JP2016519933A - ソルタギング可能なタンパク質を有する赤血球のinvitro生成 - Google Patents

ソルタギング可能なタンパク質を有する赤血球のinvitro生成 Download PDF

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Abstract

脱核赤血球のin vitro生成のための方法およびそのようにして調製される脱核赤血球が提供される。このような脱核赤血球は、ソルターゼの存在下で表面修飾を可能にするソルタギング可能な表面タンパク質を発現することができる。また、例えば、ペプチド、検出可能な標識、または化学療法剤などの目的薬剤をコンジュゲートした表面修飾脱核赤血球、および被験体への薬剤の送達におけるその使用も本明細書に記載される。【選択図】図16A−F

Description

関連出願
本出願は、米国特許法第119条(e)に基づいて、2013年5月10日に出願された米国仮特許出願第61/822,071号明細書に対する優先権を主張するものであり、この仮特許出願の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれるものとする。
政府の支援
本発明は、国防総省国防高等研究事業局(Defense Advanced Research Projects Agency)(DARPA)からの助成金第HR0011−12−2−0015号の下で、政府の支援によりなされた。政府は本発明において一定の権利を有する。
細胞表面は、表面機能を調整するために、またはそのような表面に新規機能を付与するために修飾することができる。表面の機能化としては、例えば、表面タンパク質への検出可能な標識、結合成分、または治療薬の付加が挙げられ、これにより、表面修飾細胞の検出または単離、天然には存在しない新規の細胞間相互作用の生成、または細胞表面への治療薬または診断薬のコンジュゲーションが可能になる。
細胞表面修飾は、遺伝子工学により、または細胞表面タンパク質の化学修飾により達成することができる。しかしながら、両方のアプローチとも、例えば、多くの表面タンパク質が一定の大きさを超えて挿入されるとその機能または発現が障害を受けることになるという点で、また、多くの化学修飾が非生理学的な反応条件を必要とするという点でその能力が限定されている。
本開示は、ヒトCD34末梢血液細胞を脱核赤血球に分化させるためのin vitro多段階培養工程の開発に基づいている。このin vitro培養工程は、予想外にも、動員されたヒトCD34末梢血液細胞の赤血球系拡大、最終分化、および脱核を同期させた。本開示はまた、赤血球の表面修飾のためのソルタギング系の開発に基づくものであり、この系では、目的薬剤を脱核赤血球の表面にコンジュゲートさせる。脱核赤血球は、本明細書に記載のin vitro多段階培養系により生成させることができる。このような表面修飾された脱核赤血球は、診断および治療の目的に使用することができる。
したがって、本開示の一態様は、ヒト脱核赤血球を生成させるための方法であって、(i)ヒトCD34前駆細胞(例えば、ヒトCD34末梢血液細胞)の集団を準備するステップと、(ii)ヒトCD34前駆細胞の集団を0〜6日間(例えば、4日間)、第1の培地中で拡大させるステップであって、第1の培地がFlt−3リガンド、幹細胞因子(SCF)、インターロイキン3(IL−3)、およびインターロイキン6(IL−6)を含むステップと、(iii)ステップ(ii)から得られる拡大したヒトCD34前駆細胞を4〜7日間(例えば、5日間)、第2の培地中で分化させるステップであって、第2の培地がデキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、SCF、およびエリスロポエチン(EPO)を含むステップと、(iv)ステップ(iii)から得られる細胞を3〜5日間(例えば、4日間)、第3の培地中で分化させるステップであって、第3の培地がSCFおよびEPOを含むステップと、(v)ステップ(iv)から得られる細胞を4〜12日間(例えば9日間)、第4の培地中で分化させてヒト脱核赤血球を生成させるステップであって、第4の培地がEPOを含むステップと、(vi)ステップ(v)から得られるヒト脱核赤血球を収集するステップとを含む方法を特徴とする。一部の実施形態では、上記方法のステップ(ii)〜(v)の合計期間は11〜25日の範囲である。ステップ(v)は、フィブロネクチンなどの細胞外マトリックス由来成分でコーティングされた培養容器中で実施してもよい。
一部の実施形態では、第2、第3、および第4の培地の1つまたは複数は、ホロ型ヒトトランスフェリンおよびインスリンをさらに含む。必要な場合、第2、第3、および第4の培地がすべて、これらの2つのサイトカインをさらに含む。他の実施形態では、第2、第3、および/または第4の培地は、特定のサイトカイン、例えば、トロンボポイエチン(TPO)、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、またはその両方を含まないことがある。
一例では、本明細書に記載のin vitro生成方法の何れにおいても、使用される第2の培地は、250〜1500μg/ml(例えば、500μg/ml)のホロ型ヒトトランスフェリン、5〜20μg/mlのインスリン(例えば、10μg/ml)、100nM〜5μM(例えば、2μM)のデキサメタゾン、0.5〜5μM(例えば、1μM)のβ−エストラジオール、1〜10ng/ml(例えば、5ng)のIL−3、10〜500ng/ml(例えば、100ng/ml)のSCF、および/または2〜10U(例えば、6U)のEPOを含むことができる。第2の培地は、特定のサイトカイン、例えば、Flt−3、IL−6、またはその両方を含まないことがある。
別の例では、本明細書に記載のin vitro生成方法の何れにおいても、使用される第3の培地は、250〜1500μg/ml(例えば、500μg/ml)のホロ型ヒトトランスフェリン、5〜20μg/ml(例えば、10μg/ml)のインスリン、10〜100ng/ml(例えば、50ng/ml)のSCF、および/または2〜10U(例えば、6U)のEPOを含むことができる。第3の培地は、特定のサイトカイン、例えば、Flt−3、IL−6、デキサメタゾン、β−エストラジオール、またはそれらの任意の組合せを含まないことがある。
さらに別の例では、本明細書に記載のin vitro生成方法の何れにおいても、使用される第4の培地は、250〜1500μg/ml(例えば、500μg/ml)のホロ型ヒトトランスフェリン、5〜20μg/ml(例えば、10μg/ml)のインスリン、および/または0.5〜3U(例えば、2U)のEPOを含むことができる。第4の培地は、特定のサイトカイン、例えば、Flt−3、IL−6、デキサメタゾン、β−エストラジオール、SCF、またはそれらの任意の組合せを含まないことがある。
本明細書に記載のin vitro生成方法の何れにおいても、ヒトCD34前駆細胞は、本明細書に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞(天然には存在しない)の何れであっても、例えば、赤血球膜タンパク質と目的ペプチドとを含む融合タンパク質を発現するヒトCD34であってもよい。一部の実施形態では、融合タンパク質は、I型赤血球膜貫通型タンパク質(例えば、グリコフォリンA)であって、I型赤血球膜貫通型タンパク質のN末端でアクセプターペプチドに融合したI型赤血球膜貫通型タンパク質を含む。アクセプターペプチドとしては、オリゴグリシン成分、例えば、1〜5グリシンフラグメント成分、またはオリゴアラニン(例えば、1〜5アラニンフラグメント)成分を挙げることができる。他の実施形態では、融合タンパク質は、II型赤血球膜貫通型タンパク質(例えば、KellまたはCD71)であって、II型赤血球膜貫通型タンパク質のC末端でソルターゼ(例えば、ソルターゼA)により認識される配列を含むペプチドに融合したII型赤血球膜貫通型タンパク質を含む。ソルターゼにより認識可能な配列は、LPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)であり得る。さらに他の実施形態では、膜タンパク質は、グルコース輸送体1(GLUT1)などのIII型赤血球膜貫通型タンパク質である。
別の態様では、本開示は、第1の目的ペプチドと第1の赤血球膜タンパク質とを含む第1の融合タンパク質を表面上に発現する遺伝子操作された脱核血液細胞を提供する。一部の実施形態では、第1の赤血球膜タンパク質はI型赤血球膜貫通型タンパク質(例えば、ヒトグリコフォリンAなどのグリコフォリンA)であり、かつ第1の目的ペプチドはI型赤血球膜貫通型タンパク質のN末端に融合されている。他の実施形態では、第1の赤血球膜タンパク質はII型膜貫通型タンパク質(例えば、KellまたはCD71)であり、かつ第1の目的ペプチドはII型膜貫通型タンパク質のC末端に融合されている。第1の目的ペプチドは、ソルターゼAなどのソルターゼにより認識可能な配列を含むことができる。一例では、ソルターゼにより認識可能な配列は、LPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)である。さらに他の実施形態では、第1の赤血球膜タンパク質は、GLUT1などのIII型赤血球膜貫通型タンパク質である。
一部の実施形態では、第1の融合タンパク質は、目的タンパク質(例えば、診断薬または治療薬になり得る細胞質タンパク質)をさらに含む。目的タンパク質は、細胞質空間に露出される、第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されており、第1の目的ペプチドは、細胞外空間または管腔空間に露出される、第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されている。
一部の例では、第1の赤血球膜タンパク質はI型膜タンパク質(例えば、GPA)であり得る。目的タンパク質はI型膜タンパク質のC末端に融合されており、かつ第1の目的ペプチドはI型膜タンパク質のN末端に融合されている。
他の例では、第1の赤血球膜タンパク質はII型膜タンパク質である。目的タンパク質はII型膜タンパク質のN末端に融合されており、かつ第1の目的ペプチドはI型膜タンパク質のC末端に融合されている。
さらに他の実施形態では、本明細書に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞はさらに、第2の目的ペプチドと第2の赤血球膜タンパク質とを含む第2の融合タンパク質を表面上に発現する。
一部の例では、第1の融合タンパク質中の第1の目的ペプチドは、第1のソルターゼの認識可能部位または受容可能ペプチドを含み、かつ第2の融合タンパク質中の第2の目的ペプチドは、第2のソルターゼの認識可能部位または受容可能ペプチドを含む。第1のソルターゼおよび第2のソルターゼは、異なる認識可能部位および異なる受容可能ペプチドを使用する。一例では、第1の目的ペプチドは、モチーフLPXTA(配列番号2)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)またはオリゴアラニンを含み;かつ第2の目的ペプチドは、LPXTG(配列番号1)モチーフまたはオリゴグリシン(例えば、1〜5個のグリシン残基からなる)を含む。別の例では、第1の融合タンパク質はKellを含み、そのC末端はモチーフLPXTG(配列番号1)を含む第1の目的ペプチドに融合されており、かつ第2の融合タンパク質はGPAを含み、そのC末端はオリゴアラニン(例えば、1〜5個のアラニン残基からなる)を含む第2の目的ペプチドに融合されている。
表面上の2つの融合タンパク質を発現する、本明細書に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞の何れにおいても、融合タンパク質の何れか一方またはその両方を、2つの異なる機能成分にコンジュゲートさせることができる。
上記の脱核血液細胞は、本明細書に記載のin vitro培養方法の何れによっても調製することができる。
一部の実例では、本明細書に記載の赤血球膜タンパク質に融合される第1の目的ペプチド、第2の目的ペプチド、またはその両方は、タンパク質性薬物(例えば、抗体またはその抗原結合フラグメント、これは単一ドメイン抗体であってもよい)、ワクチン抗原、蛍光タンパク質、ストレプトアビジン、ビオチン、酵素、または細胞(例えば、疾患細胞)をターゲティングすることができるペプチドを含むことができる。他の実例では、目的ペプチドは検出可能な標識または化学療法剤にコンジュゲートされる。例えば、目的ペプチドは、脂質、炭水化物、核酸、結合剤、クリックケミストリーハンドル、ポリマー、ペプチド、タンパク質、金属、キレーター、放射標識、または小分子にコンジュゲートさせることができる。
さらに別の態様では、本開示は、被験体に薬剤を送達する方法であって、本明細書に記載の脱核血液細胞の何れかを被験体に投与することを含む方法を提供する。一部の例では、送達される脱核血液細胞は、その細胞が送達される被験体に由来する。
さらに、本明細書に記載の目的ペプチドの何れかを赤血球の表面にコンジュゲートするための方法も本開示の範囲内である。この方法は、(i)膜タンパク質と第1のペプチドとを含む融合タンパク質を発現する赤血球を準備するステップと、(ii)ソルターゼ(例えば、ソルターゼA)の存在下で赤血球を目的ペプチドと、ソルターゼが目的ペプチドを融合タンパク質中の第1のペプチドにコンジュゲートさせるのに適した条件下で接触させるステップとを含む。融合タンパク質中の第1のペプチドまたは目的ペプチドの何れかがソルターゼにより認識される配列を含む。一例では、ソルターゼにより認識可能な配列はLPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)である。
一部の実施形態では、膜タンパク質はI型赤血球膜貫通型タンパク質(例えば、グリコフォリンA)であり、かつ第1のペプチドはI型赤血球膜貫通型タンパク質のN末端に融合したアクセプターペプチド(例えば、1〜5グリシンフラグメントなどのオリゴグリシンフラグメントを含む)であり、目的ペプチドはソルターゼにより認識される配列を含む。他の実施形態では、膜タンパク質はII型赤血球膜貫通型タンパク質(例えば、KellまたはCD71)であり、かつ第1のペプチドはII型赤血球膜貫通型タンパク質のC末端に融合されており、ソルターゼにより認識可能な配列を含む。さらに他の実施形態では、膜タンパク質はGLUTなどのIII型赤血球膜貫通型タンパク質である。
一部の実施形態では、本明細書に記載の方法の何れにおいても、第1の融合タンパク質は、目的タンパク質(例えば、診断薬または治療薬であり得る細胞質タンパク質)をさらに含むことができ、この目的タンパク質は細胞質空間に露出される、第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されている。融合タンパク質中の第1の目的ペプチドは、細胞外空間または管腔空間に露出される、第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されている。
一部の例では、第1の赤血球膜タンパク質はI型膜タンパク質である。第1の目的タンパク質はI型膜タンパク質のC末端に融合されており、第1のペプチドはI型膜タンパク質のN末端に融合されている。他の例では、第1の赤血球膜タンパク質はII型膜タンパク質である。目的タンパク質はII型膜タンパク質のN末端に融合されており、第1のペプチドはI型膜タンパク質のC末端に融合されている。
さらに他の実施形態では、本明細書に記載の方法の何れも、第2のソルターゼの存在下、第2のソルターゼが第2の目的ペプチドを赤血球の表面上に発現される第2の融合タンパク質にコンジュゲートさせるのに適した条件下で赤血球を接触させるステップをさらに含むことができる。第2の融合タンパク質は、第2の赤血球膜タンパク質と第2の目的ペプチドがコンジュゲートする第2のペプチドとを含む。一部の例では、融合タンパク質中の第2のペプチドまたは第2の目的ペプチドの何れかが第2のソルターゼにより認識可能な配列を含む。第1のソルターゼにより認識可能な配列は、第2のソルターゼにより認識可能な配列とは異なる。
一部の例では、第1の融合タンパク質中の第1のペプチドは、第1のソルターゼにより認識可能な配列もしくは第1のソルターゼの受容可能ペプチドを含み、かつ/または第2の融合タンパク質中の第2のペプチドは、第2のソルターゼにより認識可能な配列もしくは第2のソルターゼの受容可能ペプチドを含む。第1のソルターゼの受容可能ペプチドは、第2のソルターゼの受容可能ペプチドとは異なる。第1のソルターゼはスタフィロコッカス・アレウス(Staphylococcus arreus)由来のソルターゼAとすることができる。第1の融合タンパク質中の第1のペプチドおよび第1の目的ペプチドのうちの一方は、モチーフLPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)を含み、かつ他方は、オリゴグリシンである受容可能ペプチドを含む。第1の融合タンパク質はKellを含むことができ、そのC末端はモチーフLPXTG(配列番号1)を含む第1のペプチドに融合されており、かつ第1の目的ペプチドはオリゴグリシン(例えば、1〜5個のグリシン残基からなる)を含む。
一部の例では、第2のソルターゼはストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)由来のソルターゼAである。第2の融合タンパク質中の第2のペプチドおよび第2の目的ペプチドのうちの一方は、モチーフLPXTA(配列番号2)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)を含むことができ、かつ他方は、オリゴアラニン(例えば、1〜5個のアラニン残基からなる)であり得る受容可能ペプチドを含むことができる。第2の融合タンパク質はGPAを含むことができ、そのN末端はオリゴグリシンを含む第2のペプチドに融合されている。第2の目的ペプチドは、モチーフLPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)を含むことができる。
一部の実施形態では、第1および第2の目的ペプチドは、2つの異なる機能成分を含むかまたはそれにコンジュゲートされる。代替的または追加的に、第1の目的ペプチド、第2の目的ペプチド、またはその両方は、タンパク質性薬物、ワクチン抗原、蛍光タンパク質、ストレプトアビジン、ビオチン、酵素、または細胞をターゲティングすることができるペプチドであり得る。一例では、第1および第2の目的ペプチドのうちの一方は、疾患細胞をターゲティングすることができるペプチドである。
さらに、本開示は、(a)診断用途または治療用途用の医薬組成物であって、本明細書に記載の目的ペプチドの何れかを担持する、本明細書に記載の脱核赤血球の何れかと、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物、ならびに(b)診断目的または治療目的の薬物を製造するための、この医薬組成物の使用を提供する。
本発明の1つまたは複数の実施形態の詳細は、以下の説明で示される。本発明の他の特徴または利点は、以下の図面および特定の実施形態の詳細な説明から、また特許請求の範囲から明らかになるであろう。
図1は、ヒトCD34前駆細胞から脱核赤血球を生成させるための例示的なin vitro培養工程を示す図である。 図2は、本明細書に記載のin vitro培養工程における拡大段階および種々の分化段階での細胞の形態を示す写真である。 図3は、FACS分析により判定される、本明細書に記載のin vitro培養工程での拡大段階および種々の分化段階における、細胞の細胞表面マーカーであるグリコフォリンA(CD235)およびc−kitの発現を示す図である。 図4は、FACS分析により判定される、本明細書に記載のin vitro培養工程での拡大段階および種々の分化段階における、細胞の細胞表面マーカーであるグリコフォリンA(CD235)およびトランスフェリン受容体(CD71)の発現を示す図である。 図5は、本明細書に記載のin vitro培養工程における拡大段階および種々の分化段階での細胞の脱核を示す図である。 図6は、種々の分化段階での細胞増殖を示すチャートである。 図7は、およそ20日のウィンドウにおける細胞増殖を示すチャートである。 図8は、hCD34細胞分化の間に示される、グロビン遺伝子の発現を示すチャートである。 図9は、hCD34細胞分化の間に示される、種々の遺伝子の発現を示すチャートである。 図10は、5Gly(配列番号3)−myc−ヒトグリコフォリンA(hGYPAまたはhGPA)融合タンパク質を生成させるためのEF1発現ベクターおよびMSCV発現ベクターの構築を示す図である。 図11は、EF1発現ベクターを使用する、hCD34の赤血球系前駆細胞(種々の分化段階にある)上のソルタギング可能なhGYPAの表面発現を示す図である;5Gly:(配列番号3)。 図12は、MSCV発現ベクターを使用する、hCD34の赤血球系前駆細胞(種々の分化段階にある)上のソルタギング可能なhGYPAの表面発現を示す図である;5Gly:(配列番号3)。 図13は、ウエスタンブロッティングにより判定される、ソルタギングによるhCD34赤血球系前駆細胞上におけるビオチンのhGYPAへのコンジュゲーションを示す写真である;5G:(配列番号3)。 図14は、ソルタギングを介する、最終分化段階にあるヒトCD34細胞の表面へのビオチンのコンジュゲーションを示す図である;5Gly:(配列番号3)。 図15は、ソルタギングを介する、最終分化段階にあるヒトCD34細胞の表面へのビオチンのコンジュゲーションを示す図である;5Gly:(配列番号3)。 図16は、成熟マウス赤血球の表面上におけるグリコフォリンAの発現およびソルターゼ媒介N末端標識化を示す図である。図16Aは、グリコフォリンAのN末端ソルターゼ標識化についての概略図である。3個のグリシン残基および1個のmycタグを含むように、GPAのN末端を伸長させた。C末端ソルターゼ認識モチーフ、LPETG(配列番号44)を含有するプローブとソルターゼをプレインキュベートすると、TとGとの間の切断およびソルターゼ上のCysとプローブ上のThrとの間でのアシル酵素中間体の形成がもたらされる。GPA上のN末端グリシンの求核攻撃により中間体が分解して、プローブがGPAに連結する。このプローブは、ペプチド、タンパク質、脂質、炭水化物、小分子等であり得る。ビオチンのGPAへのコンジュゲーションの場合、プローブはK(ビオチン)LPRTGG(配列番号45);LPXTGG:(配列番号46)である。図16Bは、α−TER119およびα−mycタグ抗体により、対照血液または3G−myc−hGPAを発現するように骨髄移植を受けたマウスからの血液の何れかを染色し、フローサイトメトリーにより分析することによる、細胞表面上の3G−myc−hGPAの存在に関する成熟RBCの評価を示す図である。図16Cは、対照血液または3G−myc−hGPA血液をソルターゼおよびビオチン含有プローブとインキュベートし、α−TER119およびα−ビオチン抗体で染色し、フローサイトメトリーにより分析することによる、ソルターゼ標識化に関する成熟RBCの評価を示す図である。図16Dは、免疫ブロッティングによる、ソルターゼ標識化に関するRBCの評価を示す図である。対照血液または3G−myc−hGPA血液をソルターゼ存在下または非存在下でビオチンプローブとインキュベートし、全細胞タンパク質をSDS−PAGEにより分離し、α−mycタグおよびα−ビオチンに対して免疫ブロットした。α−mycタグ免疫ブロットにおける、ビオチンコンジュゲーションによるGPA分子量のシフトにより、ほぼ完全な修飾が示される。ビオチンをコンジュゲートしたGPAは、α−ビオチン免疫ブロットで矢印により示される。図16Eは、ビオチンでコンジュゲートされたRBCを、フローサイトメトリーによりソートした図を示す。免疫蛍光画像は、成熟RBC上のhGPA(Ter119抗体で標識、紫色)のN末端にあるビオチン(赤色で標識)を示す。図16Fは、HEK293T細胞を3A−myc−hGPA、hKell−LPETG(配列番号44)、またはその両方でトランスフェクトした結果を示す図である。細胞を、S.ピオゲネス(S.pyogenes)ソルターゼおよびビオチンプローブとインキュベートし、次いでS.アウレウス(S.aureus)ソルターゼおよびTAMRA含有プローブとインキュベートした。ビオチンのGPAへの特異的コンジュゲーションおよびTAMRAのKellへの特異的コンジュゲーションが、免疫ブロッティングおよび蛍光イメージングにより示される。 図17は、N末端にmycタグを含有する修飾ヒトGPAおよびマウスGPAの過剰発現が、マウス赤血球系前駆細胞のin vitro分化に影響を与えないことを示す図である。図17Aは、N末端がmycタグで伸長した修飾ヒト(h)またはマウス(m)GPAコンストラクト:myc−hGPAおよびmyc−mGPAを含有するレトロウイルスコンストラクトで感染された、in vitroで分化したマウス胎仔肝臓由来前駆細胞の分化能力に関するフローサイトメトリー分析を示す図である。これらの細胞の分化能力は、Ter119網状赤血球をもたらす、Ter119の発現および脱核、すなわち核排除に基づいて評価される。myc−hGPAまたはmyc−mGPAで感染された赤血球系前駆細胞により生成された網状赤血球のパーセンテージ(約20%)は、空(対照)ベクターで感染された細胞に匹敵しており、これから、これらのコンストラクトは赤血球系の最終分化を妨害しないことが示される。脱核割合の定量は、3つの独立した実験によるものであり、平均値+/−標準偏差として図示した。図17Bは、myc−hGPAまたはmyc−mGPAの表面発現に関する、マウス最終分化赤芽球、すなわち有核赤芽球、および網状赤血球の評価を示す図である。α−mycタグ抗体を使用するフローサイトメトリーにより測定すると、これらの最終分化細胞の60%超が所望の修飾GPAタンパク質を発現した。細胞表面上にmyc−タグを有する赤芽球および網状赤血球のパーセンテージは、3つの独立した実験から決定し、平均値+/−標準偏差として図示した;**はp<0.01を示す。図17Cは、in vitroで最終分化した赤芽球のmycタグ(赤色で標識)の表面発現および脱核能力(青色の核染色)をさらに確認する免疫蛍光画像である。 図18は、N末端に複数(3個または5個)のグリシン(配列番号3)を有する、mycタグ含有の操作されたヒトGPAおよびマウスGPAの過剰発現がマウス赤血球系前駆細胞のin vitroにおける分化に影響を与えないことを示す図である。N末端にmyc−タグおよび3個のグリシンを有する、操作されたヒトGPAを発現する細胞のみが、ソルタギングにより効率的にビオチン標識化することができる。図18Aは、N末端にmycタグおよび複数(3個または5個)のグリシン(配列番号3)(G)が伸長した修飾ヒト(h)またはマウス(m)GPAを含有するレトロウイルスコンストラクト:5G(配列番号3)−myc−hGPA、5G(配列番号3)−mycmGPA、および3G−myc−hGPAで感染された、in vitroで分化したマウス胎仔肝臓由来前駆細胞の分化能力に関するフローサイトメトリー分析を示す図である。これらの細胞の分化能力は、Ter119網状赤血球をもたらす、Ter119の発現および脱核、すなわち核排除に基づいて評価される。上部パネルを参照されたい。5G(配列番号3)−myc−hGPA、5G−myc−mGPA、および3G−myc−hGPAで感染された赤血球系前駆細胞により生成された網状赤血球のパーセンテージ(約17.5%)は、空(対照)ベクターで感染された細胞に匹敵しており、これから、これらのコンストラクトは赤血球系の最終分化を妨害しないことが示される。脱核割合の定量は、3つの独立した実験によるものであり、平均値+/−標準偏差として図示した。下部パネルを参照されたい。図18Bは、5G(配列番号3)−myc−hGPA、5G(配列番号3)−mycmGPA、および3G−myc−hGPAの表面発現に関する、マウス最終分化赤芽球、すなわち有核赤芽球、および網状赤血球の評価を示す図である。α−mycタグ抗体を使用するフローサイトメトリーにより測定すると、これらの最終分化細胞の50%超が所望の修飾GPAタンパク質を発現していた。上部パネルを参照されたい。細胞表面上にmyc−タグを有する赤芽球および網状赤血球のパーセンテージは、3つの独立した実験から決定し、平均値+/−標準偏差として図示した;**はp<0.01を示す。下部パネルを参照されたい。図18Cでは、5G(配列番号3)−myc−hGPA、5G(配列番号3)−myc−mGPA、3G−myc−mGPA、および3G−myc−hGPAを発現するように、HEK 293T細胞にトランスフェクトした。次いで、これらの細胞をソルターゼ存在下または非存在下でビオチンプローブとインキュベートし、全細胞タンパク質をmycタグおよびビオチンについて免疫ブロットした。ビオチンに対する免疫ブロット染色から、ヒトGPAコンストラクトである3G−myc−hGPA(強いバンド)および5G(配列番号3)−myc−hGPA(弱いバンド)へのビオチンコンジュゲーションのみが成功していることが示され、3Gmyc(強いバンド)についてはるかに高い効率であり、また5G(配列番号3)−myc−hGPA(弱いバンド)、3Gmyc−hGPAについてはるかに高い効率である。ビオチンコンジュゲーションによるhGPA分子量のシフトによって示されるように、α−mycタグ免疫ブロッティングにより、ビオチンプローブコンジュゲーションがさらに確認される。 図19は、in vitroで分化した赤芽球の表面上におけるグリコフォリンAの発現およびソルターゼ媒介N末端標識化を示す図である。図19Aは、α−mycおよびα−ビオチンタグ抗体で染色することによる、細胞表面上の3G−myc−hGPAの存在に関する、またソルターゼ標識化ビオチン3G−myc−hGPAに関する、in vitroで分化した赤芽球のフローサイトメトリー分析を示す図である。上部パネルを参照されたい。細胞表面上にmycタグを有する赤芽球および網状赤血球のパーセンテージおよびビオチンプローブでソルタギングされたmycタグ陽性細胞のパーセンテージは、3つの独立した実験から決定し、平均値+/−標準偏差として図示した;**はp<0.01を示す。下部パネルを参照されたい。図19Bは、α−mycタグおよびα−ビオチン抗体を用いた免疫ブロッティングによる、対照または3G−myc−hGPA赤芽球と、ソルターゼおよびビオチン含有プローブとをインキュベートすることによるソルターゼ標識化に関する、in vitroで分化した赤芽球の評価を示す図である。