JP2010158241A - 神経栄養成長因子 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】新規なヒト神経栄養成長因子、「エノビン」をコードしている核酸分子、該核酸分子を含有する発現ベクター、該ベクターにより形質転換される宿主細胞、該核酸分子によってコードされている神経栄養成長因子、単離されたエノビン、エノビンの作動剤もしくは拮抗剤として働く化合物、および核酸またはエノビンタンパク質またはそれらの作動剤もしくは拮抗剤を含有する製薬組成物。
【選択図】なし
Description
27,非特許文献14)は、多くの異なるグループによって同定された。GFRα−1およびGFRα−2は、ほとんど全ての組織において広く発現し、そして発現は、発生的に制御されているようである(非特許文献17,非特許文献28)。
81.5℃−16.6(log10[Na+]+0.41(%G&C)
−600/l
[式中、lは、ヌクレオチド内でのハイブリッドの長さである]
によって近似させられる。Tmは、配列相同性における1%減少毎に、ほぼ1〜1.5℃低下する。
およびリボソーム結合のための転写開始配列を含む。例えば、細菌発現ベクターは、lacプロモーターのようなプロモーター、および転写開始のためのシャイン・ダルガルノ配列および開始コドンAUGを含んでもよい。同様に、真核生物発現ベクターは、RNAポリメラーゼIIのための異種もしくは同類のプロモーター、下流ポリアデニル化シグナル、開始コドンAUG、およびリボソームの脱離のための終止コドンを含んでもよい。そのようなベクターは、商業的に得られても、または当該技術分野において周知の方法によって、既述の配列から構築できる。
Biotechnology,vol.14,December 1996「高密度オリゴヌクレオチド・アレイ中へのハイブリダイゼーションによる発現モニタリング」、参照)。単一のアレイは、別々の配置において100,500または1,000個以上もの
異なるプローブを含有できる。
をもたらす塩基における置換を含む何らかの小さい塩基変異を含む。用語「核酸分子」は、また、関連する塩基変異を与えるいかなる一本鎖配列にも相補的な配列を含む。
両方法は、DNAもしくはRNAへのポリヌクレオチドの結合に基づいている。例えば、本発明の成熟タンパク質をコードしているDNA配列の一部が、長さ10〜50塩基対のアンチセンスRNAオリゴヌクレオチドを設計するのに使用できる。DNAオリゴヌクレオチドは、転写に関与する遺伝子の領域に相補的であるように設計される(三重らせん−Lee et al.,Nucl.Acids Res.,6:3073(1979);Cooney et al.,Science,241:456(1988);Dervan et al.,Science,251:1360(1991);それによる転写の阻止およびエノビンの生産、参照)。アンチセンスRNAオリゴヌクレオチドは、イン・ビボでmRNAにハイブリダイズし、そしてエノビンへのmRNA分子の翻訳を遮断する。
成されてもよい。モノクローナル抗体は、Kohler R.and Milstein
C.,Nature(1975)256,495−497によって記述されるような既知技術にしたがって作成されてもよい。
Song,Nature 340:245 1989)。この技術は、リポーター遺伝子を活性化する転写因子のイン・ビボでの機能的再構築に基づいている。より特別には、その技術は、DNA結合ドメインと活性化ドメインをもつ転写因子によって制御されるプロモーターの調節下にリポーター遺伝子を含有するDNA構築物を提供し、本発明による核酸配列のフラグメントもしくは全部の第1の融合物をコードしている第1のハイブリッドDNA配列および転写因子の該DNA結合ドメインか該活性化ドメインのいずれかを宿主細胞において発現し、第1の融合物に組み入れられていない転写因子のDNA結合ドメインもしくは活性化ドメインと一緒に、研究されるべき推定上の結合タンパク質をコードしている少なくとも1つの第2のハイブリッドDNA配列、例えばライブラリーまたは類するものを宿主において発現すること;宿主細胞におけるいずれかリポーター遺伝子産物の存在を検出することによって、本発明によるタンパク質と研究されるべきタンパク質のいずれかの結合を検出すること;場合によっては結合タンパク質をコードしている第2のハイブリッドDNA配列を単離すること;を含む。
経傷害もしくは損傷、神経毒曝露、多発性内分泌新形成および家族性ヒルシュスプルング病、プリオン関連疾患、クロイツフェルド・ヤコブ病、卒中、事実上末梢もしくは中枢神経に由来する成分による疼痛症候群、リューマチ/炎症疾患ならびにコンダクタンス障害を治療または予防するために、該神経障害を予防または治療するのに十分な濃度における該作動剤もしくは拮抗剤量を個体に投与することによって、使用されてもよい。また、そのような化合物は、製薬組成物中に、そのための製薬的に許容しうるキャリヤー、希釈剤もしくは添加物と一緒に含有されてもよい。
和するためにも使用することができる。
十分な濃度において、本発明により適当であるような、アンチセンス分子、核酸、エノビンタンパク質、製薬組成物、または作動剤もしくは拮抗剤として同定された化合物のいずれかを投与することによって緩和もしくは予防さえできるであろう。
太い下線で指示される。成熟タンパク質の推定の始まりは、矢印によって指示される。TGF−βファミリーの全メンバーの7個の保存システイン残基特性は、太く指示される。潜在性N−グリコシル化部位は、二重の下線である、
る。SH−SY5Y細胞は、48時間の実験を始める前に25nMスタウロスポリンにより25日間分化される。ポジティブ対照として、25nMスタウロスポリンの分化効果が示される。軸索の長さは少なくとも5000細胞において算出される。データは、2並列において実施された実施から提供される。平均値および標準偏差が示される、
