐(F, Cl, Br, I, 바람직하게는 F 또는 Cl)을 포함할 것이다. R1 및 R2는 각각, 문맥 내에서, H 또는 C1-C6 알킬기이다(이것은 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로겐기, 바람직하게는 플루오린으로 임의로 치환될 수 있다). 용어 "치환된"은 또한, 규정된 화합물 및 이용된 치환체의 화학적 배경 내에서, 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같은 임의로 치환된 아릴 또는 헤테로아릴기 또는 임의로 치환된 복소환식 기를 의미할 것이다. 알킬렌기는 또한, 바람직하게는 임의로 치환된 C1-C6 알킬기(메틸, 에틸 또는 하이드록시메틸 또는 하이드록시에틸이 바람직하고, 따라서 카이럴 중심을 제공함), 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같은 아미노산기의 곁사슬, 상기에서 설명된 바와 같은 아미도 기, 또는 우레탄기 O-C(O)-NR1R2기(여기서 R1 및 R2는 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같음)로 본 명세서에서 달리 개시된 바와 같이 치환될 수 있지만, 많은 다른 기가 또한 치환체로서 사용될 수 있다. 각종 임의로 치환된 모이어티는 3개 이상의 치환체, 바람직하게는 3개 이하의 치환체, 바람직하게는 1 또는 2개의 치환체로 치환될 수 있다. 화합물 내에 분자의 특정 위치에서 치환이 필요하지만(주로, 원자가 때문에), 어떤 치환도 표시되지 않는 경우에, 상기 치환체는 치환의 문맥에서 달리 암시되지 않는 한, H인 것으로 해석되거나 또는 이해되는 것에 유의한다.
용어 "아릴" 또는 "방향족"은, 문맥 내에서, 단일 고리(예를 들어, 벤젠, 페닐, 벤질) 또는 축합 고리(예를 들어, 나프틸, 안트라세닐, 페난트레닐 등)를 갖는 치환된(본 명세서에서 달리 설명된 바와 같이) 또는 비치환된 1가 방향족 라디칼을 지칭하고, 그리고 고리(들) 상에서 임의의 이용 가능한 안정된 위치에서 또는 제공된 화학 구조 내에서 달리 지시된 바와 같이 본 발명에 따른 화합물에 결합될 수 있다. 아릴기의 다른 예는, 문맥 내에서, 고리(단환식) 내에 하나 또는 그 이상의 질소, 산소, 또는 황 원자를 갖는 복소환식 방향족 고리 시스템, "헤테로아릴"기, 예를 들면, 특히, 이미다졸, 푸릴, 피롤, 퓨란일, 티엔, 티아졸, 피리딘, 피리미딘, 피라진, 트라이아졸, 옥사졸 또는 융합된 고리 시스템, 예를 들면, 인돌, 퀴놀린, 인돌리진, 아자인돌리진, 벤조푸라잔 등을 포함할 수 있는데, 이것은 앞서 설명된 바와 같이 임의로 치환될 수 있다. 언급될 수 있는 헤테로아릴기 중에는, 특히, 질소-함유 헤테로아릴기, 예를 들면, 피롤, 피리딘, 피리돈, 피리다진, 피리미딘, 피라진, 피라졸, 이미다졸, 트라이아졸, 트라이아진, 테트라졸, 인돌, 아이소인돌, 인돌리진, 아자인돌리진, 퓨린, 인다졸, 퀴놀린, 다이하이드로퀴놀린, 테트라하이드로퀴놀린, 아이소퀴놀린, 다이하이드로이소퀴놀린, 테트라하이드로이소퀴놀린, 퀴놀리진, 프탈라진, 나프티리딘, 퀴녹살린, 퀴나졸린, 신놀린, 프테리딘, 이미다조피리딘, 이미다조트라이아진, 피라지노피리다진, 아크리딘, 페난트리딘, 카바졸, 카바졸린, 피리미딘, 페난트롤린, 페나센, 옥사디아졸, 벤즈이미다졸, 피롤로피리딘, 피롤로피리미딘 및 피리도피리미딘; 황-함유 방향족 복소환, 예를 들면, 티오펜 및 벤조티오펜; 산소-함유 방향족 복소환, 예를 들면, 퓨란, 피란, 사이클로펜타피란, 벤조퓨란 및 아이소벤조퓨란; 그리고 질소, 황 및 산소 가운데서 선택되는 2개 이상의 헤테로원자를 포함하는 방향족 복소환, 예를 들면, 티아졸, 티아다이아졸, 아이소티아졸, 벤즈옥사졸, 벤조티아졸, 벤조티아디아졸, 페노티아진, 아이소옥사졸, 푸라잔, 페녹사진, 피라졸옥사졸, 이미다조티아졸, 티에노퓨란, 퓨로피롤, 피리독사진, 퓨로피리딘, 퓨로피리미딘, 티에노피리미딘 및 옥사졸이 포함되는데, 이들은 모두 임의로 치환될 수 있다.
용어 "치환된 아릴"은 적어도 하나의 방향족 고리 또는 복수의 축합 고리(이들 중에서 적어도 하나는 방향족임)로 구성된 방향족 탄소환식 기를 지칭하고, 여기서 상기 고리(들)는 하나 이상의 치환체로 치환된다. 예를 들어, 아릴기는 다음에서 선택되는 치환체(들)를 포함할 수 있다: -(CH2)nOH, -(CH2)n-O-(C1-C6)알킬, -(CH2)n-O-(CH2)n-(C1-C6)알킬, -(CH2)n-C(O)(C0-C6)알킬, -(CH2)n-C(O)O(C0-C6)알킬, -(CH2)n-OC(O)(C0-C6)알킬, 아민, 모노- 또는 다이-(C1-C6 알킬) 아민(여기서 아민 상에서 알킬기는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로(바람직하게는 F, Cl)기, OH, COOH, C1-C6 알킬, 바람직하게는 CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2, 또는 CN 기로 임의로 치환됨)(이들은 각각 페닐 고리의 오쏘-, 메타- 및/또는 파라-위치, 바람직하게는 파라-에 서 치환될 수 있다), 임의로 치환된 페닐기(페닐기 그 자체가 바람직하게는, ULM기를 비롯한 PTM 기에 부착된 링커 기로 치환된다), 및/또는 F, Cl, OH, COOH, CH3, CF3, OMe, OCF3, NO2 또는 CN 중에서 적어도 하나(페닐 고리의 오쏘-, 메타- 및/또는 파라-위치에서, 바람직하게는 파라-에서), 나프틸기(이것은 임의로 치환될 수 있음), 임의로 치환된 헤테로아릴, 바람직하게는 메틸치환된 아이소옥사졸을 비롯한 임의로 치환된 아이소옥사졸, 메틸치환된 옥사졸을 비롯한 임의로 치환된 옥사졸, 메틸 치환된 티아졸을 비롯한 임의로 치환된 티아졸, 메틸 치환된 아이소티아졸을 비롯한 임의로 치환된 아이소티아졸, 메틸치환된 피롤을 비롯한 임의로 치환된 피롤, 메틸이미다졸을 비롯한 임의로 치환된 이미다졸, 임의로 치환된 벤즈이미다졸 또는 메톡시벤질이미다졸, 임의로 치환된 옥시미다졸 또는 메틸옥시미다졸, 메틸디아졸기를 비롯한 임의로 치환된 다이아졸기, 메틸치환된 트라이아졸기를 비롯한 임의로 치환된 트라이아졸기, 할로-(바람직하게는, F) 또는 메틸치환된 피리딘기 또는 옥사피리딘기(여기서 피리딘기는 산소에 의해 페닐기에 연결됨)를 비롯한 임의로 치환된 피리딘기, 임의로 치환된 퓨란, 임의로 치환된 벤조퓨란, 임의로 치환된 다이하이드로벤조퓨란, 임의로 치환된 인돌, 인돌리진 또는 아자인돌리진(2, 3, 또는 4-아자인돌리진), 임의로 치환된 퀴놀린, 그리고 이들의 조합.
"카복실"은 --C(O)OR기를 나타내고, 여기서 R은 수소, 알킬, 치환된 알킬, 아릴, 치환된 아릴, 헤테로아릴 또는 치환된 헤테로아릴이고, 여기서 이들 일반적 치환체는 본 명세서에서 규정된 상응하는 기의 정의와 동일한 의미를 갖는다.
용어 "헤테로아릴" 또는 "헤트아릴"은 다음을 의미할 수 있지만 이들로 결코 제한되지 않는다: 임의로 치환된 퀴놀린(이것은 약물작용발생단에 부착되거나 또는 퀴놀린 고리 내에서 임의의 탄소 원자 상에 치환될 수 있음), 임의로 치환된 인돌(다이하이드로인돌 포함), 임의로 치환된 인돌리진, 임의로 치환된 아자인돌리진(2, 3 또는 4-아자인돌리진) 임의로 치환된 벤즈이미다졸, 벤조다이아졸, 벤즈옥소퓨란, 임의로 치환된 이미다졸, 임의로 치환된 아이소옥사졸, 임의로 치환된 옥사졸(바람직하게는 메틸 치환된), 임의로 치환된 다이아졸, 임의로 치환된 트라이아졸, 테트라졸, 임의로 치환된 벤조퓨란, 임의로 치환된 티오펜, 임의로 치환된 티아졸(바람직하게는 메틸 및/또는 티올 치환된), 임의로 치환된 아이소티아졸, 임의로 치환된 트라이아졸(바람직하게는 메틸기로 치환된 1,2,3-트라이아졸, 트라이아이소프로필실릴기, 임의로 치환된 -(CH2)m-O-C1-C6 알킬기 또는 임의로 치환된 -(CH2)m-C(O)-O-C1-C6 알킬기), 임의로 치환된 피리딘(2-, 3- 또는 4-피리딘) 또는 하기 화학 구조에 따른 기:
Figure pct00008
여기서,
Sc는 CHRSS, NRURE 또는 O이고;
RHET는 H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 임의로 치환된 C1-C6 알킬 (바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기(예컨대 CF3)로 치환됨), 임의로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기로 치환됨) 또는 임의로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이며;
RSS는 H, CN, NO2, 할로(바람직하게는 F 또는 Cl), 임의로 치환된 C1-C6 알킬 (바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기로 치환됨), 임의로 치환된 O-(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기로 치환됨) 또는 임의로 치환된 -C(O)(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기로 치환됨)이고;
RURE는 H, C1-C6 알킬(바람직하게는 H 또는 C1-C3 알킬) 또는 -C(O)(C1-C6 알킬)이고, 이들 각각의 기는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로겐, 바람직하게는 플루오린기, 또는 임의로 치환된 복소환, 예를 들어 피페리딘, 몰폴린, 피롤리딘, 테트라하이드로퓨란, 테트라하이드로티오펜, 피페리딘, 피페라진으로 임의로 치환되되, 각각은 임의로 치환되며, 그리고
YC는 N 또는 C-RYC이되, 여기서 RYC는 H, OH, CN, NO2, 할로(바람직하게는 Cl 또는 F), 임의로 치환된 C1-C6 알킬(바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기(예컨대 CF3)로 치환됨), 임의로 치환된 O(C1-C6 알킬)(바람직하게는 1 또는 2개의 하이드록실기 또는 최대 3개의 할로기로 치환됨) 또는 임의로 치환된 아세틸렌기 -C≡C-Ra(여기서 Ra는 H 또는 C1-C6 알킬기(바람직하게는 C1-C3 알킬)임)이다.
용어 "아르알킬" 및 "헤테로아릴알킬"은 둘 다 상기 정의에 따른 아릴, 또는 각각 헤테로아릴뿐만 아니라 알킬 및/또는 헤테로알킬 및/또는 탄소환식 및/또는 헤테로사이클로알킬 고리 시스템을 포함하는 기를 지칭한다.
본 명세서에서 이용되는 바와 같은 용어 "아릴알킬"은 상기 규정된 알킬기에 부가된 상기 규정된 바와 같은 아릴 기를 지칭한다. 아릴알킬기는 알킬기를 통해 부모 모이어티에 부착되고, 여기서 알킬기는 1 내지 6개의 탄소 원자이다. 아릴알킬기 내의 아릴기는 상기 규정된 바와 같이 치환될 수 있다.
용어 "복소환"은 적어도 하나의 헤테로원자, 예를 들면, N, O 또는 S를 함유하고, 그리고 방향족 (헤테로아릴) 또는 비방향족일 수 있는 환식 기를 지칭한다. 따라서, 헤테로아릴 모이어티는, 이의 이용의 문맥에 따라, 복소환의 정의 하에 포함된다. 예시적인 헤테로아릴기는 본 명세서에서 기술된다.
예시적인 복소환은 다음을 포함한다: 특히, 아제티딘일, 벤즈이미다졸릴, 1,4- 벤조다이옥산일, 1,3-벤조다이옥솔릴, 벤즈옥사졸릴, 벤조티아졸릴, 벤조티엔일, 다이하이드로이미다졸릴, 다이하이드로피란일, 다이하이드로퓨란일, 다이옥산일, 다이옥솔란일, 에틸렌유레아, 1,3-다이옥솔란, 1,3-다이옥산, 1,4-다이옥산, 퓨릴, 호모피페리딘일, 이미다졸릴, 이미다졸린일, 이미다졸리딘일, 인돌린일, 인돌릴, 아이소퀴놀린일, 아이소티아졸리딘일, 아이소티아졸릴, 아이소옥사졸리딘일, 아이소옥사졸릴, 몰폴린일, 나프티리딘일, 옥사졸리딘일, 옥사졸릴, 피리돈, 2-피롤리돈, 피리딘, 피페라진일, N-메틸피페라진일, 피페리딘일, 프탈이미드, 숙신이미드, 피라진일, 피라졸린일, 피리딜, 피리미딘일, 피롤리딘일, 피롤린일, 피롤릴, 퀴놀린일, 테트라하이드로퓨란일, 테트라하이드로피란일, 테트라하이드로퀴놀린, 티아졸리딘일, 티아졸릴, 티엔일, 테트라하이드로티오펜, 옥산, 옥세탄일, 옥사티올란일, 티안.
복소환식 기는 알콕시, 치환된 알콕시, 사이클로알킬, 치환된 사이클로알킬, 사이클로알켄일, 치환된 사이클로알켄일, 아실, 아실아미노, 아실옥시, 아미노, 치환된 아미노, 아미노아실, 아미노아실옥시, 옥시아미노아실, 아자이도, 사이아노, 할로겐, 하이드록실, 케토, 티오케토, 카복시, 카복시알킬, 티오아릴옥시, 티오헤테로아릴옥시, 티오헤테로사이클로옥시, 티올, 티오알콕시, 치환된 티오알콕시, 아릴, 아릴옥시, 헤테로아릴, 헤테로아릴옥시, 복소환식, 헤테로사이클로옥시, 하이드록시아미노, 알콕시아미노, 나이트로, -SO-알킬, -SO-치환된 알킬, -SO아릴, -SO-헤테로아릴, -SO2-알킬, -SO2-치환된 알킬, -SO2-아릴, 옥소(-O), 및 -SO2-헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택된 구성원으로 임의로 치환될 수 있다. 이러한 복소환식 기는 단일 고리 또는 다수의 축합 고리를 가질 수 있다. 질소 복소환 및 헤테로아릴의 예는, 피롤, 이미다졸, 피라졸, 피리딘, 피라진, 피리미딘, 피리다진, 인돌리진, 아이소인돌, 인돌, 인다졸, 퓨린, 퀴놀리진, 아이소퀴놀린, 퀴놀린, 프탈라진, 나프틸피리딘, 퀴녹살린, 퀴나졸린, 신놀린, 프테리딘, 카바졸, 카볼린, 페난트리딘, 아크리딘, 페난트롤린, 아이소티아졸, 페나진, 아이소옥사졸, 페녹사진, 페노티아진, 이미다졸리딘, 이미다졸린, 피페리딘, 피페라진, 인돌린, 몰폴리노, 피페리딘일, 테트라하이드로퓨란일 등뿐만 아니라 N-알콕시-질소 함유 복소환을 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아니다. 용어 "복소환식"은 또한복소환식 고리의 어느 하나가 벤젠 고리 또는 사이클로헥산 고리 또는 다른 복소환식 고리(예를 들어, 인돌릴, 퀴놀릴, 아이소퀴놀릴, 테트라하이드로퀴놀릴 등)에 융합된 이환식 기를 포함한다.
용어 "사이클로알킬"은 본 명세서에서 규정된 바와 같은 단환식 또는 다환식 알킬기 또는 사이클로알칸으로부터 유래된 1가 기, 예를 들면, 사이클로프로필, 사이클로부틸, 사이클로펜틸, 사이클로헥실, 사이클로헵틸 등을 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아닌, 고리 내에 3 내지 20개의 탄소 원자를 갖는 포화된 단환식 탄화수소기를 의미할 수 있지만 이들로 결코 제한되지 않는다. 용어 "치환된 사이클로알킬"은 하나 이상의 치환체, 예를 들면, 아미노, 할로겐, 알킬, 치환된 알킬, 카빌옥시, 카빌머캅토, 아릴, 나이트로, 머캅토 또는 설포에 의해 치환되는 단환식 또는 다환식 알킬기를 의미할 수 있지만 이들로 결코 제한되지 않고, 여기서 이들 일반적 치환체 기는 본 범례에서 규정된 바와 같은 상응하는 기의 정의와 동일한 의미를 갖는다.
"헤테로사이클로알킬"은 이의 환식 구조의 적어도 하나의 고리 탄소 원자가 N, O, S 또는 P로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로원자로 대체되는 단환식 또는 다환식 알킬기를 지칭한다. "치환된 헤테로사이클로알킬"은 이의 환상 구조의 적어도 하나의 고리 탄소 원자가 N, O, S 또는 P로 이루어진 군으로부터 선택되는 헤테로원자로 대체되는 단환식 또는 다환식 알킬기를 지칭하고, 그리고 상기 기는 할로겐, 알킬, 치환된 알킬, 카빌옥시, 카빌머캅토, 아릴, 나이트로, 머캅토 또는 설포로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 치환체를 함유하고, 여기서 이들 일반적 치환체 기는 본 범례에서 규정된 바와 같은 상응하는 기의 정의와 동일한 의미를 갖는다.
용어 "하이드로카빌"은 탄소 및 수소를 함유하고, 완전히 포화된, 부분적으로 불포화된 또는 방향족일 수 있고, 그리고 아릴기, 알킬기, 알켄일기 및 알킨일기를 포함하는 화합물을 의미할 것이다.
본 명세서에서 기술된 실시형태의 어느 하나에서, W, X, Y, Z, G, G', R, R', R'', Q1 내지 Q4, A 및 Rn은 독립적으로, 링커 및/또는 하나 이상의 PTM, ULM, CLM 또는 CLM'기가 부착되는 링커에 공유적으로 커플링될 수 있다.
더욱 구체적으로는, CLM의 비제한적 예는 아래에 도시된 것들뿐만 아니라 아래의 분자에서 도시된 상이한 특징의 하나 이상의 조합으로부터 발생하는 이들 '혼성' 분자를 포함한다.
Figure pct00009
Figure pct00010
Figure pct00011
Figure pct00012
Figure pct00013
소정의 경우에, "CLM"은 세레블론 E3 연쇄에 결합하는 이미드일 수 있다. 이들 이미드 및 링커 부착점은 이하의 구조일 수 있지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
Figure pct00014
예시적인 링커
소정의 실시형태에 있어서, 본 명세서에서 기술된 바와 같은 화합물은 화학적 링커(L)를 통해서 화학적으로 연결되거나 또는 커플링될 수 있다. 소정의 실시형태에 있어서, 링커기 L은 A의 하나 이상의 공유 연결된 구조 단위(예를 들어, -A1… Aq-)를 포함하는 기이고, 여기서 A1은 ULM, PTM, 또는 이들의 조합 중에서 적어도 하나에 커플링된 기이다. 소정의 실시형태에 있어서, A1은 ULM, PTM, 또는 이들의 조합을 다른 ULM, PTM, 또는 이들의 조합에 직접적으로 연결한다. 다른 실시형태에 있어서, A1은 ULM, PTM, 또는 이들의 조합을 Aq를 통해 간접적으로 다른 ULM, PTM, 또는 이들의 조합에 연결한다.
소정의 실시형태에 있어서, A1 내지 Aq는, 각각 독립적으로, 결합, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C=C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 C3 - 11사이클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 C3 - 11헤테로사이클릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 헤테로아릴이고, 여기서 RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로, 다른 A기에 연결되어, 0-4 RL5기로 더 치환될 수 있는, 사이클로알킬 및/또는 헤테로사이클릴를 형성할 수 있고; 여기서
RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는, 각각 독립적으로, H, 할로, C1 - 8알킬, OC1 - 8알킬, SC1-8알킬, NHC1 - 8알킬, N(C1 - 8알킬)2, C3 - 11사이클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3 - 11헤테로사이클릴, OC1 - 8사이클로알킬, SC1 - 8사이클로알킬, NHC1 - 8사이클로알킬, N(C1 - 8사이클로알킬)2, N(C1 - 8사이클로알킬)(C1 - 8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1 - 8알킬, P(O)(OC1 - 8알킬)(C1 - 8알킬), P(O)(OC1 - 8알킬)2, CC-C1 - 8알킬, CCH, CH=CH(C1 - 8알킬), C(C1 - 8알킬)=CH(C1 - 8알킬), C(C1 - 8알킬)=C(C1 - 8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1 - 8알킬)3, Si(OH)(C1 - 8알킬)2, COC1 - 8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1 - 8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1 - 8알킬, SON(C1 - 8알킬)2, CONHC1 - 8알킬, CON(C1 - 8알킬)2, N(C1 - 8알킬)CONH(C1 - 8알킬), N(C1 - 8알킬)CON(C1- 8알킬)2, NHCONH(C1 - 8알킬), NHCON(C1 - 8알킬)2, NHCONH2, N(C1 - 8알킬)SO2NH(C1- 8알킬), N(C1 - 8알킬) SO2N(C1 - 8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1 - 8알킬)2, NH SO2NH2이다.
소정의 실시형태에 있어서, q는 0보다 크거나 또는 이와 동등한 정수이다. 소정의 실시형태에 있어서, q는 1보다 크거나 또는 이와 동등한 정수이다.
소정의 실시형태에 있어서, 예컨대, q가 2보다 큰 경우에, Aq는 ULM 또는 ULM' 모이어티에 연결되는 기이고, 그리고 A1 및 Aq는 A의 구조 단위를 통해서 연결된다(A의 이런 구조 단위의 개수: q-2).
소정의 실시형태에 있어서, 예컨대, q가 2인 경우에, Aq는 A1에 그리고 ULM 또는 ULM' 모이어티에 연결되는 기이다.
소정의 실시형태에 있어서, 예컨대, q가 1인 경우에, 링커기 L의 구조는 -A1-이고, 그리고 A1은 ULM 또는 ULM' 모이어티 및 PTM 모이어티에 연결되는 기이다.
추가의 실시형태에 있어서, q는 1 내지 100, 1 내지 90, 1 내지 80, 1 내지 70, 1 내지 60, 1 내지 50, 1 내지 40, 1 내 지 30, 1 내지 20, 또는 1 내지 10의 정수이다.
소정의 실시형태에 있어서, 링커(L)는 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다:
Figure pct00015
Figure pct00016
추가의 실시형태에 있어서, 링커기는 1 내지 약 100개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 1 내지 약 50개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 약 25개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 1 내지 10개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 약 8개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 6개의 에틸렌 글리콜 단위, 2 내지 4개의 에틸렌 글리콜 단위를 갖는 임의로 치환된 (폴리)에틸렌글리콜, 또는 임의로 치환된, O, N, S, P 또는 Si 원자가 산재된 임의로 치환된 알킬기이다. 소정의 실시형태에 있어서, 링커는 아릴, 페닐, 벤질, 알킬, 알킬렌, 또는 복소환 기로 치환된다. 소정의 실시형태에 있어서, 링커는 비대칭 또는 대칭일 수 있다.
본 명세서에서 기재된 화합물의 실시형태 중에서 어느 하나에서, 링커기는 본 명세서에서 기재된 바와 같은 임의의 적절한 모이어티일 수 있다. 일 실시형태에 있어서, 링커는 약 1 내지 약 12개의 에틸렌 글리콜 단위, 1 내지 약 10개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 2 내지 약 6개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 2 내지 5개의 에틸렌 글리콜 단위, 약 2 내지 4개의 에틸렌 글리콜 단위의 크기 범위의 치환된 또는 비치환된 폴리에틸렌 글리콜기이다.
비록 CLM(또는 ULM)기 및 PTM기가 링커의 화학에 적절하고 안정된 임의의 기를 통해서 링커기에 공유 연결될 수 있지만, 본 발명의 바람직한 양상에서, 링커는 독립적으로, 바람직하게는 아마이드, 에스터, 티오에스터, 케토기, 카바메이트(우레탄), 탄소 또는 에터를 통해 CLM기 및 PTM기에 공유 결합되고, 이들 각 기는 유비퀴틴 리가제 상에서 CLM기 및 분해될 표적 단백질 상에서 PTM기의 최대 결합을 제공하기 위해 CLM기 및 PTM기 상에서 어디든지 삽입될 수 있다. (PTM기가 ULM기인 소정의 양상에서, 분해를 위한 표적 단백질은 유비퀴틴 리가제 그 자체일 수 있는 점에 유의한다). 소정의 바람직한 양상에서, 링커는 CLM 및/또는 PTM기 상에서 임의로 치환된 알킬, 알킬렌, 알켄 또는 알킨기, 아릴기 또는 복소환식 기에 연결될 수 있다.
소정의 실시형태에 있어서, "L"은 4 내지 24개의 선형 원자를 가진 선형 사슬일 수 있고, 선형 사슬 내 탄소 원자는, 다음과 같이, 산소, 질소, 아마이드, 플루오린화 탄소 등으로 치환될 수 있다:
Figure pct00017
Figure pct00018
소정의 실시형태에 있어서, "L"은 비선형 사슬일 수 있고, 그리고 지방족 또는 방향족 또는 헤테로방향족 환식 모이어티일 수 있으며, "L"의 몇몇 예는 하기를 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아니다:
Figure pct00019
여기서 상기 구조 중 "X"는 2 내지 14의 범위의 원자를 가진 선형 사슬일 수 있고, 언급된 사슬은 산소와 같은 헤테로원자를 함유할 수 있으며; 그리고
상기 구조 중 "Y"는 O, N, S(O)n(n=0, 1, 2)일 수 있다.
예시적인 PTM
본 발명의 바람직한 양상에서, PTM기는 표적 단백질에 결합하는 기이다. PTM기의 표적은 종류가 다양하고, 그리고 서열의 적어도 일부가 세포 내에서 발견되고 PTM기에 결합할 수 있도록 세포에서 발현되는 단백질로부터 선택된다. 용어 "단백질"은 본 발명에 따른 PTM기에 결합할 수 있도록 충분한 길이의 올리고펩타이드 및 폴리펩타이드 서열을 포함한다. 바이러스, 세균 또는 진균류를 비롯한 진핵 시스템 또는 미생물 시스템에서 임의의 단백질은, 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같이, 본 발명에 따른 화합물에 의해 매개된 유비퀴틴화를 위한 표적이다. 바람직하게는, 표적 단백질은 진핵 단백질이다. 소정의 양상에서, 단백질 결합 모이어티는 할로알칸(바람직하게는, 알킬기의 원위 단부에서(즉, 링커 또는 CLM기로부터 멀리 떨어진) 적어도 하나의 할로기, 바람직하게는 하나의 할로기로 치환된 C1-C10 알킬기)이고, 이것은 환자 또는 대상체에서 또는 진단적 검정에서 데할로게나제 효소에 공유 결합될 수 있다.
본 발명에 따른 PTM기는, 예를 들어, 단백질에 특이적으로 결합하는(표적 단백질에 결합하는) 임의의 모이어티를 포함하고, 그리고 소분자 표적 단백질 모이어티의 다음의 비제한적 예를 포함한다: 다양한 다른 것들 중에서, Hsp90 저해제, 키나제 저해제, HDM2 및 MDM2 저해제, 인간 BET 브로모도메인-함유 단백질을 표적화하는 화합물, HDAC 저해제, 인간 라이신 메틸전달효소 저해제, 혈관형성 저해제, 핵 호르몬 수용체 화합물, 면역억제 화합물, 그리고 아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적화하는 화합물. 아래에 기재된 조성물은 이들 9가지 유형의 소분자 표적 단백질 결합 모이어티의 구성원 중에서 일부를 예시한다. 이러한 소분자 표적 단백질 결합 모이어티는, 또한 이들 조성물의 약제학적으로 허용 가능한 염, 거울상이성질체, 용매화물 및 다형체뿐만 아니라 관심 대상 단백질을 표적화할 수 있는 다른 소분자를 포함한다. 이들 결합 모이어티는 표적 단백질(여기에 단백질 표적 모이어티가 결합됨)을 유비퀴틴화 및 분해를 위한 유비퀴틴 리가제에 근접하여 제공하기 위 해, 바람직하게는 링커를 통해 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티에 연결된다.
단백질 표적 모이어티 또는 PTM기에 결합할 수 있고 유비퀴틴 리가제에 의해 작용되거나 또는 분해되는 임의의 단백질이 본 발명에 따른 표적 단백질이다. 일반적으로, 표적 단백질은, 예를 들어, 구조 단백질, 수용체, 효소, 세포 표면 단백질, 촉매 활성, 아로마타제 활성, 운동 활성, 헬리카제 활성, 물질대사 과정(동화 및 분해 대사), 항산화 활성, 단백질분해, 생합성, 키나제 활성을 갖는 단백질, 산화환원 효소 활성, 전달효소 활성, 가수분해효소 활성, 리아제 활성, 이성질체화효소 활성, 리가제 활성, 효소 조절인자 활성, 신호 변환기 활성, 구조적 분자 활성, 결합 활성(단백질, 지질 탄수화물), 수용체 활성, 세포 운동성, 막 융합, 세포 통신, 생물학적 과정의 조절, 발달, 세포 분화, 자극에 대한 반응에 관련된 단백질을 비롯하여, 세포의 통합된 기능에 관련된 단백질, 거동 단백질, 세포 부착 단백질, 세포 사멸에 관련된 단백질, 수송(단백질 전달체 활성, 핵 수송, 이온 전달체 활성, 통로 전달체 활성, 담체 활성, 투과효소 활성, 분비 활성, 전자 전달체 활성, 병인, 샤프롱 조절인자 활성, 핵산 결합 활성, 전사 조절인자 활성, 세포외 조직화 및 생물발생 활성, 번역 조절인자 활성 포함)에 관련된 단백질을 포함할 수 있다. 관심 대상 단백질은, 다양한 다른 것들 중에서, 약물 요법을 위한 표적으로서 인간, 가축을 비롯한 다른 동물, 항생제에 대한 표적의 결정을 위한 미생물, 다른 길항미생물과 식물, 그리고 심지어 바이러스를 비롯하여, 진핵생물 및 원핵생물로부터의 단백질을 포함할 수 있다.
또 다른 실시형태에 있어서, PTM기는 할로알킬기이고, 여기서 상기 알킬기는 일반적으로, 크기가 약 1 또는 2개의 탄소 내지 약 12개의 탄소의 길이, 종종 약 2 내지 10개의 탄소, 흔히 약 3개의 탄소 내지 약 8개의 탄소의 길이, 더욱 흔히 약 4개의 탄소 내지 약 6개의 탄소의 길이의 범위이다. 할로알킬기는 일반적으로 선형 알킬기(비록 분지된-사슬 알킬기 역시 이용될 수 있긴 하지만)이고, 그리고 적어도 하나의 할로겐기, 바람직하게는 단일 할로겐기, 종종 단일 염화물기로 단부 캡핑된다. 본 발명에서 이용을 위한 할로알킬 PT기는 바람직하게는 화학 구조 -(CH2)v-할로로 표시되는데, 여기서 v는 2 내지 약 12, 흔히 약 3 내지 약 8, 더욱 흔히 약 4 내지 약 6의 임의의 정수이다. 할로는 임의의 할로겐일 수 있지만, 바람직하게는 Cl 또는 Br, 더욱 흔히 Cl이다.
다른 실시형태에 있어서, 본 발명은 화합물의 라이브러리를 제공한다. 라이브러리는 1종 이상의 화합물을 포함하고, 여기서 각 조성물은 A-B의 화학식을 갖고, 여기서 A는 유비퀴틴 경로 단백질 결합 모이어티(바람직하게는, 본 명세서에서 달리 개시된 바와 같은 E3 유비퀴틴 리가제 모이어티)이고, 그리고 B는 분자 라이브러리의 단백질 결합 구성원이고, 여기서 A는 B에 (바람직하게는, 링커 모이어티를 통해) 커플링되고, 그리고 여기서 유비퀴틴 경로 단백질 결합 모이어티는 유비퀴틴 경로 단백질, 특히, E3 유비퀴틴 리가제, 예를 들면, 세레블론을 인식한다. 특정 실시형태에 있어서, 라이브러리는 무작위 표적 단백질 결합 요소(예를 들어, 화학적 화합물 라이브러리)에 결합된 특정한 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티를 함유한다. 따라서, 표적 단백질은 사전에 결정되지 않고, 그리고 상기 방법은 추정 단백질 결합 요소의 활성 및 유비퀴틴 리가제에 의한 분해 시에 표적으로서 이의 약리학적 가치를 결정하는데 이용될 수 있다.
본 발명은 단백질이 조절장애되고 환자가 단백질의 분해로부터 이익을 얻을 임의의 질환 상태 및/또는 병태를 포함하는 다수의 질환 상태 및/또는 병태를 치료하는데 이용될 수 있다.
추가의 양상에서, 본 발명은 유효량의 본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물 또는 이의 염 형태, 그리고 약제학적으로 허용 가능한 담체, 첨가제 또는 부형제, 그리고 임의로, 추가의 생리활성제를 포함하는 치료 조성물을 제공한다. 치료 조성물은 환자 또는 대상체, 예를 들면, 동물, 예를 들면, 인간에서 단백질 분해를 조정하고, 그리고 분해된 단백질을 통해 조정되는 질환 상태 또는 병태를 치료하거나 또는 개선하는데 이용될 수 있다. 소정의 실시형태에 있어서, 본 명세서에서 기재된 바와 같은 치료 조성물은 질환, 예컨대, 암의 치료 또는 개선을 위해 관심 대상 단백질의 분해를 유발하는데 이용될 수 있다. 소정의 추가의 실시형태에 있어서, 질환은 다발성 골수종이다.
대안적 양상에서, 본 발명은 질환 상태 또는 병태가 조정되는 단백질 또는 폴리펩타이드를 분해시킴으로써 치료가 필요한 개체에서 질환 상태를 치료하거나 또는 질환 또는 장애의 증상을 개선하기 위한 방법에 관한 것으로, 상기 방법은 임의로 약제학적으로 허용 가능한 담체, 첨가제 또는 부형제, 그리고 임의로, 추가의 생리활성제와 함께 유효량, 예를 들면, 치료적 유효량의본 명세서에서 기재된 바와 같은 적어도 1종의 화합물을 상기 환자 또는 대상체에 투여하는 것을 포함하고, 여기서 상기 조성물은 개체에서 질환 또는 장애 또는 이의 증상을 치료하거나 또는 개선하는데 효과적이다. 본 발명에 따른 방법은 유효량의 본 명세서에서 기재된 적어도 1종의 화합물의 투여에 의해서, 암을 비롯한 다수의 질환 상태 또는 병태를 치료하는데 이용될 수 있다. 질환 상태 또는 병태는 미생물 병원체 또는 다른 외인성 병원체, 예를 들면, 바이러스, 세균, 진균류, 원생동물 또는 다른 미생물에 의해 유발된 질환이거나, 또는 질환 상태 및/또는 병태를 야기하는 단백질의 과다발현에 의해 유발되는 질환 상태일 수 있다.
다른 양상에서, 본 기술내용은 본 발명에 따른 화합물을 이용하여 생물학적 시스템에서 관심 대상 단백질의 분해의 효과를 확인하기 위한 방법을 제공한다.
용어 "표적 단백질"은 본 발명에 따른 화합물에 결합 및 하기 유비퀴틴 리가제에 의한 분해를 위한 표적인 단백질 또는 폴리펩타이드를 설명하는데 이용된다. 이런 소분자 표적 단백질 결합 모이어티는 또한, 이들 조성물의 약제학적으로 허용 가능한 염, 거울상이성질체, 용매화물 및 다형체뿐만 아니라 관심 대상 단백질을 표적으로 할 수 있는 다른 소분자를 포함한다. 이들 결합 모이어티는 링커기 L을 통해 CLM 또는 ULM기에 연결된다.
단백질 표적 모이어티에 결합될 수 있고, 그리고 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티가 결합되는 리가제에 의해 분해될 수 있는 표적 단백질은 임의의 단백질 또는 펩타이드뿐만 아니라 이의 단편, 이의 유사체, 및/또는 이의 동족체를 포함한다. 표적 단백질은 구조, 조절, 호르몬, 효소, 유전자, 면역학, 수축, 저장, 운송, 그리고 신호 전달을 비롯한 임의의 생물학적 기능 또는 활성을 갖는 단백질 및 펩타이드를 포함한다. 소정의 실시형태에 있어서, 표적 단백질은 구조 단백질, 수용체, 효소, 세포 표면 단백질, 촉매 활성, 아로마타제 활성, 운동 활성, 헬리카제 활성, 물질대사 과정(동화 및 분해대사), 항산화 활성, 단백질분해, 생합성, 키나제 활성을 갖는 단백질, 산화환원 효소 활성, 전달효소 활성, 가수분해효소 활성, 리아제 활성, 이성질체화효소 활성, 리가제 활성, 효소 조절인자 활성, 신호 변환기 활성, 구조적 분자 활성, 결합 활성(단백질, 지질 탄수화물), 수용체 활성, 세포 운동성, 막 융합, 세포 통신, 생물학적 과정의 조절, 발달, 세포 분화, 자극에 대한 반응에 관련된 단백질을 비롯하여, 세포의 통합된 기능에 관련된 단백질, 거동 단백질, 세포 부착 단백질, 세포 사멸에 관련된 단백질, 수송(단백질 전달체 활성, 핵 수송, 이온 전달체 활성, 통로 전달체 활성, 담체 활성, 투과효소 활성, 분비 활성, 전자 전달체 활성, 병인, 샤프롱 조절인자 활성, 핵산 결합 활성, 전사 조절인자 활성, 세포외 조직화 및 생물발생 활성, 번역 조절인자 활성 포함)에 관련된 단백질을 포함한다. 관심 대상 단백질은 다양한 다른 것들 중에서, 약물 요법을 위한 표적으로서 다양한 다른 것들 중에서 인간, 미생물, 바이러스, 진균류 및 기생충을 비롯한 미생물, 바이러스, 진균류 및 기생충, 가축을 비롯한 다른 동물, 항생제에 대한 표적의 결정을 위한 미생물 및 다른 길항미생물과 식물, 그리고 심지어 바이러스를 비롯하여, 진핵생물 및 원핵생물로부터의 단백질을 포함할 수 있다.
