JP2020503884A - 植物細胞における目的タンパク質の発現のための組換えベクター - Google Patents
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Abstract
Description
であってもよい。一具体例において、前記ヒトCD45由来Mドメインを暗号化する遺伝子は、配列番号1の核酸配列を含むものであってもよい。前記ヒトCD45由来Mドメインの一部は、前記CD45由来MドメインのうちのN−グリコシル化残基(例えば、配列番号2の2番目の位置のN(Asn)、30番目の位置のN(Asn)、40番目の位置のN(Asn)、及び46番目の位置のN(Asn)の中から選ばれる)を1個以上、又は2個以上、例えば、1個、2個、3個、又は4個を含む連続する10個以上、15個以上、又は20個以上のアミノ酸を含むポリペプチド断片であってもよい。前記ポリペプチド断片は、配列番号2のアミノ酸配列において、少なくとも40番目の位置のNと46番目の位置のNの中から選ばれた1個以上のアミノ酸残基を含む連続する10個以上、15個以上、又は20個以上のアミノ酸を含むポリペプチドであってもよく、例えば、「LTECKNASVS ISHNSCTAPD(配列番号6)」、又は「NVNENVECGN NTCTNNEVHN LTECKNASVS ISHNSCTAPD(配列番号7)」)であってもよいが、これに限定されるものではない。一例において、前記N−グリコシル化ドメインは、ヒトCD45タンパク質(配列番号5)中のMドメイン(配列番号2)又は前記Mドメイン(配列番号2)中の連続する10個以上、15個以上、又は20個のアミノ酸を含むMドメインの一部を含む連続する10〜100個又は20個〜80個のアミノ酸を含むポリペプチド(例えば、配列番号6、7、又は8)であってもよい。一実施例において、前記Mドメインをコーディングする遺伝子は、配列番号1で表される核酸配列を有するものであってもよい。
シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana ecotype、Col−0)植物を16時間/8時間の明暗周期及び20℃〜22℃の温度条件における成長チャンバーのB5プレート上で成長させた。2週間成長させた植物の葉組織をプロトプラストの分離に用いた。
マウスレプチンcDNA(NM_008493.3)の成熟ペプチド領域を用いた。MドメインをコーディングするDNA断片(配列番号1)を反復的なPCR遂行によって合成し、N−グリコシル化部位の突然変異(Asn−Gln置換)は、PCRベースの部位特異的突然変異導入によって生成した。化学合成によってアプロチニンを暗号化するDNA断片(配列番号11)を作製した(Bioneer、大田、韓国)。エンテロキナーゼとフーリン(furin)の切断部位をレプチンの増幅に用いられたプライマーに含ませた(5’−GGATCCAAGATGATGATGATAAGGTGCCTATCCAGAAAGTCCAGGAT−3’(配列番号18)。HAエピトープ及びER保持シグナルであるHDELは、前記Mドメインの増幅に用いられたプライマーを用いて導入した。PCR条件は、次の通りである:94℃5分、(94℃30秒、52℃1分、72℃30秒)を30回繰り返し、72℃7分。用いられたプライマーの配列を下記の表1にまとめた:
前記参考例2で作製されたプラスミドは、ポリエチレングリコール(PEG)媒介形質転換によって、参考例1で用意された植物細胞のプロトプラスト内に導入させた。形質転換後、24時間又は所定の時点でタンパク質を抽出し、タンパク質抽出物を調製した。形質転換直後に、プロトプラストにツニカマイシン(tunicamycin,10μg/mL;Sigma−Aldrich,St.Louis,MO)を処理し、形質転換12時間後にシクロヘキシミド(50μg/mL;Sigma−Aldrich,St.Louis,MO)を処理した。タンパク質の抽出物に対して抗HA抗体(Roche Diagnostics,Indianapolis,IN)、抗アクチン抗体(MP Biomedicals,Solon,OH)、抗GFP抗体(BiO−Application、浦項、大韓民国)、又は抗BiP抗体を用いてウェスタンブロット解析を行った。タンパク質ブロットをECLキット(Amersham Pharmacia Biotech、Piscataway,NJ)で展開し、LAS4000 image analyzer(Fujifilm,Tokyo,Japan)を用いてイメージを得た。
