ES2320970T3 - Procedimiento para disminuir la antigenicidad de la proteina estructural de virus adeno-asociado. - Google Patents
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Abstract
Procedimiento para disminuir la antigenicidad de la proteína estructural de virus adeno-asociado (AAV) frente a la del tipo natural, caracterizado porque la proteína estructural se modifica por medio de, al menos, de una inserción, que está localizada por delante y/o por detrás de, al menos, un aminoácido en la secuencia, elegida entre YKQIS SQSGA, YLTLN NGSQA, YYLSR TNTPS, EEKFF PQSGV, NPVAT EQYGS, LQRGN RQAAT o NVDFT VDTNG de VP3, y además la proteína estructural, mutada de este modo, sigue siendo capaz de formar partículas.
Description
Procedimiento para disminuir la antigenicidad de
la proteína estructural de virus adeno-asociado.
La presente invención se refiere a un
procedimiento para disminuir la antigenicidad de la proteína
estructural de virus adeno-asociado (AAV) con
respecto a la del tipo natural, en el cual la proteína estructural
contiene, al menos, una inserción y es capaz de formar
partículas.
El virus AAV pertenece a la familia de los
parvovirus. Éstos se caracterizan por una cápside icosaédrica, no
recubierta, con un diámetro comprendido entre 18 y 30 nm, que
contiene un ADN lineal, monocatenario, de aproximadamente 5 kb.
Para una multiplicación eficiente del AAV se requiere una
coinfección de la célula huésped con virus auxiliares, por ejemplo
con adenovirus, con herpes virus o con virus vacinales. En ausencia
de un virus auxiliar el AAV pasa a un estado latente, siendo capaz
el genoma vírico de integrarse de manera estable en el genoma de la
célula huésped. La propiedad del AAV para integrarse en el genoma
huésped hace que este virus sea espacialmente interesante como
vector de transducción para las células de los animales mamíferos.
Para las funciones de vector son suficientes, en general, las dos
secuencias recurrentes terminales invertidas con una longitud de
145 bp aproximadamente (ITR: "Inverted Terminal Repeats").
Estas secuencias portan las necesarias señales "cis" para la
replicación, el empaquetamiento y la integración en el genoma de la
célula huésped. Para el empaquetamiento en partículas vectores
recombinantes se lleva a cabo una transfección en un plásmido
auxiliar, que porte los genes para proteínas no estructurales
(proteínas Rep) y para proteínas estructurales (proteínas Cap), en
células adecuadas para el empaquetamiento, por ejemplo células HeLa
o células 293, que han sido infectadas con esta finalidad, por
ejemplo, con adenovirus. Al cabo de algunos días se obtiene un
lisado, que contiene partículas de AAV recombinantes. Los plásmidos
auxiliares adecuados están descritos, por ejemplo, en la
publicación Chiorini et al., (1995) Hum. Gene Ther. 6,
1531-1541 o en la publicación Girod et al.
(1999), Nat. Med.
La cápside de AAV está constituida por tres
proteínas diferentes: la VP1, la VP2 y la VP3, cuyas proporciones
relativas son de un 5% para la VP1, de un 5% para la VP2 y de un 90%
para la VP3. Los genes de la cápside de AAV están localizados sobre
el extremo derecho del genoma de AAV y son codificados por
secuencias solapantes del mismo marco de lectura abierto (ORF) por
medio del empleo de diversos codones de iniciación así como por dos
variantes empalmadas de manera diferente de un transcrito. El gen de
la VP1 contiene la secuencia génica completa de la VP2, que
contiene, a su vez, la secuencia génica completa de la VP3 con una
región N-terminal específica. El hecho de que los
marcos de lectura solapantes codifiquen las tres proteínas de la
cápside de AAV es responsable de la expresión obligatoria de todas
las proteínas de la cápside, aún cuando esto se haga en
proporciones diferentes.
Las masas moleculares de las proteínas de la
cápside son 87 kD para VP1, 73 kD para VP2 y 62 kD para VP3. Las
secuencias de los genes de la cápside están descritas, por ejemplo,
en las publicaciones de Srivastava, A. et al. (1983), J.
Virol., 45, 555-564; Muzyczka, N. (1992), Curr. Top.
Micro. Immunol., 158, 97-129, de Ruffing, N. et
al. (1992), J. Virol., 66, 6922-6930 o en la
publicación de Rutledge, E. A. et al. (1998) J. Virol. 72,
309-319. El mapa físico y genético del genoma de AAV
está descrito, por ejemplo, en la publicación de Kotin, R. M.
(1994), Human Gene Therapy, 5, 793-801.
Por otra parte, se conocen diversos serotipos de
AAV, siendo el que ha sido mejor investigado el serotipo 2 de AAV
humano (AAV2). En estos análisis se observa que los virus AAV
tienen, a manera de vectores virales, ventajosas propiedades para
la terapia génica somática. Las ventajas esenciales consisten en la
ausencia de patogenicidad para los seres humanos, en la integración
estable del ADN viral en el genoma celular, en la capacidad para
infectar células no divisibles, en la estabilidad del virión, lo
cual posibilita la purificación hasta títulos elevados (desde
10^{13} hasta 10^{14} partículas por ml), en la inmunogenicidad
relativamente baja, así como en la ausencia de genes virales y de
productos génicos en el vector de AAV recombinante, lo cual es
ventajoso bajos aspectos de seguridad para el empleo en la terapia
génica. La clonación de genes en el vector de AAV se lleva a cabo,
en la actualidad, según los métodos, que son conocidos, en general,
por el técnico en la materia, como los que han sido descritos, por
ejemplo, en la publicación WO 95/23 867, en la publicación de
Chiorini, J. A. et al. (1995), Human Gene Therapy, 6,
1531-1541 o en la publicación de Kotin, R. M.