더욱 구체적으로는, 인간 치료제에 대한 다수의 약물 표적은 단백질 표적 모이어티가 본 발명에 따른 화합물에 결합되고 이들 내로 통합될 수 있는 단백질 표적을 나타낸다. 이들은, 예를 들어, B7.1 및 B7, TINFRlm, TNFR2, NADPH 옥시다제, BclIBax 및 세포자멸사 경로에서 다른 상대, C5a 수용체, HMG-CoA 환원효소, PDE V 포스포디에스테라제 유형, PDE IV 포스포디에스테라제 유형 4, PDE I, PDEII, PDEIII, 스쿠알렌 사이클라제 저해제, CXCR1, CXCR2, 산화질소(NO) 신타제, 사이클로옥시게나제 1, 사이클로옥시게나제 2, 5HT 수용체, 도파민 수용체, G 단백질, 즉, Gq, 히스타민 수용체, 5-리폭시게나제, 트립신분해효소 세린 프로테아제, 티미딜산염 신타제, 퓨린 뉴클레오사이드 인산화효소, GAPDH 트라이파노소마성, 글리코겐 인산화효소, 탄산 탈수효소, 케모킨 수용체, JAW STAT, RXR 및 유사한 것, HIV 1 프로테아제, HIV 1 인테그라제, 인플루엔자, 뉴라미니다제, B형 간염 역전사효소, 나트륨 통로, 다제 내성(MDR), 단백질 P-당단백질(및 MRP), 티로신 키 나제, CD23, CD124, 티로신 키나제 p56 lck, CD4, CD5, IL-2 수용체, IL-1 수용체, TNF-알파R, ICAM1, Cat+ 통로, VCAM, VLA-4 인테그린, 셀렉틴, CD40/CD40L, 뉴로키닌 및 수용체, 이노신 일인산염 탈수소효소, p38 MAP 키나제, RaslRaflMEWERK 경로, 인터류킨-1 전환효소, 카스파제, HCV, NS3 프로테아제, HCV NS3 RNA 헬리카제, 글리신아마이드 리보뉴클레오타이드 포르밀 전달효소, 리노바이러스 3C 프로테아제, 단순 헤르페스 바이러스-1(HSV-I), 프로테아제, 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로테아제, 폴리(ADP-리보스) 중합효소, 사이클린 의존성 키나제, 혈관 내피 성장 인자, 옥시토신 수용체, 마이크로솜 전달 단백질 저해제, 담즙산 수송 저해제, 5 알파 환원효소 저해제, 안지오텐신 11, 글리신 수용체, 노르아드레날린 재흡수 수용체, 엔도텔린 수용체, 신경펩타이드 Y 및 수용체, 에스트로겐 수용체, 안드로겐 수용체, 아데노신 수용체, 아데노신 키나제 및 AMP 탈아미노효소, 퓨린성 수용체(P2Y1, P2Y2, P2Y4, P2Y6, P2X1-7), 파르네실전달효소, 게라닐게라닐 전달효소, NGF에 대한 TrkA 수용체, 베타-아밀로이드, 티로신 키나제 Flk-IIKDR, 비트로넥틴 수용체, 인테그린 수용체, Her-21 neu, 텔로머라제 저해, 세포질 포스포리파제A2, 그리고 EGF 수용체 티로신 키나제를 비롯하여, 다양한 다유전자 질환에서 기능을 복원하는데 이용될 수 있는 단백질을 포함한다. 추가의 단백질 표적은, 예를 들어, 엑디손 20-모노옥시게나제, GABA 게이팅된 염화물 통로의 이온 통로, 아세틸콜린 에스테라제, 전압-민감성 나트륨 통로 단백질, 칼슘 방출 통로, 그리고 염화물 통로를 포함한다. 다른 추가의 표적 단백질은 아세틸-CoA 카복실라제, 아데닐로숙신산염 합성효소, 프로토포피리노겐 옥시다제, 그리고 에놀피루빌쉬키메이트-인산염 신타제를 포함한다.
할로알칸 데할로게나제 효소는 본 발명에 따른 특정한 화합물의 다른 표적이다. 클로로알칸 펩타이드 결합 모이어티(C1-C12, 종종 약 C2-C10 알킬할로기)를 함유하는 본 발명에 따른 화합물은 2011년 12월 6일자로 출원된 PCT/US2012/063401에서 기술되고 2012년 6월 14일자로 WO 2012/078559로 공개된 바와 같이 융합 단백질 또는 관련된 진단적 단백질에서 이용되는 할로알칸 데할로게나제 효소를 저해하고/하거나 분해시키는데 이용될 수 있고, 이들의 내용은 본 명세서에 참고로 편입된다.
이들 다양한 단백질 표적은 단백질에 결합하는 화합물 모이어티를 확인하는 스크린에서 이용될 수 있고, 그리고 본 발명에 따른 화합물 내로 모이어티의 통합에 의해, 단백질의 활성의 수준은 치료적 최종 결과를 위해 변경될 수 있다.
용어 "단백질 표적 모이어티" 또는 PTM은 표적 단백질 또는 관심 대상 다른 단백질 또는 폴리펩타이드에 결합되고, 그리고 유비퀴틴 리가제에 의한 상기 단백질 또는 폴리펩타이드의 분해가 일어날 수 있도록 상기 단백질 또는 폴리펩타이드를 유비퀴틴 리가제에 근접하여 배치하는/제공하는 소분자를 설명하는데 이용된다. 소분자 표적 단백질 결합 모이어티의 비제한적 예는, 다양한 다른 것들 중에서, Hsp90 저해제, 키나제 저해제, MDM2 저해제, 인간 BET 브로모도메인-함유 단백질을 표적으로 하는 화합물, HDAC 저해제, 인간 리신 메틸전달효소 저해제, 혈관형성 저해제, 면역억제 화합물, 그리고 아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적으로 하는 화합물을 포함한다. 아래에 설명된 조성물은 이들 9가지 유형의 소분자 표적 단백질의 구성원 중에서 일부를 예시한다.
본 발명에 따른 예시적인 단백질 표적 모이어티는 할로알칸 할로게나제 저해제, Hsp90 저해제, 키나제 저해제, MDM2 저해제, 인간 BET 브로모도메인-함유 단백질을 표적화하는 화합물, HDAC 저해제, 인간 리신 메틸전달효소 저해제, 혈관형성 저해제, 면역억제 화합물, 및 아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적으로 하는 화합물을 포함한다.
아래에 설명된 조성물은 이들 유형의 소분자 표적 단백질 결합 모이어티의 구성원 중에서 일부를 예시한다. 이런 소분자 표적 단백질 결합 모이어티는, 또한 이들 조성물의 약제학적으로 허용 가능한 염, 거울상이성질체, 용매화물 및 다형체뿐만 아니라 관심 대상 단백질을 표적으로 할 수 있는 다른 소분자를 포함한다. 아래에 언급된 모든 참고문헌은 본 명세서에서 전체적으로 완전히 참고로 편입된다.
I. 열 충격 단백질 90( HSP90 ) 저해제:
본 명세서에서 이용된 바와 같은 HSP90 저해제는 다음을 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. YKB(N-[4-(3H-이미다조[4,5-C]피리딘-2-일)-9H-플루오렌-9-일]-숙신아마이드)를 비롯하여, 문헌[Vallee, et al., "Tricyclic Series of Heat Shock Protein 90 (HSP90) Inhibitors Part I: Discovery of Tricyclic Imidazo[4,5-C]Pyridines as Potent Inhibitors of the HSP90 Molecular Chaperone (2011) J.Med.Chem. 54: 7206]에서 확인된 HSP90 저해제:
Figure pct00020
유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기가, 예를 들어, 말단 아마이드 기를 통해서 부착됨;
2. HSP90 저해제 p54(변형됨)(8-[(2,4-다이메틸페닐)설파닐]-3]펜트-4-인-1-일-3H-퓨린-6-아민):
Figure pct00021
여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기가, 예를 들어, 말단 아세틸렌기를 통해서 부착됨;
3. 다음의 구조를 갖는 화합물 2GJ (5-[2,4-다이하이록시-5-(1-메틸에틸)페닐]-n-에틸-4-[4-(몰폴린-4-일메틸)페닐]아이소옥사졸-3-카복스아마이드)를 비롯하여, 문헌[Brough, et al., "4,5-Diarylisoxazole HSP90 Chaperone Inhibitors: Potential Therapeutic Agents for the Treatment of Cancer", J. MED . CHEM . vol: 51, pag:196 (2008)]에서 확인된 HSP90 저해제(변형됨):
Figure pct00022
유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기가 예로서, (아민에서 또는 아민 상에 알킬기에서) 아마이드기를 통해서 부착됨;
4. 다음의 구조를 갖는 HSP90 저해제 PU3을 비롯하여, 문헌[Wright, et al., Structure-Activity Relationships in Purine-Based Inhibitor Binding to HSP90 Isoforms, Chem Biol . 2004 Jun;11(6):775-85]에서 확인된 HSP90 저해제(변형됨):
Figure pct00023
유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)가, 예를 들어, 부틸기를 통해서 부착됨; 및
5. HSP90 저해제 겔다나마이신((4E,6Z,8S,9S,10E,12S,13R,14S,16R)-13-하이드록시-8,14,19-트라이메톡시-4,10,12,16-테트라메틸-3,20,22-트라이옥소-2-아자바이사이클로[16.3.1](유도체화됨) 또는 임의의 이의 유도체(예컨대 17-알킬아미노-17-데스메톡시겔다나마이신("17-AAG") 또는 17-(2-다이메틸아미노에틸)아미노-17-데스메톡시겔다나마이신("17-DMAG"))(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기가, 예를 들어, 아마이드기를 통해서 부착됨).
II. 키나제 및 포스파타제 저해제:
본 명세서에서 이용된 바와 같은 키나제 저해제는 하기를 포함하지만, 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 에를로티닙 유도체 티로신 키나제 저해제:
Figure pct00024
(여기서 R은, 예를 들어, 에터기를 통해서 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
2. 키나제 저해제 수니티닙(유도체화됨):
Figure pct00025
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 피롤 모이어티에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
3. 키나제 저해제 소라페닙 (유도체화됨):
Figure pct00026
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 아마이드 모이어티에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
4. 키나제 저해제 데사티닙 (유도체화됨):
Figure pct00027
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 피리미딘에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
5. 키나제 저해제 라파티닙(유도체화됨):
Figure pct00028
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 설포닐 메틸기의 말단 메틸을 통해서 부착됨);
6. 키나제 저해제 U09-CX-5279 (유도체화됨):
Figure pct00029
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 아민(아닐린), 카복실산 또는 아민 알파를 통해서 사이클로프로필기, 또는 사이클로프로필기에 부착됨);
7. 다음의 구조를 갖는 키나제 저해제 Y1W 및 Y1X(유도체화됨)를 비롯하여, 문헌[Millan, et al., Design and Synthesis of Inhaled P38 Inhibitors for the Treatment of Chronic Obstructive Pulmonary Disease, J. MED . CHEM. vol:54, pag:7797 (2011)]에서 확인딘 키나제 저해제:
Figure pct00030
YIX(1-에틸-3-(2-{[3-(1-메틸에틸)[1,2,4]트라이아졸로[4,3-a]피리딘-6-일]설파닐}벤질)유레아(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, i프로필기를 통해서 부착됨);
Figure pct00031
1-{3-tert-부틸-1-페닐-1H-피라졸-5-일)3-(2-{[3-(1-메틸에틸)[1,2,4]트라이아졸로[4,3-a]피리딘-6-일]설파닐}벤질)유레아, (유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 바람직하게는 i-프로필기 또는 t-부틸기를 통해서 부착됨);
8. 다음의 구조를 갖는 화합물 6TP 및 0TP (유도체화됨)를 비롯하여, 문헌[Schenkel, et al., Discovery of Potent and Highly Selective Thienopyridine Janus Kinase 2 Inhibitors J. Med. Chem., 2011, 54 (24), pp 8440-8450]에서 확인된 키나제 저해제:
Figure pct00032
4-아미노-2-[4-tert-부틸설파모일)페닐]-N-메틸티에노[3,2-c]피리딘-7-카복스아마이드
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 아마이드 모이어티에 결합된 말단 메틸기를 통해서 부착됨);
Figure pct00033
4-아미노-N-메틸-2-[4-(몰폴리노-4-일)페닐]티에노[3,2-c]피리딘-7-카복스아마이드
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 아마이드 모이어티에 결합된 말단 메틸기를 통해서 부착됨);
9. 다음의 구조를 갖는 키나제 저해제 07U를 비롯하여, 문헌[Van Eis, et al., "2,6-Naphthyridines as potent and selective inhibitors of the novel protein kinase C isozymes", Biorg. Med. Chem. Lett.2011 Dec 15;21(24):7367-72]에서 확인된 키나제 저해제:
Figure pct00034
2-메틸-N-1-[3-(피리딘-4-일)-2,6-나프티리딘-1-일]프로판-1,2-다이아민
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 이차 아민 또는 말단 아미노기를 통해서 부착됨);
10. 다음의 구조를 갖는 키나제 저해제 YCF를 비롯하여, 문헌[Lountos, et al., "Structural Characterization of Inhibitor Complexes with Checkpoint Kinase 2 (Chk2), a Drug Target for Cancer Therapy", J.STRUCT.BIOL. vol:176, pag:292 (2011)]에서 확인된 키나제 저해제:
Figure pct00035
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 말단 하이드록실기를 통해서 부착됨);
11. 다음의 구조를 갖는 키나제 저해제 XK9 및 NXP(유도체화됨)를 비롯하여, 문헌[Lountos, et al., "Structural Characterization of Inhibitor Complexes with Checkpoint Kinase 2 (Chk2), a Drug Target for Cancer Therapy", J.STRUCT.BIOL. vol:176, pag:292 (2011)]에서 확인된 키나제 저해제:
Figure pct00036
N-4[(1E)-N-(N-하이드록시카밤이미도일)에탄하이드라조노일]페닐}-7-나이트로-1H-인돌-2-카복스아마이드
Figure pct00037
N-4[(1E)-N-카밤이미도일에탄하이드라조노일]페닐}-1H-인돌-3-카복스아마이드
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 말단 하이드록실기(XK9) 또는 하이드라존기(NXP)를 통해서 부착됨);
12. 키나제 저해제 아파티닙(유도체화됨) (N-[4-[(3-클로로-4-플루오로페닐)아미노]-7-[[(3S)-테트라하이드로-3-퓨란일]옥시]-6-퀴나졸린일]-4(다이메틸아미노)-2-부텐아마이드)(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 지방족 아민기를 통해서 부착됨);
13. 키나제 저해제 포스파티닙(유도체화됨)([6-({5-플루오로-2-[(3,4,5-트라이메톡시페닐)아미노]피리미딘-4-일}아미노)-2,2-다이메틸-3-옥소-2,3-다이하이드로-4H-피리도[3,2-b]-1,4-옥사진-4-일]메틸 다이소듐 포스페이트 육수화물)(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 메톡시기를 통해서 부착됨);
14. 키나제 저해제 제피티닙(유도체화됨)(N-(3-클로로-4-플루오로-페닐)-7-메톡시-6-(3-몰폴린-4-일프로폭시)퀴나졸린-4-아민):
Figure pct00038
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 메톡시 또는 에터기를 통해서 부착됨);
15. 키나제 저해제 렌바티닙(유도체화됨)(4-[3-클로로-4-(사이클로프로필카바모일아미노)페녹시]-7-메톡시-퀴놀린-6-카복스아마이드)(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 사이클로프로필기를 통해서 부착됨);
16. 키나제 저해제 반데타닙(유도체화됨)(N-(4-브로모-2-플루오로페닐)-6-메톡시-7-[(1-메틸피페리딘-4-일)메톡시]퀴나졸린-4-아민)(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 메톡시 또는 하이드록실기를 통해서 부착됨);
17. 키나제 저해제 베무라페닙(유도체화됨)(프로판-1-설폰산 {3-[5-(4-클로로페닐)-1H-피롤로[2,3-b]피리딘-3-카보닐]-2,4-다이플루오로-페닐}-아마이드), 유도체화됨(여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 설포닐 프로필기를 통해서 부착됨);
18. 키나제 저해제 글리벡(Gleevec)(유도체화됨):
Figure pct00039
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기로서의 R이, 예를 들어, 아마이드기를 통해서 또는 아닐린 아민기를 통해서 부착됨);
19. 키나제 저해제 파조파닙(유도체화됨)(VEGFR3 저해제):
Figure pct00040
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 아닐린 아민기를 통해서 또는 페닐 모이어티에 부착됨);
20. 키나제 저해제 AT-9283(유도체화됨) 오로라 키나제 저해제
Figure pct00041
(여기서 R은, 예를 들어, 페닐 모이어티에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
21. 키나제 저해제 TAE684(유도체화됨) ALK 저해제
Figure pct00042
(여기서 R은, 예를 들어, 페닐 모이어티에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
22. 키나제 저해제 닐로타닙(유도체화됨) Abl 저해제:
Figure pct00043
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 페닐 모이어티 또는 아닐린 아민기에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
23. 키나제 저해제 NVP-BSK805(유도체화됨) JAK2 저해제
Figure pct00044
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 페닐 모이어티 또는 다이아졸기에 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
24. 키나제 저해제 크리조티닙 유도체화된 Alk 저해제
Figure pct00045
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 페닐 모이어티 또는 다이아졸기에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
25. 키나제 저해제 JNJ FMS(유도체화됨) 저해제
Figure pct00046
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 페닐 모이어티에 부착된 링커기 L 또는 -(L-CLM)기임);
26. 키나제 저해제 포레티닙(유도체화됨) Met 저해제
Figure pct00047
(유도체화됨, 여기서 R은, 예를 들어, 퀴놀린 모이어티 상의 또는 하이드록실 또는 에터기, 또는 페닐 모이어티에 부착됨);
27. 알로스테릭(allosteric) 단백질 티로신 포스파타제 저해제 PTP1B(유도체화됨):
Figure pct00048
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨);
28. 티로신 포스파타제의 SHP-2 도메인의 저해제(유도체화됨):
Figure pct00049
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨);
29. BRAF(BRAFV600E)/MEK의 저해제 (유도체화됨):
Figure pct00050
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨);
30. 티로신 키나제 ABL의 저해제(유도체화됨)
Figure pct00051
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨);
31. 키나제 저해제 OSI-027 (유도체화됨) mTORC1/2 저해제
Figure pct00052
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨);
32. 키나제 저해제 OSI-930 (유도체화됨) c-Kit/KDR 저해제
Figure pct00053
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨); 및
33. 키나제 저해제 OSI-906 (유도체화됨) IGF1R/IR 저해제
Figure pct00054
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, R에서 부착됨).
여기서 I-XVII 부문에 기재된 실시형태의 어느 하나에 있어서, "R"은 피페라진모이어티 상에서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기의 부착을 위한 부위를 표시한다.
III. HDM2 / MDM2 저해제:
본 명세서에서 이용된 바와 같은 HDM2/MDM2 저해제는 하기를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 아래에 설명된 바와 같은 화합물인 누툴린-3, 누툴린-2 및 누툴린-1(유도체화됨)뿐만 아니라 이들의 모든 유도체 및 유사체를 비롯하여(또는 추가하여), 문헌[Vassilev, et al., In vivo activation of the p53 pathway by small-molecule antagonists of MDM2, SCIENCE vol:303, pag:844-848 (2004), 및 Schneekloth, et al., Targeted intracellular protein degradation induced by a small molecule: En route to chemical proteomics, Bioorg. Med. Chem. Lett. 18 (2008) 5904-5908]에서 확인된 HDM2/MDM2 저해제:
Figure pct00055
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 메톡시기에서 또는 하이드록실기로서 부착됨);
Figure pct00056
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 메톡시기 또는 하이드록실기에서 부착됨);
Figure pct00057
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 메톡시기를 통해서 또는 하이드록실기로서 부착됨); 및
2. 트랜스-4-아이오도-4'-보란일-칼콘
Figure pct00058
(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 하이드록시기를 통해서 부착됨).
IV. 인간 BET 브로모도메인-함유 단백질을 표적화하는 화합물:
소정의 실시형태에 있어서, "PTM"은 브로모- 및 가외 말단(BET) 단백질 BRD2, BRD3 및 BRD4에 결합되는 리간드이다. 인간 BET 브로모도메인-함유 단백질을 표적화하는 화합물은, 이하에 기재된 바와 같은 표적과 연관된 화합물을 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니며, 여기서 "R" 또는 "링커"는, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착을 위한 부위를 표시한다:
1. JQ1, 문헌[Filippakopoulos et al. Selective inhibition of BET bromodomains. Nature (2010)]:
Figure pct00059
2. I-BET, 문헌[Nicodeme et al. Supression of Inflammation by a Synthetic Histone Mimic. Nature (2010). Chung et al. Discovery and Characterization of Small Molecule Inhibitors of the BET Family Bromodomains. J. Med Chem. (2011)]:
Figure pct00060
3. 문헌[Hewings et al. 3,5-Dimethylisoxazoles Act as Acetyl-lysine Bromodomain Ligands. J. Med. Chem. (2011) 54 6761-6770]에 기재된 화합물.
Figure pct00061
4. I-BET151, 문헌[Dawson et al. Inhibition of BET Recruitment to Chromatin as an Efective Treatment for MLL-fusion Leukemia. Nature (2011)]:
Figure pct00062
5. 카바졸 유형(US 2015/0256700)
Figure pct00063
6. 피롤로피리돈 유형(US 2015/0148342)
Figure pct00064
7. 테트라하이드로퀴놀린 유형(WO 2015/074064)
Figure pct00065
8. 트라이아졸로피라진 유형(WO 2015/067770)
Figure pct00066
9. 피리돈 유형(WO 2015/022332)
Figure pct00067
10. 퀴나졸리논 유형(WO 2015/015318)
Figure pct00068
11. 다이하이드로피리도피라지논 유형(WO 2015/011084)
Figure pct00069
(여기서 R 또는 L 또는 링커는, 각 경우에, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기의 부착을 위한 부위를 표시한다).
세레블론 리간드를 이용하는 이하의 키메라 분자는 BET PROTAC의 대표예이다. 본 발명에서 기재된 방법은 이들 예로 제한되지 않는다.
Figure pct00070
Figure pct00071
Figure pct00072
Figure pct00073
Figure pct00074
Figure pct00075
Figure pct00076
Figure pct00077
V. HDAC 저해제:
HDAC 저해제(유도체화됨)는 하기를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 문헌[Finnin, M. S. et al. Structures of Histone Deacetylase Homologue Bound to the TSA and SAHA Inhibitors. Nature 40, 188-193 (1999)].
Figure pct00078
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기의 부착을 위한 부위를 표시함); 및
2. PCT WO0222577("DEACETYLASE INHIBITORS")의 화학식 (I)로 정의된 바와 같은 화합물(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 하이드록실기를 통해서 부착됨);
VI. 인간 라이신 메틸전달효소 저해제:
인간 라이신 메틸전달효소 저해제는 하기를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 문헌[Chang et al. Structural Basis for G9a-Like protein Lysine Methyltransferase Inhibition by BIX-1294. Nat. Struct. Biol. (2009) 16(3) 312].
Figure pct00079
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기의 부착을 위한 부위를 표시함);
2. 문헌[Liu, F. et al Discovery of a 2,4-Diamino-7-aminoalkoxyquinazoline as a Potent and Selective Inhibitor of Histone Methyltransferase G9a. J. Med. Chem. (2009) 52(24) 7950].
Figure pct00080
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기의 부착을 위한 부위를 표시함);
3. 아자시티딘(유도체화됨)(4-아미노-1-β-D-리보퓨라노실-1,3,5-트라이아진-2(1H)-온)(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 하이드록시 또는 아미노기를 통해서 부착됨); 및
4. 데시타빈(유도체화됨)(4-아미노-1-(2--데옥시-b-D-에리트로-펜토퓨란osyl)-1, 3, 5-트라이아진-2(1H)-온) (유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예를 들어, 하이드록시기를 통해서 또는 아미노기에서 부착됨).
VII. 혈관형성 저해제:
혈관형성 저해제는 하기를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 문헌[Sakamoto, et al., Development of Protacs to target cancer-promoting proteins for ubiquitination and degradation, Mol Cell Proteomics 2003 Dec;2(12):1350-8]에서 설명된 바와 같이 구조(들)를 갖고 링커에 결합하는 GA-1(유도체화됨) 및 이의 유도체 및 유사체;
2. 문헌[Rodriguez-Gonzalez, et al., Targeting steroid hormone receptors for ubiquitination and degradation in breast and prostate cancer, Oncogene (2008) 27, 7201-7211]에 일반적으로 기재된 바와 같이 링커기 L 또는 -(L-CLM)기에 결합될 수 있는 에스트라다이올(유도체화됨);
3. 문헌[Sakamoto, et al., Development of Protacs to target cancer-promoting proteins for ubiquitination and degradation, Mol Cell Proteomics 2003 Dec; 2(12):1350-8]에 일반적으로 기재된 바와 같은 구조(들)를 갖고 링커기 L 또는 -(L-CLM)기에 결합되는, DHT 및 이의 유도체 및 유사체를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아닌, 에스트라다이올, 테스토스테론(유도체화됨) 및 관련된 유도체; 및
4. 문헌[Sakamoto, et al., Protacs: chimeric molecules that target proteins to the Skp1-Cullin-F box complex for ubiquitination and degradation Proc Natl Acad Sci USA. 2001 Jul 17;98(15):8554-9 및 미국 특허 제7,208,157호]에 일반적으로 기재된 바와 같은 구조(들)를 갖고 링커기 L 또는 -(L-CLM)기에 결합되는, 오발리신, 푸마길린(유도체화됨), 그리고 이들의 유도체 및 유사체.
VIII. 면역억제 화합물:
면역억제 화합물은 하기를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 문헌[Schneekloth, et al., Chemical Genetic Control of Protein Levels: Selective in Vivo Targeted Degradation, J. AM. CHEM. SOC. 2004, 126, 3748-3754]에 일반적으로 기재된 바와 같은 구조(들)를 갖고 링커기 L 또는 -(L-CLM)기에 결합되는 AP21998(유도체화됨);
2. 글루코코르티코이드(예컨대, 하이드로코르티손, 프레드니손, 프레드니솔론 및 메틸프레드니솔론)(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예컨대, 하이드록실들 중 어느 하나에 결합됨) 및 베클로메타손 디프로피오네이트(유도체화됨, 여기서 링커기 또는 -(L-CLM)는, 예컨대, 프로프리오네이트에 결합됨);
3. 메토트렉세이트(유도체화됨, 여기서 링커기 또는 -(L-CLM)기는, 예컨대, 말단 하이드록실들 중 어느 하나에 결합될 수 있음);
4. 시클로스포린(유도체화됨, 여기서 링커기 또는 -(L-CLM)기는, 예컨대, 부틸기들 중 어느 하나에서 결합될 수 있음);
5. 타크롤리무스(FK-506) 및 라파마이신(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예컨대, 메톡시기들 중 하나에서 결합될 수 있음); 및
6. 악티노마이신(유도체화됨, 여기서 링커기 L 또는 -(L-CLM)기는, 예컨대 아이소프로필기들 중 하나에서 결합될 수 있음).
IX. 아릴 탄화수소 수용체( AHR )를 표적화하는 화합물:
아릴 탄화수소 수용체(AHR)를 표적화하는 화합물은 하기를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다:
1. 아피게닌(문헌[Lee, et al., Targeted Degradation of the Aryl Hydrocarbon Receptor by the PROTAC Approach: A Useful Chemical Genetic Tool, ChemBioChem Volume 8, Issue 17, pages 2058-2062, November 23, 2007]에 일반적으로 기재된 바와 같은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기에 결합되는 방식으로 유도체화됨); 및
2. 문헌[Boitano, et al., Aryl Hydrocarbon Receptor Antagonists Promote the Expansion of Human Hematopoietic Stem Cells, Science 10 September 2010: Vol. 329 no. 5997 pp. 1345-1348]에 기재된 바와 같은 SR1 및 LGC006(링커기 L 또는 -(L-CLM)가 결합되도록 유도체화됨).
X. RAF 수용체( 키나제 )를 표적화하는 화합물:
Figure pct00081
PLX4032
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
XI. FKBP를 표적화하는 화합물 :
Figure pct00082
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
XII. 안드로겐 수용체(AR)를 표적화하는 화합물
1. 안드로겐 수용체의 RU59063 리간드(유도체화됨)
Figure pct00083
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
2. of 안드로겐 수용체의 SARM 리간드(유도체화됨)
Figure pct00084
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
3. 안드로겐 수용체 리간드 DHT (유도체화됨)
Figure pct00085
(유도체화됨, 여기서 "R"은, 예를 들어, 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
4. MDV3100 리간드(유도체화됨)
Figure pct00086
5. ARN-509 리간드(유도체화됨)
Figure pct00087
6. 헥사하이드로벤즈아이소옥사졸
Figure pct00088
7. 테트라메틸사이클로부탄
Figure pct00089
XIII. 에스트로겐 수용체(ER) ICI -182780을 표적화하는 화합물
1. 에스트로겐 수용체 리간드
Figure pct00090
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
XIV . 갑상선 호르몬 수용체(TR)를 표적화하는 화합물
1. 갑상선 호르몬 수용체 리간드(유도체화됨)
Figure pct00091
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시하고, MOMO는 메톡시메톡시기를 나타낸다).
XV . HIV 프로테아제를 표적화하는 화합물
1. HIV 프로테아제의 저해제(유도체화됨)
Figure pct00092
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함). 문헌[J. Med . Chem. 2010, 53, 521-538] 참조.
2. HIV 프로테아제의 저해제
Figure pct00093
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 잠재적 부위를 표시함). 문헌[J. Med . Chem. 2010, 53, 521-538] 참조.
XVI . HIV 인테그라제를 표적화하는 화합물
1. HIV 인테그라제의 저해제(유도체화됨)
Figure pct00094
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함). See, J. Med . Chem . 2010, 53, 6466.
2. HIV 인테그라제의 저해제(유도체화됨)
Figure pct00095
3. HIV 인테그라제의 저해제 이센트레스(유도체화됨)
Figure pct00096
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함). 문헌[J. Med . Chem . 2010, 53, 6466] 참조.
XVII . HCV 프로테아제를 표적화하는 화합물
1. HCV 프로테아제의 저해제(유도체화됨)
Figure pct00097
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착용의 부위를 표시함).
XVIII . 아실-단백질 티오에스테라제 -1 및 -2( APT1 및 APT2 ) 를 표적화하는 화합물
1. APT1 및 APT2의 저해제(유도체화됨)
Figure pct00098
(유도체화됨, 여기서 "R"은 링커기 L 또는 -(L-CLM)기 부착을 위한 부위를 표시한다). 문헌[Angew . Chem . Int . Ed. 2011, 50, 9838-9842] 참조, 여기서 L은 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같은 링커기이고, 상기 CLM기는 -(L-CLM)이 CLM 기를 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같이 PTM기에 결합시키도록, 본 명세서에서 달리 설명된 바와 같다.
치료적 조성물
약제학적 유효량의 담체, 첨가제 또는 부형제와 함께, 유효량의 본 명세서에서 기재된 바와 같은 적어도 1종의 이작용성 화합물, 그리고 본 명세서에서 달리 기재된 화합물 중에서 1종 또는 그 이상(이들 모두 유효량에서)의 조합물을 포함하는 약제학적 조성물은 본 발명의 추가의 양상을 나타낸다.
본 발명은 적용 가능한 경우에, 본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물의 약제학적으로 허용 가능한 염, 특히, 산 또는 염기 부가염을 포함하는 조성물을 포함한다. 이러한 양상에 따라 유용한 전술한 염기 화합물의 약제학적으로 허용 가능한 산 부가염을 제조하는데 이용되는 산은 비독성 산 부가염, 즉, 약리학적으로 허용 가능한 음이온을 함유하는 염, 예를 들면, 다양한 다른 것들 중에서, 염산염, 브로민화수소산염, 요오드화수소산염, 질산염, 황산염, 중황산염, 인산염, 산 인산염, 아세트산염, 젖산염, 구연산염, 산 구연산염, 주석산염, 중주석산염, 숙신산염, 말레산염, 푸마르산염, 글루콘산염, 사카라이드산염, 벤조산염, 메탄설폰산염, 에탄설폰산염, 벤젠설폰산염, p-톨루엔설폰산염 및 파모산염[즉, 1,1'-메틸렌-비스-(2-하이드록시-3 나프토에이트)]염을 형성하는 것들이다.
약제학적으로 허용 가능한 염기 부가염 역시 본 발명에 따른 화합물 또는 유도체의 약제학적으로 허용 가능한 염 형태를 생산하는데 이용될 수 있다. 성질에서 산성인 본 발명 화합물의 약제학적으로 허용 가능한 염기 염을 제조하기 위한 시약으로서 이용될 수 있는 화학적 염기는 이런 화합물과 비독성 염기 염을 형성하는 것들이다. 이런 비독성 염기 염은, 그 중에서도 특히, 이러한 약리학적으로 허용 가능한 양이온, 예를 들면, 알칼리 금속 양이온(예를 들어, 칼륨 및 나트륨) 및 알칼리 토금속 양이온(예를 들어, 칼슘, 아연 및 마그네슘)으로부터 유래된 것들, 암모늄 또는 수용성 아민 부가염, 예를 들면, N-메틸글루카민-(메글루민), 그리고 저급 알칸올암모늄 및 약제학적으로 허용 가능한 유기 아민의 다른 염기 염을 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물은, 본 발명에 따라서, 경구, 비경구 또는 국소 경로에 의해 단일 또는 분할 용량으로 투여될 수 있다. 활성 화합물의 투여는 연속(정맥내 점적) 내지 하루에 수회 경구 투여(예를 들어, Q.I.D.) 범위에서 변할 수 있고, 그리고 다른 투여 경로 중에서, 경구, 국소, 비경구, 근육내, 정맥내, 피하, 경피(이것은 침투 증강 작용제를 포함할 수 있음), 협측, 설하 및 좌약 투여를 포함할 수 있다. 장 코팅된 경구 정제 역시 경구 투여 경로로부터 화합물의 생체이용률을 증강시키는데 이용될 수 있다. 가장 효과적인 투약 형태는 선택된 특정 작용제의 약물동력학뿐만 아니라 환자에서 질환의 심각도에 의존할 것이다. 비내, 기관내 또는 폐 투여를 위한 스프레이, 미스트, 또는 에어로졸로서 본 발명에 따른 화합물의 투여가 또한 이용될 수 있다. 본 발명은 이런 이유로, 임의로 약제학적으로 허용 가능한 담체, 첨가제 또는 부형제와 함께 유효량의 본 명세서에 기재된 바와 같은 화합물을 포함하는 약제학적 조성물에 또한 관한 것이다. 본 발명에 따른 화합물은 즉시 방출, 중간 방출 또는 지속된 또는 제어된 방출 형태에서 투여될 수 있다. 지속된 또는 제어된 방출 형태는 바람직하게는 경구 투여되지만, 좌약 및 경피 또는 다른 국소 형태에서 또한 투여된다. 리포솜 형태에서 근육내 주사 역시 주사 부위에서 화합물의 방출을 제어하거나 또는 지속시키는데 이용될 수 있다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 조성물은 1종 이상의 약제학적으로 허용 가능한 담체를 이용하는 전통적인 방식에서 조제될 수 있고, 또한, 제어된 방출 제형으로 투여될 수 있다. 이들 약제학적 조성물에서 이용될 수 있는 약제학적으로 허용 가능한 담체는 이온 교환체, 알루미나, 스테아르산알루미늄, 레시틴, 혈청 단 백질, 예를 들면, 인간 혈청 알부민, 완충액 물질, 예를 들면, 인산염, 글리신, 솔브산, 칼륨 솔브산염, 포화된 식물성 지방산, 물, 염 또는 전해질의 부분적인 글리세라이드 혼합물, 예를 들면, 프롤라민 황산염, 인산수소이나트륨, 인산수소칼륨, 염화나트륨, 아연염, 콜로이드성 실리카, 삼규산마그네슘, 폴리비닐 피롤리돈, 셀룰로스계 물질, 폴리에틸렌 글리콜, 나트륨 카복시메틸셀룰로스, 폴리아크릴레이트, 왁스, 폴리에틸렌-폴리옥시프로필렌-블록 중합체, 폴리에틸렌 글리콜 및 양모지를 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 조성물은 경구로, 비경구로, 흡입 스프레이에 의해, 국소로, 직장으로, 비강으로, 협측으로, 질로 또는 이식된 저장소를 통해 투여될 수 있다. 본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "비경구"는 피하, 정맥내, 근육내, 관절내, 활막내, 흉골내, 척수강내, 간내, 병소내 및 두개내 주사 또는 주입 기술을 포함한다. 바람직하게는, 조성물은 경구, 복막내 또는 정맥내 투여된다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 조성물의 무균 주사가능 형태는 수성 또는 유성 현탁액일 수 있다. 이들 현탁액은 적합한 분산제 또는 습윤제 및 현탁제를 이용하여 주지 기술에 따라 조제될 수 있다. 무균 주사가능 제조물은, 또한 비독성 비경구-허용 가능한 희석제 또는 용매에서 무균 주사가능 용액 또는 현탁액, 예를 들면, 1,3-부탄다이올에서 용액일 수 있다. 이용될 수 있는 허용 가능한 비히클과 용매 중에는 물, 링거액 및 등장성 염화나트륨 용액이 있다. 이에 더하여, 무균성의 고정유가 용매 또는 현탁 매체로서 통상 이용된다. 이런 목적으로, 합성 모노- 또는 다이글리세라이드를 비롯한 임의의 블랜드 고정유가 이용될 수 있다. 지방산, 예를 들면, 올레산 및 이의 글리세라이드 유도체가 주사가능 물질의 제조에서 유용하고, 자연 약제학적으로-허용 가능한 오일, 예를 들면, 올리브유 또는 피마자유가 특히 그들의 폴리옥시에틸화된 변이형에서 또한 그러하다. 이들 오일 용액 또는 현탁액은 또한 장쇄 알코올 희석제 또는 분산제, 예를 들면, Ph. Helv 또는 유사한 알코올을 함유할 수 있다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 약제학적 조성물은 캡슐, 정제, 수성 현탁액 또는 용액을 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아닌 임의의 경구적으로 허용 가능한 투약 형태로 경구 투여될 수 있다. 경구 이용을 위한 정제의 경우에, 통상적으로 이용되는 담체는 락토스 및 옥수수 전분을 포함한다. 윤활제, 예를 들면, 스테아르산마그네슘 역시 전형적으로 첨가된다. 캡슐 형태에서 경구 투여를 위해, 유용한 희석제는 락토스 및 건조된 옥수수 전분을 포함한다. 수성 현탁액이 경구 이용을 위해 필요할 때, 활성 성분은 유화제 및 현탁제와 합동된다. 원하는 경우에, 소정의 감미제, 풍미제 또는 착색제가 또한 첨가될 수 있다.
