JP6254257B2 - 細菌感染を処置するための方法 - Google Patents
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Description
耐性発達の進化の多くは、重要なMDR生物の疫学の変化によって推進される。かつて人間の病院及び老人介護施設にのみ制限されていたが、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)株は、現在では憂慮すべき比率で地域社会から単離されている。更に、市中MRSA株は、パントン−バレンタインロイコシジン(PVL)毒素、皮膚及び軟組織病変、並びに著しい関連死亡率を伴った急速な電撃性壊死性肺炎に結び付けられる毒性因子を担持する可能性が高い。最近、MRSA株は、家畜、ウマ、及びコンパニオンアニマルを含むいくつかの重要な動物種において宿主適応した状態になっており、ヒトから動物及び動物からヒトへの移動の日常的なケースが記録されている。これは、株伝播及び公衆衛生にとって重要な結果を有する。MRSA鼻腔保菌についての751人のオーストラリア獣医の最近の調査により、小動物獣医の4.9%及びほとんど動物と接触しない獣医の0.9%と比較して、ウマの獣医の注目すべき21.4%がMRSA陽性であることが判明した。MRSAのこれらの生態学的シフトは、リネゾリドなどのMRSAのために特に開発された新薬に対する耐性の出現とともに、新しいMRSA抗感染薬が緊急に必要とされていることを裏付ける。更に、そのときMRSAを処置するためにバンコマイシンを使用する病院は、またもや限られた代替の抗微生物薬選択を用いて、病院の患者におけるバンコマイシン−耐性腸球菌(Enterococci)(VRE)感染症のアウトブレイクに対処しなければならない。
ブルセラ・セティ(Brucella ceti);ブルセラ・メリテンシス(Brucella melitensis);ブルセラ・オビス(Brucella ovis);ブルセラ・ピンニペジアリス(Brucella pinnipedialis);ブルセラ・スイス(Brucella suis);オクロバクトラム・アンスロピ(Ochrobactrum anthropi);オクロバクトラム・インターメディウム(Ochrobactrum intermedium).−− バークホルデリア科(Burkholderiaceae):− バークホルデリア・アルボリス(Burkholderia arboris)(Burkholderia aboris);バークホルデリア・アムビファリア(Burkholderia ambifaria)(遺伝子型VII);バークホルデリア・アンシナ(Burkholderia anthina)(遺伝子型VIII);バークホルデリア・セノセファシア(Burkholderia cenocepacia)(遺伝子型III);バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)(遺伝子型I);バークホルデリア・ジフサ(Burkholderia diffusa);バークホルデリア・ドロサ(Burkholderia dolosa)(遺伝子型VI);バークホルデリア・ラテンス(Burkholderia latens);バークホルデリア・マレイ(Burkholderia mallei);バークホルデリア・メタリカ(Burkholderia metallica);バークホルデリア・マルティボランス(Burkholderia multivorans)(遺伝子型II);バークホルデリア・シュードマレイ(Burkholderia pseudomallei);バークホルデリア・ピロシニア(Burkholderia pyrrocinia)(遺伝子型IX);バークホルデリア・セミナリス(Burkholderia seminalis);バークホルデリア・スタビリス(Burkholderia stabilis)(遺伝子型IV);バークホルデリア・ユボネンシス(Burkholderia ubonensis)(遺伝子型X);バークホルデリア・ベトナミエンシス(Burkholderia vietnamiensis)(遺伝子型V);キュープリアビダス・パウクルス(Cupriavidus pauculus);キュープリアビダス・ギラルディイ(Cupriavidus gilardii);ラルストニア・ピケッティイ(Ralstonia pickettii);ラルストニア・マンニトリリティカ(Ralstonia mannitolilytica);スファエロティルス・ヒッペイ(Sphaerotilus hippei);スファエロティルス・モンタヌス(Sphaerotilus montanus);スファエロティルス・ナタンス(Sphaerotilus natans).−− カンピロバクテラセアエ(Campylobacteraceae):−アルコバクター・スキロイイ(Arcobacter skirrowii)を含むアルコバクター(Arcobacter)種;カンピロバクター・コリ(Campylobacter coli);カンピロバクター・コンシサス(Campylobacter concisus);カンピロバクター・カーブス(Campylobacter curvus);カンピロバクター・フェタス(Campylobacter fetus);カンピロバクター・グラシリス(Campylobacter gracilis);カンピロバクター・ヘルベティカス(Campylobacter helveticus);カンピロバクター・ホミニス(Campylobacter hominis);カンピロバクター・ハイオインテスティナリス(Campylobacter hyointestinalis);カンピロバクター・インスラエニグラエ(Campylobacter insulaenigrae);カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni);カンピロバクター・ラニエナエ(Campylobacter lanienae);カンピロバクター・ラリ(Campylobacter lari);カンピロバクター・ラリディス(Campylobacter laridis);カンピロバクター・ムコサリス(Campylobacter mucosalis);カンピロバクター・レクタス(Campylobacter rectus);カンピロバククー・ショウアエ(Campylobacter showae);カンピロバクター・スプトルム(Campylobacter sputorum);カンピロバクター・ウプサリエンシス(Campylobacter upsaliensis).−− カンジダタス(Candidatus):− ピシクラミジア・サルモニス(Piscichlamydia salmonis).−− カーディオバクテリアセアエ(Cardiobacteriaceae):− カーディオバクテリウム・ホミニス(Cardiobacterium hominis);カーディオバクテリウム・バルバルム(Cardiobacterium valvarum);ディケロバクター・ノドサス(Dichelobacter nodosus).−− クラミジア科(Chlamydiaceae):− クラミジア・アビウム(Chlamydia avium)、クラミジア・ガリナセア(Chlamydia gallinacea)、クラミジア・ムリダルム(Chlamydia muridarum)、クラミジア・スイス(Chlamydia suis)、クラミジア・トラコマチス(Chlamydia trachomatis)を含むクラミジア(Chlamydia)種;クラミドフィラ・ニューモニアエ(Chlamydophila pneumoniae)、クラミドフィラ・ペコルム(Chlamydophila pecorum)、クラミドフィラ・シタッシ(Chlamydophila psittaci)、クラミドフィラ・アボルタス(Chlamydophila abortus)、クラミドフィラ・カビアエ(Chlamydophila caviae)、及びクラミドフィラ・フェリス(Chlamydophila felis)を含むクラミドフィラ(Chlamydophila)種.−− クトノモナダセアエ(Chthonomonadaceae):− クトノモナス・カリディロセア(Chthonomonas calidirosea).−− コマモナス科(Comamonadaceae):− コマモナス・テストステロニ(Comamonas testosteroni);ベルミネフロバクター(Verminephrobacter)種.−− コクシエラ科(Coxiellaceae):− コクシエラ・バーネッティイ(Coxiella burnetii).−− サイトファーガ科(Cytophagaceae):− サイトファーガ・コルムナリス(Cytophaga columnaris);サイトファーガ・ハッチンソニイ(Cytophaga hutchinsonii);フレキシバクター・エキニシダ(Flexibacter echinicida);フレキシバクター・エレガンス(Flexibacter elegans);フレキシバクター・フレキシリス(Flexibacter flexilis);フレキシバクター・リトラリス(Flexibacter litoralis);フレキシバクター・ポリモーフス(Flexibacter polymorphus);フレキシバクター・ロゼオルス(Flexibacter roseolus);フレキシバクター・ルベー(Flexibacter ruber).−− デスルフォビブリオ科(Desulfovibrionaceae):− ビロフィラ・ワーズワーシア(Bilophila wadsworthia);ローソニア・イントラセルラリス(Lawsonia intracellularis).−− 腸内細菌科:− セデセア・ダヴィスアエ(Cedecea davisae);セデセア・ラパゲイ(Cedecea lapagei);セデセア・ネテリ(Cedecea neteri);アマロナティカス(amalonaticus);サイトロバクター・ディバーサス(Citrobacter diversus);サイトロバクター・フレウンディイ(Citrobacter freundii);サイトロバクター・コセリ(Citrobacter koseri);クロノバクター・コンディメンティ(Cronobacter condimenti);クロノバクター・デュブリネンシス(Cronobacter dublinensis);クロノバクター・ヘルベティカス(Cronobacter helveticus);クロノバクター・マロナティカス(Cronobacter malonaticus);クロノバクター・ムイトジェンシイ(Cronobacter muytjensii);クロノバクター・プルベリス(Cronobacter pulveris);クロノバクター・サカザキイ(Cronobacter sakazakii);クロノバクター・ツリセンシス(Cronobacter turicensis);クロノバクター・ユニバーサリス(Cronobacter universalis);クロノバクター・ズリケンシス(Cronobacter zurichensis);エドワージエラ・イクタルリ(Edwardsiella ictaluri);エドワージエラ・タルダ(Edwardsiella tarda);エンテロバクター・アエロゲネス(Enterobacter aerogenes);エンテロバクター・アグロメランス(Enterobacter agglomerans);エンテロバクター・クロアカエ(Enterobacter cloacae);エンテロバクター・コワニイ(Enterobacter cowanii);エシェリキア・アルベルティイ(Escherichia albertii);AIEC=接着性侵襲性大腸菌、EaggEC=腸管凝集性大腸菌;EHEC=腸管出血性大腸菌;EIEC=腸管組織侵入性大腸菌;EPEC=腸管病原性大腸菌;ETEC=腸内毒素原性大腸菌;ExPEC=腸外病原性大腸菌、NMEC=新生児髄膜炎大腸菌、NTEC=壊死性毒素産生性(necrotoxigenic)大腸菌、UPEC=尿路疾患性大腸菌を含む大腸菌(Escherichia coli);エシェリキア・ファグソニイ(Escherichia fergusonii);エウィンゲラ・アメリカナ(Ewingella americana);ハフニア・アルベイ(Hafnia alvei);ハフニア・パラルベイ(Hafnia paralvei);クレブシエラ・グラニュロマティス(Klebsiella granulomatis);クレブシエラ・オキシトカ(Klebsiella oxytoca);肺炎桿菌;クライベラ・アスコルバータ(Kluyvera ascorbata);クライベラ・クリオクレッセンス(Kluyvera cryocrescens);モーガネラ・モーガニイ(Morganella morganii);パントエア(Pantoea)(以前にエンテロバクター(Enterobacter))・アグロメランス(agglomerans);フォトラブダス・アシンビオティカ(Photorhabdus asymbiotica);プレシオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides);プロテウス・ミラビリス(Proteus mirabilis);プロテウス・ペンネリ(Proteus penneri);プロテウス・ブルガリス(Proteus vulgaris);プロビデンシア・アルカリファシエンス(Providencia alcalifaciens);プロビデンシア・レットゲリ(Providencia rettgeri);プロビデンシア・スチュアーティイ(Providencia stuartii);ラオウルテラ・エレクトリカ(Raoultella electrica);ラオウルテラ・オルニチノリティカ(Raoultella ornithinolytica);ラオウルテラ・プランティコーラ(Raoultella planticola);ラオウルテラ・テリジェナ(Raoultella terrigena);サルモネラ・ボンゴリ(Salmonella bongori)、サルモネラ・エンテリカ亜種エンテリカ(Salmonella enterica subspecies enterica)(多くの血清型);セラチア・リクファシエンス(Serratia liquefaciens)(Serratia liquifaciens);セラチア・マルセッセンス(Serratia marcescens)(Serratia marcesans);シゲラ・ボイディイ(Shigella boydii);シゲラ・ディセンテリアエ(Shigella dysenteriae);シゲラ・フレクスネリ(Shigella flexneri);シゲラ・ソンネイ(Shigella sonnei);エルシニア・エンテロコリティカ(Yersinia enterocolitica);ペスト菌(Yersinia pestis);エルシニア・シュードツベルクローシス(Yersinia pseudotuberculosis);エルシニア・ラッケリ(Yersinia ruckeri).−− フィンブリイモナダセアエ(Fimbriimonadaceae):− フィンブリイモナス・ギンセンギソリ(Fimbriimonas ginsengisoli).−− フラボバクテリアセアエ(Flavobacteriaceae):− バージイエラ・ズーヘルカム(Bergeyella zoohelcum);カプノサイトファガ・カニモーサス(Capnocytophaga canimorsus);カプノサイトファガ・シノデグミ(Capnocytophaga cynodegmi);カプノサイトファガ・ジンジバーリス(Capnocytophaga gingivalis);カプノサイトファガ・グラヌロサ(Capnocytophaga granulosa);カプノサイトファガ・ヘモリティカ(Capnocytophaga haemolytica);カプノサイトファガ・リードベッテリ(Capnocytophaga leadbetteri);カプノサイトファガ・オクラセア(Capnocytophaga ochracea);カプノサイトファガ・スプーティゲナ(Capnocytophaga sputigena);クリセオバクテリウム・インドロゲネス(Chryseobacterium indologenes);クリセオバクテリウム・ピシコラ(Chryseobacterium piscicola);エリザベトキンギア・メニンゴセプティカ(Elizabethkingia meningoseptica);フラボバクテリウム・ブランキオフィラム(Flavobacterium branchiophilum);フラボバクテリウム・コルムナーレ(Flavobacterium columnare);フラボバクテリウム・オンコリンキ(Flavobacterium oncorhynchi);フラボバクテリウム・ピスシシダ(Flavobacterium piscicida);フラボバクテリウム・サイクロフィルム(Flavobacterium psychrophilum);ミロイデス・オドラータス(Myroides odoratus);ミロイデス・オドラティミマス(Myroides odoratimimus);オルニソバクテリウム・リノトラケアレ(Ornithobacterium rhinotracheale);
リエメレラ・アナティペステイファー(Riemerella anatipestifer);リエメレラ・コロンビーナ(Riemerella columbina);リエメレラ・コルンビファリンギス(Riemerella columbipharyngis);テナチバキュラム・ジセントラルキ(Tenacibaculum dicentrarchi);テナチバキュラム・ディスカラー(Tenacibaculum discolor)(Tenacibaculum discolour);テナチバキュラム・ガライクム(Tenacibaculum gallaicum);テナチバキュラム・マリティマム(Tenacibaculum maritimum);テナチバキュラム・ソレアエ(Tenacibaculum soleae);ウィークセラ・ビローサ(Weeksella virosa).−− フランシセラ科(Francisellaceae):− フランシセラ・ツラレンシス亜種ツラレンシス(Francisella tularensis subsp. tularensis);フランシセラ・ツラレンシス亜種ホラークティカ(Francisella tularensis subsp. holarctica);フランシセラ・ツラレンシス亜種ノビシダ(Francisella tularensis subsp. novicida);フランシセラ・フィロミラギア(Francisella philomiragia);フランシセラ・ノアツネンシス(Francisella noatunensis);フランシセラ・ノアツネンシス亜種オリエンタリス(Francisella noatunensis subsp. orientalis)(フランシセラ・アシアチカ(Francisella asiatica)とも呼ばれる).−− フソバクテリア科(Fusobacteriaceae):− フソバクテリウム・ネクロフォーラム(Fusobacterium necrophorum)、フソバクテリウム・ヌクレアタム(Fusobacterium nucleatum)、フソバクテリウム・ポリモーフム(Fuso-bacterium polymorphum)を含むフソバクテリウム(Fusobacterium)種.−− ヘリコバクター科(Helicobacteraceae):− ヘリコバクター・シナエディ(Helicobacter cinaedi);ヘリコバクター・フェネリアエ(Helicobacter fennelliae);ピロリ菌(Helicobacter pylori).−− レジオネラ科(Legionellaceae):− レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、及びレジオネラ・アニーサ(Legionella anisa);レジオネラ・バーミンガメンシス(Legionella birminghamensis);レジオネラ・ボゼマニイ(Legionella bozemanii)(Legionella bozemannii);レジオネラ・シンシナティエンシス(Legionella cincinnatiensis);レジオネラ・デュモフィイ(Legionella dumoffii);レジオネラ・フィーレイイ(Legionella feeleii);レジオネラ・ゴルマニイ(Legionella gormanii);レジオネラ・ハッケリアエ(Legionella hackeliae);レジオネラ・ジョーダニス(Legionella jordanis);レジオネラ・ランシンゲンシス(Legionella lansingensis);レジオネラ・ロングビーチアエ(Legionella longbeachae);タトロキア・マセアケルニイ(Legionella maceachernii);レジオネラ・ミクダデイ(Legionella micdadei);レジオネラ・オークリジェンシス(Legionella oakridgensis);レジオネラ・パリシエンシス(Legionella parisiensis);レジオネラ・セントヘレンシ(Legionella sainthelensi)(Legionella sainthelens);レジオネラ・ツクソネンシス(Legionella tucsonensis)(Legionella tusconensis);レジオネラ・ワズワーシイ(Legionella wadsworthii);レジオネラ・ウォルターシイ(Legionella waltersii)を含む他の種.−− レプトスピラ科(Leptospiraceae):− レプトスピラ・アレクサンデリー(Leptospira alexanderi)(レプトスピラ・アレクサンデリー血清型ヘブドマディス(Leptospira alexanderi serovar Hebdomadis)、レプトスピラ・アレクサンデリー血清型マンハオ3(Leptospira alexanderi serovar Manhao 3)を含む);レプトスピラ・アルストニ(Leptospira alstoni)(レプトスピラ・アルストニ血清型ピングチャング(Leptospira alstoni serovar Pingchang)、レプトスピラ・アルストニ血清型シクアン(Leptospira alstoni serovar Sichuan)を含む);レプトスピラ・ビフレクサ(Leptospira biflexa)(レプトスピラ・ビフレクサ血清型アンコナ(Leptospira biflexa serovar Ancona)、レプトスピラ・ビフレクサ血清型カネラ(Leptospira biflexa serovar Canela)を含む);レプトスピラ・ボルグピータセニイ(Leptospira borgpetersenii)(レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ハルジョ(Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ハルジョ−ボビス(Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ポモナ(Leptospira borgpetersenii serovar Pomona)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型タラッソビ(Leptospira borgpetersenii serovar Tarassovi)を含む);レプトスピラ・ブローミイ(Leptospira broomii)(レプトスピラ・ブローミイ(Leptospira broomii)血清型ハーストブリッジを含む);レプトスピラ・ファイネイ(Leptospira fainei)(レプトスピラ・ファイネイ血清型ハーストブリッジ(Leptospira fainei serovar Hurstbridge)を含む);レプトスピラ・イドニイ(Leptospira idonii);レプトスピラ・イナダイ(Leptospira inadai)(レプトスピラ・イナダイ血清型ライム(Leptospira inadai serovar Lyme)、レプトスピラ・イナダイ血清型マラヤ(Leptospira inadai serovar Malaya)を含む);レプトスピラ・インターロガンス(Leptospira interrogans)(レプトスピラ・インターロガンス血清型オーストラリス(Leptospira interrogans serovar Australis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型オータムナリス(Leptospira interrogans serovar Autumnalis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ブラティスラバ(Leptospira interrogans serovar Bratislava)、レプトスピラ・インターロガンス血清型カニコーラ(Leptospira interrogans serovar Canicola)、レプトスピラ・インターロガンス血清型グリポティフォーサ(Leptospira interrogans serovar Grippotyphosa)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ハルジョ(Leptospira interrogans serovar Hardjo)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ハルジョ−ボビス(Leptospira interrogans serovar Hardjo-bovis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型イクテロヘモラジア(Leptospira interrogans serovar Icterohaemorrhagiae)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ポモナ(Leptospira interrogans serovar Pomona)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ピロゲネス(Leptospira interrogans serovar Pyrogenes)、レプトスピラ・インターロガンス血清型タラッソビ(Leptospira interrogans serovar Tarassovi)を含む);レプトスピラ・カースクネリー(Leptospira kirschneri)(レプトスピラ・カースクネリー血清型ブルガリカ(Leptospira kirschneri serovar Bulgarica)、レプトスピラ・カースクネリー血清型シノプテリ(Leptospira kirschneri serovar Cynopteri)、レプトスピラ・カースクネリー血清型グリポティフォーサ(Leptospira kirschneri serovar Grippotyphosa)を含む);レプトスピラ・メチイ(Leptospira kmetyi);レプトスピラ・リセラシアエ(Leptospira licerasiae);レプトスピラ・メイエリー(Leptospira meyeri)(レプトスピラ・メイエリー血清型ソフィア(Leptospira meyeri serovar Sofia)を含む);レプトスピラ・ノグチイ(Leptospira noguchii)(レプトスピラ・ノグチイ血清型パナマ(Leptospira noguchii serovar Panama)、レプトスピラ・ノグチイ血清型ポモナ(Leptospira noguchii serovar Pomona)を含む);レプトスピラ・サンタロサイ(Leptospira santarosai);レプトスピラ・テルプストラエ(Leptospira terpstrae);レプトスピラ・バンチエリイ(Leptospira vanthielii);レプトスピラ・ウェイリイ(Leptospira weilii)(レプトスピラ・ウェイリイ血清型セレドニ(Leptospira weilii serovar Celledoni)、レプトスピラ・ウェイリイ血清型サルミン(Leptospira weilii serovar Sarmin)を含む);レプトスピラ・ウォルバキイ(Leptospira wolbachii);レプトスピラ・ウォルフィイ(Leptospira wolffii);レプトスピラ・ヤナガワエ(Leptospira yanagawae).−− レプトトリキア科(Leptotrichiaceae):− レプトトリキア・ブカリス(Leptotrichia buccalis);ストレプトバチルス・モニリフォルミス(Streptobacillus moniliformis).−− メチロバクテリウム科(Methylobacteriaceae):− メチロバクテリウム・エクストルケンス(Methylobacterium extorquens)群;メチロバクテリウム・フジサワエンス(Methylobacterium fujisawaense);メチロバクテリウム・メソフィリカム(Methylobacterium mesophilicum);メチロバクテリウム・ザトマニイ(Methylobacterium zatmanii).−− モラクセラ科(Moraxellaceae):− アシネトバクター・バウマンニイ(Acinetobacter baumannii)(ゲノム種2);アシネトバクター・バイリイ(Acinetobacter baylyi);アシネトバクター・ブーヴェティイ(Acinetobacter bouvetii);アシネトバクター・カルコアセチカス(Acinetobacter calcoaceticus)(ゲノム種1);アシネトバクター・ゲルネリ(Acinetobacter gerneri);アシネトバクター・グリモンティイ(Acinetobacter grimontii);アシネトバクター・ヘモリティカス(Acinetobacter haemolyticus)(ゲノム種4);アシネトバクター・ジョンソニイ(Acinetobacter johnsonii)(ゲノム種7);
