RU2009101321A - Полипептид - Google Patents

Полипептид Download PDF

Info

Publication number
RU2009101321A
RU2009101321A RU2009101321/10A RU2009101321A RU2009101321A RU 2009101321 A RU2009101321 A RU 2009101321A RU 2009101321/10 A RU2009101321/10 A RU 2009101321/10A RU 2009101321 A RU2009101321 A RU 2009101321A RU 2009101321 A RU2009101321 A RU 2009101321A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
polypeptide
variant
sequence
seq
parent
Prior art date
Application number
RU2009101321/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2539776C2 (ru
Inventor
Патрик Мария Франсискус ДЕРККС (DK)
Патрик Мария Франсискус ДЕРККС
Аня Келлет-Смит ХЕММИНГСЕН (DK)
Аня Келлет-Смит ХЕММИНГСЕН
Рие МЕЙЛЬДАЛЬ (DK)
Рие МЕЙЛЬДАЛЬ
Бо Спанге СЕРЕНСЕН (DK)
Бо Спанге СЕРЕНСЕН
Карстен Маттиас КРАГХ (DK)
Карстен Маттиас Крагх
Original Assignee
Даниско А/С (Dk)
Даниско А/С
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Даниско А/С (Dk), Даниско А/С filed Critical Даниско А/С (Dk)
Publication of RU2009101321A publication Critical patent/RU2009101321A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2539776C2 publication Critical patent/RU2539776C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • C12N9/2417—Alpha-amylase (3.2.1.1.) from microbiological source
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A21—BAKING; EDIBLE DOUGHS
    • A21D—TREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
    • A21D13/00—Finished or partly finished bakery products
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A21—BAKING; EDIBLE DOUGHS
    • A21D—TREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
    • A21D2/00—Treatment of flour or dough by adding materials thereto before or during baking
    • A21D2/08—Treatment of flour or dough by adding materials thereto before or during baking by adding organic substances
    • A21D2/24—Organic nitrogen compounds
    • A21D2/26—Proteins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A21—BAKING; EDIBLE DOUGHS
    • A21D—TREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
    • A21D8/00—Methods for preparing or baking dough
    • A21D8/02—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking
    • A21D8/04—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes
    • A21D8/042—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes with enzymes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A21—BAKING; EDIBLE DOUGHS
    • A21D—TREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
    • A21D8/00—Methods for preparing or baking dough
    • A21D8/06—Baking processes
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23K—FODDER
    • A23K20/00—Accessory food factors for animal feeding-stuffs
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/0106—Glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase (3.2.1.60)

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Fodder In General (AREA)
  • Cereal-Derived Products (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

1. Полипептид варианта PS4, происходящий от родительского полипептида, обладающего амилазной активностью, где указанный полипептид варианта PS4 содержит аминокислотную замену в положении 307 на лизин (K) или аргинин (R), в соответствии с нумерацией положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO: 1. ! 2. Полипептид варианта PS4 по п.1, происходящий от родительского полипептида, обладающего экзоамилазной активностью, предпочтительно не-мальтогенной экзоамилазной активностью. ! 3. Полипептид варианта PS4 по п.1, где аминокислотной заменой в положении 307 является замена на лизин (307K), предпочтительно H307K, или замена на аргинин (307R), предпочтительно H307R. ! 4. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, который дополнительно включает аминокислотную замену в положении 70. ! 5. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где аминокислотной заменой в положении 70 является замена на аспарагиновую кислоту (70D), предпочтительно G70D. ! 6. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, в котором аминокислота в положении 272 последовательности полипептида варианта PS4 является гистидином (H). ! 7. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, в котором аминокислота в положении 303 последовательности полипептида варианта PS4 является глицином (G). ! 8. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 дополнительно включает одну или несколько мутаций, выбранных из группы, состоящей из положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 161, 178, 179, 223, 229, 309 или 334. ! 9. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где дополнительная(ые) мутация(и) полипептида варианта PS4 выбрана(ы) из группы, состоящей из: 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 309P, 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, Y14

