RU2008104637A - Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia - Google Patents
Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia Download PDFInfo
- Publication number
- RU2008104637A RU2008104637A RU2008104637/13A RU2008104637A RU2008104637A RU 2008104637 A RU2008104637 A RU 2008104637A RU 2008104637/13 A RU2008104637/13 A RU 2008104637/13A RU 2008104637 A RU2008104637 A RU 2008104637A RU 2008104637 A RU2008104637 A RU 2008104637A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- polypeptide
- variant
- seq
- sequence
- amino acid
- Prior art date
Links
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A21—BAKING; EDIBLE DOUGHS
- A21D—TREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
- A21D8/00—Methods for preparing or baking dough
- A21D8/02—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking
- A21D8/04—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes
- A21D8/042—Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes with enzymes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A23—FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
- A23L—FOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
- A23L33/00—Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof
- A23L33/10—Modifying nutritive qualities of foods; Dietetic products; Preparation or treatment thereof using additives
- A23L33/17—Amino acids, peptides or proteins
- A23L33/18—Peptides; Protein hydrolysates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
- C12N9/2417—Alpha-amylase (3.2.1.1.) from microbiological source
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2425—Beta-amylase (3.2.1.2)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2411—Amylases
- C12N9/2428—Glucan 1,4-alpha-glucosidase (3.2.1.3), i.e. glucoamylase
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Mycology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- General Preparation And Processing Of Foods (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Fodder In General (AREA)
- Cereal-Derived Products (AREA)
Abstract
1. Вариант полипептида PS4, который можно получить из исходного полипептида, обладающего амилазной активностью, выбираемый из группы, состоящей из ! (a) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 161, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334; ! (b) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 145, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307 и 334; ! (c) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334; ! (d) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 3, 33, 34, 70, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334; ! со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1. ! 2. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (а) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P. ! 3. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD229 (SEQ ID NO:13). ! 4. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (b) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, N145D, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L и S334P. ! 5. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD248 (SEQ ID NO:15). ! 6. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (с) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309
Claims (62)
1. Вариант полипептида PS4, который можно получить из исходного полипептида, обладающего амилазной активностью, выбираемый из группы, состоящей из
(a) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 161, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334;
(b) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 145, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307 и 334;
(c) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 33, 34, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334;
(d) полипетида, включающего мутацию аминокислоты в каждом из следующих положений: 3, 33, 34, 70, 121, 134, 141, 146, 157, 178, 179, 223, 229, 272, 303, 307, 309 и 334;
со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
2. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (а) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, Y146G, I157L, S161A, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P.
3. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD229 (SEQ ID NO:13).
4. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (b) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121F, G134R, A141P, N145D, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L и S334P.
5. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD248 (SEQ ID NO:15).
6. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (с) независимо выбирают из группы, состоящей из 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно N33Y, D34N, G121D, G134R, A141P, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P.
7. Вариант полипептида РS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD253 (SEQ ID NO:17).
8. Вариант полипептида PS4 по п.1, в котором каждую из мутаций аминокислот в полипептиде (d) независимо выбирают из группы, состоящей из 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, предпочтительно A3S, N33Y, D34N, G70D, G121D, G134R, A141P, Y146G, I157L, L178F, A179T, G223E, S229P, H272Q, G303E, H307L, A309P и S334P.
9. Вариант полипептида PS4 по п.1, включающий последовательность pSac-pMD271 (SEQ ID NO:19).
10. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого обладает активностью экзоамилазы, предпочтительно немальтогенной экзоамилазы, более предпочтительно глюкан-1,4-альфа-мальтотетрагидролазы (ЕС 3.2.1.60).
11. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого является полипептидом из вида Pseudomonas, предпочтительно Pseudomonas saccharophilia или Pseudomonas stutzeri, либо может быть получен из вида Pseudomonas, предпочтительно Pseudomonas saccharophilia или Pseudomonas stutzeri.
12. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого является немальтогенной экзоамилазой из Pseudomonas saccharophilia, имеющей последовательность, представленную как SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:5.
