JP2020125351A - 細菌株を含む組成物 - Google Patents

Abstract

【課題】炎症性疾患及び自己免疫疾患を治療及び予防するための細菌株を含む組成物の提供。【解決手段】ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防する方法に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物。【選択図】なし

Description

本発明は、哺乳動物の消化管から単離された細菌株を含む組成物及び疾患の治療におけるそのような組成物の使用の分野にある。

ヒトの腸管は、子宮内では無菌であると考えられるが、出生直後、多種多様な母体の微生物及び環境微生物に曝露される。その後、出産様式、環境、食物及び宿主遺伝子型などの因子が影響を及ぼす、微生物の定着及び遷移の動的な期間が生じるが、それら因子の全てが、特に幼少期に腸内微生物叢の組成に対して強い影響を及ぼす。続いて微生物叢は安定化し、成人様となる（Spor et al. (2011) Nat Rev Microbiol. 9(4):279-90）。ヒト
腸内微生物叢は、２つの主要な細菌門、バクテロイデス門（Bacteroidetes）及びフィル
ミクテス門（Firmicutes）に本質的に属する、５００〜１０００を超える様々なフィロタイプを含む（Eckburg et al. (2005) Science. 10;308(5728):1635-8）。ヒトの腸の細菌の定着から生じる共生関係の成功により、極めて多様な代謝機能、構造機能、保護機能及び他の有益な機能がもたらされてきた。定着した腸の代謝活性が増強することにより、そうでなければ消化されない食物成分が分解され、副生成物の放出により宿主にとって重要な栄養源がもたらされることが、確実となる。同様に、腸内微生物叢の免疫学的重要性は、十分に認識されており、共生細菌の導入に続いて機能的に再構築される免疫系に障害のある無菌動物において例示されている（Macpherson et al. (2001) Microbes Infect. 3(12):1021-35、Macpherson et al. (2002) Cell Mol Life Sci. 59(12):2088-96、Mazmanian et al. (2005) Cell 15;122(1):107-18）。

微生物叢組成の劇的な変化が、炎症性腸疾患（ＩＢＤ，inflammatory bowel disease）などの胃腸障害において実証されてきた。例えば、クロストリジウム（Clostridium）ク
ラスターXIVａ細菌のレベルが、ＩＢＤ患者において減少し、一方で大腸菌（E. coli）の数が増加し、これは、腸内での共生生物及び病原性共生生物の均衡のシフトを示唆している（Frank et al. (2007) PNAS 104(34):13780-5、Scanlan et al. (2006) J Clin Microbiol. 44(11):3980-8、Kang et al. (2010) Inflamm Bowel Dis. 16(12):2034-42、Machiels et al. (2013) Gut. 63(8):1275-83）。興味深いことに、この腸内菌共生バランス失調はまた、Ｔエフェクター細胞集団の不均衡と関連付けられる。

特定の細菌株が動物の腸で有しうる潜在的なプラスの効果を認めて、種々の株が種々の疾患の治療における使用のために提案されてきた（例えば、WO 2013/050792、WO 03/046580、WO 2013/008039、WO 2014/167338を参照のこと）。また、主に乳酸菌（Lactobacillus）株及びビフィズス菌（Bifidobacterium）株を含めて、特定の株が、腸管には直接に関係していない種々の炎症性疾患及び自己免疫疾患の治療において使用するために提案されてきた（総説についてはGoldin and Gorbach (2008) Clin Infect Dis. 46 Suppl 2:S96-100及びAzad et al. (2013) BMJ. 347:f6471を参照のこと）。しかし、様々な疾患と様々な細菌株との間の関係、並びに特定の細菌株が腸及び全身レベル及び任意の特定の疾患型に及ぼす明確な効果は、あまり特徴付けられていない。

Seres Health, Inc.社（WO2015/095241を参照のこと）は、糞便試料から得た細菌が免
疫系障害を治療するのに有用な可能性があると推測しているが、どの細菌が効果的であるかについては指針が提供されていない。

Honda et al.（WO2015/156419を参照のこと）は、クロストリジウム属の種を含めて、
様々な属からなる２０種の細菌混合物がどのようにＴｈ１７細胞の増殖及び集積を誘導す
るかについて記載している。Honda et al.の組成物は、免疫機能の改善、及び感染性疾患の予防又は治療に有用であるといわれている。しかし、Honda et al.は、個体において自己免疫疾患及び炎症性疾患を治療するために、Ｔｈ１７を誘導する細菌は、例えば患者に抗生物質を投与することにより、抑制すべき又は死滅させるべきであると教示している。

炎症性疾患及び自己免疫疾患を治療する新規方法が当技術分野で必要である。腸内細菌の潜在的な効果を、腸内細菌を使用する新規治療が開発できるように特徴付けることも必要である。

国際公開第２０１３／０５０７９２号パンフレット 国際公開第０３／０４６５８０号パンフレット 国際公開第２０１３／００８０３９号パンフレット 国際公開第２０１４／１６７３３８号パンフレット 国際公開第２０１５／０９５２４１号パンフレット 国際公開第２０１５／１５６４１９号パンフレット

Spor et al. (2011) Nat Rev Microbiol. 9(4):279-90 Eckburg et al. (2005) Science. 10;308(5728):1635-8 Macpherson et al. (2001) Microbes Infect. 3(12):1021-35 Macpherson et al. (2002) Cell Mol Life Sci. 59(12):2088-96 Mazmanian et al. (2005) Cell 15;122(1):107-18 Frank et al. (2007) PNAS 104(34):13780-5 Scanlan et al. (2006) J Clin Microbiol. 44(11):3980-8 Kang et al. (2010) Inflamm Bowel Dis. 16(12):2034-42 Machiels et al. (2013) Gut. 63(8):1275-83 Goldin and Gorbach (2008) Clin Infect Dis. 46 Suppl 2:S96-100 Azad et al. (2013) BMJ. 347:f6471

本発明者らは、炎症性疾患及び自己免疫疾患を治療及び予防するための新規治療を開発した。特に、本発明者らは、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療及び予防するための新規治療を開発した。特に、本発明者らは、エリシペラトクロストリジウム（Erysipelatoclostridium）属の細菌株が、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態の治療及び予防に有効でありうることを明らかにした。実施例に記載のように、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム（Erysipelatoclostridium ramosum）を含む組成物を経口投与すると、ブドウ膜炎のマウスモデルにおいてＴｈ１７炎症応答を含む炎症応答の重症度を低減させることができる。

したがって、第１の実施形態において、本発明は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防する方法に使用するためのエリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。本発明者らは、この種由来の細菌株での治療によって、ＩＬ−１７及びＴｈ１７経路によって媒介される炎症性疾患及び自己免疫疾患のマウスモデルにおいて臨床的利益をもたらすことができること、ＩＬ−１７を含めて、Ｔｈ１７経路の一部であるサイトカインレベルを低減させることができること、並び
にＴｈ１７炎症応答を緩和することができることを特定している。

特定の実施形態において、本発明は、ブドウ膜炎；乳がん、肺がん、肝臓がん、結腸がん、又は卵巣がんなどのがん；多発性硬化症；関節リウマチ、変形性関節症、乾癬性関節炎、又は若年性特発性関節炎などの関節炎；視神経脊髄炎（デビック病）；強直性脊椎炎；脊椎関節炎；乾癬；全身性紅斑性狼瘡；クローン病又は潰瘍性大腸炎などの炎症性腸疾患；セリアック病；アレルギー性喘息又は好中球性喘息などの喘息；慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ，chronic obstructive pulmonary disease）；強膜炎；血管炎；ベーチェット
病；アテローム性動脈硬化症；アトピー性皮膚炎；肺気腫；歯周炎；アレルギー性鼻炎；及び同種異系移植片拒絶からなる群から選択される疾患又は状態を治療又は予防する方法に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。Ｔｈ１７炎症応答に対して並びにＩＬ−１７及びＴｈ１７経路によって媒介される疾患に対して、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株について示された効果は、上に列記されたものなどの、ＩＬ−１７及びＴｈ１７経路によって媒介される他の疾患及び状態に対して、治療上の利益を提供することができる。

特に好ましい実施形態において、本発明は、後部ブドウ膜炎などのブドウ膜炎を治療又は予防する方法に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。本発明者らは、エリシペラトクロストリジウム株での治療により、ブドウ膜炎のマウスモデルにおいて疾患の発生率及び疾患の重症度を低減させることができ、網膜損傷を予防又は低減することができることを特定している。好ましい実施形態において、本発明は、ブドウ膜炎の治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム種の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを使用している組成物は、ブドウ膜炎を治療するのに特に有効でありうる。

さらに好ましい実施形態において、本発明は、好中球性喘息又はアレルギー性喘息などの喘息を治療又は予防する方法に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム株での治療により、好中球及び好酸球の肺への動員を低減させることができ、このことは喘息の治療又は予防の助けとなることができる。特定の実施形態において、組成物は、好中球性喘息又は好酸球性喘息を治療又は予防する方法に使用するためのものである。本発明の組成物は、好中球性喘息及び好酸球喘息を治療又は予防するのに特に有効でありうる。実際、特定の実施形態において、組成物は、喘息の治療若しくは予防において好中球性の炎症応答を低減させる方法に使用するためのものであり、又は組成物は、喘息の治療若しくは予防において好酸球性の炎症応答を低減させる方法に使用するためのものである。好ましい実施形態において、本発明は、喘息、特に好酸球性喘息又はアレルギー性喘息の治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム種の細菌株を含む組成物を提供する。また、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムは、喘息モデルにおいて好中球に対して特に顕著な効果を有することができ、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムでの治療は好中球性喘息を治療するのに特に有効でありうる。

さらなる好ましい実施形態において、本発明は、関節リウマチを治療又は予防する方法に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム株での治療により、関節リウマチのマウスモデルにおいて臨床的利益を提供することができ、関節の腫脹を低減させることができる。好ましい実施形態において、本発明は、関節リウマチの治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム種の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを使用している組成物は、関節リウマチを治療するのに特に有効でありうる。

さらに好ましい実施形態において、本発明は、多発性硬化症を治療又は予防する方法に
使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム株での治療により、多発性硬化症のマウスモデルにおいて疾患の発生率及び疾患の重症度を低減させることができる。好ましい実施形態において、本発明は、多発性硬化症の治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム種の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを使用している組成物は、多発性硬化症を治療するのに特に有効でありうる。

さらに好ましい実施形態において、本発明は、乳がん、肺がん、又は肝臓がんなどのがんを治療又は予防する方法に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を提供する。エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物により、乳がん、肺がん及び肝臓がんのマウスモデルにおいて腫瘍の増殖を低減させることができる。特定の実施形態において、組成物は、がんの治療において腫瘍のサイズを低減させる又は腫瘍の増殖を予防する方法に使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明は、がんの治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム種の細菌株を含む組成物を提供する。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態の治療又は予防において、ＩＬ−１７産生を低減させる、又はＴｈ１７細胞の分化を低減させる方法に使用するためのものである。具体的には、本発明の組成物は、喘息、関節リウマチ、多発性硬化症、ブドウ膜炎又はがんの治療又は予防において、ＩＬ−１７産生を低減させる、又はＴｈ１７細胞の分化を低減させるのに使用することができる。本発明は、喘息、関節リウマチ、多発性硬化症、ブドウ膜炎又はがんの治療又は予防において、ＩＬ−１７産生を低減させる、又はＴｈ１７細胞の分化を低減させるのに使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム属の細菌株を含む組成物を提供することが好ましい。

特定の実施形態において、組成物は、ＩＬ−１７レベル又はＴｈ１７細胞が上昇している患者に使用するためのものである。エリシペラトクロストリジウム株に関して示されたブドウ膜炎に対する効果は、Ｔｈ１７炎症応答と強く関連付けられるが、エリシペラトクロストリジウム株がそのような患者に特に有益でありうることを意味する。

本発明の好ましい実施形態において、組成物中の細菌株はエリシペラトクロストリジウム・ラモスムの細菌株である。細菌株が、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムである細菌株の１６ｓ ｒＲＮＡ配列と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株などの、近縁菌株も使用することができる。細菌株は、配列番号１、２又は３と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ配列を有するのが好ましい。配列番号３に対して配列同一性であるのが好ましい。本発明で使用する細菌株は配列番号３によって表される１６ｓ ｒＲＮＡ配列を有するのが好ましい。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、経口投与用である。本発明の株の経口投与は、ＩＬ−１７媒介の疾患及び状態又はＴｈ１７経路媒介の疾患及び状態を治療するのに有効でありうる。また、経口投与は、患者及び開業医にとって簡便であり、腸管への送達及び／又は部分的若しくは全体的な定着（colonisation）を可能とする。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、１又は２以上の薬学的に許容される賦形剤又は担体を含む。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、凍結乾燥された細菌株を含む。凍結乾燥
は、細菌の送達を可能とする安定な組成物を調製するのに有効で簡便な技法である。

特定の実施形態において、本発明は上記の組成物を含む食品を提供する。

特定の実施形態において、本発明は上記の組成物を含むワクチン組成物を提供する。

さらに、本発明は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防する方法であって、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む組成物を投与することを含む方法も提供する。

上記発明を開発する中で、本発明者らは、療法に特に有用である細菌株を同定し特徴付けた。本発明のエリシペラトクロストリジウム・ラモスム株は、ブドウ膜炎などの本明細書に記載の疾患を治療するのに有効であることが示されている。したがって、別の態様では、本発明は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）又はその派生物（derivative）の細胞を提供する。本発明はまた、そのような細胞、又はそのような細胞の生物学的に純粋な培養物を含む組成物も提供する。本発明はまた、特に本明細書に記載された疾患の治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ
４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）又はその派生物の細胞を提供する。

ブドウ膜炎のマウスモデル − 対照群のＴＥＦＩスコアの図である。データは平均値±ＳＥＭで提示されている。 ブドウ膜炎のマウスモデル − ２８日目のＴＥＦＩスコアの図である。データは平均値±ＳＥＭで提示されている。

発明の開示
細菌株
本発明の組成物は、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株を含む。実施例は、この属の細菌がブドウ膜炎並びにＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有用であることを実証している。好ましい細菌株は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム種である。

