JP7111623B2 - 自動化された診断アナライザおよびその動作のための方法 - Google Patents

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０１６年４月２２日に出願された米国仮出願第６２／３２６，２５９号の出願日の利益を主張し、その開示は、参照により本明細書に組み込まれている。

生物学的なサンプルの診断検査は、医療産業の努力に貢献しており、病気を迅速におよび効果的に診断および治療する。そのような診断検査を実施する臨床研究室は、日々、数百または数千のサンプルをすでに受け入れており、需要は増え続けている。そのような大量のサンプルを管理する課題は、サンプル分析の自動化によって支援されてきた。自動化されたサンプル分析は、典型的に、自動化されたアナライザによって実施されており、自動化されたアナライザは、一般に自己完結型のシステムであり、それは、生物学的なサンプルに多段階プロセスを実施し、診断結果を取得する。

いくつかの現在の自動化された臨床アナライザは、提供されたサンプルに実施され得る自動化されたテストまたはアッセイのアレイをユーザに提示する。追加的に、サンプルが研究室に到着したときに、それらは、分析のための準備ができていないことが多い。自動化されたアナライザによる検査のためのサンプルを用意するために、検査技師は、典型的に、サンプルのアリコートを、研究室によって受け入れられたような一次的なコンテナから、二次的なコンテナへ移送し、二次的なコンテナは、アナライザに適している。それに加えて、技師は、典型的に、サンプルに対して何のテストが実施されるべきであるかを知らなければならず、技師は、サンプルとペアにされることとなるテスト特有の試薬または希釈剤を選択することができるようになっている。これは、時間がかかる可能性があり、また、オペレータ・エラーおよび伝染病への露出につながる可能性がある。

また、事前分析システムが存在し、事前分析システムは、分析のためのサンプルを用意することを助け、また、サンプルの研究室の受け入れとアナライザのテスト結果との間のワークフローからオペレータをさらに除去することを意図している。しかし、これらのシステムの多くは、依然として、かなりの技師関与を必要とし、それは、たとえば、事前分析システムの中にサンプルをロードする前；事前分析システムによってサンプルが用意された後；および、アナライザが分析を完了した後などである。

たとえば、いくつかの事前分析システムは、サンプルのアリコートを第１のコンテナから第２のコンテナへ自動的に移送することが可能である。しかし、そのようなシステムは、システムの中へそれらをロードする前に、技師が第１および第２のコンテナの識別コードを手動で合わせることを必要とすることが多く、それは、時間がかかることがあり、間違いやすい。

それに加えて、これらのシステムの多くは、１つまたは複数のアナライザと一体化されることができず、逆に、アナライザは、そのようなシステムと一体化されることができない。この点において、事前分析システムからアナライザへ、および、分析が完了すると、アナライザから貯蔵場所へ、サンプルを手動で移送するために、技師が存在していなければならない。これは、単調なタスクを実施するために熟練労働者を必要とし、技師が事前分析システムおよびアナライザの中のサンプルの進行にまで気を配らなければならないという点において、注意散漫を生じさせる可能性があり、休止時間を最小化するために、準備ができたときに、サンプルを移送するために技師が用意されるようになっている。

そのうえ、現在の事前分析システムは、一般的に、アナライザがそのようなサンプルを評価するのとは異なるレートで、サンプルを用意する。これは、事前分析システムとアナライザとの間の一体化をさらに複雑にする。この点において、技師は、サンプルのフル・バッチがアナライザへの手動移送のために蓄積されるまで、事前分析システムによって用意されるサンプルの追跡を連続的に行うことを必要とされ得る。代替的に、技師は、部分的なバッチをアナライザへ移送することが可能であり、それは、アナライザの生産性を低減させる可能性がある。

したがって、現在の自動化された事前分析システムおよびアナライザは、臨床研究室に有益であるが、さまざまなシステムのより良好な一体化および自動化の余地がある。

米国仮出願第６２／２９６，３４９号 米国特許第７，３３２，１３０号 米国特許第７，９９８，７０８号 米国特許第８，１０５，７８３号 米国特許第８，４４０，１４９号 米国特許第８，７０９，７８７号 米国特許第８，７６５，０７６号 米国特許第８，１３３，６７１号

本開示は、サンプル処理および分析のためのデバイス、システム、および方法を説明している。とりわけ、ハイスループット・システムの中に含まれているアナライザが説明されている。１つの実施形態では、ハイスループット・システムは、また、第２のアナライザ、ならびに、第１および第２のアナライザの両方と一体化された事前分析システムを含むことが可能である。これらのコンポーネント（すなわち、アナライザおよび事前分析システム）は、モジュール式であり、特定の研究室の診断的必要に適合するように、いくつかの異なる構成で一体化され得る。

本明細書で説明されている特定のアナライザは、一般的に、垂直方向の配置で、複数のデッキまたはレベルを有している。１つのデッキは、さまざまなアッセイのための消耗品を貯蔵することが可能であり、また、液体廃棄物を含む消耗品廃棄物を収容することが可能である。１つの実施形態では、十分な消耗品が、アナライザの中に貯蔵され得、システムを再ローディングすることなく、アナライザが２４時間連続で動作することを可能にする。また、このデッキは、ＤＮＡターゲットなどのような検体を検出するための検出器を含むことが可能である。

別のデッキは、隣り合わせで配置されている複数の処理モジュールを含むことが可能である。これらの処理モジュールのそれぞれの１つは、それらの構造体および機能の観点から同様に構成され得る。１つの実施形態では、それぞれの処理モジュールは、幅広いアッセイのアレイを実施することができ、それぞれの処理モジュールが、他の処理モジュールの上で走らされているアッセイと同時に、異なるアッセイを走らせることができるようになっている。この点において、それぞれの処理モジュールは、特定の時点における処理の必要性に応じて、任意の数のアッセイを実施するように、自動的に指定および再指定され得る。たとえば、それぞれの処理モジュールは、第１の、第２の、または第３のアッセイのいずれかを実施することができ得るが、第１の処理モジュールは、第１のアッセイを実施するように指定され得、第２の処理モジュールは、第２のアッセイを実施するように指定され得、第３の処理モジュールは、第３のアッセイを実施するように指定され得、それぞれのアッセイは異なっている。しかし、それらのアッセイが完了したとき、処理モジュールの任意の１つが、異なるアッセイを実施するように自動的に再指定され得、たとえば、第１の、第２の、および第３の処理モジュールのそれぞれが同じアッセイを同時に走らせるようになっている。したがって、特定のアッセイに関する十分な消耗品がそのハウジングの中で在庫を調べられる（ｉｎｖｅｎｔｏｒｉｅｄ）という条件で、アナライザは、リアルタイムの必要性に対処するようにフレキシブルである。

それぞれの処理モジュールは、マルチチャネル・ピペッタを有することが可能であり、複数のピペット・チャネルがこれに関連付けられている。それに加えて、アナライザは、在庫ロボットを有することが可能であり、在庫ロボットは、十分な消耗品が利用可能であるかどうかを決定するために、在庫検査を定期的に実施し、在庫から処理デッキへの間で消耗品を行ったり来たり移動させ、事前分析システムとアナライザとの間でサンプル・コンテナを行ったり来たり移動させる。より具体的には、在庫ロボットは、電子的なまたは光電子工学的な在庫スキャナ、およびエンド・エフェクタを含み、エンド・エフェクタは、サンプル・コンテナ・シャトル、増幅カートリッジ、液体試薬プレート、乾燥試薬プレート、およびサンプル処理プレートを含む、さまざまな消耗品をハンドリングするように構成されている。

本発明の特徴、態様、および利点は、以下の説明、添付の特許請求の範囲、および添付の図面に関して、より良好に理解されることとなる。

本開示の１つの実施形態によるハイスループット診断システムの正面斜視図である。 本開示の１つの実施形態による、その外部ハウジングおよび中のいくつかのコンポーネントがない状態の、図１のシステムの第１のアナライザの正面部分透視図である。 図２のアナライザの正面斜視図である。 本開示の１つの実施形態による第１のピペット・チップの斜視図である。 本開示の１つの実施形態による第２のピペット・チップの斜視図である。 本開示の１つの実施形態によるサンプル・コンテナ・シャトルの斜視図である。 本開示の１つの実施形態による処理プレートの斜視図である。 本開示の１つの実施形態による乾燥試薬プレートの斜視図である。 本開示の１つの実施形態による液体試薬プレートの斜視図である。 本開示の１つの実施形態による増幅カートリッジの上面図である。 本開示の１つの実施形態による消耗品リポジトリの後方斜視図である。 本開示の１つの実施形態による廃棄物リポジトリの後方斜視図である。 本開示の１つの実施形態によるピペット・チップ引き出しの正面斜視図である。 本開示の１つの実施形態による処理デッキの上面図である。 本開示の１つの実施形態による、図１１Ａの処理デッキの第１の処理モジュールの上面図である。 図１１Ａの処理デッキのサンプル・コンテナ保持アセンブリによって係合されているサンプル・コンテナの概略図である。 本開示の１つの実施形態による、図１１Ｂの処理モジュールのエクストラクタの正面斜視図である。 図１２Ａのエクストラクタの上面図である。 エクストラクタおよび処理プレートの代替的な実施形態の斜視図である。 図１２Ｃのエクストラクタおよび処理プレートの側面図である。 図１２Ｃのエクストラクタおよび処理プレートを含む、図１のシステムの処理デッキの部分斜視図である。 本開示の実施形態による在庫ロボットの正面斜視図である。 本開示の１つの実施形態による、図１３Ａのロボットのエンド・エフェクタを示す図である。 図１３Ｂのエンド・エフェクタの増幅カートリッジ係合部材を示す図である。 増幅カートリッジに係合している、図１３Ｃの係合部材の側面図である。 本開示の実施形態による液体ハンドリング・アセンブリの正面図である。 図１４Ａの液体ハンドリング・アセンブリのマルチチャネル・ピペッタの正面斜視図である。 本開示の方法論を実装するのに適切な例示的なコンポーネントを含む、図２のアナライザに関与するコンピューティング・システムの例示的なアーキテクチャのブロック図である。 本開示の１つの実施形態による、図２のアナライザを使用する方法のフロー・ダイアグラムである。 本開示の別の実施形態によるアナライザの正面図である。 図１７Ａのアナライザの正面斜視図である。 図１７Ａのアナライザの側面図である。 外部スキンを含むがフロント・ドアのない、図１７Ａのアナライザの正面斜視図である。 単一のフロント・ドアを含む、図１８Ａのアナライザの部分的な正面斜視図である。 可動の消耗品在庫の斜視図である。

本明細書で使用されているように、「約」、「概して」、および「実質的に」という用語は、絶対値からのわずかな偏差が、そのように修飾された用語の範囲の中に含まれることを意味することが意図されている。また、以下の議論において、左、右、正面、背面、上、および下などのような、特定の方向を参照するときには、そのような方向は、例示的な動作中に下記に説明されているシステムに面するユーザの視点から説明されていることが理解されるべきである。

図１は、ハイスループット・システム００を示しており、ハイスループット・システム００は、第１のアナライザ２０００、第２のアナライザ４０００、および、事前分析システム１０を含み、事前分析システム１０は、たとえば、特許文献１（「’３４９出願」）に説明されている事前分析システムなどであり、その開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。アナライザ２０００、４０００、および事前分析システム１０は、モジュール式になっており、それらは、物理的に互いに接続され、および、互いに切り離され得るようになっており、また、電子的に互いに接続され、および、互いに切り離され得るようになっている。第１のアナライザ２０００は、それらが実施する動作およびアッセイの観点から、第２のアナライザ４０００とは異なっているが、第２のアナライザ４０００は、第１のアナライザ２０００の複製であることが可能であり、事前分析システム１０が、同じアナライザのうちの少なくとも２つに連結するようになっていることが理解されるべきである。また、事前分析システム１０のモジュール性は、それがそのように構成されている任意のアナライザに連結することを可能にすることが理解されるべきである。示されているように、第１および第２のアナライザ２０００、４０００は、線形の配置で事前分析システム１０の両側に配設されている。事前分析システム１０およびアナライザ２０００、４０００は、この物理的な配置のために構成されているが、事前分析システム１０は３つ以上のアナライザを収納するように構成され得ること、ならびに、事前分析システム１０およびアナライザ２０００、４０００は、たとえば、Ｌ字形状などの他の物理的な配置で設置され得るように構成され得ることが企図されている。

事前分析システムとの関係におけるアナライザ
図２に示されているように、第１のアナライザは、事前分析システム１０のいずれかの側に連結され得る。この点において、事前分析システム１０のサンプル・コンテナ・シャトル輸送アセンブリ３００ａは、アナライザ２０００がシステム１０の右に位置する場合には、アナライザ２０００の左側に向けて延在しており、または、事前分析システム１０のサンプル・コンテナ・シャトル輸送アセンブリ３００ｂは、アナライザ２０００がシステム１０の左に位置する場合には、アナライザ２０００の右側に向けて延在している。そのようなアセンブリ３００ａ～ｂは、示されているように、アナライザの閾値に隣接して終端することが可能である。しかし、いくつかの実施形態では、そのようなアセンブリ３００ａ～ｂは、アナライザの閾値を横切ってアナライザ２０００の中へ延在することが可能である。在庫ロボット２３００（さらに下記に説明されている）は、アナライザ２０００のどちらの側にサンプル・コンテナ・シャトル２０３０が送達されるかにかかわらず、そのようなアセンブリ３００ａ～ｂからサンプル・コンテナ・シャトル２０３０を回収することが可能である。

構造的フレーム
図２および図３にさらに示されているように、アナライザ２０００は、金属チュービングのセグメントなどのような、いくつかの支持コンポーネントから構成された構造的フレーム２０１１を含み、支持コンポーネントは、サンプル処理および分析のためのさまざまなデッキまたはレベルを支持および画定するように構成されている。そのようなデッキは、検出／分析デッキ２０１２、在庫デッキ２０１４、処理デッキ２０１６、および液体ロボット・ハンドリング・デッキ２０１８を含むことが可能である。しかし、より多くのまたはより少ないデッキが実装され、アナライザ２０００の水平方向の長さまたは垂直方向の高さを低減させることが可能である。また、アナライザ２０００は、ハウジングまたはシェル２０１０を含み、ハウジングまたはシェル２０１０は、図１に示されているように、その内部コンポーネントを取り囲む。

デッキ関係
検出／分析デッキ２０１２は、アナライザ２０００の底部の近くに配設されており、在庫デッキ２０１４の下に位置する。在庫デッキ２０１４は、処理デッキ２０１６と検出／分析デッキ２０１２との間に配設されている。処理デッキ２０１６は、在庫デッキ２０１６と液体ハンドリング・ロボット・デッキ２０１８との間に配設されている。液体ハンドリング・ロボット・デッキ２０１８は、アナライザ２０００の上部の近くに配設されている。検出／分析デッキ２０１２、在庫デッキ２０１４、および処理デッキ２０１６は、アナライザ２０００の正面にそれぞれ位置し、アナライザの背面に到達する前に終端し、スペースを提供するようになっており、スペースは、左右方向にアナライザ２０００の長さに広がっており、また、アナライザ２０００の高さに沿って延在しており、検出／分析デッキ２０１２、在庫デッキ２０１４、および処理デッキ２０１６と交差するようになっている。在庫ロボット２３００がそのスペースの中に配設されており、そのスペースは、在庫ロボット２３００がそれらの３つの上述のデッキのうちのそれぞれ１つにアクセスすることを可能にするように提供されている。

消耗品
図４Ａ～図８は、さまざまな消耗品を示しており、それは、血液、粘液、喀痰、尿、排泄物、および、液体ベースの細胞学的サンプルなどを含む、サンプルのいくつかのカテゴリーに対して幅広いアッセイのメニューを実施するために自動的にハンドリングおよび利用され得る。そのようなメニューは、クラミジア・トラコマチス、淋菌、膣トリコモナス、グループＢレンサ球菌、腸内細菌（たとえば、カンピロバクター、サルモネラ、赤痢菌、大腸菌、志賀赤痢菌）、および、腸内寄生虫（たとえば、ランブル鞭毛虫、クリプトスポリジウム、赤痢アメーバ）の検出に関するアッセイを含み、また、血液ウィルス負荷（たとえば、ＨＩＶ、ＨＣＶ、およびＨＢＶ）の決定に関するアッセイを含む。アッセイのそのような幅広いメニューを実施するための能力は、消耗品設計によって部分的に支持されている。そのような消耗品は、ピペット・チップ、サンプル・コンテナ、サンプル・コンテナ・シャトル、処理プレート、乾燥試薬プレート、液体試薬プレート、および増幅カートリッジを含む。

ピペット・チップ
ピペット・チップ２０２０は、第１のピペット・チップ２０２０ａ（図４Ａ）および第２のピペット・チップ２０２０ｂ（図４Ｂ）を含む。第１のピペット・チップ２０２０ａは、第２のピペット・チップ２０２０ｂよりも大きい。たとえば、第１のピペット・チップ２０２０ａは、１ｍＬチップであることが可能であり、一方、第２のピペット・チップ２０２０ｂは、１７５μＬチップであることが可能である。しかし、アナライザ２０００は、必要に応じて、任意のサイズのピペット・チップを収納することができる。

サンプル・シャトルおよびサンプル・コンテナ
サンプル・コンテナ・シャトル２０３０（図５）は、’３４９出願のシャトル２８４と同様であり、サンプル・コンテナ０３を受け入れるようにそれぞれ構成された受容部２０３２を含む。示されている特定のシャトル２０３０は、合計で１２個の受容部に関して、２つの列の６つの受容部２０３２を含む。しかし、任意の数の受容部２０３２が設けられ得る。たとえば、シャトル２０３０は、合計数で２４個の受容部に関して、２つの列の１２個の受容部２０３２を含むことが可能である。示されている特定のアナライザ２０００では、サンプルのバッチは、２４個の合計サンプルを含むことが可能であり、それは、２４個の合計サンプル・コンテナと同等であることとなる。しかし、アナライザ２０００は、デュアル・レーン・アッセイ、または、他の複数のレーン・アッセイを実施することが可能であり、ここで、単一のサンプルが１つのランの中で２回以上処理および分析される。したがって、２４個の合計サンプルのうちのいくつかのバッチが、その合計サンプル数を得るために、１２個の合計サンプル・コンテナだけを必要とすることが可能である。したがって、それぞれのシャトル２０３０をフル・サンプル・バッチの半分を収納可能にすることは、デュアル・レーン・アッセイまたは他の複数のレーン・アッセイを効率的に収納するためのフレキシビリティをアナライザに提供する。

また、シャトル２０３０は、在庫ロボット２３００との係合のための第１の横断方向の開口部２０３４と、第２の横断方向の開口部２０３６とを含み、第２の横断方向の開口部２０３６は、対応する受容部２０３２と交差しており、サンプル・コンテナ保持アセンブリ（下記に説明されている）がその中に配設されているコンテナ０３にアクセスすることを可能にする。サンプル・コンテナ０３は、’３４９出願の第３のタイプのコンテナ０３と同じものである。この点において、サンプル・コンテナ０３は、貫通可能なシール０９を備えたキャップを含む。

