TWI275594B - Process for preparing vancomycin phosphonate derivatives - Google Patents
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Description
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相關申請案之交又參考 本申請案主張在顧年8月24曰提出申請之美國臨時申 请案第60/314,83 1號的利益,將其整個揭示文以其全文併 入本文以供參考。 發明背景 本發明的蓺圚 本發明係針對-種製備醣肽抗生素之衍生物的新顆方法 。更具體而言’本發明更係針對—種製備具有含胺基之側 鏈的醣肽抗生素之磷酸酯衍生物之多步驟法,在不分離中 間物反應產物之單一反應容器中進行前兩步驟。 背景 醣肽(例如,dalbaheptide)係一種熟知的抗生素種類,其 係以各種Μ生物生產(參考紐約公司以R納 加拉珍(Nagarajan)編輯之聽肽抗生素((Hyc〇peptide Antibiotics))。在此項技藝中也已知許多這些醣肽的合成 衍生物,並典型係提出這些衍生物具有比天然生成之醣肽 更改進的特性,包括增強之抗細菌活性。例如,在2〇〇1年 5月1曰提出申請的美國專利申請序號第〇9/847,〇42號說明 各種醣肽磷酸酯衍生物,部份包括含胺基之側鏈。以這些 每牛酉文S曰衍生物作為治療革蘭氏陽性感染的抗生素特別有用 〇 因此’對製備具有含胺基之側鏈的醣肽抗生素之磷酸酯 衍生物有用的新有效法仍有需求。 本發明的概述 -5-本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐) 1275594 五、發明説明( &本魚月係提供製備具有含胺基之侧鏈的醣欣抗生素之鱗 2酉曰何生物的新穎方法。其中的優點係在不分離中間物反 一 T進仃本發明的前兩步驟,因此與 先前的方法比較所產生的浪#爭,丨、、, 卞竹 幻,艮賈更;,並改進該方法的總效 率及產量。 在本發明的觀點中,本於明女、甘 ^ ^ + 尽I明尤其專注於製備式I化合物 或其鹽之方法: H3C,, ,Ν—CHj~R1—Ν'
3 H〇一 、〇H OH
II N—R4—P-OH OH 其中 R1係選自由Cm伸烷基 C2M伸缔基 及C2_1G伸炔基所構 -6 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐) 1275594 A7 B7
成的群組; ,2 R係選自由。,烷基、c2.2。烯基、C2-2。炔基、c3 8環烷 基、c5.8環烯基、c6.10芳基、c29雜芳基、環系、 -Ra-Cy1、-RW_Ar2、_Ra_Arl_Rb,Ar2、_Ra_Arl_〇 Rb士2 所構成的群組; R4係C^O伸烷基; C1^伸烯基及Cl_1()伸炔基所構
Ra係選自由ChM伸烷基 成的群組;
Rb係選自由Cw伸烷基、c 的群組; I-6伸烯基及Cl-0伸炔基所構成
Cy1係選自由c3:8環烷基、c5-8環烯基、C6,芳基、匕$ 雜务基、C2_9雜環系所構成的群組; Αι:1及Ar2係獨立選自CV1()芳基及c2-9雜芳基; 其中將每一個芳基、雜芳基及雜環系基視需要以丨至3個 獨立選自由Cw烷基、Ci_6烷氧基、鹵基、羥基、硝美及 三氟甲基所構成的群組之取代基取代,及每一個雜芳美及 雜環系基包括從1至3個選自氮、氧或硫之雜原子; 該方法包含: Ο)將萬古黴素或其鹽與式π化合物:
R1—N—R2 Π (其中R及R係如本文的定義;及R3係胺不穩定性保護 基)及還原劑反應,以形成式ΙΠ化合物或其鹽: 本紙張尺度適用中國國家鮮(CNS) M規格(21GX297公爱) 1275594 A7 B7
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HO H3C,J〜CHrR1—$
h3c,、〇/ •R2 OH '〇
OH .、、、 ΌΗ
(其中R1及R2係如本t沾〜装、^ t +文的疋義),其中步驟(a)及步驟(b) 係在相同的反應混合物中淮分 JU w T進仃,不分離來自步驟(a)之中 間物;及 (C)將式IV化合物與甲醛及式V化合物·· 0 H2N —R4—·ρ—〇Η
I V
