WO2009145573A2 - 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법 - Google Patents

아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법 Download PDF

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이상목
하종천
양재균
이정식
박봉환
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주식회사 바이오큐어팜
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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
    • C07K14/555—Interferons [IFN]
    • C07K14/565—IFN-beta

Definitions

  • the present invention relates to a recombinant E. coli and a method for producing the recombinant human mutant interferon-beta protein from which the amino terminal methionine is removed.
  • N-met methionine
  • Recombinant protein does not have the same structure as the protein in the human body, so when the recombinant recombinant protein for body administration is produced from E. coli, N-met causes an unexpected immune response from the host, or the protein itself It is also unstable and may not fully function.
  • human interferon-beta production methods can be divided into three major.
  • a method of producing human interferon-beta protein by recombining human interferon-beta genes into mammalian cells such as Chinese hamster ovary (CHO) cells (McCormick, F. et al (1984) Mol. Cell) Biol. 4, 166).
  • This method is more efficient than the first method, but also inefficient in mass production compared to the production method using E. coli.
  • E. coli produces a human interferon-beta gene.
  • This method is most efficient for obtaining large amounts of human interferon-beta protein in terms of production rate, time and cost when compared to the above two methods.
  • human interferon-beta protein produced in Escherichia coli should be removed during purification because methionine is attached to the amino terminal. This leads to a decrease in yield in the purification process and an increase in time due to the addition of the purification process.
  • the present inventors were studying a method for mass production of recombinant human mutant interferon-beta protein from which amino-terminal methionine was removed, and the recombinant human mutant interferon-beta ( rHu IFN- ⁇ Ser17 , IFN- ⁇ 1b) gene was identified as pET21a.
  • the recombinant expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 was prepared by inserting into the (+) vector, and the recombinant expression vector pSTV29Map was prepared by inserting a methionine aminopeptidase gene into the pSTV29 vector.
  • E. coli (BL21 (DE3)) of the transformed E. coli was transformed to produce a recombinant E. coli, and after culturing the recombinant E. coli was confirmed that the amino-terminal methionine was removed from the recombinant human mutant interferon-beta protein, and completed the present invention .
  • the present invention is to provide a recombinant E. coli and a method for producing the recombinant human mutant interferon-beta protein from which the amino terminal methionine is removed.
  • the present invention is to provide a method for producing a recombinant human mutant interferon-beta protein from which the amino terminal methionine is removed from the recombinant E. coli.
  • FIG. 1 is a diagram showing the nucleotide sequence and amino acid sequence of the human mutant interferon-beta gene ( rHu IFN- ⁇ Ser17 , IFN- ⁇ 1b).
  • Figure 2 is a diagram showing the nucleotide sequence and amino acid sequence of the methionine aminopeptidase gene.
  • FIG. 3 shows a recombinant expression vector pET21a (+) IFN- which is inserted into the expression vector pET21a (+) after mutating the human interferon-beta gene amplified by PCR in the human T lymphocyte cDNA library so that the 17th amino acid is serine. It is a schematic diagram which shows the manufacturing process of (beta) Ser17 .
  • Figure 4 is a gel photograph showing the results of performing 1% agarose gel electrophoresis to identify fragments of the human interferon-beta gene amplified by PCR (lane M: 1kb Plus DNA ladder (Invitrogen) , Lane 1: amplified human interferon-beta gene).
  • Figure 5 is a gel photograph showing the results of performing 1% agarose gel electrophoresis to identify fragments of the human mutant interferon-beta gene amplified by PCR (lane M: 1kb Plus DNA ladder (Invitrogen) ), Lane 1: amplified human variant interferon-beta gene).
  • FIG. 6 is a schematic diagram illustrating a process of preparing a recombinant expression vector pSTV29Map by inserting a methionine aminopeptidase gene amplified by PCR into a pSTV29 vector which can coexist with a recombinant expression vector.
  • Figure 7 is a gel photograph showing the results of performing 1% agarose gel electrophoresis to identify fragments of the methionine aminopeptidase gene amplified by PCR (lane M: 1kb Plus DNA ladder (Invitrogen) ), Lane 1: amplified methionine aminopeptidase gene).
  • FIG. 8 shows two recombinant E. coli (BL21 (DE3)) transformed with recombinant expression vectors pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 and pSTV29Map to produce a recombinant human mutant interferon-beta protein with amino-terminal methionine removed. It is a schematic diagram showing the manufacturing process of the microorganism in which the Vector Vector System was constructed.
  • FIG. 9 shows that the recombinant expression vectors pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 and pSTV29Map were transformed into one Escherichia coli, and the plasmid was extracted from the transformed Escherichia coli and digested with restriction enzyme BamH I, followed by 1% agar.
  • Figure shows the results of electrophoresis on the os gel (lane M: 1kb DNA ladder (Intron Bio, Korea), lane 1: vector plasmid extracted from the transformed E. coli and cut with BamH I).
  • Figure 10 is a photograph showing the results of electrophoresis (SDS-PAGE: Sodium dodecyl sulfate-Polyacrylamide gel electrophoresis) and Western blot results of the amino terminal methionine-free recombinant human mutant interferon-beta protein (lane M: SeeBlue ® Plus2 Pre-Stained Standard (Invitrogen), lane 1: recombinant human mutant interferon-beta protein with amino-terminal methionine removal).
  • SDS-PAGE Sodium dodecyl sulfate-Polyacrylamide gel electrophoresis
  • FIG. 11 shows the gel result obtained by the protein electrophoresis method of FIG. 10 with an i-MAX TM Gel Image Analysis System of COBIO Corporation (Korea), followed by Alpha Innotech Corporation's Alpha.
  • the present invention provides recombinant E. coli (KCTC 11495BP), which produces a recombinant human mutant interferon-beta protein from which amino-terminal methionine has been removed.
  • recombinant expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 prepared in step 1) and the recombinant expression vector pSTV29Map prepared in step 2) were transformed into one Escherichia coli (BL21 (DE3)) to transform recombinant E. coli ( E Provided is a method for producing recombinant E. coli, which produces a recombinant human mutant interferon-beta protein from which amino-terminal methionine is removed, comprising preparing coli BL21 (DE3) / pET21a + pSTV29-; KCTC 11495BP).
  • the present invention is cultured transformed Escherichia coli (KCTC 11495BP) to express a recombinant human mutant interferon-beta protein, and then collected and purified to produce a recombinant human mutant interferon-beta protein is removed amino-terminal methionine Provide a method.
