JP7523219B2 - Ctla-4に対する単一ドメイン抗体及びその変異体 - Google Patents
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Description
本発明は、2016年10月11日に出願された国際特許出願第PCT/CN2016/101777号、及び2017年7月20日に出願された国際特許出願第PCT/CN2017/093644号の利益を主張し、これらの出願は、それらの全体を参照することによって本明細書に組み込まれる。
ASCIIテキストファイル上の以下の提出物の内容、すなわち、コンピューターで読取り可能な形態(CRF)の配列表(ファイル名:761422000341SeqList.txt、記録日:2017年10月9日、サイズ:699KB)は、その全体を参照することによって本明細書に組み込まれる。
[技術分野]
(1)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;または
(27)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体を含む。
(1)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;または
(27)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;またはCDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体を含む。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
CTLA-4を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分を含む単離抗CTLA-4構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号17~32及び213~222のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号49~64、233~242、及び339のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号81~96及び253~262のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、前記単離抗CTLA-4構築物。
(項目2)
前記sdAb部分が、配列番号17~32及び213~222のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号49~64、233~242、及び339のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号81~96及び253~262のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、項目1に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目3)
前記sdAb部分が、以下:
(1)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;または
(27)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、項目1または2に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目4)
前記sdAb部分が、以下:
(1)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;または
(27)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、項目1~3のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目5)
前記sdAb部分が、以下:
a-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、V、L、A、H、S、I、W、C、N、G、D、T、及びPからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、E、Q、G、D、A、K、R、L、P、S、V、H、T、N、W、M、及びIからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、P、H、F、G、Q、S、E、T、Y、C、I、D、及びVからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、S、K、A、M、Y、I、F、T、N、V、Q、P、E、及びCからなる群から選択され;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Q、L、R、P、E、K、S、T、M、A、及びHからなる群から選択され;または
b-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E及びQからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、R及びLからなる群から選択され;
b-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、及びSからなる群から選択され;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択され;または
c-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
c-2)44位のアミノ酸残基が、A、G、E、D、Q、R、S、及びLからなる群から選択され;
c-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、及びCからなる群から選択され;
c-4)103位のアミノ酸残基が、P、R、及びSからなる群から選択され;及び
c-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択される;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメインを含み、
前記アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位がQである場合、108位が、Lに適宜ヒト化することができる、項目1~4のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目6)
前記sdAb部分が、配列番号113~129、200~202、274~282、341~344、352、及び353のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または配列番号113~129、200~202、274~282、341~344、352、及び353のいずれか1つに対して少なくとも約80%の配列同一性を有するその変異体を含む、項目1~5のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目7)
前記sdAb部分が、配列番号113~129、200~202、274~282、341~344、352、及び353のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または前記V H Hドメインにおいて最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、項目6に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目8)
前記sdAb部分が、配列番号114、129、201、202、274~282、341~344、352、及び353のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメインを含む、項目7に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目9)
前記sdAb部分と前記CTLA-4の間の結合のK d が、約10 -5 M~約10 -12 Mである、項目1~8のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目10)
前記sdAb部分と前記CTLA-4の間の結合のK d が、約10 -7 M~約10 -12 Mである、項目9に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目11)
CTLA-4を特異的に認識する前記sdAb部分が、ラクダ、キメラ、ヒト、部分ヒト化、または完全ヒト化である、項目1~10のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目12)
前記単離抗CTLA-4構築物が、重鎖のみ抗体(HCAb)である、項目1~11のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目13)
前記HCAbが、単量体または二量体である、項目12に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目14)
前記HCAbが、配列番号130~133、283~291、及び366~371のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目12または13に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目15)
前記単離抗CTLA-4構築物が、第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分をさらに含む、項目1~11のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目16)
前記第2の抗体部分が、完全長抗体、Fab、Fab’、(Fab’)2、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、ダイアボディ、またはsdAbである、項目15に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目17)
前記抗CTLA-4構築物が、多重特異性である、項目15または16に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目18)
CTLA-4を特異的に認識する前記sdAb部分、及び前記第2の抗体部分が、ペプチドリンカーによって適宜連結される、項目15~17のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目19)
前記ペプチドリンカーが、配列番号162、163、307、または365のアミノ酸配列を含む、項目18に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目20)
前記第2の抗体部分が、2つの重鎖及び2つの軽鎖からなる完全長抗体である、項目15~19のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目21)
CTLA-4を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つのC末端に融合される、項目20に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目22)
CTLA-4を特異的に認識する前記sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つのN末端に融合される、項目20に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目23)
CTLA-4を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1つのC末端に融合される、項目20に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目24)
CTLA-4を特異的に認識する前記sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1つのC末端に融合される、項目20に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目25)
前記抗CTLA-4構築物が、CTLA-4を特異的に認識する4つのsdAb部分を含み、CTLA-4を特異的に認識する各sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の各鎖のN末端に融合される、項目20に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目26)
前記完全長抗体が、PD-1を特異的に認識する、項目20~25のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目27)
前記完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目26に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目28)
前記完全長抗体が、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目26に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目29)
前記完全長抗体が、配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目26に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目30)
前記完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAbに融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号134~145、292~296、及び319~323のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目26~29のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目31)
前記完全長抗体が、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAbに融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号146~157、297~301、及び324~328のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目26~29のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目32)
前記完全長抗体が、配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAbに融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号310~318及び329~337のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目26~29のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目33)
前記完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAbに融合され、前記軽鎖融合ポリペプチドが、配列番号354及び355のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目26~29のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目34)
前記完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗CTLA-4 sdAbが、前記完全長抗体の重鎖及び軽鎖の両方のN末端に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号356のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖融合ポリペプチドが、配列番号357のアミノ酸配列を含む、項目26~29のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目35)
前記抗CTLA-4構築物が、CTLA-4を特異的に認識する4つの同一なsdAbを含み、CTLA-4を特異的に認識する2つのsdAbが一緒に融合し、前記完全長抗体の各重鎖のN末端にさらに融合される、項目26~29のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目36)
前記完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号358のアミノ酸配列を含む、項目35に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目37)
前記完全長抗体が、PD-L1を特異的に認識する、項目20~25のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目38)
前記完全長抗体が、配列番号195のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号196のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目37に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目39)
前記完全長抗体が、配列番号197のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号198のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、項目37に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目40)
前記完全長抗体が、配列番号195のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号196のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAbに融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号171~182、302~306、及び345~349のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目37~39のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目41)
前記完全長抗体が、配列番号197のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号198のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAbに融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号183~194のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、項目37~39のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(項目42)
CTLA-4を特異的に認識するsdAb部分を含む単離抗CTLA-4構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号113~129、200~202、274~282、341~344、352、及び353のうちのいずれか1つのCDR1、CDR2、及びCDR3を含む、前記単離抗CTLA-4構築物。
(項目43)
項目1~42のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物と競合的にCTLA-4に特異的に結合する、単離抗CTLA-4構築物。
(項目44)