本発明は、治療に使用するための、例えば炎症性疾患及び／又は自己免疫疾患を治療又は予防するのに使用するための、エリシペラトクロストリジウム、例えば、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを提供する。同様に、治療に使用するための、例えば炎症性疾患及び／又は自己免疫疾患を治療又は予防するのに使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の細菌株、例えば、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを含む組成物を提供する。特定の実施形態において、本発明の組成物は、エリシペラトクロストリジウム、例えば、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを含み、他のいかなる細菌属も含まない。特定の実施形態において、本発明の組成物は、エリシペラトクロストリジウムの単一種、例えば、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムを含み、他のいかなる細菌種も含まない。特定の実施形態において、本発明の組成物は、エリシペラトクロストリジウムの単一株、例えば、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムの単一株を含み、他のいかなる細菌株又は細菌種も含まない。

本発明で使用するエリシペラトクロストリジウム種の例としては、エリシペラトクロストリジウム・ラモスム、（クロストリジウム）コクレアツム（cocleatum）、（Ｃ．）サ
ッカログミア（saccharogumia）、（Ｃ．）スピロフォルム（spiroforme）及び（Ｃ．）
イノキューム（innocuum）（最近Yutin and Galperin (2013) Environ Microbiol. 15(10): 2631-2641において再分類された）が挙げられる。エリシペラトクロストリジウムは、０．３〜１．０μｍ×２〜４μｍのグラム陽性染色、非運動性、偏性嫌気性桿菌及びらせん菌である。胞子形成は稀であるか又は非存在である。したがって、本発明の一部の実施形態において、エリシペラトクロストリジウム細菌株は胞子形成の形態ではなく又は胞子がある場合それはごく微量で存在する。ゲノムＤＮＡのＧ＋Ｃ含量は、２７〜３３ｍｏｌ％である。エリシペラトクロストリジウム属はグルコース、フラクトース、及びショ糖を発酵する（Yutin and Galperin (2013) Environ Microbiol. 15(10): 2631-2641）。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムの基準株はＡＴＣＣ ２５５８２＝ＤＳＭ １４０２である。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＤＳＭ １４０２株の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列のGenBank受託番号はＸ７３４４０である（配列番号１として本明細書で
開示されている）。例示的エリシペラトクロストリジウム・ラモスム株はYutin and Galperin (2013) Environ Microbiol. 15(10): 2631-2641に記載されている。本発明で使用する別の株はエリシペラトクロストリジウム・ラモスムＪＣＭ １２９８株である。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＪＣＭ １２９８株の１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列のGenBank受託番号はＮＲ＿１１３２４３．１である（配列番号２として本明細書で開示さ
れている）。

実施例において試験したエリシペラトクロストリジウム・ラモスム細菌は、本明細書ではＭＲＸ０２７株という。試験したＭＲＸ０２７株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列は配列番号３に提供されている。ＭＲＸ０２７株は、２０１６年１１月１５日に、4D Pharma Research
Ltd.社（Life Sciences Innovation Building, Aberdeen, AB25 2ZS, Scotland）により国際寄託当局NCIMB, Ltd.社（Ferguson Building, Aberdeen, AB21 9YA, Scotland）に寄託され、受託番号ＮＣＩＭＢ ４２６８８が割り当てられた。用語「ＭＲＸ０２７」及び「ＭＲｘ００２７」は本明細書では相互交換可能に使用される。

実施例において試験した株の近縁である細菌株はまた、ブドウ膜炎並びにＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効であると予想されている。特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムである細菌株の１６ｓ ｒＲＮＡ配列と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ配列を有する。本発明で使用する細菌株は、配列番号１、２又は３と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ配列を有するのが好ましい。配列番号３に対して配列同一性であるのが好ましい。本発明で使用する細菌株は配列番号３によって表される１６ｓ ｒＲＮＡ配列を有するのが好ましい。

ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株及びＪＣＭ １２９８株のバイオタイプである細菌株はまた、ブドウ膜炎並びにＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効であると予想されている。バイオタイプとは、同一の又は極めて類似した生理学的及び生化学的特徴を有する近縁株である。

ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株のバイオタイプであり、本発明の使用に適した株は、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株について他のヌクレオチド配列を配列決定することにより同定することができる。例えば、実質的には全ゲノムを配列決定することができ、本発明で使用するバイオタイプの株はその全ゲノムの少なくとも８０％にわたって（例えば少なくとも８５％、９０％、９５％若しくは９９％にわたって、又はその
全ゲノムにわたって）少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％の配列同一性を有することができる。例えば、一部の実施形態において、バイオタイプの株は、そのゲノムの少なくとも９８％にわたって少なくとも９８％の配列同一性を又はそのゲノムの９９％にわたって少なくとも９９％の配列同一性を有する。バイオタイプの株の同定に使用するのに適した他の配列としては、ｈｓｐ６０又はＢＯＸ、ＥＲＩＣ、（ＧＴＧ）_５、若しくはＲＥＰなどの反復配列又はMasco et al. (2003) Systematic and Applied Microbiology, 26:557-563を挙げることができる。バイオタイプの
株は、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株の相応する配列と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％の配列同一性を有する配列を有することができる。一部の実施形態において、バイオタイプの株は、ＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７株の相応する配列と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％の配列同一性を有する配列を有し、配列番号３と少なくとも９９％同一である（例えば少なくとも９９．５％又は少なくとも９９．９％同一である）１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を含む。一部の実施形態において、バイオタイプの株は、ＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７株の相応する配列と少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は９９．９％の配列同一性を有する配列を有し、配列番号３の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する。

あるいは、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株のバイオタイプであり、本発明の使用に適した株は、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株と制限断片分析及び／又はＰＣＲ分析とを使用することにより、例えば蛍光増幅断片長多型（ＦＡＦＬＰ，fluorescent amplified fragment length polymorphism）及び反復ＤＮＡエレメント（ｒｅｐ）−ＰＣＲフィンガープリント法、又はタンパク質プロファイリング、又は１６Ｓ若しくは２３ｓ ｒＤＮＡの部分配列決定を使用することにより、同定することができる。好ましい実施形態において、そのような技法を使用して、他のエリシペラトクロストリジウム・ラモスム株を同定することができる。

特定の実施形態において、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株のバイオタイプであり、本発明の使用に適した株は、増幅リボソームＤＮＡ制限分析法（ＡＲＤＲＡ，amplified ribosomal DNA restriction analysis）により分析したとき、例えばSau3AI制限酵素を使用するとき、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株と同一のパターンを提供する株である（例示的方法及び指針については、例えば、Srutkova et al. (2011) J. Microbiol. Methods, 87(1):10-6を参照のこと）。あるいは、バイオタイプの株は、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株と同一の炭水化物発酵パターンを有する株として同定される。

ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株のバイオタイプなどの、本発明の組成物及び方法において有用な他のエリシペラトクロストリジウム・ラモスム株は、実施例に記載のアッセイを含めて、適切な任意の方法又は戦略を使用して同定することができる。例えば、本発明で使用する株は、嫌気的ＹＣＦＡ中で細菌を培養し、及び／又はII型コラーゲン誘導関節炎のマウスモデルに本細菌を投与し、次いでサイトカインレベルを評価することにより同定することができる。具体的には、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株に
類似の増殖パターン、代謝型及び／又は表面抗原を有する細菌株が、本発明において有用でありうる。有用な株は、ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）、ＡＴＣＣ ２５５８２株又はＪＣＭ １２９８株に匹敵する免疫調節活性を有することになる。具体的には、バイオタイプの株は、ブドウ膜炎疾患に対して、実施例において示される効果に匹敵する効果を誘発することになるが、これは、実施例に記載の培養プロトコル及び投与プロトコルを使用することにより特定することができる。

本発明の特に好ましい株はＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）である。この株は実施例において試験した例示的株であり、疾患を治療するのに有効であると示されている。したがって、本発明は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）又はその派生物の単離細胞などの細胞を提供する。本発明はまた、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）又はその派生物の細胞を含む組成物も提供する。本発明はまた、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）の生物学的に純粋な培養物も提供する。本発明はまた、特に本明細書に記載された疾患の治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）又はその派生物の細胞も提供する。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）の派生物は、オリジナル株の娘株（後代）、又はオリジナル株から培養された株（サブクローン）でありうる。

本発明の株の派生物は、例えば遺伝子レベルで、生物活性を抑制することなく改変することができる。具体的には、本発明の派生株は治療的に活性である。派生株は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）に匹敵する免疫調節活性を有することになる。具体的には、派生株は、ブドウ膜炎疾患モデルに対して、実施例において示される効果に匹敵する効果を誘発することになるが、これは、実施例の記載の培養プロトコル及び投与プロトコルを使用することにより特定することができる。ＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）の派生物は、一般にはＭＲＸ０２７株（特にＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７）のバイオタイプとすることになる。

エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株の細胞への言及は、ＭＲＸ０２７株と同一の安全性及び治療有効性の特徴を有する任意の細胞を包含し、本発明によりそのような細胞が包含される。ＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７への言及は、寄託されたＭＲＸ０２７株のみを指す。

エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＤＳＭ １４０２株のゲノム配列が配列番号４として本明細書に開示されている。この配列は、ホールゲノムショットガン配列決定法を使用して得られるゲノム足場であり、またGenBank受託番号ＮＺ＿ＤＳ４９９６５９．
１を使用して入手可能である。特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号４と配列同一性を有する染色体を有する。一部の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号４の少なくとも３０％にわたって（例えば少なくとも３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％にわたって）配列番号４と少なくとも９０％の配列同一性（例えば少なくとも９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％の配列同一性）を有する染色体を有する。例えば、本発明で使用する細菌株は、配列番号４の３５％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性、又は配列番号４の４５％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性、又は配列番号４の７０％にわたって配列番号４と少なくとも９０％の配列同一性、又は配
列番号４の８０％にわたって配列番号４と少なくとも９０％の配列同一性、又は配列番号４の９０％にわたって配列番号４と少なくとも９０％の配列同一性、又は配列番号４の１００％にわたって配列番号４と少なくとも９０％の配列同一性、又は配列番号４の７０％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性、又は配列番号４の８０％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性、又は配列番号４の９０％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性、又は配列番号４の１００％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性、又は配列番号４の７０％にわたって配列番号４と少なくとも９８％の配列同一性、又は配列番号４の８０％にわたって配列番号４と少なくとも９８％の配列同一性、又は配列番号４の９０％にわたって配列番号４と少なくとも９８％の配列同一性、又は配列番号４の９５％にわたって配列番号４と少なくとも９８％の配列同一性、又は配列番号４の１００％にわたって配列番号４と少なくとも９８％の配列同一性、又は配列番号４の９０％にわたって配列番号４と少なくとも９９．５％の配列同一性、又は配列番号４の９５％にわたって配列番号４と少なくとも９９．５％の配列同一性、又は配列番号４の９８％にわたって配列番号４と少なくとも９９．５％の配列同一性、又は配列番号４の１００％にわたって配列番号４と少なくとも９９．５％の配列同一性を有する染色体を有する。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、１６Ｓ ｒＲＮＡ配列と隣接する領域において配列番号４と配列同一性を有する染色体を有する。一部の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号４において、１６Ｓ ｒＲＮＡ配列の直接上流及び／又は下流の０．５ｋｂの配列と少なくとも９５％（例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は１００％）の配列同一性を有する染色体を有する。一部の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号４において、１６Ｓ ｒＲＮＡ配列の直接上流及び／又は下流の１ｋｂの配列と少なくとも９５％（例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は１００％）の配列同一性を有する染色体を有する。一部の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号４において、１６Ｓ ｒＲＮＡ配列の直接上流及び／又は下流の１．５ｋｂの配列と少なくとも９５％（例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は１００％）の配列同一性を有する染色体を有する。一部の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号４において、１６Ｓ ｒＲＮＡ配列の直接上流及び／又は下流の２ｋｂの配列と少なくとも９５％（例えば少なくとも９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％又は１００％）の配列同一性を有する染色体を有する。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、例えば上記のように、配列番号４と配列同一性を有する染色体を有し、例えば上記のように、配列番号１、２又は３のいずれかと配列同一性を有する１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有し、好ましくは配列番号３と少なくとも９９％同一である１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を持ち、より好ましくは配列番号３の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を含む。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、例えば上記のように、配列番号４と配列同一性を有する染色体を有し、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効である。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、例えば上記のように、配列番号４と配列同一性を有する染色体と、例えば上記のように、配列番号１、２又は３のいずれかと配列同一性を有する１６Ｓ ｒＲＮＡ配列とを有し、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効である。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号３によって表される１６Ｓ ｒＲＮＡ配列と少なくとも９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６Ｓ
ｒＲＮＡ配列と（例えば、配列番号３の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を含む）、配列番号４の少なくとも４０％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性を有する染色体とを有し、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効である。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、配列番号３によって表される１６ｓ ｒＲＮＡ配列と少なくとも９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ配列と（例えば、配列番号３の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を含む）、配列番号４の少なくとも９０％にわたって配列番号４と少なくとも９５％の配列同一性を有する染色体とを有し、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効である。

特定の実施形態において、本発明で使用する細菌株は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムであり、配列番号３によって表される１６ｓ ｒＲＮＡ配列と少なくとも９９％、９９．５％又は９９．９％同一である１６ｓ ｒＲＮＡ配列と（例えば、配列番号３の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を含む）、配列番号４の少なくとも９８％にわたって（例えば少なくとも９９％又は少なくとも９９．５％にわたって）配列番号４と少なくとも９８％の配列同一性（例えば少なくとも９９％又は少なくとも９９．５％の配列同一性）を有する染色体とを有し、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有効である。

好ましい実施形態において、本発明の組成物中の細菌株は、生存しており、腸管に部分的又は全体的に定着することができる。

治療的使用
実施例に示されるように、本発明の細菌組成物はＴｈ１７炎症応答を低減させるのに有効である。具体的には、本発明の組成物での治療により、ＩＬ−１７及びＴｈ１７経路によって媒介される状態の動物モデルにおいて臨床的改善が達成され、ＩＬ−１７Ａレベル及びＴｈ１７経路の他のサイトカインの低減が可能である。したがって、本発明の組成物は、炎症性疾患及び自己免疫疾患、特にＩＬ−１７によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防するのに有用でありうる。具体的には、本発明の組成物は、ＩＬ−１７炎症応答の上昇を低減させるのに又は予防するのに有用でありうる。

