DE19845216A1 - DNA-Sequenzen codierend für eine 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat Synthase und eine Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase und deren Überproduktion in Pflanzen - Google Patents
DNA-Sequenzen codierend für eine 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat Synthase und eine Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase und deren Überproduktion in PflanzenInfo
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Abstract
Verfahren zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhter Vitamin E Biosyntheseleistung durch Überexpression eines 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat Synthase-Gens aus E.coli und einer p-Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase aus Streptomyces avermitilis.
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft die Verwendung von DNA-Sequen
zen codierend für eine 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat Synthase
(DOXS) und codierend für eine p-Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase
(HPPD) zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhtem Tocopherol-,
Vitamin K-, Chlorophyll- und/oder Carotinoid-Gehalt, speziell die
Verwendung von DNA-Sequenzen SEQ-ID No. 1 und 3 oder mit diesen
hybridisierende DNA-Sequenzen, einem Verfahren zur Herstellung
von Pflanzen mit erhöhtem Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll-
und/oder Carotinoid-Gehalt, sowie die derart hergestellte Pflanze
selbst.
Ein wichtiges Ziel pflanzenmolekulargenetischer Arbeiten ist bis
her die Erzeugung von Pflanzen mit erhöhtem Gehalt an Zuckern,
Enzymen und Aminosäuren. Wirtschaftlich interessant ist jedoch
auch die Entwicklung von Pflanzen mit erhöhtem Gehalt an Vitami
nen, wie z. B. der Erhöhung des Tocopherol-Gehaltes.
Die in der Natur vorkommenden acht Verbindungen mit Vitamin E-Ak
tivität sind Derivate des 6-Chromanols (Ullmann's Encyclopedia
of Industrial Chemistry, Vol. A 27 (1996), VCH Verlagsgesell
schaft, Chapter 4., 478-488, Vitamin E). Die erste Gruppe (1a-d)
stammt von Tocopherol ab, die zweite Gruppe besteht aus Derivaten
des Tocotrienols (2a- d):
1a, α-Tocopherol: R1 = R2 = R3 = CH3
1b, β-Tocopherol [148-03-8]: R1 = R3 = CH3, R2 = H
1c, γ-Tocopherol [54-28-4]: R1 = H, R2 = R3 = CH3
1d, δ-Tocopherol [119-13-1]: R1 = R2 = H, R3 = CH3
1b, β-Tocopherol [148-03-8]: R1 = R3 = CH3, R2 = H
1c, γ-Tocopherol [54-28-4]: R1 = H, R2 = R3 = CH3
1d, δ-Tocopherol [119-13-1]: R1 = R2 = H, R3 = CH3
2a, α-Tocotrienol [1721-51-3]: R1 = R2 = R3 = CH3
2b, β-Tocotrienol [490-23-3]: R1 = R3 = CH3, R2 = H
2c, γ-Tocotrienol [14101-61-2]: R1 = H, R2 = R3 = CH3
2d, δ-Tocotrienol [25612-59-3]: R1 = R2 = H, R3 = CH3
Wirtschaftlich große Bedeutung besitzt α-Tocopherol.
Der Entwicklung von Kulturpflanzen mit erhöhtem Tocopherol-Gehalt
durch Gewebekultur oder Samenmutagenese und natürliche Auswahl
sind Grenzen gesetzt. So muß einerseits der Tocopherol-Gehalt
bereits in Gewebekultur erfaßbar sein und andererseits können
nur diejenigen Pflanzen über Gewebekulturtechniken manipuliert
werden, deren Regeneration zu ganzen Pflanzen aus Zellkulturen
gelingt. Außerdem können Kulturpflanzen nach Mutagenese und
Selektion unerwünschte Eigenschaften zeigen, die durch teilweise
mehrmalige Rückkreuzungen wieder beseitigt werden müssen. Auch
wäre die Erhöhung des Tocopherol-Gehaltes durch Kreuzung auf
Pflanzen der selben Art beschränkt.
Aus diesen Gründen ist das gentechnische Vorgehen, die für die
Tocopherol Syntheseleistung kodierenden, essentiellen Biosynthe
segene zu isolieren und in Kulturpflanzen gezielt zu übertragen,
dem klassischen Züchtungsverfahren überlegen. Dieses Verfahren
setzt voraus, daß die Biosynthese und deren Regulation bekannt
ist und daß Gene, die die Biosyntheseleistung beeinflussen,
identifiziert werden.
Isoprenoide oder Terpenoide bestehen aus verschiedenen Klassen
lipidlöslicher Moleküle und werden teilweise oder vollständig aus
C5-Isopren-Einheiten gebildet. Reine Prenyllipide (z. B.
Carotinoide) bestehen aus C-Gerüsten, die ausschließlich auf
Isopren-Einheiten zurückgehen, während gemischte Prenyllipide
(z. B. Chlorophyll) eine Isoprenoid-Seitenkette besitzen, die mit
einem aromatischen Kern verbunden ist.
Ausgangspunkt der Biosynthese von Prenyllipiden sind 3 × Acetyl-
CoA Einheiten, die über β-Hydroxymethylglutaryl-CoA (HMG-CoA) und
Mevalonat in die Ausgangs-Isopren-Einheit (C5), dem Isopentenylpy
rophosphat (IPP), umgewandelt werden. Kürzlich wurde durch in
vivo Fütterungsexperimente mit C13 gezeigt, daß in verschiedenen
Eubakterien, Grünalgen und pflanzlichen Chloroplasten ein Mevalo
nat-unabhängiger Weg zur Bildung von IPP beschritten wird:
Dabei werden Hydroxyethylthiamin, das durch Decarboxylierung von
Pyruvat entsteht, und Glycerinaldehyd-3-Phosphat (3-GAP) in einer
durch die 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat Synthase vermittelten
"Transketolase"-Reaktion zunächst in 1-Deoxy-D-Xylu
lose-5-Phosphat umgewandelt (Schwender et al., FEBS Lett.
414(1), 129-134 (1997); Arigoni et al., Proc.Natl.Acad.Sci USA
94(2), 10600-10605 (1997); Lange et al., Proc.Natl.Acad.Sci.USA
95(5), 2100-2104 (1998); Lichtenthaler et al., FEBS Lett. 400(3),
271-274 (1997). Dieses wird dann durch eine intramolekulare Umord
nung in IPP umgesetzt (Arigoni et al., 1997). Biochemische Daten
deuten darauf hin, daß der Mevalonat-Weg im Zytosol operiert und
zur Bildung von Phytosterolen führt. Das Antibiotikum Mevinolin,
ein spezifischer Inhibitor der Mevalonat-Bildung, führt lediglich
zur Inhibition der Sterol-Biosynthese im Zytoplasma, während die
Prenyllipid-Bildung in den Plastiden unbeeinflußt ist (Bach und
Lichtenthaler, Physiol. Plant 59(1993), 50-60). Der Mevalonat-un
abhängige Weg ist dagegen plastidär lokalisiert und führt vor
nehmlich zur Bildung von Carotinoiden und plastidären Prenyllipi
den (Schwender et al., 1997; Arigoni et al., 1997).
IPP steht im Gleichgewicht mit seinem Isomer, dem Dimethylallyl
Pyrophosphat (DMAPP). Eine Kondensation von IPP mit DMAPP in
Kopf-Schwanz Anlagerung ergibt das Monoterpen (C10) Geranyl-Pyro
phosphat (GPP). Die Addition von weiteren IPP Einheiten führt zum
Sesquiterpen (C15), Farnesy-Pyrophosphat (FPP) und zum Diterpen
(C20) Geranyl-Geranyl-Pyrophosphat (GGPP). Die Verknüpfung zweier
GGPP Moleküle führt zur Bildung der C40-Vorläufer für Carotinoide.
GGPP wird durch eine Prenylketten-Hydrogenase zum Phytyl-Pyro
phosphat (PPP) umgeformt, dem Ausgangsstoff für die weitere
Bildung von Tocopherolen.
Bei den Ringstrukturen der gemischten Prenyllipide, die zur
Bildung der Vitamine E und K führen, handelt es sich um Quinone,
deren Ausgangsmetabolite aus dem Shikimat-Weg stammen. Die aroma
tischen Aminosäuren Phenylalanin bzw. Tyrosin werden in Hydroxy
phenyl-Pyruvat umgewandelt, welches durch Dioxygenierung in Homo
gentisinsäure überführt wird. Diese wird an PPP gebunden, um den
Vorläufer von α-Tocopherol und α-Tocoquinon, das 2-Methyl-6-phy
tylquinol, zu bilden. Durch Methylierungsschritte mit S-Adenosyl
methionin als Methyl-Gruppen-Donor entsteht zunächst
2,3-Dimethyl-6-phytylquinol, dann durch Zyklisierung γ-Tocopherol
und durch nochmalige Methylierung α-Tocopherol (Richter, Bioche
mie der Pflanzen, Georg Thieme Verlag Stuttgart, 1996).
