KR20130094830A - 재조합 단백질의 높은 레벨의 발현을 위한 발현 벡터 - Google Patents

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Abstract

본 발명은, 흥미있는 유전자에 실시가능하게 결합된 프로모터(promoter operably linked to gene of interest), TPL 및 VA 유전자 I 및 II, 매트릭스 부착 영역(MARs)/SARs, 항생물질 마커를 포함하는, 단백질들 및 펩티드들의 생산을 위한 발현 벡터에 관한 것이다. 상기 벡터는 적절한 숙주 세포에서 트랜스펙션된다.

Description

재조합 단백질의 높은 레벨의 발현을 위한 발현 벡터{EXPRESSION VECTOR FOR HIGH LEVEL EXPRESSION OF RECOMBINANT PROTEINS}
본 발명은, 재조합 치료 단백질(recombinant therapeutic proteins)의 높은 레벨 발현을 위한 신규한 발현 벡터에 관한 것이다. 특히, 본 발명은, 재조합 단백질을 코딩하는 유전자 서열 및 매트릭스 부착 영역(matrix attachment region)과 같은 적어도 하나의 실시가능하게 결합된 발현 증진 요소(at least one operably linked expression enhancing element)를 갖는 발현 벡터를 나타낸 것이다. 상기 벡터는, 그 밖의 조절 인자를 더 포함할 수도 있다. 다른 실시형태에서, 본 발명은 상기 발현 벡터로 트렌스펙션된 포유동물 세포를 포함한다(the invention comprises mammalian cells transfected with the said expression vector).
치료 단백질의 증가된 요구는 주로, 소분자 기초 약물(small molecule based drugs)과 비교하여, 독성의 명확한 위험을 현저하게 감소시키는, 이들의 일반적인 매우 특정한 목표의 행동 때문이다(The increased demand of therapeutic proteins is primarily due to their generally highly specific target of action which results in significantly reduced and well-defined risk of toxicity compared to small molecule based drugs). 모든 이러한 환자-우호적인 특성(patient-friendly qualities)을 가짐에도 불구하고, 대부분의 치료 단백질은, 이들은 엄청난 비용을 지속적으로 유지하여야 하기 때문에, 전 세계에서 대부분의 사람에게 접근하기 어려운 상태로 있다. 따라서, 삶의 질을 현저하게 개선시키는, 에리스로포이에틴, 다베포이에틴(Darbepoietin), TNKase, 에타너셉트(Etanercept), 성선자극호르몬(Gonadotropins)와 같은 그 밖의 중요한 약물 또는 인명구조(life saving), 및 리툭시맙(Rituximab), 트라스투주맙(Trastuzumab) 및 그 밖의 치료 모노클론 항체(other therapeutic monoclonal antibodies) 등과 같은 많은 항-암 모노클로날 약물은, 매우 작은 퍼센트의 사람에 의해서만 제공되는 반면에, 전 세계에 대다수의 아픈 사람들은 이들을 제공받지 못한다. 따라서, 이러한 약물의 비용을 낮추는 것에 대한 필요가 시급하다.
이러한 높은 비용의 높은 요소(A large component of this high cost)는, 이들의 낮은 생산 산출량(their low production yields) 때문에 발생되는 이들의 제조와 관련되어 있다. 클론(clone)의 생산 산출량은, 배양 조건[배지 구성요소(media components), 온도, pH etc.] 및 다운스트림 정제 과정(downstream purification process)과 같은 외부의 요소, 및 벡터의 선별과 같은 내부의 요소 및 프로모터, 전사(transcription) 또는 번역 증진 요소(translation enhancing elements) 등과 같은 이의 조절 요소(its regulatory elements) 및 이들의 적절한 방향(their appropriate orientation) 및 또한 적절한 숙주 세포의 선택과 같은 몇 가지 요소의 선택에 달려있다. 포유동물 세포는, 이가 글리코실화의 천연의 능력(natural capacity)을 가짐으로써, 재조합 치료의 단백질의 높은 발현을 수득하기 위한 가장 유망한 발현 시스템이다. 또한, 이러한 발현 시스템에서, 번역 후 변형(post-translational modifications)이 인간 세포 발현 단백질에서 발견되는 것과 유사하게 할 가능성이 많고, 따라서 생리적인 활동성(physiological activity)을 만들게 한다. 그러나, 진핵생물의 세포에서의 발현 레벨은, 또 다른 내부의 인자(another internal factor), 즉 숙주 세포의 게놈에서 흥미있는 유전자를 포함하는 재조합 발현 구조물(recombinant expression construct)의 통합 부위(integration site)에 따라 매우 좌우된다.
원하는 단백질을 코딩하는 흥미있는 유전자를 포함하는 재조합 발현 플라스미드는, 원하는 재조합 단백질을 발현하는, 안정된 CHO 트랜스펙턴트(stable CHO transfectants) 또는 그 밖의 포유동물 트랜스펙턴트를 생성하는데 일상적으로 사용된다. 진핵생물 과발현(eukaryotic overexpression)을 위한 이상적인 시스템은, 강하고, 안정적이거나 또는 장기간 발현을 가능하게 하는 위치에서의 타겟 세포(target cell)의 게놈에서의 발현 카세트의 통합(integration of the expression cassette)을 가질 수 있다. 그러나, 가장 현재의 방법은, 숙주 세포의 게놈 내로 플라스미드 DNA의 임의적인 통합(random integration)만을 달성한다. 상기 발현 레벨이, 이러한 트랜스펙션 공정(transfection process)에서 발생된 클론 집단(clonal populations)에서의 매우 가변적임을 상기 문헌으로부터 분명하다(Brian K Lucas et al., Nucleic Acids Research, 1996, Vol. 24, No. 9 , R.T. Schimke et al., Br. J. Cancer (1985), 51, 459-465, Wurtele H, et al., Gene Ther. 2003 Oct;10(21):1791-9. Biotechnol Prog. 2000 Sep-Oct;16(5):710-5, Yoshikawa T et al., Biotechnol Prog. 2000 Sep-Oct;16(5):710-5., Kim NS, et al., Biotechnol Prog. 2001 Jan-Feb;17(1):69-75). 또한, 높은 레벨로 원하는 재조합 단백질을 발현시킬 수 있는, 안정되게 통합된 재조합 유전자를 운반하는 형질주입종(transfectomas carrying the stably integrated recombinant gene)의 빈도는 매우 낮다.
일반적으로, 다수의 안정되게 트랜스펙션된 세포는, 높은 레벨로 상기 재조합 단백질을 발현하는 클론을 확인하기 위해 스크린되어야 한다(a large number of stably transfected cells must be screened to identify clones which express the recombinant proteins at high levels). 포유동물 게놈은 매우 크고, 이의 오직 0.1 % 만이 전사적으로 활성 서열(transcriptionally)을 포함하는 바와 같이, 이는 통합 부위의 유전적인 환경(the genomic environment of the integration site)의 효과 때문일 것으로 주로 여겨진다(Little (1993) Nature 366:204). 통합에 발현에 영향을 미치는 통합(integration influencing expression)의 부위의 이러한 현상을 "위치 효과(position effect)"라고 한다. 위치 효과는, 하기의 메커니즘의 어떠한 것 또는 모두로 인하여, 양성적인 또는 음성적인 방식(positive or negative manner)으로 통합된 유전자의 발현 레벨을 조절한다 - 1) 통합된 유전자의 발현을 조절하는데 참여할 수도 있는, 통합의 부위 근처에 조절하는 요소(regulatory elements)의 존재, 2) 통합의 부위에서 염색질 구조(chromatin structure), 3) 통합의 부위에서 DNA 메틸화 활성도(methylation activity). 위치 효과의 음성적인 영향은, DNA 메틸화 또는 히스톤 탈아세틸(histone deacetylation)을 통해 유전자 발현억제(gene silencing)로서 엄격할 수 있다(The negative impact of position effect can be as harsh as gene silencing via DNA methylation or histone deacetylation).
따라서, CHO 세포의 게놈 내로 임의적인 플라스미드 통합의 기술이, 높은 레벨의 유전자 발현시킬 수 있는 전사적으로 활성 구역(transcriptionally active zone) 내로 재조합 유전자의 삽입을 항상 야기할 것임은, 아주 가능성이 적은 일이다. 이는, 높은 발현 클론(high expressing clone)을 발견하도록 선별되는데 필요한 클론의 수가 매우 클 것임을 의미한다.
임의적인 통합(random integration)과 관련된 문제점을 극복하기 위해, 게놈에서 부위 특이적인 방식으로 원하는 유전자를 통합하기 위한 시스템의 발견은 문헌에 기재되어 있고, 제한된 성공(limited success)과 함께 사용되고 있다. 예를 들어, 몇몇 그룹은, 게놈의 전사적으로 활성 부위에서 흥미있는 유전자의 부위-특이적인 재조합 매개 도입(site-specific recombination mediated introduction)을 위한 특정한 효소를 사용한다. Cre 및 FLP와 같은 재조합효소는 동일한 타겟 부위(the same target sites)와 통합(integration) 및 절단(excision) 둘 다를 수행한다(Sauer, B. (1994) Curr Opin. Biotechnol., 5, 521-527, Sternberg et al, J Mol Biol, 1981,150,467-486, Broach et al, Cell, 1980,21,501-508). 그러나, 이러한 재조합효소가 포유동물 세포에서의 효과적인 통합을 수행할지라도, 이들이 매개하는 순 통합 빈도(net integration frequency)는 과도한 반작용(excessive back reaction) 때문에 매우 낮다. 따라서, 안정적이고 높은 발현의 문제는 해결되어야할 것으로 여전히 남아있다.
전통적으로, 안정된 높게 생산하는 세포주를 성취하기 위해, 메토트렉세이트(MTX) 매개된 유전자 확대 과정(methotrexate mediated gene amplification process)과 같은 유전자 복제 수를 증가시키는 방법이 일반적으로 사용된다. 트랜스펙션은, 원하는 표현형을 갖는 단일 세포 클론의 광범위한 검색이 따른다(Transfection is followed by extensive search of single cell clones having the desired phenotype). 또한, 메토트렉세이트의 레벨은, 각각의 증가 레벨(each increment level)에서 안정화되기 위해 세포를 위한 충분한 시간이 주어지면서, 소폭 증가로(in small increments) 일반적으로 증가된다. 따라서, 트랜스펙션된 포유동물 세포로부터 발현을 증가시키는 이러한 과정은 시간 소모가 크고, 노동 집약적이다.
진핵생물의 유전자의 전사는, 여러 가지의 cis- 및 trans-작용하는 조절 요소(cis- and trans-acting regulatory elements)에 의해 조절된다(Dillon et.al., (1993) Trends Genet. 9:134). 가장 특징지어진 cis- 요소 중 두 가지는, 프로모터 및 인핸서(enhancers)이다. 프로모터는, 상기 유전자의 코딩 서열(coding sequence)에 대한 5' 가까이의 DNA 서열이다(Promoters are DNA sequences immediately 5' to the coding sequence of the gene). 이들은, 기본적인 전사 장치(basic transcription apparatus)를 형성하는, 트랜스-작용하는 전사 인자(trans-acting transcription factors)를 위한 다수의 결합 부위를 포함한다. 유리하게, 인핸서(enhancers)는 또한, 트랜스-작용하는 전사 인자를 위한 다수의 결합 부위로 구성되어 있지만, 코팅 서열의 업스트림 또는 다운스트림에서 멀리 또는 인트론 내 조차도 발견될 수 있다. 이러한 요소는, 방향 독립 방식(orientation independent manner)으로 또한 작용할 수 있다. 프로모터 및 인핸서의 활성도는, 일시적인 발현 시스템(transient expression systems)에서 검출될 수 있고, 이들은, 조직 특이적이거나 또는 조직 특이적이지 않을 수도 있는 요소를 포함한다.
본 발명의 발명자는, 높은 발현 레벨의 재조합 단백질을 성취하기 위해, a) CMV 프로모터, b) 인트론, c) TPL, d) VA 유전자 및 e) 소의 성장 호르몬 폴리아데닐화 서열(bovine growth hormone polyadenylation sequence)와 같은 조절 요소의 병용 효과(combined effect)를, 이들의 출원 WO2007017903에 이미 기재되어 있다.
cis-작용하는 조절 요소의 그 밖의 카테고리는, 염색질 구조(chromatin structure)를 조절하는 것으로 여겨지는 것이고, 유전자자리 조절 영역(locus control regions, LCRs)[Grosveld et.al., (1987) Cell 51:975], 매트릭스 부착 영역(matrix attachment regions, MARs)[Phi-Van et.al., (1990) Mol. Cell. Biol. 10:2302], 스캐폴드 부착 영역(scaffold attachment regions, SARs)[Gasser and Laemmli (1987) Trens Genet. 3:16], 인슐레이터 요소(insulator elements)[Kellum and Schedl (1991) Cell 64:941] 및 핵 매트릭스-관련 DNAs(Nuclear matrix-Associating DNAs)[Bode J et.al., (1992) Science 255:195]을 포함한다.
MARs 및 SARs는, 이들은 긴 거리(long distances) 상에서 작용할 수 있으므로 유사한 인핸서(similar enhancers)이지만, 이들의 효과가 안정적으로 형질전환된 세포주(stably transformed cell lines) 또는 형질전환 동물(transgenic animal)에서만 검출할 수 있으므로 유일하다. LCRs는, 이들은 위치 및 방향 의존적이고, 조직 특이적인 방식으로 활동성이 있으므로, 다른 타입의 인핸서와 또한 다르다.
SARs/MARs 요소는, 위치 효과의 문제점을 제거하고, 발현 구조(expression construct)에서의 매우 유효한 유전자를 제공하는데 사용되고 있다. 이들은, 인근의 숙주 세포 염색질 요소(neighbouring host cell chromatin elements)가 전이유전자 발현(transgene expression)에 영향을 미치는 것을 예방한다.
MARs는, 유효하게 번역된 유전자를 둘러싸는 영역(regions surrounding actively transcribed genes)으로부터 분리되지만, 또한 동원체(centromere) 및 텔로미어 영역(telomeric regions)으로부터 분리된다. 그들은, 전사 활성도(transcription activity)를 조절함으로써 원하는 유전자의 발현을 증가시킨다.