α−mycブロットにおける、ビオチンコンジュゲーションによるhGPA分子量のシフトにより、hGPAの完全な修飾が示される。ビオチンをコンジュゲートしたGPAは、α−ビオチン免疫ブロットにおいて矢印で示される。図19Cは、分化した赤芽球の表面上にあるhGPAのN末端にビオチン(赤色で標識)を示す免疫蛍光を示す図である。核はヘキスト(青色)により染色した。矢印は網状赤血球を示し、一方矢頭は脱核する赤芽球を示す。スケールバーは10μmである。 図20は、マウス骨髄/胎仔肝細胞移植による、操作されたRBC生成の概略図である。単離されたマウス骨髄細胞または胎仔肝細胞に、hKell−LPETG(配列番号44)−HAまたは3G−myc−hGPAを担持するレトロウイルスを形質導入した。致死的な照射を受けたマウスを、形質導入された骨髄または胎仔肝細胞で再構成した。1ヶ月後以降、成熟RBCのかなりのパーセンテージが形質導入されたドナー前駆細胞に由来する。 図21は、成熟マウス赤血球の表面上におけるKellの発現およびソルターゼ媒介C末端標識化を示す図である。図21Aは、KellのC末端のソルターゼ標識化についての概略図である。Kellは、ソルターゼ認識モチーフLPETG(配列番号44)、次いでHAエピトープタグを含むようにC末端が伸長された。Kell−LPETG(配列番号44)を含有する細胞とソルターゼをインキュベートすることにより、認識モチーフ中のTとGとの間でペプチド切断が起こり、ソルターゼ上のCysとKell上のソルターゼモチーフとの間にアシル酵素中間体が形成される。N末端グリシン残基を有する求核性プローブ(GGG−K(ビオチン);配列番号47;ビオチンコンジュゲーション用)を添加すると、中間体が分解して、KellのC末端にプローブが連結する。このプローブは、ペプチド、タンパク質、脂質、炭水化物、小分子等であり得る;LPXTG(配列番号1)。図21Bは、対照血液またはKell−LPETG(配列番号44)を発現するように骨髄移植を受けたマウスに由来する血液の何れかをα−HAタグ抗体により染色し、フローサイトメトリー(成熟RBCに関してゲート制御)により分析することによる、細胞表面上のKell−LPETG(配列番号44)−HAの存在に関する、成熟RBCの評価を示す図である。図21Cは、対照血液またはKell−LPETG(配列番号44)−HA血液と、ソルターゼおよびビオチン含有プローブとをインキュベートし、α−ビオチン抗体で染色し、フローサイトメトリー(成熟RBCに関してゲート制御)により分析することによる、ソルターゼ標識化に関する成熟RBCの評価を示す図である。図21Dは、免疫ブロッティングによる、ソルターゼ標識化に関するRBCの評価を示す図である。対照血液またはKell−LPETG(配列番号44)−HA血液を、ソルターゼ存在下または非存在下でビオチンプローブとインキュベートした。全細胞タンパク質をSDS−PAGEにより分離し、α−HAタグおよびα−ビオチンに対して免疫ブロットした。ソルターゼ標識化によるHAタグの消失により、完全な修飾が示される。図21Eは、成熟RBC上のhKellのC末端にコンジュゲートされたビオチンを示す免疫蛍光画像である(Ter119抗体で標識化)。 図22は、in vitroで分化した赤芽球の表面上におけるKellの発現およびソルターゼ媒介C末端標識化を示す図である。図22Aは、α−HAおよびα−ビオチンタグ抗体で染色することによる、細胞表面上のhKell−LPETG(配列番号44)−HAの存在に関する、またソルターゼ標識化hKell−LPETG(配列番号44)−ビオチンに関する、in vitroで分化した赤芽球のフローサイトメトリーを示す図である。上部パネルを参照されたい。細胞表面上にHAタグを有する赤芽球および網状赤血球のパーセンテージおよびビオチンプローブでソルタギングされたHAタグ陽性細胞のパーセンテージは、3つの独立した実験から決定し、平均値+/−標準偏差として図示した;**はp<0.01を示す。下部パネルを参照されたい。図22Bは、対照またはhKell−LPETG(配列番号44)−HA赤芽球と、ソルターゼおよびビオチン含有プローブとをインキュベートし、次いでビオチンおよびKellに対する免疫ブロッティングを行うことによる、ソルターゼ標識化に関する、in vitroで分化した赤芽球の評価を示す図である。図22Cは、分化した赤芽球の表面上のhKellのC末端にビオチン(赤色で標識)を示す免疫蛍光を示す図である。核はヘキスト(青色)により染色した。矢印は網状赤血球を示し、一方矢頭は脱核する赤芽球を示す。スケールバーは10μmである。 図23は、成熟RBCの表面上のhGPAのN末端およびhKellのC末端におけるソルターゼ媒介2重標識化を示す図である。hKell−LPETG(配列番号44)−HAおよび3A−myc−hGPAを発現する成熟RBCを、S.ピオゲネス(S.pyogenes)由来のソルターゼAおよびK(ビオチン)LPETAA(配列番号45)プローブとインキュベートして、N末端GPA標識化を行うか(第2パネル)、またはS.アウレウス(S.aureus)由来のソルターゼAおよびGGGC(Alexa−647;配列番号48)プローブとインキュベートして、C末端Kell標識化を行うか(第3パネル)、あるいは両方のソルターゼ酵素およびその対応するプローブによる両方の連続的な標識化を行った(第4パネル)。hKell−LPET(配列番号49)とビオチン−myc−hGPAの両方の存在に関する、成熟RBCのフローサイトメトリー分析から2重標識化の成功が示される。 図24は、in vivoにおける、操作された赤血球の生存を示すいくつかのチャートである。図24Aは、ソルターゼの存在下もしくは非存在下での模擬C末端ソルタギング反応に供した野生型RBC(各群、n=3)または無処理の野生型RBC(n=3)をCFSEと反応させ、静脈内注射によりレシピエントマウスに移入した場合の結果を示すチャートである。それらのin vivoでの生存は、CFSE蛍光およびフローサイトメトリーにより追跡した。図24Bは、C末端にLPETG(配列番号44)が伸長した内因性Kellを有するように遺伝子操作されたマウスから得られるmKell−LPETG(配列番号44)RBCの結果を示すチャートである。野生型RBC(n=6)、mKell−LPETG(配列番号44)RBC(n=6)、およびビオチンでソルタギングされたmKell−LPETG(配列番号44)−RBC(n=6)をCFSEで染色し、レシピエントに移入し、フローサイトメトリーを使用してCFSE蛍光または抗ビオチン染色によりそれらの生存をモニターした。図24Cは、CFSE染色の野生型RBC(n=6)、および移植されたマウス(実施例5を参照)から単離し、ビオチンでソルターゼ標識したhKell−LPETG(配列番号44)RBC(n=2)をレシピエントマウスに移入し、血液循環中のそれらの生存を、フローサイトメトリーを使用してCFSE蛍光(野生型RBC)または抗ビオチン染色(hKell−LPETG(配列番号44)−ビオチンRBC)により追跡した結果を示すチャートである。図24Dは、野生型RBC(n=6)およびソルターゼ標識したビオチン−3G−myc−hGPA RBC(n=6)を、CFSE染色し、マウスに移入し、フローサイトメトリーを使用してCFSE蛍光または抗ビオチン染色により追跡した結果を示すチャートである。内部標準RBCは、3G−myc−hGPA移植マウスに由来し、ソルタギング反応およびCFSE染色に供した細胞であるが、野生型である。エラーバーは標準偏差を表わす;はp<0.01を示す。 図25は、操作された赤血球への単一ドメイン抗体のコンジュゲーションおよび細胞型特異的ターゲティングを示す図である。図25Aは、細胞表面上に3G−myc−GPAを含有するように操作されたマウス成熟赤血球を、VHH7−LPETG(配列番号44)の存在下または非存在下のソルターゼ、マウスMHCクラスII分子に対する特異性を有する単一ドメイン抗体、および3Gに相補的なソルターゼモチーフとインキュベートした結果を示す図である。グリコフォリンA上のmycエピトープタグに対する免疫ブロットは、GPA分子量の増加からGPAへのVHH7の融合を示す。図25Bは、野生型マウスB細胞(MHCクラスII)またはMHCクラスIIノックアウトマウス由来B細胞の何れかを、ビオチン化α−CD19抗体を介して磁気ストレプトアビジンビーズ上に固定化し、3G−myc−GPA赤血球またはソルターゼ標識されたVHH7−LPETG(配列番号44)−myc GPAをその表面上に含有する赤血球とインキュベートし、洗浄した結果を示す図である。すべての実験セットアップにおけるB細胞の固定化は、α−CD19免疫ブロットにおけるCD19の存在により試験し、B細胞と赤血球との間の結合は、α−ヘモグロビン免疫ブロットにおけるヘモグロビンの存在によって評価した。図25Cは、図25Bに示す実験の概略図である;LPETG:(配列番号44)。 図26は、in vitroで分化したヒト網状赤血球の表面上におけるグリコフォリンAの発現およびソルターゼ媒介標識化を示す図である。図26Aは、ヒト果粒球コロニー刺激因子により動員された末梢血CD34+幹細胞に、空ベクターまたは3G−myc−GPA−GFPを含有するベクターをウイルス形質導入し、18日間分化させた結果を示す図である。網状赤血球のフローサイトメトリー分析では、形質導入された細胞(GFP)のパーセンテージ、および脱核細胞(下部パネル、ヘキスト染色)のパーセンテージを示す。対照または3G−myc−GPA−GFP(3G−myc−hGPA−GFP−IRES−GFP)形質導入の網状赤血球を、ソルターゼおよびビオチン含有プローブとインキュベートし、α−ビオチン−PE抗体でビオチンに対して染色し、フローサイトメトリーにより分析し、脱核細胞に関してゲート制御した。図26Bは、3G−myc−GPA−GFP形質導入し、in vitroで分化させた網状赤血球をソルターゼ存在下または非存在下でビオチンプローブとインキュベートし、全細胞タンパク質をmycタグおよびビオチンに関して免疫ブロットした結果を示す図である。3G−myc−GPA−GFPの単量体および二量体(より高分子量)は両方とも、両方の免疫ブロットで視認できる。α−mycタグ免疫ブロットにおける、ビオチンコンジュゲーションによるGPA−GFP分子量のシフトから、完全な修飾が示される。
赤血球は血中で最多の細胞型であり、人体の総細胞数の4分の1を占める。RBCは、種々の目的、例えば天然または合成のペイロードのin vivo送達のための、治療および診断における魅力的なツールにRBCをする独自の特性を保有する。Yoo et al.,2011,Nature Reviews.Drug Delivery 10(7):521−535。例えば、成熟赤血球は核を有していない(すなわち、脱核されている)ため、外来遺伝子の残存物を宿主の中へ送達するリスクがないことになる。したがって、幹細胞ベースの療法の重要なリスクである腫瘍原性の可能性(Gruen et al.,2006 Stem cells 24(10):2162−2169)は、これによって排除される。さらに、赤血球は、in vivoで長い寿命、例えば、ヒト血流中で約120日、またはマウスで約50日の寿命を有し、マクロおよびミクロの血液循環の全体にわたって存在する。したがって、生物が利用可能な治療法を担う赤血球の修飾により、in vivoにおいて、効力が延長し、血液循環により灌流される全領域がカバーされる可能性がある。さらに、RBCは約140μmの大きな細胞表面積を有し、その比表面積も好ましい値になっている。また、赤血球は、治療薬または診断薬の送達用の担体として使用される場合、良好な生体適合性を示す。最終的に、古いまたは損傷されたRBCは、細網内皮系の細胞により除去され得る。このように、RBC前駆体のDNAになされたいかなる改変も、脱核に際して除去され、レシピエントへの移入後に異常成長または腫瘍原性がもたらされることはない。
したがって、診断薬または治療薬などの目的薬剤を担持する脱核赤血球を生成させるための方法を開発することは、大きな関心事である。このような脱核赤血球は、例えば、目的薬剤を被験体に送達するために使用することができる。
操作されたRBCは、封入を使用して(Biagiotti et al.,2011,IUBMB life 63(8):621−631;Godfrin et al.,2012,Expert Opinion on Biological Therapy 12(1):127−133;およびMuzykantov,2010,Expert Opinion on Drug Delivery 7(4):403−427)、外来ペプチドの非共有結合によって、またはRBCの表面タンパク質に特異的なモノクローナル抗体への融合によるタンパク質の設置を通して(Murciano,2003,Nature Biotechnology 21(8):891−896;およびZaitsev et al.,2010,Blood 115(25):5241−5248)、作製されている。修飾RBCは、in vivoでの適用を意図する場合、限界に直面する。封入により、かなり多量の物質の捕捉が可能になるが、形質膜の完全性が犠牲になると同時に修飾赤血球の循環半減期が減少する。浸透駆動的な捕捉では、封入に成功し得る物質の化学的性質が限定され、放出部位の制御が困難であり、また封入された酵素は最終目的地でのみ機能し、他の部位での再利用は低くなる。Murciano et al.,2003およびZaitsev et al.,2010。RBC特異的抗体(例えば、抗グリコフォリン抗体)への融合によるRBCへの積荷のターゲティングには限界がある。というのは、RBCへのこの結合方法は非共有結合であり、容易に解離し、そのため送達に利用可能な積荷の循環半減期および量が減少するからである。Murciano et al.,2003およびZaitsev et al.,2010。ターゲティング送達のためにRBCを利用する他の開発には、RBC模倣膜に被覆されたナノ粒子およびRBC形状ポリマーが挙げられる。Yoo et al.,2011 Nature Reviews.Drug Discovery 10(7):521−535。RBCに示唆されたこれらの担体は、in vivoでの生存期間が短い(最大約7日)ため、その治療有用性に限界がある可能性がある。
RBSを操作することに関連した別の技術的困難は、RBCの培養および分化に適したin vitro系がないことである。ヒトCD34細胞培養系が、Miharada et al.,Nat.Biotechnol.,24(10):1255−1256,2006;Sankaran et al.,Science,322(5909):1839−1842,2008、およびGiarratana et al.,Blood,118(19):5071−5079,2011に開示されている。しかしながら、これらの細胞培養系から得られる成熟脱核赤血球は、正常のヒト網状赤血球または赤血球に比較して同様のヘモグロビン含量および/または細胞サイズを示さず、培養過程中に細胞表面分化マーカーの同期した発現を示さなかった。また、Sankaran et.alに教示される細胞培養系では、最終分化した赤血球系細胞または脱核赤血球を生成しなかった。
既存の技術に関連した欠点を考慮すると、体内の特定の部位に多種多様の有用な積荷を運搬できるように、RBCを操作するための新規の方法論を開発する必要がある。
本研究では、多種多様なペイロードの全身送達のための担体として役立つ修飾赤血球が開発された。これらのRBCは、その形質膜上に修飾タンパク質を含有するが、この修飾タンパク質は、標的膜または標的細胞に損傷を与えることなく、天然条件下にてソルターゼ触媒反応で標識することができる。ソルターゼは、遺伝学的にコードすることができない置換基によるRBCの修飾を可能にする広範囲の天然および合成のペイロードに適応する。本研究では、in vitroで分化したマウス赤芽球および成熟マウスRBCへのビオチンの部位特異的コンジュゲーションの成功が示される。予想外にも、これらの修飾赤血球は、当技術分野で公知の方法により操作された赤血球をはるかに超えた最大28日間血流に残存する。RBCに酵素的に結合された単一ドメイン抗体により、抗体標的を発現する標的細胞にRBCが特異的に結合することが可能になる。本研究はヒト赤血球に拡張され、in vitroで分化したヒト網状赤血球の予想外の効率的なソルターゼ媒介標識化を実証する。
本明細書に記載の操作および標識化の方法は、細胞を損傷することもin vivoでの細胞生存に影響を与えることもない。最も重要なことには、操作された赤血球は、小分子、ペプチド、およびタンパク質を含む、多種多様な機能的プローブで標識することができ、そのため、血流への種々の治療物質の担体になる可能性がある。したがって、本明細書に記載の方法は、当技術分野で公知の浸透駆動封入方法にまさる利点を提供する。
ソルターゼ媒介細胞表面標識化は、例えば、インフルエンザ糖タンパク質の輸送を探究するために、以前利用されている。Popp et al.,2012 PLos Pathogens 8(3):e1002604;およびSanyal et al.,2013 Cell Host&Microbe 14(5):510−521。この方法論は修正され、診断目的または治療目的のためのプラットフォームとしての初代細胞に適用された。S.アウレウス(S.aureus)由来のソルターゼA変異体(Chen et al.,2011 PNAS 108(28):11399−11404)は0℃で活性であり、標識化の間に細胞損傷を与えるリスクが低減している。
本明細書に提示の方法に対しては、多くの他の適用が可能であるが、ここではタンパク質およびペプチドから合成化合物および蛍光プローブに及ぶ多種多様の可能なペイロードが案内として役立ち得る。例えば、このような方法により、特定の細胞型への修飾赤血球のターゲティングが可能になろう。さらに、本明細書に記載の方法は、小分子封入の確立したプロトコール(Godfrin et al.,2012)と組み合わせることができる。このシナリオでは、サイトゾルに治療薬が負荷され、かつ細胞型特異的認識モジュールで表面が修飾された操作された赤血球を使用して、体内の正確な組織/部位にペイロードを送達することが可能になろう。赤血球の表面への2種の異なる機能的プローブの結合が本明細書で実証されており、2種の別々のソルターゼのわずかに異なる認識特異性が利用される。したがって、赤血球表面に治療成分とターゲティングモジュールの両方を結合させて、この操作された赤血球を腫瘍または他の疾患細胞に向けることが可能になるはずである。また、このようなターゲティング成分と一緒にイメージングプローブ、すなわち放射性同位元素のコンジュゲーションにより、診断目的に使用することも可能になろう。
本明細書に記載するヒトRBCのin vitroでの生成およびそれらの前駆体の遺伝子操作は、例えばサイトゾル修飾と組み合わせて、この表面操作方法の臨床用途への適用のための強固なプラットフォームを提供することができる(Liu et al.,2010 Blood 115(10):2021−2027;Cong et al.,2013 Science 339(6121):819−826;Mali et al.,Science 339(6121):823−826;Giarratana et al.,2011 Blood 118(19):5071−5079;Douay et al.,2009 Blood 105(1):85−94;およびGriffiths et al.,2012 Blood 119(26):6296−6306)。さらに、輸血の安全性が確立されていることにより、これらの操作された赤血球が実際にヒトに使用される確信が得られる。
したがって、動員されたCD34前駆細胞(例えば、動員されたヒトCD34末梢血液細胞)から脱核赤血球を生成させるためのin vitro多段階培養工程が本明細書に記載される。このような脱核赤血球は、目的タンパク質、例えばソルタギング可能な表面タンパク質を発現するように遺伝子操作することができる。また、ソルターゼ媒介トランスペプチド反応により、目的の1種または複数の薬剤を遺伝子操作された脱核赤血球の表面にコンジュゲートするための方法、ならびに目的の標的成分による修飾膜タンパク質のソルタギングにより目的の標的にRBCを選択的にターゲティングする能力を保持させる一方、ヒトRBCなどの成熟RBC中に目的の細胞質配置タンパク質を生成させるための方法も本明細書に記載される。
I.脱核赤血球を生成させるためのin vitro培養系
CD34前駆細胞(例えば、ヒト被験体由来)から成熟脱核赤血球を生成させるためのin vitro培養工程が本明細書に記載される。この培養工程には、複数の分化段階(例えば、2、3、またはそれ以上の段階)および場合によっては分化段階の前の拡大段階が含まれる。本明細書に記載のin vitro培養工程の合計期間は、11〜25日の範囲(例えば、15〜25日、15〜20日、または18〜21日)に及び得る。一例では、合計期間は21日である。
a.CD34前駆細胞
CD34は、細胞表面糖タンパク質であり、細胞間接着因子として機能する。多くのヒト前駆細胞がこの細胞表面マーカーを発現する。Novershtern et al.,Cell 144:296−309,2011。幹細胞のような前駆細胞には、特定の細胞型に分化する傾向がある。前駆細胞は通常、幹細胞よりも特異的であり、多くの場合、標的細胞に分化するように促進される。赤血球に分化する傾向を保有する任意のCD34+前駆細胞型を、本明細書に記載のin vitro培養工程で使用することができる。そのような前駆細胞は当技術分野で周知である。例えば、Novershtern et al.,Cell 144:296−309,2011を参照されたい。一部の例では、本明細書に記載のin vitro培養工程は、脱核赤血球への分化のための前駆細胞として、動員されたCD34+末梢血液細胞を利用する。CD34+前駆細胞は、他の供給源(例えば、骨髄)に由来する場合もある。
末梢血液細胞などの適切な供給源からCD34細胞集団を分離または単離するために、種々の手法を使用することができる。例えば、CD34に結合するモノクローナル抗体などの抗体を使用して、CD34細胞を濃縮または単離することができる。抗CD34抗体を固体支持体に結合させることができるため、この表面マーカーを発現する細胞を固定化して、この表面マーカーを発現しない細胞からCD34細胞を分離することが可能になる。使用される分離手法では、回収される生細胞の保持が最大化されるべきである。そのような分離手法により、選択された細胞の最大10%、通常は約5%以下、好ましくは約1%以下しかCD34を発現しない細胞亜集団を得ることができる。使用される特定の手法は、分離効率、付随する細胞毒性、実施の容易さおよびスピード、ならびに精巧な装置および/または技術的熟練に対する必要性に依存することになる。
本明細書に記載のin vitro培養工程で使用される、「単離された」または「精製された」CD34細胞集団は、天然では付随している細胞および物質、具体的には、所望の表現型、例えばCD34の発現を欠く細胞を実質的に含まない。実質的に含まないまたは実質的に精製されたものは、少なくとも50%のCD34細胞、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、一層より好ましくは少なくとも90%のCD34細胞を含む。
CD34細胞集団を分離するための手技としては、以下に限定されるものではないが、物理的分離、磁気分離、抗体コーティング磁気ビーズ、親和性クロマトグラフィー、モノクローナル抗体に連結したもしくはモノクローナル抗体と組み合わせて使用される、補体および細胞毒素を含むが、これらに限定されない細胞傷害性薬剤、ならびに固相マトリックス、例えばプレートに結合した抗体による「パニング」、水簸、または他の任意の好都合な手法が挙げられる。
また、物理的分離手法の使用には、物理的特性(密度勾配遠心分離および向流遠心水簸)、細胞表面特性(レクチンおよび抗体親和性)、ならびに生体染色特性(ミトコンドリア結合色素rho123およびDNA結合色素ヘキスト33342)の差に基づくものが含まれる。これらの手技は当業者には周知である。
CD34細胞の正確な分離を提供する手法としてはさらに、フローサイトメトリーが挙げられるが、これは、例えば複数の色チャネル、低角度および鈍角光散乱検出チャネル、インピーダンスチャネルなど、種々の精密度を有し得る。CD34細胞はまた、光散乱特性に基づくフローサイトメトリーにより選択することができ、この場合、標的細胞は低側方散乱プロファイルおよび低から中の前方散乱プロファイルに基づいて選択される。
b.拡大段階
場合によっては、本明細書に記載のin vitro培養工程は、CD34前駆細胞を増殖させる拡大段階を含む。本明細書で使用される場合、拡大または増殖は、細胞数の任意の増加を含む。拡大には、例えば、培養の開始に使用される細胞集団に存在するCD34+細胞の数を超えてCD34+細胞の数が増加することが含まれる。拡大にはまた、既存のCD34+細胞の生存の増大が含まれる。生存という用語は、細胞が生命を保持し続けるかまたは機能し続ける能力を指す。
CD34前駆細胞の集団(例えば、動員されたCD34末梢血液細胞)は、CD34+細胞を拡大するのに適した容器に入れることができる。例えば、細胞集団の培養に適した容器としては、フラスコ、チューブ、またはプレートが挙げられる。一実施形態では、フラスコは、12.5cmまたは75cmのT型フラスコなどのT型フラスコとすることができる。プレートは、10cmプレート、3.5cmプレート、または12、24、もしくは96ウェルプレートなどの複数ウェルプレートとすることができる。ウェルは平底ウェル、v底ウェルでも、u底ウェルでもよい。容器には、細胞接着を促進するためにまたは容器の表面への細胞接着を阻止するために、組織培養に適した任意の処理を施すことができる。このような容器は、Falcon、Corning、およびCostarから市販されている。本明細書で使用される場合、「拡大容器」はまた、独立しているかまたは拡大装置に組み込まれているかに関わらず、細胞を拡大するための任意のチャンバーまたは容器を含むことを意図する。
培養されるCD34細胞集団の細胞密度は、少なくとも約1×10細胞〜約1×10細胞/mLとすることができる。好ましくは、細胞密度は、約1×10〜約1×10細胞/mLとすることができる。細胞は、約2〜20%の酸素濃度で培養することができる。
CD34前駆細胞の集団を拡大するために、以下に限定されるものではないが、ダルベッコMEM、IMDM、X−Vivo 15(血清枯渇)、およびRPMI−1640を含む、種々の培地を使用することができる。このような培地は無血清とすることができる。一実施形態では、培地は、無血清StemSpan(Stem Cell Technologies)であり、これには10μg/mlのヘパリンを添加することができる。
拡大段階に使用される培地は、1種または複数のサイトカインを含有することができる。本明細書で使用される場合、サイトカインは、細胞に対して種々の効果、例えば成長または増殖を促す因子である。in vitro培養工程の1つまたは複数の段階(例えば、拡大段階または以下に記載の分化段階の何れか)に使用することができるサイトカインの非限定例としては、インターロイキン2(IL−2)、インターロイキン3(IL−3)、可溶性IL−6受容体を含むインターロイキン6(IL−6)、インターロイキン12(IL12)、G−CSF、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、インターロイキン1アルファ(IL−1α)、インターロイキン11(IL−11)、MIP−1α、白血病抑制因子(LIF)、c−kitリガンド、およびflt3リガンドが挙げられる。一部の例では、本明細書に記載のin vitro培養工程またはその任意の段階では、1種または複数のサイトカインが培地から特異的に排除される培養条件が含まれ得る。サイトカインは、例えば、Amgen(Thousand Oaks,Calif.)、R&D Systems and Immunex(Seattle,Wash.)などのいくつかのベンダーから市販されている。サイトカインにはまた、繊維芽細胞増殖因子(FGF)(例えば、FGF−1またはFGF−2)、インスリン様増殖因子(例えば、IGF−2またはIGF−1)、トロンボポイエチン(TPO)、および幹細胞因子(SCF)、またはそれらのアナログおよび均等物が含まれ得る。それらの均等物としては、野生型または精製形態(例えば、組換えで生成)で、これらの因子(例えば、FGF、TPO、IGF、およびSCF)と同様の生物活性を有する分子が挙げられる。アナログとしては、所望の活性を保持するフラグメントおよび関連分子が挙げられる。例えば、TPOはmp1受容体のリガンドであり、そのため、mp1受容体に結合し、mp1へのTPO結合に関連した1つまたは複数の生物作用を惹起することができる分子もまた本発明の範囲内である。TPOミメティックの一例は、Cwirla et.al.(1997)Science 276:1696に見出される。
一例では、本明細書に記載のin vitro培養工程の拡大段階は、以下のように行なうことができる。動員されたヒトCD34末梢血液細胞の集団を、10×10〜10×10(例えば、1×10)細胞/mLの細胞密度で拡大用容器に入れる。CD34細胞を、Flt−3リガンド、SCF、IL−3、およびIL−6のサイトカイン混合物、ならびに2%のペニシリンおよびストレプトマイシンを添加した拡大培地(例えば、StemSpan無血清培地)中で、適切な条件(例えば、37℃)の下、1〜6日間(例えば、2〜5日間、3〜4日間、または4日間)培養する。拡大したCD34+細胞を回収し、成熟脱核赤血球への分化を可能にする条件下で、さらなるin vitro培養に供することができる。
C.複数の分化段階
本明細書に記載のin vitro培養工程には、CD34+前駆細胞が成熟脱核赤血球に分化する、複数の分化段階(2、3、4、またはそれ以上)が含まれる。各分化段階では、CD34+前駆細胞(拡大段階から得られたものかもしくは本来の供給源から収集されたもの)または前の分化段階から得られた細胞を、適切な条件下で適切な期間、1種または複数の適切なサイトカイン(例えば、本明細書に記載のもの)を含む培地中で培養することができる。赤血球形成状態を評価するために、各分化段階の間またはその終了時に、細胞のサイズおよび表面マーカーの発現など細胞の生物学的特性をモニターすることができる。必要な場合はいつでも、最適な赤血球系分化および/または培養中の細胞集団の同期化を達成するように、各分化段階でサイトカインを適時に供給または除去することができる。