アシネトバクター・ジュニイ(Acinetobacter junii)(ゲノム種5);アシネトバクター・ルヴォフィイ(Acinetobacter lwoffii)(Acinetobacter lwoffi)(ゲノム種8/9);アシネトバクター・パルブス(Acinetobacter parvus);アシネトバクター・レイディオレジステンス(Acinetobacter radioresistens)(ゲノム種12);アシネトバクター・シンドレリ(Acinetobacter schindleri);アシネトバクター・タンドイイ(Acinetobacter tandoii);アシネトバクター・チェルンベルギアエ(Acinetobacter tjernbergiae);アシネトバクター・タウネリ(Acinetobacter towneri);アシネトバクター・ウルシンギイ(Acinetobacter ursingii);アシネトバクター・べネチアヌス(Acinetobacter venetianus);モラクセラ・アトランタエ(Moraxella atlantae);モラクセラ・ベーブレイ(Moraxella boevrei);モラクセラ・ボービス(Moraxella bovis);モラクセラ・ボーボクリ(Moraxella bovoculi);モラクセラ・カニス(Moraxella canis);モラクセラ・カプラエ(Moraxella caprae);モラクセラ・カタラーリス(Moraxella catarrhalis);モラクセラ・カビアエ(Moraxella caviae);モラクセラ・クニクリ(Moraxella cuniculi);モラクセラ・エクイ(Moraxella equi);モラクセラ・ラクナータ(Moraxella lacunata);モラクセラ・リンカーニイ(Moraxella lincolnii);モラクセラ・マカカエ(Moraxella macacae);モラクセラ・ノンリクエファシエンス(Moraxella nonliquefaciens);モラクセラ・オブロンガ(Moraxella oblonga);モラクセラ・オスロエンシス(Moraxella osloensis);モラクセラ・オビス(Moraxella ovis);サイクロバクター・フェニルピルビカ(Moraxella phenylpyruvica);モラクセラ・プルラニマリウム(Moraxella pluranimalium);モラクセラ・ポルシ(Moraxella porci).−− モリテラセアエ(Moritellaceae):− モリテラ・アビシ(Moritella abyssi);モリテラ・ダサネンシス(Moritella dasanensis);モリテラ・ジャポニカ(Moritella japonica);モリテラ・マリナ(Moritella marina);モリテラ・プロファンダ(Moritella profunda);モリテラ・ビスコーサ(Moritella viscosa);モリテラ・ヤヤノシイ(Moritella yayanosii).−− ナイセリア科(Neisseriaceae):− クロモバクテリウム・ビオラセウム(Chromobacterium violaceum);エイケネラ・コローデンス(Eikenella corrodens);キンゲラ・デニトリフィカンス(Kingella denitrificans)、キンゲラ・キンガエ(Kingella kingae)、キンゲラ・オラリス(Kingella oralis)、キンゲラ・ポトス(Kingella potus);ナイセリア・シネレア(Neisseria cinerea);ナイセリア・エロンガータ(Neisseria elongata);ナイセリア・フラベッセンス(Neisseria flavescens);淋菌(Neisseria gonorrhoeae);ナイセリア・ラクタミカ(Neisseria lactamica);髄膜炎菌(Neisseria meningitidis);ナイセリア・ムコーサ(Neisseria mucosa);ナイセリア・ポリサッカレア(Neisseria polysaccharea);ナイセリア・シッカ(Neisseria sicca);ナイセリア・サブフラバ(Neisseria subflava);ナイセリア・ウィーバリ(Neisseria weaveri)(Neisseria weaver);ビトレオスチラ(Vitreoscilla)種.−− ニトロソモナス科(Nitrosomonadaceae):− ニトロソモナス・ユートロファ(Nitrosomonas eutropha);ニトロソモナス・ハロフィラ(Nitrosomonas halophila);ニトロソモナス・オリゴトロファ(Nitrosomonas oligotropha).−− パスツレラ科(Pasteurellaceae):− アクチノバチルス・アクチノミセテムコミタンス(Actinobacillus actinomycetemcomitans);アクチノバチルス・エクリ(Actinobacillus equuli);アクチノバチルス・リグニエレシイ(Actinobacillus lignieresii);アクチノバチルス・プルロニューモニアエ(Actinobacillus pleuropneumoniae);アクチノバチルス・セミニス(Actinobacillus seminis);アクチノバチルス・サクシノゲネス(Actinobacillus succinogenes);アクチノバチルス・ウレアエ(Actinobacillus ureae);アグレガチバクター・アクチノミセテムコミタンス(Aggregatibacter actinomycetemcomitans)、アグレガチバクター・セグニス(Aggregatibacter segnis)、アグレガチバクター・アフロフィルス(Aggregatibacter aphrophilus);アビバクテリウム・アビウム(Avibacterium avium);アビバクテリウム・エンドカルジチジス(Avibacterium endocarditidis);アビバクテリウム・ガリナルム(Avibacterium gallinarum);アビバクテリウム・パラガリナルム(Avibacterium paragallinarum);アビバクテリウム・ボランティウム(Avibacterium volantium);ビベルステイニア・トレハロシ(Bibersteinia trehalosi)(Bibersteinia trehalose);ガリバクテリウム・アナティス(Gallibacterium anatis);ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種1;ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種2;ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種3;ガリバクテリウム(Gallibacterium)群V;ガリバクテリウム・メロプシッタシ(Gallibacterium melopsittaci);ガリバクテリウム・サルピンギチジス(Gallibacterium salpingitidis);ガリバクテリウム・トレハロシフェルメンタンス(Gallibacterium trehalosifermentans);ヘモフィラス・エジプティウス(Haemophilus aegyptius);ヘモフィラス・アビウム(Haemophilus avium);ヘモフィラス・デュクレイー(Haemophilus ducreyi);ヘモフィラス・ヘモリティカス(Haemophilus haemolyticus);インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae);ヘモフィラス・パラヘモリティカス(Haemophilus parahaemolyticus);ヘモフィラス・パラインフルエンザエ(Haemophilus parainfluenzae);ヘモフィラス・パラスイス(Haemophilus parasuis);ヒストフィラス・ソムニー(Histophilus somni);マンヘイミア・カビアエ(Mannheimia caviae);マンヘイミア・グルコシダ(Mannheimia glucosida);マンヘイミア・グラニュロマティス(Mannheimia granulomatis);マンヘイミア・ヘモリティカ(Mannheimia haemolytica);マンヘイミア・ルミナリス(Mannheimia ruminalis);マンヘイミア・バリゲナ(Mannheimia varigena);ニコレテラ・セモリナ(Nicoletella semolina);パスツレラ・エロゲネス(Pasteurella aerogenes);パスツレラ・ベッティアエ(Pasteurella bettyae);パスツレラ・カバリイ(Pasteurella caballi);パスツレラ・カニス(Pasteurella canis);パスツレラ・ダグマティス(Pasteurella dagmatis);パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)(亜種ムルトシダ(multocida)、セプティカム(septicum)、ガリシダ(gallicida));パスツレラ・ニューモトロピカ(Pasteurella pneumotropica);パスツレラ・ストマティス(Pasteurella stomatis);パスツレラ・トレハロシ(Pasteurella trehalosi).−− ピシリケッチア科(Piscirickettsiaceae):− ピシリケッチア・サルモニス(Piscirickettsia salmonis).−− プレシオモナダセアエ(Plesiomonadaceae):− プレシオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides).−− ポリアンギウム科(Polyangiaceae):− ソランギウム・セルロスム(Sorangium cellulosum).−− ポルフィロモナス科(Porphyromonadaceae):− ディスゴノモナス・カプノサイトファゴイデス(Dysgonomonas capnocytophagoides);ディスゴノモナス・ガデイ(Dysgonomonas gadei);ディスゴノモナス・ホフスタジイ(Dysgonomonas hofstadii);ディスゴノモナス・モッシイ(Dysgonomonas mossii);ディスゴノモナス・オリザルビ(Dysgonomonas oryzarvi);ディスゴノモナス・ウィンペンニイ(Dysgonomonas wimpennyi);ポルフィロモナス・ジンジバリス(Porphyromonas gingivalis).−− プレボテラ科(Prevotellaceae):− プレボテラ・インターメディア(Prevotella intermedia)、プレボテラ・メラニノジェニカ(Prevotella melaninogenica)を含むプレボテラ(Prevotella)種.−− シュードモナス科:− クリセオモナス・ルテオラ(Chryseomonas luteola);緑膿菌;シュードモナス・ルテオラ(Pseudomonas luteola);シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens);シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida);シュードモナス・スタッツェリ(Pseudomonas stutzeri);シュードモナス・オリジハビタンス(Pseudomonas oryzihabitans).−− リゾビウム科(Rhizobiaceae):− アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens);リゾビウム・ラジオバクター(Rhizobium radiobacter).−− リケッチア科(Rickettsiaceae):− オリエンティア・クト(Orientia chuto);オリエンティア・ツツガムシ(Orientia tsutsugamushi);リケッチア・アエスクリマンニイ(Rickettsia aeschlimannii);リケッチア・アフリカーエ(Rickettsia africae);リケッチア・アカリ(Rickettsia akari);リケッチア・アルガシイ(Rickettsia argasii);リケッチア・アシアティカ(Rickettsia asiatica);リケッチア・オーストラリス(Rickettsia australis);リケッチア・ベリイ(Rickettsia bellii);リケッチア・カナデンシス(Rickettsia canadensis);リケッチア・コノーリイ(Rickettsia conorii);リケッチア・コオレイ(Rickettsia cooleyi);リケッチア・フェリス(Rickettsia felis);リケッチア・ヘイロンジャンゲンシス(Rickettsia heilongjiangensis);リケッチア・ヘルベティカ(Rickettsia helvetica);リケッチア・ホネイ(Rickettsia honei);リケッチア・ホオグストラアリイ(Rickettsia hoogstraalii);リケッチア・フリネンシス(Rickettsia hulinensis);リケッチア・フリニイ(Rickettsia hulinii);リケッチア・ジャポニカ(Rickettsia japonica);リケッチア・マルミオニイ(Rickettsia marmionii);リケッチア・マルチネト(Rickettsia martinet);リケッチア・マッシリアーエ(Rickettsia massiliae);リケッチア・モナセンシス(Rickettsia monacensis);リケッチア・モンタネンシス(Rickettsia montanensis);リケッチア・モンテイロイ(Rickettsia monteiroi);
リケッチア・モレリ(Rickettsia moreli);リケッチア・パルケリー(Rickettsia parkeri);リケッチア・ピーコッキイ(Rickettsia peacockii);リケッチア・フィリピイ(Rickettsia philipii);発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii);リケッチア・ラオウルチイ(Rickettsia raoultii);リケッチア・リピセプハリー(Rickettsia rhipicephali);リケッチア・リケッチイ(Rickettsia rickettsii);リケッチア・シビリカ(Rickettsia sibirica)亜群;リケッチア・スロバカ(Rickettsia slovaca);リケッチア・タムラエ(Rickettsia tamurae);リケッチア・ティフィー(Rickettsia typhi).−− シュワネラ科(Shewanellaceae):− シュワネラ・プトレファシエンス(Shewanella putrefaciens).−− スフィンゴモナス科(Sphingomonadaceae):− スフィンゴバクテリウム・マルチボラム(Sphingobacterium multivorum);スフィンゴバクテリウム・スピリティボラム(Sphingobacterium spiritivorum);スフィンゴモナス・パウシモビリス(Sphingomonas paucimobilis).−− スピリルム科(Spirillaceae):− スピリルム・ミヌス(Spirillum minus);スピリルム・ボルタンス(Spirillum volutans);スピリルム・ウィノグラドスキイ(Spirillum winogradskyi).−− スピロヘータ科(Spirochaetaceae):− ボレリア・アフゼリイ(Borrelia afzelii);ボレリア・アンセリナ(Borrelia anserina);ボレリア・ビセッティ(Borrelia bissettii);ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi);ボレリア・コリアセアエ(Borrelia coriaceae);ボレリア・デュトニイ(Borrelia duttonii);ボレリア・ガリニイ(Borrelia garinii);ボレリア・ハームシイ(Borrelia hermsii);ボレリア・ヒスパニカ(Borrelia hispanica);ボレリア・ジャポニカ(Borrelia japonica);ボレリア・ロネスタリ(Borrelia lonestari);ボレリア・ルシタニアエ(Borrelia lusitaniae);ボレリア・ミヤモトイ(Borrelia miyamotoi);ボレリア・パルケリ(Borrelia parkeri);ボレリア・ペルシカ(Borrelia persica);ボレリア・レカレンティス(Borrelia recurrentis);ボレリア・スピエルマニイ(Borrelia spielmanii);ボレリア・ツリカタエ(Borrelia turicatae);ボレリア・ツリカタエ;ボレリア・バレイシアナ(Borrelia valaisiana);トレポネーマ・カラテウム(Treponema carateum);トレポネーマ・パリダム種エンデミカム(Treponema pallidum ssp. endemicum);トレポネーマ・パリダム種パリダム(Treponema pallidum ssp. pallidum);トレポネーマ・パリダム種ペルテヌエ(Treponema pallidum ssp. pertenue).−− サクシニビブリオ科(Succinivibrionaceae):− アナエロビオスピリルム(Anaerobiospirillum)種.−− ステレラ科(Sutterellaceae):− ステレラ・ワーズワーシア(Sutterella wadsworthia)を含むステレラ(Sutterella)種.−− テルムス科(Thermaceae):− メイオサーマス(Meiothermus)種.−− サーモトガ科(Thermotogaceae):− サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana).−− ヴェイヨネラ科(Veillonellaceae):− ディアリスター(Dialister)種;メガモナス(Megamonas)種;メガスファエラ(Megasphaera)種;ペクチナータス(Pectinatus)種;ペロシヌス(Pelosinus)種;プロピオニスポラ(Propionispora)種;スポロミュサ(Sporomusa)種;ベイロネラ(Veillonella)種;ザイモフィラス(Zymophilus)種.−− ビブリオ科(Vibrionaceae):− フォトバクテリウム・ダムセラエ(Photobacterium damselae);ビブリオ・アダプタツス(Vibrio adaptatus);ビブリオ・アルギノリティカス(Vibrio alginolyticus);ビブリオ・アザシイ(Vibrio azasii);ビブリオ・キャンプベリイ(Vibrio campbellii);コレラ菌(Vibrio cholera);ビブリオ・ダムセラエ(Vibrio damselae)(Vibrio damsel);ビブリオ・フルビアリス(Vibrio fluvialis);ビブリオ・ファーニシイ(Vibrio furnisii);グリモンチア・ホリザエ(Vibrio hollisae);ビブリオ・メチニコフィイ(Vibrio metschnikovii);ビブリオ・ミミカス(Vibrio mimicus);ビブリオ・パラヘモリティカス(Vibrio parahaemolyticus);ビブリオ・バルニフィカス(Vibrio vulnificus).−− ボルバキア科(Wolbachieae):− ボルバキア(Wolbachia)種.−− キサントモナス科(Xanthomonadaceae):− ルテイモナス・アエスツアリイ(Luteimonas aestuarii);ルテイモナス・アクアティカ(Luteimonas aquatica);ルテイモナス・コンポスチ(Luteimonas composti);ルテイモナス・ルティマリス(Luteimonas lutimaris);ルテイモナス・マリナ(Luteimonas marina);ルテイモナス・メフィティス(Luteimonas mephitis);ルテイモナス・バドサ(Luteimonas vadosa);シュードキサントモナス・ブレーグベルネンシス(Pseudoxanthomonas broegbernensis);シュードキサントモナス・ジャポネンシス(Pseudoxanthomonas japonensis);ステノトロホモナス・マルトフィリア(Stenotrophomonas maltophilia);並びにステノトロホモナス・ニトリティレデュセンス(Stenotrophomonas nitritireducens)
本発明を詳細に記載する前に、本発明は、特定の例示した方法又は本明細書に開示の組成物に限定されないことが理解されるべきである。本明細書で使用する専門用語は、本発明の特定の実施形態を記載する目的のためだけであり、限定的であるように意図されていないことも理解されるべきである。
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)、バンコマイシン耐性腸球菌種(VRE)、及び肺炎連鎖球菌におけるNCL812の最小阻害濃度(MIC)。
細菌分離株の収集及び同定
61種の試験分離株を臨床的な診断上の微生物学実験室から調達した。MRSA分離株を、選択的ブリリアンスMRSA発色寒天(Oxoid)上で最初に培養した。疑わしいコロニーは、この寒天上のこれらのコロニー外観に基づいて選択し、黄色ブドウ球菌としての同定は、非選択的ヒツジ血液寒天上のコロニー特性、並びに表現型特性、例えば、グラム染色、カタラーゼ試験陽性、コアグラーゼ試験(ウサギ血漿を使用するチューブコアグラーゼ試験)陽性、及びクランピング因子(Oxoid Staphytectラテックス試験を用いた凝集)、フォーゲス−プロスカウアー試験陽性、及びトレハロースから酸を産生する能力などを使用して判定した。セフォキシチン耐性スクリーン陽性により、分離株をMRSAとして確認した。すべての腸球菌分離株に標準的な生化学的同定を行った。生化学的プロファイリングにより、VRE分離株の4種をエンテロコッカス・フェカリスとして、残りをエンテロコッカス・フェシウムとして暫定的に同定した。しかしながら、これは、ヒトの腸球菌株に対して100%信頼できるものではなく、同一性を100%確認するためには、API−ZYMプロファイリングを用いる完全な生化学的プロファイリングを行う。すべての肺炎連鎖球菌分離株は、標準的な生化学的プロファイリングに基づいて同定した。
1000mg/g(すなわち100%)の規定効力を有する分析グレードNCL812(バッチ20081214)を得た。粉末を、研究施設で、ロックしたフリーザ内にて−20℃の温度で保存した。原液(25.6mg/ml)のアリコート(1ml)をDMSO中で調製し、−80℃で保存し、使用直前に解凍した。
最小阻害濃度試験は、CLSI規格(CLSI2008)に従って行った。90μLの試験化合物溶液の1種又はアンピシリンを、各ウェルにCAMHBを90μL含有した96ウェルプレートの最端列に添加した。次いで、当該溶液を行に亘って順次希釈し、ポジティブ及びネガティブコントロール用に2列を残した。羊血液寒天(SBA)の一晩培養物から得た新鮮なコロニーを、9.1g/L生理食塩水に添加することにより、細菌懸濁物を調製した。この懸濁物は、4×108〜5×108CFU/mLの濃度に調整した。該懸濁物の濃度は、分光光度計を600nmの波長で用いて光学密度(OD)を測定することにより求め、補正濃度(correct concentration)として、1.00〜1.20の光学密度を有することが求められた。該懸濁物1mLを生理食塩水9mLに添加した後、ネガティブコントロールウェルを除く全てのウェルにこれを10μL添加し、各ウェルにおける最終濃度を4×105〜5×105CFU/mLとした。次いで、試験物を37℃で24時間インキュベートし、目視と、波長600nmでのマイクロプレートリーダによるOD測定値とで評価した。これらの試験は2連で行ったが、矛盾が観察された場合には、繰り返し行った。
結果
黄色ブドウ球菌巨大分子合成に対するNCL812の効果
試験化合物
試験化合物NCL812を周囲温度の条件下で実験施設に輸送し、次いでアッセイするまで2〜8℃で保存した。原液は、NCL812乾燥粉末を100% DMSO中で6,400μg/mlの濃度に溶解させることによって作製した。
MICアッセイ法は、臨床検査標準協会によって記載された手順、又はCLSI(Clinical and Laboratory Standards Institute. Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically;Approved Standard−8版.、CLSI文献M07−A8[ISBN 1−56238−689−1].、Clinical and Laboratory Standards Institute、940 West Valley Road、Suite 1400、Wayne、Pennsylvania 19087−19898 USA、2009)に従い、自動液体ハンドラーを使用して連続希釈及び液体移動を行った。MICアッセイに使用した培地は、ミューラーヒントンIIブロス(MHB II− Becton Dickinson、Sparks、MD;カタログ番号212322;ロット9044411)であった。黄色ブドウ球菌ATCC29213は、品質管理株として機能を果たし、リネゾリドを、アッセイをバリデートするための品質管理抗生物質として利用した。NCL812及びリネゾリドはともに、100% DMSO中に溶解させた後、成長培地に添加した。
細菌及び増殖条件
全細胞DNA、RNA、細胞壁、タンパク質、及び脂質合成に対するNCL812の効果を、黄色ブドウ球菌ATCC29213を使用して調査した。細胞をトリプチカーゼダイズ寒天上で35℃にて一晩増殖させた。プレートからのコロニーを使用して、ミューラーヒントンブロスII(MHBII)10mlに接種し、シェーカー内で35℃及び200rpmでインキュベートしながら初期指数増殖期(OD600=0.2〜0.3)まで培養物を増殖させた。
細胞が初期指数期に到達したとき、培養液100μLを、100% DMSO中の様々な濃度の試験化合物又は20×最終濃度の対照抗生物質(5μL)を含有する三つ組のウェルに添加した。5% DMSO処置培養液は、すべての実験の「薬物無し」対照として機能を果たした。各反応に添加される薬物のボリュームを構成するために105%でMHBII中に、又はタンパク質合成反応についてM9最少培地中に細胞を添加した。室温で15分インキュベートした後、[3H]チミジン(DNA合成)、[3H]ウリジン(RNA合成)、又は[3H]ロイシン(タンパク質合成)を、実験に応じて1反応当たり0.5〜1.0μCiで添加した。反応を室温で15〜30分間進行させ、次いで冷5%トリクロロ酢酸(TCA)又は5% TCA/2%カザミノ酸(タンパク質合成のみ)12μLを添加することによって停止した。反応物を氷上で30分間インキュベートし、TCAで沈澱した材料を25mm GF/Aフィルターで収集した。冷5% TCA 5mlで3回洗浄した後、100%エタノール5mLで2回フィルターをすすぎ、乾燥させ、次いでBeckman LS3801液体シンチレーションカウンターを使用して計数した。
