RU2000130809A - Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена zwa1 - Google Patents
Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена zwa1Info
- Publication number
- RU2000130809A RU2000130809A RU2000130809/13A RU2000130809A RU2000130809A RU 2000130809 A RU2000130809 A RU 2000130809A RU 2000130809/13 A RU2000130809/13 A RU 2000130809/13A RU 2000130809 A RU2000130809 A RU 2000130809A RU 2000130809 A RU2000130809 A RU 2000130809A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- polynucleotide
- gene encoding
- sequence
- lysine
- bacteria
- Prior art date
Links
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 title 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 title 1
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 claims 15
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 15
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 11
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims 6
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims 6
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 claims 6
- 235000019766 L-Lysine Nutrition 0.000 claims 5
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 claims 4
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims 3
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 claims 3
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 claims 3
- 229920002676 Complementary DNA Polymers 0.000 claims 2
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims 2
- DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N Phosphoenolpyruvic acid Natural products OC(=O)C(=C)OP(O)(O)=O DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 2
- 230000000295 complement Effects 0.000 claims 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims 2
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 2
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 claims 1
- 101710010137 46.1 Proteins 0.000 claims 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 claims 1
- 241000186226 Corynebacterium glutamicum Species 0.000 claims 1
- 108060002107 DAPA Proteins 0.000 claims 1
- 108010055400 EC 2.7.2.4 Proteins 0.000 claims 1
- 108091000044 EC 4.3.3.7 Proteins 0.000 claims 1
- 108010053763 EC 6.4.1.1 Proteins 0.000 claims 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims 1
- 108010081616 FAD-dependent malate dehydrogenase Proteins 0.000 claims 1
- 102100006425 GAPDH Human genes 0.000 claims 1
- 101710008404 GAPDH Proteins 0.000 claims 1
- 102100007000 PC Human genes 0.000 claims 1
- 101710017505 PP_4473 Proteins 0.000 claims 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 claims 1
- 230000037348 biosynthesis Effects 0.000 claims 1
- 101700045639 dapD Proteins 0.000 claims 1
- 108060005955 dapE Proteins 0.000 claims 1
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 claims 1
- 230000002068 genetic Effects 0.000 claims 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims 1
- 230000037353 metabolic pathway Effects 0.000 claims 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims 1
- 230000001264 neutralization Effects 0.000 claims 1
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N p-acetaminophenol Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 claims 1
- 108010056371 succinyldiaminopimelate desuccinylase Proteins 0.000 claims 1
- 101710004873 yclM Proteins 0.000 claims 1
Claims (16)
1. Выделенный полинуклеотид, содержащий полинуклеотидную последовательность, выбранную из группы, включающей:
а) полинуклеотид, идентичный по крайней мере на 70% полинуклеотиду, кодирующему полипептид, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 2,
б) полинуклеотид, кодирующий полипептид, который содержит аминокислотную последовательность, идентичную по крайней мере на 70% аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2,
в) полинуклеотид, комплементарный полинуклеотидам, указанным в подпункте а) или б), и
г) полинуклеотид, содержащий по крайней мере 15 последовательных пар оснований полинуклеотидной последовательности, указанной в подпункте а), б) или в).
а) полинуклеотид, идентичный по крайней мере на 70% полинуклеотиду, кодирующему полипептид, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 2,
б) полинуклеотид, кодирующий полипептид, который содержит аминокислотную последовательность, идентичную по крайней мере на 70% аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 2,
в) полинуклеотид, комплементарный полинуклеотидам, указанным в подпункте а) или б), и
г) полинуклеотид, содержащий по крайней мере 15 последовательных пар оснований полинуклеотидной последовательности, указанной в подпункте а), б) или в).
2. Полинуклеотид по п. 1, который представляет собой реплицируемую в коринебактериях, предпочтительно рекомбинантную, ДНК.
3. Полинуклеотид по п. 1, который представляет собой РНК.
4. Полинуклеотид по п. 2, содержащий нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1.
5. Реплицируемая ДНК по п. 2, которая включает:
(I) нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1, или
(II) по крайней мере одну последовательность, которая соответствует последовательности, указанной в подпункте (I), в пределах вырожденности генетического кода, или
(III) по крайней мере одну последовательность, которая гибридизуется с последовательностями, комплементарными последовательностям, указанным в подпункте (I) или (II), и при необходимости
(IV) функционально нейтральные смысловые мутации в последовательности, указанной в подпункте (I).
(I) нуклеотидную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 1, или
(II) по крайней мере одну последовательность, которая соответствует последовательности, указанной в подпункте (I), в пределах вырожденности генетического кода, или
(III) по крайней мере одну последовательность, которая гибридизуется с последовательностями, комплементарными последовательностям, указанным в подпункте (I) или (II), и при необходимости
(IV) функционально нейтральные смысловые мутации в последовательности, указанной в подпункте (I).