  • the recombinant Escherichia coli of the present invention inserts a recombinant human mutant interferon-beta (rHu IFN- ⁇ Ser17 , IFN- ⁇ 1b) gene into a pET21a (+) vector to produce a recombinant expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 , and methionine
  • the aminopeptidase gene was inserted into the pSTV29 vector to prepare a recombinant expression vector pSTV29Map, and these two recombinant expression vectors were characterized by transforming one E. coli (BL21 (DE3)).
  • Step 1) in the method for producing recombinant E. coli of the present invention is a step for preparing a recombinant expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 .
  • a human T lymphocyte cDNA library is used as a template and a DNA polymerase chain reaction is performed using primer pairs (SEQ ID NOs: 1 and 2) to amplify the human interferon-beta gene.
  • the amplified human interferon-beta gene and pUC118 vector are digested with restriction enzyme EcoR I, re-separated, purified and mixed. T4 DNA ligase is added to this mixture and reacted at 16 ° C. for 4 hours. This mixture was transformed into E.
  • the pET21a (+) vector under the insert the lac operator sequence immediately after the T7 promoter by controlling the expression of a target protein by the lac I gene maintain the stability of the plasmid, and further by over-production of lac regulatory elements lac UV promoter regulatory T7 It inhibits the expression of RNA synthase. Expression of a protein can be easily controlled by inserting a recombinant human mutant interferon-beta gene into the complex cloning site (MCS) of the vector.
  • MCS complex cloning site
  • Step 2) in the method for producing recombinant E. coli of the present invention is a step for preparing a recombinant expression vector pSTV29Map.
  • Methionine aminopeptidase genes are amplified by DNA polymerase chain reaction using E. coli K12 as a template using primer pairs (SEQ ID NOs. 7 and 8). The amplified methionine aminopeptidase gene was inserted into the pSTV29 vector to prepare a recombinant expression vector pSTV29Map.
  • pSTV29 Since pSTV29 has a replication origin of pACYC184, it can coexist with plasmid vectors such as pUC and pBR, and has a chloramphenicol resistance gene of Tn9, and can also be distinguished according to antibiotic resistance from pET21a (+) vector. Expression of the lac promoter can be controlled by inserting the methionine aminopeptidase gene into the complex cloning site (MCS) of the pSTV29 vector.
  • MCS complex cloning site
  • the pBR322 origin in the pET21a (+) vector can contain a pSTV29 vector that can coexist with plasmids such as pUC and pBR, creating a two vector system in which two plasmids can coexist in one E. coli.
  • methionine removal of the recombinant human mutant interferon-beta protein is thought possible by inserting the recombinant human mutant interferon-beta gene into the pET21a (+) vector and inserting the methionine aminopeptidase gene into the pSTV29 vector.
  • the transformed Escherichia coli (KCTC 11495BP) prepared by the above method is inoculated in LB medium containing empicillin and chloramphenicol and shaken at 37 ° C.
  • KCTC 11495BP The transformed Escherichia coli
  • IPTG is added to express recombinant human mutant interferon-beta protein. It is collected and purified to mass produce recombinant human mutant interferon-beta proteins with amino-terminal methionine removed.
  • the protein is purified without the step of removing methionine in the purification process by removing the methionine at the amino terminal during the synthesis and production of the protein in the cell. Reducing the production of recombinant proteins can be easily and quickly mass-produced and yields can be increased.
  • the recombinant human mutant interferon-beta protein according to the present invention is suitable for recombinant proteins for therapeutic purposes for in vivo administration.
  • Example 1 a recombinant human mutant interferon-beta production in the expression vector (pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17)
  • a restriction enzyme site of EcoR I was produced in the sequence of the primer as shown in Table 1.
  • the base sequences of the prepared two primers were described as SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2, respectively.
  • each primer was synthesized by commissioning from Genotech (Korea).
  • DNA polymerase chain reaction was performed using cloned human T-lymphocyte cDNA library as a template.
  • the DNA polymerase chain reaction was carried out with a PCR reaction of 100 ng of template DNA, 100 pmole primer 1 and primer 2, total concentration of 100 uL including 2 mM dNTP mixture (TaKaRa), 10 uL of 10X Pfu buffer, and 1 uL of Pfu polymerase (Stratagene). It was carried out using a mixture. Polymerase chain reaction was performed at 94 DEG C for 30 seconds; 30 seconds at 55 ° C .; 25 repetitions were performed at 72 ° C. for 30 seconds. Thereafter, 1% agarose gel electrophoresis was performed to confirm the amplified PCR product. The results are shown in FIG. The human interferon-beta gene was then isolated from the gel and purified using a QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN).
  • QIAquick Gel Extraction Kit QIAquick Gel Extraction Kit
  • Human interferon-beta gene a PCR product obtained by Takara's pUC118 vector and DNA polymerase chain reaction, was digested with EcoR I, a restriction enzyme from New England Biolabs (NEB), and isolated and purified. The purified DNA fragments and the pUC118 vector were mixed well, then T4 DNA ligase was added and reacted at 16 ° C for 4 hours. This mixture was transformed into Escherichia coli (DH5 ⁇ ) by the heat shock method described in Hanahan Method to prepare the expression vector pUC118IFN- ⁇ . Recombinant expression vector pUC118IFN- ⁇ was obtained from the transformed microorganism using Solgent (Pl) plasmid purification kit.
  • EcoR I EcoR I
  • NEB New England Biolabs
  • Mutagenesis was performed to convert the seventeenth cysteine of the cloned human interferon-beta gene to serine. To this end, as shown in Table 2, was prepared by attaching a phosphate group to the N terminal of the primer sequence. The base sequences of the prepared two primers were described as SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4, respectively. At this time, each primer was synthesized by commissioning from Genotech (Korea). DNA polymerase chain reaction was performed using pUC118 containing the human interferon-beta gene as a template.
  • the DNA polymerase chain reaction was carried out with a PCR reaction of 100 ng of template DNA, 100 pmole primer 3 and primer 4, total concentration of 100 uL containing 2 mM dNTP mixture (TaKaRa), 10 uL of 10X Pfu buffer, and 1 uL of Pfu polymerase (Stratagene). It was carried out using a mixture. Polymerase chain reaction was performed at 94 DEG C for 30 seconds; 1 minute at 55 ° C .; 14 repetitions were performed at 68 ° C. for 8 minutes.
  • DNAs of the template to which the methyl group was attached were cut with Dpn I, a restriction enzyme of New England Biolab (NEB), and re-separated and purified.
  • This purified DNA was transformed into Escherichia coli (DH5 ⁇ ) by the heat shock method described in Hanahan Method to prepare the expression vector pUC118IFN- ⁇ Ser17 .
