JP2015510761A5 - - Google Patents

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  1. 非修飾抗体の可変重鎖におけるアミノ酸置換Y104Dを含む修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントであって:
    該修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントがEGFR抗原と結合するのに十分な可変重(V)鎖および可変軽(V)鎖またはその一部を含み、それによりVまたはVの一方または両者は修飾され;
    その一部は抗原結合部位を形成するのに十分であり、かつ該アミノ酸置換を含み;
    非修飾抗EGFR抗体は:
    i) 配列番号3に示す可変重鎖および配列番号4または10に示す可変軽鎖を含むセツキシマブまたはその抗原結合フラグメント;
    ii) 配列番号3に示すアミノ酸の配列に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する可変重鎖および配列番号4または10に示すアミノ酸の配列に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する可変軽鎖を含むi)の変異体であって、アミノ酸置換を含まず、EGFRに特異的に結合する変異体;および
    iii)i)またはii)のヒト化形態;
    から選択され、
    修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントは、非腫瘍環境の条件下と比較して、腫瘍環境の条件下で、ヒト上皮細胞増殖因子受容体(EGFR)またはその可溶性フラグメントンに少なくとも2.0の結合活性比を示し、それにより該抗EGFR抗体またはそのフラグメントは腫瘍微小環境における条件下で条件依存活性である、
    腫瘍環境の条件は6.0〜6.5のpHまたは5mM〜20mMの乳酸濃度の一方または両者および10mg/mL〜50mg/mLのタンパク質濃度を含み;
    非腫瘍環境の条件は7.0〜7.8のpHまたは0.5mM〜5mMの乳酸濃度の一方または両者および10mg/mL〜50mg/mLのタンパク質濃度を含修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  2. 結合活性比が少なくとも3.0である、請求項1に記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  3. 該抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントが、7.4のpHを含む非腫瘍微小環境において存在する条件下と比較して6.0〜6.5のpHを含む腫瘍微小環境において存在する条件下で活性比を示す、請求項1に記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  4. 該抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントが、7.0〜7.4のpH(両端を含む)および0.5mM〜2mMの乳酸濃度を含む非腫瘍微小環境の条件下と比較して、6.0〜6.5のpHおよび10mM〜20mMの乳酸濃度を含む腫瘍微小環境の条件下で活性比を示す、請求項1〜3のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  5. 腫瘍微小環境における条件下および非腫瘍微小環境における条件下のタンパク質濃度が実質的に同じまたは同じである、請求項1〜4のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  6. i)a) 配列番号495、1062、1112、1114〜1117、1124〜1126または1128〜1130に示すアミノ酸の配列または配列番号495、1062、1112、1114〜1117、1124〜1126または1128〜1130のいずれかと少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む可変重(V)鎖;および
    b) 配列番号4または0に示すアミノ酸の配列または配列番号4または0と少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を含む可変軽(V)鎖を含む、抗体;
    ii)i)の抗体の抗原結合フラグメント;および
    iii)i)またはii)のヒト化変異体;
    から選択される、請求項1〜5のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  7. 次のものを含む抗体から選択される、請求項1〜6のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント:
    a) 配列番号495に示す可変重鎖または配列番号495に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    b) 配列番号1062に示す可変重鎖または配列番号1062に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    c) 配列番号1112に示す可変重鎖または配列番号1112に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    d) 配列番号1114に示す可変重鎖または配列番号1114に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    e) 配列番号1115に示す可変重鎖または配列番号1115に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    f) 配列番号1116に示す可変重鎖または配列番号1116に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    g) 配列番号1117に示す可変重鎖または配列番号1117に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    h) 配列番号1124に示す可変重鎖または配列番号1124に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    i) 配列番号1125に示す可変重鎖または配列番号1125に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    j) 配列番号1126に示す可変重鎖または配列番号1126に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    k) 配列番号1128に示す可変重鎖または配列番号1128に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    l) 配列番号1129に示す可変重鎖または配列番号1129に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;
