ES2201825T3

ES2201825T3 - Derivados del glicopeptidos y composiciones farmaceuticas que los contienen.

Info

Publication number: ES2201825T3
Application number: ES99965331T
Authority: ES
Inventors: J. Kevin Judice; Paul Ross Fatheree; Bernice M. T. Lam; Michael Leadbetter; Martin Sheringham Linsell; Yongqi Mu; Sean Gary Trapp; Guang Yang; Yan Zhu
Original assignee: Theravance Inc
Current assignee: Innoviva Inc
Priority date: 1998-12-23
Filing date: 1999-12-22
Publication date: 2004-03-16
Anticipated expiration: 2019-12-22
Also published as: US7723470B2; US20050239690A1; US8030445B2; AU768204B2; HK1040721B; NZ508594A; HUP0400887A2; PL348451A1; ATE242783T1; US20040204346A1; HK1040721A1; US6949681B2; IL140093A; US6392012B1; PL198311B1; CZ301184B6; DK1140993T3; US20090215982A1; AU3127300A; CN1249081C

Abstract

La presente invención proporciona nuevos derivados de los antibióticos glicopéptidos que tienen mejores propiedades comparados con los glicopéptidos no sustituidos, que incluyen mayor actividad, selectividad y menor toxicidad en mamíferos. Por ejemplo, ciertos derivados de la vancomicina de la presente invención demuestran una actividad bacteriana ampliamente mejorada comparada con la de las vancomicinas en sí. Dichos derivados de la vancomicina también son altamente eficaces frente a cepas de enterococos resistentes a la vancomicina mientras que exhiben menor toxicidad en mamíferos. La invención proporciona un compuesto con la fórmula I:

Description

Derivados del glicopéptido y composiciones farmacéuticas que los contienen.

Antecedentes de la invención Campo de la invención

La invención se refiere a nuevos derivados de antibióticos de glicopéptidos. La invención también se refiere a composiciones farmacéuticas que contienen dichos derivados de glicopéptidos, a procedimientos para usar dichos derivados de glicopéptidos como agentes antibacterianos y a procedimientos para la preparación de dichos derivados de glicopéptidos.

Antecedentes

Los glicopéptidos son una clase de antibióticos bien conocidos producidos por distintos microorganismos. Estos compuestos péptidos con anillos múltiples complejos son agentes antibacterianos eficaces frente a la mayoría de las bacterias Gram positivas. El uso de glicopéptidos como antibióticos, sin embargo, ha sido eclipsado por las penicilinas semisintéticas, las cefalosporinas y la lincomicina debido a los mayores niveles de toxicidad en mamíferos observados con los glicopéptidos. En los últimos años, sin embargo, han emergido bacterias resistentes a las penicilinas, a las cefalosporinas y similares resultando en, por ejemplo, infecciones por estafilococos multirresistentes y por estafilococos meticilino resistentes (MRS). Glicopéptidos, como la vancomicina, son típicamente eficaces frente a dichos microorganismos y la vancomicina se ha convertido en el medicamento de último recurso para MRS y para otras infecciones. Se cree que los glicopéptidos son eficaces frente a dichos microorganismos resistentes porque tienen un modo de acción diferente al de otros antibióticos. En este sentido, se cree que los glicopéptidos inhiben selectivamente una etapa diferente en la síntesis de la pared bacteriana a la de los antibióticos del tipo penicilina.

Más específicamente, la pared celular de las bacterias consiste en cadenas de polisacáridos lineales entrecruzadas mediante péptidos de cadena corta. Esta disposición de polisacáridos entrecruzados confiere a la pared celular soporte mecánico, previniendo de este modo que reviente la bacteria debido a su elevada presión osmótica interna. Durante la síntesis de la pared celular bacteriana, tiene lugar el entrecruzamiento de los polisacáridos después de que las construcciones pentapéptido disacárido enlazadas con lípidos se incorporen a cadenas de polisacáridos lineales mediante la enzima transglicolasa. La reacción de entrecruzamiento posterior es la última etapa en la síntesis de la pared celular y está catalizada mediante una enzima conocida como péptidoglicano transpeptidasa.

Un procedimiento mediante el cual los agentes antibacterianos ejercen su actividad antibacteriana es mediante la inhibición de la enzima transglicosilasa, interfiriendo de este modo en la penúltima etapa en la síntesis de la pared bacteriana. Aunque sin querer estar limitado por la teoría, se cree que los antibióticos glicopéptidos, como la vancomicina, se unen con alta afinidad y especificidad a secuencias N-terminales (por ejemplo, L-lisil-D-alanil-D-alanina en organismos sensibles a la vancomicina) de los precursores de peptidoglicanos (conocidos como intermedios lípidos II). Mediante la unión y el secuestro de estos precursores, la vancomicina evita su utilización en la biosíntesis de la pared celular. De esta forma, la vancomicina inhibe la transglicosilasa bacteriana, que es la responsable de la adición subunidades de intermedios lípidos II para el crecimiento de las cadenas de peptidoglicanos. Esta etapa de síntesis de la pared celular bacteriana precede a la etapa de entrecruzamiento por transpeptidación la cual se conoce que es inhibida por antibióticos beta-lactama. También se cree que la vancomicina inhibe la transpeptidación que implica el extremo terminal de la D-alanil-D-alanina terminal. Sin embargo, como esta etapa tiene lugar después de la transglicosilación, la inhibición de la transpeptidación no se observa directamente.

En la técnica se conocen varios derivados de la vancomicina o de otros glicopéptidos. Por ejemplo, ver patentes U.S. Nos. 4.639.433; 4.643.987; 4.497.802; 4.698.327; 5.591.714; 5.840.684 y 5.843.889. Otros derivados se describen en EP0802199; EP0801075; EP0667353; WO97/28812; WO97/38702; WO98/52589; WO98/52592; y en J. Amer. Chem. Soc., 1996, 118, 13107-13108; J. Amer. Chem. Soc., 1997, 119, 12041-12047 y J. Amer. Chem. Soc., 1994, 116, 4573-4590. Las descripciones de estos y de otros documentos referidos a lo largo de esta solicitud se incorporan en la presente invención a modo de referencia en su totalidad.

Se describen más compuestos glicopéptidos en EP-A-525499; EP-A-376041; EP-A-182157; EP-A-351597; WO-A-9011300 y WO-A-8806600.

Sin embargo, existe una necesidad de derivados de glicopéptidos que tengan mayor actividad, selectividad y menor toxicidad en mamíferos. Además, ciertos microorganismos están comenzando a desarrollar resistencia a la vancomicina, como los enterococos resistentes a la vancomicina (VRE). Por lo tanto, sería altamente deseable proporcionar nuevos derivados de los glicopéptidos que sean eficaces frente a un amplio espectro de bacterias, incluyendo cepas resistentes como las VRE. Además, sería altamente ventajoso proporcionar derivados de glicopéptidos que tengan mejor actividad antibacteriana y mejor selectividad y menor toxicidad en mamíferos.

\newpage

Resumen de la invención

La presente invención proporciona nuevos derivados de los antibióticos glicopéptidos que tienen mejores propiedades comparados con los glicopéptidos no sustituidos, que incluyen mayor actividad, selectividad y menor toxicidad en mamíferos. Por ejemplo, ciertos derivados de la vancomicina de la presente invención demuestran una actividad bacteriana ampliamente mejorada comparada con la de las vancomicinas en sí. Dichos derivados de la vancomicina también son altamente eficaces frente a cepas de enterococos resistentes a la vancomicina mientras que exhiben menor toxicidad en mamíferos.

La invención proporciona un compuesto con la fórmula I:

1

en la que

R^{1} es un grupo sacárido sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{2} es hidrógeno o un grupo sacárido opcionalmente sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{3} es -OR^{c} ó -NR^{c}R^{c};

R^{4} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, -C(O)R^{d} y un grupo sacárido opcionalmente sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-

\hbox{(Z) _{x} }

;

R^{5} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, halo, -CH(R^{c})-NR^{c}R^{c}, -CH(R^{c})-NR^{c}R^{e} y -CH(R^{c})-NR^{c}-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{6} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, -C(O)R^{d} y un grupo sacárido opcionalmente sustituido con -NR^{c}-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, ó R^{5} y R^{6} pueden estar unidos, junto con los átomos a los que están unidos, para formar un anillo heterocíclico opcionalmente sustituido con -NR^{c}-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{7} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} y -C(O)R^{d};

R^{8} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

R^{9} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

R^{10} se selecciona del grupo constituido por alquilo y alquilo sustituido;

R^{11} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico, o R^{10} y R^{11} están unidos, junto con los átomos de carbono y de nitrógeno a los que están enlazados, para formar un anillo heterocíclico;

R^{12} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido y -C(O)R^{d};

R^{13} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno u –OR^{14};

R^{14} se selecciona a partir de hidrógeno, -C(O)R^{d} y de un grupo sacárido;

cada R^{a} se selecciona de forma independiente del grupo constituido por alquileno, alquileno sustituido, alquenileno, alquenileno sustituido, alquinileno y alquinileno sustituido;

cada R^{b} se selecciona de forma independiente del grupo constituido por alquileno, alquileno sustituido, alquenileno, alquenileno sustituido, alquinileno y alquinileno sustituido;

cada R^{c} se selecciona de forma independiente del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo, grupo heterocíclico y -C(O)R^{d};

cada R^{d} se selecciona de forma independiente del grupo constituido por alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

R^{e} es un grupo sacárido;

X^{1}, X^{2} y X^{3} se seleccionan de forma independiente a partir de hidrógeno o cloro;

cada Y se selecciona de forma independiente del grupo constituido por oxígeno, azufre, -S-S-, -NR^{c}-, -S(O)-,

\hbox{-SO _{2} -}

, -NR^{c}C(O)-, -OSO_{2}-, -OC(O)-, -NR^{c}SO_{2}-, -C(O)NR^{c}-, -C(O)O-, -SO_{2}NR^{c}-, -SO_{2}O-, -P(O)(OR^{c})O-, -P(O)(OR^{c})NR^{c}-, -OP(O)(OR^{c})O-, -OP(O)(OR^{c})NR^{c}-, -OC(O)O-, -NR^{c}C(O)O-, -NR^{c}C(O)NR^{c}-, -OC(O)NR^{c}- y - NR^{c}SO_{2}NR^{c}-;

cada Z se selecciona de forma independiente a partir de hidrógeno, arilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

n es 0, 1 ó 2;

x es 1 ó 2;

y sales farmacéuticamente aceptables, y estereoisómeros de las mismas; siempre que:

(i) cuando Y es -NR^{c}-, R^{c} es alquilo de 1 a 4 átomos, Z es hidrógeno y R^{b} es alquileno, entonces R^{b} contiene al menos 5 átomos de carbono;

(ii) cuando Y es -C(O)NR^{c}-, Z es hidrógeno y R^{b} es alquileno, entonces R^{b} contiene al menos 5 átomos de carbono;

(iii) cuando Y es azufre, Z es hidrógeno y R^{b} es alquileno, entonces R^{b} contiene al menos 7 átomos de carbono; y

(iv) cuando Y es oxígeno, Z es hidrógeno y R^{b} es alquileno, entonces R^{b} contiene al menos 11 átomos de carbono.

R^{1} es un grupo sacárido sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}. Más preferiblemente, R^{1} es un grupo sacárido de fórmula:

2

en la que

R^{15} es -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, donde R^{a}, R^{b}, Y, Z y x son tal y como se definen en la presente invención; y

R^{16} es hidrógeno o metilo.

Preferiblemente, el compuesto glicopéptido está sustituido con entre 1 y 3 sustituyentes de fórmula -R^{a}-Y-R^{b} (Z)_{x}.

Cada R^{a} se selecciona de forma independiente preferiblemente a partir de alquilenos que tienen entre 1 y 10 átomos de carbono, más preferiblemente, entre 1 y 6 átomos de carbono. En una forma de realización preferida, R^{a} es etileno (-CH_{2}CH_{2}-), propileno (-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-) o butileno (-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-). Aún más preferiblemente, R^{a} es etileno o propileno.

Cuando Z es hidrógeno, R^{b} es preferiblemente un alquileno de entre 8 y 12 átomos de carbono. Por lo tanto, en esta forma de realización, R^{b} y Z forman preferiblemente un grupo n-octilo, n-nonilo, n-decilo, n-undecilo o n-dodecilo. Cuando Z es distinto de hidrógeno, R^{b} es preferiblemente un enlace covalente o un alquileno de entre 1 y 10 átomos de carbono. En esta forma de realización, R^{b} es preferiblemente, un enlace covalente, metileno, -(CH_{2})_{6}-, -(CH_{2})_{7}-, -(CH_{2})_{8}-, -(CH_{2})_{9}- o -(CH_{2})_{10}-.

\hbox{-SO _{2} -}

, -NR^{c}C(O)-, -OC(O)-, -NR^{c}SO_{2}-, -C(O)NR^{c}-, -C(O)O- y -SO_{2}NR^{c}-. Más preferiblemente, Y es oxígeno, azufre, -NR^{c}- o -NR^{c}SO_{2}-.

Preferiblemente, cada Z se selecciona de forma independiente del grupo constituido por hidrógeno, arilo, cicloalquilo, heteroarilo y grupo heterocíclico. Más preferiblemente, Z es hidrógeno o arilo. Cuando Z es arilo, los grupos Z preferidos incluyen grupos fenilo, fenilo sustituidos, bifenilo, bifenilo sustituidos y terfenilo. Grupos Z particularmente preferidos son fenilo, 4-isobutilfenilo, 4'-clorobifenil-4-ilo, 4'-trifluorometilbifenil-4-ilo, 4-(naft-2-il)fenilo, 4-(2-feniletinil)fenilo, 4-(3,4-diclorobenziloxi)fenilo y p-terfenilo.

Preferiblemente, x es 1.

Grupos -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} particularmente preferidos de la presente invención se seleccionan del grupo constituido por:

-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{7}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-(CH_{2})_{11}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{10}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{3}-CH=CH-(CH_{2})_{4}CH_{3} (trans);

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{7}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S(O)-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{6}Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-[4-(CH_{3})_{2}CHCH_{2}-]-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-(4-CF_{3}-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S(O)-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S(O)-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-[3,4-di-Cl-PhCH_{2}O-)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-[4-(4-Ph)-Ph]-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-(Ph-C\equivC-)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph; y

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-4-(naft-2-il)-Ph.

Otros grupos -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} preferidos se muestran en las Tablas I-VI que siguen.

Preferiblemente, R^{2} es hidrógeno.

R^{3} es preferiblemente -OH. Grupos R^{3} particularmente preferidos son aquellos mostrados en las Tablas I-IV como R^{22}.

Preferiblemente, R^{4}, R^{6} y R^{7} se seleccionan cada uno de forma independiente a partir de hidrógeno o -C(O)R^{d}. Más preferiblemente, R^{4}, R^{6} y R^{7} son cada uno hidrógeno.

R^{5} es preferiblemente hidrógeno, -CH_{2}-NHR^{c}, -CH_{2}-NR^{c}R^{e} y -CH_{2}-NH-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, donde R^{a}, R^{b}, R^{c}, R^{e}, Y, Z y x son tal y como se definen en la presente invención. Grupos R^{5} particularmente preferidos incluyen hidrógeno, -CH_{2}-N-(N-CH_{3}-D-glucamina); -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH- (CH_{2})_{9}CH_{3}; -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{11}CH_{3}; -CH_{2}-NH- (CH_{2})_{5}-COOH; y -CH_{2}-N-(ácido 2-amino-2-deoxiglucónico). Otros grupos R^{5} preferidos son aquellos mostrados en la Tabla III como R^{23}.

Preferiblemente, R^{8} es -CH_{2}C(O)NH_{2}, -CH_{2}COOH, bencilo, 4-hidroxifenilo o 3-cloro-4-hidroxifenilo. Más preferiblemente, R^{8} es -CH_{2}C(O)NH_{2}.

R^{9} es preferiblemente hidrógeno o alquilo. Más preferiblemente, R^{9} es hidrógeno.

R^{10} es preferiblemente alquilo o alquilo sustituido. Más preferiblemente, R^{10} es la cadena lateral de un aminoácido de origen natural. Aún más preferiblemente, R^{10} es isobutilo.

R^{11} es preferiblemente hidrógeno o alquilo. Más preferiblemente, R^{11} es hidrógeno o metilo.

R^{12} es preferiblemente hidrógeno o -CH_{2}COOH. Otros grupos R^{12} preferidos son aquellos mostrados en la Tabla II como R^{27}.

X^{1} y X^{2} son preferiblemente cloro. X^{3} es preferiblemente hidrógeno.

Preferiblemente, n es 0 ó 1. Más preferiblemente, n es 1.

Todavía en otro aspecto de su composición, la presente invención proporciona un compuesto de fórmula II:

3

en la que

R^{21} es un grupo sacárido sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{22} es -OR^{c} o -NR^{c}R^{c};

R^{23} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, halo, -CH(R^{c})-NR^{c}R^{c}, -CH(R^{c})-R^{e} y -CH(R^{c})-NR^{c}-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{24} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno y alquilos inferiores;

R^{25} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y heterocíclico;

R^{26} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno y alquilos inferiores; o R^{25} y R^{26} están juntos, junto con los átomos de carbono y de nitrógeno a los cuales están unidos, para formar un anillo heterocíclico;

R^{27} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido y -C(O)R^{d};

cada R^{d} se selecciona de forma independiente del grupo constituido por alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y heterocíclico;

R^{e} es un grupo aminosacárido;

\hbox{-SO _{2} -}

, -NR^{c}C(O)-, -OSO_{2}-,-OC(O)-, -NR^{c}SO_{2}-, -C(O)NR^{c}-, -C(O)O-, -SO_{2}NR^{c}-, -SO_{2}O-, -P(O)(OR^{c})O-, -P(O)(OR^{c})NR^{c}-, -OP(O)(OR^{c})O-, -OP(O)(OR^{c})NR^{c}-, -OC(O)O-, -NR^{c}C(O)O-, -NR^{c}C(O)NR^{c}-, -OC(O)NR^{c}- y -NR^{c}SO_{2}NR^{c}-;

cada Z se selecciona de forma independiente a partir de hidrógeno, arilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, heteroarilo y heterocíclico;

n es 0, 1 ó 2;

x es 1 ó 2;

y sales farmacéuticamente aceptables, estereoisómeros de las mismas; siempre que:

(i) cuando Y es -NR^{c}-, R^{c} es alquilo de 1 a 4 átomos de carbono, Z es hidrógeno y R^{b} es alquileno, entonces R^{b} contiene al menos 5 átomos de carbono;

R^{21} es un grupo sacárido de fórmula:

4

en la que

R^{16} es hidrógeno o metilo.

