JP4890132B2 - ウリカーゼの比活性を向上させる方法、および比活性の向上した改変型ウリカーゼ - Google Patents
ウリカーゼの比活性を向上させる方法、および比活性の向上した改変型ウリカーゼ Download PDFInfo
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しかしながら、従来のウリカーゼは一般的に酵素の比活性が低いことが知られていた。
項1.改変前のウリカーゼ活性を有する蛋白質を構成するアミノ酸配列のうち、サブユニットのインターフェースに位置するループ領域もしくはそのループ領域と相互作用する領域に位置するアミノ酸の1もしくは数個を欠失、置換もしくは付加することを含む、改変前と比較して、ウリカーゼ活性を有する蛋白質の比活性を向上させる方法。
項2.サブユニットのインターフェースに位置するループ領域が、改変前のウリカーゼ活性を有する蛋白質のT-foldモチーフ構造中のN末端側から3番目と4番目のβストランドをつなぐループ領域であることを特徴とする項1記載の方法。
項3.配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列と、アミノ酸配列が50%以上の相同性を有するアミノ酸配列からなる、項1または2に記載の方法によって比活性が向上したウリカーゼ改変体。
項4.配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列と、アミノ酸配列が80%以上の相同性を有するアミノ酸配列からなる、項1または2に記載の方法によって比活性が向上したウリカーゼ改変体。
項5.配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列の287位、279位またはそれらと同等の位置のアミノ酸が他のアミノ酸に置換されているアミノ酸配列からなる、項3または4記載のウリカーゼ改変体。
項6.配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列の287位のアミノ酸がグリシンに置換されているアミノ酸配列からなる、項5に記載のウリカーゼ改変体。
項7.配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列の279位のアミノ酸がロイシンに置換されているアミノ酸配列からなる、項5に記載のウリカーゼ改変体。
項8.項3〜7のいずれか1項に記載のウリカーゼ改変体を含む尿酸測定キット。
項9.項3〜7のいずれか1項に記載のウリカーゼ改変体を含む尿酸センサー。
項10.項3〜7のいずれか1項に記載のウリカーゼ改変体をコードする遺伝子。
項11.項10に記載の遺伝子を含むベクター。
項12.項11に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
項13.項12に記載の形質転換体を培養することを特徴とするウリカーゼ改変体の製造方法。
本発明における「比活性の向上」とは、改変体(a)と改変前の親タンパク質(b)が各々十分に精製され、適当な緩衝液中に溶解された状態で比較した場合の比活性が、(a)>(b)となるような状態をいう。「比活性の向上」の基準としては、(b)の比活性に対して(a)の比活性が高いと判断される場合であればよいが、活性測定において生じる分析誤差も考慮すれば、(a)の比活性が(b)の比活性に比べて5%以上向上した状態であれば好ましい。「十分に精製された」とは、例えばSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により、ウリカーゼ以外の夾雑タンパク質が見られない状態をいう。「適当な緩衝液」は、ウリカーゼが作用するpH範囲で十分な緩衝能を持つよう、その種類と濃度を選べば特に限定されないが、例えば、50mMトリス緩衝液(pH8.0)、または、50mMのPIPES−NaOH緩衝液(pH7.0)などが選択される。診断薬用途などを想定して、緩衝液にはさらに界面活性剤、塩類、キレート剤、防腐剤などを含んでいてもよい。
ウリカーゼのサブユニットは、共通してT-foldと呼ばれるモチーフの繰り返し構造を有することが知られている。T-foldモチーフは4つのβストランド(以下、N末側からS1,S2,S3,S4とする)と2つのαヘリックスからなる。サブユニット界面に存在するループはトポロジー構造上、S1とS2をつなぐループまたはS3とS4をつなぐループに限定されるが、本発明において好ましくは、S3とS4をつなぐループインターフェースループが選択される。
なかでも、配列番号2の129-132、142-146、277-279、283-294および295-300位のアミノ酸領域が比活性向上に効果がある点で好ましいと考えられ、特に、W279、P287が好ましい。
改変の対象となるアミノ酸は、好ましくはサブユニットのインターフェースに位置するループ領域から半径10オングストローム以内に存在するアミノ酸である。
