RU2597965C2 - Способ сохранения фермента - Google Patents

Способ сохранения фермента Download PDF

Info

Publication number
RU2597965C2
RU2597965C2 RU2014139012/10A RU2014139012A RU2597965C2 RU 2597965 C2 RU2597965 C2 RU 2597965C2 RU 2014139012/10 A RU2014139012/10 A RU 2014139012/10A RU 2014139012 A RU2014139012 A RU 2014139012A RU 2597965 C2 RU2597965 C2 RU 2597965C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nitrile hydratase
microorganisms
microbial cells
activity
enzyme
Prior art date
Application number
RU2014139012/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2014139012A (ru
Inventor
Эми ИСИИ
Масахито ОДА
Original Assignee
Мицубиси Рейон Ко., Лтд.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Мицубиси Рейон Ко., Лтд. filed Critical Мицубиси Рейон Ко., Лтд.
Publication of RU2014139012A publication Critical patent/RU2014139012A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2597965C2 publication Critical patent/RU2597965C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/06Lysis of microorganisms
    • C12N1/066Lysis of microorganisms by physical methods
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/96Stabilising an enzyme by forming an adduct or a composition; Forming enzyme conjugates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y402/00Carbon-oxygen lyases (4.2)
    • C12Y402/01Hydro-lyases (4.2.1)
    • C12Y402/01084Nitrile hydratase (4.2.1.84)

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области биотехнологии и представляет собой способ получения нитрилгидратазы, включающий следующие стадии: стадию культивирования микроорганизмов, обладающих активностью нитрилгидратазы, в защищенных от света условиях, стадию разрушения полученных при культивировании микробных клеток с использованием гомогенизатора высокого давления, стадию сохранения полученных, как указано выше, разрушенных микробных клеток при 4-37°С в условиях защиты их от действия света, и стадию получения супернатанта, содержащего нитрилгидратазу. Изобретение относится также к способу сохранения нитрилгидратазы, способу активации нитрилгидратазы и к способу получения активированной нитрилгидратазы. Изобретение позволяет разработать простой способ сохранения фермента из микробных клеток, полученных при культивировании, а также усилить активность фермента в ходе такой консервации. 4 н. и 4 з.п. ф-лы, 6 табл., 3 пр.