(1994), supra.
El empleo de vectores virales lineales en la
terapia génica depende, en gran medida, de la antigenicidad del
sistema empleado puesto que, una elevada antigenicidad va
acompañada, así mismo, por una respuesta inmune reforzada, que
podría interferir con el éxito de la terapia. Por lo tanto, la
antigenicidad del virus AAV tiene un significado decisivo, también,
para su aplicabilidad en la terapia. Se entiende por el término
antígeno aquellos productos, que desencadenan una respuesta inmune
específica tras la introducción en el organismo de los seres
humanos y de los animales. Esto se pone de manifiesto bien por medio
de la formación de anticuerpos (respuesta inmune humoral) y del
desarrollo de una inmunidad inducida por vía celular (respuesta
inmune celular) o bien por medio de en una tolerancia inmunológica
específica. La condición previa para una respuesta inmune (para la
inmunogenicidad del antígeno) consiste, en general, en que el
antígeno sea reconocido como exógeno por parte del organismo, que
tenga un peso molecular (MW) > 1 kDa y que pertenezca a la clase
de substancias correspondiente a las proteínas o a los
polisacáridos, en ocasiones más raras a los ácidos
desoxirribonucléicos o a los lípidos. Las estructuras más complejas
tales como, por ejemplo, las bacterias, los virus o los eritrocitos
(antígenos de partículas) son, en general, antígenos aún más
activos, por lo tanto tienen una antigenicidad elevada. Así pues,
se entiende por antigenicidad, en el sentido de esta invención, la
capacidad de integrarse con (de ser reconocido por) el sistema
inmune (humoral y celular) mediante enlace. En este caso, el término
abarca también la inmunogenicidad, es decir también la capacidad de
desencadenar una respuesta inmune. Precisamente, en el caso de los
virus, pueden ser determinados en principio, en este caso,
estructuras antígenas para el enlace de los anticuerpos no
solamente por medio de la estructura primaria sino, también, por
medio de la estructura secundaria, de la estructura terciaria o de
la estructura cuaternaria de la proteína de la cápside o bien de la
cápside.
Los autores Chapman M. S. y Rossmann M. G.
(1993), Virology, 194, 491-508 pudieron identificar
los determinantes antígenos más importantes de la cápside de CPV
mediante la comparación de las secuencias con diversos parvovirus,
a partir de la cual se predijeron las diferencias antígenas entre la
proteínas de la cápside. De conformidad con esta investigación, la
antigenicidad de la proteína de la cápside de CPV está enlazada, en
principio, sobre el lazo externo expuesto con elevada variabilidad
de la secuencia. Por el contrario, no existen todavía
investigaciones de este tipo para la cápside del virus de AAV.
Únicamente la publicación WO 96/00587 describe proteínas de fusión
de la cápside de AAV, en las cuales se ha introducido, por ejemplo,
en el ADN que codifica una proteína de la cápside, el ADN que
codifica el antígeno relevante desde el punto de vista clínico, sin
que esto interfiera con la formación de la cápside, y se expresa el
constructo en forma de proteína de fusión de la cápside de AAV. Los
antígenos relevantes desde el punto de vista clínico son los
epitopos, que proceden, por ejemplo, de bacterias (por ejemplo
salmonela), de virus (por ejemplo de HIV-env) o de
células tumorales. Las proteínas de fusión de la cápside de AAV
formadas desencadenarían una respuesta inmune, es decir que se
encargarían de producir una antigenicidad acrecentada de los virus
de AAV. La publicación WO/9738723 divulga la transferencia
específica de un AAV, cuya proteína estructural ha sido modificada
por medio de una secuencia diana.
En el estado de la técnica no ha sido tratada
una antigenicidad disminuida del AAV. Para la aplicación práctica
de los vectores de AAV - precisamente en la terapia génica - es
ventajosa precisamente una antigenicidad disminuida en comparación
con la del tipo natural o en comparación con la de los vectores de
AAV, derivados del tipo natural. Dado que el AAV de tipo natural
tiene, así mismo, determinantes absolutamente antígenos. De este
modo, existen individuos anti-AAV2 Ig positivos, en
los cuales es obligatoriamente difícil, hasta incluso imposible,
una terapia con vectores de AAV de una antigenicidad de tipo
natural. De igual modo, un paciente podría desarrollar una
respuesta inmune humoral y/o celular cada vez mayor contra los
vectores de AAV empleados en el caso de una terapia repetitiva con
vectores de AAV. Una inmunización de este tipo reduciría, o incluso
impediría, el éxito de una terapia. Por lo tanto, cuanto menor sea
la antigenicidad de un virus de AAV recombinante o cuanto más se
diferencie su antigenicidad de la de un virus de tipo natural o de
la de un virus de AAV recombinante, que haya sido utilizado
precedentemente, tanto más prometedor se presenta el éxito de su
empleo terapéutico.