초파리 Scs 경계 요소(Drosophila Scs boundary element), hspSAP MAR, 마우스 T 세포 수용체 TCRα, 랫 유전자자리 조절 부위(Rat locus control region), β-글로빈 MAR, 아폴리포단백질 B SAR 요소 등과 같은 몇몇의 상이한 MARs/SARs는, 존재하는 문헌에서 상이한 종 및 상이한 고도로 발현된 유전자(different highly expressed genes)로부터 보고되고 있다. 대부분의 이러한 요소는, CHO 세포에서 원하는 유전자의 발현 레벨에서의 향상을 조정하기 위해 낮게 나타난다(P.A. Girod and Nicolas Mermod, Gene Transfer and Expression in Mammalian Cell, 2003). 대조적으로, 닭 라이소자임 MAR(Chicken Lysozyme MAR, cLysMAR)은, MAR 요소가 부재한 경우의 대조군과 비교한 바와 같이, 5 내지 6 배 보다 높은 발현 레벨(5 to 6 fold higher expression levels)을 나타낸다(P.A. Girod and Nicolas Mermod, Gene Transfer and Expression in Mammalian Cell, 2003). 또한, 동일한 MARs가 발현 카세트의 측면에 배치된 양쪽에 사용된 경우, 발현 레벨에서의 4 내지 5배의 추가적인 증가가 관찰된다(P.A. Girod and Nicolas Mermod, Gene Transfer and Expression in Mammalian Cell, 2003). 따라서, 이는, cLysMAR이 선행 기술에서 보고된 가장 촉망받는 요소임을 명확하다. cLysMAR는, 닭 라이소자임 유전자의 먼 업스트림에 위치한다(cLysMAR is localized far upstream of the chicken lysozyme gene)(Phi-Van and Stratling, EMBO, 7,3, pp 655-64,1988). 형질전환된 동물 세포주에서, 이러한 MAR은, 전이유전자 발현의 전체적인 레벨을 증가시키고, 보고 유전자(reporter gene) 주위에 위치한 경우, 이의 위치 의존적인 가변성(position dependent variability)을 감소시키는 것으로 나타내었다(Stief et al., Nature, 341, pp 343-345, 1989). 이러한 효과는, 전이유전자 발현의 조직 특이성(McKnight et al., 1992) 뿐만 아니라 이종의 프로모터 및 세포까지 미치는 것으로 발견되었다(Phi-Van et al., Molecular and Cellular Biology, 10,5 pp 2302-2307, 1990).
US7422874에는, β 갈락토시다아제 보고 유전자(β galactosidase reporter gene), scu-PA 유전자 및 TGF-β SRII 유전자의 발현을 증가시키기 위해, PMS 벡터 구조에서, 조절 요소 - pSV-gal 또는 pCMV-gal 프로모터, MCS 부위 및 전사의 종결 부위(transcriptional termination site)와 결합하여, β-글로빈 MAR의 사용에 대해 기재되어 있다. 그들은, 88 %의 클론(clones)에서의 β 갈락토시다아제를 위한 20 ug/백만 세포의 중간의 발현 레벨(moderate expression levels)을 수득할 수 있었다. 이들은 또한, MARs를 제외한 상기 벡터로서 동일한 조절 요소로 구성된 대조군 벡터 구조와 비교하여, 4 배 이상의 발현 레벨을 갖는 scu-PA를 위한 클론을 생성할 수 있었다. 유전자 증폭(gene amplification)을 위한 MARs 및 DHFR 시스템이 TGF-β SRII의 발현에 함께 사용된 경우, 이들은, 트랜스펙션 후에 100 ng/million cells/day 및 1 uM MTX 까지 MTX 매개된 유전자 증폭의 몇 회 후에, 10 ug/million cells/day을 생산하는 기본적인 클론을 생산될 수 있었다. 그러나, 이러한 특허에서 수득된 발현 레벨은, TNKase, 다베포이에틴, 및 단일클론 항체와 같은 생물치료 단백질(biotherapeutics proteins)에 대해 오늘날 상업적으로 실현가능하지 않다.
US7371542는, LTBR-Fc[림프독소 베타 수용체-IgG Fc 융합 단백질(Lymphotoxin beta receptor - IgG Fc Fusion protein)]의 발현을 증가시키도록, 발현 벡터 구조에서 조절 요소 - CMV 프로모터, 인트론, Ori P 및 Poly A와 함께 β IFN S/MAR의 용도에 대해 기재되어 있고, MARs를 제외한 상기 벡터와 같은 동일한 조절 요소로 구성되는 대조군 벡터와 비교하여, CHO 세포에서 발현 레벨에서 4.5 배 향상이 달성되었다. 그들은 또한, 발현 벡터에서 β IFN S/MAR의 용도가 벡터 pCEP-LTBR-Fc를 사용하여 293 EBNA 세포에서 6.3 배 발현 레벨을 증가시킴을 발견하였다. 그러나, 상기 발현 레벨은 여전히 매우 낮다(20 mg/L in 5 days). 상기 벡터
pCB_SM1_LTBR-Fc는, 9 일에 40 mg/L의 생산성을 갖는 293 EBNA 세포에서 클론을 제공할 수 있었다. 그러나, 이러한 특허에서 수득된 생산성 레벨은, 이러한 생물치료 분자(biotherapeutic molecules)에 바람직한 레벨에 훨씬 못 미친다.
US5731178은, 프로모터 및 인핸서를 포함하는 벡터 구조에서 cLysMARs을 사용함으로써 원하는 유전자의 증진된 발현에 대해 기재되어 있다. 그들은, mar 요소가 인핸서 및 프로모터로 단지 구성된 대조군 구조 상에서 인핸서 및 프로모터 요소와 함께 사용된 경우, 안정된 트랜스펙션에서 cLysMAR 요소의 사용이 10 배 이상으로 보고 유전자 CAT 활성도를 개선시킬 수 있으나, MAR 요소가 이 자체로 어떠한 주요한 영향을 나타낼 수 없음을, 나타낸다.
Poljak et al.,(1994) Nucleic Acid Res., 22(21):4386-94)는, cLysMAR이 SV40 프로모터 및 인핸서와 결합되어 사용된 경우, 약 15 배로 CAT 보고 유전자의 발현에서의 증가를 보고하였다. 이 자체로 cLysMAR은 원하는 유전자의 발현을 증가시키는데 매우 좋지 못함, 더 정확히 말하면 이는 조금의 감소를 나타냄을 발견하였다.
따라서, 상기의 예는, 본 분야의 숙련자에게 알려진 표준 조절 요소(standard regulatory elements)를 포함하는 상기 대조군 벡터 구조가 높은 발현을 뒷받침하기에 본래 충분하지 않는 사실을 보여준다. 그리고, 추가적으로 MARs/SARs와 함께 결합 후에도, 상기 발현 레벨은, 재조합 치료법(recombinant therapeutics)의 실행 가능한 생산을 위해 상업적으로 요구된 이러한 것들로 증가되지 않는다. 따라서, 요소의 유일한 조합(unique combination)은, 원하는 발현 레벨을 성취하기 위해 여전히 요구된다.
따라서, 이는, 점점 더 많은 입수가능한 이들을 제조하기 위해, 치료 단백질의 발현을 추가적으로 증가시키도록, 산업에서의 중요한 필요가 존재함이, 명확해진다. 따라서, 하나는, 상이한 종류의 타겟 유전자와 함께 증가된 발현을 제공하도록, 합성 방식(synergistica fashion)에서의 MARs와 함께 작용할 수 있는, 상기 발현 벡터에서의 요소의 조합(combination)을 위한 필요를 느끼게 한다. 본 발명의 발명자는, 조절 요소의 유일한 조합의 공동의 작용(concerted action)이, 시간 절약 방식(time saving manner)에서의 재조합 단백질의 최적의 발현을 위해 필수적임을, 이후로 입증되고 있다.
US7129062에는, 재조합 단백질의 발현 - 약 20 배의 anti Rhesus D IgG 및 루시페라아제(luciferase)-을 증가시키기 위해, 하나의 벡터는 흥미있는 유전자를 포함하고,두 번째의 것은 cLysMARs를 포함하는, 2 개 이상의 연결되지 않는 벡터(more than 2 unlinked vectors)의 공동-트랜스펙션(co-transfection)에 대해 기재되어 있고, 이들은 이러한 공동 트렌스펙션 전략을 사용하여 200 mg/L에서 인간 항 Rhesus D IgG(human anti Rhesus D IgG)를 또한 생산할 수 있었다. 그러나, 이는 문헌(DNA Cloning: Mammalian systems; By David M. Glover, B. D. Hames)에서 널리 보고되어 있고, 또한, 공동트랜스펙션이, 트랜스펙션된 개체수에서의 가변성(variability) 및 이종혼성(heterogeneity)을 증가시킴을 우리의 경험에서도 또한 알 수 있었다. 게다가, 본 발명은, 단일 트랜스펙션(single transfection)을 사용하여 원하는 산출량을 획득하였다.
US20080102523에서는, SV40 프로모터-인핸서 및/또는 CMV 프로모터, ori site 및 폴리 A 영역으로 이루어진 상기 대조군 벡터 구조와 비교한 바와 같이, 3 배의 베터-갈락토시다아제 및 6 배의 면역글로불린의 발현을 증가시키기 위해 β-글로빈 MAR의 용도에 대해 기재되어 있다. 상기 특허 출원서는, β-글로빈 MAR 조절 요소의 도움 뿐만 아니라 MTX 매개된 유전자 증폭 둘 다를 통해 발현에서의 보통의 증가(moderate increase) 만을 성취하고, 이로 인하여 전체 과정이 지루하고, 시간 소비적으로 만들 수 있다. 이는, 본 발명자는, 조절 요소의 이들의 유일한 조합과 함께 및 MTX-DHFR 선택 방법과 같은 어떠한 길고 지루한 방법의 사용 없이, 높은 발현을 성취하는 것이 현재의 발명과 대조적이다.
US5888774에는, 인간 아폴리포단백질 B SAR 요소(human apolipoprotein B SAR element)를 이용하여 높은 발현의 에리스로포이에틴에 대해 기재되어 있고, EPO/million cells/24 Hrs의 1500 내지 1700 IU의 발현이 보고되어 있다. 본 발명자에 의해 소유된 WO 2007017903에는, US5888774에서 보고된 수치보다 현저하게 더 높은, 2366 내지 3549 IU/106 cells/24 Hrs 또는 18.2 내지 27.3 ㎍/106 cells/24 Hrs와 동등한, 168 hrs 배양에서, 11,830 IU/ml(91 ㎍/ml)의 발현 레벨에서 재조합 인간 에리스로포이에틴을 생산하기 위한 방법에 대해 기재되어 있다. 그리고, 본 발명은, 몇몇의 치료상의 단백질을 위해, WO2007017903의 벡터 상에 현저하게 발현 레벨을 추가적으로 증가시킨다.
따라서, 진핵생물의 숙주 세포의 생산성을 추가적으로 증가시키기 위해, 신규한 발현 벡터를 개발하는 것을 여전히 원하고 있다. 놀랍게도, 지난 수십 년간 이러한 분야에서 생성된 지식의 엄청난 양에도 불구하고, 오늘날 본 분야에서 알려진 숙련자가, 단순하게 선택할 수 없고, 상당한 높은 발현을 제공하는 발현 벡터를 디자인하도록, 내부의 인자 또는 조절 요소의 조합을 선택한다. 추가적으로, 높은 발현 벡터를 생성하기 위한 적절한 요소의 조합은, 터를 사용하여 흥미있는 원하는 유전자의 높은 발현이 오직 하나의 요소에 기인하지 않을 수 없고, 그러나 적절한 요소의 조합이 안정된 높게 발현하는 세포 주를 얻기 위해 바람직하지 않기 때문에, 본 분야의 숙련자에 의해 일상적으로 추정되지 않을 것이다. 따라서, 이러한 본 발명은, 예를 들어, 이의 안정성을 증가시키고, 번역 효율성(translation efficiency)을 증가시킴으로써, mRNA 분자의 생명을 확장시키는, 증가된 전사에 의해 mRNA 레벨을 증가시키는데 있어서, 다중 역할(multiple roles)을 갖는, CMV 프로모터, 인트론, TPL, 및 VA 유전자와 같은, 그 밖의 조절 요소와 함께, 닭 라이소자임 MAR 요소[chicken lysozyme MAR element(s)]와 같은 발현 증진시키는 요소를 포함하는 신규한 발현 벡터를 제공함으로써 이러한 문제를 해결책을 제공하고, 따라서, 상기 트랜스펙션된 포유동물 숙주 세포에서의 재조합 단백질의 높고 안정된 발현을 유도하는 공동의 방식(synergistic manner)을 작용한다. cis 또는 trans 방향에서의 cLysMAR의 측면의 발현 카세트로 이루어진(consisting of the expression cassette flanked by cLysMAR in a cis or trans orientation), 본 발명의 상기 발현 벡터에서의 이러한 요소의 조합은, 트랜스펙션된 세포주에서의 치료 단백질의 안정되고, 높은 발현을 결과적으로 야기한다.
본 발명의 목적
본 발명은, 포유동물 세포에서의 흥미있는 단백질의 발현 효율성을 증가시키는 발현 벡터를 제공한다.
하나의 실시형태에서, 본 발명은, 흥미있는 유전자에 실시가능하게 결합된 프로모터(a promoter operably linked to the gene of interest), 발현 증진 요소, 그 밖의 조절 요소, 즉, TPL, VA I 및 II 유전자 또는 이의 변이체, 번역 종결자(translation terminator) 및 항생물질 마커(antibiotic marker)를 포함하는 신규한 발현 벡터를 제공하고, 상기 발현 증진 요소는 염색질 부착 영역(chromatin attachment region)이다.
하나의 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, MARs 및/또는 SARs로부터 선택된 발현 증진 요소와 함께, 클로닝 부위에 실시가능하게 결합된 프로모터(promoter operably linked to cloning sites), 흥미있는 유전자, 번역 종결자, TPL, VA I 및 II 유전자, 적절한 항생물질 마커를 포함한다.
대체적인 실시형태(alternate embodiment)에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, MARs 및/또는 SARs으로부터 선택된 발현 증진 요소(expression enhancing elements)와 함께, 클론 부위에 실사가능하게 결합된 프로모터(promoter operably linked to cloning sites), 흥미있는 유전자, BGH와 같은 번역 종결자, 인트론, 적절한 마커 및 선택적으로 내부의 리보솜 결합 부위를 포함한다.
하나의 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, MARs 및/또는 SARs으로부터 선택된 발현 증진 요소와 함께, 클론 부위에 실시가능하게 결합된 프로모터, 흥미있는 유전자, BGH와 같은 번역 종결자, TPL, VA I 및 II 유전자, 인트론, 적절한 항생물질 마커 및 임의적으로 내부의 리보좀 결합 부위를 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은, 본 발명의 실시형태에 따라 상기 발현 벡터로 트렌스펙션된, 포유동물 숙주 세포에서의 흥미있는 유전자를 발현시키기 위한 방법을 제공한다.
도 1은, pZRCII의 벡터 그림(vector diagram)을 나타낸 것이다.
도 2는, pZRC III의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 3은, pZRC III-TNK-Hyg의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 4는, pZRC III-Darbe-Hyg의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 5는, pZRC III- Etanercept-Hyg의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 6은, pZRC III- FSHα-IRES-FSHβ-Hyg 벡터의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 7은, pZRC III- FSHβ-IRES-FSHβ-Hyg 벡터의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 8 은, pZRC III- TNK-Puro의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 9는, pZRC III-DARBE- Puro의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 10은, pZRC III- FSHα- IRES- FSHβ-Puro 벡터의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 11은, pZRC III- FSHα- IRES- FSH β-Neo 벡터의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 12는, pZRC III- FSHβ- IRES- FSHα-Neo 벡터의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 13은, pZRC III-Etanercept- Neo의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
도 14는, pZRC III-TNK-Neo의 벡터 그림을 나타낸 것이다.
정의
염색질 부착 영역은, 단백질성 핵 매트릭스(proteinaceous nuclear matrix)와 함께 이들의 상호작용을 통해, DNA의 위상학적으로 강요된 루프(topologically constrained loops)를 형성하는 염색질의 구조 성분(structural components of chromatin)이다.
