ES2248942T3 - Complejos con un gran desplazamiento de stokes para marcado fluorescente formado por copulacion de cianina y otros fluorocromos capares de transferir energia de resonancia. - Google Patents
Complejos con un gran desplazamiento de stokes para marcado fluorescente formado por copulacion de cianina y otros fluorocromos capares de transferir energia de resonancia.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION DESCRIBE COMPLEJOS PARA ETIQUETACION FLUORESCENTE DE BAJO PESO MOLECULAR CON GRANDES CAMBIOS DE LONGITUD DE ONDA ENTRE LA ABSORCION DE UN COLORANTE EN EL COMPLEJO Y LA EMISION DE OTRO COLORANTE EN EL COMPLEJO. ESTOS COMPLEJOS PUEDEN SER UTILIZADOS, POR EJEMPLO, PARA EL ANALISIS DE CELULAS POR FLUORESCENCIA MULTIPARAMETRO UTILIZANDO UNA SOLA LONGITUD DE ONDA DE EXCITACION. EL BAJO PESO MOLECULAR DEL COMPLEJO PERMITE MARCAR MATERIALES CON EL COMPLEJO PARA PENETRAR EN LAS ESTRUCTURAS DE LAS CELULAS CON EL FIN DE SER UTILIZADAS COMO SONDAS. LOS COMPLEJOS ETIQUETADORES SON SINTETIZADOS ACOPLANDOLOS DE FORMA COVALENTE A TRAVES DE ENLACES PARA FORMAR COMPLEJOS DONANTESRECEPTORES. LA TRANSFERENCIA DE ENERGIA POR RESONANCIA DE UN DONANTE EXCITADO A UN RECEPTOR FLUORESCENTE PROPORCIONA CAMBIOS DE LONGITUD DE ONDA HASTA DE 300 NM. LOS COMPLEJOS ETIQUETADORES FLUORESCENTES CONTIENEN PREFERIBLEMENTE GRUPOS REACTIVOS PARA EL ETIQUETADO DE GRUPOS FUNCIONALES EN COMPUESTOS OBJETIVO, TALES COMO ACIDOS OXIPOLINUCLEICOS Y DEOXIPOLINUCLEICOS, ANTICUERPOS, ENZIMAS, LIPIDOS, CARBOHIDRATOS, PROTEINAS Y OTROS MATERIALES. LOS COMPLEJOS PUEDEN CONTENER GRUPOS FUNCIONALES QUE PERMITAN LA REACCION COVALENTE CON MATERIALES QUE CONTIENEN GRUPOS REACTIVOS.
Description
Complejos con un gran desplazamiento de stokes
para marcado fluorescente formado por copulación de cianina y otros
fluorocromos capaces de transferir energía de resonancia.
La presente invención se refiere a complejos de
marcado fluorescente, y más particularmente a complejos
fluorescentes de bajo peso molecular con grandes desplazamientos de
Stokes y a su uso en la preparación de derivados fluorescentes de
materiales diana.
El marcado por fluorescencia es una tecnología
importante para detectar moléculas biológicas. Por ejemplo, los
anticuerpos pueden marcarse con colorantes fluorescentes. La unión
de los anticuerpos a sus moléculas diana específicas puede
controlarse en base a una señal de fluorescencia, que puede
detectarse con un espectrómetro, un instrumento de
inmunofluorescencia, un citómetro de flujo, o un microscopio de
fluorescencia. De una manera similar las secuencias de ADN pueden
detectarse con instrumentos de detección por fluorescencia después
de que el ADN se haya hibridado con una secuencia de ADN
complementaria que se ha marcado con un colorante fluorescente.
Se conocen complejos de transferencia de energía
que contienen moléculas dadoras y aceptoras unidas covalentemente.
Por ejemplo, Stryer y Haugland desarrollaron un sistema modelo para
el estudio de la dependencia de la transferencia de energía
singlete-singlete con la distancia (Stryer, L. y
Haugland, R.P., Proc. Nat. Acad. Sci., Vol. 58, pág.
720-26, (1967)). Se ha informado sobre la síntesis y
propiedades de nuevos compuestos de modelo fotoquímico que contienen
un colorante de cianina y una porfirina (Lindsey et al,
Tetrahedron, Vol. 45, Nº 15, pág. 4845-66, (1989)).
Se han descrito complejos que contienen cromóforos dadores y
aceptores fluorescentes como sustratos para el estudio cinético y
ensayo de enzimas hidrolíticas (Carmel et al, FEBS Letters,
Vol. 30, Nº 1, p11, (1973)).
La Solicitud de Patente Europea Nº 609894
describe un complejo de marcado que comprende colorante trinúcleo
representado por la fórmula general (1).
en la que Xa, Xb y Xc son
independientemente anillos heterocíclicos sustituidos o no
sustituidos que contienen de uno a tres heteroátomos y La y Lb son
cadenas de metino conjugadas. Uno de La y Lb puede omitirse de
manera que se une a los heterociclos directamente. Los compuestos de
estructura (1) pueden incluir un grupo reactivo para formar una
unión covalente entre el colorante trinúcleo y una sustancia
biológica. Se informa que los compuestos de dicha fórmula tienen un
gran desplazamiento de Stokes (50-100 nm). Sin
embargo, no se cree que la transferencia de energía de resonancia
esté implicada en el proceso de fluorescencia con esos
colorantes.
La Solicitud de Patente Europea Nº 601889
describe sondas de ácido nucleico que contienen una secuencia de
unión diana, una de cuyas regiones es capaz de formar una o más
horquillas imperfectas, y al menos un marcador dador y al menos un
marcador aceptor unidos covalentemente a la secuencia de nucleótidos
de manera que cuando se forma una o más estructuras de horquilla,
uno de los restos dadores y uno de los restos aceptores están muy
próximos e manera que permiten la transferencia de energía de
resonancia entre ellos. Los marcadores son preferiblemente
fluoróforos. Se describe también un método de utilización de dichas
sondas para detectar un polinucleótido diana de manera que cuando la
sonda interacciona con una secuencia diana hace cambiar la distancia
entre los grupos fluorescentes, dando como resultado un cambio en la
emisión de fluorescencia de la sonda.
Lee et al, Nucleic Acids Research,
20(10), 2471-2483, (1992) se refieren a
terminadores marcados con un colorante fluorescente para usar en la
secuenciación de ADN. Se describe un colorante
ddG-biflúor compuesto por un colorante de
fluoresceína y rodamina unidos covalentemente entre sí y a un
nucleótido purina. La absorción máxima del complejo colorante es de
498 nm y de 554 nm y la emisión máxima es de 580 nm.
La Solicitud de Patente Japonesa Nº 05 60698
describe cebadores de ADN de una sola cadena marcados con dos clases
de cuerpos fluorescentes en una relación de transferencia de energía
para usar en un método de secuenciación.
El análisis de múltiples parámetros usando
marcadores fluorescentes con longitudes de onda de emisión
claramente diferentes aumenta adicionalmente la importancia de esta
tecnología proporcionando una potente herramienta para correlacionar
múltiples parámetros antigénicos o genéticos en células
individuales. En la microscopía de epifluorescencia, se usa una
fuente luminosa continua con diferentes conjuntos de filtro de
excitación y emisión para excitar y detectar cada especie
fluorescente. Este enfoque funciona especialmente bien si las
longitudes de onda de absorción y emisión de cada uno de los
fluoróforos están relativamente próximas entre sí (por ejemplo,
desplazamientos de Stokes de 15-30 nm). La mayoría
de los fluoróforos de bajo peso molecular altamente fluorescentes
tales como cianinas y xantenos tienen picos estrechos de absorción y
emisión y pequeños desplazamientos de Stokes. Se han analizado hasta
5 marcadores fluorescentes diferentes en la misma muestra por
microscopía usando conjuntos de filtro para epifluorescencia como se
describe en DeBiasio et al, Journal of Cell Biology, Vol.
105, pág. 1613-1622,
(1987).
(1987).
Aunque es fácil encontrar un único fluoróforo que
se excite eficazmente a una longitud de onda de láser particular, es
difícil encontrar marcadores fluorescentes adicionales con
desplazamientos de Stokes suficientemente grandes para proporcionar
una emisión bien separada de la del primer fluoróforo. Las
ficobiliproteínas de origen natural son una clase de proteínas de
fotosistema fluorescente multicromóforo que tienen grandes
desplazamientos de longitud de onda; véase Oi, V.T., Glazer, A.N. y
Stryer, L., Journal of Cell Biology, Vol. 93, pág.
981-986, (1982). Estas pueden acoplarse
covalentemente a anticuerpos y se han usado ampliamente en
citometría de flujo para el análisis de subconjuntos de linfocitos
de 2 colores. R-ficoeritrina (R-PE),
una proteína fotosistema que contiene 34 fluoróforos de bilina que
pueden excitarse a 488 nm con el láser de iones de argón ampliamente
disponible, ha sido especialmente útil. Su fluorescencia máxima es a
575 nm. R-PE y fluoresceína pueden excitarse ambos a
488 nm, aunque R-PE puede discriminarse fácilmente
con conjuntos de filtro de interferencia de paso de banda óptica
desde la señal de fluoresceína que aparece a 525 nm. Recientemente,
se ha hecho posible la inmunofluorescencia de 3 colores mediante
citometría de flujo desarrollando un tándem de reactivos de marcado
conjugados que contiene un colorante fluorescente reactivo que se
excita a 488 nm y fluoresce a 613 nm, y se vende en el mercado con
el nombre Duocrhome, véase la Patente de Estados Unidos Nº 4876190.
Con otro tándem fluoróforo la transferencia de energía de
R-PE excitado al colorante de cianina unido conocido
como Cy-5 conduce a fluorescencia a 670 nm (Waggoner
et al. Ann. N.Y. Acad. Sci., Vol. 677, pág.
185-193, (1993)).