処理プレート
処理プレート２０４０（図６）は、プレート本体部２０４１を含む。係合部材２０４９が、プレート本体部２０４１の上側表面から延在している。そのような係合部材２０４９は、係合切り欠き部２０４２を含む。したがって、切り欠き部２０４２は、プレート本体部２０４１の上方に位置決めされており、また、プレート本体部２０４１の側部に対して内側に位置決めされている。これは、エンド・エフェクタ、たとえば、さらに下記に説明されているエンド・エフェクタ２３６０などが、上記のプレート本体部２０４１から処理プレート２０４０を把持することを可能にする。しかし、プレート２０４０のいくつかの実施形態では、切り欠き部２０４２は、本体部２０４１の側部表面の中へ延在することが可能であり、それは、在庫ロボット２３００が本体部２０４１の周辺から処理プレート２４００に係合することを可能にする。

プレート本体部２０４１は、複数の抽出チューブ２０４４、混合ウェル２０４６、および、ピペット・チップ保持ステーション２０４７を少なくとも部分的に画定している。それぞれの抽出チューブ２０４４は、対応する混合ウェル２０４６、および、それと整合させられたピペット・チップ保持ステーション２０４７を有している。抽出チューブ２０４４は、混合ウェル２０４６よりも本体部２０４１の正中線の近くに位置し、混合ウェル２０４６は、ピペット・チップ保持ステーション２０４７よりも本体部２０４１の正中線の近くに位置する。抽出チューブ２０４４は、本体部２０４１によって画定された開口部を有しており、また、本体部２０４１の底部表面２０４３から延在するチューブ本体部２０４５を有している。チューブ本体部２０４５は、外側回転表面、たとえば、円錐形状の回転表面などを画定している。また、ピペット・チップ保持ステーション２０４７は、本体部２０４１によって画定された開口部と、底部表面２０４３から延在するスリーブ２０４８とを有している。そのようなスリーブ２０４８は、処理プレートが移動させられる場合にも、その中に配設されているときに、ピペット・チップ２０２０を安定に維持する。２つの列の抽出チューブ２０４４、混合ウェル２０４６、およびピペット・チップ・ホルダ２０４７が設けられており、互いに平行に配置されている。示されている特定の実施形態では、処理プレート２０４０は、２つの列の６つの抽出チューブ２０４４、混合ウェル２０４６、およびピペット・チップ保持ステーション２０４７を含み、それは、１２個のサンプルがその中で処理されることを可能にする。しかし、より多いまたはより少ないものが企図される。たとえば、処理プレート２０４０は、２つの列の１２個の抽出チューブ２０４４、混合ウェル２０４６、およびピペット・チップ保持ステーション２０４７を含むことが可能であり、または、単一の列のそのようなものを含むことも可能である。処理プレート２０４０は、その側部表面または他の表面の上に、バーコードなどのような識別子を含み、それは、アナライザ２０００がプレートを識別することを助ける。

乾燥試薬プレート
乾燥試薬プレート２０５０（図７）は、プレート本体部２０５１を含む。係合切り欠き部２０５２は、本体部２０５１の側部表面２０５３の中へ延在しており、それは、在庫ロボット２３００がその任意の２つの対向する側部から乾燥試薬プレート２０５０に係合することを可能にする。プレート本体部２０５１は、複数の乾燥試薬コンパートメント２０５４を画定している。貫通可能な膜（図示せず）が、これらのコンパートメント２０５４のそれぞれの上方に設置されており、プレート本体部２０５１にシールされ、１つのコンパートメントへのアクセスを取得するために膜が貫通される場合に、残りのコンパートメントがシールされたままになるようになっている。これは、サンプルの別のバッチに関して必要とされるまで、プレート２０５０が貯蔵されることを可能にする。示されているように、９６個の合計の試薬コンパートメント２０５４が存在しており、それは、試薬プレート２０５０が２４個のサンプル・バッチの４つの別々のランに関して利用されることを可能にする。しかし、この合計数は変化することが可能である。また、乾燥試薬プレート２０５０は、その側部表面２０５３または他の表面の上に、バーコードなどのような識別子を含み、それは、アナライザ２０００がプレートを識別することを助ける。

１つの実施形態では、２つの乾燥試薬プレート２０５０が、それぞれのアッセイに関して利用され、すなわち、それは、第１の乾燥試薬プレートまたは抽出試薬プレート２０５０ａ、および、第２の乾燥試薬プレートまたは増幅試薬プレート２０５０ｂである（図１０Ｃ参照）。この点において、抽出試薬プレート２０５０ａは、溶解緩衝液および抽出ビーズをロードされ、増幅試薬プレート２０５０ｂは、マスター混合試薬をロードされる。

同じプレート２０５０の中のそれぞれの試薬コンパートメント２０５４は、同じ試薬をロードされ、試薬プレートがアッセイ特有のものになるようになっている。したがって、２つ以上のアッセイがアナライザ２０００によって実施される場合には、そのアッセイに特有の試薬をそれぞれ備えた別々の試薬プレートが利用される。したがって、アナライザ２０００によって実施される１つのアッセイに関して、少なくとも２つの乾燥試薬プレート２０５０が利用される（たとえば、１つの抽出試薬プレート２０５０ａ、および、１つの増幅試薬プレート２０５０ｂ）。同様に、２つの異なるアッセイがアナライザ２０００によって実施される場合には、少なくとも４つの乾燥試薬プレート２０５０が利用される（たとえば、２つの抽出試薬プレート２０５０ａ、および、２つの増幅試薬プレート２０５０ｂ）。抽出および増幅乾燥試薬プレート２０５０ａ～ｂが別々になっているとして説明されているが、それらは単一の試薬プレートへと組み合わせられ得ることが企図される。

液体試薬プレート
液体試薬プレート２０６０（図８）は、プレート本体部２０６１を含み、プレート本体部２０６１は、上側表面および下側表面、ならびに、それらの間に延在する側部表面２０６２によって画定されている。係合切り欠き部２０６４が、本体部２０６１の側部表面２０６２の中へ延在しており、それは、在庫ロボット２３００がその任意の２つの対向する側部から液体試薬プレート２０６０に係合することを可能にする。液体試薬プレート２０６０は、４つの処理列２０６６で組織された複数の試薬コンパートメント２０６６を含む。これらの列２０６６のうちのそれぞれ１つは、４つのコンパートメント２０６６ａ～ｄを含み、ここで、それぞれのコンパートメントは、サンプル処理ステップのための試薬を保持している。たとえば、それぞれの処理列２０６６は、再構成緩衝液のための第１のコンパートメント２０６６ａ、洗浄緩衝液のための第２のコンパートメント２０６６ｂ、溶出緩衝液のための第３のコンパートメント２０６６ｃ、および、中和緩衝液のための第４のコンパートメント２０６６ｄを含む。これらのコンパートメント２０６６ａ～ｄは、それらが使用される順序で配置されている。しかし、それらは、他の配置になっていることも可能である。それに加えて、それぞれのコンパートメント２０６６は、サンプルのフル・バッチ、たとえば、２４個の合計サンプルのバッチを処理するのに十分な試薬を保持している。貫通可能な膜（図示せず）が、これらのコンパートメント２０６６のそれぞれの上方に設置されており、プレート本体部２０６１にシールされ、１つのコンパートメントへのアクセスを取得するために膜が貫通される場合に、残りのコンパートメントがシールされたままになるようになっている。これは、サンプルの別のバッチに関して必要とされるまで、液体試薬プレート２０６０が貯蔵されることを可能にする。また、乾燥試薬プレート２０６０は、その側部表面２０６２または他の表面の上に、バーコードなどのような識別子を含み、それは、アナライザ２０００がプレートを識別することを助ける。

増幅カートリッジ
増幅カートリッジ２０７０（図９）は、ＢＤ ＭＡＸ（商標）システム（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ、Ｆｒａｎｋｌｉｎ Ｌａｋｅｓ、ＮＪ）に関連付けられるＢＤ ＭＡＸ（商標）ＰＣＲカートリッジと同様であり、特許文献２；特許文献３；特許文献４；特許文献５；特許文献６；特許文献７に説明されており、その開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。増幅カートリッジ２０７０は、入口部ポート２０７３、マイクロ流体チャネル（図示せず）、ワックス・バルブ２０７４、増幅チャンバー２０７５、および通気孔２０７６を含む。処理されたサンプルが、入口部ポート２０７３を介してカートリッジ２０７０の中へ挿入され、それは、マイクロ流体チャネルを下って増幅チャンバー２０７５の中へ進行する。通気孔２０７６は、サンプルがチャネルを下って進行するときに空気が逃げることを可能にする。ワックス・バルブ２０７４は、溶融されるときに、チャンバー２０７５をシールし、サンプルの増幅がその中で起こり得るようになっている。チャンバー２０７５を部分的に画定する透明のまたは半透明のウィンドウは、検出器がその中の検体またはターゲットの存在を検出することを可能にする。

また、増幅カートリッジ２０７０は、カートリッジ２０７０の側部表面の中へ延在する係合切り欠き部２０７２を含む。これらの切り欠き部２０７２は、その両側においてカートリッジ２０７０の中へ延在しており、カートリッジの正中線に向けて内向きにテーパを付けられている。それに加えて、切り欠き部２０７２は、入口部ポート２０７３およびベント２０７６を含むカートリッジの側部に隣接する側に位置する。これは、切り欠き部２０７２がこれらの構造体と干渉することを防止する。切り欠き部２０７２は、在庫ロボット２３００が増幅カートリッジ２０７０に係合することを可能にし、カートリッジ２０７０がロボット２３００によって運搬され得るようになっている。しかし、いくつかの実施形態では、増幅カートリッジ２０７０は、そのような切り欠き部２０７２を有していなくてもよく、また、ロボット・グリッパとの係合のための他の特徴部を用いてもよい。それが切り欠き部２０７２と交差するカートリッジ２０７０の下側表面２０７９は、さらに下記に説明され、図１３Ｄに図示されているように、傾斜が付けられており、または別のしかたでロボットの係合ポスト２３６５の輪郭に合うように輪郭決めされており、それは、切り欠き部２０７２の周りで下側表面２０７９の中に凹部または窪み部２０７７を形成しており、それは、ロボット係合をさらに支援する。また、増幅カートリッジは、上部表面２０７８または底部表面２０７９の上に、バーコードなどのような識別子を含み、それは、アナライザ２０００がカートリッジを識別することを助ける。

消耗品ステージング（ｓｔａｇｉｎｇ）
図１０Ａ～図１０Ｃは、在庫デッキ２０１４および処理デッキ２０１６の中の消耗品ステージングのさまざまな態様を示している。在庫デッキ２０１４は、少なくとも１つの消耗品リポジトリ、たとえば、消耗品リポジトリ２１１０（図１０Ａ）などを含む。また、在庫デッキ２０１４は、少なくとも１つの廃棄物リポジトリ、たとえば、廃棄物リポジトリ２１３０（図１０Ｂ）などを含む。また、処理デッキ２０１６は、複数のピペット・チップ引き出しアセンブリ２１４０（図１０Ｃ）を含む。消耗品リポジトリ２１１０、廃棄物リポジトリ２１３０、およびピペット・チップ引き出し２１４０は、アナライザ２０００の正面からユーザによってそれぞれアクセス可能であり、アナライザ２０００によって利用されるさまざまな消耗品をユーザがロードおよびアンロードすることができるようになっている。

消耗品リポジトリ
図１０Ａに示されているように、消耗品リポジトリ２１１０は、支持構造体またはビーム２１１４を含み、支持構造体またはビーム２１１４は、ベース２１１９から垂直方向に延在するカラム２１１８から、水平方向に延在している。支持構造体２１１４は、個々の消耗品アイテムのためのコンパートメントを画定しており、消耗品アイテムが、カラム２１１８の第１の側からコンパートメントの中へロードされ、カラム２１１８の第２の側からオフロードされ得るようになっている。たとえば、支持構造体２１１４は、図１０Ａに示されているように、乾燥試薬プレート２０５０または液体試薬プレート２０６０をスライド式に受け入れて支持することが可能である。そのようなプレート２０５０および２０６０は、ユーザによってカラム２１１８の正面側からそれらのそれぞれのコンパートメントの中へスライドされ得、バーコードなどのような識別子がシステム２０００の内部の方を向いているようになっている。在庫ロボット２３００（さらに下記に説明されている）は、特定のプレートを識別するために識別子をスキャンすることが可能であり、また、必要に応じて、カラム２１１８の背面側から適当なプレート２０５０、２０６０を除去することが可能である。この点において、プレート２０５０および２０６０などのような、消耗品アイテムが、ユーザによって任意の順序でロードされ得る。その理由は、システム２０００が、ロボット２３００からの支援によって、在庫を調べることが可能であり、また、消耗品がユーザによってロードされた順序を自動的に決定することが可能であるからである。それに加えて、支持構造体２１１４は、その下側端部において、プレート２０５０、２０６０を保持し、その開口部２０５２、２０６４が露出されるようになっており、それによって、それらのそれぞれのコンパートメントからの除去のために、ロボット２３００が選択されたプレートに係合することを可能にする。また、示されているように、増幅カートリッジ２０７０は、消耗品リポジトリ２１１０の上部端部において、それぞれのカートリッジ貯蔵コンパートメント２１１６の中にスタックされ得る。カートリッジ２０７０は、ユーザによってシステム２０００の正面側から貯蔵コンパートメント２１１６の中にスタックされ得、また、ロボット２３００によってそこから除去され得る。

１つの実施形態では、消耗品リポジトリ２１１０は、１組のトラックに取り付けられ得、それは、再補充のためにリポジトリ２１１０が引き出しのように引っ張り出されることを可能にする。空気圧式のピストン（図示せず）が、リポジトリ２１１０を開けることを支援することが可能であり、また、ダンピングを提供し、リポジトリ２１１０があまりに迅速に閉まることおよび適切な位置から消耗品を押しのけることを防止することが可能である。他の実施形態では、リポジトリ２１１０は、ヒンジ式になっていることが可能であり、ドア２１１２がユーザに向けてスウィングして開き、再補充のためにリポジトリを見えるようにすることができるようになっている。

廃棄物リポジトリ
廃棄物リポジトリ２１３０（図１０Ｂ）は、ドア２１３２を含み、ドア２１３２は、ユーザによってアナライザ２０００の正面からアクセスされる。廃棄物コンパートメント２１３４は、ドア２１３２に平行な開口部２１３６を有しており、ドア２１３２の背面側に取り付けられている。また、リポジトリ２１３０は、棚部２１３８を含み、棚部２１３８は、廃棄物コンパートメント２１３４から延在している。この棚部２１３８は、示されているように、使用済みの処理プレート２０４０が在庫ロボット２３００によってその上にスタックされることを可能にする。また、リポジトリ２１３０は、開口部２１３６の中に液体コンテナを含むことが可能であり、開口部２１３６は、処理デッキ２０１６の上に位置する１つまたは複数の液体廃棄物受容部２２６０（図１１Ｂを参照）と連通していることが可能である。廃棄物リポジトリ２１３０は、１組のトラックに取り付けられ得、それは、空にするためにリポジトリ２１３０が引き出しのように引っ張り出されることを可能にする。空気圧式のピストン（図示せず）が、リポジトリ２１３０を開けることを支援することが可能であり、また、ダンピングを提供し、リポジトリ２１３０があまりに迅速に開くことおよび処理プレート２０４０を押しのけることを防止することが可能である。代替的に、リポジトリ２１３０は、ヒンジ式になっていることが可能であり、空にするために、ユーザに向けてスウィングして開くようになっている。

ピペット・チップ引き出し
ピペット・チップ引き出しアセンブリ２１４０（図１０Ｃ）は、チップ引き出し２１４２を含み、チップ引き出し２１４２は、一般的に、ボックス状の構造体であり、それは、側壁部２１４４および横断方向壁部２１４５を含み、横断方向壁部２１４５は、複数のピペット・チップを担持するピペット・チップ・ラックの受け入れのための１つまたは複数の開口部を含む。示されている実施形態では、２つのピペット・チップ・ラック（図示せず）の受け入れのために、チップ引き出し２１４２の横断方向壁部２１４５の中に２つの開口部が存在している。第１のラックは、第１のピペット・チップを含むことが可能であり、第２のラックは、第２のピペット・チップを含むことが可能である。ピペット・チップ引き出し２１４２は、１つまたは複数のトラック２１４８に取り付けられており、１つまたは複数のトラック２１４８は、空のチップ・ラックの除去および新鮮なチップ・ラックの再補充のために、引き出し２１４２がアナライザ２０００から部分的に引っ張り出されることを可能にする。ドア（図示せず）が、引き出し２１４２の一方の端部に取り付けられ得、引き出し２１４２が閉じられているときに、ドアがアナライザの外側シェルの一部分を形成するようになっている。空気圧式のピストン２１４９は、引き出し２１４２を開けることを支援することが可能であり、また、ダンピングを提供し、引き出し２１４２があまりに迅速に開閉することを防止することが可能である。

処理モジュール
処理モジュール／レーン
図１１Ａは、処理デッキ２０１６を示しており、処理デッキ２０１６は、隣り合わせで配置されている複数の処理モジュール２２００を含む。示されているように、処理デッキ２０１６は、３つの処理モジュール、すなわち、第１の処理モジュール２２００ａ、第２の処理モジュール２２００ｂ、および、第３の処理モジュール２２００ｃを含む。しかし、アナライザ２０００は、より多くのまたはより少ない処理モジュール２２００を含み、スループット必要性および特定の研究室のスペース要件に対処することが可能である。処理モジュール２２００ａ～ｃは、それらの物理的な配置の観点から同様に構成されており、それらの間の相違は、ジョー・アセンブリを有するシャトル・プラットフォームに対するそれらの場所であり、ジョー・アセンブリは、サンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０として機能し、サンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０は、隣接するモジュールによって共有され得る。たとえば、第１および第２の処理モジュール２２００ａ～ｂは、両方とも、第１のサンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０ａｂを利用し、それに関するサンプル・コンテナ０３を保持することが可能であり、第２および第３の処理モジュール２２００ｂ～ｃは、両方とも、第２のサンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０ｂｃを利用し、それに関するサンプル・コンテナ０３を保持することが可能である。

それぞれの処理モジュール２２００は同様に構成されているが、それぞれの処理モジュール２２００は、幅広いアッセイのアレイを実施することができ、それぞれの処理モジュール２２００が、別の処理モジュールにおいて現在実施されているアッセイとは異なるアッセイを走らせることができるようになっている。この点において、それぞれの処理モジュール２２００は、特定の時点における処理の必要性に応じて、任意の数のアッセイ・タイプを実施するように、自動的に指定および再指定され得る。たとえば、第１の処理モジュール２２００ａは、第１のアッセイを実施するように指定され得、第２の処理モジュール２２００ｂは、第２のアッセイを実施するように指定され得、第３の処理モジュール２２００ｃは、第３のアッセイを実施するように指定され得、それぞれのアッセイは異なっている。しかし、それらのアッセイが完了したとき、処理モジュール２２００ａ～ｃのうちの任意の１つが、異なるアッセイを実施するように自動的に再指定され得、たとえば、第１の、第２の、および第３の処理モジュール２２００ａ～ｃのそれぞれが同じアッセイを走らせるようになっている。したがって、特定のアッセイに関する十分な消耗品がそのハウジング２０１０の中で在庫を調べられるという条件で、アナライザ２２００は、リアルタイムの必要性に対処するようにフレキシブルである。