  • the recombinant expression vector pUC118IFN- ⁇ Ser17 was obtained from the transformed microorganism using the plasmid purification kit of Solgent (Korea).
  • DNA polymerase chain reaction was carried out by PCR reaction of 100 ng of template DNA, 100 pmole primer 5 and primer 6, final concentration of 2 mM dNTP mixture (TaKaRa), 10 uL of 10X Pfu buffer, and 1 uL of Pfu polymerase (Stratagene). It was carried out using a mixture. Polymerase chain reaction was performed at 94 DEG C for 30 seconds; 30 seconds at 55 ° C .; 25 repetitions were performed at 72 ° C. for 30 seconds. Thereafter, 1% agarose gel electrophoresis was performed to confirm the amplified PCR product. The results are shown in FIG. Thereafter, the human mutant interferon-beta gene was isolated from the gel using a QIAquick Gel Extraction Kit (QIAGEN) and purified.
  • QIAquick Gel Extraction Kit QIAquick Gel Extraction Kit
  • the human mutant interferon-beta gene a PCR product obtained from Novagen's pET21a (+) vector and DNA polymerase chain reaction, was cleaved with Nde I and BamH I, restriction enzymes of New England Biolabs (NEB), and isolated and purified. .
  • the purified DNA fragment and pET21a (+) vector were mixed well, and then T4 DNA ligase was added and reacted at 16 ° C. for 4 hours. This mixture was transformed into Escherichia coli (DH5 ⁇ ) by the heat shock method described in Hanahan Method to prepare the expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 .
  • the recombinant expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 was obtained from the transformed microorganism using the plasmid purification kit of QIAGEN (Germany). The construction of the recombinant expression vector pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 is shown in FIG. 3.
  • a restriction enzyme site of EcoR I and BamH I was constructed in the primer sequence as shown in Table 4.
  • the base sequences of the prepared two primers were described as SEQ ID NO: 7 and SEQ ID NO: 8, respectively.
  • each primer was synthesized by commissioning from Genotech (Daejeon, Korea).
  • DNA polymerase chain reaction was performed using E. coli K12 as a template.
  • the DNA polymerase chain reaction is a template DNA containing E. coli K12 colony, 100 pmole primer 7 and primer 8, a final concentration of 2 mM dNTP mixture (TaKaRa), 10 uL of 10X Taq buffer, and 1 uL of Taq polymerase (TaKaRa).
  • TaKaRa 2 mM dNTP mixture
  • 10 uL of 10X Taq buffer 10 uL
  • Taq polymerase Taq polymerase
  • the methionine aminopeptidase gene a PCR product obtained by the pSTV29 vector of Takarasa (Japan) and DNA polymerase chain reaction, was cleaved with EcoR I and BamH I restriction enzymes of New England Biolabs (NEB) and re-separated and purified. .
  • the purified DNA fragment was well mixed with the pSTV29 vector, and then T4 DNA ligase was added and reacted at 16 ° C. for 4 hours.
  • This mixture was transformed into Escherichia coli (DH5 ⁇ ) by the heat shock method described in Hanahan Method to prepare a recombinant expression vector pSTV29Map.
  • the recombinant expression vector pSTV29Map was obtained from the transformed microorganism using the plasmid purification kit of QIAGEN (Germany).
  • Example 3 Preparation of Recombinant Escherichia coli Producing Recombinant Human Mutant Interferon-beta Protein Depleted with Amino-Terminal Methionine
  • the recombinant expression vectors pET21a (+) IFN- ⁇ Ser17 and pSTV29Map prepared in Examples 1 and 2 were transformed into Escherichia coli (BL21 (DE3)) by the heat shock method described in one method.
  • Transformed recombinant E. coli E. coli BL21 (DE3) / pET21a + pSTV29- was deposited on April 1, 2009 to the Gene Bank of Korea Institute of Biotechnology Research Institute Genetic Resource Center (KCTC 11495BP).
  • the transformed recombinant E. coli was inoculated into 5 mL of LB medium containing 100 ⁇ g / mL empicillin and 6.8 ⁇ g / mL chloramphenicol, and then plasmid was purified using a plasmid purification kit from QIAGEN (Germany). Purified plasmids were digested for 1 hour at 37 ° C. using restriction enzyme BamH I of New England Biolabs Ins. And electrophoresed on 1% agarose gel. The electrophoresis results are shown in FIG. 9 (lane M: 1 kb DNA ladder (Intron Bio, Korea), lane 1: vector plasmid extracted from transformed Escherichia coli and digested with BamH I).
  • E. coli E. coli BL21 (DE3) / pET21a + pSTV29-; KCTC 11495BP
  • LB medium containing 100 ⁇ g / mL empicillin and 6.8 ⁇ g / mL chloramphenicol, and 37 ° C. Cultured in a shaker incubator.
  • IPTG isopropyl- ⁇ -D-thiogalactopyranoside
  • the cultures were further cultured for about 4 hours to proceed with expression of the recombinant human mutant interferon-beta protein.
  • the cells expressing the recombinant human mutant interferon-beta protein were suspended in a sodium washing solution and then disrupted using a cell crusher (pressure method).
  • Recombinant human mutant interferon-beta protein from which the amino terminal methionine was removed from the lysate in the form of an inclusion body was collected and washed. Since the washed insoluble aggregate is inactive as a protein, the dissolution solution is used to dissolve the recombinant human mutant interferon-beta protein in the form of an insoluble aggregate to convert it into a water-soluble protein with biological activity, and then re-reduces it through reduction and oxidation. Go through refolding To analyze recombinant human mutant interferon-beta proteins, they were purified using Sephacryl S200 chromatography, separated by molecular weight size.
  • the molecular weight of the purified recombinant human mutant interferon-beta protein was 18.761 kDa. This was confirmed to be the same compared to 18.5 ( ⁇ 1000) kDa, the size of known human interferon-beta protein.
  • the protein is purified without the step of removing methionine in the purification process by removing the methionine at the amino terminal during the synthesis and production of the protein in the cell. Reducing the production of recombinant proteins can be easily and quickly mass-produced and yields can be increased.
  • the recombinant human mutant interferon-beta protein according to the present invention is suitable for recombinant proteins for therapeutic purposes for in vivo administration.
  • interferon-b protein removed amino terminal methionine
  • primer 3 phosphoric acid attached N-terminal
  • primer 4 phosphoric acid attached N-terminal

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Abstract

본 발명은 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법에 관한 것으로, 상세하게는 재조합 사람 변이 인터페론-베타(rHu IFN-βSer17, IFN-β 1b) 유전자를 pET21a(+) 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하고, 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 pSTV29 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조한 후, 이 두 재조합 발현벡터를 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시켜 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법에 관한 것이다.

