CN101959887A - 作为激酶抑制剂的吡咯并吡啶 - Google Patents

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Abstract

式I的化合物可用于抑制CHK1和/或CHK2。公开了使用式I的化合物以及其立体异构体和药学上可接受的盐来体外、原位和体内诊断、预防或治疗哺乳动物细胞中的这样的病症或相关联的病理状况的方法。

Description

作为激酶抑制剂的吡咯并吡啶
发明背景
发明领域
本发明涉及新型化合物,涉及包含所述化合物的药物组合物,涉及用于制备所述化合物的方法并且涉及所述化合物在治疗中的用途。更具体地,本发明涉及可用于过度增殖疾病的治疗和预防的某些4-取代的1H-吡咯并[2,3-b]吡啶。
现有技术的状况的描述
蛋白激酶是使其他蛋白磷酸化的激酶。这些蛋白的磷酸化作用通常在蛋白中产生功能性变化。大多数激酶作用于丝氨酸和苏氨酸或酪氨酸,并且一些激酶作用于所有三个。通过这些功能性变化,激酶可以调节许多细胞途径。蛋白激酶抑制剂是抑制这些蛋白激酶的化合物,并且因此可以用于影响细胞途径。
细胞周期检测点激酶1(checkpoint kinase 1)(“CHK1”)是丝氨酸/苏氨酸激酶。CHK1调节细胞周期进程(cell-cycle progression)并且是细胞内DNA损伤响应(DNA-damage response)的主要因素。CHK1抑制剂已经显示使肿瘤细胞对多种基因毒性剂(genotoxic agent)例如化学疗法和辐射敏感。(Tse,Archie N.等人,“Targeting Checkpoint Kinase 1in Cancer Therapeutics(癌症疗法中靶向细胞周期检测点激酶1).”,Clin.Cancer Res.13(7)(2007)1955-1960)。已经观察到,许多肿瘤缺乏G1DNA损伤检测点途径,导致对S和G2检测点的依赖以便修复DNA损伤以及存活。(Janetka,James W.等人,“Inhibitors of checkpoint kinases:From discovery to the clinic(细胞周期检测点激酶的抑制剂:从发现到临床).”Drug Discovery &Development第10卷,第4期(2007)473-486)。S和G2检测点通过CHK1来调节。CHK1的抑制已经显示取消S和G2检测点,从而削弱了DNA修复并且导致增加的肿瘤细胞死亡。然而非癌细胞具有起作用的G1检测点,这允许DNA修复和存活。
细胞周期检测点激酶2(“CHK2”)也是丝氨酸/苏氨酸激酶。CHK2的功能对由DNA损伤介导细胞周期阻滞(cell cycle arrest)和细胞凋亡是重要的。(Ahn,Jinwoo等人,“The Chk2protein kinase(Chk2蛋白激酶)”.DNA Repair 3(2004)1039-1047)。CHK2响应于基因毒性损伤(genotoxic insult)而被激活,并且沿着若干途径传播检测点信号,这最终导致G1、S和G2/M期中的细胞周期阻滞、DNA修复的激活和凋亡性细胞死亡(apoptotic cell death)。(Bartek,Jiri等人,“CHK2 Kinase--A Busy Messenger(CHK2激酶--忙碌的信使)”,Nature Reviews Molecular Cell Biology第2(12)卷(2001)877-886)。癌细胞经常缺乏一个或多个基因组完整性检测点(genome-integrity checkpoint),因此CHK2的抑制可以使肿瘤细胞选择性地对抗癌疗法更敏感,抗癌疗法例如γ辐射或损伤DNA的药物。正常的细胞将仍然激活其他检测点并且修复,而失去了检测点的癌细胞将更可能死亡。已经证明,CHK2的基于肽的抑制剂废除了G2检测点并且使缺乏p53的癌细胞对DNA损伤剂敏感。(Pommier,Yves,等人,“Targeting Chk2Kinase:Molecular Interaction Maps and Therapeutic Rationale(靶向Chk2激酶:分子间相互作用图和治疗基本原理).”Current Pharmaceutical Design第11卷,第22期(2005)2855-2872)。
CHK1和/或CHK2抑制剂是已知的,参见,例如,国际公布第WO2007/090493号、国际公布第WO 2007/090494号、国际公布第WO2006/106326号、国际公布第WO 2006/120573号、国际公布第WO2005/103036号和国际公布第WO 03/028724号。
某些吡咯并吡啶是已知的,但不作为CHK1/2抑制剂,参见,例如,美国专利申请公布2005/0130954、美国专利申请公布2007/0135466、美国专利7,115,741和国际公布第WO 2007/002433号。
发明概述
在一个方面,本发明涉及是CHK1和/或CHK2的抑制剂的化合物。因此,本发明的化合物可用于可以通过对CHK1和/或CHK2蛋白激酶的抑制来治疗的疾病和病状的治疗。
更具体地,本发明的一个方面提供式I的化合物以及其立体异构体和药学上可接受的盐:
Figure BPA00001216219200031
其中G、R1、R2、R3、R5、R6、R7、R8、m、n和p是如本文中所定义的。
本发明的另一个方面提供预防或治疗通过CHK1和/或CHK2调节的疾病或病症的方法,所述方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物施用有效量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐。这样的疾病和病症的例子包括但不限于过度增殖病症(例如癌症)、神经退行性变、心脏肥大、疼痛、偏头痛和神经外伤性疾病。
本发明的另一个方面提供预防或治疗癌症的方法,所述方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物施用单独的或与一种或多种具有抗癌性质的另外的化合物结合的有效量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐。
本发明的另一个方面提供一种治疗哺乳动物中的过度增殖疾病的方法,所述方法包括对哺乳动物施用治疗有效量的本发明的化合物。
本发明的另一个方面提供用于疗法的本发明的化合物。
本发明的另一个方面提供用于治疗过度增殖疾病的本发明的化合物。
本发明的另一个方面提供本发明的化合物在制造用于治疗过度增殖疾病的药物中的用途。在一个进一步的实施方案中,过度增殖疾病是癌症。
本发明的另一个方面提供本发明的化合物在制造在经历癌症疗法的患者的治疗中用作CHK1和/或CHK2抑制剂的药物中的用途。
本发明的另一个方面提供本发明的化合物在过度增殖疾病的治疗中的用途。在一个进一步的方面,过度增殖疾病是癌症。
本发明的另一个方面提供用于治疗过度增殖疾病的药物组合物,所述药物组合物包含本发明的化合物。
本发明的另一个方面提供用于癌症的治疗的药物组合物,所述药物组合物包含本发明的化合物。
本发明的另一个方面提供一种药物组合物,所述药物组合物包含本发明的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体或赋形剂。
本发明的另一个方面包括制备本发明的化合物的方法、分离本发明的化合物的方法和提纯本发明的化合物的方法。
发明详述
现在将详细地参考本发明的某些实施方案,本发明的例子以所附的结构和式来阐释。虽然将与所列举的实施方案结合描述本发明,但是应当理解,它们不意在将本发明限制于那些实施方案。相反地,本发明意在覆盖所有替换方式、修改和等效物,这些替换方式、修改和等效物可以被包括在由权利要求界限的本发明的范围内。本领域的技术人员将认识到可以用于本发明的实施的与本文所描述的方法和材料相似或等效的许多方法和材料。本发明不以任何方式被限制于所描述的方法和材料。在所并入的文献和相似的材料中的一个或多个不同于本申请或与本申请矛盾的情况,以本申请为准,所述情况包括但不限于被定义的术语、术语用法、所描述的技术或类似物。
定义
术语“烷基”包括碳原子的直链的或支链的基团。一些烷基部分已经被缩写,例如,甲基(“Me”)、乙基(“Et”)、丙基(“Pr”)和丁基(“Bu”),并且进一步的缩写用于指代化合物的具体的异构体,例如,1-丙基或正丙基(“n-Pr”)、2-丙基或异丙基(“i-Pr”)、1-丁基或正丁基(“n-Bu”)、2-甲基-1-丙基或异丁基(“i-Bu”)、1-甲基丙基或仲丁基(“s-Bu”)、1,1-二甲基乙基或叔丁基(“t-Bu”)以及类似物。缩写有时与元素缩写和化学结构结合使用,例如甲醇(“MeOH”)或乙醇(“EtOH”)。
在整个本申请中使用的另外的缩写包括苄基(“Bn”)和苯基(“Ph”)。
术语“杂环”或“杂环的”意指含有选自由氧、氮和硫组成的组的一个、两个或三个杂原子的四元至六元环。
术语“杂芳基”意指含有选自由氧、氮和硫组成的组的一个、两个或三个杂原子的五元至六元芳环。
术语“治疗(treat)”或“治疗(treatment)”是指治疗的、预防的(prophylactic)、减轻的或预防性的措施。对于本发明的目的来说,有益的或期望的临床结果包括但不限于症状减轻、疾病的程度的减小、疾病的稳定的(即不恶化的)状态、疾病进展的延迟或减慢、疾病状态的改善或减轻,以及缓解(无论部分的还是总体的),无论是可察觉的还是无法察觉的。“治疗”还可以意为与如果不接受治疗的预期的存活相比的延长的存活。需要治疗的那些包括已经有病状或病症的那些以及倾向于具有病状或病症的那些或其中病状或病症将被预防的那些。
短语“治疗有效量”或“有效量”意指当被施用于需要这样的治疗的哺乳动物时对以下足够的本发明的化合物的量:(i)治疗或预防特定的疾病、病状或病症,(ii)减少、改善或消除特定的疾病、病状或病症的一个或多个症状,或(iii)预防或延迟本文所描述的特定的疾病、病状或病症的一个或多个症状的发作。将相应于这样的量的化合物的量将根据诸如特定的化合物、疾病病状以及其严重性、需要治疗的哺乳动物的特性(例如重量)的因素而变化,但是仍然可以由本领域的技术人员常规地测定。
术语“癌症”和“癌的”是指或描述哺乳动物中的通常以不受调节的细胞生长为特征的生理状况。“肿瘤”包含一个或多个癌细胞。癌症的例子包括但不限于癌、淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤和白血病或淋巴恶性肿瘤。这样的癌症的更特定的例子包括扁平细胞癌(例如上皮扁平细胞癌)、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌(“NSCLC”)、肺的腺癌和肺的鳞状癌)、腹膜癌、肝细胞癌、胃癌(gastric cancer)或胃癌(stomach cancer)(包括胃肠癌)、胰腺癌、成胶质细胞瘤、子宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝细胞瘤、乳腺癌、结肠癌、直肠癌、结直肠癌、子宫内膜癌或子宫癌、唾液管癌、肾癌(kidneycancer)或肾癌(renal cancer)、前列腺癌、外阴癌(vulval cancer)、甲状腺癌、肝癌(hepatic carcinoma)、肛门癌(anal carcinoma)、阴茎癌、皮肤癌(包括黑素瘤)、以及头脖癌。
短语“药学上可接受的”表示物质或组合物必须与构成制剂的其他成分和/或用其治疗的哺乳动物在化学上和/或在毒理学上相容。
如本文所使用的短语“药学上可接受的盐”是指本发明的化合物的药学上可接受的有机盐或无机盐。
本发明的化合物还包括这样的化合物的其他盐,该其他盐不一定是药学上可接受的盐,并且可以用作用于制备和/或提纯本发明的化合物和/或用于分离本发明的化合物的对映体的中间体。
术语“哺乳动物”意指患有本文所描述的疾病或处于发展本文所描述的疾病的风险的温血动物并且包括但不限于豚鼠、犬、猫、大鼠、小鼠、仓鼠和灵长类,包括人类。
CHK1/2抑制剂化合物
本发明提供是可用于通过CHK1和/或CHK2调节的疾病、病状和/或病症的治疗的CHK1和/或CHK2抑制剂的某些4-取代的1H-吡咯并[2,3-b]吡啶。
已经令人吃惊地发现,在3位和/或5位具有特定的取代基的4-取代的1H-吡咯并[2,3-b]吡啶是CHK1和/或CHK2的抑制剂。此外,已经发现,相对于某些其他蛋白激酶,这些化合物中的一些对CHK1是选择性的。
因此,本发明提供式I的化合物以及其立体异构体和药学上可接受的盐:
Figure BPA00001216219200061
其中:
G是环己基或苯基,所述基团任选地用1-3个独立的R4基团取代,或
当m是0时,G可以另外地是不存在的或是C1-C4烷基;
R1选自氢、卤素、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、5元或6元杂芳基、苯基或-O-苯基,其中所述杂芳基、苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
R2选自氢、CH3或-NHC(=O)Rf,条件是当R1是氢时,那么R2是-NHC(=O)Rf
R3选自H或C1-C3烷基;
每个R4独立地选自卤素、CF3、OCF3和CN;
R5和R6独立地选自氢或CH3
R7和R8独立地选自氢或C1-C6烷基;
Ra是C1-C4烷基;
每个Rb基团独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基;
Re是任选地用OH或5元或6元杂环取代的C1-C4烷基;
Rf是任选地用OH取代的C1-C4烷基、任选地用选自氧代、卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂环或任选地用选自卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂芳基;
Rg和Rh独立地是氢或C1-C4烷基;
m、n和p独立地是0或1;
或R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的、具有一个环氮原子的5-6元杂环,并且R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,使得式I的化合物具有式II的结构:
Figure BPA00001216219200071
其中Rc和Rd独立地选自氢或C1-C4烷基;并且
r是1或2。
在某些实施方案中,G是环己基。
在某些实施方案中,G是任选地用一个至三个R4基团取代的苯基。在某些实施方案中,R4是卤素。在特定的实施方案中,G是4-氟苯基、4-氯苯基、4-溴苯基、3-氟-4-氯苯基或3-氯-4-氟苯基。
关于式I的G基团,例子包括任选地用独立地选自卤素、CF3、OCF3和CN的一个或多个R4基团取代的苯基。
在某些实施方案中,m是0并且G是环己基、任选地用1-3个独立的R4基团取代的苯基、不存在的或是C1-C4烷基。
在某些实施方案中,m是0并且G是不存在的。
在某些实施方案中,m是0并且G是C1-C4烷基。
在某些实施方案中,m是0并且G是异丙基。
在某些实施方案中,R1选自卤素、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、5元或6元杂芳基、苯基或-O-苯基,其中所述杂芳基、苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
在某些实施方案中,R1选自Br、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、5元或6元杂芳基、苯基或-O-苯基,其中所述杂芳基、苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
在某些实施方案中,R1选自卤素、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、苯基或-O-苯基,其中所述苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
在某些实施方案中,R1选自Br、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、苯基或-O-苯基,其中所述苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
在某些实施方案中,R1选自CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、苯基或-O-苯基,其中所述苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
在某些实施方案中,R1选自CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(O)ORa、-ORe、苯基或-O-苯基,其中所述苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
在某些实施方案中,R1是Br。
在某些实施方案中,R1是CN。
在某些实施方案中,R1是C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是任选地用卤素取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,R1是CF3
在某些实施方案中,R1是C(=O)ORa。在某些实施方案中,Ra是C1-C4烷基。在一个进一步的实施方案中,Ra是CH3。在某些实施方案中,R1是C(=O)OCH3
在某些实施方案中,R1是-ORe。在某些实施方案中,Re是任选地用OH或5元或6元杂环取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,Re是5元或6元杂环。在某些实施方案中,Re是吗啉基。
在某些实施方案中,Re是C1-C4烷基。在某些实施方案中,Re是异丙基。在某些实施方案中,R1是-OCH(CH3)2
在某些实施方案中,Re是用OH取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Re是2-羟基丁烷。在某些实施方案中,R1是-OCH2CH(OH)CH2CH3
在某些实施方案中,Re是任选地用5元或6元杂环取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Re是用吗啉基取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Re是CH2CH2-吗啉-4-基或CH2CH2CH2-吗啉-4-基。在某些实施方案中,R1是-OCH2CH2-吗啉-4-基或-OCH2CH2CH2-吗啉-4-基。
在某些实施方案中,R1是C3-C6环烷基。
在某些实施方案中,R1是环丙基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的5元或6元杂芳基。在某些实施方案中,所述5元或6元杂芳基是吡唑基、1-氧杂-3,4-二唑基、噻吩基和吡啶基。
在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,Rb是5元或6元杂芳基。在特定的实施方案中,Rb是吡唑基。
在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、吡唑基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的吡唑基。在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的吡唑基。在某些实施方案中,Rb是甲基。在某些实施方案中,R1是1-甲基-1H-吡唑-基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的1-氧杂-3,4-二唑基。在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的1-氧杂-3,4-二唑基。在某些实施方案中,Rb是C1-C4烷基。在某些实施方案中,R1是2-异丙基-1-氧杂-3,4-二唑-5-基。在某些实施方案中,R1是2-甲基-1-氧杂-3,4-二唑-5-基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的吡啶基。在某些实施方案中,R1是吡啶基。在某些实施方案中,R1是吡啶-3-基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的噻吩基。在某些实施方案中,R1是噻吩-2-基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素、OCH3、-C(=O)NRgRh或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素、OCH3、-C(=O)NRgRh或任选地用卤素、OH、氧代、吡唑基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个或两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是用一个或两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、吡唑基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是卤素。在某些实施方案中,R1是用F或Cl取代的苯基。在某些实施方案中,R1是2-氟苯基、3-氟苯基、3-氯苯基或4-氟苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是CN。在某些实施方案中,R1是用CN取代的苯基。在某些实施方案中,R1是3-氰基苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是OCH3。在某些实施方案中,R1是用OCH3取代的苯基。在某些实施方案中,R1是3-甲氧基苯基或4-甲氧基苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是异丙基。在某些实施方案中,R1是3-异丙基苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用卤素取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是CF3。在某些实施方案中,R1是3-三氟甲基苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用OH取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是-CH2OH。在某些实施方案中,R1是3-羟甲基苯基或4-羟甲基苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用5元或6元杂芳基取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是用吡唑基取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是(1H-吡唑-1-基)甲基。在某些实施方案中,R1是4-((1H-吡唑-1-基)甲基)苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rg和Rh是甲基。在某些实施方案中,Rb是-CH2N(CH3)2。在某些实施方案中,R1是3-(CH2N(CH3)2)苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用氧代和NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是-C(=O)NRgRh。在某些实施方案中,Rg是甲基并且Rh是氢。在某些实施方案中,Rb是-C(=O)NHCH3(N-甲基甲酰胺)。在某些实施方案中,R1是4-(C(=O)NHCH3)苯基。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用氧代和NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rb是-CH2C(=O)NRgRh。在某些实施方案中,Rg和Rh是氢。在某些实施方案中,Rb是-CH2C(=O)NH2。在某些实施方案中,R1是3-苯基乙酰胺(苯基-CH2C(=O)NH2)。
在某些实施方案中,R1是用一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是用氧代和NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rg和Rh是氢。在某些实施方案中,Rb是-C(=O)NH2。在某些实施方案中,R1是3-(C(=O)NH2)苯基或4-(C(=O)NH2)苯基。
在某些实施方案中,R1是用两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是OCH3。在某些实施方案中,R1是用OCH3二取代的苯基。在某些实施方案中,R1是3,4-二甲氧基苯基。
在某些实施方案中,R1是用两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是卤素。在某些实施方案中,R1是用F二取代的苯基。在某些实施方案中,R1是3,5-二氟苯基。
在某些实施方案中,R1是用两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素和OCH3。在某些实施方案中,R1是用F和OCH3取代的苯基。在某些实施方案中,R1是3-氟-5-甲氧基苯基。
在某些实施方案中,R1是用在3-苯基位上的至少一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb基团独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代或NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,R1是3-氟苯基、3-氯苯基、3-异丙基苯基、3-甲氧基苯基、3-氰基苯基、3-羟甲基苯基、3-三氟甲基苯基、3-(CH2N(CH3)2)苯基、3-(CH2C(=O)NH2)苯基或3-(C(=O)NH2)苯基。
在某些实施方案中,R1是用在4-苯基位上的至少一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb基团独立地选自卤素、OCH3或任选地用OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,每个Rb基团独立地选自卤素、OCH3或任选地用OH、氧代、吡唑基或NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,R1是4-氟苯基、4-甲氧基苯基、4-羟甲基苯基、4-((1H-吡唑-1-基)甲基)苯基或4-(C(=O)NHCH3)苯基或4-(C(=O)NH2)苯基。
在某些实施方案中,R1是用在2-苯基位上的至少一个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,Rb是卤素。在某些实施方案中,R1是2-氟苯基。
在某些实施方案中,R1是用两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、吡唑基或NRgRh取代的C1-C4烷基。
在某些实施方案中,R1是用在3位和4位上的两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb是OCH3。在某些实施方案中,R1是3,4-二甲氧基苯基。
在某些实施方案中,R1是用在3位和5位上的两个Rb基团取代的苯基。在某些实施方案中,每个Rb独立地选自卤素或OCH3。在某些实施方案中,R1是3,5-二氟苯基或3-氟-5-甲氧基苯基。
在某些实施方案中,R1是氢,条件是当R1是氢时,则R2是-NHC(=O)Rf
在某些实施方案中,R2是卤素。
在某些实施方案中,R2是CH3
在某些实施方案中,R2是-NHC(=O)Rf。在某些实施方案中,Rf是任选地用OH取代的C1-C4烷基、任选地用选自氧代、卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂环或任选地用选自卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂芳基。
在某些实施方案中,Rf是C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rf是甲基或丙基。在某些实施方案中,R2是-NHC(=O)CH3或-NHC(=O)CH2CH2CH3
在某些实施方案中,Rf是用OH取代的C1-C4烷基。在某些实施方案中,Rf是羟甲基。在某些实施方案中,R2是-NHC(=O)CH2OH。
在某些实施方案中,Rf是任选地用选自氧代、卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂环。
在某些实施方案中,Rf是5元或6元杂芳基。在某些实施方案中,Rf是吡啶基。在某些实施方案中,R2是烟酰胺(-NHC(=O)-吡啶-3-基)。
在某些实施方案中,Rf是5元或6元杂芳基。在某些实施方案中,Rf是吡啶基。在某些实施方案中,R2选自烟酰胺和1H-吡唑-4-甲酰胺。
在某些实施方案中,Rf是任选地用选自卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂芳基。
在某些实施方案中,Rf是任选地用选自卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂芳基。在某些实施方案中,R2选自5-氯烟酰胺和5-甲基烟酰胺。
在某些实施方案中,R3是氢。
在某些实施方案中,m是0或1。在某些实施方案中,m是0。在某些实施方案中,m是1。
在某些实施方案中,R4是卤素。在一个进一步的实施方案中,R4是Cl。
在某些实施方案中,n是0或1。在某些实施方案中,n是0。在某些实施方案中,n是1。
在某些实施方案中,p是0或1。在某些实施方案中,p是0。在某些实施方案中,p是1。
在某些实施方案中,R5和R6独立地选自氢或CH3。在某些实施方案中,R5和R6是氢。在某些实施方案中,R5和R6是CH3
在某些实施方案中,R7和R8独立地选自氢或C1-C6烷基。
在某些实施方案中,R7是氢。
在某些实施方案中,R8是氢。
在某些实施方案中,R7和R8是氢。
在某些实施方案中,R7是C1-C6烷基。在一个进一步的实施方案中,R7是C3烷基。在一个进一步的实施方案中,R7是异丙基。在某些实施方案中,R8是氢或甲基。
在某些实施方案中,R8是甲基。
在某些实施方案中,R7是异丙基并且R8是甲基。
在某些实施方案中,R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的、具有一个环氮原子的5-6元杂环,并且R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,使得式I的化合物具有式II的结构:
Figure BPA00001216219200141
其中R1、R2、R3、Rc、Rd、G、m、n和r是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,r是1(具有式IIa的结构):
Figure BPA00001216219200142
其中R1、R2、R3、Rc、Rd、G、m和n是如本文中所定义的。
在式IIa的某些实施方案中,n是0。
在式IIa的某些实施方案中,Rc是氢。
在式IIa的某些实施方案中,Rd是氢。
在式IIa的某些实施方案中,Rc和Rd都是氢。
在式IIa的某些实施方案中,Rc是甲基。
在式IIa的某些实施方案中,Rd是甲基。
在式IIa的某些实施方案中,Rc和Rd都是甲基。
在式IIa的某些实施方案中,R8是H。
在式IIa的某些实施方案中,R8是甲基。
在某些实施方案中,n是0并且r是1(具有式IIa1的结构):
Figure BPA00001216219200151
其中R1、R2、R3、Rc、Rd、G和m是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,r是2(具有式IIb的结构):
其中R1、R2、R3、Rc、Rd、G、m和n是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,n是0并且r是2(具有式IIb1的结构):
Figure BPA00001216219200161
其中R1、R2、R3、Rc、Rd、G和m是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,式I具有式III的结构:
其中R2a是H或甲基,并且R1、R3、R5、R6、R7、R8、G、m和p是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,式I具有式IV的结构:
Figure BPA00001216219200163
其中R1a是卤素或任选地用卤素取代的C1-C4烷基(例如CF3),并且R2、R3、R5、R6、R7、R8、G、m和p是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,m是0并且G是G1,使得式I的化合物具有式V的结构:
其中G1是不存在的或是C1-C4烷基,并且R1、R2、R3、R5、R6、R7、R8和p是本文所定义的。