Por lo tanto, la tarea de la presente invención
consistía en reducir la antigenicidad del virus de AAV,
especialmente de una proteína estructural, frente a la del tipo
natural. De manera especial, deberían desarrollarse vectores de AAV
por medio de modificación, que posibilitasen una transferencia
génica específica y eficiente, pero que se opusiesen de mejor
manera, o por completo, a la respuesta inmune. Por lo tanto, la
modificación debería llevarse a cabo, preferentemente, de tal
manera que, al mismo tiempo, no se redujese, de manera esencial, el
carácter infeccioso del virus o que, al menos, se mantuviese.
De manera sorprendente, se ha encontrado ahora
que las proteínas estructurales o bien que las proteínas de la
cápside de AAV pueden ser modificadas de tal manera, que se provoca,
de este modo, una disminución de la antigenicidad, sin que tampoco
se reduzca esencialmente el carácter infeccioso, manteniéndose éste
al menos.
Un objeto de la presente invención consiste, por
lo tanto, en un procedimiento para la disminución de la
antigenicidad de la proteína estructural de virus
adeno-asociado (AAV) con respecto a la del tipo
natural, modificándose la proteína estructural por medio de, al
menos, una inserción, que está localizada por delante y/o por detrás
de, al menos, un aminoácido en la secuencia elegida entre YKQIS
SQSGA, YLTLN NGSQA, YYLSR TNTPS, EEKFF PQSGV, NPVAT EQYGS, LQRGN
RQAAT o NVDFT VDTNG de la VP3, y, además, la proteína estructural,
mutada de este modo, sigue siendo capaz de formar partículas.
En el sentido de la invención y de las
definiciones precedentes se entiende por la disminución de la
antigenicidad, la disminución de la formación de anticuerpos y/o
del enlace con anticuerpos por medio de la modificación, de la
eliminación o del aporte de determinadas secuencias o epitopos o por
medio de una combinación de estas medidas, especialmente de
determinados epitopos y secuencias, que están presentes en el tipo
natural. Por medio de una antigenicidad disminuida se reduce, por
ejemplo, una inmunización de un organismo por medio de una terapia
con un vector de AAV. En este caso, se considera también, en el
sentido de esta invención, como disminuida una antigenicidad
simplemente modificada, visto desde el punto de vista absoluto, es
decir en promedio de la intensidad de la respuesta inmune, cuando
no se desencadene con la proteína estructural, preparada de
conformidad con la invención, una respuesta a los anticuerpos
-(inmune-), que se desencadenaría con el tipo natural. Una
antigenicidad de este tipo, simplemente modificada, visto desde el
punto de vista absoluto, puede conducir a una menor inmunización
cuando se utilicen, en terapias sucesivas, vectores de AAV,
preparados de conformidad con la invención, con antigenicidad
variable. La antigenicidad modificada puede referirse en este caso
tanto a la respuesta inmune humoral así como, también, a la
respuesta inmune celular.
La antigenicidad disminuida puede demostrarse
para la respuesta inmune humoral, por ejemplo, debido a que un
anticuerpo, que puede enlazarse sobre la proteína de la cápside de
AAV no modificada (de tipo natural) o sobre la cápside de AAV, ya
no reconoce, o reconoce de una manera esencialmente peor, a la
proteína de la cápside de AAV, modificada de conformidad con la
invención, o a la cápside de AAV. Estas demostraciones pueden
llevarse a cabo por medio de procedimientos normalizados como el
enzimoinmunoanálisis de absorción (Enzyme linked
Immuno-absorbent Assay (ELISA)). Un anticuerpo
adecuado es, por ejemplo, el anticuerpo monoclonal A20 (véase la
publicación de Wistuba, A. et al. (1997) J. Virol., 71,
1341-52), que reconoce de manera específica sólo la
cápside de AAV2 del tipo natural, completamente ensamblada, pero
que, sin embargo, no reconoce a ninguna de las proteínas libres de
la cápside.
Para la respuesta inmune celular puede llevarse
a cabo una demostración de la antigenicidad modificada puesto que
las inmunocélulas específicas de AAV no son estimuladas por las
células que presentan antígeno, que han sido infectadas con
partículas constituidas por proteínas estructurales modificadas, de
una manera tan intensa como lo hacen las células que presentan
antígenos, que han sido infectadas con partículas constituidas por
proteínas estructurales originales. Este procedimiento se lleva a
cabo en analogía con los procedimientos para los virus vacinales y
para los adenovirus (Tarpey, I. et al., (1994), Immunology,
81, 222-7; Nimako, M. et al., (1997), Cancer
Res. 57, 4855-61). La estimulación de las
inmunocélulas puede medirse cuantitativamente, por ejemplo, por
medio de un ensayo de citocina (capítulos 6.2 hasta 6.24 en la
publicación Current Protocols in Immunology (1999), editada por
Coligan J.E. et al., John Wiley & Sons).
Es especialmente preferente que la inserción en
la proteína estructural no provoque una disminución esencial de la
carácter infeccioso del virus, o bien que el carácter infeccioso se
mantenga al menos. Se entiende por carácter infeccioso, en el
sentido de esta invención, la capacidad para transducir células.