Ｔｈ１７細胞は、例えば、ＩＬ−１７Ａ、ＩＬ１７−Ｆ、ＩＬ−２１及びＩＬ−２２を産生するＴヘルパー細胞のサブセットである。ＩＬ−２３によりＴｈ１７細胞の分化及びＩＬ−１７発現を駆動することができる。これらのサイトカインなどがＴｈ１７経路の重要な部分を形成し、この経路は、いくつかの炎症性疾患及び自己免疫疾患の原因となり、それらの根底となる、十分に確立された炎症性のシグナル伝達経路である（例えば、（Ye
et al. (2015) PLoS One. 10(1):e0117704、Fabro et al. (2015) Immunobiology. 220(1):124-35 、Yin et al. (2014) Immunogenetics. 66(3):215-8、Cheluvappa et al. (2014) Clin Exp Immunol. 175(2):316-22、Schieck et al. (2014) J Allergy Clin Immunol. 133(3):888-91、Balato et al. (2014) J Eur Acad Dermatol Venereol. 28(8):1016-24）に記載のように）。Ｔｈ１７経路が活性化されている疾患はＴｈ１７経路によって媒介される疾患である。Ｔｈ１７経路によって媒介される疾患は、Ｔｈ１７経路を抑えることにより改善するか又は緩和することができ、これは、Ｔｈ１７細胞の分化における低減若しくはそれら細胞の活性における低減又はＴｈ１７経路サイトカインのレベルにおける低減を介している可能性がある。Ｔｈ１７経路によって媒介される疾患は、ＩＬ−１７Ａ、ＩＬ−１７Ｆ、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２６、ＩＬ−９などの、Ｔｈ１７細胞に産生されるサイトカインレベルの上昇を特徴とすることができる（Monteleone et al. (2011) BMC Medicine. 2011, 9:122において総説されている）。Ｔｈ１７経路によって媒
介される疾患は、Ｓｔａｔ３又はＩＬ−２３Ｒなどの、Ｔｈ１７関連遺伝子の発現上昇を特徴とすることができる。Ｔｈ１７経路によって媒介される疾患は、Ｔｈ１７細胞のレベルの増加と関連付けることができる。

ＩＬ−１７は、いくつかの炎症性及び自己免疫性の疾患並びに状態の病原性の一因となる炎症性サイトカインである。本明細書において使用されるＩＬ−１７とは、ＩＬ−１７Ａ、ＩＬ−１７Ｂ、ＩＬ−１７Ｃ、ＩＬ−１７Ｄ、ＩＬ−１７Ｅ、及びＩＬ−１７Ｆを含めて、ＩＬ−１７ファミリーの任意のメンバーを指すことができる。ＩＬ−１７が媒介する疾患及び状態は、疾患又は状態に侵された組織におけるＩＬ−１７の高発現及び／又はＩＬ−１７陽性細胞の集積若しくは存在を特徴とする。同様に、ＩＬ−１７が媒介する疾患及び状態は、ＩＬ−１７のレベルが高いこと又はＩＬ−１７レベルが上昇することにより悪化し、ＩＬ−１７のレベルが低いこと又はＩＬ−１７レベルが低下することにより緩和される疾患及び状態である。ＩＬ−１７の炎症性応答は、局所性の場合も全身性の場合もある。

ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される可能性がある疾患及び状態の例には、ブドウ膜炎；乳がん、肺がん、肝臓がん、結腸がん、又は卵巣がんなどのがん；多発性硬化症；関節リウマチ、変形性関節症、乾癬性関節炎、又は若年性特発性関節炎などの関節炎；視神経脊髄炎（デビック病）；強直性脊椎炎；脊椎関節炎；乾癬；全身性紅斑性狼瘡；クローン病又は潰瘍性大腸炎などの炎症性腸疾患；セリアック病；アレルギー性喘息又は好中球性喘息などの喘息；慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）；強膜炎；血管炎；ベーチェット病；アテローム性動脈硬化症；アトピー性皮膚炎；肺気腫；歯周炎；アレルギー性鼻炎；及び同種異系移植片拒絶が含まれる。好ましい実施形態において、本発明の組成物は、１又は２以上のこれらの状態又は疾患を治療するか又は予防するために使用される。さらに好ましい実施形態において、これらの状態又は疾患はＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される。

一部の実施形態において、疾患又は状態の病原性は腸管に影響を及ぼす。一部の実施形態において、疾患又は状態の病原性は腸管に影響を及ぼさない。一部の実施形態において、疾患又は状態の病原性は腸管に局在していない。一部の実施形態において、治療又は予防は腸管以外の部位で行われる。一部の実施形態において、治療又は予防は、腸管で及び腸管以外の部位でも行われる。特定の実施形態において、疾患又は状態は全身性である。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態の治療又は予防において、ＩＬ−１７産生を低減させる、又はＴｈ１７細胞の分化を低減させる方法に使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物は、炎症性疾患又は自己免疫疾患を治療又は予防するのに使用するためのものであり、この場合、前記治療又は予防はＴｈ１７炎症性応答の上昇を低減させるか又は予防することにより達成される。特定の実施形態において、本発明の組成物は、炎症性疾患又は自己免疫疾患を有する患者を治療するのに使用するためのものであり、この場合、患者はＩＬ−１７レベル又はＴｈ１７細胞が上昇しているか、又はＴｈ１７の炎症性応答を示している。特定の実施形態において、患者は、慢性炎症性又は自己免疫性の疾患若しくは状態と診断することができたか、又は本発明の組成物は、炎症性又は自己免疫性の疾患若しくは状態が慢性炎症性又は自己免疫性の疾患若しくは状態に進行すること、を予防するのに使用するためのものでありうる。特定の実施形態において、疾患又は状態は、ＴＮＦ−α阻害剤での治療に応答しない場合もある。本発明のこれらの使用は、前段落において列記された特定の疾患又は状態のいずれにも適用することができる。

ＩＬ−１７及びＴｈ１７経路は慢性炎症性疾患及び慢性自己免疫疾患と関連付けられることが多く、したがって本発明の組成物は、上に列記の慢性疾患又は慢性状態を治療又は
予防するのに特に有用でありうる。特定の実施形態において、組成物は慢性疾患の患者に使用するためのものである。特定の実施形態において、組成物は慢性疾患の進行を予防するのに使用するためのものである。

本発明の組成物は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療するのに及びＴｈ１７炎症性応答に対処するのに有用でありえ、したがって本発明の組成物は、慢性疾患を治療又は予防するのに、他の療法（ＴＮＦ−α阻害剤での治療などの）に応答しなかった患者において疾患を治療又は予防するのに、及び／又はＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞と関連付けられる組織損傷及び症状を治療又は予防するのに、特に有用でありうる。例えば、ＩＬ−１７は軟骨組織及び骨組織においてマトリクス破壊を活性化することが知られており、そしてＩＬ−１７は軟骨細胞及び骨芽細胞においてマトリクス産生に対して阻害効果を有しており、したがって本発明の組成物は、骨びらん又は軟骨損傷を治療又は予防するのに有用でありうる。

特定の実施形態において、本発明の組成物による治療は、ＩＬ−１７レベル、特にＩＬ−１７Ａレベルの低減をもたらすか又は上昇を予防する。特定の実施形態において、本発明の組成物による治療は、ＴＮＦαレベル、ＩＦＮ−γレベル又はＩＬ−６レベルの低減をもたらすか又は上昇を予防する。これらのサイトカインのレベルの上昇のそのような低減又は予防は、炎症性及び自己免疫性の疾患並びに状態、特にＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療又は予防するのに有用でありうる。

ブドウ膜炎
好ましい実施形態において、本発明の組成物は、ブドウ膜炎を治療又は予防するのに使用するためのものである。実施例は、本発明の組成物が、ブドウ膜炎の動物モデルにおいて疾患の発生率及び疾患の重症度の低減を達成することを実証しており、したがって本発明の組成物はブドウ膜炎の治療又は予防において有用でありうる。ブドウ膜炎は、ブドウ膜の炎症であり、網膜組織の破壊をもたらす恐れがある。ブドウ膜炎は、様々な解剖学的形態で存在することができ（前部、中間、後部又はびまん）、全身性自己免疫障害を含めて、様々な、しかし関連した、原因の結果である。ＩＬ−１７及びＴｈ１７経路がブドウ膜炎に中心的に関与し、したがってブドウ膜炎を治療するための本発明の組成物の有効性は、本発明の組成物はＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患及び状態を治療するのに及び予防するのに特に有用でありうることを示している。参考文献（Zhang (2015) Inflammation. Aug 23、Sun et al. (2015) Cytokine. 74(1):76-80、Mucientes et
al. (2015) Br J Ophthalmol. 99(4):566-70、Jawad et al. (2013) Ocul Immunol Inflamm. 21(6):434-9、Maya et al. (2014) J. Ophthalmology. 310329、Chi et al. (2007)
J. Allergy and Clinical Immunology. 119(5):1218-1224、Chi et al. (2008) Investigative Ophthalmology &Visual Science. 49(7): 3058-3064、Luger and Caspi (2008) Semin. Immunopathol. 30(2): 134-143）には、ブドウ膜炎の患者においてインターロイキン−１７Ａの血清レベルが上昇していること、ＩＬ１７Ａの遺伝的バリアントと全ブドウ膜炎との特異的関連性、実験的自己免疫ブドウ膜炎の病原性におけるＴｈ１７関連サイトカインの役割、単相性の実験的自己免疫ブドウ膜炎時のＴｈ１７細胞と調節性Ｔ細胞との間の不均衡、ブドウ膜炎並びに活動型ベーチェット病及びフォークト小柳原田（ＶＫＨ，Vogt-Koyanagi-Harada）病の患者におけるＩＬ−１７Ａのアップレギュレーション、セクキヌマブ（抗ＩＬ−１７Ａ抗体）での非感染性ブドウ膜炎の治療、並びにブドウ膜炎の眼におけるＴｈ１７、について記載されている。

特定の実施形態において、ブドウ膜炎は後部ブドウ膜炎である。後部ブドウ膜炎は、主として網膜及び脈絡膜の炎症を示し、実施例は、本発明の組成物が網膜炎症及び損傷を低減させるのに有効であることを実証している。

特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、網膜損傷の低減がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、ブドウ膜炎の治療において、網膜損傷を低減又は予防するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、組成物は、網膜損傷のリスクのある重症のブドウ膜炎を有する患者を治療するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、視神経乳頭の炎症の低減がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、視神経乳頭の炎症を低減又は予防するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、炎症性細胞による網膜組織浸潤の、低減がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、炎症性細胞による網膜組織浸潤を低減するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、視覚の維持又は改善がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、視覚を維持又は改善するのに使用するためのものである。

特定の実施形態において、組成物は、ベーチェット病、クローン病、フックス虹彩毛様体炎、多発血管炎を有する肉芽腫症、ＨＬＡ−Ｂ２７関連ブドウ膜炎、若年性特発性関節炎、サルコイドーシス、脊椎関節炎、交感性眼炎、尿細管間質性腎炎及びブドウ膜炎症候群又はフォークト小柳原田症候群などの、非感染性疾患又は自己免疫疾患と関連付けられたブドウ膜炎を治療又は予防するのに使用するためのものである。ＩＬ−１７Ａは、例えば、ベーチェット病及びフォークト小柳原田病に関与していることが示されてきた。

ブドウ膜炎の治療又は予防とは、例えば、症状の重症度の緩和又は再発の予防を指すことができる。

がん
好ましい実施形態において、本発明の組成物はがんを治療又は予防するのに使用するためのものである。ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路はがんの発症及び進行において中枢的役割を担っており、したがって本発明の組成物はがんを治療するか又は予防するのに有用でありうる。

がんにおけるＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞の役割は十分には理解されてないが、ＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞に関する腫瘍促進性の多数の影響が公知である。例えば、Ｔｈ１７細胞及びＩＬ−１７は血管新生を促進し、腫瘍細胞の増殖及び生存率を高め、腫瘍促進性転写因子を活性化することができる（Numasaki et al. (2003) Blood. 101:2620-2627、Zhang et al. (2008) Biochem. Biophys. Res. Commun. 374: 533-537、Karin (2006) Nature. 441: 431-436）。

特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、腫瘍サイズの低減又は腫瘍の増殖の低減がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、腫瘍サイズを低減し又は腫瘍の増殖を低減するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、腫瘍サイズを低減させるか又は腫瘍の増殖を低減させるのに有効でありうる。特定の実施形態において、本発明の組成物は固形腫瘍を有する患者に使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物はがんの治療において血管新生を低減又は予防するのに使用するためのものである。ＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞は血管新生において中枢的な役割を担っている。特定の実施形態において、本発明の組成物は転移を予防するのに使用するためのものである。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、乳がんを治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、乳がんを治療するのに有効でありえＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞は乳がんにおいて重要な役割を担っている（Faghih et al. (2013). Iranian Journal of Immunology. 10(4):193-204）。特定の実施形態において、本発明の組成
物は、乳がんの治療において腫瘍のサイズを低減させる、腫瘍の増殖を低減させる、又は血管新生を低減させるのに使用するためのものである。好ましい実施形態において、がんは乳癌である。好ましい実施形態において、がんはステージIVの乳がんである。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、肺がんを治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、肺がんを治療するのに有効でありえＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞は肺がんにおいて重要な役割を担っている（Numasaki et al. (2005) J. Immunol. 175: 6177-6189）。特定の実施形態において、本発明の組成物は、肺がんの治
療において腫瘍のサイズを低減させる、腫瘍の増殖を低減させる、又は血管新生を低減させるのに使用するためのものである。好ましい実施形態において、がんは肺癌である。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、肝臓がんを治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、肝臓がんを治療するのに有効でありえＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞は肝臓がんにおいて重要な役割を担っている（Hammerich and Tacke (2014) Clin Exp Gastroenterol. 7:297-306）。特定の実施形態において、本発明の組成物は、肝臓がんの治療において腫瘍のサイズを低減させる、腫瘍の増殖を低減させる、又は血管新生を低減させるのに使用するためのものである。好ましい実施形態において、がんはヘパトーマ（肝細胞癌）である。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、癌腫を治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、癌腫を治療するのに特に有効でありうる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、非免疫原性がんを治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、非免疫原性がんを治療するのに有効でありうる。

さらなる実施形態において、本発明の組成物は、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ，acute lymphoblastic leukemia）、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、基底細胞癌、胆管がん、膀胱がん、骨腫瘍、骨肉腫／悪性線維組織球腫、脳幹グリオーマ、脳腫瘍、小脳星状細胞腫、大脳星状細胞腫／悪性グリオーマ、上衣細胞腫、髄芽細胞腫、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、乳がん、気管支腺腫／カルチノイド、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、子宮頸がん、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性疾患、結腸がん、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、子宮内膜がん、上衣細胞腫、食道がん、ユーイング肉腫、眼内メラノーマ、網膜芽細胞腫、胆嚢がん、胃がん、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ，gastrointestinal stromal tumor）、胚細胞腫瘍、グリオーマ、小児期視経路及び視床下部、ホジキンリンパ腫、メラノーマ、膵島細胞癌、カポジ肉腫、腎細胞がん、喉頭がん、白血病、リンパ腫、中皮腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、中咽頭がん、骨肉腫、卵巣がん、すい臓がん、副甲状腺がん、咽頭がん、下垂体腺腫、形質細胞腫瘍、前立腺がん、腎細胞癌、網膜芽細胞腫、肉腫、精巣がん、甲状腺がん、又は子宮がんを治療又は予防するのに使用するためのものである。