R^{22} es preferiblemente -OH.

Grupos R^{22} particularmente preferidos son aquellos mostrados en las Tablas I-IV.

R^{23} es preferiblemente hidrógeno, -CH_{2}-R^{c}, -CH_{2}-NHR^{c} y -CH_{2}-NH-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, donde R^{a}, R^{b}, R^{c}, R^{e} Y, Z y x son tal y como se definen en la presente invención. Grupos R^{23} particularmente preferidos incluyen hidrógeno, -CH_{2}-N-(N-CH_{3}-D-glucamina); -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}; -CH_{2}-NH- CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{11}CH_{3}; -CH_{2}-NH-(CH_{2})_{5}-COOH; y -CH_{2}-N-(ácido 2-amino-2-deoxiglucónico). Otros grupos R^{23} preferidos se muestran en la Tabla III.

R^{24} es preferiblemente hidrógeno.

R^{25} es preferiblemente alquilo o alquilo sustituido. Más preferiblemente, R^{25} es la cadena lateral de un aminoácido de origen natural. Aún más preferiblemente, R^{25} es isobutilo.

R^{26} es preferiblemente hidrógeno o alquilo. Más preferiblemente, R^{26} es hidrógeno o metilo.

R^{27} es preferiblemente hidrógeno o -CH_{2}COOH. Otros grupos R^{27} preferidos son aquellos mostrados en la Tabla II.

De forma adicional, la presente invención proporciona una composición farmacéutica que comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable y una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto de las fórmulas I ó II.

Los compuestos de la presente invención son agentes antibacterianos altamente eficaces. Por lo tanto, la presente invención se puede usar para tratar a un mamífero que tiene una enfermedad causada por bacterias, comprendiendo el procedimiento la administración al mamífero de una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto glicopéptido de la fórmula I ó II.

La presente invención también proporciona procedimientos para la preparación de derivados de los glicopéptidos, procedimientos que se describen abajo más adelante en la presente invención.

En otro de sus aspectos, la presente invención se dirige al uso de un derivado de los glicopéptidos de fórmula I o de fórmula II en la fabricación de una formulación o de un medicamento para un tratamiento medicinal. Preferiblemente, la formulación o el medicamento se usan como un agente antibacteriano.

Formulaciones preferidas de la presente invención son aquellas expuestas en las tablas siguientes como fórmulas III, IV y sales farmacéuticamente aceptables de las mismas:

TABLA I

5

6

7

8

9

10

11

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24

25

26

TABLA II

27

28

29

TABLA III

30

31

32

33

34

35

36

TABLA IV

37

38

39

40

41

Descripción detallada de la invención

La invención se refiere a nuevos derivados de antibióticos de glicopéptidos y a composiciones farmacéuticas y a procedimientos que emplean dichos derivadosde glicopéptidos. Cuando se describen los compuestos, las composiciones y los procedimientos de la invención, los términos que se citan a continuación tienen los siguientes significados, salvo que se indique lo contrario.

Definiciones

El término "alquilo" se refiere a una cadena monoradical ramificada o no ramificada de hidrocarburo saturado que tiene preferiblemente entre 1 y 40 átomos de carbono, más preferiblemente entre 1 y 10 átomos de carbono e incluso más preferiblemente entre 1 y 6 átomos de carbono. Este término se ejemplifica mediante grupos tales como metilo, etilo, n-propilo, iso-propilo, n-butilo, iso-butilo, n-hexilo, n-decilo, tetradecilo y similares.

El término "alquilo sustituido" se refiere a un grupo alquilo como se ha definido antes, que tiene entre 1 y 8 sustituyentes, preferiblemente entre 1 y 5 sustituyentes y más preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados de entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, cetona, tiocetona, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "alquileno" se refiere a un diradical de una cadena de hidrocarburos saturada ramificada o no ramificada, que tiene preferiblemente entre 1 y 40 átomos de carbono, preferiblemente 1-10 átomos de carbono, más preferiblemente 1-6 átomos de carbono. Este término se ejemplifica mediante grupos como metileno (-CH_{2}-), etileno (-CH_{2}CH_{2}-), los isómeros del propileno (por ejemplo, -CH_{2}CH_{2}CH_{2}- y -CH(CH_{3})CH_{2}-) y similares.

El término "alquileno sustituido" se refiere a un grupo alquileno, como se ha definido antes, que tiene entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo. Ejemplos de alquilenos sustituidos son clorometileno (-CH(Cl)-), aminoetileno (-CH(NH_{2})CH_{2}-), isómeros de 2-carboxipropileno (-CH_{2}CH(CO_{2}H)CH_{2}-), etoxietilo (-CH_{2}CH_{2}O-CH_{2}CH_{2}-) y similares.

El término "aralquilo" se refiere a los grupos -alquileno-arilo y alquileno arilo sustituidos donde el alquileno, el alquileno sustituido y el arilo son como se han definido antes. Dichos grupos alcarilo se ejemplifican mediante bencilo, fenetilo y similares.

El término "alcoxi" se refiere a los grupos alquilo-O-, alquenilo-O-, cicloalquilo-O-, cicloalquenilo-O- y alquinilo-O-, donde alquilo, alquenilo, cicloalquilo, cicloalquenilo y alquinilo son como se han definido. Grupos alcoxi preferidos son alquil-O- e incluye, a modo de ejemplo, metoxi, etoxi, n-propoxi, iso-propoxi, n-butoxi, tert-butoxi, sec-butoxi, n-pentoxi, n-hexoxi, 1,2-dimetilbutoxi y similares.

El término "alcoxi sustituido" se refiere a los grupos alquil-O-sustituido, alquenil-O- sustituido, cicloalquil-O- sustituido, cicloalquenil-O- sustituido y alquinil-O-sustituido, donde alquilo sustituido, alquenilo sustituido, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo sustituido y alquinilo sustituido son como se han definido.

El término "alquilalcoxi" se refiere a los grupos alquileno-O-alquilo, alquileno-O-alquilo sustituido, alquileno sustituido-O-alquilo y alquileno sustituido-O-alquilo sustituido en los que alquilo, alquilo sustituido, alquileno y alquileno sustituido son como se han definido. Grupos alquilalcoxi preferidos son alquileno-O-alquilo e incluyen, a modo de ejemplo, metilenometoxi (-CH_{2}OCH_{3}), etilenometoxi (-CH_{2}CH_{2}OCH_{3}), n-propileno-iso-propoxi (-CH_{2}CH_{2}CH_{2}OCH(CH_{3})_{2}), metileno-t-butoxi (-CH_{2}-O-C(CH_{3})_{3}) y similares.

El término "alquiltioalcoxi" se refiere al grupo alquileno-S-alquilo, alquileno-S-alquilo sustituido, alquileno sustituido-S-alquilo y alquileno sustituido-S-alquilo sustituido en los que alquilo, alquilo sustituido, alquileno y alquileno sustituido son como se han definido. Grupos alquiltioalcoxi preferidos son alquileno-S-alquilo e incluyen, a modo de ejemplo, metilenotiometoxi (-CH_{2}SCH_{3}), etilenotiometoxi (-CH_{2}CH_{2}SCH_{3}), n-propileno-iso-tiopropoxi (-CH_{2}CH_{2}CH_{2}SCH(CH_{3})_{2}), metileno-t-tiobutoxi (-CH_{2}-S-C(CH_{3})_{3}) y similares.

El término "alquenilo" se refiere a un monoradical de un grupo hidrocarburo no saturado ramificado o no ramificado que tiene preferiblemente entre 2 y 40 átomos de carbono, más preferiblemente 2 a 10 átomos de carbono e incluso más preferiblemente 2 a 6 átomos de carbono y que tiene al menos 1 y preferiblemente entre 1-6 centros de insaturación vinílica. Los grupos alquenilo preferidos incluyen etenil (-CH=CH_{2}), n-propenil (-CH_{2}CH=CH_{2}), iso-propenil (-C(CH_{3})=CH_{2}) y similares.

El término "alquenilo sustituido" se refiere a un grupo alquenilo, como se ha definido, que tiene entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados de entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, cetona, tiocetona, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "alquenileno" se refiere a un diradical de un grupo hidrocarburo no saturado ramificado o no ramificado que tiene preferiblemente entre 2 y 40 átomos de carbono, más preferiblemente 2 a 10 átomos de carbono e incluso más preferiblemente 2 a 6 átomos de carbono y que tiene al menos 1 y preferiblemente entre 1-6 centros de insaturación vinílica. Este término se ejemplifica mediante grupos como etenileno (-CH=CH-), los isómeros de propenileno (por ejemplo, -CH_{2}CH=CH- y -C(CH_{3})=CH-) y similares.

El término "alquenileno sustituido" se refiere a un grupo alquenileno como se ha definido antes que tiene entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados de entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}- arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "alquinilo" se refiere a un monoradical de un hidrocarburo no saturado que tiene preferiblemente entre 2 y 40 átomos de carbono, más preferiblemente 2 a 20 átomos de carbono e incluso más preferiblemente 2 a 6 átomos de carbono y que tiene al menos 1 y preferiblemente entre 1-6 centros de insaturación acetilénica (triple enlace). Grupos alquinilo preferidos incluyen etinilo (-C\equivCH), propargilo (-CH_{2}C\equivCH) y similares.

El término "alquinilo sustituido" se refiere a un grupo alquinilo tal y como se definió anteriormente que tiene entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "alquinileno" se refiere a un diradical de un hidrocarburo no saturado que tiene preferiblemente entre 2 y 40 átomos de carbono, más preferiblemente 2 a 10 átomos de carbono e incluso más preferiblemente 2 a 6 átomos de carbono y que tiene al menos 1 y preferiblemente entre 1-6 centros de insaturación acetilénica (triple enlace). Grupos preferidos alquinileno incluyen etinileno (-C\equivC-), propargileno (-CH_{2}C\equivC-) y similares.

El término "alquinileno sustituido" se refiere a un grupo alquinileno, como se ha definido antes, que tiene entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, cetona, tiocetona, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "acilo" se refiere a los grupos HC(O)-, alquilo-C(O)-, alquilo-C(O)-sustituido, cicloalquilo-C(O)-, cicloalquilo-C(O)- sustituido, cicloalquenilo-C(O)-, cicloalquenilo-C(O)- sustituido, arilo-C(O)-, heteroarilo-C(O)- y grupo heterocíclico-C(O)- donde alquilo, alquilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y heterociclos son como se ha definido.

El término "acilamino" o "aminocarbonil" se refiere al grupo -C(O)NRR en el que cada R es de forma independiente hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo, grupo heterocíclico o donde ambos grupos R están unidos para formar un grupo heterocíclico (por ejemplo, morfolino) en el que alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico son como se han definido.

El término "aminoacil" se refiere al grupo -NRC(O)R en el que cada R es de forma independiente hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo o grupo heterocíclico en el que alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico son como se han definido.

El término "aminoaciloxi" o "alcoxicarbonilamino" se refiere al grupo - NRC(O)OR en el que cada R es de forma independiente hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo o grupo heterocíclico en el que alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico son como se han definido.

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El término "aciloxi" se refiere a los grupos alquilo-C(O)O-, alquilo-C(O)O-sustituido, cicloalquilo-C(O)O-, cicloalquilo-C(O)O- sustituido, arilo-C(O)O-, heteroarilo-C(O)O- y grupo heterocíclico-C(O)O- en los que alquilo, alquilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico son como se han definido.

El término "arilo" se refiere a un grupo carbocíclico aromático no saturado de entre 6 y 20 átomos de carbono que tiene un anillo simple (por ejemplo, fenilo) o anillos múltiples condensados (fundidos) (por ejemplo, naftilo o antrilo). Los arilos preferidos incluyen fenilo, naftilo y similares.

A menos que se obligue de otra manera por la definición para el sustituyente arilo, dichos grupos arilo pueden opcionalmente ser sustituidos con entre 1 y 5 sustituyentes, preferiblemente 1 a 3 sustituyentes, seleccionados del grupo constituido por aciloxi, hidroxi, tiol, acilo, alquilo, alcoxi, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, alquilo sustituido, alcoxi sustituido, alquenilo sustituido, alquinilo sustituido, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo sustituido, amino, amino sustituido, aminoacilo, acilamino, alcarilo, arilo, ariloxi, azido, carboxilo, carboxilalquilo, ciano, halo, nitro, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, aminoaciloxi, oxiacilamino, sulfonamida, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, tioariloxi, tioheteroariloxi, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo, -SO_{2}-heteroarilo y trihalometilo. Los sustituyentes arilo preferidos incluyen alquilo, alcoxi, halo, ciano, nitro, trihalometilo y tioalcoxi.

El término "ariloxi" se refiere al grupo arilo-O- en el que el grupo arilo es como se ha definido antes incluyendo opcionalmente grupos arilo sustituidos como se han definido.

El término "arileno" se refiere al diradical derivado del arilo (incluyendo arilos sustituidos) como se han definido y se ejemplifica mediante 1,2-fenileno, 11,3-fenileno, 1,4-fenileno, 1,2-naftileno y similares.

El término "amino" se refiere al grupo -NH_{2}.

El término "amino sustituido" se refiere al grupo -NRR en el que cada R se selecciona de forma independiente del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico con tal de que ambos grupos R no sean hidrógeno.

"Aminoácido" se refiere a cualquiera de los aminoácidos de origen natural, así como a análogos sintéticos y a derivados de los mismos. Los \alpha-aminoácidos comprenden un átomo de carbono al que se une un grupo amino, un grupo carboxilo, un átomo de hidrógeno y un grupo característico denominado como "cadena lateral". Las cadenas laterales de los aminoácidos de origen natural son bien conocidas en la técnica e incluyen, por ejemplo, hidrógeno (por ejemplo, como en la glicina), alquilo (por ejemplo, como en la alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina), alquilo sustituido (por ejemplo, como en la treonina, serina, metionina, cisteina, ácido aspártico, asparagina, ácido glutámico, glutamina, arginina y lisina), alcarilo (por ejemplo, como en la fenilalanina y el triptofan), arilalquilo sustituido (por ejemplo, como en la tirosina) y heteroarilalquilo (por ejemplo, como en la histidina).

El término "carboxialquilo" o "alcoxicarbonilo" se refiere a los grupos " -C(O)O-alquilo", "-C(O)O-alquilo sustituido", "-C(O)O-cicloalquilo", "-C(O)O-cicloalquilo sustituido", "-C(O)O-alquenilo", "-C(O)O-alquenilo sustituido", "-C(O)O-alquinilo" y "-C(O)O-alquinilo sustituido" donde alquilo, alquilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo y alquinilo alquinilo sustituido son como se han definido.

El término "cicloalquilo" se refiere a grupos alquilo cíclicos de entre 3 y 20 átomos de carbono que tienen un anillo simple cíclico o anillos múltiples condensados. Dichos grupos cicloalquilo incluyen, a modo de ejemplo, estructuras de anillo simple como ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclooctilo y similares, o estructuras de anillos múltiples como adamantanilo y similares.

El término "cicloalquilo sustituido" se refiere a grupos cicloalquilo que tienen entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados de entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, cetona, tiocetona, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "cicloalquenilo" se refiere a grupos alquenilo cíclicos de entre 4 y 20 átomos de carbono que tienen un anillo simple cíclico y al menos un punto de insaturación interna. Ejemplos de grupos cicloalquenilo adecuados incluyen, por ejemplo, 2-ciclobutenilo, 3-ciclopentenilo, 3-ciclooctenilo y similares.

El término "cicloalquenilo sustituido" se refiere a grupos cicloalquenilo que tienen entre 1 y 5 sustituyentes y preferiblemente entre 1 y 3 sustituyentes, seleccionados de entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, cetona, tiocetona, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo.

El término "halo" o "halógeno" se refiere a flúor, cloro, bromo y yodo.

"Haloalquilo" se refiere a un alquilo como se ha definido sustituido por 1-4 grupos halo como se han definido, los cuales pueden ser iguales o diferentes. Grupos haloalquilo representativos incluyen, a modo de ejemplo, trifluorometilo, 3-fluorododecilo, 12,12,12-trifluorododecilo, 2-bromooctilo, 3-bromo-6-cloroheptilo y similares.

El término "heteroarilo" se refiere a un grupo aromático de entre 1 y 15 átomos de carbono y 1 a 4 heteroátomos seleccionados de entre oxígeno, nitrógeno y azufre con al menos un anillo (si hay más de un anillo).