6. Вектор, содержащий полинуклеотид по п. 1, прежде всего pCR2.1zwalexp, отличающийся тем, что он имеет рестрикционную карту, приведенную на чертеже, и депонирован в Е. coli под регистрационным номером DSM 13115.
7. Служащие в качестве клеток-хозяев коринебактерии, которые содержат вектор по п. 6 или в которых усилен ген zwal.
8. Способ получения L-аминокислот, прежде всего L-лизина, отличающийся тем, что осуществляют следующие стадии:
а) ферментацию с использованием продуцирующих целевую L-аминокислоту бактерий, в которых по крайней мере усиливают ген zwal,
б) накопление целевого продукта в среде или в клетках бактерий и
в) выделение L-аминокислоты.
а) ферментацию с использованием продуцирующих целевую L-аминокислоту бактерий, в которых по крайней мере усиливают ген zwal,
б) накопление целевого продукта в среде или в клетках бактерий и
в) выделение L-аминокислоты.
9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что применяют бактерии, в которых дополнительно усиливают другие гены пути биосинтеза целевой L-аминокислоты.
10. Способ по п. 8, отличающийся тем, что применяют бактерии, в которых по крайней мере частично подавляют пути обмена веществ, препятствующие образованию L-лизина.
11. Способ по любому из пп. 8-10, отличающийся тем, что применяют коринебактерии, продуцирующие L-лизин.
12. Способ по п. 8, отличающийся тем, что для получения L-лизина осуществляют ферментацию с использованием бактерий, в которых одновременно усиливают, прежде всего сверхэкспрессируют или амплифицируют, один или несколько генов, выбранных из группы, включающей
12.1. ген dapA, кодирующий дигидродипиколинат-синтазу,
12.2. ген lysC, кодирующий устойчивую в отношении обратной связи аспартаткиназу,
12.3. ген dapD, кодирующий тетрадигидродипиколинат-сукцинилазу,
12.4. ген dapE, кодирующий сукцинилдиаминопимелат-десукцинилазу,
12.5. ген gap, кодирующий глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу,
12.6. ген рус, кодирующий пируваткарбоксилазу,
12.7. ген mqo, кодирующий малат-хинон-оксидоредуктазу,
12.8. ген lysE, кодирующий экспорт лизина.
12.1. ген dapA, кодирующий дигидродипиколинат-синтазу,
12.2. ген lysC, кодирующий устойчивую в отношении обратной связи аспартаткиназу,
12.3. ген dapD, кодирующий тетрадигидродипиколинат-сукцинилазу,
12.4. ген dapE, кодирующий сукцинилдиаминопимелат-десукцинилазу,
12.5. ген gap, кодирующий глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназу,
12.6. ген рус, кодирующий пируваткарбоксилазу,
12.7. ген mqo, кодирующий малат-хинон-оксидоредуктазу,
12.8. ген lysE, кодирующий экспорт лизина.
13. Способ по п. 8, отличающийся тем, что для получения L-лизина осуществляют ферментацию с использованием бактерий, в которых одновременно ослабляют один или несколько генов, выбранных из группы, включающей
13.1. ген рск, кодирующий фосфоенолпируват-карбоксикиназу,
13.2. ген pgi, кодирующий глюкозо-6-фосфатизомеразу.
13.1. ген рск, кодирующий фосфоенолпируват-карбоксикиназу,
13.2. ген pgi, кодирующий глюкозо-6-фосфатизомеразу.
14. Способ по любому из пп. 8-13, отличающийся тем, что применяют микроорганизмы вида Corynebacterium glutamicum.
15. Применение полинуклеотидных последовательностей по п. 1 или их частей в качестве гибридизационных зондов для выделения кДНК, кодирующей генный продукт Zwal.