本発明の組成物は、さらなる治療薬と組み合わせて使用するとき特に有効でありうる。本発明の組成物の免疫調節効果は、より直接的な抗がん剤と組み合わせると有効でありうる。したがって、特定の実施形態において、本発明はエリシペラトクロストリジウム属の細菌株と抗がん剤とを含む組成物を提供する。好ましい実施形態において、抗がん剤は、免疫チェックポイント阻害剤、標的抗体免疫療法、ＣＡＲ−Ｔ細胞療法、殺腫瘍ウイルス、又は細胞増殖抑制薬である。好ましい実施形態において、組成物は：
Yervoy（イピリムマブ、BMS社製）；Keytruda（ペンブロリズマブ、Merck社製）；Opdivo（ニボルマブ、BMS社製）；MEDI4736（AZ/MedImmune社製）；MPDL3280A（Roche/Genentech社製）；トレメリムマブ（AZ/MedImmune社製）；CT-011（ピジリズマブ、CureTech社製
）；BMS-986015（リリルマブ、BMS社製）；MEDI0680（AZ/MedImmune社製）；MSB-0010718C（Merck社製）；PF-05082566（Pfizer社製）；MEDI6469（AZ/MedImmune社製）；BMS-986
016（BMS社製）；BMS-663513（ウレルマブ、BMS社製）；IMP321（Prima Biomed社製）；LAG525（Novartis社製）；ARGX-110（arGEN-X社製）；PF-05082466（Pfizer社製）；CDX-1127（バルリルマブ；CellDex Therapeutics社製）；TRX-518（GITR Inc.社製）；MK-4166（Merck社製）；JTX-2011（Jounce Therapeutics社製）；ARGX-115（arGEN-X社製）；NLG-9189（インドキシモド、NewLink Genetics社製）；INCB024360（Incyte社製）；IPH2201（Innate Immotherapeutics/AZ社製）；NLG-919（NewLink Genetics社製）；anti-VISTA
（JnJ社製）；エパカドスタット（INCB24360、Incyte社製）；F001287（Flexus/BMS社製
）；CP 870893（University of Pennsylvania製）；MGA271（Macrogenix社製）；Emactuzumab（Roche/Genentech社製）；ガルニセルチブ（Eli Lilly社製）；ウロクプルマブ（BMS社製）；BKT140/BL8040（Biokine Therapeutics社製）；バビツキシマブ（Peregrine Pharmaceuticals社製）；CC 90002（Celgene社製）；852A（Pfizer社製）；VTX-2337（VentiRx Pharmaceuticals社製）；IMO-2055（Hybridon社製、Idera Pharmaceuticals社製）；LY2157299（Eli Lilly社製）；EW-7197（Ewha Women's University製、韓国）；ベムラフェニブ（Plexxikon社製）；ダブラフェニブ（Genentech/GSK社製）；BMS-777607（BMS社
製）；BLZ945（Memorial Sloan-Kettering Cancer Centre製）；Unituxin（ジヌツキシマブ、United Therapeutics Corporation社製）；Blincyto（ブリナツモマブ、Amgen社製）；Cyramza（ラムシルマブ、Eli Lilly社製）；Gazyva（オビヌツズマブ、Roche/Biogen社製）；Kadcyla（ａｄｏ−トラスツズマブ エムタンシン、Roche/Genentech社製）；Perjeta（パーツズマブ、Roche/Genentech社製）；Adcetris（ブレンツキシマブ ベドチン、Takeda/Millennium社製）；Arzerra（オファツムマブ、GSK社製）；Vectibix（パニツブ
マブ、Amgen社製）；Avastin（ベバシズマブ、Roche/Genentech社製）；Erbitux（セツキシマブ、BMS/Merck社製）；Bexxar（トシツモマブ−Ｉ１３１、GSK社製）；Zevalin（イ
ブリツモマブ チウキセタン、Biogen社製）；Campath（アレムツズマブ、Bayer社製）；Mylotarg（ゲムツズマブ オゾガマイシン、Pfizer社製）；Herceptin（トラスツズマブ
、Roche/Genentech社製）；Rituxan（リツキシマブ、Genentech/Biogen社製）；ボロシキシマブ（Abbvie社製）；エナバツズマブ（Abbvie社製）；ABT-414（Abbvie社製）；エロ
ツズマブ（Abbvie/BMS社製）；ALX-0141（Ablynx社製）；オゾラリズマブ（Ablynx社製）；アクチマブ−Ｃ（Actinium社製）；アクチマブ−Ｐ（Actinium社製）；ミラツズマブ−ｄｏｘ（Actinium社製）；Emab-SN-38（Actinium社製）；ナプツモマブ エスタフェナトクス（Active Biotech社製）；AFM13（Affimed社製）；AFM11（Affimed社製）；AGS-16C3F（Agensys社製）；AGS-16M8F（Agensys社製）；AGS-22ME（Agensys社製）；AGS-15ME（Agensys社製）；GS-67E（Agensys社製）；ALXN6000（サマリズマブ、Alexion社製）；ALT-836（Altor Bioscience社製）；ALT-801（Altor Bioscience社製）；ALT-803（Altor Bioscience社製）；AMG780（Amgen社製）；AMG 228（Amgen社製）；AMG820（Amgen社製）；AMG172（Amgen社製）；AMG595（Amgen社製）；AMG110（Amgen社製）；AMG232（アデカツムマブ、Amgen社製）；AMG211（Amgen/MedImmune社製）；BAY20-10112（Amgen/Bayer社製）；リロツムマブ（Amgen社製）；デノスマブ（Amgen社製）；AMP-514（Amgen社製）；MEDI575（AZ/MedImmune社製）；MEDI3617（AZ/MedImmune社製）；MEDI6383（AZ/MedImmune社
製）；MEDI551（AZ/MedImmune社製）；モキセツモマブ パスドトックス（AZ/MedImmune
社製）；MEDI565（AZ/MedImmune社製）；MEDI0639（AZ/MedImmune社製）；MEDI0680（AZ/MedImmune社製）；MEDI562（AZ/MedImmune社製）；AV-380（AVEO社製）；AV203（AVEO社
製）；AV299（AVEO社製）；BAY79-4620（Bayer社製）；アネツマブ ラブタンシン（Bayer社製）；バンチクツマブ（Bayer社製）；BAY94-9343（Bayer社製）；シブロツヅマブ（Boehringer Ingleheim社製）；BI-836845（Boehringer Ingleheim社製）；B-701（BioClin社製）；BIIB015（Biogen社製）；オビヌツズマブ（Biogen/Genentech社製）；BI-505（Bioinvent社製）；BI-1206（Bioinvent社製）；TB-403（Bioinvent社製）；BT-062（Biotest）BIL-010t（Biosceptre社製）；MDX-1203（BMS社製）；MDX-1204（BMS社製）；ネシツムマブ（BMS社製）；CAN-4（Cantargia AB社製）；CDX-011（Celldex社製）；CDX1401（Celldex社製）；CDX301（Celldex社製）；U3-1565（Daiichi Sankyo社製）；パトリツマブ（Daiichi Sankyo社製）；ティガツズマブ（Daiichi Sankyo社製）；ニモツズマブ（Daii
chi Sankyo社製）；DS-8895（Daiichi Sankyo社製）；DS-8873（Daiichi Sankyo社製）；DS-5573（Daiichi Sankyo社製）；MORab-004（Eisai社製）；MORab-009（Eisai社製）；MORab-003（Eisai社製）；MORab-066（Eisai社製）；LY3012207（Eli Lilly社製）；LY2875358（Eli Lilly社製）；LY2812176（Eli Lilly社製）；LY3012217（Eli Lilly社製）；LY2495655（Eli Lilly社製）；LY3012212（Eli Lilly社製）；LY3012211（Eli Lilly社製
）；LY3009806（Eli Lilly社製）；シクスツムマブ（Eli Lilly社製）；フランボツマブ
（Eli Lilly社製）；IMC-TR1（Eli Lilly社製）；ラムシルマブ（Eli Lilly社製）；タバルマブ（Eli Lilly社製）；ザノリムマブ（Emergent Biosolution社製）；FG-3019（FibroGen社製）；FPA008（Five Prime Therapeutics社製）；FP-1039（Five Prime Therapeutics社製）；FPA144（Five Prime Therapeutics社製）；カツマキソマブ（Fresenius Biotech社製）；IMAB362（Ganymed社製）；IMAB027（Ganymed社製）；HuMax-CD74（Genmab社
製）；HuMax-TFADC（Genmab社製）；GS-5745（Gilead社製）；GS-6624（Gilead社製）；OMP-21M18（デムシズマブ、GSK社製）；マパツムマブ（GSK社製）；IMGN289（ImmunoGen社製）；IMGN901（ImmunoGen社製）；IMGN853（ImmunoGen社製）；IMGN529（ImmunoGen社製）；IMMU-130（Immunomedics社製）；ミラツズマブ−ｄｏｘ（Immunomedics社製）；IMMU-115（Immunomedics社製）；IMMU-132（Immunomedics社製）；IMMU-106（Immunomedics社製）；IMMU-102（Immunomedics社製）；エプラツズマブ（Immunomedics社製）；クリバツズマブ（Immunomedics社製）；IPH41（Innate Immunotherapeutics社製）；ダラツムマブ（Janssen/Genmab社製）；CNTO-95（インテツムマブ、Janssen社製）；CNTO-328（シルツキシマブ、Janssen社製）；KB004（KaloBios社製）；モガムリズマブ（Kyowa Hakko Kirrin社製）；KW-2871（エクロメキシマブ、Life Science社製）；ソネプシズマブ（Lpath社製）；マージツキシマブ（Macrogenics社製）；エノビリツズマブ（Macrogenics社製）；MGD006（Macrogenics社製）；MGF007（Macrogenics社製）；MK-0646（ダロツズマブ、Merck社製）；MK-3475（Merck社製）；Sym004（Symphogen/Merck Serono社製）；DI17E6（Merck Serono社製）；MOR208（Morphosys社製）；MOR202（Morphosys社製）；Xmab5574（Morphosys社製）；BPC-1C（エンシツキシマブ、Precision Biologics社製）；TAS266（Novartis社製）；LFA102（Novartis社製）；BHQ880（Novartis/Morphosys社製）；QGE031（Novartis社製）；HCD122（ルカツムマブ、Novartis社製）；LJM716（Novartis社製）；AT355（Novartis社製）；OMP-21M18（Demcizumab、OncoMed社製）；OMP52M51（Oncomed/GSK社製）；OMP-59R5（Oncomed/GSK社製）；バンチクツマブ（Oncomed/Bayer社製）；CMC-544
（イノツズマブ オゾガマイシン、Pfizer社製）；PF-03446962（Pfizer社製）；PF-04856884（Pfizer社製）；PSMA-ADC（Progenics社製）；REGN1400（Regeneron社製）；REGN910（ネスバクマブ、Regeneron/Sanofi社製）；REGN421（エノチクマブ、Regeneron/Sanofi社製）；RG7221、RG7356、RG7155、RG7444、RG7116、RG7458、RG7598、RG7599、RG7600、RG7636、RG7450、RG7593、RG7596、DCDS3410A、RG7414（パルサツズマブ）、RG7160（イ
ムガツズマブ）、RG7159（オビヌツズマブ）、RG7686、RG3638（オナルツズマブ）、RG7597（Roche/Genentech社製）；SAR307746（Sanofi社製）；SAR566658（Sanofi社製）；SAR650984（Sanofi社製）；SAR153192（Sanofi社製）；SAR3419（Sanofi社製）；SAR256212
（Sanofi社製）、SGN-LIV1A（リンツズマブ、Seattle Genetics社製）；SGN-CD33A（Seattle Genetics社製）；SGN-75（ボルセツズマブマホドチン、Seattle Genetics社製）；SGN-19A（Seattle Genetics） SGN-CD70A（Seattle Genetics社製）；SEA-CD40（Seattle Genetics社製）；イブリツモマブ チウキセタン（Spectrum社製）；MLN0264（Takeda社製）；ガニツマブ（Takeda/Amgen社製）；CEP-37250（Teva社製）；TB-403（Thrombogenic
社製）；VB4-845（Viventia社製）；Xmab2512（Xencor社製）；Xmab5574（Xencor社製）
；ニモツズマブ（YM Biosciences社製）；カルルマブ（Janssen社製）；NY-ESO TCR（Adaptimmune社製）；MAGE-A-10 TCR（Adaptimmune社製）；CTL019（Novartis社製）；JCAR015（Juno Therapeutics社製）；KTE-C19 CAR（Kite Pharma社製）；UCART19（Cellectis社製）；BPX-401（Bellicum Pharmaceuticals社製）；BPX-601（Bellicum Pharmaceuticals社製）；ATTCK20（Unum Therapeutics社製）；CAR-NKG2D（Celyad社製）；Onyx-015（Onyx Pharmaceuticals社製）；H101（Shanghai Sunwaybio社製）；DNX-2401（DNAtrix社製）
；VCN-01（VCN Biosciences社製）；Colo-Ad1（PsiOxus Therapeutics社製）；ProstAtak（Advantagene社製）；Oncos-102（Oncos Therapeutics社製）；CG0070（Cold Genesys社製）；Pexa-vac（JX-594、Jennerex Biotherapeutics社製）；GL-ONC1（Genelux社製）；T-VEC（Amgen社製）；G207（Medigene社製）；HF10（Takara Bio社製）；SEPREHVIR（HSV1716、Virttu Biologics社製）；OrienX010（OrienGene Biotechnology社製）；Reolysin（Oncolytics Biotech社製）；SVV-001（Neotropix社製）；Cacatak（CVA21、Viralytics社製）；Alimta（Eli Lilly社製）、シスプラチン、オキサリプラチン、イリノテカン、
フォリン酸、メトトレキサート、シクロホスファミド、５−フルオロウラシル、Zykadia （Novartis社製）、Tafinlar（GSK社製）、Xalkori（Pfizer社製）、Iressa（AZ社製）、Gilotrif（Boehringer Ingelheim社製）、Tarceva（Astellas Pharma社製）、Halaven（Eisai Pharma社製）、ベリパリブ（Abbvie社製）、AZD9291（AZ社製）、アレクチニブ（Chugai社製）、LDK378（Novartis社製）、Genetespib（Synta Pharma社製）、テルジェンプマツセル−Ｌ（NewLink Genetics社製）、GV1001（Kael-GemVax社製）、チバンチニブ（ArQule社製）；Cytoxan（BMS社製）；Oncovin（Eli Lilly社製）；アドリアマイシン（Pfizer社製）；Gemzar（Eli Lilly社製）；Xeloda（Roche社製）；Ixempra（BMS社製）；Abraxane（Celgene社製）；Trelstar（Debiopharm社製）；Taxotere（Sanofi社製）；Nexavar（Bayer社製）；IMMU-132（Immunomedics社製）；E7449（Eisai社製）；Thermodox（Celsion社製）；Cometriq（Exellxis社製）；Lonsurf（Taiho Pharmaceuticals社製）；Camptosar（Pfizer社製）；UFT（Taiho Pharmaceuticals社製）；及びTS-1（Taiho Pharmaceuticals社製）、
からなる群から選択される抗がん剤を含む。

