CN115015450A - 一种微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种微波衍生‑拟靶标气相色谱‑质谱分析土壤中代谢物的方法,包括:1)将内标物质与提取溶剂加入到土壤样品中,涡旋提取并离心过滤得提取溶液;2)在低温条件下离心浓缩得冻干提取物;3)加入转移溶剂,转移上层清液于色谱瓶中,常温条件下氮气流下干燥,再加二氯甲烷干燥得完全干燥的土壤提取物;4)加入衍生化试剂后在微波加热反应条件下进行肟化和硅烷衍生化,得土壤代谢物衍生化产物;5)加入正十二烷吡啶溶液,混匀后取上层清液于微量色谱瓶中,采用拟靶标气相色谱‑质谱的方式进行分离、定性与定量。本发明建立的土壤代谢组分析方法可以较全面、综合地体现土壤代谢产物的差异情况,能广泛的应用于环境及土壤科学研究。
Description
技术领域
本发明涉及一种微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法,属于土壤微生物代谢组学研究的定性与定量分析方法领域。
背景技术
代谢组学是对生物或细胞在特定生理时期内全部低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析,以样本中主要代谢物为变量,通过高通量的检测和数据处理手段,对数据信息进行建模与预测,研究土壤在外界环境发生变化后其代谢产物的变化规律。土壤代谢组学具有极大的应用前景,主要表现为:1、土壤微生物群落代谢组图谱提供了一种潜在的表征土壤及评估土壤生物群落代谢状态的方法;2、土壤代谢组学指纹图谱与土壤养分评价指标密切有关,如包括pH、土地利用、水分和盐度等指标;3、土壤代谢组学能够区分土壤类别及可作为土壤质量评价指标的潜在能力;4、土壤代谢组学为揭示土壤微生物群落中复杂的分子网络和代谢途径以及评价土壤功能提供了一定依据;5、土壤代谢组学能够揭示化感代谢物对微生物群落结构及功能的影响。
代谢组学技术能够识别相互作用代谢途径中的生化中间产物,潜在地提高了对土壤中生物过程的整体理解,并提高预测结果的能力。将代谢组学应用于土壤微生物组,可以提供一种表征微生物群落差异活动的方法,反映微生物基因组与环境的相互作用,从而提供一种评估土壤健康的新方法。这有利于对细胞途径及非生物和生物胁迫下群落的反应进行理解,也可以对土壤基本生化功能提出新的见解。结合互补的“组学”技术(基因组学、蛋白质组学、转录组学),代谢图谱可以更全面地理解与环境线索相关的分子机制,更容易地区分代谢物诱导的酶抑制和基因组或蛋白质组调节,同时也有可能提供对土壤微生物分子途径及其与环境关联性的深入和整体的理解。
气相色谱-质谱能够覆盖绝大多数的初级代谢物与部分次生代谢物,标准谱库的物质鉴定结合其高分离能力,已成为代谢组学研究中重要的分析工具。但由于土壤的高复杂性和异质性,使其具有独特的物理和化学性质,如强吸附性和高含量的有机质、金属离子等,可能会影响到代谢物的提取效率和衍生反应效率。例如,氨基(如胺和氨基酸)对硅烷化反应的反应性低,不完全或部分衍生化往往导致单一分析物出现多个峰、峰重叠、峰小或缺失,从而导致定性与定量不准确。土壤基质中的代谢物丰度远低于植物,现已鉴定的代谢物类型和数量也有限,一般少于100种代谢物,无法全面地体现土壤代谢产物的差异情况。此外,在常规加热衍生化反应条件下,衍生化时间通常需要2-3h。因此,有必要开发一种提高特异性、通量、覆盖率的代谢组学分析方法,以适应土壤基质的特殊性。
发明内容
基于上述,本发明提供一种微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法,目的是设计一种高特异性、通量、覆盖率的代谢组学分析方法,方法可以全面、综合地体现土壤代谢产物的差异情况,为研究土壤代谢组学提供一种速度快、高稳定性、高灵敏度、宽线性、高覆盖性的分析方法,以克服现有技术的不足。
