DE10064454A1 - Veränderung des Gehalts an Feinchemikalien in Organismen durch genetische Veränderung des Shikimatweges - Google Patents
Veränderung des Gehalts an Feinchemikalien in Organismen durch genetische Veränderung des ShikimatwegesInfo
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Abstract
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Herstellung von Feinchemikalien, insbesondere Vitamin E, Vitamin K und/oder Ubichinon durch Kultivierung von Organismen, insbesondere Pflanzen, die gegenüber dem Wildtyp einen genetisch veränderten Shikimatweg aufweisen, sowie die transgenen Organismen selbst.
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft ein verfahren zur Herstellung
von Feinchemikalien, insbesondere Vitamin E, Vitamin K und/oder
Ubichinon durch Kultivierung von Organismen, insbesondere
Pflanzen, die gegenüber dem Wildtyp einen genetisch veränderten
Shikimatweg aufweisen, sowie die transgenen Organismen selbst.
Organismen, insbesondere Pflanzen, weisen eine Reihe von Stoff
wechselprodukten auf, die als Feinchemikalien einen hohen wirt
schaftlichen Wert haben. Als Feinchemikalien sind beispielsweise
aromatische Aminosäuren, Salicylsäurederivate, Phenylpropanoide,
Flavonoide, Stilbene, Xanthone und Chinone, insbesondere die
gemischten Prenyllipid-Verbindungen mit Vitamin E oder Vitamin K
Aktivität zu nennen.
In biotechnologischen Verfahren zur Herstellung von Fein
chemikalien werden Organismen, die in der Lage sind diese
Feinchemikalien herzustellen, kultiviert und die gewünschten
Feinchemikalien aus den Organismen isoliert.
Für wirtschaftliche Verfahren zur biotechnologischen Herstellung
von Feinchemikalien, aber auch für die Verwendung der Organismen
als prozessierte oder nicht prozessierte Lebens- oder Futter
mittel, ist es wünschenswert, den Gehalt an Feinchemikalien
in den Organismen gezielt zu verändern, wie beispielsweise den
Gehalt der gewünschten Feinchemikalie zu erhöhen und/oder den
Metabolitfluß zu nicht gewünschten Feinchemikalien zu hemmen.
Wirtschaftlich bedeutende Feinchemikalien sind beispielsweise
Plastochinone, Ubichinone sowie Verbindungen mit Vitamin E- oder
Vitamin K-Aktivität, die eine Isoprenoid-Seitenkette aufweisen,
die mit einem aromatischen Kern verbunden ist.
Die in der Natur vorkommenden acht Verbindungen mit Vitamin E-
Aktivität sind Derivate des 6-Chromanols (Ullmann's Encyclopedia
of Industrial Chemistry, Vol. A 27 (1996), VCH Verlagsgesell
schaft, Chapter 4., 478-488, Vitamin E). Die Gruppe der Toco
pherole (1a-d) weist eine gesättigte Seitenkette auf, die Gruppe
der Tocotrienole (2a-d) eine ungesättigte Seitenkette:
1a, α-Tocopherol: R1 = R2 = R3 = CH3
1b, β-Tocopherol: R1 = R3 = CH3, R2 = H
1c, γ-Tocopherol: R1 = H, R2 = R3 = CH3
1d, δ-Tocopherol: R1 = R2 = H, R3 = CH3
1b, β-Tocopherol: R1 = R3 = CH3, R2 = H
1c, γ-Tocopherol: R1 = H, R2 = R3 = CH3
1d, δ-Tocopherol: R1 = R2 = H, R3 = CH3
2a, α-Tocotrienol: R1 = R2 = R3 = CH3
2b, β-Tocotrienol: R1 = R2 = CH3, R2 = H
2c, γ-Tocotrienol: R1 = H, R2 = R3 = CH3
2d, δ-Tocotrienol: R1 = R2 = H, R3 = CH3
2b, β-Tocotrienol: R1 = R2 = CH3, R2 = H
2c, γ-Tocotrienol: R1 = H, R2 = R3 = CH3
2d, δ-Tocotrienol: R1 = R2 = H, R3 = CH3
In der vorliegenden Erfindung werden unter Vitamin E alle vor
stehend erwähnten Tocopherole und Tocotrienole mit Vitamin-E-
Aktivität verstanden.
Diese Verbindungen mit Vitamin-E-Aktivität sind wichtige natür
liche fett-lösliche Antioxidantien. Ein Mangel an Vitamin E führt
bei Menschen und Tieren zu pathophysiologischen Situationen.
Vitamin E-Verbindungen haben daher einen hohen wirtschaftlichen
Wert als Zusatzstoffe im Food- und Feed-Bereich, in pharma
zeutischen Formulierungen und in kosmetischen Anwendungen.
Die in der Natur vorkommenden Verbindungen mit Vitamin
K-Aktivität sind Derivate des 1,4-Naphthochinons (Ullmann's
Encyclopedia of Industrial Chemistry, Vol. A 27 (1996), VCH
Verlagsgesellschaft, Chapter 5., 488-506, Vitamin K).
Phyllochinon (frühere Bezeichnung: Vitamin K1) weist eine größten
teils gesättigte Seitenkette auf, während die Gruppe der Mena
chinone-n (frühere Bezeichnung: Vitamin K2) eine ungesättigte
Seitenkette mit 4 bis 13 Isoprenylresten aufweist.
In der vorliegenden Erfindung werden unter Vitamin K alle Ver
bindungen mit Vitamin K-Aktivität verstanden, insbesondere die
vorstehend erwähnten Verbindungen.
Ausgangspunkt der Biosynthese der Isoprenoidseitenkette ist Iso
pentenylpyrophosphat (IPP). IPP steht im Gleichgewicht mit seinem
Isomer Dimethylallyl Pyrophosphat (DMAPP). Eine Kondensation von
IPP mit DMAPP in Kopf-Schwanz Anlagerung ergibt das Monoterpen
(C10) Geranyl-Pyrophosphat (GPP). Die Addition von weiteren IPP
Einheiten führt zum Sesquiterpen (C15) Farnesy-Pyrophosphat (FPP)
und zum Diterpen (C20) Geranyl-Geranyl-Pyrophosphat (GGPP).
Phyllochinon enthält eine C20 Phytyl-Kette, in der nur die erste
Isopren-Einheit eine Doppelbindung enthält. GGPP wird durch die
Geranylgeranyl-Pyrophosphat-Oxidoreduktase (GGPPOR) zum Phytyl-
Pyrophosphat (PPP) umgeformt, dem Ausgangsstoff für die weitere
Bildung von Tocopherolen.
Bei den Ringstrukturen der gemischten Prenyllipide, die zur
Bildung der Vitamine E und K führen, handelt es sich um Chinone,
deren Ausgangsmetabolite aus dem Shikimat-Weg stammen.
Chorismat wird ausgehend von Erythrose-4-Phosphat und Phos
phoenolpyruvat (PEP) durch deren Kondensation zu 3-deoxy-D-
Arabino-heptulosonat-7-Phosphat (DAHP) über die Zwischenstufen
3'-Dehydroquinat, 3'-Dehydroshikimat, Shikimat, Shikimat-3-
Phosphat und 5'-Enolpyruvylshikimat-3-Phosphat gebildet. Dabei
wird das Erythrose-4-Phosphat vom Calvinzyklus gebildet und das
PEP von der Glykolyse bereitgestellt.
In höheren Pflanzen wird Tyrosin ausgehend von Chorismat über
Prephenat und Arogenat gebildet. Die aromatische Aminosäure
Tyrosin wird in Hydroxyphenyl-Pyruvat umgewandelt, welches durch
Dioxygenierung in Homogentisinsäure überführt wird.
Die Homogentisinsäure wird anschließend an Phytylpyrophosphat
(PPP) bzw. Geranylgeranylpyrophosphat gebunden, um die Vorläufer
von α-Tocopherol und α-Tocotrienol, das 2-Methyl-6-phytylhydro
chinon bzw. das 2-Methyl-6-geranylgeranylhydrochinon zu bilden.
Durch Methylierungsschritte mit S-Adenosylmethionin als Methyl-
Gruppen-Donor entsteht zunächst 2,3-Dimethyl-6-phytylquinol, dann
durch Zyklisierung γ-Tocopherol und durch nochmalige Methylierung
α-Tocopherol.
Es ist bekannt, durch Überexpression bzw. Herunterregulation von
Biosynthesegenen des Tocopherolbiosyntheseweges, unter dem in
der vorliegenden Erfindung der Biosyntheseweg von Hydroxyphenylpyruvat
bis Tocopherol verstanden wird, den Gehalt an Vitamin E
in Pflanzen zu modifizieren.
WO 97/27285 beschreibt eine Modifikation des Tocopherol-Gehaltes
durch verstärkte Expression bzw. durch Herunterregulation des
Enzyms p-Hydroxyphenylpyruvatdioxygenase (HPPD).
WO 99/04622 bzw. D. DellaPenna et al., Science 1998, 282,
2098-2100 beschreiben Gensequenzen codierend für eine γ-Toco
pherolmethyltransferase aus Synechocystis PCC6803 und Arabidopsis
thaliana und deren Einbau in transgene Pflanzen, die einen
modifizierten Vitamin E-Gehalt aufweisen.
Ferner ist bekannt, durch Überexpression bzw. Herunterregulation
von Biosynthesegenen des Biosyntheseweges der Isoprenoid-Seiten
kette, den Gehalt an Vitamin E in Pflanzen zu modifizieren.
WO 99/23231 zeigt, daß die Expression einer Geranylgeranyl-
Reductase in transgenen Pflanzen eine gesteigerte Tocopherol
biosynthese zur Folge hat.
WO 00/08169 beschreibt Gensequenzen codierend eine
1-Deoxy-D-Xylose-5-Phosphat-Synthase und eine Geranyl-Geranyl-
Pyrophosphat Oxidoreduktase un deren Einbau in transgene
Pflanzen, die einen modifizierten Vitamin E-Gehalt aufweisen.
Alle diese Methoden liefern zwar Organismen, insbesondere
Pflanzen, die einen modifizierten Gehalt an der Feinchemikalie
Vitamin E aufweisen, dennoch ist oft die Höhe des Gehalts an
Vitamin E für Verfahren zur Herstellung von Vitamin E durch
Isolierung aus diesen transgenen Organismen noch nicht zufrieden
stellend.
Der Erfindung lag daher die Aufgabe zugrunde ein weiteres Ver
fahren zur Herstellung von Feinchemikalien durch Kultivieren von
Organismen, bzw. transgene Organismen die Feinchemikalien her
stellen können, mit optimierten Eigenschaften zur Verfügung zu
stellen, die die geschilderten Nachteile des Standes der Technik
nicht aufweisen.
Demgemäß wurde ein Verfahren zur Herstellung von Feinchemikalien
gefunden, indem man Organismen kultiviert, die gegenüber dem
Wildtyp einen genetisch veränderten Shikimatweg aufweisen.
Unter Shikimatweg wird in der vorliegenden Erfindung, ins
besondere für höhere Pflanzen der vorstehend beschriebene Bio
syntheseweg ausgehend von D-Erythrose-4-Phosphat über Shikimat,
Chorismat, Prephenat, Arogenat, Tyrosin bis einschließlich
zu 4-Hydroxyphenylpyruvat verstanden (G. Michal, Biochemical
Pathways, Biochemie-Atlas, Spektrum Akademischer Verlag
Heidelberg, Berlin, 1999, Seite 59 bis 60,Abb. 4.7-1 und
Kapitel 4.7.1)
Vorzugsweise wird in der vorliegenden Erfindung unter Shikimat
weg der Stoffwechselweg von Shikimat bis 4-Hydroxyphenylpyruvat,
besonders bevorzugt der Stoffwechselweg von Chorismat bis
4-Hydroxyphenylpyruvat verstanden, wobei für Pflanzen der
Stoffwechselweg ab Chorismat über Prephenat, Arogenat und
Tyrosin verläuft.
Unter Feinchemikalien werden Stoffwechselprodukte des Organismus
verstanden, die aus dem Shikimatweg resultieren. Der Shikimatweg
beginnt dabei bei D-Erythrose-4-Phosphat und endet bei 4-Hydroxy
phenylpyruvat, wie vorstehend beschrieben. Für diese Stoff
wechselprodukte stellen die Ausgangsverbindung D-Erythrose-4-
Phosphat, die Endverbindung 4-Hydroxyphenylpyruvat sowie alle,
vorstehend erwähnten, Zwischenstufen des Shikimatweges, die
Ausgangsverbindungen, nachstehend auch Zwischenverbindungen
bezeichnet, dar, die biosynthetisch vom Organismus in die Stoff
wechselprodukte umgewandelt werden.
Bevorzugte Feinchemikalien sind die aromatischen Aminosäuren,
wie beispielsweise Phenylalanin, Tyrosin und Tryptophan, Salicyl
säurederivate, Folsäurederivate, Phenylpropanoide, wie beispiels
weise Lignin, Lignane oder Coumarine, insbesondere Scopoletin
oder Scopolin, Flavonoide, wie beispielsweise Chalcone, Flava
none, Flavanole, Anthocyanidine oder Isoflavonoide, Stilbene,
Xanthone, oder Chinonderivate, wie beispielsweise Vitamin E,
Vitamin K, Ubichinone, Plastochinone oder Shikonin.
Besonders bevorzugte Feinchemikalien sind Vitamin E, Vitamin K
oder Ubichinon, insbesondere Vitamin E.
Je nachdem ob die genetische Veränderung des Shikimatweges zu
einer Erhöhung oder Erniedrigung des Metabolitflusses zu einer
bestimmten Zwischenverbindung - die Teil des Shikimatweges ist -
führt, erhöht sich bzw. erniedrigt sich der Gehalt der Fein
chemikalie die biosynthetisch im Organismus aus dieser Zwischen
verbindung hergestellt wird. Unter genetischer Veränderung
des Shikimatweges wird somit vorzugsweise die Erhöhung oder
Erniedrigung des Metabolitflußes zu einer Zwischenverbindung
des Shikimatweges verstanden.