PEG媒介形質転換後の植物細胞のプロトプラストから、Ambion Phenol−free total RNA isolation kitを用いて全RNAを抽出し、TURBO DNase(Ambion)で処理した。high−capacity cDNA reverse transcription kit(Applied Biosystems)を用いて、前記抽出された全RNAからcDNAを合成した。Power SYBR Green PCR Master Mix(Applied Biosystems)を用いて転写レベルを検出した。ACTIN2は、内在性コントロールとして用いた。PCR混合物(20μl)は、鋳型50ng、フォワード及びリバースプライマー0.5mM、及び1×SYBR Mixを含んだ。
植物体から目的タンパク質を高発現させることができるように、目的タンパク質にヒトCD45のMドメインが融合した融合タンパク質をコーディングする遺伝子を含む植物形質転換用組換えベクターを作製した。目的タンパク質としてエンテロキナーゼ切断部位とフーリン切断部位がそれぞれアミノ末端とカルボキシル末端に融合されたレプチン(Leptin)(以下、「eLepf」という)を用いた。前記組換えベクターは、通常使用されるベクターであるpCAMBIA1300ベクターにCaMV 35Sプロモーターを用いた。タンパク質合成量の増加のためにM17配列(配列番号3)を追加し、BiP(chaperone binding protein)タンパク質のシグナルペプチドに該当するゲノムDNA配列(配列番号4)を用いて、目的タンパク質を小胞体に移動させることができるようし、最終的な目的タンパク質が小胞体に蓄積されうるようにカルボキシル末端にHDEL(His−Asp−Glu−Leu)を付与して小胞体に保持させた。また、ウェスタンブロットを介して融合タンパク質の発現可否を確認するため、HAエピトープを用いた。本実施例で作製した組換えベクターの模式図を図1に示した(M:Mドメイン)。
前記実施例1で作製したMドメインが含まれた組換えベクターによって作製された融合タンパク質eLepfMの発現量を比較するため、下記のように組換えベクターを作製した。
前記実施例2で確認したように、N−グリコシル化によるタンパク質の発現の増加の機序を理解するために、Mドメイン融合タンパク質の発現速度を確認した。前記Mドメインが融合された組換えベクターEeLepfMとMドメインのN−グリコシル化部位が変異したEeLepfM1234をそれぞれ植物細胞に形質転換させ、12時間後に、タンパク質の合成を防ぐシクロヘキシミド又はDMSO(ジメチルスルホキシド)を処理した後、12時間の間隔でタンパク質を抽出して、ウェスタンブロットで確認した。
Mドメインによる発現増加の効果が、前記実施例で使用した目的タンパク質(eLepf)以外のタンパク質にも適用されるかを確認するため、さらに他の目的タンパク質としてExendin4(配列番号51)コーディング遺伝子又はGLP−1(配列番号52)のコーディング遺伝子にMドメインコーディング遺伝子(配列番号1)を融合し、翻訳エンハンサードメイン(translation enhancer domain)としてGドメインを融合して組換えベクターを製造し(図1参照)、それぞれの組換えベクターを植物細胞(参考例1)に形質転換させた後、タンパク質の発現量をウェスタンブロットで確認した。前記結果を図5に示した。図6に示すように、N−グリコシル化を防ぐツニカマイシン(tunicamycin)を処理したときよりもツニカマイシンを処理せずにN−グリコシル化が起こった時のタンパク質の発現の程度がはるかに増加することを確認した。
また、図6aに模式的に示した組換えベクターのXxx位置にレプチン(Lep)、アプロチニン(Apr;配列番号11)、又はGFP(Gfp;配列番号15)を含む組換えベクターを準備して(「(G4S)2」:リンカー(GGGGSGGGGS))、これを植物細胞に形質転換した後、タンパク質の発現量をウェスタンブロットで確認した。
