ES2273329T3 - Produccion de plantas resistentes a los ataques de sclerotinia sclerotiorum por introduccion de un gen que codifica una oxalato oxidasa. - Google Patents

Produccion de plantas resistentes a los ataques de sclerotinia sclerotiorum por introduccion de un gen que codifica una oxalato oxidasa. Download PDF

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Abstract

SECUENCIA DE ADN QUE CODIFICA UNA OXIDASA OXALATO. LA PROTEINA SE PUEDE UTILIZAR PARA LA RESISTENCIA DE LAS PLANTAS A LAS ENFERMEDADES PROVOCADAS POR SCLEROTINIA SP. PUEDE SER PROPORCIONADA POR UN GEN QUIMERICO Y UN VECTOR QUE CONTIENE UNA SECUENCIA CODIFICANTE. SE PUEDE UTILIZAR PARA PROPORCIONAR A LAS PLANTAR UNA RESISTENCIA AUMENTADA CONTRA LAS ENFERMEDADES DEBIDAS A SCLEROTINIA SP.

Description

Producción de plantas resistentes a los ataques de Sclerotinia sclerotiorum por introducción de un gen que codifica una oxalato oxidasa.
La presente invención tiene por objeto la utilización de un gen que codifica una oxalato oxidasa, de la proteína codificada por ese gen y de los genes quimera que comprenden ese gen para la transformación de plantas con miras a conferirles resistencia a enfermedades fúngicas.
La esclerotiniosis es una enfermedad fúngica importante que afecta a un gran número de dicotiledóneas. El responsable, Sclerotinia sclerotiorum es un hongo polífago que presenta poca especificidad de huésped.
El hongo puede atacar a la planta o bien directamente al nivel del tallo, o bien a nivel de las hojas y después ganar el tallo, o bien a nivel del capítulo floral. En los dos primeros casos, la planta se marchita por agotamiento de la alimentación. En el último caso, la flor se marchita comprometiendo la cosecha.
El hongo produce enzimas líticas que degradan la pared celular del vegetal infectado facilitando su desarrollo en la planta. Esas enzimas juegan un rol importante en la patogenicidad, pero no parecen suficientes. Ese hongo produce también ácido oxálico (Godov et al., 1990). Ese ácido oxálico provoca un descenso del pH en los tejidos infectados que facilita la hidrólisis de la pared celular por parte de las enzimas líticas. Una reducción de la producción de ácido oxálico o una degradación de ese ácido oxálico debe permitir un enlentecimiento o incluso una inhibición del desarrollo del hongo.
Para desarrollar una planta resistente a "nos", se puede utilizar la estrategia de desintoxicación del ácido oxálico. La degradación de ese ácido limitará las disminuciones del pH intracelular del tejido vegetal atacado, las enzimas líticas funcionarán por lo tanto demasiado lejos de su pH óptimo para ser realmente activas y eficaces. Como resultado habrá una disminución de la patogenicidad del hongo.
Para lograr ese objetivo, se puede utilizar la oxalato oxidasa que cataliza la reacción siguiente:
\vskip1.000000\baselineskip
C_{2}O_{4}H_{2}\xrightarrow[\textstyle{oxalato \ oxidasa}]{\textstyle{O_{2}}} 2CO_{2} + H_{2}O_{2}
\vskip1.000000\baselineskip
La oxalato oxidasa se aísla de plantas diferentes, en general de las monocotiledóneas (Pieta et al., 1982); se puede, por ejemplo purificar la proteína de cebada utilizando técnicas de cromatografía clásica (geles de filtración Superdex G75 y de intercambio de iones MonoQ, Pharmacia), siguiendo la actividad enzimática según el protocolo colorimétrico siguiente (Obzansky y Richardson, 1983).
\vskip1.000000\baselineskip
Ácido \ oxálico + O_{2} \xrightarrow[\textstyle{oxalato \ oxidasa}] 2CO_{2} + H_{2}O_{2} +
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,4cmH_{2}O_{2} + MBTH + DMA \xrightarrow[\textstyle{peroxidasa}] indamina + H_{2}O \ +
\vskip1.000000\baselineskip
MBTH = 3-metil-2-benzotiazolinona hidrazona
DMA = N,N-dimetilalinina.