Los marcadores basados en ficobiliproteína son
muy fluorescentes y proporcionan excelentes señales en experimentos
de 2 y 3 parámetros para la detección de antígenos en la superficie
celular. Sin embargo estos reactivos no se han utilizado ampliamente
para la medida de antígenos citoplásmicos o para la detección de
marcadores cromosómicos por hibridación de fluorescencia in
situ debido a que su gran tamaño (PM 210.000 Dalton) limita la
penetración en estructuras celulares densas.
No obstante lo anterior, aún faltan compuestos
fluorescentes de bajo peso molecular que pueden usarse como
marcadores para el marcado covalente de moléculas diana y que
proporcionará detección de fluorescencia multicolor usando una sola
longitud de onda de excitación. También hay una necesidad de varios
de dichos marcadores fluorescentes, cada uno de los cuales puede
excitarse óptimamente a una longitud de onda particular de láser
pero que fluoresce a longitudes de onda de emisión
significativamente diferentes. Ahora se ha descubierto una clase de
marcadores fluorescentes de bajo peso molecular que proporcionará
detección de fluorescencia multicolor usando una sola longitud de
onda de excitación.
En consecuencia, la presente invención se refiere
a un complejo marcador fluorescente de bajo peso molecular que
comprende:
a) incubar cada muestra diferente con un marcador
diferente de dicho conjunto de marcadores fluorescentes para
proporcionar muestras marcadas fluorescentemente;
b) mezclar cada una de dichas muestras marcadas
fluorescentemente para formar una mezcla que contiene todas las
muestras;
c) irradiar la mezcla con dicha fuente de
excitación de una sola longitud de onda; y
d) detectar las emisiones de fluorescencia
correspondientes a cada una de las diferentes muestras marcadas
fluorescentemente;
caracterizado porque uno o más marcadores de
dicho conjunto de marcadores fluorescentes es un complejo marcador
fluorescente que comprende:
i) un primer fluorocromo que tiene primeros
espectros de absorción y emisión;
ii) un segundo fluorocromo que tiene segundos
espectros de absorción y emisión, siendo mayor la longitud de onda
de la emisión máxima de dicho segundo fluorocromo que la longitud de
onda de la emisión máxima de dicho primer fluorocromo, y una porción
del espectro de absorción de dicho segundo fluorocromo solapando una
porción del espectro de emisión de dicho primer fluorocromo;
iii) al menos un enlazador para unir
covalentemente dichos primer y segundo fluorocromos para
transfererir la energía de resonancia entre dichos primer y segundo
fluorocromos;
iv) al menos un grupo de unión diana capaz de
formar un enlace covalente con dicho compuesto biológico diana;
donde dicho grupo de unión diana es un grupo
reactivo para reaccionar con un grupo funcional de los compuestos
diana; y donde el peso molecular combinado de dichos primer y
segundo fluorocromos y dicho enlazador es menor de aproximadamente
20.000 Dalton.
Preferiblemente al menos uno de dicho primer o
segundo fluorocromos es un colorante de cianina.
El enlazador puede ser rígido o flexible para
orientar los momentos de transición de los cromóforos dador y
aceptor. Para que ocurra una transferencia de energía óptima, los
momentos de transición del primer y del segundo fluorocromos se
orientan entre sí en una dirección no perpendicular, por ejemplo,
generalmente se sitúan en paralelo o en tándem entre sí. Los
momentos de transición de los fluorocromos unidos de manera flexible
cambiará cuando se flexiona el enlazador, pero como los momentos de
transición del el dador y del aceptor son no perpendicular durante
el tiempo en estado excitado del dador, tendrá lugar la
transferencia de energía. Los complejos preparados y descritos en
este documento muestran una transferencia de energía que varía del
50% al 99% de eficacia. La eficacia de transferencia de energía
depende de diversos factores tales como solapamiento espectral,
separación espacial entre el dador y el aceptor, orientación
relativa de las moléculas dadora y aceptora, rendimiento cuántico
del dador y tiempo en estado excitado del dador. En una realización
preferida, los fluorocromos pueden estar separados por una distancia
que proporciona una transferencia de energía eficaz, preferiblemente
mejor del
75%.
75%.
La mayor proximidad entre los fluoróforos dador y
aceptor potenciaría la transferencia de energía, ya que la eficacia
de transferencia de energía varía como la inversa de la 6ª potencia
de la separación de los centros de los cromóforos de acuerdo con la
ecuación de Forster:
ET \propto
K^{2} \ \Phi_{D} \ J/R^{6} \
\tau_{D}
en la que ET es la constante de
velocidad de transferencia de energía, K^{2} es la orientación
relativa de los momentos de transición del dador y del aceptor,
\Phi_{D} es el rendimiento cuántico de la molécula dadora, R es
la distancia entre los centros de los fluorocromos dador y aceptor,
J es el solapamiento entre el espectro de emisión del fluorocromo
dador y el espectro de absorción del fluorocromo aceptor, y
\tau_{D} es el tiempo en estado excitado de la molécula dadora.
Véase, Forster, T. "Intermolcular Energy Transfer and
Fluorescence", Ann. Physik., Vol. 2, pág. 55, (1948). La
distancia R entre los centros de los fluorocromos dador y aceptor
puede ser preferiblemente de 10 a 80 Angstroms. El enlazador debería
permitir la transferencia de energía de resonancia entre los
fluorocromos. Los fluorocromos no deberían interactuar químicamente
o formar enlaces secundarios entre sí. El enlazador puede ser
preferiblemente de 2 a 20 longitudes de enlace. Por ejemplo, si el
enlazador contiene una cadena alquílica, -(CH_{2})_{n}-,
el número de carbonos "n" puede ser de 1 a aproximadamente 15.
El enlazador puede incluir parte de los constituyentes que se
extienden desde el fluorocromo. En otras palabras, el enlazador se
une al colorante cromóforo aunque no es parte de él. Haciendo
referencia a los enlazadores mostrados en la Tabla 2, algunos se
extienden desde el nitrógeno del anillo en une cianina hasta un
grupo funcional en el anillo de benceno de otra cianina. Algunos
enlazadores se extienden entre los grupos funcionales en los anillos
de benceno de colorantes enlazados. Sin embargo, en estos ejemplos,
ninguno de los enlazadores incluye una red de dobles enlaces que
permita la conjugación del dador y el aceptor. Con un enlazador
relativamente corto y una orientación óptima, puede haber una
transferencia de energía de resonancia eficaz incluso cuando el
solapamiento espectral se hace pequeño. Por lo tanto, es posible
obtener grandes desplazamientos de longitud de onda incluso cuando
solo se usan dos cromóforos en el
complejo.
Los enlazadores adecuados se selecciona entre el
grupo compuesto por cadenas alquílicas que contienen de 1 a 20
átomos de carbono que pueden incluir opcionalmente de 1 a 8 átomos
de oxígeno como uniones poliéter, o de 1 a 8 átomos de nitrógeno
como uniones poliamina, o de 1 a 4 grupos CO-NH como
uniones poliamida, hasta 2 grupos biciclo[2,2,2]octilo
y hasta 10 unidades nucleotídicas.
Los complejos de la presente invención incluyen
un grupo de unión diana capaz de formar un enlace covalente con un
compuesto diana para permitir que el complejo marque a la diana, tal
como un material vehículo o un compuesto biológico. El grupo de
unión diana puede ser un grupo reactivo para reaccionar con un grupo
funcional en el material diana. Como alternativa el complejo puede
contener un grupo funcional y la diana puede contener el
constituyente reactivo.
Adecuadamente, el grupo reactivo se selecciona
entre el grupo compuesto por succinimidil éster, isotiocianatos,
diclorotriazina, isocianatos, haloacetamida, maleimida, haluros de
sulfonilo, haluros de ácido, alquilimido ésteres, arilimido ésteres,
hidrazinas sustituidas, hidroxilaminas sustituidas, carbodiimidas y
fosforamiditas.
Adecuadamente, el grupo funcional se selecciona
entre el grupo compuesto por amino, sulfhidrilo, carboxilo,
hidroxilo, carbonilo, tiofosfato.
Adecuadamente, halo- y haluro se seleccionan
entre cloro, bromo y yodo, o cloruro, bromuro y yoduro.
Los materiales diana adecuados pueden incluir
anticuerpos, antígenos, proteínas, carbohidratos, lípidos,
nucleótidos derivatizados para que contengan un grupo amino,
hidroxilo, sulfhidrilo, carboxilo, o carbonilo, y oxi o
desoxipoliácidos nucleicos derivatizados para que contengan un grupo
amino, hidroxilo, tiofosforilo, sulfhidrilo, carboxilo, o carbonilo,
células, partículas poliméricas, o perlas de vidrio. En la
realización alternativa, la diana puede derivatizarse para que
contenga los grupos reactivos identificados anteriormente para
formar enlaces covalentes con los grupos funcionales el
complejo.
En una segunda realización, los complejos
fluorescentes de la invención pueden contener un grupo polimerizable
adecuado para la formación de un polímero que contiene el complejo.
Los grupos polimerizables adecuados se seleccionan entre acrilato,
metacrilato y acrilamida. La polimerización puede realizarse con un
complejo adecuadamente derivatizado de la presente invención usado
junto con un segundo material de partida monomérico polimerizable,
tal como estireno o viniltolueno, para formar un copolímero que
contiene el complejo fluorescente.
Como alternativa, los complejos fluorescentes de
la invención no necesitan tener un grupo reactivo cuando se usan
para unirse de una manera no covalente a otro material. Por ejemplo,
el complejo puede incorporarse durante la polimerización o la
formación de las partículas o puede absorberse en o sobre las
partículas poliméricas.