Genetische Veränderung des Shikimatweges die zu einer Erhöhung
des Metabolitflusses zu einer Zwischenverbindung und damit der
entsprechenden Feinchemikalie führen, sind beispielsweise die
folgenden Maßnahmen A, B oder C:
- 1. A: Erhöhung der Aktivität mindestens eines Enzyms des Shikimat weges des Wildtyps, beispielsweise durch Überexpression von Genen des Shikimat weges, die Proteine mit dieser enzymatischen Aktivität codieren, durch das Ausschalten von negativen Regulations mechanismen von zur Zwischenverbindung führenden Stoff wechselwegen, wie beispielsweise das Ausschalten der Feed back-Inhibierung oder das Einbringen von orthologen Genen die im gewünschten Organismus keiner Regulation unterliegen.
- 2. B: Einbringen mindestens eines Gens in den Organismus zu dem der Wildtyp kein orthologes Gen aufweist und das den Stoffwechselweg des Shikimatweges des Wildtyps überbrückt. Dieses Gen kann beispielsweise durch die neue Genfunktion eine Erhöhung des Stoffflusses zu der Zwischenverbindung bewirken, bei der die Überbrückung endet.
- 3. C: Inaktivierung von Genen die Enzyme kodieren, die mit den
Enzymen des Stoffwechselwegs, der zum gewünschten Produkt
führt, konkurrieren.
Genetische Veränderung des Shikimatweges die zu einer Erniedrigung des Metabolitflusses zu einer Zwischenverbindung und damit der entsprechenden Feinchemikalie führen, sind beispielsweise die folgenden Maßnahmen D, E oder F. - 4. D: Überexpression eines Stoffwechselgens und damit die Erhöhung der entsprechenden Enzymaktivität, die von dieser Zwischen verbindung wegführt;
- 5. E: Inaktivierung von Genen die Enzyme kodieren, die zu dieser Zwischenverbindung führen, beispielsweise durch Antisenese- Technik oder Kosuppression;
- 6. F: Expression eines Gens zu dem der Wildtyp kein orthologes Gen aufweist. Dieses Gen kann beispielsweise den Stoffwechselweg des Shikimatweges des Wildtyps überbrücken und durch die neue Genfunktion eine Erniedrigung des Stofflusses zu den über brückten Zwischenverbindungen bewirken.
In einer bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen
Verfahrens führt die genetische Veränderung des Shikimatweges
im Organismus zu einer Erhöhung des Metabolitflusses zu einer
gewünschten Zwischenverbindung und damit der entsprechenden
gewünschten Feinchemikalie.
Bevorzugt erfolgt die Erhöhung des Metabolitflusses zu einer
gewünschten Zwischenverbindung des Shikimatweges und damit zur
gewünschten Feinchemikalie durch mindestens eine Maßnahme aus
gewählt aus der Gruppe der Maßnahme A und B, also durch die Maß
nahme A und/oder B, wobei die Maßnahmen A und B die vorstehend
beschriebene Bedeutung haben.
Eine bevorzugte Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens
ist daher dadurch gekennzeichnet, daß man zur genetischen Ver
änderung des Shikimatweges mindestens eine Maßnahme ausgewählt
aus der Gruppe der Maßnahmen A und B durchführt, wobei A und B
folgende Bedeutung haben:
- 1. A: Erhöhung der Aktivität mindestens eines Enzyms des Shikimat weges des Wildtyps;
- 2. B: Einbringen mindestens eines Gens in den Organismus zu dem der Wildtyp kein orthologes Gen aufweist und das den Stoffwechselweg des Shikimatweges des Wildtyps überbrückt.
Die Erhöhung der Aktivität mindestens eines Enzyms des Shikimat
weges des Wildtyps nach Maßnahme A kann beispielsweise durch
Überexpression von Nukleinsäuren, also Genen des Shikimatweges,
die Proteine mit dieser enzymatischen Aktivität codieren, durch
das Ausschalten von negativen Regulationsmechanismen von zur
Zwischenverbindung führenden Stoffwechselwegen, wie beispiels
weise das Ausschalten der Feed-back-Inhibierung oder das Ein
bringen von orthologen Genen erfolgen, die im gewünschten
Organismus keiner Regulation unterliegen.
Vorzugsweise erfolgt die Erhöhung der Aktivität mindestens eines
Enzyms des Shikimatweges des Wildtyps gemäß Maßnahme A durch
Überexpression von Nukleinsäuren des Shikimatweges, die Proteine
1 mit dieser enzymatischen Aktivität codieren.
In einer bevorzugten Ausführungsform des Verfahrens erfolgt die
Durchführung der Maßnahme A dadurch, daß man eine Nukleinsäure,
codierend eine Chorismatmutase, in den Organismus einbringt.
Unter einer Chorismatmutase wird ein Protein verstanden, das
die enzymatische Aktivität aufweist, Chorismat in Prephenat
umzuwandeln.
Prinzipiell sind alle Chorismatmutasen im erfindungsgemäßen
Verfahren verwendbar, wie beispielsweise die Chorismatmutase
aus Petroselinum Crispum (Accessionsnummer: T14902, T14901),
Chorismatmutase aus Streptomyces coelicolor (T36865), Chorismat
mutase aus Bacillus subtilis (A33894), Chorismatmutase aus Asper
gillus nidulans (AAD30065) oder die nachstehend beschriebenen
Chorismatmutasen aus Arabidopsis thaliana oder die nachstehend
beschriebene Chorismatmutase Aktivität der Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenase (tyrA) aus E. coli.
In einer bevorzugten Ausführungsform werden Chorismatmutasegene
verwendet, die eine Chorismatmutase kodieren, deren Aktivität
einer reduzierten posttranslationalen Regulation im Organismus
unterliegt. Unter einer reduzierten Regulation wird eine
Regulation der Aktivität von höchstens 99%, vorzugsweise
höchstens 70%, besonders bevorzugt 50%, insbesondere bevor
zugt 0%, also keine Regulation der Aktivität, verglichen mit
der Wildtypregulation verstanden.
Chorismatmutasegene, die eine Chorismatmutase kodieren, deren
Aktivität im Organismus einer reduzierten, insbesondere keiner
Regulation unterliegt, sind beispielsweise Chorismatmutasegene
aus gattungsverschiedenen Organismen oder Chorismatmutasegene aus
dem gleichen Organismus oder gattungsverwandten Organismen die an
der Lokalisation der Expression einer reduzierten, insbesondere
keiner posttranslationalen Regulation unterliegen.
Unter Organismen werden erfindungsgemäß prokaryontische
Organismen oder eukaryontische Organismen, wie beispielsweise
Bakterien, Hefen, Algen, Moose, Pilze oder Pflanzen, verstanden,
die in der Lage sind, als Wildtyp oder durch genetische Ver
änderung die vorstehend erwähnten Feinchemikalien herzustellen.
Bevorzugte Organismen sind photosynthetisch aktive Organismen,
wie beispielsweise Cyanobakterien, Moose, Algen oder Pflanzen,
die bereits als Wildtyp in der Lage sind, die vorstehend
erwähnten Feinchemikalien herzustellen.
Besonders bevorzugte Organismen sind Pflanzen.
In einer weiter bevorzugten Ausführungsform der Maßnahme A des
erfindungsgemäßen Verfahrens werden Chorismatmutasegene, die
eine Chorismatmutase kodieren, deren Aktivität in Pflanzen einer
reduzierten posttranslationalen Regulation unterliegt, in
Pflanzen eingebracht.
Beispielsweise sind dies einige bakterielle oder davon abge
leitete Chorismatmutasegene, also Nukleinsäuren, die ein Protein
kodieren, enthaltend die Aminosäuresequenz einer bakteriellen
Chorismatmutase deren Aktivität in Pflanzen einer reduzierten
posttranslationalen Aktivität unterliegt, beispielsweise
die nachstehend beschriebene Nukleinsäure kodierend für die
Chorismatmutase Aktivität der Chorismatmutase-Prephenatdehydro
genase (tyrA) aus E. coli. oder eine von dieser Sequenz durch
Substitution, Insertion oder Deletion von Aminosäuren abgeleitete
Sequenz, die eine Homologie von mindestens 30%, vorzugsweise
mindestens 50%, bevorzugter mindestens 70%, besonders bevor
zugt mindestens 90% auf Aminosäureebene mit der Sequenz der
bakteriellen Chorismatmutase und die enzymatische Eigenschaft
einer Chorismatmutase aufweist.
Unter dem Begriff "Substitution" ist in der Beschreibung der Aus
tausch einer oder mehrerer Aminosäuren durch eine oder mehrere
Aminosäuren zu verstehen. Bevorzugt werden sog. konservative
Austausche durchgeführt, bei denen die ersetzte Aminosäure eine
ähnliche Eigenschaft hat wie die ursprüngliche Aminosäure, bei
spielsweise Austausch von Glu durch Asp, Gln durch Asn, Val
durch Ile, Leu durch Ile, Ser durch Thr.
Deletion ist das Ersetzen einer Aminosäure durch eine direkte
Bindung. Bevorzugte Positionen für Deletionen sind die Termini
des Polypeptides und die Verknüpfungen zwischen den einzelnen
Proteindomänen.
Insertionen sind Einfügungen von Aminosäuren in die Polypeptid
kette, wobei formal eine direkte Bindung durch ein oder mehrere
Aminosäuren ersetzt wird.
Unter Homologie zwischen zwei Proteinen wird vorzugsweise die
Identität der Aminosäuren über die jeweils gesamte Proteinlänge
verstanden, vorzugsweise die Identität die durch Vergleich
mit Hilfe des Programmalgorithmus GAP (UWGCG, University of
Wisconsin, Genetic Computer Group) unter Einstellung folgender
Parameter berechnet wird:
Gap Weight: 12
Length Weight: 4
Average Match: 2,912
Average Mismatch: -2,003
Gap Weight: 12
Length Weight: 4
Average Match: 2,912
Average Mismatch: -2,003
Unter einem Protein, das eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz der vorstehend beschriebenen
Chorismatmutase aus E. coli aufweist, wird dementsprechend ein
Protein verstanden, das bei einem Vergleich seiner Sequenz mit
der Sequenz der vorstehend beschriebenen Chorismatmutase, vor
zugsweise nach obigen Programmalgorithmus mit obigem Parameter
satz eine Homologie von mindestens 30% aufweist.
Die bakteriellen oder davon abgeleiteten Chorismatmutasegene
können auch Proteine kodieren die die Eigenschaft einer
Chorismatmutase und die Eigenschaft eines weiteren Enzyms
aufweisen, wie beispielsweise das nachstehend beschriebene
Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase-Gen (tyrA) aus E. coli K12.
Diese Ausführungsform ist, wie nachstehend beschrieben, besonders
bevorzugt, wenn die Maßnahmen A und B in Kombination durchgeführt
werden.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform der Maßnahme A
des erfindungsgemäßen Verfahren, insbesondere bei der Durch
führung der Maßnahme A alleine, werden die Chorismatmutasegene
in spezifische Orte in den Organismus gebracht, an denen die
entsprechenden Chorismatmutasen einer reduzierten posttrans
lationalen Regulation unterliegen.
Vorzugsweise werden dabei Nukleinsäuren, kodierend eine
Chorismatmutase aus dem gleichen oder aus gattungsverwandten
Organismen verwendet, die an Ort der Expression einer reduzierten
posttranslationalen Regulation unterliegen.
Die Isoformen von Chorismatmutasen die aus unterschiedlichen
Kompartimenten eines Organismus isoliert werden, weisen eine
unterschiedliche Regulation auf.
Die entsprechenden Corismatmutasegene aus einem spezifischen
Kompartiment des Organismus oder aus gattungsverwandten
Organismen können in andere Kompartimente des Organismus ein
gebracht werden, in denen die kodierten Chorismatmutasen keiner
posttranslationalen Regulation unterliegen.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform des erfindungs
gemäßen Verfahrens in Pflanzen wird zur Durchführung der Maßnahme
A eine Nukleinsäure, codierend eine cytosolische Chorimatmutase
aus Pflanzen in Plastiden von Pflanzen eingebracht.
Prinzipiell eignen sich dafür alle Nukleinsäuren, die eine
cytosolische Chorismatmutase aus Pflanzen kodieren, vorzugsweise
die Nukleinsäure kodierend eine cytosolische Chorismatmutase aus
Arabidopsis thaliana (Seq ID NO. 3) und davon abgeleitete natür
liche oder nicht natürliche Nukleinsäuren.
Die Existenz verschiedener Isoformen der Chorismatmutase konnte
für verschiedene Organismen nachgewiesen werden. So konnten aus
Arabidopsis thaliana drei verschiedene Chorismatmutasen isoliert
werden (Eberhard et al. 1993. FEBS 334, 233-236; Eberhard et
al. 1996. Plant J. 10, 815-821; Mobley et al. 1999. Gene
15; 240 (1): 115-123).
Diese Isoformen unterschieden sich in ihrer Lokalisation als
auch in ihren enzymatischen Eigenschaften. So ist die Chorismat
mutase-1 plastidär lokalisiert und wird durch die aromatischen
Aminosäuren allosterisch kontrolliert.
Das cytosolische Isoenzym Chorismatmutase-2 unterliegt keiner
bekannten Regulation (Benesova, M. Bode, R, Phytochemistry 1992,
31, 2983-2987).
Unter Nukleinsäuren, kodierend eine cytosolische Chorismatmutase
aus Arabidopsis thaliana und davon abgeleitete natürliche oder
nicht natürliche Nukleinsäuren werden Nukleinsäuren verstanden,
die ein Protein kodieren, enthaltend die Aminosäuresequenz der
cytosolischen Chorismatmutase (SEQ ID NO. 4) oder eine von dieser
Sequenz durch Substitution, Insertion oder Deletion von Amino
säuren abgeleitete Sequenz, die eine Homologie von mindestens
30%, vorzugsweise mindestens 50%, bevorzugter mindestens 70%,
besonders bevorzugt mindestens 90% auf Aminosäureebene mit der
Sequenz SEQ ID NO. 4 und die enzymatische Eigenschaft einer
Chorismatmutase aufweisen.
Unter einem Protein, das eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz SEQ ID NO. 4 aufweist,
wird dementsprechend ein Protein verstanden, das bei einem
Vergleich seiner Sequenz mit der Sequenz SEQ ID NO. 4, vorzugs
weise nach vorstehendem Programmalgorithmus mit vorstehenden
Parametersatz eine Homologie von mindestens 30% aufweist.
In einer weiter bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen
Verfahrens wird eine Nukleinsäure, codierend die cytosolische
Chorismatmutase aus Arabidopsis thaliana (SEQ ID NO. 4) in
Plastiden von Pflanzen eingebracht.
