CN113403255A - 一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,1)配制试剂与培养基,2)组织预处理,3)组织消化解离,4)终止消化,5)μm细胞过滤器过滤,6)获取目的组织单细胞悬液;7)测活细胞得率,本发明制备鱼类组织单细胞悬液的方法,能够实现低成本、快速、高效获得鱼类组织单细胞悬液,并保证解离的细胞保持良好活率,可应用于大范围的鱼类细胞的解离、分离纯化以及细胞系的建立,为鱼类单细胞、基因功能及遗传育种研究提供重要参考资料。
Description
技术领域
本发明涉及基因检测技术领域,具体为一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法。
背景技术
近年来,随着生物研究领域技术的飞速发展,单细胞测序技术应运而生,该技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术。单细胞测序能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达情况,对细胞进行分类比较,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、免疫学、微生物学等领域发挥重要作用。
不同的组织细胞具有各自独特的生理特性,是导致组织细胞培养成为世界性难题的主要原因。现存的实验技术仍不能获得细胞活率较好的组织单细胞悬液,制约着组织的细胞培养、细胞系的建立和功能基因验证等方面研究工作。因此,高效制备组织单细胞悬液有助于建立和优化成体组织细胞的体外培养技术,为细胞系的建立提供重要的参考资料,并在功能基因、遗传育种等研究领域具有重要的理论和实践意义。
发明内容
本发明的提供一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法。
本发明的方案是:
一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,包括下列步骤:
1)配制试剂与培养基,培养基包括无血清培养基与完全培养基,配制细胞清洗液,配制混合酶解离原液;
2)组织预处理,在无菌无RNA酶细胞培养皿中加入适量1*DPBS溶液;组织剪碎成0.5~1mm2小块后,吸入已含有1*DPBS溶液的15ml试管中,并用1*DPBS溶液冲洗1~2次,直至把多余组织去除干净;
3)组织消化解离,吸除多余1*DPBS溶液,加入3~5ml混合酶解离原液;消化孵育,37℃水浴锅,15min;
4)终止消化:加入早配置好的等体积培养基溶液,轻轻吸打混匀,肉眼观察不见其中的组织小段,转移至50ml试管中;
5)μm细胞过滤器过滤,将4)中获取的细胞悬液混匀后通过细胞过滤器缓慢吸吹至新的试管中,并在试管管壁上标记;
6)获取目的组织单细胞悬液;
7)测活细胞得率,吸取AO/PI染液与等体积的步骤6)的目的组织单细胞悬液充分混匀后吸打充入计数板中的池中,由细胞计数仪测得活细胞比率。
作为优选的技术方案,每100ml所述无血清培养基中含有99ml的基础培养基与1ml的青链霉素混合液,每100ml所述的培养基中含有89ml的基础培养基、10ml的FBS与1ml的青链霉素混合液,所述基础培养基为M199-HEPES培养基。
作为优选的技术方案,所述细胞清洗液为HBSS-5%FBS溶液,所述HBSS-5%FBS溶液含有95mlHBSS溶液与5mlFBS溶液。
作为优选的技术方案,所述混合酶解离原液包括胶原酶Ⅱ的冻干粉,DispaseII的冻干粉与无血清基础培养基,每10ml的无血清基础培养基中加入10mg胶原酶Ⅱ型的冻干粉与5mg DispaseII的冻干粉,配制混合酶解离原液,所述无血清基础培养基为M199-HEPES培养基。
作为优选的技术方案,所述步骤5)中细胞过滤器为40μm的细胞过滤器。
作为优选的技术方案,所述步骤6)中获取目的组织单细胞悬液的方法如下:
重悬计数,将步骤5)中过滤的细胞悬液混匀后,1100rpm,5min离心后弃上清液,加入200~500ul含有5%FBS的HBSS细胞清洗液重悬;吸取重选后的细胞悬液10ul和10ul的AO/PI染液混匀后打入计数板,细胞计数仪计数后,获取原始单细胞悬液浓度。
获取目的组织单细胞悬液,用5%FBS的HBSS细胞清洗液将原始单细胞悬液浓度稀释至8.5*105~1.8*106cells/ml。
作为优选的技术方案,所述步骤2)中多余组织包括血液、脂肪。
本发明还公开了一种鱼类组织单细胞悬液。
本发明还公开了一种鱼类组织单细胞悬液在单细胞测序中的应用。
由于采用了上述技术方案,一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,1)配制试剂与培养基,培养基包括无血清培养基与完全培养基,配制细胞清洗液,配制混合酶解离原液;2)组织预处理,在无菌无RNA酶细胞培养皿中加入适量1*DPBS溶液;组织剪碎成0.5~1mm2小块后,吸入已含有1*DPBS溶液的15ml试管中,并用1*DPBS溶液冲洗1~2次,直至把多余组织去除干净;3)组织消化解离,吸除多余1*DPBS溶液,加入3~5ml混合酶解离原液;消化孵育,37℃水浴锅,15min;4)终止消化:加入早配置好的等体积培养基溶液,轻轻吸打混匀,肉眼观察不见其中的组织小段,转移至50ml试管中;5)μm细胞过滤器过滤,将4)中获取的细胞悬液混匀后通过细胞过滤器缓慢吸吹至新的试管中,并在试管管壁上标记;6)获取目的组织单细胞悬液;7)测活细胞得率,吸取AO/PI染液与等体积的步骤6)的目的组织单细胞悬液充分混匀后吸打充入计数板中的池中,由细胞计数仪测得活细胞比率。