대안적으로, 본 명세서에서 기재된 바와 같은 약제학적 조성물은 직장 투여를 위한 좌약의 형태로 투여될 수 있다. 이들은 실온에서 고체이지만 직장 온도에서 액체이고, 이런 이유로 직장에서 융해되어 약물을 방출하는 적합한 비자극성 부형제와 약물을 혼합함으로써 제조될 수 있다. 이런 물질은 코코아 버터, 밀랍 및 폴리에틸렌 글리콜을 포함한다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 약제학적 조성물은 또한 국소 투여될 수 있다. 적합한 국소 제형은 이들 영역 또는 장기의 각각을 위해 쉽게 제조된다. 하부 장관에 대한 국소 적용은 직장 좌약 제형(상기 참조)으로 또는 적합한 관장 제형으로 달성될 수 있다. 국소-허용 가능한 경피 패치가 또한 이용될 수 있다.
국소 적용을 위해, 약제학적 조성물은 1종 이상의 담체에 현탁되거나 또는 용해된 활성 성분을 함유하는 적합한 연고로 조제될 수 있다. 본 발명의 화합물의 국소 투여를 위한 담체는 무기질 오일, 액체 바셀린, 백색 바셀린, 프로필렌 글리콜, 폴리옥시에틸렌, 폴리옥시프로필렌 화합물, 유화 왁스 및 물을 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다. 본 발명의 일정한 바람직한 양상에서, 화합물은 환자 내에 스텐트에서 발생하는 폐색의 가능성을 저해하거나 또는 감소시키기 위해, 환자 내로 외과적으로 이식되는 스텐트 위에 코팅될 수 있다.
대안적으로, 약제학적 조성물은 1종 이상의 약제학적으로 허용 가능한 담체에 현탁되거나 또는 용해된 활성 성분을 함유하는 적합한 로션 또는 크림으로 조제될 수 있다. 적합한 담체는 무기질 오일, 솔비탄 모노스테아레이트, 폴리솔베이트 60, 세틸 에스터 왁스, 세테아릴 알코올, 2-옥틸도데칸올, 벤질 알코올 및 물을 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아니다.
안과적 용도를 위하여, 약제학적 조성물은 등장성, pH 조정된 무균 식염수에서 미소화된 현탁액으로서, 또는 바람직하게는, 보존제, 예를 들면, 염화벤잘코늄을 포함하거나 또는 포함하지 않는 등장성, pH 조정된 무균 식염수에 용액으로서 조제될 수 있다. 대안적으로, 안과적 용도를 위하여, 약제학적 조성물은 연고, 예를 들면, 바셀린으로 조제될 수 있다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 약제학적 조성물은 또한 코 에어로졸 또는 흡입에 의해 투여될 수 있다. 이러한 조성물은 약제학적 제형의 분야에서 널리 공지된 기술에 따라 제조되고, 그리고 벤질 알코올 또는 다른 적합한 보존제, 생체이용률을 증강하는 흡수 증진제, 탄화플루오르, 및/또는 다른 통상의 가용화제 또는 분산제를 이용하여, 식염수에서 용액으로서 제조될 수 있다.
단일 투약 형태를 생산하기 위해 담체 물질과 조합될 수 있는 본 명세서에서 기재된 바와 같은 약제학적 조성물에서 화합물의 양은 치료되는 대상 및 질환, 특정 투여 방식에 따라 변할 것이다. 바람직하게는, 조성물은 단독으로 또는 본 발명에 따른 적어도 하나의 다른 화합물과 함께, 약 0.05 밀리그램 내지 약 750 밀리그램 또는 그 이상, 더욱 바람직하게는 약 1 밀리그램 내지 약 600 밀리그램, 더욱더 바람직하게는 약 10 밀리그램 내 지 약 500 밀리그램의 활성 성분을 함유하도록 조제되어야 한다.
임의의 특정 환자에 대한 특정한 용량 및 치료 요법은 이용된 특정한 화합물의 활성, 연령, 체중, 전반적인 건강, 성별, 식이, 투여 시간, 배출 속도, 약물 조합, 치료하는 의사의 판단, 그리고 치료 중인 특정 질환 또는 병태의 중증도를 비롯한 다양한 인자에 의존할 것으로 또한 이해되어야 한다.
본 명세서에서 기재된 방법에 따라 화합물을 이용하여 요법이 필요한 환자 또는 대상체는 단독으로 또는 본 명세서에서 달리 확인된 바와 같은 다른 공지된 적혈구생성 자극제와 함께, 임의로 약제학적으로 허용 가능한 담체 또는 희석제에서 유효량의 본 발명에 따른 화합물뿐만 아니라 이의 약제학적으로 허용 가능한 염, 용매화물 또는 다형체를 상기 환자(대상체)에 투여함으로써 치료될 수 있다.
이들 화합물은 임의의 적절한 경로에 의해, 예를 들어, 경구로, 비경구로, 정맥내로, 피부내로, 피하로, 또는 액체, 크림, 겔, 또는 고체 형태로 경피를 비롯한 국소로, 또는 에어로졸 형태에 의해 투여될 수 있다.
활성 화합물은 치료되는 환자에서 심각한 독성 효과를 유발하지 않으면서, 원하는 징후에 대한 치료적 유효량을 환자에 전달하는데 충분한 양으로 약제학적으로 허용 가능한 담체 또는 희석제 내에 포함된다. 본 명세서에서-언급된 모든 병태에 대해서 활성 화합물의 바람직한 용량은 1일당 약 10 ng/kg 내지 300 mg/kg, 바람직하게는 하루에 0.1 내지 100 mg/kg, 더욱 일반적으로 1일당 수용자/환자의 킬로그램 체중 당 0.5 내지 약 25 ㎎의 범위 내이다. 전형적인 국소 용량은 적합한 담체에서 0.01 내지 5% wt/wt의 범위일 것이다.
화합물은 단위 투약 형태당 1㎎, 1㎎ 내지 3000㎎, 바람직하게는 5 내지 500㎎보다 적은 활성 성분을 함유하는 것을 포함하지만 이들로 제한되는 것은 아닌 임의의 적절한 단위 투약 형태로 편리하게 투여된다. 약 25 내지 250㎎의 경구 용량 이 종종 편리하다.
활성 성분은 바람직하게는, 약 0.00001 내지 30mM, 바람직하게는 약 0.1 내내지 30μM의 활성 화합물의 피크 혈장 농도를 달성하도록 투여된다. 이것은, 예를 들어, 임의로 식염수 또는 수성 매체에서 활성 성분의 용액 또는 제형의 정맥내 주사에 의해, 또는 활성 성분의 일시 주사로서 투여에 의해 달성될 수 있다. 경구 투여가 또한 활성제의 효과적인 혈장 농도를 생성하는데 적절하다.
약물 조성물에서 활성 화합물의 농도는 약물의 흡수, 분포, 비활성화 및 배출 속도뿐만 아니라 당업자에게 공지된 다른 인자에 의존할 것이다. 용량 값은 또한 경감될 병태의 중증도에 따라 변할 것임에 유의해야 한다. 임의의 특정 대상체에 대해서, 특정 투약 요법은 조성물을 투여하거나 또는 조성물의 투여를 감독하는 개인의 개별적 요구 및 전문적인 판단에 따라 경시적으로 조정되어야 하며, 그리고 본 명세서에서 제시된 농도 범위는 단지 예시에 불과하고 청구된 조성물의 범위 또는 실시를 제한하는 것으로 의도되지 않는 것으로 더욱 이해된다. 활성 성분은 한번에 투여될 수 있거나, 또는 다양한 시간 간격에서 투여될 다수의 더 작은 용량으로 나눠질 수 있다.
경구 조성물은, 일반적으로, 비활성 희석제 또는 식용 담체를 포함할 것이다. 이들은 젤라틴 캡슐에 동봉되거나 또는 정제로 압축될 수 있다. 경구 치료적 투여의 목적으로, 활성 화합물 또는 이의 전구약물 유도체는 부형제와 통합되고, 그리고 정제, 트로키제, 또는 캡슐의 형태로 이용될 수 있다. 약제학적으로 양립적인 결합제, 및/또는 애쥬번트 물질이 조성물의 일부로서 포함될 수 있다.
정제, 알약, 캡슐, 트로키제 등은 다음 성분, 또는 유사한 성격의 화합물 중임의의 것을 함유할 수 있다: 결합제, 예를 들면, 미정질 셀룰로스, 트래거캔트검 또는 젤라틴; 부형제, 예를 들면, 전분 또는 락토스; 분산제, 예를 들면, 알긴산, 프리모겔, 또는 옥수수 전분; 윤활제, 예를 들면, 스테아르산마그네슘 또는 스테로테스; 활택제, 예를 들면, 콜로이드성 이산화실리콘; 감미제, 예를 들면, 수크로스 또는 사카린; 또는 풍미제, 예를 들면, 박하, 메틸 살리실산염, 또는 오렌지향. 투약 단위 형태가 캡슐일 때, 이것은, 상기 유형의 물질 이외에도, 액체 담체, 예를 들면, 지방유를 함유할 수 있다. 또한, 투약 단위 형태는 투약 단위의 물리적 형태를 변형시키는 다양한 다른 물질, 예를 들면, 당, 셸락, 또는 장용제의 코팅을 함유할 수 있다.
활성 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용 가능한 염은 엘릭시르, 현탁액, 시럽, 웨이퍼, 검 등의 성분으로서 투여될 수 있다. 시럽은, 활성 화합물 이외에도, 감미제로서 수크로스, 그리고 일정한 보존제, 염료 및 착색제와 향미제를 함유할 수 있다.
활성 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용 가능한 염은, 또한 원하는 작용을 손상시키지 않는 다른 활성 물질, 또는 원하는 작용을 보충하는 물질, 예를 들면, 특히, EPO 및 다베포에틴 알파를 비롯한 에리트로포이에틴 자극제와 혼합될 수 있다. 본 발명의 일정한 바람직한 양상에서, 본 발명에 따른 1종 이상의 화합물은, 본 명세서에서 달리 기재된 바와 같이, 다른 생리활성제, 예를 들면, 에리트로포이에틴 자극제, 또는 항균제를 비롯한 상처 치유 작용제와 공동투여된다.
비경구, 피내, 피하, 또는 국소 적용을 위해 이용된 용액 또는 현탁액은 다음 성분을 포함할 수 있다: 무균 희석제, 예를 들면, 주사용수, 식염수, 고정유, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 다른 합성 용매; 항균제, 예를 들면, 벤질 알코올 또는 메틸 파라벤; 항산화제, 예를 들면, 아스코르브산 또는 아황산수소 나트륨; 킬레이트화제, 예를 들면, 에틸렌다이아민테트라아세트산; 완충액, 예를 들면, 아세트산염, 구연산염 또는 인산염, 그리고 긴장성의 조정을 위한 작용제, 예를 들면, 염화나트륨 또는 덱스트로스. 비경구 제조물은 유리 또는 플라스틱으로 만들어진 앰풀, 일회용 주사기 또는 복수 분량 바이알에 봉입될 수 있다.
정맥내 투여되는 경우에, 바람직한 담체는 생리 식염수 또는 인산염 완충된 식염수(PBS)이다.
일 실시형태에서, 활성 화합물은 상기 화합물을 신체로부터의 급속한 제거에 대하여 보호하는 담체, 예를 들면, 이식물 및 미세캡슐화된 전달 시스템을 비롯한 제어된 방출 제형으로 제조된다. 생물분해성, 생체적합성인 중합체, 예를 들면, 에틸렌 비닐 아세트산염, 폴리무수물, 폴리글리콜산, 콜라겐, 폴리오쏘에스터, 그리고 폴리락트산이 이용될 수 있다. 이런 제형의 제조 방법은 당업자에게 명백할 것이다.
리포솜 현탁액이 또한 약제학적으로 허용 가능한 담체일 수 있다. 이들은 예로서, 미국 특허 제4,522,811호(이것은 전체적으로 본 명세서에 참고로 편입됨)에서 기재된 바와 같이, 당업자에게 공지된 방법에 따라 제조될 수 있다. 예를 들어, 리포솜 제제는 적절한 지질(들)(예를 들어, 스테아로일 포스파티딜 에탄올아민, 스테아로일 포스파티딜 콜린, 아라카도일 포스파티딜 콜린, 및 콜레스테롤)을 무기 용매에 용해시킴으로써 제조될 수 있는데, 상기 용매는 이어서 증발되어, 건조된 지질의 박막이 용기의 표면 상에 남게 된다. 활성 화합물의 수성 용액이 이어서 용기 내로 도입된다. 용기는 이어서 지질 물질을 용기의 측면으로부터 유리시키고 지질 응집체를 분산시키기 위해 손에 의해 빙빙 돌려지고, 따라서 리포솜 현탁액이 형성된다.
치료 방법
추가의 양상에서, 본 발명은 유효량의 본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물 또는 이의 염 형태, 그리고 약제학적 으로 허용되는 담체를 포함하는 치료 조성물을 제공한다. 치료 조성물은 환자 또는 대상체, 예를 들면, 동물, 예를 들면, 인간에서 단백질 분해를 조정하고, 그리고 분해된 단백질을 통해 조정되는 질환 상태 또는 병태를 치료하거나 또는 개선하는데 이용될 수 있다.
본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "치료한다", "치료하는", 그리고 "치료" 등은 본 발명 화합물이 결합하는 단백질을 통해 조정되는 임의의 질환 상태 또는 병태의 치료를 비롯하여, 본 발명 화합물이 투여될 수 있는 환자에 이익을 제공하는 임의의 행위를 지칭한다. 본 발명에 따른 화합물을 이용하여 치료될 수 있는, 암을 비롯한 질환 상태 또는 병태는 위에서 제시되어 있다.
본 발명은 질환, 예를 들면, 암의 치료 또는 개선을 위해 관심되는 단백질의 분해를 유발하기 위한 본 명세서에서 기재된 바와 같은 치료 조성물을 제공한다. 일정한 추가의 실시형태에서, 질환은 다발성 골수종이다. 따라서, 다른 양상에서, 본 발명은 세포에서 표적 단백질을 유비퀴틴화시키는/분해시키는 방법을 제공한다. 일정한 실시형태에서, 상기 방법은, 본 명세서에서 달리 기재된 바와 같이, 바람직하게는 링커 모이어티를 통해 연결된 CLM 및 PTM을 예로서 포함하는 본 명세서에서 기재된 바와 같은 이작용성 화합물을 투여하는 것을 포함하고, 여기서 CLM은 PTM에 연계되고, 그리고 여기서 CLM은 유비퀴틴 경로 단백질(예를 들어, 유비퀴틴 리가제, 바람직하게는 E3 유비퀴틴 리가제, 예를 들면, 예를 들어, 세레블론)을 인식하고 PTM은 표적 단백질이 유비퀴틴 리가제에 근접하여 위치될 때 표적 단백질의 분해가 발생하도록 표적 단백질을 인식하고, 따라서 표적 단백질의 효과의 저하/저해 및 단백질 수준의 제어를 유발한다. 본 발명에 의해 제공된 단백질 수준의 제어는 질환 상태 또는 병태의 치료를 제공하는데, 이것은 세포, 예를 들면, 환자의 세포에서 표적 단백질의 수준을 낮춤으로써 표적 단백질을 통해 조정된다. 일정한 실시형태에서, 상기 방법은 임의로 약제학적으로 허용 가능한 부형제, 담체, 애쥬번트, 다른 생리활성제 또는 이들의 조합물과 함께, 유효량의 본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물을 투여하는 것을 포함한다.
추가의 실시형태에서, 본 발명은 대상체 또는 환자, 예를 들면, 동물, 예를 들면, 인간에서 질환, 장애 또는 이의 증상을 치료하거나 또는 개선하기 위한 방법을 제공하고, 상기 방법은 유효량, 예를 들면, 치료 유효량의 본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물 또는 이의 염 형태, 그리고 약제학적으로 허용 가능한 부형제, 담체, 애쥬번트, 다른 생리활성제 또는 이들의 조합물을 포함하는 조성물을 치료가 필요한 대상체에 투여하는 것을 포함하고, 여기서 상기 조성물은 대상체에서 상기 질환 또는 장애 또는 이의 증상을 치료하거나 또는 개선하는데 효과적이다.
다른 양상에서, 본 발명은 본 발명에 따른 화합물을 이용하여 생물학적 시스템에서 관심 대상 단백질의 분해의 효과를 확인하기 위한 방법을 제공한다.
다른 실시형태에서, 본 발명은 단백질을 통해 조정된 질환 상태 또는 병태에 대한 치료가 필요한 인간 환자를 치료하는 방법에 관한 것으로, 여기서 상기 단백질의 분해는 상기 환자에서 치료 효과를 생산할 것이고, 상기 방법은 임의로 다른 생리활성제와 합동으로 유효량의 본 발명에 따른 화합물을 병든 환자에 투여하는 것을 포함한다. 질환 상태 또는 병태는 미생물 병원체 또는 다른 외인성 병원체, 예를 들면, 바이러스, 세균, 진균류, 원생동물 또는 다른 미생물에 의해 유발된 질환이거나, 또는 질환 상태 및/또는 병태를 야기하는 단백질의 과다발현에 의해 유발되는 질환 상태일 수 있다.
용어 "질환 상태 또는 병태"는 단백질 조절장애(즉, 환자에서 발현된 단백질의 양이 상승됨)가 발생하고, 환자에서 하나 또는 그 이상의 단백질의 분해가 치료가 필요한 환자에 유익한 요법 또는 증상의 경감을 제공할 수 있는 임의의 질환 상태 또는 병태를 설명하는데 이용된다. 소정의 사례에서, 질환 상태 또는 병태는 치 유될 수 있다.
본 발명에 따른 화합물을 이용하여 치료될 수 있는 질환 상태 또는 병태는 예로서, 천식, 자가면역 질환, 예를 들면, 다발성 경화증, 다양한 암, 융모질환, 구개열, 당뇨병, 심장병, 고혈압, 염증성 장질환, 정신 지체, 기분 장애, 비만, 굴절 이상, 불임, 안젤만 증후군(Angelman syndrome), 캐너번병(Canavan disease), 만성 소화 장애증, 샤르코-마리-투스 병(Charcot-Marie-Tooth disease), 낭포성 섬유증, 듀시엔형 근이영양증, 혈색소증, 혈우병, 클라인펠터 증후군, 신경섬유종증, 페닐케톤뇨, 다낭성 신장병(PKD1) 또는 4(PKD2) 프레더-윌리 증후군(Prader-Willi syndrome), 겸상 적혈구병, 테이-사크스 병(Tay-Sachs disease), 터너 증후군을 포함한다.
본 발명에 따른 화합물에 의해 치료될 수 있는 다른 질환 상태 또는 병태는 알츠하이머병, 근위축성 측삭 경화증(루게릭병), 신경성 식욕부진, 불안 장애, 죽상경화증, 주의력 결핍 과다활동 장애, 자폐증, 양극성 장애, 만성 피로 증후군, 만성 폐쇄성 폐 질환, 크론병, 관상동맥성 심장 질환, 치매, 우울증, 진성 당뇨병 1형, 진성 당뇨병 2형, 간질, 길랭 바레 증후군, 과민성 대장 증후군, 루푸스, 대사 증후군, 다발성 경화증, 심근 경색, 비만, 강박 장애, 공황 장애, 파킨슨병, 건선, 류마티스성 관절염, 사르코이드증, 정신분열병, 뇌졸중, 폐색성 혈전혈관염, 투렛 증후군, 맥관염을 포함한다.
본 발명에 따른 화합물에 의해 치료될 수 있는 다른 추가의 질환 상태 또는 병태는, 특히, 선천성철분 대사이상증, 연골무발생증 유형 II, 연골무형성증, 뾰족머리증, 고셔병 유형 2, 급성 간헐성 포르피린증, 캐너번병, 대장 선종증, ALA 탈수효소 결핍, 아데닐로숙신산염 리아제 결핍, 부신생식기 증후군, 부신백질이영양증, ALA-D 포르피린증, ALA 탈수효소 결핍, 알캅톤뇨, 알렉산더병, 알캅톤뇨증 갈색증, 알파 1-항트립신 결핍, 알파-1 단백질분해효소 저해제, 기종, 근위축성 측삭 경화증, 알스트롬 증후군, 알렉산더병, 불완전 사기질형성증, ALA 탈수효소 결핍, 앤더슨 파브리병(Anderson-Fabry disease), 안드로겐 무감응 증후군, 빈혈, 광범위 몸통 혈관각화종, 망막혈관종증(폰 히펠-린다우 병), 아페르 증후군(Apert syndrome), 거미가락증(마르팡 증후군), 스티클러 증후군(Stickler syndrome), 선천성 다발성 관절이완증(엘러스-단로스 증후군#관절이완증형(Ehlers-Danlos syndrome#arthrochalasia type)), 모세혈관확장성 운동실조증, 레트 증후군, 원발성 폐 고혈압, 샌드호프병, 신경섬유종증 유형 II, 비아레-스티븐슨 뇌회상 두피 증후군(Beare-Stevenson cutis gyrata syndrome), 지중해열, 가족성, 벤자민 증후군, 베타-지중해빈혈, 양측성 청신경섬유종증(신경섬유종증 유형 II), 인자 V 라이덴 혈전성향, 블로크-슐쯔베르거 증후군(Bloch-Sulzberger syndrome)(색소실조증), 블룸 증후군(Bloom syndrome), X-연관된 철적혈모구 빈혈(X-linked sideroblastic anemia), 보네비-율리히 증후군(Bonnevie-Ullrich syndrome)(터너 증후군), 부르네빌병(Bourneville disease)(결절성 경화증), 프리온 질환, 버트-호그-두베 증후군(Birt-Hogg-Dube syndrome), 취약골 질환(불완전 골형성), 넓은 엄지손가락-발가락 증후군(루빈스타인-테이비 증후군(Rubinstein-Taybi syndrome)), 청동색 당뇨병/청동 간경변(혈색소증), 구척수 근위축(케네디병), 버거-그러츠 증후군(지질단백질 지질분해효소 결핍), CGD 만성 육아종 장애, 굴지 형성장애, 비오티니다아제 결핍, 심근병증(누난 증후군), 묘성 증후군, CAVD(정관의 선천성 결손), 카일로 심안면 증후군(CBAVD), CEP(선천성 적혈구형성 포르피린증), 낭포성 섬유증, 선천성 갑상선기능저하증, 연골발생장애 증후군(연골무형성증), 귀척 추거대골단 형성장애, 레슈 니한 증후군, 갈락토스혈증, 엘러스 단로스 증후군, 치명적 형성장애, 코핀 로우 리 증후군, 코케인 증후군(가족성 샘종 폴립증), 선천성 적혈구형성 포르피린증, 선천성 심장 질환, 메트헤모 글로빈혈증/선천성 메트헤모글로빈혈증, 연골무형성증, X 연관된 철적혈모구 빈혈, 결합 조직병, 뿔줄기 기형 안면 증후군, 쿨리 빈혈(베타-지중해빈혈), 구리 축적병(윌슨병), 구리 운반병(멘케스병(Menkes disease)), 유전성 코프로포 르피린증, 카우덴 증후군, 두개안면 관절기형(크루종 증후군(Crouzon syndrome)), 크로이츠펠트-야콥병(프리온 질환), 코케인 증후군, 카우덴 증후군, 쿠루슈만-배튼-스타이너트 증후군(Curschmann-Batten-Steinert syndrome )(근긴장 디스트로피), 비아레-스티븐슨 뇌회상 두피 증후군(Beare-Stevenson cutis gyrata syndrome), 원발성 고옥살산뇨, 척추골단골간단 형성장애(스트루드위크형), 근이영양증, 듀센 베커형(DBMD), 어셔 증후군, 드 그루쉬 증후군(de Grouchy syndrome) 및 데제린-소타스 증후군(Dejerine-Sottas syndrome)을 비롯한 퇴행성 신경병, 발달 장애, 원위 척수 근위축증, 유형 V, 안드로겐 무감응 증후군, 확산성 글로보이드체 경화증(크라베병(Krabbe disease)), 디 조지 증후군(Di George's syndrome), 다이하이드로테스토스 테론 수용체 결핍, 안드로겐 무감응 증후군, 다운 증후군, 난쟁이, 적혈구형성 프로토포르피린증, 적혈구 5-아미노레불린산염 합성효소 결핍, 적혈구형성 포르피린증, 적혈구형성 프로토포르피린증, 적혈구형성 우로포르피린증, 프리드리히 운동실조증, 가족성 발작 다발장막염, 지연 피부 포르피린증, 가족성 압력 민감성 신경병증, 원발성 폐 고혈압(PPH), 췌장의 섬유낭병, 여린 X 증후군, 갈락토스혈증, 유전성 뇌장애, 거대 세포 간염(신생아 혈색소증), 그론블라드-스트랜드버그 증후군(Gronblad-Strandberg syndrome)(탄력섬유성 가황색종), 군터병(Gunther disease)(선천성 적혈구형성 포르 피린증), 혈색소증, 홀그렌 증후군, 겸상 적혈구성 빈혈, 혈우병, 간적혈구형성 포르피린증(HEP), 히펠-린다우 병(Hippel-Lindau disease)(폰 히펠-린다우 병), 헌팅턴병, 허치슨 길포드 조로 증후군(Hutchinson-Gilford progeria syndrome)(조로증), 안드로겐과잉증, 연골저형성증, 저색소성 빈혈, X 연관된 중증 복합형 면역 부전증을 비롯한 면역계 장애, 인슬리-아슬리 증후군(Insley-Astley syndrome), 잭슨 바이스 증후군, 주버트 증후군(Joubert syndrome), 레슈-니한 증후군(Lesch-Nyhan syndrome), 잭슨-바이스 증후군(Jackson-Weiss syndrome), 고옥살산뇨를 비롯한 신장병, 클라인펠터 증후군, 니스트 형성장애(Kniest dysplasia), 열공성 치매, 랑거-살디노 연골무형성증(Langer-Saldino achondrogenesis), 모세혈관확장성 운동실조증, 린치 증후군(Lynch syndrome), 리실-하이드록실라제 결핍(Lysyl-hydroxylase deficiency), 마카도-조셉병(Machado-Joseph disease), 니스트 형성장애를 비롯한 대사 장애, 마르팡 증후군(Marfan syndrome), 운동 장애, 모왓-윌슨 증후군(Mowat-Wilson syndrome), 낭포성 섬유증, 뮈엔케 증후군(Muenke syndrome), 다발성 신경섬유종증, 낸스-인슬리 증후군(Nance-Insley syndrome), 낸스-스위니 연골형성 장애증(Nance-Sweeney chondrodysplasia), 니이만-픽병(Niemann-Pick disease), 노악 증후군(Noack syndrome)(파이퍼 증후군(Noack syndrome)), 오슬러-웨버-랑뒤병(Osler-Weber-Rendu disease), 포이츠-제거스 증후군(Peutz-Jeghers syndrome), 다낭성 신장병, 다골성 섬유성 골이형성증(맥쿤-올브라이트 증후군(McCune-Albright syndrome)), 포이츠-제거스 증후군(Peutz-Jeghers syndrome), 프레이더-랩하트-윌리 증후군(Prader-Labhart-Willi syndrome), 혈색소증, 원발성 고요산혈증 증후군(레슈-니한 증후군(Lesch-Nyhan syndrome)), 원발성 폐 고혈압, 원발성 노인성 퇴행성 치매, 프리온 질환, 조로증(허친슨 길포드 조로 증후군(Hutchinson Gilford Progeria Syndrome)), 진행성 무도병, 만성 유전성 (헌팅턴)(헌팅턴병), 진행성 근위축, 척수 근위축증, 프로피온산혈증, 프로토포르피린증, 근위 근긴장성 이영양증, 폐 동맥성 고혈압, PXE(탄력섬유성 가황색종), Rb(망막모세포종), 레클링하우젠병(신경섬유종증 유형 I), 재발성 다발 장막염, 망막 장애, 망막모세포종, 레트 증후군(Rett syndrome), RFALS 유형 3, 리커 증후군(Ricker syndrome), 릴리-데이 증후군(Riley-Day syndrome), 로우시-레비 증후군(Roussy-Levy syndrome), 발달 지연 및 흑색극세포증을 동반한 중증 연골무형성증(SADDAN), 리-프라우메니 증후군(Li-Fraumeni syndrome), 육종, 유방, 백혈병 및 부신(SBLA) 증후군, 결절성 경화증(결절성 경화증), SDAT, SED 선천성(선천성 척추골단 형성장애), SED 스트루드위크(Strudwick)(척추골단골간단 형성장애, 스트루드위크형), SEDc(선천성 척추골단 형성장애), SEMD, 스트루드 위크형(척추골단골간단 형성장애, 스트루드위크형), 스프린젠 증후군(Shprintzen syndrome), 피부 색소침착 장애, 스미스-렘리-오피쯔 증후군(Smith-Lemli-Opitz syndrome), 유전성 남아프리카 포르피린증(혼합 포르피린증), 영아 발병 증가 유전적 경련성 마비, 언어 및 소통 장애, 스핑고리피드증, 테이-사크스병(Tay-Sachs disease), 척수소뇌 운동실조, 스티클러 증후군(Stickler syndrome), 뇌졸중, 안드로겐 무감응 증후군, 테트라하이드로바이오프테린 결핍, 베타-지중해빈혈, 갑상선 질환 순대양 신경병증(압박 마비에 대한 책임 동반 유전성 신경 장애) 트리처 콜린스 증후군(Treacher Collins syndrome), 3중 X 증후군(Triplo X syndrome), 삼염색체 21(다운 증후군), 삼 염색체 X, VHL 증후군(폰 히펠-린다우 병), 시력 손상 및 실명(알스트롬 증후군), 브롤릭병(Vrolik disease), 바르덴부르크 증후군(Waardenburg syndrome), 바르부르크 쇼 플레델리우스 증후군(Warburg Sjo Fledelius Syndrome), 바이센바처-즈베이뮬러 증후군(Weissenbacher-Zweymueler syndrome), 울프 허쉬호른 증후군(Wolff Periodic disease), 볼프 주기적 질환(Wolff Periodic disease), 바이센바처-즈베이뮬러 증후군 및 색소성 건피증을 포함한다.
용어 "신생물" 또는 "암"은 명세서 전반에서, 암성 또는 악성 신생물, 즉, 종종 정상보다 더욱 급속하게 세포 증식에 의해 성장하고, 그리고 새로운 성장을 개시시킨 자극이 중단된 이후에도 계속 성장하는 비정상적인 조직의 형성 및 성장을 유발하는 병리학적 과정을 지칭하는데 이용된다. 악성 신생물은 구조적 조직화 및 정상적인 조직과의 기능적 조화의 부분적인 또는 완전한 결여를 나타내고, 그리고 대부분이 주위 조직을 침범하며, 여러 부위로 전이되고, 제거 시도 후 재발하여 적절하게 치료되지 않으면 환자의 사망을 유발할 개연성이 있다. 본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 신생물은 모든 암성 질환 상태를 설명하고, 그리고 악성 혈행성, 복수 및 고형 종양과 연관된 병리학적 과정을 아우르거나 또는 포괄하는데 이용된다. 단독으로 또는 적어도 1종의 추가의 항암제와 함께 본 발명의 화합물에 의해 치료될 수 있는 예시적인 암은 편평 세포 암종, 기저 세포 암종, 선암종, 간세포 암종, 그리고 신장 세포 암종, 방광암, 장암, 유방암, 자궁경부암, 결장암, 식도암, 두부암, 신장암, 간암, 폐암, 목암, 난소암, 췌장암, 전립선 및 위암; 백혈병; 양성과 악성 림프종, 특히 버킷 림프종 및 비호지킨 림프종; 양성과 악성 흑색종; 골수증식성 질환; 유잉 육종, 혈관육종, 카포시 육종, 지방육종, 근육종, 말초 신경상피종, 윤활막 육종, 신경교종, 성상세포종, 희돌기교종, 상의세포종, 교아종, 신경모세포종, 신경절신경종, 신경절교종, 수모세포종, 송과체 세포 종양, 수막종, 뇌막 육종, 신경섬유종 및 신경초종을 비롯한 육종; 장암, 유방암, 전립선암, 자궁경부암, 자궁암, 폐암, 난소암, 고환암, 갑상선암, 성상세포종, 식도암, 췌장암, 위암, 간암, 결장암, 흑색종; 암육종, 호지킨병, 빌름스 종양(Wilms' tumor) 및 기형암종을 포함한다. 본 발명에 따른 화합물을 이용하여 치료될 수 있는 추가의 암은 예로서, T-계통 급성 림프모구성 백혈병(T-ALL), T-계통 림프모구성 림프종(T-LL), 말초 T-세포 림프종, 성체 T-세포 백혈병, Pre-B ALL, Pre-B 림프종, 큰 B-세포 림프종, 버킷 림프종, B-세포 ALL, 필라델피아 염색체 양성 ALL 및 필라델피아 염색체 양성 CML을 포함한다.
용어 "생리활성제"는 본 발명 화합물이 이용되는 의도된 요법, 저해 및/또는 방지/예방을 달성하는데 보조하기 위한 생물학적 활성을 갖는 제제로서 본 발명 화합물과 함께 이용되는, 본 발명에 따른 화합물 이외의 제제를 설명하는데 이용된다. 본 명세서에서 이용을 위한 바람직한 생리활성제는 본 발명 화합물이 이용되거나 또는 투여되는 것과 유사한 약리학적 활성을 갖는 제제를 포함하고, 그리고 예로서, 항암제, 항바이러스제(특히, 항-HIV제 및 항-HCV제 포함), 항균제, 항진균제 등을 포함한다.
용어 "추가의 항암제"는 암을 치료하기 위해 본 발명에 따른 화합물과 합동될 수 있는 항암제를 설명하는데 이용된다. 이들 작용제는 예로서, 에베롤리무스, 트라벡테딘, 아브락산, TLK 286, AV-299, DN-101, 파조파닙, GSK690693, RTA 744, ON 0910.Na, AZD 6244(ARRY-142886), AMN-107, TKI-258, GSK461364, AZD 1152, 엔자스 타우린, 반데타닙, ARQ-197, MK-0457, MLN8054, PHA-739358, R-763, AT-9263, FLT-3 저해제, VEGFR 저해제, EGFR TK 저해제, 오로라 키나제 저해제, PIK-1 조절인자, Bcl-2 저해제, HDAC 저해제, c-MET 저해제, PARP 저해제, Cdk 저해제, EGFR TK 저해제, IGFR-TK 저해제, 항-HGF 항체, PI3 키나제 저해제, AKT 저해제, mTORC1/2 저해제, JAK/STAT 저해제, 체크포인트-1 또는 2 저해제, 초점 부착 키나제 저해제, Map 키나제 키나제(mek) 저해제, VEGF 트랩 항체, 페메트렉스드, 에를로티닙, 다사타닙, 닐로티닙, 데카타닙, 파니투무맙, 암루비신, 오르고보맙, Lep-etu, 놀라트렉스드, azd2171, 바타불린, 오파투무맙, 자놀리무맙, 에도테카린, 테트 란드린, 루비테칸, 테스밀리펜, 오블리메르센, 티실리무맙, 이필리무맙, 고시폴, Bio 111, 131-I-TM-601, ALT-110, BIO 140, CC 8490, 실렌지타이드, 기마테산, IL13-PE38QQR, INO 1001, IPdR1 KRX-0402, 루칸톤, LY 317615, 뉴라디압, 비테스판, Rta 744, Sdx 102, 탈람파넬, 아트라센탄, Xr 311, 로미뎁신, ADS-100380, 수니 티닙, 5-플루오로유라실, 보리노스탯, 에토포사이드, 젬시타빈, 독소루비신, 리포솜 독소루비신, 5'-데옥시-5-플루오로유리딘, 빈크리스틴, 테모졸로마이드, ZK-304709, 셀리시클립; PD0325901, AZD-6244, 카페시타빈, L-글루탐산, N-[4-[2-(2-아미노-4,7-다이하이드로-4-옥소-1H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)에틸]벤조일]-, 이나트륨염, 칠수화물, 캄프토테신, PEG-표지화된 이리노테칸, 타목시펜, 토레미펜 구연산염, 아나스트라졸, 에세메스테인, 레트로졸, DES(다이에틸스틸베스트롤), 에스트라다이올, 에스트로겐, 접합 에스트로겐, 베바시주맙, IMC-1C11, CHIR- 258,); 3-[5-(메틸술포닐피페라딘메틸)-인돌릴]-퀴놀론, 바탈라닙, AG-013736, AVE-0005, 고세렐린 아세트산염, 류프롤라이드 아세트산염, 트립토렐린 파모산염, 메드록시프로게스테론 아세트산염, 하이드록시프로게스테론 카프 론산염, 메게스트롤 아세트산염, 랄록시펜, 비칼루타마이드, 플루타마이드, 닐루타마이드, 메게스트롤 아세트산염, CP-724714; TAK-165, HKI-272, 에를로티닙, 라파타닙, 카넬티닙, ABX-EGF 항체, 어비툭스, EKB-569, PKI- 166, GW-572016, 로나파르닙, BMS-214662, 티피파르닙; 아미포스틴, NVP-LAQ824, 수베로일 아날라이드 하이드록삼산, 발프로산, 트리코스타틴 A, FK-228, SU11248, 소라페닙, KRN951, 아미노글루테티마이드, 암사크라인, 아나그렐라이드, L-아스파라기나제, 칼메트-게랑 간균(Bacillus Calmette-Guerin)(BCG) 백신, 아드리아마이신, 블레오마이신, 부세레린, 부설판, 카보플라틴, 카무스틴, 클로람부실, 시스플라틴, 클라드리빈, 클로드로네이트, 시프로테론, 시타라빈, 다카바진, 닥티노마이신, 다우노루비신, 다이에틸스틸베스트롤, 에피루비신, 플루 다라빈, 플루드로콜티손, 플루오시메스테론, 플루타마이드, 글리벡, 젬시타빈, 하이드록시요소, 이다루비신, 이포스파마이드, 이마티닙, 류프롤라이드, 레바미솔, 로무스틴, 메클로르에타민, 멜팔란, 6-메르캅토퓨린, 메스나, 메토트렉세이트, 미토마이신, 미토탄, 미톡산트론, 닐루타마이드, 옥트레오타이드, 옥살리플라틴, 파마이드로네이트, 펜토스 타틴, 플리카마이신, 포르피머, 프로카바진, 랄티트렉스드, 리툭시맙, 스트렙토조신, 테니포사이드, 테스토스테론, 탈리도미드, 티오구아닌, 티오테파, 트레티노인, 빈데신, 13-시스-레티노산, 페닐알라닌 머스타드, 유라실 머스타드, 에스트라무스틴, 알트레타민, 플록수리딘, 5-데옥시유리딘, 시토신 아라비노사이드, 6-메르캅토퓨린, 데옥시코포르마이신, 칼시트라이올, 발루비신, 미트라마이신, 빈블라스틴, 비노렐빈, 토포테칸, 라족신, 마리마스 타트, COL-3, 네오바스타트, BMS-275291, 스쿠알라민, 엔도스타틴, SU5416, SU6668, EMD121974, 인터류킨-12, IM862, 앤지오스타틴, 비탁신, 드로로시펜, 이독시펜, 스피로놀락톤, 피나스테리드, 시미티딘, 트라스투주맙, 데닐류킨 디프티톡스, 제피티닙, 보르테지밉, 파클리탁셀, 크레모포르-무함유 파클리탁셀, 도세탁셀, 에피틸론 B, BMS-247550, BMS-310705, 드로로시펜, 4-하이드록시타목시펜, 피펜독시펜, ERA-923, 아르족시펜, 풀베스트란트, 아콜비페네, 라소폭시펜, 이독시펜, TSE-424, HMR-3339, ZK186619, 토포테칸, PTK787/ZK 222584, VX-745, PD 184352, 라파마이신, 40-O-(2-하이드록시에틸)-라파마이신, 템시롤리무스, AP-23573, RAD001, ABT-578, BC-210, LY294002, LY292223, LY292696, LY293684, LY293646, 워트만닌, ZM336372, L-779,450, PEG-필그라스팀, 다베포 에틴, 에리트로포이에틴, 과립구 집락 자극 인자, 졸렌드로네이트, 프레드니손, 세툭시맙, 과립구 대식세포 집락 자극 인자, 히스트렐린, 페길화된 인터페론 알파-2a, 인터페론 알파-2a, 페길화된 인터페론 알파-2b, 인터페론 알파-2b, 아자시티딘, PEG-L-아스파라기나제, 레날리도미드, 젬투주맙, 하이드로코르티손, 인터류킨-11, 덱스라족세인, 알렘투주맙, 올-트랜스 레티노산, 케토코나졸, 인터류킨-2, 메게스트롤, 면역글로불린, 질소 머스 타드, 메틸프레드니솔론, 이브리투모맙 튜세탄, 안드로겐, 데시타빈, 헥사메틸멜라민, 벡사로텐, 토시투모맙, 삼산화비소, 코르티손, 에디트로네이트, 미토탄, 시클로스포린, 리포솜 다우노루비신, 에드위나-아스파라기나제, 스트론튬 89, 카소피탄트, 네투피탄트, NK-1 수용체 길항제, 팔로노세트론, 아프레피탄트, 디펜히드라민, 하이드록시진, 메토클로프라마이드, 로라제팜, 알프라졸람, 할로페리돌, 드로페리돌, 드로나비놀, 덱사메타손, 메틸 프레드니솔론, 프로클로르페라진, 그라니세트론, 온단세트론, 도라세트론, 트로피세트론, 페그필그라스팀, 에리트로포이에틴, 에포에틴 알파, 다베포에틴 알파, 그리고 이들의 혼합물을 포함한다.