Geeignete Nukleinsäuresequenzen sind beispielsweise durch Rück
übersetzung der Polypeptidsequenz gemäß dem genetischen Code
erhältlich.
Bevorzugt werden dafür solche Codons verwendet, die entsprechend
der pflanzenspezifischen codon usage häufig verwendet werden. Die
codon usage läßt sich anhand von Computerauswertungen anderer,
bekannter Gene der betreffenden Pflanze leicht ermitteln.
In einer weiter besonders bevorzugten Ausführungsform des
erfindungsgemäßen Verfahrens wird eine Nukleinsäure der Sequenz
SEQ ID NO. 3 in Plastiden von Pflanzen eingebracht. Die Sequenz
SEQ ID NO. 3 stellt das Gen der cytosolischen Chorismatmutase
aus Arabidopsis thaliana (Chorismatmutase-2) dar.
Das Einbringen der Nukleinsäuren, codierend eine Chorismatmutase
in Plastiden von Pflanzen kann beispielsweise, wie nachstehend
für die Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase näher beschrieben,
durch Einbringen von Expressionskassetten in Pflanzen erreicht
werden, deren Nukleinsäure-Sequenz für ein Chorismatmutase-
Fusionsprotein kodiert, wobei ein Teil des Fusionsproteins
ein Transitpeptid ist, das die Translokation des Polypeptides
steuert. Bevorzugt sind für die Chloroplasten spezifische
Transitpeptide, welche nach Translokation der cytosolischen
Chorismatmutase in die Chloroplasten vom Chorismatmutase-Teil
enzymatisch abgespalten werden.
In einer weiteren besonders bevorzugten Ausführungsform des
erfindungsgemäßen Verfahrens bringt man daher ein Nukleinsäure
konstrukt in die Pflanze ein, enthaltend eine Nukleinsäure
kodierend ein plastidäres Transitpeptid und eine Nukleinsäure
die ein Protein kodiert, enthaltend die Aminosäuresequenz
SEQ ID NO. 4 oder eine von dieser Sequenz durch Substitution,
Insertion oder Deletion von Aminosäuren abgeleitete Sequenz,
die eine Homologie von mindestens 30% auf Aminosäureebene mit
der Sequenz SEQ ID NO. 2 und die enzymatische Eigenschaft einer
Chorismatmutase aufweist.
Nukleinsäuren, codierend plastidäre Transitpeptide sind bei
spielsweise DNA-Sequenzen von drei Kassetten des Plastiden-Trans
itpeptids der plastidären Transketolase aus Tabak in drei Lese
rastern als KpnI/BamHI Fragmente mit einem ATG-Codon in der NcoI
Schnittstelle:
oder die Nukleinsäure, codierend das plastidäre Transitpeptid
der plastidären Chorismatmutase-1 aus Arabidopsis thaliana
(SEQ ID NO. 7):
Vorzugsweise wird zur plastidären Lokalisation einer cyto
solischen Chorismatmutase die Nukleinsäure, codierend das
plastidäre Transitpeptid der plastidären Chorismatmutase-1
aus Arabidopsis thaliana verwendet.
In einer weiteren besonders bevorzugten Ausführungsform des
erfindungsgemäßen Verfahrens bringt man daher ein Nukleinsäure
konstrukt in die Pflanze ein, enthaltend eine Nukleinsäure
kodierend ein plastidäres Transitpeptid der plastidären
Chorismatmutase-1 aus Arabidopsis thaliana und eine Nuk
leinsäure die ein Protein kodiert, enthaltend die Aminosäure
sequenz SEQ ID NO. 4 oder eine von dieser Sequenz durch
Substitution, Insertion oder Deletion von Aminosäuren abge
leitete Sequenz, die eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz SEQ ID NO. 4 und die
enzymatische Eigenschaft einer Chorismatmutase aufweist.
Besonders bevorzugt wird für Maßnahme A des erfindungsgemäßen
Verfahrens ein Nukleinsäurekonstrukt enthaltend die Sequenz
(SEQ ID NO. 5) in Pflanzen eingebracht.
SEQ ID NO. 5 stellt ein Nukleinsäurekonstrukt aus der Nuklein
säure, codierend das plastidäre Transitpeptid der plastidären
Chorismatmutase-1 aus Arabidopsis thaliana und der Nukleinsäure,
codierend die cytosolische Chorismatmutase-2 aus Arabidopsis
thaliana dar.
Die vorliegende Anmeldung betrifft insbesondere diese Nuklein
säurekonstrukte als auch deren Verwendung in der Maßnahme A des
erfindungsgemäßen Verfahrens.
Fig. 1 zeigt beispielsweise das Biosyntheseschema ausgehend
von Erythrose-4-Phosphat zu Vitamin E. Durch die zusätzliche
Expression eines Chorismatmutasegens wird der Shikimatweg des
Wildtyps genetisch verändert und der Metabolitfluß zu Hydroxy
phenylpyruvat erhöht. Das nun vermehrt zur Verfügung stehende
Hydroxyphenylpyruvat wird weiter in Richtung Tocopherole umge
setzt. Ein erhöhter Gehalt an Hydroxyphenylpyruvat führt zu einer
erhöhten Umsetzung Richtung Vitamin E und/oder Vitamin K. Vor
zugsweise führt ein erhöhter Gehalt an Hydroxyphenylpyruvat zu
einer Erhöhung des Vitamin E-Gehalts.
Die Herstellung einer Expressionskassette erfolgt, wie nach
stehend ausführlich beschrieben, durch Fusion eines geeigneten
Promotors mit einer geeigneten Chorismatmutase-Nukleinsäure-
Sequenz und vorzugsweise einer zwischen Promotor und Chorismat
mutase-Nukleinsäure-Sequenz inserierten Nukleinsäure, die für ein
plastidäres Transitpeptid kodiert, also vorzugsweise durch Fusion
eines geeigneten Promotors mit einem geeigneten, vorstehend be
schriebenen Nukleinsäurekonstrukt, sowie einem Polyadenylierungs
signal nach gängigen Rekombinations- und Klonierungstechniken,
wie sie beispielsweise in T. Maniatis, E. F. Fritsch und J. Sam
brook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989) sowie in T. J. Silhavy,
M. L. Berman und L. W. Enquist, Experiments with Gene Fusions,
Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1984)
und in Ausubel, F. M. et al., Current Protocols in Molecular
Biology, Greene Publishing Assoc. and Wiley-Interscience (1987)
beschrieben sind.
Die Maßnahme B zur Veränderung des Shikimatweges des Wildtyps
erfolgt, wie vorstehend ausgeführt durch Einbringen mindestens
eines Gens in den Organismus zu dem der Wildtyp kein ortho
loges Gen aufweist und das den Stoffwechselweg des Shikimat
weges des Wildtyps überbrückt. Dieses Gen codiert ein Enzym, daß
durch die neue enzymatische Aktivität eine Erhöhung des Stoff
flusses zu der Zwischenverbindung bewirkt, bei der die Über
brückung endet. Diese neue enzymatische Aktivität unterliegt
vorzugsweise keiner Regulation durch den Organismus, schließt
also den Stoffwechselweg kurz, um beispielsweise limitierende
Regulationsstellen im Stoffwechsel zu umgehen. Dadurch ist es
möglich, den Metabolitfluß zu limitierenden Substanzen von vor
handenen Regulationen zu entkoppeln.
Unter einem zum Wildtyp orthologen Gen wird ein Gen verstanden,
daß aus einem anderen Organismus stammt, wobei die Enzymaktivität
die das Gen kodiert bereits im Wildtyp vorhanden ist.
Dementsprechend wird unter der Formulierung "Gen, zu dem der
Wildtyp kein orthologes Gen aufweist" ein Gen aus einem anderen
Organismus verstanden, wobei die Enzymaktivität die das Gen
kodiert vor der Transformation im Wildtyp nicht vorhanden oder
nicht aktiviert war.
Vorzugsweise wir unter einem zum Wildtyp orthologen Gen ein
funktionelles Äquivalent aus einem anderen Organismus verstanden,
wobei unter funktionellem Äquivalent die Gesamtheit der Eigen
schaften des Genproduktes (Protein) verstanden wird.
Dementsprechend wird vorzugsweise unter der Formulierung "Gen, zu
dem der Wildtyp kein orthologe Gen aufweist" ein Gen verstanden,
zudem der Wildtyp kein funktionelles Äquivalent gemäß der vor
stehend gegebenen Definition besitzt und somit eine Stoffwechsel
leistung etabliert wird, die einen alternativen Stoffwechselweg
erzeugt, um ein bereits in der Pflanze vorhandenes Produkt
(enthaltenen Metaboliten) zu produzieren.
Unter Organismen werden erfindungsgemäß, wie vorstehend
für Maßnahme A beschrieben, prokaryontische Organismen oder
eukaryontische Organismen, wie beispielsweise Bakterien, Hefen,
Algen, Moose, Pilze oder Pflanzen, verstanden, die in der Lage
sind, als Wildtyp oder durch genetische Veränderung die vor
stehend erwähnten Feinchemikalien herzustellen. Bevorzugte
Organismen sind photosynthetisch aktive Organismen, wie bei
spielsweise Cyanobakterien, Moose, Algen oder Pflanzen, die
bereits als Wildtyp in der Lage sind, die vorstehend erwähnten
Feinchemikalien herzustellen.
Besonders bevorzugte Organismen sind Pflanzen.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform des erfindungs
gemäßen Verfahrens verwendet man deshalb Pflanzen als zu
transformierende Organismen. In diesem Fall eignen sich für
die Durchführung der Maßnahme B vorzugsweise bakterielle Gene
als Gene zu denen die Pflanze kein orthologes Gen aufweist.
In einer bevorzugten Ausführungsform der Maßnahme B des
erfindungsgemäßen Verfahrens wird der Stoffwechselweg des
Shikimatweges der Pflanze durch das mindestens eine einge
brachte Gen überbrückt.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform der Maßnahme B
des erfindungsgemäßen Verfahrens bringt man eine Nukleinsäure,
codierend eine Prephenatdehydrogenase in eine Pflanze ein. Für
die bevorzugte Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens
eignen sich alle Gene die eine Prephenatdehydrogenase kodieren.
Unter einer Prephenatdehydrogenase wird ein Enzym verstanden,
das die enzymatische Aktivität aufweist, Prephenat in 4-Hydroxy
phenylpyruvat umzuwandeln.
Beispiele für Nukleinsäuren, die eine Prephenatdehydrogenase
codieren und im erfindungsgemäßen Verfahren verwendet werden
können sind die bekannten und beispielsweise in Datenbanken im
Internet zugänglichen Prephenatdehydrogenasegene aus Lactococcus
lactis (Accession X78413), Synechocystis spec PCC 6803 (slr2081),
Deinococcus radiodurans (AAF10695) oder Bacillus subtilis
(P20692). Weitere Beispiele können durch Vergleich der Homologien
der Sequenzen mit diesen bekannten Prephenatdehydrogenasegenen
gefunden werden, wie beispielsweise die potentiellen Prephenat
dehydrogenase aus Termotoga maitima (AAD35430) oder Heliobacter
pylori 26695 (Accession AAD08422).
In einer bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Ver
fahren unter Verwendung eines Prephenatdehydrogenasegens bringt
man man eine Nukleinsäure ein, die ein Protein kodiert, ent
haltend die Aminosäuresequenz der Prephenatdehydrogenase aus
Synechocystis spec PCC 6803 oder eine von dieser Sequenz durch
Substitution, Insertion oder Deletion von Aminosäuren abgeleitete
Sequenz, die eine Homologie von mindestens 30%, vorzugsweise
mindestens 50%, bevorzugter mindestens 70%, besonders bevorzugt
mindestens 90% auf Aminosäureebene mit der Sequenz der Pre
phenatdehydrogenase aus Synechocystis spec PCC 6803 und die
enzymatische Eigenschaft Prephenatdehydrogenase aufweist.
Unter einem Protein, das eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz der Prephenatdehydrogenase
aus Synechocystis spec PCC 6803 aufweist, wird dementsprechend
ein Protein verstanden, das bei einem Vergleich seiner Sequenz
mit der Sequenz der Prephenatdehydrogenase aus Synechocystis spec
PCC 6803, vorzugsweise nach vorstehendem Programmalgorithmus mit
vorstehenden Parametersatz eine Homologie von mindestens 30%
aufweist.
Fig. 1 zeigt beispielsweise das Biosyntheseschema ausgehend von
Erythrose-4-Phosphat zu den Tocopherolen. Durch die zusätzliche
Expression eines Prephenatdehydrogenase-Gens wird der Shikimat
weg des Wildtyps genetisch verändert und der Metabolitfluß zu
Hydroxyphenylpyruvat erhöht. Das nun vermehrt zur Verfügung
stehende Hydroxyphenylpyruvat wird weiter in Richtung Tocopherole
umgesetzt. Ein erhöhter Gehalt an Hydroxyphenylpyruvat führt zu
einer erhöhten Umsetzung Richtung Vitamin E und/oder Vitamin K.
Vorzugsweise führt ein erhöhter Gehalt an Hydroxyphenylpyruvat
zu einer Erhöhung des Vitamin E-Gehalts.
Es ist jedoch vorteilhaft, gegebenenfalls in Kombination mit
der erfindungsgemäßen Überbrückung des Stoffwechselweges weitere
Enzyme des Shikimatweges überzuexprimieren, um einen erhöhten
Metabolitfluß zu den gewünschten Feinchemikalien zu erreichen.
In einer weiteren, bevorzugten Ausführungsform des erfindungs
gemäßen Verfahrens werden daher die Maßnahmen A und B in
Kombination durchgeführt.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform dieser erfindungs
gemäßen Verfahrensvariante bringt man eine Nukleinsäure codierend
eine Prephenatdehydrogenase in Kombination mit einer Nukleinsäure
codierend eine Chorismatmutase in eine Pflanze ein.
Diese Kombination kann beispielsweise durch Einbringen von zwei
Nukleinsäuren erfolgen, die jeweils ein Enzym mit der Aktivität
einer Chorismatmutase und ein Enzym mit der Aktivität einer
Prephenatdehydrogenase codieren. Für diese Ausführungsform ist
es notwendig, zwei verschiedene Nukleinsäuren, die jeweils eines
dieser Enzyme kodieren, in die Pflanze einzubringen.