分化段階のそれぞれにおいて、本明細書に記載の拡大段階から得られたかもしくは本来の供給源(例えば、ヒト末梢血)から単離されたCD34+前駆細胞または前の分化段階から得られた細胞を、適切な培養条件下で適切な期間、1種または複数の適切なサイトカインを添加した、本明細書に記載のものなどの適切な培地中で培養することができる。一例では、培地(例えば、IMDM)に、適切な濃度のホロ型ヒトトランスフェリンおよびインスリンが添加される。例えば、ホロ型ヒトトランスフェリンの濃度は、250〜1,500μg/ml(例えば、250〜1,000μg/ml;300〜800μg/ml、または400〜600μg/ml)の範囲であり;インスリンの濃度は、5〜20μg/ml(例えば、5〜15μg/ml、5〜10μg/ml、または10〜20μg/ml)の範囲とすることができる。培地にはまた、細胞培養で一般に使用される他の成分、例えば、ウシ胎仔血清、グルタミン、ウシ血清アルブミン、1種もしくは複数の抗生物質(例えば、ペニシリンおよびストレプトマイシン)、またはそれらの任意の組合せを添加することができる。
一部の実施形態では、本明細書に記載のin vitro培養工程は、3つの分化段階、分化段階I(「分化I」)、分化段階II(「分化II」)、および分化段階III(「分化III」)を含む。
分化Iでは、細胞は、グルココルチコイド(例えば、デキサメタゾン)、β−エストラジオール、IL−3、SCF、およびEPO(ヒトEPO、他の種からのEPO、またはエポエチンアルファ、エポエチンベータ、もしくはダルベポエチンアルファなどのEPOアナログを含む)を含む、適切な濃度のサイトカインの混合物の存在下で、適切な期間(例えば、4〜7日間、4〜6日間、5〜7日間、または5〜6日間)培養することができる。一部の例では、デキサメタゾンの濃度は、100nM〜5μM(例えば、100nM〜2μM、500nM〜5μM、1μM〜3μM、1μM〜2μM、または2μM〜5μM)の範囲とすることができる。β−エストラジオールの濃度は、0.5〜5μM(例えば、0.5〜4μM、1〜5μM、0.5〜3μM、0.5〜2μM、0.5〜1μM、1〜2μM、1〜3μM、または3〜5μM)の範囲とすることができる。IL−3の濃度は、1〜10ng/ml(例えば、1〜8ng/ml、1〜5ng/ml、3〜6ng/ml、4〜8ng/ml、または5〜10ng/ml)の範囲とすることができる。SCFの濃度は、10〜500ng/ml(例えば、10〜300ng/ml、50〜500ng/ml、50〜200ng/ml、50〜100ng/ml、100〜200ng/ml、または100〜400ng/ml)の範囲とすることができる。代替的または追加的に、EPOの量は、2〜10U(例えば、2〜8U、2〜6U、5〜10U、または6〜10U)の範囲とすることができる。当技術分野で周知のように、1EPO単位は、げっ歯類(歴史的に、絶食ラット)において、5マイクロモルの塩化コバルトと同じ赤血球刺激応答を誘発する。例えば、Jelkmann,Nephrol Dial.Transplant,2009を参照されたい。一部の例では、分化Iで使用される培地は、ホロ型ヒトトランスフェリン、インスリン、デキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、SCF、およびEPOを含有する。この培地は、Flt−3リガンドまたはIL−6などの特定の他のサイトカインを実質的に含まないか、または他のサイトカインを実質的に含まないことがある。
分化IIでは、分化Iから得られた細胞を、SCFおよびEPOを含む、適切な濃度のサイトカインの混合物の存在下、適切な期間(例えば、3〜5日間、3〜4日間、または4〜5日間)培養することができる。一部の例では、SCFの濃度は、10〜100ng/ml(例えば、10〜80ng/ml、20〜80ng/ml、20〜50ng/ml、30〜50ng/ml、40〜50ng/ml、50〜80ng/ml、または50〜60ng/ml)の範囲とすることができる。代替的または追加的に、EPOの量は、2〜10U(例えば、2〜8U、2〜6U、5〜10U、または6〜10U)の範囲とすることができる。一部の例では、分化IIで使用される培地は、ホロ型ヒトトランスフェリン、インスリン、SCF、およびEPOを含有する。この培地は、Flt−3、IL−6、デキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、またはそれらの任意の組合せなどの特定のサイトカインを実質的に含まないか、または他のサイトカインを実質的に含まないことがある。
分化IIIでは、分化IIから得られた細胞を、適切な濃度のEPOの存在下、適切な期間(例えば、4〜12日間、5〜10日間、8〜12日間、または8〜10日間)培養することができる。一部の例では、EPOの量は、0.5〜3U(例えば、1〜3U、0.5〜2U、1〜2U、または2〜3U)の範囲とすることができる。一部の例では、分化IIIで使用される培地は、ホロ型ヒトトランスフェリン、インスリン、およびEPOを含有する。この培地は、特定のサイトカイン、例えば、Flt−3、IL−6、デキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、SCF、またはそれらの任意の組合せを実質的に含まないか、または他のサイトカインを実質的に含まないことがある。
一部の実施形態では、本明細書に記載のin vitro培養工程は、本明細書に記載の分化段階の1つまたは任意の組合せ、例えば、分化Iと分化III、分化IIと分化III、または分化Iと分化IIを含むことができる。
分化段階の前に、CD34前駆細胞は、目的の表面タンパク質、例えば、ソルタギング可能な表面タンパク質を発現するように遺伝子改変することができるが、これは以下に詳細に説明される。
II.目的の表面タンパク質を発現する赤血球の調製
ソルタギング可能な表面タンパク質、緑色蛍光タンパク質(GFP)などの蛍光タンパク質、またはタンパク質性薬物(例えば、抗体またはその抗原結合フラグメント)など、目的の表面タンパク質を発現することができる、遺伝子操作された赤血球を調製する方法も本明細書に記載される。
(a)前駆細胞の遺伝子改変
目的の表面タンパク質を生成させるための発現ベクターを、CD34前駆細胞に導入することができるが、この前駆細胞は、本来の供給源から単離することも、またはルーチン的な組換え技術により上記の拡大段階から得ることもできる。一部の実例では、発現ベクターは、当技術分野で公知の方法により、相同または非相同組換えによる細胞ゲノムへの組込みができるように設計することができる。CD34前駆細胞に発現ベクターを導入するための方法としては、以下に限定されるものではないが、ウイルス媒介遺伝子導入、リポソーム媒介導入、形質転換、トランスフェクション、および形質導入、例えば、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、およびヘルペスウイルスなどのDNAウイルスに基づくベクターならびにレトロウイルスベースのベクターの使用などのウイルス媒介遺伝子導入が挙げられる。遺伝子導入方法の例としては、例えば、裸のDNA、CaPO沈殿、DEAEデキストラン、エレクトロポレーション、プロトプラスト融合、リポフェクション、細胞マイクロインジェクション、およびウイルスベクター、アジュバント支援DNA、遺伝子銃、カテーテルが挙げられる。一例では、ウイルスベクターが使用される。細胞への非ウイルスベクターの送達を増強するために、核酸またはタンパク質を、細胞表面抗原、例えばCD34に結合する抗体またはその結合フラグメントにコンジュゲートすることができる。ターゲティング抗体またはそのフラグメントをさらに含むリポソームを、本明細書に記載の方法で使用することができる。
本明細書に記載される「ウイルスベクター」は、in vivo、ex vivo、またはin vitroで宿主細胞に送達されるポリヌクレオチドを含む、組換えにより生成したウイルスまたはウイルス粒子を指す。ウイルスベクターの例としては、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター等のレトロウイルスベクターが挙げられる。遺伝子導入がレトロウイルスベクターにより媒介される態様では、ベクターコンストラクトは、レトロウイルスゲノムまたはその一部および治療用遺伝子を含むポリヌクレオチドを指す。
目的の表面タンパク質をコードする遺伝子は、当技術分野で周知の方法を使用して、適切なベクター(例えば、レトロウイルスベクター)に挿入することができる。Sambrook et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Mannual,3rd Ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press。例えば、遺伝子およびベクターを適切な条件下で制限酵素と接触させて、互いと対を形成し、リガーゼで互いに連結することができる相補末端を各分子上に生成させることができる。あるいは、合成の核酸リンカーを遺伝子の末端に連結することができる。これらの合成リンカーは、ベクター中の特定の制限部位に対応する核酸配列を含有する。加えて、ベクターは、例えば、以下のうちの一部または全部を含有することができる:選択可能マーカー遺伝子、例えば、哺乳類細胞において、安定なまたは一過性のトランスフェクタントを選択するためのネオマイシン遺伝子;高レベル転写のための、ヒトCMVの前初期遺伝子由来のエンハンサー/プロモーター配列;mRNAの安定性のための、SV40由来の転写終結シグナルおよびRNAプロセシングシグナル;SV40ポリオーマの複製起点および適切なエピソーム複製のためのColE1;多用途の多重クローニング部位;ならびにセンスおよびアンチセンスRNAのin vitro転写のためのT7およびSP6のRNAプロモーター。導入遺伝子を含有するベクターの生成に適したベクターおよび方法は当技術分野で周知であり、入手可能である。Sambrook et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Mannual,3rd Ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press。
CD34前駆細胞の修飾は、導入された遺伝子の構成的発現または誘導性発現のために作製された発現カセットの使用を含むことができる。そのような発現カセットは、プロモーター、開始コドン、停止コドン、およびポリアデニル化シグナルなどの調節エレメントを含むことができる。これらのエレメントは、好ましくは、個体に投与(例えば、点滴)後、前駆細胞または前駆細胞から生じる細胞(例えば、脱核赤血球)において作動可能である。さらに、これらのエレメントは、目的の表面タンパク質をコードする遺伝子に作動可能に連結することができ、それによりこの遺伝子は前駆細胞またはそれに由来する赤血球で作動する(例えば、発現される)。
種々のプロモーターを目的の表面タンパク質の発現に使用することができる。タンパク質を発現するために使用することができるプロモーターは、当技術分野で周知である。プロモーターとしては、サイトメガロウイルス(CMV)中初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスLTR、HIV−LTR、HTLV−1 LTRなどのウイルスLTR、シミアンウイルス40(SV40)初期プロモーター、大腸菌(E.coli)lac UV5プロモーター、および単純ヘルペスtkウイルスプロモーターが挙げられる。
調節可能なプロモーターも使用することができる。そのような調節可能なプロモーターとしては、lacオペレーターを保持する哺乳類細胞プロモーターからの転写を調節するための転写モジュレーターとして大腸菌(E.coli)に由来するlacリプレッサーを使用するもの[Brown,M.et al.,Cell,49:603−612(1987)]、テトラサイクリンリプレッサー(tetR)を使用するもの[Gossen,M.,and Bujard,H.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:5547−5551(1992);Yao,F.et al.,Human Gene Therapy,9:1939−1950(1998);Shockelt,P.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,92:6522−6526(1995)]が挙げられる。他の系としては、FK506二量体、アストラジオールを使用するVP16もしくはp65、RU486、ジフェノールムリスレロン(diphenol murislerone)、またはラパマイシンが挙げられる。誘導性の系は、Invitrogen、Clontech、およびAriadから入手可能である。
オペロンと共にリプレッサーを含む調節可能なプロモーターを使用することができる。一実施形態では、lacオペレーターを保持する哺乳類細胞プロモーターからの転写を調節するために、大腸菌(E.coli)由来のlacリプレッサーを転写モジュレーターとして機能させることができる[M.Brown et al.,Cell,49:603−612(1987)];GossenおよびBujard(1992);[M.Gossen et al.,Natl.Acad.Sci.USA,89:5547−5551(1992)]は、テトラサイクリンリプレッサー(tetR)を転写アクチベーター(VP16)と組み合わせて、tetR−哺乳類細胞転写アクチベーター融合タンパク質、tTa(tetR−VP16)を作製し、ヒトサイトメガロウイルス(hCMV)主要前初期プロモーターに由来する、tetOを保持する最小プロモーターと組み合わせて、哺乳類細胞において遺伝子発現を制御するためのtetR−tetオペレーター系を作製した。一実施形態では、テトラサイクリン誘導性スイッチが使用される。テトラサイクリンオペレーターがCMVIEプロモーターのTATAエレメントの下流に適切に配置されると、tetR−哺乳類細胞転写因子融合誘導体よりもむしろテトラサイクリンリプレッサー単独(tetR)が、哺乳類細胞において強力なトランスモジュレーターとして機能して、遺伝子発現を調節することができる[F.Yao et al.,Human Gene Therapy、前出]。このテトラサイクリン誘導性スイッチの1つの特別な利点は、その調節可能な効果を達成するために、場合によっては細胞にとって有毒になり得るテトラサイクリンリプレッサー−哺乳類細胞トランス活性化因子またはリプレッサー融合タンパク質の使用を必要としないことである[M.Gossen et al.,Natl.Acad.Sci.USA,89:5547−5551(1992);P.Shockett et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,92:6522−6526(1995)]。
一部の誘導性プロモーターの有効性は、時間経過と共に増大することがある。そのような場合には、複数のリプレッサーを縦列に挿入する、例えば、配列内リボソーム進入部位(IRES)によりTetRをTetRに連結させることによって、そのような系の有効性を増強させることができる。あるいは、所望の機能をスクリーニングする前に、少なくとも3日間待ってもよい。サイレンシングが一部起こることもあるが、これは、適切な細胞数、好ましくは少なくとも1×10、より好ましくは少なくとも1×10、さらにより好ましくは少なくとも1×10、一層より好ましくは1×10を使用することによって最小化することができる。この系の有効性を増強する公知の手段により所望のタンパク質の発現を増強することができる。例えば、Woodchuck肝炎ウイルス転写後調節エレメント(WPRE)を使用する。Loeb,V.E.,et al.,Human Gene Therapy 10:2295−2305(1999);Zufferey,R.,et al.,J.of Virol.73:2886−2892(1999);Donello,J.E.,et al.,J.of Virol.72:5085−5092(1998)を参照されたい。
本明細書に記載の方法を実施するのに有用なポリアデニル化シグナルの例としては、以下に限定されるものではないが、ヒトコラーゲンIポリアデニル化シグナル、ヒトコラーゲンIIポリアデニル化シグナル、およびSV40ポリアデニル化シグナルが挙げられる。
調節エレメントに作動可能に連結された表面タンパク質コード化遺伝子を含む外来性遺伝物質は、機能する細胞質分子、機能するエピソーム分子として細胞内に存在し続けても、または細胞の染色体DNAに組み込まれてもよい。外来性遺伝物質は、細胞に導入されて、プラスミドの形態で別個の遺伝物質として留まってもよい。あるいは、染色体に組み込まれ得る直鎖状DNAを細胞に導入することもできる。細胞にDNAを導入するときに、染色体へのDNA組込みを促進する試薬を加えてもよい。組込みを促進するのに有用なDNA配列をDNA分子に含めることもできる。あるいは、RNAを細胞に導入することもできる。
本明細書に記載の前駆細胞への所望の導入遺伝子の取り込みをモニターするために、選択可能マーカーを使用することができる。これらのマーカー遺伝子は、任意のプロモーターまたは誘導性プロモーターの制御下に置くことができる。これらは当技術分野で公知であり、栄養素、抗生物質等の刺激に対する細胞の感受性を変化させる遺伝子を含む。遺伝子としては、neo、puro、tk、多剤耐性(MDR)等に対するものが挙げられる。他の遺伝子は、緑色蛍光タンパク質(GFP)、青色蛍光タンパク質(BFP)、ルシフェラーゼ、およびLacZなどの容易にスクリーニングできるタンパク質を発現する。
(b)ソルタギング可能な表面タンパク質を発現するための遺伝子改変
一部の実施形態では、CD34前駆細胞は、赤血球膜タンパク質とペプチド(例えば、膜タンパク質に異種のペプチド)とを含む融合タンパク質などのソルタギング可能な表面タンパク質を発現できるように、本明細書に記載または当技術分野で公知の任意の方法を使用して遺伝子改変することができる。ソルタギング可能な表面タンパク質は、ソルターゼ媒介ペプチド転移反応により、別のペプチドにコンジュゲートすることができる。Strijbis et al.,Traffic 13(6):780−789,2012。好ましくは、ソルタギング可能な表面タンパク質をコードする遺伝子によるCD34前駆細胞の形質導入は、レトロウイルスベクターなどのウイルスベクターを介するものである(例えば、国際公開第94/29438号パンフレット、国際公開第97/21824号パンフレット、および国際公開第97/21825号パンフレットに記載のように)。
ソルタギング可能な表面タンパク質は、膜タンパク質と少なくとも1つの異種タンパク質とを含む融合タンパク質とすることができる。一部の実施形態では、成熟RBC上に存在し得る、本明細書に記載の方法で使用される膜タンパク質は、赤血球系分化を阻害することも、脱核および後期網状赤血球段階で起こる広範な膜リモデリング中に分解の標的にされることもない。そのような膜タンパク質は当技術分野で公知である。例えば、Liu et al.,2010,Blood,115(10):2021−2027を参照されたい。例えば、赤血球前駆体は高レベルのトランスフェリン受容体(Tfr)、II型膜タンパク質を発現するが、Tfrは、成熟RBC上にはもはや存在しないため、ソルタギング可能な表面タンパク質の調製に使用される適切な標的にはなり得ない。成熟RBCに存在する任意の膜タンパク質を、本明細書に記載のソルタギング可能な表面タンパク質を構築するために使用することができる。膜タンパク質は、細胞外空間または管腔空間に露出される末端で異種ペプチドに融合することができる。一部の例では、細胞質に露出される膜タンパク質の末端も、細胞質タンパク質になり得る、第2の目的異種タンパク質に融合することができる。
膜タンパク質のN末端が細胞外空間または管腔空間に露出される場合(例えば、I型膜タンパク質)、異種タンパク質は、ソルターゼ触媒ペプチド転移反応により別のペプチドがコンジュゲートすることができるアクセプターペプチドを含んでもよい。典型的には、アクセプターペプチドは、1〜5グリシンフラグメントまたは1〜5アラニンフラグメントなどのオリゴグリシンまたはオリゴアラニンである。一部の例では、オリゴグリシンは3個または5個のグリシン(配列番号3)残基からなる。他の例では、オリゴアラニンは3個または5個のアラニン残基(配列番号79)からなる。
一例では、ソルタギング可能な表面タンパク質は、グリコフォリンA、細胞間接着分子4(ICAM−4)、ルーテル(Lutheran)糖タンパク質(CD329)、ベイシジン(CD147)、およびアクセプターペプチドを含むペプチド(例えば、1〜5グリシンフラグメントなどのオリゴグリシン成分を含むペプチド)などのI型赤血球膜貫通型タンパク質を含む融合タンパク質である。これらの膜タンパク質はヒトタンパク質とすることができる。アクセプターペプチドは、I型膜貫通型タンパク質のN末端に融合される。I型膜貫通型タンパク質は、細胞外空間または管腔空間に露出されたN末端を有する1回膜貫通型タンパク質である。
別の例では、ソルタギング可能な表面タンパク質は、II型赤血球膜貫通型タンパク質、例えばKellまたはCD71とソルターゼ(例えば、ソルターゼA)により認識可能な配列を含むペプチドとを含む融合タンパク質である。II型膜貫通型タンパク質は、細胞外空間または管腔空間に露出されたC末端を有する1回膜貫通型タンパク質である。
ソルターゼにより認識可能なモチーフは当技術分野で周知である。ソルターゼ、特にソルターゼAにより認識可能な1つの例示的なモチーフはLPXTG(配列番号1)であり、ここでXは任意のアミノ酸残基(天然または非天然)、例えば、生物に見出されるタンパク質中に最も一般的に見出される20種の標準アミノ酸の何れかであり得る。一部の例では、認識モチーフは、LPXTG(配列番号1)またはLPXT(配列番号50)であり、ここでXはD、E、A、N、Q、K、またはRである。他の例では、ソルターゼAにより認識可能なLPXTG(配列番号1)またはLPXT(配列番号50)モチーフ中のXは、K、E、N、Q、Aから選択される。さらに他の例では、クラスCソルターゼにより認識可能なLPXTG(配列番号1)またはLPXT(配列番号50)モチーフ中のXは、K、S、E、L、A、Nから選択される。例示的なソルターゼ認識モチーフとしては、以下に限定されるものではないが、LPKTG(配列番号51)、LPITG(配列番号52)、LPDTA(配列番号53)、SPKTG(配列番号54)、LAETG(配列番号55)、LAATG(配列番号56)、LAHTG(配列番号57)、LASTG(配列番号58)、LPLTG(配列番号59)、LSRTG(配列番号60)、LPETG(配列番号44)、VPDTG(配列番号61)、IPQTG(配列番号62)、YPRRG(配列番号63)、LPMTG(配列番号64)、LAFTG(配列番号65)、LPQTS(配列番号66)、LPXT(配列番号50)、LAXT(配列番号67)、LPXA(配列番号68)、LGXT(配列番号69)、IPXT(配列番号70)、NPXT(配列番号71)、NPQS(配列番号72)、LPST(配列番号73)、NSKT(配列番号74)、NPQT(配列番号75)、NAKT(配列番号76)、LPIT(配列番号77)、またはLAET(配列番号78)が挙げられる。
本明細書に記載のソルタギング可能な表面タンパク質はまた、III型赤血球膜貫通型タンパク質と異種ペプチドとを含む融合タンパク質であってもよい。III型膜タンパク質は複数回貫通構造であり、通常、細胞外空間または管腔空間に露出されたN末端を有する。III型赤血球膜貫通型タンパク質の例としては、GLUT1、アクアポリン1、バンド3が挙げられる。一例では、III型膜貫通型タンパク質は、膜貫通型タンパク質のN末端でアクセプターペプチドに融合することができる。
一部の実施形態では、上記のようなソルターゼ認識配列は、例えばN末端またはC末端に、1つまたは複数のアミノ酸をさらに含むことができる。例えば、天然のソルターゼ基質中の5アミノ酸認識配列のN末端側またはC末端側に直ちに見出されるアミノ酸に同一である1つまたは複数のアミノ酸(例えば、5アミノ酸以内)を組み込むことができる。そのような追加のアミノ酸は、認識モチーフの認識を改善する状況を提供することがある。
一部の実施形態では、ソルターゼ認識モチーフはマスクされていることがある。ソルターゼにより認識され得る、アンマスクされているソルターゼ認識モチーフとは対照的に、マスクされているソルターゼ認識モチーフは、ソルターゼにより認識されないが、容易に修飾する(アンマスクする)ことができ、その結果得られるモチーフはソルターゼにより認識されるモチーフになる。例えば、一部の実施形態では、マスクされているソルターゼ認識モチーフの少なくとも1つのアミノ酸は、目的のソルターゼ、例えばSrtAアウレウスによる配列の認識を阻害する、例えば妨げる成分を含む側鎖を含む。そこで、阻害する成分を除去すると、ソルターゼによるモチーフの認識が可能になる。特定の実施形態では、マスキングにより、例えば、少なくとも80%、90%、95%、またはそれ以上(例えば、検出不可能なレベルに)認識が低下する。例として、特定の実施形態では、LPXTG(配列番号1)などのソルターゼ認識モチーフ中のスレオニン残基がリン酸化されて、モチーフがSrtAによる認識および切断に抵抗性になる。マスクされている認識配列は、ホスファターゼによる処理によりアンマスクすることができ、それによってSrtA触媒アミド基転移反応に使用することが可能になる。
必要な場合、CD34+前駆細胞の遺伝子改変膜タンパク質は、以下に限定されるものではないが、アミノ酸、核酸、ポリヌクレオチド、糖、炭水化物、ポリマー、脂質、脂肪酸、および小分子を含む、追加の適切なタグをさらに含むことができる。他の適切なタグは当業者には明らかであり、本発明はこの点において限定されない。
一部の実施形態では、そのようなタグは、ポリペプチドの精製、発現、可溶化、および/または検出に有用な配列を含む。一部の実施形態では、タグは複数の機能を果たすことができる。一部の実施形態では、タグは比較的小さく、例えば、少数のアミノ酸から約100アミノ酸長の範囲である。一部の実施形態では、タグは、約100アミノ酸長を超えており、例えば、最大約500アミノ酸長、またはそれ以上である。一部の実施形態では、タグは、少数の例を挙げると、HA、TAP、Myc、6xHis、Flag、ストレプトアビジン、ビオチン、またはGSTタグを含む。一部の実施形態では、タグは、溶解性増強タグ(例えば、SUMOタグ、NUS Aタグ、SNUTタグ、またはバクテリオファージT7のOcrタンパク質の単量体突然変異体)を含む。例えば、Esposito D and Chatterjee DK.Curr Opin Biotechnol.;17(4):353−8(2006)を参照されたい。一部の実施形態では、タグは、例えプロテアーゼにより、切断可能であり、そのため除去することができる。一部の実施形態では、これは、例えばタグの機能部分に隣接してまたはそれに連結して、タグ中にプロテアーゼ切断部位を含ませることによって達成される。例示的なプロテアーゼとしては、例えば、トロンビン、TEVプロテアーゼ、第Xa因子、PreScissionプロテアーゼ等が挙げられる。一部の実施形態では、「自己切断」タグが使用される。例えば、Wood et al.、2005年2月24日に出願され、2005年9月22日に国際公開第2005/086654号パンフレットとして公開された国際PCT出願PCT/US2005/05763号明細書を参照されたい。
一部の実施形態では、遺伝子改変赤血球は、本明細書に記載の赤血球膜タンパク質と、細胞外空間または管腔空間に露出される膜タンパク質末端に融合した第1の異種ペプチドと、細胞質空間に露出される膜タンパク質末端に融合した第2の異種タンパク質とを含む融合タンパク質を表面上に発現することができる。第1の異種ペプチドは、膜タンパク質(例えば、I型膜タンパク質)のN末端に融合される場合、ソルターゼのアクセプターペプチド(本明細書に記載の任意のアクセプターペプチド)を含むことができる。あるいは、第1の異種ペプチドは、膜タンパク質(例えば、II型膜タンパク質)のC末端に融合される場合、ソルターゼにより認識可能な配列(例えば、LPXTG(配列番号1)またはLPXT(配列番号50))を含むことができる。
膜タンパク質がI型(例えば、GPA)またはIII型の膜タンパク質である場合、第2の異種タンパク質は、膜タンパク質のC末端に融合される。そのような融合タンパク質を生成させるための発現カセットは、第2の異種タンパク質をコードする配列を2コピー含有することができ、一方は膜タンパク質にインフレームで融合されるが、他方は2コピー間に位置するIRES部位に対して3’側下流に位置する。この設計によれば、第2の異種タンパク質の生成が、遊離形態および膜タンパク質との融合形態で可能になろう。例えば、以下の実施例を参照されたい。あるいは、膜タンパク質がII型膜タンパク質(例えば、Kell)である場合、第2の異種タンパク質は膜タンパク質のN末端に融合される。そのような融合タンパク質を生成させるための発現カセットは、第2の異種タンパク質をコードする配列を2コピー含有することができ、それらは、第2の異種タンパク質が遊離および融合の両形態で生成するように、IRES部位によって分離される。
第2の異種タンパク質は細胞質タンパク質であってもよい。一部の例では、異種タンパク質は、診断用タンパク質、例えば適切な条件下で検出可能なシグナルを放出することができる蛍光タンパク質(例えば、GFP)などのタンパク質である。他の例では、異種タンパク質は、治療用タンパク質、例えばタンパク質性薬物である。
必要な場合、ソルターゼ反応により、上記の第1の異種ペプチドにターゲティング薬剤をコンジュゲートすることができる。そのような標的薬剤(例えば、単一ドメイン抗体などの抗体)は、特定の細胞型(例えば、癌細胞などの疾患細胞)に特異的に結合することができる。得られる遺伝子改変赤血球は、細胞質に配置される目的タンパク質(第2の異種タンパク質)を標的薬剤により認識可能な標的細胞に送達するのに有用である。