In der Literatur finden sich Beispiele die zeigen, daß die Mani
pulation eines Enzyms den Metabolit-Fluß direktional beeinflußen
kann. In Experimenten mit einer veränderten Expression der Phy
toen Synthase, welche zwei GGPP-Moleküle zu 15-cis-Phytoen
miteinander verknüpft, konnte ein direkter Einfluß auf die Caro
tinoid-Mengen dieser transgenen Tomatenpflanzen gemessen werden
(Fray und Grierson, Plant Mol.Biol.22(4), 589-602 (1993); Fray et
al., Plant J., 8, 693-701 (1995)). Wie zu erwarten, zeigen
transgene Tabakpflanzen mit verringerten Mengen an Phenylalanin-
Ammonium Lyase reduzierte Phenylpropanoid-Mengen. Das Enzym
Phenylalanin-Ammonium Lyase katalysiert den Abbau von Phenyl
alanin, entzieht es also der Phenylpropanoid-Biosynthese (Bate et
al.,Proc. Natl. Acad. Sci USA 91 (16): 7608-7612 (1994); Howles
et al., Plant Physiol. 112. 1617-1624(1996)).
Über die Erhöhung des Metabolitflusses zur Steigerung des Toco
pherol-Gehaltes in Pflanzen durch Überexpression einzelner Bio
synthesegene ist bisher wenig bekannt. Lediglich WO 97/27285
beschreibt eine Modifikation des Tocopherol-Gehaltes durch
verstärkte Expression bzw. durch Herunterregulation des Enzyms
p-Hydroxyphenylpyruvatdioxygenase (HPPD).
Aufgabe der vorliegenden Erfindung war die Entwicklung einer
transgenen Pflanze mit erhöhtem Gehalt an Tocopherolen,
Vitamin K, Chlorophyllen und Carotinoiden.
Die Aufgabe wurden überraschenderweise gelöst durch die Über
expression eines 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat Synthase
(DOXS)-Gens und eines p-Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase
(HPPD)-Gens in den Pflanzen, siehe Abb. 1.
Um den Metabolit-Fluß aus dem Primärstoffwechsel in den Isopre
noid-Stoffwechsel zu verstärken, wurde die Bildung von IPP als
allgemeines Ausgangssubstrat für alle plastidären Isoprenoide er
höht. Zu diesem Zweck wurde in transgenen Tabak- und Rapspflanzen
die Aktivität der DOXS durch Überexpression der DOXS aus E.coli
erhöht. Dies kann durch Expression homologer oder anderer hetero
loger Gene erreicht werden. DOXS-Nukleotidsequenzen sind aus Ara
bidopsis thaliana (Acc. No. U 27099), Reis (Acc. No. AF024512)
und Pfefferminze (Acc. No. AF019383) beschrieben.
In einem Ausführungsbeispiel wird das DOXS-Gen aus E.coli (SEQ-ID
No. 1; Rosa Putra et al., Tetrahedron Lett. 39(1998), 23-26; Acc.
No.035440) in transgenen Pflanzen verstärkt exprimiert. Um eine
Plastidenlokalisation zu gewährleisten wird der E.coli DOXS in
einem weiteren Konstrukt eine Transitsignalsequenz vorangestellt.
Auch geeignet als Expressionskassette ist eine DNA-Sequenz, die
für ein DOXS-Gen codiert, das mit Seq-ID No. 1 hybridisiert und
das aus anderen Organismen bzw. aus anderen Pflanzen stammt.
Das nun vermehrt zur Verfügung stehende D-1-Desoxy-Xylu
lose-5-Phosphat wird weiter in Richtung Tocopherole und
Carotinoide umgesetzt.
Darüberhinaus verstärkt die Bildung von Homogentisinsäure den
Metabolitfluß weiter in Richtung von Phytylquinonen und damit
Tocopherol, siehe Abb. 1. Homogentisinsäure wird gebildet
aus p-Hydroxyphenylpyruvat durch das Enzym p-Hydroxyphenylpyruvat
Dioxygenase (HPPD). cDNAs, die für dieses Enzym kodieren, wurden
aus verschiedenen Organismen wie beispielsweise aus Mikroorganis
men, aus Pflanzen und aus dem Menschen beschrieben.
In Ausführungsbeispiel 4 wurde erstmals das HPPD-Gen aus Strepto
myces avermitilis (Denoya et al., J. Bacteriol. 176(1994),
5312-5319; SEQ-ID No. 3) zusammen mit der DOXS aus E.coli in
Pflanzen und pflanzlichen Plastiden überexprimiert.
Die Erhöhung der plastidären IPP Bildung führt zur verstärkten
Bildung aller plastidären Isoprenoide. Die erhöhte Bereitstellung
von Homogentisinsäure gewährleistet, daß genügend Substrat für
die Bildung von Tocopherolen in den Plastiden zur Verfügung
steht. Dieses nun vermehrt zur Verfügung stehende Homogentisat
kann in den transgenen Pflanzen seinerseits mit der durch die
Überexpression der DOXS erhöhten Menge an Phytyldiphosphat (PPP)
umgesetzt werden. PPP nimmt dabei eine Schlüsselstellung ein, da
es einerseits als Ausgangssubstrat für Chlorophylle und Phyllo
quinone, andererseits für Tocopherole dient.
Die Herstellung der transgenen Pflanzen erfolgt durch Transforma
tion der Pflanzen mit einem das DOXS und das HPPD-Gen ent
haltenden Konstrukt. Als Modellpflanzen für die Produktion von
Tocopherolen, Vitamin K, Chlorophyllen und Carotinoiden wurden
Tabak und Raps eingesetzt.
Gegenstand der Erfindung ist die Verwendung der DNA-Sequenzen
SEQ-ID No. 1 und SEQ-ID No. 3, die für eine DOXS bzw. HPPD oder
deren funktionelle Äquivalente kodieren, zur Herstellung einer
Pflanze mit erhöhtem Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll- und/
oder Carotinoid-Gehalt. Die Nukleinsäuresequenzen können dabei
z. B. DNA- oder cDNA-Sequenzen sein. Zur Insertion in eine Expres
sionskassette geeignete kodierende Sequenzen sind beispielsweise
solche, die für eine DOXS bzw. HPPD kodieren und die dem Wirt die
Fähigkeit zur Überproduktion von Tocopherol verleihen.
Die Expressionskassetten beinhalten außerdem regulative Nuklein
säuresequenzen, welche die Expression der kodierenden Sequenz in
der Wirtszelle steuern. Gemäß einer bevorzugten Ausführungsform
umfaßt eine Expressionskassette stromaufwärts, d. h. am 5'-Ende
der kodierenden Sequenz, einen Promotor und stromabwärts, d. h. am
3'-Ende, ein Polyadenylierungssignal und gegebenenfalls weitere
regulatorische Elemente, welche mit der dazwischenliegenden ko
dierenden Sequenz für das DOXS- bzw. HPPD-Gen operativ verknüpft
sind. Unter einer operativen Verknüpfung versteht man die sequen
zielle Anordnung von Promotor, kodierender Sequenz, Terminator
und ggf. weiterer regulativer Elemente derart, daß jedes der
regulativen Elemente seine Funktion bei der Expression der
kodierenden Sequenz bestimmungsgemäß erfüllen kann. Die zur ope
rativen Verknüpfung bevorzugten aber nicht darauf beschränkten
Sequenzen sind Targeting-Sequenzen zur Gewährleistung der subzel
lulären Lokalisation im Apoplasten, in der Vakuole, in Plastiden,
im Mitochondrium, im Endoplasmatischen Retikulum (ER), im Zell
kern, in Ölkörperchen oder anderen Kompartimenten und Translati
onsverstärker wie die 5'-Führungssequenz aus dem Tabak-Mosaik-Vi
rus (Gallie et al., Nucl. Acids Res. 15 (1987), 8693-8711).
Beispielhaft kann die pflanzliche Expressionskassette in den
Tabak-Transformationsvektor pBinAR-Hyg eingebaut werden. Abb. 2
zeigt die Tabaktransformationsvektoren pBinAR-Hyg mit 35S-Promo
tor (A) bzw. pBinAR-Hyg mit samenspezifischem Promotor Phaseolin
796 (B):
- - HPT: Hygromycin-Phosphotransferase
- - OCS: Octopin-Synthase-Terminator
- - PNOS: Nopalin-Synthase-Promotor
- - außerdem sind solche Restriktionsschnittstellen eingezeich net, die nur einmal den Vektor schneiden.
Als Promotoren der Expressionskassette ist grundsätzlich jeder
Promotor geeignet, der die Expression von Fremdgenen in Pflanzen
steuern kann. Vorzugsweise verwendet man insbesondere einen
pflanzlichen Promotor oder einen Promotor, der einem Pflanzenvi
rus entstammt. Insbesondere bevorzugt ist der CaMV 35S-Promotor
aus dem Blumenkohl-Mosaik-Virus (Franck et al., Cell 21 (1980),
285-294). Dieser Promotor enthält bekanntlich unterschiedliche
Erkennungssequenzen für transkriptionale Effektoren, die in ihrer
Gesamtheit zu einer permanenten und konstitutiven Expression des
eingeführten Gens führen (Benfey et al., EMBO J. 8 (1989),
2195-2202).