本发明的优点,本发明制备鱼类组织单细胞悬液的方法,能够实现低成本、快速、高效获得鱼类组织单细胞悬液,并保证解离的细胞保持良好活率,可应用于鱼类的细胞的解离、分离纯化以及细胞系的建立,为鱼类单细胞、基因功能及遗传育种研究提供重要参考资料。
附图说明
图1为本发明的制备流程图;
图2为本发明实施例鱼类组织单细胞悬液质检结果(AO/PI)图。
具体实施方式
为了弥补以上不足,本发明提供了一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法以解决上述背景技术中的问题。
一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,包括下列步骤:
1)配制试剂与培养基,培养基包括无血清培养基与完全培养基,配制细胞清洗液,配制混合酶解离原液;
2)组织预处理,在无菌无RNA酶细胞培养皿中加入适量1*DPBS溶液;组织剪碎成0.5~1mm2小块后,吸入已含有1*DPBS溶液的15ml试管中,并用1*DPBS溶液冲洗1~2次,直至把多余组织去除干净;
3)组织消化解离,吸除多余1*DPBS溶液,加入3~5ml混合酶解离原液;消化孵育,37℃水浴锅,15min;
4)终止消化:加入早配置好的等体积培养基溶液,轻轻吸打混匀,肉眼观察不见其中的组织小段,转移至50ml试管中;
5)μm细胞过滤器过滤,将4)中获取的细胞悬液混匀后通过细胞过滤器缓慢吸吹至新的试管中,并在试管管壁上标记;
6)获取目的组织单细胞悬液;
7)测活细胞得率,吸取AO/PI染液与等体积的步骤6)的目的组织单细胞悬液充分混匀后吸打充入计数板中的池中,由细胞计数仪测得活细胞比率。
每100ml所述无血清培养基中含有99ml的基础培养基与1ml的青链霉素混合液,每100ml所述的培养基中含有89ml的基础培养基、10ml的FBS与1ml的青链霉素混合液,所述基础培养基为M199-HEPES培养基。
所述细胞清洗液为HBSS-5%FBS溶液,所述HBSS-5%FBS溶液含有95mlHBSS溶液与5mlFBS溶液。
所述混合酶解离原液包括胶原酶Ⅱ的冻干粉,DispaseII的冻干粉与无血清基础培养基,每10ml的无血清基础培养基中加入10mg胶原酶Ⅱ型的冻干粉与5mgDispaseII的冻干粉,配制混合酶解离原液,所述无血清基础培养基为M199-HEPES培养基。
所述步骤5)中细胞过滤器为40μm的细胞过滤器。
所述步骤6)中获取目的组织单细胞悬液的方法如下:
重悬计数,将步骤5)中过滤的细胞悬液混匀后,1100rpm,5min离心后弃上清液,加入200~500ul含有5%FBS的HBSS细胞清洗液重悬;吸取重选后的细胞悬液10ul和10ul的AO/PI染液混匀后打入计数板,细胞计数仪计数后,获取原始单细胞悬液浓度。
获取目的组织单细胞悬液,用5%FBS的HBSS细胞清洗液将原始单细胞悬液浓度稀释至8.5*105~1.8*106cells/ml。
所述步骤2)中多余组织包括血液、脂肪。
本发明还公开了一种鱼类组织单细胞悬液。
本发明还公开了一种鱼类组织单细胞悬液在单细胞测序中的应用。
为了使本发明实现的技术手段、创作特征、达成目的与功效易于明白了解,下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。
实施例1:
第一步:配置试剂和培养基
1.分别准备以下两种培养基
(1)无血清培养基:分装的M199-HEPES培养基中含有1%的Penicillin-Streptomycin;99ml M199-HEPES培养基加入1mlPenicillin-Streptomycin
(2)完全培养基:分装的M199-HEPES培养基中含有10%FBS和1%Penicillin-Streptomycin;89ml M199-HEPES培养基加入10mlFBS和1mlPenicillin-Streptomycin;
2.准备细胞清洗液:HBSS-5%FBS溶液:95ml HBSS溶液与5m lFBS溶液混匀;
3.配制混合酶解离原液:将10mgII型胶原酶的冻干粉(Sigma,货号C6885-1G),5mgDispaseII的冻干粉(Sigma,货号D4693-1G)溶于10ml的无血清M199-HEPES培养基(Sigma,货号12340030)中,待完全溶解后,过滤除菌并保存于-20℃冷冻柜中,避免反复冻融。
第二步:组织预处理
在无菌无RNA酶细胞培养皿中加入适量1*DPBS溶液。组织剪碎成0.5-1mm2小块后,吸入已含有1*DPBS溶液的15mltube管中,并用1*DPBS溶液冲洗1-2次,直至把血液、脂肪层等多余组织去除干净。
第三步:组织消化解离
吸除多余1*DPBS溶液,加入3-5ml混合酶解离原液。消化孵育:37℃水浴锅,15min
第四步:终止消化