13. Вариант полипептида PS4 по п.1, который включает мутации аминокислот в каждом из положений, указанных в (а), (b), (c) или (d) п.1, и который имеет аминокислотную последовательность, идентичную, по крайней мере, на 75% SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:5.
14. Вариант полипептида PS4 по п.1, исходный полипептид которого является немальтогенной экзоамилазой из Pseudomonas stutzeri, имеющей последовательность, представленную как SEQ ID NO:7 или SEQ ID NO:11.
15. Вариант полипептида PS4 по п.1, который включает мутации аминокислот в каждом из положений, указанных в (а), (b), (c) или (d) п.1, и который имеет аминокислотную последовательность, идентичную, по крайней мере, на 75% SEQ ID NO:7 или SEQ ID NO:11.
16. Вариант полипептида PS4 по п.1, обладающий большей термостабильностью, чем исходный полипептид или полипептид дикого типа, при проверке в одних и тех же условиях.
17. Вариант полипептида PS4 по любому из предшествующих пунктов, время полужизни (t1/2) которого предпочтительно при 60°С увеличено на 15% или более предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более, по сравнению с исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
18. Вариант полипептида PS4 по п.1, обладающий большей экзоспецифичностью, чем исходный полипептид или полипептид дикого типа при проверке в одних и тех же условиях.
19. Вариант полипептида PS4 по п.1, обладающий большей на 10% или более, предпочтительно на 20% или более, предпочтительно на 50% или более, экзоспецифичностью, чем исходный полипептид или полипептид дикого типа.
20. Вариант полипептида PS4 по п.1, при обработке которым пищевого продукта последний имеет любое одно или более, предпочтительно все, из следующих свойств: (а) меньшую твердость; (b) большую эластичность и (c) большую слипаемость, чем пищевой продукт, обработанный исходным полипептидом или полипептидомом дикого типа.
21. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым эластичность или слипаемость пищевого продукта независимо увеличивается на 15% или более, предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более, по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
22. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым как эластичность, так и слипаемость пищевого продукта увеличивается по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
23. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым твердость пищевого продукта независимого уменьшается на 15% или более, предпочтительно на 50% или более, наиболее предпочтительно на 100% или более, по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
24. Вариант полипептида PS4 по п.20, при обработке которым твердость пищевого продукта уменьшается по сравнению с пищевым продуктом, обработанным исходным полипептидом или полипептидом дикого типа.
25. Полипептид, включающий фрагмент из, по крайней мере, 20 остатков варианта полипептида PS4 по п.1, который обладает немальтогенной экзоамилазной активностью.
26. Применение полипептида по п.1 в качестве пищевой или кормовой добавки.
27. Способ обработки крахмала, включающий приведение в контакт крахмала с вариантом полипептида по п.1 и предоставление возможности полипептиду образовывать из крахмала один или несколько линейных продуктов.
28. Применение полипептида по п.1 для приготовления пищевого или кормового продукта.
29. Способ приготовления пищевого или кормового продукта, включающий смешивание полипептида по п.1 с пищевым или кормовым ингредиентом.
30. Применение по п.28, в котором пищевым продуктом является тесто или продукт из теста, предпочтительно подвергшийся технологической обработке продукт из теста.
31. Применение по п.26, в котором пищевым продуктом является хлебобулочное изделие.
32. Способ приготовления хлебобулочного изделия, включающий (а) получение крахмальной среды; (b) добавление к крахмальной среде полипептида по п.1 и (с) нагревание крахмальной среды во время или после стадии (b) с получением хлебобулочного изделия.
33. Пищевой продукт, кормовой продукт, продукт из теста или хлебобулочное изделие, полученные или которые можно получить способом по п.29 или 32.
34. Содержащая улучшитель композиция для теста, в которой содержащая улучшитель композиция содержит полипептид по п.1 и, по крайней мере, один дополнительный ингредиент теста или одну тестовую добавку.
35. Композиция, содержащая муку и полипептид по п.1.
36. Применение полипептида по п.1 в продукте из теста для замедления или уменьшения очерствения, предпочтительно вредной ретроградации, продукта из теста.
37. Применение варианта полипептида PS4 по п.1 в продукте из теста для улучшения любого одного или нескольких из следующих свойств продукта из теста: твердости, эластичности или слипаемости.
