CN116063517A - Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途 - Google Patents

Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途 Download PDF

Info

Publication number
CN116063517A
CN116063517A CN202211312304.2A CN202211312304A CN116063517A CN 116063517 A CN116063517 A CN 116063517A CN 202211312304 A CN202211312304 A CN 202211312304A CN 116063517 A CN116063517 A CN 116063517A
Authority
CN
China
Prior art keywords
antibody
seq
amino acid
chain variable
heavy chain
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202211312304.2A
Other languages
English (en)
Inventor
杰弗里·D·沃特金斯
辛迪·T·迪克森
拉法尔·罗贾斯
马修·里斯曼
帕特丽夏·麦克内利
J·比尔斯伯勒
布拉德利·亨克尔
S·R·塔尔干
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Cedars Sinai Medical Center
Prometheus Biosciences Inc
Original Assignee
Cedars Sinai Medical Center
Prometheus Biosciences Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Cedars Sinai Medical Center, Prometheus Biosciences Inc filed Critical Cedars Sinai Medical Center
Priority claimed from PCT/US2020/057119 external-priority patent/WO2021081365A1/en
Publication of CN116063517A publication Critical patent/CN116063517A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2875Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the NGF/TNF superfamily, e.g. CD70, CD95L, CD153, CD154
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • C07K16/241Tumor Necrosis Factors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/21Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from primates, e.g. man
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/24Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin containing regions, domains or residues from different species, e.g. chimeric, humanized or veneered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/33Crossreactivity, e.g. for species or epitope, or lack of said crossreactivity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/40Immunoglobulins specific features characterized by post-translational modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/51Complete heavy chain or Fd fragment, i.e. VH + CH1
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/515Complete light chain, i.e. VL + CL
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/52Constant or Fc region; Isotype
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/52Constant or Fc region; Isotype
    • C07K2317/524CH2 domain
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/52Constant or Fc region; Isotype
    • C07K2317/526CH3 domain
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/52Constant or Fc region; Isotype
    • C07K2317/53Hinge
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/565Complementarity determining region [CDR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/50Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
    • C07K2317/56Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
    • C07K2317/567Framework region [FR]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/71Decreased effector function due to an Fc-modification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • C07K2317/732Antibody-dependent cellular cytotoxicity [ADCC]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/73Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
    • C07K2317/734Complement-dependent cytotoxicity [CDC]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/92Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/90Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
    • C07K2317/94Stability, e.g. half-life, pH, temperature or enzyme-resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00Nucleic acids vectors
    • C12N2800/10Plasmid DNA
    • C12N2800/106Plasmid DNA for vertebrates
    • C12N2800/107Plasmid DNA for vertebrates for mammalian

Abstract

本文描述了用于治疗炎性肠病(IBD)如克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)的人源化抗TL1A抗体和药物组合物。