代替的または追加的に、本開示は、異なる基質特異性を有するソルターゼ酵素による触媒反応により、異なる機能成分にコンジュゲートされ得る、2種のソルタギング可能な表面タンパク質を発現する遺伝子操作された赤血球を提供する。以下の議論を参照されたい。一例では、2種のソルタギング可能な表面タンパク質は両方とも、I型膜タンパク質(例えば、GPA)を含む。一方のソルタギング可能な表面タンパク質では、I型膜タンパク質のN末端は、オリゴグリシン(例えば、GまたはG(配列番号3))に融合され;他方のソルタギング可能な表面タンパク質では、I型膜タンパク質のN末端は、オリゴアラニン(例えば、AまたはA(配列番号79))に融合される。別の例では、2種のソルタギング可能な表面タンパク質は両方とも、II型膜タンパク質(例えば、KellまたはCD71)を含む。一方のソルタギング可能な表面タンパク質では、II型膜タンパク質のC末端は、モチーフLPXTG(配列番号1)に融合され;他方のソルタギング可能な表面タンパク質では、II型膜タンパク質のC末端は、モチーフLPXTA(配列番号2)に融合される。さらに別の例では、ソルタギング可能な表面タンパク質の一方は、I型膜タンパク質(例えば、GPA)を含み、そのN末端はアクセプターペプチドに融合され、他方のソルタギング可能な表面タンパク質は、II型膜タンパク質(例えば、KellまたはCD71)を含み、そのC末端はソルターゼにより認識可能な配列に融合される。アクセプターペプチドがオリゴグリシン(例えば、GまたはG(配列番号3))である場合、ソルターゼにより認識可能な配列は、LPXTA(配列番号2)のモチーフとすることができる。アクセプターペプチドがオリゴアラニン(例えば、AまたはA(配列番号79))である場合、ソルターゼにより認識可能な配列は、LPXTG(配列番号1)のモチーフとすることができる。
本明細書に記載の遺伝子改変CD34前駆細胞は何れも、成熟脱核赤血球に分化させることができる適切な条件下、例えば本明細書に記載のin vitro培養工程で培養することができる。得られる脱核赤血球は、本明細書に記載のソルタギング可能な表面タンパク質などの目的の表面タンパク質を発現することができるが、これは、ルーチン的な方法論(例えば、ウエスタンブロッティングまたはFACS分析)により評価および確認することができる。
III.ソルタギングによる、細胞発現のソルタギング可能な表面タンパク質への薬剤のコンジュゲーション
ソルタギング可能な表面タンパク質を発現する遺伝子改変細胞(例えば、CD34+前駆細胞または成熟脱核赤血球)は何れも、ソルターゼの存在下で修飾して、目的薬剤を細胞の表面にコンジュゲートさせることができる。これはソルタギングとして知られるプロセスである。本明細書で使用される「ソルタギング」という用語は、ソルターゼ媒介ペプチド転移反応により、標的分子、例えば赤血球の表面上の標的タンパク質に、タグ、例えば成分または分子(例えば、タンパク質、ポリペプチド、検出可能な標識、結合剤、またはクリックケミストリーハンドル)を付加するプロセスを指す。
(a)ソルターゼ
ソルターゼは、アミド基転移を介してタンパク質のC末端を別のタンパク質のN末端にコンジュゲートさせるペプチド転移反応を行うことができる酵素のファミリーである。ソルターゼは、トランスアミダーゼとも呼ばれ、典型的にはプロテアーゼとペプチド転移活性の両方を示す。原核生物由来の種々のソルターゼが同定されている。例えば、グラム陽性細菌由来の一部のソルターゼは、タンパク質を切断して無傷細胞壁のプロテオグリカン成分に転位置させる。スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)から単離されたソルターゼの中に、ソルターゼA(Srt A)およびソルターゼB(Srt B)がある。そこで、特定の実施形態では、本明細書に記載のコンジュゲーション方法に従って使用されるトランスアミダーゼは、例えば、S.アウレウス(S.aureus)由来で、本明細書でSrtAアウレウスとも呼ばれるソルターゼAである。他の実施形態では、トランスアミダーゼは、例えば、S.アウレウス(S.aureus)由来で、本明細書でSrtBアウレウスとも呼ばれるソルターゼBである。
ソルターゼは、グラム陽性細菌ゲノム由来の61種のソルターゼの配列アライメントおよび系統発生分析に基づいて、A、B、C、およびD(すなわち、それぞれソルターゼA、ソルターゼB、ソルターゼC、およびソルターゼD)と称される、4つのクラスに分類されている(Dramsi et al.,Res Microbiol.156(3):289−97,2005;この文献の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる)。ソルターゼはさらに、ComfortおよびClubbによりサブファミリーに分類されており、これらのクラスは、以下のサブファミリーに対応している(Comfort et al.,Infect Immun.,72(5):2710−22,2004;この文献の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる):クラスA(サブファミリー1)、クラスB(サブファミリー2)、クラスC(サブファミリー3)、クラスD(サブファミリー4および5)。前述の参考文献は、数多くのソルターゼおよびその認識モチーフを開示している。Pallen et al.,TRENDS in Microbiology,2001,9(3),97−101も参照されたい;この文献の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれる)。当業者は、Drami,et al.前出、に記載のものなど、ソルターゼの配列および/または他の特性に基づいて、ソルターゼを正確なクラスに容易に帰属させることができる。
「ソルターゼA」という用語は、クラスAソルターゼを指すために本明細書で使用され、通常、特定の任意の細菌種のSrtA、例えばS.アウレウス(S.aureus)由来のSrtAと命名される。同様に、「ソルターゼB」は、クラスBソルターゼを指すために本明細書で使用され、通常、特定の任意の細菌種のSrtB、例えばS.アウレウス(S.aureus)由来のSrtBと命名される。本開示は、当技術分野で公知のソルターゼクラスの何れに関連する実施形態も包含する(例えば、任意の細菌種または細菌株由来のソルターゼA、任意の細菌種または細菌株由来のソルターゼB、任意の細菌種または細菌株由来のクラスCソルターゼ、および任意の細菌種または細菌株由来のクラスDソルターゼ)。
SrtAおよびSrtBのアミノ酸配列、ならびにそれらをコードするヌクレオチド配列は、当業者に公知であり、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、本明細書に引用のいくつかの参考文献に開示されている。S.アウレウス(S.aureus)のSrtAとSrtBのアミノ酸配列は相同性があり、例えば、22%の配列同一性および37%の配列類似性を共有する。スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)由来のソルターゼ−トランスアミダーゼのアミノ酸配列はまた、他のグラム陽性細菌由来の酵素の配列と実質的な相同性を有し、そのようなトランスアミダーゼは本明細書に記載の連結プロセスで利用することができる。例えば、SrtAの場合、S.ピオゲネス(S.pyogenes)の翻訳領域の配列決定領域全体にわたって最も良好にアライメントすると、約31%の配列同一性(および約44%の配列類似性)がある。A.ネスルンディ(S.naeslundii)の翻訳領域の配列決定領域全体にわたって最も良好にアライメントすると、約28%の配列同一性がある。異なる細菌株は特定のポリペプチドの配列において相違を示す可能性があり、本明細書の配列は例示的であることを認識されよう。
特定の実施形態では、ソルターゼをコードする、S.ピオゲネス(S.pyogenes)、A.ネスルンディ(S.naeslundii)、S.ミュータンス(S.mutans)、E.フェカリス(E.faecalis)、またはB.スブチリス(B.subtilis)の翻訳領域と18%以上の配列同一性、20%以上の配列同一性、または30%以上の配列同一性を有するトランスアミダーゼをスクリーニングすることができ、S.アウレアス(S.aureas)由来のSrtAまたはSrtBに匹敵するトランスアミダーゼ活性を有する酵素を利用することができる(例えば、匹敵する活性は、場合によってはSrtAまたはSrtB活性の10%以上である)。
一部の実施形態では、本明細書に記載のコンジュゲーション方法は、ソルターゼA(SrtA)を使用する。SrtAはモチーフLPXTX(配列番号80;Xの各存在は独立して任意のアミノ酸残基を表わす)を認識し、一般的な認識モチーフは、例えば、LPKTG(配列番号81)、LPATG(配列番号82)、LPNTG(配列番号83)である。一部の実施形態では、LPETG(配列番号44)がソルターゼ認識モチーフとして使用される。しかしながら、このコンセンサスから外れるモチーフも認識されることがある。例えば、一部の実施形態では、モチーフは、位置4で「T」ではなく「A」を含み、例えばLPXAG(配列番号84)、例えばLPNAG(配列番号85)である。一部の実施形態では、モチーフは、位置5で「G」ではなく「A」を含み、例えばLPXTA(配列番号2)、例えばLPNTA(配列番号86)である。一部の実施形態では、モチーフは、位置2で「P」ではなく「G」を含み、例えばLGXTG(配列番号87)、例えばLGATG(配列番号88)である。一部の実施形態では、モチーフは、位置1で「L」ではなく「I」を含み、例えばIPXTG(配列番号89)、例えばIPETG(配列番号91)である。さらなる適切なソルターゼ認識モチーフが当業者に明らかであり、本発明はこの点において限定されない。トランスアミダーゼまたはソルターゼにより認識される配列に関する「認識モチーフ」および「認識配列」という用語は、互換的に使用されることを認識されよう。このようなソルターゼ認識モチーフは、本明細書に記載のソルタギング可能な表面タンパク質を構築するために使用することができる。
本発明の一部の実施形態では、ソルターゼは、ソルターゼB(SrtB)、例えば、S.アウレウス(S.aureus)、B.アンスラシス(B.anthracis)、またはL.モノサイトゲネス(L.monocytogenes)のソルターゼBである。Bクラスのソルターゼ(SrtB)により認識されるモチーフは、多くの場合、コンセンサス配列NPXTX(配列番号92)の範囲内に入り、例えば、NPQTN(配列番号94)またはNPKTG(配列番号95)などのNP[Q/K]−[T/s]−[N/G/s](配列番号93)である。例えば、S.アウレウス(S.aureus)またはB.アンスラシス(B.anthracis)のソルターゼBは、それぞれの細菌のIsdCのNPQTN(配列番号94)またはNPKTG(配列番号95)モチーフを切断する(例えば、Marraffini et al.,Journal of Bacteriology,189(17):6425−6436,2007を参照のこと)。クラスBソルターゼの推定基質に見出される他の認識モチーフは、NSKTA(配列番号96)、NPQTG(配列番号97)、NAKTN(配列番号98)、およびNPQSS(配列番号99)である。例えば、L.モノサイトゲネス(L.monocytogenes)由来のSrtBは、NAKTN(配列番号98)およびNPQSS(配列番号99)など、位置2にPを欠き、かつ/または位置3にQもしくはKを欠く特定のモチーフを認識する(Mariscotti et al.,J Biol Chem.2009 Jan 7)。このようなソルターゼ認識モチーフも、本明細書に記載のソルタギング可能な表面タンパク質を構築するために使用することができる。
別々の基質特異性を有するソルターゼを使用して、N末端標識化戦略とC末端標識化戦略とを組み合わせて(Antos et al.,2009,J.Am.Chem.Soc.,131(31):10800−10801)、多重標識RBCを生成させることが可能である。例えば、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)由来のソルターゼAと異なり、ストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)由来のソルターゼAは、LPXTA(配列番号2)モチーフを認識し、求核試薬としてオリゴアラニンプローブを受容する。したがって、両酵素のソルターゼ反応は、直交型反応として行なうことができる。適切なソルターゼによる、このようなソルターゼ反応の利用も、本開示の範囲内である。
一部の実施形態では、ソルターゼはソルターゼC(SrtC)である。ソルターゼCは、認識モチーフとしてLPXTX(配列番号80)を利用することができ、Xの各存在は、独立して任意のアミノ酸残基を表わす。この認識モチーフは本明細書に記載のソルタギング可能な表面タンパク質を構築するために使用することができる。
さらに他の実施形態では、ソルターゼはソルターゼD(SrtD)である。このクラスのソルターゼは、コンセンサス配列NA−[E/A/S/H]−TG(配列番号100;Comfort D、前出)を有するモチーフを認識すると予測される。ソルターゼDは、例えば、ストレプトミセス(Streptomyces)種、コリネバクテリウム(Corynebacterium)種、トロフェリマ・ウィッペリ(Tropheryma whipplei)、サーモビフィダ・フスカ(Thermobifida fusca)、およびビフィドバクテリウム・ロングム(Bifidobacterium longum)で見出されている。LPXTA(配列番号2)またはLAXTGは、例えば、それぞれサブファミリー4および5のクラスDソルターゼの認識配列として機能することができ、サブファミリー−4およびサブファミリー−5酵素はそれぞれ、モチーフLPXTA(配列番号2)およびLAXTG(配列番号101)を処理する。例えば、B.アンスラシス(B.anthracis)のソルターゼCは、B.アンスラシス(B.anthracis)のBasIおよびBasHにおけるLPNTA(配列番号102)モチーフを特異的に切断することが示されている(Marrafini、前出を参照のこと)。
さらなるソルターゼ認識モチーフを認識するソルターゼを含むが、これに限定されないさらなるソルターゼも、本発明の一部の実施形態で使用するのに適している。例えば、その内容全体が本明細書に組み込まれるChen et al.,Proc Natl Acad Sci USA.2011 Jul 12;108(28):11399に記載されるソルターゼ;およびその内容全体が参照により本明細書に組み込まれるBarnett et al.,Journal of Bacteriology,Vol.184,No.8,p.2181−2191,2002に記載されるQVPTGV(配列番号103)モチーフを認識するソルターゼ)。
本明細書および/または本明細書に引用の参考文献(データベースを含む)に記載のものなど、任意のグラム陽性菌で見出されるソルターゼの使用が、本発明の一部の実施形態に関連して企図される。グラム陰性菌、例えば、コルウェリア・サイクレリスラエ(Colwellia psychrerythraea)、ミクロブルビファー・デグラダンス(Microbulbifer degradans)、ブラディリゾビウム・ジャポニクム(Bradyrhizobium japonicum)、シェワネラ・オネイデンシス(Shewanella oneidensis)、およびシュワネラ・プトレファシエンス(Shewanella putrefaciens)に見出されるソルターゼの使用も企図される。このようなソルターゼは、LPXTX(配列番号80)コンセンサスを超えた配列モチーフ、例えばLP[Q/K]T[A/S]T(配列番号104)を認識する。グラム陽性菌由来のソルターゼにおいて位置3で許容される変異と一致して、配列モチーフLPXT[A/S](配列番号105)、例えば、LPXTA(配列番号2)またはLPSTS(配列番号106)を使用することができる。
(b)細胞表面へのコンジュゲーション用の薬剤
ソルタギングにより(直接的または間接的に)細胞表面にコンジュゲートさせることができる薬剤は、以下に限定されるものではないが、タンパク質、アミノ酸、ペプチド、ポリヌクレオチド、炭水化物、検出可能な標識、結合剤、タグ、金属原子、造影剤、触媒、非ポリペプチドポリマー、合成ポリマー、認識エレメント、脂質、リンカー、または小分子などの化学物質を含む、任意の分子、実体、または成分であり得る。一部の実施形態では、薬剤は、結合剤、例えば、リガンドまたはストレプトアビジン/ビオチンなどのリガンド結合分子および抗体または抗体フラグメントである。
薬剤がポリペプチドの場合、ソルターゼの存在下でソルタギング可能な表面タンパク質を発現する細胞に直接コンジュゲートさせることができる。「タンパク質」、「ペプチド」、および「ポリペプチド」という用語は、本明細書で互換的に使用され、ペプチド(アミド)結合により相互に連結されたアミノ酸残基のポリマーを指す。この用語は、任意のサイズ、構造、または機能のタンパク質、ペプチド、またはポリペプチドを指す。典型的には、タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドは、少なくとも3アミノ酸長である。タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドは、個々のタンパク質を指しても、タンパク質の集合を指してもよい。タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドの中の1つまたは複数のアミノ酸は、例えば、コンジュゲーション、官能基化、または他の修飾等のために、炭水化物基、ヒドロキシル基、リン酸基、ファルネシル基、イソファルネシル基、脂肪酸基、リンカーなどの化学実体を付加することによって修飾してもよい。タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドはまた、単一分子であっても、複数分子複合体であってもよい。タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドは、単に天然のタンパク質またはペプチドの断片であってもよい。タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドは、天然、組換え、もしくは合成、またはそれらの任意の組合せであってもよい。
本明細書に記載のコンジュゲーション方法により細胞表面にコンジュゲートされるタンパク質は、所望の生物活性を有する、例えば、診断用または治療用の任意のタンパク質とすることができる。一部の例では、タンパク質は、タンパク性薬物(例えば、抗体またはそのフラグメント)、特定の細胞型(例えば、癌細胞などの疾患細胞)をターゲティングすることができるペプチド、または所望の免疫応答(例えば、B細胞応答またはT細胞応答)を誘発することができる抗原性ペプチドである。このようなタンパク質はまた、タンパク質ベースの結合剤(例えば、ストレプトアビジン)であってもよい。
本開示を何ら限定することなく、このセクションでは特定の標的タンパク質について論じる。一般に、任意のタンパク質またはポリペプチドを、クリックケミストリーハンドルを担持するように、かつ/または本明細書に提供の方法に従ってクリックケミストリーにより別の分子にコンジュゲートするように修飾することができる。一部の実施形態では、標的タンパク質は、天然のタンパク質またはポリペプチドに対して、少なくとも80%または少なくとも90%、例えば、少なくとも95%、86%、97%、98%、99%、99.5%、または100%同一であるポリペプチドを含むかまたはそれからなる。一部の実施形態では、標的タンパク質は、天然の配列に対して、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸の相違を有する。一部の実施形態では、天然タンパク質は、例えばヒト起源の哺乳類タンパク質である。
本明細書で使用される「抗体」という用語は、免疫グロブリンスーパーファミリーに属するタンパク質を指す。抗体および免疫グロブリンという用語は、互換的に使用される。一部の例外を除いて、哺乳類の抗体は、典型的には、それぞれが2つの大きな重鎖および2つの小さな軽鎖を有する基本構造単位からなる。いくつかの異なるタイプの抗体重鎖、および保有する重鎖に基づいて異なるアイソタイプに分類される、いくつかの異なる種類の抗体がある。5つの異なる抗体アイソタイプ、IgG、IgA、IgE、IgD、およびIgMが哺乳類で公知であり、これらは、異なる役割を担い、遭遇する異なるタイプの異物それぞれに対して適切な免疫応答を導く助けとなる。一部の実施形態では、抗体は、IgG抗体、例えば、IgG1、2、3、または4のヒトサブクラスの抗体である。哺乳類の種(例えば、ヒト、マウス、ラット、ヤギ、ブタ、ウマ、ウシ、ラクダ)に由来する抗体は、この用語の範囲内であり、哺乳類以外の種に由来する(例えば、鳥類、爬虫類、両生類に由来する)抗体、例えば、IgY抗体も、この用語の範囲内である。
抗体の一部のみが、抗原の結合に関与し、抗原結合抗体フラグメント、その調製および使用は、当業者に周知である。当技術分野で周知のように、抗体分子の小部分、パラトープのみが、エピトープへの抗体の結合に関与する(一般的には、Clark,W.R.(1986)The Experimental Foundations of Modern Immunology Wiley&Sons,Inc.,New York;Roitt,I.(1991)Essential Immunology,7th Ed.,Blackwell Scientific Publications,Oxfordを参照のこと)。本発明の一部の実施形態に関連して使用される適切な抗体および抗体フラグメントとしては、例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、ドメイン抗体、F(ab’)、F(ab’)2、Fab、Fv、Fc、およびFdフラグメント、Fcおよび/またはFRおよび/またはCDR1および/またはCDR2および/または軽鎖CDR3領域が相同なヒトまたは非ヒト配列で置き換えられている抗体;FRおよび/またはCDR1および/またはCDR2および/または軽鎖抗体CDR3領域が相同なヒトまたは非ヒト配列で置き換えられている抗体;FRおよび/またはCDR1および/またはCDR2および/または軽鎖抗体CDR3領域が相同なヒトまたは非ヒト配列で置き換えられている抗体;ならびにFRおよび/またはCDR1および/またはCDR2領域が相同なヒトまたは非ヒト配列で置き換えられている抗体が挙げられる。一部の実施形態では、いわゆる一本鎖抗体(例えば、ScFv)、(単一)ドメイン抗体、および他の細胞内抗体を、本発明に関連して使用することができる。ドメイン抗体(単一ドメイン抗体)、ラクダ抗体およびラクダ化抗体、ならびにそれらのフラグメント、例えば、VHHドメインまたはナノボディ、例えばAblynx NVおよびDomantisの特許および特許出願公開に記載のものも、抗体という用語に包含される。単一ドメイン抗体は、単一単量体可変抗体ドメインからなり得るもので、抗原に特異的に結合することができる。さらに、キメラ抗体、例えば、異なる抗原に結合する2つの抗原結合ドメインを含む抗体も、本発明の一部の実施形態に関連して使用するのに適している。
本明細書で使用される「抗原結合抗体フラグメント」という用語は、パラトープを含む抗体のフラグメントまたはインタクト抗体と同様の特異性および親和性で、抗体が結合する抗原に結合する抗体のフラグメントを指す。抗体、例えば完全ヒトモノクローナル抗体は、ファージディスプレイ(または酵母ディスプレイ、リボソームディスプレイ、細菌ディスプレイなどの他のディスプレイ方法)を使用して同定することができる。ディスプレイライブラリー、例えばファージディスプレイライブラリーは入手可能であり(かつ/または当業者により生成させることができ)、これを、例えばパニングを使用してスクリーニングし、目的の抗原に結合する抗体を同定することができる。例えば、Sidhu,S.(ed.)Phage Display in Biotechnology and Drug Discovery(Drug Discovery Series;CRC Press;1st ed.,2005;Aitken,R.(ed.)Antibody Phage Display:Methods and Protocols(Methods in Molecular Biology)Humana Press;2nd ed.,2009を参照されたい。
例示的な抗体としては、以下に限定されるものではないが、アブシキシマブ(糖タンパク質IIb/IIIa;心血管疾患)、アダリムマブ(TNF−α、種々の自己免疫疾患、例えば、関節リウマチ)、アレムツズマブ(CD52;慢性リンパ球性白血病)、バシリキシマブ(IL−2Rα受容体(CD25);移植拒絶反応)、ベバシズマブ(血管内皮増殖因子A;種々の癌、例えば、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、神経膠芽腫、腎臓癌;滲出型加齢黄斑変性症)、カツマキソマブ、セツキシマブ(EGF受容体、種々の癌、例えば結腸直腸癌、頭頸部癌)、セルトリズマブ(例えば、セルトリズマブペゴル)(TNFアルファ;クローン病、関節リウマチ)、ダクリズマブ(IL−2Rα受容体(CD25);移植拒絶反応)、エクリズマブ(補体タンパク質C5;発作性夜間血色素尿症)、エファリズマブ(CD11a;乾癬)、ゲムツズマブ(CD33;急性骨髄性白血病(例えばカリチアマイシンとの併用))、イブリツモマブ・チウキセタン(CD20;非ホジキンリンパ腫(例えば、イットリウム90またはインジウム111との併用))、インフリキシマブ(TNFアルファ;種々の自己免疫疾患、例えば、関節リウマチ)、ムロモナブ−CD3(T細胞CD3受容体;移植拒絶反応)、ナタリズマブ(アルファ−4(α4)インテグリン;多発性硬化症、クローン病)、オマリズマブ(IgE;アレルギー関連喘息)、パリビズマブ(RSV Fタンパク質のエピトープ;呼吸合包体ウイルス感染症)、パニツムマブ(EGF受容体;癌、例えば、結腸直腸癌)、ラニビズマブ(血管内皮増殖因子A;滲出型加齢黄斑変性症)、リツキシマブ(CD20;非ホジキンリンパ腫)、トシツモマブ(CD20;非ホジキンリンパ腫)、トラスツズマブ(ErbB2;乳癌)、およびそれらの任意の抗原結合フラグメントが挙げられる。
本明細書で使用される「結合剤」という用語は、別の分子に高親和性で結合する任意の分子を指す。一部の実施形態では、結合剤はその結合相手に高特異性で結合する。結合剤の例としては、限定されるものではないが、抗体、抗体フラグメント、受容体、リガンド、アプタマー、およびアドネクチンが挙げられる。
一部の実施形態では、赤血球にコンジュゲートされる目的タンパク質は、サイトカイン、例えばI型サイトカインである。特定の目的の一部の実施形態では、標的タンパク質は、4ヘリックスバンドルタンパク質、例えば4ヘリックスバンドルサイトカインである。例示的な4ヘリックスバンドルサイトカインとしては、例えば、特定のインターフェロン(例えばI型インターフェロン、例えばIFN−α)、インターロイキン(例えば、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−12)、およびコロニー刺激因子(例えば、G−CSF、GM−CSF、M−CSF)が挙げられる。IFNは、例えばインターフェロンアルファ−2aまたはインターフェロンアルファ−2bであり得る。例えば、Mott HR and Campbell ID.“Four−helix bundle growth factors and their receptors:protein−protein interactions.”Curr Opin Struct Biol.1995 Feb;5(1):114−21;Chaiken IM,Williams WV.“Identifying structure−function relationships in four−helix bundle cytokines:towards de novo mimetics design.”Trends Biotechnol.1996 Oct;14(10):369−75;Klaus W,et al.,“The three−dimensional high resolution structure of human interferon alpha−2a determined by heteronuclear NMR spectroscopy in solution”を参照されたい。これらのサイトカインの特定のものに関するさらなる議論については、J.Mol Biol.,274(4):661−75,1997。
目的タンパク質はまた、前述のサイトカインの1種または複数に類似の構造を有するサイトカインタンパク質であってもよい。例えば、サイトカインは、白血病抑制因子(LIF)またはオンコスタチンMなどのIL−6クラスサイトカインであり得る。一部の実施形態では、サイトカインは、GP130シグナル伝達サブユニットを含む受容体に天然で結合するサイトカインである。他の目的4ヘリックスバンドルタンパク質としては、成長ホルモン(GH)、プロラクチン(PRL)、および胎盤性ラクトゲンが挙げられる。一部の実施形態では、標的タンパク質は、赤血球形成刺激剤、例えば(EPO)であり、これも4ヘリックスバンドルサイトカインである。一部の実施形態では、赤血球形成刺激剤は、EPO変異体、例えば、5つのN連結炭水化物鎖を含有するように操作されている、新規赤血球形成刺激タンパク質(NESP)とも称されるダルベポエチンアルファである(3つ以上の組換えHuEPO)。一部の実施形態では、タンパク質は5ヘリックスを含む。例えば、タンパク質は、インターフェロンベータ、例えばインターフェロンベータ1a、インターフェロンベータ1bであり得、これは、(認識されるように)4ヘリックスバンドルサイトカインとして分類されることが多い。一部の実施形態では、標的タンパク質は、IL−9、IL−10、IL−11、IL−13、またはIL−15である。特定のサイトカインの議論については、例えば、Hunter,CA,Nature Reviews Immunology 5,521−531,2005を参照されたい。Paul,WE(ed.),Fundamental Immunology,Lippincott Williams&Wilkins;6th ed.,2008も参照されたい。本明細書に引用の参考文献に記載の任意のタンパク質を、これらはすべて、参照により本明細書に組み込まれるが、標的タンパク質として使用することができる。
加えて、目的タンパク質は、ヒトの疾患または障害の処置に使用するために、米国食品医薬品局(US Food&Drug Administration)(または欧州医薬品審査庁(European Medicines Evaluation Agency)などの同等の規制当局)により認可されているタンパク質である場合もある。そのようなタンパク質は、PEG化バージョンが臨床試験で判定され、かつ/または市販について認可されたタンパク質であっても、そうでなくてもよい。