Description

아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법
본 발명은 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법에 관한 것이다.
재조합 미생물을 이용하여 필요한 단백질을 제조하는 방법이 급속도로 발전하여 왔다. 그러나, 일반적으로 유전자 재조합 기술로 발현된 단백질 생산물은 아미노 말단에 그 단백질 생산물의 유전자가 지정하는 아미노산 서열 이외에 추가로 메티오닌(N-met)을 가지는 비천연형의 재조합 단백질이 만들어지며, 대장균의 경우도 예외는 아니다. 재조합 단백질은 인체 내의 단백질과 동일한 구조를 가지지 못하므로, 체내 투여를 목적으로 하는 치료제용 재조합 단백질을 대장균으로부터 발현하여 생산할 경우, N-met은 숙주로부터 예기치 못했던 면역반응을 유발시키거나, 단백질 자체가 불안정하여 기능을 완전히 수행하지 못하기도 한다.
따라서, 이러한 재조합 단백질의 문제를 해결하기 위하여 다양한 방법들이 개발되어 왔다. 예를 들면, 아미노 말단에 위치한 메티오닌을 제거하기 위해 재조합 단백질을 생산하여 절단하는 방법(참조: WO 89/12678, EP 20209, EP 321940) 또는 재조합 단백질이 숙주세포 밖으로 분비되는 과정에서 메티오닌이 절단되도록 하는 방법(참조: EP 008832, USP 4,755,464) 등이 제안된 바 있다.
지금까지의 사람 인터페론-베타 생산방법은 크게 세 가지로 나누어 볼 수 있다. 첫째, 사람의 섬유아세포를 대량으로 키우면서 폴리 I, 폴리 C 및 시클로헥사미드로 슈퍼인덕션(Super Induction)시켜 얻는 방법이다. 이 방법은 사람 인터페론-베타 발견 후 그에 대한 기초연구를 위한 필요한 양만큼의 사람 인터페론-베타를 얻기 위해 사용된 방법으로 다량의 사람 인터페론-베타 단백질 생산방법으로는 매우 비효율적이다.
둘째, 사람 인터페론-베타 유전자를 중국 햄스터 난소(Chinese hamster ovary; CHO) 세포와 같은 포유동물 세포에 재조합시켜서 사람 인터페론-베타 단백질을 생산하는 방법이다(McCormick, F. et al(1984) Mol. Cell. Biol. 4, 166). 이 방법은 첫째 방법에 비해서는 효율적이나, 이 역시 대량 생산하는데 있어서 대장균을 이용한 생산방법에 비해 비효율적이다.
셋째, 사람 인터페론-베타 유전자를 대장균 발현벡터에 재조합시킨 뒤, 대장균에서 사람 인터페론-베타 유전자를 생산하는 방법이다. 이 방법은 상기 두 방법과 비교할 경우, 생산율, 시간 및 비용면에서 볼 때 다량의 사람 인터페론-베타 단백질을 얻기에는 가장 효율적이다. 그러나, 대장균에서 생성되어 나오는 사람 인터페론-베타 단백질은 아미노 말단에 메티오닌이 붙어서 나오기 때문에 정제과정에서 이를 제거하여야 한다. 이로 인해 정제 과정에서 수율의 감소 및 정제공정의 추가로 인한 시간의 증가를 초래한다.
따라서, 아미노 말단의 메티오닌을 효율적으로 제거하여 대장균으로부터 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 인터페론-베타 단백질을 간편하면서 신속하게 대량 생산할 수 있는 방법에 대한 연구가 필요한 실정이다.
본 발명자들은 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 대량 생산할 수 있는 방법에 대해 연구하던 중, 재조합 사람 변이 인터페론-베타(rHu IFN-βSer17, IFN-β 1b) 유전자를 pET21a(+) 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하고, 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 pSTV29 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조한 후, 이 두 재조합 발현벡터를 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시켜 재조합 대장균을 제조하였으며, 이 재조합 대장균을 배양한 후 발현된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질에서 아미노 말단의 메티오닌이 제거되었음을 확인하고, 본 발명을 완성하였다.
본 발명은 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균 및 이의 제조방법을 제공하고자 한다.
또한, 본 발명은 상기 재조합 대장균으로부터 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 생산방법을 제공하고자 한다.
도 1은 사람 변이 인터페론-베타 유전자(rHu IFN-βSer17, IFN-β 1b)의 염기서열 및 아미노산 염기서열을 나타낸 도이다.
도 2는 메티오닌 아미노펩티다제 유전자의 염기서열 및 아미노산 염기서열을 나타낸 도이다.
도 3은 사람 T 림프구 cDNA library에서 PCR에 의해 증폭된 사람 인터페론-베타 유전자를 17번째 아미노산이 세린이 되도록 변이시킨 후, 발현 벡터인 pET21a(+)에 삽입시킨 재조합 발현 벡터 pET21a(+)IFN-βSer17의 제작 과정을 나타낸 모식도이다.
도 4는 PCR에 의해 증폭된 사람 인터페론-베타 유전자의 단편을 확인하기 위하여 1% 아가로오스 겔 전기영동을 수행한 결과를 나타낸 겔 사진이다(레인 M: 1kb Plus DNA ladder(인비트로젠사), 레인 1: 증폭된 사람 인터페론-베타 유전자).
도 5는 PCR에 의해 증폭된 사람 변이 인터페론-베타 유전자의 단편을 확인하기 위하여 1% 아가로오스 겔 전기영동을 수행한 결과를 나타내는 겔 사진이다(레인 M: 1kb Plus DNA ladder(인비트로젠사), 레인 1: 증폭된 사람 변이 인터페론-베타 유전자).
도 6는 PCR에 의해 증폭된 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 재조합 발현 벡터와 공존할 수 있는 pSTV29 벡터에 삽입시켜 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제작하는 과정을 나타낸 모식도이다.
도 7은 PCR에 의해 증폭된 메티오닌 아미노펩티다제 유전자의 단편을 확인하기 위하여 1% 아가로오스 겔 전기영동을 수행한 결과를 나타낸 겔 사진이다(레인 M: 1kb Plus DNA ladder(인비트로젠사), 레인 1: 증폭된 메티오닌 아미노펩티다제 유전자).
도 8은 재조합 발현 벡터인 pET21a(+)IFN-βSer17과 pSTV29Map을 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시켜, 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 둘 벡터 시스템(Two Vector System)이 구축된 미생물의 제작과정을 나타낸 모식도이다.