初期指数増殖期における細菌細胞をM9最少培地に移し、上述したように100% DMSO中の様々な濃度の試験化合物又は20×最終濃度の対照抗生物質(5μL)を含有する1.5mLエッペンドルフチューブ(100μL/チューブ)に添加した。37℃で5分インキュベートした後、[14C]N−アセチルグルコサミン(0.4μCi/反応)を各チューブに添加し、37℃の加熱ブロック中で45分間インキュベートした。各チューブに8%SDS 100μLを添加することによって反応を停止した。次いで反応物を加熱ブロック中で95℃にて30分間加熱し、冷却し、短時間遠心分離し、プレウェットHAフィルター(0.45μM)上にスポットした。0.1% SDS 5mLで3回洗浄した後、脱イオン水5mlで2回フィルターをすすぎ、乾燥させ、次いでBeckman LS3801液体シンチレーションカウンターを使用して計数した。
細菌細胞をMHBIIブロス中で初期指数増殖期まで増殖させ、上述したように様々な濃度の試験化合物又は対照抗生物質を含有する1.5mLエッペンドルフチューブに(三つ組で)添加した。室温で5分インキュベートした後、[3H]グリセロールを1反応当たり0.5μCiで添加した。
感受性試験を、NCL812及び黄色ブドウ球菌ATCC29213を用いて行って、巨大分子合成アッセイで必要とされる薬物の濃度を判定した。
黄色ブドウ球菌からのATP放出に対するNCL812の効果
試験化合物
試験化合物NCL812を周囲温度の条件下で出荷し、次いでアッセイするまで2〜8℃で保存した。原液は、NCL812乾燥粉末を100% DMSO中で1,600μg/mlの濃度に溶解させることによって作製した。比較ための剤は、ポリミキシンB(Sigma P−4932(Lot 044K1 1905))とした。
黄色ブドウ球菌ATCC29213は、アメリカンタイプカルチャーコレクション(Manassas、VA)から最初に取得した。
ATP放出アッセイ
NCL812のMICは、4μg/mlであると以前に判定されていた。ATP放出アッセイは、黄色ブドウ球菌を指数期まで増殖させ、次いで用量依存的応答を検出する目的で、MICの倍数で抗生物質を添加することによって行った。
メチシリン耐性及びメチシリン感受性黄色ブドウ球菌に対するNCL812のin vitro抗菌活性
抗微生物剤
NCL812の原液(25.6mg/mL)のアリコートをジメチルスルホキシド中で調製し、−80℃で保存し、使用直前に解凍した。アンピシリンストックは、Sigma−Aldrich(オーストラリア)から得た。抗微生物薬ディスクは、Thermo Fisher Scientific(オーストラリア)から得た。
MRSAの29臨床分離株(図13)を、黄色ブドウ球菌対照生物ATCC49775とともに得た。分離株の同定は、スライドコアグラーゼ試験、フォーゲス−プロスカウエル試験、ポリミキシンB感度(300ユニット)、及びStaphytect Plus Protein Aラテックススライド凝集(Thermo Fisher Scientific Australia)を含む慣例的な表現型方法によって確認した。細菌を40%グリセロールブロス中で−80℃にて保存し、37℃でインキュベートしたヒツジ血液寒天(SBA)上でストックからルーチン的に増殖させた。後続の実験では、24時間未満の新鮮な培養液のみを使用した。
分離株収集物の抗生物質感受性プロファイリングは、ミューラー−ヒントン寒天上で臨床検査標準協会(CLSI)によって推奨されたように、カービー・バウアーディスク拡散を使用して行った。分離株を37℃にてSBA上で一晩増殖させた。コロニーを生理食塩水中に懸濁させた。濁度を0.5 McFarland標準に調整し、懸濁液を培地にわたって散在させた。抗生物質ディスクを、接種した培地上に移し、37℃で24時間インキュベートした後に分析した。カービー−バウアー試験に基づいてβ−ラクタム耐性でなかったMRSAと標識された分離株を、5μg/ml アンピシリンを添加したプレートカウント寒天上でストックから増殖させ、繰り返し試験に付した。理由は、ペニシリン結合タンパク質2a発現は、β−ラクタム抗微生物薬への曝露によって誘導され得るためである。
分離株同一性を、spa(プロテインA)及びmecA(メチシリン耐性)遺伝子を標的にする、新規なデュプレックス従来のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)試験を使用して遺伝子型で確認した。更に、分離株を、mecA及びspa SybrグリーンリアルタイムPCRにおいて試験した。それぞれの一晩細菌継代培養のおよそ10のコロニーを1×リン酸緩衝溶液(pH7.4)中に懸濁させ、ボルテックスした。分離株を、製造者のプロトコールに従って、QIAamp(登録商標)DNA Mini Kit(Qiagen、オーストラリア)を使用してDNA抽出に付した。鋳型DNAを溶出緩衝液50μL中に溶出し、PCRにおいて直接使用し、又は20℃で保存した後、spa順方向(5’−TGATACAGTAAATGACATTG−3’)及び逆方向(5’−TTCTTATCAACAACAAGTTC−3’)プライマー、並びにmecA順方向(5’−TTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGG−3’)及び逆方向(5’−ATGAAGTGGTAAATGGTAATATCG−3’)プライマー(Invitrogen、オーストラリア)を使用してDNAを増幅させた。慣例的なPCR増幅を、HotStarTaq Plus Master Mix(Qiagen、オーストラリア)10μL、0.5μMの各spaプライマー、0.2μMの各mecAプライマー、及び抽出されたDNA 3μLを含有する20μLのボリュームで実施した。自動サーマルサイクラー(T100サーマルサイクラー、Bio−Rad)を、spa及びmecA遺伝子のPCR増幅のために使用した。
NCL812及び陽性対照としてのアンピシリンのin vitro活性を、陽イオン調整ミューラー−ヒントンIIブロス中で、CLSIによって推奨されたブロス微量希釈によって判定した。2倍希釈の各抗微生物剤を含有するマイクロタイタープレートに、最終ボリューム100μl中の約105CFU/mlの各分離株を接種した。プレートを37℃で24時間インキュベートした。濁度(OD600の吸光度)を、Microplate Manager(登録商標)バージョン5.2.1(Bio−Rad)中のBio−Rad Benchmark Plusマイクロプレート分光光度計を使用して測定した。最小阻害濃度(MIC)エンドポイントを、細菌増殖を阻害した、分光光度計によって評価される最小抗微生物薬濃度として定義した。CLSIによって定義されたブレイクポイントを使用して対照生物としてATCC49775を分離株収集物中に含めた。MIC50、MIC90(それぞれ全生物の下位50%及び90%の増殖を阻害した濃度)、並びにMIC範囲(最小及び最大)を計算して、分離株収集物の抗微生物薬感受性をプロファイリングした。
NCL812の殺菌活性を、CLSIガイドラインを使用して最小殺菌濃度(MBC)の判定及びタイム−キル分析によって確立した。MBCを、元の種菌の99.95%が排除される最小薬物濃度として定義した。
微生物学的データを、CLSIガイドラインを使用して解釈した。スチューデントt−検定、フィッシャーの直接確率検定、分散分析、及び適切な場合、対象間効果の試験についての一般化線形モデルを使用してデータを検査した。差異は、IBM SPSS(登録商標)バージョン19.0(アデレード大学)において0.05レベルで有意であると見なした。
黄色ブドウ球菌同一性及びmecA状態の確認
ラテックス凝集試験により、30種すべての分離株がプロテインA陽性であることが確認された。分離株は、スライド凝集を使用してコアグラーゼ活性について陽性と試験された。フォーゲス−プロスカウエル及びポリミキシンB耐性試験により、1種のメチシリン感受性分離株;MSSA DE−25を除いて、すべての分離株が黄色ブドウ球菌であることが確認された(図14)。spa遺伝子PCR増幅に基づいて、この分離株は、プロテインAラテックス凝集及びスライドコアグラーゼ試験において陽性の試験にもかかわらず、黄色ブドウ球菌分離株として同定されなかった。このイヌ起源ブドウ球菌種は、生化学的特性に基づいてスタフィロコッカス・シュードインターメディウスと同定された。mecAの慣例的及びリアルタイムPCRの結果により、分離株の66.66%が、mecA遺伝子を持つことに基づいてメチシリン耐性を有すると分類されることが確認された。mecA遺伝子を検出するための慣例的PCRとリアルタイムPCRの能力の間に有意な差異はなかった(P>0.05)。
抗微生物薬感受性アッセイにより、HA−MRSA分離株は、複数の抗微生物薬クラスに対する耐性の最高平均普及率を有することが明らかになった(P<0.000)。CA−MRSA分離株は、2番目に耐性であり(P<0.007)、その後にメチシリン感受性ブドウ球菌(staphylococci)が続いた(P<0.037)(図15)。オキサシリン耐性は、それぞれHA−MRSA及びCA−MRSA分離株の80.00%及び10.00%においてのみ発現された。セフォテタン耐性は、それぞれHA−MRSA及びCA−MRSA分離株の80.00%及び20.00%において発現された。オキサシリン及びセフォテタンは、MRSAを検出するその能力において有意に異ならなかったが(P>0.05)、検出は、ディスク拡散と比較した場合にmecA PCRを使用すると有意に改善された(P<0.013)。HA−MRSA分離株の大部分は、アモキシシリン−クラブラン酸、セフォテタン、セファレキシン、クリンダマイシン、エリスロマイシン、オキサシリン、及びペニシリン−Gに対して耐性を発現した一方、CA−MRSA分離株の大部分は、クリンダマイシン、エリスロマイシン、及びペニシリン−Gのみに対して耐性であった。試験した分離株のいずれもバンコマイシン耐性でなかった。全体的に、最も普及している耐性表現型は、ペニシリン−G(83.33%)、エリスロマイシン(73.33%)、及びクリンダマイシン(43.33%)であった一方、わずか1種の分離株(3.33%)がトリメトプリム−スルファメトキサゾール及びリファンピシンに対して耐性であった。
mec遺伝子複合体Aに属するすべてのMRSA分離株は、オキサシリン及びセフォテタンの両方に対して耐性を発現した(図16)。しかし、mec遺伝子複合体B MRSA分離株の20%のみが、これらの抗微生物薬に対して表現型的に耐性であった。mec遺伝子複合体C2に属するMRSA分離株のうち、わずか1種の分離株がオキサシリンに対してメチシリン耐性を発現し、わずか2種の分離株がセフォテタンに対して耐性を発現した。分類されていないMRSA分離株は、オキサシリン及びセフォテタンに対して完全な耐性を発現した。
NCL812の初期試験から、DMSOに可溶であるが、陽イオン調整ミューラー−ヒントンIIブロス中に溶解させたとき、濁った溶液が生成した(CAMHB)(図18)。初期試験において、NCL812は、一貫したMIC値を有することが判明した(図18)。
化合物NCL812のMIC50及びMIC90値(4及び4〜8μg/ml)を図19に示す。MIC値は、黄色ブドウ球菌の分類(感受性、HA−又はCA−MRSA)によって異なった(P<0.005)。多くの場合では、NCL812は、HA−MRSAと比較したとき、CA−MRSA及びメチシリン感受性ブドウ球菌(staphylococci)に対する活性を1希釈有意に増大させた(それぞれP<0.002及びP<0.020)が、メチシリン感受性ブドウ球菌(staphylococci)及びCA−MRSAのMIC値間で有意な差異はなかった(P>0.05)。アンピシリンのMIC値は、CLSIガイドラインに基づいて予期される正常範囲内であった。
NCL812から判定されたMBCは、それぞれ黄色ブドウ球菌分離株の93.33%及び83.33%についてのMICと等価であった(図19)。すべての残りの場合では、MBCは、1希釈高かった。NCL812について、MBCは、それぞれ2〜8μg/ml及び4〜16μg/mlの範囲であった。
ATCC49775の比濁増殖曲線と比較すると、微量希釈アッセイにおいて、1×及び4×MICでNCL812を添加した陽イオン調整ミューラーヒントンIIブロス中にATCC49775を接種したとき、目に見える細菌増殖は観察されなかった(それぞれP<0.033及びP<0.038)(図20)。
肺炎連鎖球菌の新しい抗微生物剤のin vitro薬力学。
肺炎球菌の抗微生物薬感受性
肺炎球菌株及び増殖条件
8種の特徴付けられた実験室株及び12種の臨床分離株を含んだ20種の肺炎球菌分離株を得た。
NCL812は、Neoculiにより乾燥粉末形態で提供された。合計256mgを100% ジメチルスルホキシド(DMSO) 10ml中に分注して25.6mg/mLのストックを作製し、次いでこれをCAHMB中で1:100に希釈して256μg/mlの最終ワーキングストックを作製した。アンピシリン乾燥粉末は、Sigma A0166からのものであった。元の25.6mg/mlストックを生理食塩水中で1:100、1:4、1:20に希釈し、最後にCAMHB中で1:16に希釈して0.18μg/mlの最終ワーキングストックを作製した。エリスロマイシンは、Sigma E077から得、塩化コリンは、Roche Diagnosticsから得た。0.05μg/mlエリスロマイシン20マイクロリットルをCAMHB 4.980ml中で1:25に希釈して0.2μg/mlの最終ワーキングストックを得た。特異的死滅動態アッセイのために塩化コリン(0.5%)を4% LHB:CAMHBに添加した。
12種の異なる抗微生物薬(図22)に対する分離株の感受性を、CLSI及び抗菌薬感受性試験に関する欧州委員会(EUCAST)の方法によって判定した。抗微生物薬は、CLSI及びEUCASTのガイドラインに基づいて選択した。肺炎連鎖球菌に対するシプロフロキサシン以外の抗微生物薬についてのゾーン直径は、CLSI標準によって判定し、肺炎連鎖球菌に対するシプロフロキサシン抗微生物薬感受性についてのゾーン直径は、EUCASTによって判定した。
表2に列挙したすべての分離株のNCL812のMICを、5% CO2中で37℃にて24時間インキュベートした後、96ウェルマイクロタイタートレイを使用して、細菌増殖の指標として600nmにおける光学密度(OD600nm)(Spectramax分光光度計、Molecular Devices Corporation)を測定することによって判定した。[マイクロブロス希釈液及び96ウェルトレイを、以下の方法によって準備する:4% LHB:CAMHB 90μLを、多チャンネルピペットを使用してすべてのウェル中にアリコートする。ワーキング抗微生物薬ストック90μLは、1:2希釈によってトレイに連続希釈しなかった。陰性ブロス対照及び希釈液対照を、96ウェルトレイのセットアップを計画するとき考慮に入れた。]次いで細菌懸濁液10μLを96ウェルトレイ中の適切なウェルに添加した。適切な陽性(抗微生物薬無し)、陰性(抗微生物薬又は細菌無し)、及び陰性希釈液(抗微生物薬及びブロスの連続希釈液対照)対照を各アッセイに含めた。死滅動態アッセイのMBC及びプレートカウントを、HBA上に96ウェルマイクロタイタートレイの各ウェルから20μLをアリコートし、5% CO2とともに37℃でインキュベートすることによって判定した。MBCは、希釈係数を考慮に入れて、肺炎連鎖球菌の99.95%阻害によって判定した。MIC及びMBCは、四つ組で判定し、最頻値を代表値として採用した。MIC50、MIC90、及びMIC範囲、並びにMBC50、MBC90、及びMBC範囲は、CLSI標準によって判定した。MIC50及びMIC90又はMBC50及びMBC90は、分離株のすべてのMIC及びMBCが最小から最高まで配列されるとき、それぞれ、分離株の合計量の50及び90パーセンタイルを阻害した最小濃度によって定義される。
細菌懸濁液を、128μg/mLの出発濃度を有するNCL812を含有する96ウェルマクロタイタートレイに三つ組で添加し、0.25μg/mLの濃度まで順次1:2で連続希釈した。陰性希釈液対照を中央値の増殖値から減じることによって、全体的な細菌生産の適当な指標を得た。96ウェルトレイを5% CO2中で37℃にてインキュベートし、OD600を、最初の12時間にわたって2時間毎に読み取り、その後、600nmで24及び48時間において最終的な読み取りを行った。このデータを更に補充するために、96ウェルトレイが14時間にわたって分光光度計(Spectramax分光光度計、Molecular Devices Corporation)を使用して30分間隔毎に自動的に読み取られた別個の実験を実施して、元のマイクロブロス希釈試験から観察された増殖曲線の傾向を確認した。
MBC死滅動態アッセイでは、3つの96ウェルマイクロタイタートレイを準備した。特定の時点で、これらのトレイから得たアリコートを、HBA上で、5% CO2中で37℃にてインキュベートした後に生菌数計測を行い、MBCを、増殖させて24時間後に判定した。
細菌懸濁液及びワーキング抗生物質ストックを上述したように調製した。[マクロブロス希釈液を調製するために、20mlチューブにそれぞれ、4% LHB:CAMHB 9mlを満たした。ワーキング抗微生物薬ストック9mlを、チューブの1つに添加したとき、1:2に希釈し、次いで高濃度から低濃度の抗微生物薬まで連続希釈した。肺炎連鎖球菌細菌懸濁液1mlを、陽性対照を含む適切なチューブに添加した。最初の12時間にわたって10分毎にNCL812で処置したチューブを穏やかに手動で傾けながら、5% CO2とともに37℃でチューブをインキュベートした。増殖の最初の12時間の間の2〜3時間毎に、次いで24時間及び48時間に、各細菌懸濁液50μLをHBA上に広げて蒔き、5% CO2とともに37℃で16〜24時間インキュベートした。]
マクロブロス希釈液を上述したように調製した。株D39のブロス培養液(10ml)を、2μg/ml及び4μg/mlのNCL812、並びに0.022μg/mlのアンピシリンの存在下で、5% CO2中で37℃にて6時間インキュベートした。試料を、101.45×gの相対遠心力(RCF)で10分間遠心分離し、リン酸緩衝溶液(PBS)50mlで2回洗浄して、いずれの残留抗微生物薬、並びに/又は細菌最終産物及び培地も除去した。洗浄した細菌を再懸濁させ、MICを実施した。
D39細胞膜超微細構造に対するNCL812の効果
細胞膜の形態学的外観及び形態計測分析を、透過型電子顕微鏡法(TEM)を使用して判定した。細菌懸濁液、及びD39の培養液10mlを以前のように調製した。10分毎に培養液を穏やかに手動で傾けながら、5% CO2中で37℃にて試料をインキュベートした。培養液を1μg/ml、4μg/ml、又は16μg/mlのNCL812に曝露し、101.45×gで20分間遠心分離することによって6又は12時間で回収し、PBS 50mlで2回洗浄した。TEM作業の決定的な時点は、死滅動態試験から作成された増殖曲線中の傾向を分析することによって判定した。試料を、20%グリセロールを含有するPBS中に再懸濁させ、必要になるまで−80℃で保存した。固定する前に、遠心分離し、PBS 50mlで3回氷上にて洗浄することによって20%グリセロールを除去した。
統計分析は、Windows(登録商標)用統計プログラムGraphPad Prism(5版、GraphPad Software Inc.)を使用して行った。増殖曲線については、提示したデータは、マクロブロス希釈試験を除いて各データ点について、平均及び平均の標準誤差(SEM)(エラーバーとして表した)であった。マクロブロス希釈試験では、このアッセイに伴う高コストに起因して複数のレプリケートを得ることができなかった。両側の対応のないt−検定を実施した。
肺炎連鎖球菌におけるNCL812の薬力学
20種の肺炎連鎖球菌分離株の品質管理ディスク拡散分析
ディスク拡散分析に使用した12種の抗微生物薬のうち9種は、EUCASTによって確立されたQC範囲を有していたが、QC範囲は、アモキシシリン−クラブラネート、クラリスロマイシン、及びクリンダマイシンについて定義されなかった(表3)。
NCL812を100%DMSOには溶解した(brought)が、CAMHB又はPBSに更に希釈すると、濁りを生じた。
NCL812のMIC50、MIC90、MIC範囲の判定
20種類すべての株について試験したところ、NCL812は、8μg/mlのMIC50及びMIC90、並びに4〜8μg/mlのMIC範囲を呈した。アンピシリンのMICは、肺炎球菌分離株における抗微生物薬耐性のエンドポイントとしてマイクロブロス希釈を使用して最近公開された知見と同等であり、したがって、NCL812について得られたMICの正確さが確認された。
サブ阻害濃度(2μg/ml以下)のNCL812に曝露されたD39は、48時間の期間にわたって、曝露されていない対照と同様に増殖した(図24)。より高い濃度のNCL812(16μg/ml以上)は、48時間にわたって細菌増殖をもたらさなかった(図24)。これらの増殖特性は、Spectramax分光光度計を使用するマイクロブロス死滅動態試験によってバリデートされた。この試験では、NCL812及びアンピシリンについて、14時間にわたって30分間隔で増殖を測定した(OD600として表した)(図25及び26)。NCL812で処置されたD39についての指数関数的増殖の開始を図27に示す。
4μg/ml以下のNCL812で処置したD39は、4つの独立した実験で示されたように、6時間で増殖の対数期に入った(図24)。5から6時間の間のNLC812に対する抗微生物薬耐性の可能性を、2μg/mlのNCL812、4μg/mlのNCL812、及び0.0225μg/mlのアンピシリンに6時間曝露したD39に対してMICを更に判定することによって調査した。結果は、増殖対照、及びアンピシリンと比較して、NCL812に曝露されたD39のすべての試料についてMICの有意な増大を示さなかった。
**D39増殖2対照:生理食塩水中に再懸濁させ(0.1 OD600)、滅菌生理食塩水中で1/20に希釈したHBA O/N上の肺炎連鎖球菌株D39。
NCL812及び対照抗微生物薬アンピシリン及びエリスロマイシン(図32及び33)について48時間インキュベートしたブロス希釈アッセイを使用することから特定の時間間隔で相対MBCを判定した。D39についてのアンピシリン(0.023μg/ml)及びエリスロマイシン(0.00275μg/ml)のMICは、他の肺炎連鎖球菌分離株の公開された知見と同様の範囲であった。NCL812、アンピシリン及びエリスロマイシンの増殖の比較による差を観察した(図32及び33)。アンピシリン及びエリスロマイシンは、細菌の時間依存性低減を実証した。NCL812は、速い殺菌作用を呈し、5時間以内のMBCのおおよそ3分の1の減少によって立証された。NCL812について一貫した殺菌濃度(8μg/ml)が全48時間にわたって維持された。
各時点の生菌数を、NCL812(図34)及びアンピシリン(図35)について、log10CFU/mlの低減として表した。一貫したコンフルエントな増殖(2×104CFUの限界によって判定された)が、曝露されていない対照及び2μg/mlのNCL812について観察された。128μg/mlのNCL812についての完全な殺菌活性(3−logのCFUの低減によって定義される)が、3時間での4−logのコロニー形成単位(CFU)の低減によって観察され、16μg/mlから64μg/mlの間の濃度のNCL812は、8時間以内に細菌増殖を排除することにおいて有効であった(図34)。4μg/ml及び8μg/mlのNCL812は、曝露して11時間後に不活化されると思われ、理由は、この時点後の株D39の増殖の増大が観察されたためである(図34)。
形態計測分析により、増殖対照と比較して、6時間にわたって16μg/mlのNCL812に曝露された株D39における細胞膜の有意な変化が明らかになった。4μg/ml及び12時間の培養で処置した試料は、各セクションで入手可能な細菌細胞の欠如に起因して形態計測分析に考慮しなかった。処置された試料は、未処置の試料と比較して(4.35±0.24nm)、有意により厚い細胞膜を持っていた(6.43±0.29nm)(p<0.0001)(図36)。16μg/mlのNCL812で処置されたD39の細胞膜周辺腔(細胞膜と細胞壁と間の細胞内空間)は、未処置の試料(3.91±0.14nm)と比較して有意に広かった(4.54±0.096nm)(p<0.001)(図37)。
オーストラリア由来のスタフィロコッカス・シュードインターメディウスのメチシリン感受性及びメチシリン耐性分離株の特徴付け、並びに新しい抗ブドウ球菌化合物の事前のin vitro有効性
メチシリン感受性スタフィロコッカス・シュードインターメディウス(MSSP)及びメチシリン耐性スタフィロコッカス・シュードインターメディウス(MRSP)の試料収集及び同定
合計23種のスタフィロコッカス・シュードインターメディウス分離株をイヌから得た(図38)。
mecA遺伝子は、MRSPの13種の分離株中に存在し、10種のMSSP中で陰性であった。すべてのMRSP分離株は、ディスク拡散(17mm以下)及びE−試験MIC(0.5mg/L以上)に基づくとオキサシリンに対して耐性であった。
グラム陰性生物に対するNCL812の活性
大腸菌ATCC25922を、寒天上37℃で一晩増殖させた。一晩培養物の2つのコロニーを用いて、陽イオン調整ミューラーヒントンブロス約20mlに植菌した。植菌したブロスを、37℃で18時間インキュベートした。一晩ブロス培養物6mlを、添加済み陽イオン調整ミューラーヒントンブロス(50mg/mlアンピシリン、0.4Mスクロース、8mM MgSO4を添加)20mlに添加し、37℃で一晩インキュベートした。スフェロプラストの形成を、位相差顕微鏡を用いて確認した。
スフェロプラスト培養物3mlを各試験管に添加し、適切な濃度のNCL812を含有するDMSO50μlを各試験管に添加した。DMSOを単独で50μl、対照試験管に添加した。スフェロプラストを24時間インキュベートし、0、2、4、6、8、及び24時間の時点でサンプルを20μl取った。20μlのサンプルを、1:10で順次希釈し、適切な希釈物の10μlサンプルを、3連でブレインハートインフュージョン培地にスポットした。ブレインハートインフュージョン培地を、37℃で48時間インキュベートし、24時間と48時間の時点でコロニーを計数して、コロニー形成単位の数を求めた。
NCL812化合物に24時間曝露後にサンプルを取り、トリパンブルーで染色し、画像化した。
99%を超えるスフェロプラスト誘発率が、一貫して観察された。NCL812の標的が、大腸菌細胞内に存在することが分かり、NCL812の濃度が32μg/ml以上になると、コロニー形成単位の有意な減少が経時で観察された(図40)。実験は、3連で繰り返し行い、1つの代表例を図40に示した。NCL812化合物に24時間曝露後に取ったスフェロプラストの画像から、NCL812濃度の上昇に伴って多形性細胞が発達頻度が高くなることが示された(データ示さず)。これらの結果は、グラム陰性細菌に対する抗菌剤としてのNCL812の有効性を示す。
NCL812の製剤
製剤A − 局部製剤 − NCL812を含むPEGベースゲル
PEG4000 4.0g;
PEG200 3.5g;
プロピレングリコール 0.6g;
水 1.9g;及び
NCL812 0.204g
製剤B − 局部製剤 − NCL812を含むPEGベースゲル
PEG4000 3.0g;
PEG8000 1.0g;
PEG200 3.0g;
プロピレングリコール 1.0g;
水 1.9g;及び
NCL812 0.202g
製剤C − 局部製剤 − NCL812−Solplusを含むPEGベースゲル
PEG4000 2.5g;
PEG200 4.0g;
プロピレングリコール 2.5g;
水 1.0g;及び
NCL812−SolPlusの固体分散系 1.8g
製剤D − 錠剤製剤
リン酸水素カルシウムデハイドレート 30mg;
微結晶性セルロース 80mg;
ラクトース 50mg;
ヒドロキシプロピルメチルセルロース 8mg
タルク 1.5mg
NCL812 10mg
製剤E − 経口懸濁液
グリセロール 2.0ml;
無水エタノール 1.5ml;
NCL812 600mg;及び
ビヒクル(Ora Sweet及びOra Plus、1:1) 60mlまで。
製剤F − 筋肉内注射剤
ポリビニルピロリドンK30(PVPK30) 20mg/ml;
NCL812 0.09mg/ml;及び
水 50ml。
製剤BからのNCL812の放出
他のクラスの抗微生物剤との相乗作用試験
チェッカーボード法(Gunicsら、2000、Int.J.Antimicrob.Agents.、14:239〜42頁)を使用して、テトラサイクリン、クロラムフェニコール、エリスロマイシン(マクロライド)、アンピシリン(β−ラクタム広域スペクトル)、ゲンタマイシン(アミノグリコシド)、シプロフロキサシン(フルオロキノロン)、スルファメトキサゾール(スルホンアミド)、又はペニシリンG(β−ラクタム狭スペクトル)と組み合わせたNCL812の相互作用(相乗作用、アンタゴニズム、効果無し)を見出した。初期の実験について、黄色ブドウ球菌T3−129の実験室株を使用したが、この株は、抗微生物薬のいくつかについて一貫性のない結果を与えたので、すべての試験した抗微生物薬に対して感受性であったMK1と命名されたブドウ球菌種の新しい株(明示的な種同定は現在進行中)を、後続の試験で使用した。
試験した抗生物質のFIC=組合せでの試験した抗生物質のMIC/抗生物質単独のMIC。
NCL812のFIC=組合せでのNCL812のMIC/NCL812単独のMIC。