在式V的某些实施方案中,G1是不存在的。
在式V的某些实施方案中,G1是C1-C4烷基。
在式V的某些实施方案中,G1是异丙基。
在某些实施方案中,m和n是0,R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的、具有一个环氮原子的5-6元杂环,R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,并且G是G1,使得式I的化合物具有式VI的结构:
Figure BPA00001216219200172
其中G1是不存在的或是C1-C4烷基,并且R1、R2、R3、Rc、Rd和r是如本文中所定义的。
在式VI的某些实施方案中,G1是不存在的。
在式VI的某些实施方案中,G1是C1-C4烷基。
在式VI的某些实施方案中,G1是异丙基。
在式VI的某些实施方案中,r是1。
在式VI的某些实施方案中,r是2。
在式VI的某些实施方案中,R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组。
在式VI的某些实施方案中,Rc是氢或C1-C4烷基。
在式VI的某些实施方案中,Rd是氢或C1-C4烷基。
在某些实施方案中,m和n是0,R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的、具有一个环氮原子的5-6元杂环,R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,并且G是G1,使得式I的化合物具有式VIa的结构:
Figure BPA00001216219200181
其中G1是不存在的或是C1-C4烷基,并且R1、R2、R3、Rc和Rd是如本文中所定义的。
在某些实施方案中,m和n是0,R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的具有一个环氮原子的6元杂环,R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,并且G是G1,使得式I的化合物具有式VIb的结构:
其中G1是不存在的或是C1-C4烷基,并且R1、R2、R3、R8、Rc和Rd是如本文中所定义的。
应理解,本发明的某些化合物可以含有不对称中心或手性中心,并且因此以不同的立体异构形成存在。预期本发明的化合物的所有立体异构形式形成本发明的一部分,所述立体异构形式包括但不限于非对映体、对映体和阻转异构体以及其混合物例如外消旋混合物。
在本文所示的结构中,如果任何特定的手性原子的立体化学未具体说明,那么所有的立体异构体都被设想并且被包括为本发明的化合物。如果通过代表特定的构型的实楔形或虚线具体说明了立体化学,那么立体异构体是如所具体说明的和所定义的。
应进一步理解,本发明的化合物可以以未溶剂化的形式以及与药学上可接受的溶剂例如水、乙醇以及类似物一起的溶剂化的形式存在,并且预期本发明包括溶剂化的和未溶剂化的形式两者。
化合物的合成
本发明的化合物可以通过包括类似于化学领域中所熟知的那些方法的工艺合成路线尤其是根据本文所含有的说明书来合成。起始材料通常可从商业来源例如Sigma-Aldrich(St.Louis,MO)、Alfa Aesar(Ward Hill,MA)或TCI(Portland,OR)获得,或使用为本领域的技术人员所熟知的方法容易地制备(例如,通过通常在Louis F.Fieser和Mary Fieser,Reagents for Organic Synthesis(用于有机合成的试剂),第1-19卷,Wiley,N.Y.(1967-1999版本)或Beilsteins Handbuch der organischen Chemie,4,Aufl.编辑,Springer-Verlag,Berlin(包括增刊,也可通过Beilstein在线数据库获得)中所描述的方法来制备)。
为了阐述性的目的,方案1-6和方案A-H示出用于制备本发明的化合物以及关键的中间体的一般方法。对于单个反应步骤的更详细的描述,参见下面的实施例部分。本领域的技术人员将理解,可以使用其他的合成路线合成本发明的化合物。虽然在这些方案中描绘了并且在下面讨论了具体的起始材料和试剂,但是可以容易地替换其他起始材料和试剂,以提供多种衍生物和/或反应条件。此外,可以根据本公开内容使用本领域的技术人员所熟知的常规的化学进一步改性通过下面所描述的方法制备的化合物中的许多。
Figure BPA00001216219200201
方案1
方案1示出了制备式I的化合物7的方法,其中R11是氢、卤素、CN、任选地用卤素取代的烷基、任选地用一个或两个Rb基团取代的芳基、任选地用一个或两个Rb基团取代的杂芳基、-ORr或-C(=O)ORj,Rr是任选地用一个或两个Rb基团取代的芳基、杂芳基、C3-C8环烷基、5-7元杂环或任选地用OH或5元或6元杂环取代的C1-C6烷基,Rj是H、NH2或C1-C6烷基;R12是W-Y或-NHC(=O)Ru(二者都在方案3中定义),并且R3和Rb是如本文所定义的。化合物1(其中PG是保护基并且X是卤素)的制备可以如文献(L′Heureux,Alexandre等人,“Synthesis of functionalized 7-azaindoles viadirected ortho-matalations(官能化7-氮杂吲哚通过直接邻金属化的合成)”,Tetrahedron Lett.45(2004)2317-2319和Thibault,Carl等人,“Concise and efficient synthesis of 4-fluoro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine(4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶的简便和高效率的合成).”,Organic Letters 5,(2003),5023-5025)中所描述的进行。可以通过在标准条件下(例如在合适的溶剂例如四氢呋喃“THF”中的仲丁基锂(s-BuLi))的锂化和用合适的亲电子试剂(CBr4、(1R)-(-)-(10-樟脑磺酰基)哑嗪((1R)-(-)-(10-camphorsulfonyl)oxaziridine)、氯甲酸甲酯等等,如方案2中详细描述的)捕集来进行化合物1的官能化以引入R11,以得到化合物2。在标准条件下除去保护基(例如,四-N-丁基氟化铵(“TBAF”)以除去甲硅烷基(silyl group))提供化合物3。可以如在方案3中描述的在化合物3上进行R12基团的引入以得到4。通过在标准SNAr反应条件下使化合物4与合适地被取代的哌嗪反应来获得化合物5。对5的进一步加工(elaboration)可以根据需要如方案4所示的进行。然后把化合物5脱保护以得到化合物6。在偶联试剂(例如2-(1H-苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基脲六氟磷酸盐,“HBTU”)的存在下用合适的酸酰化6,然后是R1的加工(如方案5中详细描述的)和脱保护(如果需要),得到式I的化合物7,其中R17和R18独立地选自氢;任选地用卤素、氧代、OH、OCH3、CF3、NH2、NH(C1-C6烷基)、N(C1-C6烷基)2、C3-C6环烷基、4元-6元杂环、C4-C6芳基、5-6元杂芳基取代的C1-C6烷基,并且环烷基、杂环、芳基和杂芳基进一步任选地用选自卤素、C1-C3烷基、OH、O(C1-C3烷基)、CF3、CN、环丙基甲基或氧代(仅在环烷基或杂环上)的一个至三个取代基取代;-O-(C1-C6烷基),其中烷基任选地用卤素、氧代、OH、O(C1-C3烷基)、CF3、NH2、NH(C1-C6烷基)、N(C1-C6烷基)2、C3-C6环烷基、4元-6元杂环、C4-C6芳基、5-6元杂芳基取代,并且环烷基、杂环、芳基和杂芳基进一步任选地用选自卤素、C1-C3烷基、OH、O(C1-C3烷基)、CF3、CN、环丙基甲基或氧代(仅在环烷基或杂环上)的一个至三个取代基取代;C3-C6环烷基、4元-6元杂环、C4-C6芳基、5-6元杂芳基,其中环烷基、杂环、芳基和杂芳基进一步任选地用选自卤素、C1-C3烷基、OH、O(C1-C3烷基)、CF3、CN、NH2、NH(C1-C6烷基)、N(C1-C6烷基)2、环丙基、环丙基甲基或氧代(仅在环烷基或杂环上)的一个至三个取代基取代;或-CH(CH3)CH(OH)苯基;并且R5、R6、G、m、n和p是如上文定义的。
在本发明的另一个实施方案中,提供了一种用于制备式I的化合物的方法,所述方法包括:
(a)在偶联试剂的存在下用式A的化合物酰化式6的化合物:
Figure BPA00001216219200221
其中R1选自氢、卤素、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、5元或6元杂芳基、苯基或-O-苯基,其中杂芳基、苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
R2选自氢、CH3或-NHC(=O)Rf,条件是当R1是氢时,那么R2是-NHC(=O)Rf
R3选自H或C1-C3烷基;
Ra是C1-C4烷基;
每个Rb基团独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基;
Re是任选地用OH或5元或6元杂环取代的C1-C4烷基;
Rf是任选地用OH取代的C1-C4烷基、任选地用选自氧代、卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂环或任选地用选自卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂芳基;并且
Rg和Rh独立地是氢或C1-C4烷基;
Figure BPA00001216219200222
其中G是环己基或苯基,所述基团任选地用1-3个独立的R4基团取代,或
当m是0时,G可以另外地是不存在的或是C1-C4烷基;
每个R4独立地选自卤素、CF3、OCF3和CN;
R5和R6独立地选自氢或CH3
R7和R8独立地选自氢或C1-C6烷基;
m、n和p独立地是0或1;
(b)然后是任选对R1加工;以及
(c)然后是任选脱保护以提供式I的化合物。
Figure BPA00001216219200231
方案2
方案2示出了制备化合物2a、2b、2c、2d和2e的方法,其中Rs是C1-C6烷基,Rq是烷基、芳基或5-7元杂芳基,Rr是C1-C6烷基、芳基、杂芳基、C3-C8环烷基、5-7元杂环等等,Q是卤素,且X和PG是如方案1中描述的。如方案1中描述的,化合物1的锂化以及与合适的亲电子试剂的反应得到化合物2a、2c或2e。可以使用合适的偶联反应(例如但不限于Suzuki偶联或Negishi偶联)进行2a的进一步加工,以得到化合物2b。也可以使用与合适的卤代烷的取代反应或与合适的醇的Mitsunobu反应把化合物2c转化为化合物2d。
方案3
方案3示出了用于引入R12基团以提供化合物4a-e的方法。在标准条件下卤化方案1的化合物3得到化合物4a,其中Z是卤素,并且R11和X是如方案1中定义的。通过保护吡咯N-H,然后进行合适的偶联反应,化合物4a可以被转化为化合物4b,其中Rt是W-Y,并且W是O、CH2、NH或与Y的直接的键,并且Y是C1-C6烷基、C1-C6烯基(其中当Y是烯基时,W是与Y的直接的键)、C3-C6环烷基、芳基、5元或6元杂环或5元或6元杂芳基,其中芳基、杂环或杂芳基可以进一步任选地用选自卤素、OH、CF3、CN或氧代(仅在杂环上)的一个至三个取代基取代,并且烷基、烯基和环烷基可以任选地用选自卤素、OH、CF3、CN、氧代、芳基、杂环或杂芳基的一个至三个取代基取代。这些偶联反应包括但不限于Negishi偶联、Heck偶联、Suzuki偶联或可以用于引入多种Rt基团的多种过渡金属介导的偶联方法(包括Cu、Pd和Ni)。具体的偶联程序在实施例部分中详细描述。然后脱保护得到化合物4b。也可以进行化合物3的硝化以得到化合物4c,然后化合物4c可以被还原为胺4d。用合适的酸或酰基氯偶联胺4d得到化合物4e,其中Ru是C1-C6烷基、芳基、杂芳基、C3-C8碳环、5-7元杂环等等,其中烷基、烯基、环烷基、芳基、杂环或杂芳基可以任选地用选自卤素、OH、C1-C3烷基、CF3、CN或氧代(仅在烷基、烯基、环烷基或杂环上)的一个至三个取代基取代。任选地,化合物3可以被转化为3-甲酰基-吡咯并[2,3-b]吡啶,如在Bioorganic & MedicinalChemistry,12(21),5505-5513(2004)中所描述的,其中可以通过多种取代反应例如Wittig、Horner-Emmons或Emmons-Wadsworth将甲酰基取代进一步加工为Rt。此外,在吡咯氮(pyrrole nitrogen)上被合适地保护的化合物4d可以通过还原性胺化、烷基化或过渡金属介导的偶联被转化为4b,其中Rt是NHY。反应条件的选择将取决于Y的性质。
Figure BPA00001216219200241
方案4
方案4示出了用于加工方案1的化合物5的方法。其中Y是卤素且R12、R3和PG是如方案1中定义的化合物5a可以使用与方案2中描述的用于将2a转化为2b的程序相似的程序来转化为化合物5b,其中Rv=芳基或杂芳基。任选地,化合物5e(其中Rw是CH3)可以使用在实施例部分中详细描述的程序来加工为化合物5f,其中Rx是C1-C6烷基。
Figure BPA00001216219200251
方案5
方案5示出了用于加工式I的化合物7的方法。在碱性条件下对化合物7e的水解得到酸7g,其中Ry是烷基并且R12、R3和R是如方案1中定义的。酸7g的偶联提供酰胺7h。酰胺7h的脱水得到腈7i,其中R12是氢。此外,其中Y是卤素的化合物7a可以使用方案2中用于将2a转化为2b的相似条件来转化为化合物7b,其中Rz是芳基或杂芳基。
Figure BPA00001216219200261
方案6
方案6示出了制备化合物17的方法。可以在叔胺碱(tertiary amine base)例如Hunig碱的存在下使用酰基氯例如新戊酰氯作为活化剂,进行合适地被取代的苯乙酸8与手性助剂(例如Evans噁唑烷酮9)的缩合,其中G和m是如本文所定义的。用还原剂(例如,二异丁基氢化铝(“DIBAL-H”)在-78℃至25℃)还原内酰胺11并且用甲醇骤冷并且在诸如pTsOH的酸的存在下,产生中间体甲氧基杂环12,其中Rc、Rd和r是如本文所定义的。可以使用合适的路易斯酸和弱碱(例如四氯化钛和二异丙基乙胺)实现10和12的缩合,以形成2-取代的杂环13。该反应可能需要在低温(例如,-100℃至0℃)下进行,以在反应中获得可接受的非对映异构选择性。使用碱(例如LiOH、H2O2)在0℃至50℃进行手性助剂的水解产生羧酸14。可以使用形成肽键的条件(例如HBTU和N,N-二异丙基乙胺(“DIEA”),在0℃至50℃)通过使酸14与哌嗪中间体15(其中R11、R12和R3是如本文所定义的)偶联来合成充分加工的类似物。使用无水酸(例如,在二氧六环中的HCl)对化合物16脱保护产生游离胺。如果期望,对该胺的还原性胺化(使用醛和还原剂(例如NaBH(OAc)3),或在标准条件下的烷基化允许制备叔胺17,其中R8是如本文所定义的。
如在方案1-6和在实施例中所阐释的本发明的化合物的合成中使用的氨基酸是可商购获得的或可以根据本文公开的方法来制备。例如,在某些实施方案中,用于制备式I的化合物的氨基酸包括具有式1A的β-苯基甘氨酸氨基酸、具有式2A的γ-苯基甘氨酸氨基酸、具有式3A的β-苯基丙氨酸氨基酸和具有式4A的γ-苯基丙氨酸氨基酸:
Figure BPA00001216219200271
其中R17、R18、G、R5和R6是如上文所定义的。
在方案A-H中示出了制备式1A-4A的氨基酸的方法。
方案A
方案A阐释了制备任选地被取代的式1A的β-苯基甘氨酸氨基酸25和26的方法,其中t是0至3,PG是胺保护基,R17、R18和R4是如上文所定义的。根据方案A,使用标准条件,例如在催化量的酸例如浓H2SO4或偶联剂例如二环己基碳二亚胺(“DCC”)/4-二甲氨基吡啶(“DMAP”)的存在下用合适的醇(例如MeOH)处理;或任选地通过在碱例如NEt3/DMAP的存在下,在合适的温度(例如,-20℃至100℃)下用合适的亲电子试剂(例如MeI、EtBr、BnBr)处理,把酸20转化为酯21,其中R′是C1-C6烷基。酯的合适的选择通过合成结束时重整酸所需的条件来确定,且许多合适的例子和条件被列在Greene和Wuts的‘Protective Groups in Organic Synthesis(有机合成中的保护基)’,Wiley-Interscience,第3版,第5章中。可以通过在碱例如NaOEt的存在下,在合适的温度(例如-20℃至室温)下用合适的醛(例如甲醛)处理进行引入羟甲基基团以提供化合物22。可以通过在过量的碱例如NEt3、DIEA或1,8-二氮杂二环十一碳-7-烯(“DBU”)的存在下,在合适的温度(例如-20℃至室温)下用例如甲磺酰氯处理来实现化合物22的醇基的活化以形成离去基团(例如甲磺酸盐、甲苯磺酸盐、卤化物)。在许多情况下,烯烃23可以从该程序中直接被分离,在其它情况下,可能需要加热(30℃至100℃)或另外的碱(例如DBU,在卤化物的情况下)来完成消除,以提供化合物23。可以在合适的溶剂例如THF中,在合适的温度(例如-20℃至回流)下用期望的伯胺(例如,乙胺)处理活化的烯烃23,以生成氨基酯中间体。在化合物23具有多电子(electron rich)芳环或缺电子(electron poor)/体积大的(bulky)伯胺的情况下,可能需要加热(例如,在密封管中30℃-240℃)或微波化学。可以使用二碳酸二叔丁酯(“Boc2O”)在标准条件下实现氨基的保护(例如,叔丁氧基羰基(“Boc”)基团),以提供化合物24,其中Pg是保护基。可以使用任选的保护基,并且许多合适的例子被列在Greene和Wuts的‘Protective Groups in Organic Synthesis(有机合成中的保护基)’,Wiley-Interscience,第3版,第7章中。可以使用适合于酯的条件(例如,含水LiOH用于甲酯,氢化用于苄酯,酸用于叔丁酯)实现酯24的皂化以形成被保护的氨基酸25。
任选地,可以在合适的溶剂例如THF中,在合适的温度(例如-20℃至回流)下用仲胺(例如,二乙胺)处理活化的烯烃23,以生成氨基酯中间体(未示出)。其中化合物23具有多电子芳环或缺电子/体积大的仲胺的情况下,可能需要加热(例如,在密封管中30℃-240℃)或微波化学。可以使用适合于酯的条件(例如,含水LiOH用于甲酯,氢化用于苄酯,酸用于叔丁酯等等)实现酯的皂化以形成氨基酸26。
Figure BPA00001216219200291
方案B
方案B示出了制备任选地被取代的式2A的γ-苯基甘氨酸氨基酸30的方法,其中R4、R5和R6是如本文所定义的,并且t是0至4。可以在碱例如DBU的存在下,在合适的温度(例如0℃至室温)下用被取代的硝基甲烷衍生物(例如硝基乙烷)处理起始的不饱和酯23(可以根据方案A来制备),以得到同系加合物27。可以使用标准条件(例如氢化、Zn/酸等等)在合适的温度(例如室温至回流)下还原化合物27的硝基基团,并且可以环化所得到的中间体以得到内酰胺中间体28。可以在标准条件下使用Boc2O实现胺的保护(例如带有Boc-基团)以提供化合物29。可以使用任选的保护基,并且许多合适的例子被列在Greene和Wuts的‘Protective Groups in Organic Synthesis(有机合成中的保护基)’,Wiley-Interscience,第3版,第7章中。在合适的温度(例如0℃至100℃)下用含水碱例如LiOH或KOH处理化合物29实现内酰胺的开环,以得到适当地被取代的被保护的氨基酸化合物30。
在方案B的一个替换形式中,在化合物29和30中,Boc可以用R17替换。
Figure BPA00001216219200292
方案C
方案C示出了形成γ-氨基酸34和35的单一对映体的代表性的方法,其中t是0至3,PG是胺保护基,例如Boc,R*是手性助剂(例如Evans噁唑烷酮),并且R4、R5和R6是如本文所定义的。在一个可能的方法中,使外消旋氨基酸经受使用手性固定相的手性色谱法分离。任选地,可以制备可以通过常规的色谱技术或结晶技术分离的非对映体混合物。例如,在碱性胺(例如Hunig碱)存在下在-20℃至50℃下活化化合物30(例如,COCl2、碱)并且引入手性助剂(例如Evans噁唑烷酮)得到化合物32和33的非对映体混合物。可以使用标准条件(例如柱色谱法、HPLC、SFC等等)分离该混合物,以得到单独的非对映体。可以通过手性助剂的分解(cleavage)(在Evans助剂的情况下,通过在-15℃至室温下使用(例如)LiOH/HOOH)把这些单独的非对映体转化为期望的酸,以得到化合物34和35。可能需要保持低温,以便预防最近被分离的手性中心的外消旋作用。
方案D
方案D示出了制备任选地被取代的式3A的β-苯基丙氨酸氨基酸39、40和41的方法,其中t是0至3,PG是胺保护基,R17和R18是如上所定义的,并且R4是如本文所定义的。可以在合适的碱例如哌啶的存在下,在合适的温度(例如室温至回流)下用式CN-CH2CO2R″′(其中R″′是C1-C6烷基(例如2-氰基乙酸乙酯))的氰基乙酸酯处理适当地被取代的醛36,以得到不饱和酯37。可以以许多方式实现烯烃和化合物37的腈基的还原,以提供化合物38。例如,可以用已知实现1,4-还原的任何试剂例如NaBH4,来还原烯烃。可以使用诸如LiAlH4或NaBH4的试剂,在诸如BF3OEt2或三氟乙酸(“TFA”)的路易斯酸的存在下还原腈。可以使用许多任选的还原剂,诸如列在Hudlicky的‘Reductions in Organic Chemistry(有机化学中的还原)’,ACS专题论文,第2版,第18章中的那些。如果期望,可以在本阶段使用标准条件(例如使用合适的醛、路易斯酸和还原剂的还原性胺化)单烷基化或双烷基化伯胺38,以提供通向化合物39和40的中间体(未示出)。为了制备伯胺和仲胺,可以使用任何数量的保护基(例如,Greene和Wuts的‘Protective Groups in Organic Synthesis(有机合成中的保护基)’Wiley-Interscience,第3版,第7章)实现保护,例如在0℃至室温下使用Boc酐保护为Boc-基团。可以使用含水碱例如LiOH或KOH或在上述的‘Protecting Groups(保护基)’正文中所列出的任选的试剂中的任一种(例如,氢化用于苄酯)来实现酯基的分解,以形成氨基酸39、40或41。
Figure BPA00001216219200311
方案E
方案E示出了制备任选地被取代的式4A的α-苯基丙氨酸氨基酸45的方法,其中t是0至3,PG是胺保护基,并且R4是如本文所定义的。可以在室温到回流的范围内的温度下使用例如LiAlH4把适当地被取代的酸42还原为苄醇43。可以使用例如PBr3、MsCl/NEt3等等把化合物43的醇基活化为离去基团(例如,卤化物、甲磺酸盐等等)。在强碱例如二异丙基氨基锂(“LDA”)或n-BuLi的存在下使用被保护的甘氨酸衍生物例如2-(二苯基亚甲基氨基)乙酸乙酯置换该离去基团,提供氨基酯中间体44,其中R′是C1-C6烷基。合适的保护基列于Greene和Wuts的‘Protective Groups in Organic Synthesis(有机合成中的保护基)’,Wiley-Interscience中。可以在本阶段改变胺保护基,例如以引入Boc-基团。酯44的随后在合适的温度(例如0℃至回流)下的脱保护(例如使用3N HCl、LiOH、氢化用于苄酯,等等)提供所期望的N-被保护的氨基酸45。
Figure BPA00001216219200321
方案F
可以使用诸如方案F中所示的程序的程序制备β-氨基酸的任何一个对映体。可以用亚胺或亚胺离子(iminium ion)合成子(例如,通过在路易斯酸(例如TiCl4)和适当地被取代的烷氧基六亚甲基四胺(alkoxymethanamine)或N-(烷氧基甲基)酰胺/氨基甲酸酯的存在下,在-100℃至50℃原位制备的)处理具有带有对在氨基酸的β位生成期望的化学合适的立体化学的合适的手性助剂(R*)(例如Evans助剂或磺内酰胺)的2-苯基乙酸酯46(其中t是0至3,且R4是如上文所定义的),以制备化合物47,其中R17是胺保护基或如上文所定义的。不对称加成可能需要路易斯酸(例如TiCl4)、胺碱(例如Hunig碱)和较低的温度(例如-100℃至0℃)的存在,以生成最佳水平的立体化学诱导(stereochemical induction)。如果非对映体选择性低于所需要的,那么可以在本阶段通过例如色谱法或结晶分离单独的非对映体。然后使用已知分解所选择的助剂的方法(例如,对于Evans助剂,LiOH/H2O2,在-50℃至50℃)分解手性助剂导致在β位具有所期望的立体化学的所期望的N-被保护的β-氨基酸48。此外,如果R17也是保护基(例如,2,4-二甲氧基苄基),那么可以在Boc-基团的存在下除去R17(例如、氢化或DDQ等等),以得到Boc-氨基酸71,Boc-氨基酸71在除去Boc-基团时将提供伯胺(未示出),该伯胺可以通过烷基化、酰化或还原性胺化(在与嘧啶-哌嗪单元偶联之前或之后)来进一步官能化。任选地,化合物48的Boc基团可以被加工为R18,R18如上文所定义的。
方案G
方案G示出了制备用于制备式VI的化合物的任选地被取代的氨基酸55的方法,其中Rk是甲基或乙基,R19和R20独立地选自氢、卤素、任选地用选自卤素、OH、CF3、CN或氧代的一个至三个取代基取代的C1-C4烷基,PG是胺保护基,并且R8、G1和r是如上文所定义的。可以使用例如LiBEt3H把适当地被取代的内酰胺50还原为缩醛胺。然后可以用氢化钠和诸如(EtO)2P(O)CH2CO2Et的试剂处理缩醛胺,以提供不饱和酯51。除去保护基PG并且用碱(例如Et3N)处理,提供环化的化合物52。对胺的随后的保护得到化合物53。可以使用合适的碱(例如六甲基二硅基胺基锂(“LHMDS”))和卤代烷进行任选的将G1基团引入到化合物53上,以提供化合物54。然后可以在54上直接进行酯水解,以直接地得到相应的酸,或者可以任选地使化合物54脱保护,然后进行R8引入和酯水解,以得到化合物55。
Figure BPA00001216219200332
方案H
方案H示出了制备用于制备式V的化合物的任选地被取代的氨基酸59的方法,其中PG1与上文所定义的PG相同,并且R17、R18和G1是如上文所定义的。可以通过可商购获得的或由相应的氨基酸制备的氨基酸甲酯的还原性胺化、烷基化或过渡金属催化的偶联引入R17,以得到化合物57。可以以相似的方式引入R18并且然后进行水解以得到任选的被取代的氨基酸59。
在制备式I的化合物时,对中间体的远处(remote)的官能度(例如伯胺或仲胺等等)的保护可能是必要的。对这样的保护的需要将根据远处的官能度的性质和制备方法的条件而变化。合适的氨基保护基(NH-Pg)包括乙酰基、三氟乙酰基、Boc、苄氧基羰基(CBz)和9-芴基亚甲基氧基羰基(Fmoc)。对这样的保护的需要由本领域的技术人员容易地确定。对于保护基和它们的使用的一般描述,参见T.W.Greene,Protective Groups in Organic Synthesis(有机合成中的保护基),John Wiley & Sons,New York,1991。
分离的方法
把反应产物互相分离和/或与起始材料分离可以是有利的。每个步骤或一系列步骤的所期望的产物通过本领域中普通的技术来分离和/或提纯(然后分离)为所期望的均匀度。通常,这样的分离涉及多相萃取、从溶剂或溶剂混合物的结晶、蒸馏、升华或色谱法。色谱法可以涉及任何数量的方法,所述方法包括,例如:反相和正相;尺寸排阻;离子交换;高压、中压和低压液相色谱方法和装置;小规模分析;模拟移动床(SMB)和制备薄层或厚层色谱法以及小规模薄层和快速色谱法的技术。本领域的技术人员将应用最可能实现所期望的分离的技术。
非对映体混合物可以基于它们的物理化学差异,通过本领域的技术人员所熟知的方法例如通过色谱法和/或分步结晶来分离为它们的单个非对映体。可以通过以下方式来分离对映体:通过与合适的光学活性化合物(例如手性助剂,例如手性醇或Mosher酰基氯(Mosher’s acid chloride))反应来将对映体混合物转化为非对映体混合物,分离非对映体以及把单个非对映体转化(例如水解)为相应的纯的对映体。还可以通过使用手性HPLC柱来分离对映体。
可以通过使用这样的方法拆分外消旋混合物来获得基本上不含有其立体异构体的单一立体异构体例如对映体,所述方法例如使用光学活性拆分剂形成非对映体(Eliel,E.和Wilen,S.“Stereochemistry of OrganicCompounds,(有机化合物的立体化学)”,John Wiley & Sons,Inc.,New York,1994;Lochmuller,C.H.,(1975)J.Chromatogr.,113(3):283-302)。可以通过任何合适的方法来分离和离析本发明的手性化合物的外消旋混合物,所述方法包括:(1)与手性化合物形成离子的非对映体的盐并且通过分步结晶或其他方法分离,(2)与手性衍生化试剂形成非对映体的化合物,分离非对映体,并且转化为纯的立体异构体,以及(3)直接在手性条件下分离基本上纯的或富集的立体异构体。参见:“Drug Stereochemistry,Analytical Methods and Pharmacology(药物立体化学、分析方法和药理学)”,Irving W.Wainer编辑,Marcel Dekker,Inc.,New York(1993)。
在方法(1)中,可以通过对映体纯的手性碱例如马钱子碱、奎宁、麻黄素、士的宁、α-甲基-β-苯乙胺(安非他明)以及类似物与带有酸性官能度的不对称化合物例如羧酸和磺酸的反应来形成非对映体的盐。可以诱导非对映体的盐以通过分步结晶或离子色谱法分离。对于氨基化合物的光学异构体的分离,手性羧酸或磺酸例如樟脑磺酸、酒石酸、扁桃酸或乳酸的加入可以导致形成非对映体的盐。
任选地,对于方法(2),将被拆分的底物与手性化合物的一种对映体反应以形成非对映体对(E.和Wilen,S.“Stereochemistry of Organic Compounds(有机化合物的立体化学)”,John Wiley & Sons,Inc.,1994,第322页)。可以通过使不对称化合物与对映体纯的手性衍生化试剂例如薄荷基衍生物反应来形成非对映体的化合物,然后分离非对映体并且水解以获得纯的或富集的对映体。确定光学纯度的方法涉及制备外消旋混合物的手性酯,例如薄荷酯(menthyl ester),例如在碱的存在下的(-)氯甲酸薄荷酯或Mosher酯、乙酸α-甲氧基-α-(三氟甲基)苯基酯(Jacob III.J.Org.Chem.,(1982)47:4165);以及分析1H NMR光谱以分析两种阻转异构体的对映体或非对映体的存在。可以通过正相和反相色谱法分离和离析阻转异构体的化合物的稳定的非对映体,然后进行用于分离阻转异构体的萘基异喹啉的方法(WO96/15111)。
对于方法(3),可以通过使用手性固定相的色谱法来分离两种对映体的外消旋混合物(W.J.Lough编辑,Chapman and Hall,New York,“Chiral Liquid Chromatography(手性液相色谱法)”(1989);Okamoto,J.of Chromatogr.,513:375-378(1990))。可以通过用于区别其他手性分子与不对称碳原子的方法来区别富集的或提纯的对映体,所述方法例如旋光性和圆二色性。
施用和药物制剂
可以通过适合于待治疗的病状的任何便利的途径来施用本发明的化合物。合适的途径包括口服的、胃肠外的(包括皮下的、肌肉内的、静脉内的、动脉内的、皮内的、鞘内的和硬膜外的)、透皮的、直肠的、鼻的、局部的(包括颊的和舌下的)、阴道的、腹膜内的、肺内的和鼻内的。
可以以任何便利的施用形式来施用化合物,例如片剂、粉末、胶囊、溶液、分散体、悬浮液、糖浆剂、喷雾剂、栓剂、凝胶剂、乳剂、贴剂等等。这样的组合物可以含有药物制剂中常规的组分,例如稀释剂、载体、pH调节剂、增甜剂、膨胀剂(bulking agent)和另外的活性剂。如果期望胃肠外施用,那么组合物将是无菌的并且以适合于注射或输注的溶液或悬浮液形式。
典型的制剂通过混合本发明的化合物和载体或赋形剂来制备。合适的载体和赋形剂是本领域的技术人员所熟知的并且在例如Howard C.Ansel等人,Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems(药物剂型和药物递送系统),(第8版,2004);Alfonso R.Gennaro等人,Remington:The Science and Practice of Pharmacy(雷明顿:药学的科学和实践),(第20版,2000);以及Raymond C.Rowe,Handbook of Pharmaceutical Excipients(药物赋形剂手册),(第5版,2005)中详细描述。制剂还可以包括一种或多种缓冲剂、稳定剂、表面活性剂、润湿剂、润滑剂、乳化剂、悬浮剂、防腐剂、抗氧化剂、不透明剂(opaquing agent)、助流剂、加工助剂、着色剂、增甜剂、芳香剂、调味剂、稀释剂和其他已知的添加剂,以提供药物(即本发明的化合物或其药物组合物)的极好外观或在药物产品(即药物)的制造中提供帮助。
本发明的一个实施方案包括一种包含本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐的药物组合物。在一个另外的实施方案中,本发明提供一种包含本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐连同药学上可接受的载体或赋形剂的药物组合物。
用本发明的化合物治疗的方法
本发明包括通过施用本发明的一种或多种化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐来治疗或预防疾病或病状的方法。在一个实施方案中,用以可检出地抑制CHK1活性的量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体、佐剂或媒介物来治疗人类患者。