Description

TNF样配体1A(TL1A)的人源化抗体及其用途
本申请是申请日为2020年10月23日、申请号为202080090377.4、发明名称为“TNF样配体1A(TL1A)的人源化抗体及其用途”的中国专利申请(其对应PCT申请的申请日为2020年10月23日、申请号为PCT/US2020/057119)的分案申请。
交叉引用
本申请要求于2019年10月24日提交的美国临时申请号62/925,736的权益,该申请的全部内容通过引用并入本文。
序列表
本申请包含序列表,该序列表已经以ASCII格式电子方式提交,并且其全部内容通过引用并入本文。所述ASCII副本创建于2020年10月23日,名为56884-767_601_SL.txt,大小为376,991字节。
背景技术
炎性肠病(IBD)是指引起胃肠道炎性病况的肠道病症的总称。IBD的主要类型是溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD)。这些疾病非常普遍,全球约有186万人被诊断为UC,全球约有130万人被诊断为CD。严重类型的IBD可能以肠纤维化为特征,肠纤维化为肠壁瘢痕组织的积聚。IBD患者可用的疗法数量有限,新型治疗的开发受到临床试验中次优结果的阻碍。此外,相当一部分患者对现有的抗炎疗法缺乏反应或失去反应。当患者接受这种无效的抗炎治疗时,疾病恶化。目前,对一线治疗无反应的患者唯一的疗法是手术,即狭窄整形术(肠的整形)或切除术(肠的切除)。IBD的手术治疗是侵入性的,估计有三分之一的患者在接受手术后会出现术后风险,如吻合口瘘、感染和出血。
IBD的发病机制被认为涉及一种不受控制的免疫应答,这种免疫应答可能在遗传易感宿主体内由某些环境因素触发。疾病发病机制和临床病程的异质性,结合对治疗及其相关副作用的不同反应,表明治疗这些疾病的靶向治疗方法是一种理想的治疗策略。然而,对于IBD患者而言,靶向疗法非常少,尤其是那些可能对现有IBD疗法无反应的患者。因此,需要特异性靶向IBD发病机制的新型治疗来治疗IBD。
发明内容
本公开内容提供了用于治疗IBD的肿瘤坏死因子配体1A(TL1A)结合抗体,包括以肠纤维化为特征的严重类型的IBD。在各个方面,本文所述的抗体具有对治疗应用有用的特征,例如低免疫原性,和/或促进抗体制造的特征,例如通过尺寸排阻色谱法测量的高百分比单体级分(fraction),和/或高表达。
在一个方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变骨架区,以及含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变骨架区;其中,重链可变骨架区和轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含:(a)重链可变区中氨基酸位置47处的修饰;(b)重链可变区中氨基酸位置45处的修饰;(c)重链可变区中氨基酸位置55处的修饰;(d)重链可变区中氨基酸位置78处的修饰;(e)重链可变区中氨基酸位置80处的修饰;(f)重链可变区中氨基酸位置82处的修饰;(g)重链可变区中氨基酸位置89处的修饰;或(h)重链可变区中氨基酸位置91处的修饰;按照Kabat编号;或选自(a)至(h)的两个或更多个修饰的组合。在一些实施方案中,(a)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置47处,且位置47处的氨基酸为R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;(b)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置45处,且位置45处的氨基酸为A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;(c)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置55处,且位置55处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V;(d)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置78处,且位置78处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y;(e)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置80处,且位置80处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V;(f)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置82处,且位置82处的氨基酸为A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;(g)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置89处,且位置89处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y;或(h)氨基酸修饰位于重链可变区中的位置91处,且位置91处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V;或选自(a)至(h)的两个或更多个修饰的组合。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含以下一个或多个:重链可变区中的A47R、R45K、M55I、V78A、M80I、R82T、V89A、M91L,按照Kabat编号。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含:(a)轻链可变区中氨基酸位置54处的修饰;和/或(b)轻链可变区中氨基酸位置55处的修饰;按照Kabat编号。在一些实施方案中,(a)氨基酸修饰在轻链可变区的位置54处,且位置54处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;和/或(b)氨基酸修饰在轻链可变区的位置55处,且位置55处的氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含轻链可变区中的L54P和/或L55W,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:1所示的重链CDR1,如SEQ ID NO:2-5中任一个所示的重链CDR2,如SEQ ID NO:6-9中任一个所示的重链CDR3,如SEQ ID NO:10所示的轻链CDR1,如SEQ ID NO:11所示的轻链CDR2,和如SEQ ID NO:12-15中任一个所示的轻链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:1所示的重链CDR1,如SEQ ID NO:2所示的重链CDR2,如SEQ ID NO:6所示的重链CDR3,如SEQ ID NO:10所示的轻链CDR1,如SEQ IDNO:11所示的轻链CDR2,和如SEQ ID NO:12所示的轻链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含含如SEQ ID NO:304所示的重链骨架(FR)1,如SEQ ID NO:305或SEQ IDNO:313所示的重链FR2,如SEQ ID NO:306、307、314或315中任一个所示的重链FR3,如SEQID NO:308所示的重链FR4,如SEQ ID NO:309所示的轻链FR1,如SEQ ID NO:310所示的轻链FR2,如SEQ ID NO:311所示的轻链FR3,或如SEQ ID NO:312所示的轻链FR4,或其组合。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)选自(a)-(uu)的两个或更多个的任何组合,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含人IgG4 Fc区。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含Fc区,该Fc区包含与SEQ ID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段表达至少约20ug/ml总抗体,任选约20ug/ml和70ug/mL总抗体。
在另一方面中,本文提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含与SEQ ID NO:104具有至少96%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域,和含与SEQ ID NO:201具有至少97%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少97%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含SEQ ID NO:104。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含SEQ ID NO:201。
在另一方面中,本文提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含与SEQ ID NO:101-135中的任一个具有至少约99%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域,和含与SEQ ID NO:201-206中的任一个具有至少约99%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含人IgG1 Fc区,该人IgG1Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)选自(a)–(uu)中的两个或更多个的任何组合,按照Kabat编号。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含人IgG4 Fc区。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含Fc区,该Fc区包含与SEQ ID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段表达至少约20ug/ml总抗体,任选约20ug/ml和70ug/mL总抗体。
在另一方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含重链可变区,该重链可变区包含:(a)包含由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的HCDR1;(b)包含由SEQ ID NO:2-5中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR2;和(c)包含由SEQ ID NO:6-9中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR3;以及轻链可变区,该轻链可变区包含:(d)包含由SEQ IDNO:10所示的氨基酸序列的LCDR1;(e)包含由SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列的LCDR2;(f)包含由SEQ ID NO:12-15中的任一个所示的氨基酸序列的LCDR3;以及可结晶片段(Fc)区,该可结晶片段(Fc)区包含与人IgG1相比降低的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)功能和/或与人IgG1相比降低的补体依赖性细胞毒性(CDC)。在一些实施方案中,人IgG1包含SEQ ID NO:320。在一些实施方案中,包含降低的ADCC的Fc区的ADCC功能与人IgG1相比降低至少约50%。在一些实施方案中,包含降低的CDC的Fc区的CDC功能与人IgG1相比降低至少约50%。在一些实施方案中,Fc区包含人IgG1,该人IgG1包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含(i)人IgG4Fc区或(ii)包含(a)S228P、(b)S228P和L235E或(c)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。在一些实施方案中,Fc区包含人IgG1,该人IgG1具有选自329A、329G、329Y、331S、236F、236R、238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、238Y、248A、254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、254V、264S、265H、265K、265S、265Y、265A、267G、267H、267I、267K、434I、438G、439E、439H、439Q、440A、440D、440E、440F、440M、440T和440V的置换,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含与SEQ ID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,HCDR1包含SEQ ID NO:1,HCDR2包含SEQ ID NO:2-5中的任一个,HCDR3包含SEQ ID NO:6-9中的任一个,LCDR1包含SEQ ID NO:10,LCDR2包含SEQ ID NO:11,且LCDR3包含SEQ ID NO:12-15中的任一个。在一些实施方案中,Fc区包含SEQ ID NO:401-413中的任一个或与SEQ ID NO:401-413中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,重链包含SEQ ID NO:501-513中的任一个或与SEQ ID NO:501-513中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链包含SEQ ID NO:514中的任一个或与SEQ ID NO:514中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:2,HCDR3包含SEQ ID NO:6,且LCDR3包含SEQ ID NO:12,并且其中Fc区包含SEQ ID NO:401-413中的任一个或与SEQ ID NO:401-413中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段表达至少约20ug/ml总抗体,任选约20ug/ml和70ug/mL总抗体。
进一步提供了治疗有此需要的对象的纤维化或肠道炎性病况、疾病或病症的方法,方法包括向对象施用本文公开的任何抗体或抗原结合片段的抗体或抗原结合片段。在一些实施方案中,对象患有纤维化。在一些实施方案中,对象患有肠道炎性病况、疾病或病症。在一些实施方案中,肠道炎性病况、疾病或病症包括炎性肠病(IBD)。在一些实施方案中,IBD包括克罗恩病。在一些实施方案中,IBD包括溃疡性结肠炎。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段以包含浓度为10mg/ml至170mg/ml的抗体或抗原结合片段的液体组合物形式存在。在一些实施方案中,抗体或其抗原结合片段的浓度为10mg/ml至170mg/ml。在一些实施方案中,粘度为约4至约30mPa-s(毫帕秒(mPa·s))。在一些实施方案中,粘度为约4至约10mPa-s(毫帕秒(mPa·s))。
在另一方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变骨架区,以及含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变骨架区;其中重链可变骨架区和轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于约14个氨基酸修饰。在一些实施方案中,重链可变骨架区和轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1或无氨基酸修饰。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置1处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置1处的氨基酸包括A、R、N、D、C、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置1处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置1处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置1处的氨基酸包括E。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置45处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置45处的氨基酸包括A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置45处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置45处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置45处的氨基酸包括K。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置47处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置47处的氨基酸包括R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置47处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置47处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置47处的氨基酸包括R。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置55处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括I。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置78处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置78处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y。在一些实施方案中,位置78处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置78处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置78处的氨基酸包括A。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置80处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置80处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置80处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置80处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置80处的氨基酸包括I。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置82处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置82处的氨基酸包括A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置82处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置82处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置82处的氨基酸包括T。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置89处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置89处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y。在一些实施方案中,位置89处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置89处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置89处的氨基酸包括A。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含重链可变区中氨基酸位置91处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置91处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置91处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置91处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置91处的氨基酸包括L。
在一些实施方案中,氨基酸修饰包含以下一个或多个:重链可变区中的Q1E、R45K、A47R、M55I、V78A、M80I、R82T、V89A、M91L,按照Kabat编号。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含Q1E。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含R45K。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含A47R。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含M55I。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含V78A。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含M80I。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含R82T。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含V89A。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含M91L。
在一些实施方案中,氨基酸修饰包含轻链可变区中氨基酸位置54处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置54处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置54处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置54处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置54处的氨基酸包括P。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含轻链可变区中氨基酸位置55处的修饰,按照Kabat编号。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,位置55处的氨基酸包括W。
在一些实施方案中,氨基酸修饰包含轻链可变区中的L54P和/或L55W,按照Kabat编号。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含L54P。在一些实施方案中,氨基酸修饰包含L55W。
在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:1所示的重链CDR1。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:2所示的重链CDR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:3所示的重链CDR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:4所示的重链CDR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:5所示的重链CDR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:6所示的重链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:7所示的重链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:8所示的重链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:9所示的重链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:10所示的轻链CDR1。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:11所示的轻链CDR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:12所示的轻链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:13所示的轻链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:14所示的轻链CDR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQID NO:15所示的轻链CDR3。
在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:304所示的重链FR1。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:305所示的重链FR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:313所示的重链FR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:306所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:307所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:314所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:315所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ IDNO:308所示的重链FR4。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:309所示的轻链FR1。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:310所示的轻链FR2。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:311所示的轻链FR3。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:312所示的轻链FR4。
在另一方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含:(a)重链可变区,该重链可变区包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),和(b)轻链可变区,该轻链可变区包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X1-X11的每一个独立地选自A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。
在一些实施方案中,X1包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X1包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X2包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X2包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X3包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X3包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X4包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X4包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X5包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X5包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X6包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X6包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X7包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X7包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X8包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X8包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X9包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X9包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X10包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X10包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X11包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X11包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。
在一些实施方案中,X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,X9=M或L,X10=L或P,且X11=L或W。在一些实施方案中,X1=Q。在一些实施方案中,X1=E。在一些实施方案中,X2=R。在一些实施方案中,X2=K。在一些实施方案中,X3=A。在一些实施方案中,X3=R。在一些实施方案中,X4=M。在一些实施方案中,X4=I。在一些实施方案中,X5=V。在一些实施方案中,X5=A。在一些实施方案中,X6=M。在一些实施方案中,X6=I。在一些实施方案中,X7=R。在一些实施方案中,X7=T。在一些实施方案中,X8=V。在一些实施方案中,X8=A。在一些实施方案中,X9=M。在一些实施方案中,X9=L。在一些实施方案中,X10=L。在一些实施方案中,X10=P。在一些实施方案中,X11=L。在一些实施方案中,X11=W。
在一些实施方案中,HCDR1包含SEQ ID NO:1。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQID NO:2。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQID NO:4。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:5。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQID NO:6。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:7。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQID NO:8。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:9。在一些实施方案中,LCDR1包含SEQID NO:10。在一些实施方案中,LCDR2包含SEQ ID NO:11。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQID NO:12。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:13。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQID NO:14。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含如SEQ ID NO:15所示的轻链CDR3。
在另一方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含:(a)重链可变区,该重链可变区包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),和(b)轻链可变区,该轻链可变区包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X1-X11的每一个独立地选自A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。
在一些实施方案中,X1包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X1包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X2包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X2包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X3包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X3包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X4包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X4包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X5包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X5包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X6包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X6包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X7包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X7包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X8包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X8包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X9包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X9包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X10包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X10包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。在一些实施方案中,X11包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。在一些实施方案中,X11包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。
在一些实施方案中,X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,X9=M或L,X10=L或P,且X11=L或W。在一些实施方案中,X1=Q。在一些实施方案中,X1=E。在一些实施方案中,X2=R。在一些实施方案中,X2=K。在一些实施方案中,X3=A。在一些实施方案中,X3=R。在一些实施方案中,X4=M。在一些实施方案中,X4=I。在一些实施方案中,X5=V。在一些实施方案中,X5=A。在一些实施方案中,X6=M。在一些实施方案中,X6=I。在一些实施方案中,X7=R。在一些实施方案中,X7=T。在一些实施方案中,X8=V。在一些实施方案中,X8=A。在一些实施方案中,X9=M。在一些实施方案中,X9=L。在一些实施方案中,X10=L。在一些实施方案中,X10=P。在一些实施方案中,X11=L。在一些实施方案中,X11=W。
在一些实施方案中,HCDR1包含SEQ ID NO:1。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQID NO:2。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQID NO:4。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:5。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQID NO:6。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:7。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQID NO:8。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:9。在一些实施方案中,LCDR1包含SEQID NO:10。在一些实施方案中,LCDR2包含SEQ ID NO:11。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQID NO:12。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:13。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQID NO:14。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:15。
在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:101。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:102。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:103。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:104。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:105。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:106。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:107。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:108。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:109。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:110。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:111。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:112。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:113。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:114。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:115。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:116。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQID NO:117。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:118。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:119。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:120。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:121。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ IDNO:122。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:123。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:124。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:125。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:126。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:127。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:128。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:129。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:130。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:131。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:132。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:133。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:134。在一些实施方案中,重链可变区包含SEQ ID NO:135。在一些实施方案中,轻链可变区包含SEQ ID NO:201。在一些实施方案中,轻链可变区包含SEQ ID NO:202。在一些实施方案中,轻链可变区包含SEQ ID NO:203。在一些实施方案中,轻链可变区包含SEQID NO:204。在一些实施方案中,轻链可变区包含SEQ ID NO:205。在一些实施方案中,轻链可变区包含SEQ ID NO:206。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含与SEQ ID NO:104具有至少约96%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域,和含与SEQ ID NO:201具有至少约97%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约97%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含SEQ ID NO:104。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含SEQ ID NO:201。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含与SEQ ID NO:107具有至少约99%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域,和含与SEQ ID NO:201具有至少约97%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方案中,重链可变结构域包含SEQ ID NO:107。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含SEQ ID NO:201。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含与SEQ ID NO:101-135中的任一个具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列的重链可变结构域和含与SEQ ID NO:201-206中的任一个具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列的轻链可变结构域。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:101具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:102具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:103具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:105具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:106具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:107具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:108具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:109具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:110具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:111具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:112具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ IDNO:113具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:114具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:115具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:116具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:117具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:118具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:119具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:120具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:121具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:122具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:123具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ IDNO:124具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:125具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:126具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:127具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:128具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:129具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:130具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:131具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:132具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:133具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:134具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ IDNO:135具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:202具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:203具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:204具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:205具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:206具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:101的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:102的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:103的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:104的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:105的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:103的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:106的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:107的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:109的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:109的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:203的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:107的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:107的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:110的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:111的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:112的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:113的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:114的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:115的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:116的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:117的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:118的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:114的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:102的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:104的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:119的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:119的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:101的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:105的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:120的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:121的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:123的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:124的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:125的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:116的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:117的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:126的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:127的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:127的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:121的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:206的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:124的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:124的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:128的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:128的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:206的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:129的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:130的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:131的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:132的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:133的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:134的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:135的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:132的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:126的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:130的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
本文进一步提供了一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,包含含SEQ ID NO:501-513中的任一个的重链结构域,和含SEQ ID NO:514的轻链结构域。
在另一方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含重链可变区,该重链可变区包含:(a)包含由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的HCDR1;(b)包含由SEQ ID NO:2-5中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR2;和(c)包含由SEQ ID NO:6-9中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR3;以及轻链可变区,该轻链可变区包含:(d)包含由SEQ IDNO:10所示的氨基酸序列的LCDR1;(e)包含由SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列的LCDR2;(f)包含由SEQ ID NO:12-15中的任一个所示的氨基酸序列的LCDR3;以及可结晶片段(Fc)区,该可结晶片段(Fc)区包含与人IgG1相比降低的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)功能和/或与人IgG1相比降低的补体依赖性细胞毒性(CDC)。在一些实施方案中,人IgG1包含SEQ ID NO:320。在一些实施方案中,包含降低的ADCC的Fc区的ADCC功能与人IgG1相比降低至少约50%。在一些实施方案中,包含降低的ADCC的Fc区的CDC功能与人IgG1相比降低至少约50%。在一些实施方案中,Fc区包含人IgG1,该人IgG1包含(a)297A、297Q或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗原结合片段的抗体包含(i)人IgG4Fc区或(ii)包含(a)S228P和L235E或(b)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗原结合片段的抗体包含人IgG2Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。在一些实施方案中,抗原结合片段的抗体包含人Fc区,该人Fc区包含高甘露糖糖基化。在一些实施方案中,Fc区包含人IgG1,该人IgG1具有选自297A、297Q、297D、279F、279K、279L、228P、235A、235E、235G、235Q、235R、235S、237A、237E、237K、237N、237R、268K、269N、269Q、270A、270G、270M、270N、424H、424M和424V的置换,按照Kabat编号。在一些实施方案中,Fc区包含人IgG1,该人IgG1具有选自271T、272N、292E、292F、292G、292I、293S、301W、304E、311E、311G、311S、255N、256H、256K、256R、256V、316F、328V、330R、339E、339L、343I、343V、373A、373G、373S、376E、376W、376Y、380D、382D、382P、385P、234A、234V、234F、233P、328A、327Q和327T的置换,按照Kabat编号。在一些实施方案中,Fc区包含具有置换的人IgG1,该置换选自329A、329G、329Y、331S、236F、236R、238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、238Y、248A、254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、254V、264S、265H、265K、265S、265Y、265A、267G、267H、267I、267K、434I、438G、439E、439H、439Q、440A、440D、440E、440F、440M、440T和440V,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段包含与SEQ ID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,HCDR1包含SEQ ID NO:1。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:2。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:3。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:4。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:5。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:6。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:7。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:8。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:9。在一些实施方案中,LCDR1包含SEQ ID NO:10。在一些实施方案中,LCDR2包含SEQ ID NO:11。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:12。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:13。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:14。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:15。
在另一方面中,本文提供了一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含重链可变区,该重链可变区包含:(a)包含由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的HCDR1;(b)包含由SEQ ID NO:2-5中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR2;和(c)包含由SEQ ID NO:6-9中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR3;以及轻链可变区,该轻链可变区包含:(d)包含由SEQ IDNO:10所示的氨基酸序列的LCDR1;(e)包含由SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列的LCDR2;和(f)包含由SEQ ID NO:12-15中的任一个所示的氨基酸序列的LCDR3。在一些实施方案中,重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架。在一些实施方案中,轻链可变骨架区包含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架。在一些实施方案中,重链可变区包含以下氨基酸中的一个或多个:1E、45K、47R、55I、78A、80I、82T、89A、91L,按照Kabat编号。在一些实施方案中,重链可变区包含1E。在一些实施方案中,重链可变区包含45K。在一些实施方案中,重链可变区包含47R。在一些实施方案中,重链可变区包含55I。在一些实施方案中,重链可变区包含78A。在一些实施方案中,重链可变区包含80I。在一些实施方案中,重链可变区包含82T。在一些实施方案中,重链可变区包含89A。在一些实施方案中,重链可变区包含91L。在一些实施方案中,轻链可变区包含以下氨基酸中的一个或多个:54P和55W,按照Kabat编号。在一些实施方案中,轻链可变区包含54P。在一些实施方案中,轻链可变区包含55W。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:2。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQID NO:3。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQ ID NO:4。在一些实施方案中,HCDR2包含SEQID NO:5。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:6。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQID NO:7。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQ ID NO:8。在一些实施方案中,HCDR3包含SEQID NO:9。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:12。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQID NO:13。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQ ID NO:14。在一些实施方案中,LCDR3包含SEQID NO:15。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含人IgG1 Fc区,该人IgG1Fc区包含(a)297A、297Q或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些实施方案中,本文的抗原结合片段的抗体包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含(a)S228P和L235E或(b)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。在一些实施方案中,本文的抗原结合片段的抗体包含人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。在一些实施方案中,本文的抗原结合片段的抗体包含人Fc区,该人Fc区包含高甘露糖糖基化。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段中的任一个包含人IgG4 Fc区。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含人IgG1,该人IgG1具有选自297A、297Q、297D、279F、279K、279L、228P、235A、235E、235G、235Q、235R、235S、237A、237E、237K、237N、237R、268K、269N、269Q、270A、270G、270M、270N、424H、424M和424V的置换,按照Kabat编号。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含人IgG1,该人IgG1具有选自271T、272N、292E、292F、292G、292I、293S、301W、304E、311E、311G、311S、255N、256H、256K、256R、256V、316F、328V、330R、339E、339L、343I、343V、373A、373G、373S、376E、376W、376Y、380D、382D、382P、385P、234A、234V、234F、233P、328A、327Q和327T的置换,按照Kabat编号。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含人IgG1,该人IgG1具有选自329A、329G、329Y、331S、236F、236R、238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、238Y、248A、254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、254V、264S、265H、265K、265S、265Y、265A、267G、267H、267I、267K、434I、438G、439E、439H、439Q、440A、440D、440E、440F、440M、440T和440V的置换,按照Kabat编号。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含Fc区,该Fc区包含与SEQID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段包含至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%单体级分。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱法包括将纯化的抗体或抗原结合片段注射到尺寸排阻柱上,其中抗体或抗原结合片段通过蛋白质A纯化。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段如实施例2中描述进行纯化。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段在实施例2中描述的条件下表达。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱柱的内径为4.6mm。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱柱的长度为150mm。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱柱的孔径为
Figure BDA0003907474270000361
在一些实施方案中,尺寸排阻色谱柱的粒度为1.7微米。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱柱为ACQUITYUPLC BEH200 SEC柱。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段以15μL的总体积注射。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段以约0.1μg/μL至约1.0μg/μL的浓度注射。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱法在Shimadzu UPLC仪器上进行。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱法以0.2mL/min的流速进行。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱法在30℃的柱箱温度下进行。在一些实施方案中,使用Shimadzu软件计算单体的百分比。在一些实施方案中,尺寸排阻色谱法如实施例2中描述进行。
在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段表达至少约20ug/ml总抗体。在一些实施方案中,本文描述的抗体或抗原结合片段表达约20ug/ml至70ug/mL总抗体。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段在FreeStyle 293-F细胞中表达。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段如实施例2中描述表达。在一些实施方案中,抗体或抗原结合片段表达水平使用酶联免疫吸附试验(ELISA)定量。在一些实施方案中,ELISA包括用与人或人源化抗体结合的捕获抗体包被底物的表面,将该抗体或抗原结合片段施加到底物,并将与人或人源化抗体结合的第二抗体施加到底物。在一些实施方案中,捕获抗体包含抗κ抗体。在一些实施方案中,第二抗体包含抗Fc抗体。在一些实施方案中,ELISA如实施例2中描述进行。
本文还提供了治疗有此需要的对象的炎性肠病(IBD)的方法,该方法包括向对象施用本文描述的抗体或抗原结合片段。在一些实施方案中,IBD包括克罗恩病。在一些实施方案中,IBD包括溃疡性结肠炎。
附图说明
示例性实施方案在参考附图中进行说明。本文公开的实施方案和附图旨在被认为是说明性的,而非限制性的。
图1A-1C显示了抗TL1A抗体的分析性尺寸排阻色谱法的色谱图。
图2描绘了抗TL1A抗体对人血液中的干扰素γ的抑制。
图3A-3C描绘了展示pH和蛋白质浓度对粘度的影响的PLS模型。图3A显示了PLS图表,图3B显示了预测的粘度与抗TL1A抗体浓度(以mg/mL为单位)的模型,且图3C显示了估计粘度与实际粘度的模型。粘度单位为mPa-s。
具体实施方式
肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)是一种促炎分子,其在TCR刺激的存在下,刺激CD8(+)细胞毒性T细胞以及Th1、Th2和Th17细胞的增殖和效应子功能。TL1A与炎性肠病(IBD)如克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎的发展和严重程度有关。TL1A被认为通过桥接先天性和适应性免疫应答,通过增强Th1、Th2和Th17效应细胞功能以及发炎组织的T细胞聚集和免疫病理学来调节适应性免疫,从而参与IBD的发病机制。TL1A是与肠道炎症和肠道纤维化相关的靶点,其在UC的2a期临床试验中得到了临床验证。此外,临床前和人遗传关联数据表明TL1A是CD的潜在治疗靶点。本公开内容描述了针对TL1A的优化的抗体,并为IBD的治疗提供了新的治疗。本文描述的抗TL1A抗体可显著改善有增加的TL1A表达倾向的中重度IBD患者的预后。例如,基于与参考水平(例如,来自没有IBD的对象)相比患者体内增加的TL1A表达,挑选患者接受本文的抗TL1A抗体的治疗。通过基因分型分析测定以确定与增加的TL1A表达相关的基因型的存在可以挑选TL1A表达增加的患者。如Entrez Gene:9966;UniProtKB:O95150所示提供TL1A和编码TL1A(肿瘤坏死因子配体超家族成员15(TNFSF15))的核酸。因此,本公开内容进一步提供了用本文描述的抗体治疗具有增加的TL1A表达的对象的方法。
抗体
在一个方面,本文提供了抗体和抗原结合片段。在一些实施方案中,抗体包含抗原结合片段,该抗原结合片段是指具有抗体的抗原决定可变区的抗体的一部分。抗原结合片段的示例包括但不限于Fab、Fab’、F(ab’)2和Fv片段,线性抗体、单链抗体和由抗体片段形成的多特异性抗体。在一些实施方案中,抗体是指通过免疫球蛋白分子可变区内的至少一个抗原识别位点识别并特异性结合靶标如蛋白质、多肽、肽、碳水化合物、多核苷酸、脂质或前述的组合的免疫球蛋白分子。在一些实施方案中,抗体包括完整的多克隆抗体、完整的单克隆抗体、抗体片段(如Fab、Fab’、F(ab’)2和Fv片段)、单链Fv(scFv)突变体、CDR移植的抗体、多特异性抗体、嵌合抗体、人源化抗体、人抗体、包含抗体的抗原决定部分的融合蛋白,以及其他任何修饰的包含抗原识别位点的免疫球蛋白分子,只要该抗体表现出所需的生物学活性。抗体可以是免疫球蛋白的五种主要类别中的任何一种:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,或其亚类(同种型)(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2),基于它们的重链恒定结构域的身份,分别被称为α、δ、ε、γ和μ。不同类别的免疫球蛋白具有不同且众所周知的亚单位结构和三维构型。抗体可以是裸露的,或与诸如毒素、放射性同位素等其他分子缀合。
在一些实施方案中,人源化抗体是指具有特定免疫球蛋白链、嵌合免疫球蛋白或其片段的非人(例如鼠)抗体的形式,其包含最少的非人(例如鼠)序列。在非限制性实例中,人源化抗体在可变区中包含少于约40%的非人序列。在一些情况下,人源化抗体在全长抗体序列中包含少于约20%的非人序列。在进一步的非限制性示例中,人源化抗体在每个重链和轻链可变区的骨架区中包含少于约20%的非人序列。例如,人源化抗体在每个重链和轻链可变区的骨架区中包含少于约20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%或1%的非人序列。作为另一示例,人源化抗体在每个重链和轻链可变区的骨架区中包含约或少于约15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个非人序列。在一些情况下,人源化抗体是这样的人免疫球蛋白,其中来自互补决定区(CDR)的残基被具有所需特异性、亲和力和能力的来自非人物种(例如小鼠、大鼠、兔、仓鼠)的CDR的残基所替代。这些人源化抗体可包含一个或多个非人物种突变,例如,重链在骨架区中包含约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个非人物种突变,且轻链在骨架区中包含约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15个非人物种突变。人源化重链可变结构域可包含没有或具有少于约10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸突变的IGHV1-46*02骨架。人源化轻链可变结构域可包含没有或具有少于约10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸突变的IGKV3-20骨架。
在一些实施方案中,嵌合抗体是指其中免疫球蛋白分子的序列来源于两个或更多个物种的抗体。作为非限制性实例,轻链和重链的可变区均对应于具有所需特异性、亲和力和能力的来源于一个哺乳动物物种(例如,小鼠、大鼠、兔等)的抗体的可变区,而恒定区与来源于另一个物种(通常是人)的抗体中的序列同源,以避免在该物种中引发免疫应答。
与“高变区”或“HVR”同义的术语“互补决定区”和“CDR”在本领域中是已知的,是指抗体可变区内的非连续氨基酸序列,其赋予抗原特异性和/或结合亲和力。通常,每个重链可变区中有三个CDR(CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3),并且每个轻链可变区中有三个CDR(CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3)。“骨架区”和“FR”在本领域中是已知的,是指重链和轻链的可变区的非CDR部分。通常,每个全长重链可变区中有四个FR(FR-H1、FR-H2、FR-H3和FR-H4),并且每个全长轻链可变区中有四个FR(FR-L1、FR-L2、FR-L3和FR-L4)。给定CDR或FR的精确氨基酸序列边界可以使用许多公知方案中的任何一种来容易地确定,包括以下文献中描述的那些方案:Kabat等人(1991),“Sequences of Proteins of Immunological Interest,”第5版.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(“Kabat”编号方案),Al-Lazikani等人,(1997)JMB 273,927-948(“Chothia”编号方案);MacCallum等人,J.Mol.Biol.262:732-745(1996),“Antibody-antigen interactions:Contact analysisand binding site topography,”J.Mol.Biol.262,732-745.”(“Contact”编号方案);Lefranc MP等人,“IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptorvariable domains and Ig superfamily V-like domains,”Dev Comp Immunol,2003年1月;27(1):55-77(“IMGT”编号方案);Honegger A和Plückthun A,“Yet another numberingscheme for immunoglobulin variable domains:an automatic modeling and analysistool,”J Mol Biol,2001年6月8日;309(3):657-70(“Aho”编号方案);和Whitelegg NR和Rees AR,“WAM:an improved algorithm for modelling antibodies on the WEB,”Protein Eng.2000年12月;13(12):819-24(“AbM”编号方案)。在某些实施方案中,本文所述抗体的CDR可以通过选自Kabat、Chothia、IMGT、Aho、AbM或其组合的方法来定义。
在一些实施方案中,与蛋白质特异性结合的抗体表示,与包括不相关蛋白质在内的替代物质相比,该抗体与该蛋白质的反应或缔合更频繁、更快速、持续时间更长、亲和力更高,或以上所述的一些组合。
在一些实施方案中,术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”在本文中可互换使用,是指任何长度的氨基酸的聚合物。该聚合物可以是直链或支链的,其可以包含修饰的氨基酸,并且其可被非氨基酸中断。这些术语还包括天然修饰的或通过干预而修饰的氨基酸聚合物;例如,通过二硫键形成、糖基化、酯化、乙酰化、磷酸化或其他任何操作或修饰,例如与另一种多肽融合和/或缀合,例如与标记组分缀合而修饰的。该定义内还包括,例如,含有一种或多种氨基酸类似物(例如,非天然氨基酸等)的多肽,以及本领域已知的其他修饰。
在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含疏水氨基酸。非限制性示例性疏水氨基酸包括甘氨酸(Gly)、脯氨酸(Pro)、苯丙氨酸(Phe)、丙氨酸(Ala)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)和缬氨酸(Val)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含亲水氨基酸。非限制性示例性亲水氨基酸包括丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)、半胱氨酸(Cys)、天冬酰胺(Asn)、谷氨酰胺(Gln)、精氨酸(Arg)和组氨酸(His)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含两亲性氨基酸。非限制性示例性两亲性氨基酸包括赖氨酸(Lys)、色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)和蛋氨酸(Met)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含脂肪族氨基酸。非限制性示例性脂肪族氨基酸包括丙氨酸(Ala)、异亮氨酸(Ile)、亮氨酸(Leu)和缬氨酸(Val)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含芳香族氨基酸。非限制性示例性芳香族氨基酸包括苯丙氨酸(Phe)、色氨酸(Trp)和酪氨酸(Tyr)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含酸性氨基酸。非限制性示例性氨基酸包括天冬氨酸(Asp)和谷氨酸(Glu)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含碱性氨基酸。非限制性示例性碱性氨基酸包括精氨酸(Arg)、组氨酸(His)和赖氨酸(Lys)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含羟基氨基酸。非限制性示例性羟基氨基酸包括丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含含硫氨基酸。非限制性示例性含硫氨基酸包括半胱氨酸(Cys)和蛋氨酸(Met)。在一些实施方案中,诸如本文描述的抗体的蛋白质包含酰胺氨基酸。非限制性示例性酰胺氨基酸包括天冬酰胺(Asn)和谷氨酰胺(Gln)。
在一些实施方案中,在本文中可互换使用的“多核苷酸”或“核酸”是指任何长度的核苷酸聚合物,并且包括DNA和RNA。核苷酸可以是脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、修饰的核苷酸或碱基和/或它们的类似物,或可以通过DNA或RNA聚合酶掺入聚合物中的任何底物。多核苷酸可包含修饰的核苷酸,例如但不限于甲基化的核苷酸及其类似物或非核苷酸组分。对核苷酸结构的修饰可以在聚合物装配之前或之后赋予。多核苷酸可以在聚合后进一步修饰,例如通过与标记组分缀合。
相对于参考多肽序列的序列同一性百分比(%)是在将序列进行比对并在必要时引入空位以达到最大序列同一性百分比之后,候选序列中的氨基酸残基与参考多肽序列中的氨基酸残基相同的百分比,并且不认为任何保守置换是序列同一性的一部分。旨在确定氨基酸序列同一性百分比的比对可以通过各种已知的方式来实现,例如使用可公开获得的计算机软件,如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。能够确定用于比对序列的适当参数,包括在所比较的序列的全长上实现最大比对所需的算法。然而,对于本文而言,使用序列比较计算机程序ALIGN-2生成氨基酸序列同一性百分比。ALIGN-2序列比较计算机程序由Genentech,Inc.开发,源代码已作为用户文档提交美国版权局(WashingtonD.C.,20559),并以美国版权登记号TXU510087进行了登记。ALIGN-2程序可从Genentech,Inc.,South San Francisco,Calif.公开获得,也可以从源代码进行编译。ALIGN-2程序应进行编译,以供在UNIX操作系统(包括数字UNIX V4.0D)上使用。所有序列比较参数均由ALIGN-2程序设置,并且保持不变。
在使用ALIGN-2进行氨基酸序列比较的情况下,给定氨基酸序列A与或相对于给定氨基酸序列B的氨基酸序列同一性百分比(或者可以用以下短语表示:给定氨基酸A与或相对于给定氨基酸序列B具有或包含一定的氨基酸序列同一性百分比)计算如下:分数X/Y乘以100,其中X是在A和B的该程序比对中由序列比对程序ALIGN-2评分为相同匹配的氨基酸残基数,并且其中Y是B中的氨基酸残基总数。应当理解,在氨基酸序列A的长度不等于氨基酸序列B的长度时,A与B的氨基酸序列同一性百分比将不等于B与A的氨基酸序列同一性百分比。除非另有特别说明,否则使用ALIGN-2计算机程序如前一段所述获得本文使用的所有氨基酸序列同一性百分比值。
在一些实施方案中,术语“约”是指在规定数量的10%以内。例如,包含与参考可变区约80%同一性的抗体可变区可包含与参考可变区72%至88%同一性。
在某些方面中,抗体是本文描述的与TL1A(Entrez Gene:9966;UniProtKB:O95150)特异性结合。在一些实施方案中,所述抗体与可溶性TL1A特异性结合。在一些实施方案中,所述抗体与膜结合TL1A特异性结合。在一些实施方案中,提供了一种抗TL1A抗体,其具有包含四个重链骨架区(HCFR)和三个重链互补决定区(HCDR)的重链:HCFR1、HCDR1、HCFR2、HCDR2、HCFR3、HCDR3和HCFR4;以及包含四个轻链骨架区(LCFR)和三个轻链互补决定区(LCDR)的轻链:LCFR1、LCDR1、LCFR2、LCDR2、LCFR3、LCDR3和LCFR4。抗TL1A抗体可包括本文提供的任何区域,例如,如表6-11、实施例和序列中提供的。
示例性抗TL1A CDR
在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:1所示的HCDR1。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:2-5中任一个所示的HCDR2。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:6-9中任一个所示的HCDR3。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:10所示的LCDR1。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:11所示的LCDR2。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:12-15中任一个所示的LCDR3。
在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含选自表6的HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、LCDR3。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体A中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体B中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体C中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体D中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体E中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体F中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体G中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体H中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体A2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体B2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体C2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体D2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体E2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体F2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体G2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体H2中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体I中所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表10所示的抗体I2中所示的CDR。
在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表1的抗体中的任一个所示的CDR。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A217中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A220中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A223中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A219中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A221中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A200中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A213中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A212中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A107中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A205中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A211中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A199中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A15中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A30中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A100中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A181中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A129中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A214中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A216中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A122中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A222中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A188中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A203中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A147中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A127中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A126中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A160中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A157中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A159中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A218中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A158中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A125中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A103中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A64中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A67中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A138中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A68中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A94中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A110中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A197中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A112中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A169中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A173中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A179中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A148中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A115中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A149中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A134中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A113中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A151中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A96中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A132中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A196中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A172中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A75中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A174中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A109中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A198中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A170中所示的CDR,其中CDR由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。
示例性抗TL1A骨架区
表7-9A和表11提供了示例性骨架和可变区序列。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS)。在一些情况下,X1为Q。在一些情况下,X1=E。在一些情况下,X2=R。在一些情况下,X2=K。在一些情况下,X3=A。在一些情况下,X3=R。在一些情况下,X4=M。在一些情况下,X4=I。在一些情况下,X5=V。在一些情况下,X5=A。在一些情况下,X6=M。在一些情况下,X6=I。在一些情况下,X7=R。在一些情况下,X7=T。在一些情况下,X8=V。在一些情况下,X8=A。在一些情况下,X9=M。在一些情况下,X9=L。在一些实施方案中,X1在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置1处。在一些实施方案中,X2在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置45处。在一些实施方案中,X3在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置47处。在一些实施方案中,X4在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置55处。在一些实施方案中,X5在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置78处。在一些实施方案中,X6在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置80处。在一些实施方案中,X7在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置82处。在一些实施方案中,X8在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置89处。在一些实施方案中,X9在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置91处。