용어 "항-HIV제" 또는 "추가의 항-HIV제"는, 특히, 예를 들어, 뉴클레오사이드 역전사효소 저해제(NRTI), 다른 비뉴클레오사이드 역전사효소 저해제(즉, 본 발명에 해당하지 않는 것들), 단백질분해효소 저해제, 융합 저해제를 포함하고, 이들의 예시적인 화합물은 현재 임상 시험 중인 또는 개발 중인 항-HIV 화합물을 비롯하여, 예를 들어, 3TC(라미부딘), AZT(지도부딘), (-)-FTC, ddI(디다노신), ddC(잘시타빈), 아바카비어(ABC), 테노포비어(PMPA), D-D4FC(레버세트(Reverset)), D4T(스타부딘), 라시비르, L-FddC, L-FD4C, NVP(네비라핀), DLV(델 라비딘), EFV(에파비렌즈), SQVM(사퀴나비어 메실레이트), RTV(리토나비어), IDV(인디나비어), SQV(사퀴나비어), NFV(넬피나비어), APV(암프레나비어), LPV(로피나비어), 융합 저해제, 예를 들면, T20, 특히, 푸세온 및 이들의 혼합물을 포함할 수 있다.
본 발명에 따른 화합물과의 공동투여에서 이용될 수 있는 다른 항-HIV 작용제는, 예를 들어, 다른 NNRTI(즉, 본 발명에 따른 NNRTI 이외에)를 포함하는데, 이것은, 특히, 네비라핀(BI-R6-587), 델라비딘(U-90152S/T), 에파비렌즈(DMP-266), UC-781(N-[4-클로로-3-(3-메틸-2-부텐일옥시)페닐]-2메틸3-퓨란카보티아마이드), 에트라비린(TMC125), 트로비어딘(Ly300046.HCl), MKC-442(에미비린, 코악티논), HI-236, HI-240, HI-280, HI-281, 릴피비린(TMC-278), MSC-127, HBY 097, DMP266, 바이칼린(TJN-151) 아담-II(메틸 3',3'-다이클로로-4',4"-다이메톡시-5',5"-비스(메톡시카보닐)-6,6-다이페닐헥사노에이트), 메틸 3-브로모-5-(1-5-브로모-4-메톡시-3-(메톡시카보닐)페닐)헵트-1-엔일)-2-메톡시벤조에이트(알켄일다이아릴메탄 유사체, 아담(Adam) 유사체), (5-클로로-3-(페닐설피닐)-2'-인돌카복스아마이드), AAP-BHAP(U-104489 또는 PNU-104489), 카프라비린(AG-1549, S-1153), 아테비어딘(U-87201E), 오린 트라이카복실산(SD-095345), 1-[(6-사이아노-2-인돌릴)카보닐]-4-[3-(아이소프로필아미노)-2-피리딘일]피페라진, 1-[5-[[N-(메틸)메틸설포닐아미노]-2-인돌릴카보닐-4-[3-(아이소프로필아미노)-2-피리딘일]피페라진, 1-[3-(에틸아미노)-2-[피리딘일]-4-[(5-하이드록시-2-인돌릴)카보닐]피페라진, 1-[(6-폼일-2-인돌릴)카보닐]-4-[3-(아이소프로필아미노)-2-피리딘일]피페라진, 1-[[5-(메틸설포닐옥시)-2-인돌릴)카보닐]-4-[3-(아이소프로필아미노)-2-피리딘일]피페라진, U88204E, 비스(2-나이트로페닐)설폰(NSC 633001), 칼라놀라이드 A(NSC675451), 칼라놀라이드 B, 6-벤질-5-메틸-2-(사이클로헥실옥시)피리미딘-4-온(DABO-546), DPC 961, E-EBU, E-EBU-dm, E-EPSeU, E-EPU, 포스카넷(포스카비어), HEPT(1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-6-(페닐티오)티민), HEPT-M(1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-6-(3-메틸페닐)티오)티민), HEPT-S(1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-6-(페닐티오)-2-티오티민), 이노필룸 P, L-737,126, 미셀라민 A(NSC650898), 미셀라민 B(NSC649324), 미셀라민 F, 6-(3,5-다이메틸벤질)-1-[(2-하이드록시에톡시)메틸]-5-아이소프로필유라실, 6-(3,5-다이메틸벤질)-1-(에톡시메틸)-5-아이소프로필유라실, NPPS, E-BPTU(NSC 648400), 올티프라즈(4-메틸-5-(피라진일)-3H-1,2-다이티올-3-티온), N-{2-(2-클로로-6-플루오로페네틸]-N'-(2-티아졸릴)티오유레아(PETT Cl, F 유도체), N-{2-(2,6-다이플루오로페네틸]-N'-[2-(5-브로모피리딜)]티오유레아{PETT 유도체), N-{2-(2,6-다이플루오로페네틸]-N'-[2-(5-메틸피리딜)]티오유레아{PETT 피리딜 유도체), N-[2-(3-플루오로퓨란일)에틸]-N'-[2-(5-클로로피리딜)]티오유레아, N-[2-(2-플루오로-6-에톡시페네틸)]-N'-[2-(5-브로모피리딜)]티오유레아, N-(2-페네틸)-N'-(2-티아졸릴)티오유레아(LY-73497), L-697,639, L-697,593, L-697,661, 3-[2-(4,7-다이플루오로벤즈옥사졸-2-일)에틸}-5-에틸-6-메틸(피리딘-2(1H)-티온(2-피리디논 유도체), 3-[[(2-메톡시-5,6-다이메틸-3-피리딜)메틸]아민]-5-에틸-6-메틸(피리딘-2(1H)-티온, R82150, R82913, R87232, R88703, R89439(로비라이드), R90385, S-2720, 수라민 나트륨, TBZ(티아졸로벤즈이미다졸, NSC 625487), 티아졸로아이소인돌-5-온, (+)(R)-9b-(3,5-다이메틸페닐-2,3-다이하이드로티아졸로[2,3-a]아이소인돌-5(9bH)-온, 티비라핀(R86183), UC-38 및 UC-84로 이루어진 군으로부터 선택될 수 있다.
용어 "약제학적으로 허용 가능한 염"은, 본 명세서 전반에서, 적용 가능한 경우에, 화합물의 용해 및 생체이용률을 증진시키기 위해 환자의 위장관의 위액에서 화합물의 용해도를 증가시키도록 제공되는 본 명세서에서 기재된 화합물의 1종 이상의 염 형태를 설명하는데 이용된다. 약제학적으로 허용 가능한 염은, 적용 가능한 경우에, 약제학적으로 허용 가능한 무기 또는 유기 염기 및 산으로부터 유래된 것들을 포함한다. 적합한 염은, 약제학적 분야에서 널리 공지된 다양한 다른 산 및 염기 중에서, 알칼리 금속, 예를 들면, 칼륨 및 나트륨, 알칼리 토금속으로부터 유래된 것들, 예를 들면, 칼슘, 마그네슘 및 암모늄 염을 포함한다. 나트륨 및 칼륨 염은, 특히 본 발명에 따른 인산염의 중화염으로서 바람직하다.
용어 "약제학적으로 허용 가능한 유도체"는, 본 명세서 전반에서, 임의의 약제학적으로 허용 가능한 전구약물 형태(예를 들어, 에스터, 아마이드 다른 전구약물 군)를 설명하는데 이용되고, 이것은 환자에게 투여 시에, 본 발명의 화합물 또는 본 발명의 화합물의 활성 대사산물을 직접 또는 간접적으로 제공한다.
일반적 합성 접근법
본 명세서에서 기재된 바와 같은 이작용성 분자의 합성 실현 및 최적화는 단계별 또는 모듈식 방식으로 접근될 수 있다. 예를 들어, 표적 분자에 결합하는 화합물의 확인은 적합한 리간드가 즉시 이용 가능하지 않으면, 높은 또는 중간 처리량 선별검사 캠페인을 수반할 수 있다. 초기 리간드가 적합한 시험관내 및 약리학적 및/또는 ADMET 검정으로부터 데이터에 의해 확인된 바와 같이, 준최적 양상을 향상시키기 위해 반복적인 설계 및 최적화 주기를 필요로 한다는 것은 이상할 것이 없다. 최적화/SAR 캠페인의 일부는 치환을 관용하고, 그리고 본 명세서에서 앞서 지칭된 링커 화학을 부착하는데 적합한 장소일지도 모르는 리간드의 위치를 탐침하는 것일 것이다. 결정학적 또는 NMR 구조적 데이터가 이용 가능한 경우에, 이들은 이런 합성 노력을 집중하는데 이용될 수 있다.
매우 유사한 방식으로, E3 리가제에 대한 리간드, 즉, ULM/CLM를 확인하고 최적화할 수 있다.
PTM 및 ULM(예를 들어, CLM)이 수중에 있으면, 당업자는 링커 모이어티를 갖거나 또는 링커 모이어티가 없는 이들의 조합을 위해 공지된 합성 방법을 이용할 수 있다. 링커 모이어티는 다양한 조성, 길이 및 유연성으로 합성될 수 있고, 그리고 PTM 및 ULM 기가 링커의 원위 단부에 순차적으로 부착될 수 있도록 작용화될 수 있다. 따라서 이작용성 분자의 라이브러리가 시험관내 및 생체내 약리학적 및 ADMET/PK 연구에서 실현되고 프로파일링될 수 있다. PTM 및 ULM기에서처럼, 최종 이작용성 분자는 바람직한 성질을 갖는 분자를 확인하기 위해 반복적인 설계 및 최적화 주기를 거칠 수 있다.
본 명세서에서 기재된 바와 같은 CLM을 생성하는 일부 비제한적 예시적인 방법은 이하에 나타낸 바와 같이 요약된다.
Figure pct00099
Figure pct00100
Figure pct00101
Figure pct00102
Figure pct00103
대표적인 반응 1에 나타낸 바와 같이, 다이메틸 프탈산염 유도체는 글루타민(라세미체 또는 거울상이성질체) 또는 글루타민 유사체와 축합되고, 이후 제제, 예를 들면, 카보닐 다이이미다졸과 더욱 반응되어 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 형성할 수 있다.
대안적으로, 대표적인 반응 2에 나타낸 바와 같이, 앞서 설명된 초기 축합 동안 생성된 중간체 프탈이미드는 별도로 제조되고/되거나 단리되고, 이어서, 탈수제, 예를 들면, 트라이플루오로아세트아마이드, POCl3 또는 무수 아세트산과 반응되어 목적하는 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 형성할 수 있다. 동일한 유형의 중간체 프탈이미드는 또한, 탈수 단계에 앞서 로손 시약과 반응되어, 티오 유사체, 예를 들면, 대표적인 반응 8 및 9에서 도시된 것을 제공할 수 있다.
2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체의 보호된 예, 예를 들면, 대표적인 실시예 3에 나타낸 N1-BOC 종류는 이 경우에, 시약, 예를 들면, TFA 또는 실리카를 이용함으로써 탈보호되어 목표 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 생성할 수 있다.
프탈산 무수물, 예를 들면, 대표적인 실시예 4에 나타낸 것은 아민, 예를 들면, 3-아미노피페리딘-2,6-다이온과의 반응에 의해 개환되어 중간체 카복실산염 종류를 형성할 수 있고, 이것은 카보닐다이이미다졸 및 벤조트라이아졸로 처리 시에 목표 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 형성할 것이다. 대안적으로, 이들 2가지 성분은 대표적인 반응 13에 나타낸 바와 같이, 아세트산의 존재에서 배합되어 목적하는 생성물을 제공할 수 있다.
유사한 반응에서, 대표적인 반응 5에 나타낸 것들과 같은 무수물 유도체는 아민(나타낸 실시예에서 암모니아), 이후 카보닐다이이미다졸과 반응되어 목적하는 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 형성할 수 있다.
프탈로일 염화물이 이용 가능한 경우에, 대표적인 반응 6에 나타낸 바와 같이, 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 형성하기 위해, 글루타민(라세미체 또는 거울상이성질체) 또는 글루타민 유사체로 직접적인 축합에 이어서, 제제, 예를 들면, 카보닐 다이이미다졸과의 추가 반응이 가능하다.
o-브로모벤즈아마이드는 팔라듐 촉매제 및 연관된 포스핀 리간드의 존재에서 대표적인 반응 7에 나타낸 CO의 공급원, 예를 들면, 산 염화물과 반응되어 목적하는 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체를 생성할 수 있다. 대안적으로, CO 가스 그 자체가 목적하는 생성물을 제공하기 위해 로듐(II) 촉매 및 탄산은과 함께 이용될 수 있다.
2-(2,4-다이옥소-1,2,3,4-테트라하이드로피리미딘-5-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온, 및 5-(1,3-다이옥소 -2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-2-일)-1,3-다이아지난-2,4,6-트라이온 유도체는 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체에 대해서 앞서 설명된 방법 중에서 일부와 유사한 수단에 의해 제조될 수 있다. 대표적인 반응 20 및 21에서, 프탈산 무수물은 목적하는 생성물을 형성하기 위해 아세트산의 존재에서 각각, 5-아미노-1,2,3,4-테트라하이드로피리딘-2,4-다이온 또는 5-아미노-1,3-다이아지난-2,4,6-트라이온 유도체와 반응될 수 있다.
대안적으로, 5-(1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-2-일)-1,3-다이아지난-2,4,6-트라이온 유도체는 대표적인 반응 12에 나타낸 바와 같이 후니그 염기, 카보다이이미드 및 벤조트라이아졸의 존재에서 5-아미노-1,3-다이아지난- 2,4,6-트라이온 유도체와 프탈산 모노 tert-부틸 에스터의 반응에 의해 제조될 수 있다. 유사한 조건이 대표적인 반응 14에 나타낸 바와 같이 프탈산 모노 tert-부틸 에스터로부터 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체의 제조에 이용될 수 있다.
화합물, 예를 들면, 3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,2,3,4-테트라하이드로퀴나졸린-2,4-다이온은 대표적인 반응 16에서처럼 3-아미노피페리딘-2,6-다이온 및 카보다이이미드의 반응에 의해 안트라닐산 유도체로부터 제조될 수 있다. 중간체 벤즈아마이드 생성물은 대표적인 반응 15에 나타낸 바와 같이 단리되고(또는 별도로 생성되고) 카보다이이미드와 더욱 반응되어 3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,2,3,4-테트라하이드로퀴나졸린-2,4-다이온 유도체를 생성할 수 있다.
3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-3,4-다이하이드로-2H-1,3-벤즈옥사진-2,4-다이온 유사체는 대표적인 반응 17에 나타낸 바와 같이 클로로폼산염으로 살리실산의 활성화에 이어서, 3-아미노피페리딘-2,6-다이온과의 축합에 의해 제조될 수 있다.
대표적인 반응 18에 나타낸 바와 같이 3,3-다이클로로-2,1λ6-벤즈옥사티올-1,1-다이온은 2-술포벤조산과 POCl3 및 PCl5와의 반응에 의해 제조될 수 있다. 이들 화합물은 아미노 유도체와 반응되어, 예를 들어, 목적하는 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1λ6,2-벤조티아졸-1,1,3-트라이온 유도체를 생성할 수 있다.
대표적인 반응 19에 나타낸 바와 같이, 사카린 유도체의 음이온은 친전자체, 예를 들면, 3-브로모-3-메틸피페리딘-2-온으로 알킬화되어 목표로 하는 2-(3-메틸-2-옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1λ6,2-벤조티아졸-1,1,3-트라이온 유도체를 생성할 수 있다.
2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1λ6,2-벤조티아졸-1,1,3-트라이온의 유사체는, 또한 메틸 2-[(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)설파모일]벤조에이트와 강염기, 예를 들면, 수소화나트륨의 반응에 의해 제조될 수 있다(대표적인 반응 20 참조).
대표적인 반응 21에 나타낸 바와 같이 나트륨 에톡사이드로 2-메틸-2,3-다이하이드로-1H-인덴-1,3,다이온 유도체의 탈양성자화에 이어서, 친전자체, 예를 들어, 3-브로모피페리딘-2,6-다이온과의 반응은 3-(2-메틸-1,3-다이옥소-1H-인덴-2- 일)피페리딘-2,6-다이온을 제공한다.
N1-치환된 화합물, 예를 들면, 2-[1-(벤질옥시)-2,6-다이옥소피페리딘-3-일]-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,4-다이온(대표적인 반응 22)의 제조는 2-(1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-2-일)펜탄이산을 N-벤질하이드록실아민과 그리고 트라이플루오로아세트산 무수물과 반응시킴으로써 달성될 수 있다.
차례로 분자, 예를 들면, 2-[1-(벤질옥시)-2,6-다이옥소피페리딘-3-일]-2,3- 다이하이드로-1H-아이소인돌-1,4-다이온(대표적인 반응 23)은 수소화 조건 하에 벤질 제거되어 N1-하이드록시 유사체, 예를 들면, 2-(1-하이드록시-2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온을 생성할 수 있다.
대표적인 반응 24에서, 메틸 1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-2-카복실산염(및 유사체)은 3-아미노피페리딘-2-온과 반응되어 2-(2-옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온을 제공한다.
동일한 아민은 또한, 대표적인 반응 25에 나타낸 바와 같이 루이스 산, 예를 들면, 브로민화아연 및 트라이메틸실릴 에터의 존재에서 프탈산 무수물 유도체와 반응되어 동일한 유형의 산물을 수득할 수 있다. 이러한 반응으로부터 중간 생성물은 단리되거나 또는 달리 제조되면(대표적인 반응 26), 탈수제의 이용을 통해 완전한 고리화로 추진될 수 있다.
대표적인 반응 27에서 나타낸 이성질체성성 유도체, 예를 들면, 2-(6-옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌 -1,3-다이온은 프탈산과 5-아미노피페리딘-2-온의 반응을 통해 획득 가능하다.
N1-치환된 화합물, 예를 들면, 2-(1-벤질-2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,4-다이온(대표적인 반응 28 및 29)의 제조는 다수의 경로를 통해 달성될 수 있다. 예를 들어, 무수물 (2-(2,6-다이옥소옥산-3-일)-2,3- 다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온)은 DMAP 및 카보닐다이이미다졸의 존재에서 3-아미노피페리딘-2,6-다이온과 축합될 수 있거나(대표적인 반응 28), 또는 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온 유도체는 대표적인 반응 29에 나타낸 바와 같이 염기의 존재에서 친전자체, 예를 들면, 벤질 브로민화물로 알킬화될 수 있다.
몇몇 경우에, 보호기 전략 및/또는 작용기 상호전환(FGI)이 목적하는 물질의 제조를 용이하게 하기 위해 필요로 될 수 있다. 이런 화학적 과정은 합성 유기 화학자에게 널리 공지되어 있고, 그리고 이들 중에서 다수는, 예를 들면, 문헌["Greene's Protective Groups in Organic Synthesis" Peter G. M. Wuts and Theodora W. Greene (Wiley), 및 "Organic Synthesis: The Disconnection Approach" Stuart Warren and Paul Wyatt (Wiley)]과 같은 텍스트에서 발견될 수 있다.
단백질 수준 제어
본 발명은 또한 세포로 단백질 수준의 제어를 위한 방법을 제공한다. 이것은 본 명세서에서 기재된 바와 같은 화합물의 사용에 기반하는데, 이는 생체 내에서 표적 단백질의 분해가 바람직하게는 특정 치료적 유익에 부합하게 생물학적 시스템에서 단백질의 양의 제어를 유발하도록, 특정 표적 단백질과 상호작용하는 것으로 알려져 있다.
다음의 실시예는 본 발명을 설명함에 있어서 보조하는데 이용되지만, 본 발명을 어떤 방식으로도 제한하지 않는 것으로 간주되어야 한다.
본 개시내용의 예시적인 실시형태
본 발명은 다음의 특정 실시형태를 포괄한다. 이들 다음의 실시형태는, 특정된 바와 같이, 선행하는 실시형태에서 언급된 모든 특징을 포함할 수 있다. 적용 가능한 경우에, 다음의 실시형태는 또한 임의의 선행하는 실시형태에서 포괄적으로 또는 대안적으로 언급된 특징을 포함할 수 있다.
일 양상은 화학 구조: PTM-L-CLM을 갖는 화합물을 개시하며, 여기서 CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티이고; PTM은 단백질 표적화 모이어티이며; L은 결합(부재) 또는 화학적 링커기로 이루어진 군으로부터 선택된 링커이고; PTM은 링커를 통해서 CLM에 공유 결합된다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, PTM은 브로모도메인-함유 단백질, 예컨대, Brd4에 결합하는 모이어티이다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, 본 명세서에 기재된 화합물은 링커기를 통해서 커플링된 제2의 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티를 더 포함한다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, CLM은 이미드, 프탈이미도기, 탈리도마이드, 레날리도마이드, 포말리도마이드, 또는 이들의 유사체, 이들의 등배전자체, 또는 이들의 유도체로부터 유도된 화학기를 포함하며; CLM은 하기 화학 구조로 표시된다:
Figure pct00104
여기서,
W는 CH2, CHR, C=O, SO2, NH 및 N-알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고;
각각의 X는 독립적으로 O, S 및 H2로 이루어진 군으로부터 선택되며;
Y는 NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-사이클로알킬, N-헤테로사이클릴, O 및 S로 이루어진 군으로부터 선택되고;
Z는 O, S 및 H2로 이루어진 군으로부터 선택되며;
G 및 G'은 독립적으로 H, 알킬, OH, R'으로 임의로 치환된 CH2-헤테로사이클릴, 및 R'으로 임의로 치환된 벤질의 군으로부터 선택되고;
Q1, Q2, Q3 및 Q4는 R', N 또는 N-옥사이드로부터 독립적으로 선택된 기로 치환된 탄소 C를 나타내며;
A는 독립적으로 알킬, 사이클로알킬, Cl 및 F의 군으로부터 선택되고;
R은 -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, -아릴, -헤트아릴, -알킬, -사이클로알킬, -헤테로사이클릴, -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3를 포함하며;
R' 및 R"은 독립적으로 결합, H, 알킬, 사이클로알킬, 아릴, 헤트아릴, 헤테로사이클릴로 이루어진 군으로부터 선택되고;
Figure pct00105
은 입체특이적((R) 또는 (S)) 또는 비-입체특이적일 수 있는 결합을 나타내며; 그리고
Rn은 작용기 또는 원자를 포함하고,
n은 1 내지 4의 정수이되,
n이 1일 경우, Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 그리고
n이 2, 3 또는 4일 경우, 하나의 Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 임의의 다른 Rn은 PTM, ULM, CLM과 동일한 화학 구조를 갖는 제2의 CLM, CLM', 제2의 링커, 또는 이들의 임의의 다수 또는 조합에 공유 결합되도록 임의로 변형된다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, CLM은 하기로 표시된 화학 구조를 갖는다:
Figure pct00106
여기서,
W는 CH2, C=O, SO2 및 NH로 이루어진 군으로부터 선택되고;
각각의 X는 독립적으로 O, H2로 이루어진 군으로부터 선택되며;
G는 독립적으로 H, 알킬, OH로 이루어진 군으로부터 선택되고;
A 및 A'는 독립적으로 알킬, 사이클로알킬, Cl 및 F의 군으로부터 선택되며;
Rn은 작용기 또는 원자를 포함하고,
n은 1 내지 4의 정수이되,
n이 1일 경우, Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 그리고
n이 2, 3 또는 4일 경우, 하나의 Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 임의의 다른 Rn은 PTM, ULM, CLM과 동일한 화학 구조를 갖는 제2의 CLM, CLM', 제2의 링커, 또는 이들의 임의의 다수 또는 조합에 공유 결합되도록 임의로 변형된다.
다른 양상에 있어서, 본 개시내용은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 호을 제공한다:
2-[(9R)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[4-({1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}옥시)페닐]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-(4-{5-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]피리미딘-2-일}페닐)에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-{2-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]에틸}아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1R)-1-{4-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]페닐}에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[5-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)피리미딘-2-일]페닐}에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[3-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)프로폭시]페닐}에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]페닐}에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(4-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}부틸)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에틸)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(5-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}펜틸)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로필)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(4-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}부틸)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]-3-플루오로페닐}에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[4-({1-[2-(3-메틸-2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}옥시)페닐]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[4-({1-[2-(1-메틸-2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}옥시)페닐]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1R)-1-[3-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)페닐]에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(3S)-1-{4-[(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에틸)아미노]벤조일}피롤리딘-3-일]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[2-(2-{[3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2-메틸-4-옥소-3,4-다이하이드로퀴나졸린-5-일]아미노}에톡시)에틸]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[3-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)프로필]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(3S)-1-[4-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)벤조일]피롤리딘-3-일]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(4-{2-[2-(2-{[3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2-메틸-4-옥소-3,4-다이하이드로퀴나졸린-5-일]아미노}에톡시)에톡시]에톡시}페닐)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(5-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}펜틸)아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[3-(3-{[3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2-메틸-4-옥소-3,4-다이하이드로퀴나졸린-5-일]아미노}프로폭시)프로필]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(3S)-1-[4-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)벤조일]피롤리딘-3-일]아세트아마이드;
2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1R)-1-[3-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)페닐]에틸]아세트아마이드;
4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10,13-테트라옥사-1-아자펜타데칸-15-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴;
4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴;
4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10,13,16-펜타옥사-1-아자옥타데칸-18-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴; 및
4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10,13,16,19-헥사옥사-1-아자헨아이코산-21-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴, 및 이의 약제학적으로 허용 가능한 염 형태.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, 링커(L)는 하기 식으로 표시되는 화학 구조 단위를 포함한다:
-Aq-
여기서,
q는 1보다 큰 정수이고; 그리고
A는 독립적으로 결합, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C=C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 임의로 치환된 C3-11사이클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 임의로 치환된 C3-11헤테로사이클릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 임의로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2 기로 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 선택되고;
RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는, 각각 독립적으로, H, 할로, C1-8알킬, OC1-8알킬, SC1-8알킬, NHC1-8알킬, N(C1-8알킬)2, C3-11사이클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3-11헤테로사이클릴, OC1-8사이클로알킬, SC1-8사이클로알킬, NHC1-8사이클로알킬, N(C1-8사이클로알킬)2, N(C1-8사이클로알킬)(C1-8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1-8알킬, P(O)(OC1-8알킬)(C1-8알킬), P(O)(OC1-8알킬)2, CC-C1-8알킬, CCH, CH=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=C(C1-8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1-8알킬)3, Si(OH)(C1-8알킬)2, COC1-8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1-8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1-8알킬, SON(C1-8알킬)2, CONHC1-8알킬, CON(C1-8알킬)2, N(C1-8알킬)CONH(C1-8알킬), N(C1-8알킬)CON(C1-8알킬)2, NHCONH(C1-8알킬), NHCON(C1-8알킬)2, NHCONH2, N(C1-8알킬)SO2NH(C1-8알킬), N(C1-8알킬) SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1-8알킬)2, 및 NH SO2NH2로 이루어진 군으로부터 선택되며; 그리고
q가 1보다 클 경우, RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로, 다른 A기에 연결되어, 0 내지 4개의 RL5기로 더 치환될 수 있는 사이클로알킬 및/또는 헤테로사이클릴 모이어티를 형성할 수 있다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, L은 비선형 슬, 지방족 또는 방향족 또는 헤테로방향족 환식 모이어티를 포함한다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, L은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된다:
Figure pct00107
Figure pct00108
여기서 "X"는 헤테로원자를 함유하도록 임의로 치환된 2 내지 14의 범위의 원자를 가진 선형 사슬이며; 그리고
"Y"는 독립적으로 O, N, S(O)n(n=0, 1, 2)으로 이루어진 군으로부터 선택된다.
추가의 양상에 있어서, 본 개시내용은 유효량의 본 명세서에 기재된 바와 같은 화합물을 포함하는 조성물을 제공한다.
추가의 양상에 있어서, 본 개시내용은 유효량의 본 명세서에 기재된 바와 같은 화합물, 및 약제학적으로 허용 가능한 담체, 첨가제, 및/또는 부형제를 포함하는 약제학적 조성물을 제공한다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, 약제학적 조성물은 추가의 생리활성제를 더 포함할 수 있다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, 추가의 생리활성제는항암제이다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, 항암제는 에베롤리무스, 트라벡테딘, 아브락산, TLK 286, AV-299, DN-101, 파조파닙, GSK690693, RTA 744, ON 0910.Na, AZD 6244 (ARRY-142886), AMN-107, TKI-258, GSK461364, AZD 1152, 엔자스 타우린, 반데타닙, ARQ-197, MK-0457, MLN8054, PHA-739358, R-763, AT-9263, FLT-3 저해제, VEGFR 저해제, EGFR TK 저해제, 오로라 키나제 저해제, PIK-1 조절인자, Bcl-2 저해제, HDAC 저해제, c-MET 저해제, PARP 저해제, Cdk 저해제, EGFR TK 저해제, IGFR-TK 저해제, 항-HGF 항체, PI3 키나제 저해제, AKT 저해제, mTORC1/2 저해제, JAK/STAT 저해제, 체크포인트-1 또는 2 저해제, 초점 부착 키나제 저해제, Map 키나제 키나제(mek) 저해제, VEGF 트랩 항체, 페메트렉스드, 에를로티닙, 다사타닙, 닐로티닙, 데카타닙, 파니투무맙, 암루비신, 오르고보맙, Lep-etu, 놀라트렉스드, azd2171, 바타불린, 오파투무맙, 자놀리무맙, 에도테카린, 테트란드린, 루비테칸, 테스밀리펜, 오블리메르센, 티실리무맙, 이필리무맙, 고시폴, Bio 111, 131-I-TM-601, ALT-110, BIO 140, CC 8490, 실렌지타이드, 기마테칸, IL13-PE38QQR, INO 1001, IPdR1 KRX-0402, 루칸톤, LY 317615, 뉴라디압, 비테스판, Rta 744, Sdx 102, 탈람파넬, 아트라센탄, Xr 311, 로미뎁신, ADS-100380, 수니티닙, 5-플루오로유라실, 보리노스탯, 에토포사이드, 젬시타빈, 독소루비신, 리포솜 독소루비신, 5'-데옥시-5-플루오로유리딘, 빈크리스틴, 테모졸로마이드, ZK-304709, 셀리시클립; PD0325901, AZD-6244, 카페시타빈, L-글루탐산, N-[4-[2-(2-아미노-4,7-다이하이드로-4-옥소-1H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)에틸]벤조일]-, 이나트륨염, 칠수화물, 캄프토테신, PEG-표지화된 이리노테칸, 타목시펜, 토레미펜 구연산염, 아나스트라졸, 에세메스테인, 레트로졸, DES(다이에틸스틸베스트롤), 에스트라다이올, 에스트로겐, 접합 에스트로겐, 베바시주맙, IMC-1C11, CHIR- 258); 3-[5-(메틸설포닐피페라딘메틸)-인돌릴]-퀴놀론, 바탈라닙, AG-013736, AVE-0005, [D-Ser(But)6, Azgly 10]의 아세트산염(피로-Glu-His-Trp-Ser-Tyr-D-Ser(But)-Leu-Arg-Pro-Azgly-NH2 아세트산염[C59H84N18O14-(C2H4O2)X(x = 1 내지 2.4)], 고세렐린 아세트산염, 류프롤라이드 아세트산염, 트립토렐린 파모산염, 메드록시프로게스테론 아세트산염, 하이드록시프로게스테론 카프론산염, 메게스트롤 아세트산염, 랄록시펜, 비칼루타마이드, 플루타마이드, 닐루타마이드, 메게스트롤 아세트산염, CP-724714; TAK-165, HKI-272, 에를로티닙, 라파타닙, 카넬티닙, ABX-EGF 항체, 어비툭스, EKB-569, PKI-166, GW-572016, 로나파르닙, BMS-214662, 티피파르닙; 아미포스틴, NVP-LAQ824, 수베로일 아날라이드 하이드록삼산, 발프로산, 트리코스타틴 A, FK-228, SU11248, 소라페닙, KRN951, 아미노글루테티마이드, 암사크라인, 아나그렐라이드, L-아스파라기나제, 칼메트-게랑 간균(Bacillus Calmette-Guerin)(BCG) 백신, 아드리아마이신, 블레오마이신, 부세레린, 부설판, 카보플라틴, 카무스틴, 클로람부실, 시스플라틴, 클라드리빈, 클로드로네이트, 시프로테론, 시타라빈, 다카바진, 닥티노마이신, 다우노루비신, 다이에틸스틸베스트롤, 에피루비신, 플루다라빈, 플루드로콜티손, 플루오시메스테론, 플루타마이드, 글리벡(Gleevec), 젬시타빈, 하이드록시요소, 이다루비신, 이포스파마이드, 이마티닙, 류프롤라이드, 레바미솔, 로무스틴, 메클로르에타민, 멜팔란, 6-메르캅토퓨린, 메스나, 메토트렉사트, 미토마이신, 미토탄, 미톡산트론, 닐루타마이드, 옥트레오타이드, 옥살리플라틴, 파마이드로네이트, 펜토스타틴, 플리카마이신, 포르피머, 프로카바진, 랄티트렉스드, 리툭시맙, 스트렙토조신, 테니포사이드, 테스토스테론, 탈리도마이드, 티오구아닌, 티오테파, 트레티노인, 빈데신, 13-시스-레티노산, 페닐알라닌 머스타드, 유라실 머스타드, 에스트라무스틴, 알트레타민, 플록수리딘, 5-데옥시유리딘, 시토신 아라비노사이드, 6-메르캅토퓨린, 데옥시코포르마이신, 칼시트라이올, 발루비신, 미트라마이신, 빈블라스틴, 비노렐빈, 토포테칸, 라족신, 마리마스타트, COL-3, 네오바스타트, BMS-275291, 스쿠알라민, 엔도스타틴, SU5416, SU6668, EMD121974, 인터류킨-12, IM862, 앤지오스타틴, 비탁신, 드롤록시펜, 이독시펜, 스피로놀락톤, 피나스테라이드, 시미티딘, 트라스투주맙, 데닐류킨 디프티톡스, 제피티닙, 보르테지밉, 파클리탁셀, 크레모포-무함유 파클리탁셀, 도세탁셀, 에피틸론 B, BMS-247550, BMS-310705, 드롤록시펜, 4-하이드록시타목시펜, 피펜독시펜, ERA-923, 아르족시펜, 풀베스트란트, 아콜비페네, 라소폭시펜, 이독시펜, TSE-424, HMR-3339, ZK186619, 토포테칸, PTK787/ZK 222584, VX-745, PD 184352, 라파마이신, 40-O-(2-하이드록시에틸)-라파마이신, 템시롤리무스, AP-23573, RAD001, ABT-578, BC-210, LY294002, LY292223, LY292696, LY293684, LY293646, 워트만닌, ZM336372, L-779,450, PEG-필그라스팀, 다베포에틴, 에리트로포이에틴, 과립구 집락 자극 인자, 졸렌드로네이트, 프레드니손, 세툭시맙, 과립구 대식세포 집락 자극 인자, 히스트렐린, 페길화된 인터페론 알파-2a, 인터페론 알파-2a, 페길화된 인터페론 알파-2b, 인터페론 알파-2b, 아자시티딘, PEG-L-아스파라기나제, 레날리도마이드, 젬투주맙, 하이드로코르티손, 인터류킨-11, 덱스라족세인, 알렘투주맙, 올-트랜스 레티노산, 케토코나졸, 인터류킨-2, 메게스트롤, 면역글로불린, 질소 머스타드, 메틸프레드니솔론, 이브리투모맙 튜세탄, 안드로겐, 데시타빈, 헥사메틸멜라민, 벡사로텐, 토시투모맙, 삼산화비소, 코르티손, 에디트로네이트, 미토탄, 시클로스포린, 리포솜 다우노루비신, 에드위나-아스파라기나제, 스트론튬 89, 카소피탄트, 네투피탄트, NK-1 수용체 길항제, 팔로노세트론, 아프레피탄트, 다이펜하이드라민, 하이드록시진, 메토클로프라마이드, 로라제팜, 알프라졸람, 할로페리돌, 드로페리돌, 드로나비놀, 덱사메타손, 메틸프레드니솔론, 프로클로르페라진, 그라니세트론, 온단세트론, 도라세트론, 트로피세트론, 페그필그라스팀, 에리트로포이에틴, 에포에틴 알파, 다베포에틴 알파, 및 이들의 혼합물로 이루어진 군으로부터 선택된다.
추가의 양상에 있어서, 본 개시내용은 세포에서 표적 단백질의 분해를 유도하기 위한 방법을 제공하되, 해당 방법은 유효량의 본 명세서에 기재된 바와 같은 화합물을 세포에 투여하는 단계를 포함하며, 여기서 화합물은 표적 단백질의 분해를 유발시킨다.