도 9는 재조합 발현 벡터인 pET21a(+)IFN-βSer17와 pSTV29Map가 하나의 대장균에 형질전환 되었음을 확인하기 위해, 형질전환된 대장균으로부터 플라스미드를 추출하여 제한효소 BamHⅠ으로 절단 후, 1% 아가로오스 겔에 전기영동한 결과를 나타낸 도이다(레인 M: 1kb DNA ladder(인트론 바이오, 한국), 레인 1: 형질전환된 대장균으로부터 플라스미드를 추출하여 BamHⅠ으로 절단한 벡터).
도 10은 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질에 대한 전기영동(SDS-PAGE: Sodium dodecyl sulfate-Polyacrylamide gel electrophoresis) 및 웨스턴 블럿(Western blot) 결과를 나타낸 사진이다(레인 M: SeeBlue® Plus2 Pre-Stained Standard(인비트로젠사), 레인 1: 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질).
도 11은 도 10의 단백질 전기영동법에 의한 겔 결과를 코아바이오사(한국)의 겔 이미지 분석 시스템(i-MAXTM Gel Image Analysis System)으로 촬영 후, 알파 인노테크사(Alpha Innotech Corporation)의 알파이지 소프트웨어(AlphaEaseFCTM Software, version 4.0.0)를 이용하여 분자량을 계산한 결과를 나타낸 도이다(레인 M: SeeBlue® Plus2 Pre-Stained Standard(인비트로젠사), 레인 1: 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질).
도 12 내지 도 14는 둘 벡터 시스템이 구축된 재조합 미생물로부터 발현된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질에서 아미노 말단의 메티오닌이 제거되었음을 확인하기 위해, 한국기초과학지원연구원에 N-말단 아미노산 염기서열 확인 시험(N-terminal Sequencing)을 의뢰한 결과를 나타낸 도이다.
본 발명은 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균(KCTC 11495BP)을 제공한다.
또한, 본 발명은
1) 재조합 사람 변이 인터페론-베타(rHu IFN-βSer17, IFN-β 1b) 유전자를 pET21a(+) 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하는 단계,
2) 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 pSTV29 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조하는 단계, 및
3) 상기 1)단계에서 제조한 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17과 상기 2)단계에서 제조한 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시켜 재조합 대장균(E.coli BL21(DE3)/pET21a+ pSTV29-; KCTC 11495BP)을 제조하는 단계를 포함하는, 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균의 제조방법을 제공한다.
또한, 본 발명은 형질전환된 대장균(KCTC 11495BP)을 배양하여 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 발현시킨 후, 이를 수집 및 정제하여 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 방법을 제공한다.
이하, 본 발명에 대해 상세히 설명한다.
본 발명의 재조합 대장균은 재조합 사람 변이 인터페론-베타(rHu IFN-βSer17, IFN-β 1b) 유전자를 pET21a(+) 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하고, 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 pSTV29 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조한 후, 이 두 재조합 발현벡터를 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시킨 것을 특징으로 한다.
본 발명의 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균의 제조방법을 단계별로 상세히 설명하면 다음과 같다.
본 발명의 재조합 대장균의 제조방법에서 상기 1)단계는 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하는 단계이다. 먼저, 사람 T 림프구 cDNA library를 주형으로 하고 프라이머쌍(서열번호 1 및 2)을 이용하여 DNA 중합효소 연쇄반응을 수행하여 사람 인터페론-베타 유전자를 증폭시킨다. 증폭된 사람 인터페론-베타 유전자와 pUC118 벡터를 제한효소인 EcoRⅠ으로 절단하여 재분리 및 정제한 후 혼합한다. 이 혼합물에 T4 DNA 리가아제를 첨가하고, 16℃에서 4시간 동안 반응시킨다. 이 혼합물을 하나한(Hanahan)법에 서술된 열 충격(Heat shock) 방법으로 대장균 (DH5α)에 형질전환시켜 발현벡터 pUC118IFN-β를 제조한다. 이 증폭된 유전자의 아미노산 중 17번째 아미노산을 세린으로 변이시켜 발현벡터 pUC118IFN-βSer17를 제조한 후, 이를 pET21a(+) 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조한다.
상기 pET21a(+) 벡터는 T7 프로모터 직후에 lac 오퍼레이터 서열을 삽입하고 lacⅠ 유전자에 의해 목적 단백질의 발현을 제어함으로써 플라스미드의 안정성을 유지하고, 또한 lac 조절인자를 과잉 생산함으로써 lacUV 프로모터 조절하의 T7 RNA 합성효소의 발현을 억제하게 된다. 이 벡터의 복합 클로닝 부위(MCS)에 재조합 사람 변이 인터페론-베타 유전자를 삽입함으로써 손쉽게 단백질의 발현을 조절할 수 있다.
본 발명의 재조합 대장균의 제조방법에서 상기 2)단계는 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조하는 단계이다. 대장균 K12를 주형으로 하여 프라이머쌍(서열번호 7 및 8)을 이용하여 DNA 중합효소 연쇄반응을 수행하여 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 증폭시킨다. 증폭된 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 pSTV29 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조한다.
상기 pSTV29는 pACYC184의 복제기점을 갖고 있기 때문에 pUC, pBR 등의 플라스미드 벡터와 공존이 가능하고, Tn9의 클로람페니콜 내성 유전자를 가지고 있어, pET21a(+) 벡터와도 항생제 내성에 따른 구별을 할 수 있다. pSTV29 벡터의 복합 클로닝 부위(MCS)에 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 삽입함으로써 lac 프로모터를 이용한 발현을 조절할 수 있다.
본 발명의 재조합 대장균의 제조방법에서 상기 3)단계는 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17과 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시켜 재조합 대장균(E.coli BL21(DE3)/pET21a+ pSTV29-; KCTC 11495BP)을 제조하는 단계이다.
pET21a(+) 벡터 내에 있는 pBR322 오리진은 pUC, pBR 등의 플라스미드와 공존할 수 있는 pSTV29 벡터를 넣을 수 있어 하나의 대장균 내에 두 개의 플라스미드가 공존할 수 있는 둘 벡터 시스템(Two Vector System)을 구축할 수 있게 한다. 따라서, pET21a(+) 벡터에 재조합 사람 변이 인터페론-베타 유전자를 삽입하고, pSTV29 벡터에 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 삽입함으로써 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 메티오닌 제거가 가능한 것으로 생각된다.