サイズは、ゲルにおいてサイズ参照として使用された100bpDNAラダーに基づいて右手側に指示される。
エノビンをコードしているDNA配列を含有しているプラスミドEVNmat/pRSETBは、1997年4月28日のブダペスト条約の約定に従って、Laboratorium voor Moleculaire−Plasmidencollectie(LMBP)B9000,Ghent,Belgiumにおけるザ・ベルジアン・コオーディネーテッド・コレクションズ・オブ・ミクロ−ビオロジー(the Belgian Cordinated Collections of Micro−Biologie)(BCCM)に、受託番号LMBP3931の下、1999年5月6日に寄託された。
材料
ネイティブTaqポリメラーゼ、アンピシリン、IPTG(イソプロピル−β−チオガラクトシド)、X−gal(5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−ガラクトピラノシド)および使用される全制限酵素は、Boehringer Mannheim(Mannheim,Germany)製であった。10mMdNTP混合物は、Life Technologies(Gaithersburg,MD,USA)から購入した。TOPO−TAクローニングキットは、Invitrogen BV(Leek,The Netherlands)から購入した。Qiagen プラスミド・ミニ−もしくはミディ−DNA精製キット、Qiaprep Spin MiniprepキットおよびQiaquickゲル抽出キットは、Qiagen GmbH(Dusseldorf,Germany)から購入した。cDNAライブラリー、MarathonTm Ready cDNAキット、ヒト多組織cDNA(MTCTM)パネルIおよびII多組織ノザンブロット、およびAdvantage−GC cDNA PCRキットは、Clontech Laboratories(Palo Alto,CA,USA)から得られた。全PCR反応は、GeneAmp PCRシステム9600サイクラー(perk
in Elmer,Foster City,CA,USA)において行われた。LB(Luria−Bertani)培地は、トリプトン10g/l、酵母エキス5g/lおよびNaCl 10g/lからなる。2xYT/アンピシリンプレートは、トリプトン16g/l、酵母エキス10g/l、NaCl 5g/l、寒天15g/lおよびアンピシリン100mg/lからなる。
完全なヒト・グリア細胞系誘導の神経栄養因子(GDNF;受託番号Q99748)、クウィリー(query)配列としてのニュールツリン(neurturin)(NTN;受託番号P39905)およびペルセフィン(persephin)(PSP;受託番号AF040962)cDNA誘導のタンパク質配列を使用して、BLAST(Basic Local Alignment Search Tool;Altschul et al.,J.Mol.Biol. 215(1990),403−410)検索が、EMBL/GenBankヒト発現配列tag(EST)およびゲノムデータベースの毎日最新のものにおいて遂行された。
すべてのオリゴヌクレオチドプライマーは、Eurogentec(Seraing,Belgium)から整えられた。インサート特異的配列決定プライマー(15−および16量体)およびPCR反応に使用するためのプライマーは、手作業で計画された。DNAは、Qiagen−tip−20もしくは−100陰イオン交換またはQiaquickスピンカラム(Qiagen GmbH,Dusseldorf,Germany)において調製され、そしてカラムからTEバッファー(10mMTris.HCl,1mMEDTA(ナトリウム塩),pH8.0)30μl中に回収された。
翻訳タンパク質配列が成熟NTNおよびPSPに相同であった、EMBL受託番号AC005038のヌクレオチド67411〜68343にわたるDNA領域が、PCR増幅のためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計するために使用された。使用された種々のプライマーが表1に示される。
Miniprepキットを用いて調製された。期待されるサイズのインサートの存在は、EcoRIによる制限消化によって確認された。若干のポジティブクローンのプラスミドインサートが配列決定され、そして配列がClustalWアラインメントプログラムを用いて比較された。
オリゴヌクレオチドプライマーPNHsp3およびPNHap1(表1参照)が,エノビンからの502bpフラグメントの特異的PCR増幅のために使用された。6種の異なる保管遺伝子のmRNA発現レベルに標準化されたヒト多組織cDNA(MTCTM)パネルにおいて遂行された。エノビン特異的プライマーによるPCR反応は、cDNA5μl、1xGC cDNA PCR反応バッファー、0.2mMdNTP、1MGC−MELTTM,プライマーPNHsp3およびPNHap1 400nM、およびAdvantage KlenTaqポリメラーゼ混合物1μlを含有する全容量50μlにおいて遂行された。サンプルは30秒間95℃に加熱され、そしてサイクリングは、35サイクルの間95℃で30秒および68℃で30秒間であった。サンプルは、1xTAEバッファー(40mMTris−酢酸、1mMEDTA(ナトリウム塩),pH8.3)における1.2%(w/v)アガロースゲルにおいて解析され、そして臭化エチジウム染色されたゲ
ルの像が、Eagle Eye II Videoシステム(Stratagene,La Jolla,CA,USA)を用いて得られた。