本发明的技术方案是:一种微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法,包括:
S1土壤样品提取:将内标物质与提取溶剂加入到土壤样品中,混匀,涡旋提取,离心过滤得土壤提取溶液;
S2土壤提取溶液低温干燥:将土壤提取溶液在0-8℃条件下离心浓缩,得到冻干提取物;采用低温冷冻干燥能最大程度降低微生物活性,减少代谢物降解。
S3土壤冻干提取物溶解:向冻干提取物中加入转移溶剂,涡旋溶解,离心,转移上层清液于色谱瓶中,常温条件下氮气流下干燥,再加二氯甲烷干燥,得到完全干燥的土壤提取物;对代谢物再次溶解与干燥处理能最大程度减少结晶水的衍生化的影响,也能减少有机质及金属离对硅烷化的基质效应。
S4土壤代谢物衍生化:向完全干燥的土壤提取物中加入衍生化试剂,涡旋混匀,在微波反应条件下进行肟化和硅烷衍生化,得土壤代谢衍生化产物;采用肟化和硅烷2步衍生化能有效保护羰基,减少糖类代谢物定量的多重异构体峰,减少色谱峰的复杂性,且使得衍生化产物具有较高的挥发性进行气相色谱-质谱分析。
S5土壤代谢物衍生化产物的转移:向土壤代谢衍生化产物中加入正十二烷吡啶溶液,涡旋混匀,离心后取上层清液于微量色谱瓶中;
S6土壤代谢衍生化产物的测定:采用拟靶标气相色谱-质谱的方式对土壤代谢衍生化产物进行分离、定性与定量,以保留时间、保留指数、标准品及质谱数据库比对进行定性,内标法定量。
可选的,在土壤样品提取中,内标物质为邻甲氧基苯酚-D3、L-(+)-正缬氨酸、己二酸、阿东糖醇、棕榈酸-D31和苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷水合物。
可选的,在土壤样品提取中,采用甲醇:水(v:v=3:2)与水作为提取溶剂进行序列提取,甲醇:水提取2次,水提取1次。
可选的,在土壤冻干提取物溶解中,转移溶剂为甲醇溶液,转移进行衍生化的容器为螺旋颈回收瓶。
可选的,在土壤代谢物衍生化中,衍生化试剂先加入甲氧胺盐酸盐吡啶溶液肟化反应,再加入BSTFA+1%TMCS硅烷化反应,体积比为1:5-1:6(甲氧胺盐酸盐吡啶溶液与BSTFA+1%TMCS v/v)。
可选的,在土壤代谢物衍生化反应中,微波能量为800w,肟化微波加热反应分别3+2min;硅烷化衍生微波加热反应分别3+3+3min。
可选的,气相色谱-质谱分析的条件为:拟靶标气相色谱-质谱的方式采集数据进行定量;色谱柱:HP-5MS(60m×250μm×0.25μm)毛细管色谱柱,进样口温度:280℃;进样量:1.00uL;分流比:8:1;柱流速:1.0mL/min;升温程序:60℃保持2min,然后以5℃/min升到230℃保持5min,8℃/min升到290℃保持25.5min,一共运行74min;质谱条件:离子源温度:230℃,四级杆温度:150℃;电离能:70eV,传输线温度:280℃,全扫描质量数范围45-600aum,溶剂延迟:11.90min;采集模式:全扫描(Scan)采集;MS谱库:NIST14库和Willy08库,对定性的物质进行拟靶标代谢组学方法进行选择离子扫描定量。
本发明的有益效果是:发明了一种土壤中代谢物的前处理方法,主要包括提取、干燥及衍生化3个步骤,采用拟靶标气相色谱-质谱的方法对土壤代谢物衍生化产物进行定性与定量。合适的提取、干燥是决定衍生化反应程度的关键。本发明中提取方法能高覆盖度的提取土壤中的代谢物,且减少土壤干扰物质的提取,进一步的转移再干燥可以最大程度减少结晶水的衍生化的影响,也能减少有机质及金属离子对硅烷化的基质效应。本发明中的提取、干燥方法确保了高效率的肟化与硅烷化反应,获得最佳的线性、精密度与灵敏度。该分析方法简单易行,可以较全面、综合地体现土壤代谢产物的差异情况,可以广泛的应用于环境及土壤科学研究。方法为土壤代谢组学提供一种速度快、高稳定性、高灵敏度、宽线性、高覆盖性的分析方法。