상기 방법에 의해 제조된 형질전환된 대장균(KCTC 11495BP)을 엠피실린과 클로람테니콜을 포함한 LB 배지에 접종하여 37℃에서 진탕배양한다. 배양액의 OD600 값이 0.4~0.6이 되었을 때, IPTG를 첨가하여 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 발현시킨다. 이를 수집 및 정제하여 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 대량 생산한다.
본 발명에 따른 재조합 대장균의 제조방법은, 세포 내에서 단백질이 합성되어 생산되는 과정 중에 아미노 말단의 메티오닌이 제거되도록 하여 정제 과정에서 메티오닌을 따로 제거해 주는 공정 없이 단백질을 정제할 수 있으므로 공정의 단계를 줄여 재조합 단백질을 간편하고 신속하게 대량생산할 수 있으며, 수율을 높일 수 있다. 또한, 본 발명에 따른 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질은 체내투여를 목적으로 하는 치료제용 재조합 단백질에 적합하다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 국한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1 : 재조합 사람 변이 인터페론-베타 발현벡터(pET21a(+)IFN-βSer17)의 제작
1-1. 재조합 발현벡터 pUC118IFN-β의 제조
사람 인터페론-베타 유전자를 확보하기 위하여, 표 1에 기재된 바와 같이 프라이머의 서열 내에 EcoRⅠ의 제한효소 자리가 존재하도록 제작하였다. 제작된 2개의 프라이머의 염기서열을 서열번호 1과 서열번호 2로 각각 기재하였다. 이때 각 프라이머는 제노텍사(한국)에 의뢰하여 합성하였다. 사람 인터페론-베타 유전자를 얻기 위하여 클론텍사의 사람 T-림프구 cDNA library를 주형으로 하여 DNA 중합효소 연쇄반응을 수행하였다.
표 1
. 염기서열
프라이머 1 (서열번호 1) 5'-GAA GAA TTC ATG AGC TAC-3' EcoRⅠ
프라이머 2 (서열번호 2) 5'-TTC GAA TTC TCA GTT TCG GAG-3' EcoRⅠ
DNA 중합효소 연쇄반응은 주형 DNA 100ng, 100pmole 프라이머 1 및 프라이머 2, 최종농도 각각 2mM의 dNTP 혼합물(TaKaRa), 10X Pfu 완충용액 10uL, Pfu 중합효소(Stratagene) 1uL를 포함하는 총 부피 100uL의 PCR 반응 혼합물을 이용하여 수행하였다. 중합효소 연쇄반응은 94℃에서 30초; 55℃에서 30초; 72℃에서 30초를 한 주기로 하여 25회 반복 수행하였다. 이후, 1% 아가로오스 겔 전기영동을 수행하여 증폭된 PCR 산물을 확인하였다. 결과는 도 4에 나타내었다. 이후, QIA퀵 겔 추출 킷(QIAquick Gel Extraction Kit, QIAGEN)을 이용하여 겔로부터 사람 인터페론-베타 유전자를 분리하고, 정제하였다.
타카라사의 pUC118 벡터와 DNA 중합효소 연쇄반응으로 얻은 PCR 산물인 사람 인터페론-베타 유전자를 뉴잉글랜드 바이오랩사(NEB)의 제한효소인 EcoRⅠ으로 절단하여 재분리 및 정제하였다. 정제된 DNA 절편과 pUC118 벡터를 잘 혼합한 다음, T4 DNA 리가아제를 첨가하고, 16℃에서 4시간 동안 반응시켰다. 이 혼합물을 하나한법에 서술된 열 충격 방법으로 대장균(DH5α)에 형질전환시켜 발현벡터 pUC118IFN-β를 제조하였다. 솔젠트사(한국)의 플라스미드 정제 키트를 이용하여 형질전환된 미생물로부터 재조합 발현벡터 pUC118IFN-β를 얻었다.
1-2. 재조합 발현벡터 pUC118IFN-βSer17의 제조
클로닝한 사람 인터페론-베타 유전자의 아미노산 중 17번째 시스테인을 세린으로 바꾸기 위하여 돌연변이생성(mutagenesis)을 실시하였다. 이를 위해 표 2에 기재된 바와 같이, 프라이머 서열의 N 말단에 인산기를 붙여 제작하였다. 제작된 2개의 프라이머의 염기서열을 서열번호 3과 서열번호 4로 각각 기재하였다. 이때 각 프라이머는 제노텍사(한국)에 의뢰하여 합성하였다. 사람 인터페론-베타 유전자를 함유하는 pUC118을 주형으로 하여 DNA 중합효소 연쇄반응을 수행하였다.
표 2
. 염기서열
프라이머 3 (서열번호 3) 5'-ⓟ-AGA AGC AGC AAT TTT CAG AGT CAG AAG-3'
프라이머 4 (서열번호 4) 5'-ⓟ-TTG CCA CAG GAG CTT CTG ACT CTG-3'
DNA 중합효소 연쇄반응은 주형 DNA 100ng, 100pmole 프라이머 3 및 프라이머 4, 최종농도 각각 2mM의 dNTP 혼합물(TaKaRa), 10X Pfu 완충용액 10uL, Pfu 중합효소(Stratagene) 1uL를 포함하는 총 부피 100uL의 PCR 반응 혼합물을 이용하여 수행하였다. 중합효소 연쇄반응은 94℃에서 30초; 55℃에서 1분; 68℃에서 8분을 한 주기로 하여 14회 반복 수행하였다. 이후, 뉴잉글랜드 바이오랩사(NEB)의 제한효소인 DpnⅠ으로 메틸기가 붙어있는 주형의 DNA들을 절단하여 재분리 및 정제하였다. 이 정제된 DNA를 하나한법에 서술된 열 충격 방법으로 대장균(DH5α)에 형질전환시켜 발현벡터 pUC118IFN-βSer17를 제조하였다. 솔젠트사(한국)의 플라스미드 정제 키트을 이용하여 형질전환된 미생물로부터 재조합 발현벡터 pUC118IFN-βSer17을 얻었다.
1-3. 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17의 제조
사람 변이 인터페론-베타 유전자를 클로닝하기 위하여, 표 3에 기재된 바와 같이 프라이머의 서열 내에 NdeⅠ과 BamHⅠ의 제한효소 자리가 존재하도록 제작하였다. 제작된 2개의 프라이머의 염기서열을 서열번호 5와 서열번호 6으로 각각 기재하였다. 이때 각 프라이머는 제노텍사(한국)에 의뢰하여 합성하였다.
