JP2016540974A - 光学素子を含むマイクロイメージャー分析システムおよびその使用方法 - Google Patents

光学素子を含むマイクロイメージャー分析システムおよびその使用方法 Download PDF

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Abstract

本開示の態様は、アナライトに関してサンプルをアッセイするための方法およびシステムを含む。ある特定の実施形態に係る方法は、スリット状光ビームによりサンプルを照明する工程と、サンプルを透過した光を検出する工程と、透過した光の吸光度を1つ以上の波長で決定する工程と、アナライトに関してサンプルをアッセイするために吸光度に基づいてアナライトの濃度を計算する工程とを含む。主題の方法を実施するためのシステムもまた開示されている。

Description

生物学的流体中のアナライトの特徴付けは、患者の健康全般およびウェルネスの医学的診断および評価に不可欠な部分となった。特定的には、生理学的流体、たとえば、血液または血液由来産物でのアナライト検出は、重要性がますます高くなっており、その結果は、さまざまな疾患病態の患者の治療プロトコルに顕著な役割を果たしうる。アナライト検出のこうした重要性の高まりを受けて、実験室用、臨床用、および家庭用のさまざまなアナライト検出プロトコルおよびデバイスが開発されてきた。
たとえば、異常レベルのヘモグロビンを有する患者は、多くの場合、貧血、鎌状赤血球貧血、失血、栄養欠乏、真性一次性赤血球増加症などの骨髄の問題および障害、脱水症、肺疾患、ある特定の腫瘍、ならびに薬物エリトロポイエチンの乱用などの薬物乱用をはじめとする種々の病態を抱えている。
これらの病態に特異的な治療は、多くの場合、ヘモグロビン異常の持続期間およびレベルに依存する。したがって、患者の血中ヘモグロビン濃度を迅速かつ正確に決定できれば、異常レベルのヘモグロビンに起因して生じる患者の病態の診断および管理に実質的に役立つであろう。
本開示の態様は、アナライトに関してサンプルをアッセイする方法を含む。ある特定の実施形態に係る方法は、スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程と、サンプルを透過した光を検出する工程と、アナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程とを含む。スリットからの光を集束させるフォーカスレンズと組み合わせて光源からの光ビームを狭くするスリットを有するスリット投影モジュール、サンプルをアッセイするためのサンプルチャンバを有するマイクロカートリッジデバイス、および、光源と、スリット投影モジュールと、サンプルを透過した光を集束させるための対物レンズと、主題の方法を実施するために好適な1つ以上の波長の透過光を検出するための検出器とを有するイメージングシステムもまた記載されている。
以上に概説したように、本開示の態様は、アナライトに関してサンプルをアッセイする方法を含み、本方法は、スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程と、サンプルを透過した光を検出する工程と、アナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程とを含む。
いくつかの実施形態では、サンプルは、1つ以上の広域スペクトル光源により照明される。サンプルは、1つ以上の可視光源または近赤外光源を用いた光により、ある特定の場合には500nm〜850nmの範囲内の波長の光により、照明されうる。たとえば、サンプルは、2つの広域スペクトル光源により照明されうる。この場合、サンプルは、500nm〜700nmの波長範囲を有する第1の広域スペクトル光源と、700nm〜850nmの波長範囲を有す第2の広域スペクトル光源とにより照明される。ある特定の実施形態では、1つ以上の広域スペクトル光源は、約450nm、550nm、および830nmに発光ピークを有する照射プロファイルを有する。
いくつかの実施形態では、サンプルは、光源からの狭光を集束させるフォーカスレンズと組み合わせて光ビームを狭くするスリットを有するスリット投影モジュールを介して広域スペクトル光源により照明される。スリット投影モジュールは、照明時、スリットの形状の光ビームをサンプルチャンバ上に投影する。いくつかの実施形態では、サンプルチャンバは、スリット状ビームを横切るようにサンプルチャンバを移動させることにより照明される。他の実施形態では、サンプルチャンバは、サンプルチャンバの長さに沿ってスリット状投影モジュールを移動させることにより照明される。
いくつかの場合には、スリット投影モジュールは、スリット状ビーム投影の長さがサンプルチャンバの幅よりも短くなるように光ビームを狭くする。他の場合には、スリット投影モジュールは、スリット状ビーム投影の長さがサンプルチャンバの幅より長くなるように光ビームを狭くする。さらに他の場合には、スリット投影モジュールは、スリット状ビーム投影の長さがサンプルチャンバの幅と実質的に同一になるように光ビームを狭くする。これらの実施形態では、スリット投影モジュールは、スリット状ビーム投影が約2.5mm〜約3.5mm、たとえば約3mmの長さを有するように光ビームを狭くする。いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールは、約25μm〜約75μm、たとえば約50μmなどの幅を有するスリットの形状の光ビームを投影するように構成される。
いくつかの実施形態では、サンプルは、マイクロ流体チャンバの長さの75%以上に沿ってスリット状ビーム投影を横切るように、サンプルを含有するマイクロ流体チャンバを移動させることにより、照明される。ある特定の場合には、サンプルは、スリット状ビーム投影に沿ってサンプルチャンバの長さを移動させることにより照明される。いくつかの場合には、本方法は、離散増分で、たとえば1mm以上の増分、たとえば2mm以上の増分、さらには5mm以上の増分などでスリット状ビーム投影に沿ってマイクロ流体チャンバの長さを移動させる工程を含む。他の場合には、本方法はまた、スリット状ビーム投影に沿ってサンプルチャンバの長さを連続移動させる工程を含む。いくつかの実施形態では、スリットに沿ってサンプルチャンバの長さを移動させる際に光の吸光度を連続測定する。
他の実施形態では、サンプルは、マイクロ流体チャンバの長さの75%以上に沿ってスリット状ビーム投影を変位させるために十分なようにスリット投影モジュールを移動させることにより照明される。ある特定の場合には、サンプルは、サンプルチャンバの長さに沿ってスリット状ビーム投影を変位させるために十分なようにスリット投影モジュールを移動させることにより照明される。いくつかの場合には、本方法は、離散増分で、たとえば1mm以上の増分、たとえば2mm以上の増分、さらには5mm以上の増分などでサンプルチャンバの長さに沿ってスリット状ビーム投影を変位させるために十分なようにスリット投影モジュールを移動させる工程を含む。他の場合には、本方法は、サンプルチャンバの長さに沿ってスリット状ビーム投影を連続移動させるために十分なようにスリット投影モジュールを移動させる工程を含む。いくつかの実施形態では、光の吸光度が連続測定される。
いくつかの実施形態では、サンプルを透過した光を検出する工程は、透過光の波長を空間分離する工程を含む。ある特定の場合には、透過光の波長を空間分離する工程は、回折グレーティングを使用する工程を含む。ある特定の実施形態では、サンプルを透過した光を検出する工程は、たとえば検出器の校正における使用など、スリットの非回折像を検出器上に投影する工程を含む。
いくつかの実施形態では、方法はまた、アナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程を含む。たとえば、2つの異なる波長で検出光の吸光度を計算しうる。ある特定の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、500nm〜600nmの波長で、たとえば548nmで透過光の吸光度を計算する。他の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、600nm〜700nmの波長で、たとえば650nmかつたとえば675nmで透過光の吸光度を計算する。さらに他の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、500nm〜600nmの波長で透過光の第1の吸光度を計算し、かつ600nm〜700nmの波長で第2の吸光度を計算する。たとえば、548nmかつ675nmで透過光の吸光度を計算する。さらに他の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、500nm〜600nmの波長で透過光の第1の吸光度を計算し、かつ600nm〜700nmの波長で第2の吸光度を計算する。たとえば、548nmかつ650nmで透過光の吸光度を計算する。
本開示の態様はまた、主題の方法を実施するためのシステムを含む。ある特定の実施形態に係るシステムは、サンプルチャンバを照明するための光源と、スリット状ビーム投影をサンプルチャンバに提供するように、光源からの光ビームを狭くするスリットおよびスリットにより狭くされた光を集束させるためのフォーカスレンズを含有するスリット投影モジュールとを含む。システムはまた、サンプルを透過した光を集束させるための対物レンズと、サンプルを透過した1つ以上の波長の光を検出するための検出器とを含む。
いくつかの実施形態では、システムは1つ以上の広域スペクトル光源を含む。広域スペクトル光源は、ある特定の場合には、1つ以上の可視光源または近赤外光源、たとえば、500nm〜850nmの範囲内の波長を有するものを含む。たとえば、第1の広域スペクトル光源は、500nm〜700nmの範囲内の発光波長を有しうるとともに、第2の広域スペクトル光源は、700nm〜850nmの範囲内の発光波長を有しうる。ある特定の実施形態では、1つ以上の広域スペクトル光源は、約450nm、550nm、および830nmに発光ピークを有する照射プロファイルを有する。
システムはまた、スリットの形状で光ビームの投影を提供するように、光源からの光ビームを狭くするスリットと狭光ビームを集束させるフォーカスレンズとを有するスリット投影モジュールを含む。スリット投影モジュールは、スリット状ビーム投影の長さがサンプルチャンバの幅に直交するように構成されうる。スリットの形状で投影される光ビームの幅は、たとえば100μmをはじめとして75μm〜125μmの範囲内でさまざまでありうる。また、スリットの形状で投影される光ビームの長さは、2.5mmなど2mm〜3mmの範囲内でさまざまでありうる。スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも長いスリットの形状で光ビームを投影するように構成されうる。他の選択肢として、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅に等しいスリットの形状で光ビームを投影するように構成されうる。同様に、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも短いスリットの形状で光ビームを投影するように構成されうる。
いくつかの場合には、スリット投影モジュールはまた、光学調整プロトコルを含む。「光学調整」とは、必要に応じて、たとえば、寸法を増加もしくは減少させるようにまたはスリット状ビームの光学分解能を向上させるように、スリットの形状の光ビームを変化させうることを意味する。いくつかの場合には、光学調整は、スリットの幅をたとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば25%以上、たとえば50%以上増加させるように、さらにはスリット状ビームの幅を75%以上増加させるように構成された拡大プロトコルである。他の場合には、光学調整は、スリットの幅をたとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば25%以上、たとえば50%以上減少させるように、さらにはスリット状ビームの幅を75%以上減少させるように構成された縮小プロトコルである。ある特定の実施形態では、光学調整は、スリット状ビームの分解能をたとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば25%以上、たとえば50%以上向上させるように、さらにはスリット状ビームの分解能を75%以上向上させるように構成された分解能向上プロトコルである。スリット状ビームは、限定されるものではないが、レンズ、ミラー、ピンホール、スリット、およびそれらの組合せを含む任意の好都合な光学調整プロトコルにより調整されうる。ある特定の実施形態では、スリット投影モジュールは、スリットにより狭くされた光を集束させるためにスリットと組み合わせてフォーカスレンズを含む。フォーカスレンズは、たとえば、約0.5〜0.75の倍率を有するものなどの縮小レンズでありうる。たとえば、縮小レンズは、約0.6の倍率を有する二重色消し縮小レンズでありうる。
いくつかの実施形態に係るシステムはまた、サンプルチャンバを透過した光を集束させるための対物レンズを含む。いくつかの場合には、対物レンズは、1.5〜2.5の倍率を有するものなどの拡大レンズである。たとえば、対物レンズは、約1.7の倍率を有する二重色消し拡大レンズでありうる。
以上に記載したように、サンプルを透過した捕集光は、検出用の個別の波長に空間分離されうる。いくつかの実施形態では、システムは、光を個別の波長に分離するための回折グレーティングを含む。他の実施形態では、システムは、光を検出用の個別の波長に分離するための複数のフィルタを含みうる。さらに他の実施形態では、システムは、1つ以上の回折グレーティングと複数のフィルタとの組合せを含みうる。
システムはまた、サンプルからの透過光を検出するための検出器を含む。いくつかの実施形態では、検出器は電荷結合デバイスである。検出器は、ある特定の場合には、400nm〜900nmの範囲内の波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される。たとえば、検出器は、500nm〜800nmの透過光のスペクトルを検出するように構成されうる。
本開示の実施形態では、システムは、5nm以下、たとえば4nm以下、たとえば3nm以下、たとえば2nm以下、さらには1nm以下の空間分離分解能を提供するように構成される。このため、いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールと、対物レンズと、回折グレーティングと、透過光を検出するための検出器とを含むシステムは、5nm以下、たとえば4nm以下、たとえば3nm以下、たとえば2nm以下、さらには1nm以下の空間分離分解能を提供するように構成される。他の実施形態では、スリット投影モジュールと、対物レンズと、フィルタホイールと、透過光を検出する検出器とを含むシステムは、5nm以下、たとえば4nm以下、たとえば3nm以下、たとえば2nm以下、さらには1nm以下の空間分解能を提供するように構成される。
本開示の態様はまた、主題の方法に従ってサンプルをアッセイするためのスリット投影モジュールを含む。スリット投影モジュールは、いくつかの実施形態では、スリットの形状で光ビームを提供するように、光源からの光ビームを狭くするスリットと狭光ビームを集束させるフォーカスレンズとを含む。スリット投影モジュールは、スリットの長さがサンプルチャンバの幅に直交するように構成されうる。ある特定の場合には、スリット投影モジュールは、スリットの形状で光ビームを投影してサンプルチャンバを照明するように構成される。スリットの形状で投影される光ビームの幅は、たとえば100μmをはじめとして75μm〜125μmの範囲内でさまざまでありうる。また、スリットの形状で投影される光ビームの長さは、2.5mmなど2mm〜3mmの範囲内でさまざまでありうる。スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも長いスリットの形状で光ビームを投影するように構成されうる。他の選択肢として、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅に等しいスリットの形状で光ビームを投影するように構成されうる。同様に、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも短いスリットの形状で光ビームを投影するように構成されうる。ある特定の実施形態では、スリット投影モジュールは、スリットにより狭くされた光を集束させるためにスリットと組み合わせてフォーカスレンズを含む。フォーカスレンズは、ある特定の実施形態では、約0.5〜0.75の倍率を有するものなどの縮小レンズである。たとえば、縮小レンズは、約0.6の倍率を有する二重色消し縮小レンズでありうる。
方法はまた、アナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程を含む。たとえば、2つの異なる波長で検出光の吸光度を計算しうる。ある特定の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、500nm〜600nmの波長で、たとえば548nmで透過光の吸光度を計算する。他の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、600nm〜700nmの波長で、たとえば675nmで透過光の吸光度を計算する。さらに他の場合には、アナライトに関してサンプルをアッセイするために、500nm〜600nmの波長で透過光の第1の吸光度を計算し、かつ600nm〜700nmの波長で第2の吸光度を計算する。たとえば、548nmかつ675nmで透過光の吸光度を計算したり、さらには548nmかつ650nmで透過光の吸光度を計算したりする。
本開示の態様はまた、液体サンプルのアッセイを行うように構成されたマイクロ流体デバイスを含む。このデバイスは、接続されたサンプル適用部位と、入口と、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと、サンプルと1種以上の試薬とを接触させるための試薬混合チャンバとを含む。ある特定の実施形態のマイクロ流体デバイスはまた、吸光度測定時にブランクを提供するように構成されたブランク参照ウィンドウを含む。
本発明は、添付の図面と組み合わせて読むと以下の詳細な説明から最もよく理解されうる。図面には以下の図が含まれる。
ある特定の実施形態に従ってスリット投影モジュールにより提供されるスリット状ビームによりサンプルチャンバを照明する例を示す。 ある特定の実施形態に従ってスリット状ビームによりサンプルチャンバを照明するためのスリット投影モジュールを有する吸光度システムの構成例を示し、スリット投影モジュールを有する吸光度システムの側面図である。 ある特定の実施形態に従ってスリット状ビームによりサンプルチャンバを照明するためのスリット投影モジュールを有する吸光度システムの構成例を示し、スリット投影モジュールを有する吸光度システムの上面図である。 ある特定の実施形態に従って蛍光検出システムに結合されたスリット投影モジュールを有する吸光度システムの構成例を示す。 ある特定の実施形態に従って対象のシステムの例を示す。 ある特定の実施形態に従ってマイクロ流体サンプルチャンバとブランク透過率を提供するための参照スリットウィンドウとを有するマイクロ流体カートリッジの例を示す。 ある特定の実施形態に従ってマイクロ流体カートリッジを有するキットの例を示す。 ある特定の実施形態に従ってボックス中に一緒に提供された一群のさまざまなタイプのキットの例を示す。 ある特定の実施形態に従ってヘモグロビン濃度を決定する概略図である。 ある特定の実施形態に従ってスリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより取得されたヘモグロビン吸収スペクトル例を示し、全血中25g/dLの濃度のヘモグロビンの吸収スペクトルを示す。 ある特定の実施形態に従ってスリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより取得されたヘモグロビン吸収スペクトル例を示し、全血中7g/dLの濃度のヘモグロビンの吸収スペクトルを示す。 ある特定の実施形態に従ってスリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより取得されたヘモグロビン吸収スペクトル例を示し、ヘモグロビン濃度および569nmの吸光度のプロットを示す。 ある特定の実施形態に係る方法を用いた全血中ヘモグロビン測定と血液アナライザーとの比較を示す。
本発明をより詳細に説明する前に、本発明が記載の特定の実施形態に限定されるものではないことを理解すべきである。なぜなら、それらは変更されうるからである。また、本発明の範囲は添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるため、本明細書で用いられる用語が特定の実施形態を説明することのみを目的としたものにすぎず、限定することを意図したものではないことも理解すべきである。
値の範囲が提示された場合、その範囲の上限と下限との間の各介在値(文脈上明らかに異なる規定がないかぎり下限の1/10単位まで)およびその指定範囲内の任意の他の指定値または介在値は、本発明の範囲内に包含されるものと理解される。これらのより小さい範囲の上限および下限は、独立して、そのより小さい範囲内に含まれうるものであり、また、その指定範囲内の任意の特定的に除外された限界の制約を受けて、本発明の範囲内に包含される。指定範囲が一方または両方の限界を含む場合、それらの含まれる一方または両方の限界を除外した範囲もまた、本発明に含まれる。
特に定義されていないかぎり、本明細書で用いられる科学技術用語はすべて、本発明が属する技術分野の当業者により一般に理解されているものと同一の意味を有する。本発明を実施または試験する際、本明細書に記載のものと類似のまたは均等な任意の方法および材料を使用することが可能であるが、代表的な例示的な方法および材料を次に記載する。
本明細書に引用された刊行物および特許はすべて、あたかもそれぞれ個々の刊行物または特許が具体的かつ個別的に示されて参照により組み込まれたごとく参照により本明細書に組み込まれ、かつ引用された刊行物に示された関連する方法および/または材料を開示および記載すべく参照により本明細書に組み込まれる。いずれの刊行物の引用も、本出願日前のその開示に関するものであるが、先行発明に基づいてかかる刊行物に先行する権利が本発明に与えられていないことを容認するものとみなされるべきでない。さらに、提示された刊行日は、独立して確認の必要がありうる実際の刊行日とは異なりうる。
本明細書および添付の特許請求の範囲で用いられる場合、文脈上明らかに異なる規定がないかぎり、単数形の「1つの(a)」、「1つの(an)」、および「その(the)」が複数形の参照語を包含することに留意されたい。さらに、いずれかの任意選択の要素を除外するように特許請求の範囲を構成しうることに留意されたい。したがって、この記載は、クレーム要素の列挙との関連で「〜単独」、「〜のみ」などの排他的用語を用いる場合または「否定的」限定を用いる場合の先行基礎として機能することが意図される。
本開示を読めば当業者には自明であろうが、本明細書に記載および例示された個々の実施形態はそれぞれ、本発明の範囲または趣旨から逸脱することなく他のいくつかの実施形態のいずれかの特徴から容易に分離しうるかまたはそれらと容易に組み合わせうる個別の成分および特徴を有する。挙げられた方法はいずれも、挙げられた事象の順序でまたは論理的に可能な任意の他の順序で行うことが可能である。
以上に概説したように、本開示は、1種以上のアナライトに関してサンプルをアッセイするための方法を提供する。本開示の実施形態のさらなる説明では、最初にアナライトに関してサンプルをアッセイするための方法をより詳細に説明する。次に、アナライトに関してサンプルをアッセイする主題の方法を実施するために好適なシステムを説明する。マイクロカートリッジ、コンピュータ制御システム、およびキットもまた提供される。
アナライトに関してサンプルをアッセイするための方法
以上に概説したように、本開示の態様は、1種以上のアナライトに関してサンプルをアッセイするための方法を含む。「アッセイ」という用語は、本明細書では、標的アナライト種の存在または量の定性的評価または定量的測定を意味するようにその通常の意味で用いられる。ある特定の実施形態では、方法は、ヘモグロビンに関してサンプルをアッセイする工程を含む。
本発明に係る方法に従って、たとえば本明細書に記載されるような多種多様なサンプルをアッセイしうる。いくつかの場合には、サンプルは生物学的サンプルである。「生物学的サンプル」という用語は、生物体、植物体、もしくは菌類体を意味するように、または動物組織の一部、細胞、もしくはある特定の場合には血液、粘液、リンパ液、滑液、脳脊髄液、唾液、気管支肺胞洗浄液、羊水、羊膜帯血、尿、膣液、および精液に見いだされうる成分部分を意味するように、その通常の意味で用いられる。このため、「生物学的サンプル」とは、天然生物またはその組織の一部の両方を意味し、さらには、たとえば、限定されるものではないが、血漿、血清、脊髄液、リンパ液、皮膚切片、気道切片、胃腸管切片、心血管切片、泌尿生殖管切片、涙、唾液、乳、血液細胞、腫瘍、器官を含む、生物またはその組織の一部から調製されるホモジネート、ライセート、または抽出物を意味する。生物学的サンプルは、健常組織または罹患組織(たとえば、癌性組織、悪性組織、壊死性組織など)の両方を含めて任意のタイプの生物組織を含みうる。ある特定の実施形態では、生物学的サンプルは、液体サンプル、たとえば、血液または血漿などのその派生物、涙、尿、精液などであり、いくつかの場合には、サンプルは、全血をはじめとする血液サンプル、たとえば、静脈穿刺または指穿刺から得られる血液である(この場合、アッセイ前に血液を保存剤、抗凝固剤などの任意の試薬と組み合わせてもよく、またはそうでなくてもよい)。
ある特定の実施形態では、サンプル源は、「哺乳動物」または「哺乳類」であり、これらの用語は、食肉目動物(たとえば、イヌおよびネコ)、齧歯目動物(たとえば、マウス、モルモット、およびラット)、および霊長動物(たとえば、ヒト、チンパンジー、およびサル)をはじめとする哺乳綱動物に属する生物を記述するように、広義に用いられる。いくつかの場合には、被験者はヒトである。本方法は、両方の性別および任意の発達段階のヒト被験者(すなわち、新生児、乳児、年少者、青年、成人)から得られるサンプルに適用されうるとともに、ある特定の実施形態では、ヒト被験者は、年少者、青年、または成人である。本発明はヒト被験者からのサンプルに適用されうるが、本方法はまた、他の動物被験者(すなわち「非ヒト被験者」)、たとえば、限定されるものではないが、鳥、マウス、ラット、イヌ、ネコ、家畜、および馬からのサンプルでも行われうることを理解すべきである。
いくつかの実施形態では、主題の方法でアッセイされるサンプルの量は、たとえば、0.01μL〜1000μL、たとえば0.05μL〜900μL、たとえば0.1μL〜800μL、たとえば0.5μL〜700μL、たとえば1μL〜600μL、たとえば2.5μL〜500μL、たとえば5μL〜400μL、たとえば7.5μL〜300μL、さらにはサンプル10μL〜200μLの範囲内でさまざまでありうる。
いくつかの実施形態では、生物学的サンプルは、生物学的サンプルをアッセイする前に容器(たとえば、ブレンダーカップ、ボルテックスマイクロチューブ、ソニケーター槽など)中に前負荷されて所定の時間にわたり貯蔵された試料である。たとえば、より詳細に以下に記載されるように、生物学的サンプルを主題の方法に従ってアッセイする前に、生物学的サンプルを一定の時間にわたりマイクロ流体カートリッジ中に前負荷しうる。生物学的サンプルをアッセイする前に生物学的サンプルを容器中に前負荷してから貯蔵する時間は、たとえば0.1時間以上、たとえば0.5時間以上、たとえば1時間以上、たとえば2時間以上、たとえば4時間以上、たとえば8時間以上、たとえば16時間以上、たとえば24時間以上、たとえば48時間以上、たとえば72時間以上、たとえば96時間以上、たとえば120時間以上、たとえば144時間以上、たとえば168時間以上でさまざまでありうるとともに、さらには容器中に生物学的サンプルを前負荷するのは生物学的サンプルをアッセイする240時間以上前でありうるか、またはたとえば生物学的サンプルをアッセイする0.1時間〜240時間前、たとえば0.5時間〜216時間前、たとえば1時間〜192時間前、さらには生物学的サンプルをアッセイする5時間〜168時間前の範囲内でありうる。たとえば、遠隔地で(たとえば、家庭用キットを用いて家庭でまたは診療所で)サンプルをアッセイするためのシステム(以下に記載)で使用するように構成された容器(たとえば、マイクロ流体カートリッジ)中に生物学的サンプルを前負荷し、および主題の方法に従ってアッセイするために試験所に送付しうる。「遠隔地」とは、サンプルが容器中に含有され前負荷される場所以外の場所を意味する。たとえば、遠隔地は、たとえば、より詳細に以下に記載されるように、処理デバイスの場所と対比して、同一の都市の他の場所(たとえば、診療所、試験所など)、異なる都市の他の場所、異なる州の他の場所、異なる国の他の場所などでありうる。いくつかの場合には、2つの場所は、それらが10m以上、たとえば50m以上、さらには100m以上、たとえば500m以上、たとえば1000m以上、10,000m以上などの距離だけ互いに分離されていれば、互いに遠隔地である。
ある特定の実施形態に係る方法を実施する場合には、スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明し、サンプルを透過した光を検出し、およびアナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する。標的アナライトに依存して、サンプルを1つ以上の光源により照明しうる。いくつかの実施形態では、サンプルは1つ以上の広帯域光源により照明される。「広帯域」という用語は、本明細書では、広い波長範囲、たとえば50nm以上、たとえば100nm以上、たとえば150nm以上、たとえば200nm以上、たとえば250nm以上、たとえば300nm以上、たとえば350nm以上、たとえば400nm以上の波長、さらには500nm以上をカバーする波長範囲を有する光を発する光源を意味するようにその通常の意味で用いられる。たとえば、1つの好適な広帯域光源は、400nm〜700nmの波長を有する光を発する。好適な広帯域光源の他の例は、500nm〜700nmの波長を有する光を発する光源を含む。任意の好都合な広帯域光源プロトコル、たとえば、広帯域光源の中でも特に、ハロゲンランプ、ジュウテリウムアークランプ、キセノンアークランプ、安定化ファイバー結合広帯域光源、広帯域連続スペクトルLED、超高輝度発光ダイオード、半導体発光ダイオード、広域スペクトルLED白色光源、マルチLED統合白色光源、またはそれらの任意の組合せを利用しうる。
他の実施形態では、サンプルは、特定の波長または狭い波長範囲の光を発する1つ以上の狭帯域光源により照明される。「狭帯域」という用語は、本明細書では、狭い波長範囲、たとえば50nm以下、たとえば40nm以下、たとえば30nm以下、たとえば25nm以下、たとえば20nm以下、たとえば15nm以下、たとえば10nm以下、たとえば5nm以下、たとえば2nm以下の波長範囲を有する光を発する光源、さらには特定の波長の光(すなわち単色光)を発する光源を意味するようにその通常の意味で用いられる。任意の好都合な狭帯域光源プロトコル、たとえば、狭波長LED、レーザーダイオード、または1つ以上の光学バンドパスフィルタ、回折グレーティング、モノクロメーター、もしくはそれらの任意の組合せに結合された広帯域光源を利用しうる。