Por otra parte, la proteína estructural,
preparada de este modo, es capaz también, de manera preferente, de
formar partículas, es decir de formar una cápside icosaédrica,
especialmente en forma de una cápside de AAV, puesto que las
partículas o bien las cápsides son especialmente adecuadas como
portadores de los compuestos elegidos, por ejemplo para los
vectores de transducción AAVr. La formación de partículas puede
demostrarse, por ejemplo, por medio de la microscopia electrónica.
Otra demostración consiste en el comportamiento a la sedimentación
durante una centrifugación con gradiente de densidad con cloruro de
cesio con subsiguiente demostración, opcional, del ADN viral
contenido en las partículas.
En general, la modificación puede encontrarse en
la proteína estructural VP1, en la proteína estructural VP2 y/o en
la proteína estructural VP3, siendo preferente la proteína
estructura VP1 y/o la proteína estructural VP3. Por otra parte, la
proteína estructural puede derivarse de todos los serotipos de AAV,
especialmente de los serotipos humanos, de manera preferente de
AAV1, de AAV2, de AAV3, de AAV4 de AAV5 y/o de AAV6, ante todo de
AAV2, AAV3 y/o de AAV6.
De manera preferente, la/las modificaciones
están localizadas sobre la superficie del virus. Para la
determinación de las regiones de la proteína estructural,
localizadas en la superficie, se ha encontrado, de manera
sorprendente, que son comparables el CPV (Canine Parvovirus) y las
secuencias y las estructuras de AAV2. Por lo tanto, puede
recurrirse de manera preferente a las conocidas estructuras
cristalinas de los parvovirus como las del parvovirus B19 o del CPV
y a la identificación de los dominios proteicos, con ayuda de la
comparación de la homología, cuyos dominios están localizados sobre
la superficie del virus. De manera ejemplificativa, una comparación
realizada con ayuda de un ordenador entre CPV y AAV2 o bien entre el
parvovirus B19 y AAV2, conduce de una manera sorprendentemente
reproducible, a la identificación de los lazos (loops) en VP3, cuya
secuencia varía, es decir que tienen una pequeña homología y que
están localizados supuestamente sobre la superficie del virus.
Puesto que los antígenos tienen que ser accesibles a los anticuerpos
para respuesta inmune humoral y, por lo tanto, tienen que
encontrarse sobre la superficie del virus, estos lazos representan
candidatos preferentes para las modificaciones. De este modo, se
tomó como muestra la conocida estructura cristalina de la proteína
de la cápside de CPV VP2 (por ejemplo Luo M. (1988), J. Mol. Biol.,
200, 209-211; Wu y Rossmann (1993), J. Mol. Biol.,
233, 231-244; Tsao J. et al. (1991) Science,
251, 1456-1464) debido a su elevada similitud con
AAV2 VP3 en la estructura secundaria de la proteína, con el objeto
de encontrar aquellas regiones que estén expuestas sobre la
superficie de la cápside viral y que sean suficientemente flexibles,
debido a la secuencia local de aminoácidos, por ejemplo para
soportar la inserción de una secuencia péptida. En este caso, se
tomaron precauciones minuciosas para que no se eligiese ningún
elemento estructural secundario de la proteína de la cápside de
AAV2 que desestabilizase a la cápside.
En una forma de realización que ha sido
descrita, la o las modificaciones están localizadas sobre el extremo
N de la proteína estructural puesto que se ha encontrado que, por
ejemplo, en el caso del parvovirus B 19, el extremo N se encuentra
sobre la superficie de la célula.
Otra posibilidad para llevar a cabo la
determinación de las regiones localizadas en la superficie de la
proteína estructura consiste en una comparación de las secuencias
de ácidos nucleicos, que codifican la cápside, de diversos
serotipos de AAV. Con esta finalidad puede recurrirse, por ejemplo,
a las secuencias de ADN conocidas de diversos serotipos de AAV,
tales como de AAV1, de AAV2, de AAV3, de AAV4, de AAV5 o de AAV6,
para el análisis estructural de las posibles morfologías de la
cápside, por ejemplo de AAV2, pudiendo ser calculadas desde un
inicio las posibles estructuras terciarias y pudiendo ser asociadas
las regiones de la secuencia a las regiones internas o a las
regiones externas de la cápside, en base a los mapas propios de los
aminoácidos, conocidos en general. De este modo, podrían
determinarse, de conformidad con la presente invención, los posibles
puntos de inserción en la región VP3 de la cápside de AAV2, que
posibilitasen (véase más adelante) la inserción de, por ejemplo,
péptidos y su expresión sobre la superficie del virus.