AAC AGG AGG G−3’]およびネストプライマーPNHsp6[5’−GGT GGG GGA ACA GCT CAA CAA TGG−3’]、ならびに3’末端に位置するプライマー(プライマーPNHap1およびネストプライマーPNHap2[表1参照]を用いて遂行された。実験は、ヒト多組織cDNAパネル(Clontech MTCパネルIおよびII),胎児心臓cDNAライブラリー(Clontech)およびヒト小脳、海馬もしくは前頭皮質から得られたcDNA(Masure et
al.,1998)において遂行された。1次PCR反応は、GCリッチ条件下でプライマーPNHsp5およびPNHap1を用いて(Advantage−GC PCRキ
ット(Clontech)、既述のように30サイクル(95℃−30秒、60℃−30秒、72℃−1分)の間遂行された。ネストPCR反応は、同じ条件下でプライマーPNHsp6およびPNHap2を用いて30サイクルの間遂行された。得られるPCR生成物は、1.5%アガロースゲルにおいて解析され、そしてサイズは±350bp〜±800bpにわたった。いくつかのバンドがゲルから精製され、そしてPCRフラグメントが直接配列決定された。また、若干の精製PCR生成物が、また、ベクターpCR2.1−TOPO(TOPO−TAクローニングキット、Invitrogen)中にクローン化され、次いで配列決定された。
genome project.Methods Enzymol.183,252−278)。同定された種々のエノビンスプライシング変異体およびそれらの種々のヒト組織における存在が図22に総括される。5種の配列決定された転写物のわずか2種が、ATG開始コドンからの翻訳により機能的なエノビンタンパク質を生成する。これらの2種の転写物は、それぞれ47および39アミノ酸残基の予想シグナルペプチドをもつアミノ酸228もしくは220個のタンパク質をコードしている。これら2種の変異体の予想されるタンパク質配列は、図23(長い変異体)および図24(短い変異体)に示される。長い変異体は、場所5’−1および3’−1における第1のイントロンを、そして5’−2および3’−3における第2のイントロンをスプライシングアウトすることによって図21のDNA配列から得られると推定できる。読み枠の翻訳によって、図23の予測されたタンパク質配列が得られる。より短い変異体は、場所5’−1および3’−2における第1のイントロンを、そして5’−2および3’−3における第2のイントロンをスプライシングアウトすることによって図21のDNA配列から得られると推定できる。読み枠の翻訳によって、図24の予測されたタンパク質配列が得られる。
エノビン発現プラスミドの構築
414bpPCRフラグメントが、プライマーPNHsp4およびPNHap2(表1)を用いてヒトゲノムDNAから増幅され、TA−クローニング(Invitrogen)を用いてベクターpCR2.1−TOPO中にクローン化された。インサートの配列は、配列解析によって確認された。エノビン共通配列をもつインサートを含有する1つのクローン(クローン36)が、続く発現プラスミドの構築のために使用された。2種のプラスミドが、それらの5’末端において適当な制限部位を含有するように設計された。正プライマーPNHexp−sp1(5’−GCG GAT CCG GCT GGG GGC CCG GGC A−3’)は、BamHI制限部位(下線)を含有し、そして逆プライマーPNHexp−ap1(5’−GCC TCG AGT CAG CCC AGG CAG CCG CAG G−3’)は、XhoI制限部位(また下線)を含有した。これらのプライマーを使用して、成熟エノビンをコードしている343bpフラグメント(図1における位置81〜422)が、クローン36から増幅された。PCR反応は、1xGC cDNA PCR反応バッファー、0.2mMdNTP、1MGC−MELTTM,プライマーPNHexp−sp1およびPNHexp−ap1 200nM、Advantage KlenTaqポリメラーゼ混合物1μl、およびクローン36からのプラスミドDNA10ngを含有する全容量50μlにおいて遂行された。サンプルは5分間94℃に加熱され、そしてサイクリングは、25サイクルの間94℃で45秒、58℃で1分そして72℃で30秒間実施されたが、最終段階は72℃で7分であった。得られる50μl生成物は、Qiaquick PCR精製キット(Qiagen)を用いて精製され、そしてDNAは30μlに溶出された。この精製生成物25μlが、次に、1xバッファーB(Boehringer Mannheim)中BamHI 10UおよびXhoI 10Uを含む反応液30μlにおいて37℃で1時間消化された。1xTAEバッファー(40mMTris−酢酸、1mMEDTA(ナトリウム塩),pH8.3)における1%(w/v)アガロースゲルにおける電気泳動の後、期待される353bpバンドが、ゲルから切除され、そしてQiaquickゲル抽出キットを用いて精製された。得られるフラグメントは、BamHIとXhoIにより線状にされたベクターpRSET B(Invitrogen)中に連結された。得られるプラスミド構築物のインサート(hEVNmat/pRSETB)は、完全配列解析によって確認された。得られる構築物は、成熟エノビンコーディング配列にフレーム内融合されたNH2末端6xHis−tagを含む推定分子質量15704Daをもつ146アミノ酸タンパク質をコードしている。かくして、得られるタンパク質のNH2末端アミノ酸配列は、