Die Expressionskassette kann auch einen chemisch induzierbaren
Promotor enthalten, durch den die Expression des exogenen DOXS-
bzw. HPPD-Gens in der Pflanze zu einem bestimmten Zeitpunkt
gesteuert werden kann. Derartige Promotoren wie z. B. der
PRP1-Promotor (Ward et al., Plant. Mol. Biol. 22 (1993),
361-366), ein durch Salizylsäure induzierbarer Promotor
(WO 95/19443), ein durch Benzenesulfonamid-induzierbarer
(EP-A 388186), ein durch Tetrazyklin-induzierbarer (Gatz et al.,
(1992) Plant J. 2, 397-404), ein durch Abscisinsäure-induzier
barer (EP-A 335528) bzw. ein durch Ethanol- oder Cyclohexanon-in
duzierbarer (WO 93/21334) Promotor können u. a. verwendet werden.
Weiterhin sind insbesonders solche Promotoren bevorzugt, die die
Expression in Geweben oder Pflanzenteilen sicherstellen, in denen
die Biosynthese von Tocopherol bzw. dessen Vorstufen stattfindet.
Insbesondere zu nennen sind Promotoren, die eine blattspezifische
Expression gewährleisten. Zu nennen sind der Promotor der cyto
solischen FBPase aus Kartoffel oder der ST-LSI Promotor
aus Kartoffel (Stockhaus et al., EMBO J. 8 (1989), 2445-245).
Mit Hilfe eines samenspezifischen Promotors konnte ein Fremd
protein stabil bis zu einem Anteil von 0,67% des gesamten
löslichen Samenproteins in den Samen transgener Tabakpflanzen
exprimiert werden (Fiedler und Conrad, Bio/Technology 10 (1995),
1090-1094). Die Expressionskassette kann daher beispielsweise
einen samenspezifischen Promotor (bevorzugt den Phaseolin-
Promotor (US 5504200), den USP- (Baumlein, H. et al., Mol. Gen.
Genet. (1991) 225 (3), 459-467) oder LEB4-Promotor (Fiedler und
Conrad, 1995)), das LEB4-Signalpeptid, das zu exprimierende Gen
und ein ER-Retentionssignal enthalten.
Die Herstellung einer Expressionskassette erfolgt durch Fusion
eines geeigneten Promotors mit einer geeigneten DOXS- bzw. HPPD-
DNA Sequenz und vorzugsweise einer zwischen Promotor und DOXS-
bzw. HPPD-DNA-Sequenz inserierten DNA, die für ein chloropla
stenspezifisches Transitpeptid kodiert, sowie einem Polyadenylie
rungssignal nach gängigen Rekombinations- und Klonierungs
techniken, wie sie beispielsweise in T. Maniatis, E. F. Fritsch
und J. Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989) sowie in
T. J. Silhavy, M. L. Berman und L. W. Enquist, Experiments with Gene
Fusions, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY
(1984) und in Ausubel, F. M. et al., Current Protocols in Molecu
lar Biology, Greene Publishing Assoc. and Wiley-Interscience
(1987) beschrieben sind.
Insbesondere bevorzugt sind Sequenzen, die ein Targeting in den
Apoplasten, in Plastiden, in die Vakuole, in das Mitochondrium,
in das Endoplasmatische Retikulum (ER) oder durch ein Fehlen ent
sprechender operativer Sequenzen einen Verbleib im Kompartiment
des Entstehens, dem Zytosol, gewährleisten (Kermode, Crit. Rev.
Plant Sci. 15, 4 (1996), 285-423). Für die Menge der Proteinakku
mulation in transgenen Pflanzen besonders förderlich erwiesen hat
sich eine Lokalisation im ER (Schouten et al., Plant Mol. Biol.
30 (1996), 781-792).
Es können auch Expressionskassetten verwendet werden, deren DNA-
Sequenz für ein DOXS- bzw. HPPD-Fusionsprotein kodiert, wobei ein
Teil des Fusionsproteins ein Transitpeptid ist, das die Translo
kation des Polypeptides steuert. Bevorzugt sind für die Chloro
plasten spezifische Transitpeptide, welche nach Translokation des
DOXS- bzw. HPPD-Gens in die Chloroplasten vom DOXS- bzw. HPPD-
Teil enzymatisch abgespalten werden. Insbesondere bevorzugt ist
das Transitpeptid, das von der plastidären Transketolase (TK)
oder einem funktionellen Äquivalent dieses Transitpeptids (z. B.
dem Transitpeptid der kleinen Untereinheit der Rubisco oder der
Ferredoxin NADP Oxidoreduktase) abgeleitet ist.
Besonders bevorzugt sind DNA-Sequenzen von drei Kassetten des
Plastiden-Transitpeptids der plastidären Transketolase aus
Kartoffel in drei Leserastern als KpnI/BamHI Fragmente mit einem
ATG-Codon in der NcoI Schnittstelle:
Die inserierte Nukleotid-Sequenz kodierend für eine DOXS bzw.
HPPD kann synthetisch hergestellt oder natürlich gewonnen sein
oder eine Mischung aus synthetischen und natürlichen DNA-Bestand
teilen enthalten, sowie aus verschiedenen heterologen DOXS bzw.
HPPD-Genabschnitten verschiedener Organismen bestehen. Im allge
meinen werden synthetische Nukleotid-Sequenzen mit Kodons
erzeugt, die von Pflanzen bevorzugt werden. Diese von Pflanzen
bevorzugten Kodons können aus Kodons mit der höchsten Proteinhäu
figkeit bestimmt werden, die in den meisten interessanten Pflan
zenspezies exprimiert werden. Bei der Präparation einer Expres
sionskassette können verschiedene DNA-Fragmente manipuliert
werden, um eine Nukleotid-Sequenz zu erhalten, die zweckmäßiger
weise in der korrekten Richtung liest und die mit einem korrekten
Leseraster ausgestattet ist. Für die Verbindung der DNA-Fragmente
miteinander können an die Fragmente Adaptoren oder Linker ange
setzt werden.
Zweckmäßigerweise können die Promotor- und die Terminator-Regio
nen in Transkriptionsrichtung mit einem Linker oder Polylinker,
der eine oder mehrere Restriktionsstellen für die Insertion die
ser Sequenz enthält, versehen werden. In der Regel hat der Linker
1 bis 10, meistens 1 bis 8, vorzugsweise 2 bis 6 Restriktions
stellen. Im allgemeinen hat der Linker innerhalb der regulatori
schen Bereiche eine Größe von weniger als 100 bp, häufig weniger
als 60 bp, mindestens jedoch 5 bp. Der Promotor kann sowohl nativ
bzw. homolog als auch fremdartig bzw. heterolog zur Wirtspflanze
sein. Die Expressionskassette beinhaltet in der 5'-3'-Transkrip
tionsrichtung den Promotor, eine DNA-Sequenz die für ein DOXS-
bzw. HPPD-Gen codiert und eine Region für die transkriptionale
Termination. Verschiedene Terminationsbereiche sind gegeneinander
beliebig austauschbar.
Ferner können Manipulationen, die passende Restriktionsschnitt
stellen bereitstellen oder die überflüssige DNA oder Restrikti
onsschnittstellen entfernen, eingesetzt werden. Wo Insertionen,
Deletionen oder Substitutionen wie z. B. Transitionen und Trans
versionen in Frage kommen, können in vitro-Mutagenese, "primerre
pair", Restriktion oder Ligation verwendet werden. Bei geeigneten
Manipulationen, wie z. B. Restriktion, "chewing-back" oder Auffül
len von Überhängen für "bluntends", können komplementäre Enden
der Fragmente für die Ligation zur Verfügung gestellt werden.
Von Bedeutung für den erfindungsgemäßen Erfolg kann u. a. das
Anhängen des spezifischen ER-Retentionssignals SEKDEL sein
(Schouten, A. et al., Plant Mol. Biol. 30 (1996), 781-792), die
durchschnittliche Expressionshöhe wird damit verdreifacht bis
vervierfacht. Es können auch andere Retentionssignale, die natür
licherweise bei im ER lokalisierten pflanzlichen und tierischen
Proteinen vorkommen, für den Aufbau der Kassette eingesetzt
werden.
Bevorzugte Polyadenylierungssignale sind pflanzliche Polyadeny
lierungssignale, vorzugsweise solche, die im wesentlichen T-DNA-
Polyadenylierungssignale aus Agrobacterium tumefaciens, ins
besondere des Gens 3 der T-DNA (Octopin Synthase) des Ti-Plasmids
pTiACH5 entsprechen (Gielen et al., EMBO J. 3 (1984), 835 ff)
oder funktionelle Äquivalente.