Description

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ
[0001] Настоящее изобретение относится к способу сохранения фермента из микроорганизмов, обладающих активностью нитрилгидратазы, к способу ее активации и к способу получения активированной нитрилгидратазы.
ПРЕДПОСЫЛКИ СОЗДАНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0002] Фермент, продуцируемый микроорганизмами, используется во многих областях в качестве катализатора реакции химической конверсии. В частности, при использовании нитрилгидратазы или другого близкого фермента, обладающего способностью гидратировать или гидролизовать нитрильную группу, можно получать с низкими затратами амиды, карбоновые кислоты, α-гидроксикарбоновые кислоты и т.п., нужные для химической промышленности. Кроме того, при использовании этого фермента, обладающего оптически специфичной гидратирующей активностью или оптически специфичной гидролизующей активностью, можно получать оптически активные карбоновые кислоты, аминокислоты, α-гидроксикарбоновые кислоты или т.п., которые нужны в качестве исходного материала при получении фармацевтических средств и агрохимикатов.
[0003] Для реакции химической конверсии, в которой в качестве катализатора используется фермент, полученный из микроорганизмов, важно сохранять в стабильном состоянии полученные при культивировании и собранные микроорганизмы, вплоть до момента их применения. Конкретно, указанное сохранение должно проводиться таким образом, чтобы каталитическая активность фермента не терялась или не снижалась в результате процессов разложения или лизиса, вызванных контаминацией. Соответственно, инактивация, разложение или лизис микробного фермента ингибируется при сохранении микробных клеток, где указанное сохранение в основном осуществляется в присутствии стабилизирующего агента, ингибитора метаболизма или высоких концентраций соли, а указанный фермент затем используется в реакции химической конверсии. В том случае, когда стабилизирующий агент или подобное средство не добавляется, в качестве одного из подходящих вариантов известен способ сохранения путем замораживания, охлаждения или перемешивания в условиях аэрации с целью сохранения активности фермента.
[0004] Для тех случаев, когда микроорганизмы содержат фермент с нитрилгидратазной активностью, известны разные подходы к сохранению фермента, такие как способ сохранения в водном растворе, содержащем высокую концентрацию неорганических солей (Патентный документ 1), способ сохранения путем замораживания (Патентный документ 2), способ, включающий перемешивание в условиях аэрации и при контроле показателя рН (Патентный документ 3) или т.п.
[0005] Известен также способ, включающий выделение твердого материала после разрушения микробных клеток и последующую очистку микробного фермента, где указанный подход предоставляет пользователю более удобные условия в работе с микробным катализатором (Патентный документ 4).
СПИСОК ЦИТИРОВАННЫХ МАТЕРИАЛОВ
ПАТЕНТНЫЕ ДОКУМЕНТЫ
[0006] Патентный документ 1: Патент Японии №3163224
Патентный документ 2: JP 2003-219870 А
Патентный документ 3: JP 2003-144144 А
Патентный документ 4: WO 2011/007725 А
РАСКРЫТИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0007] Однако применяемый в настоящее время способ сохранения, включающий несколько стадий его осуществления, весьма громоздок и экономически не рентабелен. К тому же, учитывая тот факт, что фермент обладает сниженной активностью, этот способ к тому же не рассматривается как удовлетворительный подход для решения задачи сохранения данного фермента. Так, например, способ, основанный на использовании водного раствора, содержащего высокую концентрацию неорганических солей, который описан в Патентном документе 1, включает обязательную промывку на следующей стадии процесса, а это может повлиять на качество продукта, и к тому же производственный процесс становится более сложным за счет добавления новых стадий. Далее, способ замораживания, описанный в Патентном документе 2, осложнен проблемой, которая заключается в том, что обработка, связанная с замораживанием и плавлением, является весьма трудоемкой и ферментативная активность либо также теряется, либо снижается в процессе такой обработки. Способ сохранения, включающий перемешивание в условиях аэрации и при контроле значений рН, описанный в Патентном документе 3, сопряжен с необходимостью применения кислых или щелочных химических средств или устройств или соответствующих мощностей для проведения перемешивания в условиях аэрации. В Патентном документе 4 описан способ разрушения микробных клеток и последующего центрифугирования с целью их выделения после кислотной и тепловой обработки. Однако с точки зрения активности получаемого фермента, которая в этом случае также снижается в ходе разных стадий реакции, этот способ также нуждается в усовершенствовании.
Целью настоящего изобретения является разработка способа сохранения фермента из микробных клеток, получаемых в результате процесса культивирования, который бы характеризовался меньшими затратами при большем удобстве его осуществления, в сравнении со способами, известными в данной области.
[0008] Авторы настоящего исследования провели интенсивные исследования для решения указанных выше проблем. В итоге, было показано, что при разрушении микробных клеток после культивирования микроорганизмов с нитрилгидратазной активностью, в защищенных от света условиях, с использованием гомогенизатора высокого давления, и их последующем сохранении в защищенных от света условиях, с невысоким затратами и легко может быть получен фермент из микробных клеток и, к тому же, указанная ферментативная активность даже усиливается при таком сохранении. Конкретно, настоящее изобретение относится к способу сохранения фермента из микробных клеток, который решает указанную выше проблему.
Конкретно, настоящее изобретение относится к недорогому и простому способу сохранения фермента из микробных клеток, получаемых в результате культивирования, и усиления активности фермента в ходе такого сохранения, в сравнении со способом, известным на данном уровне развития техники. Объектом настоящего изобретения является способ сохранения фермента с нитрилгидратазной активностью, который отличается тем, что микробы, обладающие нитрилгидратазной активностью, культивируют в защищенных от света условиях, и затем полученные микробные клетки разрушают гомогенизатором высокого давления, также в защищенных от света условиях.
[0009] Способ, который более предпочтителен в качестве способа по настоящему изобретению, относится к аспекту, согласно которому суспензию разрушенных микробных клеток сохраняют с использованием определенной методики; а также используют определенные микроорганизмы с нитрилгидратазной активностью.
[0010] Согласно другому аспекту настоящего изобретения, существенно отметить следующее: суспензию разрушенных микробных клеток консервируют при температуре от 4 до 37°С; суспензию разрушенных микробных клеток консервируют в течение периода времени от 4 до 24 часов; и используют микроорганизмы из рода Rhodococcus или рода Pseudonocardia.
[0011] Настоящее изобретение также относится к способу активации фермента с нитрилгидратазной активностью и к способу получения активированной нитрилгидратазы, который отличается тем, что микробные клетки, полученные при культивировании микроорганизмов с нитрилгидратазной активностью в защищенных от света условиях, далее обрабатывают гомогенизатором высокого давления, также в защищенных от света условиях.
[0012] Согласно настоящему изобретению, при разрушении микробных клеток, полученных при их культивировании в защищенных от света условиях и при их последующем суспендировании в диспергирующей среде с использованием гомогенизатора высокого давления, также в защищенных от света условиях, удается поддерживать состояние, при котором сохраняется активность фермента, такого как нитрилгидратаза, а именно: указанный фермент сохраняется, без разложения или ухудшения его качеств, даже в том случае, когда не проводится аэрация или перемешивание, или не проводится коррекция значения рН, или тепловая обработка. Кроме того, согласно настоящему изобретению, активность фермента может быть усилена в процессе такого сохранения. Иными словами, трудовые или финансовые издержки, которые на достигнутом уровне техники рассматривались как неизбежные для достижения сохранения, могут быть значительно сокращены, так что в итоге обеспечивается подходящий для промышленного использования способ сохранения микробного фермента.