在一个方面中,本文提供了抗TL1A抗体的第一实施方案,该抗TL1A抗体包含含IGHV1-46*02或其变体的重链骨架,其中变体包含来自IGHV1-46*02骨架的约1至约9个之间的氨基酸置换或约1至约20个之间的氨基酸置换或约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。附加实施方案包括:(2)实施方案(1)所述的抗TL1A,其中重链骨架包含SEQ ID NO:301。(3)实施方案2所述的抗TL1A,其中X1=Q。(4)实施方案2所述的抗TL1A,其中X1=E。(5)实施方案2-4中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=R。(6)实施方案2-4中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=K。(7)实施方案2-6中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=A。(8)实施方案2-6中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=R。(9)实施方案2-8中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=M。(10)实施方案2-8中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=I。(11)实施方案2-10中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=V。(12)实施方案2-10中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=A。(13)实施方案2-12中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=M。(14)实施方案2-12中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=I。(15)实施方案2-14中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=R。(16)实施方案2-14中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=T。(17)实施方案2-16中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=V。(18)实施方案2-16中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=A。(19)实施方案2-18中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=M。(20)实施方案2-4中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=L。(21)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体A。(22)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体B。(23)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体C。(24)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体D。(25)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体E。(26)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体F。(27)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体G或I。(28)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体H。(29)实施方案1-28中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含:(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。如本文所用,如(a)至(uu)的分组的任何组合包括来自该分组的至少约两个或更多个项目,例如(a)至(uu)的分组的任何组合包括2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46和多达47个或所有该分组的成员。(30)实施方案1-28中的任一个所述的抗TL1A,包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含(a)S228P、(b)S228P和L235E或(c)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。(31)实施方案1-28中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。(32)实施方案1-31中的任一个所述的抗TL1A,包含重链Fc区,该重链Fc区包含SEQ ID NO:320-362中的任一个。(33)实施方案1-32中的任一个所述的抗TL1A,包含轻链恒定区,该轻链恒定区包含SEQ ID NO:319。(34)实施方案1-33中的任一个所述的抗TL1A,包含含轻链骨架的轻链,该轻链骨架包含IGKV3-20*01或其变体,其中变体在骨架中包含约1至约2个之间的置换,或约1至约20个之间的氨基酸置换,或约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。(35)实施方案34所述的抗TL1A抗体,其中X10为L。(36)实施方案34所述的抗TL1A抗体,其中X10为P。(37)实施方案34-36中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中X11为L。(38)实施方案34-36中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中X11为W。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS)。在一些情况下,X1为Q。在一些情况下,X1=E。在一些情况下,X2=R。在一些情况下,X2=K。在一些情况下,X3=A。在一些情况下,X3=R。在一些情况下,X4=M。在一些情况下,X4=I。在一些情况下,X5=V。在一些情况下,X5=A。在一些情况下,X6=M。在一些情况下,X6=I。在一些情况下,X7=R。在一些情况下,X7=T。在一些情况下,X8=V。在一些情况下,X8=A。在一些情况下,X9=M。在一些情况下,X9=L。在一些实施方案中,X1在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置1处。在一些实施方案中,X2在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置45处。在一些实施方案中,X3在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置47处。在一些实施方案中,X4在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置55处。在一些实施方案中,X5在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置78处。在一些实施方案中,X6在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置80处。在一些实施方案中,X7在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置82处。在一些实施方案中,X8在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置89处。在一些实施方案中,X9在通过Kabat编号确定的IGHV1-46*02的位置91处。
在一个方面中,本文提供了抗TL1A抗体的另一个第一实施方案,该抗TL1A抗体包含含IGHV1-46*02或其变体的重链骨架,其中变体包含来自IGHV1-46*02骨架的约1至约9个之间的氨基酸置换或约1至约20个之间的氨基酸置换或约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。附加实施方案包括:(2)实施方案(1)所述的抗TL1A,其中重链骨架包含SEQ ID NO:302。(3)实施方案2所述的抗TL1A,其中X1=Q。(4)实施方案2所述的抗TL1A,其中X1=E。(5)实施方案2-4中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=R。(6)实施方案2-4中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=K。(7)实施方案2-6中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=A。(8)实施方案2-6中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=R。(9)实施方案2-8中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=M。(10)实施方案2-8中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=I。(11)实施方案2-10中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=V。(12)实施方案2-10中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=A。(13)实施方案2-12中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=M。(14)实施方案2-12中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=I。(15)实施方案2-14中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=R。(16)实施方案2-14中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=T。(17)实施方案2-16中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=V。(18)实施方案2-16中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=A。(19)实施方案2-18中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=M。(20)实施方案2-4中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=L。(21)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体A。(22)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体B。(23)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体C。(24)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体D。(25)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体E。(26)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体F。(27)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体G或I。(28)实施方案1-20中的任一个所述的抗TL1A,包含抗体H。(29)实施方案1-28中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含:(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(30)实施方案1-28中的任一个所述的抗TL1A,包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含(a)S228P和L235E或(b)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。(31)实施方案1-28中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG2Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。(32)实施方案1-31中的任一个所述的抗TL1A,包含重链Fc区,该重链Fc区包含SEQ ID NO:320-362中的任一个。(33)实施方案1-32中的任一个所述的抗TL1A,包含轻链恒定区,该轻链恒定区包含SEQ ID NO:319。(34)实施方案1-33中的任一个所述的抗TL1A,包含含轻链骨架的轻链,该轻链骨架包含IGKV3-20*01或其变体,其中变体在骨架中包含约1至约2个之间的置换,或约1至约20个之间的氨基酸置换,或约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。(35)实施方案34所述的抗TL1A抗体,其中X10为L。(36)实施方案34所述的抗TL1A抗体,其中X10为P。(37)实施方案34-36中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中X11为L。(38)实施方案34-36中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中X11为W。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK)。在一些情况下,X10为L。在一些情况下,X10为P。在一些情况下,X11为L。在一些情况下,X11为W。在一些实施方案中,X10在通过Kabat编号确定的IGKV3-20*01的位置54处。在一些实施方案中,X11在通过Kabat编号确定的IGKV3-20*01的位置55处。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含含IGHV1-46*02的重链骨架。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含重链骨架,该重链骨架包含IGHV1-46*02的变体,该变体包含约1至约20个之间的来自SEQ ID NO:316的氨基酸置换。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含重链骨架,该重链骨架包含IGHV1-46*02的变体,该变体包含约1至约9个之间的来自SEQ ID NO:316的氨基酸置换。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含重链骨架,该重链骨架包含IGHV1-46*02的变体,该变体在骨架中包含约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个来自SEQ ID NO:316的氨基酸置换。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的Q1E。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的R45K。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的A47R。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的M55I。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的V78A。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的M80I。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的R82T。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的V89A。在一些情况下,重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的M91L。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含轻链骨架,该轻链骨架包含IGKV3-20*01。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含IGKV3-20*01的变体,该变体包含约1至约20个之间的来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含IGKV3-20*01的变体,该变体包含约1个来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含轻链骨架,该轻链骨架包含IGKV3-20*01的变体,该变体包含约2个来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含轻链骨架,该轻链骨架包含IGKV3-20*01的变体,该变体在骨架中包含约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。在一些情况下,轻链骨架置换包含通过Kabat编号确定的Q1E。在一些情况下,轻链骨架置换包含通过Kabat编号确定的R45K。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:304所示的重链FR1。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:305所示的重链FR2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:313所示的重链FR2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ IDNO:306所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:307所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:314所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:315所示的重链FR3。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:308所示的重链FR4。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:309所示的轻链FR1。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:310所示的轻链FR2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:311所示的轻链FR3。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含如SEQ ID NO:312所示的轻链FR4。
在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含表1中的抗体中的任一个所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A217中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A220中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A223中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A219中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A221中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A200中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A213中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A212中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A107中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A205中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A211中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A199中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A15中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A30中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A100中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A181中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A129中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A214中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A216中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A122中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A222中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A188中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A203中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A147中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A127中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A126中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A160中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A157中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A159中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A218中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A158中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A125中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A103中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A64中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A67中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A138中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A68中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A94中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A110中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A197中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A112中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A169中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A173中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A179中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A148中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A115中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A149中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A134中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A113中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A151中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A96中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A132中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A196中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A172中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A75中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A174中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A109中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A198中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A170中所示的骨架区,其中骨架区由Kabat、Chothia或IMGT方法定义。
示例性抗TL1A可变区
在一个方面中,本文提供了抗TL1A抗体,该抗TL1A抗体包含含与SEQ ID NO:101-135中的任一个具有至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列的重链可变区;和与SEQ ID NO:201-206中的任一个具有至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的轻链可变区。
本文进一步提供了抗TL1A抗体的第一实施方案,该抗TL1A抗体包含重链可变区和轻链可变区。非限制性附加实施方案包括:(实施方案2)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:101。(实施方案3)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:101具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案4)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:101相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案5)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:102。(实施方案6)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:102具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案7)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:102相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案8)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:103。(实施方案9)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:103具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案10)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:103相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案11)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:104。(实施方案12)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:104具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案13)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:104相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案14)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:105。(实施方案15)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:105具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案16)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:105相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案17)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:106。(实施方案18)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:106具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案19)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:106相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案20)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:107。(实施方案21)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:107具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案22)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:107相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案23)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:108。(实施方案24)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:108具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案25)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:108相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案26)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:109。(实施方案27)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:109具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案28)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:109相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案29)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:110。(实施方案30)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:110具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案31)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:110相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案32)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:111。(实施方案33)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:111具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案34)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:111相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案35)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:112。(实施方案36)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQID NO:112具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案37)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:112相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案38)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:113。(实施方案39)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:113具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案40)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ IDNO:113相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案41)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:114。(实施方案42)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:114具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案43)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:114相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案44)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:115。(实施方案45)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:115具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案46)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:115相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案47)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:116。(实施方案48)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:116具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案49)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:116相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案50)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:117。(实施方案51)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:117具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案52)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:117相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案53)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:118。(实施方案54)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:118具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案55)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:118相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案56)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:119。(实施方案57)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:119具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案58)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:119相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案59)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:120。(实施方案60)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:120具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案61)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:120相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案62)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:121。(实施方案63)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:121具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案64)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:121相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案65)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:122。(实施方案66)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案67)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案68)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:123。(实施方案69)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:123具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案70)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:123相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案71)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:124。(实施方案72)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:124具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案73)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:124相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案74)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:125。(实施方案75)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:125具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案76)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:125相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案77)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:126。(实施方案78)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:126具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案79)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:126相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案80)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:127。(实施方案81)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:127具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案82)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:127相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案83)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:128。(实施方案84)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:128具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案85)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:128相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案86)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:129。(实施方案87)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:129具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案88)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:129相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案89)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:130。(实施方案90)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:130具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案91)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:130相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案92)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:131。(实施方案93)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:131具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案94)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:131相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案95)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:132。(实施方案96)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:132具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案97)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:132相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案98)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:133。(实施方案99)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:133具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案100)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:133相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案101)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:134。(实施方案102)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:134具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案103)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:134相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案104)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含SEQ ID NO:135。(实施方案105)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:135具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案106)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:135相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案107)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含SEQ ID NO:201。(实施方案108)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案109)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:201相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案110)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含SEQ IDNO:202。(实施方案111)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案112)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQID NO:202相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案113)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含SEQ ID NO:203。(实施方案114)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQID NO:203具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案115)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:203相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案116)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含SEQ ID NO:204。(实施方案117)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案118)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:204相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案119)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含SEQ ID NO:205。(实施方案120)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案121)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:205相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。(实施方案122)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含SEQ ID NO:206。(实施方案123)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:206具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案124)实施方案1-106中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链可变区包含与SEQ ID NO:206相比具有约1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个氨基酸置换或缺失的序列。
(实施方案125)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A217。(实施方案126)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:101具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案127)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A220。(实施方案128)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:102具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案129)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A223。(实施方案130)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:103具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案131)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A219。(实施方案132)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:104具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案133)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A221。(实施方案134)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:105具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案135)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A200。(实施方案136)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:103具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案137)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A213。(实施方案138)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:106具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案139)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A212。(实施方案140)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:107具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案141)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A107。(实施方案142)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:108具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案143)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A205。(实施方案144)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:109具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案145)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A211。(实施方案146)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:108具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案147)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A199。(实施方案148)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:109具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案149)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A15。(实施方案150)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:108具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:203具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案151)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A30。(实施方案152)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:108具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案153)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A100。(实施方案154)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:107具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案155)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A181。(实施方案156)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:107具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案157)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A129。(实施方案158)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:110具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案159)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A214。(实施方案160)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:111具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案161)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A216。(实施方案162)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:112具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案163)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A122。(实施方案164)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:113具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案165)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A222。(实施方案166)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:114具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案167)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A188。(实施方案168)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:115具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案169)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A203。(实施方案170)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:116具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案171)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A147。(实施方案172)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:117具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案173)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A127。(实施方案174)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:118具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案175)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A126。(实施方案176)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:114具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案177)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A160。(实施方案178)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:102具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案179)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A157。(实施方案180)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:104具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案181)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A159。(实施方案182)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:119具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案183)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A218。(实施方案184)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:119具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案185)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A158。(实施方案186)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:101具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案187)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A125。(实施方案188)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:105具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案189)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A103。(实施方案190)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:120具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案191)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A64。(实施方案192)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:121具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案193)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A67。(实施方案194)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案195)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A138。(实施方案196)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:204具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案197)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A68。(实施方案198)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:123具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案199)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A94。(实施方案200)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:124具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:202具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案201)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A110。(实施方案202)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:125具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案203)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A197。(实施方案204)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:116具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案205)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A112。(实施方案206)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:117具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案207)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A169。(实施方案208)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:126具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案209)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A173。(实施方案210)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:127具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案211)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A179。(实施方案212)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:127具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案213)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A148。(实施方案214)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:121具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案215)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A115。(实施方案216)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案217)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A149。(实施方案218)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案219)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A134。(实施方案220)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:122具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:206具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案221)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A113。(实施方案222)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:124具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案223)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A151。(实施方案224)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:124具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案225)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A96。(实施方案226)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:128具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案227)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A132。(实施方案228)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:128具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:206具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案229)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A196。(实施方案230)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:129具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案231)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A172。(实施方案232)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:130具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案233)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A75。(实施方案234)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:131具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案235)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A174。(实施方案236)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:132具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案237)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A109。(实施方案238)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:133具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案239)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A198。(实施方案240)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:134具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案241)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A170。(实施方案242)实施方案1所述的抗TL1A抗体,其中重链可变区包含与SEQ ID NO:135具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列,且轻链可变区包含与SEQ ID NO:205具有至少约90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案243)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A500。(实施方案244)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含A501。
(实施方案245)实施方案1-244中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含:(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案246)实施方案1-244中的任一个所述的抗TL1A,包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含(a)S228P和L235E或(b)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。(实施方案247)实施方案1-244中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。(实施方案248)实施方案1-247中的任一个所述的抗TL1A,包含重链Fc区,该重链Fc区包含SEQ ID NO:320-362中的任一个。(实施方案249)实施方案1-248中的任一个所述的抗TL1A,包含轻链恒定区,该轻链恒定区包含SEQ ID NO:319。
(实施方案250)实施方案1-249中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案251)实施方案1-250中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约81%、至少约82%、至少约83%或至少约84%单体级分。(实施方案252)实施方案1-251中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约85%单体级分。(实施方案253)实施方案1-252中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约86%、至少约87%、至少约88%或至少约89%单体级分。(实施方案254)实施方案1-253中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约90%单体级分。(实施方案255)实施方案1-254中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约91%、至少约92%、至少约93%或至少约94%单体级分。(实施方案256)实施方案1-255中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约95%单体级分。(实施方案257)实施方案1-256中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%单体级分。
(实施方案258)实施方案1-257中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的至少约2μg/mL表达。(实施方案259)实施方案1-258中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达。(实施方案260)实施方案1-259中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的约5μg/mL至约60μg/mL之间的表达。(实施方案261)实施方案1-260中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达。(实施方案262)实施方案1-261中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的至少约5μg/mL表达。(实施方案263)实施方案1-262中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的至少约10μg/mL表达。(实施方案264)实施方案1-263中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的至少约15μg/mL表达。(实施方案265)实施方案1-264中的任一个所述的抗TL1A,包含通过本文公开的方法测定的至少约20μg/mL表达。
示例性抗TL1恒定区
在一些实施方案中,可将一种或更多种氨基酸修饰引入人或人源化抗体的可结晶片段(Fc)区,从而产生Fc区变体。Fc区可包含免疫球蛋白重链的C末端区,该免疫球蛋白重链包含铰链区、CH2结构域、CH3结构域或其任何组合。如本文所用,Fc区包括天然序列Fc区和变体Fc区。Fc区变体可包含人Fc区序列(例如,人IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 Fc区),该人Fc区序列包含在一个或多个氨基酸位置的氨基酸修饰(例如,置换、添加或缺失)。在一个示例性实施方案中,Fc区包含SEQ ID NO:320-362中的任一个。
在一些实施方案中,与人IgG相比,本公开内容的抗体具有降低的效应子功能。效应子功能是指抗体Fc区与Fc受体或配体相互作用产生的生物事件。非限制性效应子功能包括C1q结合、补体依赖性细胞毒性(CDC)、Fc受体结合、抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)、抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)、细胞因子分泌、抗原提呈细胞对免疫复合物介导的抗原摄取、细胞表面受体(如B细胞受体)的下调和B细胞激活。在一些情况下,抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)是指其中表达Fc受体的非特异性细胞毒性细胞(如自然杀伤细胞、中性粒细胞、巨噬细胞)识别靶细胞上的结合抗体,从而导致靶细胞裂解的细胞介导的反应。在一些情况下,补体依赖性细胞毒性(CDC)是指在补体存在下靶细胞的裂解,其中补体作用途径由C1q与结合靶细胞的抗体的结合启动。
一些Fc区天生缺乏效应子功能,且一些Fc区可能包含降低效应子功能的突变。例如,IgG4具有低ADCC和CDC活性,且IgG2具有低ADCC活性。
本公开内容提供了包含Fc区的抗体,特征在于与包含非变体Fc区的抗体相比,显示出降低至少约30%、至少约40%、至少约50%、至少约60%、至少约70%或更多的ADCC,即具有相同序列同一性但用于减少ADCC的置换(多个)的抗体(例如人IgG1,SEQ ID NO:320)。本公开内容提供了包含Fc区的抗体,特征在于与包含非变体Fc区的抗体相比,显示出降低至少约30%、至少约40%、至少约50%、至少约60%、至少约70%或更多的CDC,即具有相同序列同一性但用于减少CDC的置换(多个)的抗体(例如人IgG1,SEQ ID NO:320)。在某些实施方案中,本公开内容的抗体具有与人IgG1相比降低的效应子功能。效应子功能的测量可如实施例3所述进行。
可能降低ADCC和/或CDC的IgG1中Fc突变的非限制性示例包括一个或多个位置的置换:IgG1中的231、232、234、235、236、237、238、239、264、265、267、269、270、297、299、318、320、322、325、327、328、329、330和331,其中恒定区的编号体系是由Kabat所示的EU索引的编号体系。在某些实施方案中,本公开内容的抗体具有与人IgG1相比降低的效应子功能。
在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297Q置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297D置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含D265A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含S228P置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含L235A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L237A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含E233P置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含C236缺失,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含P238A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含A327Q置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含P329A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含P329G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含L235E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含P331S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含L234F置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含235G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含235Q置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含235R置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含235S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含236F置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含236R置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含237E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含237K置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含237N置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含237R置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238I置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238W置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含238Y置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含248A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254D置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254I置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254N置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254P置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254Q置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254T置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含254V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含255N置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含256H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含256K置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含256R置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含256V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含264S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含265H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含265K置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含265S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含265Y置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含267G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含267H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含267I置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含267K置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含268K置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含269N置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含269Q置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含270A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含270G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含270M置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含270N置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含271T置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含272N置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含279F置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含279K置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含279L置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含292E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含292F置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含292G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含292I置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含293S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含301W置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含304E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含311E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含311G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含311S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含316F置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含327T置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含328V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含329Y置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含330R置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含339E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含339L置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含343I置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含343V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含373A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含373G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含373S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含376E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含376W置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含376Y置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含380D置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含382D置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含382P置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含385P置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含424H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含424M置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含424V置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含434I置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含438G置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含439E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含439H置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含439Q置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含440A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含440D置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含440E置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含440F置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含440M置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含440T Fc区置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含440V置换,根据Kabat编号体系。
在一些实施方案中,抗体包含Fc区,该Fc区选自表3中公开的代表性序列。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含E233P,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区,该IgG4 Fc区包含S228P和L235E。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L235E,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A和L235A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A、L235A和G237A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A、L235A、P329G,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234F、L235E和P331S,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A、L235E和G237A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A、L235E、G237A和P331S,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ),根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含L234A、L235A和P329A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含G236R和L328R,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含G237A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含F241A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含V264A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含D265A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含D265A和N297A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含D265A和N297G,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1Fc区包含D270A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297G,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297D,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含N297Q,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含P329A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含P329G,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含P329R,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含A330L,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含P331A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG1 Fc区,该IgG1 Fc区包含P331S,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG2 Fc区。在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区。在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区,该IgG4 Fc区包含S228P,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区,该IgG4 Fc区包含S228P、F234A和L235A,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG2-IgG4跨亚类(IgG2/G4)Fc区。在一些实施方案中,抗体包含IgG2-IgG3跨亚类Fc区。在一些实施方案中,抗体包含IgG2Fc区,该IgG2 Fc区包含H268Q、V309L、A330S和P331S,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG2 Fc区,该IgG2 Fc区包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S和P331S,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含Fc区,该Fc区包含高甘露糖糖基化。