目的タンパク質はまた、神経栄養因子、すなわち、神経系統細胞(本明細書に使用される用語としては、神経前駆細胞、神経細胞、およびグリア細胞、例えば、星状細胞、乏突起膠細胞、ミクログリアが挙げられる)の生存、発生、および/または機能を促進する因子であってもよい。例えば、一部の実施形態では、標的タンパク質は神経突起伸長を促進する因子である。一部の実施形態では、タンパク質は、毛様体神経栄養因子(CNTF;4ヘリックスバンドルタンパク質)またはアキソカインなどのそのアナログであり、アキソカインは、C末端の15アミノ酸の短縮および2つのアミノ酸置換を有するヒト毛様体神経栄養因子の改変バージョンであって、in vitroおよびin vivoのアッセイでCNTFよりも3〜5倍強力であり、安定性も改善されている。
別の例では、目的タンパク質は、ホモ二量体またはヘテロ二量体(または3つ以上のサブユニットを含むホモオリゴマーまたはヘテロオリゴマー、例えば四量体)を形成するタンパク質である。特定の実施形態では、ホモ二量体、ヘテロ二量体、またはオリゴマーの構造は、第1のサブユニットの末端が第2のサブユニットの末端に近接しているような構造である。例えば、第1のサブユニットのN末端は、第2のサブユニットのC末端に近接している。特定の実施形態では、ホモ二量体、ヘテロ二量体、またはオリゴマーの構造は、第1のサブユニットの末端および第2のサブユニットの末端が、受容体との相互作用に関与しないような構造であり、そのため生物活性にあまり影響を与えることなく、非遺伝学的にコードされたペプチドエレメントを介して末端を連結させることができる。一部の実施形態では、ホモ二量体、ヘテロ二量体、またはオリゴマーの2つのサブユニットの末端が、本明細書に記載の方法を使用して、クリックケミストリーによりコンジュゲートされ、それによって、少なくとも2つのサブユニットが共有結合で連結される二量体(またはオリゴマー)が生成する。例えば、ニューロトロフィン神経成長因子(NGF);脳由来神経栄養因子(BDNF);ニューロトロフィン3(NT3);およびニューロトロフィン4(NT4)は、約50%の配列同一性を共有し、二量体の形態で存在する二量体分子である。例えば、Robinson RC,et al.,“Structure of the brain−derived neurotrophic factor/neurotrophin 3 heterodimer.”,Biochemistry.34(13):4139−46,1995;Robinson RC,et al.,“The structures of the neurotrophin 4 homodimer and the brain−derived neurotrophic factor/neurotrophin 4 heterodimer reveal a common Trk−binding site.”Protein Sci.8(12):2589−97,1999、およびその中の参考文献を参照されたい。一部の実施形態では、二量体タンパク質は、サイトカイン、例えばインターロイキンである。
あるいは、目的タンパク質は、酵素、例えば、代謝または他の生理学的プロセスで重要な酵素である。当技術分野で公知のように、酵素または他のタンパク質の欠損は、種々の疾患をもたらし得る。そのような疾患としては、炭水化物代謝、アミノ酸代謝、有機酸代謝、ポルフィリン代謝、プリンまたはピリミジン代謝、リソソーム蓄積症、血液凝固等の欠陥に関連した疾患が挙げられる。例としては、ファブリ病、ゴーシェ病、ポンペ病、アデノシンデアミナーゼ欠損症、アスパラギナーゼ欠損症、ポルフィリン症、血友病、および遺伝性血管浮腫が挙げられる。一部の実施形態では、タンパク質は、凝固(clottingまたはcoagulation)因子(例えば、第VII因子、第VIIa因子、第VIII因子、または第IX因子)である。他の実施形態では、タンパク質は、炭水化物代謝、アミノ酸代謝、有機酸代謝、ポルフィリン代謝、プリンもしくはピリミジン代謝、および/またはリソソーム蓄積に役割を担う酵素であり、この酵素の外部からの投与は疾患を少なくとも部分的に緩和する。
さらに、目的タンパク質は、受容体または受容体フラグメント(例えば、細胞外ドメイン)であってもよい。一部の実施形態では、受容体はTNFα受容体である。特定の実施形態では、標的タンパク質は尿酸オキシダーゼを含む。
一部の実施形態では、目的タンパク質は、病原体(例えば、ウイルスまたは細菌)に由来し得る抗原性タンパク質である。抗原性タンパク質は、種々の実施形態において、天然または合成であり得る。抗原性タンパク質は、病原体、感染細胞、または新生物細胞(例えば、癌細胞)により天然に生成され得るものであり、かつ/またはそれらにより遺伝的にコードされるポリペプチドまたはペプチドを含む。一部の例では、抗原性タンパク質は、自己抗原(autoantigen)(「自己抗原(self antigen)」)であり、自己免疫反応を惹起または増強する能力を有する。他の例では、抗原性タンパク質は、ウイルス、細菌、菌類、または一部の実施形態では、病原体である寄生生物により生成されるかまたは遺伝的にコードされる。一部の実施形態では、病原体(例えば、ウイルス、細菌、菌類、寄生生物)は感染し、一部の実施形態では、少なくとも1つの哺乳類または鳥類の種、例えば、ヒト、非ヒト霊長類、ウシ、ヒツジ、ウマ、ヤギ、および/またはブタの種に疾患を引き起こす。一部の実施形態では、病原体は、少なくともその生活環の一部では細胞内にある。一部の実施形態では、病原体は細胞外にある。特定の供給源に由来する抗原は、種々の実施形態では、例えば、抗原を使用する目的のために、例えば、抗原に対する抗体を同定、生成、試験、または使用するために、その供給源から単離するか、または任意の適切な手段(例えば、組換え、合成等)を使用して生成させることができることを認識されよう。抗原は、例えば、別の分子または実体(例えば、アジュバント)へのコンジュゲーション、化学的または物理的な変性等により修飾することができる。一部の実施形態では、抗原は、エンベロープタンパク質、カプシドタンパク質、分泌タンパク質、構造タンパク質、細胞壁のタンパク質もしくは多糖、カプセルのタンパク質もしくは多糖、または酵素である。一部の実施形態では、抗原は毒素、例えば細菌毒素である。
例示的なウイルスとしては、例えば、レトロウイルス科(Retroviridae)(例えば、ヒト免疫不全ウイルス、例えばHIV−Iなどのレンチウイルス);カリシウイルス科(Caliciviridae)(例えば、胃腸炎を引き起こす株);トガウイルス科(Togaviridae)(例えば、ウマ脳炎ウイルス、風疹ウイルス);フラウイルス科(Flaviridae)(例えば、デング熱ウイルス、脳炎ウイルス、黄熱病ウイルス、C型肝炎ウイルス);コロナウイルス科(Coronaviridae)(例えば、コロナウイルス);ラブドウイルス科(Rhabdoviridae)(例えば、水疱性口内炎ウイルス、狂犬病ウイルス);フィロウイルス科(Filoviridae)(例えば、エボラウイルス);パラミクソウイルス科(Paramyxoviridae)(例えば、パラインフルエンザウイルス、ムンプスウイルス、麻疹ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス);オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)(例えば、インフルエンザウイルス);ブニヤウイルス科(Bunyaviridae)(例えば、ハンタンウイルス、ブンガウイルス、フレボウイルス、およびナイロウイルス);アレナウイルス科(Arena viridae)(出血熱ウイルス);レオウイルス科(Reovi ridae)(例えば、レオウイルス、オルビウイルス、およびロタウイルス);ビルナウイルス科(Birnaviridae);ヘパドナウイルス科(Hepadnaviridae)(B型肝炎ウイルス);パルボウイルス科(Parvoviridae)(パルボウイルス);パポバウイルス科(Papovaviridae)(乳頭腫ウイルス、ポリオーマウイルス);アデノウイルス科(Adenoviridae);ヘルペスウイルス科(Herpesviridae)(単純ヘルペスウイルス(HSV)1および2、水痘帯状疱疹ウイルス、サイトメガロウイルス(CMV)、EBV、KSV);ポックスウイルス科(Poxviridae)(痘瘡ウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス);およびピコルナウイルス科(Picornaviridae)(例えば、ポリオウイルス、A型肝炎ウイルス;エンテロウイルス、ヒトコクサッキーウイルス、ライノウイルス、エコーウイルス)が挙げられる。
例示的な細菌としては、例えば、ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ボレリア・ブルグドルフェリ(Borellia burgdorferi)、レジュネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophilia)、マイコバクテリア(例えば、結核菌(M.tuberculosis)、M.アビウム(M.avium)、M.イントラセルラレ(M.intracellulare)、M.カンサシ(M.kansasii)、M.ゴルドナエ(M.gordonae))、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)、ナイセリア・ゴノレア(Neisseria gonorrhoeae)、ナイセリア・メニンギティディス(Neisseria meningitidis)、リステリア・モノサイトゲネス(Listeria monocytogenes)、ストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)(A群連鎖球菌)、ストレプトコッカス・アガラクティエ(Streptococcus agalactiae)(B群連鎖球菌)、連鎖球菌(ビリダンス群)、糞便連鎖球菌(Streptococcus faecalis)、ストレプトコッカス・ボヴィス(Streptococcus bovis)、連鎖球菌(嫌気性種)、肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)、キャンピロバクター(Campylobacter)種、エンテロコッカス(Enterococcus)種、クラミジア(Chlamydia)種、ヘモフィルス・インフルエンザエ(Haemophilus influenzae)、バシラス・アンスラシス(Bacillus anthracis)、コリネバクテリウム・ジフテリエ(Corynebacterium diphtheriae)、エリジペロスリックス・ルジオパシエ(Erysipelothrix rhusiopathiae)、クロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)、クロストリジウム・テタニ(Clostridium tetani)、エンテロバクター・エロゲネス(Enterobacter aerogenes)、クレブシエラ・ニューモニエ(Klebsiella pneumoniae)、パスツレラ・マルトシダ(Pasturella multocida)、バクテロイデス(Bacteroides)種、フソバクテリウム・ヌクレアタム(Fusobacterium nucleatum)、ストレプトバシラス・モリニフオルミス(Streptobacillus moniliformis)、トレポネーマ・パリダム(Treponema pallidum)、トレポネーマ・ペルニュ(Treponema pertenue)、レプトスピラ(Leptospira)、アクチノミセス・イスラエリ(Actinomyces israelii)、およびフランシセラ・ツラレンシス(Francisella tularensis)が挙げられる。
例示的な菌類としては、例えば、アスペルギルス属(Aspergillus)、例えば、アスペルギルス・フラブス(Aspergillus flavus)、アスペルギルス・フミガーツス(Aspergillus fumigatus)、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)、ブラストミセス属(Blastomyces)、例えば、ブラストミセス・デルマティティディス(Blastomyces dermatitidis)、カンジダ属(Candida)、例えば、カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ・グラブラータ(Candida glabrata)、カンジダ・ギリエルモンジ(Candida guilliermondii)、カンジダ・クルセイ(Candida krusei)、カンジダ・パラシローシス(Candida parapsilosis)、カンジダ・トロピカリス(Candida tropicalis)、コクシジオイデス属(Coccidioides)、例えば、コクシジオイデス・イミチス(Coccidioides immitis)、クリプトコックス属(Cryptococcus)、例えば、クリプトコックス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、エピデルモフィトン属(Epidermophyton)、フザリウム属(Fusarium)、ヒストプラスマ属(Histoplasma)、例えば、ヒストプラスマ・カプスラーツム(Histoplasma capsulatum)、マラセジア属(Malassezia)、例えば、マラセジア・フルフール(Malassezia furfur)、ミクロスポルム属(Microsporum)、ムコール属(Mucor)、パラコクシディオイデス属(Paracoccidioides)、例えば、パラコクシディオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、ペニシリウム属(Penicillium)、例えば、ペニシリウム・マルネフェイ(Penicillium marneffei)、ピチア属(Pichia)、例えば、ピチア・アノマラ(Pichia anomala)、ピチア・ギリエルモンジ(Pichia guilliermondii)、ニューモシスティス属(Pneumocystis)、例えば、ニューモシスティス・カリニ(Pneumocystis carinii)、シューダレシェリア属(Pseudallescheria)、例えば、シューダレシェリア・ボイジ(Pseudallescheria boydii)、リゾプス属(Rhizopus)、例えば、リゾプス・オリザエ(Rhizopus oryzae)、ロドトルラ属(Rhodotorula)、例えば、ロドトルラ・ルブラ(Rhodotorula rubra)、シェドスポリウム属(Scedosporium)、例えば、シェドスポリウム・アピオスペルマム(Scedosporium apiospermum)、シゾフィラム属(Schizophyllum)、例えば、シゾフィラム・コミュネ(Schizophyllum commune)、スポロトリックス属(Sporothrix)、例えば、スポロトリックス・シェンキ(Sporothrix schenckii)、トリコフィトン属(Trichophyton)、例えば、トリコフィトン・メンタグロフィテス(Trichophyton mentagrophytes)、トリコフィトン・ルブラム(Trichophyton rubrum)、トリコフィトン・ベルコサム(Trichophyton verrucosum)、トリコフィトン・ビオラセウム(Trichophyton violaceum)、トリコスポロン属(Trichosporon)、例えば、トリコスポロン・アサヒ(Trichosporon asahii)、トリコスポロン・クタネウム(Trichosporon cutaneum)、トリコスポロン・インキン(Trichosporon inkin)、およびトリコスポロン・ムコイデス(Trichosporon mucoides)が挙げられる。
一部の実施形態では、抗原は腫瘍抗原(TA)である。一般に、腫瘍抗原は、腫瘍細胞(例えば、腫瘍原性細胞、または一部の実施形態では、腫瘍間質細胞、例えば、癌関連繊維芽細胞などの腫瘍関連細胞)により生成される任意の抗原性物質であり得る。多くの実施形態では、腫瘍抗原は、非腫瘍細胞と比較して、腫瘍細胞により差次的に発現される分子(またはその一部)である。腫瘍抗原としては、例えば、通常はごく少量で生成されるが、腫瘍細胞により大量に発現されるタンパク質、通常は特定の発生段階でのみ生成されるタンパク質、腫瘍細胞における突然変異によりその構造(例えば、配列または翻訳後修飾)が修飾されているタンパク質、または(正常状態下では)免疫系から隔離されている正常タンパク質が挙げられる。腫瘍抗原は、例えば、腫瘍細胞の同定もしくは検出において(例えば、診断目的のため、かつ/もしくは腫瘍について処置を受けた被験体を、例えば再発について検査するためにモニターする目的のため)、かつ/または種々の薬剤(例えば、治療薬)を腫瘍細胞にターゲティングする目的に対して、有用となり得る。例えば、一部の実施形態では、腫瘍抗原に結合する抗体フラグメントの抗体を含み、かつクリックケミストリーにより治療薬、例えば細胞傷害性薬剤にコンジュゲートされているキメラ抗体が提供される。一部の実施形態では、TAは、突然変異遺伝子、例えば、癌遺伝子または突然変異癌抑制遺伝子の発現産物、過剰発現または異常発現の細胞タンパク質、癌ウイルス(例えば、HBV;HCV;EBV、KSVなどのヘルペスウイルスファミリーメンバー;パピローマウイルス等)によりコードされた抗原、または腫瘍胎児性抗原である。腫瘍胎児性抗原は、通常、胚発生の初期段階で生成され、免疫系が完全に発生する時期までに大部分または完全に消失する。例としては、αフェトプロテイン(AFP、例えば胚細胞腫瘍および肝細胞癌で見出される)および癌胎児性抗原(CEA、例えば腸癌および時として肺癌または乳癌に見出される)がある。チロシナーゼは、通常はごく少量で生成されるが、特定の腫瘍細胞(例えば、メラノーマ細胞)でその生成が大幅に増大するタンパク質の例である。他の例示的なTAとしては、例えば、CA125(例えば卵巣癌に見出される);MUC‐1(例えば乳癌に見出される);上皮性腫瘍抗原(例えば乳癌に見出される);メラノーマ関連抗原(MAGE;例えば悪性メラノーマに見出される);前立腺酸性ホスファターゼ(PAP、前立腺癌で見出される)が挙げられる。一部の実施形態では、TAは、腫瘍細胞の細胞表面に少なくとも部分的に露出される。一部の実施形態では、腫瘍抗原は、異常修飾されたポリペプチドまたは脂質、例えば異常修飾された細胞表面糖脂質、糖タンパク質を含む。TAは、特定タイプの腫瘍サブセットおよび/または腫瘍中の細胞サブセットによって発現されることがあることを認識されよう。
下記の表1に、例示的な目的タンパク質およびそのアミノ酸配列を記載する。
Figure 2016519933
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本明細書に記載の目的タンパク質は何れも、修飾することができ、(i)N末端にグリシンなどの1つまたは複数の求核性残基(例えば、1〜10残基の間)および場合によっては、切断認識配列、例えば、求核性残基をマスクするプロテアーゼ切断認識配列;または(ii)C末端またはC末端近辺のソルターゼ認識モチーフを含むことができる。一部の実施形態では、標的タンパク質は、(i)と(ii)の両方を含む。このような修飾タンパク質は、本明細書に記載のタンパク質コンジュゲーション方法に使用することができる。
当業者であれば、特定のタンパク質、例えば、分泌型の真核生物(例えば、哺乳類)タンパク質は、多くの場合、細胞内プロセシング(例えば、分泌に先立つ分泌シグナルの切断および/または生物活性に必要としない他の部分の除去)を受けて、成熟形態を生成することを認識されよう。標的タンパク質のそのような成熟した生物活性バージョンが、本開示の特定の実施形態で使用される。
他の目的タンパク質は、例えば、米国特許出願第10/773,530号明細書;同第11/531,531号明細書;米国特許出願第11/707,014号明細書;同第11/429,276号明細書;同第11/365,008号明細書に見出すことができる。これらの特許出願はすべて参照により本明細書に組み込まれる。本発明は、本明細書に記載のタンパク質の何れに対しても、また当業者に公知の何れのタンパク質に対しても、本発明の方法を適用することを包含する。
薬剤がタンパク質でない場合、そのような薬剤は、タンパク質骨格にコンジュゲートすることができ、ソルターゼの存在下で表面のソルタギング可能なタンパク質に連結することができる。非タンパク質性薬剤としては、以下に限定されるものではないが、脂質、炭水化物、クリックケミストリーハンドルもしくは化学療法剤などの小分子、検出可能な標識(例えば、イメージング剤)、または化学療法剤を挙げることができる。本開示の実施形態で使用するのに適したさらなる薬剤は、当業者に明らかであろう。
一部の例では、非タンパク質性薬剤は、免疫応答を誘発できるような抗原性がある。そのような抗原性薬剤としては、例えば、多糖、炭水化物、脂質、核酸、またはそれらの組合せを挙げることができ、またそれは病原体、例えば、本明細書に記載のものに由来するものであってもよい。
「コンジュゲートされた」または「コンジュゲーション」という用語は、直接的または間接的な共有結合的または非共有結合的な相互作用によって連結されるような、2つの分子、例えば、2つのタンパク質またはタンパク質と薬剤、例えば小分子との相互の結合を指す。特定の実施形態では、結合は共有結合であり、実体が相互に「コンジュゲートされている」と言う。一部の実施形態では、タンパク質は、タンパク質が形成された後に、また一部の実施形態では、タンパク質が単離された後に、タンパク質と他の分子との間に共有結合を形成させることにより、別の分子、例えば、第2のタンパク質、小分子、検出可能な標識、クリックケミストリーハンドル、結合剤に、翻訳後コンジュゲートされる。一部の実施形態では、2つの分子が両方の分子を連結するリンカーを介してコンジュゲートされる。例えば、2つのタンパク質が相互にコンジュゲートしてタンパク質融合体を形成する一部の実施形態では、2つのタンパク質は、ポリペプチドリンカー、例えば、一方のタンパク質のC末端を他方のタンパク質のN末端に連結するアミノ酸配列を介してコンジュゲートされ得る。一部の実施形態では、2つのタンパク質が、それぞれのC末端でコンジュゲートされて、C−Cコンジュゲートされたキメラタンパク質が生成する。一部の実施形態では、2つのタンパク質が、それぞれのN末端でコンジュゲートされて、N−Nコンジュゲートされたキメラタンパク質が生成する。一部の実施形態では、ペプチドへのタンパク質のコンジュゲーションは、ソルターゼを使用するペプチド転移により達成される。例えば、ソルターゼ媒介ペプチド転移のための例示的なソルターゼ、タンパク質、認識モチーフ、試薬、および方法については、それぞれの内容全体が、参照により本明細書に組み込まれる、Ploegh et al、2010年2月1日に出願され、2010年8月5日に国際公開第2010/087994号パンフレットとして公開された国際PCT特許出願PCT/US2010/000274号明細書、およびPloegh et al、2011年4月20日に出願され、2011年10月27日に国際公開第2011/133704号パンフレットとして公開された国際特許出願PCT/US2011/033303号明細書を参照されたい。
クリックケミストリーは、The Scripps Research InstituteのK.Barry Sharplessにより導入された化学原理であり、反応性基を含む小さな単位を相互に連結させることにより、迅速かつ信頼性高く共有結合を生成する目的に適った化学が記載される(H.C.Kolb,M.G.Finn and K.B.Sharpless(2001).Click Chemistry:Diverse Chemical Function from a Few Good Reactions.Angewandte Chemie International Edition 40(11):2004−2021を参照のこと)。クリックケミストリーは、具体的な反応を指すものではないが、これに限定されるものではないが、天然に見出される反応を模倣する反応を含む概念を指す。一部の実施形態では、クリックケミストリー反応は、モジュール式であり、範囲が広く、高い化学収率を与え、無害の副産物を生成し、立体特異的であり、単一反応生成物を伴う反応を促進するように84kJ/molを超える大きな熱力学的推進力を示し、かつ/または生理学的条件下で行うことができる。一部の実施形態では、クリックケミストリー反応は、高い原子経済性を示し、簡単な反応条件下で行うことができ、容易に入手可能な出発物質および試薬を使用し、有毒な溶媒を使用しないかまたは無害もしくは除去が容易な溶媒(好ましくは水)を使用し、かつ/または非クロマトグラフ法(結晶化または蒸留)による簡単な生成物単離を提供する。
クリックケミストリーハンドルは、クリックケミストリー反応に参加することができる反応物であっても反応性基であってもよい。例えば、歪みのあるアルキン、例えばシクロオクチンは、歪み促進の環化付加に参加することができるため、クリックケミストリーハンドルである。一般に、クリックケミストリー反応は、相互に反応することができるクリックケミストリーハンドルを含む、少なくとも2つの分子を必要とする。相互に反応するそのようなクリックケミストリーハンドルペアは、本明細書でパートナークリックケミストリーハンドルと呼ばれることもある。例えば、アジドは、シクロオクチンまたは他の任意のアルキンに対するパートナークリックケミストリーハンドルである。本発明の一部の態様による使用に適した例示的なクリックケミストリーハンドルは、本明細書、例えば表AおよびBに記載されている。他の適切なクリックケミストリーハンドルは当業者に公知である。クリックケミストリーによりコンジュゲートされる2つの分子の場合、例えば、クリックケミストリーハンドルのうちの一方の反応性成分が、もう一方のクリックケミストリーハンドルの反応性成分と反応して共有結合を形成するという点で、分子のクリックケミストリーハンドルは相互に反応しなければならない。クリックケミストリーハンドルのこのような反応ペアは、当業者に周知であり、以下に限定されるものではないが、表2に記載されるものが含まれる:
Figure 2016519933
表2に、クリックケミストリーハンドルおよび反応の例を提供する。R、R1、およびR2は、ソルターゼ認識モチーフを含む任意の分子を表すことができる。一部の実施形態では、R、R1、およびR2の各存在は独立して、RR−LPXT(配列番号50)−[X]y−または−[X]y−LPXT(配列番号50)−RR(式中、Xの各存在は独立して、任意のアミノ酸残基を表し、yの各存在は、0〜10の間の0と10を含む整数である)であり、RRの各存在は独立して、タンパク質または薬剤(例えば、タンパク質、ペプチド、検出可能な標識、結合剤、小分子等)および場合によってはリンカーを表す。
一部の実施形態では、金属触媒の非存在下で反応して共有結合を形成することができるクリックケミストリーハンドルが使用される。このようなクリックケミストリーハンドルは当業者に周知であり、Becer,Hoogenboom,and Schubert,Click Chemistry beyond Metal−Catalyzed Cycloaddition,Angewandte Chemie International Edition(2009)48:4900−4908に記載されるクリックケミストリーハンドルを含む。下記の表3を参照されたい。
Figure 2016519933
検出可能な標識は、標識を結合する分子、例えば、タンパク質もしくはペプチドまたは他の実体の検出を可能にする、成分に組み込まれた少なくとも1つの元素、同位体、または官能基を有する成分である。標識は直接結合(すなわち結合を介して)させることも、リンカー(例えば、リンカーを構築することができる、置換されていてもよいアルキレン;置換されていてもよいアルケニレン;置換されていてもよいアルキニレン;置換されていてもよいヘテロアルキレン;置換されていてもよいヘテロアルケニレン;置換されていてもよいヘテロアルキニレン;置換されていてもよいアリーレン;置換されていてもよいヘテロアリーレン;もしくは置換されていてもよいアシレン、またはそれらの任意の組合せなど)により結合させることもできる。標識は、分子、例えば、タンパク質、ポリペプチド、または他の実体に、任意の位置で結合させるかまたは組み込むことができることは認識されよう。一般に、検出可能な標識は、以下の5つのクラスの何れか1つ(またはそれ以上)に分類することができる:a)同位体成分を含有する標識、これは放射性同位元素であっても重同位元素であってもよく、以下に限定されるものではないが、2H、3H、13C、14C、15N、18F、31P、32P、35S、67Ga、76Br、99mTc(Tc−99m)、111In、123I、125I、131I、153Gd、169Yb、および186Reが含まれる;b)免疫成分を含有する標識、これは、抗体であっても抗原であってもよく、酵素(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼなど)に結合している場合もある;c)着色性、発光性、リン光性、または蛍光性の成分(たとえば、蛍光性標識フルオレセインイソチオシアネート(FITC)である標識;d)1つまたは複数の光親和性成分を有する標識;およびe)1つまたは複数の公知の結合パートナー(例えば、ビオチンストレプトアビジン、FK506−FKBP)に対するリガンドである標識。特定の実施形態では、標識は、放射性同位体、好ましくはβ粒子などの検出可能な粒子を放射する同位体を含む。特定の実施形態では、標識は蛍光性成分を含む。特定の実施形態では、標識は、蛍光性標識フルオレセインイソチオシアネート(FITC)である。特定の実施形態では、標識は、1つまたは複数の公知の結合パートナーを有するリガンド成分を含む。特定の実施形態では、標識はビオチンを含む。一部の実施形態では、標識は、蛍光性ポリペプチド(例えば、GFPもしくは改良型GFP(EGFP)などのその誘導体)またはルシフェラーゼ(例えば、ホタル、ウミシイタケ、またはガウシアのルシフェラーゼ)である。特定の実施形態では、標識は、適切な基質(例えば、ルシフェリン)と反応して検出可能なシグナルを生成し得ることを認識されよう。蛍光タンパク質の非限定例としては、GFPおよびその誘導体、赤色、黄色、およびシアン色の蛍光タンパク質など、異なる色の光を放射するフルオロフォアを含むタンパク質が挙げられる。例示的な蛍光タンパク質としては、例えば、Sirius、Azurite、EBFP2、TagBFP、mTurquoise、ECFP、Cerulean、TagCFP、mTFP1、mUkG1、mAG1、AcGFP1、TagGFP2、EGFP、mWasabi、EmGFP、TagYPF、EYFP、Topaz、SYFP2、Venus、Citrine、mKO、mKO2、mOrange、mOrange2、TagRFP、TagRFP−T、mStrawberry、mRuby、mCherry、mRaspberry、mKate2、mPlum、mNeptune、T−Sapphire、mAmetrine、mKeimaが挙げられる。例えば、GFPおよび数多くの他の蛍光または発光タンパク質の議論については、Chalfie,M.and Kain,SR(eds.)Green fluorescent protein:properties,applications,and protocols Methods of biochemical analysis,v.47 Wiley−Interscience,Hoboken,N.J.,2006;およびChudakov,DM,et al.,Physiol Rev.90(3):1103−63,2010を参照されたい。一部の実施形態では、標識は、ダーククエンチャー、例えば、フルオロフォアからの励起エネルギーを吸収し、このエネルギーを熱として散逸する物質を含む。