在本发明的另一个实施方案中,提供了一种预防或治疗通过CHK1和/或CHK2调节的疾病或病症的方法,所述方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物施用有效量的本发明的化合物。
在本发明的另一个实施方案中,提供了一种治疗哺乳动物中的过度增殖疾病的方法,该方法包括对哺乳动物施用治疗有效量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐。
在另一个实施方案中,一种治疗或预防在需要这样的治疗的哺乳动物中的癌症(包括下文所指出的病状)的方法,其中所述方法包括对所述哺乳动物施用治疗有效量本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐。
因为CHK1抑制剂的加强许多抗癌剂的活性的能力,预期的是,可以通过本发明的组合物和方法治疗许多肿瘤类型。这些病状包括但不限于:心脏的:肉瘤(血管肉瘤、纤维肉瘤、横纹肌肉瘤、脂肪肉瘤)、粘液瘤、横纹肌瘤、纤维瘤、脂肪瘤和畸胎瘤;肺的:支气管癌(扁平细胞、未分化的小细胞、未分化的大细胞、腺癌)、肺泡(细支气管)癌、支气管腺瘤、肉瘤、淋巴瘤、软骨瘤错构瘤(chondromatous hamartoma)、间皮瘤;胃肠的:食管(鳞状细胞癌、腺癌、平滑肌肉瘤、淋巴瘤)、胃(癌、淋巴瘤、平滑肌肉瘤)、胰腺(导管腺癌、胰岛素瘤、高血糖素瘤、胃泌素瘤、类癌瘤、舒血管肠肽瘤)、小肠(腺癌、淋巴瘤、类癌瘤、卡波西氏肉瘤、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤、神经纤维瘤、纤维瘤)、大肠(腺癌、管状腺瘤、绒毛状腺瘤、错构瘤、平滑肌瘤);泌尿生殖道:肾(腺癌、维尔姆斯氏肿瘤[肾胚细胞瘤]、淋巴瘤、白血病)、膀胱和尿道(鳞状细胞癌、移行细胞癌、腺癌)、前列腺(腺癌、肉瘤)、睾丸(精原细胞瘤、畸胎瘤、胚胎性癌、畸胎癌、绒毛膜癌、肉瘤、间质细胞癌、纤维瘤、纤维腺瘤、腺瘤样瘤、脂肪瘤);肝:肝癌(肝细胞癌)、胆管癌、肝胚细胞瘤、血管肉瘤、肝细胞腺瘤、血管瘤;骨:成骨肉瘤(骨肉瘤)、纤维肉瘤、恶性纤维性组织细胞瘤、软骨肉瘤、尤因肉瘤、恶性淋巴瘤(网状细胞肉瘤)、多发性骨髓瘤、恶性巨细胞瘤脊索瘤(malignant giant cell tumor chordoma)、骨软骨性外生骨疣(osteochronfroma)(骨软骨性外生骨疣)、良性软骨瘤、软骨母细胞瘤、软骨粘液样纤维瘤(chondromyxofibroma)、骨样骨瘤和巨细胞瘤;神经系统:颅骨(骨瘤、血管瘤、肉芽瘤、黄色瘤、畸形性骨炎)、脑脊膜(脑脊膜瘤、脑脊膜肉瘤(meningiosarcoma)、神经胶质瘤病)、脑(星形细胞瘤、神经管母细胞瘤、神经胶质瘤、室管膜瘤、生殖细胞瘤[松果体瘤]、多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiform)、少突神经胶质瘤、神经鞘瘤、视网膜母细胞瘤、先天性肿瘤)、脊髓神经纤维瘤、脑脊膜瘤、神经胶质瘤、肉瘤);妇科学的:子宫(子宫内膜癌)、宫颈(宫颈癌、肿瘤前宫颈非典型增生(pre-tumor cervical dysplasia))、卵巢(卵巢癌[浆液性囊腺癌、粘液性囊腺癌、未分类的癌]、粒-膜细胞肿瘤(granulosa-thecal cell tumor)、支持-间质细胞瘤、无性细胞瘤、恶性畸胎瘤)、外阴(鳞状细胞癌、上皮内癌、腺癌、纤维肉瘤、黑素瘤)、阴道(透明细胞癌、鳞状细胞癌、葡萄状肉瘤[胚胎性横纹肌肉瘤]、输卵管(癌);血液学的:血液(骨髓性白血病[急性的和慢性的]、急性淋巴母细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、骨髓增生性疾病、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征)、霍奇金病、非霍奇金淋巴瘤[恶性淋巴瘤;皮肤:恶性黑色素瘤、基底细胞癌、鳞状细胞癌、卡波西氏肉瘤、发育异常痣(moles dysplastic nevi)、脂肪瘤、血管瘤、皮肤纤维瘤、瘢痕疙瘩、牛皮癣;乳房:浸润性乳腺癌(invasive breast carcinomas)(浸润性导管癌和浸润性小叶癌),等等;以及肾上腺:神经母细胞瘤。术语过度增殖疾病包括上面提到的病状。如本文提供的术语“癌细胞”包括被上面提到的病状中的任何一个侵袭的细胞。
本发明的另一个实施方案提供本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐在制造用于癌症的治疗的药物中的用途。
在另一个实施方案中,提供了一种治疗或预防通过CHK1和/或CHK2调节的疾病或病症的方法,该方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物施用有效量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐。
在另一个实施方案中,提供了一种预防或治疗癌症的方法,该方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物施用单独的或与一种或多种具有抗癌性质的另外的化合物结合的有效量的本发明的化合物。
预期在CHK1抑制剂触发CHK1依赖的细胞周期检测点时,CHK1抑制剂加强很多抗癌剂的活性。
本发明涉及用于哺乳动物中的过度增殖疾病的治疗的组合物,所述组合物包含与抗肿瘤剂结合的治疗有效量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐,所述抗肿瘤剂选自有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物(anti-metabolite)、反义DNA或反义RNA、嵌入抗生素(intercalating antibiotic)、生长因子抑制剂、信号转导抑制剂、细胞周期抑制剂、酶抑制剂、类视黄醇受体调节剂、蛋白酶体抑制剂、拓扑异构酶抑制剂、生物反应修饰剂、抗激素、血管生成抑制剂、抗雄激素、靶向抗体、HMG-CoA还原酶抑制剂和含异戊二烯基的蛋白转移酶抑制剂。
本发明还涉及用于治疗哺乳动物中的过度增殖病症的方法,该方法包括对所述哺乳动物施用与抗肿瘤剂结合的治疗有效量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐,所述抗肿瘤剂选自有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、反义DNA或反义RNA、嵌入抗生素、生长因子抑制剂、信号转导抑制剂、细胞周期抑制剂、酶抑制剂、类视黄醇受体调节剂、蛋白酶体抑制剂、拓扑异构酶抑制剂、生物反应修饰剂、抗激素、血管生成抑制剂、抗雄激素、靶向抗体、HMG-CoA还原酶抑制剂和含异戊二烯基的蛋白转移酶抑制剂。
另一个实施方案提供用于疗法的本发明的化合物。
另一个实施方案提供用于治疗过度增殖疾病的本发明的化合物。在一个另外的实施方案中,所述过度增殖疾病是癌症,包括上文所提出的病状。
本发明还涉及用于抑制哺乳动物中的异常的细胞生长的药物组合物,所述药物组合物包含与适量的化学治疗剂结合的适量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐,其中化合物、立体异构体或盐和化学治疗剂的量是共同对抑制异常的细胞生长有效的。许多化学治疗剂是本领域已知的。在某些实施方案中,化学治疗剂选自有丝分裂抑制剂、烷化剂、抗代谢物、反义DNA或反义RNA、嵌入抗生素、生长因子抑制剂、信号转导抑制剂、细胞周期抑制剂、酶抑制剂、类视黄醇受体调节剂、蛋白酶体抑制剂、拓扑异构酶抑制剂、生物反应修饰剂、抗激素、血管生成抑制剂、抗雄激素、靶向抗体、HMG-CoA还原酶抑制剂和/或含异戊二烯基的蛋白转移酶抑制剂。
本发明涉及用于抑制哺乳动物中的异常的细胞生长或用于治疗过度增殖病症的方法,所述方法包括对哺乳动物施用与放射疗法结合的适量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐,其中与放射疗法结合的化合物或盐的量是对抑制哺乳动物中的异常的细胞生长或治疗过度增殖病症有效的。用于施用放射疗法的技术是本领域已知的,并且这些技术可以用于本文所描述的组合治疗。本发明的化合物在这一组合治疗中的施用可以如本文所描述的来确定。
据信,本发明的化合物可以使异常的细胞对用辐射以便杀死和/或抑制这样的细胞的生长的治疗更敏感。因此本发明进一步涉及用于使哺乳动物中的异常的细胞对用辐射治疗敏感的方法,所述方法包括对哺乳动物施用适量的本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐,所述量是对使异常的细胞对辐射治疗敏感有效的。在本方法中使用的化合物、立体异构体或盐的量可以根据如本文所描述的用于确定这样的化合物的有效量的手段或通过本领域的技术人员所知的方法来确定。
本发明的另一个实施方案提供本发明的化合物或其立体异构体或药学上可接受的盐在制造用于治疗过度增殖疾病的药物中的用途。在一个另外的实施方案中,所述过度增殖疾病可以是癌症,包括上文所提出的病状。
在本发明的另一个实施方案中,提供本发明的化合物在制造在经历癌症疗法(包括上文所提出的病状)的患者的治疗中用作CHK1和/或CHK2抑制剂的药物中的用途。
本发明的另一个实施方案提供本发明的化合物在过度增殖疾病的治疗中的用途。在一个进一步的实施方案中,所述过度增殖疾病是癌症,包括上文所提出的病状。
另一个实施方案提供本发明的化合物在制造在经历癌症疗法的患者的治疗中用作CHK1和/或CHK2抑制剂的药物中的用途。
在另一个实施方案中,提供用于治疗过度增殖疾病的药物组合物,所述药物组合物包含本发明的化合物。
在另一个实施方案中,提供用于癌症的治疗的药物组合物,所述药物组合物包含本发明的化合物。
组合治疗
可以采用单独的或与其他用于治疗的治疗剂结合的本发明的化合物以及其立体异构体和药学上可接受的盐。可以使用与一种或多种另外的药物结合的本发明的化合物,所述另外的药物包括以不同的作用机理起作用的化合物。药物组合制剂或剂量方案的第二化合物优选具有与本发明的化合物互补的活性,使得它们不会不利地互相影响。这样的分子以对预期的目标有效的量的组合合适地存在。这些化合物可以在单一的药物组合物中一起施用,或可以分离地施用,并且当分离地施用时,施用可以同时发生或以任何顺序相继地发生。这样的相继施用可以有短的时间间隔或长的时间间隔。
实施例
为了阐述本发明,包括了以下的实施例。然而,应当理解,这些实施例并不限制本发明并且仅意在提出实施本发明的方法。本领域的技术人员将认识到,所描述的化学反应可以容易地被修改以制备本发明的许多其他的化合物,并且用于制备本发明的化合物的任选的方法被认为在本发明的范围内。例如,可以通过对本领域的技术人员来说明显的修改来成功地进行根据本发明的未被举例说明的化合物的合成,例如,通过适当地保护干扰基团、通过利用除了所描述的那些试剂之外的本领域中已知的其他合适的试剂、和/或通过进行反应条件的常规修改。任选地,本文公开的或本领域已知的其他反应将被认为具有用于制备本发明的其他化合物的适用性。
在下面所描述的实施例中,除非另外指出,否则所有温度都以摄氏度给出。试剂从商业供应者例如Sigma-Aldrich、Alfa Aesar或TCI购买,并且没有进一步的提纯就使用,除非另外指出。
下面阐述的反应通常在氮气或氩气的正压力下或用干燥管(除非另有说明)在无水溶剂中进行,并且反应烧瓶通常配有用于通过注射器引入底物和试剂的橡胶隔片。玻璃器皿被烘箱干燥和/或加热干燥。
柱色谱法在具有硅胶柱的Biotage系统(制造商:Dyax Corporation)或在二氧化硅SepPak筒(Waters)上或在使用C18H柱的Biotage SP4系统上进行(除非另有说明)。1H NMR光谱在以400MHz操作的Varian仪器上记录。1H NMR光谱使用TMS作为参考标准以CDCl3、d6-DMSO、CH3OD或d6-丙酮溶液获得(以ppm报告)。当报告峰多重性时,使用以下缩写:s(单峰)、d(双峰)、t(三重峰)、q(四重峰)、m(多重峰)、br(宽峰)、dd(双二重峰)、dt(双三重峰)。偶合常数当给出时,以赫兹(Hz)报告。
实施例A
CHK1酶测定
以3倍连续稀释把化合物稀释在二甲亚砜(“DMSO”)中并且然后加入反应中以得到1%DMSO的最终浓度。在酶测定中,使用从杆状病毒提纯的在羧基末端具有10个另外的组氨酸残基的人类CHK1激酶域氨基酸1至273,来测试化合物。底物是来自Invitrogen的荧光Omnia肽S/T11。测定含有在25μL反应体积中的25mM HEPES pH 7.4、10mM MgCl2、1mM DTT、0.01%Triton-X100、0.5nM CHK1酶、2uM S/T 11肽底物、60M ATP、测试化合物1%DMSO。测定在室温下在白色384井聚丙烯板(可从Naperville,IL的Nunc,Inc获得)中进行,在Envision平板读数器(Waltham,MA的PerkinElmer,Inc.),激发340nM,发射495nM中每50秒收集数据,收集45分钟。把来自每个井的所收集的数据拟合成直线,并且使用所得到的比率计算对照的百分比。使用四参数拟合从对照的百分比对化合物浓度的图确定每种测试化合物的IC50值。
实施例1-74的化合物在上述测定中被测试并且发现具有小于10.5uM的IC50
实施例B
5-甲氧基-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
把5,5-二甲基吡咯烷-2-酮(0.108g,0.953mmol,如Ganem,B.等人,TetLett 26:6413(1985)中所描述的制备)溶解在THF(3mL)中并且冷却至-20℃。把溶液用LHMDS(1.05mL,1.05mmol)处理,并且在-20℃搅拌30分钟。加入二碳酸二叔丁酯(0.250g,1.14mmol),并且允许反应混合物升温至环境温度。在环境温度下把反应搅拌两小时,并且然后用饱和NH4Cl骤冷,用乙酸乙酯稀释并且分离。把有机层用饱和NH4Cl、饱和NaHCO3、饱和NaCl洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩为油。使粗产物经受SiO2色谱法,并用4∶1己烷/乙酸乙酯洗脱。回收固体状的2,2-二甲基-5-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(0.11的Rf,在4∶1己烷/乙酸乙酯中)(0.87g,43%)。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ2.48(t,J=7.8,2H),1.85(t,2H),1.54(s,9H),1.47(s,6H)。
把DIBAL-H(73.65mL,110.5mmol,1.5M在甲苯中)分部分加入2,2-二甲基-5-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(23.10g,108.3mmol)在被冷却至-78℃的干燥Et2O(200mL)中的溶液中。在-78℃把反应搅拌1小时,并且然后允许升温至室温并且搅拌过夜。把反应用NH4OH(50mL)骤冷,并且搅拌20分钟。然后用EtOAc(200mL)稀释反应,加入0.5M罗谢尔盐(100mL),并且分离各层。把有机部分用0.5M罗谢尔盐(2×100mL)、盐水(100mL)洗涤,干燥(MgSO4)并且浓缩为油。把所述油加入对甲苯磺酸一水合物(2.06g,10.8mmol)在MeOH(200mL)中的溶液中,并且在室温下搅拌过夜。然后把反应浓缩,加入EtOAc(200mL)中,用饱和Na2CO3(2×100mL)、盐水(50mL)洗涤,干燥(MgSO4)并且浓缩以得到油状的5-甲氧基-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(24.07g,收率96.9%)。
实施例C
Figure BPA00001216219200431
(S)-2-(4-溴苯基)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)乙酸
在甲苯(30mL)和三乙胺(10.2mL,73.0mmol)中结合2-(4-溴苯基)乙酸(7.85g,36.5mmol)和(R)-4-苄基噁唑烷-2-酮(3.23g,18.3mmol)。然后把溶液加热至80℃,并且缓慢加入新戊酰氯(4.49mL,36.5mmol)在甲苯(7.5mL)中的溶液。把反应加热至110℃并且搅拌过夜。然后把反应冷却,并且用2N HCl、水、5%Na2CO3、盐水洗涤甲苯溶液,并且然后在Na2SO4上干燥。在除去溶剂之后,通过柱色谱法提纯残留物,以得到固体状的(R)-4-苄基-3-(2-(4-溴苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(5.65g,83%)。
在-78℃把1.0M在甲苯中的TiCl4(3.52mL,3.52mmol)加入(R)-4-苄基-3-(2-(4-溴苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(1.26g,3.35mmol)在二氯甲烷(“DCM”;30mL)中的溶液中。然后把DIEA(0.64mL,3.69mmol)加入冷的搅拌溶液中。在-78℃搅拌反应15分钟,然后加入5-甲氧基-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.00g,4.36mmol,参见实施例B)在DCM(10mL)中的溶液。然后使反应升温至-10℃并且搅拌2小时。用饱和NH4Cl溶液(20mL)骤冷反应,并且把有机部分分离,在硫酸钠上干燥,过滤并且浓缩。通过柱色谱法提纯所得到的残留物,以得到固体状的(S)-5-((R)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-溴苯基)-2-氧代乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.63g,85%)。
把30%H2O2(0.67mL,7.0mmol)加入LiOH-H2O(0.24g,5.60mmol)在THF/水(2∶1,93mL)中的溶液中,并且在室温下搅拌溶液10分钟。然后把溶液冷却至0℃并且用(S)-5-((R)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-溴苯基)-2-氧代乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.60g,2.80mmol)在THF(10mL)中的溶液处理。在0℃把反应搅拌2小时,并且允许升温至室温并且搅拌过夜。然后把反应冷却至0℃,并且用1M Na2SO3(10mL)处理并且搅拌10分钟。然后使反应升温至室温并且搅拌10分钟。接着,浓缩反应并且用EtOAc(2×20mL)萃取。然后把水层用1N HCl酸化至约1至约2的pH,并且用DCM(2×20mL)萃取。把结合的DCM部分在硫酸钠上干燥,过滤,并且浓缩以得到固体状的(S)-2-(4-溴苯基)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)乙酸(1.01g,收率87%)。检测到MS ESI(+)m/z412。
实施例D
Figure BPA00001216219200441
(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-2-(4-氯-3-氟苯基) 乙酸
在0℃把2-(4-氯-3-氟苯基)乙酸(1.00g,5.30mmol)溶解在THF(14mL)中,并且用三乙胺(0.81mL,5.8mmol)处理。然后把新戊酰氯(0.69mL,5.6mmol)加入溶液中,并且允许在0℃搅拌混合物一小时。在单独的烧瓶中,在-78℃把(R)-4-苄基噁唑烷-2-酮(0.987g,5.57mmol)溶解在THF(14mL)中,并且用n-BuLi(2.54mL,5.83mmol)处理。在-78℃把上述的阴离子溶液搅拌20分钟并且然后用套管引入酐中。然后允许在-78℃把反应搅拌一小时,并且然后升温至0℃,保持两小时。把混合物通过加入饱和NH4Cl溶液(20mL)骤冷,并且在真空中浓缩。然后把所得到的残留物在乙酸乙酯和水之间分配。用乙酸乙酯萃取水层一次,并且把有机部分结合,用盐水洗涤,分离,在MgSO4上干燥,过滤,并且在真空中浓缩。通过柱色谱法(3∶1己烷∶乙酸乙酯)提纯所得到的残留物,以得到油状的(R)-4-苄基-3-(2-(4-氯-3-氟苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(0.95g,51%),(R)-4-苄基-3-(2-(4-氯-3-氟苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮刚静置就固化。
把在甲苯中的TiCl4(7.79mL,7.79mmol)加入(R)-4-苄基-3-(2-(4-氯-3-氟苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(2.58g,7.42mmol)在DCM(60mL)中的溶液中。把DIEA(1.42mL,8.16mmol)加入该搅拌的冷溶液中,然后加入5-甲氧基-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(2.21g,9.65mmol)在DCM(20mL)中的溶液。在-78℃把反应搅拌15分钟并且然后升温至-10℃并且搅拌3小时。用饱和NH4Cl溶液(20mL)骤冷反应,并且把有机层分离,并且在硫酸钠上干燥。在除去溶剂之后,通过柱色谱法提纯所得到的残留物,以得到固体状的(S)-5-((R)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-溴苯基)-2-氧代乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(2.62g,65%)。
把30%H2O2(0.159mL,1.65mmol)加入LiOH-H2O(0.055g,1.32mmol)在2∶1的THF∶H2O(40mL)中的溶液中。把混合物搅拌20分钟并且然后冷却至0℃。接着缓慢加入(S)-5-((S)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-氯-3-氟苯基)-2-氧代乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(0.360g,0.660mmol)在THF(3mL)中的溶液。当加入完成后,允许反应升温至室温并且搅拌过夜。然后把反应混合物再冷却至0℃,并且加入1M Na2SO3(4mL)。在0℃搅拌反应10分钟并且然后升温至室温并且搅拌另外的10分钟。然后在真空中把反应浓缩至除去THF,并且用EtOAc洗涤所得到的混合物。然后把有机部分在硫酸钠上干燥,过滤并且浓缩以得到粉末状的(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-2-(4-氯-3-氟苯基)乙酸钠盐(0.24g,94%)。检测到MS ESI(+)m/z 386。
实施例E
3-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丙酸
把纯的SOCl2(25.7g,216.7mmol)逐滴加入甲醇(100mL)的-60℃溶液中。当加入完成后,分几部分加入3-(4-氯苯基)丙酸(10.0g,54.1mmol)。当加入完成后,除去冷却浴,并且使反应混合物缓慢升温至室温并且搅拌过夜。然后把反应浓缩至干燥,并且把所得到的残留物溶解在DCM(100mL)中,用饱和NaHCO3洗涤,干燥(MgSO4),过滤,并且浓缩以得到油状的3-(4-氯苯基)丙酸甲酯(10.48g,97%)。
把BuLi(5.2mL,1.6M在己烷中)加入二异丙胺(0.91g,9.0mmol)在THF(40mL)中的0℃溶液中。然后在0℃把反应混合物搅拌30分钟,并且然后冷却至-78℃。缓慢加入3-(4-氯苯基)丙酸甲酯(1.5g,7.5mmol)在THF(8mL)中的溶液,并且在-78℃把反应混合物搅拌40分钟。然后加入2-溴乙酸叔丁酯(4.4g,22.7mmol)在THF(5mL)中的溶液。然后在-78℃把反应搅拌30分钟,并且然后升温至室温并且搅拌过夜。然后把反应用饱和NH4Cl骤冷并且浓缩以除去THF。然后用EtOAc萃取反应,并且把结合的萃取物干燥(Na2SO4),过滤,浓缩并且在真空中干燥以得到油状的1-甲基-2-(4-氯苄基)琥珀酸4-叔丁酯(1.91g,81%)。
把TFA(15mL)在0℃逐滴加入1-甲基-2-(4-氯苄基)琥珀酸4-叔丁酯(1.91g,6.1mmol)在DCM(30mL)中的溶液中。然后使反应混合物升温至室温并且搅拌5小时。然后把反应浓缩至干燥以得到糖浆状的3-(4-氯苄基)-4-甲氧基-4-氧代丁酸(1.55g,95%),3-(4-氯苄基)-4-甲氧基-4-氧代丁酸不经进一步提纯就被使用。
把叠氮化磷酸二苯酯(2.1g,76mmol)加入3-(4-氯苄基)-4-甲氧基-4-氧代丁酸(1.6g,6.4mmol)和三乙胺(“TEA”;0.97g,9.58mmol)在t-BuOH(40mL)中的溶液中。然后把反应混合物加热至回流并且搅拌6小时。然后把反应冷却至室温并且浓缩为油。通过柱色谱法(9∶1至5∶1的己烷∶EtOAc)提纯得到3-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丙酸甲酯(0.64g,31%)。
把LiOH-H2O(0.09g,2.1mmol)加入3-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丙酸甲酯(0.64g,1.9mmol)在2∶1的THF∶H2O(20mL)中的溶液中。然后在室温下把反应搅拌3小时,并且然后用H2O(50mL)稀释并且用乙醚(50mL)洗涤。接着把水层用固体KHSO4酸化,用固体NaCl饱和,并且用DCM萃取。把结合的有机萃取物干燥(Na2SO4),过滤,浓缩,并且在真空中干燥以得到固体状的3-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丙酸(0.523g,85%)。检测到MS ESI(-)m/z 312。
实施例F
Figure BPA00001216219200461
(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-2-基)-2-(4-氯苯基)乙酸
在甲苯(100mL)中结合2-(4-氯苯基)乙酸(20.00g,117.2mmol)和(R)-4-苄基噁唑烷-2-酮(10.39g,58.62mmol)。加入三乙胺(32.68mL,234.5mmol),并且把溶液加热至80℃。逐滴加入在甲苯(25mL)中的新戊酰氯(14.42mL,117.2mmol)的溶液。在加入之后,把混合物加热至回流,持续16小时。把反应冷却,并且用2N HCl(2×)、水、5%Na2CO3(2×)、饱和NaCl洗涤,在Na2SO4上干燥,并且在真空中浓缩至固体。使粗物质固体经受SiO2色谱法,用4∶1己烷/乙酸乙酯洗脱。回收固体状的(R)-4-苄基-3-(2-(4-氯苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(30.7g,80%)。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ7.34-7.26(m,7H),7.16-7.11(m,2H),4.71-4.64(m,1H),4.35-4.16(m,4H),3.26(dd,J1=2.9,J2=13.2,1H),2.76(dd,J1=9.3,J2=13.2,1H)。
把2-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(12.33g,66.57mmol)溶解在Et2O(60mL)中并且冷却至-78℃。用DIBAL-H(45.27mL,67.90mmol;1.5M在甲苯中)逐滴处理悬浮液,并且在-78℃搅拌混合物2小时。允许混合物在浴中升温至环境温度并且搅拌过夜。通过加入对甲苯磺酸水合物(0.075g)在MeOH(75mL)中的溶液来骤冷反应。在环境温度下搅拌混合物16小时。在真空中将悬浮液浓缩至固体。把固体再悬浮在罗谢尔盐(0.5N)和乙酸乙酯的混合物中。分离各层,并且用二氯甲烷(2×)洗涤水层。把结合的有机层用饱和NaCl洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩以提供油。把氯化钛(IV)的溶液(10.0mL,10.0mmol;1M在甲苯中)冷却至0℃并且用溶解在二氯甲烷(20mL)中的(R)-4-苄基-3-(2-(4-氯苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(3.00g,9.10mmol)的溶液处理。5分钟之后,加入二异丙基乙胺(1.74mL,10.0mmol)。在0℃把所得到的溶液搅拌1小时,然后冷却至-20℃。加入溶解在二氯甲烷(20mL)中的2-甲氧基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(2.55g,13.65mmol)的溶液,并且在-20℃搅拌混合物75分钟。把混合物用饱和NH4Cl(约100mL)骤冷,并且用水稀释以溶解固体。在分离之后,用二氯甲烷(3×)洗涤水层。把结合的有机物用水(2×)洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩。使回收的油经受SiO2色谱法,用8∶1己烷/乙酸乙酯洗脱。回收粘性泡沫状的(S)-2-((S)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-氯苯基)-2-氧代乙基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.55g,40%)。MS(APCI+)[M+Na]521.1。
把氢氧化锂水合物(0.0471g,1.12mmol)加入THF/水(3∶1,19mL)的溶液中,并且搅拌直到溶解。把混合物冷却至0℃并且用30%过氧化氢(0.231mL,2.24mmol)处理并且搅拌10分钟。加入(S)-2-((S)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-氯苯基)-2-氧代乙基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(0.280g,0.561mmol)在THF(2mL)中的溶液。在0℃把反应搅拌30分钟。薄层色谱法(“TLC”)未显示很多进展(progress),因此允许反应升温至环境温度并且搅拌过夜。通过加入1.5M Na2SO3(1mL)骤冷反应并且搅拌15分钟。用Et2O稀释反应混合物并且分离反应混合物。用Et2O(2×)洗涤含水部分然后用3N HCl将含水部分调节至1的pH。用乙酸乙酯(3×)萃取含水部分。把结合的有机层用水(2×)、饱和NaCl洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩至粘稠油,粘稠油缓慢固化以得到泡沫状的(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-2-基)-2-(4-氯苯基)乙酸(0.55g,72%)。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ7.30(d,2H),7.21(d,2H),4.53-4.40(m,1H),4.37-4.27(m,1H),3.34-3.22(m,1H),2.98-2.90(m,1H),2.02-1.90(m,1H),1.83-1.74(m,1H),1.64-1.53(m,2H),1.50(s,9H)。
实施例G
Figure BPA00001216219200481
(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-2-(4-氯苯基)乙酸
把5,5-二甲基吡咯烷-2-酮(0.108g,0.953mmol,可以如Ganem,B.和Osby,JO;Tet Lett 26:6413(1985)中所描述的来制备)溶解在THF(3mL)中并且冷却至-20℃。把溶液用LHMDS(1.05mL,1.05mmol)处理,并且在-20℃搅拌30分钟。加入二碳酸二叔丁酯(0.250g,1.14mmol),并且允许反应混合物升温至环境温度。在环境温度下把反应搅拌两小时,并且然后用饱和NH4Cl骤冷,用乙酸乙酯稀释并且分离。把有机层用饱和NH4Cl、饱和NaHCO3、饱和NaCl洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩至油。使粗产物经受SiO2色谱法,并用4∶1己烷/乙酸乙酯洗脱。回收固体状的2,2-二甲基-5-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(0.11的Rf,在4∶1己烷/乙酸乙酯中)(0.087g,43%)。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ2.48(t,J=7.8,2H),1.85(t,2H),1.54(s,9H),1.47(s,6H)。