In einer insbesondere bevorzugten Ausführungsform des erfindungs
gemäßen Verfahrens erfolgt diese Kombination in einer Nuklein
säure, in dem man eine Nukleinsäure, codierend eine Chorismat
mutase-Prephenatdehydrogenase in eine Pflanze einbringt.
Das Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase-Gen, codiert ein
Protein, daß sowohl die enzymatischen Eigenschaften einer
Chorismatmutase als auch einer Prephenatdehydrogenase auf
weist. Dadurch wird durch Einbringen einer Nukleinsäure eine
enzymatische Aktivität überexprimiert, bzw. eine enzymatische
Aktivität eingebracht, die einer reduzierten posttranslationalen
Regulation unterliegt (Chorismatmutase) und eine enzymatische
Eigenschaft (Prephenatdehydrogenase) neu eingeführt.
Unter einer Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase wird ein Enzym
verstanden, das die enzymatische Aktivität aufweist, Chorismat in
4-Hydroxyphenylpyruvat umzuwandeln.
In einer weiter besonders bevorzugten Ausführungsform dieser
erfindungsgemäßen Verfahrensvariante bringt man man eine Nuklein
säure ein, die ein Protein kodiert, enthaltend die Aminosäure
sequenz SEQ ID NO. 2 oder eine von dieser Sequenz durch Substi
tution, Insertion oder Deletion von Aminosäuren abgeleitete
Sequenz, die eine Homologie von mindestens 30%, vorzugsweise
mindestens 50%, bevorzugter mindestens 70%, besonders bevorzugt
mindestens 90% auf Aminosäureebene mit der Sequenz SEQ ID NO. 2
und die enzymatische Eigenschaft einer Chorismatmutase-Prephenat
dehydrogenase aufweist.
Das Protein mit der Aminosäuresequenz SEQ ID NO. 2 stellt die
Chorismatmutase-Prephenatedehydrogenase (tyrA) aus E. coli K12
dar.
Unter einem Protein, das eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz SEQ ID NO. 2 aufweist,
wird dementsprechend ein Protein verstanden, das bei einem Ver
gleich seiner Sequenz mit der Sequenz SEQ ID NO. 2, vorzugsweise
nach vorstehendem Programmalgorithmus mit vorstehenden Parameter
satz eine Homologie von mindestens 30% aufweist.
Alle in der Beschreibung erwähnten Nukleinsäuren können bei
spielsweise eine RNA-, DNA- oder cDNA-Sequenz sein.
Geeignete Nukleinsäuresequenzen sind, wie vorstehend beschrieben,
durch Rückübersetzung der Polypeptidsequenz gemäß dem genetischen
Code erhältlich.
Bevorzugt werden dafür solche Codons verwendet, die entsprechend
der Organismus spezifischen codon usage häufig verwendet werden.
Die codon usage läßt sich anhand von Computerauswertungen
anderer, bekannter Gene des betreffenden Organismus leicht
ermitteln.
Soll das Protein beispielsweise in einer Pflanze exprimiert
werden, so ist es häufig vorteilhaft, die codon usage der Pflanze
bei der Rückübersetzung zu verwenden.
Weitere bevorzugte Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenasen bzw.
deren kodierende Nukleinsäuren sind insbesondere Nukleinsäuren
bakterieller Herkunft, wie beispielsweise, die Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenasegene aus Erwinia herbicola (Accession
X60420; Dieses Protein kann durch Deletion eins 109 Bp Bereiches
am 5'Ende auch in eine monofunktionelle Prephenatdehydrogenase
umgewandelt werden und dann beispielsweise wie vorstehend be
schrieben als Prephenatdehydrogenase verwendet werden) oder
Bordetella bronchiseptica (Accession AAF01289) oder lassen sich
beispielsweise aus verschiedenen Organismen deren genomische
Sequenz bekannt ist durch Homologievergleiche der Aminosäure
sequenzen oder der entsprechenden rückübersetzten Nuklein
säuresequenzen aus Datenbanken mit der SEQ ID NO. 2 oder den
anderen vorstehend beschriebenen Sequenzen leicht auffinden,
wie beispielsweise die potentielle Chorismatmutase-Prephenat
dehydrogenasegene aus Methanococcus janaschii (Accession Q58029).
Besonders bevorzugt verwendete Nukleinsäuren kodieren eine
Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase aus Bakterien.
Eine besonders bevorzugt verwendete Nukleinsäure hat die Sequenz
SEQ ID NO. 1. Diese Nukleinsäure stellt eine prokaryontische
genomische DNA aus E. Coli K12 dar, die die Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenase der Sequenz SEQ ID NO. 2, auch tyrA-Gen
genannt, kodiert.
Fig. 1 zeigt beispielsweise das Biosyntheseschema ausgehend
von Erythrose-4-Phosphat zu den Tocopherolen. Durch die zusätz
liche Expression eines Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase-
Gens wird der Shikimatweg des Wildtyps genetisch verändert und
der Metabolitfluß zu Hydroxyphenylpyruvat erhöht. Das nun ver
mehrt zur Verfügung stehende Hydroxyphenylpyruvat wird weiter in
Richtung Tocopherole umgesetzt. Ein erhöhter Gehalt an Hydroxy
phenylpyruvat führt zu einer erhöhten Umsetzung Richtung Vitamin
E und/oder Vitamin K. Vorzugsweise führt ein erhöhter Gehalt
an Hydroxyphenylpyruvat im erfindungsgemäßen Verfahren zu einer
Erhöhung des Vitamin E-Gehalts.
Im erfindungsgemäßen Verfahren zur Herstellung von Fein
chemikalien wird vorzugsweise dem Kultivierungsschritt der
transgenen Organismen ein Ernten der Organismen und ein
Isolieren der Feinchemikalien aus den Organismen angeschlossen.
Das Ernten der Organismen erfolgt in an sich bekannter Weise
dem jeweiligen Organismus entsprechend. Mikroorganismen, wie
Bakterien, Moose, Hefen und Pilze oder Pflanzenzellen, die durch
Fermentation in flüssigen Nährmedien kultiviert werden, können
beispielsweise durch Zentrifugieren, Dekantieren oder Filtrieren
abgetrennt werden. Pflanzen werden in an sich bekannter Weise
auf Nährböden gezogen und entsprechend geerntet.
Die Isolierung der Feinchemikalien aus der geernteten Biomasse
erfolgt in an sich bekannter Weise, beispielsweise durch
Extraktion und gegebenenfalls weiterer chemische oder physika
lischer Reinigungsprozesse, wie beispielsweise Fällungsmethoden,
Kristallographie, thermische Trennverfahren, wie Rektifizier
verfahren oder physikalische Trennverfahren, wie beispielsweise
Chromatographie.
Die Isolierung von Vitamin E aus Ölhaltigen Pflanzen
erfolgt beispielsweise bevorzugt durch chemische Umwandlung und
Destillation aus Pflanzenölen oder aus den bei der Desodorierung
pflanzlicher Öle anfallenden Wasserdampfdestillate (Dämpfer
kondensate).
Weitere Isolierverfahren von Vitamin E aus Dämpferkondensaten
sind beispielsweise in DE 31 26 110 A1, EP 171 009 A2,
GB 2 145 079, EP 333 472 A2 und WO 94/05650 beschrieben.
Die Herstellung der transgenen Organismen, insbesondere Pflanzen
erfolgt vorzugsweise durch Transformation der Ausgangsorganismen,
insbesondere Pflanzen, mit einem Nukleinsäurekonstrukt, daß die
vorstehend beschriebenen Nukleinsäuren, insbesondere die Nuklein
säuren codierend eine Chorismatmutase, eine Prephenatdehydro
genase oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase oder die
vorstehen beschriebenen Nukleinsäurekonstrukte, insbesondere das
Nukleinsäurekonstrukt, kodierend für ein plastidäres Transit
peptid und eine cytosolische Chorismatmutase enthält, wobei
diese Nukleinsäuren
Diese Nukleinsäurekonstrukte, in denen die kodierende Nuklein
säureseguenz oder das kodierende Nukleinsäurekonstrukt mit einem
oder mehreren Regulationssignalen funktionell verknüpft sind, die
die Transkription und Translation in Organismen, insbesondere in
Pflanzen gewährleisten, werden im folgenden auch Expressions
kassetten genannt.
Dementsprechend betrifft die Erfindung ferner als Expressions
kassette fungierende Nukleinsäurekonstrukte, enthaltend eine,
vorstehend beschriebene Nukleinsäure, insbesondere die Nuklein
säure codierend eine Chorismatmutase, eine Prephenatdehydrogenase
oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase oder die vor
stehen beschriebenen Nukleinsäurekonstrukte, insbesondere das
Nukleinsäurekonstrukt, kodierend für ein plastidäres Transit
peptid und eine cytosolische Chorismatmutase, die mit einem oder
mehreren Regulationssignalen funktionell verknüpft sind, die die
Transkription und Translation im Wirtsorganismus, insbesondere in
Pflanzen gewährleisten.
Vorzugsweise enthält die Expressionskassette eine Nukleinsäure
kodierend ein plastidäres Transitpeptid, das die Lokalisation in
Plastiden gewährleistet.
Die Expressionskassetten beinhalten Regulationssignale, also
regulative Nukleinsäuresequenzen, welche die Expression der
kodierenden Sequenz in der Wirtszelle steuern. Gemäß einer bevor
zugten Ausführungsform umfaßt eine Expressionskassette strom
aufwärts, d. h. am 5'-Ende der kodierenden Sequenz, einen Promotor
und stromabwärts, d. h. am 3'-Ende, ein Polyadenylierungssignal
und gegebenenfalls weitere regulatorische Elemente, welche mit
der dazwischenliegenden kodierenden Sequenz für mindestens eines
der vorstehend beschriebenen Gene operativ verknüpft sind. Unter
einer operativen Verknüpfung versteht man die sequenzielle
Anordnung von Promotor, kodierender Sequenz, Terminator und ggf.
weiterer regulativer Elemente derart, daß jedes der regulativen
Elemente seine Funktion bei der Expression der kodierenden
Sequenz bestimmungsgemäß erfüllen kann.
Im folgenden werden beispielhaft die bevorzugten Nukleinsäure
konstrukte, Expressionskassetten für Pflanzen und Verfahren zur
Herstellung von transgenen Pflanzen beschrieben.
Die zur operativen Verknüpfung bevorzugten aber nicht darauf be
schränkten Sequenzen sind Targeting-Sequenzen zur Gewährleistung
der subzellulären Lokalisation im Apoplasten, in der Vakuole, in
Plastiden, im Mitochondrium, im Endoplasmatischen Retikulum (ER),
im Zellkern, in Ölkörperchen oder anderen Kompartimenten und
Translationsverstärker wie die 5'-Führungssequenz aus dem Tabak-
Mosaik-Virus (Gallie et al., Nucl. Acids Res. 15 (1987),
8693-8711).
Als Promotoren der Expressionskassette ist grundsätzlich jeder
Promotor geeignet, der die Expression von Fremdgenen in Pflanzen
steuern kann. Vorzugsweise verwendet man insbesondere einen
pflanzlichen Promotor oder einen Promotor, der einem Pflanzen
virus entstammt. Insbesondere bevorzugt ist der CaMV 35S-Promotor
aus dem Blumenkohl-Mosaik-Virus (Franck et al., Cell 21 (1980),
285-294). Dieser Promotor enthält bekanntlich unterschiedliche
Erkennungssequenzen für transkriptionale Effektoren, die in ihrer
Gesamtheit zu einer permanenten und konstitutiven Expression des
eingeführten Gens führen (Benfey et al., EMBO J. 8 (1989),
2195-2202).
Die Expressionskassette kann auch einen chemisch induzierbaren
Promotor enthalten, durch den die Expression des exogenen tyrA-
Gens in der Pflanze zu einem bestimmten Zeitpunkt gesteuert
werden kann. Derartige Promotoren wie z. B. der PRP1-Promotor
(Ward et al., Plant. Mol. Biol. 22 (1993), 361-366), ein durch
Salizylsäure induzierbarer Promotor (WO 95/19443), ein durch
Benzenesulfonamid-induzierbarer (EP-A 388186), ein durch Tetra
zyklin-induzierbarer (Gatz et al., (1992) Plant J. 2, 397-404),
ein durch Abscisinsäure-induzierbarer (EP-A 335528) bzw. ein
durch Ethanol- oder Cyclohexanon-induzierbarer (WO 93/21334)
Promotor können u. a. verwendet werden.
Weiterhin sind insbesondere solche Promotoren bevorzugt, die
die Expression in Geweben oder Pflanzenteilen sicherstellen,
in denen beispielsweise die Biosynthese der entsprechenden Fein
chemikalien, insbesondere Vitamin E bzw. dessen Vorstufen statt
findet. Insbesondere zu nennen sind Promotoren, die eine blatt
spezifische Expression gewährleisten. Zu nennen sind der Promotor
der cytosolischen FBPase aus Kartoffel oder der ST-LSI Promotor
aus Kartoffel (Stockhaus et al., EMBO J. 8 (1989), 2445-245).
Mit Hilfe eines samenspezifischen Promotors konnte ein Fremd
protein stabil bis zu einem Anteil von 0,67% des gesamten
löslichen Samenproteins in den Samen transgener Tabakpflanzen
exprimiert werden (Fiedler und Conrad, Bio/Technology 10 (1995),
1090-1094). Die Expressionskassette kann daher beispielsweise
einen samenspezifischen Promotor (bevorzugt den Phaseolin-
Promotor (US 5504200), den USP- (Baumlein, H. et al., Mol.
Gen. Genet. (1991) 225 (3), 459-467), LEB4-Promotor (Fiedler
und Conrad, 1995), Sucrose-Bindeprotein-Promotor (Zitat),
das LEB4-Signalpeptid, das zu exprimierende Gen und ein
ER-Retentionssignal enthalten.
Die Herstellung einer Expressionskassette erfolgt vorzugsweise
durch Fusion eines geeigneten Promotors mit einer geeigneten,
vorstehend beschriebenen Nukleinsäure-Sequenz, insbesondere der
Nukleinsäure-Sequenz codierend eine Chorismatmutase, eine Pre
phenatdehydrogenase oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydro
genase und vorzugsweise einer zwischen Promotor und Nukleinsäure-
Sequenz inserierten Nukleinsäure, die für ein chloroplasten
spezifisches Transitpeptid kodiert, sowie einem Polyadeny
lierungssignal nach gängigen Rekombinations- und Klonierungs
techniken, wie sie beispielsweise in T. Maniatis, E. F. Fritsch
und J. Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989) sowie in
T. J. Silhavy, M. L. Berman und L. W. Enquist, Experiments with Gene
Fusions, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY
(1984) und in Ausubel, F. M. et al., Current Protocols in Molecular
Biology, Greene Publishing Assoc. and Wiley-Interscience
(1987) beschrieben sind.