与现有技术相比,本发明还具有以下优点:1)玻璃螺旋颈回收瓶进行衍生化能有效减少杂质的干扰,提高代谢物鉴定的准确度;2)微波反应衍生化,能减少代谢组学样品的分析时间,从2-3h减少到14min左右;3)拟靶标代谢组学定性与定量方法能分析更低丰度的代谢物,稳定性更高;4)土壤代谢物鉴定达到184个;5)衍生化试剂BSTFA替代MSTFA能够有效提高氨基酸、酚类、短链胺、糖醇等代谢物的反应衍生化效率;6)与常规加热衍生化反应比较,本发明分析速度快,高稳定性、高灵敏度、宽线性、高覆盖性。
附图说明
图1微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法流程图;
图2质量控制土壤样品(QC)重复性分析(±2SD以内);
图3土壤代谢物对根际土(Gjt)与非根际土(Fgjt)的主成分分析(左)与偏最小二乘-判别分析(右);
图4S-plot对根际土(Gjt)与非根际土(Fgjt)中的差异代谢物筛选;
图5VIP图对根际土(Gjt)与非根际土(Fgjt)中的差异代谢物筛选;
图6微波辅助衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析质量控制土壤样品(QC)典型色谱图(A为全扫描图谱;B为选择性离子扫描图谱)。
具体实施方式
为使本发明的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂,下面结合附图对本发明的具体实施方式做详细的说明。在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本发明。但是本发明能够以很多不同于在此描述的其它方式来实施,本领域技术人员可以在不违背本发明内涵的情况下做类似改进,因此本发明不受下面公开的具体实施的限制。
实施例1:一种微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法
S1土壤样品提取:将0.5g过筛的土壤(冷冻干燥)置于10mL玻璃锥形管中,然后加入6μL内标混合液为邻甲氧基苯酚-D3、L-(+)-正缬氨酸、己二酸、阿东糖醇、棕榈酸-D31和苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷水合物(0.250mg/mL、0.272mg/mL、0.528mg/mL、0.210mg/mL、0.260mg/mL和0.520mg/mL,50%甲醇水作为溶剂)和1.5mL预冻(4℃)甲醇-水(v:v 3:2)。使用多管旋涡振荡器强旋涡(2500rpm)与4℃下提取土壤样品5min,然后,将样品离心5min(3000rpm,4℃),并用0.22μm尼龙膜过滤于5mL玻璃锥形管中。依次用0.8mL甲醇:水(v:v 3:2)与0.8mL水重复提取1次。
S2土壤提取溶液低温干燥:根据上述步骤S1得到3次提取溶液合并到5mL玻璃锥形管中,约4℃条件下冷冻干燥离心浓缩18h,得到土壤冻干提取物。土壤样品提取应尽可能冷却,以限制微生物的活性,减少代谢物降解,最后得土壤冻干提取物。
S3土壤冻干提取物溶解:向冻干土壤提取物中加入300μL甲醇,2500rpm涡旋5min,3000rpm离心5min,转移上层清液于2mL螺旋颈回收瓶中常温氮气流下干燥,再加入300μL二氯甲烷干燥,得到完全干燥的土壤提取物。
S4土壤代谢物衍生化:向完全干燥的土壤提取物中通过加入17μL甲氧胺盐酸盐(25mg/mL,吡啶配制)进行肟化反应,微波反应3+2min,能量为800W。然后,加入103μL BSTFA+1%TMCS,进行3+3+3min的微波硅烷化反应。反应时间间隔稍微冷却1分钟的情况下进行。因为长时间会导致样品过热,从而导致压力升高,可能导致反应瓶爆炸。
S5土壤代谢物衍生化产物的转移:反应冷却后,加入5μL正十二烷吡啶溶液(1.00mg/mL)并混匀。将所得溶液离心5分钟(3000rpm),取上层清液于150uL微量色谱瓶中进行拟靶标气相色谱-质谱分析。