OH 在鹼的存在下反應,以提供式][化合物或其鹽。 在以上的方法中,R1係以Cu伸烷基較佳。Rl係以C卜2 伸烷基更佳。R1係以_CH2-還更佳。 R2係以CV〗4烷基較佳。R2係以C8 U烷基更佳。R2係以正 -9 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 1275594 A7 ------- Β7 五、發明説明(6 ) 癸基還更佳。 在本發明的方法中,R3係胺基-保護基,將其以胺(即親 核胺)處理方式除去。R3係以式(A)之基較佳: W-OC(O)- (A) 其中W係選自由9-芴基甲基、3-茚基曱基、苯并[f]茚-3-基 甲基、17-四苯并[a,c,g,i]芴基甲基、2,7-二第三丁基[9-(ιο,ιο_二氧基_10,10,1010_四氫噻嘮烷基)]甲基、11_二氧 苯并[b]噻吩-2-基甲基,其中將9-芴基甲基視需要以1至3個 遥自由C i_6烧基、鹵基、硝基及石黃基所構成的群組取代。 W係以9-芴基甲基較佳,其中將9_芴基甲基視需要以1至 3個遠自由c i_6烧基、鹵基、确基及磧基所構成的群組取代 。W係以9_芴基甲基更佳。 R4係Cw伸烷基較佳。R4係Cl-4伸烷基更佳。R4係-CH2-還更佳。 在步驟(a)中,還原劑係以胺/甲硼烷複合物較佳。還原 劑係以吡啶/甲硼烷或第三丁胺/甲硼烷更佳,並且還原劑 係以第三丁胺/甲硼烷還更佳。 在本發明較佳的具體實施例中,步驟(a)包含步驟: (i) 將萬古黴素或其鹽與式II化合物在驗的存在下組合, 以形成反應混合物; (ii) 將來自步驟(i)之反應混合物以酸酸化;及 (iii) 將來自步驟(Π)之反應混合物與還原劑接觸。 在該較佳的具體實施例中,在步驟⑴中的鹼係以三級胺 較佳,鹼係以二異丙基乙胺更佳。 -10- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 1275594
在步驟(u)中使用的酸係以三氟醋酸或醋酸較佳。 f步驟(b)中,所使用的胺係以氫氧化銨或一級胺較佳 胺係以氫氧化銨、甲胺或第三丁胺更佳,並且胺係 三丁胺還更佳。 一在步驟(c)中,所使用的胺係以三級胺較佳。所使用的 一及胺係以一異丙基乙胺較佳。在較佳的具體實施例中, 三級胺對式v化合物之莫耳比係約3:1至約5:1,以約4:1更 佳。 本發明的詳細說明 本發明係關於製備具有含胺基之側鏈的醣肽磷酸酯衍生 物之新穎方法。在說明這些方法時,以下的術語具有以下 的意義,除非有其它另外的指示。 定義 “烷基”術語表示可以是直鏈或支鏈之單價飽和烴基。除 卜有/、匕另外的疋義,這些烧基典型係包括從^至個碳 原子。以貫例方式的代表性烷基包括例如甲基、乙基、正 丙基、異丙基、正丁基、第二丁基、異丁基、第三丁基、 正戊基正己基、正庚基、正辛基、正壬基、正癸基及類 似物。 “烯基”術語表示可以是直鏈或支鏈及具有至少一個(及 典型係1、2或3個)碳-碳雙鍵之單價不飽和烴基。除非有 ,、匕另外的疋義,這些烯基典型係包括從2至2〇個碳原子 以灵例方式的代表性烯基包括例如乙烯基、正丙烯基、 異丙烯基、正丁 ·2-烯基、正己基及類似物。 -11 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) χ 复) 1275594 A7
“炔基”術語表示可]^直鏈或支鏈及具有至少— 典型係1、2或3個)碳-碳參鍵之單價不飽和烴基。除 其它另外的定義,這些炔基典型係包括從2至2〇個碳原子 。以實例方式的代表性炔基包括例如乙炔基、〖丙炔基、 正丁-2-炔基、正己_3_炔基及類似物。 “伸烷基”術語表示可以是直鏈或支鏈之二價飽和烴基。 除非有其它另外的定義,這些伸烷基典型係包括從1至W 個碳原子。以實例方式的代表性伸烷基包括例如亞甲基、 乙烷-1,2-二基伸乙基,,)、丙烷β1,2_二基、丙烷·-二基 、丁烷-1,4·二基、戊烷二基及類似物。 伸稀基術語表示可以是直鏈或支鏈及具有至少一個(及 典型係1、2或3個)碳-碳雙鍵之二價不飽和烴基。除非有 其它另外的定義’這些伸烯基典型係包括從2至丨〇個碳原 子。以實例方式的代表性伸烯基包括乙烯_丨,2_二基、丙-1-烯-1,2-二基、丙-1·烯-ΐ,3-二基、丁-2-烯-1,4-二基及類 似物。 “伸炔基”術語表示可以是直鏈或支鏈及具有至少一個(及 典型係1、2或3個)碳-碳參鍵之二價不飽和烴基。除亦有 其它另外的定義,這些伸炔基典型係包括從2至1 0個碳原 子。以實例方式的代表性伸炔基包括乙炔-1,2-二基、丙-1-炔-1,2_ 二基、丙-1-炔-1,3_ 二基、丁-2-炔-1,4-二基及類 似物。 “烷氧基,,術語表示式-0-R之基,在此R係如本文定義之 烷基。以實例方式的代表性烷氧基包括甲氧基、乙氧基、 -12- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) Α4規格(210X 297公釐)
裝 訂