アッセイされるアナライトさらには生物学的サンプル中に存在する干渉物質に依存して、生物学的サンプルは、1つ以上の光源、たとえば2つ以上の光源、たとえば3つ以上の光源、たとえば4つ以上の光源、たとえば5つ以上の光源、さらには10以上の光源により照明されうる。必要に応じて、光源の任意の組合せを使用しうる。たとえば、2つの光源を利用する場合、第1の光源は広帯域白色光源(たとえば、広帯域白色光LED)でありうるとともに、第2の光源は広帯域近赤外光源(たとえば、広帯域近IR LED)でありうる。他の場合には、2つの光源を利用する場合、第1の光源が広帯域白色光源(たとえば、広帯域白色光LED)でありうるとともに、第2の光源は狭域スペクトル光源(たとえば、狭帯域可視LEDまたは近IR LED)でありうる。さらに他の場合には、光源は、それぞれ特定の波長を発光する複数の狭帯域光源、たとえば一連の2つ以上のLED、たとえば一連の3つ以上のLED、たとえば一連の5つ以上のLED、さらには一連の10以上のLEDである。
2つ以上の光源を利用する場合、サンプルは、光源により同時にもしくは逐次的にまたはそれらの組合せで照明されうる。たとえば、サンプルを2つの光源により照明する場合、主題の方法は、両方の光源によりサンプルを同時に照明する工程を含みうる。他の実施形態では、サンプルは、2つの光源により逐次的に照明されうる。2つ以上の光源によりサンプルを逐次的に照明する場合、各光源により照明する時間は、独立して、0.001秒間以上、たとえば0.01秒間以上、たとえば0.1秒間以上、たとえば1秒間以上、たとえば5秒間以上、たとえば10秒間以上、たとえば30秒間以上、さらには60秒間以上でありうる。2つ以上の光源によりサンプルを逐次的に照明する実施形態では、各光源によりサンプルが照明される持続時間は、同一であっても異なっていてもよい。
各光源による照明間の時間はまた、必要に応じて、1秒間以上、たとえば5秒間以上、たとえば10秒間以上、たとえば15秒間以上、たとえば30秒間以上、さらには60秒間以上の遅延で独立して分離されてさまざまでありうる。2つ超(すなわち、3つ以上)の光源によりサンプルを逐次的に照明する実施形態では、各光源による照明間の遅延は、同一であっても異なっていてもよい。
アッセイプロトコルに依存して、サンプルの照明は連続的または離散間隔でありうる。たとえば、いくつかの実施形態では、サンプルは、サンプルがアッセイされる全時間にわたり連続的に照明されうる。2つ以上の光源を備える場合、サンプルは、すべての光源により同時に連続的に照明されうる。他の場合には、サンプルは、各光源により逐次的に連続的に照明される。他の実施形態では、サンプルは、たとえば、0.001マイクロ秒ごと、0.01マイクロ秒ごと、0.1マイクロ秒ごと、1マイクロ秒ごと、10マイクロ秒ごと、100マイクロ秒ごと、さらには1000マイクロ秒ごとにサンプルを照明するなど、規則的間隔で照明されうる。サンプルは、任意の所与の測定時間で1回またはそれ以上、たとえば2回以上、たとえば3回以上、さらには各測定時間で5回以上、光源により照明されうる。
より詳細に以下に記載されるように、サンプルを照明するための光源は、400nm〜900nm、たとえば450nm〜850nm、たとえば500nm〜800nm、たとえば550nm〜750nm、さらには600nm〜700nmの範囲内の波長を有する光のスペクトルを発しうる。いくつかの実施形態では、サンプルは、400nm〜900nmの波長の光を発する単一の広帯域光源により照明される。他の実施形態では、サンプルは、複数の光源を用いて400nm〜900nmの波長の光により照明される。たとえば、サンプルは、400nm〜900nmの範囲内の波長を有する光をそれぞれ独立して発する複数の狭帯域光源により照明されうる。
ある特定の実施形態では、サンプルは、400nm〜900nmの波長の光を発する2つの広帯域光源により照明される。たとえば、光源は、400nm〜700nmの範囲内の波長を有する光を発する白色光LEDおよび700nm〜900nmの範囲内の波長を有する光を発する近赤外LEDでありうる。以上に記載したように、光源のタイプに依存して、各光源の照射プロファイルは、任意の数の発光ピークを有してさまざまでありうる。ある特定の場合には、サンプルは、400nm〜700nmの範囲内の波長を有する光を発しかつ約450nmおよび550nmに発光ピークを有する白色光LEDならびに700nm〜900nmの範囲内の波長を有する光を発しかつ約830nmに発光ピークを有する近赤外LEDにより照明される。
他の実施形態では、サンプルは、400nm〜900nmの範囲内の特定の波長の光をそれぞれ独立して発する複数の狭帯域ランプまたはLEDにより照明される。一例では、狭帯域光源は、500nm〜700nmの範囲内、たとえば、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、586nm、またはそれらの任意の組合せの光を発する1つ以上の単色LEDである。他の例では、狭帯域光源は、500nm〜700nmの範囲内の光を発する1つ以上の狭帯域ランプ、たとえば、狭帯域カドミウムランプ、セシウムランプ、ヘリウムランプ、水銀ランプ、水銀−カドミウムランプ、カリウムランプ、ナトリウムランプ、ネオンランプ、亜鉛ランプ、またはそれらの任意の組合せである。
本開示の実施形態では、サンプルはスリット状の照明光により照明される。スリット状の照明光は、たとえば、より詳細に以下に記載されるように、任意の好都合なプロトコルを用いて生成されうる。いくつかの実施形態では、スリット状の照明光は、1つ以上の追加のコンポーネント、たとえば、1つ以上のレンズに光結合されていてもされていなくてもよいスリットを含むスリット投影モジュールを用いて生成される。たとえば、いくつかの場合には、スリット状の照明光は、光源からの狭光ビームを集束させるためのフォーカスレンズと組み合わせて光ビームを狭くするスリットを有するスリット投影モジュールを介して1つ以上の光源から生成される。スリット投影モジュールは、光ビームを狭くし、かつサンプルチャンバ上に投影される光ビームをスリットの形状で生成する。サンプルの精査時、サンプルチャンバを横切るようにスリット状光ビームを変位させるために、サンプルチャンバもしくはスリット投影モジュールの一方、または、サンプルチャンバおよびスリット投影モジュールの両方を(必要に応じて)移動させうる。
以上に記載したように、スリット投影モジュールは、長さおよび幅を有するスリット状ビームを提供するように構成され、照明スリットの長さおよび幅はさまざまでありうる。スリット投影モジュールは、1つ以上の光源からの光ビームを狭くするように構成されたアパーチャーを有するスリットと、スリットアパーチャーを通過する光を集束させるためにスリットと組み合わされたフォーカスレンズとを含む。スリットアパーチャーは、限定されるものではないが、卵形、矩形、または他の多角形を含めて、任意の好都合な形状でありうる。ある特定の実施形態では、スリットアパーチャーは矩形である。以上に記載したように、光源により提供されるスリット状ビームの所望の寸法に依存して、スリットアパーチャーの寸法は、1mm〜10mm、たとえば1.25mm〜9.5mm、たとえば1.5mm〜9mm、たとえば2mm〜8mm、たとえば2.5mm〜7mm、たとえば3mm〜6mm、さらには3.5mm〜5mmの範囲内の長さを有してさまざまでありうる。スリットアパーチャーの幅は、1μm〜250μm、たとえば2μm〜225μm、たとえば5μm〜200μm、たとえば10μm〜150μm、さらには15μm〜125μmの範囲内でありうる。たとえば、スリットは100μmのアパーチャー幅を有する。
スリットにより狭くされた光ビームは、必要に応じて、スリットと組み合わされたフォーカスレンズを用いて集束される。いくつかの実施形態では、狭光ビームは、0.1〜0.95の範囲内の倍率、たとえば0.2〜0.9の倍率、たとえば0.3〜0.85の倍率、たとえば0.35〜0.8の倍率、たとえば0.5〜0.75の倍率を有する縮小レンズを介して集束され、さらには、狭光ビームは、0.55〜0.7の倍率、たとえば0.6の倍率を有する縮小レンズを介して集束される。たとえば、狭光ビームは、ある特定の場合には、約0.6の倍率を有する二重色消し縮小レンズを介して集束される。
より詳細に以下に記載されるように、スリット投影モジュールは、さまざまな長さおよび幅を有するスリット状ビームを提供するように構成されうる。いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールは、1mm〜5mm、たとえば1.5mm〜4.5mm、たとえば2mm〜4mm、たとえば2.5mm〜3.5mmの範囲内の長さを有するスリット状ビーム、さらには3mmの長さを有するスリット状ビームを提供するように構成される。これらの実施形態では、スリット投影モジュールは、10μm〜100μm、たとえば15μm〜95μm、たとえば20μm〜90μm、たとえば25μm〜85μm、たとえば30μm〜80μm、たとえば35μm〜75μm、たとえば40μm〜70μm、たとえば45μm〜65μm、さらには50μm〜60μmの範囲内の幅を有するスリット状ビームを提供するように構成される。
いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールは、スリット状ビームの長さがアッセイされるサンプルチャンバの長さに直交するスリット状光ビームを提供するように構成される。換言すれば、スリット状ビームの長さは、アッセイサンプルチャンバの幅に沿って位置決めされる。サンプルチャンバのサイズ(より詳細に以下に記載される)およびスリット状ビーム投影に依存して、スリット状ビームは、サンプルチャンバの幅の50%以上、たとえば55%以上、たとえば60%以上、たとえば65%以上、たとえば70%以上、たとえば75%以上、たとえば80%以上、たとえば85%以上、たとえば90%以上、たとえば95%以上、たとえば97%以上を照明しうるとともに、さらには、サンプルチャンバの幅の99%以上を照明する。ある特定の場合には、スリット状ビーム投影は、サンプルチャンバの幅と実質的に同一の長さを有する。他の実施形態では、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも長い長さを有するスリット状ビーム投影を提供するように構成される。たとえば、スリット状光ビームは、サンプルチャンバの幅よりも1%以上、たとえば2%以上、たとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば15%以上、たとえば20%以上長い長さ、さらにはサンプルチャンバの幅よりも25%長い長さを有しうる。さらに他の実施形態では、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも短い長さを有するスリット状ビーム投影を提供するように構成される。たとえば、スリット状光ビームは、サンプルチャンバの幅よりも1%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも2%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも5%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも10%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも15%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも20%以上短い長さ、さらにはサンプルチャンバの幅よりも25%以上短い長さを有しうる。
サンプルの精査時、サンプルチャンバを横切るようにスリット状光ビームを変位させるために、サンプルチャンバもしくはスリット投影モジュールの一方、または、サンプルチャンバおよびスリット投影モジュールの両方を(必要に応じて)移動させうる。「移動」という用語は、サンプルチャンバ上に投影されたスリット状光ビームがサンプルのアッセイ時にサンプルチャンバに沿って時間とともに位置を変えるようなスリット投影モジュールとサンプルチャンバとの間の変位を意味する。いくつかの実施形態では、精査時にサンプルチャンバに沿ってスリット状光ビームを側方変位させるためにスリット投影モジュールを静止位置に維持した状態でサンプルチャンバを移動させる。他の実施形態では、精査時にサンプルチャンバに沿ってスリット状光ビームを側方変位させるためにサンプルチャンバを静止位置で維持した状態でスリット投影モジュールを移動させる。さらに他の実施形態では、精査時にサンプルチャンバに沿ってスリット状光ビームを側方変位させるためにスリット投影モジュールおよびサンプルの両方を移動させる。
いくつかの実施形態では、スリット状光ビームがサンプルチャンバに対して任意の方向に側方変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させうる。この際、いくつかの例では、スリット状ビームの長さは、サンプルチャンバの長さに直交した状態を維持する。いくつかの場合には、スリット状光ビームがサンプルチャンバの先端から基端に変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させうる。他の場合には、スリット状光ビームがサンプルチャンバの基端から先端に変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させうる。サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールは、サンプルを精査するためにスリット状光ビームがサンプルチャンバの長さの全部または一部に沿って変位されるように移動させるべく構成されうる。いくつかの実施形態では、スリット状光ビームは、サンプルチャンバの50%以上、たとえば55%以上、たとえば60%以上、たとえば65%以上、たとえば70%以上、たとえば75%以上、たとえば80%以上、たとえば85%以上、たとえば90%以上、たとえば95%以上、たとえば97%以上に沿って、さらにはサンプルチャンバの長さの99%以上に沿って変位される。ある特定の場合には、スリット状ビームは、実質的にサンプルチャンバの全長に沿って変位される。
ある特定の実施形態では、スリット状ビーム光がサンプルチャンバに対して前進後退運動により変位されるように、たとえば、サンプルチャンバの先端から基端に移動してからサンプルチャンバの基端から先端に戻るように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる。他の場合には、スリット状光ビームがサンプルチャンバに対してサンプルチャンバの基端から先端に変位してからサンプルチャンバの先端から基端に戻るように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる。ある特定の場合には、スリット状光ビームがサンプルチャンバの一部のみに沿って前進後退運動により変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる。たとえば、スリット状ビームがサンプルチャンバの99%以下、たとえば95%以下、たとえば90%以下、たとえば85%以下、たとえば80%以下、たとえば75%以下、たとえば70%以下、たとえば65%以上に沿って前進後退運動により変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させうるとともに、さらには、スリット状ビームがサンプルチャンバの長さの50%以下に沿って前進後退運動により変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させうる。
スリット状光ビームを前進後退運動により移動させる場合、任意の所与の精査時間の間に1回以上、たとえば2回以上、たとえば5回以上、たとえば10回以上、たとえば15回以上、さらには各精査時間の間に25回以上、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールの移動を繰り返しうる。
精査時のサンプルチャンバに沿ったスリット状光ビームの変位幅は、さまざまでありうる。「変位幅」または「全変位」とは、スリット状光ビームがサンプルチャンバに沿って移動する距離の総和を意味する。一例では、スリット状光ビームを60mmのサンプルチャンバの基端から先端に移動させる場合、スリット状光ビームの全変位は60mmである。他の例では、スリット状ビームを60mmのサンプルチャンバの先端から基端に移動させる場合、スリット状光ビームの全変位は60mmである。さらに他の例では、スリット状ビームを前進後退運動により60mmのサンプルチャンバの基端から先端に移動させてから先端から基端に戻す場合、全変位は120mmである。さらに他の例では、スリット状ビームを60mmのサンプルチャンバの50%に沿って前進後退運動により移動させる場合(たとえば、基端から先端に移動させてから先端から基端に戻す場合)、全変位は60mmである。さらに他の例では、スリット状ビームを60mmのサンプルチャンバの50%に沿って前進後退運動により移動させ(たとえば、先端から基端に移動させてから基端から先端に戻し)、かつそれを5回繰り返した場合、全変位は300mmである。
本開示の実施形態では、全変位は、0.1mm〜1000mm、たとえば0.2mm〜950mm、たとえば0.3mm〜900mm、たとえば0.4mm〜850mm、たとえば0.5mm〜800mm、たとえば0.6mm〜750mm、たとえば0.7mm〜700mm、たとえば0.8mm〜650mm、たとえば0.9mm〜600mm、たとえば1mm〜550mm、たとえば1.25mm〜500mm、たとえば1.5mm〜450mm、たとえば1.75mm〜400mm、たとえば2mm〜300mm、たとえば2.5mm〜250mm、さらには3mm〜200mmの範囲内でさまざまである。
スリット状光ビームは、さまざまな速度で、たとえば0.001mm/秒以上の速度で、たとえば0.005mm/秒以上の速度で、たとえば0.01mm/秒以上の速度で、たとえば0.05mm/秒以上の速度で、たとえば0.1mm/秒以上の速度で、たとえば0.5mm/秒以上の速度で、たとえば1mm/秒以上の速度で、たとえば1.5mm/秒以上の速度で、たとえば2mm/秒以上の速度で、たとえば2.5mm/秒以上の速度で、たとえば3mm/秒の速度で、たとえば5mm/秒以上の速度で、たとえば10mm/秒以上の速度で、たとえば20mm/秒以上の速度で、たとえば30mm/秒以上の速度で、たとえば40mm/秒以上の速度で、サンプルチャンバに沿って移動させうるとともに、さらには、スリット状ビームは、60mm/秒以上の速度でサンプルチャンバに沿って移動させうる。スリット状ビームをサンプルチャンバに沿って前進後退運動により移動させる場合、速度は、1前進後退サイクル/分以上、たとえば2サイクル/分以上、たとえば3サイクル/分以上、たとえば4サイクル/分以上、たとえば5サイクル/分以上、たとえば10サイクル/分以上、たとえば15サイクル/分以上、たとえば20サイクル/分以上、たとえば30サイクル/分以上、たとえば45サイクル/分以上、さらには60前進後退サイクル/分以上でありうる。
サンプルチャンバに沿ってスリット状ビームを変位させるサンプルチャンバまたはスリット投影モジュールの移動は、連続的または離散増分でありうる。いくつかの実施形態では、サンプルがアッセイされる全時間にわたり連続的に、たとえば0.001mm/秒以上の速度で、たとえば0.005mm/秒以上の速度で、たとえば0.01mm/秒以上の速度で、たとえば0.05mm/秒以上の速度で、たとえば0.1mm/秒以上の速度で、たとえば0.5mm/秒以上の速度で、たとえば1mm/秒以上の速度で、たとえば1.5mm/秒以上の速度で、たとえば2mm/秒以上の速度で、たとえば2.5mm/秒以上の速度で、たとえば3mm/秒の速度で、たとえば5mm/秒以上の速度で、たとえば10mm/秒以上の速度で、たとえば20mm/秒以上の速度で、たとえば30mm/秒以上の速度で、たとえば40mm/秒以上の速度でスリット状光ビームがサンプルチャンバに沿って変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させるとともに、さらには、サンプルチャンバに対して60mm/秒以上の速度でスリット状光ビームが連続的に変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる。
他の実施形態では、スリット状ビームがサンプルチャンバに対して離散増分で変位されるように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる。これらの実施形態では、スリット状光ビームは、いくつかの場合には、サンプルチャンバに対して規則的増分で、たとえば0.01mmの増分、0.05mmの増分、0.1mmの増分、0.2mmの増分、0.3mmの増分、0.5mmの増分、0.75mmの増分、1mmの増分、2.5mmの増分、5mmの増分、7.5mmの増分、10mmの増分、15mmの増分、20mmの増分、またはなんらかの他の増分で変位される。他の場合には、スリット状光ビームは、サンプルチャンバに対して0.01mm〜20mmの増分、たとえば0.1mm〜17.5mm、たとえば0.5mm〜15mmの増分の範囲内のランダム増分、さらには1mm〜10mmの増分の範囲内のランダム増分で変位される。
以上に記載したように、いくつかの実施形態では、サンプルチャンバは複数の光源で逐次的に照明される。サンプルチャンバが2つ以上の光源で逐次的に照明される場合、各光源は、独立して、サンプルチャンバに対して変位されるスリット状光ビームを提供する。複数の光源により提供される各スリット状光ビームのサンプルチャンバに対する移動は、以上に記載したように、同一であっても異なっていてもよい。たとえば、サンプルチャンバが2つの光源(たとえば、広帯域白色光LEDおよび近IR LED)により逐次的に照明される場合、第1の光源(たとえば、広帯域白色光LED)により生成される第1のスリット状ビームは、第2の光源(たとえば、近IR LED)により生成される第2のスリット状ビームとともに逐次的にサンプルチャンバを精査する。換言すれば、これらの実施形態では、サンプルチャンバを精査するために少なくとも2つのスリット状ビームが提供される。たとえば、いくつかの実施形態では、第1のスリット状ビームを提供する第1の光源は、前進後退運動によりサンプルチャンバに沿って移動されうるが、第2のスリット状ビームを提供する第2の光源は、単一方向にのみサンプルチャンバに沿って移動されうる。他の実施形態では、第1のスリット状ビームを提供する第1の光源は、前進後退運動によりサンプルチャンバに沿って複数サイクルで移動されうるが、第2のスリット状ビームを提供する第2の光源は、前進後退運動により単一サイクルで移動されうる。
図1は、サンプルチャンバに対するスリット状光ビームの変位を示している。スリット投影モジュールにより提供されるスリット状ビーム(101)は、サンプルチャンバ(102)の幅を横切るように配向し、かつサンプルチャンバは、サンプルチャンバの全部または一部を照明すべくスリット状光ビームを横切るように側方移動される(103)。必要に応じて、スリット状ビームがサンプルチャンバに対して1回以上または前進後退運動により変位可能なように、サンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させうる。
いくつかの実施形態では、サンプルチャンバを透過した光は捕集されて1つ以上の対物レンズを通過する。ある特定の場合には、サンプルチャンバを透過した光は捕集されて、1.2〜2.5の範囲内の公称倍率、たとえば1.3〜2.4の公称倍率、たとえば1.4〜2.3の公称倍率、たとえば1.5〜2.2の公称倍率、たとえば1.6〜2.1の公称倍率を有する拡大レンズを通過するとともに、さらには、透過光は、1.7〜2.0の公称倍率、たとえば1.7の公称倍率を有する拡大レンズを通過する。たとえば、透過光は、ある特定の場合には、捕集されて、1.7の公称倍率を有する拡大色消し二重レンズを通過する。光源、サンプルチャンバ、および検出器の構成に依存して、対物レンズの性質はさまざまでありうる。たとえば、主題の対物レンズの開口数はまた、0.01〜1.7、たとえば0.05〜1.6、たとえば0.1〜1.5、たとえば0.2〜1.4、たとえば0.3〜1.3、たとえば0.4〜1.2、たとえば0.5〜1.1の範囲内でさまざまでありうるとともに、さらには開口数は0.6〜1.0の範囲内でありうる。同様に、対物レンズの焦点距離は、10mm〜20mm、たとえば10.5mm〜19mm、たとえば11mm〜18mm、さらには12mm〜15mmの範囲内でさまざまでありうる。
いくつかの実施形態では、サンプルチャンバを透過したスリット状ビーム投影はまた、オートフォーカスモジュールを用いて集束される。たとえば、サンプルチャンバを透過したスリット状ビーム投影を集束させるために好適なプロトコルとしては、限定されるものではないが、1999年10月29日出願の米国特許第6,441,894号明細書(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のものが挙げられうる。
本開示のいくつかの実施形態に係る方法はまた、1つ以上の波長セパレータを介して透過光を通過させる工程を含む。「波長セパレータ」という用語は、本明細書では、多色光をその検出用成分波長に分離するための光学プロトコルを意味するようにその通常の意味で用いられる。ある特定の実施形態に係る波長分離は、多色光の特定の波長または波長範囲の選択的な通過または遮断を行う工程を含みうる。光の波長を分離するために、任意の好都合な波長分離プロトコルを介して、たとえば、限定されるものではないが、波長分離プロトコルの中でも特に、着色ガラス、バンドパスフィルタ、干渉フィルタ、ダイクロイックミラー、回折グレーティング、モノクロメーター、およびそれらの組合せを介して、透過光を通過させうる。
いくつかの実施形態では、方法は、1つ以上の回折グレーティングを介して透過光を通過させることによりサンプルチャンバからの透過光を分離する工程を含む。対象の回折グレーティングとしては、透過型、分散型、または反射型の回折グレーティングが挙げられうるが、これらに限定されるものではない。回折グレーティングの好適な間隔は、光源、スリット投影モジュール、サンプルチャンバ、対物レンズの構成に依存して、0.01μm〜10μm、たとえば0.025μm〜7.5μm、たとえば0.5μm〜5μm、たとえば0.75μm〜4μm、たとえば1μm〜3.5μm、さらには1.5μm〜3.5μmの範囲内でさまざまでありうる。他の実施形態では、方法は、1つ以上のバンドパスフィルタ、たとえば1つ以上の光学フィルタを介して透過光を通過させることによりサンプルチャンバからの透過光を分離する工程を含む。たとえば、対象の光学フィルタは、2nm〜100nm、たとえば3nm〜95nm、たとえば5nm〜95nm、たとえば10nm〜90nm、たとえば12nm〜85nm、たとえば15nm〜80nmの範囲内の最小帯域幅を有するバンドパスフィルタ、さらには20nm〜50nmの範囲内の最小帯域幅を有するバンドパスフィルタを含みうる。ある特定の場合には、方法は、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜520nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、またはそれらの任意の組合せの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを介してサンプルチャンバからの透過光を通過させる工程を含む。
たとえば、一例では、方法は、500nm〜520nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを介してサンプルチャンバからの透過光を通過させる工程を含む。他の場合には、方法は、540nm〜560nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを介してサンプルチャンバからの透過光を通過させる工程を含む。さらに他の場合には、方法は、560nm〜590nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを介してサンプルチャンバからの透過光を通過させる工程を含む。さらに他の場合には、方法は、500nm〜520nm、560nm〜590nm、および650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを介してサンプルチャンバからの透過光を通過させる工程を含む。
本開示の態様に係る方法を実施する場合には、サンプルチャンバを透過した光は、1つ以上の波長で測定される。いくつかの実施形態では、透過光は、1つ以上の波長で、たとえば5つ以上の異なる波長で、たとえば10以上の異なる波長で、たとえば25以上の異なる波長で、たとえば50以上の異なる波長で、たとえば100以上の異なる波長で、たとえば200以上の異なる波長で、たとえば300以上の異なる波長で測定され、さらにはサンプルチャンバを透過した光は、400以上の異なる波長で測定される。
いくつかの実施形態では、サンプルチャンバを透過した光を測定する工程は、一定の波長範囲(たとえば、400nm〜800nm、495nm〜525nm、800nm〜835nmなど)にわたり透過光を測定する工程を含む。たとえば、方法は、400nm〜800nm、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜700nm、500nm〜575nm、500nm〜550nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、650nm〜830nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、およびそれらの任意の組合せの波長範囲の1つ以上にわたりサンプルチャンバを透過した光を測定する工程を含みうる。一例では、方法は、400nm〜800nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定する工程を含む。他の場合には、方法は、500nm〜520nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定する工程を含む。他の場合には、方法は、540nm〜560nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定する工程を含む。さらに他の場合には、方法は、560nm〜590nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定する工程を含む。さらに他の場合には、方法は、500nm〜520nm、560nm〜590nm、および650〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定する工程を含む。
一定の波長範囲にわたり透過光を測定する工程は、ある特定の場合には、その波長範囲にわたり透過光のスペクトルを収集する工程を含む。たとえば、方法は、400nm〜800nm、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜700nm、500nm〜520nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、およびそれらの任意の組合せの波長範囲の1つ以上にわたりサンプルチャンバを透過した光のスペクトルを収集する工程を含みうる。一例では、方法は、400nm〜800nmの範囲内の波長にわたり透過光のスペクトルを収集する工程を含む。他の場合には、方法は、500nm〜700nmの範囲内の波長にわたり透過光のスペクトルを収集する工程を含む。