A menos que se obligue de otra manera por la definición para el sustituyente heteroarilo, dichos grupos heteroarilo pueden opcionalmente ser sustituidos con 1 a 5 sustituyentes, preferiblemente 1 a 3 sustituyentes, seleccionados del grupo constituido por aciloxi, hidroxi, tiol, acilo, alquilo, alcoxi, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, alquilo sustituido, alcoxi sustituido, alquenilo sustituido, alquinilo sustituido, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo sustituido, amino, amino sustituido, aminoacilo, acilamino, alcarilo, arilo, ariloxi, azido, carboxilo, carboxilalquilo, ciano, halo, nitro, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, aminoaciloxi, oxiacilamino, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, tioariloxi, tioheteroariloxi, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo, -SO_{2}-heteroarilo y trihalometilo. Los sustituyentes arilo preferidos incluyen alquilo, alcoxi, halo, ciano, nitro, trihalometilo y tioalcoxi. Tales grupos heteroarilo pueden tener un anillo simple (por ejemplo, piridilo o furilo) o anillos múltiples condensados (por ejemplo, indolicinilo o benzotienilo). Los heteroarilos preferidos incluyen piridilo, pirrolilo y furilo.

"Heteroarilalquilo" se refiere a (heteroarilo)alquilo-,donde heteroarilo y alquilo son como se han definido. Ejemplos representativos incluyen 2-piridilmetilo y similares.

El término "heteroariloxi" se refiere al grupo heteroarilo-O-.

El término "heteroarileno" se refiere al grupo diradical derivado del heteroarilo (incluyendo heteroarilos sustituidos), como se ha definido antes, y se ejemplifica mediante los grupos 2,6-piridileno, 2,4-piridileno, 1,2-quinolinileno, 1,8-quinolinileno, 1,4-benzofuranileno, 2,5-piridileno, 2,5-indolenilo y similares.

El término "heterociclo" o "grupo heterocíclico" se refiere a un grupo monoradical saturado o no saturado que tiene un anillo simple o anillos múltiples condensados, entre 1 y 40 átomos de carbono y entre 1 y 10 heteroátomos, preferiblemente 1 a 4 heteroátomos, seleccionados entre nitrógeno, azufre, fósforo y/o oxígeno dentro del anillo.

A menos que se obligue de otra manera por la definición para el sustituyente heterocíclico, tales grupos heterocíclicos pueden ser opcionalmente sustituidos con de 1 a 5 y preferiblemente de 1 a 3 sustituyentes, seleccionados entre el grupo constituido por alcoxi, alcoxi sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, acilo, acilamino, aciloxi, amino, amino sustituido, aminoacilo, aminoaciloxi, oxiaminoacilo, azido, ciano, halógeno, hidroxilo, cetona, tiocetona, carboxilo, carboxilalquilo, tioariloxi, tioheteroariloxi, tioheterociclooxi, tiol, tioalcoxi, tioalcoxi sustituido, arilo, ariloxi, heteroarilo, heteroariloxi, grupo heterocíclico, heterociclooxi, hidroxiamino, alcoxiamino, nitro, -SO-alquilo, -SO-alquilo sustituido, -SO-arilo, -SO-heteroarilo, -SO_{2}-alquilo, -SO_{2}-alquilo sustituido, -SO_{2}-arilo y -SO_{2}-heteroarilo. Tales grupos heterocíclicos pueden tener un anillo simple o anillos múltiples condensados. Los heterocíclicos preferidos incluyen morfolino, piperidinilo y similares.

Ejemplos de heterociclos con nitrógeno y de heteroarilos incluyen, pero no se limitan a ellos, pirrol, imidazol, pirazol, piridina, piracina, pirimidina, piridacina, indolicina, isoindol, indol, indazol, purina, quinolicina, isoquinolina, quinolina, ftalacina, naftilpiridina, quinoxalina, quinazolina, cinolina, pteridina, carbazol, carbolina, fenantridina, acridina, fenantrolina, isotiazol, fenacina, isoxazol, fenoxacina, fenotiacina, imidazolidina, imidazolina, piperidina, piperacina, indolina, morfolino, piperidinilo, tetrahidrofuranilo y similares así como N-alcoxi-nitrógeno que contiene heterociclos.

Otro tipo de heterocíclicos se conoce como "compuestos corona", lo cual se refiere a un tipo específico de compuestos heterocíclicos que tienen una o más unidades repetidas de fórmula [-(CH_{2}-)_{a} A-] donde a es igual o mayor de 2, y A en cada caso por separado puede ser O, N, S ó P. Ejemplos de compuestos corona incluyen, sólo a modo de ejemplo, [-(CH_{2})_{3}-NH-]_{3}, [-((CH_{2})_{2}-O)_{4}-((CH_{2})_{2}-NH)_{2} ] y similares. Típicamente, tales compuestos corona pueden tener de 4 a 10 heteroátomos y de 8 a 40 átomos de carbono.

El término "heterociclooxi" se refiere al grupo heterocíclico-O-.

El término "tioheterociclooxi" se refiere al grupo heterocíclico-S-.

El término "heterocicleno" se refiere al grupo diradical formado a partir de un heterociclo, como se ha definido, y se ejemplifica mediante los grupos 2,6-morfolino, 2,5-morfolino y similares.

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El término "oxiacilamino" o "aminocarboniloxi" se refiere al grupo -OC(O)NRR en el que cada R es de forma independiente hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo o grupo heterocíclico en el que alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico son como se ha definido.

El término "grupo sacárido" se refiere a un monoradical sacárido oxidado, reducido o sustituido unido covalentemente al glicopéptido o a otro compuesto a través de cualquier átomo del radical sacárido, preferiblemente a través del átomo de carbono del grupo aglicona. Ejemplos representativos de sacáridos incluyen, a modo de ilustración, hexoxas como D-glucosa, D-manosa, D-xilosa, D-galactosa, vancosamina, 3-desmetil-vancosamina, 3-epi-vancosamina, 4-epi-vancosamina, acosamina, actinosamina, daunosamina, 3-epi-daunosamina, ristosamina, N-metil-D-glucamina, ácido D-glucurónico, N-acetil-D-glucosamina, N-acetil-D-galactosamina, ácido siálico, ácido idurónico, L-fucosa y similares; pentosas como D-ribosa o D-arabinosa; cetosas como D-ribulosa o D-fructosa; disacáridos como 2-O-(\alpha-L-vancosaminil) -\beta-D-glucopiranosa, 2-O-(3-desmetil-\alpha-L-vancosaminil)-\beta-D-glucopiranosa, sacarosa, lactosa o maltosa; derivados como acetales, aminas, azúcares acilados, sulfatados y fosforilados; oligosacáridos que tienen entre 2 y 10 unidades sacárido. Para los propósitos de la presente definición, estos sacáridos se citan usando una nomenclatura convencional de tres letras y los sacáridos pueden estar o en su forma abierta o preferiblemente en su forma piranosa.

El término "grupo sacárido que contiene grupo amino" se refiere a un grupo sacárido que tiene un sustituyente amino. Los sacáridos que contienen grupo amino representativos incluyen la L-vancosamina, 3-desmetil-vancosamina, 3-epi-vancosamina, 4-epi-vancosamina, acosamina, actinosamina, daunosamina, 3-epi-daunosamina, ristosamina, N-metil-D-glucamina y similares.

El término "grupo cicloalquilo unido a un grupo espiro" se refiere a un grupo cicloalquilo unido a otro anillo por vía de un átomo de carbono común a ambos anillos.

El término "sulfonamida" se refiere al grupo de fórmula -SO_{2}NRR, donde R es de forma independiente hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo o grupo heterocíclico en el que alquilo, alquilo sustituido, arilo, heteroarilo y heterociclo son como se han definido.

El término "tiol" se refiere al grupo -SH.

El término "tioalcoxi" se refiere al grupo -S-alquilo.

El término "tioalcoxi sustituido" se refiere al grupo -S-alquilo sustituido.

El término "tioariloxi" se refiere al grupo arilo-S- en el que el grupo arilo es como se ha definido incluyendo opcionalmente grupos arilo sustituidos también definidos antes.

El término "tioheteroariloxi" se refiere al grupo heteroarilo-S- en el que el grupo heteroarilo es como se ha definido antes incluyendo opcionalmente grupos arilo sustituidos como se definieron también antes.

En cuanto a cualquiera de los grupos anteriores que contienen uno o más sustituyentes, se da por sentado, por supuesto, que dichos grupos no contienen ninguna sustitución o pauta de sustitución que sea estéricamente poco factible y/o sintéticamente inviable. Además, los compuestos de la invención incluyen todos los isómeros estereoquímicos que surgen de la sustitución de estos compuestos.

"Glicopéptido" se refiere a antibióticos heptapéptidos, caracterizados por un núcleo péptido multianillo opcionalmente sustituido con grupos sacárido, como la vancomicina. Se pueden encontrar ejemplos de glicopéptidos incluidos en esta definición en "Glycopeptides Classification, Occurrence, and Discovery", por Raymond C. Rao y Louise W. Crandall, ("Drugs and the Pharmaceutical Sciences" Volumen 63, editada por Ramakrishnan Nagarajan, publicada por Marcal Dekker, Inc.), que se incorpora por la presente a modo de referencia en su totalidad. Glicopéptidos representativos incluyen a aquellos identificados como A477, A35512, A40926, A41030, A42867, A47934, A80407, A82846, A83850, A84575, AB-65, Actaplanina, Actinoidina, Ardacina, Avoparcina, Azureomicina, Balhimicina, Cloroorientieina, Cloropolisporina, Decaplanina, N-demetilvancomicina, Eremomicina, Galacardina, Helvecardina, Izupeptina, Kibdelina, LL-AM374, Manopeptina, MM45289, MM47756, MM47761, MM49721, MM47766, MM55260, MM55266, MM55270, MM56597, MM56598, OA-7653, Orenticina, Parvodicina, Ristocetina, Ristomicina, Sinmonicina, Teicoplanina, UK-68597, UK-69542, UK-72051, Vancomicina y similares. El término "glicopéptido" tal y como se usa en la presente invención también se desea que incluya al tipo general de péptidos mostrados anteriormente en los que el radical azúcar está ausente, es decir las series de agliconas de los glicopéptidos. Por ejemplo, la eliminación del radical disacárido asociado al fenol en la vancomicina mediante hidrólisis moderada proporciona aglicona de vancomicina. También, dentro del alcance de la presente invención se encuentran los glicopéptidos que además han sido asociados con residuos de sacárido adicionales, especialmente aminoglicósidos, en cierto modo similar a la vancosamina.

"Vancomicina" se refiere a un antibiótico de glicopéptido que tiene la fórmula:

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Cuando se describen los derivados de la vancomicina, el término "N^{van}-" indica que un sustituyente está unido covalentemente al grupo amino del resto vacosamina de la vacomicina. De forma similar, el término "N^{leu}-" indica que un sustituyente está unido covalentemente al grupo amino del resto leucina de la vancomicina.

"Opcional" u "opcionalmente" significa que el evento o circunstancia descrito posteriormente puede ocurrir o puede no ocurrir y que la descripción incluye casos donde dicho evento o circunstancia ocurre y casos en los que no ocurre. Por ejemplo, "opcionalmente sustituido" significa que un grupo puede estar o puede no estar sustituido con el sustituyente descrito.

"Sustrato de enzima de transglicosilasa" tal y como se usa en la presente invención denota el objetivo molecular de la enzima transglicosilasa. El sustrato se une a la enzima y eventualmente da como resultado la síntesis de la pared celular bacteriana. La acción de esta enzima se inhibe mediante una zona del ligando que se une al sustrato enzimático. Un ligando como la vancomicina se une a este sustrato y en realidad "secuestra" al sustrato para prevenir su reconocimiento por la enzima y su uso posterior en la construcción de la pared celular bacteriana.

"Potencia" tal y como se usa en la presente invención se refiere a la concentración mínima a la que un compuesto o ligando es capaz de alcanzar un efecto biológico o terapéutico deseable. La potencia de un compuesto o ligando es típicamente proporcional a su afinidad por su centro de unión. En algunos casos, la potencia puede no estar linealmente correlacionada con su afinidad.

Tal y como se usan en la presente invención, los términos "disolvente orgánico inerte" o "disolvente inerte" o "diluyente inerte" quieren decir un disolvente o un diluyente que es esencialmente inerte bajo las condiciones de la reacción en las que se emplea como un disolvente o como un diluyente. Ejemplos representativos de materiales que se pueden usar como disolventes inertes o como diluyentes incluyen, a modo de ilustración, benceno, tolueno, acetonitrilo, tetrahidrofurano ("THF"), dimetilformamida ("DMF"), cloroformo ("CHCl_{3}"), cloruro de metileno (o diclorometano o "CH_{2}Cl_{2}"), dietil éter, acetato de etilo, acetona, metiletilcetona, metanol, etanol, propanol, isopropanol, tert-butanol, dioxano, piridina y similares. A menos que se especifique lo contrario, los disolventes usados en las reacciones de la presente invención son disolventes inertes.

"Sal farmacéuticamente aceptable" significa aquellas sales que retienen la eficacia biológica y las propiedades de los precursores y que no son nocivas biológicamente o de otra manera cuando se administra la dosis. Los compuestos de la presente invención son capaces de formar tanto sales de ácido como de base debido a la presencia de grupos amino y carboxilo, respectivamente.

Se pueden preparar sales de adición de base farmacéuticamente aceptables a partir de bases inorgánicas y orgánicas. Sales derivadas de bases inorgánicas incluyen, pero no se limitan a ellas, a sales de sodio, potasio, litio, amonio, calcio y magnesio. Sales derivadas de bases orgánicas incluyen, pero no se limitan a ellas, a sales de aminas primarias, secundarias y terciarias, aminas sustituidas incluyendo las aminas sustituidas de origen natural y las aminas cíclicas, incluyendo isopropilamina, trimetilamina, dietilamina, trietilamina, tripropilamina, etanolamina, 2-dimetilaminoetanol, trometamina, lisina, arginina, histidina, cafeina, procaina, hidrabamina, cholina, betaina, etilendiamina, glucosamina, N-alquilglucaminas, teobromina, purinas, piperacina, piperidina y N-etilpiperidina. También se debería dar por sentado que serían útiles otros derivados de ácidos carboxílicos en la práctica de la presente invención, por ejemplo amidas de ácido carboxílico, incluyendo carboxamidas, carboxamidas de alquilo inferiores, di(alquilo inferior)carboxamidas y similares.

Se pueden preparar sales de adición de ácido farmacéuticamente aceptables a partir de ácidos inorgánicos y orgánicos. Sales derivadas de ácidos inorgánicos incluyen al ácido clorhídrico, ácido bromídrico, ácido sulfúrico, ácido nítrico, ácido fosfórico y similares. Sales derivadas de ácidos orgánicos incluyen al ácido acético, ácido propiónico, ácido glicólico, ácido pirúvico, ácido oxálico, ácido málico, ácido malónico, ácido succínico, ácido maléico, ácido fumárico, ácido tartárico, ácido cítrico, ácido benzóico, ácido cinnámico, ácido mandélico, ácido metanosulfónico, ácido etanosulfónico, ácido p-toluenosulfónico, ácido salicílico y similares.

Los compuestos de la presente invención típicamente contienen uno o más centros quirales. Por lo tanto, se desea que la presente invención incluya mezclas racémicas, diasterómeros, enantiómeros y mezclas enriquecidas en uno o más estereoisómeros. El alcance de la presente invención tal y como se describe y se reivindica abarca las formas racémicas de los compuestos así como los enantiómeros individuales y las mezclas no racémicas de los mismos.

El término "tratamiento" como se usa en la invención incluye cualquier tratamiento de una afección o enfermedad en un animal, particularmente en un mamífero, más particularmente en un humano e incluye:

(i) prevenir que ocurra la enfermedad o la afección en un sujeto que puede estar predispuesto a la enfermedad pero en el que todavía no se le ha diagnosticado que la tenga;

(ii) inhibir la enfermedad o la afección, por ejemplo deteniendo su desarrollo; aliviar la enfermedad o la afección, por ejemplo causando la regresión de la afección; o aliviar las afecciones causadas por la enfermedad, por ejemplo los síntomas de la enfermedad.

El término "estado de la enfermedad que se alivia mediante tratamiento con un antibacteriano de amplio espectro" como se usa en la invención se piensa que cubre todos los estados de la enfermedad que se reconocen generalmente en la técnica que son tratados de manera provechosa con un antibacteriano de amplio espectro en general, y aquellos estados de la enfermedad que se ha encontrado que son tratados de manera provechosa mediante los antibacterianos específicos de la presente invención. Dichos estados de la enfermedad incluyen, pero no se limitan a ellos, el tratamiento de un mamífero afligido por una bacteria patogénica, en particular estafilococia (sensible y resistente a la meticilina), estreptococia (sensible y resistente a la penicilina), enterococia (sensible y resistente a la vancomicina) y Clostridium difficile.

El término "cantidad terapéuticamente eficaz" se refiere a aquella cantidad que es suficiente para efectuar el tratamiento, tal y como se define en la presente invención, cuando se administra a un mamífero necesitado de dicho tratamiento. La cantidad terapéuticamente eficaz variará dependiendo del sujeto y del estado de la enfermedad que está siendo tratada, de la gravedad de afección y de la forma de administración y se puede determinar de forma rutinaria por un experto normal en la técnica.

El término "grupo protector" o "grupo de bloqueo" se refiere a cualquier grupo que, cuando se une a uno o más grupos hidroxilo, tiol, amino, carboxilo u otros grupos de los compuestos, evita que ocurran reacciones no deseadas a estos grupos y cuyo grupo protector se puede eliminar mediante etapas químicas o enzimáticas convencionales para restablecer el grupo hidroxilo, tio, amino, carboxilo u otro. El grupo particular de bloqueo eliminable que se emplea no es crítico y grupos de bloqueo hidroxilo eliminables preferidos incluyen sustituyentes convencionales como alilo, bencilo, acetilo, cloroacetilo, tiobencilo, bencilidina, fenacilo, t-butil-difenilsilil y cualquier grupo que puede introducirse químicamente sobre una funcionalidad hidroxilo y que se elimina más tarde selectivamente o mediante procedimientos químicos o enzimáticos, en condiciones moderadas compatibles con la naturaleza del producto. Se describen grupos protectores con mayor detalle en T. W. Greene y P. G. M. Wuts, "Protective Groups in Organic Synthesis" 2a. Ed., 1991, John Wiley and Sons, N.Y.