Se entenderá por una inserción, por ejemplo, una
modificación de la proteína de la cápside, que se consigue mediante
enlace covalente o no covalente de una molécula sobre uno o sobre
varios aminoácidos o secuencias de aminoácidos. De este modo, puede
modificarse una proteína de la cápside, por ejemplo mediante enlace
covalente de monosacáridos o de oligosacáridos, de biotina o de
otros compuestos de elevado peso molecular, sobre uno o sobre
varios aminoácidos. Sin embargo, la inserción puede conseguirse
también mediante enlace covalente de compuestos de bajo peso
molecular, tal como un grupo hidroxilo, sobre uno o varios
aminoácidos. De la misma manera, pueden adicionarse moléculas o
complejos moleculares sobre la proteína de la cápside por medio de
enlace no covalente y, de este modo, pueden apantallarse las
regiones antígenas. Éste puede ser, por ejemplo, el punto de enlace
del antígeno de las inmunoglobulinas, por ejemplo un fragmento
F_{ab} u otras moléculas, que presenten una elevada afinidad con
respecto a la región antígena o con respecto a las regiones
contiguas. Tales moléculas pueden ser seleccionadas con respecto a
su afinidad, por ejemplo, a partir de bancos moleculares. En el
caso de la estructura tridimensional, conocida, de la región
antígena o de la proteína de la cápside, puede ser concebida y
sintetizada una serie de moléculas potencialmente enlazantes, cuyas
moléculas pueden ser ensayadas a continuación con respecto a su
afinidad.
En una realización preferente, se inserta
proteína o péptido, de manera preferente proteína o péptido
inmunosupresor. En este caso, el péptido puede estar constituido,
por ejemplo, por 5 hasta 30 aminoácidos, de manera preferente puede
estar constituido por 8 hasta 20 aminoácidos y, de manera especial,
puede estar constituido por 10 hasta 18 aminoácidos. El péptido
tiene, por ejemplo, la secuencia QAGTFALRGDNPQG o tiene una
secuencia que sea fuertemente homóloga con esta.
Es especialmente preferente una proteína
estructural, preparada de conformidad con la invención, que
contenga, al menos, otra modificación. Se entenderá por este
término que la proteína estructural contiene, además de una
modificación, que provoque una disminución de la antigenicidad del
virus, también otra modificación, que no provoque obligatoriamente
también una disminución de la antigenicidad del virus. En este caso,
es especialmente preferente otra modificación que provoque una
modificación, preferentemente que provoque un aumento de la
carácter infeccioso del virus.
En otra forma preferente de realización la otra
o las otras modificaciones representan una o varias eliminaciones
y/o una o varias inserciones en la proteína estructural o
representan combinaciones de estas modificaciones. En este caso, la
inserción es, de manera preferente, la inserción de un ligando del
receptor de la membrana celular, una proteína Rep o un péptido Rep,
por ejemplo en forma de un dominio Rep, de una proteína
inmunosupresora o de un péptido inmunosupresor y/o de una proteína
o de un péptido con una señal para la síntesis en doble hebra de un
transgen o bien de un gen exógeno.
Ejemplos de otras inserciones son, entre otras,
la integrina, la citocina o los dominios de enlace del receptor de
las citocinas, de las integrinas o de los factores del crecimiento
tales como, por ejemplo, GM-CSF,
IL-2, IL-12, CD40L, TNF, NGF, PDGF
o EGF, sobre anticuerpos monocelulares, que se enlazan sobre los
receptores superficiales de la célula, denominados anticuerpos
monocatenarios "single chain" (scFv), por ejemplo los
anticuerpos monocatenarios, que se enlazan sobre los receptores
superficiales CD40, CD40L, B7, CD28 o CD34, o los epitopos o bien
los puntos de enlace con el receptor que son reconocidos por su
parte, por ejemplo, por determinados anticuerpos, por ejemplo por
los anticuerpos anti-CD40L- monoclonales, o bien por
substancias químicas o por hormonas, por ejemplo la
catecolamina.
En una forma preferente de realización de la
otra modificación, se insertan estructuras enlazantes con los
anticuerpos, tales como, por ejemplo, la proteína A, la proteína G o
los anticuerpos anti-Fc, o bien partes de los
mismos. Sobre éstos se acoplan, a su vez, anticuerpos específicos
contra determinadas estructuras superficiales de la célula (por
ejemplo contra el CD40 en el caso de las células linfáticas o contra
el CD34 en el caso de las células hematopoyéticas).
En la forma de realización presente se
encuentran una o varias inserciones en la proteína estructural VP3
(Rutledge, E. A. et al. (1998) supra) por delante y/o
por detrás de, al menos, un aminoácido en la secuencia elegida
entre YKQIS SQSGA, YLTLN NGSQA, YYLSR TNTPS, EEKFF PQSGV, NPVAT,
EQYGS, LQRGN RQAAT, NVDFT VDTNG, puesto que estos puntos se
encuentran en los puntos expuestos de un lazo, siendo pequeño el
riesgo de que se modifique la estructura de la VP3.
La proteína estructural, preparada de
conformidad con la invención, puede estar presente así mismo en
forma de una partícula de AAV, especialmente en forma de una
cápside de AAV, puesto que las partículas o bien las cápsides son
especialmente adecuadas como portadores de compuestos seleccionados,
por ejemplo de los vectores de transducción AAVr.
La presente descripción se refiere, así mismo, a
un ácido nucleico, de manera preferente a un ARN o a un ADN, de
manera especial, se refiere a un ADN de doble hebra, que codifica
una proteína estructural, preparada de conformidad con la
invención.
La presente descripción se refiere, así mismo, a
una célula, de manera preferente, se refiere a una célula de animal
mamífero, de manera especial, se refiere a una célula COS, a una
célula HeLa o a una célula 293, que contenga el ácido nucleico
citado. Tales células son adecuadas, por ejemplo, para la obtención
de partículas de AAV recombinantes.