把2,2-二甲基-5-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.17g,5.49mmol)溶解在Et2O(15mL)中并且冷却至-78℃。用DIBAL-H(3.73mL,5.60mmol)处理溶液。在-78℃把混合物搅拌2小时并且然后升温至环境温度过夜。通过加入对甲苯磺酸水合物(0.012g)在甲醇(12mL)中的溶液的一部分(7mL)来骤冷反应。在环境温度下搅拌混合物60小时。把悬浮液在真空中浓缩并且再悬浮在罗谢尔盐(0.5N)和乙酸乙酯的混合物中。在分离之后,用乙酸乙酯(2×)洗涤含水部分。然后把结合的有机物用饱和NaCl洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩至油(92%)。把氯化钛(IV)在甲苯中的溶液(3.71mL,3.71mmol)冷却至0℃并且用溶解在二氯甲烷(7mL)中的(R)-4-苄基-3-(2-(4-氯苯基)乙酰基)噁唑烷-2-酮(1.11g,3.38mmol)的溶液处理。5分钟之后,加入二异丙基乙胺(0.647mL,3.71mmol)。在0℃把所得到的溶液搅拌1小时,并且然后冷却至-20℃。加入5-羟基-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.09g,5.06mmol)在二氯甲烷(7mL)中的溶液,并且在-20℃搅拌混合物75分钟。把反应用饱和NH4Cl(约4mL)骤冷,并且用水稀释以溶解固体。在分离之后,用二氯甲烷(3×)洗涤含水部分。把结合的有机物用水(2×)洗涤,在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩。使粗产物经受SiO2色谱法,并用9∶1己烷/乙酸乙酯洗脱以生产(S)-5-((S)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-氯苯基)-2-氧代乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸酯叔丁酯(1.62g,61%)。MS(ESI+)[M+H]526.7/528.8。
使用(S)-5-((S)-2-((R)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-1-(4-氯苯基)-2-氧代乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯,根据实施例D所描述的程序,来制备(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-2-(4-氯苯基)乙酸。1HNMR(CDCl3,400MHz)δ7.33-7.21(m,4H),4.60-4.51(m,1H),4.39-4.32(m,1H),2.04-1.92(m,2H),1.78-1.68(m,2H),1.51(s,9H),1.22(s,6H)。
实施例H
Figure BPA00001216219200491
(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸
把2-(4-氯苯基)乙酸甲酯(36.7g,199mmol)和多聚甲醛(6.27g,209mmol)溶解/悬浮在DMSO(400mL)中并且用NaOMe(537mg,9.94mmol)处理。允许混合物在室温下搅拌2小时,以根据粗物质的TLC分析来确定完成。把反应倒入冰冻水(700mL;乳状液)中并且通过加入1M HCl溶液来中和。用乙酸乙酯(3×)萃取水层,并且结合有机物。把有机层用水(2×)、盐水(1×)洗涤,分离,在MgSO4上干燥,过滤并且在真空中浓缩,以得到油状的粗产物。把残留物装载到具有硅胶的大烧结过滤器(large fritted filtered)上并且用9∶1的己烷∶乙酸乙酯洗脱,直到收集起始材料/烯烃。然后用1∶1己烷∶乙酸乙酯洗脱塞子,直到纯的所期望的产物被完全洗脱。浓缩的纯的部分获得油状的2-(4-氯苯基)-3-羟基丙酸甲酯(39.4g,92%)。
把2-(4-氯苯基)-3-羟基丙酸甲酯(39.4g,184mmol)溶解在DCM(500mL)中并且用TEA(64.0mL,459mmol)处理。把溶液冷却至0℃并且用MsCl(15.6mL,202mmol)缓慢处理,然后允许搅拌30分钟以通过TLC分析确定完成。用1N HCl溶液来分配溶液,并且用DCM萃取水层一次。把所结合的有机层用1N HCl溶液再次洗涤,分离,用稀NaHCO3溶液洗涤,并且分离。把有机层在MgSO4上干燥,过滤,并且在真空中浓缩以得到油。把残留物装载到具有硅胶塞子的大烧结过滤器上并且用9∶1的己烷∶乙酸乙酯洗脱,通过TLC分析确定得到纯的所期望的产物。浓缩的纯的部分获得油状的2-(4-氯苯基)丙烯酸甲酯(30.8g,85%)。把该2-(4-氯苯基)丙烯酸甲酯(500mg,2.54mmol)作为在THF(1.35mL)中的溶液在0℃加入(叔丁基胺)(i-PrNH2)(217μL,2.54mmol)在THF(5.0mL)中的搅拌溶液中。允许反应在室温下搅拌过夜,以通过LCMS分析确定完成。通过吸管把Boc2O(584μL,2.54mmol)加入搅拌的胺中。允许反应搅拌过夜,以通过混合物的LCMS和TLC分析确定完成。在真空中浓缩溶液,以得到油状的3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸甲酯(854mg,94%)。LC/MS(APCI+)m/z 256.1[M-Boc]+。
在室温下,把3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸甲酯(133g,374mmol)溶解在THF(1.0L)中,并且用三甲基硅醇钾(“KOTMS”;56.0g,392mmol)处理。允许混合物搅拌过夜,以通过粗物质的LCMS分析确定完成。在真空中浓缩混合物,以得到湿泡沫,允许湿泡沫在真空下干燥过夜,以得到固体状的3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸钾(148.7g,105%)。LC/MS(APCI+)m/z 242.1[M-Boc-K]+。
在室温下,把3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸钾(77.2g,203mmol)溶解在THF(515mL)中,并且用新戊酰氯(26.3mL,213mmol)处理。允许搅拌混合物3小时,以形成混合酐。在单独的烧瓶中把(S)-4-苄基噁唑烷-2-酮(46.1g,260mmol)溶解在THF(600mL)中,并且冷却至-78℃。溶液用n-BuLi(102mL的2.50M在己烷中的溶液,254mmol)处理,并且允许搅拌一小时。把所制备的酐溶液通过套管加入到搅拌的Li-噁唑烷酮中,并且允许混合物升温至室温,过夜。通过加入饱和氯化铵溶液来骤冷混合物,并且然后使混合物在较多的水和乙酸乙酯之间分配。萃取水层若干次,并且结合有机物。把有机层用水洗涤,然后用盐水洗涤,分离,在MgSO4上干燥,过滤,并且在真空中浓缩。通过色谱法(用4∶1己烷∶乙酸乙酯洗脱硅胶)提纯/分离残留物(非对映体),以得到完全地分离的粘性油状的非对映体:(R)-3-((S)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(12.16g,基于1/2的酸外消旋物(acid racemate)的24%)和(S)-3-((S)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(39.14g,基于1/2的酸外消旋物的77%)。LC/MS(APCI+)m/z401.2[M-Boc]+。
在室温下把LiOH-H2O(168mg,4.00mmol)加入THF(30mL)和水(15mL)的搅拌溶液,直到其被溶解。混合物用过氧化氢(658μL的35%wt.水溶液,8.00mmol)处理,并且允许其在室温下搅拌10分钟。在冰浴中把反应冷却至0℃,并且在10分钟内通过加料漏斗逐滴加入作为THF(15mL)中的溶液的(S)-3-((S)-4-苄基-2-氧代噁唑烷-3-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(1.00g,2.00mmol)。允许在室温下搅拌混合物过夜,以通过粗物质的LCMS分析确定完成。把反应冷却至0℃,并且然后在10分钟时间内通过加料漏斗用1M Na2SO3(9.00mL)溶液处理。在加入完成之后,允许混合物升温至室温,持续10分钟。把混合物浓缩以除去THF,并且然后用水稀释。用乙酸乙酯(废的)洗涤水层两次。用乙酸乙酯来分配水层,并且然后在同时搅拌下逐滴加入1M HCl,直到获得约2至约3的pH。用乙酸乙酯萃取水层两次,并且结合有机物。把有机物用盐水洗涤,分离,在MgSO4上干燥,过滤,并且在真空中浓缩。在高真空下干燥油产物一小时,以得到粘性油/泡沫状的(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(685mg,100%)。LC/MS(APCI+)m/z 242.1[M-Boc]+。
实施例1
Figure BPA00001216219200521
(R)-2-氨基-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯 基)丙-1-酮
在10℃把间氯过苯甲酸(“m-CPBA”;25.4g,147mmol)分部分加入在1∶2二甲氧基乙烷(“DME”)∶庚烷(80∶160mL)中的1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(15.0g,127mmol)中。然后在室温下搅拌反应1小时。把沉淀物过滤并且用1∶2DME∶庚烷洗涤。然后干燥沉淀物以得到3-氯苯甲酸7-羟基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-7-鎓(7-hydroxy-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-7-ium 3-chlorobenzoate)(33.0g,收率89.4%)。
把POCl3(10mL)加入3-氯苯甲酸7-羟基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-7-鎓(1.0g,3.4mmol)中。把所得到的混合物加热至90℃,持续18小时。然后把混合物冷却至室温并且浓缩。用乙腈(“ACN”;3mL)和水(3mL)稀释所得到的残留物。用50%NaOH将pH调节至9的pH。把所得到的固体过滤并且用水洗涤。然后用DCM洗涤固体以得到4-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.30g,收率57%)。
在0℃把NaH(0.177g,4.42mmol)加入在二甲基甲酰胺(“DMF”;5mL)中的4-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.450g,2.95mmol)中。然后把反应升温至室温并且搅拌1小时。然后把反应冷却至0℃。把三异丙基氯硅烷(0.945mL,4.42mmol)加入混合物中。把反应混合物升温至70℃并且搅拌2小时。接着把反应倒入水(50mL)中并且用DCM(3×50mL)萃取。把结合的有机部分干燥(MgSO4),过滤并且浓缩。通过柱色谱法(10∶1己烷∶DCM)提纯所得到的残留物以得到4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.55g,收率60.4%)。
把4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.55g,1.78mmol)溶解在THF(15mL)中并且冷却至-78℃。然后逐滴加入s-BuLi(2.80mL,3.92mmol)。然后在-78℃搅拌溶液30分钟。然后加入作为THF(2mL)溶液的CBr4(1.48g,4.45mmol)。把反应搅拌另外的30分钟,同时允许其升温至0℃。然后用饱和NH4Cl骤冷反应并且允许升温至室温。然后把反应用DCM(3×50mL)萃取,干燥,并且过滤以得到粗残留物。通过色谱法以己烷提纯粗残留物,以得到5-溴-4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.502g,收率72.7%)。
把5-溴-4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.375g,0.96mmol)和哌嗪(0.666g,7.73mmol)放入N-甲基吡咯烷酮(“NMP”;3mL)中并且在微波中加热至130℃,持续3小时。然后用DCM(15mL)稀释反应。然后加入三乙胺(0.20mL,1.45mmol)和Boc2O(3.17g,14.5mmol)。在室温下搅拌反应1小时。然后把反应用饱和NaHCO3骤冷,并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,把粗残留物溶解在2∶1THF∶MeOH(共18mL)中。然后加入LiOH(4.83mL,14.5mmol),并且搅拌反应1小时。然后把反应用水(20mL)稀释并且用甲基叔丁基醚(“MTBE”)萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(500∶7DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.2g,收率54%)。
在室温下把4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.40g,1.05mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。把反应在室温下搅拌1小时并且浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.28g,收率94.9%)。
在室温下把5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.20g,0.56mmol)和(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.677g,2.25mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入1-羟基苯并三唑(“HOBT”)-H2O(0.121g,0.79mmol)、1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺(“EDCI”;0.14g,0.73mmol)和三乙胺(0.39mL,2.82mmol),并且在室温下搅拌反应18小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(500∶7DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到(R)-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.20g,收率62.9%)。
在室温下把(R)-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.022g,0.039mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。把反应在室温下搅拌1小时并且然后浓缩。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。收集并且干燥所得到的固体,二盐酸盐形式的(R)-2-氨基-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)丙-1-酮(0.016g,收率88%)。检测到MS ESI(+)m/z 463。
实施例2
Figure BPA00001216219200541
(R)-4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶 -5-羧酸甲酯
把4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.50g,1.612mmol,参见实施例1)溶解在THF(15mL)中并且冷却至-78℃。然后逐滴加入s-BuLi(2.54mL,3.56mmol),并且在-78℃搅拌溶液30分钟。然后加入作为THF(2mL)溶液的氯甲酸甲酯(0.38mL,4.98mmol),并且搅拌反应另外的30分钟。然后用饱和NH4Cl骤冷反应并且允许升温至室温。然后把反应用DCM(3×50mL)萃取,干燥,并且过滤以得到粗残留物。通过柱色谱法以5∶1己烷∶DCM提纯粗残留物,以得到4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.55g,收率91%)。
把4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.45g,1.23mmol)和哌嗪(0.845g,9.81mmol)放入NMP(5mL)中并且在微波中加热至100℃,持续30分钟。然后用DCM(5mL)稀释反应。加入三乙胺(0.259mL,1.84mmol)和Boc2O(4.01g,18.4mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。把粗反应用饱和NaHCO3洗涤并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(2∶1至1∶1的己烷∶乙酸乙酯(“EtOAc”))提纯残留物,以得到4-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-1,5-二羧酸1-叔丁基5-甲酯(1-tert-butyl 5-methyl 4-(4-(tert-butoxycarbonyl)piperazin-1-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-1,5-dicarboxylate)(0.40g,收率70.8%)。
在室温下把4-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-1,5-二羧酸1-叔丁基5-甲酯(0.34g,0.74mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL)。把反应在室温下搅拌4小时并且然后浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。收集并且干燥所得到的固体,二盐酸盐形式的4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.19g,收率98.9%)。
在室温下把4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.23g,0.69mmol)和(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.227g,0.759mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.147g,0.966mmol)、EDCI(0.172g,0.897mmol)和三乙胺(0.48mL,3.45mmol),并且在室温下搅拌反应18小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(500∶7DCM∶MeOH)提纯残留物以得到(R)-4-(4-(2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.11g,收率29.4%)。
在室温下把(R)-4-(4-(2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.025g,0.046mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。把反应在室温下搅拌1小时并且然后浓缩。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。收集并且干燥所得到的固体,二盐酸盐形式的(R)-4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.015g,收率74%)。检测到MS ESI(+)m/z 442。
实施例3
Figure BPA00001216219200551
(R)-4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶 -5-腈
把(R)-4-(4-(2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(0.210g,0.3874mmol,参见实施例2)放入2∶1THF∶MeOH(6mL)中。然后加入3M LiOH(水溶液,1.29mL,3.87mmol),并且把反应加热至65℃,持续2小时。然后把反应用水稀释并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(20∶1 DCM∶MeOH)提纯残留物以得到(R)-4-(4-(2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸(0.050g,收率24.4%)。
在室温下把(R)-4-(4-(2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸(0.050g,0.0947mmol)放入DMF(3mL)中。然后把NH4Cl(0.020g,0.378mmol)、DIEA(d 0.742;0.082mL,0.473mmol)和HBTU(0.071g,0.189mmol)加入混合物中。把反应在室温下搅拌1小时,用水骤冷并且用EtOAc萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩。提纯(20∶1 DCM∶MeOH)粗残留物,以得到(R)-1-(4-(5-氨基甲酰基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.030g,收率60.1%)。
把(R)-1-(4-(5-氨基甲酰基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.035g,0.066mmol)放入POCl3(2mL)中并且加热至70℃,持续2小时。然后把反应浓缩,用DCM稀释,并且用饱和NaHCO3洗涤。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。提纯(SP4,12+M,水/CAN 95/5->60/40,20CV)残留物以得到(R)-4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-腈(0.002g,收率7.4%)。检测到MS ESI(+)m/z 409。
实施例4
Figure BPA00001216219200561
(S)-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-(异 丙基氨基)丙-1-酮
在室温下把5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.100g,0.282mmol,参见实施例1)、(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.145g,0.424mmol,参见实施例H)、HOBT-H2O(0.0606g,0.395mmol)、EDCI(0.0704g,0.367mmol)和三乙胺(0.0394mL,0.282mmol)在DCM(5mL)中搅拌5小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且萃取入DCM中。把有机物干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物。提纯(500∶6DCM∶MeOH)得到(S)-3-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.103g,收率60.2%)。
把(S)-3-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.040g,0.066mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮(0.03g,收率90%)。检测到MS ESI(+)m/z 505。
实施例5
Figure BPA00001216219200571
(R)-2-氨基-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-环己基 乙酮
在室温下把5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.075g,0.26mmol,参见实施例1)和(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-2-环己基乙酸(0.205g,0.80mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.057g,0.37mmol)、EDCI(0.066g,0.39mmol)和三乙胺(0.18mL,1.33mmol)。在室温下搅拌反应过夜。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且萃取入DCM中。然后把产物干燥,过滤,并且浓缩。提纯(500∶5 DCM∶MeOH)产物以获得(R)-2-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-环己基-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.025g,收率18.0%)。
在室温下把(R)-2-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-环己基-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.010g,0.019mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-2-氨基-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-环己基乙酮(0.005g,收率62%)。检测到MS ESI(+)m/z 421。
实施例6
(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基) 哌嗪-1-基)丙-1-酮
在室温下把5-溴-4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(4.1g,10.57mmol,参见实施例1)放入THF(80mL)中。然后加入TBAF(1.1当量),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应倒入水中并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗固体。然后把固体悬浮在10∶1己烷∶DCM中,并且过滤以得到固体产物5-溴-4-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(2.20g,收率89.9%)。
在0℃把5-溴-4-氯-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.50g,2.160mmol)放入DMF(5mL)中。然后加入NaH(0.10g,2.59mmol),并且搅拌反应20分钟。然后加入苯磺酰氯(0.304mL,2.38mmol),并且在0℃搅拌反应30分钟。然后加入水(50mL)。把沉淀物过滤,用水洗涤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到5-溴-4-氯-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.8g,收率99.6%)。
把5-溴-4-氯-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.660g,1.78mmol)、3-氟苯基硼酸(0.298g,2.13mmol)、Pd(PPh3)4(0.103g,0.0888mmol)和10%K2CO3(水溶液,3.70mL,2.66mmol)加入2∶1甲苯∶EtOH(6mL)的氩气脱气过的溶液中。然后把反应加热至80℃,持续18小时。然后把反应用水稀释并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,浓缩并且通过柱色谱法(1∶1己烷∶DCM)提纯以得到4-氯-5-(3-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.508g,收率73.9%)。
把4-氯-5-(3-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.100g,0.259mmol)和哌嗪(0.356g,4.14mmol)放入NMP(1mL)中并且在微波中加热至150℃,持续1小时。然后用DCM(20mL)稀释反应,并且加入Boc2O(1.92g,8.79mmol)。然后把反应搅拌1小时,倒入水中,并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩。提纯(5∶1-4∶1己烷∶EtOAc)粗残留物以得到4-(5-(3-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.080g,收率57.7%)。
把4-(5-(3-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.220g,0.410mmol)放入1∶1THF∶MeOH(6mL)中。然后加入3M LiOH(0.683mL,2.05mmol),并且在50℃搅拌反应1小时。然后把反应冷却,加入水中并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤并且浓缩以得到粗产物4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.150g,收率92.29%),4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯不经进一步的提纯就被使用。
在室温下把4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.162g,0.409mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的5-(3-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.116g,收率95.8%)。
在室温下把5-(3-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.062g,0.168mmol)和(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.0604g,0.201mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.0360g,0.235mmol)、EDCI(0.0418g,0.218mmol)和DIEA(d 0.742;0.146mL,0.840mmol)。在室温下搅拌反应2小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗油。通过柱色谱法(500∶5DCM∶MeOH)提纯油以得到(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.045g,收率46.3%)。
在室温下把(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.045g,0.078mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.018g,收率48%)。检测到MS ESI(+)m/z 478。
实施例7
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1- 基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮
在室温下把5-(3-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.050g,0.135mmol,参见实施例6)和(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0555g,0.162mmol,参见实施例H)放入DCM(3mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.0290g,0.190mmol)、EDCI(0.0337g,0.176mmol)和DIEA(d0.742;0.118mL,0.677mmol),并且在室温下搅拌反应2小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且用DCM萃取。把产物干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物。提纯(500∶5DCM∶MeOH)粗产物以获得(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.038g,收率45.2%)。