一部の実施形態において、１又は２以上のエリシペラトクロストリジウム細菌株が、本発明の組成物における唯一の治療活性剤である。一部の実施形態において、組成物中の細菌株が、本発明の組成物における唯一の治療活性剤である。

喘息
好ましい実施形態において、本発明の組成物は、喘息を治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、ハウスダストダニの抽出物による感作及びチャレンジの後、好中球及び／又は好酸球の気道への動員を低減させることができ、したがって喘息の治療又は予防において有用でありうる。喘息は、気道の炎症及び制限を特徴とする慢性疾患である。喘息の炎症はＩＬ−１７及び／又はＴｈ１７細胞によって媒介されることもあり、したがって本発明の組成物は、喘息を予防又は治療するのに特に有効でありうる。喘息の炎症は好酸球及び／又は好中球によって媒介されることもある。

特定の実施形態において、喘息は好酸球性喘息又はアレルギー性喘息である。好酸球性喘息又はアレルギー性喘息は、末梢血中及び気道分泌物中の好酸球数の増加を特徴とし、病理学的には基底膜帯の肥厚化と関連付けられ、薬理学的にはコルチコステロイド応答性によって関連付けられる（Fahy (2009) Proc Am Thorac Soc 6.256-259）。好酸球の動員又は活性化を低減させるか又は阻害する組成物は、好酸球性喘息又はアレルギー性喘息を治療又は予防するのに有用でありうる。

さらなる実施形態において、本発明の組成物は、好中球性喘息（又は非好酸球性喘息）を治療又は予防するのに使用するためのものである。好中球数が高いことは、コルチコステロイド治療に対して非感受性の可能性もある重症の喘息と関連付けられる。好中球の動員又は活性化を低減させるか又は阻害する組成物は、好中球性喘息を治療又は予防するのに有用でありうる。

好酸球性喘息及び好中球性喘息は相互に排他的状態でなく、好酸球性応答及び好中球性応答のいずれかを対処する助けとなる治療は喘息一般を治療するのに有効でありうる。

ＩＬ−１７レベルの上昇及びＴｈ１７経路の活性化は重症の喘息と関連付けられ、したがって本発明の組成物は、重症の喘息の発症を予防するのに又は重症の喘息を治療するのに有用でありうる。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、喘息の治療又は予防において好酸球性の炎症応答を低減させる方法に使用するためか、又は喘息の治療又は予防において好中球性の炎症応答を低減させる方法に使用するためのものである。上述の通り、喘息において好酸球レベルが高いことは病理学的には基底膜帯の肥厚化と関連付けられ、したがって喘息の治療又は予防において好酸球性の炎症応答を低減させることによって、本疾患のこの特徴に特異的に対処することができる可能性がある。また、好酸球の増加とあいまって又はこれらの非存在下のいずれかで、好中球の増加は、重症の喘息及び慢性的な気道狭窄と関連付けられる。したがって、好中球性の炎症応答を低減させることは、重症の喘息に対処するのに特に有用でありうる。

特定の実施形態において、組成物は、アレルギー性喘息において細気管支周囲の浸潤を低減させ、すなわちこれはアレルギー性喘息の治療において細気管支周囲の浸潤を低減させるのに使用するためのものである。特定の実施形態において、組成物は、好中球性喘息において細気管支周囲の浸潤及び／又は血管周囲浸潤を低減させ、すなわちこれはアレルギー性の好中球性喘息の治療において細気管支周囲の浸潤及び／又は血管周囲浸潤を低減させるのに使用するためのものである。

特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、ＴＮＦαレベルの低減がもたらされるか又はそのレベルの上昇が予防される。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、好酸球性炎症応答及び／又は好中球性炎症応答の低減をもたらす、喘息の治療方法に使用するためのものである。特定の実施形態において、治療対象の患者は、例えば、血液サンプリング又は痰分析によって特定して、好中球レベル若しくは好酸球レベルが上昇しているか、又はそうであったことが以前に特定されている。

本発明の組成物は、新生児に、又は妊婦に投与したとき、新生児における喘息の発症を予防するのに有用でありうる。本発明の組成物は、小児における喘息の発症を予防するのに有用でありうる。本発明の組成物は、成人発症の喘息を治療又は予防するのに有用でありうる。本発明の組成物は、喘息をマネージするか又は緩和するのに有用でありうる。本発明の組成物は、ハウスダストダニなどの、アレルゲンにより悪化する喘息と関連付けられる症状を低減させるのに特に有用でありうる。

喘息の治療又は予防とは、例えば、症状の重症度の緩和、又は発作頻度の低減若しくは患者にとって問題であるトリガーの範囲の低減を指すことができる。

関節炎
好ましい実施形態において、本発明の組成物は、関節リウマチ（ＲＡ，rheumatoid arthritis）を治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、マウスモデルにおいてＲＡの徴候の低減を達成すること、軟骨損傷及び骨損傷を低減させること、及びＩＬ−１７炎症性応答を低減させることができ、したがってＲＡの治療又は予防において有用でありうる。ＲＡとは、主として関節に影響を与える全身性の炎症性障害である。ＲＡは関節の腫脹、滑膜過形成、及び軟骨及び骨の破壊をもたらす炎症性応答と関連付けられる。例えば、ＩＬ−１７は、軟骨細胞及び骨芽細胞においてマトリクス産生を阻害し、マトリクスメタロプロテアーゼの産生及び機能を活性化させることから、並びにＲ
Ａ疾患活動性はＩＬ−１７レベル及びＴｈ−１７細胞数と相関することから、ＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞はＲＡにおいて主要な役割を担っている可能性があり（Miossec and Kolls (2012) Nat Rev Drug Discov. 11(10):763-76、Yang et al. (2014) Trends Pharmacol Sci. 35(10):493-500）、したがって本発明の組成物は、ＲＡの予防又は治療に特に有効でありうる。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＲＡの治療又は予防において、ＩＬ−１７レベルを低下させ又はＩＬ−１７レベルの上昇を予防するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、ＩＬ−１７レベル、特にＩＬ−１７Ａレベルの低減がもたらされるか又はそのレベルの上昇が予防される。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、ＩＦＮ−γレベル又はＩＬ−６レベルの低減がもたらされるか又はそのレベルの上昇が予防される。

特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、関節の腫脹の低減がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、腫脹関節を有する患者又は腫脹関節を有するリスクがあると特定された患者に使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＲＡにおける関節の腫脹を低減させる方法に使用するためのものである。

特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、軟骨損傷又は骨損傷の低減がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＲＡの治療において軟骨損傷又は骨損傷を低減又は予防するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、組成物は、軟骨損傷又は骨損傷のリスクがある重症のＲＡを有する患者を治療するのに使用するためのものである。

ＩＬ−１７レベル及びＴｈ１７細胞数の増加はＲＡにおける軟骨破壊及び骨破壊と関連付けられる（Miossec and Kolls (2012) Nat Rev Drug Discov. 11(10):763-76、Yang et
al. (2014) Trends Pharmacol Sci. 35(10):493-500）。ＩＬ−１７は軟骨組織及び骨組織においてマトリクス破壊を活性化すると知られ、ＩＬ−１７は軟骨細胞及び骨芽細胞においてマトリクス産生に対して阻害効果を有する。したがって特定の実施形態において、本発明の組成物は、ＲＡの治療において骨びらん又は軟骨損傷を予防するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、組成物は、骨びらん又は軟骨損傷を示す患者又は骨びらん又は軟骨損傷のリスクがあると特定された患者を治療するのに使用するためのものである。

ＴＮＦ−αもまたＲＡと関連付けられるが、ＴＮＦ−αは疾患の後期の病原性に関与していない。対照的に、ＩＬ−１７は慢性疾患の全期を通してある役割を担っている（Koenders et al. (2006) J. Immunol. 176:6262-6269）。したがって、特定の実施形態において、本発明の組成物は、関節破壊及び軟骨損失を含む疾患などの、慢性ＲＡ又は後期のＲＡを治療するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物は、以前に抗ＴＮＦ−α療法を受けた患者を治療するためのものである。特定の実施形態において、治療対象の患者は抗ＴＮＦ−α療法に応答しないか又はもはや応答しない。

本発明の組成物は、患者の免疫系を調節するのに有用とすることができ、したがって特定の実施形態において本発明の組成物は、ＲＡのリスクがあると特定されたか、又はＲＡの初期と診断された患者におけるＲＡを予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、ＲＡの発症を予防するのに有用でありうる。

本発明の組成物は、ＲＡをマネージするか又は緩和するのに有用とすることができる。本発明の組成物は、関節腫脹又は骨破壊と関連付けられる症状を低減させるのに特に有用
でありうる。ＲＡの治療又は予防とは、例えば、症状の重症度の緩和、又は発作頻度の低減若しくは患者にとって問題であるトリガーの範囲の低減を指すことができる。

多発性硬化症
好ましい実施形態において、本発明の組成物は、多発性硬化症を治療又は予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、多発性硬化症のマウスモデル（ＥＡＥモデル）において疾患の発生率及び疾患の重症度の低減を達成することができ、したがって本組成物は多発性硬化症の治療又は予防において有用でありうる。多発性硬化症とは、特に脊柱及び脳における、ニューロンのミエリン鞘への損傷と関連付けられる炎症性障害である。多発性硬化症は慢性疾患であり、この疾患は進行的に機能不能となり、症状の発現において徐々に進展する。例えば、ＩＬ−１７レベルは多発性硬化症の病変と相関しうることから、ＩＬ−１７は血液脳関門の内皮細胞接合部を破壊しうることから、及びＴｈ１７細胞は中枢神経系にマイグレーションしニューロンの欠損を起こしうることから（Amedei et al. (2012) Int J Mol Sci. 13(10):13438-60、Shabgah et al. (2014) Postepy. Dermatol. Alergol. 31(4):256-61）、ＩＬ−１７及びＴｈ１７細胞は多発性硬化症にお
いて主要な役割を担っている可能性がある。したがって本発明の組成物は、多発性硬化症を予防又は治療するのに特に有効でありうる。

特定の実施形態において、本発明の組成物による治療は、疾患の発生率又は疾患の重症度の低減をもたらす。特定の実施形態において、本発明の組成物は、疾患の発生率又は疾患の重症度を低減させるのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、運動機能の減退が予防されるか又は運動機能の改善がもたらされる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、運動機能の減退を予防するのに使用するため、又は運動機能を改善するのに使用するためのものである。特定の実施形態において、本発明の組成物での治療により、麻痺の発生が予防される。特定の実施形態において、本発明の組成物は、多発性硬化症の治療において、麻痺を予防するのに使用するためのものである。

本発明の組成物は、患者の免疫系を調節するのに有用とすることができ、したがって特定の実施形態において本発明の組成物は、多発性硬化症のリスクがあると特定された患者、又は初期の多発性硬化症若しくは「再発寛解型」多発性硬化症と診断された患者における多発性硬化症を予防するのに使用するためのものである。本発明の組成物は、硬化症の発症を予防するのに有用でありうる。

本発明の組成物は、多発性硬化症をマネージするか又は緩和するのに有用とすることができる。本発明の組成物は、多発性硬化症と関連付けられる症状を低減させるのに特に有用でありうる。多発性硬化症の治療又は予防とは、例えば、症状の重症度の緩和、又は発作頻度の低減若しくは患者にとって問題であるトリガーの範囲の低減を指すことができる。

投与様式
本発明の組成物は、本発明の細菌株とともに腸管への送達及び／又は部分的又は全体的な定着を可能とするために、消化管に投与することが好ましい。一般に、本発明の組成物は、経口的に投与するが、これらは直腸に、鼻腔内に、又はバッカル経路若しくは舌下経路を介して投与してもよい。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、発泡剤として、スプレー剤又はゲル剤として投与してもよい。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、例えばカカオ脂（ココアバター）、合成
ハードファット（例えばsuppocire、witepsol）、グリセロゼラチン、ポリエチレングリ
コール、又はグリセリンせっけん組成物の形態で、肛門坐剤などの、坐剤として投与してもよい。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、経鼻チューブ、経口胃チューブ、胃チューブ、経皮空腸瘻チューブ（Ｊ ｔｕｂｅ，jejunostomy tube）、経皮的内視鏡下胃瘻造設術（ＰＥＧ，percutaneous endoscopic gastrostomy）などのチューブを介して、又は
胃、空腸へのアクセスを可能とする胸壁ポートなどのポート及び他の適切なアクセスポートを介して、消化管に投与する。

本発明の組成物は、１回で投与してもよく、又は治療レジメンの一部として連続的に投与してもよい。特定の実施形態において、本発明の組成物は、日毎に投与することができる。

本発明の特定の実施形態において、本発明による治療は患者の腸内微生物叢の評価をともなう。本発明の細菌株の送達及び／又は本発明の細菌株での一部の若しくは全体的な定着が達成されず、その結果有効性が観察されない場合、治療を繰り返してもよいし、送達及び／又は一部の若しくは全体的な定着が成功し、有効性が観察される場合、治療を中止してもよい。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、炎症性疾患又は自己免疫疾患が子宮内の妊婦の子に及び／又はその子の出生後に発症することを予防するために、妊娠動物、例えばヒトなどの哺乳動物に投与してもよい。

本発明の組成物は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態と診断された患者に、又はＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態のリスクがあると特定された患者に投与することができる。本発明の組成物はまた、健常患者においてＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態の発症を予防するための予防的措置として投与することもできる。

本発明の組成物は、異常な腸内微生物叢を有すると特定された患者に投与することができる。例えば、患者はエリシペラトクロストリジウムによる定着が低減しているか又は非存在の場合もある。