FICI=FIC指数=NCL812のFIC+それぞれの試験した抗生物質のFIC。
NCL812と8種の抗生物質との間のMIC、FIC、FICI、及び相互作用を表14に示す。別個のクラスの抗微生物剤を代表する8種の試験した化合物のいずれも、抗菌剤がNCL812に添加されるとき、NCL812との正の(相乗効果)又は負の(アンタゴニズム)相互作用を示さず、相加効果と一致する。
表14:NCL812と8種の抗生物質との間のMIC、FIC、FICI、及び相互作用
黄色ブドウ球菌及びエンテロコッカス・フェカリスの抗微生物薬感受性分離株に対するNCL812の効果
株情報
2種の黄色ブドウ球菌分離株:黄色ブドウ球菌MK01ヒト皮膚株及び黄色ブドウ球菌KC01ウマ皮膚株を以下の実験で使用した。これらの分離株を、Remel Staphaurex市販キットを含むグラム染色及び生化学的方法によって同定した。1種のエンテロコッカス・フェカリス分離株(USA01)は、VRE株と同定されなかった。この分離株は、以前に種分化していたので、血液寒天上の純粋な特徴的な増殖の観察を除いて更なる試験に付さなかった。
最小殺菌濃度(MBC)の調査
以前の実験と同様に、MICから開始する各ウェルの内容物10μLをコロンビアSBAプレート上に接種し、37℃で48時間インキュベートした。プレートを24及び48時間に検査し、MBCを、細菌のコロニーがプレート上で観察されなかった(又は増殖の有意な阻害が対照と比較して観察された)NCL812の最小濃度として記録した(CLSI 2005)。
それぞれMRSA又はVREであると判定されなかった黄色ブドウ球菌KC01及びE.フェカリスUSA01を、コロンビアSBA上で37℃にて一晩増殖させた。次いで細菌の2〜3のコロニーをCAMHB(陽イオン調整ミューラーヒントンブロス)中に懸濁させ、0.08〜0.10のOD600に調整した。細菌懸濁液を1:10に希釈した。細菌1ミリリットルを様々な濃度(最大で4×MIC)のNCLを含有するCAMHB 9mLに添加して、1〜3×106CFU/mlの最終細菌濃度を実現した。チューブを、一定に振盪させながら37℃でインキュベートした。様々な時点で存在する生菌の数を判定するために、アリコート100μLを各チューブから取り出し、希釈した。次いで各希釈液100μLをコロニーカウント寒天上に2通りに散在させ、37℃で48時間インキュベートした。24時間後に、各プレート上に存在するコロニーの数を計数し、したがって元の懸濁液中に存在する生菌の数を数え上げた。プレートを48時間後に再点検した。
最小阻害濃度(MIC)
分離株黄色ブドウ球菌MK01及びKC01、並びにE.フェカリスUSA01のNCL812のMICを調査した。結果は、黄色ブドウ球菌MK01=4〜8μg/mL、黄色ブドウ球菌KC01=2μg/mL、E.フェカリスUSA01=4μg/mLであった。
コロニー計数法をt=0、120、240、及び360分で実施し、次いで24時間で再び実施した。2時間の時点で、黄色ブドウ球菌KC01は、初期数から最小の2.5log10の細菌数の低減、及び同じ時点における対照と比較して3log10超の低減を示した。最小の2log10の低減は、6時間のインキュベーションにおいて依然として明白であったが、24時間後に、存在する細菌の数は、増大しており、対照と有意に異ならなかった。
NCL812の投与によるin vivoでの細菌感染の処置方法
有用な動物モデルシステムは、実施するのに臨床的に妥当な、実験的にロバストな、倫理的に許容される、好都合なものであるはずであり、信頼できる且つ再現可能な結果をもたらすはずである。クロトン油−炎症性皮膚モデル(Akiyama,H.、H.Kanzaki、Y.Abe、J.Tada、及びJ.Arata(1994)、「Staphylococcus aureus infection on experimental croton oil−inflamed skin in mice」、Journal of Dermatological Science、8(1):1〜10頁)、やけどした皮膚モデル(Stieritz,D.D.、A.Bondi、D.McDermott、及びE.B.Michaels、(1982)、「A burned mouse model to evaluate anti−pseudomonas activity of topical agents」、Journal of Antimicrobial Chemotherapy、9(2):133〜140頁)、皮膚縫合−創傷モデル(McRipley,R.J.及びR.R.Whitney、(1976)、「Characterization and Quantitation of Experimental Surgical−Wound Infections Used to Evaluate Topical Antibacterial Agents」、Antimicrobial Agents and Chemotherapy、10(1):38〜44頁)、皮膚テープストリッピングモデル(Kugelberg,E.、T.Norstrom、T.K.Petersen、T.Duvold、D.I.Andersson、 and D.Hughes、(2005)、「Establishment of a Superficial Skin Infection Model in Mice by Using Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes」、Antimicrobial Agents and Chemotherapy、49(8):3435〜3441頁)、並びに線状全層メスカット法(linear full thickness scalpel cut method)(Guo,Y.、R.I.Ramos、J.S.Cho、N.P.Donegan、A.L.Cheung、及びL.S.Miller、(2013)、「In Vivo Bioluminescence Imaging To Evaluate Systemic and Topical Antibiotics against Community−Acquired Methicillin−Resistant Staphylococcus aureus−Infected Skin Wounds in Mice」、Antimicrobial Agents and Chemotherapy、57(2):855〜863頁)を含めて、記載されている局部的な皮膚感染の多くの動物モデルがある。
感染種菌の調製
細菌(黄色ブドウ球菌)の新鮮な培養液をヒツジ血液寒天上で37℃にて16〜18時間増殖させた。2〜3の典型的なコロニーを選択し、トリプティックソイブロス10ml中に懸濁させ、振盪インキュベーター(240rpm)内で37℃にて一晩インキュベートした。一晩懸濁液をボルテックスし、新鮮なトリプティックソイブロス中に希釈した(1:100)(ブロス9.9ml中100μl[0.1ml])。中期対数期細菌を得るために、新鮮な懸濁液を振盪インキュベーター(上記の通り)内で3時間インキュベートした。7,500rpmで10分分間遠心分離することによって細菌をペレット化した。ブロス上清を除去し、細菌をリン酸緩衝溶液(PBS)10ml中に懸濁させた。これらのステップを更に2回繰り返した。ブランクとして生理食塩水を用いて分光光度計を使用して、600nmで吸光度を測定することによって懸濁液の密度を点検することによって、2.5×107CFU/mlの細菌密度と一致するおよそ0.100の読みでの標的密度を確認した。輸送中の冷蔵を維持するための氷のレンガを有する施錠可能な輸送箱内に配置されたラック中に懸濁液を置き、その後マウス皮膚感染実験室に到着した後、涼しい部屋内で保存した。最終的な懸濁液を徹底的に混合した後、マウスに創られた皮膚創傷に接種した。
各マウスを誘導チャンバー内に入れ、2%イソフルランを使用して麻酔を誘導した。それぞれの麻酔されたマウスの目を、角膜の脱水を防止するために獣医学用の目の潤滑剤で覆った。各マウスを誘導チャンバーから取り出し、個々の麻酔ノーズコーン(aesthetic nose cone)の前で手術範囲上に配置した。麻酔下で、麻酔の深さ(痛みに対する応答、瞬目反射、骨格筋緊張)、並びに呼吸器及び心臓機能の評価について各マウスを監視した。背中の皮膚の毛髪を、機械クリッパーで手術範囲から剪毛した。剪毛した範囲をペーパータオルに施した70%エタノール、その後10%w/vポビドン−ヨウ素溶液を使用して浄化した。ヨウ素溶液が乾燥した後、非ステロイド性抗炎症剤(anti−inflammatroy agent)メロキシカムの皮下注射を投与した。背側の皮膚を穏やかにつまむことによって、耳パンチ/生検パンチを使用して円形全層創傷を創ることを可能にした。ビヒクル対照並びにNCL812処置マウスの創傷に、マイクロピペットを使用して細菌懸濁液10μl(2.5×105CFU/10μl)を接種した。細菌懸濁液が乾燥した後、マウスをマウス番号で標識された個々の回収箱内に入れた。接種の時間を記録した。各マウスの初期体重を適切なスコアシートに記録した。マウスは、5分以内に完全な意識を回復した。回復したマウスを個々の収納容器に戻し、術後又は麻酔薬合併症について毎時間監視した。
マウスを術後合併症について評価し、知見を診療所の記録シート(clinic record sheet)に記録した。各マウスを、過剰な取り扱い又は手術部位に触れることを回避して、IVCから慎重に取り出し、評価容器内に入れた。マウスが評価容器内に入った後、これを評価し、知見を手術後のカルテシートに記録した。示唆された健康ブレイクポイント(wellness breakpoint)に到達したときはいつでも、術後の鎮痛を施し、カルテシートに記録した。
抗生物質投与(7am及び6pm)。ビヒクル又はNCL812軟膏の第1の投与を、手術して4時間後に行った。各軟膏容器を投与の前に秤量し、重量を記録した。各マウスを慎重に拘束した。軟膏(ビヒクル又はNCL812)を病変範囲に塗布し、処置したマウスをIVCに戻し、そこで各マウスを観察して、軟膏が毛づくろいによって直ちに除去されなかったことを保証した。投与後の軟膏容器の重量を記録した。ビヒクル及び活性NCL製品を、合計で14の連続した処置にわたって第1の投与後に12時間毎に皮膚創傷部に塗布した。NCL812軟膏(実施例8に提示した製剤B)は、20mg/gの濃度でロベニジンを含有していた。およそ0.1〜0.2gの軟膏を各機会に塗布し、28から56mgの間のNCL812の総局部的用量を18gから25gの間の体重のマウスに送達した。
7日の皮膚創傷評価期間の最後に、すべての試験マウスを安楽死させた後、創傷部を収集し、死後の検査を行った。皮膚創傷部を各マウスの背側から解剖した。試料を試料チューブ内に入れ、秤量した後、PBS 1ml及び滅菌した組織ホモジナイゼーションビーズを添加した。組織試料を、組織ホモジナイザー(Next Advance Bullet Blender)を使用して10分間ホモジナイズし、次いでおよそ30秒間ボルテックスした。上清100μlを取り出し、PBS 900μlを含有するエッペンドルフチューブ内に入れた。この手順を、合計8希釈にわたる連続希釈を使用して繰り返した。最後に、各希釈液100μlをプレートカウント寒天上に、2通りにピペットで移し、37℃で一晩インキュベートした。元の懸濁液10マイクロリットルをヒツジ血液寒天上に置き、培養液の純度を評価し、37℃で一晩インキュベートした。翌日、生菌数計測を、インキュベートしたプレートカウント寒天プレートを使用して実施し、回収した株としての黄色ブドウ球菌(チャレンジ生物)の同一性を確認した。
ビヒクル処置群において観察された組織1g当たりの平均コロニー数は、5,888,436(6.77log10)であった。NCL812群において観察された組織1g当たりの平均コロニー数は、141,254(5.15log10)であった。組織1グラム当たりのlog10コロニー形成単位及び%低減を以下の表に要約する。
Claims (24)
- 対象におけるグラム陰性細菌による細菌コロニー形成又は感染を処置する医薬の製造における、ロベニジン、又は治療的に許容されるその塩、及びグラム陰性細菌の細胞壁の完全性を除去し、又は低減する化合物又は作用物質の使用。
- 治療有効量のロベニジン、又は治療的に許容されるその塩、及びグラム陰性細菌の細胞壁の完全性を除去し、又は低減する化合物又は作用物質を含む、抗グラム陰性細菌用医薬組成物。
- さらに、薬学的に許容される賦形剤又は担体を含む請求項2に記載の組成物。
- 前記対象が、ヒト、イヌ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、トリ、魚、及びウマの種を含む群から選択される請求項1に記載の使用。
- 前記ロベニジンが、0.1mg/体重1kg〜250mg/体重1kgの範囲内の用量で前記対象に投与される請求項1に記載の使用。
- 前記グラム陰性細菌の細胞壁の完全性を除去し、又は低減する化合物又は作用物質が、βラクタム、ホスホマイシン、リゾチーム、ポリミキシン、キレート化剤、及び免疫学的薬剤から選択される請求項1に記載の使用。
- 前記グラム陰性細菌が、アクチノバチルス(Actinobacillus)、アエロモナス(Aeromonas)、アナプラズマ(Anaplasma)、アルコバクター(Arcobacter)、アビバクテリウム(Avibacterium)、バクテロイデス(Bacteroides)、バルトネラ(Bartonella)、ボルデテラ(Bordetella)、ボレリア(Borrelia)、ブラキスピラ(Brachyspira)、ブルセラ(Brucella)、カンピロバクター(Campylobacter)、カプノサイトファガ(Capnocytophaga)、クラミジア(Chlamydia)、クラミドフィラ(Chlamydophila)、クリセオバクテリウム(Chryseobacterium)、コクシエラ(Coxiella)、サイトファーガ(Cytophaga)、ディケロバクター(Dichelobacter)、エドワージエラ(Edwardsiella)、エールリキア(Ehrlichia)、エシェリキア(Escherichia)、フラボバクテリウム(Flavobacterium)、フランシセラ(Francisella)、フソバクテリウム(Fusobacterium)、ガリバクテリウム(Gallibacterium)、ヘモフィラス(Haemophilus)、ヒストフィラス(Histophilus)、クレブシエラ(Klebsiella)、ローソニア(Lawsonia)、レプトスピラ(Leptospira)、マンヘイミア(Mannheimia)、メガスファエラ(Megasphaera)、モラクセラ(Moraxella)、ネオリケッチア(Neorickettsia)、ニコレテラ(Nicoletella)、オルニソバクテリウム(Ornithobacterium)、パスツレラ(Pasteurella)、フォトバクテリウム(Photobacterium)、ピシクラミジア(Piscichlamydia)、ピシリケッチア(Piscirickettsia)、ポルフィロモナス(Porphyromonas)、プレボテラ(Prevotella)、プロテウス(Proteus)、シュードモナス(Pseudomonas)、リケッチア(Rickettsia)、リエメレラ(Riemerella)、サルモネラ、ストレプトバチルス(Streptobacillus)、テナチバキュラム(Tenacibaculum)、ビブリオ(Vibrio)、及びエルシニア(Yersinia)を含む群から選択される請求項1に記載の使用。
- 前記グラム陰性細菌が、アセトバクテラセアエ(Acetobacteraceae):− ロゼオモナス・サービカリス(Roseomonas cervicalis);ロゼオモナス・ファウリアエ(Roseomonas fauriae);ロゼオモナス・ジラーディイ(Roseomonas gilardii).−− アエロモナダセアエ(Aeromonadaceae):− アエロモナス・アロサッカロフィラ(Aeromonas allosaccharophila);アエロモナス・アクアリオルム(Aeromonas aquariorum);アエロモナス・カビアエ(Aeromonas caviae);アエロモナス・ヒドロフィラ(Aeromonas hydrophila)(及び亜種);アエロモナス・サルモニシダ(Aeromonas salmonicida);アエロモナス・シュベルティイ(Aeromonas schubertii)(Aeromonas shubertii);アエロモナス・ベロニイ次亜種ソブリア(Aeromonas veronii biovar sobria)(アエロモナス・ソブリア(Aeromonas sobria)).−− アルカリゲナセアエ(Alcaligenaceae):− アクロモバクター・キシロソキシダンス(Achromobacter xylosoxidans);アルカリゲネス・フェーカリス(Alcaligenes faecalis);ボルデテラ・アンソルピイ(Bordetella ansorpii);ボルデテラ・アビウム(Bordetella avium);ボルデテラ・ブロンキセプチカ(Bordetella bronchiseptica);ボルデテラ・ヒンジイ(Bordetella hinzii);ボルデテラ・ホルメシイ(Bordetella holmesii);パラ百日咳菌(Bordetella parapertussis);百日咳菌(Bordetella pertussis);ボルデテラ・ペツリイ(Bordetella petrii);ボルデテラ・トレマツム(Bordetella trematum);オリゲラ・ウレオリティカ(Oligella ureolytica);オリゲラ・ウレスラリス(Oligella urethralis).−− アナプラズマ科(Anaplasmataceae):− アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum);アナプラズマ・プラチス(Anaplasma platys);アナプラズマ・ボビス(Anaplasma bovis);アナプラズマ・センツラレ(Anaplasma centrale);アナプラズマ・マーギナレ(Anaplasma marginale);アナプラズマ・オドコイレイ(Anaplasma odocoilei);アナプラズマ・オビス(Anaplasma ovis);エールリキア・カニス(Ehrlichia canis);エールリキア・シャフィンシス(Ehrlichia chaffeensis);エールリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii);エールリキア・ムリス(Ehrlichia muris);エールリキア・オビナ(Ehrlichia ovina);エールリキア・ルミナンティウム(Ehrlichia ruminantium);ネオエールリキア・ロトリス(Neoehrlichia lotoris);ネオエールリキア・ミクレンシス(Neoehrlichia mikurensis);ネオリケッチア・ヘルミンソエカ(Neorickettsia helminthoeca);ネオリケッチア・リスティシイ(Neorickettsia risticii);ネオリケッチア・センネツ(Neorickettsia sennetsu);ウォルバキア・ピピエンティス(Wolbachia pipientis).−− アルマティモナダセアエ(Armatimonadaceae):− アルマティモナス・ロセア(Armatimonas rosea).−− バクテロイダセアエ(Bacteroidaceae):− バクテロイデス・フォーサイス(Bacteroides forsythus);バクテロイデス・フラギリス(Bacteroides fragilis);バクテロイデス・メラニノジェニクス(Bacteroides melaninogenicus);バクテロイデス・ルベル(Bacteroides ruber);バクテロイデス・ウレオリティカス(Bacteroides ureolyticus)(Bacteroides urealtyicus).−− バルトネラセアエ(Bartonellaceae):− バルトネラ・アルサティカ(Bartonella alsatica);バルトネラ・オーストラリス(Bartonella australis);バルトネラ・バシリフォルミス(Bartonella bacilliformis);バルトネラ・バートレシイ(Bartonella birtlesii);バルトネラ・ボービス(Bartonella bovis);バルトネラ・カプレオリ(Bartonella capreoli);バルトネラ・コメリイ(Bartonella chomelii);バルトネラ・クラリゲイアエ(Bartonella clarridgeiae);バルトネラ・ドシアエ(Bartonella doshiae);バルトネラ・エリザベサエ(Bartonella elizabethae);バルトネラ・グラハミイ(Bartonella grahamii);バルトネラ・ヘンセラエ(Bartonella henselae);バルトネラ・コエレラエ(Bartonella koehlerae);バルトネラ・ペロミシ(Bartonella peromysci);バルトネラ・ホセエンシス(Bartonella phoceensis);バルトネラ・クインタナ(Bartonella quintana);バルトネラ・ラッチマッシリエンシス(Bartonella rattimassiliensis);バルトネラ・ロカリマエ(Bartonella rochalimae);バルトネラ・シェーンブヘンシス(Bartonella schoenbuchensis);バルトネラ・タルパエ(Bartonella talpae);バルトネラ・タミアエ(Bartonella tamiae);バルトネラ・タイロリイ(Bartonella taylorii);バルトネラ・トリボコルム(Bartonella tribocorum);バルトネラ・ビンソニイ亜種バーコフィー(Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii);バルトネラ・ビンソニイ亜種アルペンシス(Bartonella vinsonii subsp. arupensis);バルトネラ・ビンソニイ亜種ビンソニイ(Bartonella vinsonii subsp. vinsonii).−− ブデロビブリオナセアエ(Bdellovibrionaceae):− ブデロビブリオ(Bdellovibrio)種.−− ブラキスピラ科:− ブラキスピラ・ハンプソニイ(Brachyspira hampsonii)、ブラキスピラ・ハイオディセンテリアエ(Brachyspira hyodysenteriae)、ブラキスピラ・ムルドチイ(Brachyspira murdochii)、ブラキスピラ・ピロシコリ(Brachyspira pilosicoli)を含むブラキスピラ(Brachyspira)種.−− ブルセラ科(Brucellaceae):− ブルセラ・アボルタス(Brucella abortus);ブルセラ・カニス(Brucella canis);ブルセラ・セティ(Brucella ceti);ブルセラ・メリテンシス(Brucella melitensis);ブルセラ・オビス(Brucella ovis);ブルセラ・ピンニペジアリス(Brucella pinnipedialis);ブルセラ・スイス(Brucella suis);オクロバクトラム・アンスロピ(Ochrobactrum anthropi);オクロバクトラム・インターメディウム(Ochrobactrum intermedium).−− バークホルデリア科(Burkholderiaceae):− バークホルデリア・アルボリス(Burkholderia arboris)(Burkholderia aboris);バークホルデリア・アムビファリア(Burkholderia ambifaria)(遺伝子型VII);バークホルデリア・アンシナ(Burkholderia anthina)(遺伝子型VIII);バークホルデリア・セノセファシア(Burkholderia cenocepacia)(遺伝子型III);バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)(遺伝子型I);バークホルデリア・ジフサ(Burkholderia diffusa);バークホルデリア・ドロサ(Burkholderia dolosa)(遺伝子型VI);バークホルデリア・ラテンス(Burkholderia latens);バークホルデリア・マレイ(Burkholderia mallei);バークホルデリア・メタリカ(Burkholderia metallica);バークホルデリア・マルティボランス(Burkholderia multivorans)(遺伝子型II);バークホルデリア・シュードマレイ(Burkholderia pseudomallei);バークホルデリア・ピロシニア(Burkholderia pyrrocinia)(遺伝子型IX);バークホルデリア・セミナリス(Burkholderia seminalis);バークホルデリア・スタビリス(Burkholderia stabilis)(遺伝子型IV);バークホルデリア・ユボネンシス(Burkholderia ubonensis)(遺伝子型X);バークホルデリア・ベトナミエンシス(Burkholderia vietnamiensis)(遺伝子型V);キュープリアビダス・パウクルス(Cupriavidus pauculus);キュープリアビダス・ギラルディイ(Cupriavidus gilardii);ラルストニア・ピケッティイ(Ralstonia pickettii);ラルストニア・マンニトリリティカ(Ralstonia mannitolilytica);スファエロティルス・ヒッペイ(Sphaerotilus hippei);スファエロティルス・モンタヌス(Sphaerotilus montanus);スファエロティルス・ナタンス(Sphaerotilus natans).−− カンピロバクテラセアエ(Campylobacteraceae):−アルコバクター・スキロイイ(Arcobacter skirrowii)を含むアルコバクター(Arcobacter)種;カンピロバクター・コリ(Campylobacter coli);カンピロバクター・コンシサス(Campylobacter concisus);カンピロバクター・カーブス(Campylobacter curvus);カンピロバクター・フェタス(Campylobacter fetus);カンピロバクター・グラシリス(Campylobacter gracilis);カンピロバクター・ヘルベティカス(Campylobacter helveticus);カンピロバクター・ホミニス(Campylobacter hominis);カンピロバクター・ハイオインテスティナリス(Campylobacter hyointestinalis);カンピロバクター・インスラエニグラエ(Campylobacter insulaenigrae);カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni);カンピロバクター・ラニエナエ(Campylobacter lanienae);カンピロバクター・ラリ(Campylobacter lari);カンピロバクター・ラリディス(Campylobacter laridis);カンピロバクター・ムコサリス(Campylobacter mucosalis);カンピロバクター・レクタス(Campylobacter rectus);カンピロバククー・ショウアエ(Campylobacter showae);カンピロバクター・スプトルム(Campylobacter sputorum);カンピロバクター・ウプサリエンシス(Campylobacter upsaliensis).−− カンジダタス(Candidatus):− ピシクラミジア・サルモニス(Piscichlamydia salmonis).−− カーディオバクテリアセアエ(Cardiobacteriaceae):− カーディオバクテリウム・ホミニス(Cardiobacterium hominis);カーディオバクテリウム・バルバルム(Cardiobacterium valvarum);ディケロバクター・ノドサス(Dichelobacter nodosus).−− クラミジア科(Chlamydiaceae):− クラミジア・アビウム(Chlamydia avium)、クラミジア・ガリナセア(Chlamydia gallinacea)、クラミジア・ムリダルム(Chlamydia muridarum)、クラミジア・スイス(Chlamydia suis)、クラミジア・トラコマチス(Chlamydia trachomatis)を含むクラミジア(Chlamydia)種;クラミドフィラ・ニューモニアエ(Chlamydophila pneumoniae)、クラミドフィラ・ペコルム(Chlamydophila pecorum)、クラミドフィラ・シタッシ(Chlamydophila psittaci)、クラミドフィラ・アボルタス(Chlamydophila abortus)、クラミドフィラ・カビアエ(Chlamydophila caviae)、及びクラミドフィラ・フェリス(Chlamydophila felis)を含むクラミドフィラ(Chlamydophila)種.−− クトノモナダセアエ(Chthonomonadaceae):− クトノモナス・カリディロセア(Chthonomonas calidirosea).−− コマモナス科(Comamonadaceae):− コマモナス・テストステロニ(Comamonas testosteroni);ベルミネフロバクター(Verminephrobacter)種.−− コクシエラ科(Coxiellaceae):− コクシエラ・バーネッティイ(Coxiella burnetii).−− サイトファーガ科(Cytophagaceae):− サイトファーガ・コルムナリス(Cytophaga columnaris);サイトファーガ・ハッチンソニイ(Cytophaga hutchinsonii);フレキシバクター・エキニシダ(Flexibacter echinicida);