더욱 추가의 양상에 있어서, 본 개시내용은 암의 치료 방법에서 사용하기 위한 유효량의 본 명세서에 기재된 바와 같은 화합물을 포함하는 조성물을 제공하되, 상기 방법은 암의 치료를 필요로 하는 환자에게 조성물을 투여하는 단계를 포함하고, 조성물은 환자에서 암의 적어도 하나의 증상을 치료 또는 완화를 달성한다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, 암은 편평 세포 암종, 기저 세포 암종, 선암종, 간세포 암종, 및 신장 세포 암종, 방광암, 장암, 유방암, 자궁경부암, 결장암, 식도암, 두부암, 신장암, 간암, 폐암, 목암, 난소암, 췌장암, 전립선암 및 위암; 백혈병; 양성 및 악성 림프종, 특히 버킷 림프종 및 비호지킨 림프종; 양성 및 악성 흑색종; 골수증식성 질환; 다발성 골수종, 유잉 육종, 혈관육종, 카포시 육종, 지방육종, 근육종, 말초 신경상피종, 윤활막 육종, 신경교종, 성상세포종, 희돌기교종, 뇌실막세포종, 교아종, 신경모세포종, 신경절신경종, 신경절교종, 수모세포종, 송과체 세포 종양, 수막종, 뇌막 육종, 신경섬유종 및 신경초종을 비롯한 육종; 장암, 유방암, 전립선암, 자궁경부암, 자궁암, 폐암, 난소암, 고환암, 갑상선암, 성상세포종, 식도암, 췌장암, 위암, 간암, 결장암, 흑색종; 암육종, 호지 킨병, 빌름스 종양 또는 기형암종, T-계통 급성 림프모구성 백혈병(T-ALL), T-계통 림프모구성 림프종(T-LL), 말초 T-세포 림프종, 성체 T-세포 백혈병, Pre-B ALL, Pre-B 림프종, 큰 B-세포 림프종, 버킷 림프종, B-세포 ALL, 필라델피아 염색체 양성 ALL 및 필라델피아 염색체 양성 CML이다.
본 명세서에 기재된 양상 또는 실시형태 중 임의의 것에 있어서, CLM은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 구조를 가진 PTM에 커플링된다:
Figure pct00109
Figure pct00110
Figure pct00111
여기서 R 또는 링커는 CLM을 PTM에 커플링시키기 위한 결합 또는 화학적 링커 모이어티, 및 이의 약제학적으로 허용 가능한 염 형태이다.
실시예
A. 인간 CRBN 및 DDB1의 클로닝, 발현 및 정제. 본 절차는 Lopez-Girona 등에서 설명에 의해 대표된 바와 같이, 당해 분야에 정통한 자에게 표준이다. (세레블론은 레날리도미드 및 포말리도미드의 면역조정성 및 항증식성 활성에 대한 직접적인 단백질 표적이다, 문헌[A Lopez-Girona, D Mendy, T Ito, K Miller, A K Gandhi, J Kang, S Karasawa, G Carmel, P Jackson, M Abbasian, A Mahmoudi, B Cathers, E Rychak, S Gaidarova, R Chen, P H Schafer, H Handa, T O Daniel, J F Evans and R Chopra, Leukemia 26: 2326-2335, 2012]).
CRBN 및 DDB1 유전자에 대한 cDNA는 중합효소로서 Pfusion(NEB) 및 다음의 프라이머 서열을 이용한 PCR에 의해 증폭될 수 있다:
Figure pct00112
결찰-독립적 클로닝 26을 이용하여, CRBN은 pBV-ZZ-HT-LIC, pBV-GST-LIC, pMA-HT-LIC 내로 클로닝될 수 있고, 그리고 DDB1은 pBV-notag-LIC 내로 클로닝될 수 있다. 포유류 벡터 pMA-HT-LIC 내로 내로의 클로닝을 위해, CRBN-플래그-역방향 올리고는 면역검출을 위하여 C-말단 플래그 태그를 부가한다. DDB1-Rev는 StrepTag 27을 부가한다. ZZ-태그 28은 가용성 CRBN의 높은 발현을 달성하기 위해 필요하다; 이것 없이, His-CRBN은 낮은 수준에서 발현되고, 반면 GST-CRBN은 응집된 단백질을 유발한다. ZZ-His-CRBN 및 DDB1-StrepTag(ST)의 재조합 배큘로바이러스는 Sf9 곤충 세포에서 인비트로젠사(Invitrogen)로부터 Bac-to-Bac 배큘로바이러스 발현 시스템을 이용하여 산출되고 증폭된다. ZZ-His-CRBN 및 DDB1-ST는 익스프레션 시스템즈사(Expression Systems)로부터 비-보충된 ESF921 배지를 이용하여 27℃에서 10ℓ 웨이브 백 내에 High Five(Tni) 곤충에서 공동발현된다. 세포는 감염 후 48 시간에 원심분리에 의해 수확되고, 그리고 페이스트는 PBS plus5X 프로테아제 저해제 칵테일(로슈사(Roche), 나인디애나주의 인디애나폴리스 소재)에 재현탁된다.
모든 후속의 단백질 정제 단계는 4℃에서 수행된다. 동결된 세포는 해동되고, 5 용적의 용해 완충액(50mM Tris HCl pH 8.0, 0.5M NaCl, 10% 글리세롤, 2mM DTT) + 20mM 이미다졸 및 프로테아제 저해제에 재현탁되고, 용해되고, 그리고 원심분리되어 투명한 상청액을 수득한다. CRBN-DDB1은 니켈-세파로스 및 S200 세파크릴 크로마토그래피를 이용하여 KTA-xpress 시스템(GE 헬스케어사(GE Healthcare))에서 정제된다. 이어서 복합체는 8㎖ MonoQ 칼럼에서 음이온 교환 크로마토그래피 및 S-200 겔 여과에서 제2 통과를 이용하여 더욱 정제된다. CRBN-DDB1은 SDS-PAGE에 의해 확인되고, 그리고 CRBN-DDB1 함유 분획물은 혼주되어 -70℃에서 보관되었다.
2. 재조합 CRBN에의 화합물의 결합을 계측하기 위한 형광 열 융해 검정
본 검정은 Lopez-Girona 등에서 설명에 의해 대표된 바와 같이, 당해 분야에 정통한 자에게 표준이다. (세레블론은 레날리도미드 및 포말리도미드의 면역조정성 및 항증식성 활성에 대한 직접적인 단백질 표적이다, 문헌[A Lopez-Girona, D Mendy, T Ito, K Miller, A K Gandhi, J Kang, S Karasawa, G Carmel, P Jackson, M Abbasian, A Mahmoudi, B Cathers, E Rychak, S Gaidarova, R Chen, P H Schafer, H Handa, T O Daniel, J F Evans and R Chopra, Leukemia 26: 2326-2335, 2012]).
시험 화합물의 존재 또는 부재에서 CRBN-DDB1의 열 안정성은 Pantoliano et al.(Pantoliano MW, Petrella EC, Kwasnoski JD, Lobanov VS, Myslik J, Graf E et al. High-density miniaturized thermal shift assays as a general strategy for drug discovery. J Biomol Screen 2001; 6: 429-440)에 따라 마이크로평판 형식에서 시프로 오렌지(Sypro Orange)의 존재에서 행위된다. 20㎖의 검정 완충액(25mM Tris HCl, pH 8.0, 150mM NaCl, 2uM 시프로 오렌지)에서 2㎎의 단백질이 20℃에서 70℃까지 온도의 단계별 증가를 거치고, 그리고 형광이 ABIPrism 7900HT(어플라이드 바이오시스템즈사(Applied Biosystems), 미국 캘리포니아주 칼스배드시 소재)에서 1℃마다 판독된다. 화합물은 DMSO(검정에서 1% 최종)에 용해되고, 그리고 30nM 내지 1000uM의 농도 범위에서 네 벌로 시험된다; 대조군은 단지 1%의 DMSO만을 함유하였다.
3. LCMS 방법
본 분석은 45℃에서 Poroshell 120 EC C18 칼럼(50mm x 3.0mm 내부 직경 2.7㎛ 패킹 직경)에서 수행된다.
이용된 용매는 다음과 같다:
A = 수중 폼산의 0.1% v/v 용액.
B = 아세토나이트릴 중 폼산의 0.1% v/v 용액.
이용된 구배는 다음과 같다:
Figure pct00113
UV 검출은 210㎚ 내지 350㎚의 파장으로부터 평균화된 신호이고, 질량 스펙트럼은 포지티브 방식 전기분무 이온화를 이용하여 질량분광계에서 기록된다.
다음은 화합물이 분취용 HPLC에 의한 정제를 거칠 때 이용된 이동상 및 구배를 예시한다.
4. 분취용 HPL C (폼산 조절제)
HPLC 분석은 주위 온도에서 X Bridge RP18 OBD 칼럼(150mm x 19mm 내부 직경, 5㎛ 패킹 직경)에서 수행된다.
이용된 용매는 다음과 같다:
A = 수중 폼산의 0.1% v/v 용액.
B = 아세토나이트릴.
5. 분취용 HPL C (중탄산암모늄 조절제)
HPLC 분석은 주위 온도에서 X Bridge RP18 OBD 칼럼(150mm x 19mm 내부 직경, 5㎛ 패킹 직경)에서 수행된다.
이용된 용매는 다음과 같다:
A = 수중 10mM 중탄산암모늄.
B = 아세토나이트릴.
각 분취용 정제의 경우에, 이용된 조절제와 상관없이, 이용된 구배는 분석적 LCMS에서 기록될 때 정제를 거치는 특정 화합물의 체류 시간에 의존한다. 유량은 20 ㎖/분이다.
UV 검출은 254㎚ 또는 220㎚의 파장으로부터 신호이다.
본 발명의 바람직한 실시형태가 본 명세서에서 나타내고 설명되었지만, 이러한 실시형태는 단지 예로서 제공되는 것으로 이해될 것이다. 다양한 변이, 변화 및 치환이 본 발명의 사상으로부터 벗어나는 일 없이 당업자에게 떠오를 것이다. 따라서, 첨부된 청구범위는 본 발명의 사상과 범위 내에 들어가는 바와 같은 이러한 모든 변이를 포함하는 것으로 의도된다.
B. 합성
아래에 포함된 실시예에 대한 합성 상세는 더욱 넓은 실시예 세트의 합성에 관한 정보를 제공하는 일반적인 절차를 대표한다.
1. 2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-4- 플루오로 -2,3- 다이하이드로 -1H- 아이소인돌 -1,3-다이온
Figure pct00114
단계 1: 4-플루오로아이소벤조퓨란-1,3-다이온
Figure pct00115
아세트산 무수물(400㎖) 중 3-플루오로프탈산(50g, 271.7 m㏖)의 혼합물을 2시간 동안 환류시켰다. 휘발성 물질을 진공에 의해 제거하고, 잔사를 아세트산 무수물 중에서 결정화시켜 4-플루오로아이소벤조퓨란-1,3-다이온(40g, 조질물)을 갈색 고체로서 제공하였다. LC-MS: 167.1 [MH]+. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.58 (t, J = 8.0 Hz, 1H), 7.86 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.92-7.97 (m, 1H).
단계 2: 5-아미노-2-(4-플루오로-1,3-다이옥소아이소인돌린-2-일)-5-옥소펜탄산
Figure pct00116
건조 DMF(200㎖) 중 상기 4-플루오로아이소벤조퓨란-1,3-다이온(40g, 조질물) 및 L-글루타민(35g, 239 m㏖)의 혼합물을 90℃에서 8시간 동안 교반하였다. 용매를 감압 하에 제거하였다. 잔사를 4N HCl(200㎖)에 재용해시키고, 추가로 8시간 동안 교반하였다. 얻어진 석출물을 여과에 의해 수집하고, 물로 세척하고, 건조시켜, 5-아미노-2-(4-플루오로-1,3-다이옥소아이소인돌린-2-일)-5-옥소펜탄산(37g, 조질물)을 회백색 고체로서 제공하였다. LC-MS: 295.2 [MH]+. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 2.16-2.20 (m. 2H), 2.31-2.43 (m, 2H), 4.79-4.83 (m, 1H), 6.79 (br, 1H), 7.26(br, 1H), 7.77-7.85 (m, 2H), 7.98-8.03 (m, 1H), 13.32(br, 1H).
단계 3: 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온
Figure pct00117
아세토나이트릴(80㎖) 중 상기 5-아미노-2-(4-플루오로-1,3-다이옥소아이소인돌린-2-일)-5-옥소펜탄산(37g, 조질물), 1,1'-카보닐다이이미다졸(CDI)(24.2g, 149.4 m㏖) 및 4-다이메틸아미노피리딘(DMAP)(1.3g, 11.5 m㏖)의 혼합물을 5시간 동안 환류시켰다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시켰다. 얻어진 고체를 여과에 의해 수집하고, 아세토나이트릴(100㎖)로 세척하여 조질의 생성물을 제공하였으며, 이것을 DCM 중 1-10% MeOH를 용리액으로 사용하는 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로아이소인돌린-1,3-다이온(9.0g, 3 단계에 걸쳐 12% 수율)을 밝은 황색 고체로서 제공하였다. LC-MS: 277.2 [MH]+. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 2.14-2.19 (m, 1H), 2.75-2.95 (m, 3H), 4.97-5.01 (m, 1H), 7.43 (t, J = 8.4 Hz, 1H), 7.10-7.81 (m, 2H), 8.08 (br, 1H).
2. N-(3-(5- 브로모 -2- 클로로피리미딘 -4- 일아미노 )프로필)-N- 메틸사이클로부탄 카복스아마이드
Figure pct00118
단계 1: tert-부틸 N-{3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}-N-메틸카바메이트
Figure pct00119
MeOH(10㎖) 중 tert-부틸 N-(3-아미노프로필)-N-메틸카바메이트(826㎎, 4.40 m㏖) 및 5-브로모-2,4-다이클로로피리미딘(400㎎, 1.76 m㏖)의 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 이어서 진공 중 농축시키고, 잔사를 텔레다인(Teledyne) ISCO 크로마토그래피[0 → 35% EtOAc/헵탄]를 이용해서 정제시켜 tert-부틸 N-{3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}-N-메틸카바메이트(615㎎, 92% 수율)를 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z = 381.05/383.05 [MH+], t R = 2.55분.
단계 2: {3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}(메틸)아민
Figure pct00120
DCM(5㎖) 중 tert-부틸 N-{3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}-N-메틸카바메이트(615㎎, 1.62 m㏖)의 용액에 트라이플루오로아세트산(0.54㎖, 6.5 m㏖)을 실온에서 첨가하였다. 이 혼합물을 1시간 동안 교반한 후, 진공 중 농축시켰다. 잔사를 텔레다인 ISCO 크로마토그래피[DCM 중 0 → 15% 메탄올]를 이용해서 정제시켜 {3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}(메틸)아민(371㎎, 82% 수율)을 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z = 280.99/282.99 [MH+], t R = 1.13분.
단계 3: N-{3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}-N-메틸사이클로부탄카복스아마이드
Figure pct00121
실온에서 DCM(10㎖) 중 {3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}(메틸)아민(371㎎, 1.33 m㏖) 및 사이클로부탄카보닐 클로라이드(188㎎, 1.60 m㏖)의 용액에 트라이에틸 아민(0.41㎖, 2.92 m㏖)을 첨가하였다 반응 혼합물을 실온에서 16시간 동안 교반하고, 이어서 진공 중 농축시켰다. 잔사를 텔레다인 ISCO 크로마토그래피[0 → 100% EtOAc/헵탄]를 이용해서 정제시켜 N-{3-[(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일)아미노]프로필}-N-메틸사이클로부탄 카복스아마이드(268㎎, 56%)를 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z = 363.04/365.04 [MH+], t R = 2.18분.
3. ( S )-2-(4-(4- 클로로페닐 )-2,3,9- 트라이메틸 -6H- 티에노 [3,2-f] [1,2,4] 트라이아졸로 [ 4,3-a][1,4]다이아제핀 -6-일)아세트산
Figure pct00122
표제의 화합물은 WO2011/143660에 기재된 절차에 따라서 제조하였다.
4. (Z)-4-(4-((2,4- 다이옥소티아졸리딘 -5- 일리덴 ) 메틸 )-2- 메톡시페녹시 )-3- ( 트라이플루오로메틸 ) 벤조나이트릴
Figure pct00123
표제의 화합물은 문헌[Patch, R. J. et al J. Med . Chem . 2011, 54, 788-808]에 기재된 절차에 따라서 제조하였다.
5. 4-[3-(4- 하이드록시페닐 )-4,4- 다이메틸 -5-옥소-2- 설파닐리딘아미다졸리딘 -1-일]-2-( 트라이플루오로메틸 ) 벤조나이트릴
Figure pct00124
표제의 화합물은 문헌[Jung, M. E. et al J. Med . Chem . 2010, 53, 2779-2796]에 기재된 절차에 따라서 제조하였다.
6. 2- 클로로 -4-( 트랜스- 3-아미노-2,2,4,4- 테트라메틸사이클로부톡시 ) 벤조나이트릴 염산염
Figure pct00125
표제의 화합물은 문헌[Guo, C. et al J. Med . Chem . 2011, 54, 7693-7704]에 기재된 절차에 따라서 제조하였다.
7. [N-(3-(5- 브로모 -2-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소아이소인돌린 -4- 일아미노 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 페닐아미노 )피리미딘-4-일 아미 노)프로필)-N- 메틸사이클로부탄카복스아마이드 ]
Figure pct00126
(표 1에 나타낸 화합물 구조 #17)
단계 1: 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트
Figure pct00127
건조 N,N-다이메틸폼아마이드(20㎖) 중 2,2'-(2,2'-옥시비스(에탄-2,1-다이일)비스(옥시))비스(에탄-2,1-다이일) 비스(4-메틸벤젠설포네이트)(3g, 5.96 m㏖), 4-나이트로페놀(813㎎, 5.84 m㏖) 및 탄산칼륨(1.65g, 11.94 m㏖)의 혼합물을 50℃에서 하룻밤 교반하였다. 이 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(60㎖)에 붓고 이어서 에틸 아세테이트(80㎖ x 3)로 추출하였다. 합한 유기 상을 물(50㎖) 및 염수(50㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 10-20% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(2.65g, 95% 수율)를 황색 오일로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 470.2 [MH+] (tR = 2.83 min)
단계 2: [1-(2-(2-(2-(2-아자이도에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-4-나이트로벤젠]
Figure pct00128
에탄올(30㎖) 중 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(2.65g, 5.64 m㏖) 및 아자이드화나트륨(734㎎, 11.29 m㏖)의 혼합물을 16시간 동안 환류시켰다. 이 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(50㎖)로 반응 중지시키고, 다이클로로메탄(50㎖ x 3)으로 추출하였다. 합한 유기 상을 (50㎖) 및 염수(40㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 1-(2-(2-(2-(2-아자이도에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-4-나이트로벤젠(865 mg)을 황색 오일로서 제공하였다.
단계 3: [2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄아민]
Figure pct00129
테트라하이드로퓨란(10㎖) 중 상기 1-(2-(2-(2-(2-아자이도에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)-4-나이트로벤젠(865㎎, 2.54 m㏖), 트라이페닐포스핀(999㎎, 3.81 m㏖) 및 물(69㎎, 3.83 m㏖)의 혼합물을 실온에서 14시간 동안 질소 분위기 하에. 휘발성 물질을 감압 하에 제거하여 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(다이클로로메탄 중 3-5% 메탄올로 용리)에 의해 정제시켜 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄아민(661㎎, 83% 수율)을 황색 오일로서 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 2.86 (t, J = 5.2 Hz, 2H), 3.51 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 3.63-3.75 (m, 8H), 3.90 (t, J = 4.4 Hz, 2H), 4.23 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 6.97-6.99 (m, 2H), 8.18-8.22 (m, 2H).
단계 4: tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트
Figure pct00130
다이클로로메탄(25㎖) 중 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄아민(661㎎, 2.1 m㏖), 트라이에틸아민(449㎎, 4.43 m㏖) 및 다이-tert-부틸 다이카보네이트(505㎎, 2.31 m㏖)의 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 이 혼합물을 다이클로로메탄(100㎖)으로 희석시키고, 물(30㎖ x 2) 및 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 20-40% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트(818㎎, 94% 수율)를 황색 오일로서 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 1.44 (s, 9H), 3.37 (d, J = 5.2 Hz, 2H), 3.54 (t, J = 5.2 Hz, 2H), 3.62-3.70 (m, 6H), 3.73-3.76 (m, 2H), 3.90 (t, J = 4.4 Hz, 2H), 4.23 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 5.01(br, 1H), 6.96-7.00 (m, 2H), 8.18-8.22 (m, 2H).
단계 5: tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-아미노페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트
Figure pct00131
에탄올(20㎖) 및 물(5㎖) 중 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트(818㎎, 1.97 m㏖), 철 분말(1.1g, 0.65 m㏖) 및 염화암모늄(528㎎, 9.87 m㏖)의 혼합물을 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 이 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 고체 석출물을 여과에 의해 제거하고, 에틸 아세테이트(20㎖ x 2). 여과액을 에틸 아세테이트(120㎖)와 물(30㎖) 간에 분배시켰다. 유기 상을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔사를 실리카겔 크로마토그래피(헥산 중 30-40% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-아미노페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트(512㎎, 67% 수율)를 황색 오일로서 제공하였다.
단계 6: tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-(5-브로모-4-(3- (N-메틸사이클로부탄카복스아미도) 프로필아미노)피리미딘-2-일아미노)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트
Figure pct00132
다이옥산(1.5㎖) 중 tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-아미노페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸 카바메이트(130㎎, 0.34 m㏖), N-(3-(5-브로모-2-클로로피리미딘-4-일아미노)프로필)-N-메틸사이클로부탄카복스아마이드(24㎎, 0.06 m㏖) 및 p-톨루엔설폰산(11.6㎎, 0.07 m㏖)의 혼합물을 16시간 동안 환류시켰다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 수성 중탄산나트륨 용액(1.0 N，30㎖)으로 반응 중지시키고, 에틸 아세테이트(30㎖ x 3)로 추출하였다. 합한 유기 상을 물(30㎖) 및 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 50% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-(5-브로모-4-(3-(N-메틸사이클로부탄카복스아미도)프로필아미노)피리미딘-2-일아미노)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트(40㎎, 17% 수율)를 황색 오일로서 제공하였다.
단계 7: N-(3-(2-(4-(2-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시) 에톡시)에톡시)페닐아미노)-5-브로모피리미딘-4-일아미노)프로필)-N-메틸사이클로부탄카복스아마이드
Figure pct00133
2,2,2-트라이플루오로아세트산(1㎖) 및 다이클로로메탄(1㎖) 중 tert-부틸 2-(2-(2-(2-(4-(5-브로모-4-(3-(N-메틸사이클로부탄카복스아미도) 프로필아미노)피리미딘-2-일아미노)페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트(40㎎, 0.06 m㏖)의 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 휘발성 물질을 감압 하에 제거하였다. 잔사를 다이클로로메탄(60㎖)과 수성 중탄산나트륨 용액(2.0N, 30㎖) 간에 분배시켰다. 유기 층을 염수(20㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 N-(3-(2-(4-(2-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐아미노)-5-브로모피리미딘-4-일아미노)프로필)-N-메틸사이클로부탄카복스아마이드(18㎎, 52% 수율)을 황색 오일로서 제공하였다.
단계 8: N-(3-(5-브로모-2-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐아미노)피리미딘-4-일아미노)프로필)-N-메틸사이클로부탄카복스아마이드
Figure pct00134
건조 N,N-다이메틸폼아마이드(1㎖) 중 N-(3-(2-(4-(2-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에톡시)에톡시) 페닐아미노)-5-브로모피리미딘-4-일아미노)프로필)-N-메틸사이클로부탄 카복스아마이드(130㎎, 0.03m㏖), 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온(8.2㎎, 0.03m㏖) 및 N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(7.6㎎, 0.06m㏖)의 혼합물을 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 에틸 아세테이트(100㎖)와 물(30㎖) 간에 분배시켰다. 유기 상을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 잔사를 분취-TLC에 의해 정제시켜 N-(3-(5-브로모-2-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐아미노)피리미딘-4-일아미노)프로필)-N-메틸사이클로부탄카복스아마이드(10.2㎎, 40% 수율)를 황색 고체로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z = 865.27/867.27 (1:1) [MH]+. tR = 2.06분.1H NMR (400 MHz, CD3OD): δ 1.68-1.77 (m, 3H), 1.89-1.92 (m, 3H), 2.08-2.15 (m, 3H), 2.60-2.79 (m, 7H), 3.28-3.35 (m, 6H), 3.55-3.61 (m, 10H), 3.69-3.72 (m, 2H), 3.96-3.99 (m, 2H), 4.91-4.95 (m, 1H), 6.75-6.78 (m, 2H), 6.91-6.94 (m, 2H), 7.34-7.42 (m, 3H), 7.76 (d, J = 12.8 Hz, 1H).
8. 2-((S)-4-(4- 클로로페닐 )-2,3,9- 트라이메틸 -6H- 티에노 [3,2-f][1,2,4] 트라이아졸로 [ 4,3-a][1,4]다이아제핀 -6-일)-N-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소아이소인돌린 -4- 일아미노 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 페닐 )아세트아마이드
Figure pct00135
(표 1에 나타낸 화합물 구조 #14)
단계 1: (2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)- 4-(2-(2-(2-(2-( 4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸아미노)아이소인돌린-1,3-다이온
Figure pct00136
건조 N,N-다이메틸폼아마이드(2㎖) 중 2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에탄아민(128㎎, 0.41 m㏖), 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온(112.5㎎, 0.41 m㏖) 및 N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(105㎎, 0.81 m㏖)의 혼합물을 90℃에서 12시간 동안 교반하였다. 이 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(20㎖)에 붓고 에틸 아세테이트(35㎖×2)로 추출하였다. 합한 유기 상을 물(30㎖)로 세척하고, 염수(30㎖), 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 분취-TLC에 의해 정제시켜 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-(2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시)에톡시) 에톡시)에틸아미노)아이소인돌린-1,3-다이온(73㎎, 31% 수율)을 황색 고체로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 571.3 [MH+], tR = 2.46분.
단계 2: (4-(2-(2-(2-(2-(4-아미노페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸아미노)-2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)아이소인돌린-1,3-다이온)
Figure pct00137
에탄올(2㎖) 중 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-(2-(2-(2-(2-(4-나이트로페녹시)에톡시) 에톡시)에톡시)에틸아미노)아이소인돌린-1,3-다이온(73㎎, 0.128 m㏖) 및 철 분말(71.6㎎, 1.28 m㏖)의 현탁액에 물(0.5㎖) 중 염화암모늄(68㎎, 1.26 m㏖)의 용액을 실온에서 첨가하고, 얻어진 혼합물을 80℃에서 1시간 동안 교반하였다. 이 혼합물을 실온까지 냉각시킨 후, 고체 석출물을 여과 제거하고 에틸 아세테이트(10㎖ x 2)로 세척하였다. 여과액을 에틸 아세테이트(60㎖)와 물(30㎖) 간에 분배시켰다. 유기 층을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 4-(2-(2-(2-(2-(4-아미노페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸아미노)-2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)아이소인돌린-1,3-다이온(66.5㎎, 조질물)을 황색 오일로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 541.5 [MH+], tR = 1.593분.
단계 3: 2-((S)-4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노 [3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)-N-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐)아세트아마이드
Figure pct00138
건조 N,N-다이메틸폼아마이드(1㎖) 중 4-(2-(2-(2-(2-(4-아미노페녹시)에톡시)에톡시)에톡시)에틸아미노)-2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)아이소인돌린-1,3-다이온(58.4㎎, 0.11 m㏖), (S)-2-(4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)아세트산(43.3㎎, 0.11 m㏖) 및 N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(41.8㎎, 0.32 m㏖)의 교반된 용액에 (2-(7-아자-1H-벤조트라이아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄헥사플루오로포스페이트)(82㎎, 0.21m㏖)를 0℃에서 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 실온까지 가온시키고, 실온에서 20분 동안 교반하였다. 이 혼합물을 물(25㎖)에 붓고, 에틸 아세테이트(35㎖×2)로 추출하였다. 합한 유기 상을 물(20㎖) 및 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 분취-TLC에 의해 정제시켜 2-((S)-4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)-N-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐)아세트아마이드(52㎎, 52% 수율)를 황색 고체로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 923.29/925.29 (3:1) [MH+], tR = 2.689분.1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 1.67 (s, 3H), 2.05-2.12 (m, 1H), 2.40 (s, 3H), 2.65-2.85 (m, 6H), 3.41-3.54 (m, 4H), 3.65-3.74 (m, 10H), 3.81-3.85 (m, 2H), 4.06-4.11 (m, 2H), 4.63-4.69 (m, 1H), 4.85-4.93 (m, 1H), 6.38-6.55 (m, 1H), 6.83 (d, J = 8.8 Hz, 2H), 6.92 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 7.09 (d, J = 7.2 Hz, 1H), 7.33 (d, J = 8.4 Hz, 2H), 7.39-7.51 (m, 5H), 8.59 (d, J = 5.2 Hz, 1H), 8.77 (d, J = 3.2 Hz, 1H).
9. (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-(2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소아이소인돌린 -4- 일아미노 ) 에톡시 ) 에톡시 )에틸)-2,4- 다이옥소티아졸리딘 -5- 일리덴 ) 메틸 )-2- 메톡시페녹시 )-3-( 트라이플루오로메틸 ) 벤조나이트릴
Figure pct00139
(표 1에 나타낸 화합물 구조 #22)
단계 1: (Z)-2-(2-(2-(5-(4-(4-사이아노-2-(트라이플루오로메틸)페녹시)-3-메톡시벤질리덴)-2,4-다이옥소티아졸리딘-3-일)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트)
Figure pct00140
N,N-다이메틸폼아마이드(10㎖) 중 (Z)-4-(4-((2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(1.0g, 2.3 m㏖), 탄산칼륨(1.0g, 6.9 m㏖) 및 2,2'-(에탄-1,2-다이일비스(옥시))비스(에탄-2,1-다이일) 비스(4-메틸벤젠설포네이트)(1.3g, 2.7 m㏖)의 혼합물을 80℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(10㎖)로 반응 중지시키고, 에틸 아세테이트(40㎖ x 3)로 추출하였다. 합한 유기 상을 물(50㎖) 및 염수(50㎖)로 세척하고, 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 증발시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 10-30% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 (Z)-2-(2-(2-(5-(4-(4-사이아노-2-(트라이플루오로메틸)페녹시)-3-메톡시벤질리덴)-2,4-다이옥소티아졸리딘-3-일)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(1.0g, 61% 수율)를 밝은 황색 고체로서 제공하였다.
단계 2: (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-아자이도에톡시)에톡시)에틸) -2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴
Figure pct00141
에탄올(20㎖) 중 (Z)-2-(2-(2-(5-(4-(4-사이아노-2-(트라이플루오로메틸)페녹시)-3-메톡시벤질리덴)-2,4-다이옥소티아졸리딘-3-일)에톡시)에톡시)에틸 4-메틸벤젠설포네이트(1.0g, 1.4 m㏖) 및 아자이드화나트륨(185㎎, 2.8 m㏖)의 혼합물을 16시간 동안 환류시켰다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 에틸 아세테이트(100㎖)와 물(20㎖) 간에 분배시켰다. 유기 층을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-아자이도에톡시)에톡시)에틸)-2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(130㎎, 조질물)을 밝은 황색 오일로서 제공하였으며, 이것은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다.
단계 3: (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에틸)-2,4- 다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴
Figure pct00142
물(0.2㎖) 및 테트라하이드로퓨란(20㎖) 중 (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-아자이도에톡시)에톡시)에틸)-2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴)(130㎎, 조질물), 트라이페닐포스핀(100㎎, 0.34 m㏖)의 혼합물을 실온에서 14시간 동안 교반하였다. 이 혼합물을 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(다이클로로메탄 중 3-5% 메탄올로 용리)에 의해 정제시켜 (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-아미노에톡시) 에톡시)에틸)-2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(60㎎, 2단계에 걸쳐 8% 수율)을 황색 오일로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 552.1 [MH+], tR = 2.15분.
단계 4: (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3- 다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에틸)-2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴
Figure pct00143
1-메틸피롤리딘-2-온(1㎖) 중 (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에틸)-2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴) 메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴)(60㎎, 0.10 m㏖), 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온(30㎎, 0.13 m㏖) 및 N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(50㎎, 0.39 m㏖)의 혼합물을 90℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(5㎖)로 반응 중지시키고, 에틸 아세테이트(20㎖ x 3)로 추출하였다. 합한 유기층을 물(10㎖ x 2) 및 염수(10㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 분취-TLC에 의해 정제시켜 (Z)-4-(4-((3-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에틸)-2,4-다이옥소티아졸리딘-5-일리덴)메틸)-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(9.5㎎, 11.8% 수율)을 황색 고체로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 808.19 [MH+], tR = 3.022분.1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 2.12-2.16 (m, 1H), 2.73-2.91 (m, 3H), 3.42 (s, 2H), 3.67-3.80 (m, 11H), 3.99 (s, 2H), 4.91-4.95 (m, 1H), 6.51 (s, 1H), 6.76-6.86 (m, 2H), 7.02-7.19 (m, 4H), 7.43 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 7.68 (d, J = 8.0 Hz, 1H), 7.85-8.12 (m, 3H).
10. 4-(3-(4-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소아이소인돌린 -4-일)아미노) 에톡시 ) 에톡시 ) 에톡시 ) 프로폭시 ) 페닐 )-4,4- 다이메틸 -5-옥소-2- 티옥소이미다졸리딘 -1-일)-2-( 트라이플루오로메틸 ) 벤조나이트릴
Figure pct00144
(표 1에 나타낸 화합물 구조 #1)
단계 1: 1,1,1,16-테트라페닐-2,5,8,11,15-펜타옥사헥사데칸
Figure pct00145
2-(2-(2-(트라이틸옥시)에톡시)에톡시)에탄올(7g, 17.7 m㏖) in N,N-다이메틸폼아마이드(50㎖) 중 수소화나트륨(광유 중 60%, 707㎎, 17.7 m㏖)을 0℃에서 서서히 첨가하였다. 이 혼합물을 30분 동안 실온에서 교반한 후, 3-(벤질옥시)프로필 4-메틸벤젠설포네이트(5.8 g 18.0 m㏖)를 0℃에서 한번에 첨가하고, 얻어진 혼합물을 70℃에서 하룻밤 교반하였다. 이 혼합물을 실온까지 냉각시킨 후, 물(40㎖)로 주의해서 반응 중지시키고, 에틸 아세테이트(60㎖×3)로 추출하였다. 합한 유기 상을 염수(80㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 크로마토그래피(헥산 중 5-10% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 1,1,1,16-테트라페닐-2,5,8,11,15-펜타옥사헥사데칸(4.8g, 50% 수율)을 무색 오일로서 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 1.85-1.92 (m, 2H), 3.23 (t, J = 5.2 Hz, 2H), 3.53-3.59 (m, 6H), 3.64-3.68 (m, 8H), 4.47 (s, 2H), 7.19-7.33 (m, 15H), 7.45-7.47 (m, 5H).
단계 2: 1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-올
Figure pct00146
메틸렌 다이클로라이드(10㎖) 및 메탄올(10㎖) 중 1,1,1,16-테트라페닐-2,5,8,11,15-펜타옥사헥사데칸 (4.8 g 8.8 m㏖)의 용액에 수성 염산(37%, 2.5㎖)을 0℃에서 첨가하였다. 반응 혼합물을 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 물(30㎖)에 붓고, 다이클로로메탄(20㎖×3)으로 추출하였다. 합한 유기 상을 수성 중탄산나트륨(1N, 50㎖), 물(30㎖), 염수로 세척하고 무수 Na2SO4 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 20-40% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-올(1.9g, 73% 수율)을 무색 오일로서 제공하였다.
단계 3: 1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-일 4-메틸벤젠설포네이트
Figure pct00147
다이클로로메탄(20㎖) 중 1-페닐-2,7,10,13-테트라옥사펜타데칸-15-올(1.9g, 6.3 m㏖), 트라이에틸아민(1.3㎖, 9.5 m㏖), N,N-다이메틸피리딘-4-아민(75㎎, 0.63 m㏖) 및 4-메틸벤젠-1-설포닐 클로라이드(1.45g, 7.65 m㏖)의 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 물(20㎖)을 첨가하여 반응을 반응 중지시키고, 생성물을 다이클로로메탄(40㎖ x 3)으로 추출하였다. 합한 유기 상을 염수(50㎖)로 세척하고, 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 증발시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 10-30% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-일 4-메틸벤젠설포네이트(2.2g, 78% 수율)를 무색 오일로서 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 1.87-1.92 (m, 2H), 2.43 (s, 3H), 3.54-3.60 (m, 12H), 3.67 (t, J = 5.2 Hz, 2H), 4.15 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 4.48 (s, 2H), 7.27-7.33 (m, 7H), 7.79 (d, J = 8.4 Hz, 2H).
단계 4: 14-아자이도-1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸
Figure pct00148
에탄올(10㎖) 중 1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-일 4-메틸벤젠설포네이트(2.2g, 4.9 m㏖) 및 아자이드화나트륨(420㎎, 6.3 m㏖)의 혼합물을 5시간 동안 환류시켰다. 이 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(10㎖)에 붓고, 다이클로로메탄(50㎖ x 3)으로 추출하였다. 합한 유기층을 염수(50㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 14-아자이도-1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸(1.4g, 조질물)을 무색 오일로서 제공하였으며, 이것은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다.
단계 5: tert-부틸 (1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-일)카바메이트
Figure pct00149
테트라하이드로퓨란(15㎖) 및 물(0.5㎖) 중 상기 14-아자이도-1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸(1.4g, 조질물) 및 트라이페닐포스핀(1.7g, 6.5 m㏖)의 혼합물을 실온에서 하룻밤 질소 분위기 하에 교반하였다. 반응 혼합물에 트라이에틸아민(0.9㎖, 6.5 m㏖) 및 다이-tert-부틸 다이카보네이트(1.1g, 5.2 m㏖)를 0℃에서 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 실온까지 가온시키고, 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 휘발성 물질을 감압 하에 증발시키고, 잔사를 다이클로로메탄(100㎖)과 물(50㎖) 간에 분배시켰다. 유기 상을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 크로마토그래피(헥산 중 30-50% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 (1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-일)카바메이트(1.2g, 2 단계에 걸쳐서 50% 수율)를 무색 오일로서 제공하였다.
단계 6: tert-부틸 2-(2-(2-(3-하이드록시프로폭시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트
Figure pct00150
에탄올(50㎖) 중 tert-부틸 (1-페닐-2,6,9,12-테트라옥사테트라데칸-14-일)카바메이트(1.2g, 3 m㏖) 및 탄소 상의 팔라듐(10%, 200 mg)의 혼합물을 실온에서 수소 분위기(수소 풍선) 하에 교반하였다. 탄소 상의 팔라듐을 여과에 의해 제거하고, 에탄올(20㎖)로 세척하였다. 여과액을 감압 하에 농축시켜 tert-부틸 2-(2-(2-(3-하이드록시프로폭시)에톡시)에톡시)에틸카바메이트(900㎎, 조질물)를 무색 오일로서 제공하였으며, 이것은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다.