線 1275594 五 發明説明( 9 正:氧基、異丙氧基、正丁氧基、第二丁氧基 氧 、‘匕三丁氧基及類似物。 ,、丁乳基 單严方—基^语表示具有單環(即苯基)或稠合環(即萘基)之 :方矢烴。除非有其它另外的定義,這些芳基典型俜包 括從6至1 〇個破谔店2 i你匕 .„^ 1 # "衣原子。以貫例方式的代表性芳基包括苯 土 不、-土、奈-2-基及類似物。 基”術語表示單價飽和碳㈣烴基。除非有其它另 二的疋義,廷些環烷基典型係包括從3至1〇個碳原子。以 實例方式的代表性環烧基包括環丙基、環 環己基及類似物。 衣戍基 “環稀基,,術語表示在碳環系環中具有至少—個碳-碳雙 鍵之早價不飽和碳環系烴基。除非有其它另外的定義,这 =烯基典型係包括從5至10個碳原子。以實 代 :性環婦基包括環戊_3-稀小基、環己…基及類似 “齒基”術語表示氟基 '氯基1基及填基;以氯基、漠 基及埃基較佳。 、 “雜芳基”術語表示具有單環或兩個稍合環及包括在環中 至少-個選自II、氧或硫之雜原子(典型係U 3個雜原子) 之單價芳族基。除非有其它另外的定義,這些雜芳基典型 係包括從5至10個總環原子。以實例方式的代表性雜芳基 包括吡咯、咪唑、噻唑、嘮唑、呋喃、噻吩、三唑、吡唑 、異噚唑、異噻唑、吡啶、吡嗪、噠嗪、嘧啶、三嗪"引 嗓、苯并。夫喃、苯并嗟吩、苯并㈣、苯并料”奎琳、 -13- 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公羡) 1275594 A7
異喳啉、喹嗤啉、異崎啉及類似物之單價種類,在此附著 點係在任何有效的碳或氮環原子上。
裝 “雜環,,或“雜環系,,術語表*具有單環或多濃縮環及包括 在環中至少一個選自氮、氧或硫之雜原子(典型係丨至3個 雜原子)之單價飽和或不飽和(非芳族)基。除非有其它另外 的定義,這些雜環系基典型係包括從2至9個總環原子。以 實例方式的代表性雜環系基包括吡咯啶、咪唑啶、吡唑啶 、哌啶、1,4-二嘮烷、嗎啉、硫代嗎啉、六氫吡畊、3_吡 咯啉及類似物之單價種類,在此附著點係在任何有效的碳 或鼠環原子上。 在本文以此項技藝認知的方式使用的‘‘萬古黴素”術語表 示已知係萬古彳放素之醣肽抗生素。參考例如Dekker 公司以R·納加拉珍(Nagarajan)編輯之醣肽抗生素
(GlyCOpeptide Antibi〇tiCS)(1994年)及在本文引證參考。以 N -命名表示在萬古黴素的萬古胺氮上的取代作用。也 將該位置稱為萬古黴素之N3 ’’位置。此外,使用熟知的萬 古黴素編號系統,以“29-,,命名表示介於兩個在胺基酸7 (AA-7)的苯基環上的羥基之間的碳原子位置。有時也將該 位置稱為萬古黴素之“7d”或“間苯二酚位置”。 在與本文提及的化合物連結使用時的“鹽”術語表示自無 機或有機鹼或自無機或有機酸衍生之化合物的鹽。自無機 驗衍生之鹽類包括鋁、銨、鈣、銅、三價鐵、二價鐵、鋰 、鎂、三價猛、二價錳、鉀、鈉、鋅及類似物。以銨、鈣 、鎂、钟及納鹽特別佳。自有機驗衍生之鹽類包括一級、 -14- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐) 1275594 A7 _B7 五、發明説明(11 ) 二級及三級胺之鹽類,包括取代之胺、環系胺、天然生成 的胺及類似物,如精胺酸、甜菜驗、咖啡因、膽驗、 N,N’-二苄基乙撐二胺、二乙胺、2-二乙胺基乙醇、2-二曱 胺基乙醇、乙醇胺、乙撐二胺、N-乙基嗎啉、N-乙基哌啶 、甲葡胺、葡糖胺、組胺酸、哈胺(hydrabamine)、異丙胺 、賴胺酸、甲基甲葡胺、嗎啉、六氫吡畊、piperadine、 多胺樹脂、普魯因 '嘌吟、可可驗、三乙胺、三甲胺、.三 丙胺、胺基丁二醇及類似物。自酸驗衍生之鹽類包括醋酸 、抗壞血酸、苯磺酸、苯甲酸、樟腦磺酸、檸檬酸、乙烧 石黃酸、富馬酸、葡糖酸、glucoronic、谷胺酸、馬尿酸、’ 氫溴酸、氫氣酸、羥乙磺酸、乳酸、乳糖醛酸、馬來酸、 蘋果酸、扁桃酸、甲烷磺酸、黏酸、萘磺酸、煙酸、硝酸 、雙羥萘酸、泛酸、磷酸、丁二酸、硫酸、酒石酸、對· 甲苯磺酸及類似物。以擰檬酸、氫溴酸、氫氯酸、馬來酸 、磷酸、硫酸及酒石酸特別佳。 “保護基’’或“封閉基”術語表示以在以共價附著於如胺基 、經基、硫赶基、敌基、羰基及類似物之類的官能基時的 基避免官能基進行非預期反應,但是其允許官能基在以適 合的試劑處理保護基時再生(即去保護或去封閉)。例如, 在紐约 John Wiley and Sons 之T. W·葛林(Greene)及p G M 烏兹(Wuts)的第三版“Protective Gr〇ups in 〇职*々義仏,·, (1999年)中揭示代表性保護基。 胺不%疋性保護基”術語表示在以適合的胺處理時除去 的保護基。 μ -15-
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本方法的彳 以萬古黴素或其鹽開始的三步驟進行本發明的方法。本 方法,的第一個步驟係還原烷基化步驟,其包含先將丨當量 萬古黴素或其鹽與1或更多當量之式II之駿組合: Η