Los grupos de bloqueo amino eliminables preferidos incluyen sustituyentes convencionales como el t-butoxicarbonilo (t-BOC), benciloxicarbonilo (CBZ), fluorenilmetoxicarbonilo (FMOC), aliloxicarbonilo (ALOC) y similares, los cuales se pueden eliminar mediante condiciones convencionales compatibles con la naturaleza del producto.

Los grupos protectores carboxilo preferidos incluyen ésteres como metilo, etilo, propilo, t-butilo, etc., que se pueden eliminar mediante condiciones moderadas compatibles con la naturaleza del producto.

"Efecto biológico" como se usa en la invención incluye, pero no se limita a ellos, mayor afinidad, mayor selectividad, mayor potencia, mayor eficacia, mayor duración de la acción, menor toxicidad y similares.

Procedimientos sintéticos generales

Los compuestos de glicopéptidos de la invención se pueden preparar a partir de materiales de partida fácilmente disponibles usando los siguientes métodos y procedimientos generales. Se comprenderá que donde se dan las condiciones del procedimiento típicas o preferidas (es decir, temperaturas de reacción, tiempos, relaciones molares de reactantes, disolventes, presiones, etc.), también se pueden usar otras condiciones de procedimiento a no ser que se indique lo contrario. Las condiciones de reacción óptimas pueden variar con los reactantes o con los disolventes particulares usados, pero dichas condiciones se pueden determinar por un experto en la técnica mediante procedimientos de optimización rutinarios.

De forma adicional, como será obvio para los expertos en la técnica, pueden ser necesarios grupos protectores convencionales para evitar que ciertos grupos funcionales sufran reacciones no deseadas. La elección de un grupo protector adecuado para un grupo funcional particular así como las condiciones adecuadas para la protección y la desprotección son bien conocidas en la técnica. Por ejemplo, se describen numerosos grupos protectores y su introducción y eliminación en T. W. Greene y G. M. Wuts, Protecting Groups in Organic Synthesis, segunda edición, Wiley, Nueva York, 1991 y en las referencias allí citadas.

En los siguientes esquemas de reacción, los compuestos de glicopéptidos se representan en una forma simplificada como un recuadro "G" que muestra un grupo carboxi terminal etiquetado [C], el grupo amino vancosamina terminal etiquetado [V], el grupo amino "no sacárido" terminal (radical amina leucina) etiquetado [N] y, opcionalmente, el radical resorcinol etiquetado [R] como sigue:

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En una realización preferida, los compuestos de glicopéptidos de la presente invención se preparan mediante alquilación reductiva de un glicopéptido como se muestra en la siquiente reacción:

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donde A representa R^{a} menos un átomo de carbono y R^{a}, R^{b}, Y, Z y x son como se han definido en la invención. Esta reacción se conduce típicamente primero mediante el contacto de un equivalente de un glicopéptido, tal como la vancomicina, con un exceso, preferiblemente de 1,1 a 1,3 equivalentes, del aldehído deseado en presencia de un exceso, preferiblemente de aproximadamente 2,0 equivalentes, de una amina terciaria, tal como la diisopropiletilamina (DIPEA) y similares. Esta reacción se conduce típicamente en un diluyente inerte, como la DMF, a temperatura ambiente durante aproximadamente 1 a 2 horas hasta que la formación de la correspondiente imina y/o del hemiaminal se complete sustancialmente. La imina y/o el hemiaminal resultante típicamente no se aisla, sino que se hace reaccionar in situ con un agente reductor de hidruro de metal, como cianoborohidruro de sodio y similares, para dar la correspondiente amina. Esta reacción se conduce típicamente mediante el contacto de la imina y/o el hemiaminal con aproximadamente 1 a 1,2 equivalentes del agente reductor a temperatura ambiente en metanol en presencia de un exceso, preferiblemente aproximadamente 3 equivalentes, de ácido trifluoroacético. El producto alquilado resultante es fácilmente purificable mediante procedimientos convencionales, tales como HPLC en fase inversa. Sorprendentemente, la formación de la imina y/o del hemiaminal en presencia de una amina trialquilo, aumenta mucho la selectividad para la reacción de alquilación reductiva, es decir, la alquilación reductiva del grupo amina del sacárido (por ejemplo, vancosamina) está favorecida sobre la alquilación reductiva del grupo N-terminal (por ejemplo, el grupo leucinilo) en al menos 10:1, más preferiblemente 20:1.

Si se desea, los compuestos de glicopéptidos de la invención también se pueden preparar en una forma por etapas en la que primero se une un precursor al grupo -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} del glicopéptido mediante alquilación reductiva, seguida de la posterior elaboración del precursor que se une usando reactivos y procedimientos convencionales para formar el grupo -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} tal y como se ilustra más abajo. De forma adicional, también se pueden emplear cetonas en las reacciones de alquilación reductiva anteriormente descritas para dar aminas \alpha-sustituidas.

En estas reacciones de alquilación reductiva se puede emplear cualquier glicopéptido que tenga un grupo amina. Tales glicopéptidos son bien conocidos en la técnica y se encuentran disponibles comercialmente o se pueden aislar usando procedimientos convencionales. Glicopéptidos adecuados se describen, a modo de ejemplo, en las patentes U.S. Nos. 3.067.099; 3.338.786; 3.803.306; 3.928.571; 3.952.095; 4.029.769; 4.051.237; 4.064.233; 4.122.168; 4.239.751; 4.303.646; 4.322.343; 4.378.348; 4.497.802; 4.504.467; 4.542.018; 4.547.488; 4.548.925; 4.548.974; 4.552.701;
4.558.008; 4.639.433; 4.643.987; 4.661.470; 4.694.069; 4.698.327; 4.782.042; 4.914.187; 4.935.238; 4.946.941;
4.994.555; 4.996.148; 5.187.082; 5.192.742; 5.312.738; 5.451.570; 5.591.714; 5.721.208; 5.750.509; 5.840.684 y 5.843.889; cuyas descripciones se incorporan en la presente invención como referencia en su totalidad. Preferiblemente, el glicopéptido empleado en la anterior reacción es la vancomicina.

Los aldehídos y las cetonas empleados en la reacción de alquilación reductiva son también bien conocidos en la técnica y se encuentran disponibles comercialmente o se pueden preparar mediante procedimientos convencionales usando materiales de partida comercialmente disponibles y reactivos convencionales. Típicamente, tales materiales se preparan mediante el acoplamiento de, por ejemplo, acetales funcionalizados que tienen un sustituyente amino, tiol, hidroxilo, halo u otro, con un intermedio adecuado que tiene un grupo funcional complementario para formar sulfuros, éteres, aminas, sulfonamidas y similares. La hidrólisis posterior del acetal da el correspondiente aldehído. Tales reacciones son bien conocidas en la técnica y se describen, por ejemplo, en Marzo, Advanced Organic Chemistry, Cuarta Edición, John Wiley & Sons, Nueva York (1992) y en las referencias allí citadas. La síntesis representativa de los compuestos de aldehído se ilustra en los Esquemas 1-5:

Esquema 1

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Esquema 2

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Esquema 3

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Esquema 4

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Esquema 5

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donde R representa -R^{b}-(Z)_{x}, ó -(R^{b} menos un átomo de carbono)-(Z)_{x} (donde R^{b}, Z y x son como se han definido).

A modo de ilustración adicional, los siguientes esquemas describen la síntesis de materiales de partida y de compuestos representativos de la invención. Por ejemplo, el esquema A ilustra un procedimiento para preparar un aminoaldehído de Fmoc (5) a partir del correspondiente aminoalcohol (3), donde A es como se ha definido. En esta reacción, el aminoalcohol se protege mediante técnicas convencionales, por ejemplo, mediante tratamiento con cloroformato de 9-fluorenilmetilo en presencia de una base, para producir el aminoalcohol protegido con Fmoc (4). Luego, la oxidación mediante técnicas conocidas proporciona el aldehído (5).

Esquema A

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El esquema B ilustra una ruta alternativa para preparar el aminoaldehído protegido con F-moc (5). Esta ruta se describe con mayor detalle en Sasake, Y., Abe, J. Chem. Pharm. Bull. (1997), 45(1), 13-17.

Esquema B

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El aminoaldehído protegido con Fmoc de fórmula (5) se puede hacer reaccionar luego con un glicopéptido, por ejemplo la vancomicina, como muestra el esquema C.

Esquema C

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donde B representa -(R^{b} menos un átomo de carbono)-(Z)_{x}, donde R^{b}, Z y x son como se han definido.

Esta reacción se conduce bajo condiciones de alquilación reductiva para producir un intermedio de glicopéptido (11). La desprotección de (11) con piperidina produce el correspondiente glicopéptido (12) que tiene un grupo amino primario. La reacción de (12) con el aldehído (13) bajo condiciones estándar de alquilación reductiva da el derivado de glicopéptido (14) y el correspondiente aducto bis (15), que son separados mediante técnicas convencionales, tal como HPLC.

El esquema D ilustra un procedimiento para preparar un aminoaldehído protegido con Fmoc (24). En este esquema, la reacción del cloruro de ácido (19) con el aminoéster (20) bajo condiciones de acoplamiento de amida convencionales, da el amidoéster (21). La reducción de ambos, del éster y de los radicales amida, usando un agente reductor de hidruro de metal, como hidruro de aluminio y litio (LAH) da el aminoalcohol (22). La protección y la oxidación, como en el esquema A, producen un aldehído de fórmula (24).

Esquema D

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Alternativamente, el aldehído (24) se puede preparar como muestra el esquema D'. En esta reacción, la alquilación directa del amino alcohol (3) bajo condiciones de alquilación de amina convencionales da el amino alcohol (22), el cual se puede usar luego como se describió en el esquema D.

Esquema D'

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El esquema E ilustra un procedimiento alternativo para preparar el aldehído (24). En esta reacción, el aminoacetal (6) se alquila reductivamente para proporcionar (25). La protección posterior del grupo amino y la hidrólisis del acetal bajo condiciones convencionales proporciona luego el aldehído (24).

Esquema E

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El esquema F ilustra otro procedimiento para la alquilación reductiva de un glicopéptido. En este esquema, el aldehído protegido con Fmoc (24), preparado como se describió antes, se hace reaccionar con un glicopéptido (10), tal como la vancomicina, bajo condiciones de alquilación reductiva para dar el derivado de glicopéptido (27). La desprotección posterior con piperidina proporciona el derivado de glicopéptido (14).

Esquema F

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El esquema G ilustra la conversión del grupo carboxilo de un derivado de glicopéptido, tal como la vancomicina, en una amida. En esta reacción la amina (28) se hace reaccionar con un derivado de glicopéptido, tal como (27), bajo condiciones estándar de acoplamiento de péptidos, por ejemplo, PyBOP y HOBT en DMF, para proporcionar la amida (29), después de la desprotección.

Esquema G

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El esquema H ilustra la introducción de una cadena lateral de aminoalquilo en el radical resorcinol de un glicopéptido, tal como la vancomicina, a través de la reacción de Mannich. En esta reacción, la amina (30) y un aldehído, tal como la formalina (una fuente de formaldehído), se hacen reaccionar con el glicopéptido bajo condiciones básicas para dar el derivado de glicopéptido (31).

Esquema H

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De forma similar, el esquema I ilustra una introducción de un sustituyente de la fórmula -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} en el radical resorcinol de un glicopéptido usando la reacción de Mannich. En estas reacciones, el exceso de aldehído, tal como el formaldehído, puede reaccionar para dar los compuestos ciclados de fórmula VIIa y/o VIIb.

Esquema I

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El esquema J ilustra una síntesis de un derivado de glicopéptido usando varias de las reacciones descritas anteriormente. En este esquema, el derivado de glicopéptido (27) se derivatiza en el radical resorcinol usando la reacción de Mannich descrita en el esquema H para proporcionar el derivado de glicopéptido (40). La desprotección y el acoplamiento de la amida en el grupo carboxilo, como se describe en el esquema G, da el derivado de glicopéptido (42).

Esquema J

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El esquema L ilustra la reacción de alquilación reductiva múltiple de un derivado de glicopéptido (27) para dar el derivado de glicopéptido (44a).

\newpage

Esquema K

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En los ejemplos que siguen se describen detalles adicionales y otros procedimientos para preparar los compuestos de la invención.

Composiciones farmacéuticas

Esta invención también incluye la composición farmacéutica que contiene los nuevos compuestos de glicopéptidos de la invención. Por lo tanto, el compuesto de glicopéptido, preferiblemente en la forma de una sal farmacéuticamente aceptable, se puede formular para su administración por vía oral o por vía parenteral para el tratamiento terapéutico o profiláctico de infecciones bacterianas.

A modo de ilustración, el compuesto de glicopéptido se puede administrar con vehículos y excipientes farmacéuticos convencionales y usarse en la forma de comprimidos, cápsulas, elixires, suspensiones, jarabes, comprimidos y similares. Dichas composiciones farmacéuticas contendrán entre aproximadamente el 0,1 y aproximadamente el 90% en peso del compuesto activo y más generalmente entre aproximadamente el 10 y aproximadamente el 30%. Las composiciones farmacéuticas pueden contener vehículos y excipientes comunes, como almidón o gelatina de maíz, lactosa, sacarosa, celulosa microcristalina, caolín, manitol, fosfato dicálcico, cloruro sódico y ácido algínico. Los desintegradores comúnmente usados en las formulaciones de la invención incluyen la croscarmelosa, celulosa microcristalina, almidón de maíz, glicolato sódico de almidón y ácido algínico.

Una composición líquida generalmente constará de una suspensión o de una disolución del compuesto o de la sal farmacéuticamente aceptable en un vehículo(s) líquido adecuado, por ejemplo etanol, glicerina, sorbitol, disolventes no acuosos como el polietilenglicol, glicol, aceites o agua, con un agente de suspensión, conservante, tensioactivo, agente humectante, potenciador del sabor o con un agente colorante. Alternativamente, se puede preparar una formulación líquida a partir de un polvo reconstituible.

Por ejemplo, se puede reconstituir con agua un polvo que contiene un compuesto activo, un agente de suspensión, sacarosa y un edulcorante para formar una suspensión; y se puede preparar un jarabe a partir de un polvo que contiene el ingrediente activo, sacarosa y un edulcorante.

Se puede preparar una composición en forma de comprimidos usando cualquier vehículo(s) farmacéutico adecuado usado rutinariamente para preparar composiciones sólidas. Ejemplos de tales vehículos incluyen al estearato de magnesio, almidón, lactosa, sacarosa, celulosa microcristalina y ligantes, por ejemplo polivinilpirrolidona. El comprimido también se puede obtener con un recubrimiento de película coloreada, o se incluye el color como parte del vehículo(s). Además, el compuesto activo se puede formular en una forma de dosificación con liberación controlada como un comprimido que comprende una matriz hidrófila o hidrófoba.

Se puede preparar una composición en la forma de cápsula usando procedimientos de encapsulación rutinarios, por ejemplo mediante la incorporación del compuesto activo y de los excipientes dentro de una cápsula de gelatina dura. Alternativamente, se puede preparar una matriz semi sólida del compuesto activo y polimetilenglicol de alto peso molecular y llenarse dentro de una cápsula de gelatina dura; o se puede preparar una disolución del compuesto activo en polietilenglicol o una suspensión en aceite comestible, por ejemplo parafina líquida o aceite de coco fraccionado y llenarse dentro de una cápsula de gelatina blanda.

Ligantes para comprimidos que se pueden incluir son acacia, metilcelulosa, carboximetilcelulosa de sodio, polivinilpirrolidona (Povidona), hidroxipropilmetilcelulosa, sacarosa, almidón y etilcelulosa. Los lubricantes que se pueden usar incluyen estearato de magnesio u otros estearatos metálicos, ácido esteárico, fluido de silicona, talco, ceras, aceites y sílice coloidal.

También se pueden usar potenciadores del sabor como menta, aceite de gaulteria, potenciador del sabor de cereza o similares. De forma adicional, puede ser deseable añadir un agente colorante para hacer la forma de dosificación más atractiva en apariencia o para ayudar a identificar al producto.

Los compuestos de la invención y sus sales farmacéuticamente aceptables que son activos cuando se dan parenteralmente, se pueden formular para su administración por vía intramuscular, intratecal o intravenosa.

Una composición típica para administración por vía intramuscular o intratecal constará de una suspensión o disolución de ingrediente activo en un aceite, por ejemplo aceite de arachis o aceite de sésamo. Una composición típica para administración por vía intravenosa o intratecal constará de una disolución acuosa isotónica esterilizada que contiene, por ejemplo, el ingrediente activo y dextrosa o cloruro sódico, o una mezcla de dextrosa y de cloruro sódico. Otros ejemplos son la inyección de Ringer con lactato, la inyección de lactato de Ringer más dextrosa, Normosol-M y dextrosa, Isolite E, inyección de acilato de Ringer, y similares. Opcionalmente, se pueden incluir en la formulación un codisolvente, por ejemplo polietilenglicol, un agente quelante, por ejemplo ácido etilendiamina tetraacético y un antioxidante, por ejemplo metabisulfito sódico. Alternativamente, la disolución se puede congelar, secar y ser luego reconstituida con un disolvente adecuado justo antes de su administración.

Los compuestos de la invención y sus sales farmacéuticamente aceptables que son activos bajo administración por vía rectal se pueden formular como supositorios. Una formulación típica de supositorio constará generalmente del ingrediente activo con un agente ligante y/o lubricante como una gelatina o mantequilla de coco u otra cera o grasa vegetal o sintética de bajo punto de fusión.