Mドメインの4個のN−グリコシル化部位(実施例1の図を参照)の様々な組み合わせにAsn−Gln置換突然変異を導入した突然変異体(4個のN−グリコシル化部位のうちの1個が変異、2個が変異、3個が変異、及び4個がすべて変異)を暗号化する遺伝子を含む組換えベクターを用いて、目的タンパク質(レプチン)の発現レベルを測定した(図7a−7c)。前記組換えベクターを植物細胞プロトプラストに形質転換させた後、タンパク質を抽出し、前記得られたタンパク質抽出物を抗−HA抗体を用いたウェスタンブロッティングで分析した。前記ウェスタンブロッティングの結果、得られたバンドのシグナル強度をLAS4000画像分析機とともに提供されたソフトウェアを用いて定量化して、その結果を図7a−7cに示した(x軸のEeLepfMの後ろに記載された数字は、Asn−to−Gln変異されたN−glycosylation siteを意味する)。図7a−7cにおいて、各突然変異体を使用した場合の目的タンパク質の発現レベルをER標的化された野生型タンパク質(野生型Mドメインと目的タンパク質の融合)であるEeLepfMの発現レベル(1)に対する相対値で示した。図7a−7cにおいて、図7aは、単一のAsn−Gln突然変異体を使用した場合の目的タンパク質が相対的発現レベルを、図7bは、二重Asn−Gln突然変異体を使用する場合の目的タンパク質が相対的発現レベルを、図7cは、トリプルAsn−Gln突然変異体を使用した場合の目的タンパク質が比較的発現レベルを、それぞれ示す(エラーバーはSD(n=4))。
非グリコシル化タンパク質の発現レベルが低いことがER関連分解と関連があるかどうかを試験した。結論として、非糖化タンパク質の低い発現レベルは、ER関連分解に起因するものではないことを確認した。
(HAT:形質転換後時間数)
目的タンパク質がN−グリコシル化部位を内在的に含み、それ自体でN−グリコシル化しうる場合、Mドメインと融合されずに目的タンパク質自体がN−グリコシル化される場合にも、目的タンパク質の発現レベルが増加するかを確認した。
目的タンパク質(レプチン)がMドメインの一部又は延長部と融合した融合タンパク質の発現レベルを試験した。このために、実施例2の方法を参照して、目的タンパク質とMドメイン(配列番号2;総60aa)の41−60位置の20個のアミノ酸の長さの断片(配列番号6)が融合した融合タンパク質(EeLepfM20; N−グリコシル化位置の1個(N4:46番目の位置のAsn)を含む)、21−60位置の40個のアミノ酸の長さの断片(配列番号7)が融合した融合タンパク質(EeLepfM40;MドメインのN−グリコシル化位置の3個(N2:30番目の位置のAsn;N3:40番目の位置のAsn;及びN4:46番目の位置のAsn)を含む)、Mドメイン(配列番号2)と融合された融合タンパク質(EeLepfM60)、及びCD45(配列番号5)において、配列番号2のMドメインのN末端側及びC末端側にそれぞれ10個のアミノ酸だけ延長された計80個のアミノ酸の長さの断片(配列番号8)が融合した融合タンパク質(EeLepfM80)を、植物細胞のプロトプラストに導入してそれぞれ発現させた後、タンパク質を抽出してウェスタンブロッティングで発現量を測定した。比較のために、Mドメインが融合されていないEeLepfの発現レベルもともに測定した。
植物細胞(参照例1)を野生型(変異されていない)Mドメイン又はN−グリコシル化部位がそれぞれ変異された様々なMドメイン変異体とレプチンがそれぞれ融合された融合タンパク質のコーディング遺伝子を含む組換えベクターでそれぞれ形質転換させ、1日後に全RNAを抽出して、定量的RT−PCRを行った。具体的な方法は、参考例4に記載した。
Claims (18)
- 目的タンパク質及び前記目的タンパク質のC−末端又はN−末端に融合したN−グリコシル化ドメインを含む融合タンパク質をコーディングする遺伝子を含む組換えベクターと、
前記組換えベクターを含む組換え細胞と、
前記組換え細胞を含む形質転換有機体と、
からなる群から選ばれた1種以上を含む、目的タンパク質の生産用組成物。 - 前記N−グリコシル化ドメインは、配列番号2のヒトCD45由来Mドメイン又は前記Mドメインの一部を含む、配列番号1のヒトCD45タンパク質内の連続する10〜100個のアミノ酸の長さのポリペプチドであり、