S6土壤代谢衍生化产物的测定:采用拟靶标气相色谱-质谱的方式进行定性与定量,以保留时间、保留指数、标准品及质谱数据库等比对进行定性,内标法邻甲氧基苯酚-D3、L-(+)-正缬氨酸、己二酸、阿东糖醇、棕榈酸-D31和苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷水合物进行定量。采用气相色谱-质谱检测器进行色谱分析,色谱柱:HP-5MS(60m×250μm×0.25μm)毛细管色谱柱,进样口温度:280℃;进样量:1.00uL;分流比:8:1;柱流速:1.0mL/min;升温程序:60℃保持2min,然后以5℃/min升到230℃保持5min,8℃/min升到290℃保持25.5min,一共运行74min。质谱条件:离子源温度:230℃,四级杆温度:150℃;电离能:70eV,传输线温度:280℃,全扫描质量数范围45-600aum,溶剂延迟:11.90min;采集模式:全扫描(Scan)采集。MS谱库:NIST14库和Willy08库,对定性的代谢物采用拟靶标代谢组学方法进行选择离子扫描定量。
实施例2:土壤代谢物定性分析
在实施例1的基础上,通过质谱数据库、文献、保留指数、标准品等对土壤代谢物质进行鉴定,鉴定的物质组成如下:一共包含184种土壤代谢产物,主要包含了可以分为26类代谢物,主要有糖水化合物27种、氨基酸18种、长链脂肪酸18种、土壤酚酸15种、糖醇13种、短链脂肪酸12种、长链脂肪醇10种、多元醇10种、二元羧酸6种、磷酯6种、羟基羧酸6种、甾醇6种等。表明该方法定性定量的主要物质为初级代谢物,同时也包括少部分次生代谢物,这些物质包含了初级代谢产物中80-90%的代谢物,可以有效的进行代谢途径分析。
实施例3:土壤代谢物定量分析
在实施例2的基础上,土壤中代谢物的含量按照式(1)进行计算。
式中,
R——土壤样品中代谢物质的含量,单位为微克每克(μg/g);
c——相对定量校正的内标物质浓度,单位为毫克每毫升(mg/mL);
v——添加内标的体积含量,单位为微升(μL);
s1——土壤样品中代谢物质面积;
s2——土壤样品定量内标物质面积;
m——样品的质量,单位为克(g);
取QC样品进行方法重现性及稳定性进行验证,结果表明重复性94%的土壤代谢物的相对标准偏差小于20%,重现性92.9%的土壤代谢物的相对标准偏差小于25%,稳定性表现为18h内偏差小于10%,24h偏差小于20%,且大部分土壤代谢物仍然小于10%。
应用例4:根际土壤与非根际土壤差异分析
根际土壤与非根际土壤按实施例1方法进行操作,采用微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析根际土与非根际土壤中代谢物,同时将等质量混匀的样品作为土壤质量控制样品QC进行分析以监测稳定性,对QC进行主成分分析,结果如图2所示,QC样品波动都小于2SD,且基本在0值波动较小,表明在样品分析中具有较好的稳定性,符合代谢分析的要求。对根际土与非根际土进行主成分差异分析,结果表明二者在第一成分上区分明显,表明二者差异较大,进一步采用偏最小二乘判别分析进行区分,获得类似的区分结果,以上结果说明烟草根际土与非根际土在代谢物上的差异显著,这与根系具有富集代谢物与微生物、同时还能够分泌代谢物等功能有关(图3)。
对根际土与非根际土起区分作用的关键代谢物分别用S-plot与VIP值进行筛选,结果表明大部分代谢物都在根系富集,富集上调的代谢物有55种,而下调的代谢物只有4种(图4和图5)。对关键代谢物进行分类,显示富集上调的代谢物主要为氨基酸类10种、糖类10种、高级脂肪酸10种、酚酸类8种、短链脂肪酸类4种、多元醇酸4种等,而下调的代谢物为胺类3种、磷酸化糖1种(表1)。富集代谢物主要表现氨基酸、糖类等,这些代谢物主要是微生物与烟草的营养物质,高级脂肪酸是合成微生物细胞膜的重要成分,而酚酸类是引起土壤连作障碍的一种关键化感物质,短链脂肪酸是一类显著改变微生物群落的一种有机酸。以上研究结果表明,烟草根际土与非根际土代谢物的分析值得进一步深入进行功能研究。