Eine Expressionskassette kann beispielsweise einen konstitutiven
Promotor (bevorzugt den CaMV 35 5-Promotor), das LeB4-Signalpep
tid, das zu exprimierende Gen und das ER-Retentionssignal enthal
ten. Als ER-Retentionssignal wird bevorzugt die Aminosäuresequenz
KDEL (Lysin, Asparaginsäure, Glutaminsäure, Leucin) verwendet.
Vorzugsweise wird die fusionierte Expressionskassette, die für
ein DOXS-Gen und ein HPPD-Gen kodiert, in einen Vektor,
beispielsweise pBin19, kloniert, der geeignet ist, Agrobacterium
tumefaciens zu transformieren. Mit einem solchen Vektor transfor
mierte Agrobakterien können dann in bekannter Weise zur Transfor
mation von Pflanzen, insbesondere von Kulturpflanzen, wie z. B.
von Tabakpflanzen, verwendet werden, indem beispielsweise verwun
dete Blätter oder Blattstücke in einer Agrobakterienlösung geba
det und anschließend in geeigneten Medien kultiviert werden. Die
Transformation von Pflanzen durch Agrobakterien ist unter anderem
bekannt aus F. F. White, Vectors for Gene Transfer in Higher
Plants; in Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and Utiliza
tion, herausgegeben von S. D. Kung und R. Wu, Academic Press,
1993, S. 15-38. Aus den transformierten Zellen der verwundeten
Blätter bzw. Blattstücke können in bekannter Weise transgene
Pflanzen regeneriert werden, die ein in die Expressionskassette
integriertes Gen für die Expression eines DOXS-Gens bzw. eines
HPPD-Gens enthalten.
Zur Transformation einer Wirtspflanze mit einer für eine DOXS und
HPPD kodierenden DNA wird eine Expressionskassette als Insertion
in einen rekombinanten Vektor eingebaut, dessen Vektor-DNA
zusätzliche funktionelle Regulationssignale, beispielsweise
Sequenzen für Replikation oder Integration enthält. Geeignete
Vektoren sind unter anderem in "Methods in Plant Molecular
Biology and Biotechnology" (CRC Press), Kap. 6/7, S. 71-119
(1993) beschrieben.
Unter Verwendung der oben zitierten Rekombinations- und
Klonierungstechniken können die Expressionskassetten in geeignete
Vektoren kloniert werden, die ihre Vermehrung, beispielsweise in
E. coli, ermöglichen. Geeignete Klonierungsvektoren sind u. a.
pBR332, pUC-Serien, M13mp-Serien und pACYC184. Besonders geeignet
sind binäre Vektoren, die sowohl in E. coli als auch in Agrobak
terien replizieren können.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung betrifft die Verwendung
einer Expressionskassette enthaltend DNA-Sequenzen SEQ ID No. 1
und SEQ ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende DNA-Sequenzen
zur Transformation von Pflanzen, -zellen, -geweben oder Pflanzen
teilen. Vorzugsweise ist Ziel der Verwendung die Erhöhung des
Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll- und Carotinoid-Gehaltes der
Pflanze.
Dabei kann je nach Wahl des Promotors die Expression spezifisch
in den Blättern, in den Samen oder anderen Teilen der Pflanze
erfolgen. Solche transgenen Pflanzen, deren Vermehrungsgut, sowie
deren Pflanzenzellen, -gewebe oder -teile sind ein weiterer
Gegenstand der vorliegenden Erfindung.
Die Expressionskassette kann darüberhinaus auch zur Transforma
tion von Bakterien, Cyanobakterien, Hefen, filamentösen Pilzen
und Algen mit dem Ziel einer Erhöhung der Tocopherol-, Vitamin
K-, Chlorophyll- und/oder Carotinoid-Produktion eingesetzt wer
den.
Die Übertragung von Fremdgenen in das Genom einer Pflanze wird
als Transformation bezeichnet. Es werden dabei die beschriebenen
Methoden zur Transformation und Regeneration von Pflanzen aus
Pflanzengeweben oder Pflanzenzellen zur transienten oder stabilen
Transformation genutzt. Geeignete Methoden sind die Protoplasten
transformation durch Polyethylenglykol-induzierte DNA-Aufnahme,
das biolistische Verfahren mit der Genkanone - die sogenannte
particle bombardment Methode, die Elektroporation, die Inkubation
trockener Embryonen in DNA-haltiger Lösung, die Mikroinjektion
und der durch Agrobacterium vermittelte Gentransfer. Die genann
ten Verfahren sind beispielsweise in B. Jenes et al., Techniques
for Gene Transfer, in: Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering
and Utilization, herausgegeben von S. D. Kung und R. Wu, Academic
Press (1993), 128-143 sowie in Potrykus, Annu. Rev. Plant Phy
siol. Plant Molec. Biol. 42 (1991), 205-225) beschrieben.
Vorzugsweise wird das zu exprimierende Konstrukt in einen Vektor
kloniert, der geeignet ist, Agrobacterium tumefaciens zu trans
formieren, beispielsweise pBin19 (Bevan et al., Nucl. Acids Res.
12 (1984), 8711).
Mit einer Expressionskassette transformierte Agrobakterien können
ebenfalls in bekannter Weise zur Transformation von Pflanzen,
insbesondere von Kulturpflanzen, wie Getreide, Mais, Hafer, Soja,
Reis, Baumwolle, Zuckerrübe, Canola, Sonnenblume, Flachs, Hanf,
Kartoffel, Tabak, Tomate, Raps, Alfalfa, Salat und den verschie
denen Baum-, Nuß- und Weinspezies, verwendet werden, z. B. indem
verwundete Blätter oder Blattstücke in einer Agrobakterienlösung
gebadet und anschließend in geeigneten Medien kultiviert werden.
Funktionell äquivalente Sequenzen, die für ein DOXS-Gen bzw.
HPPD-Gen kodieren, sind solche Sequenzen, welche trotz abweichen
der Nukleotidsequenz noch die gewünschten Funktionen besitzen.
Funktionelle Äquivalente umfassen somit natürlich vorkommende
Varianten der hierin beschriebenen Sequenzen sowie künstliche,
z. B. durch chemische Synthese erhaltene, an den Kodon-Gebrauch
einer Pflanze angepaßte, künstliche Nukleotid-Sequenzen.
Unter einem funktionellen Äquivalent versteht man insbesondere
auch natürliche oder künstliche Mutationen einer ursprünglich
isolierten für eine DOXS bzw. HPPD kodierende Sequenz, welche
weiterhin die gewünschte Funktion zeigen. Mutationen umfassen
Substitutionen, Additionen, Deletionen, Vertauschungen oder In
sertionen eines oder mehrerer Nukleotidreste. Somit werden
beispielsweise auch solche Nukleotidsequenzen durch die vorlie
gende Erfindung mit umfaßt, welche man durch Modifikation der
DOXS- bzw. HPPD-Nukleotidsequenz erhält. Ziel einer solchen Modi
fikation kann z. B. die weitere Eingrenzung der darin enthaltenen
kodierenden Sequenz oder z. B. auch die Einfügung weiterer
Restriktionsenzym-Schnittstellen sein.
Funktionelle Äquivalente sind auch solche Varianten, deren Funk
tion, verglichen mit dem Ausgangsgen bzw. Genfragment, abge
schwächt oder verstärkt ist.
Außerdem sind artifizielle DNA-Sequenzen geeignet, solange sie,
wie oben beschrieben, die gewünschte Eigenschaft beispielsweise
der Erhöhung des Tocopherol-Gehaltes in der Pflanze durch Über
expression des DOXS- und des HPPD-Gens in Kulturpflanzen vermit
teln. Solche artifiziellen DNA-Sequenzen können beispielsweise
durch Rückübersetzung mittels Molecular Modelling konstruierter
Proteine, die DOXS- bzw. HPPD-Aktivität aufweisen oder durch in
vitro-Selektion ermittelt werden. Besonders geeignet sind kodie
rende DNA-Sequenzen, die durch Rückübersetzung einer Polypeptid
sequenz gemäß der für die Wirtspflanze spezifischen Kodon-Nutzung
erhalten wurden. Die spezifische Kodon-Nutzung kann ein mit
pflanzengenetischen Methoden vertrauter Fachmann durch Compute
rauswertungen anderer, bekannter Gene der zu transformierenden
Pflanze leicht ermitteln.
Als weitere geeignete äquivalente Nukleinsäure-Sequenzen sind zu
nennen Sequenzen, welche für Fusionsproteine kodieren, wobei
Bestandteil des Fusionsproteins ein DOXS- bzw. HPPD-Polypeptid
oder ein funktionell äquivalenter Teil davon ist. Der zweite Teil
des Fusionsproteins kann z. B. ein weiteres Polypeptid mit enzyma
tischer Aktivität sein oder eine antigene Polypeptidsequenz mit
deren Hilfe ein Nachweis auf DOXS- bzw. HPPD-Expression möglich
ist (z. B. myc-tag oder his-tag). Bevorzugt handelt es sich dabei
jedoch um eine regulative Proteinsequenz, wie z. B. ein Signal-
oder Transitpeptid, das das DOXS- bzw. HPPD-Protein an den
gewünschten Wirkort leitet.