Insbesondere bevorzugt sind insertierte Sequenzen, die, wie
vorstehend für die Chorismatmutase beschrieben, ein Targeting
in den Plastiden gewährleisten.
Es können auch Expressionskassetten verwendet werden, deren
Nukleinsäure-Sequenz für ein Fusionsprotein, insbesondere ein
Chorismatmutase-, Prephenatdehydrogenase- oder Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenase-Fusionsprotein kodiert, wobei ein Teil
des Fusionsproteins ein Transitpeptid ist, das die Translokation
des Polypeptides steuert. Bevorzugt sind für die Chloroplasten
spezifische Transitpeptide, welche nach Translokation der
Proteine, insbesondere der Chorismatmutase, Prephenatdehydro
genase oder Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase in die Chloro
plasten vom Proteinteil, insbesondere vom Chorismatmutase-, Pre
phenatdehydrogenase- bzw. Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase-
Teil enzymatisch abgespalten werden. Insbesondere bevorzugt ist
das Transitpeptid, das von der plastidären Nicotiana tabacum
Transketolase oder einem anderen Transitpeptid (z. B. dem Transit
peptid der kleinen Untereinheit der Rubisco oder der Ferredoxin
NADP Oxidoreduktase als auch der Isopentenylpyrophosphat Iso
merase-2) oder dessen funktionellem Äquivalent abgeleitet ist.
Für die Verwendung der cytosolischen Chorismatmutase bzw. der
Nukleinsäure, codierend eine cytosolische Chorismatmutase ist,
wie vorstehend beschrieben, insbesondere die Verwendung des
Transitpeptids der plastidären Chorismatmutase, bzw. deren
kodierende Nukleinsäure bevorzugt.
Besonders bevorzugt bei der erfindungsgemäßen Verwendung der
anderen, erfindungsgemäßen Nukleinsäuren sind DNA-Sequenzen von
drei Kassetten des Plastiden-Transitpeptids der plastidären
Transketolase aus Tabak in drei Leserastern als KpnI/BanHI
Fragmente mit einem ATG-Codon in der NcoI Schnittstelle:
Ein weiteres Beispiel für ein plastidäres Transitpeptid ist
das Transitpeptid der plastidären Isopentenyl-pyrophosphat Iso
merase-2 (IPP-2) aus Arabisopsis thaliana.
Die erfindungsgemäßen Nukleinsäuren, insbesondere die Nuklein
säuren codierend eine Chorismatmutase, eine Prephenatdehydro
genase oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase können
synthetisch hergestellt oder natürlich gewonnen sein oder eine
Mischung aus synthetischen und natürlichen Nukleinsäure-Bestand
teilen enthalten, sowie aus verschiedenen heterologen Gen
abschnitten verschiedener Organismen bestehen.
Bevorzugt sind, wie vorstehend beschrieben, synthetische
Nukleotid-Sequenzen mit Kodons, die von Pflanzen bevorzugt
werden. Diese von Pflanzen bevorzugten Kodons können aus Kodons
mit der höchsten Proteinhäufigkeit bestimmt werden, die in den
meisten interessanten Pflanzenspezies exprimiert werden.
Bei der Präparation einer Expressionskassette können verschiedene
DNA-Fragmente manipuliert werden, um eine Nukleotid-Sequenz zu
erhalten, die zweckmäßigerweise in der korrekten Richtung liest
und die mit einem korrekten Leseraster ausgestattet ist. Für die
Verbindung der DNA-Fragmente miteinander können an die Fragmente
Adaptoren oder Linker angesetzt werden.
Zweckmäßigerweise können die Promotor- und die Terminator-
Regionen in Transkriptionsrichtung mit einem Linker oder Poly
linker, der eine oder mehrere Restriktionsstellen für die
Insertion dieser Sequenz enthält, versehen werden. In der Regel
hat der Linker 1 bis 10, meistens 1 bis 8, vorzugsweise 2 bis
6 Restriktionsstellen. Im allgemeinen hat der Linker innerhalb
der regulatorischen Bereiche eine Größe von weniger als 100 bp,
häufig weniger als 60 bp, mindestens jedoch 5 bp. Der Promotor
kann sowohl nativ bzw. homolog als auch fremdartig bzw. heterolog
zur Wirtspflanze sein. Die Expressionskassette beinhaltet vor
zugsweise in der 5'-3'-Transkriptionsrichtung den Promotor, eine
kodierende Nukleinsäuresequenz oder ein Nukleinsäurekonstrukt und
eine Region für die transkriptionale Termination. Verschiedene
Terminationsbereiche sind gegeneinander beliebig austauschbar.
Ferner können Manipulationen, die passende Restriktions
schnittstellen bereitstellen oder die überflüssige DNA oder
Restriktionsschnittstellen entfernen, eingesetzt werden. Wo
Insertionen, Deletionen oder Substitutionen wie z. B. Transitionen
und Transversionen in Frage kommen, können in vitro-Mutagenese,
"primerrepair", Restriktion oder Ligation verwendet werden.
Bei geeigneten Manipulationen, wie z. B. Restriktion, "chewing-
back" oder Auffüllen von Überhängen für "bluntends", können
komplementäre Enden der Fragmente für die Ligation zur Verfügung
gestellt werden.
Bevorzugte Polyadenylierungssignale sind pflanzliche Poly
adenylierungssignale, vorzugsweise solche, die im wesentlichen
T-DNA-Polyadenylierungssignale aus Agrobacterium tumefaciens,
insbesondere des Gens 3 der T-DNA (Octopin Synthase) des
Ti-Plasmids pTiACH5 entsprechen (Gielen et al., EMBO J. 3 (1984),
835 ff) oder funktionelle Äquivalente.
Ferner betrifft die Erfindung die Verwendung der vorstehend
beschriebenen Nukleinsäuren, insbesondere der Nukleinsäuren
kodierend eine Chorismatmutase, eine Prephenatdehydrogenase oder
eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase oder der vorstehend
beschriebenen Nukleinsäurekonstrukte oder Proteine, insbesondere
der Chorismatmutasen, der Prephenatdehydrogenasen oder der
Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenasen zur Herstellung von
transgenen Pflanzen.
Vorzugsweise weisen diese transgenen Pflanze gegenüber dem
Wildtyp einen erhöhten Gehalt an Feinchemikalien, insbesondere
an Ubichinon, Vitamin E und/oder Vitamin K, vorzugsweise an
Vitamin E auf.
Es ist bekannt, daß Pflanzen mit einem hohen Vitamin-E-Gehalt
eine erhöhte Resistenz gegenüber abiotischem Streß aufweisen.
Unter abiotischem Streß wird beispielsweise Kälte, Frost,
Trockenheit, Hitze und Salz verstanden.
Daher betrifft die Erfindung weiterhin die Verwendung der
vorstehend erwähnten Nukleinsäuren zur Herstellung transgener
Pflanzen, die gegenüber dem Wildtyp eine erhöhte Resistenz
gegenüber abiotischem Streß aufweisen.
Die vorstehend beschriebenen Proteine und Nukleinsäuren können
zur Herstellung von Feinchemikalien in transgenen Organismen,
vorzugsweise zur Herstellung von Vitamin E, Vitamin K und/oder
Ubichinon, insbesondere Vitamin E in transgenen Pflanzen ver
wendet werden.
Die Übertragung von Fremdgenen in das Genom eines Organismus,
insbesondere einer Pflanze wird als Transformation bezeichnet.
Dazu können insbesondere bei Pflanzen an sich bekannte Methoden
zur Transformation und Regeneration von Pflanzen aus Pflanzen
geweben oder Pflanzenzellen zur transienten oder stabilen Trans
formation genutzt werden.
Geeignete Methoden zur Transformation von Pflanzen sind die
Protoplastentransformation durch Polyethylenglykol-induzierte
DNA-Aufnahme, das biolistische Verfahren mit der Genkanone - die
sogenannte particle bombardment Methode, die Elektroporation, die
Inkubation trockener Embryonen in DNA-haltiger Lösung, die Mikro
injektion und der, vorstehend beschriebene, durch Agrobacterium
vermittelte Gentransfer. Die genannten Verfahren sind beispiels
weise in B. Jenes et al., Techniques for Gene Transfer, in:
Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and Utilization, heraus
gegeben von S. D. Kung und R. Wu, Academic Press (1993), 128-143
sowie in Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec. Biol.
42 (1991), 205-225) beschrieben.
Vorzugsweise wird das zu exprimierende Konstrukt in einen Vektor
kloniert, der geeignet ist, Agrobacterium tumefaciens zu trans
formieren, beispielsweise pBin19 (Bevan et al., Nucl. Acids Res.
12 (1984), 8711).
Dementsprechend betrifft die Erfindung weiterhin Vektoren ent
haltend die vorstehend beschriebenen Nukleinsäuren, Nukleinsäure
konstrukte oder Expressionskassetten.
Mit einer Expressionskassette transformierte Agrobakterien können
in bekannter Weise zur Transformation von Pflanzen verwendet
werden, z. B. indem verwundete Blätter oder Blattstücke in einer
Agrobakterienlösung gebadet und anschließend in geeigneten Medien
kultiviert werden.
Die Expressionskassette kann über die Pflanzen hinaus auch
zur Transformation von Bakterien, insbesondere Cyanobakterien,
Moosen, Hefen, filamentösen Pilzen und Algen eingesetzt werden.
Zur bevorzugten Herstellung von genetisch veränderten Pflanzen,
im folgenden auch transgene Pflanzen bezeichnet, wird die
fusionierte Expressionskassette, die ein erfindungegemäßes
Protein, insbesondere eine Chorismatmutase, Prephenatdehydro
genase oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase kodiert,
vorzugsweise in einen Vektor, beispielsweise pBin19, kloniert,
der geeignet ist, Agrobacterium tumefaciens zu transformieren.
Mit einem solchen Vektor transformierte Agrobakterien können dann
in bekannter Weise zur Transformation von Pflanzen, insbesondere
von Kulturpflanzen verwendet werden, indem beispielsweise ver
wundete Blätter oder Blattstücke in einer Agrobakterienlösung
gebadet und anschließend in geeigneten Medien kultiviert werden.
Die Transformation von Pflanzen durch Agrobakterien ist unter
anderem bekannt aus F. F. White, Vectors for Gene Transfer in
Higher Plants; in Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and
Utilization, herausgegeben von S. D. Kung und R. Wu, Academic
Press, 1993, S. 15-38. Aus den transformierten Zellen der
verwundeten Blätter bzw. Blattstücke können in bekannter
Weise transgene Pflanzen regeneriert werden, die ein in
die Expressionskassette integriertes Gen für die Expression
eines erfindungsgemäßen Gens, insbesondere einer Nukleinsäure
kodierend eine eine Chorismatmutase, eine Prephenatdehydrogenase
oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase enthalten.
Zur Transformation einer Wirtspflanze mit einer für eine
Chorismatmutase, Prephenatdehydrogenase oder Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenase kodierenden Nukleinsäure wird eine
Expressionskassette als Insertion in einen rekombinanten
Vektor eingebaut, dessen Vektor-DNA zusätzliche funktionelle
Regulationssignale, beispielsweise Sequenzen für Replikation
oder Integration enthält. Geeignete Vektoren sind unter anderem
in "Methods in Plant Molecular Biology and Biotechnology"
(CRC Press), Kap. 6/7, S. 71-119 (1993) beschrieben.
Beispielhaft kann die pflanzliche Expressionskassette in ein
Derivat des Transformationsvektors pBin-19 mit 35s Promotor
(Bevan, M., Nucleic Acids Research 12: 8711-8721 (1984)) ein
gebaut werden. Fig. 2 zeigt ein Derivat des Transformations
vektors pBin-19 mit samenspezifischem Legumin B4-Promotor.
Unter Verwendung der oben zitierten Rekombinations- und
Klonierungstechniken können die Expressionskassetten in geeignete
Vektoren kloniert werden, die ihre Vermehrung, beispielsweise
in E. coli, ermöglichen. Geeignete Klonierungsvektoren sind u. a.
pBR332, pUC-Serien, M13mp-Serien und pACYC184. Besonders geeignet
sind binäre Vektoren, die sowohl in E. coli als auch in Agro
bakterien replizieren können.
Die Erfindung betrifft daher die Verwendung der vorstehend
beschriebenen Nukleinsäuren, insbesondere die Nukleinsäuren
koodierend eine Chorismatmutase, Prephenatdehydrogenase oder
eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase, der vorstehend be
schriebenen Nukleinsäurekonstrukte, insbesondere der Expressions
kassetten zur Herstellung von genetisch veränderten Pflanzen oder
zur Transformation von Pflanzen, -zellen, -geweben oder Pflanzen
teilen. Vorzugsweise ist Ziel der Verwendung die Erhöhung des
Gehaltes der Pflanze oder Pflanzenteile an Feinchemikalien,
insbesondere des Gehalts an Vitamin E, Vitamin K oder Ubichinon,
vorzugsweise an Vitamin E.
Dabei kann je nach Wahl des Promotors die Expression spezifisch
in den Blättern, in den Samen, Blütenblättern oder anderen Teilen
der Pflanze erfolgen.
Dementsprechend betrifft die Erfindung ferner ein Verfahren
zur Herstellung von genetisch veränderten Organismen indem man
eine vorstehend beschriebene Nukleinsäure oder ein vorstehend
beschriebenes Nukleinsäurekonstrukt in das Genom des Ausgangs
organismus einführt.
Vorzugsweise betrifft die Erfindung ein Verfahren zur
Transformation einer Pflanze dadurch gekennzeichnet, daß
man Expressionskassetten enthaltend Nukleinsäuresequenzen,
kodierend eine kodierend eine Chorismatmutase, Prephenatdehydro
genase oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase in eine
Pflanzenzelle oder Protoplasten von Pflanzen einbringt und
diese zu ganzen Pflanzen regeneriert.
Die Erfindung betrifft auch die genetisch veränderte Organismen,
wobei die genetische Veränderung den Metabolitfluß des Shikimat
weges gegenüber dem Wildtyp verändert und der Organismus gegen
über dem Wildtyp einen veränderten Gehalt an Feinchemikalien auf
weist.