Claims (69)

1. Полипептид варианта PS4, происходящий от родительского полипептида, обладающего амилазной активностью, где указанный полипептид варианта PS4 содержит аминокислотную замену в положении 307 на лизин (K) или аргинин (R), в соответствии с нумерацией положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO: 1.
2. Полипептид варианта PS4 по п.1, происходящий от родительского полипептида, обладающего экзоамилазной активностью, предпочтительно не-мальтогенной экзоамилазной активностью.
3. Полипептид варианта PS4 по п.1, где аминокислотной заменой в положении 307 является замена на лизин (307K), предпочтительно H307K, или замена на аргинин (307R), предпочтительно H307R.
4. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, который дополнительно включает аминокислотную замену в положении 70.
5. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где аминокислотной заменой в положении 70 является замена на аспарагиновую кислоту (70D), предпочтительно G70D.
6. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, в котором аминокислота в положении 272 последовательности полипептида варианта PS4 является гистидином (H).
7. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, в котором аминокислота в положении 303 последовательности полипептида варианта PS4 является глицином (G).
8. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 дополнительно включает одну или несколько мутаций, выбранных из группы, состоящей из положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 161, 178, 179, 223, 229, 309 или 334.
9. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где дополнительная(ые) мутация(и) полипептида варианта PS4 выбрана(ы) из группы, состоящей из: 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 309P, 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, A309P и S334P.
10. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 содержит следующие замены: 33Y, 34N, 70D, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 307K, 309P, 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G70D, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, H307K, A309P, S334P, по сравнению с последовательностью экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO: 1.
11. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 содержит последовательность SEQ ID NO: 21 (pSac-pMS382).
12. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 содержит следующие замены: 33Y, 34N, 70D, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 307R, 309P, 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G70D, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, H307R, A309P, S334P по сравнению с последовательностью экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO: 1.
13. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 содержит последовательность SEQ ID NO: 23 (pSac-pMS382R).
14. Полипептид варианта PS4, происходящий от родительского полипептида, обладающего не-мальтогенной экзоамилазной активностью, где полипептид варианта PS4 содержит следующие замены 33Y, 34N, 70D, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 309P, 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G70D, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, A309P, S334P по сравнению с последовательностью экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO:1.
15. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 содержит последовательность SEQ ID NO: 25 (pSac-pMS382H).
16. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где родительский полипептид содержит не-мальтогенную экзоамилазу, предпочтительно, глюкан-1,4-альфа- мальтотетрагидролазу (EC 3.2.1.60).
17. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где родительский полипептид представляет собой полипептид из видов Pseudomonas, предпочтительно, Pseudomonas saccharophilia или Pseudomonas stutzeri, или происходит от этого полипептида.
18. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где родительским полипептидом является не-мальтогенная экзоамилаза из Pseudomonas saccharophilia, имеющая последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO:5.
19. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 75% идентична последовательности SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 5.
20. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где родительским полипептидом является не-мальтогенная экзоамилаза из Pseudomonas stutzeri, имеющая последовательность, представленную в SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 11.
21. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 75% идентична последовательности SEQ ID NO: 7 или SEQ ID NO: 11.
22. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, который содержит последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 21 (pSac-pMS382), SEQ ID NO: 23 (pSac-pMS382R) и SEQ ID NO: 25 (pSac-pMS382H).
23. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где полипептид варианта PS4 обладает более высокой термостабильностью по сравнению с родительским полипептидом или полипептидом дикого типа при их тестировании в одних и тех же условиях.
24. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, время полужизни которого (tl/2), предпочтительно при 60°С на 15% или более, предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более превышает время полужизни родительского полипептида или полипептида дикого типа.
25. Полипептид варианта PS4 по пп.1, 2 или 3, где пищевой продукт, обработанный полипептидом варианта PS4, имеет любое одно или более предпочтительно все следующие свойства, такие как (а) пониженная плотность; (b) повышенная упругость; (c) повышенная слипаемость; (d) пониженная раскрашиваемость; и (e) более высокая способность к сворачиваемости по сравнению с пищевым продуктом, обработанным родительским полипептидом или полипептидом дикого типа.
26. Полипептид варианта PS4 по п.25, где упругость, слипаемость или сворачиваемость пищевого продукта независимо друг от друга на 15%, или более предпочтительно на 50%, или наиболее предпочтительно на 100%, или превышают указанные параметры пищевого продукта, обработанного родительским полипептидом или полипептидом дикого типа.
27. Полипептид варианта PS4 по п.25, где каждый из упругости, слипаемости и сворачиваемости пищевого продукта, обработанного полипептидом варианта PS4, являются улучшенными по сравнению с указанными свойствами пищевого продукта, обработанного родительским полипептидом или полипептидом дикого типа.
28. Полипептид варианта PS4 по п.25, где плотность или раскрашиваемость указанного пищевого продукта независимо друг от друга на 15%, или более предпочтительно на 50%, или наиболее предпочтительно на 100%, или ниже, чем указанные параметры пищевого продукта, обработанного родительским полипептидом или полипептидом дикого типа.
29. Полипептид варианта PS4 по п.25, где каждый из плотности и раскрашиваемости указанного пищевого продукта, обработанного полипептидом варианта PS4, ниже по сравнению с указанными свойствами пищевого продукта, обработанного родительским полипептидом или полипептидом дикого типа.
30. Полипептид, содержащий фрагмент, состоящий по меньшей мере из 20 остатков полипептида варианта PS4 по любому из предыдущих пунктов, где полипептид обладает не-мальтогенной экзоамилазной активностью.
31. Полипептид, происходящий от полипептида варианта PS4 по любому из предыдущих пунктов, путем введения мутаций в одном или нескольких остатках полипептидной последовательности варианта PS4, где полипептид обладает более высокой термостабильностью, или более высокой экзоспецифичностью, или и тем и другим свойством, по сравнению со свойствами родительского полипептида, полипептида варианта PS4, или полипептида дикого типа, либо где пищевой продукт, обработанный полипептидом варианта PS4, имеет одно или несколько, предпочтительно все следующие свойства: (а) пониженная плотность; (b) повышенная упругость; (c) повышенная слипаемость; (d) пониженная раскрашиваемость; или (e) более высокая способность к сворачиваемости по сравнению с пищевым продуктом, обработанным родительским полипептидом или полипептидом дикого типа.