「小分子」とは、天然に存在するかまたは人為的に作製されたか(例えば、化学合成により)に関わらず、比較的低分子量を有する分子を指す。典型的には、小分子は有機化合物(すなわち、それは炭素を含有する)である。小分子は、複数の炭素間結合、立体中心、および他の官能基(例えば、アミン、ヒドロキシル、カルボニル、複素環等)を含有することができる。一部の実施形態では、小分子は、単量体であり、約1500g/モル未満の分子量を有する。特定の実施形態では、小分子の分子量は、約1000g/モル未満または約500g/モル未満である。特定の実施形態では、小分子は、薬物、例えば、適切な政府機関または規制団体によりヒトまたは動物での使用が安全かつ効果的であるとすでに認められた薬物である。
本明細書に記載の非タンパク質性薬剤は何れも、当業者に公知の方法によりタンパク質骨格にコンジュゲートさせることができる。
(c)ソルターゼ触媒ペプチド転移反応
ソルターゼ触媒アシル基転移反応、およびタンパク質工学のためのペプチド転移(場合によってはアシル基転移とも呼ばれる)におけるその使用は、当業者に周知である(例えば、その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ploegh et al.、国際公開第2010/087994号パンフレットおよびPloegh et al.、国際公開2011/133704号パンフレットを参照のこと)。一般に、ソルターゼにより触媒されるペプチド転移反応により、C末端ソルターゼ認識モチーフ、例えばLPXTX(配列番号80;Xの各存在は独立して、任意のアミノ酸残基を表わす)を含有する第1のタンパク質がN末端ソルターゼアクセプターペプチド、例えば、1つまたは複数のN末端グリシン残基を含む第2のタンパク質とコンジュゲートする。一部の実施形態では、ソルターゼ認識モチーフは、本明細書に記載のソルターゼ認識モチーフである。特定の実施形態では、ソルターゼ認識モチーフは、LPXT(配列番号50)モチーフまたはLPXTG(配列番号1)である。
ソルターゼアシル基転移反応は、アシルドナーを求核性アシルアクセプターと効率的に連結する手段を提供する。この原理は、多くのアシルドナーおよび多数の異なるアシルアクセプターに広く適用可能である。これまで、ソルターゼ反応は、タンパク質および/またはペプチドを相互に連結するために、合成ペプチドを組換えタンパク質に連結するために、レポーティング分子をタンパク質またはペプチドに連結するために、核酸をタンパク質またはペプチドに連結するために、タンパク質またはペプチドを固体支持体またはポリマーにコンジュゲートするために、またタンパク質またはペプチドを標識に連結するために使用された。このような生成物およびプロセスは、連結生成物の合成に関連した費用および時間を節約し、アシルドナーをアシルアクセプターに好都合に連結するのに有用である。しかしながら、本明細書に提供される、ソルタギングによる、ウイルス粒子表面上のタンパク質の修飾および機能化は、これまでに記載されていない。
ソルターゼ媒介ペプチド転移反応(場合によってはアシル基転移反応とも呼ばれる)は、ソルターゼのトランスアミダーゼ活性により触媒され、アシルドナー化合物とNH2−CH2成分を含有する求核性アシルアクセプターとの間にペプチド結合(アミド結合)が形成される。一部の実施形態では、ソルターゼ媒介ペプチド転移反応を行なうために使用されるソルターゼはソルターゼA(SrtA)である。しかしながら、本発明はソルターゼAの使用に限定されるものではないため、アシル基転移反応を触媒する任意のソルターゼまたはトランスアミダーゼを、本発明の一部の実施形態では使用することができることに留意するべきである。
典型的には、目的薬剤(例えば、タンパク質またはタンパク質骨格にコンジュゲートされる非タンパク質性薬剤)は、タンパク質性薬剤または目的薬剤がコンジュゲートされているタンパク質骨格を、ペプチド転移反応の発生を可能にする適切な条件下で細胞と接触させることにより、ソルタギング可能な表面タンパク質を発現する細胞の表面に連結することができる。一部の例では、目的薬剤は、最初に、ソルターゼ認識部位での切断が可能になる適切な時間、適切な条件下でソルターゼとインキュベートすることができる。次いで、目的薬剤が細胞上で表面のソルタギング可能なタンパク質にコンジュゲートされるように、この混合物を適切な条件下で細胞と接触させる。
一部の実例では、CD4+前駆細胞または脱核赤血球などの細胞は、C末端にソルターゼ認識モチーフを含む融合タンパク質(例えば、C末端にソルターゼ認識モチーフが融合したII型赤血球膜貫通型タンパク質)を発現する。目的タンパク質または目的薬剤をコンジュゲートしたタンパク質骨格は、ソルターゼの存在下で融合タンパク質のC末端にコンジュゲートさせることができる。他の実例では、細胞は、膜タンパク質と、膜タンパク質(例えば、I型またはIII型の膜貫通型タンパク質)のN末端に融合したアクセプターペプチド(例えば、グリシンポリマー)とを含む融合タンパク質を発現する。細胞表面融合タンパク質にコンジュゲートされるタンパク質は、上記のソルターゼ認識モチーフをC末端に含み、表面融合タンパク質のN末端にコンジュゲートさせることができる。
本明細書に記載のコンジュゲーション方法における特定のソルターゼの使用は、細胞上の表面ソルタギング可能なタンパク質または表面タンパク質にコンジュゲートされるタンパク質の何れかに含まれるソルターゼ認識モチーフに依存することになる。これは当業者の知識の十分範囲内である。例えば、種々のソルターゼの認識部位に関しては上記の説明を参照されたい。
一部の実施形態では、CD34+細胞またはそれに由来する脱核赤血球は、複数の異なる表面ソルタギング可能なタンパク質(例えば、2つ、3つ、またはそれ以上)を発現することができる。一部の実施形態では、複数の表面ソルタギング可能なタンパク質の1つまたは複数の特定の修飾には、1つまたは複数のソルタギング可能なタンパク質に含まれる異なるソルターゼ認識モチーフをそれぞれが特異的に認識する異なるソルターゼの使用が含まれる。例えば、第1のソルタギング可能なタンパク質は、C末端ソルターゼ認識モチーフLPETGG(配列番号107)およびN末端ソルターゼ認識モチーフ(G)を認識するSrtAアウレウスで修飾することができ、第2のソルタギング可能なタンパク質は、C末端ソルターゼ認識モチーフLPETAA(配列番号108)およびN末端ソルターゼ認識モチーフ(A)を認識するSrtAピオゲネスで修飾することができる。この例のソルターゼは、それぞれの認識モチーフを認識するが、他のソルターゼの認識モチーフを有意な程度に認識することはなく、したがって、それぞれの認識モチーフを「特異的に」認識する。一部の実施形態では、ソルターゼは、異なるモチーフに結合する親和性よりも、少なくとも5倍、10倍、20倍、50倍、100倍、200倍、500倍、1000倍、または1000倍を超えて高い親和性でソルターゼ認識モチーフに結合する場合に、ソルターゼ認識モチーフに特異的に結合する。このような直交したソルターゼおよびそれぞれの認識モチーフの組合せ、例えば、直交したソルターゼA酵素であるSrtAアウレウスとSrtAピオゲネスの組合せは、2つの異なる表面ソルタギング可能なタンパク質上に2つの異なる成分を部位特異的にコンジュゲートさせるために使用することができる。
他の実施形態では、複数の異なるタンパク質のソルタギングは、異なるソルタギング可能な表面タンパク質を含む細胞を、第1のソルタギング可能なタンパク質のソルターゼ認識モチーフを認識する第1のソルターゼおよび適切な第1の目的タンパク質と、次いで第2のソルタギング可能なタンパク質のソルターゼ認識モチーフを認識する第2のソルターゼおよび第2の目的タンパク質と等々、逐次的に接触させることにより、達成される。あるいは、例えば、第1のソルタギング可能なタンパク質のソルターゼ認識モチーフを認識する第1のソルターゼおよび適切な第1の目的タンパク質と、第2のソルタギング可能なタンパク質のソルターゼ認識モチーフを認識する第2のソルターゼおよび第2の目的タンパク質と等々、細胞を複数のソルターゼと並行して接触させてもよい。
例えば、一部の実施形態では、第1のソルタギング可能なタンパク質、例えば、オリゴグリシンが融合したI型膜貫通型タンパク質は、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)由来のソルターゼA(SrtAアウレウス)を使用して修飾され、第2のソルタギング可能なタンパク質、例えば、適切なソルターゼ認識モチーフが融合したII型膜貫通型タンパク質は、ストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)由来のソルターゼA(SrtAピオゲネス)を使用して修飾される。SrtAアウレウスは、モチーフLPXTG(配列番号1)(Xは任意のアミノ酸残基である)を認識し、アクセプターペプチドとしてオリゴグリシンを使用する。これとは異なり、SrtAピオゲネスは、モチーフLPXTA(配列番号2)(Xは任意のアミノ酸残基である)を認識し、アクセプターペプチドとしてオリゴアラニンを使用する。
十分に異なるソルターゼ認識モチーフを十分な特異性で認識する任意のソルターゼは、赤血球上に発現される複数のソルタギング可能なタンパク質のソルタギングに適している。それぞれのソルターゼ認識モチーフは、当業者に公知の組換え技術を使用して、ソルタギング可能なタンパク質またはソルタギング可能なタンパク質にコンジュゲートされるタンパク質に挿入することができる。一部の実施形態では、適切なソルターゼ認識モチーフは、野生型膜タンパク質に存在し得る。当業者であれば、例えば、ソルタギング可能なタンパク質が、そのC末端またはN末端に、公知の任意のソルターゼにより基質として認識され得る配列を含むか否かにかかわらず、所与のタンパク質のコンジュゲーションに適したソルターゼの選択はソルタギング可能なタンパク質の配列に依存し得ることを理解されよう。一部の実施形態では、標的タンパク質のさらなる操作を回避することができるため、天然のC末端またはN末端認識モチーフを認識するソルターゼの使用が好ましい。
IV.目的薬剤のin vivo送達用の担体としての赤血球の使用
遺伝子改変のCD34+前駆細胞、およびこれも記載されるように遺伝子改変することができる脱核赤血球(本明細書に記載のin vitro培養工程から得られるものを含む)は何れも、本開示の範囲内である。
本明細書に記載される、目的薬剤の表面修飾を有する脱核赤血球は、種々の目的のために、例えば、目的薬剤が治療薬である場合に特定疾患を処置するために、目的薬剤が標的細胞を認識することができる場合に特定の細胞型の存在を検出するために、また目的薬剤が免疫原性である場合に所望の免疫応答を惹起するために、それを必要とする被験体(例えば、ヒト患者)に投与することができる。任意の適切な送達ルート、例えば細胞点滴を本明細書に記載の方法で使用することができる。
一部の例では、赤血球は、この細胞が由来する被験体に送達される。例えば、末梢血液細胞をヒト患者などの被験体から入手し、in vitroで拡大し、ソルタギング可能な表面タンパク質を発現するように遺伝子改変し、脱核赤血球に分化させ、そして目的薬剤をコンジュゲートさせることができる。次いで、修飾脱核赤血球を、同じ被験体に投与することができる。
他の例では、CD34前駆細胞を、適切な被験体から入手し、本明細書に記載のように分化させ遺伝子改変した後、得られた脱核赤血球を、好ましくはドナーと免疫適合性がある(例えば、脱核血液細胞の投与により望ましくない免疫応答が誘発されないであろう)異なる被験体に投与する。
脱核赤血球は、赤血球欠乏、例えば、貧血、外科手術または外傷による失血と関連した症状を有するかまたはその疑いのある被験体に投与することができる。脱核赤血球はまた、脱核赤血球の表面上にコンジュゲートされた目的薬剤により達成することができる処置または診断を必要とする被験体に投与することができる。例えば、脱核赤血球は、癌抗原または病原体に由来する抗原にコンジュゲートさせることができる。そのような細胞は、予防処置または治療処置を必要とする被験体(例えば、癌または病原体による感染症に罹患しているかまたはそのリスクがあるヒト被験体)に送達することができる。
別の例では、有核赤血球は、酵素欠損に関連した疾患または障害、例えば、ファブリ病、ゴーシェ病、ポンペ病、アデノシンデアミナーゼ欠損症、アスパラギナーゼ欠損症、ポルフィリン症、血友病、および遺伝性血管浮腫の処置に有効な酵素にコンジュゲートさせることができる。
他の例では、脱核赤血球は、凝固(clottingまたはcoagulation)因子(例えば、第VII因子、第VIIa因子、第VIII因子、または第IX因子)を担持し、異常な血液凝固(clottingまたはcoagulation)に関連した症状を有するかまたはその疑いのあるヒト被験体に送達することができる。
V.キット
本開示の一部の態様は、赤血球の遺伝子改変およびソルタギングによる表面修飾に有用なキットを提供する。このようなキットは、それぞれが赤血球膜タンパク質と本明細書に記載のペプチドとを含む1つまたは複数の融合タンパク質をコードする1つまたは複数の発現ベクターを含む。キットが記載のように複数の発現ベクターを含む場合、発現ベクターは異なるソルターゼ認識モチーフをコードする配列を含むことができる。一部の実施形態では、異なるソルターゼ認識モチーフは、直交したソルターゼにより認識され、例えば、SrtAアウレウスによりあるモチーフが、SrtAピオゲネスにより別のモチーフが認識される。
代替的または追加的に、本明細書に記載のキットは、脱核赤血球を生成させるためのin vitro培養工程で使用される培地成分の1つまたは複数、例えば、そこで使用されるサイトカインの1つまたは複数、およびそこで使用される培地の1つまたは複数、および/または細胞培養の他の成分を含むことができる。
さらに、キットは1つまたは複数の適切なソルターゼを含むことができる。典型的には、キットに含まれるソルターゼは、キットに含まれる核酸によりコードされるソルターゼ認識モチーフを認識する。一部の実施形態では、ソルターゼは、保存溶液中に、ソルターゼの構造完全性および/または活性を保持する条件下で提供される。一部の実施形態では、2つ以上の直交したソルターゼ認識モチーフがキットに含まれる核酸によりコードされる場合、核酸によりコードされる異なるソルターゼ認識モチーフをそれぞれが認識する複数のソルターゼが提供される。一部の実施形態では、キットはSrtAアウレウスおよび/またはSrtAピオゲネスを含む。
一部の実施形態では、キットは、目的薬剤、例えば、目的タンパク質または非タンパク質性薬剤にコンジュゲートされたタンパク質骨格をさらに含む。一部の実施形態では、目的タンパク質またはタンパク質骨格は、ソルターゼ認識モチーフを含み、両方のモチーフが同じソルターゼにより触媒されるソルターゼ媒介ペプチド転移反応に参加することができるという点で、キット中の核酸によりコードされる融合タンパク質中のペプチドと適合し得る。例えば、キットがSrtAアウレウスN末端認識配列を含む融合膜タンパク質をコードする核酸を含む場合、キットはまた、SrtAアウレウスと、C末端ソルターゼ認識モチーフを含む目的タンパク質またはタンパク質骨格とを含むことができる。
一部の実施形態では、キットは、ソルターゼ媒介ペプチド転移反応を行うために有用な緩衝剤または試薬、例えば、実施例の部に記載の緩衝剤または試薬をさらに含む。
さらなる詳細な説明がなくとも、当業者は、上記の説明に基づいて、本発明をその最大限度まで利用することができると考えられる。したがって、以下の特定の実施形態は、単に説明のためのものとして解釈されるべきであり、本開示のその他の部分を決して限定するものではない。本明細書に引用の刊行物はすべて、本明細書で言及された目的または対象のために、参照により本明細書に組み込まれる。
実施例1:ヒト成熟脱核赤血球のin vitro生成
CD34+について濃縮されたヒト末梢血G−CSF動員造血幹/前駆細胞を、Fred Hutchinson Cancer Research Center(FHCRC),Seattleから購入する。FHCRCプロトコールに従って、細胞を解凍する。ヒトCD34+(hCD34+)血液細胞は、21日の間に、図1に示され、また以下に記載される4段階:(a)拡大、(b)分化I(「分化I」)、(c)分化II(「分化II」)、および分化III(「分化III」)で構成される方法により、成熟脱核赤血球に分化させた。
拡大段階では、ヒトCD34+血液細胞を、拡大培地(StemspanSFEM、Flt−3リガント(ligant)、SCF、IL−3、およびIL−6を含むCC100サイトカイン混合物、ならびに2%ペニシリン−ストレプトマイシン)中、10細胞/mLで1〜4日目の間培養した。拡大後、続いて、分化I、II、およびIIIにおいて、種々のサイトカインを添加したIMDMベースの赤血球系分化培地中で、細胞を培養する。3つの分化段階すべてに対する基礎培地は、IMDM、15%FBS、2mMグルタミン、1%BSA、500μg/mLホロ型ヒトトランスフェリン、10μg/mL組換え体ヒトインスリン、および2%ペニシリン−ストレプトマイシンを含む。5〜9日目では、赤血球系基礎培地、2μMデキサメタゾン、1μM b−エストラジオール、5ng/mL IL−3、100ng/mL SCF、および6U Epoを含有する分化I培地で細胞を培養する。10〜13日目では、赤血球系基礎培地、50ng/mL SCF、および6U Epoを含有する分化II培地中で細胞を増殖させる。14〜21日目では、2U Epoを添加した赤血球系基礎培地である分化III培地中、フィブロネクチンでコーティングされたプレートで細胞を培養した。分化I、II、およびIIIの最初に再播種した細胞数はそれぞれ、10、2×10、および3×10/mLであった。
上記の4段階工程中の種々の時点の赤血球を、ベンジジン−ギムザ染色に供し、その細胞形態を顕微鏡下で観察した。図2に示すように、細胞サイズの減少が赤血球系成熟と共に観察され、脱核赤血球が分化IIIの8日目に観察された。本明細書に記載の4段階法から得られる脱核赤血球のサイズは、正常ヒト網状赤血球または赤血球のサイズと同様であることが見出された。下記の表4。

Figure 2016519933
分化I、分化II、および分化IIIでの赤血球のヘモグロビン含量は、Drabkin試薬により測定した。結果から、分化工程の終了時に得られた脱核血液細胞では、約30pg/細胞であることが示される。
CD235a(グリコフォリンA)、c−Kit、およびCD71を含む種々の赤血球表面タンパク質の発現レベルを検討した。FACS分析から、CD235a発現が赤血球形成(赤血球分化)の間に上昇することが示された。分化工程の種々の段階における、CD235aの発現レベル対c−kitまたはCD71(トランスフェリン)の発現レベルを図4および5に示す。ヘキストおよびグリコフォリンAの染色から、赤血球の約40〜50%が、分化工程の終了時に脱核を受けていることが示された。図5。脱核%=32.5/(37.8+32.5)=46.2%。
分化工程中の細胞数をカウントし、その結果から、分化I〜分化IIIの間、ほぼ毎日、細胞数が2倍になることが示された。図6および7。hCD34+細胞分化における、グロビン遺伝子および他の遺伝子(hc−kit、hGATA2、hGATA1、hGYPA、hALAS2、およびhSLCA1)の発現レベルも、FACS分析により検討した。結果を図8および9に示す。
要約すると、上記の試験から、4段階のhCD34+細胞培養および分化の工程の開発に成功したことが示される。この工程により、21日間の培養後に約17,000〜32,000倍の細胞拡大(14〜15回の倍加)が得られ、細胞の約40〜50%が脱核を受けることが見出された。この培養工程から得られた脱核赤血球は、細胞のサイズ、ヘモグロビン含量(約30pg/細胞)、および細胞表面マーカーの発現において、正常ヒト網状赤血球または正常赤血球に類似している。
実施例2:ソルターゼ反応による、操作された赤血球への機能的プローブのコンジュゲーション
RBCは核を欠いており、その成熟段階では遺伝子改変することができない。そこで、赤血球系前駆体を、成熟RBCの形質膜上に保持される、ソルターゼ修飾可能なタンパク質を発現するように遺伝子操作した。この試験では、2つのソルターゼ修飾可能な膜タンパク質、KellおよびグリコフォリンA(GPA)を、赤血球系前駆細胞で発現させた:
(1)血液型抗原Kellは、細胞外に露出したC末端を有するII型膜タンパク質であり、C末端標識化の標的として選択された。
(2)細胞外に配置されたN末端を有するI型膜タンパク質であるGPAは、RBC表面上で最も豊富なタンパク質であり、N末端修飾のために選択された。
材料および方法
(i)プラスミド
ヒト、マウスのグリコフォリンA(GPA)およびKellのコード配列はそれぞれ、NCBI参照配列NM_002099.6、NM_010369.3、およびNM_000420.2から入手した。細胞表面の発現を検出するために、Mycタグコード配列(GAGCAGAAACTCATCTCAGAAGAGGATCTG;配列番号109)をシグナルペプチドと成熟GPAとの間に挿入した。GPAのN末端にソルターゼタグを結合させるために、5個のグリシン(配列番号3)または3個のグリシンタグコード配列(GGTGGCGGAGGTGGA;配列番号110またはGGTGGCGGA)を、シグナルペプチドの直後に挿入した。完全長の操作されたヒトおよびマウスGPAは、Genscriptにより合成され、次いでMSCVレトロウイルスベクターにクローニングされた。ヒトKellは、Mycタグ(GAACAAAAACTTATTTCTGAAGAAGATCTG;配列番号112)、LPETGG(配列番号107)(CTGCCAGAAACTGGTGGA;配列番号113)、次いでHAエピトープタグ(TACCCATACGACGTCCCAGACTACGCT;配列番号114)のコード配列をそのC末端に伸長してMSCVレトロウイルスベクターにクローニングした。
(ii)タンパク質の発現および精製
pET30における、Kcatの改善(1)(P94R、D160N、D165A、K190E、K196T)およびCa2+非依存性活性(Hirakawa et al.,Biotechnol.Bioeng 109(12):2955−2961)(E105K、E108Q)のために突然変異させたスタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)Δ59由来のソルターゼAならびにストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)由来のソルターゼAを両方とも、以前に記載のように発現させ精製した。Guimaraes et al.,(2013)Nat Protoc 8(9):1787−1799。pHEN中の、LPETGGHHHHHH(配列番号115)がC末端に伸長したVHH7も、以前に(4)記載のように発現させ精製した。ソルターゼプローブの設計および合成も同様に以前に記載されている。Guimaraes et al.,2013;およびTheile et al.,(2013)Nat.Protoc.8(9):1800−1807。
(iii)ソルターゼ標識化反応
ビオチンによりGPAのN末端を標識化するために、83mM Tris−HCl pH7.5、250mM NaCl緩衝液中の500μM S.アウレウス(S.aureus)ソルターゼおよび1mM K(ビオチン)LPRTGG(配列番号116)ペプチド30μlを、氷上で15分間プレインキュベートし、(DMEMで前洗浄した)DMEM中の約1×10個の培養細胞(網状赤血球またはHEK293T細胞)または最大5×10個の赤血球(全血10μl)70μlに加えた。VHH7によりGPAのN末端を標識化するために、50mM Tris−HCl pH7.5、150mM NaCl緩衝液中の100μM S.アウレウス(S.aureus)ソルターゼ、100μM VHH−LPETG−His6(配列番号126)50μlを、氷上で15分間プレインキュベートし、DMEM中の最大5×10個の赤血球50μlに加えた。ビオチンによりKellのC末端を標識化するために、83mM Tris−HCl pH7.5、250mM NaCl緩衝液中の500μM S.アウレウス(S.aureus)ソルターゼ、1.4mM GGGK(ビオチン)(配列番号47)ペプチド30μlを、(DMEMで前洗浄した)DMEM中の約1×106個の培養細胞(網状赤血球またはHEK293T細胞)または最大5×107個の赤血球に加えた。すべてのソルターゼと細胞の混合物は、随時緩やかに混合しながら30分間、氷上でインキュベートした。これらの混合物を4℃で2分間、2000RPMで遠心して緩衝液/DMEMを除去し、氷冷PBS1mlで3回洗浄した。GPAとKellの連続した2重標識化のために、83mM TrisHCl、250mM NaCl、16.7mM CaCl2緩衝液中の333μM S.ピオゲネス(S.pyogenes)ソルターゼ、1.33mM K(ビオチン)LPETAA(配列番号45)ペプチド30μlを、37℃で15分間、プレインキュベートし、(DMEMで前洗浄した)DMEM中の1×10個のHEK293T細胞70μlに加え、時々緩やかに混合しながら37℃で25分間インキュベートした。細胞を4℃で2分間、2000RPMで遠心し、氷冷PBS1mlで2回洗浄し、最後に氷冷DMEM70μlに再懸濁した。83mM Tris−HCl pH7.5、250mM NaCl中の333μM S.アウレウス(S.aureus)ソルターゼ、1.67mM GGGK(Alexa647;配列番号117)ペプチド30μlを細胞に加え、時々緩やかに混合しながら氷上で30分間インキュベートした。細胞を氷冷PBS1mlで3回洗浄した。
(iv)ウエスタンブロッティング
全血をソルターゼ標識化する場合、赤血球を最初に、塩化アンモニウム溶液(Stemcell Technologies)500μlで、氷上5分間のインキュベーションにより溶解し、4℃で10分間、14000RPMで遠心沈殿させた。PBS500μlで膜を1回洗浄した。コンプリートミニプロテアーゼ阻害剤カクテルタブレット(Roche)を添加した25mM Tris−HCl pH7.5、0.5%NP40、5mM MgCl、150mM NaCl中で細胞を可溶化し、撹拌し、氷上で10分間インキュベートし、4℃で10分間、14,000RPMで遠心した。上清をSDS試料緩衝液とインキュベートし、8分間煮沸した。SDS−PAGE後、タンパク質をPVDF膜上に転写し、ビオチン(ストレプトアビジン−HRP(GE Healthcare)を使用)、mycタグ(Cell Signaling #2040)、HAタグ(Rosh 3F10)、ヘモグロビン、またはCD19(Cell Signaling #3574)について免疫ブロットした。
(v)トランスフェクション
ウイルス生成:600万個の293T細胞を分離して、15%ウシ胎仔血清(FBS)および2mM L−グルタミンを添加した抗生物質不含ダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)(Invitrogen)中、トランスフェクションの1日前に10cmプレート上に播種した。0日目に、プラスミド10ugをパッケージングベクター5ugと一緒に、Fugene 6(Promega)を含む、293Tの10cmプレートに加えた。68時間後に、15%FBS、2mM L−グルタミン、および1×Pen Strep(Invitrogen)を添加した新たなDMEMで、古い培地を交換した。1日目に、新鮮なウイルスを含有する上清を回収し、0.45μmフィルター(Millipore)を通して濾過し、その直後に使用してマウス赤血球系前駆細胞に感染させた。GPAおよびKellの発現:HEK293T細胞を10cmディッシュ上に播種し、製造業者(Mirus)の推奨に従い、TransITトランスフェクション試薬を使用して、レトロウイルスベクター中のGn−myc−h/mGPAコンストラクト15μgまたはレトロウイルスベクター中のhKell−LPETG(配列番号44)−HA7.5μgと3G−myc−hGPA7.5μgの両方(連続した2重ソルターゼ標識化用)の何れかでトランスフェクトした。細胞をタンパク質発現について分析し、細胞トランスフェクションの24時間後にソルターゼ標識した。
(vi)マウスE14.5胎仔肝細胞からの赤血球系前駆細胞の単離
二酸化炭素による麻酔後、14.5日の妊娠C57BL/6Jマウスを解剖して胎仔を単離した。胎仔肝臓全体を慎重に分離し、2%ウシ胎仔血清(FBS)および100uM EDTAを含むリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中に入れた。粉砕して70μmフィルター(BD)を通して濾過した後、単一胎仔肝細胞懸濁液を得た。胎仔肝細胞懸濁液中の成熟赤血球は、塩化アンモニウム溶液(Stemcell)との10分間インキュベーション後、溶解した。1500RPMで5分間遠心分離することにより有核細胞を回収し、PBS中に再懸濁した。BD Biotin Mouse Lineage Panel(559971)およびBD Streptavidin Particles Plus DM(557812)を使用して、系統陰性胎仔肝細胞を精製したところ、これは、赤血球系前駆細胞について濃縮されていた(90%超)。