СПОСОБ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0013] Ниже приводится подробное описание настоящего изобретения. Однако следует отметить, что приведенные здесь варианты осуществления настоящего изобретения даны лишь в качестве примера с целью дополнительного пояснения настоящего изобретения, и они ни в коей мере не ограничивают область настоящего изобретения. Соответственно, настоящее изобретение, при условии соответствия указанной выше тематике, составляющей цель настоящего изобретения, может быть осуществлено в самых разных формах.
[0014] В настоящем изобретении, микроорганизмы, обладающие нитрилгидратазной активностью, характеризуются способностью продуцировать желательный ферментный катализатор и накапливать его в микробной клетке или секретировать за пределы микробной клетки. Примеры таких микроорганизмов включают как природные микроорганизмы, встречающиеся в естественном состоянии, так и микроорганизмы, которые были получены рекомбинантными методами. Репрезентативные примеры соответствующих микроорганизмов, обладающих нитрилгидратазной активностью, включают микроорганизмы из рода Rhodococcus, из рода Gordona, из рода Pseudomonas, из рода Pseudonocardia и из рода Geobacillus. Кроме того, в их числе можно отметить микроорганизмы полученные методами рекомбинантной технологии, которые содержат нитрилгидратазный ген из указанных выше микроорганизмов. Среди них, предпочтительными для масштабного использования в промышленности являются микроорганизмы из рода Rhodococcus, рода Pseudonocardia, а также рекомбинантный Е. coli и рекомбинантный микроорганизм из рода Rhodococcus, в клетки которых был встроен ген нитрилгидратазы из указанных микроорганизмов. Конкретные примеры микроорганизмов из рода Rhodococcus включают штамм Rhodococcus rhodochrous J-1, описанный в JP 6-55148 В, и Rhodococcus rhodochrous NCIMB41164, описанный в WO 2005/054456 А. Штамм Rhodococcus rhodochrous J-1 был депонирован 18 сентября 1987 г. в Депозитарном Центре запатентованных организмов при Национальном Институте промышленной науки и технологии, независимом административном учреждении (Patent Organism Depository Center of National Institute of Industrial Science and Technology, an Independent Administrative Institution (zip code: 305-8566, Central 6, 1-1-1 Higashi, Tsukuba, Ibaraki, Japan (ditto, в настоящем описании)) с номером доступа FERM ВР-1478. Далее, штамм NCIMB41164 был депонирован 5 марта 2003 года в Национальной Коллекции промышленных и морских бактерий (National Collection of Industrial and Marine Bacteria (NCIMB)) (NCIMB Ltd Ferguson Building Craibstone Estate Bucksburn Aberdeen AB21 9YA) с номером доступа NCIMB41164. Конкретные примеры микроорганизмов из рода Pseudonocardia включают Pseudonocardia thermophila JCM3095, который был описан в JP 09-275978 А. Этот штамм был депонирован в том же Депозитарном Центре запатентованных организмов (Patent Organism Depository Center) с номером доступа FERM ВР-5785.
В настоящем изобретении, один тип микроорганизма, выбранный из указанного выше перечня, может использоваться в отдельности, сам по себе, или может использоваться сочетание двух или более таких микроорганизмов.
Культивирование микроорганизмов, обладающих нитрилгидратазной активностью, может проводиться в обычных условиях, применяемых для культивирования микроорганизмов, с тем исключением, что указанное культивирование проводится в защищенных от света условиях.
[0015] Нитрилгидратаза обозначает фермент, обладающий способностью гидролизовать нитрильное соединение с образованием соответствующего амидного соединения. Нуклеиновые кислоты, кодирующие нитрилгидратазу, а также примеры соответствующих нуклеотидных последовательностей описаны в Патентном документе 2. Нуклеиновые кислоты могут экспрессироваться в клетке микроорганизмов после их встраивания по известному молекулярно-биологическому методу (относительно методов молекулярной биологии см. работу: Sambrook, Fritsch and Maniatis, «Molecular Cloning: A Laboratory Manual» 2nd Edition (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press). Конкретно, в настоящем изобретении, может использоваться фермент, полученный из природных микроорганизмов, обладающих нитрилгилратазной активностью, или может использоваться фермент, полученный при экспрессии в микробных клетках нуклеиновых кислот, кодирующих нитрилгидратазу. В настоящем изобретении, один тип фермента, выбранный из указанного выше списка, может использоваться в отдельности или может использоваться сочетание двух или более ферментов.
[0016] В настоящем изобретении, термин «консервировать», во всех его формах, обозначает сохранение разрушенных микробных клеток в реакторе или контейнере. При этом обычно проводится перемешивание или аэрация, поскольку в данной ситуации не достигается однородная концентрация в реакторе или контейнере. Однако в настоящем изобретении, выдерживание без перемешивания или аэрации также возможно. В настоящем изобретении, термин «выдерживание» обозначает, что разрушенные микробные клетки содержатся в реакторе или контейнере без перемешивания или аэрации. Что касается способа защиты от света, используемого в настоящем изобретении, то возможно сохранять разрушенные микробные клетки в реакторе, защищенном от проникновения света или в закрытом контейнере в темной комнате.
[0017] В настоящем изобретении, температура сохранения варьируется, в зависимости от природы микроорганизмов, которые продуцируют рассматриваемый фермент, от типа фермента или т.п. Однако при использовании активности фермента в качестве индикатора, возможно подобрать подходящую температуру сохранения.
В настоящем изобретении, указанное сохранение в основном может быть проведено при комнатной температуре. Однако с целью достижения желательной активации фермента, предпочтительно проводить ее при температуре от 4 до 37°С, более предпочтительно при температуре от 4 до 25°С и еще более предпочтительно при температуре от 4 до 15°С. В том случае, когда температура сохранения ниже 4°С, не только может заморозиться суспензия микробных клеток, но также могут возрасти затраты, связанные с таким охлаждением. С другой стороны, если температура повышается выше 37°С, то может снижаться нитрилгидратазная активность в зависимости от природы самого микробного фермента.
[0018] В настоящем изобретении, длительность указанного сохранения варьирует в зависимости от природы микроорганизмов, продуцирующих фермент, от типа этого фермента, температуры, поддерживаемой в ходе сохранения, и т.п. Однако, используя ферментативную активность в качестве индикатора, можно подобрать подходящую длительность этого процесса. В основном, длительность периода сохранения может составлять от 4 до 24 часов. Однако, более предпочтительно, указанная длительность составляет от 6 до 24 часов. Когда период сохранения длится менее 4 часов, указанная нитрилгидратазная активность может не усилиться в достаточной мере. С другой стороны, когда указанный период сохранения длится более 24 часов, нитрилгидратазная активность может снижаться из-за разложения суспензии микробных клеток в зависимости от температуры или природы микробного фермента.
[0019] Когда микробный фермент консервируют по способу настоящего изобретения, указанная ферментативная активность повышается, в сравнении с вариантом, когда не проводится защита от действия света. В том, что касается активности нитрилгидратазы, то указанная нитрилгидратазная активность после сохранения в основном повышается на 100%, в сравнении с активностью нитрилгидратазы до сохранения. Она поддерживается на уровне предпочтительно 103% или выше, более предпочтительно на уровне 110% или выше, или еще более предпочтительно на уровне 120% или выше.