エノビンタンパク質の組み換え生産は、本質的に、Creedon et al.(1997)によるニュールツリンに関する記述のように改変して遂行された。組み換えエノビンタンパク質の生産のために、プラスミドhEVNmat/pRSETBが、E.コリ菌株BL21(DE3)(Novagen)中にトランスフォームされ、そして2xYT/アンピシリン培地(トリプトン16g/l、酵母エキス10g/l、NaCl 5g/lおよびアンピシリン100mg/l)において、発現を誘導するために最終濃度0.2mMまでIPTGを添加する前に、OD600約0.5まで30℃(225rpm)または37℃(300rpm)において増殖された。3時間の誘導時間に続いて、細胞ペレットが遠心によって回収され、リン酸バッファー食塩水で洗浄され、遠心され、そして凍結保存された。精製および再生(refolding)では、細胞ペレットは、音波処理バッファー(20mMTris−HCl,pH8.0,300mMNaCl,1mM2−メルカプトエタノール、プロテアーゼ阻害剤(CompleteTMプロテアーゼ阻害剤反応
混液タブレット(Boehringer Mannheim,50mlバッファー当たり1タブレット)および細胞ペレット500mg当たりリゾチーム1mg)中に再懸濁された。細胞が音波処理によって破壊され、そして封入体が遠心によって回収された。封入体は、バッファーA(8M尿素、20mMTris−HCl,pH7.6,200mMNaCl,1mM2−メルカプトエタノール)に溶解され、そして37℃で30分間インキュベートされ、その後Ni−NTA樹脂(ニッケルニトリロ三酢酸、Qiagen)に添加された。37℃で40分振盪後、サンプルがバッファーAで1回洗浄され、そして5mlNi−NTAカラム上に負荷された。カラムは、連続して10カラム容量のバッファーA、10カラム容量のpH7.2のバッファーAおよび10カラム容量のpH7.2+10mMイミダゾールのバッファーAで洗浄された。エノビンは、カラムから、4カラム容量のpH7.2+200mMイミダゾールのバッファーAにおいて溶出された。
エノビン遺伝子の3.3kbフラグメントが、EMBL受託番号AC005038の配列において設計されたプライマーEVN(7)−sp1(5’−TTC GCG TGT
CTA CAA ACT CAA CTC CC−3’)およびPNHap1(5’−GCA GGA AGA GCC ACC GGT AAG G−3’)を用いて小脳cDNAから増殖された。PCR反応は、1xExpand Long Template
PCR反応バッファー(Boehringer Mannheim)、0.5mMdNTP、1MGC−MELT(Clontech Laboratories),プライマーEVN(7)−sp1およびPNHap1 400nMおよび小脳cDNA1μlを含有する全容量50μlにおいて遂行された。最初94℃で2分間後、Expand Long Template ポリメラーゼ(Boehringer Mannheim)が添加され、そしてサイクリングは、10サイクルの間94℃で10秒、58℃で30秒そして68℃で3分間実施された。次いで、さらなるサイクルは、各サイクル20秒づつ68℃で伸長時間を増加しつつ遂行された。最終68℃で7分が、また含まれた。得られる3.3kbフラグメントは、0.8%アガロース/TAEゲルにおける電気泳動後精製され、そしてTA−クローニング(Invitrogen)を用いてベクターpCR2.1−TOPO中にクローン化された。1つのクローンの3.3kbインサートの完全配列解析は、得られたcDNA配列が、EMBLデータベース中のゲノム配列(受託番号AC005038)に対応することを確認した。小脳cDNAから得られたcDNAにおいて、イントロンはスプライシングアウトされなかった。
t(20xNaCl/Citは3MNaCl、0.3Mクエン酸二ナトリウム、pH7.0である)中70%ホルムアルデヒド中で70℃2分間変性され、続いて、エタノールで脱水された。プローブは、変性染色体スライドに装填する前に変性された。一夜ハイブリダイゼーションの後、スライドが洗浄され、そしてFISHシグナルおよび4’,6’−ジアミジノ−2−フェニルインドール・バンディングパターンが、写真フィルム上に別々に記録され、そして染色体バンドによるFISHマッピングデータの割り当てが、FISHシグナルを4’,6’−ジアミジノ−2−フェニルインドールで縞模様にされた染色体と重ね合わせることによって達成された(同上:Heng & Tsui,1993)。使用された条件下で、ハイブリダイゼーション効率は、このプローブでは約72%であった(100個のチェックされた有糸分裂図中で、それらの72個が、1対の染色体においてシグナルを示した)。4’,6’−ジアミジノ−2−フェニルインドール・バンディングが、特定の染色体を同定するために使用されたので、プローブからのシグナルと染色体1の短い腕との間の割り当てが得られた。さらに、詳細な位置は10枚の写真からの総括に基づいて決定された(図4A)。使用された条件下のFISH検出によって選ばれるさらなる座はなく、したがって、本発明者らは、エノビンがヒト染色体1、領域p31.3−p32に位置すると結論する。マッピング結果の例は図4Bに提示される。
種々のヒト組織から得られたポリ(A)−リッチRNAを含有するノザンブロット(Clontech Laboratories,Palo Alto,CA,USA;MTNTMブロット、MTNTMブロットIIおよび胎児MTNTMブロットII)が、製造者の指示にしたがって、(α−32P−dCTPランダムプライミング標識(HighPrimeキット、Boehringer Mannheim)された897bpエノビンフラグメントとハイブリダイズされた。このフラグメントは、前頭皮質cDNAにおいてプライマーPNHsp1およびPNHap1を用いるPCR増幅、続くベクターpCR2.1−TOPO中へのクローニングによって得られた。フラグメントは、終止コドンまでのエノビン配列897bpを含有し、そして成熟エノビンタンパク質の完全コーディング配列を含む。