処理モジュールの例
図１１Ｂは、第１の処理モジュール２２００ａを示しており、他の処理モジュールの例示的なものである。第１の処理モジュール２２００ａは、一般的に、第１のサンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０ａｂ（それは、第２の処理モジュール２２００ｂによって共有されている）、乾燥試薬ステーション２２２０、液体試薬ステーション２２３０、エクストラクタ２２４０、増幅カートリッジ・ステーション２２５０、ピペット引き出し２１４０、および廃棄物受容部２２６０を含む。これらのコンポーネントは、任意の構成で配置され得る。しかし、示されている実施形態では、乾燥試薬ステーション２２２０および液体試薬ステーション２２３０は、処理デッキ２０１６のバック・エンドに位置し、互いに隣接して配設されている。第１および第２のエクストラクタ２２４０ａ～ｂは、試薬ステーション２２２０および２２３０に隣接して位置し、また、増幅カートリッジ・ステーション２２５０と試薬ステーション２２２０、２２３０との間に位置決めされている。これは、それらの間の液体の効率的な移送を可能にする。ピペット・チップ引き出し２１４０は、処理デッキ２０１６の正面に位置し、ユーザがそれへの容易なアクセスを有することを可能にする。処理モジュール２２００ａは、好ましくは、３つのピペット・チップ引き出し２１４０を含み、３つのピペット・チップ引き出し２１４０は、第１のピペット・チップ２０２０ａを担持する第１のピペット・チップ・ラック２０２２ａ、および、第２のピペット・チップ２０２０ｂを担持する第２のピペット・チップ・ラック２０２２ｂをそれぞれ保持している。ピペット・チップ２０２０のこの量は、再補充することなく、処理モジュール２２００ａが約１２個のアッセイ・ランを実施することを可能にする。サンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０ａｂは、エクストラクタ２２４０ａ～ｂおよび試薬プレート・ステーション２２２０、２２３０の側部に配設されており、また、第１および第２の処理モジュール２２００ａ～ｂの間に配設されている。また、第１および第２の処理モジュール２２００ａ～ｂの間に、廃棄物受容部２２６０がある。廃棄物受容部は、使用済みのピペット・チップが上記の処理デッキ２０１６から廃棄物リポジトリ２１３０の中へ廃棄されることを可能にする。また、廃棄物受容部２２６０は、液体廃棄物入口部（図示せず）を含むことが可能であり、液体廃棄物入口部は、液体廃棄物が廃棄物リポジトリ２１３０の中のボトルまたは何らかの他のコンテナの中へ廃棄されることを可能にする。

サンプル・コンテナ保持アセンブリ
サンプル・コンテナ保持アセンブリ２２１０ａｂは、それがクランピング・アセンブリ２２１２を含むという点において、’３４９出願のサンプル・コンテナ保持アセンブリ１１００と同様であり、クランピング・アセンブリ２２１２は、クランピング・アセンブリの中に配設されているシャトル２０３０に向けて閉じ、アリコートがコンテナ０３から吸引されている間に、シャトル２０３０およびシャトル２０３０の中のコンテナ０３を保つ。この点において、クランピング・アセンブリ２２１２は、係合部材２２１４を含み、クランピング・アセンブリ２２１２が、図１１Ｃに最良に見られるように、サンプル・コンテナ０３の底部端部におけるスカート０７に係合するように閉じられるときに、係合部材２２１４は、シャトル２０３０の中の第２の横断方向の開口部２０３６を通って突出するように構成されている。これらの係合部材２２１４は、それぞれのコンテナ０３のスカート０７の中へ貫通し／噛み込み、吸引の間にコンテナ０３がシャトル２０３０から不注意に除去されることを防止する。しかし、保持アセンブリ１１００とは異なり、保持アセンブリ２２１０ａｂは、静止したプラットフォーム２２１６を有しており、静止したプラットフォーム２２１６の上にシャトル２０３０が置かれ、一方、保持アセンブリ１１００は、移動式コンベヤ１１１６を利用する。したがって、コンベヤの代わりに、クランピング・アセンブリ２２１０ａｂの中の位置へシャトル２０３０を輸送するために、在庫ロボット２３００は、クランピング・アセンブリ２２１２の中の位置へシャトル２０３０を設置する。

試薬プレート・ステーション
乾燥試薬プレート・ステーション２２２０および液体試薬プレート・ステーション２２３０は、デッキ２０１６の表面から延在する支持構造体（図示せず）、たとえば、１対のレールなどによって画定された受容部をそれぞれ含むことが可能である。そのような受容部は、対応する試薬プレートを受け入れることが可能であり、それぞれのプレートが正確な場所に設置されることを確実にすることを助ける。示されているように、処理モジュール２２００ａは、１つの乾燥試薬プレート・ステーション２２２０、および、１つの液体試薬プレート・ステーション２２３０を含む。アナライザ２０００は、典型的に、実施されるそれぞれのアッセイに関して、２つの乾燥試薬プレート２０５０ａ～ｂを利用するので、乾燥試薬プレート２０５０ａ～ｂは、動作の間に交換される。しかし、追加的な乾燥試薬プレート・ステーションが、処理モジュール２２００ａの中へ組み込まれ得、試薬プレート２０５０ａ～ｂのそれぞれが一度に処理デッキ２０１６の上に位置することを可能にすることが企図される。また、処理モジュール２２００ａは、凹んだ支持構造体を含むことが可能であり、凹んだ支持構造体は、増幅カートリッジ２０７０が在庫ロボット２３００によって正確に設置されることを可能にする。

エクストラクタ
図１２Ａおよび図１２Ｂに示されているようなエクストラクタ・アセンブリは、２つのエクストラクタ、すなわち、第１のエクストラクタ２２４０ａおよび第２のエクストラクタ２２４０ｂを含む。それぞれのエクストラクタ２２４０ａ～ｂは、ハウジング２２４２、プリント回路基板２２４７（「ＰＣＢ」）、モータ２２４４、駆動メカニズム２２４６、永久磁石２２４１、および加熱エレメント２２４８を含む。他の例示的なエクストラクタ・アセンブリは、ＢＤ ＭＡＸ（商標）システム（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ、Ｆｒａｎｋｌｉｎ Ｌａｋｅｓ、ＮＪ）のエクストラクタを含み、また、特許文献８に説明されており、その開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。永久磁石２２４１は、駆動メカニズム２２４６に装着されており、ハウジング２２４２の中に配設されている。永久磁石２２４１は、２つの列の６つの磁石の中に配置されており、６対の隣接する磁石２２４１ａ～ｂを形成するようになっている。磁石２２４１ａ～ｂのこの隣り合わせのペアリングは、単一の磁石のものを上回って、処理プレート２０４０の中の磁気ビーズの磁気引力を強化することが見出された。磁石２２４１の列は、駆動メカニズム２２４６に可動式に接続されており、また、モータ２２４４によって動作させられる駆動メカニズム２２４６を介して、ハウジング２２４２の上部における開口部を通して、ハウジング２２４２の中へ、および、ハウジング２２４２から外へ可動である。

ＰＣＢ２２４７および加熱エレメント２２４８は、ハウジング２２４２の対向する側部に接続されている。加熱エレメント２２４８は、２つの列の６つで配置されており、ハウジング２２４２の上方に延在している。それぞれの加熱エレメント２２４２は、凹部２２４９を画定しており、凹部２２４９は、カップ状の構造体を形成しており、それは、処理プレートの抽出チューブ２０４５の外側回転表面に一致する幾何学形状を有している。これは、加熱エレメント２２４８がそのような回転表面に直接的に接触し、抽出チューブ２０４５の中へ熱を伝達することを可能にし、また、処理プレート２０４０が安定的にエクストラクタ２２４０によって支持されることを可能にする。それに加えて、エクストラクタ２２４０ａ～ｂの幅は、処理プレートがそれによって保たれるときに、ピペット・チップ２０２０がピペット・チップ保持ステーションの中へ設置され得るように、および、エクストラクタ２２４０による干渉なしに処理プレート２０４０を通って延在することができるようになっている。モータ２２４４が動作させられるときに、永久磁石２２４１の列は、加熱エレメント２２４８と隣接する抽出ウェル２０４５との間のスペース２２４３の中へ、上方へ移動させられ、その中に配設され得る磁気ビーズを引き付けることが可能である。

図１２Ｃおよび図１２Ｄは、本開示のさらなる実施形態によるエクストラクタ２２４０’および処理プレート２０４０を示している。以前に説明されているように、処理プレートは、プレート本体部２０４１の対向する側部に係合切り欠き部２０４２を含むことが可能である。しかし、係合切り欠き部２０４２がプレート本体部２０４１の両側に位置する代わりに、処理プレート２０４０は、好ましくは、プレート本体部２０４１の上側表面から延在する係合部材２０４９を含む。そのような係合部材２０４９は、係合切り欠き部２０４２を含む。したがって、処理プレート２０４０は、プレート本体部２０４１の上方に、および、プレート本体部２０４１の側部に対して内側に、切り欠き部２０４２を配置する。これは、プレート本体部２０４１の側部においてではなくプレート本体部２０４１の上方から、エンド・エフェクタ２３６０が処理プレート２０４０を把持することを可能にし、それは、より詳細に下記に説明されているように、エンド・エフェクタ２３６０がほぼクリアランスなしでスペースの中で動作することを可能にする。

エクストラクタ２２４０’は、エクストラクタ２２４０と同様であり、その相違は、エクストラクタ２２４０’がドリップ・トレイ２２８０を含むことである。ドリップ・トレイ２２８０は、示されているように、中間部材２０８８によって接続されているトラフ部材２２８１ａ～ｂを含む。中間部材２０８８は、エクストラクタ２２４０’の対向する側部の間に延在しており、抽出チューブ２０４５および混合ウェル２０４６がそれを通って延在するための開口部を含み、図１２Ｄに最良に示されているように、抽出チューブ２０４５がエクストラクタ２２４０’の加熱エレメント２２４８に係合するようになっている。それに加えて、中間部材２０８８は、処理プレート２０４０を支持することを助ける。その理由は、それが、一般的に、平坦な上側表面を有しており、それは、処理プレート本体部２０４１がその上に置かれることを可能にするからである。それぞれのトラフ部材２２８１ａ～ｂは、外側シールド２０８２、内側シールド２０８４、および下側シールド２０８６を含む。内側シールド２０８４は、中間部材２０８８に接続されており、そこから下向きに延在しており、図１２Ｄに最良に示されているように、処理プレート２０４０がエクストラクタ２２４０’に装着されるときに、内側シールド２０８４が加熱エレメント２２４８とピペット・スリーブ２０４８の列との間に位置するようになっている。下側シールド２０８６は、外側シールド２０８２および内側シールド２０８４に接続しており、外側シールド２０８２と内側シールド２０８４との間に延在している。外側シールド２０８２は、下側シールド２０８２から上向きに延在している。この構成は、トラフを形成しており、トラフは、ピペット・チップ２０２０がピペット・スリーブ２０４８のそれぞれの１つの中に配設されているときに、そのようなピペット・チップ２０２０の列を受け入れるようにサイズ決めされている。この点において、トラフ部材２２８１ａ～ｂは、システム２０００の中のバリアを形成し、それは、ピペット・チップ２０２０からの汚染を防止することを助け、ピペット・チップ２０２０は、再使用のために、ピペット・スリーブ２０４８の中に貯蔵され得る。

図１２Ｅは、エクストラクタ２２４０’を含む第３の処理モジュール２２１０ｃを示している。処理プレート２０４０は、前記エクストラクタ２２４０’に装着されている。エクストラクタ２２４０’および処理プレート２０４０は、乾燥試薬プレート２０５０および液体試薬プレート２０６０とピペット・チップ・シュート２１３５および増幅カード・ステーション２０７０との間に配設されている。しかし、示されているように、処理プレート２０４０は、一般的に、これらの周囲のコンポーネントよりも低く、処理デッキ２０１６の上に位置している。しかし、システム２０００の全体的なサイズを節約することを助けるために、これらのコンポーネントと処理プレート２０４０との間の横方向のクリアランスが最小になっている。したがって、処理プレート２０４０をエクストラクタ２２４０’の上に設置し、また、処理プレート２０４０をエクストラクタ２２４０’からピックアップするのに十分なクリアランスを、エンド・エフェクタ２３６０が有することは困難である可能性がある。この点において、処理プレート２０４０は、係合部材２０４９を提供しており、係合部材２０４９は、エンド・エフェクタ２３６０が処理プレート２０４０をピックアップおよび設置するのに十分なクリアランスを提供する。また、示されているように、細長い開口部２０１７が、処理デッキ表面２０１６を通って延在しており、それは、処理プレート２０４０に装着される再使用可能なピペット・チップ２０２０がそれを通って延在することを可能にする。ドリップ・トレイのトラフ部材２２８１ａ～ｂは、そのような開口部２０１７と整合させられ、それは、そのようなピペット・チップ２０２０からの滴下によって汚染されないようにシステム２０００を守る。

検出器
それぞれの処理モジュール２２００ａ～ｃは、関連の検出器２２７０を有しており、検出器２２７０は、図１０Ａに示されている実施形態では、アナライザ２０００の底部において、検出／分析デッキ２０１２の中にそれぞれ位置する。たとえば、第１の処理モジュール２２００ａは、第１の検出器２２７０ａに関連付けられており、第２の処理モジュール２２００ｂは、第２の検出器２２７０ｂに関連付けられており、第３の処理モジュール２２００ｃは、第３の検出器２２７０ｃに関連付けられている。処理デッキ２０１６の下の検出器２２７０ａ～ｃの場所は、可能性のある汚染物質から検出器２２７０ａ～ｃを隔離することを助ける。例示的な検出器は、ＢＤ ＭＡＸ（商標）システム（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ、Ｆｒａｎｋｌｉｎ Ｌａｋｅｓ、ＮＪ）の検出器であり、特許文献８に説明されており、その開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれている。検出器２２７０ａ～ｃのそれぞれは、リーダ・ヘッド２２７１およびサーモサイクラ２２７５を含む。リーダ・ヘッド２２７１は、光エミッタおよび検出器（図示せず）を含み、検出器は、増幅カートリッジ２０７０のチャンバー２０７５の中の蛍光プローブの存在を検出するように構成されている。サーモサイクラ２２７５は、可動プラットフォーム２２７６を含み、可動プラットフォーム２２７６は、増幅カートリッジ２０７０を受け入れるように構成された凹部２２７７を有している。サーモサイクラ２２７５は、加熱エレメント（図示せず）を有しており、加熱エレメントは、精製されたＤＮＡなどのような、増幅カートリッジ２０７０の内容物を、所定の温度まで定期的に加熱し、そのような内容物の増幅を支援する。リーダ・ヘッド２２７１は、アナライザ２０００の構造体から懸下されており、そのリーダが下向き方向を指すようになっている。サーモサイクラ２２７５は、リーダ・ヘッド２２７１の下に配設されており、モータ２２７８および駆動ねじを含み、それは、プラットフォーム２２７６を垂直方向に移動させ、増幅カートリッジ２０７０をリーダ・ヘッド２２７１に押し付ける。サーモサイクラ２２７５とリーダ・ヘッド２２７１との間に存在するスペースは、十分に幅広くなっており、在庫ロボット２３００が増幅カートリッジ２０７０をサーモサイクラ２２７５の上に設置することを可能にする。

消耗品ハンドリング
図１３Ａ～図１３Ｄは、本開示の１つの実施形態による在庫ロボット２３００を示している。在庫ロボット２３００は、アナライザ２０００の中のすべての消耗品の在庫を調べることを助け、また、アナライザ２０００の中のすべての消耗品をハンドリングする。それに加えて、在庫ロボット２３００は、アナライザ２０００から事前分析システム１０の中へ到達することが可能であり、サンプル・コンテナ０３を備えたシャトル２０３０をアナライザ２０００と事前分析システム１０との間で行ったり来たり移動させるようになっている。この点において、アナライザ２０００のハウジングは、その左側または右側において側部開口部を含むことが可能であり、それは、ロボット２３００がそれを通って到達することを可能にするようにサイズ決めされている。在庫ロボット２３００は、トラック部材２３１０、本体部／ポスト２３２０、ショルダー部２３３０、第１のアーム部材２３４０、第２のアーム部材２３５０、および、エンド・エフェクタまたはハンド２３６０を含む。

ロボット・アーム
トラック部材２３１０は、アナライザ２０００の一方の側から左右方向に他方の側へ延在しており、また、上述の正面に位置するデッキ２０１２、２０１４、および２０１６よりも、アナライザ２０００のバック・エンドの近くに位置する。本体部２３２０は、トラック部材２３１０にスライド可能に取り付けられており、そこから直交して延在している。本体部２３２０は、キャリッジ２３２２を介してトラック部材２３１０に連結されている。キャリッジ２３２２およびトラック部材２３１０は、リニア・モータを形成しており、リニア・モータは、本体部２３２０が左右方向に単一の軸線に沿って並進させられることを可能にする。アナライザ２０００の中に実装され得るリニア・モータの例は、Ｆｅｓｔｏ Ｌｉｎｅａｒ Ｍｏｔｏｒ Ａｃｔｕａｔｏｒ（「ＦＬＭＡ」）（Ｆｅｓｔｏ ＡＧ ＆ Ｃｏ． ＫＧ Ｅｓｓｌｉｎｇｅｎ ａｍ Ｎｅｃｋａｒ、Ｇｅｒｍａｎｙ）である。しかし、ベルトおよびプーリ・メカニズムなどのような、他の駆動メカニズムも、トラック部材２３１０に沿って本体部２３２０を駆動するように企図される。

ショルダー部２３３０は、本体部２３２０にスライド可能に取り付けられており、ショルダー部２３３０が本体部２３２０の垂直方向軸線に沿って駆動され得るようになっており、それは、リニア・モータまたは何らかの他の駆動メカニズムによっても実現され得る。ショルダー部２３３０は、第１のアーム部材２３４０の一方の端部において第１のアーム部材２３４０に取り付けられており、第１のアーム部材２３４０が、ショルダー部２３３０および第１のアーム部材２３４０の両方によって共有されている垂直方向軸線の周りに回転可能であるようになっている。第２のアーム部材２３５０は、第１のアーム部材２３４０の他方の端部に接続されており、第２のアーム部材２３５０が、アーム部材２３４０および２３５０の両方によって共有されている垂直方向軸線の周りに回転可能であるようになっている。エンド・エフェクタ２３６０は、第１のアーム部材２３４０から遠隔にある第２のアーム部材２３５０の端部に接続されており、エンド・エフェクタ２３６０および第２のアーム部材２３５０の両方によって共有されている垂直方向軸線の周りに回転可能である。