사용된 약어:
CMV --- 거대세포 바이러스(Cytomegalovirus)
TPL --- 삼부 리더(Tripartite Leader)
VA 유전자 또는 VA I 및 II 유전자 --- 바이러스 관련된 RNA 유전자 I 및 II(Virus associated RNA genes I and II)
BGH ---소의 성장 호르몬(Bovine growth hormone)
본 발명은, 포유동물 숙주 세포에서 의미 있는 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현의 효율성을 증가시키는 신규한 발현 벡터를 제공한다. 상기 신규한 벡터는, 증가된 전사(transcription)의 장점을 첨가하면서, 위치 효과(position effect)와 연관된 문제점을 추가적으로 제거하고, 번역(translation)이 조절 요소의 유일한 조합과 함께 성취된다.
하나의 실시형태에서, 본 발명은, 흥미있는 유전자에 실시가능하게 결합된 프로모터, 발현 증진 요소, PL, VAI 및 II 유전자 또는 이의 변이체, 번역 종결자 및 항생물질 마커를 포함하는 신규한 발현 벡터를 제공하고, 상기 발현 부착 요소는, 염색질 부착 영역이다. 염색질 부착 영역은 MARs 및 SARs로부터 선택된 것이다.
실시형태에서, 본 발명은, 흥미있는 유전자에 실시가능하게 결합된 프로모터, TPL 및 VA 유전자 I 및 II, 매트릭스 부착 영역(matrix attachment regions)(MARs)/SARs, 번역 종결자(translation terminator), 항생물질 마커를 포함하는 단백질 및 펩티드의 생산을 위한 발현 벡터를 제공한다.
대체적인 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, 클론 부위에 실시가능하게 결합된 프로모터, 흥미있는 유전자, BGH와 같은 번역 종결자, 인트론, 적절한 항생물질 마커, 및 임의적으로 MARs 및/또는 SARs으로부터 선택된 발현 증진 요소(expression enhancing elements)와 함께 내부의 리보솜 결합 부위를 포함한다.
하나의 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, 클론 부위에 실시가능하게 결합된 프로모터, 흥미있는 유전자, BGH와 같은 번역 종결자, TPL, VA I 및 II 유전자, 인트론, 적절한 항생물질 마커 및 MARs 및/또는 SARs로부터 선택된 발현 증진 요소와 함께 임의적으로 내부의 리보솜 결합을 포함한다.
본 발명의 실시형태에 따라, 상기 프로모터는, CMV 프로머터, SV40 프로모터, 아데노바이러스 프로머터(adenovirus promoter), 베타 액틴 프로모터(Beta actin promoter), 금속티오닌 프로모터(metallothionin promoters) 또는 그 밖의 원핵세포(prokaryotic) 또는 진핵생물의 바이러스 프로모터(eukaryotic virus promoters)로 이루어진 군으로부터 선택된 것이다. 바람직한 실시형태에서, CMV 프로머터가 사용된다.
상기 프로모터는 유전자의 가까이에 일반적으로 위치하고, 이는, 동일한 가닥 및 즉, 상기 전사가닥(sense strand)의 5' 영역을 향하는, 업스트림(upstream)에서 조절되고, 이는 전사를 촉진시킨다.
본 발명의 실시형태에 따라, 상기 클론 부위는, AatI, AatII, Acc113I, Acc16I, Acc65I, AccIII, AclNI, AseI, AsnI, Asp718I, BalI, BamHI, BanI, BanII, BbeI, BbiII, BbsI, BbuI, Bbv16II, BclI, BcoI, BglI, BglII, BlnI, Bsh1365I, BsiEI, BsiHKAI, BsiI, BspEIBspHI, BstZI, CciNI, Cfr10I, Cfr42I, Cfr9I, CfrI, Csp45I, DrdI, DsaIEaeI, EagI, Eam1104I, Eco47III, Eco52I, Eco57I, Eco88I, Eco91I, EcoICRI, EcoO109I, EcoRI, EcoT14I, FriOI, FseI, FspI, HaeII, Hin1I, HincII, HindII, KasI, Ksp632I, KspI, KpnI, LspI, MamI, MflI, MluNI, MroI, MroNI, MspA1I, NaeI, NarI, NcoI, NdeI, NgoAIV, NheI, NotI, NspBII, NspI, NspV, PacI, PaeI, PflMI, PinAI, Ple19I, Pme55I, PmeI, Ppu10I, PpuMI, PshBI, Psp124BI, Psp5II, PspAI, PspALI, PspEI, PstI, PstNHI, PvuI, PvuII, SacI, SacII, ScaI, SfcI, SfiI, SpeI, SphI, Van91I, VneI, XhoI, XhoII, XmaI, XmaIII, Zsp2I로부터 선택될 수 있지만, 이로 제한되지 않는다.
본 발명의 실시형태에 따라, 상기 번역 종결자는, 소 성장 호르몬, 아데노바이러스 및 진핵생물 바이러스 번역 종결자 서열로 이루어진 군으로부터 선택된 것이다. 바람직한 실시형태에서, 상기 번역 종결자는 BGH Poly A이다.
추가적인 실시형태에서, 상기 내부의 리보좀 결합 부위(internal ribosomal binding sites)는, 피코르나바이러스 IRES(Picornavirus IRES), 아프타바이러스 IRES(Aphthovirus IRES), 간염 A IRES(Hepatitis A IRES), 간염 C IRES, 페스티바이러스 IRES(Pestivirus IRES), 뇌심근염 바이러스 IRES로부터 선택된 것이고, 바람직하게 뇌심근염 바이러스 IRES이다.
본 발명의 실시형태에 따라, 매트릭스 부착 영역과 같은 발현 증진 요소는, 닭 라이소자임 MAR, 초파리 Scs 경계 요소(Drosophila Scs boundary element), hspSAP MAR, 마우스 T 세포 수용체 TCRa, 랫 유전자자리 대조 영역(rat locus control region), 및 β-글로불린 MAR, 및 아폴리포 단백질 B SAR 요소로부터 선택된 것이다.
바람직한 실시형태에서, 닭 라이소자임 MAR(Sequence id 5)은, 5' 측면 서열(5' flanking sequence) 또는 3' 측면 서열에서 복제된다(cloned). 가장 바람직한 실시형태에서, 닭 라이소자임 MAR은, 전사의 조립(transcriptional assembly)의 5' 및 3' 측면 서열 둘 다에서 클론된다.
본 발명에서, 흥미있는 유전자는, 본 분야에서 알려진 방법에 따라 발현 벡터에서 클론된다(SAMBROOK, J.; FRITSCH, E.F. and MANIATIS, T. Molecular Cloning: a laboratory manual. 2nd ed. N.Y., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989. 1659). 본 발명의 실시형태에 따라, 흥미있는 유전자는, 조직 플라스미노겐 활성인자, TNK-TPA, 다베포이에틴, 에리스로포이에틴, 인슐린, GCSF, 인터류킨, 종양 괴사 인자, 인터페론, TNFR-IgGFc, 리툭시맙, 베바시주맙, 아달리무맙, 트라스투주맙[지네릭 네임(generic names)]과 같은 모노클론항체 및 Fc 영역, Fab와 같은 이들의 단편, GLP-I, GLP-II, IGF-I, IGF-II, 혈소판 유래 증식 인자, FVII, FVIII, FIV 및 FXIII, 엑센딘-3, 엑센딘 4, MYT-2, NF-κB 억제 인자 NRF, AML1/RUNX1, Gtx 호메오도메인 단백질과 같은 전사 인자, 진핵생물 개시 인자 4G(elF4G)a, 진핵생물 개시 인자 4Gl(elF4Gl)a, 사멸 관련 단백질 5(DAP5)와 같은 번역 인자, c-myc, L-myc, Pim-1, 단백질 키나아제 p58PITSLRE, p53과 같은 종양유전자, 여포 자극 호르몬, 융모성 생식선 자극호르몬, 인간 황체형성 호르몬 등으로부터 선택된 생식선 자극 호르몬과 같은 호르몬, 및 면역글로불린 중쇄 결합 단백질(BiP), 열 충격 단백질 70, 미토콘드리아의 H+-ATP 생성효소의 β-서브유닛(subunit), 오르니틴 탈카르복실화효소, 코넥신 32 및 43, HIF-1a, APC 로부터 선택된, 단백질들 및 펩티드들 및 이의 기능적인 유사체들을 코딩할 수도 있다(According to an embodiment of the present invention the gene of interest may encode suitable proteins and peptides and functional analogues thereof selected from tissue plasminogen activator, TNK-TPA, Darbepoietin, Erythropoietin, Insulin, GCSF, Interleukin, Tumor necrosis factor, Interferon, TNFR-IgGFc, Monoclonal antibodies such as Rituximab, Bevacizumab, Adalimumab, Trastuzumab (generic names) and their fragments like Fc region, Fab, GLP-I, GLP-II, IGF-I, IGF-II, Platelet derived growth factor, FVII, FVIII, FIV and FXIII, exendin-3, exendin 4, transcription factors like MYT-2, NF-?B repressing factor NRF, AML1/RUNX1, Gtx homeodomain protein, translation factors like Eukaryotic initiation factor 4G (elF4G)a, Eukaryotic initiation factor 4Gl (elF4Gl)a, Death associated protein 5 (DAP5), oncogene like c-myc, L-myc, Pim-1, Protein kinase p58PITSLRE, p53 hormones such as gonadotropic hormones selected from Follicle stimulating hormone, Human Chorionic Gonadotropin, Human Leutinizing Hormone, etc. and immunoglobulin heavy chain binding protein (BiP), Heat shock protein 70, β-subunit of mitochondrial H+-ATP synthase, Ornithine decarboxylase, connexins 32 and 43, HIF-1a, APC). 이에 따라서, 기능적인 유사체(functional analogues)는, 이의 천연 단백질 및 펩티드와 유사하거나 또는 동일한 기능을 갖는 단백질 또는 펩티드를 의미한다.
본 발명에 따라, 발현 벡터 구조는, 실시가능하게 결합된 프로모터, 클론 부위(cloning sites), 흥미있는 유전자, 전사 종결자, 인트론, 적절한 항생물질 마커, TPL, VA 유전자 I 및 II을 추가적으로 포함하는 발현 조립(expression assembly)을 포함한다. 이러한 발현 벡터는, 서열 id no. 4(6)에 나타낸 pZRCII로서 나타낸다. 또 다른 실시형태에서, 매트릭스 부착 영역(Matrix attachment region, MAR) 또는 SARs, 바람직하게 MAR과 같은 발현 증진 요소의 유전자 서열은 추가적으로 pZRCII에서 클론된다. 이는 새로운 발현 벡터는, 서열 id no 6에 나타낸 pZRCIII로서 나타낸다. 매트릭스 부착 영역은 pZRCIII의 5' 또는 3' 측면 영역(5' or 3' flanking region)에서 클론된다. 바람직한 실시형태에서, 매트릭스 부착 영역은, pZRCIII의 5' 및 3' 측면 영역에서 클론된다. 본 발명의 pZRCIII 구조는, 현저하게 흥미있는 유전자의 발현을 증진시킬 뿐만 아니라, 트랜스펙션 효율성을 개선시키는 것으로서, 선행 기술에 알려진 벡터를 넘어 향상된 것이다. 본 벡터 구조 pZRCIII는 모든 단백질 및 펩티드의 발현에 적합하다.
발현 벡터 pZRCIII에서 적절한 항생물질 마커는, 카나마이신(kanamycine), 히그로마이신 퓨로마이신(hygromycin puromycin), 및 DHFR로부터 선택된 것이다. 또 다른 실시형태에서, 상기 발현 벡터 pZRCIII는,임의적으로 DHFR 및/또는 내부의 리보솜의 결합 부위(internal ribosomal binding site, IRES)의 유전자 서열을 운반한다(carries).
하나의 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, MARs 및/또는 SARs로부터 선택된 발현 증진 요소와 결합하여, 클론 부위, 흥미있는 유전자, 번역 종결자, TPL(Seq ID no. 2), VA I 및 II 유전자(Seq ID no. 3), 적절한 항생물질 마커를 포함한다.
또 다른 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, MARs 및/또는 SARs로부터 선택된 발현 증진 요소와 결합하여, 클론 부위에 실시가능하게 결합된 프로모터, 흥미있는 유전자, 번역 종결자, 인트론(Seq ID no. 1), 적절한 마커 및 임의적으로 내부의 리보좀 결합 부위를 포함한다.
단백질 및 펩티드의 원하는 발현의 생산을 위한 발현 벡터는, 적절한 요소를 포함하지만, 3 가지 요소, 즉 프로모터의 3' 말단에서의 아데노바이러스성 삼부 리 서열(Adenoviral Tripartite leader sequence), 아데노바이러스 주요한 최근의 전사물(adenovirus major late transcript)의 5' 제공 부위(5' donor site) 및 TPL의 3' 말단에 위치하는 마우스 면역글로불린의 3' 절단 부위(3' splice site)(Seq ID no. 2)를 포함하는 혼성 (키메라) 인트론[hybrid (chimeric) intron], 아데노바이러스성 VA RNA I 및 II 유전자(Seq ID no. 3)로 한정하는 것은 아니다. 매트릭스 부착 영역은, Mlu I에서 5' 측면 서열(5' flanking sequence) 또는 BGH 폴리 A 서열의 말단에서 3' 측면 서열(3' flanking sequence)에서 클론된다. 매트릭스 부착 영역의 방향(orientation)은 선택적이다. 게다가, 본 발명의 MARs 요소는, 아세노바이러스성 삼부 리더 서열, 혼성 (키메라) 인트론, TPL (Seq ID no. 2) 및 아데노바이러스성 VA RNA I 및 II 유전자(Seq ID no. 3)와 결합하여, 상승 작용에 의해 원하는 유전자의 발현을 증진시킬 뿐 아니라, 트랜스펙션 효율 및 원하는 클론의 수를 증가시킨다.
바람직한 실시형태에서, 본 발명은, 치료학적 단백질 및 펩티드의 발현을 위한 신규한 발현 벡터 구조를 제공하고, 상기 발현 벡터 구조는, MARs 및/또는 SARs로부터 선택된 발현 증진시키는 요소(expression enhancing elements)와 결합하여, 클론 부위에 실시가능하게 결합된 프로모터, 흥미로운 유전자, 전사 종결자, TPL(Seq ID no. 2), VA I 및 II 유전자(Seq ID no. 3), 인트론(Seq ID no. 1), 적절한 마커 및 임의적으로 내부의 리소좀 결합을 포함한다. 실시형태에서, 상기 발현 벡터는, 흥미있는 유전자에 실시가능하게 결합된 프로모터 또는 이의 변이체, VA I 및 II 유전자 또는 이의 변이체, TPL 또는 이의 변이체, 키메라 인트론(Chimeric Intron) 또는 이의 변이체, 항생물질 마커, 매트릭스 부착 영역, 임의적으로 내부의 리보솜 결합 부위, 소의 성장 호르몬 폴리아데닐화(Bovine growth harmone polyadenylation)를 포함한다.