(viii)マウス赤血球系前駆細胞のウイルス感染および培養
精製後、系統陰性胎仔肝細胞を1ml当たり1000万個の細胞濃度に調製した。細胞10μlを、5ug/mlポリブレンを含むウイルス含有上清1mlと共に、24ウェルプレートのそれぞれのウェルに播種した。プレートを37℃で90分間、2000RPMで遠心した。スピン感染の直後に、ウイルス含有上清を吸引し、組換えマウス幹細胞因子(100ng/ml SCF、R&D)、組換えマウスIGF−1(40ng/ml、R&D)、デキサメタゾン(100nM、Sigma)、およびエリスロポエチン(2u/ml、Amgen)を添加した赤血球系維持培地(StemSpan−SFEM(StemCell Technologies))と交換した。翌朝、フローサイトメトリーによりGFP陽性細胞の集団を検査することにより、感染率を調べた。感染率は典型的には95%超であった。次いで、細胞を、15%FBS(Stemcell)、1%無毒化ウシ血清アルブミン(BSA)(Stemcell)、500μg/mLホロ型トランスフェリン(Sigma−Aldrich)、0.5U/mL Epo(Amgen)、10μg/mL組換えヒトインスリン(Sigma−Aldrich)、2mM L−グルタミン(Invitrogen)、および1×Pen Strep(Invitrogen)を含有する、Epoのみの赤血球系分化培地(イスコフ改変ダルベッコ培地(IMDM))中で48時間培養した。
(ix)フローサイトメトリー
FACSソーティングまたは分析のために、所望の細胞をPBSで1回洗浄し、1μg/mlのPI含有PBS中に、5〜10M/mlの密度で再懸濁した。脱核分析において、最初に、抗マウスTER−119抗体(eBioscience、14〜5921)およびヘキスト(Sigma)により室温で15分間、細胞を染色した。Mycタグ、HAタグの表面発現もしくは標識化、またはビオチン標識化を検出するために、抗Myc抗体(Cell signalling、3739)、抗HA抗体(Thermo Fisher Scientific、NC9843881)、または抗ビオチン抗体(eBioscience、12−9895−82)でそれぞれ、室温で30分間、細胞を染色した。
(x)骨髄細胞のウイルス感染
C57BL/6Jマウス由来の大腿骨および脛骨中の骨髄を、23G注射針を使用して単離し、15%ウシ胎仔血清、2mM L−グルタミン(Invitrogen)、1×Pen/Strep(Invitrogen)、20ng/ml IL−3(Peprotech)、50ng/ml SCF(Peprotech)、および50ng/ml IL−6(Peprotech)を添加したDMEM中で18時間、2×106細胞/mlの密度で6ウェルプレートにて培養した。レトロウイルス含有培地500μl、DMEM500μl、5μg/mlポリブレン中で4×106個の細胞をインキュベートし、室温で1.5時間、2500RPMで細胞を遠心し、さらにCOインキュベーター中で5時間細胞をインキュベートすることにより、細胞を感染させた。上記のIL−3/SCF/IL−6添加培地に細胞を戻して、さらに16時間インキュベートした。
(xi)照射手順およびマウス胎仔肝臓移植
B6.SJL−Ptprca Pep3b/BoyJマウス(The Jackson Lab)を、移植1日前に、Gammacell 40照射器チャンバー中で、1050cGyの全身照射に供した。マウス胎仔肝細胞を採取し、上記のように調製した。レトロウイルス感染後、細胞を赤血球系維持培地で18時間培養した。あるいは、マウス骨髄細胞を採取し、上記のようにレトロウイルス形質導入した。次いで、感染細胞を滅菌PBSで2回洗浄し、2〜5百万個の細胞/mLで滅菌PBS中に再懸濁した。次いで、これらのマウス幹細胞および前駆細胞100μlを、致死的照射を受けたマウスに後眼窩注射した。4週目から開始して、分析およびソルタギングのために照射マウスから成熟赤血球を抜き取った。
(xii)サイトスピン調製および免疫蛍光法
成熟赤血球およびin vitroで分化した網状赤血球をビオチンでソルタギングした後、冷1×PBSで2回洗浄した。50,000個のソートされたビオチン化成熟赤血球またはソートされていないin vitroで分化した網状赤血球を、400rpmで5分間、ポリ‐L‐リジンコーティングされたスライド上で遠心分離した(Cytospin 3、Thermo Shandon)。試料を風乾し、室温で30分間、4%パラホルムアルデヒドで固定し、ブロッキング緩衝液(PBS中2%BSA+2%ロバ血清)中で1時間ブロックした。次いで、細胞を、ブロッキング緩衝液中で、一次抗体:PEコンジュゲート抗ビオチン(1:1000、eBioscience、12−9895−82)およびAPCコンジュゲート抗Ter119(1:100、eBioscience、14−5921)と4℃で一晩インキュベートした後、冷1×PBSで3回洗浄した。最後に、すべての免疫染色実験において、DAPI(Prolong Gold Antifade,Invitrogen)を含有するマウンティング培地で細胞をマウントして、核を視覚化した。視覚化は、Zeiss LSM 700レーザスキャン共焦点顕微鏡を使用して行った。
(xiii)eRBCの移入および生存
成熟RBCをソルタギングした後、1×PBSで2回洗浄し、RPMI培地中に再懸濁した。これらのソルタギングされたRBCを、1500rpmで5分間遠心分離することにより回収し、ハンクス平衡塩類溶液(HBSS)中の5μM CFSEを用いて、8分間標識した(Life Technologies)。次いで、HBSS中の10%FBSを等量加えて反応をクエンチした。RBCを洗浄し、カウントし、注射のために滅菌HBSS中に再懸濁した。次いで、25億個のCFSE標識化RBC(±300μlマウス血液)を、レシピエントCD45.1+マウスに静脈内注射した。正常RBCを対照として用いた。RBCの20〜50%のみが、操作されたhGPAまたはhKellを発現したため、RBCの残りは正常なものであり、CFSEシグナルをモニターすることにより内部標準として用いた。移入の1時間後に、最初の血液試料(20μl)を後眼窩から採取し、0日目として標記した。その後同量の血液試料を1、4、および7日目等に、28日目まで採取した。フローサイトメトリー分析中に、ビオチンを連結したeRBCが強力なPEシグナルを示すように、PEがコンジュゲートした抗ビオチン抗体(ebioscience)で血液試料を染色した。しかしながら、hKell−ビオチンを有するRBCは、PEがコンジュゲートした抗ビオチン抗体による染色後、極めて低い赤色蛍光強度しか示さなかった。CFSE由来の強力な緑色蛍光シグナルの存在下でその赤色蛍光を検出することは困難であった。hKell−RBCをビオチンでソルタギングし、CFSE染色なしでマウスに移入した。hKell−RBCを、その固有のGFPシグナルおよびPEがコンジュゲートした抗ビオチン抗体からの弱いPEシグナルによりモニターした。対照RBCおよびhGPA−RBCを、2回の別々の時に合計6匹のマウスに移入した。hKell−RBCは合計3匹のマウスに移入し、理由は不明であるが一匹が死亡した。
結果
(I)遺伝子改変されたI型膜タンパク質ヒトグリコフォリンA(GPA)は、RBC表面上に発現され、ソルターゼ標識化された。
(a)RBC上のソルタギング可能なヒトグリコフォリン(hGPA)の発現
融合タンパク質5Gly(配列番号3)−myc−hGYPAおよび3Gly−myc−hGYPAの発現カセットは、図10に示すように、2つのレンチウイルスベクターEF1およびMSCV(System Biosciences,Inc.)に挿入された。両方のベクターとも、レポート遺伝子としてGFPを担持する。融合タンパク質を発現する、得られたレンチウイルスベクターは、分化Iの開始時にヒトCD34細胞に形質導入された。
図11に、上記の実施例Iに記載のように、分化Iおよび分化IIの終了時に得られたヒトCD34細胞および赤血球における融合タンパク質の発現を示す。EF1ベクターにより形質導入された赤血球の表面上の5Gly(配列番号3)−myc−hGYPA融合タンパク質の発現は、少なくとも分化IIの終了時に観察された。
同様の結果が、MSCV発現ベクターで形質導入された赤血球でも観察された。図12に示すように、赤血球の表面上のMSCV−5Gly(配列番号3)−myc−hGYPAの発現は、分化IIIの終了時に観察された。
5Gly(配列番号3)−myc−hGYPAおよび3Gly−myc−hGYPA融合タンパク質を発現するためのレンチウイルスベクターはまた、K562細胞に形質導入され、両方の融合タンパク質の発現が、K562細胞の表面上で観察された。
要約すると、ソルタギング可能なhGYPAの発現が、フローサイトメトリーおよびウエスタンブロッティングにより、分化Iの終了時に細胞の50〜70%で検出された。hGYPAの発現は分化IIIの終了時まで一定のまま継続した。
(b)ソルターゼの存在下で、赤血球表面に目的薬剤をコンジュゲートする
hGYPAをソルタギングするために、スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)の300μMソルターゼAおよび500μMビオチン−LPRTGG(配列番号118)を、37℃で30分間、ソルターゼ緩衝液中でプレインキュベートした。次いで、ソルタギング可能なhGYPA(5Gly(配列番号3)−myc−hGYPAまたは3Gly−myc−hGYPA)を発現する100万個の赤血球を、ソルターゼ−基質混合物と37℃で1時間インキュベートした。細胞をPBSで3〜4回洗浄した後、フローサイトメトリーまたはウエスタンブロッティングにより、ビオチンコンジュゲーションを検出した。標識率は通常80〜100%である。
図13に示すように、ウエスタンブロッティングの結果から、赤血球上の5Gly(配列番号3)−myc−hGYPAの発現およびhGYPAへのビオチンのコンジュゲーションが示される。FACS分析から、分化IIIの8日目に赤血球の表面にビオチンがコンジュゲートされていることが示された。図14および15。この結果から、成熟脱核赤血球の表面を、ソルターゼ触媒反応により修飾することができることが示される。
同様に、K562細胞上で発現されたソルタギング可能なhGYPAも、ソルターゼの存在下でのビオチンによる修飾に成功した。
別の実験では、LPXTG(配列番号1)モチーフを含む、PEがコンジュゲートしたペプチドを、37℃で45分間、ソルターゼAと一緒にした。次いで、この混合物を、3Gly−GYPAまたは5Gly(配列番号3)−GYPAのソルタギング可能な表面タンパク質を発現する赤血球と37℃で30分間インキュベートした。次いで、細胞をFACS分析に供した。このようにして得られた結果から、PEがコンジュゲートしたペプチドが、赤血球の表面上の3Gly−GYPAおよび5Gly(配列番号3)−GYPAの両方にコンジュゲートしたことが示される。
(c)遺伝子改変されたhGPAは、ソルターゼ標識化されるように、マウスRBC上に発現された
グリシン残基による、GPA(GPA)のN末端の伸長は、GPAを適切なソルターゼ基質にするために必要とされる最小の修飾であった。修飾バージョンでは、N末端シグナル配列が保持され、その後にグリシン残基およびmycエピトープタグが続いた。シグナルペプチドの切断により、(Gly)n−mycタグ−GPAが得られることになる。修飾GPAを担持する細胞をスタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)由来のソルターゼAおよびLPETG(配列番号44)ベースのプローブとインキュベートすると、このプローブがGPAのN末端にコンジュゲートする。
3個または5個のN末端グリシン残基(配列番号3)がそのN末端に伸長した生成物をコードする、GPAについての4つのレトロウイルスコンストラクトを、下記のKellの場合のように、マウスまたはヒトのGPAおよびin vitroの赤血球系分化系(Zhang et al.,203,Blood 102(12):3938−3946)を使用して、GPAの発現およびソルターゼによる修飾を試験するために調製した。本発明者らが、その表面上に修飾GPAを発現する、正常数の脱核Ter119陽性赤芽球を得た、それぞれの場合と同様に、前駆細胞のレトロウイルス形質導入の際に、4つのGPAコンストラクトは何れも、分化工程に影響を与えなかった(図17および図18A、B)。
これらのGPAコンストラクトは、HEK293T細胞においてそれらが発現することによって、またそれに続くビオチン含有プローブによるソルタギングによって、ソルターゼ修飾可能なものと確認された(図18C)。マウスコンストラクトの高レベルの発現は観察されたが、コードされた生成物のビオチン化は検出されなかった。これに対して、ヒト3G−myc−GPA(3G−myc−hGPA)は容易にソルタギングされ、その後の実験に使用された。赤血球系前駆細胞において3Gmyc−hGPAを発現させると、in vitroでの分化の際、表面上に修飾GPAを有するものが、有核赤芽球で約36%、また脱核網状赤血球で約67%得られた。有核および脱核の両細胞上の修飾GPAはほぼすべて、フローサイトメトリー、免疫ブロッティング、および免疫蛍光法によりモニターすると、ビオチン含有プローブでソルタギングされていた(図19)。
Kellの場合のように(下記の説明を参照のこと)、マウス胎仔肝臓系統陰性細胞に3G−myc−hGPAを発現するレトロウイルスベクターを感染させ、致死的照射を受けたマウスにそれらを移植した(図20)。4週間後、これらの移植マウスは、修飾GPAを発現するTer119陽性の円盤型成熟RBCを20〜50%含有し、これらのRBCは、フローサイトメトリーにより判定すると、85%+/−5%の効率でビオチン含有プローブによりソルタギングすることができる(図16C)。ビオチンによりソルタギングすると、3Gmyc−hGPAのゲル移動度が減少するという観察は、反応効率の読み出しとして使用することができ、GPAの大部分がソルターゼにより修飾されていることを示す。免疫蛍光顕微鏡(図16E)により、これらの修飾赤血球はすべて、実際に、それらの表面にコンジュゲートされたビオチンを有することが確認された。これらの結果から、ソルタギング可能なGPAが成熟RBCの表面上に保持され、ソルターゼ触媒反応で効率的に標識されたことが示される。
(d)II型膜タンパク質Kellは、RBC表面上に発現され、ソルターゼ標識された
ルーチン的な組換え技術により、表面融合タンパク質hsCD71−LPETG(配列番号44)−HAおよびhsKell−LPETG(配列番号44)−HAを生成するための発現ベクターをHEK293T細胞にトランスフェクトした。融合タンパク質を発現する安定な細胞株が確立された。200μMソルターゼ、0.5mMまたは1mM GGG−ビオチンと細胞をインキュベートし、ウエスタンブロッティング分析に供した。この結果から、ビオチンの融合タンパク質へのコンジュゲーションが成功したことが示される。
ソルターゼ認識モチーフLPXTG(配列番号1)によるKellのC末端の伸長は、ソルターゼ修飾可能にするために必要とされる最小の修飾であった。LPETG(配列番号44)による伸長によりC末端が修飾されたヒトKellをコードするレトロウイルスコンストラクトを、本明細書に記載のように構築し、その後にヘマグルチニン(HA)エピトープタグにより伸長させた。グリシンベースのプローブを使用して、本明細書に記載のように、このように修飾されたKellに対して行ったソルターゼ反応により、HAタグが消失すると同時に、KellのC末端上にプローブがコンジュゲートされた(図21A)。
Kellの発現およびソルターゼによる修飾を試験するために、以前に記載されたin vitroの赤血球系分化系を使用した。Zhang et al.,2003。マウス胎仔肝臓由来前駆細胞のin vitroでの約48時間培養により、約4回の最終細胞分裂およびヘモグロビン含有赤芽球の形成が可能になり、このうちの約30〜50%に脱核が起こり、網状赤血球が得られる。hKell−LPETG(配列番号44)−HAの発現は、in vitro分化工程を阻害しなかった。有核赤芽球と脱核網状赤血球は両方ともそのほぼ半分が、細胞表面に修飾Kellを示し、これらのうちの大きな割合が、フローサイトメトリー、免疫ブロッティング、および免疫蛍光法により示されるように、ビオチン含有プローブでソルタギングすることができた(図22)。
in vitro分化により得られた網状赤血球は、残存する細胞小器官の排除を受けなければならないだけでなく、両凹円盤型の成熟RBCをもたらす膜再編成も行わなければならない。この成熟ステップが修飾Kellの消失をもたらさないことを保証するために、マウス胎仔肝臓系統陰性細胞を、操作されたhKell−LPETG(配列番号44)−HAを発現するレトロウイルスベクターで感染させ、致死的照射を受けたマウスに移植した(図20)。4週間後に移植マウスから成熟赤血球を採取し、その表面上のソルターゼ修飾可能なKellの存在について分析した。これらのキメラマウス中の成熟RBCの約20〜50%が、その表面上にソルタギング可能なヒトKellを含有すること(図21B)、およびこれらの細胞が、フローサイトメトリーにより判定すると、81%+/−28%の効率で、ソルターゼを使用してビオチンで共有結合的に修飾することができること(図21C)がルーチン的に見出された。免疫ブロット上でのHAの完全な消失によって証明されるように、ソルタギングによる、KellのC末端へのビオチンプローブの高レベルのコンジュゲーションが観察された(図21D)。免疫蛍光顕微鏡(図21E)により、赤血球の表面にコンジュゲートされたビオチンの存在が確認される。これらのデータから、ソルターゼ認識モチーフでそのC末端が伸長したKellは、赤血球系分化を阻害せず、成熟赤血球の形質膜上に保持され、ソルタギング反応で標識化することができることが実証される。
(e)RBCの2重標識化
別々の基質特異性を有するソルターゼを使用し、N末端標識化とC末端標識化の戦略を組み合わせて、多重標識化RBCを生成させることが可能である(Antos et al.,2009,J.Ameri.Chem.Soc.,131(31):10800−10801)。スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)由来のソルターゼAと異なり、ストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)由来のソルターゼAは、LPXTA(配列番号2)モチーフを認識し、求核試薬としてオリゴアラニンプローブを受容する。したがって、両酵素のソルターゼ反応は、直交した反応として行なうことができる。
HEK293T細胞に2つのコンストラクト:AAA−myc−hGPAおよびhKell−LPETG(配列番号44)−HAを感染させた。ビオチン−LPETA(配列番号119;S.ピオゲネス(S.pyogenes)ソルターゼによるGPAソルタギング用)またはGGG−TAMRA(S.アウレウス(S.aureus)ソルターゼによるKellソルタギング用)の何れかの存在下で、2つの異なるタイプのソルターゼAと細胞を逐次的にインキュベートし、ビオチン化GPAとTAMRA修飾Kellの両方を含有するHEK293T細胞を生じさせる(図16F)。さらに、3A−myc−hGPAとhKell−LPETG(配列番号44)−HAの両方が細胞表面に発現した成熟RBCを生成させた。個々のRBC上のhKellおよびhGPAの発現レベルがいくぶん変動するという事実にもかかわらず、RBC表面上で、hGPAのビオチンによるソルタギングおよびhKellのAlexa−647によるソルタギングが成功した(図23)。したがって、2重標識化を使用して、RBCの表面上に2つの異なる機能成分を結合させることができる。
(f)血液循環における、操作されたRBCの生存
ソルターゼとのインキュベーション、遠心分離、および洗浄を含む、RBCをソルタギングする工程が、RBCのin vivoでの生存に影響を与えるか否かを評価するために、野生型RBCおよびソルターゼの存在下または非存在下(プローブのコンジュゲーションはない)で、模擬C末端ソルタギング反応を受けた野生型RBCを、生細胞のサイトゾルを安定的に染色する蛍光色素であるCFSEで標識化した。次いで、RBCを正常なレシピエントマウスに移入し、血液循環での細胞生存を、CFSE蛍光を使用して定期的に評価した。実験群間の差は、RBCのin vivo生存では観察されず(図24A)、ソルタギング手順により、細胞が早発に除去されることになる顕著な損傷が細胞にもたらされないことが示された。
実施例3:細胞型特異的ターゲティングのための、操作された赤血球への抗体のコンジュゲーション
修飾RBCの有望な1つの用途は、特定の組織型または細胞型へのその送達を可能にするターゲティング成分(および結合したまたは組み込まれたペイロード)をそれに装着させることである。このようなターゲティングは、目的標的の特異的認識に関与することができる、特定の受容体のリガンドなど、タンパク質または他の実体の設置により行うことができる。
RBCの表面上への機能タンパク質のコンジュゲーションを試験するために、ソルタギング可能なアルパカ由来の単一ドメイン抗体を使用した。この抗体は、マウスMHCクラスII分子、VHH7−LPETG(配列番号44)に特異的であり、その表面上に3G−myc−hGPAを有する赤血球に共有結合させた。3G−myc−hGPAのゲル移動度のシフトにより示されるように、ソルタギング反応は化学量論的である(図25A)。
B細胞−赤血球の結合アッセイを以下のように行った。製造業者の推奨に従い、Dynabeads Mouse CD43(Untouched B cells)(Life Technologies)を使用して、野生型C57BL/6マウスまたはMHCクラスIIについてノックアウトされたマウスの何れかから、B細胞を単離した。1〜1.5個の脾臓に由来する細胞を、ビオチン標識化抗マウスCD19抗体(BD Pharmigen)5μgと、氷上で30分間インキュベートし、氷冷PBS500μlで1回洗浄した。予め洗浄した磁気Dynabeads MyoneストレプトアビジンT1(Life Technologies)70μlと共にPBS500μl中に、細胞を再懸濁し、4℃で1時間、回転プラットフォーム上でインキュベートし、氷冷PBS500μlで洗浄した。再懸濁した細胞(PBS500μl)を、3G−myc−hGPAを発現し、ソルターゼ標識化された約2×107個の赤血球と4℃で1時間さらにインキュベートし、氷冷PBS1mlで4回洗浄し、最後にSDS試料緩衝液とインキュベートして、その後のSDS−PAGE分析のために煮沸した。
ビーズ上に固定されたMHCクラスII陽性B細胞とこれらの修飾RBCのインキュベーションにより、RBCのB細胞への結合が生じる。洗浄後にB細胞と共精製するヘモグロビンの存在から、特異的結合が推定された。未修飾赤血球と野生型B細胞のインキュベーションも、修飾赤血球とMHCクラスIIノックアウト動物由来のB細胞のインキュベーションも2つの細胞型の結合をもたらさなかった(図25B、C)。
実施例4:最終分化したヒト赤血球のソルタギングおよびサイトゾル修飾
本明細書に記載の方法の有用性を拡張するために、赤血球系前駆細胞の修飾およびその後のソルターゼ媒介細胞表面標識化がヒト細胞についても実行可能であるか否かを検討した。
最終分化したヒト赤血球を以下のように遺伝子操作した。in vitroで分化したヒトRBCを操作するために使用するプラスミドは、GGG含有ヒトGPAを、3G−myc−hGPA−EGFPを作製するためにそのC末端に改良型GFPを付加したHIV/MSCVレンチウイルスベクターにクローニングすることにより作製した。レンチウイルスは、pVSV−GエンベローププラスミドおよびpDelta 8.9パッケージングベクターによる293T細胞の共感染により生成した。以前に記載の方法(Zaitsev et al.,2010,Blood 115(25):5241−5248)を使用して、G−CSF(果粒球コロニー刺激因子)動員のCD34+末梢血幹細胞を、18日の間にヘモグロビン含有網状赤血球にin vitroで分化させた。培養3日目に、ポリブレンの存在下、レンチウイルス含有培地2ml中で5×10個の細胞をインキュベートすることにより、分化中の細胞を感染させ、室温で1.5時間、2500RPMで遠心した後、CO2インキュベーター中で一晩、さらにインキュベートした。次の日、感染細胞を2回洗浄し、新鮮な分化培地に入れた。18日目に、脱核網状赤血球を回収し、本明細書に記載のようにビオチン含有プローブによるソルターゼ標識化に供した。得られた操作ヒト網状赤血球のデータ分析は、以下の抗体:PEがコンジュゲートした抗ビオチン(1:1000、eBioscience、12−9895−82)、ヘキスト(Sigma)、およびAPCコンジュゲート(1:100、eBioscience、17−0087−42)を使用して、フローサイトメトリーにより行った。
この実施例に記載の実験は、以前に記載のin vitroヒト赤血球系分化系である。例えば、Hu et al.,2013を参照されたい。G−CSF(果粒球コロニー刺激因子)動員のCD34+末梢血幹細胞を、約50%の脱核効率で、18日の間にヘモグロビン含有網状赤血球にin vitroで分化させた。そのC末端で改良型GFPに融合した3G−myc−hGPAのバージョン(3G−myc−GPA−GFP)をコードするレンチウイルスベクターを構築した。これは、GPAへのその遺伝子融合を介して成熟RBC中に保持されるように設計された、細胞質内で発現されるタンパク質ドメインの例を提供する。空(対照)ベクターと3G−myc−hGPA−GFPベクターは両方とも、IRES配列の3’側にGFP成分をコードした(3G−myc−hGPA−GFP−IRES−GFP)。GPAの細胞質ドメインに結合した追加の改良型GFPを含有する3G−myc−hGPA−GFPの細胞への形質導入が成功した場合、これらの細胞は、フローサイトメトリーにより示されように(図26A、最初のパネル)、顕著に高レベル(約2倍)のGFPシグナルを発現することになる。GFPおよびhGPAの分子量がそれぞれ、32.7kDaおよび37kDaであるため、SDS−PAGE上の3G−myc−hGPA−GFPの移動度からも、修飾GPAタンパク質が単量体および二量体の形態で発現されることが示される(図26B)。3G−myc−hGPA−GFPによるヒトCD34+細胞のウイルス形質導入は、空(対照)ベクターに感染した培養物と同様の数の脱核網状赤血球(50〜60%)が形成されたため(図26A、中央のパネル)、ヒトCD34+細胞の分化には影響を与えなかった。
フローサイトメトリーによりモニターされるように、表面に修飾GPAを含有する脱核網状赤血球はすべて、ビオチン含有プローブでソルターゼ標識化することができた(図26A)。さらに、3G−mychGPA−GFPのゲル移動度のシフトにより証明されるように、網状赤血球表面上に存在する3G−myc−hGPA−GFPはすべて、ビオチンソルタギングにより修飾された(図26B)。したがって、この実験により、目的のターゲティング成分による修飾GPAのソルタギングにより、目的とする標的にRBCを選択的にターゲティングする能力を保持させながら、細胞質内に配置された目的タンパク質を成熟ヒトRBCに備えさせる技術が確立された。
実施例5:CRISPR/Cas9技術を使用する、mKell−LPETG(配列番号44)マウスの作製
相同組換え修復(HDR)を刺激するCRISPR/Cas9依存性二本鎖切断のためのsgRNA配列を、表5のように、mKel遺伝子座の最後のエキソン上に設計し、LPETG(配列番号44)をmKelのC末端に導入するための鋳型としてオリゴDNAを表6のように設計した。
Figure 2016519933
Figure 2016519933
標的配列の潜在的なオフターゲット効果を、NCBIマウスヌクレオチドBLASTを使用して検索した。Wang et al.,2013に記載のように、Cas9 mRNAを調製した。下記の表7に示すように、鋳型としてpX330ベクター、そしてプライマー、mKel T7−sgRNA FwおよびsgRNAの一般的なRvを使用するPCR増幅によって、T7プロモーターおよびPAMモチーフのないmKel−CTターゲティングsgRNAコード配列を、sgRNAの一般的な尾部(ヘアピン領域から末端モチーフまでの部分)の直前に加えた。
Figure 2016519933
in vitro転写(IVT)のためのT7−sgRNA鋳型PCR産物を、カラム(Promega)によりゲル精製し、精製したPCR産物を、MEGAshortscript T7キット(Life Technologies)を使用するIVTのための鋳型として使用した。Cas9 mRNAとsgRNAの両方を、MEGAclearキット(Life Technologies)を使用して精製し、RNアーゼ不含水で溶出した。受精接合体を、過剰排卵した雌の卵管から集め、Cas9 mRNA、sgRNA、および鋳型オリゴDNAを、前核段階の細胞質に注入した。注入された接合体を、偽妊娠した雌の卵管の中に2細胞段階で移入した。マウスの遺伝子型を同定するために:マウス尾部を、尾部溶解緩衝液を使用して55℃で12時間溶解し、溶解物からイソプロパノール沈殿によりゲノムDNAを精製した。sgRNA標的近傍のゲノムDNAを、プライマーであるmKelシークエンシング用FwおよびmKelシークエンシング用Rvを使用して、表3のように[KOD Xtreme(VWR)、条件:95℃で2分間;35×(98℃で10秒間、50℃で30秒間、68℃で30秒間);68℃で2分間;4℃に保持]、PCRにより増幅し、次いでゲル精製した。精製したPCR産物を同じFwプライマーを使用してシークエンシングした。
CRISPR/Cas−9ゲノム編集技術(Jinek et al.,2012,Science 337(6096):816−821;およびWang et al.,2013,Cell 153(4):910−918)を使用して構築されたトランスジェニックマウスを使用して、in vivoでのRBC生存を検討した。このようなトランスジェニックマウスは、マウス内因性Kell遺伝子のC末端に挿入されたLPETG(配列番号44)を含有する(mKell−LPETG;配列番号44)。これらのマウスは正常に見え、かつ正常に繁殖する。これらのマウスに由来するmKell−LPETG(配列番号44)RBCは、hKell−LPETG(配列番号44)−HA RBCと同様に効率的に、ソルターゼ媒介反応でプローブにより標識することができる。