Wie vorstehend erwähnt, weisen bevorzugte genetisch veränderte
Organismen einen erhöhten Gehalt an Feinchemikalien, insbesondere
einen erhöhten Gehalt an Vitamin E, Vitamin K und Ubichinon,
vorzugsweise einen erhöhten Gehalt an Vitamin E gegenüber dem
Wildtyp auf.
Unter einem genetisch veränderter Organismus wird erfindungsgemäß
insbesondere ein Organismus verstanden, bei dem die genetische
Veränderung die Genexpression einer Nukleinsäure kodierend eine
Chorismatmutase, Prephenatdehydrogenase oder Choroismatmutase-
Prephenatdehydrogenase gegenüber einem Wildtyp
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure enthält, erhöht oder
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure nicht enthält, verursacht.
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure enthält, erhöht oder
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure nicht enthält, verursacht.
Als Organismen und zur Herstellung von Organismen mit einem
erhöhten Gehalt an Feinchemikalien im Vergleich zum Wildtyp
werden in einer bevorzugten Ausführungsform, wie vorstehend
erwähnt, photosynthetisch aktive Organismen wie beispielsweise
Cyanobakterien, Moose, Algen oder Pflanzen, besonders bevorzugt
Pflanzen als Ausgangsorganismen und dementsprechend auch als
genetisch veränderte Organismen verwendet.
Solche transgenen Pflanzen, deren Vermehrungsgut, sowie deren
Pflanzenzellen, -gewebe oder -teile sind ein weiterer Gegenstand
der vorliegenden Erfindung.
Pflanzen im Sinne der Erfindung sind insbesondere mono- und
dikotyle Pflanzen.
Bevorzugte Pflanzen sind Tagetes, Sonnenblume, Arabidopsis,
Tabak, Roter Pfeffer, Soja, Tomate, Aubergine, Paprika, Möhre,
Karotte, Kartoffel, Mais, Salate und Kohlarten, Getreide,
Alfalfa, Hafer, Gerste, Roggen, Weizen, Triticale, Hirse, Reis,
Luzerne, Flachs, Baumwolle, Hanf, Brassicacaen wie beispielsweise
Raps oder Canola, Zuckerrübe, Zuckerrohr, Nuß- und Weinspezies
oder Holzgewächse wie beispielsweise Espe oder Eibe.
Besonders bevorzugt sind Arabidopsis thaliana, Tagetes erecta,
Brassica napus, Nicotiana tabacum, Canola, Kartoffeln sowie
weitere Ölsaaten, wie beispielsweise Soja.
Die genteisch veränderten Organismen, insbesondere Pflanzen
können, wie vorstehend beschrieben zur Herstellung von Fein
chemikalien, insbesondere zur Herstellung von Vitamin E,
Vitamin K und Ubichinon verwendet werden.
Von Menschen und Tieren verzehrbare erfindungsgemäße, genetisch
veränderte Pflanzen mit erhöhtem Gehalt an Feinchemikalien,
insbesondere mit einem erhöhten Gehalt an Vitamin-E, Ubichinon
und/oder Vitamin K, vorzugsweise Vitamin E können auch beispiels
weise direkt oder nach an sich bekannter Prozessierung als
Nahrungsmittel oder Futtermittel verwendet werden.
Erhöhung des Gehaltes an Feinchemikalien bedeutet im Rahmen der
vorliegenden Erfindung die künstlich erworbene Fähigkeit einer
erhöhten Biosyntheseleistung dieser Verbindungen in der Pflanze
gegenüber der nicht gentechnisch modifizierten Pflanze für die
Dauer mindestens einer Pflanzengeneration.
Unter einem erhöhten Gehalt an Vitamin E wird in der Regel ein
erhöhter Gehalt an Gesamt-Tocopherol verstanden. Unter einem
erhöhten Gehalt an Vitamin E wird aber auch insbesondere ein ver
änderter Gehalt der vorstehend beschriebenen 8 Verbindungen mit
Tocopherolaktivität verstanden.
Beispielsweise führt das Einbringen eines Chorismatmutase-Pre
phenatdehydrogenase-Gens in Pflanzen überraschenderweise zu einem
besonders erhöhten Anstieg des Gehalts an Tocotrienolen.
Im Falle der Erhöhung des Gehalts an Vitamin E kann sowohl der
Gehalt an Tocopherolen oder Tocotrienolen gesteigert werden. Vor
zugsweise wird der Gehalt an Tocopherolen gesteigert. Aber es ist
auch möglich unter bestimmten Bedingungen vorzugsweise den Gehalt
an Tocotrienolen zu steigern.
Der Biosyntheseort von Vitamin E beispielsweise ist in Pflanzen
unter anderem das Blattgewebe, so daß eine blattspezifische
Expression der erfindungsgemäßen Nukleinsäuren, insbesondere der
Nukleinsäuren codierend eine Chorismatmutase, eine Prephenat
dehydrogenase oder eine Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase
sinnvoll ist. Dies ist jedoch nicht einschränkend, da die
Expression auch in allen übrigen Teilen der Pflanze - besonders
in fetthaltigen Samen - gewebespezifisch erfolgen kann.
Eine weitere bevorzugte Ausführungsform betrifft deshalb eine
samenspezifische Expression der erfindungsgemäßen Nukleinsäuren,
insbesondere der Nukleinsäuren codierend eine Chorismatmutase,
eine Prephenatdehydrogenase oder eine Chorismatmutase-Prephenat
dehydrogenases.
Darüber hinaus ist eine konstitutive Expression von exogenen
Chorismatmutase-, Prephenatdehydrogenase- oder Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenase-Genen von Vorteil. Andererseits kann aber
auch eine induzierbare Expression wünschenswert erscheinen.
Die Wirksamkeit der Expression des transgen exprimierten
Chorismatmutase-, Prephenatdehydrogenase- oder Chorismatmutase-
Prephenatdehydrogenase-Gens kann beispielsweise in vitro durch
Sproßmeristemvermehrung ermittelt werden. Zudem kann eine in Art
und Höhe veränderte Expression des Chorismatmutase-, Prephenat
dehydrogenase- oder Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase-Gens
und deren Auswirkung auf die Vitamin E-Biosyntheseleistung an
Testpflanzen in Gewächshausversuchen getestet werden.
Die Erfindung wird durch die nun folgenden Beispiele erläutert,
ist aber nicht auf diese beschränkt:
Die Sequenzierung rekombinanter DNA-Moleküle erfolgte mit einem
Laserfluoreszenz-DNA-Sequenzierer der Firma Licor (Vertrieb durch
MWG Biotech, Ebersbach) nach der Methode von Sanger (Sanger
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74 (1977), 5463-5467).
Die DNA kodierend für das tyrA-Gen wurde mittels polymerase
chain reaction (PCR) aus E. coli K12 unter Verwendung eines sense
spezifischen Primers (tyrA5' SEQ ID NO. 10) und eines antisense
spezifischen Primers (tyrA3' SEQ ID NO. 9) amplifiziert.
Die PCR Bedingungen waren die folgenden:
Die PCR erfolgte in einem 50 µl Reaktionsansatz in dem enthalten war:
Die PCR erfolgte in einem 50 µl Reaktionsansatz in dem enthalten war:
- - 2 µl einer E. coli K12 Zellsuspension
- - 0,2 mM dATP, dTTP, dGTP, dCTP
- - 1,5 mM Mg(OAc)2
- - 5 µg Rinderserum-Albumin
- - 40 pmol tyrA5'
- - 40 pmol tyrA3'
- - 15 µl 3,3 × rTth DNA Polymerase XLPuffer (PE Applied Biosystems)
- - 5 U rTth DNA Polymerase XL (PE Applied Biosystems)
Die PCR wurde unter folgenden Zyklus Bedingungen durchgeführt:
Schritt 1: 5 Minuten 94°C (Denaturierung)
Schritt 2: 3 Sekunden 94°C
Schritt 3: 1 Minute 55°C (Annealing)
Schritt 4: 2 Minuten 72°C (Elongation)
30 Wiederholungen der Schritte 2 bis 4
Schritt 5: 10 Minuten 72°C (Post-Elongation)
Schritt 6: 4°C (Warteschleife)
Schritt 1: 5 Minuten 94°C (Denaturierung)
Schritt 2: 3 Sekunden 94°C
Schritt 3: 1 Minute 55°C (Annealing)
Schritt 4: 2 Minuten 72°C (Elongation)
30 Wiederholungen der Schritte 2 bis 4
Schritt 5: 10 Minuten 72°C (Post-Elongation)
Schritt 6: 4°C (Warteschleife)
Das Amplikon wurde unter Verwendung von Standardmethoden in den
PCR Klonierungsvektor pGEM-T (Promega) kloniert. Die Identität
des erzeugten Amplikons wurde durch Sequenzierung unter Ver
wendung des M13F (-40) Primers bestätigt.
Transgene Nicotiana tabacum und Arabidopsis thaliana Pflanzen
wurden erzeugt, die die Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase
aus E. coli K12 unter Kontrolle des konstitutiven 35S-Promotor des
CaMV (Blumenkohlmosaikvirus) (Franck et al., Cell 21: 285-294,
1980) exprimieren. Die Grundlage des zur konstitutiven Expression
der Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase aus E. coli K12 erzeug
ten Plasmides war der pBinAR-TkTp-10 (Ralf Badur, Dissertation
Universität Göttingen, 1998). Dieser Vektor ist ein Derivat des
pBinAR (Höfgen und Willmitzer, Plant Sci. 66: 221-230, 1990) und
enthält den 35S-Promotor des CaMV (Blumenkohlmosaikvirus) (Franck
et al., 1980) das Terminationssignal des Octopin-Synthase Gens
(Gielen et al., EMBO J. 3: 835-846, 1984) sowie die für das
Transitpeptid der Nicotiana tabacum plastidären Transketolase
kodierenden DNA Sequenz. Die unter Berücksichtigung des korrekten
Leserasters erfolgte Klonierung der Chorismatmutase-Prephenat
dehydrogenase aus E. coli K12 in diesen Vektor, erzeugt eine
Translationsfusion der Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase mit
dem plastidären Transitpeptid. Dadurch erfolgt ein Transport des
Transgens in die Plastiden.
Zur Erstellung dieses Plasmides wurde das tyrA-Gen unter Ver
wendung der flankierenden SmaI bzw. SalI Restriktionsschnitt
stellen aus dem Plasmid pGEM-T/tyrA isoliert. Dieses Fragment
wurde unter Anwendung von Standardmethoden in einen SmaI/SalI
geschnittenen pBinAR-TkTp-10 ligiert (siehe Fig. 2). Dieses
Plasmid (pBinAR-TkTp-10/tyrA) wurde zur Erzeugung transgener
Nicotiana tabacum und A. thaliana Pflanzen verwendet.
Fragment A (529 bp) in Fig. 2 beinhaltet den 35S-Promotor
des CaMV (Nukleotide 6909 bis 7437 des Blumenkohlmosaikvirus),
Fragment B (245 bp) kodiert für das Transitpeptid der Nicotiana
tabacum Transketolase, Fragment C (1232 Bp) kodiert für das
tyrA-Gen aus E. coli K12, Fragment D (219 Bp) kodiert für das
Terminationssignal des Octopin-Synthase Gens.
Zur Herstellung von chimären DNA Konstrukten zur Erzeugung trans
gener Arabidopsos thaliana, Nicotiana tabacum bzw. Brassica napus
Pflanzen, die die Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase aus
E. coli K12 unter Kontrolle eines samenspezifischen Promotors
exprimieren, wurde der Vektor pPTVkanLeP-IPP-TP-9 verwendet.
Dieser Vektor ist ein Derivat des pGPTVkan (D. Becker, E. Kemper,
J. Schell, R. Masterson. Plant Molecular Biology 20: 1195-1197,
1992) dem das uidA Gen deletiert wurde. Stattdessen enthält der
Vektor pPTVkanLeP-IPP-TP-9 den samenspezifischen Promotor des
Legumin B4 Gens (Kafatos et al., Nuc. Acid. Res., 14 (6): 2707-2720,
1986), die Sequenz kodierend für das Transitpeptid der A. thaliana
plastiden-spezifischen Isopentenyl-pyrophosphat Isomerase-2
(IPP-2) (Badur, unveröffentlicht) und das Terminationssignal der
Nopalinsynthase aus A. tumefaciens (Depicker et al., J. Mol. Appl.
Genet. 1, 561-73, 1982).
Das Nukleinsäure-Fragment kodierend für die tyrA aus E. coli K12
wurde als SmaI/SalI Fragment mit durch die T4-Polymerase auf
gefüllten stumpfen Enden in den Vektor pPTVkanLeP-IPP-TP-9
(Fig. 3) kloniert, wodurch eine Translationsfusion mit dem
Transitpeptid der IPP-2 erzeugt wurde. Somit konnte ein Import
der Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase in die Plastiden
gewährleistet werden. Dieses Plasmid (pPTVkanLeP-IPP-TP-9/TyrA)
wurde zur Erzeugung transgener Nicotiana tabacum, A. thaliana
bzw. Brassica napus Pflanzen verwendet.
Fragment A (2700 bp) in Fig. 3 beinhaltet den Promotor
des Legumin B4 Gens aus Vicia faba, Fragment B (206 bp) Fragment
kodierend für das Transitpeptid der A. thaliana Isopentenyl-pyro
phosphat-Isomerase-2. Fragment C (1234 Bp) kodiert für das tyrA-
Gen aus E. coli K12. Fragment D (272 Bp) für das Terminationssignal
des Nopalin-Synthase Gens.
Wildtyp Arabidopsis thaliana Pflanzen (Columbia) wurden mit dem
Agrabacterium tumefaciens Stamm (GV3101 [pMP90]) auf Grundlage
einer modifizierten Vakuuminfiltrationsmethode transformiert
(Steve Clough und Andrew Bent. Floral dip: a simplified method
for Agrobacterium mediated transformation of A. thaliana. Plant J
16 (6): 735-43, 1998; der Bechtold, N. Ellis, J. und Pelltier, G.,
in: Planta Agrobacterium mediated gene transfer by infiltration
of adult Arabidopsis thaliana plants. CRAcad Sci Paris, 1993,
1144 (2): 204-212). Die verwendeten Agrobacterium tumefaciens
Zellen waren im Vorfeld mit den Plasmiden pBinAR-TkTp-10/tyrA
bzw. pPTVkanLeP-IPP-TP-9/tyrA (Fig. 2 bzw. 3) transformiert
worden.