フレキシバクター・エレガンス(Flexibacter elegans);フレキシバクター・フレキシリス(Flexibacter flexilis);フレキシバクター・リトラリス(Flexibacter litoralis);フレキシバクター・ポリモーフス(Flexibacter polymorphus);フレキシバクター・ロゼオルス(Flexibacter roseolus);フレキシバクター・ルベー(Flexibacter ruber).−− デスルフォビブリオ科(Desulfovibrionaceae):− ビロフィラ・ワーズワーシア(Bilophila wadsworthia);ローソニア・イントラセルラリス(Lawsonia intracellularis).−− 腸内細菌科(Enterobacteriaceae):− セデセア・ダヴィスアエ(Cedecea davisae);セデセア・ラパゲイ(Cedecea lapagei);セデセア・ネテリ(Cedecea neteri);アマロナティカス(amalonaticus);サイトロバクター・ディバーサス(Citrobacter diversus);サイトロバクター・フレウンディイ(Citrobacter freundii);サイトロバクター・コセリ(Citrobacter koseri);クロノバクター・コンディメンティ(Cronobacter condimenti);クロノバクター・デュブリネンシス(Cronobacter dublinensis);クロノバクター・ヘルベティカス(Cronobacter helveticus);クロノバクター・マロナティカス(Cronobacter malonaticus);クロノバクター・ムイトジェンシイ(Cronobacter muytjensii);クロノバクター・プルベリス(Cronobacter pulveris);クロノバクター・サカザキイ(Cronobacter sakazakii);クロノバクター・ツリセンシス(Cronobacter turicensis);クロノバクター・ユニバーサリス(Cronobacter universalis);クロノバクター・ズリケンシス(Cronobacter zurichensis);エドワージエラ・イクタルリ(Edwardsiella ictaluri);エドワージエラ・タルダ(Edwardsiella tarda);エンテロバクター・アエロゲネス(Enterobacter aerogenes);エンテロバクター・アグロメランス(Enterobacter agglomerans);エンテロバクター・クロアカエ(Enterobacter cloacae);エンテロバクター・コワニイ(Enterobacter cowanii);エシェリキア・アルベルティイ(Escherichia albertii);AIEC=接着性侵襲性大腸菌(E. coli)、EaggEC=腸管凝集性大腸菌;EHEC=腸管出血性大腸菌;EIEC=腸管組織侵入性大腸菌;EPEC=腸管病原性大腸菌;ETEC=腸内毒素原性大腸菌;ExPEC=腸外病原性大腸菌、NMEC=新生児髄膜炎大腸菌、NTEC=壊死性毒素産生性大腸菌、UPEC=尿路疾患性大腸菌を含む大腸菌(Escherichia coli);エシェリキア・ファグソニイ(Escherichia fergusonii);エウィンゲラ・アメリカナ(Ewingella americana);ハフニア・アルベイ(Hafnia alvei);ハフニア・パラルベイ(Hafnia paralvei);クレブシエラ・グラニュロマティス(Klebsiella granulomatis);クレブシエラ・オキシトカ(Klebsiella oxytoca);肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae);クライベラ・アスコルバータ(Kluyvera ascorbata);クライベラ・クリオクレッセンス(Kluyvera cryocrescens);モーガネラ・モーガニイ(Morganella morganii);パントエア(Pantoea)(以前にエンテロバクター(Enterobacter))・アグロメランス(agglomerans);フォトラブダス・アシンビオティカ(Photorhabdus asymbiotica);プレシオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides);プロテウス・ミラビリス(Proteus mirabilis);プロテウス・ペンネリ(Proteus penneri);プロテウス・ブルガリス(Proteus vulgaris);プロビデンシア・アルカリファシエンス(Providencia alcalifaciens);プロビデンシア・レットゲリ(Providencia rettgeri);プロビデンシア・スチュアーティイ(Providencia stuartii);ラオウルテラ・エレクトリカ(Raoultella electrica);ラオウルテラ・オルニチノリティカ(Raoultella ornithinolytica);ラオウルテラ・プランティコーラ(Raoultella planticola);ラオウルテラ・テリジェナ(Raoultella terrigena);サルモネラ・ボンゴリ(Salmonella bongori)、サルモネラ・エンテリカ亜種エンテリカ(Salmonella enterica subspecies enterica)(多くの血清型);セラチア・リクファシエンス(Serratia liquefaciens)(Serratia liquifaciens);セラチア・マルセッセンス(Serratia marcescens)(Serratia marcesans);シゲラ・ボイディイ(Shigella boydii);シゲラ・ディセンテリアエ(Shigella dysenteriae);シゲラ・フレクスネリ(Shigella flexneri);シゲラ・ソンネイ(Shigella sonnei);エルシニア・エンテロコリティカ(Yersinia enterocolitica);ペスト菌(Yersinia pestis);エルシニア・シュードツベルクローシス(Yersinia pseudotuberculosis);エルシニア・ラッケリ(Yersinia ruckeri).−− フィンブリイモナダセアエ(Fimbriimonadaceae):− フィンブリイモナス・ギンセンギソリ(Fimbriimonas ginsengisoli).−− フラボバクテリアセアエ(Flavobacteriaceae):− バージイエラ・ズーヘルカム(Bergeyella zoohelcum);カプノサイトファガ・カニモーサス(Capnocytophaga canimorsus);カプノサイトファガ・シノデグミ(Capnocytophaga cynodegmi);カプノサイトファガ・ジンジバーリス(Capnocytophaga gingivalis);カプノサイトファガ・グラヌロサ(Capnocytophaga granulosa);カプノサイトファガ・ヘモリティカ(Capnocytophaga haemolytica);カプノサイトファガ・リードベッテリ(Capnocytophaga leadbetteri);カプノサイトファガ・オクラセア(Capnocytophaga ochracea);カプノサイトファガ・スプーティゲナ(Capnocytophaga sputigena);クリセオバクテリウム・インドロゲネス(Chryseobacterium indologenes);クリセオバクテリウム・ピシコラ(Chryseobacterium piscicola);エリザベトキンギア・メニンゴセプティカ(Elizabethkingia meningoseptica);フラボバクテリウム・ブランキオフィラム(Flavobacterium branchiophilum);フラボバクテリウム・コルムナーレ(Flavobacterium columnare);フラボバクテリウム・オンコリンキ(Flavobacterium oncorhynchi);フラボバクテリウム・ピスシシダ(Flavobacterium piscicida);フラボバクテリウム・サイクロフィルム(Flavobacterium psychrophilum);ミロイデス・オドラータス(Myroides odoratus);ミロイデス・オドラティミマス(Myroides odoratimimus);オルニソバクテリウム・リノトラケアレ(Ornithobacterium rhinotracheale);リエメレラ・アナティペステイファー(Riemerella anatipestifer);リエメレラ・コロンビーナ(Riemerella columbina);リエメレラ・コルンビファリンギス(Riemerella columbipharyngis);テナチバキュラム・ジセントラルキ(Tenacibaculum dicentrarchi);テナチバキュラム・ディスカラー(Tenacibaculum discolor)(Tenacibaculum discolour);テナチバキュラム・ガライクム(Tenacibaculum gallaicum);テナチバキュラム・マリティマム(Tenacibaculum maritimum);テナチバキュラム・ソレアエ(Tenacibaculum soleae);ウィークセラ・ビローサ(Weeksella virosa).−− フランシセラ科(Francisellaceae):− フランシセラ・ツラレンシス亜種ツラレンシス(Francisella tularensis subsp. tularensis);フランシセラ・ツラレンシス亜種ホラークティカ(Francisella tularensis subsp. holarctica);フランシセラ・ツラレンシス亜種ノビシダ(Francisella tularensis subsp. novicida);フランシセラ・フィロミラギア(Francisella philomiragia);フランシセラ・ノアツネンシス(Francisella noatunensis);フランシセラ・ノアツネンシス亜種オリエンタリス(Francisella noatunensis subsp. orientalis)(フランシセラ・アシアチカ(Francisella asiatica)とも呼ばれる).−− フソバクテリア科(Fusobacteriaceae):− フソバクテリウム・ネクロフォーラム(Fusobacterium necrophorum)、フソバクテリウム・ヌクレアタム(Fusobacterium nucleatum)、フソバクテリウム・ポリモーフム(Fuso-bacterium polymorphum)を含むフソバクテリウム(Fusobacterium)種.−− ヘリコバクター科(Helicobacteraceae):− ヘリコバクター・シナエディ(Helicobacter cinaedi);ヘリコバクター・フェネリアエ(Helicobacter fennelliae);ピロリ菌(Helicobacter pylori).−− レジオネラ科(Legionellaceae):− レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、及びレジオネラ・アニーサ(Legionella anisa);レジオネラ・バーミンガメンシス(Legionella birminghamensis);レジオネラ・ボゼマニイ(Legionella bozemanii)(Legionella bozemannii);レジオネラ・シンシナティエンシス(Legionella cincinnatiensis);レジオネラ・デュモフィイ(Legionella dumoffii);レジオネラ・フィーレイイ(Legionella feeleii);レジオネラ・ゴルマニイ(Legionella gormanii);レジオネラ・ハッケリアエ(Legionella hackeliae);レジオネラ・ジョーダニス(Legionella jordanis);レジオネラ・ランシンゲンシス(Legionella lansingensis);レジオネラ・ロングビーチアエ(Legionella longbeachae);
タトロキア・マセアケルニイ(Legionella maceachernii);レジオネラ・ミクダデイ(Legionella micdadei);レジオネラ・オークリジェンシス(Legionella oakridgensis);レジオネラ・パリシエンシス(Legionella parisiensis);レジオネラ・セントヘレンシ(Legionella sainthelensi)(Legionella sainthelens);レジオネラ・ツクソネンシス(Legionella tucsonensis)(Legionella tusconensis);レジオネラ・ワズワーシイ(Legionella wadsworthii);レジオネラ・ウォルターシイ(Legionella waltersii)を含む他の種.−− レプトスピラ科(Leptospiraceae):− レプトスピラ・アレクサンデリー(Leptospira alexanderi)(レプトスピラ・アレクサンデリー血清型ヘブドマディス(Leptospira alexanderi serovar Hebdomadis)、レプトスピラ・アレクサンデリー血清型マンハオ3(Leptospira alexanderi serovar Manhao 3)を含む);レプトスピラ・アルストニ(Leptospira alstoni)(レプトスピラ・アルストニ血清型ピングチャング(Leptospira alstoni serovar Pingchang)、レプトスピラ・アルストニ血清型シクアン(Leptospira alstoni serovar Sichuan)を含む);レプトスピラ・ビフレクサ(Leptospira biflexa)(レプトスピラ・ビフレクサ血清型アンコナ(Leptospira biflexa serovar Ancona)、レプトスピラ・ビフレクサ血清型カネラ(Leptospira biflexa serovar Canela)を含む);レプトスピラ・ボルグピータセニイ(Leptospira borgpetersenii)(レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ハルジョ(Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ハルジョ−ボビス(Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ポモナ(Leptospira borgpetersenii serovar Pomona)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型タラッソビ(Leptospira borgpetersenii serovar Tarassovi)を含む);レプトスピラ・ブローミイ(Leptospira broomii)(レプトスピラ・ブローミイ(Leptospira broomii)血清型ハーストブリッジを含む);レプトスピラ・ファイネイ(Leptospira fainei)(レプトスピラ・ファイネイ血清型ハーストブリッジ(Leptospira fainei serovar Hurstbridge)を含む);レプトスピラ・イドニイ(Leptospira idonii);レプトスピラ・イナダイ(Leptospira inadai)(レプトスピラ・イナダイ血清型ライム(Leptospira inadai serovar Lyme)、レプトスピラ・イナダイ血清型マラヤ(Leptospira inadai serovar Malaya)を含む);レプトスピラ・インターロガンス(Leptospira interrogans)(レプトスピラ・インターロガンス血清型オーストラリス(Leptospira interrogans serovar Australis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型オータムナリス(Leptospira interrogans serovar Autumnalis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ブラティスラバ(Leptospira interrogans serovar Bratislava)、レプトスピラ・インターロガンス血清型カニコーラ(Leptospira interrogans serovar Canicola)、レプトスピラ・インターロガンス血清型グリポティフォーサ(Leptospira interrogans serovar Grippotyphosa)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ハルジョ(Leptospira interrogans serovar Hardjo)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ハルジョ−ボビス(Leptospira interrogans serovar Hardjo-bovis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型イクテロヘモラジア(Leptospira interrogans serovar Icterohaemorrhagiae)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ポモナ(Leptospira interrogans serovar Pomona)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ピロゲネス(Leptospira interrogans serovar Pyrogenes)、レプトスピラ・インターロガンス血清型タラッソビ(Leptospira interrogans serovar Tarassovi)を含む);レプトスピラ・カースクネリー(Leptospira kirschneri)(レプトスピラ・カースクネリー血清型ブルガリカ(Leptospira kirschneri serovar Bulgarica)、レプトスピラ・カースクネリー血清型シノプテリ(Leptospira kirschneri serovar Cynopteri)、レプトスピラ・カースクネリー血清型グリポティフォーサ(Leptospira kirschneri serovar Grippotyphosa)を含む);レプトスピラ・メチイ(Leptospira kmetyi);レプトスピラ・リセラシアエ(Leptospira licerasiae);レプトスピラ・メイエリー(Leptospira meyeri)(レプトスピラ・メイエリー血清型ソフィア(Leptospira meyeri serovar Sofia)を含む);レプトスピラ・ノグチイ(Leptospira noguchii)(レプトスピラ・ノグチイ血清型パナマ(Leptospira noguchii serovar Panama)、レプトスピラ・ノグチイ血清型ポモナ(Leptospira noguchii serovar Pomona)を含む);レプトスピラ・サンタロサイ(Leptospira santarosai);レプトスピラ・テルプストラエ(Leptospira terpstrae);レプトスピラ・バンチエリイ(Leptospira vanthielii);レプトスピラ・ウェイリイ(Leptospira weilii)(レプトスピラ・ウェイリイ血清型セレドニ(Leptospira weilii serovar Celledoni)、レプトスピラ・ウェイリイ血清型サルミン(Leptospira weilii serovar Sarmin)を含む);レプトスピラ・ウォルバキイ(Leptospira wolbachii);レプトスピラ・ウォルフィイ(Leptospira wolffii);レプトスピラ・ヤナガワエ(Leptospira yanagawae).−− レプトトリキア科(Leptotrichiaceae):− レプトトリキア・ブカリス(Leptotrichia buccalis);ストレプトバチルス・モニリフォルミス(Streptobacillus moniliformis).−− メチロバクテリウム科(Methylobacteriaceae):− メチロバクテリウム・エクストルケンス(Methylobacterium extorquens)群;メチロバクテリウム・フジサワエンス(Methylobacterium fujisawaense);メチロバクテリウム・メソフィリカム(Methylobacterium mesophilicum);メチロバクテリウム・ザトマニイ(Methylobacterium zatmanii).−− モラクセラ科(Moraxellaceae):− アシネトバクター・バウマンニイ(Acinetobacter baumannii)(ゲノム種2);アシネトバクター・バイリイ(Acinetobacter baylyi);アシネトバクター・ブーヴェティイ(Acinetobacter bouvetii);アシネトバクター・カルコアセチカス(Acinetobacter calcoaceticus)(ゲノム種1);アシネトバクター・ゲルネリ(Acinetobacter gerneri);アシネトバクター・グリモンティイ(Acinetobacter grimontii);アシネトバクター・ヘモリティカス(Acinetobacter haemolyticus)(ゲノム種4);アシネトバクター・ジョンソニイ(Acinetobacter johnsonii)(ゲノム種7);アシネトバクター・ジュニイ(Acinetobacter junii)(ゲノム種5);アシネトバクター・ルヴォフィイ(Acinetobacter lwoffii)(Acinetobacter lwoffi)(ゲノム種8/9);アシネトバクター・パルブス(Acinetobacter parvus);アシネトバクター・レイディオレジステンス(Acinetobacter radioresistens)(ゲノム種12);アシネトバクター・シンドレリ(Acinetobacter schindleri);アシネトバクター・タンドイイ(Acinetobacter tandoii);アシネトバクター・チェルンベルギアエ(Acinetobacter tjernbergiae);アシネトバクター・タウネリ(Acinetobacter towneri);アシネトバクター・ウルシンギイ(Acinetobacter ursingii);アシネトバクター・べネチアヌス(Acinetobacter venetianus);モラクセラ・アトランタエ(Moraxella atlantae);モラクセラ・ベーブレイ(Moraxella boevrei);モラクセラ・ボービス(Moraxella bovis);モラクセラ・ボーボクリ(Moraxella bovoculi);モラクセラ・カニス(Moraxella canis);モラクセラ・カプラエ(Moraxella caprae);モラクセラ・カタラーリス(Moraxella catarrhalis);モラクセラ・カビアエ(Moraxella caviae);モラクセラ・クニクリ(Moraxella cuniculi);モラクセラ・エクイ(Moraxella equi);モラクセラ・ラクナータ(Moraxella lacunata);モラクセラ・リンカーニイ(Moraxella lincolnii);モラクセラ・マカカエ(Moraxella macacae);モラクセラ・ノンリクエファシエンス(Moraxella nonliquefaciens);モラクセラ・オブロンガ(Moraxella oblonga);モラクセラ・オスロエンシス(Moraxella osloensis);モラクセラ・オビス(Moraxella ovis);サイクロバクター・フェニルピルビカ(Moraxella phenylpyruvica);モラクセラ・プルラニマリウム(Moraxella pluranimalium);モラクセラ・ポルシ(Moraxella porci).−− モリテラセアエ(Moritellaceae):− モリテラ・アビシ(Moritella abyssi);モリテラ・ダサネンシス(Moritella dasanensis);モリテラ・ジャポニカ(Moritella japonica);モリテラ・マリナ(Moritella marina);モリテラ・プロファンダ(Moritella profunda);モリテラ・ビスコーサ(Moritella viscosa);モリテラ・ヤヤノシイ(Moritella yayanosii).−− ナイセリア科(Neisseriaceae):− クロモバクテリウム・ビオラセウム(Chromobacterium violaceum);エイケネラ・コローデンス(Eikenella corrodens);キンゲラ・デニトリフィカンス(Kingella denitrificans)、キンゲラ・キンガエ(Kingella kingae)、キンゲラ・オラリス(Kingella oralis)、キンゲラ・ポトス(Kingella potus);ナイセリア・シネレア(Neisseria cinerea);ナイセリア・エロンガータ(Neisseria elongata);ナイセリア・フラベッセンス(Neisseria flavescens);淋菌(Neisseria gonorrhoeae);ナイセリア・ラクタミカ(Neisseria lactamica);髄膜炎菌(Neisseria meningitidis);ナイセリア・ムコーサ(Neisseria mucosa);ナイセリア・ポリサッカレア(Neisseria polysaccharea);ナイセリア・シッカ(Neisseria sicca);ナイセリア・サブフラバ(Neisseria subflava);ナイセリア・ウィーバリ(Neisseria weaveri)(Neisseria weaver);ビトレオスチラ(Vitreoscilla)種.−− ニトロソモナス科(Nitrosomonadaceae):− ニトロソモナス・ユートロファ(Nitrosomonas eutropha);ニトロソモナス・ハロフィラ(Nitrosomonas halophila);ニトロソモナス・オリゴトロファ(Nitrosomonas oligotropha).−− パスツレラ科(Pasteurellaceae):− アクチノバチルス・アクチノミセテムコミタンス(Actinobacillus actinomycetemcomitans);アクチノバチルス・エクリ(Actinobacillus equuli);アクチノバチルス・リグニエレシイ(Actinobacillus lignieresii);アクチノバチルス・プルロニューモニアエ(Actinobacillus pleuropneumoniae);アクチノバチルス・セミニス(Actinobacillus seminis);アクチノバチルス・サクシノゲネス(Actinobacillus succinogenes);アクチノバチルス・ウレアエ(Actinobacillus ureae);アグレガチバクター・アクチノミセテムコミタンス(Aggregatibacter actinomycetemcomitans)、アグレガチバクター・セグニス(Aggregatibacter segnis)、アグレガチバクター・アフロフィルス(Aggregatibacter aphrophilus);アビバクテリウム・アビウム(Avibacterium avium);アビバクテリウム・エンドカルジチジス(Avibacterium endocarditidis);アビバクテリウム・ガリナルム(Avibacterium gallinarum);アビバクテリウム・パラガリナルム(Avibacterium paragallinarum);アビバクテリウム・ボランティウム(Avibacterium volantium);ビベルステイニア・トレハロシ(Bibersteinia trehalosi)(Bibersteinia trehalose);ガリバクテリウム・アナティス(Gallibacterium anatis);ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種1;ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種2;
ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種3;ガリバクテリウム(Gallibacterium)群V;ガリバクテリウム・メロプシッタシ(Gallibacterium melopsittaci);ガリバクテリウム・サルピンギチジス(Gallibacterium salpingitidis);ガリバクテリウム・トレハロシフェルメンタンス(Gallibacterium trehalosifermentans);ヘモフィラス・エジプティウス(Haemophilus aegyptius);ヘモフィラス・アビウム(Haemophilus avium);ヘモフィラス・デュクレイー(Haemophilus ducreyi);ヘモフィラス・ヘモリティカス(Haemophilus haemolyticus);インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae);ヘモフィラス・パラヘモリティカス(Haemophilus parahaemolyticus);ヘモフィラス・パラインフルエンザエ(Haemophilus parainfluenzae);ヘモフィラス・パラスイス(Haemophilus parasuis);ヒストフィラス・ソムニー(Histophilus somni);マンヘイミア・カビアエ(Mannheimia caviae);マンヘイミア・グルコシダ(Mannheimia glucosida);マンヘイミア・グラニュロマティス(Mannheimia granulomatis);マンヘイミア・ヘモリティカ(Mannheimia haemolytica);マンヘイミア・ルミナリス(Mannheimia ruminalis);マンヘイミア・バリゲナ(Mannheimia varigena);ニコレテラ・セモリナ(Nicoletella semolina);パスツレラ・エロゲネス(Pasteurella aerogenes);パスツレラ・ベッティアエ(Pasteurella bettyae);パスツレラ・カバリイ(Pasteurella caballi);パスツレラ・カニス(Pasteurella canis);パスツレラ・ダグマティス(Pasteurella dagmatis);パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)(亜種ムルトシダ(multocida)、セプティカム(septicum)、ガリシダ(gallicida));パスツレラ・ニューモトロピカ(Pasteurella pneumotropica);パスツレラ・ストマティス(Pasteurella stomatis);パスツレラ・トレハロシ(Pasteurella trehalosi).−− ピシリケッチア科(Piscirickettsiaceae):− ピシリケッチア・サルモニス(Piscirickettsia salmonis).−− プレシオモナダセアエ(Plesiomonadaceae):− プレシオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides).−− ポリアンギウム科(Polyangiaceae):− ソランギウム・セルロスム(Sorangium cellulosum).−− ポルフィロモナス科(Porphyromonadaceae):− ディスゴノモナス・カプノサイトファゴイデス(Dysgonomonas capnocytophagoides);ディスゴノモナス・ガデイ(Dysgonomonas gadei);ディスゴノモナス・ホフスタジイ(Dysgonomonas hofstadii);ディスゴノモナス・モッシイ(Dysgonomonas mossii);ディスゴノモナス・オリザルビ(Dysgonomonas oryzarvi);ディスゴノモナス・ウィンペンニイ(Dysgonomonas wimpennyi);ポルフィロモナス・ジンジバリス(Porphyromonas gingivalis).−− プレボテラ科(Prevotellaceae):− プレボテラ・インターメディア(Prevotella intermedia)、プレボテラ・メラニノジェニカ(Prevotella melaninogenica)を含むプレボテラ(Prevotella)種.−− シュードモナス科:− クリセオモナス・ルテオラ(Chryseomonas luteola);緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa);シュードモナス・ルテオラ(Pseudomonas luteola);シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens);シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida);シュードモナス・スタッツェリ(Pseudomonas stutzeri);シュードモナス・オリジハビタンス(Pseudomonas oryzihabitans).−− リゾビウム科(Rhizobiaceae):− アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens);リゾビウム・ラジオバクター(Rhizobium radiobacter).−− リケッチア科(Rickettsiaceae):− オリエンティア・クト(Orientia chuto);オリエンティア・ツツガムシ(Orientia tsutsugamushi);リケッチア・アエスクリマンニイ(Rickettsia aeschlimannii);リケッチア・アフリカーエ(Rickettsia africae);リケッチア・アカリ(Rickettsia akari);リケッチア・アルガシイ(Rickettsia argasii);リケッチア・アシアティカ(Rickettsia asiatica);リケッチア・オーストラリス(Rickettsia australis);リケッチア・ベリイ(Rickettsia bellii);リケッチア・カナデンシス(Rickettsia canadensis);リケッチア・コノーリイ(Rickettsia conorii);リケッチア・コオレイ(Rickettsia cooleyi);リケッチア・フェリス(Rickettsia felis);リケッチア・ヘイロンジャンゲンシス(Rickettsia heilongjiangensis);リケッチア・ヘルベティカ(Rickettsia helvetica);リケッチア・ホネイ(Rickettsia honei);リケッチア・ホオグストラアリイ(Rickettsia hoogstraalii);リケッチア・フリネンシス(Rickettsia hulinensis);リケッチア・フリニイ(Rickettsia hulinii);リケッチア・ジャポニカ(Rickettsia japonica);リケッチア・マルミオニイ(Rickettsia marmionii);リケッチア・マルチネト(Rickettsia martinet);リケッチア・マッシリアーエ(Rickettsia massiliae);リケッチア・モナセンシス(Rickettsia monacensis);リケッチア・モンタネンシス(Rickettsia montanensis);リケッチア・モンテイロイ(Rickettsia monteiroi);リケッチア・モレリ(Rickettsia moreli);リケッチア・パルケリー(Rickettsia parkeri);リケッチア・ピーコッキイ(Rickettsia peacockii);リケッチア・フィリピイ(Rickettsia philipii);発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii);リケッチア・ラオウルチイ(Rickettsia raoultii);リケッチア・リピセプハリー(Rickettsia rhipicephali);リケッチア・リケッチイ(Rickettsia rickettsii);リケッチア・シビリカ(Rickettsia sibirica)亜群;リケッチア・スロバカ(Rickettsia slovaca);リケッチア・タムラエ(Rickettsia tamurae);リケッチア・ティフィー(Rickettsia typhi).−− シュワネラ科(Shewanellaceae):− シュワネラ・プトレファシエンス(Shewanella putrefaciens).−− スフィンゴモナス科(Sphingomonadaceae):− スフィンゴバクテリウム・マルチボラム(Sphingobacterium multivorum);スフィンゴバクテリウム・スピリティボラム(Sphingobacterium spiritivorum);スフィンゴモナス・パウシモビリス(Sphingomonas paucimobilis).−− スピリルム科(Spirillaceae):− スピリルム・ミヌス(Spirillum minus);スピリルム・ボルタンス(Spirillum volutans);スピリルム・ウィノグラドスキイ(Spirillum winogradskyi).−− スピロヘータ科(Spirochaetaceae):− ボレリア・アフゼリイ(Borrelia afzelii);ボレリア・アンセリナ(Borrelia anserina);ボレリア・ビセッティ(Borrelia bissettii);ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi);ボレリア・コリアセアエ(Borrelia coriaceae);ボレリア・デュトニイ(Borrelia duttonii);ボレリア・ガリニイ(Borrelia garinii);ボレリア・ハームシイ(Borrelia hermsii);ボレリア・ヒスパニカ(Borrelia hispanica);ボレリア・ジャポニカ(Borrelia japonica);ボレリア・ロネスタリ(Borrelia lonestari);ボレリア・ルシタニアエ(Borrelia lusitaniae);ボレリア・ミヤモトイ(Borrelia miyamotoi);ボレリア・パルケリ(Borrelia parkeri);ボレリア・ペルシカ(Borrelia persica);ボレリア・レカレンティス(Borrelia recurrentis);ボレリア・スピエルマニイ(Borrelia spielmanii);ボレリア・ツリカタエ(Borrelia turicatae);ボレリア・ツリカタエ;ボレリア・バレイシアナ(Borrelia valaisiana);トレポネーマ・カラテウム(Treponema carateum);トレポネーマ・パリダム種エンデミカム(Treponema pallidum ssp. endemicum);トレポネーマ・パリダム種パリダム(Treponema pallidum ssp. pallidum);トレポネーマ・パリダム種ペルテヌエ(Treponema pallidum ssp. pertenue).−− サクシニビブリオ科(Succinivibrionaceae):− アナエロビオスピリルム(Anaerobiospirillum)種.−− ステレラ科(Sutterellaceae):− ステレラ・ワーズワーシア(Sutterella wadsworthia)を含むステレラ(Sutterella)種.−− テルムス科(Thermaceae):− メイオサーマス(Meiothermus)種.−− サーモトガ科(Thermotogaceae):− サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana).−− ヴェイヨネラ科(Veillonellaceae):− ディアリスター(Dialister)種;メガモナス(Megamonas)種;メガスファエラ(Megasphaera)種;ペクチナータス(Pectinatus)種;ペロシヌス(Pelosinus)種;プロピオニスポラ(Propionispora)種;スポロミュサ(Sporomusa)種;ベイロネラ(Veillonella)種;ザイモフィラス(Zymophilus)種.−− ビブリオ科(Vibrionaceae):− フォトバクテリウム・ダムセラエ(Photobacterium damselae);ビブリオ・アダプタツス(Vibrio adaptatus);ビブリオ・アルギノリティカス(Vibrio alginolyticus);ビブリオ・アザシイ(Vibrio azasii);ビブリオ・キャンプベリイ(Vibrio campbellii);コレラ菌(Vibrio cholera);ビブリオ・ダムセラエ(Vibrio damselae)(Vibrio damsel);ビブリオ・フルビアリス(Vibrio fluvialis);ビブリオ・ファーニシイ(Vibrio furnisii);グリモンチア・ホリザエ(Vibrio hollisae);ビブリオ・メチニコフィイ(Vibrio metschnikovii);ビブリオ・ミミカス(Vibrio mimicus);ビブリオ・パラヘモリティカス(Vibrio parahaemolyticus);ビブリオ・バルニフィカス(Vibrio vulnificus).−− ボルバキア科(Wolbachieae):− ボルバキア(Wolbachia)種.−− キサントモナス科(Xanthomonadaceae):− ルテイモナス・アエスツアリイ(Luteimonas aestuarii);ルテイモナス・アクアティカ(Luteimonas aquatica);ルテイモナス・コンポスチ(Luteimonas composti);ルテイモナス・ルティマリス(Luteimonas lutimaris);ルテイモナス・マリナ(Luteimonas marina);ルテイモナス・メフィティス(Luteimonas mephitis);ルテイモナス・バドサ(Luteimonas vadosa);シュードキサントモナス・ブレーグベルネンシス(Pseudoxanthomonas broegbernensis);シュードキサントモナス・ジャポネンシス(Pseudoxanthomonas japonensis);ステノトロホモナス・マルトフィリア(Stenotrophomonas maltophilia);並びにステノトロホモナス・ニトリティレデュセンス(Stenotrophomonas nitritireducens)を含む群から選択される請求項1に記載の使用。 - 前記グラム陰性細菌が、アシネトバクター種、アエロモナス・ヒドロフィラ(Aeromonas hydrophila)、サイトロバクター(Citrobacter)種、エンテロバクター種、大腸菌、肺炎桿菌、モーガネラ・モーガニイ(Morganella morganii)、緑膿菌、及びステノトロホモナス・マルトフィリア(Stenotrophomonas maltophilia)を含む群から選択される請求項8に記載の使用。
- 前記グラム陰性細菌が、細胞壁を有さない請求項1に記載の使用。
- 前記グラム陰性細菌が、マイコプラズマ種、マイコプラズマ・アガラクティアエ(Mycoplasma agalactiae)、マイコプラズマ・アルカレッセンス(Mycoplasma alkalescens)、マイコプラズマ・アンフォリフォルメ(Mycoplasma amphoriforme)、マイコプラズマ・アルギニニ(Mycoplasma arginini)、マイコプラズマ・ボービゲニタリウム(Mycoplasma bovigenitalium)(Mycoplasma bovigenitalum)、マイコプラズマ・ボービリニス(Mycoplasma bovirhinis)、マイコプラズマ・ボービス(Mycoplasma bovis)、マイコプラズマ・ボーボクリ(Mycoplasma bovoculi)、マイコプラズマ・ブカーレ(Mycoplasma buccale)、マイコプラズマ・カリフォルニカム(Mycoplasma californicum)、マイコプラズマ・カナデンス(Mycoplasma canadense)、マイコプラズマ・カプリコラム亜種カプリコラム(Mycoplasma capricolum subsp. capricolum)、マイコプラズマ・カプリコラム亜種カプリニューモニアエ(Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae)、マイコプラズマ・コンジャンクティバエ(Mycoplasma conjunctivae)、マイコプラズマ・シノス(Mycoplasma cynos)、マイコプラズマ・ディスパー(Mycoplasma dispar)、マイコプラズマ・イクイゲニタリウム(Mycoplasma equigenitalium)、マイコプラズマ・ファウシウム(Mycoplasma faucium)、マイコプラズマ・フェリス(Mycoplasma felis)、マイコプラズマ・フェルメンタンス(Mycoplasma fermentans)(インコグニタス株)、マイコプラズマ・ガリセプティカム(Mycoplasma gallisepticum)(MG)、マイコプラズマ・ガテアエ(Mycoplasma gateae)、マイコプラズマ・ジェニタリウム(Mycoplasma genitalium)、マイコプラズマ・ヘモカニス(Mycoplasma haemocanis)、マイコプラズマ・ヘモフェリス(Mycoplasma haemofelis)、マイコプラズマ・ヘモスイス(Mycoplasma haemosuis)(以前にエペリスロゾーン・スイス(Eperythrozoon suis))、マイコプラズマ・ホミニス(Mycoplasma hominis)、マイコプラズマ・ヒオニューモニエ(Mycoplasma hyopneumoniae)、マイコプラズマ・ハイオリニス(Mycoplasma hyorhinis)、マイコプラズマ・ハイオシノビアエ(Mycoplasma hyosynoviae)、マイコプラズマ・アイオワエ・メレアグリディス(Mycoplasma iowae meleagridis)(MM)、マイコプラズマ・アイオワエ(Mycoplasma iowae)、マイコプラズマ・リーチイ(Mycoplasma leachii)、マイコプラズマ・リポフィラム(Mycoplasma lipophilum)、マイコプラズマ・メレアグリディス(Mycoplasma meleagridis)、マイコプラズマ・マイコイデス亜種カプリ(Mycoplasma mycoides subsp capri)、マイコプラズマ・マイコイデス亜種マイコイデス(Mycoplasma mycoides subsp mycoides)、マイコプラズマ・マイコイデス亜種マイコイデス(Mycoplasma mycoides subsp. mycoides)(伝染性ウシ胸膜肺炎CBPPなど)、マイコプラズマ・オラーレ(Mycoplasma orale)、マイコプラズマ・オビニューモニアエ(Mycoplasma ovipneumoniae)、マイコプラズマ・オビス(Mycoplasma ovis)、マイコプラズマ・ペネトランス(Mycoplasma penetrans)、マイコプラズマ・ピラム(Mycoplasma pirum)、マイコプラズマ・ニューモニアエ(Mycoplasma pneumoniae)、マイコプラズマ・プリマタム(Mycoplasma primatum)、マイコプラズマ・プトレファシエンス(Mycoplasma putrefaciens)、マイコプラズマ・サリバリウム(Mycoplasma salivarium)、マイコプラズマ・スペルマトフィラム(Mycoplasma spermatophilum)、マイコプラズマ・スイス(Mycoplasma suis)、マイコプラズマ・シノビアエ(Mycoplasma synoviae)(MS)、マイコプラズマ・ウェニオニイ(Mycoplasma wenyonii)、マイコプラズマ(Mycoplasma)、ウレアプラズマ(Ureaplasma)種、ウレアプラズマ・パルバム(Ureaplasma parvum)、ウレアプラズマ・ウレアリティカム(Ureaplasma urealyticum)、ウレアプラズマ、及びウレアプラズマ・ディベルサム(Ureaplasma diversum)を含む群から選択される請求項10に記載の使用。
- 抗菌性獣医学的組成物である請求項2に記載の組成物。
- 抗菌剤及び抗真菌剤を含む群から選択される更なる抗微生物剤を含む請求項2に記載の組成物。
- 経口投与用、非経口投与用、又は局部投与用に適応されている請求項2に記載の組成物。
- 前記グラム陰性細菌の細胞壁の完全性を除去し、又は低減する化合物又は作用物質が、βラクタム、ホスホマイシン、リゾチーム、ポリミキシン、キレート化剤、及び免疫学的薬剤から選択される請求項2に記載の組成物。
- 対象における細菌コロニー形成又は感染を処置又は防止する方法において使用する場合の医療用デバイスであって、請求項2に記載の組成物を含むことを特徴とする医療用デバイス。
- 対象における細菌又はコロニー形成感染に適用されるプラスター、絆創膏、包帯材、又はインプラントを含む群から選択される形態である請求項16に記載の医療用デバイス。
- 生体外でグラム陰性細菌を死滅させる方法であって、前記細菌をロベニジン、又は治療的に許容されるその塩、及びグラム陰性細菌の細胞壁の完全性を除去し、又は低減する化合物又は作用物質とを接触させるステップを含むことを特徴とする方法。
- 生体外でグラム陰性細菌を死滅させるためのロベニジン、又は治療的に許容されるその塩の使用であって、前記細菌をロベニジン、又は治療的に許容されるその塩、及びグラム陰性細菌の細胞壁の完全性を除去し、又は低減する化合物又は作用物質と接触させるステップを含むことを特徴とする使用。
- 前記グラム陰性細菌が、アクチノバチルス(Actinobacillus)、アエロモナス(Aeromonas)、アナプラズマ(Anaplasma)、アルコバクター(Arcobacter)、アビバクテリウム(Avibacterium)、バクテロイデス(Bacteroides)、バルトネラ(Bartonella)、ボルデテラ(Bordetella)、ボレリア(Borrelia)、ブラキスピラ(Brachyspira)、ブルセラ(Brucella)、カンピロバクター(Campylobacter)、カプノサイトファガ(Capnocytophaga)、クラミジア(Chlamydia)、クラミドフィラ(Chlamydophila)、クリセオバクテリウム(Chryseobacterium)、コクシエラ(Coxiella)、サイトファーガ(Cytophaga)、ディケロバクター(Dichelobacter)、エドワージエラ(Edwardsiella)、エールリキア(Ehrlichia)、エシェリキア(Escherichia)、フラボバクテリウム(Flavobacterium)、フランシセラ(Francisella)、フソバクテリウム(Fusobacterium)、ガリバクテリウム(Gallibacterium)、ヘモフィラス(Haemophilus)、ヒストフィラス(Histophilus)、クレブシエラ(Klebsiella)、ローソニア(Lawsonia)、レプトスピラ(Leptospira)、マンヘイミア(Mannheimia)、メガスファエラ(Megasphaera)、モラクセラ(Moraxella)、ネオリケッチア(Neorickettsia)、ニコレテラ(Nicoletella)、オルニソバクテリウム(Ornithobacterium)、パスツレラ(Pasteurella)、フォトバクテリウム(Photobacterium)、ピシクラミジア(Piscichlamydia)、ピシリケッチア(Piscirickettsia)、ポルフィロモナス(Porphyromonas)、プレボテラ(Prevotella)、プロテウス(Proteus)、シュードモナス(Pseudomonas)、リケッチア(Rickettsia)、リエメレラ(Riemerella)、サルモネラ、ストレプトバチルス(Streptobacillus)、テナチバキュラム(Tenacibaculum)、ビブリオ(Vibrio)、及びエルシニア(Yersinia)を含む群から選択される請求項2に記載の組成物。
- 前記グラム陰性細菌が、アセトバクテラセアエ(Acetobacteraceae):− ロゼオモナス・サービカリス(Roseomonas cervicalis);ロゼオモナス・ファウリアエ(Roseomonas fauriae);ロゼオモナス・ジラーディイ(Roseomonas gilardii).−− アエロモナダセアエ(Aeromonadaceae):− アエロモナス・アロサッカロフィラ(Aeromonas allosaccharophila);アエロモナス・アクアリオルム(Aeromonas aquariorum);アエロモナス・カビアエ(Aeromonas caviae);アエロモナス・ヒドロフィラ(Aeromonas hydrophila)(及び亜種);アエロモナス・サルモニシダ(Aeromonas salmonicida);アエロモナス・シュベルティイ(Aeromonas schubertii)(Aeromonas shubertii);アエロモナス・ベロニイ次亜種ソブリア(Aeromonas veronii biovar sobria)(アエロモナス・ソブリア(Aeromonas sobria)).−− アルカリゲナセアエ(Alcaligenaceae):− アクロモバクター・キシロソキシダンス(Achromobacter xylosoxidans);アルカリゲネス・フェーカリス(Alcaligenes faecalis);ボルデテラ・アンソルピイ(Bordetella ansorpii);ボルデテラ・アビウム(Bordetella avium);ボルデテラ・ブロンキセプチカ(Bordetella bronchiseptica);ボルデテラ・ヒンジイ(Bordetella hinzii);ボルデテラ・ホルメシイ(Bordetella holmesii);パラ百日咳菌(Bordetella parapertussis);百日咳菌(Bordetella pertussis);ボルデテラ・ペツリイ(Bordetella petrii);ボルデテラ・トレマツム(Bordetella trematum);オリゲラ・ウレオリティカ(Oligella ureolytica);オリゲラ・ウレスラリス(Oligella urethralis).−− アナプラズマ科(Anaplasmataceae):− アナプラズマ・ファゴサイトフィルム(Anaplasma phagocytophilum);アナプラズマ・プラチス(Anaplasma platys);アナプラズマ・ボビス(Anaplasma bovis);アナプラズマ・センツラレ(Anaplasma centrale);アナプラズマ・マーギナレ(Anaplasma marginale);アナプラズマ・オドコイレイ(Anaplasma odocoilei);アナプラズマ・オビス(Anaplasma ovis);エールリキア・カニス(Ehrlichia canis);エールリキア・シャフィンシス(Ehrlichia chaffeensis);エールリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii);エールリキア・ムリス(Ehrlichia muris);エールリキア・オビナ(Ehrlichia ovina);エールリキア・ルミナンティウム(Ehrlichia ruminantium);ネオエールリキア・ロトリス(Neoehrlichia lotoris);ネオエールリキア・ミクレンシス(Neoehrlichia mikurensis);ネオリケッチア・ヘルミンソエカ(Neorickettsia helminthoeca);ネオリケッチア・リスティシイ(Neorickettsia risticii);ネオリケッチア・センネツ(Neorickettsia sennetsu);ウォルバキア・ピピエンティス(Wolbachia pipientis).−− アルマティモナダセアエ(Armatimonadaceae):− アルマティモナス・ロセア(Armatimonas rosea).−− バクテロイダセアエ(Bacteroidaceae):− バクテロイデス・フォーサイス(Bacteroides forsythus);バクテロイデス・フラギリス(Bacteroides fragilis);バクテロイデス・メラニノジェニクス(Bacteroides melaninogenicus);バクテロイデス・ルベル(Bacteroides ruber);バクテロイデス・ウレオリティカス(Bacteroides ureolyticus)(Bacteroides urealtyicus).