El complejo puede incluir también constituyentes
de solubilización en agua unidos al mismo para conferir
características hidrófilas al complejo. Se unen preferiblemente al
sistema de anillo aromático del fluorocromo de cianina. Si el
colorante de cianina no contiene el constituyente de solubilización
en agua, entonces el otro colorante o el resto enlazador puede
contener el grupo solubilizador del agua. Los constituyentes para
solubilizar el agua no deben ser reactivos con el grupo de unión
diana del complejo. Los constituyentes solubilizadores adecuados
pueden seleccionarse entre el grupo compuesto por amida, sulfonato,
sulfato, fosfato, amonio cuaternario, hidroxilo, guanidinio y
fosfonato. Los grupos sulfonato o ácido sulfónico unidos
directamente al anillo aromático del fluorocromo de cianina son
particularmente preferidos. La solubilidad en agua puede ser
necesaria cuando se marcan proteínas y ácidos oxi y desoxinucleicos
derivatizados con grupos amino o grupos sulfhidrilo en soluciones
acuosas. Como alternativa, una forma polar menos hidrófila del
compuesto de transferencia de energía puede unirse de manera no
covalente al ADN por intercalado entre los pares de bases o por
interacción en el surco menor del ADN. Dichos compuestos pueden ser
útiles para cuantificar o localizar el ADN.
Además de la realización de la invención que
incluye un único fluorocromo dador y un único fluorocromo aceptor,
el complejo marcador fluorescente puede incluir fluorocromos
adicionales. Los fluorocromos adicionales deben tener espectros de
absorción o emisión que permitan que ocurra la transferencia de
energía. Por ejemplo, un tercer fluorocromo puede unirse al segundo
fluorocromo. En este ejemplo, la longitud de onda del espectro de
emisión del tercer fluorocromo es mayor que la longitud de onda de
emisión del segundo fluorocromo, y una porción del espectro de
emisión del segundo fluorocromo solapa con una porción del espectro
de absorción del tercer fluorocromo para transferir la energía
absorbida del primer fluorocromo al segundo fluorocromo al tercer
fluorocromo.
En otra realización de la presente invención, el
complejo puede incluir una pluralidad de los primeros fluorocromos,
cada uno unido covalentemente mediante un resto enlazador al segundo
fluorocromo y cada uno capaz, después de excitarse con luz, de
transferir energía al segundo fluorocromo. En una realización
adicional de la presente invención, el complejo puede incluir una
pluralidad de los segundos fluorocromos, cada uno unido
covalentemente mediante un resto enlazador a un primer fluorocromo y
cada uno capaz de aceptar energía desde el primer fluorocromo cuando
el primer fluorocromo es excitado por la luz. La pluralidad de de
primer y segundo fluorocromos puede ser la misma molécula o puede
ser diferente. Por ejemplo, puede haber diversos fluorocromos
dadores siendo cada uno de ellos excitable a diferentes longitudes
de onda para acomodarse a diferentes fuentes luminosas de
excita-
ción.
ción.
En otra realización más de la presente invención,
el complejo puede incluir uno o una pluralidad de los segundos
fluorocromos, cada uno unido covalentemente mediante un resto
enlazador a uno o una pluralidad del primer fluorocromo y cada uno
unido covalentemente mediante un resto enlazador a un tercer
fluorocromo. La transferencia de energía transcurre en paralelo en
estas realizaciones.
El primer fluorocromo preferiblemente tiene un
coeficiente de extinción mayor de 20.000 litros/mol.cm y más
preferiblemente mayor de 50.000 litros/mol.cm. El segundo
fluorocromo tiene un rendimiento cuántico de fluorescencia mayor de
o igual a aproximadamente 0,05. El rendimiento cuántico generalmente
está relacionado con la rigidez o planaridad de una molécula e
indica la propensión de la molécula a fluorescer, es decir, a emitir
energía en forma de luz, en lugar de en forma de calor cuando se
proporciona energía a la molécula.
Los complejos de la presente invención
preferiblemente incluyen al menos un fluorocromo de cianina y
preferiblemente al menos un colorante de polimetino cianina. Las
cianinas son particularmente útiles debido al amplio intervalo de
variaciones estructurales y propiedades espectrales disponibles que
pueden obtenerse variando el número de átomos de carbono en el
puente de metino, y los heteroátomos u otros constituyentes de los
colorantes de cianina. Es posible sintetizar colorantes que tienen
longitudes de onda de excitación particulares para corresponder a
una fuente de excitación particular, tal como un láser, por ejemplo,
un láser de HeNe o un láser de diodo. Por lo tanto, puede hacerse
que los marcadores de transferencia de energía absorban y emitan
eficazmente a la mayoría de longitudes de onda en la región visible
del espectro. Las fuentes de excitación usadas habitualmente excitan
a una línea de láser de 488 nm. Mientras se use esta excitación de
longitud de onda para los propósitos de la descripción de la
invención, los especialistas en la técnica deben entender que pueden
prepararse otros marcadores de transferencia de energía para fuentes
de excitación específicas sin alejarse del alcance de la
invención.
Los ejemplos de colorantes que pueden usarse como
fluorocromos dador y aceptor en los complejos de marcado
fluorescente de la presente invención se muestran en las fórmulas 2
y 3,
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
y en la fórmula
(4),
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
en la que X se selecciona entre
C(CH_{3})_{2}, azufre y oxígeno, R^{1} y R^{2}
se seleccionan independientemente entre el grupo compuesto por
CH_{2}NH_{2}, SO_{3}^{-}, CH_{2}COOH y NCS, P se
selecciona entre SO_{3}^{-}, NH_{2} y COOH, m = 1, 2, o 3 y n
es un entero de
1-5.
Las cianinas adicionales para usar en complejos
de la invención son las monometino cianinas rígidas descritas en la
solicitud en trámite junto con la presente de Waggoner et al,
titulada "Rigidized Monomethine Cyanines", presentada en la
misma fecha que este documento. Los colorantes de monometino rígidos
tienen la siguiente estructura general (5).
\vskip1.000000\baselineskip
opcionalmente sustituida con de uno
a seis grupos R^{2} a
R^{7};
donde T es un grupo de unión tal como:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
es un anillo de seis o siete
miembros;
X e Y se seleccionan entre carbono
bis-sustituido, oxígeno, azufre, selenio, -CH=CH-, y
-N-W donde N es nitrógeno y W se selecciona entre
hidrógeno y un grupo -(CH_{2})_{n}R^{8} donde n es un
entero de 1 a 26 y R^{8} se selecciona entre hidrógeno, amino,
aldehído, acetal, cetal, halo, ciano, arilo, heteroarilo, hidroxilo,
sulfonato, sulfato, carboxilato, amino sustituido, amino
cuaternario, nitro, amida primaria, amida sustituida, y grupos
reactivos con grupos amino, hidroxilo, aldehído, fosforilo, o
sulfhidrilo;
los grupos Z^{1} y Z^{2} representan los
átomos necesarios para completar uno, dos o tres anillos aromáticos
condensados, teniendo cada anillo cinco o seis átomos, seleccionados
entre átomos de carbono y, opcionalmente, no más de dos átomos de
oxígeno, nitrógeno y azufre; y
R^{2} y R^{3} se unen a los átomos de carbono
de T cuando T contiene átomos de carbono.
Los colorantes de monometino cianina rígidos
tienen señales nítidas distinguibles de absorción y emisión, que son
fotoestables. Algunos de los colorantes de monometino cianina
rígidos absorben y emiten luz como máximo a longitudes de onda entre
300 y 500 nm.
Otros fluorocromos de bajo peso molecular además
de los fluorocromos de cianina pueden seleccionarse entre
fluoresceínas, pireno trisulfonatos (que se venden con la marca
comercial "Cascada Azul "), rodaminas, y derivados de los
colorantes de difluoruro de bis-pirrometino boro,
tal como difluoruro de
3,3',5,5'-tetrametil-2,2'-pirrometeno-1,1'-boro,
comercializado con la marca comercial BODIPY de Molecular Probes
Inc. Los análogos de BODIPY se describen en las Patentes de Estados
Unidos Nº 4774339, 5187223, 5248782 y 5274113 (Haugland y Kang), así
como en "Handbook of Fluorescent Probes and Research
Chemicals", publicado por Molecular Probes Inc.
Para obtener desplazamientos de longitud de onda
de excitación-emisión excepcionalmente grandes, es
posible usar etapas secuenciales de transferencia de energía en el
complejo. Por ejemplo, se han unido tres cromóforos para
proporcionar una emisión máxima a la longitud de onda de un
colorante de cianina, la heptametino cianina, CY7, (compuesto 4,
X=C(CH_{3})_{2}, R^{1}, R^{2}=-SO_{3}^{-},
P=COOH, n=5, m=3), por encima de 780 nm con excitación a 488 nm. El
dador inicial fue isotiocianato de fluoresceína y el fluoróforo
intermedio en el complejo fue el colorante de trimetino cianina
denominado CY3 (compuesto 4, X=C(CH_{3})_{2},
R^{1}=R^{2}=CH_{2}NH_{2}, P=SO_{3}^{-}, n=4, m=1). La
fluoresceína se excitó a 488 nm y casi el 100% de su energía en
estado excitado se transfirió a la trimetino cianina, que a su vez
transfirió aproximadamente el 90% de su energía en estado excitado
al CY7 que fluorescía a 782 nm. Se observó la misma eficacia cuando
se usó una pentametino cianina CY5 en lugar de CY7, con
fluorescencia a 667 nm. El desarrollo de dichos complejos
multicromóforo es particularmente útil para sistemas de detección
multicolor.
Aunque varios de los complejos muestran una
transferencia de energía eficaz, el rendimiento cuántico global de
estos complejos marcadores puede mejorarse adicionalmente. Por
ejemplo, el uso de colorantes aceptores con rendimiento cuántico
mayor que el de CY5 mejoraría el brillo global del complejo.
Los complejos de marcado fluorescente de la
invención tienen pesos moleculares bajos y pueden conjugarse
fácilmente con anticuerpos, otras proteínas y sondas de ADN. Peso
molecular bajo como se usa en este documento significa que el peso
molecular combinado de los fluorocromos y el enlazador del complejo
está preferiblemente entre aproximadamente 500 y 10000 Dalton, y
para los dos complejos fluorocromo, preferiblemente en el intervalo
de 1000 a 2500 Dalton. Por lo tanto, estas especies marcadas tendrán
una penetración mucho mayor en los entornos intracelulares de lo que
es posible con los grandes marcadores de ficobiliproteína usados
actualmente. Los complejos fluorescentes de bajo peso molecular de
la presente invención deberían apreciarse no sólo para la citometría
de flujo, si no también para microscopía confocal con láser y para
otros sistemas de detección que requieren detección multicolor con
una única longitud de onda excitación.