本発明の組成物は、栄養補助剤などの食品として投与することができる。

一般に、本発明の組成物はヒトの治療用であるが、組成物を使用して、家禽、ブタ、ネコ、イヌ、ウマ、又はウサギなどの単胃哺乳動物を含む動物を治療してもよい。本発明の組成物は動物の発育成績を高めるのに有用でありうる。動物に投与する場合、強制経口を使用することができる。

組成物
一般に、本発明の組成物は、細菌を含む。本発明の好ましい実施形態において、組成物は凍結乾燥の形態で製剤化される。例えば、本発明の組成物は、本発明の細菌株を含む顆粒又はゼラチンカプセル、例えば硬質ゼラチンカプセルを含みうる。

本発明の組成物は凍結乾燥細菌を含むことが好ましい。細菌の凍結乾燥は十分に確立された手順であり、関連した指針が、例えば、参考文献Miyamoto-Shinohara et al. (2008)
J. Gen. Appl. Microbiol., 54, 9-24、Cryopreservation and Freeze-Drying Protocols, ed. by Day and McLellan, Humana Press、Leslie et al. (1995) Appl. Environ. Mi
crobiol. 61, 3592-3597で入手可能である。

あるいは、本発明の組成物は生きている活性細菌培養物を含むこともできる。

一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株については不活化をしなかったが、例えば、熱不活化をしなかった。一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株については殺菌をしなかったが、例えば、加熱殺菌をしなかった。一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株については弱毒化をしなかったが、例えば、加熱弱毒化をしなかった。例えば、一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株については、殺菌を、不活化を及び／又は弱毒化をしなかった。例えば、一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株は生きている。例えば、一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株は生存している。例えば、一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株は、腸管に部分的又は全体的に定着することができる。例えば、一部の実施形態において、本発明の組成物中の細菌株は生存しており、腸管に部分的又は全体的に定着することができる。

一部の実施形態において、組成物は生きている菌株と殺菌された細菌株との混合物を含む。

好ましい実施形態において、本発明の組成物は、腸管への細菌株の送達が可能となるようにカプセル化される。カプセル化により、例えば、圧力、酵素活性、又はｐＨの変化によって惹起される可能性のある物理的崩壊などの化学的刺激又は物理的刺激での破裂を介する劣化から、標的部位に送達されるまで、組成物を保護する。適当な任意のカプセル化法を使用することができる。例示的なカプセル化技法としては、多孔質マトリクス内での閉じ込め、固体担体表面での結合又は吸着、凝集による又は架橋剤での自己凝集、及び微孔膜又はマイクロカプセルの裏側への機械的封じ込めが挙げられる。本発明の組成物を調製するのに有用でありうる、マイクロカプセル化に関する指針については、例えば、参考文献Mitropoulou et al. (2013) J Nutr Metab. (2013) 716861及びKailasapathy et al.
(2002) Curr Issues Intest Microbiol. 3(2):39-48で入手可能である。

組成物は、経口で投与することができ、錠剤、カプセル又は散剤の形態でありうる。エリシペラトクロストリジウム・ラモスムは嫌気性なのでカプセル化製品が好ましい。酸素除去剤及びプレバイオティクス基質として他の成分（例えばビタミンＣなど）を含めて、送達及び／又は一部の若しくは全体的な定着並びにインビボでの生存率を改良することができる。あるいは、本発明のプロバイオティクス組成物は、ミルク若しくは乳清を基にした発酵乳製品などの、食物又は栄養剤として、又は医薬品として経口投与することができる。

組成物はプロバイオティクスとして製剤化することができる。

本発明の組成物は、本発明の細菌株の治療有効量を含む。細菌株の治療有効量は患者に対して有益な効果を発揮するのに十分である。細菌株の治療有効量は、患者の腸管への送達及び／又は部分的又は全体的な定着をもたらすのに十分でありうる。

例えば成人用の、細菌の適切な１日用量は約１×１０^３〜約１×１０^１１のコロニー形成単位（ＣＦＵ，colony forming unit）；例えば約１×１０^７〜約１×１０^１０のＣＦ
Ｕ；別の例では例えば約１×１０^６〜約１×１０^１０のＣＦＵでありうる。

特定の実施形態において、組成物は、組成物の重量に対して、約１×１０^６〜約１×１０^１１のＣＦＵ／ｇ；例えば、約１×１０^８〜約１×１０^１０のＣＦＵ／ｇの量で細菌株
を含む。用量は、例えば、１ｇ、３ｇ、５ｇ、及び１０ｇでありうる。

典型的には、本発明の組成物などの、プロバイオティクスは、少なくとも１つの適切なプレバイオティクス化合物と組み合わされていてもよい。プレバイオティクス化合物は通常、オリゴ糖若しくは多糖などの非消化性炭水化物、又は上部消化管において分解若しくは吸収されない糖アルコールである。公知のプレバイオティクスには、イヌリン及びトランスガラクトオリゴ糖などの市販製品が含まれる。

特定の実施形態において、本発明のプロバイオティクス組成物は、組成物の全重量に対して、約１〜約３０重量％（例えば５〜２０重量％）の量でプレバイオティクス化合物を含む。炭水化物は、フラクトオリゴ糖（又はＦＯＳ，fructo-oligosaccharide）、短鎖フラクトオリゴ糖、イヌリン、イソマルトオリゴ糖、ペクチン、キシロオリゴ糖（又はＸＯＳ，xylo-oligosaccharide）、キトサンオリゴ糖（又はＣＯＳ，chitosan-oligosaccharide）、ベータ−グルカン、アラブルガム（arable gum）修飾及び難消化性デンプン、ポリデキストロース、Ｄ−タガトース、アカシア繊維、イナゴマメ、オートムギ、並びに柑橘類繊維から選択することができる。一態様では、プレバイオティクスは、短鎖フラクトオリゴ糖（以下、簡単に本明細書ではＦＯＳ−ｃ．ｃ，short-chain fructo-oligosaccharideと示す）であり、前記ＦＯＳ−ｃ．ｃは消化されない炭水化物であり、一般に甜菜糖の変換により得られ、３個のグルコース分子が結合するサッカロース分子を含んでいる。

本発明の組成物は薬学的に許容される賦形剤又は担体を含みうる。そのような適切な賦形剤の例は、参考文献Handbook of Pharmaceutical Excipients, 2nd Edition, (1994), Edited by A Wade and PJ Wellerに見出すことができる。治療的使用のために許容される担体又は希釈剤は、薬剤分野において周知であり、例えば、参考文献Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co. (A. R. Gennaro edit. 1985)に記載されてい
る。適切な担体の例には、ラクトース、デンプン、グルコース、メチルセルロース、ステアリン酸マグネシウム、マンニトール、ソルビトールなどが含まれる。適切な希釈剤の例には、エタノール、グリセロール及び水が含まれる。医薬担体、賦形剤又は希釈剤の選択は、目的とする投与経路及び標準的な薬務に対して選択することができる。医薬組成物は、担体、賦形剤又は希釈剤として、又はこれらに加えて、適切な任意の結合剤、潤滑剤、懸濁化剤、コーティング剤、可溶化剤を含みうる。適切な結合剤の例には、デンプン、ゼラチン、グルコースなどの天然糖、無水ラクトース、フリーフローラクトース、ベータ−ラクトース、コーンシロップ、アカシア、トラガカント又はアルギン酸ナトリウムなどの天然及び合成ゴム、カルボキシメチルセルロース並びにポリエチレングリコールが含まれる。適切な潤滑剤の例には、オレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸マグネシウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウムなどが含まれる。保存料、安定剤、染料及びさらに香味料が、医薬組成物中に提供されてもよい。保存料の例には、安息香酸ナトリウム、ソルビン酸及びｐ−ヒドロキシ安息香酸のエステルが含まれる。抗酸化剤及び懸濁化剤もまた、使用してもよい。

本発明の組成物は食品として製剤化することができる。例えば、食品は、本発明の治療効果に加えて、例えば栄養補助剤において、栄養学的な利益をもたらすことができる。同様に、本発明の組成物の風味が高まるように、又は組成物が、医薬組成物ではなくむしろ通常の食料品にさらに類似していることで消費するのに一層魅力的となるように、食品を製剤化することができる。特定の実施形態において、本発明の組成物は、乳ベースの製品として製剤化される。用語「乳ベースの製品」とは、様々な脂肪含量を有する任意の液体又は半固体の乳ベースの製品若しくは乳清ベースの製品を意味する。乳ベースの製品は、例えば、牛乳、山羊乳、羊乳、スキムミルク、全乳、粉乳から還元したミルク、及び加工していない乳清、又はヨーグルト、凝固した乳、凝乳、酸乳、酸全乳、バターミルク及び他の酸乳製品などの加工製品でありうる。別の重要な群には、乳清飲料、発酵乳、コンデ
ンスミルク、幼児用又は乳児用ミルクなどの乳飲料、フレーバーミルク、アイスクリーム、スイーツなどのミルクを含有する食品が含まれる。

一部の実施形態において、本発明の組成物は、エリシペラトクロストリジウム属の１又は２以上の細菌株を含み、他の属の細菌を含有していないか又はごく微量の若しくは生物学的に無関係な量の別の属の細菌のみを含む。したがって、一部の実施形態において、本発明は、治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の１又は２以上の細菌株を含み、他の属の細菌を含有していないか又はごく微量の若しくは生物学的に無関係な量の別の属の細菌のみを含む組成物を提供する。

特定の実施形態において、本発明の組成物は、単一の細菌株又は種を含み、他の細菌株又は種を含まない。そのような組成物は、ごく微量の又は生物学的に無関係な量の他の細菌株又は種のみを含む。そのような組成物は、他の種の生物を実質的に含まない培養物でありうる。したがって、一部の実施形態において、本発明は、治療に使用するための、エリシペラトクロストリジウム属の単一の細菌株又は種を含み、他の属の細菌を含有していないか又はごく微量の若しくは生物学的に無関係な量の別の属の細菌のみを含む組成物を提供する。

一部の実施形態において、本発明の組成物は２以上の細菌株又は種を含む。例えば、一部の実施形態において、本発明の組成物は同一種内に由来する２以上の株を含み（例えば２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１６、２１、２６、３１、３６、４１又は４６を超える株）、他の種由来の細菌を含んでいなくてもよい。一部の実施形態において、本発明の組成物は同一種内に由来する５０未満の株を含み（例えば４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１２、１０、９、８、７、６、５、４又は３未満の株）、他の種由来の細菌を含んでいなくてもよい。一部の実施形態において、本発明の組成物は同一種内に由来する１〜４０、１〜３０、１〜２０、１〜１９、１〜１８、１〜１５、１〜１０、１〜９、１〜８、１〜７、１〜６、１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、２〜５０、２〜４０、２〜３０、２〜２０、２〜１５、２〜１０、２〜５、６〜３０、６〜１５、１６〜２５、又は３１〜５０の株を含み、他の種由来の細菌を含んでいなくてもよい。一部の実施形態において、本発明の組成物は同一属内に由来する２以上の種を含み（例えば２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１３、１６、１８、２１、２４、２６、３１、３６、又は４１を超える種）、他の属の細菌を含んでいなくてもよい。一部の実施形態において、本発明の組成物は同一属内に由来する５０未満の種を含み（例えば５０、４５、４０、３５、３０、２５、２０、１５、１２、１０、８、７、６、５、４又は３未満の種）、他の属の細菌を含んでいなくてもよい。一部の実施形態において、本発明の組成物は同一属内に由来する１〜５０、１〜４０、１〜３０、１〜２０、１〜１５、１〜１０、１〜９、１〜８、１〜７、１〜６、１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、２〜５０、２〜４０、２〜３０、２〜２０、２〜１５、２〜１０、２〜５、６〜３０、６〜１５、１６〜２５、又は３１〜５０の種を含み、他の属の細菌を含んでいなくてもよい。本発明は前述の任意の組合せを含む。

一部の実施形態において、組成物は微生物コンソーシアを含む。例えば、一部の実施形態において、組成物は微生物コンソーシアの一部としてエリシペラトクロストリジウム細菌株を含む。例えば、一部の実施形態において、エリシペラトクロストリジウム細菌株は、腸管においてインビボで共生することができる他の属の１又は２以上（例えば少なくとも２、３、４、５、１０、１５又は２０）の他の細菌株と組合せで存在する。例えば、一部の実施形態において、組成物は、エリシペラトクロストリジウム・ラモスムの細菌株を異なる属の細菌株と組合せで含む。一部の実施形態において、微生物コンソーシアは、単一生物、例えばヒトの糞便試料から得た２又は３以上の細菌株を含む。一部の実施形態において、微生物コンソーシアは自然界では一緒には見出されない。例えば、一部の実施形
態において、微生物コンソーシアは、異なる少なくとも２つの生物の糞便試料から得た細菌株を含む。一部の実施形態において、異なる２つの生物は同一種、例えば異なる２人のヒトに由来する。一部の実施形態において、異なる２つの生物はヒト幼児及び成人である。一部の実施形態において、異なる２つの生物はヒト及びヒト以外の哺乳動物である。

一部の実施形態において、本発明の組成物は、ＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７株と同一の安全性及び治療有効性の特徴を有する細菌株をさらに含むが、この細菌株は、ＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されたＭＲＸ０２７でもないし、又はエリシペラトクロストリジウム・ラモスムでもないし又はエリシペラトクロストリジウムでもない。

本発明の組成物が２以上の細菌株、種又は属を含む一部の実施形態において、個々の細菌株、種又は属は、個別、同時又は連続投与用でありうる。例えば、組成物に２以上の細菌株、種又は属の全てを含めてもよいし、細菌株、種又は属を別々に貯蔵し、個別に、同時に、連続して投与してもよい。一部の実施形態において、２以上の細菌株、種又は属を別々に貯蔵するが、使用前に一緒に混合する。

一部の実施形態において、本発明で使用する細菌株はヒト成人の糞便から得る。本発明の組成物が２以上の細菌株を含む一部の実施形態において、細菌株の全てはヒト成人の糞便から得るが、すなわち他の細菌株が存在する場合、これらはごく微量でのみ存在する。細菌は、ヒト成人の糞便から得た後に培養して、本発明の組成物において使用する場合がある。

上記のように、１又は２以上のエリシペラトクロストリジウム細菌株が本発明の組成物中の唯一の治療活性剤である。一部の実施形態において、組成物中の細菌株が本発明の組成物中の唯一の治療活性剤である。

