CN107708733B - 抗分拣蛋白抗体和其使用方法 - Google Patents

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Abstract

本公开一般说来针对包括特异性地结合例如人分拣蛋白或哺乳动物分拣蛋白的分拣蛋白内的一个或多个表位的抗体,例如单克隆、嵌合、人源化抗体、抗体片段等的组合物,和所述组合物用于对有需要的个体进行预防、降低其风险或进行治疗的用途。

Description

抗分拣蛋白抗体和其使用方法
相关申请的交叉参考
本申请要求2015年4月7日提交的美国临时申请号62/144,270的权益,所述临时申请以引用的方式整体并入本文。
呈ASCII文本文件形式的序列表的提交
呈ASCII文本文件形式的以下提交的内容以引用的方式整体并入本文:序列表的计算机可读形式(CRF)(文件名称:735022000240SEQLIST.TXT,记录日期:2016年4月6日,大小:345KB)。
发明领域
本公开涉及抗分拣蛋白抗体和所述抗体的治疗用途。
发明背景
分拣蛋白是I型跨膜蛋白,其充当数种配体的受体,并且用于从反式高尔基体网络(TGN)选择货物分选至晚期内体和用于降解的溶酶体。分拣蛋白具有大的细胞外域,所述细胞外域是VPS10家族的一部分,与酵母VPS10P同源,并且含有10叶片β-螺旋桨结构和富半胱氨酸10CC模块(Nykjaer,A等人,(2012)Trends Neurosci 35:261-270;和Zheng,Y等人,(2011)PLoS One 6:e21023)。分拣蛋白的一小部分可由ADAM10或γ-分泌酶的活性遮蔽(<5%)(Nykjaer,A等人,(2012)Trends Neurosci 35:261-270;和Willnow,TE等人,(2011)Curr Opin Lipidol 22:79-85)。
分拣蛋白结合分泌性蛋白颗粒蛋白前体(PGRN)并且靶向PGRN以用于溶酶体降解,因此不利地调节PGRN的细胞外水平(Hu,F等人(2010)Neuron 68,654-667。一致地,分拣蛋白的缺乏显著地增加小鼠模型(体内)和人细胞(体外)中的血浆PGRN水平(Carrasquillo,M.M等人,(2010)Am J Hum Genet 87,890-897;Lee,W.C等人,(2014)23,1467-1478)。此外,分拣蛋白中的多态性显示出与人中的PGRN血清水平强烈地相关(Carrasquillo MM等人,2010),Am J HumGenet.10;87(6):890-7)。
颗粒蛋白前体(PGRN)是所分泌的、生长因子样、营养和消炎蛋白,其还发挥饮食诱导的肥胖和胰岛素抗性中牵涉的脂肪因子的作用(Nguyen DA等人,(2013).Trends inEndocrinology andMetabolism,24,597-606)。颗粒蛋白前体缺乏占额颞叶痴呆(FTD)的所有可遗传形式的大约25%,额颞叶痴呆(FTD)是一种早发神经变性疾病。具有PGRN的杂合功能缺失型突变的患者具有约50%降低的所述蛋白的细胞外水平并且其将总是发展FTD,使PGRN成为所述疾病的因果基因(Baker,M等人,(2006)Nature 442,916-919;Carecchio M等人,(2011)J Alzheim0ers Dis 27,781-790;Cruts,M等人,(2008)Trends Genet 24,186-194;Galimberti,D等人,(2010)J Alzheimers Dis 19,171-177)。另外,PGRN突变型等位基因已经在阿尔兹海默氏病患者中得到鉴别(Seelaar,H等人,(2011).Journal ofneurology,neurosurgery,and psychiatry 82,476-486)。重要的是,PGRN在具有增加的PGRN水平的数种疾病模型中起保护性作用,从而促进缺血的行为恢复(Tao,J等人,(2012)Brain Res 1436,130-136;Egashira,Y.等人,(2013).JNeuroinflammation 10,105),抑制帕金森氏病模型中的运动缺乏(Van Kampen,J.M等人(2014).PLoS One 9,e97032),削弱肌萎缩性侧索硬化(Laird,A.S等人,(2010).PLoS One 5,e13368.)和关节炎(Tang,W等人,(2011).Science 332,478-484)的模型中的病理学并且预防阿尔兹海默氏病模型中的记忆缺失(Minami,S.S等人,2014).Nat Med 20,1157-1164)。
分拣蛋白还直接地结合于前神经营养蛋白,如神经生长因子前体(前NGF)、前BDNF、前神经营养蛋白-3等,其具有前域并且典型地为促细胞凋亡的。所述前神经营养蛋白前体在应力期间被释放,并且分拣蛋白牵涉于调节其释放以及结合于接收细胞上和与p75NTR联合刺激细胞凋亡中(Willnow,TE等人,(2008)Nat Rev Neurosci9:899-909;Nykjaer,A等人,Trends Neurosci 35:261-270;和Nykjaer,A等人,(2004)Nature 427:843-848;Hiroko Yano等人,(2009)J Neurosci.;29:14790–14802。Teng H.K.等人,J.Neurosci.25:5455-5463(2005))。分拣蛋白还直接地结合于p75NTR(Skeldal S等人,(2012)J Biol Chem.;287:43798)。分拣蛋白还结合于神经紧张素中部分地与颗粒蛋白前体结合重叠的区域中(Quistgaard,EM等人,(2009)Nat Struct Mol Biol 16:96-98;和Zheng,Y等人,PLoS One 6:e21023)。分拣蛋白还与Trk受体NTRK1、NTRK2和NTRK3相互作用;并且可调节其顺行性轴突运输和信号传导(Vaegter,CB等人,(2011)Nat.Neurosci.14:54-61)。分拣蛋白还与淀粉样前体蛋白相互作用并且调节其加工和转运和所引起的病理性β淀粉样肽的产生(Gustafsen C等人,(2013).JNeurosci._2;33(1):64-71。
分拣蛋白也已经显示出结合于阿朴脂蛋白和脂蛋白脂肪酶,并且因此缺乏会导致降低的肝的VLDL释放和降低的胆固醇(Willnow,TE等人,(2011)Curr Opin Lipidol 22:79-85;Kjolby,M等人,(2010)Cell Metab 12:213-223;Nilsson,SK等人,(2007)Biochemistry 46:3896-3904.;Nilsson,SK等人,(2008)J BiolChem 283:25920-25927;和Klinger,SC等人,(2011)J Cell Sci124:1095-1105)。近来,分拣蛋白也已经牵涉于直接地结合于APP(Gustafsen,C等人,(2013)J.Neurosc.33:64-71)以及结合于APP加工酶BACE1(Gustafsen,C等人,(2013)J.Neurosc.33:64-71;和Finan,GM等人,J Biol Chem 286:12602-12616)。分拣蛋白还结合于阿朴脂蛋白E(APOE),结合于Aβ肽(Carlo,AS等人,(2013)J,Neurosc,33:358-370),并且结合于PCSK9(Gustafsen等人,(2014)Cell Metab,19:310-318)。分拣蛋白也已经显示出结合于PCSK9并且调节其细胞外水平,PCSK9引导低密度脂蛋白受体在溶酶体中降解,导致增加的LDL胆固醇的水平(Gustafsen C等人,(2014).CellMetab.2014年2月4日;19(2):310-8)。
当存在于细胞内囊泡(如内体)处时,分拣蛋白的氨基末端细胞外域被引导朝向细胞腔,其中存在囊泡的货物。然而,分拣蛋白的羧基末端细胞内/细胞质域结合于一系列衔接蛋白,所述衔接蛋白调节其从表面并且在细胞内隔室内转运。这些衔接蛋白包括AP2(网格蛋白衔接体以调节细胞表面的内吞作用),和异源五聚体复合物(Retromer Complex)/AP1,其调节从早期内体移动至高尔基体以用于再循环;和与GGA(高尔基体定位,含有γ耳,ADP-核糖基化因子结合)家族蛋白的相互作用以从高尔基体直接地移动至早期内体,通常用于通过溶酶体进行后续降解。因此,分拣蛋白可在其内腔域处结合于配体,同时衔接细胞质衔接体,所述衔接体决定其目的地以决定细胞内命运,如针对颗粒蛋白前体和其它因子的降解。
通过其与如颗粒蛋白前体的蛋白的多种相互作用,分拣蛋白和其多种配体已经显示出牵涉于多种疾病、病症和病况,如额颞叶痴呆、肌萎缩性侧索硬化、肌萎缩性侧索硬化-额颞叶痴呆表型、阿尔兹海默氏病、帕金森氏病、抑郁、神经精神病症、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、年龄相关黄斑变性、青光眼、创伤性脑损伤、老化、癫痫发作、伤口愈合、中风、关节炎和动脉粥样硬化性血管疾病。
因此,需要特异性地结合分拣蛋白并且阻断分拣蛋白结合于如颗粒蛋白前体的其配体,或以其它方式调节所述配体的有效浓度,以便治疗一种或多种与分拣蛋白活性有关的疾病、病症和病况的治疗性抗体。
本文所引用的所有参考文献(包括专利申请和公布)均以引用的方式整体并入本文。
发明概述
本公开大体而言针对抗分拣蛋白抗体和使用所述抗体的方法。本文所提供的方法可用于预防、降低风险或治疗个体,所述个体具有额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤、椎间盘退变或正常老化的一种或多种不需要的症状。
本公开的某些方面至少部分地基于以下抗体的鉴别:能够阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体(参见例如实施例4),能够增加由培养物中的细胞分泌和来自在阿尔兹海默氏病的小鼠模型的脑中的细胞的颗粒蛋白前体的细胞外水平的抗分拣蛋白抗体(参见例如实施例5),能够降低人原代单核细胞中分拣蛋白的细胞水平的抗分拣蛋白抗体(参见例如实施例25),和能够增加体内颗粒蛋白前体的细胞水平的抗分拣蛋白抗体(参见例如实施例26)。令人意外的是,一类抗体显示出能够增加颗粒蛋白前体的细胞外水平而不能阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,抗体S-2、S-15和S-22),而第二类抗体显示出能够阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且增加颗粒蛋白前体的细胞外水平(例如,抗体S-8、S-49和S-60)。此外,能够增加颗粒蛋白前体的细胞外水平的抗分拣蛋白抗体(例如,抗体S-2、S-8、S-15、S-22、S-49和S-60)令人意外地显示出还降低分拣蛋白的细胞水平,如分拣蛋白的细胞表面水平(参见例如实施例5)。此外,分拣蛋白的细胞水平显示出强烈地并且相反地与颗粒蛋白前体的细胞水平的增加有关(参见例如图10B-10E和图23B和23C)。能够增加颗粒蛋白前体的细胞外水平的抗分拣蛋白抗体还能够阻断前NGF结合于分拣蛋白(参见例如实施例6)。本公开的其它方面至少部分地基于抗分拣蛋白抗体的鉴别,所述抗体阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且能够增加颗粒蛋白前体的细胞外水平而不降低分拣蛋白的细胞水平(例如,抗体S-30和实施例30)。本公开的其它方面至少部分地基于抗分拣蛋白抗体的鉴别,所述抗体阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用而不增加颗粒蛋白前体的细胞外水平或降低分拣蛋白的细胞水平(例如,抗体S-5和S-64和实施例5)。
因此,本公开的某些方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体具有选自由以下组成的组的特性:增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,降低分拣蛋白的细胞水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,和其任何组合。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗体降低分拣蛋白的细胞表面水平,降低分拣蛋白的细胞内水平,降低分拣蛋白的总水平,或其任何组合。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白降解、分拣蛋白裂解、分拣蛋白内化、分拣蛋白下调或其任何组合。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且增加颗粒蛋白前体的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且增加颗粒蛋白前体的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加体内颗粒蛋白前体的水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加体内颗粒蛋白前体的水平而不降低分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加脑中颗粒蛋白前体的水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加血液中颗粒蛋白前体的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加一个或多个外周器官中颗粒蛋白前体的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加脑、血液、一种或多种更多外周器官或其任何组合中颗粒蛋白前体的水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低体内分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低脑中分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低一个或多个外周器官中分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低脑、一个或多个外周器官或其任何组合中分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且不降低分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平并且不降低分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,并且不增加颗粒蛋白前体的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,并且不增加颗粒蛋白前体的细胞外水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,并且不降低分拣蛋白的细胞水平。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,不增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,颗粒蛋白前体的细胞水平、颗粒蛋白前体的细胞外水平、分拣蛋白的细胞水平或其任何组合利用体外分析来测量。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,颗粒蛋白前体的细胞水平、颗粒蛋白前体的细胞外水平、分拣蛋白的细胞水平或其任何组合利用细胞分析来测量。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,颗粒蛋白前体的细胞水平、颗粒蛋白前体的细胞外水平、分拣蛋白的细胞水平或其任何组合利用体内模型来测量。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体进一步抑制分拣蛋白与神经生长因子前体(前NGF)之间的相互作用。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体进一步抑制分拣蛋白与选自由以下组成的组的一种或多种蛋白之间的相互作用:前神经营养蛋白、神经营养蛋白、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经紧张素、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体进一步如下抑制分拣蛋白与一种或多种蛋白之间的相互作用,通过:a)降低可用于与所述一种或多种蛋白相互作用的分拣蛋白的有效水平;b)诱导分拣蛋白的降解;或两者。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制PCSK9的细胞分泌,抑制Aβ肽产生,或两者。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体特异性地结合于人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白或两者。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体为人抗体、人源化抗体、双特异性抗体、单克隆抗体、多价抗体、缀合抗体或嵌合抗体。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体为识别第一抗原和第二抗原的双特异性抗体。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述第一抗原为分拣蛋白并且所述第二抗原为促进跨血脑屏障运输的抗原。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述第二抗原是选自由分拣蛋白、转铁蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和2(LPR-1和2)、白喉毒素受体、CRM197、骆驼单域抗体、TMEM 30(A)、蛋白转导域、TAT、Syn-B、穿膜肽、多精氨酸肽、angiopep肽、basigin、Glut1和CD98hc和ANG1005组成的组。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体为结合于包含人分拣蛋白或哺乳动物分拣蛋白上的氨基酸残基的表位的抗体片段。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述片段为Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体进一步包含选自由以下组成的组的一种或多种活性:(a)诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性;(b)降低颗粒蛋白前体或其片段的内体内化;和(c)增加颗粒蛋白前体的有效浓度。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合不连续的分拣蛋白表位。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述不连续的分拣蛋白表位包含两种或更多种肽、三种或更多种肽、四种或更多种肽、五种或更多种肽、六种或更多种肽、七种或更多种肽、八种或更多种肽、九种或更多种肽或10种或更多种肽。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述肽中的每一者包含氨基酸序列SEQ IDNO:1的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个、10个或更多个、11个或更多个、12个或更多个、13个或更多个、14个或更多个、15个或更多个、16个或更多个、17个或更多个、18个或更多个、19个或更多个、20个或更多个、21个或更多个、22个或更多个、23个或更多个、24个或更多个、25个或更多个、26个或更多个、27个或更多个、28个或更多个、29个或更多个或30个或更多个氨基酸残基;或对应于氨基酸序列SEQ IDNO:1的哺乳动物分拣蛋白上的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个、10个或更多个、11个或更多个、12个或更多个、13个或更多个、14个或更多个、15个或更多个、16个或更多个、17个或更多个、18个或更多个、19个或更多个、20个或更多个、21个或更多个、22个或更多个、23个或更多个、24个或更多个、25个或更多个、26个或更多个、27个或更多个、28个或更多个、29个或更多个或30个或更多个氨基酸残基。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于分拣蛋白的构象表位。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:i.SEQ ID NO:1的氨基酸残基740-749,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基740-749的氨基酸残基;ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基623-632,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基623-632的氨基酸残基;iii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443的氨基酸残基;iv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基367-391,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基367-391的氨基酸残基;v.SEQ ID NO:1的氨基酸残基314-338,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基314-338的氨基酸残基;vi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基297-317,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基297-317的氨基酸残基;vii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ IDNO:1的氨基酸残基237-260的氨基酸残基;viii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317的氨基酸残基;ix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247的氨基酸残基;x.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247和314-338,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247和314-338的氨基酸残基;xi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基233-243,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基233-243的氨基酸残基;xii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基212-221,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基212-221的氨基酸残基;xiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227的氨基酸残基;xiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260的氨基酸残基;xv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231的氨基酸残基;xvi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基175-181,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基175-181的氨基酸残基;和xvii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138的氨基酸残基。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于选自由SEQ ID NO:1的H131、V132、P133、L134、V135、I136、M137、T138、T210、T218、Y222、S223、S227、S242、K243、K248、K254、S305、R311、S316、R325、S379、R382、Y386和S595组成的组的一种或多种氨基酸残基,或哺乳动物分拣蛋白上对应于选自由SEQ ID NO:1的H131、V132、P133、L134、V135、I136、M137、T138、T210、T218、Y222、S223、S227、S242、K243、K248、K254、S305、R311、S316、R325、S379、R382、Y386和S595组成的组的氨基酸残基的一种或多种氨基酸残基。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含:(a)包含选自由SEQ ID NO:6、9-12、14和15组成的组的氨基酸序列的HVR-L1;(b)包含选自由SEQ ID NO:26、27、29、30和32组成的组的氨基酸序列的HVR-L2;(c)包含选自由SEQ ID NO:45、46、48、85、89、100、103-105、112和123组成的组的氨基酸序列的HVR-L3;(d)包含选自由SEQ ID NO:126、127、136、140、142、145和148组成的组的氨基酸序列的HVR-H1;(e)包含选自由SEQ ID NO:151、152、163、166、169、170、173和175组成的组的氨基酸序列的HVR-H2;或(f)包含选自由SEQ ID NO:182、183、185、219、223、233、236、237、244和254组成的组的氨基酸序列的HVR-H3。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:6、9-12、14和15组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6、9-12、14和15组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26、27、29、30和32组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26、27、29、30和32组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:45、46、48、85、89、100、103-105、112和123组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:45、46、48、85、89、100、103-105、112和123组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126、127、136、140、142、145和148组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126、127、136、140、142、145和148组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:151、152、163、166、169、170、173和175组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ IDNO:151、152、163、166、169、170、173和175组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:182、183、185、219、223、233、236、237、244和254组成的组的氨基酸序列或与选自由SEQ ID NO:182、183、185、219、223、233、236、237、244和254组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域,其包含选自由SEQ ID NO:324、326、330、401、409、430、436、438、439、453和474组成的组的氨基酸序列;和/或重链可变域,其包含选自由SEQ ID NO:325、327、331、402、410、431、437、440、454和475组成的组的氨基酸序列。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-2、S-14、S-15、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-29、S-51、S57、S-61和S-82。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含:(a)包含选自由SEQ ID NO:7-10、13和14组成的组的氨基酸序列的HVR-L1;(b)包含选自由SEQ ID NO:26-31和33-35组成的组的氨基酸序列的HVR-L2;(c)包含选自由SEQ ID NO:42、54、55、58、59、60、61、62、69、91、97、101和122组成的组的氨基酸序列的HVR-L3;(d)包含选自由SEQ ID NO:126、129、130、135、140、142和147组成的组的氨基酸序列的HVR-H1;(e)包含选自由SEQ IDNO:150、155-158、162、166、169和173组成的组的氨基酸序列的HVR-H2;或(f)包含选自由SEQ ID NO:180、190、193-197、203、225、231、234和253组成的组的氨基酸序列的HVR-H3。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:7-10、13和14组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:7-10、13和14组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26-31和33-35组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQID NO:26-31和33-35组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:42、54、55、58、59、60、61、62、69、91、97、101和122组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:42、54、55、58、59、60、61、62、69、91、97、101和122组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126、129、130、135、140、142和147组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126、129、130、135、140、142和147组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150、155-158、162、166、169和173组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQID NO:150、155-158、162、166、169和173组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:180、190、193-197、203、225、231、234和253组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:180、190、193-197、203、225、231、234和253组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域,其包含选自由SEQ ID NO:319、341、343、348、350、352、354、356、370、413、425、430和472组成的组的氨基酸序列;和/或重链可变域,其包含选自由SEQ ID NO:320、342、349、351、353、355、357、369、414、426、431和473组成的组的氨基酸序列。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:10;(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:30;(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:45、70和100组成的组的氨基酸序列;(d)HVR-H1,其包含选自由SEQ IDNO:126、136和142组成的组的氨基酸序列;(e)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:151、163和170组成的组的氨基酸序列;或(f)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:182、204和233组成的组的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:10,或与包含氨基酸序列SEQ ID NO:10具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:30,或与包含氨基酸序列SEQ ID NO:30具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:45、70和100组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:45、70和100组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQID NO:126、136和142组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126、136和142组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ IDNO:151、163和170组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:151、163和170组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ IDNO:182、204和233组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:182、204和233组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域,其包含选自由SEQ ID NO:324、371和430组成的组的氨基酸序列;和/或重链可变域,其包含选自由SEQ ID NO:325、372和431组成的组的氨基酸序列。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ IDNO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列或与选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-6、S-8、S-49、S-60、S-63、S-72、S-83和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-45、S-64、S-65和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-30、S-60和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-1、S-2、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-12、S-14、S-15、S-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-24、S-25、S-26、S-28、S-29、S-30、S-32、S-34、S-39、S-40、S-42、S-43、S-44、S-45、S-48、S-49、S-50、S-51、S-55、S-57、S-58、S-59、S-60、S-61、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-69、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-78、S-81、S-82、S-83、S-84和S-85。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含:(a)包含选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列的HVR-L1;(b)包含选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列的HVR-L2;(c)包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列的HVR-L3;(d)包含选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列的HVR-H1;(e)包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列的HVR-H2;或(f)包含选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列的HVR-H3。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ IDNO:26-40组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列或与选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和/或重链可变域,所述可变域包含选自由SEQ ID NO:317-334、337-338、341-345、348-357、360-365、368-372、375-376、379-380、389-392、395-402、407-414、421-422、425-433、436-444、447-448、451-461、464-465和470-479组成的组的氨基酸序列。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-2、S-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-28、S-29、S-82和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-1、S-3、S-4、S-6、S-7、S-9、S-10、S-14、S-15、S-26、S-32、S-48、S-51、S-55、S57、S-58、S-59、S-61、S-69、S-71、S-73、S-74、S-75、S-85和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-12、S-24、S-25、S-30、S-34、S-39、S-40、S-42、S-43、S-44、S-45、S-60、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-72、S-76、S-78、S-81、S-83、S-84和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-8、S-49、S-50和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其结合基本上与选自由以下组成的组的抗体相同的分拣蛋白表位:S-1、S-2、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-12、S-14、S-15、S-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-24、S-25、S-26、S-28、S-29、S-30、S-32、S-34、S-39、S-40、S-42、S-43、S-44、S-45、S-48、S-49、S-50、S-51、S-55、S-57、S-58、S-59、S-60、S-61、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-69、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-78、S-81、S-82、S-83、S-84和S-85。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;或其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列或与选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,增加颗粒蛋白前体的水平,并且降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-8、S-49和S-60。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:11;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:26;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:48;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:127;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:152;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:185。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:6;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:26;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:89;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQID NO:140;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:166;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:223。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:10;(b)包含氨基酸序列SEQ IDNO:30;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:100;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:142;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:147;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:233。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,增加颗粒蛋白前体的水平,并且降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-8、S-49、S-60和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,增加颗粒蛋白前体的水平,并且降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体结合于选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:i.SEQ IDNO:1的氨基酸残基429-443,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443的氨基酸残基;ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基232-243,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基232-243的氨基酸残基;和iii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231的氨基酸残基。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其增加颗粒蛋白前体的水平并且降低分拣蛋白的细胞水平而不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,其中所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-2、S-19和S-22。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:7;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:27;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:42;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:126;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:150;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:180。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:7;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:35;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:59;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQID NO:130;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:158;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:194。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:7;(b)包含氨基酸序列SEQ IDNO:27;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:61;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:130;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:157;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:196。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其增加颗粒蛋白前体的水平并且降低分拣蛋白的细胞水平而不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-2、S-19、S-22和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其增加颗粒蛋白前体的水平并且降低分拣蛋白的细胞水平而不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,其中所述抗分拣蛋白抗体结合于选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:i.SEQ IDNO:1的氨基酸残基237-260和297-317,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317的氨基酸残基;和ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260的氨基酸残基。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用而不增加颗粒蛋白前体的水平并且不降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-5和S-64。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:10;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:30;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:45;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:126;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:151;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:182。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:15;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:27;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:104;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ IDNO:142;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:169;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:236。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用而不增加颗粒蛋白前体的水平并且不降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-64和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且增加颗粒蛋白前体的水平而不降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体包含抗体S-30的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR。在一些实施方案中,所述抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:10;(b)包含氨基酸序列SEQ ID NO:30;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:70;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:136;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:163;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:204。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且增加颗粒蛋白前体的水平而不降低分拣蛋白的细胞水平,其中所述抗分拣蛋白抗体与抗体S-30竞争结合于分拣蛋白。
本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSISSYLN(SEQ ID NO:7);(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列AASSLQS(SEQ IDNO:27);和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列QQSDVSPIT(SEQ ID NO:42);和/或其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列YTFX1X2YX3MX4(SEQ ID NO:480),其中X1为T、G、V、P、L、F、A或R,X2为G、A或S,X3为Y、M或L,并且X4为H或W;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列X1X2X3PX4X5GX6TX7YAQKFQG(SEQ ID NO:481),其中X1为W、I或G,X2为I、V或T,X3为N、G或L,X4为N、S、V或M,X5为S、G、W或Q,X6为G、F、A、Y、S、N或R,并且X7为N、R、S或M;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列ARGKRSSGWYEGYGMDV(SEQ ID NO:180)。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的抗体序列中任一者的轻链可变区;和/或选自由S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14和S-2-15组成的组的抗体的抗体序列中任一者的重链可变区。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSX1X2SNLA(SEQ ID NO:508),其中X1为V或I并且X2为S或G;(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列GASTRAT(SEQ ID NO:29);和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列QQARLGPWT(SEQ ID NO:55);和/或其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列YTX1X2X3X4X5X6S(SEQ ID NO:509),其中X1为F或L,X2为T或A,X3为S或K,X4为Y、T、R、L、T、G、Q或H,X5为Y、T或L,并且X6为M或I;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列X1INPx2GGX3X4SYAX5X6FX7G(SEQ ID NO:510),其中X1为I或V,X2为S、W、Y、V、F、L或I,X3为S或T,X4为T或A,X5为Q或R,X6为K或R,并且X7为Q或R;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列X1RDPX2GX3X4X5X6X7PX8X9RX10X11X12GX13DV(SEQ ID NO:511),其中X1为A、V或T,X2为S、F或G,X3为I或A,X4为A或G,X5为A、L或V,X6为A、L或P,X7为G、F或Y,X8为A、G或F,X9为S、G或A,X10为Y、G、P、H或S,X11为Y或N,X12为Y、L、Q或R,并且X13为M或L。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在某些实施方案中,抗分拣蛋白抗体包含选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的抗体序列中任一者的轻链可变区;和/或选自由S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15和S-15-16组成的组的抗体的抗体序列中任一者的重链可变区。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSISSWLA(SEQID NO:8);(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列KASSLES(SEQ ID NO:28);和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列QQADGHIT(SEQ ID NO:62);和/或其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列X1TFX2X3YAX4X5(SEQ ID NO:565),其中X1为G或Y,X2为S、R、G或T,X3为S、G或N,X4为I或M,并且X5为S或A;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列GIX1PX2X3GX4AX5YAQKFQG(SEQ ID NO:566),其中X1为I或V,X2为I、R、G、A、S、T或Q,X3为F或G,X4为T、R或W,并且X5为S、N、Q或W;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列ARQGRKTGYYYYYGMDV(SEQ ID NO:197)。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在某些实施方案中,抗分拣蛋白抗体包含选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的抗体序列中任一者的轻链可变区;和/或选自由S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8和S-22-9组成的组的抗体的抗体序列中任一者的重链可变区。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列RSSQX1LLX2SNGYNYLD(SEQ ID NO:580),其中X1为S或G并且X2为H或R;(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列LGSNRXS(SEQ ID NO:581),其中X为A或V;和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列MQQQETPLT(SEQ ID NO:100);和/或其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列YSISSX1X2YWG(SEQ ID NO:582),其中X1为G或V并且X2为Y或R;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列X1IYX2SGSTYYNPSLKS(SEQ ID NO:583),其中X1为T、S或A并且X2为H或P;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列ARQGSIKQGYYGMDV(SEQID NO:233)。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在某些实施方案中,抗分拣蛋白抗体包含选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的抗体序列中任一者的轻链可变区;和/或选自由S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9组成的组的抗体的抗体序列中任一者的重链可变区。本公开的其它方面涉及一种分离的(例如,单克隆)抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSVSSSYLA(SEQ ID NO:14);(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列GASSRAT(SEQ ID NO:26);和(c)HVR-L3,其包含氨基酸序列QQSHVSPWT(SEQ ID NO:122);和/或其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含氨基酸序列X1SIX2SX3X4YYWG(SEQ ID NO:589),其中X1为G或Y,X2为S、V、Y、K或P,X3为S或R,并且X4为D或E;(b)HVR-H2,其包含氨基酸序列X1IYX2X3GSTX4YNPSLKS(SEQ ID NO:590),其中X1为S、G、Q或L,X2为Y、W或R,X3为S、R、K或A,并且X4为Y或V;和(c)HVR-H3,其包含氨基酸序列ARGVGSGYSYGYRYFDY(SEQ ID NO:253)。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在某些实施方案中,抗分拣蛋白抗体包含选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的抗体序列中任一者的轻链可变区;和/或选自由S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8组成的组的抗体的抗体序列中任一者的重链可变区。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同型。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述抗分拣蛋白抗体具有人或小鼠IgG1同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:N297A、N297Q、D265A、L234A、L235A、C226S、C229S、P238S、E233P、L234V、P238A、A327Q、A327G、P329A、K322A、L234F、L235E、P331S、T394D、A330L、M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;(b)所述抗分拣蛋白抗体具有IgG2同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、H268E、V309L、N297A、N297Q、A330S、P331S、C232S、C233S、M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;或(c)所述抗分拣蛋白抗体具有IgG4同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:E233P、F234V、L234A/F234A、L235A、G237A、E318A、S228P、L236E、S241P、L248E、T394D、M252Y、S254T、T256E、N297A、N297Q和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述Fc区进一步包含选自由以下组成的组的位置处的一种或多种额外氨基酸取代:A330L、L234F、L235E、P331S和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;(b)所述Fc区进一步包含选自由以下组成的组的位置处的一种或多种额外氨基酸取代:M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;或(c)所述Fc区进一步包含根据EU或Kabat编号的S228P氨基酸取代。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低选自由以下组成的组的一种或多种促发炎介体的表达:IL-6、IL12p70、IL12p40、IL-1β、TNF-α、CXCL1、CCL2、CCL3、CCL4和CCL5。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有介于约100nM至约0.005nM或小于0.005nM范围内的针对人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白或两者的解离常数(KD)。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有介于约70.4nM至约0.005nM或小于0.005nM范围内的针对人分拣蛋白的解离常数(KD)。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有介于约40.3nM至约0.07nM或小于0.07nM范围内的针对小鼠分拣蛋白的解离常数(KD)。
本公开的其它方面涉及一种分离的核酸,其包含编码前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体的核酸序列。本公开的其它方面涉及一种载体,其包含前述实施方案中的任一者的核酸。本公开的其它方面涉及一种分离的宿主细胞,其包含前述实施方案中的任一者的载体。本公开的其它方面涉及一种产生抗分拣蛋白抗体的方法,所述方法包括培养前述实施方案中的任一者的宿主细胞,使得产生所述抗分拣蛋白抗体。在某些实施方案中,所述方法进一步包括回收由所述宿主细胞产生的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及一种由前述实施方案中的任一者的方法产生的分离的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及一种药物组合物,其包含前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体和药学上可接受的载体。
本公开的其它方面涉及一种增加有需要的个体的脑中的颗粒蛋白前体水平的方法,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及一种用于增加有需要的个体的脑中的颗粒蛋白前体水平的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及抗分拣蛋白抗体在制造用于增加有需要的个体的脑中的颗粒蛋白前体水平的药剂中的用途。本公开的其它方面涉及一种增加有需要的个体中的颗粒蛋白前体水平的方法,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及一种用于增加有需要的个体中的颗粒蛋白前体水平的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及抗分拣蛋白抗体在制造用于增加有需要的个体中的颗粒蛋白前体水平的药剂中的用途。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述个体的脑、血液和/或或一个或多个外周器官中的颗粒蛋白前体水平增加。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,颗粒蛋白前体的水平增加而不降低分拣蛋白的细胞水平。
本公开的其它方面涉及一种增加一种或多种细胞的细胞外颗粒蛋白前体水平的方法,所述方法包括使一种或多种细胞与抗分拣蛋白抗体接触。本公开的其它方面涉及一种用于增加一种或多种细胞的细胞外颗粒蛋白前体水平的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及抗分拣蛋白抗体在制造用于增加一种或多种细胞的细胞外颗粒蛋白前体水平的药剂中的用途。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,颗粒蛋白前体的水平增加而不降低分拣蛋白的细胞水平。本公开的其它方面涉及一种降低有需要的个体中的分拣蛋白的细胞水平的方法,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及一种用于降低有需要的个体中的分拣蛋白的细胞水平的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及抗分拣蛋白抗体在制造用于降低有需要的个体中的分拣蛋白的细胞水平的药剂中的用途。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述个体的脑和/或一个或多个外周器官中的分拣蛋白水平降低。本公开的其它方面涉及一种降低一种或多种细胞的分拣蛋白的细胞水平的方法,所述方法包括使一种或多种细胞与抗分拣蛋白抗体接触。本公开的其它方面涉及一种用于降低一种或多种细胞的分拣蛋白的细胞水平的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及抗分拣蛋白抗体在制造用于降低一种或多种细胞的分拣蛋白的细胞水平的药剂中的用途。