R1—N—R2 Π (其中R1、R2及R3係如本文的定義)’當場形成亞胺及 胺中間物。 在此項技藝中熟知在本發明的方法中使用的式j〗之醛, 其或是市場商品,或可以使用市售原料及熟知的試劑以孰 知的步驟製備。例如,參考在2000年7月6日發表的w〇 00/39156,其說明各種製備這些醛之方法。 典型係將萬古黴素或其鹽與醛在惰性稀釋劑中以過量適 合的鹼存在下組合,以形成反應混合物。惰性稀釋劑係以 N,N-二乙基甲醯胺、N,N二甲基乙醯胺、冰甲基環吡啶酮 、乙腈/水及類似物或彼之混合物較佳。以使用從約丨至約 2當量醛較佳,以約u至約當量更佳。在該反應混合物 中,咸信在醛與萬古黴素之基本氮原子(即萬古胺氮原子 及N-末端(π胺酸基)氮原子)之間形成亞胺及/或半胺之混 合物。 胺及/或半胺中間物的形成作用典型係在從約ot:至約 75C為範圍之溫度下(以室溫較佳,即約2〇-25。〇)進行約i 至約24小時(以約6至12小時較佳),或直到幾乎完成胺及/ 或半胺的形成作用為止。 -16- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐) 1275594 A7 B7
五、發明説明( 可以使用任何適合的鹼中和萬古黴素鹽及加速胺及/或 半胺的形成作用’其包括有機驗(如胺、驗金屬羧酸酯鹽 (即醋酸納及類似物))及無機驗(如驗金屬破酸鹽(即碳酸叙 、碳酸鉀及類似物))。鹼係以三級胺較佳,其包括以例證 方式的三乙胺、二異丙基乙胺、N_甲基嗎啉及類似物。較 佳的鹼係二異丙基乙胺。典型係使用相對於萬古黴素過量 的鹼莫耳量。以使用以萬古黴素為基準計從約i ·5至約3當 1為範圍之驗量較佳,以約1 · 8至2 · 2當量更佳。 在幾乎完成胺及/或半胺的形成作用時,則將反應混合 物以過量的酸酸化。可以使用任何適合的酸,其包括以例 證方式的羧酸(例如,醋酸、三氯醋酸、檸檬酸、曱酸、 三氟醋酸、甲烷磺酸、甲苯磺酸及類似物)、無機酸(例如 ’氫氯酸、硫酸或磷酸)及類似物。酸係以三氟醋酸或醋 酸較佳。典型係加入相對於萬古黴素(及鹼)過量的酸莫耳 里。以使用以萬古黴素為基準計從約3至約6當量為範圍之 酸量較佳,以約3.5至5.5當量更佳。 雖然不想以理論限制,但是咸信酸以選擇性水解在萬古 徽素之Ν-末端胺上形成的亞胺及/或半胺,以偏向在萬古 私氮原子上开^成的亞胺及/或半胺。反應混合物的酸化作 用典型係在從約〇 °c至約3 0 °c為範圍之溫度下(以約2 5 °c較 佳)進行約0.25至約2.0小時(以約〇·5至約小時較佳)。以 在該步驟期間加入極性質子溶劑較佳,其包括以實例方式 的甲醇、乙醇、丙醇、異丙醇、丁醇、乙二醇及類似物。 或者可以使用混合的極性質子/非質子溶劑,如甲醇/四氫 -17- 本紙張尺度適财® ®轉準(CNS) A4規格(21GX297公I) 1275594 A7 B7 五、發明説明( 呋喃、甲醇/1,2-二甲氧基乙烷及類似物。 在酸化之後,將反應混合物與還原劑接觸,以還原亞胺 及/或半胺。可以使用任何與在醣肽中存在的官能性相容 的適合的還原劑。例如,適合的還原劑包括硼氫化鈉、氰 基硼氫化鈉、硼氫化鋅、三乙醯氧基硼氫化鈉、吡啶/甲 硼烷、第三丁胺/曱硼烷、N-甲基嗎啉/甲硼烷、氨/甲硼烷 、二甲胺/甲硼烷、三乙胺/甲硼烷、三甲胺/甲硼烷及類似 物。較佳的還原劑係胺/甲硼烷複合物,如吡啶/甲爛烧及 第三丁胺/甲硼烷。 該反應的還原相典型係在從約〇°c至約3〇°c為範圍之溫 度下(以約25 °C較佳)進行約〇·5至約24小時(以約1至約6小 時較佳)’或直到幾乎完成還原作用為止。在該還原步驟 期間有極性質子溶劑的存在較佳。以在上述的酸化期間加 入極性質子溶劑較佳。 與先前的步驟比較,不將還原烷基化法的產物分離,但 是將反應混合物與胺接觸,以除去中間產物的保護基(即 R3)。可在本方法的該步驟中使用任何適合的胺。適用的 代表性胺包括以實例方式的甲胺、乙胺、第三丁胺、三乙 胺、哌啶、嗎啉、氫氧化銨、:1,4_二氮雜雙環[2·2·2]辛烷 (DABCO)及類似物。較佳的胺係曱胺、第三丁胺、氫氧化 銨及1,4-二氮雜雙環[2.2.2]辛烷。 該去保護步驟典型係在從約〇t:至約6〇t為範圍之溫度 下(以約40°C至約45°C較佳)進行約2至約60小時(以約3至約 10小時較佳)’或直到反應幾乎完成。該步驟典型係在惰 -18- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X 297公釐) 1275594 A7 _ B7 五、發明説明^15 ^ " --- 性稀釋劑中進行,如N,N-二甲基曱醯胺、二甲基乙酿 胺、N-甲基環吡啶酮及類似物。可以熟知的步驟輕易分離 及純化生成之式IV化合物。 在本發明以下的步驟中,將式IV化合物與曱醛及式▽化 合物: 0 …'
HA—R4—P-OH V
I