단계 7: 2,2-다이메틸-4-옥소-3,8,11,14-테트라옥사-5-아자헵타데칸-17-일 4-메틸벤젠설포네이트
Figure pct00151
무수 다이클로로메탄(15㎖) 중 상기 tert-부틸 2-(2-(2-(3-하이드록시프로폭시)에톡시)에톡시) 에틸카바메이트(900㎎, 조질물), 트라이에틸아민(0.6㎖, 4.35 m㏖), N,N-다이메틸피리딘-4-아민(16㎎, 0.14 m㏖) 및 4-메틸벤젠-1-설포닐 클로라이드(660㎎, 3.5 m㏖)의 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하였다. 물(20㎖)을 첨가하여 반응을 중지시키고, 생성물을 다이클로로메탄(50㎖ x 3)으로 추출하였다. 합한 유기 상을 염수(50㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 증발시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 20-30% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 2,2-다이메틸-4-옥소-3,8,11,14-테트라옥사-5-아자헵타데칸-17-일 4-메틸벤젠설포네이트(650㎎, 77% 수율)를 밝은 황색 오이롤서 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 1.44 (s, 9H), 1.88-1.95 (m, 2H), 2.45 (s, 3H), 3.29-3.33 (m, 2H), 3.48-3.61 (m, 12H), 4.09-4.15 (m, 2H), 5.04 (brs, 1H), 7.34 (d, J = 8.0 Hz, 2H), 7.79 (d, J = 8.0 Hz, 2H).
단계 8: tert-부틸 (2-(2-(2-(3-(4-(3-(4-사이아노-3-(트라이플루오로메틸)페닐)-5,5-다이메틸-4-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)페녹시)프로폭시)에톡시)에톡시)에틸)카바메이트
Figure pct00152
아세토나이트릴(5㎖) 중 2,2-다이메틸-4-옥소-3,8,11,14-테트라옥사-5-아자헵타데칸-17-일 4-메틸벤젠설포네이트(115㎎, 0.25 m㏖), 탄산칼륨(69㎎, 0.50 m㏖) 및 4-(3-(4-하이드록시페닐)-4,4-다이메틸-5-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)-2-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(100㎎, 0.25 m㏖)의 혼합물을 80℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(30㎖)로 반응 중지시키고, 에틸 아세테이트(30㎖ x 3)로 추출하였다. 합한 유기 상을 물(30㎖) 및 염수(30㎖)로 세척하고, 황산마그네슘 위에서 건조시키고, 감압 하에 증발시켰다. 조질의 잔사를 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 10-30% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 2-(2-(2-(3-(4-(3-(4-사이아노-3-(트라이플루오로메틸)페닐)-5,5-다이메틸-4-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)페녹시)프로폭시)에톡시)에톡시) 에틸카바메이트(150㎎, 82% 수율)를 황색 오일로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 695.40 [MH+], tR = 2.79분.
단계 9: 4-(3-(4-(3-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에톡시)프로폭시)페닐)-4,4-다이메틸-5-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)-2-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴
Figure pct00153
무수 다이클로로메탄(2㎖) 및 2,2,2-트라이플루오로아세트산(1㎖) 중 tert-부틸 2-(2-(2-(3-(4-(3-(4-사이아노-3-(트라이플루오로메틸)페닐)-5,5-다이메틸-4-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)페녹시)프로폭시)에톡시)에톡시) 에틸카바메이트(150㎎, 0.21 m㏖)의 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 휘발성 물질을 감압 하에 증발시키고, 잔사를 수성 중탄산나트륨(1N, 20㎖)에 붓고, 다이클로로메탄(50㎖ x 3)으로 추출하였다. 합한 유기 상을 염수(50㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 4-(3-(4-(3-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에톡시)프로폭시)페닐)-4,4-다이메틸-5-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)-2-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(115㎎, 조질물)을 갈색 오일로서 제공하였으며, 이것은 추가의 정제 없이 다음 단계에서 사용되었다.
단계 10: 4-(3-(4-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일)아미노)에톡시)에톡시)에톡시)프로폭시)페닐)-4,4-다이메틸-5-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)-2-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴
Figure pct00154
N,N-다이메틸폼아마이드(2㎖) 중 상기 4-(3-(4-(3-(2-(2-(2-아미노에톡시)에톡시)에톡시) 프로폭시)페닐)-4,4-다이메틸-5-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)-2-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(115㎎, 조질물), 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온(41㎎, 0.15 m㏖) 및 N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(58㎎, 0.44 m㏖)의 혼합물을 90℃에서 16시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 실온까지 냉각시키고, 물(3㎖)로 반응 중지시키고, 에틸 아세테이트(30㎖ x 3)로 추출하였다. 합한 유기층을 물(30㎖ x 2) 및 염수(20㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켰다. 조질의 잔사를 분취-TLC에 의해 정제시켜 4-(3-(4-(3-(2-(2-(2-((2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일)아미노)에톡시)에톡시)에톡시)프로폭시)페닐)-4,4-다이메틸-5-옥소-2-티옥소이미다졸리딘-1-일)-2-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴(34.5㎎, 27% 수율)을 황색 고체로서 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 851.25 [MH+], tR = 2.652분.1H NMR (400 MHz, CD3OD): δ 1.57 (s, 6H), 2.07-2.11 (m, 3H), 2.70-2.90 (m, 3H), 3.46-3.72 (m, 14H), 4.10 (t, J = 6.2 Hz, 2H), 4.88-4.92 (m, 1H), 6.48-6.49 (m, 1H), 6.91-7.26 (m, 6H), 7.49 (t, J = 7.8 Hz, 1H), 7.83-7.85(m, 1H), 7.97-8.02 (m, 3H).
11. 4-{[5-(3-{[2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소 -2,3- 다이하이드로 -1H-아 이소 인돌-4-일]아미노} 프로폭시 ) 펜틸 ] 옥시 }-N-[트랜스-3-(3- 클로로 -4- 사이아노페녹시 )-2,2,4,4- 테트라메틸사이클로부틸 ] 벤즈아마이드
Figure pct00155
단계 1: 3-[(5-하이드록시펜틸)옥시]프로판나이트릴
Figure pct00156
펜탄-1,5-다이올(2.98g, 28.6 m㏖)을 THF(50㎖) 중 수소화나트륨(광유 중 60% 분산액, 820㎎, 34.2 m㏖)의 현탁액에 첨가하였다. 이 혼합물을 실온에서 20분 동안 교반한 후, 0℃까지 냉각시키고, 아크릴로나이트릴(1.20g, 22.8 m㏖)을 적가하였다. 얻어진 혼합물을 실온에서 10시간 동안 교반하였다. 용매의 일부를 진공 하에 제거하고, 잔사를 물에 부었다. 이 혼합물을 DCM(3x)으로 추출하였다. 유기 층을 바이오타지 유니버셜 페이지 세퍼레이터(Biotage Universal Phase Separator)를 통해 여과시키고 진공 중 농축시켰다. 조질의 물질을 MeOH/DCM(0:100 내지 3:97)으로 용리시키는 텔레다인 콤비플래시(Teledyne Combiflash) ISCO 상에서의 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 3-[(5-하이드록시펜틸)옥시]프로판나이트릴(635㎎, 18% 수율)을 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 3.60-3.73 (m, 4H), 3.45-3.55 (m, 2H), 2.60 (dt, J = 4.1, 6.4 Hz, 2H), 2.06 (d, J = 3.9 Hz, 1H), 1.57-1.69 (m, 4H), 1.43-1.50 (m, 2H).
단계 2: tert-부틸 N-{3-[(5-하이드록시펜틸)옥시]프로필}카바메이트
Figure pct00157
MeOH(12㎖) 및 H2O(2.0㎖) 중 3-[(5-하이드록시펜틸)옥시]프로판나이트릴(400㎎, 2.54 m㏖)의 용액에 염화니켈(II)(393㎎, 3.04 m㏖)를 첨가하고 나서, 수소화붕소나트륨(360㎎, 9.52 m㏖)을 나누어서 첨가하였다. 이 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하고 나서, MeOH(12㎖)로 반응 중지시켰다. 이 혼합물을 셀라이트를 통해서 여과시키고, MeOH로 세척하였다. 여과액을 진공 중 농축시켰다. THF(5㎖) 중 상기 조질의 생성물의 용액에 6M 수성 NaOH(0.5㎖) 및 다이-tert-부틸 다이카보네이트(831㎎, 3.81 m㏖)를 첨가하였다, 얻어진 혼합물을 실온에서 3시간 동안 교반하고, 이어서 진공 중 농축시켰다. 조질의 물질을 MeOH/DCM(0:100 내지 4:96)으로 용리시키는 텔레다인 콤비플래시 ISCO 상에서의 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 tert-부틸 N-{3-[(5-하이드록시펜틸)옥시]프로필}카바메이트(366㎎, 55% 수율)를 제공하였다.
1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 4.91 (br. s., 1H), 3.66 (br. s., 2H), 3.49 (t, J = 5.9 Hz, 2H), 3.43 (t, J = 6.3 Hz, 2H), 3.24 (q, J = 5.9 Hz, 2H), 1.75 (quin, J = 6.2 Hz, 2H), 1.57-1.65 (m, 5H), 1.41-1.52 (m, 11H).
단계 3: tert-부틸 N-[3-({5-[(4-메틸벤젠설포닐)옥시]펜틸}옥시)프로필]카바메이트
Figure pct00158
DCM(10㎖) 중 tert-부틸 (3-((5-하이드록시펜틸)옥시)프로필)카바메이트(300㎎, 3.88 m㏖)의 용액에 DIPEA(599.3㎕, 3.44 m㏖), 토실 클로라이드(262.3㎎, 1.38 m㏖) 및 4-다이메틸아미노피리딘(14.0㎎, 0.115 m㏖)을 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 실온에서 20시간 동안 교반하였다. 반응을 반-포화된 중탄산나트륨으로 중지시키고, DCM(2x)으로 추출하고, 바이오타지 유니버셜 페이지 세퍼레이터를 통해 여과시키고, 진공 중 농축시켰다. 조질의 물질을 EtOAc/헵탄(0:100 내지 30:70)으로 용리시키는 텔레다인 콤비플래시 ISCO 상에서의 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 tert-부틸 N-[3-({5-[(4-메틸벤젠설포닐)옥시]펜틸}옥시)프로필]카바메이트(914㎎, 26% 수율)를 제공하였다. 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.78 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.34 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 4.02 (t, J = 6.5 Hz, 2H), 3.44 (t, J = 6.1 Hz, 2H), 3.35 (t, J = 6.3 Hz, 2H), 3.19 (q, J = 5.9 Hz, 2H), 2.44 (s, 3H), 1.64-1.74 (m, 5H), 1.49-1.54 (m, 2H), 1.42 (s, 9H), 1.33-1.40 (m, 2H). LC-MS (ES+): m/z 438.19 [MNa+], t R = 2.65분.
단계 4: 메틸 4-{[5-(3-{[(tert-부톡시)카보닐]아미노}프로폭시)펜틸]옥시}벤조에이트
Figure pct00159
MeCN(10㎖) 중 tert-부틸 N-[3-({5-[(4-메틸벤젠설포닐)옥시]펜틸}옥시)프로필]카바메이트(340㎎, 0.82 m㏖), 메틸 4-하이드록시벤조에이트(117㎎, 0.77 m㏖), 탄산칼륨(203㎎, 1.47 m㏖)의 혼합물을 80℃에서 24시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 EtOAc로 희석시키고, 반-포화된 중탄산나트륨 용액(1x), 물(2x), 염수(1x)로 세척하고, 이어서 바이오타지 유니버셜 페이지 세퍼레이터를 통해 여과시켰다. 여과액을 진공 중 농축시키고, 잔사를 EtOAc/헵탄(0:100 내지 50:50)으로 용리시키는 텔레다인 콤비플래시 ISCO 상에서의 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 메틸 4-{[5-(3-{[(tert-부톡시)카보닐]아미노}프로폭시)펜틸]옥시}벤조에이트(300㎎, 93% 수율)를 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 418.21 [MNa+], t R = 2.74분.
단계 5: 4-{[5-(3-{[(tert-부톡시)카보닐]아미노}프로폭시)펜틸]옥시}벤조산
Figure pct00160
1:1:1 THF/물/MeOH(6.0㎖, v/v/v) 중 4-{[5-(3-{[(tert-부톡시)카보닐]아미노}프로폭시)펜틸]옥시}벤조에이트(150㎎, 0.38 m㏖)의 용액에 수산화리튬(81.6㎎, 3.41 m㏖)을 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 하룻밤 실온에서 교반하고, 이어서 6N 수성 HCl을 이용해서 pH 2 내지 3으로 산성화시켰다. 이 혼합물을 진공 중 농축시켜 대부분의 용매를 제거하고, 이어서 EtOAc로 희석시키고, 물(2 x), 염수(2 x)로 세척하고, 바이오타지 유니버셜 페이지 세퍼레이터를 통해 여과시키고, 진공 중 농축시켰다. 조질의 생성물은 추가의 정제 없이 다음 단계 상에서 수행되었다(123㎎). LC-MS (ES+): m/z 404.20 [MNa+], t R = 2.40분.
단계 6: tert-부틸 N-(3-{[5-(4-{[트랜스-3-(3-클로로-4-사이아노페녹시)-2,2,4,4-테트라메틸사이클로부틸]카바모일}페녹시)펜틸]옥시}프로필)카바메이트
Figure pct00161
DMF(5㎖) 중 4-{[5-(3-{[(tert-부톡시)카보닐]아미노}프로폭시)펜틸]옥시}벤조산(124㎎, 0.322 m㏖), 2-클로로-4-(트랜스-3-아미노-2,2,4,4-테트라메틸사이클로부톡시)벤조나이트릴(89.8㎎, 0.322 m㏖)의 용액에 DIPEA(112㎕, 0.65 m㏖) 및 TBTU(155㎎, 0.48 m㏖)를 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반시키고, 이어서 EtOAc로 희석시키고, 물(3 x), 염수(1 x)로 세척하고, 바이오타지 유니버셜 페이지 세퍼레이터를 통해서 여과시키고, 진공 중 농축시켰다. 잔사를 MeOH/DCM(0:100 내지 5:95)으로 용리시키는 텔레다인 콤비플래시 ISCO 상에서의 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 tert-부틸 N-(3-{[5-(4-{[트랜스-3-(3-클로로-4-사이아노페녹시)-2,2,4,4-테트라메틸사이클로부틸] 카바모일}페녹시)펜틸]옥시}프로필)카바메이트(169㎎, 82% 수율)를 제공하였다. LC-MS (ES+): m/z 643.32/645.31 (3:1) [MH+], t R = 3.04분.
12. 4-{[5-(3- 아미노프로폭시 ) 펜틸 ] 옥시 }-N-[트랜스-3-(3- 클로로 -4- 사이아노페녹시 )-2,2,4,4- 테트라메틸사이클로부틸 ] 벤즈아마이드
Figure pct00162
DCM(5㎖) 중 tert-부틸 N-(3-{[5-(4-{[트랜스-3-(3-클로로-4-사이아노페녹시)-2,2,4,4-테트라메틸사이클로부틸]카바모일}페녹시)펜틸]옥시}프로필)카바메이트(124㎎, 0.192 m㏖)의 용액에 트라이플루오로아세트산(372㎕, 4.86 m㏖)을 첨가하고 완료될 때까지 45℃에서 1시간 동안 가열하였다. 이어서 이 반응물을 진공 중 고체로 농축시키고, 추가의 정제 없이 다음 단계 상에서 수행되었다(104㎎, 99% 수율). LC-MS (ES+): m/z 543.27/545.26 (3:1) [MH+], t R = 2.26분.
13. 4-{[5-(3-{[2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소 -2,3- 다이하이드로 -1H-아 이소인 돌-4-일]아미노} 프로폭시 ) 펜틸 ] 옥시 }-N-[트랜스-3-(3- 클로로 -4- 사이아노페녹시 )-2,2,4,4- 테트라메틸사이클로부틸 ] 벤즈아마이드
Figure pct00163
(표 1에 나타낸 화합물 구조 #11)
1,4-다이옥산(2㎖) 중 4-{[5-(3-아미노프로폭시)펜틸]옥시}-N-[트랜스-3-(3-클로로-4-사이아노페녹시)-2,2,4,4-테트라메틸사이클로부틸]벤즈아마이드(30.0㎎, 0.0553 m㏖)의 용액에 다이아이소프로필에틸아민(384㎕, 2.21 m㏖), 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-1,3-다이온(18.3㎎, 0.0664 m㏖)을 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 16시간 동안 환류시키고, 이어서 EtOAc로 희석시키고, 반-포화된 염수 용액(2 x)으로 세척하고, 바이오타지 유니버셜 페이지 세퍼레이터를 통해서 여과시키고, 진공 중 농축시켰다. 잔사를 MeOH/DCM(0:100 내지 7:93)로 용리시키는 텔레다인 콤비플래시 ISCO 상에서의 실리카겔 크로마토그래피에 의해 정제시켜 4-{[5-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)펜틸]옥시}-N-[트랜스-3-(3-클로로-4-사이아노페녹시)-2,2,4,4-테트라메틸사이클로부틸]벤즈아마이드(12㎎, 28% 수율)를 수득하였다. LC-MS (ES+): m/z 799.31/801.31 (3:1) [MH+], t R = 2.97분.1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 8.03 (s, 1H), 7.72 (d, J = 9.0 Hz, 2H), 7.58 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 7.48 (dd, J = 7.2, 8.4 Hz, 1H), 7.07 (d, J = 7.0 Hz, 1H), 6.98 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 6.89-6.96 (m, 3H), 6.82 (dd, J = 2.5, 8.8 Hz, 1H), 6.18 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 4.89 (dd, J = 5.1, 12.1 Hz, 1H), 4.16 (d, J = 7.8 Hz, 1H), 4.06 (s, 1H), 4.02 (t, J = 6.7 Hz, 2H), 3.56 (t, J = 5.9 Hz, 2H), 3.50 (s, 2H), 3.46-3.48 (m, 1H), 3.41 (t, J = 6.5 Hz, 2H), 2.82-2.90 (m, 1H), 2.76-2.81 (m, 1H), 2.67-2.75 (m, 1H), 2.07-2.14 (m, 1H), 1.94 (quin, J = 6.1 Hz, 2H), 1.82-1.87 (m, 2H), 1.67-1.73 (m, 2H), 1.53-1.59 (m, 2H), 1.28 (s, 6H), 1.20-1.25 (m, 6H).
14. 2-[(9S)-7-(4- 클로로페닐 )-4,5,13- 트라이메틸 -3- 티아 -1,8,11,12-테 트라아자트라이사이클로[8.3.0.0 2 , 6 ] 트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[5-(3-{[2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소 -2,3-다 이하이드로 -1H-아이소인돌-4-일]아미노} 프로폭시 )피리미딘-2-일] 페닐 }에틸] 아세트아마이드 라고도 지칭되는 2-(( S )-4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)-N-((1 S )-1-(4-(5-(3-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸)아세트아마이드
Figure pct00164
(화합물 # 40, 표 1)
화합물 40은 이하의 예시적인 반응식에 의해 제조될 수 있다:
Figure pct00165
단계 1: (S)-tert-부틸 1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-다이옥사보롤란-2-일)페닐)에틸카바메이트의 제조
Figure pct00166
다이옥산(50㎖) 중 (S)-tert-부틸 1-(4-브로모페닐)에틸카바메이트(6g, 20.0 m㏖), 4,4,4',4',5,5,5',5'-옥타메틸-2,2'-바이(1,3,2-다이옥사보롤란)(7.6g, 29.9 m㏖) 및 아세트산칼륨(5.9㎎, 60.1 m㏖)의 교반된 용액에 [1,1'-비스(다이페닐포스피노)페로센 다이클로로팔라듐(II)(440㎎, 0.60 m㏖)을 실온에서 질소 분위기 하에 첨가하였다. 이 혼합물을 탈기시키고, 질소로 3회 재충전시켰다. 얻어진 혼합물을 90℃에서 하룻밤 교반하였다. 실온까지 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(100㎖)와 물(50㎖) 간에 분배시켰다. 수성 층을 분액시키고, 에틸 아세테이트(50㎖ x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 염수(100㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 5-10% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 (S)-tert-부틸 1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-다이옥사보롤란-2-일)페닐)에틸카바메이트(7.4g, 수율 98%)를 황색 오일로서 제공하였다. LC/MS (ES+): m/z 370.0 [M+Na+]; tR = 3.165분; 1HNMR (400MHz, CDCl3): δ 1.26 (s, 12H), 1.34 (s, 12H), 4.78 (br, 1H), 7.30 (d, J = 7.6 Hz, 2H), 7.78 (d, J = 8.0 Hz, 2H); 화학식: C19H30BNO4; 분자량: 347.26
단계 2: 벤질 3- 하이드록시프로필카바메이트의 제조
Figure pct00167
물(50㎖)과 테트라하이드로퓨란(100㎖)의 혼합물 중 3-아미노프로판-1-올(20g, 266m㏖) 및 탄산칼륨(73g, 529 m㏖) 의 교반된 용액에 벤질클로로폼에이트(68g, 398 m㏖)를 0℃에서 첨가하였다. 이 혼합물을 실온까지 가온시키고, 실온에서 하룻밤 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(200㎖)와 물(100㎖) 간에 분배시켰다. 유기 층을 수집하고, 염수(100㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 20-50% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 벤질 3-하이드록시프로필카바메이트(26.9g, 수율 52%)를 무색 오일로서 제공하였다. LC/MS (ES+): m/z 232.1 [M+Na+]; tR = 1.697분; 1HNMR (400MHz, CDCl3): δ 1.67-1.73 (m, 2H), 2.56 (t, J = 5.8 Hz, 1H), 3.33-3.38 (m, 2H), 3.65-3.70 (m, 2H), 5.06 (br, 1H), 5.11 (s, 2H), 7.29-7.36 (m, 5H); 화학식: C11H15NO3; 분자량: 209.24
단계 3: 3-( 벤질옥시카보닐아미노 )프로필 4- 메틸벤젠설포네이트의 제조
Figure pct00168
피리딘(40㎖) 중 벤질 3-하이드록시프로필카바메이트(26.9g, 128.6 m㏖)의 교반된 용액에 4-톨루엔설포닐 클로라이드(73g, 384 m㏖)를 0℃에서 첨가하였다. 이 혼합물을 실온까지 가온시키고, 실온에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(120㎖)와 물(80㎖) 간에 분배시켰다. 유기 층을 수집하고, 염산(1N, 480㎖) 및 염수(100㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 10-20% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 3-(벤질옥시카보닐아미노)프로필 4-메틸벤젠설포네이트(38.5g, 수율 82%)를 황색 오일로서 제공하였다. LC/MS (ES+): m/z 386.2 [M+Na+]; tR = 2.582분; 1HNMR (400MHz, CDCl3): δ 1.85-1.91 (m, 2H), 2.43 (s, 3H), 3.25 (m, 2H), 4.09 (t, J = 6.0 Hz, 2H), 4.83 (br, 1H), 5.07 (s, 2H), 7.26-7.39 (m, 7H), 7.78 (d, J = 8.4 Hz, 2H); 화학식: C18H21NO5S; 분자량: 363.43
단계 4: 2- 브로모피리미딘 -5-올의 제조
Figure pct00169
무수 다이클로로메탄(60㎖) 중 2-클로로-5-메톡시피리미딘 10g, 69.1 m㏖)의 교반된 용액에 -78에서 다이클로로메탄(100㎖) 중 삼브로민화붕소(34.7g, 138.5 m㏖)이 용액을 첨가하였다. 이 혼합물을 실온까지 가온시키고, 실온에서 하룻밤 교반하였다. 반응은 메탄올(80㎖)을 -78℃에서 적가하여 중지시켰다. 용매를 감압 하에 제거하여 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(무수 다이클로로메탄 중 2-5% 메탄올로 용리)에 의해 정제시켜 2-브로모피리미딘-5-올(6.5g, 수율 54%)을 황색 고체로서 제공하였다. 1HNMR (400MHz, DMSO-d6): δ 8.26(s, 2H), 8.49 (s, 1H); 화학식: C4H3BrN2O; 분자량: 174.98
단계 5: 벤질 3-(2- 브로모피리미딘 -5- 일옥시 ) 프로필카바메이트의 제조
Figure pct00170
N,N-다이메틸폼아마이드(30㎖) 중 2-브로모피리미딘-5-올(5g, 38.3m㏖), 3-(벤질옥시카보닐아미노)프로필 4-메틸벤젠설포네이트(13.9g, 38.2 m㏖) 및 탄산칼륨(10.6g, 76.8 m㏖)의 혼합물을 80℃에서 하룻밤 교반하였다. 실온까지 냉각시킨 후, 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(50㎖)와 물(30㎖) 간에 분배시켰다. 수성 층을 분액시키고, 에틸 아세테이트(50㎖ x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 염수(80㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 20-40% 에틸 아세테이트로 용리됨)에 의해 정제시켜 벤질 3-(2-브로모피리미딘-5-일옥시)프로필카바메이트(2.4g, 수율 23%)를 무색 오일로서 제공하였다. LC/MS (ES+): Br81에 대해서 m/z 367.9 [M+1]; tR = 2.375분; 1HNMR (400MHz, CDCl3): δ 2.04-2.08 (m, 2H), 3.39-3.43 (m, 2H), 4.08-4.13 (m, 2H), 5.09 (s, 2H), 7.34-7.36 (m, 5H), 8.22 (s, 2H); 화학식: C15H16BrN3O3; 분자량: 366.21
단계 6: tert -부틸 ( S )-(1-(4-(5-(3-((( 벤질옥시 ) 카보닐 )아미노) 프로폭시 )피리미딘-2-일) 페닐 )에틸) 카바메이트의 제조
Figure pct00171
N,N-다이메틸폼아마이드(30㎖) 및 물(5㎖) 중 벤질 3-(2-브로모피리미딘-5-일옥시)프로필카바메이트(2.4g, 6.6m㏖), (S)-tert-부틸 1-(4-(4,4,5,5-테트라메틸-1,3,2-다이옥사보롤란-2-일)페닐)에틸카바메이트(2.3g, 6.6 m㏖) 및 제3인산칼륨 삼수화물(3.5g, 13.3m㏖)의 교반된 용액에 비스(트라이페닐포스핀)팔라듐(II) 클로라이드(766㎎, 0.66 m㏖)를 실온에서 질소 분위기 하에 첨가하였다. 이 혼합물을 탈기시키고, 질소로 3회 재충전시켰다. 얻어진 혼합물을 80℃에서 4시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(70㎖)와 물(30㎖) 간에 분배시켰다. 유기 층을 수집하고, 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 실리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(헥산 중 10-50% 에틸 아세테이트로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 (S)-(1-(4-(5-(3-(((벤질옥시)카보닐)아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸)카바메이트(2.2g, 수율 67%)를 백색 고체로서 제공하였다. LC/MS (ES+): m/z 507.5 [M+H+]; tR = 2.841분; 화학식: C28H34N4O5; 분자량: 506.59
단계 7: tert -부틸 (1 S )-1-(4-(5-(3-(2-(2,6- 다이옥소피페리딘 -3-일)-1,3- 다이옥소아이소인돌린 -4- 일아미노 ) 프로폭시 )피리미딘-2-일) 페닐 ) 에틸카바메이트의 제조
Figure pct00172
메탄올(5㎖) 중 tert-부틸 (S)-(1-(4-(5-(3-(((벤질옥시)카보닐)아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸)카바메이트(2.2g, 4.4 m㏖) 및 탄소 상 수산화팔라듐(10%, 200 mg)의 혼합물을 실온에서 수소 분위기(수소 풍선) 하에 하룻밤 교반하였다. 촉매를 여과를 통해서 제거하고 메탄올(50㎖)로 세척하고, 합한 여과액을 감압 하에 농축시켰다. 잔사를 1-메틸-2-피롤리디논(20㎖)에 재용해시키고 나서, 2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-4-플루오로아이소인돌린-1,3-다이온(1.2g, 4.3 m㏖) 및 N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(2.3g, 17.4 m㏖)을 순차로 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 80℃에서 2시간 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(30㎖)와 물(15㎖) 간에 분배시켰다. 수성 층을 분액시키고, 에틸 아세테이트(25㎖ x 2)로 추출하였다. 합한 유기 층을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 리카겔 플래시 칼럼 크로마토그래피(다이클로로메탄 중 1-2% 메탄올로 용리)에 의해 정제시켜 tert-부틸 (1S)-1-(4-(5-(3-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸카바메이트(710㎎, 수율 26%)를 황색 오일로서 제공하였다. LC/MS (ES+): m/z 629.3 [M+H+]; tR = 2.660분; 1HNMR (400MHz, CDCl3): δ 1.42-1.48(m, 12H), 2.04-2.07 (m, 2H), 2.11-2.26 (m, 4H), 3.54-3.59 (m, 2H), 4.24-4.26 (m, 2H), 4.90-4.94 (m, 1H), 6.50-6.53 (m, 1H), 6.93-6.95 (m, 1H), 7.11-7.12 (m, 1H), 7.39-7.41 (m, 2H), 7.43-7.48 (m, 3H), 8.08 (br, 1H), 8.28-8.32 (m, 2H), 8.51 (s, 2H); 화학식: C33H36N6O7; 분자량: 628.67;
단계 8: 2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[5-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)피리미딘-2-일]페닐}에틸]아세트아마이드로도 알려진 2-((S)-4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)-N-((1S)-1-(4-(5-(3-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸)아세트아마이드의 제조
Figure pct00173
다이클로로메탄(7㎖) 중 tert-부틸 (1S)-1-(4-(5-(3-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸카바메이트(710㎎, 1.1 m㏖) 및 2,2,2-트라이플루오로아세트산(7㎖)의 혼합물을 실온에서 1시간 동안 교반하였다. 휘발성 물질을 감압 하에 증발시켰다. 잔사를 건조 N,N-다이메틸폼아마이드(10㎖)에 재용해시키고 나서, (S)-2-(4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)아세트산(407㎎, 1.0 m㏖), N-에틸-N-아이소프로필프로판-2-아민(730㎎, 5.6 m㏖), 및 HATU(2-(7-아자-1H-벤조트라이아졸-1-일)-1,1,3,3-테트라메틸우로늄 헥사플루오로포스페이트)(1.3g, 3.3 m㏖)를 0℃에서 순차로 첨가하였다. 얻어진 혼합물을 실온까지 가온시키고 실온에서 30분 동안 교반하였다. 반응 혼합물을 에틸 아세테이트(40㎖)와 물(20㎖) 간에 분배시켰다. 수성 층을 분액시키고, 에틸 아세테이트(25㎖ x 2)로 추출하였다. 합한 유기층을 염수(30㎖)로 세척하고, 무수 황산나트륨 위에서 건조시키고, 감압 하에 농축시켜 조질의 잔사를 제공하였으며, 이것을 분취용 TLC(다이클로로메탄 중 7% 메탄올로 용리)에 의해 정제시켜 2-((S)-4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)-N-((1S)-1-(4-(5-(3-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)프로폭시)피리미딘-2-일)페닐)에틸)아세트아마이드(160㎎, 2 단계 후 15.5% 수율)를 황색 고체로서 제공하였다. LC/MS (ES+): m/z 911.3 [M+H+]; tR = 2.666분; 1HNMR (400MHz, CDCl3): δ 1.58 (d, J = 6.8 Hz, 3H), 1.66 (s, 3H), 1.94-2.01 (m, 1H), 2.11-2.14 (m, 1H), 2.22-2.23 (m, 2H), 2.38 (s, 3H), 2.66 (s, 3H), 2.75-2.90 (m, 2H), 3.38-3.43 (m, 1H), 3.55-3.62 (m, 3H), 4.24-4.26 (m, 2H), 4.58-4.61 (m, 1H), 4.89-4.93 (m, 1H), 5.18-5.22 (m, 1H), 6.48-6.55 (m, 1H), 6.89-6.94 (m, 2H), 7.10-7.12 (m, 1H), 7.32-7.41 (m, 6H), 7.50 (t, J = 7.6 Hz, 1H), 8.26-8.28 (m, 3H), 8.51 (s, 2H); 화학식: C47H43ClN10O6S; 분자량: 911.43
C. 단백질 분해 생물학적 검정:
본 명세서에서 개시된 대표적인 화합물을 이용하여 다양한 세포 유형에서 관찰된 단백질 분해의 수준을 평가하기 위하여 다음의 생물학적 검정이 수행되었다.
각 생물학적 검정에서, 세포는, 표 1에 나타낸 바와 같이, 본 개시내용에 의해 포괄된 다양한 양의 화합물로 처리되었다. 다음의 단백질의 분해가 본 연구에서 평가되었다: TANK-결합 키나제 1(TBK1), 에스트로겐 수용체 α(ERα), 브로모도메인-함유 단백질 4(BRD4), 안드로겐 수용체(AR) 및 c-Myc.
1. TBK1 웨스턴 프로토콜
Panc02.13 세포는 ATCC로부터 구입하였고, 15% FBS(ATCC) 및 10 단위/㎖ 인간 재조합 인슐린(깁코사(Gibco))으로 보충된 RPMI-1640(깁코사)에서 배양하였다. DMSO 대조 및 화합물 처리(0.1μM, 0.3μM, 그리고 1μM)는 12-웰 평판에서 16 시간 동안 수행되었다. TLR3 작용제 폴리 I:C(인비트로젠사; tlrl-pic)를 최종 3시간 동안 첨가하였다. 세포를 수확하고, 그리고 프로테아제 저해제 및 포스파타제 저해제로 보충된 RIPA 완충액(50mM Tris pH8, 150mM NaCl, 1% Tx-100, 0.1% SDS, 0.5% 데옥시콜산 나트륨)에 용해시켰다. 용해물은 16,000g에서 10분 동안 투명해졌고, 상청액을 SDS-PAGE에 의해 분리시켰다. 면역블롯팅은 표준 프로토콜을 이용하여 수행하였다. 이용된 항체는 TBK1(셀 시그널링(Cell Signaling) #3504), pIRF3(abcam #ab76493) 및 GAPDH(셀 시그널링 #5174)였다. 밴드는 바이오라드 케미독(Biorad ChemiDoc) MP 영상화 시스템을 이용하여 정량화되었다.
2. ERRα 웨스턴 프로토콜
나말와 세포(ATCC)는 15% FBS(라이프 테크놀로지즈사(Life Technologies))로 보충된 RPMI-1640(라이프 테크놀로지즈사)에서 배양하였다. DMSO 대조 및 화합물 배양(0.1μM, 0.3μM, 그리고 1μM)은 24-웰 평판에서 16시간 동안 수행하였다. 세포를 수확하고, 그리고 단백질분해효소 저해제(써모 사이언티픽사(Thermo Scientific))를 함유하는 세포 용해 완충액(셀 시그널링 테크놀로지즈사(Cell Signaling Technologies))으로 용해시켰다. 용해물은 16,000g에서 10분 동안 투명해졌고, 그리고 상청액을 SDS-PAGE에 의해 분리시켰다. 면역블롯팅은 표준 프로토콜을 이용하여 수행하였다. 이용된 항체는 ERRα (Cell Signaling #8644), 및 GAPDH(Cell Signaling #5174)였다. 밴드는 바이오-라드 케미독 MP 영상화 시스템을 이용하여 정량화되었다.
3. BRD4 웨스턴 프로토콜
VCaP 세포는 ATCC로부터 구입하였고, 10% FBS(ATCC) 및 페니실린/스트렙토마이신(라이프 테크놀로지즈사)으로 보충된 둘베코의 변형된 이글 배지(ATCC)에서 배양하였다. DMSO 대조 및 화합물 처리(0.003μM, 0.01μM, 0.03μM 및 0.1μM)는 12-웰 평판에서 16시간 동안 수행하였다. 세포를 수확하고, 그리고 프로테아제 저해제 및 포스파타제 저해제로 보충된 RIPA 완충액(50mM Tris pH8, 150mM NaCl, 1% Tx-100, 0.1% SDS, 0.5% 데옥시콜산 나트륨)에 용해시켰다. 용해물은 16,000g에서 10분 동안 투명해졌고, 단백질 농도가 결정되었다. 동등한 양의 단백질(20μg)에 대해서 SDS-PAGE 분석, 그 이후에 표준 프로토콜에 따른 면역블롯팅을 시행하였다. 이용된 항체는 BRD4(셀 시그널링 #13440), 그리고 액틴(시그마 #5441)이었다. 검출 시약은 클래러티 웨스턴 ECL 기질(Clarity Western ECL substrate)(바이오-라드 #170-5060)이었다.
4. AR ELISA 프로토콜
VCaP 세포는 ATCC로부터 구입하였고, 10% FBS(ATCC) 및 페니실린/스트렙토마이신(라이프 테크놀로지즈사)으로 보충된 둘베코의 변형된 이글 배지(ATCC)에서 배양하였다. DMSO 대조 및 화합물 처리(0.0001μM 내지 1μM)는 96-웰 평판에서 16시간 동안 수행하였다. 세포를 수확하고, 세포 용해 완충액(카탈로그# 9803)(20mM Tris-HCL(pH 7.5), 150 mM NaCl, 1mM Na2EDTA, 1mM EGTA, 1% 트리톤(Triton), 2.5 mM 나트륨 피로인산염, 1mM B-글리세로포스페이트, 1mM Na3VO4, 1 ug/㎖ 류펩틴으로 용해시켰다. 용해물은 16,000g에서 10분 동안 투명해졌고, 그리고 PathScan AR ELISA(셀 시그널링 카탈로그#12850) 내로 장입하였다. PathScan® 총 안드로겐 수용체 샌드위치 ELISA 키트는 총 안드로겐 수용체 단백질의 내인성 수준을 검출하는 고체상 샌드위치 효소 결 합 면역흡착 검정(ELISA)이다. 안드로겐 수용체 토끼 mAb를 마이크로웰 위에 코팅하였다. 세포 용해물과 함께 배양 후, 안드로겐 수용체 단백질은 코팅된 항체에 의해 포획한다. 광범위한 세척 이후에, 안드로겐 수용체 마우스 검출 mAb를 포획된 안드로겐 수용체 단백질을 검출하기 위해 첨가한다. 이어서 항-마우스 IgG, HRP-연결된 항체가 결합된 검출 항체를 인식하는데 이용된다. HRP 기질인 TMB를 컬러를 현색시키기 위하여 첨가한다. 현색된 컬러에 대한 흡광도의 크기는 총 안드로겐 수용체 단백질의 양에 비례한다.
키트 내 항체는 키트에 특이적인 맞춤 제형이다.
5. c- Myc ELISA 검정 프로토콜
22RV-1 세포는 ATCC로부터 구입하였고, RPMI +10% FBS 배지에서 배양하였다. 세포는 트립신(깁코사 #25200-114)을 이용하여 수확하고, 계수하고, 그리고 96-웰 평판 내에 RPMI +10% FBS 배지에서 75 ㎕/웰의 용적에서 30,000 세포/웰로 파종하였다. 세포에는 0.1% DMSO에서 희석된 화합물을 투약하고, 18시간 동안 배양하고, 이후 세척하고 프로테아제 저해제 및 포스파타제 저해제로 보충된 50uL RIPA 완충액(50mM Tris pH8, 150mM NaCl, 1% Tx-100, 0.1% SDS, 0.5% 데옥시콜산 나트륨)에 용해시켰다. 용해물은 4000rpm에서 4℃에서 10분 동안 투명해졌고, 이후 분취량을 라이프 테크놀로지즈사의 카탈로그 #KHO2041로부터 노벡스 휴먼(Novex Human) c-myc ELISA 키트의 96-웰 ELISA 평판 내로 첨가하였다. 50㎕의 c-Myc 검출 항체를 모든 웰 내로 첨가하고, 이들 평판은 실온에서 3시간 동안 배양하고, 이후 ELISA 세척 완충액으로 세척하였다. 100㎕의 항-토끼 IgG-HRP 이차 항체를 각 웰에 첨가하고 실온에서 30분 동안 배양하였다. 평판을 ELISA 세척 완충액으로 세척하고, 100㎕ TMB를 각 웰에 첨가하고, 그리고 이후, 5분마다 컬러 변화에 대해 모니터링되었다. 100㎕의 정지액을 첨가하고, 평판을 450㎚에서 판독하였다.