本公开的其它方面涉及一种用于抑制分拣蛋白与选自由颗粒蛋白前体、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)组成的组的一种或多种蛋白之间的一种或多种相互作用的方法,所述方法包括:使所述分拣蛋白与结合于包含SEQ ID NO:4的表位的抗分拣蛋白抗体接触。本公开的其它方面涉及一种结合于包含SEQID NO:4的表位的抗分拣蛋白抗体,其用于抑制分拣蛋白与选自由颗粒蛋白前体、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)组成的组的一种或多种蛋白之间的一种或多种相互作用。本公开的其它方面涉及结合于包含SEQ ID NO:4的表位的抗分拣蛋白抗体在制造用于抑制分拣蛋白与选自由颗粒蛋白前体、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)组成的组的一种或多种蛋白之间的一种或多种相互作用的药剂中的用途。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述抗分拣蛋白抗体具有选自由以下组成的组的特性:增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,降低分拣蛋白的细胞水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,和其任何组合;(b)所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞表面水平,降低分拣蛋白的细胞内水平,降低分拣蛋白的总水平,或其任何组合;(c)所述抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白降解、分拣蛋白裂解、分拣蛋白内化、分拣蛋白下调或其任何组合;(d)所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用;(e)所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用;(f)所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且增加颗粒蛋白前体的细胞水平;(g)所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用;(h)所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且增加颗粒蛋白前体的细胞水平;(i)所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且不降低分拣蛋白的细胞水平;(j)所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平并且不降低分拣蛋白的细胞水平;(k)所述抗分拣蛋白抗体进一步抑制分拣蛋白与神经生长因子前体(前NGF)之间的相互作用;(l)所述抗分拣蛋白抗体进一步抑制分拣蛋白与选自由以下组成的组的一种或多种蛋白之间的相互作用:前神经营养蛋白、神经营养蛋白、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经紧张素、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP);(m)所述抗分拣蛋白抗体通过:a)降低可用于与选自由以下组成的组的一种或多种蛋白相互作用的分拣蛋白的有效水平;b)诱导分拣蛋白的降解;或两者进一步抑制分拣蛋白与所述一种或多种蛋白之间的相互作用:前神经营养蛋白、神经营养蛋白、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经紧张素、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP);(n)所述抗分拣蛋白抗体抑制PCSK9的细胞分泌,抑制Aβ肽产生,或两者;(o)所述抗分拣蛋白抗体诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性;(p)所述抗分拣蛋白抗体降低颗粒蛋白前体或其片段的内体内化;和/或(q)所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的有效浓度。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述抗分拣蛋白抗体特异性地结合于人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白或两者;(b)所述抗分拣蛋白抗体为人抗体;(c)所述抗分拣蛋白抗体为人源化抗体;(d)所述抗分拣蛋白抗体为双特异性抗体;(e)所述抗分拣蛋白抗体为识别第一抗原和第二抗原的双特异性抗体;(f)所述抗分拣蛋白抗体为识别第一抗原和第二抗原的双特异性抗体,其中所述第一抗原为分拣蛋白并且所述第二抗原为促进跨血脑屏障运输的抗原,并且任选地,其中所述第二抗原是选自由分拣蛋白、转铁蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和2(LPR-1和2)、白喉毒素受体、CRM197、骆驼单域抗体、TMEM 30(A)、蛋白转导域、TAT、Syn-B、穿膜肽、多精氨酸肽、angiopep肽、basigin、Glut1、CD98hc和ANG1005组成的组;(g)所述抗分拣蛋白抗体为多价抗体;(h)所述抗分拣蛋白抗体为缀合抗体;(i)所述抗分拣蛋白抗体为嵌合抗体;(j)所述抗分拣蛋白抗体为抗体;(k)所述抗分拣蛋白抗体为结合于包含人分拣蛋白或哺乳动物分拣蛋白上的氨基酸残基的表位的抗体片段;或(l)所述抗分拣蛋白抗体为结合于包含人分拣蛋白或哺乳动物分拣蛋白上的氨基酸残基的表位的抗体片段,并且任选地,其中所述片段为Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合不连续的分拣蛋白表位。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述不连续的分拣蛋白表位包含两种或更多种肽、三种或更多种肽、四种或更多种肽、五种或更多种肽、六种或更多种肽、七种或更多种肽、八种或更多种肽、九种或更多种肽或10种或更多种肽。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述肽中的每一者包含氨基酸序列SEQ ID NO:1的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个、10个或更多个、11个或更多个、12个或更多个、13个或更多个、14个或更多个、15个或更多个、16个或更多个、17个或更多个、18个或更多个、19个或更多个、20个或更多个、21个或更多个、22个或更多个、23个或更多个、24个或更多个、25个或更多个、26个或更多个、27个或更多个、28个或更多个、29个或更多个或30个或更多个氨基酸残基;或对应于氨基酸序列SEQ ID NO:1的哺乳动物分拣蛋白上的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个、10个或更多个、11个或更多个、12个或更多个、13个或更多个、14个或更多个、15个或更多个、16个或更多个、17个或更多个、18个或更多个、19个或更多个、20个或更多个、21个或更多个、22个或更多个、23个或更多个、24个或更多个、25个或更多个、26个或更多个、27个或更多个、28个或更多个、29个或更多个或30个或更多个氨基酸残基。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于分拣蛋白的构象表位。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于选自由以下组成的组的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸:i.SEQ ID NO:1的氨基酸残基740-749,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基740-749的氨基酸残基;ii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基623-632,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基623-632的氨基酸残基;iii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443的氨基酸残基;iv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基367-391,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基367-391的氨基酸残基;v.SEQ ID NO:1的氨基酸残基314-338,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基314-338的氨基酸残基;vi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基297-317,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基297-317的氨基酸残基;vii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ IDNO:1的氨基酸残基237-260的氨基酸残基;viii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317的氨基酸残基;ix.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247的氨基酸残基;x.SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247和314-338,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247和314-338的氨基酸残基;xi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基233-243,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基233-243的氨基酸残基;xii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基212-221,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基212-221的氨基酸残基;xiii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227的氨基酸残基;xiv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260的氨基酸残基;xv.SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231的氨基酸残基;xvi.SEQ ID NO:1的氨基酸残基175-181,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基175-181的氨基酸残基;和vii.SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138,或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138的氨基酸残基。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于选自由SEQ ID NO:1的H131、V132、P133、L134、V135、I136、M137、T138、T210、T218、Y222、S223、S227、S242、K243、K248、K254、S305、R311、S316、R325、S379、R382、Y386和S595组成的组的一种或多种氨基酸残基,或哺乳动物分拣蛋白上对应于氨基酸残基SEQ ID NO:1的H131、V132、P133、L134、V135、I136、M137、T138、T210、T218、Y222、S223、S227、S242、K243、K248、K254、S305、R311、S316、R325、S379、R382、Y386和S595的一种或多种氨基酸残基。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含选自由以下组成的组的抗体的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:S-1、S-2、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-12、S-14、S-15、S-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-24、S-25、S-26、S-28、S-29、S-30、S-32、S-34、S-39、S-40、S-42、S-43、S-44、S-45、S-48、S-49、S-50、S-51、S-55、S-57、S-58、S-59、S-60、S-61、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-69、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-78、S-81、S-82、S-83、S-84和S-85。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含:(a)包含选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列的HVR-L1;(b)包含选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列的HVR-L2;(c)包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列的HVR-L3;(d)包含选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列的HVR-H1;(e)包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列的HVR-H2;或(f)包含选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、22组成的组的氨基酸序列的HVR-H3。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6-16、20-22和24-25组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQID NO:26-40组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26-40组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;并且其中所述重链可变域包含:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145和147-149组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175和177-178组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列或与选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249和252-256组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中:(a)所述轻链可变域包含HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSISSYLN(SEQ ID NO:7);HVR-L2,其包含氨基酸序列AASSLQS(SEQ ID NO:27);和HVR-L3,其包含氨基酸序列QQSDVSPIT(SEQ ID NO:42);和/或所述重链可变域包含HVR-H1,其包含氨基酸序列YTFX1X2YX3MX4(SEQ ID NO:480),其中X1为T、G、V、P、L、F、A或R,X2为G、A或S,X3为Y、M或L,并且X4为H或W;HVR-H2,其包含氨基酸序列X1X2X3PX4X5GX6TX7YAQKFQG(SEQ ID NO:481),其中X1为W、I或G,X2为I、V或T,X3为N、G或L,X4为N、S、V或M,X5为S、G、W或Q,X6为G、F、A、Y、S、N或R,并且X7为N、R、S或M;和HVR-H3,其包含氨基酸序列ARGKRSSGWYEGYGMDV(SEQ IDNO:180);(b)所述轻链可变域包含HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSX1X2SNLA(SEQ ID NO:508),其中X1为V或I并且X2为S或G;HVR-L2,其包含氨基酸序列GASTRAT(SEQ ID NO:29);和HVR-L3,其包含氨基酸序列QQARLGPWT(SEQ ID NO:55);和/或所述重链可变域包含HVR-H1,其包含氨基酸序列YTX1X2X3X4X5X6S(SEQ ID NO:509),其中X1为F或L,X2为T或A,X3为S或K,X4为Y、T、R、L、T、G、Q或H,X5为Y、T或L,并且X6为M或I;HVR-H2,其包含氨基酸序列X1INPx2GGX3X4SYAX5X6FX7G(SEQ ID NO:510),其中X1为I或V,X2为S、W、Y、V、F、L或I,X3为S或T,X4为T或A,X5为Q或R,X6为K或R,并且X7为Q或R;和HVR-H3,其包含氨基酸序列X1RDPX2GX3X4X5X6X7PX8X9RX10X11X12GX13DV(SEQ ID NO:511),其中X1为A、V或T,X2为S、F或G,X3为I或A,X4为A或G,X5为A、L或V,X6为A、L或P,X7为G、F或Y,X8为A、G或F,X9为S、G或A,X10为Y、G、P、H或S,X11为Y或N,X12为Y、L、Q或R,并且X13为M或L;(c)所述轻链可变域包含HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSISSWLA(SEQ ID NO:8);HVR-L2,其包含氨基酸序列KASSLES(SEQ ID NO:28);和HVR-L3,其包含氨基酸序列QQADGHIT(SEQ ID NO:62);和/或所述重链可变域包含HVR-H1,其包含氨基酸序列X1TFX2X3YAX4X5(SEQ ID NO:565),其中X1为G或Y,X2为S、R、G或T,X3为S、G或N,X4为I或M,并且X5为S或A;HVR-H2,其包含氨基酸序列GIX1PX2X3GX4AX5YAQKFQG(SEQ IDNO:566),其中X1为I或V,X2为I、R、G、A、S、T或Q,X3为F或G,X4为T、R或W,并且X5为S、N、Q或W;和HVR-H3,其包含氨基酸序列ARQGRKTGYYYYYGMDV(SEQ ID NO:197);(d)所述轻链可变域包含HVR-L1,其包含氨基酸序列RSSQX1LLX2SNGYNYLD(SEQ ID NO:580),其中X1为S或G并且X2为H或R;HVR-L2,其包含氨基酸序列LGSNRXS(SEQ ID NO:581),其中X为A或V;和HVR-L3,其包含氨基酸序列MQQQETPLT(SEQ ID NO:100);和/或所述重链可变域包含HVR-H1,其包含氨基酸序列YSISSX1X2YWG(SEQ ID NO:582),其中X1为G或V并且X2为Y或R;HVR-H2,其包含氨基酸序列X1IYX2SGSTYYNPSLKS(SEQ ID NO:583),其中X1为T、S或A并且X2为H或P;和HVR-H3,其包含氨基酸序列ARQGSIKQGYYGMDV(SEQ ID NO:233);或(e)所述轻链可变域包含HVR-L1,其包含氨基酸序列RASQSVSSSYLA(SEQ ID NO:14);HVR-L2,其包含氨基酸序列GASSRAT(SEQ IDNO:26);和HVR-L3,其包含氨基酸序列QQSHVSPWT(SEQ ID NO:122);和/或所述重链可变域包含HVR-H1,其包含氨基酸序列X1SIX2SX3X4YYWG(SEQ ID NO:589),其中X1为G或Y,X2为S、V、Y、K或P,X3为S或R,并且X4为D或E;HVR-H2,其包含氨基酸序列X1IYX2X3GSTX4YNPSLKS(SEQ IDNO:590),其中X1为S、G、Q或L,X2为Y、W或R,X3为S、R、K或A,并且X4为Y或V;和HVR-H3,其包含氨基酸序列ARGVGSGYSYGYRYFDY(SEQ ID NO:253)。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-6、S-8、S-49、S-60、S-63、S-72、S-83和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;(b)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-45、S-64、S-65和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;(c)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-30、S-60和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;(d)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-2、S-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-28、S-29、S-82和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;(e)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-1、S-3、S-4、S-6、S-7、S-9、S-10、S-14、S-15、S-26、S-32、S-48、S-51、S-55、S57、S-58、S-59、S-61、S-69、S-71、S-73、S-74、S-75、S-85和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;(f)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-5、S-12、S-24、S-25、S-30、S-34、S-39、S-40、S-42、S-43、S-44、S-45、S-60、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-72、S-76、S-78、S-81、S-83、S-84和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;(g)所述抗分拣蛋白抗体与选自由S-8、S-49、S-50和其任何组合组成的组的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白;或(h所述抗分拣蛋白抗体结合基本上与选自由以下组成的组的抗体相同的分拣蛋白表位:S-1、S-2、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-12、S-14、S-15、S-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-24、S-25、S-26、S-28、S-29、S-30、S-32、S-34、S-39、S-40、S-42、S-43、S-44、S-45、S-48、S-49、S-50、S-51、S-55、S-57、S-58、S-59、S-60、S-61、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-69、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-78、S-81、S-82、S-83、S-84和S-85。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和/或重链可变域,所述可变域包含选自由SEQ ID NO:317-334、337-338、341-345、348-357、360-365、368-372、375-376、379-380、389-392、395-402、407-414、421-422、425-433、436-444、447-448、451-461、464-465和470-479组成的组的氨基酸序列。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述抗分拣蛋白抗体具有IgG类别IgM类别或IgA类别;或(b)所述抗分拣蛋白抗体具有IgG1、IgG2、IgG3或IgG4同型;(c)所述抗分拣蛋白抗体具有人或小鼠IgG1同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:N297A、N297Q、D265A、L234A、L235A、C226S、C229S、P238S、E233P、L234V、P238A、A327Q、A327G、P329A、K322A、L234F、L235E、P331S、T394D、A330L、M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;(d)所述抗分拣蛋白抗体具有IgG2同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:P238S、V234A、G237A、H268A、H268QH268E、V309L、N297A、N297Q、A330S、P331S、C232S、C233S、M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;或(e)所述抗分拣蛋白抗体具有IgG4同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:E233P、F234V、L234A/F234A、L235A、G237A、E318A、S228P、L236E、S241P、L248E、T394D、M252Y、S254T、T256E、N297A、N297Q和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(c)、(d)和(e)中的一者或多者的Fc区进一步包含:(a)选自由以下组成的组的位置处的一种或多种额外氨基酸取代:A330L、L234F、L235E、P331S和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;(b)选自由以下组成的组的位置处的一种或多种额外氨基酸取代:M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU或Kabat编号;或(c)根据EU或Kabat编号的S228P氨基酸取代。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,(a)所述抗分拣蛋白抗体具有介于约100nM至约0.005nM或小于0.005nM范围内的针对人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白或两者的解离常数(KD);(b)所述抗分拣蛋白抗体具有介于约70.4nM至约0.005nM或小于0.005nM范围内的针对人分拣蛋白的解离常数(KD);或(c)所述抗分拣蛋白抗体具有介于约40.3nM至约0.07nM或小于0.07nM范围内的针对小鼠分拣蛋白的解离常数(KD)。在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体为前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。
本公开的其它方面涉及一种预防、降低风险或治疗个体的方法,所述个体具有选自由以下组成的组的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和正常老化的一种或多种不需要的症状,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及用于预防、降低风险或治疗个体的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体,所述个体具有选自由以下组成的组的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和正常老化的一种或多种不需要的症状。本公开的其它方面涉及前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体在制造用于预防、降低风险或治疗个体的药剂中的用途,所述个体具有选自由以下组成的组的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和正常老化的一种或多种不需要的症状。本公开的其它方面涉及一种预防、降低风险或治疗个体的方法,所述个体具有选自由以下组成的组的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、进行性核上麻痹、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、肌萎缩性侧索硬化、创伤性脑损伤、脊髓损伤、痴呆、中风、帕金森氏病、急性播散性脑脊髓炎、视网膜变性、年龄相关黄斑变性、青光眼、多发性硬化、败血性休克、细菌感染、关节炎和骨关节炎,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及用于预防、降低风险或治疗个体的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体,所述个体具有选自由以下组成的组的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、进行性核上麻痹、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、肌萎缩性侧索硬化、创伤性脑损伤、脊髓损伤、痴呆、中风、帕金森氏病、急性播散性脑脊髓炎、视网膜变性、年龄相关黄斑变性、青光眼、多发性硬化、败血性休克、细菌感染、关节炎和骨关节炎。本公开的其它方面涉及前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体在制造用于预防、降低风险或治疗个体的药剂中的用途,所述个体具有选自由以下组成的组的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、进行性核上麻痹、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、肌萎缩性侧索硬化、创伤性脑损伤、脊髓损伤、痴呆、中风、帕金森氏病、急性播散性脑脊髓炎、视网膜变性、年龄相关黄斑变性、青光眼、多发性硬化、败血性休克、细菌感染、关节炎和骨关节炎。
本公开的其它方面涉及一种抑制神经发炎、特征为短轴突生长和异常分支的轴突病、小胶质细胞活化和发炎反应中的一者或多者的方法,所述方法包括向个体施用治疗有效量的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及用于抑制神经发炎、特征为短轴突生长和异常分支的轴突病、小胶质细胞活化和发炎反应中的一者或多者的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体在制造用于抑制神经发炎、特征为短轴突生长和异常分支的轴突病、小胶质细胞活化和发炎反应中的一者或多者的药剂中的用途。本公开的其它方面涉及一种促进伤口愈合、自体吞噬和聚集蛋白的清除中的一者或多者的方法,所述方法包括向个体施用治疗有效量的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及用于促进伤口愈合、自体吞噬和聚集蛋白的清除中的一者或多者的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体在制造用于促进伤口愈合、自体吞噬和聚集蛋白的清除中的一者或多者的药剂中的用途。本公开的其它方面涉及一种预防、降低风险或治疗患有关节炎的个体的方法,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及用于预防、降低风险或治疗患有关节炎的个体的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体在制造用于预防、降低风险或治疗患有关节炎的个体的药剂中的用途。本公开的其它方面涉及一种降低一种或多种促发炎介体的表达的方法,所述方法包括向所述个体施用治疗有效量的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及用于降低一种或多种促发炎介体的表达的前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体。本公开的其它方面涉及前述实施方案中的任一者的抗分拣蛋白抗体在制造用于降低一种或多种促发炎介体的表达的药剂中的用途。在某些实施方案中,所述一种或多种促发炎介体是选自由IL-6、IL12p70、IL12p40、IL-1β、TNF-α、CXCL1、CCL2、CCL3、CCL4和CCL5组成的组。
在可与前述实施方案中的任一者组合的某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体包含两种或更多种抗分拣蛋白抗体。
附图简要说明
所述专利或申请文件含有至少一个以彩色制成的图。这一具有彩色图的专利或专利申请公布的拷贝将由事务所在必要费用的要求和支付后提供。
图1描绘人分拣蛋白的数个视图,其示出抗分拣蛋白抗体S-1、S-65、S-49、S-78、S-44和S-8的分拣蛋白结合位点。分拣蛋白骨架以透明灰色表示来呈递。以彩色突出显示的是针对抗体S-1(绿色)、S-65(红色)、S-49(蓝色)、S-78(黄色)、S-44(粉色)和S-8(紫色)所鉴别的线性结合区。所述结合位点在分拣蛋白的柔性环区中发现,
图2A-2C示出使用表面等离子体共振(SPR)和ELISA对分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用的表征。图2A示出使用Biacore SPR对结合于His捕捉的分拣蛋白1(SORT1)的颗粒蛋白前体(PGRN)的动力学分析。图2B示出在ELISA板上生物素标记的人PGRN结合于固定的人SORT1。图2C示出在ELISA板上生物素标记的小鼠PGRN结合于固定的小鼠SORT1。
图3A示出抗体亲合力结合于传感器芯片上的人分拣蛋白(b-HSort)和与抗分拣蛋白抗体(IgG)竞争。图3B示出使用Forte Bio分析表征分拣蛋白(SORT)与颗粒蛋白前体(PGRN)之间的相互作用和与抗分拣蛋白抗体(IgG)竞争。左栏:生物素标记的颗粒蛋白前体肽固定于所述传感器芯片上并且添加呈溶液形式的SORT,随后添加IgG。中心栏:生物素标记的重组人SORT固定于传感器芯片上并且添加呈溶液形式的重组PGRN,随后添加IgG。右栏:生物素标记的重组PGRN固定于传感器芯片上并且添加呈溶液形式的人SORT,随后添加IgG。(SORT=分拣蛋白,PGRN=颗粒蛋白前体,b=生物素标记,H=人,mono=单体)。
图4A示出以不同ForteBio取向(描述于图3B中)阻断颗粒蛋白前体结合的不同类别的抗分拣蛋白抗体的实例。左栏描绘了使用结合固定于传感器芯片上的PGRN肽的人SORT的竞争结合。中间栏描绘了使用结合固定于传感器芯片上的人SORT的原生PGRN蛋白的竞争结合。右栏描绘了使用结合固定于传感器芯片上的原生PGRN蛋白的原生SORT蛋白的竞争结合。图4B示出使用Biacore SPR在pH6.4和pH7.4下使抗分拣蛋白抗体结合于His捕捉的分拣蛋白(SORT1)。
图5A-5D示出细胞上分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用的表征。图5A示出FACS图,其示出人PGRN-Bio与表达人SORT的HEK293T细胞的结合水平。图5B示出FACS图,其示出人PGRN-Bio与对照对照细胞的结合水平。图5C示出针对结合于表达人SORT的HEK293T细胞(圆形)或对照细胞(正方形)的人PGRN的浓度绘制的平均荧光强度(MFI)。图5D示出针对结合于表达小鼠SORT的HEK293T细胞(圆形)或对照细胞(正方形)的小鼠PGRN的浓度绘制的MFI。
图6A-6E示出抗分拣蛋白抗体对生物素标记的颗粒蛋白前体与表达分拣蛋白的细胞的结合的剂量依赖性抑制。图6A和图6B描绘了人颗粒蛋白前体结合于人分拣蛋白的抗体抑制。图6C和图6D描绘了小鼠颗粒蛋白前体结合于小鼠分拣蛋白的抗体抑制。图6E描绘了67nM抗分拣蛋白抗体对生物素标记的人颗粒蛋白前体与表达人分拣蛋白的细胞的结合的抑制。
图7描绘了抗体组合对生物素标记的颗粒蛋白前体与在HEK293T细胞上表达的分拣蛋白的结合的协同效应的测试。S-49、S-64(仓4)和S-16(仓1)与同型对照抗体或彼此组合。
图8A示出荧光标记的颗粒蛋白前体(PGRN)的时间依赖性结合和内吞作用和与PGRN竞争的10μM分拣蛋白前肽所达成的其阻断的成像分析的结果。用人分拣蛋白(hSort)或lacZ转染的细胞用颗粒蛋白前体(PGRN)孵育4、15、30或60分钟并且其后成像。所述分析是设计成测试抗分拣蛋白抗体防止分拣蛋白(Sort)对颗粒蛋白前体(PGRN)的结合和内吞作用的能力。图8B示出FACS图的结果,描绘了表达人分拣蛋白的细胞对PGRN-DyLight650的时间依赖性结合和内吞作用。所述分析是设计成测试抗分拣蛋白抗体防止人分拣蛋白对荧光标记的颗粒蛋白前体的结合和内吞作用的能力。图8C示出FACS图的结果,描绘了表达小鼠分拣蛋白的细胞对PGRN-DyLight650的时间依赖性结合和内吞作用。所述分析是设计成测试抗分拣蛋白抗体防止小鼠分拣蛋白对荧光标记的颗粒蛋白前体的结合和内吞作用的能力。人PGRN-DyLight650添加至人Sort(图8B)或小鼠Sort(图8C)或对照HEK293T细胞中,并且通过FACS定量所结合的和被内吞的PGRN的量。图8D示出FACS分析的结果,证明了人PGRN抑制剂Sort前肽防止人分拣蛋白对荧光标记的PGRN的结合和内吞作用的能力。图8E示出FACS分析的结果,证明了小鼠PGRN抑制剂Sort前肽防止小鼠分拣蛋白对荧光标记的PGRN的结合和内吞作用的能力。
图9A-9D示出分析的结果,证明了抗分拣蛋白抗体在人星形细胞细胞系U-251的培养基中增加内源分泌的颗粒蛋白前体的水平的能力,所述人星形细胞细胞系U-251表达内源人分拣蛋白。图9A描绘了用50nM抗分拣蛋白抗体孵育72h的U-251细胞的结果。图9B描绘了用5nM抗分拣蛋白抗体孵育72h的U-251细胞的结果。图9C描绘了用50nM抗分拣蛋白抗体孵育72h的U-251细胞的结果。图9D描绘了用5nM抗分拣蛋白抗体孵育72h的U-251细胞的结果。所述培养基中的颗粒蛋白前体水平通过ELISA分析来定量。示出两个独立实验的平均值。使用ANOVA执行统计学并且星号示出显著地提高颗粒蛋白前体水平的抗体。
图10A-10F示出抗分拣蛋白抗体对人U-251细胞或鼠类N2A细胞上分拣蛋白的细胞表面水平的影响,和所述抗体以剂量依赖性方式增加内源颗粒蛋白前体(PGRN)的分泌水平的相应能力。细胞用50nM阻断IgG孵育72h,收集并且用结合分拣蛋白上不同于测试抗体的区域的抗分拣蛋白抗体染色。图10A示出U-251细胞上分拣蛋白的细胞表面表达,以用X轴上列出的测试抗体预处理的对照水平的百分比(%)示出。灰条指示示出分拣蛋白的显著降低的抗体(ANOVA,p<0.05),而白条指示未示出分拣蛋白的降低的抗体。黑条表示对照IgG。图10B示出N2A细胞上分拣蛋白的细胞表面表达,以用X轴上列出的测试抗体预处理的对照水平的百分比(%)示出。灰条指示示出分拣蛋白的显著降低的抗体(ANOVA,p<0.05),而白条指示未示出分拣蛋白的降低的抗体。黑条表示对照IgG。图10C和图10D描绘了用不同浓度的抗分拣蛋白抗体孵育72h的U-251细胞中的细胞表面分拣蛋白的水平。所述抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白的细胞表面表达的剂量依赖性降低。分拣蛋白水平的降低由结合于分拣蛋白的S-20抗体的降低的荧光强度(MFI)描绘。图10E描绘了在用所列出的抗分拣蛋白抗体孵育72h的图10B中的U-251细胞的培养基中PGRN的相应水平的基于ELISA的定量。降低分拣蛋白细胞表面水平的抗分拣蛋白抗体还引起细胞外PGRN的水平的剂量依赖性增加。图10F示出由所述抗分拣蛋白抗体诱导的分拣蛋白的细胞表面水平的降低与颗粒蛋白前体(PGRN)的细胞外水平的增加之间的关系。
图11A-11F示出结果,证明了在阿尔兹海默氏病的Tg2576小鼠模型中抗分拣蛋白抗体的输注会提高脑颗粒蛋白前体的内源水平达数倍。图11A描绘了在ICV输注位点对侧的不同脑区中的颗粒蛋白前体水平。图11B描绘了在ICV输注位点同侧的不同脑区中的颗粒蛋白前体水平。不同脑区为海马(Hip)、前额皮质(F Ctx)和枕叶皮质(RCtx)。14月龄Tg2576小鼠ICV输注缓冲液、山羊IgG或山羊抗分拣蛋白多克隆抗体(n=3/组)。图11C描绘了所述三个不同脑区中抗分拣蛋白抗体的水平。图11D描绘了抗分拣蛋白抗体水平与内源颗粒蛋白前体(PGRN)水平之间的强烈正相关(r2=0.92)。较高水平的抗分拣蛋白抗体导致脑PGRN以剂量依赖性方式增加。图11F描绘了在ICV输注抗分拣蛋白抗体之后可溶性蛋白部分中的Aβ42肽水平。
图12A描绘了表面等离子体共振(SPR)biacore分析以监测前NGF与抗分拣蛋白抗体之间竞争结合于分拣蛋白。所述分析示出人分拣蛋白被捕捉至Biacore芯片,随后前NGF结合于分拣蛋白,随后抗分拣蛋白抗体结合于分拣蛋白。图12B描绘了非阻断对照组。如果前NGF和给定抗分拣蛋白抗体结合分拣蛋白上的同一区,那么前NGF的结合将抑制所述抗分拣蛋白抗体的后续结合。因此,如果给定抗体在前NGF存在(虚线)或不存在(实线)下结合分拣蛋白至相同程度,那么如图12B中所描绘,所述抗体不阻断前NGF结合于分拣蛋白。图12C描绘了抗分拣蛋白抗体在前NGF存在(虚线)或不存在(实线)下与分拣蛋白的结合。所示出的抗体部分地由结合于分拣蛋白的前NGF的存在阻断。抗体S-1和S-65强烈地受到影响。实线对应于在前NGF不存在下抗体与分拣蛋白的结合。虚线对应于在前NGF存在下抗体与分拣蛋白的结合。灰线对应于在前NGF存在下前NGF与分拣蛋白的结合(最大竞争)。
图13A-13G描绘了在用浓度为20nM、5nM或1.25nM的抗分拣蛋白抗体孵育72h之后分拣蛋白细胞表面表达的水平。图13A、图13B、图13C和13D描绘了人U-251细胞上的分拣蛋白细胞表面表达。图13E、图13F和13G描绘了小鼠N2A细胞上的分拣蛋白细胞表面表达。结果指示了亲和力成熟的抗体诱导分拣蛋白的细胞表面水平的增加的减少,尤其当在1.25nM的最低浓度下使用时。
图14描绘了150nM源于抗体S-15的亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体对颗粒蛋白前体与表达分拣蛋白的HEK293T细胞的结合的抑制(以PGRN阻断百分率表示)。亲和力成熟的抗体S-15-6示出PGRN阻断的改进。
图15A和图15B描绘了在源于分拣蛋白消化的肽不存在(图15A)或存在(图15B)下抗体S-2-11结合于分拣蛋白的质谱概况。肽不与抗体竞争结合于分拣蛋白。关于其它抗分拣蛋白抗体观察到相似的肽竞争的缺乏。
图16A是在分拣蛋白的酶蛋白水解之后肽覆盖率的示意图。94.78%的分拣蛋白细胞外域(ECD)(SEQ ID NO:714)由通过蛋白水解产生的肽覆盖。图16B示出S-30抗体与特定分拣蛋白突变体的降低的结合,其中人氨基酸被交换成小鼠分拣蛋白氨基酸。结果指示S-30结合需要氨基酸HVPLVIMT131或其子集。图16C示出S-60抗体与特定分拣蛋白突变体的降低的结合,其中人氨基酸被交换成小鼠分拣蛋白氨基酸。结果指示S-60结合需要S595氨基酸。
图17A-17E描绘了表面等离子体共振迹线。图17A示出在神经紧张素(NTS)存在或不存在下颗粒蛋白前体(PGRN)与分拣蛋白的结合水平。图17B示出在NTS存在或不存在下抗分拣蛋白抗体S-15与分拣蛋白的结合水平。图17C示出在NTS存在或不存在下抗分拣蛋白抗体S-22与分拣蛋白的结合水平。图17D示出在NTS存在或不存在下抗分拣蛋白抗体S-49与分拣蛋白的结合水平。图17E示出在NTS存在或不存在下抗分拣蛋白抗体S-60与分拣蛋白的结合水平。NTS不影响所述抗体与分拣蛋白的结合,指示所述抗分拣蛋白抗体不结合于NTS结合位点。
图18A描绘了抗分拣蛋白抗体的全长抗体(IgG)和抗体Fab均降低人原代巨噬细胞中的分拣蛋白水平。图18B描绘了全长抗体(IgG)降低人原代树突状细胞中的分拣蛋白水平。15μg蛋白装载至凝胶中,点出印迹,并且用对抗分拣蛋白和β-肌动蛋白的抗体染色。
图19A和19B描绘了在第0日腹膜内(IP)注射40mg/kg之后,体内抗分拣蛋白抗体的半衰期的测量。图19A描绘了人抗分拣蛋白IgG1N297A抗体的注射,n=4-5只动物/组。图19B描绘了小鼠抗分拣蛋白IgG1N297A抗体的注射。数据使用单相衰减函数(Graph Pad Prism)进行拟合。抗分拣蛋白抗体具有比对照IgG短的半衰期。
图20A-20D描绘了在注射40mg/kg的抗分拣蛋白抗体之后的多个时间处在小鼠血浆样品中的小鼠颗粒蛋白前体(PGRN)蛋白水平的测量。图20A和图20B描绘了使用小鼠抗分拣蛋白IgG1N297A抗体时的结果。图20C和图20D描绘了使用人抗分拣蛋白IgG1N297A抗体时的结果。图20B和图20D概述了使用具有Tukey事后测试的单因素Anova的统计学分析。星号指示与ms或hu IgG1同型对照下相比的显著水平:*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001,****p<0.0001。所述抗分拣蛋白抗体诱导血浆PGRN蛋白水平的增加,其中所述效应的持续时间与抗体半衰期有关。
图21A-21F描绘了使用来自小鼠的白血球溶解产物的免疫印迹分析对分拣蛋白水平的测量。抗β肌动蛋白用作装载对照物并且用于标准化。图21A和图21B描绘了第5日的蛋白水平。图21C和图21D示出第12日的蛋白水平。抗分拣蛋白抗体S-20、S-15-6和S-2-11诱导第5日分拣蛋白水平的显著降低(具有Tukey事后测试的单因素Anova。星号指示显著水平:**p<0.01,***p<0.001)。抗体S-15-6在3只小鼠中的2只中诱导第12日降低的分拣蛋白水平。图21E和21F示出在小鼠中每周IP注射20、40或80mg/kg的抗分拣蛋白抗体S15-6的长期六周过程中白血球的蛋白水平。所有三种剂量均导致白血球中分拣蛋白的强烈并且统计学显著下调(****p<0.0001,与对照IgG相比,单因素ANOVA)。
图22A-22D描绘了在2周ICV输注之后在野生型(WT)小鼠的脑样品中抗分拣蛋白抗体的IgG水平与颗粒蛋白前体(PGRN)蛋白水平之间的正相关。与同型对照抗体无显著相关性。图22A描绘了抗体S-15。图22B描绘了抗体S-20。图22C描绘了抗体S-30。图22D描绘了同型对照抗体。
图23A描绘了在IV注射40mg/kg的抗分拣蛋白抗体S-15-6huIgG1N297A之后所测量的IgG水平。IgG半衰期随降低的分拣蛋白水平而增加,证明了在野生型(WT)小鼠中S-15-6的相对较短的半衰期是归因于标靶衔接之后的降解,而非免疫原性或其它非特异性降解。图23B描绘了与分拣蛋白杂合(Het)和野生型(WT)同窝出生仔畜相比,分拣蛋白基因剔除(KO)小鼠中提高的基线颗粒蛋白前体(PGRN)蛋白水平。使用ELISA分析在血浆样品中测量PGRN。图23C描绘了结果,示出抗体S-15-6在注射至野生型(WT)和分拣蛋白杂合(Het)小鼠中之后诱导颗粒蛋白前体(PGRN)蛋白水平的增加持续长达八天,但在分拣蛋白基因剔除(KO)小鼠中并非如此。黑色箭头指示在第7日注射S-15-6抗体。****p<0.0001,n.s.-通过单因素ANOVA发现无显著性,KO对Het并且对WT。
图24描绘了小鼠中胶原蛋白诱导的关节炎研究的结果。与对照组(PBS和MOPC-21/msIgG1)相比,每两周注射40mg/kg的抗分拣蛋白抗体S-15-6会显著降低临床关节炎评分。
图25A描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后颗粒蛋白前体的血清水平。图25B描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后腹膜嗜中性粒细胞的数目。图25C描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后大的腹膜巨噬细胞的数目。图25D描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后小的腹膜巨噬细胞的数目。结果描绘了增加的颗粒蛋白前体水平;然而,腹膜嗜中性粒细胞、大的腹膜巨噬细胞和小的腹膜巨噬细胞的数目并未显著不同。空心圆表示野生型小鼠并且空心正方形表示分拣蛋白基因剔除小鼠。n=8-10只小鼠/组。通过具有Tukey氏多重比较测试的单因素ANOVA发现,*p<0.01,**p<0.001,***p<0.001,并且****p<0.0001。
图26A描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IL-6的血清水平。图26B描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后TNFα的血清水平。图26C描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IFNγ的血清水平。图26D描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IL-10的血清水平。图26E描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IL-12p70的血清水平。图26F描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IL-12/IL-23p40的血清水平。图26G描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IL-1α的血清水平。图26H描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后IL-1β的血清水平。空心圆表示野生型小鼠并且空心正方形表示分拣蛋白基因剔除小鼠。n=8-10只小鼠/组。通过具有Tukey氏多重比较测试的单因素ANOVA发现,*p<0.01,**p<0.001,***p<0.001,并且****p<0.0001。
图27A描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后CXCL1的血清水平。图27B描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后CCL2的血清水平。图27C描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后CCL3的血清水平。图27D描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后CCL4的血清水平。图27E描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的1.5小时LPS处理之后CCL5的血清水平。空心圆表示野生型小鼠并且空心正方形表示分拣蛋白基因剔除小鼠。n=8-10只小鼠/组。通过具有Tukey氏多重比较测试的单因素ANOVA发现,*p<0.01,**p<0.001,***p<0.001,并且****p<0.0001。
图28A描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IL-6的血清水平。图28B描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后TNFα的血清水平。图28C描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IFNγ的血清水平。图28D描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IL-10的血清水平。图28E描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IL-12p70的血清水平。图28F描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IL-12/IL-23p40的血清水平。图28G描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IL-1α的血清水平。图28H描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后IL-1β的血清水平。空心圆表示野生型小鼠并且空心正方形表示分拣蛋白基因剔除小鼠。n=8-10只小鼠/组。通过具有Tukey氏多重比较测试的单因素ANOVA发现,*p<0.01,**p<0.001,***p<0.001,并且****p<0.0001。
图29A描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后CXCL1的血清水平。图29B描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后CCL2的血清水平。图29C描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后CCL3的血清水平。图29D描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后CCL4的血清水平。图29E描绘了在野生型小鼠和分拣蛋白基因剔除(分拣蛋白-/-)小鼠的6小时LPS处理之后CCL5的血清水平。空心圆表示野生型小鼠并且空心正方形表示分拣蛋白基因剔除小鼠。n=8-10只小鼠/组。通过具有Tukey氏多重比较测试的单因素ANOVA发现,*p<0.01,**p<0.001,***p<0.001,并且****p<0.0001。
发明详述
一般技术
本文中所描述或引用的技术和程序一般为本领域技术人员充分理解并且通常使用常规方法使用的,例如Sambrook等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual第3版(2001)Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.;CurrentProtocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel等人编,(2003));系列Methods inEnzymology(Academic Press,Inc.):PCR 2:APractical Approach(M.J.MacPherson,B.D.Hames和G.R.Taylor 编(1995)),Harlow和Lane编(1988)Antibodies,A LaboratoryManual,and Animal Cell Culture(R.I.Freshney编(1987));OligonucleotideSynthesis(M.J.Gait编,1984);Methods in Molecular Biology,Humana Press;CellBiology:A Laboratory Notebook(J.E.Cellis编,1998)Academic Press;Animal CellCulture(R.I.Freshney)编,1987);Introduction to Cell and Tissue Culture(J.P.Mather和P.E.Roberts,1998)Plenum Press ;Cell and Tissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle,J.B.Griffiths和D.G.Newell编,1993-8)J.Wiley andSons;Handbook of Experimental Immunology(D.M.Weir和C.C.Blackwell编);GeneTransfer Vectors for Mammalian Cells(J.M.Miller和M.P.Calos编,1987);PCR:ThePolymerase Chain Reaction,(Mullis等人编,1994);Current Protocols in Immunology(J.E.Coligan等人编,1991);Short Protocols in Molecular Biology(Wiley and Sons,1999);Immunobiology(C.A.Janeway和P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,1997);Antibodies:A Practical Approach(D.Catty.编,IRL Press,1988-1989);MonoclonalAntibodies:A Practical Approach(P.Shepherd和C.Dean编,Oxford University Press,2000);Using Antibodies:A Laboratory Manual(E.Harlow和D.Lane(Cold SpringHarbor Laboratory Press,1999);The Antibodies(M.Zanetti和J.D.Capra编,HarwoodAcademic Publishers,1995);和Cancer:Principles and Practice of Oncology(V.T.DeVita 等人编,J.B.Lippincott Company,1993)中所描述的广泛使用的方法。
定义
如本文所用,术语“预防”包括关于个体中特定疾病、病症或病况的发生或复发提供预防。个体可易患、易感染特定疾病、病症或病况,或处于发展所述疾病、病症或病况的风险中,但尚未被诊断患有所述疾病、病症或病况。
如本文所用,“处于发展特定疾病、病症或病况的风险中”的个体可或可不具有可检测的疾病或疾病症状,并且在本文所述的治疗方法之前可已经或可尚未展示可检测的疾病或疾病症状。“处于风险中”表示个体具有一种或多种风险因素,所述因素是与特定疾病、病症或病况的发展有关的可测量参数,如本领域中已知。具有这些风险因素中的一者或多者的个体具有高于不具有这些风险因素中的一者或多者的个体的发展特定疾病、病症或病况的可能性。
如本文所用,术语“治疗”是指被设计成改变在临床病理学的过程期间所治疗的个体的天然过程的临床干预。可需要的治疗效应包括降低进展速率、改善或缓和病理状态和特定疾病、病症或病况的康复或改进的预后。例如,如果与特定疾病、病症或病况有关的一种或多种症状有所减轻或消除,那么个体成功地“得到治疗”。
“有效量”至少是指在必需的剂量和时间段下有效实现所需的治疗或预防结果的量。有效量可在一次或多次施用中提供。
“治疗有效量”至少是实现特定疾病、病症或病况的可测量改进所需的最小浓度。本文中治疗有效量可根据如下因素改变,如患者的疾病状态、年龄、性别和重量,和分拣蛋白拮抗剂在个体中引起所需的反应的能力。治疗有效量还为其中分拣蛋白拮抗剂的任何毒性或有害效应被治疗有益效应超过的量。
如本文所用,与另一化合物或组合物“联合”施用包括同时施用和/或在不同时间施用。联合施用还涵盖呈共制剂形式施用或呈独立组合物形式施用,包括以不同的给药频率或时间间隔,并且使用相同施用途径或不同施用途径。
用于治疗、预防或降低风险目的的“个体”是指被分类为哺乳动物的任何动物,包括人、家养和农场动物和动物园、运动或宠物动物,如狗、马、兔、牛、猪、仓鼠、沙鼠、小鼠、雪貂、大鼠、猫等。优选地,所述个体为人。
术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中可与“抗体”互换使用。术语“抗体”在本文中以最广泛意义使用并且特定地涵盖单克隆抗体、多克隆抗体、由至少两种完整抗体形成的多特异性抗体(例如,双特异性抗体)和抗体片段,只要其展现所需生物活性即可。
基础4链抗体单元是由两条一致的轻(L)链和两条一致的重(H)链构成的异四聚体糖蛋白。VH和VL合起来的配对形成了单一抗原结合位点。关于不同类别的抗体的结构和特性,参见例如Basic and Clinical Immunology,第8版,Daniel P.Stites,Abba I.Terr和Tristram G.Parslow(编),Appleton&Lange,Norwalk,CT,1994,第71页和第6章。
来自任何脊椎动物物种的L链可基于其恒定域的氨基酸序列被指派两种明显不同的类型(称作κ和λ)之一。视其重链的恒定域(CH)的氨基酸序列而定,免疫球蛋白可被指派不同类别或同型。存在五个类别的免疫球蛋白:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,其分别具有被称为α、δ、ε、γ和μ的重链。γ和α类别基于CH序列和功能的相对微小差异进一步被分为亚类(同型),例如人表达以下亚类:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2。不同类别的免疫球蛋白的亚单位结构和三维配置为众所周知的并且一般描述于例如Abbas等人,Cellular andMolecular Immunology,第4版(W.B.Saunders Co.,2000)中。
“原生抗体”通常为具有约150,000道尔顿的异四聚体糖蛋白,由两条一致的轻(L)链和两条一致的重(H)链构成。各轻链通过一个共价二硫键连接至重链,而二硫键的数目在不同免疫球蛋白同型的重链之中改变。各重链和轻链还具有规律间隔的链内二硫桥。各重链在一个末端处具有可变域(VH),随后为多个恒定域。各轻链在一个末端处具有可变域(VL)并且在其另一末端处具有恒定域;所述轻链的恒定域与所述重链的第一恒定域对准,并且所述轻链可变域与所述重链的可变域对准。相信特定氨基酸残基在轻链与重链可变域之间形成界面。
如本公开的抗分拣蛋白抗体的“分离的”抗体是已经被鉴别、与其产生环境(例如,天然地或重组地)的组分分离和/或回收的抗体。优选地,分离的多肽不与来自其产生环境的所有其它污染物组分缔合。来自其产生环境的污染物组分,如由重组转染的细胞产生的那些,是将典型地干扰抗体的研究、诊断或治疗用途的材料,并且可包括酶、激素和其它蛋白或非蛋白溶质。在优选实施方案中,所述多肽将被纯化:(1)至超过95重量%的抗体,如通过例如Lowry方法所测定,并且在一些实施方案中,至超过99重量%;(2)至足以通过使用转杯式测序仪获得N端或内部氨基酸序列的至少15个残基的程度,或(3)至在非还原或还原条件下使用考马斯蓝或优选地银染色通过SDS-PAGE发现均质性。分离的抗体包括在重组T细胞内的原位抗体,因为所述抗体的天然环境的至少一种组分将不存在。然而,通常地,分离的多肽或抗体将通过至少一个纯化步骤制备。
如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体的“可变区”或“可变域”是指所述抗体的重链或轻链的氨基端域。重链和轻链的可变域可分别被称作“VH”和“VL”。这些域一般为所述抗体的最可变部分(相对于同一类别的其它抗体)并且含有抗原结合位点。
术语“可变”是指如下事实,即在如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体之中,可变域的某些区段的序列广泛地不同。V域介导抗原结合并且定义特定抗体针对其特定抗原的特异性。然而,变异性未在可变域的整个范围中均匀地分布。反而,其集中于轻链和重链可变域中的三个被称作高变区(HVR)的区段中。可变域的更高度保守部分被称作框架区(FR)。原生重链和轻链的可变域各自包含四个FR区,所述FR区主要采用β-折叠配置,由三个HVR连接,所述HVR形成连接β-折叠结构的环并且在一些情况下形成β-折叠结构的一部分。各链中的HVR通过FR区紧密地保持在一起并且与另一条链的HVR一起有助于形成抗体的抗原结合位点(参见Kabat等人,Sequences of Immunological Interest,第五版,NationalInstitute of Health,Bethesda,MD(1991))。恒定域未直接牵涉于抗体与抗原的结合中,但展现多种效应子功能,如使抗体参与抗体依赖性细胞毒性。
如本文所用,术语“单克隆抗体”是指获自大体上均质抗体的群体的抗体,如本公开的抗分拣蛋白抗体,即,构成所述群体的个别抗体是一致的,除了可能的天然存在的突变和/或翻译后修饰(例如,异构化、酰胺化),其可少量存在。单克隆抗体针对一个或多个抗原位点具有高度特异性。在一些实施方案中,本公开的抗体可为双特异性抗体。与典型地包括针对不同决定子(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂形成对比,各单克隆抗体针对所述一个或多个抗原位点上的单一决定子。修饰语“单克隆”指示所述抗体的特征是获自抗体的大体上均质群体,并且不应解释为需要由任何特定方法产生所述抗体。例如,欲根据本公开使用的单克隆抗体可通过多种技术制得,包括例如噬菌体展示技术(参见例如Clackson等人,Nature,352:624-628(1991);Marks等人,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Sidhu等人,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee等人,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 101(34):12467-472(2004);和Lee等人,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)、杂交瘤方法(例如Kohler和Milstein.,Nature,256:495-97(1975);Hongo等人,Hybridoma,14(3):253-260(1995),Harlow等人,Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,第2版1988);Hammerling等人,Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681(Elsevier,N.Y.,1981))、重组DNA方法(参见例如美国专利号4,816,567)和用于在具有人免疫球蛋白基因座或编码人免疫球蛋白序列的基因的部分或全部的动物中产生人或人样抗体的技术(参见例如WO 1998/24893;WO1996/34096;WO 1996/33735;WO 1991/10741;Jakobovits等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature362:255-258(1993);Bruggemann等人,Year in Immunol.7:33(1993);美国专利号5,545,807;5,545,806;5,569,825;5,625,126;5,633,425;和5,661,016;Marks等人,Bio/Technology 10:779-783(1992);Lonberg等人,Nature368:856-859(1994);Morrison,Nature 368:812-813(1994);Fishwild等人,Nature Biotechnol.14:845-851(1996);Neuberger,Nature Biotechnol.14:826(1996);和Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995)。
术语“全长抗体”、“完整抗体”或“全抗体”可互换使用以指如与抗体片段相对,呈其大体上完整形式的抗体,如本公开的抗分拣蛋白抗体。具体说来,全抗体包括具有包括Fc区的重链和轻链的那些。恒定域可为原生序列恒定域(例如,人原生序列恒定域)或其氨基酸序列变体。在一些情况下,完整抗体可具有一种或多种效应子功能。
“抗体片段”包含完整抗体的一部分,优选地完整抗体的抗原结合和/或可变区。抗体片段的实例包括Fab、Fab'、F(ab')2和Fv片段;双功能抗体;线性抗体(参见美国专利5,641,870,实施例2;Zapata等人,Protein Eng.8(10):1057-1062(1995));单链抗体分子和由抗体片段形成的多特异性抗体。
如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体的木瓜蛋白酶消化产生两个一致的抗原结合片段(称作“Fab”片段),和残留“Fc”片段(反映容易结晶的能力的名称)。Fab片段由整个L链连同H链的可变区域(VH)和一条重链的第一恒定域(CH1)组成。各Fab片段关于抗原结合为单价的,即,其具有单一抗原结合位点。抗体的胃蛋白酶处理产生单一大F(ab')2片段,所述片段粗略地对应于具有不同抗原结合活性的两个二硫键连接的Fab片段且仍能够与抗原交联。Fab'片段与Fab片段的不同之处在于在CH1域的羧基端处具有数个额外残基,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。Fab'-SH在本文中为其中恒定域的半胱氨酸残基具有游离硫醇基的Fab'的名称。F(ab')2抗体片段最初以Fab'片段对的形式产生,所述片段之间具有铰链半胱氨酸。还已知抗体片段的其它化学偶合。
Fc片段包含通过二硫化物保持在一起的两个H链的羧基端部分。抗体的效应子功能通过Fc区中的序列确定,所述Fc区是另外通过某些类型的细胞上发现的Fc受体(FcR)识别的区。
“Fv”为含有完全抗原识别和抗原结合位点的最小抗体片段。这一片段由一个重链和一个轻链可变区域呈紧密、非共价缔合形式的二聚体组成。由这两个域的折叠发出六个高变环(来自H和L链的各自3个环),所述高变环促进氨基酸残基的抗原结合并且向抗体赋予抗原结合特异性。然而,即使单一可变域(或仅包含对抗原具特异性的三个HVR的Fv的一半)也具有识别并且结合抗原的能力,不过亲和力低于完整结合位点。
“单链Fv”也缩写为“sFv”或“scFv”,是包含连接至单一多肽链中的VH和VL抗体域的抗体片段。优选地,sFv多肽进一步包含在VH与VL域之间的多肽连接子,其使得sFv能够形成抗原结合所需的结构。关于sFv的回顾,参见Pluckthun in The Pharmacology ofMonoclonal Antibodies,第113卷,Rosenburg和Moore编,Springer-Verlag,New York,第269-315页(1994)。
如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体的“功能片段”包含完整抗体的一部分,一般包括完整抗体的抗原结合或可变区或保留或具有改进的FcR结合能力的抗体F区。抗体片段的实例包括线性抗体、单链抗体分子和由抗体片段形成的多特异性抗体。
术语“双功能抗体”是指通过用VH与VL域之间的短连接子(约5-10个)残基)构建sFv片段(参见前一段落)而制备的小抗体片段,以致实现V域的链间而非链内配对,由此产生二价片段,即具有两个抗原结合位点的片段。双特异性双功能抗体是两个“交叉”sFv片段的异型二聚体,其中两种抗体的VH和VL域存在于不同多肽链上。双功能抗体更详细地描述于例如EP 404,097;WO 93/11161;Hollinger等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 90:6444-48(1993)中。
如本文所用,“嵌合抗体”是指抗体(免疫球蛋白),如本公开的抗分拣蛋白抗体,其中重链和/或轻链的一部分与源于特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的相应序列一致或同源,而所述链的剩余部分与源于另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体中的相应序列一致或同源,以及所述抗体的片段,只要其展现所需生物活性即可(美国专利号4,816,567;Morrison等人,Proc.Nat’lAcad.Sci.USA,81:6851-55(1984))。本文中所关注的嵌合抗体包括
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抗体,其中所述抗体的抗原结合区源于通过例如用所关注的抗原使猕猴免疫化而产生的抗体。如本文所用,“人源化抗体”是用作“嵌合抗体”的子集。
如本公开的抗分拣蛋白抗体的非人(例如鼠类)抗体的“人源化”形式为含有源于非人免疫球蛋白的最小序列的嵌合抗体。在一个实施方案中,人源化抗体是其中来自接受者的HVR的残基由来自非人物种(供体抗体)的HVR的残基置换的人免疫球蛋白(接受者抗体),所述非人物种如小鼠、大鼠、兔或具有所需特异性、亲和力和/或能力的非人灵长类动物。在一些情况下,人免疫球蛋白的FR残基由相应非人残基置换。此外,人源化抗体可包含在接受者抗体中或在供体抗体中未发现的残基。可进行这些修饰以进一步细化抗体性能,如结合亲和力。一般来说,人源化抗体将包含至少一个并且典型地两个可变域中的大体上全部,其中高变环中的全部或大体上全部对应于非人免疫球蛋白序列中的那些,并且FR区中的全部或大体上全部是人免疫球蛋白序列中的那些,不过所述FR区可包括一种或多种个别FR残基取代,其改进抗体性能,如结合亲和力、异构化、免疫原性等。FR中的这些氨基酸取代的数目典型地为在H链中不超过6,并且在L链中不超过3。人源化抗体任选地还将包含免疫球蛋白恒定区(Fc)、典型地人免疫球蛋白的恒定区的至少一部分。关于进一步细节,参见例如Jones等人,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature332:323-329(1988);和Presta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593-596(1992)。还参见例如Vaswani和Hamilton,Ann.Allergy,Asthma&Immunol.1:105-115(1998);Harris,Biochem.Soc.Transactions23:1035-1038(1995);Hurle和Gross,Curr.Op.Biotech.5:428-433(1994);和美国专利号6,982,321和7,087,409。
“人抗体”是由人产生和/或已经使用任何用于制备如本文所公开的人抗体的技术制得的抗体,其具有的氨基酸序列对应于如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体的氨基酸序列。人抗体的这一定义具体地排除了包含非人抗原结合残基的人源化抗体。人抗体可使用本领域中已知的多种技术,包括噬菌体展示文库产生。Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.,227:381(1991);Marks等人,J.Mol.Biol.,222:581(1991)。Cole等人,MonoclonalAntibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,第77页(1985);Boerner等人,J.Immunol.,147(1):86-95(1991)中所述的方法也可用于制备人单克隆抗体。还参见vanDijk和van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)。人抗体可通过向转基因动物施用所述抗原来制备,所述转基因动物已经经过修饰以响应抗原攻击产生所述抗体,但其内源基因座已经失能,例如免疫化的异种小鼠(关于XENOMOUSETM技术,参见例如美国专利号6,075,181和6,150,584)。关于经由人B细胞杂交瘤技术产生的人抗体,还参见例如Li等人,Proc.Nat’lAcad.Sci.USA,103:3557-3562(2006)。
术语“高变区”、“HVR”或“HV”当用于本文中时是指抗体可变域的区,如本公开的抗分拣蛋白抗体的区,其在序列方面是高变的和/或形成结构上限定的环。一般说来,抗体包含六个HVR;三个在VH中(H1、H2、H3),并且三个在VL中(L1、L2、L3)。在原生抗体中,H3和L3展示所述六个HVR的最大多样性,并且相信H3尤其在向抗体赋予良好特异性时发挥独特作用。参见例如Xu等人,Immunity 13:37-45(2000);Johnson和Wu Methods in MolecularBiology 248:1-25(Lo编,Human Press,Totowa,NJ,2003))。实际上,仅由重链组成的天然存在的骆驼科动物抗体在轻链不存在下具功能性并且稳定。参见例如Hamers-Casterman等人,Nature363:446-448(1993)和Sheriff等人,Nature Struct.Biol.3:733-736(1996)。
多种HVR描绘在使用中并且涵盖于本文中。作为EU或Kabat互补决定区(CDR)的HVR是基于序列变异性并且最常用(Kabat等人,上述)。Chothia反而提及结构环的位置(Chothia和Lesk J.Mol.Biol.196:901-917(1987))。AbM HVR表示在EU或Kabat CDR与Chothia结构环之间的折衷,并且通过Oxford Molecular的AbM抗体建模软件使用。“接触”HVR是基于对可用的复杂晶体结构的分析。来自这些HVR中的每一者的残基记录如下。
Figure BDA0001494797660000711
HVR可包含如下“延伸的HVR”:在VL中24-36或24-34(L1),46-56或50-56(L2),和89-97或89-96(L3),和在VH中26-35(H1),50-65或49-65(优选实施方案)(H2),和93-102、94-102或95-102(H3)。可变域残基根据EU或Kabat等人,上文针对这些延伸的HVR定义中的每一者所述进行编号。
“框架”或“FR”残基为除如本文所定义的HVR残基外的那些可变域残基。
措辞“如EU或Kabat中的可变域残基编号”或“如EU或Kabat中的氨基酸位置编号”和其变化形式是指EU或Kabat等人,上述中用于抗体的汇编的重链可变域或轻链可变域的编号系统。使用这种编号系统,实际线性氨基酸序列可含有较少或额外氨基酸,其对应于可变域的FR或HVR的缩短或插入其中。例如,重链可变域可包括在H2的残基52后面的单一氨基酸插入物(根据Kabat的残基52a)和在重链FR残基82后面插入的残基(例如,根据Kabat的残基82a、82b和82c等)。残基的EU或Kabat编号可针对给定抗体通过在所述抗体的序列的同源区处与“标准”Kabat编号序列比对而确定。
当提及可变域中的残基(大约为轻链的残基1-107和重链的残基1-113)时通常使用EU或Kabat编号系统(例如,Kabat等人,Sequences of Immunological Interest.第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991))。当提及免疫球蛋白重链恒定区中的残基时一般使用“EU或Kabt编号系统”或“EU指数”(例如,Kabat等人,上述中报道的EU指数)。“如Kabat中的EU指数”是指人IgG1EU抗体的残基编号。除非本文中另外陈述,否则对抗体可变域中的残基编号的提及意指通过Kabat编号系统编号的残基。除非本文中另外陈述,否则对抗体恒定域中的残基编号的提及意指通过EU或Kabat编号系统编号的残基(参见例如美国专利公布号2010-280227)。
如本文所用,“受体人框架”是包含源于人免疫球蛋白框架或人共有框架的VL或VH框架的氨基酸序列的框架。“源于”人免疫球蛋白框架或人共有框架的受体人框架可包含其相同氨基酸序列,或其可含有预先存在的氨基酸序列改变。在一些实施方案中,预先存在的氨基酸改变的数目为10或更少、9或更少、8或更少、7或更少、6或更少、5或更少、4或更少、3或更少或2或更少。在预先存在的氨基酸改变存在于VH中的情况下,优选地那些改变出现于位置71H、73H和78H中的仅三者、两者或一者处;例如,在那些位置处的氨基酸残基可为71A、73T和/或78A。在一个实施方案中,所述VL受体人框架的序列与所述VL人免疫球蛋白框架序列或人共有框架序列一致。
“人共有框架”是表示在人免疫球蛋白VL或VH框架序列的选择中最常出现的氨基酸残基的框架。一般说来,人免疫球蛋白VL或VH序列是从可变域序列的亚群中选择。一般说来,序列的亚群是如Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)中的亚群。实例包括关于VL,所述亚群可为如Kabat等人,上述中的亚群κI、κII、κIII或κIV。另外,关于VH,所述亚群可为如Kabat等人,上述中的亚群I、亚群II或亚群III。
在例如本公开的抗分拣蛋白抗体的规定位置处的“氨基酸修饰”是指规定残基的取代或缺失,或邻近规定残基的至少一种氨基酸残基的插入。“邻近”规定残基的插入意指插入其一个至两个残基内。插入可为规定残基的N端或C端。本文中优选的氨基酸修饰为取代。
如本公开的抗分拣蛋白抗体的“亲和力成熟”抗体是其一个或多个HVR内具有一种或多种改变的抗体,与不具有那些改变的亲本抗体相比,所述改变导致所述抗体对抗原的亲和力的改进。在一个实施方案中,亲和力成熟抗体对标靶抗原具有纳摩尔或甚至皮摩尔亲和力。亲和力成熟抗体通过本领域中已知的程序产生。例如,Marks等人,Bio/Technology10:779-783(1992)描述了通过VH和VL域改组实现亲和力成熟。HVR和/或框架残基的随机诱变由例如以下描述:Barbas等人Proc Nat.Acad.Sci.USA 91:3809-3813(1994);Schier等人Gene169:147-155(1995);Yelton等人J.Immunol.155:1994-2004(1995);Jackson等人,J.Immunol.154(7):3310-9(1995);和Hawkins等人,J.Mol.Biol.226:889-896(1992)。
如本文所用,术语“特异性地识别”或“特异性地结合”是指可测量并且可再现的相互作用,如标靶与抗体(如本公开的抗分拣蛋白抗体)之间的吸引或结合,其决定了在包括生物分子的分子异源群体存在下标靶的存在。例如,特异性地或优先地结合于标靶或表位的抗体(如本公开的抗分拣蛋白抗体)是结合这一标靶或表位的抗体,与其结合于其它标靶或所述标靶的其它表位相比,其具有更大亲和力、亲合力、更容易和/或具有更长持续时间。通过阅读这一定义还应理解,例如,特异性地或优先地结合于第一标靶的抗体(或部分)可或可不特异性地或优先地结合于第二标靶。因而,“特异性结合”或“优先结合”未必需要(尽管其可包括)排他性结合。特异性地结合于标靶的抗体可具有至少约103M-1或104M-1,有时约105M-1或106M-1,在其它情况下约106M-1或107M-1,约108M-1至109M-1,或约1010M-1至1011M-1或更高的缔合常数。多种免疫分析格式可用于选择特异性地与特定蛋白具有免疫反应性的抗体。例如,固相ELISA免疫分析常规地用于选择特异性地与蛋白具有免疫反应性的单克隆抗体。关于可用于确定特异性免疫反应性的免疫分析格式和条件的描述,参见例如Harlow和Lane(1988)Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Publications,NewYork。
如本文所用,分拣蛋白与第二蛋白之间的“相互作用”涵盖而不限于蛋白-蛋白相互作用、物理相互作用、化学相互作用、结合、共价结合和离子结合。如本文所用,当抗体破坏、降低或完全地消除两种蛋白之间的相互作用时,所述抗体“抑制两种蛋白之间的相互作用”。当本公开的抗体或其片段结合于两种蛋白之一时,所述抗体或其片段“抑制两种蛋白之间的相互作用”。
“阻断”抗体、“拮抗剂”抗体或“抑制”抗体是如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体,其抑制或降低其所结合的抗原的一种或多种生物活性,如与一种或多种蛋白的相互作用。在一些实施方案中,阻断抗体、拮抗剂抗体或抑制抗体大体上或完全地抑制抗原的一种或多种生物活性或相互作用。
抗体“效应子功能”是指可归因于抗体的Fc区(原生序列Fc区或氨基酸序列变体Fc区)的那些生物活性,并且随抗体同型改变。
本文中术语“Fc区”用于定义免疫球蛋白重链的C端区,包括原生序列Fc区和变体Fc区。尽管免疫球蛋白重链的Fc区的边界可能改变,人IgG重链Fc区通常经过界定以从位置Cys226处的氨基酸残基或从Pro230延伸至其羧基端。Fc区的C端赖氨酸(根据EU或Kabat编号系统的残基447)可例如在抗体的产生或纯化期间,或通过重组工程改造编码抗体重链的核酸而去除。因此,完整抗体的组合物可包含其中所有K447残基均去除的抗体群体,未去除K447残基的抗体群体,和具有含有和不含K447残基的抗体混合物的抗体群体。用于本公开抗体的合适原生序列Fc区包括人IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。
“原生序列Fc区”包含与自然界中发现的Fc区的氨基酸序列一致的氨基酸序列。原生序列人Fc区包括原生序列人IgG1Fc区(非A和A同种异型);原生序列人IgG2Fc区;原生序列人IgG3Fc区;和原生序列人IgG4Fc区以及其天然存在的变体。
“变体Fc区”包含由于至少一种氨基酸修饰、优选地一种或多种氨基酸取代而不同于原生序列Fc区的氨基酸序列的氨基酸序列。优选地,所述变体Fc区与原生序列Fc区相比或与亲本多肽的Fc区相比具有原生序列Fc区中或亲本多肽的Fc区中的至少一种氨基酸取代,例如约一种至约十种氨基酸取代,并且优选地约一种至约五种氨基酸取代。本文中的所述变体Fc区将优选地与原生序列Fc区和/或与亲本多肽的Fc区具有至少约80%同源性,并且最优选地与其具有至少约90%同源性,更优选地与其具有至少约95%同源性。
“Fc受体”或“FcR”描述了结合于抗体的Fc区的受体。优选的FcR为原生序列人FcR。此外,优选的FcR为结合IgG抗体的FcR(γ受体)并且包括FcγRI、FcγRII和FcγRIII亚类的受体,包括这些受体的等位基因变体和替代地剪接形式,FcγRII受体包括FcγRIIA(“活化受体”)和FcγRIIB(“抑制受体”),其具有相似的氨基酸序列,主要不同之处在于其细胞质域。活化受体FcγRIIA在其细胞质域中含有基于免疫受体酪氨酸的活化基序(“ITAM”)。抑制受体FcγRIIB在其细胞质域中含有基于免疫受体酪氨酸的抑制基序(“ITIM”)。(参见例如M.