在室温下把(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.040g,0.064mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮(0.020g,收率60%)。检测到MS ESI(+)m/z 521。
实施例8
Figure BPA00001216219200611
(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶 -4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把5-溴-4-氯-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.750g,2.01mmol,参见实施例6)、3-甲氧基苯基硼酸(0.321g,2.11mmol)、Pd(PPh3)4(0.116g,0.100mmol)和K2CO3(4.20mL,3.02mmol)加入2∶1甲苯∶EtOH(8mL)的氩气脱气过的溶液中。然后把反应加热至80℃,持续过夜。然后把反应倒入水中并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物。提纯(1∶1至1∶2己烷∶DCM)粗产物以得到4-氯-5-(3-甲氧基苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.610g,收率75.8%)。
把4-氯-5-(3-甲氧基苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.400g,1.00mmol)、哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.280g,1.50mmol)、Pd(OAc)2(0.0225g,0.100mmol)、4,5-双二苯基膦-9,9-二甲基氧杂蒽(Xantphos)(0.0870g,0.150mmol)和Cs2CO3(0.490g,1.50mmol)放入脱气过的甲苯(4mL)中。把混合物加热至100℃,持续24小时。把反应冷却至室温,通过硅藻土过滤,并且浓缩。提纯(500∶5至500∶7DCM∶MeOH)产物以获得4-(5-(3-甲氧基苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.160g,收率29.0%)。
把4-(5-(3-甲氧基苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.150g,0.273mmol)溶解在1∶1THF∶MeOH(6mL)中。然后加入3M LiOH(0.911mL,2.73mmol),并且把反应加热至50℃,持续1小时。然后把反应冷却至室温,加入水中并且用DCM萃取。然后把有机物干燥,过滤并且浓缩以得到粗产物4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.111g,收率99.4%),4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯不经进一步的提纯就被使用。
在室温下把4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.111g,0.272mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应2小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的5-(3-甲氧基苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.083g,收率99%)。
把5-(3-甲氧基苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.045g,0.118mmol)和(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.0425g,0.142mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.0253g,0.165mmol)、EDCI(0.0294g,0.153mmol)和DIEA(d 0.742;0.103mL,0.591mmol),并且搅拌反应2小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且用DCM萃取。把产物干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物。提纯(500∶5DCM∶MeOH)粗产物以获得(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.038g,收率54.6%)。
在室温下把(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.021g,0.036mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.015g,收率86%)。检测到MS ESI(+)m/z 491。
实施例9
Figure BPA00001216219200621
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把5-(3-甲氧基苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.045g,0.118mmol,参见实施例8)和(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0424g,0.124mmol,参见实施例H)放入DCM(3mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.0253g,0.165mmol)、EDCI(0.0294g,0.153mmol)和DIEA(d0.742;0.103mL,0.591mmol),并且在室温下搅拌反应2小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且用DCM萃取。把产物干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物。提纯(500∶5DCM∶MeOH)粗产物以获得(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.040g,收率53.6%)。
在室温下把(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.041g,0.065mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(3-甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.028g,收率81%)。检测到MSESI(+)m/z 533。
实施例10
(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪 -1-基)丙-1-酮
把(R)-1-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.180g,0.320mmol,参见实施例1)、苯基硼酸(0.0468g,0.384mmol)、Pd(PPh3)4(0.0185g,0.0160mmol)和10%K2CO3(水溶液,0.66mL,0.47mmol)加入2∶1甲苯∶EtOH(3mL)的氩气脱气过的溶液中。然后把反应加热至80℃,持续过夜。然后把反应冷却至室温,用水稀释,并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,浓缩,并且提纯(500∶10-500∶15)以得到(R)-3-(4-氯苯基)-1-氧代-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.018g,收率10.0%)。
把(R)-3-(4-氯苯基)-1-氧代-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.020g,0.036mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.015g,收率79%)。检测到MS ESI(+)m/z 460。
实施例11
Figure BPA00001216219200641
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基) 哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮
把(S)-3-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.100g,0.165mmol,参见实施例4)、3,4-二甲氧基苯基硼酸(0.0361g,0.198mmol)、Pd(PPh3)4(0.009g,0.0083mmol)和10%K2CO3(水溶液,0.344mL,0.248mmol)加入2∶1甲苯∶EtOH(3mL)的氩气脱气过的溶液中。然后把反应加热至80℃,持续24小时。然后把反应冷却至室温,用水稀释,并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,浓缩,并且提纯(500∶10-500∶15)以得到(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.020g,收率18.2%)。
把(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.013g,0.020mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3,4-二甲氧基苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮(0.009g,收率72%)。检测到MS ESI(+)m/z 563。
实施例12
Figure BPA00001216219200651
(R)-4-氨基-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基) 哌嗪-1-基)-4-甲基戊-1-酮
把2-(4-氯苯基)乙酸甲酯(15.3g,82.7mmol)溶解在DMSO(160mL)中,并且把该溶液以一部分加入多聚甲醛(2.61g,86.9mmol)和NaOMe(8.27mL,4.14mmol)中。在环境温度下搅拌混合物20小时。然后把混合物倒入冰冷水(550mL)中并且用1N HCl中和至约8至约8.5的pH。用EtOAc萃取混合物,并且把结合的有机部分用盐水洗涤,在Na2SO4上干燥并且浓缩。回收油状的粗产物2-(4-氯苯基)-3-羟基丙酸甲酯(16.2g,91%),并且2-(4-氯苯基)-3-羟基丙酸甲酯不经进一步的提纯就被使用。
把2-(4-氯苯基)-3-羟基丙酸甲酯(16.2g,75.5mmol)溶解在DCM(200mL)中。然后加入三乙胺(26.3mL,188.7mmol),并且把溶液冷却至0℃。然后用甲磺酰氯(5.84mL,75.5mmol)处理溶液,并且在0℃下搅拌混合物30分钟。把冷溶液酸化至1的pH,并且用二氯甲烷萃取。把结合的有机层用1NHCl、水、6%NaHCO3洗涤,在Na2SO4上干燥并且浓缩。把粗油用在SiO2(具有石膏,Aldrich 28,852-7,350g)上的色谱法并且用20∶1己烷∶EtOAc洗脱来过滤,以得到2-(4-氯苯基)丙烯酸甲酯(10.9g,73%)。
在0℃在氮气下把1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯(33.7mL,225.2mmol)加入2-(4-氯苯基)丙烯酸甲酯(36.9g,187.7mmol)和2-硝基丙烷(20.2mL,225.2mmol)在CH3CN(500mL)中的溶液中。把混合物升温至室温并且搅拌过夜。把溶液在真空中浓缩并且经受柱色谱法(20%EtOAc/己烷)以得到油状的2-(4-氯苯基)-4-甲基-4-硝基戊酸甲酯(52.9g,收率98.7%)。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ7.31-7.29(m,2H),7.21-7.19(m,2H),3.66(s,3H),3.60-3.57(m,1H),2.87-2.81(dd,1H),2.39-2.34(dd,1H),1.56(s,3H),1.55(s,3H)。
用溶解在乙醇(490mL)中的2-(4-氯苯基)-4-甲基-4-硝基戊酸甲酯(28g,98.0mmol)的溶液处理锌粉尘(128g,1.96mol)。缓慢加入浓HCl(26.9mL,323mmol),并且然后把反应加热至70℃,持续2小时。通过SiO2和硅藻土的塞子过滤反应混合物。用乙酸乙酯洗涤过滤垫,并且在真空中浓缩滤液。把残留物溶解在最少的乙醇中并且然后用水处理。3-(4-氯苯基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-酮从溶液沉淀出来并且通过过滤来收集。把固体用水洗涤并且空气干燥(11.2g,收率51%)。1H NMR(CD3OD,400MHz)δ7.35-7.32(m,2H),7.26-7.24(m,2H),3.94-3.90(m,1H),2.50-2.44(m,1H),1.99-1.93(m,1H),1.36(s,3H),1.34(s,3H)。
在-78℃在氮气下把双(三甲硅基)氨基锂(36mL,36mmol)加入3-(4-氯苯基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-酮(6.7g,30mmol)在THF(200mL)中的搅拌溶液中。在-78℃搅拌溶液30分钟。然后以单个部分加入二碳酸二叔丁酯(7.6mL,33mmol)在THF(30mL)中的溶液。把溶液升温至室温并且允许在室温下搅拌过夜。把反应倒入0.5M HCl溶液中并且用乙酸乙酯(2×)萃取。把结合的有机层用水洗涤,分离,在MgSO4上干燥,过滤,并且在真空中浓缩,以提供油状的接近纯的产物(过量Boc2O)。通过柱色谱法(20%EtOAc/己烷)以得到纯的4-(4-氯苯基)-2,2-二甲基-5-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯。LCMS(APCI+)[M-Boc+H]+224.1;保留时间:3.68min。1H NMR(CDCl3,400MHz)δ7.32-7.30(m,2H),7.22-7.20(m,2H),3.80-3.74(m,1H),2.33-2.28(m,1H),2.05-1.97(m,1H),1.58(s,3H),1.55(s,9H),1.53(s,3H)。
在室温下把氢氧化锂水合物(6.44mL,232mmol)加入4-(4-氯苯基)-2,2-二甲基-5-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(7.5g,23.2mmol)在THF/MeOH/H2O(30mL/30mL/30mL)中的搅拌溶液中。在室温下搅拌混合物过夜并且在真空中浓缩。把混合物加入水(200mL)中,用EtOAc(100mL)洗涤,用浓HCl酸化并且萃取入EtOAc(2×200mL)中。把混合物在Na2SO4上干燥并且在真空中浓缩。通过蒸发从甲苯除去残留的HCl,以得到固体状的4-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苯基)-4-甲基戊酸(5.0g,收率63.2%)。LCMS(APCI+)[M-Boc+H]+242.0;保留时间:2.8min。
把5-(3-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.040g,0.108mmol,参见实施例6)、(R)-4-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苯基)-4-甲基戊酸(0.0407g,0.119mmol,使用手性色谱法分离)、HOBT-H2O(0.0232g,0.152mmol)和EDCI(0.0270g,0.141mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入DIEA(d0.742;0.0943mL,0.542mmol),并且在室温下搅拌反应过夜。然后把反应倒入Na2CO3中,并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩。提纯(500∶5至500∶10DCM∶MeOH)产物以得到(R)-4-(4-氯苯基)-5-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-甲基-5-氧代戊-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.022g,收率32.7%)。
在室温下把(R)-4-(4-氯苯基)-5-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-甲基-5-氧代戊-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.026g,0.042mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体产物通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-4-氨基-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(3-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-4-甲基戊-1-酮(0.019g,收率76%)。检测到MS ESI(+)m/z 521。
实施例13
Figure BPA00001216219200671
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4- 基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把(S)-3-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.150g,0.248mmol,参见实施例4)、苯基硼酸(0.0363g,0.298mmol)、Pd(PPh3)4(0.0143g,0.0124mmol)和10%K2CO3(水溶液,0.517mL,0.372mmol)放入氩气脱气过的2∶1甲苯∶EtOH中并且加热至80℃,持续过夜。然后把反应冷却至室温,用水稀释,并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩,并且提纯(500∶7DCM∶MeOH)以得到(S)-2-(4-氯苯基)-3-氧代-3-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.003g,收率2.0%)。
在室温下把(S)-2-(4-氯苯基)-3-氧代-3-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.003g,0.0050mmol)放入DCM(2mL)中。然后加入TFA(0.4mL),并且搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把粗残留物溶解在最少的DCM中并且逐滴加入1M HCl在乙醚(10mL)中的搅拌溶液中。然后把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.001g,收率40%)。检测到MSESI(+)m/z 503。
实施例14
Figure BPA00001216219200681
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-1H-吡 咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把(S)-3-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.05g,0.083mmol,参见实施例4)放入二氧六环(1mL)和在H2O(0.3mL)中的Na2CO3(水溶液,0.087g,0.82mmol)中。然后加入1-甲基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡唑(0.034g,0.16mmol)和PS-Pd(PPh3)4(0.075g,0.1g/mmol)。在微波中把反应加热至150℃,持续1小时。然后把反应用水稀释并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩。粗残留物的提纯(500∶10至500∶20DCM∶MeOH)得到(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.005g,收率9.9%)。
在室温下把(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.005g,0.008mmol)放入DCM(2mL)中。然后加入TFA(0.4mL),并且搅拌反应1小时。浓缩反应。把粗残留物溶解在最少的DCM中并且逐滴加入1M HCl在乙醚(10mL)中的搅拌溶液中。然后把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.002g,收率48%)。检测到MS ESI(+)m/z 507。
实施例15
Figure BPA00001216219200691
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b] 吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把5-溴-4-氯-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(3.70g,9.96mmol,参见实施例6)和苯基硼酸(1.27g,10.5mmol)放入2∶1甲苯∶EtOH(30mL)中。然后把内容物在氩气下脱气并且加热至80℃,持续24小时。把反应冷却至室温,用DCM稀释,并且倒入水中。把有机部分过滤,干燥,并且浓缩。通过柱色谱法(1∶1至1∶2己烷∶DCM)进行提纯以得到4-氯-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(3.20g,收率87.1%)。
把4-氯-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.70g,4.61mmol)放入1∶1THF∶水(30mL)中。然后加入3M LiOH(水溶液,15.4mL,46.1mmol),并且把反应加热至65℃,持续18小时。把反应冷却至室温,用DCM(50mL)稀释并且倒入水中。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物4-氯-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.01g,收率95.8%),4-氯-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶不经进一步的提纯就被使用。
在室温下把4-氯-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.912g,3.99mmol)放入CHCl3(5mL)中。然后加入N-溴代琥珀酰亚胺(0.710g,3.99mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。把反应用DCM稀释并且用饱和NaHCO3洗涤。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物3-溴-4-氯-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.1g,收率89.7%)。
在0℃把3-溴-4-氯-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.30g,4.23mmol)放入DMF(10mL)中。然后加入NaH(0.203g,5.07mmol),并且搅拌反应20分钟。然后加入苯磺酰氯(0.595mL,4.65mmol),并且在0℃搅拌反应30分钟。然后把反应倒入水中并且用EtOAc萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩并且提纯(2∶1DCM∶己烷)以得到3-溴-4-氯-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.80g,收率95.1%)。
把氯化甲基锌(3.35mL,6.70mmol)加入在THF(10mL)中的3-溴-4-氯-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.00g,2.23mmol)和Pd(PPh3)4(0.129g,0.111mmol)中。然后把反应加热至80℃,持续2小时,冷却至室温,并且用饱和NH4Cl骤冷。把所得到的固体过滤并且弃去。把滤液用DCM(500mL)稀释并且用水洗涤。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗固体,通过柱色谱法(2∶1DCM∶己烷)提纯粗固体以得到4-氯-3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.75g,收率87.7%)。
把4-氯-3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.300g,0.784mmol)和哌嗪(0.675g,7.84mmol)放入NMP(1mL)中并且在微波中加热至200℃,持续1小时。然后把反应倒入水中并且用MTBE萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.339g,收率100%),3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶不经进一步的提纯就被使用。
把3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.600g,1.39mmol)放入DCM(10mL)中。然后加入Boc2O(0.333g,1.53mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应用NaHCO3骤冷并且萃取入DCM中。把结合的有机层干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物4-(3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.738g,收率100%),4-(3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯不经进一步的提纯就被使用。
把4-(3-甲基-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.9g,1.69mmol)放入1∶1THF∶MeOH(10mL)中。加入3MLiOH(水溶液,5.63mL,16.9mmol),并且把反应加热至50℃,持续1小时。然后把反应冷却,加入水中并且用DCM萃取。把有机物干燥,过滤并且浓缩以得到粗产物,提纯(500∶3至500∶8DCM∶MeOH)粗产物以得到4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.390g,收率58.8%)。
在室温下把4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.390g,0.994mmol)放入DCM(10mL)中。加入TFA(1mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.350g,收率96.4%),3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶不经进一步的提纯就被使用。
在室温下把3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.050g,0.137mmol)和(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0491g,0.144mmol,实施例H)放入DCM(3mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.0293g,0.192mmol)、EDCI(0.0341g,0.178mmol)和DIEA(d0.742;0.0954mL,0.548mmol),并且在室温下搅拌反应18小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且用DCM萃取。把有机部分干燥,过滤,浓缩并且提纯(500∶5DCM∶MeOH)以得到(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.047g,收率55.7%)。
在室温下把(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.047g,0.076mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。把反应在室温下搅拌1小时并且浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.041g,收率91%)。检测到MS ESI(+)m/z 517。
实施例16
Figure BPA00001216219200721
(R)-4-氨基-2-(4-氯苯基)-4-甲基-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b] 吡啶-4-基)哌嗪-1-基)戊-1-酮
在室温下把3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.040g,0.110mmol,参见实施例15)、(R)-4-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苯基)-4-甲基戊酸(0.0412g,0.120mmol,实施例12)、HOBT-H2O(0.0235g,0.153mmol)和EDCI(0.0273g,0.142mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d0.742;0.0954mL,0.548mmol),并且在室温下搅拌反应18小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩并且提纯(500∶5DCM∶MeOH)以得到(R)-4-(4-氯苯基)-2-甲基-5-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-5-氧代戊-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.040g,收率59.3%)。
把(R)-4-(4-氯苯基)-2-甲基-5-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-5-氧代戊-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.040g,0.065mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。把反应搅拌1小时并且然后浓缩至干燥。把所得到的油溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-4-氨基-2-(4-氯苯基)-4-甲基-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)戊-1-酮(0.034g,收率89%)。检测到MSESI(+)m/z 517。
实施例17
Figure BPA00001216219200731