シグナルペプチドおよびGPI固定に関与するCOOH−末端疎水性領域をコードしている配列を除いてGFRα−1、GFRα−2およびGFRα−3(アミノ酸27〜427、20〜431および28〜371をそれぞれコードしている)のcDNA領域が、発現ベクターSignal pIg plus(R&D Systems Europe Ltd)中にインフレームにクローン化された。これらの構築物から発現される得られるタンパク質は、17アミノ酸NH2−末端CD33シグナルペプチド、GFRαタンパク質領域および243アミノ酸COOH−末端ヒトIgG1−Fc融合ドメインを含有する。CHO細胞は、GFRα融合構築物によりトランスフェクションされ、そして安定にトランスフェクションされた細胞が、G418 500μgを用いて選択された。永久クローンは、抗Fc抗体を用いて選択された。GFRα融合タンパク質の精製では、細胞が血清不含培地で増殖され、そして培地が3日後毎に回収された。培地は遠心され、そしてプロテインAカラム(Protein A Sepharose,Pharmacia Biotech)に適用された。結合タンパク質は、0.1Mクエン酸Na、pH3.0で溶出され、そして1MTrisバッファー、pH8.4中に回収された。タンパク質濃度は、吸光係数1.5を用いて280nmにおける吸光度によって評価された。これらの精製された可溶性GFRα−1〜−3Fc融合タンパク質は、続いての結合研究のために使用された。
表面プラスモン共鳴(SPR)実験は、BIAcore3000装置を用いて25℃において行われた。解析は、固定化リガンドとしてのエノビンおよびNGFにより遂行された。FIセンサーチップのカルボキシル化マトリックスが、最初に、400mMN−エチル−N−(ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミドおよび100mMN−ヒドロキシ−スクシンイミドの1:1混合液により10分間活性化された。次いで、組み換えエノビンおよびNGFが、10mM酢酸バッファー,pH4.5において流速5μl/minで活性化された表面上に適用された。占有されなかった反応基は、1Mエタノールアミン塩酸塩で不活性化された。結合実験では、可溶性GFRα1−3−Fcが、HEPESバッファー食塩水(150mMNaCl,3.5mMEDTA,0.05%P−20、10mMHEPES,pH7.4)中濃度10〜100nMにおいて、流速10μl/minで流下された。会合が3分間モニターされ、そして1分間解離され、続いて、5mMNaOHにより再生された。解離は、HEPESバッファー食塩水を流下することによって開始された。BIAcore評価ソフトウエアー,3.0が、会合速度(Ka)、解離速度(Kd)および平衡解離定数(kp,Kd/Kaとして算出される)を計算するために使用された。
SPRが、固定化エノビンへの可溶性GFRα1−3の結合を測定するために使用された。エノビンの特異的結合は、可溶性GFRα3によってのみ検出できた。GFRα1およびGFRα2は、固定化エノビンには結合しなかった。観察されたGFRα3の結合は特異的であり、したがってNGFへの結合は存在しなかった。別の対照実験では、固定化NGFへのTrkA−Fc(NGF受容体)の特異的結合は、固定化エノビンへの結合なしに検出された。
細胞生存率は、0.02mMフェナジンメトサルフェート(PMS,Sigma)を補足したDMEM(37℃)中、2,3−ビス[2−メトキシ−4−ニトロ−5−スルホフェニル]−2H−テトラゾリウム−5−カルボキシアニリド(XTT,Sigma)1mg/ml溶液の100μlを、各ウェルに添加することによって決定された。次いで、プレートは、37℃で2.5時間インキュベートされた。光学密度は、標準として650n
mを用いて、450nmにおいて読まれた(Molecular devices)。XTTアッセイは、テトラゾリウム塩XTTの赤色ホルマザン生成物への転化に基づいている。この反応は、ミトコンドリア酵素によって遂行される。
1.ヒト神経芽細胞腫SHSY5Y細胞における分化
SHSY5Y細胞が、25nMスタウロスポリンにより5日間分化される。エノビンの効果は、実験開始後72時間目に測定される。(引用文献 Jalava et al.”プロテインキナーゼ阻害剤スタウロスポリンは、a,b,z PKC独立経路を通してSH−SY5Yヒト神経芽細胞腫細胞において成熟ニューロン表現型を誘発する”Journ cell Physiol 155,301−312(1993))。
ニューロンの形態学的変化が、次にように自動的に定量された。簡単に言えば、適当な時間において、グルタルアルデヒドが、培地に直接添加され、そして室温で30分間放置された。これは、その時点における細胞の形態が、実際の状況を反映することを確認した。細胞は、Indyワークステーション(Silicon Graphics,Mountain View,USA)によって作動されるMarzhauserスキャニングステージを備えたAxiovert顕微鏡(Zeiss Oberkochen,Germany)において、透過光方式により観察された。影像は、MX5ビデオカメラ(HCS)を用いて撮影された。約3000細胞が、像の8x8四角格子を形成している64の整列された像において評価された。像の正確な整列は、軸索が、1つの像視野から次まで続くことを確認した。ポリクローナルtau抗体によって標識された軸索伸長の自動検出は、曲線構造の無偏向検出器(Steger 1998)を用いて遂行された。解析ソフトウエアーは、全細胞体面積、細胞体数および全軸索長を自動的に算出した。