La invención incluye un reactivo y un método para
preparar el reactivo incluyendo la incubación del complejo marcador
fluorescente soluble en agua descrito anteriormente con un material
vehículo.
La presente invención proporciona también
procesos para la preparación de los complejos de marcado
fluorescente que comprenden unir covalentemente fluorocromos tales
como fluorocromos de cianina a cianinas u otros fluorocromos, por
métodos bien conocidos por los especialistas en la técnica para
formar complejos dador-aceptor de transferencia de
energía.
Por ejemplo, los complejos de la presente
invención en los que la unión contiene una amida o un éster pueden
prepararse por la reacción de un compuesto de fórmula (6) con un
compuesto de fórmula (7);
\hskip0.2cmR --- (M) --- COA
\hskip4.3cmB --- (N) --- R'
(6)
\hskip6.5cm(7)
en las que R y R' son diferentes
fluorocromos; COA es un grupo carboxilo activado o activable; B es
NH_{2} o OH; y M y N son independientemente restos alifáticos que
contienen alquilo C_{1-12} y que opcionalmente
incluyen una o más funcionalidades de unión fenilo, naftilo, amida,
éster, o éter. Véase por ejemplo, Mujumdar, R.B. et al,
Bioconjugado Chemistry, Vol. 4, pág. 105-111,
(1993); Patente de Estados Unidos Nº 5268486 de Waggoner et
al, cuya descripción se incorpora a este documento como
referencia. Los grupos A adecuados incluyen halo, por ejemplo cloro
o bromo, para-nitrofenoxilo,
N-hidroxisuccinimidilo, o OCOR'' donde R'' es
alquilo
C_{1-6}.
Los complejos de la presente invención en los que
la unión contiene un grupo amino, éter o tioéter, pueden prepararse
por la reacción de un compuesto de fórmula (8) con un compuesto de
fórmula (9);
R --- (M) --- B'
\hskip4.5cmC --- (N) --- R'
(8)
\hskip6.4cm(9)
en las que R, R', M y N son como se
han definido anteriormente; B' es OH, NH_{2}, o SH; y C es un
grupo que puede desplazarse por ejemplo yodo, o
para-toluenosulfonato. La reacción se realiza
adecuadamente en presencia de una
base.
Como alternativa, los complejos de la presente
invención pueden prepararse acoplando juntos en primer lugar dos
precursores colorantes usando un enlazador no conjugado para dar un
intermedio representado por la estructura (10).
\hskip6cmXa --- (L) --- Xb
\hskip7cm(10)
en la que Xa y Xb son
independientemente precursores heterocíclicos sustituidos o no
sustituidos y (L) es un grupo enlazador no conjugado que comprende
alquilo C_{1-12}, incluyendo opcionalmente uno o
más grupos de unión fenilo, naftilo,
biciclo[2,2,2]octilo, éter, amina, éster, o amida, o
combinaciones de los mismos. Los precursores heterocíclicos
adecuados, Xa y Xb se muestran en la Tabla 1, Compuestos I y II. A
modo de ejemplo, la síntesis del intermedio (10) en la que el
enlazador consta de una cadena alquílica unida a los átomos de
nitrógeno de dos unidades de indolnina, puede conseguirse por la
reacción con un \alpha,\omega-dihaloalcano, tal
como un 1,6-dibromohexano, en un proceso con una o
dos etapas de reacción. Adecuadamente, la reacción se realiza a una
temperatura elevada tal como de aproximadamente
100-110ºC, en un disolvente inerte tal como xileno.
Véase por ejemplo, Hamer, F.M., "The Cyanine Colorants and
Compuestos Relacionados", pág. 676, Wiley Interscience
(1964).
El intermedio (10) puede usarse después como
precursor en la formación, por métodos conocidos en la técnica, de
complejos que contienen dos fluoróforos diferentes conectados
mediante el enlazador. Véase por ejemplo, Hamer, F.M., "The
Cyanine Colorants and Compuestos Relacionados", pág.
118-119, Wiley Interscience (1964).
Los siguientes ejemplos sirven para ilustrar la
preparación de los complejos de la presente invención y sus
propiedades espectrales.
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Esquema pasa a página
siguiente)
\vskip1.000000\baselineskip
Se mezclaron cloruro cianúrico (triclorotriazina)
(5 mg), bicarbonato sódico (2 mg), y dimetilformamida purificada
(DMF) (0,25 ml) a 0ºC. A esta solución se le añadieron 5 mg de
colorante de amino-cianina (Mujumdar et al,
Citometry, Vol. 10, pág. 11-19, (1989)),
representado anteriormente por la caja que contiene CY5 y la mezcla
se agitó a 0ºC durante 10 minutos. Se continuó agitando durante una
noche a temperatura ambiente. La cromatografía en capa fina (TLC)
puso de manifiesto una mancha más grande y dos manchas más pequeñas;
se determinó que estas últimas manchas eran impurezas.
La mezcla de reacción se trató por precipitación
con éter. Se obtuvo un polvo azul oscuro. Se añadió DMF (0,3 ml)
para disolver el polvo. A esta solución se le añadió bicarbonato
sódico (2 mg) y 4,7 mg del colorante amino-CY7
representado por la caja que contiene CY7. La mezcla se agitó a
temperatura ambiente durante 24 horas. El producto se precipitó y se
lavó varias veces con éter, proporcionando un polvo oscuro. El
complejo mostró un espectro de absorción con picos para los
fluorocromos individuales a 650 nm (CY5) y 761 nm (CY7), indicando
que no se había generado cromóforo nuevo.
La purificación de los fluorocromos se realizó en
una unidad de HPLC analítica Spectra-Physics modelo
SP8700 equipado con una columna C8-RP. La
purificación podría conseguirse también mediante cromatografía en
columna convencional o ultrarrápida en polvo C18-RP
disponible en el mercado. Se usaron mezclas agua/metanol para la
elución en todos los experimentos. Los colorantes se recuperaron de
las fracciones por evaporación rotatoria a 60-70ºC
sin pérdida apreciable. Para purificación adicional, el fluorocromo,
haciendo pasar una composición de contraiones indeterminada a través
de una columna Dowex-50W (en forma de
hidrógeno).
Se midieron los espectros
ultra-violeta/visible con un espectrofotómetro
Hewlett-Packard HP8452 con una serie de diodos. Los
espectros de RMN con protón se obtuvieron con un espectrómetro IBM
300 FT-RMN usando D_{2}O, CD_{3}OD o
DMSO-d_{6} como disolventes. Las señales de RMN se
describen en \delta usando s para singlete, d para doblete, t para
triplete, c para cuartete y m para multiplete. Las medidas de
fluorescencia se realizaron usando un Sistema SPEX Fluorolog 2. Los
rendimientos cuánticos se determinaron por técnicas conocidas como
se describe en Mujumdar R.B., et al, "Cyanine Colorant
Labelling Reagents Containing Isotiocianate Groups", Citometry,
Vol. 10, pág. 11-19 (1989).
Los leucocitos mononucleares se obtuvieron en
Histopaque, densidad 1,077, separación de voluntarios sanos. La
población de linfocitos se seleccionó por citometría de flujo
basándose en características de dispersión hacia delante y lateral.
Las sub-poblaciones se identificaron usando
anticuerpos monoclonales específicos (CD4, tinción células
T-adyuvantes y CD3, población de células T). La
concentración óptima de anticuerpo marcado con el Complejo 1 se
determinó analizando los resultados de una dilución en serie. La
inmunofluorescencia directa se consiguió incubando la cantidad
recomendada de anticuerpo marcado con 1-2 x 10^{6}
células durante 45 minutos a 4ºC. Las muestras se lavaron después
dos veces con solución salina equilibrada de Hank (HBSS) que
contenía suero bovino fetal al 2% y azida sódica al 0,1%. Después
del lavado final, las células se resuspendieron en 1 ml de HBSS que
contenía paraformaldehído al 1% y se analizaron en una semana. Las
medidas de citrometría de flujo se realizaron con un citómetro de
flujo Becton Dickinson FACS 440 de doble láser equipado con un
sistema de análisis de datos Consort 40. El láser de iones de argón
proporcionó 400 mW de excitación a 488 nm. Las señales de
fluorescencia del Complejo 1 y R-ficoeritrina se
recogieron usando filtros con paso de banda de 670/13,5 nm y 575/26
nm respectivamente.
Las eficacias de transferencia de energía de
resonancia se estimaron a partir de la inactivación de las
intensidades de fluorescencia del dador. Se obtuvieron los espectros
de absorción y fluorescencia del dador (solo) y el complejo marcador
fluorescente para determinar las concentraciones relativas de cada
uno en los experimentos de fluorescencia. La excitación del dador se
usó para obtener los espectros de emisión de ambos compuestos.
Después se calculó la DQE usando:
DQE% = (1 -
F^{ET}A/FA^{ET}) x
100
en la que F es la intensidad de
fluorescencia del dador solo, F^{ET} es la intensidad de
fluorescencia del complejo a la longitud de onda del dador, A es la
absorbancia a la longitud de onda de excitación del dador solo y
A^{ET} es la absorbancia a la longitud de onda de excitación del
complejo marcador
fluorescente.