Указанная нитрилгидратазная активность может быть определена в рамках любого способа, известного в данной области техники. Так, например, оценка активности может быть проведена путем сравнения скорости реакции образования акриламида на основе субстрата (например, акрилонитрила), до начала сохранения и после сохранения.
[0020] В настоящем изобретении, термин «диспергирующая среда» обозначает раствор, используемый для суспендирования микробных клеток, подлежащих разрушению. При этом может использоваться любой тип диспергирующей среды, где такая диспергирующая среда может представлять собой жидкую среду, используемую для разрушения культуры микробных клеток, или среду, полученную путем замены жидкой среды, использованной для культивирования, водной средой или кислотой.
[0021] Компонент водного раствора органической кислоты особо не ограничивается, главное, чтобы он не ингибировал ферментативную активность. Примеры такого рода компонента включают карбоновые кислоты, такие как акриловая кислота, муравьиная кислота, уксусная кислота, пропионовая кислота, масляная кислота или щавелевая кислота. Среди них, с точки зрения поддержания качества акриламида, предпочтительной является акриловая кислота.
[0022] Суспензию разрушенных клеток по настоящему изобретению предпочтительно изготавливают с использованием микробных клеток, полученных путем культивирования, до проведения химической обработки (например, обработки глютаральдегидом, как описано в JP 7-265091 А). В качестве способа разрушения может использоваться гомогенизатор высокого давления, который позволяет разрушать микробные клетки, суспендированные в диспергирующей среде. Примеры гомогенизатора высокого давления включают френч-пресс и гомогенизатор с постоянным рабочим давлением. Предпочтительным является гомогенизатор с постоянным рабочим давлением, позволяющий осуществлять промышленное получение суспензии разрушенных клеток в больших количествах и с требуемой стабильностью. В том, что касается способа разрушения клеток, следует отметить, что предпочтительно проводить разрушение с использованием гомогенизатора высокого давления, на основе суспендированной в диспергирующей среде массы. Температура в момент разрушения составляет, с тем чтобы избежать термического разложения, предпочтительно от 0 до 37°С, и более предпочтительно от 0 до 25°С. Давление в процессе разрушения особо не ограничивается, главное, чтобы используемое давление позволяло разрушать микробные клетки. Однако его обычно корректируют до уровня от 50 до 150 МПа или предпочтительно от 70 до 120 МПа. Концентрация клеток в момент разрушения также особо не ограничивается. Однако этот показатель, в эквиваленте сухой микробной массы, может варьировать в диапазоне от 0,1 до 30 мас.%.
[0023] Таким образом, согласно настоящему изобретению, возможно осуществлять сохранение суспензии разрушенных клеток, с последующим отделением от этой массы твердого компонента, с целью дальнейшего использования. Способ выделения твердого компонента не ограничивается, и его примеры включают отделение центрифугированием. Температура в указанном процессе выделения составляет предпочтительно от 0 до 37°С и более предпочтительно, от 0 до 25°С.
ПРИМЕРЫ
[0024] Ниже, приводится более подробное описание настоящего изобретения с использованием примеров. Однако все эти примеры даны лишь для целей пояснения настоящего изобретения, и они никоим образом не должны рассматриваться как ограничивающие в чем-то настоящее изобретение. В приведенных далее тест-примерах (примеры, сравнительные примеры и стандартные примеры) оценка ферментативной активности проводится при измерении скорости реакции гидратации, когда супернатант, полученный после центрифугирования культуры микробных клеток, а также после сохранения по определенному способу, приводится во взаимодействие с нитрилом в рамках определенного, описанного ниже, метода.
Ниже, в тексте описания примеров, сравнительных примеров и стандартных примеров, символ «%» обозначает % по массе, т.е. мас.%.
[0025] <Получение трансформанта из рода Rhodococcus, содержащего ген нитрилгидратазы>
В качестве трансформанта, содержащего встроенный в него ген нитрилгидратазы из Rhodococcus rhodochrous J1, использовали Rhodococcus rhodochrous ATCC12674/pSJ042, полученный по способу, описанному в JP 2008-154552 А.
В том, что касается трансформанта, содержащего встроенный в него ген нитрилгидратазы из Pseudonocardia thermophila JCM3095, то использовали трансформант Rhodococcus rhodochrous ATCC12674/pSJ-N02A, который был получен при введении плазмиды pSJ-N02A, как описано в JP 2011-200132 А, в штамм АТСС12674 по описанному здесь методу.
[0026] <Культивирование микробных клеток>
(1) Культивирование трансформанта штамма АТСС12674
В коническую колбу на 500 мл добавляли 100 мл среды (рН 7,2), которая была получена при растворении компонентов, указанных в таблице 1, в водопроводной воде, и затем подвергали все стерилизации в автоклаве при температуре 121°С в течение 20 мин. К среде добавляли мочевину и канамицин до концентрации 0,1 г/л и 50 мг/л соответственно. После инокуляции проводили культивирование ATCC12674/pSJ042 или ATCC12674/pSJ-N02A в течение 72 ч при температуре 30°С и при качании со скоростью 230 об/мин в защищенных от света условиях. Компоненты среды, которые использовались в данном тест-примере, показаны в таблице 1.
(2) Культивирование штамма Rhodococcus rhodochrous J-1
В баночный ферментер объемом 3 л (производство компании Takasugi Seisakusho), добавляли 2,5 л среды (рН 7,0), которая была получена при растворении компонентов, указанных в таблице 2, в водопроводной воде и затем подвергали все стерилизации в автоклаве при температуре 121°С в течение 20 мин. В среду инокулировали 20 мл штамма Rhodococcus rhodochrous J-1, полученного при культивировании в описанных выше условиях (1), и проводили культивирование в течение 42 ч в защищенных от света условиях. Температура в процессе культивирования составляла 35°С. Компоненты среды, которая использовалась в данном тест-примере, показаны в таблице 2.
(3) Культивирование штамма Rhodococcus rhodochrous NCIMB-41164
В коническую колбу объемом 500 мл вносят 100 мл среды (рН 7.2), полученной при растворении компонентов, указанных в таблице 3, в водопроводной воде, после чего все стерилизуют в автоклаве при температуре 121°С в течение 20 мин. К полученной смеси добавляют мочевину до конечной концентрации 5,0 г/л. После инокуляции штамма Rhodococcus rhodochrous NCIMB-41164 проводят культивирование в течение 65 ч при температуре 30°С и качании со скоростью 230 об/мин, в защищенных от света условиях. Компоненты среды, которые были использованы в данном тест-примере, показаны в таблице 3.
[0027]
Figure 00000001
[0028]
Figure 00000002
[0029]
Figure 00000003
[0030] <Определение концентрации микробных клеток в сухом состоянии>
Фраза «концентрация микробных клеток в сухом состоянии (сухая микробная масса [%])» обозначает долю сухой массы микробных клеток, которые содержатся в суспензии микробных клеток. Конкретно, этот показатель вычисляют путем вычитания из массовой доли микробных клеток до и после сушки суспензии микробных клеток величины, определенной в виде разницы массы жидкого слоя до и после сушки, где указанную сушку проводят в течение 3 ч с использованием сушилки при температуре 120°С, после разделения суспензии микробных клеток на слой микробных клеток и жидкий слой, который, о существу,не содержит микробных клеток (процент: концентрация соли в супернатанте [%]), в соответствии с указанным выше способом (процент: доля сухого остатка, полученного из микробного раствора [%]).
[0031] <Определение активности нитрилгидратазы>