32. Применение полипептида варианта PS4 по любому из предыдущих пунктов в качестве пищевой или кормовой добавки.
33. Способ обработки крахмала, включающий контактирование крахмала с полипептидом по любому из пп.1-31 и получение из указанного крахмала одного или нескольких линейных продуктов под действием указанного полипептида.
34. Применение полипептида по любому из пп.1-31 для получения пищевого или кормового продукта.
35. Применение по п.34, где пищевой продукт содержит тесто или продукт из теста предпочтительно обработанный продукт из теста.
36. Применение по пп.34 и 35, где пищевой продукт является хлебобулочным изделием.
37. Способ получения пищевого или кормового продукта, включающий смешивание полипептида по любому из пп.1-31 с пищевым или кормовым ингредиентом.
38. Способ по п.37, где пищевой продукт содержит тесто или продукт из теста предпочтительно обработанный продукт из теста.
39. Способ по пп.37 и 38, где пищевой продукт является хлебобулочным изделием.
40. Способ изготовления хлебобулочного изделия, включающий: (a) приготовление крахмальной среды; (b) добавление в крахмальную среду полипептида по любому из пп.1-31, и (c) подачу тепла к крахмальной среде во время или после стадии (b) с получением хлебобулочного изделия.
41. Пищевой продукт, кормовой продукт, продукт из теста или хлебобулочное изделие, получаемые способом по п.37 или 40.
42. Улучшенная композиция для теста, где указанная улучшенная композиция содержит полипептид по любому из пп.1-31 и по меньшей мере один дополнительный ингредиент теста или добавку в тесто.
43. Композиция, содержащая муку и полипептид по любому из пп.1-31.
44. Применение полипептида варианта PS4 по любому из пп.1-31 в продукте из теста для замедления или снижения черствения, предпочтительно, нежелательной ретроградации продукта из теста.
45. Применение полипептида варианта PS4 по любому из п.п.1-31 в продукте из теста для улучшения любого одного или нескольких свойств, таких как плотность, упругость, слипаемость, раскрашиваемость или сворачиваемость продукта из теста.
46. Комбинация полипептида варианта PS4 по любому из предыдущих пунктов вместе с любым одним или несколькими из следующего:
(a) мальтогенная альфа-амилаза, также называемая глюкан- 1,4-α-мальтогидролазой (EC 3.2.1.133) из Bacillus stearothermophilus или ее вариант, гомолог или мутанты, обладающие мальтогенной альфа-амилазной активностью;
(b) пекарская ксиланаза (EC 3.2.1.8) из, например, Bacillus sp., Aspergillus sp., Thermomyces sp. или Trichoderma sp.;
(c) α-амилаза (EC 3.2.1.1) из Bacillus amyloliqufaciens или ее вариант, гомолог или мутанты, обладающие альфа-амилазной активностью; и
(d) липаза, такая как гликолипаза из Fusarium heterosporum.
47. Применение комбинации по п.46 в соответствии с любым из предыдущих пунктов.
48. Пищевой или кормовой продукт, полученный путем обработки комбинацией по п.46.
49. Нуклеиновая кислота, способная кодировать полипептид по любому из пп.1-31.
50. Нуклеиновая кислота по п.49, имеющая последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере на 75% идентична SEQ ID NO: 6 или SEQ ID NO: 12.
51. Нуклеиновая кислота, содержащая фрагмент, состоящий по меньшей мере из 60 остатков нуклеиновой кислоты по п.49 или 50, которая способна кодировать полипептид, обладающий не-мальтогенной экзоамилазной активностью.
52. Последовательность нуклеиновой кислоты, происходящая от родительской последовательности, способной кодировать не-мальтогенную экзоамилазу, где последовательность нуклеиновой кислоты содержит замену в одном или нескольких остатках, в результате чего такая нуклеиновая кислота кодирует лизин (K) или аргинин (R) в положении 307, необязательно вместе с одной или несколькими дополнительными мутациями, в результате чего такая нуклеиновая кислота кодирует один или несколько остатков, выбранных из группы, состоящей из: 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 309P, 334P в соответствии с нумерацией положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO: 1.