하나의 실시형태에서, 흥미있는-히그로마이신 벡터의 PZRCIII-유전자는, CMV 프로모터에 의해 유도된 흥미있는 유전자와 실시가능하게 결합된 서열 id no 5에 나타낸 cLysMARs(cLysMARs setforth the in sequence id no 5 operably linked with gene of interest driven by a CMV promoter), TPL, 서열 id no 1에 나타낸 키메라 인트론(chimeric intron), 서열 id no.3에 나타낸 VA 유전자 I 및 II, BGH 폴리아데닐화(polyadenylation) 및 다수의 클론 부위(multiple cloning sites)를 포함한다. 다수의 클론 부위는, XhoI, NotI와 같은 제한 부위를 포함한다. 흥미있는 어떠한 유전자는, 발현 카세트 외부에 위치하는 VA 유전자 및 발현 카세트에서 CMV 프로모터, TPL, 키메라 인트론(chimeric intron)과 같은 그 밖의 조절 요소와 함께, 상기 발현 카세트의 업스트림(upstream) 및 다운스트림(downstream) 둘 다에서 닭 라이소자임 MAR 요소를 갖는 벡터의 다수의 클론부위(multiple cloning site) 내로 클론된 융합 단백질 에타너셉트(fusion protein Etanercept)(TNFR-Fc)의 화학적으로 합성된 유전자와 유사한 다수의 클론 부위에서 클론될 수 있다. 상기 벡터는, 트랜스팩턴트의 선별을 위한 히그로마이신 저항성 유전자를 갖는다(The vector has a hygromycin resistance gene for selection of transfectants). 본 발명의 이러한 양상에 따라 제조된 벡터 구조의 예로서, pZRCIII-에타너셉트에타너셉트(etanerceptetanercept)-히그로마이신 벡터가 부다페스트 조약(Budapest treaty) 하에 맡겼고, 접근 번호(accession number)는 MTCC 5656이다.
또 다른 실시형태에서, 흥미있는-네오마시니 벡터의 PZRCIII-유전자는, CMV 프로모터와 실시가능하게 결합된 서열 id no 5에 나타낸 C-Lys-MARs, TPL, 서열 id no 1에 나타낸 키메릭 인트론(chimeric intron), 서열 id no. 3에 나타낸 VA 유전자 I 및 II, BGH 폴리아데닐화(BGH polyadenylation) 및 다수 클론 부위를 포함한다. 다수 클론 부위는, XhoI, NotI와 같은 제한 부위를 포함한다. 흥미있는 어떠한 유전자는, 상기 발현 카세트에서 CMV 프로모터, TPL, 키메릭 인트론과 같은 그 밖의 조절 요소 및 발현 카세트 외부에 위치한 VA 유전자(VA genes placed outside the expression cassette)와 결합하여, 상기 발현 카세트의 업스트림 및 다운스트림 둘 다에서 닭 리소자임 MAR 요소를 갖는 벡터의 다수의 클론 부위 내로 클론된 융합 단백질 에타너셉트(TNFR-Fc)의 화학적으로 합성된 유전자와 같은 다수 클론 부위에서 클론될 수 있다. 상기 벡터는 트랜스펙턴트(transfectants)의 선별을 위해 히그로마이신(네오마이신) 저항성 유전자를 갖는다.
본 발명의 이러한 양상에 따라 제조된 벡터 구조의 예로서, pZRCIII-에타너셉트-네오마이신 벡터는 부다페스트 조약(Budapest treaty) 하에 맡겼고, 접근 번호(accession number)는 MTCC 5657이다.
다른 실시형태에서, 흥미있는-IRES-히그로마이신 벡터(interest-IRES-Hygromycin vector)의 PZRCIII-유전자는, CMV 프로모터에 실시가능하게 결합된 서열 id no 5 에 나타낸 cLysMARs, TPL, 서열 id no 1에 나타낸 키메릭 인트론, 서열 id no. 3에 나타낸 VA 유전자 I 및 II, BGH 폴리아데닐화 및 다수의 클론 부위를 포함한다. 다수의 클론 부위는, XhoI, NotI와 같은 제한 부위를 포함한다. 흥미있는 어떠한 유전자는, 발현 카세트에서 CMV 프로모터, TPL, 키메릭 인트론과 같은 그 밖의 조절 요소 및 상기 발현 카세트의 외부에 위치한 VA 유전자와 함께, 벡터의 다중 클론 부위 내로 클론된 FSH α 및 FSH β 서브유닛(subunits) 및 발현 카세트의 업스트림 및 다운스트림 둘 다에서 닭 라이소자임 MAR 요소를 갖는, IRES에 의해 각각 실시가능하게 결합된 둘 다 FSH α 및 FSH β 서브유닛 둘 다의 화학적으로 합성된 유전자와 같은 다수 클론 부위에서 클론될 수 있다. 상기 벡터는 트랜스펙턴트의 선별을 위해 히그로마이신 저항성 유전자를 갖는다. 본 발명의 이러한 측면에 따라 제조된 벡터 구조의 예로서, pZRCIII FSH α-IRES-FSH β 히그로마이신 벡터는 부다페스트 조약(Budapest treaty) 하에 맡겼고, 접근 번호(accession number)는 MTCC 5655이다.
실시형태에서, 본 분야의 숙련자에게 알려진 방법에 의해 포유동물 숙주 세포로 트랜스펙션된다. 포유동물 숙주 세포는, 단백질의 상업적인 생산을 위해 널리 알려진, CHO[중국 햄스터 난소(Chinese hamster ovary)] 세포주, BHK[어린 햄스터 신장(Baby hamster kidney)] 세포주 등으로부터 선택될 수도 있다. 또 다른 실시형태에서, 상기 트랜스펙션된 숙주 세포는, 흥미있는 유전자의 추가적인 발현을 증가시키도록, 카나마이신, 히그로마이신, 퓨로마이신으로부터 선택된 적절한 항생물질을 포함하는 상이한 벡터로 추가적으로 트랜스펙션된다.
하나의 실시형태에서, 상기 트랜스펙션된 세포주는, 히그로마이신, 퓨로마이신, 카나마이신, G418 또는 그 밖의 항생물질을 사용함으로써 선택된 CHO K1 이다.
게다가, 상기 트랜스펙션된 세포주는, 만약 상기 발현 벡터가 DHFR의 유전자를 운반한다면, 예를 들어, 메토트렉세이트, DHFR 선택 배지를 사용함으로써 선택된다. 이러한 선택은, 상기 트랜스펙션된 세포주에서 선택 압력에서 점진적으로 증가에 의존한다(Kaufman and Sharp, 1982; Schimke et al., 1982).
또 다른 실시형태에서, 상기 트랜스펙션된 세포주는, 발현 벡터가 글루타민 합성효소(Glutamine synthetase)의 유전자를 운반하는 바와 같이, 글루타민 합성효소(GS) 선택 배지, 예를 들어 메티오닌 술폭시민(methionine sulphoximine)(MSX)에서 선택된다.
이런 이유로, 본 발명은, 현저하게 전사 및 번역을 증가시키고, 또한 유전자 통합의 위치 효과를 억제하는, 조절 요소(regulatory elements)의 유일한 조합(unique combination)을 포함하는 신규한 발현 벡터를 제공하고, 따라서 상기 재조합 단백질의 안정되고, 높은 발현에 대한 상승 효과(synergistic effect)를 제공한다. 게다가, 이는, 많은 수의 클론의 노동 집약적인 선별이 일반적인 요소(typical element)의 존재에서 급격히 감소되는 바와 같은, 시간 효과적인 방식에서의 산업적인 규모에서의 치료학적 단백질 및 펩티드, 모노클로날 항체의 생산을 제공한다. 게다가, 본 발현 벡터는, 안정되고 일시적인 발현 둘 다에 사용될 수 있다.
본 발명은, 실시예의 도움과 함께 추가적으로 설명된다. 실시예는, 설명적인 목적을 위해서만 나타낸 것이고, 본 발명은 이들만으로 제한되는 것은 아니다.
실시예 1. pZRC III 벡터의 구성
모든 조절 요소, 즉 TPL, VA, CMV 프로모터, 키메릭 인트론 및 BGH 폴리아데닐환 및 종결 서열(termination sequences)과 함께 전체의 전사 조립(whole transcription assembly)은 독일 GeneART에서 화학적으로 합성된, 특허 출원 WO2007017903에 기재되어 있다. 클로닝 벡터 pMK (GeneART, Germany)에서 클론된 이러한 전체 조립(this whole assembly)(GeneART, Germany)은, pZRC II (도 1, Seq ID No. 4)라고 부른다. 닭 라이소자임 MAR DNA 단편(Seq ID No 5)(Phi-Van, L. and Stratling,W.H, Biochemistry 35 (33), 10735-10742 (1996))은 화학적으로 합성되고, 클로닝 벡터(cloning vector)에서 클론된다. 두 개의 닭 라이소자임 MAR 단편은, 상기 벡터 내로 이미 예비-디자인된(pre-designed) SacI 및 MluI 부위를 사용하여, pZRC II 벡터에서 발현 카세트의 어느 한 쪽에서의 측면(flanks)으로서 삽입된다. SacI 오버행(SacI overhang)은, SacI 부위를 갖는 프라이머를 사용하여 PCR에 의해 닭 라이소자임 MAR 단편에 첨가되었다. 명확하게, 40 사이클의 PCR 증폭(amplification)은, 50 mM Tris-Cl(pH 8.3), 2.5 mM MgCl2, 각각 250 μM의 4 dNTPs 및 Pfu 중합효소의 5 유닛을 포함하는 50 ㎕의 부피에서의 유전자 특이적인 올리고뉴클레오티드 프라이머(gene specific oligonucleotide primers)의 100 피코몰(100 picomoles)을 사용하여 실행하였다. 각각의 PCR 증폭 사이클은, 30 sec 동안 95 ℃[변성(denaturation)], 30 sec 동안 62 ℃[어닐링(annealing)] 및 2 min 동안 72 ℃[확장(extension)]으로 이루어져 있다. PCR 반응의 증폭된 생산물은, 1 % 아가로스 겔(Agarose gel)에서 용해된다(resolved). 대략 1664 염기쌍 크기(approx 1664 base pairs size)의 원하는 단편을 겔로부터 잘라내고, Qiagen Gel 추출 키트를 사용하여 정제되었다. 이러한 정제된 DNA 단편은, Sac I(MBI Fermentas, USA)와 함께 상기 정제된 PCR 생산물 및 벡터 둘 다의 제한 절단(restriction digestion) 후에 pZRC II 벡터 내로 연결되었다(ligated). 상기 연결 생산물은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 수득된 형질전환체(transformant)는 카나마이신 저항을 기초로 기록된다. 적은 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소를 사용하여 제한 절단에 의해 닭 라이소자임 MAR 단편의 존재를 위해 분석된다. pZRC II 벡터에서 정확한 통합(correct integration)을 갖는 것으로 발현된 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC II 1MAR (Sac) 매개 벡터[pZRC II 1MAR (Sac) intermediate vector]로 명명되었다.
또 다른 닭 라이소자임 MAR 단편에 Mlu I 오버행(Mlu I overhang)을 첨가하기 위해, 이를, 50 mM Tris-Cl (pH8.3), 2.5 mM MgCl2, 4 dNTPs의 250 μM 각각 및 5 units의 Pfu 중합효소를 포함하는 50 ㎕의 부피에서 유전자 특이적인 올리고뉴클레오티드 프라이머의 100 피코몰(picomoles)을 사용하여 PCR 증폭의 40 사이클을 하였다. 각각의 PCR 증폭 사이클은, 30 sec 동안 95 ℃(변성), 30 sec 동안 62 ℃(어닐링) 및 2 min 동안 72 ℃(확장)으로 이루어져 있다. PCR 반응의 증폭된 생산물은 1 % 아가로스 겔에 용해시켰다. 대략 1664 염기쌍 크기(approx 1664 base pairs size)의 원하는 단편을 겔로부터 잘라내고, Qiagen Gel 추출 키트를 사용하여 정제되었다. 이러한 정제된 DNA 단편은, Mlu I(MBI Fermentas, USA)와 함께 상기 정제된 PCR 생산물 및 벡터 둘 다의 제한 절단(restriction digestion) 후에 pZRC II-1MAR(Sac) 벡터 내로 연결되었다. 상기 연결 생산물은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformant)는 카나마이신 저항을 기초로 기록된다. 약 10 개의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소를 사용하여 제한 절단에 의해 MluI 위치에서 닭 라이소자임 MAR 단편의 존재를 위해 분석되었다. pZRC II-1MAR(Sac) 벡터에서 MluI 부위에서 cLysMAR의 정확한 통합을 갖는 것으로 발견된 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III로 명명된다(도 2, Seq ID no 6).
실시예 2. pZRC III - TNK 벡터의 구조
테넥테플라즈(Tenecteplase)(TNKase 또는 TNK-TPA) 유전자(Seq ID No7)는 화학적으로 합성되고, 클로닝 벡터 pMK (Geneart, Germany) 내로 클론된다. pZRC II 벡터에서 TNK 유전자를 클론하기 위해, 첫 번째 EcoR I 및 Not I 오버행은 50 mM Tris-Cl (pH8.3), 2.5 mM MgCl2, 4 dNTPs의 250 μM 각각 및 5 units의 Pfu 중합효소를 포함하는 50 ㎕의 부피에서 상기 제한 부위를 포함하는 특이적인 올리고뉴클레오티드 프라이머의 100 피코몰(picomoles)을 사용하여 PCR 증폭의 40 사이클을 사용하여 TNK 유전자 내로 포함되었다. 각각의 PCR 증폭 사이클은, 30 sec 동안 95 ℃(변성), 30 sec 동안 62 ℃(어닐링) 및 2 min 동안 72 ℃(확장)에서의 배양(incubation)으로 이루어져 있다. PCR 반응의 증폭된 생산물은 1 % 아가로스 겔에 용해시켰다. 크기에서 대략 1710 염기쌍의 원하는 단편을 겔로부터 잘라내고, Qiagen Gel 추출 키트를 사용하여 정제되었다. TNK의 이러한 정제된 DNA 단편은 EcoR I 및 Not I으로 절단되고, EcoR I 및 Not I (MBI Fermentas, USA)과 함께 절단된 pZRC III 벡터(실시예 1에 기재되어 있음) 내로 연결된다(ligated). 상기 연결 생산물(ligation product)은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformant)는 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 약 10 개의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소를 사용하여 제한 소화에 의해 TNK 단편의 존재를 위해 분석되었다. pZRC III 벡터에서 통합된 TNK 유전자를 갖는, 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III-TNK로 명명된다.
실시예 3. pZRC III - TNK - Hyg 벡터의 구조
히그로마이신 저항성 유전자로 조절된 종결자 및 SV40 프로모터를 갖고 대략 1550 염기쌍의 히그로마이신 전사 조립(Hygromycin transcription assembly)은 Pfu 중합효소(MBI Fermentas, USA)를 사용하여 뭉툭하게 절단되고(blunt ended), 그리고 난 다음에 Kpn I (MBI Fermentas, USA)로 미리 절단된, pZRC III-TNK 벡터 내로 연결되고, Pfu 중합효소를 사용하여 무디게 만들었다(blunted). 연결 생산물(ligation product)을, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 히그로마이신 저항 유전자의 존재에 대해 분석되었다. pZRC III-TNK 에 연결된 히그로마이신 전사 조립(Hygromycin transcription assembly)을 갖는 하나의 이러한 플라스미드가 pZRC III-TNK-Hyg 벡터로 명명되었다(도 3, Seq ID No.8). 그리고 난 다음에, 이러한 벡터를, 상기 클론된 TNK 유전자의 서열을 확인하기 위해, 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용하여 DNA를 시퀀싱하였다(This vector was then subjected to DNA sequencing using automated DNA sequencer to verify the sequence of the cloned TNK gene).