ある特定の実施形態では、サンプルチャンバを透過した光は、1つ以上の特定の波長(たとえば、548nmまたは675nm)で検出される。たとえば、方法は、2つ以上の特定の波長で、たとえば3つ以上の特定の波長で、たとえば4つ以上の特定の波長で、たとえば5つ以上の特定の波長で、たとえば10以上の特定の波長で透過光を検出する工程、さらには25以上の特定の波長で透過光を検出する工程を含みうる。いくつかの場合には、方法は、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、586nm、675nm、710nm、808nm、815nm、830nm、およびそれらの任意の組合せの1つ以上で透過光を検出する工程を含む。ある特定の実施形態では、透過光は548nmで検出される。他の実施形態では、透過光は675nmで検出される。さらに他の実施形態では、透過光は830nmで検出される。さらに他の実施形態では、透過光は548nmおよび675nmで検出される。さらに他の実施形態では、透過光は、548nm、675nm、および830nmで検出される。さらに他の実施形態では、透過光は、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、586nm、650nm、675nm、710nm、808nm、815nm、および830nmで検出される。
特定のアッセイプロトコルに依存して、透過光は連続的にまたは離散間隔で測定されうる。たとえば、いくつかの実施形態では、透過光を測定する工程は、サンプルがアッセイされる全時間にわたり連続的である。透過光の測定が2つ以上の波長または波長範囲の測定を含む場合、波長または波長範囲はすべて、同時に測定されうるか、または各波長または波長範囲は、逐次的に測定されうる。
他の実施形態では、透過光は、たとえば、0.001マイクロ秒ごと、0.01マイクロ秒ごと、0.1マイクロ秒ごと、1マイクロ秒ごと、10マイクロ秒ごと、100マイクロ秒ごと、さらには1000マイクロ秒ごとに、サンプルを透過した光を測定するなど、離散間隔で測定される。
生物学的サンプルの質(たとえば均一性)、干渉物質の存在、光源、および測定波長に依存して、サンプルチャンバを透過した光は、主題の方法時に1回以上、たとえば2回以上、たとえば3回以上、たとえば5回以上、さらには10回以上を測定されうる。ある特定の実施形態では、透過光は2回以上測定され、そのデータは、以下に記載されるように標的アナライトによる吸光度を計算するために平均化される。
ある特定の実施形態では、方法は、ブランク測定を提供するためにスリット状ビームを検出器上に投影する工程を含む。これらの実施形態では、スリット状ビームによりブランク参照ウィンドウを照明する工程と、ブランク参照ウィンドウを介して投影されたスリット状ビームを検出器上に集束させる工程とにより、スリット状ビームを操作しうる。
たとえば、光源からの光が統合されたブランク参照ウィンドウを介して方向付けられるように、ブランク参照ウィンドウを主題のシステムに統合しうる(以下に記載)。いくつかの場合には、ブランク参照ウィンドウを透過した光は、対物レンズを介して波長セパレータおよび検出器上に方向付けられる。他の場合には、ブランク参照ウィンドウを透過した光は、検出器上に直接提供される。いくつかの場合には、ブランク参照ウィンドウは、たとえばサンプルチャンバと同一の光学軸に沿って、マイクロ流体カートリッジ上に位置決めされうる。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法を実施した時のマイクロ流体カートリッジによる吸収、散乱などをブランク参照ウィンドウを介する透過により補正できるように、ブランク参照ウィンドウによる吸光度をサンプルチャンバによる吸光度と同一にすべく構成される。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、入射光の1つ以上の波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の吸光度および透過率を有する。他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1つ以上の波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の光を散乱する。さらに他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1つ以上の入射波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の吸光度、透過率を有し、かつ実質的に同一の光を散乱する。さらに他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の屈折率を有する。
他の実施形態では、方法は、ブランクの入射光を提供するように光源からの非回折光を検出器上に投影する工程を含む。ある特定の実施形態では、非回折光は検出器の校正用に使用される。
サンプルチャンバを透過した光は、任意の好都合な光検出プロトコルにより、たとえば、限定されるものではないが、フォトセンサーまたはフォトディテクターにより、たとえば、フォトディテクターの中でも特に、アクティブピクセルセンサー(APS)、アバランシュフォトダイオード、イメージセンサー、電荷結合デバイス(CCD)、インテンシファイア付き電荷結合デバイス(ICCD)、発光ダイオード、フォトンカウンタ、ボロメーター、焦電検出器、フォトレジスタ、光起電力電池、フォトダイオード、光電子増倍管、フォトトランジスタ、量子ドット光導電体、またはフォトダイオード、およびそれらの組合せにより測定されうる。ある特定の実施形態では、透過光は電荷結合デバイス(CCD)により測定される。透過光をCCDにより測定する場合、CCDのアクティブ検出表面積は、たとえば0.01cm2 〜10cm2 、たとえば0.05cm2 〜9cm2 、たとえば0.1cm2 〜8cm2 、たとえば0.5cm2 〜7cm2 、さらには1cm2 〜5cm2 で、さまざまでありうる。
以上に概説したように、本開示の態様は、1種以上のアナライトに関してサンプルをアッセイするための方法を含む。いくつかの実施形態では、アナライトをアッセイするために、測定された透過光を用いて標的アナライトによる光の吸光度が計算される。いくつかの実施形態では、吸光度は、1つ以上の波長で、たとえば2つ以上の異なる波長で、たとえば3つ以上の異なる波長で、たとえば4つ以上の異なる波長で計算され、さらには、標的アナライトの吸光度は、5つ以上の異なる波長で計算される。たとえば、標的アナライトの吸光度は、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、586nm、675nm、710nm、808nm、815nm、830nm、またはそれらの任意の組合せの1つ以上で検出された透過光を用いて計算されうる。ある特定の実施形態では、アナライトの吸光度は、548nmで検出された透過光を用いて計算される。他の実施形態では、アナライトの吸光度は、675nmで検出された透過光を用いて計算される。さらに他の実施形態では、アナライトの吸光度は、830nmで検出された透過光を用いて計算される。さらに他の実施形態では、アナライトの吸光度は、548nmおよび675nmで検出された透過光を用いて計算される。さらに他の実施形態では、アナライトの吸光度は、548nm、675nm、および830nmで検出された透過光を用いて計算される。
いくつかの実施形態では、標的アナライトによる光の吸光度を計算する工程は、一定の波長範囲(たとえば、400nm〜800nm、495nm〜525nm、800nm〜835nmなど)にわたり吸光度を計算する工程を含む。たとえば、方法は、400nm〜800nm、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜700nm、500nm〜520nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、およびそれらの任意の組合せの波長範囲の1つ以上にわたり吸光度を計算する工程を含みうる。たとえば、方法は、400nm〜800nmの範囲内の波長にわたり標的アナライトによる光の吸光度を計算する工程を含む。他の場合には、方法は、500nm〜520nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり標的アナライトによる光の吸光度を計算する工程を含む。他の場合には、方法は、540nm〜560nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり標的アナライトによる光の吸光度を計算する工程を含む。さらに他の場合には、方法は、560nm〜590nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり標的アナライトによる光の吸光度を計算する工程を含む。さらに他の場合には、方法は、500nm〜520nm、560nm〜590nm、および650〜750nmの範囲内の波長にわたり標的アナライトによる光の吸光度を計算する工程を含む。
たとえば、サンプルが全血でありかつ対象のアナライトがヘモグロビンである場合、全血中のヘモグロビンの濃度は、第1および第2の波長の透過光を測定することにより計算されうる。この場合、波長は、さまざまでありうるとともに、限定されるものではないが等吸収点などを含む。いくつかの場合には、第1の波長は、ヘモグロビンと、オキシヘモグロビン、カルボキシヘモグロビン、メトヘモグロビン、スルホヘモグロビン、アジドメトヘモグロビン、およびシアノメトヘモグロビンの1つ以上との等吸収点、たとえば、ヘモグロビンとオキシヘモグロビンの等吸収点、またはヘモグロビンとオキシヘモグロビンとカルボキシヘモグロビンとの三重等吸収点である。たとえば、第1の波長は、ある特定の場合には、506nm、548nm、569nm、579nm、585nm、または586nmである。これらの実施形態では、第2の波長は、低吸収波長(たとえば近IR)であり、ヘモグロビンと、オキシヘモグロビン、カルボキシヘモグロビン、メトヘモグロビン、スルホヘモグロビン、アジドメトヘモグロビン、およびシアノメトヘモグロビンの1つ以上との等吸収点、たとえば、ヘモグロビンとオキシヘモグロビンとの等吸収点、またはヘモグロビンとオキシヘモグロビンとカルボキシヘモグロビンとの三重等吸収点であってもよい。たとえば、第2の波長は、ある特定の場合には、650nm、675nm、710nm、785nm、808nm、815nm、または830nmである。
標的アナライトによる光の吸光度は、任意の好都合な原理、たとえば、ベール・ランベルトの法則:
吸光度(λ)=−Log10(I/I0
(式中、Iは、サンプルチャンバを透過した光の強度であり、かつI0 は、サンプルの精査に用いられる入射光の強度である)
を用いて計算されうる。サンプルチャンバの経路長に依存して(以下に記載)、アナライトの濃度は、アナライトの計算吸光度:
吸光度(λ)=[モル吸光率]×[濃度]×[経路長]
を用いて決定可能である。
吸光度は、透過光の測定と組み合わせて計算されうるか、または透過光の測定に続いて所定の持続時間後に処理されうる。いくつかの実施形態では、たとえば、透過光が1つ以上の特定の波長で測定される場合には、吸光度は、透過光の測定と組み合わせて連続的に計算される。主題の方法が2つ以上の波長でアナライトの吸光度を計算する工程を含む場合には、吸光度は、両方の波長で同時に計算されうるか、または吸光度は、各波長で逐次的に計算されうる。
他の実施形態では、吸光度は、透過光の測定から所定の持続時間後、たとえば測定の0.001秒以上後、たとえば測定の0.01秒以上後、たとえば測定の0.1秒以上後、たとえば測定の0.5秒以上後、たとえば測定の1秒以上後、さらには透過光の測定の5秒以上後に計算される。たとえば、一定の波長範囲にわたるスペクトルが収集されるいくつかの実施形態では、吸光度は、全スペクトルが収集されてから所定の持続時間後に計算されうる。
いくつかの実施形態では、方法は、透過光から決定される吸光度に基づいて濃度を計算する工程を含む。いくつかの実施形態では、アナライトの濃度は、任意の所望の波長、たとえば2つ以上の波長、たとえば3つ以上の波長、さらには5つ以上の波長の吸光度を用いて計算可能である。いくつかの実施形態では、サンプル中のアナライトの濃度は、吸収スペクトル中の1つ以上のピーク吸光度値で計算される。他の実施形態では、サンプル中のアナライトの濃度は、アナライトが最大モル吸光率を有する1つ以上の波長を用いて計算される。2種以上のアナライトが対象となる場合、アナライトの濃度は、ある特定の場合には、2種以上のアナライトの等吸収点に対応する波長の吸光度を用いて計算されうる。
アナライトの濃度を計算する場合には、ベール・ランベルトの法則:
吸光度(λ)=−Log10(I/I0
(式中、Iは、サンプルチャンバを透過した光の強度であり、かつI0 は、サンプルの精査に用いられる入射光の強度である)
を用いて、標的アナライトによる光の吸光度が最初に決定される。次いで、サンプルチャンバの経路長に依存して、アナライトの計算吸光度:
吸光度(λ)=[モル吸光率]×[濃度]×[経路長]
を用いてアナライトの濃度が決定される。
一実施形態では、方法は、第1および第2の波長で透過光を測定することによりサンプルによる散乱を補正しながらアナライトの濃度を計算する工程を含む。第1の波長は、いくつかの場合には、アナライトが高いモル吸光率を有する波長である。他の場合には、第1の波長は、アナライト濃度に含まれるアナライトの1種以上の誘導体との等吸収点の波長である。これらの実施形態では、第2の波長は、アナライトが低いモル吸光率を有する波長である。第2の波長はまた、アナライトの1種以上の誘導体との等吸収点の波長でありうる。アナライトの濃度を計算するために、以下のように散乱を補正する。
濃度analyte=A(Absλ1 )+B(Absλ2 )+C
(式中、A、B、およびCは、精査波長および測定アナライトに依存する係数である)
いくつかの実施形態では、Aの値は、ある特定の場合には、20g/dL〜60g/dL、たとえば25g/dL〜57.5g/dL、たとえば30g/dL〜55g/dL、たとえば35g/dL〜50g/dL、さらには37.5g/dL〜45g/dLの範囲内でさまざまでありうる。Bの値もまた、ある特定の場合には、0.01g/dL〜5g/dL、たとえば0.05g/dL〜4.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜4g/dL、たとえば0.25g/dL〜3.5g/dL、たとえば0.5g/dL〜3g/dL、さらには0.5g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。同様に、Cの値もまた、0.01g/dL〜2g/dL、たとえば0.025g/dL〜1.75g/dL、たとえば0.05g/dL〜1.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜1.25g/dL、さらには0.25g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。
以上で考察したように、ある特定の実施形態では、サンプルは全血であり、かつ対象のアナライトはヘモグロビンである。いくつかの場合には、方法は、第1および第2の波長で透過光を測定することによりサンプルによる散乱を補正しながら全血中の全ヘモグロビンの濃度を計算する工程を含む。第1の波長は、ヘモグロビンが高いモル吸光率を有する波長でありうる。いくつかの場合には、第1の波長は、ヘモグロビンと、オキシヘモグロビン、カルボキシヘモグロビン、メトヘモグロビン、スルホヘモグロビン、アジドメトヘモグロビン、およびシアノメトヘモグロビンの1つ以上との等吸収点、たとえば、ヘモグロビンとオキシヘモグロビンとの等吸収点、またはヘモグロビンとオキシヘモグロビンとカルボキシヘモグロビンとの三重等吸収点でありうる。たとえば、第1の波長は、ある特定の場合には、506nm、548nm、569nm、579nm、585nm、または586nmである。散乱を補正するために、ヘモグロビンが低い吸収率を有する第2の波長、たとえば近赤外波長を選択しうる。いくつかの場合には、第2の波長は、ヘモグロビンと、オキシヘモグロビン、カルボキシヘモグロビン、メトヘモグロビン、スルホヘモグロビン、アジドメトヘモグロビン、およびシアノメトヘモグロビンの1つ以上との等吸収点、たとえば、ヘモグロビンとオキシヘモグロビンとの等吸収点、またはヘモグロビンとオキシヘモグロビンとカルボキシヘモグロビンとの三重等吸収点である。たとえば、第2の波長は、ある特定の場合には、650nm、675nm、710nm、785nm、808nm、815nm、または830nmである。
たとえば、第1の波長が548nmでありかつ第2の波長が675nmである場合、ヘモグロビンの濃度を計算するために、以下のように散乱を補正する。
濃度Hb=A(Abs548nm )+B(Abs675nm )+C
いくつかの実施形態では、全血サンプルのAの値は、ある特定の場合には、20g/dL〜60g/dL、たとえば25g/dL〜57.5g/dL、たとえば30g/dL〜55g/dL、たとえば35g/dL〜50g/dL、さらには37.5g/dL〜45g/dLの範囲内でさまざまでありうる。全血サンプルのBの値もまた、ある特定の場合には、0.01g/dL〜5g/dL、たとえば0.05g/dL〜4.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜4g/dL、たとえば0.25g/dL〜3.5g/dL、たとえば0.5g/dL〜3g/dL、さらには0.5g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。同様に、全血サンプルのCの値もまた、0.01g/dL〜2g/dL、たとえば0.025g/dL〜1.75g/dL、たとえば0.05g/dL〜1.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜1.25g/dL、さらには0.25g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。
他の例では、第1の波長が548nmでありかつ第2の波長が650nmである場合、ヘモグロビンの濃度を計算するために、以下のように散乱を補正する。
濃度Hb=A(Abs548nm )+B(Abs650nm )+C
いくつかの実施形態では、全血サンプルのAの値は、ある特定の場合には、20g/dL〜60g/dL、たとえば25g/dL〜57.5g/dL、たとえば30g/dL〜55g/dL、たとえば35g/dL〜50g/dL、さらには37.5g/dL〜45g/dLの範囲内でさまざまでありうる。全血サンプルのBの値もまた、ある特定の場合には、0.01g/dL〜5g/dL、たとえば0.05g/dL〜4.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜4g/dL、たとえば0.25g/dL〜3.5g/dL、たとえば0.5g/dL〜3g/dL、さらには0.5g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。同様に、全血サンプルのCの値もまた、0.01g/dL〜2g/dL、たとえば0.025g/dL〜1.75g/dL、たとえば0.05g/dL〜1.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜1.25g/dL、さらには0.25g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。
他の実施形態では、方法は、第1の波長および第2の波長で透過光の測定および吸光度の決定を行うことにより干渉物質を補正しながらアナライトの濃度を計算する工程を含む。この実施形態では、第1の波長で吸光度から濃度を決定し、第2の波長で吸光度から濃度を決定し、かつ第1の波長で得られた濃度から第2の波長で得られた濃度を減算することにより、アナライトの濃度が計算される。
ある特定の実施形態では、主題の方法は、蛍光アッセイにより1種以上のアナライトに関してサンプルを精査する方法と組み合わせうる。たとえば、より詳細に以下に記載されるように、サンプルは、1つ以上のフォトセンサーまたはフォトディテクターにより発光を検出可能な蛍光マーカーを有する1種以上の試薬に接触させうる。したがって、ある特定の実施形態に係る本開示の態様は、サンプルを1種以上の試薬に接触させて、吸収アッセイ(以上で考察)と蛍光アッセイとを組み合わせてサンプルを光学精査することにより、1種以上のアナライトに関してサンプルをアッセイする工程を含む。
いくつかの実施形態では、蛍光でアッセイされるサンプルは、1つ以上の光源により照明されうる。標的アナライトに依存して、サンプルは、1つ以上の広帯域光源(たとえば、以上に記載したように、ハロゲンランプ、ジュウテリウムアークランプ、キセノンアークランプ、安定化ファイバー結合広帯域光源、広帯域連続スペクトルLED、超高輝度発光ダイオード、半導体発光ダイオード、広域スペクトルLED白色光源、マルチLED統合白色光源、それらの組合せ)により照明されうるか、または特定の波長もしくは狭い波長範囲で発光する1つ以上の狭帯域光源(たとえば、以上に記載したように、狭波長LED、レーザーダイオード、または1つ以上の光学バンドパスフィルタ、回折グレーティング、モノクロメーターと組み合わされた広帯域光源、それらの組合せ)により照明されうる。
サンプルチャンバの寸法および位置に依存して、蛍光アッセイ用の入射照明の角度は、サンプルチャンバの平面に対して30°〜60°、たとえば35°〜55°、たとえば40°〜50°の範囲内でさまざまでありうるとともに、さらには、サンプルチャンバの平面に対して45°でサンプルチャンバを照明しうる。
2つ以上の光源を利用する場合、サンプルは、光源により同時にもしくは逐次的にまたはそれらの組合せで照明されうる。2つ以上の光源によりサンプルを逐次的に照明する場合、各光源により照明する時間は、独立して、0.001秒間以上、たとえば0.01秒間以上、たとえば0.1秒間以上、たとえば1秒間以上、たとえば5秒間以上、たとえば10秒間以上、たとえば30秒間以上、さらには60秒間以上でありうる。2つ以上の光源によりサンプルを逐次的に照明する実施形態では、各光源によりサンプルが照明される持続時間は、同一であっても異なっていてもよい。各光源による照明間の時間はまた、必要に応じて、1秒間以上、たとえば5秒間以上、たとえば10秒間以上、たとえば15秒間以上、たとえば30秒間以上、さらには60秒間以上の遅延で独立して分離されてさまざまでありうる。
アッセイされる特定のアナライトさらには利用される試薬および蛍光マーカーに依存して、サンプルの照明は、連続的または離散間隔でありうる。たとえば、いくつかの実施形態では、サンプルは、サンプルがアッセイされる全時間にわたり連続的に照明されうる。他の実施形態では、サンプルは、たとえば、0.001マイクロ秒ごと、0.01マイクロ秒ごと、0.1マイクロ秒ごと、1マイクロ秒ごと、10マイクロ秒ごと、100マイクロ秒ごと、さらには1000マイクロ秒ごとにサンプルを照明するなど、規則的間隔で照明されうる。サンプルは、任意の所与の測定時間で1回またはそれ以上、たとえば2回以上、たとえば3回以上、さらには各測定時間で5回以上、光源により照明されうる。
蛍光アッセイ時、サンプルは、300nm〜900nm、たとえば325nm〜875nm、たとえば350nm〜850nm、たとえば375nm〜825nm、さらには400nm〜800nmの範囲内、またはなんらかの他の範囲内の波長を有する広帯域光源で照明されうる。他の実施形態では、サンプルは、特定の波長または狭域の特定の波長の光により(たとえば、狭帯域ランプまたはLEDにより)照明される。たとえば、サンプルは、蛍光を得るために、狭帯域光源により、または450nm〜700nmの範囲内、たとえば、480nm、565nm、および650nmの光を発する1つ以上の単色LEDにより、照明されてもよい。
主題の蛍光アッセイが以上に記載の吸収アッセイの方法と組み合わされる場合、サンプルからの発光光は、以上に記載したのと同様に、捕集され、成分波長に空間分離されて検出されうる。以下に詳細に記載されるように、蛍光検出システムおよび吸光度検出システムでは、本明細書に記載の1つ以上の共通のコンポーネントが利用される。たとえば、いくつかの場合には、蛍光アッセイおよび吸光度アッセイの両方で、サンプルチャンバからの光(たとえば、発光光または透過光)を捕集して集束させるために共通の対物レンズモジュールが利用される。他の場合には、蛍光アッセイおよび吸光度アッセイの両方で、捕集された光を成分波長に空間分離するために共通の波長分離プロトコル(たとえば、回折グレーティング、光学フィルタ、1つ以上の回折グレーティングおよび光学フィルタを有するフィルタホイール)が利用される。さらに他の場合には、蛍光アッセイおよび吸光度アッセイの両方で、サンプルチャンバから光(たとえば、発光光または透過光)を測定するために同一の検出プロトコルが利用される。
ある特定の実施形態では、主題の蛍光アッセイは、たとえば、米国特許第8,248,597号明細書、同第7,927,561号明細書、および同第7,738,094号明細書に記載されるように、さらには2012年8月20日出願の同時係属米国特許出願第13/590,114号明細書に記載されるように(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)、キャピラリーチャネル中のサンプルを画像化する方法を含みうる。
ある特定の実施形態では、主題の方法は、ヘモグロビンの吸光度アッセイを提供する。以上で考察したように、ヘモグロビンは、任意のタイプの診断サンプル、たとえば、上清、ライセート、緩衝溶液、さらには全血を含む生物学的サンプル中に存在しうる。以上に記載の方法によれば、一定量のサンプルがサンプルチャンバ中に負荷され、1つ以上の光源によりスリット投影モジュールを介して照明され、サンプルチャンバ中の全血サンプルを透過した光が捕集され、および検出用の成分波長に空間分離される。全血サンプルのサイズに依存して、サンプルチャンバはマイクロ流体キャピラリーチャネルサンプルチャンバでありうる。1つ以上の波長の透過光からヘモグロビン吸光度を決定可能であるか、または他の選択肢としてヘモグロビン吸収の全スペクトルを計算しうる。主題の方法のこれらの実施形態では、1つ以上の波長の吸光度に基づいて全血サンプル中のヘモグロビン濃度を決定可能である。
ある他の特定の実施形態では、主題の方法は、試薬フリーのヘモグロビン吸光度アッセイを提供する。「試薬フリー」とは、相互作用する試薬またはサンプル中のヘモグロビンを可視化するために使用される試薬をヘモグロビンのアッセイで利用しないことを意味する。したがって、ヘモグロビン(オキシヘモグロビンおよびカルボキシヘモグロビンなどの誘導体を含む)は、試薬修飾を用いることなくその天然の状態でアッセイされる。これらの例では、改変されていない全血サンプルがサンプルチャンバ中に負荷され、スリット投影モジュールを介して1つ以上の光源により照明され、サンプルチャンバ中の全血サンプルを透過した光が捕集され、および検出用の成分波長に空間分離される。全血サンプルのサイズに依存して、サンプルチャンバはマイクロ流体キャピラリーチャネルサンプルチャンバでありうる。1つ以上の波長でヘモグロビン吸光度を検出可能であるか、または他の選択肢としてヘモグロビン吸収の全スペクトルを計算しうる。主題の方法のこれらの実施形態では、1つ以上の波長の吸光度に基づいて改変されていない全血サンプル中のヘモグロビン濃度を決定可能である。
ある他の特定の実施形態では、主題の方法は、たとえば細胞表面マーカーなどの1種以上の追加のアナライトに関してもアッセイされるサンプルでヘモグロビン吸光度アッセイを提供する。これらの実施形態では、特異的結合性メンバー、酵素、基質、酸化剤、さらには1種以上の蛍光マーカーと組み合わされた結合性分子をはじめとする1種以上の試薬を全血に接触させ、試薬混合全血サンプルをサンプルチャンバに負荷する。負荷されたサンプルチャンバ(たとえば、マイクロ流体キャピラリーチャネルサンプルチャンバ)は、スリット投影モジュールを介して1つ以上の光源により照明され、サンプルチャンバ中の全血サンプルを透過した光は捕集され、および検出用の成分波長に空間分離される。1つ以上の波長でヘモグロビン吸光度を検出可能であるか、または他の選択肢としてヘモグロビン吸収の全スペクトルを計算しうる。主題の方法のこれらの実施形態では、1つ以上の波長の吸光度に基づいて試薬混合全血サンプル中のヘモグロビン濃度を決定可能である。試薬混合サンプル中のヘモグロビンのアッセイと組み合わせて、1種以上の追加のアナライトをアッセイしうる。いくつかの場合には、主題の方法は、全血サンプル中に混合された1種以上の試薬に結合する1種以上の細胞表面マーカーをアッセイするためにヘモグロビン吸光度アッセイと組み合わせて行われる蛍光アッセイを提供する。これらの例では、試薬混合全血サンプルが負荷されたサンプルチャンバが蛍光光源により照明され、標的アナライトに結合された蛍光タグからの蛍光発光が捕集され、および検出のために空間分離される。
ある他の特定の実施形態では、主題の方法は、CD4および%CD4に関しても蛍光アッセイされるサンプルでヘモグロビン吸光度アッセイを提供する。これらの例では、全血サンプルは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバを有するマイクロ流体カートリッジのサンプル適用部位に適用される。適用されたサンプルは、マイクロ流体キャピラリーチャネルの入口を介して、試薬混合物と全血サンプルとを接触させるための多孔性ディスクを有する試薬混合チャンバ中に移送される。これらの例では、試薬混合物は、乾燥貯蔵安定性試薬CD4−PECy5、CD3−APC、CD45RA−APC、およびCD14−PEを含む。試薬混合全血サンプルは、毛管作用によりサンプルチャンバ中に移送され、サンプルチャンバは、サンプルチャンバを横切るように側方移動されるスリット投影モジュールを介して広帯域白色光LEDと近赤外LEDの2つの光源によりヘモグロビンアッセイのために照明される。サンプルチャンバを透過した光は、対物拡大レンズにより捕集され、および透過光がCCD検出器の表面上に空間分離されるように回折グレーティング上に自動集束される。2つの波長548nmおよび675nmの吸光度が決定され、ヘモグロビンをアッセイするために散乱を補正した全ヘモグロビン吸光度が計算される。
キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中の試薬混合全血サンプルはまた、試薬混合物中の蛍光タグによる蛍光を検出することによりCD4に関してもアッセイされる。CD4は、キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中の試薬混合全血サンプルを光源により照明することによりアッセイされうるとともに、試薬混合全血サンプル中の蛍光タグからの発光は、共通の対物拡大レンズにより捕集され、およびCDD検出器の表面上に自動集束される。次いで、蛍光画像サイトメトリーによりCD4細胞計数が行われる。
ある特定の実施形態では、本方法の態様は、サンプル適用部位と、サンプル適用部位からサンプルを入力するための入口と、サンプルと1種以上の試薬とを接触させるための試薬接触チャンバと、試薬接触チャンバに流体連通するキャピラリーサンプルチャンバとを有して液体サンプルのアッセイを行うように構成されたマイクロ流体デバイスにサンプルを適用する工程を含む。