53. Последовательность нуклеиновой кислоты PS4 по любому из пп.49-52, которая происходит от родительской последовательности, кодирующей не-мальтогенную экзоамилазу, в результате замены одного или нескольких нуклеотидных остатков.
54. Последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.49-52, выбранная из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 22 (pSac-pMS382), SEQ ID NO: 24 (pSac-pMS382R) и SEQ ID NO: 26 (pSac-pMS382H).
55. Плазмида, содержащая нуклеиновую кислоту PS4 по любому из пп.49-54.
56. Экспрессионный вектор, содержащий нуклеиновую кислоту PS4 по любому из пп.49-55, или способный экспрессировать полипептид по любому из пп.1-31.
57. Клетка-хозяин, содержащая плазмиду по п.55 или экспрессионный вектор по п.56, предпочтительно трансформированная указанной плазмидой или указанным экспрессионным вектором.
58. Клетка, способная экспрессировать полипептид по любому из пп.1-31.
59. Клетка-хозяин по п.57 или клетка по п.58, которая представляет собой бактериальную, грибковую или дрожжевую клетку.
60. Способ экспрессии полипептида варианта PS4, включающий получение клетки-хозяина или клетки по пп.57, 58 или 59, и экспрессию полипептида из клетки или клетки-хозяина, и необязательно очистку полипептида.
61. Способ изменения последовательности полипептида предпочтительно не-мальтогенной экзоамилазы путем введения аминокислотной замены в положение 70 на основный или положительно заряженный остаток, необязательно, вместе с одной или несколькими дополнительными мутациями, выбранными из группы, состоящей из: 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272H, 303G, 309P, 334P (в соответствии с нумерацией положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO:1), в родительский полипептид, обладающий не-мальтогенной экзоамилазной активностью.
62. Способ по п.61, где основным или положительно заряженным остатком является лизин (K), аргинин (R) или гистидин (H).
63. Способ по п.61 или 62, где последовательность не-мальтогенной экзоамилазы изменяют путем изменения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей не-мальтогенную экзоамилазу.
64. Способ получения полипептида варианта PS4, включающий введение аминокислотной замены в родительский полипептид, обладающий не-мальтогенной экзоамилазной активностью, где аминокислотная замена выбрана из группы, состоящей из: 33Y, 34N, 70K/R/H, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272H, 303G, 309P, 334P в соответствии с нумерацией положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO:1.
65. Способ по п.64, где последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую родительский полипептид, изменяют путем введения аминокислотной замены.
66. Способ изменения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей не-мальтогенную экзоамилазу, включающий введение в последовательность кодона, кодирующего аминокислотный остаток, выбранный из группы, состоящей из: 33Y, 34N, 70K/R/H, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272H, 303G, 309P, 334P, в соответствии с нумерацией положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной в SEQ ID NO:1.
67. Способ повышения термостабильности или экзоспецифичности полипептида или того и другого, включающий стадии по любому из пп.60-66.
68. Способ по п.60, в котором полипептид выделяют или очищают, или и то и другое.
69. Полипептид, полученный способом по любому из пп.60-68.
RU2009101321/10A 2006-06-19 2007-06-19 Полипептид RU2539776C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US81485106P 2006-06-19 2006-06-19
US60/814,851 2006-06-19
PCT/IB2007/002056 WO2007148224A2 (en) 2006-06-19 2007-06-19 Polypeptide