    m) 配列番号1130に示す可変重鎖または配列番号1130に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列;および
    ) 配列番号1118に示す可変重鎖または配列番号1118に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列および配列番号4または10に示す可変軽鎖または配列番号4または10に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列。
  8. 配列同一性が少なくとも86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、98%、99%またはそれ以上である、請求項または請求項に記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  9. a)修飾抗EGFR抗体の可変重鎖またはその一部が、配列番号3に示すアミノ酸位置を参照して、V24E、V24I、V24L、S25C、S25H、S25R、S25A、S25D、S25G、S25M、S25Q、S25V、S25L、S28C、L29H、N31H、G54D、G54S、F63R、F63C、F63M、F63P、F63S、T64V、L67G、D72L、D72P、D72W、N73Q、K75H、K75G、K75P、K75W、S76I、S76V、Q77E、T100P、Q111IおよびQ111Vから選択されるアミノ酸置換に対応するアミノ酸置換を含み、ここで:
    対応するアミノ酸位置は、抗体のV鎖と配列番号3に示すV鎖のアラインメントにより同定し;
    その一部は抗原結合部位を形成するのに十分であり、かつ該アミノ酸置換を含み;および/または
    b)修飾抗EGFR抗体の可変軽鎖またはその一部が、配列番号4に示すアミノ酸位置を参照して、L4F、L4V、T5PおよびR24Gから選択されるアミノ酸置換に対応するアミノ酸置換を含み、ここで:
    対応するアミノ酸位置は、抗体のV鎖と配列番号4に示すV鎖のアラインメントにより同定し;
    その一部は抗原結合部位を形成するのに十分であり、かつ該アミノ酸置換を含む、
    請求項に記載の修飾抗EGFR抗体またはそのフラグメント。
  10. 修飾抗EGFR抗体の可変重鎖またはその一部がさらにV24E、S25C、S25V、F27R、T30F、S53G、D72L、R97HおよびQ111Pから選択されるアミノ酸置換を含む、
    請求項に記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント
  11. 修飾セツキシマブ抗体、その抗原結合フラグメントまたはその変異体が:
    配列番号1に示すアミノ酸の配列または配列番号1に示すアミノ酸の配列に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する重鎖および配列番号2に示すアミノ酸の配列または配列番号2に示すアミノ酸の配列に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する軽鎖;または
    配列番号8に示すアミノ酸の配列または配列番号8に示すアミノ酸の配列に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する重鎖および配列番号9に示すアミノ酸の配列または配列番号9に示すアミノ酸の配列に対して少なくとも85%配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する軽鎖を含む、
    請求項1〜10のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  12. 該非修飾抗EGFR抗体がヒト化されている、請求項1〜11のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  13. 該非修飾抗EGFR抗体が配列番号28に示す可変重鎖および配列番号29に示す可変軽鎖を含む、請求項12に記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  14. 非修飾抗EGFR抗体が抗原結合フラグメントであり;
    抗原結合フラグメントはFab、Fab’、F(ab’)、一本鎖Fv(scFv)、Fv、dsFv、二重特異性抗体、FdおよびFd’フラグメントから選択される、請求項1〜13のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  15. 完全長IgG抗体であるか、またはFab、Fab’、F(ab’) 、一本鎖Fv(scFv)、Fv、dsFv、二重特異性抗体、FdおよびFd’フラグメントから選択される抗原結合フラグメントである、請求項1〜14のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント。
  16. 標的剤に直接的または間接的に結合した請求項1〜15のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントを含む、コンジュゲート。
  17. 該標的剤が治療部分である、請求項16に記載のコンジュゲート。
  18. 治療部分が細胞毒性部分、放射性同位体、化学療法剤、溶菌性ペプチドまたはサイトカインである、請求項17に記載のコンジュゲート。
  19. 治療部分がタキソール;サイトカラシンB;グラミシジンD;臭化エチジウム;エメチン;マイトマイシン;エトポシド;テニポシド;ビンクリスチン;ビンブラスチン;コルヒチン;ドキソルビシン;ダウノルビシン;ジヒドロキシアントラシンジオン;マイタンシンまたはその類似体もしくは誘導体;オーリスタチンまたはその機能的ペプチド類似体もしくは誘導体;ドラスタチン10または15またはその類似体;イリノテカンまたはその類似体;ミトキサントロン;ミトラマイシン;アクチノマイシンD;1−デヒドロテストステロン;グルココルチコイド;プロカイン;テトラカイン;リドカイン;プロプラノロール;ピューロマイシン;カリチアマイシンまたはその類似体もしくは誘導体;代謝拮抗剤;アルキル化剤;白金誘導体;デュオカルマイシンA、デュオカルマイシンSA、ラシェルマイシン(CC−1065)またはその類似体もしくは誘導体;抗生物質;ピロロ[2,l−c][1,4]−ベンゾジアゼピン類(PDB);毒素;リボヌクレアーゼ(RNase);DNase I、ブドウ球菌エンテロトキシンA;およびヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質から選択される、請求項18に記載のコンジュゲート。