いくつかの実施形態では、サンプルは、マイクロ流体デバイスの適用部位に適用され、入口を貫流して試薬接触チャンバに流入し、続いて、以上に記載されるようにキャピラリーサンプルチャンバ中で精査するために十分なサンプルが提供されるようにキャピラリーサンプルチャンバを貫流する。
ある特定の場合には、方法は、マイクロ流体デバイスのサンプル接触サンプル適用部位を提供する工程を含む。「サンプル接触サンプル適用部位」とは、サンプルに接触されたサンプル適用部位を意味する。本開示の方法を実施する場合には、サンプル接触適用部位は、サンプルをマイクロ流体デバイスのサンプル適用部位に適用することにより提供される。サンプル適用部位に適用されるサンプルの量は、サンプルチャンバを介する所望のキャピラリーフローおよび本明細書に記載の主題の方法による精査に適したサンプルを提供するために十分であるかぎり、さまざまでありうる。たとえば、適用部位に適用されるサンプルの量、0.01μL〜1000μL、たとえば0.05μL〜900μL、たとえば0.1μL〜800μL、たとえば0.5μL〜700μL、たとえば1μL〜600μL、たとえば2.5μL〜500μL、たとえば5μL〜400μL、たとえば7.5μL〜300μL、さらにはサンプル10μL〜200μLの範囲内でありうる。
サンプルは、任意の好都合なプロトコルを用いて、たとえば、ドロッパー、ピペット、シリンジなどを介してサンプル適用部位に適用されうる。サンプルは、適正な流体フローを提供するように、一定量の好適な液体たとえば緩衝液と組み合わせて適用されうるか、またはその中に組み込まれうる。任意の好適な液体、たとえば、限定されるものではないが、緩衝剤、細胞培養培地(たとえば、DMEM)などを利用しうる。緩衝剤としては、トリス、トリシン、MOPS、HEPES、PIPES、MES、PBS、TBSなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。必要に応じて、界面活性剤、たとえば、NP−40、TWEEN(登録商標)、またはTritonX100の界面活性剤が液体中に存在しうる。
ある特定の実施形態では、サンプル接触サンプル適用部位は、アッセイ成分を有するサンプルをサンプル適用部位に適用する前にサンプルと1種以上のアッセイ成分(たとえば、試薬、緩衝剤など)とを組み合わせることにより提供される。アッセイ成分を有するサンプルをサンプル適用部位に適用する前にサンプルと1種以上のアッセイ成分とを組み合わせる場合、組合せは、任意の好都合なプロトコルを用いて達成されうる。アッセイ成分の量は、サンプルと組み合わせる場合、必要に応じてさまざまでありうる。いくつかの実施形態では、サンプル接触サンプル適用部位は、サンプルをサンプル適用部位に適用する前に1種以上のアッセイ成分をサンプル受容適用部位に適用することにより提供される。いくつかの実施形態では、サンプル接触サンプル適用部位は、1種以上のアッセイ成分をサンプル適用部位に適用する前にサンプルをサンプル適用部位に適用することにより提供される。上述したように、いくつかの実施形態では、デバイスは1種以上のアッセイ成分(たとえば試薬)を含む。そのような場合には、サンプル接触サンプル適用部位は、たとえば、1種以上のアッセイ成分との事前の組合せを行うことなく、サンプルをサンプル適用部位に適用することにより提供される。
サンプル適用後、サンプルは、キャピラリーサンプルチャンバを貫流し、次いで、サンプル中の標的アナライトをアッセイするために、全チャネルを含めて、チャネルの1つ以上の部分、たとえば、検出領域が精査される。標的アナライトおよび1種以上の試薬の存在に依存して、サンプルは、サンプル適用直後またはサンプル適用から所定の時間後、たとえば10秒後〜1時間後、たとえば30秒後〜30分後、たとえば30秒後〜10分後、さらには30秒後〜1分後の範囲内の時間で精査されうる。
好適な方法の一例および主題の方法による精査に供されるサンプルを調製するためのマイクロ流体デバイスとしては、2014年1月10日出願の同時係属米国特許出願第14/152,954号明細書(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のものが挙げられうるが、これらに限定されるものではない。
アナライトに関してサンプルをアッセイするためのシステム
本開示の態様は、主題の方法を実施するためのシステムをさらに含む。いくつかの実施形態では、光源と、スリット投影モジュール(たとえば、光ビームを狭くするためのスリットまたは狭光を集束させるフォーカスレンズと組み合わされたスリット)と、1つ以上の波長の透過光を検出するための検出器とを含むシステムが提供される。ある特定の実施形態では、システムは、主題のシステムを用いたアッセイに供されるサンプルを調製および提供するためのマイクロ流体デバイスをさらに含む。
以上に概説したように、本開示の態様は、1種以上のアナライトに関してサンプルをアッセイする工程を含む。システムは、対象のサンプルを含有するサンプルチャンバを精査するための1つ以上の光源を含む。いくつかの実施形態では、光源は、広い波長範囲、たとえば50nm以上、たとえば100nm以上、たとえば150nm以上、たとえば200nm以上、たとえば250nm以上、たとえば300nm以上、たとえば350nm以上、たとえば400nm以上をカバーする波長範囲、さらには500nm以上をカバーする波長範囲を有する光を発する広帯域光源である。たとえば、1つの好適な広帯域光源は、400nm〜800nmの波長を有する光を発する。好適な広帯域光源の他の例は、500nm〜700nmの波長を有する光を発する光源を含む。任意の好都合な広帯域光源プロトコル、たとえば、広帯域光源の中でも特に、ハロゲンランプ、ジュウテリウムアークランプ、キセノンアークランプ、安定化ファイバー結合広帯域光源、広帯域連続スペクトルLED、超高輝度発光ダイオード、半導体発光ダイオード、広域スペクトルLED白色光源、マルチLED統合白色光源、またはそれらの任意の組合せを利用しうる。
他の実施形態では、光源は、特定の波長または狭い波長範囲の光を発する狭帯域光源である。いくつかの場合には、狭帯域光源は、狭い波長範囲、たとえば50nm以下、たとえば40nm以下、たとえば30nm以下、たとえば25nm以下、たとえば20nm以下、たとえば15nm以下、たとえば10nm以下、たとえば5nm以下、たとえば2nm以下の波長範囲を有する光を発し、さらには光源は、特定の波長の光(すなわち、単色光)を発する。任意の好都合な狭帯域光源プロトコル、たとえば、狭波長LED、レーザーダイオード、または1つ以上の光学バンドパスフィルタ、回折グレーティング、モノクロメーター、もしくはそれらの任意の組合せに結合された広帯域光源を利用しうる。
主題のシステムは、必要に応じて、1つ以上の光源、たとえば2つ以上の光源、たとえば3つ以上の光源、たとえば4以上の光源、たとえば5種以上の光源、さらには10以上の光源を含みうる。光源は、いくつかのタイプの光源の組合せを含みうる。たとえば、2つの光源を利用する場合、第1の光源は広帯域白色光源(たとえば、広帯域白色光LED)でありうるとともに、第2の光源は広帯域近赤外光源(たとえば、広帯域近IR LED)でありうる。他の場合には、2つの光源を利用する場合、第1の光源が広帯域白色光源(たとえば、広帯域白色光LED)でありうるとともに、第2の光源は狭域スペクトル光源(たとえば、狭帯域可視LEDまたは近IR LED)でありうる。さらに他の場合には、光源は、それぞれ特定の波長を発光する複数の狭帯域光源、たとえば一連の2つ以上のLED、たとえば一連の3つ以上のLED、たとえば一連の5つ以上のLED、さらには一連の10以上のLEDである。
いくつかの実施形態では、光源は、400nm〜900nm、たとえば450nm〜850nm、たとえば500nm〜800nm、たとえば550nm〜750nm、さらには600nm〜700nmの範囲内の波長を有して光を発する。たとえば、光源は、400nm〜900nmの波長を有する光を発する広帯域光源を含みうる。他の場合には、光源は、400nm〜900nmの範囲内の波長を発する複数の狭帯域光源を含む。たとえば、光源は、一定の波長範囲400nm〜900nmを有する光をそれぞれ独立して発する複数の狭帯域LED(1nm〜25nm)でありうる。
ある特定の実施形態では、システムは、全体として400nm〜900nmの範囲内の波長を有する光を発するように構成された2つの広帯域光源を含む。たとえば、光源は、400nm〜700nmの範囲内の波長を有する光を発する白色光LEDおよび700nm〜900nmの範囲内の波長を有する光を発する近赤外LEDでありうる。いくつかの実施形態では、各光源の照射プロファイルは、任意の数の発光ピークを有してさまざまでありうる。ある特定の場合には、光源は、400nm〜700nmの範囲内の波長を有する光を発しかつ約450nmおよび550nmに発光ピークを有する白色光LEDならびに700nm〜900nmの範囲内の波長を有する光を発しかつ約830nmに発光ピークを有する近赤外LEDを含む。
他の実施形態では、光源は、400nm〜900nmの範囲内の特定の波長の光をそれぞれ独立して発する複数の狭帯域ランプまたはLEDである。一例では、狭帯域光源は、500nm〜700nmの範囲内、たとえば、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、586nm、またはそれらの任意の組合せの光を発する1つ以上の単色LEDである。他の例では、狭帯域光源は、400nm〜900nmの範囲内の波長の光を発するLEDのアレイである。他の例では、狭帯域光源は、500nm〜700nmの範囲内の光を発する1つ以上の狭帯域ランプ、たとえば、狭帯域カドミウムランプ、セシウムランプ、ヘリウムランプ、水銀ランプ、水銀−カドミウムランプ、カリウムランプ、ナトリウムランプ、ネオンランプ、亜鉛ランプ、またはそれらの任意の組合せである。
以上に概説したように、システムは、光ビームを狭くしかつスリットの形状でサンプルチャンバ上に投影される光ビームを生成するように構成されたスリット投影モジュールを含む。いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールはスリットを含む。他の実施形態では、スリット投影モジュールは、狭いスリット状光ビームをサンプルチャンバに集束させるように構成されたフォーカスレンズと組み合わせてスリットを含む。
いくつかの実施形態では、本開示のシステムは、サンプルチャンバもしくはスリット投影モジュールの一方、または、サンプルチャンバおよびスリット投影モジュールの両方を移動させてサンプルチャンバを横切るようにスリット状光ビームを変位させるべく構成される。サンプルチャンバを横切るスリット状光ビームの移動が望まれる場合には、いくつかの実施形態では、システムは、スリット投影モジュールを静止位置に維持した状態でサンプルチャンバを移動させるように構成される。他の実施形態では、システムは、スリット投影を移動させかつサンプルチャンバを静置状態に維持するように構成される。さらに他の実施形態では、システムは、スリット投影モジュールおよびサンプルチャンバの両方を移動させるように構成される。たとえば、機械的デバイスを用いて手動により(すなわち、サンプルチャンバもしくはスリット投影モジュールを手で直接移動させる)またはモータ作動変位デバイスにより、サンプルチャンバを横切るようにスリット状光ビームを移動させるために、任意の変位プロトコルを主題のシステムで利用しうる。たとえば、いくつかの実施形態では、機械的作動並進ステージ、機械的リードスクリューアセンブリ、機械的スライドデバイス、機械的側方移動デバイス、機械的操作ギア付き並進デバイスにより、サンプルチャンバを主題のシステムで移動させる。他の実施形態では、モータ作動並進ステージ、リードスクリュー並進アセンブリ、ギア付き並進デバイス、たとえば、モータタイプの中でもとく、ステッパーモータ、サーボモータ、ブラシレス電気モータ、ブラシ付きDCモータ、マイクロステップ駆動モータ、高分解能ステッパーモータを利用したものにより、サンプルチャンバを移動させる。ある特定の場合には、サンプルチャンバは、並進デバイスまたは変位デバイスに機能可能にまたは機械的に接続されたカートリッジホルダー内に収容される。これらの例では、サンプルチャンバ(またはサンプルチャンバを含有するマイクロカートリッジ)を最初にカートリッジハウジングにロードし、主題の方法時に全ハウジングを変位させる。
同様に、ある特定の場合には、機械的作動並進ステージ、機械的リードスクリューアセンブリ、機械的スライドデバイス、機械的側方移動デバイス、機械的操作ギア付き並進デバイスにより、スリット投影モジュールを主題のシステムで移動させる。他の実施形態では、モータ作動並進ステージ、リードスクリュー並進アセンブリ、ギア付き並進デバイス、たとえば、モータタイプの中でも、ステッパーモータ、サーボモータ、ブラシレス電気モータ、ブラシ付きDCモータ、マイクロステップ駆動モータ、高分解能ステッパーモータを利用したものにより、スリット投影モジュールを移動させる。
いくつかの実施形態では、システムは、静止スリット投影モジュールに対してサンプルチャンバを移動させてサンプルの精査時に単一方向にサンプルチャンバを横切るようにスリット状ビームを側方変位させるべく構成される。他の実施形態では、システムは、静止スリット投影モジュールに対してサンプルチャンバを移動させてサンプルの精査時に前進後退運動によりサンプルチャンバを横切るようにスリット状ビームを側方変位させるべく構成される。たとえば、スリット状ビームがサンプルチャンバの50%以上、たとえば55%以上、たとえば60%以上、たとえば65%以上、たとえば70%以上、たとえば75%以上、たとえば80%以上、たとえば85%以上、たとえば90%以上、たとえば95%以上、たとえば97%以上に沿って、さらにはサンプルチャンバの長さの99%以上に沿って移動するようにサンプルチャンバを移動させうる。ある特定の場合には、スリット状ビームが実質的にサンプルチャンバの全長に沿って移動するようにサンプルチャンバを移動させる。
他の実施形態では、システムは、静止サンプルチャンバに対してスリット投影モジュールを移動させてサンプルの精査時に単一方向にサンプルチャンバを横切るようにスリット状ビームを側方変位させるべく構成される。他の実施形態では、システムは、静止サンプルチャンバに対してスリット投影モジュールを移動させてサンプルの精査時に前進後退運動によりサンプルチャンバを横切るようにスリット状ビームを側方変位させるべく構成される。たとえば、スリット状ビームがサンプルチャンバの50%以上、たとえば55%以上、たとえば60%以上、たとえば65%以上、たとえば70%以上、たとえば75%以上、たとえば80%以上、たとえば85%以上、たとえば90%以上、たとえば95%以上、たとえば97%以上に沿って、さらにはサンプルチャンバの長さの99%以上に沿って移動するようにスリット投影モジュールを移動させうる。ある特定の場合には、スリット状ビームが実質的にサンプルチャンバの全長に沿って移動するようにスリット投影モジュールを移動させる。さらに他の実施形態では、システムは、スリット投影モジュールおよびサンプルチャンバの両方を移動させてサンプルの精査時に単一方向にサンプルチャンバを横切るようにスリット状ビームを側方変位させるべく構成される。他の実施形態では、システムは、静止スリット投影モジュールおよびサンプルチャンバの両方を移動させてサンプルの精査時に前進後退運動によりサンプルチャンバを横切るようにスリット状ビームを側方変位させるべく構成される。たとえば、スリット状ビームがサンプルチャンバの50%以上、たとえば55%以上、たとえば60%以上、たとえば65%以上、たとえば70%以上、たとえば75%以上、たとえば80%以上、たとえば85%以上、たとえば90%以上、たとえば95%以上、たとえば97%以上に沿って、さらにはサンプルチャンバの長さの99%以上に沿って移動するようにスリット投影モジュールおよびサンプルチャンバの両方を移動させうる。ある特定の場合には、スリット状ビームが実質的にサンプルチャンバの全長に沿って移動するようにスリット投影モジュールおよびサンプルチャンバの両方を移動させる。
スリットアパーチャーは、限定されるものではないが、卵形、矩形、または他の好適な多角形を含めて、任意の好都合な形状でありうる。ある特定の実施形態では、スリットアパーチャーは矩形である。サンプルチャンバのサイズおよび光源により提供されるスリット状ビームさらにはスリット投影モジュールと光源とサンプルチャンバと検出器との間の距離に依存して、スリットアパーチャーの寸法は、1mm〜10mm、たとえば1.25mm〜9.5mm、たとえば1.5mm〜9mm、たとえば2mm〜8mm、たとえば2.5mm〜7mm、たとえば3mm〜6mm、さらには3.5mm〜5mmの範囲内の長さを有してさまざまでありうる。スリットアパーチャーの幅は、1μm〜250μm、たとえば2μm〜225μm、たとえば5μm〜200μm、たとえば10μm〜150μm、さらには15μm〜125μmの範囲内でありうる。たとえば、スリットは100μmのアパーチャー幅を有する。サンプルチャンバの精査に所望のスリット状光ビームを提供するために十分であるかぎり、任意の好都合なスリットデバイスを利用しうる。たとえば、スリットは、金、銀、金メッキ銅、セラミック、クロム、銅、モリブデン、およびタングステンでありうる。
いくつかの場合には、スリット投影モジュールはまた、光学調整プロトコルを含む。「光学調整」とは、必要に応じて、たとえば、寸法を増加もしくは減少させるようにまたはスリット状ビームの光学分解能を向上させるように、スリットの形状の光ビームを変化させうることを意味する。いくつかの場合には、光学調整は、スリットの幅をたとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば25%以上、たとえば50%以上増加させるように、さらにはスリット状ビームの幅を75%以上増加させるように構成された拡大プロトコルである。他の場合には、光学調整は、スリットの幅をたとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば25%以上、たとえば50%以上減少させるように、さらにはスリット状ビームの幅を75%以上減少させるように構成された縮小プロトコルである。ある特定の実施形態では、光学調整は、スリット状ビームの分解能をたとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば25%以上、たとえば50%以上向上させるように、さらにはスリット状ビームの分解能を75%以上向上させるように構成された分解能向上プロトコルである。スリット状ビームは、限定されるものではないが、レンズ、ミラー、ピンホール、スリット、およびそれらの組合せを含む任意の好都合な光学調整プロトコルにより調整されうる。
ある特定の実施形態では、スリット投影モジュールはまた、狭いスリット状光ビームを集束させるように構成されたフォーカスレンズをスリットと組み合わせて含みうる。いくつかの実施形態では、フォーカスレンズは、0.1〜0.95の範囲内の倍率、たとえば0.2〜0.9の倍率、たとえば0.3〜0.85の倍率、たとえば0.35〜0.8の倍率、たとえば0.5〜0.75の倍率、さらには0.55〜0.7の倍率、たとえば0.6の倍率を有する縮小レンズである。たとえば、フォーカスレンズは、ある特定の場合には、約0.6の倍率を有する二重色消し縮小レンズである。スリット投影モジュールと光源とサンプルチャンバと検出器と間の距離さらにはサンプルチャンバのサイズおよびスリット状ビームの所望のサイズに依存して、フォーカスレンズの焦点距離は、5mm〜20mm、たとえば6mm〜19mm、たとえば7mm〜18mm、たとえば8mm〜17mm、たとえば9mm〜16mm、さらには10mm〜15mmの焦点距離の範囲内でさまざまでありうる。ある特定の実施形態では、フォーカスレンズは約13mmの焦点距離を有する。
いくつかの実施形態では、スリットおよびフォーカスレンズは、光伝送状態であるが、物理的接触状態ではない。サンプルチャンバのサイズさらにはサンプルチャンバ上に投影されるスリット状ビームの所望の形状およびサイズに依存して、スリットは、フォーカスレンズからさまざまな距離に位置決めされうるとともに、この距離は、0.1mm以上、たとえば0.2mm以上、たとえば0.5mm以上、たとえば1mm以上、たとえば5mm以上、たとえば10mm以上、たとえば25mm以上、たとえば50mm以上、さらには100mm以上でありうる。他の実施形態では、スリットは、接着剤などによりフォーカスレンズに物理的に結合されるか、一体的に共成形されるか、またはスリットに近接して位置決めされたフォーカスレンズを有するハウジング内に一体的に統合される。したがって、スリットおよびフォーカスレンズは、単一ユニットに統合されうる。
以上に記載したように、スリット投影モジュールは、さまざまな長さおよび幅を有するスリット状ビームを提供するように構成される。いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールは、1mm〜5mm、たとえば1.5mm〜4.5mm、たとえば2mm〜4mm、たとえば2.5mm〜3.5mmの範囲内の長さを有するスリット状ビーム、さらには3mmの長さを有するスリット状ビームを提供するように構成される。これらの実施形態では、スリット投影モジュールは、10μm〜100μm、たとえば15μm〜95μm、たとえば20μm〜90μm、たとえば25μm〜85μm、たとえば30μm〜80μm、たとえば35μm〜75μm、たとえば40μm〜70μm、たとえば45μm〜65μm、さらには50μm〜60μmの範囲内の幅を有するスリット状ビームを提供するように構成される。
以上に記載したように、いくつかの実施形態では、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの長さに直交する長さを有するスリット状ビームを提供するように構成される。以下に記載されるように、サンプルチャンバのサイズに依存して、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅の50%以上、たとえば55%以上、たとえば60%以上、たとえば65%以上、たとえば70%以上、たとえば75%以上、たとえば80%以上、たとえば85%以上、たとえば90%以上、たとえば95%以上、たとえば97%以上の長さを有するスリット状ビームを提供するように構成されうるとともに、さらには、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅の99%以上の長さを有するスリット状ビームを提供するように構成されうる。ある特定の場合には、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅と実質的に同一の長さを有するスリット状ビームを提供するように構成される。他の実施形態では、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも長い長さを有するスリット状ビーム投影を提供するように構成される。たとえば、スリット投影モジュールは、ある特定の場合には、サンプルチャンバの幅よりも1%以上、たとえば2%以上、たとえば5%以上、たとえば10%以上、たとえば15%以上、たとえば20%以上長い長さ、さらにはサンプルチャンバの幅よりも25%長い長さを有するスリット状光ビームを提供するように構成される。さらに他の場合には、スリット投影モジュールは、サンプルチャンバの幅よりも短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも1%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも2%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも5%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも10%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも15%以上短い長さ、たとえばサンプルチャンバの幅よりも20%以上短い長さ、さらにはサンプルチャンバの幅よりも25%以上短い長さを有するスリット状光ビームを提供するように構成される。
より詳細に以下に考察されるように、ある特定の実施形態では、主題のシステムは、キャピラリーサンプルチャンバを有するマイクロ流体カートリッジデバイスを受容するように構成される。これらの実施形態では、システムはまた、システム中にカートリッジを受容するためのカートリッジホルダーを含みうる。たとえば、カートリッジホルダーは、マイクロ流体カートリッジデバイスを受容するための支持体と、カートリッジホルダー内にマイクロ流体カートリッジデバイスを保持するための1つ以上のカートリッジリテーナーとを含みうる。いくつかの場合には、カートリッジホルダーは、カートリッジホルダー内に位置決めされたマイクロ流体カートリッジデバイスの撹拌を低減するための振動ダンパーと、さらにはマイクロ流体カートリッジデバイスがカートリッジホルダー内に存在することを示すように構成された1つ以上のカートリッジ存在フラグとを含む。
主題のシステムが精査時にサンプルチャンバを移動させるように構成される場合(以上で考察)、システムはまた、マイクロ流体カートリッジデバイスを移動させるためにカートリッジホルダーと組み合わされたカートリッジシャトルを含みうる。いくつかの実施形態では、カートリッジシャトルは、マイクロ流体カートリッジデバイスを移動させるために1つ以上の並進移動または側方移動プロトコルに結合される。たとえば、カートリッジシャトルは、機械的作動並進ステージ、機械的リードスクリューアセンブリ、機械的スライドデバイス、機械的側方移動デバイス、機械的操作ギア付き並進デバイス、モータ作動並進ステージ、リードスクリュー並進アセンブリ、ギア付き並進デバイス、たとえば、モータタイプの中でもとく、ステッパーモータ、サーボモータ、ブラシレス電気モータ、ブラシ付きDCモータ、マイクロステップ駆動モータ、高分解能ステッパーモータを利用したものに結合されうる。システムはまた、カートリッジホルダーの側方移動を容易にするためにカートリッジシャトルを位置決めするための一群のレールを含みうる。
いくつかの実施形態では、システムは、アナライト濃度の計算に使用されるブランク吸光度を提供するためにブランク参照ウィンドウをさらに含む。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法を実施した時のマイクロ流体カートリッジによる吸収、散乱などをブランク参照ウィンドウを介する透過により補正できるように、ブランク参照ウィンドウによる吸光度をサンプルチャンバによる吸光度と同一にすべく構成される。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、入射光の1つ以上の波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の吸光度および透過率を有する。他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1つ以上の波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の光を散乱する。さらに他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1つ以上の入射波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の吸光度、透過率を有し、かつ実質的に同一の光を散乱する。さらに他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の屈折率を有する。
主題のシステムに統合されるブランク参照ウィンドウは、任意の好都合なサイズおよび形状でありうる。たとえば、ブランク参照ウィンドウは、正方形、円形、卵形、矩形、五角形、六角形、八角形、または任意の他の好適な多角形の形態でありうる。いくつかの実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1〜50、たとえば3〜25、たとえば4〜10、たとえば5〜8、さらには15〜20の範囲内の長さ対幅の比を有する。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは正方形であり、長さ対幅の比は1である。ブランク参照ウィンドウの長さは、1mm〜50mm、たとえば2mm〜25mm、さらには5mm〜20mmの範囲内でさまざまでありうる。ブランク参照ウィンドウの幅は、0.001mm〜20mm、たとえば0.005mm〜19mm、たとえば0.01mm〜18mm、たとえば0.05mm〜17mm、たとえば0.1mm〜15mm、たとえば0.5mm〜12.5mm、たとえば1mm〜10mm、さらには3mm〜5mmの範囲内でさまざまでありうる。いくつかの場合には、チャネルの高さは、5μm〜500μm、たとえば10μm〜150μm、さらには20μm〜70μmの範囲内である。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバの幅と実質的に同一の幅を有する。以上に記載したように、サンプルチャンバを透過したスリット状光ビームは、捕集され、1つ以上のフォトディテクターを用いて検出される。ある特定の実施形態では、システムは、サンプルチャンバを透過した光を捕集するために1つ以上の対物レンズを含む。たとえば、対物レンズは、1.2〜2.5の範囲内の公称倍率、たとえば1.3〜2.4の公称倍率、たとえば1.4〜2.3の公称倍率、たとえば1.5〜2.2の公称倍率、たとえば1.6〜2.1の公称倍率を有する拡大レンズでありうるとともに、さらには1.7〜2.0の公称倍率、たとえば1.7の公称倍率を有する拡大レンズを介して透過光を通過させうる。ある特定の場合には、対物レンズは、1.7の公称倍率を有する拡大色消し二重レンズである。光源、サンプルチャンバ、および検出器の構成に依存して、対物レンズの性質はさまざまでありうる。たとえば、主題の対物レンズの開口数はまた、0.01〜1.7、たとえば0.05〜1.6、たとえば0.1〜1.5、たとえば0.2〜1.4、たとえば0.3〜1.3、たとえば0.4〜1.2、たとえば0.5〜1.1の範囲内でさまざまでありうるとともに、さらには開口数は0.6〜1.0の範囲内でありうる。同様に、対物レンズの焦点距離は、10mm〜20mm、たとえば10.5mm〜19mm、たとえば11mm〜18mm、さらには12mm〜15mmの範囲内でさまざまでありうる。
いくつかの実施形態では、対物レンズは、サンプルチャンバを透過したスリット状ビーム投影を検出用の検出器上に集束させるためにオートフォーカスモジュールに結合される。たとえば、サンプルチャンバを透過したスリット状ビーム投影を集束させるために好適なオートフォーカスモジュールとしては、限定されるものではないが、1999年10月29日出願の米国特許第6,441,894号明細書(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のものが挙げられうる。