表1根际土与非根际土的差异代谢物种类与分类
以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。
Claims (7)
1.一种微波衍生-拟靶标气相色谱-质谱分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,包括:
S1土壤样品提取:将内标物质与提取溶剂加入到土壤样品中,混匀,涡旋提取,离心过滤得土壤提取溶液;
S2土壤提取溶液低温干燥:将土壤提取溶液在0-8℃条件下离心浓缩,得到冻干提取物;
S3土壤冻干提取物溶解:向冻干提取物中加入转移溶剂,涡旋溶解,离心,转移上层清液于色谱瓶中,常温条件下氮气流下干燥,再加二氯甲烷干燥,得到完全干燥的土壤提取物;
S4土壤代谢物衍生化:向完全干燥的土壤提取物中加入衍生化试剂,涡旋混匀,在微波加热条件下进行肟化和硅烷衍生化反应,得土壤代谢物衍生化产物;
S5土壤代谢物衍生化产物的转移:向土壤代谢物衍生化产物中加入正十二烷吡啶溶液,涡旋混匀,离心后取上层清液于微量色谱瓶中;
S6土壤代谢衍生化产物的测定:采用拟靶标气相色谱-质谱的方式对土壤代谢物衍生化产物进行分离、定性与定量,以保留时间、保留指数、标准品及质谱数据库比对进行定性,内标法定量。
2.根据权利要求1所述的分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,在土壤样品提取中,内标物质为邻甲氧基苯酚-D3、L-(+)-正缬氨酸、己二酸、阿东糖醇、棕榈酸-D31和苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷水合物。
3.根据权利要求1所述的分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,在土壤样品提取中,采用甲醇:水(v:v=3:2)与水作为提取溶剂进行序列提取,甲醇:水提取2次,水提取1次。
4.根据权利要求1所述的分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,在土壤冻干提取物溶解中,转移溶剂为甲醇溶液,转移进行衍生化的容器为螺旋颈回收瓶。
5.根据权利要求1所述的分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,在土壤代谢物衍生化中,衍生化试剂先加入甲氧胺盐酸盐吡啶溶液进行肟化反应,再加入BSTFA+1%TMCS进行硅烷化反应,甲氧胺盐酸盐吡啶溶液与BSTFA+1%TMCS的体积比为1:5-1:6。
6.根据权利要求5所述的分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,在土壤代谢物衍生化反应中,微波能量为800w,肟化微波加热反应分别3+2min;硅烷化衍生微波加热反应分别3+3+3min。
7.根据权利要求1所述的分析土壤中代谢物的方法,其特征在于,气相色谱-质谱分析的条件为:拟靶标气相色谱-质谱的方式采集数据进行定量;色谱柱:HP-5MS(60m×250μm×0.25μm)毛细管色谱柱,进样口温度:280℃;进样量:1.00uL;分流比:8:1;柱流速:1.0mL/min;升温程序:60℃保持2min,然后以5℃/min升到230℃保持5min,8℃/min升到290℃保持25.5min,一共运行74min;质谱条件:离子源温度:230℃,四级杆温度:150℃;电离能:70eV,传输线温度:280℃,全扫描质量数范围45-600aum,溶剂延迟:11.90min;采集模式:全扫描(Scan)采集;MS谱库:NIST14库和Willy08库,对定性的物质进行拟靶标代谢组学方法进行选择离子扫描定量。
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