  20. 治療部分がアンサマイトシンまたはメルタンシン(DM1)から選択されるマイタンシノイドであるマイタンシン誘導体であるか;または
    オーリスタチンまたはモノメチルオーリスタチンE(MMAE)またはF(MMAF)であるその機能的ペプチド類似体もしくは誘導体であるか;または
    メトトレキサート、6−メルカプトプリン、6−チオグアニン、シタラビン、フルダラビン、5−フルオロウラシル、ダカルバジン、ヒドロキシウレア、アスパラギナーゼ、ゲムシタビンおよびクラドリビンから選択される代謝拮抗剤であるか;または
    メクロレタミン、チオテパ、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン(BSNU)、ロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、ダカルバジン(DTIC)、プロカルバジンおよびマイトマイシンCから選択されるアルキル化剤であるか;または
    シスプラチンまたはカルボプラチンである白金誘導体であるか;または
    ダクチノマイシン、ブレオマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、イダルビシン、ミトラマイシン、マイトマイシン、ミトキサントロン、プリカマイシンおよびアントラマイシン(AMC)から選択される抗生物質であるか;または
    ジフテリア毒素およびその活性フラグメントおよびハイブリッド分子、リシン毒素、コレラ毒素、志賀毒素様毒素、LT毒素、C3毒素、志賀毒素、百日咳毒素、破傷風毒素、ボウマン・バーク大豆プロテアーゼインヒビター、シュードモナス外毒素、アロリン、サポリン、モデシン、ガラニン、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ−サルシン、シナアブラギリタンパク質、ジアンチンタンパク質、ヨウシュヤマゴボウタンパク質、ニガウリ阻害剤、クルシン、クロチン、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシンおよびエノマイシン毒素から選択される毒素である、
    請求項18または請求項19に記載のコンジュゲート。
  21. 請求項1〜15のいずれかに記載の抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントのいずれかの重鎖をコードするヌクレオチドの配列を含む、核酸分子;
    請求項1〜15のいずれかに記載の抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントのいずれかの軽鎖をコードするヌクレオチドの配列を含む、核酸分子;および
    請求項1〜15のいずれかの修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントをコードするヌクレオチドの配列を含む、核酸分子
    の1つ以上から選択される、核酸分子。
  22. コンジュゲートが融合タンパク質を含む、請求項16〜20のいずれかに記載のコンジュゲートをコードする核酸分子。
  23. 請求項21または請求項22に記載の核酸分子を含む、ベクター。
  24. 請求項23に記載のベクターを含む、単離された細胞または細胞培養物
  25. 修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントの製造方法であって、該修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントの重鎖および/または軽鎖を産生する条件下、請求項21に記載の核酸分子を含む細胞または請求項21に記載の核酸分子を含む請求項23に記載のベクターを培養することを含む、方法。
  26. 該重鎖および/または軽鎖を単離することをさらに含む、請求項25に記載の方法。
  27. 重鎖および軽鎖またはその一部が単一ベクターにおいて発現され、修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントを産生する、請求項25に記載の方法。
  28. 重鎖またはその一部が第一ベクターにおいて発現され、軽鎖またはその一部が第一ベクターと異なる第二ベクターにおいて発現され、修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントを産生する、請求項25に記載の方法。
  29. 抗体またはその抗原結合フラグメントを回収することをさらに含む、請求項27または請求項28に記載の方法。
  30. ポリペプチドに結合した修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントを含むコンジュゲートの製造方法であって、該コンジュゲートが産生される条件下、請求項22に記載の核酸分子を含む細胞または請求項22に記載の核酸分子を含む請求項23に記載のベクターを培養することを含み、所望により該コンジュゲートを回収することを含む、方法。
  31. 請求項1〜15のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメントまたは請求項1620のいずれかに記載のコンジュゲート;および
    薬学的に許容される担体または添加物
    を含む、医薬組成物。
  32. 腫瘍、癌および/または転移を処置するための使用のための、請求項31に記載の医薬組成物
  33. 腫瘍、癌または転移の処置のための医薬として製剤された、請求項31または32に記載の医薬組成物
  34. 腫瘍、癌または転移を処置するための医薬の製造のための、請求項1〜15のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体または抗原結合フラグメントまたは請求項16〜20のいずれかに記載のコンジュゲートまたは請求項31〜33のいずれかに記載の医薬組成物の使用。
  35. 請求項1〜15のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体または抗原結合フラグメントまたは請求項1620のいずれかに記載のコンジュゲート;および
    化学療法剤または抗癌剤
    を含む、組み合わせ剤。
  36. 該化学療法剤がアルキル化剤、ニトロソウレア類、トポイソメラーゼ阻害剤および抗体から選択される、請求項35に記載の組み合わせ剤。
  37. 1個以上の容器中に請求項1〜15のいずれかに記載の修飾抗EGFR抗体またはその抗原結合フラグメント、請求項1620のいずれかに記載のコンジュゲートまたは請求項35または請求項36に記載の組み合わせ剤および所望により使用指示を含む、キット。
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