16. Применение полинуклеотидных последовательностей по п. 1 или их частей в качестве гибридизационных зондов для выделения кДНК или генов, обладающих высоким сходством с последовательностью гена zwal.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19959328.0 | 1999-12-09 | ||
DE19959328A DE19959328A1 (de) | 1999-12-09 | 1999-12-09 | Neue für das zwa1-Gen codierende Nukleotidsequenzen |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2000130809A true RU2000130809A (ru) | 2003-01-10 |
RU2260048C2 RU2260048C2 (ru) | 2005-09-10 |
Family
ID=7931969
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2000130809/13A RU2260048C2 (ru) | 1999-12-09 | 2000-12-08 | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена zwal |
Country Status (17)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US6632644B2 (ru) |
EP (1) | EP1111062B1 (ru) |
JP (1) | JP2001197893A (ru) |
KR (1) | KR20010062272A (ru) |
CN (1) | CN1304998A (ru) |
AT (1) | ATE293698T1 (ru) |
AU (1) | AU7201800A (ru) |
BR (1) | BR0005804A (ru) |
DE (2) | DE19959328A1 (ru) |
ES (1) | ES2241538T3 (ru) |
HU (1) | HUP0004880A2 (ru) |
ID (1) | ID28607A (ru) |
MX (1) | MXPA00010971A (ru) |
PL (1) | PL202783B1 (ru) |
RU (1) | RU2260048C2 (ru) |
SK (1) | SK18342000A3 (ru) |
ZA (1) | ZA200007269B (ru) |
Families Citing this family (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20060014259A9 (en) * | 1999-07-09 | 2006-01-19 | Kevin Burke | Process for the preparation of L-amino acids with amplification of the zwf gene |
US20050112733A1 (en) * | 2000-03-20 | 2005-05-26 | Degussa Ag | Process for the preparation of L-amino acids with amplification of the zwf gene |
DE10047142A1 (de) * | 2000-09-23 | 2002-04-11 | Degussa | Verfahren zur fermentativen Herstellung von D-Pantothensäure unter Verwendung coryneformer Bakterien |
KR100943834B1 (ko) * | 2001-08-06 | 2010-02-24 | 에보니크 데구사 게엠베하 | L-리신을 생산하는 코리네형 세균 및 코리네형 세균을 사용하여 l-리신을 생산하는 방법 |
US7160711B2 (en) | 2001-08-06 | 2007-01-09 | Degussa Ag | Coryneform bacteria which produce chemical compounds I |
JP4152320B2 (ja) * | 2001-09-28 | 2008-09-17 | 協和醗酵工業株式会社 | アミノ酸の製造法 |
DE10210527A1 (de) | 2002-03-09 | 2003-09-18 | Degussa | Allele des aceA-Gens aus coryneformen Bakterien |
DE102004011248A1 (de) * | 2004-03-09 | 2005-09-22 | Degussa Ag | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien |
KR100768748B1 (ko) * | 2004-12-30 | 2007-10-19 | 씨제이 주식회사 | 외래의 nadp 의존적 글리세르알데히드-3-포스페이트디히드로게나제 유전자를 포함하는 에세리키아 종 또는코리네박리움 종 미생물 및 그를 이용하여 l-라이신을생산하는 방법 |
DE102005013676A1 (de) | 2005-03-24 | 2006-09-28 | Degussa Ag | Allele des zwf-Gens aus coryneformen Bakterien |
US20070092951A1 (en) | 2005-03-24 | 2007-04-26 | Degussa Ag | Alleles of the zwf gene from coryneform bacteria |
DE102005023829A1 (de) | 2005-05-24 | 2006-11-30 | Degussa Ag | Allele des opcA-Gens aus coryneformen Bakterien |
DE102007005072A1 (de) | 2007-02-01 | 2008-08-07 | Evonik Degussa Gmbh | Verfahren zur fermentativen Herstellung von Cadaverin |
US20090246226A1 (en) * | 2008-03-28 | 2009-10-01 | Zeon Corporation | Avian vaccines possessing a positive marker gene |
KR101294935B1 (ko) | 2011-04-01 | 2013-08-08 | 씨제이제일제당 (주) | 에세리키아 속 균주에서 유래된 프락토키나제 유전자가 도입된 코리네박테리움 속 균주 및 상기 균주를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법 |
US11208649B2 (en) | 2015-12-07 | 2021-12-28 | Zymergen Inc. | HTP genomic engineering platform |
US9988624B2 (en) | 2015-12-07 | 2018-06-05 | Zymergen Inc. | Microbial strain improvement by a HTP genomic engineering platform |
BR112018011503A2 (pt) | 2015-12-07 | 2018-12-04 | Zymergen Inc | promotores da corynebacterium glutamicum |
WO2018005655A2 (en) | 2016-06-30 | 2018-01-04 | Zymergen Inc. | Methods for generating a bacterial hemoglobin library and uses thereof |
JP2019519241A (ja) | 2016-06-30 | 2019-07-11 | ザイマージェン インコーポレイテッド | グルコース透過酵素ライブラリーを生成するための方法およびその使用 |
JP2020524492A (ja) | 2017-06-07 | 2020-08-20 | ザイマージェン インコーポレイテッド | Corynebacterium glutamicum由来のプロモーターおよび補助遺伝子発現の制御におけるその使用 |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5643758A (en) * | 1987-03-10 | 1997-07-01 | New England Biolabs, Inc. | Production and purification of a protein fused to a binding protein |