Figure BDA0001494797660000751
Annu.Rev.Immunol.15:203-234(1997))。FcR回顾于Ravetch和Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457-92(1991);Capel等人,Immunomethods4:25-34(1994);和deHaas等人,J.Lab.Clin.Med.126:330-41(1995)中。其它FcR(包括未来欲鉴别的那些)在本文中由术语“FcR”涵盖。FcR也可增加抗体的血清半衰期。
体内结合于FcRn和人FcRn高亲和力结合多肽的血清半衰期可例如在表达人FcRn的转基因小鼠或经过转染的人细胞系中,或在施用具有变体Fc区的多肽的灵长类动物中进行分析。WO 2004/42072(Presta)描述了具有改进或削弱的与FcR的结合的抗体变体。还参见例如Shields等人,J.Biol.Chem.9(2):6591-6604(2001)。
如本文所用,关于肽、多肽或抗体序列的“百分比(%)氨基酸序列一致性”和“同源性”是指在比对序列并且引入间隙(必要时)以实现最大百分比序列一致性之后,并且不考虑作为序列一致性的一部分的任何保守取代,候选序列中与所述特定肽或多肽序列中的氨基酸残基一致的氨基酸残基的百分率。用于达成确定百分比氨基酸序列一致性的目的的比对可以在本领域的技能内的多种方式实现,例如使用公开可得的计算机软件,如BLAST、BLAST-2、ALIGN或MEGALIGNTM(DNASTAR)软件。本领域技术人员可确定用于测量比对的适当参数,包括在所比较的序列的全长内实现最大比对所需的本领域中已知的任何算法。
编码抗体(如本公开的抗分拣蛋白抗体)的“分离的”核酸分子是从至少一种污染物核酸分子鉴别并且分离的核酸分子,所述污染物核酸分子在其产生环境中通常与其缔合。优选地,所述分离的核酸不与所有与产生环境缔合的组分缔合。编码本文中的多肽和抗体的分离的核酸分子呈不同于其在自然界中发现的形式或设定的形式。因此,分离的核酸分子区别于天然存在于细胞中的编码本文中的多肽和抗体的核酸。
如本文所用,术语“载体”意图指能够运输已经与其连接的另一核酸的核酸分子。一种类型的载体是“质粒”,其是指其中可接合额外DNA区段的环状双链DNA。另一类型的载体是噬菌体载体。另一类型的载体是病毒载体,其中额外DNA区段可接合至病毒基因组中。某些载体能够在其中引入所述载体的宿主细胞中自主复制(例如,具有细菌复制起点的细菌载体和游离型哺乳动物载体)。其它载体(例如,非游离型哺乳动物载体)可在引入至宿主细胞中时整合至宿主细胞的基因组中,并且由此连同宿主基因组一起复制。此外,某些载体能够指导其可操作性连接的基因的表达。所述载体在本文中被称作“重组表达载体”或简单地称作“表达载体”。一般说来,用于重组DNA技术中的表达载体通常呈质粒的形式。在本说明书中,“质粒”和“载体”可互换使用,因为质粒是载体的最常用形式。
如本文中可互换使用的“聚核苷酸”或“核酸”是指任何长度的核苷酸的聚合物,并且包括DNA和RNA。所述核苷酸可为脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、经过修饰的核苷酸或碱基和/或其类似物,或可通过DNA或RNA聚合酶或通过合成反应并入聚合物中的任何底物。聚核苷酸可包含经过修饰的核苷酸,如甲基化核苷酸和其类似物。如果存在核苷酸结构的修饰,那么其可在聚合物的组装之前或之后给予。核苷酸的序列可由非核苷酸组分中断。聚核苷酸可包括在合成之后产生的修饰,如缀合于标记。其它类型的修饰包括例如一种或多种天然存在的核苷酸用类似物进行的“帽”取代;核苷酸间修饰,例如具有不带电的键(例如,膦酸甲酯、磷酸三酯、氨基磷酸盐、氨基甲酸酯等)和具有带电的键(例如,硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯等)的那些、含有例如蛋白(例如,核酸酶、毒素、抗体、信号肽、聚L-赖氨酸等)的悬垂部分的那些、具有嵌入剂(例如,吖啶、补骨脂素等)的那些、含有螯合剂(例如,金属、放射性金属、硼、氧化性金属等)的那些、含有烷基化剂的那些、具有经过修饰的键(例如,α异头核酸等)的那些,以及聚核苷酸的未修饰形式。此外,通常存在于糖中的任何羟基均可例如由膦酸酯基、磷酸酯基置换,由标准保护基保护,或经过活化以制备与额外核苷酸的额外键,或可缀合于固体或半固体支撑物。5’和3’端OH可经过磷酸化或用胺或1至20个碳原子的有机加帽基团取代。其它羟基也可衍生化至标准保护基。聚核苷酸也可含有本领域中一般已知的核糖或脱氧核糖的类似形式,包括例如2'-O-甲基-、2'-O-烯丙基-、2'-氟-或2'-叠氮基-核糖、碳环糖类似物、α-异头糖、差向异构体糖(如阿拉伯糖、木糖或来苏糖)、吡喃糖、呋喃糖、景天庚酮糖、无环类似物和碱性核苷酸类似物(如甲基核糖苷)。一种或多种磷酸二酯键可由替代连接基团置换。这些替代连接基团包括但不限于如下实施方案,其中磷酸酯由P(O)S(“硫代酯”)、P(S)S(“二硫代酯”)、(O)NR2(“酰胺化物”)、P(O)R、P(O)OR’、CO或CH2(“甲缩醛”)置换,其中各R或R’独立地为H或任选地含有醚(-O-)键、芳基、烯基、环烷基、环烯基或芳烷基的取代或未取代的烷基(1-20C)。并非聚核苷酸中的所有键均需要一致。先前描述适用于本文中所提及的所有聚核苷酸,包括RNA和DNA。
“宿主细胞”包括可为或已经为用于并入聚核苷酸插入物的载体的接受者的个别细胞或细胞培养物。宿主细胞包括单一宿主细胞的后代,并且所述后代可归因于天然、意外或有意突变而未必与原始亲本细胞完全一致(在形态方面或在基因组DNA补体方面)。宿主细胞包括用本公开的聚核苷酸体内转染的细胞。
如本文所用,“载体”包括在所用剂量和浓度下对暴露于其的细胞或哺乳动物无毒的药学上可接受的载体、赋形剂或稳定剂。通常,生理学上可接受的载体为pH缓冲水溶液。生理学上可接受的载体的实例包括缓冲液,如磷酸盐、柠檬酸盐和其它有机酸;包括抗坏血酸的抗氧化剂;低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、二糖和其它碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂,如EDTA;糖醇,如甘露醇或山梨醇;成盐抗衡离子,如钠;和/或非离子性表面活性剂,如TWEENTM、聚乙二醇(PEG)和PLURONICSTM
如本文所用,术语“细胞凋亡”是指基因指导的细胞内细胞破坏过程。细胞凋亡不同于坏死;其包括细胞骨架破坏、细胞质收缩和浓缩、磷脂酰丝氨酸在细胞膜的外表面上的表达和起泡,导致形成细胞膜结合的囊泡或细胞凋亡体。所述过程还称作“程序性细胞死亡”。在细胞凋亡期间,观察到特征性现象,如弯曲细胞表面、核染色质的浓缩、染色体DNA的片段化和线粒体功能的损失。多种已知技术可用于检测细胞凋亡,如用Annexin V、碘化丙啶、DNA片段化分析和YO-PRO-1(Invitrogen)对细胞染色。在一些实施方案中,可使用用Annexin V和碘化丙啶染色,并且Annexin V+/PI+、Annexin V+/PI-和Annexin V-/PI+群体的组合百分率被视作死亡细胞。
如本文所用,术语“约”是指针对这一技术领域中的熟练人员容易知晓的各别值的通常误差范围。对“约”本文中的值或参数的提及包括(并且描述)本身针对这一值或参数的实施方案。
除非本文另外清楚指示,否则如本文中和附图中所用,单数形式“一(a)”、“一(an)”和“所述(the)”包括复数个提及物。例如,对“抗体”的提及是提及一种至多种抗体,如摩尔量,并且包括本领域技术人员已知的其相等物,等等。
应理解,本文所述的本公开的方面和实施方案包括“包含”方面和实施方案、“由方面和实施方案组成”和“基本上由方面和实施方案组成”。
分拣蛋白
一方面,本公开提供结合于本公开的分拣蛋白内的表位的分离的(例如,单克隆)抗体。本公开的分拣蛋白包括而不限于哺乳动物分拣蛋白、人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白和大鼠分拣蛋白。
分拣蛋白不同地被称作分拣蛋白1、sort1、100kDa NT受体、糖蛋白95(GP95)、颗粒蛋白前体受体(PGRN-R)和神经紧张素受体3(NT-3或NTR-3)。分拣蛋白是831个氨基酸的蛋白,其编码I型膜受体。已知多种分拣蛋白同系物,包括而不限于人分拣蛋白、大鼠分拣蛋白和小鼠分拣蛋白。人分拣蛋白的氨基酸序列在下文中陈述为SEQ ID NO:1(其中关键氨基酸残基经预测参与以粗体描绘的颗粒蛋白前体结合并且,并且所预测的前NGF结合区加下划线):
Figure BDA0001494797660000801
另外,小鼠分拣蛋白的氨基酸序列陈述于SEQ ID NO:2中:
Figure BDA0001494797660000802
另外,大鼠分拣蛋白的氨基酸序列陈述于SEQ ID NO:3中。
Figure BDA0001494797660000811
在一些实施方案中,分拣蛋白为包括信号序列的前蛋白。在一些实施方案中,分拣蛋白为成熟蛋白。在一些实施方案中,所述成熟分拣蛋白不包括信号序列。在一些实施方案中,所述成熟分拣蛋白在细胞上表达。
本公开的分拣蛋白包括数个域,包括而不限于信号序列、前肽、内腔域、Vps10p域、10CC域、跨膜域和细胞质域。另外,本公开的蛋白以高水平在多种组织中表达,包括而不限于脑、脊髓、心脏和骨骼肌、甲状腺、胎盘和睾丸。
分拣蛋白是分选受体的Vps10p家族的成员,所述家族还包括而不限于具有A型重复的分选蛋白相关受体(SorLA)、分选蛋白相关受体CNS表达1(SorCS1)、分选蛋白相关受体CNS表达2(SorCS2)和分选蛋白相关受体CNS表达3(SorCS3)。分拣蛋白的内腔区与酵母Vps10p中的两个内腔域(Vps10p域)中的每一者比对。Vps10p域的特点为氨基端前肽和含有10个保守半胱氨酸(10CC)残基的羧基端区段。Vps10p家族的其它受体共有Vps10p域,所述域位于氨基端处,并且含有额外胞外域。
分选受体的Vps10p家族在神经系统内和别处均具有不同的功能。所述受体已经显示出为多官能的,结合数种不同配体,包括而不限于颗粒蛋白前体(PGRN)、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、PCSK9、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3(前NT3)、前神经营养蛋白-4/5、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经营养蛋白-3(NT3)、神经营养蛋白-4/5、神经紧张素、p75NTR、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE 2、3、4)、受体相关蛋白(RAP)和血纤维蛋白溶酶原活化剂系统的要素;并且参与细胞内分选、内吞和信号转导。本公开的分拣蛋白已经显示出介导脂蛋白脂肪酶、神经紧张素和神经生长因子的前形式的快速内吞;并且靶向用于从高尔基体运输至晚期内体的蛋白。此外,本公开的分拣蛋白已经显示出与细胞膜上的p75形成复合物并且对神经生长因子前体(NGF)诱导的神经元死亡是必要的。最近还示出Vps10p受体家族的成员与神经营养蛋白家族的成员相互作用,所述神经营养蛋白家族包括NGF、脑源性神经营养因子、神经营养蛋白-3和神经营养蛋白-4/5或神经营养蛋白的前域形式(前神经营养蛋白)。本公开的分拣蛋白还已经显示出结合于PCSK9并且调节其细胞外水平,PCSK9指定低密度脂蛋白受体用于在溶酶体中降解,导致增加的LDL胆固醇水平。
因此,如本文所用,本公开的“分拣蛋白”包括而不限于哺乳动物分拣蛋白、人分拣蛋白、灵长类动物分拣蛋白、小鼠分拣蛋白和大鼠分拣蛋白。另外,本公开的抗分拣蛋白抗体可结合哺乳动物分拣蛋白、人分拣蛋白、灵长类动物分拣蛋白、小鼠分拣蛋白和大鼠分拣蛋白中的一者或多者内的表位。
分拣蛋白域
本公开的分拣蛋白含有数个域,如含有Asp-box基序、十叶片β-螺旋桨结构和疏水性环的Vps10p域;和10CC域。
如本文所公开,本公开的分拣蛋白与前神经营养蛋白或神经营养蛋白之间的相互作用由含有十叶片β-螺旋桨结构和Asp-box基序的Vps10p域介导。在某些实施方案中,本公开的分拣蛋白含有Vps10p域,所述Vps10p域包括十叶片β-螺旋桨结构并且位于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基78-611或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基78-611的氨基酸残基内。在某些实施方案中,人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基190-220或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基190-220的氨基酸残基位于Vps10p域内。
本公开的Vps10p域可包括Asp-box基序。如本文所用,Asp-box基序具有以下序列:(S/T)-X-(D/N)-X-X-X-X-(W/F/Y)(SEQ ID NO:4)或X-X-(S/T)-X-(D/N)-X-G-X-(T/S)-(W/F/Y)-X(SEQ ID NO:5),其中X表示任何氨基酸。在人分拣蛋白中,Asp-box基序位于氨基酸残基200-207(SSDFAKNF(SEQ ID NO:694))处。因此,在某些实施方案中,Asp-box基序位于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基200-207或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ IDNO:1的氨基酸残基200-207的氨基酸残基处。
如本文所公开,本公开的分拣蛋白与p75之间的相互作用由Vps10p域的疏水性环的10CC域介导。
在某些实施方案中,本公开的分拣蛋白含有10CC域,所述10CC域位于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基610-757或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基610-757的氨基酸残基内。在优选实施方案中,人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基592-593、610-660和/或667-749或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQID NO:1的氨基酸残基592-593、610-660和/或667-749的氨基酸残基位于分拣蛋白的10CC域内。
在其它实施方案中,本公开的分拣蛋白含有在Vps10p域内的疏水性环,所述疏水性环位于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基130-141或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基130-141的氨基酸残基内。
如本领域技术人员应理解,本公开的域的开始和结束残基可视所用的计算机建模程序或用于确定所述域的方法而改变。
分拣蛋白结合搭配物
本公开的分拣蛋白可与一种或多种蛋白相互作用(例如,结合),所述蛋白包括而不限于颗粒蛋白前体蛋白;神经营养蛋白,如前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)和脑源性神经营养因子(BDNF);神经紧张素、p75、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、淀粉样前体蛋白、Aβ肽、PCSK9、p75NTR和受体相关蛋白(RAP)。
颗粒蛋白前体
本公开的分拣蛋白已经显示出直接地与颗粒蛋白前体相互作用(例如,结合)并且介导颗粒蛋白前体的降解(例如,Zheng,Y等人,(2011)PLoS ONE 6(6):e21023)。
颗粒蛋白前体不同地被称作PGRN、上皮素前体、颗粒蛋白-上皮素前体、PC(前列腺癌)细胞源性生长因子(PCDGF)和颗粒蛋白(acrogranin)。颗粒蛋白前体为593个氨基酸的蛋白,其编码具有介于6-25kDa范围内的较小颗粒蛋白(上皮素)基序的7.5个重复的68.5kD分泌性糖蛋白,所述分泌性糖蛋白可从前体PGRN蛋白水解裂解。颗粒蛋白前体裂解产物的实例包括而不限于颗粒蛋白A/上皮素1、颗粒蛋白B上皮素2、颗粒蛋白C、颗粒蛋白D、颗粒蛋白E、颗粒蛋白F、颗粒蛋白G和任何其它已知的源于颗粒蛋白前体的肽产物。
颗粒蛋白前体广泛地表达,并且在非神经元细胞中已经与多种事件有关,如细胞周期调节和细胞运动性、伤口修复、发炎、如血管内皮生长因子(VEGF)的生长因子的诱导和肿瘤发生。颗粒蛋白前体还广泛地在早期神经发育中表达,但晚期发育局限于规定的神经元群体,如皮层神经元、海马椎体神经元和浦肯野细胞。然而,颗粒蛋白前体在神经元细胞中的作用尚不清楚,直至经历额颞叶痴呆(FTD)的患者显示出在染色体17上的颗粒蛋白前体基因中携带突变。随后,颗粒蛋白前体已经显示出促进神经元存活并且增强皮层和运动神经元中的神经突生长。因此,尽管颗粒蛋白前体并非神经营养蛋白或神经营养蛋白家族的成员,其已经由于其促进神经元存活的能力而被称作神经营养因子。
此外,已经显示出颗粒蛋白前体的单倍型不足(其包括超过70种不同突变,如功能缺失型突变)与具有TDP-43病理学的额颞叶痴呆(FTD)有关。此外,血浆中的颗粒蛋白前体水平在具有FTD突变的患者中降低。颗粒蛋白前体突变占家族性FTD的25%。另外,低水平的颗粒蛋白前体在一些不具有颗粒蛋白前体突变的FTD患者中可见,并且颗粒蛋白前体水平在阿尔兹海默氏病和ALS中改变。因此,相信颗粒蛋白前体可一般牵涉于变性疾病中。
还已经显示出颗粒蛋白前体的完全损失会导致神经元类脂核素沉积病(NPL)表型。因此,相信具有多种溶酶体贮积症的个体可对增加的颗粒蛋白前体水平起反应。颗粒蛋白前体广泛地表达,并且在中枢神经系统中由神经元和小胶质细胞产生。颗粒蛋白前体还一般地被认为在巨噬细胞和小胶质细胞中具有消炎作用,并且在神经元中具有促存活作用。
因此,本公开的增加颗粒蛋白前体水平、降低分拣蛋白的细胞表面水平和/或阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)的抗分拣蛋白抗体将有益于预防、降低风险或治疗与颗粒蛋白前体表达和/或活性的降低的水平有关的病况和/或疾病、细胞死亡(例如,神经元细胞死亡)、额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和/或正常老化的一种或多种不需要的症状。另外,本公开的增加颗粒蛋白前体水平、降低分拣蛋白的细胞表面水平和/或阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)的抗分拣蛋白抗体可抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,可诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性,可降低颗粒蛋白前体或其片段的内体内化,和/或可增加颗粒蛋白前体的有效浓度。
在一些实施方案中,本公开的增加颗粒蛋白前体水平、降低分拣蛋白的细胞表面水平和/或阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)的抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白(SEQ IDNO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的增加颗粒蛋白前体水平、降低分拣蛋白的细胞表面水平和/或阻断分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)的抗分拣蛋白抗体可结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
神经营养蛋白
本公开的分拣蛋白已经显示出直接地与前神经营养蛋白(例如,前NGF)相互作用(例如,结合),所述前神经营养蛋白具有前域并且典型地为促细胞凋亡的(例如,Andersen,OS等人(2010)The Journal of Biological Chemistry,285,12210-12222)。所述前NGF前体在应力期间被释放,并且分拣蛋白已经显示出牵涉于调节其释放以及结合于接收细胞上。这种结合可通过分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基163-174的线性表位介导。
神经营养蛋白是诱导神经元细胞存活、发育和功能的二聚体肽激素蛋白的家族。神经营养蛋白属于一类生长因子,所述生长因子是能够对特定细胞传导信号以存活、分化或生长的分泌性蛋白。促进神经元的存活的生长因子(如神经营养蛋白)被称作神经营养因子。神经营养因子由标靶组织分泌并且通过防止缔合的神经元开始程序性细胞死亡而起作用。神经营养蛋白也可诱导祖细胞分化形成神经元。本公开的神经营养蛋白在细胞内呈30-35kDa前体蛋白形式形成,含有信号肽和糖基化位点。在加工期间,前体蛋白也通过钙依赖性丝氨酸蛋白酶弗林蛋白酶和激素原转化酶家族的其它成员在高尔基体内在二碱性裂解位点处裂解。这种裂解的N端部分为118-120个氨基酸的成熟神经营养蛋白和生物活性12-14kDa C端产物(Seidah等人,Biochem.J.(1996)314:951-960)。如本文所用,“神经营养蛋白”和“神经营养因子”可互换使用。本公开的神经营养蛋白包括而不限于结构上相关的因子神经生长因子(NGF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经营养蛋白-3(NT-3)和神经营养蛋白-4(NT-4)。如本文所用,“前神经营养蛋白”可指神经营养蛋白家族的任何前肽,包括而不限于前NGF、前BDNF、前神经营养蛋白-3和前神经营养蛋白-4/5。
已经显示出,前神经营养蛋白在老化、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤和长期抑郁中发挥病理学作用(例如,Beattie,MS等人,(2002)Neuron 36,375–386;Volosin,M等人(2006)J.Neurosci.26,7756–7766;Nykjaer,A等人,(2005)Curr.Opin.Neurobiol.15,49–57;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,1449-1457;Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870–9879;Fahnestock,M等人,(2001)Mol.CellNeurosci.18,210-220;Nakamura,K等人,(2007)Cell Death.Differ.14,1552-1554;Yune,T等人(2007)J.Neurosci.27,7751-7761;Arnett,MG等人,(2007)Brain Res.1183,32-42;Wei,Y等人,(2007)Neurosci.Lett.429,169-174;Provenzano,MJ等人,(2008)Laryngoscope 118,87-93;和Pang,PT等人,(2004)Science 306,487-491)。
神经生长因子(NGF)为小的、分泌性蛋白,其同型二聚化并且并入较大的复合物中。NGF具有神经生长刺激活性并且所述复合物牵涉于生长、维持、存活和交感神经元和某些感觉神经元的分化的调节。NGF中的突变已经与遗传性感觉和自主神经病5型(HSAN5)有关,并且NGF表达的失调与过敏性鼻炎有关。不希望受理论束缚,还相信前NGF可诱导细胞凋亡和长期抑郁。
脑源性神经营养因子(BDNF)是由皮层神经元诱导的分泌性蛋白,并且是脑中纹状体神经元的存活所必需的。BDNF的表达在阿尔兹海默氏病和亨廷顿病患者中均降低。BDNF可在应力反应的调节中和情绪障碍的生物学中发挥作用。编码不同亚型的多种转录变体已经关于这种基因进行了描述。不希望受理论束缚,还相信前BDNF可诱导细胞凋亡和长期抑郁。
神经营养蛋白-3是多种周围和中枢神经系统神经元的存活和功能所必需的分泌性蛋白。神经营养蛋白-3基因变体与精神分裂症的重度形式有关并且前神经营养蛋白-3(前NT3)诱导交感神经元死亡。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体还可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白)之间的相互作用。所述抗体可有益于预防、降低风险或治疗与神经营养蛋白表达和/或活性的降低的水平有关的病况和/或疾病、细胞死亡(例如,神经元细胞死亡)、额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和/或正常老化的一种或多种不需要的症状。本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白)之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体还可防止由前神经营养蛋白诱导的细胞死亡(例如,细胞凋亡)。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内的氨基酸残基内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
神经紧张素
本公开的分拣蛋白已经显示出与分拣蛋白的β-螺旋桨结构内的神经紧张素相互作用(例如,结合),并且在人分拣蛋白的丝氨酸283处已经显示出重要接触(例如,Quistgaard,EM等人(2009)Nature Structural and Molecular Biology,16第96-98页)。这种残基还已经显示出对颗粒蛋白前体结合至关重要。神经紧张素结合位点在分拣蛋白的β-螺旋桨结构的位于中央的管道内,而前神经营养蛋白域在β-螺旋桨结构的表面上。前神经营养蛋白结合于分拣蛋白部分地由神经紧张素抑制,因为结合区并未隔开太远。
神经紧张素是13个氨基酸的神经肽,其牵涉于促黄体生成素和催乳激素释放的调节。神经紧张素已经显示出与多巴胺能系统具有显著相互作用。神经紧张素作为169-170个氨基酸的前体蛋白的一部分被合成,所述前体蛋白还含有相关神经肽神经介素N。肽编码域串联地位于所述前体的羧基末端附近并且由成对碱性氨基酸(赖氨酸-精氨酸)加工位点约束并且分隔。神经紧张素与数种其它神经肽(包括神经介素N)共享其6个C端氨基酸残基的显著序列相似性。这一C端区负责完全生物活性,而N端部分具有调节作用。在中枢神经系统中,神经紧张素具有多巴胺传输和垂体前叶激素分泌的神经调节剂的双重功能。其还在脑中显示出有效的低温和止痛效应。神经紧张素还已经牵涉于精神分裂症、亨廷顿和帕金森疾病的病理生理学。神经紧张素还已经显示出在脑缺血的实验模型中提供神经保护。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与神经紧张素之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与神经紧张素表达和/或活性的降低的水平有关的病况和/或疾病、细胞死亡(例如,神经元细胞死亡)、额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病和/或正常老化的不需要的症状。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与神经紧张素之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ IDNO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与神经紧张素之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
低亲和力神经生长因子受体(p75)
本公开的分拣蛋白已经显示出与分拣蛋白的10CC域或分拣蛋白的Vps10p域的疏水性环内的低亲和力神经生长因子(NGF)受体(p75)相互作用(例如,结合)。如本文所公开,本公开的分拣蛋白可与p75一起充当前神经营养蛋白的共受体,其诱导细胞凋亡信号传导。
低亲和力NGF受体不同地被称作p75、p75神经营养蛋白受体、p75NGF受体、p75NTR、LNGFR、NGFR、CD271、Gp80-LNGFR和TNFRSF16和p75NTR。P75是本公开的神经营养蛋白的两种受体类型之一。P75已经显示出结合神经营养蛋白并且充当神经营养蛋白的“接收器”。然而,还已经显示出在共表达的TrkA(神经营养蛋白的另一受体类型)不存在下,p75可在细胞中诱导细胞死亡(例如,细胞凋亡)。因而并且不希望受理论束缚,相信阻断分拣蛋白与p75之间的相互作用会降低p75免疫原性细胞死亡依赖性细胞死亡信号的产生。
因此,抑制分拣蛋白与p75的相互作用(例如,结合)将降低前神经营养蛋白的有效浓度并且因此降低所引起的神经元细胞死亡。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与p75之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与p75表达和/或活性的降低的水平有关的病况和/或疾病、细胞死亡(例如,神经元细胞死亡)、额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病和/或正常老化的不需要的症状。本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与p75之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体也将降低由p75进行的细胞凋亡信号传导所需的前神经营养蛋白的有效浓度,降低指定用于内体的p75或其片段的内化,降低细胞中p75免疫原性细胞死亡依赖性细胞死亡信号的产生,并且防止由p75诱导的细胞死亡(例如,细胞凋亡)。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与p75之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与p75之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
淀粉样前体蛋白(APP)
本公开的分拣蛋白已经显示出与淀粉样前体蛋白(APP)相互作用(例如,结合)。如本文所公开,本公开的分拣蛋白可用于改变APP的亚细胞定位并且增加其加工成Aβ肽和与阿尔兹海默氏病有关的细胞内片段。
淀粉样前体蛋白(APP)是在多种组织中表达并且在神经元的突触中浓缩的内在膜蛋白。其主要功能未知,不过其已经被牵涉作为突触形成、神经可塑性和铁输出的调节剂。APP众所周知为前体分子,其蛋白水解产生β淀粉样蛋白(Aβ),β淀粉样蛋白是37至49个氨基酸的肽,其淀粉样原纤维形式是在阿尔兹海默氏病患者的脑中发现的淀粉样斑块的主要组分。
因此,抑制分拣蛋白与APP的相互作用(例如,结合)将增加前神经营养蛋白的有效浓度。此外,阻断分拣蛋白与APP之间的相互作用将导致APP的降低的内体内化和其加工成Aβ肽。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与APP之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与APP表达和/或活性的异常水平或加工有关的病况和/或疾病、细胞死亡(例如,神经元细胞死亡)、额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病和/或正常老化的不需要的症状。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与APP之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与APP之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
脂蛋白脂肪酶
本公开的分拣蛋白已经显示出与脂蛋白脂肪酶(LpL)相互作用(例如,结合)。如本文所公开,本公开的分拣蛋白结合于LpL并且修饰其降解。
脂蛋白脂肪酶为具有EC 3.1.1.34活性的分泌性酶。脂蛋白脂肪酶是脂肪酶基因家族的成员,所述家族包括胰脂肪酶、肝脂肪酶和内皮脂肪酶。其为将脂蛋白中的三酸甘油酯(如在乳糜微滴和极低密度脂蛋白(VLDL)中发现的那些)水解成两种游离脂肪酸和一种单酰基甘油分子的水溶性酶。脂蛋白脂肪酶还牵涉于促进乳糜微滴剩余物、富胆固醇脂蛋白和游离脂肪酸的细胞摄取。脂蛋白脂肪酶在毛细血管中附接至内皮细胞的内腔表面,并且最广泛地分布于脂肪、心脏和骨骼肌组织中。脂蛋白脂肪酶呈糖基化同型二聚体形式从实质细胞分泌,并且接着通过细胞外基质并且跨内皮细胞易位至毛细血管腔。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与脂蛋白脂肪酶之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与脂蛋白脂肪酶表达和/或活性的降低的水平有关的病况和/或疾病、血管性痴呆和/或动脉粥样硬化性血管疾病。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与脂蛋白脂肪酶之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与脂蛋白脂肪酶之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
阿朴脂蛋白AV
本公开的分拣蛋白已经显示出与阿朴脂蛋白AV(APOA5)相互作用(例如,结合)。如本文所公开,本公开的分拣蛋白结合于APOA5并且修饰其降解。
阿朴脂蛋白AV不同地被称作阿朴脂蛋白A-V、APOA5、APOAV和RAP3。阿朴脂蛋白AV是血浆三酸甘油酯水平的重要调节剂,所述水平是动脉粥样硬化性血管疾病(如冠状动脉疾病)的主要风险因子。其为包括VLDL、HDL和乳糜微滴的数种脂蛋白部分的组分。阿朴脂蛋白AV可通过与LDL-R基因家族受体相互作用而影响脂蛋白代谢。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与阿朴脂蛋白AV之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与阿朴脂蛋白AV表达和/或活性的异常水平有关的病况和/或疾病、血管性痴呆和/或动脉粥样硬化性血管疾病。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与阿朴脂蛋白AV之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与阿朴脂蛋白AV之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
阿朴脂蛋白E
本公开的分拣蛋白已经显示出与阿朴脂蛋白E(APOE2、APOE3、APOE4)相互作用(例如,结合)。如本文所公开,本公开的分拣蛋白结合于APOE以及APOE携带的试剂(如Aβ肽)并且修饰其降解和运输。
阿朴脂蛋白E(APOE)是富三酸甘油酯脂蛋白组分的正常代谢所必需的在乳糜微滴和中间密度脂蛋白(IDL)中发现的一类阿朴脂蛋白。在周围组织中,APOE主要由肝和巨噬细胞产生,并且以亚型依赖性方式介导胆固醇代谢。在中枢神经系统中,APOE主要由星形细胞产生,并且经由ApoE受体运输胆固醇至神经元,所述受体是低密度脂蛋白受体基因家族的成员。APOE变体与阿尔兹海默氏病和心血管病症的增加的风险有关,以及与血管屏障的损坏有关。APOE还显示出经由分拣蛋白受体运输A β肽至神经元中。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与阿朴脂蛋白E之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与阿朴脂蛋白E表达和/或活性的异常水平有关的病况和/或疾病、血管性痴呆和/或动脉粥样硬化性血管疾病。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与阿朴脂蛋白E之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与阿朴脂蛋白E之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
受体相关蛋白
本公开的分拣蛋白已经显示出与受体相关蛋白(RAP)相互作用(例如,结合)。
受体相关蛋白不同地被称作RAP、低密度脂蛋白受体相关蛋白相关蛋白1、LRPAP1、A2MRAP、A2RAP、HBP44和MRAP。受体相关蛋白是牵涉于转运LDL受体家族的某些成员的伴侣蛋白,包括而不限于LRP1和LRP2。受体相关蛋白是结合于α-2-巨球蛋白受体,以及结合于低密度脂蛋白受体家族的其它成员的糖蛋白。其用于抑制所有已知的配体对所述受体的结合,并且可防止内质网中的受体聚集和降解,由此充当分子伴侣。受体相关蛋白也可处于钙调蛋白的调节控制下。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与RAP之间的相互作用。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与RAP表达和/或活性的降低的水平有关的病况和/或疾病、血管性痴呆和/或动脉粥样硬化性血管疾病。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与RAP之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与RAP之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
PCSK9
本公开的分拣蛋白已经显示出与9型前蛋白转化酶枯草杆菌蛋白酶/kexin(PCSK9)相互作用(例如,结合),并且将其分泌至循环中。
PCSK9是分泌性蛋白酶的蛋白酶K子家族的成员。PCSK9在胆固醇动态平衡中发挥主要调节作用。其结合于低密度脂蛋白受体(LDLR),从而诱导LDLR降解和LDLR去除胆固醇的能力的降低,这可导致高胆固醇血症。
因此,本公开的抗分拣蛋白抗体也可抑制(例如,阻断)分拣蛋白与PCSK9之间的相互作用和PCSK9的分泌。所述抗体将有益于预防、降低风险或治疗与PCSK9表达和/或活性的增加的水平有关的病况和/或疾病、血管性痴呆和/或动脉粥样硬化性血管疾病。
在一些实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与PCSK9之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749内;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138、175-181、190-220、199-220、190-211、196-207、196-199、200-207、203-207、207-231、207-227、212-221、233-243、237-247、237-260、297-317、314-338、367-391、429-443、623-632和/或740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在其它实施方案中,本公开的抑制(例如,阻断)分拣蛋白与PCSK9之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体结合人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白中对应于SEQ ID NO:1的一种或多种氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。
抗分拣蛋白抗体
本公开的抗分拣蛋白抗体可抑制分拣蛋白的一种或多种活性,包括但不限于增加颗粒蛋白前体水平(例如,颗粒蛋白前体的细胞外水平和/或颗粒蛋白前体的细胞水平)、降低分拣蛋白的细胞水平(例如,分拣蛋白的细胞表面水平、分拣蛋白的细胞内水平和/或分拣蛋白的总水平)、抑制与颗粒蛋白前体的相互作用(例如,结合)和/或抑制与本公开的前神经营养蛋白(前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF等)、本公开的神经营养蛋白(神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)和受体相关蛋白(RAP)中的一者或多者的相互作用(例如,结合)、降低PCSK9的分泌、降低β淀粉样肽的产生。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体体外或体内(例如,在个体的脑、血液或外周器官中)增加颗粒蛋白前体的细胞外水平和/或颗粒蛋白前体的细胞水平。如本文所用,如通过任何体外基于细胞的分析或在本文中所述或本领域中已知的基于组织(如基于脑组织)的分析中所测量,如果抗分拣蛋白抗体诱导颗粒蛋白前体的细胞外水平的20%或更高增加,那么所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平。如本文所用,如通过任何体外基于细胞的分析或在本文中所述或本领域中已知的基于组织(如基于脑组织)的分析中所测量,如果抗分拣蛋白抗体诱导颗粒蛋白前体的细胞水平的20%或更高增加,那么所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体体外或体内(例如,在个体的脑和/或外周器官中)降低分拣蛋白的细胞水平。在一些实施方案中,分拣蛋白的细胞水平的降低包含分拣蛋白的细胞表面水平的降低。如本文所用,如通过任何体外基于细胞的分析或本文中所述或本领域中已知的合适的体内模型所测量,如果抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白的细胞表面水平的20%或更高降低,那么所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞表面水平。在一些实施方案中,分拣蛋白的细胞水平的降低包含分拣蛋白的细胞内水平的降低。如本文所用,如通过任何体外基于细胞的分析或本文中所述或本领域中已知的合适的体内模型所测量,如果抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白的细胞内水平的20%或更高降低,那么所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞内水平。在一些实施方案中,分拣蛋白的细胞水平的降低包含分拣蛋白的总水平的降低。如本文所用,如通过任何体外基于细胞的分析或本文中所述或本领域中已知的合适的体内模型所测量,如果抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白的总水平的20%或更高降低,那么所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的总水平。
在某些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体水平和/或降低分拣蛋白的细胞水平而不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)。因此,在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)。如本文所用,通过任何体外分析或本文中所述或本领域中已知的基于细胞的培养物分析,如果抗分拣蛋白抗体在饱和抗体浓度(例如,67nM)下降低颗粒蛋白前体与分拣蛋白的结合达20%或更少,那么所述抗分拣蛋白抗体不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)。
在某些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体可通过诱导分拣蛋白降解而降低分拣蛋白的细胞水平(例如,分拣蛋白的细胞表面水平、分拣蛋白的细胞内水平和/或分拣蛋白的总水平)。因此,在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白降解。
如本文所用,颗粒蛋白前体的水平可指编码颗粒蛋白前体的基因的表达水平;编码颗粒蛋白前体的一种或多种转录物的表达水平;颗粒蛋白前体蛋白的表达水平;和/或从细胞分泌和/或存在于细胞内的颗粒蛋白前体蛋白的量。如本文所用,分拣蛋白的水平可指编码分拣蛋白的基因的表达水平;编码分拣蛋白的一种或多种转录物的表达水平;分拣蛋白的表达水平;和/或存在于细胞内和/或细胞表面上的分拣蛋白的量。本领域中已知的任何用于测量基因表达、转录、翻译的水平和/或蛋白丰度或定位的方法均可用于确定颗粒蛋白前体和分拣蛋白的水平。
另外,本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防、降低风险或治疗细胞死亡(例如,神经元细胞死亡)、额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和/或正常老化的一种或多种不需要的症状。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体为单克隆抗体。
本公开的某些方面提供结合不连续的分拣蛋白表位的抗分拣蛋白抗体。在一些实施方案中,所述不连续的分拣蛋白表位包含两种或更多种肽、三种或更多种肽、四种或更多种肽、五种或更多种肽、六种或更多种肽、七种或更多种肽、八种或更多种肽、九种或更多种肽或10种或更多种肽。在一些实施方案中,所述肽中的每一者包含氨基酸序列SEQ ID NO:1的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个、10个或更多个、11个或更多个、12个或更多个、13个或更多个、14个或更多个、15个或更多个、16个或更多个、17个或更多个、18个或更多个、19个或更多个、20个或更多个、21个或更多个、22个或更多个、23个或更多个、24个或更多个、25个或更多个、26个或更多个、27个或更多个、28个或更多个、29个或更多个或30个或更多个氨基酸残基;或对应于氨基酸序列SEQ ID NO:1的哺乳动物分拣蛋白上的五个或更多个、六个或更多个、七个或更多个、八个或更多个、九个或更多个、10个或更多个、11个或更多个、12个或更多个、13个或更多个、14个或更多个、15个或更多个、16个或更多个、17个或更多个、18个或更多个、19个或更多个、20个或更多个、21个或更多个、22个或更多个、23个或更多个、24个或更多个、25个或更多个、26个或更多个、27个或更多个、28个或更多个、29个或更多个或30个或更多个氨基酸残基。本公开的其它方面提供结合于分拣蛋白的构象表位的抗分拣蛋白抗体。
本公开的某些方面提供结合于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基131-138内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基131-138的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基175-181内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基175-181的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基207-231内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基207-227内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基207-227和237-260内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQID NO:1)的氨基酸残基212-221内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基212-221的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基233-243内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基233-243的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基237-247内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基237-247和314-338内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247和314-338的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基237-260内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基237-260和297-317内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基297-317内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基297-317的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基314-338内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基314-338的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基367-391内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ IDNO:1的氨基酸残基367-391的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基429-443内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基623-632内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基623-632的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸;和/或人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基740-749内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基740-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸的抗分拣蛋白抗体。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基190-220内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基190-220的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白的氨基酸残基199-220、190-211、196-207、196-199、200-207和/或203-207内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基199-220、190-211、196-207、196-199、200-207和/或203-207的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。本公开的其它方面提供结合于具有氨基酸残基(S/T)-X-(D/N)-X-X-X-X-(W/F/Y)的表位的抗分拣蛋白抗体,其中X表示任何氨基酸(SEQ ID NO:4)。
在某些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,和/或降低分拣蛋白的细胞表面水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平并且增加颗粒蛋白前体的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且增加颗粒蛋白前体的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体体内增加颗粒蛋白前体的水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体体内增加颗粒蛋白前体的水平而不降低分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加脑中颗粒蛋白前体的水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加血液中颗粒蛋白前体的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加一个或多个外周器官中颗粒蛋白前体的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体体内降低分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低脑中分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低一个或多个外周器官中分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用并且不降低分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平并且不降低分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,并且不增加颗粒蛋白前体的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,并且不增加颗粒蛋白前体的细胞外水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用,并且不降低分拣蛋白的细胞水平。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,不增加颗粒蛋白前体的细胞水平,并且不抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞水平,增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,并且抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。颗粒蛋白前体的细胞外水平、颗粒蛋白前体的细胞水平、分拣蛋白的细胞表面水平或两者可通过本领域中已知和/或本文中所公开的任何基于细胞的分析测量。在某些实施方案中,颗粒蛋白前体的细胞外水平、分拣蛋白的细胞表面水平或两者可通过利用体外细胞分析测量。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体还抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体还抑制PCSK9的运输和分泌。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体还抑制β淀粉样肽的产生。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体还抑制分拣蛋白与神经生长因子前体(前NGF)之间的相互作用(例如,结合)。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体还抑制分拣蛋白与选自以下的一种或多种蛋白之间的相互作用(例如,结合):前神经营养蛋白、神经营养蛋白、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经紧张素、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)。
本公开的其它方面提供抗分拣蛋白抗体,其结合于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基130-141或592-757内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基130-141或592-757的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白的氨基酸残基610-666、592-593和/或667-749内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基610-666、592-593和/或667-749的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白的氨基酸残基130-141内;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基130-141的氨基酸残基内的一种或多种氨基酸。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与选自以下的一种或多种蛋白之间的相互作用(例如,结合):颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)和/或天然存在的变体。优选地,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与p75之间的相互作用(例如,结合)。
本公开的其它方面提供抗分拣蛋白抗体,其结合于具有人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700中的一种或多种氨基酸;或哺乳动物分拣蛋白上对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基His131、Val132、Pro133、Leu134、Val135、Ile136、Met137、Thr138、Arg196、Phe198、Arg199、Phe203、Lys205、Phe207、Thr210、Thr218、Tyr222、Ser223、Ser227、Ser242、Lys243、Lys248、Lys254、Lys260、Ser305、Phe306、Gly307、Arg311、Phe314、Ser316、Arg325、Arg326、Ile327、Phe350、Tyr351、Ser352、Ile353、Asn373、Ser379、Arg382、Tyr386、Ser595和/或Glu700的氨基酸残基中的一种或多种氨基酸的表位。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与选自以下的一种或多种蛋白之间的相互作用(例如,结合):颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)。优选地,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用(例如,结合)。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体降低颗粒蛋白前体或其片段的内体内化。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的有效浓度。
在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白(如前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF和BDNF)之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与神经紧张素之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与p75之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与Sort-pro之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与APP之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制Aβ肽的产生。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制PCSK9的运输和分泌。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与LpL之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与APOA5之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与APOE之间的相互作用(例如,结合)。在其它实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体抑制本公开的分拣蛋白与RAP之间的相互作用(例如,结合)。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于本公开的分拣蛋白和/或天然存在的变体。在某些优选实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体结合于人分拣蛋白。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于在细胞表面上表达的本公开的分拣蛋白并且所述裸抗体抑制所述分拣蛋白与颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用(例如,结合)。
在一些实施方案中,结合于本公开的分拣蛋白的本公开的抗分拣蛋白抗体通过降低可用于与细胞表面上或细胞内部的如下蛋白相互作用的分拣蛋白的有效水平而抑制所述分拣蛋白与颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用(例如,结合)。
在一些实施方案中,结合于本公开的分拣蛋白的本公开的抗分拣蛋白抗体通过诱导分拣蛋白的降解而抑制所述分拣蛋白与颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、神经生长因子前体(前NGF)、神经生长因子(NGF)、前脑源性神经营养因子(前BDNF)、脑源性神经营养因子(BDNF)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用(例如,结合)。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体竞争性地抑制选自表1-3和11-15中列出的抗体中的任一者的至少一种抗体的结合。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体竞争性地抑制选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的至少一种抗体的结合。在一些实施方案中,当本公开的抗分拣蛋白抗体降低选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体与分拣蛋白的结合达介于约50%至100%范围内的量时(如与所述抗分拣蛋白抗体不存在下与分拣蛋白的结合相比),所述抗分拣蛋白抗体与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,当本公开的抗分拣蛋白抗体降低选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体与分拣蛋白的结合达至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%时(如与所述抗分拣蛋白抗体不存在下与分拣蛋白的结合相比),所述抗分拣蛋白抗体与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体降低选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体与分拣蛋白的结合达100%指示了,所述抗分拣蛋白抗体基本上完全地阻断选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体与分拣蛋白的结合。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体以对应于10:1比率、9:1比率、8:1比率、7:1比率、6:1比率、5:1比率、4:1比率、3:1比率、2:1比率、1:1比率、0.75:1比率、0.5:1比率、0.25:1比率、0.1:1比率、0.075:1比率、0.050:1比率、0.025:1比率、0.01:1比率、0.0075:比率、0.0050:1比率、0.0025:1比率、0.001:比率、0.00075:1比率、0.00050:1比率、0.00025:1比率、0.0001:比率、1:10比率、1:9比率、1:8比率、1:7比率、1:6比率、1:5比率、1:4比率、1:3比率、1:2比率、1:0.75比率、1:0.5比率、1:0.25比率、1:0.1比率、1:0.075比率、1:0.050比率、1:0.025比率、1:0.01比率、1:0.0075比率、1:0.0050比率、1:0.0025比率、1:0.001比率、1:0.00075比率、1:0.00050比率、1:0.00025比率或1:0.0001比率的抗分拣蛋白抗体:选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体的量存在。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体的量相比过量达介于约1.5倍至100倍或高于100倍范围内的量存在。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体以与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体的量相比约2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、45倍、50倍、55倍、60倍、65倍、70倍、75倍、80倍、85倍、90倍、95倍或100倍过量的量存在。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于与选自表1-3和11-15中列出的抗体中的任一者的至少一种抗体所结合的分拣蛋白表位相同或重叠的人分拣蛋白的表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的至少一种抗体所结合的分拣蛋白表位相同或重叠的人分拣蛋白的表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体基本上结合选自表1-3和11-15中列出的抗体中的任一者的至少一种抗体所结合的相同分拣蛋白表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体基本上结合选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的至少一种抗体所结合的相同分拣蛋白表位。用于定位抗体结合的表位的详细示例性方法提供于Morris(1996)“Epitope Mapping Protocols,”Methods inMolecular Biology第66卷(Humana Press,Totowa,NJ)中。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-6、S-8、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-72、S-83和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-5、S-45、S-64、S-65和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-5、S-30、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-28、S-29、S-53、S-56、S-82和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-1、S-3、S-4、S-6、S-7、S-9、S-10、S-11、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-23、S-26、S-27、S-31、S-32、S-38、S-46、S-48、S-51、S-52、S-54、S-55、S57、S-58、S-59、S-61、S-62、S-68、S-69、S-70、S-71、S-73、S-74、S-75、S-77、S-79、S-80、S-85和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-5、S-12、S-24、S-25、S-30、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-47、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-72、S-76、S-78、S-81、S-83、S-84和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-8、S-49、S-50和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。
本领域中已知的任何合适的竞争分析或分拣蛋白结合分析(如BIAcore分析、ELISA分析或流式细胞术)均可用于确定抗分拣蛋白抗体是否与选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85和其任何组合的一种或多种抗体竞争结合于分拣蛋白。在一示例性竞争分析中,固定的分拣蛋白或在细胞表面上表达分拣蛋白的细胞在包含结合于分拣蛋白(例如,人或非人灵长类动物)的第一标记的抗体和第二未标记的抗体的溶液中孵育,所述第二未标记的抗体正在测试其与所述第一抗体竞争结合于分拣蛋白的能力。所述第二抗体可存在于杂交瘤上清液中。作为对照组,固定的分拣蛋白或表达分拣蛋白的细胞在包含所述第一标记的抗体但不包含所述第二未标记的抗体的溶液中孵育。在允许所述第一抗体结合于分拣蛋白的条件下孵育之后,去除过量的未结合抗体,并且测量与固定的分拣蛋白或表达分拣蛋白的细胞缔合的标记的量。如果与固定的分拣蛋白或表达分拣蛋白的细胞缔合的标记的量在测试样品中相对于对照样品大体上降低,那么这指示所述第二抗体正在与所述第一抗体竞争结合于分拣蛋白。参见Harlow和Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual第14章(ColdSpring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,NY)。在一些实施方案中,所用的竞争分析为实施例1、3或4中所述的竞争分析中的一者或多者。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含(a)包含选自表1-3和11-15中列出或选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体中的任一者的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3的至少一种、两种或三种HVR的轻链可变区;和/或(b)包含选自表1-3和11-15中列出或选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体中的任一者的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3的至少一种、两种或三种HVR的重链可变区。在一些实施方案中,HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3包含如表1-3和11-15中所示或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的EU或Kabat CDR、Chothia CDR或接触CDR序列。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR,其选自(i)包含表1-3和11-15中列出或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的HVR-L1序列中的任一者的氨基酸序列的HVR-L1;(ii)包含表1-3和11-15中列出或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的HVR-L2序列中的任一者的氨基酸序列的HVR-L2;(iii)包含表1-3和11-15中列出或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的HVR-L3序列中的任一者的氨基酸序列的HVR-L3;(iv)包含表1-3和11-15中列出或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的HVR-H1序列中的任一者的氨基酸序列的HVR-H1;(v)包含表1-3和11-15中列出或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的HVR-H2序列中的任一者的氨基酸序列的HVR-H2;和(vi)包含表1-3和11-15中列出或来自选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体的HVR-H3序列中的任一者的氨基酸序列的HVR-H3。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:6-16、20-22、24-25、512、584和585组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6-16、20-22、24-25、512、584和585组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26-40和586组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26-40和586组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQID NO:41-50、52、54-56、58-62、64-66、68-70、72、74、79-80、82-85、88-91、95、97-101、103-107、109、111-116、118和121-125组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和/或其中所述重链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ IDNO:126-127、129-130、133-140、142、144-145、147-149、482-492、513-524、567-570、587和591-596组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126-127、129-130、133-140、142、144-145、147-149、482-492、513-524、567-570、587和591-596组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175、177-178、493-507、525-539、571-579、588和597-603组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:150-153、155-158、160-166、169-175、177-178、493-507、525-539、571-579、588和597-603组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249、252-256和540-564组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:179-186、188、190-191、193-197、199-201、203-204、206、208、213-214、216-219、222-225、229、231-234、236-239、241、243-247、249、252-256和540-564组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含表1-3和11-15中列出或选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体中的任一者的轻链可变区;和/或表1-3和11-15中列出或选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体中的任一者的重链可变区。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含轻链可变区和/或重链可变域,其包含选自SEQ ID NO:317-334、337-338、341-345、348-357、360-365、368-372、375-376、379-380、389-392、395-402、407-414、421-422、425-433、436-444、447-448、451-461、464-465、470-479、604-692中的任一者的氨基酸序列。
任何本公开的抗体均可由细胞系产生。在一些实施方案中,所述细胞系可为酵母细胞系。在其它实施方案中,所述细胞系可为哺乳动物细胞系。在某些实施方案中,所述细胞系可为杂交瘤细胞系。本领域中已知适用于抗体产生的任何细胞系均可用于产生本公开的抗体。用于抗体产生的示例性细胞系描述于本公开中。