在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区,该IgG4 Fc区包含S228P置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区,该IgG4 Fc区包含A330S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG4 Fc区,该IgG4 Fc区包含P331S置换,根据Kabat编号体系。
在一些实施方案中,抗体包含IgG2 Fc区,该IgG2 Fc区包含A330S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG2 Fc区,该IgG2 Fc区包含P331S置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG2 Fc区,该IgG2 Fc区包含234A置换,根据Kabat编号体系。在一些实施方案中,抗体包含IgG2 Fc区,该IgG2 Fc区包含237A置换,根据Kabat编号体系。
在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含表9B中的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A包含如表14中所示的Fc区。
表14.示例性Fc突变
Figure BDA0003907474270000921
Figure BDA0003907474270000931
在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:320或与SEQ ID NO:320具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ IDNO:321或与SEQ ID NO:321具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:322或与SEQ ID NO:322具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:323或与SEQ ID NO:323具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:324或与SEQ ID NO:324具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:325或与SEQ ID NO:325具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:326或与SEQ ID NO:326具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:327或与SEQ ID NO:327具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:328或与SEQ ID NO:328具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:329或与SEQID NO:329具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:330或与SEQ ID NO:330具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:331或与SEQ ID NO:331具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQID NO:332或与SEQ ID NO:332具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:333或与SEQ ID NO:333具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:334或与SEQ ID NO:334具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:335或与SEQ ID NO:335具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:336或与SEQ ID NO:336具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:337或与SEQ ID NO:337具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:338或与SEQ ID NO:338具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:339或与SEQ ID NO:339具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:340或与SEQID NO:340具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:341或与SEQ ID NO:341具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:342或与SEQ ID NO:342具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQID NO:343或与SEQ ID NO:343具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:344或与SEQ ID NO:344具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:345或与SEQ ID NO:345具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:346或与SEQ ID NO:346具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:347或与SEQ ID NO:347具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:348或与SEQ ID NO:348具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:349或与SEQ ID NO:349具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:350或与SEQ ID NO:350具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:351或与SEQID NO:351具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:352或与SEQ ID NO:352具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:353或与SEQ ID NO:353具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQID NO:354或与SEQ ID NO:354具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:355或与SEQ ID NO:355具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:356或与SEQ ID NO:356具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:357或与SEQ ID NO:357具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:358或与SEQ ID NO:358具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:359或与SEQ ID NO:359具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:360或与SEQ ID NO:360具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:361或与SEQ ID NO:361具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:362或与SEQID NO:362具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。
在一些实施方案中,本公开内容的抗体是具有一些但非全部效应子功能的变体,这使其成为用于应用的理想候选,其中体内抗体半衰期很重要但某些效应子功能(例如补体和ADCC)不必要或有害。
可以进行体外和/或体内细胞毒性分析,以确认CDC和/或ADCC活性的降低/消耗。例如,可以进行Fc受体(FcR)结合分析,以确保抗体缺乏FcγR结合(因此可能缺乏ADCC活性),但保留FcRn结合能力。效应子功能的测量可如实施例3所述进行。
在一些实施方案中,通过ELISA检测抗体与Fcγ受体和补体C1q的结合。在一些实施方案中,例如,通过评估抗体诱导激活标志物表达的能力,测试抗体在体外激活原代人类免疫细胞的能力。
在一些实施方案中,评估抗TL1A抗体的ADCC活性包括将抗体添加到靶细胞与免疫效应细胞的组合,免疫效应细胞可被抗原-抗体复合物激活,从而导致靶细胞的细胞裂解。细胞裂解可通过从裂解的细胞中释放标签(例如放射性底物、荧光染料或天然细胞内蛋白质)来检测。用于此类分析的有用效应细胞包括外周血单核细胞(PBMC)和自然杀伤(NK)细胞。体外ADCC分析的具体示例在Wisecarver等人,1985 79:277-282;Bruggemann等人,1987,J Exp Med 166:1351-1361;Wilkinson等人,2001,J Immunol Methods 258:183-191;Patel等人,1995J Immunol Methods 184:29-38中描述。替代地或附加地,可以在体内评估感兴趣的抗体的ADCC活性,例如,在动物模型中,如Clynes等人,1998,PNAS USA 95:652-656中公开的动物模型中。
在一些实施方案中,与未修饰的抗体(例如,含有人IgG1的抗体)相比,包含本文中Fc区的抗体表现出降低的ADCC活性。在一些实施方案中,本文的抗体表现出小于未修饰的抗体的ADCC活性到至少1/2或至少1/3或至少1/5或至少1/10或至少1/50或至少1/100的ADCC活性。在一些实施方案中,本文的抗体表现出相对于未修饰的抗体降低至少10%或至少20%或至少30%或至少40%或至少50%或至少60%或至少70%或至少80%或至少90%或至少100%或至少200%或至少300%或至少400%或至少500%的ADCC活性。在某些实施方案中,本文的抗体没有可检测的ADCC活性。在某些实施方案中,ADCC活性的降低和/或消融可归因于本发明对Fc配体和/或受体展示的降低亲和力的抗体。
在一些实施方案中,可以进行补体激活的评估,即CDC分析如Gazzano-Santoro等人,1996,J.Immunol.Methods,202:163所描述的。
在一些实施方案中,包含本文描述的Fc区的抗体表现出相对于未修饰的抗体(例如,人IgG1)对C1q的降低的亲和力。在一些实施方案中,本文的抗体表现出小于未修饰的抗体到至少1/2或至少1/3或至少1/5或至少1/7或至少1/10或至少1/20或至少1/30或至少1/40或至少1/50或至少1/60或至少1/70或至少1/80或至少1/90或至少1/100或至少1/200的对C1q受体的亲和力。在一些实施方案中,本文的抗体表现出小于未修饰的抗体至少90%、至少80%、至少70%、至少60%、至少50%、至少40%、至少30%、至少20%、至少10%或至少5%的对C1q的亲和力。在一些实施方案中,本文的抗体表现出约100nM至约100μM、或约100nM至约10μM、或约100nM至约1μM、或约1nM至约100μM、或约10nM至约100μM、或约1μM至约100μM、或约10μM至约100μM之间的对C1q的亲和力。在某些实施方案中,本文的抗体表现出大于1μM、大于5μM、大于10μM、大于25μM、大于50μM或大于100μM的对C1q的亲和力。
在一些实施方案中,包含本文描述的Fc区的抗体表现出与未修饰的抗体(例如,人IgG1)相比降低的CDC活性。在一些实施方案中,本文的抗体表现出小于未修饰的抗体的CDC活性到至少1/2或至少1/3或至少1/5或至少1/10或至少1/50或至少1/100的CDC活性。在一些实施方案中,本文的抗体表现出相对于未修饰的抗体降低至少10%、或至少20%、或至少30%、或至少40%、或至少50%、或至少60%、或至少70%、或至少80%、或至少90%、或至少100%、或至少200%、或至少300%、或至少400%、或至少500%的CDC活性。在某些实施方案中,本文的抗体表现出没有可检测的CDC活性。在一些实施方案中,CDC活性的降低和/或消融可归因于本发明对Fc配体和/或受体展示的降低亲和力的抗体。
因此,本文进一步提供并描述了抗TL1A抗体,其包含减少由抗TL1A抗体引起的细胞毒性反应(例如,ADCC或CDC)的变体(例如,含有突变)Fc区。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:401或与SEQ ID NO:401具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:402或与SEQ ID NO:402具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:403或与SEQ ID NO:403具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:404或与SEQ ID NO:404具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:405或与SEQID NO:405具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:406或与SEQ ID NO:406具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:407或与SEQ ID NO:407具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQID NO:408或与SEQ ID NO:408具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:409或与SEQ ID NO:409具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:410或与SEQ ID NO:410具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:411或与SEQ ID NO:411具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:412或与SEQ ID NO:412具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含Fc区,该Fc区包含SEQ ID NO:413或与SEQ ID NO:413具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。
进一步举例而言,在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:501或与SEQ ID NO:501具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:502或与SEQ ID NO:502具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:503或与SEQ ID NO:503具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:504或与SEQ ID NO:504具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:505或与SEQ ID NO:505具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:506或与SEQ ID NO:506具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:507或与SEQ ID NO:507具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:508或与SEQID NO:508具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:509或与SEQ ID NO:509具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:510或与SEQ ID NO:510具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQID NO:511或与SEQ ID NO:511具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:512或与SEQ ID NO:512具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,本文描述的抗TL1A抗体包含重链,该重链包含SEQ ID NO:513或与SEQ ID NO:513具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,重链与轻链配对,该轻链包含SEQ ID NO:514或与SEQ ID NO:514具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。在某些实施方案中,重链与SEQ ID NO:514的轻链可变区或与SEQ ID NO:514的轻链可变区具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列配对。
在一些实施方案中,本文描述的抗TL1A包含轻链恒定区,该轻链恒定区包含SEQID NO:319或与SEQ ID NO:319具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。
其他非限制性示例性抗TL1A抗体
在一个方面中,本文提供了抗TL1A抗体的第一实施方案,该抗TL1A抗体包含含HCDR1、HCDR2和HCDR3的重链,和含LCDR1、LCDR2和LCDR3的轻链。非限制性附加实施方案包括:(实施方案2)实施方案1所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:1的HCDR1。(实施方案3)实施方案1或实施方案2所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:2的HCDR2。(实施方案4)实施方案1或实施方案2所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:3的HCDR2。(实施方案5)实施方案1或实施方案2所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:4的HCDR2。(实施方案6)实施方案1或实施方案2所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:5的HCDR2。(实施方案7)实施方案1-6中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:6的HCDR3。(实施方案8)实施方案1-6中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:7的HCDR3。(实施方案9)实施方案1-6中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:8的HCDR3。(实施方案10)实施方案1-6中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:9的HCDR3。(实施方案11)实施方案1-10中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:10的LCDR1。(实施方案12)实施方案1-11中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:11的LCDR2。(实施方案13)实施方案1-12中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:12的LCDR3。(实施方案14)实施方案1-12中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:13的LCDR3。(实施方案15)实施方案1-12中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含SEQ ID NO:14或15的LCDR3。
(实施方案16)实施方案1-15中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGHV1-46*02的重链骨架。(实施方案17)实施方案1-15中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGHV1-46*02的变体的重链骨架,该变体包含约1至约20个之间的来自SEQ ID NO:316的氨基酸置换。(实施方案18)实施方案1-15中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGHV1-46*02的变体的重链骨架,该变体包含约1至约9个之间的来自SEQ ID NO:316的氨基酸置换。(实施方案19)实施方案1-15中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGHV1-46*02的变体的重链骨架,该变体在骨架中包含约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个来自SEQID NO:316的氨基酸置换。(实施方案20)实施方案17-19中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的Q1E。(实施方案21)实施方案17-20中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的R45K。(实施方案22)实施方案17-21中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的A47R。(实施方案23)实施方案17-22中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的M55I。(实施方案24)实施方案17-23中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的V78A。(实施方案25)实施方案17-24中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的M80I。(实施方案26)实施方案17-25中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的R82T。(实施方案27)实施方案17-26中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的V89A。(实施方案28)实施方案17-27中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中重链骨架置换包含通过Kabat编号确定的M91L。
(实施方案29)实施方案1-15中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301。(实施方案30)实施方案29所述的抗TL1A抗体,其中X1为Q。(实施方案31)实施方案29所述的抗TL1A抗体,其中X1=E。(实施方案32)实施方案29-31中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=R。(实施方案33)实施方案29-31中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=K。(实施方案34)实施方案29-33中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=A。(实施方案35)实施方案29-33中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=R。(实施方案36)实施方案29-35中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=M。(实施方案37)实施方案29-35中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=I。(实施方案38)实施方案29-37中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=V。(实施方案39)实施方案29-37中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=A。(实施方案40)实施方案29-39中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=M。(实施方案41)实施方案29-39中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=I。(实施方案42)实施方案29-41中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=R。(实施方案43)实施方案29-41中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=T。(实施方案44)实施方案29-43中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=V。(实施方案45)实施方案29-43中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=A。(实施方案46)实施方案29-45中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=M。(实施方案47)实施方案29-45中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=L。
(实施方案48)实施方案1-15中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302。(实施方案49)实施方案48所述的抗TL1A抗体,其中X1为Q。(实施方案50)实施方案48所述的抗TL1A抗体,其中X1=E。(实施方案51)实施方案48-50中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=R。(实施方案52)实施方案48-50中的任一个所述的抗TL1A,其中X2=K。(实施方案53)实施方案48-52中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=A。(实施方案54)实施方案48-52中的任一个所述的抗TL1A,其中X3=R。(实施方案55)实施方案48-54中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=M。(实施方案56)实施方案48-54中的任一个所述的抗TL1A,其中X4=I。(实施方案57)实施方案48-56中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=V。(实施方案58)实施方案48-56中的任一个所述的抗TL1A,其中X5=A。(实施方案59)实施方案48-58中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=M。(实施方案60)实施方案48-58中的任一个所述的抗TL1A,其中X6=I。(实施方案61)实施方案48-60中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=R。(实施方案62)实施方案48-60中的任一个所述的抗TL1A,其中X7=T。(实施方案63)实施方案48-62中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=V。(实施方案64)实施方案48-62中的任一个所述的抗TL1A,其中X8=A。(实施方案65)实施方案48-64中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=M。(实施方案66)实施方案48-64中的任一个所述的抗TL1A,其中X9=L。
(实施方案67)实施方案1-66中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含轻链骨架,该轻链骨架包含IGKV3-20*01。(实施方案68)实施方案1-66中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGKV3-20*01的变体的轻链骨架,该变体包含约1至约20个之间的来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。(实施方案69)实施方案1-66中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGKV3-20*01的变体的轻链骨架,该变体包含约1个来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。(实施方案70)实施方案1-66中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGKV3-20*01的变体的轻链骨架,该变体包含约2个来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。(实施方案71)实施方案1-66中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含含IGKV3-20*01的变体的轻链骨架,该变体在骨架中包含约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个来自SEQ ID NO:317的氨基酸置换。(实施方案72)实施方案69-71中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链骨架置换包含通过Kabat编号确定的Q1E。(实施方案73)实施方案69-72中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中轻链骨架置换包含通过Kabat编号确定的R45K。
(实施方案74)实施方案1-66中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含轻链,该轻链包含含SEQ ID NO:303的轻链骨架。(实施方案75)实施方案74所述的抗TL1A抗体,其中X10为L。(实施方案76)实施方案74所述的抗TL1A抗体,其中X10为P。(实施方案77)实施方案74-76中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中X11为L。(实施方案78)实施方案74-76中的任一个所述的抗TL1A抗体,其中X11为W。
(实施方案79)实施方案1-78中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案80)实施方案1-78中的任一个所述的抗TL1A,包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含(a)S228P和L235E或(b)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。(实施方案81)实施方案1-78中的任一个所述的抗TL1A,包含人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2)的IgG2。(实施方案82)实施方案1-81中的任一个所述的抗TL1A,包含重链Fc区,该重链Fc区包含SEQ ID NO:320-362中的任一个。(实施方案83)实施方案1-82中的任一个所述的抗TL1A,包含含SEQ ID NO:319的轻链恒定区。
(实施方案84)实施方案1-83中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案85)实施方案1-84中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约81%、至少约82%、至少约83%或至少约84%单体级分.(实施方案86)实施方案1-85中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约85%单体级分。(实施方案87)实施方案1-86中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约86%、至少约87%、至少约88%或至少约89%单体级分.(实施方案88)实施方案1-87中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约90%单体级分。(实施方案89)实施方案1-88中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约91%、至少约92%、至少约93%或至少约94%单体级分。(实施方案90)实施方案1-89中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约95%单体级分。(实施方案91)实施方案1-90中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文描述的尺寸排阻色谱法测定的至少约96%、至少约97%、至少约98%或至少约99%单体级分。
(实施方案92)实施方案1-91中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的至少约2μg/mL表达。(实施方案93)实施方案1-92中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达。(实施方案94)实施方案1-93中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的约5μg/mL至约60μg/mL之间的表达。(实施方案95)实施方案1-94中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达。(实施方案96)实施方案1-95中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的至少约5μg/mL表达。(实施方案97)实施方案1-96中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的至少约10μg/mL表达。(实施方案98)实施方案1-97中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的至少约15μg/mL表达。(实施方案99)实施方案1-98中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的至少约20μg/mL表达。(实施方案100)实施方案1-91中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的约2μg/mL至约50μg/mL之间、约2μg/mL至约40μg/mL之间、约2μg/mL至约30μg/mL之间的表达、约2μg/mL至约20μg/mL之间、约5μg/mL至约50μg/mL之间、约5μg/mL至约40μg/mL之间、约5μg/mL至约30μg/mL之间、约10μg/mL至约50μg/mL之间、约10μg/mL至约40μg/mL之间或约10μg/mL至约30μg/mL之间。(实施方案101)实施方案1-91中的任一个所述的抗TL1A抗体,包含通过本文公开的方法测定的约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30μg/mL表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A。如本文所用,抗体A包含表10中的抗体A的CDR。在一些情况下,抗体A包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(实施方案X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体A包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(实施方案EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体A包含重链可变区,该重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体A包含轻链可变区,该轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体A包含人IgG1 Fc区,该人IgG1Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A包含通过实施例2中所述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体A以如实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F(例如,ThermoFisher Scientific#R79007)细胞中表达。在一些情况下,抗体A以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle293-F细胞表达。在一些情况下,抗体A以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体A包含小于约30mPa-s的粘度。在一些情况下,抗体A包含约4mPa-s至约30mPa-,或约4、5、6、7、8、9、10.11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30mPa-s的粘度。在一些情况下,抗体A被配制在浓度为约10mg/ml至约170mg/ml和粘度小于约30mPa-s的溶液中。在一些情况下,制剂的pH为约5至约7.5。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体B。如本文所用,抗体B包含表10中的抗体B的CDR。在一些情况下,抗体B包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体B包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体B包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体B包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体B包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体B以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体B以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体B以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体C。如本文所用,抗体C包含表10中的抗体C的CDR。在一些情况下,抗体C包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,和X9=M或L。在一些情况下,抗体C包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体C包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体C包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体C包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体C以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体C以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体C以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体D。如本文所用,抗体D包含表10中的抗体D的CDR。在一些情况下,抗体D包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体D包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体D包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体D包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体D包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体D以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体D以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体D以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体E。如本文所用,抗体E包含表10中的抗体E的CDR。在一些情况下,抗体E包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体E包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体E包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体E包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体E包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体E以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体E以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体E以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体F。如本文所用,抗体F包含表10中的抗体F的CDR。在一些情况下,抗体F包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体F包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体F包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体F包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体F包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体F以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体F以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体F以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体G。如本文所用,抗体G包含表10中的抗体G的CDR。在一些情况下,抗体G包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体G包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体G包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体G包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体G包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体G以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体G以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体G以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体H。如本文所用,抗体H包含表10中的抗体H的CDR。在一些情况下,抗体H包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体H包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体H包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体H包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体H包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体H以实施例2中描述的方法测定的表达水平约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体H以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体H以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体I。如本文所用,抗体I包含表10中的抗体I的CDR。在一些情况下,抗体I包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:301(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体I包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体I包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体I包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体I包含人IgG1 Fc区,该人IgG1Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ IDNO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体I包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体I以实施例2中描述的方法测定的表达水平约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体I以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体I以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体A2。如本文所用,抗体A2包含表10中的抗体A2的CDR。在一些情况下,抗体A2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体A2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体A2包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体A2包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体A2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体A2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体A2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体A2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体A2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体B2。如本文所用,抗体B2包含表10中的抗体B2的CDR。在一些情况下,抗体B2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,且X9=M或L。在一些情况下,抗体B2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P且X11=L或W。在一些情况下,抗体B2包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变区,其中修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体B2包含含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变区,其中修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体B2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体B2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体B2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体B2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体B2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体C2。如本文所用,抗体C2包含表10中抗体C2的CDR。在一些情况下,抗体C2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,以及X9=M或L。在一些情况下,抗体C2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P以及X11=L或W。在一些情况下,抗体C2包含重链可变区,所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或经修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中经修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体C2包含轻链可变区,所述轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或经修饰的人IGKV3-20骨架,其中经修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,所述恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体C2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G、或297D、(b)279F、279K、或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R、或235S、(e)237A、237E、237K、237N、或237R、(f)234A、234V、或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R、或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y、或265A、(t)267G、267H、267I、或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M、或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G、或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G、或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G、或373S、(kk)376E、376W、或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M、或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H、或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T、或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A、和G237A、(xx)L234A、L235A、和P329G、(yy)L234F、L235E、和P331S、(zz)L234A、L235E、和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A、和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S、和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A、和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321具有至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体C2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻方法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体C2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体C2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle293-F细胞表达。在一些情况下,抗体C2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体D2。如本文所用,抗体D2包含表10中抗体D2的CDR。在一些情况下,抗体D2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,以及X9=M或L。在一些情况下,抗体D2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P以及X11=L或W。在一些情况下,抗体D2包含重链可变区,所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或经修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中经修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体D2包含轻链可变区,所述轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或经修饰的人IGKV3-20骨架,其中经修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,所述恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体D2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G、或297D、(b)279F、279K、或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R、或235S、(e)237A、237E、237K、237N、或237R、(f)234A、234V、或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R、或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y、或265A、(t)267G、267H、267I、或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M、或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G、或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G、或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G、或373S、(kk)376E、376W、或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M、或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H、或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T、或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A、和G237A、(xx)L234A、L235A、和P329G、(yy)L234F、L235E、和P331S、(zz)L234A、L235E、和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A、和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S、和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A、和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体D2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻方法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体D2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体D2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle293-F细胞表达。在一些情况下,抗体D2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体E2。如本文所用,抗体E2包含表10中抗体E2的CDR。在一些情况下,抗体E2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,以及X9=M或L。在一些情况下,抗体E2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P以及X11=L或W。在一些情况下,抗体E2包含重链可变区,所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或经修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中经修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体E2包含轻链可变区,所述轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或经修饰的人IGKV3-20骨架,其中经修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,所述恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体E2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G、或297D、(b)279F、279K、或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R、或235S、(e)237A、237E、237K、237N、或237R、(f)234A、234V、或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R、或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y、或265A、(t)267G、267H、267I、或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M、或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G、或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G、或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G、或373S、(kk)376E、376W、或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M、或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H、或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T、或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A、和G237A、(xx)L234A、L235A、和P329G、(yy)L234F、L235E、和P331S、(zz)L234A、L235E、和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A、和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S、和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A、和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体E2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻方法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体E2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体E2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle293-F细胞表达。在一些情况下,抗体E2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体F2。如本文所用,抗体F2包含表10中抗体F2的CDR。在一些情况下,抗体F2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,以及X9=M或L。在一些情况下,抗体F2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P以及X11=L或W。在一些情况下,抗体F2包含重链可变区,所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或经修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中经修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体F2包含轻链可变区,所述轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或经修饰的人IGKV3-20骨架,其中经修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,所述恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体F2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G、或297D、(b)279F、279K、或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R、或235S、(e)237A、237E、237K、237N、或237R、(f)234A、234V、或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R、或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y、或265A、(t)267G、267H、267I、或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M、或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G、或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G、或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G、或373S、(kk)376E、376W、或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M、或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H、或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T、或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A、和G237A、(xx)L234A、L235A、和P329G、(yy)L234F、L235E、和P331S、(zz)L234A、L235E、和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A、和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S、和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A、和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S、或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体F2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻方法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体F2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体F2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体F2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体G2。如本文所用,抗体G2包含表10中抗体G2的CDR。在一些情况下,抗体G2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,以及X9=M或L。在一些情况下,抗体G2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P以及X11=L或W。在一些情况下,抗体G2包含重链可变区,所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或经修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中经修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体G2包含轻链可变区,所述轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或经修饰的人IGKV3-20骨架,其中经修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,所述恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体G2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G、或297D、(b)279F、279K、或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R、或235S、(e)237A、237E、237K、237N、或237R、(f)234A、234V、或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R、或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y、或265A、(t)267G、267H、267I、或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M、或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G、或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G、或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G、或373S、(kk)376E、376W、或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M、或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H、或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T、或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A、和G237A、(xx)L234A、L235A、和P329G、(yy)L234F、L235E、和P331S、(zz)L234A、L235E、和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A、和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S、和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A、和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体G2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻方法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体G2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体G2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle293-F细胞表达。在一些情况下,抗体G2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
在一些实施方案中,抗TL1A抗体包含抗体H2。如本文所用,抗体H2包含表10中抗体H2的CDR。在一些情况下,抗体H2包含重链骨架,该重链骨架包含SEQ ID NO:302(X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QX3PGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS),其中X1=Q或E,X2=R或K,X3=A或R,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,以及X9=M或L。在一些情况下,抗体H2包含轻链骨架,该轻链骨架包含SEQ ID NO:303(EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK),其中X10=L或P以及X11=L或W。在一些情况下,抗体H2包含重链可变区,所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或经修饰的人IGHV1-46*02骨架,其中经修饰的人IGHV1-46*02骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体H2包含轻链可变区,所述轻链可变区包含人IGKV3-20骨架或经修饰的人IGKV3-20骨架,其中经修饰的人IGKV3-20骨架在骨架中具有小于或等于约1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸置换。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,所述恒定区包含与IgG1相比降低的ADCC和/或CDC。例如,抗体H2包含人IgG1 Fc区,该人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G、或297D、(b)279F、279K、或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R、或235S、(e)237A、237E、237K、237N、或237R、(f)234A、234V、或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y、或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R、或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y、或265A、(t)267G、267H、267I、或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M、或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G、或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G、或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G、或373S、(kk)376E、376W、或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M、或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H、或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T、或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A、和G237A、(xx)L234A、L235A、和P329G、(yy)L234F、L235E、和P331S、(zz)L234A、L235E、和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A、和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S、和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A、和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:320至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:321至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:322至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:323至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:324至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:325至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:326至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:327至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:328至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:329至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:330至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:331至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:332至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:333至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:334至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:335至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:336至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:337至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:338至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:339至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:340至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:341至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:342至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:343至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:344至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:345至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:346至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:347至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:348至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:349至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:350至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:351至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:352至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQID NO:353至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:354至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:355至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:356至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:357至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:358至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:359至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:360至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:361至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含恒定区,该恒定区包含与SEQ ID NO:362至少约85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性。在一些情况下,抗体H2包含通过实施例2中描述的尺寸排阻方法测量的至少约80%、81%、82%、83%、84%、85%、85%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。在一些情况下,抗体H2以实施例2中描述的方法测定的约或至少约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59或60μg/mL的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。在一些情况下,抗体H2以约2μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle293-F细胞表达。在一些情况下,抗体H2以约10μg/mL至约60μg/mL之间的表达水平从FreeStyle 293-F细胞表达。
本文所述的TL1A抗体结合人TL1A的特定区或表位,本文证明这可用于抑制T淋巴细胞分泌干扰素γ。各种实施方案提供了与参考抗体一样结合TL1A蛋白或其部分的相同区的抗TL1A抗体,例如本文所述的抗TL1A抗体。在一些实施方案中,参考抗体包括抗体A、B、C、D、E、F、G、H、A2、B2、C2、D2、E2、F2、G2或H2,或其组合。在一些实施方案中,本文提供的是抗TL1A抗体,它与参考抗体一样特异性结合TL1A的相同区,所述抗TL1A抗体包含重链序列和轻链,所述重链序列与SEQ ID NO:104具有至少约90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性并且所述轻链包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,本文提供的是抗TL1A抗体,它与参考抗体一样特异性结合TL1A的相同区,所述抗TL1A抗体包含重链序列和轻链,所述重链序列与SEQ ID NO:107具有至少约90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性并且所述轻链包含与SEQ ID NO:201具有至少约90%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
提供了用于确定抗TL1A抗体(即测试抗体)是否与本文所述的抗体结合TL1A蛋白或其部分的相同区的非限制性方法。示例性实施方案包括竞争测定。例如,所述方法包括确定测试抗体是否可以竞争参考抗体与TL1A蛋白或其部分之间的结合,或者确定参考抗体是否可以竞争测试抗体与TL1A蛋白或其部分之间的结合。示例性方法包括使用表面等离子体共振来评价抗TL1A抗体是否可以竞争TL1A与另一种抗TL1A抗体之间的结合。在一些情况下,该竞争测定中利用表面等离子体共振。实施例中描述了非限制性方法。
在某些实施方案中,本文公开的是与本文描述的抗体竞争结合TL1A的抗体。在某些实施方案中,本文公开的是结合离散表位的抗体,该离散表位与本文所述抗体所结合的TL1A表位重叠。在某些实施方案中,本文公开的是这样的抗体,其结合TL1A的相同表位,与TL1A的表位重叠一个或多个氨基酸残基,或与以下抗体或其片段竞争结合TL1A的表位:该抗体或其片段包含含SEQ ID NO:104氨基酸序列的重链可变区;和含有SEQ ID NO:201氨基酸序列的轻链可变区。在某些实施方案中,本文公开的是这样的抗体,其结合TL1A的相同表位,与TL1A的表位重叠一个或多个氨基酸残基,或与以下抗体或其片段竞争结合TL1A的表位:该抗体或其片段包含含SEQ ID NO:107氨基酸序列的重链可变区;以及轻链可变区,其包含SEQ ID NO:201的氨基酸。
另外的抗体实施方案
(实施方案1)本文进一步提供了与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段的实施方案,所述与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段包含含修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变骨架区,和含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变骨架区;其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的1个至约14个氨基酸修饰,并且其中所述氨基酸修饰包含修饰的人IGHV1-46*02骨架中的A47R。(实施方案2)如实施方案1所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸修饰。(实施方案3)如实施方案1或实施方案2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置1处的修饰。(实施方案4)如实施方案3所述的抗体或抗原结合片段,其中位置1处的氨基酸包括A、R、N、D、C、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案5)如实施方案3所述的抗体或抗原结合片段,其中位置1处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案6)如实施方案3所述的抗体或抗原结合片段,其中位置1处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案7)如实施方案3所述的抗体或抗原结合片段,其中位置1处的氨基酸包括E。(实施方案8)如实施方案1-7中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置45处的修饰。(实施方案9)如实施方案8所述的抗体或抗原结合片段,其中位置45处的氨基酸包括A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案10)如实施方案8所述的抗体或抗原结合片段,其中位置45处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案11)如实施方案8所述的抗体或抗原结合片段,其中位置45处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案12)如实施方案8所述的抗体或抗原结合片段,其中位置45处的氨基酸包括K。(实施方案13)如实施方案1-12中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置55处的修饰。(实施方案14)如实施方案13所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案15)如实施方案13所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案16)如实施方案13所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案17)如实施方案13所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括I。(实施方案18)如实施方案1-17中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置78处的修饰。(实施方案19)如实施方案18所述的抗体或抗原结合片段,其中位置78处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y。(实施方案20)如实施方案18所述的抗体或抗原结合片段,其中位置78处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案21)如实施方案18所述的抗体或抗原结合片段,其中位置78处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案22)如实施方案18所述的抗体或抗原结合片段,其中位置78处的氨基酸包括A。(实施方案23)如实施方案1-22中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置80处的修饰。(实施方案24)如实施方案23所述的抗体或抗原结合片段,其中位置80处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案25)如实施方案23所述的抗体或抗原结合片段,其中位置80处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。
(实施方案26)如实施方案23所述的抗体或抗原结合片段,其中位置80处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案27)如实施方案23所述的抗体或抗原结合片段,其中位置80处的氨基酸包括I。(实施方案28)如实施方案1-27中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置82处的修饰。(实施方案29)如实施方案28所述的抗体或抗原结合片段,其中位置82处的氨基酸包括A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案30)如实施方案28所述的抗体或抗原结合片段,其中位置82处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案31)如实施方案28所述的抗体或抗原结合片段,其中位置82处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案32)如实施方案28所述的抗体或抗原结合片段,其中位置82处的氨基酸包括T。(实施方案33)如实施方案1-32中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置89处的修饰。(实施方案34)如实施方案33所述的抗体或抗原结合片段,其中位置89处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y。(实施方案35)如实施方案33所述的抗体或抗原结合片段,其中位置89处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案36)如实施方案33所述的抗体或抗原结合片段,其中位置89处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案37)如实施方案33所述的抗体或抗原结合片段,其中位置89处的氨基酸包括A。(实施方案38)如实施方案1-37中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述重链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置91处的修饰。(实施方案39)如实施方案38所述的抗体或抗原结合片段,其中位置91处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案40)如实施方案38所述的抗体或抗原结合片段,其中位置91处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案41)如实施方案38所述的抗体或抗原结合片段,其中位置91处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案42)如实施方案38所述的抗体或抗原结合片段,其中位置91处的氨基酸包括L。(实施方案43)如实施方案1或实施方案2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含以下中的一个或多个:所述重链可变区中按照Kabat编号的Q1E、R45K、M55I、V78A、M80I、R82T、V89A、M91L。(实施方案44)如实施方案43所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含Q1E。(实施方案45)如实施方案43或实施方案44所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含R45K。(实施方案46)如实施方案43-45中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含M55I。(实施方案47)如实施方案43-46中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含V78A。(实施方案48)如实施方案43-47中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含M80I。(实施方案49)如实施方案43-48中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含R82T。(实施方案50)如实施方案43-49中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含V89A。(实施方案51)如实施方案43-50中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含M91L。(实施方案52)如实施方案1-51中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述轻链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置54处的修饰。(实施方案53)如实施方案52所述的抗体或抗原结合片段,其中位置54处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案54)如实施方案52所述的抗体或抗原结合片段,其中位置54处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案55)如实施方案52所述的抗体或抗原结合片段,其中位置54处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案56)如实施方案52所述的抗体或抗原结合片段,其中位置54处的氨基酸包括P。(实施方案57)如实施方案1-56中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括在所述轻链可变区中按照Kabat编号的氨基酸位置55处的修饰。(实施方案58)如实施方案57所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案59)如实施方案57所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案60)如实施方案57所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案61)如实施方案57所述的抗体或抗原结合片段,其中位置55处的氨基酸包括W。(实施方案62)如实施方案1-51中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含在所述轻链可变区中按照Kabat编号的L54P和/或L55W。(实施方案63)如实施方案62所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含L54P。(实施方案64)如实施方案62或实施方案63所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含L55W。
(实施方案65)如实施方案1-64中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:1所示的重链CDR1。(实施方案66)如实施方案1-65中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:2所示的重链CDR2。(实施方案67)如实施方案1-65中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:3所示的重链CDR2。(实施方案68)如实施方案1-65中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:4所示的重链CDR2。(实施方案69)如实施方案1-65中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:5所示的重链CDR2。(实施方案70)如实施方案1-69中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:6所示的重链CDR3。(实施方案71)如实施方案1-69中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:7所示的重链CDR3。(实施方案72)如实施方案1-69中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:8所示的重链CDR3。(实施方案73)如实施方案1-69中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:9所示的重链CDR3。(实施方案74)如实施方案1-73中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQID NO:10所示的轻链CDR1。(实施方案75)如实施方案1-74中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:11所示的轻链CDR2。(实施方案76)如实施方案1-75中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:12所示的轻链CDR3。(实施方案77)如实施方案1-75中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:13所示的轻链CDR3。(实施方案78)如实施方案1-75中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:14或15所示的轻链CDR3。(实施方案79)如实施方案1-78中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:304所示的重链FR1。(实施方案80)如实施方案1-79中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:305所示的重链FR2。(实施方案81)如实施方案1-79中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:313所示的重链FR2。(实施方案82)如实施方案1-81中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:306所示的重链FR3。(实施方案83)如实施方案1-81中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:307所示的重链FR3。(实施方案84)如实施方案1-81中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:314所示的重链FR3。(实施方案85)如实施方案1-81中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:315所示的重链FR3。(实施方案86)如实施方案1-85中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:308所示的重链FR4。(实施方案87)如实施方案1-86中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:309所示的轻链FR1。(实施方案88)如实施方案1-87中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:310所示的轻链FR2。(实施方案89)如实施方案1-88中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:311所示的轻链FR3。(实施方案90)如实施方案1-89中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含如SEQ ID NO:312所示的轻链FR4。(实施方案91)如实施方案1-90中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG1Fc区,所述人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案92)如实施方案1-90中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG4 Fc区。(实施方案93)如实施方案1-90中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含含与SEQID NO:320-362中任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列的Fc区。(实施方案94)如实施方案1-93中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案95)如实施方案94所述的抗体或抗原结合片段,其包含至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%单体级分。(实施方案96)如实施方案94或实施方案95所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法包括将纯化的抗体或抗原结合片段注射到尺寸排阻柱上,其中所述抗体或抗原结合片段通过蛋白质A纯化。(实施方案97)如实施方案96所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述纯化。(实施方案98)如实施方案96或实施方案97所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在实施例2所述的条件下表达。(实施方案99)如实施方案96-98中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有4.6mm的内径。(实施方案100)如实施方案96-99中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有150mm的长度。(实施方案101)如实施方案96-100中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有