項目1~43のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物、及び医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
(項目45)
CTLA-4関連疾患を有する個体の治療方法であって、前記個体に有効量の項目44に記載の医薬組成物を投与することを含む、前記方法。
(項目46)
前記CTLA-4関連疾患が、がんである、項目45に記載の方法。
(項目47)
前記がんが、固形腫瘍である、項目46に記載の方法。
(項目48)
前記がんが、大腸癌である、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記個体に追加のがん療法を投与することをさらに含む、項目45~48のいずれか1項に記載の方法。
(項目50)
前記医薬組成物が、全身投与される、項目45~49のいずれか1項に記載の方法。
(項目51)
前記医薬組成物が、局所投与される、項目45~49のいずれか1項に記載の方法。
「細胞傷害性Tリンパ球関連抗原-4」、「CTLA-4」、「CTLA4」、「CTLA-4抗原」、及び「CD152」(例えば、Murata(1999)AM.J.Pathol.155:453-460を参照されたい)という用語は、交換可能に使用され、ヒトCTLA-4の変異体、アイソフォーム、種ホモログ、及びCTLA-4との少なくとも1つの共通エピトープを有するアナログを含む(例えば、Balzano(1992)InJ.Cancer Suppl.7:28-32を参照されたい)。従って、本発明の抗CTLA-4構築物は、ある特定の場合には、ヒト以外の種に由来するCTLA-4、またはヒトCTLA-4に構造的に関連する他のタンパク質(例えば、ヒトCTLA-4ホモログ)と交差反応し得る。他の場合には、抗CTLA-4構築物は、ヒトCTLA-4に対して完全に特異的であり得、種または他の種類の交差反応性を示さない場合がある。
(I)抗CTLA-4単一ドメイン抗体部分
本明細書に記載の単離抗CTLA-4構築物は、CTLA-4(または「抗CTLA-4 sdAb」)を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分を含む。いくつかの実施形態では、単離抗CTLA-4構築物は、抗CTLA-4 sdAbである。
例示のsdAbとしては、重鎖のみ抗体に由来する重鎖可変ドメイン(例えば、ラクダ科におけるVHH(重鎖抗体の重鎖の可変ドメイン)または軟骨魚類におけるVNAR(サメ新抗原受容体の可変ドメイン))、軽鎖を天然に欠く結合分子、慣用の4鎖抗体に由来する単一ドメイン(例えば、VHまたはVL)、ヒト化重鎖のみ抗体、ヒト重鎖セグメントを発現するトランスジェニックマウスまたはラットにより産生されたヒト単一ドメイン抗体、ならびに抗体に由来するもの以外の操作されたドメイン及び単一ドメイン足場が挙げられるが、これらに限定されるものではない。sdAbは、マウス、ラット、ヒト、ラクダ、ラマ、ヤツメウナギ、サカナ、サメ、ヤギ、ウサギ、及びウシを含むが、これらに限定されない任意の種由来であってもよい。本明細書で検討される単一ドメイン抗体は、ラクダ科及びサメ以外の種に由来する天然に生じる単一ドメイン抗体分子も含む。
CTLA-4は、細胞外Vドメイン、膜貫通ドメイン、及び細胞質尾部を含む。選択的スプライス変異体によってコードされるいくつかのアイソフォームが特徴付けられている。膜結合アイソフォームは、ジスルフィド結合によって相互連結されるホモ二量体として機能する一方、可溶性アイソフォームは、モノマーとして機能する。CTLA-4は、CD28のものと同様の細胞内ドメインを有し、これは、固有の触媒活性が欠如し、PI3K、PP2A、及びSHP-2に結合することができる1つのYVKMモチーフ、ならびにSH3含有タンパク質に結合することができる1つのプロリンリッチモチーフを含む。
抗体または抗原結合ドメインの結合特異性は、当該技術分野で公知の方法によって実験的に決定することができる。そのような方法は、ウェスタンブロット、ELISA-、RIA-、ECL-、IRMA-、EIA-、BIAcore試験及びペプチドスキャンを含むが、これらに限定されるものではない。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗CTLA-4 sdAb部分は、キメラ抗体である。ある特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号、及びMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855(1984)に記載されている。一例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、ラクダ科の種、例えば、ラマに由来する可変領域)及びヒト定常領域を含む。さらなる例では、キメラ抗体は、クラスまたはサブクラスが親抗体のものから変更された「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗CTLA-4 sdAb部分は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野で公知の様々な技術を用いて生産することができる。ヒト抗体は、一般的に、van Dijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)及びLonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450-459(2008)に記載されている。完全ヒト単一ドメイン抗体を産生することができるトランスジェニックマウスまたはラットは、当該技術分野で公知である。例えば、US20090307787A1、米国特許第8,754,287号、US20150289489A1、US20100122358A1、及びWO2004049794を参照されたい。
本発明の抗体は、所望の活性(複数可)を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって単離することができる。例えば、種々の方法が、ファージ提示ライブラリーを生成し、所望の結合特性を有する抗体についてそのようなライブラリーをスクリーニングするために、当該技術分野で知られている。そのような方法は、例えば、Hoogenboom et al.in Methods in Molecular Biology 178:1-37(O’Brien et al.,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2001)に総説され、さらに、例えば、McCafferty et al.,Nature 348:552-554;Clackson et al.,Nature 352:624-628(1991);Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Marks and Bradbury,in Methods in Molecular Biology 248:161-175(Lo,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2003);Sidhu et al.,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee et al.,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):12467-12472(2004);及びLee et al.,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)に記載されている。単一ドメイン抗体ライブラリーを構築する方法は、例えば、米国特許第7371849号に記載されている。
本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAb部分の生物学的活性は、その50%阻害濃度(IC50)を測定することで決定することができ、これは、特異的な生物学的または生化学的機能を阻害する(例えば、CTLA-4及びそのリガンドB7-1及び/またはB7-2の間の結合を阻害する)抗体の有効性の尺度である。例えば、ここで、IC50は、CTLA-4生物活性の50%をインビトロで中和するのに必要な抗CTLA-4 sdAbの有効濃度を示すために使用することができる。IC50は、作動薬または他の物質(例えば、抗体)のEC50に匹敵する。EC50は、最大効果の50%をインビボで得るために必要な血漿濃度も表す。IC50またはEC50は、当該技術分野で公知のアッセイ、例えば、FACS分析(競合結合アッセイ)によるリガンド結合の阻害などのバイオアッセイ、細胞ベースサイトカイン放出アッセイ、または増幅発光近接均質アッセイ(AlphaLISA)によって測定することができる。
抗CTLA-4 sdAb部分を含む抗CTLA-4構築物は、任意の可能な形式のものであり得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAb部分は、リンカー配列を適宜介して、1つ以上の(好ましくは、ヒト)CH2及び/またはCH3ドメイン、例えば、Fc断片に連結して、その半減期をインビボで増加させることができる。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4構築物は、1つ以上の他の抗体部分(例えば、別の抗原または別のエピトープを特異的に認識する抗体部分)に融合した本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAb部分を含む。1つ以上の他の抗体部分は、任意の抗体または抗体断片形式、例えば、多重特異性sdAb(例えば、二重特異性sdAb)、完全長抗体、Fab、Fab’、(Fab’)2、Fv、一本鎖Fv(scFv)、scFv-scFv、ミニボディ、ダイアボディ、またはsdAbであり得る。いくつかの実施形態では、1つ以上の抗体部分は、重鎖可変ドメイン(VH)及び軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。ある特定の抗体断片の総説については、Hudson et al.Nat.Med.9:129-134(2003)を参照されたい。scFv断片の総説については、例えば、Pluckthun,in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,(Springer-Verlag,New York),pp.269-315(1994)を参照されたい;WO93/16185;及び米国特許第5,571,894号及び同第5,587,458号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、かつインビボ半減期を増加させたFab及びF(ab’)2断片の議論については、米国特許第5,869,046号を参照されたい。多重特異性抗体の概説については、Weidle et al.,Cancer Genomics Proteomics,10(1):1-18,2013;Geering and Fussenegger,Trends Biotechnol.,33(2):65-79,2015;Stamova et al.,Antibodies,1(2):172-198,2012を参照されたい。ダイアボディは、二価または二重特異性であり得る2つの抗原結合部位を有する抗体断片である。例えば、EP404,097;WO1993/01161;Hudson et al.,Nat.Med.9:129-134(2003);及びHollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448(1993)を参照されたい。トリアボディ及びテトラボディもまた、Hudson et al.,Nat.Med.9:129-134(2003)に記載されている。抗体断片は、種々の技術で作製することができ、限定されないが、本明細書に記載されるように、無傷抗体の分解、ならびに組み換え宿主細胞(例えば、E.coliまたはファージ)による産生を含む。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4構築物内の2つ以上の抗体部分(例えば、抗CTLA-4 sdAb、VH及びVLを含む完全長抗体または抗原結合部分)は、場合により、ペプチドリンカーによって連結することができる。抗CTLA-4構築物で使用されるペプチドリンカー(複数可)の長さ、柔軟性の程度、及び/または他の特性は、1つ以上の特定の抗原またはエピトープに対する親和性、特異性、またはアビディティを含むが、これらに限定されない特性にいくらかの影響を与え得る。例えば、2つの隣接するドメインが互いに立体的に干渉しないことを確実にするために、より長いペプチドリンカーが選択され得る。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、隣接するドメインが互いに自由に動くように、フレキシブル残基(例えば、グリシン及びセリン)を含む。例えば、グリシン-セリンダブレットは、適当なペプチドリンカーであり得る。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4構築物は、第2の抗体部分に融合した本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAb部分を含み、第2の抗体部分は、2つの重鎖及び2つの軽鎖からなる完全長抗体(例えば、抗PD-1または抗PD-L1完全長抗体)である。CTLA-4及びPD-1に対する二重特異性を含む構築物は、「抗CTLA-4/PD-1抗体」、「抗CTLA-4/PD-1構築物」、または「CTLA-4×PD-1抗体」と以下で呼ばれる。CTLA-4及びPD-L1に対する二重特異性を含む構築物は、「抗CTLA-4/PD-L1抗体」、「抗CTLA-4/PD-L1構築物」、または「CTLA-4×PD-L1抗体」と以下で呼ばれる。
いくつかの実施形態では、重鎖可変ドメイン(VH)及び軽鎖可変ドメイン(VL)を含む完全長抗体または抗原結合断片に融合した本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAb部分を含む抗CTLA-4構築物であって、抗CTLA-4構築物は、多重特異性である(「多重特異性抗CTLA-4構築物」または「抗CTLA-4多重特異性抗原結合タンパク質(MABP)」と以下で呼ばれる)、抗CTLA-4構築物が提供される。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4 MABPは、二重特異性(「二重特異性抗CTLA-4構築物」または「抗CTLA-4二重特異性抗原結合タンパク質(BABP)」と以下で呼ばれる)である。抗CTLA-4 sdAbは、完全長抗体または抗原結合断片により認識される標的(複数可)とは異なるCTLA-4に特異的に結合することで、より広範な標的化能力を与える。sdAbの小さいサイズのため、いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗CTLA-4 MABPは、完全長抗体または抗原結合断片成分のものと比較して、同様の分子量及び薬物動態特性を有し得る。例えば、抗CTLA-4 MABPは、臨床効果及び安全性が証明されたモノクローナル抗体に1つ以上のsdAbを融合させることで設計し、多重特異性構築物の発現性を妨げることなく臨床的有用性の増加及び望ましい薬物動態特性を提供することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の1つ以上の抗CTLA-4 sdAbは、適宜ペプチドリンカーによって完全長抗体または抗原結合断片に融合される。本明細書に記載の抗CTLA-4 MABPは、CTLA-4を加えた種々の疾患関連エピトープまたは抗原の組み合わせ、例えば、免疫チェックポイント分子、細胞表面抗原(例えば、腫瘍抗原)、またはプロ炎症性分子との組み合わせによるCTLA-4を標的にするように使用し、種々の疾患及び条件、例えば、がん、炎症、及び自己免疫疾患の治療に有用な薬剤を提供することができる。
抗CTLA-4 MABPの第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分は、互いに融合される(すなわち、共有結合される)。従って、本発明の抗CTLA-4 MABPは、1つ以上の融合ポリペプチドを含む。各融合ポリペプチドは、本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAbを含む第1の抗原結合部分、及び第2の抗原結合部分に由来するポリペプチドを含み得る。
抗CTLA-4 MABP(例えば、BABP)は、重鎖可変ドメイン(VH)及び軽鎖可変ドメイン(VL)を含む少なくとも1つの抗原結合部分を含む。そのような抗原結合部分は、2つの重鎖及び2つの軽鎖からなる完全長の従来抗体、またはそれらに由来する抗原結合断片であり得る。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4 MABP(例えば、BABP)は、(a)本明細書に記載のCTLA-4を特異的に認識するsdAbを含む第1の抗原結合部分、及び(b)重鎖可変ドメイン(VH)及び軽鎖可変ドメイン(VL)を含む第2の抗原結合部分を含み、VH及びVLは一緒に、PD-1に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分は、互いに融合され、「CTLA-4×PD-1 BABP」または「CTLA-4×PD-1 BABP」と以下で呼ばれる。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4 MABP(例えば、BABP)は、(a)本明細書に記載のCTLA-4を特異的に認識するsdAbを含む第1の抗原結合部分、及び(b)重鎖可変ドメイン(VH)及び軽鎖可変ドメイン(VL)を含む第2の抗原結合部分を含み、VH及びVLは一緒に、PD-L1に特異的に結合する抗原結合部位を形成し、第1の抗原結合部分及び第2の抗原結合部分は、互いに融合され、「CTLA-4×PD-L1 BABP」または「CTLA-4×PD-L1 BABP」と以下で呼ばれる。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗体のアミノ酸配列変異体が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/または他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードする核酸配列に適切な改変を導入するか、またはペプチド合成によって調製し得る。そのような改変には、例えば、抗体のアミノ酸配列内における残基の欠失、及び/または挿入、及び/または置換が含まれる。最終構築物が所望の特徴(例えば、抗原結合)を有する限り、最終構築物に到達するために、欠失、挿入及び置換のいかなる組み合わせをも行うことができる。
いくつかの実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換を有する抗体変異体を提供する。置換突然変異誘発のための目的の部位には、HVR及びFRが含まれる。保存的置換は、「好ましい置換」という見出しの下で表3に示す。より実質的な変化は、「例示的な置換」という見出しの下で表3に提供し、これは、アミノ酸側鎖クラスに関連して以下にさらに記載する通りである。アミノ酸置換を目的の抗体に導入し、生成物を所望の活性、例えば、保持/改善された抗原結合、低減した免疫原性、または改善されたADCCもしくはCDCについて、スクリーニングすることができる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖配向に影響を及ぼす残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗CTLA-4構築物を変化させて、構築物がグリコシル化される程度を増加または減少させる。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つ以上のグリコシル化部位が作出または除去されるようにアミノ酸配列を変化させることによって、簡便に達成することができる。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗CTLA-4構築物のFc領域に1つ以上のアミノ酸改変を導入することにより、Fc領域変異体を生成させてもよい。Fc領域変異体は、1つ以上のアミノ酸位置にアミノ酸改変(例えば、置換)を含むヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4 Fc領域)を含み得る。