在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体是选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗分拣蛋白单克隆抗体。在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体为拮抗剂抗体。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体竞争性地抑制选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的至少一种抗体的结合。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于与选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的至少一种抗体所结合的分拣蛋白表位相同或重叠的人分拣蛋白的表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体基本上结合选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的至少一种抗体所结合的相同分拣蛋白表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含(a)包含选自从S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83选出的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3的至少一种、两种或三种HVR的轻链可变区;和/或(b)包含选自从S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83选出的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3的至少一种、两种或三种HVR的重链可变区。在一些实施方案中,HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3包含来自选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的EU或Kabat CDR、Chothia CDR或接触CDR序列。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体中的任一者的轻链可变区;和/或选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-83的抗体中的任一者的重链可变区。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体是选自S-5、S-6、S-8、S-45、S-49、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-63、S-64、S-65、S-72和S-835的抗分拣蛋白单克隆抗体。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:6、9-12、14和15组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:6、9-12、14和15组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26、27、29、30和32组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26、27、29、30和32组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:45、46、48、85、89、100、103-105、112和123组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:45、46、48、85、89、100、103-105、112和123组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和/或其中所述重链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQID NO:126、127、136、140、142、145和148组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126、127、136、140、142、145和148组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:151、152、163、166、169、170、173和175组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:151、152、163、166、169、170、173和175组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:182、183、185、219、223、233、236、237、244和254组成的组的氨基酸序列或与选自由SEQ IDNO:182、183、185、219、223、233、236、237、244和254组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体竞争性地抑制选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的至少一种抗体的结合。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于与选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的至少一种抗体所结合的分拣蛋白表位相同或重叠的人分拣蛋白的表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体基本上结合选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的至少一种抗体所结合的相同分拣蛋白表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含(a)包含选自从S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8选出的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3的至少一种、两种或三种HVR的轻链可变区;和/或(b)包含选自从S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8选出的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3的至少一种、两种或三种HVR的重链可变区。在一些实施方案中,HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3包含来自选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的EU或Kabat CDR、Chothia CDR或接触CDR序列。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体中的任一者的轻链可变区;和/或选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗体中的任一者的重链可变区。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体是选自S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-29、S-51、S57、S-61、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7和S-82-8的抗分拣蛋白单克隆抗体。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-L1,其包含选自由SEQ ID NO:7-10、13和14组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:7-10、13和14组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含选自由SEQ ID NO:26-31和33-35组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:26-31和33-35组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:42、54、55、58、59、60、61、62、69、91、97、101和122组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:42、54、55、58、59、60、61、62、69、91、97、101和122组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和/或其中所述重链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQID NO:126、129、130、135、140、142和147组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126、129、130、135、140、142和147组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:150、155-158、162、166、169和173组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:150、155-158、162、166、169和173组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:180、190、193-197、203、225、231、234和253组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:180、190、193-197、203、225、231、234和253组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体竞争性地抑制选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的至少一种抗体的结合。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体结合于与选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的至少一种抗体所结合的分拣蛋白表位相同或重叠的人分拣蛋白的表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体基本上结合选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的至少一种抗体所结合的相同分拣蛋白表位。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含(a)包含选自从S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9选出的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3的至少一种、两种或三种HVR的轻链可变区;和/或(b)包含选自从S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9选出的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3的至少一种、两种或三种HVR的重链可变区。在一些实施方案中,HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3、HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3包含来自选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的EU或Kabat CDR、Chothia CDR或接触CDR序列。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含选自以下的至少一个、两个、三个、四个、五个或六个HVR:(i)HVR-L1,其包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的HVR-L1序列中任一者的氨基酸序列;(ii)HVR-L2,其包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的HVR-L2序列中任一者的氨基酸序列;(iii)HVR-L3,其包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的HVR-L3序列中任一者的氨基酸序列;(iv)HVR-H1,其包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的HVR-H1序列中任一者的氨基酸序列;(v)HVR-H2,其包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的HVR-H2序列中任一者的氨基酸序列;和(vi)HVR-H3,其包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体的HVR-H3序列中任一者的氨基酸序列。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体中的任一者的轻链可变区;和/或选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗体中的任一者的重链可变区。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体是选自S-5、S-30、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8和S-60-9的抗分拣蛋白单克隆抗体。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-L1,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:10,或与氨基酸序列SEQ ID NO:10具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-L2,其包含氨基酸序列SEQ ID NO:30,或与氨基酸序列SEQ ID NO:30具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-L3,其包含选自由SEQ ID NO:45、70和100组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:45、70和100组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和/或其中所述重链可变域包含以下一者或多者:(a)HVR-H1,其包含选自由SEQ ID NO:126、136和142组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:126、136和142组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;(b)HVR-H2,其包含选自由SEQ ID NO:151、163和170组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:151、163和170组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列;和(c)HVR-H3,其包含选自由SEQ ID NO:182、204和233组成的组的氨基酸序列,或与选自由SEQ ID NO:182、204和233组成的组的氨基酸序列具有至少约95%同源性的氨基酸序列。
抗分拣蛋白抗体针对人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白或两者的解离常数(KD)可为小于100nM、小于90nM、小于80nM、小于70nM、小于60nM、小于50nM、小于40nM、小于30nM、小于20nM、小于10nM、小于9nM、小于8nM、小于7nM、小于6nM、小于5nM、小于4nM、小于3nM、小于2nM、小于1nM、小于0.5nM、小于0.1nM、小于0.09nM、小于0.08nM、小于0.07nM、小于0.06nM、小于0.05nM、小于0.04nM、小于0.03nM、小于0.02nM、小于0.01nM、小于0.009nM、小于0.008nM、小于0.007nM、小于0.006nM、小于0.005nM、小于0.004nM、小于0.003nM、小于0.002nM、小于0.001nM或小于0.001nM。在一些实施方案中,所述抗体具有介于约100nM至约0.005nM或小于0.005nM的范围内的针对人分拣蛋白、小鼠分拣蛋白或两者的解离常数(KD)。优选地,所述解离常数小于50nM。在一些实施方案中,解离常数(KD)是在4℃或室温下使用例如如本文所述的细胞结合分析、ForteBio分析或MSD-SET分析(参见例如实施例1和23)来测量。
抗分拣蛋白抗体针对人分拣蛋白和小鼠分拣蛋白的解离常数(KD)可为小于71nM、小于70.9nM、小于70.8nM、小于70.7nM、小于70.6nM、小于70.5nM、小于70.4nM、小于70.3nM、小于70.2nM、小于70.1nM、小于70nM、小于60nM、小于50nM、小于40nM、小于30.5nM、小于30nM、小于29.9nM、小于29.8nM、小于29.7nM、小于29.6nM、小于29.5nM、小于29.4nM、小于29.3nM、小于29.2nM、小于29.1nM、小于29nM、小于28.5nM、小于28nM、小于27.5nM、小于27nM、小于26.5nM、小于26nM、小于25.5nM、小于25nM、小于24.5nM、小于24nM、小于23.5nM、小于23nM、小于22.5nM、小于22nM、小于21.5nM、小于21nM、小于20.5nM、小于20nM、小于19.5nM、小于19nM、小于18.9nM、小于18.8nM、小于18.7nM、小于18.6nM、小于18.5nM、小于18.4nM、小于18.3nM、小于18.2nM、小于18.1nM、小于18nM、小于17.5nM、小于17nM、小于16.5nM、小于16nM、小于15.5nM、小于15nM、小于14.5nM、小于14nM、小于13.5nM、小于13nM、小于12.5nM、小于12nM、小于11.5nM、小于11nM、小于10.5nM、小于10nM、小于9.5nM、小于9nM、小于8.5nM、小于8nM、小于7.5nM、小于7nM、小于6.9nM、小于6.8nM、小于6.7nM、小于6.6nM、小于6.5nM、小于6.4nM、小于6.3nM、小于6.2nM、小于6.1nM、小于6nM、小于5.5nM、小于5nM、小于4.5nM、小于4nM、小于3.5nM、小于3nM、小于2.5nM、小于2nM、小于1.5nM、小于1nM、小于0.95nM、小于0.9nM、小于0.89nM、小于0.88nM、小于0.87nM、小于0.86nM、小于0.85nM、小于0.84nM、小于0.83nM、小于0.82nM、小于0.81nM、小于0.8nM、小于0.75nM、小于0.7nM、小于0.65nM、小于0.64nM、小于0.63nM、小于0.62nM、小于0.61nM、小于0.6nM、小于0.55nM、小于0.5nM、小于0.45nM、小于0.4nM、小于0.35nM、小于0.3nM、小于0.29nM、小于0.28nM、小于0.27nM、小于0.26nM、小于0.25nM、小于0.24nM、小于0.23nM、小于0.22nM、小于0.21nM、小于0.2nM、小于0.15nM、小于0.1nM、小于0.09nM、小于0.08nM、小于0.07nM、小于0.06nM、小于0.05nM、小于0.04nM、小于0.03nM、小于0.02nM、小于0.01nM、小于0.009nM、小于0.008nM、小于0.007nM、小于0.006nM、小于0.005nM、小于0.004nM、小于0.003nM、小于0.002nM或小于0.001nM。在一些实施方案中,抗分拣蛋白抗体针对人分拣蛋白的解离常数介于小于约70.4nM至小于约0.29nM或小于约18.7nM至小于约0.89nM范围内。在一些实施方案中,抗分拣蛋白抗体针对人分拣蛋白的解离常数介于约70.4nM至约0.005nM或小于0.005nM范围内。在一些实施方案中,抗分拣蛋白抗体针对小鼠分拣蛋白的解离常数介于小于约40.3nM至小于约0.61nM或小于约29.6nM至小于约0.61nM范围内。在一些实施方案中,抗分拣蛋白抗体针对小鼠分拣蛋白的解离常数介于约40.3nM至约0.07nM或小于0.07nM范围内。在一些实施方案中,抗分拣蛋白抗体针对人和小鼠分拣蛋白的解离常数介于小于约70.4nM至小于约0.29nM或小于约29.6nM至小于约0.61nM范围内。解离常数可通过任何分析技术,包括任何生物化学或生物物理技术,如ELISA、表面等离子体共振(SPR)、生物层干涉术(参见例如ForteBio的Octet System)、meso scale discover(参见例如MSD-SET)、等温滴定量热法(ITC)、差示扫描量热法(DSC)、圆形二色性(CD)、停流分析和比色或荧光蛋白熔化分析;或细胞结合分析来确定。因此,在一些实施方案中,解离常数(KD)是在4℃或室温下使用例如如本文所述的细胞结合分析、ForteBio分析或MSD-SET分析(参见例如实施例1和23)来测量。
额外抗分拣蛋白抗体(例如,特异性地结合于本公开的分拣蛋白的抗体)可通过本领域中已知的多种分析进行鉴别、筛选和/或表征其物理/化学特性和/或生物活性。
促发炎介体的降低的表达
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体可在结合于在细胞中表达的分拣蛋白之后降低促发炎介体的表达。
如本文所用,促发炎介体是直接地或间接地(例如,经由促发炎信号传导途径)牵涉于诱导、活化、促进或以其它方式降低发炎反应的机制中的蛋白。可使用本领域中已知用于鉴别和表征促发炎介体的任何方法。
促发炎介体的实例包括而不限于细胞因子,如I和II型干扰素、IL-6、IL12p70、IL12p40、IL-1β、TNF-α、IL-8、CRP、IL-20家族成员、IL-33、LIF、OSM、CNTF、GM-CSF、IL-11、IL-12、IL-17、IL-18和CRP。促发炎介体的其它实例包括而不限于趋化因子,如CXCL1、CCL2、CCL3、CCL4和CCL5。
在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体可降低促发炎介体IL-6、IL12p70、IL12p40、IL-1β、TNF-α、CXCL1、CCL2、CCL3、CCL4和CCL5的功能性表达和/或分泌。在某些实施方案中,促发炎介体的降低的表达出现于巨噬细胞、树突状细胞、单核细胞、破骨细胞、皮肤的朗格汉斯细胞、库普弗细胞、T细胞和/或小胶质细胞中。降低的表达可包括而不限于基因表达的降低、转录表达的降低或蛋白表达的降低。可使用本领域中已知用于确定基因、转录物(例如,mRNA)和/或蛋白表达的任何方法。例如,Northern印迹分析可用于确定促发炎介体基因表达水平,RT-PCR可用于确定促发炎介体转录的水平,并且Western印迹分析可用于确定促发炎介体蛋白水平。
如本文所用,如果促发炎介体在用分拣蛋白试剂(如本公开的促效剂抗分拣蛋白抗体)处理的受试者的一种或多种细胞中的表达高于在未用所述促效剂抗分拣蛋白抗体处理的相应受试者的一种或多种细胞中表达的相同促发炎介体的表达,那么所述促发炎介体可具有降低的表达。在一些实施方案中,如与未用所述抗分拣蛋白抗体处理的相应受试者的一种或多种细胞中的促发炎介体表达相比,本公开的抗分拣蛋白抗体可降低受试者的一种或多种细胞中的促发炎介体表达达例如至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少100%、至少110%、至少115%、至少120%、至少125%、至少130%、至少135%、至少140%、至少145%、至少150%、至少160%、至少170%、至少180%、至少190%或至少200%。在其它实施方案中,如与未用所述抗分拣蛋白抗体处理的相应受试者的一种或多种细胞中的促发炎介体表达相比,所述抗分拣蛋白抗体可降低受试者的一种或多种细胞中的促发炎介体表达达例如至少至少1.5倍、至少1.6倍、至少1.7倍、至少1.8倍、至少1.9倍、至少2.0倍、至少2.1倍、至少2.15倍、至少2.2倍、至少2.25倍、至少2.3倍、至少2.35倍、至少2.4倍、至少2.45倍、至少2.5倍、至少2.55倍、至少3.0倍、至少3.5倍、至少4.0倍、至少4.5倍、至少5.0倍、至少5.5倍、至少6.0倍、至少6.5倍、至少7.0倍、至少7.5倍、至少8.0倍、至少8.5倍、至少9.0倍、至少9.5倍或至少10倍。
抗分拣蛋白抗体Fc同型
在一些实施方案中,本公开的抗体包括拮抗剂抗体。在一些实施方案中,结合分拣蛋白的抗体可包括通过防止分拣蛋白与一种或多种其配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、神经营养蛋白、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽、APP、Aβ肽、LpL、APOA5、APOE和RAP)之间的相互作用而结合分拣蛋白并且抑制一种或多种分拣蛋白活性的拮抗剂抗体。在一些实施方案中,本公开的拮抗剂抗体可具有不能结合Fcg受体的Fc域。
示例性阻断和/或拮抗剂抗体Fc同型和修饰提供于下表A中。在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体具有下表A中列出的Fc同型。
表A:示例性抗分拣蛋白抗体Fc同型
Figure BDA0001494797660001621
Figure BDA0001494797660001631
在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有IgG1同型。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体含有小鼠IgG1恒定区。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体含有人IgG1恒定区。在一些实施方案中,所述人IgG1恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,所述Fc区含有一种或多种修饰。例如,在一些实施方案中,所述Fc区含有一种或多种氨基酸取代(例如,相对于相同同型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,所述一种或多种氨基酸取代是选自N297A、N297Q(Bolt S等人(1993)Eur J Immunol 23:403-411)、D265A、L234A、L235A(McEarchern等人,(2007)Blood,109:1185-1192)、C226S、C229S(McEarchern等人,(2007)Blood,109:1185-1192)、P238S(Davis等人,(2007)J Rheumatol,34:2204-2210)、E233P、L234V(McEarchern等人,(2007)Blood,109:1185-1192)、P238A、A327Q、A327G、P329A(Shields RL.等人,(2001)J Biol Chem.276(9):6591-604)、K322A、L234F、L235E(Hezareh等人,(2001)JVirol 75,12161–12168;Oganesyan等人,(2008).ActaCrystallographica64,700–704)、P331S(Oganesyan等人,(2008)Acta Crystallographica 64,700–704)、T394D(Wilkinson等人(2013)MAbs 5(3):406–417)、A330L、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号惯例。在某些实施方案中,所述Fc区进一步包括在对应于根据EU或Kabat编号惯例的甘氨酸236的位置处的氨基酸缺失。
在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有IgG1同型,所述同型具有含有根据EU或Kabat编号惯例的C220S氨基酸取代的重链恒定区。
在一些实施方案中,所述Fc区进一步含有一种或多种选自根据EU或Kabat编号惯例的t A330L、L234F、L235E和/或P331S的额外氨基酸取代。
在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有IgG2同型。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体含有人IgG2恒定区。在一些实施方案中,所述人IgG2恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,所述Fc区含有一种或多种修饰。例如,在一些实施方案中,所述Fc区含有一种或多种氨基酸取代(例如,相对于相同同型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,所述一种或多种氨基酸取代是选自P238S、V234A、G237A、H268A、H268Q、H268E、V309L、N297A、N297Q、V309L、A330S、P331S、C232S、C233S、M252Y、S254T和/或T256E,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号惯例(Vafa O.等人,(2014)Methods 65:114–126)。
在某些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体具有IgG4同型。在一些实施方案中,所述抗分拣蛋白抗体含有人IgG4恒定区。在一些实施方案中,所述人IgG4恒定区包括Fc区。在一些实施方案中,所述Fc区含有一种或多种修饰。例如,在一些实施方案中,所述Fc区含有一种或多种氨基酸取代(例如,相对于相同同型的野生型Fc区)。在一些实施方案中,所述一种或多种氨基酸取代是选自E233P、F234V、L235A、G237A、E318A(Hutchins等人(1995)ProcNatl Acad Sci USA,92:11980-11984)、S228P、L234A/F234A、L236E、S241P、L248E(Reddy等人,(2000)J Immunol,164:1925-1933;Angal等人,(1993)Mol Immunol.30(1):105-8;US8614299B2;Vafa O.等人,(2014)Methods 65:114–126)、T394D、M252Y、S254T、T256E、N297A和/或N297Q,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号惯例。
在一些实施方案中,所述Fc区进一步含有一种或多种选自a M252Y、S254T和/或T256E的额外氨基酸取代,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号惯例。
其它IgG突变
在一些实施方案中,本文所述的IgG1变体中的一者或多者可与A330L突变(Lazar等人,(2006)Proc Natl Acad Sci USA,103:4005-4010)或L234F、L235E和/或P331S突变(Sazinsky等人,(2008)Proc Natl Acad Sci USA,105:20167-20172)中的一者或多者组合,其中氨基酸位置是根据EU或Kabat编号惯例,以消除补体活化。在一些实施方案中,本文所述的IgG变体可与一种或多种突变组合以增强人血清中的抗分拣蛋白抗体半衰期(例如,根据EU或Kabat编号惯例的M252Y、S254T、T256E突变)(Dall’Acqua等人,(2006)J BiolChem,281:23514-23524;和Strohl等人,(2009)Current Opinion in Biotechnology,20:685–691)。
在一些实施方案中,本公开的IgG4变体可与根据EU或Kabat编号惯例的S228P突变(Angal等人,(1993)Mol Immunol,30:105-108)和/或与Peters等人,(2012)J BiolChem.13;287(29):24525-33)中所述的一种或多种突变组合以增强抗体稳定化。
双特异性抗体
本公开的某些方面涉及结合于本公开的分拣蛋白上的一种或多种域和第二抗原的双特异性抗体。产生双特异性抗体的方法为本领域中众所周知的并且描述于本文中。在一些实施方案中,本公开的双特异性抗体结合于本公开的分拣蛋白的一种或多种氨基酸残基。在一些实施方案中,本公开的双特异性抗体识别第一抗原和第二抗原。在一些实施方案中,所述第一抗原是分拣蛋白或其天然存在的变体。在一些实施方案中,所述第二抗原也是分拣蛋白,或其天然存在的变体。在一些实施方案中,所述第二抗原是促进跨血脑屏障运输的抗原(参见例如Gabathuler R.,Neurobiol.Dis.37(2010)48-57)。所述第二抗原包括而不限于转铁蛋白受体(TR)、胰岛素受体(HIR)、胰岛素样生长因子受体(IGFR)、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和2(LPR-1和2)、白喉毒素受体、CRM197、骆驼单域抗体、TMEM 30(A)、蛋白转导域、TAT、Syn-B、穿膜肽、多精氨酸肽、如ANG1005的Angiopep肽(参见例如Gabathuler,2010)、basigin、Glut1、CD98hc和富集在血脑屏障内皮细胞上的其它细胞表面蛋白(参见例如Daneman等人,PLoS One.2010年10月29日;5(10):e13741)。
抗体组合
本公开的某些方面涉及两种或更多种抗分拣蛋白抗体的用途,如与使用相应的单一抗分拣蛋白抗体相比,当合起来使用时展示相加或协同效应。
抗体片段
本公开的某些方面涉及结合于本公开的分拣蛋白的抗体片段。在一些实施方案中,所述抗体片段是Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。在一些实施方案中,所述抗体片段与第二分拣蛋白抗体和/或与一种或多种特异性地结合致病蛋白的抗体组合使用,所述致病蛋白选自:淀粉样β或其片段、Tau、IAPP、α-突触核蛋白、TDP-43、FUS蛋白、朊病毒蛋白、PrPSc、亨廷顿蛋白、降钙素、超氧化物歧化酶、共济失调蛋白、路易体、心房钠尿因子、胰岛淀粉样多肽、胰岛素、阿朴脂蛋白AI、血清淀粉样A、介素、催乳激素、转甲状腺素蛋白、溶菌酶、β2微球蛋白、凝溶胶蛋白、角膜上皮蛋白、胱抑素、免疫球蛋白轻链AL、S-IBM蛋白、重复相关的非ATG(RAN)翻译产物、二肽重复(DPR)肽、甘氨酸-丙氨酸(GA)重复肽、甘氨酸-脯氨酸(GP)重复肽、甘氨酸-精氨酸(GR)重复肽、脯氨酸-丙氨酸(PA)重复肽、脯氨酸-精氨酸(PR)重复肽和其任何组合。
在一些实施方案中,本公开的抗体片段可为与本公开的抗分拣蛋白抗体中的任一者结合相同表位的功能性片段。在一些实施方案中,所述抗体片段是本公开的抗分拣蛋白抗体或抗体片段的小型形式,其具有相应的全长抗体的相同表位,但具有小得多的分子量。所述小型抗分拣蛋白抗体片段可具有较好的脑穿透能力和较短的半衰期,这对成像和诊断效用有利(参见例如Lütje S等人,Bioconjug Chem.2014年2月19日;25(2):335-41;TavaréR等人,Proc Natl Acad Sci U S A.2014年1月21日;111(3):1108-13;和Wiehr S等人,Prostate.2014年5月;74(7):743-55)。因此,在一些实施方案中,本公开的抗分拣蛋白抗体片段如与其相应的全长抗体相比具有较好的脑穿透和/或如与其相应的全长抗体相比具有较短的半衰期。
抗体框架
任何本文所述的抗体均进一步包括框架。在一些实施方案中,所述框架为人免疫球蛋白框架。例如,在一些实施方案中,抗体(例如,抗分拣蛋白抗体)如以上实施方案中的任一者中包含HVR并且进一步包含受体人框架,例如人免疫球蛋白框架或人共有框架。人免疫球蛋白框架可为人抗体的一部分,或非人抗体可通过用人框架区置换一种或多种内源框架而人源化。可用于人源化的人框架区包括但不限于:使用“最佳拟合”方法选择的框架区(参见例如Sims等人J.Immunol.151:2296(1993));源于轻链或重链可变区的特定亚群的人抗体的共有序列的框架区(参见例如Carter等人Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);和Presta等人J.Immunol.,151:2623(1993));人成熟(体细胞突变)框架区或人生殖系框架区(参见例如Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008));和源于筛选FR文库的框架区(参见例如Baca等人,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997)和Rosok等人,J.Biol.Chem.271:22611-22618(1996))。
在一些实施方案中,抗体包含轻链可变区,其包含本公开的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3和如表2和SEQ ID NO:630、667和641-684所示的轻链框架区中的一者、两者、三者或四者。在一些实施方案中,抗体包含重链可变区,其包含本公开的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3和如表3和SEQ ID NO:604-618、619-629、631-666、668、669、670-678-680和685-692所示的重链框架区中的一者、两者、三者或四者。在一些实施方案中,抗体包含轻链可变区,其包含本公开的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3和如表2和SEQ ID NO:630、667和641-684所示的轻链框架区中的一者、两者、三者或四者,并且进一步包含重链可变区,其包含本公开的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3和如表3和SEQ ID NO:604-618、619-629、631-666、668、669、670-678-680和685-692所示的重链框架区中的一者、两者、三者或四者。
抗体制备
本公开的抗分拣蛋白抗体可涵盖多克隆抗体、单克隆抗体、人源化和嵌合抗体、人抗体、抗体片段(例如,Fab、Fab’-SH、Fv、scFv和F(ab’)2)、双特异性和多特异性抗体、多价抗体、杂缀合物抗体、缀合抗体、文库源性抗体、具有经过修饰的效应子功能的抗体、含有抗体部分的融合蛋白,和包括抗原识别位点(如具有本公开的分拣蛋白的氨基酸残基的表位)的免疫球蛋白分子的任何其它经过修饰的配置,包括抗体的糖基化变体、抗体的氨基酸序列变体和共价修饰的抗体。所述抗分拣蛋白抗体可为人、鼠类、大鼠或具有任何其它起源(包括嵌合或人源化抗体)。
(1)多克隆抗体
如多克隆抗分拣蛋白抗体的多克隆抗体一般通过相关抗原和佐剂的多次皮下(sc)或腹膜内(ip)注射在动物中产生。使用双官能或衍生化试剂,例如马来酰亚胺基苯甲酰基硫代琥珀酰亚胺酯(通过半胱氨酸残基缀合)、N-羟基琥珀酰亚胺(通过赖氨酸残基)、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl2或R1N=C=NR(其中R和R1独立地为低碳烷基)使相关抗原(例如,本公开的纯化或重组分拣蛋白)缀合至在欲免疫的物种中具免疫原性的蛋白(例如,钥孔戚血蓝蛋白(KLH)、血清白蛋白、牛甲状腺球蛋白或大豆胰蛋白酶抑制剂)可为适用的。可使用的佐剂的实例包括弗氏完全佐剂和MPL-TDM佐剂(单磷酰脂质A、合成海藻糖二棒分枝菌酸酯)。免疫化方案可由本领域技术人员选择而无不当实验。
动物针对所需抗原、免疫原性缀合物或衍生物通过使例如100μg(关于兔)或5μg(关于小鼠)的所述蛋白或缀合物与3体积的弗氏完全佐剂组合并且在多个位点处皮内注射所述溶液而免疫化。一个月后,动物通过在多个位点处皮下注射而用弗氏完全佐剂中原始体积的1/5至1/10的肽或缀合物加强。七天至十四天后,对动物放血并且分析血清的抗体效价。对动物进行加强直至效价稳定状态。缀合物也可在重组细胞培养物中制成蛋白融合物。另外,如明矾的聚集剂适用于增强免疫反应。
(2)单克隆抗体
如单克隆抗分拣蛋白抗体的单克隆抗体是获自大体上均质抗体的群体,即,构成所述群体的个别抗体是一致的,除了可能的天然存在的突变和/或翻译后修饰(例如,异构化、酰胺化),其可少量存在。因此,修饰语“单克隆”指示所述抗体的特征为并非个别抗体的混合物。
例如,单克隆抗分拣蛋白抗体可使用首先由Kohler等人,Nature256:495(1975)描述的杂交瘤方法制得,或可通过重组DNA方法制得(美国专利号4,816,567)。
在杂交瘤方法中,小鼠或其它适当的宿主动物(如仓鼠)如上文所述免疫化以引起淋巴细胞,所述淋巴细胞产生或能够产生将特异性地结合于用于免疫化的蛋白的抗体(例如,本公开的纯化或重组分拣蛋白)。或者,淋巴细胞可体外免疫化。淋巴细胞接着使用如聚乙二醇的合适融合剂与骨髓瘤细胞融合,以形成杂交瘤细胞(Goding,MonoclonalAntibodies:Principles and Practice,第59-103页(Academic Press,1986))。
免疫剂将典型地包括所述抗原蛋白(例如,本公开的纯化或重组分拣蛋白)或其融合变体。一般说来,如果需要人起源的细胞,那么使用外周血淋巴细胞(“PBL”),而如果需要非人哺乳动物来源,那么使用脾或淋巴结细胞。所述淋巴细胞接着使用如聚乙二醇的合适融合剂与永生化细胞系融合,以形成杂交瘤细胞。Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice,Academic Press(1986),第59-103页。
永生化细胞系通常为转化的哺乳动物细胞,尤其啮齿动物、牛或人起源的骨髓瘤细胞。通常,使用大鼠或小鼠骨髓瘤细胞系。由此制备的杂交瘤细胞在优选地含有一种或多种抑制未融合、亲本骨髓瘤细胞的生长或存活的物质的合适培养基中接种并且生长。例如,如果所述亲本骨髓瘤细胞缺乏酶次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(HGPRT或HPRT),那么用于杂交瘤的培养基典型地将包括次黄嘌呤、氨基喋呤和胸苷(HAT培养基),其为防止HGPRT缺乏细胞的生长的物质。
优选的永生化骨髓瘤细胞为有效地融合、支持由所选的抗体产生细胞稳定高水平产生抗体并且对如HAT培养基的培养基敏感的那些。其中,优选的是鼠类骨髓瘤系,如源于MOPC-21和MPC-11小鼠肿瘤的那些(可获自Salk Institute Cell Distribution Center,San Diego,California USA),以及SP-2细胞和其衍生物(例如,X63-Ag8-653)(可获自American Type Culture Collection,Manassas,Virginia USA)。人骨髓瘤和小鼠-人异源骨髓瘤细胞系也已经关于人单克隆抗体的产生加以描述(Kozbor,J.Immunol.,133:3001(1984);Brodeur等人,Monoclonal Antibody Production Techniques andApplications,第51-63页(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987))。
其中杂交瘤细胞正在生长的培养基关于针对抗原(例如,本公开的分拣蛋白)的单克隆抗体的产生进行分析。优选地,由杂交瘤细胞产生的单克隆抗体的结合特异性通过免疫沉淀或通过体外结合分析,如放射性免疫分析(RIA)或酶联免疫吸附剂分析(ELISA)来确定。
其中培养杂交瘤细胞的培养基可关于针对所需抗原(例如,本公开的分拣蛋白)的单克隆抗体的存在进行分析。优选地,单克隆抗体的结合亲和力和特异性可通过免疫沉淀或通过体外结合分析,如放射性免疫分析(RIA)或酶联分析(ELISA)来确定。所述技术和分析是本领域中已知的。例如,结合亲和力可通过Munson等人,Anal.Biochem.,107:220(1980)的斯卡查德分析(Scatchard analysis)来确定。
在鉴别出产生具有所需特异性、亲和力和/或活性的抗体的杂交瘤细胞之后,所述克隆可通过限制稀释程序进行亚克隆并且通过标准方法(Goding,上述)生长。用于这一目的的合适培养基包括例如D-MEM或RPMI-1640培养基。此外,所述杂交瘤细胞可作为哺乳动物中的肿瘤体内生长。
由所述亚克隆分泌的单克隆抗体合适地通过常规免疫球蛋白纯化程序,例如蛋白A-琼脂糖色谱法、羟磷灰石色谱法、凝胶电泳、透析、亲和力色谱法和如上文所述的其它方法与培养基、腹水液或血清分离。
抗分拣蛋白单克隆抗体也可通过重组DNA方法,如美国专利号4,816,567中所公开和如上文所述的那些制得。编码所述单克隆抗体的DNA容易地使用常规程序分离并且测序(例如,通过使用特异性地结合于编码鼠类抗体的重链和轻链的基因的寡核苷酸探针)。所述杂交瘤细胞用作所述DNA的优选来源。一旦经分离,所述DNA可放置于表达载体中,所述表达载体接着被转染至不以其它方式产生免疫球蛋白的宿主细胞,如大肠杆菌细胞、猿COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞中,以在所述重组宿主细胞中合成单克隆抗体。关于编码所述抗体的DNA在细菌中的重组表达的回顾文章包括Skerra等人,Curr.Opin.Immunol.,5:256-262(1993)和Plückthun,Immunol.Rev.130:151-188(1992)。
在某些实施方案中,抗分拣蛋白抗体可从使用McCafferty等人,Nature,348:552-554(1990)中所述的技术产生的抗体噬菌体文库分离。Clackson等人,Nature,352:624-628(1991)和Marks等人,J.Mol.Biol.,222:581-597(1991)描述了分别地从噬菌体文库分离鼠类和人抗体。后续出版物描述了通过链改组(Marks等人,Bio/Technology,10:779-783(1992))产生高亲和力(纳摩尔(“nM”)范围)人抗体,以及作为用于构建极大噬菌体文库的策略的组合感染和体内重组(Waterhouse等人,Nucl.Acids Res.,21:2265-2266(1993))。因此,这些技术是用于分离具有所需特异性的单克隆抗体(例如,结合本公开的分拣蛋白的那些)的传统单克隆抗体杂交瘤技术的可行性替代。
编码抗体或其片段的DNA也可例如通过用人重链和轻链恒定域的编码序列取代来替代同源鼠类序列(美国专利号4,816,567;Morrison等人,Proc.Natl Acad.Sci.USA,81:6851(1984)),或通过将非免疫球蛋白多肽的编码序列的全部或一部分共价接合至免疫球蛋白编码序列而经修饰。典型地,所述非免疫球蛋白多肽取代抗体的恒定域,或其取代抗体的一个抗原组合位点的可变域以产生包含对抗原具有特异性的一个抗原组合位点和对不同抗原具有特异性的另一抗原组合位点的嵌合二价抗体。
本文所述的单克隆抗体(例如,本公开的抗分拣蛋白抗体或其片段)可为单价,其制备是本领域中众所周知的。例如,一种方法涉及免疫球蛋白轻链和经过修饰的重链的重组表达。所述重链一般地在Fc区中的任一点处被截短以便防止重链交联。或者,相关半胱氨酸残基可用另一氨基酸残基取代或缺失以便防止交联。体外方法也适用于制备单价抗体。抗体消化产生其片段、尤其Fab片段可使用本领域中已知的常规技术实现。
嵌合或杂合抗分拣蛋白抗体也可使用合成蛋白化学中的已知方法,包括涉及交联剂的那些方法体外制备。例如,可使用二硫化物交换反应或通过形成硫醚键来构建免疫毒素。用于这一目的的合适试剂的实例包括亚氨基硫醇盐和4-巯基丁酰亚氨酸甲酯。
(3)人源化抗体
本公开的抗分拣蛋白抗体或其抗体片段可进一步包括人源化或人抗体。非人(例如,鼠类)抗体的人源化形式为含有源于非人免疫球蛋白的最小序列的嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其片段(如Fab、Fab’-SH、Fv、scFv、F(ab’)2或抗体的其它抗原结合子序列)。人源化抗体包括其中来自接受者的互补决定区(CDR)的残基由来自非人物种(供体抗体)的CDR的残基置换的人免疫球蛋白(接受者抗体),所述非人物种如具有所需特异性、亲和力和能力的小鼠、大鼠或兔。在一些情况下,人免疫球蛋白的Fv框架残基由相应的非人残基置换。人源化抗体还可包含在接受者抗体中和在输入的CDR或框架序列中均未发现的残基。一般说来,人源化抗体将包含至少一个并且典型地两个可变域中的大体上全部,其中全部或大体上全部的CDR区对应于非人免疫球蛋白的那些并且全部或大体上全部的FR区为人免疫球蛋白共有序列的那些。人源化抗体任选地还将包含免疫球蛋白恒定区(Fc)、典型地人免疫球蛋白的恒定区的至少一部分。Jones等人,Nature321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature332:323-329(1988)和Presta,Curr.Opin.Struct.Biol.2:593-596(1992)。
用于人源化非人抗分拣蛋白抗体的方法是本领域中众所周知的。一般说来,人源化抗体具有从非人来源引入其中的一种或多种氨基酸残基。这些非人氨基酸残基通常被称作“输入”残基,其典型地从“输入”可变域取得。人源化可基本上根据Winter和同事的方法(Jones等人,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature 332:323-327(1988);Verhoeyen等人,Science239:1534-1536(1988)),或通过用啮齿动物CDR或CDR序列取代人抗体的相应序列来执行。因此,所述“人源化”抗体为嵌合抗体(美国专利号4,816,567),其中大体上少于完整人可变域已经由来自非人物种的相应序列取代。实际上,人源化抗体典型地为人抗体,其中一些CDR残基和可能一些FR残基由来自啮齿动物抗体中的类似位点的残基取代。
欲用于制造人源化抗体的人可变域(轻链和重链两者)的选择对于降低抗原性极其重要。根据所谓的“最佳拟合”方法,啮齿动物抗体的可变域的序列针对已知的人可变域序列的整个文库进行筛选。最接近啮齿动物的序列的人序列接着被认可为用于人源化抗体的人框架(FR)。Sims等人,J.Immunol.,151:2296(1993);Chothia等人,J.Mol.Biol.,196:901(1987)。另一方法使用源于轻链或重链的特定亚群的所有人抗体的共有序列的特定框架。相同框架可用于数种不同的人源化抗体。Carter等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 89:4285(1992);Presta等人,J.Immunol.151:2623(1993)。
此外,重要的是抗体在保留对抗原的高亲和力和其它有利的生物特性的情况下人源化。为达成这一目标,根据优选的方法,通过使用亲本和人源化序列的三维模型分析亲本序列和多种概念性人源化产物的过程来制备人源化抗体。三维免疫球蛋白模型通常可获得并且是本领域技术人员所熟悉的。可获得说明并且展示所选的候选免疫球蛋白序列的可能的三维构象结构的计算机程序。对这些程序的检查允许分析所述残基在所述候选免疫球蛋白序列的功能中的可能作用,即,分析影响所述候选免疫球蛋白结合其抗原的能力的残基。以这种方式,可从接受者和输入序列选择FR残基并且组合,使得实现所需的抗体特征,如增加的对一种或多种标靶抗原(例如,本公开的分拣蛋白)的亲和力。一般说来,CDR残基直接地并且最基本地牵涉于影响抗原结合。
预期人源化抗分拣蛋白抗体的多种形式。例如,人源化抗分拣蛋白抗体可为抗体片段(如Fab),其任选地与一种或多种细胞毒性剂缀合以便产生免疫缀合物。或者,人源化抗分拣蛋白抗体可为完整抗体,如完整IgG1抗体。
(4)人抗体
或者,可产生人抗分拣蛋白抗体。例如,现在有可能产生在免疫时能够在不存在内源免疫球蛋白产生的情况下产生人抗体的完整谱系的转基因动物(例如,小鼠)。嵌合和生殖系突变型小鼠中抗体重链接合区(JH)基因的纯合性缺失会导致内源抗体产生的完全抑制。人生殖系免疫球蛋白基因阵列在所述生殖系突变型小鼠中的转移将导致在抗原攻击时产生人抗体。参见例如Jakobovits等人,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA,90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature,362:255-258(1993);Bruggermann等人,Year in Immunol.,7:33(1993);美国专利号5,591,669和WO 97/17852。
或者,可使用噬菌体展示技术由来自未免疫的供体的免疫球蛋白可变(V)域基因谱系体外产生人抗分拣蛋白抗体和抗体片段。McCafferty等人,Nature348:552-553(1990);Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.227:381(1991)。根据这一技术,抗体V域基因被同框克隆至丝状噬菌体(如M13或fd)的主要或次要外壳蛋白基因中,并且在噬菌体粒子的表面上展示为功能性抗体片段。因为丝状粒子含有噬菌体基因组的单链DNA拷贝,基于抗体的功能特性的选择还会导致选择编码展现那些特性的抗体的基因。因此,噬菌体模拟B细胞的一些特性。噬菌体展示可以例如Johnson,KevinS.和Chiswell,David J.,Curr.OpinStruct.Biol.3:564-571(1993)中回顾的多种形式执行。V基因区段的数种来源可用于噬菌体展示。Clackson等人,Nature 352:624-628(1991)从源于免疫小鼠的脾的V基因的小的随机组合文库分离了抗噁唑酮抗体的多样化阵列。可构建来自未免疫人供体的V基因的谱系并且针对抗原的多样化阵列(包括自主抗原)的抗体可基本上根据由Marks等人,J.Mol.Biol.222:581-597(1991)或Griffith等人,EMBO J.12:725-734(1993)描述的技术来分离。还参见美国专利号5,565,332和5,573,905。另外,可使用酵母展示技术体外产生人抗分拣蛋白抗体和抗体片段(例如,WO 2009/036379;WO 2010/105256;WO2012/009568;US2009/0181855;US 2010/0056386;和Feldhaus和Siegel(2004)J.Immunological Methods290:69-80)。在其它实施方案中,可使用核糖体展示技术体外产生人抗分拣蛋白抗体和抗体片段(例如,Roberts和Szostak(1997)Proc Natl Acad Sci94:12297-12302;Schaffitzel等人(1999)J.Immunolical Methods 231:119-135;Lipovsek和Plückthun(2004)J.Immunological Methods 290:51-67)。
也可获得Cole等人和Boerner等人的用于制备人抗分拣蛋白单克隆抗体的技术(Cole等人,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,第77页(1985)和Boerner等人,J.Immunol.147(1):86-95(1991)。同样,人抗分拣蛋白抗体可通过将人免疫球蛋白基因座引入至其中内源免疫球蛋白基因已经部分地或完全地不活化的转基因动物(例如,小鼠)中而制得。在攻击时,观察到人抗体产生,其密切地类似在人中可见的抗体产生的所有方面,包括基因重排、组装和抗体谱系。这种方法描述于例如美国专利号5,545,807;5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,661,016中和以下科学出版物中:Marks等人,Bio/Technology10:779-783(1992);Lonberg等人,Nature368:856-859(1994);Morrison,Nature368:812-13(1994),Fishwild等人,Nature Biotechnology 14:845-51(1996),Neuberger,Nature Biotechnology 14:826(1996)和Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995)。
最后,人抗分拣蛋白抗体也可通过活化的B细胞体外产生(参见美国专利号5,567,610和5,229,275)。
(5)抗体片段
在某些实施方案中,使用抗分拣蛋白抗体片段而非完整的抗分拣蛋白抗体是有利的。较小的片段大小允许快速清除和较好的脑穿透。
已开发多种技术来产生抗体片段。传统地,这些片段经由完整抗体的蛋白水解消化而衍生(参见例如Morimoto等人,J.Biochem.Biophys.Method.24:107-117(1992);和Brennan等人,Science229:81(1985))。然而,这些片段现在可直接地由重组宿主细胞,例如使用编码本公开的抗分拣蛋白抗体的核酸产生。Fab、Fv和scFv抗体片段均可在大肠杆菌中表达并且从大肠杆菌中分泌,因此允许直接地产生大量的这些片段。抗分拣蛋白抗体片段也可从如上文所论述的抗体噬菌体文库分离。或者,Fab’-SH片段可直接地从大肠杆菌回收并且以化学方式偶合以形成F(ab’)2片段(Carter等人,Bio/Technology 10:163-167(1992))。根据另一方法,F(ab’)2片段可直接地从重组宿主细胞培养物分离。具有增加的体内半衰期的Fab和F(ab’)2抗体片段的产生描述于美国专利号5,869,046中。在其它实施方案中,所选抗体为单链Fv片段(scFv)。参见WO93/16185;美国专利号5,571,894和美国专利号5,587,458。所述抗分拣蛋白抗体片段也可为“线性抗体”,例如,如美国专利5,641,870所述。所述线性抗体片段可为单特异性或双特异性的。
(6)双特异性和多特异性抗体
双特异性抗体(BsAb)是对至少两种不同的表位,包括在相同或另一蛋白(例如,一种或多种本公开的分拣蛋白)上的那些具有结合特异性的抗体。或者,BsAb的一部分可接臂以结合于标靶分拣蛋白,并且另一部分可与结合于第二蛋白的臂组合。所述抗体可源于全长抗体或抗体片段(例如,F(ab’)2双特异性抗体)。
用于制造双特异性抗体的方法为本领域中已知的。全长双特异性抗体的传统产生是基于两个免疫球蛋白重链/轻链对的共表达,其中所述两个链具有不同特异性。Millstein等人,Nature,305:537-539(1983)。由于免疫球蛋白重链和轻链的随机分类,这些杂交瘤(四源杂交瘤)产生10种不同抗体分子的潜在混合物,其中仅一种具有正确双特异性结构。所述正确分子的纯化通常通过亲和力色谱步骤进行,相当麻烦,且产物产率低。相似程序公开于WO93/08829中和Traunecker等人,EMBOJ.,10:3655-3659(1991)中。
根据不同的方法,具有所需结合特异性的抗体可变域(抗体-抗原组合位点)融合至免疫球蛋白恒定域序列。所述融合优选地使用免疫球蛋白重链恒定域,包含铰链区、CH2和CH3区的至少一部分。优选在至少一种融合物中存在第一重链恒定区(CH1),其含有轻链结合所必需的位点。编码所述免疫球蛋白重链融合物和必要时免疫球蛋白轻链的DNA插入至独立表达载体中,并且共转染至合适的宿主生物体中。当用于构建的三条多肽链的不等比率提供最佳产率时,此举提供了调节实施方案中的三种多肽片段的相互比例的极大灵活性。然而,当至少两条呈相等比率的多肽链的表达导致高产率时或当所述比率不具有特定重要性时,有可能在一种表达载体中插入两条或所有三条多肽链的编码序列。
在这种方法的优选实施方案中,所述双特异性抗体由一条臂中的具有第一结合特异性的杂合免疫球蛋白重链和另一条臂中的杂合免疫球蛋白重链-轻链对(提供第二结合特异性)构成。发现这种不对称结构促进所需双特异性化合物与不想要的免疫球蛋白链组合的分离,因为所述双特异性分子的仅一半中存在免疫球蛋白轻链会提供容易的分离方式。这种方法公开于WO 94/04690中。关于产生双特异性抗体的其它细节,参见例如Suresh等人,Methods in Enzymology121:210(1986)。
根据描述于WO 96/27011或美国专利号5,731,168中的另一方法,在一对抗体分子之间的界面可经过工程改造以使从重组细胞培养物回收的异型二聚体的百分率最大化。所述优选的界面包含抗体恒定域的CH3区的至少一部分。在这种方法中,来自第一抗体分子的界面的一个或多个小氨基酸侧链用较大侧链(例如,酪氨酸或色氨酸)置换。与大侧链具有一致或相似大小的补偿性“空腔”在第二抗体分子的界面上通过用较小氨基酸侧链(例如,丙氨酸或苏氨酸)置换大氨基酸侧链而产生。这提供了一种用于增加异型二聚体的产率超过如同型二聚体的其它不想要的终产物的机制。
所述文献中已经描述了用于由抗体片段产生双特异性抗体的技术。例如,双特异性抗体可使用化学连接制备。Brennan等人,Science 229:81(1985)描述了一种程序,其中完整抗体经过蛋白水解裂解以产生F(ab’)2片段。这些片段在二硫醇复合剂亚砷酸钠存在下被还原以稳定化邻近二硫醇且防止分子间二硫化物形成。所产生的Fab’片段接着转化为硫代硝基苯甲酸盐(TNB)衍生物。所述Fab’-TNB衍生物之一接着再转化为Fab’-TNB衍生物以形成双特异性抗体。所产生的双特异性抗体可用作用于酶的选择性固定的试剂。
Fab’片段可直接地从大肠杆菌回收并且以化学方式偶合以形成双特异性抗体。Shalaby等人,J.Exp.Med.175:217-225(1992)描述了完全人源化双特异性抗体F(ab’)2分子的产生。各Fab'片段独立地从大肠杆菌分泌并且经历体外定向化学偶合以形成双特异性抗体。因此形成的双特异性抗体能够结合于过度表达ErbB2受体的细胞和正常人T细胞,以及促发人细胞毒性淋巴细胞针对人乳房肿瘤标靶的溶解活性。
还已经描述了用于直接地从重组细胞培养物制造并且分离二价抗体片段的多种技术。例如,已经使用白氨酸拉链产生二价异型二聚体。Kostelny等人,J.Immunol.,148(5):1547-1553(1992)。来自Fos和Jun蛋白的白氨酸拉链肽通过基因融合连接至两种不同抗体的Fab’部分。抗体同型二聚体在铰链区被还原以形成单体且接着再氧化以形成抗体异型二聚体。由Hollinger等人,Proc.Nat’lAcad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)描述的“双功能抗体”技术已提供了一种用于制造双特异性/二价抗体片段的替代机制。所述片段包含通过连接子连接至轻链可变域(VL)的重链可变域(VH),所述连接子过短而不允许同一链上的两个域之间的配对。因此,迫使一个片段的VH及VL域与另一片段之互补VL及VH域配对,由此形成两个抗原结合位点。也已经报道了另一种通过使用单链Fv(sFv)二聚体来制造双特异性/二价抗体片段的策略。参见Gruber等人,J.Immunol.,152:5368(1994)。
还预期具有超过两种价态的抗体。例如,可制备三特异性抗体。Tutt等人,J.Immunol.147:60(1991)。
示例性双特异性抗体可结合于给定分子(例如,本公开的分拣蛋白)上的两个不同表位。或者,靶向分拣蛋白信号传导组分的臂可与结合于白细胞上的触发分子的臂组合以使细胞防御机制聚焦于表达所述特定抗原的细胞,所述触发分子如T细胞受体分子(例如,CD2、CD3、CD28或B7),或针对IgG的Fc受体(FcγR),如FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)和FcγRIII(CD16)。双特异性抗体也可用于使细胞毒性剂局限于表达特定蛋白的细胞。所述抗体具有蛋白结合臂和结合细胞毒性剂或放射性核素螯合剂(如EOTUBE、DPTA、DOTA或TETA)的臂。另一种所关注的双特异性抗体结合所关注的蛋白并且进一步结合组织因子(TF)。
(7)多价抗体
多价抗体可比二价抗体快速地由表达所述抗体所结合的抗原的细胞内化(和/或代谢)。本公开的抗分拣蛋白抗体或其抗体片段可为具有三个或更多个抗原结合位点(例如,四价抗体)的多价抗体(其并非IgM类别),其可容易地通过编码所述抗体的多肽链的核酸的重组表达而产生。所述多价抗体可包含二聚化域和三个或更多个抗原结合位点。优选的二聚化域包含Fc区或铰链区。在这种情况下,所述抗体将包含Fc区和在所述Fc区的氨基端的三个或更多个抗原结合位点。本文中优选的多价抗体含有三个至约八个、但优选地四个抗原结合位点。所述多价抗体含有至少一条多肽链(并且优选地两条多肽链),其中所述一条或多条多肽链包含两个或更多个可变域。例如,所述一条或多条多肽链可包含VD1-(X1)n-VD2-(X2)n-Fc,其中VD1为第一可变域,VD2为第二可变域,Fc为Fc区的一条多肽链,X1和X2表示氨基酸或多肽,并且n为0或1。同样,所述一条或多条多肽链可包含VH-CH1-柔性连接子-VH-CH1-Fc区链;或VH-CH1-VH-CH1-Fc区链。本文中的多价抗体优选地进一步包含至少两种(并且优选地四种)轻链可变域多肽。本文中的多价抗体可例如包含约两种至约八种轻链可变域多肽。此处预期的轻链可变域多肽包含轻链可变域并且任选地进一步包含CL域。所述多价抗体可识别所述分拣蛋白抗原以及不限于额外抗原Aβ肽抗原或α突触核蛋白抗原或Tau蛋白抗原或TDP-43蛋白抗原或朊病毒蛋白抗原或亨廷顿蛋白抗原或RAN翻译产物抗原(包括由甘氨酸-丙氨酸(GA)、甘氨酸-脯氨酸(GP)、甘氨酸-精氨酸(GR)、脯氨酸-丙氨酸(PA)或脯氨酸-精氨酸(PR)构成的二肽重复(DPR肽))、胰岛素受体、胰岛素样生长因子受体、转铁蛋白受体或促进抗体跨血脑屏障转移的任何其它抗原。
(8)杂缀合物抗体
杂缀合物抗体也在本公开的范围内。杂缀合物抗体由两种共价接合的抗体(例如,本公开的抗分拣蛋白抗体或其抗体片段)构成。例如,所述杂缀合物中的抗体之一可偶合至抗生物素蛋白,另一抗体可偶合至生物素。所述抗体已经例如被提出使免疫系统细胞靶向不需要的细胞(美国专利号4,676,980),并且已经用于治疗HIV感染。国际公布号WO 91/00360、WO 92/200373和EP 0308936。预期所述抗体可使用合成蛋白化学中的已知方法,包括涉及交联剂的那些方法体外制备。例如,可使用二硫化物交换反应或通过形成硫醚键来构建免疫毒素。用于这一目的的合适试剂的实例包括亚氨基硫醇盐和4-巯基丁酰亚氨酸甲酯和例如美国专利号4,676,980中公开的那些。杂缀合物抗体可使用任何便利交联方法制得。合适的交联剂为本领域中众所周知的,且连同多种交联技术一起在美国专利号4,676,980中公开。
(9)效应子功能工程改造
也可需要修饰本公开的抗分拣蛋白抗体以修饰抗体的效应子功能和/或增加血清半衰期。例如,恒定区上的Fc受体结合位点可经过修饰或突变以去除或降低对如FcγRI、FcγRII和/或FcγRIII的某些Fc受体的结合亲和力。在一些实施方案中,效应子功能通过去除抗体的Fc区(例如,在IgG的CH 2域中)的N-糖基化而削弱。在一些实施方案中,效应子功能通过修饰如PCT WO 99/58572和Armour等人,Molecular Immunology 40:585-593(2003);Reddy等人,J.Immunology 164:1925-1933(2000)所述的人IgG的区(如233-236、297和/或327-331)而削弱。
为了增加抗体的血清半衰期,可将挽救受体结合表位并入抗体(尤其抗体片段)中,如例如美国专利5,739,277所述。如本文所用,术语“挽救受体结合表位”是指IgG分子(例如,IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)的Fc区中负责增加IgG分子的体内血清半衰期的表位。
(10)其它氨基酸序列修饰
还预期本公开的抗分拣蛋白抗体或其抗体片段的氨基酸序列修饰。例如,可需要改进所述抗体或抗体片段的结合亲和力和/或其它生物特性。所述抗体或抗体片段的氨基酸序列变体通过将适当核苷酸改变引入至编码所述抗体或抗体片段的核酸中,或通过肽合成制备。所述修饰包括例如所述抗体的氨基酸序列内残基的缺失和/或插入和/或取代。制成缺失、插入和取代的任何组合以获得最终构建体,只要所述最终构建体具有所需特征(即,结合本公开的分拣蛋白或以物理方式与其相互作用的能力)即可。所述氨基酸改变还可改变所述抗体的翻译后过程,如改变糖基化位点的数目或位置。
用于鉴别所述抗分拣蛋白抗体中作为诱变的优选位置的某些残基或区的适用方法被称作“丙氨酸扫描诱变”,如由Cunningham和Wells,Science,244:1081-1085(1989)所述。此处,标靶残基的残基或基团经过鉴别(例如带电残基,如arg、asp、his、lys和glu)并且由中性或带负电氨基酸(最优选地,丙氨酸或聚丙氨酸)置换以影响所述氨基酸与标靶抗原的相互作用。证明对取代的功能灵敏性的那些氨基酸位置接着通过在取代位点处或针对所述位点引入进一步或其它变体而细化。因此,虽然用于引入氨基酸序列变异的位点经过预定,但突变本身的性质无需预定。例如,为了分析在给定位点处突变的性能,在标靶密码子或区处进行丙氨酸扫描或随机诱变并且针对所需活性筛选所表达的抗体变体。
氨基酸序列插入包括介于一个残基至含有一百个或更多残基的多肽的长度范围内的氨基-(“N”)和/或羧基(“C”)端融合,以及单一或多个氨基酸残基的序列内插入。末端插入的实例包括具有N端甲硫氨酰基残基的抗体或融合至细胞毒性多肽的抗体。抗体分子的其它插入变体包括抗体的N端或C端融合至酶或增加抗体的血清半衰期的多肽。
另一类型的变体为氨基酸取代变体。这些变体在抗体分子中具有至少一个由不同残基置换的氨基酸残基。用于取代性诱变的最关注位点包括高变区,但也预期FR改变。保守性取代在标题为“优选的取代”的下表B中示出。如果所述取代导致生物活性的改变,那么可引入更多实质性改变(表B中命名为“示例性取代”,或如下文参考氨基酸类别进一步描述)并且筛选产物。
表B:氨基酸取代
Figure BDA0001494797660001841
Figure BDA0001494797660001851
所述抗体的生物特性的实质性修饰通过选择取代来实现,所述取代在其对维持(a)取代区域中多肽骨架的结构,例如,呈薄片或螺旋构象,(b)所述分子在标靶位点处的电荷或疏水性,或(c)侧链的大小的影响方面显著不同。天然存在的残基是基于常见侧链特性分成各组:
(1)疏水性:正白氨酸、met、ala、val、leu、ile;
(2)中性亲水性:cys、ser、thr;
(3)酸性:asp、glu;
(4)碱性:asn、gln、his、lys、arg;
(5)影响链取向的残基:gly、pro;和
(6)芳香性:trp、tyr、phe。
非保守性取代需要将这些类别之一的成员换成另一类别。
未牵涉于维持抗体的适当构象中的任何半胱氨酸残基也可一般地用丝氨酸取代,以改进所述分子的氧化稳定性并且防止异常交联。相反地,半胱氨酸键可添加至所述抗体中以改进其稳定性(尤其在所述抗体为如Fv片段的抗体片段的情况下)。
一种特别优选的类型的取代变体涉及取代亲本抗体(例如,人源化或人抗分拣蛋白抗体)的一种或多种高变区残基。一般说来,针对进一步开发所选择的所得变体将具有相对于产生所述变体的亲本抗体有所改进的生物特性。用于产生所述取代变体的便利方式涉及使用噬菌体展示的亲和力成熟。简单地说,数个高变区位点(例如,6-7个位点)突变以在各位点处产生所有可能的氨基取代。因此产生的抗体变体以单价形式从丝状噬菌体粒子展示为与包装于各粒子内的M13的基因III产物的融合物。噬菌体展示的变体接着针对如本文所公开的其生物活性(例如,结合亲和力)进行筛选。为了鉴别用于修饰的候选高变区位点,可执行丙氨酸扫描诱变以鉴别显著有助于抗原结合的高变区残基。或者或另外,分析抗原-抗体复合物的晶体结构以鉴别所述抗体与所述抗原(例如,本公开的分拣蛋白)之间的接触点可为有利的。所述接触残基和相邻残基根据本文中详细阐述的技术为用于取代的候选者。一旦产生所述变体,变体的组即经受如本文所述的筛选并且在一种或多种相关分析中具有卓越特性的抗体可筛选用于进一步开发。
所述抗体的另一类型的氨基酸变体会改变所述抗体的原始糖基化模式。改变意指缺失一种或多种在所述抗体中发现的碳水化合物部分,和/或添加一个或多个未存在于所述抗体中的糖基化位点。
抗体的糖基化典型地为N连接或O连接的。N连接是指所述碳水化合物部分附接至天冬酰胺残基的侧链。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸(其中X为除了脯氨酸外的任何氨基酸)为关于所述碳水化合物部分酶促附接至天冬酰胺侧链的识别序列。因此,多肽中这些三肽序列中的任一者的存在均会产生潜在糖基化位点。O连接的糖基化是指糖N-乙酰基半乳糖胺、半乳糖或木糖之一附接至羟基氨基酸,最通常为丝氨酸或苏氨酸,不过也可使用5-羟基脯氨酸或5-羟基赖氨酸。
糖基化位点添加至所述抗体中便利地通过改变氨基酸序列以致其含有一种或多种上述三肽序列来实现(关于N连接的糖基化位点)。所述改变也可通过添加一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基至原始抗体的序列中或由所述一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基取代来进行(关于O连接的糖基化位点)。
通过本领域中已知的多种方法制备编码抗IgE抗体的氨基酸序列变体的核酸分子。这些方法包括但不限于从天然来源分离(在天然存在的氨基酸序列变体的情况下)或通过所述抗体(例如,本公开的抗分拣蛋白抗体)或抗体片段的早先制备的变体或非变体形式的寡核苷酸介导的(定点)诱变、PCR诱变和卡匣诱变制备。
(11)其它抗体修饰
本公开的抗分拣蛋白抗体或其抗体片段可进一步经过修饰以含有本领域中已知并且可容易地获得的额外非蛋白部分。优选地,适用于抗体的衍生化的部分为水溶性聚合物。水溶性聚合物的非限制性实例包括但不限于聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇的共聚物、羧基甲基纤维素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二氧戊环、聚-1,3,6-三噁烷、乙烯/马来酸酐共聚物、聚氨基酸(均聚物或无规共聚物)和葡聚糖或聚(n-乙烯基吡咯烷酮)聚乙二醇、聚丙二醇均聚物、聚氧化丙烯/氧化乙烯共聚物、聚氧乙基化多元醇(例如,甘油)、聚乙烯醇和其混合物。聚乙二醇丙醛可由于其在水中的稳定性而在制造方面具有优势。所述聚合物可具有任何分子量,且可为分支或无分支的。附接至抗体的聚合物的数目可改变,并且如果连接超过一种聚合物,那么其可为相同或不同分子。一般来说,用于衍生化的聚合物的数目和/或类型可基于多种考虑因素确定,所述考虑因素包括但不限于欲改进的抗体的特定特性或功能、抗体衍生物是否将在规定条件下用于疗法等。所述技术和其它合适的制剂在Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第20版,AlfonsoGennaro编,Philadelphia College of Pharmacy and Science(2000)中公开。
结合分析和其它分析
本公开的抗分拣蛋白抗体可例如通过如ELISA、表面等离子体共振(SPR)、Western印迹等已知方法测试抗原结合活性。
在一些实施方案中,竞争分析可用于鉴别与表1-3和11-15中列出或选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体中的任一者竞争的抗体。在某些实施方案中,所述竞争抗体结合于表1-3和11-15中列出或选自S-1、S-2、S-2-1、S-2-2、S-2-3、S-2-4、S-2-5、S-2-6、S-2-7、S-2-8、S-2-9、S-2-10、S-2-11、S-2-12、S-2-13、S-2-14、S-2-15、S-3、S-4、S-5、S-6、S-7、S-8、S-9、S-10、S-11、S-12、S-13、S-14、S-15、S-15-1、S-15-2、S-15-3、S-15-4、S-15-5、S-15-6、S-15-6-1、S-15-6-2、S-15-6-3、S-15-6-4、S-15-6-5、S-15-6-6、S-15-6-7、S-15-6-8、S-15-6-9、S-15-6-10、S-15-6-11、S-15-6-12、S-15-6-13、S-15-7、S-15-8、S-15-9、S-15-10、S-15-10-1、S-15-10-2、S-15-10-3、S-15-10-4、S-15-10-5、S-15-10-6、S-15-10-7、S-15-10-8、S-15-10-9、S-15-10-10、S-15-10-11、S-15-10-12、S-15-10-13、S-15-10-14、S-15-10-15、S-15-10-16、S-15-10-17、S-15-10-18、S-15-10-19、S-15-10-20、S-15-10-21、S-15-11、S-15-12、S-15-13、S-15-14、S-15-15、S-15-16、S-16、S-17、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-22-1、S-22-2、S-22-3、S-22-4、S-22-5、S-22-6、S-22-7、S-22-8、S-22-9、S-23、S-24、S-25、S-26、S-27、S-28、S-29、S-30、S-31、S-32、S-33、S-34、S-35、S-36、S-37、S-38、S-39、S-40、S-41、S-42、S-43、S-44、S-45、S-46、S-47、S-48、S-49、S-50、S-51、S-52、S-53、S-54、S-55、S-56、S-57、S-58、S-59、S-60、S-60-1、S-60-2、S-60-3、S-60-4、S-60-5、S-60-6、S-60-7、S-60-8、S-60-9、S-61、S-62、S-63、S-64、S-65、S-66、S-67、S-68、S-69、S-70、S-71、S-72、S-73、S-74、S-75、S-76、S-77、S-78、S-79、S-80、S-81、S-82、S-82-1、S-82-2、S-82-3、S-82-4、S-82-5、S-82-6、S-82-7、S-82-8、S-83、S-84和S-85的抗体中的任一者所结合的相同表位(例如,线性或构象表位)。用于定位抗体结合的表位的详细示例性方法提供于Morris(1996)“Epitope MappingProtocols,”Methods in Molecular Biology第66卷(Humana Press,Totowa,NJ)中。