표 3
. 염기서열
프라이머 5 (서열번호 5) 5'-ATA TAC ATA TGA GCT ACA ACT TG-3' NdeⅠ
프라이머 6 (서열번호 6) 5'-TTC GGA TCC TCA GTT TCG GAG-3' BamHⅠ
DNA 중합효소 연쇄반응은 주형 DNA 100ng, 100pmole 프라이머 5 및 프라이머 6, 최종농도 각각 2mM의 dNTP 혼합물(TaKaRa), 10X Pfu 완충용액 10uL, Pfu 중합효소(Stratagene) 1uL를 포함하는 총 부피 100uL의 PCR 반응 혼합물을 이용하여 수행하였다. 중합효소 연쇄반응은 94℃에서 30초; 55℃에서 30초; 72℃에서 30초를 한 주기로 하여 25회 반복 수행하였다. 이후, 1% 아가로오스 겔 전기영동을 수행하여 증폭된 PCR 산물을 확인하였다. 결과는 도 5에 나타내었다. 이후, QIA퀵 겔 추출 킷(QIAquick Gel Extraction Kit, QIAGEN)을 이용하여 겔로부터 사람 변이 인터페론-베타 유전자를 분리하고, 정제하였다.
노바젠사의 pET21a(+) 벡터와 DNA 중합효소 연쇄반응으로 얻은 PCR 산물인 사람 변이 인터페론-베타 유전자를 뉴잉글랜드 바이오랩사(NEB)의 제한효소인 NdeⅠ과 BamHⅠ으로 절단하여 재분리 및 정제하였다. 정제된 DNA 절편과 pET21a(+) 벡터를 잘 혼합한 다음, T4 DNA 리가아제를 첨가하고, 16℃에서 4시간 동안 반응시켰다. 이 혼합물을 하나한법에 서술된 열 충격 방법으로 대장균(DH5α)에 형질전환시켜 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하였다. QIAGEN사(독일)의 플라스미드 정제 킷을 이용하여 형질전환된 미생물로부터 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 얻었다. 재조합 발현 벡터 pET21a(+)IFN-βSer17의 제작 과정은 도 3에 나타내었다.
실시예 2 : 재조합 메티오닌 아미노펩티다제 발현벡터(pSTV29Map)의 제작
메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 클로닝하기 위하여, 표 4에 기재된 바와 같이 프라이머의 서열 내에 EcoRⅠ과 BamHⅠ의 제한효소 자리가 존재하도록 제작하였다. 제작된 2개의 프라이머의 염기서열을 서열번호 7과 서열번호 8로 각각 기재하였다. 이때 각 프라이머는 제노텍사(대전, 한국)에 의뢰하여 합성하였다. 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 얻기 위하여 대장균 K12를 주형으로 하여 DNA 중합효소 연쇄반응을 수행하였다.
표 4
. 염기서열
프라이머 7(서열번호 7) 5'-GGA ATT CAC GTA TCC CAT ATT ACC GAC CCC AAA GG-3' EcoRⅠ
프라이머 8(서열번호 8) 5'-CGG GAT CCA TCT TAT TCG TCG TGC GAG ATT ATC GC-3' BamHⅠ
DNA 중합효소 연쇄반응은 주형 DNA로 대장균 K12 콜로니, 100pmole 프라이머 7 및 프라이머 8, 최종농도 각각 2mM의 dNTP 혼합물(TaKaRa), 10X Taq 완충용액 10uL, Taq 중합효소(TaKaRa) 1uL를 포함하는 총 부피 100uL의 PCR 반응 혼합물을 이용하여 수행하였다. 중합효소 연쇄반응은 94℃에서 1분; 55℃에서 1분; 72℃에서 1분을 한 주기로 하여 25회 반복 수행하였다. 이후, 1% 아가로오스 겔 전기영동을 수행하여 증폭된 PCR 산물을 확인하였다. 결과는 도 7에 나타내었다. 이후, QIA퀵 겔 추출 킷(QIAquick Gel Extraction Kit, QIAGEN)을 이용하여 겔로부터 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 분리하고, 정제하였다.
타카라사(일본)의 pSTV29 벡터와 DNA 중합효소 연쇄반응으로 얻은 PCR 산물인 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 뉴잉글랜드 바이오랩사(NEB)의 제한효소인 EcoRⅠ과 BamHⅠ으로 절단하여 재분리 및 정제하였다. 정제된 DNA 절편과 pSTV29 벡터를 잘 혼합한 다음, T4 DNA 리가아제를 첨가하고, 16℃에서 4시간 동안 반응시켰다. 이 혼합물을 하나한법에 서술된 열 충격 방법으로 대장균(DH5α)에 형질전환시켜 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조하였다. QIAGEN사(독일)의 플라스미드 정제 킷을 이용하여 형질전환된 미생물로부터 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 얻었다.
재조합 발현벡터 pSTV29Map의 제작과정은 도 6에 나타내었다.
실시예 3 : 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균의 제조
상기 실시예 1과 2에서 제작한 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17와 pSTV29Map을 하나한 방법에 서술된 열 충격 방법으로 대장균(BL21 (DE3))에 형질전환시켰다. 형질전환된 재조합 대장균(E.coli BL21(DE3)/pET21a+ pSTV29-)을 2009년 4월 1일자로 국제기탁기관인 생명공학연구소 유전자원센터 유전자은행에 기탁하였다(KCTC 11495BP).
재조합 발현 벡터인 pET21a(+)IFN-βSer17과 pSTV29Map을 하나의 대장균에 형질전환하여, 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 둘 벡터 시스템이 구축된 미생물의 제작과정은 도 8에 나타내었다.
상기 형질전환된 재조합 대장균을 100㎍/mL 엠피실린과 6.8㎍/mL 클로람페니콜을 포함한 LB배지 5mL에 접종하여 배양한 후, QIAGEN사(독일)의 플라스미드 정제 킷을 이용하여 플라스미드를 정제하였다. 정제한 플라스미드를 뉴잉글랜드 바이오랩사(New England Biolabs Ins.)의 제한효소 BamHⅠ을 사용하여 37℃에서 한 시간 동안 절단한 후, 1% 아가로오스 겔에 전기영동 하였다. 전기영동 결과는 도 9에 나타내었다(레인 M: 1kb DNA ladder(인트론 바이오, 한국), 레인 1: 형질전환된 대장균으로부터 플라스미드를 추출하여 BamHⅠ으로 절단한 벡터).
도 9에 나타난 바와 같이, 아가로오스 겔의 레인 1에 두 개의 플라스미드가 있음을 확인하였다. 따라서, 재조합 발현 벡터인 pET21a(+)IFN-βSer17와 pSTV29Map가 하나의 대장균에 형질전환 되었음을 확인하였다.