Активность нитрилгидратазы рассчитывают исходя из скорости реакции образования акриламида при использовании супернатанта, из которого были удалены твердые компоненты после разрушения микробных клеток. При добавлении к супернатанту водного раствора акрилонитрила начинается реакция. После встряхивания реакционной смеси в течение 10 мин при температуре 10°С реакцию останавливают при отделении фильтрованием микробных клеток и добавлении фосфорной кислоты. Далее проводят анализ с использованием газовой хроматографии (GC-14B, производство компании Shimadzu Corporation). Для анализа используют стеклянную колонку длиной 1 м, заполненную Porapack PS (производство компании Waters Company), температура в колонке составляет 210°С и в качестве детектора был использован FID при температуре 230°С.
В настоящем изобретении, ферментативную активность нитрилгидратазы определяют как количество акриламида (мкмоль), полученного в расчете на 1 мг микробных клеток в течение одной минуты.
[0032] Тест-пример
<Пример 1>
Концентрацию микробных клеток в сухом состоянии определяют в штаммах ATCC12674/pSJ042 и ATCC12674/pSJ-N02A, которые были получены при культивировании по описанной выше методике. Далее, с использованием небольшого дезинтегратора микробных клеток PANDA2K (производство компании Niro Soavi), представляющего собой гомогенизатор высокого давления, и суспензии микробных клеток, полученных в результате культивирования, разрушают указанные микробные клетки. Разрушение проводят под давлением 100 МПа при поддержании температуры в процессе разрушения клеток на уровне 4°С.
Суспензию разрушенных микроорганизмов, сразу же после получения (0 часов) и после сохранения в течение периода времени от 4 до 24 ч путем выдерживания в темном помещении при температуре от 4 до 37°С, подвергают центрифугированию в течение 5 мин при температуре 4°С и скорости 15000 об/мин, с получением супернатанта. Далее, в полученном супернатанте определяют активность нитрилгидратазы. Относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 часов, которая принята за 100, показаны в таблице 4.
[0033] <Стандартный пример 1>
Эффект повышения ферментативной активности определяли по процедуре примера 1, с тем исключением, что изменили температуру сохранения, которая здесь составляет 50°С. Ниже, в таблице 4 показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 часов, которая принята за 100.
[0034]
Figure 00000004
[0035] Было показано, что при культивировании микроорганизмов в защищенных от света условиях и при сохранении фермента из микробных клеток в течение соответствующего периода времени и с соблюдением нужной температуры, также при защите от действия света, ферментативная активность усиливается. В том случае, когда применяли фермент, полученный из микроорганизмов, которые использовали в указанных выше примерах и стандартных примерах, фермент терял свою активность при сохранении при температуре 50°С, то есть не наблюдался эффект активации фермента.
[0036] <Пример 2>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 1, с тем исключением, что в качестве культивируемых микроорганизмов здесь был взят штамм Rhodococcus rhodochrous J1 и для культивирования использовали баночный ферментер на 3 л (производство компании Takasugi Seisakusho), а не коническую колбу объемом 500 мл. После культивирования концентрация микробных клеток в сухом состоянии составляла 39,8 г/л. Ниже, в таблице 5, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
[0037] <Стандартный пример 2>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 2, с тем исключением, что изменили температуру сохранения, которая здесь составляла 50°С. Ниже, в таблице 5, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
<Стандартный пример 3>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 2, с тем исключением, что изменили длительность периода сохранения, которая здесь составляла 48 ч. Ниже, в таблице 5, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
<Сравнительный пример 4>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 2, с тем исключением, что здесь, в качестве устройства для разрушения клеток, использовали ультразвуковой генератор (VP-300, производство компании TAITEC). Для работы с ультразвуковым дезинтегратором отбирали 1 мл суспензии полученных при культивировании микробных клеток в коническую пробирку на 15 мл (производство компании Corning) и проводили разрушение клеток по 5 мин с интенсивностью на уровне 20%, при охлаждении льдом. Ниже, в таблице 5, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
<Сравнительный пример 5>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 2, с тем исключением, что здесь не предпринимались меры по защите клеток от действия света. Ниже, в таблице 5, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
[0038]
Figure 00000005
[0039] Было показано, что при культивировании микроорганизмов в защищенных от света условиях и при выдерживании фермента из микробных клеток в течение соответствующего периода времени и с соблюдением нужной температуры, также при защите от действия света, ферментативная активность усиливается. В том случае, когда применяли фермент, полученный из микроорганизмов, которые использовали в указанных выше примерах, сравнительных примерах и стандартных примерах, эффект активации фермента не наблюдался в условиях сохранения при температуре 50°С. Не наблюдался также эффект активации фермента ни в случае сохранения при температуре от 30 до 37°С, ни в случае сохранения в течение 48 ч. Однако при использовании гомогенизатора высокого давления наблюдался эффект активации фермента.
[0040] <Пример 3>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 1, с тем исключением, что в качестве культивируемых микроорганизмов здесь был взят штамм Rhodococcus rhodochrous NCIMB41164, а для разрушения микробных клеток использовали ручной френч-пресс (Модель 5502, производство компании Otake Seisakusho), представляющий собой вариант гомогенизатора высокого давления. Концентрация микробных клеток в сухом состоянии после культивирования составляла 5,4 г/л. Ниже, в таблице 6, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
[0041] <Стандартный пример 6>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 3, с тем исключением, что изменили температуру сохранения, которая здесь составляла 50°С. Ниже, в таблице 6, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
<Стандартный пример 7>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 3, с тем исключением, что изменили длительность периода сохранения, которая здесь составляла 48 ч. Ниже, в таблице 6, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
<Сравнительный пример 8>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 3, с тем исключением, что здесь, в качестве устройства для разрушения клеток, использовали ультразвуковой генератор (VP-300, производство компании TAITEC). Для работы с ультразвуковым дезинтегратором отбирали 1 мл суспензии полученных при культивировании микробных клеток в коническую пробирку на 15 мл (производство компании Corning) и проводили разрушение клеток по 5 мин интенсивностью на уровне 20% при охлаждении льдом. Ниже, в таблице 6, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
<Сравнительный пример 9>
Эффект усиления ферментативной активности определяли по процедуре примера 3, с тем исключением, что здесь не предпринимались меры по защите клеток от действия света. Ниже, в таблице 6, показаны относительные значения, вычисленные применительно к активности в момент 0 ч, которая принята за 100.
[0042]
Figure 00000006
[0043] Было показано, что при культивировании микроорганизмов в защищенных от света условиях и при выдерживании фермента из микробных клеток в течение соответствующего периода времени и с соблюдением нужной температуры, также при защите от действия света, ферментативная активность усиливается. В том случае, когда применяли фермент, полученный из микроорганизмов, которыйиспользовали в указанных выше примерах, сравнительных примерах и стандартных примерах, эффект активации фермента не наблюдался, если разрушение клеток проводили с использованием ультразвукового гомогенизатора. Кроме того, эффект активации также не наблюдался, если в процессе сохранения не проводилась защита от действия света.