より詳細には、例えば、Bacillus sp.TB−90株に由来するウリカーゼが例示され、そのアミノ酸配列は配列表の配列番号2、当該アミノ酸配列をコードする遺伝子は配列番号1でそれぞれ示される。これらの両配列はいずれも特許第1966484号公報に記載されている。なお、配列番号2において、アミノ酸の表記は、メチオニンを1として番号付けされている。
このような改変部位としては、例えば、バチルス・エスピー(Bacillus sp.)TB−90株由来のウリカーゼをコードするアミノ酸配列(配列番号2)では、287位および279位のアミノ酸が例示される。配列番号2における287位および279位のアミノ酸では、各々、特にグリシンおよびロイシンに置換されてなるものが好ましい。
なお、当業者であれば、上記で例示した287位および279位に限らず、該当領域のアミノ酸を適宜選択して変換することで、高い確率で比活性が向上する改変体を取得することが期待できる。
例えば、アスペルギルス・フラバス(Aspergillus flavus株由来のウリカーゼは、バチルス・エスピー(Bacillus sp.)TB−90株と一次配列上の相同性は26%と低いことが知られているが(J.Biochem.119,80-84,1996)、立体構造上高い類似性を有しており、本発明を用いてウリカーゼの比活性を向上させることができる。
なお、アミノ酸配列の相同性は、例えば、GENETYX等の市販の遺伝子解析ソフトウェアを利用した2種類の配列のhomology searchにより検索することができる。
さらに、本発明のウリカーゼ改変体は、尿酸に対する作用性が本質的に維持される限り、そのアミノ酸配列にヒスチジンタグなどのタグを結合または挿入させた態様、あるいは少なくとも一方の末端に他のペプチドや他の蛋白質(例えばストレプトアビジンやシトクロム)を融合させた態様、糖鎖や他の化合物により化学修飾された態様、分子内および/または分子間でジスルフィド結合などにより架橋されたものやリンカーペプチドなどを介して連結されたもの等の態様をも含み得る。または、いくつかに由来する野生型ウリカーゼの断片を組み合わせて構成したキメラ蛋白質も含み得る。
ベクターとしてプラスミドを用いる場合、例えば、エシェリヒア・コリー(Escherichia coli)を宿主微生物とする場合にはpBluescript,pUC18などが使用できる。宿主微生物としては、例えば、エシェリヒア・コリー W3110、エシェリヒア・コリーC600、エシェリヒア・コリーJM109、エシェリヒア・コリーDH5αなどが利用できる。宿主微生物に組換えベクターを移入する方法としては、例えば宿主微生物がエシェリヒア属に属する微生物の場合には、カルシウムイオンの存在下で組換えDNAの移入を行なう方法などを採用することができ、更にエレクトロポレーション法を用いても良い。更には、市販のコンピテントセル(例えば、コンピテントハイJM109;東洋紡績製)を用いても良い。
本発明の別の一形態は、項3〜7のいずれかに記載のウリカーゼを含む尿酸測定センサーである。
本発明へのそれらの添加物の配合法は特に制限されるものではない。例えばウリカーゼ改変体を含む緩衝液に添加剤を配合する方法、添加剤を含む緩衝液にウリカーゼ改変体を配合する方法、あるいはウリカーゼ改変体と安定化剤を緩衝液に同時に配合する方法などが挙げられる。
使用できるアルブミンとしては、牛血清アルブミン(BSA)、卵白アルブミン(OVA)などが挙げられる。特にBSAが好ましい。該アルブミンの含有量は、好ましくは1〜80%(重量比)、より好ましくは5〜70%(重量比)の範囲で使用される。
宿主由来のタンパク質成分以外のタンパク質成分としては、例えばBSA等の生体由来物質が挙げられる。
また、粉末組成物において、緩衝剤の含有量(W/W)は、1.0%〜50%であることが望ましい。
ウリカーゼ活性は、尿酸を基質とし、ウリカーゼ反応による尿酸の消失を吸光度の変化で測定した。40μMの尿酸、0.00083%(W/V)のトリトンX−100および0.83mMのEDTAを含む42mM ホウ酸緩衝液(pH8.0) 2.5mlを37℃で5分間予備加温後、予め、酵素希釈液(0.001%(W/V)のトリトンX−100および0.1mMのEDTAを含む50mM ホウ酸緩衝液(pH8.0))で希釈したウリカーゼ溶液0.5mlを加え、反応を開始する。37℃で正確に5分間反応させた後、20%(W/V)のKOH水溶液0.2mlを加えて反応を停止させ、290nmの吸光度を測定する(ΔODtest)。盲検は酵素溶液の代わりに酵素希釈液0.5mlを加え、上記同様に操作を行って吸光度を測定した(ΔODblank)。得られた吸光度より、下記計算式に基づきウリカーゼの酵素活性を算出した。尚、上記条件で1分間に1マイクロモルの尿酸を酸化する酵素量を1単位(U)とする。
計算式
活性値(U/ml)={ΔOD/min(ΔODtest−ΔODblank)×3.2(ml)×希釈倍率}/{12.2×1.0(cm)×0.5(ml)}
3.2(ml):全液量
12.2:尿酸を上記測定条件下で測定した時のミリモル吸光係数
1.0cm:セルの光路長
0.5(ml):酵素サンプル液量