Las amino cianinas (CY3NH_{2},
CY3(NH_{2})_{2} y CY3NH_{2}SO_{3}) y
carboxialquil cianinas (CY5COOH,
CY3O(SO_{3})_{2},
CY5(SO_{3})_{2} y CY7(SO_{3})_{2}) necesarias como precursores para fluorocromos de transferencia de energía se sintetizaron mediante los métodos descritos anteriormente en Ernst, L.A. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents for Sulphydryl Groups", Citometry, Vol. 10, pág. 3-10, (1989), Hammer, F.M., "The Cyanine Colorants and Related Compounds", (Wiley, pub. Nueva York 1964), Mujumdar, R.B. et al, "Cyanine Colorant Reagents Containing Isotiocianate Groups", Citometry, Vol. 10, pág. 11-19, (1989); Mujumdar, R.B. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents: Sulphoindocyanine succinimidil éster", Bioconjugado Chemistry, Vol. 4, pág. 105-111, (1993); Southwick, P.L. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents: Carboxymethylindocyanine succinimidyl esters", Citometry, Vol. 11, pág. 418-430, (1990). A continuación se describe la síntesis y propiedades de un fluorocromo de amino-cianina, CY3NH_{2}SO_{3} y su conjugación con el succinimidil éster de CY5(SO_{3})_{2} para formar el Complejo 1. Las propiedades espectrales para todos los fluorocromos se muestran en las Tablas 3 y 4. La trimetinocarbocianina no simétrica, CY3NH_{2}SO_{3}, se sintetizó en cuatro etapas. Se remite a la Tabla 1 para las estructuras (I)-(VI).
CY5(SO_{3})_{2} y CY7(SO_{3})_{2}) necesarias como precursores para fluorocromos de transferencia de energía se sintetizaron mediante los métodos descritos anteriormente en Ernst, L.A. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents for Sulphydryl Groups", Citometry, Vol. 10, pág. 3-10, (1989), Hammer, F.M., "The Cyanine Colorants and Related Compounds", (Wiley, pub. Nueva York 1964), Mujumdar, R.B. et al, "Cyanine Colorant Reagents Containing Isotiocianate Groups", Citometry, Vol. 10, pág. 11-19, (1989); Mujumdar, R.B. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents: Sulphoindocyanine succinimidil éster", Bioconjugado Chemistry, Vol. 4, pág. 105-111, (1993); Southwick, P.L. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents: Carboxymethylindocyanine succinimidyl esters", Citometry, Vol. 11, pág. 418-430, (1990). A continuación se describe la síntesis y propiedades de un fluorocromo de amino-cianina, CY3NH_{2}SO_{3} y su conjugación con el succinimidil éster de CY5(SO_{3})_{2} para formar el Complejo 1. Las propiedades espectrales para todos los fluorocromos se muestran en las Tablas 3 y 4. La trimetinocarbocianina no simétrica, CY3NH_{2}SO_{3}, se sintetizó en cuatro etapas. Se remite a la Tabla 1 para las estructuras (I)-(VI).
La
5-ftalimidometil-2,3,3-trimetilindolnina
(II) se sintetizó de acuerdo con el procedimiento de Gale y
Wilshire, "The Amidomethylation and Bromination of Fischer's Base.
The Preparation of Some New Polymethyne Colorants", Aust. J.
Chem., Vol. 30, pág. 689-694, (1977). Se añadió
N-hidroximetilftalimida en polvo (70 g, 0,4 mol) en
pequeñas porciones durante un periodo de 45 minutos a una solución
agitada de
2,3,3-trimetil-(3H)-indolnina (I)
(70 g, 0,44 mol) en ácido sulfúrico concentrado (360 ml) a
temperatura ambiente. La solución se agitó durante 70 horas a
temperatura ambiente antes de verterla sobre agua enfriada con
hielo. La basificación de la solución con hidróxido de amonio
concentrado dio un polvo amarillo que se filtró y se secó (111 g,
rendimiento 80%, p.f. 180-182ºC). ^{1}H RMN
(DMSO-d_{6}), \delta, 7,8-7,95
(m, 4H, ftalimido), 7,4 (s, 1H, 4-H), 7,38 (d, 1H,
J=9,0 Hz, 6-H), 7,2 (d, 1H, J=9,0 Hz,
7-H), 4,7 (s, 2H, -CH_{2}), 2,2 (s, 3H, CH_{3}),
1,2 (s, 6H, -(CH_{3})_{2}).
Este polvo seco (10 g, 0,03 mol) y ácido
6-bromohexanoico (9,1 g, 0,05 mol) se mezclaron en
1,2-diclorobenceno (25 ml) y se calentaron a 125ºC
durante 12 horas en una atmósfera de nitrógeno. La mezcla se enfrió.
El 1,2-diclorobenceno se decantó y la masa sólida se
trituró con isopropanol hasta que se obtuvo un polvo libre (11 g,
rendimiento 80%, p.f. 124-126ºC). ^{1}H RMN
(DMSO-d_{6}), \delta, 7,8-7,95
(m, 4H, ftalimido), 7,4 (s, 1H, 4-H), 7,38 (d, 1H,
J=9,0 Hz, 6-H), 7,2 (d, 1H, J=9,0 Hz,
7-H), 4,7 (s, 2H, -CH_{2}), 4,5 (t, 2H, J=7,5 Hz,
\alpha-CH_{2}), 2,3 (t, 2H, J=7 Hz,
\varepsilon-CH_{2}), 1,99 (m, 2H,
\beta-CH_{2}), 2,3-1,7 (m, 4H,
\gamma-CH_{2} y
\delta-CH_{2} fundido con s de
6H-(CH_{3})_{2}).
El compuesto (IV) se sintetizó de acuerdo con el
procedimiento descrito anteriormente en Mujumdar, R.B. et al,
Bioconjugado Chemistry, (1993), supra. La sal potásica de
2,3,3-trimetilindolninio-5-sulfonato
(11 g, 0,04 mol) y ácido 6-bromohexanoico (9,8 g,
0,05 mol) se mezclaron en 1,2-diclorobenceno, (100
ml) y se calentaron a 110ºC durante 12 horas en una atmósfera de
nitrógeno. La mezcla se enfrió. Se decantó
1,2-diclorobenceno y la masa sólida se trituró con
isopropanol hasta que se obtuvo polvo libre (11 g, rendimiento 80%).
\lambdamax (agua) 275 nm: ^{1}H-RMN (D_{2}O),
\delta, 8,13 (s, 1H, 4-H), 8,03 (dd, 1H, J=9,0,
1,1 Hz, 6-H), 7,2 (d, 1H, J=9,0 Hz,
7-H), 4,51 (t, 2H, J=7,5 Hz,
\alpha-CH_{2}), 2,25 (t, 2H, J=7,5 Hz,
\gamma-CH_{2}), 1,99 (m, 2H,
\beta-CH_{2}), 1,35-1,66 (m, 4H,
\delta-CH_{2},
\gamma-CH_{2}), 1,61 (s, 6H,
-(CH_{3})_{2}). R_{f} = 0,55 (C-18,
agua-metanol, 25%).
Una solución de
1-(\varepsilon-carboxipentil)-2,3,3-trimetilindolninio-5-sulfonato
(IV) (10 g, 0,03 mol) y N,N-dimetilformamida (7,2 g,
0,04 mol) en ácido acético (20 ml) se calentó a reflujo durante 1
hora. El ácido acético se retiró en un evaporador rotatorio y el
producto se lavó con acetato de etilo (3x50 ml) obteniéndose de esta
manera un sólido pardo oscuro. \lambdamax (agua) 415 nm R_{f} =
0,32 (C-18, 25% metanol en agua). El producto bruto
obtenido de esta manera se usó para la siguiente reacción sin
purificación adicional. El sólido (3,8 g) se disolvió en una mezcla
de anhídrido acético (10 ml) y piridina (5 ml). Se añadió
5-ftalimidometil-1-(\varepsilon-carboxipentil)-2,3,3-trimetilindol
(III) (2,5 g, 6 mmol) y la mezcla de reacción se calentó a 110ºC
durante 1 hora. La solución se enfrió y se diluyó con éter dietílico
(500 ml). El producto se separó en forma de un polvo rojo del que se
retiró el fluido sobrenadante por decantación. Se disolvió en un
volumen mínimo de metanol y volvió a precipitarse con
2-propanol. El producto se recogió en un papel de
filtro y se secó hasta un rendimiento de 5,3 g del compuesto (V). Se
purificó por cromatografía ultrarrápida en columna en fase inversa
C-18 usando una mezcla agua metanol como eluyente,
(1,6 g, rendimiento 30%). \lambdamax (agua) 554 nm; e1,3x10^{5}
L/mol.cm. ^{1}H RMN (CD_{3}OD), \delta, 8,5 (t, 1H, J = 14 Hz,
\beta-protón del puente), 7,8-8,0
(m, 6H, 4 protones del grupo ftalimido y 4-H y
6-H del anillo de sulfoindol), 7,55 (s, 2H,
4'-H), 7,6 (d, 1H, J=12 Hz, 6'-H),
7,3 (dos d, 2H, 7-H y 7'-H),
6,1-6,3 (t, 2H,
\alpha,\alpha'-protones del puente), 4,1 (m, 4H,
\alpha,\alpha'-CH_{2}-), 2,9 (t, 2H, J = 7 Hz,
-CH_{2}COOH), 1,4-2,0 (m, 21H, tres -CH_{2}, un
-CH_{3}, y dos -(CH_{3})_{2}, los protones de metilo
del grupo ftalimidometilo se funden en una señal de agua a 4,8.
El compuesto (V) (1 g, 1,1 mmol) se disolvió en
ácido clorhídrico concentrado (5 ml) y se calentó a reflujo durante
12 horas. Después de enfriar, el ácido ftálico cristalino se retiró
por filtración. El filtrado se concentró con un evaporador rotatorio
y después se neutralizó lentamente con hidróxido de amonio
concentrado mientras la temperatura se mantenía por debajo de 30ºC.
Se obtuvo el fluorocromo CY3NH_{2}SO_{3} (VI) puro por
cromatografía en columna en fase inversa usando una mezcla
agua-metanol como eluyente. \lambdamax (metanol)
552 nm. ^{1}H RMN (DMSO-d_{6}), \delta, 8,45
(t, J = 7,2 Hz, 1H, 9-H), 7,3-7,9
(m, 6H, protones aromáticos), 6,55 (dd, 2H, 8 y
8'-H), 4,5 (m, 4H, N-CH_{2}), 4,1
(s, 2H, CH_{2}NH_{2}), 2,15 (t, 2H, CH_{2}COOH),
\alpha,\alpha'-protones del puente), 4,1 (m, 4H,
\alpha,\alpha'-CH_{2}-), 2,9 (t, 2H, J = 7 Hz,
-CH_{2}COOH), 1,25-1,8 (ancho m, 24H, dos
-(CH_{2})_{2} y
6-C-(CH_{3})_{2}). R_{f} = 0,415 (RP
C18 metanol al 60% en agua).