\newpage
Otro objeto de la presente descripción consiste,
por lo tanto, también en un procedimiento para la obtención de una
proteína estructural, preparada de conformidad con la invención,
especialmente para la obtención de una proteína estructural en
forma de una partícula de AAV, cultivándose una célula adecuada, que
contenga un ácido nucleico, que codifique la proteína estructura y,
en caso dado, se aísla la proteína estructural expresada. De manera
ejemplificativa, puede aislarse la proteína estructural, preparada
de conformidad con la invención, por medio de un gradiente de
cloruro de cesio, tal como se ha descrito, por ejemplo, en la
publicación de Chiorini, J. A. et al. (1995),
supra.
Otro objeto de la presente descripción se
refiere, así mismo, a un medicamento, que contiene una proteína
estructural, preparada de conformidad con la invención, o un ácido
nucleico citado o una célula citada y, en caso dado, productos
auxiliares y aditivos adecuados tales como, por ejemplo, una
solución fisiológica de sal común, estabilizantes, inhibidores de
proteinasa, inhibidores de la desoxirribonucleasa
(DNA-asa), etc.
Así mismo, el medicamento puede contener, al
menos, dos proteínas estructurales diferentes, preparadas de
conformidad con la invención, que presenten, respectivamente,
modificaciones diferentes. En este caso, es especialmente
preferente que tengan una antigenicidad diferente.
Otro objeto de la descripción consiste, así
mismo, en un estuche (kit), que contiene, al menos, dos proteínas
estructurales diferentes, preparadas de conformidad con la
invención, estando presente en el estuche cada proteína estructural
de manera independiente del/de las otras proteínas
estructurales.
Para una aplicación del estuche o bien del
medicamento con, al menos, dos proteínas estructurales diferentes,
preparadas de conformidad con la invención, por ejemplo en el ámbito
de una terapia, se aplicará, en este caso, en primer lugar una
proteína estructural. Para una o varias aplicaciones ulteriores se
emplea o se emplean proteínas estructurales con otra antigenicidad.
Por consiguiente, una terapia con ayuda del medicamento o bien del
estuche comprende la administración sucesiva de proteínas
estructurales, preparadas de conformidad con la invención. El
medicamento o bien el estuche tienen, por lo tanto, la ventaja de
que (1) puede evitarse la potenciación de una respuesta inmune,
desencadenada en el caso de una aplicación repetitiva de la misma
proteína estructural y de que (2) en el caso en que se desencadene
una reacción inmune durante la primera aplicación, la reacción de
defensa presente contra la segunda aplicación es menos activa, como
consecuencia de la utilización de una proteína estructura con una
antigenicidad diferente, que lo que ocurriría en el caso de una
aplicación con la primera proteína estructural. La inmunización del
apaciento, que queda reducida de este modo, aumenta la actividad.
Por lo tanto, en el caso de aplicaciones continuas, puede
intercambiarse varias veces entre diversas proteínas estructurales
diferentes, con objeto de mantener tan baja como sea posible una
inmunización del paciente. Es preferente un juego con varias
proteínas estructurales en forma de partículas infecciosas con
antigenicidad diferente, que son empleadas como vector para la
transferencia múltiple de, por ejemplo, genes terapéuticos
idénticos. Otro medicamento abarca un juego de proteínas
estructurales en forma de partículas infecciosas, que se emplean
como vector para terapias diferentes.
La proteína estructural, preparada de
conformidad con la invención, puede ser empleada para la
transformación de una célula y/o - en forma de vectores adecuados
de AAVr - para la terapia génica. Se entiende por terapia génica,
aquella forma de terapia en la que se expresa un gen efector y, por
lo tanto, en la mayoría de los casos una proteína, por medio de la
introducción de ácidos nucleicos en la célula. En principio, se hace
una distinción entre procedimientos in-vitro
y procedimientos in-vivo. En los
procedimientos in-vitro se toman células del
organismo y se someten a una transducción
ex-vivo con vectores, con objeto de ser
reintroducidas a continuación en el mismo organismo o en otro
organismo. En el caso de la terapia génica
in-vivo se aplican de manera sistémica
vectores, por ejemplo para la lucha contra tumores, (por ejemplo a
través del riego sanguíneo) o son aplicados de manera local (por
ejemplo en el tumor).
Una ventaja esencial de la presente invención
consiste en que puede modificarse la antigenicidad, por medio de la
mutagénesis de las proteínas estructurales de AAV, de conformidad
con la invención, esencialmente sin pérdida de la eficiencia de
empaquetamiento de los vectores de AAV recombinantes - y por lo
tanto de la condición previa básica del carácter infeccioso - dentro
de la cápside del virus. Por lo tanto, las proteínas estructurales,
preparadas de conformidad con la invención, son adecuadas, de manera
especial, para la transducción in vivo de células, por ejemplo para
la terapia génica somática, cuando sea deseable una inmunización
disminuida de los pacientes.
Los ejemplos siguientes explican la invención
con mayor detalle, sin limitarla.