いくつかの実施形態では、抗体の1つ以上の残基がシステイン残基で置換されている、システイン改変抗CTLA-4構築物、例えば、「チオMAb」を作製することが望まれ得る。特定の実施形態では、置換された残基は、抗体のアクセス可能な部位で起きる。それらの残基をシステインで置換することにより、反応性チオール基は、それによって抗体のアクセス可能な部位に配置され、本明細書中でさらに記載されるように、イムノコンジュゲートを作製するために、例えば、薬物部分またはリンカー-薬剤部分などの他の部分に抗体をコンジュゲートするために使用することができる。いくつかの実施形態では、以下の残基のいずれか1つ以上がシステインで置換され得る:軽鎖のA118(EU番号付け);及び重鎖Fc領域のS400(EU番号付け)。システイン改変抗CTLA-4構築物は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されるように生成され得る。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗CTLA-4構築物は、当該技術分野で知られ、容易に入手されている追加の非タンパク質部分を含むようにさらに改変することができる。抗体の誘導体化に適した部分としては、限定されないが、水溶性ポリマーが挙げられる。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールの共重合体、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ-1,3-ジオキソラン、ポリ-1,3,6-トリオキソラン、エチレン/無水マレイン酸共重合体、ポリアミノ酸(単独重合体またはランダム共重合体のいずれか)及びデキストランまたはポリ(n-ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロピレングリコール単独重合体、プロピレンオキシド/エチレンオキシド共重合体、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール及びこれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されるものではない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、その水中での安定性のために製造上の利点を有し得る。ポリマーは、いずれかの分子量のものであり得、分枝鎖または未分枝鎖であり得る。抗体に結合するポリマーの数は、変動し得、1つ以上の重合体が結合する場合、それらは同じかまたは異なる分子であることができる。一般的に、誘導体化に使用するポリマーの数及び/または種類は、限定されないが、向上させるべき抗体の特定の特性または機能、抗体誘導体が特定の条件下で治療に使用されるのかなどを考慮しながら決定することができる。
本明細書に記載されるようにCTLA-4を特異的に認識するsdAbを含む抗CTLA-4構築物のいずれか1つ(例えば、抗CTLA-4 sdAb、抗CTLA-4 HCAb、抗CTLA-4/PD-1二重特異性抗体(例えば、CTLA-4×PD-1 BABP)、または抗CTLA-4/PD-L1二重特異性抗体(例えば、CTLA-4×PD-L1 BABP))、及び適宜、医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物が本発明でさらに提供される。医薬組成物は、所望の純度を有する本明細書に記載の抗CTLA-4構築物を、医薬的に許容可能な担体、賦形剤、または安定剤と適宜混合することにより(Remington’s Pharmaceutical sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製することができる。
本明細書に記載されるようにCTLA-4を特異的に認識するsdAbを含む抗CTLA-4構築物(例えば、抗CTLA-4 sdAb、抗CTLA-4 HCAb、抗CTLA-4/PD-1二重特異性抗体(例えば、CTLA-4×PD-1 BABP)、または抗CTLA-4/PD-L1二重特異性抗体(例えば、CTLA-4×PD-L1 BABP))、及びその組成物(例えば、医薬組成物)は、種々の用途、例えば、診断、分子アッセイ、及び治療において有用である。
本明細書に記載の抗CTLA-4構築物(例えば、抗CTLA-4単一ドメイン抗体)は、当該技術分野で公知の任意の方法を用いて、または本明細書に記載されるように調製され得る。実施例1~4、6、及び8も参照されたい。
a)ベクター構築
本発明の抗体をコードするポリ核酸配列は、標準的な組み換え技術を使用して得ることができる。所望のポリ核酸配列は、抗体産生細胞、例えば、ハイブリドーマ細胞から単離し、配列決定してもよい。あるいは、ポリヌクレオチドをヌクレオチドシンセサイザーまたはPCR技術を使用して合成することができる。一旦得られると、ポリペプチドをコードする配列を、原核生物宿主において異種ポリヌクレオチドを複製及び発現することができる組み換えベクター中に挿入する。当該技術分野において利用可能で公知の多くのベクターを、本発明の目的のために使用することができる。適切なベクターの選択は、ベクター中に挿入される核酸のサイズ及びそのベクターを用いて形質転換される特定の宿主細胞に主に依存するであろう。各ベクターは、その機能(異種ポリヌクレオチドの増幅もしくは発現、または両方)及びそれが存在する特定の宿主細胞とのその適合性に応じて、種々の成分を含む。ベクター成分は、一般的に、限定はされないが、以下:複製起点、選択マーカー遺伝子、プロモーター、リボゾーム結合部位(RBS)、シグナル配列、異種核酸インサート、及び転写終結配列を含む。
本発明の抗体を発現させるために適した原核生物宿主細胞は、古細菌と真正細菌、例えば、グラム陰性またはグラム陽性生物などを含む。有用な細菌の例としては、Escherichia(例えば、E.coli)、Bacilli(例えば、B.subtilis)、腸内細菌、シュードモナス属(例えば、P.aeruginosa)、Salmonella typhimurium、Serratia marcescans、Klebsiella、Proteus、Shigella、Rhizobia、Vitreoscilla、またはParacoccusが挙げられる。いくつかの実施形態では、グラム陰性細胞を使用する。いくつかの実施形態では、E.coli細胞を本発明のための宿主として使用する。E.coli株の例としては、W3110株(Bachmann,Cellular and Molecular Biology,vol.2(Washington,D.C.:American Society for Microbiology,1987),pp.1190-1219;ATCCDeposit No.27,325)及びその誘導体が挙げられ、遺伝子型W3110 AfhuA(AtonA)ptr3 lac Iq lacL8 AompT A(nmpc-fepE)degP41 kanR(米国特許第5,639,635号)を有する33D3株を含む。他の株及びその誘導体、例えば、E.coli 294(ATCC 31,446)、E.coli B、E.coli 1776(ATCC 31,537)及びE.coli RV308(ATCC 31,608)なども適する。これらの例は、限定的よりも、むしろ説明的である。定義された遺伝子型を有する上記の細菌のいずれかの誘導体を構築するための方法が、当該技術分野において公知であり、例えば、Bass et al.,Proteins,8:309-314(1990)に記載される。一般的に、細菌の細胞におけるレプリコンの複製能を考慮に入れて適切な細菌を選択することが必要である。例えば、E.coli、Serratia、またはSalmonella属が、周知のプラスミド(例えば、pBR322、pBR325、pACYC177、またはpKN410など)を、レプリコンを供給するために使用する場合、宿主として使用するのに適し得る。
宿主細胞を上記の発現ベクターを用いて形質転換し、プロモーターを誘導し、形質転換体を選択し、または所望の配列をコードする遺伝子を増幅するために適宜改変された従来の栄養培地中で培養する。形質転換は、DNAを原核生物宿主中に導入し、DNAが、染色体外エレメントとしてまたは染色体組み込み体のいずれかとして複製可能であることを意味する。使用する宿主細胞に応じて、形質転換は、そのような細胞に適切である標準的な技術を使用して行う。塩化カルシウムを用いたカルシウム処理は、実質的な細胞壁バリアを含む細菌細胞のために一般的に使用される。形質転換のための別の方法では、ポリエチレングリコール/DMSOを用いる。使用されるさらに別の技術は、エレクトロポレーションである。
本明細書において産生される抗体をさらに精製し、さらなるアッセイ及び使用のための実質的に均質である調製物を得る。当該技術分野において公知の標準的なタンパク質精製方法を用いることができる。以下の手順:免疫親和性カラムまたはイオン交換カラム上での分画、エタノール沈殿、逆相HPLC、シリカ上または陽イオン交換樹脂(例えば、DEAEなど)上でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、SDS-PAGE、硫安塩析、及びゲルろ過(例えば、Sephadex G-75を使用)は、適した精製手順の例示である。
真核生物での発現のために、ベクター成分は、一般的に、限定はされないが、以下:シグナル配列、複製起点、1つ以上のマーカー遺伝子、ならびにエンハンサーエレメント、プロモーター、及び転写終結配列の1つ以上を含む。
真核生物宿主における使用のためのベクターはまた、成熟タンパク質またはポリペプチドのN末端に特定の切断部位を有するシグナル配列または他のポリペプチドをコードするインサートを含んでもよい。選択される異種シグナル配列は、宿主細胞により認識され、処理される(すなわち、シグナルペプチダーゼにより切断される)ものである。哺乳動物細胞での発現において、哺乳動物シグナル配列ならびにウイルス分泌リーダー、例えば、単純ヘルペスgDシグナルを利用可能である。
一般的に、複製起点成分は、哺乳動物発現ベクターのために必要とされない(SV40起点を典型的に使用してもよい。なぜなら、ただ、それは初期プロモーターを含むからである)。
発現ベクター及びクローニングベクターは、選択遺伝子(選択可能マーカーとも呼ばれる)を含んでもよい。典型的な選択遺伝子は、(a)抗生物質または他の毒素(例えば、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキサート、またはテトラサイクリン)に対して耐性を付与する、(b)栄養要求性欠損を補完する、または(c)複雑な培地から利用可能ではない決定的な栄養分を供給するタンパク質をコードする(例えば、BacilliについてのDアラニンラセマーゼをコードする遺伝子)。
発現ベクター及びクローニングベクターは、通常、宿主生物により認識され、所望のポリペプチド配列をコードする核酸に作動可能に連結されたプロモーターを含む。事実上、全ての真核生物遺伝子が、転写が開始される部位から約25~30塩基上流に位置付けられるATリッチ領域を有する。多くの遺伝子の転写の開始から70~80塩基上流に見出される別の配列は、CNCAAT領域であり、そこでNは任意のヌクレオチドであり得る。大半の真核生物の3’末端は、AATAAA配列であり、それはコード配列の3’末端へのポリAテールの付加のためのシグナルであり得る。これらの配列の全てを、真核生物発現ベクター中に挿入してもよい。
より高い真核生物による本発明の抗体をコードするDNAの転写は、しばしば、ベクター中にエンハンサー配列を挿入することにより増加される。多くのエンハンサー配列が、現在、哺乳動物遺伝子から公知である(グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α-フェトプロテイン、及びインスリン)。典型的には、しかしながら、真核細胞ウイルスからのエンハンサーが使用され得る。例としては、複製開始点の後期側のSV40エンハンサー(100~270bp)、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製開始点の後期側のポリオーマエンハンサー、及びアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。また、真核生物プロモーターの活性化のための増強エレメントに関するYaniv,Nature 297:17-18(1982)を参照されたい。エンハンサーは、抗体コード配列に対する位置5’または3’でベクター中にスプライシングされ得るが、しかし、好ましくはプロモーターから部位5’に位置付けられる。
真核生物宿主細胞(酵母、真菌、昆虫、植物、動物、ヒト、または他の多細胞生物からの有核細胞)において使用される発現ベクターは、転写の終結のために及びmRNAを安定化させるために必要な配列も含み得る。そのような配列は、一般的に、真核生物またはウイルスのDNAまたはcDNAの5’及び、時には3’の非翻訳領域から利用可能である。これらの領域は、ポリペプチドをコードするmRNAの非翻訳部分におけるポリアデニル化断片として転写されるヌクレオチドセグメントを含む。1つの有用な転写終結成分は、ウシ成長ホルモンポリアデニル化領域である。WO94/11026及びその中で開示される発現ベクターを参照されたい。
本明細書におけるベクター中でDNAをクローン化または発現するための適した宿主細胞は、本明細書に記載のより高い真核細胞(脊椎動物宿主細胞を含む)を含む。培養(組織培養)における脊椎動物細胞の増殖は、通常の手順になっている。有用な哺乳動物宿主細胞株の例は、以下:SV40により形質転換されたサル腎臓CV1株(COS-7,ATCC CRL 1651);ヒト胚腎臓株(293細胞または浮遊培養中での増殖のためにサブクローン化された293細胞、Graham et al.,J.Gen Virol.36:59(1977));仔ハムスター腎細胞(BHK,ATCCCCL 10);チャイニーズハムスター卵巣細胞/-DHFR(CHO,Urlaub et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216(1980));マウスセルトリ細胞(TM4,Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980));サル腎臓細胞(CV1 ATCC CCL 70);アフリカミドリザル腎臓細胞(VERO-76,ATCC CRL-1587);ヒト子宮頚癌細胞(HELA,ATCC CCL 2);イヌ腎臓細胞(MDCK,ATCC CCL 34);バッファローラット肝細胞(BRL 3A,ATCC CRL 1442);ヒト肺細胞(W138,ATCC CCL 75);ヒト肝細胞(Hep G2,HB 8065);マウス乳癌(MMT 060562,ATCC CCL51);TR1細胞(Mather et al.,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982));MRC5細胞;FS4細胞;及びヒト肝細胞癌株(Hep G2)である。
本発明の抗体を産生するために使用される宿主細胞を、種々の培地中で培養してもよい。商業的に利用可能な培地、例えば、Ham’s F10(Sigma)、最小必須培地((MEM)、(Sigma)、RPMI-1640(Sigma)、及びダルベッコ改変イーグル培地((DMEM)、Sigma)などが、宿主細胞を培養するために適する。また、Ham et al.,Meth.Enz.58:44(1979)、Barnes et al.,Anal.Biochem.102:255(1980)、米国特許第4,767,704号;同第4,657,866号;同第4,927,762号;同第4,560,655号;または同第5,122,469号;WO90/03430;WO87/00195;または米国特許Re.30,985に記載される培地のいずれかを宿主細胞用の培養培地として使用してもよい。これらの培地のいずれかに、必要に応じて、以下を補給してもよい:ホルモン及び/または他の増殖因子(例えば、インスリン、トランスフェリン、または上皮増殖因子など)、塩(例えば、塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム、及びリン酸など)、緩衝剤(例えば、HEPESなど)、ヌクレオチド(例えば、アデノシン及びチミジンなど)、抗生物質(例えば、GENTAMYCIN(商標)薬物など)、微量元素(通常マイクロモル範囲の最終濃度で存在する無機化合物と定義される)、及びグルコースまたは等価のエネルギー供給源。任意の他の必要な補給剤を、また、当業者に公知であり得る適切な濃度で含めてもよい。培養条件、例えば、温度、pHなどは、発現のために選択された宿主細胞と共に以前に使用されたものであり、当業者に明らかであろう。
組み換え技術を使用する場合、抗体は、細胞内に、ペリプラズム間隙中に産生され得る、または培地中に直接的に分泌され得る。抗体が細胞内に産生される場合、最初のステップとして、微粒子細片、宿主細胞または溶解断片のいずれかを、例えば、遠心分離または限外ろ過により除去する。Carter et al.,Bio/Technology 10:163-167(1992)には、E.coliのペリプラズム間隙に分泌される抗体を単離するための手順が記載される。簡単に説明すると、細胞ペーストを、酢酸ナトリウム(pH3.5)、EDTA、及びフェニルメチルスルホニルフルオリド(PMSF)の存在において約30分にわたり溶解させる。細胞片を遠心分離により除去することができる。抗体が培地中に分泌される場合、そのような発現系からの上清を、一般的に、商業的に利用可能なタンパク質濃縮フィルター、例えば、AmiconまたはMillipore Pellicon限外ろ過ユニットを使用して最初に濃縮する。プロテアーゼ阻害剤、例えば、PMSFなどを、先のステップのいずれかに含め、タンパク質分解を阻害してもよく、抗生物質を含め、外来性混入菌の増殖を予防してもよい。
ポリクローナル抗体は、一般的に、関連抗原及びアジュバントの複数回の皮下(s.c.)または腹腔内(i.p.)注射により動物において産生される。関連抗原を、免疫化される種において免疫原性であるタンパク質、例えば、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、血清アルブミン、ウシサイログロブリン、または大豆トリプシン阻害剤に、二官能性薬剤または誘導体化薬剤、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を通じた抱合)、Nヒドロキシスクシンイミド(リジン残基を通じて)、グルタルアルデヒド、無水コハク酸、SOCl2、またはR1N=C=NR(式中、R及びR1は、独立してより低いアルキル基である)を使用して抱合することが有用であり得る。用いてもよいアジュバントの例としては、フロイント完全アジュバント及びMPL-TDMアジュバント(モノホスホリル脂質A、合成トレハロースジコリノミコラート)が挙げられる。免疫化プロトコルは、過度の実験なしに当業者により選択され得る。
モノクローナル抗体を実質的に均質な抗体の集団から得る、すなわち、その集団を含む個々の抗体は、少量で存在し得る、天然に生じる突然変異及び/または翻訳後改変(例えば、異性化、アミド化)を除いて同一である。従って、改変語「モノクローナル」は、別々の抗体の混合物ではないとして抗体の特徴を示す。
ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)を含み、それにおいてレシピエントのCDRからの残基が、非ヒト種(例えば、所望の特異性、親和性、及び能力を有するマウス、ラット、またはウサギ、ラクダ、またはラマ)(ドナー抗体)のCDRからの残基により置換される。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基により置換される。ヒト化抗体は、レシピエント抗体においても、移入されたCDRまたはフレームワーク配列においても見出されない残基も含み得る。一般的に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的に2つの可変ドメインの実質的に全てを含み得るが、それにおいてCDR領域の全てまたは実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域の全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである。いくつかの実施形態では、ヒト化抗体は、免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも部分、典型的には、ヒト免疫グロブリンのそれを含む。例えば、Jones et al.,Nature 321:522-525(1986);Riechmann et al.,Nature 332:323-329(1988)及びPresta,Curr.Opin.Struct.Biol.2:593-596(1992)を参照されたい。