Erhöhung des Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll- und/oder Caro
tinoid-Gehaltes bedeutet im Rahmen der vorliegenden Erfindung die
künstlich erworbene Fähigkeit einer erhöhten Biosyntheseleistung
dieser Verbindungen durch funktionelle Überexpression des DOXS-
und des HPPD-Gens in der Pflanze gegenüber der nicht gentechnisch
modifizierten Pflanze für die Dauer mindestens einer Pflanzenge
neration.
Der Biosyntheseort von Tocopherol ist im allgemeinen das Blattge
webe, so daß eine blattspezifische Expression des DOXS- und des
HPPD-Gens sinnvoll ist. Es ist jedoch naheliegend, daß die Toco
pherol-Biosynthese nicht auf das Blattgewebe beschränkt sein muß,
sondern auch in allen übrigen Teilen der Pflanze - beispielsweise
in fetthaltigen Samen - gewebespezifisch erfolgen kann.
Darüberhinaus ist eine konstitutive Expression des exogenen DOXS-
und des HPPD-Gens von Vorteil. Andererseits kann aber auch eine
induzierbare Expression wünschenswert erscheinen.
Die Wirksamkeit der Expression des transgen exprimierten DOXS-
und HPPD-Gens kann beispielsweise in vitro durch Sproßmeristem
vermehrung ermittelt werden. Zudem kann eine in Art und Höhe ver
änderte Expression des DOXS und des HPPD-Gens und deren Auswir
kung auf die Tocopherol-Biosyntheseleistung an Testpflanzen in
Gewächshausversuchen getestet werden.
Gegenstand der Erfindung sind außerdem transgene Pflanzen, trans
formiert mit einer Expressionskassette enthaltend die Sequenz
SEQ-ID No. 1 und SEQ-ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende
DNA-Sequenzen, sowie transgene Zellen, Gewebe, Teile und Vermeh
rungsgut solcher Pflanzen. Besonders bevorzugt sind dabei
transgene Kulturpflanzen, wie z. B. Gerste, Weizen, Roggen, Mais,
Hafer, Soja, Reis, Baumwolle, Zuckerrübe, Canola, Sonnenblume,
Flachs, Hanf, Kartoffel, Tabak, Tomate, Raps, Alfalfa, Salat und
die verschiedenen Baum-, Nuß- und Weinspezies.
Pflanzen im Sinne der Erfindung sind mono- und dikotyle Pflanzen
oder Algen.
Durch Überexpression der für eine DOXS kodierenden Gensequenz SEQ
ID NO: 1 in einer Pflanze kann prinzipiell eine erhöhte Resistenz
gegenüber Inhibitoren der DOXS erreicht werden. Die derart herge
stellten transgenen Pflanzen sind ebenfalls Gegenstand der Erfin
dung.
Durch Überexpression der für eine HPPD kodierenden Gensequenz SEQ
ID NO: 3 in einer Pflanze kann prinzipiell eine erhöhte Resistenz
gegenüber Inhibitoren der HPPD erreicht werden. Die derart herge
stellten transgenen Pflanzen sind ebenfalls Gegenstand der Erfin
dung.
Durch Überexpression der für eine DOXS kodierenden Gensequenz SEQ
ID NO: 1 und einer für die HPPD kodierenden Gensequenz SEQ ID NO:
3 in einer Pflanze kann prinzipiell eine erhöhte Resistenz gegen
über Inhibitoren der DOXS und der HPPD erreicht werden. Die
derart hergestellten transgenen Pflanzen sind ebenfalls Gegen
stand der Erfindung.
Weitere Gegenstände der Erfindung sind:
- - Verfahren zur Transformation einer Pflanze dadurch gekenn zeichnet, daß man Expressionskassetten enthaltend eine DNA- Sequenz SEQ-ID No. 1 und eine DNA-Sequenz SEQ-ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende DNA-Sequenzen in eine Pflanzen zelle, in Kallusgewebe, eine ganze Pflanze oder Protoplasten von Pflanzen einbringt.
- - Verwendung der Expressionskassette enthaltend eine DNA-Se quenz SEQ-ID No. 1 und eine DNA-Sequenz SEQ-ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende DNA-Sequenzen zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhter Resistenz gegenüber Inhibitoren der DOXS und HPPD durch verstärkte Expression der DNA-Sequenzen SEQ-ID No. 1 und SEQ-ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende DNA Sequenzen.
- - Verwendung der DNA-Sequenz SEQ-ID No. 1 und SEQ-ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende DNA-Sequenzen zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhtem Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll- und/oder Carotinoid-Gehalt durch Expression einer DOXS und einer HPPD DNA-Sequenz in Pflanzen.
Die Erfindung wird durch die nun folgenden Beispiele erläutert,
ist aber nicht auf diese beschränkt:
Die im Rahmen der vorliegenden Erfindung durchgeführten Klonie
rungsschritte wie z. B. Restriktionsspaltungen, Agarose-Gel
elektrophorese, Reinigung von DNA-Fragmenten, Transfer von
Nukleinsäuren auf Nitrozellulose und Nylonmembranen, Verknüpfen
von DNA-Fragmenten, Transformation von E. coli Zellen, Anzucht
von Bakterien, Vermehrung von Phagen und Sequenzanalyse rekombi
nanter DNA wurden wie bei Sambrook et al. (1989) Cold Spring
Harbor Laboratory Press; ISBN 0-87969-309-6 beschrieben durchge
führt.
Die im folgenden verwendeten Bakterienstämme (E. coli, XL-I Blue)
wurden von Stratagene bezogen. Der zur Pflanzentransformation
verwendete Agrobakterienstamm (Agrobacterium tumefaciens, C58C1
mit dem Plasmid pGV2260 oder pGV3850 kann) wurde von Deblaere et
al. in Nucl. Acids Res. 13 (1985), 4777 beschrieben. Alternativ
können auch der Agrobakterienstamm LBA4404 (Clontech) oder andere
geeignete Stämme eingesetzt werden. Zur Klonierung können die
Vektoren pUCl9 (Yanish-Perron, Gene 33 (1985), 103-119)
pBluescript SK- (Stratagene), pGEM-T (Promega), pZerO (Invitro
gen), pBin19 (Bevan et al., Nucl. Acids Res. 12 (1984),
8711-8720) und pBinAR (Höfgen und Willmitzer, Plant Science 66
(1990), 221-230) benutzt werden.
Die Sequenzierung rekombinanter DNA-Moleküle erfolgte mit einem
Laserfluoreszenz-DNA-Sequenzierer der Firma Licor (Vertrieb durch
MWG Biotech, Ebersbach) nach der Methode von Sanger (Sanger
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 74 (1977), 5463-5467).
Eine Kultur von Escherichia coli XL1 Blue wurde in 300 ml Luria
Broth-Medium für 12 Stunden bei 37°C angezogen. Aus dieser Kultur
wurde die genomische DNA des Bakteriums isoliert, indem diese zu
nächst bei 5000 Umdrehungen in einer Sorvall RC50-Fuge pelletiert
wurde. Anschliessend wurde das Pellet in 1/30 Volumen der Ur
sprungskultur Lysis-Puffer (25 mM EDTA, 0,5% SDS; 50 mM Tris HCl,
pH 8,0) resuspendiert. Ein gleiches Volumen Phenol/Chloroform/
Isoamylalkohol (25 : 24 : 1) wurde zugegeben und bei 70 Grad 10 Minu
ten inkubiert. Anschliessend wurde in einer Heraeus Untertisch-
Zentrifuge bei 3500 U 15 Minuten die wässrige Phase von der
phenolischen getrennt. Der wässrige Überstand wurde mit 2,5 Volu
men Ethanol und 1/10 Volumen 8 M Lithiumchlorid versetzt und die
Nukleinsäuren bei Raumtemperatur für 10 Minuten gefällt. Das
Pellet wurde anschliessend in 400 µl TE/RNAse aufgenommen und bei
37 Grad für 10 Minuten inkubiert. Die Lösung wurde erneut mit
einem Volumen Phenol/Chloroform/Isoamylalkohol (25 : 24 : 1) ausge
schüttelt und der Überstand gefällt mit 2,5 Volumen Ethanol und
1/10 Volumen 8 M Lithiumchlorid. Das Pellet wurde anschliessend
mit 80% Ethanol gewaschen und in 400 µl TE/RNAse aufgenommen.
Von der DNA-Sequenz der DOXS (Acc. Number AF035440) wurden für
eine PCR Oligonukleotide abgeleitet, denen am 5'-Ende eine BamHI
und am 3'-Ende eine XbaI bzw. eine weitere BamHI Restriktions
schnittstelle angefügt wurde. Das Oligonukleotid am 5' Ende um
faßt die Sequenz 5'-ATGGATCCATGAGTTTT-GATATTGCCAAATAC-3'
(Nukleotide 1-24 der DNA-Sequenz; unterstrichen dargestellt) beginnend
mit dem ATG-Startcodon des Gens, das Oligonukleotid am 3'-Ende
umfaßt die Sequenz 5'-ATTCTAGATTATGCCAGCCAGGCCTTG-3' bzw. 5'-ATG
GATCCTTATGCCAGCCAGGCCTTG-3' (Nukleotide 1845-1863 der revers kom
plementären DNA-Sequenz; unterstrichen dargestellt) beginnend mit dem
Stop-Kodon des Gens. Die PCR-Reaktion mit den beiden BamHI ent
haltenden Oligonukleotiden wurde durchgeführt mit der Pfu-
Polymerase (Stratagene GmbH, Heidelberg) nach Herstellerangaben.