Claims (8)

1. Способ получения нитрилгидратазы, включающий следующие стадии:
(1) стадию культивирования микроорганизмов, обладающих активностью нитрилгидратазы, в защищенных от света условиях,
(2) стадию разрушения полученных при культивировании микробных клеток с использованием гомогенизатора высокого давления,
(3) стадию сохранения полученных, как указано выше, разрушенных микробных клеток при 4-37°С в условиях защиты их от действия света, и
(4) стадию получения супернатанта, содержащего нитрилгидратазу.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что указанные микроорганизмы, обладающие активностью нитрилгидратазы, представляют собой микроорганизмы из рода Rhodococcus или из рода Pseudonocardia.
3. Способ сохранения нитрилгидратазы, включающий следующие стадии:
(1) стадию культивирования микроорганизмов, обладающих активностью нитрилгидратазы, в защищенных от света условиях,
(2) стадию разрушения полученных при культивировании микробных клеток с использованием гомогенизатора высокого давления,
(3) стадию сохранения полученных, как указано выше, разрушенных микробных клеток в течение 4-24 ч, при температуре от 4 до 37°С, в условиях защиты от действия света, и
(4) стадию получения супернатанта, содержащего нитрилгидратазу.
4. Способ по п. 3, отличающийся тем, что указанные микроорганизмы, обладающие активностью нитрилгидратазы, представляют собой микроорганизмы из рода Rhodococcus или из рода Pseudonocardia.
5. Способ активации нитрилгидратазы, включающий следующие стадии:
(1) стадию культивирования микроорганизмов, обладающих активностью нитрилгидратазы, в защищенных от света условиях,
(2) стадию разрушения полученных при культивировании микробных клеток с использованием гомогенизатора высокого давления,
(3) стадию сохранения полученных, как указано выше, разрушенных микробных клеток в течение 4-24 ч, при температуре от 4 до 37°С, в условиях защиты от действия света, и
(4) стадию получения супернатанта, содержащего нитрилгидратазу.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что указанные микроорганизмы, обладающие активностью нитрилгидратазы, представляют собой микроорганизмы из рода Rhodococcus или из рода Pseudonocardia.
7. Способ получения активированной нитрилгидратазы, включающий следующие стадии:
(1) стадию культивирования микроорганизмов, обладающих активностью нитрилгидратазы, в защищенных от света условиях,
(2) стадию разрушения полученных при культивировании микробных клеток с использованием гомогенизатора высокого давления,
(3) стадию сохранения полученных, как указано выше, разрушенных микробных клеток в течение 4-24 ч, при температуре от 4 до 37°С, в условиях защиты от действия света, и
(4) стадию получения супернатанта, содержащего нитрилгидратазу.
8. Способ по п. 7, отличающийся тем, что указанные микроорганизмы, обладающие активностью нитрилгидратазы, представляют собой микроорганизмы из рода Rhodococcus или из рода Pseudonocardia.
RU2014139012/10A 2012-02-28 2013-02-19 Способ сохранения фермента RU2597965C2 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2012041610 2012-02-28
JP2012-041610 2012-02-28
JP2012239614 2012-10-30
JP2012-239614 2012-10-30
PCT/JP2013/053955 WO2013129179A1 (ja) 2012-02-28 2013-02-19 酵素の保存方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014139012A RU2014139012A (ru) 2016-04-20
RU2597965C2 true RU2597965C2 (ru) 2016-09-20