在一示例性竞争分析中,固定的分拣蛋白或在细胞表面上表达分拣蛋白的细胞在包含结合于分拣蛋白(例如,人或非人灵长类动物)的第一标记的抗体和第二未标记的抗体的溶液中孵育,所述第二未标记的抗体正在测试其与所述第一抗体竞争结合于分拣蛋白的能力。所述第二抗体可存在于杂交瘤上清液中。作为对照组,固定的分拣蛋白或表达分拣蛋白的细胞在包含所述第一标记的抗体但不包含所述第二未标记的抗体的溶液中孵育。在允许所述第一抗体结合于分拣蛋白的条件下孵育之后,去除过量的未结合抗体,并且测量与固定的分拣蛋白或表达分拣蛋白的细胞缔合的标记的量。如果与固定的分拣蛋白或表达分拣蛋白的细胞缔合的标记的量在测试样品中相对于对照样品大体上降低,那么这指示所述第二抗体正在与所述第一抗体竞争结合于分拣蛋白。参见Harlow和Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual第14章(Cold Spring Harbor Laboratory,ColdSpring Harbor,NY)。
配体结合分析
本文中进一步提供筛选结合人分拣蛋白的Lys260、Phe314、Ser316、Ile329、Arg325、Arg326、Tyr351、Ser352和/或Ile353,并且阻断分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体的方法。在一些实施方案中,可合成肽文库,其中分拣蛋白被剖成连续的15聚体和25聚体肽,所述肽由一种氨基酸残基分隔并且随后被滴到过滤器上。接着接着可通过SPOT结合分析(例如,Frank,R和Overwin,H(1996)Methods.Mol.Biol.66,149-169;Reineke,U等人,(2002)J.Immunol.Methods 267,13-26;和Andersen,OS等人,(2010)J,BIOLOGICAL CHEMISTRY 285,12210-12222)针对分拣蛋白配体与受体肽或与例如在人分拣蛋白文库的Lys260、Phe314、Ser316、Ile329、Arg325、Arg326、Tyr351、Ser352和/或Ile353处突变的肽在抗分拣蛋白抗体存在或不存在下相互作用的能力测试分拣蛋白配体的结合。在一些实施方案中,可在纤维素膜上构建用于VPS10p-域受体基因家族成员的成员的肽文库或关于所鉴别的配体结合肽的取代或长度分析的特异性肽变异。在一些实施方案中,总计2181种肽可用于表示分拣蛋白基因家族,包括用于分拣蛋白(登记号CAA66904)的273种肽,在16聚体肽之间具有13个氨基酸的重叠(Frank,R(1992)Tetrahedron 48,9217-9232)。在一些实施方案中,纤维素支撑物可制备为N-修饰的纤维素-氨基羟基丙基醚膜,并且所有轮的合成均以9-芴基甲氧基羰基丙氨酸-五氟苯基酯的斑点清晰度开始,所述酯在肽与膜之间产生丙氨酸连接子。例如自动化线性合成,其中逐步添加在N端处由9-芴基-甲氧基羰基保护并且针对增长的肽链具有适当侧链保护的不同氨基酸。在一些实施方案中,继续脱除保护基、活化和偶合的模式直至产生16聚体肽,导致共价锚定至在C末端处具有N端游离末端的纤维素支撑物的肽的相等分布的阵列(Scharn,D等人,(2000)J.Comb.Chem.2,361-369)。在一些实施方案中,侧链保护基的去除可分两个步骤执行。首先,所述膜可用90%三氟乙酸(在二氯甲烷中,含有3%三异丁基硅烷和2%H2O);并且其次用例如60%三氟乙酸(在二氯甲烷中,含有3%三异丁基硅烷和2%H2O)处理。为了去除三氟乙酸盐,所述膜可用H2O、乙醇、Tris缓冲的生理盐水和乙醇洗涤数次,并且接着干燥。最后,在预定的肽文库准备用于配体结合分析之前,所述膜在阻断缓冲液中阻断2h,所述阻断缓冲液在Tris缓冲的生理盐水(pH 8.0)中扩张并且补充5%蔗糖。在一些实施方案中,关于纤维素结合的肽的结合研究,膜结合的文库可用组合的S-肽和聚组氨酸标记的配体在抗分拣蛋白抗体存在或不存在下,例如在4℃下在阻断缓冲液中孵育过夜,随后也在阻断缓冲液中但在室温下用1mg/ml的HRP缀合的S-蛋白进行第二次孵育持续3h。随后,所述膜可例如用Tris缓冲的生理盐水洗涤三次持续10min,接着可使用UptiLight化学发光底物和LumiImager仪器进行结合的配体的定量表征,所述仪器以Boehringer光单位提供斑点信号强度。或者,可通过免疫化学分析用针对组氨酸标签的抗体和二次HRP缀合的抗小鼠抗体执行结合的配体的检测。可使用标准Western印迹程序和斑点检测执行孵育。
本文中进一步提供筛选阻断分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用(例如,结合)的抗分拣蛋白抗体的方法。
在一些实施方案中,用于检测的分拣蛋白配体的经过标记的形式,可针对各蛋白制备允许添加N端S-肽和聚组氨酸标签的构建体。用于人NGF和BDNF的模板cDNA包括用于使用引物对5′-GGTATTGAGGGTCGCGAACCACACTCAGAGAGCAATGTCCC-3′(SEQ IDNO:695)和3′-GGGGGAAGTTGTCCTGAGTGTCCTCGTTCGCCACTCCGAGATTGAGAGGAGA-5′(SEQ ID NO:696);和引物对5′-GGTATTGAGGGTCGCGC CCCCATGAAAGAAGCAAACAT CCGAGG-3′(SEQID NO:697)和3′-CACGTTTGTAC AGGTACTCCCAGGCCGCGACTCCGAGATTGAGAGGAGA-5′(SEQ ID NO:698)产生跨NGF的残基Glu1–Arg102和BDNF的Ala1–Arg110的片段的ATCC克隆。所述cDNA可包括用于接合独立性克隆至pET-30Xa/LIC载体中,并且使用Phusion DNA聚合酶进行扩增并且根据如由制造商提供的方案的相容性悬垂物。蛋白可在大肠杆菌的BL21/DE3菌株中表达,使用具有附加的全能核酸酶(benzonase)的Bugbuster试剂有效地从细菌包涵体提取,并且通过标准镍-次氮基三乙酸亲和力色谱法,例如在500mM NaCl、5mM咪唑和20mM Tris-HCl(pH 8.0)中纯化。在补充有20mM EDTA的缓冲液中进行蛋白洗脱。HisS-NGFpro和HisS-BDNFpro的完整经过标记的形式的验证可通过SDS-PAGE分析,随后使用来自Sigma(H-1029)的针对组氨酸标签的抗体和二次HRP缀合的抗小鼠抗体进行考马斯染色或Western印迹分析,或替代地通过来自Novagen的HRP缀合的S-蛋白(目录号69047-3)的直接结合进行(例如,Andersen,OS等人,P(2010)THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,285,12210–12222)。相似方法也可用于产生GST标记的分拣蛋白配体(例如,Quistgaard,EM等人,(2009)Nat.Struct.Mol.Biol.16,96–98)。
在一些实施方案中,分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用可使用表面等离子体共振分析表征(例如,Skeldal,S等人,(2012)J Biol Chem.,287:43798;和Andersen,OS等人,(2010)THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,285,12210-12222)。在阻断性抗分拣蛋白抗体存在或不存在下分拣蛋白配体直接结合于固定的分拣蛋白的确定可例如在Biacore2000仪器(Biacore,Sweden)上使用CaHBS作为标准电泳缓冲液(10mMHEPES pH7.4、140mM NaCl、2mM CaCl2、1mM EGTA和0.005%Tween20)来执行。在一些实施方案中,来自Biacore(CM5)的生物传感器芯片可使用NHS/EDC方法、随后用分拣蛋白涂布至79fmol/mm2的蛋白密度而活化并且用于NGF、BDNF和NT3的重组前域的亲和力测量。具有前分拣蛋白的生物传感器表面的制备将遵循相等程序。在配体结合实验的各循环之后流动细胞的再生可通过再生缓冲液(10mM甘氨酸-HCl pH 4.0、500mM NaCl、20mM EDTA和0.005%Tween 20)的两个10-μl脉冲和0.001%SDS的单一注射来进行。关于亲和力估计值的传感图的拟合可例如通过使用BIA评估版本3.1来进行。根据相似方案,HisS-NGFpro或HisS-BDNFpro的固定也可在CM5生物传感器芯片上使用NHS/EDC偶合试剂盒来进行,给出固定的蛋白的相似表面密度(约300fmol/mm2)。具有固定的NGFpro或BDNFpro的生物传感器芯片也可用于检查在竞争性分拣蛋白抗体不存在或存在下分拣蛋白的结合。前NGF和前BDNF的未加工形式,以及另一分拣蛋白配体(例如,受体相关蛋白(RAP)、神经紧张素、颗粒蛋白前体、p75、LpL、APOA5、APOE或APP)也可应用于固定的分拣蛋白并且可测量在竞争性抗体不存在或存在下的结合。
在一些实施方案中,分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用可使用下拉分析表征(例如,Andersen,OS等人,(2010)THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,285,12210-12222)。例如,分拣蛋白的所表达的细胞外域可在分拣蛋白阻断抗体不存在或存在下用经过标记的分拣蛋白配体孵育并且使用100μl谷胱甘肽(GSH)-琼脂糖珠粒(AmershamBiosciences,目录号17-0756-01)进行沉淀。所应用的受体域的量可通过沉淀使用Talon珠粒作为对照组来确定。结合的蛋白可通过SDS-PAGE分析分离并且使用抗组氨酸抗体通过标准Western印迹分析来显现。
在一些实施方案中,分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用可使用纤维素结合的蛋白表征(例如,Andersen,OS等人,(2010)THE JOURNAL OF BIOLOGICALCHEMISTRY,285,12210-12222)。例如,膜结合的蛋白可用S-肽和聚组氨酸标记的前NGF、前BDNF、颗粒蛋白前体或另一分拣蛋白配体(如颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5或APOE)在4℃下在阻断缓冲液中孵育过夜,随后也在阻断缓冲液中但在室温下用1μg/ml的HRP缀合的S-蛋白进行第二次孵育持续3h。随后,所述膜可用Tris缓冲的生理盐水洗涤三次持续10min,接着使用UptiLight化学发光底物和LumiImager仪器进行结合的配体的定量表征,所述仪器以Boehringer光单位提供斑点信号强度。或者,可通过免疫化学分析用针对组氨酸标签的抗体和二次HRP缀合的抗小鼠抗体执行结合的配体的检测。孵育之后可为标准Western印迹分析和斑点检测。
在一些实施方案中,分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用可使用邻近接合分析表征(例如,Gustafsen,C等人,(2013)The Journal of Neuroscience,33:64-71)。例如,在表达或暴露于分拣蛋白和其结合搭配物的细胞上的邻近接合分析(PLA)(DuolinkII)可用初级抗体抗分拣蛋白/F11、抗SorLA/20C11和针对结合搭配物的抗体(如抗APP/AF1168抗体)执行,随后用缀合至寡核苷酸的二次抗体孵育,所述寡核苷酸杂交至后续添加的成环寡核苷酸,并且当所述抗原位于40nm邻近内时引发滚环扩增。扩增的DNA可通过添加互补荧光标记的寡核苷酸来显现。
在一些实施方案中,分拣蛋白与分拣蛋白配体(例如,颗粒蛋白前体、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、前NT3、p75、APP、LpL、APOA5、APOE)之间的相互作用可使用碱性磷酸酶标记的配体在细胞结合分析中表征(例如,Hu,F等人,(2005)J.Neurosci.25,5298-5304;Fournier,AE等人,(2001)Nature 409,341-346;Lauren,J等人,(2009)Nature 457,1128-1132;和Hu,F等人,(2010)Neuron 68,654-667)。例如,可制成碱性磷酸酶(AP)标记的配体以分析在经过转染的细胞或初级神经元上与分拣蛋白的结合。为了检测AP标记的配体与表达分拣蛋白的细胞的结合,可用例如含有20mM HEPES钠pH 7.05和1mg ml-1牛血清白蛋白(BSA)的汉克斯平衡盐溶液(HBH)洗涤培养物。接着,板可在分拣蛋白阻断抗体存在或不存在下,例如在23℃下在HBH中用AP标记的配体孵育持续2h。AP结合的配体可根据本领域中众所周知的方法进行检测并且定量。
基于细胞的分析
本文中进一步提供筛选如抗分拣蛋白抗体的分拣蛋白结合拮抗剂的方法,其包括使试剂(例如,抗分拣蛋白抗体)与表达分拣蛋白的细胞在其细胞表面上接触。在一些实施方案中,所述试剂和细胞进一步与本公开的分拣蛋白配体接触。在一些实施方案中,所述细胞本身表达本公开的分拣蛋白配体。所述基于细胞的方法尤其适用于通过分析在细胞的背景下对分拣蛋白与分拣蛋白配体之间的相互作用的影响来筛选并且验证分拣蛋白结合拮抗剂(例如,抗分拣蛋白抗体)。
因此,本公开的某些方面涉及在细胞表面上表达本公开的分拣蛋白的细胞。在一些实施方案中,所述细胞内源性地表达本公开的分拣蛋白。在一些实施方案中,所述细胞经过重组性工程改造以表达本公开的分拣蛋白。在这些实施方案中的任一者中,由所述聚核苷酸编码的本公开的分拣蛋白(无论内源或重组)将优选地包括翻译后加工、膜易位和靶向细胞表面所需的至少一种蛋白域,包括而不限于信号肽和跨膜域。在一些实施方案中,所述信号肽和/或跨膜域可指内源分拣蛋白信号肽和/或跨膜域。在其它实施方案中,所述信号肽和/或跨膜域可指已知促进所需的宿主细胞中的细胞表面表达的外源信号肽和/或跨膜域。在优选实施方案中,所述分拣蛋白还将含有足以用于结合本公开的分拣蛋白配体的域。
本领域中众所周知的标准分子生物学技术(如本公开中所述并且提及的那些)可用于重组性工程改造细胞(例如,本公开的宿主细胞)以表达本公开的分拣蛋白。在一些实施方案中,所述方法包括在适用于抗体的表达的条件下培养含有编码本公开的分拣蛋白的聚核苷酸的本公开的宿主细胞。
关于本公开的分拣蛋白的重组产生,分离编码分拣蛋白的核酸并且将其插入至一种或多种载体中以用于宿主细胞中的进一步克隆和/或表达。所述核酸可容易地使用常规程序分离并且测序(例如,通过使用能够特异性地结合于编码分拣蛋白的基因的寡核苷酸探针)。
本文所述的含有编码本公开的分拣蛋白或其细胞表面表达的片段中的任一者的核酸序列的合适的载体包括而不限于克隆载体和表达载体。合适的克隆载体可根据标准技术构建,或可选自本领域中可获得的大量克隆载体。虽然所选择的克隆载体可根据意图使用的宿主细胞而改变,但适用的克隆载体一般具有自主复制的能力,可具有针对特定的限制核酸内切酶的单一标靶,和/或可携带针对可用于选择含有所述载体的克隆的标记物的基因。合适的实例包括质粒和细菌病毒,例如pUC18、pUC19、Bluescript(例如,pBS SK+)和其衍生物、mp18、mp19、pBR322、pMB9、ColE1、pCR1、RP4、噬菌体DNA,和穿梭载体(如pSA3和pAT28)。这些和多种其它克隆载体可获自商业供应商,如BioRad、Strategene和Invitrogen。
表达载体一般为含有本公开的核酸的可复制聚核苷酸构建体。所述表达载体可在宿主细胞中复制,呈游离体形式或作为染色体DNA的主要部分。合适的表达载体包括但不限于质粒、病毒载体(包括腺病毒、腺相关病毒、反转录病毒)、柯斯质粒和在PCT公布号WO87/04462中公开的表达载体。载体组分可一般地包括但不限于以下一者或多者:信号序列;复制起点;一种或多种标记物基因;合适的转录控制元件(如启动子、增强子和终止子)。关于表达(即,翻译),也通常需要一种或多种翻译控制元件,如核糖体结合位点、翻译起始位点和终止密码子。
含有所关注的核酸的载体可通过多种适当方式中的任一种,包括电穿孔、使用氯化钙、氯化铷、磷酸钙、DEAE-葡聚糖或其它物质的转染;微粒轰击;脂质转染;和感染(例如,其中所述载体为传染剂,如牛痘病毒)被引入至宿主细胞中。引入的载体或聚核苷酸的选择将通常取决于宿主细胞的特征。在一些实施方案中,所述载体含有核酸,所述核酸含有一种或多种编码本公开的分拣蛋白的氨基酸序列。
用于抗体编码载体的克隆或表达的合适宿主细胞包括真核细胞。在优选实施方案中,本公开的宿主细胞为哺乳动物细胞,包括而不限于由SV40转化的猴肾CV1系(COS-7);人胚胎肾系(如例如Graham等人,J.Gen Virol.36:59(1977)中所述的293或293细胞);幼仓鼠肾细胞(BHK);小鼠塞尔托利细胞(如例如Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980)中所述的TM4细胞);猴肾细胞(CV1);非洲绿猴肾细胞(VERO-76);人子宫颈癌细胞(HELA);犬肾细胞(MDCK;水牛大鼠肝细胞(BRL 3A);人肺细胞(W138);人肝细胞(Hep G2);小鼠乳房肿瘤(MMT 060562);TRI细胞,如例如Mather等人,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982)中所述;MRC 5细胞;和FS4细胞。其它适用的哺乳动物宿主细胞系包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括DHFR-CHO细胞(Urlaub等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216(1980));和骨髓瘤细胞系,如Y0、NS0和Sp2/0。在一些实施方案中,所述宿主细胞为人细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞为HEK293T细胞。
除了哺乳动物细胞以外,如丝状真菌或酵母的真核微生物也为用于蛋白编码载体的合适克隆或表达宿主,包括糖基化途径已经“人源化”的真菌和酵母菌株,导致产生具有部分或完全人糖基化模式的蛋白(例如,Gerngross,Nat.Biotech.22:1409-1414(2004);和Li等人,Nat.Biotech.24:210-215(2006))。用于糖基化蛋白的表达的合适宿主细胞也可源于多细胞生物体(无脊椎动物和脊椎动物)。无脊椎动物细胞的实例包括植物和昆虫细胞(例如,Sf9或S2细胞)。已经鉴别出多种杆状病毒菌株,其可结合昆虫细胞使用,尤其用于草地贪夜蛾细胞的转染。
在一些实施方案中,本公开的方法包括使在细胞表面上表达分拣蛋白的细胞与试剂(例如,抗分拣蛋白抗体)和分拣蛋白配体在其中分拣蛋白能够结合于分拣蛋白配体的条件下接触。如本文所用,其中分拣蛋白能够结合于分拣蛋白配体的条件可指其中存在分拣蛋白和分拣蛋白配体的环境的参数或方面(例如,温度、pH、溶液等),并且条件可指其中存在分拣蛋白和分拣蛋白配体的环境(例如,多种个别条件的总和)。这些条件将允许如上文所述发生分拣蛋白-分拣蛋白配体相互作用。在优选实施方案中,这些方法还允许在所述分析的时间量程内维持细胞活力。
在一些实施方案中,分拣蛋白配体附接至荧光团。可使用本领域中已知的任何荧光团。在一些实施方案中,荧光团可为荧光蛋白或肽,包括而不限于GFP、RFP、YFP、CFP、其衍生物等。在一些实施方案中,荧光团可为非蛋白有机荧光团,包括而不限于氧杂蒽衍生物(例如,若丹明、荧光素、德克萨斯红等)、方酸衍生物、萘衍生物、菁衍生物(例如,菁、吲哚碳菁、氧杂碳菁等)、香豆素衍生物、芘衍生物、蒽衍生物、噁二唑衍生物、吖啶衍生物、四吡咯衍生物、芳基次甲基衍生物或噁嗪衍生物。在一些实施方案中,荧光团可为量子点。合适的荧光团和其特性(例如,吸收和发射光谱、摩尔消光系数、光漂白特性、亮度、光稳定性,等等)的列表通常通过制造商获得,例如The Molecular
Figure BDA0001494797660001991
Handbook,第11版(LifeTechnologies,Carlsbad,CA)。在一些实施方案中,分拣蛋白配体附接至非荧光检测部分,如发光或生物发光部分(例如荧光素酶,如海肾荧光素酶或其衍生物),并且致生物发光底物(例如荧光素,如腔肠素或腔肠素衍生物,包括而不限于DeepBlueCTM)进一步包括在内。
在一些实施方案中,附接至分拣蛋白配体的荧光团在分拣蛋白配体结合于分拣蛋白时与细胞缔合。举例来说,如果附接至分拣蛋白配体的荧光团可在细胞表面上检测到和/或在细胞内部(例如,在内吞、内体或溶酶体隔室内)检测到,那么其可与细胞缔合。以这种方式,对所发射的与细胞缔合的荧光(例如,在细胞表面上或细胞内部的荧光)的检测允许在表达分拣蛋白的细胞的背景下检测分拣蛋白与分拣蛋白配体之间的相互作用。优选地,荧光团本身和附接至分拣蛋白配体的荧光团不破坏分拣蛋白配体与由细胞表达的分拣蛋白之间的结合。
在一些实施方案中,与细胞缔合的荧光团用足以使荧光团发射荧光的波长的光处理。在一些实施方案中,检测由与细胞缔合的荧光团发射的后续荧光。在一些实施方案中,足以使荧光团发射荧光的波长在所述荧光团的吸收光谱内。在一些实施方案中,用于处理细胞的波长是最大吸收或激发最大值的波长。在一些实施方案中,所检测的波长在所述荧光团的发射光谱内。在一些实施方案中,所检测的波长为发射最大值。作为非限制性实例,附接至本公开的颗粒蛋白前体蛋白的DyLight-650可在652nm下激发,并且所发射的荧光可在672nm下检测到。关于足以使本公开的荧光团发射荧光的光波长和由所述荧光团发射的光波长的信息在本领域中广泛可获得并且典型地由制造商(例如,Life Technologies、Pierce Biotechnology、Thermo Scientific、abcam等)供应。
可使用用于检测在适当波长(例如,上文所述的波长)下发射的荧光的任何合适方法。荧光检测技术可使用板式读取器(例如,来自BMG LABTECH,Ortenberg,Germany的PHERAstar板式读取器)、荧光显微镜、流式细胞仪或本领域中已知用于荧光检测的任何其它设备。
在一些实施方案中,所述荧光团直接地偶合至分拣蛋白配体。在一些实施方案中,所述分拣蛋白配体偶合至生物素,并且所述荧光团偶合至抗生蛋白链菌素,所述抗生蛋白链菌素通过结合于所述生物素而附接至所述分拣蛋白配体。与本领域中已知的荧光供体/受体附接技术相似,所述荧光团可通过直接偶合附接至所述分拣蛋白配体,或其可通过中间物(例如,抗体结合、生物素:抗生蛋白链菌素结合、亲和力标签等)间接地偶合。举例来说并且无限制,如果所述荧光团为荧光蛋白,那么所述分拣蛋白配体可用同框附接(例如,通过肽连接子)所述分拣蛋白配体的编码序列的荧光蛋白的编码序列翻译,以致产生融合蛋白。举例来说并且无限制,如果所述荧光团为非蛋白有机荧光团,那么所述荧光团可以化学方式附接(例如,通过共价键)至所述分拣蛋白配体。用于使荧光团附接至所关注的蛋白(例如,本公开的分拣蛋白配体)的标记试剂盒在市面上可获得并且典型地使用所述蛋白的伯胺与胺反应性荧光团或交联剂之间的化学反应。荧光供体/受体对的成员可附接于N端、C端或沿所述分拣蛋白配体的氨基酸序列的任何合适位置处。典型地,荧光蛋白可附接至所述分拣蛋白配体的N端或C端。
在一些实施方案中,在细胞表面上表达分拣蛋白的细胞与试剂(例如,抗分拣蛋白抗体)和分拣蛋白配体在其中所述分拣蛋白能够结合于所述分拣蛋白配体的条件下接触,所述分拣蛋白配体附接至荧光团,并且所述荧光团在所述分拣蛋白配体结合于所述分拣蛋白时与所述细胞缔合。与细胞缔合的荧光团用足以使所述荧光团发射荧光的波长的光处理;并且如与在所述试剂不存在下由与细胞缔合的荧光团发射的荧光相比,检测由与细胞缔合的荧光团发射的荧光的降低。所发射的荧光的降低指示了所述试剂为分拣蛋白结合拮抗剂。不希望束缚于理论,认为在细胞表面上表达的本公开的分拣蛋白与用本公开的荧光团标记的本公开的分拣蛋白配体之间的相互作用将导致可检测的与细胞缔合的荧光(例如,如果所述分拣蛋白配体由所述细胞内化,那么在细胞表面上和/或在细胞内部)。分拣蛋白结合拮抗剂被认为通过降低这种相互作用来降低由与细胞缔合的荧光团发射的荧光信号。
在一些实施方案中,使用基于细胞的分析,其在无发射的荧光下操作。例如,在一些实施方案中,在细胞表面上表达分拣蛋白的细胞与试剂(例如,抗分拣蛋白抗体)和分拣蛋白配体在其中所述分拣蛋白能够结合于所述分拣蛋白配体的条件下接触;并且如与在所述试剂不存在下所述分拣蛋白配体的水平的降低相比,检测所述分拣蛋白配体的水平的降低的失败。所述分拣蛋白配体的水平的降低的失败指示了所述试剂为分拣蛋白结合拮抗剂。不希望束缚于理论,认为使表达分拣蛋白的细胞与本公开的分拣蛋白配体接触会导致通过结合于分拣蛋白、内吞和溶酶体降解而降低细胞外分拣蛋白配体。认为用某一水平的所述分拣蛋白配体孵育表达分拣蛋白的细胞将导致分拣蛋白配体随时间降低,并且本公开的分拣蛋白结合拮抗剂(例如,抗分拣蛋白抗体)能够降低这种降低(例如,降低的失败)。因此,与对照处理相比,用本公开的分拣蛋白结合拮抗剂处理会导致分拣蛋白配体的降低的失败。
在这些实施方案中,可使用在细胞表面上表达本公开的分拣蛋白的任何细胞。在一些实施方案中,所述细胞在其细胞表面上内源地表达本公开的分拣蛋白。在一些实施方案中,所述细胞经过重组性工程改造以在其细胞表面上表达本公开的分拣蛋白。可使用本公开的任何合适的分拣蛋白配体,以致其保留结合于在细胞表面上表达的分拣蛋白的能力。所述分拣蛋白配体无需荧光标记。分拣蛋白配体的水平可通过本领域中已知的任何分析,包括而不限于ELISA、SPR、Western印迹、质谱法、免疫沉淀、肽微阵列等等进行检测。
在一些实施方案中,在细胞表面上表达本公开的分拣蛋白的细胞在含有某一水平的本公开的分拣蛋白配体的细胞培养基中培养。在一些实施方案中,已知量的分拣蛋白配体添加至所述细胞培养基中。在一些实施方案中,可使用调整细胞培养基(例如,分拣蛋白配体调整的细胞培养基),例如其中本公开的分拣蛋白配体由产生分拣蛋白配体的细胞表达并且分泌至所述细胞培养基中(此时分拣蛋白配体调整的细胞培养基与产生分拣蛋白配体的细胞分离并且随后添加至表达分拣蛋白的细胞中)。
可使用适用于培养在细胞表面上表达本公开的分拣蛋白的细胞的任何合适的细胞培养基。适用于培养多种细胞类型的细胞培养基为本领域中已知的并且在市面上可获得。如Ham氏F10(Sigma)、最低必需培养基((MEM),(Sigma)、RPMI-1640(Sigma)和杜氏改良伊格尔氏培养基((DMEM),Sigma)的市面上可获得的培养基可适用于培养表达本公开的分拣蛋白的细胞。另外,Ham等人,Meth.Enz.58:44(1979);Barnes等人,Anal.Biochem.102:255(1980);美国专利号4,767,704;4,657,866;4,927,762;4,560,655;或5,122,469;WO90/03430;WO 87/00195;或美国专利再审30,985中所述的任何培养基均可用作培养基。这些培养基中的任一者均可在必要时补充盐(如氯化钠、钙、镁和磷酸盐)、缓冲液(如HEPES)、生长因子或激素(如胰岛素、转铁蛋白或表皮生长因子)、核苷酸、抗生素、痕量元素(定义为通常以微摩尔浓度范围内的最终浓度存在的无机化合物)和葡萄糖或相等能源。也可包括在本领域技术人员将已知的适当浓度下的任何其它必要补充物。如温度、pH等培养条件为先前用于针对表达所选择的宿主细胞的那些条件,且将为本领域技术人员显而易知的。
在一些实施方案中,本文所公开的方法涉及在其中表达分拣蛋白和分拣蛋白配体并且所述分拣蛋白配体被释放至培养基中的条件下培养在细胞表面上表达分拣蛋白并且在培养基中表达分拣蛋白配体的细胞;使所述细胞与试剂(例如,抗分拣蛋白抗体)在其中所述分拣蛋白能够结合于所述分拣蛋白配体的条件下接触;和如与所述试剂不存在下培养基中的所述分拣蛋白配体的水平相比,检测培养基中所述分拣蛋白配体的水平的增加。所述分拣蛋白配体的水平的增加指示了所述试剂为分拣蛋白结合拮抗剂。不希望束缚于理论,认为在细胞表面上表达的分拣蛋白与所分泌的分拣蛋白配体之间的相互作用将导致所述分拣蛋白配体的内吞和溶酶体降解。因此,认为降低这种相互作用(例如,通过添加本公开的分拣蛋白结合拮抗剂)会导致培养基中的所述分拣蛋白配体的水平随时间增加。
在这些实施方案中,可使用在细胞表面上表达本公开的分拣蛋白并且分泌本公开的分拣蛋白配体的任何细胞。在一些实施方案中,所述细胞可在其细胞表面上内源地表达本公开的分拣蛋白。在一些实施方案中,所述细胞可内源地表达并且分泌本公开的分拣蛋白配体。在一些实施方案中,所述细胞为U-251细胞,并且所述分拣蛋白配体为颗粒蛋白前体蛋白。在一些实施方案中,所述细胞可经过重组性工程改造以在其细胞表面上表达本公开的分拣蛋白。在一些实施方案中,所述细胞可经过重组性工程改造以表达并且分泌本公开的分拣蛋白配体。
在本文所述的基于细胞的分析中的任一者中,可使用本公开的分拣蛋白配体。在一些实施方案中,所述分拣蛋白配体为颗粒蛋白前体蛋白。所述分拣蛋白配体可为全长蛋白,或其可为其分拣蛋白结合肽片段。
核酸、载体和宿主细胞
本公开的抗分拣蛋白抗体可使用重组方法和组合物产生,例如,如美国专利号4,816,567中所述。在一些实施方案中,提供分离的核酸,其具有编码本公开的抗分拣蛋白抗体中的任一者的核苷酸序列。所述核酸可编码含有抗分拣蛋白抗体的VL的氨基酸序列和/或含有抗分拣蛋白抗体的VH的氨基酸序列(例如,所述抗体的轻链和/或重链)。在一些实施方案中,提供一种或多种含有所述核酸的载体(例如,表达载体)。在一些实施方案中,还提供含有所述核酸的宿主细胞。在一些实施方案中,所述宿主细胞含有(例如,已经用以下各物转导):(1)含有编码含有抗体的VL的氨基酸序列和含有抗体的VH的氨基酸序列的核酸的载体,或(2)含有编码含有抗体的VL的氨基酸序列的核酸的第一载体和含有编码含有抗体的VH的氨基酸序列的核酸的第二载体。在一些实施方案中,所述宿主细胞是真核的,例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或淋巴样细胞(例如Y0、NS0、Sp20细胞)。
提供制备本公开的抗分拣蛋白抗体的方法。在一些实施方案中,所述方法包括在适用于抗体的表达的条件下培养含有编码所述抗分拣蛋白抗体的核酸的本公开的宿主细胞。在一些实施方案中,所述抗体随后从宿主细胞(或宿主细胞培养基)回收。
关于本公开的抗分拣蛋白抗体的重组产生,分离编码抗分拣蛋白抗体的核酸并且将其插入至一种或多种载体中以用于宿主细胞中的进一步克隆和/或表达。所述核酸可容易地使用常规程序分离并且测序(例如,通过使用能够特异性地结合于编码抗体的重链和轻链的基因的寡核苷酸探针)。
本文所述的含有编码本公开的抗分拣蛋白抗体或其片段多肽(包括抗体)中的任一者的核酸序列的合适的载体包括而不限于克隆载体和表达载体。合适的克隆载体可根据标准技术构建,或可选自本领域中可获得的大量克隆载体。虽然所选择的克隆载体可根据意图使用的宿主细胞而改变,但适用的克隆载体一般具有自主复制的能力,可具有针对特定的限制核酸内切酶的单一标靶,和/或可携带针对可用于选择含有所述载体的克隆的标记物的基因。合适的实例包括质粒和细菌病毒,例如pUC18、pUC19、Bluescript(例如,pBSSK+)和其衍生物、mp18、mp19、pBR322、pMB9、ColE1、pCR1、RP4、噬菌体DNA,和穿梭载体(如pSA3和pAT28)。这些和多种其它克隆载体可获自商业供应商,如BioRad、Strategene和Invitrogen。
表达载体一般为含有本公开的核酸的可复制聚核苷酸构建体。所述表达载体可在宿主细胞中复制,呈游离体形式或作为染色体DNA的主要部分。合适的表达载体包括但不限于质粒、病毒载体(包括腺病毒、腺相关病毒、反转录病毒)、柯斯质粒和在PCT公布号WO87/04462中公开的表达载体。载体组分可一般地包括但不限于以下一者或多者:信号序列;复制起点;一种或多种标记物基因;合适的转录控制元件(如启动子、增强子和终止子)。关于表达(即,翻译),也通常需要一种或多种翻译控制元件,如核糖体结合位点、翻译起始位点和终止密码子。
含有所关注的核酸的载体可通过多种适当方式中的任一种,包括电穿孔、使用氯化钙、氯化铷、磷酸钙、DEAE-葡聚糖或其它物质的转染;微粒轰击;脂质转染;和感染(例如,其中所述载体为传染剂,如牛痘病毒)被引入至宿主细胞中。引入的载体或聚核苷酸的选择将通常取决于宿主细胞的特征。在一些实施方案中,所述载体含有核酸,所述核酸含有一种或多种编码本公开的抗分拣蛋白抗体的氨基酸序列。
用于抗体编码载体的克隆或表达的合适宿主细胞包括原核细胞或真核细胞。例如,本公开的抗分拣蛋白抗体可在细菌中产生,尤其当不需要糖基化和Fc效应子功能时。关于细菌中抗体片段和多肽的表达(例如,美国专利号5,648,237、5,789,199和5,840,523;和Charlton,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ,2003),第245-254页,描述了大肠杆菌中抗体片段的表达)。在表达后,所述抗体可从细菌细胞浆中的可溶性部分中分离并且可进一步纯化。
除了原核生物以外,如丝状真菌或酵母的真核微生物也为用于抗体编码载体的合适克隆或表达宿主,包括糖基化途径已经“人源化”的真菌和酵母菌株,导致产生具有部分或完全人糖基化模式的抗体(例如,Gerngross,Nat.Biotech.22:1409-1414(2004);和Li等人,Nat.Biotech.24:210-215(2006))。
用于糖基化抗体的表达的合适宿主细胞也可源于多细胞生物体(无脊椎动物和脊椎动物)。无脊椎动物细胞的实例包括植物和昆虫细胞。已经鉴别出多种杆状病毒菌株,其可结合昆虫细胞使用,尤其用于草地贪夜蛾细胞的转染。植物细胞培养物也可用作宿主(例如,美国专利号5,959,177、6,040,498、6,420,548、7,125,978和6,417,429,描述用于在转基因植物中产生抗体的PLANTIBODIESTM技术)。
脊椎动物细胞也可用作宿主。例如,经过调适以在悬浮液中生长的哺乳动物细胞系可适用。适用的哺乳动物宿主细胞系的其它实例为由SV40转化的猴肾CV1系(COS-7);人胚胎肾系(如例如Graham等人,J.Gen Virol.36:59(1977)中所述的293或293细胞);幼仓鼠肾细胞(BHK);小鼠塞尔托利细胞(如例如Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980)中所述的TM4细胞);猴肾细胞(CV1);非洲绿猴肾细胞(VERO-76);人子宫颈癌细胞(HELA);犬肾细胞(MDCK;水牛大鼠肝细胞(BRL 3A);人肺细胞(W138);人肝细胞(HepG2);小鼠乳房肿瘤(MMT 060562);TRI细胞,如例如Mather等人,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982)中所述;MRC 5细胞;和FS4细胞。其它适用的哺乳动物宿主细胞系包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括DHFR-CHO细胞(Urlaub等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216(1980));和骨髓瘤细胞系,如Y0、NS0和Sp2/0。关于适用于抗体产生的某些哺乳动物宿主细胞系的回顾,参见例如Yazaki和Wu,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ),第255-268页(2003)。
药物组合物
本公开的抗分拣蛋白抗体可通过使所述抗体与适当的药学上可接受的载体或稀释剂组合而并入多种用于治疗性施用的制剂中,并且可配制成呈固体、半固体、液体或气体形式的制剂。所述制剂的实例包括而不限于片剂、胶囊、粉剂、颗粒、软膏、溶液、栓剂、注射剂、吸入剂、凝胶、微球和气雾剂。视所需要的制剂而定,药物组合物可包括药学上可接受的无毒载体或稀释剂,其为通常用于配制用于动物或人施用的药物组合物的媒剂。选择所述稀释剂以便不影响组合的生物活性。所述稀释剂的实例包括而不限于蒸馏水、缓冲水、生理食盐水、PBS、林格氏溶液、右旋糖溶液和汉克斯溶液。本公开的药物组合物或制剂可进一步包括其它载体、佐剂或无毒、非治疗性、非免疫原性稳定剂、赋形剂等。所述组合物也可包括额外物质以接近生理学条件,如pH调节和缓冲剂、毒性调节剂、湿润剂和清洁剂。
本公开的药物组合物也可包括多种稳定剂中的任一种,例如抗氧化剂。当所述药物组合物包括多肽时,所述多肽可与多种众所周知的化合物复合,所述化合物增强所述多肽的体内稳定性,或以其它方式增强其药理学特性(例如,增加所述多肽的半衰期,降低其毒性,并且增强溶解性或摄取)。所述修饰或复合剂的实例包括而不限于硫酸盐、葡糖酸盐、柠檬酸盐和磷酸盐。组合物的多肽也可与增强其体内属性的分子复合。所述分子包括而不限于碳水化合物、多胺、氨基酸、其它肽、离子(例如,钠、钾、钙、镁、锰)和脂质。
适用于多种类型的施用的制剂的其它实例可发现于Remington’sPharmaceutical Sciences,Mace Publishing Company,Philadelphia,PA,第17版(1985)中。关于用于药物递送的方法的简要回顾,参见Langer,Science 249:1527-1533(1990)。
关于口服施用,活性成分可以固体剂型(如胶囊、片剂和粉剂),或以液体剂型(如酏剂、糖浆和悬浮液)施用。活性组分可与无活性成分和粉末状载体,如葡萄糖、乳糖、蔗糖、甘露醇、淀粉、纤维素或纤维素衍生物、硬脂酸镁、硬脂酸、糖精钠、滑石、碳酸镁一起封装于明胶胶囊中。可添加以提供所需的颜色、味道、稳定性、缓冲能力、分散或其它已知的所需特征的额外无活性成分的实例为红色氧化铁、硅胶、月桂基硫酸钠、二氧化钛和可食用白墨。相似的稀释剂可用于制造压缩片剂。片剂和胶囊均可制造为持续释放产品以在数小时的时期内提供药物的连续释放。压缩片剂可包覆糖衣或包覆膜衣以遮蔽任何不受欢迎的味道并且保护所述片剂不受大气影响,或包覆肠溶包衣以在胃肠道中选择性崩解。用于口服施用的液体剂型可含有色素和调味剂以增加患者接受度。
适用于肠胃外施用的制剂包括水性和非水性、等张无菌注射溶液,其可含有抗氧化剂、缓冲液、抑菌剂和使所述制剂与预期的接受者的血液等张的溶质;和水性和非水性无菌悬浮液,其可包括悬浮剂、增溶剂、增稠剂、稳定剂和防腐剂。
用于配制所述药物组合物的组分优选地具有高纯度并且大体上不含潜在有害的污染物(例如至少国家食品(NF)级,一般地至少分析级,并且更典型地至少医药级)。此外,预期用于体内用途的组合物通常为无菌的。就给定的化合物必须在使用之前合成来说,所得产物典型地大体上不含任何潜在毒性剂,尤其任何内毒素,其可在合成或纯化过程期间存在。用于肠胃外施用的组合物也为无菌的、大体上等张并且在GMP条件下制得。
制剂可针对脑或中枢神经系统中的保持和稳定化进行优化。当所述试剂施用于颅骨隔室中时,可需要所述试剂保持于所述隔室中,并且不扩散或以其它方式跨血脑屏障。稳定化技术包括交联、多聚化或连接至如聚乙二醇、聚丙烯酰胺、中性蛋白载体等基团以便实现分子量的增加。
用于增加保持的其它策略包括将如本公开的抗分拣蛋白抗体的抗体截留于生物可降解或生物可侵蚀的植入物中。治疗活性剂的释放速率由通过聚合物基质的运输速率和植入物的生物降解控制。药物通过聚合物屏障的运输也将受化合物溶解度、聚合物亲水性、聚合物交联的程度、在水吸收时聚合物的膨胀以便使聚合物屏障对所述药物更具渗透性、植入物的几何形状等影响。所述植入物具有与选择作为植入位点的区域的大小和形状相称的尺寸。植入物可为粒子、薄片、贴片、斑块、纤维、微胶囊等并且可具有与所选择的插入位点一致的任何大小或形状。
所述植入物可为单块的,即具有均匀地分布于聚合物基质中的活性剂,或经过封装,其中活性剂的贮器由聚合物基质封装。欲使用的聚合物组合物的选择将随施用位点、所需治疗时期、患者耐受性、欲治疗的疾病的性质等改变。所述聚合物的特征将包括在植入位点处的生物可降解性、与所关注的试剂的相容性、封装简易性、在生理学环境中的半衰期。
可使用的生物可降解的聚合物组合物可为有机酯或醚,其在降解时产生生理学上可接受的降解产物,包括单体。可使用单独或与其它单体组合的酐、酰胺、原酸酯等。所述聚合物将为缩聚物。所述聚合物可为交联或未交联的。尤其关注羟基脂肪族羧酸的聚合物(均聚物或共聚物),和多糖。在所关注的聚酯中包括D-乳酸、L-乳酸、外消旋乳酸、乙醇酸、聚己内酯和其组合的聚合物。通过使用L-乳酸盐或D-乳酸盐,获得正在缓慢降解的聚合物,而降解大体上由外消旋盐增强。乙醇酸和乳酸的共聚物尤其受到关注,其中降解速率由乙醇酸与乳酸的比率控制。最快降解的共聚物具有大致等量的乙醇酸和乳酸,其中任一均聚物均更加抵抗降解。乙醇酸与乳酸的比率还将影响植入物的脆性,其中较大的几何形状可需要更具柔性的植入物。在所关注的多糖中为海藻酸钙和功能化纤维素,尤其羧基甲基纤维素酯,其特征在于水不溶性、约5kD至500kD的分子量等。生物可降解的水凝胶也可用于本公开的植入物中。水凝胶典型地为共聚物材料,其特征在于吸收液体的能力。可使用的示例性生物可降解的水凝胶描述于Heller:Hydrogels in Medicine and Pharmacy,N.A.Peppes编,第III卷,CRC Press,Boca Raton,Fla.,1987,第137-149页中。
药物剂量
含有本公开的抗分拣蛋白抗体的本公开的药物组合物可根据已知方法,如以大丸药形式静脉内施用或通过在一段时期内连续输注、通过肌肉内、腹膜内、脑脊髓内、颅内、脊柱内、皮下、关节内、滑膜内、鞘内、口服、表面或吸入途径施用于需要用所述抗分拣蛋白抗体治疗的个体(优选地,人)。
本公开的药物组合物的剂量和所需药物浓度可视预想的特定用途而改变。适当剂量或施用途径的确定充分地在一般技术人员的技能内。动物实验提供了用于确定人疗法的有效剂量的可靠指导。有效剂量的种间类推可根据描述于Mordenti,J.和Chappell,W.“TheUse of Interspecies Scaling in Toxicokinetics,”Toxicokinetics and New DrugDevelopment,Yacobi等人编,Pergamon Press,New York 1989,第42-46页中的原则执行。
关于本公开的抗分拣蛋白抗体中的任一者的体内施用,正常剂量可从每天约10ng/kg直至约100mg/kg个体的体重或更高,优选地约1mg/kg/天至10mg/kg/天改变,视施用途径而定。关于在数天或更长时间内的重复施用,视欲治疗的疾病、病症或病况的严重程度而定,所述治疗持续直至实现症状的所需抑制。
示例性给药方案可包括施用约2mg/kg的抗分拣蛋白抗体的初始剂量,随后每隔一周施用约1mg/kg的每周维持剂量。其它给药方案可为适用的,视医师希望实现的药物动力学衰减的模式而定。例如,本文中涵盖一周一次至二十一次对个体给药。在某些实施方案中,可使用介于约3μg/kg至约2mg/kg范围内的给药(如约3μg/kg,、约10μg/kg、约30μg/kg、约100μg/kg、约300μg/kg、约1mg/kg和约2/mg/kg)。在某些实施方案中,给药频率为每天三次、每天两次、每天一次、每隔一天一次、一周一次、每两周一次、每四周一次、每五周一次、每六周一次、每七周一次、每八周一次、每九周一次、每十周一次或每个月一次、每两个月一次、每三个月一次或更长时间。所述疗法的进展容易地通过常规技术和分析监测。给药方案(包括所施用的抗分拣蛋白抗体)可与所用的剂量无关随时间改变。
特定抗分拣蛋白抗体的剂量可在已经给予所述抗分拣蛋白抗体的一次或多次施用的个体中凭经验确定。个体被给予增加剂量的抗分拣蛋白抗体。为了分析抗分拣蛋白抗体的功效,可监测本公开的疾病、病症或病况的临床症状(例如,额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病和正常老化的不需要的症状)。
本公开的抗分拣蛋白抗体的施用可为连续或间歇的,例如视接受者的生理条件、施用目的是治疗性的或预防性的和熟练从业人员已知的其它因素而定。抗分拣蛋白抗体的施用可在预先选择的一段时间内基本上为连续的或可呈一系列间隔剂量。
关于特定剂量和递送方法的指导在文献中提供;参见例如美国专利号4,657,760;5,206,344;或5,225,212。在本公开的范围内,不同制剂将有效用于不同治疗和不同病症,并且意图治疗具体器官或组织的施用可使得需要以不同于另一器官或组织的递送方式的方式递送。此外,剂量可通过一次或多次独立施用,或通过连续输注来施用。关于在数天或更长时间内的重复施用,视病况而定,治疗持续直至出现疾病症状的所需抑制。然而,其它给药方案也可适用。这种疗法的进展容易地通过常规技术和分析监测。
治疗性用途
本公开的其它方面提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的一种或多种本公开的抗分拣蛋白抗体来增加所述个体中(如在所述个体的脑、血液和/或外周器官中)的颗粒蛋白前体水平的方法。本公开的其它方面提供通过使一种或多种细胞与一种或多种本公开的抗分拣蛋白抗体接触来增加颗粒蛋白前体的细胞外水平的方法。在一些实施方案中,颗粒蛋白前体的水平增加而不降低分拣蛋白的细胞水平。本公开的其它方面提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的一种或多种本公开的抗分拣蛋白抗体来降低所述个体中(如在所述个体的脑和/或外周器官中)的分拣蛋白的细胞水平的方法。本公开的其它方面提供降低一种或多种细胞的分拣蛋白的细胞水平的方法,所述方法包括使一种或多种细胞与一种或多种本公开的抗分拣蛋白抗体接触。
本公开的其它方面提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗分拣蛋白抗体以抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9、和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用来增加所述个体中的颗粒蛋白前体的有效浓度和/或降低本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前神经营养蛋白、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和/或受体相关蛋白(RAP)的有效浓度的方法。
本公开还提供了通过向个体施用治疗有效量的本公开的抗分拣蛋白抗体来抑制所述个体中分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)、PCSK9和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;以及分拣蛋白、颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)和/或受体相关蛋白(RAP)的一种或多种活性的方法。
如本文所公开,本公开的抗分拣蛋白抗体也可用于预防、降低风险或治疗额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和正常老化的一种或多种不需要的症状。
在一些实施方案中,本公开提供了在有需要的个体中通过向所述个体施用治疗有效量的本公开的抗分拣蛋白抗体以:(i)抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;和/或(ii)抑制分拣蛋白、颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)和/或受体相关蛋白(RAP)的一种或多种活性,而预防、降低风险或治疗具有额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、变性椎间盘疾病、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、发炎病症、关节炎、多发性硬化、代谢病症、肥胖、胰岛素抗性、2型糖尿病、组织或血管损坏、损伤和正常老化的一种或多种不需要的症状的个体的方法。在一些实施方案中,本公开提供通过向有需要的个体施用治疗有效量的本公开的抗分拣蛋白抗体来诱导所述个体中的伤口愈合的方法。
本公开还提供了通过施用本公开的抗分拣蛋白抗体以抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、淀粉样前体蛋白(APP)和Aβ肽之间的相互作用,而促进细胞存活(如神经元细胞存活)的方法。所述抗分拣蛋白抗体可体外施用于细胞以促进细胞存活。或者,所述抗分拣蛋白抗体可体内施用(例如,通过将所述抗体施用于个体)以促进细胞存活。
本公开还提供了通过施用本公开的抗分拣蛋白抗体以抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、淀粉样前体蛋白(APP)和Aβ肽之间的相互作用,而抑制神经发炎、特征为短轴突生长和异常分支的轴突病、小胶质细胞活化和发炎反应并且促进伤口愈合、自体吞噬和聚集蛋白的清除的方法。所述抗分拣蛋白抗体可体外施用于细胞。或者,所述抗分拣蛋白抗体可体内施用(例如,通过将所述抗体施用于个体)。
本公开还提供了通过向有需要的个体施用本公开的抗分拣蛋白抗体来降低一种或多种促发炎介体的表达的方法。在一些实施方案中,所述一种或多种促发炎介体是选自IL-6、IL12p70、IL12p40、IL-1β、TNF-α、CXCL1、CCL2、CCL3、CCL4和CCL5。
痴呆
痴呆是非特异性综合征(即,病征和症状的集合),其在先前未受损害的人中提供全部认知能力的严重损失,超出从正常老化可能预期的情况。痴呆可由于独特的全脑损伤而为静态的。或者,痴呆可为进行性的,由于体内的损害或疾病而导致长期衰退。虽然痴呆在老年群体中常见得多,但其也可在65岁之前发生。受痴呆影响的认知领域包括而不限于记忆、注意广度、语言和问题解决。一般说来,症状在个体被诊断患有痴呆之前至少六个月必须存在。
痴呆的示例性形式包括而不限于额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、词义性痴呆和路易体痴呆。
不希望受理论束缚,相信施用本公开的抗分拣蛋白抗体可预防、降低风险和/或治疗痴呆。在一些实施方案中,施用抗分拣蛋白抗体可在具有痴呆的个体中诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性(例如,神经元上的神经营养和/或存活活性,和消炎活性)。
额颞叶痴呆
额颞叶痴呆(FTD)是由脑额叶的进行性退化引起的病况。所述变性可随时间进展至颞叶。患病率仅次于阿尔兹海默氏病(AD),FTD占早老性痴呆病例的20%。FTD的临床特征包括记忆缺失、行为异常、人格改变和语言受损(Cruts,M.和Van Broeckhoven,C.,TrendsGenet.24:186-194(2008);Neary,D.等人,Neurology 51:1546-1554(1998);Ratnavalli,E.,Brayne,C.,Dawson,K.和Hodges,J.R.,Neurology 58:1615-1621(2002))。
大部分的FTD病例以常染色体显性方式遗传,但即使在一个家庭中,症状也可跨从具有行为紊乱的FTD、至原发性进行性失语、至皮质基底节变性的范围。如大多数的神经变性疾病,FTD的特征可在于患病的脑中特异性蛋白聚集物的病理性存在。从历史观点上说,最初的FTD描述识别了神经纤维缠结或皮克小体中存在超磷酸化Tau蛋白的神经元内积聚。微管相关蛋白Tau的因果作用通过在数种家族中鉴别出编码Tau蛋白的基因的突变而得到支持(Hutton,M.等人,Nature 393:702-705(1998)。然而,FTD脑的主要部分不显示超磷酸化Tau的积聚,但展现对泛素(Ub)和TAR DNA结合蛋白(TDP43)的免疫反应性(Neumann,M.等人,Arch.Neurol.64:1388-1394(2007))。那些具有Ub包涵的FTD病例(FTD-U)中的大多数显示出携带颗粒蛋白前体基因的突变。
颗粒蛋白前体突变导致单倍型不足并且已知存在于家族性FTD病例中的几乎50%中,使颗粒蛋白前体突变成为FTD的主要遗传促成因素。不希望受理论束缚,相信颗粒蛋白前体突变的功能缺失型杂合特征指示了在健康个体中,颗粒蛋白前体表达发挥了保护健康个体免于发展FTD的剂量依赖性、关键作用。
因此,通过抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用增加颗粒蛋白前体的水平可预防、降低风险和/或治疗FTD。
阿尔兹海默氏病
阿尔兹海默氏病(AD)是痴呆的最常见形式。所述疾病无法治愈,当其进展时会恶化,并且最终导致死亡。最通常地,AD在超过65岁的人中被诊断出。然而,不太普遍的早发性阿尔兹海默氏病的发生可早得多。
阿尔兹海默氏病的常见症状包括行为症状,如难以记起最近的事件;认知症状、混淆、易怒和侵略性、情绪波动、语言障碍和长期记忆丧失。当所述疾病进展时,身体功能丧失,最终导致死亡。阿尔兹海默氏病在变得完全显现之前发展持续未知并且可变的时间量,并且其可未确诊地进展数年。
已经显示出分拣蛋白结合于淀粉样前体蛋白(APP)和APP加工酶BACE1。不希望受理论束缚,相信这些相互作用牵涉于阿尔兹海默氏病中。相应地,并且不希望受理论束缚,相信本公开的抗分拣蛋白抗体可用于抑制所述相互作用并且预防、降低风险或治疗有需要的个体中的阿尔兹海默氏病。
最近研究也已经显示出前神经营养蛋白(例如,前NGF、前BDNF等)的水平在阿尔兹海默氏病的早期阶段中增加(例如,Fahnestock,M等人,(2001)Cell Neurosci.18,210-220;Michalski,B等人,(2003)Brain Res.Mol.Brain Res.111,148-154;Pedraza,CE等人,(2005)Am.J.Pathol.166,533-543;和Peng,S等人,(2005)J.Neurochem.93,1412-1421)。此外,前神经营养蛋白在阿尔兹海默氏病患者的海马和内嗅皮质中经历糖化和脂肪氧化(Counts,SE等人,(2004)Ann.Neurol.56,520-531;和Counts,SE等人,(2005)J.Neuropathol.Exp.Neurol.64,263-272)。这使得前神经营养蛋白不太容易加工成成熟神经营养蛋白。此外,在阿尔兹海默氏病患者中,TrkA表达降低,而p75和分拣蛋白的表达未改变。相应地,并且不希望受理论束缚,相信抑制分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、p75、淀粉样前体蛋白(APP)和/或Aβ肽之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防、降低风险或治疗有需要的个体中的阿尔兹海默氏病。
血管性痴呆
血管性痴呆(VaD)是记忆和其它认知功能的敏锐进行性恶化,相信它是归因于脑血管疾病(脑内的血管疾病)。脑血管疾病是在我们的脑(大脑)中的血管(脉管系统)中的进行性改变。与年龄相关的最常见血管改变是血管壁中积聚胆固醇和其它物质。这导致所述壁的增厚和硬化,以及血管狭窄,这可导致由受影响的动脉供应的血液流动至脑区的降低或甚至完全停止。血管性痴呆患者通常提供与阿尔兹海默氏病(AD)患者相似的症状。然而,脑中的相关改变并非归因于AD病理学,而是归因于脑中长期降低的血流,最终导致迟到。VaD被视为老年人中最常见的痴呆类型之一。VaD的症状包括难以记忆、难以组织并且解决复杂问题、减慢的思考、精力不集中或“失神”、难以从记忆提取词汇、情绪或行为改变(如抑郁、易怒或冷漠)和幻觉或错觉。
不希望受理论束缚,相信分拣蛋白的一种或多种活性或分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、脂蛋白脂肪酶、阿朴脂蛋白AV和/或受体相关蛋白之间的一种或多种相互作用牵涉于血管性痴呆中。相应地,并且不希望受理论束缚,相信抑制分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、分拣蛋白前肽(Sort-pro)、淀粉样前体蛋白(APP)、Aβ肽、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防、降低风险或治疗有需要的个体中的血管性痴呆。
癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤和长期抑郁
如本文所用,视网膜营养不良是指涉及视网膜变性的任何疾病或病况。所述疾病或病况可导致视力丧失或完全失明。
如本文所用,癫痫发作还包括癫痫性发作,并且是指脑中异常过多或同步神经元活动的短暂症状。所述向外效应可如野蛮鞭打动作般剧烈或如意识短暂丧失般温和。癫痫发作可表现为精神状态的改变、紧张性或阵挛性动作、抽搐和多种其它精神症状。
创伤性脑损伤(TBI)也可被称作颅内损伤。当外力创伤性地损伤脑时,创伤性脑损伤发生。创伤性脑损伤可基于严重程度、机制(闭合或穿透性头部损伤)或其它特征(例如,在具体位置中或在广泛区域上发生)分类。
脊髓损伤(SCI)包括对脊髓的任何损伤,其由创伤而非疾病引起。视何处脊髓和神经根受损害而定,症状可广泛地改变,从疼痛至瘫痪至失禁。脊髓损伤在“不完全”的多种水平下被描述,其可从对患者无影响改变至“完全”损伤,“完全”损伤意指全部功能丧失。
长期抑郁(LTD)是在长期模式化刺激之后持续数小时或更长时间的神经元突触的功效的活性依赖性降低。长期抑郁可在中枢神经系统的多个区域中发生,视脑区和发展进展而具有可变机制。长期抑郁可在海马、小脑中,并且在释放多种神经传递质的不同类型的神经元中发生。不希望受理论束缚,相信长期抑郁可与神经变性、痴呆和阿尔兹海默氏病有关。
已经显示出,前神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白-4/5、神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF等)在癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤和长期抑郁中发挥作用(例如,Beattie,MS等人,(2002)Neuron 36,375–386;Volosin,M等人(2006)J.Neurosci.26,7756-7766;Nykjaer,A等人,(2005)Curr.Opin.Neurobiol.15,49–57;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,1449-1457;Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870–9879;Fahnestock,M等人,(2001)Mol.Cell Neurosci.18,210-220;Nakamura,K等人,(2007)Cell Death.Differ.14,1552-1554;Yune,T等人(2007)J.Neurosci.27,7751-7761;Arnett,MG等人,(2007)Brain Res.1183,32-42;Wei,Y等人,(2007)Neurosci.Lett.429,169-174;Provenzano,MJ等人,(2008)Laryngoscope 118,87-93;和Pang,PT等人,(2004)Science 306,487-491)。
相应地,并且不希望受理论束缚,相信抑制分拣蛋白与本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防、降低风险或治疗有需要的个体中的癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤和/或长期抑郁。
动脉粥样硬化性血管疾病
如本文所用,“动脉粥样硬化性血管疾病”、“ASVD”和“动脉粥样硬化”可互换使用并且是指其中动脉壁由于如胆固醇、脂质和三酸甘油酯的脂肪材料的积聚而增厚的任何病况。“动脉粥样硬化性血管疾病”包括而不限于任何ASVD相关病况、病症或疾病,包括而不限于血栓栓塞、中风、缺血、梗塞形成、冠状动脉血栓症、心肌梗死(例如,心脏病发作)和跛行。
动脉粥样硬化性血管疾病是影响动脉血管的综合征,是动脉壁中的长期发炎反应,主要由巨噬细胞白血球的积聚引起并且由低密度脂蛋白(LDL)促进,而未由功能性高密度脂蛋白(HDL)从所述巨噬细胞适当去除脂肪和胆固醇。动脉粥样硬化性血管疾病通常被称作动脉的硬化或堵塞,并且通过在动脉内形成多个斑块而引起。
如本文所公开,本公开的分拣蛋白通过结合脂质相关蛋白,如受体相关蛋白、脂蛋白脂肪酶和阿朴脂蛋白APOA5和APOE而牵涉于脂质调节中(例如,Nisson,SK等人,(2007)Biochemistry 46:3896-3904;Nisson,SK等人,(2008)J Biol Chem 283:25920-25927;和Klinger,SC等人,J Cell Sci 124:1095-1105)。也已经显示出,分拣蛋白缺乏小鼠在主动脉中具有降低的斑块负载,并且在LDL受体缺乏的背景下具有血浆中降低的胆固醇水平(例如,Kjolby,M等人,Cell Metab 12:213-223)。与分拣蛋白受体在脂质代谢中的相似作用一致,SorLA已经显示出对脂质代谢具有与分拣蛋白相似的效应,因为SorLA的损失具有保护性(例如,Guo,Z等人,MediatorsInflamm 2012:540794)。SorLA在兔和小鼠中的粥样斑块中有所上调,并且基因剔除小鼠得到保护免于血管套损伤(例如,Guo,Z等人,MediatorsInflamm 2012:540794)。
相应地,并且不希望受理论束缚,相信抑制分拣蛋白与脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)、阿朴脂蛋白E(APOE)和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防、降低风险或治疗有需要的个体中的一种或多种动脉粥样硬化性血管疾病。
老化的不需要的症状
如本文所用,老化的不需要的症状包括而不限于记忆丧失、行为改变、痴呆、阿尔兹海默氏病、视网膜变性、动脉粥样硬化性血管疾病、听力损失和细胞分解。
已经显示出,前神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF等)在老化和老化相关症状中发挥作用(例如,Beattie,MS等人,(2002)Neuron36,375–386;Volosin,M等人(2006)J.Neurosci.26,7756-7766;Nykjaer,A等人,(2005)Curr.Opin.Neurobiol.15,49–57;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,1449-1457;Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870–9879;Fahnestock,M等人,(2001)Mol.CellNeurosci.18,210-220;Nakamura,K等人,(2007)CellDeath.Differ.14,1552-1554;Yune,T等人,(2007)J.Neurosci.27,7751-7761;Arnett,MG等人,(2007)Brain Res.1183,32-42;Wei,Y等人,(2007)Neurosci.Lett.429,169-174;Provenzano,MJ等人,(2008)Laryngoscope 118,87-93;Pang,PT等人,(2004)Science 306,487-491;和Al-Shawi,R等人,Ann N Y Acad Sci.2007;1119:208-15)。
在一些实施方案中,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防、降低风险或治疗老化的一种或多种不需要的症状。
肌萎缩性侧索硬化(ALS)
如本文所用,肌萎缩性侧索硬化(ALS)或运动神经元疾病或Lou Gehrig氏病可互换使用并且是指具有改变的病因学的使人衰弱的疾病,其特征在于快速进行性虚弱、肌肉萎缩和自发性收缩、肌痉挛、难以讲话(发音困难)、难以吞咽(吞咽困难)和难以呼吸(呼吸困难)。
已经显示出颗粒蛋白前体在ALS中发挥作用(Schymick,JC等人,(2007)J NeurolNeurosurg Psychiatry.;78:754-6)并且保护以免受由ALS致病蛋白,如TDP-43引起的损害(Laird,AS等人,(2010).PLoS ONE 5:e13368)。也证明了,前NGF诱导在脊髓损伤后p75介导的少突细胞和皮质脊髓神经元的死亡(Beatty等人,Neuron(2002),36,第375-386页;Giehl等人,Proc.Natl.Acad.Sci USA(2004),101,第6226-30页)。
在一些实施方案中,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防或治疗ALS的一种或多种不需要的症状。
抑郁
如本文所用,抑郁或重度抑郁症(MDD)、临床抑郁、重度抑郁、单相抑郁、单相病症、复发性抑郁或精神抑郁可互换使用并且是指精神病症,其特征在于伴有自尊心低下和对正常愉悦性活动丧失兴趣或愉悦的包罗万象的低落情绪的发作。这种症状丛集(综合征)在美国精神病协会的诊断手册的1980年版本中被命名、描述并且分类为情绪病症之一。术语“抑郁”是不明确的。其通常用于表示这种综合征,但也可指其它情绪病症或缺乏临床显著性的较低落情绪状态。重度抑郁症是不利地影响一个人的家庭、工作或学校生活、睡眠和饮食习惯和一般健康状况的失能病况。在没做,约有3.4%的具有重度抑郁的人自杀,并且高达60%的自杀的人具有抑郁或另一情绪病症。
神经营养蛋白已经显示出牵涉于抑郁和抗抑郁作用中(Duman等人,Arch GenPsychiatry(1997)54:597-606);例如,BDNF输注至海马中已经在抑郁的两种行为模型中产生抗抑郁效应(Shirayama等人,(2002),J Neurosci 22:3251-3261)。此外,发现bdnf基因中导致前域的密码子66处的缬氨酸(Val)至甲硫氨酸(Met)取代的单核苷酸多态性(BDNFMet)与对所述多态性具杂合性的人中对包括阿尔兹海默氏病、帕金森氏病、抑郁和双相病症的神经精神病症的增加的易感性有关(Chen等人,J.Neuroscience(2005),25:6156-6166;Kuipers和Bramham,Curr.Opin.Drug Discov.Devel.(2006)9(5):580-6;和Bath和Lee,Cogn.Affect.Behav.Neurosci(2006)1:79-85)。另外,对BDNFMet具杂合性的人显示出具有记忆障碍(Egan等人,Cell(2003).112,第257-269页)。
在一些实施方案中,抑制分拣蛋白与颗粒蛋白前体、本公开的神经营养蛋白(例如,前神经营养蛋白、前神经营养蛋白-3、前神经营养蛋白-4/5、前NGF、前BDNF、神经营养蛋白-3、神经营养蛋白-4/5、NGF、BDNF等)、神经紧张素、p75、脂蛋白脂肪酶(LpL)、阿朴脂蛋白AV(APOA5)和/或受体相关蛋白(RAP)之间的相互作用;或抑制分拣蛋白的一种或多种活性的本公开的抗分拣蛋白抗体可用于预防或治疗抑郁的一种或多种不需要的症状。
帕金森氏病
帕金森氏病可被称作特发性或原发性帕金森综合症、运动功能减退的强直综合征(HRS)或震颤麻木,是影响运动系统控制的神经变性脑病症。脑中产生多巴胺的细胞的进行性死亡导致帕金森氏病的主要症状。最通常地,帕金森氏病在超过50岁的人中被诊断出。帕金森氏病在大多数人中是特发性的(具有未知原因)。然而,遗传因素也在所述疾病中发挥作用。
帕金森氏病的症状包括而不限于手、臂、腿、下巴和脸的震颤、肢和躯干中的肌肉强直性、运动缓慢(运动迟缓)、姿势不稳定、难以走路、神经精神问题、讲话或行为改变、抑郁、焦虑、疼痛、精神病、痴呆、幻觉和睡眠问题。
不希望受理论束缚,相信施用本公开的抗分拣蛋白抗体可预防、降低风险和/或治疗帕金森氏病。在一些实施方案中,施用抗分拣蛋白抗体可在具有帕金森氏病的个体中诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性。
亨廷顿氏病
亨廷顿氏病(HD)是由亨廷顿基因(HTT)的常染色体显性突变引起的遗传性神经变性疾病。亨廷顿基因内细胞因子-腺嘌呤-鸟嘌呤(CAG)三联体重复序列的扩展导致产生由所述基因编码的亨廷顿蛋白(Htt)的突变形式。这种突变型亨廷顿蛋白(mHtt)是毒性的并且促进神经元死亡。亨廷顿氏病的症状最通常地出现在35岁与44岁之间,不过其可在任何年龄出现。
亨廷顿氏病的症状包括而不限于运动控制问题、痉挛性、随意动作(舞蹈病)、异常眼运动、平衡受损、癫痫发作、难以咀嚼、难以吞咽、认知问题、改变的讲话、记忆缺失、思考困难、失眠、疲劳、痴呆、人格改变、抑郁、焦虑和强迫行为。
不希望受理论束缚,相信施用本公开的抗分拣蛋白抗体可预防、降低风险和/或治疗亨廷顿氏病(HD)。在一些实施方案中,施用抗分拣蛋白抗体可在具有HD的个体中诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性
τ病变疾病
τ病变疾病或τ病变是由脑内微管相关蛋白tau的聚集引起的一类神经变性疾病。阿尔兹海默氏病(AD)是最众所周知的τ病变疾病,并且涉及神经元内呈不溶性神经纤维缠结(NFT)形式的tau蛋白积聚。其它τ病变疾病和病症包括进行性核上性麻痹、拳击员痴呆(慢性创伤性脑病)、与染色体17有关的额颞叶痴呆和帕金森综合征、Lytico-Bodig病(关岛帕金森-痴呆复合体)、纠结主导型痴呆、神经节神经胶质瘤和神经节细胞瘤、脑膜血管瘤病、亚急性硬化性全脑炎、铅中毒脑病、结节性脑硬化、哈勒沃登-施帕茨病(Hallervorden-Spatz disease)、脂褐质沉积症、皮克氏病、皮质基底节变性、嗜银颗粒病(AGD)、亨廷顿氏病、额颞叶痴呆和额颞叶变性。
不希望受理论束缚,相信施用本公开的抗分拣蛋白抗体可预防、降低风险和/或治疗τ病变疾病。在一些实施方案中,施用抗分拣蛋白抗体可在具有τ病变疾病的个体中诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性。
多发性硬化
多发性硬化(MS)也可被称作播散性硬化或播散性脑脊髓炎。MS是发炎疾病,其中围绕脑和脊髓的轴突的脂肪髓鞘受损,导致脱髓鞘和瘢痕形成以及多种多样的病征和症状。MS影响脑和脊髓中的神经细胞彼此有效地通信的能力。神经细胞通过沿被称作轴突的长纤维发送被称作动作电位的电信号而通信,所述轴突含于被称作髓磷脂的绝缘物质内。在MS中,身体本身的免疫系统攻击并且损害髓磷脂。当失去髓磷脂时,所述轴突无法再有效地传导信号。MS发作通常发生在年轻人中,并且妇女中更常见。
MS的症状包括而不限于感觉改变,如灵敏性或麻刺感丧失;刺痛感或麻木,如感觉迟钝和感觉异常;肌肉虚弱;阵挛;肌肉痉挛;难以移动;难以协调和平衡,如共济失调;讲话问题,如发音困难,或吞咽问题,如吞咽困难;视觉问题,如眼球震颤、视神经炎(包括压眼闪光)和复视;疲劳;急性或慢性疼痛;和膀胱和肠困难;可变程度的认知障碍;抑郁或不稳定情绪的情绪综合征;Uhthoff氏现象,其为归因于暴露于高于通常环境温度的显著症状的恶化;和Lhermitte氏病征,其为当弯曲颈部时沿背部向下的触电感。
不希望受理论束缚,相信施用本公开的抗分拣蛋白抗体可预防、降低风险和/或治疗多发性硬化。在一些实施方案中,施用抗分拣蛋白抗体可在具有多发性硬化的个体中诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性。
青光眼和黄斑变性
青光眼描述而不限于一组疾病,其特征在于受损的视神经,导致视力丧失或失明。青光眼通常由在角膜下面的前房内增加的流体压力(=眼内压)引起。青光眼导致对于视力至关重要的视网膜神经节细胞的连续损失。年龄相关黄斑变性通常影响老年人并且主要引起黄斑(中心视野)中的视力丧失。黄斑变性引起而不限于玻璃疣、色素改变、斜视、眼出血、萎缩、视力敏锐度减退、视力模糊、中心暗点、色觉减退和对比灵敏度减退。
不希望受理论束缚,相信施用本公开的抗分拣蛋白抗体可预防、降低风险和/或治疗青光眼和黄斑变性。在一些实施方案中,施用抗分拣蛋白抗体可在具有青光眼或黄斑变性的个体中诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性。
变性椎间盘疾病(DDD)
变性椎间盘疾病(DDD)描述而不限于一组疾病,其中椎间盘(IVD)经历大量的形态以及生物机械改变,并且通常在临床上在具有下背痛的患者中显现。变性椎间盘典型地显示变性纤维软骨和软骨细胞丛集,提示修复。发炎可或可不存在。DDD中的病理发现包括突出、椎骨脱离和/或椎骨的不全脱位(椎骨滑脱)和椎管狭窄。
试剂盒/制造物件
本公开还提供了含有分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)或其功能片段的试剂盒。本公开的试剂盒可包括一个或多个容器,所述容器包含纯化的本公开的抗体。在一些实施方案中,所述试剂盒进一步包括根据本公开的方法使用的说明书。在一些实施方案中,这些说明书包含对根据本公开的任何方法施用分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)以预防、降低风险或治疗个体的描述,所述个体具有选自以下的疾病、病症或损伤:额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、创伤性脑损伤、脊髓损伤、长期抑郁、动脉粥样硬化性血管疾病、正常老化的不需要的症状、痴呆、混合性痴呆、Creutzfeldt-Jakob疾病、正常压力脑积水、肌萎缩性侧索硬化、亨廷顿氏病、τ病变疾病、Nasu-Hakola疾病、中风、急性创伤、慢性创伤、狼疮、急性和慢性结肠炎、伤口愈合、克罗恩氏病、发炎性肠病、溃疡性结肠炎、疟疾、特发性震颤、中枢神经系统狼疮、白塞氏病、帕金森氏病、路易体痴呆、多系统萎缩、Shy-Drager综合征、进行性核上麻痹、皮质基底节变性、急性播散性脑脊髓炎、肉芽肿病症、类肉瘤病、老化疾病、年龄相关黄斑变性、青光眼、色素性视网膜炎、视网膜变性、呼吸道感染、败血症、眼睛感染、全身性感染、狼疮、关节炎、多发性硬化和伤口愈合。
在一些实施方案中,所述说明书包含对如何在例如个体中、组织样品中或细胞中检测分拣蛋白的描述。所述试剂盒可进一步包含对基于鉴别个体是否具有所述疾病和所述疾病状态选择适用于治疗的个体的描述。
在一些实施方案中,所述试剂盒可进一步包括本公开的另一抗体(例如,至少一种特异性地结合于抑制检查点分子的抗体、至少一种特异性地结合于抑制细胞因子的抗体和/或至少一种特异性地结合于刺激检查点蛋白的促效剂抗体)和/或至少一种刺激细胞因子。在一些实施方案中,所述试剂盒可进一步包括关于与分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)组合使用所述抗体和/或刺激细胞因子的说明书,关于与抗体和/或刺激细胞因子组合使用分离的本公开的抗体的说明书,或关于根据本公开的任何方法使用分离的本公开的抗体和抗体和/或刺激细胞因子的说明书。
所述说明书一般地包括关于用于预期治疗的剂量、给药时程和施用途径的信息。所述容器可为单位剂量、大包装(例如,多剂量包装)或亚单位剂量。在本公开的试剂盒中供应的说明书典型地为在标签或包装插页(例如,所述试剂盒中包括的纸张)上的书写说明书,但机器可读的说明书(例如,在磁性或光学存储盘上携带的说明书)也是可接受的。
所述标签或包装插页指示了所述组合物用于治疗例如本公开的疾病。说明书可提供用于实践本文所述的方法中的任一种。
本公开的试剂盒是在合适的包装中。合适的包装包括但不限于小瓶、瓶、罐、柔性包装(例如,密封的Mylar或塑料袋)等。还预期与具体装置,如吸入器、鼻施用装置(例如,雾化器)或输注装置(如微型真空泵)组合使用的包装。试剂盒可具有无菌存取口(例如,所述容器可为静脉内溶液袋或具有可由皮下注射针刺穿的塞子的小瓶)。所述容器也可具有无菌存取口(例如,所述容器可为静脉内溶液袋或具有可由皮下注射针刺穿的塞子的小瓶)。所述组合物中的至少一种活性剂为分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)。所述容器可进一步包含第二药学活性剂。
试剂盒可任选地提供额外组分,如缓冲液和解说信息。通常地,所述试剂盒包含容器和在所述容器上或与所述容器缔合的标签或包装插页。
诊断性用途
分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)也具有诊断效用。本公开因此提供了使用本公开的抗体或其功能片段来达成诊断性目的(如检测个体或源于个体的组织样品中的分拣蛋白)的方法。
在一些实施方案中,所述个体为人。在一些实施方案中,所述个体为患有本公开的疾病、病症或损伤或处于发展所述疾病、病症或损伤的风险中的人患者。在一些实施方案中,所述诊断性方法涉及检测如活组织检查样本、组织或细胞的生物样品中的分拣蛋白。使分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)与所述生物样品接触并且检测抗原结合的抗体。例如,活组织检查样本可用本文所述的抗分拣蛋白抗体染色以便检测和/或定量疾病相关细胞。所述检测方法可涉及定量所述抗原结合的抗体。生物样品中的抗体检测可用本领域中已知的任何方法发生,包括免疫荧光显微镜方法、免疫细胞化学、免疫组织化学、ELISA、FACS分析、免疫沉淀或微正电子发射断层扫描。在某些实施方案中,所述抗体例如用18F放射性标记并且随后使用微正电子发射断层扫描分析进行检测。抗体结合也可在患者中通过非侵入技术定量,如正电子发射断层扫描(PET)、X射线计算机断层扫描、单一光子发射计算机断层扫描(SPECT)、计算机断层扫描(CT)和计算机轴向断层扫描(CAT)。
在其它实施方案中,分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)可用于检测和/或定量例如从临床前疾病模型(例如,非人疾病模型)取得的脑样本中的小胶质细胞。因而,分离的本公开的抗体(例如,本文所述的抗分拣蛋白抗体)可适用于评估如与对照组相比,在关于如额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、血管性痴呆、癫痫发作、视网膜营养不良、动脉粥样硬化性血管疾病、Nasu-Hakola疾病或多发性硬化的神经系统疾病或损伤的模型中治疗之后的治疗反应。
本公开将参考以下实施例更充分地加以理解。然而,其不应被视为限制本公开的范围。本公开中的所有引用均由此以引用的方式明确地并入。
实施例
实施例1:抗分拣蛋白抗体的产生、鉴别和表征
引言
抗分拣蛋白抗体可使用例如如WO 2009/036379、WO 2010/105256、WO 2012/009568、US 2009/0181855和US 2010/0056386中公开的确定的基于酵母的抗体呈现文库来鉴别。所述文库可用于鉴别阻断分拣蛋白与分拣蛋白配体(如颗粒蛋白前体和/或前NGF)之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体,和/或与其它哺乳动物分拣蛋白(如小鼠分拣蛋白、大鼠分拣蛋白和/或灵长类动物分拣蛋白)交叉反应的抗分拣蛋白抗体。
或者,可使用标准酵母展示筛选方案,如Patrick Chames(编),AntibodyEngineering:Methods and Protocols,Second Edition,Methods in MolecularBiology,第907卷,Springer Science+Business Media,LLC 2012第15章,Selection ofAntibody Fragments by Yeast Display by Nathalie Scholler中所述。