−− バルトネラセアエ(Bartonellaceae):− バルトネラ・アルサティカ(Bartonella alsatica);バルトネラ・オーストラリス(Bartonella australis);バルトネラ・バシリフォルミス(Bartonella bacilliformis);バルトネラ・バートレシイ(Bartonella birtlesii);バルトネラ・ボービス(Bartonella bovis);バルトネラ・カプレオリ(Bartonella capreoli);バルトネラ・コメリイ(Bartonella chomelii);バルトネラ・クラリゲイアエ(Bartonella clarridgeiae);バルトネラ・ドシアエ(Bartonella doshiae);バルトネラ・エリザベサエ(Bartonella elizabethae);バルトネラ・グラハミイ(Bartonella grahamii);バルトネラ・ヘンセラエ(Bartonella henselae);バルトネラ・コエレラエ(Bartonella koehlerae);バルトネラ・ペロミシ(Bartonella peromysci);バルトネラ・ホセエンシス(Bartonella phoceensis);バルトネラ・クインタナ(Bartonella quintana);バルトネラ・ラッチマッシリエンシス(Bartonella rattimassiliensis);バルトネラ・ロカリマエ(Bartonella rochalimae);バルトネラ・シェーンブヘンシス(Bartonella schoenbuchensis);バルトネラ・タルパエ(Bartonella talpae);バルトネラ・タミアエ(Bartonella tamiae);バルトネラ・タイロリイ(Bartonella taylorii);バルトネラ・トリボコルム(Bartonella tribocorum);バルトネラ・ビンソニイ亜種バーコフィー(Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii);バルトネラ・ビンソニイ亜種アルペンシス(Bartonella vinsonii subsp. arupensis);バルトネラ・ビンソニイ亜種ビンソニイ(Bartonella vinsonii subsp. vinsonii).−− ブデロビブリオナセアエ(Bdellovibrionaceae):− ブデロビブリオ(Bdellovibrio)種.−− ブラキスピラ科:− ブラキスピラ・ハンプソニイ(Brachyspira hampsonii)、ブラキスピラ・ハイオディセンテリアエ(Brachyspira hyodysenteriae)、ブラキスピラ・ムルドチイ(Brachyspira murdochii)、ブラキスピラ・ピロシコリ(Brachyspira pilosicoli)を含むブラキスピラ(Brachyspira)種.−− ブルセラ科(Brucellaceae):− ブルセラ・アボルタス(Brucella abortus);ブルセラ・カニス(Brucella canis);ブルセラ・セティ(Brucella ceti);ブルセラ・メリテンシス(Brucella melitensis);ブルセラ・オビス(Brucella ovis);ブルセラ・ピンニペジアリス(Brucella pinnipedialis);ブルセラ・スイス(Brucella suis);オクロバクトラム・アンスロピ(Ochrobactrum anthropi);オクロバクトラム・インターメディウム(Ochrobactrum intermedium).−− バークホルデリア科(Burkholderiaceae):− バークホルデリア・アルボリス(Burkholderia arboris)(Burkholderia aboris);バークホルデリア・アムビファリア(Burkholderia ambifaria)(遺伝子型VII);バークホルデリア・アンシナ(Burkholderia anthina)(遺伝子型VIII);バークホルデリア・セノセファシア(Burkholderia cenocepacia)(遺伝子型III);バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)(遺伝子型I);バークホルデリア・ジフサ(Burkholderia diffusa);バークホルデリア・ドロサ(Burkholderia dolosa)(遺伝子型VI);バークホルデリア・ラテンス(Burkholderia latens);バークホルデリア・マレイ(Burkholderia mallei);バークホルデリア・メタリカ(Burkholderia metallica);バークホルデリア・マルティボランス(Burkholderia multivorans)(遺伝子型II);バークホルデリア・シュードマレイ(Burkholderia pseudomallei);バークホルデリア・ピロシニア(Burkholderia pyrrocinia)(遺伝子型IX);バークホルデリア・セミナリス(Burkholderia seminalis);バークホルデリア・スタビリス(Burkholderia stabilis)(遺伝子型IV);バークホルデリア・ユボネンシス(Burkholderia ubonensis)(遺伝子型X);バークホルデリア・ベトナミエンシス(Burkholderia vietnamiensis)(遺伝子型V);キュープリアビダス・パウクルス(Cupriavidus pauculus);キュープリアビダス・ギラルディイ(Cupriavidus gilardii);ラルストニア・ピケッティイ(Ralstonia pickettii);ラルストニア・マンニトリリティカ(Ralstonia mannitolilytica);スファエロティルス・ヒッペイ(Sphaerotilus hippei);スファエロティルス・モンタヌス(Sphaerotilus montanus);スファエロティルス・ナタンス(Sphaerotilus natans).−− カンピロバクテラセアエ(Campylobacteraceae):−アルコバクター・スキロイイ(Arcobacter skirrowii)を含むアルコバクター(Arcobacter)種;カンピロバクター・コリ(Campylobacter coli);カンピロバクター・コンシサス(Campylobacter concisus);カンピロバクター・カーブス(Campylobacter curvus);カンピロバクター・フェタス(Campylobacter fetus);カンピロバクター・グラシリス(Campylobacter gracilis);カンピロバクター・ヘルベティカス(Campylobacter helveticus);カンピロバクター・ホミニス(Campylobacter hominis);カンピロバクター・ハイオインテスティナリス(Campylobacter hyointestinalis);カンピロバクター・インスラエニグラエ(Campylobacter insulaenigrae);カンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni);カンピロバクター・ラニエナエ(Campylobacter lanienae);カンピロバクター・ラリ(Campylobacter lari);カンピロバクター・ラリディス(Campylobacter laridis);カンピロバクター・ムコサリス(Campylobacter mucosalis);カンピロバクター・レクタス(Campylobacter rectus);カンピロバククー・ショウアエ(Campylobacter showae);カンピロバクター・スプトルム(Campylobacter sputorum);カンピロバクター・ウプサリエンシス(Campylobacter upsaliensis).−− カンジダタス(Candidatus):− ピシクラミジア・サルモニス(Piscichlamydia salmonis).−− カーディオバクテリアセアエ(Cardiobacteriaceae):− カーディオバクテリウム・ホミニス(Cardiobacterium hominis);カーディオバクテリウム・バルバルム(Cardiobacterium valvarum);ディケロバクター・ノドサス(Dichelobacter nodosus).−− クラミジア科(Chlamydiaceae):− クラミジア・アビウム(Chlamydia avium)、クラミジア・ガリナセア(Chlamydia gallinacea)、クラミジア・ムリダルム(Chlamydia muridarum)、クラミジア・スイス(Chlamydia suis)、クラミジア・トラコマチス(Chlamydia trachomatis)を含むクラミジア(Chlamydia)種;クラミドフィラ・ニューモニアエ(Chlamydophila pneumoniae)、クラミドフィラ・ペコルム(Chlamydophila pecorum)、クラミドフィラ・シタッシ(Chlamydophila psittaci)、クラミドフィラ・アボルタス(Chlamydophila abortus)、クラミドフィラ・カビアエ(Chlamydophila caviae)、及びクラミドフィラ・フェリス(Chlamydophila felis)を含むクラミドフィラ(Chlamydophila)種.−− クトノモナダセアエ(Chthonomonadaceae):− クトノモナス・カリディロセア(Chthonomonas calidirosea).−− コマモナス科(Comamonadaceae):− コマモナス・テストステロニ(Comamonas testosteroni);ベルミネフロバクター(Verminephrobacter)種.−− コクシエラ科(Coxiellaceae):− コクシエラ・バーネッティイ(Coxiella burnetii).−− サイトファーガ科(Cytophagaceae):− サイトファーガ・コルムナリス(Cytophaga columnaris);サイトファーガ・ハッチンソニイ(Cytophaga hutchinsonii);フレキシバクター・エキニシダ(Flexibacter echinicida);
フレキシバクター・エレガンス(Flexibacter elegans);フレキシバクター・フレキシリス(Flexibacter flexilis);フレキシバクター・リトラリス(Flexibacter litoralis);フレキシバクター・ポリモーフス(Flexibacter polymorphus);フレキシバクター・ロゼオルス(Flexibacter roseolus);フレキシバクター・ルベー(Flexibacter ruber).−− デスルフォビブリオ科(Desulfovibrionaceae):− ビロフィラ・ワーズワーシア(Bilophila wadsworthia);ローソニア・イントラセルラリス(Lawsonia intracellularis).−− 腸内細菌科(Enterobacteriaceae):− セデセア・ダヴィスアエ(Cedecea davisae);セデセア・ラパゲイ(Cedecea lapagei);セデセア・ネテリ(Cedecea neteri);アマロナティカス(amalonaticus);サイトロバクター・ディバーサス(Citrobacter diversus);サイトロバクター・フレウンディイ(Citrobacter freundii);サイトロバクター・コセリ(Citrobacter koseri);クロノバクター・コンディメンティ(Cronobacter condimenti);クロノバクター・デュブリネンシス(Cronobacter dublinensis);クロノバクター・ヘルベティカス(Cronobacter helveticus);クロノバクター・マロナティカス(Cronobacter malonaticus);クロノバクター・ムイトジェンシイ(Cronobacter muytjensii);クロノバクター・プルベリス(Cronobacter pulveris);クロノバクター・サカザキイ(Cronobacter sakazakii);クロノバクター・ツリセンシス(Cronobacter turicensis);クロノバクター・ユニバーサリス(Cronobacter universalis);クロノバクター・ズリケンシス(Cronobacter zurichensis);エドワージエラ・イクタルリ(Edwardsiella ictaluri);エドワージエラ・タルダ(Edwardsiella tarda);エンテロバクター・アエロゲネス(Enterobacter aerogenes);エンテロバクター・アグロメランス(Enterobacter agglomerans);エンテロバクター・クロアカエ(Enterobacter cloacae);エンテロバクター・コワニイ(Enterobacter cowanii);エシェリキア・アルベルティイ(Escherichia albertii);AIEC=接着性侵襲性大腸菌(E. coli)、EaggEC=腸管凝集性大腸菌;EHEC=腸管出血性大腸菌;EIEC=腸管組織侵入性大腸菌;EPEC=腸管病原性大腸菌;ETEC=腸内毒素原性大腸菌;ExPEC=腸外病原性大腸菌、NMEC=新生児髄膜炎大腸菌、NTEC=壊死性毒素産生性大腸菌、UPEC=尿路疾患性大腸菌を含む大腸菌(Escherichia coli);エシェリキア・ファグソニイ(Escherichia fergusonii);エウィンゲラ・アメリカナ(Ewingella americana);ハフニア・アルベイ(Hafnia alvei);ハフニア・パラルベイ(Hafnia paralvei);クレブシエラ・グラニュロマティス(Klebsiella granulomatis);クレブシエラ・オキシトカ(Klebsiella oxytoca);肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae);クライベラ・アスコルバータ(Kluyvera ascorbata);クライベラ・クリオクレッセンス(Kluyvera cryocrescens);モーガネラ・モーガニイ(Morganella morganii);パントエア(Pantoea)(以前にエンテロバクター(Enterobacter))・アグロメランス(agglomerans);フォトラブダス・アシンビオティカ(Photorhabdus asymbiotica);プレシオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides);プロテウス・ミラビリス(Proteus mirabilis);プロテウス・ペンネリ(Proteus penneri);プロテウス・ブルガリス(Proteus vulgaris);プロビデンシア・アルカリファシエンス(Providencia alcalifaciens);プロビデンシア・レットゲリ(Providencia rettgeri);プロビデンシア・スチュアーティイ(Providencia stuartii);ラオウルテラ・エレクトリカ(Raoultella electrica);ラオウルテラ・オルニチノリティカ(Raoultella ornithinolytica);ラオウルテラ・プランティコーラ(Raoultella planticola);ラオウルテラ・テリジェナ(Raoultella terrigena);サルモネラ・ボンゴリ(Salmonella bongori)、サルモネラ・エンテリカ亜種エンテリカ(Salmonella enterica subspecies enterica)(多くの血清型);セラチア・リクファシエンス(Serratia liquefaciens)(Serratia liquifaciens);セラチア・マルセッセンス(Serratia marcescens)(Serratia marcesans);シゲラ・ボイディイ(Shigella boydii);シゲラ・ディセンテリアエ(Shigella dysenteriae);シゲラ・フレクスネリ(Shigella flexneri);シゲラ・ソンネイ(Shigella sonnei);エルシニア・エンテロコリティカ(Yersinia enterocolitica);ペスト菌(Yersinia pestis);エルシニア・シュードツベルクローシス(Yersinia pseudotuberculosis);エルシニア・ラッケリ(Yersinia ruckeri).−− フィンブリイモナダセアエ(Fimbriimonadaceae):− フィンブリイモナス・ギンセンギソリ(Fimbriimonas ginsengisoli).−− フラボバクテリアセアエ(Flavobacteriaceae):− バージイエラ・ズーヘルカム(Bergeyella zoohelcum);カプノサイトファガ・カニモーサス(Capnocytophaga canimorsus);カプノサイトファガ・シノデグミ(Capnocytophaga cynodegmi);カプノサイトファガ・ジンジバーリス(Capnocytophaga gingivalis);カプノサイトファガ・グラヌロサ(Capnocytophaga granulosa);カプノサイトファガ・ヘモリティカ(Capnocytophaga haemolytica);カプノサイトファガ・リードベッテリ(Capnocytophaga leadbetteri);カプノサイトファガ・オクラセア(Capnocytophaga ochracea);カプノサイトファガ・スプーティゲナ(Capnocytophaga sputigena);クリセオバクテリウム・インドロゲネス(Chryseobacterium indologenes);クリセオバクテリウム・ピシコラ(Chryseobacterium piscicola);エリザベトキンギア・メニンゴセプティカ(Elizabethkingia meningoseptica);フラボバクテリウム・ブランキオフィラム(Flavobacterium branchiophilum);フラボバクテリウム・コルムナーレ(Flavobacterium columnare);フラボバクテリウム・オンコリンキ(Flavobacterium oncorhynchi);フラボバクテリウム・ピスシシダ(Flavobacterium piscicida);フラボバクテリウム・サイクロフィルム(Flavobacterium psychrophilum);ミロイデス・オドラータス(Myroides odoratus);ミロイデス・オドラティミマス(Myroides odoratimimus);オルニソバクテリウム・リノトラケアレ(Ornithobacterium rhinotracheale);リエメレラ・アナティペステイファー(Riemerella anatipestifer);リエメレラ・コロンビーナ(Riemerella columbina);リエメレラ・コルンビファリンギス(Riemerella columbipharyngis);テナチバキュラム・ジセントラルキ(Tenacibaculum dicentrarchi);テナチバキュラム・ディスカラー(Tenacibaculum discolor)(Tenacibaculum discolour);テナチバキュラム・ガライクム(Tenacibaculum gallaicum);テナチバキュラム・マリティマム(Tenacibaculum maritimum);テナチバキュラム・ソレアエ(Tenacibaculum soleae);ウィークセラ・ビローサ(Weeksella virosa).−− フランシセラ科(Francisellaceae):− フランシセラ・ツラレンシス亜種ツラレンシス(Francisella tularensis subsp. tularensis);フランシセラ・ツラレンシス亜種ホラークティカ(Francisella tularensis subsp. holarctica);フランシセラ・ツラレンシス亜種ノビシダ(Francisella tularensis subsp. novicida);フランシセラ・フィロミラギア(Francisella philomiragia);フランシセラ・ノアツネンシス(Francisella noatunensis);フランシセラ・ノアツネンシス亜種オリエンタリス(Francisella noatunensis subsp. orientalis)(フランシセラ・アシアチカ(Francisella asiatica)とも呼ばれる).−− フソバクテリア科(Fusobacteriaceae):− フソバクテリウム・ネクロフォーラム(Fusobacterium necrophorum)、フソバクテリウム・ヌクレアタム(Fusobacterium nucleatum)、フソバクテリウム・ポリモーフム(Fuso-bacterium polymorphum)を含むフソバクテリウム(Fusobacterium)種.−− ヘリコバクター科(Helicobacteraceae):− ヘリコバクター・シナエディ(Helicobacter cinaedi);ヘリコバクター・フェネリアエ(Helicobacter fennelliae);ピロリ菌(Helicobacter pylori).−− レジオネラ科(Legionellaceae):− レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、及びレジオネラ・アニーサ(Legionella anisa);レジオネラ・バーミンガメンシス(Legionella birminghamensis);レジオネラ・ボゼマニイ(Legionella bozemanii)(Legionella bozemannii);レジオネラ・シンシナティエンシス(Legionella cincinnatiensis);レジオネラ・デュモフィイ(Legionella dumoffii);レジオネラ・フィーレイイ(Legionella feeleii);レジオネラ・ゴルマニイ(Legionella gormanii);レジオネラ・ハッケリアエ(Legionella hackeliae);レジオネラ・ジョーダニス(Legionella jordanis);レジオネラ・ランシンゲンシス(Legionella lansingensis);レジオネラ・ロングビーチアエ(Legionella longbeachae);
タトロキア・マセアケルニイ(Legionella maceachernii);レジオネラ・ミクダデイ(Legionella micdadei);レジオネラ・オークリジェンシス(Legionella oakridgensis);レジオネラ・パリシエンシス(Legionella parisiensis);レジオネラ・セントヘレンシ(Legionella sainthelensi)(Legionella sainthelens);レジオネラ・ツクソネンシス(Legionella tucsonensis)(Legionella tusconensis);レジオネラ・ワズワーシイ(Legionella wadsworthii);レジオネラ・ウォルターシイ(Legionella waltersii)を含む他の種.−− レプトスピラ科(Leptospiraceae):− レプトスピラ・アレクサンデリー(Leptospira alexanderi)(レプトスピラ・アレクサンデリー血清型ヘブドマディス(Leptospira alexanderi serovar Hebdomadis)、レプトスピラ・アレクサンデリー血清型マンハオ3(Leptospira alexanderi serovar Manhao 3)を含む);レプトスピラ・アルストニ(Leptospira alstoni)(レプトスピラ・アルストニ血清型ピングチャング(Leptospira alstoni serovar Pingchang)、レプトスピラ・アルストニ血清型シクアン(Leptospira alstoni serovar Sichuan)を含む);レプトスピラ・ビフレクサ(Leptospira biflexa)(レプトスピラ・ビフレクサ血清型アンコナ(Leptospira biflexa serovar Ancona)、レプトスピラ・ビフレクサ血清型カネラ(Leptospira biflexa serovar Canela)を含む);レプトスピラ・ボルグピータセニイ(Leptospira borgpetersenii)(レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ハルジョ(Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ハルジョ−ボビス(Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型ポモナ(Leptospira borgpetersenii serovar Pomona)、レプトスピラ・ボルグピータセニイ血清型タラッソビ(Leptospira borgpetersenii serovar Tarassovi)を含む);レプトスピラ・ブローミイ(Leptospira broomii)(レプトスピラ・ブローミイ(Leptospira broomii)血清型ハーストブリッジを含む);レプトスピラ・ファイネイ(Leptospira fainei)(レプトスピラ・ファイネイ血清型ハーストブリッジ(Leptospira fainei serovar Hurstbridge)を含む);レプトスピラ・イドニイ(Leptospira idonii);レプトスピラ・イナダイ(Leptospira inadai)(レプトスピラ・イナダイ血清型ライム(Leptospira inadai serovar Lyme)、レプトスピラ・イナダイ血清型マラヤ(Leptospira inadai serovar Malaya)を含む);レプトスピラ・インターロガンス(Leptospira interrogans)(レプトスピラ・インターロガンス血清型オーストラリス(Leptospira interrogans serovar Australis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型オータムナリス(Leptospira interrogans serovar Autumnalis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ブラティスラバ(Leptospira interrogans serovar Bratislava)、レプトスピラ・インターロガンス血清型カニコーラ(Leptospira interrogans serovar Canicola)、レプトスピラ・インターロガンス血清型グリポティフォーサ(Leptospira interrogans serovar Grippotyphosa)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ハルジョ(Leptospira interrogans serovar Hardjo)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ハルジョ−ボビス(Leptospira interrogans serovar Hardjo-bovis)、レプトスピラ・インターロガンス血清型イクテロヘモラジア(Leptospira interrogans serovar Icterohaemorrhagiae)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ポモナ(Leptospira interrogans serovar Pomona)、レプトスピラ・インターロガンス血清型ピロゲネス(Leptospira interrogans serovar Pyrogenes)、レプトスピラ・インターロガンス血清型タラッソビ(Leptospira interrogans serovar Tarassovi)を含む);レプトスピラ・カースクネリー(Leptospira kirschneri)(レプトスピラ・カースクネリー血清型ブルガリカ(Leptospira kirschneri serovar Bulgarica)、レプトスピラ・カースクネリー血清型シノプテリ(Leptospira kirschneri serovar Cynopteri)、レプトスピラ・カースクネリー血清型グリポティフォーサ(Leptospira kirschneri serovar Grippotyphosa)を含む);レプトスピラ・メチイ(Leptospira kmetyi);レプトスピラ・リセラシアエ(Leptospira licerasiae);レプトスピラ・メイエリー(Leptospira meyeri)(レプトスピラ・メイエリー血清型ソフィア(Leptospira meyeri serovar Sofia)を含む);レプトスピラ・ノグチイ(Leptospira noguchii)(レプトスピラ・ノグチイ血清型パナマ(Leptospira noguchii serovar Panama)、レプトスピラ・ノグチイ血清型ポモナ(Leptospira noguchii serovar Pomona)を含む);レプトスピラ・サンタロサイ(Leptospira santarosai);レプトスピラ・テルプストラエ(Leptospira terpstrae);レプトスピラ・バンチエリイ(Leptospira vanthielii);レプトスピラ・ウェイリイ(Leptospira weilii)(レプトスピラ・ウェイリイ血清型セレドニ(Leptospira weilii serovar Celledoni)、レプトスピラ・ウェイリイ血清型サルミン(Leptospira weilii serovar Sarmin)を含む);レプトスピラ・ウォルバキイ(Leptospira wolbachii);レプトスピラ・ウォルフィイ(Leptospira wolffii);レプトスピラ・ヤナガワエ(Leptospira yanagawae).