Family

ID=49082379

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014139012/10A RU2597965C2 (ru) 2012-02-28 2013-02-19 Способ сохранения фермента

Country Status (9)

Country Link
US (1) US9353348B2 (ru)
EP (1) EP2821483B1 (ru)
JP (1) JP5967189B2 (ru)
KR (2) KR101736018B1 (ru)
CN (1) CN104145017B (ru)
AU (1) AU2013227585B2 (ru)
BR (1) BR112014020899A2 (ru)
RU (1) RU2597965C2 (ru)
WO (1) WO2013129179A1 (ru)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ITUA20163572A1 (it) * 2016-05-18 2017-11-18 Columbia S R L Metodo biotecnologico per la produzione di acrilammide e relativo nuovo ceppo batterico
JP7020614B2 (ja) * 2018-03-30 2022-02-16 三井化学株式会社 ニトリルヒドラターゼを含む菌体処理物の製造方法及びアミド化合物の製造方法

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2028380C1 (ru) * 1990-02-28 1995-02-09 Нитто Кемикал Индастриз Ко., Лтд. Фрагмент нуклеиновой кислоты, кодирующий полипептид, обладающий активностью нитрилгидротазы, рекомбинантная плазмидная днк ppcl 4, кодирующая полипептид, обладающий активностью нитрилгидратазы, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, обладающего активностью нитрилгидратазы, способ получения нитрилгидратазы
US6316242B1 (en) * 1998-08-06 2001-11-13 The Institute Of Physical And Chemical Research Method for producing nitrile hydratase
EP1767624A1 (en) * 2004-05-26 2007-03-28 Mitsubishi Rayon Engineering Co., Ltd. Improved nitrile hydratase
WO2011007725A1 (ja) * 2009-07-13 2011-01-20 三井化学株式会社 菌体処理物の製造方法
EP2363473A1 (en) * 2008-11-14 2011-09-07 Mitsui Chemicals, Inc. Nitrile hydratase variant

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DD274631A5 (de) 1987-09-18 1989-12-27 Kk Verfahren zur biologischen herstellung von amiden
JPH03163224A (ja) 1989-11-22 1991-07-15 Tochigi Fuji Ind Co Ltd ハブクラッチ及びそのストッパ加工方法
JPH07265091A (ja) 1994-03-30 1995-10-17 Mitsubishi Chem Corp アミド化合物の製造法
JP3163224B2 (ja) 1994-10-14 2001-05-08 三菱レイヨン株式会社 菌体または固定化菌体の懸濁液の保存方法
US5607441A (en) 1995-03-24 1997-03-04 Ethicon Endo-Surgery, Inc. Surgical dissector
JP3380133B2 (ja) * 1996-02-14 2003-02-24 三井化学株式会社 新規なニトリルヒドラターゼ
CN1260363C (zh) 1996-02-14 2006-06-21 三井化学株式会社 由腈化合物生产酰胺的方法
JP4205332B2 (ja) 2001-11-09 2009-01-07 三井化学株式会社 菌体または菌体処理物を含有する液体の保存方法
JP2003219870A (ja) 2002-01-29 2003-08-05 Mitsui Chemicals Inc ニトリルヒドラターゼの保存方法
ATE532859T1 (de) 2003-12-02 2011-11-15 Ciba Spec Chem Water Treat Ltd Stamm von rhodococcus rhodochrous ncimb 41164 sowie dessen verwendung als nitrilhydrataseproduzent
TW200634151A (en) 2004-12-09 2006-10-01 Asahi Chemical Ind Transformant expressing nitrile hydratase
GB2447860B (en) * 2006-11-21 2011-08-03 Salamander Pumped Shower Systems Ltd Improvements in fluid pumping systems
JP5030579B2 (ja) 2006-12-26 2012-09-19 三菱レイヨン株式会社 ロドコッカス属細菌用発現ベクター
JP5817088B2 (ja) 2010-03-24 2015-11-18 三菱レイヨン株式会社 ニトリルヒドラターゼ遺伝子を欠失又は不活性化させた微生物