Polvo seco del succinimidil éster
CY5(SO_{3})_{2} (425 mg, 0,26 mmol) preparado por
el método de Mujumdar et al, Bioconjugado Chemistry, Vol. 4,
pág. 105-111, (1993), se añadió en pequeñas
porciones a una solución bien agitada de CY3NH_{2}SO_{3} (200
mg, 0,26 mmol) en 10 ml de tampón
carbonato-bicarbonato (0,1 M, pH 9,4). Se continuó
agitando durante 30 minutos más después de lo cual la reacción se
purificó por cromatografía ultrarrápida en columna en fase inversa
en C-18 en polvo usando agua-metanol
(6,3:3,7) como eluyente. Se recogieron fracciones de 5 ml y se
controlaron por TLC. Las fracciones que contienen ácido
CY5(SO_{3})_{2} y CY3NH_{2}SO_{3} se
desecharon. Las fracciones de color violeta se comprobaron bajo luz
ultravioleta en metanol y las fracciones que contienen el
fluorocromo Complejo 1 (Tabla 2) se combinaron. La evaporación del
disolvente dio el Complejo 1 en forma de un polvo violeta,
(rendimiento 37%). R_{f} = 0,45 (RP 37%
metanol-agua). ^{1}H RMN el espectro registrado en
D_{2}O mostró señales anchas y fue difícil asignarlas. El
fluorocromo se purificó en una columna de intercambio iónico
fuertemente ácida (Dowex 50, forma H^{+}). La espectrometría de
masas FAB de alta resolución mostró iones (M+H)^{+} a
1391,83 (C_{73}H_{91}N_{5}O_{16}S_{3} +H requiere
1391,73).
El complejo 1 (60 mg, 0,04 mmol) se disolvió en
una mezcla de DMF seca (1 ml) y piridina seca (0,05 ml). Se añadió
disuccinimidil carbonato (DSC) (46 mg, 0,18 mmol, 1,5 equiv/grupo
carboxilo) y la mezcla se agitó a 55-60ºC durante 90
minutos en una atmósfera de nitrógeno. Después de diluir la mezcla
con éter dietílico seco (20 ml), el sobrenadante se decantó. El
producto se lavó repetidamente con éter, se filtró y se secó al
vacío. La formación del succinimidil éster activo se confirmó por su
reacción con bencilamina en DMF o su reacción con taurina en un
tampón bicarbonato a pH 9,4. Las manchas de TLC en
C-18 en fase inversa para el conjugado, el
succinimidil éster y el producto carboxilato hidrolizado para
comparación se desarrolló con una mezcla
agua-metanol (1:1). R_{f} = 0,78 (Ácido), 0,3
(aducto de bencilamina).
Una solución madre del fluorocromo succinimidil
éster activo Complejo 1 se preparó en DMF seca (1 mg/100 \mul). En
una muestra, se disolvió un miligramo
(\gamma-globulina de oveja en 0,25 ml de tampón
carbonato/bicarbonato (aproximadamente 6,45 nmol/0,25 ml). En otro
ejemplo, se disolvió estreptavidina (1 mg) en 0,25 ml del tampón
carbonato/bicarbonato. Los volúmenes apropiados de la solución madre
de fluorocromo se añadieron a porciones de 0,25 ml de cada solución
de proteína para producir las proporciones de partida deseadas de
fluorocromo a anticuerpo, y cada mezcla de reacción se agitó a
temperatura ambiente durante 30 minutos. El conjugado proteico se
separó del fluorocromo sin reaccionar en cada muestra por
cromatografía de filtración en gel sobre Sefadex
G-50 (columna 0,7x20 cm), usando PBS, pH 7,4, que
contiene azida al 0,1%. Las proteínas conjugadas con el colorante se
eluyeron como bandas coloreadas bien separadas del fluorocromo sin
reaccionar. En la Figura 4 se muestra el espectro de excitación
normalizado del conjugado Complejo 1-estreptavidina
en PBS. En la Figura 5 se muestra el espectro de absorbancia del
Complejo 1-IgI de oveja en PBS. La Figura 6 muestra
el análisis por citometría de flujo del Complejo
1-estreptavidina usado para detectar el anticuerpo
CD3.
Los complejos dador aceptor adicionales de
transferencia de energía de acuerdo con la presente invención se
prepararon a partir de fluorocromo de cianinas para investigar la
eficacia de la transferencia de energía de dichos compuestos. Las
estructuras de estos análogos se muestran en la Tabla 2.
Las propiedades espectrales de las cianinas
precursoras se dan en la Tabla 3 y las de los complejos se muestran
en la Tabla 4.
\vskip1.000000\baselineskip
"A" indica el fluorocromo
que actúa como aceptor de energía y "D" indica el fluorocromo
que actúa como dador de
energía.
Los complejos de transferencia de energía
mostrados en la Tabla 2 son de la siguiente manera: Complejo 1,
CY3NH_{2}SO_{3} (Dador) + CY5(SO_{3})_{2}
(Aceptor); Complejo 2,
CY3-O(SO_{3})_{2} (Dador) +
CY3NH_{2} (Aceptor); Complejo 3, CY3NH_{2} (Dador) + CY5COOH
(Aceptor); Complejo 4, CY3NH_{2} (Dador) +
CY5(SO_{3})_{2} (Aceptor); Complejo 5,
CY3(NH_{2})_{2} (Dador) +
CY7(SO_{3})_{2} (Aceptor); Complejo 6, 2
CY3NH_{2}SO_{3} (Dador) + CY5(SO_{3})_{2}
(Aceptor).
Propiedades Espectrales de los Colorantes de Cianina Usados como Precursores para los | ||||
Complejos Fluorescentes de Transferencia de Energía de la Invención. | ||||
Colorante | Disolvente | Absorción Máxima (nm) | Emisión Máxima (nm) | Rendimiento Cuántico (M) |
Colorantes de Cianina que contienen Amina | ||||
CY3NH_{2} | Metanol | 552 | 569 | 0,05 |
PBS | 548 | 563 | 0,05 | |
CY3(NH_{2})_{2} | Metanol | 552 | 569 | 0,05 |
PBS | 548 | 653 | 0,05 | |
CY3NH_{2}SO_{3} | Metanol | 556 | 573 | 0,08 |
PBS | 548 | 653 | 0,09 | |
Colorantes de Cianina que contiene Carboxilo | ||||
CY5COOH | Metanol | 658 | 685 | 0,22 |
PBS | 648 | 667 | 0,13 | |
CY5(SO_{3})_{2} | Metanol | 658 | 677 | 0,4 |
PBS | 650 | 667 | 0,27 | |
CY3-O(SO_{3})_{2} | Metanol | 492 | 506 | 0,2 |
PBS | 486 | 500 | 0,09 | |
CY7(SO_{3})_{2} | Metanol | 758 | 789 | ND^{a} |
PBS | 750 | 777 | ND^{a} | |
^{a}ND significa no determinado. PBS significa solución salina tamponada con fosfato. |
La eficacia de transferencia de energía se estimó
calculando la cantidad de inactivación de dador fluorescencia que
ocurre (DQE) cuando el aceptor está unido. Es posible que ocurra
algo de inactivación por rutas distintas a la transferencia de
energía de resonancia cuando el aceptor está unido. Sin embargo, el
dador de cianina preferido para los complejos de marcado
fluorescente de la presente invención son relativamente insensibles
a su entorno molecular. Además, la adición de sustituyentes grandes
a las trimetino cianinas normalmente aumenta, en lugar de disminuir,
su fluorescencia. Por lo tanto, DQE puede ser igual a la eficacia de
transferencia de energía. Las eficacias de transferencia de energía
estimadas basadas en medidas de DQE variaron entre el 50% y el 99% y
los desplazamientos de longitud de
onda entre la absorción máxima del dador y la emisión máxima del aceptor terminal (DI) varió entre 83 nm y 294 nm.
onda entre la absorción máxima del dador y la emisión máxima del aceptor terminal (DI) varió entre 83 nm y 294 nm.
Dos de los Complejos, 1 y 6, son capaces de
absorber luz la longitud de onda del láser de argón, 488 nm. El
Complejo 1 contiene un único dador y un único single aceptor, y
Complejo 6 contiene 2 dadores por cada aceptor. El Complejo 1 tiene
3 grupos carboxilo y el Complejo 6 tiene 4 grupos carboxilo. Estos
se convierten en succinimidil ésteres
activos tras la activación. La Figura 2 muestra los espectros de absorción del Complejo 1 y el Complejo 6 en metanol.
activos tras la activación. La Figura 2 muestra los espectros de absorción del Complejo 1 y el Complejo 6 en metanol.
El Complejo 1 se seleccionó para realizar
estudios adicionales. Como se muestra en las Figuras 3(a) y
3(b), la absorbancia (línea continua) del Complejo 1 varía
ligeramente en solución salina tamponada con fosfato (Figura
3(b)) y metanol (Figura 3(a)) aunque la fluorescencia
permanece sin cambios. La emisión del componente dador a 572 nm es
muy débil comparada con la emisión del aceptor a 675 nm, como sería
de esperar cuando la transferencia de energía es eficaz.