エンド・エフェクタ
エンド・エフェクタ２３６０は、本体部２３６２と、本体部２３６２に連結されている１対の可動フィンガ２３６３ａ～ｂとを含む。可動フィンガ２３６３ａ～ｂは動作可能であり、図１３Ａに図示されているように、アイテムを把握または解放するために、それらが、より近くに一緒になるように移動するか、または、より遠くへ離れるように移動するようになっている。この点において、可動フィンガ２３６３ａ～ｂは、一般的に、動作の間に平行のままになっている。本体部２３６０は、一般的にフィンガ２３６３ａ～ｂから離れる方を向く本体部２３６２の表面の中に、１つまたは複数の識別子リーダ２３６６、たとえば、バーコード・スキャナなどを含む。本体部２３６２は、第２のアーム部材２３５０に対して約１８０度回転することができ、それは、そのような識別子リーダ２３６６がアナライザ２０００の正面の方を向くこと、および、在庫デッキ２０１４の中にまたは他の場所に位置する消耗品をスキャンすることを可能にする。また、本体部２３６２は、その底部表面の中に識別子リーダを含むことが可能であり、そのようなリーダが、上向きの識別子、たとえば、増幅カートリッジ２０７０の上に位置し得るものなどを読み取ることができるようになっている。

フィンガ２３６３ａ～ｂは、とりわけ、さまざまな異なる消耗品に係合するように構成されている。この点において、フィンガ２３６３ａ～ｂは、第１の係合特徴部２３６１および第２の係合特徴部２３６４を含む。第１の係合特徴部２３６１は、示されているように、タブまたは突出部であり、それは、一方のフィンガ２３６３から他方のフィンガ２３６３に向けて内側に延在している。第１の係合特徴部２３６１は、それぞれ、プレート２０４０、２０５０、２０６０の係合切り欠き部２０４２、２０５２、２０６２の中に、および、シャトル２０３０の第１の横断方向の開口部２０３４の中にフィットするようにサイズ決めされている。動作時に、フィンガ２３６３ａ～ｂが消耗品アイテムの上へ閉じられるときに、第１の係合特徴部２３６１は、対応する消耗品アイテムの切り欠き部または開口部の中へ延在し、フィンガ２３６３ａ～ｂ自身が消耗品アイテムの側部表面にクランプしている間に、消耗品アイテムが落下することを防止し、そのようなアイテムをさらに制御および保つ。示されているように、それぞれのフィンガ２３６３ａ～ｂは、好ましくは、２つの係合特徴部２３６１を含み、それは、フィンガの把握の中の消耗品アイテムの不意の回転を防止することを助ける。

第２の係合特徴部２３６４は、一般的に、第１の係合特徴部２３６１とは、フィンガ２３６３ａ～ｂの反対側に位置し、また、下向きに延在するポストまたはダブテール２３６５を含む。ポスト２３６５は、係合特徴部２３６４の概して平面的な底部表面２３６６から延在しており、また、図１３Ｃに最良に示されているように、そこから外向きにテーパが付けられており、切頭円錐形状の回転表面を形成している。これらのポスト２３６５は、増幅カートリッジ２０７０の中の対応する切り欠き部２０７２に係合する。上記に議論されているように、増幅カートリッジ２０７０は、窪み部２０７７を形成するそれぞれの切り欠き部２０７２の周りに、傾斜付きのまたは輪郭決めされた表面を含む。動作時に、ポスト２０３６５がそれぞれの切り欠き部２０７２の中へスライドするときに、ポスト２３６５は最終的にこの窪み部２０７７に到達する。それが窪み部２０７７に到達するときに、ポスト２３６５は、図１３Ｄに図示されているように、一致するように窪み部２０７７の中に受け入れられる。窪み部２０７７がポストの回転表面に一致するので、これは、アナライザ２０００の周りで移動させられることとなるカートリッジ２０７０に対して、安定したプラットフォームを提供することを助ける。それに加えて、ポスト２３６５のフレアまたはテーパは、カートリッジ２０７０が落下することを防止することを助ける。

図１３Ｂに示されているように、それぞれのフィンガ２３６３ａ～ｂは、３つの係合特徴部２３６４を含む。しかし、より多くのまたはより少ない係合特徴部２３６４が企図されるが、それぞれのフィンガ２３６３ａ～ｂが単一の第２の係合特徴部２３６４を含むことが好ましい。これは、フィンガ２３６３が増幅カートリッジ２０７０に十分に係合することを可能にし、増幅カートリッジ２０７０は、垂直方向軸線の周りで不注意に回転させられる可能性があり、その側部がフィンガ２３６３ａと平行にはならないようになっている。これは、単一の係合特徴部２３６４よりも多くを備えたフィンガ２３６３ａ～ｂにとってより大幅に困難なタスクである可能性がある。その理由は、増幅カートリッジ２０７０が不注意に回転させられる場合には、特徴部２３６４のうちの少なくともいくつかが、そのようなカートリッジ２０７０の対応する切り欠き部２０７２と適正に整合することができない可能性があるからである。

また、それぞれのフィンガ２３６３ａ～ｂは、可撓性であることが可能であり、水平方向軸線の周りに下向きにまたは上向きに曲がることができるようになっているが、あまりに容易に接触を生み出さない程度に弾性である。そのような可撓性は、第２の係合特徴部２３６４を含むその終端端部の近くの長さに沿ってそれぞれのフィンガ２３６３ａ～ｂに付与され得る。これは、フィンガ２３６３ａ～ｂが増幅カートリッジ２０７０に係合するように自動的に調節することを可能にし、増幅カートリッジ２０７０は、水平方向軸線の周りに傾けられ得、カートリッジ２０７０がフィンガ２３６３ａ～ｂに対して平行にならないようになっている。

液体ハンドリング
図１４Ａおよび図１４Ｂは、本開示の１つの実施形態による液体ハンドリング・ロボット２４００を示している。液体ハンドリング・ロボット２４００は、液体ハンドリング・ロボット・デッキ２０１８において、および、処理デッキ２０１６の上方に懸下されている。液体ハンドリング・ロボット２４００は、トラック部材２４０５を含み、トラック部材２４０５は、アナライザ２０００の一方の側から別の側へ左右方向に延在している。複数のマルチチャネル・ピペッタ２４４０は、キャリッジ２４２０および横断方向のアーム２４３０を介してトラック部材２４０５に接続されている。アーム２４３０は、キャリッジ２４２０に接続されており、キャリッジ２４２０は、トラック部材２４０５にスライド可能に接続されており、アーム２４３０がトラック部材２４０５に対して横断する方向に延在するようになっている。キャリッジ２４２０およびトラック部材２４０５は、リニア・モータを形成しており、リニア・モータは、マルチチャネル・ピペッタ２４４０およびアーム２４３０がトラック部材２４０５に沿って左右方向に駆動されることを可能にする。そのようなリニア・モータの例は、Ｆｅｓｔｏ Ｌｉｎｅａｒ Ｍｏｔｏｒ Ａｃｔｕａｔｏｒ（「ＦＬＭＡ」）（Ｆｅｓｔｏ ＡＧ ＆ Ｃｏ． ＫＧ Ｅｓｓｌｉｎｇｅｎ ａｍ Ｎｅｃｋａｒ、Ｇｅｒｍａｎｙ）である。示されているように、各処理モジュール２２００に対して１つのマルチチャネル・ピペッタ２４４０が存在している。したがって、この特定の実施形態では、３つのピペット・アセンブリ、すなわち、第１のマルチチャネル・ピペッタ２４４０ａ、第２のマルチチャネル・ピペッタ２４４０ｂ、および、第３のマルチチャネル・ピペッタ２４４０ｂが存在している。第１のマルチチャネル・ピペッタ２４４０ａは、第１の処理モジュール２２００ａに対応しており、第２のマルチチャネル・ピペッタ２４４０ｂは、第２の処理モジュール２２００ｂに対応しており、第３のマルチチャネル・ピペッタ２４４０ｃは、第３の処理モジュール２２００ｃに対応している。しかし、より多くのまたはより少ないマルチチャネル・ピペッタ２４４０も可能であり、処理モジュール２２００の数に基づいている。

マルチチャネル・ピペッタ
図１４Ｂは、本開示の実施形態によるマルチチャネル・ピペッタ２４４２を示しており、それは、マルチチャネル・ピペッタ２４４０ａ～ｃの例示的なものである。マルチチャネル・ピペッタ２４４２は、バックプレーン・コネクタ２４５０と、バックプレーン・コネクタ２４５０に接続されている複数の液体ハンドリング・アセンブリ２４４２とを含む。示されている実施形態では、３つの液体ハンドリング・アセンブリ２４４２、すなわち、第１の液体ハンドリング・アセンブリ２４４２ａ、第２の液体ハンドリング・アセンブリ２４４２ｂ、および、第３の液体ハンドリング・アセンブリ２４４２ｃが存在している。しかし、より多くのまたはより少ないものが企図される。それぞれの液体ハンドリング・アセンブリ２４４２は、メイン・ボード・アセンブリ２４６０およびピペット・アセンブリ２４７０を含む。液体ハンドリング・アセンブリ２４４２ａ～ｃは、極めて近接して互いに隣接してバックプレーン・コネクタ２４５０に接続されている。

それぞれのメイン・ボード・アセンブリ２４６０は、データ、パワー、および、プラス／マイナスの空気圧力を、対応するピペット・アセンブリ２４７０に提供することを助ける。示されている実施形態では、３つのピペット・アセンブリ２４６０、すなわち、第１のピペット・アセンブリ２４６０ａ、第２のピペット・アセンブリ２４６０ｂ、および、第３のピペット・アセンブリ２４６０ｃが存在している。これらのアセンブリ２４６０ａ～ｃは、それぞれの液体ハンドリング・アセンブリ２４４２ａ～ｃに対応している。それぞれのメイン・ボード・アセンブリ２４６０は、’３４９出願の図２７Ａおよび図２７Ｂに説明されて示されているメイン・ボード・アセンブリ１４０１と同様である。この点において、それぞれのメイン・ボード・アセンブリ２４６０は、ハウジング２４６２を含み、たとえば、ＰＣＢ、プラスおよびマイナスの圧力入力、弁、ならびに、入力および弁と連通する液体／ガス導管などのような、さまざまなコンポーネントが、その中に配設されている。また、メイン・ボード・アセンブリ２４６０ａ～ｃは、ｚ駆動メカニズムを含み、ｚ駆動メカニズムは、ハウジング２４６２の一方の側に垂直方向のレール２４６４を含み、また、モータ２４６６および駆動シャフト（図示せず）を含む。駆動シャフトは、ハウジング２４６２の中に配設されている。

それぞれのピペット・アセンブリ２４７０は、それぞれのピペット・アセンブリ２４７０が、そのそれぞれのメイン・ボード・アセンブリ２４６０にヒンジ式に接続されておらず、複数のヒンジ位置へと回転しないことを除いて、’３４９出願の図１７Ａ～図１７Ｄのピペット・アセンブリ５０２、ならびに、図２７Ａおよび図２７Ｂのピペット・アセンブリ１４０２と同様である。それぞれのピペット・アセンブリ２４７０は、回転を妨げられており、モータ２４６６を介して、垂直方向のレール２４６４に沿って、垂直方向のｚ方向に移動する。したがって、第１の、第２の、および第３のピペット・アセンブリ２４７０ａ～ｃは、垂直方向にまたはｚ方向に独立して移動することができる。他の点では、ピペット・アセンブリ２４７０は、とりわけ、そのピペット・チャネル・アセンブリ（図示せず）およびピペット・チップ・イジェクター・アセンブリ２４７２に関して、ピペット・アセンブリ５０２および１４０２と同様に構築されている。

バックプレーン・コネクタ２４５０は、バックプレーン・コネクタ２４５０が、図示されている第１の、第２の、および第３のアセンブリ２４４２ａ～ｃなどのような、それに装着されている複数の液体ハンドリング・アセンブリ２４４２を有するように構成されていることを除いて、’２４９出願の図２９Ａおよび図２９Ｂのバックプレーン・コネクタ１６００と同様である。この点において、バックプレーン・コネクタ２４５０は、それぞれの液体ハンドリング・アセンブリ２４４２のメイン・ボード・アセンブリ２４７０ａ～ｃに接続しており、また、いくつかのコネクタ（図示せず）、たとえば、イーサネット（登録商標）、マルチピン、プラスの圧力入力コネクタ、およびマイナスの圧力入力コネクタなどを含み、プラスの圧力入力コネクタおよびマイナスの圧力入力コネクタは、必要なパワー、圧力、およびデータ信号を液体ハンドリング・アセンブリ２４４２ａ～ｃに供給するためのものである。これは、外部ケーブリングを低減または排除することを助け、外部ケーブリングは、引っ掛かる可能性があり、また、そのように極めて近接して接続されている複数の液体ハンドリング・アセンブリ２４４２によって管理することが困難である可能性がある。

自動化
図１５は、アナライザ２０００のコンピューティング・システムの全体的なアーキテクチャを示している。コンピューティング・システム２５１０は、’２４９出願の図２６のシステム１３００の中のサブシステムであることが可能であり、それは、ハイスループット・システム００のコンピューティング・システム・ダイアグラムを示している。この点において、クロス・インスツルメント・バス２５０４およびワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０は、’２４９出願の図２６に示されているバス１３２０およびコンピューティング・デバイス１３３０と同じである。それに加えて、コンピューティング・デバイス２５１０は、コンピューティング・デバイス１３６０と同様であり、アナライザ２０００の中のその入力および出力とともに、より詳細に本明細書で説明されている。

コンピュータ制御デバイス２５１０は、任意の汎用コンピュータであることが可能であり、汎用コンピュータ制御デバイスの中に典型的に存在する、プロセッサ２５１２、メモリ２５１４、および、他のコンポーネントを含むことが可能である。コンピュータ制御デバイス２５１０は、特定のコンピューティング・プロセスを実施するための専用ハードウェア・コンポーネントを含むことが可能であるが、プロセッサ２５１２は、市販のＣＰＵなどのような、任意の従来のプロセッサであることが可能である。代替的に、プロセッサ２５１２は、特定用途向け集積回路（「ＡＳＩＣ」）または他のハードウェア・ベースのプロセッサなどのような、専用のコンポーネントであることが可能である。

メモリ２５１４は、プロセッサ２５１２によって実行され得る命令２５１６を含む、プロセッサ２５１２によってアクセス可能な情報を記憶することが可能である。また、メモリ２５１４は、データ２５１８を含むことが可能であり、データ２５１８は、プロセッサ２５１２によって取得されるか、操作されるか、または記憶され得る。メモリ２５１４は、プロセッサ２５１２によってアクセス可能な情報を記憶することができる任意の非一時的なタイプのものであることが可能であり、それは、たとえば、ハード・ドライブ、メモリ・カード、ＲＯＭ、ＲＡＭ、ＤＶＤ、ＣＤ－ＲＯＭ、書き込みできるメモリ、および読み出し専用メモリなどである。

命令２５１６は、プロセッサ２５１２によって直接的に実行されるか（たとえば、マシン・コードなど）、または、間接的に実行される（たとえば、スクリプトなど）、命令の任意のセットであることが可能である。その点において、「命令」、「アプリケーション」、「ステップ」、「プログラム」という用語は、本明細書では相互交換可能に使用され得る。命令２５１６は、プロセッサ２５１２による直接的な処理のために、オブジェクト・コード・フォーマットで記憶され得、または、任意の他のコンピューティング・デバイス言語で記憶され得、それは、オンデマンドで解釈されるかまたは事前にコンパイルされる、独立したソース・コード・モジュールのスクリプトまたはコレクションを含む。

アナライザ２０００の１つの実施形態では、コンピューティング・システム２５１０は、命令のいくつかのセットを含むことが可能である。たとえば、実施されることとなるそれぞれのアッセイは、それに関連付けられる命令のいくつかのセットを有することが可能であり、それは、在庫チェックを実施するように、ならびに、そのアッセイに関して適当な試薬および他の消耗品を回収するように、在庫ロボット２３００を動作させる命令を含むことが可能である。別の例では、命令のセットは、特定のマルチチャネル・ピペッタ２４４０によって実施される動作のシーケンスを決定し、分析のためにサンプルを処理することを支援することが可能である。

データ２５１８は、グラフィカル・ユーザ・インターフェース（「ＧＵＩ」）を通して入力およびビューされ得、グラフィカル・ユーザ・インターフェースは、具体的にはアナライザ２０００に関連付けられているディスプレイ・インターフェース２５００の上に表示され得るか、または、ハイスループット・システム００全体と関連付けられている、’３４９出願の図１および図２６のディスプレイ・インターフェース１３３２の上に表示され得る。また、データ２５１８は、たとえば、在庫ロボット２３００のエンド・エフェクタ２３６０の上のスキャナ２３６６、または、事前分析システム１０の中のスキャナなどの、スキャナから入力され得る。また、データは、光学センサおよび温度センサなどのような、センサによって取得され得、たとえば、特定の消耗品の場所および空気品質などのような、アナライザの中で起こっている特定の条件および活動に関する情報を取得する。

このデータ２５１８は、実装されているフィールドまたは関連のデータベースの中の特定の識別コード（たとえば、バーコード・シリアル番号）にデジタルでタグ付けされ得、それは、また、メモリ２５１４の中に記憶され得る。これは、アナライザ２０００がアナライザ３０００の中のさまざまな消耗品を追跡することを助け、また、ユーザ入力の必要性なしに、プロセッサ・命令２５１６の実行の間に特定の情報をプロセッサ２５１２に提供することを助ける。たとえば、液体試薬プレート２０６０は、識別コードを有することが可能であり、識別コードは、その外側表面の上に位置するバーコードと関連付けられ得、それは、たとえば、その中に記憶されている試薬のタイプ、および、どの試薬がすでに利用されたかなど、特定の記憶されたデータとともにデータベースの中にタグ付けされ得る。これは、アナライザがその在庫をチェックすることを可能にし、いつ試薬および他の消耗品がなくなりそうか、または、追加的なアッセイを実施するのに不十分になるかを決定する。別の例では、シャトル２０３０は、識別コードを有することが可能であり、識別コードは、特定の記憶されたデータとともにデータベースの中にタグ付けされ得、それは、たとえば、シャトル２０３０によって運搬されるサンプル・コンテナ０３のそれぞれに関するデータなど、たとえば、患者名、実施されることとなるアッセイ、および処理パラメーターなどである。さらなる例では、分析が完了したときに、アッセイの結果は、データベースの中の特定のサンプルに関連付けられ得、ユーザが、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０へのアクセスを介して、結果を容易に回収することができるようになっている。その理由は、そのような結果が、デバイス２５１０によって、それに通信され得るからである。