ヒト皮膚繊維芽細胞(39SK)、ヒト臍静脈内皮細胞(HUVEC)、ヒト平滑筋細胞(HSMC)、ヒト軟骨細胞およびラット骨芽細胞を含む細胞が、10%FBSを含有するDMEM(39−SK、HSMC、ラット骨芽細胞)または合成培地(骨芽細胞およびHUVEC)において5%CO2および95%空気を含む37℃において維持された。DNA合成アッセイでは、細胞が、96穴組織培養プレートにおいて、10%FBSを含有するDMEM中に5000細胞/ウェルの密度で接種され、そして24時間培養された。次いで、培地は、種々の濃度のエノビンおよび0.1%BSAを含有するDMEM(39−SK、骨芽細胞、HSMC、軟骨細胞のため)または種々の濃度のエノビンおよび0.5%FBSを含有するDMEM(HUVECのため)により置換され、そして細胞は24時間培養された。続いて、培地は、5%FBSおよび0.1μCiの[3H]−チミジンを含有するDMEM100μlで置換された。2時間のパルスラベルに続いて、細胞は、室温で1時間メタノール/酢酸(3:1,vol/vol)により固定された。固定細胞は80%メタノールで2回洗浄された。細胞は0.05%トリプシン(100μl/ウェル)において30分間、そして0.5%SDS(100μl/ウェル)においてさらに30分間可溶化された。細胞溶解物の一定量(180μl)がシンチレーション混液2mlと合わせられ、そして細胞溶解物の放射能が液体シンチレーションカウンター(Wallac 1409)を用いて測定された。
細胞は「DNA合成アッセイ」において記述されたように維持された。エノビンの走化
活性は、12穴改変Boydenチャンバー(McQuillan,D.J.,Handley,C.J.,Campbell,M.A.,Bolis,S.,Milway,V.E.,Herington,A.C.,(1986),「培養ウシ関節間軟骨における血清およびインシュリン様成長因子−Iによるプロテオグリカン生合成の促進」,Biochem.J.240:423−430)を用いて分析された。細胞は、0.05%トリプシンおよび0.5mMEDTAを用いてトリプシン処理され、そしてDMEM中に再懸濁された。Boydenチャンバーの下部ウェルに、種々の濃度のエノビンを含有する培地の一定分量150μlが添加された。タイプIコラーゲン0.1mg/mlでコーティングされたポリカーボネートメンブラン(8μm)が、下部ウェルの上に置かれ、続いて上部ウェルを組み立てた。上部ウェルには、細胞(70,000細胞/ml)の一定量100μlが添加された。6時間の培養時間後、装置が解体された。メンブランの上に残っている細胞が除去された。メンブランは、10%ホルムアルデヒドにより15分間固定され、続いてGillのストレングス ヘモトキシリン(strength hemotoxylin)によって染色された。細胞が顕微鏡下(250x倍率)でカウントされ、そして各ウェルの5区域からの平均細胞数が使用された。各実験は少なくとも4回繰り返された。結果は対照(0.1%BSA含有DMEM)の倍数として表された。
有用である。ペプチド合成もしくは組み換え技術を用いて、GDNF、NTNもしくはPSPの一部、またはエノビンの一部をもついずれか他の神経栄養もしくは成長因子を含んでなるハイブリッド成長因子が製造されて、新しい性質をもつ新規な合成成長因子を得ることができる。
操作
オスのSprague−Dawleyラット、体重300〜340グラムが使用された。動物は、食餌および任意の水により個々に飼われた。実験開始前に、動物は標準の観察ケージに入れられ、そして15分の順応後、針突き反射が評価された。そうするためには、動物の右足の足底面が針により刺激され、そしてこの針突きに対する反応性が存在(スコア=1)もしくは不在(スコア=0)のいずれかで記録された。1試行内に、操作は、2度の連続刺激提示間に1分の間隔を置いて3回繰り返された;そのような針突き試験は、針突きに対する反応性の3測定値からなった。3回の針突きにおいて正常な反応を有するラットのみが、実験に含まれた。
連続3日間のタキソールの反復足底下注射は、大部分の動物において針突き刺激に対する応答を欠如させる急性炎症反応をもたらした。食塩水もしくは媒質の足底下注射は、タキソール誘導感覚欠乏に影響を与えなかった。最初の測定では、20の対照のうち4対照のみが、3回の針突きに対して少なくとも1回の反応を示し、最初の測定における対照の平均(±SEM)針突きスコアは0.25(±0.12)であった;これは、全動物が針突きに応答したので平均スコアが3.0(±0.0)であった実験の開始時とは対照的である。測定の8日後でさえも、なお、対照における反応性は、20ラット中11ラットが少なくとも1回反応し、そして平均針突きスコア0.75(±0.18)もつように弱められた。この対照グループ内では、どのラットも全3回の刺激に対して正常な反応性を示さなかった。経時的な対照の累積針突きスコアが図19に示される。動物は、8日間にわたって9回試験されたので、各試験において3回の針突きにより到達される最高スコアは27である。グラフに見られるように、食塩水もしくは媒質の足底下注射は、タキソール誘導感覚欠乏を試験された期間にわたって回復できなかった。実験の最後における対照の平均全累積スコアは5.10(±0.87)であって;到達される最高スコアの18.9
%であった。
操作
オスのSprague−Dawleyラット、体重300〜340グラムが使用された。動物は、食餌および任意の水により個々に飼われた。実験開始前に、動物は標準の観察ケージに入れられ、そして15分の順応後、針突き反射が評価された。そうするためには、動物の右足の足底面が針により刺激され、そしてこの針突きに対する反応性が存在(スコア=1)もしくは不在(スコア=0)のいずれかで記録された。1試行内に、操作は、2度の連続刺激提示間に1分の間隔を置いて3回繰り返された;そのような針突き試験は、針突きに対する反応性の3測定値からなった。3回の針突きにおいて正常な反応を有するラットのみが、実験に含まれた(針突きスコア=3)。この対照測定の後、動物はランダムにサブグループ(n=10/グループ)に分けられて、媒質、食塩水またはエノビン23もしくは130μg/mlのいずれか75μlの右後ろ足における足底下注射を受けた。媒質および食塩水処置された動物の結果の間に差異は観察されなかったので、両グループは一緒にされた(対照グループ)。連続3日間、動物はタキソール(クレモホルおよび脱水アルコールプラス水中に溶解されたパクリタキセル3mg/ml)50μlの足底下注射を右後ろ足に毎日受けた。タキソール後1、4、5および7日目に、針突き試験が、午前(8〜9am)および午後(3.30〜4.30pm)両方に行われた。8日目には、最終針突き試験が午前中に行われた。各動物では、針突きに対する反応性の累積スコアが経時的に測定された。全部で9回の針突き試験(各々、3回の針突き提示からなる)がタキソール処置後に遂行されたので、実験の全期間にわたって到達される最高累積スコアは27である。