本開示のシステムはまた、1つ以上の波長セパレータを含みうる。以上で考察したように、「波長セパレータ」は、各波長が好適に検出されうるように多色光を成分波長に分離するように構成される。主題のシステム内の好適な波長セパレータの例としては、限定されるものではないが、波長分離プロトコルの中でも特に、着色ガラス、バンドパスフィルタ、干渉フィルタ、ダイクロイックミラー、回折グレーティング、モノクロメーター、およびそれらの組合せが挙げられうる。光源およびアッセイされるサンプルに依存して、システムは、1つ以上、たとえば2つ以上、たとえば3つ以上、たとえば4つ以上、たとえば5つ以上の波長セパレータ、さらには10以上の波長セパレータを含みうる。一例では、システムは、2つ以上のバンドパスフィルタを含む。他の例では、システムは、2つ以上のバンドパスフィルタおよび回折グレーティングを含む。さらに他の例では、システムは、複数のバンドパスフィルタおよびモノクロメーターを含む。ある特定の実施形態では、システムは、フィルタホイール機構中に構成された複数のバンドパスフィルタおよび回折グレーティングを含む。システムが2つ以上の波長セパレータを含む場合、波長セパレータは、多色光を成分波長に分離するために個別にまたは直列に利用されうる。いくつかの実施形態では、波長セパレータは直列に配置される。他の実施形態では、波長セパレータは、波長セパレータのそれぞれを用いて所望の吸光度データを収集するために1回以上の測定を行うように個別に配置される。
いくつかの実施形態では、システムは1つ以上の回折グレーティングを含む。対象の回折グレーティングとしては、透過型、分散型、または反射型の回折グレーティングが挙げられうるが、これらに限定されるものではない。回折グレーティングの好適な間隔は、光源、スリット投影モジュール、サンプルチャンバ、対物レンズの構成に依存して、0.01μm〜10μm、たとえば0.025μm〜7.5μm、たとえば0.5μm〜5μm、たとえば0.75μm〜4μm、たとえば1μm〜3.5μm、さらには1.5μm〜3.5μmの範囲内でさまざまでありうる。
いくつかの実施形態では、システムは1つ以上の光学フィルタを含む。ある特定の場合には、システムは、2nm〜100nmのたとえば3nm〜95nm、たとえば5nm〜95nm、たとえば10nm〜90nm、たとえば12nm〜85nm、たとえば15nm〜80nmの範囲内の最小帯域幅を有するバンドパスフィルタを含み、さらには20nm〜50nmの範囲内の最小帯域幅を有するバンドパスフィルタを含む。たとえば、システムは、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜520nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、またはそれらの任意の組合せの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを含みうる。
ある特定の場合には、システムは、500nm〜520nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを含む。他の場合には、システムは、540nm〜560nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを含む。さらに他の場合には、システムは、560nm〜590nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを含む。さらに他の場合には、システムは、500nm〜520nm、560nm〜590nm、および650nm〜750nmの範囲内の波長を選択的に通過させる1つ以上のバンドパスフィルタを含む。
本開示のシステムはまた、1つ以上の検出器を含む。好適な検出器の例としては、光学センサーまたは光検出器、たとえば、光検出器の中でも特に、アクティブピクセルセンサー(APS)、アバランシュフォトダイオード、イメージセンサー、電荷結合デバイス(CCD)、インテンシファイア付き電荷結合デバイス(ICCD)、発光ダイオード、フォトンカウンタ、ボロメーター、焦電検出器、フォトレジスタ、光起電力電池、フォトダイオード、光電子増倍管、フォトトランジスタ、量子ドット光伝導体、またはフォトダイオード、およびそれらの組合せが挙げられうるが、これらに限定されるものではない。ある特定の実施形態では、透過光は電荷結合デバイス(CCD)により測定される。透過光をCCDにより測定する場合、CCDのアクティブ検出表面積は、たとえば0.01cm2 〜10cm2 、たとえば0.05cm2 〜9cm2 、たとえば0.1cm2 〜8cm2 、たとえば0.5cm2 〜7cm2 、さらには1cm2 〜5cm2 で、さまざまでありうる。
本開示の実施形態では、対象の検出器は、1つ以上の波長で、たとえば2つ以上の波長で、たとえば5つ以上の異なる波長で、たとえば10以上の異なる波長で、たとえば25以上の異なる波長で、たとえば50以上の異なる波長で、たとえば100以上の異なる波長で、たとえば200以上の異なる波長で、たとえば300以上の異なる波長でサンプルチャンバを透過した光を測定するように、さらには400以上の異なる波長でサンプルチャンバを透過した光を測定するように、構成される。
いくつかの実施形態では、対象の検出器は、一定の波長範囲(たとえば、400nm〜800nm、495nm〜525nm、800nm〜835nmなど)にわたりサンプルチャンバを透過した光を測定するように構成される。たとえば、システムは、400nm〜800nm、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜700nm、500nm〜520nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、およびそれらの任意の組合せの波長範囲の1つ以上にわたりサンプルチャンバを透過した光を測定するように構成された1つ以上の検出器を含みうる。ある特定の場合には、検出器は、400nm〜800nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定するように構成される。他の場合には、検出器は、500nm〜520nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定するように構成される。他の場合には、検出器は、540nm〜560nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定するように構成される。さらに他の場合には、検出器は、560nm〜590nmおよび650nm〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定するように構成される。さらに他の場合には、検出器は、500nm〜520nm、560nm〜590nm、および650〜750nmの範囲内の波長にわたり透過光を測定するように構成される。
ある特定の実施形態では、対象の検出器は、一定の波長範囲にわたり光のスペクトルを収集するように構成される。たとえば、システムは、400nm〜800nm、498nm〜510nm、500nm〜600nm、500nm〜700nm、500nm〜520nm、540nm〜550nm、545nm〜555nm、550nm〜570nm、550nm〜580nm、560nm〜590nm、575nm〜595nm、580nm〜590nm、600nm〜700nm、600nm〜630nm、650nm〜750nm、750nm〜850nm、810nm〜830nm、815nm〜825nm、およびそれらの任意の組合せの波長範囲の1つ以上にわたり光のスペクトルを収集するように構成された1つ以上の検出器を含みうる。ある特定の場合には、検出器は、400nm〜800nmの範囲内の波長を有する光のスペクトルを収集するように構成される。他の場合には、検出器は、500nm〜700nmの範囲内の波長を有する光のスペクトルを収集するように構成される。
さらに他の実施形態では、対象の検出器は、1つ以上の特定の波長で光を測定するように構成される。たとえば、システムは、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、586nm、675nm、710nm、808nm、815nm、830nm、およびそれらの任意の組合せの1つ以上で光を測定するように構成された1つ以上の検出器を含みうる。ある特定の場合には、検出器は、548nmで光を測定するように構成される。他の場合には、検出器は、675nmで光を測定するように構成される。他の場合には、検出器は、830nmで光を測定するように構成される。さらに他の場合には、検出器は、548nmおよび675nmで光を測定するように構成される。さらに他の実施形態では、検出器は、548nm、675nm、および830nmで測定するように構成される。
いくつかの実施形態では、検出器は、光を連続的にまたは離散間隔で測定するように構成されうる。いくつかの場合には、対象の検出器は、光を連続的に測定するように構成される。他の場合には、対象の検出器は、離散間隔で測定を行うように、たとえば、0.001ミリ秒ごと、0.01ミリ秒ごと、0.1ミリ秒ごと、1ミリ秒ごと、10ミリ秒ごと、100ミリ秒ごと、さらには1000ミリ秒ごとまたはなんらかの他の間隔で光を測定するように、構成される。
主題のシステムの実施形態はまた、任意の所望の構成を提供するように必要に応じて1つ以上の光学コンポーネントを含みうる。たとえば、システムは、各コンポーネント(すなわち、光源、スリット投影モジュール、サンプルチャンバ、対物レンズ、波長セパレータ、および検出器)を「インライン」構成で有しうる。この場合、光源から発せられた光は、そのインライン経路からの実質的な進路変更を伴うことなく各コンポーネントを通って移動する。必要に応じて、異なる経路に沿うように光の進路を変えたりまたは光を検出用の個別のビームに分離したりするために、1つ以上のミラー、ビームスプリッター、または他のタイプの光進路変更コンポーネントを使用しうる。
図2aは、一実施形態に係る主題のシステムの側方構成図を示している。光源(201)は、光ビームを狭くしてスリット状ビームを生成するためのスリット(202a)と、スリット状ビームを集束および縮小するための対物レンズ(202b)とを含むスリット投影モジュールを介して1つ以上の波長を有する光を提供する。スリット状ビームがサンプルチャンバ(203)を照明すると、サンプル中のアナライトは光を吸収し、光の残りの部分は透過され、および光をその成分波長に空間分離する波長セパレータ(たとえば、回折グレーティング205)上に光を集束させるように構成された対物レンズ(204)により捕集される。次いで、空間分離された光は、検出器(たとえば206のCCD)により検出される。
図2bは、他の実施形態に係る主題のシステムの構成の上面図を示している。光源(207)は、スリット状ビームを提供するためにスリットと対物レンズとを含むスリット投影モジュール(208)を介して1つ以上の波長を有する光を提供する。スリット状ビームがサンプルチャンバ(209)を照明すると、サンプル中のアナライトは光を吸収し、光の残りの部分は透過され、対物レンズ(210)により捕集され、および光をその成分波長に空間分離する波長セパレータ(211)上に提供される。次いで、空間分離された光は、検出器(212)により検出される。
いくつかの実施形態では、システムは、光源、スリット投影モジュール、サンプルチャンバ、対物レンズ、波長セパレータ、および検出器の1つ以上をオフセット位置に有して構成される。「オフセット」とは、光源と検出器とを結ぶ中心光軸に沿っていない空間内の点にシステムコンポーネントの幾何学的中心が位置決めされることを意味する。たとえば、いくつかの実施形態では、光源はオフセット位置にある。他の実施形態では、スリット投影モジュールはオフセット位置にある。スリット投影モジュールがフォーカスレンズを含む場合、フォーカスレンズは、ある特定の場合には、オフセット位置にある。さらに他の実施形態では、サンプルチャンバはオフセット位置にある。さらに他の実施形態では、透過光を捕集して集束させるための対物レンズはオフセット位置にある。さらに他の実施形態では、波長セパレータはオフセット位置にある。ある特定の実施形態では、検出器はオフセット位置にある。いくつかの場合には、光源、スリット投影モジュール、サンプルチャンバ、対物レンズ、波長セパレータ、および検出器はすべて、オフセット位置にある。
オフセット距離は、0.1mm〜100mm、たとえば0.2mm〜95mm、たとえば0.3mm〜90mm、たとえば0.4mm〜85mm、たとえば0.5mm〜80mm、たとえば0.6mm〜75mm、たとえば0.7mm〜70mm、たとえば0.8mm〜65mm、たとえば0.9mm〜60mm、たとえば1mm〜55mm、たとえば1.25mm〜50mm、たとえば1.5mm〜45mm、たとえば1.75mm〜40mm、たとえば2mm〜30mm、たとえば2.5mm〜25mm、さらには1mm〜20mmの範囲内で、必要に応じてさまざまでありうる。
たとえば、波長セパレータが回折グレーティングである場合、回折グレーティングは、特定のアッセイプロトコルのための所望の波長(たとえば、548nm、675nmなど)の回折を容易にするオフセット位置にありうる。他の例では、検出器がCCD検出器である場合、CCD検出器は、校正ピクセルを備えた検出器上の位置への光(たとえば、透過光または発光光)の捕集を容易にするオフセット位置にありうる。
ある特定の実施形態では、対象のシステムは、サンプル適用部位が流体サンプルの入力用の入口に結合されたキャピラリーチャネルサンプルチャンバを有する統合マイクロ流体サンプリングデバイスを含む。したがって、これらの実施形態では、主題のシステムは、以上に記載のマイクロ流体カートリッジデバイスを受容するようには構成されず、その代わりに、流体サンプルを直接受容し、続いてサンプルのアッセイ後にそれを除去するように構成される。
いくつかの実施形態では、統合サンプリングデバイスは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと、流体サンプルの入力用の入口に結合されたサンプル適用部位とを含む。統合マイクロ流体サンプリングデバイスのキャピラリーチャネルサンプルチャンバは、その幅よりも長い長さを有するように長尺状構造を有しうる。長さ対幅の比はさまざまでありうるが、いくつかの場合には、長さ対幅の比は、2〜5000、たとえば3〜2500、たとえば4〜1000、たとえば5〜500、たとえば6〜100、たとえば10〜50、さらには15〜20の範囲内である。いくつかの場合には、チャネルの長さは、10mm〜500mm、たとえば20mm〜250mm、さらには50mm〜75mmの範囲内である。いくつかの場合には、チャネルは、マイクロメートルサイズの断面寸法を有し、たとえば、最大断面寸法(たとえば、管状チャネルの場合の直径)は、0.1mm〜20mm、たとえば1mm〜10mm、さらには3mm〜5mmの範囲内である。いくつかの場合には、チャネルの幅は、0.001mm〜20mm、たとえば0.005mm〜19mm、たとえば0.01mm〜18mm、たとえば0.05mm〜17mm、たとえば0.1mm〜15mm、たとえば0.5mm〜12.5mm、たとえば1〜10、さらには3〜5mmの範囲内である。いくつかの場合には、チャネルの高さは、5μm〜500μm、たとえば10μm〜150μm、さらには20μm〜70μmの範囲内である。同様に、キャピラリーチャネルは、直線で囲まれた断面形状、たとえば、正方形、長方形、台形、三角形、六角形など、曲線で囲まれた断面形状、たとえば、円形、卵形など、さらには、不規則形状、たとえば、平面状頂部に結合された放物状底部などの断面形状を有しうる。
統合マイクロ流体サンプリングデバイスのサンプル適用部位は、5μL〜100μL、たとえば10μL〜50μL、さらには20μL〜30μLの範囲内の体積を有するサンプルを受容するように構成された構造である。キャピラリーチャネルへの流体アクセスを直接提供するか、または流体連通を提供する介在コンポーネントを貫通するように提供するかのいずれかであるかぎり、サンプル適用部位は任意の好都合な形状を有しうる。
統合マイクロ流体サンプリングデバイスの入口は、サンプル適用部位とキャピラリーチャネルサンプルチャンバとに流体連通し、かつ任意の好適な形状でありうるとともに、対象の入口の断面形状としては、限定されるものではないが、直線で囲まれた断面形状、たとえば、正方形、長方形、台形、三角形、六角形など、曲線で囲まれた断面形状、たとえば、円形、卵形など、さらには、不規則形状、たとえば、平面状頂部に結合された放物状底部などが挙げられる。入口の形状に依存して、サンプル入口は、0.1mm2 〜100mm2 、たとえば1mm2 〜75mm2 、さらには5mm2 〜50mm2 の範囲内でさまざまな開口サイズを有しうる。
いくつかの場合には、統合マイクロ流体サンプリングデバイスは、サンプル適用部位とキャピラリーチャネルサンプルチャンバとの間で流体路中に位置決めされた混合チャンバを含み、混合チャンバは、サンプル適用部位に適用されてキャピラリーチャネルを貫流するサンプルと1種以上の試薬とを組み合わせるように構成される。
いくつかの場合には、統合マイクロ流体サンプリングデバイスの混合チャンバは、1種以上の試薬が配置されうる大表面積を提供する接触構造(たとえば多孔性ディスク)を含み、ある特定の場合には、大表面積構造は、サンプルの1種以上の成分を濾過したりまたはサンプルの1種以上の成分と混合チャンバ中に存在する試薬との接触を容易にしたりするように構成される。ある特定の場合には、大表面積構造は、サンプルの成分を濾過しないようにかつ単に試薬と貫流するサンプルとの接触を容易にするように構成される。たとえば、サンプルが全血サンプルである場合、大表面積構造は、大表面積構造を貫通する全血成分、たとえば、白血球、赤血球、血小板などのいずれのフローも妨害しないように構成されたものでありうる。そのような場合には、大表面積構造は、20〜80、たとえば30〜70、さらには40〜60の範囲内の多孔度を有しうる。サンプルと試薬との接触を容易にするために好適な大表面積多孔性材料としては、高分子材料、ガラス材料、セラミック材料、金属材料など、たとえば、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリビニリジンフルオリドなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
混合チャンバ中に含まれる試薬としては、たとえば、特異的結合性メンバー、酵素、基質、酸化剤、蛍光マーカーなど、たとえば、以下に記載のものが挙げられうる。同様に、統合マイクロ流体サンプリングデバイスの混合チャンバ中または接触構造中に存在する試薬の量は、たとえば、デバイスの構成の対象となるアッセイの特定のタイプに依存してさまざまでありうる。いくつかの場合には、試薬の量は、混合チャンバを貫流した後のサンプル中の試薬の濃度が0.002マイクログラム/mL〜100マイクログラム/mL、たとえば0.02マイクログラム/mL〜10マイクログラム/mL、さらには0.2〜1マイクログラム/mLの範囲内であれば、十分である。混合チャンバ中に存在する試薬の乾燥重量はさまざまでありうるが、いくつかの場合には、乾燥重量は、0.01ng〜500ng、たとえば0.3ng〜120ng、さらには3ng〜12ngの範囲内である。
以上で考察したように、主題のシステムが統合マイクロ流体サンプリングデバイスを含む場合には、サンプリングデバイスは、流体サンプルを受容し、続いてサンプルのアッセイ後にそれを除去するように構成される。「除去」とは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバ、サンプル適用部位、入口、さらには混合チャンバのいずれをも含めて、主題のシステムとの接触を維持するサンプルの量がゼロであることを意味する。換言すれば、サンプルが除去される場合、痕跡量のサンプルがすべて、システムのコンポーネントから排除される。いくつかの実施形態では、システムは、統合マイクロ流体サンプリングデバイスを洗浄するための1つ以上の洗浄デバイスをさらに含みうる。たとえば、洗浄デバイスは、サンプリングデバイスを洗浄するための洗浄緩衝液を送達するためにスプレーノズルを備えたまたは備えていないマイクロ導管を含みうる。ある特定の実施形態では、これらのシステムは、1種以上の洗浄緩衝液の貯蔵用の貯蔵部を含む。
いくつかの場合には、主題のシステムは、マイクロ流体カートリッジ上のユニークな識別子(たとえば、バーコード、シリアルナンバー)の読取りまたは精査を行うための1つ以上のコンポーネントを含みうる。対象の識別子は、デバイスに関する情報、たとえば、その構成の対象となる特定のアッセイ、製造ロット番号などを提供しうるとともに、識別子はユニークな識別子でありうる。識別子は、ある特定の場合には、マイクロ流体カートリッジに関する情報または特徴、たとえば、限定されるものではないが、サンプルチャネルの屈折率、ブランク参照ウィンドウの屈折率、サンプルチャネルの寸法、たとえば、サンプルチャネルの高さ、サンプルチャネルの幅、サンプルチャネルの長さ、全サンプルチャネルの奥行き、サンプルチャネル壁の厚さを提供しうる。同様に、識別子は、ブランク参照ウィンドウに関する情報、たとえば、ブランク参照ウィンドウの屈折率、ブランク参照ウィンドウの寸法、たとえば、ブランク参照ウィンドウの高さ、ブランク参照ウィンドウの幅、ブランク参照ウィンドウの長さ、全ブランク参照ウィンドウ、ブランク参照ウィンドウ壁の厚さを含みうる。
任意の好都合な識別リーダーまたは精査プロトコル、たとえば、限定されるものではないが、識別プロトコルの中でも特に、バーコードリーダー、RFID精査システム、磁気ストリップリーダー、触覚コードアイデンティファイヤーを利用しうる。
ある特定の実施形態では、主題の吸光度検出システムは、蛍光に関してサンプルチャンバを精査するために1つ以上の蛍光検出システムに結合されうる。たとえば、蛍光検出システムは、1つ以上の光源(たとえば、以上に記載したような広帯域光源または狭帯域光源)、発光光を捕集して集束させるための光学モジュール、検出される捕集光を空間分離するための波長セパレータ、および1つ以上のフォトセンサーまたはフォトディテクターを含みうる。
ある特定の実施形態では、蛍光検出システムおよび吸光度検出システムは両方とも、本明細書に記載の1つ以上の共通のコンポーネントを利用する。たとえば、いくつかの場合には、蛍光検出システムおよび吸光度検出システムは両方とも、サンプルチャンバからの光(たとえば、発光光または透過光)を捕集して集束させるために共通の対物レンズモジュールを利用する。他の場合には、蛍光検出システムおよび吸光度検出システムは両方とも、共通の波長セパレータ機器(たとえば、回折グレーティング、光学フィルタ、1つ以上の回折グレーティングおよび光学フィルタを有するフィルタホイール)を利用する。さらに他の場合には、蛍光検出システムおよび吸光度検出システムは両方とも、サンプルチャンバからの光を測定するために同一の検出器を利用する。
主題のシステムに結合されうる蛍光イメージングシステムおよびディジタル処理システムは、ある特定の場合には、米国特許第8,248,597号明細書、同第7,927,561号明細書、および同第7,738,094号明細書に記載されるように、さらには2012年8月20日出願の同時係属米国特許出願第13/590,114号明細書に記載されるように(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)、キャピラリーチャネル中のサンプルを画像化するためのシステムを含む。
図3は、吸光度検出システムが蛍光検出システムに結合される他の実施形態に係る主題のシステムの構成図を示している。以上で考察したように、吸光度検出システムは、光ビームを狭くしてスリット状ビーム生成するためのスリットと、スリット状ビームを集束および縮小させるための対物レンズとを含むスリット投影モジュール(302)を介して1つ以上の波長光を発する光源(301)を含む。スリット状ビームがマイクロ流体カートリッジ(303)中のサンプルチャンバを照明すると、サンプル中のアナライトは光を吸収し、光の残りの部分は透過され、および光をその成分波長に空間分離する波長セパレータ305(たとえば、1つ以上の光学フィルタおよび回折グレーティングを有するフィルタホイール)上に光を集束させるように構成された対物レンズ(304)により捕集される。次いで、空間分離された光は、検出器(たとえば306のCCD)により検出される。蛍光検出では、システムは、サンプルチャンバを照明するようにサンプルチャンバ上に位置決めされた第2の光源(307)を含み、アナライトにより生成された蛍光は、対物レンズ(304)により捕集され、フィルタホイール305を用いて空間分離され、および検出器306により検出される。この実施形態では、蛍光検出システムおよび吸光度検出システムは、サンプルチャンバ(303)からの光を捕集するための共通の対物レンズ(304)、波長セパレータ機器(305)、および検出器(306)を利用する。
いくつかの実施形態では、対象のシステムはまた、収集されたアッセイデータを処理するための1つ以上のプロセッサ、ディスプレイ、たとえば、アッセイ時に収集された生データまたはプロセッサから受け取った処理結果を表示するための液晶ディスプレイ(LCD)、さらには入力デバイス、たとえば、ボタン、キーボード、マウス、またはタッチスクリーンを含む。その他に、システムは、1つ以上の有線もしくは無線の通信プロトコルまたは一人以上の使用者に結果を伝達するための統合プリンタを含みうる。たとえば、システムは、より詳細に以下に記載されるように、1つ以上のコンピュータシステムコンポーネントを含みうる。
図4は、一実施形態に係る対象のアッセイリーダーシステムの例を示している。システムは、前側(400a)と後側(400b)とを有するハウジング(400)を含む。前側(400a)は、ディスプレイ(401)、たとえば、アッセイ時に収集された生データまたはプロセッサから受け取った処理結果を表示するための液晶ディスプレイ(LCD)、使用者にアッセイデータを伝達するための統合プリンタ(403)、さらにはマイクロ流体カートリッジデバイスをアッセイリーダーシステムに挿入するためのスロット(404)を含む。アッセイリーダーシステムはまた、主題のシステムと、1つ以上の他の外部デバイス、たとえば、類似の補完的データ通信用として構成されたコンピュータ端末との間のデータ通信を可能にする通信インターフェース(405)(たとえばUSBポート)を含む。後側(400b)は、電力供給用のケーブル接続およびデータ通信プロトコル、さらには冷却ファンおよびヒートシンクに機能可能に接続された冷却ベント(図示せず)を含みうる。後側(400b)はまた、アッセイリーダーシステムを手動で移動または移送するための1つ以上のリフトハンドルを含みうる。図4に示されるように、主題のシステムは、光学素子のすべて、電子素子(より詳細に以下に記載)、ディスプレイ、通信プロトコルをすべて単一ハウジング内に納めた単体「オールインワン」タイプのシステムになるように構成可能である。ある特定の実施形態では、対象のシステムは、機械を用いずに(たとえば、リフトハンドルを用いて)ヒトにより移動させることができるように(持ち上げたりまたは50メートル以上の距離を移送したりできるように)構成される。このため、対象のシステムは、これらの実施形態では、25kg以下、たとえば20kg以下、たとえば15kg以下、さらには10kg以下、たとえば5kg以下であり、必要に応じて、操作/輸送を容易にするようにビルトインハンドルまたは他の構造を含みうる。
マイクロ流体カートリッジデバイス
本開示の態様はまた、本明細書に記載されたある特定のシステムにより受容されるように構成されたマイクロ流体カートリッジデバイスを含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体カートリッジデバイスは、流体サンプルの入力用の入口に結合されたサンプル適用部位に流体連通するキャピラリーチャネルサンプルチャンバを含む。「マイクロ流体」という用語は、本明細書では、小スケール(たとえばサブミリメートル)に幾何学的に拘束された流体を制御および操作すべく構成されたデバイスを意味するようにその通常の意味で用いられる。デバイスがキャピラリーチャネルサンプルチャンバを含む場合、デバイスは、それを貫通する液体のキャピラリーフローを提供するように構成された長尺状構造を含む。サンプル適用部位、キャピラリーチャネルサンプルチャンバ、および入口の他に、マイクロ流体デバイスの態様は、流体サンプルと1種以上の試薬との接触および混合を行うためにサンプル適用部位および入口に連通する試薬混合チャンバを含む。ある特定の実施形態では、混合チャンバは、サンプルに接触させるための試薬を含有する多孔性ディスクとして構成される。
本開示の実施形態では、キャピラリーチャネルサンプルチャンバは、その幅よりも長い長さを有するように長尺状構造である。長さ対幅の比はさまざまでありうるが、いくつかの場合には、長さ対幅の比は、2〜5000、たとえば3〜2500、たとえば4〜1000、たとえば5〜500、たとえば6〜100、たとえば10〜50、さらには15〜20の範囲内である。いくつかの場合には、チャネルの長さは、10mm〜500mm、たとえば20mm〜250mm、さらには50mm〜75mmの範囲内である。いくつかの場合には、チャネルは、マイクロメートルサイズの断面寸法を有し、たとえば、最大断面寸法(たとえば、管状チャネルの場合の直径)は、0.1mm〜20mm、たとえば1mm〜10mm、さらには3mm〜5mmの範囲内である。いくつかの場合には、チャネルの幅は、0.001mm〜20mm、たとえば0.005mm〜19mm、たとえば0.01mm〜18mm、たとえば0.05mm〜17mm、たとえば0.1mm〜15mm、たとえば0.5mm〜12.5mm、たとえば1〜10、さらには3〜5mmの範囲内である。いくつかの場合には、チャネルの高さは、5μm〜500μm、たとえば10μm〜150μm、さらには20μm〜70μmの範囲内である。
キャピラリーチャネルの断面形状はさまざまでありうるが、いくつかの場合には、対象のチャネルの断面形状としては、限定されるものではないが、直線で囲まれた断面形状、たとえば、正方形、長方形、台形、三角形、六角形など、曲線で囲まれた断面形状、たとえば、円形、卵形など、さらには、不規則形状、たとえば、平面状頂部に結合された放物状底部などが挙げられる。
キャピラリーチャネルの一端(すなわち基端)には、サンプルをキャピラリーチャネルサンプルチャンバ中に搬送するための流体入口を有するサンプル適用部位が位置決めされる。サンプル適用部位は、分析される一定量のサンプル、たとえば生物学的サンプルを受容するように構成された部位または位置である。いくつかの場合には、サンプル適用部位は、5μL〜100μL、たとえば10μL〜50μL、さらには20μL〜30μLの範囲内の体積を有するサンプルを受容するように構成された構造である。キャピラリーチャネルへの流体アクセスを直接提供するか、または流体連通を提供する介在コンポーネントを貫通するように提供するかのいずれかであるかぎり、サンプル適用部位は任意の好都合な形状を有しうる。
サンプル適用部位は、キャピラリーチャネルサンプルチャンバの一端への入口に連通している。サンプル適用部位は、サンプル適用部位に適用されたサンプルがキャピラリーチャネルサンプルチャンバの入口に吸い込まれるようにマイクロ流体デバイスの側部に沿って位置決めされうる。サンプルをキャピラリーチャネルサンプルチャンバ中に搬送するための入口は、任意の好適な形状でありうるが、対象のチャネルの断面形状としては、限定されるものではないが、直線で囲まれた断面形状、たとえば、正方形、長方形、台形、三角形、六角形など、曲線で囲まれた断面形状、たとえば、円形、卵形など、さらには、不規則形状、たとえば、平面状頂部に結合された放物状底部などが挙げられる。入口の形状さらにはマイクロ流体カートリッジの寸法に依存して、サンプル入口は、0.1mm2 〜100mm2 、たとえば1mm2 〜75mm2 、さらには5mm2 〜50mm2 の範囲内でさまざまな開口サイズを有しうる。