38. Комбинация варианта полипептида PS4 по п.1 с новамилом или его вариантом, гомологом или мутантами, имеющими мальтогенную альфа-амилазную активность.
39. Применение комбинации по п.38 для применения, указанного в любом из предшествующих пунктов.
40. Пищевой или кормовой продукт, полученный обработкой комбинацией по п.38.
41. Нуклеиновая кислота, способная кодировать полипептид по п.1.
42. Нуклеиновая кислота по п.41, которая кодирует полипептид, включающий мутации аминокислот в каждом из положений, указанных в (а), (b), (c) или (d) п.1, и который имеет последовательность нуклеиновой кислоты, идентичную, по крайней мере, на 75% SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:12.
43. Нуклеиновая кислота, включающая фрагмент из, по крайней мере, 60 остатков нуклеиновой кислоты по п.41, которая способна кодировать полипептид, имеющий немальтогенную экзоамилазную активность.
44. Последовательность нуклеиновой кислоты, которую можно получить из исходной последовательности, причем исходная последовательность способна кодировать амилазу, которая включает замену одного или нескольких остатков, так что нуклеиновая кислота кодирует одну или более из следующих мутаций в указанных положениях: (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
45. Последовательность нуклеиновой кислоты по п.41, которую получают из исходной последовательности, кодирующей немальтогенную экзоамилазу, заменой одного или нескольких нуклеотидных остатков.
46. Последовательность нуклеиновой кислоты по п.41, которую выбирают из группы, состоящей из pSac-pMD229 (SEQ ID NO:14), pSac-pMD248 (SEQ ID NO:16), pSac-pMD253 (SEQ ID NO:18) и pSac-pMD271 (SEQ ID NO:20).
47. Плазмида, включающая нуклеиновую кислоту PS4 по п.41.
48. Экспрессирующий вектор, который включает нуклеиновую кислоту PS4 по п.41 или способен экспрессировать полипептид по п.1.
49. Клетка-хозяин, включающая плазмиду по п.47 или экспрессирующий вектор по п.48, предпочтительно трансформированная указанной плазмидой или указанным экспрессирующим вектором.
50. Клетка, способная экспрессировать полипептид по п.1.
51. Клетка-хозяин по п.49 или клетка по п.50, которая является клеткой бактерий, грибка или дрожжей.
52. Способ экспрессии варианта полипептида PS4, включающий получение клетки-хозяина по п.49 и экспрессию полипептида клеткой или клеткой-хозяином и, по желанию, очистку полипептида.
53. Способ изменения последовательности полипептида введением замены аминокислоты, выбираемой из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P (со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1), в исходный полипептид, обладающий амилазной активностью.
54. Способ изменения последовательности немальтогенной экзоамилазы введением замены, выбираемой из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, ссылаясь на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
55. Способ по п.53, в котором последовательность немальтогенной экзоамилазы изменяют с помощью изменения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей немальтогенную экзоамилазу.
56. Способ получения варианта полипептида PS4, включающий введение замены аминокислоты в исходный полипептид, обладающий амилазной активностью, причем замену аминокислоты выбирают из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
57. Способ по п.53, в котором последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую исходный полипептид, изменяют для введения аминокислотной замены.
58. Способ изменения последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей немальтогенную экзоамилазу, причем этот способ включает введение в последовательность кодона, который кодирует аминокислотный остаток, выбираемый из группы, состоящей из (a) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 146G, 157L, 161A, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (b) 33Y, 34N, 121F, 134R, 141P, 145D, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L и 334P; (c) 33Y, 34N, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P; (d) 3S, 33Y, 34N, 70D, 121D, 134R, 141P, 146G, 157L, 178F, 179T, 223E, 229P, 272Q, 303E, 307L, 309P и 334P, со ссылкой на нумерацию положений последовательности экзоамилазы Pseudomonas saccharophilia, представленной как SEQ ID NO:1.
59. Способ увеличения термостабильности или экзоспецифичности или обоих этих свойств полипептида, причем этот способ включает стадии, указанные в п.53.
60. Способ по п.53, в котором полипептид выделяют или очищают или выделяют и очищают.