Figure BDA0003907474270002201
的孔径。(实施方案102)如实施方案96-101中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有1.7微米的粒度。(实施方案103)如实施方案96-102中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱是ACQUITY UPLCBEH200 SEC柱。(实施方案104)如实施方案96-103中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段以15μL的总体积注射。(实施方案105)如实施方案96-104中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中以约0.1μg/μL至约1.0μg/μL的浓度注射所述抗体或抗原结合片段。(实施方案106)如实施方案96-105中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在Shimadzu UPLC仪器上进行。(实施方案107)如实施方案96-106中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法以0.2mL/min的流速进行。(实施方案108)如实施方案96-107中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在30℃的柱箱温度下进行。(实施方案109)如实施方案96-108中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中单体的百分比使用Shimadzu软件计算。(实施方案110)如实施方案96-109中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法如实施例2中描述进行。(实施方案111)如实施方案1-110中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体。(实施方案112)如实施方案1-110中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达约20ug/ml至70ug/mL总抗体。(实施方案113)如实施方案111或实施方案112所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在FreeStyle 293-F细胞中表达。(实施方案114)如实施方案111-113中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述表达。(实施方案115)如实施方案111-114中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中使用酶联免疫吸附测定(ELISA)定量所述抗体或抗原结合片段表达水平。(实施方案116)如实施方案115所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA包括用结合人或人源化抗体的捕获抗体包被底物表面,将所述抗体或抗原结合片段施加到所述底物,并将与人或人源化抗体结合的第二抗体施加到所述底物。(实施方案117)如实施方案116所述的抗体或抗原结合片段,其中所述捕获抗体包含抗κ抗体。(实施方案118)如实施方案116或实施方案117所述的抗体或抗原结合片段,其中所述第二抗体包含抗Fc抗体。(实施方案119)如实施方案115-118中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA如实施例2中描述进行。
(实施方案120)一种结合TL1A的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含:a)包含SEQ ID NO:1301的重链可变区,b)X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QRPGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYCAR[HCDR3]WGQGTTVTVSS,和c)包含SEQ ID NO:303的轻链可变区,d)EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK,e)其中X1、X2、X4、X5、X6、X7、X8、X9、X10和X11中的每一个独立地选自A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案121)如实施方案120所述的抗体或抗原结合片段,其中X1包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案122)如实施方案120所述的抗体或抗原结合片段,其中X1包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案123)如实施方案120-122中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案124)如实施方案120-122中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案125)如实施方案120-124中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案126)如实施方案120-124中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案127)如实施方案120-126中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案128)如实施方案120-126中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案129)如实施方案120-128中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案130)如实施方案120-128中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案131)如实施方案120-130中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案132)如实施方案120-130中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案133)如实施方案120-132中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案134)如实施方案120-132中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案135)如实施方案120-134中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案136)如实施方案120-134中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案137)如实施方案120-136中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案138)如实施方案120-136中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案139)如实施方案120-138中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案140)如实施方案120-138中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案141)如实施方案120所述的抗体或抗原结合片段,其中X1=Q或E,X2=R或K,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,X9=M或L,X10=L或P,以及X11=L或W。(实施方案142)如实施方案120-141中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X1=Q。(实施方案143)如实施方案120-141中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X1=E。(实施方案144)如实施方案120-143中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2=R。(实施方案145)如实施方案120-143中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2=K。(实施方案146)如实施方案120-145中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4=M。(实施方案147)如实施方案120-145中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4=I。(实施方案148)如实施方案120-147中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5=V。(实施方案149)如实施方案120-147中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5=A。(实施方案150)如实施方案120-149中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6=M。(实施方案151)如实施方案120-149中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6=I。(实施方案152)如实施方案120-151中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7=R。(实施方案153)如实施方案120-151中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7=T。(实施方案154)如实施方案120-153中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8=V。(实施方案155)如实施方案120-153中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8=A。(实施方案156)如实施方案120-155中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9=M。(实施方案157)如实施方案120-155中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9=L。(实施方案158)如实施方案120-157中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10=L。(实施方案159)如实施方案120-157中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10=P。(实施方案160)如实施方案120-159中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11=L。(实施方案161)如实施方案120-159中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11=W。(实施方案162)一种结合TL1A的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含:a)包含SEQID NO:1302的重链可变区,b)X1VQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAS[HCDR1]WVX2QRPGQGLEWX4G[HCDR2]RX5TX6TX7DTSTSTX8YX9ELSSLRSEDTAVYYC[HCDR3]WGQGTTVTVSS,和c)包含SEQ IDNO:303的轻链可变区,d)EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC[LCDR1]WYQQKPGQAPRX10X11IY[LCDR2]GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC[LCDR3]FGGGTKLEIK,e)其中X1、X2、X4、X5、X6、X7、X8、X9、X10和X11中的每一个独立地选自A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。(实施方案163)如实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中X1包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案164)如实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中X1包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案165)如实施方案162-164中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案166)如实施方案162-164中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案167)如实施方案162-166中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案168)如实施方案162-166中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案169)如实施方案162-168中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案170)如实施方案162-168中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案171)如实施方案162-170中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案172)如实施方案162-170中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案173)如实施方案162-172中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案174)如实施方案162-172中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案175)如实施方案162-174中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案176)如实施方案162-174中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案177)如实施方案162-176中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案178)如实施方案162-176中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案179)如实施方案162-178中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案180)如实施方案162-178中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案181)如实施方案162-180中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11包含疏水氨基酸、亲水氨基酸或两亲性氨基酸。(实施方案182)如实施方案162-180中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11包含脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、酸性氨基酸、碱性氨基酸、羟基氨基酸、含硫氨基酸或酰胺氨基酸。(实施方案183)如实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中X1=Q或E,X2=R或K,X4=M或I,X5=V或A,X6=M或I,X7=R或T,X8=V或A,X9=M或L,X10=L或P,以及X11=L或W。(实施方案184)如实施方案162-183中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X1=Q。(实施方案185)如实施方案162-183中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X1=E。(实施方案186)如实施方案162-185中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2=R。(实施方案187)如实施方案162-185中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X2=K。(实施方案188)如实施方案162-187中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4=M。(实施方案189)如实施方案162-187中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X4=I。(实施方案190)如实施方案162-189中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5=V。(实施方案191)如实施方案162-189中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X5=A。(实施方案192)如实施方案162-191中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6=M。(实施方案193)如实施方案162-191中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X6=I。(实施方案194)如实施方案162-193中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7=R。(实施方案195)如实施方案162-193中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X7=T。(实施方案196)如实施方案162-195中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8=V。(实施方案197)如实施方案162-195中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X8=A。(实施方案198)如实施方案162-197中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9=M。(实施方案199)如实施方案162-197中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X9=L。(实施方案200)如实施方案162-199中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10=L。(实施方案201)如实施方案162-199中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X10=P。(实施方案202)如实施方案162-201中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11=L。(实施方案203)如实施方案162-201中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中X11=W。(实施方案204)如实施方案120-203中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR1包含SEQ ID NO:1。(实施方案205)如实施方案126-204中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:2。(实施方案206)如实施方案126-204中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:3。(实施方案207)如实施方案126-204中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:4。(实施方案208)如实施方案126-204中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQID NO:5。(实施方案209)如实施方案126-208中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:6。(实施方案210)如实施方案126-208中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:7。(实施方案211)如实施方案126-208中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:8。(实施方案212)如实施方案126-208中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:9。(实施方案213)如实施方案126-212中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR1包含SEQ ID NO:10。(实施方案214)如实施方案126-213中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR2包含SEQ ID NO:11。(实施方案215)如实施方案126-214中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR3包含SEQ ID NO:12。(实施方案216)如实施方案126-214中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR3包含SEQ ID NO:13。(实施方案217)如实施方案126-214中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR3包含SEQ ID NO:14或15。(实施方案218)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:101。(实施方案219)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:102。(实施方案220)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:103。(实施方案221)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:104。(实施方案222)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQID NO:105。(实施方案223)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:106。(实施方案224)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:107。(实施方案225)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:108。(实施方案226)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:109。(实施方案227)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:110。(实施方案228)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:111。(实施方案229)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:112。(实施方案230)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:113。(实施方案231)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:114。(实施方案232)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:115。(实施方案233)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:116。(实施方案234)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:117。(实施方案235)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQID NO:118。(实施方案236)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:119。(实施方案237)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:120。(实施方案238)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:121。(实施方案239)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:122。(实施方案240)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:123。(实施方案241)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:124。(实施方案242)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:125。(实施方案243)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:126。(实施方案244)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:127。(实施方案245)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:128。(实施方案246)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:129。(实施方案247)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:130。(实施方案248)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQID NO:131。(实施方案249)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:132。(实施方案250)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:133。(实施方案251)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:134。(实施方案252)如实施方案120或实施方案162所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含SEQ ID NO:135。(实施方案253)如实施方案120、162或218-252中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:201。(实施方案254)如实施方案120、162或218-252中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:202。(实施方案255)如实施方案120、162或218-252中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:203。(实施方案256)如实施方案120、162或218-252中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:204。(实施方案257)如实施方案120、162或218-252中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:205。(实施方案258)如实施方案120、162或218-252中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含SEQ ID NO:206。
(实施方案259)如实施方案120-258中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG1 Fc区,所述人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案260)如实施方案120-258中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含含SEQ ID NO:319的轻链。(实施方案261)如实施方案120-258中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含含与SEQ ID NO:320-362中任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列的Fc区。(实施方案262)如实施方案120-261中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案263)如实施方案262所述的抗体或抗原结合片段,其包含至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%单体级分。
(实施方案264)如实施方案262或实施方案263所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法包括将纯化的抗体或抗原结合片段注射到尺寸排阻柱上,其中所述抗体或抗原结合片段通过蛋白质A纯化。(实施方案265)如实施方案264所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述纯化。(实施方案266)如实施方案264或实施方案265所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在实施例2所述的条件下表达。(实施方案267)如实施方案264-266中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有4.6mm的内径。(实施方案268)如实施方案264-267中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有150mm的长度。(实施方案269)如实施方案264-268中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有
Figure BDA0003907474270002321
的孔径。(实施方案270)如实施方案264-269中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有1.7微米的粒度。(实施方案271)如实施方案264-270中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱是ACQUITY UPLC BEH200SEC柱。(实施方案272)如实施方案264-271中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段以15μL的总体积注射。(实施方案273)如实施方案264-272中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中以约0.1μg/μL至约1.0μg/μL的浓度注射所述抗体或抗原结合片段。(实施方案274)如实施方案264-273中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在Shimadzu UPLC仪器上进行。(实施方案275)如实施方案264-274中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法以0.2mL/min的流速进行。(实施方案276)如实施方案264-275中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在30℃的柱箱温度下进行。(实施方案277)如实施方案264-276中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中单体的百分比使用Shimadzu软件计算。(实施方案278)如实施方案262-277中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法如实施例2中描述进行。(实施方案279)如实施方案120-278中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体。(实施方案280)如实施方案120-278中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达约20ug/ml至70ug/mL之间的总抗体。(实施方案281)如实施方案279或实施方案280所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在FreeStyle 293-F细胞中表达。(实施方案282)如实施方案279-281中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述表达。(实施方案283)如实施方案279-282中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中使用酶联免疫吸附测定(ELISA)定量所述抗体或抗原结合片段表达水平。(实施方案284)如实施方案283所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA包括用结合人或人源化抗体的捕获抗体包被底物表面,将所述抗体或抗原结合片段施加到所述底物,并将与人或人源化抗体结合的第二抗体施加到所述底物。(实施方案285)如实施方案284所述的抗体或抗原结合片段,其中所述捕获抗体包含抗κ抗体。(实施方案286)如实施方案284或实施方案285所述的抗体或抗原结合片段,其中所述第二抗体包含抗Fc抗体。(实施方案287)如实施方案284-286中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA如实施例2中描述进行。
(实施方案288)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变结构域和轻链可变结构域,所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约97%同一性的氨基酸序列,并且所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约97%同一性的氨基酸序列。
(实施方案289)如实施方案288所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约98%同一性的氨基酸序列。(实施方案290)如实施方案289所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约99%同一性的氨基酸序列。(实施方案291)如实施方案290所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:104。(实施方案292)如实施方案288-291中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约98%同一性的氨基酸序列。(实施方案293)如实施方案288-291中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约99%同一性的氨基酸序列。(实施方案294)如实施方案288-291中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:201。(实施方案295)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变结构域和轻链可变结构域,所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:107具有至少约99%同一性的氨基酸序列,并且所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约99%同一性的氨基酸序列。(实施方案296)如实施方案295所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:107。(实施方案297)如实施方案295或实施方案296所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:201。
(实施方案298)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变结构域和轻链可变结构域,所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:101-135中的任一个具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列,并且所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201-206中的任一个具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的氨基酸序列。(实施方案299)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:101具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案300)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:102具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案301)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:103具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案302)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案303)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:105具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案304)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:106具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案305)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:107具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案306)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:108具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案307)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:109具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案308)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:110具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案309)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:111具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案310)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQID NO:112具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案311)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:113具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案312)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:114具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案313)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:115具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案314)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:116具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案315)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:117具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案316)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:118具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案317)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:119具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案318)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:120具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案319)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:121具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案320)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:122具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案321)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:123具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案322)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:124具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案323)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQID NO:125具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案324)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:126具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案325)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:127具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案326)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:128具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案327)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:129具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案328)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:130具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案329)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:131具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案330)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:132具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案331)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:133具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案332)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:134具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案333)如实施方案298所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:135具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案334)如实施方案298-333中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案335)如实施方案298-333中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:202具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案336)如实施方案298-333中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:203具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案337)如实施方案298-333中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:204具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案338)如实施方案298-333中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:205具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案339)如实施方案298-333中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:206具有至少约95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
(实施方案340)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:101的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案341)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:102的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案342)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:103的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案343)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:104的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案344)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:105的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案345)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:103的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案346)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:106的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案347)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:107的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案348)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案349)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:109的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案350)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案351)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:109的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案352)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,包含SEQ ID NO:203的轻链可变结构域。(实施方案353)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:108的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案354)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:107的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案355)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:107的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案356)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:110的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案357)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:111的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案358)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:112的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案359)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:113的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案360)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:114的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案361)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:115的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案362)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:116的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案363)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:117的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案364)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:118的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案365)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:114的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案366)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:102的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案367)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:104的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案368)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:119的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案369)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:119的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案370)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:101的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案371)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:105的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案372)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:120的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案373)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:121的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案374)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案375)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:204的轻链可变结构域。(实施方案376)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:123的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案377)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:124的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:202的轻链可变结构域。(实施方案378)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:125的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案379)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:116的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案380)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:117的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案381)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:126的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案382)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:127的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案383)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:127的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案384)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:121的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案385)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案386)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案387)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:122的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:206的轻链可变结构域。(实施方案388)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:124的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案389)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:124的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案390)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:128的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案391)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQIDNO:128的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:206的轻链可变结构域。(实施方案392)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:129的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案393)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:130的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案394)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:131的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案395)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:132的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案396)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:133的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案397)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ IDNO:134的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案398)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:135的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:205的轻链可变结构域。(实施方案399)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:132的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案400)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:126的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。(实施方案401)一种与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含含SEQ ID NO:130的重链可变结构域,和含SEQ ID NO:201的轻链可变结构域。
(实施方案402)如实施方案288-401中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG1 Fc区,所述人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案403)如实施方案288-401中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG4 Fc区。(实施方案404)如实施方案288-401中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含含与SEQ ID NO:320-362中任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列的Fc区。(实施方案405)如实施方案288-404中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案406)如实施方案405所述的抗体或抗原结合片段,其包含至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%单体级分。(实施方案407)如实施方案405或实施方案406所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法包括将纯化的抗体或抗原结合片段注射到尺寸排阻柱上,其中所述抗体或抗原结合片段通过蛋白质A纯化。(实施方案408)如实施方案407所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述纯化。(实施方案409)如实施方案47或实施方案408所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在实施例2所述的条件下表达。(实施方案410)如实施方案407-409中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有4.6mm的内径。(实施方案411)如实施方案407-410中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有150mm的长度。(实施方案412)如实施方案407-411中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有
Figure BDA0003907474270002461
的孔径。(实施方案413)如实施方案407-412中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有1.7微米的粒度。(实施方案414)如实施方案407-413中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱是ACQUITY UPLC BEH200 SEC柱。(实施方案415)如实施方案407-414中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段以15μL的总体积注射。(实施方案416)如实施方案407-415中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中以约0.1μg/μL至约1.0μg/μL的浓度注射所述抗体或抗原结合片段。(实施方案417)如实施方案407-416中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在Shimadzu UPLC仪器上进行。(实施方案418)如实施方案407-417中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法以0.2mL/min的流速进行。(实施方案419)如实施方案407-418中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在30℃的柱箱温度下进行。(实施方案420)如实施方案407-419中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中单体的百分比使用Shimadzu软件计算。(实施方案421)如实施方案405-420中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法如实施例2中描述进行。(实施方案422)如实施方案288-421中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体。(实施方案423)如实施方案288-421中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达约20ug/ml至70ug/mL之间的总抗体。(实施方案424)如实施方案422或实施方案423所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在FreeStyle 293-F细胞中表达。(实施方案425)如实施方案422-424中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述表达。(实施方案426)如实施方案422-425中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中使用酶联免疫吸附测定(ELISA)定量所述抗体或抗原结合片段表达水平。(实施方案427)如实施方案426所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA包括用结合人或人源化抗体的捕获抗体包被底物表面,将所述抗体或抗原结合片段施加到所述底物,并将与人或人源化抗体结合的第二抗体施加到所述底物。(实施方案428)如实施方案427所述的抗体或抗原结合片段,其中所述捕获抗体包含抗κ抗体。(实施方案429)如实施方案427或实施方案428所述的抗体或抗原结合片段,其中所述第二抗体包含抗Fc抗体。(实施方案430)如实施方案426-429中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA如实施例2中描述进行。(实施方案431)一种结合TL1A的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变区、轻链可变区和/或包含与人IgG1相比降低的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)功能和/或与人IgG1相比降低的补体依赖性细胞毒性(CDC)的可结晶片段(Fc)区,所述重链可变区包含:(a)HCDR1,其包含由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;(b)HCDR2,其包含由SEQ ID NO:2-5中任一个所示的氨基酸序列;和(c)HCDR3,其包含由SEQ ID NO:6-9中任一个所示的氨基酸序列;所述轻链可变区包含:(d)LCDR1,其包含由SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列;(e)LCDR2,其包含由SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列;(f)LCDR3,其包含由SEQ ID NO:12-15中任一个所示的氨基酸序列。(实施方案432)如实施方案431所述的抗体或抗原结合片段,其中所述人IgG1包含SEQ ID NO:320。(实施方案433)如实施方案431或实施方案432所述的抗体或抗原结合片段,其中包含降低的ADCC的Fc区的ADCC功能与人IgG1相比降低至少约50%。(实施方案434)如实施方案431-433中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中包含降低的ADCC的Fc区的CDC功能与人IgG1相比降低至少约50%。(实施方案435)如实施方案431-434中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述Fc区包含人IgG1,所述人IgG1包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案436)如实施方案431-434中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含按照Kabat编号的(a)S228P、(b)S228P和L235E、(c)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区。(实施方案437)如实施方案431-434中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包括人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S的IgG2(IgG2m4);或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S的IgG2(IgG2σ)。(实施方案438)如实施方案431-435中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述Fc区包含具有选自以下的置换的人IgG1:329A、329G、329Y、331S、236F、236R、238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、238Y、248A、254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、254V、264S、265H、265K、265S、265Y、265A、267G、267H、267I、267K、434I、438G、439E、439H、439Q、440A、440D、440E、440F、440M、440T和440V,按照Kabat编号。(实施方案439)如实施方案431-437中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含与SEQ ID NO:320-362中任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案440)如实施方案431-439中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR1包含SEQ IDNO:1。(实施方案441)如实施方案431-440中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:2。(实施方案442)如实施方案431-440中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:3。(实施方案443)如实施方案431-440中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:4。(实施方案444)如实施方案431-440中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR2包含SEQ ID NO:5。(实施方案445)如实施方案431-444中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:6。(实施方案446)如实施方案431-444中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:7。(实施方案447)如实施方案431-444中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:8。(实施方案448)如实施方案431-444中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中HCDR3包含SEQ ID NO:9。(实施方案449)如实施方案431-448中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR1包含SEQ ID NO:10。(实施方案450)如实施方案431-449中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR2包含SEQ ID NO:11。(实施方案451)如实施方案431-450中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR3包含SEQ ID NO:12。(实施方案452)如实施方案431-450中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR3包含SEQ ID NO:13。(实施方案453)如实施方案431-450中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中LCDR3包含SEQID NO:14或15。(实施方案454)如实施方案431-453中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案455)如实施方案454所述的抗体或抗原结合片段,其包含至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%单体级分。(实施方案456)如实施方案454或实施方案455所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法包括将纯化的抗体或抗原结合片段注射到尺寸排阻柱上,其中所述抗体或抗原结合片段通过蛋白质A纯化。(实施方案457)如实施方案456所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述纯化。(实施方案458)如实施方案456或实施方案457所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在实施例2所述的条件下表达。(实施方案459)如实施方案456-458中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有4.6mm的内径。(实施方案460)如实施方案456-459中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有150mm的长度。(实施方案461)如实施方案456-460中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有
Figure BDA0003907474270002511
的孔径。(实施方案462)如实施方案456-461中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有1.7微米的粒度。(实施方案463)如实施方案456-462中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱是ACQUITYUPLC BEH200 SEC柱。(实施方案464)如实施方案456-463中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段以15μL的总体积注射。(实施方案465)如实施方案456-464中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中以约0.1μg/μL至约1.0μg/μL的浓度注射所述抗体或抗原结合片段。(实施方案466)如实施方案456-465中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在Shimadzu UPLC仪器上进行。(实施方案467)如实施方案456-466中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法以0.2mL/min的流速进行。(实施方案468)如实施方案456-467中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在30℃的柱箱温度下进行。(实施方案469)如实施方案456-468中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中单体的百分比使用Shimadzu软件计算。(实施方案470)如实施方案454-469中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法如实施例2中描述进行。(实施方案471)如实施方案431-470中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体。(实施方案472)如实施方案431-470中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达约20ug/ml至70ug/mL之间的总抗体。(实施方案473)如实施方案471或实施方案472所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在FreeStyle293-F细胞中表达。(实施方案474)如实施方案471-473中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述表达。(实施方案475)如实施方案471-474中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中使用酶联免疫吸附测定(ELISA)定量所述抗体或抗原结合片段表达水平。(实施方案476)如实施方案475所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA包括用结合人或人源化抗体的捕获抗体包被底物表面,将所述抗体或抗原结合片段施加到所述底物,并将与人或人源化抗体结合的第二抗体施加到所述底物。(实施方案477)如实施方案476所述的抗体或抗原结合片段,其中所述捕获抗体包含抗κ抗体。(实施方案478)如实施方案476或实施方案477所述的抗体或抗原结合片段,其中所述第二抗体包含抗Fc抗体。(实施方案479)如实施方案475-478中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA如实施例2中描述进行。(实施方案480)一种结合TL1A的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变区和轻链可变区,所述重链可变区包含:(a)HCDR1,其包含由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;(b)HCDR2,其包含由SEQ ID NO:2-5中任一个所示的氨基酸序列;和(c)HCDR3,其包含由SEQ ID NO:6-9中任一个所示的氨基酸序列;所述轻链可变区包含:(d)LCDR1,其包含由SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列;(e)LCDR2,其包含由SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列;和(f)LCDR3,其包含由SEQ ID NO:12-15中任一个所示的氨基酸序列,其中所述重链可变区包含47R。(实施方案481)如实施方案480所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架。(实施方案482)如实施方案480或实施方案481所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变骨架区包含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架。(实施方案483)如实施方案480-482中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含以下氨基酸中的一个或多个:1E、45K、55I、78A、80I、82T、89A、91L,按照Kabat编号。(实施方案484)如实施方案483所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含1E。(实施方案485)如实施方案483或实施方案484所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含45K。(实施方案486)如实施方案483-485中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含55I。(实施方案487)如实施方案483-486中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含78A。(实施方案488)如实施方案483-487中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含80I。(实施方案489)如实施方案483-488中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含82T。(实施方案490)如实施方案483-489中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含89A。(实施方案491)如实施方案483-490中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含91L。(实施方案492)如实施方案480-491中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含以下氨基酸中的一个或多个:54P和55W,按照Kabat编号。(实施方案493)如实施方案492所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含54P。(实施方案494)如实施方案492或实施方案493所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链可变区包含55W。(实施方案495)如实施方案480-494中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR2包含SEQ IDNO:2。(实施方案496)如实施方案480-494中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR2包含SEQ ID NO:3。(实施方案497)如实施方案480-494中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR2包含SEQ ID NO:4。(实施方案498)如实施方案480-494中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR2包含SEQ ID NO:5。(实施方案499)如实施方案480-498中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:6。(实施方案500)如实施方案480-498中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR3包含SEQID NO:7。(实施方案501)如实施方案480-498中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:8。(实施方案502)如实施方案480-498中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述HCDR3包含SEQ ID NO:9。(实施方案503)如实施方案480-502中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述LCDR3包含SEQ ID NO:12。(实施方案504)如实施方案480-502中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述LCDR3包含SEQ ID NO:13。(实施方案505)如实施方案480-502中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述LCDR3包含SEQ ID NO:14或15。
(实施方案506)如实施方案480-505中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG1 Fc区,所述人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。(实施方案507)如实施方案480-505中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含(i)人IgG4 Fc区或(ii)包含按照Kabat编号的(a)S228P、(b)S228P和L235E、(c)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区。(实施方案508)如实施方案480-505中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包括人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S的IgG2(IgG2m4);或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S的IgG2(IgG2σ)。(实施方案509)如实施方案480-506中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含人IgG1,人IgG1包含选自以下的置换:329A、329G、329Y、331S、236F、236R、238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、238Y、248A、254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、254V、264S、265H、265K、265S、265Y、265A、267G、267H、267I、267K、434I、438G、439E、439H、439Q、440A、440D、440E、440F、440M、440T和440V,按照Kabat编号。(实施方案510)如实施方案480-505中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含与SEQ IDNO:320-362中任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。(实施方案511)如实施方案480-510中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。(实施方案512)如实施方案511所述的抗体或抗原结合片段,其包含至少约85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%单体级分。(实施方案513)如实施方案511或实施方案512所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法包括将纯化的抗体或抗原结合片段注射到尺寸排阻柱上,其中所述抗体或抗原结合片段通过蛋白质A纯化。(实施方案514)如实施方案513所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述纯化。(实施方案515)如实施方案513或实施方案514所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在实施例2所述的条件下表达。(实施方案516)如实施方案513-514中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有4.6mm的内径。(实施方案517)如实施方案513-514中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有150mm的长度。(实施方案518)如实施方案513-515中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有
Figure BDA0003907474270002561
的孔径。(实施方案519)如实施方案513-516中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱具有1.7微米的粒度。(实施方案520)如实施方案513-517中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱柱是ACQUITY UPLC BEH200 SEC柱。(实施方案521)如实施方案513-520中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段以15μL的总体积注射。(实施方案522)如实施方案513-521中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中以约0.1μg/μL至约1.0μg/μL的浓度注射所述抗体或抗原结合片段。(实施方案523)如实施方案513-522中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在Shimadzu UPLC仪器上进行。(实施方案524)如实施方案513-523中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法以0.2mL/min的流速进行。(实施方案525)如实施方案513-524中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法在30℃的柱箱温度下进行。(实施方案526)如实施方案513-525中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中单体的百分比使用Shimadzu软件计算。(实施方案527)如实施方案511-526中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述尺寸排阻色谱法如实施例2中描述进行。(实施方案528)如实施方案480-527中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体。(实施方案529)如实施方案480-527中任一个所述的抗体或抗原结合片段,表达约20ug/ml至70ug/mL总抗体。(实施方案530)如实施方案528或实施方案529所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段在FreeStyle 293-F细胞中表达。(实施方案531)如实施方案528-530中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段如实施例2中描述表达。(实施方案532)如实施方案528-531中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中使用酶联免疫吸附测定(ELISA)定量所述抗体或抗原结合片段表达水平。(实施方案533)如实施方案532所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA包括用结合人或人源化抗体的捕获抗体包被底物表面,将所述抗体或抗原结合片段施加到所述底物,并将与人或人源化抗体结合的第二抗体施加到所述底物。(实施方案534)如实施方案533所述的抗体或抗原结合片段,其中所述捕获抗体包含抗κ抗体。(实施方案535)如实施方案533或实施方案534所述的抗体或抗原结合片段,其中所述第二抗体包含抗Fc抗体。(实施方案536)如实施方案532-535中任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述ELISA如实施例2中描述进行。(实施方案537)一种在有需要的对象中治疗炎性肠病(IBD)的方法,所述方法包括向所述对象施用如实施方案1-536中任一个所述的抗体或抗原结合片段。(实施方案538)如实施方案537所述的方法,其中所述IBD包括克罗恩病。(实施方案539)如实施方案537的方法,其中所述IBD包括溃疡性结肠炎。
还提供了与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变结构域和轻链可变结构域,所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少96%同一性的氨基酸序列并且所述轻链可变结构域包含与SEQ IDNO:201具有至少97%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQID NO:104具有至少97%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含与SEQ ID NO:104具有至少99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,重链可变结构域包含SEQ ID NO:104。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少98%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201具有至少约99%同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中,轻链可变结构域包含SEQ ID NO:201。
进一步提供了与肿瘤坏死因子样蛋白1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变结构域和轻链可变结构域,所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:101-135中任一个具有至少约99%同一性的氨基酸序列并且所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:201-206中任一个具有至少约99%同一性的氨基酸序列。表7和表8列出了抗TL1A抗体的示例性可变区氨基酸序列。
还提供了如本文所述的抗体或抗原结合片段,其进一步包含人IgG1 Fc区,所述人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)(a)–(uu)的任何组合,按照Kabat编号。在一些实施方案中,抗体包含人IgG4 Fc区。在一些实施方案中,抗体Fc区包含与SEQ ID NO:320-362中任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。在一些实施方案中,抗体包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。在一些实施方案中,抗体以至少约20ug/ml总抗体、任选约20ug/ml和70ug/mL总抗体的量表达。
抗体特性
在各个实施方案中,所述抗TL1A抗体是TL1A受体的拮抗剂,例如但不限于DR3和TR6/DcR3。在某些实施方案中,该抗体抑制所结合的TL1A受体的一种或多种活性的至少约10%、至少约20%、至少约30%、至少约50%、至少约75%、至少约90%或约100%。在某些实施方案中,通过人血中的干扰素γ释放所测量的,该抗体抑制TL1A活化。在某些实施方案中,该抗体以约1纳摩尔至约30皮摩尔之间的IC50抑制人血中干扰素γ的释放。在某些实施方案中,该抗体以约500皮摩尔至约30皮摩尔之间的IC50抑制人血中干扰素γ的释放。在某些实施方案中,该抗体以约200皮摩尔至约30皮摩尔之间的IC50抑制人血中干扰素γ的释放。在某些实施方案中,抗体以小于或等于约200皮摩尔的IC50抑制人血中的干扰素γ释放。在某些实施方案中,抗体以小于或等于约100皮摩尔的IC50抑制人血中的干扰素γ释放。
在各种实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体对人TL1A的结合亲和力小于约1E-7、1E-8、1E-9或1E-10Kd。在一些情况下,结合亲和力是约1E-9至约1E-10Kd。在一些实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体对鼠TL1A和/或大鼠TL1A的结合亲和力小于约1E-7、1E-8、1E-9、1E-10或1E-11Kd。用于确定结合亲和力的方法在本文中举例说明,包括在实施例2中。
在各种实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体在如实施例2或本文其他地方所描述的表达和纯化后包含至少约80%单体级分。在各种实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体在如实施例2或本文其他地方所描述的表达和纯化后包含至少约85%单体级分。在各种实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体在如实施例2或本文其他地方所描述的表达和纯化后包含至少约90%单体级分。在各种实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体在如实施例2或本文其他地方所描述的表达和纯化后包含至少约91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%单体级分。
在各种实施方案中,通过本文公开的方法确定,本文提供的抗TL1A抗体具有至少约2μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有约2μg/mL至约60μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有约5μg/mL至约60μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有约10μg/mL至约60μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有至少约5μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有至少约10μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有至少约15μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有至少约20μg/mL表达。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体表达约2μg/mL至约50μg/mL之间、约2μg/mL至约40μg/mL之间、约2μg/mL至约30μg/mL之间的表达、约2μg/mL至约20μg/mL之间、约5μg/mL至约50μg/mL之间、约5μg/mL至约40μg/mL之间、约5μg/mL至约30μg/mL之间、约10μg/mL至约50μg/mL之间、约10μg/mL至约40μg/mL之间或约10μg/mL至约30μg/mL之间。在一些实施方案中,通过本文公开的方法确定,抗TL1A抗体具有约2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30μg/mL表达。本文公开的方法包括实施例2中描述的那些。