いくつかの実施形態では、流体サンプルは、サンプル適用部位上に前負荷され、前負荷されたマイクロ流体デバイスは、サンプルをアッセイする前に所定の時間にわたり貯蔵される。このため、本開示のシステムはまた、1つ以上の前負荷されたマイクロ流体カートリッジを含みうる。たとえば、流体サンプルは、サンプルをアッセイする前に0.001時間以上、たとえば0.005時間以上、たとえば0.01時間以上、たとえば0.05時間以上、たとえば0.1時間以上、たとえば0.5時間以上、たとえば1時間以上、たとえば2時間以上、たとえば4時間以上、たとえば8時間以上、たとえば16時間以上、たとえば24時間以上、たとえば48時間以上、たとえば72時間以上、たとえば96時間以上、たとえば120時間以上、たとえば144時間以上、たとえば168時間以上にわたりサンプル適用部位上に前負荷されうるとともに、さらには、前負荷されたマイクロ流体デバイスは、サンプルをアッセイする前に240時間以上にわたり貯蔵されうるか、またはサンプルをアッセイする前の貯蔵時間は、たとえば0.1時間〜240時間、たとえば0.5時間〜216時間、たとえば1時間〜192時間、さらには5時間〜168時間の範囲内でありうる。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体デバイスは、サンプル適用部位とキャピラリーチャネルサンプルチャンバとの間で流体路中に位置決めされた混合チャンバを含む。混合チャンバとは、サンプル適用に適用されてキャピラリーチャネルに流動するサンプルと1種以上の試薬とを組み合わせるように構成された流体路中の領域または位置を意味する。
いくつかの場合には、混合チャンバは、1種以上の試薬が配置されうる大表面積を提供する接触構造(たとえば多孔性ディスク)を含み、ある特定の場合には、大表面積構造は、サンプルの1種以上の成分を濾過したりまたはサンプルの1種以上の成分と混合チャンバ中に存在する試薬との接触を容易にしたりするように構成される。ある特定の場合には、大表面積構造は、サンプルの成分を濾過しないようにかつ単に試薬と貫流するサンプルとの接触を容易にするように構成される。たとえば、サンプルが全血サンプルである場合、大表面積構造は、大表面積構造を貫通する全血成分、たとえば、白血球、赤血球、血小板などのいずれのフローも妨害しないように構成されたものでありうる。そのような場合には、大表面積構造は、20〜80、たとえば30〜70、さらには40〜60の範囲内の多孔度を有しうる。サンプルと試薬との接触を容易にするために好適な大表面積多孔性材料としては、高分子材料、ガラス材料、セラミック材料、金属材料など、たとえば、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリビニリジンフルオリドなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
混合チャンバ中には1種以上の試薬が存在し、かかる試薬は、存在する場合、大表面積構造の表面上に存在しうる。デバイスの構成の対象となる特定のアッセイに依存して、デバイスの混合チャンバ中またはドメイン中には多種多様な試薬が存在しうる。対象の試薬は、特に、標識された特異的結合性メンバー、酵素、基質、酸化剤などを含む。ある特定の実施形態では、混合チャンバ中の1種以上の試薬は、標識された特異的結合性メンバーを含む。たとえば、標識された特異的結合性メンバーは、特異的結合性ドメインと標識ドメインとを含みうる。「特異的結合性」、「特異的に結合する」などの用語は、溶液中または反応混合物中の他の分子または部分と対比してドメインの優先的結合(たとえば、同一の結合対の一方の結合対メンバーと他方の結合対メンバーとの優先的結合)を意味する。特異的結合性ドメインは、対象のアナライトの特異的エピトープに結合しうる(たとえば、共有結合または非共有結合で)。特定の態様では、特異的結合性ドメインは標的に非共有結合する。そのような場合には、特異的結合性ドメインと結合性標的(たとえば、細胞表面マーカー)との会合は、10-5M以下、10-6M以下、たとえば10-7M以下、さらには10-8M以下、たとえば10-9M以下、10-10 M以下、10-11 M以下、10M-12 以下、10-13M以下、10-14 M以下、10-15 M以下、さらには10-16 M以下のKD(解離定数)により特徴付けられうる。
多種多様なタイプの特異的結合性ドメインをキャプチャーリガンドとして利用しうる。対象の特異的結合性ドメインは、限定されるものではないが、抗体結合剤、タンパク質、ペプチド、ハプテン、核酸などを含む。本明細書で用いられる「抗体結合剤」という用語は、ポリクロナール抗体またはモノクローナル抗体または対象のアナライトに結合するために十分なフラグメントを含む。抗体フラグメントは、たとえば、単量体Fabフラグメント、単量体Fab’フラグメント、または二量体F(ab)’2フラグメントでありうる。また、抗体工学により産生された分子、たとえば、一本鎖抗体分子(scFv)、またはキメラ抗体を産生するように重鎖および軽鎖の定常領域の置換えによりもしくはヒト化抗体を産生するように定常領域と可変領域のフレームワーク部分との両方の置換えによりモノクローナル抗体から産生されたヒト化抗体もしくはキメラ抗体も、「抗体結合剤」という用語の範囲内にある。ある特定の実施形態では、対象の試薬は、CD4−PECy5、CD3−APC、CD45RA−APC、CD14−PEを含む。
標識ドメインは、たとえば、蛍光発光極大、蛍光偏光、蛍光寿命、光散乱、質量、分子質量、またはそれらの組合せに基づいて、検出可能である。特定の態様では、標識ドメインは、フルオロフォア(すなわち、蛍光標識、蛍光色素など)でありうる。フルオロフォアは、分析用途(たとえば、フローサイトメトリー、イメージングなど)に使用するために好適な多くの色素のいずれかから選択可能である。さまざまな供給元、たとえば、Molecular Probes(Eugene,OR)、Exciton(Dayton,OH)などから多数の色素か市販されている。マイクロ粒子中に組み込みうるフルオロフォアの例としては、4−アセトアミド−4’−イソチオシアナトスチルベン−2,2’−ジスルホン酸、アクリジンおよび誘導体、たとえば、アクリジン、アクリジンオレンジ、アクリジンイエロー、アクリジンレッド、およびアクリジンイソチオシアネート、5−(2’−アミノエチル)アミノナフタレン−1−スルホン酸(EDANS)、4−アミノ−N−[3−ビニルスルホニルフェニル]ナフタルイミド−3,5−ジスルホネート(ルシファーイエローVS)、N−(4−アニリノ−1−ナフチル)マレイミド、アントラニルアミド、ブリリアントイエロー、クマリンおよび誘導体、たとえば、クマリン、7−アミノ−4−メチルクマリン(AMC、クマリン120)、および7−アミノ−4−トリフルオロメチルクマリン(クマリン151)、シアニンおよび誘導体、たとえば、シアノシン、Cy3、Cy5、Cy5.5、およびCy7、4’,6−ジアミニジノ−2−フェニルインドール(DAPI)、5’,5”−ジブロモピロガロール−スルホンフタレイン(ブロモピロガロールレッド)、7−ジエチルアミノ−3−(4’−イソチオシアナトフェニル)−4−メチルクマリン、ジエチルアミノクマリン、ジエチレントリアミンペンタアセテート、4,4’−ジイソチオシアナトジヒドロ−スチルベン−2,2’−ジスルホン酸、4,4’−ジイソチオシアナトスチルベン−2,2’−ジスルホン酸、5−[ジメチルアミノ]ナフタレン−1−スルホニルクロリド(DNS、ダンシルクロリド)、4−(4’−ジメチルアミノフェニルアゾ)安息香酸(DABCYL)、4−ジメチルアミノフェニルアゾフェニル−4’−イソチオシアネート(DABITC)、エオシンおよび誘導体、たとえば、エオシンおよびエオシンイソチオシアネート、エリトロシンおよび誘導体、たとえば、エリトロシンBおよびエリトロシンイソチオシアネート、エチジウム、フルオレセインおよび誘導体、たとえば、5−カルボキシフルオレセイン(FAM)、5−(4,6−ジクロロトリアジン−2−イル)アミノフルオレセイン(DTAF)、2’,7’−ジメトキシ−4’5’−ジクロロ−6−カルボキシフルオレセイン(JOE)、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)、フルオレセインクロロトリアジニル、ナフトフルオレセイン、およびQFITC(XRITC)、フルオレスカミン、IR144、IR1446、緑色蛍光タンパク質(GFP)、造礁サンゴ蛍光タンパク質(RCFP)、Lissamine(登録商標)、Lissamineローダミン、ルシファーイエロー、マラカイトグリーンイソチオシアネート、4−メチルウンベリフェロン、オルトクレゾールフタレイン、ニトロチロシン、パラローザニリン、ナイルレッド、オレゴングリーン、フェノールレッド、B−フィコエリトリン、o−フタルジアルデヒド、ピレンおよび誘導体、たとえば、ピレン、ピレンブチレート、およびスクシンイミジル1−ピレンブチレート、リアクティブレッド4(Cibacron(登録商標)ブリリアントレッド3B−A)、ローダミンおよび誘導体、たとえば、6−カルボキシ−X−ローダミン(ROX)、6−カルボキシローダミン(R6G)、4,7−ジクロロローダミンリサミン、ローダミンBスルホニルクロリド、ローダミン(Rhod)、ローダミンB、ローダミン123、ローダミンXイソチオシアネート、スルホローダミンB、スルホローダミン101、スルホローダミン101のスルホニルクロリド誘導体(テキサスレッド)、N,N,N’,N’−テトラメチル−6−カルボキシローダミン(TAMRA)、テトラメチルローダミン、およびテトラメチルローダミンイソチオシアネート(TRITC)、リボフラビン、ロゾール酸およびテルビウムキレート誘導体、キサンテン、またはそれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されるものではない。当業者に公知の他のフルオロフォアまたはそれらの組合せ、たとえば、Molecular Probes(Eugene,OR)およびExciton(Dayton,OH)から入手可能なものなどもまた、使用されうる。蛍光標識は、蛍光発光極大に基づいて、任意選択でさらに光散乱または消光に基づいて、識別可能でありうる。
混合チャンバ中または接触構造中に存在する試薬の量は、たとえば、デバイスの構成の対象となるアッセイの特定のタイプに依存してさまざまでありうる。いくつかの場合には、試薬の量は、混合チャンバを貫流した後のサンプル中の試薬の濃度が0.002マイクログラム/mL〜100マイクログラム/mL、たとえば0.02マイクログラム/mL〜10マイクログラム/mL、さらには0.2〜1マイクログラム/mLの範囲内であれば、十分である。混合チャンバ中に存在する試薬の乾燥重量はさまざまでありうるが、いくつかの場合には、乾燥重量は、0.01ng〜500ng、たとえば0.3ng〜120ng、さらには3ng〜12ngの範囲内である。
いくつかの場合には、デバイスは、アナライト特異的キャプチャードメインを含みうる。アナライト特異的キャプチャードメインは、デバイスの使用時に結果を読み取りうるキャピラリーチャネルのドメインまたは領域である。アナライト特異的キャプチャードメインは、デバイスのサンプル適用部位から下流側へ適宜離して位置決めされる。「下流」とは、毛管作用によりサンプルが流動する方向、すなわち、サンプル適用部位から流体が流動する方向を意味する。サンプル受容領域と検出領域との間を流体が流動する全距離はさまざまでありうるが、いくつかの場合には、2cm〜500cm、たとえば10cm〜100cm、さらには20cm〜50cmの範囲内である。
アナライト特異的キャプチャードメインは、一定量のキャプチャープローブを含む領域であり、本明細書では「検出キャプチャープローブ」としても参照される。検出キャプチャープローブは、アナライト特異的キャプチャードメインに固定され、対象の標的分子、たとえば、アナライト、対照分子などに特異的に結合する。検出キャプチャープローブ領域のサイズはさまざまでありうるが、いくつかの場合には、キャプチャープローブ領域は、0.01cm2 〜0.5cm2 、たとえば0.05cm2 〜0.1cm2 、さらには0.1cm2 〜0.2cm2 の範囲内の面積を有しうる。アナライト特異的キャプチャードメインは、多種多様な構成を有しうるとともに、必要に応じて、構成はランダムでありうるか、または構成は、特定の形状、たとえば、線、丸形、正方形、またはより複雑な形状、たとえば、交差形を有しうる。所与のアナライト特異的キャプチャードメインは、単一キャプチャープローブまたは2種以上の異なるキャプチャープローブを含みうるとともに、2種以上の異なるキャプチャープローブのそれぞれ、検出領域が2種以上のキャプチャープローブを含む場合には、キャプチャープローブは、必要に応じて、互いに識別可能である(すなわち、異なる標的分子に結合する)。
いくつかの実施形態では、標的分子、たとえば、対象のアナライト、対照または参照の分子などに対して特異的結合性メンバーを提示する粒子を含むアナライト特異的キャプチャードメインを提供しうる。たとえば、いくつかの実施形態では、デバイスは、好都合な表面、たとえば、キャピラリーチャネルのドメインの上側表面、たとえば、本出願をもって参照により組み込まれる2012年11月16日出願の国際出願第PCT/US2012/065683号パンフレットに記載されるようなキャピラリーチャネル中のキャピラリーチャンバの上側表面に固定されたキャプチャービーズで構成されたアナライト特異的キャプチャードメインを含みうる。キャプチャービーズは、対象のアナライトに特異的に結合する結合試薬で被覆されうる。いくつかの実施形態では、キャプチャービーズは、対象の抗体が特異的に結合する抗原で被覆される。そのような場合には、アナライトに特異的に結合する検出用の蛍光標識試薬を添加することにより、キャプチャーされたアナライトの検出をその蛍光発光により行えるようにしうる。任意の好適な手段によりキャピラリーチャンバの上側表面上のスポットにキャプチャービーズを固定しうる。いくつかの場合には、ビーズとキャピラリーチャンバ表面との間の受動的相互作用によりビーズがスポットに局在した状態に維持されるが、必要に応じて、共有結合を使用しうる。
異なる抗原で被覆されたキャプチャービーズをキャピラリーチャンバ中の異なるスポットに局在させることにより、複数のアナライトの多重検出を行うことが可能である。他の選択肢として、互いに識別可能でありかつキャプチャーされたアナライトの測定に使用される色素標識検出試薬と識別可能である蛍光色素を用いて、異なる抗原で被覆されたキャプチャービーズを識別標識することが可能である。このようにすれば、同一のスポットにビーズを固定可能であり、それらの蛍光発光により識別可能である。他の実施形態では、サンプル適用部位に配置されたアナライト特異的キャプチャードメインに標識試薬を配置して、標識されたサンプルをキャピラリーチャネル中の検出用の反応チャンバに流動させうる。
いくつかの場合には、マイクロ流体カートリッジは、たとえば、サンプル適用部位から最も離れたチャネルの端近傍に位置決めされた品質管理ドメインをキャピラリーチャネル中に含みうる。品質管理チャネルはさまざまでありうるが、たとえば、より詳細に以下に記載されるように、所与のアッセイ時にサンプルがデバイスを貫流することを確認するために、標識試薬に特異的なキャプチャーメンバーたとえば抗体を含みうる。
いくつかの場合には、マイクロ流体カートリッジは、1つ以上の識別子を含みうる。かかる識別子は、デバイスに関する情報、たとえば、構成の対象となる特定のアッセイ、製造ロット番号などを提供しうるとともに、かかる識別子はユニークな識別子でありうる。識別子は、人間可読および/または機械可読でありうる。たとえば、必要に応じて、テキスト(たとえばシリアルナンバー)またはバーコードでありうる。識別子は、ある特定の場合には、マイクロ流体カートリッジに関する情報または特徴、たとえば、限定されるものではないが、サンプルチャネルの屈折率、ブランク参照ウィンドウの屈折率、サンプルチャネルの寸法、たとえば、サンプルチャネルの高さ、サンプルチャネルの幅、サンプルチャネルの長さ、全サンプルチャネルの奥行き、サンプルチャネル壁の厚さを提供しうる。同様に、識別子は、ブランク参照ウィンドウに関する情報、たとえば、ブランク参照ウィンドウの屈折率、ブランク参照ウィンドウの寸法、たとえば、ブランク参照ウィンドウの高さ、ブランク参照ウィンドウの幅、ブランク参照ウィンドウの長さ、全ブランク参照ウィンドウ、ブランク参照ウィンドウ壁の厚さを含みうる。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体カートリッジは、アナライト濃度の計算に使用されるブランク吸光度を提供するために同様にスリット投影モジュールにより精査されるブランク参照ウィンドウをさらに含む。ある特定の実施形態では、本明細書に記載の方法を実施した際のマイクロ流体カートリッジによる吸収、散乱などをブランク参照ウィンドウを介する透過により補正できるように、ブランク参照ウィンドウによる吸光度をサンプルチャンバによる吸光度と同一にすべく構成される。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、入射光の1つ以上の波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の吸光度および透過率を有する。他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1つ以上の波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の光を散乱する。さらに他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1つ以上の入射波長でキャピラリーチャネルサンプルチャンバと実質的に同一の吸光度、透過率を有し、かつ実質的に同一の光を散乱する。さらに他の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の屈折率を有する。
ブランク参照ウィンドウは、任意の好都合なサイズおよび形状でありうる。たとえば、ブランク参照ウィンドウは、正方形、円形、卵形、矩形、五角形、六角形、八角形、または任意の他の好適な多角形の形態でありうる。いくつかの実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、1〜50、たとえば3〜25、たとえば4〜10、たとえば5〜8、さらには15〜20の範囲内の長さ対幅の比を有する。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは正方形であり、長さ対幅の比は1である。ブランク参照ウィンドウの長さ、1mm〜50mm、たとえば2mm〜25mm、さらには5mm〜20mmの範囲内でさまざまでありうる。ブランク参照ウィンドウの幅は、0.001mm〜20mm、たとえば0.005mm〜19mm、たとえば0.01mm〜18mm、たとえば0.05mm〜17mm、たとえば0.1mm〜15mm、たとえば0.5mm〜12.5mm、たとえば1〜10、さらには3〜5mmの範囲内でさまざまでありうる。いくつかの場合には、チャネルの高さは、5μm〜500μm、たとえば10μm〜150μm、さらには20μm〜70μmの範囲内である。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバの幅と実質的に同一の幅を有する。
ブランク参照ウィンドウは、マイクロ流体カートリッジ上の任意の好都合な位置で位置決めされうる。ある特定の実施形態では、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の軸に沿って位置決めされる。たとえば、ブランク参照ウィンドウは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の軸に沿ってキャピラリーチャネルサンプルチャンバから1mm以上離れた位置に、たとえばキャピラリーチャネルサンプルチャンバから2mm以上、たとえば3mm以上、たとえば4mm以上、たとえば5mm以上、さらには10mm以上離れた位置に位置決めされうる。
図5は、吸光度測定用のマイクロ流体サンプルチャンバ(501)と吸光度測定時にブランクを提供する参照ウィンドウ(502)とを有するマイクロ流体カートリッジの一例を示している。
本明細書に記載のシステムに受容されうる好適なマイクロ流体カートリッジの一例としては、限定されるものではないが、2014年1月10日出願の同時係属米国特許出願第14/152,954号明細書(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のものが挙げられうる。
コンピュータ制御システム
本開示の態様は、主題の方法を実施するためのコンピュータ制御システムをさらに含む。かかるシステムは、本明細書に記載の方法を実施するためのシステムの自動化または半自動化のために1つ以上のコンピュータをさらに含む。ある特定の実施形態では、システムは、コンピュータプログラムを記憶したコンピュータ可読記憶媒体を有するコンピュータを含む。かかるコンピュータプログラムは、コンピュータにロードされる場合、光源によりサンプルチャンバ中のサンプルを照明するアルゴリズム、すなわち、サンプルチャンバの長さに沿ってスリット投影モジュールを移動させるためのアルゴリズム、サンプルチャンバを透過した光を検出するためのアルゴリズム、検出された透過光を用いて1つ以上の波長で光の吸光度を計算するためのアルゴリズム、および、透過光から決定される吸光度に基づいてアナライトの濃度を計算するためのアルゴリズムを含む。
いくつかの実施形態では、システムは、検出器により検出された透過光に基づいて1つ以上の波長で光の吸光度を計算するためのアルゴリズムを含むコンピュータプログラムを含む。標的アナライトによる光の吸光度は、ベール・ランベルトの法則:
吸光度(λ)=−Log10(I/I0
(式中、Iは、サンプルチャンバを透過した光の強度であり、かつI0 は、サンプルの精査に用いられる入射光の強度である)
を適用して所与の波長で吸光度を計算するプロセッサに検出器からの透過率データを入力することにより決定される。
システムはまた、1つ以上の波長の計算吸光度に基づいてアナライトの濃度を計算するためのアルゴリズムを含むコンピュータプログラムを含む。アナライトの濃度は、ある特定の実施形態では、透過率データに基づいて計算された吸光度値を式:
吸光度(λ)=[モル吸光率λ]×[濃度]×[経路長]
が適用されるプロセッサに入力することにより計算される。
いくつかの実施形態では、システムは、サンプルによる散乱を補正しながらアナライトの吸光度を計算するためのアルゴリズムを含む。サンプルによる散乱が同時に補正したアナライトによる吸光度は、ある特定の場合には、透過率データに基づいて計算された吸光度値を式:
濃度analyte=A(Absλ1 )+B(Absλ2 )+C
(式中、A、B、およびCは、精査波長および測定アナライトに依存する係数である)
が適用されるプロセッサに入力することにより決定される。いくつかの実施形態では、Aの値は、ある特定の場合には、20g/dL〜60g/dL、たとえば25g/dL〜57.5g/dL、たとえば30g/dL〜55g/dL、たとえば35g/dL〜50g/dL、さらには37.5g/dL〜45g/dLの範囲内でさまざまでありうる。Bの値もまた、ある特定の場合には、0.01g/dL〜5g/dL、たとえば0.05g/dL〜4.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜4g/dL、たとえば0.25g/dL〜3.5g/dL、たとえば0.5g/dL〜3g/dL、さらには0.5g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。同様に、Cの値もまた、0.01g/dL〜2g/dL、たとえば0.025g/dL〜1.75g/dL、たとえば0.05g/dL〜1.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜1.25g/dL、さらには0.25g/dL〜2g/dLの範囲内でさまざまでありうる。
たとえば、ある特定の場合には、システムは、散乱を補正しながら全血中のヘモグロビンの濃度を計算するように構成される。これらの例では、システムは、全血サンプルによる散乱を補正しながら全血中のヘモグロビンの吸光度を計算するためのアルゴリズムを含む。システムは、サンプルを精査するために第1の波長および第2の波長を選択するためのアルゴリズムを有するコンピュータプログラムを含む。これらの実施形態では、コンピュータアルゴリズムは、ヘモグロビンが高いモル吸光率を有する第1の波長を選択する工程を含む。第1の波長は、ヘモグロビンと、オキシヘモグロビン、カルボキシヘモグロビン、メトヘモグロビン、スルホヘモグロビン、アジドメトヘモグロビン、およびシアノメトヘモグロビンの1つ以上との等吸収点、たとえば、ヘモグロビンとオキシヘモグロビンとの等吸収点またはヘモグロビンとオキシヘモグロビンとカルボキシヘモグロビンとの三重等吸収点でありうる。たとえば、第1の波長は、ある特定の場合には、506nm、548nm、569nm、579nm、585nm、または586nmである。コンピュータアルゴリズムはまた、散乱を補正しながら第2の波長を選択する工程を含む。いくつかの場合には、コンピュータアルゴリズムは、ヘモグロビンと、オキシヘモグロビン、カルボキシヘモグロビン、メトヘモグロビン、スルホヘモグロビン、アジドメトヘモグロビン、およびシアノメトヘモグロビンの1つ以上との等吸収点、たとえば、ヘモグロビンとオキシヘモグロビンとの等吸収点、またはヘモグロビンとオキシヘモグロビンとカルボキシヘモグロビンとの三重等吸収点である第2の波長を選択する工程を含む。たとえば、第2の波長は、ある特定の場合には、650nm、675nm、710nm、785nm、808nm、815nm、または830nmである。
たとえば、ある特定の実施形態では、システムは、548nmの第1の波長および675nmの第2の波長を選択して、
1)透過率データをベール・ランベルトの法則が適用されるプロセッサに入力し、かつ2)計算吸光度値を式:
濃度Hb=A(Abs548nm )+B(Abs675nm )+C
が適用されるプロセッサに入力することにより、全血サンプル中の散乱を補正しながら全血中のヘモグロビンの濃度を決定するためのアルゴリズムを含むコンピュータプログラムを含む。上記式中、全血サンプルのAの値は、20g/dL〜60g/dL、たとえば25g/dL〜57.5g/dL、たとえば30g/dL〜55g/dL、たとえば35g/dL〜50g/dL、さらには37.5g/dL〜45g/dLの範囲内であり、全血サンプルのBの値は、0.01g/dL〜5g/dL、たとえば0.05g/dL〜4.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜4g/dL、たとえば0.25g/dL〜3.5g/dL、たとえば0.5g/dL〜3g/dL、さらには0.5g/dL〜2g/dLの範囲内であり、全血サンプルのCの値は、0.01g/dL〜2g/dL、たとえば0.025g/dL〜1.75g/dL、たとえば0.05g/dL〜1.5g/dL、たとえば0.1g/dL〜1.25g/dL、さらには0.25g/dL〜2g/dLの範囲内である。
いくつかの実施形態では、システムは、入力モジュール、処理モジュール、および出力モジュールを含む。いくつかの実施形態では、主題のシステムは、各流体サンプルに関するパラメータまたは情報、適用光源の強度および波長(離散または範囲)、スリット投影モジュールによる移動幅、スリット投影モジュールによるスキャン数および移動回数、光源による照明の持続時間、異なる光源の数、光源からサンプルチャンバまでの距離、対物レンズの焦点距離、集束モジュールのパラメータ、サンプルチャンバの経路長、サンプルの屈折率、サンプルチャンバの屈折率、波長セパレータの数、波長セパレータの性質、たとえば、バンドパス幅、不透明度、グレーティング間隔、および分解能、さらにはフォトディテクターの性質および感度を含む入力モジュールを含みうる。
処理モジュールは、主題の方法の工程、たとえば、サンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程、サンプルチャンバの長さに沿ってスリット投影モジュールを移動させる工程、サンプルチャンバを透過した光を検出する工程、および検出された透過光を用いて1つ以上の所定の波長で光の吸光度を計算する工程を行うための複数の命令を有するメモリを含む。
処理モジュールにより主題の方法の工程の1つ以上を行った後、出力モジュールは、たとえば、レポートをモニター上に表示することによりまたは印刷することにより、結果(たとえば、1つ以上の波長のアナライトの吸光度)を使用者に伝達する。
主題のシステムは、ハードウェアコンポーネントおよびソフトウェアコンポーネントの両方を含みうる。かかるハードウェアコンポーネントは、機能エレメント、すなわち、システムの特定のタスク(たとえば、情報入出力管理、情報処理など)を行うシステムのエレメントが、システムの提示された1つ以上のコンピュータプラットフォーム上でおよびそれらをまたいでソフトウェアアプリケーションを実行することにより行われるように、1つ以上のプラットフォームの形態、たとえば、サーバの形態をとりうる。
システムは、ディスプレイおよびオペレータ入力デバイスを含みうる。オペレータ入力デバイスは、たとえば、キーボード、マウスなどでありうる。処理モジュールは、主題の方法の工程、たとえば、サンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程、サンプルチャンバの長さに沿ってスリット投影モジュールを移動させる工程、サンプルチャンバを透過した光を検出する工程、および検出された透過光を用いて1つ以上の所定の波長で光の吸光度を計算する工程を行うために、記憶命令を有するメモリにアクセスするプロセッサを含む。
処理モジュールは、オペレーティングシステム、グラフィカルユーザインターフェース(GUI)コントローラ、システムメモリ、メモリ記憶デバイス、入出力コントローラ、キャッシュメモリ、データバックアップユニット、および多くの他のデバイスを含みうる。プロセッサは、市販のプロセッサであってもよく、あるいは現在または今後入手可能な他のプロセッサの1つであってもよい。プロセッサは、オペレーティングシステムを実行し、オペレーティングシステムは、周知のようにファームウェアとハードウェアとのインターフェースをとり、さまざまなプログラミング言語、たとえば、当技術分野で公知のJava(登録商標)、Perl、C++、他の高水準言語または低水準言語さらにはそれらの組合せで記述されうる種々のコンピュータプログラムの機能を連携および実行するプロセッサを支援する。オペレーティングシステムは、典型的には、プロセッサと協同してコンピュータの他のコンポーネントの機能の連携および実行を行う。オペレーティングシステムはまた、すべて公知の技術に従って、スケジュール管理、入出力制御、ファイルおよびデータ管理、メモリ管理、ならびに通信制御および関連サービスを提供する。
システムメモリは、さまざまな公知のまたは将来的なメモリ記憶デバイスのいずれであってもよい。例としては、任意の一般に入手可能なランダムアクセスメモリ(RAM)、磁気媒体、たとえば、常駐ハードディスクまたはテープ、光学媒体、たとえば、読取りおよび書込みコンパクトディスク、フラッシュメモリデバイス、または他のメモリ記憶デバイスが挙げられる。メモリ記憶デバイスは、コンパクトディスクドライブ、テープドライブ、リムーバブルハードディスクドライブ、またはディスケットドライブをはじめとするさまざまな公知のまたは将来的なデバイスのいずれであってもよい。かかるタイプのメモリ記憶デバイスは、典型的には、プログラム記憶媒体(図示せず)、たとえば、それぞれ、コンパクトディスク、磁気テープ、リムーバブルハードディスク、またはフロッピー(登録商標)ディスケットからの読取りおよび/またはそれらへの書込みを行う。これらのプログラム記憶媒体または現在使用されている他のものまたは今後開発されうるものはいずれも、コンピュータプログラム製品とみなされうる。分かるであろうが、これらのプログラム記憶媒体は、典型的には、コンピュータソフトウェアプログラムおよび/またはデータを記憶する。コンピュータソフトウェアプログラムは、コンピュータ制御ロジックとも呼ばれ、典型的には、メモリ記憶デバイスと組み合わせて使用されるシステムメモリおよび/またはプログラム記憶デバイスに記憶される。