所述抗体也可通过任何其它确定的抗体产生方法,如Antibody Engineering:Methods and Protocols,第二版,Methods in Molecular Biology,第907卷,SpringerScience+Business Media,LLC 2012中所述的那些而产生。
抗体抑制分拣蛋白与其配体之间的相互作用的能力可接着在多种确定的生物化学和/或基于细胞的分析中验证,包括但不限于表面等离子体共振分析、共免疫沉淀、下拉分析、纤维素结合蛋白分析、β-半乳糖苷酶互补分析、细胞群体FRET分析、邻近接合分析和细胞结合分析。
如本文所述,85种抗分拣蛋白抗体得到鉴别和表征。
材料和方法
单体和Fc缀合的人和小鼠分拣蛋白的产生
分拣蛋白抗原的哺乳动物表达通过将基于cDNA的合成基因克隆至哺乳动物表达载体中,随后短暂转染并且在HEK293T细胞中表达而执行。构建体包括针对Fc融合构建体的异源信号肽和人IgG1Fc。简单地说,含有所关注的抗原的表达载体通过与转染试剂复合而进行转染,随后暴露于HEK293T细胞持续一小时,随后稀释培养基至每mL 4百万个细胞的最终密度。所述细胞接着每48小时用新鲜进料培养基培养持续7天。7天后,在离心后收集上清液并且使用蛋白Ni-琼脂糖并且必要时使用SEC柱纯化执行纯化以达到>95%非聚集单体含量。通过用经过FabRICATOR(IdeS)蛋白酶(Genovis,目录#A2-FR2-1000)修饰的铰链区(Lynaugh等人,MAbs.2013年10月;5(5):641-45)使分拣蛋白Fc融合抗原片段化来制备分拣蛋白单体抗原,随后进行蛋白A亲和力纯化以去除未消化的Fc融合蛋白并且进行SEC以去除聚集的单体。
生物素标记的分拣蛋白和颗粒蛋白前体
使用EZ-Link Sulfo-NHS-生物素标记试剂盒,ThermoScientific,目录#21425执行蛋白试剂生物素标记。
将分拣蛋白和颗粒蛋白前体浓缩至约1mg/mL并且缓冲液交换至PBS中,接着添加1:7.5摩尔比率的生物素标记试剂(EZ-LinkSulfo-NHS-生物素标记试剂盒,ThermoScientific,目录#21425.)。混合物在4℃下保持过夜,接着进行另一次缓冲液交换以去除溶液中的游离生物素。通过ForteBio上经过标记的蛋白的抗生蛋白链菌素传感器结合来确认生物素标记。
分拣蛋白抗体筛选
如先前所述,设计、产生和传播各自具有约109多样性的八个原生人合成酵母文库(参见例如:Xu等人,2013;WO2009036379;WO2010105256;WO2012009568;Xu等人,ProteinEng Des Sel.2013年10月;26(10):663-70)。针对人分拣蛋白Fc融合抗原选择使用所述八个原生文库并且针对人分拣蛋白单体选择使用所述八个文库的两个池,执行十次平行选择。关于前两轮选择,基本上如所述(Siegel等人,J Immunol Methods.2004年3月;286(1-2):141-53)执行利用Miltenyi MAC系统的磁珠分选技术。简单地说,酵母细胞(约1010个细胞/文库)在室温下在具有0.1%BSA的FACS洗涤缓冲液PBS中用3ml 10nM生物素标记的分拣蛋白Fc融合抗原或100nM生物素标记的分拣蛋白单体抗原孵育持续15min。在用50ml冰冷洗涤缓冲液洗涤一次之后,细胞集结粒再悬浮于40mL洗涤缓冲液中,并且500μl抗生蛋白链菌素微珠(Miltenyi Biotec,BergischGladbach,Germany.目录#130-048-101)添加至酵母中并且在4℃下孵育持续15min。接着,酵母集结成粒,再悬浮于5mL洗涤缓冲液中,并且装载至MACS LS柱(Miltenyi Biotec,BergischGladbach,Germany.目录#130-042-401)上。在装载5mL之后,所述柱用3ml FACS洗涤缓冲液洗涤3次。所述柱接着从磁场中取出,并且酵母用5mL生长培养基洗脱并且接着生长过夜。使用流式细胞术执行以下四轮分选。大约1×108个酵母集结成粒,用洗涤缓冲液洗涤三次,并且在室温下用10nM生物素标记的分拣蛋白Fc融合抗原或100nM生物素标记的分拣蛋白单体抗原孵育持续10min。酵母接着洗涤两次并且在4℃下用山羊抗人F(ab’)2κ-FITC(1:100稀释)(Southern Biotech,Birmingham,Alabama,目录#2062-02)和抗生蛋白链菌素-Alexa Fluor 633(Life Technologies,GrandIsland,NY,目录#S21375)(1:500稀释)或Extravidin-藻红蛋白(Sigma-Aldrich,St Louis,目录#E4011)(1:50稀释)第二试剂染色持续15min。在用冰冷洗涤缓冲液洗涤两次之后,细胞集结粒再悬浮于0.4mL洗涤缓冲液中并且转移至滤器-盖帽分选管中。使用FACS ARIA分选仪(BDBiosciences)执行分选并且确定分选门以仅选择分拣蛋白结合克隆用于一轮并且第二轮为阴性分选以减少试剂结合剂、多特异性结合剂(Xu等人,PEDS.2013年10月;26(10):663-70)和控制蛋白人SorCS1HIS标记的单体的结合剂。第三轮利用了用10nM人和小鼠分拣蛋白Fc融合抗原、100nM人分拣蛋白单体抗原标记,和使用与500nM颗粒蛋白前体预复合的分拣蛋白抗原(10nM)与颗粒蛋白前体竞争。关于与颗粒蛋白前体竞争的酵母,执行最后一轮以富集分拣蛋白Fc融合抗原结合剂。在最后一轮分选之后,使酵母涂板并且拣选个别集落进行表征。
使用来自第二和第四轮FACS分选选择输出的重链以制备用于额外选择的轻链多样化文库。关于这些选择,第一轮选择利用了Miltenyi MAC珠粒和用10nM人分拣蛋白Fc融合抗原标记。以下为四轮FACS分选。第一轮使用了100nM人分拣蛋白单体抗原。第二轮FACS为阴性分选以减少结合于试剂粘合剂、多特异性粘合剂和控制蛋白人SorCS1HIS标记的单体的粘合剂。最后两轮利用了人分拣蛋白单体滴定(100nM、10nM和1nM)以选择最高亲和力结合剂,100nM小鼠分拣蛋白单体,和与对照3E3抗体竞争以分析富集群体中的竞争者表示。在最后一轮分选之后,使酵母涂板并且拣选个别集落进行表征。
抗体IgG和Fab产生和纯化
使酵母克隆生长至饱和并且接着在30℃下在振荡下孵育持续48h。在诱导之后,酵母细胞集结成粒并且收集上清液用于纯化。IgG使用蛋白A柱纯化并且用乙酸(pH 2.0)洗脱。Fab片段通过木瓜蛋白酶消化产生并且经CaptureSelect IgG-CH1亲和力基质(LifeTechnologies,目录#1943200250)纯化。
ForteBio结合实验
通过由ForteBio测量所述分拣蛋白抗体的KD来确定其亲和力。ForteBio亲和力测量一般地如先前所述(Estep等人,MAbs.2013年3月-4月;5(2):270-8)执行。简单地说,ForteBio亲和力测量通过将IgG线上装载至AHQ传感器上来执行。传感器离线在分析缓冲液中平衡持续30min并且接着线上监测持续60秒以用于基线建立。关于亲合力结合测量,使具有装载的IgG的传感器暴露于100nM抗原(人或小鼠分拣蛋白Fc融合)持续3,之后将其转移至分析缓冲液中持续3min以用于离线测量。通过将生物素标记的分拣蛋白单体装载于SA传感器上并且暴露于溶液中的约100nM IgG来确定额外亲合力结合。通过将人或小鼠分拣蛋白Fc融合抗原装载至AHQ传感器并且随后暴露于约100nM分拣蛋白抗体Fab来获得单价结合测量。通过将生物素标记的人或小鼠分拣蛋白单体装载至SA传感器,随后暴露于溶液中的约100nM Fab来进行额外单价测量。
在由ForteBio提供的数据分析软件中使用1:1结合模型拟合动力学数据。
表位建仓
使用标准夹心形式建仓分析在ForteBio Octet Red384系统(ForteBio,MenloPark,CA)上执行抗分拣蛋白抗体的表位建仓。将对照抗标靶IgG装载至AHQ传感器上并且用非相关人IgG1抗体阻断所述传感器上的未占据Fc结合位点。所述传感器接着暴露于100nM标靶抗原、随后第二抗标靶抗体。使用ForteBio的数据分析软件7.0处理数据。在抗原缔合后所述第二抗体的额外结合指示了未占据的表位(非竞争者),而无结合指示了表位阻断(竞争者)。针对四种对照抗体重复这一过程:(i)3E3,其结合于分拣蛋白的域1(仓1);(ii)S-29,其结合于分拣蛋白的域2(仓2_;(iii)S-3,其结合于分拣蛋白的域3(仓3);和S-40,其结合于分拣蛋白的域4(仓4)。抗体仓列于下表5中。相似建仓方法可用于确定抗分拣蛋白抗体与全长人或小鼠颗粒蛋白前体之间,以及抗分拣蛋白抗体与C端颗粒蛋白前体肽之间的竞争。
颗粒蛋白前体竞争分析
所有实验均在ForteBio HTX仪器上执行。所有样品均稀释至PBSF(含0.1%BSA的PBS)中。所有浸渍和读取ForteBio步骤均涉及在1000rpm下振荡。
使用三种ForteBio分析来分析关于颗粒蛋白前体的竞争。
分析1:使用生物素标记的颗粒蛋白前体C端肽的颗粒蛋白前体竞争实验:
在分析之前将SA传感器浸泡于PBS中持续10min。所述空白传感器在分析之前浸渍于100nM的生物素标记的颗粒蛋白前体(PGRN)C端肽(Bio-TKCLRREAPRWDAPLRDPA LRQLL(SEQ ID NO:693))中并且接着浸泡于PBSF中持续至少10min。装载肽的尖端依序浸渍于PBSF中(60s)、人分拣蛋白单体(100nM)中持续3min,并且最终浸渍于100nM抗体中。数据准备用于如下使用ForteBio数据分析软件8.1.0.36版的分析。使数据y轴对准并且针对分拣蛋白捕捉步骤的开始进行步骤间校正并且接着进行修剪以仅显示分拣蛋白捕捉和抗体相互作用步骤。其中在添加给定的测试分拣蛋白抗体溶液时未观察到结合信号的分析指示了,测试分拣蛋白抗体结合位点与分拣蛋白表面上的PRGN-肽结合位点重叠。其中在添加给定的测试分拣蛋白抗体溶液时观察到结合信号的分析指示了,测试分拣蛋白抗体不阻断PRGN肽结合于分拣蛋白。
分析2:使用生物素标记的人分拣蛋白单体的颗粒蛋白前体竞争实验:
在分析之前将SA传感器浸泡于PBS中持续10min。所述空白传感器在分析之前浸渍于生物素标记的人分拣蛋白单体(100nM)中并且接着浸泡于PBSF中持续10min。装载分拣蛋白的尖端依序浸渍于PBSF中(1min)、颗粒蛋白前体(1.0uM)中持续3min并且最终浸渍于100nM抗体中。数据准备用于如下使用ForteBio数据分析软件8.1.0.36版的分析。使数据y轴对准并且针对颗粒蛋白前体捕捉步骤的开始进行步骤间校正并且接着进行修剪以仅显示颗粒蛋白前体捕捉和抗体相互作用步骤。其中在添加给定的测试分拣蛋白抗体溶液时未观察到结合信号的分析指示了,测试分拣蛋白抗体结合位点与分拣蛋白表面上的颗粒蛋白前体结合位点重叠。其中在添加给定的测试分拣蛋白抗体溶液时观察到结合信号的分析指示了,所述分拣蛋白抗体不阻断颗粒蛋白前体结合于分拣蛋白。
分析3:使用生物素标记的颗粒蛋白前体的颗粒蛋白前体竞争实验:
在分析之前将SA传感器浸泡于PBS中持续10min。所述空白传感器在分析之前浸渍于生物素标记的颗粒蛋白前体(100nM)中并且接着浸泡于PBSF中持续10min。装载颗粒蛋白前体的尖端依序浸渍于PBSF中(1min)、100nM人分拣蛋白单体中(3min)并且最终浸渍于100nM抗体中。数据准备用于如下使用ForteBio数据分析软件8.1.0.36版的分析。使数据y轴对准并且针对分拣蛋白捕捉步骤的开始进行步骤间校正并且接着进行修剪以仅显示分拣蛋白捕捉和抗体相互作用步骤。其中在添加给定的测试分拣蛋白抗体溶液时未观察到结合信号的分析指示了,分拣蛋白抗体结合位点与分拣蛋白表面上的颗粒蛋白前体结合位点重叠。其中在添加给定的测试分拣蛋白抗体溶液时观察到结合信号的分析指示了,所述分拣蛋白抗体不阻断颗粒蛋白前体结合于分拣蛋白。
结果
抗分拣蛋白抗体产生
从如上所述的八个原生人合成酵母文库鉴别出结合于分拣蛋白、尤其位于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的氨基酸残基78-611处的Vps10p域内的抗体。产生总计85种抗体(S-1至S-85)。所述抗体接着针对分拣蛋白结合进行筛选。
抗体重链和轻链可变域序列
使用标准技术,确定编码所产生的抗体的重链可变域和轻链可变域的氨基酸序列。所述抗体的EU或Kabat CDR序列陈述于表1中。所述抗体的EU或Kabat轻链框架序列陈述于表2中。所述抗体的Kabat重链框架序列陈述于表3中。
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分拣蛋白抗体结合的表征
抗分拣蛋白抗体的初始表征涉及确定其结合在表达重组人分拣蛋白(hSort)或重组小鼠分拣蛋白(mSort)的人胚胎肾(293)细胞上表达的分拣蛋白的能力。收集细胞,以105/ml涂板于96孔板上,洗涤,并且在冰中在含有10μg/ml Mab和2%FBS的100μl PBS中孵育持续1小时。细胞接着洗涤两次并且在冰中在含有5μg/ml PE缀合的抗人二次抗体的100μl PBS+2%FBS中孵育持续30分钟。细胞在冷PBS中洗涤两次并且在BD FACS Canto上获取数据。用FlowJo(TreeStar)软件10.0.7版执行MFI值的数据分析和计算。
由分拣蛋白抗体S1-S85结合的细胞类型的中值荧光强度(MFI)值列于表4中。结合与亲本细胞系(293)相比。表4中的结果指示了,S1-S85特异性地结合于在细胞膜上表达人和小鼠分拣蛋白的细胞系,但不结合于不表达分拣蛋白的对照细胞系。
表4:结合于人和小鼠细胞的分拣蛋白抗体
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在室温下通过由ForteBio或MSD-SET测量各抗分拣蛋白抗体的KD来确定其结合亲和力。ForteBio亲和力测量如先前所述(Estep等人,(2013)MAbs 5(2):270-8)执行。简单地说,ForteBio亲和力测量通过将IgG线上装载至AHQ传感器上来执行。传感器离线在分析缓冲液中平衡持续30min并且接着线上监测持续60秒以用于基线建立。使具有装载的IgG的传感器暴露于100nM抗原持续5分钟,接着将其转移至分析缓冲液中持续5min以用于离线测量。使用1:1结合模型分析动力学。
平衡亲和力测量如先前所述(Estep等人,(2013)MAbs5(2):270-8)执行。在具有恒定保持在50pM下的抗原的PBS+0.1%无IgG BSA(PBSF)中执行溶液平衡滴定(SET)并且用以10nM开始的抗体的3至5倍连续稀释液孵育。抗体(20nM于PBS中)在4℃下涂布于标准结合MSD-ECL板上过夜或在室温下持续30min。板接着在700rpm振荡下被阻断持续30min,随后用洗涤缓冲液(PBSF+0.05%Tween 20)进行三次洗涤。SET样品被涂覆于所述板上并且在700rpm振荡下孵育持续150s,随后进行一次洗涤。用含250ng/mL的磺基标签标记的抗生蛋白链菌素的PBSF检测通过在板上孵育持续3min而在所述板上捕捉的抗原。所述板用洗涤缓冲液洗涤三次并且接着使用具有表面活性剂的1x读取缓冲液T在MSD Sector Imager 2400仪器上读取。百分比游离抗原在Prism中随经过滴定的抗体绘制曲线并且拟合至二次方程以推断出KD。为了改进通量,在MSD-SET实验(包括SET样品制备)中使用液体处置机器人。
表5列出表示抗体S1-S85与人分拣蛋白Fc融合蛋白(hSort-Fc)和小鼠分拣蛋白Fc融合蛋白(mSort-Fc)的结合亲和力(KD)的值,以及其所属的仓。属于同一仓的抗体彼此竞争结合于分拣蛋白。在表5中,“N.B.”对应于无结合;并且“P.F.”对应于不良曲线拟合。
表5:分拣蛋白抗体的结合亲和力
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实施例2:分拣蛋白抗体的表位定位
测试分拣蛋白抗体结合跨完整人分拣蛋白的15聚体或25聚体肽的能力。
基于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的序列合成线性15聚体肽,具有14个残基的重叠。另外,基于人分拣蛋白(SEQ ID NO:1)的序列合成线性25聚体肽,具有24个残基的重叠。所述肽使用标准Fmoc-化学合成并且使用具有清除剂的三氟酸脱除保护基。分拣蛋白抗体与合成的肽中的每一者的结合在基于ELISA的方法中测试。在这种分析中,肽阵列用初级抗体溶液孵育(在4℃下过夜)。在洗涤之后,肽阵列在25℃下用抗体过氧化物酶缀合物(SBA,目录号2010-05)的1/1000稀释液孵育持续一小时。在洗涤之后,添加过氧化物酶底物2,2’-连氮基-二-3-乙基苯并噻唑啉磺酸盐(ABTS)和2μl/ml 3%H2O2。一小时之后,测量显色。显色用电荷耦合装置(CCD)摄影机和图像处理系统定量。
针对六种抗分拣蛋白抗体确定分拣蛋白结合区:S-1、S-8、S-44、S-49、S-65和S-78。结合区列于表6中。图1示出人分拣蛋白的示意图,指示了由所述六种抗分拣蛋白抗体结合的区域。
表6:分拣蛋白抗体结合区
Figure BDA0001494797660002581
如表6中所指示,由抗体S-1识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基623-632并且具有氨基酸序列:HSTDPEDYED(SEQ ID NO:708)。由抗体S-8识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基429-443并且具有氨基酸序列:ITFDQGGRWTHLRKP(SEQ ID NO:709)。由抗体S-44识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基740-749并且具有氨基酸序列:CTSNFLSPEK(SEQ ID NO:710)。由抗体S-49识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基233-243并且具有氨基酸序列:LSTENGLWVSK(SEQ ID NO:711)。由抗体S-65识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基175-181并且具有氨基酸序列:GPENSGK(SEQ ID NO:712)。由抗体S-78识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基212-221并且具有氨基酸序列:LPFHPLTQMM(SEQ ID NO:713)。各抗体结合的肽描绘于图1中。由S-1识别的肽以绿色显示,由S-65识别的肽以红色显示,由S-49识别的肽以蓝色显示,由S-78识别的肽以黄色显示,由S-44识别的肽以粉色显示,并且由S-8识别的肽以紫色显示。
实施例3:分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用的表征
引言
分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用使用ForteBio和表面等离子体共振分析(例如,Skeldal,S等人,(2012)J Biol Chem.,287:43798;和Andersen,OS等人,(2010)THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,285,12210-12222)表征。
材料和方法
分拣蛋白(SORT1)与颗粒蛋白前体(PGRN)之间的相互作用使用表面等离子体共振(SPR)分析(参见例如Skeldal,S等人,(2012)JBiol Chem.,287:43798;和Andersen,OS等人,(2010)THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,285,12210-12222)表征。
在阻断性抗分拣蛋白抗体存在或不存在下人或小鼠颗粒蛋白前体直接结合于固定的分拣蛋白以及人或小鼠分拣蛋白结合于固定的颗粒蛋白前体的确定是在Biacore2000仪器(Biacore,Sweden)上使用CaHBS作为标准电泳缓冲液(10mM HEPES pH 7.4、140mMNaCl、2mM CaCl2、1mM EGTA和0.005%Tween 20)来执行。
来自Biacore的生物传感器芯片(CM5,目录号BR-1000-14)使用如由供应商描述的NHS/EDC方法活化,随后涂布分拣蛋白至79fmol/mm2的蛋白密度并且用于原生颗粒蛋白前体蛋白的亲和力测量。在配体结合实验的各循环之后流动细胞的再生是通过再生缓冲液(10mM甘氨酸-HCl pH 4.0、500mM NaCl、20mM EDTA和0.005%Tween 20)的两个10-μl脉冲和0.001%SDS的单一注射来进行。关于亲和力估计值的传感图的拟合使用BIA评估版本3.1来进行。根据相似方案,His-颗粒蛋白前体的固定也在CM5生物传感器芯片上使用NHS/EDC偶合试剂盒根据制造商的说明书(Biacore,Sweden)来进行,给出固定的蛋白的相似表面密度(约300fmol/mm2)。具有固定的颗粒蛋白前体的生物传感器芯片也用于检查在竞争性分拣蛋白抗体不存在或存在下分拣蛋白的结合。
与以上实施例1中描述的分拣蛋白抗体的表位建仓相似地执行颗粒蛋白前体与抗分拣蛋白抗体之间的配体竞争。简单地说,在Forte Bio Octet Red384系统(Pall ForteBio Corporation,MenloPark,CA)上使用标准夹心形式建仓分析执行竞争分析。将对照抗标靶IgG装载至AHQ传感器上并且用非相关人IgG1抗体阻断所述传感器上的未占据Fc-结合位点。所述传感器接着暴露于100nM标靶抗原、随后第二抗标靶抗体。使用ForteBio的数据分析软件7.0处理数据。在抗原缔合后所述第二抗体的额外结合指示了未占据的表位(非竞争者),而无结合指示了表位阻断(竞争者)。
结果
与分拣蛋白结合的颗粒蛋白前体的表征
首先使用SPR和ELISA分析表征分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。图2A示出使用Biacore SPR对结合于His捕捉的SORT1的PGRN的动力学分析。简单地说,分拣蛋白被捕捉于用抗His抗体固定的CM5传感器芯片(来自GE的试剂盒)上。颗粒蛋白前体以多种浓度流过HBS结合缓冲液。关于亲和力估计值的传感图的拟合使用BIA评估版本3.1来进行。结果指示,人颗粒蛋白前体以14.3nM的KD结合于人分拣蛋白。
分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的结合也通过ELISA确认。简单地说,人或小鼠分拣蛋白(R&D Systems)在ELISA板上固定过夜(2μg/ml于PBS中)。所述板用洗涤缓冲液(PBS+0.05%TWEEN20)洗涤并且在37℃下用结合缓冲液(PBS+1%BSA)阻断持续一小时。重组人或小鼠颗粒蛋白前体(Adipogen)用来自ThermoScientific/Pierce的EZ-Link Micro NHS-PEG4试剂盒进行生物素标记。生物素标记的颗粒蛋白前体以多种浓度添加至固定的分拣蛋白中并且在RT下孵育持续30min。板在洗涤缓冲液中洗涤三次并且用抗生蛋白链菌素-HRP(1:200于结合缓冲液中,R&D Systems)孵育持续20min。板再洗涤三次并且用TMB底物溶液孵育直至显色。所述反应通过添加50ul 2N硫酸而停止并且使用Biotek Synergy H1板式读取器对颜色定量。数据在Prism中进行分析并且拟合。
图2B示出在ELISA板上生物素标记的人颗粒蛋白前体与固定的人分拣蛋白的结合(OD=光学密度),并且图2C示出在ELISA板上生物素标记的小鼠颗粒蛋白前体与固定的小鼠分拣蛋白的结合。结果指示,人颗粒蛋白前体以14nM的KD结合于人分拣蛋白,并且小鼠颗粒蛋白前体以40nM的KD结合于小鼠分拣蛋白。
使用颗粒蛋白前体肽的抗体竞争分析
图3A描绘了用于确定抗分拣蛋白抗体结合分拣蛋白的能力并且用于定量所述结合(即,KD)的ForteBio分析方案。在本图中,“RU”是指反应单位。示例性结果由抗体S-14示出,所述抗体经过计算具有0.8nM的KD
使用分拣蛋白的抗体竞争分析
图3B描绘了不同的ForteBio竞争分析方案。左栏描绘了使用结合于SA传感器上的生物素标记的颗粒蛋白前体肽和重组人分拣蛋白(单体)和抗分拣蛋白IgG抗体的ForteBio竞争分析(参见左栏;SORT=分拣蛋白,PGRN=颗粒蛋白前体,b=生物素标记,H=人,mono=单体)。
图3B的中间栏描绘了使用结合于SA传感器上的生物素标记的单体人分拣蛋白和人原生全长颗粒蛋白前体和抗分拣蛋白抗体的ForteBio竞争分析。
图3B的右栏描绘了使用结合于SA传感器上的生物素标记的人颗粒蛋白前体蛋白和人分拣蛋白单体和抗分拣蛋白抗体的ForteBio竞争分析。
抗体竞争分析的结果
图4A描绘了图3A和3B中描绘的三种不同ForteBio分析的结果,并且示出阻断颗粒蛋白前体(PGRN)结合于分拣蛋白(SORT1)的抗分拣蛋白抗体的数种实例。
图4A的左栏示出了图3B的左栏中描述的结合设置,其中结合SORT1的PGRN肽固定于传感器芯片上。SORT1被结合并且接着测试所述测试抗分拣蛋白抗体是否可能结合。能够结合分拣蛋白的抗体被视为非竞争者。结果指示抗体S-20和S-22为非竞争者,而抗体S-14为竞争者。
图4A的中间栏示出了图3B的中间栏中描述的结合设置,其中生物素标记的SORT1单体固定于传感器芯片上。全长PGRN蛋白被结合并且接着测试所述测试抗分拣蛋白抗体是否可能结合。能够结合分拣蛋白的抗体被视为非竞争者。结果指示抗体S-20为非竞争者,而抗体S-14和S-22为竞争者。
图4A的右栏示出了图3B的右栏中描述的结合设置,其中生物素标记的PGRN蛋白固定于传感器芯片上。SORT1被结合并且接着测试所述测试抗分拣蛋白抗体是否可能结合。能够结合分拣蛋白的抗体被视为非竞争者。结果指示抗体S-20和S-22为非竞争者,而抗体S-14为竞争者。
图4A中的结果指示了并非所有抗分拣蛋白抗体均为竞争者,并且一些(如抗体S-22)可以一种或两种形式充当非竞争者,同时以其它形式充当竞争者。
图4B示出了使用Biacore SPR在pH 6.4和pH 7.4下抗分拣蛋白抗体(S-5、S-8、S-49、S-60、S-63、S-64、S-72和S-83)与His捕捉的分拣蛋白(SORT1)的结合。
表7示出了用抗体S1-S85执行的SPR竞争分析的结果。表7的第2栏对应于图3B的左栏中描述的分析。表7的第3栏对应于图3B的中间栏中描述的分析。表7的第4栏对应于图3B的右栏中描述的分析。在表7中,“hPGRN”是指人颗粒蛋白前体;“是”指示所述抗体以给定形式阻断,并且“否”指示所述抗体不以给定形式阻断。
表7:ForteBio抗体竞争分析
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Figure BDA0001494797660002661
实施例4:使用基于细胞的分析表征分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用
材料和方法
重组人或小鼠颗粒蛋白前体(Adipogen)用来自ThermoScientific/Pierce的EZ-Link Micro NHS-PEG4试剂盒根据制造商的说明书进行生物素标记。通过HEK293T细胞的病毒感染和使用潮霉素的阳性选择(Genscript定制项目)建立表达全长未标记人分拣蛋白的稳定细胞系。全长小鼠分拣蛋白被克隆至pCMV-AC-IRES-GFP(Origene)中并且HEK293T细胞使用Fugene HD(Promega)用这种质粒短暂地转染。作为对照细胞,使用亲本HEK293T细胞或表达全长人SORCS1(克隆至pCMV-AC-IRES-GFP中)的HEK293T细胞。
收集表达分拣蛋白的细胞或对照细胞并且在PBS中洗涤。将生物素标记的人或小鼠颗粒蛋白前体添加于具有或不具有抗分拣蛋白抗体(10μg/ml)或对照人IgG1同型抗体的PBS+2%FBS中,并且在冰上孵育持续2h。在PBS+2%FBS中洗涤细胞3次之后,细胞在冰上在抗生蛋白链菌素-APC(BD Biosciences,1:100)中孵育持续30min。接着再次洗涤细胞,再悬浮于PBS+2%FBS中并且在FACSCantoTM流式细胞仪(BD Biosciences,Mississauga,ON)上进行分析。PGRN结合作为表达分拣蛋白的细胞群体的APC的中值荧光强度加以测量。
结果
结合于分拣蛋白的颗粒蛋白前体
分析生物素标记的人颗粒蛋白前体(PGRN)或生物素标记的小鼠PGRN结合于在HEK293T细胞表面上表达的人或小鼠分拣蛋白(SORT1)的能力。生物素标记的颗粒蛋白前体以递增的浓度(0nM-100nM)添加至表达分拣蛋白的HEK293T细胞或对照细胞中,并且使用FACSCantoTM分析结合。
图5A是FACS图,证明了人PGRN与在HEK293T细胞上表达的重组SORT1的剂量依赖性结合。如图5B所示,PGRN未显示更多结合于对照细胞。
图5C和5D示出如与不表达重组分拣蛋白的对照细胞相比,针对结合于在HEK293T细胞上表达的重组人分拣蛋白(SORT)的人PGRN(图5C)或结合于在HEK293T细胞上表达的小鼠分拣蛋白(SORT1)的小鼠PGRN(图5D)的浓度绘制的中值荧光强度(MFI)。结果证明了,PGRN以剂量依赖性方式结合于分拣蛋白。
能够阻断颗粒蛋白前体结合的分拣蛋白抗体
为了测试抗分拣蛋白抗体是否可阻断颗粒蛋白前体与分拣蛋白的结合,表达人或小鼠分拣蛋白的细胞用15nM生物素标记的人或小鼠颗粒蛋白前体连同67nM抗分拣蛋白抗体一起孵育。基于细胞的颗粒蛋白前体竞争分析的结果在表8中示出。抗分拣蛋白抗体示出阻断颗粒蛋白前体的能力的范围。抗体S-64、S-63、S-60、S-05、S-49、S-72、S-06、S-76、S-83和S-65被鉴别为顶级颗粒蛋白前体阻断抗体。
在表8中,“hPGRN”是指人颗粒蛋白前体,“mPGRN”是指小鼠颗粒蛋白前体,“hSort”是指人分拣蛋白,并且“mSort”是指小鼠分拣蛋白。
表8:基于细胞的抗体竞争
Figure BDA0001494797660002681
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为了测试所述顶级颗粒蛋白前体阻断性抗分拣蛋白抗体的阻断能力,表达分拣蛋白的HEK293T细胞用15nM生物素标记的人或小鼠颗粒蛋白前体连同递增浓度的抗分拣蛋白或对照抗体一起孵育。测量中值荧光强度并且在Prism中进行曲线拟合(非线性回归:在三种参数下log抑制剂对剂量反应)以确定阻断常数。
图6A-6D证明了抗分拣蛋白抗体以剂量依赖性方式抑制人颗粒蛋白前体与在HEK293T细胞上表达的人分拣蛋白和小鼠颗粒蛋白前体与在HEK293T细胞上表达的小鼠分拣蛋白的结合。图6A和6B示出了抗体S-5、S-60、S-63、S-64、S-49、S-8、S-76、S-83、S-6、S-65和S-72抑制人颗粒蛋白前体与人分拣蛋白的结合。图6C和6D示出了抗体S-1、S-6、S-26、S-30、S-39、S-44、S-24、S-81和S-85抑制小鼠颗粒蛋白前体与小鼠分拣蛋白的结合,而抗体S-49不能抑制小鼠颗粒蛋白前体与小鼠分拣蛋白的结合,而是增加颗粒蛋白前体与分拣蛋白的结合。图6A-6D中的结果指示了如抗体S-6的某些抗分拣蛋白抗体能够抑制人和小鼠颗粒蛋白前体与相应分拣蛋白的结合。
图6E描绘了抗分拣蛋白抗体阻断PGRN与分拣蛋白的结合的能力存在一个渐进的范围。在饱和抗体浓度(67nM)下降低颗粒蛋白前体与分拣蛋白的结合达20%或更低的抗分拣蛋白抗体被指定为非颗粒蛋白前体阻断抗体。
表9基于图6中描绘的数据定量了抗分拣蛋白抗体抑制颗粒蛋白前体(PGRN)与分拣蛋白的结合的能力。表9描绘了由所指示的抗分拣蛋白抗体(在150nM IgG下)实现的分拣蛋白:颗粒蛋白前体结合的半最大(IC50)阻断和百分比最大阻断。“NT”是指未测试的抗体。
表9:抑制PGRN/SORT1相互作用的阻断抗体
Figure BDA0001494797660002721
用分拣蛋白抗体的组合增加颗粒蛋白前体阻断
图7示出了阻断颗粒蛋白前体结合的抗分拣蛋白抗体的组合的协同效应。简单地说,表达重组人分拣蛋白的HEK293T细胞用15nM生物素标记的颗粒蛋白前体和67nM S-49或S-64或S-16抗体、连同67nM同型对照抗体或S-49或S-64彼此或与S-16的不同组合(各抗体均在67nM下)一起孵育。结合的颗粒蛋白前体通过抗生蛋白链菌素-APC(1:100,BDBiosciences)检测并且被定量为APC的中值荧光强度。图7中的结果证明了如与单独任一抗体的颗粒蛋白前体阻断能力相比,人颗粒蛋白前体的阻断由S-49和S-16抗体的组合、S-64和S-16抗体的组合和S-49和S-64抗体的组合增加。这些结果指示了抗分拣蛋白抗体的组合可比单一抗分拣蛋白抗体更有效。
表达分拣蛋白的细胞结合并且内吞颗粒蛋白前体
关于图8中描绘的结果,表达分拣蛋白或LacZ(对照组)的HEK293T细胞在37℃下用颗粒蛋白前体(PGRN)孵育持续长达60分钟。通过荧光显微镜方法观察PGRN的时间依赖性结合和内吞。重组人颗粒蛋白前体(Adipogen)用DyLight 650(Life Technologies,Carlsbad,CA)标记。细胞使用Fugene用人分拣蛋白或LacZ(对照组)和GFP短暂地转染并且24h后收集。GFP由第二载体(Topo3.3,Invitrogen)表达或位于同一载体上,由IRES(pCMV6-AC-IRES-GFP,Origene)隔开。使用未标记(Topo3.3)或具有C端myc标签(pCMV6-AC-IRES-GFP)的全长分拣蛋白。细胞接着涂板于用聚-l-赖氨酸涂布的显微镜腔室载玻片上。4-6h后,细胞在OptiMem无血清培养基中洗涤,并且添加40nM颗粒蛋白前体-650,其中具有或不具有作为阻断剂的10uM分拣蛋白前肽。细胞在37℃下孵育持续长达60’。随后,细胞固定于4%多聚甲醛中,在PBS中洗涤并且在Nikon荧光显微镜上成像。
图8A示出随着孵育时间增加,颗粒蛋白前体与表达分拣蛋白的细胞的结合和内吞增加,如通过DyLight-650荧光所分析。当细胞表达对照LacZ蛋白时,或当细胞用10μM阻断性分拣蛋白前肽共孵育时,仅观察到可忽略的颗粒蛋白前体结合。
图8B-8E描绘了定量颗粒蛋白前体内吞和阻断性分拣蛋白前肽抑制颗粒蛋白前体内吞的能力的FACS分析。荧光标记的人颗粒蛋白前体(PGRN-DyLight650)添加至人分拣蛋白(Sort)(图8B)或小鼠分拣蛋白(Sort)(图8C)或对照HEK293T细胞中并且由FACS通过测量表达分拣蛋白的细胞的中值荧光强度来定量所结合和内吞的颗粒蛋白前体的量。图8D和8E证明了定量分拣蛋白前肽抑制人Sort(图8D)或小鼠Sort(图8E)对颗粒蛋白前体的内吞的能力。
实施例5:用分拣蛋白抗体处理的细胞中分泌的颗粒蛋白前体的增加的水平
增加的颗粒蛋白前体的细胞外水平
将U-251人星细胞瘤细胞接种于96孔盘中并且孵育过夜。第二天早晨,以50nM或5nM最终稀释液添加阻断性抗分拣蛋白抗体(S-1至S-10、S-12、S-14至S-16、S-18至S-22、S-24至S-26、S-28至S-30、S-32、S-34、S-39、S-40、S-42至S-45、S-48至S-51、S-55、S-57至S-61、S-63、S-64、S-65、S-67、S-69、S-71至S-76、S-78和S-81至S-85)以及阳性阻断性抗体(来自R&D Systems,AF3154的山羊抗人分拣蛋白(gtSort))和同型对照抗体(山羊(gt)IgG、ADI-88(人IgG1)和ADI-89(人IgG1)并且细胞因此孵育持续72h。接着收集培养基并且使用R&D Systems人颗粒蛋白前体DuosetELISA试剂盒测量培养基样品中的颗粒蛋白前体浓度。
如图9A-9D所示,使用多种抗分拣蛋白抗体阻断颗粒蛋白前体与分拣蛋白的结合导致分泌至U-251细胞的培养基中的颗粒蛋白前体的水平的3倍增加。图9A和9C示出了50nM添加的抗体的结果并且图9B和9D示出了5nM添加的抗体的结果。图9A和9B中的结果证明了属于仓3/4和4的一类抗分拣蛋白抗体的子集(包括例如S-8、S-49和S-60)不仅阻断颗粒蛋白前体与分拣蛋白的结合,而且实际上增加天然地表达分拣蛋白和颗粒蛋白前体两者的U-251细胞中的内源颗粒蛋白前体的水平。此外,图9C和9D中的结果进一步证明了不阻断颗粒蛋白前体结合于分拣蛋白或仅微弱地阻断颗粒蛋白前体结合于分拣蛋白的属于仓1/2、2和3的第二类抗分拣蛋白抗体(包括例如S-2、S-14、S-15、S-18、S-19、S-20、S-21、S-22、S-29、S-51、S-57、S-61和S-82)也能够诱导增加U-251细胞中的内源颗粒蛋白前体的水平。
降低的分拣蛋白的细胞表面水平
在U-251细胞如上用50nM抗分拣蛋白抗体孵育持续72h之后,用胰蛋白酶收集细胞,在PBS中洗涤并且用抗分拣蛋白抗体S-20(其结合未受到颗粒蛋白前体阻断抗体显著竞争)标记。在细胞在冰上用5μg/ml S-20孵育持续一小时之后,细胞在PBS+2%FBS中洗涤三次并且接着用5μg/ml抗人PE第二抗体(Southern Biotech)孵育。接着再次洗涤细胞并且使用FACSCantoTM将S-20结合定量为PE的中值荧光强度。
图10A示出某些抗分拣蛋白抗体降低人U-251细胞中的分拣蛋白的细胞表面水平,其中诱导所分泌的颗粒蛋白前体的最强增加的抗体(例如,S-2、S-19和S-22)还诱导分拣蛋白的细胞表面水平的最强降低。不降低分拣蛋白的细胞表面水平的抗体(如S-64和S-5)不能增加颗粒蛋白前体的细胞外水平,即使其阻断颗粒蛋白前体结合于分拣蛋白的能力不啻于或优于抗体S-49、S-60的颗粒蛋白前体阻断能力。图10B示出某些抗分拣蛋白抗体降低鼠类Neuro-2A(N2A)细胞中的分拣蛋白的细胞表面水平。总之,降低人U-251细胞中的分拣蛋白的细胞表面水平的抗体还降低鼠类N2A细胞中的分拣蛋白的细胞表面水平。这些结果指示了降低分拣蛋白的细胞表面水平是这些抗体的普遍活性并且因此所述抗体也可能够体外和体内降低其它细胞类型中的分拣蛋白的细胞表面水平。
图10C和10D示出用不同浓度的抗分拣蛋白抗体孵育持续72h的U-251细胞中的细胞表面分拣蛋白的水平。所述抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白的细胞表面表达的剂量依赖性降低。分拣蛋白水平的降低由结合于分拣蛋白的S-20抗体的降低的荧光强度(MFI)描绘。图10E示出在用所列出的抗分拣蛋白抗体孵育持续72h的U-251细胞的培养基中PGRN的相应水平的定量(利用ELISA分析)。降低分拣蛋白细胞表面水平的抗分拣蛋白抗体还引起细胞外PGRN的水平的剂量依赖性增加。
图10F示出分拣蛋白(SORT)的细胞表面水平与颗粒蛋白前体(PGRN)的细胞外水平的倍数增加强烈地并且相反地相关。基于这些结果,降低分拣蛋白的细胞表面水平的抗分拣蛋白抗体还增加颗粒蛋白前体的细胞外水平。此外,降低分拣蛋白的细胞表面水平并且增加颗粒蛋白前体的细胞外水平的抗分拣蛋白抗体(例如,S-49、S-60和S-8)属于抗体仓2、3、4或未分类的仓(表5)。因此,结果指示了属于与抗体S-49、S-60和S-8相同的仓的额外抗分拣蛋白抗体(属于同一仓的抗体彼此竞争结合于分拣蛋白)还将能够降低分拣蛋白的细胞表面水平并且增加颗粒蛋白前体的细胞外水平。
表10指示了能够降低人U-251细胞和/或鼠类N2A细胞中的分拣蛋白的细胞表面水平和/或增加颗粒蛋白前体的细胞外水平的抗体。所述抗体以最强至最弱活性的顺序列出。“N.T.”是指未测试的抗体。
表10:抗分拣蛋白抗体活性
Figure BDA0001494797660002761
Figure BDA0001494797660002771
增加的小鼠脑中的颗粒蛋白前体水平
持续两周对14月龄Tg2576小鼠输注(经由植入的Alzet 1002泵)总计240μg的山羊(gt)抗小鼠分拣蛋白(R&D Systems,AF2934)或山羊(gt)IgG多克隆抗体或单独aCSF缓冲液(n=3/组)。随后处死小鼠并且将脑部剖成左对右海马、前额皮质和枕叶皮质,每只动物总计6块。各块立即在N-Per(Thermo Scientific Pierce)中提取,或闪冻并且随后在以后时间提取。为了分离聚集的Aβ42肽,用TBSX洗涤不溶性蛋白部分集结粒,再悬浮于70%甲酸中至150mg/ml(基于集结粒重量),并且通过在室温下旋转持续2h并偶尔涡旋来混合。使样品离心(100,000x g,在4℃下1h),并且用20体积的1MTris碱中和甲酸可溶性部分,等分,并且在80℃下冷冻。使用BCA(Thermo Scientific Pierce)或A280分光光度法测量所有提取物的蛋白含量。
使用R&D Systems Duoset ELISA试剂盒测量小鼠颗粒蛋白前体的水平。使用来自Life Technologies的ELISA试剂盒测量可溶性和不溶性Aβ42水平。使用定制的ELISA分析测量山羊抗分拣蛋白抗体的脑水平。简单地说,含2μg/ml的重组小鼠分拣蛋白(R&DSystems)的PBS在4℃下在Immulon ELISA板上与板结合过夜。次日,所述板在PBS+0.05%TWEEN20中洗涤并且在RT下在PBS+1%BSA中阻断持续1h。添加100μl经过稀释的样品并且在RT下孵育持续1h。洗涤板并且随后用100μl抗山羊HRP检测抗体(1:20,000,JacksonImmuno)孵育。再次洗涤板并且用100μl TMB底物孵育直至显色。所述反应通过添加50μl 2N硫酸而停止并且使用Biotek板式读取器对显色定量。
与对照组(gt IgG和单独aCSF缓冲液)相比,对小鼠脑输注山羊抗分拣蛋白多克隆抗体导致在所有三种动物中,在所有三个经过检查的脑区中的颗粒蛋白前体水平的强烈增加(图11A和11B)。颗粒蛋白前体水平的增加在输注位点的同一侧的右半球上最强烈(图11B)。与这些结果一致,所述抗分拣蛋白抗体的水平在同一侧的脑区中最高(海马>前额皮质>枕叶皮质)(图11C)。当抗体浓度针对颗粒蛋白前体水平绘制曲线时,由R平方值0.92观察到强烈的正相关(图11D)。
图11E和11F示出使用来自Life Technologies的ELISA在脑提取物中测量的Aβ42肽的水平。图11E示出在不溶性、甲酸提取的蛋白部分中的Aβ42肽水平并且图11F示出在可溶性蛋白部分中的Aβ42肽水平。结果指示了所述抗分拣蛋白抗体看来对不溶性、甲酸提取的蛋白部分中的Aβ42肽水平具有影响。
实施例6:阻断前NGF结合于分拣蛋白
使用Biacore T200SPR分析来检查抗分拣蛋白抗体S-28、S-5、S-1、S-6、S-65、S-83、S-72、S-8、S-49、S-60、S-63、S-64和S-76对前NGF结合于分拣蛋白的阻断。在25℃下在BiaCore T200仪器上收集SPR数据并且使用BiaCore T200评估软件(版本2.0)进行分析。HBS-EP+(100mM HEPES、1.5M NaCl、30mM EDTA、0.5%v/v表面活性剂P20,pH 7.4)用作电泳缓冲液并且用于制备试剂。
人His标记的分拣蛋白(200nM,R&D Systems)被捕捉于用抗His小鼠IgG固定(60s接触时间,30μl/min流动速率,0s解离时间)的CM5传感器芯片上。使人前NGF(400nM)或HBS-EP+缓冲液流过芯片表面(60s接触时间,30μl/min流动速率,0s解离时间)。使抗分拣蛋白抗体(200nM)流过芯片表面(60s接触时间,30μl/min流动速率,30s解离时间)。所述芯片表面在各循环之间使用10mM甘氨酸-HCl(pH 1.7)再生(75s接触时间,30μl/min流动速率,60s稳定化时间)。所得SPR信号作为对空白流动池执行的测量的反应差异获得。
图12A-12C中所示的结果证明了某些抗分拣蛋白抗体与分拣蛋白的结合可部分地由前NGF阻断。图12A示出实验设置。图12B示出不阻断颗粒蛋白前体的对照抗体(S-28)的反应痕迹。S-28与分拣蛋白的结合并未通过用前NGF预孵育而受到阻断。图12C示出抗分拣蛋白抗体S-1和S-65与分拣蛋白的结合通过使前NGF结合于分拣蛋白而受到最强烈阻断(RU=反应单位)。
实施例7:使用创伤性脑损伤的确定的动物模型表征分拣蛋白阻断抗体的治疗性 用途
分拣蛋白阻断抗体的治疗效用可在创伤性脑损伤的确定的动物模型中测试(Tanaka,Y等人,(2013)Neuroscience 231 49-60)。
例如,可使用诱导小胶质细胞和星形细胞的活化的创伤性脑损伤的模型。可使用八或九周龄雄性C57BL/6J WT小鼠或颗粒蛋白前体杂合小鼠。小鼠是购自查尔斯河实验室(Charles River Laboratories)或杰克森实验室(Jackson labs)。通过腹膜内施用溶解于无菌生理盐水中的甲苯噻嗪盐酸盐(8mg/kg)和水合氯醛(300mg/kg)使小鼠麻醉,并且随后放置于立体定位器(Narishige,Tokyo,Japan)中。在头皮上产生切口并且使头盖骨暴露。从颅骨清除骨膜,用牙钻在右脑半球上钻孔,并且用针尖去除硬脑膜。使用具有0.5-mm外径的不锈钢套管在右半球中产生纵向刺伤。所述套管定位于中间线侧面1.3mm,并且前囱后面1mm处,并且被引入至脑中直至所述尖到达2mm深度。所述套管接着在尾部被移位2mm(前囱3mm),并且接着在其初始位置的吻侧移回2mm。最后,从脑中去除所述套管,并且缝合头皮伤口。小鼠接着用分拣蛋白阻断抗体根据标准程序处理并且接着通过组织学和免疫荧光染色和行为测试进行分析
实施例8:使用在毒素诱导或突触核蛋白诱导的损伤后的帕金森氏神经发炎和神 经元损失的模型表征分拣蛋白阻断抗体的治疗性用途
分拣蛋白阻断抗体的治疗效用也可在毒素诱导的损伤后的神经发炎和神经元损失的模型中测试(Martens,LH等人,(2012)The Journal of Clinical Investigation,122,3955)。
用每日MPTP的4次i.p.注射持续2天(4μg/g体重)(Sigma-Aldrich)或PBS处理三月龄小鼠。MPTP会破坏在帕金森氏病中变性的多巴胺能神经元。用分拣蛋白阻断抗体根据标准方案处理小鼠并且接着使用体视学计数进行分析以定量SNpc中的多巴胺神经元和小胶质细胞。如所述。或者,可使用表达针对α-突触核蛋白的基因的基因突变(A53T、A30P和E46K)或过度表达α-突触核蛋白的帕金森氏模型(Maguire-Zeiss(2008)Pharmacol Res;58(5-6):271-280;Chesselet(2008)Exp Neurol 209:22–27)。
实施例9:使用老化、癫痫发作、脊髓损伤、视网膜营养不良、额颞叶痴呆和阿尔兹 海默氏病的动物模型表征分拣蛋白阻断抗体的治疗性用途
分拣蛋白阻断抗体的治疗效用也可在老化、癫痫发作、脊髓损伤、视网膜营养不良、额颞叶痴呆和阿尔兹海默氏病的动物模型中测试,如先前所述(例如,Beattie,MS等人,(2002)Neuron 36,375-386;Volosin,M等人,(2006)J.Neurosci.26,7756-7766;Nykjaer,A等人,(2005)Curr.Opin.Neurobiol.15,49-57;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,1449-1457;Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870-9879;Fahnestock,M等人,(2001)Mol.Cell Neurosci.18,210-220;Nakamura,K等人,(2007)Cell Death.Differ.14,1552-1554;Yune,T等人,(2007)Brain Res.1183,32-42;Wei,Y等人,(2007)Neurosci.Lett.429,169-174;Provenzano,MJ等人,(2008)Laryngoscope 118,87-93;Nykjaer,A等人,(2004)Nature 427,843-848;Harrington,AW等人,(2004)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.101,6226-6230;Teng,HK等人,(2005)J.Neurosci.25,5455-5463;Jansen,P等人,(2007)Nat.Neurosci.10,1449-1457;Volosin,M等人,(2008)J.Neurosci.28,9870-9879;Fan,YJ等人,(2008)Eur.J.Neurosci.27,2380-2390;Al-Shawi,R等人,(2008)Eur.J.Neurosci.27,2103-2114;和Yano,H等人,(2009)J.Neurosci.29,14790-14802)。
实施例10:使用动脉粥样硬化的模型表征分拣蛋白阻断抗体的治疗性用途
分拣蛋白阻断抗体的治疗效用也可在动脉粥样硬化的模型中测试,如先前所述(例如,Lance,A等人,(2011)Diabetes,60,2285;和Kjolby,M等人,(2012)Cell Metabolism12,213-223)。
实施例11:使用感染的模型表征分拣蛋白阻断抗体的治疗性用途
分拣蛋白阻断抗体的治疗效用也可在感染的模型中测试。例如,可使用正常小鼠或颗粒蛋白前体杂合小鼠中的单核球增多性李斯特菌或其它感染,如先前所述(例如,Yin,F等人,(2009)J.Exp.Med,207,117-128)。
实施例12:整体动物中的体内保护以免于EAE和双环己酮草酰双腙
成年7-9周龄雌性C57BL/6小鼠(获自查尔斯河实验室)在尾基中双侧注射200μl在不完全弗氏佐剂(Difco)中的接种体,其含有100μg髓磷脂少突细胞糖蛋白肽35–55(氨基酸MEVGWYRSPFSRVVHLYRNGK(SEQ ID NO:707);Seqlab)和1mg结核分枝杆菌H37Ra(Difco)。在免疫化之后的第0天和第2天注射百日咳毒素(200ng;List Bio-logical Laboratories)。临床病征评分如下:0,无临床病征;1,完全柔软的尾巴;2,完全柔软的尾巴和异常步态;3,一个后肢轻截瘫;4,完全后肢轻截瘫;和5,前肢和后肢瘫痪或垂死。仅在第14天具有疾病发作的小鼠(临床评分为1或更高)用于实验。在最初临床症状当日或在任何其它所需时间将拮抗性抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体腹膜内或静脉内注射于EAE致病小鼠中(PLoS Med(2007)4(4):e124)。
对年轻或老龄野生型(WT)小鼠喂食含有0.2%双环己酮草酰双腙(CPZ)粉末状草酸双(环亚己基酰肼)(Sigma-Aldrich)的标准饮食(Harlan)持续4、6或12周。关于组织学和免疫组织化学分析,在对小鼠灌注4%多聚甲醛(PFA)之后取出脑,固定于4%PFA中持续24h,随后浸没于30%蔗糖中持续24-48h。为了评估髓磷脂完整性和损害,以及细胞增殖和发炎切片或小鼠脑用抗MBP(1:100;Abcam,ab7349)、抗dMBP(1:2000;Millipore,ab5864)、抗βAPP(1:100;Invitrogen,51-2700)、抗SMI-31(1:1000;Covance,smi-31R)、抗Iba1(1:600;Wako,019-19741)、抗BrdU(1:250;Abcam,ab1893)、抗GFAP(1:200;Invitrogen,13-0300)、抗iNOS(1:100;BD Pharmingen,610329)、抗LPL(1:400,来自Dr.G.Olivecrona)和抗MHC II(1:100;BD Pharmingen,553549)染色。关于所述抗体的行为效应,使用透明聚苯乙烯外壳和计算机化光束仪器分析小鼠的活动能力。分析一般活动变量(总的移动、垂直后腿直立),连同情绪指数,包括花费的时间、行进的距离和进入。执行一系列的感觉运动测试以分析平衡性(台阶和平台)、强度(倒转的屏幕)、协调性(杆和倾斜的屏幕)和运动开始(行走开始)。使用转棒协议研究运动协调性和平衡性(Cantoni等人,Acta Neuropathol(2015)129(3):429-47)。
实施例13:使用创伤性脑损伤的确定的动物模型表征分拣蛋白拮抗性或双特异性 抗体的治疗性用途
分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗效用是在创伤性脑损伤的确定的动物模型中测试(Tanaka,Y等人(2013)Neuroscience231 49-60)。例如,使用诱导小胶质细胞和星形细胞的活化的创伤性脑损伤的模型。使用八或九周龄雄性C57BL/6J WT小鼠或颗粒蛋白前体杂合小鼠(购自查尔斯河实验室或杰克森实验室)。通过腹膜内施用溶解于无菌生理盐水中的甲苯噻嗪盐酸盐(8mg/kg)和水合氯醛(300mg/kg)使小鼠麻醉,并且随后放置于立体定位器(Narishige,Tokyo,Japan)中。在头皮上产生切口并且使头盖骨暴露。从颅骨清除骨膜,用牙钻在右脑半球上钻孔,并且用针尖去除硬脑膜。使用具有0.5mm外径的不锈钢套管在右半球中产生纵向刺伤。所述套管定位于中间线侧面1.3mm,并且前囱后面1mm处,并且被引入至脑中直至所述尖到达2mm深度。所述套管接着在尾部被移位2mm(前囱3mm),并且接着在其初始位置的吻侧移回2mm。最后,从脑中去除所述套管,并且缝合头皮伤口。小鼠接着用拮抗性抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体根据标准程序处理并且接着通过组织学和免疫荧光染色和行为测试进行分析。
实施例14:在毒素诱导的损伤后的神经发炎和神经元损失的模型中表征分拣蛋白 抗体和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗性用途
分拣蛋白抗体和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗效用是在毒素诱导的损伤后的神经发炎和神经元损失的模型中测试(Martens,LH等人,(2012)The Journal of ClinicalInvestigation,122,3955)。用每日MPTP(1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶)的4次腹膜内注射持续2天(4μg/g体重)(Sigma-Aldrich)或PBS处理三月龄小鼠。小鼠用拮抗性抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体根据标准程序处理并且接着使用体视学计数进行分析以定量黑质致密部(SNpc)中的多巴胺神经元和小胶质细胞。
实施例15:分析抗分拣蛋白抗体刺激先天免疫细胞和/或神经元的活力的能力
在M-CSF存在下培养野生型(WT)小鼠骨髓源性巨噬细胞,或使标准条件下的神经细胞培养物暴露于分拣蛋白抗体并且测量细胞活力。将从WT和KO小鼠的骨髓分离的巨噬细胞涂板于非组织培养物处理的96孔板上,所述96孔板预涂布有抗分拣蛋白抗体或对照抗体。细胞在10ng/ml M-CSF存在下培养持续48小时。使用Cell Titer Glo试剂盒(Promega)执行活力的分析。用BioTek Synergy微板读取器使用GEN5 2.04软件对板进行读取。
实施例16:分析分拣蛋白抗体的抗中风效应
在小鼠中使用大脑中动脉(MCAO)的短暂阻塞(密切地类似人中风的模型)来诱导脑梗死。通过右颈总动脉的切口将单丝(70SPRe,Doccol Corp,USA)引入至颈内动脉中。在一系列再灌注时间下(6h、12h、24h、2d、7d和28d)使大脑中动脉闭塞持续30分钟。在12h和7d时使用假动物控制手术的效应。假动物经历相同手术程序,但无大脑中动脉的闭塞。MCAO动物用拮抗性抗分拣蛋白抗体或对照抗体处理并且测试梗死体积、急性发炎反应(12h再灌注)、促发炎细胞因子TNFa、IL-1a和IL-1b的转录、小胶质细胞活性(CD68、Iba1)、趋化因子CCL2(MCP1)、CCL3(MIP1a)和趋化因子受体CX3CR1的转录和CD3阳性T细胞的侵入(Sieber等人(2013)PLoSONE 8(1):e52982)。
实施例17:分析抗分拣蛋白抗体的抗阿尔兹海默氏病效应
为了评估抗分拣蛋白抗体延迟、预防或逆转阿尔兹海默氏病(AD)的发展的能力,使用5X FAD小鼠。5X FAD小鼠过度表达具有Swedish(K670N、M671L)、Florida(I716V)和London(V717I)家族性阿尔兹海默氏病(FAD)突变的突变型人APP(695),连同具有两种FAD突变M146L和L286V的人PS1。通过小鼠Thy1启动子调节两种转基因以驱动脑上的过度表达并且概括AD的主要特征。用组织提取物的免疫组织化学并且通过ELISA测试用拮抗性抗分拣蛋白抗体或用对照抗体处理的小鼠的Aβ斑块负荷。进一步测试其脑中的小胶质细胞的数目,并且使用Morris水迷宫(空间学习和记忆任务)、放射臂水迷宫(空间学习和记忆任务)、Y迷宫(定量自发改变作为空间认知的量度)、开放场中的新奇性偏好、分析学习和记忆的操作性学习和恐惧条件反射来测试认知缺陷的降低(mousebiology.org网站;Wang等人,(2015)Cell.pii:S0092-8674(15)00127-0)。
实施例18:分析分拣蛋白抗体在伤口愈合中的保护性效应
为了评估抗分拣蛋白抗体在损伤后增加结肠伤口修复的能力,使用结肠中的活组织检查损伤的小鼠模型。在这种模型中,将具有外操作套的内窥镜插入至降结肠中部并且检查肛门直肠连接处的粘膜。接着,用具有3弗伦奇的直径的灵活活组织检查镊子去除整个粘膜和粘膜下层的单一全厚度区,从而避免穿透固有肌层。各小鼠在沿结肠的背侧的3-5个位点处经受活组织检查损伤(参见例如SenoH,2008,Proc Natl Acad Sci U S A.2009年1月6日;106(1):256-261)。在活组织检查损伤后2或3天,用分拣蛋白抗体处理小鼠的群。每天监测小鼠持续15天,以检查重量损失并且通过测量病变的表面积来检查伤口愈合。
实施例19:分析分拣蛋白抗体在视网膜变性中的保护性效应
拮抗剂抗分拣蛋白抗体降低发炎巨噬细胞的积聚和/或功能,并且因而延迟、预防和/或治疗年龄相关黄斑变性(AMD)。AMD是外层视网膜的变性疾病。认为发炎、尤其发炎细胞因子和巨噬细胞促进AMD疾病进展。在玻璃疣、布鲁赫氏膜、脉络膜和视网膜中记录了在AMD病变附近存在巨噬细胞。巨噬细胞释放组织因子(TF)和血管内皮生长因子(VEGF),其在患者中触发新血管形成的扩张,显示脉络膜新生血管。
存在于黄斑脉络膜中的巨噬细胞的类型随年龄改变,展示出与年轻人眼睛相比,在老人眼睛中的M2巨噬细胞的水平提高。然而,与相似年龄的正常尸检眼睛相比,晚期AMD黄斑具有较高M1:M2比例。(参见例如Cao X等人,(2011),Pathol Int 61(9):第528-35页)。这表明了在AMD进展的晚期发作中眼睛中的经典M1巨噬细胞活化之间的关联。
视网膜小胶质细胞是组织定居巨噬细胞,其通常还存在于内层视网膜中。如果发生损害,那么小胶质细胞可活化并且充当发炎的介体。活化的巨噬细胞已经在AMD组织样品中检测到并且已经被提出为导致AMD发病机理的发炎过程的潜在促成因素(Gupta等人,(2003)Exp Eye Res.,76(4):463-71.)。拮抗剂分拣蛋白抗体预防、延迟或逆转AMD的能力在一种或多种AMD模型中测试(参见例如Pennesi等人,(2012)Mol Aspects Med.;33(4):487–509)。
总的发炎巨噬细胞(M1和/或活化的小胶质细胞)被记录与AMD疾病进展相关并且因此表示拮抗剂分拣蛋白抗体的治疗标靶。在青光眼和遗传形式或视网膜变性(如色素性视网膜炎)中可实现相似的治疗益处。
在青光眼模型中测试抗分拣蛋白抗体预防、延迟或逆转视网膜神经节细胞变性的能力(参见例如El-Danaf等人,(2015).J Neurosci.11;35(6):2329-43;Demetriades等人,(2013)Invest Ophthalmol Vis Sci 54:Abstract 4940)。同样,测试抗分拣蛋白抗体在遗传诱导的视网膜变性和色素性视网膜炎中的治疗益处,如Chang等人,(2002)Vision Res.;42(4):517-25中,和Gargin等人,(2007)J Comp Neurol.500(2):222–238中;和“RetinalDegeneration Rat Model Resource Availability of P23H and S334the MutantRhodopsin Transgenic Rats and RCS Inbred and RCSCongenic Strains of Rats,”MMLaVail,2011年6月30日中所述。同样,可如Hans等人,(2010)Prog Retin Eye Res.;29(6):500–519中所述测试抗分拣蛋白抗体在病毒和毒素诱导的脉络膜和视网膜新生血管模型中的治疗益处。所述研究的终点包括视网膜电图描记术和眼底成像、光学相干断层扫描以及组织病理学。
实施例20:在感染模型中表征分拣蛋白抗体和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗 性用途
拮抗剂抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗效用在感染模型中测试。例如,可使用正常小鼠或颗粒蛋白前体杂合小鼠中的单核球增多性李斯特菌或其它感染,如先前所述(例如,Yin,F等人,(2009)J.Exp.Med,207,117-128)。
实施例21:在发炎疾病和骨病理的模型中表征分拣蛋白抗体和/或分拣蛋白双特 异性抗体的治疗性用途
抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗效用在发炎疾病的模型中测试。例如,类风湿性关节炎或在另一发炎疾病的确定的模型中(Mizoguchi(2012)Prog MolBiol Transl Sci.,105:263-320;和Asquith等人,(2009)Eur J Immunol.39:2040-4)。或者,抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体的治疗效用在椎间盘(IVD)变性的模型中测试(Zhao,PY等人,(2015).SCIENTIFIC REPORTS.5:9102)。
实施例22:筛选促进破骨细胞、小胶质细胞和/或神经元的存货的抗分拣蛋白抗体 和/或分拣蛋白双特异性抗体
通过用冷PBS冲洗胫骨和股骨骨髓细胞来获得鼠类骨髓前体细胞。在用PBS洗涤一次之后,使用ACK溶解缓冲液(Lonza)溶解红血球,用PBS洗涤两次并且以0.5×106个细胞/ml悬浮于具有所指示的量的50ng/ml M-CSF的完全RPMI培养基(10%FCS、Pen/Strep、Gln、neAA)中以产生巨噬细胞或10ng/ml GM-CSF。关于M2类型巨噬细胞,10ng/ml IL-4添加至培养的细胞中。关于M1类型巨噬细胞,添加50ng/ml IFN-γ。在一些实验中,LPS或酵母聚糖在第5天,以1μg/ml-0.01ng/ml的浓度添加至细胞培养物中。由Peprotech购买重组细胞因子。为了分析BM源性巨噬细胞的活力,如上制备所指示的表型的细胞并且在分级浓度的MCSF中培养。在非组织培养物处理的板中,细胞以105/200μl涂板于96孔板中(针对使用基于荧光素酶的分析的活力分析)或以0.5×106/1ml涂板于6孔板中(针对锥虫蓝排除细胞计数)。在第3天添加含有新鲜M-CSF的培养基。在所指示的时间点,用3mM EDTA小心地从所述板剥离细胞并且使用Burker腔室计数。在一些实验中,细胞还染色用于使用CD11b抗体和DAPI的FACS分析。或者,细胞直接地用ToxGlo试剂(Promega)孵育并且确定荧光素酶活性。在一些实验中,在第5天从培养基抽出或不抽出MCSF并且在36小时后通过FACS分析细胞活力。
在24孔盘中用RANKL和M-CSF使成熟破骨细胞培养物分化。4天后,完全培养基用无血清培养基取代以诱导细胞凋亡。在过夜血清饥饿期间,用RANKL、PBS和抗分拣蛋白和/或分拣蛋白双特异性抗体或同型匹配的对照抗体处理细胞。细胞固定于1%多聚甲醛中并且用基于TUNEL的试剂盒(Millipore Corporation)根据制造商的说明书染色。用NikonTE2000-E显微镜以20×放大率对凋亡的细胞核计数。结果表述为在所述两种孔的六个随机选择的场中的凋亡细胞相对于细胞总数的百分率,如所述(例如,Peng等人,(2010)SciSignal.,3(122):ra38)。用原代小胶质细胞执行相似分析。
实施例23:亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体的产生、鉴别和表征
材料和方法
分拣蛋白抗体筛选
使抗分拣蛋白抗体S-2、S-15、S-22、S-60和S-82(称作“亲本”抗体)亲和力成熟。简单地说,在酵母中针对开始亲本抗体中的每一者产生多样化抗体文库。通过使用标准分子克隆技术组合亲本重链CDR-H3和轻链(LC)来产生多样性,其中在重链(HC)的CDR-H1和CDR-H2区中具有预先存在的遗传多样性(称作“H1/H2”优化)。这产生大约108大小的六个文库,其准备用于选择以富集具有改进的亲和力的抗体。用于筛选所述文库的选择压力包括人和小鼠分拣蛋白抗原平衡滴定、亲本抗体Fab竞争动力学,和多特异性试剂取消选择的使用(如例如WO 2014/179363;Xu等人,Protein Eng Des Sel,第26(10)卷,第663-670页中所述)。接着使用FACS流式细胞术以使用标准技术显现并且选择抗体(参见例如Chao等人Nature Protocols,2006)。所需的群体接着被转入额外选择轮中。在6轮富集之后,析出酵母以便获得单一抗体分离物,其接着如实施例1中所述产生并且加以表征。因此获得来自所述六种开始亲本抗体中的每一者的五十种亲和力改进的抗体。
选择三种亲本抗体克隆用于第二轮亲和力成熟:1)S-60,因为第一轮亲和力成熟并未产生任何具有显著改进的亲和力的克隆;2)亲和力成熟的抗体克隆S-15-6;和3)亲和力成熟的抗体克隆S-15-10。所述亲和力成熟的克隆被选择用于第二轮亲和力成熟,因为这些克隆的亲和力和功能的差异在第一轮成熟中并未改进很多。关于第二轮亲和力成熟,重链可变区(VH)和轻链可变区(VK)序列均得到优化,尤其关注CDR-H3。
抗体IgG和Fab产生和纯化
使酵母克隆生长至饱和并且接着在30℃下在振荡下孵育持续48h。在诱导之后,酵母细胞集结成粒并且收集上清液用于纯化。免疫球蛋白使用蛋白A柱纯化并且用乙酸(pH2.0)洗脱。Fab片段通过木瓜蛋白酶消化产生并且经CaptureSelect IgG-CH1亲和力基质(LifeTechnologies)纯化。
亲和力确定
通过由ForteBio和MSD测量所述抗分拣蛋白抗体的KD来确定其亲和力。ForteBio亲和力测量一般地如先前所述(Estep等人,MAbs.2013年3月-4月;5(2):270-8)在室温下执行。简单地说,ForteBio亲和力测量通过将免疫球蛋白(IgG)线上装载至AHQ传感器上来执行。传感器离线在分析缓冲液中平衡持续30min并且接着线上监测持续60秒以用于基线建立。关于亲合力结合测量,使具有装载的IgG的传感器暴露于100nM抗原(人或小鼠分拣蛋白Fc融合)持续3min,之后将其转移至分析缓冲液中持续3min以用于离线测量。通过将生物素标记的分拣蛋白单体装载于SA传感器上并且暴露于溶液中的约100nM IgG来确定额外亲合力结合。通过将人或小鼠分拣蛋白Fc融合抗原装载至AHQ传感器并且随后暴露于约100nM分拣蛋白抗体Fab来获得单价结合测量。通过将生物素标记的人或小鼠分拣蛋白单体装载至SA传感器,随后暴露于溶液中的约100nM Fab来进行额外单价测量。在由ForteBio提供的数据分析软件中使用1:1结合模型拟合动力学数据。
关于MSD-SET KD测量,在具有恒定保持在100pM下的重组人或小鼠分拣蛋白的PBS+0.1%无IgG BSA(PBSF)中执行溶液平衡滴定(SET)并且用以大约50nM开始的抗体的3至5倍连续稀释液孵育。抗体(20nM于PBS中)在4℃下涂布于标准结合MSD-ECL板上过夜或在室温下持续30min。板接着在700rpm振荡下用1%BSA阻断持续30min,随后用洗涤缓冲液(PBSF+0.05%Tween 20)进行三次洗涤。SET样品被涂覆于所述板上并且在700rpm振荡下孵育持续150s,随后进行一次洗涤。用含250ng/ml的磺基标签标记的抗生蛋白链菌素的PBSF检测通过在板上孵育持续3min而在所述板上捕捉的抗原。所述板用洗涤缓冲液洗涤三次并且接着使用具有表面活性剂的1x读取缓冲液T在MSD Sector Imager 2400仪器上读取。百分比游离抗原在Prism中随经过滴定的抗体绘制曲线并且拟合至二次方程以推断出KD。为了改进通量,在MSD-SET实验(包括SET样品制备)中使用液体处置机器人。
在4°下使用用小鼠分拣蛋白短暂地转染或稳定地表达人分拣蛋白的HEK293T细胞执行细胞结合亲和力测量。简单地说,收集细胞,在PBS中洗涤并且用接近抗体的KD的量的抗体孵育(亲本结合于人分拣蛋白的KD:S2=1.1nM,S15=3.3nM,S22=2.4nM,S60=1.0nM,S82=1.4nM;结合于小鼠分拣蛋白的Kd:S2=6.6nM,S15=6.4nM,S22=5.0nM)。抗体稀释于FACS缓冲液(PBS+2%FBS+0.01%叠氮化钠)中。在冰上孵育1h之后,细胞在FACS缓冲液中洗涤三次并且在冰上用抗人PE缀合的第二抗体(BD Biosciences,1:100稀释)孵育持续30min。接着细胞在200ul FACS缓冲液中洗涤两次,并且随后在FACS Canto或iQE FACS筛选仪器(Intellicyt Corp)上进行分析。选择具有增加的与人和小鼠分拣蛋白的结合(测量为PE的中值荧光强度)的最高三种抗体进行进一步分析。
关于与细胞表达的分拣蛋白的表观亲和力的确定,将抗体以针对人分拣蛋白0.16-40nM和针对小鼠分拣蛋白0.39-50nM的滴定添加至细胞中,并且通过非线性曲线拟合(经过修改的OneSiteTotal,Graph Pad Prism)确定其结合KD
如实施例5中所述执行U-251和N2A细胞中的分拣蛋白下调、细胞上的颗粒蛋白前体(PGRN)阻断和U-251细胞的PGRN分泌。
结果
抗分拣蛋白抗体选择
进一步表征与相应的亲本抗体相比显示改进的亲和力的亲和力成熟的抗分拣蛋白克隆。在所有亲和力成熟的抗体克隆的初始筛选之后,选择针对各亲本抗体的克隆进行进一步分析。
抗体重链和轻链可变域序列
使用标准技术,确定编码所选择的亲和力成熟的抗体克隆的重链可变域和轻链可变域的氨基酸序列。S-2抗体变体的EU或KabatCDR序列陈述于表11中,S-15抗体变体陈述于表12中,S-22抗体变体陈述于表13中,S-60抗体变体陈述于表14中,并且S-82抗体变体陈述于表15中。
Figure BDA0001494797660002931
Figure BDA0001494797660002941
Figure BDA0001494797660002951
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Figure BDA0001494797660003011
Figure BDA0001494797660003021
亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体结合的表征
关于所选择的亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体的细胞结合亲和力在表16A和16B中示出。在所述表中,“N.B.”指示无结合,“P.F.”指示不良拟合,“N.D.”指示未确定,“Bt-”指示生物素标记的,“hSort”指示人分拣蛋白,“msSort”指示小鼠分拣蛋白,并且“(M)”指示单价。
表16A:顶级亲和力成熟的抗体克隆的亲和力
Figure BDA0001494797660003031
表16B:顶级亲和力成熟的抗体克隆的亲和力
Figure BDA0001494797660003041
接着,使亲和力成熟的抗体彼此并且与其相应的亲本抗体比较其降低人U-251和小鼠N2A细胞中的分拣蛋白的原生细胞表面水平的能力。抗体以可变浓度添加至所述细胞中持续72小时并且通过FACS使用不同于所述测试抗体的仓的DyLight缀合抗体(S-29-DyLight650或S-30-DyLight650)测量分拣蛋白水平。亲和力成熟的抗体总体显示降低人和小鼠细胞中的分拣蛋白的原生细胞表面水平的能力增强(图13A-13G),尤其在1.25nM的最低抗体(IgG)浓度下。
测试亲本抗体S-15和源于其的亲和力成熟的抗体阻断15nMPGRN与HEK293T细胞上表达的分拣蛋白的结合的能力。如图14所示,如与亲本S-15抗体相比,S-15的亲和力成熟的抗体克隆(例如,S-15-1至S-15-7,和S-15-12至S-15-14)诱导阻断15nM PGRN与分拣蛋白的结合的能力的微小增加。
总之,我们已经鉴别出多达三种具有改进的与人和小鼠分拣蛋白的结合并且具有改进的下调分拣蛋白水平和/或阻断PGRN结合的功能性的亲和力成熟的克隆。
结果指示了亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体的鉴别,如与相应的亲本抗体相比,其具有改进的与人分拣蛋白和小鼠分拣蛋白的结合并且具有改进的降低分拣蛋白的原生细胞表面水平和/或阻断PGRN结合于分拣蛋白的功能性。
实施例24:抗分拣蛋白抗体的表位定位
材料和方法
结合于线性表位
如下文所述对抗体表位定位。关于抗原的表征,使用配备有HM4相互作用模块的Ultraflex III MALDI ToF(Bruker)执行测量。这种模块含有被设计成以纳摩尔灵敏性优化检测高达2MDa的特殊检测系统。
使抗原和抗体样品混合至分别为1μM至0.5μM的最终浓度。使1μl所获得的混合物与1μl由乙腈/水(1:1,v/v)、TFA 0.1%中的再结晶的芥子酸基质(10mg/ml)构成的基质(K200MALDI试剂盒)混合。在混合后,将1μl各样品滴于MALDI板(SCOUT 384)上。在室温下结晶之后,所述板被引入MALDI质谱仪中并且立即进行分析,并且一式三份重复分析。
使用K200MALDI MS分析试剂盒使准备用于对照实验的混合物交联。9微升的所述混合物与1μl K200稳定剂试剂(2mg/ml)混合并且在室温下孵育。在孵育时间(180分钟)之后,所述样品准备用于关于对照实验的MALDI分析。在结晶之后立即通过High-Mass MALDI分析所述样品。
为了测试结合表位是否具有线性性质,用固定的胃蛋白酶对重组人分拣蛋白抗原执行蛋白水解。使50微升在4μM浓度下的所述抗原与在2.5μM下的固定的胃蛋白酶混合并且在室温下孵育持续30分钟。在孵育时间之后,使样品离心并且用移液管吸移上清液。通过High-Mass MALDI质谱方法以线性模式和反射模式控制所述蛋白水解的完成。优化胃蛋白酶蛋白水解以便获得大量在1000-3500Da范围内的肽。使5微升通过蛋白水解产生的抗原肽与5μl在2μM下的S-2-11、S-15-6、S-60、S-22-9或S-82-8抗体混合并且在37℃下孵育持续2小时。其后,使所述混合物与5μl在2μM下的完整抗原混合。如上所述执行抗体与抗原之间的相互作用。
分拣蛋白抗原的肽质量指纹和结合界面的表征
关于肽指纹,使10μl分拣蛋白(5μM)与10μl抗体(2.5μM)混合。添加2μl DSS d0/d12(2mg/mL;DMF),随后在室温下孵育3h。反应通过添加2μl在400mM下的碳酸氢铵(最终=20mM),随后在室温下孵育1h来停止。使用speedvac使所述溶液脱水,接着用20μl H2O 8M尿素悬浮。在混合之后,2μl DTT(500mM)添加至所述溶液中。所述混合物接着在37℃下孵育1小时。在孵育之后,添加2μl碘乙酰胺(1M),接着在暗室中在室温下孵育1小时。在孵育之后,添加80μl蛋白水解缓冲液。随后,使100μl还原/烷基化的抗原与来自Roche Diagnostics的消化酶(1.66μl胰蛋白酶或0.83μl胰凝乳蛋白酶或0.83μl ASP-N或1.66μl弹性蛋白酶或3.32μl嗜热菌蛋白酶)混合并且在37℃(胰蛋白酶、ASP-N、弹性蛋白酶)、25℃(胰凝乳蛋白酶)或70℃(嗜热菌蛋白酶)下孵育过夜。在消化后,最终1%的甲酸添加至所述溶液中。所述样品接着被提交至Atlantis dC18 3μM 2.1*30mm柱上的SPE洗涤。
在蛋白水解之后,将10μl所产生的肽装载至纳米液相色谱系统(Ultimate 3000,Dionex)中并且执行LTQ orbitrap质谱方法。
为了以高分辨率确定分拣蛋白抗原上抗体S-2-11、S-15-6、S-22-9、S-60和S-82-8的表位,用氘化交联剂孵育抗体/抗原复合物并且使其经受多酶裂解。在交联的肽的富集之后,通过高分辨率质谱方法(nLC-Orbitrap MS)分析所述样品并且使用XQuest和Stavrox软件分析所产生的数据。使用与Orbitrap质谱方法组合的nLC。使5微升抗原样品(浓度4μM)与5μl抗体样品(浓度2μM)混合以便获得具有最终浓度2μM/1μM的抗体/抗原混合物。所述混合物在37℃下孵育持续180分钟。在第一步中,使1mg d0交联剂与1mg d12交联剂混合。使所制备的2mg与1ml DMF混合以便获得DSS do/d12的2mg/ml溶液。使10微升先前制备的抗体/抗原混合物与1μl交联剂d0/d12的溶液(2mg/ml)混合。所述溶液在室温下孵育180分钟以便完成交联反应。使10微升交联的溶液与40μl碳酸氢铵(25mM,pH 8.3)混合。在混合之后,2μlDTT(500mM)添加至所述溶液中。所述混合物在55℃下孵育1小时。在孵育之后,添加2μl碘乙酰胺(1M)并且接着在暗室中在室温下孵育持续1小时。在孵育之后,通过添加120μl用于蛋白水解的缓冲液对所述溶液进行1/5稀释。使145μl还原/烷基化的抗原与0.7μl胰蛋白酶、0.35μl胰凝乳蛋白酶、0.35μl ASP-N、0.7μl弹性蛋白酶或1.4μl嗜热菌蛋白酶混合。所述蛋白水解混合物在37℃(胰蛋白酶、ASP-N、弹性蛋白酶)或25℃(胰凝乳蛋白酶)或70℃(嗜热菌蛋白酶)下孵育过夜。接着使用Xquest版本2.0和Stavrox 2.1软件分析交联剂肽。
结果
结合于线性表位
亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体S-2-11、S-15-6和S-60各自在1:1化学计量的复合物中结合于分拣蛋白。这种结合并未通过肽的存在而受到抑制(图15)。亲和力成熟的抗分拣蛋白抗体S-22-9和S-82-8各自与分拣蛋白形成1:1和1:2(抗体:抗原)复合物。这些复合物并未通过任一肽的存在而受到抑制。图15还指示了分拣蛋白肽并未与抗体S-2-11竞争结合于分拣蛋白。我们观察到,关于抗体S-15-6、S-22-9、S-82-8和S-60也观察到分拣蛋白肽竞争的相似缺乏。结果指示了针对抗体S-2-11、S-15-6、S-22-9、S-82-8和S-60的结合表位是构象和/或不连续的。这与不能使用肽文库方法将抗体S-2-11、S-15-6、S-22-9、S-82-8和S-60定位于分拣蛋白上是一致的。
分拣蛋白抗原的肽质量指纹和结合界面的表征
在胰蛋白酶蛋白水解之后,在分拣蛋白的序列中鉴别出52种肽,覆盖所述序列的57.72%。在胰凝乳蛋白酶蛋白水解之后,在分拣蛋白的序列中鉴别出73种肽,覆盖所述序列的81.12%。在ASP-N蛋白水解之后,在分拣蛋白的序列中鉴别出12种肽,覆盖所述序列的24.22%。在弹性蛋白酶蛋白水解之后未在分拣蛋白的序列中鉴别出肽。在嗜热菌蛋白酶蛋白水解之后,在分拣蛋白的序列中鉴别出2种肽,覆盖所述序列的1.47%。使来自所有蛋白水解的肽组合,覆盖分拣蛋白序列的94.78%(图16A)。由于分拣蛋白细胞外域的94.78%由蛋白水解所产生的肽覆盖,相信使用这种方法未丢失表位。