本発明による使用のための組成物は、製造販売承認が必要な場合も不要な場合もある。

特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、前記細菌株は凍結乾燥されている。特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、前記細菌株は噴霧乾燥されている。特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、細菌株は、凍結乾燥されているか又は噴霧乾燥されており、生きている。特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、細菌株は、凍結乾燥されているか又は噴霧乾燥されており、生存している。特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、細菌株は、凍結乾燥されているか又は噴霧乾燥されており、腸管に部分的又は全体的に定着することができる。特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、細菌株は、凍結乾燥されているか又は噴霧乾燥されており、生存しており、腸管に部分的又は全体的に定着することができる。

場合によっては、凍結乾燥又は噴霧乾燥細菌株は投与前に再構成される。場合によっては、本明細書に記載の希釈剤を使用して再構成する。

本発明の組成物は薬学的に許容される賦形剤、希釈剤又は担体を含みうる。

特定の実施形態において、本発明は、本発明で使用の細菌株と、薬学的に許容される賦形剤、担体又は希釈剤とを含む医薬組成物を提供し、この場合、それを必要とする対象に投与したとき、細菌株は障害を治療するのに十分な量であり、障害は、ブドウ膜炎；乳がん、肺がん、肝臓がん、結腸がん、又は卵巣がんなどのがん；多発性硬化症；関節リウマ
チ、変形性関節症、乾癬性関節炎、又は若年性特発性関節炎などの関節炎；視神経脊髄炎（デビック病）；強直性脊椎炎；脊椎関節炎；乾癬；全身性紅斑性狼瘡；クローン病又は潰瘍性大腸炎などの炎症性腸疾患；セリアック病；アレルギー性喘息又は好中球性喘息などの喘息；慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）；強膜炎；血管炎；ベーチェット病；アテローム性動脈硬化症；アトピー性皮膚炎；肺気腫；歯周炎；アレルギー性鼻炎；及び同種異系移植片拒絶からなる群から選択される。

特定の実施形態において、本発明は、本発明で使用の細菌株と、薬学的に許容される賦形剤、担体又は希釈剤とを含む医薬組成物を提供し、この場合、細菌株は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防するのに十分な量である。好ましい実施形態において、前記疾患又は状態は、ブドウ膜炎；乳がん、肺がん、肝臓がん、結腸がん、又は卵巣がんなどのがん；多発性硬化症；関節リウマチ、変形性関節症、乾癬性関節炎、又は若年性特発性関節炎などの関節炎；視神経脊髄炎（デビック病）；強直性脊椎炎；脊椎関節炎；乾癬；全身性紅斑性狼瘡；クローン病又は潰瘍性大腸炎などの炎症性腸疾患；セリアック病；アレルギー性喘息又は好中球性喘息などの喘息；慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）；強膜炎；血管炎；ベーチェット病；アテローム性動脈硬化症；アトピー性皮膚炎；肺気腫；歯周炎；アレルギー性鼻炎；及び同種異系移植片拒絶からなる群から選択される。

特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、細菌株の量は組成物の重量に対して１ｇ当たり約１×１０^３〜約１×１０^１１のコロニー形成単位である。

特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、組成物は１ｇ、３ｇ、５ｇ又は１０ｇの用量で投与される。

特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、組成物は、経口、直腸、皮下、鼻腔、バッカル及び舌下からなる群から選択される方法によって投与される。

特定の実施形態において、本発明は、ラクトース、デンプン、グルコース、メチルセルロース、ステアリン酸マグネシウム、マンニトール及びソルビトールからなる群から選択される担体を含む、上記医薬組成物を提供する。

特定の実施形態において、本発明は、上記医薬組成物を提供し、エタノール、グリセロール及び水からなる群から選択される希釈剤を含む。

特定の実施形態において、本発明は、上記医薬組成物を提供し、デンプン、ゼラチン、グルコース、無水ラクトース、フリーフローラクトース、ベータ−ラクトース、コーンシロップ、アカシア、トラガカント、アルギン酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロース、ポリエチレングリコール、オレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸マグネシウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム及び塩化ナトリウムからなる群から選択される賦形剤を含む。

特定の実施形態において、本発明は、上記医薬組成物を提供し、保存剤、抗酸化剤及び安定化剤の少なくとも１つをさらに含む。

特定の実施形態において、本発明は、上記医薬組成物を提供し、安息香酸ナトリウム、ソルビン酸及びｐ−ヒドロキシ安息香酸のエステルからなる群から選択される保存剤を含む。

特定の実施形態において、本発明は上記医薬組成物を提供し、この場合、組成物を約４℃又は約２５℃で密封容器に貯蔵し、この容器を５０％の相対湿度である雰囲気中に置く場合、少なくとも約１ヵ月、３ヵ月、６ヵ月、１年、１．５年、２年、２．５年又は３年の期間の後にコロニー形成ユニットで測定して少なくとも８０％の細菌株が残存している。

一部の実施形態において、本発明の組成物は、本明細書に記載の組成物を含む密封容器で提供される。一部の実施形態において、密封容器は分包又はボトルである。一部の実施形態において、本発明の組成物は、本明細書に記載の組成物を含むシリンジで提供される。

本発明の組成物は、一部の実施形態において、医薬製剤として提供することができる。例えば、組成物は錠剤又はカプセルとして提供することができる。一部の実施形態において、カプセルはゼラチンカプセル（「ｇｅｌ−ｃａｐ」，gelatine capsule）である。

一部の実施形態において、本発明の化合物は経口で投与される。経口投与は、化合物が消化管に入るような嚥下及び／又は化合物が口腔から直接血流に入るバッカル、舌又は舌下投与を含みうる。

経口投与に適切な医薬製剤には、固体プラグ、固体微粒子、半固体及び液体（多相又は分散系を含む）、例えば錠剤；マルチ粒子又はナノ粒子を含む軟カプセル又は硬カプセル、液体（例えば水溶液）、エマルジョン又は散剤；ロゼンジ（充填液体を含む）；噛むもの；ゲル；速分散性剤形；フィルム；腔坐剤；スプレー；及びバッカル／粘膜付着性パッチが含まれる。

一部の実施形態において、医薬組成物は腸溶性製剤、すなわち本発明の組成物を経口投与により腸管へ送達することに適した胃耐性製剤（例えば、胃内ｐＨに耐性）である。腸溶性製剤は、細菌又は組成物の別の成分が酸感受性である場合、例えば胃酸条件下で分化しやすい場合、特に有用でありうる。

一部の実施形態において、腸溶性製剤は腸溶性コーティングを含む。一部の実施形態において、製剤は腸溶性コーティング剤形である。例えば、製剤は腸溶性コーティング錠剤又は腸溶性コーティングカプセルなどでもよい。腸溶性コーティングは従来の腸溶性コーティング、例えば、経口送達用の錠剤、カプセルなどのための従来のコーティングでもよい。製剤は、フィルムコーティング、例えば、酸不溶性ポリマーなど腸溶性ポリマーの薄膜層を含んでもよい。

一部の実施形態において、腸溶性製剤は、本質的に腸溶性であり、例えば、腸溶性コーティングを必要とせずに胃耐性である。したがって、一部の実施形態において、製剤は、腸溶性コーティングを含まない腸溶性製剤である。一部の実施形態において、製剤は、熱ゲル化材料製のカプセルである。一部の実施形態において、熱ゲル化材料は、メチルセルロース、ヒドロキシメチルセルロース又はヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ，hydroxypropylmethylcellulose）などの、セルロース性材料である。一部の実施形態において、カプセルはいかなるフィルム形成ポリマーも含有していない殻を含む。一部の実施形態において、カプセルは殻を含み、殻はヒドロキシプロピルメチルセルロースを含み、いかなるフィルム形成ポリマーも含まない（例えばUS 2016/0067188を参照のこと）
。一部の実施形態において、製剤は本質的に腸溶性カプセルである（例えば、Capsugel社製のVcaps（登録商標））。

一部の実施形態において、製剤はソフトカプセルである。ソフトカプセルは、カプセルの殻に存在する例えばグリセロール、ソルビトール、マルチトール及びポリエチレングリコールなどの、軟化剤の添加により、特定の弾性及び柔軟性を有することができるカプセルである。ソフトカプセルは、例えばゼラチン又はデンプンをベースとして産生できる。ゼラチンベースのソフトカプセルは種々の供給業者から市販されている。例えば、経口又は経直などの投与方法に応じて、ソフトカプセルは種々の形状をとることができ、例えば円形、卵型、長方形又は魚雷のような形状（torpedo-shaped）でありうる。ソフトカプセルは、従来のプロセス、例えばSchererプロセス、Accogelプロセス又は小滴プロセス若しくはブローイングプロセスによって産生できる。

培養方法
本発明で使用する細菌株は、例えば、参考文献Handbook of Microbiological Media, Fourth Edition (2010) Ronald Atlas, CRC Press、Maintaining Cultures for Biotechnology and Industry (1996) Jennie C. Hunter-Cevera, Academic Press、Strobel (2009)
Methods Mol Biol. 581:247-61に詳述のように標準微生物技法を使用して培養すること
ができる。

培養に使用する固体又は液体培地はＹＣＦＡ寒天培地でもよいしＹＣＦＡ培地でもよい。ＹＣＦＡ培地には、カシトン（１．０ｇ）、酵母抽出物（０．２５ｇ）、ＮａＨＣＯ_３（０．４ｇ）、システイン（０．１ｇ）、Ｋ_２ＨＰＯ_４（０．０４５ｇ）、ＫＨ_２ＰＯ_４（０．０４５ｇ）、ＮａＣｌ（０．０９ｇ）、（ＮＨ_４）_２ＳＯ_４（０．０９ｇ）、ＭｇＳＯ_４・７Ｈ_２Ｏ（０．００９ｇ）、ＣａＣｌ_２（０．００９ｇ）、レサズリン（０．１ｍｇ）、ヘミン（１ｍｇ）、ビオチン（１μｇ）、コバラミン（１μｇ）、ｐ−アミノ安息香酸（３μｇ）、葉酸（５μｇ）、及びピリドキサミン（１５μｇ）が含まれてもよい（１００ｍｌ当たり、近似値）。

ワクチン組成物において使用するための細菌株
本発明者らは、本発明の細菌株は、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態を治療又は予防するのに有用であることを特定している。これは、本発明の細菌株が宿主免疫系に対して有する効果の結果と思われる。したがって、本発明の組成物もまた、ワクチン組成物として投与した場合、ＩＬ−１７又はＴｈ１７経路によって媒介される疾患又は状態を予防するのに有用でありうる。特定のそのような実施形態において、本発明の細菌株は生存している。特定のそのような実施形態において、本発明の細菌株は腸管に部分的又は全体的に定着することができる。特定のそのような実施形態において、本発明の細菌株は生存しており、腸管に部分的又は全体的に定着することができる。他の特定のそのような実施形態において、本発明の細菌株は殺菌されていても、不活化されていても又は弱毒化されていてもよい。特定のそのような実施形態において、組成物はワクチンアジュバントを含みうる。特定の実施形態において、組成物は、皮下注射によるなどの、注射による投与用である。

全般
本発明の実施は、他に指摘しない限り、当業者の能力内である、化学、生化学、分子生物学、免疫学及び薬理学の従来技術を使用するであろう。そのような技術は、文献に十分に説明されている。例えば、参考文献Gennaro (2000) Remington: The Science and Practice of Pharmacy. 20th edition, ISBN: 0683306472及びMolecular Biology Techniques: An Intensive Laboratory Course, (Ream et al., eds., 1998, Academic Press)、Methods In Enzymology (S. Colowick and N. Kaplan, eds., Academic Press, Inc.)、Handbook of Experimental Immunology, Vols. I IV (D.M. Weir and C.C. Blackwell, eds, 1986, Blackwell Scientific Publications)、Sambrook et al. (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd edition (Cold Spring Harbor Laboratory Press)、Hand
book of Surface and Colloidal Chemistry (Birdi, K.S. ed., CRC Press, 1997)、Ausubel et al. (eds) (2002) Short protocols in molecular biology, 5th edition (Current Protocols)、PCR (Introduction to Biotechniques Series), 2nd ed. (Newton & Graham eds., 1997, Springer Verlag)などを参照のこと。

用語「含む（comprising）」は「含む、含有する（including）」並びに「からなる（consisting）」を包含し、例えば、Ｘを「含む（comprising）」組成物は、例えばＸのみ
からなる場合もあり、さらなる何か、例えばＸ＋Ｙを含む場合もある。

数値ｘに関連する用語「約（about）」とは、任意であり、例えば、ｘ±１０％を意味
する。

単語「実質的に（substantially）」は、「完全に（completely）」を排除せず、例え
ば、Ｙを「実質的に含まない（substantially free）」組成物は、完全にＹを含まなくてもよい。必要な場合、単語「実質的に（substantially）」は本発明の定義から省略して
もよい。

２つのヌクレオチド配列間の配列同一性パーセンテージに対する言及は、整列させると、そのパーセンテージのヌクレオチドが、２つの配列の比較において、同じであることを意味する。このアラインメント及び相同性パーセント又は配列同一性パーセントは、当分野で公知のソフトウェアプログラム、例えば、参考文献Current Protocols in Molecular
Biology (F.M. Ausubel et al., eds., 1987) Supplement 30の第７．７．１８節に記載されるソフトウェアを使用して、決定することができる。好ましいアライメントは、ギャップオープンペナルティ１２及びギャップエクステンションペナルティ２、ＢＬＯＳＵＭマトリクス６２とともにアフィンギャップサーチを使用して、Smith-Waterman相同性サーチアルゴリズムによって決定される。このSmith-Waterman相同性サーチアルゴリズムは、参考文献Smith & Waterman (1981) Adv. Appl. Math. 2: 482-489に開示されている。

具体的に記載されていなければ、多数のステップを含むプロセス又は方法は、方法の初めに又は終わりにさらなるステップを含んでもよいし、又は途中に介在するさらなるステップを含んでもよい。また、ステップは、もし適切なら、組み合わせてもよいし、省略してもよいし、又は代替順序で実施してもよい。

本発明の種々の実施形態が本明細書に記載されている。各実施形態において特定される特徴は、他の特定される特徴と組み合わされてさらなる実施形態を提供することができることを、理解されたい。特に、適切、典型的又は好ましいと本明細書において強調される実施形態は、互いに組み合わせることができる（それらが互いに排他的である場合を除く）。