Los compuestos de la presente invención y sus sales farmacéuticamente aceptables que son activos bajo administración por vía tópica se pueden formular como composiciones transdérmicas o como dispositivos de liberación transdérmica ("parches"). Tales composiciones incluyen, por ejemplo, una capa de refuerzo, un reservorio de compuesto activo, una membrana de control, una capa de revestimiento y un adhesivo de contacto. Tales parches transdérmicos se pueden usar para proporcionar la infusión continua o discontinua de los compuestos de la presente invención en cantidades controladas. La construcción y el uso de parches transdérmicos para la liberación de agentes farmacéuticos es bien conocida en la técnica. Ver, por ejemplo, la patente U.S. No. 5.023.252, expedida el 11 de junio, 1991, incorporada en la presente invención a modo de referencia en su totalidad. Dichos parches se pueden construir para liberación continua, pulsátil o bajo demanda de los agentes farmacéuticos.

El compuesto activo es eficaz a lo largo de un amplio intervalo de dosificación y se administra generalmente en una cantidad farmacéuticamente eficaz. Se comprenderá, sin embargo, que la cantidad del compuesto administrada realmente será determinada por un médico, a la luz de las circunstancias relevantes, incluyendo la afección a ser tratada, la ruta de administración escogida, el compuesto exacto administrado y su actividad relativa, la edad, el peso y la respuesta del paciente individual, la gravedad de los síntomas del paciente y similares.

Las dosis adecuadas están en el intervalo general de entre 0,01-100 mg/kg/día, preferiblemente 0,1-50 mg/kg/día. Para un humano medio de 70 kg, esto ascendería a 0,7 mg a 7 g por día, o preferiblemente 7 mg a 3,5 g por día.

Otras formulaciones adecuadas para usar en la presente invención se pueden encontrar en Remington's Pharmaceutical Sciences, Mace Publishing Company, Filadelfia, Pa., 17a. ed. (1985).

Los siguientes ejemplos de formulaciones ilustran composiciones farmacéuticas representativas de la presente invención.

Ejemplo de formulación A

Este ejemplo ilustra la preparación de una composición farmacéutica representativa para administración por vía oral de un compuesto de la invención:

Ingredientes	Cantidad por comprimido, (mg)
Compuesto activo	200
Lactosa, secada por pulverización	148
Estearato de magnesio	2

Los ingredientes anteriores se mezclan y se introducen en una cápsula con cubierta de gelatina dura.

Ejemplo de formulación B

Este ejemplo ilustra la preparación de otra composición farmacéutica representativa para administración por vía oral de un compuesto de la invención:

Ingredientes	Cantidad por comprimido, (mg)
Compuesto activo	400
Almidón de maíz	50
Lactosa	145
Estearato de magnesio	5

Los ingredientes anteriores se mezclan íntimamente y se prensan en forma de comprimidos con una sola estría.

Ejemplo de formulación C

Este ejemplo ilustra la preparación de una composición farmacéutica representativa para administración por vía oral de un compuesto de la invención.

Se prepara una suspensión oral que tiene la siguiente composición.

Ingredientes
Compuesto activo	1,0 g
Ácido fumárico	0,5 g
Cloruro sódico	2,0 g
Metil paraben	0,1 g
Azúcar granulado	25,5 g
Sorbitol (disolución al 70%)	12,85 g
Veegum K (Vanderbilt Co.)	1,0 g
Potenciador del sabor	0,035 ml
Colorantes	0,5 mg
Agua destilada	c.s. hasta 100 mL

Ejemplo de formulación D

Este ejemplo ilustra la preparación de una composición farmacéutica representativa que contiene un compuesto de la invención.

Se prepara una preparación inyectable tamponada a un pH de 4 que tiene la siguiente composición:

Ingredientes
Compuesto activo	0,2 g
Disolución tampón de acetato de sodio (0,4 M)	2,0 mL
HCl (1N)	c.s. hasta pH 4
Agua (destilada, esterilizada)	c.s. hasta 20 mL

Ejemplo de formulación E

Este ejemplo ilustra la preparación de una composición farmacéutica representativa para la inyección de un compuesto de la invención.

Se prepara una solución reconstituida añadiendo 20 mL de agua esterilizada a 1 g del compuesto de la invención. Antes de usarla, la disolución se diluye luego con 200 mL de un fluido intravenoso que es compatible con el compuesto activo. Dichos fluidos se escogen entre disolución de dextrosa al 5%, cloruro sódico al 0,9%, o una mezcla de dextrosa al 5% y cloruro sódico al 0,9%. Otros ejemplos son la inyección de lactato de Ringer, la inyección de lactato de Ringer más dextrosa al 5% Normosol-M y dextrosa al 5%, Isolite E, inyección de acilato de Ringer.

Ejemplo de formulación F

Este ejemplo ilustra la preparación de una composición farmacéutica representativa para la aplicación por vía tópica de un compuesto de la invención.

Ingredientes	gramos
Compuesto activo	0,2-10
Span 60	2
Tween 60	2
Aceite mineral	5
Vaselina	10
Metil paraben	0,15
Propil paraben	0,05
BHA (butil hidroxi anisol)	0,01
Agua	c.s. hasta 100

Todos los ingredientes anteriores, excepto el agua, se combinan y se calientan con agitación hasta 60ºC. Luego se añade una cantidad suficiente de agua a 60ºC con agitación vigorosa para emulsionar los ingredientes y se añade luego la cantidad suficiente de agua hasta 100 g.

Ejemplo de formulación G

Se prepara un supositorio con un peso total de 2,5 gramos que tiene la siguiente composición:

Ingredientes
Compuesto activo	500 mg
Witepsol H-15*	resto
(*triglicéridos de ácidos grasos saturados de vegetales,
un producto de Riches-Nelson, Inc., Nueva York, N.Y.)

Utilidad

Los compuestos de glicopéptidos de la invención y sus sales farmacéuticamente aceptables son útiles en tratamientos médicos y exhiben actividad biológica, incluyendo actividad antibacteriana, lo cual se puede demostrar en los ensayos descritos en los Ejemplos. Tales ensayos son bien conocidos por los expertos en la técnica y se referencian y describen en Lorian "Antibiotics in Laboratory Medicine", Cuarta Edición, Williams y Wilkins (1991), que se incorpora en la invención a modo de referencia.

Por lo tanto, la invención proporciona procedimientos para tratar enfermedades infecciosas, especialmente aquellas causadas por microorganismos Gram positivos, en animales. Los compuestos de la invención son particularmente útiles en el tratamiento de infecciones causadas por estafilococia resistente a la meticilina. También, los compuestos son útiles en el tratamiento de infecciones debidas a enterococos, incluyendo esterococos resistentes a la vancomicina (VRE). Ejemplos de tales enfermedades son infecciones graves por estafilococos, por ejemplo, endocarditis por estafilococos y septicemia por estafilococos. El animal también puede o ser susceptible o estar infectado por el microorganismo. El procedimiento comprende la administración al animal de una cantidad de un compuesto de la invención que sea eficaz para este propósito. En general, una cantidad eficaz de un compuesto de la invención es una dosis entre aproximadamente 0,5 y aproximadamente 100 mg/kg. Una dosis preferida es entre aproximadamente 1 y aproximadamente 60 mg/kg de compuesto activo. Una dosis diaria típica para un humano adulto es entre aproximadamente 50 mg y aproximadamente 5 g.

En la práctica de este procedimiento, el antibiótico se puede administrar en una dosis diaria única o en dosis múltiples por día. El régimen de tratamiento puede requerir la administración a lo largo de prolongados periodos de tiempo, por ejemplo, durante varios días o durante entre una y seis semanas. La cantidad por dosis administrada o la cantidad total administrada dependerá de factores tales como la naturaleza y la gravedad de la infección, la edad y el estado general de salud del paciente, la tolerancia del paciente al antibiótico y el microorganismo o los microorganismos presentes en la infección.

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Entre otras propiedades, se ha encontrado también que los compuestos de la invención son más estables químicamente comparados con derivados de N-acilo glicopéptidos. Más específicamente, se ha observado que la acilación del grupo amino del radical vancosamina de la vancomicina aumenta la velocidad de hidrólisis del radical disacárido. Por contraste, cuando los compuestos de la invención se sustituyen en el grupo amino del radical vancosamina de la vancomicina con un grupo -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, no se observa aumento en la velocidad de hidrólisis del radical disacárido.

Los siguientes ejemplos sintéticos y biológicos se ofrecen para ilustrar la presente invención y no se construyen de ninguna forma para limitar el alcance de la invención.

Ejemplos

En los ejemplos que siguen, las siguientes abreviaturas tienen los siguientes significados. Cualquiera de las abreviaturas no definidas tienen su significado generalmente aceptado. A no ser que se indique lo contrario, todas las temperaturas son en grados Celsius.

\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\+\hfil#\hfil\+#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
 BOC, Boc \+ = \+ tert-butoxicarbonilo\cr 
DIBAL-H \+ = \+ hidruro de diisobutilaluminio\cr 
DIPEA) \+ = \+ diisopropiletilamina\cr  DMF \+ = \+
N,N-dimetilformamida\cr  DMSO \+ = \+
dimetilsulfóxido\cr  eq \+ = \+ equivalente\cr  Et \+ = \+ etilo\cr 
EtOAc \+ = \+ acetato de etilo\cr  Fmoc \+ = \+
9-fluorenilmetoxicarbonilo\cr  HOBT \+ = \+ hidruro
de 1-hidroxibenzotriazol\cr  Me \+ = \+ metilo\cr 
PyBOP \+ = \+  hexafluorofosfato de
benzotriazol-1-il-oxi-tris-pirrolidinofosfonio\cr
 TEMPO \+ = \+
2,2,6,6-tetrametil-piperidiniloxi,
radical libre\cr  TFA \+ = \+ ácido trifluoroacético\cr  THF \+ = \+
tetrahidrofurano\cr  TLC, tlc \+ = \+ cromatografía en capa
fina\cr}

En el ejemplo siguiente, se adquirió clorhidrato de vancomicina semihidratado en Alpharma, Inc. Fort Lee, NJ 07024 (Alpharma AS, Oslo Noruega). Otros reactivos y reactantes están disponibles en Aldrich Chemical Co., Milwaukee, WI. 53201.

Procedimiento general A

Alquilación reductiva de vancomicina

Se añadió DIPEA (2 eq.) a una mezcla de vancomicina (1 eq.) y del aldehído deseado (1,3 eq.) en DMF. La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 1-2 horas y se siguió la marcha de la misma mediante HPLC en fase inversa. Se añadieron a la disolución metanol y NaCNBH_{3} (1 eq.), seguidos por TFA (3 eq.). Se mantuvo la agitación durante una hora adicional a temperatura ambiente. Una vez que se completó la reacción, el metanol se eliminó al vacío. El residuo se precipitó en acetonitrilo. La filtración dio el producto bruto que se purificó luego mediante HPLC en fase inversa. Si se desea, se pueden usar otros glicopéptidos en este procedimiento.

Procedimiento general B

Procedimiento de alquilación de aglicón I

Se agita una suspensión de color blanco de sal de TFA de aglicón de vancomicina (1,0 eq.), Cs_{2}CO_{3} (3,5 eq) en DMF a temperatura ambiente durante 30 minutos. Se añade un haluro de alquilo (1,1 eq.). Luego, la mezcla de reacción se agita durante 5-24 h antes de la congelación de la reacción con ácido acético. La disolución marrón resultante se deja caer gota a gota en agua para dar un precipitado blanco. La filtración dio el producto monoalquilado bruto que se puede purificar luego mediante HPLC en fase inversa si se desea.

Procedimiento general C

Procedimiento de alquilación de aglicón II

Bajo nitrógeno, la sal de trifluoroacetato de aglicona de vancomicina (1 eq) se disuelve en DMF y se agita vigorosamente a temperatura ambiente con carbonato de potasio (8-10 eq) durante una hora. Se añade un haluro de alquilo (1 eq) y se agita la mezcla vigorosamente durante la noche. El producto bruto se reúne mediante precipitación en dietiléter, se lava con acetonitrilo y se recoge en una disolución acuosa de ácido acético al 10%. El producto monoalquilado se obtiene tras purificación mediante HPLC en fase inversa.

Procedimiento General D

Preparación de aldehídos sustituidos con grupos amino

Se agita una disolución de un aminoacetal (1 eq), tal como 2- aminoacetaldehído dimetil acetal, un aldehído (1,05 eq) y NaCNBH_{3} (1 eq) en CH_{2}Cl_{2} a temperatura ambiente durante 1-4 horas. El seguimiento de la reacción se lleva a cabo mediante TLC. Se añade a la mezcla de reacción FmocCl (1 eq) y DIPEA (2 eq) a 0ºC. Se mantiene la agitación durante 1-2 horas a temperatura ambiente. Luego, se lava la mezcla de reacción con HCl 0,1 N, agua y salmuera. El disolvente se elimina al vacío y el residuo se purifica mediante cromatografía flash para dar el acetal sustituido con grupos amino.

Se añade HCl 6 N (1,5 eq) a la disolución en acetona del anterior acetal sustituido con grupos amino. Se agita la mezcla de reacción a temperatura ambiente durante 5-16 horas. Se elimina el disolvente al vacío y se seca el residuo a alto vacío para dar el aldehído bruto sustituido con grupos amino que se usa típicamente sin purificación posterior.

Procedimiento general E

Preparación de aldehídos sustituidos con grupos tio

Se agita a temperatura ambiente una disolución de un bromoacetal (1 eq), tal como dimetil 2-bromoacetaldehído y yoduro de sodio (1 eq) en DMF durante 0,5 h. Se añade a la disolución un tiol sustituido (1 eq), tal como n-decil tiol, seguido de carbonato de potasio (1 eq). Se agita la mezcla a 25-80ºC durante 4-16 horas. La mezcla de reacción se recoge con , se lava dos veces con agua y una con disolución saturada de NaCl. La capa orgánica se seca sobre MgSO_{4} y el disolvente se elimina al vacío. La purificación mediante cromatografía flash (hexano:acetato de etilo = 8:1) proporciona el correspondiente acetal sustituido con grupos tio.

Se añadió HCl 6 N (1,5 eq) a la disolución en acetona del acetal sustituido con grupos tio. Se agita la mezcla de reacción a temperatura ambiente durante 5-16 horas. Se elimina el disolvente al vacío y se seca el residuo a alto vacío para dar el aldehído bruto sustituido con grupos tio que se usa típicamente sin purificación adicional.

Procedimiento general F

Preparación de aldehídos sustituidos con grupos tio

Se agita a temperatura ambiente una mezcla de un éster tiol (1 eq), tal como tioglicolato de metilo, yoduro de sodio (1 eq), un bromuro de alquilo (1 eq) y carbonato de potasio (1 eq) en DMF durante 4-16 horas. La mezcla de reacción se recoge con acetato de etilo y se lava con agua y salmuera. La capa orgánica se seca sobre sulfato de magnesio y el disolvente se elimina al vacío. La purificación mediante cromatografía flash proporciona el éster sustituido con grupos tio.

El éster sustituido con grupos tio en éter seco se trata con DIBAL-H (disolución 1 M en ciclohexano, 1,3 eq) a -78ºC. Luego, la mezcla de reacción se agita a -78ºC durante 2-4 horas. Se usa TLC para llevar a cabo el seguimiento del curso de la reacción. Tras la finalización, se añade formiato de etilo (0,5 eq) para congelar la reacción. Luego, se lava la mezcla de reacción con ácido acético al 10%, agua y salmuera. La capa orgánica se seca sobre sulfato de magnesio y el disolvente se elimina para dar el aldehído bruto sustituido con grupos tio que se usa típicamente sin purificación adicional.

Procedimiento general G

Preparación de aldehídos sustituidos con grupos alcoxi

Se trata una disolución en THF de un hidroxiacetal (1 eq), tal como dimetil 2-hidroxiacetaldehído, con hidruro de sodio (1 eq) a 0ºC. Después de que cesa la evolución de hidrógeno, se añade un bromuro de alquilo a 0ºC. Luego, la reacción se agita a temperatura ambiente durante 1-4 horas. La mezcla de reacción se recoge con acetato de etilo y se lava con agua y con salmuera. El disolvente se elimina al vacío y el residuo se purifica típicamente mediante cromatografía flash para dar el acetal sustituido con grupos alcoxi.

Se añade HCl 6 N (1,5 eq) a la disolución en acetona del acetal sustituido con grupos alcoxi. Se agita la mezcla de reacción a temperatura ambiente durante 5-16 horas. Se elimina el disolvente al vacío y se seca el residuo a alto vacío para dar el aldehído crudo sustituido con grupos alcoxi que se usa típicamente sin purificación adicional.

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Procedimiento general H

Preparación de aldehídos sustituidos con grupos sulfonamida

Se trata una disolución en THF de un aminoacetal (1 eq), tal como dimetil 2-aminoacetaldehído y diisopropiletilamina (2 eq) con un cloruro de sulfonilo (1 eq) a 0ºC. Luego, la mezcla de reacción se agita a temperatura ambiente durante 1-4 horas. La mezcla de reacción se recoge luego con acetato de etilo y se lava con HCl 0,1 N, con agua y con salmuera. El disolvente se elimina al vacío y el residuo se purifica mediante cromatografía flash para dar el acetal sustituido con grupos sulfonamida.

Se añade HCl 6 N (1,5 eq) a la disolución en acetona del acetal sustituido con grupos sulfonamida. Se agita la mezcla de reacción a temperatura ambiente durante 5-16 horas. Luego, se elimina el disolvente al vacío y se seca el residuo a alto vacío para dar el aldehído bruto sustituido con grupos sulfonamida que se usa típicamente sin purificación adicional.

Ejemplo A Preparación de aminoacetaldehído con fmoc

Se preparó aminoetanol protegido con Fmoc a partir de aminoetanol mediante técnicas convencionales (por ejemplo, como se describe más abajo en los Ejemplos B y C).