D. 결과
표 1은 본 개시내용에 의해 포괄된 대표적인 번호의 화합물로부터 획득된 실험 데이터의 결과를 제공한다. 특히, 다양한 세포 유형이 표 1에 열거된 화합물로 처리되었는데, 이들은 화학 구조, 질량 분광분석 특징규명, 그리고 화합물 명칭에 의해 확인된다.
표 1은 (A) 10 내지 30% 분해가 1uM의 화합물 1, 6 내지 9, 12 및 17로 처리된 세포에서 달성되었고; (B) 31 내지 50% 분해가 1uM의 화합물 2 내지 5, 10 및 20으로 처리된 세포에서 달성되었으며; 그리고 (C) 50% 초과의 분해가 1uM의 화합물 11, 13 내지 16, 18 내지 19, 21 및 22로 처리된 세포에서 달성되었음을 나타낸다. 표 1은 또한, (D) 화합물 24 및 26 내지 35가 IC50 < 50nM을 갖고, 반면 (E) 화합물 23 및 25가 IC50 > 50nM을 갖는 것을 나타낸다.
실시예 2
소분자 저해제는 종양학 약물 개발의 초석이었으며, 일반적으로 효소 활성을 저해함으로써(예컨대, 키나제 저해제) 또는 단백질-단백질 상호작용을 방해함으로써(예컨대, BRD4 저해제) 작용한다. 대부분의 소분자 억제제의 가역적 결합을 고려하면, 충분한 기능 저해를 보장하기 위하여 커다란 전신 약물 농도가 흔히 요구된다. 또한, 생체내 효능에 요구되는 높은 전신 약물 수준을 달성하고 유지하는 것은 많은 목표에 대해서 힘든 것으로 입증되었다.
브로모도메인 및 가외 말단 도메인(BET) 패밀리의 구성원인 BRD4는 N-말단에서 2개의 브로모도메인(BD 도메인) 및 C-말단에서 가외말단 도메인(ET 도메인)을 특징으로 한다. 2개의 BD 도메인은 히스톤 단백질의 N-말단 후미에서 아세틸화-라이신 잔기를 인식하고 이와 상호 작용한다. ET 도메인은 아직 완전히 특징규명되어 있지 않지만, 다양한 전사 조절자를 동원함에 있어서 비계 기능을 수행하는 것으로 간주된다. BRD4가 c-MYC, Bcl-xL 및 BCL-6과 같은 중요한 종양 유전자의 상류에 종종 존재하는 수퍼 인핸서 영역에 우선적으로 위치되고, 이들의 발현 조절에 중요한 역할을 한다는 여러 연구가 확립되어 있다. BRD4는, 특정 게놈 유전자 좌에 관련된 전사 조절 인자를 동원함으로써 유전자 발현 조절에서의 그의 역할을 기초로, 중심선 암종, 급성 골수성 백혈병(AML), 다발성 골수종(MM), 버킷 림프종(BL) 및 전립선암과 같은 다수의 인간 암을 치료하고/하거나 예방하기 위한 후보 약물 표적이다.
BL을 비롯하여 다양한 암의 소정의 전임상 모델에서 치료적 가능성을 나타낸 JQ1, iBET 및 OTX15와 같은 몇 가지 소분자 BET 브로모도메인 저해제가 개발되었다. 거의 모든 BL 사례는 IgH의 상류에 위치된 슈퍼-인핸서의 제어 하에 그것을 배치하는 c-myc 유전자 전좌를 포함하므로, 비정상적으로 높은 수준의 c-MYC 발현, 종양 발생 및 유지를 유도한다. BRD4 저해제에 의한 전임상 연구는 BL 세포주에서 c-MYC 및 증식을 억제하는 능력을 입증하지만; 그러나 이들 저해제의 IC50값은 흔히 100nM 내지 1μM의 범위이다.
재료 및 방법
이 연구로부터의 실험적 설계 및 절차의 상세는 이하에 제공된다:
1. 화합물
화합물 번호 14(표 1)는 실시예 1, 합성 #8에서 위에서 논의된 절차에 따라서 합성되었다. 이 실시예 전체를 통해서 "A825"로 지칭되는 이 화합물은, 하기 명칭과 구조를 갖는다.
2-((S)-4-(4-클로로페닐)-2,3,9-트라이메틸-6H-티에노[3,2-f][1,2,4]트라이아졸로[4,3-a][1,4]다이아제핀-6-일)-N-(4-(2-(2-(2-(2-(2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소아이소인돌린-4-일아미노)에톡시)에톡시)에톡시)에톡시)페닐)아세트아마이드
Figure pct00174
도 2에 나타낸 바와 같이, A825는 테트라옥사테트라데칸 링커를 통해서 E3 유비퀴틴 리가제 세레블론 동원 모이어티(포말리도마이드의 유도체)에 연결된 BRD4 결합 모이어티(OTX-15의 유도체)를 함유한다.
A825의 세포 효과는 각종 세포주에서 평가되었고, 이들의 효과는 2가지 공지된 BET 도메인 저해제인 JQ1 및 OTX-15에 대해서 비교되었다. JQ1은 공개된 연구에서 가장 빈번하게 사용되는 BET 도메인 저해제이고 OTX-15는 임상 개발의 진보된 단계의 BET 도메인 저해제이다.
A825의 세레블론 동원 모이어티가 또한 각종 세포주에 대해서 평가되었고 포말리도마이드와 비교되었다.
저해제인 JQ1, OTX-15 및 포말리도마이드는 공개된 방법에 따라서 합성되었다.
2. 세포 및 시약
나말와 세포, 라모스 세포, CA-46 세포 및 다우디 세포는 ATCC로부터 구입하였고 지시된 바와 같이 유지하였다. BRD4(#E2A7X), c-MYC(#D84C12), PARP(#46D11)에 대한 항체들은 셀 시그널링 테크놀로지즈사로부터 구입하였다. 액틴(#A5441) 항체는 시그마알드리치사(SigmaAldrich)로부터 구입하였다. 2차 항체(#7074, #7076)는 셀 시그널링 테크놀로지즈사로부터 구입하였다. MG132(#M7449)는 시그마알드리치사로부터 구입하였다. 카피조밉(#S2853)은 셀렉사(Selleck)로부터 구입하였다.
3. 웨스턴 블롯 분석
배양된 세포를 40mM HEPES(pH 7.4), 140mM NaCl, 2.5mM EDTA, 1% NP-40, 0.1% SDS 및 프로테아제 저해제 칵테일을 함유하는 용해 완충액에 수집하였다. 10분의 원심분리(14000 rpm) 후에, BCA 방법에 의한 단백질 농도 결정을 위하여 상청액을 수집하고 표준 프로토콜에 의한 면역블롯팅을 시행하였다. 웨스턴 블롯 결과는 바이오-라드 케미독(상표명) MP 영상화 시스템 상에서의 바이오-라드 클래러티 ECL 웨스턴 블로팅 기질(Bio-Rad Clarity ECL Western Blotting Substrate)을 이용해서 가시화하였다.
4. RT- PCR
RNA 추출은 바이오-라드사로부터의 아우룸(Aurum)(상표명) 토탈 RNA 미니 키트(#732-6820)로 수행하였다. 총 RNA로부터의 제1 가닥 cDNA는 제조사의 지사에 따라서 라이프 테크놀로지즈사로부터의 고용량 cDNA 역방향 전사 키트(High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit)(#4368813)로 합성하였다. 정량적 PCR은 바이오-라드 쏘어드밴스트(상표명) 유니버설 SYBR(등록상표) 그린 수퍼믹스(Bio-rad SsoAdvanced™ Universal SYBR™ Green Supermix)(#172-5271)를 사용해서 수행하였다. 이하의 프라이머가 사용되었다:
5. 증식 검정
Figure pct00175
증식에 대한 저해제의 효과를 평가하기 위하여, 세포(50,000/100㎕)를 96-웰 조직 배양 평판에 파종하고 나서 표시된 농도에서 화합물을 첨가하였다. 72시간 후에, 재구성된 셀타이터-글로(CellTiter-Glo)(CTG) 시약(프로메가사(Promega)로부터의 #G7572)을 웰 당 100㎕ 첨가하고 바이오텍사(BioTek)로부터의 시타틴 3(Cytation 3) 영상화 판독기 상에서 판독하였다. 상대적 세포 성장은 처리된 세포의 검정 판독치를 대조군 DMSO 처리된 세포와 비교함으로써 결정되었다.
6. Kd 결정
BRD4의 브로모도메인 1 및 2에 의한 화합물의 친화도는 디스커버엑스(DiscoverX)에 의한 브로모스캔(BROMOscan)(상표명)으로 걸정되었다.
B. 결과
JQ1, OTX-15 및 A825의 세포 효과는 이하의 실험에서 평가되고 비교되었다.
1. 소분자 BET 도메인 저해제는 상당한 BRD4 단백질 축적 및 비효율적인 c-MYC 억제를 초래한다
a. JQ1 및 OTX -15 처리에 의한 BRD4 의 용량-의존적 축적
연구는, 버킷 림프종(BL) 세포주가 BRD4의 하류의 IgH 슈퍼-인핸서의 제어 하에 전좌시켜서 c-myc 종양 유전자에 대한 세포주의 의존성으로 인해 BRD4 저해제에 반응한 것을 나타내었다.
초기의 실험에서, 각종 BL 세포주(나말와, 라모스, CA-46 및 다우디 세포)를 이들 저해제가 BRD4의 분해를 저감 및/또는 예방하는데 효과적이었음을 확인하기 위하여 각종 농도에서 두 공지된 BET 도메인 저해제(JQ1 및 OTX-15)로 처리하였다. 구체적으로는, 나말와 세포 및 라모스 세포는 각종 농도의 JQ1 및 OTX-15(3nM, 10nM, 100nM, 300nM, 1000nM 및 3000nM)로 처리하고; CA-46 세포 및 다우디 세포는 100nM 및 300nM의 JQ1 및 OTX-15로 처리하였다. 저해제 대신에 DMSO를 사용한 이외에, 별도의 세트의 세포를 동일 방식으로 처리하였다. 모든 세포를 증가되는 용량의 JQ1 및 OTX15로 하룻밤 처리하였다. 처리 후에, 세포 용해물을 수집하여 BRD4 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
이들 처리로부터의 효과는 처리후의 웨스턴 블롯 분석에 의해 세포 내에 존재하는 BRD4의 양을 평가함으로써 결정되었다(도 3a, 도 3b, 도 3c 및 도 3d).
도 3a 내지 도 3d는 JQ1 및 OTX-15가 둘 다 시험된 모든 세포주에서 용량-의존적 방식으로 BRD4 단백질의 상당한 축적을 초래하는 것을 나타낸다. 이들 결과는 JQ1 처리가 몇몇 폐암 세포주에서 BRD4 상승 조절을 초래한 것과 일치한다[Shimamura, T., Chen, Z., Soucheray, M., Carretero, J., Kikuchi, E., Tchaicha, J.H., Gao, Y., Cheng, K.A., Cohoon, T.J., Qi, J., et al. (2013). (J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674; 및 K. Klapproth, et al., British journal of haematology, 149 (2010) 484-497)].
b. JQ1 및 OTX -15 처리에 의한 BRD4 의 축적 속도
JQ1 및 OTX-15로 처리한 후 BL 세포주에 BRD4가 축적되는 속도가 또한 결정되었다. 구체적으로는, 나말와 세포 및 라모스 세포는 0 hr, 0.5 hr, 1.0 hr, 2.0 hr, 4.0 hr, 7.0 hr, 24 hr, 및 48.0 hr 동안 각 저해제 300nM으로 처리하였다. 처리 후, 세포 용해물을 수집하여, BRD4 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 3e는 나말와 세포가 임의의 저해제에 의한 처리 전에(0 hr) 검출 가능한 수준의 BRD4를 함유하는 것을 나타낸다. 나말와 세포에 존재하는 BRD4의 양은 JQ1 또는 OTX-15로 처리한 30분 이내에 현저하게 증가되었고 BRD4의 양은 보다 긴 시간 처리(0.5 hr 내지 48.0 hr)에 따라 계속 증가하였다.
도 3f은, 나말와 세포와 유사하게, 라모스 세포가 또한 임의의 저해제에 의한 처리 전에(0 hr) 검출 가능한 수준의 BRD4를 함유하는 것을 나타낸다. 그러나, BRD4는 나말와 세포에 비해서 라모스 세포에서 느린 속도로 축적되었다. 구체적으로는, BRD4의 양의 현저한 증가는 JQ1 또는 OTX-15에 의한 처리 약 4.0 내지 약 7.0 시간 사이에서 관찰되었다. 라모스 세포에서 BRD4의 양의 현저한 증가는 두 저해제에 의한 처리 24.0 시간 후에 관찰되었다.
일괄적으로, 도 3e 및 도 3f에 도시된 결과는 소분자 BRD4 저해제가 0.3μM의 JQ1 또는 OTX15에 의해 각종 BL 세포주의 신속한 BRD4 축적을 초래하는 것을 입증한다.
c. JQ1 및 OTX -15가 하류 c- Myc 억제를 초래한다
위에서 논의된 바와 같이, BRD4는 슈퍼-인핸서 영역에 위치된 것으로 도시되어 있고, 이는 흔히 중요한 발암유전자, 예컨대, c-Myc, Bcl-xL 및 BCL-6의 상류에 체류한다. 발암유전자의 하류의 발현에 영향을 미칠 수 있는지를 결정하기 위하여, 나말와 세포를 증가되는 농도(3nM, 10nM, 100nM, 300nM, 1000nM 및 3000nM)의 JQ1 또는 OTX-15로 하룻밤 처리하였다. 저해제 대신에 DMSO를 사용한 이외에, 별도의 세트의 세포를 동일 방식으로 처리하였다. 처리 후에, 세포 용해물을 수집하여 c-Myc 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 3g는 BET 도메인 저해제에 의해 세포를 처리하는 것이 c-Myc의 하류 억제를 어느 정도까지 초래할 수 있지만, 고농도에서도, 저해제는 c-Myc 발현을 완전히 저해하는 것은 가능하지 않음을 나타낸다. 구체적으로는, 이 도면은 저농도(3nM 내지 30nM)에서, 저해제는 세포 내에 존재하는 c-Myc의 수준에 현저한 영향을 미치지 않았음을 나타낸다. 그러나, c-Myc의 양은 100nM의 JQ1 또는 OTX-15로 처리된 세포에서 현저하게 저감되었고, 300nM 및 1000nM의 JQ1 또는 OTX-15로 처리된 세포에서 훨씬 더 저감되었다. JQ1 및 OTX-15 둘 다 100nM 내지 1000nM의 농도에서 c-Myc 수준을 상당히 억제하였지만, 그 결과는 더 높은 용량의 둘 중 어느 저해제도 c-Myc의 추가의 저감 결과를 보이지 않았음을 나타낸다(도 3g, 1000nM을 3000nM과 비교).
이들 결과에 기초하여, BET 도메인 저해제 JQ1 및 OTX-15에 의한 세포의 처리는 100nM 내지 1000nM의 농도에서 BRD4 하류 단백질 c-Myc의 상당한 억제를 초래한다. 그러나, 더 높은 농도의 JQ1 및 OTX-15(1000nM 초과)는 1000nM의 저해제에서 보이는 효과를 넘어 c-Myc 단백질의 추가의 억제를 초래하지 않았다. 게다가, JQ1 또는 OTX-15의 어느 것도 3000nM의 농도에서도 c-Myc 발현을 완전히 억제할 수 없었다.
d. JQ1 및 OTX -15에 의한 c- Myc 의 억제가 가역적이다
이하의 연구는 JQ1 및 OTX-15에 의한 c-Myc 발현의 억제 효과가 가역적인지의 여부를 결정하기 위하여 수행되었다.
이 연구에서, 나말와 세포는 24시간 동안 JQ1(1000nM)로 처리되고 나서, 3회 세척하여 저해제를 제거하였다. 세포를 재차 파종하고 0 hr, 0.5 hr, 1.0 hr, 2.0 hr, 3.0 hr, 4.0 hr, 및 6.0 hr 동안 저해제 없이 항온처리하였다. 이어서 세포 용해물을 각종 시점에서 수집하고, c-Myc 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다. 병렬 대조 실험에서, 나말와 세포는 JQ1 대신에 DMSO를 이용한 것을 제외하고 마찬가지 방식으로 처리하였다.
도 3h는 1000nM의 JQ1이 나말와 세포에서 c-Myc 단백질 수준을 상당히 억제하였으며(0 hr 레인의 JQ1 처리된 세포를 0 hr 레인의 DMSO 대조군과 비교), 이것은 도 3a 내지 도 3d에 도시된 결과와 일치한다. 도 3h는 또한 c-Myc 단백질 수준이 저해제의 제거 후 1.0 내지 2.0 시간 사이에 상당히 증가하였고 저해제의 제거 후 3.0시간 이내에, c-Myc 단백질이 대조군 샘플의 수준으로 복귀되었기 때문에 JQ1에 의한 c-Myc의 억제가 신속하게 가역적인 것을 나타낸다.
다른 실험에서, 라모스 세포는 JQ1(1000nM), OTX-15(1000nM), 또는 DMSO(대조군)로 24시간 동안 처리하였다. 처리 후, 세포를 저해제에 의한 c-Myc의 억제를 평가하기 위하여) 용해시키거나 또는 (c-Myc 억제의 가역성을 평가하기 위하여) 세척하여 저해제를 제거하고 재차 파종하고 저해제 없이 4.0시간 동안 항온처리하였다. 세포 용해물을 수집하여, c-Myc 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
라모스 세포로부터의 결과는 나말와 세포에서 관찰된 것과 일치하였다. 구체적으로는, 도 3i(하부 패널)는, JQ1 및 OTX-15가 라모스 세포에서 c-Myc를 억제하였지만("JQ1" 및 "OTX15" 레인), 이 억제 효과는, 저해제가 제거된 후 4.0시간 내에 c-Myc 수준이 상당히 증가하였으므로("JQ1 약효세척 후 4Hr" 레인 및 "OTX15 약효세척 후 4Hr" 레인) 가역적이었던 것을 나타낸다.
이 연구로부터의 결과는 소분자 BRD4 저해제(JQ1 및 OTX-15)가 BL 세포주에서 하류 c-Myc 억제를 초래한 것을 입증한다. 그러나, 저해제는 고농도에서도 세포 내 c-Myc의 발현을 완전히 억제할 수 없었다. 또한, 이들 저해제에 의한 c-Myc 발현의 억제 효과는 신속하게 가역적인 것으로 판명되었고, c-Myc 단백질 수준은 저해제의 제거 약 2.0 내지 4.0시간 후에 증가하였다. 이 연구에서 얻어진 결과는 c-MYC가 JQ1 처리에 의해 억제되지만 JQ1 제거 시 신속하게 도로 결합되는 AML에서의 이전의 지견과 일치한다(J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674).
2. BRD4를 효과적으로 분해시키기 위하여 E3 유비퀴틴 리가제 세레블론을 하이재킹(h ijacking )하여 PROTAC를 생성
JQ1 및 OTX-15 처리에 의한 BRD4의 신속하고도 강인한 축적은, 이전의 연구에서 관찰된 BRD4에의 저해제 결합의 가역적 속성과 함께, BL 및 기타 암에서 관찰된 하류 c-Myc 억제 및 증식 저해에 대한 보통의 효과를 설명할 수 있다. 소분자 BRD4 저해제의 제한을 피하기 위하여, 키메라 화합물인 A825가 PROTACs 기술(위에서 논의되고 도 2에 도시됨)을 이용해서 설계되었다.
a. BRD4의 브로모 도메인에 대한 저해제 결합 친화도
BRD4의 브로모도메인 1(BD1) 및 브로모도메인 2(BD2)에 대한 A825의 결합 친화도가 평가되었고 동일 도메인에서 JQ1 및 OTX-15의 결합 친화도와 비교되었다. 이들 화합물의 각각의 결합 친화도는 이하의 표에 요약되어 있다.
Figure pct00176
결합 친화도 연구는 A825가 JQ1 및 OTX-15의 것에 비해서 BRD4의 BD1 및 BD2에 대해서 약간 저감된 결합 친화도를 갖는 것을 나타내었다.
b. A825는 BRD4 의 효과적인 분해를 초래한다
BL 세포주 내 BRD4 단백질 수준에 대한 A825의 효과가 평가되었다.
구체적으로는, 나말와 세포 및 CA-46 세포를 증가하는 농도(0.3nM, 1.0nM, 3.0nM, 10mM, 30nM, 100nM, 300nM 및 1000nM)의 A825로 하룻밤 처리하였다. 처리 후에, 세포 용해물을 수집하고 BRD4 및 액틴에 대해서 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 4a 및 도 4b는 A825에 의한 BL 세포주의 처리가 저농도의 이 화합물에서 완전한 BRD4 단백질 분해를 유발하는 것을 나타낸다. 특히, 이 도면에 도시된 데이터에 기초하여, 나말와 세포에서 BRD4의 DC50(최대 분해의 50%)은 1.0nM 이하의 A825로 세포를 처리함으로써 달성되는 것으로 보인다(4a). 마찬가지로, CA-46 세포 내 BRD4의 DC50은 0.3nM 내지 1.0nM 이하의 A825로 세포를 처리함으로써 달성되는 것으로 보인다(4b).
또한, BRD4는, 이들 처리 농도에서 BRD4에 대한 임의의 주목할만한 단백질 띠의 부재에 의해 입증되는 바와 같이, 약 3.0nM 내지 약 300nM 범위의 농도에서 A825로 처리된 두 BL 세포주에서 완전히 분해된 것으로 보인다. 흥미롭게도, 소량의 BRD4 단백질이 1000nM의 A825로 처리된 두 BL 세포주의 용해물을 함유하는 레인에서 관찰되었으며, 이는 A825에 의한 BRD4 분해가 용량-의존적인 벨-형상 방식으로 발생함을 나타낸다. 즉, A825가 임계 농도보다 높거나 낮게 존재할 경우에 불완전한 BRD4 분해가 관찰되기 때문에, A825의 임계 농도 범위 내에서 BRD4의 완전한 분해가 일어난다.
A825 내 BRD4와 세레블론 결합 모이어티가 각각의 표적에 대해 28 내지 90nM 및 3uM의 Kd를 갖는다는 사실을 고려하면, 이것은 A825가 BRD4 분해를 매개하는데 촉매작용을 한다는 것을 시사한다.
c. A825는 BRD4 의 신속한 분해를 초래한다
A825로 처리 후에 BL 세포주 내 BRD4의 분해 속도가 또한 결정되었다. 이 연구에서 나말와 세포 및 라모스 세포를 0 hr, 0.5 hr, 1.0 hr, 2.0 hr, 4.0 hr, 7.0 hr 및 24 hr 동안 A825(100nM)로 처리하였다. 처리 후, 세포 용해물을 수집하여, BRD4 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 4c 및 도 4d는 BRD4가 A825로 처리하기 전(0 hr)에 두 BL 세포주에 존재하는 것을 나타낸다. BRD4 단백질 수준은 A825에 의한 처리 1시간 이내에 현저하게 감소하였고, 단백질 수준은 24.0 시간의 처리 기간 과정에 걸쳐서 계속해서 감소되었다. 이 도면은 또한 A825에 의한 BRD4 분해가 빠르게 일어나서 A825 처리 2시간 이내에 단백질의 50% 초과분이 손실된 것을 나타낸다.
d. A825에 의한 BRD4 분해는 세레블론에 의존적이다
A825 처리에 의해 유도된 BRD4 분해가 세레블론에 의존적인 것을 확인하기 위하여, BL 세포주를 A825, 포말리돈아마이드 또는 이들 두 화합물의 조합물로 처리한 경쟁적 저해 실험을 수행하였다. 위에서 논의되고 도 2에 도시된 바와 같이, A825는 E3 유비퀴틴 리가제 세레블론 동원 모이어티를 함유하며, 이것은 포말리도마이드의 유도체, 예컨대, 포말리도마이드 및 A825는 세레블론 결합을 위해 경쟁한다. 따라서, A825 처리에 의한 BRD4 분해가 세레블론에 의존적인 경우, A825와 포말리도마이드의 조합으로 처리된 세포는 A825 단독으로 처리된 세포에 비해 BRD4 분해의 감소를 나타내야 한다.
이 연구에서, 나말와 세포와 라모스 세포는 각종 농도의 A825 단독(10nM, 100nM, 및 1000nM), 포말리도마이드(10μM) 단독, 또는 A825와 포말리도마이드의 조합물로 하룻밤 처리하였다. 처리 후, 세포 용해물을 수집하여, BRD4 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 4e 및 도 4f는 1000nM의 A825로 처리된 세포에 소량의 BRD4가 존재하는 한편 10nM 및 100nM의 A825로 처리된 세포 내에서 완전한 BRD4 분해를 나타내며, 이것은 도 4a 및 도 4b에 도시된 결과와 일치한다. 도 4e 및 도 4f는 또한 BRD4 수준이 포말리도마이드 단독으로 처리된 세포에 영향을 미치지 않음을 나타내며, 이는 포말리도마이드가 분해를 위하여 BRD4를 표적화하지 않으므로 예상되었다. 마지막으로, 도 4e 및 도 4f는 BRD4 단백질 수준이 A825와 포말리도마이드의 조합물로 처리된 세포 내 분해로부터 부분적으로 구제되었음을 나타낸다.
이 연구로부터의 결과는 A825에 의한 BRD4 분해가 세레블론에 의해 매개됨을 확인해준다.
e. 프로테아좀 저해제는 A825에 의한 BRD4 분해를 방지한다
세레블론은, 단독으로 또는 E2 유비퀴틴-접합 효소와 조합하여, 표적 단백질 상의 라이신에 유비퀴틴의 부착을 초래하고 이어서 프로테아좀에 의해 분해용의 특정 단백질 기질을 표적화하는 E3 유비퀴틴 리가제 단백질이다. A825에 의한 BRD4 분해가 프로테아좀 경로를 통해서 일어나는 것을 확인하기 위하여, BL 세포주는 프로테아좀 저해제와 함께 또는 이것 없이 A825로 처리되었다.
구체적으로는, 나말와 세포는 A825 단독(10nM 및 100nM); MG132 단독(5μM); 또는 카피조밉 단독(5μM); 또는 A825와 MG132과의 또는 카피조밉과의 조합으로 하룻밤 처리하였다. 처리 후, 세포 용해물을 수집하여, BRD4 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 4g는 BRD4가 10nM 또는 100nM의 A825 단독으로 처리된 세포에서 완전하게 분해된 것을 나타내며, 이것은 도 4a 및 도 4b에 도시된 결과와 일치한다. 도 4e 및 4f는 또한 MG132와 카피조밉은 둘 다 10nM 또는 100nM의 A825에 의해 유도된 BRD4 분해를 완전히 방지한 것을 나타낸다. 이들 결과는 A825에 의한 BRD4 분해가 프로테아좀을 통해서 통상의 세레블론 경로에 따라서 진행되는 것을 확인해준다.
e. 요약 및 논의
중합하면, 상기 실험 (a) 내지 (f)로부터 얻어진 데이터는 A825가 세레블론-매개 및 프로테아좀-의존적 기전에서 신속하고 유효한 BRD4 분해를 초래하는 것을 입증한다.
이 연구에서 관찰된 BRD4 분해 프로파일은 작용 모델의 이하의 기전을 뒷받침하며, 이것은 도 8에 예시되어 있다. 구체적으로는, 미처리 세포에서, BRD4 발현이 저해되지 않고 정규의 세포 제어 하에 기능한다. 그러나, 세포가 저농도의 A825로 처리된 경우, 충분한 A825가 세포 내에 존재하여, 분자의 일단부 상에 BRD4를 타단부에서 세레블론을 효율적으로 결합하여 "BRD4-A825-세레블론" 삼량체 복합체를 형성한다(도 8a). 이 "BRD4-A825-세레블론" 삼량체 복합체는 세포 내에서 효율적인 BRD4 분해를 유발시킨다. 삼량체 복합체는 특정 농도 범위 내에서 A825로 처리된 세포에 형성될 수 있고, 세포 내 BRD4의 완전한 고갈을 초래할 수 있다(도 8a). 그러나, 세포가 고농도의 A825로 처리된 경우, "BRD4-A825" 및 "A825-세레블론" 이량체가 형성되어 최적의 삼량체 형성을 방해하며, 이는 덜 효율적인 BRD4 분해를 초래한다(도 8b).
3. A825는 소분자 저해제보다 더 상당히 더 길게 지속하는 c- MYC 억제를 초래한다
위에서 논의된 바와 같이, 100nM 이상의 소분자 BET 도메인 저해제인 JQ1 및 OTX-15로 세포를 처리하는 것은 하류 단백질 c-Myc의 유의하지만 불완전한 억제를 초래하며, 1000nM보다 높은 농도는 c-Myc의 추가의 억제를 초래하지 않았다. 이하의 연구에서, c-Myc 발현에 대한 A825의 하류 효과가 소분자 저해제인 JQ1 및 OTX15와 비교되었다.
a. A825는 JQ1 및 OTX-15보다 더 큰 정도로 c- Myc를 억제시킨다
이 연구에서, A825에 의한 c-Myc의 억제는 JQ1 및 OTX-15와 비교되었다.
구체적으로는, 나말와 세포 및 라모스 세포를 각종 농도의 A825(100nM, 300nM, 및 1000nM), 또는 JQ1(100nM, 300nM, 1000nM, 3000nM, 및 10000nM), 또는 OTX15(100nM, 300nM, 1000nM, 3000nM, 및 10000nM)에 의해 하룻밤 처리하였다. 처리 후, 세포 용해물을 수집하여, BRD4, c-Myc 및 액틴에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도s 5a 및 도 5b는 JQ1 및 OTX-15가 두 BL 세포주에서 강인한 BRD4 축적을 초래하고 유의하지만 불완전한 c-Myc 억제를 초래하는 것을 나타낸다(도 3g와 일치). 도 5a 및 도 5b는 또한 A825가 두 BL 세포주에서 JQ1 및 OTX-15와 비교해서 상당한 BRD4 분해(도 4a 내지 도 4g와 일치) 및 c-Myc의 훨씬 더 현저한 하향조절을 초래한 것을 나타낸다. 현저하게는, A825는 훨씬 저농도의 화합물로 JQ1 및 OTX-15보다 훨씬 더 많은 정도로 c-Myc 발현을 하향조절할 수 있었다.
b. A825는 JQ1 및 OTX-15보다 더 길게 c- Myc 발현을 억제시킨다
이하의 연구는 A825, JQ1 및 OTX-15에 의한 c-Myc 억제의 지속기간을 비교하기 위하여 수행되었다.
구체적으로는, 나말와 세포는 A825(0.1μM), JQ1(1.0μM) 및 OTX-15(1.0μM)로 24시간 동안 처리하고 나서 3회 세척하여 화합물을 제거하였다. 세포를 신선한 배지에 재차 파종하고 0 hr, 2.0 hr, 4.0 hr, 6.0 hr, 및 24.0 hr 동안 어떠한 화합물도 없이 항온처리하였다. 병행 대조 실험에서, 세포를 저해제 대신에 DMSO를 사용한 것을 제외하고 동일한 방식으로 처리하였다. 용해물을 수집하고 BRD4, c-Myc 및 액틴에 대해서 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 5c는 A825에 의한 BRD4에 대한 처리 후 효과(BRD4 분해)가 JQ1 및 OTX-15에 의한 처리 후 효과(BRD4 축적)보다 훨씬 더 길게 유지되는 것을 나타낸다. 또한, A825에 의한 c-Myc에 대한 처리 후 하류 억제 효과가 또한 JQ1 및 OTX-15에 비해서 A825에 의해 훨씬 더 길게 유지된다. 특히, 이 도면은 A825에 의한 처리 후 6시간에 세포에서 검출 가능한 BRD4 단백질이 관찰되지 않았음을 나타낸다.
또한, A825에 의한 처리 후 24시간 후에도, 웨스턴블롯에서 단지 소량의 BRD4만이 관찰되었으며, 이것은 대조군 샘플에서 관찰된 BRD4 수준보다 훨씬 낮았다. 이와 대조적으로, JQ1 및 OTX-15에 의한 BRD4의 축적은 짧게 생존하였으며, 이들 샘플 내 BRD4의 단백질 수준은 처리 후 약 4시간 이내에 대조군 샘플의 수준으로 복귀되었다. 도면은 또한 단지 낮은 수준의 c-Myc 단백질만이 A825에 의한 처리 후 2시간 내지 6시간에 검출되었고, 처리 후 24시간에도, c-Myc의 수준은 대조군 샘플보다 훨씬 낮았던 것을 나타낸다. 이와 대조적으로, 도면은 c-Myc 단백질 수준이 JQ1 및 OTX15 제거 후 약 4시간 이내에 대조군 수준으로 회복되는 것을 나타낸다. 따라서, 이들 결과는 A825에 의한 BRD4 및 c-Myc에 대한 처리후 효과가 JQ1 및 OTX-15에 비해서 더 긴 시간 기간에 걸쳐서 유지되는 것을 입증한다.
c. A825는 JQ1 및 OTX-15보다 더 길게 c- Myc 기능을 억제시킨다. c-Myc 단백질은, 엽산염의 수송체인 막 단백질이고 엽산염의 세포내 농도의 조절에 연루되는 SLC19A1을 비롯하여, 많은 유전자의 발현을 활성화시키는 전사 인자이다. 선행하는 실험에서, A825, JQ1 및 OTX-15가 c-Myc 발현을 억제하고, A825에 의한 효과가 JQ1 및 OTX-15에 비해서 더 강하고 더 오래 지속된 것을 나타낸다. A825, JQ1 및 OTX-15가 BRD4의 하류의 경로 및 이벤트에 어떻게 영향을 미칠 수 있는지를 더욱 연구하기 위하여, 세포는 각 화합물로 처리되었고, SLC19A1 유전자의 발현은 처리 후 다양한 시점에서 평가되었다.
구체적으로는, 나말와 세포는 A825(0.1μM), JQ1(1.0μM) 및 OTX-15(1.0μM)로 24시간 동안 처리되고 나서, 3회 세척에 의해 화합물을 제거하였다. 세포를 새로운 배지에 재차 파종하고, 0 hr, 6.0 hr, 및 24.0 hr 동안 어떠한 저해제도 없이 항온처리하였다. 병행 대조 실험에서, 세포는 저해제 대신에 DMSO가 사용된 것을 제외하고 동일한 방식으로 처리하였다. 각 시점에서, RNA는 용해물로부터 추출되고, cDNA로 역전사되었으며, SLC19A1 특이적 프라이머로 QPCR에 의해 정량화되었다. GAPDH는 또한 내부 대조군으로서 QPCR에 의해 정량화되었다.
c-Myc 단백질 억제에 대한 결과와 일치하여(도 5c에 도시), 도 5d 내지 도 5f는 A825 처리가, JQ1 및 OTX-15에 비해서, SLC19A1 유전자 발현에 의해 결정된 바와 같이, c-Myc 기능의 더욱 실질적이고도 더 오래 지속되는 억제를 초래하는 것을 나타낸다. 특히, 이들 도면은 SLC19A1 유전자 발현이 A825에 의해 상당히 저감되고 처리후 24시간에도, SLC19A1 유전자 발현이 대조군 샘플에 비해서 크게 저감되는 것을 나타낸다. 이와 대조적으로, 도면은 SLC19A1 유전자 발현이 JQ1 및 OTX-15에 의해 저감되지만, 6.0 내지 24.0시간 이내에 대조군 처리 수준으로 복귀되는 것을 나타낸다.
4. A825는 소분자 저해제에 비해서 우수한 세포 증식 억제를 지닌다
BL 세포는 BRD4 저해제에 대해서 민감하고, 이것은 c-Myc 신호전달을 억제하고 세포증식의 억제를 유도하는 것으로 공지되어 있다(J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674). 세포 증식에 대한 A825, JQ1 및 OTX-15 처리의 효과는 이하의 실험에서 평가되었다.
a. A825는 JQ1 및 OTX-15보다 더 큰 정도로 세포 증식을 억제시킨다
이 연구에서, 각종 BL 세포주의 증식은 A825, JQ1 및 OTX-15로 처리 후 평가되었다.
구체적으로는, 나말와, 라모스, CA-46, 및 다우디 세포주가 96-웰 평판에 50,000 세포/100㎕에서 파종되었다. 세포를, 도 6a 내지 도 6d에 도시된 바와 같이, 증가하는 농도의 A825(100 pM, 300 pM, 1nM, 3nM, 10nM, 30 nM, 100nM, 300 nM, 1μM) JQ1 및 OTX15(1nM, 3nM, 10nM, 30nM, 100nM, 300nM, 1μM, 3μM로 처리하였고; 나말와에 대해서, JQ1 및 OTX-15가 10uM까지 사용되었 다. 처리 후, 샘플의 상대적 증식은 처리 후 72시간에 CTG 검정에 의해 결정되었다.
도 6a 내지 도 6d는, A825처리가 시험된 모든 BL 세포주에서 JQ1 또는 OTX15에 비해서 더욱 현저한 증식 억제를 초래하였고, 이 효과는 상당히 낮은 농도의 화합물을 이용해서 달성된 것을 나타낸다. 흥미롭게도, 더 높은 농도의 A825로 처리된 라모스 및 다우디 세포주에서의 상대적 성장이 0.0에 가까웠다.
b. A825는 JQ1 및 OTX-15보다 더 긴 세포 증식을 억제시킨다
이 연구에서, 나말와 세포에서의 항증식 효과의 지속기간이 A825, JQ1 및 OTX-15에 의한 처리 및 제거 후에 평가되었다.
구체적으로는, 나말와 세포를 A825(0.1μM), JQ1(1.0μM) 및 OTX15(1.0μM)로 24시간 동안 처리하고 나서, 3회 세척하여 화합물을 제거하였다. 세포를 새로운 배지에 재차 파종하고 0 hr, 24.0 hr, 및 48.0 hr 동안 어떠한 화합물도 없이 항온처리하였다. 병행 대조 실험에서, 세포는 저해제 대신에 DMSO가 사용된 것을 제외하고 동일한 방식으로 처리하였다. 처리 후, 샘플의 상대적 증식은 CTG 검정에 의해 결정되었다.