対照RBC、mKell−LPETG(配列番号44)RBC、およびビオチンでソルタギングされたmKell−LPETG(配列番号44)RBCに対してCFSE染色を行い、それらを野生型レシピエントマウスに移入し、血液循環におけるそれらの生存をモニターした。そのC末端でのLPETG(配列番号44)によるmKellの修飾は、in vivoにおける修飾RBCの生存に影響を与えなかった(図24B)。ビオチンプローブでソルタギングされたmKell−LPETG(配列番号44)RBCの生存では、わずかであるが有意な差が観察された。hKell−LPETG(配列番号44)RBCも移植マウスから採取し、ビオチンでソルタギングし、レシピエントに移入した。同様に、野生型RBCに比較するとわずかに生存が低下するものの、操作されたビオチン標識化Kell−LPETG(配列番号44)RBCも28日を超えて血液循環中に存続する(図24C)。これらの結果から、正常RBCのin vivo生存をソルターゼ標識化ビオチン−3G−myc−hGPA RBCに比較する同様の実験が示唆される。その結果(図24D)は、Kell−LPETG(配列番号44)RBCで見られた傾向を反復したものであり;ソルタギングされたRBCについて、わずかではあるが有意な生存率の低下があった。それにもかかわらず、重要なことには、正常マウスにおける操作されたRBCの半減期は、ビオチンでコンジュゲートされたものも含めて、少なくとも28日であり、したがって、これまでに設計された他のRBCベースの担体よりも大幅に長い。
他の実施形態
本明細書に開示の特徴はすべて、任意の組合せで組み合わせることができる。本明細書に開示の特徴はそれぞれ、同一、均等、または同様の目的に役立つ別の特徴に置き換えることができる。したがって、明示的に他に記載がない限り、開示されるそれぞれの特徴は、一般的な一連の均等または同様の特徴の一例にすぎない。
上記の説明から、当業者は、本発明の本質的特性を容易に確認することができ、本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく、種々の使用および条件に本発明を適応させるために、本発明の種々の変更形態および修正形態をなすことができる。したがって、他の実施形態もまた特許請求の範囲内にある。

Claims (92)

  1. 第1の目的ペプチドと第1の赤血球膜タンパク質とを含む第1の融合タンパク質を表面上に発現することを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  2. 請求項1に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の赤血球膜タンパク質がI型赤血球膜貫通型タンパク質であり、かつ前記第1の目的ペプチドが前記I型赤血球膜貫通型タンパク質のN末端に融合されていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  3. 請求項2に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記I型赤血球膜貫通型タンパク質がグリコフォリンA(GPA)であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  4. 請求項1に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の赤血球膜タンパク質がII型膜貫通型タンパク質であり、かつ前記第1の目的ペプチドが前記II型膜貫通型タンパク質のC末端に融合されていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  5. 請求項4に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが第1のソルターゼにより認識可能な第1の配列を含むことを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  6. 請求項5に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1のソルターゼが第1のソルターゼAであることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  7. 請求項6に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1のソルターゼにより認識可能な前記配列が、LPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  8. 請求項4乃至7の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記II型赤血球膜貫通型タンパク質がKellまたはCD71であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  9. 請求項1に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の赤血球膜タンパク質がIII型赤血球膜貫通型タンパク質であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  10. 請求項9に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記III型赤血球膜貫通型タンパク質がGLUT1であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  11. 請求項1乃至10の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記目的ペプチドが、タンパク質性薬物、ワクチン抗原、蛍光タンパク質、ストレプトアビジン、ビオチン、酵素、または細胞をターゲティングすることができるペプチドを含むことを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  12. 請求項11に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが、疾患細胞をターゲティングすることができるペプチドであることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  13. 請求項12に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが抗体またはそのフラグメントであることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  14. 請求項13に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記抗体が単一ドメイン抗体であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  15. 請求項1乃至14の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが検出可能な標識または化学療法剤にコンジュゲートされていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  16. 請求項1乃至B14の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが、脂質、炭水化物、核酸、結合剤、クリックケミストリーハンドル、または小分子にコンジュゲートされていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  17. 請求項1乃至16の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の融合タンパク質が目的タンパク質をさらに含み、前記目的タンパク質が、細胞質空間に露出される、前記第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されており、かつ前記第1の目的ペプチドが、細胞外空間または管腔空間に露出される、前記第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  18. 請求項17に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の赤血球膜タンパク質がI型膜タンパク質であり、前記目的タンパク質が前記I型膜タンパク質のC末端に融合されており、かつ前記第1の目的ペプチドが前記I型膜タンパク質のN末端に融合されていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  19. 請求項17に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の赤血球膜タンパク質がII型膜タンパク質であり、前記目的タンパク質が前記II型膜タンパク質のN末端に融合されており、かつ前記第1の目的ペプチドがI型膜タンパク質のC末端に融合されていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  20. 請求項17乃至19の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記目的タンパク質が細胞質タンパク質であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  21. 請求項20に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記目的タンパク質が診断薬または治療薬であることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  22. 請求項20または21に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが、タンパク質性薬物、ワクチン抗原、蛍光タンパク質、ストレプトアビジン、ビオチン、酵素、または細胞をターゲティングすることができるペプチドであることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  23. 請求項22に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが疾患細胞をターゲティングすることができるペプチドであることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  24. 請求項1乃至23の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、第2の目的ペプチドと第2の赤血球膜タンパク質とを含む第2の融合タンパク質を表面上にさらに発現することを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  25. 請求項24に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の融合タンパク質中の前記第1の目的ペプチドが、第1のソルターゼの認識可能部位または受容可能ペプチドを含み、かつ前記第2の融合タンパク質中の前記第2の目的ペプチドが、第2のソルターゼの認識可能部位または受容可能ペプチドを含み、前記第1のソルターゼおよび前記第2のソルターゼが、異なる認識可能部位および異なる受容可能ペプチドを使用することを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  26. 請求項25に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の目的ペプチドが、LPXTAのモチーフ(配列番号2)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)またはオリゴアラニンを含み;かつ前記第2の目的ペプチドが、モチーフLPXTG(配列番号1)またはオリゴグリシンを含むことを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  27. 請求項24に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の融合タンパク質がKellを含み、そのC末端がモチーフLPXTG(配列番号1)を含む第1の目的ペプチドに融合されており、かつ前記第2の融合タンパク質がGPAを含み、そのC末端がオリゴアラニンを含む第2の目的ペプチドに融合されていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  28. 請求項24乃至27の何れか1項に記載の遺伝子操作された脱核血液細胞において、前記第1の融合タンパク質および前記第2の融合タンパク質が2つの異なる機能成分にコンジュゲートされていることを特徴とする遺伝子操作された脱核血液細胞。
  29. 被験体に薬剤を送達するための方法において、請求項11乃至28の何れか1項に記載の脱核血液細胞を、それを必要とする被験体に投与することを含むことを特徴とする方法。
  30. 請求項29に記載の方法において、前記脱核血液細胞が同じ被験体に由来することを特徴とする方法。
  31. 目的ペプチドを赤血球の表面にコンジュゲートするための方法において、
    第1の赤血球膜タンパク質と第1のペプチドとを含む第1の融合タンパク質を発現する赤血球を準備するステップと、
    第1のソルターゼの存在下で前記赤血球を第1の目的ペプチドと、前記ソルターゼが前記目的ペプチドを前記融合タンパク質中の前記第1のペプチドにコンジュゲートさせるのに適した条件下で接触させるステップと
    を含み、前記融合タンパク質中の前記第1のペプチドまたは前記第1の目的ペプチドの何れかが前記第1のソルターゼにより認識可能な配列を含むことを特徴とする方法。
  32. 請求項31に記載の方法において、前記ソルターゼがソルターゼAであることを特徴とする方法。
  33. 請求項31または32に記載の方法において、前記ソルターゼにより認識可能な前記配列が、LPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)であることを特徴とする方法。
  34. 請求項31乃至33の何れか1項に記載の方法において、前記第1の赤血球膜タンパク質がI型赤血球膜貫通型タンパク質であり、かつ前記第1のペプチドが前記I型赤血球膜貫通型タンパク質のN末端に融合したアクセプターペプチドであり、前記第1の目的ペプチドが前記ソルターゼにより認識可能な前記配列を含むことを特徴とする方法。
  35. 請求項34に記載の方法において、前記I型赤血球膜貫通型タンパク質がグリコフォリンA(GPA)であることを特徴とする方法。
  36. 請求項34または35に記載の方法において、前記アクセプターペプチドがオリゴグリシンであることを特徴とする方法。
  37. 請求項36に記載の方法において、前記アクセプターペプチドが1〜5個のグリシン残基からなるオリゴグリシンであることを特徴とする方法。
  38. 請求項31乃至33の何れか1項に記載の方法において、前記第1の赤血球膜タンパク質がII型赤血球膜貫通型タンパク質であり、かつ前記第1のペプチドが前記II型赤血球膜貫通型タンパク質のC末端に融合されており、前記第1のペプチドが前記ソルターゼにより認識可能な前記配列を含むことを特徴とする方法。
  39. 請求項38に記載の方法において、前記II型赤血球膜貫通型タンパク質がKellまたはCD71であることを特徴とする方法。
  40. 請求項31乃至33の何れか1項に記載の方法において、前記第1の赤血球膜タンパク質がIII型赤血球膜貫通型タンパク質であることを特徴とする方法。
  41. 請求項40に記載の方法において、前記III型赤血球膜貫通型タンパク質がGLUT1であることを特徴とする方法。
  42. 請求項31乃至41の何れか1項に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが、タンパク質性薬物、ワクチン抗原、蛍光タンパク質、ストレプトアビジン、ビオチン、酵素、または細胞をターゲティングすることができるペプチドを含むことを特徴とする方法。
  43. 請求項42に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが、疾患細胞をターゲティングすることができるペプチドであることを特徴とする方法。
  44. 請求項42に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが抗体またはそのフラグメントであることを特徴とする方法。
  45. 請求項44に記載の方法において、前記抗体が単一ドメイン抗体であることを特徴とする方法。
  46. 請求項31乃至45の何れか1項に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが検出可能な標識または化学療法剤にコンジュゲートされていることを特徴とする方法。
  47. 請求項31乃至45の何れか1項に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが、脂質、炭水化物、核酸、結合剤、クリックケミストリーハンドル、または小分子にコンジュゲートされていることを特徴とする方法。
  48. 請求項31乃至47の何れか1項に記載の方法において、前記第1の融合タンパク質が目的タンパク質をさらに含み、前記目的タンパク質が、細胞質空間に露出される、前記第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されており、かつ前記第1の目的ペプチドが、細胞外空間または管腔空間に露出される、前記第1の赤血球膜タンパク質の末端に融合されていることを特徴とする方法。
  49. 請求項48に記載の方法において、前記第1の赤血球膜タンパク質がI型膜タンパク質であり、前記第1の目的タンパク質が前記I型膜タンパク質のC末端に融合されており、かつ前記第1のペプチドが前記I型膜タンパク質のN末端に融合されていることを特徴とする方法。
  50. 請求項48に記載の方法において、前記第1の赤血球膜タンパク質がII型膜タンパク質であり、前記目的タンパク質が前記II型膜タンパク質のN末端に融合されており、かつ前記第1のペプチドがI型膜タンパク質のC末端に融合されていることを特徴とする方法。
  51. 請求項48乃至50の何れか1項に記載の方法において、前記目的タンパク質が細胞質タンパク質であることを特徴とする方法。
  52. 請求項51に記載の方法において、前記目的タンパク質が診断薬または治療薬であることを特徴とする方法。
  53. 請求項51または52に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが、タンパク質性薬物、ワクチン抗原、蛍光タンパク質、ストレプトアビジン、ビオチン、酵素、または細胞をターゲティングすることができるペプチドであることを特徴とする方法。
  54. 請求項53に記載の方法において、前記第1の目的ペプチドが、疾患細胞をターゲティングすることができるペプチドであることを特徴とする方法。
  55. 請求項31乃至54の何れか1項に記載の方法において、第2のソルターゼの存在下、前記第2のソルターゼが第2の目的ペプチドを赤血球の表面上に発現される第2の融合タンパク質にコンジュゲートさせるのに適した条件下で前記赤血球を接触させるステップであって、前記第2の融合タンパク質が第2の赤血球膜タンパク質と前記第2の目的ペプチドがコンジュゲートする第2のペプチドとを含むステップをさらに含み、
    前記融合タンパク質中の前記第2のペプチドまたは前記第2の目的ペプチドの何れかが前記第2のソルターゼにより認識可能な配列を含み、かつ
    前記第1のソルターゼにより認識可能な前記配列が、前記第2のソルターゼにより認識可能な前記配列とは異なることを特徴とする方法。
  56. 請求項55に記載の方法において、前記第1の融合タンパク質中の前記第1のペプチドが、前記第1のソルターゼにより認識可能な配列または前記第1のソルターゼの受容可能ペプチドを含み、かつ前記第2の融合タンパク質中の前記第2のペプチドが、前記第2のソルターゼにより認識可能な配列または前記第2のソルターゼの受容可能ペプチドを含み、前記第1のソルターゼの前記受容可能ペプチドが、前記第2のソルターゼの前記受容可能ペプチドとは異なることを特徴とする方法。
  57. 請求項56に記載の方法において、前記第1のソルターゼがスタフィロコッカス・アレウス(Staphylococcus arreus)由来のソルターゼAであり、前記第1の融合タンパク質中の前記第1のペプチドおよび前記第1の目的ペプチドのうちの一方が、モチーフLPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)を含み、かつ他方が、オリゴグリシンである受容可能ペプチドを含むことを特徴とする方法。
  58. 請求項57に記載の方法において、前記第1の融合タンパク質がKellを含み、そのC末端がモチーフLPXTG(配列番号1)を含む前記第1のペプチドに融合されており、かつ前記第1の目的ペプチドがオリゴグリシンを含むことを特徴とする方法。
  59. 請求項57または58に記載の方法において、前記第2のソルターゼがストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcus pyogenes)由来のソルターゼAであり、前記第2の融合タンパク質中の前記第2のペプチドおよび前記第2の目的ペプチドのうちの一方が、モチーフLPXTA(配列番号2)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)を含み、かつ他方が、オリゴアラニンである受容可能ペプチドを含むことを特徴とする方法。
  60. 請求項59に記載の方法において、前記第2の融合タンパク質がGPAを含み、そのN末端がオリゴグリシンを含む前記第2のペプチドに融合されており、かつ前記第2の目的ペプチドが、モチーフLPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)を含むことを特徴とする方法。
  61. 請求項55乃至60の何れか1項に記載の方法において、前記第1および第2の目的ペプチドが、2つの異なる機能成分を含むかまたはそれにコンジュゲートされていることを特徴とする方法。
  62. ヒト脱核赤血球を生成させるための方法において、
    (i)ヒトCD34前駆細胞の集団を準備するステップと、
    (ii)前記ヒトCD34前駆細胞の集団を0〜6日間、第1の培地中で拡大させるステップであって、前記第1の培地がFlt−3リガンド、幹細胞因子(SCF)、インターロイキン3(IL−3)、およびインターロイキン6(IL−6)を含むステップと、
    (iii)ステップ(ii)から得られる拡大したヒトCD34末梢血液細胞を4〜7日間、第2の培地中で分化させるステップであって、前記第2の培地がデキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、SCF、およびエリスロポエチン(EPO)を含むステップと、
    (iv)ステップ(iii)から得られる細胞を3〜5日間、第3の培地中で分化させるステップであって、前記第3の培地がSCFおよびEPOを含むステップと、
    (v)ステップ(iv)から得られる細胞を4〜12日間、第4の培地中で分化させてヒト脱核赤血球を生成させるステップであって、前記第4の培地がEPOを含むステップと、
    (vi)ステップ(v)から得られる前記ヒト脱核赤血球を収集するステップと
    を含むことを特徴とする方法。
  63. 請求項62に記載の方法において、ステップ(ii)では、ヒトCD34末梢血液細胞の集団が前記第1の培地中で4日間培養されることを特徴とする方法。
  64. 請求項62または63に記載の方法において、ステップ(iii)では、前記拡大したヒトCD34前駆細胞が、前記第2の培地中で5日間分化させられることを特徴とする方法。
  65. 請求項62乃至64の何れか1項に記載の方法において、ステップ(iv)では、前記細胞が前記第3の培地中で4日間分化させられることを特徴とする方法。
  66. 請求項62乃至65の何れか1項に記載の方法において、ステップ(v)では、前記細胞が前記第4の培地中で9日間分化させられることを特徴とする方法。
  67. 請求項62乃至66の何れか1項に記載の方法において、ステップ(ii)〜(v)の合計期間が11〜25日間の範囲であることを特徴とする方法。
  68. 請求項67に記載の方法において、ステップ(ii)〜(v)の合計期間が21日間であることを特徴とする方法。
  69. 請求項62乃至68の何れか1項に記載の方法において、ステップ(v)が、細胞外マトリックス成分の表面コーティングを有する培養容器中で行なわれることを特徴とする方法。
  70. 請求項62乃至69の何れか1項に記載の方法において、前記第2、第3、および第4の培地の1つまたは複数が、ホロ型ヒトトランスフェリンおよびインスリンをさらに含むことを特徴とする方法。
  71. 請求項70に記載の方法において、前記第2の培地が、250〜1500μg/mlのホロ型ヒトトランスフェリン、5〜20μg/mlのインスリン、100nM〜5μMのデキサメタゾン、0.1〜5μMのβ−エストラジオール、1〜10ng/mlのIL−3、10〜500ng/mlのSCF、および2〜10UのEPOを含むことを特徴とする方法。
  72. 請求項71に記載の方法において、前記第2の培地が、約500μg/mlのホロ型ヒトトランスフェリン、約10μg/mlのインスリン、約2μMのデキサメタゾン、約1μMのβ−エストラジオール、約5ng/mlのIL−3、約100ng/mlのSCF、および約6UのEPOを含むことを特徴とする方法。
  73. 請求項70乃至72の何れか1項に記載の方法において、前記第2の培地が、Flt−3リガンド、IL−6、またはその両方を含まないことを特徴とする方法。
  74. 請求項70乃至73の何れか1項に記載の方法において、前記第3の培地が、250〜1500μg/mlのホロ型ヒトトランスフェリン、5〜20μg/mlのインスリン、10〜100ng/mlのSCF、および2〜10UのEPOを含むことを特徴とする方法。
  75. 請求項74に記載の方法において、前記第3の培地が、約500μg/mlのホロ型ヒトトランスフェリン、約10μg/mlのインスリン、約50ng/mlのSCF、および約6UのEPOを含むことを特徴とする方法。
  76. 請求項70、74、または75の何れか1項に記載の方法において、前記第3の培地が、Flt−3リガング、IL−6、デキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、またはそれらの組合せを含まないことを特徴とする方法。
  77. 請求項70乃至76の何れか1項に記載の方法において、前記第4の培地が、250〜1500μg/mlのホロ型ヒトトランスフェリン、5〜20μg/mlのインスリン、および0.5〜3UのEPOを含むことを特徴とする方法。
  78. 請求項77に記載の方法において、前記第4の培地が、約500μg/mlのホロ型ヒトトランスフェリン、約10μg/mlのインスリン、および約2UのEPOを含むことを特徴とする方法。
  79. 請求項70、77、または78の何れか1項に記載の方法において、前記第4の培地が、Flt−3リガンド、IL−6、デキサメタゾン、β−エストラジオール、IL−3、SCF、またはそれらの組合せを含まないことを特徴とする方法。
  80. 請求項62乃至79の何れか1項に記載の方法において、前記ヒトCD34前駆細胞が、赤血球膜タンパク質と目的ペプチドとを含む融合タンパク質を発現することを特徴とする方法。
  81. 請求項80に記載の方法において、前記融合タンパク質が、I型赤血球膜貫通型タンパク質であって、前記I型赤血球膜貫通型タンパク質のN末端でアクセプターペプチドに融合したI型赤血球膜貫通型タンパク質を含むことを特徴とする方法。
  82. 請求項81に記載の方法において、前記I型赤血球膜貫通型タンパク質がグリコフォリンAであることを特徴とする方法。
  83. 請求項81または82に記載の方法において、前記アクセプターペプチドがオリゴグリシンであることを特徴とする方法。
  84. 請求項83に記載の方法において、前記アクセプターペプチドが1〜5個のグリシン残基からなるオリオゴグリシンであることを特徴とする方法。
  85. 請求項80に記載の方法において、前記融合タンパク質が、II型赤血球膜貫通型タンパク質であって、前記II型赤血球膜貫通型タンパク質のC末端でソルターゼにより認識可能な配列を含むペプチドに融合されたII型赤血球膜貫通型タンパク質を含むことを特徴とする方法。
  86. 請求項85に記載の方法において、前記ソルターゼがソルターゼAであることを特徴とする方法。
  87. 請求項86に記載の方法において、前記ソルターゼAにより認識可能な前記配列が、LPXTG(配列番号1)(ここで、Xは任意のアミノ酸残基である)であることを特徴とする方法。
  88. 請求項85乃至87の何れか1項に記載の方法において、前記II型赤血球膜貫通型タンパク質がKellまたはCD71であることを特徴とする方法。
  89. 請求項80に記載の方法において、前記膜タンパク質がIII型赤血球膜貫通型タンパク質であることを特徴とする方法。
  90. 請求項89に記載の方法において、前記III型赤血球膜貫通型タンパク質がグルコース輸送体1(GLUT1)であることを特徴とする方法。
  91. 請求項62乃至90の何れか1項に記載の方法において、前記ヒトCD34前駆細胞がヒトCD34末梢血液細胞であることを特徴とする方法。
  92. 請求項62乃至91に記載の方法の何れかにより調製されることを特徴とするヒト脱核血液細胞集団。
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