バチルス・エスピー(TB−90株)由来のウリカーゼ遺伝子を含む発現プラスミドpKU1(特許第1966484号公報)と、配列表の配列番号3記載の合成オリゴヌクレオチドおよびこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを用いて、QuickChangeTM Site-Directed Mutagenesis Kit(STRATAGENE製)を使用して、そのプロトコールに従って変異処理操作を行い、更に塩基配列を決定して、配列番号2に記載のアミノ酸配列の287番目のプロリンがグリシンに置換されたウリカーゼ改変体をコードする組換えプラスミド(pUODM1)を取得した。
実施例1で取得した組換えプラスミド(pUODM1)を用いて、エシェリヒア・コリーJM109株コンピテントセル(東洋紡績製)を形質転換し、該形質転換体を取得した。得られた形質転換体は、エシェリヒア・コリーJM109(pUODM1)と命名した。500mlのTB培地を2L容坂口フラスコに分注し、121℃、20分間オートクレーブを行い、放冷後別途無菌濾過したアンピシリンとイソプロピル−β−D−チオガラクトシドをそれぞれ終濃度が100μl/mlと0.1mMになるように添加した。この培地に100μl/mlのアンピシリンを含むLB培地で予め30℃、16時間培養したエシェリヒア・コリーJM109(pUODM1)の培養液を5ml接種し、37℃で24時間通気攪拌培養を行った。培養終了より菌体を遠心分離により集菌し、50mMホウ酸緩衝液(pH8.0)に懸濁した後、フレンチプレスにて破砕し、更に遠心分離を行い、上清液を粗酵素液として得た。得られた粗酵素液をポリエチレンイミンによる除核酸および硫安分画を行い、55℃、1時間の熱処理後、50mMホウ酸緩衝液(pH8.0)で透析を行った。更にDEAEセファロースCL−6B(GEヘルスケアバイオサイエンス製)、およびオクチルセファロース(GEヘルスケアバイオサオエンス製)の各カラムクロマトグラフィーにより分離・精製することにより、精製酵素標品(P287G)を得た。本方法により得られた標品は、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により、単一であることが確認された。
バチルス・エスピー(TB−90株)由来のウリカーゼ遺伝子を含む発現プラスミドpKU1(特許第1966484号公報)と、配列表の配列番号4記載の合成オリゴヌクレオチドおよびこれと相補的な合成オリゴヌクレオチドを用いて、実施例1と同様の操作により変異処理操作を行い、更に塩基配列を決定して、配列番号2に記載のアミノ酸配列の279番目のトリプトファンがロイシンに置換されたウリカーゼ改変体をコードする組換えプラスミド(pUODM2)を取得した。
実施例3で取得した組換えプラスミド(pUODM2)を用いて、エシェリヒア・コリーJM109株コンピテントセル(東洋紡績製)を形質転換し、該形質転換体を取得した。得られた形質転換体は、エシェリヒア・コリーJM109(pUODM2)と命名した。実施例2の方法と同様にして培養・精製を行うことにより、精製酵素標品(W279L)を得た。本方法により得られた標品は、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により、単一であることが確認された。
ウリカーゼ遺伝子を含む発現プラスミドpKU1を用いて、エシェリヒア・コリーJM109株コンピテントセル(東洋紡績製)を形質転換して、形質転換体を取得した。該形質転換体より、実施例2の方法と同様にして培養および精製を行い、野生型ウリカーゼの精製酵素標品を取得した。本方法により得られた標品は、SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により、単一であることが確認された。
実施例2および実施例4のウリカーゼ改変体および比較例1で取得した野生型ウリカーゼの各精製酵素標品の比活性を測定した結果、野生型酵素が7.8U/mgであったのに対し、改変型酵素では、P287Gが9.1U/mg、W279Lが9.3U/mgとなり、改変前と比較して比活性が向上したことが確認された。なお、比活性の測定において蛋白質量は、Bradford法に基づく比色定量法により測定した。
Claims (8)
- 配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列の287位のアミノ酸がグリシンに置換されているアミノ酸配列からなる、ウリカーゼ改変体。
- 配列表の配列番号2に記載されるアミノ酸配列の279位のアミノ酸がロイシンに置換されているアミノ酸配列からなる、ウリカーゼ改変体。
- 請求項1または2に記載のウリカーゼ改変体を含む尿酸測定キット。
- 請求項1または2に記載のウリカーゼ改変体を含む尿酸センサー。
- 請求項1または2に記載のウリカーゼ改変体をコードする遺伝子。
- 請求項5に記載の遺伝子を含むベクター。
- 請求項6に記載のベクターで形質転換された形質転換体。
- 請求項7に記載の形質転換体を培養することを特徴とするウリカーゼ改変体の製造方法。
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