La Figura 5 demuestra que los anticuerpos de
oveja pueden marcarse fácilmente con el Complejo 1 activado. Se
ensayaron los conjugados preparados a partir del Complejo 1
conjugados con IgG de oveja a diversas proporciones
colorante:proteína. La menor proporción colorante:proteína se
representa mediante la línea que tiene su primer pico (a
aproximadamente 270 nm) a 0,8 y la mayor proporción
colorante:proteína se representa mediante la línea que tiene su
primer pico (a aproximadamente 270 nm) a un poco menor de 0,4. No se
observó formación de dímeros que implique a cualquiera de los
fluorocromos dador o aceptor con el aumento de las proporciones
colorante:proteína. Cada Complejo 1 contiene hasta 3 grupos
reactivos. Pueden usarse más grupos reactivos con la condición de
que no ocurra reticulación. Es importante usar condiciones de
marcado que eviten la reticulación de la proteína que inactiven la
fluorescencia. La reticulación por cianinas doblemente activadas se
ha observado previamente en Southwick, P.L. et al, "Cyanine
Colorant Labelling Reagents: Carboxymethylindocyanine succinimidil
esters", Citometry, Vol. 11, pág. 418-430, (1990)
y puede minimizarse limitando la concentración de proteína que se va
a marcar a aproximadamente 1 mg/ml.
Después de la unión a los anticuerpos, el
rendimiento cuántico del complejo se potenció tres veces como se
muestra en la Tabla 4. Se cree que esto ocurre debido a la ruta de
desactivación sin radicación de ambos componentes CY3 y CY5 del
Complejo 1 se reducen debido a su movilidad restringida cuando se
unen a la superficie de la proteína. Se sabe que otros medios para
restringir la movilidad conformacional aumentan la eficacia de
fluorescencia de los fluorocromos de cianina, como se describe en
Mujumdar, R.B. et al, "Cyanine Colorant Labelling Reagents:
Sulphoindocyanine Succinimidil Ester", Bioconjugate Chemistry,
Vol. 4, pág. 105-111, (1993).
De hecho, cuando el Complejo 1 se disolvió en
glicerina, el rendimiento cuántico aumentó varias veces, como se
muestra en la Tabla 4.
El Complejo Activado 1 puede usarse como marcador
fluorescente para experimentos de citometría de flujo de 2 colores
con excitación a 488 nm. El gráfico de dispersión se muestra en la
Figura 6. Se usaron linfocitos T humanos para comparar el marcador
del Complejo 1 con otro reactivo de dos colores,
R-ficoeritrina, que también se excita a 488 nm y
emite a 575 nm. Se usó estreptavidina marcada con el Complejo 1
(fluorocromo/proteína \sim4) para detectar anticuerpo CD3
biotinilado, que marca todas las células T. En la misma muestra de
linfocitos, se usó anti-CD4 marcado con ficoeritrina
(PE) para marcar el subconjunto de Células Adyuvantes de las células
T. Por lo tanto, en la población total de linfocitos hay una
población de células que no contienen CD3 ni CD4 (es decir, CD3 y
CD4 negativo, en la población izquierda inferior del gráfico de
dispersión bidimensional en la Figura 6), un subconjunto de células
CD3-positivas marcadas con el Complejo 1 que no
tienen una señal de ficoeritrina (es decir, CD3 positivo y CD4
negativo, mostrado en la población izquierda superior de la Figura
6), y un tercer subconjunto compuesto por células marcadas con el
Complejo 1 que están teñidas con ficoeritrina (es decir, CD3 y CD4
positivo, mostrado en la población derecha superior de la Figura 6).
Está claro que el Complejo 1 dio la separación inicial de las
poblaciones de células positivas y negativas, y que hubo un derrame
mínimo sobre la fluorescencia del Complejo 1 hacia el canal de
ficoeritrina. El fluorocromo del Complejo 1 dios una señal tres
veces más brillante cuando el fluorocromo se excitó a 514 nm.
Se sintetizaron otros varios complejos con la
estructura general mostrada en la fórmula (10) a continuación. La
Tabla 5 muestra sus propiedades espectrales en solución en
metanol.
Esta serie de espectros demuestra la
transferencia de energía eficaz grandes desplazamientos de Stokes.
Cada espectro de emisión muestra sustancialmente toda la emisión que
viene desde el fluorocromo aceptor final en cada serie con sólo la
emisión mínima desde cada dador de fluoresceína, o la cianina
intermedia.
Propiedades Espectrales de los Complejos de Transferencia de Energía | ||||||
Colorante | Abs. Máx. | Longitud de onda | Em. máx. | Rto. Cuántico | Energía | Desplazamiento de |
(nm) | de Excitación (nm) | (nm) | (M) | Transferida | Longitud de Onda^{e} | |
(%) | (nm) | |||||
Complejo 1ª | 556 (9,5), | 488 | 675 | 0,32 | 91 | 119 |
652 (14,3) | 514 | 676 | 0,37 | 92 | 120 | |
600 | 673 | 0,49 | - | - | ||
Complejo 1^{b} | 536 (16), | 488 | 675 | 0,03 | 89 | 139 |
658 (16) | 514 | 673 | 0,04 | 89 | 137 | |
600 | 668 | 0,21 | - | - | ||
Complejo 1^{c} | 558, 658 | 488 | 674 | 0,11 | 95 | 116 |
(PBS) | 514 | 673 | 0,13 | 95 | 116 | |
600 | 676 | 0,14 | - | - | ||
Complejo 1^{d} | 562, 658 | 488 | 674 | 0,19 | ND | ND |
514 | 674 | 0,32 | ND | ND | ||
600 | 674 | 0,39 | ND | ND | ||
Complejo 2ª | 490 (13), | 466 | 571 | 0,15 | 89 | 81 |
554 (9,5) | ||||||
Complejo 3ª | 545 (9,5), | 514 | 679 | 0,08 | 83 | 133 |
658 (14,3) | ||||||
Complejo 4ª | 550 (9,4), | 514 | 674 | 0,2 | 96 | 124 |
656 (14,2) | ||||||
Complejo 5ª | 445 (9,5), | 520 | 782 | ND | 99 | 226 |
754 (14,4) | ||||||
Complejo 6ª | 556 (9,5), | 488 | 674 | 0,23 | 49 | 118 |
652 (14,4) | 514 | 674 | 0,24 | 50 | 118 | |
600 | 674 | 0,34 | - | - | ||
Complejo 6^{b} | 548 (20,0) | 488 | 566 | 0,05 | 43 | 118 |
652 (15,0) | 514 | 564 | 0,05 | 38 | 116 | |
600 | 668 | 0,23 | - | - | ||
^{a} = en metanol, | ||||||
^{b} = en PBS, | ||||||
^{c} = Complejo 1 sobre estreptavidina, d/p = 4 | ||||||
^{d} = en glicerina, | ||||||
^{e} = diferencia entre Em_{max}(A)-Ab_{max}(D) | ||||||
ND significa no determinado. |
\newpage
El análisis de múltiples parámetros puede
realizarse en múltiples muestras para detectar la presencia de
compuestos biológicos diana. Cada muestra se marca mediante métodos
de marcado bien conocidos con un complejo diferente. Por ejemplo,
una muestra que se cree que contiene un compuesto biológico diana se
incuba con un único fluorocromo, tal como fluoresceína, Cascada
Azul, un colorante de BODIPY, o uno de los colorantes de monometino
rígidos, o CY3O(SO_{3})_{2}, o
CY3(SO_{3})_{2}, todos los cuales emiten en un
intervalo de longitud de onda de 500-575 nm (de
verde a naranja). Una segunda muestra que se cree que contiene el
compuesto biológico diana (el mismo compuesto o un compuesto
diferente que en la muestra 1), se incuba con un complejo de la
invención, por ejemplo fluoresceína-CY3NH_{2}, que
absorberá luz a 488 nm y que emite fluorescencia a 574 nm (naranja).
Las muestras adicionales que se cree que contienen otro compuesto
diana se incuban con otros complejos marcadores de la invención,
tales como fluoresceína-CY3-CY5 y
fluoresceína-CY3-CY7, iluminándose
ambos a 488 nm, pero emitiendo fluorescencia a 672 nm y 782 nm
respectivamente (del rojo al infla-rojo cercano).
Después de un periodo adecuado para permitir que los marcadores
fluorescentes se unan a los compuestos diana, el marcador no unido
se retira por lavado y las muestras marcadas se mezclan. La
detección es posible con una fuente de excitación de una única
longitud de onda, es decir, una línea de láser a 488 nm. Cada
muestra marcada de manera diferente fluorescerá en un color
diferente a la longitud de onda de emisión de su marcador
particular. Los especialistas en la técnica reconocerán que los
complejos de marcado fluorescente de la presente invención pueden
usarse para una variedad de técnicas inmunofluorescentes, incluyendo
inmunoensayos directos e indirectos, y otros métodos de detección
fluorescente. Las condiciones de cada incubación, por ejemplo, pH,
temperatura y tiempo se conocen en la técnica, aunque generalmente
se prefiere temperatura ambiente. Si se hace reaccionar con una
amina, se prefiere pH 9,4. El pH se ajusta dependiendo de las
condiciones de reacción óptimas para los grupos reactivos particular
de acuerdo con técnicas conocidas.
Los complejos de marcado fluorescente pueden
usarse para formar reactivos por unión covalente de los complejos al
material vehículo, tal como partículas poliméricas, células, perlas
de vidrio, anticuerpos, proteínas, enzimas, carbohidratos, lípidos y
nucleótidos o ácido nucleicos (ADN y RNA) y análogos que se han
derivatizado para incluir al menos un primer grupo reactivo capaz de
formar un enlace covalente con el grupo funcional del complejo
marcador (o un grupo funcional capaz de formar un enlace covalente
con un grupo reactivo del complejo, como se ha descrito
anteriormente) y al menos un segundo grupo reactivo (o un grupo
funcional, según el caso), que tiene especificidad para, y que es
capaz de formar un enlace covalente con, un compuesto biológico
diana, tal como anticuerpos, células, fármacos, antígenos,
bacterias, virus y otros microorganismos. Cuando el vehículo tiene
grupos funcionales, puede ser un anticuerpo o ADN adecuado para la
unión al antígeno o a una secuencia complementaria de ADN,
respectivamente. Cuando el material vehículo tiene grupos reactivos
sobre él, el vehículo puede ser una partícula polimérica o un
antígeno adecuado para la unión al ADN o a un anticuerpo, por
ejemplo. Las técnicas para la unión covalente de los fluorocromos a
las moléculas de vehículo tales como las mencionadas se conocen bien
en la técnica y están fácilmente disponibles en la bibliografía. El
material vehículo puede incluir adicionalmente nucleótidos
derivatizados para contener un grupo amino, sulfhidrilo, carboxilo,
carbonilo o hidroxilo, y poliácidos oxi o desoxinucleicos
derivatizados para contener un grupo amino, tiofosforilo,
sulfhidrilo, carboxilo, carbonilo o hidroxilo. Los grupos
funcionales del material vehículo que son complementarios a, es
decir, que forman enlaces covalentes con, los grupos reactivos de
los complejos marcadores de la invención incluyen grupos amino,
sulfhidrilo, carboxilo, carbonilo e hidroxilo.