OH (其中R4係如本文的定義)在鹼的存在下反應,以提供式I 化合物或其鹽。 典型係以1當量式IV化合物或其鹽與1或更多當量之式V 化合物(以約2至約10當量較佳)及過量的醛(以約4至約5當 量較佳)在鹼的存在下接觸,以進行本方法的該步驟。 式V之磷酸酯化合物係或市售商品,或可以使用市售原 料及試劑以熟知的步驟製備。參考例如紐約j〇hn Wiley & Sons第四版的 jerry March 之 Advanced Organic Chemistry (1992年),第 959頁;及紐約 j〇hn wiley & Sons 第 1·4 冊的 法蘭克(Ft*ank) R.哈特雷(Hartley)編輯之 The Chemistry of Organophosphorous Compounds (1996年)。胺基甲基磷酸 係威斯康辛州米爾瓦基(Milwaukee)之Aldrich Chemical Company的市售商品〇 典型係將在本方法的該步驟中使用的甲酸以水溶液加入 ,例如,成為在視需要包括約5至約1 5重量%之甲醇的水 中的37%溶液(即福馬林)。 -19- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公爱) 1275594 A7 ______ B7 五、發明説明(16 ) 一可在該反應中使用任何適合的驗,其包括例如有機驗(如 三級胺)及無機鹼(如鹼金屬氫氧化物(即氫氧化鈉)。鹼係 以三級胺較佳,其包括以實例方式的三乙胺、二異丙基乙 胺及類似物。較佳的三級胺係二異丙基乙胺。三級胺對化 合物V之莫耳比係以約3 :丨至約5 :丨較佳,以約3 5 :丨至約 4.5.1更佳,亚以約4:1還更佳。反應混合物之?11係以約1〇 至約11較佳。 該反應以在惰性稀釋劑中進行較佳,如水、乙腈/水及 類似物。在較佳的具體實施例中,本方法的該步驟係在具 有從約3 :2至全是水為範圍之體積/體積比之乙腈/水或水中 進行。 本方法的該步驟典型係在從約_2〇至約2〇它為範圍之 溫度下(以約_1〇。(:至約·5^較佳)進行約6至約48小時,或 直到反應幾乎完成為止。 以熟知的步驟分離生成之式Ϊ化合物或其鹽,包括以沉 澱、過濾及類似作用。在較佳的分離步驟中,將反應混合 物之pH以加入適合的酸(如水性氫氣酸)調整成約2至約3。 將酸化期間的反應混合物溫度以維持在小於約5它較佳。 接著加入乙腈,以促進反應產物(即式I化合物)的沉澱作用 ,並以過濾收集生成之沉澱物及視需要將其以另外的乙腈 清洗。 若必要,可以使用反相HPLC或其它色層分離法進一步 純化反應產物。在較佳的具體實施例中,使用如在與本文 同一天提出申請的共同審理之美國專利申請序號第 -20 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐) 1275594 A7 B7 五、發明説明( -號(代理人待審案件第)說明的樹 脂純化產物’ I亥申請案主張在2〇〇1年8月24日提出申請之 美國臨時中請案第60/314,712號的利&,將該揭示文以其 全文併入本文以供參考。 其中的優點係以本發明的方法提供改進的產量、純度及 選擇性,即在萬古胺胺基上的還原烷基化作用以至少ι〇:ι (以20.1較佳)的優勢超越在N-末端上(例如,亮胺酸基)的 還原烷基化作用。此外,因為還原烷基化及去保護步驟係 在不分離反應中間物的單一反應容器中進行,故使本發明 的方法更有效,提供比先前的方法更高的產量及產生的浪 費更少。 以本發明的方法產製的醣肽衍生物用作抗生素。參考例 如在2001年5月1日提出申請的美國專利申請序號第 09/847,042號;將該揭示文以其全文併入本文以供參考。 以提供例證本發明的以下實例說明本發明的方法另外的 細節’並不是以任何方式將以下的實例解釋成對本發明範 圍的限制。 實例 在以下的實例中,以下的縮寫具有以下的意義。任何未 定義的縮寫具有彼等一般所公認的意義。除非有其它另外 的說明,否則所有的溫度係以攝氏度數fC )計。 DIPEA = 二異丙基乙胺 DMF = N,N-二甲基甲醯胺 DMSO = 二甲基亞颯 -21 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(21〇χ297公釐)
裝 訂
線 A7 B7 1275594 五、發明説明(18 ) eq. = 當量 Fmoc =9-苟基甲氧基羰基 TFA = 三氟醋酸 在以下的實例中,萬古黴素氫氯酸鹽半水合物係購自 Alpharma, Inc. Fort Lee, NJ 07024 (Alpharma AS5 Oslo Norway)。其它的試劑及反應物可取自威斯康辛州米爾瓦 基 WI 53201 之 Aldrich Chemical Co.。