単離された抗CTLA-4構築物(例えば、抗CTLA-4 sdAb、抗CTLA-4 HCAb、CTLA-4×PD-1二重特異性構築物(例えば、BABP)、CTLA-4×PD-L1二重特異性構築物(例えば、BABP))、単離された核酸もしくはそれをコードするベクター、または抗CTLA-4構築物をコードする単離された核酸もしくはベクターを含む単離された宿主細胞のいずれかを含むキット及び製造品がさらに提供される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の医薬組成物のいずれか1つを含むキットが提供され、好ましくは、その使用のための説明書を提供する。
実施形態1.CTLA-4を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分を含む単離抗CTLA-4構築物であって、前記sdAb部分が、配列番号17~32及び213~222のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号49~64、233~242、及び339のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号81~96及び253~262のいずれか1つのアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む、前記単離抗CTLA-4構築物。
(1)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;または
(27)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3、または最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、実施形態1または2に記載の単離抗CTLA-4構築物。
(1)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(3)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(4)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(5)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(6)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(7)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(8)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(9)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(10)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(11)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(12)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(13)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(14)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(15)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(16)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(17)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(18)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(19)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(20)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(21)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(22)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(23)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(24)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(25)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;
(26)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体;または
(27)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1;配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2;及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;または前記CDR領域において最大で約3つ(例えば、約1、2、または3のいずれか)のアミノ酸置換を含むその変異体
のいずれか1つを含む、実施形態1~3のいずれか1つに記載の単離抗CTLA-4構築物。
a-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、V、L、A、H、S、I、W、C、N、G、D、T、及びPからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、E、Q、G、D、A、K、R、L、P、S、V、H、T、N、W、M、及びIからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、P、H、F、G、Q、S、E、T、Y、C、I、D、及びVからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、S、K、A、M、Y、I、F、T、N、V、Q、P、E、及びCからなる群から選択され;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Q、L、R、P、E、K、S、T、M、A、及びHからなる群から選択され;または
b-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E及びQからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、R及びLからなる群から選択され;
b-4)103位のアミノ酸残基が、W、R、G、及びSからなる群から選択され;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択され;または
c-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
c-2)44位のアミノ酸残基が、A、G、E、D、Q、R、S、及びLからなる群から選択され;
c-3)45位のアミノ酸残基が、L、R、及びCからなる群から選択され;
c-4)103位のアミノ酸残基が、P、R、及びSからなる群から選択され;及び
c-5)108位のアミノ酸残基が、Q及びLからなる群から選択される;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVHHドメインを含み、
前記アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位がQである場合、108位が、Lに適宜ヒト化することができる、実施形態1~4のいずれか1つに記載の単離抗CTLA-4構築物。
a-1)37位のアミノ酸残基が、F、Y、L、I、及びVからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、A、G、E、D、Q、R、S、及びLからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L、C、及びRからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、W、G、及びRからなる群から選択され;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
b-1)37位のアミノ酸残基が、F及びYからなる群から選択され;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E及びQからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、R及びLからなる群から選択され;
b-4)103位のアミノ酸残基が、Wであり;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
c-1)37位のアミノ酸残基が、F及びYからなる群から選択され;
c-2)44位のアミノ酸残基が、G、E、及びQからなる群から選択され;
c-3)45位のアミノ酸残基が、L及びRからなる群から選択され;
c-4)103位のアミノ酸残基が、R及びSからなる群から選択され;及び
c-5)108位のアミノ酸残基が、Qである;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVHHドメインを含み、
前記アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位のQが、Lに適宜ヒト化することができる、実施形態5に記載の単離抗CTLA-4構築物。
a-1)37位のアミノ酸残基が、F及びYからなる群から選択され;
a-2)44位のアミノ酸残基が、G、E、及びQからなる群から選択され;
a-3)45位のアミノ酸残基が、L及びRからなる群から選択され;
a-4)103位のアミノ酸残基が、Wであり;及び
a-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
b-1)37位のアミノ酸残基が、Fであり;
b-2)44位のアミノ酸残基が、E及びQからなる群から選択され;
b-3)45位のアミノ酸残基が、Rであり;
b-4)103位のアミノ酸残基が、Wであり;及び
b-5)108位のアミノ酸残基が、Qであり;または
c-1)37位のアミノ酸残基が、Fであり;
c-2)44位のアミノ酸残基が、G、E、及びQからなる群から選択され;
c-3)45位のアミノ酸残基が、L及びRからなる群から選択され;
c-4)103位のアミノ酸残基が、R及びSからなる群から選択され;及び
c-5)108位のアミノ酸残基が、Qである;
のいずれか1つのアミノ酸配列を含むVHHドメインを含み、
前記アミノ酸位置が、Kabat番号付けに従っており、108位のQが、Lに適宜ヒト化することができる、実施形態6に記載の単離抗CTLA-4構築物。
免疫化
最新の動物保護規制に全て従い、組み換えCTLA-4 ECDタンパク質により3匹のラマを免疫化した。免疫化用に、抗原をCFA(一次免疫化)またはIFA(ブースト免疫化)による乳剤として製剤化した。抗原は、首の筋肉内にダブルスポット注射で投与した。各動物に、100μgのCTLA-4 ECDを含む乳剤を2本注射し、続いて50μgの抗原を含む4本の注射を1週間間隔でした。免疫化の間の異なった時点で、動物から10mlの血液試料を回収し、血清を調製した。抗原特異的体液免疫応答の誘導は、固定化したCTLA-4 ECDタンパク質を用いたELISAに基づく実験で血清試料を用いて確認した(図1及び図2)。最後の免疫化から5日後、300mlの血液試料を回収した。末梢血リンパ球(PBL)を、ラマ重鎖免疫グロブリン(HcAb)の遺伝源として、血液試料300mlからFicoll-Paque勾配(Amersham Biosciences)を用いて単離し、1×109個のPBLを得た。抗体の最大多様性は、サンプリングしたBリンパ球の数、すなわちPBLの数の約10%に等しいことが予想される(1×108個)。ラマにおける重鎖抗体の割合は、Bリンパ球の数の最大で20%である。従って、血液試料300ml中のHCAbの最大多様性は、2×107個の異なる分子として計算する。
PBL及びリンパ節から抽出したRNAを、RT-PCRの出発物質として使用して、sdAbをコードする遺伝子断片を増幅した。これらの断片を社内プラスミドベクターにクローニングした。sdAbコード配列とインフレームで、ベクターは、C末端(His)6タグをコードしていた。ライブラリーサイズは、1×109個を超える。ライブラリーファージは、標準プロトコルに従って調製し、滅菌ろ過の後、さらなる使用のために4℃で保管した。
選別は、固形パニングならびに細胞に基づくパニングを用いて、上記ライブラリーで実施した。両方の条件について選別を1回だけ行なった。各々の選別のアウトプットを濃縮係数(対照と比べた溶出液中に存在するファージの数)、多様性、及びCTLA-4陽性クローンの割合(ELISA)について分析した。これらのパラメーターに基づき、さらなる分析のために最良の選別を選択した。そのために、各々の選別からのアウトプットを、ハイスループットスクリーニング用の可溶性発現ベクターにプールとして再クローニングした。sdAbコード配列とインフレームで、ベクターは、C末端(His)6タグをコードしていた。コロニーを採取して、96ディープウェルプレート(1ml容量)で培養し、IPTG及び0.1%Tritonを添加することにより上清中でsdAb発現を誘導した。
His6標識sdAbは、AKTAによるペリプラズム抽出液から精製した。NTA樹脂は、製造者の指示に従って処理した。調製したペリプラズム抽出液を、回転子上で室温にて30分間、樹脂でインキュベートした。樹脂をPBSで洗浄し、カラムに移した。充填した樹脂を15mMイミダゾールで洗浄した。150mMイミダゾールを用いて、sdAbをカラムから溶出した。溶出した画分を、Hybond Membraneにスポットすることで分析し、Ponceauで可視化した。タンパク質を含む画分をプールし、PBSで透析した。透析したタンパク質を回収し、ろ過滅菌し、濃度を測定し、-20℃で保存した。
リガンド結合の遮断は、フローサイトメトリーを用いて試験した。抗CTLA-4 sdAbを評価するため、ヒトB7-1を発現するCHO細胞を接着培養フラスコから解離して、種々の濃度の抗体、及び一定濃度のビオチン標識hCTLA-4/Fcタンパク質と混合した(両方とも、96ウェルプレート中で)。ヤーボイ(登録商標)は、抗CTLA-4抗体陽性対照として使用した。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%BSAを含有するPBS)で3回洗浄した。その後、PE/Cy5ストレプトアビジン二次抗体を添加し、室温で15分間インキュベートした。細胞をFACS緩衝液で再び洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。非線形回帰を用いて、Prism(商標)(GraphPad Software、San Diego、CA)でデータを分析し、IC50値を算出した。図3Aから分かるように、低濃度(1~10μg/ml)でCTLA4-B7-1相互作用を効果的に阻害する抗CTLA-4 sdAb(A34311、A36566、及びA36922)の能力が競合アッセイにより実証され、A34311が、約14.52nMのEC50で最も強力なものであった。
各sdAbの親和定数(Kd)をBIAcore T200機器による表面プラズモン共鳴(SPR)によって決定した。
ヒトCD4+T細胞は、単離キット(Miltenyl Biotec)によってPBMCから精製した。各ウェルは、105個のCD4+T細胞及び104個のCHO-K1/ヒトCD80(ヒトCD80を安定して発現するCHO-K1)を含み、200μlの最終作用体積であった。8つの試験精製sdAbを異なる濃度で各ウェルに添加した。抗体は、バックグラウンド対照として使用しなかった。ヒトIgG4は、陰性対照として使用し、ヤーボイ(登録商標)は、陽性抗CTLA4抗体対照として使用した。CTLA-4-Fc(GenScript、Z03373-50)をシステムに添加し、反応を開始させた。37℃/5%CO2インキュベーターで24時間インキュベーションした後、100μl培地を各試験ウェルから採取し、IL-2を測定した(Cisbio)。CTLA-4遮断バイオアッセイにおけるT細胞によるIL-2の抗体濃度依存的分泌を使用して、試験抗体ごとのEC50値、ならびに陽性対照の完全長抗CTLA-4抗体ヤーボイ(登録商標)のEC50値を抽出した。図4及び図27A~27Cから分かるように、9つのsdAb(A37067、A34625、A34311、A34313、A36566、A36922、AS07014、AS07189、及びAS07745)は、CTLA-4とB7-1の間の結合を阻害し、その中で、A34311、A36566、A36922、AS07014、AS07189、及びAS07745 sdAbは、より強い機能的活性を示した。
sdAb A34311のタンパク質配列を、最も高い相同性を共有している5つの最も近いヒト生殖細胞系列配列と並べた。最良のヒト生殖細胞系列配列をヒトアクセプターとして選択した。ヒトアクセプターに対するフレームワーク領域中のアミノ酸差異は、濃い灰色で網掛けした(図6及び図31A)。ホモロジーモデルを作製した。モデル分析データに従って、抗原結合または抗体足場形成のために潜在的に重要な残基を放置した一方、ヒト対応物に変換するために残りを選択した。最初に、4~6個の配列最適化変異体のパネルを生成した(ステージ1)。これらの変異体を多数のパラメーターについて分析し、得られた結果を使用して、第2セットのsdAbを設計した(ステージ2)。トップの4つのヒト化sdAb(AS02636、AS02626、AS02640、及びA34311VH11)を、結合、安定性、及び機能的活性データに基づいて選択し、それらの配列アライメントを図6及び図31Aに示す(他のヒト化sdAbも示す)。
ヒト化His6標識sdAbは、AKTAによるペリプラズム抽出液から精製した。sdAb産生及び純度決定プロトコルは、実施例1のものに従った。
精製ヒト化sdAbは、実施例1に記載されるように、FACS分析によってCTLA-4-B7-1結合を阻害するそれらの能力について試験した。ヒト化sdAbが低濃度(1~10μg/ml;例えば、図7のAS02640 sdAbを参照されたい)でCTLA4-B7-1相互作用を効果的に阻害できたことが競合アッセイ結果により実証された。
各ヒト化sdAbの親和定数(Kd)は、実施例1に記載されるように、BIAcore T200機器による表面プラズモン共鳴(SPR)によって決定された。異なるsdAb濃度での結合曲線を使用して、動態パラメーターkon、koff、及びKdを算出した(図9)。図9から分かるように、ヒト化クローンAS02640の結合親和性は、野生型sdAb A34311のものに匹敵した。
CTLA-4に基づく封鎖アッセイは、実施例1に記載されるように行った。ヒト化sdAb AS02640は、T細胞によるIL-2産生によって反映されるように、CTLA-4とB7-1の間の結合を効果的に阻害することが分かった(図8、図27A~27C)。
上記の研究から機能的活性及び遅いオフレートを有するsdAb(A34311、A36566、A34313、及びA36922 sdAb)を選択して、HCAb構築及び産生をした。選択されたsdAbのDNA配列をヒトIgG1 FcのDNA配列と融合させて、HCAb構築物を作製した。HCAb構築物を哺乳動物細胞株にトランスフェクトして、HCAb発現させた。条件培地中の分泌HCAbをプロテインAカラムによって精製した。
精製抗CTLA-4 HCAb(A34311 HCAb、A36566 HCAb、及びA36922 HCAb)は、実施例1に記載されるように、FACS分析によってCTLA-4/B7-1結合を阻害するそれらの能力について試験した。図3Bから分かるように、低濃度(1~10μg/ml)でCTLA-4/B7-1相互作用を効果的に阻害する抗CTLA-4 HCAbの能力が競合アッセイ結果により実証された。FACSデータのEC50に従って、A34311 HCAb、A36566 HCAb、及びA36922 HCAbは、市場の薬ヤーボイ(登録商標)に匹敵する機能的活性を示した(図3B)。
CTLA-4に基づく封鎖アッセイは、実施例1に記載されるように行った。図5A~5F及び図10から分かるように、A34311 HCAb、A36566 HCAb、A36922 HCAb、及びA34313 HCAbは、CTLA-4とB7-1の間の結合の阻害において、市場の薬ヤーボイ(登録商標)に匹敵する機能的活性を示し、FACSに基づくリガンド競合アッセイ結果と一致した(図3B)。A34311 HCAbとAS02640 HCAbの機能的活性は、非常に近く(図10)、抗体の親和性及び活性が、sdAbヒト化後に影響を受けなかったことが示唆された。