실시예 4. pZRC III - Darbe - Hyg 벡터의 구조
pZRC - EPO (WO2007017903)는, TA 벡터 pTZ57R (MBI Fermentas)에서 클론된 다음에, pTZ57R-Darbe로 명명된, 대략 600 bp의 다베포이에틴 유전자 단편(Darbepoetin gene fragment)(Seq ID No.9 및 이에 상응하는 DNA 서열 ID 21)을 수득하기 위해, 에리스로포이에틴 유전자의 부위 지정 돌연변이(site directed mutagenesis)를 수행하기 위한 주형(template)으로서 사용된다.
pZRC III-TNK-Hyg는, TNK 유전자를 제거하기 위해 Xho I 및 Not I으로 절단시키고, 남아있는 높은 분자량 DNA(remaining high molecular weight DNA)는 다베포이에틴 유전자 삽입물(Darbepoetin gene insert)과 함께 연결을 위해 벡터로서 사용된다. pTZ57R-Darbe는 대략 600 bp 다베포이에틴 유전자 단편을 겔 분리하기 위해 Xho I 및 Not I 으로 절단되었다. 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 실행하고, 상기 연결 생산물을 E. coli Top 10F'에서 변형되고, 형질전환체는 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 다베포이에틴 유전자(Darbepoetin gene)의 존재에 대해 분석되었다. 연결된 다베포이에틴 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III-Darbe-Hyg 벡터로 명명된다(도 4, Seq ID No. 10). 그리고 난 다음에, 이러한 벡터를, 상기 클론된 다베포이에틴 유전자의 서열을 확인하기 위해, 자동화된 DNA 서열기(automated DNA sequencer)(ABI)를 사용하여 DNA를 시퀀싱하였다
실시예 5. pZRC III - Etanercept - Hyg 벡터의 구조
벡터 pZRC III- Darbe-Hyg는, 대략 600 bp의 다베포이에틴 유전자를 제거하고, 대략 9430 bp의 벡터 골격(vector backbone)을 생성하기 위해, Xho I 및 Not I 효소(MBI Fermentas)로 절단되었다. 대략 1481 bp의 화학적으로 합성된, CHO 코돈 최적화된, 에타너셉트 유전자(Etanercept gene)(Seq ID No. 11 및 이에 상응하는 DNA 서열 ID 22)는, 삽입물을 수득하기 위해, Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)를 사용하여 상기 클로닝 벡터로부터 분리된다. 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결이 실행되고, 연결 생산물(ligation product)은 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 에타너셉트 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 연결된 에타너셉타 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III-Etanercept-Hyg 벡터로 명명되었다(도 5, Seq ID No. 12). 그리고 난 다음에, 이러한 벡터를, 상기 클론된 에타너셉타 유전자의 서열을 확인하기 위해, 자동화된 DNA 서열기(automated DNA sequencer)(ABI)를 사용하여 DNA를 시퀀싱하였다.
실시예 6. pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Hyg 벡터의 구조
a) pZRC III - FSH α - Hyg 벡터의 구조
대략 9430 bp의 벡터 골격(vector backbone)은, 대략 600 bp의 다베포이에틴 유전자를 제거하기 위해, Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)로 pZRC III- Darbe-Hyg 벡터로 절단시킴으로써 생산된다. 대략 359 bp의 FSH 알파 서브유닛(FSH alpha subunit)의 화학적으로 합성된 유전자(Seq ID No. 13 이에 상응하는 DNA 서열 ID 23)는, 효소 Xho I 및 Not I(MBI Fermentas)를 사용하여, 진아트 클로닝 벡터 pMA(Geneart cloning vector pMA)로부터 분리된다. 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 수행하고, 상기 연결 생산물은 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 FSH 알파 서브유닛 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 상기 연결된 FSH 알파 서브유닛 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III-FSH α-Hyg 벡터로 명명된다.
b) pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Hyg 벡터의 구조
벡터 pZRC III-FSH α-Hyg는, 대략 9790 bp의 상기 벡터 골격을 생성하기 위해, Not I(MBI Fermentas)로 절단되었다. 대략 591 bp의 IRES 유전자 단편(Seq ID No. 14)은, 첫 번째 삽입물을 수득하기 위해, 효소 Not I 및 Xma I(MBI Fermentas)를 사용하여 벡터 pIRES Hyg로부터 분리된다. 대략 401 bp의 FSH 베타 서브유닛(Seq ID No. 15 이에 상응하는 DNA 서열 ID 24)의 화학적으로 합성된 유전자는, 두 번째 삽입물을 수득하기 위해, 효소 Xma I 및 Not I (MBI Fermentas)를 사용하여 진아트 클론 벡터 pMA(Geneart cloning vector pMA)로부터 분리된다. 상기 2 개의 삽입물을 융합시키고, 상기 융합된 유전자 생산물을 상기 벡터와 함께 연결시켰다. 상기 연결 생산물을, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 IRES 및 FSH 베타 서브유닛 유전자의 존재에 대해 분석되었다. IRES 및 FSH 베타 서브유닛 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Hyg 벡터로 명명된다(도 6, Seq ID No. 16). 그리고 난 다음에, 이러한 벡터를, FSHα 및 FSHβ 유전자의 서열을 확인하기 위해, 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용하여 DNA를 시퀀싱하였다. 상기 클론도니 유전자의 서열은, 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용함으로써 확인되었다.
실시예 7. pZRC III - FSH β- IRES - FSH α- Hyg 벡터의 구조
a) pZRC III - FSH β - Hyg 벡터의 구조
벡터 pZRC III- FSHα-IRES-FSHβ-Hyg는, FSHα, IRES 및 FSHβ 유전자의 제거 후에, 대략 9430 bp의 벡터 골격을 생성하기 위해, Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)로 절단되었다. 대략 401 bp의 FSH 베타 서브유닛의 화학적으로 합성된 유전자는, 효소 Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)를 사용하여 진아트 클로닝 벡터 pMA(Geneart cloning vector pMA)로부터 분리된다. 상기 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 수행하고, 상기 연결 생성물을 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 FSH 베타 서브유닛 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 상기 연결된 FSH 베타 서브유닛을 갖는 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III-FSH β-Hyg 벡터로 명명된다.
b) pZRC III - FSH β- IRES - FSH α- Hyg 벡터 의 구조
벡터 pZRC III- FSH β-Hyg는, 대략 9790 bp의 상기 벡터 골격을 생성하기 위해 Not I (MBI Fermentas)로 절단된다. 대략 591 bp의 IRES 유전자 단편은, 첫 번째 삽입물(IRES)를 수득하기 위해, 효소 Not I 및 Xho I (MBI Fermentas)를 사용하여 벡터 pIRES Hyg로부터 분리된다. 대략 359 bp의 FSH 알파 서브유닛의 화학적으로 합성된 유전자는, 두 번째 삽입물을 수득하기 위해, 효소 Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)를 사용하여 진아트 클로닝 벡터 pMA로부터 분리된다. 이는 상기 벡터 및 2 개의 삽입물의 세 조각 연결이 뒤따른다(This was followed by three piece ligation of the vector and the 2 inserts). 상기 연결 생산물(ligation product)을, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 IRES 및 FSH 알파 서브유닛 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 연결된 IRES 및 FSH 알파 서브유닛 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III FSH β- IRES - FSH α- Hyg 벡터로 명명된다(도 7). 상기 클론된 유전자의 서열은, 자동화된 DNA 서열기(automated DNA sequencer)(ABI)를 사용하여 확인되었다.
실시예 10. pZRC III - TNK - 퓨로마이신 벡터의 구조
SV40 프로모터 및 종결자 조절된 퓨로마이신 저항 유전자를 갖고, BamH1 호환가능한 말단을 운반하는 크기로 대략 1110 염기쌍의 퓨로마이신 전사 조립은 BamH I(MBI Fermentas, USA)로 또한 절단된 pZRC III-TNK 벡터 내로 연결된다(The Puromycin transcription assembly of approx 1110 base pairs in size having the SV40 Promoter and terminator controlled Puromycin resistance gene and carrying BamH1 compatible ends ligated into pZRC III-TNK vector which was also digested with BamH I). 상기 연결 생산물은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소를 사용하여 제한 절단에 의해 퓨로마이신 단편의 존재를 위해 분석된다. pZRC III- TNK 벡터에서 연결된 퓨로마이신 전사 조립을 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III- TNK-Puro 벡터로 명명된다(도 8, Seq ID No. 17). 상기 클론된 TNK 유전자의 서열은, 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용함으로써 확인되었다.
실시예 11. pZRC III - 다베포이에틴 - Puro 벡터( pZRC III - Darbepoetin - Puro vector)의 구조
pZRC III-TNK-Puro는, TNK 유전자 단편을 제거하기 위해 Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)로 절단된다. pTZ57R-Darbe는, 대략 600 bp 다베포이에틴 유전자 단편을 겔 분리하기 위해 Xho I 및 Not I으로 절단된다. 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 하였다. 상기 연결 생산물은 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 다베포이에틴 유전자 단편의 존재에 대해 분석되었다. 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III-Darbe-Puro 벡터로 명명된 연결된 다베포이에틴 유전자를 갖는 것이다(도 9, Seq ID No. 18). 상기 클론된 다베포이에틴 유전자의 서열은, 자동화된 DNA 서열기(automated DNA sequencer)(ABI)를 사용함으로써 확인된다.
실시예 12. pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Puro 벡터의 구조
pZRC III- FSHα-IRES-FSHβ-Puro 벡터로부터의 히그로마이신 카세트가 제거되고, 특정한 올리고뉴클레오티드 프라이머(specific oligonucleotide primers)와 함께 PCR 반응을 사용하여, pZRC III-Darbe-Puro로부터 확장된 퓨로마이신 저항 유전자 통제된 종결자 및 SV40 프라이머를 갖는 크기에서 대략 1110 염기쌍의 퓨로마이신 전사 조절로 교체된다(Hygromycin cassette from pZRC III- FSHα-IRES-FSHβ-Puro vector was removed and replaced with the Puromycin transcription assembly of approx. 1110 base pairs in size having the SV40 Promoter and terminator controlled Puromycin resistance gene amplified from pZRC III-Darbe-Puro using a PCR reaction with specific oligonucleotide primers). 상기 수득된 PCR 생산물은 특정한 엔도뉴클레아제(specific endonucleases)를 사용하여 절단되고, 벡터 골격과 함께 추가적인 연결에 사용된다. 상기 연결 생산물은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 퓨로마이신 저항 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 상기 연결된 퓨로마이신 저항 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Puro 벡터로 명명된다(도 10).
실시예 13. pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- 네오 벡터의 구조
벡터 pZRC III- FSHα- IRES- FSHβ-Puro는, 퓨로마이신 저항 유전자의 제거 후에, 대략 9980 bp의 벡터 골격을 생산하기 위해, Pac I 및 Bam HI (MBI Fermentas)로 절단된다. 대략 1518 bp의 네오마이신 저항 유전자는, pcDNA 3.1 (Invitrogen) 플라스미드로부터 분리된다. 상기 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 수행하고, 상기 연결 생산물은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 네오마이신 저항 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 연결된 네오마이신 저항 서브유닛 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Neo 벡터로 명명된다(도 11). FSHα, IRES 및 FSHβ 유전자의 서열은 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용함으로써 확인된다.
실시예 14. pZRC III - FSH β- IRES - FSH α- Neo 벡터의 구조
a) pZRC III - FSH β - Neo 벡터의 구조
벡터 pZRC III- FSHα- IRES-FSH β-Neo는, FSHα, IRES 및 FSH β 유전자의 제거 후에, 대략 9400 bp의 상기 벡터 골격을 생성하기 위해, Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)로 절단된다. 대략 401 bp의 FSH 베타 서브유닛의 화학적으로 합성된 유전자는, 효소 Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)를 사용하여 진아트 클로닝 벡터 pMA로부터 분리된다. 상기 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 수행하고, 상기 연결 생산물은 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 FSH 베타 서브유닛 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 상기 연결된 FSH 베타 서브유닛을 갖는 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III- FSH β-Neo 벡터로 명명된다.
b) pZRC III FSH β- IRES - FSH α- Neo 벡터 의 구조
벡터 pZRC III- FSH β-Neo는 대략 9800 bp의 상기 벡터 골격을 생성하기 위해, Not I (MBI Fermentas)로 절단된다. 대략 591 bp의 IRES DNA단편은, 첫 번째 삽입물을 수득하기 위해, 효소 Not I 및 Xho I(MBI Fermentas)를 사용하여 벡터 pIRES Hyg로부터 분리된다. 대략 359 bp의 FSH 알파 서브유닛의 화학적으로 합성된 유전자는, 두 번째 삽입물을 수득하기 위해, 효소 Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)를 사용하여 진아트 벡터 pMA(Geneart vector pMA)로부터 분리된다. 이는 상기 벡터 및 2 개의 삽입물의 세 개의 조각의 연결이 뒤따른다. 그리고 난 다음에, 상기 연결 생산물은, E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 IRES 및 FSH 알파 서브유닛 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 상기 연결된 IRES 및 FSH 알파 서브유닛 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, 수득된 pZRC III FSH β- IRES - FSH α- Neo 벡터로 명명되었다(도 12). 상기 클론된 유전자의 서열은, 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용함으로써 확인된다.
실시예 17. pZRC III - Etanercept - Neo 벡터의 구조
벡터 pZRC III- FSHα-IRES- FSHβ-Neo는, FSHα, IRES 및 FSHβ 유전자를 제거하고, 에타너셉트 유전자(Etanercept gene)를 클로닝하기 위해 사용될 수 있도록, 대략 9400 bp의 상기 벡터 골격을 수득하기 위해, Xho I 및 Not I (MBI Fermentas) 효소와 함께 절단되었다. 에타너셉트의 대략1481 bp 유전자는, 상기 삽입물을 수득하기 위해, Xho I 및 Not I(MBI Fermentas) 효소를 사용하여 벡터 pZRC III-Etanercept-Hyg 로부터 분리되었다. 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 수행하고, 상기 연결 생산물은 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 에타너셉트 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 통합된 에타너셉트 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는, pZRC III-Etanercept-Neo 벡터로 명명된다(도 13, Seq ID No. 19). 상기 클론된 에타너셉트 유전자의 서열은 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용함으로써 확인되었다.