4-氨基-2-(4-氯苄基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌 嗪-1-基)丁-1-酮
把LHMDS(28.3mL,28.3mmol)稀释在THF(90mL)中并且冷却至-78℃。把2-氧代吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(5.00g,27.0mmol)溶解在THF(35mL)中并且在-78℃在5分钟内加入LHMDS中。允许搅拌反应45分钟,并且然后加入1-(溴甲基)-4-氯苯(5.82g,28.3mmol,1.05当量)的THF(35mL)溶液。允许在-78℃搅拌反应1小时,并且然后在3小时内升温至室温。通过加入3MLiOH溶液(90mL)骤冷混合物,并且在室温下搅拌48小时。然后把反应用水稀释并且用乙酸乙酯洗涤。水层用3M HCl酸化并且用乙酸乙酯萃取若干次。把结合的有机部分用水洗涤,在MgSO4上干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物。通过柱色谱法(60∶40己烷∶乙酸乙酯)提纯粗产物,以得到4-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丁酸(0.84g,9.4%)。
在室温下把3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.050g,0.137mmol,参见实施例15)、4-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丁酸(0.0494g,0.151mmol)、HOBT-H2O(0.0293g,0.192mmol)和EDCI(0.0341g,0.178mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入DIEA(d=0.742;0.119mL,0.684mmol),并且在室温下搅拌反应15小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩并且提纯(500∶5DCM∶MeOH)以得到3-(4-氯苄基)-4-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-4-氧代丁基氨基甲酸叔丁酯(0.010g,收率12.1%)。
把3-(4-氯苄基)-4-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-4-氧代丁基氨基甲酸叔丁酯(0.045g,0.075mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL)。把反应搅拌1小时并且然后浓缩至干燥。把所得到的油溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的4-氨基-2-(4-氯苄基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丁-1-酮(0.032g,收率74%)。检测到MS ESI(+)m/z 503。
实施例18
Figure BPA00001216219200741
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(5-异丙基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b] 吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮
把4-氯-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(5.0g,13.62mmol)放入NMP(40mL)中。然后加入哌嗪(9.39g,109mmol),并且把反应加热至100℃,持续45分钟。然后把反应冷却至室温,并且用DCM(100mL)稀释。然后加入Boc2O(44.60g,204.38mmol),然后加入三乙胺(2.85mL,20.4mmol)。然后搅拌反应1小时。然后把反应倒入水中,用DCM萃取并且通过色谱法(100∶1DCM∶MeOH)提纯,以得到4-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(8.1g,164%),其被大量的双Boc-哌嗪(bis Boc-piperazine)污染。
把肼(1.8g,55mmol)加入在MeOH(200mL)中的4-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-羧酸甲酯(2.0g,5.5mmol)中,并且把反应加热至回流24小时。冷却之后,4-(5-(肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯沉淀为固体(1.3g,65%)。
把2-乙氧基喹啉-1(2H)-羧酸乙酯(226mg,0.916mmol)加入在THF/ACN(5mL)中的乙酸(50.0mg,0.832mmol)中,并且在室温下搅拌反应1小时。加入4-(5-(肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(300mg,0.832mmol),并且把反应加热至70℃,持续1小时。然后把溶液浓缩至干燥。把所得到的残留物从DCM结晶以获得固体状的4-(5-(2-乙酰基肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(241mg,收率71.9%)。
把在POCl3(1mL)中的4-(5-(2-乙酰基肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(70mg,0.16mmol)加热至90℃,持续1小时。然后把反应浓缩至干燥以获得油状的2-甲基-5-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)-1,3,4-噁二唑(58mg,收率125%),2-甲基-5-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)-1,3,4-噁二唑不经进一步的提纯就被使用。
把(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(180mg,0.52mmol,参见实施例H)、N1-((乙基亚氨基)亚甲基)-N3,N3-二甲基丙烷-1,3-二胺盐酸盐(134mg,0.70mmol)、HOBt·H2O(108mg,0.70mmol)和三乙胺(106mg,1mmol)加入在DCM(10mL)中的2-甲基-5-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)-1,3,4-噁二唑(100mg,0.36mmol)中。在室温下搅拌反应18小时。在用DCM稀释之后,用1N HCl、10%K2CO3和盐水洗涤混合物。把有机相在MgSO4上干燥并且通过色谱法(SP4,12+M,水/ACN90/10->10/90,20CV)提纯以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(60mg)。
把在TFA(3mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.082mmol)搅拌30分钟并且然后浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM(0.2mL)中并且加入在乙醚中的2N HCl中。把所得到的固体过滤并且在氮气下干燥以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(21mg,收率50%)盐酸盐。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.10(s,1H),8.84(s,1H),8.35(s,2H),7.52-7.48(m,2H),7.46-4.42(m,1H),7.40-7.36(m,2H),6.64(s,1H),4.58(m,1H),3.70-3.20(m,10H),3.01(s,1H),2.78(s,1H),2.54(s,3H),1.24(dq,6H);m/z(ESI pos)508.4(100%)[M]。
实施例19
Figure BPA00001216219200761
(S)-2-(4-氯苯基)-2-((S)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮
把4-氯-5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.30g,0.81mmol)和哌嗪(0.701g,8.13mmol)放入NMP(0.3mL)中并且在微波中加热至150℃,持续1小时。然后把反应倒入水中,并且用MTBE萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,把粗残留物放入DCM(10mL)中。然后加入Boc2O(0.195g,0.895mmol),并且搅拌反应1小时。加入饱和Na2CO3的水溶液(30mL),并且用DCM(3×50mL)萃取反应。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物4-(5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.40g,收率95.4%),4-(5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯不经进一步的提纯就被用于下一步骤。
把4-(5-苯基-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(1.10g,2.12mmol)放入1∶1THF∶MeOH(20mL)中。然后加入LiOH(3.54mL,10.6mmol),并且把反应加热至50℃,持续1小时。把反应冷却至室温,倒入水中,并且用DCM(3×50mL)萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩,并且然后通过柱色谱法(500∶5DCM∶MeOH)提纯以得到4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.40g,收率49.8%)。
把4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.40g,1.06mmol)放入DCM(10mL)中。然后加入TFA(2mL),并且搅拌反应1小时。把反应浓缩至干燥,再溶解在最少的DCM中,并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.350g,收率94.3%)。
把DIEA(0.0833mL,0.478mmol)加入在DCM(1mL)中的5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.042g,0.120mmol,)、(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-2-(4-氯苯基)乙酸(0.0440g,0.120mmol,参见实施例G)和O-(苯并三唑-1-基)-N,N,N,N′-四甲基脲四氟硼酸盐(“TBTU”;0.0461g,0.143mmol)中,并且在室温下搅拌1小时。把混合物直接装载到柱上并且通过色谱法(1∶1己烷∶乙酸乙酯)提纯以得到固体状的(S)-5-((S)-1-(4-氯苯基)-2-氧代-2-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯。把产物溶解在DCM(1mL)中,并且加入TFA(0.2mL)。在室温下搅拌混合物1小时。除去溶剂。把残留物溶解在DCM(0.5mL)中,并且加入在乙醚(1mL)中的2MHCl。通过过滤收集所得到的固体以得到(S)-2-(4-氯苯基)-2-((S)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮二盐酸盐(0.042g,59%)。检测到MS ESI(+)m/z 528。
实施例20
Figure BPA00001216219200771
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1- 基)-2-((S)-吡咯烷-2-基)乙酮
把DIEA(0.103mL,0.592mmol)加入在DCM(1mL)中的5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.052g,0.15mmol,参见实施例19)、(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-2-基)-2-(4-氯苯基)乙酸(0.0503g,0.148mmol,参见实施例F)和TBTU(0.0570g,0.178mmol)中,并且在室温下搅拌1小时。把混合物直接装载到柱上并且通过色谱法(1∶1己烷∶乙酸乙酯)提纯以得到固体状的(S)-2-((S)-1-(4-氯苯基)-2-氧代-2-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯。然后把固体溶解在DCM(1mL)中,并且加入TFA(0.2mL)。在室温下搅拌混合物1小时。除去溶剂。把残留物溶解在DCM(0.5mL)中,并且加入在乙醚(1mL)中的2MHCl。通过过滤收集所得到的固体以得到(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-((S)-吡咯烷-2-基)乙酮二盐酸盐(0.062g,63%)。检测到MS ESI(+)m/z 500。
实施例21
Figure BPA00001216219200781
3-氨基-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
在室温下把5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.10g,0.285mmol,参见实施例19)、3-(叔丁氧基羰基氨基)丙酸(0.0646g,0.342mmol)、HOBT-H2O(0.0610g,0.399mmol)和EDCI(0.0709g,0.370mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.248mL,1.42mmol),并且在室温下搅拌反应18小时。然后把反应倒入Na2CO3中,并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,浓缩并且提纯(500∶10DCM∶MeOH)以得到3-氧代-3-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙基氨基甲酸叔丁酯(0.055g,收率43.0%)。
在室温下把3-氧代-3-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙基氨基甲酸叔丁酯(0.054g,0.12mmol)放入DCM(3mL)中。加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体通过过滤收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到3-氨基-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.050g,收率99%)。检测到MS ESI(+)m/z 350。
实施例22
Figure BPA00001216219200791
(S)-2-(4-氯苯基)-2-((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮
把在MeOH(0.5mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-((S)-吡咯烷-2-基)乙酮二盐酸盐(0.060g,0.105mmol,参见实施例20)冷却至约0℃至约5℃的温度。加入甲醛(0.0234mL,0.314mmol)和NaCNBH3(0.0132g,0.210mmol)。在约14℃至约16℃的温度下搅拌混合物45分钟。加入甲胺(2mL,2.0M在THF中),并且搅拌反应30分钟。加入饱和NaHCO3(5mL),并且用DCM(20mL)萃取水相。把结合的有机相用盐水(10mL)洗涤,并且在硫酸钠上干燥。在除去溶剂之后,把所得到的残留物溶解在DCM(0.5mL)中,并且加入在乙醚(1mL)中的2MHCl。通过过滤收集所得到的固体,以得到(S)-2-(4-氯苯基)-2-((S)-1-甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮二盐酸盐(0.060g,98%)。检测到MS ESI(+)m/z 514。
实施例23
Figure BPA00001216219200792
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基(甲基)氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把甲醛(0.0712mL,0.957mmol)和NaCNBH3(0.0120g,0.191mmol)加入在MeOH(0.5mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.055g,0.096mmol,参见实施例13)中。在室温下搅拌混合物20分钟。加入饱和NaHCO3(5mL),用DCM(20mL)萃取水层,并且在硫酸钠上干燥结合的有机相。在除去溶剂之后,通过色谱法(20∶1∶0.1DCM∶乙酸乙酯∶氢氧化铵)提纯残留物,以得到固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基(甲基)氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.013g,23%)。检测到MS ESI(+)m/z 516。
实施例24
Figure BPA00001216219200801
3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙 -1-酮
把3-氨基-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.040g,0.095mmol,参见实施例21)和丙酮(0.0696mL,0.947mmol)放入1∶1二氯乙烯(“DCE”)∶DMF(2mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0495mL,0.284mmol),然后加入NaBH(OAc)3(0.0401g,0.189mmol)。然后搅拌反应30分钟。然后把反应倒入含水Na2CO3中,并且用DCM萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过色谱法(9∶1DCM∶MeOH)提纯残留物以得到纯产物。然后把固体溶解在最少的MeOH中,并且然后加入在乙醚中的1M HCl。把沉淀物收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.005g,收率11.4%)。检测到MS ESI(+)m/z 392。
实施例25
Figure BPA00001216219200811
(S)-N-(4-(4-(2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-3-基)丁酰胺
在0℃把4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.80g,13.2mmol,如在以上的方案1中引用的Thibault等人中所描述的制备)缓慢加入发烟HNO3中并且搅拌10分钟。然后加入冰,然后加入水。然后过滤反应,并且把固体产物用水洗涤并且干燥以得到4-氟-3-硝基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.80g,收率75.2%)。
把4-氟-3-硝基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.300g,1.66mmol)和1-苄基哌嗪(0.350g,1.99mmol)放入NMP(3mL)中并且在微波中加热至80℃,持续30分钟。然后把反应倒入水中并且用MTBE萃取。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩。把粗残留物浆化在最少的DCM中,并且然后用己烷研磨以得到4-(4-苄基哌嗪-1-基)-3-硝基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.425g,收率76.1%)。
把4-(4-苄基哌嗪-1-基)-3-硝基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.30g,0.889mmol)加入浓HCl(5mL)的搅拌溶液中。然后加入SnCl2(0.843g,4.45mmol),并且搅拌反应1小时。然后把反应冷却至0℃,并且用饱和含水Na2CO3把pH升高至8。然后把反应倒入水中并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,粗残留物不经进一步的提纯就被直接使用。把粗物质4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺(0.125g,0.407mmol)放入DCM(2mL)和吡啶(1mL)中。然后加入丁酸酐(0.0670mL,0.407mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应倒入水中并且萃取至EtOAc中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶5DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)丁酰胺(0.070g,收率45.6%)。
把N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)丁酰胺(0.070g,0.19mmol)溶解在MeOH(1mL)中。然后加入Pd/C(0.0197g,0.0185mmol),然后加入3滴浓HCl。然后把反应放入H2球形瓶(H2balloon)下18小时。然后把反应过滤,用MeOH洗涤,并且浓缩以得到粗产物N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)丁酰胺(0.050g,收率93.8%)。
在室温下把N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)丁酰胺(0.050g,0.174mmol)、(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0625g,0.183mmol,参见实施例H)、HOBT-H2O(0.0373g,0.244mmol)和EDCI(0.0434g,0.226mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.152mL,0.870mmol),并且在室温下搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶10-500∶20DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到(S)-3-(4-(3-丁酰氨基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.050g,收率47.0%)。
把(S)-3-(4-(3-丁酰氨基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.045g,0.074mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入TFA(0.5mL)。把反应在室温下搅拌1小时并且然后浓缩至干燥。然后把粗残留物溶解在最少的DCM中并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-N-(4-(4-(2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)丁酰胺(0.035g,收率81%)。检测到MS ESI(+)m/z 512。
实施例26
Figure BPA00001216219200821
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(吡啶-3-基)-1H-吡咯并[2,3-b] 吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把吡啶-3-基硼酸(20mg,0.17mmol)、PS-四(三苯基膦)钯(PS-tetrakis)(41mg,0.0041mmol)和碳酸钠(18mg,0.17mmol,2N水溶液)加入在氩气脱气过的二氧六环(1mL)中的(S)-3-(4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.083mmol,参见实施例4)中。把反应在微波辐射下加热至160℃,持续1小时。在冷却之后,把反应用DCM稀释,过滤,在MgSO4上干燥并且浓缩至干燥。通过反相柱色谱法(水∶ACN 4∶1至1∶9)提纯所得到的残留物以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-氧代-3-(4-(5-(吡啶-3-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(32mg,收率64%)。
把在TFA(3mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-3-氧代-3-(4-(5-(吡啶-3-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(25mg,0.041mmol)搅拌30分钟并且然后浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM(0.2mL)中并且加入在乙醚中的2N HCl中。把所得到的固体过滤并且在氮气下干燥以获得(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(吡啶-3-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(16mg,收率77%)三盐酸盐。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.40(br s,1H),8.96(s,1H),8.77(d,1H),8.45(m,1H),8.13(s,1H),7.89-7.84(m,1H),7.52-7.45(m,3H),7.41-7.32(m,3H),6.74(s,1H),4.66-4.61(m,1H),3.90-3.15(m,10H),3.00-2.96(m,1H),2.82-2.75(m,1H),1.23(dq,6H);m/z(APCI pos)503.3(100%)[M]。
根据以上程序并且使用合适的硼酸或酯来制备以下的化合物:
表1
Figure BPA00001216219200841
Figure BPA00001216219200851
Figure BPA00001216219200861
Figure BPA00001216219200871
Figure BPA00001216219200881
Figure BPA00001216219200891
实施例42
Figure BPA00001216219200892
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H- 吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
把2-乙氧基喹啉-1(2H)-羧酸乙酯(226mg,0.916mmol)加入在THF/ACN(5mL)中的乙酸(50.0mg,0.832mmol)中,并且在室温下搅拌反应1小时。加入4-(5-(肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(300mg,0.832mmol,实施例18),并且把反应加热至70℃,持续1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物从DCM结晶以获得固体状的4-(5-(2-乙酰基肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(241mg,收率71.9%)。
把在POCl3(1mL)中的4-(5-(2-乙酰基肼羰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(70mg,0.16mmol)加热至90℃,持续1小时。把反应浓缩至干燥以获得油状的2-甲基-5-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)-1,3,4-噁二唑(58mg,收率125%),在下一步骤中使用2-甲基-5-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)-1,3,4-噁二唑。
把(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(180mg,0.52mmol,参见实施例H)、N1-((乙基亚氨基)亚甲基)-N3,N3-二甲基丙烷-1,3-二胺盐酸盐(134mg,0.70mmol)、HOBt-H2O(108mg,0.70mmol)和三乙胺(106mg,1mmol)加入在DCM(10mL)中的2-甲基-5-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-基)-1,3,4-噁二唑(100mg,0.36mmol)中。在室温下搅拌反应18小时。在用DCM稀释之后,用1N HCl、10%K2CO3和盐水洗涤混合物。把有机相在MgSO4上干燥并且通过色谱法(SP4,12+M,水/ACN90/10->10/90,20CV)提纯以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(60mg)。
把在TFA(3mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.082mmol)搅拌30分钟并且然后浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM(0.2mL)中并且加入在乙醚中的2N HCl中。把所得到的固体过滤并且在氮气下干燥以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(5-甲基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(21mg,收率50%)盐酸盐。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.10(s,1H),8.84(s,1H),8.35(s,2H),7.52-7.48(m,2H),7.46-4.42(m,1H),7.40-7.36(m,2H),6.64(s,1H),4.58(m,1H),3.70-3.20(m,10H),3.01(s,1H),2.78(s,1H),2.54(s,3H),1.24(dq,6H);检测到MS ESI(+)m/z 508。
实施例43
Figure BPA00001216219200901
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(4-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1- 基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮
把4-氟苯基硼酸(44.0mg,0.315mmol)、PS-四(三苯基膦)钯(PS-palladium tetrakis)(119mg,0.0131mmol)和2N碳酸钠(262μL,0.525mmol)加入在二氧六环(1mL,氩气脱气过)中的4-(5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(100mg,0.262mmol,参见实施例1)中。把反应在微波辐射下加热至150℃,持续1小时。然后把反应冷却并且过滤。把滤液用DCM稀释并且用MgSO4干燥。浓缩之后,通过色谱法(SP4,25+M,水/ACN 90/10->10/90,20CV)提纯残留物以获得固体状的4-(5-(4-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(69mg,收率66.4%)。