61. Полипептид, который можно получить способом по п.53.
62. Полипептид, полученный способом по п.53.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US69730205P | 2005-07-07 | 2005-07-07 | |
US60/697,302 | 2005-07-07 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2008104637A true RU2008104637A (ru) | 2009-08-20 |
Family
ID=37331082
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2008104637/13A RU2008104637A (ru) | 2005-07-07 | 2006-07-07 | Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US20070141693A1 (ru) |
EP (1) | EP1907538A1 (ru) |
JP (1) | JP2008544751A (ru) |
KR (1) | KR20080023746A (ru) |
CN (1) | CN101238210A (ru) |
AU (1) | AU2006268418A1 (ru) |
BR (1) | BRPI0612288A2 (ru) |
CA (1) | CA2614274A1 (ru) |
MX (1) | MX2008000374A (ru) |
RU (1) | RU2008104637A (ru) |
WO (1) | WO2007007053A1 (ru) |
Families Citing this family (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2004111217A2 (en) * | 2003-06-13 | 2004-12-23 | Danisco A/S | Variant pseudomonas polypeptides having a non-maltogenic exoamylase activity and their use in preparing food products |
US8143048B2 (en) * | 2003-07-07 | 2012-03-27 | Danisco A/S | Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof |
WO2005007818A2 (en) * | 2003-07-07 | 2005-01-27 | Genencor International, Inc. | Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof |
WO2006003461A2 (en) * | 2004-07-07 | 2006-01-12 | Danisco A/S | Polypeptide |
US8030050B2 (en) * | 2005-07-07 | 2011-10-04 | Danisco A/S | Modified amylases from Pseudomonas species |
JP2008544751A (ja) * | 2005-07-07 | 2008-12-11 | ダニスコ エイ/エス | Pseudomonassaccharophilia由来の修飾アミラーゼ |
CA2656313C (en) * | 2006-06-19 | 2018-07-03 | Danisco A/S | Ps4 exoamylase h307k/r variant |
US7666637B2 (en) * | 2006-09-05 | 2010-02-23 | Xuan Nghinh Nguyen | Integrated process for separation of lignocellulosic components to fermentable sugars for production of ethanol and chemicals |
CN102978258A (zh) * | 2008-01-02 | 2013-03-20 | 丹尼斯科美国公司 | 应用嗜糖假单胞菌g4-淀粉酶和其变体获得乙醇的无葡糖淀粉酶的方法 |
JP2010148488A (ja) * | 2008-12-26 | 2010-07-08 | Biomaterial In Tokyo Co Ltd | カンジダ・グラブラータ(C.glabrata)を用いるエタノール製造方法 |
WO2010118269A2 (en) * | 2009-04-10 | 2010-10-14 | Danisco Us Inc. | Production of maltotetraose syrup using a pseudomonas saccharophila maltotetraohydrolase variant |
WO2010133644A2 (en) * | 2009-05-19 | 2010-11-25 | Danisco A/S | Amylase polypeptides |
EP3392268B1 (en) | 2010-03-29 | 2021-06-30 | DuPont Nutrition Biosciences ApS | Polypeptides having transgalactosylating activity |
CA2852601C (en) | 2011-10-17 | 2023-05-23 | Novozymes A/S | Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same |
CA2852603A1 (en) | 2011-10-17 | 2013-04-25 | Novozymes A/S | Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same |
HRP20220545T1 (hr) | 2012-06-08 | 2022-06-10 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | Polipeptidi koji imaju transgalaktozilirajuću aktivnost |
US9850512B2 (en) | 2013-03-15 | 2017-12-26 | The Research Foundation For The State University Of New York | Hydrolysis of cellulosic fines in primary clarified sludge of paper mills and the addition of a surfactant to increase the yield |
WO2015086027A1 (en) | 2013-12-09 | 2015-06-18 | Carlsberg A/S | Stable haze for beverages |
CA2932864A1 (en) | 2013-12-11 | 2015-06-18 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | A method for preparing a dairy product having a stable content of galacto-oligosaccharide(s) |