Als Template wurden 500 ng der genomischen DNA aus E. coli einge
setzt. Das PCR-Programm lautete:
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 52°C, 2 min 72°C;
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 48°C, 2 min 72°C;
25 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 44°C, 2 min 72°C.
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 52°C, 2 min 72°C;
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 48°C, 2 min 72°C;
25 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 44°C, 2 min 72°C.
Das Fragment wurde mittels Gene-Clean-Kit (Dianova GmbH, Hilden)
gereinigt und nach Herstellerangaben in den Vektor PCR-Script
(Stratagene GmbH, Heidelberg) kloniert. Die Richtigkeit der Se
quenz wurde durch Sequenzierung festgestellt. Das Fragment wurde
BamHI aus dem PCR-Script-Vektor isoliert und in einen ent
sprechend geschnittenen Bin19-Vektor ligiert, der zusätzlich das
Transitpeptid der Transketolase aus Kartoffel hinter dem CaMV 35S
Promotor enthält. Das Transitpeptid gewährleistet die plastidäre
Lokalisierung. Die Konstrukte sind in Abb. 3 und 4 darge
stellt und die Fragmente haben die folgende Bedeutung:
Fragment A (529 bp) beinhaltet den 35S-Promotor des Cauliflower- Mosaik-Virus (Nukleotide 6909 bis 7437 des Cauliflower-Mosaik-Vi rus). Fragment B (259 bp) beinhaltet das Transitpeptid der Trans ketolase. Fragment E beinhaltet das Gen der DOXS. Fragment D (192 bp) enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen et al., 1984) zur Transkriptions-ter mination.
Fragment A (529 bp) beinhaltet den 35S-Promotor des Cauliflower- Mosaik-Virus (Nukleotide 6909 bis 7437 des Cauliflower-Mosaik-Vi rus). Fragment B (259 bp) beinhaltet das Transitpeptid der Trans ketolase. Fragment E beinhaltet das Gen der DOXS. Fragment D (192 bp) enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen et al., 1984) zur Transkriptions-ter mination.
Die PCR-Reaktion mit den 5'-BamHI und 3'-XbaI enthaltenden Oligo
nukleotiden wurde durchgeführt mit Tag-Polymerase (Takara, Sosei
Co., Ltd.) nach Herstellerangaben. Als Template wurden 500 ng der
genomischen DNA aus E. coli eingesetzt. Das PCR-Programm lautete:
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 4 sec 50°C, 2 min 30°C
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 46°C, 2 min 68°C
25 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 42°C, 2 min 68°C.
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 4 sec 50°C, 2 min 30°C
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 46°C, 2 min 68°C
25 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 42°C, 2 min 68°C.
Das Fragment wurde mit dem Gene-Clean-Kit gereinigt und in den
Vektor pGemT (Promega GmbH, Mannheim) ligiert. Es wurde als
BamHI/XbaI-Fragment in einen entsprechend geschnittenen pBin19AR-
Vektor hinter den CaMV 35S Promotor kloniert. Die Sequenz wurde
durch Sequenzierung überprüft (SEQ-ID No. 1). Dabei wurden zwei
nicht konservative Basenaustausche festgestellt, die im Vergleich
zur veröffentlichten Sequenz zur Veränderung der Aminosäure 152
(Asparagin) in Valin und Aminosäure 330 (Cystein) in Tryptophan
führen.
Isolierung genomischer DNA des Bakteriums Streptomyces avermiti
lis U11864:
Eine Kultur von Streptomyces avermitilis U11864 wurde in 300 ml YEME-Medium (5 g Malz-Extrakt, 2 g Hefe-Extrakt, 2 g Glukose) für 96 h bei 28°C angezogen. Aus dieser Kultur wurde die genomische DNA des Bakteriums isoliert, indem diese zunächst bei 5000 U in einer Sorvall RC5C-Fuge pelletiert wurde. Anschliessend wurde das Pellet in 1/30 Volumen Lysis-Puffer (25 mM EDTA, 0,5% SDS, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0) resuspendiert. Ein gleiches Volumen Phenol/ Chloroform/Isoamylalkohol (25 : 24 : 1) wurde zugegeben und bei 70°C 10 Minuten inkubiert. Anschliessend wurde in einer Heraeus Unter tisch-Zentrifuge bei 3500 U 15 Minuten die wässrige Phase von der phenolischen getrennt. Der wässrige Überstand wurde mit 2,5 Volu men Ethanol und 1/10 Volumen 8 M Lithiumchlorid versetzt und die Nukleinsäuren bei Raumtemperatur für 10 Minuten gefällt. Das Pel let wurde anschliessend in 400 µl TE/RNAse aufgenommen und bei 37 Grad für 10 Minuten inkubiert. Die Lösung wurde erneut mit einem Volumen Phenol/Chloroform/Isoamylalkohol (25 : 24 : 1) ausgeschüttelt und der Überstand gefällt mit 2,5 Volumen Ethanol und 1/10 Volu men 8 M Lithiumchlorid. Das Pellet wurde anschließend mit 80% Ethanol gewaschen und in 400 µl TE/RNAse aufgenommen.
Eine Kultur von Streptomyces avermitilis U11864 wurde in 300 ml YEME-Medium (5 g Malz-Extrakt, 2 g Hefe-Extrakt, 2 g Glukose) für 96 h bei 28°C angezogen. Aus dieser Kultur wurde die genomische DNA des Bakteriums isoliert, indem diese zunächst bei 5000 U in einer Sorvall RC5C-Fuge pelletiert wurde. Anschliessend wurde das Pellet in 1/30 Volumen Lysis-Puffer (25 mM EDTA, 0,5% SDS, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0) resuspendiert. Ein gleiches Volumen Phenol/ Chloroform/Isoamylalkohol (25 : 24 : 1) wurde zugegeben und bei 70°C 10 Minuten inkubiert. Anschliessend wurde in einer Heraeus Unter tisch-Zentrifuge bei 3500 U 15 Minuten die wässrige Phase von der phenolischen getrennt. Der wässrige Überstand wurde mit 2,5 Volu men Ethanol und 1/10 Volumen 8 M Lithiumchlorid versetzt und die Nukleinsäuren bei Raumtemperatur für 10 Minuten gefällt. Das Pel let wurde anschliessend in 400 µl TE/RNAse aufgenommen und bei 37 Grad für 10 Minuten inkubiert. Die Lösung wurde erneut mit einem Volumen Phenol/Chloroform/Isoamylalkohol (25 : 24 : 1) ausgeschüttelt und der Überstand gefällt mit 2,5 Volumen Ethanol und 1/10 Volu men 8 M Lithiumchlorid. Das Pellet wurde anschließend mit 80% Ethanol gewaschen und in 400 µl TE/RNAse aufgenommen.
Von der DNA-Sequenz der HPPD aus Streptomyces avermitilis (Denoya
et al. 1994; Acc. Number U11864) wurden für eine PCR Oligo
nukleotide abgeleitet, denen am 5'-Ende eine BamHI und am 3'-Ende
eine XbaI Restriktionsschnittstelle angefügt worden war. Das
Oligonukleotid am 5'-Ende umfasst die Seguenz 5'-GGATCCAGCGGA
CAAGCCAAC-3' (37 bis 55 Basen vom ATG in 5'-Richtung entfernt;
unterstrichen dargestellt), das Oligonukleotid am 3'-Ende umfaßt die
Sequenz 5'-TCTAGATTATGCCAGCCAGGCCTTG-3' (Nukleotide 1845-1863 der
revers komplementären DNA-Sequenz; unterstrichen dargestellt).
Die PCR-Reaktion wurde durchgeführt mit Pfu-Polymerase (Strata
gene GmbH, Heidelberg) nach Herstellerangaben. Als Vorlage wurden
400 ng der genomischen DNA eingesetzt. Das PCR-Programm lautete:
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 54°C, 2 min 72°C
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 52°C, 2 min 72°C
25 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 50°C, 2 min 72°C.
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 54°C, 2 min 72°C
5 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 52°C, 2 min 72°C
25 Zyklen: 4 sec 94°C, 30 sec 50°C, 2 min 72°C.
Das Fragment wurde mittels Gene-Clean-Kit (Dianova GmbH, Hilden)
gereinigt und nach Herstellerangeben in den Vektor PCR-Script
(Stratagene GmbH, Heidelberg) kloniert. Die Richtigkeit der Se
quenz wurde durch Sequenzierung überprüft. Dabei wurde festge
stellt, daß das isolierte Gen für eine zusätzliche Aminosäure
kodiert. Es enthält die drei Basen TAC (kodierend für Tyrosin),
vor dem Nukleotid N429 der zitierten Sequenz (Denoya et al.,
1994).