實例A N-Fmoc·癸胺基乙醛之製備作用。 步驟A - N_Fmoc_2-(正癸胺基)乙醇之製備作用 將2-(正癸胺基)乙醇(2.3公克,11亳莫耳,υ當量)及 DIPEA (2.0毫升,11毫莫耳,1.1當量)溶解在二氣甲烧(15 毫升)中及在冰浴中冷卻。加入在二氧甲烷(15毫升)中的氯 基甲酸9 -芴基甲酯(2.6公克,10亳莫耳,1 ·〇當量),將混 合物攪拌30分鐘,接著以3當量氫氯酸(50毫升)清洗兩次 及以飽和碳酸氫納(50毫升)清洗。將有機物經硫酸鎖乾燥 及在減壓下除去溶劑。使用未進一步純化之N-Fmoc-2_(正 癸胺基)乙醇(4.6公克,11毫莫耳,108%)。 步驟B _ Ν-Fmoc·2-(正癸胺基)乙醛之製備作用 將在二氯曱烷(25毫升)中的DMSO (14.75公克)在-3 5至 -4 5 °C下經20分鐘加入草醯氯(12.24亳升)及二氯甲烧(5〇毫 升)之溶液中。將反應混合物在-3 5至-45°C下攪拌10分鐘。 經25分鐘加入在二氯甲烷(70毫升)中的N-Fmoc-2-(正癸胺 基)乙醇(20.0公克)之溶液及接著在-35至-45。(:下攪拌40分 -22- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 裝 訂
線 1275594 A7 B7 五、發明説明( 鐘。接著加入三乙胺(2 1.49公克)及將混合物在-10至-20 °C 下攪拌30分鐘。將反應混合物以水(120毫升)及接著以濃 縮硫酸(20.0公克)中止,同時將内溫維持在0-5°C。將有機 層分離,並以2%硫酸(100毫升)及接著以水(2x100亳升)清 洗。將有機溶液在60°C之真空下蒸餾成約100毫升。加入 庚烷(100毫升),將油浴溫度上升至80°C,並持續蒸顧, 直到具有100毫升的殘餘體積為止。再加入庚烧(1〇〇毫升) ,並重複蒸餾至體積約100毫升。以15t的冷水浴代替加 熱浴。將浴經2 0分鐘緩慢冷卻至5 °C,產物開始沉殿。接 著將泥漿冷卻至-5至-10°C及將泥漿攪拌2小時。接著在究 漏斗上收集固體及以冷(-5°C )庚烷(2χ 15毫升)清洗。在真 空中乾燥濕固體,以產生醛。 實例1 訂
線
Nvan-2-(正癸胺基)乙基萬古擻素氩氣酸鹽之製備作用 將130亳升N,N-二甲基甲醯胺及4.7毫升(26.92毫莫耳) N,N-二異丙基乙胺加入20公克(13.46亳莫耳)萬古黴素氫氣 酸鹽與6.526公克(15·48毫莫耳)N-Fm〇c_2-(正癸胺基)乙酸 之攪拌混合物中。將所得混合物在室溫的氮氣下攪拌丨5小 時,並在0°C下連續加入75毫升甲醇及4·15毫升三氟醋酸 (5 3 · 8 4晕莫耳)。將混合物擾拌1小時,並加入1 · 9 3毫升 (15.48毫莫耳)甲硼烷·吡啶複合物。將所得混合物在下 攪拌4小時,並加入在甲醇中的8〇毫升(161·52亳莫耳^之〕 克分子置甲胺。將所得混合物溫熱至室溫及攪拌5〇小時, 冷卻至〇°C,並逐滴加入水(350毫升)。將混合物以緩慢加 -23-
1275594 A7
入的11亳升濃縮氫氣酸酸化成阳3·60,並發生沉澱。將 混合物再it拌30分鐘及接著經n漏斗過濾、。將所得 以水(2x200毫升)清洗及在真空中以16小時乾燥,以得到 9·8 a克粗N _2’(正癸胺基)乙基萬古黴素氫氯酸鹽。接著 可在如實例3說明的該方法之步驟(c)中使用該中間物。 實例2 N _2_(正癸胺基)乙基萬古黴素氫氣酸鹽之製備作用 將180毫升N,N-一甲基甲醯胺(DMF)加入配備機械攪拌 器、溫度計及I氣泡器公升三頸圓底燒瓶中。在授掉 的同時連續加入6.75公克(0·016〇莫耳)N-Fm〇c_2_(正癸胺 基)乙醛及25公克(0·0168莫耳)萬古黴素氫氣酸鹽。以2〇亳 升DMF沖洗加料漏斗,並接著加入5·85亳升(〇〇336莫耳) Ν,Ν-一異丙基乙胺。將所得混合物在室溫的氮氣下攪拌 8小時,同時將溫度維持在2〇-25它。加入一份甲醇(95毫 升)及接著在1分鐘之内加入5.2毫升(〇 〇672莫耳)三氟醋酸 :將混合物攪拌〇·25小時,並接著將一份丨39公克(〇 〇16 莫耳)甲硼烷-第三丁胺複合物加入反應混合物中。以5毫 升甲醇沖洗加料漏斗,並將所得混合物在室溫下攪拌2小 %。加入一份第三丁胺(1〇·6亳升,〇1〇1莫耳),並將所得 混合物在40-42°C下攪拌約7小時。接著將混合物冷卻至室 溫’並在室溫下加入140亳升之〇·5當量HC1及接著加入600 笔升之10%食鹽水溶液。將所得混合物在2〇-25。(:下攪拌2 小時,並接著冷卻至1(TC及攪拌1小時。將反應混合物經 約90分鐘過濾,使用12·5公分瓷漏斗收集所得沉澱物。將 I275594 A7 B7 五、 發明説明( 21 濕塊以冷水(2χ50毫升)清洗及以5小時㈣。.將所得物質 ^入2,升乙腈中,同時在爪抓下授拌2小時。 :泥水經8公分瓷漏斗過濾,並將收集的濕塊以乙腈(2a? 宅升)清洗及在室内真空下(約25毫米果柱)以…、時乾於, 公克粗N〜_(正癸胺基)乙基萬古黴素氯氯酸 =接耆可在如實例3說明的該方法之步驟⑷中使用該中 間物。 