실시예 4 : 재조합 대장균을 이용한 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 발현
상기 실시예 3에서 제조한 재조합 대장균(E.coli BL21(DE3)/pET21a+ pSTV29-; KCTC 11495BP)을 100㎍/mL 엠피실린과 6.8㎍/mL 클로람페니콜을 포함한 LB 배지 250 mL에 접종하여, 37℃ 진탕 배양기에서 배양하였다. 배양액의 OD600 값이 0.4~0.6이 되었을 때, IPTG(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside)를 첨가하여 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 발현을 유도시켰다. 이후, 4시간 정도 더 배양하여 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 발현을 진행시켰다.
실시예 5 : 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 확인
재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질이 발현된 균체를 나트륨 세척 용액으로 현탁한 다음, 세포 파쇄기(압력 방식)을 이용하여 파쇄하였다. 파쇄액으로부터 불용성 응집체(Inclusion body) 형태의 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 수거하고, 세척하였다. 세척한 불용성 응집체는 단백질로서 활성을 갖지 못하기 때문에 생물학적 활성을 가진 수용성 단백질로 전환시키기 위해 용해 용액을 사용하여 불용성 응집체 형태의 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 녹이고, 환원과정 및 산화과정을 통해 재폴딩(refolding)을 거친다. 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 분석하기 위해, 분자량 크기에 따라 분리하는 세파크릴 S200 크로마토그래피를 이용하여 정제하였다.
5-1. 웨스턴 블럿을 통한 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 확인
정제된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 인비트로젠사(Invitrogen)의 14% 트리스-글리신 겔에 전기영동을 실시하여 분자량을 확인하였다. 또한 R&D사의 사람 인터페론-베타 단일 항체(Monoclonal Anti-human IFN-β Antibody)를 이용하여 웨스턴 블럿을 실시하여 인터페론-베타 단백질의 유무를 확인하였다. 전기영동 및 웨스턴 블럿 결과는 도 10에 나타내었다.
5-2. 겔 이미지 분석 시스템을 통한 분자량 측정
정제된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 분자량을 좀더 세밀히 측정하기 위하여, 단백질 전기영동법에 의한 겔 결과를 코아바이오사(한국)의 겔 이미지 분석 시스템(i-MAXTM Gel Image Analysis System)으로 촬영 후, 알파 인노테크사(Alpha Innotech Corporation)의 알파이지 소프트웨어(AlphaEaseFCTM Software, version 4.0.0)를 이용하여 분자량을 계산하였다. 결과는 도 11에 나타내었다.
도 11에 나타난 바와 같이, 정제된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질의 분자량은 18.761 kDa 이었다. 이는 알려진 사람 인터페론-베타 단백질의 크기인 18.5(±1000) kDa과 비교하여 같음을 확인하였다.
5-3. 아미노 말단 염기서열 분석을 통한 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질에서 아미노 말단의 메티오닌 제거 확인
재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17과 pSTV29Map로 형질전환된 재조합 대장균으로부터 발현된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질에서 아미노 말단의 메티오닌이 제거되었는지를 확인하기 위하여, 정제된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 단백질 전기영동을 실시하고, 이를 PVDF 멤브레인에 옮겼다. 이 옮겨진 PVDF 멤브레인을 한국기초과학지원연구원 서울센터 메타볼롬분석 연구팀에 아미노 말단 염기서열분석(N-termianl Amino Acid Sequencing)을 의뢰하였다. 분석기기로는 Procise 491 HT protein sequencer(Applied Biosystems, USA)를 이용하였다.
결과는 도 12 내지 도 14에 나타내었다.
도 12 내지 도 14에 나타난 바와 같이, 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17과 pSTV29Map로 형질전환된 재조합 대장균으로부터 발현된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질에서 아미노 말단의 메티오닌이 제거되었음을 알 수 있었다.
본 발명에 따른 재조합 대장균의 제조방법은, 세포 내에서 단백질이 합성되어 생산되는 과정 중에 아미노 말단의 메티오닌이 제거되도록 하여 정제 과정에서 메티오닌을 따로 제거해 주는 공정 없이 단백질을 정제할 수 있으므로 공정의 단계를 줄여 재조합 단백질을 간편하고 신속하게 대량생산할 수 있으며, 수율을 높일 수 있다. 또한, 본 발명에 따른 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질은 체내투여를 목적으로 하는 치료제용 재조합 단백질에 적합하다.
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<160> 8
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 1 : EcoRI restriction site
<400> 1
gaagaattca tgagctac 18
<210> 2
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 2 : EcoRI restriction site
<400> 2
ttcgaattct cagtttcgga g 21
<210> 3
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 3 : phosphoric acid attached N-terminal
<400> 3
agaagcagca attttcagag tcagaag 27
<210> 4
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 4 : phosphoric acid attached N-terminal
<400> 4
ttgccacagg agcttctgac tctg 24
<210> 5
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 5 : NdeI restriction site
<400> 5
atatacatat gagctacaac ttg 23
<210> 6
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 6 : BamHI restriction site
<400> 6
ttcggatcct cagtttcgga g 21
<210> 7
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 7 : EcoRI restriction site
<400> 7
ggaattcacg tatcccatat taccgacccc aaagg 35
<210> 8
<211> 35
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> primer 8 : BamHI restriction site
<400> 8
cgggatccat cttattcgtc gtgcgagatt atcgc 35
[미생물 기탁증]
Figure PCTKR2009002835-appb-I000001

Claims (4)

  1. 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 재조합 대장균(KCTC 11495BP).
  2. 제 1항에 있어서, 상기 재조합 대장균은 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17과 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시킨 것을 특징으로 하는 재조합 대장균.
  3. 1) 재조합 사람 변이 인터페론-베타(rHu IFN-βSer17, IFN-β 1b) 유전자를 pET21a(+) 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17를 제조하는 단계,
    2) 메티오닌 아미노펩티다제 유전자를 pSTV29 벡터에 삽입하여 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 제조하는 단계, 및
    3) 상기 1)단계에서 제조한 재조합 발현벡터 pET21a(+)IFN-βSer17과 상기 2)단계에서 제조한 재조합 발현벡터 pSTV29Map을 하나의 대장균(BL21(DE3))에 형질전환시켜 재조합 대장균(E.coli BL21(DE3)/pET21a+ pSTV29-; KCTC 11495BP)을 제조하는 단계를 포함하는, 제 1항의 재조합 대장균의 제조방법.
  4. 제 3항에 의해 제조된 재조합 대장균(KCTC 11495BP)을 배양하여 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 발현시킨 후, 이를 수집 및 정제하여 아미노 말단의 메티오닌이 제거된 재조합 사람 변이 인터페론-베타 단백질을 생산하는 방법.
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