실시예 18. pZRC III - TNK - Neo 벡터의 구조
벡터 pZRC III-Etanercept-Neo는, 대략 1481 에타너셉트 유전자(Etanercept gene)를 제거하고, 대략 9400 bp의 벡터 구조를 수득하기 위해, 효소 Xho I 및 Not I (MBI Fermentas)로 절단된다. 대략 1692 bp의 TNK 유전자의 삽입물은, Xho I 및 Not I 효소(MBI Fermentas)로 상기 벡터 pZRC III - TNK - Hyg를 절단한 후에 수득되었다. 상기 벡터 및 삽입물 둘 다의 연결을 수행하고, 상기 연결 생산물은 E. coli Top 10F'에서 변형되고(transformed), 형질전환체(transformants)가 카나마이신 저항의 기초로 기록된다. 몇몇의 이러한 콜로니로부터 분리된 플라스미드 DNA는, 다양한 제한 효소(restriction enzymes)를 사용하여 제한 절단(restriction digestion)에 의해 TNK 유전자의 존재에 대해 분석되었다. 상기 연결된 TNK 유전자를 갖는 하나의 이러한 플라스미드는 pZRC III-TNK-Neo 벡터로 명명된다(도 14). 상기 클론된 TNK 유전자의 서열은, 자동화된 DNA 서열기(ABI)를 사용함으로써 확인되었다.
실시예 19. 에타너셉트의 발현
Set - pZRC III - Etanercept - Hyg 벡터를 사용하여 CHO - K1 -S 세포주에서 안정된 트랜스펙션
FreestyleTM CHO-K1-S 세포는, 4 mM 글루타민으로 보충된, PowerCHO2 CD 배지[화학적 규명된 배지(chemically defined medium), Lonza]에서 일상적으로 배양된다. 세포는, 습기가 있는 인큐베이터(humidified incubator)에서 5% CO2 및 37 ℃에서 교반(agitation)(120 rpm) 하에서 유지시켰다. 세포를 매일 3rd/4th 일마다 계수하였고, 완전한 배지 교환이 제공되었다. 트랜스펙션은 네온 트랜스펙션 시스템(Neon Transfection system)(Invitrogen)을 사용하여 수행되었다. 트랜스펙션 하루 전에, CHO-KI-S 세포를 신선한 배지 내로 통과되었고, 트랜스펙션을 위해 사용전에 적어도 하나의 더블링을 가능하게 한다(and allowed at least one doubling before use for transfection). 트랜스펙션은, 제조사(Invitrogen)에 의해 기재된 표준 프로토콜 당으로서, Sgs I (Asc I) linearised pZRC III-Etanercept-Hyg 플라스미드를 사용하여 수행되었다. 트랜스펙션 후에, 상기 세포는, 1 mL의 예비-항온된 배양 배지(pre-warmed culture medium)를 포함하는, 24 웰 플레이트의 하나의 웰 내로 이동되었다. 세포를, 습기가 있는 인큐베이터(humidified incubator)에서 5 % CO2, 37 ℃ 에서 유지시켰다. 그 다음날에, 미니폴 생성(minipool generation)을 위해, 트랜스펙션된 개채군(transfected population)을, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에 평편시켰다(plated). 15 내지 30일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액(supernatant)은 ELISA에 의한 생산물 형성 분석(product formation analysis)을 위해 제거되었다. 상기 선택된 높게 발현하는 미니폴(The selected high expressing minipools)은 24 웰 플레이트로 이동시킨 다음에, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트에 이동시키고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 발현하는 미니폴(High expressing minipools)은, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 디미팅 희석(single cell dimiting dilution)을 수행하기 위해 선택되었다. 약 15 내지 30일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은, ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 클론은, 24 웰 플레이트로 이동시키고, 그런 다음에 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트로 이동시켰고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 생산하는 클론(High producing clones)은 재트랜스펙션(re transfections)을 위해 선택된다.
Set - pZRC III - Etanercept - Neo 벡터 를 사용하여 Set 로부터 수득된 클론의 안정된 재트랜스펙션
높게 발현되는 클론은, Set I 트랜스펙션에서, 동일한 방법에 의해 Sgs I (Acs I)에 의해 선형화된 pZRC III-Etanercept-Neo 플라스미드를 사용하여 재-트랜스펙션을 수행하기 위해 선택되었다. 그 다음 날에, 미니폴 생성을 위해, 트랜스펙션된 개체군(transfected population)은, 4 mM 글루타민, 600 ㎍/ml의 히그로마이신, 및 500 ㎍/ml의 네오마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다(plated). 15 내지 30일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 미니폴은, 24 웰 플레이트에 이동된 다음에, 4 mM 글루타민 및 상기 항생물질 압력(antibiotic pressures)으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트에 이동시키고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 생산하는 미니폴은, 4 mM 글루타민으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 한정하는 희석(single cell limiting dilution)을 수행하기 위해 선택되었다. 15 내지 30일 후에 또 다시, 96웰 플레이트로부터 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 클론은 24 웰 플레이트에 이동시킨 다음에, 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트에 이동시키고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 발현하는 재트랜스펙션된 클론(High expressing retransfected clones)은, 패드 배치 모드(fed batch mode)에서의 진탕 튜브(shake tubes)에서의 상기 생산물 형성을 분석하기 위해 선택되었다. 이러한 실험은, 120 rpm, 37 ℃, 5 % CO2 에서, 진탕기(shaker)에서 스핀 튜브(spin tubes)에서의 이러한 선택된 클론을 사용하여 실행되었다. 클론은, 12 일에 대략 700 mg/l 내지 1000 mg/1의 범위에서의 생산 레벨로 수득되었다.
실시예 20. TNK 의 발현
Set - pZRC III - TNK - Hyg 벡터를 사용한 CHO - K1 -S 세포주에서 안정된 트랜스펙션
FreestyleTM CHO-K1-S 세포는, 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 일상적으로 배양된다. 세포는, 습기가 있는 인큐베이터에서 5% CO2, 및 37 ℃에서 교반(agitation)(120 rpm) 하에서 유지된다. 세포를 3rd/4th 일마다 계수하였고, 완전한 배지 교환(complete medium exchange)을 제공하였다. 트랜스펙션은 네오 트랜스펙션 시스템(Neon Transfection system)(Invitrogen)을 사용하여 수행되었다. 트랜스펙션 하루 전에, CHO-KI-S 세포는 신선한 배지 내로 통과되었고, 트랜스펙션을 위해 사용 전에 적어도 하나의 더블링(at least one doubling)을 가능하게 한다. 트랜스펙션은, 제조사(Invitrogen)에 의해 기재된 표준 프로토콜 당 Sgs I (Asc I) linearised pZRC III-TNK-Hyg 플라스미드를 사용하여 실행하였다. 트랜스펙션 후에, 상기 세포는 1 mL의 예비-항온된 배양 배지를 포함하는, 24 웰 플레이트의 하나의 웰 내로 이동시켰다. 세포는, 습기가 있는 인큐베이터에서 5 % CO2, 37 ℃에서 유지되었다. 그 다음 일에, 미니폴 생성(minipool generation)을 위해, 트랜스펙션된 개체군은 4 mM 글루타민 및 500 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된, PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다. 15 내지 30 일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 상기 선택된 높게 발현하는 미니폴은, 24 웰 플레이트에 이동시킨 다음에, 그 다음에 6 웰 플레이트에 이동시키고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 발현하는 미니폴은, 4 mM 글루타민 및 500 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza) PowerCHO2 CD 배지에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 디미팅 희석(single cell dimiting dilution)을 수행하기 위해 선택되었다. 약 15 내지 30 일 후에, 96웰 플레이트로부터의 상청액을 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 클론은 24 웰 플레이트로 이동된 다음에, 6 웰 플레이트로 이동된 다음에, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석하였다. 높게 생산하는 클론(High producing clones)은 재트랜스펙션을 위해 선택되었다. 높게 발현하는 클론은, 피드 배치 모드(fed batch mode)에서 진탕 튜브(shake tubes)에서 상기 생산물 형성을 분석하기 위해 선택되었다. 이러한 실험은, 5 % CO2 , 37 ℃, 230 rpm에서 진탕기(Kuhner-Germany)에서 스핀 튜브(spin tubes)에서 10 ml 배지에서 이러한 선택된 클론을 사용하여 실행되었다. 클론은 9 일에 150 mg/l의 생산 레벨을 수득하였다.
Set Ⅱa - pZRC III - TNK - Puro 벡터를 사용하여 Set I로부터 수득된 클론의 안정된 재- 트랜스펙션
높게 발현하는 클론은, Set I 트랜스펙션에서 동일한 절차에 의해 Sgs I (Acs I)에 의해 선형화된 pZRC III-TNK-Puro 플라스미드를 사용하여 재-트랜스펙션을 수행하기 위해 선택되었다. 그 다음 날에, 미니폴 생성을 위해, 트랜스펙션된 개체군은, 4 mM 글루타민, 500 ㎍/ml의 히그로마이신, 및 3 ug/ml의 퓨로마이신으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다. 15 내지 30 일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은, ELISA에 의해 생산물 형성을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 미니폴은 24 웰 플레이트로 이동되고, 그리고 난 다음에 6 웰 플레이트에 이동되고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 생성되는 미니폴은, 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 한정 희석(single cell limiting dilution)을 수행하기 위해 선택되었다. 15 내지 20 일 후에, 96웰 플레이트로부터의 상청액은, ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 상기 선택된 높게 발현하는 클론은 24 웰 플레이트로 이동된 다음에, 6 웰 플레이트로 이동되고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 발현하는 클론은, 피드 배치 모드에서 진탕 튜브에서 생산물 형성을 분석하기 위해 선택되었다. 이러한 실험은, 5 % CO2, 37 ℃, 120 rpm에서 진탕기(Kuhner-Germany)에서의 스핀 튜브(spin tubes)에서 이러한 선택된 클론을 사용하여 수행되었다. 클론은 11 일에 290 mg/l의 생산 레벨을 산출되었다.
Set Ⅱb - pZRC III - TNK - Neo 벡터를 사용하여 Set I로부터 수득된 클론의 안정된 재- 트랜스펙션
높게 생성하는 클론(High producing clones)은, Set I 트랜스펙션에서 동일한 절차에 의해 Sgs I (Acs I)에 의해 선형화된 pZRC III-TNK-Neo 플라스미드를 사용하여 재-트랜스펙션을 수행하기 위해 선택되었다. 그 다음 날에, 미니폴 생성을 위해, 트랜스펙션된 개체군은, 4 mM 글루타민, 600 ㎍/ml의 히그로마이신 및 500 ㎍/ml의 네오마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다. 15 내지 30일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되엇다. 상기 선택된 높게 발현하는 미니폴은 24 웰 플레이트로 이동된 다음에, 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트로 이동되고, 상기 언급된 항생물질 압력(the mentioned antibiotic pressures) 및 발현 레벨은 ELISA에 의한 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 생성하는 미니폴은, 4 mM 글루타민으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 한정 희석(single cell limiting dilution)을 수행하기 위해 선택되었다. 15 내지 30 일 후에 또 다시, 96웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 상기 선택된 높게 발현하는 클론은 24 웰 플레이트로 이동시킨 다음에, 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트로 이동시키고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 발현하는 클론은, 피드 배치 모드에서 진탕 튜브에서 상기 생산물 형성을 분석하기 위해 선택되었다. 이러한 실험은, 5% CO2, 37 ℃, 120 rpm 에서 진탕기(Kuhner-Germany)에서의 스핀 튜브(spin tubes)에서 이러한 선택된 클론을 사용하여 수행되었다. 클론은 10 일에 390 mg/l의 생산 레벨로 산출되었다.
실시예 21. pZRC III - Darbe - Hyg 벡터를 사용한 다베포이에틴의 발현
Set - pZRC III - Darbe - Hyg 벡터를 사용하여 CHO - K1 -S 세포주에서의 안정된 트랜스펙션
FreestyleTM CHO-K1-S 세포는 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 일상적으로 배양되었다. 세포는, 습기가 있는 인큐베이터에서 5 % CO2 및 37 ℃에서 교반(120 rpm) 하에서 유지시켰다. 세포를 매 3rd/4th 일에 계수하고, 완전한 배지 교환을 제공하였다. 트랜스펙션은 네오 트랜스펙션 시스템(Invitrogen)을 사용하여 수행되었다. 트랜스펙션 하루 전에, CHO-KI-S 세포를 신선한 배지 내로 통과시키고, 트랜스펙션을 위해 사용 전에 적어도 하나 더블링(at least one doubling)을 가능하게 하였다. 트랜스펙션은, 제조사(Invitrogen)에 의해 기재된 표준 프로토콜 당 Sgs I (Asc I) linearised pZRC III-Darbe-Hyg 플라스미드를 사용하여 수행되었다. DNA의 트랜스펙션 후에, 상기 세포는, 1 mL의 예비-항온된 배양 배지를 포함하는, 24 웰 플레이트의 하나의 웰 내로 이동되었다. 세포는 습기가 있는 인큐베이터에서 5 % CO2, 37 ℃에서 유지되었다. 그 다음 날에, 미니폴 생성을 위해, 트랜스펙션된 개체군은, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다. 15 내지 20일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에 상기 선택된 높게 발현되는 미니폴은 24 웰 플레이트에 이동되고, 6 웰 플레이트에 이동되고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 두 개의 높게 발현하는 미니폴은, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 ProCHO5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 한정 희석을 수행하기 위해 선택되었다. 15 내지 30 일 후에 또 다시, 96웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생성물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 클론은 24 웰 플레이트로 이동되고, 그리고 난 다음에 6 웰 플레이트로 이동되고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 발현하는 클론은, 피드 배치 모드에서 진탕 튜브에서 상기 생성물 형성을 분석하기 위해 선택되었다. 이러한 실험은, 5% CO2, 37 ℃, 230 rpm에서 진탕기(Kuhner-Germany)에서 스핀 튜브(spin tubes)에서 10 ml 배지에서 이러한 선택된 클론을 사용하여 수행되었다. 클론은 11 일에 340 mg/l의 생산 레벨을 산출되었다.
실시예 22. FSH 의 발현
Set - pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Hyg 벡터를 사용하여 CHO - K1 -S 세포주에서 안정된 트랜스펙션
FreestyleTM CHO-K1-S 세포는, 4 mM 글루타민으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 일상적으로 배양되었다. 세포를 습기가 있는 인큐베이터에서 5 % CO2, 및 37 ℃에서 교반(120 rpm) 하에서 유지시켰다. 세포를 매 3rd/4th 일마다 계수하였고, 완전한 배지 교환이 제공되었다. 트랜스펙션은 네오 트랜스펙션 시스템(Invitrogen)을 사용하여 실행되었다. 트랜스펙션 하루 전에, CHO-KI-S 세포는 신선한 배지 내로 통과하고, 트랜스펙션을 위해 사용 전에 적어도 하나의 더블링(at least one doubling)을 가능하게 한다. 트랜스펙션은, 제조사(Invitrogen)에 의해 기재된 표준 프로토콜 당 Sgs I (Asc I) linearised pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Hyg _플라스미드를 사용하여 실행되었다. 트랜스펙션 후에, 상기 세포는 1 mL의 예비-항온된 배양 배지를 포함하는, 24 웰 플레이트의 하나의 웰 내로 이동되었다. 세포는 습기가 있는 인큐베이터에서 5 % CO2, 37 ℃에서 유지되었다. 그 다음 날에, 미니폴 생성을 위해, 트랜스펙션된 개체군은, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다. 15 내지 30 일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 미니폴은 24 웰 플레이트로 이동되고, 그 다음에 4 mM 글루타민 및 상기 항생물질 압력으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트로 이동되었고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 발현하는 미니폴은, 4 mM 글루타민 및 600 ㎍/ml의 히그로마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 한정 희석을 수행하기 위해 선택되었다. 15 내지 30 일 후에, 96웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 상기 선택된 높게 발현하는 클론은 그리고 난 다음에 24 웰 플레이트로 이동되고, 그리고 난 다음에 4 mM 글루타민 및 상기 항생물질 압력으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트로 이동되고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨에서 분석되었다. 높게 생산하는 클론(High producing clones)은 재트랜스펙션(retransfections)을 위해 선택되었다.