在TFA(2mL)中搅拌4-(5-(4-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(60mg,0.15mmol)1小时。然后把溶液浓缩为油并且在下一步骤中使用。
把(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(87mg,0.25mmol,参见实施例H)、N1-((乙基亚氨基)亚甲基)-N3,N3-二甲基丙烷-1,3-二胺盐酸盐(65mg,0.34mmol)、HOBt-H2O(52mg,0.34mmol)和三乙胺(51mg,0.51mmol)加入在DCM(10mL)中的5-(4-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(50mg,0.17mmol)中。搅拌反应18小时。然后把反应用DCM(50mL)稀释并且用1N HCl、10%K2CO3和盐水洗涤。在用MgSO4干燥并且浓缩之后,通过色谱法(SP4,12+M,水/ACN 80/20->0/100,20CV)提纯所得到的残留物以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(4-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(42mg,收率40%)。
把在TFA(3mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(4-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(30mg,0.048mmol)搅拌30分钟并且然后浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM(0.2mL)中并且加入在乙醚中的2N HCl中。把所得到的固体过滤并且在氮气下干燥以获得(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(4-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮(23mg,收率91%)二盐酸盐。检测到MS ESI(+)m/z 520。
实施例44
Figure BPA00001216219200921
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1- 基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮
在-78℃把仲丁基锂(8.06mL,11.3mmol,1.4M在环己烷中)逐滴加入在THF(100mL)中的4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(1.5g,5.13mmol,如在L′Heureux等人,Org.Lett.,5(26)第5023页(2003)中所描述的制备)中。搅拌反应30分钟。快速加入在THF(10mL)中的(1R)-(-)-(10-樟脑磺酰基)哑嗪(2.94g,12.8mmol),并且在-78℃搅拌反应30分钟。加入饱和氯化铵的溶液(50mL),并且允许反应混合物达到室温。一小时之后,把水相用AcOEt萃取,在MgSO4上干燥并且浓缩至固体,在乙醚中研磨固体。滤掉固体(大部分樟脑副产物),并且把滤液浓缩和通过色谱法(25M,甲苯/AcOEt 95/5)提纯以获得糊状物。用己烷研磨糊状物,并且把滤液浓缩至干燥以获得油状的4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-醇(820mg,收率51.8%),4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-醇刚静置就固化。
把2-溴丙烷(120mg,0.973mmol)和碳酸钾(448mg,3.24mmol)加入在DMF(3mL)中的4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-5-醇(200mg,0.648mmol)中。把反应在密封管中加热至80℃,持续18小时并且然后冷却。把反应混合物浓缩至干燥。然后把混合物悬浮在DCM中并且过滤。把滤液浓缩并且通过色谱法(SP4,12+M,水/ACN 80/20->10/90,20CV)提纯以获得固体状的4-氟-5-异丙氧基-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(65mg,42%)。
把哌嗪(222mg,2.6mmol)加入在NMP(1mL)中的4-氟-5-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(50mg,0.26mmol)中,并且把反应在微波辐射下加热至200℃,持续1小时。把反应在高真空下浓缩至干燥并且然后通过色谱法(SP4,12+M,水/ACN 100/0->40/60,20CV)提纯以获得油状的5-异丙氧基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(33mg,收率49%)。
把(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(59mg,0.17mmol,参见实施例H)、N1-((乙基亚氨基)亚甲基)-N3,N3-二甲基丙烷-1,3-二胺盐酸盐(44mg,0.23mmol)、HOBt-H2O(35mg,0.23mmol)和三乙胺(12mg,0.12mmol)加入在DCM(10mL)中的5-异丙氧基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(30mg,0.12mmol)中。在室温下搅拌反应18小时。然后把反应用DCM(50mL)稀释并且用1N HCl、10%K2CO3和盐水洗涤。在MgSO4上干燥之后,把残留物浓缩至干燥并且通过色谱法(SP4,12+M,水/ACN90/10->0/100,20CV)提纯以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(42mg,收率62%)。
把在TFA(3mL)中的(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(30mg,0.051mmol)搅拌30分钟并且然后浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM(0.2mL)中并且加入在乙醚中的2N HCl中。把所得到的固体过滤并且在氮气下干燥以获得固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-异丙氧基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮(15mg,收率60%)盐酸盐。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.30(s,1H),9.23(s,1H),8.56(s,1H),7.99(s,1H),7.51-7.47(m,2H),7.44-7.39(m,3H),6.69(s,1H),4.76(m,1H),4.43(m,1H),3.85-3.50(m,7H),3.47-3.40(m,1H),3.35-3.27(m,1H),3.23-3.15(m,1H),3.05-2.98(m,1H),1.28-1.20(m,12H);m/z(ESI pos)484.4(100%)[M]。
用合适的卤代烷,根据相同的程序,制备以下的化合物:
表2
Figure BPA00001216219200931
Figure BPA00001216219200941
Figure BPA00001216219200951
实施例48
(S)-2-(4-溴苯基)-2-((S)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮
把在DCM(1mL)中的5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.0159g,0.0454mmol,参见实施例19)、(S)-2-(4-溴苯基)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)乙酸(0.017g,0.0412mmol,参见实施例C)和TBTU(0.0159g,0.0495mmol)加入DIEA(0.0287mL,0.165mmol)中并且在室温下搅拌1小时。把混合物直接装载到柱上并且通过色谱法(1∶1己烷∶乙酸乙酯)提纯以得到固体状的(S)-5-((S)-1-(4-溴苯基)-2-氧代-2-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯。把固体溶解在DCM(1mL)中,并且加入TFA(0.2mL)。在室温下搅拌混合物1小时。除去溶剂。把残留物溶解在DCM(0.5mL)中,并且加入在乙醚(1mL)中的2M HCl。通过过滤收集所得到的固体,以得到(S)-2-(4-溴苯基)-2-((S)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮二盐酸盐(0.025g,95%)。检测到MS APCI(+)m/z 574。
实施例49
Figure BPA00001216219200953
(S)-2-(4-氯-3-氟苯基)-2-((S)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H- 吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮
把在DCM(1mL)中的5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶二盐酸盐(0.0200g,0.0570mmol,参见实施例19)、(S)-2-((S)-1-(叔丁氧基羰基)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-2-(4-氯-3-氟苯基)乙酸(0.020g,0.0518mmol,参见实施例D)和TBTU(0.0200g,0.0622mmol)加入DIEA(0.0361mL,0.207mmol)中并且在室温下搅拌1小时。把混合物直接装载到柱上并且通过色谱法(1∶1己烷∶乙酸乙酯)提纯以得到固体状的(S)-5-((S)-1-(4-氯-3-氟苯基)-2-氧代-2-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙基)-2,2-二甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯。把固体溶解在DCM(1mL)中,并且加入TFA(0.2mL)。在室温下搅拌混合物1小时。除去溶剂。把所得到的残留物溶解在DCM(0.5mL)中,并且加入在乙醚(1mL)中的2M HCl。通过过滤收集所得到的固体,以得到(S)-2-(4-氯-3-氟苯基)-2-((S)-5,5-二甲基吡咯烷-2-基)-1-(4-(5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)乙酮二盐酸盐(0.009g,28%)。检测到MS APCI(+)m/z 546。
实施例50
Figure BPA00001216219200961
(S)-N-(4-(4-(2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺
在室温下把粗物质4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺(0.200g,0.651mmol,参见实施例25)、烟酸(0.0961g,0.781mmol)和三乙胺(0.453mL,3.25mmol)放入DMF(3mL)中。然后加入三乙胺(0.453mL,3.25mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。然后用MeOH(5mL)稀释反应,并且加入3M LiOH(0.5mL)并且搅拌10分钟。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶20-500∶30DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.160g,收率59.6%)。
把N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.080g,0.19mmol)放入MeOH(2mL)中。然后加入Pd/C(0.0206g,0.0194mmol),然后加入4滴浓HCl。然后把反应放入H2球形瓶下并且搅拌过夜。把反应过滤,用MeOH洗涤,并且浓缩以得到粗产物N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.050g,收率79.9%),N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺不经进一步的提纯就被使用。
在室温下把N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.030g,0.0931mmol)和(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0334g,0.0977mmol,参见实施例H)放入DCM(2mL)中。然后加入HOBT-H2O(0.020g,0.13mmol)、EDCI(0.023g,0.12mmol)和DIEA(d 0.742;0.0810mL,0.465mmol)。在室温下搅拌反应3小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶10-500∶30DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.010g,收率16.6%)。
在室温下把(S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.010g,0.015mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,并且溶解在最少的DCM中。然后把DCM溶液逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体收集,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-N-(4-(4-(2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.007g,收率73%)。检测到MS APCI(+)m/z 547。
实施例51
Figure BPA00001216219200981
(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(2-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1- 基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮
在-78℃把s-BuLi(53.7mL,75.2mmol,1.4M在环己烷中)加入4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(10.0g,34.2mmol,如在L′Heureux等人,Org.Lett.,5(26),第5023页(2003)中所描述的制备)在THF(250mL)中的溶液中,并且在-78℃搅拌反应30分钟。接着加入CBr4(28.3g,85.5mmol)在THF(40mL)中的溶液,并且在该温度搅拌反应1小时。然后加入饱和氯化铵溶液(80mL),并且把反应用己烷(200mL)萃取,用盐水洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤并且浓缩。然后通过柱色谱法(己烷)提纯粗产物,以得到5-溴-4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(7.8g,收率61.4%)。
在0℃把5-溴-4-氟-1-(三异丙基甲硅烷基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(12.60g,33.9mmol)放入THF(200mL)中。然后加入TBAF(33.9mL,1M THF溶液),并且然后在0℃搅拌反应1小时。把反应用NaHCO3(水溶液)骤冷并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶5DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(6.8g,收率93.2%)。
在0℃把5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(5.3g,24.7mmol)放入DMF(53mL)中。然后加入NaH(1.18g,29.6mmol),并且搅拌20分钟。然后加入苯磺酰氯(3.47mL,27.1mmol),并且在0℃搅拌反应30分钟。然后加入水,并且把所得到的固体过滤并且干燥。然后在1∶1己烷∶EtOAc中研磨粗固体以得到5-溴-4-氟-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(5.2g,收率59.4%)。
把5-溴-4-氟-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.200g,0.563mmol,如在方案1中所描述的制备)和2-氟苯基硼酸(0.0867g,0.619mmol)放入脱气过的2∶1甲苯∶EtOH(3mL)中。然后加入Pd(PPh3)4(0.0325g,0.0282mmol),然后加入K2CO3(水溶液,1.17mL,0.845mmol)。然后把反应加热至80℃,持续18小时。然后把反应冷却至室温,倒入水中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(1∶1己烷∶DCM-4∶1己烷∶DCM)提纯粗残留物以得到4-氟-5-(2-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.203g,收率97.3%)。
把4-氟-5-(2-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.200g,0.540mmol)和哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.121g,0.648mmol)放入NMP(2mL)中。然后把反应放入微波中并且加热至160℃,持续1小时。然后把反应冷却,倒入水中,并且用乙醚萃取。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗油,通过柱色谱法(3∶1己烷∶EtOAc)提纯粗油以得到4-(5-(2-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.102g,收率35.2%)。
把4-(5-(2-氟苯基)-1-(苯基磺酰基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.100g,0.186mmol)放入1∶1THF∶MeOH(6mL)中。然后加入LiOH(0.621mL,1.86mmol),并且在50℃搅拌反应1小时。然后把反应倒入水中并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物4-(5-(2-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.066g,收率89.3%),4-(5-(2-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯不经进一步的提纯就被使用。
在室温下把4-(5-(2-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-羧酸叔丁酯(0.045g,0.11mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.3mL),并且把反应在室温下搅拌1小时并且浓缩至干燥。然后把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到5-(2-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.034g,收率81%)。
在室温下把5-(2-氟苯基)-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.034g,0.0921mmol)、(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0330g,0.0967mmol,参见实施例H)、HOBT-H2O(0.0197g,0.129mmol)和EDCI(0.0229g,0.120mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0802mL,0.460mmol),并且在室温下搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶10DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到(2S)-2-(4-氯苯基)-3-(4-(5-(2-氟苯基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.040g,收率70.0%)。检测到MS APCI(+)m/z 520。
实施例52
Figure BPA00001216219201001
(S)-N-(4-(4-(2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并 [2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺
把4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺(0.35g,1.14mmol,参见实施例25)放入DCM(2mL)和吡啶(1mL)中。然后加入乙酸酐(0.129mL,1.37mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。然后用MeOH(5mL)稀释反应,并且加入3M LiOH(0.5mL)。把反应搅拌10分钟并且然后倒入饱和Na2CO3中并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶8-500∶20DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.35g,收率88.0%)。
把N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.150g,0.429mmol)放入MeOH(3mL)中。然后加入Pd/C(0.0914g,0.0429mmol),然后加入3滴浓HCl。然后把反应放入H2球形瓶下3小时。然后过滤反应,但是产物是不可溶的。把固体用1∶1MeOH∶THF(5×)浆化并且过滤。然后浓缩滤液以得到粗产物N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.110g,收率77.1%),N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺不经进一步的提纯就被使用。
把N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.050g,0.151mmol)、(S)-3-(叔丁氧基羰基(异丙基)氨基)-2-(4-氯苯基)丙酸(0.0540g,0.158mmol,参见实施例H)、HOBT-H2O(0.0323g,0.211mmol)和EDCI(0.0375g,0.196mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.131mL,0.752mmol),并且搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶13-500∶18DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到(S)-3-(4-(3-乙酰氨基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.043g,收率48%)。
在室温下把(S)-3-(4-(3-乙酰氨基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-(4-氯苯基)-3-氧代丙基(异丙基)氨基甲酸叔丁酯(0.043g,0.074mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。然后把粗残留物溶解在最少的DCM中并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(S)-N-(4-(4-(2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.035g,收率85%)。检测到MS APCI(+)m/z 484。
实施例53
Figure BPA00001216219201011
(R)-N-(4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡 啶-3-基)乙酰胺
把粗物质N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.050g,0.15mmol,参见实施例52)、(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.0496g,0.166mmol)、HOBT-H2O(0.0323g,0.211mmol)和EDCI(0.0375g,0.196mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.131mL,0.752mmol),并且搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶13-500∶18DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到(R)-1-(4-(3-乙酰氨基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.047g,收率57.7%)。
在室温下把(R)-1-(4-(3-乙酰氨基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(4-氯苯基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.047g,0.087mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。然后把粗残留物溶解在最少的DCM中并且逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-N-(4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.04g,收率90%)。检测到MS APCI(+)m/z 441。
实施例54
Figure BPA00001216219201021
(R)-N-(4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡 啶-3-基)-2-羟基乙酰胺
在室温下把4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺(0.30g,0.976mmol,参见实施例25)、2-(苄氧基)乙酸(0.195g,1.17mmol)和双(2-氧代-3-噁唑烷基)膦酰氯(bis(2-oxo-3-oxazolidinyl)phosphonicchloride)(“BOP-Cl”;0.298g,1.17mmol)放入DMF(3mL)中。然后加入三乙胺(0.680mL,4.88mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。然后用MeOH(5mL)稀释反应,并且加入3M LiOH(0.5mL)并且搅拌10分钟。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物,通过柱色谱法(500∶10-500∶20DCM∶MeOH)提纯粗残留物以得到2-(苄氧基)-N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.22g,收率49.4%)。
把2-(苄氧基)-N-(4-(4-苄基哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.100g,0.219mmol)放入MeOH(2mL)中。然后加入Pd/C(0.0467g,0.0220mmol),然后加入3滴浓HCl。接着把反应放入H2填充的球形瓶下3小时。然后加入另外的Pd/C(0.0467g,0.0219mmol),并且把反应放入H2填充的球形瓶下另外的3小时以推动反应完全。加入DIEA以实现可溶性。然后把反应过滤,用MeOH洗涤,并且浓缩以得到粗产物2-羟基-N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.060g,收率99.2%)。
在室温下把2-羟基-N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)乙酰胺(0.060g,0.22mmol)、(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.0719g,0.240mmol)、HOBT-H2O(0.0467g,0.305mmol)和EDCI(0.0543g,0.283mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d0.742;0.190mL,1.09mmol),并且搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把反应干燥,过滤,浓缩并且提纯(500∶10至500∶30DCM∶MeOH)以得到(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(3-(2-羟基乙酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.040g,收率32.9%)。
在室温下把(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(3-(2-羟基乙酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.040g,0.072mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,并且把所得到的残留物溶解在最少的DCM中。把溶液逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-N-(4-(4-(2-氨基-3-(4-氯苯基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)-2-羟基乙酰胺(0.030g,收率79%)。检测到MS APCI(+)m/z 457。
实施例55
Figure BPA00001216219201031
(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4- 基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
在室温下把3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.050g,0.14mmol,参见实施例15)、(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(4-氯苯基)丙酸(0.0451g,0.151mmol)、HOBT-H2O(0.0293g,0.192mmol)和EDCI(0.0341g,0.178mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.119mL,0.684mmol),并且搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。然后把反应干燥,过滤,浓缩并且提纯(500∶5DCM∶MeOH)以得到(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.030g,收率38.1%)。