US9951363B2 (en) | 2014-03-14 | 2018-04-24 | The Research Foundation for the State University of New York College of Environmental Science and Forestry | Enzymatic hydrolysis of old corrugated cardboard (OCC) fines from recycled linerboard mill waste rejects |
EP3915384A1 (en) | 2014-11-07 | 2021-12-01 | DuPont Nutrition Biosciences ApS | Recombinant host cell expressing beta-galactosidase and/or transgalactosylating activity deficient in cellulase |
WO2018187524A1 (en) | 2017-04-07 | 2018-10-11 | Dupont Nutrition Biosciences Aps | BACILLUS HOST CELLS PRODUCING β-GALACTOSIDASES AND LACTASES IN THE ABSENCE OF P-NITROBENZYLESTERASE SIDE ACTIVITY |
EP4071242A1 (en) * | 2021-04-06 | 2022-10-12 | DuPont Nutrition Biosciences ApS | Amylase polypeptides with improved properties |
Family Cites Families (19)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA1171374A (en) * | 1981-04-13 | 1984-07-24 | Takeda Chemical Industries, Ltd. | Pseudo-aminosugars, their production and use |
US4683202A (en) * | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
JP2660836B2 (ja) * | 1987-07-08 | 1997-10-08 | 株式会社 林原生物化学研究所 | マルトテトラオース生成アミラーゼ活性を有するポリペプチドとその用途 |
DE4017595A1 (de) * | 1990-05-31 | 1991-12-05 | Consortium Elektrochem Ind | Maltopentaose produzierende amylasen |
JP3533239B2 (ja) * | 1994-03-01 | 2004-05-31 | 株式会社林原生物化学研究所 | マルトヘキサオース・マルトヘプタオース生成アミラーゼとその製造方法並びに用途 |
US6093562A (en) * | 1996-02-05 | 2000-07-25 | Novo Nordisk A/S | Amylase variants |
DE69637940D1 (de) * | 1995-02-03 | 2009-07-09 | Novozymes As | Eine methode zum entwurf von alpha-amylase mutanten mit vorbestimmten eigenschaften |
DK2316929T3 (en) * | 1998-02-27 | 2016-07-25 | Novozymes As | Maltogenic alpha-amylase variants |
PT1068302E (pt) * | 1998-04-01 | 2005-10-31 | Danisco | Exoamilases nao maltogenicas e sua utilizacao no retardamento da retrogrdacao do amido |
US20030134395A1 (en) * | 2001-12-19 | 2003-07-17 | Shetty Jayarama K. | Process for hydrolyzing starch without pH adjustment |
WO2004111217A2 (en) * | 2003-06-13 | 2004-12-23 | Danisco A/S | Variant pseudomonas polypeptides having a non-maltogenic exoamylase activity and their use in preparing food products |
US8143048B2 (en) * | 2003-07-07 | 2012-03-27 | Danisco A/S | Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof |
WO2005007818A2 (en) * | 2003-07-07 | 2005-01-27 | Genencor International, Inc. | Exo-specific amylase polypeptides, nucleic acids encoding those polypeptides and uses thereof |
US20060008890A1 (en) * | 2004-07-07 | 2006-01-12 | Kragh Karsten M | Polypeptide |
US20060018997A1 (en) * | 2004-07-07 | 2006-01-26 | Kragh Karsten M | Polypeptide |
US20060008888A1 (en) * | 2004-07-07 | 2006-01-12 | Kragh Karsten M | Polypeptide |
US20060073583A1 (en) * | 2004-09-22 | 2006-04-06 | Kragh Karsten M | Polypeptide |
JP2008544751A (ja) * | 2005-07-07 | 2008-12-11 | ダニスコ エイ/エス | Pseudomonassaccharophilia由来の修飾アミラーゼ |
US8030050B2 (en) * | 2005-07-07 | 2011-10-04 | Danisco A/S | Modified amylases from Pseudomonas species |
-
2006
- 2006-07-07 JP JP2008518981A patent/JP2008544751A/ja active Pending
- 2006-07-07 AU AU2006268418A patent/AU2006268418A1/en not_active Abandoned
- 2006-07-07 CA CA002614274A patent/CA2614274A1/en not_active Abandoned
- 2006-07-07 WO PCT/GB2006/002513 patent/WO2007007053A1/en active Search and Examination