Set - pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Neo 벡터를 사용하여 Set 로부터 수득된 클론의 안정된 재- 트랜스펙션
클론은, Set I 트랜스펙션으로서 상기 동일한 방법에 의해 Sgs I (Acs I)에 의해 선형화된 pZRC III - FSH α- IRES - FSH β- Neo 플라스미드를 사용하여 재-트랜스펙션을 수행하기 위해 선택되었다. 그 다음 날에, 미니폴 생성을 위해, 트랜스펙션된 개체군은 4 mM 글루타민, 600 ㎍/ml의 히그로마이신, 및 500 ㎍/ml의 네오마이신으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 평판되었다. 15 내지 30 일 후에, 96 웰 플레이트로부터의 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에 선택된 높게 발현하는 미니폴은 24 웰 플레이트로 이동되고, 그리고 난 다음에 4 mM 글루타민 및 상기 항생물질 압력으로 보충된 PowerCHO2 CD(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트로에 이동시키고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 생성하는 재트랜스펙션된 미니폴은, 4 mM 글루타민 및 언급된 항생물질 압력으로 보충된 Pro CHO 5 배지(Lonza)에서 96 웰 플레이트에서 단일 세포 한정 희석(single cell limiting dilution)을 수행하기 위해 선택되었다. 15 내지 30 일 후에 또다시, 96 웰 플레이트로부터 상청액은 ELISA에 의해 생산물 형성 분석을 위해 제거되었다. 그리고 난 다음에, 상기 선택된 높게 발현하는 클론은, 24 웰 플레이트로 이동된 다음에, 4 mM 글루타민 및 언급된 항생물질 압력으로 보충된 PowerCHO2 CD 배지(화학적으로 한정된 배지, Lonza)에서 6 웰 플레이트에 이동되고, 발현 레벨은 ELISA에 의해 각각의 레벨로 분석되었다. 높게 발현하는 클론은 즉, 피드 배치 모드(fed batch mode)에서 진탕 튜브에서 상기 생산물 형성을 분석하기 위해 선택되었다. 이러한 실험은, 5 % CO2, 37 ℃, 120 rpm에서 진탕기(Kuhner-Germany)에서 스핀 튜브에서 이러한 선택된 클론을 사용하여 실행되었다. 생산 레벨은, 상이한 클론과 함께 10 일에 대략 20 mg/l 내지 50 mg/l의 범위로 수득되었다.
SEQUENCE LISTING <110> CADILA HEALTHCARE LIMITED <120> A NOVEL EXPRESSION VECTOR FOR HIGH LEVEL EXPRESSION OF RECOMBINANT PROTEINS <130> 2806-MUM-10 <150> IN: 2806/MUM/2010 <151> 2010-10-08 <160> 24 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 324 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> Chimeric INTRON <400> 1 aattaattcg ctgtctgcga gggccagctg ttggggtgag tactccctct caaaagcggg 60 catgacttct gcgctaagat tgtcagtttc caaaaacgag gaggatttga tattcacctg 120 gcccgcggtg atgcctttga gggtggccgc gtccatctgg tcagaaaaga caatcttttt 180 gttgtcaagc ttgaggtgtg gcaggcttga gatctggcca tacacttgag tgacaatgac 240 atccactttg cctttctctc cacaggtgtc cactcccagg tccaactgca ggtcgagcat 300 gcatctaggg cgcccgcact agag 324 <210> 2 <211> 395 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> TPL <400> 2 gtttagtgaa ccgtcagatc ctcttccgca tcgctgtctg cgagggccag ctgttggggt 60 gagtactccc tctcaaaagc gggcatgact tctgcgctaa gaatgtcagt ttccaaaaac 120 gaggaggatt tgatattcac tggcccgcgg tgatgccttt gagggtggcc gcgtccatct 180 ggtcagaaaa gacaatcttt ttgttgtcaa gcttccttga tgatgtcata cttatcctgt 240 cccttttttt tccacagctc gcggttgagg acaaactctt cgcggtcttt ccagtactct 300 tggatcggaa acccgtcggc ctccgaacgg tactccgcca ccgagggacc tgagcgagtc 360 cgcatcgacc ggatcggaaa acctctcgac gtacc 395 <210> 3 <211> 627 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> VA I & II Genes <400> 3 ggtacctcgg gacgctctgg ccggtgaggc gtgcgcagtc gttgacgctc tagaccgtgc 60 aaaaggagag cctgtaagcg ggcactcttc cgtggtctgg tggataaatt cgcaagggta 120 tcatggcgga cgaccggggt tcgaaccccg gatccggccg tccgccgtga tccatgcggt 180 taccgcccgc gtgtcgaacc caggtgtgcg acgtcagaca acgggggagc gctccttttg 240 gcttccttcc aggcgcggcg gctgctgcgc tagctttttt ggccactggc cgcgcgcggc 300 gtaagcggtt aggctggaaa gcgaaagcat taagtggctc gctccctgta gccggagggt 360 tattttccaa gggttgagtc gcaggacccc cggttcgagt ctcgggccgg ccggactgcg 420 gcgaacgggg gtttgcctcc ccgtcatgca agaccccgct tgcaaattcc tccggaaaca 480 gggacgagcc ccttttttgc ttttcccaga tgcatccggt gctgcggcag atgcgccccc 540 ctcctcagca gcggcaagag caagagcagc ggcagacatg cagggcaccc tccccttctc 600 ctaccgcgtc aggaggggca acatccg 627 <210> 4 <211> 4584 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> pZRC II <400> 4 gtggcacttt tcggggaaat gtgcgcggaa cccctatttg tttatttttc taaatacatt 60 caaatatgta tccgctcatg agacaataac cctgataaat gcttcaataa tattgaaaaa 120 ggaagagtat gattgaacag gatggcctgc atgcgggtag cccggcagcg tgggtggaac 180 gtctgtttgg ctatgattgg gcgcagcaga ccattggctg ctctgatgcg gcggtgtttc 240 gtctgagcgc gcagggtcgt ccggtgctgt ttgtgaaaac cgatctgagc ggtgcgctga 300 acgagctgca ggatgaagcg gcgcgtctga gctggctggc caccaccggt gttccgtgtg 360 cggcggtgct ggatgtggtg accgaagcgg gccgtgattg gctgctgctg ggcgaagtgc 420 cgggtcagga tctgctgtct agccatctgg cgccggcaga aaaagtgagc attatggcgg 480 atgccatgcg tcgtctgcat accctggacc cggcgacctg tccgtttgat catcaggcga 540 aacatcgtat tgaacgtgcg cgtacccgta tggaagcggg cctggtggat caggatgatc 600 tggatgaaga acatcagggc ctggcaccgg cagagctgtt tgcgcgtctg aaagcgagca 660 tgccggatgg cgaagatctg gtggtgaccc atggtgatgc gtgcctgccg aacattatgg 720 tggaaaatgg ccgttttagc ggctttattg attgcggccg tctgggcgtg gcggatcgtt 780 atcaggatat tgcgctggcc acccgtgata ttgcggaaga actgggcggc gaatgggcgg 840 atcgttttct ggtgctgtat ggcattgcgg caccggatag ccagcgtatt gcgttttatc 900 gtctgctgga tgaatttttc taataactgt cagaccaagt ttactcatat atactttaga 960 ttgatttaaa acttcatttt taatttaaaa ggatctaggt gaagatcctt tttgataatc 1020 tcatgaccaa aatcccttaa cgtgagtttt cgttccactg agcgtcagac cccgtagaaa 1080 agatcaaagg atcttcttga gatccttttt ttctgcgcgt aatctgctgc ttgcaaacaa 1140 aaaaaccacc gctaccagcg gtggtttgtt tgccggatca agagctacca actctttttc 1200 cgaaggtaac tggcttcagc agagcgcaga taccaaatac tgttcttcta gtgtagccgt 1260 agttaggcca ccacttcaag aactctgtag caccgcctac atacctcgct ctgctaatcc 1320 tgttaccagt ggctgctgcc agtggcgata agtcgtgtct taccgggttg gactcaagac 1380 gatagttacc ggataaggcg cagcggtcgg gctgaacggg gggttcgtgc acacagccca 1440 gcttggagcg aacgacctac accgaactga gatacctaca gcgtgagcta tgagaaagcg 1500 ccacgcttcc cgaagggaga aaggcggaca ggtatccggt aagcggcagg gtcggaacag 1560 gagagcgcac gagggagctt ccagggggaa acgcctggta tctttatagt cctgtcgggt 1620 ttcgccacct ctgacttgag cgtcgatttt tgtgatgctc gtcagggggg cggagcctat 1680 ggaaaaacgc cagcaacgcg gcctttttac ggttcctggc cttttgctgg ccttttgctc 1740 attaggcacc ccaggcttta cccgaacgac cgagcgcagc gagtcagtga gcgaggaagc 1800 ggagagcgcc caatacgcaa ggaaacagct atgaccatgt taatgcagct ggcacgacag 1860 gtttcccgac tggaaagcgg gcagtgaaag gaaggcccat gaggccagtt aattaagagg 1920 tacctcggga cgctctggcc ggtgaggcgt gcgcagtcgt tgacgctcta gaccgtgcaa 1980 aaggagagcc tgtaagcggg cactcttccg tggtctggtg gataaattcg caagggtatc 2040 atggcggacg accggggttc gaaccccgga tccggccgtc cgccgtgatc catgcggtta 2100 ccgcccgcgt gtcgaaccca ggtgtgcgac gtcagacaac gggggagcgc tccttttggc 2160 ttccttccag gcgcggcggc tgctgcgcta gcttttttgg ccactggccg cgcgcggcgt 2220 aagcggttag gctggaaagc gaaagcatta agtggctcgc tccctgtagc cggagggtta 2280 ttttccaagg gttgagtcgc aggacccccg gttcgagtct cgggccggcc ggactgcggc 2340 gaacgggggt ttgcctcccc gtcatgcaag accccgcttg caaattcctc cggaaacagg 2400 gacgagcccc ttttttgctt ttcccagatg catccggtgc tgcggcagat 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aggttttttt gcctgttttt tttgttgttt 360 ttttttttta agtaaggtgt tcttttttct tagtaaaatt tctactggac tgtatgtttt 420 gacaggtcag aaacatttct tcaaaagaag aaccttttgg aaactgtaca gcccttttct 480 ttcattccct ttttgctttc tgtgccaatg cctttggttc tgattgcatt atggaaaacg 540 ttgatcggaa cttgaggttt ttatttatag tgtggcttga aagcttggat agctgttgtt 600 acatgagata ccttattaag tttaggccag cttgatgctt tatttttttt cctttgaagt 660 agtgagcgtt ctctggtttt tttcctttga aactggcgag gcttagattt ttctaatggg 720 attttttacc tgatgatcta gttgcatacc caaatgcttg taaatgtttt cctagttaac 780 atgttgataa cttcggattt acatgttgta tatacttgtc atctgtgttt ctagtaaaaa 840 tatatggcat ttatagaaat acgtaattcc tgatttcctt ttttttttat ctctatgctc 900 tgtgtgtaca ggtcaaacag acttcactcc tatttttatt tatagaattt tatatgcagt 960 ctgtcgttgg ttcttgtgtt gtaaggatac agccttaaat ttcctagagc gatgctcagt 1020 aaggcgggtt gtcacatggg ttcaaatgta aaacgggcac gtttgctgct gccttcccag 1080 atccaggaca ctaaactgct tctgcaactg aggtataaat cgcttcagat cccaggaagt 1140 gtagatccac gtgcatattc ttaaagaaga atgaatactt tctaaaatat gttggcatag 1200 gaagcaagct gcatggattt atttgggact taaattattt tggtaacgga gtgcataggt 1260 tttaaacaca gttgcagcat gctaacgagt cacagcattt atgcagaagt gatgcctgtt 1320 gcagctgttt acggcactgc cttgcagtga gcattgcaga taggggtggg gtgctttgtg 1380 tcgtgttggg acacgctgcc acacagccac ctcccgaaca tatctcacct gctgggtact 1440 tttcaaacca tcttagcagt agtagatgag ttactatgaa acagagaagt tcctcagttg 1500 gatattctca tgggatgtct tttttcccat gttgggcaaa gtatgataaa gcatctctat 1560 ttgtaaatta tgcacttgtt agttcctgaa tcctttctat agcaccactt attgcagcag 1620 gtgtaggctc tggtgtggcc tgtgtctgtg cttcaatctt ttaagctt 1668 <210> 6 <211> 7932 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> pZRC III <400> 6 gtggcacttt tcggggaaat gtgcgcggaa cccctatttg tttatttttc taaatacatt 60 caaatatgta tccgctcatg agacaataac cctgataaat gcttcaataa tattgaaaaa 120 ggaagagtat gattgaacag gatggcctgc atgcgggtag cccggcagcg tgggtggaac 180 gtctgtttgg ctatgattgg gcgcagcaga ccattggctg ctctgatgcg gcggtgtttc 240 gtctgagcgc gcagggtcgt ccggtgctgt ttgtgaaaac cgatctgagc 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cctcttgcct 720 gccttggaac tccatgatcc tgatcggcaa ggtgtacacc gcccagaacc cttccgctca 780 ggccctggga ctcggaaagc acaattattg tcgcaatccc gacggcgacg ccaaaccttg 840 gtgtcacgtg ctgaagaacc ggcggctgac atgggaatac tgcgacgtgc cttcctgctc 900 tacctgcggc ctgcggcagt actcccagcc tcagttccgg atcaagggcg gcctgttcgc 960 cgatatcgcc tcccaccctt ggcaggccgc catcttcgcc gctgctgccg cttctcctgg 1020 cgagagattc ctgtgcggcg gcatcctgat ctccagctgc tggattctgt ctgccgccca 1080 ctgcttccag gaacggttcc ctcctcacca cctgaccgtg atcctgggcc ggacctacag 1140 agtcgtgccc ggcgaggaag aacagaaatt cgaggtggag aagtatatcg tgcacaaaga 1200 gttcgacgac gacacctacg acaacgatat cgccctgctg cagctgaagt ccgactcctc 1260 cagatgcgcc caggaatcct ccgtcgttcg gaccgtgtgt ctgccacctg ccgacctgca 1320 gctgcctgac tggaccgagt gcgagctgtc