Esto permitió purificar una proteína que, en gel de acrilamida en condiciones desnaturalizantes, tiene una masa molecular de 26 000 Dalton. Una parte de la oxalato oxidasa purificada se utilizó para obtener anticuerpos antioxalato oxidasa de conejo; el resto de la proteína se utilizó para hacer la secuenciación de la proteína nativa (N-terminal) o, después del corte con bromuro de cianógeno, la secuenciación de ciertos péptidos internos. Los resultados obtenidos son los siguientes:
N-terminal: TDPDPLQDF-VADLDGKAVSVNGH
S
Péptido interno nº 2: HFQFNVGKTEAY
El ADNc
\newpage
La comparación de las secuencias peptídicas descritas antes con los datos contenidos en el banco proteico Swiss-Prot nos permitió identificar una proteína de trigo llamada Germine y publicada en 1989 por Dratewka-kos et al. Se realizaron experiencias y nos permitieron determinar que el ADNc publicado por los autores codifica una proteína de 201 aminoácidos y que presenta una actividad de oxalato oxidasa. Para el desarrollo de la descripción de las experiencias presentadas en esa patente retomaremos la numeración de los nucleótidos de la figura 2 del artículo de los autores publicados en J. Biol. Chem., 264, 4 896 - 4 900.
La secuencia de ese ADNc tiene una longitud de 1 075 nucleótidos con un 5' sin traducir de 85 residuos, una fase de lectura abierta de 672 nucleótidos (de la posición 86 a la 757) después un 3' sin traducir de 318 residuos.
La comparación de la secuencia proteica deducida de la secuencia del ADNc con la obtenida por secuenciación de la proteína nativa muestra que el ADNc codifica no solamente la oxalato oxidasa madura sino también un péptido señal de 23 aminoácidos en la parte N-terminal. La oxalato oxidasa se sintetiza por lo tanto en forma de una preproteína (péptido señal más péptido maduro) que es madurada por eliminación del péptido señal para liberar la enzima activa madura.
Para el desarrollo utilizaremos o bien la parte que codifica la preproteína (nucleótidos 86 a 757) o bien solamente la parte que codifica la proteína madura (de la posición 155 a la 757). En ese último caso, deberemos colocar un codón AUG (que codifica una metionina) delante del codón ACC (que codifica la treonina, primer aminoácido de la proteína madura).
Como los ataques de plantas por el Sclerotinia sclerotiorum se hacen principalmente por el tallo o por la planta, es interesante poder expresar la oxalato oxidasa o bien en los tejidos clorofílicos y para eso se puede utilizar el promotor de la subunidad pequeña de la ribulosa-1,5-bifosfato carboxilasa de Helianthus annuus (PSUHa, Waksman et al., 1987) o bien en diferentes tejidos del vegetal y para eso utilizaremos el promotor ubicuo del ARN 35S del virus del mosaico de la coliflor (CaMV 35S) del cual se duplicó una parte que se denominó "doble CaMV".
El documento WO 88/08450 menciona un gen quimera que contiene una oxalato oxidasa, pero no menciona ni sugiere expresarlo en los tejidos vegetales para conferir resistencia a Sclerotinia.
Los genes quimera utilizables de acuerdo con la invención pueden ser construidos por ejemplo a partir de los elementos siguientes:
A.
Promotor doble CaMV seguido de la parte del ADNc de la oxalato oxidasa que codifica la preproteína (péptido señal más péptido maduro) y del terminador "nos" obtenido a partir del gen de la nopalina sintasa de pTi 37 (Bevan et al., 1983).
B.
Promotor doble CaMV seguido de la parte del ADNc de la oxalato oxidasa que codifica solamente la proteína madura seguido del terminador "nos".
C.
Gen idéntico a "A" pero con el promotor de la subunidad pequeña de la ribulosa-1,5-bifosfato carboxilasa del girasol (PSUHa) en el lugar del doble CaMV.
D.
Gen idéntico a "B" pero con el promotor de la PSUHa en el lugar del doble CaMV.
Cada gen quimera se introduce en la célula vegetal por un sistema que utiliza Agrobacterium o por cualquier otro sistema conocido por otra parte por transformar las células vegetales. Se regeneran plantas a partir de las células transformadas. Éstas presentan una mayor tolerancia al Sclerotinia sclerotiorum.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo 1 Preparación de dos secuencias codificantes
Preproteína: se la obtiene a partir del ADNc descrito precedentemente digerido por Hind III (en posición 66). El extremo cohesivo obtenido se vuelve romo por tratamiento con polimerasa de Klenow. Ese ADN se digiere a continuación con Nhe I (en posición 811).
Paralelamente el plásmido pUC 19 (Yanisch-Perron et al., 1985) se digiere con Sac I.
El extremo cohesivo obtenido se vuelve romo por tratamiento con polimerasa de Klenow. A continuación el plásmido se digiere con Xba I (compatible con Nhe I).