図２０は、コンピュータ制御デバイス２５１０のプロセッサ２５１２、メモリ２５１４、および他のエレメントを、同じブロックの中にあるものとして機能的に図示しているが、コンピュータ制御デバイス２５１０、プロセッサ２５１２、および／またはメモリ２５１４は、それぞれ、複数のプロセッサ、コンピュータ制御デバイス、およびメモリから構成され得、それは、同じ物理的なハウジングの中に記憶されていてもよく、または、記憶されていなくてもよい。たとえば、メモリ２５１４は、コンピュータ制御デバイス２５１０のものとは異なる、ハウジングの中に位置するハード・ドライブまたは他のストレージ媒体であることが可能である。したがって、プロセッサ２５１２、コンピュータ制御デバイス２５１０、およびメモリ２５１４への言及は、並列に動作してもしなくてもよい、プロセッサ、コンピュータ制御デバイス、およびメモリのコレクションへの言及を含むことが理解されるべきである。

ディスプレイ・インターフェース
ディスプレイ・インターフェース２５２０は、具体的には、アナライザ２０００と関連付けられ得、アナライザ２０００に関する情報だけを表示することが可能であり、また、アナライザ２０００の構造体の中へ一体化され得る。しかし、ディスプレイ・インターフェース２５２０は、随意的なものであり（図１５の中の点線によって示されている）、図１に示されている実施形態では、含まれていない。その理由は、全体的なシステム・ディスプレイ・インターフェース１３３２がその代わりに利用されるからである。しかし、ディスプレイ・インターフェース２５２０が含まれている場合には、インターフェース２５２０は、モニターまたはＬＣＤパネルなどであることが可能であり、それは、ハウジング２０１０のフロント・パネルに連結されており、または、アナライザ２０００から遠隔に位置する。ディスプレイ・インターフェースは、ＧＵＩ、ユーザ・プロンプト、ユーザ・命令、および、ユーザに関連し得る他の情報を表示することが可能である。

入力インターフェース
ユーザ制御／入力インターフェース２５３０は、ユーザがＧＵＩをナビゲートすることを可能にし、また、繰り返しになるが、図１のディスプレイ・インターフェース１３３２によって提供される全体的なシステム入力インターフェースから分離されたコンポーネントとして随意的に提供され得る。しかし、ユーザ制御／入力インターフェース２５３０が提供される場合には、そのようなインターフェースは、たとえば、タッチ・パネル、キーボード、またはマウスであることが可能である。それに加えて、入力インターフェース２５３０は、ディスプレイ・インターフェース２５２０の中へ一体化され得、プロンプトなどを表示する同じデバイスが、ユーザが前記プロンプトに応答することを可能にする同じデバイスであるようになっている。

図１５に示されているように、コンピュータ制御デバイス２５１０は、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０に接続され得、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０は、第２のアナライザ４０００および事前分析システム１０などのような、ハイスループット・システム００のコンポーネントのすべてを一体化させるために利用され、また、とりわけ、研究室の研究室情報システム（「ＬＩＳ」）と一体化するために利用される。したがって、事前分析システム１０の中に生じるアナライザ２０００に関連する情報は、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０を介してアナライザ２０００に通信され得る。同様に、アナライザ２０００から生じる事前分析システム１０に関連する情報は、コンピュータ制御デバイス２５００を介してワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０に通信され得、それは、その情報を事前分析システム１０に通信する。また、そのような情報は、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０によってＬＩＳから取得された情報、たとえば、患者情報などによって、補完され得る。

また、コンピュータ制御デバイスは、アナライザ３０００の中の複数のコンポーネントに接続されており、命令およびデータなどのような情報を、行ったり来たり共有する。内部バスを介してコンピュータ制御デバイスに接続されているコンポーネントのうちのいくつかは、処理モジュール２２００ａ～ｃ、在庫ロボット２３００、検出器２２７０ａ～ｃ、および液体ハンドリング・ロボット２４００のそれぞれを含む。コンピュータ制御デバイス２５１０とのそのような接続は、コンピュータ制御デバイス２５１０がそのようなコンポーネントに命令を提供すること、および、そこから情報を受け取ることを可能にする。たとえば、在庫ロボット２３００は、コンピュータ制御デバイス２５１０から命令を受け取り、特定の消耗品を回収し、特定の場所にそれらを設置することが可能であり、また、在庫情報をコンピュータ制御デバイス２５１０に通信することが可能である。したがって、アナライザ２０００は完全に自動化されているので、アナライザ２０００の内部コンポーネントによって実施される動作は、一般的に、プロセッサ２５１２によって提供される命令の結果としてのものである。

方法
ステップ１： 注文を受け取る
アナライザ２０００の動作の方法（図１６）において、アッセイに関する注文が、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０からアナライザ２０００によって受け取られ得る２６０２。サンプルのバッチがそれによって事前処理され、分析される準備ができているときに、そのような注文は、最初に、事前分析システム１０からワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０へ通信され得る。この点において、事前分析システム１０は、完全なバッチによってシャトル２０３０をロードすることが可能であり、それは、この実施形態では、１つのシャトル２０３０当たり１２個のサンプル・コンテナ０３の２つのシャトル２０３０を含む。そのようなシャトル２０３０は、’３４９出願の図１２Ａのドッキング・ステーション２６０に置いておかれる。

ステップ２： 在庫を調べる
注文がアナライザ２０００によって受け取られると、在庫ロボット２３００は、消耗品の在庫を調べ２６０４、注文されたアッセイを実施するために十分な量の消耗品が存在しているかどうかを決定する。そのような在庫調査は、在庫ロボット２３００によって実施され得る。この点において、注文が受け取られるときに、在庫ロボット２３００は、処理デッキ２０１６の下で在庫デッキ２０１４に向けてエンド・エフェクタ２３６０を移動させる。エンド・エフェクタ２３６０は、約１８０度回転させられ、識別子リーダ２３６６が在庫デッキ２０１４の方を向くようになっている。次いで、在庫ロボット２３００は、その中に位置する消耗品をスキャンするように進行し、どの消耗品がアナライザ２０００の中にロードされているかを決定する。次いで、アナライザ２０００は、注文されたアッセイを実施するのに十分な消耗品が存在しているかどうかを決定する。消耗品在庫をモニタリングするための他の自動化された装置が企図される。消耗品在庫を追跡するためのそのような他の自動化された方法は、当業者に良く知られており、本明細書では詳細に議論されていない。

在庫ロボット２３００は、注文が受け取られるたびに消耗品をスキャンする必要がない可能性がある。その代わりに、アナライザ２０００は、ユーザを介してアナライザ２０００の中へ入力された消耗品を追跡する。たとえば、ユーザが消耗品をロードするときに、在庫ロボット２３００は、消耗品をスキャンし、メモリ２５１４の中のデータベースの中へそれらのログを取る。アナライザ２０００は、消耗品が使用されるときを追跡する。したがって、アナライザ２０００は、スキャニング、プロセッサ２５１２を介してそのメモリ２５１４の中のデータベースをスキャンすることによって、注文に応答して消耗品の在庫を調べることが可能であり、どの消耗品が使用され、また、どの消耗品が使用されていないかを決定し、完全な集計を取得することが可能である。

１つの例では、たとえば、クラミジアなどのような、特定のアッセイ・ターゲットの存在を識別するというアッセイ注文が、アナライザ２０００によって受け取られる。アナライザ２０００は、アッセイを実施するために、どの試薬がアナライザ２０００の中に存在していなければならないかを知っている。それに加えて、アナライザ２０００は、ピペット・チップ２０２０、処理プレート２０４０、および増幅カートリッジ２０７０などのような、どのような他の消耗品が使用されなければならないかを知っている。そのような情報は、そのメモリ２５１４の中に事前プログラムされ得る。アナライザ２０００は、そのメモリ２５１４の中のデータベースをスキャンするか、または、在庫ロボット２３００を利用し、必要な消耗品が使用のために利用可能であることを確認する。

利用可能な消耗品が、注文されたアッセイを実施するのに不十分である場合には、ユーザは通知され２６２０、それは、ディスプレイ１３３２もしくは２５２０の上に表示される警告、モバイル・デバイスへのプッシュ通知、または電子メールの形態であることが可能である。異なるアッセイを必要とする他のサンプルが、アナライザ２０００による処理のための準備ができており、アッセイを実施するのに十分な消耗品が存在している場合には、アナライザ２０００は、その代わりにそれらのコンテナ０３を受け入れることが可能であり、ユーザが必要な消耗品によってアナライザ２０００をロードするまで、休止時間を回避するようになっている。

たとえば、ワーク・シフトの始まりにおいて、または、消耗品が不十分であるという警告に応答して、ユーザが消耗品をロードし、そのような消耗品がアナライザ２０００によって受け取られる２６２２ときに、ユーザは、アナライザ２０００の正面を通して消耗品をロードする。したがって、ユーザは、ピペット・チップ２０２０をピペット引き出し２１４２の中へロードし、試薬プレート２０５０および２０６０、増幅カートリッジ２０７０ならびに／または処理プレート２０４０を、消耗品リポジトリ２１１０の中へロードすることが可能である。十分な消耗品がロードされ得、アナライザ２０００が２４時間連続で連続的に走ることを可能にする。

そのような消耗品がユーザによってロードされるときに、アナライザ２０００は、たとえば、ドア・センサなどを介して、在庫デッキ２０１４がアクセスされたことを認識する。次いで、在庫ロボット２３００は、在庫スキャンを自動的に実施し、アナライザ２０００の中へロードされた任意の新しい消耗品を識別することが可能である。たとえば、試薬プレート２０５０、２０６０、処理プレート２０４０、チップ・ラック２０２２、および増幅カートリッジ２０７０などのような、消耗品の上に位置する識別子は、たとえば、試薬プレート２０５０および２０６０のケースでは試薬など、何の消耗品があるか、および、それらが何を含むかを決定するために使用される。

ステップ３： サンプル・コンテナを回収する
アッセイを実施するのに十分な消耗品が存在していること、および、処理モジュール２２００のうちの１つが使用のために利用可能であることを、アナライザ２０００が決定すると、アナライザ２０００は、その準備状態をワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０に通信する。次いで、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０は、事前分析システム１０に通知し、事前分析システム１０は、応答して、サンプル・コンテナ０３を含むシャトル２０３０をシャトル輸送アセンブリ３００の上にロードし、アナライザ２０００に向けてそれを送る。シャトル２０３０は、アナライザ２０００の閾値に到達する直前に停止することが可能である。しかし、いくつかの実施形態では、シャトル２０３０は、アナライザ２０００の中へ直接的に搬送され得る。

次いで、在庫ロボット２３００は、事前分析システム１０に向けて移動し、事前分析システム１０の中へ到達する２６０６。エンド・エフェクタ２３６０は、シャトル２０３０を把持し、第１の係合特徴部２３６１が第２の横断方向の開口部２０３６の中に受け入れられるようになっている。次いで、シャトル２０３０は、アナライザ２０００の中へ輸送され、また、指定された処理モジュール２２００に隣接するシャトル保持アセンブリ２２１０へ輸送され、静止したプラットフォーム２２１６の上へシャトル２０３０を設置する。次いで、クランピング・アセンブリ２２１２が閉じ、係合部材２２１４が第２の横断方向の開口部２０３４を通って延在し、それぞれのコンテナ０３のスカート０７の中へ貫通するようになっており、それによって、マルチチャネル・ピペッタ２４４０による吸引のために、適切な位置にコンテナ０３を保つ。

ステップ４： 消耗品およびアリコートをステージングする
サンプル・コンテナ０３が十分に保たれた状態で、処理モジュール２２００は、適当な消耗品によってステージングされる。この点において、在庫ロボット２３００は、２つの処理プレート２０４０を回収し、１つのプレートをそれぞれのエクストラクタ２２４０ａ～ｂの上に設置し、それぞれのプレート２０４０の抽出チューブ２０４４がそれぞれのエクストラクタ２２４０ａ～ｂのヒーター・エレメント２２４８によって受け入れられるようになっている。また、在庫ロボット２３００は、第１の乾燥試薬プレート２０５０ａおよび液体試薬プレート２０６０を回収し、それぞれ、乾燥試薬ステーション２２２０および液体試薬ステーション２２３０にそれらを設置する。典型的に、液体および乾燥試薬プレート２０５０、２０６０は、シャトル２０３０によって運搬されるサンプルの数よりも多くのもののために試薬を提供する。したがって、アナライザ２０００は、シャトル２０３０がアナライザの中へ設置されるたびに、試薬プレートをステージングしなくてもよい。追加的に、在庫ロボット２３００は、第２の係合特徴部２３６４を介して切り欠き部２０７２に係合することによって、在庫デッキ２０１４から増幅カートリッジ２０７０を回収する。増幅カートリッジ２０７０は、増幅カートリッジ・ステーション２２５０に設置され、入口開口部２０７３がエクストラクタ２２４０ａに隣接して位置決めされるようになっている。

その後に、マルチチャネル・ピペッタ２４４０は、第１のピペット・チップ２０２０ａを回収し、３つのピペット・アセンブリ２４７０ａ～ｃのそれぞれに関して１つのチップを回収する。サンプル・コンテナの貫通可能なシール０９をピペット・チップ２０２０によって穿孔することによって、および、その中のサンプルを吸引することによって、アリコートがサンプル・コンテナ０３のそれぞれから回収される２６０７。アリコートは、処理プレート２０４０のそれぞれの抽出チューブ２０４４の中へ吸引される。それぞれの混合チューブ２０４４がアリコートによって植え付けられた後に、マルチチャネル・ピペッタ２４４０は、後の使用のために、隣接するチップ保持ステーション２０４７の中へピペット・チップ２０２０ａを挿入する。これは、アリコートがそれぞれのコンテナ０３から抽出されるまで実施される。たとえば、シールが穿孔しないことなどに起因して、アリコートが回収されることができないなどの故障が存在する場合には、アナライザ２０００は、そのメモリ２５１４の中にその情報を保ち、したがって、それは、事前分析システム１０に通信され得、事前分析システム１０は、’３４９出願に議論されているように、欠陥のあるサンプルを適当に組織することとなる。

ステップ５： サンプル・コンテナ・シャトルを戻し、別のものを回収する
アリコートがシャトル２０３０の中のそれぞれのサンプル・コンテナ０３から回収されると、アナライザ２０００は、それがシャトル２０３０を事前分析システム１０に戻そうとしている２６０８ことを、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０に通信する。ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０は、この通信を事前分析システム１０へリレーし、事前分析システム１０は、バッチの他方の半分を含む別のシャトル２０３０をシャトル輸送アセンブリ３００へ移動させる。アナライザ２０００の中で、クランピング・アセンブリ２２１２は、シャトル２０３０を解放し、在庫ロボット２３００は、シャトル輸送アセンブリ３００の戻りレーンの中へシャトル２０３０を設置することによって、使用済みのコンテナ０３を含むシャトル２０３０を事前分析システム１０へ戻す。次いで、在庫ロボット２３００は、バッチの第２のシャトル２０３０に係合し、それを移動させ２６１０、それをシャトル保持アセンブリ２２１０へ輸送し、シャトル保持アセンブリ２２１０において、それは保たれ、バッチの残りのアリコートが吸引される。アリコートが処理プレート２０４０の残りの抽出チューブ２０４４へ移送されると、シャトル２０３０は、再度在庫ロボット２３００を介して事前分析システム１０へ戻される。

いくつかの実施形態では、デュアル・レーン・アッセイは、アナライザ２０００によって実施され得、それぞれのサンプル・コンテナ０３からのアリコートは、１つではなく２つの抽出チューブ２０４４の中へ吸引される。そのような実施形態では、１２個のサンプル・コンテナ０３の単一のシャトル２０３０が、１２個の抽出チューブ２０４４をそれぞれ有する２つの処理プレート２０４０を充填することとなる。したがって、この実施形態では、在庫ロボット２３００は、１つのアッセイに関して１つのシャトル２０３０だけを回収し、任意のさらなるシャトル２０３０を回収しない。

ステップ６： サンプルを処理する
処理プレート２０４０がサンプルのアリコートによって植え付けられた状態で、アナライザ２０００は、サンプルを処理する２６１２。手順は、アッセイにかかわらず、一般的に同じである。相違は、方法においてそれほど大きくはないが、利用される試薬において大きい。したがって、処理モジュール２２００は、幅広いアッセイのアレイを実施することができる。処理することは、一般的に、ＤＮＡターゲットなどのような検体の抽出、隔離、および増幅を含む。

抽出は、ＤＮＡに結合するように構成された磁気ビーズを含み得る、乾燥された溶解剤を再構成することを必要とする。この点において、マルチチャネル・ピペッタ２４４０は、以前に使用されたピペット・チップ２０２０ａを処理プレート２０４０の中のピペット・チップ保持ステーション２０４７からピックアップする。マルチチャネル・ピペッタ２４４０は、一般的に、複数のピペット・アセンブリ２４７０ａ～ｃを含むが、単一のピペット・アセンブリ２４７０は、以前に使用されたピペット・チップ２０２０ａを処理プレート２０４０から回収するために、他のピペット・アセンブリ２４７０から独立して、対応するｚ－レール２４６４に沿って駆動され得る。チップ２０２０ａが回収されると、ピペット・アセンブリ２４７０は、液体試薬プレート２０６０の中の再構成緩衝液のシールを穿孔し、緩衝液のアリコートを回収し、それを乾燥試薬プレート２０５０ａへ移送し、ここで、それは、コンパートメント２０４４のうちの１つの上方のシールを穿孔し、緩衝液によってコンパートメント２０５４を植え付け、溶解剤を再水和する。次いで、再構成された溶解剤は吸引され、抽出チューブ２０４４へ移送される。これは、すべての抽出チューブ２０４４が溶解剤および磁気ビーズによって植え付けられるまで繰り返される。

次いで、エクストラクタ２２４０ａ～ｃは、抽出チューブ２０４４と接触している加熱エレメント２２４８を介して、抽出チューブ２０４４およびその中の内容物を加熱する。混合物が培養されている間に、在庫ロボット２３００は、第１の乾燥試薬プレート２０５０を処理モジュール２２００から除去し、第２の乾燥試薬プレート２０５０ｂを在庫デッキ２０１４から回収し、乾燥試薬プレート・ステーション２２２０にそれを設置する。

培養が完了するとき、エクストラクタ２２４０ａ～ｂのモータ２２４４が、それらのそれぞれのハウジング２２４２から外へ永久磁石２２４１を移動させ、抽出チューブ２０４４に隣接してそれを設置し、磁気ビーズが、抽出されたＤＮＡがそれに取り付けられた状態で、チューブ２０４４の側部へ引き出される。次いで、マルチチャネル・ピペッタ２４４０は、洗浄緩衝液のアリコートを試薬プレート２０６０から回収し、チューブ混合物をすすぐ。磁石２２４１が、それらのハウジング２２４２の中へ移動して戻され、上澄みが、混合チューブから除去され、液体廃棄物入口部を介して廃棄され、液体廃棄物入口部は、在庫デッキ２０１４の中の液体廃棄物ボトルと連通している。中和緩衝液が、液体試薬プレート２０６０から、抽出チューブ２０４４に隣接した処理プレート２０４０の中の混合ウェル２０４６へ移送される。次いで、ピペッタ２４４０は、溶出緩衝液を液体試薬プレート２０４０から回収し、溶出緩衝液を抽出チューブ２０４４の中へディスペンスし、隔離されたＤＮＡから磁気ビーズを分離する。磁石２２４１は、適切な場所へ移動して戻され、溶出液が吸引され、混合ウェル２０４６へ移送され、混合ウェル２０４６において、それは、中和緩衝液と混合される。次いで、中和されたサンプルは、第２の乾燥試薬プレート２０５０ｂの中のマスター混合を再構成するために使用される。次いで、混合物は、マルチチャネル・ピペッタ２４４０および第２のピペット・チップ２０２０ｂを介して、増幅カートリッジ２０７０の中へロードされ、第２のピペット・チップ２０２０ｂは、カートリッジ２０７０の入口開口部２０７３の中へ混合物を吸引することによって、カートリッジ２０７０を植え付ける。増幅カートリッジ２０７０は、バッチ全体を受け取ることが可能である。