精製後、A34311 HCAbの結合親和性パラメーターを、実施例1に記載のものと同様の方法で測定した。ヤーボイ(登録商標)は、抗CTLA-4抗体に対する陽性対照として使用した。簡単に言うと、抗体をCM5センサーチップ上に固定化し、CTLA-4-Hisタンパク質は、0.78、1.56、3.15、6.25、12.5、25、50、及び100nMの濃度で分析物として流した。図13C~13Eから分かるように、A34311 HCAbのCTLA-4に対する結合親和性は、ヤーボイ(登録商標)に非常に近かった。
本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAbは、C末端抗HSA sdAb、9アミノ酸Gly/Ser(9GS)リンカー、及びN末端抗CTLA-4 sdAbを含む二重特異性構築物として発現することもできる。さらに、C末端及びN末端に本明細書に記載の抗CTLA-4 sdAb、中央に抗HSA sdAbを含み、場合により、9アミノ酸Gly/Serリンカーを介して全てが連結した三価及び二重特異性抗体を構築することができる。C末端またはN末端の抗CTLA-4 sdAbは、抗PD-1 sdAbまたは抗PD-L1 sdAbと置換することができる。
リンカー(9アミノ酸Gly/SerリンカーまたはヒトIgG1ヒンジ)の有無に関わらず、抗PD-1完全長抗体(キイトルーダ(登録商標)(ペンブロリズマブ)またはオプジーボ(登録商標)(ニボルマブ))の重鎖のN末端またはC末端に融合した抗CTLA-4 sdAbを含む二重特異性抗体(A34311またはAS02640)を構築した(生成した全てのCTLA-4×PD-1構築物について、表4を参照されたい)。リンカー(9アミノ酸Gly/SerリンカーまたはヒトIgG1ヒンジ)の有無に関わらず、抗PD-L1完全長抗体(テセントリク(登録商標)(アテゾリズマブ)またはIMFINZI(商標)(デュルバルマブ))の重鎖のN末端またはC末端に融合した抗CTLA-4 sdAbを含む二重特異性抗体(A34311またはAS02640)も構築した(生成した全てのCTLA-4×PD-L1構築物について、表5を参照されたい)。CTLA-4×PD-L1構築物のうち、A34311-9GS-テセントリク、A34311-hIgG1ヒンジ-テセントリク、A34311-テセントリク、AS02640-9GS-テセントリク、AS02640-hIgG1ヒンジ-テセントリク、AS02640-テセントリク、A34311-9GS-デュルバルマブ、A34311-hIgG1ヒンジ-デュルバルマブ、A34311-デュルバルマブ、AS02640-9GS-デュルバルマブ、AS02640-hIgG1ヒンジ-デュルバルマブ、及びAS02640-デュルバルマブを構築し、発現し、次いで精製した;テセントリク-9GS-A34311、テセントリク-hIgG1ヒンジ-A34311、テセントリク-A34311、テセントリク-9GS-AS02640、テセントリク-hIgG1ヒンジ-AS02640、テセントリク-AS02640、デュルバルマブ-9GS-A34311、デュルバルマブ-hIgG1ヒンジ-A34311、デュルバルマブ-A34311、デュルバルマブ-9GS-AS02640、デュルバルマブ-hIgG1ヒンジ-AS02640、及びデュルバルマブ-AS02640を構築し、発現し、次いで精製する。
精製後、二重特異性抗体の結合親和性パラメーターを、実施例1に記載のものと同様の方法で測定し、それらのモノマー抗体(抗CTLA-4 Abまたは抗PD-1 Ab)と比較した。簡単に言うと、抗体をCM5センサーチップ上に固定化し、CTLA-4-HisまたはPD-1-Hisタンパク質は、0.78、1.56、3.15、6.25、12.5、25、50、及び100nMの濃度で分析物として流した。
構築されたCTLA-4×PD-1二重特異性抗体の抗PD-1活性を評価するために、ヒトPD-1を発現するCHO細胞を接着培養フラスコから解離して、種々の濃度の二重特異性抗体、及び一定濃度のビオチン標識hPD-L1-Fc融合タンパク質と混合した(両方とも、96ウェルプレート中で)。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%BSAを含有するPBS)で3回洗浄した。その後、PE/Cy5ストレプトアビジン二次抗体を添加し、室温で15分間インキュベートした。細胞をFACS緩衝液で再び洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。非線形回帰を用いて、Prism(商標)(GraphPad Software、San Diego、CA)でデータを分析し、IC50値を算出した。図14から分かるように、低濃度(1~10μg/ml)でPD-1/PD-L1相互作用を効果的に阻害する構築二重特異性抗体の能力が競合アッセイにより実証された。抗体親和性データ(図12A~12D)と一致して、BCP-311K及びBCP-K311の機能的活性は、それらのモノクローナル抗PD-1抗体に匹敵した(図14)。
二重特異性抗体によるPD-1及びCTLA-4経路の遮断は、PD-1またはCTLA-4経路中のシグナリング分子によって駆動されるレポーター遺伝子のT細胞増殖、IFN-γ放出、IL-2分泌または発現をモニターする種々のバイオアッセイを用いて研究することができる。
6~8週齢のヒトCTLA-4 KI(ノックイン)雌のC57/BL6マウスの低背部を剃毛し、75%(vol/vol)RPMI(Life Technologies)及び25%(vol/vol)培地密度マトリゲル(Corning)の50μL懸濁液中の1×106個の大腸癌細胞株MC38を皮下注射した。腫瘍が目視検査によって7日以内に生着しなかったマウスは、さらなる研究から除外した。MC38移植後の7日目に開始して、腫瘍を毎日測定した。マウスを治療コホートに個別に分類し、全ての場合において移植の約10日後に腫瘍が閾値の150mm3に到達した場合にのみ治療を受け始めた。デジタルノギス測定及び体重測定は、治療の期間中3日ごとに行った(図11A)。実験では、マウスには、10mg/kgの社内製ヤーボイバイオシミラー抗体、または同等の量の抗CTLA-4 HCAb(A34311 HCAbまたはAS02640 HCAb)で16日間静脈内治療を与えた。治療は、4日ごとに実施した。マウスには、陰性対照として機能したPBSを注入した。図11Bから分かるように、A34311 HCAb及びそのヒト化クローンAS02640の両方とも、MC38同系マウスモデル中の腫瘍増殖を効果的に制御し、市場の薬ヤーボイ(登録商標)のバイオシミラーと同等の機能的活性を有した。これらの治療は全て、モック対照と比較して、MC38移植したマウスの体重に影響を与えなかった(図11C)。
上記の研究から機能的活性及び遅いオフレートを有するsdAb(A34311、A36566、A36922、AS07014、AS07189、及びAS07745)及びヒト化抗CTLA-4変異体(AS02636、AS02626、AS02640、A34311VH11、AS07014VH11、AS07014VH11G54、AS07014VH11SGA、AS07014VH11SGQ、AS07014VH11SGS、AS07189TKDVH11、AS07189TKDVH11F27、及びAS07189TKDVH11FY)を選択して、HCAb構築及び産生をした。選択されたsdAbのDNA配列をヒトIgG1 FcのDNA配列と融合させて、HCAb構築物を作製した。HCAb構築物を哺乳動物細胞株にトランスフェクトして、HCAb発現させた。条件培地中の分泌HCAbをプロテインAカラムによって精製した。
抗CTLA-4 HCAbの結合動態は、表面プラズモン共鳴(SPR)バイオセンサー、Biacore T200(GE Healthcare)を用いて決定した。抗原CTLA-4-His融合タンパク質をセンサーチップ上に固定化した。HCAbは、5、10、20、40、80、及び160nMの濃度で分析物として流した。解離(Kd)及び会合(ka)速度定数のデータは、Biacore T200評価ソフトウェアを用いて得た。見かけの平衡解離定数(KD)は、Kd/kaの比から算出した。図23A~23B(A34311 HCAbについて、図13D及び図13Eも参照されたい)で分かるように、ヒト化HCAb(A34311VH11、AS07014VH11、AS07014VH11G54、AS07014VH11SGA、AS07014VH11SGQ、AS07014VH11SGS、AS07189TKDVH11、AS07189TKDVH11F27、及びAS07189TKDVH11FY)のほとんどの結合親和性は、対応する親HCAb(A34311 HCAb、AS07014 HCAb、及びAS07189 HCAb)のものと非常に近く、抗体親和性が、sdAbヒト化後に影響を受けなかったことが示唆された。
CHO細胞上で発現されたヒトCTLA-4へのHCAbの結合は、蛍光活性化細胞選別(FACS)に基づくアッセイを用いて決定した。ヒトCTLA-4を発現するCHO細胞を接着培養フラスコから解離して、種々の濃度の抗体と(96ウェルプレート中で)混合した。ヤーボイ(登録商標)は、抗CTLA-4抗体陽性対照として使用した。混合物を室温で30分間平衡化し、FACS緩衝液(1%BSAを含有するPBS)で3回洗浄した。その後、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)コンジュゲート抗ヒトκ抗体(Jackson ImmunoResearch)を添加し、室温で15分間インキュベートし、二次抗体として機能させた。細胞をFACS緩衝液で再び洗浄し、フローサイトメトリーで分析した。非線形回帰を用いて、Prism(商標)(GraphPad Software、San Diego、CA)でデータを分析し、EC50値を算出した。図32A~32Bに示すように、種々のHCAbがヤーボイ(登録商標)と同等の結合能力を示したことがFACS結合アッセイにより実証された。
精製抗CTLA-4 HCAb(A34311 HCAb、A36566 HCAb、A36922 HCAb、AS07014 HCAb、及びAS07189 HCAb)及びヒト化抗CTLA-4 HCAb(A34311VH11 HCAb、AS07014VH11 HCAb、AS07189TKDVH11 HCAb、AS02636 HCAb、AS02626 HCAb、AS02640 HCAb、AS07014VH11G54 HCAb、AS07014VH11SGA HCAb、AS07014VH11SGQ HCAb、AS07014VH11SGS HCAb、AS07189TKDVH11F27 HCAb、及びAS07189TKDVH11FY HCAb)は、実施例1に同様に記載されるように、FACS分析によってCTLA-4-B7-1結合を阻害するそれらの能力について試験した。ヤーボイ(登録商標)は、陽性対照として使用した。図18A~18Jから分かるように(他の構築物の結果は不図示)、低濃度(1~10μg/ml)でCTLA4-B7-1相互作用を効果的に阻害する抗CTLA-4 HCAbの能力が競合アッセイ結果により実証された。FACSデータのIC50に従って、A34311 HCAb、A36566 HCAb、A36922 HCAb、及びほとんどのヒト化抗CTLA-4 HCAb(A34311VH11 HCAb、AS07014VH11 HCAb、AS07189TKDVH11 HCAb、AS02640 HCAb、AS07014VH11G54 HCAb、AS07014VH11SGA HCAb、AS07014VH11SGQ HCAb、AS07014VH11SGS HCAb、AS07189TKDVH11F27 HCAb、及びAS07189TKDVH11FY HCAb)は、市場の薬ヤーボイ(登録商標)に匹敵する機能的活性を示した(図18J;他の構築物の結果は不図示)。
CTLA-4に基づく封鎖アッセイは、実施例1に同様に記載されるように行った。ヒトIgGは、陰性対照として使用した。図28A~28Bから分かるように(他の構築HCAbの試験結果は、不図示)、A34311 HCAb、AS07014 HCAb、AS07189 HCAb、及びほとんどのヒト化HCAb(A34311VH11 HCAb、AS07014VH11 HCAb、AS07189TKDVH11 HCAb、AS07014VH11G54 HCAb、AS07014VH11SGQ HCAb、及びAS07189TKDVH11FY HCAb)は、CTLA-4とB7-1の間の結合を阻害する市場の薬ヤーボイ(登録商標)に匹敵する機能的活性を示し、上述のFACSに基づくリガンド競合アッセイ結果と一致した(図18A~18J)。
A34311 HCAb、ヒト化AS07014VH11 HCAb、及びヒト化AS07189TKDVH11 HCAbを、それらのインビボ有効性について試験した。6~8週齢のヒトCTLA-4 KI(ノックイン)雌のC57/BL6マウスの低背部を剃毛し、75%(vol/vol)RPMI(Life Technologies)及び25%(vol/vol)培地密度マトリゲル(Corning)の50μL懸濁液中の1×106個の大腸癌細胞株MC38を皮下注射した。腫瘍が目視検査によって7日以内に生着しなかったマウスは、さらなる研究から除外した。MC38移植後の7日目に開始して、腫瘍を毎日測定した。マウスを治療コホートに個別に分類し、全ての場合において移植の約10日後に腫瘍が閾値の150mm3に到達した場合にのみ治療を受け始めた。デジタルノギス測定及び体重測定は、治療の期間中3日ごとに行った(図36A)。実験では、マウスには、10mg/kgの社内製ヤーボイバイオシミラー抗体、または同等の量の抗CTLA-4 HCAbで16日間静脈内治療を与えた。治療は、4日ごとに実施した。マウスには、陰性対照として機能したPBSを注入した。図36Bから分かるように、A34311 HCAb、AS07014VH11 HCAb、及びAS07189TKDVH11 HCAbは、MC38同系マウスモデル中の腫瘍増殖を効果的に制御し、市場の薬ヤーボイ(登録商標)のバイオシミラーと同等の機能的活性を有した。これらの治療は全て、モック対照と比較して、MC38移植したマウスの体重に影響を与えなかった(PBSを注入;図36C)。
CTLA-4×PD-1及びCTLA-4×PD-L1二重特異性抗原結合タンパク質(BABP)の構築
二重特異性抗体は、完全長抗体、またはC末端にFc領域を有する完全長抗体のscFvもしくはFab領域、例えば、抗PD-1抗体、例えば、キイトルーダ(登録商標)(ペンブロリズマブ)、オプジーボ(登録商標)(ニボルマブ)、PD1BMmin、または抗PD-L1抗体、例えば、テセントリク(登録商標)(アテゾリズマブ)、IMFINZI(商標)(デュルバルマブ)に融合した抗CTLA-4 sdAbで構築することができる。抗CTLA-4 sdAbは、リンカー(例えば、9アミノ酸Gly/Serリンカー(9GSリンカー)、ヒトIgG1(hIgG1)ヒンジ、または変異hIgG1ヒンジ)を介して、またはリンカーを介さずに、完全長抗体(またはC末端にFc領域を有する完全長抗体のscFvもしくはFab領域)に連結することができる。抗CTLA-4 sdAbは、重鎖の少なくとも1つ、軽鎖の少なくとも1つ、または重鎖及び軽鎖の両方に融合することができる。
68個のBABP構築物(構築物1~43、63~74、87~94、及び95~99)のプラスミドを調製し、CHO-3E7細胞で一過性に発現させた。そのうち、19個の例示のBABP構築物(BCP-311K、BCP-K311(BCP-2)、BCP-73、BCP-74、BCP-75、BCP-78、BCP-79、BCP-80、BCP-16、BCP-17、BCP-31、BCP-32、BCP-33、BCP-34、BCP-35、BCP-36、BCP-83、BCP-84、及びBCP-85)を一段階プロテインAクロマトグラフィーによって精製し、PBS緩衝液(pH7.2)中で保存した。精製BABPの組成及び純度を、還元及び非還元の両方の条件下でSDS-PAGEにより分析した。ポリペプチド鎖ならびに完全長BABP分子のサイズは、アミノ酸配列に基づいて算出されたそれらの分子質量と一致した。溶液中のBABPの物理的特性をさらに研究するため、サイズ排除クロマトグラフィーを使用して、各タンパク質を分析した。全てのBABPは単一の主要なピークを示し、単量体分子、すなわち、各々が第1のポリペプチド鎖の2つのコピー、及び第2のポリペプチド鎖の2つのコピーを含む4つのポリペプチド鎖からなる二量体タンパク質である非凝集BABP分子としての物理的な均質性が実証された(BCP-34は、ポリペプチド鎖の2つのコピーからなる二量体タンパク質である)。いくつかのデータの概要を表10に示す。表10のデータは、ほとんどのBABPの産生レベルが規則モノクローナル抗体のものに匹敵したことを実証し、哺乳動物細胞中で効果的に発現することができることが示された。
種々のBABPの熱安定性は、MICROCAL(商標)VP-キャピラリー示差走査熱量法(DSC、Microcal、Northampton、MA、USA、Malvern Instruments)を用いて調べた。おおよそ370μlの各BABP(1mg/ml)及びその対応する緩衝液を、MICROCAL(商標)VP-キャピラリーDSCユーザーマニュアルに従って96ウェルプレートに添加した。洗剤洗浄プログラムを各試料ランの間に含め、参照及び試料細胞を清潔に保った。全ての試料を、パッシブモードにおいて90℃/時間(1.5℃/分)の走査速度で20℃~100℃まで走査した。収集したデータは、ORGIN(商標)7.0(Northampton、MA、USA)に基づくVP-キャピラリーDSCソフトウェアを用いて分析した。全てのサーモグラムを制御し、ベースラインを減算して、タンパク質アンフォールディングの見かけの中点(Tm)及び見かけのエンタルピー(ΔH)を得た。種々のBABPのアンフォールディング中点温度(Tm)を表11(DSC)に示す。
精製BABPの溶解性を特徴付けるため、10mgの各BABPを1mg/mlで、約2.5mlの体積でMICROCON(登録商標)-30kDa遠心濃縮器(EMD Millipore)に添加し、4000×g(4℃)で遠心分離した。体積を定期的にチェックし、タンパク質を、残りのタンパク質溶液が消費されるまで濃縮器に添加した。体積が約20μlに到達するかまたは下げ止まるまで、濃縮を2時間進行させた。濃度は、1μlの濃縮BABPを199μlのそれぞれの緩衝液に希釈することで得られた試料のUV測定を行うことで決定した。BABPをそれぞれの緩衝剤中で1mg/mlに希釈後、分析的SEC-HPLCを用いて、試料の凝集について評価した。表13は、BABPがこれらのこれらのストレス条件下で完全な整合性を保持したことを示した。
精製後、二重特異性抗体の結合親和性パラメーターを、実施例1に記載のものと同様の方法で測定し、それらのモノマー抗体(例えば、抗CTLA-4 Ab、抗PD-L1 Ab、または抗PD-1 Ab)と比較した。ヤーボイ(登録商標)は、陽性抗CTLA-4 Ab対照として機能し、キイトルーダ(登録商標)及びオプジーボ(登録商標)は、陽性抗PD-1 Ab対照として機能し、テセントリク(登録商標)は、抗PD-L1抗体の陽性対照として機能した。簡単に言うと、CTLA-4への結合親和性を決定するために、抗体をチップ上に固定化し、CTLA-4-Hisタンパク質は、12.5、25、50、100、及び200nMの濃度で分析物として流し;PD-1への結合親和性を決定するために、抗体をチップ上に固定化し、PD-1-Hisタンパク質は、3.125、6.25、12.5、25、50、及び100nMの濃度で分析物として流し;PD-L1への結合親和性を決定するために、抗体をチップ上に固定化し、PD-L1-Hisタンパク質は、1.56、3.125、6.25、12.5、25、及び50nMの濃度で分析物として流した。
CHO細胞上で発現されたヒトCTLA-4へのCTLA-4×PD-1二重特異性抗体(BCP-73、BCP-74、BCP-75、BCP-78、BCP-79、及びBCP-80)またはCTLA-4×PD-L1二重特異性抗体(BCP-83、BCP-84、及びBCP-85)の結合は、サブセクション「FACS分析によるCTLA-4-CHO結合」の下で実施例6に記載されるように、同様のFACSに基づくアッセイを用いて決定した。図33A~33Bに示すように、精製BABPがヤーボイ(登録商標)と同等のCTLA-4結合能力を示したことがFACS結合アッセイにより実証された。
BABPによるリガンド結合の阻害は、FACSアッセイを用いて評価した。
BABP CTLA-4×PD-1によるPD-1及びCTLA-4経路の遮断、またはBABP CTLA-4×PD-L1によるPD-L1及びCTLA-4経路の遮断は、PD-1、PD-L1、またはCTLA-4経路中のシグナリング分子によって駆動されるレポーター遺伝子のT細胞増殖、IFN-γ放出、IL-2分泌または発現をモニターする種々のバイオアッセイを用いて研究することができる。