En la Tabla 6 a continuación se muestra una
comparación de los complejos de transferencia de energía de la
presente invención con los colorantes de
R-ficoeritrina convencionales.
Complejo 2 frente a R-Ficoeritrina | ||
R-Ficoeritrina | Complejo 2 | |
Longitud de onda de | 488 | 488 |
Excitación (nm) | ||
Longitud de onda de | 580 | 578 |
Emisión (nm) | ||
Citómetro de Flujo con | La fluorescencia PE se redujo en gran medida | Las señales fueron estables en |
línea de láser a 488 | a pH 8,5 y se extinguió a pH 9,5 | todo el intervalo de pH |
PM | 240000 | 1667 |
Tinción | No penetra fácilmente en los tejidos | El anticuerpo marcado penetra en los |
intracelulares para alcanzar el | tejidos intracelulares para alcanzar | |
antígeno diana | el antígeno diana | |
Velocidad de Unión | La velocidad de unión al antígeno es baja | Unión rápida |
Los complejos de transferencia de energía de la
presente invención proporcionan un conjunto valioso de marcadores
fluorescentes que son particularmente útiles para análisis de
múltiples parámetros y además, tienen un peso molecular
suficientemente bajo para permitir que los materiales marcados con
los complejos fluorescentes penetren en todas las estructuras. Como
tales, los complejos son bastante adecuados para usar como sondas de
ADN. Los complejos de la invención y los reactivos que pueden
prepararse a partir de ellos ofrecen una amplia variedad de
marcadores fluorescentes con grandes desplazamientos de Stokes. Los
especialistas en la técnica reconocerán que los complejos de la
invención pueden usarse en diversas aplicaciones de fluorescencia en
un amplio intervalo del espectro visible.
La Figura 1 es una ilustración esquemática del
solapamiento de los espectros de absorción y emisión de cuatro
fluorocromos de cianina que pueden usarse en los complejos
marcadores de transferencia de energía de la presente invención.
La Figura 2 ilustra los espectros de absorción de
dos complejos de marcado fluorescente, el Complejo 1 (línea
continua) en metanol, compuesto por un dador de cianina y un aceptor
de cianina, y el Complejo 6 (línea discontinua) en metanol,
compuesto por dos dadores de cianina y un aceptor de cianina.
Las Figuras 3(a) y (b) ilustran los
espectros de absorción (línea continua) y emisión (línea
discontinua) del Complejo 1 de la invención preparado con colorante
de trimetino y pentametino cianinas en (a) metanol y (b) PBS.
La Figura 4 ilustra los espectros de excitación
normalizados del Complejo 1 en PBS (línea continua), metanol
(-...-), glicerol (- - -), y el conjugado Complejo
1-estreptavidina en PBS
(- - - - - - -).
La Figura 5 ilustra los espectros de absorbancia
en PBS de conjugados de IgG de oveja-Complejo 1 a
diversas proporciones molécula de colorante:proteína
(1-4:1) lo que demuestra que no hay formación de
dímero evidente que implique al dador o al aceptor al aumentar la
proporción de colorante:proteína.
La Figura 6 ilustra el análisis de citometría de
flujo de dos colores de linfocitos humanos marcados con
anti-CD4-PE y
anti-CD3-estreptavidina-Complejo
1 para marcar el subconjunto de células adyuvantes de las células T
y el subconjunto de células T totales, respectivamente, mostrando un
subconjunto de células marcadas con el Complejo 1 sin la señal PE y
un segundo subconjunto de células marcadas con el Complejo 1 que
está teñido con PE.
Claims (10)
1. Un método multiparámetro para detectar los
compuestos biológicos diana presentes en múltiples muestras usando
un conjunto de diferentes marcadores fluorescentes incluyendo al
menos dos marcadores, siendo capaz cada uno de dichos marcadores de
ser excitado por una fuente de excitación de una única longitud de
onda y emitiendo fluorescencia cada uno de ellos a una longitud de
onda diferente, comprendiendo dicho método:
a) incubar cada muestra diferente con un marcador
diferente de dicho conjunto de marcadores fluorescentes para
proporcionar muestras marcadas fluorescentemente;
b) mezclar cada una de dichas muestras marcadas
fluorescentemente para formar una mezcla que contiene todas las
muestras;
c) irradiar la mezcla con dicha fuente de
excitación de una sola longitud de onda; y
d) detectar las emisiones de fluorescencia
correspondientes a cada una de las diferentes muestras marcadas
fluorescentemente;
caracterizado porque uno o
más marcadores de dicho conjunto de marcadores fluorescentes es un
complejo marcador fluorescente que
comprende:
i) un primer fluorocromo que tiene primeros
espectros de absorción y emisión;
ii) un segundo fluorocromo que tiene segundos
espectros de absorción y emisión, siendo mayor la longitud de onda
de la emisión máxima de dicho segundo fluorocromo que la longitud de
onda de la emisión máxima de dicho primer fluorocromo, y una porción
del espectro de absorción de dicho segundo fluorocromo solapando una
porción del espectro de emisión de dicho primer fluorocromo;
iii) al menos un enlazador para unir
covalentemente dichos primer y segundo fluorocromos para
transfererir la energía de resonancia entre dichos primer y segundo
fluorocromos;
iv) al menos un grupo de unión diana capaz de
formar un enlace covalente con dicho compuesto biológico diana;
donde dicho grupo de unión diana es un grupo
reactivo para reaccionar con un grupo funcional de los compuestos
diana; y
donde el peso molecular combinado de dichos
primer y segundo fluorocromos y dicho enlazador es menor de
aproximadamente 20.000 Dalton.
2. El método de acuerdo con la reivindicación 1
en el que dicho conjunto de marcadores fluorescentes comprende un
único fluorocromo seleccionado entre fluoresceína, Cascada Azul, un
colorante BODIPY y un colorante de cianina.
3. El método de acuerdo con la reivindicación 1 y
la reivindicación 2 en el que dicho primer y segundo fluorocromos en
dicho uno o más complejos marcadores fluorescentes se seleccionan
entre fluoresceína, trisulfonatos de pireno, rodaminas, colorantes
de cianina y derivados de colorantes de difluoruro de
bis-pirrometino boro.
4. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3 en el que al menos uno de dichos primero o
segundo fluorocromo en dicho uno o más complejos marcadores
fluorescentes es un colorante de cianina.
5. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4 en el que dichos complejos marcadores
fluorescentes comprenden adicionalmente constituyentes
solubilizadores del agua unidos a los mismos, no siendo reactivos
dichos constituyentes solubilizadores del agua con dicho grupo de
unión diana, donde dichos constituyentes solubilizadores del agua se
seleccionan entre el grupo compuesto por amida, sulfonato, sulfato,
fosfato, amonio cuaternario, hidroxilo, guanidino y fosfonato.
6. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 5 en el que dicho grupo reactivo se selecciona
entre el grupo compuesto por succinimidil éster, isotiocianato,
isocianato, haloacetamida, diclorotriazina, maleimida, haluro de
sulfonilo, alquilimidoéster, arilimidoéster, hidrazina sustituida,
hidroxilamina sustituida, carbodiimida, haluro de acilo, anhídrido,
fosforamidita, acrilato y acrilamida.
7. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o
la reivindicación 2 en el que dicho complejo marcador fluorescente
se selecciona entre: Complejo 1, CY3NH_{2}SO_{3} (Dador) +
CY5(SO_{3})_{2} (Aceptor); Complejo 2,
CY3-O(SO_{3})_{2} (Dador) +
CY3NH_{2} (Aceptor); Complejo 3, CY3NH_{2} (Dador) + CY5COOH
(Aceptor); Complejo 4, CY3NH_{2} (Dador) +
CY5(SO_{3})_{2} (Aceptor); Complejo 5,
CY3(NH_{2})_{2} (Dador) +
CY7(SO_{3})_{2} (Aceptor); Complejo 6, 2
CY3NH_{2}SO_{3} (Dador) + CY5(SO_{3})_{2}
(Aceptor).
\newpage
8. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o
la reivindicación 2 en el que uno o más de dichos complejos
marcadores fluorescentes comprenden adicionalmente un tercer
fluorocromo que tiene un tercer espectro de absorción y emisión
unido covalentemente a dicho segundo fluorocromo; la longitud de
onda de la emisión máxima de dicho tercer fluorocromo es mayor que
la longitud de onda de la emisión máxima de dicho segundo
fluorocromo y una porción del espectro de emisión de dicho segundo
fluorocromo solapa con una porción del espectro de absorción de
dicho tercer fluorocromo de manera que la excitación de dicho primer
fluoróforo produce fluorescencia a partir de dicho tercer
fluorocromo.
9. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8 en el que dicho complejos marcadores se
seleccionan entre fluoresceína-CY3NH_{2},
fluoresceína-CY3-CY5 y
fluoresceína-CY3-CY7.
10. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 9 en el que dichos compuestos biológicos diana
se seleccionan entre el grupo compuesto por anticuerpos, lípidos,
proteínas, carbohidratos, nucleótidos derivatizados para contener un
grupo amino, hidroxilo, sulfhidrilo, carbonil., hidroxilo y
carboxilo, grupos fosfato y tiofosfato y poliácidos oxi y
desoxinucleicos derivatizados para contener un grupo amino,
sulfhidrilo, carbonilo, hidroxilo y carboxilo, fosfato y
tiofosfato.
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