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2009101321A true RU2009101321A (ru) 2010-07-27
RU2539776C2 RU2539776C2 (ru) 2015-01-27

Family

ID=38833826

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2009101321/10A RU2539776C2 (ru) 2006-06-19 2007-06-19 Полипептид

Country Status (15)

Country Link
US (1) US8178336B2 (ru)
EP (1) EP2035447B1 (ru)
JP (1) JP5448812B2 (ru)
KR (2) KR20150004920A (ru)
CN (2) CN101528769B (ru)
AU (1) AU2007262442B2 (ru)
BR (1) BRPI0713286A2 (ru)
CA (1) CA2656313C (ru)
DK (1) DK2035447T3 (ru)
ES (1) ES2644745T3 (ru)
MX (2) MX345513B (ru)
NZ (1) NZ573564A (ru)
RU (1) RU2539776C2 (ru)
WO (1) WO2007148224A2 (ru)
ZA (1) ZA200810738B (ru)

Families Citing this family (23)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101068921A (zh) * 2004-07-07 2007-11-07 丹尼斯科公司 多肽
EP2546338A1 (en) * 2008-01-02 2013-01-16 Danisco US Inc. A process of obtaining ethanol without glucoamylase using pseudomonas saccharophila g4-amylase and variants thereof
WO2009100102A2 (en) * 2008-02-04 2009-08-13 Danisco Us Inc., Genencor Division Ts23 alpha-amylase variants with altered properties
US8809392B2 (en) 2008-03-28 2014-08-19 Ecolab Usa Inc. Sulfoperoxycarboxylic acids, their preparation and methods of use as bleaching and antimicrobial agents
US8871807B2 (en) 2008-03-28 2014-10-28 Ecolab Usa Inc. Detergents capable of cleaning, bleaching, sanitizing and/or disinfecting textiles including sulfoperoxycarboxylic acids
AU2009230713C1 (en) 2008-03-28 2018-08-02 Ecolab Inc. Sulfoperoxycarboxylic acids, their preparation and methods of use as bleaching and antimicrobial agents
EP2417255A2 (en) * 2009-04-10 2012-02-15 Danisco US Inc. Production of maltotetraose syrup using a pseudomonas saccharophila maltotetraohyfrolase variant
CN102421910A (zh) * 2009-05-11 2012-04-18 丹尼斯科美国公司 使用嗜糖假单胞菌麦芽四糖水解酶变体和脱支酶的麦芽四糖浆液的改良生产
MX2011012313A (es) * 2009-05-19 2011-12-12 Danisco Uso.
DK3591046T3 (da) * 2009-05-19 2021-07-26 Dupont Nutrition Biosci Aps Amylasepolypeptide
US9321664B2 (en) 2011-12-20 2016-04-26 Ecolab Usa Inc. Stable percarboxylic acid compositions and uses thereof
CN104254496B (zh) 2012-03-30 2016-10-26 艺康美国股份有限公司 过乙酸/过氧化氢和过氧化物还原剂用于处理钻井液、压裂液、回流水和排放水的用途
US20140256811A1 (en) 2013-03-05 2014-09-11 Ecolab Usa Inc. Efficient stabilizer in controlling self accelerated decomposition temperature of peroxycarboxylic acid compositions with mineral acids
US8822719B1 (en) 2013-03-05 2014-09-02 Ecolab Usa Inc. Peroxycarboxylic acid compositions suitable for inline optical or conductivity monitoring
US10165774B2 (en) 2013-03-05 2019-01-01 Ecolab Usa Inc. Defoamer useful in a peracid composition with anionic surfactants
US9850512B2 (en) 2013-03-15 2017-12-26 The Research Foundation For The State University Of New York Hydrolysis of cellulosic fines in primary clarified sludge of paper mills and the addition of a surfactant to increase the yield
WO2015086027A1 (en) 2013-12-09 2015-06-18 Carlsberg A/S Stable haze for beverages
US9951363B2 (en) 2014-03-14 2018-04-24 The Research Foundation for the State University of New York College of Environmental Science and Forestry Enzymatic hydrolysis of old corrugated cardboard (OCC) fines from recycled linerboard mill waste rejects
BR112021002549A2 (pt) 2018-08-22 2021-05-04 Ecolab Usa Inc. composição de ácido peroxicarboxílico estabilizada, e, método para reduzir uma população microbiana usando uma composição de ácido peroxicarboxílico estabilizada.
US12096768B2 (en) 2019-08-07 2024-09-24 Ecolab Usa Inc. Polymeric and solid-supported chelators for stabilization of peracid-containing compositions
BR112023005131A2 (pt) * 2020-09-21 2023-04-25 Dupont Nutrition Biosci Aps Processo para fazer um produto de panificação com resiliência melhorada, produto de panificação, uso de uma exoamilase não maltogênica e uma glucoamilase, composição melhoradora para uma massa e massa
WO2024088549A1 (en) 2022-10-24 2024-05-02 Novozymes A/S Baking method with thermostable amg variant and alpha-amylase
WO2024088550A1 (en) 2022-10-24 2024-05-02 Novozymes A/S Baking method for pulse protein fortified bread employing thermostable amyloglucosidase variante (ec 3.2.1.3)