表17概述了交联实验的结果以确定表位。嗜热菌蛋白酶消化并未产生针对所述抗体中任一者的任何可检测的肽。关于抗体S-2-11、S-15-6和S-22-9,鉴别出两种不同的表位。关于抗体S-60和S-82-8,鉴别出单一表位。在所述表中,交联的氨基酸以粗体字描绘。
表17A:肽的数目
Figure BDA0001494797660003091
表17B:分拣蛋白抗体结合区
Figure BDA0001494797660003092
如表17中所指示,由抗体S-2-11识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260和297-317并且具有氨基酸序列:NGLWVSKNFGGKWEEIHKAVCLAK(SEQ ID NO:703)和KTIGVKIYSFGLGGRFLFA SV(SEQ ID NO:699)。此外,所述肽内的交联的残基对应于SEQ IDNO:1的氨基酸残基237-260内的残基K243和K248;和SEQ ID NO:1的氨基酸残基297-317内的残基S305、R311和S316。由抗体S-15-6识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247和314-338并且具有氨基酸序列:NGLWVSKNFGG(SEQ ID NO:700)和FASVMADKDTTRRIHVSTDQGDTWS(SEQ ID NO:701)。此外,所述肽内的交联的残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-247内的残基S242和K243;和SEQ ID NO:1的氨基酸残基314-338内的残基S316和R325。由抗体S-22-9识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-227和237-260并且具有氨基酸序列:FVQTDLPFHPLTQMMYSPQNS(SEQ ID NO:702)和NGLWVSKNFGGKWEEIHKAVCLAK(SEQ ID NO:703)。此外,所述肽内的交联的残基对应于SEQ IDNO:1的氨基酸残基207-227内的残基T210、T218和S223;和SEQ ID NO:1的氨基酸残基237-260内的残基K243、K248和K254。由抗体S-60识别的肽对应于SEQID NO:1的氨基酸残基207-231并且具有氨基酸序列:FVQTDLPFHPLTQMMYSPQNSDYLL(SEQ ID NO:704)。此外,所述肽内的交联的残基对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基207-231内的残基T218、Y222、S223和S227。由抗体S-82-8识别的肽对应于SEQ ID NO:1的氨基酸残基367-391并且具有氨基酸序列:EPGDTGFGTIFTSDDRGIVYSKSLD(SEQ ID NO:705)。此外,所述肽内的交联的残基对应于SEQID NO:1的氨基酸残基367-391内的残基S379、R382和Y386
功能性定位
使用突变型引物产生分拣蛋白突变型变体HVPLVIMT131QVPLVIVS(SEQ ID NO:706)(其中野生型分拣蛋白氨基酸序列的加下划线的残基H、M和T已经分别用Q、V和S取代)和S595R并且将其克隆至质粒载体pCMV-AC-IRES-GFP(Origene)中。根据制造商的说明书使抗分拣蛋白抗体S-30和S-60与DyLight 650抗体标记试剂盒(Thermo Scientific Pierce)缀合。
使用Fugene HD(Promega)根据制造商的说明书用所述质粒短暂地转染HEK293T细胞。24小时后收集经过转染的HEK293T细胞,用PBS洗涤,并且在冰上在FACS缓冲液(PBS+2%FBS)中用5μg/ml抗体孵育持续一小时。细胞随后用200μl FACS缓冲液洗涤两次并且在FACSCanto和FlowJo软件上进行分析。选择GFP阳性细胞并且将分拣蛋白表达测量为APC通道中的中值荧光强度。
分拣蛋白突变体HVPLVIMT131QVPLVIVS强烈地降低抗体S-30的结合(图16B),而抗体S-60的结合未降低。相比之下,抗体S-60与分拣蛋白突变体S595R的结合强烈地降低(图16C),而抗体S-30的结合未降低。这些结果指示了,分拣蛋白的131HVPLVIMT138肽内的氨基酸必需用于S-30结合,并且残基S595对于S-60结合于分拣蛋白至关重要。
实施例25:分拣蛋白与神经紧张素之间的相互作用的表征
材料和方法
在25℃下在BiaCore T200仪器上以1Hz的速率收集表面等离子体共振(SPR)数据。使用BiaCore T200评估软件(版本2.0)执行数据分析。HBS-EP+(100mM HEPES、1.5M NaCl、30mM EDTA、0.5%v/v表面活性剂P20,pH 7.4)用作电泳缓冲液并且用于制备试剂。
将组氨酸标记的人分拣蛋白(25nM;R&D Biosystems)捕捉(60s接触时间,30μl/min流动速率,0s稳定化时间)于用抗组氨酸IgG固定的CM5传感器芯片(GE Healthcare)上。接着使含有0nM、100nM或500nM神经紧张素(NTS;Sigma)的人颗粒蛋白前体(PGRN;50nM;AdipoGen)流过被捕捉的分拣蛋白表面(60s接触时间,30μl/min流动速率,30s解离时间)。所述芯片表面在各循环之间使用10mM甘氨酸-HCl(pH 1.7)再生(60s接触时间,30μl/min流动速率,60s稳定化时间)。所得SPR信号作为对空白流动池执行的测量的反应差异获得。
将抗分拣蛋白抗体S-15(25nM)、S-22(25nM)、S-49(25nM)和S-60(25nM)捕捉(60s接触时间,30μl/min流动速率,0s解离时间)于用抗人IgG(Jackson Labs)固定的CM5传感器芯片(GEHealthcare)上。用0nM、100nM、500nM或10,000nM神经紧张素(NTS;Sigma)预孵育人分拣蛋白(100nM;R&D Biosystems)并且接着使其流过被捕捉的抗分拣蛋白表面(60s接触时间,30μl/min流动速率,30s解离时间)。所述芯片表面在各循环之间使用10mM甘氨酸-HCl(pH 1.7)再生(60s接触时间,30μl/min流动速率,60s稳定化时间)。所得SPR信号作为对空白流动池执行的测量的反应差异获得。
结果
如图17A所示,神经紧张素的共注射阻断了重组人颗粒蛋白前体(PGRN)与人分拣蛋白的结合,确认了PGRN和神经紧张素结合于分拣蛋白上的同一位点。为了测试抗分拣蛋白抗体(S-15、S-22、S-49和S-60)是否与神经紧张素一样结合于分拣蛋白上的同一位点,捕捉所述芯片上的抗体并且接着共注射用不同剂量的神经紧张素预孵育的分拣蛋白。关于抗体S-15、S-22和S-49仅观察到抗体与分拣蛋白抗原的结合的微小降低(图17B、17C和17D)。然而,并未观察到S-60与分拣蛋白的结合的降低(图17E)。如实施例4所示,抗体S-60为阻断PGRN与分拣蛋白的结合的PGRN阻断抗体。结果指示了,抗体S-15、S-22、S-49和S-60不在神经紧张素结合位点处结合分拣蛋白。由于神经紧张素可阻断PGRN与分拣蛋白的结合,但无法阻断抗体S-60的结合,相信抗体S-60阻断PGRN结合于分拣蛋白的能力是通过分拣蛋白上的PGRN结合位点附近的S-60结合来实现,并且可能通过位阻,而非通过对分拣蛋白上的PGRN结合位点的直接竞争来闭塞PGRN结合位点。此外,抗体S-15、S-22、S-49和S-60表示仓2、3、4和5(n.d.),其表明了实施例1和23中列出的也属于仓2、3和4的抗分拣蛋白抗体不在神经紧张素结合位点处结合分拣蛋白。
实施例26:细胞中的分拣蛋白水平的降低
材料和方法
使用RosetteSep人单核细胞富集混合液(STEMCELL Technologies),根据制造商的协议从肝素化人血液(Blood Centers of the Pacific)分离人原代单核细胞。将单核细胞接种于含有10%胎牛血清(Hyclone)和用于诱导分化为巨噬细胞的50μg/ml M-CSF(Peprotech)或用于诱导分化为树突状细胞的100μg/ml IL-4+100μg/ml GM-CSF(Peprotech)的RPMI(Invitrogen)中。5天后,收集细胞。关于巨噬细胞,使用细胞刮棒仅收集到附接于所述板的细胞。关于树突状细胞,收集到呈悬浮形式的细胞。在PBS中洗涤之后,将细胞以0.4Mi/孔涂板于12孔板中。
将50纳摩尔浓度的全长抗分拣蛋白抗体(IgG)或抗分拣蛋白抗体Fab添加至各孔中并且孵育持续48h。接着在冰上使用具有蛋白酶抑制剂(Life Technologies)的RIPA缓冲液(Thermo Fisher Scientific)使细胞溶解。收集溶解产物并且在4℃下在10,000xg下离心持续10min。收集上清液并且使用BCA试剂盒根据制造商的说明书(Thermo FisherPierce)测量蛋白浓度。使用以下抗分拣蛋白抗体:S-2-11、S-5、S-15-6、S-22-9、S-60和S-82-8。
将每个泳道15微克蛋白装载至4-12%Bolt Bis-Tris蛋白凝胶(LifeTechnologies)上并且在150V下跑胶持续45min。使用iBlot根据制造商的说明书(LifeTechnologies)将蛋白转移至PVDF膜上。所述膜接着在TBS+0.05%Triton(TBST)中洗涤并且在RT下在TBST+5%BSA中阻断持续至少一小时。使用在TBST中稀释的抗神经紧张素(BDBiosciences,1:200)标记分拣蛋白并且使用在TBST中稀释的抗β肌动蛋白(Santa Cruz,1:500)标记肌动蛋白,在4℃下孵育过夜。膜接着用TBST洗涤三次并且在RT下在抗小鼠-HRP缀合的第二抗体(Jackson Laboratories)中孵育持续一小时。膜再次在TBST中洗涤三次并且在ECL Western检测试剂(GE Life Sciences)中孵育持续1min并且在Amersham Imager600(GE Life Sciences)上成像。
结果
与对照物(对照物、对照人IgG1和人IgG1Fab)相比,用50nM抗分拣蛋白S-2-11、S-15-6、S-22-9和S-82-8的全长抗体或Fab片段处理会导致在48h内人原代巨噬细胞(图18A)和人原代树突状细胞(图18B)中的分拣蛋白表达的强烈降低。抗分拣蛋白抗体S-60仅诱导人原代单核细胞中的分拣蛋白表达的微弱降低,即使其能几乎完全地消除分拣蛋白的细胞表面水平(图18A和18B)。抗分拣蛋白抗体S-5并未诱导人原代单核细胞中的分拣蛋白表达的降低(图18A和18B)。使用抗体S-5时的结果与抗体S-5不能降低U-251细胞中的分拣蛋白的细胞表面水平一致(实施例5和图10)。这些结果指示了抗分拣蛋白抗体S-5是纯PGRN结合阻断剂。
图18中描绘的结果指示了,源于患者血样的人原代骨髓细胞可用于测量降低分拣蛋白的水平的抗分拣蛋白抗体的体内活性。也已经用小鼠证明了体内相似结果。
实施例27:体内分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用的表征
材料和方法
重组抗分拣蛋白抗体如William J.Harris和John R.Adair,Eds.(AntibodyTherapeutics,1997)中所述通过标准程序克隆至表达质粒中并且在HEK293T细胞中产生。其中克隆所述抗体的表达质粒含有共有人或鼠类IgG1恒定重链和轻链区,包括重链Fc中防止所述抗体的糖基化的N297A突变。
C57BL6小鼠(Taconic)、分拣蛋白基因剔除小鼠或分拣蛋白杂合小鼠在第0天腹膜内注射40mg/kg IgG。使用以下抗分拣蛋白抗体:S-2-11、S-15-6、S-20和S-30。
在4h后并且在第2、5、8和12天收集血液以分离血浆和白血球。关于血浆分离,将血液收集于肝素化管中并且在4℃下在10,000xg下离心持续10min。收集血浆上清液,存储于-80℃下。关于后续白血球分离,添加1×体积的PBS+1mM EDTA并且通过涡旋使细胞再悬浮。添加10×体积的1×ACK溶解缓冲液(Lonza)并且细胞在冰上孵育持续10min并且随后在4℃下在500xg下离心持续10min。弃去上清液并且使细胞再悬浮于10×体积的ACK溶解缓冲液中,并且再次在冰上孵育持续5min并且随后在4℃下在500xg下离心持续10min。细胞在1mlPBS+1mM EDTA中洗涤,再次短暂离心,并且弃去上清液并且将细胞集结粒存储于-80℃下。
为了从白血球分离蛋白,将细胞集结粒再悬浮于50μl含有蛋白酶抑制剂混合液的N-Per(Thermo Scientific Pierce)中。所述溶液在冰上孵育持续20min并且在4℃下在10,000xg下离心持续10min。收集上清液,通过BCA测量并且如先前部分所述装载于蛋白凝胶中。使用定制的ELISA分析来确定血浆中的人IgG1抗体的水平。简单地说,96孔板在4℃下用0.1μg/孔的对IgG具特异性的山羊抗人Fab片段(Jackson Immuno)涂布过夜。板在200μl洗涤缓冲液(PBS+0.05%Tween)中洗涤三次并且在RT下在结合缓冲液(PBS+1%BSA)中阻断持续1h。将血浆稀释于结合缓冲液中并且添加至阻断的板中并且在37℃下孵育持续1h。板随后在200μl洗涤缓冲液中洗涤三次并且在RT下用1:10,000稀释于结合缓冲液中的抗人Fc特异性HRP缀合的第二抗体(Jackson Immuno Research)孵育持续1h。板在洗涤缓冲液中洗涤三次并且接着添加100μl TMB底物并且孵育,直至充分显色。所述反应通过添加50μl 2N硫酸而停止并且在SynergyH1板式读取器(Biotek)上对板进行读取。对照IgG1抗体以16-1000pM的标准浓度使用。使用相似的ELISA设置测试小鼠IgG1抗体的水平。板用0.1μg/孔的重组小鼠分拣蛋白(R&D Systems)涂布并且对山羊IgG具特异性的抗小鼠Fc(JacksonImmuno Research)以1:10,000稀释于结合缓冲液(PBS+3%BSA)中用作检测抗体。所注射的抗体用作37-3000pM的标准物。
使用来自R&D Systems的Duoset ELISA试剂盒根据制造商的协议测量小鼠颗粒蛋白前体(PGRN)的水平。使用Western印迹和如实施例25中所述的其定量来测量白血球的溶解产物中的分拣蛋白水平。
关于将抗体ICV输注至小鼠脑中,对小鼠植入皮下Alzet渗透微型真空泵(型号1002,流动速率=0.25μl/h),所述微型真空泵涂布并且预填充有所述抗体(2mg/ml)并且连接至Alzet套管(BrainInfusion Kit 3)用于单侧ICV施用。在手术之前,根据由Alzet提供的指令起动微型真空泵。简单地说,所有包装、瓶、注射器和手套均喷射有70%乙醇。所述微型真空泵使用清洁的针和注射器用所需的测试物件填充。其接着用异丙醇浸泡的组织清洁并且在37℃下放入无菌0.9%生理盐水的容器中过夜以起动所述泵。
使用配备有面罩的汽化器使用异氟烷+氧气使小鼠麻醉。其后,将各小鼠放置于立体定位框内的可调节的加热垫上。虽然在立体定位框上,所述小鼠继续经由鼻椎体接收异氟烷麻醉。小鼠接着在颅骨上的切开位点处接收马卡因(布比卡因+肾上腺素)的局部应用。覆盖颅骨的皮肤用外科纱布和聚维酮碘清洁,并且接着用外科纱布上的75%乙醇擦拭。使用解剖刀通过覆盖颅骨的皮肤产生1-cm中央矢状切口,从而使骨骼暴露。使用具有0.9%生理盐水或3%H2O2的无菌棉签来清洁手术区域中的任何血液。使用止血钳来夹紧皮瓣并且在侧面收缩。一旦用解剖刀刮掉筋膜和骨膜,有可能使前囱显现。首先沿肩胛骨/背部皮下植入所述微型真空泵,至脊柱的左侧或右侧。接着,用所述解剖刀的尖端或细尖记号笔标记钻孔的位置,并且用手动钻头在颅骨中钻孔,小心不要损害下层硬脑膜或脑组织。将附接至所述微型真空泵的Alzet套管(Kit 3)插入侧脑室或海马中。用于侧脑室的套管的尖端的座标为:前后轴(AP)=距前囱-0.3mm,内侧-外侧(ML)=距中线-1.0mm并且腹部(V)=距硬脑膜-1.7mm,牙棒设定于处0mm。在手术后,小鼠被个别地圈养于笼中并且随意提供食物和水。小鼠的条件在手术后每天加以监测。在终止时间点,对所有小鼠实施安乐死。在安乐死或自发死亡后,打开微型真空泵植入位点并且记录观察结果,包括坏死或流体积聚的任何病征。
关于外周注射至小鼠中,根据标准程序腹膜内(IP)或静脉内(IV)施用无菌PBS中的抗体。抽取50-200μl血样并且收集至肝素化管中。随后,所述血样在4℃下在2,000xg下离心持续10min并且收集血浆。
将脑部剖成左和右海马、前额皮质和枕叶皮质。为了制备脑溶解产物,连同蛋白酶和磷酸酯酶抑制剂添加20μl N-Per/mg组织。借助于超声作用破坏组织和细胞。在破坏后,组织和N-per混合物在冰上孵育持续30min并且随后用20,000xg短暂离心持续30min。收集上清液并且存储于-80℃下直至分析。使用ELISA分析来测量脑溶解产物样品中的抗分拣蛋白抗体和小鼠PGRN水平。
结果
在第0天将抗分拣蛋白抗体S-2-11、S-15-6、S-20和S-30以40mg/kg腹膜内注射至小鼠中。在第0(注射后4h)、2、5、8和12天使用定制的ELISA分析来测量抗体水平。使用定制的Excel插件测量血清半衰期。如图19A所示,呈huIgG1N297A形式的抗体S-20具有0.9天的半衰期,而同型对照抗体(huIgG1N297A)具有4.2天的半衰期。在Fc区中具有防止糖基化并且因此防止结合于Fc受体的N297A突变的鼠类或人IgG1N297A抗体用于这些实验中。
如图19B所示,抗分拣蛋白抗体S-2-11、S-15-6、S-20和S-30的鼠类IgG1N297A形式具有介于0.5天至2.0天范围内的半衰期。
所述抗分拣蛋白抗体具有比对照IgG短的半衰期,相信这是标靶衔接的结果。如图19所示,抗体S-15-6和S-20具有所述抗分拣蛋白抗体中的最长半衰期。
接着使用小鼠PGRN Duoset ELISA试剂盒(R&D Systems)来测试所述抗分拣蛋白抗体以确定其是否可诱导小鼠的血浆中的PGRN的蛋白水平的改变。诱导细胞中的分拣蛋白水平的降低(图10和18)的抗分拣蛋白抗体S-2-11、S-15-6和S-20还能够诱导小鼠的血浆中的PGRN蛋白水平的大约4倍增加(图20A至20D)。虽然由抗体S-2-11诱导的PGRN蛋白水平的增加看来是间歇的,但抗体S-20和S-15-6诱导PGRN蛋白水平的显著增加持续长达8天(图20A至20D)。纯PGRN结合阻断剂抗体S-30还能够在4小时后显著地增加PGRN水平(图20A和20B)。结果表明不诱导分拣蛋白的细胞水平的降低的PGRN阻断性抗分拣蛋白抗体也可增加PGRN的蛋白水平。然而,如与仅阻断分拣蛋白与PGRN之间的相互作用的抗分拣蛋白抗体相比诱导分拣蛋白的细胞水平的降低(如抗体S-15-6和S-20),并且还能够诱导延长的对PGRN蛋白水平的影响的抗分拣蛋白抗体被认为更加适用于体内功效研究。
为了确认由抗分拣蛋白抗体S-2-11、S-15-6和S-20诱导的PGRN蛋白水平的增加是归因于对分拣蛋白的细胞水平的降低的诱导,使从经过处理的小鼠获得的白血球样品的溶解产物在蛋白凝胶上跑胶并且通过Western印迹进行测试。在注射后五天,抗体S-2-11、S-15-6和S-20诱导白血球中的分拣蛋白的水平的强烈降低(图21A和21B)。在用抗体S-2-11、S-20和S-30处理后十二天来自小鼠的白血球样品显示了分拣蛋白的水平已经返回对照水平(图21C和21D)。然而,在用抗体S-15-6处理后十二天来自小鼠的白血球样品仍显示降低的分拣蛋白的水平(图21C和21D)。抗体S-30看来并未诱导分拣蛋白水平的降低(图21A至21D),这与体外结果一致(表10)。抗分拣蛋白抗体S-30为特异性PGRN阻断剂。
为了测量长期注射后的标靶衔接,一周一次对小鼠注射20、40或80mg/kg的抗体S-15-6或msIgG1对照抗体持续六周。35天后,从全血样品分离白血球。在从处于所有注射剂量下的小鼠获得的样品中可见分拣蛋白水平的强烈降低(图21E和21F)。这些结果指示了可实现持久标靶衔接。
为了测量脑中分拣蛋白抗体的标靶衔接,使用Alzet渗透微型真空泵将抗分拣蛋白抗体S-15、S-20、S-30的人IgG1N297A形式以及人同型对照抗体输注至小鼠脑部的右侧脑室中。在输注两周后,将脑部剖成左对右海马、前额皮质和枕叶皮质。从这些区域产生溶解产物并且使用ELISA分析来测量人IgG水平。如图22A至22C所示,当抗体(IgG)水平针对PGRN蛋白水平绘制曲线时,在两种变量之间发现强烈正相关,指示了增加的抗分拣蛋白抗体剂量可增加脑中的PGRN蛋白水平。在对照IgG水平与PGRN蛋白水平之间未观察到所述相关(图22D)。
为了确定由抗分拣蛋白抗体诱导的对PGRN蛋白水平的影响是否是归因于分拣蛋白水平的降低而非任何脱靶效应,在分拣蛋白基因剔除(KO)小鼠中,并且在分拣蛋白杂合(Het)和野生型(WT)同窝出生者中测试抗体S-15-6的人IgG1N297A形式(huIgG)。在血浆中测量抗体S-15-6的水平并且观察到当表达的分拣蛋白的水平降低时,所述抗体的半衰期急剧地增加(图23A)。结果指示了抗体S-15-6特异性地识别分拣蛋白并且有可能在受体参与时(即,结合于分拣蛋白)再循环并且降解。
还确定了分拣蛋白基因剔除小鼠中的PGRN水平。如与野生型(WT)同窝出生者相比,分拣蛋白基因剔除小鼠(KO)中的PGRN蛋白的基线水平是4倍高(图23B)。另外,在分拣蛋白基因剔除小鼠以及杂合(Het)和野生型(WT)同窝出生者中以单一剂量注射40mg/kg的抗体S-15-6,并且使用ELISA分析来测量PGRN蛋白水平。图23C中的结果示出了,虽然抗体S-15-6注射至野生型和分拣蛋白杂合小鼠中会强烈地增加PGRN蛋白水平,但在分拣蛋白基因剔除小鼠中未观察到PGRN蛋白水平的进一步增加,指示了抗体S-15-6特异性地通过降低分拣蛋白的水平而增加PGRN蛋白水平。
实施例28:抗分拣蛋白抗体改善小鼠中胶原蛋白诱导的关节炎的症状
材料和方法
在研究第0和21天,用异氟烷使小鼠麻醉并且在尾基处给予总计100μl含II型胶原蛋白的弗氏完全佐剂的皮内注射。胶原蛋白通过在0.01N乙酸中制备4mg/ml溶液来制备。通过手动混合使相等体积的胶原蛋白和5mg/ml弗氏佐剂乳化。在研究第0天,小鼠基于体重被随机分至各处理组。在登记后,开始处理。在第0和21天注射胶原蛋白。在研究第0、3、7、10、14、17、21、24和28天腹膜内注射40mg/kg的呈小鼠IgG1N297A形式的抗体S-15-6,或对照抗体MOPC-21。每天给予地塞米松。
在登记后记录小鼠的体重和所有四只爪的临床评分。接着从研究第18至35天每天测量爪评分。测试物件的总体功效是基于每天爪评分,和爪评分随时间的曲线下面积(AUC)计算。
如下确定临床爪评分:
0=正常
1=1个后爪或前爪关节受影响或最小程度弥漫性红斑和肿胀
2=2个后爪或前爪关节受影响或轻微弥漫性红斑和肿胀
3=3个后爪或前爪关节受影响或中等程度弥漫性红斑和肿胀
4=显著弥漫性红斑和肿胀,或4个趾关节受影响
5=严重弥漫性红斑和整个爪严重肿胀,不能使趾弯曲
结果
用40mg/kg的抗分拣蛋白抗体S-15-6对动物给药会导致临床爪评分的适度、但统计学显著的降低,以及疾病发作的一天延迟(图24)。表18A和18B示出了使用t测试和两因素ANOVA计算的p值,指示了图24中描绘的结果的统计学显著性。
表18A:T测试
S15-6(40)对PBS S15-6(40)对MOPC-21 MOPC-21
25 0.299 0.299 0.797
26 0.083 0.048 0.905
27 0.046 0.002 0.417
28 0.031 0.000 0.263
29 0.055 0.001 0.252
30 0.031 0.002 0.368
31 0.048 0.002 0.188
32 0.040 0.003 0.279
33 0.046 0.005 0.335
34 0.037 0.007 0.474
35 0.037 0.007 0.474
表18B:两因素ANOVA
个别比较 p值
PBS对原生 <0.0001
PBS对MOPC-21 0.8379
PBS对DEX <0.0001
PBS对S15-6(40mg/kg) 0.0003
这些结果指示了抗分拣蛋白抗体诱导的颗粒蛋白前体水平的增加可降低关节炎的临床症状。
实施例29:体内分拣蛋白活性的表征
材料和方法
来自大肠杆菌0111:B4的脂多糖(LPS)以0mg/kg、0.4mg/kg和4mg/kg腹膜内注射至9-10周龄C57Bl6野生型小鼠和分拣蛋白-/-(分拣蛋白基因剔除)小鼠中。在LPS施用后1.5小时和6小时,从小鼠收集血清样品。接着使用包括IL-6、TNFα、IFN-γ、IL-10、IL12p70和CCL2的BD Cytometric Bead Array小鼠发炎试剂盒和涵盖IL12/IL-23p40、IL-1β、IL-1α、CXCL1、CCL3、CCL4和CCL5的flex set来分析细胞因子和趋化因子水平。在LPS施用后6小时执行腹膜腔灌洗以分析细胞迁移和浸润。使用BD FACSCanto II系统执行分析。
结果
图25A中的结果指示了如与LPS施用6小时后的野生型小鼠相比,在分拣蛋白基因剔除小鼠中的颗粒蛋白前体的血清水平提高。另外,0mg/kg、0.4mg/kg或4mg/kg LPS的腹膜内注射对血清颗粒蛋白前体水平无影响(图25A)。如图25b-25D所示,嗜中性粒细胞、大的腹膜(CD11b+F4/80hi)巨噬细胞或小的腹膜(CD11b+F4/80lo)巨噬细胞的数目并未改变。
如图26A-26H所示,如与野生型小鼠相比,在分拣蛋白基因剔除小鼠中在用4mg/kgLPS处理1.5小时后,促发炎细胞因子IL-6、IL12p70、IL12p40和IL-1β的血清水平降低。在用0.4mg/kg LPS处理的分拣蛋白基因剔除小鼠中可见消炎细胞因子IL-10的血清水平的增加(图26D)。如图27A-27E所示,在分拣蛋白基因剔除小鼠中在用LPS处理1.5小时后,负责募集单核细胞、树突状细胞、T细胞、嗜中性粒细胞和其它粒细胞的趋化因子(如CXCL1、CCL2、CCL3和CCL5)的血清水平降低。
如图28A-28H所示,用0.4mg/kg LPS处理6小时的分拣蛋白基因剔除小鼠示出了IL-6的血清水平的适度增加,并且用4mg/kg LPS处理6小时的分拣蛋白基因剔除小鼠示出了TNFα水平的血清水平的降低。如图29A-29E所示,在用LPS处理6小时的分拣蛋白基因剔除小鼠中,CCL2、CCL3和CCL4的血清水平降低。
结果指示了,分拣蛋白基因剔除小鼠中的增加的颗粒蛋白前体的血清水平可成为在对LPS的发炎反应的抑制中的有益效应的基础。阻断分拣蛋白的抗分拣蛋白抗体具有升高颗粒蛋白前体水平的能力,其也发生在分拣蛋白基因剔除小鼠中。因此,认为本公开的抗分拣蛋白抗体可与分拣蛋白基因剔除小鼠具有重叠作用,包括促发炎细胞因子IL-6、TNFα、IL-12p40和IL-1β;以及趋化因子CXCL1、CCL2、CCL3、CCL4和CCL5的降低。进一步相信,所述抗分拣蛋白抗体也可诱导由分拣蛋白的降低或抑制诱导的其它活性,如分拣蛋白基因剔除小鼠的所述活性。
序列表
<110> ROSENTHAL, Arnon
<120> 抗分拣蛋白抗体和其使用方法
<130> 735022000240
<140> 尚未分配
<141> 与此同时
<150> US 62/144,270
<151> 2015-04-07
<160> 714
<170> 用于Windows的FastSEQ 4.0版
<210> 1
<211> 830
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 1
Met Glu Arg Pro Trp Gly Ala Ala Asp Gly Leu Ser Arg Trp Pro His
1 5 10 15
Gly Leu Gly Leu Leu Leu Leu Leu Gln Leu Leu Pro Pro Ser Thr Leu
20 25 30
Ser Gln Asp Arg Leu Asp Ala Pro Pro Pro Pro Ala Ala Pro Leu Pro
35 40 45
Arg Trp Ser Gly Pro Ile Gly Val Ser Trp Gly Leu Arg Ala Ala Ala
50 55 60
Ala Gly Gly Ala Phe Pro Arg Gly Gly Arg Trp Arg Arg Ser Ala Pro
65 70 75 80
Gly Glu Asp Glu Glu Cys Gly Arg Val Arg Asp Phe Val Ala Lys Leu
85 90 95
Ala Asn Asn Thr His Gln His Val Phe Asp Asp Leu Arg Gly Ser Val
100 105 110
Ser Leu Ser Trp Val Gly Asp Ser Thr Gly Val Ile Leu Val Leu Thr
115 120 125
Thr Phe His Val Pro Leu Val Ile Met Thr Phe Gly Gln Ser Lys Leu
130 135 140
Tyr Arg Ser Glu Asp Tyr Gly Lys Asn Phe Lys Asp Ile Thr Asp Leu
145 150 155 160
Ile Asn Asn Thr Phe Ile Arg Thr Glu Phe Gly Met Ala Ile Gly Pro
165 170 175
Glu Asn Ser Gly Lys Val Val Leu Thr Ala Glu Val Ser Gly Gly Ser
180 185 190
Arg Gly Gly Arg Ile Phe Arg Ser Ser Asp Phe Ala Lys Asn Phe Val
195 200 205
Gln Thr Asp Leu Pro Phe His Pro Leu Thr Gln Met Met Tyr Ser Pro
210 215 220
Gln Asn Ser Asp Tyr Leu Leu Ala Leu Ser Thr Glu Asn Gly Leu Trp
225 230 235 240
Val Ser Lys Asn Phe Gly Gly Lys Trp Glu Glu Ile His Lys Ala Val
245 250 255
Cys Leu Ala Lys Trp Gly Ser Asp Asn Thr Ile Phe Phe Thr Thr Tyr
260 265 270
Ala Asn Gly Ser Cys Lys Ala Asp Leu Gly Ala Leu Glu Leu Trp Arg
275 280 285
Thr Ser Asp Leu Gly Lys Ser Phe Lys Thr Ile Gly Val Lys Ile Tyr
290 295 300
Ser Phe Gly Leu Gly Gly Arg Phe Leu Phe Ala Ser Val Met Ala Asp
305 310 315 320
Lys Asp Thr Thr Arg Arg Ile His Val Ser Thr Asp Gln Gly Asp Thr
325 330 335
Trp Ser Met Ala Gln Leu Pro Ser Val Gly Gln Glu Gln Phe Tyr Ser
340 345 350
Ile Leu Ala Ala Asn Asp Asp Met Val Phe Met His Val Asp Glu Pro
355 360 365
Gly Asp Thr Gly Phe Gly Thr Ile Phe Thr Ser Asp Asp Arg Gly Ile
370 375 380
Val Tyr Ser Lys Ser Leu Asp Arg His Leu Tyr Thr Thr Thr Gly Gly
385 390 395 400
Glu Thr Asp Phe Thr Asn Val Thr Ser Leu Arg Gly Val Tyr Ile Thr
405 410 415
Ser Val Leu Ser Glu Asp Asn Ser Ile Gln Thr Met Ile Thr Phe Asp
420 425 430
Gln Gly Gly Arg Trp Thr His Leu Arg Lys Pro Glu Asn Ser Glu Cys
435 440 445
Asp Ala Thr Ala Lys Asn Lys Asn Glu Cys Ser Leu His Ile His Ala
450 455 460
Ser Tyr Ser Ile Ser Gln Lys Leu Asn Val Pro Met Ala Pro Leu Ser
465 470 475 480
Glu Pro Asn Ala Val Gly Ile Val Ile Ala His Gly Ser Val Gly Asp
485 490 495
Ala Ile Ser Val Met Val Pro Asp Val Tyr Ile Ser Asp Asp Gly Gly
500 505 510
Tyr Ser Trp Thr Lys Met Leu Glu Gly Pro His Tyr Tyr Thr Ile Leu
515 520 525
Asp Ser Gly Gly Ile Ile Val Ala Ile Glu His Ser Ser Arg Pro Ile
530 535 540
Asn Val Ile Lys Phe Ser Thr Asp Glu Gly Gln Cys Trp Gln Thr Tyr
545 550 555 560
Thr Phe Thr Arg Asp Pro Ile Tyr Phe Thr Gly Leu Ala Ser Glu Pro
565 570 575
Gly Ala Arg Ser Met Asn Ile Ser Ile Trp Gly Phe Thr Glu Ser Phe
580 585 590
Leu Thr Ser Gln Trp Val Ser Tyr Thr Ile Asp Phe Lys Asp Ile Leu
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Thr Asp Pro Glu Asp Tyr Glu Asp Gly Cys Ile Leu Gly Tyr Lys Glu
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Gln Phe Leu Arg Leu Arg Lys Ser Ser Val Cys Gln Asn Gly Arg Asp
645 650 655
Tyr Val Val Thr Lys Gln Pro Ser Ile Cys Leu Cys Ser Leu Glu Asp
660 665 670
Phe Leu Cys Asp Phe Gly Tyr Tyr Arg Pro Glu Asn Asp Ser Lys Cys
675 680 685
Val Glu Gln Pro Glu Leu Lys Gly His Asp Leu Glu Phe Cys Leu Tyr
690 695 700
Gly Arg Glu Glu His Leu Thr Thr Asn Gly Tyr Arg Lys Ile Pro Gly
705 710 715 720
Asp Lys Cys Gln Gly Gly Val Asn Pro Val Arg Glu Val Lys Asp Leu
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740 745 750
Lys Ser Asn Ser Val Pro Ile Ile Leu Ala Ile Val Gly Leu Met Leu
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770 775 780
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<220>
<223> 合成构建体
<400> 2
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450 455 460
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485 490 495
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Gly
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<223> 合成构建体
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Gly
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<213> 人工序列
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<223> 合成构建体
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<400> 202
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<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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Asp Val
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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Ala Arg Glu Ser Gly Asp Arg Ala Thr Leu Val Tyr Tyr Tyr Tyr Tyr
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Gly Met Asp Val
20
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<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 232
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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Leu Phe Asp Ile
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<400> 235
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
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<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
<400> 241
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Gly Met Asp Val
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<400> 242
000
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 244
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 245
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 246
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 247
Ala Arg Gly Val Gly Ile Gln Gln Gln Leu Val Leu Gly Phe Asp Pro
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<210> 248
<400> 248
000
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 249
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1 5 10
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<400> 250
000
<210> 251
<400> 251
000
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 252
Ala Arg Glu Arg Trp Asp Leu Gly His Gly Met Asp Val
1 5 10
<210> 253
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 253
Ala Arg Gly Val Gly Ser Gly Tyr Ser Tyr Gly Tyr Arg Tyr Phe Asp
1 5 10 15
Tyr
<210> 254
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 254
Ala Arg Gly Ser Pro Thr Trp Leu Arg Asp Tyr Tyr Met Asp Val
1 5 10 15
<210> 255
<211> 12
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 255
Ala Arg Gly Gly Thr Thr Trp Leu Val Ala Asp Val
1 5 10
<210> 256
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 256
Ala Arg Gly Arg Gly Arg Tyr Ser Tyr Gly Tyr His Lys Ala Ala Phe
1 5 10 15
Asp Ile
<210> 257
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 257
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
20
<210> 258
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 258
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
20
<210> 259
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 259
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
20
<210> 260
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 260
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
20
<210> 261
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 261
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys
20
<210> 262
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 262
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
20
<210> 263
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 263
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
20
<210> 264
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 264
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
20
<210> 265
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 265
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
20
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<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys
20
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<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 267
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys
20
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<211> 23
<212> PRT
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<220>
<223> 合成构建体
<400> 268
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
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<223> 合成构建体
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<210> 270
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<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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<220>
<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
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<223> 合成构建体
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Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
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Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys
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<223> 合成构建体
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Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr
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<223> 合成构建体
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Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr
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<223> 合成构建体
<400> 280
Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
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Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 281
Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
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<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 282
Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly
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<211> 26
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<220>
<223> 合成构建体
<400> 285
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly
20 25
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<400> 286
000
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 287
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
20 25
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<211> 26
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 288
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
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<220>
<223> 合成构建体
<400> 289
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
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Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
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Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ala Val Ser Gly
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Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
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Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly
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000
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<220>
<223> 合成构建体
<400> 294
Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
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Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly
20 25
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 295
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly
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<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 297
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala
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<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 300
Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile Gly
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<211> 14
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 301
Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met Gly
1 5 10
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 302
Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr Met Glu
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Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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<210> 303
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 303
Arg Val Thr Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu
1 5 10 15
Leu Arg Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 304
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 304
Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Met Glu
1 5 10 15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 305
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 305
Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu
1 5 10 15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 306
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 306
Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gln
1 5 10 15
Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 307
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 307
Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr Leu Gln
1 5 10 15
Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
20 25 30
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<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 308
Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gln
1 5 10 15
Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
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<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 309
Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser Leu Lys
1 5 10 15
Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 310
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 310
Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr Leu Gln
1 5 10 15
Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 311
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 311
Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 312
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 312
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 313
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 313
Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 314
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 314
Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 315
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 315
Trp Gly Lys Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 316
<400> 316
000
<210> 317
<211> 105
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 317
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Pro Trp Thr Phe
85 90 95
Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 318
<211> 128
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 318
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Pro Gly Gly Ala Thr Asp Gly Leu Val Tyr Tyr Tyr Tyr
100 105 110
Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 319
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 319
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Asp Val Ser Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 320
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 320
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 321
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 321
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Thr Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Trp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Asp Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Lys Ser Tyr Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 322
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 322
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Pro Gln Leu Arg Val Ala Glu Tyr Phe Gln His Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 323
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 323
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Arg Val Leu Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 324
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 324
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Leu Gly Ser Asn Arg Ala Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Val
85 90 95
Ser Thr Glu Pro Pro Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 325
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 325
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ser Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 326
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 326
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
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Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 401
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<223> 合成构建体
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 408
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<223> 合成构建体
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<220>
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<400> 447
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<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 448
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Asp Arg Gly Gly Thr His Phe Gly Ala Asp His Tyr Tyr
100 105 110
Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 449
<400> 449
000
<210> 450
<400> 450
000
<210> 451
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 451
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Ala Ser Ser Pro
85 90 95
Ile Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 452
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 452
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Val Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Leu Pro Gly Tyr Pro Leu Gly Leu Phe Asp Ile Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 453
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 453
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Ser Trp
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Asn Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Pro Ser Val Pro Pro
85 90 95
Ile Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 454
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 454
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Thr Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Asp Arg Gly Arg Thr Glu Ser Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 455
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 455
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Ser Val Tyr Pro Pro
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Ile Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 456
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 456
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Thr Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Val Gly Arg Tyr Arg Val Ala Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 457
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 457
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ser Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Glu Thr Asn Met Pro Pro
85 90 95
Ile Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 458
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 458
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ala Leu Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 459
<211> 126
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 459
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Asn Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Asp Arg Gly Met Gly Pro Lys Leu Tyr Tyr Tyr Tyr Gly
100 105 110
Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 460
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 460
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Ser Phe
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Ser Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr Arg Glu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 461
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 461
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Val Gly Ile Gln Gln Gln Leu Val Leu Gly Phe Asp
100 105 110
Pro Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 462
<400> 462
000
<210> 463
<400> 463
000
<210> 464
<211> 113
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 464
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Ile Asn Cys Lys Ser Ser Gln Ser Val Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Asn Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Leu Gln Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Ala Asn Ala Pro Ile Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile
100 105 110
Lys
<210> 465
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 465
Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Ser
20 25 30
Asp Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
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Cys Ala Arg Ser Leu Ala Met Ser Gly Ala Tyr Phe Asp Leu Trp Gly
100 105 110
Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 466
<400> 466
000
<210> 467
<400> 467
000
<210> 468
<400> 468
000
<210> 469
<400> 469
000
<210> 470
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 470
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Gln Val Leu Ile Tyr Leu Gly Ser Asn Arg Ala Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Ala
85 90 95
Leu Asp Val Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 471
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 471
Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Ser
20 25 30
Ser Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
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100 105 110
Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 472
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 472
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser His Val Ser Pro
85 90 95
Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 473
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 473
Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Ser
20 25 30
Asp Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Val Gly Ser Gly Tyr Ser Tyr Gly Tyr Arg Tyr Phe
100 105 110
Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 474
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 474
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Asn
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Thr Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ala Phe Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 475
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 475
Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Ser
20 25 30
Ser Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
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100 105 110
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115 120
<210> 476
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 476
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln Ala
85 90 95
Ile Asp Thr Pro Pro Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 477
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 477
Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Ser