El fragmento de ADNc y el plásmido preparados antes se ligan. El nuevo plásmido obtenido de ese modo se denomina pRPA-oxo-01 y su mapa se presenta en la figura 1.
\newpage
B. Proteína madura: se la obtiene a partir del ADNc descrito antes después de la digestión con BstN I (en posición 173). El fragmento obtenido y el ligador que tiene por secuencia:
5'
\hskip4,5cm
3'
ATGACCGACCCAGACCCTCTCC
TACTGGCTGGGTCTGGGAGAGGT
3'
\hskip4,8cm
5'
se ligan. Esto da lugar a una modificación de la secuencia N-terminal de la proteína madura que pasa de TDPDPLQ a MTDPDPLQ.
Ese fragmento de ADNc s digiere a continuación con Nhe I (en posición 811) para después ligarlo con el plásmido pUC19 preparado como se describe en el párrafo antes mencionado. El nuevo plásmido constituido de esa manera se denomina pRPA-oxo-02 y su mapa se presenta en la figura 1.
Ejemplo 2 Preparación de los genes quimera a. Preparación de los vectores que comprenden el promotor y el terminador nos
- ejemplo doble CaMV: ese vector se obtiene a partir del plásmido pRPA-BL-410 obtenido de la manera siguiente:
Fusión "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA"
El péptido de tránsito de la PSU del gen de la RuBisCO de maíz proviene de un fragmento EcoRI-SphI de 192 pb; que procede del ADNc correspondiente al gen de la PSU del gen de la RuBisCO de maíz, descrito por Lebrun et al (1987), que posee un sitio NcoI que recubre el codón iniciador de la traducción y un sitio SphI correspondiente al sitio de corte del péptido de tránsito.
Por tratamiento del extremo SphI con la polimerasa del bacteriófago T4 y ligándolo con el extremo NcoI, tratado con la polimerasa de Klenow, del gen AroA de pRPA-BL 104 vuelto a cortar con EcoRI, se obtiene la fusión traduccional entre el péptido de tránsito de maíz y el gen de la EPSPS bacteriana.
Fusión péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/secuencia de 22 aminoácidos de la parte madura de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA
De manera similar se liga un fragmento EcoRI-HindII de 228 bp del ADNc de la PSU del gen de la RuBisCO de maíz con el extremo NcoI tratado con la polimerasa de Klenow del gen AroA de pRPA-BL 104 y vuelto a cortar con EcoRI. Se obtiene una fusión traduccional entre el péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz, los 22 aminoácidos de la parte madura de la PSU de la RuBisCO de maíz y el gen de la EPSPS bacteriana.
Péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol
El fragmento procede del ADNc aislado por Waksman y Freyssinet (1987). Se creó un sitio SphI según el método de Zoller y Smith (1984) en el sitio de corte del péptido de tránsito. El péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol obtenido de esa manera es un fragmento EcoRI-SphI de 171 pb.
Fusión péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la parte madura de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA
La construcción que contiene la fusión péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/secuencia de 22 aminoácidos de la PSU de la RuBisCO de maíz de la parte madura del gen de maíz se cortó con EcoRI-SphI de 171 pb correspondiente al péptido de tránsito de la PSU del gen de la RuBisCO de girasol. Una construcción resultante presenta una sustitución de los fragmentos EcoRI-SphI y es una fusión traduccional "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la parte madura de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA".
El fragmento EcoRI-SalI se ligó con el fragmento SalI-SstI que contiene la secuencia nos 3' y el borde derecho del ADN-T. El fragmento EcoRI-SstI resultante que comprende "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la parte madura de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA/nos 3'/borde derecho del ADN-T" es sustituido en el fragmento EcoRI-SstI que contiene el borde derecho del ADN-T del plásmido 150 A alfa 2 que contiene el promotor doble CaMV. La fusión transcripcional ``doble CaMV/péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la parte madura de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA/nos 3' en el vector 150 A alfa 2 se denominó pRPA-BL 294.
Fusión "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la PSU de la RuBisCO de maíz/péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA"
La construcción antes mencionada se corta con NcoI-HindIII liberando el gen AroA. Después se pone a ligar con un fragmento NcoI-Hind III de 1,5 kpb que contiene la fusión "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA". Una construcción resultante presenta una sustitución de los fragmentos NcoI-HindIII y es una fusión traduccional "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la PSU de la RuBisCO de la parte madura del gen de maíz/péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA".