在多个实施方案中,本文提供的抗TL1A抗体是人源化的并且在每个重链和轻链可变区的骨架区中具有少于约20%的非人序列。例如,人源化抗体在重链和轻链可变区各自的骨架区中包含少于约20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%或1%的非人序列。作为另一个实例,人源化抗体在重链和轻链可变区各自的骨架区中包含约或少于约15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个非人序列。人源化重链可变结构域可包含IGHV1-46*02骨架,其不具有非人突变或具有少于约10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个非人突变。人源化轻链可变结构域可包含IGKV3-20骨架,其不具有非人突变或具有少于约10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个非人突变。
测定
用于鉴定在哺乳动物细胞中良好表达并保持TL1A结合活性同时使抗体聚集倾向最小化的抗体变体的示例性筛选范例包括五步过程。如示例中详述的那样执行该筛选。简而言之,(1)使用小规模(3mL,6孔培养板)转染,在293细胞中克隆变体并瞬时表达为完整Ig,(2)在转染后96-120小时使用抗体定量ELISA评估培养上清液中抗体的表达水平,(3)通过ELISA评估上清液抗体变体与人TL1A的结合,(4)使用蛋白质A以一步纯化抗体和(5)通过分析型SEC分析材料以评估单体/聚集体含量。这种方法能够鉴定表达良好、保持与TL1A结合并显示出高单体含量的变体。
本文进一步提供了基于单体级分百分比分析抗体溶解度的方法。例如,如实施例2中所述。
本文进一步提供了用于量化抗体表达的测定。例如,如实施例2中所述。
本文进一步提供了用于量化抗体的免疫原性的测定。
可以通过本领域已知的任何方法来测定本文所述抗体的特异性结合。可以使用的免疫测定包括但不限于使用诸如BIAcore分析、FACS分析、免疫荧光、免疫细胞化学、Western印迹法、放射免疫测定、ELISA、“夹心”免疫测定、免疫沉淀测定、沉淀反应、凝胶扩散沉淀反应、免疫扩散测定、凝集测定、补体固定测定、免疫放射测定、荧光免疫测定和蛋白质A免疫测定等技术的竞争和非竞争测定系统。这类测定在例如Ausubel等人编,1994,Current Protocols in Molecular Biology,Vol.1,John Wiley&Sons,Inc.,New York中提供。
产生抗体的方法
在各个实施方案中,使用本领域已知的方法制备单克隆抗体,例如但不限于杂交瘤方法,其中对宿主动物进行免疫以引发淋巴细胞产生与免疫抗原特异性结合的抗体(Kohler和Milstein(1975)Nature256:495)。杂交瘤产生特异性针对所选抗原的单克隆抗体。当在体外或体内增殖时,通过本领域已知的技术从培养基或腹水中纯化单克隆抗体。
在一些实施方案中,使用重组DNA方法制备单克隆抗体。从成熟B细胞或杂交瘤细胞中分离出编码单克隆抗体的多核苷酸。然后将分离的编码重链和轻链的多核苷酸克隆到合适的表达载体中,所述载体在被转染到宿主细胞(例如,大肠杆菌细胞、猿猴COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞)中时生成单克隆抗体。可以使用重组DNA技术以多种不同方式进一步修饰编码单克隆抗体的多核苷酸,以生成备选抗体。
在各个实施方案中,可以生成嵌合抗体,即其中不同部分来源于不同动物物种的分子,例如具有衍生自鼠单克隆抗体的可变区和人免疫球蛋白恒定区的那些抗体(例如人源化抗体)。
在一些实施方案中,所述抗TL1A单克隆抗体是人源化抗体,以便在施用于人类对象时降低抗原性和HAMA(人抗小鼠抗体)应答。可以使用本领域已知的多种技术来产生人源化抗体。例如,通过以下步骤使抗体人源化:(1)确定起始抗体轻链和重链可变域的核苷酸和预测的氨基酸序列;(2)设计人源化抗体,例如,决定在人源化过程中使用哪个抗体骨架区;(3)实际的人源化方法/技术;和(4)人源化抗体的转染和表达。在各个实施方案中,可以进一步优化人源化抗体,以降低潜在的免疫原性,同时保持功能活性,以用于在人体内的治疗。
也可以在含有人免疫球蛋白基因座的转基因小鼠中制备人源化抗体,该基因座能够在免疫后在不产生内源性免疫球蛋白的情况下产生人抗体的全部组库(repertoire)。人源化抗体还可以通过遗传工程方法获得,该方法能够在大型动物体内产生亲和力成熟的人样多克隆抗体。
可以通过首先设计包含嵌入人源骨架序列中的非人源,例如啮齿类动物来源的CDR的可变区氨基酸序列来创建完全人源化的抗体。非人CDR提供所需的特异性。因此,在一些情况下,这些残基基本上未改变地包含在重塑的可变区的设计中。因此,在一些情况下,应将修饰限制在最低限度,并密切关注抗体特异性和亲和力的变化。另一方面,理论上骨架残基可以来源于任何人可变区。应当选择人骨架序列,其同样适合于创建重塑的可变区并保持抗体亲和力,以便创建显示出可接受的或甚至改善的亲和力的重塑抗体。人骨架可以是种系起源的,或者可以衍生自非种系(例如突变的或亲和力成熟的)序列。本领域技术人员公知的遗传工程技术,例如但不限于人抗体文库的噬菌体展示、转基因小鼠、人-人杂交瘤、杂合杂交瘤、B细胞无限增殖化和克隆、单细胞RT-PCR或HuRAb技术,可用来生成具有包含人骨架和非人CDR的杂合DNA序列的人源化抗体。
在某些实施方案中,所述抗TL1A抗体是人抗体。可以使用本领域已知的多种技术直接制备人抗体。可以生成在体外免疫或从免疫个体中分离的、产生针对靶抗原的抗体的无限增殖化人B淋巴细胞。
嵌合、人源化和人抗体可以通过重组表达来产生。重组多核苷酸构建体通常包含与抗体链的编码序列可操作地连接的表达控制序列,包括天然关联的或异源的启动子区。在某些实施方案中,可能希望生成这些人源化抗体的氨基酸序列变体,特别是在这些改善抗体的结合亲和力或其他生物学性质的情况下。
在某些实施方案中,抗体片段用来治疗和/或改善IBD。产生抗体片段的各种技术是已知的。通常,这些片段是通过完整抗体的蛋白水解消化而衍生的(例如,Morimoto等人,1993,Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117;Brennan等人,1985,Science,229:81)。Fab、Fv和scFv抗体片段都可以在大肠杆菌或其他宿主细胞中表达以及从中分泌,从而允许产生大量这些片段。产生抗体片段的其他技术对熟练技术人员来说将是显而易见的。
根据本公开内容,可以改变技术以适应于产生TL1A特异性的单链抗体。另外,可以改变方法以适应于Fab表达文库的构建,以允许快速有效地鉴定对TL1A具有所需特异性的单克隆Fab片段或其衍生物、片段、类似物或同源物。抗体片段可以通过本领域的技术产生,包括但不限于:(a)通过胃蛋白酶消化抗体分子产生的F(ab’)2片段;(b)通过还原F(ab’)2片段的二硫键生成的Fab片段,(c)通过用木瓜蛋白酶和还原剂处理抗体分子生成的Fab片段,和(d)Fv片段。
本文还提供了包含任何类型的可变区的修饰抗体,该可变区提供该抗体与TL1A的缔合。本领域技术人员将会理解,修饰抗体可包含这样的抗体(例如,全长抗体或其免疫应答性片段),其中一个或多个恒定区结构域的至少一部分已经缺失或以其他方式改变,以提供所需的生物化学特性,例如减少TL1A。在某些实施方案中,重链和轻链中的可变区均被改变,方法是通过至少部分置换一个或多个CDR,并且如果必要,通过部分骨架区置换和序列改变。在一些实施方案中,置换的CDR可以衍生自相同类别、亚类的抗体,衍生自不同类别的抗体,例如衍生自来自不同物种的抗体,和/或其组合。在一些实施方案中,修饰抗体的恒定区将包含人恒定区。与本公开内容相容的恒定区的修饰包括在一个或多个结构域中一个或多个氨基酸的添加、缺失或置换。
在各个实施方案中,如本文所述的抗体或其抗原结合片段的表达可以在原核或真核细胞中发生。合适的宿主包括细菌或真核宿主,包括体内或原位的酵母、昆虫、真菌、鸟类和哺乳动物细胞,或哺乳动物、昆虫、鸟类或酵母来源的宿主细胞。哺乳动物细胞或组织可以是人、灵长类动物、仓鼠、兔、啮齿类动物、牛、猪、绵羊、马、山羊、狗或猫来源的,但是可以使用其他任何哺乳动物细胞。在其他实施方案中,本文所述的抗体或其抗原片段可以被转染到宿主中。
在一些实施方案中,将表达载体转染到接受细胞系中,以产生本文所述的嵌合、人源化或复合人抗体。在各个实施方案中,哺乳动物细胞可用作产生抗体蛋白质的宿主,其可包括但不限于成纤维细胞来源的细胞,如Vero(ATCC CRL 81)或CHO-K1(ATCC CRL 61)细胞、HeLa细胞和L细胞。可用于表达多肽的示例性真核细胞包括但不限于COS细胞,包括COS7细胞;293细胞,包括293-6E细胞;CHO细胞,包括CHO-S和DG44细胞;PER.C6TM细胞(Crucell);和NSO细胞。在一些实施方案中,特定的真核宿主细胞基于其对重链和/或轻链进行所需翻译后修饰的能力来选择。
在本领域中已经开发了许多能够分泌完整异源蛋白质的合适的宿主细胞系,包括但不限于CHO细胞系、各种COS细胞系、HeLa细胞、L细胞和多发性骨髓瘤细胞系。
根据细胞宿主的类型,可以通过多种合适的手段中的任一种,包括但不限于本领域普通技术人员已知的转化、转染、脂质转染、缀合、电穿孔、直接显微注射和微粒轰击,将携带本文所述的嵌合、人源化或复合人抗体构建体、抗体或其抗原结合片段的表达载体引入合适的宿主细胞中。用于这些细胞的表达载体可包含表达控制序列,如复制起点、启动子、增强子和必需的加工信息位点,如核糖体结合位点、RNA剪接位点、聚腺苷酸化位点和转录终止子序列。
在各个实施方案中,酵母也可以用作宿主,以供产生本文所述的抗体分子或肽。在各个其他实施方案中,细菌菌株也可以用作宿主,以供产生本文所述的抗体分子或肽。细菌菌株的实例包括但不限于大肠杆菌、芽孢杆菌属(Bacillus)的种、肠杆菌属(enterobacteria)和各种假单胞菌属(Pseudomonas)的种。
在一些实施方案中,本文所述的一种或多种抗体或其抗原结合片段可以根据任何合适的方法,在已经被工程改造(转基因)或用一种或多种编码所述多肽的核酸分子转染的动物体内产生。为了产生转基因动物,可将转基因显微注射到受精卵母细胞中,或者可将其引入胚胎干细胞的基因组中,并将这类细胞的核转移到去核卵母细胞中。一旦表达,就可以按照本领域的标准程序纯化抗体,包括HPLC纯化、柱色谱法、凝胶电泳等(一般参见Scopes,Protein Purification(Springer-Verlag,NY,1982))。
一旦在宿主中表达,本公开内容的完整抗体、抗体片段(例如,单个轻链和重链)或其他免疫球蛋白形式可以通过已知技术回收并纯化,例如免疫吸附或免疫亲和色谱法、色谱方法如HPLC(高效液相色谱法)、硫酸铵沉淀、凝胶电泳或这些方法的任意组合。一般参见Scopes,PROTEIN PURIF.(Springer-Verlag,NY,1982)。具有至少约90%至95%同质性的基本上纯的免疫球蛋白是有利的,具有98%至99%或更高同质性的那些免疫球蛋白也是有利的,尤其用于制药用途。一旦部分纯化或纯化到所需的同质性,人源化抗体或复合人抗体然后可以治疗性地使用,或用于开发和进行测定程序、免疫荧光染色等。一般参见Immunol.Meth.(Lefkovits&Pernis编著,Acad.Press,NY,1979和1981)的第I卷和第II卷。
各个实施方案提供了遗传构建体,其包含编码本文提供的抗TL1A抗体或片段的核酸。抗体的遗传构建体可以是表达盒的形式,其可以适合于表达所编码的抗TL1A抗体或片段。可以将遗传构建体在并入或不并入载体中的情况下引入宿主细胞中。例如,可以将遗传构建体并入脂质体或病毒颗粒内。或者,可以通过本领域已知的方法将纯化的核酸分子直接插入到宿主细胞中。可以通过转染、感染、电穿孔、细胞融合、原生质体融合、显微注射或弹道轰击将遗传构建体直接引入宿主对象的细胞中。
各个实施方案提供了包含本文提供的抗体的遗传构建体的重组载体。该重组载体可以是质粒、粘粒或噬菌体。该重组载体可包括其他功能元件;例如,合适的启动子以启动基因表达。
各个实施方案提供了包含本文所述的遗传构建体和/或重组载体的宿主细胞。
各种宿主系统也有利地用于表达重组蛋白。合适的哺乳动物宿主细胞系的实例包括猴肾细胞的COS-7系,以及能够表达适当载体的其他细胞系,包括例如L细胞、C127、3T3、中国仓鼠卵巢(CHO)、HeLa和BHK细胞系。哺乳动物表达载体可以包含非转录元件,例如复制起点、与要表达的基因连接的合适的启动子和增强子、以及其他5’或3’侧翼非转录序列、以及5’或3’非翻译序列,例如必需的核糖体结合位点、聚腺苷酸化位点、剪接供体和受体位点以及转录终止序列。
可以根据任何合适的方法纯化由转化的宿主产生的蛋白质。这类标准方法包括色谱法(例如,离子交换色谱法、亲和色谱法和大小柱色谱法)、离心、差异溶解度或通过用于蛋白质纯化的其他任何标准技术。可以将亲和标签如六组氨酸(SEQ ID NO:1303)、麦芽糖结合域、流感外壳序列和谷胱甘肽-S-转移酶附接到蛋白质上,以使其易于通过合适的亲和柱纯化。分离的蛋白质还可以使用诸如蛋白水解、核磁共振和X射线晶体学等技术进行物理表征。可以分离在细菌培养物中产生的重组蛋白。
技术人员将会认识到,对核酸、肽、多肽或蛋白质序列进行个别的置换、缺失或添加,以改变编码序列中的一个氨基酸或一小部分氨基酸,是一种“保守修饰的变体”,其中的改变导致氨基酸被化学上相似的氨基酸所置换,并保留特异性结合靶抗原的能力。这类保守修饰的变体是与本公开内容一致的多态性变体、种间同源体和等位基因的补充,并且不排除它们。
可以将给定的氨基酸置换为具有相似理化特性的残基,例如,用一个脂肪族残基置换另一个(例如He、Val、Leu或Ala彼此置换),或者用一个极性残基置换另一个(例如在Lys与Arg之间;Glu与Asp之间;或Gln与Asn之间)。其他这样的保守置换,例如具有相似疏水性特性的整个区的置换,是众所周知的。可以在本文所述的任何一种测定中测试包含保守性氨基酸置换的多肽,以证实天然或参考多肽的所需活性例如抗原结合活性和特异性得到保留。
具体的保守置换包括,例如:Ala置换为Gly或置换为Ser;Arg置换为Lys;Asn置换为Gin或置换为His;Asp置换为Glu;Cys置换为Ser;Gin置换为Asn;Glu置换为Asp;Gly置换为Ala或置换为Pro;His置换为Asn或置换为Gin;lie置换为Leu或置换为Val;Leu置换为lie或置换为Val;Lys置换为Arg、置换为Gin或置换为Glu;Met置换为Leu、置换为Tyr或置换为lie;Phe置换为Met、置换为Leu或置换为Tyr;Ser置换为Thr;Thr置换为Ser;Trp置换为Tyr;Tyr置换为Trp;和/或Phe置换为Val、置换为lie或置换为Leu。
在一些实施方案中,本文所述的抗体和/或其抗原结合片段可以是本文所述的序列的变体,例如抗体多肽的保守置换变体。在一些实施方案中,该变体是保守修饰的变体。变体可指与天然或参考多肽基本同源的多肽,但是由于一个或多个缺失、插入或置换而具有与天然或参考多肽的氨基酸序列不同的氨基酸序列。编码变体多肽的DNA序列包括这样的序列,与天然或参考DNA序列相比,该序列包含核苷酸的一个或多个添加、缺失或置换,但是编码保留针对相关目标多肽的活性例如抗原特异性结合活性的变体蛋白质或其片段。
天然氨基酸序列的改变可以通过本领域技术人员已知的多种技术中的任何技术来完成。可以在特定基因座处或通过寡核苷酸引导的位点特异性诱变程序引入突变。进行这类改变的技术已经非常完善,并且包括例如Walder等人(Gene 42:133,1986);Bauer等人(Gene37:73,1985);Craik(BioTechniques,January 1985,12-19);Smith等人(GeneticEngineering:Principles and Methods,Plenum Press,1981)。
通过本领域已知的多种方法来制备编码抗体的氨基酸序列变体的核酸分子。这些方法包括但不限于通过对先前制备的抗体变体或非变体形式进行寡核苷酸介导的(或定点)诱变、PCR诱变和盒式诱变来制备。可以根据常规技术将编码至少一种本文所述的抗体、部分或多肽的核酸序列与载体DNA重组,所述常规技术包括但不限于用于连接的平端或交错末端和限制酶消化。此类操作的技术公开于,例如,Maniatis等人,Molecular Cloning,Lab.Manual(Cold Spring Harbor Lab.Press,NY,1982和1989),并且可用来构建编码单克隆抗体分子或抗原结合区的核酸序列。
在一些实施方案中,编码本文所述的抗体或其抗原结合片段的核酸由载体包含。在本文所述的一些方面中,将编码本文所述的抗体或其抗原结合片段的核酸序列或其任何模块可操作地连接至载体。如本文所用的术语“载体”是指设计用于递送至宿主细胞或用于在不同宿主细胞之间转移的核酸构建体。如本文所用的,载体可以是病毒载体或非病毒载体。术语“载体”涵盖当与适当的控制元件缔合时能够复制并且可以将基因序列转移至细胞的任何遗传元件。载体可以包括但不限于克隆载体、表达载体、质粒、噬菌体、转座子、粘粒、染色体、病毒、病毒体等。
如本文所用的,术语“表达载体”是指指导从载体上与转录调节序列连接的序列表达RNA或多肽的载体。术语“表达”是指涉及产生RNA和蛋白质以及适当时分泌蛋白质的细胞过程,在适用时包括但不限于例如转录、转录物加工、翻译和蛋白质折叠、修饰和加工。“表达产物”包括从基因转录的RNA和通过从基因转录的mRNA的翻译获得的多肽。术语“基因”是指当可操作地连接至合适的调节序列时,在体外或体内转录(DNA)为RNA的核酸序列。该基因可以包括或可以不包括编码区之前和之后的区,例如,5'非翻译(5'UTR)或“前导”序列和3'UTR或“尾随”序列,以及各个编码区段(外显子)之间的间插序列(内含子)。
如本文所用的,术语“病毒载体”是指核酸载体构建体,其包含至少一个病毒来源的元件并且具有被包装到病毒载体颗粒中的能力。病毒载体可包含编码本文所述的抗体或其抗原结合部分的核酸来代替非必需病毒基因。可以将载体和/或颗粒用于在体外或体内将任何核酸转移到细胞中的目的。多种形式的病毒载体是本领域已知的。
所谓“重组载体”意指该载体包含能够在体内表达的异源核酸序列或“转基因”。
药物组合物、给药和剂量
提供的抗TL1A抗体可用于多种应用,包括但不限于治疗性处理方法,如IBD的治疗。所述使用方法可以是体外、离体或体内方法。在某些实施方案中,该抗TL1A抗体是TL1A受体的拮抗剂。
在某些实施方案中,用抗TL1A抗体或TL1A受体拮抗剂治疗的疾病是IBD、CD、UC和/或MR-UC。
在各个实施方案中,所述药物组合物被配制用于通过任何给药途径递送。“给药途径”可指本领域已知的任何给药途径,包括但不限于气雾剂、经鼻、口服、经粘膜、经皮或肠胃外。
药物组合物还可含有任何药学上可接受的载体。“药学上可接受的载体”是指在将目的化合物从一个组织、器官或身体部分携带或转运至另一个组织、器官或身体部分中所涉及的药学上可接受的材料、组合物或媒介物。例如,该载体可以是液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或包封材料或其组合。该载体的每个组分必须是“药学上可接受的”,因为它必须与制剂的其他成分相容。它也必须适用于接触任何可能与之接触的组织或器官,这意味着它一定不能带有毒性、刺激性、变态反应、免疫原性或远远超过其治疗益处的其他任何并发症的风险。
在各个实施方案中,提供了包含药学上可接受的赋形剂以及治疗有效量的抗TL1A抗体的药物组合物。“药学上可接受的赋形剂”意指可用于制备药物组合物的通常是安全的、无毒的且理想的赋形剂,并且包括针对兽医应用以及人药学应用可接受的赋形剂。活性成分可以与药学上可接受的且与活性成分相容的赋形剂混合,并且其量适合用于本文所述的治疗方法。这样的赋形剂可以是固体、液体、半固体,或者在气雾剂组合物的情况下是气态的。合适的赋形剂是,例如,淀粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明胶、麦芽、大米、面粉、白垩、硅胶、硬脂酸钠、单硬脂酸甘油酯、滑石、氯化钠、脱脂奶粉、水、盐水、右旋糖、丙二醇、甘油、乙醇、甘露醇、聚山梨酸酯等及其组合。另外,如果需要,所述组合物可以含有少量辅助物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂等,它们增强或维持活性成分的有效性。本文所述的治疗性组合物可包含药学上可接受的盐。药学上可接受的盐包括与无机酸如盐酸或磷酸形成的酸加成盐,与有机酸如乙酸、酒石酸或扁桃酸形成的酸加成盐,由无机碱如氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化铵、氢氧化钙或氢氧化铁形成的盐,以及由有机碱如异丙胺、三甲胺、2-乙基氨基乙醇、组氨酸、普鲁卡因等形成的盐。液体组合物还可包含除水以外的液相,例如甘油、植物油如棉籽油和油包水乳剂,该组合物包含水以及不包含水。生理上可耐受的载体是本领域公知的。在特定病症或病况的治疗中有效的活性剂(即抗体或其片段)的使用量将取决于该病症或病况的性质,并且可以由本领域技术人员通过标准临床技术来确定。
所述药物组合物可以以治疗有效量进行递送。精确的治疗有效量是在给定对象中的治疗效果方面将产生最有效结果的组合物的量。该量将根据多种因素而变化,这些因素包括但不限于治疗性化合物的特性(包括活性、药代动力学、药效学和生物利用度)、对象的生理状况(包括年龄、性别、疾病类型和阶段、一般身体状况、对给定剂量的反应性和药物类型)、制剂中的一种或多种药学上可接受的载体的性质以及给药途径。临床和药理学领域的技术人员将能够通过常规实验,例如通过监测对象对化合物给药的反应并相应地调整剂量来确定治疗有效量。关于其他指导,参见Remington:The Science and Practice ofPharmacy(Gennaro编,第20版,Williams&Wilkins PA,USA)(2000)。
对于疾病的治疗,抗体的适当剂量取决于待治疗疾病的类型、疾病的严重程度和病程、疾病的反应性、施用抗体是用于治疗目的还是预防目的、既往治疗以及患者的临床病史。在发生任何并发症的情况下,根据主治医师的考量,也可以由单独的医生调整剂量。用药医师可以确定最佳剂量、给药方法和重复频率。TL1A抗体可以一次性施用或在持续数天至数月的一系列治疗期间施用,或施用到实现治愈或达到疾病状态减轻(例如,IBD的治疗或改善)。治疗的持续时间取决于对象的临床进展和对治疗的反应性。在某些实施方案中,剂量是每kg体重0.01μg至100mg,并且可以每天、每周、每月或每年一次或多次给予。
适用于注射和/或施用的抗体治疗对于实现mAb(单克隆抗体,例如抗TL1A单克隆抗体)的全部治疗潜力非常重要。然而,施用通常受到体积的限制。这进而阐明了研发大于,例如在一些情况下,100mg/ml的高浓度mAb制剂,的重要性。与mAb开发相关的问题包括高溶液粘度和乳光,这在高浓度(例如大于100mg/ml)的开发过程中经常遇到。粘度和乳光都广泛影响mAb的可开发性,影响可制造性、稳定性和递送。在mAb浓缩装置操作期间,高溶液粘度(例如大于30mPa-s)会导致超滤/渗滤中的背压受限。同样,当通过注射施用时,包括通过患者友好型自动注射器施用时,粘性mAb溶液也会导致妨碍注射力或不相容的注射力。实际上,溶液粘度可能是通过注射可能的最大mAb剂量的决定因素。治疗性mAb中的溶液乳光可能同样是问题,因为乳光可以指示液-液相分离、沉淀或聚集的倾向。
本文提供的抗TL1A抗体在高抗体浓度(例如大于100mg/mL或大于150mg/mL)下表现出有利的粘度和聚集特性。值得注意的是,本文提供的抗TL1A抗体的特征在于高浓度下的低粘度(例如小于10mPa-s)和低聚集(例如少于5%高分子量物质)(图3A-3C)。
例如,对于其中HCDR1包含SEQ ID NO:1、HCDR2包含SEQ ID NO:2、HCDR3包含SEQID NO:6、LCDR1包含SEQ ID NO:10、LCDR2包含SEQ ID NO:11并且LCDR3包含SEQ ID NO:12的抗体或抗原结合片段或其中重链可变区包含SEQ ID NO:104并且轻链可变区包含SEQ IDNO:201的抗体或抗原结合片段,在一些实施方案中,抗T1LA抗体特征在于在大于约100mg/mL,例如高达约170mg/mL的浓度下,粘度小于约30、20、15或10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在大于至少约100mg/mL的浓度下的粘度小于约30、20、15或10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在高达约170mg/mL的浓度下粘度小于约30、20、15或10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在约100mg/mL至约125mg/mL、约100mg/mL至约150mg/mL、约100mg/mL至约160mg/mL、约100mg/mL至约170mg/mL、约125mg/mL至约150mg/mL、约125mg/mL至约160mg/mL、约125mg/mL至约170mg/mL、约150mg/mL至约160mg/mL、约150mg/mL至约170mg/mL或约160mg/mL至约170mg/mL的浓度下粘度小于约30、20、15或10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在约或大于约100mg/mL、约125mg/mL、约150mg/mL、约160mg/mL或约170mg/mL的浓度下粘度小于约30、20、15或10mPa-s/mL。在一些实施方案中,小于约10mPa-s包括约4至约10mPa-s、约4至约9mPa-s、约4至约8mPa-s、约4至约7mPa-s、约4至约6mPa-s、约4至约5mPa-s、约5至约10mPa-s、约5至约9mPa-s、约5至约8mPa-s、约5至约7mPa-s、约5至约6mPa-s、约6至约10mPa-s、约6至约9mPa-s、约6至约8mPa-s或约6至约7mPa-s。在一些实施方案中,大于约100、125、150或160mg/ml是高达约170mg/ml。
另外,对于其中HCDR1包含SEQ ID NO:1、HCDR2包含SEQ ID NO:2、HCDR3包含SEQID NO:6、LCDR1包含SEQ ID NO:10、LCDR2包含SEQ ID NO:11并且LCDR3包含SEQ ID NO:12的抗体或抗原结合片段或其中重链可变区包含SEQ ID NO:104并且轻链可变区包含SEQ IDNO:201的抗体或抗原结合片段,在一些实施方案中,抗-TL1A抗体的特征在于当浓度大于约100mg/mL至约170mg/mL时,浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,当浓度大于至少约100mg/mL时,抗TL1A抗体的特征在于浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,当浓度高达约170mg/mL时,抗TL1A抗体的特征在于浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,抗TL1A抗体的特征在于当浓度为约100mg/mL至约125mg/mL、约100mg/mL至约150mg/mL、约100mg/mL至约160mg/mL、约100mg/mL至约170mg/mL、约125mg/mL至约150mg/mL、约125mg/mL至约160mg/mL、约125mg/mL至约170mg/mL、约150mg/mL至约160mg/mL、约150mg/mL至约170mg/mL或约160mg/mL至约170mg/mL时浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,抗TL1A抗体的特征在于当浓度等于或大于约100mg/mL、约125mg/mL、约150mg/mL、约160mg/mL,或约170mg/mL时,浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。
进一步举例而言,对于其中HCDR1包含SEQ ID NO:1、HCDR2包含SEQ ID NO:2、HCDR3包含SEQ ID NO:6、LCDR1包含SEQ ID NO:10、LCDR2包含SEQ ID NO:11、并且LCDR3包含SEQ ID NO:12的抗体或抗原结合片段或其中重链可变区包含SEQ ID NO:104并且轻链可变区包含SEQ ID NO:201的抗体或抗原结合片段,在一些实施方案中,浓度为约150mg/mL至约或大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约10mPa-s至约30mPa-s。在一些实施方案中,浓度为约150mg/mL至约或大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约30mPa-s。在一些实施方案中,浓度为约150mg/mL至约或大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约5mPa-s至约10mPa-s、约5mPa-s至约15mPa-s、约5mPa-s至约20mPa-s、约5mPa-s至约30mPa-s、约10mPa-s至约15mPa-s、约10mPa-s至约20mPa-s、约10mPa-s至约30mPa-s、约15mPa-s至约20mPa-s、约15mPa-s至约30mPa-s、约20mPa-s至约30mPa-s、约5mPa-s至约9mPa-s、约4至约10mPa-s、约4至约9mPa-s、约4至约8mPa-s、约4至约7mPa-s、约4至约6mPa-s、约4至约5mPa-s、约5至约10mPa-s、约5至约9mPa-s、约5至约8mPa-s、约5至约7mPa-s、约5至约6mPa-s、约6至约10mPa-s、约6至约9mPa-s、约6至约8mPa-s或约6至约7mPa-s。在一些实施方案中,浓度为约150mg/mL至约或大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约5mPa-s、约10mPa-s、约15mPa-s、约20mPa-s或约30mPa-s。在一些实施方案中,小于约5、10、15、20或30mPa-s是至少约1mPa-s。
另外,对于其中HCDR1包含SEQ ID NO:1、HCDR2包含SEQ ID NO:2、HCDR3包含SEQID NO:6、LCDR1包含SEQ ID NO:10、LCDR2包含SEQ ID NO:11并且LCDR3包含SEQ ID NO:12的抗体或抗原结合片段或其中重链可变区包含SEQ ID NO:104并且轻链可变区包含SEQ IDNO:201的抗体或抗原结合片段,在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于约5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于至少约5比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于至多约15比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于约5比浊法浊度单位(NTU)至约7.5比浊法浊度单位(NTU)、约5比浊法浊度单位(NTU)至约10比浊法浊度单位(NTU)、约5比浊法浊度单位(NTU)至约12.5比浊法浊度单位(NTU)、约5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)至约10比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)至约12.5比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)、约10比浊法浊度单位(NTU)至约12.5比浊法浊度单位(NTU)、约10比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)或约12.5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于约5比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)、约10比浊法浊度单位(NTU))、约12.5比浊法浊度单位(NTU)或约15比浊法浊度单位(NTU)。
本文所述的抗TL1A抗体还显示出有利的聚集特性。对于其中HCDR1包含SEQ IDNO:1、HCDR2包含SEQ ID NO:2、HCDR3包含SEQ ID NO:6、LCDR1包含SEQ ID NO:10、LCDR2包含SEQ ID NO:11并且LCDR3包含SEQ ID NO:12的抗体或抗原结合片段或其中重链可变区包含SEQ ID NO:104并且轻链可变区包含SEQ ID NO:201的抗体或抗原结合片段,在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度大于约100mg/mL至约大于170mg/mL时,高分子量物质(例如分子量大于单体分子量的物质))的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度大于至少约100mg/mL时,高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度高达约170mg/mL时,高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物特征在于当浓度为约100mg/mL至约125mg/mL、约100mg/mL至约150mg/mL、约100mg/mL至约160mg/mL、约100mg/mL至约170mg/mL、约125mg/mL至约150mg/mL、约125mg/mL至约160mg/mL、约125mg/mL至约170mg/mL、约150mg/mL至约160mg/mL、约150mg/mL至约170mg/mL或约160mg/mL至约170mg/mL时高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度为约或大于约100mg/mL、约125mg/mL、约150mg/mL、约160mg/mL,或约170mg/mL时,高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于少于约5%至约15%的高分子量物质。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于少于至多约15%的高分子量物质。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于高分子量物质小于约5%至约7.5%、约5%至约10%、约5%至约15%、约5%至约17.5%、约5%至约20%、约5%至约25%、约7.5%至约10%、约7.5%至约15%、约7.5%至约17.5%、约7.5%至约20%、约7.5%至约25%、约10%至约15%、约10%至约17.5%、约10%至约20%、约10%至约25%、约15%至约17.5%、约15%至约20%、约15%至约25%、约17.5%至约20%、约17.5%至约25%或约20%至约25%。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于少于约5%、约7.5%、约10%、约15%、约17.5%、约20%或约25%的高分子量物质。
进一步举例来说,对于包含重链可变骨架区(其包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架)以及轻链可变骨架区(其包含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架)的抗体或抗原结合片段;其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰,在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在大于约100mg/mL至约大于170mg/mL的浓度下粘度小于10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在大于至少约100mg/mL的浓度下粘度小于10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在大于至多约170mg/mL的浓度下粘度小于10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在大于约100mg/mL至约125mg/mL、约100mg/mL至约150mg/mL、约100mg/mL至约160mg/mL、约100mg/mL至约170mg/mL、约125mg/mL至约150mg/mL、约125mg/mL至约160mg/mL、约125mg/mL至约170mg/mL、约150mg/mL至约160mg/mL、约150mg/mL至约170mg/mL或约160mg/mL至约170mg/mL的浓度下粘度小于约10mPa-s。在一些实施方案中,抗T1LA抗体的特征在于在大于约100mg/mL、约125mg/mL、约150mg/mL、约160mg/mL或约170mg/mL的浓度下粘度小于10mPa-s。
另外,对于包含重链可变骨架区(其包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架)以及轻链可变骨架区(其包含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架)的抗体或抗原结合片段;其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰,在一些实施方案中,抗TL1A抗体的特征在于当浓度大于约100mg/mL至约大于170mg/mL时浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,当浓度大于至少约100mg/mL时,抗TL1A抗体的特征在于浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,当浓度大于至多约170mg/mL时,抗TL1A抗体的特征在于浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,抗TL1A抗体的特征在于当浓度大于约100mg/mL至约125mg/mL、约100mg/mL至约150mg/mL、约100mg/mL至约160mg/mL、约100mg/mL至约170mg/mL、约125mg/mL至约150mg/mL、约125mg/mL至约160mg/mL、约125mg/mL至约170mg/mL、约150mg/mL至约160mg/mL、约150mg/mL至约170mg/mL或约160mg/mL至约170mg/mL时浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,抗TL1A抗体的特征在于当浓度大于约100mg/mL、约125mg/mL、约150mg/mL、约160mg/mL或约170mg/mL时,浊度小于12比浊法浊度单位(NTU)。
另外,对于包含重链可变骨架区(其包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架)以及轻链可变骨架区(其包含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架)的抗体或抗原结合片段;其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰,在一些实施方案中,浓度大于150mg/mL至大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约10mPa-s至约30mPa-s。在一些实施方案中,浓度大于150mg/mL至大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于至多约30mPa-s。在一些实施方案中,浓度大于150mg/mL至大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约5mPa-s至约10mPa-s、约5mPa-s至约15mPa-s、约5mPa-s至约20mPa-s、约5mPa-s至约30mPa-s、约10mPa-s至约15mPa-s、约10mPa-s至约20mPa-s、约10mPa-s至约30mPa-s、约15mPa-s至约20mPa-s、约15mPa-s至约30mPa-s或约20mPa-s至约30mPa-s。在一些实施方案中,浓度为大于150mg/mL至大于约170mg/mL的抗T1LA抗体的特征在于粘度小于约5mPa-s、约10mPa-s、约15mPa-s、约20mPa-s或约30mPa-s。
另外,对于包含重链可变骨架区(其包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架)以及轻链可变骨架区(其包含人IGKV3-20骨架或修饰的人类IGKV3-20骨架)的抗体或抗原结合片段;其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰,在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体特征在于浊度小于约5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于至少约5比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于至多约15比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于约5比浊法浊度单位(NTU)至约7.5比浊法浊度单位(NTU)、约5比浊法浊度单位(NTU)至约10比浊法浊度单位(NTU)、约5比浊法浊度单位(NTU)至约12.5比浊法浊度单位(NTU)、约5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)至约10比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)至约12.5比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)、约10比浊法浊度单位(NTU)至约12.5比浊法浊度单位(NTU)、约10比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)或约12.5比浊法浊度单位(NTU)至约15比浊法浊度单位(NTU)。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL浓度的抗TL1A抗体的特征在于浊度小于约5比浊法浊度单位(NTU)、约7.5比浊法浊度单位(NTU)、约10比浊法浊度单位(NTU))、约12.5比浊法浊度单位(NTU)或约15比浊法浊度单位(NTU)。
本文所述的抗TL1A抗体还显示出有利的聚集特性。对于包含重链可变骨架区(其包含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架)以及轻链可变骨架区(其包含人IGKV3-20骨架或修饰的人类IGKV3-20骨架)的抗体或抗原结合片段;其中所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自人IGHV1-46*02骨架和人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰,在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度大于约100mg/mL至约大于170mg/mL时,高分子量物质(例如,分子量大于单体分子量的物质))的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度大于至少约100mg/mL时,高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度大于至多约170mg/mL时,高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物特征在于当浓度大于约100mg/mL至约125mg/mL、约100mg/mL至约150mg/mL、约100mg/mL至约160mg/mL、约100mg/mL至约170mg/mL、约125mg/mL至约150mg/mL、约125mg/mL至约160mg/mL、约125mg/mL至约170mg/mL、约150mg/mL至约160mg/mL、约150mg/mL至约170mg/mL或约160mg/mL至约170mg/mL时高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,抗TL1A抗体组合物的特征在于当浓度为大于约100mg/mL、约125mg/mL、约150mg/mL、约160mg/mL,或约170mg/mL时,高分子量物质的百分比小于10%。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于少于约5%至约15%的高分子量物质。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于少于至多约15%的高分子量物质。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于高分子量物质小于约5%至约7.5%、约5%至约10%、约5%至约15%、约5%至约17.5%、约5%至约20%、约5%至约25%、约7.5%至约10%、约7.5%至约15%、约7.5%至约17.5%、约7.5%至约20%、约7.5%至约25%、约10%至约15%、约10%至约17.5%、约10%至约20%、约10%至约25%、约15%至约17.5%、约15%至约20%、约15%至约25%、约17.5%至约20%、约17.5%至约25%或约20%至约25%。在一些实施方案中,具有大于150mg/mL抗体浓度的抗TL1A抗体组合物的特征在于少于约5%、约7.5%、约10%、约15%、约17.5%、约20%或约25%的高分子量物质。
治疗方法
各个实施方案提供了治疗炎性肠病(IBD)的方法,其包括向有需要的对象施用本文所述的抗TL1A抗体。在一些实施方案中,该对象包括一种或多种风险基因型。在一些实施方案中,该IBD是IBD的严重形式。IBD的严重形式的特征可在于本文所述的亚临床表型。
在一些实施方案中,术语“个体”或“对象”可互换使用,并且是指任何动物,包括但不限于人、非人灵长类动物、啮齿类动物以及家养动物和狩猎动物,它们将成为特定治疗的接受者。灵长类动物包括黑猩猩、食蟹猴、蜘蛛猴和猕猴,例如恒河猴。啮齿类动物包括小鼠、大鼠、土拨鼠、雪貂、兔和仓鼠。家养动物和狩猎动物包括牛、马、猪、鹿、野牛、水牛,猫科物种,例如家猫,犬科物种,例如狗、狐狸、狼,禽类物种,例如鸡、鸸鹋、鸵鸟,和鱼类,例如,鳟鱼、鲶鱼和鲑鱼。在各个实施方案中,对象可以是先前已经被诊断出患有或被确定为患有或具有需要治疗的病况的对象。在某些实施方案中,对象是人。在各个其他实施方案中,先前被诊断出患有或被确定为患有或具有病况的对象可以经历过或可以未经历过针对该病况的治疗。在另外其他的实施方案中,对象还可以是先前未被诊断出具有病况的对象(即,表现出病况的一种或多种风险因素的对象)。“需要针对特定病况的治疗的对象”可以是具有该病况、被诊断出具有该病症或处于发展该病况的风险中的对象。在一些实施方案中,对象是已被诊断出患有本文所述的疾病或病况的“患者”。
在一些实施方案中,术语“治疗有效量”是指有效“治疗”对象或哺乳动物的疾病或病症的抗体、多肽、多核苷酸、有机小分子或其他药物的量。在一些情况下,治疗有效量的药物降低疾病或病症的症状的严重程序。在一些情况下,该疾病或病症包括炎性肠病(IBD)、克罗恩病(CD)或溃疡性结肠炎(UC)。在一些情况下,该IBD、CD和/或UC是IBD、CD和/或UC的严重或医学上难治性形式。IBD、CD和/或UC症状的非限制性实例包括但不限于腹泻、发热、疲劳、腹痛、腹部绞痛、炎症、溃疡、恶心、呕吐、出血、便血、食欲降低和体重减轻。
在一些实施方案中,本文使用的术语“治疗”或“进行治疗”指治疗性治疗和预防性或预防性措施(例如疾病进展),其中目的是预防或减缓(减轻)目标病理状况。在本文提供的一些方面,需要治疗的对象包括那些已经患有疾病或病症的对象,以及那些易患疾病或病症的对象。疾病或病症可以包括炎性疾病或病症。
在各个实施方案中,本文提供了一种在有需要的对象中治疗炎性肠病(IBD)的方法,其包括:向该对象施用治疗有效量的特异性结合TL1A的抗体或抗原结合片段。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体B。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体C。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体D。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体E。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体F。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体G。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体I。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体H。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体B2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体C2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体D2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体E2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体F2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体G2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体I2。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体H2。在某些实施方案中,抗TL1A抗体包括表1的任何一种抗体。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A217。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A220。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A223。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A219。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A221。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A200。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A213。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A212。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A107。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A205。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A211。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A199。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A15。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A30。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A100。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A181。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A129。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A214。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A216。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A122。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A222。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A188。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A203。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A147。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A127。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A126。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A160。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A157。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A159。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A218。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A158。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A125。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A103。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A64。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A67。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A138。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A68。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A94。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A110。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A197。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A112。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A169。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A173。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A179。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A148。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A115。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A149。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A134。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A113。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A151。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A96。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A132。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A196。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A172。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A75。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A174。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A109。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A198。在一些实施方案中,抗TL1A抗体包括抗体A170。
本文公开的对象可以是哺乳动物,例如小鼠、大鼠、豚鼠、兔、非人灵长类动物或农场动物。在一些情况下,该对象是人。在一些情况下,该对象是被诊断出患有IBD的患者。在一些情况下,该对象未被诊断出患有IBD。在一些情况下,该对象罹患与本文公开的疾病或病况有关的症状(例如,腹痛、绞痛、腹泻、直肠出血、发热、体重减轻、疲劳、食欲不振、脱水和营养不良、贫血或溃疡)。
在各个其他实施方案中,确定对象具有增加的TL1A表达。在一些实施方案中,治疗有效量的抗TL1A抗体的施用导致所治疗的对象中的TL1A减少。
本文公开的方法提供了通过向对象施用本文所述的抗TL1A抗体来治疗对象的炎性肠病(IBD)的方法。在各个实施方案中,IBD是克罗恩病(CD)或溃疡性结肠炎(UC)。在一些实施方案中,该IBD是IBD的严重形式。在一些实施方案中,该IBD是IBD的中度至重度形式。在一些实施方案中,该IBD是IBD的中度形式。
试剂盒
进一步提供了用于治疗IBD(例如,CD、UC和/或mrUC)的试剂盒。该试剂盒包含可用于执行本文所述方法的本文所述的抗体。该试剂盒可用于实施通过施用抗TL1A抗体为IBD、CD、UC和/或mrUC患者提供治疗的本发明的方法。该试剂盒是材料或组分的集合,包括至少一种本发明的组合物。因此,在一些实施方案中,该试剂盒包含如上所述用于治疗IBD、CD、UC和/或MR-UC的包含抗TL1A抗体的组合物。在其他实施方案中,该试剂盒包含对TL1A进行检测测定所必需的和/或足以进行该检测测定的所有组分,包括所有对照、关于进行测定的指导以及用于分析和呈现结果的任何必要软件。
本发明试剂盒中配置的组分的确切性质取决于其预期目的。例如,一些实施方案被配置用于治疗IBD、CD、UC和/或MR-UC的目的。在一个实施方案中,该试剂盒特别被配置用于治疗哺乳动物对象的目的。在另一个实施方案中,该试剂盒特别被配置用于治疗人对象的目的。在进一步的实施方案中,该试剂盒被配置用于兽医应用,从而治疗对象,诸如但不限于农场动物、家养动物和实验室动物。
所述试剂盒中可包含使用说明书。“使用说明书”通常包括描述在使用试剂盒的组分来实现所需结果(例如治疗或缓解IBD、CD、UC和/或MR-UC)中所采用的技术的有形表示。任选地,该试剂盒还包含其他有用的组分,如稀释剂、缓冲液、药学上可接受的载体、注射器、导管、涂抹器、移液或测量工具、包扎材料或本领域技术人员容易认识到的其他有用的用具。
组装在试剂盒中的材料或组分可以以保持其可操作性和实用性的任何方便且合适的方式提供给从业者。例如,所述组分可以是溶解的、脱水的或冻干的形式;它们可以在室温、冷藏或冷冻温度下提供。这些组分通常包含在合适的包装材料中。如本文所用的,短语“包装材料”是指用于容纳试剂盒的内容物如本发明组合物等的一个或多个物理结构。通过公知的方法构建包装材料,以优选地提供无菌、无污染的环境。试剂盒中采用的包装材料是在基因表达试验中和治疗施用中惯常使用的那些包装材料。如本文所用的,术语“包装”是指能够容纳各个试剂盒组分的合适的固体基质或材料,如玻璃、塑料、纸、箔等。因此,例如,包装可以是玻璃小瓶或预填充注射器,其用来容纳适量的包含抗TL1A抗体和/或针对TL1A的引物和探针的本发明组合物。包装材料通常具有指示试剂盒的内容物和/或目的和/或其组分的外部标签。
本发明提供了包括但不限于以下实施方式:
1.一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含含人IGHV1-46*02骨架或修饰的人IGHV1-46*02骨架的重链可变骨架区,以及含人IGKV3-20骨架或修饰的人IGKV3-20骨架的轻链可变骨架区;其中,所述重链可变骨架区和所述轻链可变骨架区共同包含来自所述人IGHV1-46*02骨架和所述人IGKV3-20骨架的少于9个氨基酸修饰。
2.根据实施方式1所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含:(a)所述重链可变区中氨基酸位置47处的修饰;(b)所述重链可变区中氨基酸位置45处的修饰;(c)所述重链可变区中氨基酸位置55处的修饰;(d)所述重链可变区中氨基酸位置78处的修饰;(e)所述重链可变区中氨基酸位置80处的修饰;(f)所述重链可变区中氨基酸位置82处的修饰;(g)所述重链可变区中氨基酸位置89处的修饰;或(h)所述重链可变区中氨基酸位置91处的修饰;按照Kabat编号;或选自(a)至(h)的两个或更多个修饰的组合。
3.根据实施方式2所述的抗体或抗原结合片段,其中:(a)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置47处,且位置47处的所述氨基酸为R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;(b)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置45处,且位置45处的所述氨基酸为A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;(c)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置55处,且位置55处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V;(d)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置78处,且位置78处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y;(e)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置80处,且位置80处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V;(f)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置82处,且位置82处的所述氨基酸为A、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;(g)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置89处,且位置89处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、M、F、P、S、T、W或Y;或(h)所述氨基酸修饰位于所述重链可变区中的位置91处,且位置91处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、L、K、F、P、S、T、W、Y或V;或选自(a)至(h)的两个或更多个修饰的组合。
4.根据实施方式1所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含以下一个或多个:所述重链可变区中的A47R、R45K、M55I、V78A、M80I、R82T、V89A、M91L,按照Kabat编号。
5.根据实施方式1或实施方式2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含:(a)所述轻链可变区中氨基酸位置54处的修饰;和/或(b)所述轻链可变区中氨基酸位置55处的修饰;按照Kabat编号。
6.根据实施方式5所述的抗体或抗原结合片段,其中:(a)所述氨基酸修饰在所述轻链可变区的位置54处,且位置54处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V;和/或(b)所述氨基酸修饰在所述轻链可变区的位置55处,且位置55处的所述氨基酸为A、R、N、D、C、Q、E、G、H、I、K、M、F、P、S、T、W、Y或V。
7.根据实施方式5所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含所述轻链可变区中的L54P和/或L55W,按照Kabat编号。
8.根据实施方式1-7中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含如SEQ ID NO:1所示的重链CDR1,如SEQ ID NO:2-5中任一个所示的重链CDR2,如SEQ ID NO:6-9中任一个所示的重链CDR3,如SEQ ID NO:10所示的轻链CDR1,如SEQ ID NO:11所示的轻链CDR2,和如SEQ ID NO:12-15中任一个所示的轻链CDR3。
9.根据实施方式1-8中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含如SEQ ID NO:304所示的重链骨架(FR)1,如SEQ ID NO:305或SEQ ID NO:313所示的重链FR2,如SEQ ID NO:306、307、314或315中任一个所示的重链FR3,如SEQ ID NO:308所示的重链FR4,如SEQ IDNO:309所示的轻链FR1,如SEQ ID NO:310所示的轻链FR2,如SEQ ID NO:311所示的轻链FR3,或如SEQ ID NO:312所示的轻链FR4,或其组合。
10.根据实施方式1-9中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含人IgG1 Fc区,所述人IgG1 Fc区包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)选自(a)–(uu)中的两个或更多个的任何组合,按照Kabat编号。
11.根据实施方式1-9中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含人IgG4 Fc区。
12.根据实施方式1-9中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含Fc区,所述Fc区包含与SEQ ID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
13.根据实施方式1-12中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。
14.根据实施方式1-13中任一项所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体,任选约20ug/ml和70ug/mL总抗体。
15.一种与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,包含重链可变区,所述重链可变区包含:(a)包含由SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的HCDR1;(b)包含由SEQ ID NO:2-5中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR2;和(c)包含由SEQ ID NO:6-9中的任一个所示的氨基酸序列的HCDR3;以及轻链可变区,所述轻链可变区包含:(d)包含由SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列的LCDR1;(e)包含由SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列的LCDR2;(f)包含由SEQ ID NO:12-15中的任一个所示的氨基酸序列的LCDR3;以及可结晶片段(Fc)区,所述可结晶片段(Fc)区包含与人IgG1相比降低的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)功能和/或与人IgG1相比降低的补体依赖性细胞毒性(CDC)。
16.根据实施方式15所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述人IgG1包含SEQ IDNO:320。
17.根据实施方式15或实施方式16所述的抗体或其抗原结合片段,其中包含降低的ADCC的所述Fc区的ADCC功能与人IgG1相比降低至少约50%。
18.根据实施方式15-17中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中包含降低的CDC的所述Fc区的CDC功能与人IgG1相比降低至少约50%。
19.根据实施方式15-18中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述Fc区包含人IgG1,所述人IgG1包含(a)297A、297Q、297G或297D、(b)279F、279K或279L、(c)228P、(d)235A、235E、235G、235Q、235R或235S、(e)237A、237E、237K、237N或237R、(f)234A、234V或234F、(g)233P、(h)328A、(i)327Q或327T、(j)329A、329G、329Y或329R(k)331S、(l)236F或236R、(m)238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W或238Y、(n)248A、(o)254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T或254V、(p)255N、(q)256H、256K、256R或256V、(r)264S、(s)265H、265K、265S、265Y或265A、(t)267G、267H、267I或267K、(u)268K、(v)269N或269Q、(w)270A、270G、270M或270N、(x)271T、(y)272N、(z)292E、292F、292G或292I、(aa)293S、(bb)301W、(cc)304E、(dd)311E、311G或311S、(ee)316F、(ff)328V、(gg)330R、(hh)339E或339L、(ii)343I或343V、(jj)373A、373G或373S、(kk)376E、376W或376Y、(ll)380D、(mm)382D或382P、(nn)385P、(oo)424H、424M或424V、(pp)434I、(qq)438G、(rr)439E、439H或439Q、(ss)440A、440D、440E、440F、440M、440T或440V、(tt)E233P、(uu)L235E、(vv)L234A和L235A、(ww)L234A、L235A和G237A、(xx)L234A、L235A和P329G、(yy)L234F、L235E和P331S、(zz)L234A、L235E和G237A、(aaa)、L234A、L235E、G237A和P331S(bbb)L234A、L235A、G237A、P238S、H268A、A330S和P331S(IgG1σ)、(ccc)L234A、L235A和P329A、(ddd)G236R和L328R、(eee)G237A、(fff)F241A、(ggg)V264A、(hhh)D265A、(iii)D265A和N297A、(jjj)D265A和N297G、(kkk)D270A、(lll)A330L、(mmm)P331A或P331S或(nnn)选自(a)–(uu)中的两个或更多个的任何组合,按照Kabat编号。
20.根据实施方式15-18中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,包含(i)人IgG4Fc区或(ii)包含(a)S228P、(b)S228P和L235E或(c)S228P、F234A和L235A的人IgG4 Fc区,按照Kabat编号。
21.根据实施方式15-18中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,包含人IgG2 Fc区;IgG2-IgG4跨亚类Fc区;IgG2-IgG3跨亚类Fc区;包含H268Q、V309L、A330S、P331S(IgG2m4)的IgG2;或包含V234A、G237A、P238S、H268A、V309L、A330S、P331S(IgG2σ)的IgG2。
22.根据实施方式15-18中任一项所述的抗体或其抗原结合片段,其中所述Fc区包含人IgG1,所述人IgG1具有选自329A、329G、329Y、331S、236F、236R、238A、238E、238G、238H、238I、238V、238W、238Y、248A、254D、254E、254G、254H、254I、254N、254P、254Q、254T、254V、264S、265H、265K、265S、265Y、265A、267G、267H、267I、267K、434I、438G、439E、439H、439Q、440A、440D、440E、440F、440M、440T和440V的置换,按照Kabat编号。
23.根据实施方式15-18中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含与SEQ ID NO:320-362中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一性的序列。
24.根据实施方式15-18中的任一个所述的抗体或抗原结合片段,其中所述Fc区包含SEQ ID NO:401-413中的任一个或与SEQ ID NO:401-413中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。
25.根据实施方式15-18中任一项所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链包含SEQ ID NO:501-513中的任一个或与SEQ ID NO:501-513中的任一个具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。
26.根据实施方式15-25中任一项所述的抗体或抗原结合片段,其中所述轻链包含SEQ ID NO:514或与SEQ ID NO:514具有至少约90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%同一性的序列。
27.根据实施方式15-26中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%单体级分。
28.根据实施方式15-27中任一项所述的抗体或抗原结合片段,表达至少约20ug/ml总抗体,任选约20ug/ml和70ug/mL总抗体。
29.一种治疗有此需要的对象的炎性肠病(IBD)的方法,所述方法包括向所述对象施用根据实施方式1-28中任一项所述的抗体或抗原结合片段。
30.根据实施方式29所述的方法,其中所述对象患有纤维化。
31.根据实施方式29所述的方法,其中所述IBD包括克罗恩病。
32.根据实施方式29所述的方法,其中所述IBD包括溃疡性结肠炎。
33.一种液体组合物,包含根据实施方式1-28中任一项所述的抗体或抗原结合片段,包含浓度为10mg/ml至170mg/ml的所述抗体或抗原结合片段。
34.一种液体组合物,包含与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段的浓度为10mg/ml至170mg/ml。
35.根据实施方式33或实施方式34所述的液体组合物,包含药学上可接受的赋形剂。
36.根据实施方式33-35中任一项所述的液体组合物,其中粘度为约4至约30mPa-s(毫帕秒(mPa·s))。
37.根据实施方式33-35中任一项所述的液体组合物,其中粘度为约4至约10mPa-s(毫帕秒(mPa·s))。
实施例
以下实施例说明了本文所述的实施方案,而不应解释为限制本公开内容的范围。在提及具体材料时,这仅仅是为了说明目的,而非旨在限制。本领域技术人员可以开发等同的手段或反应物,而无需具有创造性能力,并且不会偏离本公开内容的范围。
实施例1:人源化抗TL1A抗体的设计
采用两种不同的策略来鉴定在哺乳动物细胞中表达良好、保持TL1A结合并显示高单体含量的人源化变体。
第一策略使用了以前人源化的变体作为额外诱变的模板,该变体称为ASX,它显示出高单体含量(98%)并且表达良好(在小规模瞬时培养中为30μg/mL)。然而,ASX含有大量鼠骨架残基、八个重链残基和7个轻链残基,这可能会造成免疫原性风险。ASX重链和轻链模板用于系统地将鼠骨架残基突变为与最密切相关的人种系骨架相对应的人残基。该策略的目标是减少鼠骨架残基的总数,同时保留ASX的有利表达和溶解度特征。由于ASX包含15个鼠骨架残基,因此可以制造和测试2^15(32,768)个不同的变体(将每个位置限制为鼠残基或人残基)。
第二策略利用了以前人源化的变体作为额外诱变的模板,该变体称为c34,它表达良好(在小规模瞬时培养中为17μg/mL)并包含针对在全人种系骨架内结合而优化的CDR。c34的大规模表达出乎意料地导致了次优的单体含量(55-60%)。c34重链和轻链模板用于系统地将某些骨架残基突变为对应于原始鼠抗体骨架的鼠残基。该策略的目标是通过引入尽可能少的鼠骨架残基(最大限度地降低潜在的免疫原性风险)来提高c34(单体含量)的溶解度,同时保留c34的有利表达特征。
对于这两种策略,最初的方法是扫描不同的骨架残基,一次一个,然后表达和表征这些变体。因此,人骨架残基被引入变体ASX,它不同于c34并且相反,鼠骨架突变被引入变体c34,在这方面它不同于ASX。最初的扫描确定了某些骨架和CDR残基,它们对模板抗体显示的特征影响最小,而其他突变具有更显著的影响,这在一些情况下是有利的,在其他情况下是不利的。从位置扫描中获得的信息随后以迭代和组合方式使用,以鉴定具有有利特征的多个变体。重要的是,通过应用逐步、迭代和组合的方法,无需表达和表征32,768个不同的变体即可鉴定出有益的变体。
在某些情况下,评估了重链的第一个残基从谷氨酰胺到天冬氨酸或谷氨酸的突变,单独评估或与其他突变组合评估。
此外,对于这两种策略,某些CDR残基也被突变以确定对表达和溶解度的影响。例如,检查了HCDR2、HCDR3和LCDR3中有限数量的突变。与骨架使用的方法类似,突变主要限于原始鼠CDR残基或先前被鉴定为增强结合亲和力的突变。
最后,对于这两种策略,都使用了重链和轻链的“改组”。具体而言,在该过程的早期鉴定了某些含有少量鼠骨架残基并对具有较高单体含量的抗体的表达具有有利影响的人轻链,并将这些与各种工程化的重链配对以加速鉴定合适变体的过程。
表1.某些设计的抗TL1A抗体的序列
Figure BDA0003907474270002951
Figure BDA0003907474270002961
Figure BDA0003907474270002971
Figure BDA0003907474270002981
Figure BDA0003907474270002991
Figure BDA0003907474270003001
Figure BDA0003907474270003011
如本文所用,提及A(数字)是指该表的抗体。例如,此处使用的A15是指表1中的A15。
实施例2:人源化抗TL1A抗体的产生和表征
制备和表征实施例1中设计的人源化抗TL1A抗体。
人源化抗体的克隆
将编码目的人源化变体的前导序列和重链和轻链可变区的DNA分别克隆到pFuse1-hIgG1-Fc1(InvivoGen)和pFuse2-CLig-hk(InvivoGen)中。两种不同的人源化重链模板(称为ASX-HC和c34-HC)以及四种不同的人源化轻链模板(称为ASX-LC、cH3-1、c34-LC、cXL3-13-LC和cXL3-15-LC)都被克隆。
为了将突变引入模板,按照制造商的说明使用QuickChange定点突变试剂盒(Agilent,cat.#200518)。简而言之,使用小量制备(miniprep)双链质粒DNA、两个含有所需突变的合成寡核苷酸引物、
Figure BDA0003907474270003021
聚合酶和温度循环仪进行诱变。温度循环后,将产物用DpnI处理。含有一个或多个目的突变的带切口的载体DNA用于转化细菌。随后,挑取菌落,对DNA进行测序以确认诱变,随后用于转染哺乳动物FreeStyle 293-F细胞。
抗体表达
变体在FreeStyle 293-F细胞中的小规模(3mL,6孔)表达以下列方式进行。在转染前一天或两天传代细胞,以便在转染当天密度>1x106个细胞/mL。通常,这意味着在前一天以6-7x105个细胞/mL或前两天以4x105个细胞/mL传代。仅在细胞活率>90%时进行转染。在转染当天,将Opti-MEM培养基加热至37℃,将细胞重新悬浮至1.1x106个细胞/mL,使用3.3x106个细胞/3mL转染。每次转染总共使用3μg DNA。简而言之,转染使用重链和轻链质粒,重链:轻链比率为1:3。对于3mL转染,将4μL 293fectin添加到96μL Opti-MEM,与100μLDNA混合物组合,并在25℃孵育20-30分钟。随后,将该混合物逐滴添加到2.8mL细胞中,并将板转移到培养箱中并放置在旋转平台上以175rpm持续120小时。96-120小时后,通过以1200rpm离心经转染的细胞和上清液5分钟收集转染上清液。将上清液转移到干净的试管中,再次以3900rpm离心10分钟以去除任何剩余的细胞碎片。将上清液通过0.45mm PES注射器过滤器过滤,并在4℃储存直至下一步。
抗体表达的定量
通过ELISA定量抗体表达。简而言之,将Corning Costar 336696孔圆底高结合板在4℃用PBS中的50mL抗κ(2μg/mL)包被过夜。将板用PBS-0.05% Tween 20(PBS-T)洗涤3x,并在25℃用100μL 1% BSA/PBS封闭1小时。去除封闭,添加稀释5倍的培养上清液,并在平板上连续稀释2倍。每个板还包含从1μg/mL开始连续稀释3倍的IgG标准品。将样品在25℃孵育1小时,用PBS-T洗涤板三次,并且在25℃添加50μL在BSA/PBS中以1:4000稀释的抗Fc HRP二抗(Southern Biotech#2048-05)保持1小时。在添加50μL Ultra TMB ELISA底物(Thermo#34028)后,将板用PBS-T洗涤三次并显色长达15分钟。通过添加50μL 2N H2SO4终止反应并测量A450 nm。从3mL规模转染获得的抗体表达水平显示在表2中。
表2.抗TL1A抗体的表达、结合和分析性SEC表征(ND,未确定)
Figure BDA0003907474270003031
Figure BDA0003907474270003041
Figure BDA0003907474270003051
Figure BDA0003907474270003061
Figure BDA0003907474270003071
Figure BDA0003907474270003081
Figure BDA0003907474270003091
Figure BDA0003907474270003101
与人TL1A结合的抗体
通过ELISA对与人TL1A(Fitzgerald#30R-AT070)结合的抗体进行定量。简而言之,将Corning Costar 3366 96孔圆底高结合板在4℃用PBS中的50μL TL1A(1μg/mL)包被过夜。将板用PBS-0.05%Tween 20(PBS-T)洗涤3x,并在25℃用100μL 1% BSA/PBS封闭1小时。去除封闭,添加稀释5倍的培养上清液,并在平板上连续稀释2倍。将样品在25℃孵育1小时,用PBS-T洗涤板三次,并且在25℃添加50μL在BSA/PBS中以1:4000稀释的抗Fc HRP二抗保持1小时。在添加50μL Ultra TMB ELISA底物后,将板用PBS-T洗涤三次并显色长达15分钟。通过添加50μL 2N H2SO4终止反应并测量A450nm。表2中显示了抗体亲和力,如使用未纯化的培养上清液通过针对人TL1A的ELISA滴定确定的。
抗体纯化
使用Dynabeads蛋白质A(ThermoFisher Scientific,cat.#10002D)从培养上清液中一步纯化抗体。首先,按照制造商的说明使用Amicon Ultra-4离心过滤装置(30,000MWCO;MilliporeSigma,cat.#C7719)浓缩培养上清液。将Dynabeads通过温和涡旋重新悬浮,并将100μL转移到Eppendorf试管中。使用磁铁保留珠,除去储存缓冲液,并用0.5mL的20mM磷酸钠、150mM NaCl(pH 7.4)(EB,平衡缓冲液)洗涤珠。将来自培养上清液的总共多达24μg IgG添加到珠并轻轻混合,直到珠重新悬浮。必要时,用EB稀释抗体上清液。将试管横向放置在振荡平台上并在25℃以500rpm混合10分钟。随后,使用微量离心机以10,000rpm30秒将珠收集在试管的底部。使用磁铁保留珠,去除上清液。用0.5mL的20mM磷酸钠、500mMNaCl(pH7.4)洗涤珠一次,然后用50mM磷酸钠(pH 6.0)再次洗涤。使用微量离心机以10,000rpm 30秒将珠收集在试管的底部。使用20μL 50mM乙酸钠(pH 3.5)在25℃温和混合2分钟从珠上洗脱纯化的抗体。使用磁铁保留珠,将洗脱液转移到含有1.1μL 1M Tris(pH 8.5)的新试管中以中和样品的pH。然后将该样品以10,000rpm离心2分钟并转移到新试管中以确保去除残留的Dynabeads。使用DeNovix DS-11分光光度计/荧光计、缓冲液空白和针对1%IgG溶液在280nm处质量消光系数为13.70来确定经纯化的样品的浓度。
尺寸排阻色谱法
通过尺寸排阻色谱法(SEC)分析抗体以确定单体百分比并鉴定任何大分子量聚集污染物物质。在Shimadzu UPLC仪器上使用Waters SEC色谱柱(Acquity UPLC BEH SEC,
Figure BDA0003907474270003111
1.7μm,4.6x150mm)以0.2mL/min流速和30℃柱温箱温度分析总体积15μL的经蛋白质A纯化的抗体(浓度为0.1–1μg/μL)。标准PBS用作流动相,280nm处的吸光度用于监测蛋白洗脱。对于一些表现出非对称洗脱谱的测试抗体克隆,使用补充有350mM NaCl的PBS缓冲液(pH6.0)来减少与柱基质的非特异性相互作用。使用Shimadzu软件计算百分比主峰(单体)值。代表性样品谱如图1A-C所示。经纯化的抗体变体的单体含量见表2。
实施例3:消除效应子功能
在某些情况下,降低抗体的潜在效应子功能可能是有益的。已经描述了多种降低效应子功能的策略,包括消除FcγR和C1q结合的点突变,消除FcγR和C1q结合的跨亚类Fc设计,以及消除FcγR和C1q结合的糖工程。表3中突出显示了代表性示例。
表3.消除效应子功能的代表性方法
Figure BDA0003907474270003121
Figure BDA0003907474270003131
Figure BDA0003907474270003141
为了表达效应子功能被消除的抗体,实施例2和表1中公开的抗体的轻链可变区被克隆有κ轻链恒定区,而重链可变区克隆被克隆有修饰的IgG1重链主链,或修饰的IgG2主链,或修饰的IgG4主链,或未修饰的IgG2或IgG4主链,例如在表3或其他地方公开的那些。
可以使用C1q结合和C3固定测定来评估各种Fc工程方法对CDC活性的影响。将经纯化的抗体在PBS中稀释,并在4℃将连续稀释液置于微量滴定板上12-18小时。将板用含有1%(v/v)Tween-20的5%明胶/PBS在25℃封闭1小时。随后,将板与PBS中的10%(v/v)人血清一起孵育,并使用含有1%(v/v)Tween-20的HRP缀合兔抗C1q(Bioss Inc.)的1:500稀释液检测C1q结合。为了测试C3固定,使用兔抗C3(abcam)的1:1000稀释液,然后使用HRP缀合鸡抗兔IgG(abcam)的1:2000稀释液。如实施例1中针对抗体定量测定所述对板进行显影。通过使用GraphPad Prism(Sunnyvale,CA)将数据拟合到对数(激动剂)相比于响应变量斜率(四参数)模型来计算EC50值。
此外,变体的特征可能在于与分离的C1q的结合。将MaxiSorp384孔板(ThermoScientific,Nunc)用在50mM碳酸盐缓冲液(pH9.6)(包被缓冲液)中连续稀释的抗体包被,在4℃保持12-18小时。将板用含有0.05%聚山梨醇酯20的磷酸盐缓冲盐水(PBS)(pH 7.4)洗涤,并用含有0.5% BSA、0.05%聚山梨醇酯20、15ppm Proclin和10%封闭剂酪蛋白(Thermo Scientific)PBS(pH 7.4)封闭。在25℃孵育1小时后,洗涤板。添加在相同缓冲液中的人C1q(Quidel,San Diego,CA)并孵育1.5小时。通过添加20ng/mL生物素化的小鼠抗小鼠C1q(Hycult biotech;与人C1q交叉反应)保持1.5小时,然后添加辣根过氧化物酶(HRP)缀合的链霉亲和素(GE Healthcare Life Sciences)保持1小时来检测结合的C1q。为了检查包被效率,一些经包被的孔只接受前两个孵育步骤的缓冲液,并且当用于测量C1q结合的孔接受链霉亲和素-HRP时,接受山羊抗人Fab'2-HRP。在每个孵育步骤后洗涤板。用底物3,3',5,5'-四甲基联苯胺(TMB)(Kirkegaard&Perry Laboratories)检测过氧化物酶活性。用1M磷酸终止反应并在450nm处测量吸光度。使用四参数模型拟合剂量-响应结合曲线,并使用GraphPad Prism(Sunnyvale,CA)计算EC50值。
使用可溶性Fc R受体结合ELISA评估各种Fc工程方法对ADCC活性的影响。可溶性人FcγRI、FcγRIIb和FcγRIII(评估可对FcγRIII的F158和V158多态形式的结合亲和力)被表达为在受体胞外结构域的C末端有Gly-His6-谷胱甘肽-S-转移酶(GST)的重组融合蛋白。将MaxiSorp 384孔板用在包被缓冲液中的1μg/ml人FcγR包被。用含有0.5% BSA、15ppm Proclin、pH 7.4的PBS洗涤和封闭板。孵育1小时后,洗涤板并将抗体在含有0.5%BSA、0.05%聚山梨醇酯20、15ppm Proclin的PBS(pH 7.4)中的3倍连续稀释液添加到板中并且孵育2h。为了提高由于亲合力导致的结合敏感性,使用抗人抗体形成免疫复合物。如实施例1中所述,使用Ultra TMB底物用HRP缀合的山羊抗人κ(Southern Biotech)检测结合的抗体。终止反应并如上所述读取板。用GraphPad Prism(Sunnyvale,CA)四参数曲线拟合程序拟合野生型抗体(无Fc修饰)的剂量依赖性结合曲线。变体相比于野生型的相对亲和力是通过在适当浓度下除以等效的ng/ml野生型浓度来估计的。
此外,这些变体按照制造商的指示直接在Fc效应生物测定(Promega)中进行测试。这些测定包括FcγRIIa-H ADCP生物测定(Promega,cat#G9901)、ADCC Reporter生物测定,FcγRIIIa F变体(Promega,cat#G9798)、ADCC Reporter生物测定、FcγRIIIa V变体(Promega,cat.#G7015)。将变体作为单体Ig和小免疫复合物(IC)(通过使用抗hu Ig抗体形成小IC)进行测试。
进行基于铕的ADCC测定。简而言之,通过Ficoll Paque Plus梯度离心分离外周血淋巴细胞(PBL)。收集PBL,用RPMI1640、10% FCS洗涤并重新悬浮于细胞培养基中。将细胞稀释至2.5x106个细胞/ml。用BADTA(2,2':6',2”-三联吡啶-6,6”-二羧酸乙酰氧基甲基酯)标记靶细胞:通过添加Accutase(Millipore)收获细胞,洗涤一次并稀释至1x106个细胞/ml。接下来,每1x106个细胞添加2.5μL BADTA,并在37℃和5% CO2孵育35分钟。标记后,用10ml培养基稀释细胞,以200x g离心10分钟并吸出上清液。用培养基/2mM对一苯甲酸(Probenicid)重复该步骤3次,并将样品稀释至1x105个细胞/ml,以300x g离心5分钟,取出上清液并将50μL移液到用于背景对照的孔中。效应细胞(PBL)比靶细胞的最终比率为25:1。
对照包括:(1)背景:50μL等分试样,用100μL培养基稀释,(2)自发裂解:50μL的经标记的靶细胞悬浮液加100μL培养基,在37℃孵育2小时,(3)最大裂解:50μL/孔的经标记的靶细胞悬浮液加100μL Triton X-100(在PBS中0.5%)在37℃孵育2小时,(4)不含抗体的裂解对照:50μL/孔的经标记的靶细胞悬浮液和50L培养基加50μL效应细胞,在37℃孵育2小时,(5)不含效应细胞的裂解对照:50μL/孔的经标记的靶细胞悬浮液;添加50μL培养基加最高使用浓度的抗体,并在37℃孵育2小时。在孵育期结束时,将96孔板以100rpm离心。将20μL的每个上清液转移到OptiPlate HTRF-96(Packard)中,添加200μL铕溶液并在振荡器上孵育15分钟。测量荧光作为时间分辨荧光并计算自发释放和特定释放。
进行CDC测定。简而言之,将靶细胞洗涤并稀释至1x105个细胞/ml,并将100μL/孔(104个细胞)添加到96孔平底微量滴定板。使用从1μg/mL开始的连续稀释创建测试抗体的滴定曲线。将抗体加入板中,轻轻混合,然后置于37℃/5% CO2培养箱中30分钟。接下来,添加25μL新鲜溶解的仔兔补体(Cedarlane CL3441,1ml冻干,在4ml双蒸水中新鲜稀释),轻轻混合,并且将板在37℃/5% CO2培养箱中孵育30分钟。孵育期后,取出50μL上清液并且将100μL Cell Titer Glo试剂(Promega Corp.)添加到剩余的100μL上清液中。将板置于定轨振荡器上2分钟,将100μL/孔转移到黑色发光微量滴定板(Costar)中并测量发光。
对照包括:(1)培养基对照(靶细胞加50μL培养基),(2)最大裂解对照(靶细胞加50μL 0.5% Triton X-100),(3)补体对照(靶细胞加25μL培养基加25μL补体)。
实施例4:全血测定中效力和种类选择性的表征
首先通过使用1nM和10nM的抗体测定对人血中干扰素γ释放的抑制来评估一组候选抗体的相对效力。所有抗体都显示出有效的活性,其中A219似乎是最有效的候选物之一(表4)。
表4.
Figure BDA0003907474270003171
接下来,使用多个人献血供体并在更广泛的浓度范围(0.01–100nM)中测试抗体,对其中三个变体在人血液中的干扰素γ释放的抑制作用进行了表征。变体A212、A213和A219的代表性抑制谱显示在图2中。表5中显示了这些变体和称为1D1的对照抗体抑制来自多个人供体的血液中的干扰素γ释放的平均IC50值。
表5.
Figure BDA0003907474270003172
Figure BDA0003907474270003181
实施例5:抗TL1A功效的体内评估
评估了抗TL1A抗体在结肠炎动物模型中的功效。在通过直肠内施用二硝基苯磺酸或三硝基苯磺酸(D/TNBS)或噁唑酮诱发的急性结肠炎的啮齿类动物模型中,以及通过在饮用水中施用DSS或转移CD45RBhi T诱发的慢性结肠炎的啮齿类动物模型中,测试了抗TL1A抗体。DNBS和噁唑酮诱发局部溃疡和炎症。DSS施用诱发肠道强烈的全面炎症,其特征在于糜烂性病变和炎性浸润。所有这些模型的症状通常包括腹泻、潜血、体重减轻以及偶尔的直肠脱垂。在预防性模型中,抗体处理从开始施用诱发结肠炎的化合物开始。在治疗性模型中,抗体治疗在诱发开始后几天开始。确定该治疗对体重、大便稠度和潜血的影响,以及显微镜下所见的对上皮完整性和炎性浸润程度的影响。基于大便稠度和隐血的存在进行每天临床评分,给出疾病活动指数(DAI)评分。
实施例6:1期临床试验
进行1期临床试验以评估本文提供的抗TL1A抗体在正常健康志愿者对象中的安全性、耐受性、药代动力学和药效学。表15中提供了概要。
表15.抗TL1A抗体在健康志愿者中的1期、单中心、双盲、安慰剂对照、安全性和药代动力学研究的概要
Figure BDA0003907474270003182
Figure BDA0003907474270003191
Figure BDA0003907474270003201
Figure BDA0003907474270003211
Figure BDA0003907474270003221
表6.氨基酸序列
Figure BDA0003907474270003231
表7.重链可变区氨基酸
Figure BDA0003907474270003241
Figure BDA0003907474270003251
Figure BDA0003907474270003261
Figure BDA0003907474270003271
Figure BDA0003907474270003281
Figure BDA0003907474270003291
Figure BDA0003907474270003301
Figure BDA0003907474270003311
表8.轻链可变区氨基酸序列
Figure BDA0003907474270003321
Figure BDA0003907474270003331
Figure BDA0003907474270003341
Figure BDA0003907474270003351
表9A.另外的序列
Figure BDA0003907474270003361
Figure BDA0003907474270003371
Figure BDA0003907474270003381
Figure BDA0003907474270003391
Figure BDA0003907474270003401
表9B.Fc和恒定区
Figure BDA0003907474270003411
Figure BDA0003907474270003421
Figure BDA0003907474270003431
Figure BDA0003907474270003441
Figure BDA0003907474270003451
Figure BDA0003907474270003461
Figure BDA0003907474270003471
Figure BDA0003907474270003481
Figure BDA0003907474270003491
Figure BDA0003907474270003501
Figure BDA0003907474270003511
Figure BDA0003907474270003521
Figure BDA0003907474270003531
Figure BDA0003907474270003541
Figure BDA0003907474270003551
Figure BDA0003907474270003561
Figure BDA0003907474270003571
Figure BDA0003907474270003581
Figure BDA0003907474270003591
Figure BDA0003907474270003601
Figure BDA0003907474270003611
Figure BDA0003907474270003621
Figure BDA0003907474270003631
Figure BDA0003907474270003641
表10.选择的抗体
Figure BDA0003907474270003651
表11.选择的抗体–可变区
Figure BDA0003907474270003661
Figure BDA0003907474270003671
Figure BDA0003907474270003681
实施例7:具有降低的细胞介导的细胞毒性的人源化抗TL1A抗体的设计。
如本文所提供和描述的,Fc变体(例如SEQ ID NO:401-413)被设计为减少效应子功能,并且随后测试了其(i)有效被纯化/制造(表12),(ii)降低抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC),以及(iii)降低补体依赖性细胞毒性的能力。测试的测试制品包含重链SEQID NO:501-513,其包含分别包含SEQ ID NO:401-413的Fc区。使用的重链与包含SEQ IDNO:514的轻链配对。针对重组TL1A抗原(“EC50”,表13)生成ELISA滴定谱和EC50。有趣的是,对于选择的突变/Fc变体(表12,野生型IgG1对照),通过单体含量测量,Fc突变确实影响纯度。
CDC活性降低
在表达TL1A的HEK293靶细胞上,与阴性对照人IgG4同种型对照相比,评估了测试制品的CDC活性。Rituxan(抗CD20)用作表达CD20的Raji细胞上的阳性技术对照。所有测试制品均以10μg/mL的最终最高浓度使用,然后进行五倍稀释系列(总共7个点),此外还有无处理对照,一式三份。将细胞与测试制品在37℃孵育15分钟,然后在37℃、5% CO2下用最终浓度为25%的人补体处理3小时。孵育后,在流式细胞术分析之前,将细胞洗涤并重新悬浮于碘化丙啶(P.I.)中,最终浓度为5μg/mL。在样品采集期间通过流式细胞术检查总细胞。数据绘制在XY图表上,绘制P.I.阳性细胞百分比相对于浓度对数并拟合非线性回归曲线。在所有测试制品存在下的细胞细胞毒性与在同种型对照存在下的细胞细胞毒性没有区别(表13)。在用Rituxan处理的Raji靶细胞上观察到CDC生物活性。
CDC活性降低
在HEK 293TL1A细胞上进行了抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)报告测定以表征测试制品和IgG4同种型对照。一种经过工程改造以表达人Fc-γ-RIIIaV158(高亲和力)的报告细胞系作为效应细胞。
在最高浓度10ug/mL(对数稀释,总共7个点,此外还有无测试制品对照)评估了Prometheus测试制品。一式三份测试处理条件,将效应细胞和靶细胞在37C和5% CO2下共培养6小时。Raji靶细胞用作阳性对照,Rituxan处理的最高浓度为10ug/mL,7点对数稀释系列,以及无处理对照。测试制品502处理导致萤光素酶报告基因活性的剂量依赖性增加,并且5044处理导致报告基因活性在最高测试浓度下增加。其余的测试制品没有诱导报告基因活性(表13)。
表12
Figure BDA0003907474270003701
表13
Figure BDA0003907474270003702
Figure BDA0003907474270003711
实施例8:高浓度抗TL1A抗体的生物物理特性
使用称为偏最小二乘法(PLS)的化学计量学方法一起分析溶液中A219抗TL1A抗体特性的数据。PLS建模的详细描述已在例如以下中发表:Katz,M.H.MultivariateAnalysis:A Practice Guide for Clinicians.Cambridge University Press,New York,第158-162页(1999);Stahle,L.,Wold,K.,Multivariate data analysis andexperimental design in biomedical research.Prog.Med.Chem.1988,25:291-338;WoldS.PLS-regression:a basic tool of chemometrics.Chemom.Intell.Lab.Syst.2001,58:109-130;和Martens,H.;Martens,M.Multivariate Analysis of Quality:AnIntroduction,Wiley and Sons,Chichester,UK(2001)。
图3A-C证明粘度与抗体浓度和pH值的函数关系。抗体浓度范围从大于约125mg/mL到大于约170mg/mL。pH范围从小于5.0到约7.5。浓度依赖性很明显,粘度非常低(例如,如粘度小于5mPa-s或7mPa-s所示)。通过Rheosense带有A10芯片的m-VROCTM粘度计测量粘度。使用的剪切速率约为1820s-1。使用ThermoCube热电冷却器对粘度计进行温度控制,并使用Hamilton 100μL注射器(81060)递送样品。使用纯异丙醇验证仪器的准确性,并在25℃测量。此外,在所测试的浓度范围内,通过尺寸排阻色谱法测量的HMW级分的增加百分比在0%至1.3%增加的范围内。如本文所用,HMW是指高分子量抗体级分,例如聚集的蛋白质,并且不包括单体抗体。
已经呈现了本申请人在提交本申请时已知的各个实施方案的以上描述,并且旨在用于说明和描述的目的。本发明的描述并非穷尽性的,也并非局限于所公开的精确形式,并且根据上述教导可以进行许多修改和改变。所描述的实施方案用于解释原理及实际应用,并且使本领域的其他技术人员能够利用各个实施方案,任选地具有各种修改,并适合于预期的特定用途。因此,意为本公开内容不限于所公开的特定实施方案。