도 6e는 A825에 의한 증식 억제 효과가 JQ1 또는 OTX15의 것에 비해서 처리 후 48시간 초과 동안 유지된 것을 나타낸다. 이 결과는 위에서 논의된 실험 결과와 일치하며, 여기서 A825는 BRD4 분해 및 하류 신호전달 억제에 대한 오래 지속되는 효과를 제공한다(예컨대, 도 5a 내지 도 5f).
c. 포말리도마이드는 A825에 의해 초래된 항증식 효과를 저감시킨다
위에서 논의된 바와 같이, 도 4c의 결과는, 포말리도마이드가 A825 처리 동안 존재할 경우, 세레블론 결합의 경쟁적 저해로 인해 BRD4 단백질 수준이 분해로부터 부분적으로 구제된 것을 입증하였다. 이하의 실험은 포말리도마이드가 또한 A825에 의해 각종 BL 세포주에서 항증식 효과를 방지하거나 적어도 저감시킬 수 있는지를 결정하기 위하여 수행되었다.
구체적으로는, 나말와, CA-46, 및 다우디 세포를 A825(10nM 또는 100nM) 단독, 또는 포말리도마이드(1.0μM 또는 10.0μM)와의 조합으로 72시간 동안 처리하였다. 병행 대조 실험에서, 세포는 저해제 대신에 DMSO가 사용된 것을 제외하고 동일한 방식으로 처리하였다. 처리 후, 샘플의 상대적 증식은 CTG 검정에 의해 결정되었다.
10nM의 A825 단독에 의해 세포를 처리하는 것은 대조 세포에 비해서 상당한 증식 억제를 초래하였으며(도 6f), 이것은 도 6a 내지 도 6e에 도시된 것과 일치한다. 도 6f는 10nM의 A825 단독에 의한 처리가 대조 세포의 성장에 비해서 나말와 세포 및 CA-46 세포에서 대략 40%까지 그리고 다우디 세포에서 대략 65%까지 세포 성장을 저감시킨 것을 나타낸다. 포말리도마이드는 용량-의존적 방식으로 10nM의 A825에 의해 초래된 항증식 효과를 저감시킨다. 특히 10nM의 A825와 조합하여 1.0μM 포말리도마이드에 의한 처리는 대조군 샘플에 비해서 세포 성장의 더 적은 극적인 저감(나말와 세포에서 약 80%, CA-46 세포에서 약 90%, 다우디 세포에서 약 95%)을 초래하였다. 10nM의 A825에 의한 처리 동안 포말리도마이드의 농도를 10.0μM로 증가시키는 것은 대조군 샘플에 관하여 시험된 모든 세포주에서의 항증식 효과를 방지하였다.
100nM의 A825 단독에 의해 세포를 처리하는 것은 10nM의 A825 단독에 의한 처리에 비해서 더 큰 정도로 시험된 모든 세포 유형의 증식을 억제하였으며(도 6g와 도 6b를 비교), 이것은 도 6a 내지 도 6e에 도시된 결과와 일치한다. 도 6b는 100nM의 A825 단독에 의한 처리가 대조 세포의 성장에 비해서 나말와 및 다우디 세포에서 대략 25% 내지 27%로, 다우디 세포에서 대략 33%로 저감된 것을 나타낸다. 포말리도마이드는 용량-의존적 방식으로 100nM의 A825에 의해 초래된 항증식 효과를 저감시켰다. 특히, 100nM의 A825와 조합하여 1.0μM 포말리도마이드에 의한 처리는 대조군 샘플에 비해서 세포 성장의 덜 극적인 저감(모든 세포주에서 약 55%)을 초래하였다. 100nM의 A825에 의한 처리 동안 포말리도마이드의 농도를 10.0μM로 증가시키는 것은 모든 세포주에서 항증식 효과를 더욱 저감시켰다(대조군 샘플에 비해서 모든 세포주에서 약 70% 내지 약 80%).
추가의 대조군으로서, BL 세포는, A825 없이 포말리도마이드 단독이 세포 증식에 효과를 지니는지의 여부를 결정하기 위하여 포말리도마이드로 처리하였다. 구체적으로는, BL 세포를 72시간 동안 각종 농도의 포말리도마이드 단독(도 6b에 도시된 바와 같이 0.001uM, 0.003uM, 0.01uM 0.03μM, 0.1μM, 0.3μM, 1μM, 3μM, 10μM)으로 처리하였다. 병행 실험에서, 세포는 포말리도마이드 대신에 DMSO가 사용된 것을 제외하고 동일한 방식으로 처리하였다. 처리 후, 포말리도마이드에 의해 처리된 샘플의 상대적 증식은 CTG 검정에 의해 결정하고, DMSO 대조군과 비교하였다.
도 6b는 포말리도마이드 단독에 의해 세포를 처리하는 것이 이들 세포주에 대한 유의한 효과를 초래하지 않았음을 나타낸다.
5. A825는 소분자 저해제에 비해서 우수한 세포자멸사 유도를 지닌다
c-Myc는, 상이한 종양 실체에 따라서 세포 주기, 노쇠, 증식 및 세포자멸사를 비롯하여, 암의 많은 홀마크에 연루된 다면발현성 발암단백질이다(M. Gabay, et al., Cold Spring Harb Perspect Med . (2014) 4:a014241). 선행하는 실험은 소분자 BRD4 저해제(JQ1 및 OTX-15) 뿐만 아니라 A825에 의한 처리 후에 시험된 모든 BL 세포주에서 증식 억제에 대해서 일반적인 효과를 입증한다. 이하의 실험은 JQ1, OTX-15, 및 A825가 BL 세포주에서 세포자멸사를 유도할 수 있는 정도를 평가한다.
a. A825는 JQ1 및 OTX-15에 비해서 카스파제 활성의 훨씬 더 유의한 증가를 초래한다
각종 BL 세포주는 24시간 동안 세포자멸사 유도의 양성 대조 군으로서 ARV-825(0.1mM), 또는 JQ1(1.0mM), 또는 OTX015(1.0mM), 또는 퓨로마이신(10 mg/㎖)에 의해 처리하였으며, 카스파제 3/7 활성은 카스파제 3/7-글로 검정(Caspase 3/7- Glow assay)에 의해 측정되었다.
도 7a는 카스파제 활성이 처리에 사용된 저해제 및 시험된 BL 세포주 둘 다에 현저하게 의존하여 변하는 것을 나타낸다. 구체적으로는, 100nM의 A825에 의한 BL 세포의 처리는 JQ1 및 OTX-15에 의해 처리된 BL 세포에 비해서 카스파제 활성의 통계학적으로 유의한 증가를 초래한다. 카스파제 활성의 증가는 라모스 세포 및 CA-56 세포에 비해서 다우리 세포 및 나말와 세포에서 훨씬 더 유의하였다.
본 발명자들은 A825에 의한 모든 BL 세포주의 24시간 처리 후에 카스파제 3/7 활성의 증가를 관찰하였지만 더 높은 용량의 JQ1 및 OTX15에 의해서는 그렇지 않았다(도 5a).
b. A825는 JQ1 및 OTX-15에 비해서 PARP 절단의 더욱 유의한 증가를 초래한다
라모스 세포 및 CA-46 세포를 증가된 용량의 ARV-825(최대 1.0mM), 또는 JQ1 및 OTX015(최대 10.0mM)로 48시간 동안 처리하였다. 용해물을 수집하고 장입 대조군으로서 액틴에 의한 PARP 절단에 대한 면역블롯에 의해 분석하였다.
도 7b는, 48시간까지, 라모스 세포가, 입증된 유망한 PARP 절단으로서, 0.1uM의 A825 처리에 의해 상당한 세포자멸사를 입증한 것으로 나타낸다. 이와 대조적으로, 상당히 높은 용량의 저해제인 JQ1 및 OTX15가 대응하는 세포주에서 유사한 수준의 세포자멸사를 유발할 필요가 있다. 더 높은 농도의 JQ1 및 OTX-15에 대한 필요성은 비효율적인 BRD4 저해 및 하류 c-Myc 억제를 지니는 이들 저해제에 의한 것으로 여겨진다.
종합하면, 이들 지견은 PROTAC-매개 BRD4 분해가 소분자 저해제에 비해서 BL 내 BRD4를 표적화하는데 있어서 더욱 효과적인 전략이라는 강력한 증거를 제공한다.
6. 요약 및 논의
BL 세포는 BRD4 저해제에 대해서 민감하고, 이것은 c-Myc 신호전달을 억제하고 세포 증식의 저해를 유도하는 것으로 공지되어 있다(J.A. Mertz, et al., PNAS, 108 (2011) 16669-16674). 최근, 세포 내 BRD4를 효율적으로 저해하는 화합물을 설계함에 있어서 상당한 진전이 있었다. 그러나, 최근의 전전에도 불구하고, 상당한 기능 및 임상 유익을 가진 BRD4 저해제는 아직 발견되지 않았으며, 이것은, 저해제 처리 동안 관찰된 현저한 BRD4 축적과, 저해제가 제거된 후에, 처리 후 관찰된 저해의 가역적/이행 속성에 의해 부분적으로 설명될 수 있다.
이 실시예에서 수행된 실험은 소분자 BRD4 저해제인 JQ1 및 OTX15가 시험된 모든 BL 세포주에서 상당한 BRD4 단백질 축적을 초래하는 것을 입증한다. 두 저해제는 하류 c-Myc 수준을 억제하였지만, 그 억제는 고농도의 화합물을 필요로 하였다. 게다가, 이들 저해제의 높은 농도에서도, c-Myc 억제는 완전하지 않았다. JQ1 및 OTX-15에 대해서 이 실시예에서 관찰된 결과는 폐 및 전립선암 세포주의 패널에서 다른 것에 의해서 얻어진 결과와 일치한다(Shimamura, T., Chen, Z., Soucheray, M., Carretero, J., Kikuchi, E., Tchaicha, J.H., Gao, Y., Cheng, K.A., Cohoon, T.J., Qi, J., et al. (2013). 데이터 제시 생략). 위에서 얻어진 결과는, BRD4의 강력한 축적이, BRD4에 대한 저해제 결합의 가역적 속성과 함께, 하류 c-Myc 억제의 보통의 효과 및 소분자 저해제에 의한 관련된 제한된 증식 저해를 설명할 수 있다. JQ1 및 OTX-15 데이터에 대한 하나의 가능한 설명은 BRD4에 의한 저해제의 결합이 그의 안정성의 증가를 초래하거나 또는 그의 자연 분해 기구에 대한 그의 접근성을 방해하는 입체 배좌 변화를 초래한다. 대안적으로, BRD4 저해제는 BRD4 단백질 수준을 조절하는 BRD4-매개된 음성 피드백 루프를 억제할 수 있다. 그럼에도 불구하고, BRD4 수준의 현저한 증가는, 저해제 결합의 가역적 속성과 함께, BRD4 저해의 비효율 및 하류 MYC 억제를 부분적으로 해명할 수 있다.
전임상 및 임상 연구는 둘 다 BRD4 저해제의 효과가 크게 세포분열 억제성이었고 세포자멸사가 약간 세포주 및 I상 환자에게 한정된 것을 나타내었다. 이것은 인해 BRD4 저해제의 임상 달성 농도에서 향후 환자의 잠재적인 혜택을 상당히 제한할 수 있었다.
소분자 저해제 약물 개별의 다른 반복 현상은 내성을 매개하거나 또는 심지어 길항제에서 작용로 변환되도록 표적 단백질의 돌연변이의 발생이다. 예를 들어, although 엔잘루타마이드가 안드로겐 수용체를 저해함으로써 전립선암을 치료하는데 효과적이지만, 이것은 안드로겐 수용체 함유 F876L 돌연변이를 가진 종양 세포에서 작용제로 된다. 따라서, 종양이 기존 또는 처리-유도 ARF876L을 함유하는 전립선 암 환자는 에잘루타마이드 처리로부터 유익하지 않을 것이다. 이와 대조적으로, PROTAC 매개 표적 분해는 이들 위험을 피하여 효과적인 표적화의 강력한 전략을 제공한다.
소분자 BRD4 저해제의 제한을 피하기 위하여, 키메라 화합물인 A825가 PROTACs 기술을 통해서 소분자 BRD4 결합 모이어티를 E3 리가제 세레블론 결합 모이어티에 연결함으로써 설계되었다.
상기 실험은 A825가 E3 리가제 세레블론을 BRD4에 활성적으로 동원함으로써 신속하고 효율적인 BRD4 분해를 유도하고, 이것은 BRD4를 프로테아좀 분해 기구로 지향시키는 것을 나타낸다. 이들 결과는 또한 A825가 소분자 BRD4 저해제에 비해서 하류 c-Myc 발현 및 기능에 대한 더욱 현저한 억제, 세포 증식 및 세포자멸사 유도를 초래하는 것을 입증한다.
저해제에 비해서 BRD4 분해인자의 개선된 기능적 효과는 BL 내 유발자 발암단백질인 c-MYC에 대해 더욱 완전하고 지속적인 억제에 부분적으로 기여할 수 있었다. 이것은 BRD4가 더욱 확인되고 석명될 여지가 있는 많은 결합 파트너와 대형 단백질이므로 "샤프롱" 기능을 갖는 것 또한 가능하다. 당연히 BRD4를 제거하면 아세틸-라이신 함유 파트너에 대한 그의 결합을 더욱 저해하는 것보다 훨씬 더 심오한 효과를 유발할 것이다. 저해제에 의한 BRD4 저해의 것과 (예컨대, CRISPR 및 shRNA에 의해서) BRD4 넉아웃 또는 넉다운의 표현형의 비교는 이 문제를 해결할 것이지만, 이것은 본 연구 범위 밖이다.
각각의 표적인, BRD4 및 세레블론에 대한 OTX15 및 포말리도마이드의 결합 친화도는 각각 대략 10nM 및 대략 3uM이다. 이들 두 리간드에 기초한 A825는, 1nM 미만의 BRD4에 대한 DC50을 달성한다. 이것은 BRD4 PROTAC가 촉매 특성을 지니고 공지된 기능이 없는 차선의 친화도를 가진 표적 리간드로 이루어진 작용성 분해인자를 개발함에 있어서 막대한 기회를 여는 것을 강력하게 시사한다. 따라서, 전형적으로 천연 리간드 결합 부위를 결여하는 많은 "어려운" 표적이 PROTAC 매개 분해에 의해 "약물성"(druggable)이 될 수 있다.
요약하면, 본 개시내용은 PROTAC 기술을 통해서 강력한 BRD4 분해인자를 생성함으로써 효율적으로 BRD4를 표적화함에 있어서 새로운 전략을 제공한다. 게다가, 분해를 위한 특정 생리학적 단백질을 표적화하기 위하여 E3 리가제를 활동적으로 동원하는 신규한 부류의 약물 분자에 대한 장을 열고 있으므로, 전통적인 소분자 접근법에 의한 많은 "어려운" 표적에 "약물성"을 부여한다.
7. 산업적 적용 가능성
PROTAC 기술을 통해서 BRD4 동원 모이어티 및 E3 리가제 세레블론 동원 모이어티를 함유하는 신규한 이작용성 분자가 기재되어 있다. A825 활성은 BRD4를 분해시켜서, BL에서 유의하면서도 지속적인 하류 MYC 억제와 강인한 세포 증식 억제 및 세포자멸사 유도를 초래한다. A825는 BRD4를 효율적으로 표적화하는 새로운 전략을 나타내며, 이것은 다수의 암에서 유망한 표적으로서 부상한다. A825는 PROTAC 매개 단백질 분해가 전통적인 접근법에 의해서 "난공불락"(undruggable)인 생리학적 단백질을 표적화함에 있어서 유망한 전략을 제공하는 일례를 나타낸다.
본 출원 전반에서 인용된 모든 참고문헌, 특허, 계류 중인 특허 출원 및 공개된 특허의 내용은 본 명세서에 명시적으로 참고로 편입된다.
당업자라면 본 명세서에서 기재된 발명의 특정 실시형태에 대한 많은 등가물을 인식하거나, 또는 단지 일과적인 실험을 이용하여 확인할 수 있을 것이다. 이러한 등가물은 이하의 청구범위에 의해 포괄될 것으로 의도된다. 본 명세서에서 기재된 상세한 실시예와 실시형태는 단지 예시적인 목적으로 예로서 제공되고, 그리고 어떤 방식으로도 본 발명을 한정하는 것으로 고려되지 않는 것임이 이해된다. 이를 감안하여 다양한 변형 또는 변화는 당업자에게 제시될 것이고, 본 출원의 사상과 이해범위 내에 포함되고, 그리고 첨부된 청구범위의 범주 내에 있는 것으로 간주된다. 예를 들어, 성분의 상대적 양이 원하는 효과를 최적화하기 위해 변화될 수 있고, 추가의 성분이 첨가될 수 있고, 그리고/또는 유사한 성분이 설명된 성분 중의 하나 또는 그 이상을 대신할 수 있다. 본 발명의 시스템, 방법 및 과정과 연 관된 추가의 유리한 특성 및 기능성은 첨부된 청구범위로부터 명백해질 것이다. 게다가, 당업자는 본 명세서에 기재된 발명의 특정 실시형태에 대한 다양한 등가물을 인식하거나, 또는 단지 일과적인 실험을 이용하여 확인할 수 있을 것이다. 이러한 등가물은 이하의 청구범위에 의해 포괄될 것으로 의도된다.
Figure pct00177
Figure pct00178
Figure pct00179
Figure pct00180
Figure pct00181
Figure pct00182
Figure pct00183
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Figure pct00190
Figure pct00191
Figure pct00192
Figure pct00193
Figure pct00194
Figure pct00195
Figure pct00196
Figure pct00197
Figure pct00198
Figure pct00199
Figure pct00200

Claims (18)

  1. 하기 화학 구조를 갖는 화합물:
    PTM-L-CLM
    상기 구조 중, CLM은 세레블론 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티이고;
    PTM은 브로모도메인-함유 단백질에 결합하는 단백질 표적화 모이어티이며; 그리고
    L은 결합(부재(absent)) 또는 화학적 링커기로 이루어진 군으로부터 선택된 링커이고;
    상기 PTM은 상기 링커를 통해서 상기 CLM에 공유 결합된다.
  2. 제1항에 있어서, 상기 PTM은 모이어티는 Brd4와 결합하는 모이어티인, 화합물.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 화합물은 링커기를 통해서 커플링된 제2 E3 유비퀴틴 리가제 결합 모이어티를 더 포함하는, 화합물.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 이미드, 프탈이미도기, 탈리도마이드, 레날리도마이드, 포말리도마이드, 또는 이들의 유사체, 이들의 등배전자체, 또는 이들의 유도체로부터 유도된 화학 기를 포함하며; 상기 CLM은 하기 화학 구조로 표시되는, 화합물:
    Figure pct00201

    식 중,
    W는 CH2, CHR, C=O, SO2, NH 및 N-알킬로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    각각의 X는 독립적으로 O, S 및 H2로 이루어진 군으로부터 선택되며;
    Y는 NH, N-알킬, N-아릴, N-헤트아릴, N-사이클로알킬, N-헤테로사이클릴, O 및 S로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    Z는 O, S 및 H2로 이루어진 군으로부터 선택되며;
    G 및 G'은 독립적으로 H, 알킬, OH, R'으로 임의로 치환된 CH2-헤테로사이클릴, 및 R'으로 임의로 치환된 벤질로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    Q1, Q2, Q3 및 Q4는 R', N 또는 N-옥사이드로부터 독립적으로 선택된 기로 치환된 탄소 C를 나타내며;
    A는 독립적으로 알킬, 사이클로알킬, Cl 및 F의 군으로부터 선택되고;
    R은 -CONR'R", -OR', -NR'R", -SR', -SO2R', -SO2NR'R", -CR'R"-, -CR'NR'R"-, -아릴, -헤트아릴, -알킬, -사이클로알킬, -헤테로사이클릴, -P(O)(OR')R", -P(O)R'R", -OP(O)(OR')R", -OP(O)R'R", -Cl, -F, -Br, -I, -CF3, -CN, -NR'SO2NR'R", -NR'CONR'R", -CONR'COR", -NR'C(=N-CN)NR'R", -C(=N-CN)NR'R", -NR'C(=N-CN)R", -NR'C(=C-NO2)NR'R", -SO2NR'COR", -NO2, -CO2R', -C(C=N-OR')R", -CR'=CR'R", -CCR', -S(C=O)(C=N-R')R", -SF5 및 -OCF3를 포함하고;
    R' 및 R"는 독립적으로 결합, H, 알킬, 사이클로알킬, 아릴, 헤트아릴, 헤테로사이클릴로 이루어진 군으로부터 선택되며;
    Figure pct00202
    는 입체특이적 ((R) 또는 (S)) 또는 비-입체특이적일 수 있는 결합을 나타내고; 그리고
    Rn은 작용기 또는 원자를 포함하며,
    n은 1 내지 4의 정수이되,
    n이 1일 경우, Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 그리고
    n이 2, 3 또는 4일 경우, 하나의 Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 임의의 다른 Rn은 PTM, ULM, CLM과 동일한 화학 구조를 갖는 제2의 CLM, CLM', 제2의 링커, 또는 이들의 임의의 다수 또는 조합에 공유 결합되도록 임의로 변형된다.
  5. 제1항 또는 제4항에 있어서, 상기 CLM은 하기로 표시되는 화학 구조를 갖는, 화합물:
    Figure pct00203

    상기 구조 중,
    W는 CH2, C=O, SO2 및 NH로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    각각의 X는 독립적으로 O, H2로 이루어진 군으로부터 선택되며;
    G는 독립적으로 H, 알킬, OH로 이루어진 군으로부터 선택되고;
    A 및 A'는 독립적으로 알킬, 사이클로알킬, Cl 및 F의 군으로부터 선택되며;
    Rn은 작용기 또는 원자를 포함하고,
    n은 1 내지 4의 정수이되,
    n이 1일 경우, Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 그리고
    n이 2, 3 또는 4일 경우, 하나의 Rn은 링커기(L)에 공유 결합되도록 변형되고, 임의의 다른 Rn은 PTM, ULM, CLM과 동일한 화학 구조를 갖는 제2의 CLM, CLM', 제2의 링커, 또는 이들의 임의의 다수 또는 조합에 공유 결합되도록 임의로 변형된다.
  6. 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 화합물:
    2-[(9R)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[4-({1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}옥시)페닐]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-(4-{5-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]피리미딘-2-일}페닐)에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-{2-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]에틸}아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1R)-1-{4-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]페닐}에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에틸]아세트아마이드
    (1S)-1-{4-[5-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[5-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)피리미딘-2-일]페닐}에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[3-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)프로폭시]페닐}에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]페닐}에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(4-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}부틸)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에틸)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(5-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}펜틸)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로필)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(4-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}부틸)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1S)-1-{4-[2-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)에톡시]-3-플루오로페닐}에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[4-({1-[2-(3-메틸-2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}옥시)페닐]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[4-({1-[2-(1-메틸-2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}옥시)페닐]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1R)-1-[3-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)페닐]에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(3S)-1-{4-[(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에틸)아미노]벤조일}피롤리딘-3-일]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[2-(2-{[3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2-메틸-4-옥소-3,4-다이하이드로퀴나졸린-5-일]아미노}에톡시)에틸]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[3-(3-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}프로폭시)프로필]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(3S)-1-[4-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)벤조일]피롤리딘-3-일]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(4-{2-[2-(2-{[3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2-메틸-4-옥소-3,4-다이하이드로퀴나졸린-5-일]아미노}에톡시)에톡시]에톡시}페닐)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-(5-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}펜틸)아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[3-(3-{[3-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-2-메틸-4-옥소-3,4-다이하이드로퀴나졸린-5-일]아미노}프로폭시)프로필]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(3S)-1-[4-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)벤조일]피롤리딘-3-일]아세트아마이드;
    2-[(9S)-7-(4-클로로페닐)-4,5,13-트라이메틸-3-티아-1,8,11,12-테트라아자트라이사이클로[8.3.0.02,6]트라이데카-2(6),4,7,10,12-펜타엔-9-일]-N-[(1R)-1-[3-(2-{[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1-옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]아미노}에톡시)페닐]에틸]아세트아마이드;
    4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10,13-테트라옥사-1-아자펜타데칸-15-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴;
    4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10-트라이옥사-1-아자도데칸-12-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴;
    4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10,13,16-펜타옥사-1-아자옥타데칸-18-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴; 및
    4-(4-{[(5Z)-3-{1-[2-(2,6-다이옥소피페리딘-3-일)-1,3-다이옥소-2,3-다이하이드로-1H-아이소인돌-4-일]-4,7,10,13,16,19-헥사옥사-1-아자헨아이코산-21-일}-2,4-다이옥소-1,3-티아졸리딘-5-일리덴]메틸}-2-메톡시페녹시)-3-(트라이플루오로메틸)벤조나이트릴, 및 이들의 약제학적으로 허용 가능한 염 형태.
  7. 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 링커 (L)은 하기 식으로 표시되는 화학 구조 단위를 포함하는, 화합물:
    -Aq-
    식 중,
    q는 1보다 큰 정수이고;
    A는 결합, CRL1RL2, O, S, SO, SO2, NRL3, SO2NRL3, SONRL3, CONRL3, NRL3CONRL4, NRL3SO2NRL4, CO, CRL1=CRL2, C=C, SiRL1RL2, P(O)RL1, P(O)ORL1, NRL3C(=NCN)NRL4, NRL3C(=NCN), NRL3C(=CNO2)NRL4, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 C3-11사이클로알킬, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 C3-11헤테로사이클릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 아릴, 0 내지 6개의 RL1 및/또는 RL2기로 임의로 치환된 헤테로아릴로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택되며;
    RL1, RL2, RL3, RL4 및 RL5는 각각, 독립적으로, H, 할로, C1-8알킬, OC1-8알킬, SC1-8알킬, NHC1-8알킬, N(C1-8알킬)2, C3-11사이클로알킬, 아릴, 헤테로아릴, C3-11헤테로사이클릴, OC1-8사이클로알킬, SC1-8사이클로알킬, NHC1-8사이클로알킬, N(C1-8사이클로알킬)2, N(C1-8사이클로알킬)(C1-8알킬), OH, NH2, SH, SO2C1-8알킬, P(O)(OC1-8알킬)(C1-8알킬), P(O)(OC1-8알킬)2, CC-C1-8알킬, CCH, CH=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=CH(C1-8알킬), C(C1-8알킬)=C(C1-8알킬)2, Si(OH)3, Si(C1-8알킬)3, Si(OH)(C1-8알킬)2, COC1-8알킬, CO2H, 할로겐, CN, CF3, CHF2, CH2F, NO2, SF5, SO2NHC1-8알킬, SO2N(C1-8알킬)2, SONHC1-8알킬, SON(C1-8알킬)2, CONHC1-8알킬, CON(C1-8알킬)2, N(C1-8알킬)CONH(C1-8알킬), N(C1-8알킬)CON(C1-8알킬)2, NHCONH(C1-8알킬), NHCON(C1-8알킬)2, NHCONH2, N(C1-8알킬)SO2NH(C1-8알킬), N(C1-8알킬) SO2N(C1-8알킬)2, NH SO2NH(C1-8알킬), NH SO2N(C1-8알킬)2, 및 NH SO2NH2로 이루어진 군으로부터 선택되고; 그리고
    q가 1보다 클 경우, RL1 또는 RL2는, 각각 독립적으로, 다른 A기에 연결되어, 0 내지 4개의 RL5기로 더 치환될 수 있는 사이클로알킬 및/또는 헤테로사이클릴 모이어티를 형성할 수 있다.
  8. 제7항에 있어서, L은 비선형 사슬, 지방족 또는 방향족 또는 헤테로방향족 환식 모이어티를 포함하는, 화합물.
  9. 제7항 또는 제8항에 있어서, L은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된, 화합물:
    Figure pct00204

    Figure pct00205

    Figure pct00206

    식 중, "X"는 헤테로원자를 함유하도록 임의로 치환된 2 내지 14개의 범위의 원자를 가진 선형 사슬이고; 그리고
    "Y"는 O, N, S(O)n(n=0, 1, 2)으로 이루어진 군으로부터 독립적으로 선택된다.
  10. 유효량의 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항의 화합물을 포함하는 조성물.
  11. 유효량의 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항의 화합물 및 약제학적으로 허용 가능한 담체, 첨가제, 및/또는 부형제를 포함하는 약제학적 조성물.
  12. 제11항에 있어서, 추가의 생리활성제를 더 포함하는, 약제학적 조성물.
  13. 제12항에 있어서, 상기 추가의 생리활성제는 항암제인, 약제학적 조성물.
  14. 제13항에 있어서, 상기 항암제는, 에베롤리무스, 트라벡테딘, 아브락산, TLK 286, AV-299, DN-101, 파조파닙, GSK690693, RTA 744, ON 0910.Na, AZD 6244 (ARRY-142886), AMN-107, TKI-258, GSK461364, AZD 1152, 엔자스 타우린, 반데타닙, ARQ-197, MK-0457, MLN8054, PHA-739358, R-763, AT-9263, FLT-3 저해제, VEGFR 저해제, EGFR TK 저해제, 오로라 키나제 저해제, PIK-1 조절인자, Bcl-2 저해제, HDAC 저해제, c-MET 저해제, PARP 저해제, Cdk 저해제, EGFR TK 저해제, IGFR-TK 저해제, 항-HGF 항체, PI3 키나제 저해제, AKT 저해제, mTORC1/2 저해제, JAK/STAT 저해제, 체크포인트-1 또는 2 저해제, 초점 부착 키나제 저해제, Map 키나제 키나제(mek) 저해제, VEGF 트랩 항체, 페메트렉스드, 에를로티닙, 다사타닙, 닐로티닙, 데카타닙, 파니투무맙, 암루비신, 오르고보맙, Lep-etu, 놀라트렉스드, azd2171, 바타불린, 오파투무맙, 자놀리무맙, 에도테카린, 테트란드린, 루비테칸, 테스밀리펜, 오블리메르센, 티실리무맙, 이필리무맙, 고시폴, Bio 111, 131-I-TM-601, ALT-110, BIO 140, CC 8490, 실렌지타이드, 기마테칸, IL13-PE38QQR, INO 1001, IPdR1 KRX-0402, 루칸톤, LY 317615, 뉴라디압, 비테스판, Rta 744, Sdx 102, 탈람파넬, 아트라센탄, Xr 311, 로미뎁신, ADS-100380, 수니티닙, 5-플루오로유라실, 보리노스탯, 에토포사이드, 젬시타빈, 독소루비신, 리포솜 독소루비신, 5'-데옥시-5-플루오로유리딘, 빈크리스틴, 테모졸로마이드, ZK-304709, 셀리시클립; PD0325901, AZD-6244, 카페시타빈, L-글루탐산, N-[4-[2-(2-아미노-4,7-다이하이드로-4-옥소-1H-피롤로[2,3-d]피리미딘-5-일)에틸]벤조일]-, 이나트륨염, 칠수화물, 캄프토테신, PEG-표지화된 이리노테칸, 타목시펜, 토레미펜 구연산염, 아나스트라졸, 에세메스테인, 레트로졸, DES(다이에틸스틸베스트롤), 에스트라다이올, 에스트로겐, 접합 에스트로겐, 베바시주맙, IMC-1C11, CHIR- 258); 3-[5-(메틸설포닐피페라딘메틸)-인돌릴]-퀴놀론, 바탈라닙, AG-013736, AVE-0005, [D-Ser(But)6, Azgly 10]의 아세트산염(피로-Glu-His-Trp-Ser-Tyr-D-Ser(But)-Leu-Arg-Pro-Azgly-NH2 아세트산염[C59H84N18O14-(C2H4O2)X(x = 1 내지 2.4)], 고세렐린 아세트산염, 류프롤라이드 아세트산염, 트립토렐린 파모산염, 메드록시프로게스테론 아세트산염, 하이드록시프로게스테론 카프론산염, 메게스트롤 아세트산염, 랄록시펜, 비칼루타마이드, 플루타마이드, 닐루타마이드, 메게스트롤 아세트산염, CP-724714; TAK-165, HKI-272, 에를로티닙, 라파타닙, 카넬티닙, ABX-EGF 항체, 어비툭스, EKB-569, PKI-166, GW-572016, 로나파르닙, BMS-214662, 티피파르닙; 아미포스틴, NVP-LAQ824, 수베로일 아날라이드 하이드록삼산, 발프로산, 트리코스타틴 A, FK-228, SU11248, 소라페닙, KRN951, 아미노글루테티마이드, 암사크라인, 아나그렐라이드, L-아스파라기나제, 칼메트-게랑 간균(Bacillus Calmette-Guerin)(BCG) 백신, 아드리아마이신, 블레오마이신, 부세레린, 부설판, 카보플라틴, 카무스틴, 클로람부실, 시스플라틴, 클라드리빈, 클로드로네이트, 시프로테론, 시타라빈, 다카바진, 닥티노마이신, 다우노루비신, 다이에틸스틸베스트롤, 에피루비신, 플루다라빈, 플루드로콜티손, 플루오시메스테론, 플루타마이드, 글리벡(Gleevec), 젬시타빈, 하이드록시요소, 이다루비신, 이포스파마이드, 이마티닙, 류프롤라이드, 레바미솔, 로무스틴, 메클로르에타민, 멜팔란, 6-메르캅토퓨린, 메스나, 메토트렉사트, 미토마이신, 미토탄, 미톡산트론, 닐루타마이드, 옥트레오타이드, 옥살리플라틴, 파마이드로네이트, 펜토스타틴, 플리카마이신, 포르피머, 프로카바진, 랄티트렉스드, 리툭시맙, 스트렙토조신, 테니포사이드, 테스토스테론, 탈리도마이드, 티오구아닌, 티오테파, 트레티노인, 빈데신, 13-시스-레티노산, 페닐알라닌 머스타드, 유라실 머스타드, 에스트라무스틴, 알트레타민, 플록수리딘, 5-데옥시유리딘, 시토신 아라비노사이드, 6-메르캅토퓨린, 데옥시코포르마이신, 칼시트라이올, 발루비신, 미트라마이신, 빈블라스틴, 비노렐빈, 토포테칸, 라족신, 마리마스타트, COL-3, 네오바스타트, BMS-275291, 스쿠알라민, 엔도스타틴, SU5416, SU6668, EMD121974, 인터류킨-12, IM862, 앤지오스타틴, 비탁신, 드롤록시펜, 이독시펜, 스피로놀락톤, 피나스테라이드, 시미티딘, 트라스투주맙, 데닐류킨 디프티톡스, 제피티닙, 보르테지밉, 파클리탁셀, 크레모포-무함유 파클리탁셀, 도세탁셀, 에피틸론 B, BMS-247550, BMS-310705, 드롤록시펜, 4-하이드록시타목시펜, 피펜독시펜, ERA-923, 아르족시펜, 풀베스트란트, 아콜비페네, 라소폭시펜, 이독시펜, TSE-424, HMR-3339, ZK186619, 토포테칸, PTK787/ZK 222584, VX-745, PD 184352, 라파마이신, 40-O-(2-하이드록시에틸)-라파마이신, 템시롤리무스, AP-23573, RAD001, ABT-578, BC-210, LY294002, LY292223, LY292696, LY293684, LY293646, 워트만닌, ZM336372, L-779,450, PEG-필그라스팀, 다베포에틴, 에리트로포이에틴, 과립구 집락 자극 인자, 졸렌드로네이트, 프레드니손, 세툭시맙, 과립구 대식세포 집락 자극 인자, 히스트렐린, 페길화된 인터페론 알파-2a, 인터페론 알파-2a, 페길화된 인터페론 알파-2b, 인터페론 알파-2b, 아자시티딘, PEG-L-아스파라기나제, 레날리도마이드, 젬투주맙, 하이드로코르티손, 인터류킨-11, 덱스라족세인, 알렘투주맙, 올-트랜스 레티노산, 케토코나졸, 인터류킨-2, 메게스트롤, 면역글로불린, 질소 머스타드, 메틸프레드니솔론, 이브리투모맙 튜세탄, 안드로겐, 데시타빈, 헥사메틸멜라민, 벡사로텐, 토시투모맙, 삼산화비소, 코르티손, 에디트로네이트, 미토탄, 시클로스포린, 리포솜 다우노루비신, 에드위나-아스파라기나제, 스트론튬 89, 카소피탄트, 네투피탄트, NK-1 수용체 길항제, 팔로노세트론, 아프레피탄트, 다이펜하이드라민, 하이드록시진, 메토클로프라마이드, 로라제팜, 알프라졸람, 할로페리돌, 드로페리돌, 드로나비놀, 덱사메타손, 메틸프레드니솔론, 프로클로르페라진, 그라니세트론, 온단세트론, 도라세트론, 트로피세트론, 페그필그라스팀, 에리트로포이에틴, 에포에틴 알파, 다베포에틴 알파, 및 이들의 혼합물로 이루어진 군으로부터 선택되는, 약제학적 조성물.
  15. 세포에서 표적 단백질의 분해를 유도하기 위한 방법에 있어서, 유효량의 제1항의 화합물을 상기 세포에 투여하는 단계를 포함하되, 상기 화합물은 상기 표적 단백질의 분해를 유발시키는, 세포에서 표적 단백질의 분해를 유도하기 위한 방법.
  16. 암의 치료 방법에서 사용하기 위한 유효량의 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항의 화합물을 포함하는 조성물로서, 상기 방법은 암의 치료를 필요로 하는 환자에게 상기 조성물을 투여하는 단계를 포함하고, 상기 조성물은 상기 환자에서 암의 적어도 하나의 증상을 치료 또는 완화를 달성하는, 조성물.
  17. 제16항에 있어서, 상기 암은 편평 세포 암종, 기저 세포 암종, 선암종, 간세포 암종, 및 신장 세포 암종, 방광암, 장암, 유방암, 자궁경부암, 결장암, 식도암, 두부암, 신장암, 간암, 폐암, 목암, 난소암, 췌장암, 전립선암 및 위암; 백혈병; 양성 및 악성 림프종, 특히 버킷 림프종 및 비호지킨 림프종; 양성 및 악성 흑색종; 골수증식성 질환; 다발성 골수종, 유잉 육종, 혈관육종, 카포시 육종, 지방육종, 근육종, 말초 신경상피종, 윤활막 육종, 신경교종, 성상세포종, 희돌기교종, 뇌실막세포종, 교아종, 신경모세포종, 신경절신경종, 신경절교종, 수모세포종, 송과체 세포 종양, 수막종, 뇌막 육종, 신경섬유종 및 신경초종을 비롯한 육종; 장암, 유방암, 전립선암, 자궁경부암, 자궁암, 폐암, 난소암, 고환암, 갑상선암, 성상세포종, 식도암, 췌장암, 위암, 간암, 결장암, 흑색종; 암육종, 호지 킨병, 빌름스 종양 또는 기형암종, T-계통 급성 림프모구성 백혈병(T-ALL), T-계통 림프모구성 림프종(T-LL), 말초 T-세포 림프종, 성체 T-세포 백혈병, Pre-B ALL, Pre-B 림프종, 큰 B-세포 림프종, 버킷 림프종, B-세포 ALL, 필라델피아 염색체 양성 ALL 및 필라델피아 염색체 양성 CML인, 조성물.
  18. 제1항, 제4항 및 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 CLM은 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 구조를 갖는 PTM에 커플링되는, 화합물 또는 이의 약제학적으로 허용 가능한 염 형태:
    Figure pct00207

    Figure pct00208

    Figure pct00209

    Figure pct00210

    식 중, R 또는 링커는 상기 CLM을 상기 PTM에 커플링시키는 화학적 링커 모이어티 또는 결합이다.
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