El fragmento EcoRI-SalI se ligó con el fragmento SalI-SstI que contiene la secuencia nos 3' y el borde derecho del ADN-T. El fragmento EcoRI-SstI resultante que comprende "péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la PSU de la RuBisCO de la parte madura del gen de maíz/péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA/nos 3'/borde derecho del ADN-T" es sustituido en el fragmento EcoRI-SstI que contiene el borde derecho del ADN-T del plásmido 150 A alfa 2 que contiene el promotor doble CaMV. La fusión transcripcional ``doble CaMV/péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de girasol/secuencia de 22 aminoácidos de la PSU de la RuBisCO de la parte madura del gen de maíz/péptido de tránsito de la PSU de la RuBisCO de maíz/gen AroA/nos 3' en el vector 150 A alfa 2 se denominó pRPA-BL 410. Ese plásmido se digiere con EcoRI y SalI para quitar el gen estructural "péptido de tránsito optimizado-zona que codifica la EPSPS madura", pRPA-BL-410 suprimido (ver figura 1).
- ejemplo PSUHa: se obtiene ese vector a partir del plásmido pRPA-BL-207 (descrito en la solicitud de patente europea 0 337 899) que se digiere con Eco RI y Hind III para quitar la zona que codifica la nitrilasa, pRPA-BL-207 suprimido (ver figura 1).
b. Construcción de los genes quimera
pRPA-oxo-03: se obtiene digiriendo pRPA-oxo-01 con Eco RI y Sal I. El fragmento obtenido que codifica la preproteína se inserta a continuación entre los sitios Eco RI y Sal I respectivamente secuencia abajo del doble CaMV y secuencia arriba del terminador nos.
pRPA-oxo-04: se obtiene digiriendo pRPA-oxo-02 con Eco RI y Sal I. El fragmento obtenido que codifica la proteína madura se inserta a continuación entre los sitios Eco RI y Sal I respectivamente secuencia abajo del doble CaMV y secuencia arriba del terminador nos.
pRPA-oxo-05: se obtiene digiriendo pRPA-oxo-01 con Eco RI y Hind III. El fragmento obtenido que codifica la preproteína se inserta a continuación entre los sitios Eco RI y Hind III respectivamente secuencia abajo del PSUHa y secuencia arriba del terminador nos.
pRPA-oxo-06: se obtiene digiriendo pRPA-oxo-02 con Eco RI y Hind III. El fragmento obtenido que codifica la proteína madura se inserta a continuación entre los sitios Eco RI y Hind III respectivamente secuencia abajo del PSUHa y secuencia arriba del terminador nos.
TABLA 1 Representación esquemática de los cuatro genes quimera
Identificación Promotor Zona codificante Terminador
oxalato oxidasa
pRPA-oxo-03 dCaMV preproteína nos
pRPA-oxo-04 dCaMV madura nos
pRPA-oxo-05 PSUHa preproteína nos
pRPA-oxo-06 PSUHa madura nos
Ejemplo 3 Obtención de colzas transgénicas a. Transformación
Cada vector como el descrito antes se introduce en la cepa no oncogénica de Agrobacterium tumefaciens EHA 101 (Hood et al., 1987) portadora del cósmido pTVK 291 (Komari et al., 1986).
La técnica de transformación de la colza variedad Westar sigue esencialmente la descrita por Boulter et al. (1990), utilizando una concentración de bacterias de 2,5 x 10^{9} por ml (DO 600 nm = l).
b. Regeneración
La técnica de regeneración sigue esencialmente la descrita por Boulter et al. (1990). Las plantas son enraizadas en el medio de De Block et al. (1989). A continuación se llevan a floración en invernadero.
Ejemplo 4 Medición de la resistencia de la colza, al Sclerotinia sclerotorium In vitro
- Discos foliares: la resistencia se mide por pesada de la masa de tres discos foliares al cabo de 11 días de crecimiento en un medio de Murashige y Skoog (MS) con hormonas al que se agregó ácido oxálico 1 mM.
En esas condiciones, se observa que para los discos foliares procedentes de colzas modificadas con uno de los genes quimera pRPA-oxo-03, pRPA-oxo-04, pRPA-oxo-05 y pRPA-oxo-06, la masa de los discos foliares aumenta netamente, en tanto que, para los discos foliares procedentes de colzas sin modificar, la masa se estanca o incluso disminuye.
- Elongación de las raíces: la resistencia también se mide in vitro por medición de la elongación de las raíces al cabo de dos días de crecimiento en agua a la que se agregó ácido oxálico 5 mM. Se observa entonces que las raíces de plantas de colza modificadas, con uno de los genes quimera pRPA-oxo-03, pRPA-oxo-04, son capaces de extenderse y alargarse, en tanto que las raíces de colzas sin modificar no presentan, en esas condiciones, ningún crecimiento.