前記Mドメインの一部は、配列番号2の2番目の位置のアスパラギン残基、30番目の位置のアスパラギン残基、40番目の位置のアスパラギン残基、及び46番目の位置のアスパラギン残基の中から選ばれる1つ以上のN−グリコシル化の位置を含む10以上のアミノ酸、を含むポリペプチド断片である、請求項1に記載の目的タンパク質の生産用組成物。 - 前記Mドメインの一部は、LTECKNASVS ISHNSCTAPD(配列番号6)又はNVNENVECGN NTCTNNEVHN LTECKNASVS ISHNSCTAPD(配列番号7)を含む、配列番号2内の連続する10以上のアミノ酸長のポリペプチド断片である、請求項2に記載の目的タンパク質の生産用組成物。
- 前記Mドメインの一部は、NVNENVECGN NTCTNNEVHN LTECKNASVS ISHNSCTAPD(配列番号7)を含む、配列番号2内の連続する20以上のアミノ酸長のポリペプチド断片である、請求項2に記載の目的タンパク質の生産用組成物。
- 前記融合タンパク質は、目的タンパク質とN−グリコシル化ドメインの間に、ペプチドリンカーをさらに含むものである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の目的タンパク質の生産用組成物。
- 前記融合タンパク質は、小胞体で標的化されるものである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の目的タンパク質の生産用組成物。
- 前記組換えベクターは、BiP(chaperone binding protein)コーディング遺伝子、HDEL(His−Asp−Glu−Leu)ペプチドコーディング遺伝子、又はその両方をさらに含むものである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の目的タンパク質の生産用組成物。
- 前記細胞は植物細胞であり、前記有機体は植物である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の目的タンパク質の生産用組成物。
- 目的タンパク質及び前記目的タンパク質のC−末端又はN−末端に融合したN−グリコシル化ドメインを含む融合タンパク質をコーディングする遺伝子を含む、目的タンパク質の発現用組換えベクター。
- 前記融合タンパク質は、目的タンパク質とN−グリコシル化ドメインの間にペプチドリンカーをさらに含むものである、請求項9に記載の目的タンパク質の発現用組換えベクター。
- 前記融合タンパク質は、小胞体で標的化されるものである、請求項9に記載の目的タンパク質の発現用組換えベクター。
- BiP(chaperone binding protein)コーディング遺伝子、HDEL(His−Asp−Glu−Leu)ペプチドコーディング遺伝子、又はその両方をさらに含む、請求項9に記載の目的タンパク質の発現用組換えベクター。
- 植物細胞における発現に使用するためのものである、請求項9〜12のいずれか一項に記載の植物細胞発現用組換えベクター。
- 請求項9〜12のいずれか一項に記載の組換えベクターを含む、組換え細胞。
- 請求項14の組換え細胞を含む形質転換有機体。
- 請求項14の組換え細胞を培養するステップを含む、目的タンパク質の生産方法。
- 請求項15の形質転換有機体を成長させるステップを含む、目的タンパク質の生産方法。
- N−グリコシル化ドメインをコーディングする遺伝子又は前記遺伝子を含む組換えベクターを含み、
前記N−グリコシル化ドメインは、配列番号2のヒトCD45由来Mドメイン又は前記Mドメインの一部を含む、配列番号1のヒトCD45タンパク質内の連続する10〜100個のアミノ酸の長さのポリペプチドであり、
前記Mドメインの一部は、配列番号2の2番目の位置のアスパラギン残基、30番目の位置のアスパラギン残基、40番目の位置のアスパラギン残基、及び46番目の位置のアスパラギン残基の中から選ばれる1つ以上のN−グリコシル化の位置を含む10以上のアミノ酸、を含むポリペプチド断片である、タンパク質の発現用組成物。
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