Se añadió NaOCl (0,35 M, tamponado a pH 8,6 mediante NaHCO_{3}, 760 mL, 266 mmol, 2,0 equiv) a una mezcla de aminoetanol con Fmoc (37,64 g, 133 mmol, 1,0 equiv), TEMPO (0,008 M en CH_{2}Cl_{2}, 332,5 mL, 2,66 mmol, 0,02 equiv), KBr (0,5 M en agua, 53,2 mL, 26,6 mmol, 0,2 equiv) y acetato de etilo (1500 mL), a 0ºC. Se usó un agitador mecánico para asegurar una agitación eficiente, y se siguió la marcha de la reacción mediante TLF. Después de 20 min se separaron las dos capas. La capa acuosa se extrajo con acetato de etilo (2 x 250 mL), las capas orgánicas combinadas se lavaron con una disolución saturada de Na_{2}S_{2}O_{3}, agua y salmuera, se secaron sobre Na_{2}SO_{4}, se filtraron y se concentraron hasta aproximadamente 400 mL. Se añadió hexano (1600 mL) para dar un precipitado de color blanco. Después de la filtración, se recogió el aminoacetaldehído con Fmoc (25,2 g, 67%) como un polvo blanco.

Ejemplo B Preparación de N-Fmoc-2-(n-Decilamino)acetaldehído

Se añadió gota a gota a una disolución de cloruro de n-decanoilo (2,7 mL, 13 mmol, 1,0 eq) en cloruro de metileno (20 mL) en un baño de hielo/acetona, una mezcla de clorhidrato de metil éster glicina (2,0 g, 16 mmol, 1,2 eq) y DIPEA (5,1 mL, 29 mmol, 2,2 eq) en cloruro de metileno (20 mL). La mezcla de reacción se agitó durante 60 minutos más después de la adición completa, luego se lavó dos veces con ácido clorhídrico 3 N (50 mL), seguido de disolución de bicarbonato sódico saturada (50 mL). Los compuestos orgánicos se secaron sobre sulfato de magnesio y los disolventes se eliminaron a presión reducida. Se obtuvo 2-decilamidoacetato de metilo (3,0 g, 12 mmol, 95%), el cual se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional.

Bajo nitrógeno, se disolvió 2-(n-decilamido)acetato de metilo (3,0 g, 12 mmol, 1,0 eq) en tetrahidrofurano anhidro (25 mL) y se enfrió en un baño de hielo. Se añadió cuidadosamente una disolución de hidruro de aluminio litio (1 N, 25 mL, 25 mmol, 2,0 eq). La disolución resultante se mantuvo a reflujo bajo nitrógeno durante la noche y luego se enfrió en un baño de hielo. Se añadió tetrahidrofurano (50 mL) seguido por la adición lenta de sulfato de sodio decahidratado hasta que cesó la efervescencia. Se permitió que la mezcla de reacción se calentase hasta temperatura ambiente, se filtró y luego se concentró a vacío. Se obtuvo 2-(n-decilamino)etanol (2,3 g, 11 mmol, 93%) el cual se usó sin purificación adicional.

Se disolvieron en cloruro de metileno (15 mL) 2-(n-decilamino) etanol (2,3 g, 11 mmol, 1,1 eq) y DIPEA (2,0 mL, 11 mmol, 1,1 eq) y se enfriaron en un baño de hielo. Se añadió cloroformato de 9-fluorenilmetilo (2,6 g, 10 mmol, 1,0 eq) en cloruro de metileno (15 mL), la mezcla se agitó durante 30 minutos, luego se lavó dos veces con ácido clorhídrico 3 N (50 mL) y con disolución de bicarbonato sódico saturada (50 mL). Los compuestos orgánicos se secaron sobre sulfato de magnesio y los disolventes se eliminaron a presión reducida. El N-Fmoc-2-(decilamino)etanol (4,6 g, 11 mmol, 108%) se usó sin purificación adicional.

Se disolvieron en cloruro de metileno (30 mL) N-Fmoc-2-(n-decilamino)etanol (4,6 g, 11 mmol, 1,0 eq) y DIPEA (7,6 mL, 44 mmol, 4,0 eq) y se enfriaron en un baño de hielo/acetona. Se añadió una disolución de complejo de piridina trióxido de azufre (6,9 g, 43 mmol, 4,0 eq) en dimetil sulfóxido (30 mL) y se agitó la disolución durante 20 minutos. Se añadió hielo triturado y se dividió la mezcla. Los compuestos orgánicos se lavaron dos veces con ácido clorhídrico 3 N, con disolución saturada de bicarbonato de sodio y con disolución saturada de cloruro sódico, se secaron sobre cloruro de magnesio y se concentraron bajo vacío. El N-Fmoc-2-(decilamino)acetaldehído (3,4 g, 8 mmol, 74%) se usó sin purificación adicional (ver ejemplo 5).

Ejemplo C Preparación de 2-(decilamino)etanol

Se agitó una disolución de aminoetanol (30,5 g, 500 mmol, 30,1 mL) y 1-bromodecano (27,65 g, 125 mmol, 26 mL) en etanol a 65ºC durante 4 hr. El disolvente se eliminó a presión reducida. El residuo se diluyó con EtOAc (800 mL) y la disolución orgánica se lavó con H_{2}O (2 x 200 mL); disolución acuosa saturada de NaHCO_{3} (200 mL) y salmuera saturada (200 mL). La fase orgánica se secó sobre Na_{2}SO_{4} anhidro, y se concentró a presión reducida. El producto en bruto resultante, 2-(decilamino)etanol, se usó sin purificación adicional.

Ejemplo D Preparacion de N-Fmoc-2-(trans-Dec-4-en-1-ilamino)acetaldehído

Se mezcló trans-4-decenal (7,2 g, 46,6 mmol) con 40 mL (0,37 mol) de dimetilacetal aminoacetaldehído en 400 mL de metanol y se agitó a temperatura ambiente durante 30 minutos. Se añadió NaCNBH_{3} (2,9 g, 46,6 mmol), se enfrió la mezcla de reacción en un baño de hielo y se añadieron gota a gota 27 mL (0,35 mol) de TFA durante 5 minutos. Luego se retiró el baño de hielo y se agitó la mezcla de reacción durante 70 minutos a temperatura ambiente, se concentró hasta un tercio de su volumen, y se dividió entre acetato de etilo (250 mL) y NaOH 1 N (200mL). La capa orgánica se lavó con agua (3 x 75 mL), se secó sobre MgSO_{4}, se filtró y se concentró a presión reducida para producir 11,1 g (45,6 mmol) de 2-(trans-dec-4-en-1-ilamino)acetaldehído dimetil acetal como un aceite amarillo que se usó directamente en la siguiente etapa.

Se mezcló el 2-(trans-dec-4-en-1-ilamino)acetaldehído dimetil acetal (10,5 g, 43,2 mmol) con diclorometano (300 mL) y 7,5 mL (43,2 mmol) de diisopropiletilamina y se añadieron por partes 11,2 g (43,2 mmol) de FMOC-Cl. La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante 3 horas y luego se vertió en una disolución al 10% de KHSO_{4} (200 mL). La capa orgánica se lavó con agua (200 mL), se secó sobre MgSO_{4} y se concentró a presión reducida. El aceite resultante se cromatografió sobre gel de sílice en EtOAc/hexanos al 10% para dar 16,1 g (34,6 mmol) de N-Fmoc-2-(trans-dec-4-en-1-ilamino)acetaldehído dimetil acetal como un aceite claro que se usó directamente en la siguiente etapa.

Se mezcló el N-Fmoc-2-(trans-dec-4-en-1-ilamino)acetaldehído dimetil acetal (5 g, 10,7 mmol) con 30 mL de TFA y se agitó a temperatura ambiente durante 30 minutos. La mezcla de reacción se vertió en agua (140 mL) y se centrifugó para obtener un aceite claro. El sobrenadante se decantó y el aceite se mezcló con 40 mL de agua y se centrifugó de nuevo. El sobrenadante se decantó de nuevo y el aceite se disolvió en diclorometano (100 mL), se secó sobre MgSO_{4}, se filtró y se concentró a presión reducida para producir 5,2 g (12,3 mmol) de N-Fmoc-2-(trans-dec-4-en-1-ilamino)acetaldehído como un aceite claro.

Ejemplo E Preparación de un compuesto de fórmula V (donde R^{22} es OH y R^{23} es -CH_{2}-N-(N-CH_{3}-D-glucamina))

Se añadió vancomicina (9,0 g, 5,16 mmol) a una disolución de N-metil-D-glucamina (5,03 g, 25,8 mmol) y formaldehído al 37% (0,43 mL, 5,4 mmol) en acetonitrilo acuoso al 50% (60 mL) bajo nitrógeno y se agitó a temperatura ambiente. Después de 4 horas, se eliminó el acetonitrilo al vacío, se añadió agua (30 mL) y se ajustó el pH a \sim 4 con ácido trifluoroacético al 10%. La disolución se purificó mediante HPLC en fase inversa. Mediante espectrometría de masas se identificaron las fracciones que contienen el producto deseado, se juntaron y se liofilizaron para dar el compuesto del título como un polvo blanco. Este producto intermedio se puede usar además para obtener derivados usando los procedimientos descritos en la invención.

Ejemplo F Preparación de un compuesto de fórmula IV (donde R^{15} y R^{16} son H, R^{22} es OH y R^{27} es -CH_{2}CH_{2}-NH-Fmoc)

Se preparó una suspensión de clorhidrato de vancomicina (4,00 g, 2,60 mmol) en 40 mL de 1,3-dimetil-3,4,5,6-tetrahidro-2-(1H)-pirimidinona y se calentó a 70ºC durante 15 minutos. Se añadió N-(9-fluorenilmetoxicarbonil)aminoacetaldehído (720 mg, 2,6 mmol) y se calentó la mezcla a 70ºC durante una hora. Se añadió cianoborohidruro de sodio (160 mg, 2,5 mmol) en 2 mL de etanol y se calentó la mezcla a 70ºC durante 2 horas, luego se enfrió a temperatura ambiente. La disolución de la mezcla de reacción se añadió gota a gota a 20 mL de acetonitrilo, dando un precipitado que se reunió mediante centrifugación. El precipitado se purificó mediante HPLC en fase inversa en una columna Ranin C18 Dynamax (2,5 cm x 25 cm, tamaño de partícula de 8 \mum), con un caudal de 10 mL/min usando TFA al 0,045% en agua como tampón A y TFA al 0,045% en acetonitrilo como tampón B (gradiente de HPLC de 10-70% B durante 90 minutos), lo cual produjo el compuesto intermedio del título como su sal trifluoroacetato. MS calculado: MH+, 1715; encontrado, 1715.

Este compuesto se puede desproteger y además obtener derivados a partir del mismo, por ejemplo, a través de la alquilación reactiva, como se describe en la invención.

Ejemplo 1 Síntesis de un compuesto de fórmula III (donde R^{15} es -CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}, R^{17} es H y R^{22} es OH)

Se añadieron a un matraz de fondo redondeado de 1000 mL secado en un horno, equipado con una barra de agitación magnética, vancomicina (34,1 g, 23 mmol, 1 eq), N-Fmoc-aminoacetaldehído (6,5 g, 23 mmol, 1 eq), DIPEA (8,5 mL, 46 mmol, 2 eq) y DMF (340 mL). La mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 2 horas y la marcha de la misma se siguió mediante HPLC. La reacción se volvió homogénea y se observó \sim90% de conversión a la imina. Se añadieron a la disolución metanol (340 mL) y NaCNBH_{3} (4,3 g, 69 mmol, 3 eq), seguidos por TFA (5,2 mL, 69 mmol, 3 eq). Se mantuvo la agitación durante una hora adicional a temperatura ambiente. Una vez que se completó la reacción, el metanol se eliminó al vacío. El residuo que contiene el producto bruto y DMF se vertió lentamente en un matraz de 5 L y se agitó con acetonitrilo (3,5 L). Se formó un precipitado blanco. Se permitió que la suspensión se estabilizase a temperatura ambiente y se decantó el sobrenadante. Se filtró el sólido de color blanco y se trituró con éter (2 L). Después de la filtración, el producto bruto se secó a alto vacío durante la noche.

Se llenó una columna de 8 x 26 cm con gel de sílice unida a grupos octadecilo. La columna se lavó con 800 mL de disolvente B al 90% [acetonitrilo en agua, TFA al 0,1%] y se equilibró con 800 mL de disolvente B al 10%. El producto bruto (10 g) se disovió en el disolvente B al 30% (150 mL, conteniendo 2 mL de HCl 3 N) y se cargó en la columna. Luego se cromatografió en columna flash con 10%B (800 mL x 2), 40%B (800 mL x 3) y 90%B (800 mL). Las fracciones se examinaron mediante HPLC analítica. Después de la liofilización, se obtuvo N^{van}-Fmoc-aminoetil vancomicina como su sal de TFA.

La N^{van}-Fmoc-aminoetil vancomicina se desprotegió para dar la sal de tri- TFA N^{van}-Fmoc-aminoetil vancomicina usando procedimientos convencionales (por ejemplo como los descritos en los Ejemplos 2 y 3).

Se añadieron decanal (92 microL, 59 micromol) y cianoborohidruro de sodio (0,1 M en metanol, 45 microL, 4,5 micromol) a una disolución de sal de tri-TFA N^{van}-aminoetil vancomicina (15,5 mg, 8,4 micromol) en metanol:DMF:THF (2:1:1, 1,6 mL). Después de 45 minutos, se eliminaron los disolventes al vacío y se purificó el residuo mediante HPLC preparativa. Las fracciones apropiadas se combinaron y liofilizaron para dar N^{van}-2-(n-decilamino)etil vancomicina (2,4 mg) como un polvo blanco. También se aisló N^{van}, N^{van}-bis-2-(n-decilamino)etil vancomicina (2,9 mg).

Ejemplo 2 Síntesis de un compuesto de fórmula III (donde R^{15} es -CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}, R^{17} es H y R^{22} es OH)

Se agitaron a temperatura ambiente en DMF (120 mL) durante 90 minutos clorhidrato de vancomicina (12 g, 7,7 mmol, 1,0 eq), N-Fmoc-2-(n-decilamino)acetaldehído (3,2 g, 7,6 mmol, 1,0 eq) y DIPEA (2,6 mL, 14,9 mmol, 2,0 eq). Se añadió cianoborohidruro de sodio (1,4 g, 22 mmol, 3,0 eq) seguido de metanol (120 mL) y luego de ácido trifluoroacético (1,8 mL, 23 mmol, 3,0 eq). La mezcla se agitó durante 60 minutos a temperatura ambiente, luego se eliminó el metanol a presión reducida. La disolución resultante se añadió a 600 mL de dietil éter dando un precipitado que se filtró, se lavó con éter y se secó bajo vacío. El producto bruto se purificó en una columna flash en fase inversa, eluyendo con acetonitrilo al 10, 20, 30% en agua (conteniendo el 0,1% de ácido trifluoroacético) para eliminar las impurezas polares (tal como la vancomicina residual) y luego el producto se eluyó con acetonitrilo al 70% en agua (conteniendo el 0,1% de ácido trifluoroacético) para dar 9 g de N^{van}-(N-Fmoc-2-n-decilaminoetil) vancomicina como su sal trifluoroacetato (4,3 mmol, 56%).

Se disolvió N^{van}-(N-Fmoc-2-n-decilaminoetil) vancomicina (100 mg) en 1 mL de DMF (1 mL) y se trató con piperidina (200 \muL) durante 30 minutos. La mezcla se precipitó en éter, se centrifugó y se lavó con acetonitrilo. La HPLC preparativa en fase inversa (acetonitrilo al 10-70% en agua conteniendo ácido trifluoroacético al 0,1% durante 120 minutos) dio N^{van}-2-(n-decilamino)etil vancomicina como su sal de TFA.

Ejemplo 3 Síntesis de un compuesto de fórmula III (donde R^{15} es -CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}, R^{17} es H y R^{22} es -N-(D-glucosamina)

Se disolvió N^{van}-(N-Fmoc-2-n-decilaminoetil) vancomicina (100 mg, 48 \mumol, 1,0 eq) en 1 mL de DMF y se añadió clorhidrato de glucosamina (31 mg, 144 \mumol, 3,0 eq). La mezcla se agitó vigorosamente durante 30 minutos (el clorhidrato de glucosamina no se disolvió completamente), se añadió DIPEA (60 \muL, 344 \mumol, 7,2 eq) y se agitó la mezcla vigorosamente durante 30 minutos adicionales. Se preparó una disolución de hexafluorofosfato de benzotriazol-1-il-oxi-tris-irrolidinofosfonio (PyBOP, 50 mg, 96 \mumol, 2,0 eq) y 1- hidroxibenzotriazol (14 mg, 104 \mumol, 2.2 eq) en 500 \muL de DMF. La disolución de PyBOP se añadió en 5 cargas de 60 \muL a intervalos de 5 minutos a la suspensión agitada vigorosamente de los otros componentes de la reacción. La mezcla de reacción se agitó 30 minutos adicionales y luego se hizo precipitar en acetonitrilo. El sólido se reunió mediante centrifugación, se recogió en 1 mL de N,N-dimetilformamida y se trató con 200 \muL de piperidina durante 30 minutos. La precipitación en éter se siguió con centrifugación y lavado del sólido con acetonitrilo. La HPLC preparativa en fase inversa (acetonitrilo al 10-70% en agua conteniendo ácido trifluoroacético al 0,1% durante 120 minutos) dio un compuesto de fórmula III donde R^{15} es -CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3} y R^{22} es -N-(D-glucosamina como su sal de trifluoroacetato.