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2028380C1 (ru) * 1990-02-28 1995-02-09 Нитто Кемикал Индастриз Ко., Лтд. Фрагмент нуклеиновой кислоты, кодирующий полипептид, обладающий активностью нитрилгидротазы, рекомбинантная плазмидная днк ppcl 4, кодирующая полипептид, обладающий активностью нитрилгидратазы, штамм бактерий escherichia coli - продуцент полипептида, обладающего активностью нитрилгидратазы, способ получения нитрилгидратазы
US6316242B1 (en) * 1998-08-06 2001-11-13 The Institute Of Physical And Chemical Research Method for producing nitrile hydratase
EP1767624A1 (en) * 2004-05-26 2007-03-28 Mitsubishi Rayon Engineering Co., Ltd. Improved nitrile hydratase
EP2363473A1 (en) * 2008-11-14 2011-09-07 Mitsui Chemicals, Inc. Nitrile hydratase variant
WO2011007725A1 (ja) * 2009-07-13 2011-01-20 三井化学株式会社 菌体処理物の製造方法

Also Published As

Publication number Publication date
WO2013129179A1 (ja) 2013-09-06
KR101736018B1 (ko) 2017-05-15
KR20140121428A (ko) 2014-10-15
US20150050718A1 (en) 2015-02-19
CN104145017A (zh) 2014-11-12
JPWO2013129179A1 (ja) 2015-07-30
KR20160112010A (ko) 2016-09-27
EP2821483A1 (en) 2015-01-07
JP5967189B2 (ja) 2016-08-10
US9353348B2 (en) 2016-05-31
AU2013227585B2 (en) 2016-02-25
RU2014139012A (ru) 2016-04-20
EP2821483A4 (en) 2015-01-07
EP2821483B1 (en) 2017-03-29
AU2013227585A1 (en) 2014-09-18
CN104145017B (zh) 2017-03-15
BR112014020899A2 (pt) 2018-05-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2015326905B2 (en) Means and methods for producing amide compounds with less acrylic acid
CA2676926C (en) Induction of enzymatic activity in nitrile hydratase-producing bacteria
RU2403280C2 (ru) Штамм rhodococcus rhodochrous ncimb 41164 и его применение в качестве продуцента нитрилгидратазы
Li et al. A novel strategy for acetonitrile wastewater treatment by using a recombinant bacterium with biofilm-forming and nitrile-degrading capability
CN103649312A (zh) 改良型腈水合酶
JP5648354B2 (ja) 微生物菌体の保存方法及び微生物菌体の懸濁液
RU2597965C2 (ru) Способ сохранения фермента
WO2011138966A1 (ja) 微生物触媒を用いたアクリルアミドの製造方法
KR20020059332A (ko) 니트릴라제 활성을 안정화하고 미생물 세포를 보존하는 방법
Eneva et al. Biochemical studies on the production of neuraminidase by environmental isolates of Vibrio cholerae non-O1 from Bulgaria
Liu et al. Enhanced production of ε-poly-l-lysine by immobilized Streptomyces ahygroscopicus through repeated-batch or fed-batch fermentation with in situ product removal
US20220403426A1 (en) Method of storing a biocatalyst
Sulistinah et al. Biodegradation of Acetonitrile and Benzonitrile by a Newly Isolated Rhodococcus Pyridionvorans Strain I-Benzo from Leather Tanning Waste
JP2017184686A (ja) グルタルアルデヒド含有酵素組成物
Zhang et al. Biodegradation of Atrazine by Acinetobacter sp. DNS32
RU2596405C1 (ru) СПОСОБ КУЛЬТИВИРОВАНИЯ БАКТЕРИЙ РОДА Pseudomonas
Xu et al. Microbial degradation of disodium terephthalate by Rhodococcus sp. 9-003
AU2012202282B2 (en) Induction and stabilization of enzymatic activity in microorganisms
Zhang et al. Nitrile-and amide-hydrolysing activity of acrylic acid-tolerant yeast Trichosporon asahii ZZB-1
Chiş et al. RECOMBINANT Anoxybacillus flavithermus T1 ESTERASE/LIPASE: OPTIMIZATION OF EXPRESSION AND RECOVERY.
JP2006006119A (ja) 微生物菌体の処理方法および処理装置、ならびに菌体触媒
Matthew et al. Flocculation potential of crude bio-flocculants from bacteria isolated in Oyun river, Ilorin, Kwara state
JP2008061517A (ja) 微生物触媒の培養法
AU2015203784A1 (en) Induction and stabilization of enzymatic activity in microorganisms

Legal Events

Date Code Title Description
PD4A Correction of name of patent owner
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190220