實例3 正癸胺基)乙基29_{[(亞磷羧基甲基)胺基】甲基}萬 古擻素之製備作用 將5公克!srih(正癸胺基)乙基萬古黴素及16公克胺基 .甲基碟酸與30毫升乙猜裝入配備機械授摔器、溫度計及 之2 5 0亳升二頸圓底燒瓶中。將泥漿攪拌1 5分鐘, 允許在20-3(TC下分散固體,並接著加入2〇亳升水。將 合物攪動15分鐘,並加入7·5公克二異丙基乙胺。將所侍 混合物攪動,直到固體溶解為止。接著將反應混合物冷卻 =_5至-lot,裝入25公克之37%水性甲醛,並將所得 合,在-5至-10。(;下攪動24小時。以Ηριχ監控反應。在 μ凡成之後,將反應混合物以3克分子量氫氣酸溶液調 成ΡΗ 2-3,同時將反應溫度維持在-1()至5。〇。以中度擾 將125耄升乙腈經1〇分鐘加入在2〇至25C>c的反應混合物 、。將所得混合物在20至25 t下攪拌2小時及接著過濾。 濕塊以20亳升乙腈清洗兩次,並在20至25 °C之真空烘箱 乂 1 8小日守乾燥,以得到5 ·3公克成為二或三氫氣酸鹽之
N 裝 氮 以 混 得 m 反 整 拌 中 將 中 混 -25- 紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 1275594 A7 B7 五、發明説明(22 合物的標題化合物,〜100%產量,具有約80%純度(HPLC 面積)(即在R1係-CH2CH2-,R2係正癸基及R4係- CH〗 -之式Ϊ 化合物)。 實例4
Nvan-2-(正癸胺基)乙基29-{[(亞磷羧基甲基)胺基】甲基}萬 古黴素之製備作用 將117公克(約60毫莫耳)Nvan-2-(正癸胺基)乙基萬古黴 素(約80%純度)加入配備機械攪拌器、氮氣入口及溫度探 針之12公升之套層三頸燒瓶中。接著加入胺基曱基磷酸 (3 0公克,320毫莫耳),揍著加入420亳升乙腈。將所得泥 漿攪拌15分鐘及接著加入426公克水,並持續攪拌15分鐘 。加入二異丙基乙胺(144公克,1500毫莫耳),並將混合 物在室溫下攪拌1小時。將所得淺粉紅色溶液冷卻至-7°C (内溫),並加入4.51公克(60毫莫耳)之在33毫升乙腈中的 3 7%水性甲醛。將所得混合物在_7。(:(内溫)下攪拌12小時 ’同時以HPLC監控反應。在反應完成之後(即在12小時之 後,<1 %原料),將反應混合物之pH以加入的3當量氫氯酸 水溶液自10_4調整成2_59,同時將内反應溫度維持在-4至 -5 C。所使用的3當量水性氫氯酸量係4 5 5公克。將3 · 1公 斤之95%乙醇在5 °C下加入所得混合物中,將混合物攪拌3 小時,並接著經由瓷漏斗過濾。將所得濕塊以500公克醋 酸乙酯清洗,以得到135公克顆粒固體。將該固體在3〇毫 米汞柱及室溫下以20小時乾燥,以得到11 6公克成為二或 二氫氯酸鹽之混合物的標題化合物。以該物質之卡爾菲雪 -26- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 1275594 A7
爾(Karl Fisher)檢定顯示11%之水含量;及HpLc分析顯示 與標題化合物比較的17%未反應之醣肽及3 6%雙-曼里I (Mannich)副產物。 雖然以參考其特殊的具體實施例說明本發明,但是那些 熟悉此項技藝的人應瞭解可以不違背本發明實際的精神及 範圍下進行各種改變及以同等物取代。此外,可以進行許 多修改,以適應本發明的特殊情況、材料、組成物物質、 方法、本方法的步驟或步驟等、目的、精神及範圍。計劃 將所有的這些修改納入本文所附的申請專利範圍内。此外 ,將本文以上引證的所有發表案及專利文件詳細併入本文 以供參考,雖然以單獨併入以供參考。 -27- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X 297公釐)
Claims (1)
1275594
ττ、申請專利祀圍 i. 1.一種製備式I化合物或其鹽之方法:
N—R4—P~OH Η I r 〇H 1 其中 R1係選自由C^o伸烷基、(:2-10伸烯基及C2_10伸炔基 所構成的群組, R2係選自由Cwo烷基、C2_20烯基、C2_2〇炔基、03_8環 烷基、C5_8環烯基、C6_10芳基、C2_9雜芳基、C2_9雜環系 、-Ra-Cy1、-ΚΛΑ^-Αγ2、-ΚΛΑι^-ΚΛΑι·2、-ΚΛΑ^-Ο-Rb-Ar2所構成的群組; R4係C^o伸烷基; Ra*選自由Cm伸烷基、C^o伸烯基及C^o伸炔基 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐〉 1275594 A8 B8