PD-1に対する例示のCTLA-4×PD-1二重特異性抗体の腫瘍増殖に対する効果を、抗PD-1抗体(社内生成したオプジーボバイオシミラー及びキイトルーダバイオシミラー4鎖抗体)のものと比較した。6~8週齢のヒトPD-1 KI(ノックイン)雌のC57/BL6マウスの低背部を剃毛し、75%(vol/vol)RPMI(Life Technologies)及び25%(vol/vol)培地密度マトリゲル(Corning)の50μL懸濁液中の1×106個の大腸癌細胞株MC38を皮下注射した。腫瘍が目視検査によって7日以内に生着しなかったマウスは、さらなる研究から除外した。MC38移植後の7日目に開始して、腫瘍を毎日測定した。マウスを治療コホートに個別に分類し、全ての場合において移植の約10日後に腫瘍が閾値の150mm3に到達した場合にのみ治療を受け始めた。デジタルノギス測定及び体重測定は、治療の期間中3日ごとに行った(図37A~37B)。実験では、マウスには、10mg/kgのキイトルーダバイオシミラー抗体(ペムブロリズマブ)もしくはオプジーボバイオシミラー抗体(ニボルマブ)、または12.3mg/kgのCTLA-4×PD-1二重特異性抗体(BCP-75、BCP-79、及びBCP-80)で16日間静脈内治療を与えた。治療は、4日ごとに実施した。マウスには、陰性対照として機能したPBSを注入した。図37Aから分かるように、全ての二重特異性抗体は、MC38同系マウスモデル中の腫瘍増殖を効果的に制御し、キイトルーダバイオシミラー及びオプジーボバイオシミラーと同等の機能的活性を有した。全ての治療は、モック対照と比較して、MC38移植したマウスの体重に影響を与えなかった(図37B)。
配列表
配列番号97(A34310 sdAb核酸配列)
CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTGGGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCGATGATTATGCCATAGGCTGGTTCCGCCAGGCCCCAGGGAAGGAGCGTGAGGGGGTCTCATGTATTAGTAGTGGTGGCACATACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGTGACAACGCCAAGAACACGGTGTTTCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACGGCTGTTTATTACTGTGGAGCAGTTTCGTCGCTCTTAAGTGTGGAGAGGTTCCCTGGAGGTCATTGCGGCCCCCGTTATGGGTACTACCGTCACGGCTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号98(A34311 sdAb核酸配列)
CAGGTAAAGCTGGAGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCTGCCTGGGGAGTCTCTGAGACTCTCCTGTGAAGCCTCTGGTCGCACCATCACAACGATTACTATGGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGAGCGTCAGTTTGTAGCGTCTCATAGTTGGACTGATAATAACCCATACTATGCAGACTCCGTTAAGGGCCGATTCATCATCTCCAGAGACAACGCCGGGAACAGGGTATATCTGCAGATGCATAGCCTGGAACCTGAGGACACGGCCGTTTATTACTGCGCAGCAACCGCTAGAAGATCATTCGTGGGTAGACAGTGGTACACTGAAGCACGCCAGTATGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号99(A34313 sdAb核酸配列)
CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGGCTGGGGGCTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAACCTCTGTACGCACCCCCCTCAGTAACTTTGCCATGGGCTGGTTCCGCCAGACTCCAGGGAAAGAGCGTGAGTTTGTAGCAGCAATTAGCAGGAGTGGTGGAAGCACATCGTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGGGACAACGCCAAGAACACGGTGTATCTCGAAATGAACAGCCTGAAAGGCGAGGACACGGTCGTTTATTACTGTGCAGCCAAAATAGCGGGGATGAATAATATTGTCTTTATCGGCGCGCCCCAGTATAACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号100(A34625 sdAb核酸配列)
CAGGTAAAGCTGGAGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGCCTGGGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGTAGCGTCTGGAAGCATCGACAGCACCTATACCATGGGCTGGTACCGCCAGGCTCCAGGGAAACAGCGCGAGTTGGTCGCTTCTATTACTAGTTCTGGTAGCACAAACCATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACAATCTCCAGAGACAACGCCAAGAACACGGTGTATCTTCAAATGAACACCCTGAAACCCGAGGACGCGGCCGTCTATTACTGTAGATACCTAAGTGTGCTTAGTGCCTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号101(A36566 sdAb核酸配列)
GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGGTTGGGGACTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGACGCTCGTTCGAGAACTATGCCATAGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGCAAGGAGCGTGAGTTTGTAGCAACAATTTCGTGGATTCCTCGTACCGCATACTCTACCACATACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCAGATTCACCATCTCTGGAGACAACAGCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGACGAGCCTGAAACCTGAGGACACGGCCGTTTATTACTGTGCAGCAGGCGGGGCGACAGGACCGTTGGCGTTGGACTCCCACTATGGGTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号102(A36922 sdAb核酸配列)
CAGGTACAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTGGGGGGTCGCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGTCGCCTCAGTAGGACGTTTACCATGGGCTGGTACCGCCAGGCTCCAGGGAAGCAGCGCGACTTGGTCGCGTCTATTACTACAAGTGGTAGCACGAACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAACGCCAAAAACACGGTGATTCTGCAAATGAACAGCCTGGTACCTGAGGACACAGCCGTCTATTACTGCCGTTTTCTTAGCGCAAGTACTGCAGCCTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCATCTCCACG
配列番号103(A37067 sdAb核酸配列)
GCCGTGCAGCTGGTGGATTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTGGGGGGTCGCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAGCATCAGCAGTCTCAACGCCATGGCATGGTACCGCCAGGGTCCAGGGAAGGAGCGCGAGCTGGTCGCAAGTATTACTAGGGGTGGTAGTACAGCCTATACAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAACGCCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACAGCCGTCTATTACTGTAGAGCGGTTTGGGGTTTTGGGGATTATGGTTCCTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCTTCG
配列番号104(AS07014 sdAb核酸配列)
CAGGTGCACCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATACACCTACAGTAGACACTGCCTGGGCTGGTTCCGCCAGACTCCAGGGAAGGAGCGCGAGGCGGTCGCGACTATTGATAGTGATGGTAGCACAAGCTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGTGACAACGCCAAGAACACTCTATATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGATAGGGCCGAACCCGCGATATTGTAGTGGCGCGCCCAACACTCGGGGCGCCGAACACTACTTTGGTTACTGGGCCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号105(AS07172 sdAb核酸配列)
CAGGTGAAGTTAGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTAAGACTTTCCTGTGCAGTGTCTGGAGACGATTTGAGTAACTACTGCATGGGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGAGCGCGAAGAGGTCGCAACTATTGATTATGCCTTTAAGACAAATTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTCCAAAGACAACGCCGAGAATAGTCTACGCGTAAATTTGGAAATGAACGACCTGAAACCTGACGACACTGCCATGTACTATTGTGCGGCAGATTGGAGTAGTGGTGGTGTGTGTTTTGGATTAGCGGACTTTGGTACCCGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号106(AS07189 sdAb核酸配列)
CAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAGACAGTCCTAGTGTGAACTACATGGGCTGGTTCCGCCGGGCTCCAGAAAAACAGCGCGAGCAGCGCGAGGAGGTCGCAAGTATTTATCCCACAGGTGGCACGTTTTACACAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCGAGACAACGCCAAGAACACTCTGTATCTCCAAATGACCGCCCTGAAACCTGAGGATACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGGAAAATGGGGGACTGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCATCGTCTCCTCA
配列番号107(AS07392 sdAb核酸配列)
CAGGTGAAGTTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAGACAGTTATAGTGTGAAGTACATGGGCTGGTTCCGCCGGGCTCCAGGGAAACAGCGCGACCAGCGCGAGGAGGTCGCAAGTATTTATCCCACAGGTGGCACGTTTTACACAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCCGAGACAACGCCAAGAGCACTCTGTATCTCCAAATGACCGCCCTGAAACCTGAGGATACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGGCAAATGGGGGACTGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号108(AS07678 sdAb核酸配列)
CAGGTGCACCTGATGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATACACCTACAGTAGGTACTGCCTGGGCTGGTTCCGCCAGACTCCAGGGAAGGAGCGCGAGGCGGTCGCAACTATTGATATTGATGGTAGCACAAGCTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAATGACAACGCCAAGAACACTCTATATCTGCAAATGAACATCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGGGCCGAACCCGCGATATTGTAGTGGCGCAGTCTACACTCGGGGCGCCGAACACTACTTTGGTTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号109(AS07688 sdAb核酸配列)
CAGATTCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAGACAGTTATAGTGTGAACTACATGGGCTGGTTCCGCCGGGCTCCAGGGCAACAGCGCGAGCAGCGCGAGGAGGTCGCAAGTATTTATGCCACGGGTGGCACGTTTTACAGAGACTCCGTGAAGGG CCGATTCACCATCTCCCGAGACAACGCCAAGAACACTCTGTATCTCCAAATGACCGCCCTGAAACCTGAGGATACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGGCAAATGGGGGACTGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCATCGTCTCCTCA
配列番号110(AS07712 sdAb核酸配列)
CAGATTCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGCATACACCGACAGACGCTACTGCATGGCCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGAGCGCGAGGGGGTCGCAACTATGGATACTGATGGTAGTACAAGGTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCACAGACAGCGCCAAGAACACTCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGGAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGTGGGGCCGAACCCGCGATATTGTAGTGGCGCAATCAACACTCGGGGCGCCGAACACTACTTTGGTTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号111(AS07745 sdAb核酸配列)
CAGATGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGCCTGGGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTCAGTAGCTACTACATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGGTGTCCAGTATTTATAGTGATGGTAGTAACACATACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAACGCCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAATCTGAGGACA CGGCCCTGTATTACTGTGCCACCCCAAGGGGTGCTCACGGACCTACATATTGTAGTGGTGGTTACTGCTACTACGGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
配列番号112(AS07832 sdAb核酸配列)
CAGGTTCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTCGGTGCAGGCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATACTACAATAGGTACTGCCTGGGCTGGTTCCGCCAGACTCCAGGGAAGGAGCGCGAGGCGGTCGCAACTATTGATACGGATGGTAGCACAAGCTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCTTTGACAACGCCAAGAACACTCTATATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACACTGCCATGTACTACTGTGCGGCAGGGCCGAACCCGCGATATTGTAGTGGCGCGGTCAACACTCGGGGCGCCGAACACTACTTTGGTTACTGGGCCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA
QVKLEESGGGLVLPGESLRLSCEASGRTITTITMGWFRQAPGKERQFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFIISRDNAGNRVYLQMHSLEPEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTQVTVSSEPKSSDKTHTSPPSPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号131(A34311 HCAb二量体型アミノ酸配列)
QVKLEESGGGLVLPGESLRLSCEASGRTITTITMGWFRQAPGKERQFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFIISRDNAGNRVYLQMHSLEPEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTQVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号132(AS02640 HCAb単量体型アミノ酸配列)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGLEFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFIISRDNSKNRLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTSPPSPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号133(AS02640 HCAb二量体型アミノ酸配列)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGLEFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFIISRDNSKNRLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