20 25 30
Ser Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Ser Ile Ser Tyr Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Gly Thr Thr Trp Leu Val Ala Asp Val Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 478
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 478
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Phe Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu
35 40 45
Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu
65 70 75 80
Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Glu Gln Tyr Ala Ser Ser Pro
85 90 95
Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 479
<211> 125
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 479
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Thr Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Arg Gly Arg Tyr Ser Tyr Gly Tyr His Lys Ala Ala Phe
100 105 110
Asp Ile Trp Gly Gln Gly Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 480
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 4
<223> Xaa = T、G、V、P、L、F、A或R
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = G、A或S
<220>
<221> 变体
<222> 7
<223> Xaa = Y、M或L
<220>
<221> 变体
<222> 9
<223> Xaa = H或W
<400> 480
Tyr Thr Phe Xaa Xaa Tyr Xaa Met Xaa
1 5
<210> 481
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = W、I或G
<220>
<221> 变体
<222> 2
<223> Xaa = I、V或T
<220>
<221> 变体
<222> 3
<223> Xaa = N、G或L
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = N、S、V或M
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = S、G、W或Q
<220>
<221> 变体
<222> 8
<223> Xaa = G、F、A、Y、S、N或R
<220>
<221> 变体
<222> 10
<223> Xaa = N、R、S或M
<400> 481
Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Xaa Gly Xaa Thr Xaa Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 482
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 482
Tyr Thr Phe Gly Ala Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 483
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 483
Tyr Thr Phe Val Ala Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 484
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 484
Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Met Met His
1 5
<210> 485
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 485
Tyr Thr Phe Pro Gly Tyr Leu Met His
1 5
<210> 486
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 486
Tyr Thr Phe Leu Ala Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 487
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 487
Tyr Thr Phe Phe Ser Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 488
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 488
Tyr Thr Phe Thr Ala Tyr Leu Met His
1 5
<210> 489
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 489
Tyr Thr Phe Ala Ser Tyr Tyr Met Trp
1 5
<210> 490
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 490
Tyr Thr Phe Thr Ala Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 491
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 491
Tyr Thr Phe Gly Gly Tyr Leu Met His
1 5
<210> 492
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 492
Tyr Thr Phe Arg Ala Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 493
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 493
Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Phe Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 494
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 494
Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Ala Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 495
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 495
Trp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 496
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 496
Ile Ile Gly Pro Ser Gly Gly Tyr Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 497
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 497
Trp Ile Asn Pro Val Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 498
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 498
Trp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 499
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 499
Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 500
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 500
Trp Ile Asn Pro Ser Gly Gly Asn Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 501
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 501
Trp Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 502
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 502
Gly Ile Leu Pro Ser Gly Gly Arg Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 503
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 503
Trp Ile Asn Pro Ser Trp Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 504
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 504
Trp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Met Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 505
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 505
Trp Thr Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 506
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 506
Trp Ile Asn Pro Met Ser Gly Gly Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 507
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 507
Trp Ile Asn Pro Ser Gln Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 508
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = V或I
<220>
<221> 变体
<222> 7
<223> Xaa = S或G
<400> 508
Arg Ala Ser Gln Ser Xaa Xaa Ser Asn Leu Ala
1 5 10
<210> 509
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 3
<223> Xaa = F或L
<220>
<221> 变体
<222> 4
<223> Xaa = T或A
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = S或K
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = Y、T、R、L、T、G、Q或H
<220>
<221> 变体
<222> 7
<223> Xaa = Y、T或L
<220>
<221> 变体
<222> 8
<223> Xaa = M或I
<400> 509
Tyr Thr Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser
1 5
<210> 510
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = I或V
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = S、W、Y、V、F、L或I
<220>
<221> 变体
<222> 8
<223> Xaa = S或T
<220>
<221> 变体
<222> 9
<223> Xaa = T或A
<220>
<221> 变体
<222> 13
<223> Xaa = Q或R
<220>
<221> 变体
<222> 14
<223> Xaa = K或R
<220>
<221> 变体
<222> 16
<223> Xaa = Q或R
<400> 510
Xaa Ile Asn Pro Xaa Gly Gly Xaa Xaa Ser Tyr Ala Xaa Xaa Phe Xaa
1 5 10 15
Gly
<210> 511
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = A、V或T
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = S、F或G
<220>
<221> 变体
<222> 7
<223> Xaa = I或A
<220>
<221> 变体
<222> 8
<223> Xaa = A或G
<220>
<221> 变体
<222> 9
<223> Xaa = A、L或V
<220>
<221> 变体
<222> 10
<223> Xaa = A、L或P
<220>
<221> 变体
<222> 11
<223> Xaa = G、F或Y
<220>
<221> 变体
<222> 13
<223> Xaa = A、G或F
<220>
<221> 变体
<222> 14
<223> Xaa = S、G、A
<220>
<221> 变体
<222> 16
<223> Xaa = Y、G、P、H或S
<220>
<221> 变体
<222> 17
<223> Xaa = Y或N
<220>
<221> 变体
<222> 18
<223> Xaa = Y、L、Q或R
<220>
<221> 变体
<222> 20
<223> Xaa = M或L
<400> 511
Xaa Arg Asp Pro Xaa Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Xaa Arg Xaa
1 5 10 15
Xaa Xaa Gly Xaa Asp Val
20
<210> 512
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 512
Arg Ala Ser Gln Ser Val Gly Ser Asn Leu Ala
1 5 10
<210> 513
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 513
Tyr Thr Phe Thr Ser Thr Tyr Met Ser
1 5
<210> 514
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 514
Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Thr Met Ser
1 5
<210> 515
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 515
Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Leu Met Ser
1 5
<210> 516
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 516
Tyr Thr Phe Thr Ser Arg Tyr Met Ser
1 5
<210> 517
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 517
Tyr Thr Phe Ala Ser Arg Tyr Met Ser
1 5
<210> 518
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 518
Tyr Thr Leu Thr Ser Arg Tyr Met Ser
1 5
<210> 519
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 519
Tyr Thr Phe Thr Ser Leu Tyr Ile Ser
1 5
<210> 520
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 520
Tyr Thr Phe Thr Lys Tyr Tyr Met Ser
1 5
<210> 521
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 521
Tyr Thr Phe Thr Ser Leu Tyr Met Ser
1 5
<210> 522
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 522
Tyr Thr Phe Thr Ser Gly Tyr Met Ser
1 5
<210> 523
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 523
Tyr Thr Phe Thr Ser Gln Tyr Met Ser
1 5
<210> 524
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 524
Tyr Thr Phe Thr Ser His Tyr Met Ser
1 5
<210> 525
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 525
Ile Ile Asn Pro Trp Gly Gly Thr Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 526
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 526
Ile Ile Asn Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 527
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 527
Ile Ile Asn Pro Val Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 528
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 528
Val Ile Asn Pro Phe Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 529
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 529
Ile Ile Asn Pro Val Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Arg
1 5 10 15
Gly
<210> 530
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 530
Ile Ile Asn Pro Val Gly Gly Ser Ala Ser Tyr Ala Arg Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 531
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 531
Ile Ile Asn Pro Leu Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 532
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 532
Val Ile Asn Pro Val Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 533
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 533
Ile Ile Asn Pro Ile Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 534
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 534
Ile Ile Asn Pro Ile Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Arg
1 5 10 15
Gly
<210> 535
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 535
Ile Ile Asn Pro Ile Gly Gly Ser Ala Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 536
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 536
Ile Ile Asn Pro Ile Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Arg Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 537
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 537
Ile Ile Asn Pro Ile Gly Gly Ser Ile Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 538
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 538
Ile Val Asn Pro Ile Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Arg Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 539
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 539
Ile Ile Asn Pro Tyr Gly Gly Thr Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 540
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 540
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Gly Pro Ala Gly Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Leu Asp Val
20
<210> 541
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 541
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Gly Pro Ala Gly Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 542
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 542
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Gly Pro Ala Ser Arg His
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 543
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 543
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Pro Gly Pro Ala Ser Arg Gly
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 544
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 544
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Gly Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 545
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 545
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Gly
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 546
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 546
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Pro
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 547
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 547
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Leu Gly Met Asp Val
20
<210> 548
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 548
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Gly Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Arg Gly Met Asp Val
20
<210> 549
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 549
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Val Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 550
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 550
Val Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 551
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 551
Thr Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 552
<211> 21
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 552
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 553
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 553
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Gly
1 5 10 15
Tyr Gln Gly Met Asp Val
20
<210> 554
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 554
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Phe Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 555
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 555
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Gly Pro Ala Ala Arg His
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 556
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 556
Ala Arg Asp Pro Phe Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 557
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 557
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Phe Pro Ala Gly Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 558
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 558
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Tyr Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Asn Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 559
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 559
Ala Arg Asp Pro Gly Gly Ala Ala Ala Ala Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 560
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 560
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Tyr Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Arg Gly Met Asp Val
20
<210> 561
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 561
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Gly Leu Ala Gly Pro Phe Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 562
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 562
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Ala Gly Pro Ala Ser Arg Ser
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 563
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 563
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Ala Ala Phe Pro Ala Ser Arg Ser
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 564
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 564
Ala Arg Asp Pro Ser Gly Ile Ala Leu Leu Gly Pro Ala Ser Arg Tyr
1 5 10 15
Tyr Tyr Gly Met Asp Val
20
<210> 565
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = G或Y
<220>
<221> 变体
<222> 4
<223> Xaa = S、R、G或T
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = S、G或N
<220>
<221> 变体
<222> 8
<223> Xaa = I或M
<220>
<221> 变体
<222> 9
<223> Xaa = S或A
<400> 565
Xaa Thr Phe Xaa Xaa Tyr Ala Xaa Xaa
1 5
<210> 566
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 3
<223> Xaa = I或V
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = I、R、G、A、S、T或Q
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = F或G
<220>
<221> 变体
<222> 8
<223> Xaa = T、R或W
<220>
<221> 变体
<222> 10
<223> Xaa = S、N、Q或W
<400> 566
Gly Ile Xaa Pro Xaa Xaa Gly Xaa Ala Xaa Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 567
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 567
Gly Thr Phe Arg Ser Tyr Ala Ile Ser
1 5
<210> 568
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 568
Gly Thr Phe Gly Ser Tyr Ala Ile Ser
1 5
<210> 569
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 569
Tyr Thr Phe Thr Gly Tyr Ala Met Ala
1 5
<210> 570
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 570
Gly Thr Phe Arg Asn Tyr Ala Ile Ser
1 5
<210> 571
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 571
Gly Ile Val Pro Arg Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 572
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 572
Gly Ile Ile Pro Gly Phe Gly Thr Ala Gln Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 573
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 573
Gly Ile Ile Pro Gly Phe Gly Thr Ala Trp Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 574
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 574
Gly Ile Ile Pro Ala Phe Gly Thr Ala Trp Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 575
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 575
Gly Ile Ile Pro Ser Phe Gly Thr Ala Ser Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 576
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 576
Gly Ile Ile Pro Thr Phe Gly Thr Ala Trp Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 577
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 577
Gly Ile Ile Pro Gly Phe Gly Arg Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 578
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 578
Gly Ile Ile Pro Gln Phe Gly Thr Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 579
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 579
Gly Ile Ile Pro Ile Gly Gly Trp Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 580
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = S或G
<220>
<221> 变体
<222> 8
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<400> 580
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1 5 10 15
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<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = A或V
<400> 581
Leu Gly Ser Asn Arg Xaa Ser
1 5
<210> 582
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = G或V
<220>
<221> 变体
<222> 7
<223> Xaa = Y或R
<400> 582
Tyr Ser Ile Ser Ser Xaa Xaa Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 583
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = T、S或A
<220>
<221> 变体
<222> 4
<223> Xaa = H或P
<400> 583
Xaa Ile Tyr Xaa Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 584
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 584
Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu Arg Ser Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu Asp
1 5 10 15
<210> 585
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 585
Arg Ser Ser Gln Gly Leu Leu Arg Ser Asn Gly Tyr Asn Tyr Leu Asp
1 5 10 15
<210> 586
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 586
Leu Gly Ser Asn Arg Val Ser
1 5
<210> 587
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 587
Tyr Ser Ile Ser Ser Val Arg Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 588
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 588
Ala Ile Tyr Pro Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 589
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = G或Y
<220>
<221> 变体
<222> 4
<223> Xaa = S、V、Y、K或P
<220>
<221> 变体
<222> 6
<223> Xaa = S或R
<220>
<221> 变体
<222> 7
<223> Xaa = D或E
<400> 589
Xaa Ser Ile Xaa Ser Xaa Xaa Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 590
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> 变体
<222> 1
<223> Xaa = S、G、Q或L
<220>
<221> 变体
<222> 4
<223> Xaa = Y、W或R
<220>
<221> 变体
<222> 5
<223> Xaa = S、R、K或A
<220>
<221> 变体
<222> 9
<223> Xaa = Y或V
<400> 590
Xaa Ile Tyr Xaa Xaa Gly Ser Thr Xaa Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 591
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 591
Gly Ser Ile Val Ser Ser Asp Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 592
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 592
Gly Ser Ile Tyr Ser Ser Asp Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 593
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 593
Gly Ser Ile Lys Ser Ser Glu Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 594
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 594
Tyr Ser Ile Pro Ser Asp Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 595
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 595
Gly Ser Ile Ser Ser Ser Glu Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 596
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 596
Gly Ser Ile Ser Ser Arg Glu Tyr Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 597
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 597
Gly Ile Tyr Tyr Arg Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 598
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 598
Gln Ile Tyr Tyr Lys Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 599
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 599
Ser Ile Tyr Trp Arg Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 600
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 600
Ser Ile Tyr Arg Ala Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 601
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 601
Ser Ile Tyr Tyr Arg Gly Ser Thr Val Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 602
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 602
Leu Ile Tyr Tyr Arg Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 603
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 603
Ser Ile Tyr Arg Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser
1 5 10 15
<210> 604
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 604
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Gly Ala Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Phe Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 605
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 605
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Val Ala Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Ala Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 606
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 606
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Gly Ala Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 607
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 607
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Met Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Gly Pro Ser Gly Gly Tyr Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 608
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 608
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Pro Gly Tyr
20 25 30
Leu Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Val Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 609
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 609
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Gly Ala Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Val Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 610
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 610
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Leu Ala Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Asn Ser Gly Gly Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 611
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 611
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Phe Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Ser Gly Gly Asn Thr Arg Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
100 105 110
Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 612
<211> 124
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 612
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ala Tyr
20 25 30
Leu Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Arg Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Gly Lys Arg Ser Ser Gly Trp Tyr Glu Gly Tyr Gly Met Asp
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Ser
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Gln Leu Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Arg
20 25 30
Glu Tyr Tyr Trp Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Ser Ile Tyr Arg Ser Gly Ser Thr Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Gly Val Gly Ser Gly Tyr Ser Tyr Gly Tyr Arg Tyr Phe
100 105 110
Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 693
<211> 24
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 693
Thr Lys Cys Leu Arg Arg Glu Ala Pro Arg Trp Asp Ala Pro Leu Arg
1 5 10 15
Asp Pro Ala Leu Arg Gln Leu Leu
20
<210> 694
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 694
Ser Ser Asp Phe Ala Lys Asn Phe
1 5
<210> 695
<211> 41
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 695
Gly Gly Thr Ala Thr Thr Gly Ala Gly Gly Gly Thr Cys Gly Cys Gly
1 5 10 15
Ala Ala Cys Cys Ala Cys Ala Cys Thr Cys Ala Gly Ala Gly Ala Gly
20 25 30
Cys Ala Ala Thr Gly Thr Cys Cys Cys
35 40
<210> 696
<211> 52
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 696
Gly Gly Gly Gly Gly Ala Ala Gly Thr Thr Gly Thr Cys Cys Thr Gly
1 5 10 15
Ala Gly Thr Gly Thr Cys Cys Thr Cys Gly Thr Thr Cys Gly Cys Cys
20 25 30
Ala Cys Thr Cys Cys Gly Ala Gly Ala Thr Thr Gly Ala Gly Ala Gly
35 40 45
Gly Ala Gly Ala
50
<210> 697
<211> 44
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 697
Gly Gly Thr Ala Thr Thr Gly Ala Gly Gly Gly Thr Cys Gly Cys Gly
1 5 10 15
Cys Cys Cys Cys Cys Ala Thr Gly Ala Ala Ala Gly Ala Ala Gly Cys
20 25 30
Ala Ala Ala Cys Ala Thr Cys Cys Gly Ala Gly Gly
35 40
<210> 698
<211> 49
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 698
Cys Ala Cys Gly Thr Thr Thr Gly Thr Ala Cys Ala Gly Gly Thr Ala
1 5 10 15
Cys Thr Cys Cys Cys Ala Gly Gly Cys Cys Gly Cys Gly Ala Cys Thr
20 25 30
Cys Cys Gly Ala Gly Ala Thr Thr Gly Ala Gly Ala Gly Gly Ala Gly
35 40 45
Ala
<210> 699
<211> 21
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 699
Lys Thr Ile Gly Val Lys Ile Tyr Ser Phe Gly Leu Gly Gly Arg Phe
1 5 10 15
Leu Phe Ala Ser Val
20
<210> 700
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 700
Asn Gly Leu Trp Val Ser Lys Asn Phe Gly Gly
1 5 10
<210> 701
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 701
Phe Ala Ser Val Met Ala Asp Lys Asp Thr Thr Arg Arg Ile His Val
1 5 10 15
Ser Thr Asp Gln Gly Asp Thr Trp Ser
20 25
<210> 702
<211> 21
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 702
Phe Val Gln Thr Asp Leu Pro Phe His Pro Leu Thr Gln Met Met Tyr
1 5 10 15
Ser Pro Gln Asn Ser
20
<210> 703
<211> 24
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 703
Asn Gly Leu Trp Val Ser Lys Asn Phe Gly Gly Lys Trp Glu Glu Ile
1 5 10 15
His Lys Ala Val Cys Leu Ala Lys
20
<210> 704
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 704
Phe Val Gln Thr Asp Leu Pro Phe His Pro Leu Thr Gln Met Met Tyr
1 5 10 15
Ser Pro Gln Asn Ser Asp Tyr Leu Leu
20 25
<210> 705
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 705
Glu Pro Gly Asp Thr Gly Phe Gly Thr Ile Phe Thr Ser Asp Asp Arg
1 5 10 15
Gly Ile Val Tyr Ser Lys Ser Leu Asp
20 25
<210> 706
<211> 16
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 706
His Val Pro Leu Val Ile Met Thr Gln Val Pro Leu Val Ile Val Ser
1 5 10 15
<210> 707
<211> 21
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 707
Met Glu Val Gly Trp Tyr Arg Ser Pro Phe Ser Arg Val Val His Leu
1 5 10 15
Tyr Arg Asn Gly Lys
20
<210> 708
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 708
His Ser Thr Asp Pro Glu Asp Tyr Glu Asp
1 5 10
<210> 709
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 709
Ile Thr Phe Asp Gln Gly Gly Arg Trp Thr His Leu Arg Lys Pro
1 5 10 15
<210> 710
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 710
Cys Thr Ser Asn Phe Leu Ser Pro Glu Lys
1 5 10
<210> 711
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 711
Leu Ser Thr Glu Asn Gly Leu Trp Val Ser Lys
1 5 10
<210> 712
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 712
Gly Pro Glu Asn Ser Gly Lys
1 5
<210> 713
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 713
Leu Pro Phe His Pro Leu Thr Gln Met Met
1 5 10
<210> 714
<211> 678
<212> PRT
<213> 智人
<400> 714
Ser Ala Pro Gly Glu Asp Glu Glu Cys Gly Arg Val Arg Asp Phe Val
1 5 10 15
Ala Lys Leu Ala Asn Asn Thr His Gln His Val Phe Asp Asp Leu Arg
20 25 30
Gly Ser Val Ser Leu Ser Trp Val Gly Asp Ser Thr Gly Val Ile Leu
35 40 45
Val Leu Thr Thr Phe His Val Pro Leu Val Ile Met Thr Phe Gly Gln
50 55 60
Ser Lys Leu Tyr Arg Ser Glu Asp Tyr Gly Lys Asn Phe Lys Asp Ile
65 70 75 80
Thr Asp Leu Ile Asn Asn Thr Phe Ile Arg Thr Glu Phe Gly Met Ala
85 90 95
Ile Gly Pro Glu Asn Ser Gly Lys Val Val Leu Thr Ala Glu Val Ser
100 105 110
Gly Gly Ser Arg Gly Gly Arg Ile Phe Arg Ser Ser Asp Phe Ala Lys
115 120 125
Asn Phe Val Gln Thr Asp Leu Pro Phe His Pro Leu Thr Gln Met Met
130 135 140
Tyr Ser Pro Gln Asn Ser Asp Tyr Leu Leu Ala Leu Ser Thr Glu Asn
145 150 155 160
Gly Leu Trp Val Ser Lys Asn Phe Gly Gly Lys Trp Glu Glu Ile His
165 170 175
Lys Ala Val Cys Leu Ala Lys Trp Gly Ser Asp Asn Thr Ile Phe Phe
180 185 190
Thr Thr Tyr Ala Asn Gly Ser Cys Lys Ala Asp Leu Gly Ala Leu Glu
195 200 205
Leu Trp Arg Thr Ser Asp Leu Gly Lys Ser Phe Lys Thr Ile Gly Val
210 215 220
Lys Ile Tyr Ser Phe Gly Leu Gly Gly Arg Phe Leu Phe Ala Ser Val
225 230 235 240
Met Ala Asp Lys Asp Thr Thr Arg Arg Ile His Val Ser Thr Asp Gln
245 250 255
Gly Asp Thr Trp Ser Met Ala Gln Leu Pro Ser Val Gly Gln Glu Gln
260 265 270
Phe Tyr Ser Ile Leu Ala Ala Asn Asp Asp Met Val Phe Met His Val
275 280 285
Asp Glu Pro Gly Asp Thr Gly Phe Gly Thr Ile Phe Thr Ser Asp Asp
290 295 300
Arg Gly Ile Val Tyr Ser Lys Ser Leu Asp Arg His Leu Tyr Thr Thr
305 310 315 320
Thr Gly Gly Glu Thr Asp Phe Thr Asn Val Thr Ser Leu Arg Gly Val
325 330 335
Tyr Ile Thr Ser Val Leu Ser Glu Asp Asn Ser Ile Gln Thr Met Ile
340 345 350
Thr Phe Asp Gln Gly Gly Arg Trp Thr His Leu Arg Lys Pro Glu Asn
355 360 365
Ser Glu Cys Asp Ala Thr Ala Lys Asn Lys Asn Glu Cys Ser Leu His
370 375 380
Ile His Ala Ser Tyr Ser Ile Ser Gln Lys Leu Asn Val Pro Met Ala
385 390 395 400
Pro Leu Ser Glu Pro Asn Ala Val Gly Ile Val Ile Ala His Gly Ser
405 410 415
Val Gly Asp Ala Ile Ser Val Met Val Pro Asp Val Tyr Ile Ser Asp
420 425 430
Asp Gly Gly Tyr Ser Trp Thr Lys Met Leu Glu Gly Pro His Tyr Tyr
435 440 445
Thr Ile Leu Asp Ser Gly Gly Ile Ile Val Ala Ile Glu His Ser Ser
450 455 460
Arg Pro Ile Asn Val Ile Lys Phe Ser Thr Asp Glu Gly Gln Cys Trp
465 470 475 480
Gln Thr Tyr Thr Phe Thr Arg Asp Pro Ile Tyr Phe Thr Gly Leu Ala
485 490 495
Ser Glu Pro Gly Ala Arg Ser Met Asn Ile Ser Ile Trp Gly Phe Thr
500 505 510
Glu Ser Phe Leu Thr Ser Gln Trp Val Ser Tyr Thr Ile Asp Phe Lys
515 520 525
Asp Ile Leu Glu Arg Asn Cys Glu Glu Lys Asp Tyr Thr Ile Trp Leu
530 535 540
Ala His Ser Thr Asp Pro Glu Asp Tyr Glu Asp Gly Cys Ile Leu Gly
545 550 555 560
Tyr Lys Glu Gln Phe Leu Arg Leu Arg Lys Ser Ser Val Cys Gln Asn
565 570 575
Gly Arg Asp Tyr Val Val Thr Lys Gln Pro Ser Ile Cys Leu Cys Ser
580 585 590
Leu Glu Asp Phe Leu Cys Asp Phe Gly Tyr Tyr Arg Pro Glu Asn Asp
595 600 605
Ser Lys Cys Val Glu Gln Pro Glu Leu Lys Gly His Asp Leu Glu Phe
610 615 620
Cys Leu Tyr Gly Arg Glu Glu His Leu Thr Thr Asn Gly Tyr Arg Lys
625 630 635 640
Ile Pro Gly Asp Lys Cys Gln Gly Gly Val Asn Pro Val Arg Glu Val
645 650 655
Lys Asp Leu Lys Lys Lys Cys Thr Ser Asn Phe Leu Ser Pro Glu Lys
660 665 670
Gln Asn Ser Lys Ser Asn
675

Claims (32)

1.一种分离的结合人分拣蛋白的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域包含:由氨基酸序列SEQ ID NO:9组成的HVR-L1,由氨基酸序列SEQ ID NO:29组成的HVR-L2,和由氨基酸序列SEQ ID NO:55组成的HVR-L3,且所述重链可变域包含:由氨基酸序列SEQ ID NO:520组成的HVR-H1,由氨基酸序列SEQID NO:533组成的HVR-H2,和由氨基酸序列SEQ ID NO:553组成的HVR-H3。
2.一种分离的结合人分拣蛋白的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体包含轻链可变域和重链可变域,其中所述轻链可变域由氨基酸序列SEQ ID NO:343组成且所述重链可变域由氨基酸序列SEQ ID NO:648组成。
3.如权利要求1或2所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体增加颗粒蛋白前体的细胞外水平并降低分拣蛋白的细胞水平,其中降低分拣蛋白的细胞水平是降低分拣蛋白的细胞表面水平、降低分拣蛋白的细胞内水平、降低分拣蛋白的总水平、或其任何组合。
4.如权利要求1-3中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体诱导分拣蛋白降解、分拣蛋白裂解、分拣蛋白内化、分拣蛋白下调、或其任何组合。
5.如权利要求1-4中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体如下抑制分拣蛋白与一种或多种蛋白之间的相互作用,通过:a)降低可用于与所述一种或多种蛋白相互作用的分拣蛋白的有效水平;b)诱导分拣蛋白的降解;或两者。
6.如权利要求5所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体抑制分拣蛋白与神经生长因子前体之间的相互作用。
7.如权利要求1至6中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体特异性地结合于人分拣蛋白和小鼠分拣蛋白。
8.如权利要求1-7中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体以介于0.005nM至100nM的范围内的解离常数(KD)结合人分拣蛋白。
9.如权利要求7或权利要求8所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体以介于0.005nM至100nM的范围内的解离常数(KD)结合小鼠分拣蛋白。
10.如权利要求1至9中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体为人抗体、双特异性抗体、单克隆抗体、多价抗体、缀合抗体或嵌合抗体。
11.如权利要求1至9中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体是人源化抗体。
12.如权利要求1至11中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体为识别第二抗原的多价抗体。
13.如权利要求12所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述第二抗原为促进跨血脑屏障运输的抗原。
14.如权利要求13所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述第二抗原选自由转铁蛋白受体、胰岛素受体、胰岛素样生长因子受体、低密度脂蛋白受体相关蛋白1和2、白喉毒素受体、CRM197、TMEM 30(A)、蛋白转导域、TAT、Syn-B、穿膜肽、多精氨酸肽、angiopep肽和ANG1005组成的组。
15.如权利要求1至14中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体为结合于包含人分拣蛋白或哺乳动物分拣蛋白上的氨基酸残基的表位的抗体片段,而且特别是其中所述片段为Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv或scFv片段。
16.如权利要求1至15中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体:
(a)诱导一种或多种颗粒蛋白前体活性;
(b)降低颗粒蛋白前体或其片段的内体内化;和/或
(c)增加颗粒蛋白前体的有效浓度。
17.如权利要求1至16中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体抑制在细胞上表达的分拣蛋白与颗粒蛋白前体之间的相互作用。
18.如权利要求1至17中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体降低分拣蛋白的细胞表面水平。
19.如权利要求1至18中任一项所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体具有IgG1或IgG4同型。
20.如权利要求19所述的抗分拣蛋白抗体,其中:
(a)所述抗分拣蛋白抗体具有人IgG1同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:N297A、N297Q、D265A、L234A、L235A、C226S、C229S、P238S、E233P、L234V、P238A、A327Q、A327G、P329A、K322A、L234F、L235E、P331S、T394D、A330L、M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU编号;或
(b)所述抗分拣蛋白抗体具有人IgG4同型并且包含在Fc区中选自由以下组成的组的残基位置处的一种或多种氨基酸取代:E233P、F234V、L234A/F234A、L235A、G237A、E318A、S228P、L236E、S241P、L248E、T394D、M252Y、S254T、T256E、N297A、N297Q和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU编号。
21.如权利要求20所述的抗分拣蛋白抗体,其中:
(a)所述IgG1 Fc区进一步包含选自由以下组成的组的位置处的一种或多种额外氨基酸取代:A330L、L234F、L235E、P331S和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU编号;
(b)所述IgG1或IgG4 Fc区进一步包含选自由以下组成的组的位置处的一种或多种额外氨基酸取代:M252Y、S254T、T256E和其任何组合,其中所述残基的编号是根据EU编号;或
(c)所述IgG4 Fc区进一步包含根据EU编号的S228P氨基酸取代。
22.如权利要求19所述的抗分拣蛋白抗体,其中所述抗分拣蛋白抗体具有人IgG1同型并且包含残基位置L234A、L235A和P331S处的氨基酸取代,其中所述残基位置的编号是根据EU编号。
23.一种分离的核酸,其包含编码如权利要求1-22中任一项所述的抗分拣蛋白抗体的核酸序列。
24.一种载体,其包含如权利要求23所述的核酸。
25.一种分离的宿主细胞,其包含如权利要求24所述的载体,且其不为植物细胞。
26.一种产生抗分拣蛋白抗体的方法,其包括培养如权利要求25所述的宿主细胞,使得产生所述抗分拣蛋白抗体,任选地其中所述方法进一步包括回收由所述宿主细胞产生的所述抗分拣蛋白抗体。
27.一种分离的抗分拣蛋白抗体,其通过如权利要求26所述的方法来产生。
28.一种药物组合物,其包含如权利要求1至22中任一项所述的抗分拣蛋白抗体和药学上可接受的载体。
29.如权利要求1至22中任一项所述的抗分拣蛋白抗体在制备用于增加颗粒蛋白前体的细胞外水平和/或降低来自一种或多种细胞的分拣蛋白的细胞水平的药物中的用途。
30.如权利要求1至22中任一项所述的抗分拣蛋白抗体在制备用于在有需要的个体中预防疾病、病症或损伤,降低疾病、病症或损伤的风险或治疗疾病、病症或损伤的药物中的用途,其中所述疾病、病症或损伤选自:额颞叶痴呆、阿尔兹海默氏病、肌萎缩性侧索硬化、帕金森氏病、关节炎和骨关节炎。
31.如权利要求1至22中任一项所述的抗分拣蛋白抗体在制备用于在有需要的个体中预防额颞叶痴呆、降低额颞叶痴呆风险或治疗额颞叶痴呆的药物中的用途。
32.如权利要求1至22中任一项所述的抗分拣蛋白抗体在制备用于在有需要的个体中预防阿尔兹海默氏病、降低阿尔兹海默氏病风险或治疗阿尔兹海默氏病的药物中的用途。
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