En primer lugar, se partió de un plásmido
pUC-AV2, que se preparó mediante subclonación del
fragmento BgIII de 4,8 kb del pAV2 (ATCC 37261, ref. 53) en el
sitio de restricción BamHI del pUC19 (New England BioLabs Inc.). Se
llevaron a cabo mutaciones, por medio de la mutagénesis, basada en
la reacción en cadena de la polimerasa (RCP), que es conocida por
el técnico en la materia, mutaciones en sitios definidos del
plásmido. En este caso, se introdujo detrás de los nucleótidos
2985, 3345 y 3963 una secuencia que codifica P1, un péptido 14 AS,
con la secuencia AS QAGTFALRGDNPQG, que contiene el motivo de enlace
RGD de un fragmento de laminina (Aumailley et al. (1990)
FEBS Lett. 262, 82-86). Esto corresponde a una
inserción por detrás de los aminoácidos 261, 381 y 587 de la
proteína de la cápside de AAV2 (nomenclatura de acuerdo con el
número de los aminoácidos (AS) contados por detrás del AS a partir
del inicio del extremo N en la VP-1 del AAV2). En la
RCP subsiguiente se utilizan, respectivamente, 2 cebadores
específicos de la mutación y como matriz se emplea un plásmido,
pCap, que únicamente contiene el gen cap y que se forma porque se
retira por restricción a partir de pUC-AV2 el
fragmento EcoRI-BspMI de 2,2 kb y se inserta en el
sitio de restricción EcoRI del pUC19. A continuación, se amplifican
en bacterias los productos de la RCP, se secuencian y se subclona en
pUC-AV2 el fragmento EcoNI-XcmI de
1,4-kb, que contiene la P1, en el que se ha retirada
por restricción la correspondiente secuencia cap del tipo natural.
Por lo tanto, los plásmidos (mutantes) pI-261,
pI-381 y pI-587, denominados según
los puntos de inserción AS, contienen el genoma completo de AAV2.
Las proteínas correspondientes se denominan I-261,
I-381 y I-587.
Se transfectaron células HeLa (una línea celular
humana del epitelio del cuello de matriz) con los plásmidos, de
conformidad con el ejemplo 1, a continuación se incubaron durante 20
horas aproximadamente y, seguidamente, se infectaron con adenovirus
tipo 5. Al cabo de 72 horas desde la infección se sometieron a
digestión las células y se purificaron las partículas de AAV2 por
medio de un gradiente de CsCl.
En estos ensayos debía establecerse si los
mutantes de la cápside empaquetan el genoma viral y si pueden formar
cápsides completas. Se ensayaron partículas de AAV2 de los
mutantes, de conformidad con el ejemplo 2, con relación a si el
genoma del virus porta partículas y, en caso dado, en qué cantidad
lo hace y en qué cantidad estaba empaquetado el ADN en los mutantes
de la cápside. Con esta finalidad se trataron los virus purificados,
de conformidad con el ejemplo 2, (mutantes y de tipo natural) con
desoxirribonucleasa (ADN-asa), se sometieron a un
análisis por transferencia y se hibridizaron con una sonda Rep.
Los títulos, obtenidos de este modo, no
mostraron una diferencia cuantitativa o cualitativa en comparación
con los del tipo natural (véase la tabla 1). Los virus mantenían la
capacidad de empaquetar el genoma.
Por otra parte, pudo demostrarse mediante
análisis por microscopía electrónica que, incluso, se forma la
cápside.
Por lo tanto, no se llevaron a cabo las
mutaciones en aquellas regiones, que son significativas para el
plegamiento correcto, para la composición de la cápside o para el
empaquetamiento del genoma. Las partículas de AAV, de conformidad
con la invención, no quedan perjudicadas en cuanto a su función.
Con el fin de poder evaluar la antigenicidad de
las cápsides mutadas, se emplearon, en otro experimento, anticuerpos
monoclonales A20 (A20MAb) en un ELISA. Los A20MAb reaccionaron de
manera específica con la cápside de AAV2 del tipo natural,
compuesta de manera completa (Wistuba et al., (1997), J.
Virol. 71, 1341-1352). También, en este caso se han
representado los resultados en la tabla 1. En este caso, se observa
que, por medio de la inserción en los mutantes
I-261 e I-381 ya no pueden enlazarse
anticuerpos monoclonales, en contra de lo que ocurre en el caso del
tipo natural y de I-587 del A20.
\vskip1.000000\baselineskip
Se han mostrado los títulos víricos genómicos
(hibridación en gota -Dot-Blot-) y el título con la
cápside de A20-ELISA. Las concentraciones han sido
dadas en partículas/ml. "n.m." significa "no medible".
\vskip1.000000\baselineskip
Con objeto de ensayar el tropismo de los
mutantes de la cápside I-261, I-381
e I-587 se infectaron las células de la línea
celular Co-115 con los virus mutados. Las células
Co-115 se utilizaron para el ensayo del tropismo
receptor del tipo natural de los viriones, puesto que éstos son
susceptibles frente al tipo natural AAV2. Al cabo de tres días,
desde la infección, se investigó, por medición con
inmunofluorescencia con ayuda de un anticuerpo
anti-Rep, si las células expresan la proteína Rep
viral (Wistuba et al. (1997) J. Virol. 71,
1341-1352; Wistuba et al. (1995) J. Virol.
69, 5311-5319). Las células se cultivaron sobre
portaobjetos hasta una confluencia del 70% y se incubaron, en medio
exento de suero, con diversas concentraciones de las preparaciones
virales, de conformidad con la invención, junto con el adenovirus 5.