ブドウ膜炎のマウスモデルにおける細菌接種物の有効性
概要
この研究では、光受容体間のレチノイド結合タンパク質（ＩＲＢＰ，interphotoreceptor retinoid-binding protein）に誘導されるブドウ膜炎のマウスモデルを使用して、ブ
ドウ膜炎に対する細菌投与の効果について試験した。ブドウ膜炎は眼内炎症及び網膜組織崩壊に起因する視覚を脅かす状態である。この疾患は実験的自己免疫ブドウ膜網膜炎（ＥＡＵ，experimental autoimmune uveoretinitis）のモデルのげっ歯類において研究する
ことができる（Caspi (2003) Curr Protoc Immunol. Chapter 15:Unit 15.6）。ＥＡＵとは、Ｔｈ１／Ｔｈ１７細胞が、網膜抗原を標的とし、常在及び浸潤単核細胞を活性化し組織破壊をもたらすことになるサイトカインを産生している、器官特異的障害である。ＥＡ
Ｕは、光受容体間のレチノイド結合タンパク質ペプチド（ＩＲＢＰｐ，interphotoreceptor retinoid binding protein peptide）を含む網膜抗原でのチャレンジによってマウス
において誘導することができる。疾患の発症は８〜９日目から通常起こり、１４〜１５日後にピークとなる。臨床疾患の徴候を局所的内視鏡眼底画像法（ＴＥＦＩ，topical endoscopic fundal imaging）を使用してモニタリングすることができる。

株
ＭＲＸ０２７：エリシペラトクロストリジウム・ラモスム
この例において使用した株はＮＣＩＭＢ ４２６８８として寄託されている。

バイオ薬剤をグリセロールストックで提供した。微生物増殖培地（ＹＣＦＡ）を薬剤の培養に使用した。

マウス
マウスはＣ５７ＢＬ／６系統で、研究開始時には６週齢を超えていた。７２匹のマウスを使用した（＋３６匹のサテライト動物）。不健康動物は研究から除外した。動物は、特定病原体感染防止（ｓｐｆ，specific pathogen free）条件下で、サーモスタットでモニタリングされている飼育室（２２±４℃）に収容した。動物は、使用前に最短でも１週間、標準動物飼育条件下で馴致させた。動物の健康状態をこの期間を通してモニタリングし、研究開始前に各動物の実験使用への適切性を評価した。マウスは、研究期間の間は１ケージ当たり最高１０匹の動物の群で収容した。馴致期間及び研究期間を通して、照射ペレット飼料（実験室飼料、EU Rodent diet ２２％、５ＬＦ５）及び水を自由摂取で利用できた。飼料の任意の成分又は水が本研究を妨害した可能性は低い。

実験の概略
Ｃ５７ＢＬ／６の成熟雌マウスを実験群に無作為に割り付け、１週間馴致させた。以下のスケジュールに従って治療剤を投与した。０日目、結核菌（Mycobacterium Tuberculosis）Ｈ３７ ＲＡ ２．５ｍｇ／ｍｌを添加した完全フロインドアジュバント（ＣＦＡ，complete Freund’s adjuvant）中に光受容体間のレチノイド結合タンパク質ペプチド１
〜２０（ＩＲＢＰｐ１〜２０）２００μｇを含有するエマルジョンを皮下注射で、動物に投与した。また０日目に、百日咳菌（Bordetella Pertussis）毒素１．５μｇを腹腔内注射で、動物に投与した。−１４日目から、動物を１週当たり３回秤量する。−１日目から４２日目の実験終了まで、動物を、局所的内視鏡眼底画像法（ＴＥＦＩ）を使用してブドウ膜炎の臨床徴候について１週当たり２回モニタリングする。

投与スケジュール
全ての群はｎ＝１２である。

経口投与の媒体はＹＣＦＡ培地である。

１日２回の経口投与の投与容積は、５ｍｌ／ｋｇである。

陽性対照群もまた、薬物シクロスポリンＡでの治療剤を使用して試験した。

読出し
体重。−１４日目から、動物を１週当たり３回秤量する。２回連続して、動物の初期（０日目）体重の１５％に等しいか又はそれより大きい体重ロスを伴う動物を間引く。

非特異的臨床所見。−１４日目から実験の終了まで、動物を、異常姿勢（円背位）、異常外皮状態（逆毛）及び異常活動レベル（活動の低下又は亢進）を含む非特異的臨床徴候について１日１回チェックする。

臨床スコア：局所的内視鏡眼底画像法（ＴＥＦＩ）による網膜画像。−１日目から実験の終了まで、ブドウ膜炎の臨床徴候について１週に２回スコアする。１％のトロピカミド、次いで２．５％の塩酸フェニレフリンを使用する瞳孔拡張の後に、無麻酔であるが拘束した動物においてＴＥＦＩを使用して網膜画像を捕捉する。網膜画像を以下のシステムを使用してスコア付けする。最大累積スコアは２０である。

結果
本研究の結果を、図１及び図２に示す。

臨床スコア：局所的内視鏡眼底画像法（ＴＥＦＩ）による網膜画像。０日目から２８日目までに対照群において測定したＴＥＦＩデータを非パラメトリックデータについてKruskal-Wallis検定によって、続いて実験日と実験日の間の多重比較についてDunnのポスト−検定によって分析した。

対照群の０日目と比較すると（図１）、ＩＲＢＰ投与により、１４日目（ｐ＜０．０１）から及び２８日目（ｐ＜０．０００１）に測定したＴＥＦＩスコアが有意に高くなっていた。

実験群において２８日目に測定したＴＥＦＩスコアを、一元配置ＡＮＯＶＡを使用して分析した。予想された通り、陽性対照であるシクロスポリンＡ群においてスコアの有意な低下が観察された。また、陰性対照と比べて、ＭＲＸ０２７処置群のスコアも統計学的に有意に低下（ｐ＜０．０５）していた（図７３）。

結論。ＩＲＢＰ誘導性ブドウ膜炎のこのモデルにおいて予想されたように、ＴＥＦＩにより決定した臨床スコアは１４日目から高くなった。２８日目までに、疾患発生率及び疾患重症度において顕著で統計学的に有意な低減がＭＲＸ０２７処置群において観察され、これは陽性対照区に対してみられた低減に匹敵するものであった。具体的には、これらのデータは、ＭＲＸ０２７株での治療により、炎症性細胞による網膜損傷、視神経乳頭の炎症及び／又は網膜組織浸潤が低減した（上のＴＥＦＩ網膜画像スコア付けシステムを参照のこと）ことを示している。これらのデータは、ＭＲＸ０２７株はブドウ膜炎を治療又は予防するのに有用でありうることを示している。

安定性試験
本明細書に記載の少なくとも１の細菌株を含有する、本明細書に記載の組成物を、２５℃又は４℃で密封容器に貯蔵し、この容器を３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、９０％又は９５％の相対湿度である雰囲気中に置く。１ヵ月、２ヵ月、３ヵ月、６ヵ月、１年、１．５年、２年、２．５年又は３年後に、標準プロトコルにて決定されるコロニー形成ユニットで測定して、細菌株の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％又は９０％が残存しているものとする。

［配列表］
配列
配列番号１（エリシペラトクロストリジウム（クロストリジウム）・ラモスムの１６Ｓ
ｒＲＮＡ遺伝子、ＤＳＭ １４０２−Ｘ７３４４０株）
1 nnnnnnngag agtttgatcc tggctcagga tgaacgctgg cggcgtgcct aatacatgca
61 agtcgaacgc gagcacttgt gctcgagtgg cgaacgggtg agtaatacat aagtaacctg
121 ccctagacag ggggataact attggaaacg gatagctaag accgcatagg tacggacact
181 gcatggtgac cgtattaaaa gtgcctcaaa gcactggtag aggatggact tatggcgcat
241 tagctggttg gcggggtaac ggcccaccaa ggcgacgatg cgtagccgac ctgagagggt
301 gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtagggaa
361 ttttcggcaa tgggggaaac cctgaccgag caacgccgcg tgaaggaaga aggttttcgg
421 attgtaaact tctgttataa agaagaacgg cggctacagg aaatggtagc cgagtgacgg
481 tactttattt tagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg
541 gcaagcgtta tccggaatta ttgggcgtaa agagggagca ggcggcagca agggtctgtg
601 gtgaaagcct gaagcttaac ttcagtaagc catagaaacc aggcagctag agtgcaggag
661 aggatcgtgg aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga tatatggagg aacaccagtg
721 gcgaaggcga cgatctggcc tgcaactgac gctcagtccc gaaagcgtgg ggagcaaata
781 ggattagata ccctagtagt ccacgccgta aacgatgagt actaagtgtt ggatgtcaaa
841 gttcagtgct gcagttaacg caataagtac tccgcctgag tagtacgttc gcaagaatga
901 aactcaaagg aattgacggg ggccgcacaa gcggtggagc atgtggttta attcgaagca
961 acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacata ctcataaagg ctccagagat ggagagatag
1021 ctatatgaga tacaggtggt gcatggttgt cgtcagctcg tgtcgtgaga tgttgggtta
1081 agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcgtt agttaccatc attaagttgg ggactctagc
1141 gagactgcca gtgacaagct ggaggaaggc ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta
1201 tgacctgggc tacacacgtg ctacaatgga tggtgcagag ggaagcgaac cgcgaggtga
1261 agcaaaaccc ataaaaacca ttctcagttc ggattgtagt ctgcaactcg actacatgaa
1321 gttggaatcg ctagtaatcg cgaatcagca tgtcgcggtg aatacgttct cgggccttgt
1381 acacaccgcc cgtcacacca cgagagttga taacacccga agccggtggc ctaaccgcaa
1441 ggaaggagct gtctaaggtg ggattgatga ttggggtgaa gtcgtaacaa ggtatcccta
1501 cgggaacgtg cggctggatc acctcc

配列番号２（エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＪＣＭ １２９８株、１６ＳリボソームＲＮＡ遺伝子、部分配列−ＮＲ＿１１３２４３．１）
1 agagtttgat cctggctcag gatgaacgct ggcggcgtgc ctaatacatg caagtcgaac
61 gcgagcactt gtgctcgagt ggcgaacggg tgagtaatac ataagtaacc tgccctagac
121 agggggataa ctattggaaa cgatagctaa gaccgcatag gtacggacac tgcatggtga
181 ccgtattaaa agtgcctcaa agcactggta gaggatggac ttatggcgca ttagctggtt
241 ggcggggtaa cggcccacca aggcgacgat gcgtagccga cctgagaggg tgaccggcca
301 cactgggact gagacacggc ccagactcct acgggaggca gcagtaggga attttcggca
361 atgggggaaa ccctgaccga gcaacgccgc gtgaaggaag aaggttttcg gattgtaaac
421 ttctgttata aaggaagaac ggcggctaca ggaaatggta gccgagtgac ggtactttat
481 tagaaagcca cggctaacta cgtgccagca gccgcggtaa tacgtaggtg gcaagcgtta
541 tccggaatta ttgggcgtaa agagggagca ggcggcagca agggtctgtg gtgaaagcct
601 gaagcttaac ttcagtaagc catagaaacc aggcagctag agtgcaggag aggatcgtgg
661 aattccatgt gtagcggtga aatgcgtaga tatatggagg aacaccagtg gcgaaggcga
721 cgatctggcc tgcaactgac gctcagtccc gaaagcgtgg ggagcaaata ggattagata
781 ccctagtagt ccacgccgta aacgatgagt actaagtgtt ggatgtcaaa gttcagtgct
841 gcagttaacg caataagtac tccgcctgag tagtacgttc gcaagaatga aactcaaagg
901 aattgacggg ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga
961 accttaccag gtcttgacat actcataaag gctccagaga tggagagata gctatatgag
1021 atacaggtgg tgcatggttg tcgtcagctc gtgtcgtgag atgttgggtt aagtcccgca
1081 acgagcgcaa cccttatcgt tagttaccat cattaagttg gggactctag cgagactgcc
1141 agtgacaagc tggaggaagg cggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgacctggg
1201 ctacacacgt gctacaatgg atggtgcaga gggaagcgaa gccgcgaggt gaagcaaaac
1261 ccataaaacc attctcagtt cggattgtag tctgcaactc gactacatga agttggaatc
1321 gctagtaatc gcgaatcagc atgtcgcggt gaatacgttc tcgggccttg tacacaccgc
1381 ccgtcacacc acgagagttg ataacacccg aagccggtgg cctaaccgca aggaaggagc
1441 tgtctaaggt gggattgatg attggggtga agtcgtaaca aggtaacc

配列番号３（エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＭＲＸ０２７株の１６Ｓ ｒＲＮＡコンセンサス配列）
TGCGGTTAGGCCACCGGCTTCGGGTGTTATCAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGAGAACGTATTCACCGCGACATGCTGATTCGCGATTACTAGCGATTCCAACTTCATGTAGTCGAGTTGCAGACTACAATCCGAACTGAGAATGGTTTTATGGGTTTTGCTTCACCTCGCGGCTTCGCTTCCCTCTGCACCATCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCGCCTTCCTCCAGCTTGTCACTGGCAGTCTCGCTAGAGTCCCCAACTTAATGATGGTAACTAACGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTATCTCATATAGCTATCTCTCCATCTCTGGAGCCTTTATGAGTATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCATTCTTGCGAACGTACTACTCAGGCGGAGTACTTATTGCGTTAACTGCAGCACTGAACTTTGACATCCAACACTTAGTACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACTAGGGTATCTAATCCTATTTGCTCCCCACGCTTTCGGGACTGAGCGTCAGTTGCAGGCCAGATCGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCATATATCTACGCATTTCACCGCTACACATGGAATTCCACGATCCTCTCCTGCACTCTAGCTGCCTGGTTTCTATGGCTTACTGAAGTTAAGCTTCAGGCTTTCACCACAGACCCTTGCTGCCGCCTGCTCCCTCTTTACGCCCAATAATTCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTAATAAAGTACCGTCACTCGGCTACCATTTCCTGTAGCCGCCGTTCTTCCTTTATAACAGAAGTTTACAATCCGAAAACCTTCTTCCTTCACGCGGCGTTGCTCGGTCAGGGTTTCCCCCATTGCCGAAAATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGGTCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCATCGTCGCCTTGGTGGGCCGTTACCCCGCCAACCAGCTAATGCGCCATAAGTCCATCCTCTACCAGTGCTTTGAGGCACTTTTAATACGGTCACCATGCAGTGTCCGTACCTATGCGGTCTTAGCTATCGTTTCCAATAGTTATCCCCCTGTCTAGGGCAGGTTACTTATGTATTACTCACCCGTTCGCCACTCGAGCACAAGTGCTCGC

配列番号４（エリシペラトクロストリジウム・ラモスムＤＳＭ １４０株のゲノム配列）−電子配列一覧を参照のこと。

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Claims (1)

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