DE3943117A1 (de) * | 1989-12-27 | 1991-07-04 | Forschungszentrum Juelich Gmbh | Verfahren zur fermentativen herstellung von aminosaeure, insbesondere l-lysin, dafuer geeignete mikroorganismen und rekombinante dna |
US6797509B1 (en) * | 1999-07-09 | 2004-09-28 | Degussa-Huls Ag | Nucleotide sequences which code for the tal gene |
-
1999
- 1999-12-09 DE DE19959328A patent/DE19959328A1/de not_active Withdrawn
-
2000
- 2000-11-04 AT AT00124042T patent/ATE293698T1/de not_active IP Right Cessation
- 2000-11-04 EP EP00124042A patent/EP1111062B1/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-11-04 DE DE50010097T patent/DE50010097D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-11-04 ES ES00124042T patent/ES2241538T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2000-11-08 MX MXPA00010971A patent/MXPA00010971A/es unknown
- 2000-11-24 ID IDP20001018A patent/ID28607A/id unknown
- 2000-12-01 AU AU72018/00A patent/AU7201800A/en not_active Abandoned
- 2000-12-01 SK SK1834-2000A patent/SK18342000A3/sk unknown
- 2000-12-06 JP JP2000371852A patent/JP2001197893A/ja active Pending
- 2000-12-07 CN CN00134034A patent/CN1304998A/zh active Pending
- 2000-12-07 ZA ZA200007269A patent/ZA200007269B/xx unknown
- 2000-12-08 BR BR0005804-1A patent/BR0005804A/pt not_active Application Discontinuation
- 2000-12-08 PL PL344386A patent/PL202783B1/pl unknown
- 2000-12-08 KR KR1020000074679A patent/KR20010062272A/ko not_active Application Discontinuation
- 2000-12-08 RU RU2000130809/13A patent/RU2260048C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2000-12-08 HU HU0004880A patent/HUP0004880A2/hu unknown
- 2000-12-08 US US09/731,909 patent/US6632644B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2003
- 2003-08-14 US US10/640,263 patent/US7074607B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2006
- 2006-05-22 US US11/419,529 patent/US7262036B2/en not_active Expired - Fee Related
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2000130809A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена zwa1 | |
CN100357431C (zh) | 新的赖氨酸脱羧酶基因以及生产l-赖氨酸的方法 | |
RU2000126322A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена pck | |
RU2000123636A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена pg1 | |
RU2001108535A (ru) | Нуклеотидные последовательности гена tal | |
RU2001130146A (ru) | Бактерия, продуцирующая l-аминокислоту, и способ получения l-аминокислоты | |
RU2000122755A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена thre и способ ферментативного получения l-треонина с использованием коринебактерий | |
US7074607B2 (en) | Polynucleotide sequences which encode the zwa1 gene | |
KR20050059685A (ko) | 트립토판 생합성 관련 변이유전자를 함유한 대장균 변이주및 이를 이용한 트립토판 제조방법 | |
RU2000125061A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена eno | |
EP1491634A1 (en) | Feedback resistant acetohydroxy acid synthetase mutants | |
KR102434925B1 (ko) | 3-메틸-2-옥소뷰타노에이트 하이드록시 메틸트랜스퍼라아제의 활성이 강화된 미생물, 및 이의 용도 | |
KR101276978B1 (ko) | 코리네형 박테리아의 prpd-1 유전자의 대립유전자 | |
US20020151700A1 (en) | Method to monitor a fermentation process | |
US7105302B2 (en) | Nucleotide sequences coding for the pknB gene | |
ZA200102385B (en) | Nucleotide sequences coding for the dapC gene and process for the production of L-lysine. | |
KR20090086554A (ko) | 코리네형 박테리아의 oxyr 유전자의 대립유전자 | |
RU2001100696A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена ptsh | |
US7226763B2 (en) | Process for preparing L-amino acids with corynebacteria with enhanced nucleotide sequences coding for pknD | |
RU2000130808A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена zwa2 | |
RU2000129933A (ru) | Новые кодирующие нуклеотидные последовательности гена glk | |
KR20220152728A (ko) | 3-메틸-2-옥소뷰타노에이트 하이드록시 메틸트랜스퍼라아제의 활성이 강화된 미생물, 및 이의 용도 | |
CN1295131A (zh) | 利用棒状细菌发酵生产l-赖氨酸的方法 | |
RU2001107500A (ru) | Кодирующие нуклеотидные последовательности гена dapc и способ получения l-лизина | |
RU2000129483A (ru) | Новые нуклеотидные кодирующие последовательности генов sucC и sucD |