Das Fragment wurde mit einem BamHI und Xbal Verdau aus dem Vektor
isoliert und in einen entsprechend geschnittenen Bin19AR-Vektor
hinter den CaMV 35S Promotor ligiert, zur Expression des Gens im
Zytosol. Aus dem gleichen PCR-Script-Vektor wurde das Gen als
BamHI-Fragment isoliert und in einen entsprechend geschnittenen
pBin19-Vektor ligiert, der hinter dem CaMV 35S Promotor noch
zusätzlich das Transitpeptid der plastidären Transketolase aus
Kartoffel enthält. Das Transitpeptid gewährleistet die plastidäre
Lokalisierung. Die Konstrukte sind in Abb. 5 und 6 darge
stellt und die Fragmente haben folgende Bedeutung:
Fragment A (529 bp) beinhaltet den 35S-Promotor des Cauliflower- Mosaik-Virus (Nukleotide 6909 bis 7437 des Cauliflower-Mosaik-Vi rus). Fragment B (259 bp) beinhaltet das Transitpeptid der Trans ketolase. Fragment C beinhaltet das Gen der HPPD, Fragment D (192 bp) enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen, J. et al., EMBO J. 3 (1984), 835-846) zur Transkriptionstermination.
Fragment A (529 bp) beinhaltet den 35S-Promotor des Cauliflower- Mosaik-Virus (Nukleotide 6909 bis 7437 des Cauliflower-Mosaik-Vi rus). Fragment B (259 bp) beinhaltet das Transitpeptid der Trans ketolase. Fragment C beinhaltet das Gen der HPPD, Fragment D (192 bp) enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen, J. et al., EMBO J. 3 (1984), 835-846) zur Transkriptionstermination.
Zur Herstellung von Pflanzen, welche transgen für die DOXS und
die HPPD sind, wurde ein binärer Vektor angefertigt, der beide
Gensequenzen enthält (Abb. 7). Die Gensequenzen der DOXS und
der HPPD wurden jeweils als BamHI-Fragmente wie in Beispiel 2 und
3 beschrieben kloniert. Der Vektor pBinAR-Hyg enthält den 35S-
Promotor des Blumenkohlmosaikvirus und das Polyadenylierungssi
gnal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACHS (Gielen et al.,
1984) zur Transkriptionstermination. Der pBinAR-Hyg Vektor ver
mittelt in Pflanzen Resistenz gegen das Antibiotikum Hygromycin
und ist so geeignet, Pflanzen mit Kanamycinresistenz zu superin
fizieren.
Zur Klonierung der HPPD in Vektoren, welche zusätzlich noch eine
andere cDNA enthalten, wurden für eine PCR Oligonukleotide abge
leitet, denen am 5'-Ende und am 3'-Ende eine BamHI Restriktions
schnittstelle angefügt worden war. Das Oligonukleotid am 5'-Ende
umfaßt die Sequenz 5'-GGATCCTCCAGCGGACAAGCCAAC-3' (Nukleotide 37
bis 55 vom ATG in 5'-Richtung entfernt; unterstrichen dargestellt), das
Oligonukleotid am 3'-Ende umfaßt die Sequenz 5'-ATGGATC
CCGCGCCGCCTACAGGTTG-3' (endend mit Basenpaar 1140 der kodierenden
Sequenz, beginnend 8 Basenpaare 3' des TAG Stop-Codons; Kursiv
geschrieben). Die PCR-Reaktion wurde durchgeführt mit Tli-
Polymerase (Promega GmbH, Mannheim) nach Herstellerangaben. Als
Template wurden 10 ng des Plasmids pBinAR-HPPD eingesetzt. Das
PCR-Programm lautete:
5 Zyklen: 94°C 4 sec, 68°C 30 Sec, 72°C 2 min
5 Zyklen: 94°C 4 sec, 64°C 30 sec, 72°C 2 min
25 Zyklen: 94°C 4 sec, 60°C 30 sec, 72°C 2 min.
5 Zyklen: 94°C 4 sec, 68°C 30 Sec, 72°C 2 min
5 Zyklen: 94°C 4 sec, 64°C 30 sec, 72°C 2 min
25 Zyklen: 94°C 4 sec, 60°C 30 sec, 72°C 2 min.
Das Fragment wurde mittels Gene-Clean-Kit (Dianova GmbH, Hilden)
gereinigt und nach Herstellerangaben in den Vektor PCR-Script
(Stratagene GmbH, Heidelberg) kloniert. Die Richtigkeit der
Sequenz wurde durch Sequenzierung überprüft. Aus dem Vektor PCR-
Script wurde es als BamHI-Fragment ausgeschnitten und in einen
entsprechend geschnittenen pBinAR-Vektor ligiert, der zusätzlich
das Transitpeptid der Transketolase enthält, zur Einführung des
Genprodukts in den Plastiden. Es entstand das Plasmid pBinAR2-TP-
HPPD (Abb. 6).
Zur Klonierung wurde aus dem Plasmid pBinAR2-TP-HPPD der 35S-Pro
motor, das Transketolase-Transitpeptid, das HPPD-Gen und das Po
lyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids
pTIACH5 (Gielen et al., 1984) zur Transkriptionstermination
mittels PCR isoliert. Den Oligonukleotiden für den Promotor und
den Terminator wurde jeweils eine HindIII-Schnittstelle angefügt.
Die Sequenz des Oligonukleotids, welches sich an den 5'-Bereich
des Promotors (unterstrichen dargestellt) anlagert, lautet 5'-ATAAGCTT
CATGGAGTCAAA-GATTCAAATAGA-3', die des Oligonukleotids, welches
sich an die Terminationssequenz (unterstrichen dargestellt) anlagert
lautet 5'-ATAAGCTTGGACAATCAGTAAATTGAACGGAG-3'. Das erhaltene
Fragment wurde mittels Gene-Clean-Kit (Dianova GmbH, Hilden)
gereinigt und nach Herstellerangaben in den Vektor PCR-Script
(Stratagene GmbH, Heidelberg) kloniert. Die Richtigkeit der
Sequenz wurde durch Sequenzierung überprüft (SEQ-ID No. 3). Aus
diesem PCR-Script-Vektor wurde es als Hindlil-Fragment in den
entsprechend geschnittenen Vektor pBin19 (Bevan, 1984, Nucleic
Acids Res. 12, 8711-8721) übertragen.
Aus dem Plasmid pBinAR-TP-DOXS wurde der 35S-Promotor, das Trans
ketolase-Transitpeptid, das DOXS-Gen und das Polyadenylierungssi
gnal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen et al.,
1984) zur Transkriptionstermination mittels PCR isoliert. Den
Oligonukleotiden für den Promotor und die Terminatorsequenz wurde
jeweils eine EcoRI-Schnittstelle angefügt. Die Sequenz des Oligo
nukleotids, welches sich an den Promotor (unterstrichen dargestellt) an
lagert lautet 5'-ATGAATTCCATGGAGTCAAAGATTCAAATAGA-3', die des
Oligonukleotids, welches sich an die Terminatorsequenz (kursiv
geschrieben) anlagert lautet 5'-ATGAATTCGGACAATCAGTAAATTGAA-CGGA
G-3'. Das Fragment wurde mittels Gene-Clean-Kit (Dianova GmbH,
Hilden) gereinigt und nach Herstellerangaben in den Vektor PCR-
Script (Stratagene GmbH, Heidelberg) kloniert. Die Richtigkeit
der Sequenz wurde durch Sequenzierung überprüft (SEQ-ID No. 1).
Aus dem PCR-Script Vektor wurde es als EcoRI-Fragment in den ent
sprechend geschnittenen Vektor pBin19 (Bevan, 1984) übertragen.
Aus dem PCR-Script Vektor wurde es als XbaI-Fragment in den
entsprechend geschnittenen Vektor übertragen, der wie oben
beschrieben bereits die Sequenz der HPPD enthielt. Es entstand
das Konstrukt pBinAR-HPPD-DOXS (Abb. 7), dessen Fragmente
folgende Bedeutung haben:
Fragment A (529 bp) beinhaltet den 35S-Promotor des Cauliflower- Mosaik-Virus (Nukleotide 6909 bis 7437). Fragment B enthält das Transitpeptid der plastidären Transketolase. Fragment C enthält das Gen der HPPD. Fragment D enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen et al., 1984) zur Transkriptionstermination. Fragment E enthält das Gen der DOXS.
Fragment A (529 bp) beinhaltet den 35S-Promotor des Cauliflower- Mosaik-Virus (Nukleotide 6909 bis 7437). Fragment B enthält das Transitpeptid der plastidären Transketolase. Fragment C enthält das Gen der HPPD. Fragment D enthält das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-Plasmids pTIACH5 (Gielen et al., 1984) zur Transkriptionstermination. Fragment E enthält das Gen der DOXS.