- 2006-07-07 US US11/483,220 patent/US20070141693A1/en not_active Abandoned
- 2006-07-07 EP EP06755730A patent/EP1907538A1/en not_active Withdrawn
- 2006-07-07 MX MX2008000374A patent/MX2008000374A/es not_active Application Discontinuation
- 2006-07-07 KR KR1020087001580A patent/KR20080023746A/ko not_active Application Discontinuation
- 2006-07-07 CN CNA2006800279117A patent/CN101238210A/zh active Pending
- 2006-07-07 BR BRPI0612288-4A patent/BRPI0612288A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2006-07-07 RU RU2008104637/13A patent/RU2008104637A/ru not_active Application Discontinuation
-
2008
- 2008-01-07 US US11/970,473 patent/US20080292747A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP1907538A1 (en) | 2008-04-09 |
US20070141693A1 (en) | 2007-06-21 |
CN101238210A (zh) | 2008-08-06 |
CA2614274A1 (en) | 2007-01-18 |
MX2008000374A (es) | 2008-03-07 |
JP2008544751A (ja) | 2008-12-11 |
US20080292747A1 (en) | 2008-11-27 |
BRPI0612288A2 (pt) | 2009-01-27 |
KR20080023746A (ko) | 2008-03-14 |
WO2007007053A1 (en) | 2007-01-18 |
AU2006268418A1 (en) | 2007-01-18 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2008104637A (ru) | Модифицированная амилаза из pseudomonas saccharophilia | |
RU2009101321A (ru) | Полипептид | |
RU2007104586A (ru) | Полипептид | |
JP5174077B2 (ja) | マルトース産生アルファアミラーゼ変異体 | |
Aleshin et al. | Crystal structure and evolution of a prokaryotic glucoamylase | |
Axe | Estimating the prevalence of protein sequences adopting functional enzyme folds | |
Coutinho et al. | Glucoamylase structural, functional, and evolutionary relationships | |
Imamura et al. | Crystal structures of 4-α-glucanotransferase from Thermococcus litoralis and its complex with an inhibitor | |
CN102245764B (zh) | 杂合α-淀粉酶 | |
JP2018532413A (ja) | タンパク質発現の増強およびその方法 | |
US20240180172A1 (en) | Amylase polypeptides with improved properties | |
de Lemos Esteves et al. | Acidophilic adaptation of family 11 endo‐β‐1, 4‐xylanases: Modeling and mutational analysis | |
EP1601765A2 (en) | Variants of enzymes of the alpha-amylase family | |
Wang et al. | Low‐molecular‐weight glutenin subunits from the 1U genome of Aegilops umbellulata confer superior dough rheological properties and improve breadmaking quality of bread wheat | |
US20070190604A1 (en) | Novel Gene Products From Bacillus Licheniformis Forming Or Decomposing Polyamino Acids And Improved Biotechnological Production Methods Based Thereon | |
CN108795893A (zh) | 一种氨基酸脱氢酶突变体及其制备方法和应用 | |
JPH04500609A (ja) | 工業的応用条件下で安定性が減少した酵素変異体 | |
Wong et al. | High-Activity Barley\bold\ralpha-Amylase by Directed Evolution | |
GUO et al. | Characterization of HMW prolamines and their coding sequences from Crithopsis delileana | |
Miao et al. | Enhanced extracellular expression of α-Amylase DL3-4-1 in Bacillus subtilis via systematic screening of optimal signal peptides | |
Feng et al. | Molecular cloning of a novel chimeric HMW glutenin subunit gene 1Dx5′ from a common wheat line W958 | |
EP0707640A1 (en) | (1 $m(7) 3, 1 $m(7) 4)-$g(b)-GLUCANASE OF ENHANCED STABILITY | |
Wachi et al. | A novel RNase G mutant that is defective in degradation of adhE mRNA but proficient in the processing of 16S rRNA precursor | |
CN111466511B (zh) | 含有去环氧基蛋白酶的组合物及脱毒方法 | |
CN1222938A (zh) | 经修饰具有改变了的钙离子吉合性质的α-淀粉酶 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20101201 |