Samen der Primärtransformanden wurden auf Grundlage der
Antibiotikaresistenz selektioniert. Antibiotika resistente
Keimlinge wurden in Erde gepflanzt und als vollentwickelte
Pflanzen zur biochemischen Analyse verwendet.
Die Herstellung transgener Raps Pflanzen orientierte sich an
einem Protokoll von Bade, J. B. und Damm, B. (in Gene Transfer
to Plants, Potrykus, I. und Spangenberg, G., eds, Springer Lab
Manual, Springer Verlag, 1995, 30-38), in welchem auch die
Zusammensetzung der verwendeten Medien und Puffer angegeben ist.
Die Transformationen erfolgten mit dem Agrobacterium tumefaciens
Stamm GV3101 [pMP90]. Zur Transformation wurde das Plasmid
pPTVkanLeP-IPP-TP-9/tyrA verwendet (Fig. 3). Samen von Brassica
napus var. Westar wurden mit 70% Ethanol (v/v) oberflächensteril
gemacht, 10 Minuten bei 55°C in Wasser gewaschen, in 1%iger
Hypochlorit-Lösung (25% v/v Teepol, 0,1% v/v Tween 20) für
20 Minuten inkubiert und sechsmal mit sterilem Wasser für jeweils
20 Minuten gewaschen. Die Samen wurden drei Tage auf Filter
papier getrocknet und 10-15 Samen in einem Glaskolben mit 15 ml
Keimungsmedium zur Keimung gebracht. Von mehreren Keimlingen
(ca. 10 cm groß) wurden die Wurzeln und Apices entfernt und die
verbleibenden Hypokotyle in ca. 6 mm lange Stücke geschnitten.
Die so gewonnenen ca. 600 Explantate wurden 30 Minuten mit 50 ml
Basalmedium gewaschen und in einem 300 ml Kolben überführt. Nach
Zugabe von 100 ml Kallusinduktionsmedium wurden die Kulturen für
24 Stunden bei 100 U/min inkubiert.
Vom Agrobacterium Stamm wurde eine Übernachtkultur bei 29°C
in Luria Broth-Medium mit Kanamycin (20 mg/l) angesetzt, davon
2 ml in 50 ml Luria Broth-Medium ohne Kanamycin für 4 Stunden
bei 29°C bis zu einer OD600 von 0,4 bis 0,5 inkubiert. Nach der
Pelletierung der Kultur bei 2000 U/min für 25 min wurde das Zell
pellet in 25 ml Basalmedium resuspendiert. Die Konzentration der
Bakterien in der Lösung wurde durch Zugabe von weiterem Basal
medium auf eine OD600 von 0,3 eingestellt.
Aus den Raps-Explanten wurde das Kallus-Induktionsmedium mit
sterilen Pipetten entfernt, 50 ml Agrobakterium-Lösung hinzu
gefügt, vorsichtig gemischt und für 20 min inkubiert. Die Agro
bacterien-Suspension wurde entfernt, die Raps-Explante für 1 min
mit 50 ml Kallus-Induktionsmedium gewaschen und anschließend
100 ml Kallus-Induktionsmedium hinzugefügt. Die Co-Kultivierung
wurde für 24 h auf einem Rotationsschüttler bei 100 U/min durch
geführt. Die Co-Kultivierung wurde durch Wegnahme des Kallus-
Induktionsmediums gestoppt und die Explante zweimal für jeweils
1 min mit 25 ml und zweimal für 60 min mit jeweils 100 ml Wasch
medium bei 100 U/min gewaschen. Das Waschmedium mit den Explanten
wurde in 15 cm Petrischalen überführt und das Medium mit sterilen
Pipetten entfernt.
Zur Regeneration wurden jeweils 20 bis 30 Explante in 90 mm
Petrischalen überführt, welche 25 ml Sproß-Induktionsmedium
mit Kanamycin enthielten. Die Petrischalen wurden mit 2 Lagen
Leukopor verschlossen und bei 25°C und 2000 lux bei Photoperioden
von 16 Stunden Licht/8 Stunden Dunkelheit inkubiert. Alle 12 Tage
wurden die sich entwickelnden Kalli auf frische Petrischalen
mit Sproß-Induktionsmedium umgesetzt. Alle weiteren Schritte zur
Regeneration ganzer Pflanzen wurden wie von Bade, J. B und Damm,
B. (in: Gene Transfer to Plants, Potrykus, I. und Spangenberg,
G., eds, Springer Lab Manual, Springer Verlag, 1995, 30-38)
beschrieben durchgeführt.
Zehn ml YEB-Medium mit Antibiotikum (5 g/l Rinder-Extrakt, 1 g/l
Hefe-Extrakt, 5 g/l Pepton, 5 g/l Saccharose und 2 mM MgSO4.)
wurden mit einer Kolonie von Agrobacterium tumefaciens beimpft
und über Nacht bei 28°C kultiviert. Die Zellen wurden 20 min bei
4°C, 3500 U/min in einer Tischzentrifuge pelletiert und danach in
frischem YEB-Medium ohne Antibiotika unter sterilen Bedingungen
resuspendiert. Die Zellsuspension wurde für die Transformation
eingesetzt.
Die Wildtyp-Pflanzen aus Sterilkultur wurden durch vegetative
Replikation erhalten. Dazu wurde nur die Spitze der Pflanze
abgeschnitten und auf frisches 2MS-Medium in ein steriles Ein
weckglas überführt. Vom Rest der Pflanze wurden die Haare auf
der Blattoberseite und die Mittelrippen der Blätter entfernt.
Die Blätter wurden mit einer Rasierklinge in etwa 1 cm2 große
Stücke geschnitten. Die Agrobakterienkultur wurde in eine kleine
Petrischale überführt (Durchmesser 2 cm). Die Blattstücke wurden
kurz durch diese Lösung gezogen und mit der Blattunterseite auf
2MS-Medium in Petrischalen (Durchmesser 9 cm) gelegt, so daß sie
das Medium berührten. Nach zwei Tagen im Dunkeln bei 25°C wurden
die Explantate auf Platten mit Kallusinduktionsmedium überführt
und in der Klimakammer auf 28°C temperiert. Das Medium mußte
alle 7 bis 10 Tage gewechselt werden. Sobald sich Kalli bildeten,
wurden die Explantate in sterile Einweckgläser auf Sproß
induktionsmedium mit Claforan (0,6% BiTec-Agar (g/v), 2,0 mg/l
Zeatinribose, 0,02 mg/l Naphthylessigsäure, 0,02 mg/l Gibberelin
säure, 0,25 g/ml Claforan, 1,6% Glukose (g/v) und 50 mg/l
Kanamycin) überführt. Nach etwa einem Monat trat Organogenese
ein und die gebildeten Sprosse konnten abgeschnitten werden. Die
Kultivierung der Sprosse wurde auf 2MS-Medium mit Claforan und
Selektionsmarker durchgeführt. Sobald sich ein kräftiger Wurzel
ballen gebildet hatte, konnten die Pflanzen in Pikiererde getopft
werden.
Es wurden die Tocopherol- und Tocotrienol-Gehalte in Blätter
und Samen der mit den beschriebenen Konstrukten transformierten
Pflanzen (Arabidopsis thaliana, Brassica napus und Nicotiana
tabacum) analysiert. Dazu wurden die transgenen Pflanzen im
Gewächshaus kultiviert und Pflanzen die das Gen kodierend für die
Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase aus E. coli K12 exprimieren
auf Northern- und Western Ebene analysiert. In Blättern und Samen
dieser Pflanzen wurde der Tocopherolgehalt und der Tocotrienol
gehalt mittels HPLC ermittelt. In allen Fällen war der Toco
pherol- und/oder Tocotrienol-Gehalt in transgenen Pflanzen, die
zusätzlich ein tyrA-Gen exprimieren, im Vergleich zu nicht trans
formierten Pflanzen erhöht.
Tabelle 1A (junge Blätter) und 1B (seneszierende Blätter) zeigen
die Gehalte [µg/gFG] an α-Tocopherol, γ-Tocopherol, α-Tocotrienol
und Gesamt-Vitamin E in Blättern unterschiedlichen Alters in
Nicotiana tabacum, cv. SNN-Wildtyp (angegebene Werte MW +/-SD,
n = 9) und Pflanzen, die das Tyr A Gen aus E. coli über
exprimieren.
Die DNA Sequenz kodierend für das Transitpeptid des Chorismat-
Mutase-1-Gen wurde mittels polymerase chain reaction (PCR) aus
Arabidopsis thaliana unter Verwendung eines sense spezifischen
Primers (CM-1TP 5' SEQ ID Nr. 11) und eines antisense spezifi
schen Primers (CM-1TP 3' SEQ ID NO. 12) amplifiziert.
Die PCR Bedingungen waren die folgenden:
Die PCR erfolgte in einem 50 µl Reaktionsansatz in dem enthalten war:
Die PCR erfolgte in einem 50 µl Reaktionsansatz in dem enthalten war:
- - 2 µl einer Arabidopsis thaliana cDNA
- - 0,2 mM dATP, dTTP, dGTP, dCTP
- - 1,5 mM Mg(OAc)2
- - 5 µg Rinderserum-Albumin
- - 40 pmol CM-1TP 5'Primer
- - 40 pmol CM-1TP 3'Primer
- - 15 µl 3,3 µ rTth DNA Polymerase XLPuffer (PE Applied Biosystems)
- - 5 U rTth DNA Polymerase XL (PE Applied Biosystems)
Die PCR wurde unter folgenden Zyklus Bedingungen durchgeführt:
Schritt 1: 5 Minuten 94°C (Denaturierung)
Schritt 2: 3 Sekunden 94°C
Schritt 3: 1 Minute 55°C (Annealing)
Schritt 4: 2 Minuten 72°C (Elongation)
30 Wiederholungen der Schritte 2 bis 4
Schritt 5: 10 Minuten 72°C (Post-Elongation)
Schritt 6: 4°C (Warteschleife)
Schritt 1: 5 Minuten 94°C (Denaturierung)
Schritt 2: 3 Sekunden 94°C
Schritt 3: 1 Minute 55°C (Annealing)
Schritt 4: 2 Minuten 72°C (Elongation)
30 Wiederholungen der Schritte 2 bis 4
Schritt 5: 10 Minuten 72°C (Post-Elongation)
Schritt 6: 4°C (Warteschleife)
Das Amplikon wurde unter Verwendung von Standardmethoden in
den PCR Klonierungsvektor pCR-Script (Stratagene) kloniert. Die
Identität des erzeugten Amplikons wurde durch Sequenzierung
unter Verwendung eines Vektor-spezifischen Primers bestätigt.
Die DNA kodierend für das Chorismat-Mutase-2-Gen wurde
mittels polymerase chain reaction (PCR) aus Arabidopsis
thaliana unter Verwendung eines sense spezifischen Primers
(CM-2 5' SEQ ID NO. 13) und eines antisense spezifischen Primers
(CM-2 3' SEQ ID NO. 14) amplifiziert.
Die PCR Bedingungen waren die folgenden:
Die PCR erfolgte in einem 50 µl Reaktionsansatz in dem enthalten war:
Die PCR erfolgte in einem 50 µl Reaktionsansatz in dem enthalten war:
- - 2 µl einer Arabidopsis thaliana cDNA
- - 0,2 mM dATP, dTTP, dGTP, dCTP
- - 1,5 mM Mg(OAc)2
- - 5 µg Rinderserum-Albumin
- - 40 pmol CM-2 5'Primer
- - 40 pmol CM-2 3'Primer
- - 15 µl 3,3 µ rTth DNA Polymerase XLPuffer (PE Applied Biosystems)
- - 5 U rTth DNA Polymerase XL (PE Applied Biosystems)
Die PCR wurde unter folgenden Zyklus Bedingungen durchgeführt:
Schritt 1: 5 Minuten 94°C (Denaturierung)
Schritt 2: 3 Sekunden 94°C
Schritt 3: 1 Minute 55°C (Annealing)
Schritt 4: 2 Minuten 72°C (Elongation)
30 Wiederholungen der Schritte 2 bis 4
Schritt 5: 10 Minuten 72°C (Post-Elongation)
Schritt 6: 4°C (Warteschleife)
Schritt 1: 5 Minuten 94°C (Denaturierung)
Schritt 2: 3 Sekunden 94°C
Schritt 3: 1 Minute 55°C (Annealing)
Schritt 4: 2 Minuten 72°C (Elongation)
30 Wiederholungen der Schritte 2 bis 4
Schritt 5: 10 Minuten 72°C (Post-Elongation)
Schritt 6: 4°C (Warteschleife)
Das Amplikon wurde unter Verwendung von Standardmethoden in den
PCR Klonierungsvektor pGEM-T (Promega) kloniert. Die Identität
des erzeugten Amplikons wurde durch Sequenzierung unter Ver
wendung des M13F (-40) Primers bestätigt.
Zur Erzeugung des chimären Gens CM-1-TP-CM-2, wurde das Plasmid
pCR-Script/CM-1-TP mit den Restriktionsenzyme NcoI/SalI verdaut.
In dieses Plasmid wurde das aus dem Plasmid pGEM-Teasy/CM-2
mittels der Restriktionsenzyme NcoI/SalI isolierte DNA-Fragment
der CM-2 ligiert. Die Translation dieses chimären DNA-Konstruktes
(SEQ ID No. 5) (pCR-Script/AtCM-1TP-AtCM-2, Fig. 4 hat die
Bildung eines Fusionsproteins zur Folge, indem das Transitpeptid
der CM-1 mit der CM-2 kombiniert ist (SEQ ID NO. 6).
Transgene Pflanzen wurden erzeugt, die das chimäre Gen
CM-1-TP-CM2 aus A. thaliana zum einen unter Kontrolle des
konstitutiven 35S-Promotor des CaMV (Blumenkohlmosaikvirus)
(Franck et al., Cell 21: 285-294, 1980) und zum anderen unter
Kontrolle des samenspezifischen Promotors des Legumin Gens aus
Vicia faba (Kafatos et al., Nuc. Acid. Res., 14(6): 2707-2720,
1986) exprimieren.