いくつかの実施形態では、コンピュータプログラム製品は、記憶された制御ロジック(プログラムコードを含むコンピュータソフトウェアプログラム)を有するコンピュータ利用可能媒体を含めて記載される。制御ロジックは、プロセッサまたはコンピュータにより実行される場合、本明細書に記載の機能を行うようにプロセッサに命令する。他の実施形態では、いくつかの機能は、たとえばハードウェアステートマシンを用いて、主にハードウェアで実行される。本明細書に記載の機能を行うためのハードウェアステートマシンの実行は、関連技術分野の当業者に明らかであろう。
メモリは、プロセッサによるデータの記憶および取出しが可能な任意の好適なデバイス、たとえば、磁気デバイス、光学デバイス、または固体記憶デバイス(たとえば、磁気もしくは光学のディスクもしくはテープもしくはRAM、または任意の他の好適な固定型もしくは携帯型のデバイス)でありうる。プロセッサは、必要なプログラムコードを保有するコンピュータ可読媒体から好適にプログラムされる汎用ディジタルマイクロプロセッサを含みうる。プログラミングは、通信チャネルを介して遠隔でプロセッサに提供可能であるか、またはメモリに接続されたデバイスのいずれかを用いてメモリまたはなんらかの他の携帯型もしくは固定型のコンピュータ可読記憶媒体などのコンピュータプログラム製品にあらかじめ保存可能である。たとえば、磁気または光学ディスクは、プログラミングを保有しうるとともに、ディスクライター/リーダーにより読取り可能である。本発明に係るシステムはまた、プログラミング、たとえば、以上に記載の本方法の実施に使用されるアルゴリズムをコンピュータプログラム製品の形態で含む。本発明に係るプログラミングは、コンピュータ可読媒体、たとえば、コンピュータによる読取りおよび直接アクセスが可能な任意の媒体に記録されうる。かかる媒体としては、磁気記憶媒体、たとえば、フロッピーディスク(登録商標)、ハードディスク記憶媒体、および磁気テープ、光記憶媒体、たとえば、CD−ROM、電気記憶媒体、たとえば、RAMおよびROM、ポータブルフラッシュドライブ、およびこれらのカテゴリーのハイブリッド、たとえば、磁気/光学記憶媒体が挙げられるが、これらに限定されるものではない。
プロセッサはまた、遠隔地の使用者と通信するために通信チャネルを利用しうる。遠隔地とは、使用者がシステムに直接触れることなく、広域ネットワーク(「WAN」)、電話ネットワーク、衛星ネットワーク、または任意の他の好適な通信チャネル、たとえば携帯電話(すなわちスマートフォン)に接続されたコンピュータなどの外部デバイスから入力情報を入力マネージャーに中継することを意味する。
いくつかの実施形態では、本開示に係るシステムは、通信インターフェースを含むように構成されうる。いくつかの実施形態では、通信インターフェースは、ネットワークおよび/または他のデバイスと通信するためのレシーバーおよび/またはトランスミッターを含む。通信インターフェースは、有線または無線の通信用として、たとえば、限定されるものではないが、高周波(RF)通信(たとえば、無線周波数識別(RFID)、Zigbee通信プロトコル、WiFi、赤外、無線ユニバーサルシリアルバス(USB)、ウルトラワイドバンド(UWB)、Bluetooth(登録商標)通信プロトコルおよびセルラー通信、たとえば、符号分割多重アクセス(CDMA)またはモバイル通信グローバルシステム(GSM:登録商標)用として構成可能である。
一実施形態では、通信インターフェースは、主題のシステムと、類似の補完的データ通信用として構成されたコンピュータ端末などの他の外部デバイス(たとえば、診療所または病院環境)とのデータ通信を可能にするように、1つ以上の通信ポート、たとえば、物理的ポートまたはインターフェース、たとえば、USBポート、RS−232ポート、または任意の他の好適な電気接続ポートを含むように構成される。
一実施形態では、通信インターフェースは、主題のシステムと、他のデバイス、たとえば、コンピュータ端末および/またはネットワーク、通信可能携帯電話、パーソナルディジタルアシスタント、またはHIV、AIDS、貧血などの健康状態の治療を管理で使用者が組み合わせて使用しうる任意の他の通信デバイスとが通信可能になるように、赤外線通信、Bluetooth(登録商標)通信、または任意の他の好適な無線通信プロトコル用として構成される。
一実施形態では、通信インターフェースは、携帯電話ネットワーク、ショートメッセージサービス(SMS)、インターネットに接続されたローカルエリアネットワーク(LAN)上のパーソナルコンピュータ(PC)への無線接続、またはWiFiホットスポットでインターネットへのWiFi接続を介して、インターネットプロトコル(IP)を利用してデータ転送するための接続を提供するように構成される。
一実施形態では、主題のシステムは、通信インターフェースを介して、たとえば、802.11またはBluetooth(登録商標)RFプロトコルまたはIrDA赤外プロトコルなどの共通規格を用いて、サーバデバイスと無線通信するように構成される。サーバデバイスは、他のポータブルデバイス、たとえば、スマートフォン、パーソナルディジタルアシスタント(PDA)、もしくはノートブックコンピュータ、またはより大型のデバイス、たとえば、デスクトップコンピュータ、機器などでありうる。いくつかの実施形態では、サーバデバイスは、ディスプレイ、たとえば、液晶ディスプレイ(LCD)、さらには、入力デバイス、たとえば、ボタン、キーボード、マウス、またはタッチスクリーンを有する。
いくつかの実施形態では、通信インターフェースは、以上に記載の通信プロトコルおよび/または機構の1つ以上を用いて、主題のシステム、たとえば、任意選択のデータ記憶ユニットに記憶されたデータを、ネットワークまたはサーバデバイスと自動または半自動で通信するように構成される。
出力コントローラは、人間または機械にかかわらず、ローカルまたはリモートにかかわらず、使用者に情報を提示するために、さまざまな公知の表示デバイスのいずれかに対するコントローラを含みうる。表示デバイスの1つが視覚情報を提供する場合、この情報は、典型的には、画素のアレイとして論理的および/または物理的に組織化されうる。グラフィカルユーザインターフェース(GUI)コントローラは、システムと使用者との間のグラフィカル入出力インターフェースを提供するために、およびユーザ入力を処理するために、さまざまな公知のまたは将来的なソフトウェアプログラムのいずれかを含みうる。コンピュータの機能エレメントは、システムバスを介して互いに通信しうる。これらの通信のいくつかは、ネットワークまたは他のタイプの遠隔通信を用いて、代替的実施形態で達成されうる。出力マネージャーはまた、公知の技術に従って、たとえば、インターネット、電話、または衛星ネットワークを用いて、処理モジュールにより生成された情報を遠隔地の使用者に提供しうる。出力マネージャーによるデータの提示は、さまざまな公知の技術に従って実行されうる。いくつかの例として、データは、SQL、HTML、XML文書、電子メールもしくは他のファイル、または他の形態のデータを含みうる。使用者が遠隔供給元から追加のSQL、HTML、XML、または他の文書またはデータを取り出しうるように、データはインターネットURLアドレスを含みうる。主題のシステムに存在する1つ以上のプラットフォームは、任意のタイプの公知のコンピュータプラットフォームまたは将来開発されるタイプのものでありうるが、それらは、典型的には、サーバとして一般に参照されるクラスのコンピュータであろう。しかしながら、それらはまた、メインフレームコンピュータ、ワークステーション、または他のコンピュータタイプでありうる。それらは、ネットワークまたは他の形で接続された無線システムを含めて任意の公知のまたは将来的なタイプのケーブルまたは他の通信システムを介して接続されうる。それらは同位置であっても物理的に離されていてもよい。選択されるコンピュータプラットフォームのタイプおよび/またはメーカーにおそらく依存して、種々のオペレーティングシステムがコンピュータプラットフォームのいずれかで利用されうる。適切なオペレーティングシステムとしては、Windows NT(登録商標)、Windows XP、Windows 7、Windows 8、iOS、Sun Solaris、Linux(登録商標)、OS/400、Compaq Tru64 Unix、SGI IRIX、Siemens Reliant Unix、および他のものが挙げられる。
キット
本発明の態様はキットをさらに含む。かかるキットは1つ以上のマイクロ流体アッセイカートリッジを含む。いくつかの場合には、キットは、1種以上のアッセイ成分(たとえば、以上に記載されるような標識試薬、緩衝剤など)を含みうる。いくつかの場合には、キットは、必要に応じて、サンプル採取デバイス、たとえば、全血サンプルを得るために皮膚穿刺を行うように構成されたランスまたは針、ピペットなどをさらに含みうる。
図6は、全血を取得するためのランセットとともにパッケージ化されたマイクロ流体カートリッジを有するキットの例を示している。図7は、ある特定の実施形態では一緒にパッケージ化されてボックス中に提供されうる一群のさまざまなタイプのキットの例を示している。
キットの種々のアッセイ成分は、個別の容器中に存在しうるか、またはそれらの一部もしくは全部は、あらかじめ組み合わされうる。たとえば、いくつかの場合には、キットの1つ以上のコンポーネント、たとえば、デバイスは、密閉されたパウチ、たとえば、無菌のフォイルパウチまたはエンベロープの中に存在する。
以上のコンポーネントの他に、主題のキットは、(ある特定の実施形態では)主題の方法を実施するための使用説明書をさらに含みうる。これらの使用説明書は、さまざまな形態で主題のキット中に存在しうる。その1つ以上は、キット中に存在しうる。これらの使用説明書が存在しうる一形態は、好適な媒体または基材に印刷情報として存在するものであり、たとえば、キットの包装材、添付文書などで情報が印刷された1枚または複数枚の紙である。これらの使用説明書のさらに他の形態は、コンピュータ可読媒体、たとえば、ディスケット、コンパクトディスク(CD)、ポータブルフラッシュドライブなどであり、それらに情報が記録されている。存在しうるこれらの使用説明書のさらに他の形態は、遠隔地でインターネットを介して情報にアクセスするために使用しうるウェブサイトアドレスである。
有用性
本開示の方法、システム、マイクロ流体カートリッジ、およびキットは、多種多様な用途で使用され、多くの推定供給源からの多数の異なるタイプのサンプル中のアナライトの存在および量を決定するために使用可能である。本明細書に記載の方法の用途および所望の出力に依存して、アナライトは、定性的に(「存在」対「不在」、「はい、所定の閾値を超える」対「いいえ、所定の閾値を超えない」など)、または定量的に、たとえば、サンプル中の量(たとえば、サンプル中の濃度)として検出されうる。
主題の方法およびシステムは、多くのタイプのアナライト、特に、患者の医学的診断またはケアプロトコルに関連するアナライト、たとえば、限定されるものではないが、タンパク質(遊離のタンパク質および細胞などの構造の表面に結合したタンパク質の両方を含む)、核酸、ウイルス粒子などを特徴付けるために利用可能である。さらに、サンプルは、インビトロ供給源またはインビボ供給源に由来するものでありうる。また、サンプルは診断サンプルでありうる。
本発明の方法を実施する場合には、サンプルは、インビトロ供給源(たとえば、実験室で成長させた細胞培養物からの抽出物)から得られうるか、またはインビボ供給源(たとえば、哺乳類被験者、ヒト被験者、研究動物など)から得られうる。いくつかの実施形態では、サンプルはインビトロ供給源から得られる。インビトロ供給源としては、限定されるものではないが、原核(たとえば、細菌)細胞培養物、真核(たとえば、哺乳動物、菌類)細胞培養物(たとえば、樹立細胞系の培養物、既知または購入の細胞系の培養物、不死化細胞系の培養物、初代細胞の培養物、実験室酵母の培養物など)、組織培養物、カラムクロマトグラフィー溶出液、細胞溶解物/抽出物(たとえば、タンパク質含有ライセート/抽出物、核酸含有ライセート/抽出物など)、ウイルスパッケージング上清などが挙げられる。いくつかの実施形態では、サンプルはインビボ供給源から得られる。インビボ供給源は、生きている多細胞生物を含み、診断サンプルを生成することが可能である。
いくつかの実施形態では、アナライトは診断アナライトである。「診断アナライト」とは、診断を行うために生きている多細胞生物たとえば哺乳動物から得られたかまたはそれに由来するサンプルのアナライトのことである。換言すれば、サンプルは、疾患または病態を診断するために1種以上の疾患アナライトの存在を決定するために得られたものである。したがって、本方法は診断方法である。本方法は「診断方法」であるため、哺乳動物(たとえば、ヒト)などの生きている生物で疾患(たとえば、病気、糖尿病など)または病態(たとえば、妊娠)を診断する(すなわち、存在または不在を決定する)方法である。このため、本開示のある特定の実施形態は、生きている被験者が所与の疾患または病態(たとえば、糖尿病)を有するかを決定するために利用される方法である。「診断方法」はまた、所与の疾患または病態の重症度または状態を決定する方法を含む。
ある特定の実施形態では、本方法は、アナライトが診断サンプル中に存在するかを判定する方法である。このため、本方法は、対象のアナライトが存在するまたは存在しないことがありうるサンプルを評価する方法である。いくつかの場合、アッセイを行う前はアナライトがサンプル中に存在するか不明である。他の場合には、アッセイを行う前はアナライトが所定の閾値量よりも多い(超える)量でサンプル中に存在するか不明である。そのような場合、本方法は、所定の閾値量よりも多い(超える)量で対象のアナライトが存在するまたは存在しないことがありうるサンプルを評価する方法である。
診断サンプルは、インビボ供給源(たとえば、哺乳動物被験者、ヒト被験者など)から得られるものを含み、被験者の組織または細胞から得られたサンプル(たとえば、生検、組織サンプル、全血、分画血液、毛髪、皮膚など)を含みうる。いくつかの場合、被験者に由来する細胞、流体、または組織は、評価前に培養、貯蔵、または操作され、かかるサンプルは、結果を用いて生きている生物の疾患(たとえば、病気、糖尿病など)または病態(たとえば、妊娠)の存在、不在、状態、または重症度が決定されるのであれば、診断サンプルとみなされうる。
いくつかの場合には、診断サンプルは、組織サンプル(たとえば、全血、分画血液、血漿、血清、唾液など)である、または組織サンプル(たとえば、全血、分画血液、血漿、血清、唾液、皮膚、毛髪など)から得られる。診断サンプルの例としては、被験者に由来する細胞および組織の培養物(およびそれらの派生物、たとえば、上清、ライセートなど)、組織サンプルおよび体液、非細胞サンプル(たとえば、カラム溶出液、無細胞バイオ分子、たとえば、タンパク質、脂質、炭水化物、核酸、合成反応混合物、核酸増幅反応混合物、インビトロ生化学反応系または酵素反応系またはアッセイ溶液、または他のインビトロ反応産物およびインビボ反応産物など)などが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
いくつかの実施形態では、主題の方法は、ヘモグロビンのアッセイを提供する。以上で考察したように、ヘモグロビンは、任意のタイプの診断サンプル、たとえば、上清、ライセート、緩衝溶液、さらには全血を含む生物学的サンプル中に存在しうる。一定量の全血がサンプルチャンバ中に負荷され、1つ以上の光源によりスリット投影モジュールを介して照明され、サンプルチャンバ中の全血サンプルを透過した光が捕集され、および検出用の成分波長に空間分離される。全血サンプルのサイズに依存して、サンプルチャンバはマイクロ流体キャピラリーチャネルサンプルチャンバでありうる。1つ以上の波長の透過光からヘモグロビン吸光度を決定可能であるか、または他の選択肢としてヘモグロビン吸収の全スペクトルを計算しうる。主題の方法のこれらの実施形態では、1つ以上の波長の吸光度に基づいて全血サンプル中のヘモグロビン濃度を決定可能である。
ある特定の他の場合には、主題の方法は、試薬フリーのヘモグロビンアッセイを提供する。以上で考察したように、試薬フリーのアッセイは、サンプル中のヘモグロビンと相互作用したりそれを可視化したりするための試薬を利用しないヘモグロビンのアッセイである。したがって、ヘモグロビン(オキシヘモグロビンおよびカルボキシヘモグロビンなどの誘導体を含む)は、試薬修飾を用いることなくその天然の状態でアッセイされる。これらの例では、改変されていない全血サンプルがサンプルチャンバ中に負荷され、スリット投影モジュールを介して1つ以上の光源により照明され、サンプルチャンバ中の全血サンプルを透過した光が捕集され、および検出用の成分波長に空間分離される。全血サンプルのサイズに依存して、サンプルチャンバはマイクロ流体キャピラリーチャネルサンプルチャンバでありうる。1つ以上の波長でヘモグロビン吸光度を検出可能であるか、または他の選択肢としてヘモグロビン吸収の全スペクトルを計算しうる。主題の方法のこれらの実施形態では、1つ以上の波長の吸光度に基づいて改変されていない全血サンプル中のヘモグロビン濃度を決定可能である。
ある特定の他の場合には、主題の方法は、たとえば細胞表面マーカーなどの1種以上の追加のアナライトに関してもアッセイされるサンプルでヘモグロビンアッセイを提供する。これらの実施形態では、特異的結合性メンバー、酵素、基質、酸化剤、さらには1種以上の蛍光マーカーと組み合わされた結合性分子をはじめとする1種以上の試薬を全血に接触させ、試薬混合全血サンプルをサンプルチャンバに負荷する。負荷されたサンプルチャンバ(たとえば、マイクロ流体キャピラリーチャネルサンプルチャンバ)は、スリット投影モジュールを介して1つ以上の光源により照明され、サンプルチャンバ中の全血サンプルを透過した光は捕集され、および検出用の成分波長に空間分離される。1つ以上の波長でヘモグロビン吸光度を検出可能であるか、または他の選択肢としてヘモグロビン吸収の全スペクトルを計算しうる。主題の方法のこれらの実施形態では、1つ以上の波長の吸光度に基づいて試薬混合全血サンプル中のヘモグロビン濃度を決定可能である。試薬混合サンプル中のヘモグロビンのアッセイと組み合わせて、1種以上の追加のアナライトをアッセイしうる。いくつかの場合には、主題の方法は、全血サンプル中に混合された1種以上の試薬に結合する1種以上の細胞表面マーカーをアッセイするためにヘモグロビン吸光度アッセイと組み合わせて行われる蛍光アッセイを提供する。これらの例では、試薬混合全血サンプルが負荷されたサンプルチャンバが蛍光光源により照明され、標的アナライトに結合された蛍光タグからの蛍光発光が捕集され、および検出のために空間分離される。
ある特定の例では、主題の方法は、CD4および%CD4に関して蛍光アッセイされるサンプルでヘモグロビンアッセイを提供する。これらの例では、全血サンプルは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバを有するマイクロ流体カートリッジのサンプル適用部位に適用される。適用されたサンプルは、マイクロ流体キャピラリーチャネルの入口を介して、試薬混合物と全血サンプルとを接触させるための多孔性ディスクを有する試薬混合チャンバ中に移送される。これらの例では、試薬混合物は、乾燥貯蔵安定性試薬CD4−PECy5、CD3−APC、CD45RA−APC、およびCD14−PEを含む。試薬混合全血サンプルは、毛管作用によりサンプルチャンバ中に移送され、サンプルチャンバは、サンプルチャンバを横切るように側方移動されるスリット投影モジュールを介して広帯域白色光LEDと近赤外LEDとの2つの光源によりヘモグロビンアッセイのために照明される。サンプルチャンバを透過した光は、対物拡大レンズにより捕集され、および透過光がCCD検出器の表面上に空間分離されるように回折グレーティング上に自動集束される。2つの波長548nmおよび675nmの吸光度が決定され、ヘモグロビンをアッセイするために散乱を補正した全ヘモグロビン吸光度が計算される。
キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中の試薬混合全血サンプルはまた、試薬混合物中の蛍光タグによる蛍光を検出することによりCD4に関してもアッセイされる。CD4は、キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中の試薬混合全血サンプルを光源により照明することによりアッセイされうるとともに、試薬混合全血サンプル中の蛍光タグからの発光は、共通の対物拡大レンズにより捕集され、およびCDD検出器の表面上に自動集束される。次いで、蛍光画像サイトメトリーによりCD4細胞計数が行われる。
主題の方法は、多種多様なタイプの被験者に由来するサンプルで利用可能である。いくつかの実施形態では、サンプルは、哺乳綱動物に属する被験者、たとえば、食肉目動物(たとえば、イヌおよびネコ)、齧歯目動物(たとえば、マウス、モルモット、およびラット)、ウサギ目動物(たとえば、ウサギ)、霊長動物(たとえば、ヒト、チンパンジー、およびサル)などに由来する。ある特定の実施形態、動物または宿主、すなわち、被験者はヒトである。
以上に提供された本開示から分かるであろうが、本開示は多種多様な用途を有する。したがって、以下の実施例は、本発明をいかに実施および使用するかについての完全な開示および説明を当業者に提供すべく提示されたものであり、本発明者らがその発明に対して意図した範囲を限定しようとするものでもなければ、以下の実験が実施される実験のすべてであることまたはそれのみに限られることを表現しようとするものでもない。当業者であれば、変更または修正を行っても本質的に類似の結果を生じうるさまざまな重要でないパラメータは容易に分かるであろう。したがって、以下の実施例は、本発明をいかに実施および使用するかについての完全な開示および説明を当業者に提供すべく提示されたものであり、本発明者らがその発明に対して意図した範囲を限定しようとするものでもなければ、以下の実験が実施される実験のすべてであることまたはそれのみに限られることを表現しようとするものでもない。使用される数に関して正確を期すべく努力してきたが(たとえば、量、温度など)、いくらかの実験誤差および偏差を考慮すべきである。
実施例1
全血サンプルと混合したときに水和される乾燥貯蔵安定性CD4試薬(たとえば、CD4−PECy5、CD3−APC、CD45RA−APC、およびCD14−PE)を含有する混合チャンバを有するマイクロ流体カートリッジデバイスのサンプル適用部位に全血サンプルのドロップレット(約25μL)を適用する。毛管作用により試薬混合サンプルがキャピラリーチャネルサンプルチャンバ中に移送されるまで、マイクロ流体カートリッジデバイスを静置する。スリットとサンプルチャンバの表面にスリット状ビームを集束させるための縮小レンズとを有するスリット投影モジュールを介して500nm〜850nmの波長範囲を有する広域スペクトルLED光源(逐次的に照明される1つの白色光LEDおよび1つの近IR LED)によりサンプルチャンバを照明する。サンプルチャンバを前進後退運動により移動させてサンプルチャンバを介して光を通過させ、300μm間隔を有する回折グレーティングを用いてCCD検出器上に回折させる。図8は、CCD検出器により検出された光を波長に対してピクセル列のプロットで示している(801)。白色ピクセルは検出光を表す。波長に対して各ピクセル列をプロットして801のプロットを(802)の1−Dスペクトルに圧縮することにより、波長に対して透過光のスペクトルを検出する(803)。(804)でベール・ランベルトの法則を用いて吸光度を計算し、(805)でサンプルによる吸光度のスペクトルを提供する。ヘモグロビンの濃度は、決定された吸光度と、マイクロ流体カートリッジ上のブランク参照ウィンドウを介して光測定時に得られた参照ブランクとに基づいて、計算可能である。
実施例2
乾燥貯蔵安定性試薬を含有する混合チャンバを有するマイクロ流体カートリッジデバイスのサンプル適用部位に25g/Lまたは7g/Lのいずれかのヘモグロビンを有する全血サンプルのドロップレット(約25μL)を適用する。試薬混合サンプルがキャピラリーチャネルサンプルチャンバに達した後、スリットとサンプルチャンバの表面にスリット状ビームを集束させるための縮小レンズとを有するスリット投影モジュールを介して500nm〜850nmの波長範囲を有する広域スペクトルLED光源(逐次的に照明される1つの白色光LEDおよび1つの近IR LED)によりサンプルチャンバを照明する。サンプルチャンバを移動させてサンプルチャンバを介して光を通過させ、回折グレーティングを用いてCCD検出器上に回折させる。CCD検出器からのピクセルプロットを波長に対して透過光の一次元スペクトルに圧縮する。ベール・ランベルトの法則を用いて透過光のスペクトルから吸光度スペクトルを計算する。図9aは、25g/dLの濃度で全血中のヘモグロビンの吸収スペクトルを示している。図9bは、7g/dLの濃度で全血中のヘモグロビンの吸収スペクトルを示している。得られたスペクトルから各濃度のヘモグロビンで569nmの吸光度を決定した。3g/dL、13g/dL、19g/dLのヘモグロビン濃度を有する全血サンプルでプロトコルを繰り返し、各全血サンプルで569nmの吸光度を濃度に対してプロットした。図9cは、ヘモグロビン濃度と569nmの吸光度との間で直線関係を示すことから、スリット投影モジュールを用いた測定は、広範なヘモグロビン濃度にわたり使用可能であることが示唆される。
実施例3
Sysmex XS1000i自動血液システムを用いて120個の新鮮HIV+患者全血サンプル(静脈穿刺および指穿刺の両方のサンプル)を分析し、全血サンプル中のヘモグロビンの濃度を決定した。組み合わせて、乾燥貯蔵安定性CD4アッセイ試薬を含有する混合チャンバを有する個別のマイクロ流体カートリッジデバイスのサンプル適用部位に各サンプルを適用した。スリットとサンプルチャンバの表面にスリット状ビームを集束させるための縮小レンズとを有するスリット投影モジュールを介して500nm〜850nmの波長範囲を有する広域スペクトルLED光源(逐次的に照明される1つの白色光LEDおよび1つの近IR LED)により、120個のマイクロ流体カートリッジデバイスのそれぞれのサンプルチャンバを照明する。サンプルチャンバをスリット状ビーム中で移動させてサンプルチャンバを介して光を通過させ、回折グレーティングを用いてCCD検出器上に回折させる。CCD検出器からのピクセルプロットを波長に対して透過光の一次元スペクトルに圧縮する。ベール・ランベルトの法則を用いて透過光のスペクトルから吸光度スペクトルを計算する。548nmの吸光度を用いて各サンプルのヘモグロビン濃度を計算し、および650nmまたは675nmの吸光度を測定することにより散乱を補正した。図10は、本明細書に記載の吸光度アッセイを用いて決定されたヘモグロビン濃度とSysmex XS1000i自動血液システムを用いて決定されたヘモグロビン濃度とのプロットを示している。図10に示されるように、血液アナライザーと比較して主題の方法を用いて決定されたヘモグロビン濃度との間に強い直線関係が存在する。このことから、主題の方法は全血(静脈穿刺または指穿刺)中のヘモグロビンの臨床的に正確な濃度を提供するために好適であることが示される。
添付の請求項にもかかわらず、本明細書に記載される本開示は、以下の付記によっても定義される。
1.アナライトに関してサンプルをアッセイする方法であって、
スリット状ビームをサンプルチャンバ上に提供するようにスリット投影モジュールを介してサンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程と、
サンプルを透過した光を検出する工程と、
サンプル中のアナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程と
を含む方法。
2.サンプルによる散乱を補償するために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程をさらに含む付記1に記載の方法。
3.サンプルによる散乱を補償するために700nm以下の波長で検出光の吸光度を計算する工程を含む付記1または2に記載の方法。
4.サンプルによる散乱を補償するために650nmで検出光の吸光度を計算する工程を含む付記3に記載の方法。
5.サンプルが1つ以上の広域スペクトル光源により照明される付記1〜4のいずれかに記載の方法。
6.サンプルが2つの広域スペクトル光源により照明される付記5に記載の方法。
7.サンプルが、第1の広域スペクトル光源により500nm〜700nmの波長範囲を有する光で照明され、かつ、第2の広域スペクトル光源により700nm〜830nmの波長範囲を有する光で照明される付記6に記載の方法。
8.広域スペクトル光源は可視光源および近赤外光源を含む付記1〜7のいずれかに記載の方法。
9.スリット投影モジュールを介して照明することによりスリットの形状を有する光ビームを生成する付記1〜8のいずれかに記載の方法。
10.スリット状ビームは、マイクロ流体チャンバの幅より長い長さを有する付記9に記載の方法。
11.スリット状ビームは、マイクロ流体チャンバの幅より短い長さを有する付記9に記載の方法。
12.スリット状ビームは、マイクロ流体チャンバの幅と実質的に同一の長さを有する付記9に記載の方法。
13.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約2.5mm〜約3.5mmの長さを有するスリット状ビームを生成する付記9〜12のいずれかに記載の方法。
14.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約3mmの長さを有するスリット状ビームを生成する付記13に記載の方法。
15.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約25μm〜約75μmの幅を有するスリット状ビームを生成する付記9〜12のいずれかに記載の方法。
16.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約50μmの幅を有するスリット状ビームを生成する付記15に記載の方法。
17.サンプルチャンバの長さに沿ってスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる工程を含む付記9〜16のいずれかに記載の方法。
18.前進後退運動によりスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記9〜16のいずれかに記載の方法。
19.サンプルチャンバの長さの75%以上に沿ってスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記9〜16のいずれかに記載の方法。
20.サンプルチャンバの全長に沿ってスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記9〜16のいずれかに記載の方法。
21.サンプルチャンバの長さに沿って離散増分でスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記1〜20のいずれかに記載の方法。
22.サンプルチャンバの長さに沿って3mmの増分でスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記21に記載の方法。