Für die Herstellung transgener Tabakpflanzen, die einen veränder
ten Prenyllipidgehalt aufweisen, wurden Tabakblattscheiben mit
Sequenzen der DOXS und der HPPD transformiert. Zur Transformation
von Tabakpflanzen wurden 10 ml einer unter Selektion gewachsenen
Übernachtkultur von Agrobacterium tumefaciens abzentrifugiert,
der Überstand verworfen und die Bakterien in gleichem Volumen
Antibiotika-freien Mediums resuspendiert. In einer sterilen
Petrischale wurden Blattscheiben steriler Pflanzen (Durchmesser
ca. 1 cm) in dieser Bakteriensuspension gebadet. Anschließend
wurden die Blattscheiben in Petrischalen auf MS-Medium (Murashige
und Skoog, Physiol. Plant (1962) 15, 473) mit 2% Saccharose und
0.8% Bacto-Agar ausgelegt. Nach 2-tägiger Inkubation im Dunkeln
bei 25°C wurden sie auf MS-Medium mit 100 mg/l Kanamycin, 500 mg/l
Claforan, 1 mg/l Benzylaminopurin (BAP), 0.2 mg/l Naphtylessigsäure
(NAA), 1.6% Glukose und 0.8% Bacto-Agar übertragen und die Kulti
vierung (16 Stunden Licht / 8 Stunden Dunkelheit) fortgesetzt.
Wachsende Sprosse wurden auf hormonfreies MS-Medium mit 2%
Saccharose, 250 mg/l Claforan und 0.8% Bacto-Agar überführt.
Die Herstellung der transgenen Rapspflanzen, die einen veränder
ten Prenyllipidgehalt aufweisen, orientierte sich an einem Proto
koll von Bade, J. B. und Damm, B. (in Gene Transfer to Plants,
Potrykus, I. und Spangenberg, G., eds, Springer Lab Manual,
Springer Verlag, 1995, 30-38), in welchem auch die Zusammenset
zungen der verwendeten Medien und Puffer angegeben sind.
Die Transformationen erfolgten mit dem Agrobacterium tumefaciens
Stamm LBA4404 (Clontech GmbH, Heidelberg). Als binäre Vektoren
wurden die bereits oben beschriebenen binären Konstrukte mit den
gesamten cDNAs der DOXS und der HPPD verwendet. In allen hier
verwendeten binären Vektoren wurde die NOS-Terminatorsequenz
durch das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Ti-
Plasmids pTIACH5 (Gielen et al., 1984) zur Transkriptionstermi
nation ersetzt. Brassica napus Samen wurden mit 70% (v/v) Ethanol
oberflächensteril gemacht, 10 min bei 55°C in H2O gewaschen, in
1%iger Hypochlorit-Lösung (25% v/v Teepol, 0,1% v/v Tween 20) für
20 min inkubiert und sechsmal mit sterilem H2O für jeweils 20 min
gewaschen. Die Samen wurden drei Tage auf Filterpapier getrocknet
und 10-15 Samen in einem Glasskolben mit 15 ml Keimungsmedium zur
Keimung gebracht. Von mehreren Keimlingen (ca. 10 cm groß) wurden
die Wurzeln und Apices entfernt und die verbleibenden Hypokotyle
in ca. 6 mm lange Stücke geschnitten. Die so gewonnenen ca. 600
Explante werden 30 min mit 50 ml Basalmedium gewaschen und in
einen 300 ml Kolben überführt. Nach Zugabe von 100 ml Kallus-In
duktionsmedium wurden die Kulturen für 24 h bei 100 U/min
inkubiert.
Vom Agrobacterium-Stamm wurde eine Übernachtkultur bei 29°C in
Luria Broth-Medium mit Kanamycin (20 mg/l) angesetzt, davon 2 ml
in 50 ml Luria Broth-Medium ohne Kanamycin für 4 h bei 29°C bis zu
einer OD600 von 0,4-0,5 inkubiert. Nach der Pelletierung der
Kultur bei 2000 U/min für 25 min wurde das Zellpellet in 25 ml
Basalmedium resuspendiert. Die Konzentration der Bakterien in der
Lösung wurde durch Zugabe von weiterem Basalmedium auf eine OD600
von 0.3 eingestellt.
Aus den Raps-Explanten wurde das Kallus-Induktionsmedium mit ste
rilen Pipetten entfernt, 50 ml Agrobacterium-Lösung hinzugefügt,
vorsichtig gemischt und für 20 min inkubiert. Die Agrobacterien-
Suspension wurde entfernt, die Raps-Explante für 1 min mit 50 ml
Kallus-Induktionsmedium gewaschen und anschließend 100 ml Kallus-
Induktionsmedium hinzugefügt. Die Co-Kultivierung wurde für 24 h
auf einem Rotationsschüttler bei 100 U/min durchgeführt. Die Co-
Kultivierung wurde durch Wegnahme des Kallus-Induktionsmediums
gestoppt und die Explante zweimal für jeweils 1 min mit 25 ml und
zweimal für 60 min mit jeweils 100 ml Waschmedium bei 100 U/min
gewaschen. Das Waschmedium mit den Explanten wurde in 15 cm
Petrischalen überführt und das Medium mit sterilen Pipetten ent
fernt.
Zur Regeneration wurden jeweils 20-30 Explante in 90 mm Petri
schalen überführt, welche 25 ml Sproß-Induktionsmedium mit Kana
mycin enthielten. Die Petrischalen wurden mit 2 Lagen Leukopor
verschlossen und bei 25°C und 2000 lux bei Photoperioden von 16
Stunden Licht/8 Stunden Dunkelheit inkubiert. Alle 12 Tage wurden
die sich entwickelnden Kalli auf frische Petrischalen mit Sproß-
Induktionsmedium überführt. Alle weiteren Schritte zur Regenera
tion ganzer Pflanzen wurde wie von Bade, J. B, und Damm, B. (in
Gene Transfer to Plants, Potrykus, I. und Spangenberg, G., eds,
Springer Lab Manual, Springer Verlag, 1995, 30-38) beschrieben
durchgeführt.
Die cDNA der DOXS und der HPPD wurde mit einem CaMV35S-Promotor
versehen und in Raps unter Verwendung des 35S-Promotors überex
primiert. Parallel dazu wurde der samenspezifische Promotor des
Phaseolingenes verwendet, um den Tocopherolgehalt spezifisch im
Rapssamen zu erhöhen. Mit den entsprechenden Konstrukten trans
formierte Rapspflanzen wurden im Gewächshaus angezogen. Anschlie
ßend wurde der α-Tocopherolgehalt der Gesamtpflanze bzw. der
Samen der Pflanze bestimmt. In allen Fällen war die α-Tocopherol
konzentration im Vergleich zur nicht transfomierten Pflanze
erhöht.
Claims (7)
1. Verwendung von DNA-Sequenzen codierend für eine 1-Deoxy-D-Xy
lulose-5-Phosphat Synthase (DOXS) und codierend für eine
p-Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase (HPPD) zur Herstellung von
Pflanzen mit erhöhtem Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll-
und/oder Carotinoid-Gehalt.
2. Verwendung einer DNA-Sequenz SEQ ID No. 1 und einer DNA-Se
quenz SEQ ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende DNA-Se
quenzen kodierend für eine 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphat
Synthase (DOXS) und eine p-Hydroxyphenylpyruvat Dioxygenase
zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhtem Gehalt an Tocophe
rolen, Vitamin K, Chlorophyllen und/oder Carotinoiden.
3. Verfahren zur Herstellung von Pflanzen mit erhöhtem Toco
pherol-, Vitamin K-, Chlorophyll- und/oder Carotinoid-Gehalt,
dadurch gekennzeichnet, daß eine DNA-Sequenz SEQ-ID No. 1 und
eine DNA-Sequenz SEQ-ID No. 3 oder mit diesen hybridisierende
DNA-Sequenzen in Pflanzen exprimiert werden.
4. Verfahren zur Transformation einer Pflanze dadurch gekenn
zeichnet, daß man eine Expressionskassette enthaltend einen
Promotor und DNA-Sequenzen SEQ-ID No. 1 und 3 in eine
Pflanzenzelle, in Kallusgewebe, eine ganze Pflanze oder
Protoplasten von Pflanzenzellen einbringt.
5. Verfahren zur Transformation von Pflanzen gemäß Anspruch 4,
dadurch gekennzeichnet, daß die Transformation mit Hilfe des
Stammes Agrobacterium tumefaciens, der Elektroporation oder
der particle bombardment Methode erfolgt.
6. Pflanze mit erhöhtem Tocopherol-, Vitamin K-, Chlorophyll-
und/oder Carotinoid-Gehalt enthaltend eine Expressionskas
sette gemäß Anspruch 4.
7. Pflanze nach Anspruch 6, ausgewählt aus der Gruppe Soja,
Canola, Gerste, Hafer, Weizen, Raps, Mais oder Sonnenblume.
Priority Applications (6)
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