タキソール前の食塩水もしくは媒質の足底下注射は、針突き試験においてタキソール誘導感覚欠乏を防ぐことができなかった。タキソール後の最初の試験では、20ラットの内8ラットが、針突きに対して少なくとも1回応答し、平均針突きスコアは0.60(±0.18)であった。8日目には、タキソール誘導感覚欠乏は、なお存在し、20動物中8匹のみが応答し、そして平均スコア0.8(±0.25)もっていた。2動物では、標準化針突き反射が存在した。また、経時的に、累積針突きスコアは減少し、平均値6.55(±1.08)をもたらし、これは最高スコアの24.3%であった(図20)。
エノビンmRNAの発現は、Pharmagene Laboratories Ltd,Royston,United Kingdomにおいて開発され、実施されている専有技術を用いて、ABI Prism7700 Sequence Detection System(TaqMan;Perkin Elmer)を使用して定量的に分析された。システムは、PCRの間に配列特異的蛍光シグナルを生成する蛍光発生プローブを使用する。プローブは、結合された蛍光リポーターおよび消光染料をもつオリゴヌクレオチドであり、それは、正および逆PCRプライマーの間に位置している。インタクトである間は、リポーター蛍光の強度は、消光剤によって抑制される。プローブが複製複合体の一部を形成すると、蛍光リポーターが、Taqポリメラーゼにおける固有の5’〜3’エキソヌクレアーゼ活性によって消光剤から切断される。反応中の蛍光リポーターシグナルの増強が、PCR生成物の集積の直接測定値である。mRNA標的配列の出発コピー数(Cn)は、分画PCRサイクル数(Ct)を決定することによって確立され、このCtにおいて、PCR生成物が最初に検出され−この点において、蛍光シグナルが閾基線を越える。各サンプルにおける標的mRNA量の定量は、実験的Ct値と標準曲線との比較を通して確立される。
総RNAが、全組織および小分断組織から、発売者のプロトコールにしたがって、Triz−zol試薬(Life Technologies,Gaithersburg,MD,USA)を用いて単離された。全RNAサンプルについての品質管理操作は、完全性(インタクト18Sおよび28SリボソームRNA)の検査および高含有量(アクチン
)と低含有量(トランスフェリン受容体)転写物の存在の決定を含む。
1対のプライマーおよびTaqManプローブが設計されて、エノビンからの特異配列が増幅された。
試験された各組織では、総RNA2.2μgが、1xDNアーゼバッファー(Gibco BRL)20μl量中、室温で15分間、RNアーゼ不含DNアーゼ2単位により消化された。反応は、25mMEDTA溶液2μlの添加によって停止された。次いで、サンプルは、65℃で10分間インキュベートされて酵素が失活された。
試験された各組織では、総RNA100ngが、第1鎖cDNA合成のための鋳型として使用された。4mlの容量で、50nMプライマー1および2、1xPCRバッファーII(Perkin Elmer)および5mMMgCl2の存在下のRNAが、72℃で5分間加熱され、そして55℃まで徐々に冷却された。すべての他の試薬の添加後、6ml反応液は、48℃で30分間インキュベートされ、続いて90℃5分間の酵素失活段階が行われた。最終反応条件は、次のとおりである:1xPCRバッファーII、5mMMgCl2、1mMdATP、dTTP、dGTP、dCTP、12.5単位MuLVリバーストランスクリプターゼ(Gibco BRL)。
各サンプルについて100ngの総RNA由来のcDNAが、両標的およびGAPDH転写物を同定するために、1回反応におけるPCR増幅にかけられた。標的についての最
終プライマー/プローブ濃度は、300nMプライマー1、300nMプライマー3および200nMプローブ5であり、GAPDHについてのそれは、20nMプライマー2、20nMプライマー4および100nMプローブ6であった。反応における他の試薬の最終濃度は、4.5%グリセロール、1xTaqManバッファーA(Perkin Elmer)、6.25mMMgCl2、430MdATP、dUTP、dGTP、dCTP、2.5単位AmpliTaq Goldであった。PCR増幅は、ABI 7700配列検出システムにおいて、最初の酵素活性化段階94℃12分間で実施され、続いて、94℃15秒、60℃1分(最小ランプ(ramp)時間)のサイクルが続いた。
エノビンmRNA発現が、病気の患者および正常な対照個体から由来する組織において比較された(図25および26)。下記の表は、検討された疾病および対応する組織を示す。各条件について、3種の疾病組織および3種の対照サンプルが分析された。
3組織の各グループでは、平均および標準偏差が、Ct値(正規分布される)において計算され、次いで式Cn=10((Ct-40.007)/-3.623)に対応するCn値に変換された。また、変動分析(ANOVA)がCt値において行われて、正常組織対疾病組織における平均エノビンmRNA発現レベルを比較した。
周囲白質において上方制御されることを見い出した。