ステップ７： 増幅させる／分析する／検出する
その後に、在庫ロボット２３００のエンド・エフェクタ２３６０は、カートリッジ２０７０に係合し、処理モジュール２２００に関連付けられた検出器２２７０へそれを運搬する。在庫ロボット２３００は、カートリッジ２０７０をそれほど倒すことなく、サーモサイクラ２２７５のプラットフォーム２２７６の上にカートリッジ２０７０を設置する。カートリッジ２０７０がエンド・エフェクタ２３６０のフィンガ２３６３ａ～ｂから吊り下がっていること、または、カートリッジ２０７０がエンド・エフェクタ２３６０のフィンガ２３６３ａ～ｂよりも低く位置決めされるように運搬されることに少なくとも起因して、これは可能となる。フィンガ２３６３ａ～ｂがカートリッジ２０７０よりも低く位置決めされた場合には、カートリッジ２０７０は、エンド・エフェクタ２３６０から落とされなければならない可能性がある。次いで、モータ２２７８は、サーモサイクラ２２７５を上昇させ、カートリッジ２０７０をリーダ２２７１に押し付ける。次いで、カートリッジ２０７０は、サーモサイクリングにさらされ、アッセイ・ターゲットを増幅させるようになっている。リーダ２２７１は、カートリッジ２０７０のチャンバー２０７５の中のアッセイ・ターゲットの存在に関して検出する２６１４。

ステップ８： 廃棄および繰り返す
検出が完了すると、結果は、ワークフロー・コンピューティング・デバイス２５４０へ通信される。使用済みの増幅カートリッジ２０７０は、在庫ロボット２３００を介して増幅カートリッジ廃棄物へ移動させられ２６１６、増幅カートリッジ廃棄物は、廃棄物リポジトリ２１３０の中に、または、アナライザ２０００の中の他の場所にあることが可能である。また、在庫ロボット２３００は、廃棄物リポジトリ２１３０の棚部２１３８の上にプレート２０４０をスタックすることによって、使用済みの処理プレート２０４０を廃棄する。乾燥および液体試薬プレート２０５０、２０６０は、別のアッセイの中での使用のために、消耗品リポジトリ２１１０の中のそれらのそれぞれのコンパートメントの中へ戻して設置される。乾燥および液体試薬プレート２０５０、２０６０は、一般的に、４つのアッセイ・ランにおいて使用され得る。コンピューティング・デバイス２５１０は、プレート２０５０または２０６０が何回使用されたかを追跡し、また、アナライザ２０００は、廃棄物リポジトリ２１３０の中にプレート２０５０、２０６０を設置することによって、それらの最終ランの後にこれらのプレートを自動的に廃棄する。消耗品が廃棄されると、処理モジュール２２００は、別のアッセイを実施する２６１８ことが可能である。

一度に複数のアッセイ
適当な消耗品がそのハウジング２０１０の中で在庫を調べられるという条件で、処理モジュール２２００のそれぞれは、任意の所与の時間において、アッセイ・メニューの上の任意のアッセイを実施することが可能である。これは、アナライザ２０００がフレキシビリティを持ってスループットを最適化するように応答することを可能にする。たとえば、第１の処理モジュール２２００ａは、いくつかのランに関して第１のアッセイを実施してきた可能性がある。しかし、第１のアッセイとは異なる第２のアッセイを必要とする、事前分析システム１０の中のサンプルのバックログが存在している場合には、第１の処理モジュール２２００ａは、第２のアッセイを実施することによって、そのようなサンプルを処理および分析することを支援するために使用され得る。これは、アナライザ２０００が事前分析システム１０と一定の通信状態にあるので、ユーザからの支援なしに、アナライザ２０００によって自動的に行われ得る。

上記に議論されている特徴の多数の変形、追加、および組み合わせが、本発明から逸脱することなく利用され得る。たとえば、図１７Ａ～図１７Ｃは、本開示の別の実施形態によるアナライザ３０００を示している。アナライザ３０００が、複数の処理モジュール３２００ａ～ｃを有する処理デッキ３０１６、把持エンド・エフェクタ３３６０を備えた在庫ロボット３３００、複数のマルチチャネル・ピペッタ３４４０ａ～ｃを含む液体ハンドリング・ロボット、消耗品貯蔵エリア３０１４、および、検体を検出するための検出器３２７０ａ～ｃを含むという点において、アナライザ３０００は、アナライザ２０００と同様である。それに加えて、アナライザ３０００は、たとえば、以前に説明されたピペット・チップ２０２０、シャトル２０３０、処理プレート２０４０、液体試薬プレート２０６０、乾燥試薬プレート２０５０、および増幅カートリッジ２０７０などのような、アナライザ２０００と同じ消耗品を利用する。しかし、アナライザ３０００は、消耗品ストレージ３０１４および検出器３２７０ａ～ｃの配置に関して、ならびに、特定の消耗品リポジトリに関して異なっている。

とりわけ、アナライザ２０００は、在庫デッキ２０１４の下に位置する検出／分析デッキ２０１２を含む。しかし、アナライザ３０００は、垂直方向にではなく水平方向に、これらのデッキを分離している。したがって、アナライザ３０００は、在庫セクション３０１４および検出／分析セクション３０１２を含む。示されている特定の実施形態では、在庫セクション３０１４は、アナライザ３００の左側に位置し、検出／分析セクションは、アナライザ３０００の右側に位置する。

在庫セクション３０１４は、第１の消耗品リポジトリ３１１０、第２の消耗品リポジトリ３１２０、および廃棄物リポジトリ３１３０を含む。第１のリポジトリ３１１０は、それらが両方とも、たとえば、試薬プレート２０５０および２０６０ならびにカートリッジ２０７０などのような、消耗品アイテムを受け取って貯蔵するという点において、リポジトリ２１１０と同様である。第２のリポジトリ３１１０は、第１のリポジトリ３１１０と廃棄物リポジトリ３１３０との間に位置する。

第２のリポジトリ３１２０（それは、図１８Ｃに最良に示されている）は、垂直方向のコンパートメントを有しており、垂直方向のコンパートメントは、壁部３１２２と、壁部３１２２の反対側に配設されている垂直方向のロッド／カラムとによって画定されている。これらのコンパートメントは、処理プレート２０４０のスタックを受け入れるようにサイズ決めされている。ロッド３１２４は、処理プレート２０４０のスタックが倒れることを防止することを助け、一方では、処理プレート２０４０が十分に露出されることも可能にし、ロボット２３００がそれぞれのスタックからプレート２０４０を回収することができるようになっている。

廃棄物リポジトリ３１３０は、一般的に、廃棄物リポジトリ２１３０と同じである。廃棄物リポジトリ３１３０は、アナライザ３００の在庫セクション３１４０の水平方向の境界線を定めており、未使用の消耗品および検出／分析セクション３０１２を分離することを助け、それは、いずれかのエリアから生じる任意の可能性のある汚染を隔離することを助けることが可能である。

検出／分析セクション３０１２は、廃棄物リポジトリ３１３０（１つの実施形態では、廃棄物は、増幅カートリッジである）、液体廃棄物リポジトリ３１７０、および複数の検出器３２７０を含む。廃棄物リポジトリ３１６０は、ユーザがリポジトリ３１６０を空にするまで、たとえば、使用済みの増幅カートリッジ２０７０などの廃棄物を受け入れて収容するために開口部を有している。増幅された廃棄物リポジトリ３１６０は、アナライザ３０００の中へのおよびアナライザ３０００から外への制御された移動のために、１つまたは複数のレールにスライド可能に取り付けられ得る。液体廃棄物リポジトリ３１７０は、ホースまたは何らかの他のチャネリング・デバイス（図示せず）を介して、処理デッキ３０１６に接続されており、液体廃棄物が処理デッキ３０１６から配設され得るようになっている。検出器３２７０ａ～ｃは、検出器２２７０ａ～ｃと同じであり、サーモサイクラ３２７５およびリーダ・ヘッド３２７１をそれぞれ含む。検出器３２７０ａ～ｃは、垂直方向の配置で位置し、第２の検出器３２７０ｂが第３の検出器３２７０ｃの直ぐ上方に位置するようになっており、また、第１の検出器が第２の検出器３２７０ｂの直ぐ上方に位置するようになっている。検出器３２７０ａ～ｃは、在庫ロボット３３００のグリッパ３３６０によるアクセスのために、同じ方向に開いている。いくつかの実施形態では、少なくとも１つの検出器３２７０は、別の検出器と同じ水平方向の平面の上に位置し得、また、それに対して直交して配置され得る。

図１８Ａ～図１８Ｃは、本開示の別の実施形態によるアナライザ３０００’を示している。アナライザ３０００’は、アナライザ３０００と同様であり、相違は、１つまたは複数の消耗品リポジトリがアクセスしやすいように可動であることである。たとえば、図１８Ｂに示されているように、第２の消耗品リポジトリ３１２０は、引き出しのように可動であり得、処理プレート２０４０の補充のために、ユーザが垂直方向のコンパートメントのそれぞれへのアクセスを有するようになっている。図１８Ｃに示されている別の例では、第１および第２の廃棄物リポジトリ３１１０、３１２０は、可動ベース３１４４の上に位置決めされ得、可動の消耗品在庫３１４２を形成するようになっている。この点において、ベース３１４４は、レール（図示せず）の上をスライド可能であり得、第１および第２の消耗品リポジトリ３１１０、３１２０の両方が、消耗品の補充のために、システム３０００’の外側の位置へ移動させられ得るようになっている。さらなる例では、カルーセル式の消耗品在庫（図示せず）は、垂直方向軸線の周りで回転可能な複数のコンパートメントを含むことが可能である。そのようなカルーセル式の在庫は、補充のためにそのコンパートメントをユーザに露出するように回転させられ得、一方、ロボット３３００によるアクセスのために、その中に貯蔵されている消耗品が位置決めされることも可能にする。

また、アナライザ３０００’は、ハウジング３０１０を含み、ハウジング３０１０は、その正面の中にアパーチャー３０１２を含み、図１８Ａに示されているように、第１および第２のリポジトリ３１１０、３１２０、固体廃棄物リポジトリ３１３０、液体廃棄物リポジトリ３１７０、ならびに、増幅された廃棄物リポジトリ３１６０などのような、さまざまなリポジトリが移動または除去され得るようになっている。ドア３０１４は、ハウジング３０１０にヒンジ式に接続され得、ドア３０１４は、そのようなリポジトリへのユーザ・アクセスを可能にするように開く。

本明細書で説明されているアナライザの１つの例は、ｉ）ハウジングと、ｉｉ）エンド・エフェクタを含むロボット・アームとを含み、エンド・エフェクタは、ａ）関節式アームに回転可能に接続されている本体部と、ｂ）本体部に連結され、第１の方向に互いに対して可動である第１および第２のフィンガであって、フィンガのそれぞれは、係合特徴部を有しており、係合特徴部は、第１および第２のフィンガのそれぞれから内向きに、ならびに、第１および第２のフィンガの他方に向けて突出しており、係合特徴部は、物品の凹部に係合するように構成されており、凹部は、係合特徴部を受け入れるように構成されており、ロボット・アームが物品を運搬することができるようになっており、物品は、係合特徴部が物品とそのように係合されているときに、第１および第２のフィンガから懸下されている、第１および第２のフィンガとを有している。また、アナライザは、ｉｉｉ）サンプル・コンテナを運搬するシャトルを受け入れるための少なくとも１つのシャトル・プラットフォームであって、コンテナは、アナライザによって評価されることとなるサンプルを運搬する、少なくとも１つのシャトル・プラットフォームを有しており、シャトル・プラットフォームは、ジョー・アセンブリを有しており、ジョー・アセンブリは、開位置から閉位置へ自動的に移動し、ジョー・アセンブリは、係合部材を含み、係合部材は、ジョー・アセンブリが開位置にあるときに、シャトルによって運搬されているサンプル・コンテナの底部部分に接触しておらず、ジョー・アセンブリが閉位置にあるときに、サンプル・コンテナの底部部分に係合する。また、アナライザは、サンプル・コンテナからサンプルを吸引する自動ピペッタをさらに有することが可能であり、自動ピペッタがサンプル・コンテナからサンプルを吸引するときに、シャトル・プラットフォームのジョー・アセンブリが閉じられる。ロボット・アームは、シャトル・プラットフォームのジョー・アセンブリが開位置にあるときに、シャトル・プラットフォームの上にシャトルを設置する。また、自動化されたアナライザは、磁気エクストラクタを有することが可能である。磁気エクストラクタは、ｉ）キャビティを画定するハウジングと、ｉｉ）ハウジングのキャビティの中に移動可能に配設されている隣接する永久磁石の列と、ｉｉｉ）永久磁石の列に接続されている駆動メカニズムであって、キャビティの中へおよびキャビティから、永久磁石の列を移動させるように構成されている、駆動メカニズムと、ｉｖ）キャビティの両側に配設されている列でハウジングから延在する複数の加熱エレメントとを含むことが可能である。第１の位置から第２の位置へ磁石を移動させることは、磁石の列を加熱エレメントの列と列の間に直接的に配設し、それぞれの永久磁石がそれぞれの加熱エレメントと整合するようになっている。また、磁気エクストラクタは、加熱エレメントのそれぞれの列に隣接してそれぞれ配設されているトラフを画定するドリップ・プレートを有することが可能である。

磁気エクストラクタは、処理プレートをその上に受け入れるように適合され得、加熱エレメントは、凹部をそれぞれ画定しており、凹部は、磁気エクストラクタの上方に配設されている処理プレートの抽出チューブを受け入れて保持するように構成されており、加熱エレメントは、電源に接続されており、電源は、加熱エレメントを加熱し、処理プレートが加熱エレメントの上方に設置されているときに、処理プレートによって保持されたピペット・チップがドリップ・プレートのトラフの中へ延在するようになっている。アナライザの動作時に、処理プレートは、ロボット・アームによって磁気エクストラクタの上に設置されている。いくつかの例では、ロボット・アームは、ロボット・フィンガの係合特徴部を処理プレートから上向きに延在する係合部材と係合させることによって、磁気エクストラクタの上に処理プレートを輸送し、上向きに延在する係合部材は、開口部を有しており、開口部は、ロボット・フィンガが第１の係合位置にあるときに、係合特徴部を受け入れ、ロボット・フィンガは、第２の位置よりも第１の係合位置において、より近くに一緒になっており、第２の位置では、ロボット・フィンガ同士の間の距離は、係合特徴部が係合部材に係合するにはあまりに遠くに離れている。いくつかの実施形態では、ロボット・フィンガは、ロボット・フィンガから下向きに延在する第２の係合特徴部を有している。１つの例では、ロボット・アームから下向きに延在する特徴部は、そこから延在する反転した切頭円錐形状の突出部を備えたポストを含む。動作時に、反転した円錐形状の特徴部は、自動化されたアナライザの中の第１の場所から第２の場所へ輸送される消耗品物品の中の対応する切り欠き部に係合する。自動化されたアナライザは、自動化されたアナライザの中で使用するために消耗品アイテムを受け入れるための消耗品リポジトリをさらに含むことが可能である。消耗品アイテムの例は、処理プレート、乾燥試薬プレート、液体試薬プレート、および増幅カートリッジを含む。いくつかの実施形態では、ロボット・アームは、スキャナを有しており、ロボット・アームは、スキャナを使用して消耗品の上のコードを読み取ることによって、消耗品リポジトリの中に貯蔵されている消耗品を回収する。１つの例では、消耗品リポジトリは、第１の側から消耗品を受け入れ、ロボット・アームは、消耗品リポジトリの第２の側から消耗品を回収する。１つの例では、アナライザは、１つまたは複数の処理モジュールを有しており、処理モジュールは、シャトル・プラットフォームおよび磁気エクストラクタを有している。アナライザが複数の処理モジュールを有する例では、２つの隣接する処理モジュールは、１つのシャトル・プラットフォームを使用する。１つの例では、処理モジュールは、磁気エクストラクタに隣接して乾燥試薬ステーションおよび液体試薬ステーションを有しており、磁気エクストラクタは、処理プレートをその上に受け入れるように適合されており、処理プレートは、それぞれの乾燥試薬ステーションおよび液体試薬ステーションに設置されている乾燥試薬プレートおよび液体試薬プレートに対して、処理モジュールの中により低く位置決めされている。

別の態様では、自動化される診断システムを使用するための処理プレートは、ｉ）複数の抽出チューブ、混合ウェル、およびピペット・チップ保持ステーションを画定するプレート本体部であって、抽出チューブ、混合ウェル、およびピペット・チップ保持ステーションは、プレート本体部の上側表面を通って延在する開口部をそれぞれ画定している、プレート本体部と、ｉｉ）係合部材の垂直方向部分の中に開口部を有する、プレート本体部の上側表面から垂直方向上向きに延在する係合部材であって、開口部は、プレート本体部の周囲に面しており、そのような開口部は、自動化された輸送デバイスの係合特徴部を受け入れるように構成されている、係合部材とを含む。１つの例では、処理プレートは、上側表面、下側表面、および縁部を含み、縁部は、上側表面と下側表面との間に延在しており、プレート本体部の周囲を画定している。別の例では、自動化された診断システムの中での使用のための処理プレートは、ｉ）上側表面、下側表面、および縁部を有するプレート本体部であって、縁部は、上側表面と下側表面との間に延在しており、プレート本体部の周囲を画定している、プレート本体部と、ｉｉ）プレート本体部の上側表面の中の、および、それを通って延在する、複数のセットの開口部であって、開口部は、閉じた端部において終端している、複数のセットの開口部とを含む。たとえば、それぞれのセットが、ｉ）チューブ本体部を有する抽出チューブであって、チューブ本体部は、底部表面から延在し、上側表面を通って延在するチューブ開口部を画定している、抽出チューブと、ウェルと、ピペット・チップを受け入れて保持するように構成されているピペット・ステーションとを有している。１つの例では、抽出チューブ、ウェル、およびピペット・ステーションのそれぞれのセットが、一列に整合させられており、ピペット・ステーションが、プレート本体部の少なくとも１つの側部において、縁部の最も近くに位置決めされており、抽出チューブおよびウェルは、処理プレートの周囲から遠くに離れている。

１つの例では、係合部材は、プレート本体部の上側表面から垂直方向上向きに延在しており、また、係合部材の垂直方向部分の中に開口部を有しており、開口部は、プレート本体部の周囲に面しており、そのような開口部は、自動化された輸送デバイスの上の係合特徴部を受け入れるように構成されている。