El título de las preparaciones virales se determinó tres días más
tarde bien por medio de la detección in situ de la síntesis
de la proteína Rep en un ensayo de inmunofluorescencia (título
Rep). En este caso se llevó a cabo la coloración de
inmunofluorescencia con células infectadas con AAV2, según un
método de Wistuba et al. (Wistuba et al. (1997) J.
Virol. 71, 1341-1352; Wistuba et al. (1995)
J. Virol. 69, 5311-5319). Los portaobjetos se
lavaron una vez con fosfato salino tamponado (PBS), se fijaron en
metanol (5 minutos, 4ºC) y, a continuación, se trataron con acetona
(5 minutos, 4ºC). Las células se incubaron, a continuación, durante
una hora a la temperatura ambiente con el anticuerpo monoclonal
76-3, que reacciona con las proteínas Rep de AAV2. A
continuación, se lavaron y se incubaron durante una hora con
anticuerpo secundario anti-ratón conjugado de
rodamina, con una dilución de 1:50 en PBS con un 1% de albúmina de
suero bovino (BSA). Los títulos se calcularon a partir de la última
dilución limitadora de la solución madre viral, que había conducido
a células positivas a la fluorescencia.
Tras la infección con el tipo natural de AAV2 y
con los mutantes I-261 e I-587,
pudieron ser detectadas células CO115
Rep-positivas, siendo el carácter infeccioso de los
mutantes un orden de magnitud entre dos y tres veces menor que el
del tipo natural, o bien que el de un mutante no infeccioso
(I-381) (tabla 2). Sin embargo, pudo observarse
que, en el caso del mutante I-261, se mantuvo el
carácter infeccioso a pesar de que la antigenicidad era menor
(véase el ejemplo 14).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Se han mostrado los títulos sobre las células
CO115 susceptibles al tipo natural. Los títulos se han expresado en
Rep-EFU/ml para I-261, para
I-381 y para I-587 como para el tipo
natural. En este caso, EFU significa unidades formadoras de
expresión (Expressing Forming Unit). En este caso "n.m."
significa "no medible".
<110> MediGene Aktiengesellschaft
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Proteína estructural de virus
adeno-asociado con antigenicidad modificada, su
obtención y empleo
\vskip0.400000\baselineskip
<140> 199 33 288.6
\vskip0.400000\baselineskip
<141> 15.07.1999
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<170> Word 6.0,
PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus
adeno-asociado
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\hskip1cm
Claims (10)
1. Procedimiento para disminuir la antigenicidad
de la proteína estructural de virus adeno-asociado
(AAV) frente a la del tipo natural, caracterizado porque la
proteína estructural se modifica por medio de, al menos, de una
inserción, que está localizada por delante y/o por detrás de, al
menos, un aminoácido en la secuencia, elegida entre YKQIS SQSGA,
YLTLN NGSQA, YYLSR TNTPS, EEKFF PQSGV, NPVAT EQYGS, LQRGN RQAAT o
NVDFT VDTNG de VP3, y además la proteína estructural, mutada de
este modo, sigue siendo capaz de formar partículas.
2. Procedimiento según la reivindicación 1,
caracterizado porque la inserción no provoca una disminución
esencial del carácter infeccioso del virus.
3. Procedimiento según una de las
reivindicaciones 1 o 2, caracterizado porque la proteína
estructural se deriva de AAV1, de AAV2, de AAV3, de AAV4, de AAV5
y/o de AAV6 así como de otros serotipos de AAV, especialmente
derivados de AAV2.
4. Procedimiento según una de las
reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque la inserción
está basada en un enlace covalente o en un enlace no covalente de
uno o de varios compuestos de elevado peso molecular o de bajo peso
molecular, por ejemplo de biotina, de un monosacárido o de un
oligosacárido, de un grupo hidroxilo o de un fragmento F_{ab},
sobre uno o sobre varios aminoácidos o sobre una o sobre varias
secuencias de aminoácidos.
5. Procedimiento según la reivindicación 1,
caracterizado porque se inserta una proteína o un péptido, de
manera preferente se inserta una proteína inmunosupresora o un
péptido inmunosupresor.
6. Procedimiento según una de las
reivindicaciones 1 a 5, caracterizado porque la proteína
estructural contiene, al menos, otra modificación.
7. Procedimiento según la reivindicación 6,
caracterizado porque la otra o las otras modificaciones
provocan una modificación del carácter infeccioso del virus.
8. Procedimiento según la reivindicación 6 o 7,
caracterizado porque la otra o las otras modificaciones son
una o varias eliminaciones, una o varias inserciones o una
combinación de estas modificaciones.
9. Procedimiento según una de las
reivindicaciones 6 a 8, caracterizado porque la inserción es
un ligando receptor de la membrana celular, una proteína Rep o un
péptido Rep, una proteína inmunosupresora o un péptido
inmunosupresor y/o una proteína o un péptido con una señal para la
síntesis en doble hebra del gen exógeno.
10. Procedimiento según una de las
reivindicaciones 6 a 9, caracterizado porque la inserción se
elige entre una integrina, una citocina o un dominio de enlace con
el receptor de una citocina, de una integrina o de un factor de
crecimiento, un anticuerpo monocatenario, enlazante con un receptor
superficial celular, un anticuerpo contra estructuras superficiales
celulares, una estructura enlazante con anticuerpos o un
epitopo.
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