Family Cites Families (34)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0063456B1 (en) * 1981-04-13 1984-08-01 Takeda Chemical Industries, Ltd. Pseudo-aminosugars, their production and use
DK135983D0 (da) 1983-03-25 1983-03-25 Novo Industri As Maltogen amylaseenzymprodukt og fremgangsmade til dets fremstilling og anvendelse
US4683202A (en) * 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
JP2660836B2 (ja) * 1987-07-08 1997-10-08 株式会社 林原生物化学研究所 マルトテトラオース生成アミラーゼ活性を有するポリペプチドとその用途
JPH02222686A (ja) * 1989-02-27 1990-09-05 Natl Food Res Inst マルトテトラオース生成酵素遺伝子
US5023094A (en) 1989-08-10 1991-06-11 Gist-Brocades N.V. Retarding the firming of bread crumb during storage
DK474589D0 (da) 1989-09-27 1989-09-27 Novo Nordisk As Fremgangsmaade til fremstilling af bageriprodukter
DE4017595A1 (de) * 1990-05-31 1991-12-05 Consortium Elektrochem Ind Maltopentaose produzierende amylasen
JP3389666B2 (ja) 1993-01-29 2003-03-24 日産自動車株式会社 エポキシ樹脂系接着性組成物
JPH06279746A (ja) 1993-03-26 1994-10-04 Dainippon Ink & Chem Inc 磁気記録媒体用結合剤
JP3533239B2 (ja) 1994-03-01 2004-05-31 株式会社林原生物化学研究所 マルトヘキサオース・マルトヘプタオース生成アミラーゼとその製造方法並びに用途
US6093562A (en) * 1996-02-05 2000-07-25 Novo Nordisk A/S Amylase variants
DE69637940D1 (de) * 1995-02-03 2009-07-09 Novozymes As Eine methode zum entwurf von alpha-amylase mutanten mit vorbestimmten eigenschaften
JP2787764B2 (ja) 1995-03-27 1998-08-20 株式会社林原生物化学研究所 マルトテトラオースとそれを含有する飲食物
EP2386568B1 (en) 1997-10-30 2014-08-06 Novozymes A/S Alpha-amylase mutants
CN103352033B (zh) * 1998-02-27 2016-05-11 诺维信公司 麦芽α淀粉酶变体
NZ506892A (en) 1998-04-01 2003-11-28 Danisco Non-maltogenic exoamylases and their use in retarding retrogradation of starch
JP4220611B2 (ja) 1999-02-25 2009-02-04 花王株式会社 変異α−アミラーゼ
AU3450200A (en) 1999-03-30 2000-10-16 Danisco A/S Non-maltogenic exoamylase from (b. clausii) and its use in retarding rerogradation of a starch product
WO2001004273A2 (en) 1999-07-09 2001-01-18 Novozymes A/S Glucoamylase variant
US6542224B2 (en) * 2000-10-13 2003-04-01 Corning Incorporated Silica-based light-weight EUV lithography stages
CA3032990C (en) 2001-02-21 2020-07-14 Basf Enzymes Llc Enzymes having alpha amylase activity and methods of use thereof
US20030134395A1 (en) * 2001-12-19 2003-07-17 Shetty Jayarama K. Process for hydrolyzing starch without pH adjustment
CN101421400A (zh) 2003-03-06 2009-04-29 戴弗萨公司 淀粉酶、编码它们的核酸及其制备和应用方法
DK1654355T3 (da) * 2003-06-13 2010-08-09 Danisco Pseudomonas polypeptidvarianter med ikke-maltogen exoamylaseaktivitet og deres anvendelse til fremstilling af fødevarer
AU2004258115A1 (en) * 2003-07-07 2005-01-27 Danisco A/S Thermostable amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof
US8143048B2 (en) * 2003-07-07 2012-03-27 Danisco A/S Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof
US20060073583A1 (en) * 2004-09-22 2006-04-06 Kragh Karsten M Polypeptide
US20060018997A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-26 Kragh Karsten M Polypeptide
CN101068921A (zh) * 2004-07-07 2007-11-07 丹尼斯科公司 多肽
US20060008890A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-12 Kragh Karsten M Polypeptide
US20060008888A1 (en) * 2004-07-07 2006-01-12 Kragh Karsten M Polypeptide
US8030050B2 (en) * 2005-07-07 2011-10-04 Danisco A/S Modified amylases from Pseudomonas species
BRPI0612288A2 (pt) * 2005-07-07 2009-01-27 Danisco amilase modificada de pseudomonas saccharophilia