In vivo
La resistencia in vivo se mide en invernadero después de la contaminación de las plantas de colza procedentes de la regeneración, desde la aparición de las primeras flores, sea por depósito de esporas de S. sclerotiorum sobre los pétalos, teniendo entonces lugar la infección de las hojas naturalmente en el momento de la desfloración, sea por depósito directamente sobre las hojas de micelio o de un pétalo impregnado de micelio. Las plantas modificadas por uno de los genes quimera pRPA-oxo-03, pRPA-oxo-04, pRPA-oxo-05, y pRPA-oxo-06 no dejan que se desarrolle el hongo y no presentan ningún síntoma de la podredumbre característica de la esclerotiniosis, en tanto que plantas sin modificar son rápidamente invadidas por la podredumbre característica del desarrollo de Sclerotinia sclerotiorum.
Leyenda de la figura
Procedimiento de obtención de los cuatro genes quimera a partir de los dos genes estructurales, pRPA-oxo-0l y pRPA-oxo-02 H, Hind III; B, BstN; N, Nhe I; E, Eco RI; Sc, Sac I; S, Sal I y X, Xba I.

Claims (15)

1. Procedimiento para mejorar la resistencia de las plantas a las enfermedades fúngicas, en particular a las provocadas por Sclerotinia sp., que se caracteriza por expresar en dichas plantas una proteína que posee una actividad de oxalato oxidasa, dicha expresión se realiza por transformación genética de dichas plantas con un gen quimera que comprende una secuencia que codifica una proteína que posee una actividad de oxalato oxidasa.
2. Procedimiento de acuerdo con la reivindicación 1, que se caracteriza porque dicha proteína se encuentra bajo la forma de una preproteína que comprende un péptido señal y un péptido maduro, dicho péptido maduro que posee una actividad de oxalato oxidasa, proviene del mismo gen de oxalato oxidasa.
3. Procedimiento de acuerdo con la reivindicación 2, que se caracteriza porque la preproteína es una germina.
4. Procedimiento de acuerdo con la reivindicación 3, que se caracteriza porque la germina es una germina de trigo.
5. Célula vegetal genéticamente modificada, que se caracteriza por contener un vector que comprende un gen quimera que comprende una secuencia que codifica una proteína que posee una actividad de oxalato oxidasa.
6. Célula de acuerdo con la reivindicación 5, que se caracteriza porque dicha proteína se encuentra bajo la forma de una preproteína que comprende un péptido señal y un péptido maduro, dicho péptido maduro que posee una actividad de oxalato oxidasa, proviene del mismo gen de oxalato oxidasa.
7. Célula de acuerdo con la reivindicación 6, que se caracteriza porque la preproteína es una germina.
8. Célula de acuerdo con la reivindicación 7, que se caracteriza porque la germina es una germina de trigo.
9. Célula de acuerdo con una de las reivindicaciones 5 a 8, que se caracteriza porque la secuencia que codifica la proteína que posee una actividad de oxalato oxidasa se asocia a un promotor y un elemento terminador.
10. Célula de acuerdo con la reivindicación 9, que se caracteriza porque el promotor se elige entre el promotor de la subunidad pequeña de la ribulosa-1,5-bifosfato carboxilasa de Helianthus anuus (PSUHa), y el promotor duplicado del ARN 35S del virus del mosaico de la coliflor (doble CaMV).
11. Célula de acuerdo con la reivindicación 9, que se caracteriza porque el elemento terminador es la secuencia nos.
12. Célula de acuerdo con una de las reivindicaciones 5 a 11, que se caracteriza porque dicho gen quimera se elige entre los genes quimera siguientes:
a.
gen quimera que comprende el promotor doble CaMV, la secuencia que codifica la germina bajo la forma de preproteína, y el terminador nos.
b.
gen quimera que comprende el promotor doble CaMV, la secuencia que codifica únicamente la germina bajo la forma de péptido maduro, y el terminador nos.
c.
gen quimera que comprende el promotor PSUHa, la secuencia que codifica la germina bajo la forma de preproteína, y el terminador nos.
d.
gen quimera que comprende el promotor PSUHa, la secuencia que codifica únicamente la germina bajo la forma de péptido maduro, y el terminador nos.
13. Planta transformada procedente de una célula de acuerdo con una de las reivindicaciones 5 a 12.
14. Planta de acuerdo con la reivindicación 13, que se caracteriza por ser una dicotiledónea.
15. Planta de acuerdo con la reivindicación 14, que se caracteriza por ser una colza.
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