在室温下把(R)-3-(4-氯苯基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丙-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.029g,0.051mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,并且把所得到的残留物溶解在最少的DCM中。把溶液逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的(R)-2-氨基-3-(4-氯苯基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.020g,收率72%)。检测到MS APCI(+)m/z 475。
实施例56
Figure BPA00001216219201041
3-氨基-2-(4-氯苄基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌 嗪-1-基)丙-1-酮
把3-甲基-5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.125g,0.428mmol,参见实施例15)、3-(叔丁氧基羰基氨基)-2-(4-氯苄基)丙酸(0.148g,0.470mmol,参见实施例E)、HOBT-H2O(0.0917g,0.599mmol)、EDCI(0.107g,0.556mmol)和DIEA(d 0.742;0.372mL,2.14mmol)放入DCM(5mL)中。把反应在室温下搅拌3小时并且然后用饱和Na2CO3骤冷。然后用DCM萃取混合物。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗油,通过柱色谱法(500∶6)提纯粗油以得到2-(4-氯苄基)-3-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.115g,收率45.7%)。
在室温下把2-(4-氯苄基)-3-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.115g,0.196mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,并且把所得到的残留物溶解在最少的DCM中。把溶液逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到二盐酸盐形式的3-氨基-2-(4-氯苄基)-1-(4-(3-甲基-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮(0.092g,收率83.9%)。检测到MS APCI(+)m/z 489。
实施例57
Figure BPA00001216219201051
N-(4-(4-(2-氨基乙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺
把粗物质N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.025g,0.058mmol,参见实施例50)、2-(叔丁氧基羰基氨基)乙酸(0.0111g,0.0637mmol)、HOBT-H2O(0.0124g,0.0811mmol)和EDCI(0.0144g,0.075mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0504mL,0.290mmol)。把反应搅拌2小时并且用饱和Na2CO3骤冷。然后用DCM萃取混合物。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗油,通过柱色谱法(500∶20-500∶30)提纯粗油以得到2-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.013g,收率46.8%)。
在室温下把2-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.013g,0.027mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且然后逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的N-(4-(4-(2-氨基乙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.012g,收率91%)。检测到MS APCI(+)m/z 380。
实施例58
Figure BPA00001216219201061
(R)-N-(4-(4-(2-氨基-3-甲基丁酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3- 基)烟酰胺
把N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.025g,0.058mmol,参见实施例50)、(R)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-甲基丁酸(0.0138g,0.0637mmol)、HOBT-H2O(0.0124g,0.0811mmol)和EDCI(0.0144g,0.0752mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0504mL,0.290mmol),并且搅拌反应2小时。用饱和Na2CO3骤冷反应。然后用DCM萃取混合物。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗油,通过柱色谱法(500∶20-500∶28)提纯粗油以得到(R)-3-甲基-1-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丁-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.009g,收率29.7%)。
在室温下把(R)-3-甲基-1-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-1-氧代丁-2-基氨基甲酸叔丁酯(0.014g,0.027mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且然后逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的(R)-N-(4-(4-(2-氨基-3-甲基丁酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.009g,收率63%)。检测到MSAPCI(+)m/z422。
实施例59
Figure BPA00001216219201062
N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺
把N-(4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.025g,0.058mmol,参见实施例50)、3-(叔丁氧基羰基氨基)丙酸(0.0121g,0.0637mmol)、HOBT-H2O(0.0124g,0.0811mmol)和EDCI(0.0144g,0.0753mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0504mL,0.290mmol)。把反应搅拌2小时并且用饱和Na2CO3骤冷。然后用DCM萃取混合物。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗油,通过柱色谱法(500∶20-500∶40)提纯粗油以得到3-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.014g,收率48.9%)。
在室温下把3-(4-(3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.009g,0.02mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且然后逐滴加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.005g,收率55%)。检测到MS APCI(+)m/z 394。
实施例60
Figure BPA00001216219201071
(S)-2-(4-氯苯基)-3-(异丙基氨基)-1-(4-(5-(5-异丙基-1,3,4-噁二唑-2- 基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)丙-1-酮
根据实施例42中所描述的程序,使用异丁酸,分离出固体状的(S)-2-(4-氯苯基)-1-(4-(5-(5-异丙基-1,3,4-噁二唑-2-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-(异丙基氨基)丙-1-酮:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.05(s,1H),8.62(s,1H),8.34(s,1H),8.26(s,1H),7.52-7.48(m,2H),7.44-4.42(m,1H),7.39-7.36(m,2H),6.60(s,1H),4.51(m,1H),3.65-3.20(m,10H),3.02(s,1H),2.76-2.66(m,2H),1.30(d,6H),1.23(dq,6H);m/z(APCI pos)536.3(100%)[M]。
实施例61
Figure BPA00001216219201081
N-(4-(4-(2-氨基乙酰基)哌嗪-1-基)-5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟 酰胺
在0℃把5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.100g,0.465mmol,参见实施例51)缓慢加入发烟HNO3(5mL)中,并且搅拌10分钟。然后加入冰,然后加入水。然后把所得到的固体产物过滤,并且用水洗涤,并且干燥以得到5-溴-4-氟-3-硝基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(0.105g,收率86.8%)。
在室温下把5-溴-4-氟-3-硝基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶(2.0g,7.7mmol)放入6M HCl(30mL)中。然后加入SnCl2(7.29g,38.5mmol),并且在室温下搅拌反应30分钟。然后把反应冷却至0℃并且加入Na2CO3的饱和水溶液以把pH升高至8。然后用DCM(和最少的MeOH以促进溶解性)萃取反应。把结合的有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺(0.50g,收率28.2%),5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺不经提纯就被使用。
在室温下把5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-胺(0.044g,0.19mmol)、烟酸(0.0283g,0.230mmol)和BOP-Cl(0.0584g,0.230mmol)放入DMF(3mL)中。然后加入三乙胺(0.133mL,0.956mmol),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应用3M LiOH(水溶液,0.5mL)稀释并且搅拌10分钟。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,萃取至DCM中,并且把有机部分结合,干燥,过滤并且浓缩以得到粗残留物。用1∶2MeOH/DCM研磨粗残留物以得到固体状的N-(5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.035g,收率54.6%)。
把N-(5-溴-4-氟-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.100g,0.298mmol)和哌嗪(0.257g,2.98mmol)放入NMP(1.5mL)中并且在微波中加热至100℃,持续1小时。然后用旋转蒸发把反应加热至70℃,持续1小时以除去过量的哌嗪。然后把反应用水稀释并且用DCM(和最少的MeOH以促进溶解性)萃取。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩。所得到的N-(5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺的粗NMP溶液不经进一步的提纯就被使用。
把上述N-(5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.200g,0.498mmol)的NMP溶液、2-(叔丁氧基羰基氨基)乙酸(0.114g,0.648mmol)、HOBT-H2O(0.107g,0.698mmol)和EDCI(0.124g,0.648mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.434mL,2.49mmol),并且在室温下搅拌反应4小时。然后把反应用饱和Na2CO3骤冷并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(500∶15至500∶25DCM∶MeOH)提纯得到2-(4-(5-溴-3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.112g,收率40.2%)。
把2-(4-(5-溴-3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.020g,0.036mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的N-(4-(4-(2-氨基乙酰基)哌嗪-1-基)-5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.015g,收率74%)。检测到MS APCI(+)m/z 459。
实施例62
N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟 酰胺
在室温下把粗N-(5-溴-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.200g,0.498mmol,参见实施例61)、3-(叔丁氧基羰基氨基)丙酸(0.189g,0.997mmol)、HOBT-H2O(0.107g,0.698mmol)和EDCI(0.124g,0.648mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.434mL,2.49mmol),并且允许搅拌反应5小时。然后把反应倒入饱和Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩以得到粗残留物。通过柱色谱法(500∶15至500∶25DCM∶MeOH)提纯得到3-(4-(5-溴-3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.060g,收率21.0%)。
在室温下把3-(4-(5-溴-3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.020g,0.035mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL)并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的产物N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.015g,收率74%)。检测到MS APCI(+)m/z 473。
实施例63
Figure BPA00001216219201101
N-(5-溴-4-(4-(3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶 -3-基)烟酰胺
把N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-5-溴-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.060g,0.103mmol,参见实施例62)和丙酮(0.0599g,1.03mmol)放入1∶1DCE∶DMF(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0898mL,0.516mmol),然后加入NaBH(OAc)3(0.0437g,0.206mmol)。然后把反应搅拌30分钟,并且倒入饱和Na2CO3中并且萃取至DCM(3×30mL)中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩。通过反相HPLC提纯所得到的残留物以得到纯产物。然后把产物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚(10mL)中的搅拌溶液中。收集所得到的固体以得到三盐酸盐形式的N-(5-溴-4-(4-(3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.030g,收率46.6%)。检测到MS APCI(+)m/z 515。
实施例64
Figure BPA00001216219201111
N-(4-(4-(2-氨基乙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基) 烟酰胺
把2-(4-(5-溴-3-(烟酰氨基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.090g,0.16mmol)和苯基硼酸(0.039g,0.32mmol)放入二氧六环(1.5mL)中并且脱气30分钟。然后加入20%Na2CO3(0.5mL)溶液,然后加入PS-Pd(PPh3)4(0.081g,0.0081mmol)。然后在微波中在150℃加热反应1小时。接着把反应用DCM稀释并且过滤以除去催化剂。然后通过制备型HPLC提纯反应以得到2-(4-(3-(烟酰氨基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.013g,收率15%)和N-(5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.020g,收率31%)的混合物。
在室温下把2-(4-(3-(烟酰氨基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-2-氧代乙基氨基甲酸叔丁酯(0.013g,0.023mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥。把所得到的残留物溶解在最少的DCM中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的N-(4-(4-(2-氨基乙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.004g,收率38%)。检测到MS APCI(+)m/z 456。
实施例65
Figure BPA00001216219201121
N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基) 烟酰胺
在室温下把N-(5-苯基-4-(哌嗪-1-基)-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.050g,0.125mmol,参见实施例64)、3-(叔丁氧基羰基氨基)丙酸(0.0475g,0.251mmol)、HOBT-H2O(0.0269g,0.176mmol)和EDCI(0.0313g,0.163mmol)放入DCM(5mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.109mL,0.627mmol),并且搅拌反应5小时。然后把反应倒入Na2CO3中,并且萃取至DCM中。把有机部分干燥,过滤,并且浓缩以得到粗产物,通过柱色谱法(500∶20DCM∶MeOH)提纯粗产物以得到3-(4-(3-(烟酰氨基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.065g,收率90.9%)。
在室温下把3-(4-(3-(烟酰氨基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-4-基)哌嗪-1-基)-3-氧代丙基氨基甲酸叔丁酯(0.020g,0.035mmol)放入DCM(3mL)中。然后加入TFA(0.5mL),并且在室温下搅拌反应1小时。然后把反应浓缩至干燥,溶解在最少的DCM中,并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。把所得到的固体产物过滤,用乙醚洗涤,并且干燥以得到三盐酸盐形式的产物N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.008g,收率39%)。检测到MS APCI(+)m/z 470。
实施例66
Figure BPA00001216219201122
N-(4-(4-(3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡 啶-3-基)烟酰胺
把N-(4-(4-(3-氨基丙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.015g,0.026mmol,参见实施例65)和丙酮(0.0150g,0.259mmol)放入1∶1DCE∶DMF(2mL)中。然后加入DIEA(d 0.742;0.0226mL,0.130mmol),然后加入NaBH(OAc)3(0.0110g,0.0518mmol)。然后把反应搅拌30分钟,并且倒入Na2CO3中并且萃取至DCM中。把有机部分结合,干燥,过滤,并且浓缩。通过反相HPLC提纯残留物以得到产物。然后把产物溶解在最少的DCM和MeOH中并且加入1M HCl在乙醚中的搅拌溶液中。收集所得到的固体以得到三盐酸盐形式的N-(4-(4-(3-(异丙基氨基)丙酰基)哌嗪-1-基)-5-苯基-1H-吡咯并[2,3-b]吡啶-3-基)烟酰胺(0.001g,收率6.2%)。检测到MS APCI(+)m/z 512。
也可以根据上文所描述的方法作出表3中所示的实施例67-74。
表3
Figure BPA00001216219201131
Figure BPA00001216219201141
Figure BPA00001216219201151
虽然已经结合所列举的实施方案描述了本发明,但是应当理解,它们不意在将本发明限制于那些实施方案。相反,本发明意在覆盖可以被包括在如由权利要求界定的本发明的范围内的所有的替换方式、修改和等效物。因此,上述的说明书被认为仅阐述本发明的原理。
词“包括(comprise)”、“包括(comprising)、”“包括(include)、”“包括(including)、”和“包括(includes)”当在本说明书和在下面的权利要求中使用时,意在指明所陈述的特征、整数、组分或步骤的存在,但是它们不排除一个或多个其他特征、整数、组分、步骤或其组的存在或增加。

Claims (64)

1.选自式I的化合物以及其立体异构体和药学上可接受的盐:
Figure FPA00001216219100011
其中:
G是环己基或苯基,所述基团任选地用1-3个独立的R4基团取代,或
当m是0时,G可以另外地是不存在的或是C1-C4烷基;
R1选自氢、卤素、CN、任选地用卤素取代的C1-C4烷基、-C(=O)ORa、-ORe、C3-C6环烷基、5元或6元杂芳基、苯基或-O-苯基,其中所述杂芳基、苯基或-O-苯基可以任选地用一个或两个Rb基团取代;
R2选自氢、CH3或-NHC(=O)Rf,条件是当R1是氢时,那么R2是-NHC(=O)Rf
R3选自氢或C1-C3烷基;
每个R4独立地选自卤素、CF3、OCF3和CN;
R5和R6独立地选自氢或CH3
R7和R8独立地选自氢或C1-C6烷基;
Ra是C1-C4烷基;
每个Rb基团独立地选自卤素、CN、OCH3或任选地用卤素、OH、氧代、5元或6元杂芳基或NRgRh取代的C1-C4烷基;
Re是任选地用OH或5元或6元杂环取代的C1-C4烷基;
Rf是任选地用OH取代的C1-C4烷基、任选地用选自氧代、卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂环或任选地用选自卤素、CN、CF3或C1-C3烷基中的一个或两个基团取代的5元或6元杂芳基;
Rg和Rh独立地是氢或C1-C4烷基;
m、n和p独立地是0或1;
或R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的、具有一个环氮原子的5-6元杂环,并且R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,使得所述式I的化合物具有式II的结构:
Figure FPA00001216219100021
其中Rc和Rd独立地选自氢或C1-C4烷基;并且
r是1或2。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是Br。
3.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是CN。
4.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是任选地用卤素取代的C1-C4烷基。
5.根据权利要求4所述的化合物,其中R1是CF3
6.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是C(=O)ORa
7.根据权利要求6所述的化合物,其中R1是C(=O)OCH3
8.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是-ORe
9.根据权利要求8所述的化合物,其中R1选自-OCH(CH3)2、-OCH2CH(OH)CH2CH3、-OCH2CH2-吗啉-4-基和-OCH2CH2CH2-吗啉-4-基。
10.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的5元或6元杂芳基。
11.根据权利要求10所述的化合物,其中所述5元或6元杂芳基选自吡唑基、1-氧杂-3,4-二唑基、噻吩基和吡啶基。
12.根据权利要求10所述的化合物,其中R1选自1-甲基-1H-吡唑-基、2-异丙基-1-氧杂-3,4-二唑-5-基、2-甲基-1-氧杂-3,4-二唑-5-基、吡啶-3-基和噻吩-2-基。
13.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是任选地用一个或两个Rb基团取代的苯基。
14.根据权利要求13所述的化合物,其中R1选自苯基、2-氟苯基、3-氟苯基、3-氯苯基、4-氟苯基、3-氰基苯基、3-甲氧基苯基、4-甲氧基苯基、3-异丙基苯基、3-三氟甲基苯基、3-羟甲基苯基、4-羟甲基苯基、4-((1H-吡唑-1-基)甲基)苯基、3-(CH2N(CH3)2)苯基、4-(C(=O)NHCH3)苯基、3-苯基乙酰胺基、3-(C(=O)NH2)苯基、4-(C(=O)NH2)苯基、3,4-二甲氧基苯基、3,5-二氟苯基和3-氟-5-甲氧基苯基。
15.根据权利要求1所述的化合物,其中R1是氢,并且R2是-NHC(=O)Rf
16.根据权利要求1至14中任一项所述的化合物,其中R2是氢。
17.根据权利要求1至14中任一项所述的化合物,其中R2是CH3
18.根据权利要求1至14中任一项所述的化合物,其中R2是-NHC(=O)Rf
19.根据权利要求18所述的化合物,其中R2选自-NHC(=O)CH3、-NHC(=O)CH2CH2CH3、-NHC(=O)CH2OH和烟酰胺基。
20.根据权利要求18所述的化合物,其中R2选自-NHC(=O)CH3、-NHC(=O)CH2CH2CH3、-NHC(=O)CH2OH、烟酰胺基、1H-吡唑-4-甲酰胺基、5-氯烟酰胺基和5-甲基烟酰胺基。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的化合物,其中R7是氢。
22.根据权利要求1至20中任一项所述的化合物,其中R7是C1-C6烷基。
23.根据权利要求21所述的化合物,其中R7是异丙基。
24.根据权利要求1至23中任一项所述的化合物,其中R8是氢。
25.根据权利要求1至24中任一项所述的化合物,其中R8是甲基。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的化合物,其中p是1。
27.根据权利要求1至26中任一项所述的化合物,其中R5是氢。
28.根据权利要求1至26中任一项所述的化合物,其中R5是CH3
29.根据权利要求1至28中任一项所述的化合物,其中R6是氢。
30.根据权利要求1至28中任一项所述的化合物,其中R6是甲基。
31.根据权利要求1至25中任一项所述的化合物,其中p是0。
32.根据权利要求1至31中任一项所述的化合物,其中R3是氢。
33.根据权利要求1至32中任一项所述的化合物,其中n是0。
34.根据权利要求1至32中任一项所述的化合物,其中n是1。
35.根据权利要求1至34中任一项所述的化合物,其中G是环己基。
36.根据权利要求1至34中任一项所述的化合物,其中G是任选地用一个至三个R4基团取代的苯基。
37.根据权利要求36所述的化合物,其中G选自4-氟苯基、4-氯苯基、4-溴苯基、3-氟-4-氯苯基和3-氯-4-氟苯基。
38.根据权利要求1至37中任一项所述的化合物,其中m是0。
39.根据权利要求1至37中任一项所述的化合物,其中m是1。
40.根据权利要求1至33中任一项所述的化合物,其中m是0并且G是G1,所述化合物具有式V的结构:
Figure FPA00001216219100041
其中G1是不存在的或是C1-C4烷基。
41.根据权利要求40所述的化合物,其中G1是不存在的。
42.根据权利要求40所述的化合物,其中G1是C1-C4烷基。
43.根据权利要求40所述的化合物,其中G1是异丙基。
44.根据权利要求1至20中任一项所述的化合物,其中R5是氢,R6和R7与它们所连接的原子一起形成任选地被取代的、具有一个环氮原子的5-6元杂环,并且R8选自由氢或任选地用OH或O(C1-C3烷基)取代的C1-C4烷基组成的组,使得所述式I的化合物具有式II的结构:
Figure FPA00001216219100051
45.根据权利要求44所述的化合物,其中r是1。
46.根据权利要求44所述的化合物,其中r是2。
47.根据权利要求44至46中任一项所述的化合物,其中Rc是氢。
48.根据权利要求44至46中任一项所述的化合物,其中Rc是甲基。
49.根据权利要求44至48中任一项所述的化合物,其中Rd是氢。
50.根据权利要求44至48中任一项所述的化合物,其中Rd是甲基。
51.根据权利要求44至50中任一项所述的化合物,其中R8是氢。
52.根据权利要求44至50中任一项所述的化合物,其中R8是甲基。
53.根据权利要求1所定义的并且在本文的实施例1至74中任一个中命名的式I的化合物或其药学上可接受的盐。
54.一种药物组合物,所述药物组合物包含权利要求1至53中任一项的化合物以及药学上可接受的载体或赋形剂。
55.一种预防或治疗通过CHK1和/或CHK2调节的疾病或病症的方法,所述方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物施用有效量的权利要求1至53中任一项的化合物。
56.一种预防或治疗癌症的方法,所述方法包括对需要这样的治疗的哺乳动物单独使用有效量的权利要求1至53中任一项的化合物,或者组合施用有效量的权利要求1至53中任一项的化合物与一种或多种具有抗癌性质的另外化合物。
57.一种治疗哺乳动物中的过度增殖疾病的方法,所述方法包括对所述哺乳动物施用治疗有效量的权利要求1至53中任一项的化合物。
58.一种用于疗法的权利要求1至53中任一项的化合物。
59.一种用于治疗过度增殖疾病的权利要求1至53中任一项的化合物。
60.权利要求1至53中任一项的化合物在制造用于治疗过度增殖疾病的药物中的用途。
61.权利要求1至53中任一项的化合物在制造在经历癌症疗法的患者的治疗中用作CHK1和/或CHK2抑制剂的药物中的用途。
62.一种用于治疗过度增殖疾病的药物组合物,所述药物组合物包含权利要求1至53中任一项的化合物。
63.一种用于癌症的治疗的药物组合物,所述药物组合物包含权利要求1至53中任一项的化合物。
64.一种用于制备权利要求1的式I的化合物的方法,所述方法包括:
(a)在偶联试剂的存在下用式A的化合物酰化式6的化合物;
(b)然后是任选对R1加工;以及
(c)然后是任选脱保护以提供式I的化合物。
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