Claims (40)

1.一种与肿瘤坏死因子样配体1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,其包含重链可变框架区,所述重链可变框架区包含人IGHV1-46*02框架(SEQ ID NO:316)或修饰的人IGHV1-46*02框架,以及轻链可变框架区,所述轻链可变框架区包含人IGKV3-20框架(SEQID NO:317)或修饰的人IGKV3-20框架;其中所述重链可变框架区和轻链可变框架区共同包含来自人IGHV1-46*02框架和人IGKV3-20框架的1至8个氨基酸修饰,其中所述氨基酸修饰包括:(a)所述重链可变区中氨基酸位置45处的修饰;(b)所述重链可变区中氨基酸位置47处的修饰;(c)所述重链可变区中氨基酸位置55处的修饰;(d)所述重链可变区中氨基酸位置78处的修饰;(e)所述重链可变区中氨基酸位置80处的修饰;(f)所述重链可变区中氨基酸位置82处的修饰;(g)所述重链可变区中氨基酸位置89处的修饰;或(h)所述重链可变区中氨基酸位置91处的修饰;按照Aho编号;或选自(a)至(h)的两个或更多个修饰的组合。
2.根据权利要求1所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含(a)所述重链可变区中的R45K,(b)所述重链可变区中的A47R,(c)所述重链可变区中的M55I,(d)所述重链可变区中的V78A,(e)所述重链可变区中的M80I,(f)所述重链可变区中的R82T,(g)所述重链可变区中的V89A,或(h)所述重链可变区中的M91L,按照Aho编号;或者选自(a)至(h)的两种或更多种修饰的组合。
3.根据权利要求2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:A47R。
4.根据权利要求3所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:A47R、M55I、V78A、M80I、R82T、V89A和M91L;A47R、M80I和R82T;A47R、M80I、R82T、V89A和M91L;或A47R、M55I、V78A、M80I、V89A和M91L。
5.根据权利要求3所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K和A47R。
6.根据权利要求5所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K、A47R、V89A和M91L。
7.根据权利要求5所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K和A47R和M80I。
8.根据权利要求7所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K、A47R、M80I和M91L;R45K、A47R、V78A、M80I、V89A和M91L;R45K、A47R、M55I、V78A、M80I、R82T、V89A和M91L;R45K、A47R、M80I、V89A和M91L;R45K、A47R、M55I、M80I、R82T、V89A和M91L;R45K、A47R、M80I和V89A;R45K、A47R、M80I、R82T、V89A、M91L;或R45K、A47R、M55I、M80I、V89A和M91L。
9.根据权利要求2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K。
10.根据权利要求9所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K和V78A。
11.根据权利要求2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:V78A。
12.根据权利要求11所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:V78A和V89A;V78A和M80I;或V78A、M80I和R82T。
13.根据权利要求2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:V89A。
14.根据权利要求2所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:M80I。
15.一种与肿瘤坏死因子样配体1A(TL1A)结合的抗体或其抗原结合片段,其包含重链可变框架区,所述重链可变框架区包含人IGHV1-46*02框架(SEQ ID NO:316)或修饰的人IGHV1-46*02框架,以及轻链可变框架区,所述轻链可变框架区包含人IGKV3-20框架(SEQID NO:317)或修饰的人IGKV3-20框架;其中所述重链可变框架区和轻链可变框架区共同包含来自人IGHV1-46*02框架和人IGKV3-20框架的1至8个氨基酸修饰,其中所述氨基酸修饰包括:(a)所述轻链可变区中氨基酸位置54处的修饰;(b)所述轻链可变区中氨基酸位置55处的修饰;按照Aho编号。
16.根据权利要求15所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含在轻链可变区中的L54P,按照Aho编号。
17.根据权利要求15所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包含在轻链可变区中的L55W,按照Aho编号。
18.如权利要求1或15所述的抗体或抗原结合片段,其包含通过尺寸排阻色谱法测定的至少约80%的单体级分。
19.根据权利要求7所述的抗体或抗原结合片段,其中所述氨基酸修饰包括:R45K、A47R、M80I和M91L。
20.一种与TL1A结合的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段包含:(a)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:104具有至少96%同一性的氨基酸序列,和(b)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:201具有至少96%同一性的氨基酸序列。
21.根据权利要求20所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或抗原结合片段包含:(a)重链可变区,其包含与SEQ ID NO:104具有至少97%、98%或99%同一性的氨基酸序列,和(b)轻链可变区,其包含与SEQ ID NO:201具有至少97%、98%或99%同一性的氨基酸序列。
22.如权利要求20所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含三个重链互补决定区(HCDR),所述三个HCDR包含如SEQ ID NO:104所示的相应三个HCDR的氨基酸序列,其中所述轻链可变区包含三个轻链互补决定区(LCDR),所述三个LCDR包含如SEQ ID NO:201所示的相应三个LCDR的氨基酸序列,其中HCDR和LCDR由Kabat、Chothia、IMGT、Contact、AbM或Aho编号方案确定。
23.根据权利要求20所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链可变区包含重链互补决定区1(HCDR1),其包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;重链互补决定区2(HCDR2),其包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列;以及重链互补决定区3(HCDR3),其包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列;其中所述轻链可变区包含轻链互补决定区1(LCDR1),其包含如SEQ IDNO:10所示氨基酸序列;轻链互补决定区2(LCDR2),其包含如SEQ ID NO:11所示氨基酸序列;以及轻链互补决定区3(LCDR3),其包含如SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
24.权利要求20的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段包含:(a)包含SEQ ID NO:104的重链可变区和(b)包含SEQ ID NO:201的轻链。
25.根据权利要求20至24中任一项所述的抗体或抗原结合片段,其中所述抗体或其抗原结合片段是人源化抗体或人源化抗原结合片段。
26.根据权利要求20至24中任一项所述的抗体或抗原结合片段,其中(i)所述抗体或抗原结合片段包含人IgG1重链恒定区,(ii)所述抗体或抗原结合片段包含人κ轻链链恒定区,或(iii)所述抗体或抗原结合片段包含人IgGl重链恒定区和人κ轻链恒定区。
27.根据权利要求26所述的抗体或抗原结合片段,其中所述重链恒定区包含1个氨基酸缺失。
28.一种与TL1A结合的抗体,其中所述抗体包含:(a)包含与SEQ ID NO:505具有至少96%同一性的氨基酸序列的重链和(b)包含与SEQ ID NO:514具有至少96%同一性的氨基酸序列的轻链。
29.根据权利要求28所述的抗体,其中所述抗体包含:(a)包含与SEQ ID NO:505具有至少97%、98%或99%同一性的氨基酸序列的重链和(b)包含与SEQ ID NO:514具有至少96%、97%、98%或99%同一性的氨基酸序列。
30.根据权利要求28所述的抗体,其中所述重链包含三个重链互补决定区(HCDR),所述三个HCDR包含如SEQ ID NO:505所示的相应三个HCDR的氨基酸序列,并且所述轻链包含三个轻链互补决定区(LCDR),所述三个LCDR包含如SEQ ID NO:514所示的相应三个LCDR的氨基酸序列,其中所述HCDR和LCDR通过Kabat、Chothia、IMGT、Contact、AbM或Aho编号方案确定。
31.根据权利要求28所述的抗体,其中所述重链包含重链互补决定区1(HCDR1),其包含SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列;重链互补决定区2(HCDR2);其包含SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列,以及重链互补决定区3(HCDR3),其包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列,并且其中所述轻链包含轻链互补决定区1(LCDR1),其包含SEQ ID NO:10所示氨基酸序列;轻链互补决定区2(LCDR2),其包含SEQ ID NO:11所示氨基酸序列,和轻链互补决定区3(LCDR3),其包含SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列。
32.根据权利要求28所述的抗体,其中所述抗体包含:(a)包含SEQ ID NO:505的重链和(b)包含SEQ ID NO:514的轻链。
33.根据权利要求28所述的抗体,其中所述抗体是人源化抗体。
34.根据权利要求28所述的抗体,其中(i)所述重链是人IgG1同种型,(ii)所述轻链是人κ轻链,或(iii)所述重链是人IgG1同种型并且所述轻链是人类κ轻链。
35.根据权利要求28所述的抗体,其中所述重链恒定区包含1个氨基酸缺失。
36.一种分离的多核苷酸,其编码根据权利要求20至24和28至35中任一项所述的抗体或抗原结合片段。
37.一种分离的载体,包含根据权利要求36所述的多核苷酸。
38.包含根据权利要求37所述的载体的宿主细胞。
39.一种制备与TL1A结合的抗体或其抗原结合片段的方法,其中所述方法包括:
a)在适合于表达所述编码抗体或其抗原结合片段的多核苷酸的条件下培养根据权利要求38所述的宿主细胞;和
b)分离所述抗体或其抗原结合片段。
40.权利要求20至24和28至35中任一项所述的抗体或抗原结合片段在制备用于治疗炎症性肠病(IBD)的药物中的用途。
CN202211312304.2A 2019-10-24 2020-10-23 Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途 Pending CN116063517A (zh)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201962925736P 2019-10-24 2019-10-24
US62/925,736 2019-10-24
CN202080090377.4A CN114901311A (zh) 2019-10-24 2020-10-23 Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途
PCT/US2020/057119 WO2021081365A1 (en) 2019-10-24 2020-10-23 Humanized antibodies to tnf-like ligand 1a (tl1a) and uses thereof