また、本明細書で説明されているのは、物品を運搬するためのエンド・エフェクタを備えたロボット・アームを有する在庫ロボットであって、エンド・エフェクタは、ｉ）関節式アームに回転可能に接続されている本体部と、ｉｉ）本体部に連結されており、本体部から延在している、少なくとも２つのフィンガであって、少なくとも２つのフィンガのうちの一方は、少なくとも２つのフィンガのうちのもう一方に対して可動である、少なくとも２つのフィンガとを有している。少なくとも２つのフィンガのそれぞれは、物品のそれぞれの凹部に係合するために少なくとも２つのフィンガのうちの他方に向けて第１の方向に延在する第１の突出部を有している。それぞれの凹部は、突出部のうちの１つを受け入れるように構成されており、少なくとも２つのフィンガのそれぞれは、第１の方向に対して下向き方向に延在する第２の突出部を有している。第２の突出部は、物品の上部の中の凹部に係合するためのものであり、凹部は第２の突出部を受け入れるように構成される。

また、本明細書で説明されているのは、物品を運搬するためのエンド・エフェクタを備えたロボット・アームを有する自動化されたアナライザである。エンド・エフェクタは、ｉ）関節式アームに回転可能に接続されている本体部と、ｉｉ）本体部に連結され、本体部から第１の方向に延在しており、第１の方向に対して横断する第２の方向に互いに対して可動である第１および第２のフィンガであって、フィンガのそれぞれは、第１の係合特徴部および第２の係合特徴部を有しており、第１の係合特徴部は、フィンガのそれぞれから第２の方向に延在しており、第２の係合特徴部は、第１および第２のフィンガから下向きに延在しており、第２の係合特徴部は、物品の上部の中に配設されている凹部に係合するように構成されており、凹部は、第２の係合特徴部を受け入れるように構成されており、ロボット・アームが物品を第１の場所から第２の場所へ運搬するときに、第１および第２のフィンガから物品を懸下するようになっている、第１および第２のフィンガとを含む。

また、本明細書で説明されているのは、自動化されたアナライザであって、ｉ）エンド・エフェクタをその上に備えたロボット・アームを含む在庫ロボットであって、エンド・エフェクタは、関節式アームに回転可能に接続されている本体部を含む、在庫ロボットと、ｉｉ）本体部から、その第１の側から延在する、複数の把持フィンガであって、本体部は、垂直方向軸線の上で回転可能である、複数の把持フィンガと、ｉｉｉ）在庫ロボットによって物品に近接させられることとなるエンド・エフェクタの上に位置決めされているスキャナであって、在庫ロボットは、識別情報をスキャンし、識別情報は、物品の上に配設されており、また、把持フィンガがそこから延在する場所以外の位置において、エンド・エフェクタの上に位置する、スキャナとを有している。また、アナライザは、磁気エクストラクタを有しており、磁気エクストラクタは、ｉ）キャビティを画定するハウジングと、ｉｉ）ハウジングのキャビティの中に移動可能に配設されている隣接する永久磁石の列と、ｉｉｉ）永久磁石の列に接続されている駆動メカニズムであって、キャビティの中へおよびキャビティから、永久磁石の列を移動させるように構成されている、駆動メカニズムと、ｉｖ）キャビティの両側に配設されている列でハウジングから延在し、それぞれが磁気エクストラクタの上方に配設されている処理プレートの抽出チューブを受け入れて保持するように構成されている凹部を画定する複数の加熱エレメントであって、加熱エレメントを加熱する電源に接続されている、複数の加熱エレメントとを有している。動作時に、第１の位置から第２の位置へ磁石を移動させることは、磁石の列を加熱エレメントの列と列の間に直接的に配設し、それぞれの永久磁石がそれぞれの加熱エレメントと整合するようになっている。また、磁気エクストラクタは、ハウジングから延在する複数の加熱エレメントと、加熱エレメントのそれぞれの列に隣接してそれぞれ配設されているトラフを画定するドリップ・プレートと、消耗品処理プレートを受け入れるように適合されている消耗品リポジトリであって、処理プレートは、その上に機械可読ラベルを含み、処理プレートは、第１の側から消耗品リポジトリの中に設置され、消耗品の上の機械可読ラベルは、在庫ロボット・スキャナによって消耗品リポジトリの第２の側から読み取られる、消耗品リポジトリとを有している。１つの例では、在庫ロボットは、消耗品リポジトリへ移動させられ、処理プレートを取得し、消耗品リポジトリの中の物品の上のラベルをスキャンし、また、それが回収されるべき消耗品を識別するときに、消耗品リポジトリから消耗品を除去し、磁気エクストラクタの上にそれを設置し、処理プレートによって保持されたピペット・チップがドリップ・プレートのトラフの中へ延在するようになっている。

また、本明細書で説明されているのは、生物学的なサンプルの自動化されたアナライザを動作させる方法であって、ｉ）分析のためにサンプル・コンテナを運搬するシャトル・ラックを、アナライザ・ハウジングに隣接する場所に設置することと、ｉｉ）エンド・エフェクタを含むロボット・アームを移動させることであって、ロボットの他の部分がアナライザの中にあるままの状態で、エンド・エフェクタがアナライザに隣接する位置へ並進するようになっている、移動させることと、ｉｉｉ）第１および第２のフィンガの係合特徴部がラック・シャトルの中の対応するスロットに進入するように、第１および第２のフィンガをラック・シャトルに向けて前進させることであって、フィンガがスロットの中に挿入されているときに、ラックの中のスロット同士の間の距離は、本体部から延在するフィンガ同士の間の距離に対応している、前進させることと、ｉｖ）係合部材がスロットの中へ前進させられると、ロボット・アームのフィンガをより近くへ一緒になるように並進させ、事前分析システムの中に位置するシャトル・ラックを把握することと、ｖ）ロボット・アームを使用して、アナライザに隣接する位置からアナライザの中へシャトル・ラックを移動させることとを含む。１つの例では、エンド・エフェクタは、第１および第２のフィンガを備えた本体部を有しており、第１および第２のフィンガは、本体部から延在しており、それぞれのフィンガは、その上に係合特徴部を有しており、第１および第２のフィンガは、本体部の中のチャネルの中に配設されており、ロボットによって、より近くに一緒になるように、または、より遠くへ離れるように並進させられ得る。１つの例では、アナライザと隣接する事前分析システムとの間に物理的なアクセスが存在しており、隣接する事前分析システムの中には、分析のためにサンプルが用意されており、分析は、アナライザの中で起こることとなり、ロボット・アームは、隣接する事前分析システムからシャトル・ラックを回収し、それをアナライザの中へ運搬する。また、方法は、ｉ）ロボット・アームを使用して、アナライザの中へ運搬されるシャトル・ラックをシャトル保持プラットフォームの上へ設置することであって、シャトル保持プラットフォームは、開位置および閉位置を有するジョー・アセンブリを有しており、シャトル・ラックがシャトル保持プラットフォームの上に設置されているときに、ジョー・アセンブリは開位置になっている、設置することと、ｉｉ）把持フィンガとシャトル・ラックとの間のテンションを解放し、シャトル・ラックの中のスロットから、エンド・エフェクタから延在する把持フィンガを引き出すことと、ｉｉｉ）把持フィンガが引き出された後に、ジョー・アセンブリを閉位置へ移動させ、それによって、ジョー・アセンブリが閉位置にあるときに、ジョー・アセンブリの係合部材をシャトルの中のサンプル・コンテナの下側部分に対して固着させることと、ｉｖ）ロボット・ピペッタを使用して、ピペット・チップをサンプル・コンテナの中へ挿入することと、ｖ）ロボット・ピペッタを使用して、サンプル・コンテナの中のサンプルの少なくとも一部分を吸引することと、ｖｉ）ジョー・アセンブリが閉位置になっている状態で、サンプル・コンテナからピペット・チップを引き出すこととを含むことが可能である。サンプル・コンテナからピペット・チップを引き出した後に、ジョーが開位置へ移動させられ、方法は、ｖｉｉ）第１および第２のフィンガの係合特徴部がシャトル・ラックの中の対応するスロットに進入するようにエンド・エフェクタの第１および第２のフィンガをシャトル・ラックに向けて前進させることであって、フィンガがスロットの中に挿入されているときに、シャトル・ラックの中のスロット同士の間の距離は、本体部から延在するフィンガ同士の間の距離に対応している、前進させることと、ｖｉｉｉ）係合部材がスロットの中へ前進させられた後に、フィンガをより近くへ一緒になるように並進させ、事前分析システムの中に位置するシャトル・ラックを把握することと、ｉｘ）シャトル保持プラットフォームから、アナライザに隣接する場所へ、シャトル・ラックを輸送して戻すことと、ｘ）エンド・エフェクタからシャトル・ラックを解放することと、ｘｉ）エンド・エフェクタをアナライザの中へ後退させて戻すこととによって継続する。

別の例では、生物学的なサンプルの自動化されたアナライザを動作させる方法は、ｉ）第１の場所に位置決めされている物品の上方に在庫ロボットのロボット・アームのエンド・エフェクタを移動させるステップであって、エンド・エフェクタは、第１および第２のフィンガを備えた本体部を有しており、第１および第２のフィンガは、チャネルの中に位置し、第１の場所に位置決めされている物品の上方の場所へチャネルの中を線形に可動であり、フィンガは、その上に係合特徴部を有している、ステップと、ｉｉ）第１のフィンガと第２のフィンガとの間の距離が、物品の本体部から上向きに延在する突出部である係合部材同士の間の距離よりも大きくなるように、第１および第２のフィンガを離すように並進させるステップであって、係合部材は、物品の周囲に対して内側に配設されており、また、物品の周囲に面する開口部を有している、ステップと、ｉｉｉ）フィンガのそれぞれから延在する係合特徴部が、係合部材の中の対応する開口部と整合するように、エンド・エフェクタを移動させるステップと、ｉｖ）係合部材開口部に係合するように、第１および第２のフィンガを互いに向けて移動させるステップと、ｖ）物品の本体部がフィンガの下に配設されるように物品をリフトするステップと、ｖｉ）物品を第２の場所へ移動させるステップとを含む。

さらなる例では、係合特徴部は、第１および第２のフィンガのそれぞれから第１および第２のフィンガのうちの他方に向けて内向きに突出する第１の係合特徴部、または、フィンガのそれぞれから下向きに延在する第２の係合特徴部のうちの１つであり、フィンガから下向きに延在する特徴部は、そこから延在する反転した切頭円錐形状の突出部を備えたポストを含む。さらなる例では、第１の場所は、消耗品リポジトリである。消耗品リポジトリは、その上部表面の中に係合部材を含む第１の物品を含むことが可能である。この例示的な方法は、ｖｉｉ）第１の物品の上部表面の上方にエンド・エフェクタを移動させるステップと、ｖｉｉｉ）第２の係合特徴部が第１の物品の上部表面の中の対応する係合部材と係合するように、物品の上部表面の上方にエンド・エフェクタを低下させるステップとをさらに含むことが可能である。また、消耗品リポジトリは、第２の物品を含むことが可能であり、第２の物品は、物品の本体部の上側表面の中の、および、それを通って延在する、複数のセットの開口部を含み、開口部は、閉じた端部において終端し、それぞれのセットが、ａ）チューブ本体部を有する抽出チューブであって、チューブ本体部は、底部表面から延在し、上側表面を通って延在するチューブ開口部を画定している、抽出チューブと、ｂ）ウェルと、ｃ）ピペット・チップを受け入れて保持するように構成されているピペット・ステーションであって、抽出チューブ、ウェル、およびピペット・ステーションのそれぞれのセットが、一列に整合させられており、ピペット・ステーションが、プレート本体部の少なくとも１つの側部において、縁部の最も近くに位置決めされており、抽出チューブおよびウェルは、処理プレートの周囲から遠くに離れている、ピペット・ステーションと、ｄ）上部表面の上の内側にあり、その上部表面から延在している、係合部材であって、上部表面の周囲に面する開口部を有する、係合部材を有しており、方法は、エンド・エフェクタを第１の物品の上部表面の上方に移動させることをさらに含む、係合部材のそれぞれ１つを有している。方法は、ｉｘ）エンド・エフェクタの係合特徴部を係合部材と整合させるステップと、ｘ）係合特徴部を係合部材の中に挿入するステップと、ｘｉ）第１および第２のフィンガをより近くに一緒になるように並進させ、係合部材を把持するステップと、ｘｉｉ）第２の物品を第２の場所へ運搬するステップとを含むことが可能である。

１つの例では、エンド・エフェクタは、対応する凹部の中へフィンガを移動させるために水平方向に前進させられる。エンド・エフェクタがスキャナを含む実施形態では、方法は、ｉ）消耗品リポジトリから物品を回収するように在庫ロボットに指示することと、ｉｉ）消耗品リポジトリの中の物品の上にある機械可読ラベルをスキャンすることと、ｉｉｉ）在庫ロボットが回収するように指示された物品にラベル情報が合致するかどうかを決定することと、ｉｖ）合致することが決定された場合には、エンド・エフェクタのアームを物品の上の係合部材と係合させ、在庫ロボットを使用して、物品を消耗品リポジトリから第２の場所へ輸送することとをさらに含む。

本明細書では、本発明が特定の実施形態を参照して説明されてきたが、これらの実施形態は、単に、本発明の原理および用途の例示目的のものに過ぎないことが理解されるべきである。したがって、例示目的の実施形態に対して多数の修正が行われ得ること、ならびに、添付の特許請求の範囲によって定義されているような本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、他の配置も考案され得ることが理解されるべきである。

Claims (35)