所構成的群組; Cl-6伸烯基及(^·6伸炔基所構 …係選自由Cw伸烷基 成的群組; cy係選自由c3-8環烧基、c ^ C雜—盆 38衣烷暴烯基、C6_10芳基、 2-9”方土、C2.9雜環系所構成的群組; 斛1及Ar2係獨立選自C6]〇芳基及c29雜芳基; 其中將每一個芳基、雜芳基及雜環系基視需要以丨至3 個獨立選自由Cw烷基、Cw烷氧基、鹵基、羥基、硝 基及二氟甲基所構成的群組之取代基取代,及每一個雜 芳基及雜環系基包括從1至3個選自氮、氧或硫之雜原 該方法包含: (a)將萬古黴素或其鹽與式]^化合物··
R3 R1——N——R2 II (其中R1及R2係如本文的定義;及R3係胺不穩定性保 護基)及還原劑反應,以形成式III化合物或其鹽: -2- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 1275594 A8 B8 C8 D8 六、申請專利範圍
III (其中R1、R2及R3係如本文的定義); b)將式III化合物與胺反應,以提供式IV化合物或其 -3- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐) 1275594 A8 B8 C8
〇H H ycH3 CH3 IV 其中步驟(a)及步驟 不分離來自步驟(a) (其中R1及R2係如本文的定義); (b)係在相同的反應混合物中進行, 之中間物;及 (c)將式IV化合物與甲醛及式v化合物: HA—R4—p—〇H γ OH 在驗的存在下反應’以提供式I化合物或其鹽。 2.根據申請專利範圍第1項之方法,其中Ri係Cl_6伸烷基。 3·根據申請專利範圍第2項之方法,其中R1係-CH2-。 -4 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公董) 1275594
其中R2係C6_14烷基。 其中R2係正癸基。 其中R3係式(A)之基:. 4·根據申請專利範圍第1項之方法 5·根據申請專利範圍第4項之方法 6·根據申請專利範圍第1項之方法 /、中〜係選自由9-苟基甲基、3-雖基甲基、苯并[f] P 3基甲基、17·四苯并[a,c,g,i]芴基甲基、2,7-二第三 丁基[9-(1〇,1〇_二氧基_1〇,1〇,1〇1〇_四氫噻呤烷基)]甲基 、1’1 一氧苯并[b]噻吩_2_基甲基,其中將苟基甲基 視需要以1至3個選自由烷基、_基、硝基及磺基所 構成的群組取代。 7·根據中請專利範圍第"之方法,MW係91基曱基 ,其中將9_芴基甲基視需要以ί至3個選自由Cw烷基、 鹵基、硝基及磺基所構成的群組取代。 8.根據申睛專利範圍第7項之方法,其中1係9•芴基甲基。 9·根據申請專利範圍第1項之方法,其中R4係伸烷基。 10·根據申請專利範圍第9項之方法,其中R4係-CH^。 H·根據申請專利範圍第丨項之方法,其中在步驟(a)中的還 原劑係胺/甲硼烷複合物。 12.根據申請專利範圍第丨丨項之方法,其中在步驟(a)中的 還原劑係吡啶/甲硼烷或第三丁胺/甲硼烷。 13 .根據申請專利範圍第丨項之方法,其中步驟包含步驟: (i)將萬古黴素或其鹽與式Π化合物在鹼的存在下組合 "以形成反應混合物; (ii)將來自步驟⑴之反應混合物以酸酸化;及 -5- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) a4規格(210 x 297公釐) 1275594
(in)將來自步驟(π)之反應混合物與還原劑接觸。 14·根據中請專利範圍第13項之方法,其中在步驟⑴中的 鹼係三級鹼。 15·根據申請專利範圍第14項之方法,其中在步驟⑴中的 鹼係二異丙基乙胺。 根據申明專利範圍第丨3項之方法,其中在步驟(ϋ)中的 酸係三氟醋酸或醋酸。 Π.根據申請專利範圍第1項之方法,其中在步驟(b)中的胺 係氫氧化銨或一級胺。 18·根據申請專利範圍第17項之方法,其中在步驟0)中的 胺係氫氧化銨、甲胺或第三丁胺。 19·根據申請專利範圍第18項之方法,其中在步驟(b)中的 胺係第三丁胺。 0·根據申6月專利範圍第丨項之方法,其中在步驟(C)中的鹼 係三級胺。 21·根據申請專利範圍第2〇項之方法,其中在步驟⑷中的 鹼係二異丙基乙胺。 22. 根據申請專利範圍第2〇項之方法,其中三級胺對式v化 合物之莫耳比係約3 :1至约5 :1。 23. 根據申請專利範圍第22項之方法,其中莫耳比係約4··}。 24·根據申請專利範圍第1項之方法,其中 R1 係-ch2-; R2係正癸基; R3係W-OC(O)-,其中w係9-苟基甲基; -6 - m ^#i(CNs7A4 ^210 x 297/Ji)
裝 訂 t 8 8 8 8 A BCD 1275594 々、申請專利範圍 R4 係-CH2-; 在步驟(a)中的還原劑係第三丁胺/甲硼烷;及 在步驟(b)中的胺係第三丁胺。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 X 297公釐)
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