−− レプトトリキア科(Leptotrichiaceae):− レプトトリキア・ブカリス(Leptotrichia buccalis);ストレプトバチルス・モニリフォルミス(Streptobacillus moniliformis).−− メチロバクテリウム科(Methylobacteriaceae):− メチロバクテリウム・エクストルケンス(Methylobacterium extorquens)群;メチロバクテリウム・フジサワエンス(Methylobacterium fujisawaense);メチロバクテリウム・メソフィリカム(Methylobacterium mesophilicum);メチロバクテリウム・ザトマニイ(Methylobacterium zatmanii).−− モラクセラ科(Moraxellaceae):− アシネトバクター・バウマンニイ(Acinetobacter baumannii)(ゲノム種2);アシネトバクター・バイリイ(Acinetobacter baylyi);アシネトバクター・ブーヴェティイ(Acinetobacter bouvetii);アシネトバクター・カルコアセチカス(Acinetobacter calcoaceticus)(ゲノム種1);アシネトバクター・ゲルネリ(Acinetobacter gerneri);アシネトバクター・グリモンティイ(Acinetobacter grimontii);アシネトバクター・ヘモリティカス(Acinetobacter haemolyticus)(ゲノム種4);アシネトバクター・ジョンソニイ(Acinetobacter johnsonii)(ゲノム種7);アシネトバクター・ジュニイ(Acinetobacter junii)(ゲノム種5);アシネトバクター・ルヴォフィイ(Acinetobacter lwoffii)(Acinetobacter lwoffi)(ゲノム種8/9);アシネトバクター・パルブス(Acinetobacter parvus);アシネトバクター・レイディオレジステンス(Acinetobacter radioresistens)(ゲノム種12);アシネトバクター・シンドレリ(Acinetobacter schindleri);アシネトバクター・タンドイイ(Acinetobacter tandoii);アシネトバクター・チェルンベルギアエ(Acinetobacter tjernbergiae);アシネトバクター・タウネリ(Acinetobacter towneri);アシネトバクター・ウルシンギイ(Acinetobacter ursingii);アシネトバクター・べネチアヌス(Acinetobacter venetianus);モラクセラ・アトランタエ(Moraxella atlantae);モラクセラ・ベーブレイ(Moraxella boevrei);モラクセラ・ボービス(Moraxella bovis);モラクセラ・ボーボクリ(Moraxella bovoculi);モラクセラ・カニス(Moraxella canis);モラクセラ・カプラエ(Moraxella caprae);モラクセラ・カタラーリス(Moraxella catarrhalis);モラクセラ・カビアエ(Moraxella caviae);モラクセラ・クニクリ(Moraxella cuniculi);モラクセラ・エクイ(Moraxella equi);モラクセラ・ラクナータ(Moraxella lacunata);モラクセラ・リンカーニイ(Moraxella lincolnii);モラクセラ・マカカエ(Moraxella macacae);モラクセラ・ノンリクエファシエンス(Moraxella nonliquefaciens);モラクセラ・オブロンガ(Moraxella oblonga);モラクセラ・オスロエンシス(Moraxella osloensis);モラクセラ・オビス(Moraxella ovis);サイクロバクター・フェニルピルビカ(Moraxella phenylpyruvica);モラクセラ・プルラニマリウム(Moraxella pluranimalium);モラクセラ・ポルシ(Moraxella porci).−− モリテラセアエ(Moritellaceae):− モリテラ・アビシ(Moritella abyssi);モリテラ・ダサネンシス(Moritella dasanensis);モリテラ・ジャポニカ(Moritella japonica);モリテラ・マリナ(Moritella marina);モリテラ・プロファンダ(Moritella profunda);モリテラ・ビスコーサ(Moritella viscosa);モリテラ・ヤヤノシイ(Moritella yayanosii).−− ナイセリア科(Neisseriaceae):− クロモバクテリウム・ビオラセウム(Chromobacterium violaceum);エイケネラ・コローデンス(Eikenella corrodens);キンゲラ・デニトリフィカンス(Kingella denitrificans)、キンゲラ・キンガエ(Kingella kingae)、キンゲラ・オラリス(Kingella oralis)、キンゲラ・ポトス(Kingella potus);ナイセリア・シネレア(Neisseria cinerea);ナイセリア・エロンガータ(Neisseria elongata);ナイセリア・フラベッセンス(Neisseria flavescens);淋菌(Neisseria gonorrhoeae);ナイセリア・ラクタミカ(Neisseria lactamica);髄膜炎菌(Neisseria meningitidis);ナイセリア・ムコーサ(Neisseria mucosa);ナイセリア・ポリサッカレア(Neisseria polysaccharea);ナイセリア・シッカ(Neisseria sicca);ナイセリア・サブフラバ(Neisseria subflava);ナイセリア・ウィーバリ(Neisseria weaveri)(Neisseria weaver);ビトレオスチラ(Vitreoscilla)種.−− ニトロソモナス科(Nitrosomonadaceae):− ニトロソモナス・ユートロファ(Nitrosomonas eutropha);ニトロソモナス・ハロフィラ(Nitrosomonas halophila);ニトロソモナス・オリゴトロファ(Nitrosomonas oligotropha).−− パスツレラ科(Pasteurellaceae):− アクチノバチルス・アクチノミセテムコミタンス(Actinobacillus actinomycetemcomitans);アクチノバチルス・エクリ(Actinobacillus equuli);アクチノバチルス・リグニエレシイ(Actinobacillus lignieresii);アクチノバチルス・プルロニューモニアエ(Actinobacillus pleuropneumoniae);アクチノバチルス・セミニス(Actinobacillus seminis);アクチノバチルス・サクシノゲネス(Actinobacillus succinogenes);アクチノバチルス・ウレアエ(Actinobacillus ureae);アグレガチバクター・アクチノミセテムコミタンス(Aggregatibacter actinomycetemcomitans)、アグレガチバクター・セグニス(Aggregatibacter segnis)、アグレガチバクター・アフロフィルス(Aggregatibacter aphrophilus);アビバクテリウム・アビウム(Avibacterium avium);アビバクテリウム・エンドカルジチジス(Avibacterium endocarditidis);アビバクテリウム・ガリナルム(Avibacterium gallinarum);アビバクテリウム・パラガリナルム(Avibacterium paragallinarum);アビバクテリウム・ボランティウム(Avibacterium volantium);ビベルステイニア・トレハロシ(Bibersteinia trehalosi)(Bibersteinia trehalose);ガリバクテリウム・アナティス(Gallibacterium anatis);ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種1;ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種2;
ガリバクテリウム(Gallibacterium)遺伝種3;ガリバクテリウム(Gallibacterium)群V;ガリバクテリウム・メロプシッタシ(Gallibacterium melopsittaci);ガリバクテリウム・サルピンギチジス(Gallibacterium salpingitidis);ガリバクテリウム・トレハロシフェルメンタンス(Gallibacterium trehalosifermentans);ヘモフィラス・エジプティウス(Haemophilus aegyptius);ヘモフィラス・アビウム(Haemophilus avium);ヘモフィラス・デュクレイー(Haemophilus ducreyi);ヘモフィラス・ヘモリティカス(Haemophilus haemolyticus);インフルエンザ菌(Haemophilus influenzae);ヘモフィラス・パラヘモリティカス(Haemophilus parahaemolyticus);ヘモフィラス・パラインフルエンザエ(Haemophilus parainfluenzae);ヘモフィラス・パラスイス(Haemophilus parasuis);ヒストフィラス・ソムニー(Histophilus somni);マンヘイミア・カビアエ(Mannheimia caviae);マンヘイミア・グルコシダ(Mannheimia glucosida);マンヘイミア・グラニュロマティス(Mannheimia granulomatis);マンヘイミア・ヘモリティカ(Mannheimia haemolytica);マンヘイミア・ルミナリス(Mannheimia ruminalis);マンヘイミア・バリゲナ(Mannheimia varigena);ニコレテラ・セモリナ(Nicoletella semolina);パスツレラ・エロゲネス(Pasteurella aerogenes);パスツレラ・ベッティアエ(Pasteurella bettyae);パスツレラ・カバリイ(Pasteurella caballi);パスツレラ・カニス(Pasteurella canis);パスツレラ・ダグマティス(Pasteurella dagmatis);パスツレラ・ムルトシダ(Pasteurella multocida)(亜種ムルトシダ(multocida)、セプティカム(septicum)、ガリシダ(gallicida));パスツレラ・ニューモトロピカ(Pasteurella pneumotropica);パスツレラ・ストマティス(Pasteurella stomatis);パスツレラ・トレハロシ(Pasteurella trehalosi).−− ピシリケッチア科(Piscirickettsiaceae):− ピシリケッチア・サルモニス(Piscirickettsia salmonis).−− プレシオモナダセアエ(Plesiomonadaceae):− プレシオモナス・シゲロイデス(Plesiomonas shigelloides).−− ポリアンギウム科(Polyangiaceae):− ソランギウム・セルロスム(Sorangium cellulosum).−− ポルフィロモナス科(Porphyromonadaceae):− ディスゴノモナス・カプノサイトファゴイデス(Dysgonomonas capnocytophagoides);ディスゴノモナス・ガデイ(Dysgonomonas gadei);ディスゴノモナス・ホフスタジイ(Dysgonomonas hofstadii);ディスゴノモナス・モッシイ(Dysgonomonas mossii);ディスゴノモナス・オリザルビ(Dysgonomonas oryzarvi);ディスゴノモナス・ウィンペンニイ(Dysgonomonas wimpennyi);ポルフィロモナス・ジンジバリス(Porphyromonas gingivalis).−− プレボテラ科(Prevotellaceae):− プレボテラ・インターメディア(Prevotella intermedia)、プレボテラ・メラニノジェニカ(Prevotella melaninogenica)を含むプレボテラ(Prevotella)種.−− シュードモナス科:− クリセオモナス・ルテオラ(Chryseomonas luteola);緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa);シュードモナス・ルテオラ(Pseudomonas luteola);シュードモナス・フルオレッセンス(Pseudomonas fluorescens);シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida);シュードモナス・スタッツェリ(Pseudomonas stutzeri);シュードモナス・オリジハビタンス(Pseudomonas oryzihabitans).−− リゾビウム科(Rhizobiaceae):− アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens);リゾビウム・ラジオバクター(Rhizobium radiobacter).−− リケッチア科(Rickettsiaceae):− オリエンティア・クト(Orientia chuto);オリエンティア・ツツガムシ(Orientia tsutsugamushi);リケッチア・アエスクリマンニイ(Rickettsia aeschlimannii);リケッチア・アフリカーエ(Rickettsia africae);リケッチア・アカリ(Rickettsia akari);リケッチア・アルガシイ(Rickettsia argasii);リケッチア・アシアティカ(Rickettsia asiatica);リケッチア・オーストラリス(Rickettsia australis);リケッチア・ベリイ(Rickettsia bellii);リケッチア・カナデンシス(Rickettsia canadensis);リケッチア・コノーリイ(Rickettsia conorii);リケッチア・コオレイ(Rickettsia cooleyi);リケッチア・フェリス(Rickettsia felis);リケッチア・ヘイロンジャンゲンシス(Rickettsia heilongjiangensis);リケッチア・ヘルベティカ(Rickettsia helvetica);リケッチア・ホネイ(Rickettsia honei);リケッチア・ホオグストラアリイ(Rickettsia hoogstraalii);リケッチア・フリネンシス(Rickettsia hulinensis);リケッチア・フリニイ(Rickettsia hulinii);リケッチア・ジャポニカ(Rickettsia japonica);リケッチア・マルミオニイ(Rickettsia marmionii);リケッチア・マルチネト(Rickettsia martinet);リケッチア・マッシリアーエ(Rickettsia massiliae);リケッチア・モナセンシス(Rickettsia monacensis);リケッチア・モンタネンシス(Rickettsia montanensis);リケッチア・モンテイロイ(Rickettsia monteiroi);リケッチア・モレリ(Rickettsia moreli);リケッチア・パルケリー(Rickettsia parkeri);リケッチア・ピーコッキイ(Rickettsia peacockii);リケッチア・フィリピイ(Rickettsia philipii);発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii);リケッチア・ラオウルチイ(Rickettsia raoultii);リケッチア・リピセプハリー(Rickettsia rhipicephali);リケッチア・リケッチイ(Rickettsia rickettsii);リケッチア・シビリカ(Rickettsia sibirica)亜群;リケッチア・スロバカ(Rickettsia slovaca);リケッチア・タムラエ(Rickettsia tamurae);リケッチア・ティフィー(Rickettsia typhi).−− シュワネラ科(Shewanellaceae):− シュワネラ・プトレファシエンス(Shewanella putrefaciens).−− スフィンゴモナス科(Sphingomonadaceae):− スフィンゴバクテリウム・マルチボラム(Sphingobacterium multivorum);スフィンゴバクテリウム・スピリティボラム(Sphingobacterium spiritivorum);スフィンゴモナス・パウシモビリス(Sphingomonas paucimobilis).−− スピリルム科(Spirillaceae):− スピリルム・ミヌス(Spirillum minus);スピリルム・ボルタンス(Spirillum volutans);スピリルム・ウィノグラドスキイ(Spirillum winogradskyi).−− スピロヘータ科(Spirochaetaceae):− ボレリア・アフゼリイ(Borrelia afzelii);ボレリア・アンセリナ(Borrelia anserina);ボレリア・ビセッティ(Borrelia bissettii);ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi);ボレリア・コリアセアエ(Borrelia coriaceae);ボレリア・デュトニイ(Borrelia duttonii);ボレリア・ガリニイ(Borrelia garinii);ボレリア・ハームシイ(Borrelia hermsii);ボレリア・ヒスパニカ(Borrelia hispanica);ボレリア・ジャポニカ(Borrelia japonica);ボレリア・ロネスタリ(Borrelia lonestari);ボレリア・ルシタニアエ(Borrelia lusitaniae);ボレリア・ミヤモトイ(Borrelia miyamotoi);ボレリア・パルケリ(Borrelia parkeri);ボレリア・ペルシカ(Borrelia persica);ボレリア・レカレンティス(Borrelia recurrentis);ボレリア・スピエルマニイ(Borrelia spielmanii);ボレリア・ツリカタエ(Borrelia turicatae);ボレリア・ツリカタエ;ボレリア・バレイシアナ(Borrelia valaisiana);トレポネーマ・カラテウム(Treponema carateum);トレポネーマ・パリダム種エンデミカム(Treponema pallidum ssp. endemicum);トレポネーマ・パリダム種パリダム(Treponema pallidum ssp. pallidum);トレポネーマ・パリダム種ペルテヌエ(Treponema pallidum ssp. pertenue).−− サクシニビブリオ科(Succinivibrionaceae):− アナエロビオスピリルム(Anaerobiospirillum)種.−− ステレラ科(Sutterellaceae):− ステレラ・ワーズワーシア(Sutterella wadsworthia)を含むステレラ(Sutterella)種.−− テルムス科(Thermaceae):− メイオサーマス(Meiothermus)種.−− サーモトガ科(Thermotogaceae):− サーモトガ・ネアポリタナ(Thermotoga neapolitana).−− ヴェイヨネラ科(Veillonellaceae):− ディアリスター(Dialister)種;メガモナス(Megamonas)種;メガスファエラ(Megasphaera)種;ペクチナータス(Pectinatus)種;ペロシヌス(Pelosinus)種;プロピオニスポラ(Propionispora)種;スポロミュサ(Sporomusa)種;ベイロネラ(Veillonella)種;ザイモフィラス(Zymophilus)種.−− ビブリオ科(Vibrionaceae):− フォトバクテリウム・ダムセラエ(Photobacterium damselae);ビブリオ・アダプタツス(Vibrio adaptatus);ビブリオ・アルギノリティカス(Vibrio alginolyticus);ビブリオ・アザシイ(Vibrio azasii);ビブリオ・キャンプベリイ(Vibrio campbellii);コレラ菌(Vibrio cholera);ビブリオ・ダムセラエ(Vibrio damselae)(Vibrio damsel);ビブリオ・フルビアリス(Vibrio fluvialis);ビブリオ・ファーニシイ(Vibrio furnisii);グリモンチア・ホリザエ(Vibrio hollisae);ビブリオ・メチニコフィイ(Vibrio metschnikovii);ビブリオ・ミミカス(Vibrio mimicus);ビブリオ・パラヘモリティカス(Vibrio parahaemolyticus);ビブリオ・バルニフィカス(Vibrio vulnificus).−− ボルバキア科(Wolbachieae):− ボルバキア(Wolbachia)種.−− キサントモナス科(Xanthomonadaceae):− ルテイモナス・アエスツアリイ(Luteimonas aestuarii);ルテイモナス・アクアティカ(Luteimonas aquatica);ルテイモナス・コンポスチ(Luteimonas composti);ルテイモナス・ルティマリス(Luteimonas lutimaris);ルテイモナス・マリナ(Luteimonas marina);ルテイモナス・メフィティス(Luteimonas mephitis);ルテイモナス・バドサ(Luteimonas vadosa);シュードキサントモナス・ブレーグベルネンシス(Pseudoxanthomonas broegbernensis);シュードキサントモナス・ジャポネンシス(Pseudoxanthomonas japonensis);ステノトロホモナス・マルトフィリア(Stenotrophomonas maltophilia);並びにステノトロホモナス・ニトリティレデュセンス(Stenotrophomonas nitritireducens)を含む群から選択される請求項2に記載の組成物。 - 前記グラム陰性細菌が、アシネトバクター種、アエロモナス・ヒドロフィラ(Aeromonas hydrophila)、サイトロバクター(Citrobacter)種、エンテロバクター種、大腸菌、肺炎桿菌、モーガネラ・モーガニイ(Morganella morganii)、緑膿菌、及びステノトロホモナス・マルトフィリア(Stenotrophomonas maltophilia)を含む群から選択される請求項21に記載組成物。
- 前記グラム陰性細菌が、細胞壁を有さない請求項2に記載の組成物。
- 前記グラム陰性細菌が、マイコプラズマ種、マイコプラズマ・アガラクティアエ(Mycoplasma agalactiae)、マイコプラズマ・アルカレッセンス(Mycoplasma alkalescens)、マイコプラズマ・アンフォリフォルメ(Mycoplasma amphoriforme)、マイコプラズマ・アルギニニ(Mycoplasma arginini)、マイコプラズマ・ボービゲニタリウム(Mycoplasma bovigenitalium)(Mycoplasma bovigenitalum)、マイコプラズマ・ボービリニス(Mycoplasma bovirhinis)、マイコプラズマ・ボービス(Mycoplasma bovis)、マイコプラズマ・ボーボクリ(Mycoplasma bovoculi)、マイコプラズマ・ブカーレ(Mycoplasma buccale)、マイコプラズマ・カリフォルニカム(Mycoplasma californicum)、マイコプラズマ・カナデンス(Mycoplasma canadense)、マイコプラズマ・カプリコラム亜種カプリコラム(Mycoplasma capricolum subsp. capricolum)、マイコプラズマ・カプリコラム亜種カプリニューモニアエ(Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae)、マイコプラズマ・コンジャンクティバエ(Mycoplasma conjunctivae)、マイコプラズマ・シノス(Mycoplasma cynos)、マイコプラズマ・ディスパー(Mycoplasma dispar)、マイコプラズマ・イクイゲニタリウム(Mycoplasma equigenitalium)、マイコプラズマ・ファウシウム(Mycoplasma faucium)、マイコプラズマ・フェリス(Mycoplasma felis)、マイコプラズマ・フェルメンタンス(Mycoplasma fermentans)(インコグニタス株)、マイコプラズマ・ガリセプティカム(Mycoplasma gallisepticum)(MG)、マイコプラズマ・ガテアエ(Mycoplasma gateae)、マイコプラズマ・ジェニタリウム(Mycoplasma genitalium)、マイコプラズマ・ヘモカニス(Mycoplasma haemocanis)、マイコプラズマ・ヘモフェリス(Mycoplasma haemofelis)、マイコプラズマ・ヘモスイス(Mycoplasma haemosuis)(以前にエペリスロゾーン・スイス(Eperythrozoon suis))、マイコプラズマ・ホミニス(Mycoplasma hominis)、マイコプラズマ・ヒオニューモニエ(Mycoplasma hyopneumoniae)、マイコプラズマ・ハイオリニス(Mycoplasma hyorhinis)、マイコプラズマ・ハイオシノビアエ(Mycoplasma hyosynoviae)、マイコプラズマ・アイオワエ・メレアグリディス(Mycoplasma iowae meleagridis)(MM)、マイコプラズマ・アイオワエ(Mycoplasma iowae)、マイコプラズマ・リーチイ(Mycoplasma leachii)、マイコプラズマ・リポフィラム(Mycoplasma lipophilum)、マイコプラズマ・メレアグリディス(Mycoplasma meleagridis)、マイコプラズマ・マイコイデス亜種カプリ(Mycoplasma mycoides subsp capri)、マイコプラズマ・マイコイデス亜種マイコイデス(Mycoplasma mycoides subsp mycoides)、マイコプラズマ・マイコイデス亜種マイコイデス(Mycoplasma mycoides subsp. mycoides)(伝染性ウシ胸膜肺炎CBPPなど)、マイコプラズマ・オラーレ(Mycoplasma orale)、マイコプラズマ・オビニューモニアエ(Mycoplasma ovipneumoniae)、マイコプラズマ・オビス(Mycoplasma ovis)、マイコプラズマ・ペネトランス(Mycoplasma penetrans)、マイコプラズマ・ピラム(Mycoplasma pirum)、マイコプラズマ・ニューモニアエ(Mycoplasma pneumoniae)、マイコプラズマ・プリマタム(Mycoplasma primatum)、マイコプラズマ・プトレファシエンス(Mycoplasma putrefaciens)、マイコプラズマ・サリバリウム(Mycoplasma salivarium)、マイコプラズマ・スペルマトフィラム(Mycoplasma spermatophilum)、マイコプラズマ・スイス(Mycoplasma suis)、マイコプラズマ・シノビアエ(Mycoplasma synoviae)(MS)、マイコプラズマ・ウェニオニイ(Mycoplasma wenyonii)、マイコプラズマ(Mycoplasma)、ウレアプラズマ(Ureaplasma)種、ウレアプラズマ・パルバム(Ureaplasma parvum)、ウレアプラズマ・ウレアリティカム(Ureaplasma urealyticum)、ウレアプラズマ、及びウレアプラズマ・ディベルサム(Ureaplasma diversum)を含む群から選択される請求項23に記載の組成物。
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