Ejemplo 4 Síntesis de un compuesto de fórmula III (donde R^{15} es -CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3} y R^{22} es -NH-CH(COOH)CH_{2}COOH)

Se añadieron HOBt (1,47 g, 10,9 mmol), PyBOP (7,57 g, 14,6 mmol) y el bis- fluorenilmetil éster de ácido L-aspártico (TFA, 6,26 g, 10,4 mmol) a una disolución bien agitada de N^{van}-(N-Fmoc-2-n-decilaminoetil) vancomicina (20 g, 10,4 mmol) y DIPEA (5,44 mL, 31,2 mmol) en DMF (440 mL). La reacción se completó después de 1 hora mediante MS. La mezcla se precipitó en CH_{3}CN (4 L) y se centrifugó. Se decantó el sobrenadante y se redisolvió el pellet en DMF (440 mL). Se añadió piperidina (44 mL) y se siguió el curso de la reacción mediante MS. Después de 1 hora, la reacción finalizó. Se precipita a través de la adición gota a gota de Et_{2}O (4 L) con agitación continua durante la noche. El sólido se reunió a través de filtración y secado al vacío. Luego, el sólido resultante se trituró con CH_{3}CN y se reunió a través de filtración y secado al vacío dando el producto deseado como un sólido blanquecino que se purificó mediante HPLC en fase inversa.

Ejemplo 5 Síntesis de un compuesto de fórmula V (donde R^{15} es H y R^{23} es -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3})

Se añadieron diaminoetano (30 mg, 0,5 mmol), formalina al 37% (7,6 \muL, 0,20 mmol) y clorhidrato de vancomicina (140 mg, 0,10 mmol) a acetonitrilo acuoso al 50% (1,0 mL). Después de agitar durante 3h, se precipitó el producto mediante la adición de acetonitrilo (12 mL). El sólido se aisló mediante centrifugación y luego se lavó con éter (12 mL). El sólido resultante se secó al vacío y se purificó mediante HPLC en fase inversa (5-15%B durante 40 min a un caudal de 50 mL/min). Mediante espectrometría de masas se identificaron las fracciones que contienen el producto deseado, se juntaron y se liofilizaron para dar el compuesto de fórmula V donde R^{23} es -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}NH_{2} (85 mg) como un polvo blanco. MS calculado (MH+), 1520; encontrado, 1520.

Se añadió n-decanal (6,3 mg, 0,040 mmol) a una disolución del compuesto de la etapa anterior (80 mg, 0,040 mmol) en etanol (1,0 mL) y DMF (1,0 mL) y se agitó la mezcla durante 45 minutos. Luego se añadió cianoborohidruro de sodio (0,1 M en metanol, 400 \muL, 0,040 mmol) y se agitó la mezcla durante 3 horas. Los disolventes se eliminaron al vacío, y el residuo se purificó mediante HPLC preparativa. Mediante espectrometría de masas se identificaron las fracciones que contienen el producto deseado, se juntaron y se liofilizaron para dar el compuesto del título como un polvo blanco. MS calculado (MH+), 1661; encontrado, 1661.

Ejemplo 6 Síntesis de un compuesto de fórmula V (donde R^{15} es -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}, R^{22} es -N-(D-glucosamina) y R^{23} es -CH_{2}-N-(N-CH_{3}-D-glucamina))

Se añadió secuencialmente a acetonitrilo acuoso al 50% (10 mL) N-metil-D- glucanina (975 mg, 5,0 mmol), formalina al 37% (84 \muL, 1,1 mmol), DIPEA (348 \muL, 2,0 mmol) y N^{van}-(N-Fmoc-2-n-decilaminoetil) vancomicina (2,15 g, 1,030 mmol). Después de agitar durante 16 h, se precipitó el producto mediante la adición de acetonitrilo (80 mL). El sólido se aisló mediante centrifugación y luego se lavó con acetonitrilo (80 mL). El sólido se disolvió en DMF (6,0 mL) y piperidina (2,0 mL). Después de 30 minutos, se precipitó el producto mediante la adición de acetonitrilo (80 mL). El sólido se aisló mediante centrifugación y se lavó con éter (80 mL). El sólido resultante se secó al vacío y se purificó mediante HPLC en fase inversa (10-35%B durante 40 min a un caudal de 50 mL/min). Mediante espectrometría de masas se identificaron las fracciones que contienen el producto deseado, se juntaron y se liofilizaron para dar el compuesto de la fórmula V donde R^{15} es -CH_{2}-NH-CH_{2} CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3} y R^{23} es -CH_{2}-N-(N-CH_{3}-D-glucamina (1,34 g) como un polvo blanco. MS calculado (MH+), 1839; encontrado, 1839.

El compuesto anterior (sal de tetra TFA) (150 mg, 0,065 mmol) se disolvió en DMF. A esta disolución se añadió secuencialmente clorhidrato de D-glucosamina (35 mg, 0,16 mmol), DIPEA (65 \muL, 0,32 mmol) y una disolución de PyBOP y HOBt en DMF (3,85 mL de una disolución 0,02 M en cada una, 0,077 mmol en cada una). Después de 30 minutos, se precipitó el producto mediante la adición de acetonitrilo (40 mL). El sólido se aisló mediante centrifugación y se lavó con acetonitrilo (40 mL). El sólido resultante se secó al vacío y se purificó mediante HPLC en fase inversa (10-35%B durante 40 min a un caudal de 50 mL/min). Mediante espectrometría de masas se identificaron las fracciones que contienen el producto deseado, se juntaron y liofilizaron para dar el compuesto del título como un polvo blanco. MS calculado (MH+), 2000; encontrado, 2000.

Ejemplo 7 Síntesis de un compuesto de fórmula IV (donde R^{15} es -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}, R^{22} es -OH y R^{27} es -CH_{2}C(O)OCH_{2}CH_{3})

Se trató una disolución de monoclorhidrato de vancomicina (3,72 g, 2,5 mmol) en DMF (35 mL) con diisopropiletilamina (0,87 mL, 5,0 mmol) seguido de N-Fmoc-n-decilaminoacetaldehído (1,05 g, 2,5 mmol). La mezcla de reacción resultante se agitó a temperatura ambiente durante 12 horas. Se añadió etil glioxilato (2,5 mmol, disolución al 50% en tolueno) y se agitó la disolución de reacción a 50ºC durante 6 horas. La mezcla de reacción se enfrió a temperatura ambiente y se trató con NaCNBH3 (0,376 g, 6,0 mmol) seguido por una disolución de TFA (0,58 mL, 7,5 mmol) en MeOH (35 mL). Después de 20 min, se eliminó el MeOH a presión reducida y se precipitó el producto bruto en acetonitrilo (400 mL). El sólido se reunió mediante filtración. El producto bruto se purificó mediante HPLC preparativa para dar el compuesto del título. MS (M+H) 1939,2 (M+, calculado 1938,7).

Ejemplo 8 Síntesis de un compuesto de fórmula IV (donde R^{15} es -CH_{2}-C(O)OCH_{3}, R^{22} es -OH y R^{27} es -CH_{2}C(O)OCH_{3})

Se trató a temperatura ambiente una disolución de clorhidrato de vancomicina (7,43 g, 5,5 mmol) en DMSO (100 mL) con diisopropiletilamina (1,74 mL, 10,0 mmol) seguido de bromoacetato de metilo (0,842 g, 5,5 mmol). La mezcla de reacción se agitó a temperatura ambiente durante la noche. El producto bruto se precipitó usando acetonitrilo (1000 mL). El producto bruto se reunió y se purificó mediante HPLC preparativa para dar el compuesto del título. MS (M+H) 1522,0 (M+, calculado 1519,45).

Usando los procedimientos anteriores y los materiales de partida apropiados se prepararon los compuestos mostrados en las Tablas I-IV. Los datos de los espectros de masas para estos compuestos fueron como sigue:

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
1	1632,6	1632,7
2	1772,9	1774,5
3	1604,6	1605,6
4	1576,5	1577,5
5	1582,5	1583,4
6	1658,6	1659,3
7	1693,0	1693,1
8	1618,6	1619,2
9	1588,5	1589,1
10	1632,6	1634,0
11	1632,6	1633,1
12	1632,6	1634,0
13	1646,6	1647,2
14	1630,6	1631,6
15	1628,6	1626,9
16	--	--
17	1630,6	1631,9
18	--	--
19	1716,8	1718,2
20	1857,0	1859,2 (M+2H)
21	1793,8	1794,9
22	1747,7	1747,4
23	1854,2	1854,0

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
24	1779,7	1780,5
25	1789,7	1789,0
26	--	--
27	1763,7	1764,6
28	1646,6	1646,0
29	1646,6	1646,4
30	1647,6	1646,7
31	1647,6	1646,6
32	1646,6	1645,5
33	1619,5	1618,5
34	1668,6	1667,4
35	1669,6	1669,2
36	1649,7	1648,7
37	1618,5	1619,9
38	1632,6	1631,9
39	1660,6	1661,6
40	1604,5	1605,5
41	1618,5	1619,9
42	1632,6	1633,7
43	1758,8	1760,1
44	--	--
45	--	--
46	--	--
47	--	--
48	--	--
49	--	--
50	--	--
51	1739,8	1739,4
52	--	--
53	--	--
54	1675,7	1676,6

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
55	--	--
56	--	--
57	--	--
58	1719,7	1720,5
59	--	--
60	--	--
61	1689,7	1690,7
62	--	--
63	1703,7	1705,2
64	--	--
65	--	--
66	--	--
67	--	--
68	--	--
69	--	--
70	--	--
71	--	--
72	--	--
73	--	--
74	--	--
75	--	--
76	--	--
77	--	--
78	1582,5	1583,4
79	--	--
80	--	--
81	--	--
82	--	--
83	--	--
84	1624,5	1625,9
85	1638,6	1639,4

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
86	1652,6	1654,1
87	1674,6	1676,0
88	--	--
89	1674,6	1676,0
90	--	--
91	--	--
92	--	--
93	--	--
94	--	--
95	1632,6	1633,7
96	1632,6	1634,0
97	1646,6	1646,9
98	1660,7	1661,9
99	1674,7	1675,7
100	1604,6	1605,6
101	1588,5	1589,1
102	1621,6	1620,6
103	1619,5	1619,1
104	1696,7	1695,8
105	1697,7	1696,9
106	1628,6	1627,2
107	1614,6	1615,2
108	1586,5	1587,2
109	1614,6	1615,2
110	1616,9	1617,8
111	1688,6	1689,8
112	1702,6	1703,9
113	1723,0	1723,8
114	1640,5	1641,8
115	1668,6	1669,4
116	1696,7	1697,6

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
117	1724,7	1726,2
118	1638,6	1640,0
119	1690,6	1690,6
120	1726,6	1728,3
121	1744,7	1745,7
122	1652,6	1653,2
123	1680,7	1682,9
124	1690,6	1691,3
125	1810,8	1811,0
126	1712,7	1713,4
127	1687,7	1688,3
128	1719,7	1719,2
129	1546,4	1547,1
130	1619,5	1618,5
131	1761,7	1761,2
132	1818,8	1819,2
133	1572,5	1571,1
134	1832,8	1831,3
135	1832,8	1833,0
136	1761,7	1761,3
137	1718,7	1719,9
138	1708,6	1709,1
139	--	--
140	1917,9	1916,8
141	1703,7	1704,8
142	1807,8	1809,1
143	1775,8	1776,9
144	1873,7	1875,1
145	1809,8	1810,8
146	1703,7	1703,9
147	1674,6	1675,7

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
148	1665,7	1665,8
149	1653,7	1654,7
150	1690,6	1691,9
151	1731,7	1732,8
152	1743,0	1743,6
153	1704,7	1703,6
154	1809,8	1810,8
155	1759,8	1761,0
156	1535,4	1536,7
157	1637,6	1637,3
158	1743,0	1743,6
159	1696,7	1696,4
160	1757,1	1757,5
161	1884,2	1885,0
162	1838,1	1838,7
163	1758,7	1759,8
164	1660,7	1661,5
165	1760,8	1761,6
166	1857,8	1858,6
167	1783,8	1785,0
168	1887,7	1888,3
169	1813,7	1814,3
170	1776,6	1777,5
171	1738,6	1739,7
172	1654,6	1655,6
173	1670,6	1671,5
174	1624,5	1625,6
175	1662,6	1664,0
176	1640,5	1641,5
177	1682,6	1683,8
178	1638,6	1639,7

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
179	1688,6	1689,5
180	1684,6	1685,9
181	1624,5	1625,9
182	1736,7	1737,6
183	1721,7	1721,7
184	1783,8	1783,0
185	1883,9	1885,0
186	1878,8	1879,1
187	1716,7	1717,0
188	1800,8	1801,0
189	1802,9	1804,4
190	1792,8	1794,2
191	1840,9	1841,9
192	1766,7	1768,8
193	1807,8	1808,8
194	1780,8	1781,8
195	1765,8	1766,9
196	1808,8	1809,1
197	1775,8	1776,8
198	1829,8	1830,8
199	1809,8	1810,9
200	1844,9	1847,2
201	1778,8	1781,5
202	1803,9	1806,9
203	1786,8	1789,8
204	1729,7	1732,2
205	1796,8	1799,5
206	1750,7	1754,8
207	1892,9	1896,5
208	1851,9	1855,9
209	1865,9	1869,2

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
210	1841,9	1846,2 (M+2H)
211	1717,7	1718,7
212	1729,7	1731,0
213	1729,7	1731,0
214	1760,8	1761,0
215	1795,8	1796,4
216	1703,7	1705,1
217	1761,7	1763,4
218	1830,8	1830,9
219	1731,7	1733,1
220	1775,8	1777,5
221	1760,8	1761,9
222	1743,7	1744,8
223	2098,1	2085 (M+2H)
224	2020,1	2022,2 (M+2H)
225	1743,0	1743,7
226	1764,7	1765,6
227	1784,7	1784,8
228	1740,6	1740,8
229	1697,7	1698,5
230	1647,6	1648,7
231	1855,5	1856,8
232	1655,6	1656,5
233	1677,7	1679,0
234	1635,6	1636,7
235	1811,8	1812,6
236	1711,7	1712,7
237	1649,7	1649,5
238	1663,7	1663,5
239	1683,7	1684,4
240	1649,7	1650,7

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
241	1669,7	1669,9
242	1725,8	1726,6
243	1669,7	1670,6
244	1661,7	1661,7
245	1774,5	1774,6
246	1788,6	1788,7
247	1726,1	1726,6
248	1740,1	1741,0
249	1663,7	1664,5
250	1667,7	1678,9
251	1699,7	1700,5
252	1659,7	1660,3
253	1740,1	1740,7
254	1754,1	1754,5
255	1699,6	1700,5
256	1810,8	1810,9
257	1757,6	1759,6
258	1716,7	1717,6
259	1786,7	1786,4
260	1665,7	1665,8
261	1699,7	1699,7
262	1713,7	1714,6
263	1722,1	1722,9
264	1736,2	1736,8
265	1681,7	1680,8
266	1826,8	1826,1
267	1706,7	1706,0
268	1675,7	1674,2
269	1718,7	1718,6
270	1690,6	1691,3
271	1748,7	1749,2

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
272	1723,7	1722,2
273	1810,8	1811,0
274	1774,7	--
275	1766,7	1768,0
276	1889,0	1898,8
277	1718,7	1719,1
278	1840,8	1842,0
279	1830,8	1830,9
280	1846,0	1846,8
281	1674,6	1675,7
282	1839,8	1840,4
283	1900,2	1900,4
284	1855,8	1857,1
285	2001,0	2001,6
286	1954,9	1954,5
287	1661,7	1662,7
288	1857,2	1857,2
289	1719,6	1720,4
290	1801,9	1803,0
291	1733,7	1735,8
292	1775,8	1776,6
293	1731,7	1732,8
294	1749,8	1750,8
295	1735,7	1736,7
296	1749,8	1750,5
297	1746,8	1747,8
298	1832,0	1832,7
299	1769,8	1771,2
300	1788,8	1790,1
301	1774,8	1776,3
302	1875,8	1874,7

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
303	1903,9	1901,9
304	1954,9	1954,5
305	1855,8	1857,1
306	1855,8	1857,1
307	1915,8	--
308	2047,1	2048,6 (M+2H)
309	1811,8	1813,2
310	1861,0	1861,9
311	1856,9	1856,6
312	1839,8	1840,8
313	1633,6	1634,8
314	1777,7	1779,0
315	1697,7	1698,7
316	1725,7	1726,6
317	1753,8	1754,8
318	1689,7	1690,9
319	1872,9	1872,8
320	1950,3	1951,1
321	1835,8	1836,9
322	1813,8	1813,6
323	1964,3	1964,9
324	1845,8	1846,8
325	1755,7	1757,1
326	1930,3	1931,5
327	1894,9	1896,1
328	1766,8	1766,3
329	1864,8	1866,1
330	1867,9	1868,6
331	1857,7	1858,9
332	1947,8	1948,9
333	1877,8	1878,7

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
334	1809,8	1811,1
335	1825,8	1827,1
336	1833,9	1834,8
337	1914,9	1915,3
338	1650,6	1651,6
339	1664,7	1665,7
340	1739,7	1740,7
341	1678,7	1679,2
342	1711,7	1712,2
343	1933,8	1935,2
344	1706,8	1707,7
345	1767,8	1768,6
346	1698,7	1699,0
347	1726,7	1727,8
348	1754,8	1755,4
349	1772,7	1773,4
350	1904,9	1905,8
351	1738,8	1739,8
352	1856,9	1856,6
353	1505,4	1506,1
354	1505,4	1506,7
355	1688,8	1689,8
356	1712,7	1713,9
357	1666,6	1668,7
358	1589,6	1590,8
359	1603,6	1604,6
360	1633,6	1635,1
361	1633,6	1634,3
362	1634,5	1635,5
363	1547,5	1548,1
364	1642,6	1643,6

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
365	1620,5	1621,7
366	1618,6	1620,0
367	1604,6	1605,5
368	1588,6	1590,8
369	1652,6	1653,5
370	1576,5	1576,7
371	1668,6	1669,7
372	1668,6	1669,7
373	1756,7	1758,2
374	1751,6	1753,0
375	1589,5	1590,5
376	1673,6	1674,8
377	1675,7	1676,1
378	1641,5	1642,0
379	1640,5	1640,7
380	1665,6	1666,8
381	1713,7	1714,2
382	1639,6	1641,0
383	1680,6	1682,0
384	1653,6	1654,7
385	1638,6	1638,9
386	1681,6	1683,5
387	1650,5	1651,9
388	1688,6	1704,0
389	1657,7	1659,0
390	1648,6	1650,0
391	1656,5	1657,8
392	1710,6	1711,4
393	1682,6	1683,5
394	1719,6	1720,7
395	1699,5	1698,7

(Continuación)

Compuesto No.	MW (en base libre)	MH+ Observado
396	1653,5	1654,7
397	1678,6	1679,8
398	1661,6	1661,8
399	1604,5	1605,4
400	1671,6	1672,0
401	1604,6	1605,7
402	1695,7	1696,7
403	1562,5	1562,9
404	1632,6	1634,0
405	1618,6	1619,9
406	1709,7	1710,7
407	1737,7	1738,9
408	1765,8	1766,8
409	1662,7	1663,5
410	1676,7	1676,8
411	1751,8	1753,0
412	1690,7	1691,2
413	1723,7	1723,9
414	1718,8	1719,7
415	1710,7	1711,6
416	1738,8	1738,9
417	1766,8	1767,4
418	1784,7	1784,4
419	1313,3	1314,6
420	1256,4	1257,7
421	1631,6	1632,2
422	1342,3	1342,8

Ejemplo 11 Determinación de la actividad antibacteriana A. Determinación de la actividad antibacteriana in vitro 1. Determinación de las concentraciones inhibitorias mínimas (MICs)

Se obtuvieron cepas bacterianas de Colección Americana de Cultivo de Tejidos Tipo (ATCC), Hospital de la Universidad de Stanford (SU), Laboratorio Regional Permanente Kaiser en Berkeley (KPB), Hospital General de

\hbox{Massachusetts}

(MGH), los Centros para el Control de Enfermedades (CDC), el Hospital de la Administración de Veteranos de San Francisco (SFVA) o el Hospital San Francisco de la Universidad de California (UCSF). Los enterococos resistentes a la vancomicina se clasificaron según su fenotipo como Van A o Van B basándose en su sensibilidad a teicoplanina. Algunos enterococos resistentes a la vancomicina que se habían clasificado según su genotipo como Van A, Van B, Van C1 o Van C2 se obtuvieron de la Clínica Mayo.