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202080090377.4A Division CN114901311A (zh) 2019-10-24 2020-10-23 Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN116063517A true CN116063517A (zh) 2023-05-05

Family

ID=75586845

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202080090377.4A Pending CN114901311A (zh) 2019-10-24 2020-10-23 Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途
CN202211312304.2A Pending CN116063517A (zh) 2019-10-24 2020-10-23 Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202080090377.4A Pending CN114901311A (zh) 2019-10-24 2020-10-23 Tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体及其用途

Country Status (11)

Country Link
US (2) US11292848B2 (zh)
EP (1) EP4048309A4 (zh)
JP (1) JP2022553324A (zh)
KR (1) KR20220103721A (zh)
CN (2) CN114901311A (zh)
AU (1) AU2020371725A1 (zh)
BR (1) BR112022007720A2 (zh)
CA (1) CA3158638A1 (zh)
CO (1) CO2022006679A2 (zh)
IL (1) IL292419A (zh)
MX (1) MX2022004942A (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112585165A (zh) 2018-04-25 2021-03-30 普罗米修斯生物科学公司 优化的抗tl1a抗体
WO2023060144A1 (en) * 2021-10-05 2023-04-13 Lanier Biotherapeutics Monoclonal antibodies to il-25 and uses thereof

Family Cites Families (124)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4737462A (en) 1982-10-19 1988-04-12 Cetus Corporation Structural genes, plasmids and transformed cells for producing cysteine depleted muteins of interferon-β
US4518584A (en) 1983-04-15 1985-05-21 Cetus Corporation Human recombinant interleukin-2 muteins
US5225539A (en) 1986-03-27 1993-07-06 Medical Research Council Recombinant altered antibodies and methods of making altered antibodies
US4946778A (en) 1987-09-21 1990-08-07 Genex Corporation Single polypeptide chain binding molecules
EP0307434B2 (en) 1987-03-18 1998-07-29 Scotgen Biopharmaceuticals, Inc. Altered antibodies
GB8823869D0 (en) 1988-10-12 1988-11-16 Medical Res Council Production of antibodies
US5530101A (en) 1988-12-28 1996-06-25 Protein Design Labs, Inc. Humanized immunoglobulins
GB9015198D0 (en) 1990-07-10 1990-08-29 Brien Caroline J O Binding substance
US6172197B1 (en) 1991-07-10 2001-01-09 Medical Research Council Methods for producing members of specific binding pairs
US5545806A (en) 1990-08-29 1996-08-13 Genpharm International, Inc. Ransgenic non-human animals for producing heterologous antibodies
ES2246502T3 (es) 1990-08-29 2006-02-16 Genpharm International, Inc. Animales no humanos transgenicos capaces de producir anticuerpos heterologos.
US5661016A (en) 1990-08-29 1997-08-26 Genpharm International Inc. Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies of various isotypes
US5633425A (en) 1990-08-29 1997-05-27 Genpharm International, Inc. Transgenic non-human animals capable of producing heterologous antibodies
US5625126A (en) 1990-08-29 1997-04-29 Genpharm International, Inc. Transgenic non-human animals for producing heterologous antibodies
US6277969B1 (en) 1991-03-18 2001-08-21 New York University Anti-TNF antibodies and peptides of human tumor necrosis factor
ES2206447T3 (es) 1991-06-14 2004-05-16 Genentech, Inc. Anticuerpo humanizado para heregulina.
DK1024191T3 (da) 1991-12-02 2008-12-08 Medical Res Council Fremstilling af autoantistoffer fremvist på fag-overflader ud fra antistofsegmentbiblioteker
GB9325182D0 (en) 1993-12-08 1994-02-09 T Cell Sciences Inc Humanized antibodies or binding proteins thereof specific for t cell subpopulations exhibiting select beta chain variable regions
US6824767B2 (en) 1994-11-07 2004-11-30 Human Genome Sciences, Inc. Tumor necrosis factor-gamma
DE69434988T2 (de) 1994-11-07 2008-03-06 Human Genome Sciences, Inc. Tumornekrose-faktor-gamma
US7820798B2 (en) 1994-11-07 2010-10-26 Human Genome Sciences, Inc. Tumor necrosis factor-gamma
US7597886B2 (en) 1994-11-07 2009-10-06 Human Genome Sciences, Inc. Tumor necrosis factor-gamma
US20030198640A1 (en) 1994-11-07 2003-10-23 Human Genome Sciences, Inc. Methods and compositions for treating inflammatory bowel diseases relating to human tumor necrosis factor-gamma-beta
US6599719B2 (en) 1994-11-07 2003-07-29 Human Genome Sciences, Inc. Nucleic acid molecules encoding tumor necrosis factor-gamma-alpha
US20030129189A1 (en) 1994-11-07 2003-07-10 Guo-Liang Yu Tumor necrosis factor-gamma
US7264963B1 (en) 1995-08-18 2007-09-04 Morphosys Ag Protein(poly)peptide libraries
EP0859841B1 (en) 1995-08-18 2002-06-19 MorphoSys AG Protein/(poly)peptide libraries
US6632976B1 (en) 1995-08-29 2003-10-14 Kirin Beer Kabushiki Kaisha Chimeric mice that are produced by microcell mediated chromosome transfer and that retain a human antibody gene
US7357927B2 (en) 1996-03-12 2008-04-15 Human Genome Sciences, Inc. Death domain containing receptors
ATE531812T1 (de) 1997-12-05 2011-11-15 Scripps Research Inst Humanisierung von nager-antikörpern
US6297367B1 (en) 1997-12-30 2001-10-02 Chiron Corporation Polynucleotide encoding TNFL1
CA2323787A1 (en) 1998-03-13 1999-09-16 Wayne Marasco Humanized antibody and uses thereof
US6194551B1 (en) 1998-04-02 2001-02-27 Genentech, Inc. Polypeptide variants
US6737056B1 (en) 1999-01-15 2004-05-18 Genentech, Inc. Polypeptide variants with altered effector function
AU5124500A (en) 1999-04-30 2000-11-17 Human Genome Sciences, Inc. Tumor necrosis factor-gamma
WO2001002588A2 (en) 1999-07-02 2001-01-11 Morphosys Ag Generation of specific binding partners binding to (poly)peptides encoded by genomic dna fragments or ests
US20110131679A2 (en) 2000-04-19 2011-06-02 Thomas La Rosa Rice Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement
US6571638B2 (en) 2000-06-30 2003-06-03 Sawtek, Inc. Surface-acoustic-wave pressure sensor and associated methods
WO2002004643A1 (en) 2000-07-07 2002-01-17 Human Genome Sciences, Inc. Tumor necrosis factor-gamma
US6824989B1 (en) 2000-09-01 2004-11-30 Upstate Biotechnology, Inc. Recombinant monoclonal antibody to phosphotyrosine-containing proteins
CA2391711A1 (en) 2001-06-26 2002-12-26 University Of Guelph Non-radioactive assay of lipopolysaccharide kinases
CA2476166C (en) 2002-02-14 2011-11-15 Immunomedics, Inc. Anti-cd20 antibodies and fusion proteins thereof and methods of use
US7314974B2 (en) 2002-02-21 2008-01-01 Monsanto Technology, Llc Expression of microbial proteins in plants for production of plants with improved properties
US20040132101A1 (en) 2002-09-27 2004-07-08 Xencor Optimized Fc variants and methods for their generation
US20090042291A1 (en) 2002-03-01 2009-02-12 Xencor, Inc. Optimized Fc variants
EP1551876B1 (en) 2002-10-16 2011-03-16 Purdue Pharma L.P. Antibodies that bind cell-associated ca 125/0722p and methods of use thereof
AU2003293096B9 (en) 2002-11-27 2011-09-29 Biogen Ma Inc. Humanized antibodies against monocyte chemotactic proteins
US20090010920A1 (en) 2003-03-03 2009-01-08 Xencor, Inc. Fc Variants Having Decreased Affinity for FcyRIIb
US20050101889A1 (en) 2003-11-06 2005-05-12 Freeman Gary A. Using chest velocity to process physiological signals to remove chest compression artifacts
AU2005271892A1 (en) 2004-07-10 2006-02-16 Alexion Pharmaceuticals, Inc. Methods for discovering antibodies specific to cancer cells and antibodies discovered thereby
TWI380996B (zh) 2004-09-17 2013-01-01 Hoffmann La Roche 抗ox40l抗體
MX2007013609A (es) 2005-05-06 2008-01-24 Zymogenetics Inc Anticuerpos monoclonales de il-31 y meodos de uso.
WO2006122187A2 (en) 2005-05-10 2006-11-16 Biogen Idec Ma Inc. Treating and evaluating inflammatory disorders
US20090317388A1 (en) 2005-05-25 2009-12-24 Linda Burkly Tl1a in treatment of disease
US7700739B2 (en) 2005-06-30 2010-04-20 Abbott Laboratories IL-12/p40 binding proteins
US7612181B2 (en) 2005-08-19 2009-11-03 Abbott Laboratories Dual variable domain immunoglobulin and uses thereof
JP5164167B2 (ja) 2005-08-30 2013-03-13 ユニバーシティー オブ マイアミ 免疫調節性腫瘍壊死因子受容体25(tnfr25)のアゴニスト、アンタゴニスト及び免疫毒素
JP2009539413A (ja) 2006-06-12 2009-11-19 トゥルビオン・ファーマシューティカルズ・インコーポレーテッド エフェクター機能を有する単鎖多価結合タンパク質
US7691980B2 (en) 2007-01-09 2010-04-06 Bio-Rad Laboratories, Inc. Enhanced capacity and purification of antibodies by mixed mode chromatography in the presence of aqueous-soluble nonionic organic polymers
US9896511B2 (en) 2007-01-10 2018-02-20 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Dept. Of Health And Human Services Antibodies that bind to TL1A and methods of treating inflammatory or autoimmune disease comprising administering such antibodies
US20110217310A1 (en) 2007-01-10 2011-09-08 Siegel Richard M Blockade of tl1a-dr3 interactions to ameliorate t cell mediated disease pathology
US20100055700A1 (en) 2007-02-28 2010-03-04 Cedars-Sinai Medical Center Role of il-12, il-23 and il-17 receptors in inflammatory bowel disease
EP2220122A2 (en) 2007-11-13 2010-08-25 Teva Biopharmaceuticals USA, Inc. Humanized antibodies against tl1a
CN101469270B (zh) 2007-12-27 2012-08-22 牛斌 工业连续化塑料裂解器
EP2287174B8 (en) 2008-01-18 2016-12-07 Bio-Rad Laboratories, Inc. Enhanced purification of antibody fragments by apatite chromatography
MX2011003184A (es) 2008-09-29 2011-04-21 Roche Glycart Ag Anticuerpos contra il17 humana y usos de los mismos.
DK2356270T3 (da) * 2008-11-07 2016-12-12 Fabrus Llc Kombinatoriske antistofbiblioteker og anvendelser deraf
EP2411412B1 (en) 2009-03-24 2015-05-27 Teva Biopharmaceuticals USA, Inc. Humanized antibodies against light and uses thereof
CA2806840C (en) 2009-08-03 2019-08-27 Eckhard R. Podack Method for in vivo expansion of t regulatory cells
WO2011106707A2 (en) 2010-02-26 2011-09-01 Human Genome Sciences, Inc. Antibodies that specifically bind to dr3
CA2805054A1 (en) 2010-08-25 2012-03-01 F. Hoffmann-La Roche Ag Antibodies against il-18r1 and uses thereof
PL2616489T3 (pl) 2010-09-16 2017-07-31 Baliopharm Ag Przeciwciało anty-huTNFR1
US8766034B2 (en) 2010-09-22 2014-07-01 Cedars-Sinai Medical Center TL1A model of inflammation fibrosis and autoimmunity
JO3375B1 (ar) 2010-11-08 2019-03-13 Regeneron Pharma أجسام مضادة بشرية للجين a1 الشبيه بعامل النخر الورمي (tl1a)
US9902996B2 (en) 2011-02-11 2018-02-27 Cedars-Sinai Medical Center Methods of predicting the need for surgery in crohn's disease
KR20140104344A (ko) 2011-05-20 2014-08-28 더 유나이티드 스테이츠 오브 어메리카, 애즈 리프리젠티드 바이 더 시크리터리, 디파트먼트 오브 헬쓰 앤드 휴먼 서비시스 T 세포 매개성 질병의 병증을 개선하기 위한 tl1a-dr3의 상호작용의 차단 및 그것의 항체
SG10201902706VA (en) 2011-06-03 2019-04-29 Xoma Technology Ltd Antibodies specific for tgf-beta
BR112013032630B1 (pt) 2011-06-30 2022-06-14 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Polipeptídeo heterodimerizado compreendendo região fc de igg
CA2850549C (en) 2011-09-30 2023-03-14 Teva Pharmaceuticals Australia Pty Ltd. Antibodies against tl1a and uses thereof
WO2013081143A1 (ja) 2011-11-30 2013-06-06 中外製薬株式会社 免疫複合体を形成する細胞内への運搬体(キャリア)を含む医薬
GB201203051D0 (en) 2012-02-22 2012-04-04 Ucb Pharma Sa Biological products
MX2015000683A (es) 2012-08-02 2015-04-10 Hoffmann La Roche Metodo para producir moleculas monomericas y multimericas y uso de las mismas.
BR112015002263A2 (pt) 2012-08-02 2017-12-12 Hoffmann La Roche polipeptídeo de fusão, polipeptídeo de fusão dimérico, método para a produção de um receptor fc solúvel, uso de um polipeptídeo de fusão imobilizado e composição farmacêutica
JPWO2014051109A1 (ja) 2012-09-28 2016-08-25 協和発酵キリン株式会社 抗ヒトbmp9抗体および該抗体を有効成分とする異所性骨化疾患の治療剤
DK2940135T5 (da) 2012-12-27 2021-09-20 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Heterodimeriseret polypeptid
PE20151289A1 (es) 2013-01-02 2015-10-05 Glenmark Pharmaceuticals Sa Anticuerpos que se unen al tl1a y sus usos
US10017543B2 (en) 2013-03-13 2018-07-10 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Prefusion RSV F proteins and their use
CN105143257B (zh) 2013-03-15 2020-10-27 艾伯维生物医疗股份有限公司 Fc变体
EA201890895A1 (ru) 2013-03-15 2019-02-28 Зинджения, Инк. Мультивалентные и моновалентные мультиспецифические комплексы и их применение
SG11201509982UA (zh) 2013-06-06 2016-04-28 Igenica Biotherapeutics Inc
EP3022295A4 (en) 2013-07-19 2017-03-01 Cedars-Sinai Medical Center Signature of tl1a (tnfsf15) signaling pathway
JP6623353B2 (ja) 2013-09-13 2019-12-25 ベイジーン スウィッツァーランド ゲーエムベーハー 抗pd−1抗体並びにその治療及び診断のための使用
SG10201810298VA (en) 2013-11-13 2018-12-28 Pfizer Tumor necrosis factor-like ligand 1a specific antibodies and compositions and uses thereof
JP2017514837A (ja) 2014-05-02 2017-06-08 テバ ファーマシューティカル インダストリーズ リミティド 遅延放出性6−メルカプトプリンによるクローン病の治療
JP6868394B2 (ja) 2014-05-16 2021-05-12 ファイザー・インク 二重特異性抗体
US10160805B2 (en) 2014-07-11 2018-12-25 New York University Methods of treating inflammatory bowel disease by administering tumor necrosis factor-like ligand 1A or an agonistic death-domain receptor 3 antibody
EP3224275B1 (en) 2014-11-14 2020-03-04 F.Hoffmann-La Roche Ag Antigen binding molecules comprising a tnf family ligand trimer
MA41460A (fr) 2015-02-03 2017-12-12 Oncomed Pharm Inc Agents de liaison à la tnfrsf et leurs utilisations
WO2016156291A1 (en) 2015-03-31 2016-10-06 F. Hoffmann-La Roche Ag Antigen binding molecules comprising a trimeric tnf family ligand
WO2016162356A1 (en) 2015-04-07 2016-10-13 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Anti-pd-l1 immunotoxin for use in therapy
US10647756B2 (en) 2015-05-18 2020-05-12 Pfizer Inc. Humanized antibodies
AU2016323440B2 (en) 2015-09-15 2023-07-13 Amgen Inc. Tetravalent bispecific and tetraspecific antigen binding proteins and uses thereof
TWI703158B (zh) 2015-09-18 2020-09-01 美商希佛隆公司 特異性結合tl1a之抗體
BR112018002570A2 (pt) 2015-10-02 2018-10-16 Hoffmann La Roche molécula de ligação ao antígeno biespecífica, anticorpo biespecífico, polinucleotídeos, anticorpo que se liga especificamente ao ox40, composição farmacêutica e método para inibir o crescimento de células tumorais em um indivíduo
WO2017077715A1 (en) 2015-11-02 2017-05-11 La Jolla Institute For Allergy & Immunology Method and medicament for treating airway and/or lung diseases
ITUB20155097A1 (it) 2015-11-05 2017-05-05 Biouniversa Srl Anticorpi umanizzati anti-BAG3
CR20180365A (es) 2015-12-16 2018-09-28 Amgen Inc PROTEÍNAS DE UNIÓN AL ANTÍGENO BISPECÍFICO DE ANTI-TL1A/ANTI-TNF-a Y SUS USOS
RU2750454C2 (ru) 2016-04-29 2021-06-28 Пфайзер Инк. Антитела против интерферона бета и их применение
EP3455256A1 (en) 2016-05-09 2019-03-20 Bristol-Myers Squibb Company Tl1a antibodies and uses thereof
EP3487868A4 (en) 2016-07-25 2020-07-29 Cephalon, Inc. WASHING PAD FOR AFFINITY CHROMATOGRAPHY
EP3532489A4 (en) 2016-10-26 2020-07-08 Cedars-Sinai Medical Center ANTI-TL1A NEUTRALIZING MONOCLONAL ANTIBODIES
WO2018112240A1 (en) 2016-12-14 2018-06-21 Progenity Inc. Treatment of a disease of the gastrointestinal tract with a tnf inhibitor
EP4249068A3 (en) 2017-10-10 2023-11-22 Sanofi Anti-cd38 antibodies and combinations with anti-cd3 and anti-cd28 antibodies
AU2018387741A1 (en) 2017-12-19 2020-07-23 F-Star Therapeutics Limited FC binding fragments comprising a PD-L1 antigen-binding site
CN112585165A (zh) 2018-04-25 2021-03-30 普罗米修斯生物科学公司 优化的抗tl1a抗体
BR112021000394A2 (pt) 2018-07-12 2021-04-06 F-Star Beta Limited Moléculas de anticorpo que se ligam a pd-l1 e cd137
GB201811450D0 (en) 2018-07-12 2018-08-29 F Star Delta Ltd Mesothelin and CD137 binding molecules
KR20210031479A (ko) 2018-07-12 2021-03-19 에프-스타 베타 리미티드 Cd137 및 ox40에 결합하는 항체 분자
GB201811410D0 (en) 2018-07-12 2018-08-29 F Star Beta Ltd OX40 Binding molecules
GB201811408D0 (en) 2018-07-12 2018-08-29 F Star Beta Ltd CD137 Binding Molecules
GB201811404D0 (en) 2018-07-12 2018-08-29 F Star Beta Ltd Anti-CD137 Antibodies
GB201811415D0 (en) 2018-07-12 2018-08-29 F Star Beta Ltd Anti-Mesothelin Anti bodies
BR112021006558A2 (pt) 2018-10-09 2021-07-13 Sanofi proteínas de ligação triespecíficas anti-cd38, anti-cd28 e anti-cd3 e métodos de uso para o tratamento de infecção viral
BR112021007175A2 (pt) 2018-10-23 2021-08-10 Dragonfly Therapeutics, Inc. proteínas fundidas a fc heterodimérico

Also Published As

Publication number Publication date
EP4048309A4 (en) 2024-02-21
MX2022004942A (es) 2022-07-27
CO2022006679A2 (es) 2022-05-31
CN114901311A (zh) 2022-08-12
US20220259320A1 (en) 2022-08-18
JP2022553324A (ja) 2022-12-22
KR20220103721A (ko) 2022-07-22
AU2020371725A1 (en) 2022-05-26
US20210122828A1 (en) 2021-04-29
IL292419A (en) 2022-06-01
EP4048309A1 (en) 2022-08-31
CA3158638A1 (en) 2021-04-29
BR112022007720A2 (pt) 2022-08-23
US11292848B2 (en) 2022-04-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7301540B2 (ja) 抗体の混合物
AU2016333517B2 (en) Anti-PD-1 antibodies and compositions
WO2019149269A1 (zh) 全人源的抗b细胞成熟抗原(bcma)单链抗体及其应用
JP6976322B2 (ja) 新規抗ctla4抗体
DK2705057T3 (en) THERAPEUTIC immunoglobulins FOR DOGS AND METHODS OF USE THEREOF
KR102386154B1 (ko) Epo를 표적화하는 항체에 대한 조성물 및 방법
JP2017535257A (ja) 免疫応答およびがん治療の増強に使用するための組成物および方法
WO2021081365A1 (en) Humanized antibodies to tnf-like ligand 1a (tl1a) and uses thereof
US20220259320A1 (en) Humanized antibodies to tnf-like ligand 1a (tl1a) and uses thereof
KR20170110681A (ko) Pcsk9 항체, 및 약제학적 조성물 및 이의 용도
AU2019293530A1 (en) Anti-L1CAM antibodies and uses thereof
WO2020003210A1 (en) Anti-l1cam antibodies and uses thereof
WO2022176970A1 (ja) 新規抗pad4抗体
WO2022178159A1 (en) Compositions comprising humanized antibodies to tnf-like ligand 1a (tl1a) and uses thereof
WO2023009545A1 (en) Compositions comprising humanized antibodies to tnf-like ligand 1a (tl1a) and uses thereof
CN117222429A (zh) 包括针对tnf样配体1a(tl1a)的人源化抗体的组合物以及其用途
CN117202932A (zh) 治疗肺部的抗tl1a抗体组合物和方法
WO2023133538A2 (en) Methods of treating inflammatory diseases with combination of tl1a inhibitors and il23 inhibitors
AU2022221712A1 (en) Anti-tl1a antibody compositions and methods of treatment in the lung
JP2024028198A (ja) 新規抗pad4抗体を含む医薬組成物
TW202409089A (zh) 1型大麻素受體結合蛋白及其用途
WO2023039672A1 (en) Methods of treating cancer with anti-her2 biparatopic antibodies
AU2022346447A1 (en) Methods of treating cancer with anti-her2 biparatopic antibodies
AU2022272427A1 (en) Antigen binding molecule specifically binding to rankl and ngf, and medical use thereof

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: DE

Ref document number: 40083951

Country of ref document: HK