加入等体积的配置好的培养基溶液,轻轻吸打混匀(肉眼观察不见组织小段),转移至50mltube管中。
第五步:μm细胞过滤器过滤将获取的细胞悬液
通过40μm的细胞过滤器缓慢倒入干净的tube管中,并在管壁上标记。
第六步:获取目的组织单细胞悬液
重悬计数,将步骤5)中过滤的细胞悬液混匀后,1100rpm,5min离心后弃上清液,加入200~500ul含有5%FBS的HBSS细胞清洗液重悬。吸取重选后的细胞悬液10ul和10ul AO/PI染液混匀后打入计数板,细胞计数仪计数后,获取原始单细胞悬液浓度。
获取目的组织单细胞悬液,用5%FBS的HBSS细胞清洗液将原始单细胞悬液浓度稀释至8.5*105~1.8*106cells/ml;
第七步:测活细胞得率
吸取10ulAO/PI染液和等体积的单细胞悬液,充分混匀后吸取20ul充入计数板中的池中。由counterstar的FL20314进行AO-PI质检测得活细胞比率。
(图2所示)
结果如下表1所示,总细胞数在1.49-1.68*106左右,活细胞数在1.24–1.38*106cells/ml之间,活细胞率在79.73-83.98%之间。其中WT野生型和Mu突变体各一个标本,这2个标本均成功进行建库,等待上机测序。
表1如下:
以上显示和描述了本发明的基本原理、主要特征及本发明的优点。本行业的技术人员应该了解,本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和说明书中描述的只是说明本发明的原理,在不脱离本发明精神和范围的前提下,本发明还会有各种变化和改进,这些变化和改进都落入要求保护的本发明范围内。本发明要求保护范围由所附的权利要求书及其等效物界定。
Claims (9)
1.一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)配制试剂与培养基,培养基包括无血清培养基与完全培养基,配制细胞清洗液,配制混合酶解离原液;
2)组织预处理,在无菌无RNA酶细胞培养皿中加入适量1*DPBS溶液;组织剪碎成0.5~1mm2小块后,吸入已含有1*DPBS溶液的15ml试管中,并用1*DPBS溶液冲洗1~2次,直至把多余组织去除干净;
3)组织消化解离,吸除多余1*DPBS溶液,加入3~5ml混合酶解离原液;消化孵育,37℃水浴锅,15min;
4)终止消化:加入早配置好的等体积培养基溶液,轻轻吸打混匀,肉眼观察不见其中的组织小段,转移至50ml试管中;
5)μm细胞过滤器过滤,将4)中获取的细胞悬液混匀后通过细胞过滤器缓慢吸吹至新的试管中,并在试管管壁上标记;
6)获取目的组织单细胞悬液;
7)测活细胞得率,吸取AO/PI染液与等体积的步骤6)的目的组织单细胞悬液充分混匀后吸打充入计数板中的池中,由细胞计数仪测得活细胞比率。
2.如权利要求1所述的一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于:每100ml所述无血清培养基中含有99ml的基础培养基与1ml的青链霉素混合液,每100ml所述的培养基中含有89ml的基础培养基、10ml的FBS与1ml的青链霉素混合液,所述基础培养基为M199-HEPES培养基。
3.如权利要求1所述的一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于:所述细胞清洗液为HBSS-5%FBS溶液,所述HBSS-5%FBS溶液含有95mlHBSS溶液与5mlFBS溶液。
4.如权利要求1所述的一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于:所述混合酶解离原液包括胶原酶Ⅱ的冻干粉,DispaseII的冻干粉与无血清基础培养基,每10ml的无血清基础培养基中加入10mg胶原酶Ⅱ型的冻干粉与5mg DispaseII的冻干粉,配制混合酶解离原液,所述无血清基础培养基为M199-HEPES培养基。
5.如权利要求1所述的一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于:所述步骤5)中细胞过滤器为40μm的细胞过滤器。
6.如权利要求1所述的一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于,所述步骤6)中获取目的组织单细胞悬液的方法如下:
重悬计数,将步骤5)中过滤的细胞悬液混匀后,1100rpm,5min离心后弃上清液,加入200~500ul含有5%FBS的HBSS细胞清洗液重悬;吸取重选后的细胞悬液10ul和10ul的AO/PI染液混匀后打入计数板,细胞计数仪计数后,获取原始单细胞悬液浓度。
获取目的组织单细胞悬液,用5%FBS的HBSS细胞清洗液将原始单细胞悬液浓度稀释至8.5*105~1.8*106cells/ml。
7.如权利要求1所述的一种鱼类组织单细胞悬液的制备方法,其特征在于:所述步骤2)中多余组织包括血液、脂肪。
8.如权利权利要求1至7中任一项所述的方法制备的鱼类组织单细胞悬液。
9.如权利要求8所述的鱼类组织单细胞悬液在单细胞测序中的应用。
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