このアッセイを使用して、本発明者らは、神経栄養経路において活性化されるキーシグナリング・キナーゼの活性化を測定するか、またはcRET受容体キナーゼの活性化を測定することによって、神経栄養成長因子の作動もしくは拮抗化合物を同定することができる。活性化は、ホスホ特異抗体を用いて、リン酸化されるキナーゼもしくは受容体キナーゼ量を検出することによって測定される。本発明者らは、TrkA、TrkB、TrkC、GFRα1/cRET、GFRα2/cRET、GFRα3/cRETもしくはGFRα4/cRETを一時的または継続的に発現するNIH 3T3細胞を使用できる。
−96穴において10%ウシ血清中でNIH3T3細胞を接種し、細胞は刺激前に80%集密にされる。
−翌日、培地を血清不含培地と置き換え、そして細胞を18〜24時間飢餓させる。
−飢餓後、細胞を化合物およびポジティブ対照としての神経栄養因子(神経栄養因子について10ng/ml)により刺激する。
−PBS中4%ホルムアルデヒドにより4℃で20分間細胞を固定する。
−PBS/0.1%Triton200μlにより5分間3回細胞を洗浄する。
−PBS/0.1%Triton中0.6%H2O2100μlにより20分間細胞を停止させる。
−PBS/0.1%Triton200μlにより5分間3回細胞を洗浄する。
−PBS/0.1%Triton中10%胎児ウシ血清100μlにより60分間細胞をブロックする。
−5%BSA//PBS/0.1%Triton50μl中ホスホ特異的抗体により一夜4℃において細胞をインキュベートする。
抗体希釈は、実験的に決定されるべきであり、範囲1:100〜1:250が示唆される。
−PBS/0.1%Triton200μlにより5分間3回細胞を洗浄する。
−5%BSA/PBS/0.1%Triton50μl中希釈1:100で、室温で1時間、結合される第2の抗体HRPとインキュベートする。
−PBS/0.1%Triton200μlにより5分間3回細胞を洗浄する。
−バッファー(H2O0.5l中クエン酸H2O3.36gおよびNa2HPO4−2H2O)25ml中OPD(Sigma)1錠を溶解し、そしてH2O212.5μlを添加する各ウェルに50μl添加し、そしてアルミニウムフォイルで覆って、シェーカー(200ppm)上で15分間インキュベートする。
−H2SO425μlにより反応を停止する。
−ELISAリーダーにおいてOD490-650を測定する。
ニューロン培養
ニューロン培養は、酵素的および機械的分散によって胎児ラットの腹側中脳から調製された。組織が収集され、0.6%グルコースを含有する氷冷Ca2+およびMg2+不含リン酸バッファー食塩水(PBSG)中で洗浄し、そして0.1%トリプシンを含有するPBSGとともに37℃で30分間インキュベートされた。細胞懸濁液が、96穴NUNC組織培養プレートに密度2.5 105細胞/cm2で入れられた。予め、培養プレートは、ポリ−L−オルニチンおよび10%胎児ウシ血清を含有するCDMによりコーティングされた。培養物は、Dulbecco’s Modified Eagle培地、およびグルコース(0.6%)、グルタミン(2mM)、重炭酸ナトリウム(3mM)、HEPES(5mM)、インスリン(25μg/ml)、ヒト・トランスフェリン(100μg/ml)、プトレッシン(putrescine)(60μg/ml)、亜セレン酸ナトリウム(30nM)、ストレプトマイシン(100μg/ml)およびペニシリン(100IU/ml)を補足されたF12 Nutrientの1:1混合物からなる化学合成培地(CDM)中で維持された。
ニューロトロフィンは、保存物として0.5%ウシ血清アルブミンに溶解された。ニューロトロフィンは、最初のプレーティング後3時間および培養5日後に添加された。同量の0.5%ウシ血清アルブミンが、対照ウェルに添加された。
ドーパミン取り込みは、10日後に測定された。取り込みでは、細胞が、グルコース(5mM)アスコルビン酸(100mM)およびパルギリン(100mM)を補足された前加温されたPBSにより2回洗浄され、そして同じ溶液とともに10分間プレインキュベートされた。プレインキュベーション溶液は、50nM[3H]DAを含有する同じ溶液で置換され、そしてインキュベーションは37℃で15分間継続された。取り込みは、氷冷PBSによる3回の急速洗浄によって停止された。蓄積された[3H]ドーパミンは、室温で30分間、酸性化エタノールとともにインキュベートすることによって遊離された。放射能は、シンチレーション液(Packard ultima gold MV)4mlの添加後、Packardシンチレーションカウンターを使用して決定された。非特異的取り込みは、20μMコカインを添加することによって決定された。
BLAST Basic local alignment searchtoolbp 塩基対
cDNA 相補的DNA
CNS 中枢神経系
EST 発現配列Tag
EVN エノビン
GDNF グリア細胞系由来の神経栄養因子
GFRα GDNFファミリー受容体α
GPI グリコシルホスファチジルイノシトール
MTC 多組織cDNA
NTN ニュールツリン
PCR ポリメラーゼ連鎖反応
PNS 末梢神経系
PSP ペルセフィン
RT−PCR 逆転写PCR
TGF−β トランスフォーミング成長因子
FISH 蛍光インサイチューハイブリダイゼーション
MTN 多組織ノザン
NGF 神経成長因子
SPR 表面プラスモン共鳴
のいずれかに記載の神経栄養成長因子の使用。
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- 配列番号11、12、13、14もしくは15に示されるスプライシングバリアントのいずれかのヌクレオチド配列を持つヒト神経栄養成長因子をコードする単離された核酸分子。
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