表4.抗CTLA-4/PD-1二重特異性抗体配列
QVQLVQSGVEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYMYWVRQAPGQGLEWMGGINPSNGGTNFNEKFKNRVTLTTDSSTTTAYMELKSLQFDDTAVYYCARRDYRFDMGFDYWGQGTTVTVSSASTKGPSWPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
配列番号160(オプジーボ(登録商標)重鎖アミノ酸配列)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
配列番号162(リンカーペプチド(9GS)アミノ酸配列)
GGGGSGGGS
配列番号163(ヒトIgG1(hIgG1)ヒンジアミノ酸配列)
EPKSCDKTHTCPPCP
表5.抗CTLA-4/PD-L1二重特異性抗体配列
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSWPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号197(デュルバルマブ重鎖アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSRYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSEKYYVDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREGGWFGELAFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSWPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPEFEGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPASIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号199(hCTLA-4完全長アミノ酸配列、シグナルペプチドを有さない)
AMHVAQPAVVLASSRGIASFVCEYASPGKATEVRVTVLRQADSQVTEVCAATYMMGNELTFLDDSICTGTSSGNQVNLTIQGLRAMDTGLYICKVELMYPPPYYLGIGNGTQIYVIDPEPCPDSDFLLWILAAVSSGLFFYSFLLTAVSLSKMLKKRSPLTTGVYVKMPPTEPECEKQFQPYFIPIN
配列番号164(hCTLA-4細胞外ドメインアミノ酸配列)
AMHVAQPAVVLASSRGIASFVCEYASPGKATEVRVTVLRQADSQVTEVCAATYMMGNELTFLDDSICTGTSSGNQVNLTIQGLRAMDTGLYICKVELMYPPPYYLGIGNGTQIYVIDPEPCPDSD
配列番号200(A34311直接グラフトアミノ酸配列)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWVRQAPGKGLEWVASHSWTDNNPYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKTARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSS
配列番号201(AS02636ヒト化sdAbアミノ酸配列)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGRQFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFIISRDNSKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSS
配列番号202(AS02626ヒト化sdAbアミノ酸配列、コンセンサスアミノ酸配列)
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGREFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFIISRDNSKNRLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSS
配列番号264(AS02640 sdAb核酸配列)
CAAGTTCAACTGGTGGAAAGCGGCGGCGGCGTGGTGCAACCGGGTCGTAGCCTGCGTCTGAGCTGCGCGGCGAGCGGTCGTACCATCACCACCATCACCATGGGTTGGTTCCGTCAGGCGCCGGGCAAGGGTCTTGAATTTGTGGCGAGCCACAGCTGGACCGACAACAACCCGTACTATGCGGATAGCGTTAAGGGCCGTTTCATCATTAGCCGTGACAACAGCAAAAACAGGCTGTACCTGCAGATGAACAGCCTGCGTGCGGAGGATACCGCGGTGTACTATTGCGCGGCGACCGCGCGTCGTAGCTTTGTTGGTCGTCAATGGTACACCGAGGCGCGTCAATACGATTACTGGGGCCAAGGCACCCTGGTTACCGTGAGCAGC
配列番号265(A34311VH11 sdAb核酸配列)
GAAGTGCAGCTGGTGGAAAGTGGAGGGGGCGTGGTGCAGCCTGGAAGAAGCCTGAGACTGTCCTGTGCCGCATCTGGGAGAACTATTACCACAATCACCATGGGATGGTTCCGACAGGCTCCAGGCAAGGGAAGAGAGTTTGTGGCAAGCCACTCCTGGACAGACAACAATCCTTACTATGCCGATTCTGTCAAGGGCAGGTTCACAATTTCTCGCGACAACGCCAAAAATACTCTGTACCTGCAGATGAACTCACTGCGACCCGAAGATACTGCCGTGTACTATTGCGCAGCTACCGCTCGACGGAGCTTCGTCGGGAGACAGTGGTACACCGAAGCAAGACAGTATGATTATTGGGGACAGGGCACTCTGGTCACCGTCAGCAGT
配列番号266(AS07014VH11 sdAb核酸配列)
GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGGGGAGGACTGGTGCAGCCTGGGGGAAGCCTGAGACTGAGTTGTGCCGCAAGCGGATACACTTACAGCAGGCACTGCCTGGGATGGTTCCGACAGGCACCAGGCAAGGGACGAGAGGCCGTGTCTACCATCGACAGTGATGGGAGCACATCCTACGCTGACTCAGTCAAGGGACGGTTTACTATCAGCAGAGATAACGCAAAGAACACCCTGTATCTGCAGATGAACTCCCTGAGACCAGAAGACACAGCCGTGTACTATTGCGCTATCGGACCCAACCCTCGGTACTGTTCTGGCGCCCCCAATACCCGGGGAGCCGAACATTACTTTGGGTATTGGGGACAGGGCACACTGGTGACCGTGAGCAGC
配列番号267(AS07014VH11G54 sdAb核酸配列)
GAAGTCCAACTGGTCGAATCGGGTGGTGGTCTGGTCCAACCGGGCGGCTCCCTGCGTCTGTCGTGTGCGGCGTCGGGCTATACCTATTCCCGTCATTGCCTGGGTTGGTTTCGTCAGGCACCGGGCAAAGGTCGTGAAGCTGTGAGTACCATTGATTCCGGCGGTAGCACGTCTTATGCGGACTCAGTTAAAGGTCGTTTCACCATCTCGCGCGATAACGCCAAAAATACGCTGTACCTGCAAATGAACAGCCTGCGCCCGGAAGACACCGCGGTCTATTACTGCGCCATTGGCCCGAACCCGCGTTATTGTTCTGGTGCGCCGAATACGCGTGGTGCGGAACATTACTTTGGCTACTGGGGTCAGGGTACGCTGGTTACGGTGTCCTCG
配列番号268(AS07014VH11SGA sdAb核酸配列)
GAAGTCCAACTGGTCGAAAGTGGTGGTGGCCTGGTCCAACCGGGCGGCTCGCTGCGTCTGTCGTGTGCTGCGTCTGGCTATACCTACAGCCGTCATTGCCTGGGTTGGTTTCGTCAGGCACCGGGCAAAGGTCGTGAAGCCGTGTCTACCATTAGCTCTGGCGGTAGTACGTCCTATGCAGATTCAGTTAAAGGTCGTTTCACCATCTCGCGCGACAACGCCAAAAATACGCTGTACCTGCAAATGAACTCCCTGCGCCCGGAAGATACCGCAGTCTATTACTGCGCTATTGGCCCGAATCCGCGTTATTGTAGCGGTGCGCCGGCCACGCGCGGCGCAGAACACTATTTCGGCTACTGGGGTCAGGGCACGCTGGTTACCGTTTCGTCG
配列番号269(AS07014VH11SGQ sdAb核酸配列)
GAAGTCCAACTGGTCGAAAGCGGCGGCGGCCTGGTCCAACCGGGCGGCTCACTGCGTCTGTCCTGTGCGGCATCGGGCTACACCTATAGCCGTCATTGCCTGGGTTGGTTTCGTCAGGCACCGGGCAAAGGTCGTGAAGCTGTGTCTACCATTAGCTCTGGCGGTAGTACGTCCTATGCGGATTCAGTTAAAGGTCGTTTCACCATCTCGCGCGACAACGCCAAAAATACGCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGCCCGGAAGATACCGCGGTCTATTACTGCGCCATTGGCCCGAATCCGCGTTATTGTAGCGGTGCGCCGCAAACGCGTGGTGCGGAACATTACTTTGGTTATTGGGGTCAGGGTACGCTGGTTACGGTTTCGTCG
配列番号270(AS07014VH11SGS sdAb核酸配列)
GAAGTCCAACTGGTCGAATCGGGCGGCGGCCTGGTCCAACCGGGTGGCTCACTGCGTCTGTCCTGTGCGGCAAGCGGCTACACGTATTCCCGTCATTGCCTGGGTTGGTTTCGTCAGGCACCGGGCAAAGGTCGTGAAGCTGTGAGCACCATTAGCTCTGGCGGTAGTACGTCCTATGCGGATAGCGTTAAAGGTCGTTTCACCATCTCTCGCGACAACGCCAAAAATACGCTGTACCTGCAAATGAACAGTCTGCGCCCGGAAGATACCGCGGTCTATTACTGCGCCATTGGCCCGAATCCGCGTTATTGTTCAGGTGCGCCGTCGACGCGCGGTGCCGAACATTATTTTGGTTACTGGGGTCAGGGTACGCTGGTCACGGTTTCATCA
配列番号271(AS07189TKDVH11 sdAb核酸配列)
GAGGTGCAGCTGGTGGAAAGCGGGGGGGGCCTGGTGCAGCCTGGAGGAAGCCTGAGACTGAGTTGTGCCGCAAGTGGCGATAGCCCAAGCGTGAACTACATGGGGTGGTTCAGGCAGGCACCAGGAAAGGGACGAGAGGAAGTGAGCTCCATCTACCCTACCGGCGGGACATTCTATACTGACTCTGTCAAGGGCCGGTTTACCATTAGTAGAGATAACGCCAAAAATACACTGTATCTGCAGATGAACAGCCTGCGACCCGAGGACACCGCTGTCTACTATTGCGCTGCTGGGAAATGGGGGACCGACTATTGGGGACAGGGGACACTGGTGACCGTCTCATCA
配列番号272(AS07189TKDVH11F27 sdAb核酸配列)
GAAGTGCAACTGGTGGAATCGGGTGGTGGTCTGGTTCAGCCGGGTGGTAGCCTGCGTCTGTCCTGTGCGGCAAGCGGTTTTTCGCCGAGCGTCAACTATATGGGCTGGTTTCGTCAGGCGCCGGGCAAAGGTCGCGAAGAAGTGAGCTCTATCTATCCGACCGGCGGCACGTTTTACACCGATAGTGTTAAAGGTCGTTTCACGATCTCCCGCGACAACGCGAAAAATACCCTGTACCTGCAAATGAATAGCCTGCGTCCGGAAGATACGGCCGTTTATTACTGCGCGGCAGGCAAATGGGGCACGGATTACTGGGGTCAGGGCACGCTGGTCACGGTGTCGTCC
配列番号273(AS07189TKDVH11FY sdAb核酸配列)
GAAGTGCAGCTGGTGGAAAGCGGAGGAGGACTGGTGCAGCCTGGCGGAAGCCTGAGACTGAGTTGTGCCGCATCTGGGTTTAGCCCCAGCGTGAACTACATGGGGTGGTTCAGGCAGGCACCAGGAAAGGGACGAGAGGAAGTGAGCTCCATCTACCCTACCGGCGGGACATTCTATACTGACTCTGTCAAGGGCCGGTTTACCATTAGTAGAGATAACGCCAAAAATACACTGTATCTGCAGATGAACAGCCTGCGACCCGAGGACACCGCTGTCTACTATTGCGCAGCAGGGAAATACGGAACCGATTACTGGGGGCAGGGAACTCTGGTCACTGTCAGCAGC
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGREFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号284(AS07014VH11 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWFRQAPGKGREAVSTIDSDGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAIGPNPRYCSGAPNTRGAEHYFGYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号285(AS07014VH11G54 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWFRQAPGKGREAVSTIDSGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAIGPNPRYCSGAPNTRGAEHYFGYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号286(AS07014VH11SGA HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWFRQAPGKGREAVSTISSGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAIGPNPRYCSGAPATRGAEHYFGYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号287(AS07014VH11SGQ HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWFRQAPGKGREAVSTISSGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAIGPNPRYCSGAPQTRGAEHYFGYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号288(AS07014VH11SGS HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWFRQAPGKGREAVSTISSGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAIGPNPRYCSGAPSTRGAEHYFGYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVEINAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号289(AS07189TKDVH11 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGDSPSVNYMGWFRQAPGKGREEVSSIYPTGGTFYTDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGKWGTDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号290(AS07189TKDVH11F27 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSPSVNYMGWFRQAPGKGREEVSSIYPTGGTFYTDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGKWGTDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号291(AS07189TKDVH11FY HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSPSVNYMGWFRQAPGKGREEVSSIYPTGGTFYTDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGKYGTDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
EPKSSDKTHTSPPSP
配列番号308(PD1BMmin 重鎖アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFVFSRYDMAWVRQAPGKGLEWVSFISGGGSNTYYPDTVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCISPYYYAMEYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSWLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
GGGGSGGGGSGGGGS
配列番号366(AS07014直接グラフトHCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWVRQAPGKGLEWVSTIDSDGSTSYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGPNPRYCSGAPNTRGAEHYFGYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNWSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号367(AS07189直接グラフトHCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSPSVNYMGWVRQAPGKGLEWVSSIYPTGGTFYTDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARGKWGTDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号368(AS07189TKDVH21FY HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSPSVNYMGWVRQAPGKGLEEVSSIYPTGGTFYTDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAAGKYGTDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号369(A34311VH2 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGLEFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号370(A34311VH2F53 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGLEFVASHSFTDNNPYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号371(A34311VH11F53 HCAb二量体型アミノ酸配列)