Die Grundlage des zur konstitutiven Expression des chimären Gens
CM-1TP-CM-2 war der Vektor pBinAR (Höfgen und Willmitzer, Plant
Sci. 66: 221-230, 1990). Dieser Vektor enthält den 35S-Promotor
des CaMV (Blumenkohlmosaikvirus) (Franck et al., 1980) und das
Terminationssignal des Octopin-Synthase Gens (Gielen et al., EMBO
J. 3: 835-846, 1984). Zur Erstellung dieses Plasmides wurde
das chimäre Gen CM-1-TP-CM2 unter Verwendung der flankierenden
Restriktionsschnittstellen KpnI/SalI aus dem Plasmid pCR-Script/
AtCM-1TP-AtCM-2 (Abb. 4) isoliert. Dieses Fragment wurde unter
Anwendung von Standardmethoden in einen KpnI/SalI geschnittenen
pBinAR ligiert. Das resultierende Plasmid (pBinAR/CM-1TP/CM-2,
Abb. 5) wurde zur Erzeugung transgener Arabidopsis thaliana und
Nicotiana tabacum verwendet.
Zur Erzeugung eines Plasmides, welches die samenspezifische
Expression des chimären Gens CM-1TP/CM-2 in Pflanzen ermöglicht,
wurde der samenspezifiche Promotor des Legumin B4 Gens (Kafatos
et al., Nuc. Acid. Res., 14(6): 2707-2720, 1986) verwendet. Aus dem
Plasmid pGEMTeasy/lePNOS wurde das 2,7 Kb Fragment des Legumin B4
Gen Promotors unter Verwendung der den Promotor 5' flankierenden
EcoR1 und der 3' flankierenden KpnI Schnittstellen isoliert. Das
Plasmid pBinAR/CM-1TP/CM-2 wurde ebenfalls mit den Restriktions
enzymen EcoR1 und Kpn1 behandelt. Dies hatte zur Folge, daß der
35S-Promotor des CaMV aus diesem Plasmid herausgetrennt wurde,
siehe Fig. 5). Der Promotor des Legumin Gens wurde anschließend
als EcoR1/Kpn1 Fragment in diesen Vektor kloniert, wodurch ein
Plasmid erzeugt wurde, welches die Expression des chimären
Gens CM-1TP-CM-2 unter die Kontrolle dieses samenspezifischen
Promotors stellte, siehe Fig. 6). Dieses Plasmid (pBinLeP/
CM-1TP/CM-2) wurde zur Erzeugung transgener Arabidopsis thaliana,
und Nicotiana tabacum Pflanzen verwendet.
Die Herstellung der Pflanzen erfolgte analog zu Beispiel 4 unter
Verwendung der Plasmide (pBinAR/AtCM-1TP/CM-2) und (pBinLeP/
CM-1TP/CM-2).
Die Herstellung der Pflanzen erfolgte analog zu Beispiel 5 unter
Verwendung der Plasmide (pBinAR/AtCM-1TP/CM-2) und (pBinL 02387 00070 552 001000280000000200012000285910227600040 0002010064454 00004 02268eP/
CM-1TP/CM-2).
Die Herstellung der Pflanzen erfolgte analog zu Beispiel 6 unter
Verwendung der Plasmide (pBinAR/AtCM-1TP/CM-2) und (pBinARleP/
CM-1TP/CM-2).
Es wurden die Tocopherol- und Tocotrienol-Gehalte in Blätter
und Samen der mit den beschriebenen Konstrukten transformierten
Pflanzen (Arabidopsis thaliana, Brassica napus und Nicotiana
tabacum) analysiert. Dazu wurden die transgenen Pflanzen im
Gewächshaus kultiviert und Pflanzen die das Gen kodierend für
die cytosolische Chorismatmutase exprimieren auf Northern- und
Western Ebene analysiert. In Blättern und Samen dieser Pflanzen
wurde der Tocopherolgehalt und der Tocotrienolgehalt mittels HPLC
ermittelt. In allen Fällen war der Tocopherol- und/oder Toco
trienol-Gehalt in transgenen Pflanzen, die zusätzlich Chorismat
mutase-Gene exprimieren, im Vergleich zu nicht transformierten
Pflanzen erhöht.
Claims (37)
1. Verfahren zur Herstellung von Feinchemikalien durch Kulti
vierung von Organismen die gegenüber dem Wildtyp einen
genetisch veränderten Shikimatweg aufweisen.
2. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß man
zur genetischen Veränderung des Shikimatweges mindestens eine
Maßnahme ausgewählt aus der Gruppe der Maßnahmen A und B
durchführt, wobei A und B folgende Bedeutung haben:
- 1. A: Erhöhung der Aktivität mindestens eines Enzyms des Shikimatweges des Wildtyps;
- 2. B: Einbringen mindestens eines Gens in den Organismus zu dem der Wildtyp kein orthologes Gen aufweist und das den Stoffwechselweg des Shikimatweges des Wildtyps überbrückt.
3. Verfahren nach Anspruch 2, dadurch gekennzeichnet, daß man
bei Maßnahme A die Aktivität mindestens eines Enzyms des
Shikimatweges durch Überexpression von Nukleinsäuren erhöht,
die Proteine mit dieser enzymatischen Aktivität codieren.
4. Verfahren nach Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, daß man
eine Nukleinsäure, codierend eine Chorismatmutase in den
Organismus einbringt.
5. Verfahren nach Anspruch 4, dadurch gekennzeichnet, daß man
eine Nukleinsäure codierend eine Chorismatmutase in den
Organismus einbringt, deren Aktivität einer reduzierten
posttranslationalen Regulation im Organismus unterliegt.
6. Verfahren nach Anspruch 5, dadurch gekennzeichnet, daß man
eine Nukleinsäure codierend eine Chorismatmutase in den
Organismus einbringt die an der Lokalisation der Expression
im Organismus einer reduzierten posttranslationalen
Regulation unterliegt.
7. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 6, dadurch gekenn
zeichnet, daß man als Organismus eine Pflanze verwendet.
8. Verfahren nach Anspruch 7, dadurch gekennzeichnet, daß man
eine cytosolische Chorismatmutase in Plastiden einer Pflanze
einbringt.
9. verfahren nach Anspruch 8, dadurch gekennzeichnet, daß man
ein Nukleinsäurekonstrukt in die Pflanze einbringt, ent
haltend eine Nukleinsäure kodierend ein plastidäres Transit
peptid und eine Nukleinsäure die ein Protein kodiert, ent
haltend die Aminosäuresequenz SEQ ID NO. 4 oder eine von
dieser Sequenz durch Substitution, Insertion oder Deletion
von Aminosäuren abgeleitete Sequenz, die eine Homologie
von mindestens 30% auf Aminosäureebene mit der Sequenz
SEQ ID NO. 4 und die enzymatische Eigenschaft einer Choris
matmutase aufweist.
10. Verfahren nach Anspruch 9, dadurch gekennzeichnet, daß man
als Nukleinsäure, kodierend ein plastidäres Transitpeptid
eine Nukleinsäure verwendet, die das plastidäre Transitpeptid
einer plastidären Chorismatmutase kodiert.
11. Verfahren nach Anspruch 10, dadurch gekennzeichnet, daß
man ein Nukleinsäurekonstrukt der Nukleinsäuresequenz
SEQ ID NO. 5 in Pflanzen einbringt.
12. Nukleinsäurekonstrukt, enthaltend eine Nukleinsäure
kodierend ein plastidäres Transitpeptid und eine Nuklein
säure die ein Protein kodiert, enthaltend die Aminosäure
sequenz SEQ ID NO. 4 oder eine von dieser Sequenz durch
Substitution, Insertion oder Deletion von Aminosäuren
abgeleitete Sequenz, die eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz SEQ ID NO. 4 und die
enzymatische Eigenschaft einer Chorismatmutase aufweist.
13. Nukleinsäurekonstrukt nach Anspruch 12, dadurch gekenn
zeichnet, daß man als Nukleinsäure, kodierend ein plastidäres
Transitpeptid eine Nukleinsäure verwendet, die das plastidäre
Transitpeptid einer plastidären Chorismatmutase kodiert.
14. Nukleinsäurekonstrukt nach Anspruch 13, dadurch gekenn
zeichnet, daß es die Nukleinsäuresequenz SEQ ID NO. 5
aufweist.
15. Verfahren nach einem der Ansprüche 2 bis 11, dadurch
gekennzeichnet, daß man als Organismus eine Pflanze
verwendet und daß man bei Maßnahme B als Gen zu dem
der Wildtyp kein orthologes Gen aufweist eine Nukleinsäure
codierend eine Prephenatdehydrogenase in eine Pflanze ein
bringt.
16. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 11 und 15, dadurch
gekennzeichnet, daß man eine Nukleinsäure codierend eine
Prephenatdehydrogenase in Kombination mit einer Nukleinsäure
codierend eine Chorismatmuate in eine Pflanze einbringt.
17. Verfahren nach Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet, daß man
eine Nukleinsäure codierend eine Chorismatmutase-Prephenat
dehydrogenase in eine Pflanze einbringt.
18. Verfahren nach Anspruch 17, dadurch gekennzeichnet, daß man
eine Nukleinsäure einbringt, die ein Protein kodiert, ent
haltend die Aminosäuresequenz SEQ ID NO. 2 oder eine von
dieser Sequenz durch Substitution, Insertion oder Deletion
von Aminosäuren abgeleitete Sequenz, die eine Homologie
von mindestens 30% auf Aminosäureebene mit der Sequenz
SEQ ID NO. 2 und die enzymatische Eigenschaft einer
Chorismatmutase-Prephenatdehydrogenase aufweist.
19. Verfahren nach Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet, daß
man eine Nukleinsäure bakterieller Herkunft verwendet.
20. Verfahren nach Anspruch 18 oder 19, dadurch gekennzeichnet,
daß man eine Nukleinsäure verwendet, die die in SEQ ID NO. 1
dargestellten Sequenz enthält.
21. Nukleinsäurekonstrukt, enthaltend eine Nukleinsäure gemäß
einem der Ansprüche 3 bis 6, 8 und 15 bis 17, die mit einem
oder mehreren Regulationssignalen funktionell verknüpft sind,
die die Transkription und Translation in Pflanzen gewähr
leisten.
22. Nukleinsäurekonstrukt nach Anspruch 21, enthaltend zusätzlich
eine Nukleinsäure kodierend ein plastidäres Transitpeptid.
23. Nukleinsäurekonstrukt nach Anspruch 22, enthaltend ein
Nukleinsäurekonstrukt gemäß Anspruch 12.
24. Nukleinsäurekonstrukt nach Anspruch 22, enthaltend eine
Nukleinsäure kodierend ein plastidäres Transitpeptid und eine
Nukleinsäure die ein Protein kodiert, enthaltend die Amino
säuresequenz SEQ ID NO. 2 oder eine von dieser Sequenz durch
Substitution, Insertion oder Deletion von Aminosäuren abge
leitete Sequenz, die eine Homologie von mindestens 30%
auf Aminosäureebene mit der Sequenz SEQ ID NO. 2 und die
enzymatische Eigenschaft einer Chorismatmutase-Prephenat
dehydrogenase aufweist.
25. Verwendung einer Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 3 bis
6, 8 und 15 bis 17 und der Nukleinsäurekonstrukte gemäß einem
der Ansprüche 12 bis 14 und 21 bis 24 zur Herstellung von
transgenen Pflanzen.
26. Verwendung nach Anspruch 25, dadurch gekennzeichnet, daß die
transgene Pflanze gegenüber dem Wildtyp einen erhöhten Gehalt
an Feinchemikalien aufweist.
27. Verwendung nach Anspruch 25, dadurch gekennzeichnet, daß
die transgene Pflanze gegenüber dem Wildtyp eine erhöhte
Resistenz gegenüber abiotischem Streß aufweist.
28. Genetisch veränderter Organismus, wobei die genetische Ver
änderung den Metabolitfluß des Shikimatweges gegenüber dem
Wildtyp verändert und der Organismus gegenüber dem Wildtyp
einen veränderten Gehalt an Feinchemikalien aufweist.
29. Genetisch veränderter Organismus nach Anspruch 28, wobei die
genetische Veränderung die Genexpression einer Nukleinsäure
kodierend eine Chorismatmutase, Prephenatdehydrogenase oder
Choroismatmutase-Prephenatdehydrogenase gegenüber einem Wild
typ
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure enthält, erhöht oder
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure nicht enthält, verursacht.
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure enthält, erhöht oder
für den Fall, daß der Ausgangsorganismus die entsprechende Nukleinsäure nicht enthält, verursacht.
30. Genetisch veränderter Organismus nach Anspruch 29, trans
formiert mit einem Nukleinsäurekonstrukt gemäß einem der
Ansprüche 21 bis 24.
31. Genetisch veränderter Organismus nach Anspruch 29, enthaltend
einem Nukleinsäurekonstrukt gemäß einem der Ansprüche 21 bis
24.
32. Genetisch veränderter Organismus nach einem der Ansprüche 28
bis 31, dadurch gekennzeichnet, daß man als Organismus eine
Pflanze verwendet.
33. Verfahren zur Herstellung von genetisch veränderten
Organismen gemäß einem der Ansprüche 28 bis 32, dadurch
gekennzeichnet, daß man mindestens eine Nukleinsäure gemäß
einem der Ansprüche 3 bis 6, 8 und 15 bis 17 oder mindestens
ein Nukleinsäurekonstrukte gemäß einem der Ansprüche 12 bis
14 und 21 bis 24 in das Genom des Ausgangsorganismus ein
führt.
34. Verwendung der genetisch veränderten Organismen nach einem
der Ansprüche 28 bis 32 zur Herstellung von Feinchemikalien.
35. Verwendung der genetisch veränderten Organismen nach einem
der Ansprüche 28 bis 32 als Futter- und Nahrungsmittel oder
zur Herstellung von prozessierten Lebensmittel.
36. Verwendung einer Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 3
bis 6, 8 und 15 bis 17 und der Nukleinsäurekonstrukte gemäß
einem der Ansprüche 12 bis 14 und 21 bis 24 zur Erhöhung des
Gehalts an Feinchemikalien in Organismen.
37. Verwendung einer Nukleinsäure gemäß einem der Ansprüche 3 bis
6, 8 und 15 bis 17 und der Nukleinsäurekonstrukte gemäß einem
der Ansprüche 12 bis 14 und 21 bis 24 zur Herstellung von
Feinchemikalien in Organismen.
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