23.光が各離散増分で検出される付記21または22に記載の方法。
24.アナライトによる光の吸光度が検出光から計算される付記23に記載の方法。
25.サンプルチャンバの長さに沿って連続的にスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記1〜20のいずれかに記載の方法。
26.光がサンプルチャンバの移動時に連続的に検出される付記25に記載の方法。
27.アナライトによる光の吸光度が検出光から計算される付記26に記載の方法。
28.サンプルを透過した光を検出する工程は、サンプルチャンバから捕集された光の波長を空間分離する工程を含む付記1〜27のいずれかに記載の方法。
29.光の波長を空間分離する工程は、回折グレーティングにより光を回折する工程を含む付記28に記載の方法。
30.ブランク参照ウィンドウを照明する工程をさらに含む付記1〜29のいずれかに記載の方法。
31.スリットの非回折像を検出器上に投影する工程をさらに含む付記1〜30のいずれかに記載の方法。
32.校正のためにスリットの非回折像を使用する工程を含む付記31に記載の方法。
33.吸光度が500nm〜600nmの波長で計算される付記32に記載の方法。
34.吸光度が、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、および586nmからなる群から選択される1つ以上の波長で計算される付記33に記載の方法。
35.吸光度が約548nmで計算される項目33または34に記載の方法。
36.吸光度が600nm〜700nmの波長で計算される付記33または34に記載の方法。
37.吸光度が、650nm、675nm、710nm、808nm、815nm、および830nmからなる群から選択される1つ以上の波長で計算される付記33または34に記載の方法。
38.吸光度が675nmで計算される付記36または37に記載の方法。
39.吸光度が500nm〜600nmの第1の波長および600nm〜700nmの第2の波長で計算される付記33〜38のいずれかに記載の方法。
40.吸光度が548nmおよび675nmで計算される付記39に記載の方法。
41.吸光度が548nmおよび650nmで計算される付記39に記載の方法。
42.アナライトはヘモグロビンである付記1〜41のいずれかに記載の方法。
43.アナライトに関してサンプルをアッセイする方法であって、
500nm〜600nmの第1の波長および600nm〜700nmの第2の波長で光源によりサンプルチャンバ中のサンプルを照明する工程と、
サンプルを透過した光を検出する工程と、
サンプル中のアナライトに関してサンプルをアッセイするために第1および第2の波長で検出光の吸光度を計算する工程と
を含む方法。
44.第1の波長は548nmである付記43に記載の方法。
45.第2の波長は675nmである付記43に記載の方法。
46.第2の波長は650nmである付記43に記載の方法。
47.第1の波長は548nmであり、かつ、第2の波長は675nmである付記43に記載の方法。
48.第1の波長は548nmであり、かつ、第2の波長は650nmである付記43に記載の方法。
49.アナライトに関してサンプルをアッセイする方法であって、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバを有するマイクロ流体デバイスをマイクロ流体デバイス用の静止ホルダー中に位置決めする工程と、
スリット状ビームをサンプルチャンバ上に提供するようにスリット投影モジュールを介してサンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程と、
スリット投影モジュールを介して光源によりブランク参照ウィンドウを照明する工程と、
サンプルを透過した光を検出する工程と、
サンプル中のアナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程と
を含む方法。
50.アナライトに関してサンプルをアッセイするためのシステムであって、
広域スペクトル光源と、
広域スペクトル光源に結合されたスリット投影モジュールであって、
スリットであって、広域スペクトル光源からの光ビームをスリットの幅に等しい幅まで狭くするスリットと、
スリットからの光を集束させるフォーカスレンズと
を含む、スリット投影モジュールと、
サンプルからの透過光を集束させる対物レンズと、
回折グレーティングと、
1つ以上の所定の波長の透過光を検出するための検出器と
を含むシステム。
51.広域スペクトル光源は可視光源および近赤外光源を含む付記50に記載のシステム。
52.広域スペクトル光源は、約450nm、約550nm、および約830nmに発光ピークを有する照射プロファイルを含む付記51に記載のシステム。
53.スリット投影モジュールは、
広域スペクトル光源からの光ビームを狭くするように構成されたスリットと、
スリットを通過する光を集束させるためにスリットに結合されたフォーカスレンズと
を含む付記50〜52のいずれかに記載のシステム。
54.スリットは約75μm〜125μmの幅を有する付記53に記載のシステム。
55.スリットは約100μmの幅を有する付記53に記載のシステム。
56.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの幅よりも長い長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記53に記載のシステム。
57.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの幅と実質的に同一の長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記53に記載のシステム。
58.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの幅よりも短い長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記53に記載のシステム。
59.スリット投影モジュールは、約2.5mm〜約3.5mmの長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記50〜58のいずれかに記載のシステム。
60.スリット投影モジュールは、約3mmの長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記50〜58のいずれかに記載のシステム。
61.スリット投影モジュールは、約25μm〜約75μmの幅を有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記50〜58のいずれかに記載のシステム。
62.スリット投影モジュールは、約50μmの幅を有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記61に記載のシステム。
63.スリットは、金メッキ銅、セラミック、クロム、銅、モリブデン、およびタングステンからなる群から選択される材料を含む付記50〜62のいずれかに記載のシステム。
64.スリットに結合されたフォーカスレンズが縮小レンズを含む付記50〜62のいずれかに記載のシステム。
65.フォーカスレンズは二重色消しレンズである付記64に記載のシステム。
66.スリットに結合されたフォーカスレンズは約0.5〜約0.75の倍率を有する付記64または65に記載のシステム。
67.スリットに結合されたフォーカスレンズは約0.6の倍率を有す付記64または65に記載のシステム。
68.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの長さに沿って移動するように構成される付記50〜67のいずれかに記載のシステム。
69.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの長さに沿って離散増分で移動するように構成される付記68に記載のシステム。
70.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの長さに沿って連続的に移動するように構成される付記68に記載のシステム。
71.スリット投影モジュールに対してマイクロ流体チャンバを移動させるように構成されている付記50〜67のいずれかに記載のシステム。
72.マイクロ流体チャンバは離散増分で移動するように構成される付記71に記載のシステム。
73.マイクロ流体チャンバは連続的に移動するように構成される付記71に記載のシステム。
74.対物レンズは1.5〜2.5の倍率を有する付記50〜67のいずれかに記載のシステム。
75.対物レンズは約1.7の倍率を有する付記74に記載のシステム。
76.対物レンズは二重色消しレンズである付記50〜67のいずれかに記載のシステム。
77.光を個別の波長に空間分離するように構成された回折グレーティングをさらに含む付記50〜67のいずれかに記載のシステム。
78.回折グレーティングはフィルタホイール中に位置決めされる付記77に記載のシステム。
79.スリット投影モジュール、対物レンズ、および回折グレーティングは5nm以下の空間分離分解能を提供する付記77に記載のシステム。
80.スリット投影モジュール、対物レンズ、および回折グレーティングは2nm以下の空間分離分解能を提供する付記79に記載のシステム。
81.検出器は電荷結合デバイスである付記50〜80のいずれかに記載のシステム。
82.検出器は、500nm〜600nmの波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される付記50〜80のいずれかに記載のシステム。
83.検出器は、約548nmでサンプルを透過した光を検出するように構成される付記82に記載のシステム。
84.検出器は、600nm〜700nmの波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される付記50〜83のいずれかに記載のシステム。
85.検出器は、約675nmでサンプルを透過した光を検出するように構成される付記84に記載のシステム。
86.検出器は、500nm〜600nmの第1の波長および600nm〜700nmの第2の波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される付記50〜85のいずれかに記載のシステム。
87.第1の波長は約548nmであり、かつ、第2の波長は約675nmである付記86に記載のシステム。
88.広域スペクトル光源と、
広域スペクトル光源に結合されたスリット投影モジュールであって、
スリットであって、広域スペクトル光源からの光ビームをスリットの幅に等しい幅まで狭くするスリットと、
スリットからの光を集束させるフォーカスレンズと
を含む、スリット投影モジュールと、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバを有するマイクロ流体デバイスを受容するように構成されたカートリッジホルダーと、
1つ以上の所定の波長の透過光を検出するための検出器と、
カートリッジホルダー中に位置決めされている、液体サンプルのアッセイを行うように構成されたマイクロ流体デバイスであって、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中への入口に流体連通するサンプル適用部位と、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバと、
サンプル適用部位とキャピラリーチャネルサンプルチャンバとの間に位置決めされた試薬混合チャンバと
を含む、マイクロ流体デバイスと
を含むシステム。
89.広域スペクトル光源は可視光源および近赤外光源を含む付記88に記載のシステム。
90.広域スペクトル光源は、約450nm、約550nm、および約830nmに発光ピークを有する照射プロファイルを含む付記88または89に記載のシステム。
91.スリット投影モジュールは、
広域スペクトル光源からの光ビームを狭くするように構成されたスリットと、
スリットを通過する光を集束させるためにスリットに結合されたフォーカスレンズと
を含む付記88〜90のいずれかに記載のシステム。
92.スリットは約75μm〜125μmの幅を有する付記91に記載のシステム。
93.スリットは約100μmの幅を有する付記91に記載のシステム。
94.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの幅よりも長い長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記91に記載のシステム。
95.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの幅と実質的に同一の長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記91に記載のシステム。
96.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの幅よりも短い長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記91に記載のシステム。
97.スリット投影モジュールは、約2.5mm〜約3.5mmの長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記91に記載のシステム。
98.スリット投影モジュールは、約3mmの長さを有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記97に記載のシステム。
99.スリット投影モジュールは、約25μm〜約75μmの幅を有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記91に記載のシステム。
100.スリット投影モジュールは、約50μmの幅を有するスリットの形状で光ビームを投影するように構成される付記99に記載のシステム。
101.スリットは、金メッキ銅、セラミック、クロム、銅、モリブデン、およびタングステンからなる群から選択される材料を含む付記88〜100のいずれかに記載のシステム。
102.スリットに結合されたフォーカスレンズが縮小レンズを含む付記88〜100のいずれかに記載のシステム。
103.フォーカスレンズは二重色消しレンズである付記102に記載のシステム。
104.スリットに結合されたフォーカスレンズは約0.5〜約0.75の倍率を有する付記102に記載のシステム。
105.スリットに結合されたフォーカスレンズは約0.6の倍率を有する付記102に記載のシステム。
106.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの長さに沿って移動するように構成される付記88〜105のいずれかに記載のシステム。
107.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの長さに沿って離散増分で移動するように構成される付記106に記載のシステム。
108.スリット投影モジュールは、マイクロ流体チャンバの長さに沿って連続的に移動するように構成される付記106に記載のシステム。
109.スリット投影モジュールに対してマイクロ流体チャンバを移動させるように構成されている付記88〜108のいずれかに記載のシステム。
110.マイクロ流体チャンバは離散増分で移動するように構成される付記109に記載のシステム。
111.マイクロ流体チャンバは連続的に移動するように構成される付記109に記載のシステム。
112.対物レンズは1.5〜2.5の倍率を有する付記88〜111のいずれかに記載のシステム。
113.対物レンズは約1.7の倍率を有する付記112に記載のシステム。
114.対物レンズは二重色消しレンズである付記88〜113のいずれかに記載のシステム。
115.光を個別の波長に空間分離するように構成された回折グレーティングをさらに含む付記88〜114のいずれかに記載のシステム。
116.回折グレーティングはフィルタホイール中に位置決めされる付記115に記載のシステム。
117.スリット投影モジュール、対物レンズ、および回折グレーティングは5nm以下の空間分離分解能を提供する付記115に記載のシステム。
118.スリット投影モジュール、対物レンズ、および回折グレーティングは2nm以下の空間分離分解能を提供する付記115に記載のシステム。
119.検出器は電荷結合デバイスである付記88〜118のいずれかに記載のシステム。
120.検出器は、500nm〜600nmの波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される付記88〜119のいずれかに記載のシステム。
121.吸光度が、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、および586nmからなる群から選択される1つ以上の波長で計算される付記120に記載のシステム。
122.検出器は、約548nmでサンプルを透過した光を検出するように構成される付記120に記載のシステム。
123.検出器は、600nm〜700nmの波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される付記88〜119のいずれかに記載のシステム。
124.吸光度が、650nm、675nm、710nm、808nm、815nm、および830nmからなる群から選択される1つ以上の波長で計算される付記123に記載のシステム。
125.検出器は、約675nmでサンプルを透過した光を検出するように構成される付記123に記載のシステム。
126.検出器は、約650nmでサンプルを透過した光を検出するように構成される付記123に記載のシステム。
127.検出器は、500nm〜600nmの第1の波長および600nm〜700nmの第2の波長でサンプルを透過した光を検出するように構成される付記88〜119のいずれかに記載のシステム。
128.第1の波長は約548nmであり、かつ、第2の波長は約675nmである付記127に記載のシステム。
129.第1の波長は約548nmであり、かつ、第2の波長は約650nmである付記127に記載のシステム。
130.キャピラリーチャネルサンプルチャンバは20μm〜70μmの奥行きを有する付記88〜119のいずれかに記載のシステム。
131.試薬混合チャンバは、サンプルと1種以上の試薬とを接触させるための多孔性ディスクを含む付記88〜119のいずれかに記載のシステム。
132.1種以上の試薬は、CD4−PECy5、CD3−APC、CD45RA−APC、CD14−PEを含む付記131に記載のシステム。
133.マイクロ流体デバイスは、キャピラリーチャネルサンプルチャンバに流体連通していない参照ウィンドウをさらに含む付記88〜132のいずれかに記載のシステム。
134.参照ウィンドウは、1つ以上の光源による照明時に参照ブランクとして構成される付記133に記載のシステム。
135.参照ウィンドウはキャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の屈折率を有する付記133に記載のシステム。
136.アナライトに関してサンプルをアッセイするためのシステムを提供する工程であって、システムが、
広域スペクトル光源と、
広域スペクトル光源に結合されたスリット投影モジュールであって、
スリットであって、広域スペクトル光源からの光ビームをスリットの幅に等しい幅まで狭くするスリットと、
スリットからの光を集束させるフォーカスレンズと
を含む、スリット投影モジュールと、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバを有するマイクロ流体デバイスを受容するように構成されたカートリッジホルダーと、
1つ以上の所定の波長の透過光を検出するための検出器と
を含む、工程と、
マイクロ流体デバイスをカートリッジホルダー中に位置決めする工程と、
スリット状ビームをサンプルチャンバ上に提供するようにスリット投影モジュールを介してサンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程と、
サンプルを透過した光を検出する工程と、
サンプル中のアナライトに関してサンプルをアッセイするために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程と
を含む方法。
137.サンプルは1μL〜100μLの体積を有する付記136に記載の方法。
138.サンプルは25μLの体積を有する付記137に記載の方法。
139.マイクロ流体デバイスをカートリッジホルダー中に位置決めする工程は、マイクロ流体デバイスをシステムの内部にスライドさせる工程を含む付記136〜138のいずれかに記載の方法。
140.カートリッジホルダーは、システムからスライドさせてマイクロ流体デバイスを受容するように構成される付記136〜138のいずれかに記載の方法。
141.サンプルによる散乱を補償するために1つ以上の波長で検出光の吸光度を計算する工程をさらに含む付記136〜140のいずれかに記載の方法。
142.サンプルによる散乱を補償するために700nm以下の波長で検出光の吸光度を計算する工程を含む付記136〜140のいずれかに記載の方法。
143.サンプルによる散乱を補償するために650nmで検出光の吸光度を計算する工程を含む付記142に記載の方法。
144.サンプルが1つ以上の広域スペクトル光源により照明される付記136〜143のいずれかに記載の方法。
145.サンプルが2つの広域スペクトル光源により照明される付記136〜143のいずれかに記載の方法。
146.広域スペクトル光源は可視光源および近赤外光源を含む付記136〜143のいずれかに記載の方法。
147.スリット投影モジュールを介して照明することによりスリットの形状を有する光ビームを生成する付記136〜143のいずれかに記載の方法。
148.スリット状ビームはマイクロ流体チャンバの幅より長い長さを有する付記147に記載の方法。
149.スリット状ビームはマイクロ流体チャンバの幅よりも短い長さを有する付記147に記載の方法。
150.スリット状ビームはマイクロ流体チャンバの幅と実質的に同一の長さを有する付記147に記載の方法。
151.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約2.5mm〜約3.5mmの長さを有するスリット状ビームを生成する付記147に記載の方法。
152.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約3mmの長さを有するスリット状ビームを生成する付記151に記載の方法。
153.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約25μm〜約75μmの幅を有するスリット状ビームを生成する付記147に記載の方法。
154.スリット投影モジュールを介してサンプルチャンバを照明することにより約50μmの幅を有するスリット状ビームを生成する付記153に記載の方法。
155.サンプルチャンバの長さに沿ってスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバまたはスリット投影モジュールを移動させる工程を含む付記147に記載の方法。
156.前進後退運動によりスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記147に記載の方法。
157.サンプルチャンバの長さの75%以上に沿ってスリット状ビームを変位させるために十分なようにサンプルチャンバを移動させる付記147に記載の方法。
158.サンプルチャンバの長さに沿ってスリット状ビームを移動させる工程を含む付記147に記載の方法。
159.サンプルチャンバの長さに沿って前進後退運動によりスリット状ビームを移動させる工程を含む付記147に記載の方法。
160.アナライトによる光の吸光度が検出光から計算される付記136〜159のいずれかに記載の方法。
161.光が連続的に検出される付記136〜160のいずれかに記載の方法。
162.アナライトによる光の吸光度が検出光から計算される付記161に記載の方法。
163.アナライトによる光の吸光度が2つ以上の異なる波長で計算される付記136〜162のいずれかに記載の方法。
164.吸光度が500nm〜600nmの波長で計算される付記163に記載の方法。
165.吸光度が、504nm、506nm、514nm、532nm、543nm、548nm、550nm、561nm、568nm、579nm、580nm、585nm、および586nmからなる群から選択される1つ以上の波長で計算される付記164に記載の方法。
166.吸光度が約548nmで計算される付記164に記載の方法。
167.吸光度が600nm〜700nmの波長で計算される付記166に記載の方法。
168.吸光度が、650nm、675nm、710nm、808nm、815nm、および830nmからなる群から選択される1つ以上の波長で計算される付記167に記載の方法。
169.吸光度が675nmで計算される付記167に記載の方法。
170.吸光度が650nmで計算される付記167に記載の方法。
171.アナライトはヘモグロビンである付記136〜170のいずれかに記載の方法。
172.(a)マイクロ流体デバイスであって、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中への入口に流体連通するサンプル適用部位と、
キャピラリーチャネルサンプルチャンバと、
サンプル適用部位とキャピラリーチャネルサンプルチャンバとの間に位置決めされた試薬混合チャンバと
を含む、マイクロ流体デバイスと、
(b)デバイスを収容する容器と
を含む、キット。
173.容器がパウチを含む付記172に記載のキット。
以上の本発明は、明確に理解することを目的として図および例を挙げてある程度詳細に説明されているが、当業者であれば、本開示の教示に照らして、添付の特許請求の趣旨または範囲から逸脱することなく、特定の変更形態および修正形態をなしうることは容易にわかる。
したがって、以上では、本発明の原理を単に例示しているにすぎない。本明細書に明示的に説明も提示もされていないが、本発明の原理を具現化し、その趣旨および範囲に包含される種々の構成を、当業者であれば、考案できるであろうことは分かるであろう。さらに、本明細書に挙げられた実施例および条件語はすべて、読者が本発明の原理を理解することを補助するために主に意図されており、そのような特定的に挙げられた実施例および条件に限定されるものではない。さらに、本発明の原理、態様、および実施形態、さらにはその特定の実施例を述べた本明細書の記載はすべて、それらの構造的および機能的な均等物の両方を包含するものとする。その他に、そのような均等物は、現在知られている均等物および今後開発される均等物(すなわち、構造にかかわらず同一の機能を発揮する任意の開発される要素)の両方を包含するものとする。したがって、本発明の範囲は、本明細書に提示および説明された例示的実施形態に限定されるものではない。より正確に言えば、本発明の範囲および趣旨は、添付の特許請求の範囲により具現化される。
関連出願の相互参照
本出願は、2013年11月13日出願の米国仮特許出願第61/903,804号明細書および2014年3月7日出願の米国仮特許出願第61/949,833号明細書(これらの出願の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に対する優先権を主張する。

Claims (15)

  1. アナライトに関してサンプルをアッセイする方法であって、
    スリット状ビームをサンプルチャンバ上に提供するようにスリット投影モジュールを介して前記サンプルチャンバ中のサンプルを光源により照明する工程と、
    前記サンプルを透過した光を検出する工程と、
    前記サンプル中の前記アナライトに関して前記サンプルをアッセイするために、前記検出した光の吸光度を1つ以上の波長で計算する工程と
    を含むことを特徴とする方法。
  2. 前記サンプルが500nm〜600nmの第1の波長および600nm〜700nmの第2の波長で光源により照明されることを特徴とする請求項1に記載の方法。
  3. 前記サンプルチャンバの長さの75%以上に沿って前記スリット状ビームを変位させるために十分なように前記サンプルチャンバを移動させる工程をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  4. 前記サンプルを透過した光を検出する工程は、前記サンプルチャンバから捕集された光の波長を空間分離する工程を含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  5. 前記サンプルによる散乱を補償するために、前記検出した光の吸光度を1つ以上の波長で計算する工程をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  6. 前記サンプルによる散乱を補償するために、前記検出した光の吸光度を700nm以下の波長で計算する工程を含むことを特徴とする請求項5に記載の方法。
  7. 前記吸光度が548nmおよび675nmで計算されることを特徴とする請求項1に記載の方法。
  8. ブランク参照ウィンドウを照明する工程をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  9. スリットの非回折像を検出器上に投影する工程をさらに含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。
  10. アナライトに関してサンプルをアッセイするためのシステムであって、
    広域スペクトル光源と、
    前記広域スペクトル光源に結合されており、前記広域スペクトル光源からの光ビームを自身の幅に等しい幅まで狭くするスリット、および、前記スリットからの光を集束させるフォーカスレンズを含むスリット投影モジュールと、
    サンプルからの透過光を集束させる対物レンズと、
    回折グレーティングと、
    1つ以上の所定の波長の前記透過光を検出するための検出器と
    を備えることを特徴とするシステム。
  11. 前記フォーカスレンズは、前記スリットに結合され、かつ縮小レンズを含むことを特徴とする請求項10に記載のシステム。
  12. 前記広域スペクトル光源は、可視光源および近赤外光源を含むことを特徴とする請求項10に記載のシステム。
  13. キャピラリーチャネルサンプルチャンバを有するマイクロ流体デバイスを受容するように構成されたカートリッジホルダーと、
    前記カートリッジホルダー中に位置決めされている、液体サンプルのアッセイを行うように構成されたマイクロ流体デバイスであって、
    キャピラリーチャネルサンプルチャンバ中への入口に流体連通するサンプル適用部位、および、キャピラリーチャネルサンプルチャンバ、および、前記サンプル適用部位と前記キャピラリーチャネルサンプルチャンバとの間に位置決めされた試薬混合チャンバを含む、マイクロ流体デバイスと
    をさらに備えることを特徴とする請求項10に記載のシステム。
  14. 前記マイクロ流体デバイスは、前記キャピラリーチャネルサンプルチャンバに流体連通していない参照ウィンドウを含むことを特徴とする請求項13に記載のシステム。
  15. 前記参照ウィンドウは、前記キャピラリーチャネルサンプルチャンバと同一の屈折率を有することを特徴とする請求項14に記載のシステム。
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