Also Published As

Publication number Publication date
DK2035447T3 (da) 2017-11-06
CN101528769A (zh) 2009-09-09
US8178336B2 (en) 2012-05-15
ZA200810738B (en) 2018-11-28
KR20150004920A (ko) 2015-01-13
AU2007262442B2 (en) 2012-11-01
JP5448812B2 (ja) 2014-03-19
EP2035447B1 (en) 2017-07-26
WO2007148224A2 (en) 2007-12-27
JP2009540818A (ja) 2009-11-26
CN105296450A (zh) 2016-02-03
MX345513B (es) 2017-02-01
NZ573564A (en) 2012-01-12
EP2035447A2 (en) 2009-03-18
MX2008016444A (es) 2009-01-22
CA2656313A1 (en) 2007-12-27
US20090202675A1 (en) 2009-08-13
AU2007262442A1 (en) 2007-12-27
ES2644745T3 (es) 2017-11-30
WO2007148224A3 (en) 2008-05-29
BRPI0713286A2 (pt) 2012-10-09
CN101528769B (zh) 2015-09-30
CA2656313C (en) 2018-07-03
RU2539776C2 (ru) 2015-01-27
KR20090019895A (ko) 2009-02-25
WO2007148224A8 (en) 2009-05-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2009101321A (ru) Полипептид
RU2008104637A (ru) Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia
US7666650B2 (en) Amylase
Coutinho et al. Glucoamylase structural, functional, and evolutionary relationships
CA2452029C (en) A group of .alpha.-amylases and a method for identification and production of .alpha.-amylases
AU2004267142B2 (en) Fungal alpha-amylase variants
DK2316929T3 (en) Maltogenic alpha-amylase variants
JP2000210081A (ja) 耐熱性アルカリセルラ―ゼ遺伝子
US20090226564A1 (en) Bacterial alpha-amylase variants
EP2358873B2 (en) Hybrid alpha-amylases
DK2620496T3 (en) Alpha-amylase
Janeček et al. Close evolutionary relatedness of α-amylases from Archaea and plants
BG61081B1 (bg) МУТАНТНИ МИКРОБИАЛНИ α-АМИЛАЗИ С ПОВИШЕНА ТЕРМИЧНА, КИСЕЛИННА И/ИЛИ АЛКАЛНА УСТОЙЧИВОСТ
US8361529B2 (en) Xylanase
US20240180172A1 (en) Amylase polypeptides with improved properties
Wu et al. Improved thermostability, acid tolerance as well as catalytic efficiency of Streptomyces rameus L2001 GH11 xylanase by N-terminal replacement
Huang et al. Directed evolution of α-amylase from Bacillus licheniformis to enhance its acid-stable performance
EP1601765A2 (en) Variants of enzymes of the alpha-amylase family
Ruiz-Arribas et al. Analysis of xysA, a gene from Streptomyces halstedii JM8 that encodes a 45-kilodalton modular xylanase, Xys1
Miao et al. Enhanced extracellular expression of α-Amylase DL3-4-1 in Bacillus subtilis via systematic screening of optimal signal peptides
Wales et al. Site-specific substitutions of the Tyr-165 residue in the catalytic chain of aspartate transcarbamoylase promotes a T-state preference in the holoenzyme.
WO2011009747A1 (en) Carbohydrate oxidases
JP4417608B2 (ja) 変異アルカリセルラーゼ
Cheng et al. The effect of disulfide bond on the conformational stability and catalytic activity of beta-propeller phytase
CN111073876B (zh) 热稳定性提高的枯草芽孢杆菌脂肪酶a

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20160620