cggctacggc aagcacgagg ccctgtcccc 1380 cttctactcc gagcggctga aagaagctca tgtacggctg tacccctcta gccggtgcac 1440 ctcccagcat ctgctgaacc ggaccgtgac cgacaacatg ctgtgtgccg gcgacaccag 1500 atctggcggc cctcaggcca acctgcacga cgcctgccag ggcgatagtg gcggacctct 1560 cgtgtgcctc aacgacggca ggatgaccct cgtgggcatc atctcttggg gcctgggctg 1620 tggccagaaa gacgtgcctg gcgtgtacac caaagtgacc aactacctgg actggatcag 1680 ggacaacatg cggccttgat gagcggccgc 1710 <210> 21 <211> 601 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> Darbepoetin (DNA sequence corresponding to Seq ID No. 9) <400> 21 ctcgagccac catgggggtg cacgaatgtc ctgcctggct gtggcttctc ctgtccctgc 60 tgtcgctccc tctgggcctc ccagtcctgg gcgccccacc acgcctcatc tgtgacagcc 120 gagtcctgga gaggtacctc ttggaggcca aggaggccga gaatatcacg acgggctgta 180 atgaaacctg cagcttgaat gagaatatca ctgtcccaga caccaaagtt aatttctatg 240 cctggaagag gatggaggtc gggcagcagg ccgtagaagt ctggcagggc ctggccctgc 300 tgtcggaagc tgtcctgcgg ggccaggccc tgttggtcaa ctcttcccag gtgaacgaga 360 ccctgcagct gcatgtggat aaagccgtca gtggccttcg cagcctcacc actctgcttc 420 gggctctggg agcccagaag gaagccatct cccctccaga tgcggcctca gctgctccac 480 tccgaacaat cactgctgac actttccgca aactcttccg agtctactcc aatttcctcc 540 ggggaaagct gaagctgtac acaggggagg cctgcaggac aggggacaga tgagcggccg 600 c 601 <210> 22 <211> 1489 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> Etanercept (DNA sequence corresponding to Seq ID No. 11) <400> 22 ctcgagccat ggctccagtg gctgtgtggg ctgctctggc tgtgggcctg gaactgtggg 60 ccgctgctca cgctctgcct gctcaggtgg ccttcacccc ttatgcccct gagcctggct 120 ccacctgcag gctgcgggag tactacgacc agaccgccca gatgtgctgc tccaagtgct 180 ctcctggcca gcacgccaag gtgttctgca ccaagacctc cgacaccgtg tgcgactctt 240 gcgaggactc cacctacacc cagctctgga actgggtgcc cgagtgcctg tcctgcggct 300 ccagatgctc ctccgaccag gtggagacac aggcctgtac acgggagcag aatcggattt 360 gcacatgcag gcctggctgg tactgcgccc tgtccaagca ggaaggatgc aggctgtgcg 420 cccctctgag gaagtgcaga cctggcttcg gcgtggctag gcctggcacc gagacatccg 480 acgtcgtgtg caagccttgt gcccctggca ccttctccaa caccacatcc tccaccgaca 540 tctgccggcc tcaccagatc tgcaacgtgg tggccatccc tggcaacgcc agcatggacg 600 ccgtgtgcac ctccacctcc cccaccagat ctatggcccc tggcgccgtg catctgcctc 660 agcctgtgtc cacccggtcc cagcataccc agcctacacc tgagccctct accgcccctt 720 ctacctcctt cctgctgcct atgggccctt ctcctccagc tgagggctct accggcgacg 780 agcctaagtc ctgcgacaag acccacacct gtcccccctg ccctgcccct gaactgctgg 840 gaggccccag cgtgttcctg ttccccccaa agcccaagga caccctgatg atctcccgga 900 cccccgaagt gacctgcgtg gtggtggacg tgtcccacga ggaccctgaa gtgaagttca 960 attggtacgt ggacggcgtg gaagtgcaca acgccaagac caagcccaga gaggaacagt 1020 acaactccac ctaccgggtg gtgtccgtgc tgaccgtgct gcaccaggac tggctgaacg 1080 gcaaagagta caagtgcaag gtgtccaaca aggctctgcc tgcccccatc gaaaagacca 1140 tctccaaggc caagggccag ccccgcgagc ctcaggtgta caccctgcct ccttcccggg 1200 aggagatgac caagaaccag gtgtccctga cctgtctggt caagggcttc tacccctccg 1260 atatcgccgt ggaatgggag tccaacggac agcccgagaa caactacaag accacccccc 1320 ctgtgctgga ctccgacggc tcattcttcc tgtactccaa gctgaccgtg gacaagtccc 1380 ggtggcagca gggcaacgtg ttctcctgct ccgtgatgca cgaggccctg cacaaccact 1440 acacccagaa gagcttatcc ctgtctcctg gcaagtgata agcggccgc 1489 <210> 23 <211> 365 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> FSH alpha (DNA sequence corresponding to Seq ID No. 13) <400> 23 ctcgagccac catggactac taccggaagt acgccgccat cttcctggtg accctgtccg 60 tgttcctgca cgtgctgcac tctgcccctg acgtgcagga ctgccctgag tgcaccctgc 120 aggaaaaccc attcttcagc cagcctggcg cccctatcct gcagtgcatg ggctgctgct 180 tctccagagc ctaccctacc cctctgcggt ccaagaaaac catgctggtg cagaaaaacg 240 tgacctccga gtctacctgc tgcgtggcca agtcctacaa cagagtgacc gtgatgggcg 300 gcttcaaggt ggagaaccac accgcctgcc actgctctac ctgctactac cacaagtcct 360 gatga 365 <210> 24 <211> 415 <212> DNA <213> Artificial <220> <223> FSH beta (DNA sequence corresponding to Seq ID No. 15) <400> 24 cccgggccac catgaagacc ctgcagttct tcttcctgtt ctgctgctgg aaggccatct 60 gctgcaactc ttgcgagctg accaacatca caatcgccat cgagaaagag gaatgccggt 120 tctgcatctc catcaacacc acttggtgcg ccggctactg ctacacccgc gacctggtgt 180 acaaggaccc tgcccggcct aagatccaga aaacctgcac cttcaaagaa ctggtgtacg 240 agacagtgcg ggtgccaggc tgcgctcacc acgccgactc cctgtacacc taccctgtgg 300 ccacccagtg ccactgcggc aagtgcgact ccgactccac cgactgtacc gtgcggggcc 360 tgggcccttc ttactgctcc ttcggcgaga tgaaggaatg atgaccagcg gccgc 415

Claims (28)

  1. 흥미있는 유전자에 실시가능하게 결합된 프로모터, 발현 증진 요소(expression enhancement elements), TPL, VA I 및 II 유전자 또는 이의 변이체들, 번역 종결자(translation terminator) 및 항생물질 마커(antibiotic marker)를 포함하는 발현 벡터로서, 상기 발현 증진 요소는 염색질 부착 영역(chromatin attachment region)인, 발현 벡터.
  2. 제1항에 있어서,
    a) 인트론 또는 이의 변이체들
    b) 임의적으로 내부의 리보솜의 결합 부위(Internal ribosomal binding site) 또는 이의 변이체들,
    을 더 포함하는, 발현 벡터.
  3. 제1항에 있어서,
    상기 염색질 부착 영역은, 적절한 매트릭스 부착 영역(matrix attachment region)인, 발현 벡터.
  4. 제1항에 있어서,
    상기 염색질 부착 영역은, 적절한 스캐폴드 부착 영역(scaffold attachment region)인, 발현 벡터.
  5. 제3항에 있어서,
    상기 매트릭스 부착 영역은, 초파리 Scs 경계 요소(Drosophila Scs boundary element), hspSAP MAR, cLysMARs, 마우스 T 세포 수용체 TCRα, 랫 유전자자리 조절 부위(Rat locus control region), β-글로빈 MAR로부터 선택된, 발현 벡터.
  6. 제3항 또는 제5항에 있어서,
    상기 매트릭스 부착 영역은 cLysMARs인, 발현 벡터.
  7. 제5항에 있어서,
    상기 cLysMARs는, 서열 id no. 5 에 나타낸 뉴클레오티드 서열을 갖는, 발현 벡터.
  8. 제1항에 있어서,
    상기 프로모터는, CMV 프로모터, SV40 프로모터, 아데노바이러스 프로모터, 베타 액틴 프로모터(Beta actin promoter), 메탈로티오닌 프로모터(metallothionin Promoters), 또는 그 밖의 원핵세포 또는 진핵세포 바이러스 프로모터로 이루어진 군으로부터 선택된, 발현 벡터. 바람직하게 CMV 프로모터.
  9. 제2항에 있어서,
    상기 내부의 리보솜의 결합 부위는 뇌심근염 바이러스 IRES인, 발현 벡터.
  10. 제2항 및 제9항에 있어서,
    상기 내부의 리보솜의 결합 부위는 서열 id no. 14에 나타낸 뉴클레오티드 서열을 가지는, 발현 벡터.
  11. 제1항에 있어서,
    상기 VA I 및 II 유전자는, 서열 id no. 3에 나타낸 뉴클레오티드 서열을 가지는, 발현 벡터.
  12. 제1항에 있어서,
    상기 TPL은, 서열 id no. 2에 나타낸 뉴클레오티드 서열을 가지는, 발현 벡터.
  13. 제2항에 있어서,
    상기 키메라 인트론(chimeric Intron)은 서열 id no. 1에 나타낸 뉴클레오티드 서열을 갖는, 발현 벡터.
  14. 제1항에 있어서,
    흥미있는 유전자는, 조직 플라스미노겐 활성인자(tissue plasminogen activator), TNK-TPA, 다베포이에틴(Darbepoietin), 에리스로포이에틴(Erythropoietin), 인슐린, GCSF, 인터류킨(Interleukin), 종양 괴사 인자(Tumor necrosis factor), 인터페론(Interferon), TNFR-IgGFc, 리툭시맙(rituximab), 베바시주맙(bevacizumab), 아달리무맙(adalimumab), 트라스투주맙(trastuzumab)으로부터 선택된 모노클론항체 및 Fc 영역, Fab와 같은 이들의 단편, GLP-I, GLP-II, IGF-I, IGF-II, 혈소판 유래 증식 인자(Platelet derived growth factor), FVII, FVIII, FIV 및 FXIII, 엑센딘-3, 엑센딘 4, MYT-2, NF-κB 억제 인자 NRF, AML1/RUNX1, Gtx 호메오도메인 단백질과 같은 전사 인자, 진핵생물 개시 인자 4G(elF4G)a(Eukaryotic initiation factor 4G(elF4G)a), 진핵생물 개시 인자 4Gl(elF4Gl)a, 사멸 관련 단백질 5(Death associated protein 5, DAP5)로부터 선택된 번역 인자(translation factor), c-myc, L-myc, Pim-1, 단백질 키나아제 p58PITSLRE, p53과 같은 종양유전자, 여포 자극 호르몬(Follicle stimulating hormone), 융모성 생식선 자극호르몬(Human Chorionic Gonadotropin), 인간 황체형성 호르몬(Human Luteinizing Hormone)으로부터 선택된 생식선 자극 호르몬으로부터 선택된 호르몬, 및 면역글로불린 중쇄 결합 단백질(immunoglobulin heavy chain binding protein, BiP), 열 충격 단백질 70(Heat shock protein 70), 미토콘드리아의 H+-ATP 생성효소의 β-서브유닛(subunit), 오르니틴 탈카르복실화효소(Ornithine decarboxylase), 코넥신 32 및 43(connexins 32 and 43), HIF-1a, APC 로부터 선택된, 단백질 및 펩티드 및 이의 유사체를 코딩하는, 발현 벡터.
  15. 제1항에 있어서,
    상기 항생물질 마커는, 카나마이신(kanamycin), 퓨로마이신(puromycin), 히그로마이신(hygromycin) 및 네오마이신(neomycin)으로부터 선택된, 발현 벡터.
  16. 제1항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서,
    상기 cLysMARs은 상기 발현 카세트(expression cassette)의 어느 한 쪽의 측면(flank)에서 클론되는, 발현 벡터.
  17. 제1항 및 제2항 중 어느 한 항에 있어서,
    a) 프로모터 또는 이의 변이체,
    b) VA I 및 II 유전자 또는 이의 변이체,
    c) TPL 또는 이의 변이체,
    d) 키메라 인트론(chimeric Intron) 또는 이의 변이체,
    e) 항생물질 마커,
    f) 매트릭스 부착 영역,
    g) 임의적으로 내부의 리보솜의 결합 부위,
    h) 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 서열
    에 실시가능하게 결합된 흥미있는 유전자를 포함하는, 발현 벡터.
  18. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서,
    접근 번호(accession number) MTCC 5655를 갖는, 발현 벡터.
  19. 제1항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서,
    접근 번호 MTCC 5656을 갖는, 발현 벡터.
  20. 제1항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서,
    접근 번호 MTCC 5657을 갖는, 발현 벡터.
  21. 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항의 벡터로 형질전환된 숙주 세포.
  22. 제20항에 있어서,
    CHO 또는 BHK 세포주 또는 이들의 유도체들(derivatives)로부터 선택된, 숙주 세포.
  23. a) 제1항 내지 제22항 중 어느 한 항의 발현 벡터를 구성하고;
    b) 흥미있는 단백질 또는 펩티드를 발현시키는 적절한 숙주 세포에서 상기 발현 벡터의 형질전환(transformation);
    을 포함하는, 단백질들 및 펩티드들 및 이의 변이체들의 생산을 위한 방법.
  24. a) 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 발현 벡터를 구성하고;
    b) 적절한 숙주 세포에서 상기 발현 벡터의 트랜스펙션(transfection);
    c) 흥미있는 단백질 또는 펩티드를 발현하는 적절한 트랜스펙션된 숙주 세포를 선별하고;
    d) 단계 (c)에서 선별된 적절한 숙주 세포는 제1항 내지 제23항 중 어느 한 항의 발현 벡터로 더 재트랜스펙션되고(retransfected);
    e) 흥미있는 단백질 또는 펩티드를 발현하는 적절한 재트랜스펙션된 숙주 세포;
    를 포함하는, 단백질들 및 펩티드들 및 이의 변이체들의 생산을 위한 방법.
  25. 제23항 및 제24항에 있어서,
    상기 발현 벡터는 접근 번호 MTCC 5655를 갖는, 방법.
  26. 제23항 및 제24항에 있어서,
    상기 발현 벡터는 접근 번호 MTCC 5656을 갖는, 방법.
  27. 제23항 및 제24항에 있어서,
    상기 발현 벡터는 접근 번호 MTCC 5657을 갖는, 방법.
  28. 제23항 및 제24항에 있어서,
    상기 단백질 및 펩티드는, 조직 플라스미노겐 활성인자, TNK-TPA, 다베포이에틴, 에리스로포이에틴, 인슐린, GCSF, 인터류킨, 종양 괴사 인자, 인터페론, TNFR-IgGFc, 리툭시맙, 베바시주맙, 아달리무맙, 트라스투주맙과 같은 모노클론항체 및 Fc 영역, Fab와 같은 이들의 단편, GLP-I, GLP-II, IGF-I, IGF-II, 혈소판 유래 성장 인자(Platelet derived growth factor), FVII, FVIII, FIV 및 FXIII, 엑센딘-3, 엑센딘 4, 여포 자극 호르몬, 융모성 생식선 자극호르몬, 인간 황체형성 호르몬으로부터 선택된 생식선 자극 호르몬과 같은 호르몬으로부터 선택된, 방법.
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