1. 自動化されたアナライザであって、
   ハウジングと、
   エンド・エフェクタを含むロボット・アームと
   を含み、
   前記エンド・エフェクタは、
   関節式アームに回転可能に接続されている本体部と、
   前記本体部に連結され、第１の方向に互いに対して可動である第１および第２のフィンガであって、前記フィンガのそれぞれは、係合特徴部を有しており、前記係合特徴部は、前記第１および第２のフィンガのそれぞれから内向きに、ならびに、前記第１および第２のフィンガの他方に向けて突出しており、前記係合特徴部は、物品の凹部に係合するように構成されており、前記凹部は、前記係合特徴部を受け入れるように構成されており、前記ロボット・アームが前記物品を運搬することができるようになっており、前記物品は、前記係合特徴部が前記物品とそのように係合されているときに、前記第１および第２のフィンガから懸下されている、第１および第２のフィンガと
   を含み、
   また、前記自動化されたアナライザは、
   １つ以上のサンプル・コンテナを運搬するシャトルを受け入れるための少なくとも１つのシャトル・プラットフォームであって、前記サンプル・コンテナは、前記アナライザによって評価されることとなるサンプルを運搬する、少なくとも１つのシャトル・プラットフォームを含み、
   前記シャトル・プラットフォームは、ジョー・アセンブリを含み、前記ジョー・アセンブリは、開位置から閉位置へ自動的に移動し、前記ジョー・アセンブリは、係合部材を含み、前記係合部材は、前記ジョー・アセンブリが前記開位置にあるときに、前記シャトルによって運搬されている前記サンプル・コンテナの底部部分のスカートに接触しないように構成され、前記ジョー・アセンブリが前記閉位置にあるときに、前記シャトルに設けられた複数の横方向の開口部を通って伸び、前記１つ以上のサンプル・コンテナの前記底部部分の前記スカートの中へ貫通して前記サンプル・コンテナを固定するように構成されている、自動化されたアナライザ。
2. 前記サンプル・コンテナからサンプルを吸引する自動ピペッタをさらに含み、前記自動ピペッタが前記サンプル・コンテナからサンプルを吸引するときに、前記シャトル・プラットフォームの前記ジョー・アセンブリが閉じられる、請求項１に記載の自動化されたアナライザ。
3. 前記ロボット・アームは、前記シャトル・プラットフォームの前記ジョー・アセンブリが前記開位置にあるときに、前記シャトル・プラットフォームの上に前記シャトルを設置する、請求項２に記載の自動化されたアナライザ。
4. 磁気エクストラクタをさらに含む、請求項３に記載の自動化されたアナライザ。
5. 前記磁気エクストラクタは、
   キャビティを画定するハウジングと、
   前記ハウジングの前記キャビティの中に移動可能に配設されている隣接する永久磁石の列と、
   前記永久磁石の列に接続されている駆動メカニズムであって、前記キャビティの中へおよび前記キャビティから、前記永久磁石の列を移動させるように構成されている、駆動メカニズムと、
   前記キャビティの両側に配設されている列で前記ハウジングから延在する複数の加熱エレメントと
   をさらに含み、
   前記駆動メカニズムによって前記キャビティから前記永久磁石の列を移動させることは、前記永久磁石の列を前記加熱エレメントの列と列の間に直接的に配設し、それぞれの前記永久磁石がそれぞれの前記加熱エレメントと整合するようになっており、
   また、前記磁気エクストラクタは、
   前記加熱エレメントのそれぞれの列に隣接してそれぞれ配設されているトラフを画定するドリップ・プレート
   をさらに含む、請求項４に記載の自動化されたアナライザ。
6. 前記磁気エクストラクタは、処理プレートをその上に受け入れるように適合されており、前記加熱エレメントは、凹部をそれぞれ画定しており、前記凹部は、前記磁気エクストラクタの上方に配設されている前記処理プレートの抽出チューブを受け入れて保持するように構成されており、前記加熱エレメントは、電源に接続されており、前記電源は、前記加熱エレメントを加熱し、前記処理プレートが前記加熱エレメントの上方に設置されているときに、前記処理プレートによって保持されたピペット・チップが前記ドリップ・プレートの前記トラフの中へ延在するようになっている、請求項５に記載の自動化されたアナライザ。
7. 前記処理プレートは、前記ロボット・アームによって前記磁気エクストラクタの上に設置されている、請求項６に記載の自動化されたアナライザ。
8. 前記ロボット・アームは、前記第１および第２のフィンガの前記係合特徴部を前記処理プレートから上向きに延在する係合部材と係合させることによって、前記磁気エクストラクタの上に前記処理プレートを輸送し、前記上向きに延在する係合部材は、開口部を有しており、前記開口部は、前記第１および第２のフィンガが第１の係合位置にあるときに、前記係合特徴部を受け入れ、前記第１および第２のフィンガは、第２の位置よりも前記第１の係合位置において、共により近くになっており、前記第２の位置では、前記第１および第２のフィンガ同士の間の距離は、前記係合特徴部が前記係合部材に係合するにはあまりに遠くに離れている、請求項７に記載の自動化されたアナライザ。
9. 前記第１および第２のフィンガは、前記第１および第２のフィンガから下向きに延在する第２の係合特徴部を有している、請求項１に記載の自動化されたアナライザ。
10. 前記ロボット・アームの前記第２の係合特徴部は、そこから延在する反転した切頭円錐形状の突出部を備えたポストを含む、請求項９に記載の自動化されたアナライザ。
11. 前記反転した切頭円錐形状の特徴部は、前記自動化されたアナライザの中の第１の場所から第２の場所へ輸送される消耗品物品の中の対応する切り欠き部に係合する、請求項１０に記載の自動化されたアナライザ。
12. 前記自動化されたアナライザの中で使用するために消耗品アイテムを受け入れるための消耗品リポジトリをさらに含む、請求項１に記載の自動化されたアナライザ。
13. 前記消耗品アイテムは、処理プレート、乾燥試薬プレート、液体試薬プレート、および増幅カートリッジからなる群から選択される、請求項１２に記載の自動化されたアナライザ。
14. 前記ロボット・アームは、スキャナをさらに含み、前記ロボット・アームは、前記スキャナを使用して消耗品の上のコードを読み取ることによって、前記消耗品リポジトリの中に貯蔵されている前記消耗品を回収する、請求項１３に記載の自動化されたアナライザ。
15. 前記消耗品リポジトリは、第１の側から消耗品を受け入れ、前記ロボット・アームは、前記消耗品リポジトリの第２の側から消耗品を回収する、請求項１３に記載の自動化されたアナライザ。
16. 前記自動化されたアナライザの中の処理モジュールは、前記シャトル・プラットフォームおよび磁気エクストラクタを含む、請求項１に記載の自動化されたアナライザ。
17. 複数の処理モジュールを含み、２つの隣接する処理モジュールは、１つのシャトル・プラットフォームを使用する、請求項１に記載の自動化されたアナライザ。
18. 処理モジュールは、前記磁気エクストラクタに隣接して乾燥試薬ステーションおよび液体試薬ステーションをさらに含み、前記磁気エクストラクタは、処理プレートをその上に受け入れるように適合されており、前記処理プレートは、それぞれの乾燥試薬ステーションおよび液体試薬ステーションに設置されている乾燥試薬プレートおよび液体試薬プレートに対して、前記処理モジュールの中により低く位置決めされている、請求項１６に記載の自動化されたアナライザ。
19. 自動化される診断システムを使用するための処理プレートであって、
    複数の抽出チューブ、混合ウェル、およびピペット・チップ保持ステーションを画定するプレート本体部であって、前記抽出チューブ、混合ウェル、およびピペット・チップ保持ステーションは、前記プレート本体部の上側表面を通って延在する開口部をそれぞれ画定し、前記プレート本体部の下側表面から延在するピペット・スリーブを有している、プレート本体部と、
    係合部材であって、前記係合部材は、前記係合部材の垂直方向部分の中に開口部を有する前記プレート本体部の前記上側表面から垂直方向上向きに延在し、前記開口部は、前記プレート本体部の周囲に面しており、そのような開口部は、自動化された輸送デバイスの係合特徴部を受け入れるように構成されている、係合部材と、
    を含む、処理プレート。
20. 前記プレート本体部は、前記上側表面、前記下側表面、および縁部を含み、前記縁部は、前記上側表面と前記下側表面との間に延在しており、前記プレート本体部の周囲を画定している、請求項１９に記載の処理プレート。
21. 自動化された診断システムの中での使用のための処理プレートであって、
    上側表面、下側表面、および縁部を有するプレート本体部であって、前記縁部は、前記上側表面と前記下側表面との間に延在しており、前記プレート本体部の周囲を画定している、プレート本体部と、
    前記プレート本体部の前記上側表面の中の、および、それを通って延在する、複数のセットの開口部であって、閉じた端部において終端している、複数のセットの開口部と
    を含み、
    さらに、それぞれのセットが、
    チューブ本体部を有する抽出チューブであって、前記チューブ本体部は、前記下側表面から延在し、前記上側表面を通って延在するチューブ開口部を画定している、抽出チューブと、
    ウェルと、
    ピペット・チップを受け入れて保持するように構成されているピペット・チップ保持ステーションであって、前記ピペット・チップ保持ステーションは前記プレート本体部の前記下側表面から延在するピペット・スリーブを有する、ピペット・チップ保持ステーションと
    のそれぞれ１つを含み、
    抽出チューブ、ウェル、およびピペット・チップ保持ステーションのそれぞれのセットが、一列に整合させられており、前記ピペット・チップ保持ステーションが、前記プレート本体部の少なくとも１つの側部において、前記縁部の最も近くに位置決めされており、前記抽出チューブおよびウェルは、前記処理プレートの周囲から遠くに離れている、処理プレート。
22. 係合部材をさらに含み、前記係合部材は、前記係合部材の垂直方向部分の中に開口部を有する、前記プレート本体部の前記上側表面から垂直方向上向きに延在しており、前記開口部は、前記プレート本体部の前記周囲に面しており、そのような開口部は、自動化された輸送デバイスの上の係合特徴部を受け入れるように構成されている、請求項２１に記載の処理プレート。
23. 物品を運搬するためのエンド・エフェクタを備えたロボット・アームを含む在庫ロボットであって、前記エンド・エフェクタは、
    関節式アームに回転可能に接続されている本体部と、
    前記本体部に連結されており、前記本体部から延在している、少なくとも２つのフィンガであって、前記少なくとも２つのフィンガのうちの一方は、前記少なくとも２つのフィンガのうちのもう一方に対して可動であり、少なくとも２つのフィンガのそれぞれは、前記物品のそれぞれの凹部に係合するために前記少なくとも２つのフィンガのうちの他方に向けて第１の方向に延在する複数の第１の突出部を含み、前記それぞれの凹部は、前記第１の突出部のうちの１つを受け入れるように構成されており、前記少なくとも２つのフィンガのそれぞれは、前記第１の方向に対して下向き方向に延在する第２の突出部を含み、前記第２の突出部は、物品の上部の中の凹部に係合するためのものであり、前記凹部は、前記第２の突出部を受け入れるように構成されている、少なくとも２つのフィンガと
    を含む、在庫ロボット。
24. 自動化されたアナライザであって、
    物品を運搬するためのエンド・エフェクタを備えたロボット・アームを含み、前記エンド・エフェクタは、
    関節式アームに回転可能に接続されている本体部と、
    前記本体部に連結され、前記本体部から第１の方向に延在しており、前記第１の方向に対して横断する第２の方向に互いに対して可動である第１および第２のフィンガであって、前記フィンガのそれぞれは、複数の第１の係合特徴部および第２の係合特徴部を有しており、前記複数の第１の係合特徴部は、前記フィンガのそれぞれから前記第２の方向に延在しており、前記第２の係合特徴部は、前記第１および第２のフィンガから下向きに延在しており、前記第２の係合特徴部は、物品の上部の中に配設されている凹部に係合するように構成されており、前記凹部は、前記第２の係合特徴部を受け入れるように構成されており、前記ロボット・アームが前記物品を第１の場所から第２の場所へ運搬するときに、前記第１および第２のフィンガから前記物品を懸下するようになっている、第１および第２のフィンガと
    を含む、自動化されたアナライザ。
25. 自動化されたアナライザであって、
    エンド・エフェクタをその上に備えたロボット・アームを含む在庫ロボットであって、前記エンド・エフェクタは、関節式アームに回転可能に接続されている本体部を含む、在庫ロボットと、
    前記本体部の第１の側から延在する、複数の把持フィンガであって、前記本体部は、垂直方向軸線の上で回転可能である、複数の把持フィンガと、
    前記在庫ロボットによって物品に近接させられることとなる前記エンド・エフェクタの上に位置決めされているスキャナであって、前記在庫ロボットは、識別情報をスキャンするように構成されており、前記識別情報は、物品の上に配設されており、また、前記把持フィンガがそこから延在する場所以外の場所において、前記エンド・エフェクタの上に位置する、スキャナと、
    磁気エクストラクタと
    を含み、
    前記磁気エクストラクタは、
    キャビティを画定するハウジングと、
    前記ハウジングの前記キャビティの中に移動可能に配設されている隣接する永久磁石の列と、
    前記永久磁石の列に接続されている駆動メカニズムであって、前記キャビティの中へおよび前記キャビティから、前記永久磁石の列を移動させるように構成されている、駆動メカニズムと、
    前記キャビティの両側に配設されている列で前記ハウジングから延在し、それぞれが前記磁気エクストラクタの上方に配設されている処理プレートの抽出チューブを受け入れて保持するように構成されている凹部を画定する複数の加熱エレメントであって、前記加熱エレメントを加熱する電源に接続されている、複数の加熱エレメントと、
    前記駆動メカニズムによって前記キャビティから前記永久磁石の列を移動させることは、前記永久磁石の列を前記加熱エレメントの列と列の間に直接的に配設し、それぞれの永久磁石がそれぞれの加熱エレメントと整合するようになっており、
    前記ハウジングから延在する複数の加熱エレメントと、
    加熱エレメントのそれぞれの列に隣接してそれぞれ配設されているトラフを画定するドリップ・プレートと、
    消耗品処理プレートを受け入れるように適合されている消耗品リポジトリであって、前記消耗品処理プレートは、その上に機械可読ラベルを含み、前記消耗品処理プレートは、第１の側から前記消耗品リポジトリの中に設置され、前記消耗品処理プレートの上の前記機械可読ラベルは、前記スキャナによって前記消耗品リポジトリの第２の側から読み取られる、消耗品リポジトリと
    を含み、
    前記在庫ロボットは、前記消耗品リポジトリへ移動させられ、前記消耗品処理プレートを取得し、前記消耗品リポジトリの中の物品の上のラベルをスキャンし、また、それが回収されるべき消耗品を識別するときに、前記消耗品リポジトリから前記消耗品を除去し、前記磁気エクストラクタの上にそれを設置し、前記消耗品処理プレートによって保持されたピペット・チップが前記ドリップ・プレートの前記トラフの中へ延在するようになっている、自動化されたアナライザ。
26. 生物学的なサンプルの自動化されたアナライザを動作させる方法であって、
    分析のためにサンプル・コンテナを運搬するシャトル・ラックを、前記アナライザのハウジングに隣接する場所に設置することと、
    エンド・エフェクタを含むロボット・アームを移動させることであって、前記ロボット・アームの他の部分が前記アナライザの中にあるままの状態で、前記エンド・エフェクタが前記アナライザに隣接する位置へ並進するようになっており、前記エンド・エフェクタは、第１および第２のフィンガを備えた本体部を含み、前記第１および第２のフィンガは、前記本体部から延在しており、前記第１および第２のフィンガのそれぞれは、係合特徴部を有しており、前記第１および第２のフィンガは、前記本体部の中のチャネルの中に配設されており、前記ロボット・アームによって、共により近くになるように、または、より遠くへ離れるように並進させられ得る、移動させることと、
    前記第１および第２のフィンガの前記係合特徴部が前記シャトル・ラックの中の対応するスロットに進入するように、前記第１および第２のフィンガを前記シャトル・ラックに向けて前進させることであって、前記フィンガが前記スロットの中に挿入されているときに、前記シャトル・ラックの中の前記スロット同士の間の距離は、前記本体部から延在する前記フィンガ同士の間の距離に対応している、前進させることと、
    前記係合特徴部が前記スロットの中へ前進させられると、前記ロボット・アームの前記フィンガを共により近くになるように並進させ、事前分析システムの中に位置する前記シャトル・ラックを把握することと、
    前記ロボット・アームを使用して、前記アナライザに隣接する前記位置から前記アナライザの中へ前記シャトル・ラックを移動させることと
    前記ロボット・アームを使用して、前記アナライザの中へ運搬される前記シャトル・ラックをシャトル保持プラットフォームの上へ設置することであって、前記シャトル保持プラットフォームは、開位置および閉位置を有するジョー・アセンブリを有しており、前記ジョー・アセンブリは係合部材を有し、前記係合部材は、前記ジョー・アセンブリが前記開位置にあるときに、前記シャトル・ラックによって運搬されている前記サンプル・コンテナの底部部分のスカートに接触しないように構成され、前記ジョー・アセンブリが前記閉位置にあるときに、前記シャトル・ラックに設けられた複数の横方向の開口部を通って伸び、前記サンプル・コンテナの前記底部部分の前記スカートの中へ貫通して前記サンプル・コンテナを固定するように構成されており、前記シャトル・ラックが前記シャトル保持プラットフォームの上に設置されているときに、前記ジョー・アセンブリは前記開位置になっている、設置することと、
    を含む、方法。
27. 前記アナライザと隣接する事前分析システムとの間に物理的なアクセスが存在しており、前記隣接する事前分析システムの中には、分析のために前記サンプルが用意されており、前記分析は、前記アナライザの中で起こることとなり、前記ロボット・アームは、前記隣接する事前分析システムから前記シャトル・ラックを回収し、それを前記アナライザの中へ運搬する、請求項２６に記載の方法。
28. 前記第１および第２のフィンガと前記シャトル・ラックとの間のテンションを解放し、前記シャトル・ラックの中の前記スロットから、前記エンド・エフェクタから延在する前記第１および第２のフィンガを引き出すことと、
    前記第１および第２のフィンガが引き出された後に、前記ジョー・アセンブリを前記閉位置へ移動させ、それによって、前記ジョー・アセンブリが前記閉位置にあるときに、前記ジョー・アセンブリの係合部材を前記シャトル・ラックの中の前記サンプル・コンテナの下側部分に対して固着させることと、
    ロボット・ピペッタを使用して、ピペット・チップを前記サンプル・コンテナの中へ挿入することと、
    前記ロボット・ピペッタを使用して、前記サンプル・コンテナの中の前記サンプルの少なくとも一部分を吸引することと、
    前記ジョー・アセンブリが前記閉位置になっている状態で、前記サンプル・コンテナから前記ピペット・チップを引き出すことと
    をさらに含む、請求項２６に記載の方法。
29. 前記サンプル・コンテナから前記ピペット・チップを引き出した後に、前記ジョー・アセンブリを前記開位置へ移動させることと、
    前記第１および第２のフィンガの前記係合特徴部が前記シャトル・ラックの中の対応するスロットに進入するように前記エンド・エフェクタの前記第１および第２のフィンガを前記シャトル・ラックに向けて前進させることであって、前記フィンガが前記スロットの中に挿入されているときに、前記シャトル・ラックの中の前記スロット同士の間の距離は、前記本体部から延在する前記フィンガ同士の間の距離に対応している、前進させることと、
    前記係合部材が前記スロットの中へ前進させられた後に、前記フィンガをより近くへ一緒になるように並進させ、前記事前分析システムの中に位置する前記シャトル・ラックを把握することと、
    前記シャトル保持プラットフォームから、前記アナライザに隣接する場所へ、前記シャトル・ラックを輸送して戻すことと、
    前記エンド・エフェクタから前記シャトル・ラックを解放することと、
    前記エンド・エフェクタを前記アナライザの中へ後退させて戻すことと
    をさらに含む、請求項２８に記載の方法。
30. 生物学的なサンプルの自動化されたアナライザを動作させる方法であって、
    第１の場所に位置決めされている物品の上方に在庫ロボットのロボット・アームのエンド・エフェクタを移動させることであって、前記エンド・エフェクタは、第１および第２のフィンガを備えた本体部を有しており、前記第１および第２のフィンガは、チャネルの中に位置し、第１の場所に位置決めされている物品の上方の場所へ前記チャネルの中を線形に可動であり、前記第１および第２のフィンガのそれぞれは、係合特徴部を有している、移動させることと、
    前記第１のフィンガと第２のフィンガとの間の距離が、前記物品の本体部から上向きに延在する突出部である係合部材同士の間の距離よりも大きくなるように、前記第１および第２のフィンガを離すように並進させることであって、前記係合部材は、前記物品の周囲に対して内側に配設されており、また、前記物品の前記周囲に面する開口部を有している、並進させることと、
    前記フィンガのそれぞれから延在する係合特徴部が、前記係合部材の中の対応する開口部と整合するように、前記エンド・エフェクタを移動させることと、
    前記係合部材の開口部に係合するように、前記第１および第２のフィンガを互いに向けて移動させることと、
    前記物品の前記本体部が前記フィンガの下に配設されるように前記物品をリフトすることと、
    前記物品を第２の場所へ移動させることと
    を含み、
    前記係合特徴部は、前記第１および第２のフィンガのそれぞれから前記第１または第２のフィンガのうちの他方に向けて内向きに突出する第１の係合特徴部、または、前記第１および第２のフィンガのそれぞれから下向きに延在する第２の係合特徴部のうちの１つであり、前記第１および第２のフィンガから下向きに延在する前記第２の係合特徴部は、そこから延在する反転した切頭円錐形状の突出部を備えたポストを含む、方法。
31. 前記第１の場所は、消耗品リポジトリである、請求項３０に記載の方法。
32. 前記消耗品リポジトリは、その上部表面の中に係合部材を含む第１の物品を含み、前記方法は、
    前記第１の物品の前記上部表面の上方に前記エンド・エフェクタを移動させることと、
    前記第２の係合特徴部が前記第１の物品の前記上部表面の中の対応する係合部材と係合するように、前記物品の前記上部表面の上方に前記エンド・エフェクタを低下させることと
    をさらに含む、請求項３１に記載の方法。
33. 前記消耗品リポジトリは、第２の物品を含み、前記第２の物品は、前記物品の本体部の上側表面の中の、および、それを通って延在する、複数のセットの開口部を含み、前記開口部は、閉じた端部において終端し、それぞれのセットが、
    チューブ本体部を有する抽出チューブであって、前記チューブ本体部は、底部表面から延在し、前記上側表面を通って延在するチューブ開口部を画定している、抽出チューブと、
    ウェルと、
    ピペット・チップを受け入れて保持するように構成されているピペット・ステーションと
    のそれぞれ１つを含み、
    抽出チューブ、ウェル、およびピペット・ステーションのそれぞれのセットが、一列に整合させられており、前記ピペット・ステーションが、プレート本体部の少なくとも１つの側部において、縁部の最も近くに位置決めされており、前記抽出チューブおよびウェルは、前記プレート本体部の周囲から遠くに離れており、
    係合部材が、前記上側表面の上の内側にあり、その前記上側表面から延在しており、前記上側表面の周囲に面する開口部を有しており、前記方法は、
    前記エンド・エフェクタを前記第２の物品の前記上側表面の上方に移動させることと、
    前記エンド・エフェクタの係合特徴部を前記係合部材と整合させることと、
    前記係合特徴部を前記係合部材の中に挿入し、前記第１および第２のフィンガをより近くに一緒になるように並進させ、前記係合部材を把持することと、
    前記第２の物品を第２の場所へ運搬することと
    をさらに含む、請求項３１に記載の方法。
34. 前記エンド・エフェクタは、対応する凹部の中へ前記フィンガを移動させるために水平方向に前進させられる、請求項３３に記載の方法。
35. 前記エンド・エフェクタは、スキャナを含み、前記方法は、
    前記消耗品リポジトリから物品を回収するように在庫ロボットに指示することと、
    前記消耗品リポジトリの中の前記物品の上にある機械可読ラベルをスキャンすることと、
    前記在庫ロボットが回収するように指示された物品に前記機械可読ラベルの中の情報が合致するかどうかを決定することと、
    合致することが決定された場合には、前記エンド・エフェクタの前記フィンガを前記物品の上の係合部材と係合させ、前記在庫ロボットを使用して、前記物品を前記消耗品リポジトリから第２の場所へ輸送することと
    をさらに含む、請求項３１に記載の方法。

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