Las concentraciones inhibitorias mínimas (MICs) se midieron en un procedimiento de microdilución en caldo bajo las directrices del NCCLS. De forma rutinaria, se diluyeron en serie los compuestos en caldo Mueller-Hilton en una placa de microtitulación de 96 pocillos. Durante la noche se diluyeron los cultivos de cepas bacterianas basándose en la absorbancia a 600 nm de modo que la concentración final en cada pocillo fue de 5 x 10^{6} cfu/mL. Las placas se devolvieron a un incubador a 35ºC. Al día siguiente (ó 24 horas en el caso de cepas de Enterococos), se determinaron las MICs mediante inspección visual de las placas. Las cepas ensayadas en la criba inicial incluyeron Staphylococcus aureus sensible a la meticilina (MSSA) Staphylococcus aureus resistente a la meticilina, Staphylococcus epidermidis sensible a la meticilina (MSSE), Staphylococcus epidermidis resistente a la meticilina (MRSE), Enterococcus faecium sensible a la vancomicina (VSE Fm), Enterococcus faecalis sensible a la vancomicina (VSE Fs), Enterococcus faecium resistentes a la vancomicina resistentes también a la teicoplanina (VRE Fm Van A), Enterococcus faecium resistentes a la vancomicina sensibles también a la teicoplanina (VRE Fm Van B), Enterococcus faecalis resistentes a la vancomicina resistentes también a la teicoplanina (VRE Fs Van A), Enterococcus faecalis resistentes a la vancomicina sensibles a la teicoplanina (VRE Fs Van B), enterococos gallinarium del genotipo Van A (VRE Gm Van A), enterococos gallinarium del genotipo Van C-1 (VRE Gm Van C-1), enterococos casseliflavus del genotipo Van C-2 VRE Cs Van C-2), enterococos flavescens del genotipo Van C-2 (VRE Fv Van C-2) y Streptococcus pneumoniae sensibles a la penicilina (PSSP) y Streptococcus pneumoniae resistentes a la penicilina (PSRP). Debido a la incapacidad de los PSSP y PSRP para crecer bien en el caldo Mueller-Hinton, las MICs con esas cepas se determinaron usando o caldo TSA complementado con sangre desfibrinada o placas de agar sangre. Los compuestos que tuvieron una actividad significativa frente a las cepas mencionadas anteriormente se ensayaron para determinar sus valores MIC en un panel más largo de aislados clínicos que incluye las especies listadas anteriormente así como Staphylococcus coagulasa negativa sin especificar especie tanto sensibles como resistentes a la meticilina (MS-CNS y MR-CNS). Además, se ensayaron para MICs frente a organismos gram negativos, como la Escherichia coli y la Pseudomonas aeruginosa.

2. Determinación del tiempo de muerte

Los experimentos para determinar el tiempo requerido para matar las bacterias se condujeron como se describe en Lorian "Antibiotics in Laboratory Medicine", Cuarta Edición, Williams y Wilkins (1991), las descripciones de los cuales se incorporan en la invención a modo de referencia en su totalidad. Estos experimentos se condujeron normalmente tanto con cepas de estafilococos como de enterococos.

Brevemente, se seleccionaron varias colonias de una placa de agar y se hicieron crecer a 35ºC bajo agitación constante hasta que se alcanza un turbidez de aproximadamente 1,5 y 10^{8} CFU/mL. Luego se diluye la muestra hasta aproximadamente 6 x 10^{6} CFU/mL y se incuba a 35ºC continuando con la agitación constante. Se recogieron alícuotas a distintos tiempos y se realizaron diluciones en serie de cinco a diez veces. Se usó el procedimiento de placa extendida para determinar el número de unidades formadoras de colonias (CFUs).

Los compuestos de la invención fueron activos en los anteriores ensayos in vitro y demostraron un amplio espectro de actividad.

B. Determinación in vivo de la actividad antibacteriana 1. Estudios de tolerabilidad aguda en ratones

En estos estudios se administró un compuesto de la por vía intravenosa o subcutánea y se observó durante 5-15 minutos. Si no había efectos adversos, se aumentaba la dosis en un segundo grupo de ratones. Este incremento de las dosis continuó hasta que ocurrió la mortalidad, o hasta que se alcanzó la dosis máxima. Generalmente, la dosis comenzó a 20 mg/kg y se aumentó en 20 mg/kg cada vez hasta que se alcanzó la dosis máxima tolerada (MTD).

2. Estudios de biodisponibilidad en ratones

Se administró a los ratones un compuesto de la invención por vía intravenosa o subcutánea en una dosis terapéutica (en general, aproximadamente 50 mg/kg). Se pusieron grupos de animales en jaulas metabólicas de modo que se pudiesen recoger la orina y las heces para análisis. Se sacrificaron grupos de animales (n=3) a varios tiempos (10 min, 1 hora y 4 horas). Se recogió sangre mediante punción cardíaca y se recogieron los siguientes órganos: pulmón, hígado, corazón, cerebro, riñón y bazo. Los tejidos se pesaron y se prepararon para análisis mediante HPLC. El análisis mediante HPLC de los tejidos homogeneizados y de los fluidos se usó para determinar la concentración del compuesto del ensayo o el lil presente. Los productos metabólicos resultantes de cambios en el compuesto de ensayo también se determinaron en este momento.

3. Modelo de septicemia de ratones

En este modelo, se administró a los ratones (N= 5 a 10 ratones por grupo) por vía intraperitoneal una cepa apropiadamente virulenta de bacteria (lo más comúnmente S. aureus, o E. Faecalis o E. Faecium). La bacteria se combinó con mucina gástrica de cerdo para aumentar la virulencia. La dosis de bacteria (normalmente 10^{5}-10^{7}) fue la suficiente para inducir la mortalidad de todos los ratones durante un periodo de tres días. Una hora después de que se administró la bacteria, se administró un compuesto de la presente invención en una dosis única o por vía IV o por vía subcutánea. Se administró cada dosis a grupos de 5 a 10 ratones, en dosis que variaban típicamente entre un máximo de aproximadamente 20 mg/kg y un mínimo de menos de 1 mg/kg. En cada experimento se administró un control positivo (normalmente vancomicina con cepas sensibles a la vancomicina). A partir de los resultados se calculó a dosis a la cual se salvaron aproximadamente el 50% de los animales.

4. Modelo de muslo neutropénico

En este modelo, se evaluó la actividad antibacteriana de un compuesto de la invención frente a una cepa apropiadamente virulenta de bacteria (lo más comúnmente S. aureus, o E. Faecalis o E. Faecium, sensibles o resistentes a la vancomicina). Los ratones se volvieron inicialmente neutropénicos mediante la administración de ciclofosfamida a 200 mg/kg en el día 0 y en el día 2. En el día 4 se infectaron en el muslo anterior izquierdo mediante una inyección IM de una dosis única de bacterias. Luego se administró a los ratones el compuesto del ensayo una hora después de las bacterias y los ratones se sacrificaron (3 por cada punto de tiempo) más tarde a distintos tiempos (normalmente 1, 2,5, 4 y 24 horas) y se realizó la excisión del muslo, se homogeneizó y se determinó el número de CFUs (unidades formadoras de colonias) mediante preparación de cultivos en placas. La sangre también se preparó en placas para determinar las CFUs en la sangre.

5. Estudios farmacocinéticos

Se puede determinar la velocidad a la que se elimina un compuesto de la presente invención o en ratones o en ratas. En ratas, los ensayos animales se canularon en la vena yugular. El compuesto del ensayo se administró a través de la inyección en una vena de la cola y se sacó sangre de la cánula a distintos puntos de tiempo (normalmente 5, 15, 30, 60 minutos y 2, 4, 6 y 24 horas). En ratones, el compuesto del ensayo también se administró a través de inyección en una vena de la cola y a distintos puntos de tiempo. La sangre se obtuvo normalmente mediante punción cardíaca. La concentración del compuesto del ensayo restante se determinó mediante HPLC.

Claims

1. Un compuesto de fórmula I:

1

en la que

R^{1} es un grupo sacárido sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{2} es hidrógeno o un grupo sacárido opcionalmente sustituido con - R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{3} es -OR^{c} ó -NR^{c}R^{c};

\hbox{(Z) _{x} }

;

R^{5} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, halo, -CH(R^{c})-NR^{c}R^{c}, -CH(R^{c})-NR^{c}R^{e} y -CH(R^{c})- NR^{c}-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{6} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, -C(O)R^{d} y un grupo sacárido opcionalmente sustituido con -NR^{c}-R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, ó R^{5} y R^{6} pueden estar unidos, junto con los átomos a los que están unidos, para formar un anillo heterocíclico opcionalmente sustituido con -NR^{c}-R^{a}-Y- R^{b}-(Z)_{x};

R^{7} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, - R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}, y -C(O)R^{d};

R^{10} se selecciona del grupo constituido por alquilo y alquilo sustituido;

R^{11} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico, ó R^{10} y R^{11} están unidos, junto con los átomos de carbono y de nitrógeno a los que están enlazados, para formar un anillo heterocíclico;

R^{13} se selecciona del grupo constituido por hidrógeno u –OR^{14};

R^{14} se selecciona de entre hidrógeno, -C(O)R^{d} y un grupo sacárido;

cada R^{a} se selecciona independientemente de entre el grupo constituido por alquileno, alquileno sustituido, alquenileno, alquenileno sustituido, alquinileno y alquinileno sustituido;

cada R^{b} se selecciona independientemente de entre el grupo constituido por alquileno, alquileno sustituido, alquenileno, alquenileno sustituido, alquinileno y alquinileno sustituido;

cada R^{c} se selecciona independientemente de entre el grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo, grupo heterocíclico y -C(O)R^{d};

cada R^{d} se selecciona independientemente de entre el grupo constituido por alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

R^{e} es un grupo sacárido;

X^{1}, X^{2} y X^{3} se seleccionan independientemente de entre hidrógeno o cloro;

cada Y se selecciona independientemente de entre el grupo constituido por oxígeno, azufre, -S-S-, -NR^{c}-, -S(O)-, -SO_{2}-, -NR^{c}C(O)-, - OSO_{2}-, -OC(O)-, -NR^{c}SO_{2}-, -C(O)NR^{c}-, -C(O)O-, - SO_{2}NR^{c}-, -SO_{2}O-, -P(O)(OR^{c})O-, -P(O)(OR^{c})NR^{c}-, -OP(O)(OR^{c})O-, -OP(O)(OR^{c})NR^{c}-, -OC(O)O-, -NR^{c}C(O)O-, - NR^{c}C(O)NR^{c}-, -OC(O)NR^{c}- y -NR^{c}SO_{2}NR^{c}-;

cada Z se selecciona independientemente de entre hidrógeno, arilo, cicloalquilo, cicloalquenilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

n es 0, 1 ó 2;

x es 1 ó 2;

2. El compuesto de la reivindicación 1, en el que R^{1} es un grupo sacárido de fórmula:

67

en la que

R^{15} es -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x}; y

R^{16} es hidrógeno o metilo.

3. El compuesto de la reivindicación 2, en el que R^{15} es un grupo -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} seleccionado de entre el grupo constituido por:

-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{7}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-(CH_{2})_{11}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{10}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})3-CH=CH-(CH_{2})_{4}CH_{3} (trans);

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{7}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S(O)-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{6}Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-[4-(CH_{3})_{2}CHCH_{2}-]-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-(4-CF_{3}-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S(O)-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S(O)-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-[3,4-di-Cl-PhCH_{2}O-)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-[4-(4-Ph)-Ph]-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph; y

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-(Ph-C\equivC-)-Ph.

4. Un compuesto de fórmula II:

68

en la que

R^{21} es un grupo sacárido sustituido con -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{22} es -OR^{c} ó -NR^{c}R^{c};

R^{23} se selecciona de entre el grupo constituido por hidrógeno, halo, -CH(R^{c})-NR^{c}R^{c}, -CH(R^{c})-R^{e} y -CH(R^{c})-NR^{c}- R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x};

R^{24} se selecciona de entre el grupo constituido por hidrógeno y alquilos inferiores;

R^{25} se selecciona de entre el grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo y grupo heterocíclico;

R^{26} se selecciona de entre el grupo constituido por hidrógeno y alquilos inferiores; ó R^{25} y R^{26} están unidos, junto con los átomos de carbono y nitrógeno a los cuales están unidos, para formar un anillo heterocíclico;

R^{27} se selecciona de entre el grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido y -C(O)R^{d};

cada R^{c} se selecciona independientemente de entre el grupo constituido por hidrógeno, alquilo, alquilo sustituido, alquenilo, alquenilo sustituido, alquinilo, alquinilo sustituido, cicloalquilo, cicloalquilo sustituido, cicloalquenilo, cicloalquenilo sustituido, arilo, heteroarilo, grupo heterocíclico y - C(O)R^{d};

R^{e} es un grupo aminosacárido;

n es 0, 1 ó 2;

x es 1 ó 2;

5. El compuesto de la reivindicación 4, en el que R^{21} es un grupo sacárido de fórmula:

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en la que

R^{15} es -R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} , y

R^{16} es hidrógeno o metilo.

6. El compuesto de la reivindicación 5, en el que R^{15} es un grupo - R^{a}-Y-R^{b}-(Z)_{x} seleccionado de entre el grupo constituido por:

-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{7}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-(CH_{2})_{11}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{10}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{3}-CH=CH-(CH_{2})_{4}CH_{3} (trans);

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{7}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S(O)-(CH_{2})_{9}CH_{3};

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{6}Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-(CH_{2})_{8}Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-[4-(CH_{3})_{2}CHCH_{2}-]-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NH-CH_{2}-4-(4-CF_{3}-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-S(O)-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S(O)-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-S-CH_{2}-4-[3,4-di-Cl-PhCH_{2}O-)-Ph;

-CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-[4-(4-Ph)-Ph]-Ph;

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-(4-Cl-Ph)-Ph; y

-CH_{2}CH_{2}CH_{2}-NHSO_{2}-CH_{2}-4-(Ph-C\equivC-)-Ph.

7. El compuesto de la reivindicación 5, en el que R^{23} es hidrógeno, - CH_{2}-N-(N-CH_{3}-D-glucamina); -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH- (CH_{2})_{9}CH_{3}; -CH_{2}-NH-CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{11}CH_{3}; -CH_{2}-NH-(CH_{2})_{5}-COOH; ó -CH_{2}-N-(ácido 2-amino-2-deoxiglucónico).

8. El compuesto de la reivindicación 7, en el que R^{24} es hidrógeno y R^{26} es hidrógeno o metilo.

9. El compuesto de la reivindicación 8, en el que R^{25} es isobutilo.

10. Un compuesto mostrado en cualquiera de las Tablas I, II, III, IV, o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.

11. El compuesto de la reivindicación 5, en el que R^{15} es - CH_{2}CH_{2}-NH-(CH_{2})_{9}CH_{3}; R^{16} es metilo; R^{22} es - OH; R^{23} es hidrógeno; R^{24} es hidrógeno; R^{25} es isobutilo; R^{26} es metilo y R^{27} es hidrógeno.

12. Una composición farmacéutica que comprende un vehículo farmacéuticamente aceptable y una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto de glicopéptido de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11.

13. Un compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11 para uso como medicamento.

14. Uso de un compuesto según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11 para la fabricación de un medicamento para el tratamiento de un mamífero que tiene una enfermedad bacteriana.