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGREFVASHSFTDNNPYYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSSEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号372(A34311コンセンサスアミノ酸配列)
EVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGRTITTITMGWFRQAPGKGLEFVASHSWTDNNPYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATARRSFVGRQWYTEARQYDYWGQGTLVTVSS
配列番号373(AS07014コンセンサスアミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYTYSRHCLGWFRQAPGKGREAVSTIDSGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAIGPNPRYCSGAPNTRGAEHYFGYWGQGTLVTVSS
配列番号374(AS07189コンセンサスアミノ酸配列)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSPSVNYMGWFRQAPGKGREEVSSIYPTGGTFYTDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGKWGTDYWGQGTLVTVSS
配列番号375(リンカーアミノ酸配列、nは、少なくとも1の整数)
(G)n
配列番号376(リンカーアミノ酸配列、nは、少なくとも1の整数)
(GS)n
配列番号377(リンカーアミノ酸配列、nは、少なくとも1の整数)
(GSGGS)n
配列番号378(リンカーアミノ酸配列、nは、少なくとも1の整数)
(GGGS)n
配列番号379(リンカーアミノ酸配列、nは、少なくとも1の整数)
(GGGGS)n
Claims (21)
- CTLA-4を特異的に認識する単一ドメイン抗体(sdAb)部分(抗CTLA-4 sdAb部分)を含む単離抗CTLA-4構築物であって、前記抗CTLA-4 sdAb部分が、以下:
(1)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3;
(2)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3;
(3)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3体;
(4)配列番号213のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号253のアミノ酸配列を含むCDR3;
(5)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3;
(6)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3;
(7)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3;
(8)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3;
(9)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3;
(10)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3;
(11)配列番号215のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号255のアミノ酸配列を含むCDR3;
(12)配列番号216のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号256のアミノ酸配列を含むCDR3;
(13)配列番号217のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号257のアミノ酸配列を含むCDR3;
(14)配列番号218のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号258のアミノ酸配列を含むCDR3;
(15)配列番号219のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号259のアミノ酸配列を含むCDR3;
(16)配列番号220のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号260のアミノ酸配列を含むCDR3;
(17)配列番号221のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号261のアミノ酸配列を含むCDR3;
(18)配列番号222のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号262のアミノ酸配列を含むCDR3;並びに
(19)配列番号214のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号339のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号254のアミノ酸配列を含むCDR3
のいずれか1つを含み、前記抗CTLA-4 sdAb部分が、配列番号114、115、117、118、120、122、123、127、129、200~202、274~282、341~344、352、及び353のいずれか1つのアミノ酸配列を含むV H Hドメイン、または配列番号114、115、117、118、120、122、123、127、129、200~202、274~282、341~344、352、及び353のいずれか1つに対して少なくとも約90%の配列同一性を有するその変異体を含む、単離抗CTLA-4構築物。 - 前記抗CTLA-4 sdAb部分が、キメラ、部分ヒト化、またはヒト化である、請求項1に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記単離抗CTLA-4構築物が、重鎖のみ抗体(HCAb)である、請求項1または2に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記HCAbが、配列番号130~133、283~291、及び366~371のいずれか1つのアミノ酸配列を含む、請求項3に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記単離抗CTLA-4構築物が、第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分をさらに含む、請求項1または2に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記抗CTLA-4 sdAb部分、及び前記第2の抗体部分が、ペプチドリンカーによって連結される、請求項5に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記ペプチドリンカーが、配列番号162、163、307、または365のアミノ酸配列を含む、請求項6に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記第2の抗体部分が、2つの重鎖及び2つの軽鎖からなる完全長抗体である、請求項5~7のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- (1)前記抗CTLA-4 sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つのC末端に融合される;
(2)前記抗CTLA-4 sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の重鎖の少なくとも1つのN末端に融合される;
(3)前記抗CTLA-4 sdAb部分のN末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1つのC末端に融合される;
(4)前記抗CTLA-4 sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の軽鎖の少なくとも1つのN末端に融合される;
(5)前記抗CTLA-4構築物が、4つの抗CTLA-4 sdAb部分を含み、各抗CTLA-4 sdAb部分のC末端が、前記完全長抗体の各鎖のN末端に融合される;および
(6)前記抗CTLA-4構築物が、4つの抗CTLA-4 sdAb部分を含み、前記4つの抗CTLA-4 sdAb部分のうちの2つが一緒に融合し、前記完全長抗体の各重鎖のN末端にさらに融合される
からなる群から選択される立体配置を含む、請求項8に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - 前記完全長抗体が、PD-1を特異的に認識する抗PD-1完全長抗体である、請求項8または9に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記抗PD-1完全長抗体が、
(1)配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(2)配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む軽鎖;並びに
(3)配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む軽鎖
のうちのいずれかの重鎖CDR(HC-CDR)および軽鎖CDR(LC-CDR)を含む、請求項10に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - (1)前記抗PD-1完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗PD-1完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAb部分に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号134~145、292~296、及び319~323のいずれか1つのアミノ酸配列を含む;
(2)前記抗PD-1完全長抗体が、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗PD-1完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAb部分に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号146~157、297~301、及び324~328のいずれか1つのアミノ酸配列を含む;
(3)前記抗PD-1完全長抗体が、配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗PD-1完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAb部分に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号310~318及び329~337のいずれか1つのアミノ酸配列を含む;
(4)前記抗PD-1完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗PD-1完全長抗体の軽鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAb部分に融合され、前記軽鎖融合ポリペプチドが、配列番号354及び355のいずれか1つのアミノ酸配列を含む;
(5)前記抗PD-1完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗CTLA-4構築物が、4つの抗CTLA-4 sdAb部分を含み、各抗CTLA-4 sdAb部分のC末端が、前記抗PD-1完全長抗体の各鎖のN末端に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号356のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖融合ポリペプチドが、配列番号357のアミノ酸配列を含む;
(6)前記抗PD-1完全長抗体が、配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号159のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗CTLA-4構築物が、4つの抗CTLA-4 sdAb部分を含み、前記4つの抗CTLA-4 sdAb部分のうちの2つが一緒に融合し、前記抗PD-1完全長抗体の各重鎖のN末端にさらに融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号358のアミノ酸配列を含む;
(7)前記単離抗CTLA-4構築物が、配列番号134~157、292~301、310~337、356、および358のいずれか1つのアミノ酸配列を含む重鎖融合ポリペプチドを含む;または
(8)前記単離抗CTLA-4構築物が、配列番号354、355、および357のいずれか1つのアミノ酸配列を含む軽鎖融合ポリペプチドを含む、
請求項10または11に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - 前記完全長抗体が、PD-L1を特異的に認識する抗PD-L1完全長抗体である、請求項8または9に記載の単離抗CTLA-4構築物。
- 前記抗PD-L1完全長抗体が、
(1)配列番号195のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号196のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
(2)配列番号197のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号198のアミノ酸配列を含む軽鎖
のHC-CDRおよびLC-CDRを含む、請求項13に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - (1)前記抗PD-L1完全長抗体が、配列番号195のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号196のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗PD-L1完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAb部分に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号171~182、302~306、及び345~349のいずれか1つのアミノ酸配列を含む;
(2)前記抗PD-L1完全長抗体が、配列番号197のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号198のアミノ酸配列を含む軽鎖を含み、前記抗PD-L1完全長抗体の重鎖の少なくとも1つが、前記抗CTLA-4 sdAb部分に融合され、前記重鎖融合ポリペプチドが、配列番号183~194のいずれか1つのアミノ酸配列を含む;または
(3)前記単離抗CTLA-4構築物が、配列番号171~194、302~306、および345~349のいずれか1つのアミノ酸配列を含む重鎖融合ポリペプチドを含む、
請求項13または14に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - (1)前記単離抗CTLA-4構築物が、N末端からC末端までの4つのポリペプチド:(i)VL-CL、(ii)VH-CH1-任意のペプチドリンカー-第1の抗CTLA-4 sdAb部分-CH2-CH3、(iii)VH-CH1-任意のペプチドリンカー-第2の抗CTLA-4 sdAb部分-CH2-CH3、および(iv)VL-CLを含み、ポリペプチド(i)のVL-CLおよびポリペプチド(ii)のVH-CH1が第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分を形成し、ポリペプチド(iv)のVL-CLおよびポリペプチド(iii)のVH-CH1が第3のエピトープを特異的に認識する第3の抗体部分を形成する;
(2)前記単離抗CTLA-4構築物が、N末端からC末端までの2つのポリペプチド:(i)第2のエピトープを特異的に認識する第1のscFv-任意のペプチドリンカー-第1の抗CTLA-4 sdAb部分-CH2-CH3、および(ii)第3のエピトープを特異的に認識する第2のscFv-任意のペプチドリンカー-第2の抗CTLA-4 sdAb部分-CH2-CH3を含む;
(3)前記単離抗CTLA-4構築物が、N末端からC末端までの4つのポリペプチド:(i)VL-CL-任意のペプチドリンカー-第1の抗CTLA-4 sdAb部分-CL、(ii)VH-CH1-任意のペプチドリンカー-第2の抗CTLA-4 sdAb部分-CH1-CH2-CH3、(iii)VH-CH1-任意のペプチドリンカー-第3の抗CTLA-4 sdAb部分-CH1-CH2-CH3、および(iv)VL-CL-任意のペプチドリンカー-第4の抗CTLA-4 sdAb部分-CLを含み、ポリペプチド(i)のVL-CLおよびポリペプチド(ii)のVH-CH1が、第2のエピトープを特異的に認識する第2の抗体部分を形成し、ポリペプチド(iv)のVL-CLおよびポリペプチド(iii)のVH-CH1が、第3のエピトープを特異的に認識する第3の抗体部分を形成する;および
(4)前記単離抗CTLA-4構築物が、N末端からC末端までの4つのポリペプチド:(i)第1の抗CTLA-4 sdAb部分-CL、(ii)第2のエピトープを特異的に認識する第1のscFv-任意のペプチドリンカー-第2の抗CTLA-4 sdAb部分-CH1-CH2-CH3、(iii)第3のエピトープを特異的に認識する第2のscFv-任意のペプチドリンカー-第3の抗CTLA-4 sdAb部分-CH1-CH2-CH3、および(iv)第4の抗CTLA-4 sdAb部分-CLを含む、
からなる群から選択される立体配置を含む、請求項5~7のいずれか一項に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - 前記単離抗CTLA-4構築物が、
(1)配列番号359のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド、および配列番号159のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド;
(2)配列番号360のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド;
(3)配列番号361のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド、および配列番号362のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド;並びに
(4)配列番号363のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド、および配列番号364のアミノ酸配列を含む2つの同一のポリペプチド
のいずれかを含む、請求項5~7および16のいずれか一項に記載の単離抗CTLA-4構築物。 - 請求項1~17のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物、及び医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
- 個体におけるCTLA-4関連疾患を治療するための医薬であって、前記CTLA-4関連疾患を治療するのに十分な量で、請求項1~17のいずれか1項に記載の単離抗CTLA-4構築物、または請求項18に記載の医薬組成物を含む、前記医薬。
- 前記CTLA-4関連疾患が、がんまたは病原性感染である、請求項19に記載の医薬。
- 前記がんが大腸癌であり、または前記病原性感染がウイルス感染である、請求項20に記載の医薬。
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